MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus pyogenes str. Manfredo

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
3811783	3811784	SpyM50001	SpyM50002	dnaA	dnaN	TRUE	0.634	155.000	0.328	1.000	Y	NA
3811784	3811785	SpyM50002	SpyM50003	dnaN		TRUE	0.393	75.000	0.009	NA		NA
3811785	3811786	SpyM50003	SpyM50004			FALSE	0.086	330.000	0.064	NA		NA
3811786	3811787	SpyM50004	SpyM50005		pth	TRUE	0.787	70.000	0.184	1.000	Y	NA
3811787	3811788	SpyM50005	SpyM50006	pth	trcF	TRUE	0.896	3.000	0.137	1.000	N	NA
3811788	3811789	SpyM50006	SpyM50007	trcF		FALSE	0.105	162.000	0.024	1.000	N	NA
3811789	3811790	SpyM50007	SpyM50008			TRUE	0.908	-13.000	0.053	1.000	N	NA
3811790	3811791	SpyM50008	SpyM50009			TRUE	0.904	-3.000	0.011	NA		NA
3811791	3811792	SpyM50009	SpyM50010			TRUE	0.945	13.000	0.132	NA		NA
3811792	3811793	SpyM50010	SpyM50011			TRUE	0.833	-3.000	0.014	1.000	N	NA
3811793	3811794	SpyM50011	SpyM50012		hpt	TRUE	0.952	5.000	0.067	0.065	N	NA
3811794	3811795	SpyM50012	SpyM50013	hpt	ftsH	TRUE	0.911	22.000	0.192	1.000	N	NA
3811795	3811796	SpyM50013	SpyM50014	ftsH		FALSE	0.032	325.000	0.009	1.000	N	NA
3811796	3811797	SpyM50014	SpyM5r01			FALSE	0.030	565.000	0.000	NA		NA
3811797	3811798	SpyM5r01	SpyM5t01			TRUE	0.489	50.000	0.000	NA		NA
3811798	3811799	SpyM5t01	SpyM5r02			FALSE	0.051	299.000	0.000	NA		NA
3811799	3811800	SpyM5r02	SpyM5r03			FALSE	0.266	84.000	0.000	NA		NA
3811800	3811801	SpyM5r03	SpyM5t02			TRUE	0.866	13.000	0.000	NA		NA
3811801	3811802	SpyM5t02	SpyM5t03			TRUE	0.842	18.000	0.000	NA		NA
3811802	3811803	SpyM5t03	SpyM5t04			TRUE	0.692	32.000	0.000	NA		NA
3811803	3811804	SpyM5t04	SpyM5t05			TRUE	0.851	6.000	0.000	NA		NA
3811804	3811805	SpyM5t05	SpyM5t06			TRUE	0.857	11.000	0.000	NA		NA
3811805	3811806	SpyM5t06	SpyM5t07			TRUE	0.866	13.000	0.000	NA		NA
3811806	3811807	SpyM5t07	SpyM5t08			TRUE	0.855	9.000	0.000	NA		NA
3811807	3811808	SpyM5t08	SpyM5t09			TRUE	0.847	17.000	0.000	NA		NA
3811808	3811809	SpyM5t09	SpyM5t10			TRUE	0.853	7.000	0.000	NA		NA
3811809	3811810	SpyM5t10	SpyM5r04			FALSE	0.161	125.000	0.000	NA		NA
3811810	3811811	SpyM5r04	SpyM5t11			TRUE	0.489	50.000	0.000	NA		NA
3811811	3811812	SpyM5t11	SpyM5r05			FALSE	0.050	300.000	0.000	NA		NA
3811812	3811813	SpyM5r05	SpyM5r06			FALSE	0.272	83.000	0.000	NA		NA
3811813	3811814	SpyM5r06	SpyM5t12			TRUE	0.866	13.000	0.000	NA		NA
3811814	3811815	SpyM5t12	SpyM5t13			TRUE	0.842	18.000	0.000	NA		NA
3811815	3811816	SpyM5t13	SpyM5t14			TRUE	0.692	32.000	0.000	NA		NA
3811816	3811817	SpyM5t14	SpyM5t15			TRUE	0.851	6.000	0.000	NA		NA
3811817	3811818	SpyM5t15	SpyM5t16			TRUE	0.857	11.000	0.000	NA		NA
3811818	3811819	SpyM5t16	SpyM5t17			TRUE	0.866	13.000	0.000	NA		NA
3811819	3811820	SpyM5t17	SpyM5t18			TRUE	0.855	9.000	0.000	NA		NA
3811820	3811821	SpyM5t18	SpyM5t19			TRUE	0.847	17.000	0.000	NA		NA
3811821	3811822	SpyM5t19	SpyM5t20			TRUE	0.853	7.000	0.000	NA		NA
3811822	3811823	SpyM5t20	SpyM5t21			TRUE	0.851	6.000	0.000	NA		NA
3811823	3811824	SpyM5t21	SpyM5t22			TRUE	0.816	21.000	0.000	NA		NA
3811824	3811825	SpyM5t22	SpyM5t23			TRUE	0.800	23.000	0.000	NA		NA
3811825	3811826	SpyM5t23	SpyM5t24			TRUE	0.800	23.000	0.000	NA		NA
3811826	3811827	SpyM5t24	SpyM5t25			TRUE	0.866	13.000	0.000	NA		NA
3811827	3811828	SpyM5t25	SpyM5t26			TRUE	0.655	35.000	0.000	NA		NA
3811828	3811829	SpyM5t26	SpyM5t27			TRUE	0.856	10.000	0.000	NA		NA
3811829	3811830	SpyM5t27	SpyM50015			FALSE	0.027	1364.000	0.000	NA		NA
3811830	3811831	SpyM50015	SpyM50016		prs1	FALSE	0.144	253.000	0.107	NA		NA
3811831	3811832	SpyM50016	SpyM50017	prs1	recO	FALSE	0.044	186.000	0.000	1.000	N	NA
3811832	3811833	SpyM50017	SpyM50018	recO	plsX	FALSE	0.155	103.000	0.011	1.000	N	NA
3811833	3811834	SpyM50018	SpyM50019	plsX		TRUE	0.990	-7.000	0.017	0.010	Y	NA
3811834	3811835	SpyM50019	SpyM50020		purC	FALSE	0.128	151.000	0.000	NA		NA
3811835	3811836	SpyM50020	SpyM50022	purC		FALSE	0.312	76.000	0.000	NA		NA
3811836	3811837	SpyM50022	SpyM50023		purF	FALSE	0.218	234.000	0.024	1.000	Y	NA
3811837	3811838	SpyM50023	SpyM50024	purF	purM	TRUE	0.963	28.000	0.248	1.000	Y	NA
3811838	3811839	SpyM50024	SpyM50025	purM	purN	TRUE	0.825	168.000	0.238	0.003	Y	NA
3811841	3811842	SpyM50029	SpyM50030	purD	purE	FALSE	0.180	281.000	0.044	1.000	Y	NA
3811842	3811843	SpyM50030	SpyM50031	purE	purK	TRUE	0.993	-13.000	0.002	0.002	Y	NA
3811843	3811844	SpyM50031	SpyM50032	purK		TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3811844	3811845	SpyM50032	SpyM50033		purB	TRUE	0.827	20.000	0.000	NA		NA
3811845	3811846	SpyM50033	SpyM50034	purB		FALSE	0.156	131.000	0.005	1.000		NA
3811846	3811847	SpyM50034	SpyM50035		ruvB	FALSE	0.080	220.000	0.002	1.000		NA
3811847	3811848	SpyM50035	SpyM50036	ruvB		FALSE	0.092	138.000	0.005	1.000	N	NA
3811848	3811849	SpyM50036	SpyM50037			TRUE	0.866	23.000	0.019	NA		NA
3811849	3811850	SpyM50037	SpyM50038			TRUE	0.981	-3.000	0.351	NA		NA
3811850	3811851	SpyM50038	SpyM50039		adhE	FALSE	0.020	309.000	0.000	1.000	N	NA
3811851	3811852	SpyM50039	SpyM50040	adhE	adhP	FALSE	0.344	252.000	0.012	0.002		NA
3811852	3811853	SpyM50040	SpyM50041	adhP		FALSE	0.029	388.000	0.000	1.000		NA
3811853	3811854	SpyM50041	SpyM50042			FALSE	0.204	104.000	0.000	NA		NA
3811854	3811855	SpyM50042	SpyM50043		rpsJ	FALSE	0.109	181.000	0.000	NA		NA
3811855	3811856	SpyM50043	SpyM50044	rpsJ	rplC	TRUE	0.768	248.000	0.467	0.046	Y	NA
3811856	3811857	SpyM50044	SpyM50045	rplC	rplD	TRUE	0.996	24.000	0.544	0.035	Y	NA
3811857	3811858	SpyM50045	SpyM50046	rplD	rplW	TRUE	0.994	0.000	0.307	0.035	Y	NA
3811858	3811859	SpyM50046	SpyM50047	rplW	rplB	TRUE	0.999	18.000	0.849	0.039	Y	NA
3811859	3811860	SpyM50047	SpyM50048	rplB	rpsS	TRUE	0.948	139.000	0.820	0.046	Y	NA
3811860	3811861	SpyM50048	SpyM50049	rpsS	rplV	TRUE	0.998	16.000	0.769	0.046	Y	NA
3811861	3811862	SpyM50049	SpyM50050	rplV	rpsC	TRUE	0.998	13.000	0.719	0.046	Y	NA
3811862	3811863	SpyM50050	SpyM50051	rpsC	rplP	TRUE	0.998	4.000	0.828	0.046	Y	NA
3811863	3811864	SpyM50051	SpyM50052	rplP	rpmC	TRUE	0.999	10.000	0.802	0.035	Y	NA
3811864	3811865	SpyM50052	SpyM50053	rpmC	rpsQ	TRUE	0.998	26.000	0.828	0.035	Y	NA
3811865	3811866	SpyM50053	SpyM50054	rpsQ	rplN	TRUE	0.997	25.000	0.791	0.046	Y	NA
3811866	3811867	SpyM50054	SpyM50055	rplN	rplX	TRUE	0.979	79.000	0.810	0.046	Y	NA
3811867	3811868	SpyM50055	SpyM50056	rplX	rplE	TRUE	0.997	24.000	0.758	0.035	Y	NA
3811868	3811869	SpyM50056	SpyM50057	rplE	rpsN	TRUE	0.997	16.000	0.496	0.035	Y	NA
3811869	3811870	SpyM50057	SpyM50058	rpsN	rpsH	TRUE	0.882	151.000	0.473	0.035	Y	NA
3811870	3811871	SpyM50058	SpyM50059	rpsH	rplF	TRUE	0.922	203.000	0.808	0.035	Y	NA
3811871	3811872	SpyM50059	SpyM50060	rplF	rplR	TRUE	0.968	105.000	0.815	0.035	Y	NA
3811872	3811873	SpyM50060	SpyM50061	rplR	rpsE	TRUE	0.998	19.000	0.814	0.046	Y	NA
3811873	3811874	SpyM50061	SpyM50062	rpsE	rpmD	TRUE	0.998	15.000	0.789	0.046	Y	NA
3811874	3811875	SpyM50062	SpyM50063	rpmD	rplO	TRUE	0.906	215.000	0.653	0.006	Y	NA
3811875	3811876	SpyM50063	SpyM50064	rplO	secY	TRUE	0.988	17.000	0.730	1.000	N	NA
3811876	3811877	SpyM50064	SpyM50065	secY	adk	FALSE	0.322	150.000	0.241	1.000	N	NA
3811877	3811878	SpyM50065	SpyM50066	adk	infA	FALSE	0.175	118.000	0.059	1.000	N	NA
3811878	3811879	SpyM50066	SpyM50066A	infA	rpmJ	TRUE	0.928	26.000	0.067	1.000	Y	NA
3811879	3811880	SpyM50066A	SpyM50067	rpmJ	rpsM	TRUE	0.985	18.000	0.086	0.035	Y	NA
3811880	3811881	SpyM50067	SpyM50068	rpsM	rpsK	TRUE	0.998	18.000	0.810	0.035	Y	NA
3811881	3811882	SpyM50068	SpyM50069	rpsK	rpoA	TRUE	0.838	46.000	0.308	1.000	N	NA
3811882	3811883	SpyM50069	SpyM50070	rpoA	rplQ	TRUE	0.993	15.000	0.873	1.000	N	NA
3811883	3811884	SpyM50070	SpyM50071	rplQ		FALSE	0.012	624.000	0.000	1.000	N	NA
3811884	3811885	SpyM50071	SpyM5r07			FALSE	0.054	291.000	0.000	NA		NA
3811885	3811886	SpyM5r07	SpyM5t28			TRUE	0.489	50.000	0.000	NA		NA
3811886	3811887	SpyM5t28	SpyM5r08			FALSE	0.050	300.000	0.000	NA		NA
3811887	3811888	SpyM5r08	SpyM5r09			FALSE	0.272	83.000	0.000	NA		NA
3811888	3811889	SpyM5r09	SpyM5t29			TRUE	0.866	13.000	0.000	NA		NA
3811889	3811890	SpyM5t29	SpyM5t30			TRUE	0.851	6.000	0.000	NA		NA
3811890	3811891	SpyM5t30	SpyM5t31			TRUE	0.655	35.000	0.000	NA		NA
3811891	3811892	SpyM5t31	SpyM5t32			TRUE	0.800	23.000	0.000	NA		NA
3811892	3811893	SpyM5t32	SpyM5t33			TRUE	0.857	11.000	0.000	NA		NA
3811893	3811894	SpyM5t33	SpyM5t34			TRUE	0.856	10.000	0.000	NA		NA
3811894	3811895	SpyM5t34	SpyM5t35			TRUE	0.816	21.000	0.000	NA		NA
3811895	3811896	SpyM5t35	SpyM5t36			TRUE	0.827	20.000	0.000	NA		NA
3811896	3811897	SpyM5t36	SpyM5t37			TRUE	0.853	7.000	0.000	NA		NA
3811897	3811898	SpyM5t37	SpyM5t38			TRUE	0.861	12.000	0.000	NA		NA
3811898	3811899	SpyM5t38	SpyM5t39			TRUE	0.855	9.000	0.000	NA		NA
3811899	3811900	SpyM5t39	SpyM5t40			TRUE	0.827	20.000	0.000	NA		NA
3811900	3811901	SpyM5t40	SpyM50071A			FALSE	0.064	260.000	0.000	NA		NA
3811901	3811902	SpyM50071A	SpyM50075			FALSE	0.027	1323.000	0.000	NA		NA
3811902	3811903	SpyM50075	SpyM50076			TRUE	0.929	4.000	0.192	1.000	N	NA
3811903	3811904	SpyM50076	SpyM50077			TRUE	0.996	-7.000	0.673	1.000	Y	NA
3811905	3811906	SpyM50078	SpyM50079		tyrS	TRUE	0.472	51.000	0.000	NA		NA
3811907	3811908	SpyM50080	SpyM50081	pbp1B	rpoB	FALSE	0.026	264.000	0.000	1.000	N	NA
3811908	3811909	SpyM50081	SpyM50082	rpoB	rpoC	TRUE	0.984	91.000	0.851	0.002	Y	NA
3811909	3811910	SpyM50082	SpyM50083	rpoC		FALSE	0.165	152.000	0.007	NA		NA
3811910	3811911	SpyM50083	SpyM50084			TRUE	0.394	93.000	0.083	NA		NA
3811911	3811912	SpyM50084	SpyM50085			TRUE	0.997	-16.000	0.639	1.000	Y	NA
3811912	3811913	SpyM50085	SpyM50086		comYC	TRUE	0.999	2.000	0.861	0.002	Y	NA
3811913	3811914	SpyM50086	SpyM50087	comYC		TRUE	0.985	-25.000	0.110	NA	Y	NA
3811914	3811915	SpyM50087	SpyM50088			TRUE	0.993	5.000	0.786	NA		NA
3811915	3811916	SpyM50088	SpyM50089			TRUE	0.977	-7.000	0.250	NA		NA
3811916	3811917	SpyM50089	SpyM50090			TRUE	0.981	-16.000	0.232	NA		NA
3811917	3811918	SpyM50090	SpyM50091			TRUE	0.377	98.000	0.087	NA		NA
3811918	3811919	SpyM50091	SpyM50092		ackA	TRUE	0.517	59.000	0.130	1.000	N	NA
3811919	3811920	SpyM50092	SpyM50093	ackA		FALSE	0.102	187.000	0.000	NA		NA
3811921	3811922	SpyM50094	SpyM50095	proC	pepA	TRUE	0.503	48.000	0.041	1.000	N	NA
3811922	3811923	SpyM50095	SpyM50095A	pepA		FALSE	0.353	110.000	0.100	NA		NA
3811924	3811925	SpyM50096	SpyM50097			TRUE	0.948	-3.000	0.140	NA		NA
3811925	3811926	SpyM50097	SpyM50098			TRUE	0.958	18.000	0.239	1.000		NA
3811926	3811927	SpyM50098	SpyM50099			FALSE	0.172	151.000	0.034	1.000		NA
3811928	3811929	SpyM50100	SpyM50101			TRUE	0.748	20.000	0.005	1.000	N	NA
3811929	3811930	SpyM50101	SpyM50102		hslO	TRUE	0.900	-13.000	0.034	1.000	N	NA
3811930	3811931	SpyM50102	SpyM50103	hslO	rofA	FALSE	0.194	126.000	0.003	NA		NA
3811932	3811933	SpyM50104	SpyM50105			TRUE	0.939	-7.000	0.061	NA		NA
3811933	3811934	SpyM50105	SpyM50106			TRUE	0.917	7.000	0.061	NA		NA
3811934	3811935	SpyM50106	SpyM50107		srtB	TRUE	0.985	1.000	0.500	NA		NA
3811935	3811936	SpyM50107	SpyM50106a	srtB		TRUE	0.995	17.000	1.000	NA		NA
3811942	3811943	SpyM50114	SpyM50115	atoB1	atoD1	TRUE	0.966	12.000	0.100	1.000	Y	NA
3811943	3811944	SpyM50115	SpyM50116	atoD1	atoA1	TRUE	0.990	3.000	0.200	0.052	Y	NA
3811946	3811947	SpyM50118	SpyM50119			TRUE	0.636	37.000	0.016	NA	N	NA
3811947	3811948	SpyM50119	SpyM50120			FALSE	0.033	449.000	0.000	NA		NA
3811948	3811949	SpyM50120	SpyM50121		ntpI	TRUE	0.939	-10.000	0.029	NA		NA
3811949	3811950	SpyM50121	SpyM50122	ntpI	ntpK	TRUE	0.998	2.000	0.848	0.012		NA
3811950	3811951	SpyM50122	SpyM50123	ntpK	ntpE	TRUE	0.781	68.000	0.045	0.012		NA
3811951	3811952	SpyM50123	SpyM50124	ntpE	ntpC	TRUE	0.983	16.000	0.097	0.002		NA
3811952	3811953	SpyM50124	SpyM50125	ntpC		TRUE	0.998	-3.000	0.487	0.002	Y	NA
3811953	3811954	SpyM50125	SpyM50126		ntpA	TRUE	0.858	201.000	0.462	0.011	Y	NA
3811954	3811955	SpyM50126	SpyM50127	ntpA	ntpB	TRUE	0.999	1.000	0.776	0.011	Y	NA
3811955	3811956	SpyM50127	SpyM50128	ntpB	ntpD	TRUE	0.975	45.000	0.238	0.011	Y	NA
3811957	3811958	SpyM50129	SpyM50130			TRUE	0.994	13.000	0.818	NA		NA
3811959	3811960	SpyM50131	SpyM50132	purA		FALSE	0.163	327.000	0.000	0.020		NA
3811960	3811961	SpyM50132	SpyM50133		nusG	FALSE	0.093	174.000	0.000	1.000		NA
3811961	3811962	SpyM50133	SpyM50134	nusG	nga	FALSE	0.031	372.000	0.000	1.000		NA
3811962	3811963	SpyM50134	SpyM50135	nga		TRUE	0.466	134.000	0.286	1.000		NA
3811963	3811964	SpyM50135	SpyM50136		slo	TRUE	0.930	15.000	0.125	1.000		NA
3811965	3811966	SpyM50137	SpyM50138			FALSE	0.036	401.000	0.000	NA		NA
3811966	3811967	SpyM50138	SpyM50139			FALSE	0.105	185.000	0.000	NA		NA
3811968	3811969	SpyM50140	SpyM50141		leuS	FALSE	0.036	212.000	0.000	1.000	N	NA
3811969	3811970	SpyM50141	SpyM50142	leuS		FALSE	0.038	307.000	0.000	1.000		NA
3811970	3811971	SpyM50142	SpyM50143			TRUE	0.928	71.000	0.431	0.024		NA
3811971	3811972	SpyM50143	SpyM50144			TRUE	0.860	123.000	0.279	0.018	Y	NA
3811972	3811973	SpyM50144	SpyM50145		ulaD	TRUE	0.792	91.000	0.328	1.000	Y	NA
3811973	3811974	SpyM50145	SpyM50146	ulaD		TRUE	0.992	5.000	0.536	1.000	Y	NA
3811974	3811975	SpyM50146	SpyM50147		araD	TRUE	0.995	2.000	0.700	1.000	Y	NA
3811975	3811976	SpyM50147	SpyM50147A	araD		TRUE	0.417	58.000	0.000	NA		NA
3811976	3811977	SpyM50147A	SpyM50148			FALSE	0.168	121.000	0.000	NA		NA
3811977	3811978	SpyM50148	SpyM50149			FALSE	0.252	253.000	0.231	NA		NA
3811978	3811979	SpyM50149	SpyM50150			FALSE	0.032	488.000	0.000	NA		NA
3811979	3811980	SpyM50150	SpyM50151			TRUE	0.989	16.000	0.177	0.088	Y	NA
3811980	3811981	SpyM50151	SpyM50152		pol	FALSE	0.094	131.000	0.003	1.000	N	NA
3811981	3811982	SpyM50152	SpyM50153	pol		FALSE	0.141	178.000	0.005	NA		NA
3811982	3811983	SpyM50153	SpyM50154			TRUE	0.551	52.000	0.010	NA		NA
3811985	3811986	SpyM50156	SpyM50157		tgt	TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3811986	3811987	SpyM50157	SpyM50158	tgt		FALSE	0.084	218.000	0.004	1.000		NA
3811987	3811988	SpyM50158	SpyM50159			TRUE	0.903	4.000	0.039	NA		NA
3811988	3811989	SpyM50159	SpyM50160			FALSE	0.214	140.000	0.033	NA		NA
3811989	3811990	SpyM50160	SpyM50161			TRUE	0.968	0.000	0.013	0.020		NA
3811992	3811993	SpyM50163	SpyM5s01			TRUE	0.489	50.000	0.000	NA		NA
3811995	3811996	SpyM50165	SpyM50166	speG		FALSE	0.262	85.000	0.000	NA		NA
3811996	3811997	SpyM50166	SpyM50167		pgi	FALSE	0.067	252.000	0.000	NA		NA
3811999	3812000	SpyM50169	SpyM50170			FALSE	0.175	117.000	0.000	NA		NA
3812000	3812001	SpyM50170	SpyM50171			TRUE	0.739	28.000	0.000	NA		NA
3812002	3812003	SpyM50172	SpyM50173	hasC2	gpsA	TRUE	0.579	33.000	0.007	1.000	N	NA
3812004	3812005	SpyM50174	SpyM50175			TRUE	0.905	-7.000	0.080	1.000	N	NA
3812005	3812006	SpyM50175	SpyM50176			TRUE	0.998	3.000	0.720	0.008	Y	NA
3812006	3812007	SpyM50176	SpyM50177			FALSE	0.229	118.000	0.010	NA		NA
3812007	3812008	SpyM50177	SpyM50178		dut	FALSE	0.233	110.000	0.005	NA		NA
3812008	3812009	SpyM50178	SpyM50179	dut	radA	FALSE	0.253	81.000	0.028	1.000	N	NA
3812009	3812010	SpyM50179	SpyM50180	radA		FALSE	0.070	188.000	0.009	1.000	N	NA
3812010	3812011	SpyM50180	SpyM50181			TRUE	0.500	131.000	0.278	NA		NA
3812011	3812012	SpyM50181	SpyM50182		gltX	FALSE	0.144	182.000	0.008	NA		NA
3812012	3812013	SpyM50182	SpyM50183	gltX	fasB	FALSE	0.015	395.000	0.000	1.000	N	NA
3812013	3812014	SpyM50183	SpyM50186	fasB	fasA	FALSE	0.062	1283.000	0.000	1.000	Y	NA
3812014	3812015	SpyM50186	SpyM5s02	fasA		FALSE	0.184	113.000	0.000	NA		NA
3812015	3812016	SpyM5s02	SpyM50187		rnpA	FALSE	0.043	343.000	0.000	NA		NA
3812016	3812017	SpyM50187	SpyM50188	rnpA		TRUE	0.912	-16.000	0.052	1.000	N	NA
3812017	3812018	SpyM50188	SpyM50189			TRUE	0.925	12.000	0.106	1.000		NA
3812018	3812019	SpyM50189	SpyM50190		rpmH	FALSE	0.047	315.000	0.002	1.000		NA
3812019	3812020	SpyM50190	SpyM50191	rpmH		FALSE	0.047	274.000	0.000	1.000		NA
3812020	3812021	SpyM50191	SpyM50192			TRUE	0.957	49.000	0.500	1.000	Y	NA
3812021	3812022	SpyM50192	SpyM50193			TRUE	0.779	105.000	0.133	0.042	Y	NA
3812022	3812023	SpyM50193	SpyM50194			TRUE	0.999	13.000	1.000	0.042	Y	NA
3812023	3812024	SpyM50194	SpyM50195			FALSE	0.124	157.000	0.000	NA		NA
3812024	3812025	SpyM50195	SpyM50196		nanH	TRUE	0.987	12.000	0.500	NA		NA
3812025	3812026	SpyM50196	SpyM50197	nanH		TRUE	0.853	22.000	0.108	1.000	N	NA
3812028	3812029	SpyM50199	SpyM50200			TRUE	0.973	-7.000	0.058	NA	Y	NA
3812029	3812030	SpyM50200	SpyM50201		ksgA	FALSE	0.218	114.000	0.093	1.000	N	NA
3812030	3812031	SpyM50201	SpyM50202	ksgA	engC	FALSE	0.035	424.000	0.003	1.000		NA
3812031	3812032	SpyM50202	SpyM50203	engC	rpe	TRUE	0.958	10.000	0.213	1.000		NA
3812032	3812033	SpyM50203	SpyM50204	rpe	thiN	TRUE	0.942	-7.000	0.166	1.000	N	NA
3812033	3812034	SpyM50204	SpyM50205	thiN		TRUE	0.901	2.000	0.030	NA		NA
3812034	3812035	SpyM50205	SpyM50206			TRUE	0.940	-10.000	0.030	NA		NA
3812035	3812036	SpyM50206	SpyM50207		purR	FALSE	0.089	267.000	0.052	1.000		NA
3812036	3812037	SpyM50207	SpyM50208	purR		TRUE	0.933	-9.000	0.017	NA		NA
3812037	3812038	SpyM50208	SpyM50209		rpsL	FALSE	0.125	208.000	0.012	NA		NA
3812038	3812039	SpyM50209	SpyM50210	rpsL	rpsG	TRUE	0.993	21.000	0.224	0.006	Y	NA
3812039	3812040	SpyM50210	SpyM50211	rpsG	fus	TRUE	0.470	485.000	0.579	1.000	Y	NA
3812040	3812041	SpyM50211	SpyM50212	fus	gapA	FALSE	0.018	341.000	0.000	1.000	N	NA
3812042	3812043	SpyM50213	SpyM50214		glnQ2	FALSE	0.208	142.000	0.032	NA		NA
3812043	3812044	SpyM50214	SpyM50215	glnQ2		TRUE	0.997	-7.000	0.758	1.000	Y	NA
3812045	3812046	SpyM50216	SpyM50217		bacA	TRUE	0.592	66.000	0.118	NA		NA
3812046	3812047	SpyM50217	SpyM50218	bacA	mecA	FALSE	0.223	146.000	0.132	NA	N	NA
3812047	3812048	SpyM50218	SpyM50219	mecA	rgpG	TRUE	0.959	7.000	0.267	NA	N	NA
3812048	3812049	SpyM50219	SpyM50220	rgpG	sufC	FALSE	0.130	122.000	0.013	1.000	N	NA
3812049	3812050	SpyM50220	SpyM50221	sufC	sufD	TRUE	0.607	95.000	0.139	1.000	Y	NA
3812050	3812051	SpyM50221	SpyM50222	sufD	csdB	TRUE	0.963	31.000	0.606	1.000	N	NA
3812051	3812052	SpyM50222	SpyM50223	csdB	iscU	TRUE	0.976	-13.000	0.292	1.000	N	NA
3812052	3812053	SpyM50223	SpyM50224	iscU	sufB	TRUE	0.988	-7.000	0.152	0.002	N	NA
3812054	3812055	SpyM50225	SpyM50226			TRUE	0.813	168.000	0.231	0.005	Y	NA
3812056	3812057	SpyM50227	SpyM50228			TRUE	0.938	65.000	0.273	0.042	Y	NA
3812057	3812058	SpyM50228	SpyM50229			TRUE	0.997	0.000	0.556	0.042	Y	NA
3812058	3812059	SpyM50229	SpyM50230			TRUE	0.994	9.000	0.650	1.000	Y	NA
3812059	3812060	SpyM50230	SpyM50231			TRUE	0.994	-7.000	0.095	0.002	Y	NA
3812061	3812062	SpyM50231A	SpyM50232			TRUE	0.907	-12.000	0.000	NA		NA
3812062	3812063	SpyM50232	SpyM50235			TRUE	0.679	33.000	0.000	NA		NA
3812064	3812065	SpyM5r10	SpyM5t41			TRUE	0.489	50.000	0.000	NA		NA
3812065	3812066	SpyM5t41	SpyM5r11			FALSE	0.050	300.000	0.000	NA		NA
3812066	3812067	SpyM5r11	SpyM5r12			FALSE	0.272	83.000	0.000	NA		NA
3812067	3812068	SpyM5r12	SpyM5t42			TRUE	0.846	1.000	0.000	NA		NA
3812068	3812069	SpyM5t42	SpyM5t43			FALSE	0.290	80.000	0.000	NA		NA
3812069	3812070	SpyM5t43	SpyM50236		comX1	TRUE	0.882	-4.000	0.000	NA		NA
3812070	3812071	SpyM50236	SpyM50237	comX1	truA	FALSE	0.081	187.000	0.000	1.000		NA
3812071	3812072	SpyM50237	SpyM50238	truA	thiD	TRUE	0.903	-10.000	0.058	1.000	N	NA
3812072	3812073	SpyM50238	SpyM50239	thiD		TRUE	0.981	-10.000	0.276	NA		NA
3812073	3812074	SpyM50239	SpyM50240			TRUE	0.949	14.000	0.149	NA		NA
3812076	3812077	SpyM50242	SpyM50243	tig	rpoE	FALSE	0.053	217.000	0.005	1.000	N	NA
3812077	3812078	SpyM50243	SpyM50244	rpoE	pyrG	FALSE	0.056	257.000	0.029	1.000	N	NA
3812078	3812079	SpyM50244	SpyM50245	pyrG		FALSE	0.117	168.000	0.002	1.000		NA
3812079	3812080	SpyM50245	SpyM5t44			TRUE	0.449	54.000	0.000	NA		NA
3812080	3812081	SpyM5t44	SpyM50246		fba	FALSE	0.088	208.000	0.000	NA		NA
3812081	3812082	SpyM50246	SpyM50247	fba	rpmB	FALSE	0.016	382.000	0.000	1.000	N	NA
3812082	3812083	SpyM50247	SpyM50248	rpmB		FALSE	0.203	152.000	0.044	NA		NA
3812083	3812084	SpyM50248	SpyM50249			TRUE	0.988	0.000	0.567	NA		NA
3812084	3812085	SpyM50249	SpyM50250			FALSE	0.080	237.000	0.006	1.000		NA
3812085	3812086	SpyM50250	SpyM50251			FALSE	0.061	230.000	0.000	1.000		NA
3812086	3812087	SpyM50251	SpyM50252		pgk	FALSE	0.099	193.000	0.003	1.000		NA
3812087	3812088	SpyM50252	SpyM50253	pgk		FALSE	0.076	263.000	0.002	NA		NA
3812088	3812089	SpyM50253	SpyM50254		glnR	TRUE	0.638	67.000	0.154	NA		NA
3812089	3812090	SpyM50254	SpyM50255	glnR	glnA	TRUE	0.789	38.000	0.179	1.000	N	NA
3812091	3812092	SpyM50256	SpyM50257			TRUE	0.988	2.000	0.576	NA		NA
3812093	3812094	SpyM50258	SpyM50259			TRUE	0.807	2.000	0.000	1.000		NA
3812094	3812095	SpyM50259	SpyM50260			TRUE	0.878	-10.000	0.000	1.000		NA
3812096	3812097	SpyM50261	SpyM50262	rpsN		FALSE	0.033	221.000	0.000	1.000	N	NA
3812098	3812099	SpyM50263	SpyM50264	udp		TRUE	0.936	21.000	0.015	1.000	Y	NA
3812099	3812100	SpyM50264	SpyM50265		deoC	TRUE	0.970	30.000	0.333	1.000	Y	NA
3812102	3812103	SpyM50267	SpyM50268			TRUE	0.918	10.000	0.057	NA		NA
3812103	3812104	SpyM50268	SpyM50269			FALSE	0.220	152.000	0.156	1.000	N	NA
3812105	3812106	SpyM50270	SpyM50271			FALSE	0.120	193.000	0.002	NA		NA
3812108	3812109	SpyM50273	SpyM50274	pepXP		TRUE	0.883	22.000	0.081	1.000		NA
3812110	3812111	SpyM50275	SpyM50276			FALSE	0.103	186.000	0.000	NA		NA
3812111	3812112	SpyM50276	SpyM50277		gla	FALSE	0.118	170.000	0.000	NA		NA
3812114	3812115	SpyM50279	SpyM50280			TRUE	0.986	-15.000	0.326	NA		NA
3812118	3812119	SpyM50283	SpyM50284			FALSE	0.359	91.000	0.050	NA		NA
3812119	3812120	SpyM50284	SpyM50285		spi	TRUE	0.484	58.000	0.099	1.000	N	NA
3812120	3812121	SpyM50285	SpyM50286	spi		TRUE	0.876	11.000	0.080	1.000	N	NA
3812122	3812123	SpyM50287	SpyM50288			TRUE	0.895	3.000	0.019	NA		NA
3812123	3812124	SpyM50288	SpyM50289		mutS2	FALSE	0.203	149.000	0.070	1.000		NA
3812124	3812125	SpyM50289	SpyM50290	mutS2		TRUE	0.851	4.000	0.005	1.000		NA
3812125	3812126	SpyM50290	SpyM50291			TRUE	0.372	81.000	0.053	1.000		NA
3812127	3812128	SpyM50292	SpyM50293			FALSE	0.068	177.000	0.002	1.000	N	NA
3812129	3812130	SpyM50294	SpyM50295		rpsF	FALSE	0.116	173.000	0.000	NA		NA
3812130	3812131	SpyM50295	SpyM50296	rpsF	ssb	TRUE	0.751	22.000	0.012	1.000	N	NA
3812131	3812132	SpyM50296	SpyM50297	ssb	rpsR	FALSE	0.090	165.000	0.012	1.000	N	NA
3812133	3812134	SpyM50298	SpyM50299			FALSE	0.261	133.000	0.072	NA		NA
3812135	3812136	SpyM50300	SpyM50301	uvrA		FALSE	0.125	116.000	0.008	1.000	N	NA
3812136	3812137	SpyM50301	SpyM50302			TRUE	0.606	35.000	0.018	1.000	N	NA
3812137	3812138	SpyM50302	SpyM50303		efp	FALSE	0.147	96.000	0.005	1.000	N	NA
3812138	3812139	SpyM50303	SpyM50304	efp		TRUE	0.676	46.000	0.031	NA		NA
3812139	3812140	SpyM50304	SpyM50305		nusB	TRUE	0.978	-7.000	0.265	NA		NA
3812141	3812142	SpyM50306	SpyM50307	scrR	scrB	TRUE	0.982	5.000	0.571	1.000	N	NA
3812143	3812144	SpyM50308	SpyM50309	scrA		FALSE	0.060	231.000	0.000	1.000		NA
3812144	3812145	SpyM50309	SpyM50310		scrK	FALSE	0.049	264.000	0.000	1.000		NA
3812145	3812146	SpyM50310	SpyM50311	scrK	manA	TRUE	0.786	95.000	0.333	1.000	Y	NA
3812146	3812147	SpyM50311	SpyM50312	manA	secA	FALSE	0.136	134.000	0.042	1.000	N	NA
3812147	3812148	SpyM50312	SpyM50313	secA	acpS	FALSE	0.126	116.000	0.008	1.000	N	NA
3812148	3812149	SpyM50313	SpyM50314	acpS	alr	TRUE	0.892	-3.000	0.093	1.000	N	NA
3812149	3812150	SpyM50314	SpyM50315	alr		FALSE	0.361	87.000	0.022	NA		NA
3812150	3812151	SpyM50315	SpyM50316			FALSE	0.032	491.000	0.000	NA		NA
3812151	3812152	SpyM50316	SpyM50317			TRUE	0.368	197.000	0.273	NA		NA
3812152	3812153	SpyM50317	SpyM50318			TRUE	0.975	-16.000	0.182	NA		NA
3812153	3812154	SpyM50318	SpyM50319			TRUE	0.997	2.000	0.877	1.000	Y	NA
3812154	3812155	SpyM50319	SpyM50320			TRUE	0.995	-3.000	0.657	1.000	Y	NA
3812155	3812156	SpyM50320	SpyM50321			TRUE	0.861	-3.000	0.047	1.000	N	NA
3812156	3812157	SpyM50321	SpyM50322			TRUE	0.997	-7.000	0.576	0.008	N	NA
3812157	3812158	SpyM50322	SpyM50323			TRUE	0.933	-3.000	0.081	NA		NA
3812158	3812159	SpyM50323	SpyM50324			TRUE	0.989	-3.000	0.562	NA		NA
3812159	3812160	SpyM50324	SpyM50325			TRUE	0.982	-3.000	0.429	1.000		NA
3812162	3812163	SpyM50326	SpyM50327	recG		FALSE	0.022	293.000	0.000	1.000	N	NA
3812163	3812164	SpyM50327	SpyM50328			TRUE	0.866	13.000	0.000	NA		NA
3812168	3812169	SpyM50332	SpyM50333		codY	FALSE	0.065	218.000	0.015	1.000	N	NA
3812169	3812170	SpyM50333	SpyM50334	codY		FALSE	0.155	147.000	0.083	1.000	N	NA
3812170	3812171	SpyM50334	SpyM50335			FALSE	0.033	444.000	0.000	NA		NA
3812171	3812172	SpyM50335	SpyM50337		gatC	FALSE	0.076	232.000	0.000	NA		NA
3812172	3812173	SpyM50337	SpyM50338	gatC	gatA	TRUE	0.998	0.000	0.643	0.002	Y	NA
3812173	3812174	SpyM50338	SpyM50339	gatA	gatB	TRUE	0.998	0.000	0.492	0.002	Y	NA
3812174	3812175	SpyM50339	SpyM50340	gatB		TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812175	3812176	SpyM50340	SpyM50341			FALSE	0.087	209.000	0.000	NA		NA
3812176	3812177	SpyM50341	SpyM50342			FALSE	0.029	392.000	0.000	1.000		NA
3812177	3812178	SpyM50342	SpyM50343			TRUE	0.952	-10.000	0.174	1.000	N	NA
3812178	3812179	SpyM50343	SpyM50344			TRUE	0.934	-3.000	0.174	1.000	N	NA
3812179	3812180	SpyM50344	SpyM50345		hrcA	FALSE	0.102	135.000	0.009	1.000	N	NA
3812180	3812181	SpyM50345	SpyM50346	hrcA	grpE	TRUE	0.835	3.000	0.051	1.000	N	NA
3812181	3812182	SpyM50346	SpyM50347	grpE	dnaK	TRUE	0.619	181.000	0.026	0.009	Y	NA
3812182	3812183	SpyM50347	SpyM50348	dnaK	dnaJ	TRUE	0.630	281.000	0.196	0.004	Y	NA
3812183	3812184	SpyM50348	SpyM50349	dnaJ		FALSE	0.033	221.000	0.000	1.000	N	NA
3812184	3812185	SpyM50349	SpyM50350			TRUE	0.378	74.000	0.098	1.000	N	NA
3812185	3812186	SpyM50350	SpyM50351		fabH	TRUE	0.859	1.000	0.070	1.000	N	NA
3812186	3812187	SpyM50351	SpyM50352	fabH	acpP	TRUE	0.833	61.000	0.065	0.009		NA
3812187	3812188	SpyM50352	SpyM50353	acpP	fabK	FALSE	0.283	201.000	0.216	1.000		NA
3812188	3812189	SpyM50353	SpyM50354	fabK	fabD	TRUE	0.870	25.000	0.099	1.000		NA
3812189	3812190	SpyM50354	SpyM50355	fabD	fabG	TRUE	0.998	-10.000	0.432	0.009	Y	NA
3812190	3812191	SpyM50355	SpyM50356	fabG	fabF	TRUE	0.958	15.000	0.056	1.000	Y	NA
3812191	3812192	SpyM50356	SpyM50357	fabF	fabE	TRUE	0.957	2.000	0.074	1.000	Y	NA
3812192	3812193	SpyM50357	SpyM50358	fabE	fabZ	TRUE	0.988	0.000	0.047	0.009	Y	NA
3812193	3812194	SpyM50358	SpyM50359	fabZ	accC	TRUE	0.891	32.000	0.045	1.000	Y	NA
3812194	3812195	SpyM50359	SpyM50360	accC	accD	TRUE	0.991	9.000	0.090	0.004	Y	NA
3812195	3812196	SpyM50360	SpyM50361	accD	accA	TRUE	0.996	-3.000	0.234	0.002	Y	NA
3812197	3812198	SpyM50362	SpyM50363	serS		FALSE	0.046	392.000	0.003	NA		NA
3812198	3812199	SpyM50363	SpyM50364		manN	TRUE	0.775	114.000	0.583	NA		NA
3812199	3812200	SpyM50364	SpyM50365	manN	manM	TRUE	0.999	17.000	0.812	0.023	Y	NA
3812200	3812201	SpyM50365	SpyM50366	manM	manL	TRUE	0.983	89.000	0.943	0.023	Y	NA
3812201	3812202	SpyM50366	SpyM50367	manL		FALSE	0.033	352.000	0.000	1.000		NA
3812203	3812204	SpyM50368	SpyM50369			FALSE	0.166	154.000	0.008	NA		NA
3812204	3812205	SpyM50369	SpyM50370			TRUE	0.952	-25.000	0.033	NA		NA
3812205	3812206	SpyM50370	SpyM50371			TRUE	0.962	9.000	0.283	NA	N	NA
3812207	3812208	SpyM50372	SpyM50373			TRUE	0.928	-3.000	0.063	NA		NA
3812209	3812210	SpyM50374	SpyM50375			TRUE	0.928	3.000	0.167	NA	N	NA
3812210	3812211	SpyM50375	SpyM50376			TRUE	0.507	64.000	0.107	NA	N	NA
3812211	3812212	SpyM50376	SpyM50377		trmB	TRUE	0.947	0.000	0.154	NA		NA
3812212	3812213	SpyM50377	SpyM5t45	trmB		TRUE	0.374	65.000	0.000	NA		NA
3812213	3812214	SpyM5t45	SpyM50378			FALSE	0.196	108.000	0.000	NA		NA
3812214	3812215	SpyM50378	SpyM50379		nusA	TRUE	0.756	175.000	0.759	NA		NA
3812215	3812216	SpyM50379	SpyM50380	nusA		TRUE	0.987	16.000	0.323	NA	Y	NA
3812216	3812217	SpyM50380	SpyM50381			TRUE	0.982	-7.000	0.408	NA	N	NA
3812217	3812218	SpyM50381	SpyM50382		infB	TRUE	0.979	20.000	0.223	NA	Y	NA
3812218	3812219	SpyM50382	SpyM50383	infB	rbfA	TRUE	0.691	206.000	0.530	1.000	Y	NA
3812221	3812222	SpyM50385	SpyM50386	copY	copA	TRUE	0.859	0.000	0.064	1.000	N	NA
3812222	3812223	SpyM50386	SpyM50387	copA	copZ	TRUE	0.990	14.000	0.048	0.004	Y	NA
3812225	3812226	SpyM50389	SpyM50390			TRUE	0.998	-7.000	0.429	0.017	Y	NA
3812226	3812227	SpyM50390	SpyM50391			TRUE	0.982	26.000	0.143	0.023	Y	NA
3812227	3812228	SpyM50391	SpyM50391A			FALSE	0.290	80.000	0.000	NA		NA
3812228	3812229	SpyM50391A	SpyM50392		lacA1	TRUE	0.374	65.000	0.000	NA		NA
3812229	3812230	SpyM50392	SpyM50393	lacA1	lacB1	TRUE	0.998	15.000	0.500	0.002	Y	NA
3812230	3812231	SpyM50393	SpyM50394	lacB1	lacC1	TRUE	0.856	10.000	0.000	NA		NA
3812231	3812232	SpyM50394	SpyM50395	lacC1	lacD1	TRUE	0.575	44.000	0.000	NA		NA
3812232	3812233	SpyM50395	SpyM50396	lacD1		FALSE	0.145	197.000	0.019	NA		NA
3812233	3812234	SpyM50396	SpyM50397			TRUE	0.905	2.000	0.047	NA		NA
3812238	3812239	SpyM50401	SpyM50402			FALSE	0.205	118.000	0.090	1.000	N	NA
3812239	3812240	SpyM50402	SpyM50403			FALSE	0.225	122.000	0.045	1.000		NA
3812240	3812241	SpyM50403	SpyM50404			FALSE	0.225	135.000	0.074	1.000		NA
3812241	3812242	SpyM50404	SpyM50405		glyQ	FALSE	0.031	372.000	0.000	1.000		NA
3812242	3812243	SpyM50405	SpyM50406	glyQ	glyS	TRUE	0.832	378.000	0.651	0.001	Y	NA
3812243	3812244	SpyM50406	SpyM50407	glyS		FALSE	0.190	154.000	0.020	NA		NA
3812244	3812245	SpyM50407	SpyM50408			FALSE	0.178	175.000	0.029	NA		NA
3812245	3812246	SpyM50408	SpyM50409		glpK	FALSE	0.032	360.000	0.000	1.000		NA
3812246	3812247	SpyM50409	SpyM50410	glpK	glpO	TRUE	0.998	16.000	0.500	0.001	Y	NA
3812247	3812248	SpyM50410	SpyM50411	glpO	glpF1	TRUE	0.978	2.000	0.500	1.000	N	NA
3812248	3812249	SpyM50411	SpyM50412	glpF1		TRUE	0.623	109.000	0.364	1.000		NA
3812249	3812250	SpyM50412	SpyM50413			TRUE	0.990	-10.000	0.462	NA		NA
3812250	3812251	SpyM50413	SpyM50414			FALSE	0.159	126.000	0.000	NA		NA
3812251	3812252	SpyM50414	SpyM50415		tkt	FALSE	0.174	218.000	0.000	1.000	Y	NA
3812252	3812253	SpyM50415	SpyM50416	tkt		TRUE	0.407	192.000	0.300	NA		NA
3812253	3812254	SpyM50416	SpyM50417			TRUE	0.846	34.000	0.136	NA		NA
3812254	3812255	SpyM50417	SpyM50418			TRUE	0.977	5.000	0.341	NA		NA
3812255	3812256	SpyM50418	SpyM50421		proA	FALSE	0.028	878.000	0.000	NA		NA
3812256	3812257	SpyM50421	SpyM50422	proA		TRUE	0.827	20.000	0.000	NA		NA
3812257	3812258	SpyM50422	SpyM50423		mraW	FALSE	0.053	293.000	0.000	NA		NA
3812258	3812259	SpyM50423	SpyM50424	mraW	ftsL	TRUE	0.864	5.000	0.077	1.000	N	NA
3812259	3812260	SpyM50424	SpyM50425	ftsL	pbpX	TRUE	0.974	4.000	0.456	1.000	N	NA
3812260	3812261	SpyM50425	SpyM50426	pbpX	mraY	TRUE	0.951	2.000	0.038	1.000	Y	NA
3812261	3812262	SpyM50426	SpyM50427	mraY	mraW	FALSE	0.085	158.000	0.007	1.000	N	NA
3812262	3812263	SpyM50427	SpyM50428	mraW		FALSE	0.081	194.000	0.018	1.000	N	NA
3812263	3812264	SpyM50428	SpyM50429			TRUE	0.985	0.000	0.310	1.000	Y	NA
3812264	3812265	SpyM50429	SpyM50430			TRUE	0.669	104.000	0.364	NA		NA
3812265	3812266	SpyM50430	SpyM50431			TRUE	0.609	64.000	0.117	NA		NA
3812266	3812267	SpyM50431	SpyM50432			FALSE	0.107	169.000	0.033	1.000	N	NA
3812267	3812268	SpyM50432	SpyM50433			FALSE	0.105	171.000	0.032	1.000	N	NA
3812268	3812269	SpyM50433	SpyM50434		nadE	TRUE	0.993	2.000	0.194	0.004	Y	NA
3812269	3812270	SpyM50434	SpyM50435	nadE	pepC	FALSE	0.085	185.000	0.017	1.000	N	NA
3812271	3812272	SpyM50436	SpyM50437	pbp1A	recU	TRUE	0.983	-13.000	0.319	1.000		NA
3812273	3812274	SpyM50438	SpyM50439			TRUE	0.757	119.000	0.579	NA		NA
3812274	3812275	SpyM50439	SpyM5s03			TRUE	0.525	48.000	0.000	NA		NA
3812275	3812276	SpyM5s03	SpyM50440			FALSE	0.355	68.000	0.000	NA		NA
3812276	3812277	SpyM50440	SpyM50441			TRUE	0.913	14.000	0.029	NA		NA
3812278	3812279	SpyM50442	SpyM50443	luxS		TRUE	0.873	-16.000	0.006	1.000	N	NA
3812279	3812280	SpyM50443	SpyM50444			TRUE	0.705	71.000	0.333	1.000	N	NA
3812280	3812281	SpyM50444	SpyM50445		atoA2	TRUE	0.679	33.000	0.000	NA		NA
3812281	3812282	SpyM50445	SpyM50446	atoA2	atoD2	TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3812282	3812283	SpyM50446	SpyM50447	atoD2	atoB2	TRUE	0.955	24.000	0.150	1.000	Y	NA
3812284	3812285	SpyM50448	SpyM50449			FALSE	0.162	130.000	0.006	1.000		NA
3812285	3812286	SpyM50449	SpyM50450		gmk	FALSE	0.212	110.000	0.010	1.000		NA
3812286	3812287	SpyM50450	SpyM50451	gmk	rpoZ	TRUE	0.977	16.000	0.471	1.000	N	NA
3812287	3812288	SpyM50451	SpyM50452	rpoZ	priA	TRUE	0.649	65.000	0.032	0.065	N	NA
3812288	3812289	SpyM50452	SpyM50453	priA	fmt	TRUE	0.388	62.000	0.052	1.000	N	NA
3812289	3812290	SpyM50453	SpyM50454	fmt		TRUE	0.991	-10.000	0.305	1.000	Y	NA
3812290	3812291	SpyM50454	SpyM50455			TRUE	0.656	38.000	0.074	1.000	N	NA
3812291	3812292	SpyM50455	SpyM50456		stk1	TRUE	0.996	-3.000	0.704	1.000	Y	NA
3812292	3812293	SpyM50456	SpyM50457	stk1		FALSE	0.253	123.000	0.039	NA		NA
3812293	3812294	SpyM50457	SpyM50458			TRUE	0.993	-3.000	0.679	NA		NA
3812294	3812295	SpyM50458	SpyM50459			TRUE	0.999	-7.000	0.853	0.013	Y	NA
3812295	3812296	SpyM50459	SpyM50460			TRUE	0.829	37.000	0.164	1.000		NA
3812296	3812297	SpyM50460	SpyM50461			TRUE	0.937	0.000	0.151	1.000		NA
3812298	3812299	SpyM50462	SpyM50463	cysM		FALSE	0.205	128.000	0.033	1.000		NA
3812300	3812301	SpyM50464	SpyM50465	comFA	comFC	TRUE	0.969	-28.000	0.130	NA		NA
3812301	3812302	SpyM50465	SpyM50466	comFC		TRUE	0.463	80.000	0.080	NA		NA
3812302	3812303	SpyM50466	SpyM5r13			FALSE	0.027	908.000	0.000	NA		NA
3812303	3812304	SpyM5r13	SpyM5t46			TRUE	0.489	50.000	0.000	NA		NA
3812304	3812305	SpyM5t46	SpyM5r14			FALSE	0.050	300.000	0.000	NA		NA
3812305	3812306	SpyM5r14	SpyM5r15			FALSE	0.272	83.000	0.000	NA		NA
3812306	3812307	SpyM5r15	SpyM5t47			TRUE	0.866	13.000	0.000	NA		NA
3812307	3812308	SpyM5t47	SpyM5t48			TRUE	0.842	18.000	0.000	NA		NA
3812308	3812309	SpyM5t48	SpyM5t49			TRUE	0.692	32.000	0.000	NA		NA
3812309	3812310	SpyM5t49	SpyM5t50			TRUE	0.851	6.000	0.000	NA		NA
3812310	3812311	SpyM5t50	SpyM5t51			TRUE	0.857	11.000	0.000	NA		NA
3812311	3812312	SpyM5t51	SpyM5t52			TRUE	0.640	36.000	0.000	NA		NA
3812312	3812313	SpyM5t52	SpyM5t53			TRUE	0.800	23.000	0.000	NA		NA
3812314	3812315	SpyM50467	SpyM50468			FALSE	0.180	115.000	0.000	NA		NA
3812315	3812316	SpyM50468	SpyM50469			FALSE	0.149	132.000	0.000	NA		NA
3812316	3812317	SpyM50469	SpyM50470		recX	TRUE	0.403	80.000	0.025	NA		NA
3812317	3812318	SpyM50470	SpyM50471	recX		FALSE	0.077	230.000	0.003	1.000		NA
3812318	3812319	SpyM50471	SpyM50472			FALSE	0.108	182.000	0.000	NA		NA
3812319	3812320	SpyM50472	SpyM50473			TRUE	0.858	15.000	0.000	NA		NA
3812320	3812321	SpyM50473	SpyM50474			TRUE	0.975	2.000	0.333	NA		NA
3812322	3812323	SpyM50475	SpyM50476			TRUE	0.891	28.000	0.000	0.064		NA
3812325	3812326	SpyM50478	SpyM50479			FALSE	0.284	71.000	0.000	1.000		NA
3812326	3812327	SpyM50479	SpyM50480			TRUE	0.978	31.000	0.667	NA		NA
3812327	3812328	SpyM50480	SpyM50481			FALSE	0.229	94.000	0.000	NA		NA
3812328	3812329	SpyM50481	SpyM50482			TRUE	0.910	-13.000	0.000	NA		NA
3812329	3812330	SpyM50482	SpyM50483			TRUE	0.994	-9.000	0.667	NA		NA
3812330	3812331	SpyM50483	SpyM50484			TRUE	0.992	13.000	0.667	NA		NA
3812331	3812332	SpyM50484	SpyM50485			TRUE	0.995	-19.000	0.667	NA		NA
3812332	3812333	SpyM50485	SpyM50486			TRUE	0.961	22.000	0.286	NA		NA
3812333	3812334	SpyM50486	SpyM50487			TRUE	0.846	1.000	0.000	NA		NA
3812334	3812335	SpyM50487	SpyM50488			TRUE	0.851	6.000	0.000	NA		NA
3812335	3812336	SpyM50488	SpyM50489			TRUE	0.851	0.000	0.000	NA		NA
3812336	3812337	SpyM50489	SpyM50490			TRUE	0.914	-3.000	0.018	NA		NA
3812337	3812338	SpyM50490	SpyM50491			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812338	3812339	SpyM50491	SpyM50492			TRUE	0.851	0.000	0.000	NA		NA
3812339	3812340	SpyM50492	SpyM50493			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812340	3812341	SpyM50493	SpyM50494			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812341	3812342	SpyM50494	SpyM50495			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3812342	3812343	SpyM50495	SpyM50496			TRUE	0.847	5.000	0.000	NA		NA
3812343	3812344	SpyM50496	SpyM50497			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812344	3812345	SpyM50497	SpyM50498			FALSE	0.175	117.000	0.000	NA		NA
3812345	3812346	SpyM50498	SpyM50499			TRUE	0.597	42.000	0.000	NA		NA
3812346	3812347	SpyM50499	SpyM50500			FALSE	0.131	149.000	0.000	NA		NA
3812347	3812348	SpyM50500	SpyM50501			FALSE	0.054	291.000	0.000	NA		NA
3812348	3812349	SpyM50501	SpyM50504			FALSE	0.043	344.000	0.000	NA		NA
3812349	3812350	SpyM50504	SpyM50505			TRUE	0.580	83.000	0.182	NA		NA
3812350	3812351	SpyM50505	SpyM50506			TRUE	0.955	14.000	0.167	NA		NA
3812351	3812352	SpyM50506	SpyM50507			TRUE	0.847	5.000	0.000	NA		NA
3812352	3812353	SpyM50507	SpyM50509			TRUE	0.851	0.000	0.000	NA		NA
3812353	3812354	SpyM50509	SpyM50510			FALSE	0.257	87.000	0.000	NA		NA
3812354	3812355	SpyM50510	SpyM50511			FALSE	0.159	126.000	0.000	NA		NA
3812355	3812356	SpyM50511	SpyM50512			TRUE	0.843	4.000	0.000	NA		NA
3812356	3812357	SpyM50512	SpyM50513			TRUE	0.449	54.000	0.000	NA		NA
3812357	3812358	SpyM50513	SpyM50514			TRUE	0.985	-10.000	0.333	NA		NA
3812358	3812359	SpyM50514	SpyM50515			TRUE	0.983	0.000	0.438	NA		NA
3812359	3812360	SpyM50515	SpyM50516			TRUE	0.962	-3.000	0.188	NA		NA
3812360	3812361	SpyM50516	SpyM50517			TRUE	0.995	0.000	1.000	NA		NA
3812361	3812362	SpyM50517	SpyM50518			TRUE	0.981	44.000	1.000	NA		NA
3812362	3812363	SpyM50518	SpyM50519			TRUE	0.942	4.000	0.150	NA		NA
3812363	3812364	SpyM50519	SpyM50521			TRUE	0.902	-10.000	0.000	NA		NA
3812364	3812365	SpyM50521	SpyM50522			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812365	3812366	SpyM50522	SpyM50523			TRUE	0.964	-3.000	0.200	NA		NA
3812366	3812367	SpyM50523	SpyM50524			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812367	3812368	SpyM50524	SpyM50525			TRUE	0.866	13.000	0.000	NA		NA
3812368	3812369	SpyM50525	SpyM50527			TRUE	0.861	12.000	0.000	NA		NA
3812369	3812370	SpyM50527	SpyM50528			TRUE	0.841	3.000	0.000	NA		NA
3812370	3812371	SpyM50528	SpyM50529			TRUE	0.856	10.000	0.000	NA		NA
3812371	3812372	SpyM50529	SpyM50530			FALSE	0.187	112.000	0.000	NA		NA
3812372	3812373	SpyM50530	SpyM50531			FALSE	0.333	140.000	0.154	NA		NA
3812373	3812374	SpyM50531	SpyM50532			TRUE	0.979	-12.000	0.231	NA		NA
3812375	3812376	SpyM50533	SpyM50534			FALSE	0.060	272.000	0.000	NA		NA
3812377	3812378	SpyM50535	SpyM50536			FALSE	0.148	191.000	0.016	NA		NA
3812378	3812379	SpyM50536	SpyM50537			FALSE	0.017	666.000	0.000	NA	N	NA
3812380	3812381	SpyM50538	SpyM50539			TRUE	0.954	15.000	0.194	1.000		NA
3812382	3812383	SpyM50540	SpyM50541			TRUE	0.820	51.000	0.286	1.000		NA
3812383	3812384	SpyM50541	SpyM50542			TRUE	0.916	25.000	0.182	1.000		NA
3812385	3812386	SpyM50543	SpyM50544			TRUE	0.692	32.000	0.000	NA		NA
3812387	3812388	SpyM50545	SpyM50546			TRUE	0.999	10.000	0.917	0.038	Y	NA
3812388	3812389	SpyM50546	SpyM50547			TRUE	0.928	81.000	0.333	0.038	Y	NA
3812389	3812390	SpyM50547	SpyM50548			FALSE	0.049	306.000	0.000	NA		NA
3812390	3812391	SpyM50548	SpyM50549			TRUE	0.994	-10.000	0.667	NA		NA
3812391	3812392	SpyM50549	SpyM50550			TRUE	0.992	0.000	0.167	0.013	Y	NA
3812392	3812393	SpyM50550	SpyM50551			TRUE	0.908	20.000	0.167	1.000	N	NA
3812393	3812394	SpyM50551	SpyM50552		aroE	FALSE	0.145	138.000	0.061	1.000	N	NA
3812394	3812395	SpyM50552	SpyM50553	aroE		FALSE	0.028	252.000	0.000	1.000	N	NA
3812395	3812396	SpyM50553	SpyM50554			TRUE	0.583	53.000	0.026	NA		NA
3812396	3812397	SpyM50554	SpyM50555			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3812397	3812398	SpyM50555	SpyM50556			TRUE	0.827	20.000	0.000	NA		NA
3812399	3812400	SpyM50557	SpyM50558	aroB		TRUE	0.907	56.000	0.003	0.003	Y	NA
3812400	3812401	SpyM50558	SpyM5t54			FALSE	0.071	241.000	0.000	NA		NA
3812402	3812403	SpyM50559	SpyM50560			TRUE	0.735	64.000	0.214	NA		NA
3812403	3812404	SpyM50560	SpyM50562		sag0443	FALSE	0.056	285.000	0.000	NA		NA
3812404	3812405	SpyM50562	SpyM50563	sag0443		TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812405	3812406	SpyM50563	SpyM50564		valS	TRUE	0.882	2.000	0.008	NA		NA
3812408	3812409	SpyM50566	SpyM50567			TRUE	0.689	92.000	0.375	1.000		NA
3812409	3812410	SpyM50567	SpyM50568			FALSE	0.149	220.000	0.000	0.079	N	NA
3812410	3812411	SpyM50568	SpyM50569			TRUE	0.993	13.000	0.500	1.000	Y	NA
3812411	3812412	SpyM50569	SpyM50570		msrAB	TRUE	0.987	43.000	0.875	1.000	Y	NA
3812412	3812413	SpyM50570	SpyM50571	msrAB		TRUE	0.593	88.000	0.240	1.000		NA
3812413	3812414	SpyM50571	SpyM50572			TRUE	0.995	-3.000	0.480	0.013		NA
3812414	3812415	SpyM50572	SpyM50573			FALSE	0.346	73.000	0.007	1.000		NA
3812415	3812416	SpyM50573	SpyM50574			TRUE	0.849	23.000	0.009	NA		NA
3812418	3812419	SpyM50576	SpyM50577		arcA	FALSE	0.024	274.000	0.000	1.000	N	NA
3812419	3812420	SpyM50577	SpyM50578	arcA		FALSE	0.295	100.000	0.056	1.000		NA
3812420	3812421	SpyM50578	SpyM50579		arcB	TRUE	0.758	40.000	0.104	1.000		NA
3812421	3812422	SpyM50579	SpyM50580	arcB		FALSE	0.209	170.000	0.104	1.000		NA
3812422	3812423	SpyM50580	SpyM50581			TRUE	0.929	17.000	0.140	1.000		NA
3812423	3812424	SpyM50581	SpyM50582		arcC	TRUE	0.944	20.000	0.035	1.000	Y	NA
3812424	3812425	SpyM50582	SpyM50584	arcC	asnA	FALSE	0.105	313.000	0.000	1.000	Y	NA
3812425	3812426	SpyM50584	SpyM50585	asnA		FALSE	0.112	123.000	0.006	1.000	N	NA
3812426	3812427	SpyM50585	SpyM50586		coaD	TRUE	0.980	-10.000	0.367	1.000	N	NA
3812427	3812428	SpyM50586	SpyM50587	coaD		TRUE	0.907	-13.000	0.052	1.000	N	NA
3812428	3812429	SpyM50587	SpyM50588			FALSE	0.014	412.000	0.000	1.000	N	NA
3812429	3812430	SpyM50588	SpyM50590			FALSE	0.034	424.000	0.000	NA		NA
3812430	3812431	SpyM50590	SpyM50591			TRUE	0.893	4.000	0.016	NA		NA
3812433	3812434	SpyM50593	SpyM50594	dpr		FALSE	0.226	142.000	0.058	NA		NA
3812434	3812435	SpyM50594	SpyM50595		glkA	TRUE	0.985	5.000	0.496	NA		NA
3812435	3812436	SpyM50595	SpyM50596	glkA		TRUE	0.887	10.000	0.064	NA	N	NA
3812436	3812437	SpyM50596	SpyM50597			FALSE	0.086	183.000	0.003	NA	N	NA
3812437	3812438	SpyM50597	SpyM50598			FALSE	0.235	122.000	0.015	NA		NA
3812438	3812439	SpyM50598	SpyM50599		murD	FALSE	0.055	356.000	0.006	NA		NA
3812439	3812440	SpyM50599	SpyM50600	murD	murG	TRUE	0.957	0.000	0.060	1.000	Y	NA
3812440	3812441	SpyM50600	SpyM50601	murG		TRUE	0.963	1.000	0.072	NA	Y	NA
3812441	3812442	SpyM50601	SpyM50602		ftsA	TRUE	0.379	212.000	0.389	NA	N	NA
3812442	3812443	SpyM50602	SpyM50603	ftsA	ftsZ	TRUE	0.985	24.000	0.460	1.000	Y	NA
3812443	3812444	SpyM50603	SpyM50604	ftsZ		TRUE	0.899	3.000	0.030	NA		NA
3812444	3812445	SpyM50604	SpyM50605			TRUE	0.961	12.000	0.194	NA		NA
3812445	3812446	SpyM50605	SpyM50606			TRUE	0.978	5.000	0.370	NA		NA
3812446	3812447	SpyM50606	SpyM50607			TRUE	0.967	0.000	0.287	1.000		NA
3812447	3812448	SpyM50607	SpyM50608			TRUE	0.989	10.000	0.579	NA		NA
3812448	3812449	SpyM50608	SpyM50609		ileS	FALSE	0.057	273.000	0.012	NA	N	NA
3812450	3812451	SpyM50610	SpyM50611			TRUE	0.688	51.000	0.114	NA		NA
3812451	3812452	SpyM50611	SpyM50612		clpE	FALSE	0.176	128.000	0.079	1.000	N	NA
3812453	3812454	SpyM50613	SpyM50614			FALSE	0.247	127.000	0.044	NA		NA
3812454	3812455	SpyM50614	SpyM50615		glnQ3	TRUE	0.994	0.000	0.640	1.000	Y	NA
3812455	3812456	SpyM50615	SpyM50616	glnQ3	phr	FALSE	0.057	149.000	0.000	1.000	N	NA
3812458	3812459	SpyM50618	SpyM50619		folD	FALSE	0.067	208.000	0.013	1.000	N	NA
3812459	3812460	SpyM50619	SpyM50620	folD	xseA	FALSE	0.118	153.000	0.045	1.000	N	NA
3812460	3812461	SpyM50620	SpyM50621	xseA	xseB	TRUE	0.999	-22.000	0.412	0.001	Y	NA
3812461	3812462	SpyM50621	SpyM50622	xseB	fps	TRUE	0.883	0.000	0.100	1.000	N	NA
3812462	3812463	SpyM50622	SpyM50623	fps		TRUE	0.891	-7.000	0.058	1.000	N	NA
3812463	3812464	SpyM50623	SpyM50624			TRUE	0.905	-13.000	0.048	1.000	N	NA
3812464	3812465	SpyM50624	SpyM50625		recN	TRUE	0.800	21.000	0.037	1.000	N	NA
3812465	3812466	SpyM50625	SpyM50626	recN		FALSE	0.093	172.000	0.000	1.000		NA
3812466	3812467	SpyM50626	SpyM50627			FALSE	0.078	228.000	0.000	NA		NA
3812467	3812468	SpyM50627	SpyM50628			TRUE	0.972	-7.000	0.203	NA		NA
3812468	3812469	SpyM50628	SpyM50629			TRUE	0.997	-22.000	0.828	NA		NA
3812469	3812470	SpyM50629	SpyM50630		hlpA	TRUE	0.468	99.000	0.156	NA		NA
3812471	3812472	SpyM50631	SpyM50632			FALSE	0.162	124.000	0.000	NA		NA
3812472	3812473	SpyM50632	SpyM50633			TRUE	0.861	12.000	0.000	NA		NA
3812473	3812474	SpyM50633	SpyM50634			TRUE	0.841	3.000	0.000	NA		NA
3812475	3812476	SpyM50635	SpyM50636			TRUE	0.866	13.000	0.000	NA		NA
3812476	3812477	SpyM50636	SpyM50636A			FALSE	0.041	363.000	0.000	NA		NA
3812477	3812478	SpyM50636A	SpyM50638			FALSE	0.299	79.000	0.000	NA		NA
3812478	3812479	SpyM50638	SpyM50639			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3812479	3812480	SpyM50639	SpyM50640			FALSE	0.193	109.000	0.000	NA		NA
3812480	3812481	SpyM50640	SpyM50641			FALSE	0.125	155.000	0.000	NA		NA
3812481	3812482	SpyM50641	SpyM50642			TRUE	0.947	-19.000	0.018	NA		NA
3812482	3812483	SpyM50642	SpyM50643			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812483	3812484	SpyM50643	SpyM50644			TRUE	0.855	9.000	0.000	NA		NA
3812484	3812485	SpyM50644	SpyM50645			TRUE	0.434	56.000	0.000	NA		NA
3812485	3812486	SpyM50645	SpyM50646			TRUE	0.841	3.000	0.000	NA		NA
3812486	3812487	SpyM50646	SpyM50647			TRUE	0.933	10.000	0.100	NA		NA
3812487	3812488	SpyM50647	SpyM50649			FALSE	0.097	196.000	0.000	NA		NA
3812488	3812489	SpyM50649	SpyM50650			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812489	3812490	SpyM50650	SpyM50651			TRUE	0.910	-13.000	0.000	NA		NA
3812490	3812491	SpyM50651	SpyM50652			TRUE	0.739	28.000	0.000	NA		NA
3812491	3812492	SpyM50652	SpyM50653			TRUE	0.902	-10.000	0.000	NA		NA
3812492	3812493	SpyM50653	SpyM50654			TRUE	0.525	48.000	0.000	NA		NA
3812493	3812494	SpyM50654	SpyM50655			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812494	3812495	SpyM50655	SpyM50657			FALSE	0.034	434.000	0.000	NA		NA
3812495	3812496	SpyM50657	SpyM50658			FALSE	0.193	109.000	0.000	NA		NA
3812496	3812497	SpyM50658	SpyM50659			FALSE	0.131	149.000	0.000	NA		NA
3812497	3812498	SpyM50659	SpyM50660			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812498	3812499	SpyM50660	SpyM50661			TRUE	0.984	-7.000	0.353	NA		NA
3812499	3812500	SpyM50661	SpyM50662			TRUE	0.851	6.000	0.000	NA		NA
3812500	3812501	SpyM50662	SpyM50663			FALSE	0.308	77.000	0.000	NA		NA
3812501	3812502	SpyM50663	SpyM50664			TRUE	0.890	-7.000	0.000	NA		NA
3812502	3812503	SpyM50664	SpyM50665			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3812503	3812504	SpyM50665	SpyM50666			FALSE	0.278	82.000	0.000	NA		NA
3812504	3812505	SpyM50666	SpyM50667			TRUE	0.732	71.000	0.263	NA		NA
3812505	3812506	SpyM50667	SpyM50668			TRUE	0.970	25.000	0.417	NA		NA
3812506	3812507	SpyM50668	SpyM50669			TRUE	0.851	0.000	0.000	NA		NA
3812507	3812508	SpyM50669	SpyM50670			TRUE	0.856	10.000	0.000	NA		NA
3812508	3812509	SpyM50670	SpyM50671			TRUE	0.996	-40.000	0.667	NA		NA
3812509	3812510	SpyM50671	SpyM50672			TRUE	0.988	-7.000	0.467	NA		NA
3812510	3812511	SpyM50672	SpyM50673			TRUE	0.992	1.000	0.750	NA		NA
3812511	3812512	SpyM50673	SpyM50674			TRUE	0.985	12.000	0.444	NA		NA
3812512	3812513	SpyM50674	SpyM50675			TRUE	0.965	11.000	0.222	NA		NA
3812513	3812514	SpyM50675	SpyM50676			TRUE	0.994	15.000	0.833	NA		NA
3812514	3812515	SpyM50676	SpyM50677			TRUE	0.967	0.000	0.250	NA		NA
3812515	3812516	SpyM50677	SpyM50678			TRUE	0.962	-3.000	0.188	NA		NA
3812516	3812517	SpyM50678	SpyM50679			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812517	3812518	SpyM50679	SpyM50680			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812518	3812519	SpyM50680	SpyM50681			TRUE	0.858	15.000	0.000	NA		NA
3812519	3812520	SpyM50681	SpyM50682			TRUE	0.861	12.000	0.000	NA		NA
3812520	3812521	SpyM50682	SpyM50683			TRUE	0.841	3.000	0.000	NA		NA
3812521	3812522	SpyM50683	SpyM50684			TRUE	0.857	11.000	0.000	NA		NA
3812522	3812523	SpyM50684	SpyM50685			TRUE	0.992	-3.000	0.667	NA		NA
3812523	3812524	SpyM50685	SpyM50686			TRUE	0.843	4.000	0.000	NA		NA
3812524	3812525	SpyM50686	SpyM50687			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812525	3812526	SpyM50687	SpyM50688			TRUE	0.655	35.000	0.000	NA		NA
3812526	3812527	SpyM50688	SpyM50689			FALSE	0.135	142.000	0.000	NA		NA
3812527	3812528	SpyM50689	SpyM50690			FALSE	0.106	184.000	0.000	NA		NA
3812528	3812529	SpyM50690	SpyM50691			FALSE	0.079	222.000	0.000	NA		NA
3812529	3812530	SpyM50691	SpyM50692			FALSE	0.366	66.000	0.000	NA		NA
3812530	3812531	SpyM50692	SpyM50693			FALSE	0.031	532.000	0.000	NA		NA
3812531	3812532	SpyM50693	SpyM50694			TRUE	0.439	72.000	0.018	NA		NA
3812534	3812535	SpyM50696	SpyM50697	gpmA		FALSE	0.226	107.000	0.012	1.000		NA
3812535	3812536	SpyM50697	SpyM50698			FALSE	0.249	161.000	0.107	NA		NA
3812536	3812537	SpyM50698	SpyM50699			FALSE	0.313	124.000	0.105	NA		NA
3812537	3812538	SpyM50699	SpyM50700			FALSE	0.024	560.000	0.000	1.000		NA
3812538	3812539	SpyM50700	SpyM50701		recR	TRUE	0.475	47.000	0.000	1.000		NA
3812539	3812540	SpyM50701	SpyM50702	recR	ddl	FALSE	0.158	101.000	0.010	1.000	N	NA
3812540	3812541	SpyM50702	SpyM50703	ddl	murF	TRUE	0.583	199.000	0.046	0.010	Y	NA
3812541	3812542	SpyM50703	SpyM50704	murF		TRUE	0.460	80.000	0.078	NA		NA
3812542	3812543	SpyM50704	SpyM50705		prfC	FALSE	0.086	248.000	0.003	NA		NA
3812543	3812544	SpyM50705	SpyM50706	prfC		FALSE	0.108	307.000	0.000	1.000	Y	NA
3812544	3812545	SpyM50706	SpyM50707			FALSE	0.110	127.000	0.007	1.000	N	NA
3812546	3812547	SpyM50708	SpyM50709			TRUE	0.972	-10.000	0.209	1.000		NA
3812548	3812549	SpyM50710	SpyM50711		comEA	FALSE	0.072	199.000	0.014	1.000	N	NA
3812549	3812550	SpyM50711	SpyM50712	comEA	comEC	TRUE	0.961	-19.000	0.130	1.000		NA
3812550	3812551	SpyM50712	SpyM50713	comEC	holA	TRUE	0.588	71.000	0.163	1.000		NA
3812551	3812552	SpyM50713	SpyM50714	holA	sodA	FALSE	0.170	97.000	0.012	1.000	N	NA
3812552	3812553	SpyM50714	SpyM50715	sodA		FALSE	0.119	168.000	0.000	NA		NA
3812554	3812555	SpyM50716	SpyM50717		queA	TRUE	0.881	7.000	0.004	NA		NA
3812556	3812557	SpyM50718	SpyM50719	nagB		FALSE	0.308	74.000	0.051	1.000	N	NA
3812557	3812558	SpyM50719	SpyM50721			FALSE	0.081	295.000	0.020	NA		NA
3812558	3812559	SpyM50721	SpyM50722		pepB	TRUE	0.965	13.000	0.204	NA		NA
3812559	3812560	SpyM50722	SpyM50723	pepB		FALSE	0.016	376.000	0.000	1.000	N	NA
3812560	3812561	SpyM50723	SpyM50724			TRUE	0.406	66.000	0.012	1.000		NA
3812561	3812562	SpyM50724	SpyM50725		prsA	TRUE	0.434	63.000	0.012	1.000		NA
3812562	3812563	SpyM50725	SpyM50726	prsA	alaS	FALSE	0.015	387.000	0.000	1.000	N	NA
3812563	3812564	SpyM50726	SpyM50727	alaS		FALSE	0.103	186.000	0.000	NA		NA
3812564	3812565	SpyM50727	SpyM50728			TRUE	0.606	41.000	0.000	NA		NA
3812565	3812566	SpyM50728	SpyM50729			TRUE	0.981	-3.000	0.362	NA		NA
3812566	3812567	SpyM50729	SpyM50730			TRUE	0.913	19.000	0.077	NA		NA
3812568	3812569	SpyM50732	SpyM50733			TRUE	0.679	33.000	0.000	NA		NA
3812569	3812570	SpyM50733	SpyM50734			FALSE	0.061	138.000	0.000	1.000	N	NA
3812570	3812571	SpyM50734	SpyM50735		nrdF	TRUE	0.917	-10.000	0.083	1.000	N	NA
3812571	3812572	SpyM50735	SpyM50737	nrdF		TRUE	0.788	333.000	0.500	0.003	Y	NA
3812572	3812573	SpyM50737	SpyM50738		nrdH	TRUE	0.978	20.000	0.562	1.000	N	NA
3812574	3812575	SpyM50739	SpyM50740	ptsH	pstI	TRUE	0.994	5.000	0.240	0.015	Y	NA
3812575	3812576	SpyM50740	SpyM50741	pstI	gapN	FALSE	0.095	185.000	0.035	1.000	N	NA
3812576	3812577	SpyM50741	SpyM50742	gapN		FALSE	0.199	95.000	0.028	1.000	N	NA
3812579	3812580	SpyM50744	SpyM50745	udk		FALSE	0.367	80.000	0.010	NA		NA
3812582	3812583	SpyM50747	SpyM50748		dnaH	TRUE	0.864	0.000	0.030	NA	N	NA
3812585	3812586	SpyM50750	SpyM50751		metK	FALSE	0.024	537.000	0.000	1.000		NA
3812586	3812587	SpyM50751	SpyM50752	metK	murA2	FALSE	0.101	174.000	0.026	1.000	N	NA
3812587	3812588	SpyM50752	SpyM50753	murA2	graB	FALSE	0.032	358.000	0.000	1.000		NA
3812588	3812589	SpyM50753	SpyM50754	graB		FALSE	0.058	238.000	0.000	1.000		NA
3812589	3812590	SpyM50754	SpyM50755			TRUE	0.967	9.000	0.342	1.000	N	NA
3812590	3812591	SpyM50755	SpyM50756			TRUE	0.947	16.000	0.235	1.000	N	NA
3812591	3812592	SpyM50756	SpyM50757			TRUE	0.974	2.000	0.373	1.000		NA
3812592	3812593	SpyM50757	SpyM50758		aroA	FALSE	0.210	102.000	0.003	1.000		NA
3812593	3812594	SpyM50758	SpyM50759	aroA	aroK	TRUE	0.963	-7.000	0.012	1.000	Y	NA
3812594	3812595	SpyM50759	SpyM50760	aroK		FALSE	0.119	208.000	0.111	1.000	N	NA
3812595	3812596	SpyM50760	SpyM50761			TRUE	0.566	49.000	0.093	1.000	N	NA
3812596	3812597	SpyM50761	SpyM50762			TRUE	0.620	39.000	0.000	NA		NA
3812597	3812598	SpyM50762	SpyM50763			FALSE	0.262	85.000	0.000	NA		NA
3812603	3812604	SpyM50770	SpyM50771			TRUE	0.679	33.000	0.000	NA		NA
3812604	3812605	SpyM50771	SpyM50772			FALSE	0.200	78.000	0.000	NA	N	NA
3812607	3812608	SpyM50774	SpyM50775			TRUE	0.966	21.000	0.000	0.059	Y	NA
3812609	3812610	SpyM50776	SpyM50777		obgE	TRUE	0.516	57.000	0.011	NA		NA
3812610	3812611	SpyM50777	SpyM50778	obgE		TRUE	0.428	69.000	0.009	NA		NA
3812613	3812614	SpyM50780	SpyM50781			TRUE	0.985	9.000	0.500	1.000		NA
3812614	3812615	SpyM50781	SpyM50782			FALSE	0.289	106.000	0.064	1.000		NA
3812615	3812616	SpyM50782	SpyM50783			TRUE	0.953	23.000	0.064	0.015	N	NA
3812616	3812617	SpyM50783	SpyM50784			TRUE	0.997	3.000	0.500	0.015	Y	NA
3812617	3812618	SpyM50784	SpyM50785			TRUE	0.988	-3.000	0.500	NA		NA
3812618	3812619	SpyM50785	SpyM50786			TRUE	0.376	193.000	0.273	NA		NA
3812619	3812620	SpyM50786	SpyM50787			TRUE	0.961	-3.000	0.182	NA		NA
3812621	3812622	SpyM50788	SpyM50789	glnQ1		TRUE	0.986	0.000	0.326	1.000	Y	NA
3812623	3812624	SpyM50790	SpyM50791	uvrB		FALSE	0.063	263.000	0.000	NA		NA
3812624	3812625	SpyM50791	SpyM50792		dltA	TRUE	0.988	12.000	0.549	NA		NA
3812625	3812626	SpyM50792	SpyM50793	dltA	dltB	TRUE	0.980	-3.000	0.435	NA	N	NA
3812626	3812627	SpyM50793	SpyM50794	dltB	dltC	TRUE	0.979	18.000	0.387	NA		NA
3812627	3812628	SpyM50794	SpyM50795	dltC	dltD	TRUE	0.987	-7.000	0.409	NA		NA
3812628	3812629	SpyM50795	SpyM50796	dltD		TRUE	0.733	31.000	0.042	NA	N	NA
3812630	3812631	SpyM50797	SpyM50798			FALSE	0.054	291.000	0.000	NA		NA
3812633	3812634	SpyM50800	SpyM50801	malD	malC	TRUE	0.998	0.000	0.793	0.036	Y	NA
3812634	3812635	SpyM50801	SpyM50802	malC	malE	TRUE	0.848	274.000	0.690	0.036	Y	NA
3812636	3812637	SpyM50803	SpyM50804		malM	TRUE	0.665	115.000	0.538	1.000	N	NA
3812637	3812638	SpyM50804	SpyM50805	malM	glgP	TRUE	0.984	35.000	0.289	0.021	Y	NA
3812639	3812640	SpyM50806	SpyM5s04		ssrA	FALSE	0.049	302.000	0.000	NA		NA
3812642	3812643	SpyM50808	SpyM50809			TRUE	0.985	10.000	0.471	NA		NA
3812643	3812644	SpyM50809	SpyM50810			TRUE	0.972	0.000	0.412	1.000	N	NA
3812645	3812646	SpyM50811	SpyM50812	dnaE	pfk	FALSE	0.348	80.000	0.098	1.000	N	NA
3812646	3812647	SpyM50812	SpyM50813	pfk	pyk	TRUE	0.958	63.000	0.261	0.006	Y	NA
3812647	3812648	SpyM50813	SpyM50814	pyk	sipC	FALSE	0.091	218.000	0.072	1.000	N	NA
3812648	3812649	SpyM50814	SpyM50815	sipC	gcaA	FALSE	0.083	176.000	0.011	1.000	N	NA
3812649	3812650	SpyM50815	SpyM50816	gcaA		FALSE	0.066	196.000	0.008	1.000	N	NA
3812650	3812651	SpyM50816	SpyM50817			FALSE	0.167	107.000	0.018	1.000	N	NA
3812651	3812652	SpyM50817	SpyM50818			TRUE	0.968	10.000	0.130	1.000	Y	NA
3812652	3812653	SpyM50818	SpyM50819			TRUE	0.972	16.000	0.154	1.000	Y	NA
3812653	3812654	SpyM50819	SpyM50820		cfa	FALSE	0.039	371.000	0.000	NA		NA
3812655	3812656	SpyM50821	SpyM50822			TRUE	0.407	120.000	0.060	0.074	N	NA
3812657	3812658	SpyM50823	SpyM50824	pcrA		FALSE	0.032	363.000	0.000	1.000		NA
3812658	3812659	SpyM50824	SpyM50825			TRUE	0.930	37.000	0.357	NA		NA
3812659	3812660	SpyM50825	SpyM50826			TRUE	0.945	11.000	0.143	NA		NA
3812660	3812661	SpyM50826	SpyM50827			TRUE	0.924	13.000	0.060	NA		NA
3812661	3812662	SpyM50827	SpyM50828			TRUE	0.960	41.000	0.600	NA		NA
3812662	3812663	SpyM50828	SpyM50829			TRUE	0.989	8.000	0.600	NA		NA
3812663	3812664	SpyM50829	SpyM50830			TRUE	0.403	163.000	0.238	NA		NA
3812666	3812667	SpyM50832	SpyM50833			TRUE	0.991	15.000	0.438	1.000	Y	NA
3812667	3812668	SpyM50833	SpyM50834			TRUE	0.400	92.000	0.121	1.000		NA
3812668	3812669	SpyM50834	SpyM50835			TRUE	0.914	11.000	0.045	NA		NA
3812669	3812670	SpyM50835	SpyM50836			FALSE	0.331	97.000	0.045	NA		NA
3812670	3812671	SpyM50836	SpyM50837		truB	FALSE	0.248	116.000	0.014	NA		NA
3812671	3812672	SpyM50837	SpyM50838	truB	ribC	TRUE	0.917	29.000	0.308	1.000	N	NA
3812672	3812673	SpyM50838	SpyM50839	ribC	spxA	TRUE	0.529	43.000	0.017	1.000	N	NA
3812673	3812674	SpyM50839	SpyM50840	spxA		TRUE	0.949	2.000	0.169	NA		NA
3812674	3812675	SpyM50840	SpyM50841			TRUE	0.986	-10.000	0.337	NA		NA
3812675	3812676	SpyM50841	SpyM50842			TRUE	0.949	3.000	0.229	NA	N	NA
3812676	3812677	SpyM50842	SpyM50843		pstS	TRUE	0.431	140.000	0.303	NA	N	NA
3812677	3812678	SpyM50843	SpyM50844	pstS	pstC	TRUE	0.979	11.000	0.206	1.000	Y	NA
3812678	3812679	SpyM50844	SpyM50845	pstC		TRUE	0.999	-10.000	0.907	0.003	Y	NA
3812679	3812680	SpyM50845	SpyM50846		pstB2	TRUE	0.998	16.000	0.490	0.003	Y	NA
3812680	3812681	SpyM50846	SpyM50847	pstB2	pstB1	TRUE	0.998	13.000	0.542	0.001	Y	NA
3812681	3812682	SpyM50847	SpyM50848	pstB1	phoU	TRUE	0.911	68.000	0.413	NA	Y	NA
3812682	3812683	SpyM50848	SpyM50849	phoU	lap	FALSE	0.118	205.000	0.067	NA	N	NA
3812683	3812684	SpyM50849	SpyM50850	lap	ciaR	FALSE	0.044	345.000	0.061	1.000	N	NA
3812684	3812685	SpyM50850	SpyM50851	ciaR	ciaH	TRUE	0.996	-7.000	0.606	1.000	Y	NA
3812686	3812687	SpyM50852	SpyM50853	rpsT	coaA	FALSE	0.289	69.000	0.014	1.000	N	NA
3812688	3812689	SpyM50854	SpyM50855		cdd	FALSE	0.012	654.000	0.000	1.000	N	NA
3812689	3812690	SpyM50855	SpyM50856	cdd		TRUE	0.618	94.000	0.300	1.000		NA
3812690	3812691	SpyM50856	SpyM50857			FALSE	0.187	139.000	0.036	1.000		NA
3812691	3812692	SpyM50857	SpyM50858			TRUE	0.986	-7.000	0.438	1.000		NA
3812692	3812693	SpyM50858	SpyM50859			TRUE	0.996	2.000	0.720	0.036		NA
3812694	3812695	SpyM50860	SpyM50861	pgmA		FALSE	0.228	176.000	0.098	NA		NA
3812695	3812696	SpyM50861	SpyM50862		coaC	TRUE	0.536	58.000	0.019	NA		NA
3812696	3812697	SpyM50862	SpyM50863	coaC	dpfB	TRUE	0.889	-7.000	0.002	1.000		NA
3812698	3812699	SpyM50864	SpyM50865			TRUE	0.845	-3.000	0.019	1.000	N	NA
3812699	3812700	SpyM50865	SpyM50866			TRUE	0.972	-3.000	0.100	NA	Y	NA
3812700	3812701	SpyM50866	SpyM50867			TRUE	0.943	42.000	0.571	NA	N	NA
3812701	3812702	SpyM50867	SpyM50868			TRUE	0.951	-7.000	0.107	NA		NA
3812702	3812703	SpyM50868	SpyM50869			TRUE	0.979	-7.000	0.286	NA		NA
3812703	3812704	SpyM50869	SpyM50870		lplA	TRUE	0.794	47.000	0.250	1.000	N	NA
3812704	3812705	SpyM50870	SpyM50871	lplA	fhs1	FALSE	0.318	129.000	0.200	1.000	N	NA
3812705	3812706	SpyM50871	SpyM50872	fhs1		FALSE	0.310	85.000	0.094	1.000	N	NA
3812706	3812707	SpyM50872	SpyM50873			FALSE	0.037	322.000	0.000	1.000		NA
3812709	3812710	SpyM50875	SpyM50876			TRUE	0.970	-22.000	0.142	NA		NA
3812710	3812711	SpyM50876	SpyM50877			FALSE	0.281	113.000	0.040	NA		NA
3812711	3812712	SpyM50877	SpyM50878		murM	FALSE	0.073	202.000	0.000	1.000		NA
3812714	3812715	SpyM50880	SpyM50881			TRUE	0.588	56.000	0.057	NA		NA
3812715	3812716	SpyM50881	SpyM50882			TRUE	0.609	89.000	0.032	0.042		NA
3812716	3812717	SpyM50882	SpyM50883		ffh	TRUE	0.941	15.000	0.151	1.000		NA
3812719	3812720	SpyM50885	SpyM50886	xerS		FALSE	0.028	408.000	0.000	1.000		NA
3812720	3812721	SpyM50886	SpyM50887		citC	FALSE	0.203	89.000	0.000	1.000		NA
3812722	3812723	SpyM50888	SpyM50889		citX	TRUE	0.895	0.000	0.123	1.000	N	NA
3812723	3812724	SpyM50889	SpyM50890	citX	citF	TRUE	0.929	-7.000	0.138	1.000	N	NA
3812724	3812725	SpyM50890	SpyM50891	citF	citE	TRUE	0.979	3.000	0.119	0.001	N	NA
3812725	3812726	SpyM50891	SpyM50892	citE	citD	TRUE	0.994	-12.000	0.284	0.002	N	NA
3812726	3812727	SpyM50892	SpyM50893	citD		TRUE	0.857	36.000	0.192	1.000		NA
3812727	3812728	SpyM50893	SpyM50894			TRUE	0.991	18.000	0.273	0.003		NA
3812728	3812729	SpyM50894	SpyM50895			TRUE	0.635	45.000	0.103	1.000	N	NA
3812729	3812730	SpyM50895	SpyM50896			TRUE	0.606	57.000	0.077	NA		NA
3812731	3812732	SpyM50897	SpyM50898			TRUE	0.453	158.000	0.400	1.000	N	NA
3812732	3812733	SpyM50898	SpyM50899		citG	TRUE	0.991	-7.000	0.700	1.000	N	NA
3812734	3812735	SpyM50900	SpyM50901			TRUE	0.977	10.000	0.062	0.001	N	NA
3812735	3812736	SpyM50901	SpyM50902			TRUE	0.986	0.000	0.500	NA		NA
3812736	3812737	SpyM50902	SpyM50903			TRUE	0.879	43.000	0.250	NA		NA
3812737	3812738	SpyM50903	SpyM50904			FALSE	0.081	154.000	0.005	1.000	N	NA
3812738	3812739	SpyM50904	SpyM50905		topA	FALSE	0.215	135.000	0.137	1.000	N	NA
3812739	3812740	SpyM50905	SpyM50906	topA		TRUE	0.689	106.000	0.238	1.000	Y	NA
3812740	3812741	SpyM50906	SpyM50907		rnhB	TRUE	0.681	65.000	0.037	1.000	Y	NA
3812741	3812742	SpyM50907	SpyM50908	rnhB	rbgA	TRUE	0.958	-10.000	0.148	1.000		NA
3812743	3812744	SpyM50909	SpyM50910			TRUE	0.943	-3.000	0.146	1.000		NA
3812744	3812745	SpyM50910	SpyM50912			FALSE	0.175	117.000	0.000	NA		NA
3812746	3812747	SpyM50913	SpyM50914			FALSE	0.029	614.000	0.000	NA		NA
3812747	3812748	SpyM50914	SpyM50915		srtA	FALSE	0.299	83.000	0.039	NA	N	NA
3812748	3812749	SpyM50915	SpyM50916	srtA	cafB	TRUE	0.820	20.000	0.013	NA	N	NA
3812751	3812752	SpyM50918	SpyM50919	nox		FALSE	0.057	240.000	0.000	1.000		NA
3812752	3812753	SpyM50919	SpyM50920			TRUE	0.999	3.000	0.895	0.007	Y	NA
3812753	3812754	SpyM50920	SpyM50921			TRUE	0.911	10.000	0.035	NA		NA
3812754	3812755	SpyM50921	SpyM50922			TRUE	0.846	1.000	0.000	NA		NA
3812755	3812756	SpyM50922	SpyM50923		glyA	TRUE	0.853	7.000	0.000	NA		NA
3812756	3812757	SpyM50923	SpyM50924	glyA		TRUE	0.934	-10.000	0.056	1.000		NA
3812757	3812758	SpyM50924	SpyM50925			TRUE	0.888	18.000	0.012	NA		NA
3812758	3812759	SpyM50925	SpyM50926			TRUE	0.977	-16.000	0.029	NA	Y	NA
3812759	3812760	SpyM50926	SpyM50927		prfA	TRUE	0.961	0.000	0.084	1.000	Y	NA
3812760	3812761	SpyM50927	SpyM50928	prfA	tdk	TRUE	0.664	35.000	0.062	1.000	N	NA
3812762	3812763	SpyM50929	SpyM50930			TRUE	0.737	53.000	0.189	1.000		NA
3812764	3812765	SpyM50931	SpyM50932	pbuX	xpt	TRUE	0.954	0.000	0.046	1.000	Y	NA
3812765	3812766	SpyM50932	SpyM5s05	xpt		FALSE	0.247	89.000	0.000	NA		NA
3812766	3812767	SpyM5s05	SpyM50933			FALSE	0.164	123.000	0.000	NA		NA
3812767	3812768	SpyM50933	SpyM50934			FALSE	0.024	278.000	0.000	1.000	N	NA
3812768	3812769	SpyM50934	SpyM50935			TRUE	0.978	-7.000	0.382	1.000	N	NA
3812771	3812772	SpyM50937	SpyM50938		eutD	TRUE	0.461	128.000	0.031	0.043		NA
3812772	3812773	SpyM50938	SpyM50939	eutD		TRUE	0.854	4.000	0.067	1.000	N	NA
3812773	3812774	SpyM50939	SpyM50940		ppnK	TRUE	0.922	-3.000	0.150	1.000	N	NA
3812774	3812775	SpyM50940	SpyM50941	ppnK		TRUE	0.995	-16.000	0.725	1.000		NA
3812776	3812777	SpyM50942	SpyM50943		prs2	FALSE	0.283	140.000	0.145	1.000		NA
3812777	3812778	SpyM50943	SpyM50944	prs2		TRUE	0.966	-3.000	0.089	1.000	Y	NA
3812778	3812779	SpyM50944	SpyM50945			TRUE	0.968	-10.000	0.166	NA		NA
3812779	3812780	SpyM50945	SpyM50946		rex	FALSE	0.134	252.000	0.083	NA		NA
3812780	3812781	SpyM50946	SpyM50947	rex		TRUE	0.991	10.000	0.714	1.000		NA
3812782	3812783	SpyM50948	SpyM50949	radC		TRUE	0.647	49.000	0.046	NA		NA
3812783	3812784	SpyM50949	SpyM50950			TRUE	0.851	0.000	0.000	NA		NA
3812784	3812785	SpyM50950	SpyM50951			TRUE	0.552	46.000	0.000	NA		NA
3812785	3812786	SpyM50951	SpyM50952			FALSE	0.133	163.000	0.071	1.000	N	NA
3812786	3812787	SpyM50952	SpyM50953		aphA	FALSE	0.089	178.000	0.000	1.000		NA
3812789	3812790	SpyM50955	SpyM50956		malP	TRUE	0.976	31.000	0.432	1.000	Y	NA
3812791	3812792	SpyM50957	SpyM50958			TRUE	0.985	-19.000	0.154	1.000	Y	NA
3812793	3812794	SpyM50959	SpyM50960	potD	potC	TRUE	0.995	-7.000	0.253	0.035	Y	NA
3812794	3812795	SpyM50960	SpyM50961	potC	potB	TRUE	0.997	-3.000	0.492	0.035	Y	NA
3812795	3812796	SpyM50961	SpyM50962	potB	potA	TRUE	0.999	-16.000	0.928	0.035	Y	NA
3812796	3812797	SpyM50962	SpyM50963	potA	murB	TRUE	0.530	46.000	0.041	1.000	N	NA
3812797	3812798	SpyM50963	SpyM50964	murB	folK	FALSE	0.094	150.000	0.010	1.000	N	NA
3812798	3812799	SpyM50964	SpyM50965	folK	folB	TRUE	0.973	-3.000	0.142	1.000	Y	NA
3812799	3812800	SpyM50965	SpyM50966	folB	folP	TRUE	0.963	7.000	0.094	1.000	Y	NA
3812800	3812801	SpyM50966	SpyM50967	folP	folE	TRUE	0.961	9.000	0.073	1.000	Y	NA
3812801	3812802	SpyM50967	SpyM50968	folE	folC1	TRUE	0.878	35.000	0.057	1.000	Y	NA
3812802	3812803	SpyM50968	SpyM50969	folC1		FALSE	0.247	89.000	0.000	NA		NA
3812805	3812806	SpyM50971	SpyM50972		rplL	FALSE	0.030	239.000	0.000	1.000	N	NA
3812806	3812807	SpyM50972	SpyM50973	rplL	rplJ	TRUE	0.989	65.000	0.884	0.028	Y	NA
3812808	3812809	SpyM50974	SpyM50975		trmE	FALSE	0.199	90.000	0.000	1.000		NA
3812810	3812811	SpyM50976	SpyM50977	pepV		FALSE	0.299	125.000	0.179	1.000	N	NA
3812811	3812812	SpyM50977	SpyM50978		uvrC	FALSE	0.066	185.000	0.004	1.000	N	NA
3812812	3812813	SpyM50978	SpyM50979	uvrC		FALSE	0.095	102.000	0.000	1.000	N	NA
3812813	3812814	SpyM50979	SpyM50980			FALSE	0.080	115.000	0.000	1.000	N	NA
3812814	3812815	SpyM50980	SpyM50981			TRUE	0.987	-6.000	0.571	1.000	N	NA
3812815	3812816	SpyM50981	SpyM50982			TRUE	0.997	4.000	0.500	0.012	Y	NA
3812816	3812817	SpyM50982	SpyM50983			TRUE	0.561	136.000	0.222	0.058	N	NA
3812817	3812818	SpyM50983	SpyM50984			TRUE	0.999	-3.000	0.778	0.024	Y	NA
3812818	3812819	SpyM50984	SpyM50985			TRUE	0.998	17.000	0.778	0.024	Y	NA
3812819	3812820	SpyM50985	SpyM50986			TRUE	0.998	19.000	0.786	0.020	Y	NA
3812820	3812821	SpyM50986	SpyM50987			FALSE	0.071	207.000	0.000	1.000		NA
3812821	3812822	SpyM50987	SpyM50988		csrA	FALSE	0.123	130.000	0.000	1.000		NA
3812822	3812823	SpyM50988	SpyM50989	csrA	scl2	FALSE	0.102	187.000	0.000	NA		NA
3812823	3812824	SpyM50989	SpyM50990	scl2	lepA	FALSE	0.102	187.000	0.000	NA		NA
3812824	3812825	SpyM50990	SpyM50991	lepA		FALSE	0.051	298.000	0.000	NA		NA
3812825	3812826	SpyM50991	SpyM50992			TRUE	0.975	0.000	0.330	NA		NA
3812826	3812827	SpyM50992	SpyM50993			TRUE	0.849	0.000	0.055	1.000	N	NA
3812827	3812828	SpyM50993	SpyM50994		hemN	TRUE	0.859	10.000	0.060	1.000	N	NA
3812828	3812829	SpyM50994	SpyM50995	hemN		TRUE	0.513	63.000	0.021	NA		NA
3812829	3812830	SpyM50995	SpyM50996			FALSE	0.196	124.000	0.003	NA		NA
3812830	3812831	SpyM50996	SpyM50997			TRUE	0.712	54.000	0.150	NA		NA
3812831	3812832	SpyM50997	SpyM50998			TRUE	0.989	-3.000	0.502	NA		NA
3812833	3812834	SpyM50999	SpyM51000			TRUE	0.992	0.000	0.796	1.000		NA
3812837	3812838	SpyM51003A	SpyM51003B		IS861-truncation	TRUE	0.751	27.000	0.000	NA		NA
3812838	3812839	SpyM51003B	SpyM51004	IS861-truncation	acoL	FALSE	0.131	149.000	0.000	NA		NA
3812839	3812840	SpyM51004	SpyM51006	acoL	pdhC	FALSE	0.100	331.000	0.000	1.000	Y	NA
3812840	3812841	SpyM51006	SpyM51007	pdhC	pdhB	TRUE	0.569	185.000	0.077	0.043	Y	NA
3812841	3812842	SpyM51007	SpyM51008	pdhB	pdhA	TRUE	0.992	56.000	0.769	0.001	Y	NA
3812842	3812843	SpyM51008	SpyM51009	pdhA		FALSE	0.044	285.000	0.000	1.000		NA
3812843	3812844	SpyM51009	SpyM51010			TRUE	0.673	46.000	0.029	NA		NA
3812844	3812845	SpyM51010	SpyM51011			TRUE	0.882	30.000	0.150	NA		NA
3812845	3812846	SpyM51011	SpyM51012			FALSE	0.331	133.000	0.143	NA		NA
3812846	3812847	SpyM51012	SpyM51013			FALSE	0.119	204.000	0.026	1.000		NA
3812847	3812848	SpyM51013	SpyM51014			TRUE	0.995	-3.000	0.895	1.000		NA
3812848	3812849	SpyM51014	SpyM51015			FALSE	0.114	176.000	0.000	NA		NA
3812849	3812850	SpyM51015	SpyM51016			TRUE	0.847	5.000	0.000	NA		NA
3812852	3812853	SpyM51018	SpyM51019			TRUE	0.984	-10.000	0.324	NA		NA
3812853	3812854	SpyM51019	SpyM51020		mutX	TRUE	0.597	58.000	0.074	NA		NA
3812854	3812855	SpyM51020	SpyM51021	mutX	speH	FALSE	0.023	604.000	0.000	1.000		NA
3812855	3812856	SpyM51021	SpyM51024	speH	speI	TRUE	0.761	26.000	0.000	NA		NA
3812856	3812857	SpyM51024	SpyM51025	speI	lys	FALSE	0.059	274.000	0.000	NA		NA
3812857	3812858	SpyM51025	SpyM51026	lys		FALSE	0.187	112.000	0.000	NA		NA
3812858	3812859	SpyM51026	SpyM51027			TRUE	0.992	-3.000	0.667	NA		NA
3812859	3812860	SpyM51027	SpyM51028			TRUE	0.856	10.000	0.000	NA		NA
3812860	3812861	SpyM51028	SpyM51029			TRUE	0.841	3.000	0.000	NA		NA
3812861	3812862	SpyM51029	SpyM51030			TRUE	0.861	12.000	0.000	NA		NA
3812862	3812863	SpyM51030	SpyM51031			TRUE	0.996	15.000	1.000	NA		NA
3812863	3812864	SpyM51031	SpyM51032			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812864	3812865	SpyM51032	SpyM51033			TRUE	0.856	10.000	0.000	NA		NA
3812865	3812866	SpyM51033	SpyM51034			TRUE	0.982	12.000	0.400	NA		NA
3812866	3812867	SpyM51034	SpyM51035			TRUE	0.982	15.000	0.400	NA		NA
3812867	3812868	SpyM51035	SpyM51036			TRUE	0.690	75.000	0.235	NA		NA
3812868	3812869	SpyM51036	SpyM51037			TRUE	0.611	54.000	0.062	NA		NA
3812869	3812870	SpyM51037	SpyM51038			TRUE	0.915	12.000	0.041	NA		NA
3812870	3812871	SpyM51038	SpyM51039			TRUE	0.993	4.000	0.800	NA		NA
3812871	3812872	SpyM51039	SpyM51040			TRUE	0.993	-3.000	0.750	NA		NA
3812872	3812873	SpyM51040	SpyM51041			TRUE	0.991	11.000	0.667	NA		NA
3812873	3812874	SpyM51041	SpyM51042			TRUE	0.987	12.000	0.500	NA		NA
3812874	3812875	SpyM51042	SpyM51043			TRUE	0.962	13.000	0.192	NA		NA
3812875	3812876	SpyM51043	SpyM51044			FALSE	0.122	162.000	0.000	NA		NA
3812876	3812877	SpyM51044	SpyM51045			TRUE	0.847	5.000	0.000	NA		NA
3812877	3812878	SpyM51045	SpyM51046			TRUE	0.906	28.000	0.167	NA		NA
3812878	3812879	SpyM51046	SpyM51047			TRUE	0.984	-34.000	0.250	NA		NA
3812879	3812880	SpyM51047	SpyM51048			TRUE	0.982	16.000	0.429	NA		NA
3812880	3812881	SpyM51048	SpyM51049			TRUE	0.992	-10.000	0.176	0.002		NA
3812881	3812882	SpyM51049	SpyM51050			TRUE	0.492	90.000	0.176	1.000		NA
3812882	3812883	SpyM51050	SpyM51051			FALSE	0.148	133.000	0.000	NA		NA
3812883	3812884	SpyM51051	SpyM51052			FALSE	0.120	164.000	0.000	NA		NA
3812884	3812885	SpyM51052	SpyM51053			TRUE	0.975	-3.000	0.286	NA		NA
3812885	3812886	SpyM51053	SpyM51054			FALSE	0.038	386.000	0.000	NA		NA
3812886	3812887	SpyM51054	SpyM51055			TRUE	0.931	5.000	0.111	NA		NA
3812887	3812888	SpyM51055	SpyM51056			TRUE	0.879	43.000	0.250	NA		NA
3812888	3812889	SpyM51056	SpyM51057			TRUE	0.990	15.000	0.643	NA		NA
3812889	3812890	SpyM51057	SpyM51058			TRUE	0.942	0.000	0.143	NA		NA
3812890	3812891	SpyM51058	SpyM51059			TRUE	0.929	88.000	1.000	NA		NA
3812891	3812892	SpyM51059	SpyM51060			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812892	3812893	SpyM51060	SpyM51061			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3812893	3812894	SpyM51061	SpyM51062			TRUE	0.991	0.000	0.667	NA		NA
3812894	3812895	SpyM51062	SpyM51062A			TRUE	0.998	-19.000	1.000	NA		NA
3812895	3812896	SpyM51062A	SpyM51063			TRUE	0.990	2.000	0.667	NA		NA
3812896	3812897	SpyM51063	SpyM51064			TRUE	0.778	79.000	0.375	NA		NA
3812900	3812901	SpyM51067	SpyM51068			TRUE	0.841	3.000	0.000	NA		NA
3812901	3812902	SpyM51068	SpyM51069			TRUE	0.861	12.000	0.000	NA		NA
3812902	3812903	SpyM51069	SpyM51070			FALSE	0.155	128.000	0.000	NA		NA
3812904	3812905	SpyM51071	SpyM51072	rmlB	rmlC	TRUE	0.506	244.000	0.350	1.000	Y	NA
3812905	3812906	SpyM51072	SpyM51073	rmlC	rmlA	TRUE	0.970	0.000	0.149	1.000	Y	NA
3812906	3812907	SpyM51073	SpyM51074	rmlA		TRUE	0.422	58.000	0.059	1.000	N	NA
3812907	3812908	SpyM51074	SpyM51075			TRUE	0.721	40.000	0.021	NA		NA
3812908	3812909	SpyM51075	SpyM51076			TRUE	0.982	-10.000	0.283	NA		NA
3812909	3812910	SpyM51076	SpyM51077		nth	TRUE	0.398	72.000	0.006	NA		NA
3812910	3812911	SpyM51077	SpyM51078	nth		TRUE	0.958	-3.000	0.007	NA	Y	NA
3812911	3812912	SpyM51078	SpyM51079		apt	FALSE	0.242	81.000	0.005	NA	N	NA
3812912	3812913	SpyM51079	SpyM51080	apt		FALSE	0.184	150.000	0.128	1.000	N	NA
3812913	3812914	SpyM51080	SpyM51081			TRUE	0.894	-3.000	0.016	1.000		NA
3812914	3812915	SpyM51081	SpyM51082		rnz	TRUE	0.908	0.000	0.074	1.000		NA
3812915	3812916	SpyM51082	SpyM51083	rnz		TRUE	0.891	15.000	0.022	1.000		NA
3812916	3812917	SpyM51083	SpyM51084			TRUE	0.910	-7.000	0.014	1.000		NA
3812917	3812918	SpyM51084	SpyM51085		miaA	TRUE	0.396	73.000	0.027	1.000		NA
3812920	3812921	SpyM51087	SpyM51088			FALSE	0.073	237.000	0.056	1.000	N	NA
3812921	3812922	SpyM51088	SpyM51089			TRUE	0.509	49.000	0.000	NA		NA
3812922	3812923	SpyM51089	SpyM51090			FALSE	0.337	71.000	0.000	NA		NA
3812925	3812926	SpyM5t55	SpyM51092		rpsA	FALSE	0.184	113.000	0.000	NA		NA
3812926	3812927	SpyM51092	SpyM5t56	rpsA		FALSE	0.158	127.000	0.000	NA		NA
3812927	3812928	SpyM5t56	SpyM5t57			TRUE	0.472	51.000	0.000	NA		NA
3812928	3812929	SpyM5t57	SpyM51093			TRUE	0.402	61.000	0.000	NA		NA
3812929	3812930	SpyM51093	SpyM51094			TRUE	0.604	61.000	0.095	NA		NA
3812930	3812931	SpyM51094	SpyM51095		parC	FALSE	0.199	120.000	0.086	1.000	N	NA
3812931	3812932	SpyM51095	SpyM51096	parC		FALSE	0.142	198.000	0.018	NA		NA
3812932	3812933	SpyM51096	SpyM51097		parE	TRUE	0.482	67.000	0.025	NA		NA
3812935	3812936	SpyM51099	SpyM51100	pyrC	ung	FALSE	0.107	132.000	0.009	1.000	N	NA
3812936	3812937	SpyM51100	SpyM51101	ung		FALSE	0.129	133.000	0.025	1.000	N	NA
3812937	3812938	SpyM51101	SpyM51102			TRUE	0.975	29.000	0.125	0.034	Y	NA
3812938	3812939	SpyM51102	SpyM51103			FALSE	0.322	118.000	0.182	1.000	N	NA
3812939	3812940	SpyM51103	SpyM51104		pyrE	FALSE	0.040	197.000	0.000	1.000	N	NA
3812940	3812941	SpyM51104	SpyM51105	pyrE	pyrF	TRUE	0.788	58.000	0.133	1.000	Y	NA
3812941	3812942	SpyM51105	SpyM51106	pyrF		FALSE	0.058	277.000	0.000	NA		NA
3812944	3812945	SpyM51108	SpyM51109		deoD	TRUE	0.890	-7.000	0.000	NA		NA
3812945	3812946	SpyM51109	SpyM51110	deoD	punA	FALSE	0.341	663.000	0.040	0.001	Y	NA
3812946	3812947	SpyM51110	SpyM51111	punA		TRUE	0.936	-16.000	0.108	1.000	N	NA
3812947	3812948	SpyM51111	SpyM51112		deoB	TRUE	0.874	19.000	0.108	1.000	N	NA
3812948	3812949	SpyM51112	SpyM51113	deoB	rpiA	TRUE	0.599	77.000	0.018	1.000	Y	NA
3812951	3812952	SpyM51115	SpyM51116		engB	FALSE	0.163	148.000	0.004	NA		NA
3812952	3812953	SpyM51116	SpyM51117	engB	clpX	TRUE	0.896	10.000	0.043	1.000		NA
3812953	3812954	SpyM51117	SpyM51118	clpX		FALSE	0.209	130.000	0.012	NA		NA
3812954	3812955	SpyM51118	SpyM51119		dfrB	TRUE	0.889	20.000	0.030	NA		NA
3812955	3812956	SpyM51119	SpyM51120	dfrB	thyA	TRUE	0.619	80.000	0.295	1.000	N	NA
3812957	3812958	SpyM51121	SpyM51122	mvaS	mvaA	TRUE	0.986	-13.000	0.183	1.000	Y	NA
3812959	3812960	SpyM51123	SpyM51124	fni	mvaK2	TRUE	0.929	-13.000	0.097	1.000	N	NA
3812960	3812961	SpyM51124	SpyM51125	mvaK2	mvaD	TRUE	0.997	-7.000	0.312	0.004	Y	NA
3812961	3812962	SpyM51125	SpyM51126	mvaD	mvaK1	TRUE	0.998	-18.000	0.281	0.003	Y	NA
3812962	3812963	SpyM51126	SpyM51127	mvaK1		FALSE	0.021	294.000	0.000	1.000	N	NA
3812963	3812964	SpyM51127	SpyM51128			TRUE	0.993	9.000	0.533	1.000	Y	NA
3812964	3812965	SpyM51128	SpyM51129			TRUE	0.992	3.000	0.800	1.000		NA
3812967	3812968	SpyM51131	SpyM51132	fms		FALSE	0.065	256.000	0.000	NA		NA
3812970	3812971	SpyM51133	SpyM51134		cca	TRUE	0.910	-3.000	0.056	1.000		NA
3812971	3812972	SpyM51134	SpyM51135	cca		FALSE	0.211	125.000	0.009	NA		NA
3812972	3812973	SpyM51135	SpyM51136			TRUE	0.941	0.000	0.139	NA		NA
3812973	3812974	SpyM51136	SpyM51138			FALSE	0.078	228.000	0.000	NA		NA
3812974	3812975	SpyM51138	SpyM51139			FALSE	0.077	229.000	0.000	NA		NA
3812976	3812977	SpyM51141	SpyM51142		speJ	TRUE	0.863	14.000	0.000	NA		NA
3812977	3812978	SpyM51142	SpyM51143	speJ		FALSE	0.072	240.000	0.000	NA		NA
3812979	3812980	SpyM51144	SpyM51145		mur1.1	TRUE	0.882	151.000	0.333	0.002	Y	NA
3812980	3812981	SpyM51145	SpyM51146	mur1.1	fruA	FALSE	0.204	93.000	0.022	1.000	N	NA
3812981	3812982	SpyM51146	SpyM51147	fruA	fruB	TRUE	0.997	-3.000	0.816	1.000	Y	NA
3812982	3812983	SpyM51147	SpyM51148	fruB		TRUE	0.996	-3.000	0.721	1.000	Y	NA
3812983	3812984	SpyM51148	SpyM51149			FALSE	0.027	256.000	0.000	1.000	N	NA
3812984	3812985	SpyM51149	SpyM51150			TRUE	0.979	13.000	0.333	NA		NA
3812985	3812986	SpyM51150	SpyM51151			FALSE	0.191	178.000	0.059	NA		NA
3812986	3812987	SpyM51151	SpyM51152		trmD	TRUE	0.787	0.000	0.007	1.000	N	NA
3812987	3812988	SpyM51152	SpyM51153	trmD	rimM	TRUE	0.997	-10.000	0.672	1.000	Y	NA
3812988	3812989	SpyM51153	SpyM51154	rimM		FALSE	0.035	215.000	0.000	1.000	N	NA
3812991	3812992	SpyM51156	SpyM51157			TRUE	0.944	20.000	0.200	1.000		NA
3812992	3812993	SpyM51157	SpyM51158			FALSE	0.021	932.000	0.000	1.000		NA
3812993	3812994	SpyM51158	SpyM51159		rpsP	TRUE	0.978	10.000	0.385	1.000		NA
3812994	3812995	SpyM51159	SpyM51160	rpsP		FALSE	0.098	127.000	0.003	1.000	N	NA
3812995	3812996	SpyM51160	SpyM51161			FALSE	0.027	254.000	0.000	1.000	N	NA
3812996	3812997	SpyM51161	SpyM51162			TRUE	0.997	12.000	0.923	1.000	Y	NA
3812997	3812998	SpyM51162	SpyM51163			TRUE	0.989	24.000	0.923	1.000	N	NA
3812998	3812999	SpyM51163	SpyM51164		carB	FALSE	0.072	208.000	0.017	1.000	N	NA
3812999	3813000	SpyM51164	SpyM51165	carB	carA	TRUE	0.631	246.000	0.117	0.001	Y	NA
3813000	3813001	SpyM51165	SpyM51166	carA	pyrB	TRUE	0.814	44.000	0.014	1.000	Y	NA
3813001	3813002	SpyM51166	SpyM51167	pyrB	pyrP	TRUE	0.728	61.000	0.064	1.000	Y	NA
3813002	3813003	SpyM51167	SpyM51168	pyrP	pyrR	TRUE	0.969	16.000	0.140	1.000	Y	NA
3813003	3813004	SpyM51168	SpyM51169	pyrR		FALSE	0.034	396.000	0.048	1.000	N	NA
3813004	3813005	SpyM51169	SpyM51170		lsp	TRUE	0.917	-10.000	0.082	1.000	N	NA
3813005	3813006	SpyM51170	SpyM51171	lsp		TRUE	0.906	-3.000	0.119	1.000	N	NA
3813006	3813007	SpyM51171	SpyM51172		rpmA	FALSE	0.017	349.000	0.000	1.000	N	NA
3813007	3813008	SpyM51172	SpyM51173	rpmA		TRUE	0.962	28.000	0.203	NA	Y	NA
3813008	3813009	SpyM51173	SpyM51174		rplU	TRUE	0.982	12.000	0.208	NA	Y	NA
3813009	3813010	SpyM51174	SpyM51175	rplU		FALSE	0.035	214.000	0.000	1.000	N	NA
3813010	3813011	SpyM51175	SpyM51176		thiI	FALSE	0.112	137.000	0.014	1.000	N	NA
3813011	3813012	SpyM51176	SpyM51177	thiI		TRUE	0.969	12.000	0.349	1.000	N	NA
3813013	3813014	SpyM51178	SpyM51179		folC2	TRUE	0.941	30.000	0.308	NA		NA
3813015	3813016	SpyM51180	SpyM51181	gor		FALSE	0.109	221.000	0.010	NA		NA
3813016	3813017	SpyM51181	SpyM51182		aroC	TRUE	0.466	61.000	0.005	NA		NA
3813017	3813018	SpyM51182	SpyM51183	aroC	aroD	TRUE	0.791	94.000	0.004	0.003	Y	NA
3813018	3813019	SpyM51183	SpyM51184	aroD		TRUE	0.935	-3.000	0.125	1.000		NA
3813021	3813022	SpyM51186	SpyM51187	rplT	rpmI	TRUE	0.991	59.000	0.928	0.026	Y	NA
3813022	3813023	SpyM51187	SpyM51188	rpmI	infC	TRUE	0.978	42.000	0.652	1.000	Y	NA
3813023	3813024	SpyM51188	SpyM51189	infC	cmk	FALSE	0.087	162.000	0.010	1.000	N	NA
3813024	3813025	SpyM51189	SpyM51190	cmk		TRUE	0.878	15.000	0.012	1.000		NA
3813027	3813028	SpyM51191	SpyM51192		pepT	TRUE	0.734	41.000	0.051	NA		NA
3813028	3813029	SpyM51192	SpyM51193	pepT		FALSE	0.229	94.000	0.000	NA		NA
3813029	3813030	SpyM51193	SpyM51194			TRUE	0.968	-7.000	0.182	NA		NA
3813030	3813031	SpyM51194	SpyM51195			TRUE	0.931	-7.000	0.027	NA		NA
3813031	3813032	SpyM51195	SpyM51196			TRUE	0.987	2.000	0.568	NA		NA
3813032	3813033	SpyM51196	SpyM51197			FALSE	0.255	179.000	0.000	NA	Y	NA
3813033	3813034	SpyM51197	SpyM51198			TRUE	0.948	-3.000	0.000	NA	Y	NA
3813034	3813035	SpyM51198	SpyM51199			TRUE	0.982	-3.000	0.385	NA		NA
3813035	3813036	SpyM51199	SpyM51200			TRUE	0.774	25.000	0.000	NA		NA
3813036	3813037	SpyM51200	SpyM51201			TRUE	0.695	0.000	0.000	1.000	N	NA
3813037	3813038	SpyM51201	SpyM51202			TRUE	0.970	3.000	0.289	NA		NA
3813038	3813039	SpyM51202	SpyM51203			TRUE	0.982	-10.000	0.289	NA		NA
3813039	3813040	SpyM51203	SpyM51205		rmlD	FALSE	0.170	119.000	0.000	NA		NA
3813040	3813041	SpyM51205	SpyM51206	rmlD		FALSE	0.141	138.000	0.000	NA		NA
3813041	3813042	SpyM51206	SpyM51207		rpoD	FALSE	0.123	237.000	0.044	NA		NA
3813042	3813043	SpyM51207	SpyM51208	rpoD	dnaG	TRUE	0.941	9.000	0.209	1.000	N	NA
3813045	3813046	SpyM51210	SpyM51211	rpsU		FALSE	0.177	141.000	0.027	1.000		NA
3813046	3813047	SpyM51211	SpyM51212		addA	FALSE	0.060	140.000	0.000	1.000	N	NA
3813047	3813048	SpyM51212	SpyM51213	addA	addB	TRUE	0.986	-3.000	0.070	0.054	Y	NA
3813050	3813051	SpyM51215	SpyM51216			TRUE	0.959	10.000	0.222	1.000		NA
3813051	3813052	SpyM51216	SpyM51217			FALSE	0.324	73.000	0.000	NA		NA
3813052	3813053	SpyM51217	SpyM51218			TRUE	0.915	-7.000	0.006	NA		NA
3813053	3813054	SpyM51218	SpyM51219		pheT	FALSE	0.117	110.000	0.002	1.000	N	NA
3813054	3813055	SpyM51219	SpyM51220	pheT	pheS	TRUE	0.910	210.000	0.574	0.001	Y	NA
3813055	3813056	SpyM51220	SpyM51221	pheS	endA	FALSE	0.056	283.000	0.000	NA		NA
3813056	3813057	SpyM51221	SpyM51223	endA	epuA	TRUE	0.640	36.000	0.000	NA		NA
3813057	3813058	SpyM51223	SpyM51224	epuA	murA1	TRUE	0.929	4.000	0.110	NA		NA
3813058	3813059	SpyM51224	SpyM51225	murA1		TRUE	0.772	65.000	0.279	NA		NA
3813059	3813060	SpyM51225	SpyM51226		atpC	FALSE	0.102	266.000	0.039	NA		NA
3813060	3813061	SpyM51226	SpyM51227	atpC	atpD	TRUE	0.999	13.000	0.837	0.008	Y	NA
3813061	3813062	SpyM51227	SpyM51228	atpD	atpG	TRUE	0.946	163.000	0.724	0.008	Y	NA
3813062	3813063	SpyM51228	SpyM51229	atpG	atpA	TRUE	0.999	19.000	0.846	0.008	Y	NA
3813063	3813064	SpyM51229	SpyM51230	atpA	atpH	TRUE	0.999	16.000	0.864	0.008	Y	NA
3813064	3813065	SpyM51230	SpyM51231	atpH	atpF	TRUE	0.994	0.000	0.222	0.008	Y	NA
3813065	3813066	SpyM51231	SpyM51232	atpF	atpB	TRUE	0.986	18.000	0.032	0.010	Y	NA
3813066	3813067	SpyM51232	SpyM51233	atpB	atpE	TRUE	0.960	35.000	0.189	0.010		NA
3813067	3813068	SpyM51233	SpyM51234	atpE		FALSE	0.029	392.000	0.000	1.000		NA
3813068	3813069	SpyM51234	SpyM51235		ligA	TRUE	0.825	14.000	0.013	1.000	N	NA
3813069	3813070	SpyM51235	SpyM51236	ligA		FALSE	0.133	194.000	0.010	NA		NA
3813070	3813071	SpyM51236	SpyM51237			FALSE	0.058	278.000	0.000	NA		NA
3813073	3813074	SpyM51239	SpyM51240	sagI	sagH	TRUE	0.993	-3.000	0.160	0.007	Y	NA
3813074	3813075	SpyM51240	SpyM51241	sagH	sagG	TRUE	0.980	9.000	0.500	1.000	N	NA
3813075	3813076	SpyM51241	SpyM51242	sagG	sagF	TRUE	0.989	23.000	0.750	NA		NA
3813076	3813077	SpyM51242	SpyM51243	sagF	sagE	TRUE	0.993	-3.000	0.750	NA		NA
3813077	3813078	SpyM51243	SpyM51244	sagE		TRUE	0.970	-25.000	0.136	NA		NA
3813078	3813079	SpyM51244	SpyM51245		sagC	TRUE	0.969	20.000	0.318	NA		NA
3813079	3813080	SpyM51245	SpyM51246	sagC	sagB	TRUE	0.964	-3.000	0.200	NA		NA
3813080	3813081	SpyM51246	SpyM51247	sagB		FALSE	0.079	222.000	0.000	NA		NA
3813081	3813082	SpyM51247	SpyM51248		eno	FALSE	0.028	770.000	0.000	NA		NA
3813084	3813085	SpyM51250	SpyM51251	ezrA	gyrB	FALSE	0.029	368.000	0.011	1.000	N	NA
3813085	3813086	SpyM51251	SpyM51252	gyrB		TRUE	0.870	1.000	0.013	1.000		NA
3813088	3813089	SpyM5t58	SpyM51253		rplS	FALSE	0.070	247.000	0.000	NA		NA
3813089	3813090	SpyM51253	SpyM51254	rplS		FALSE	0.121	115.000	0.006	1.000	N	NA
3813090	3813091	SpyM51254	SpyM51255			TRUE	0.911	-7.000	0.094	1.000	N	NA
3813091	3813092	SpyM51255	SpyM51256			FALSE	0.211	175.000	0.167	1.000	N	NA
3813093	3813094	SpyM51257	SpyM51258		rpmE2	FALSE	0.226	115.000	0.020	1.000		NA
3813095	3813096	SpyM51259	SpyM51260	agaS		TRUE	0.913	20.000	0.178	1.000	N	NA
3813096	3813097	SpyM51260	SpyM51261		adcA	FALSE	0.150	157.000	0.091	1.000	N	NA
3813097	3813098	SpyM51261	SpyM51262	adcA	pepD	FALSE	0.127	152.000	0.000	NA		NA
3813099	3813100	SpyM51263	SpyM51264		speC	FALSE	0.152	111.000	0.000	1.000		NA
3813101	3813102	SpyM51265	SpyM51266			FALSE	0.177	116.000	0.000	NA		NA
3813102	3813103	SpyM51266	SpyM51267			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3813103	3813104	SpyM51267	SpyM51268			TRUE	0.856	10.000	0.000	NA		NA
3813104	3813105	SpyM51268	SpyM51269			TRUE	0.841	3.000	0.000	NA		NA
3813105	3813106	SpyM51269	SpyM51270			TRUE	0.861	12.000	0.000	NA		NA
3813106	3813107	SpyM51270	SpyM51271			TRUE	0.996	13.000	1.000	NA		NA
3813107	3813108	SpyM51271	SpyM51272			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3813108	3813109	SpyM51272	SpyM51273			TRUE	0.964	-3.000	0.200	NA		NA
3813109	3813110	SpyM51273	SpyM51274			TRUE	0.991	0.000	0.667	NA		NA
3813110	3813111	SpyM51274	SpyM51275			TRUE	0.992	13.000	0.667	NA		NA
3813111	3813112	SpyM51275	SpyM51276			TRUE	0.990	30.000	1.000	NA		NA
3813112	3813113	SpyM51276	SpyM51277			TRUE	0.858	53.000	0.333	NA		NA
3813113	3813114	SpyM51277	SpyM51278			TRUE	0.991	16.000	0.667	NA		NA
3813114	3813115	SpyM51278	SpyM51279			TRUE	0.972	-3.000	0.250	NA		NA
3813115	3813116	SpyM51279	SpyM51280			TRUE	0.952	-3.000	0.150	NA		NA
3813116	3813117	SpyM51280	SpyM51281			TRUE	0.975	-3.000	0.286	NA		NA
3813117	3813118	SpyM51281	SpyM51282			TRUE	0.841	3.000	0.000	NA		NA
3813118	3813119	SpyM51282	SpyM51283			TRUE	0.863	14.000	0.000	NA		NA
3813119	3813120	SpyM51283	SpyM51284			TRUE	0.774	25.000	0.000	NA		NA
3813120	3813121	SpyM51284	SpyM51285			TRUE	0.920	-22.000	0.000	NA		NA
3813121	3813122	SpyM51285	SpyM51286			TRUE	0.668	34.000	0.000	NA		NA
3813122	3813123	SpyM51286	SpyM51286A			TRUE	0.890	-7.000	0.000	NA		NA
3813123	3813124	SpyM51286A	SpyM51287			TRUE	0.983	-3.000	0.400	NA		NA
3813124	3813125	SpyM51287	SpyM51288			TRUE	0.846	1.000	0.000	NA		NA
3813125	3813126	SpyM51288	SpyM51289			TRUE	0.841	3.000	0.000	NA		NA
3813126	3813127	SpyM51289	SpyM51290			FALSE	0.245	171.000	0.111	NA		NA
3813128	3813129	SpyM51292	SpyM51293			TRUE	0.841	52.000	0.294	NA		NA
3813130	3813131	SpyM51294	SpyM51295			FALSE	0.030	583.000	0.000	NA		NA
3813131	3813132	SpyM51295	SpyM51296			FALSE	0.061	270.000	0.000	NA		NA
3813132	3813133	SpyM51296	SpyM51297			TRUE	0.851	0.000	0.000	NA		NA
3813133	3813134	SpyM51297	SpyM51297A			TRUE	0.866	13.000	0.000	NA		NA
3813134	3813135	SpyM51297A	SpyM51298			TRUE	0.902	-10.000	0.000	NA		NA
3813135	3813136	SpyM51298	SpyM51299			TRUE	0.843	4.000	0.000	NA		NA
3813136	3813137	SpyM51299	SpyM51300			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3813137	3813138	SpyM51300	SpyM51301			TRUE	0.856	10.000	0.000	NA		NA
3813138	3813139	SpyM51301	SpyM51302			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3813139	3813140	SpyM51302	SpyM51302A			TRUE	0.883	-6.000	0.000	NA		NA
3813140	3813141	SpyM51302A	SpyM51303			TRUE	0.910	-13.000	0.000	NA		NA
3813141	3813142	SpyM51303	SpyM51304			TRUE	0.892	-3.000	0.002	NA		NA
3813142	3813143	SpyM51304	SpyM51305			FALSE	0.113	177.000	0.000	NA		NA
3813143	3813144	SpyM51305	SpyM51306			TRUE	0.890	-7.000	0.000	NA		NA
3813144	3813145	SpyM51306	SpyM51307			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3813145	3813146	SpyM51307	SpyM51308			TRUE	0.851	0.000	0.000	NA		NA
3813146	3813147	SpyM51308	SpyM51309			TRUE	0.434	56.000	0.000	NA		NA
3813147	3813148	SpyM51309	SpyM51310			TRUE	0.855	9.000	0.000	NA		NA
3813148	3813149	SpyM51310	SpyM51310A			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3813149	3813150	SpyM51310A	SpyM51311			TRUE	0.947	-19.000	0.018	NA		NA
3813150	3813151	SpyM51311	SpyM51312			FALSE	0.183	159.000	0.018	NA		NA
3813151	3813152	SpyM51312	SpyM51313			FALSE	0.214	100.000	0.000	NA		NA
3813152	3813153	SpyM51313	SpyM51313A			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3813155	3813156	SpyM51316	SpyM51317			TRUE	0.447	49.000	0.000	1.000		NA
3813159	3813160	SpyM51320	SpyM51321			TRUE	0.856	10.000	0.000	NA		NA
3813160	3813161	SpyM51321	SpyM51322			FALSE	0.164	123.000	0.000	NA		NA
3813162	3813163	SpyM51323	SpyM51324			TRUE	0.986	-3.000	0.470	NA		NA
3813163	3813164	SpyM51324	SpyM51325			TRUE	0.967	-3.000	0.214	NA		NA
3813164	3813165	SpyM51325	SpyM51326		asnC	FALSE	0.035	414.000	0.000	NA		NA
3813165	3813166	SpyM51326	SpyM51327	asnC	aspC	TRUE	0.830	21.000	0.068	1.000	N	NA
3813166	3813167	SpyM51327	SpyM51328	aspC		FALSE	0.018	335.000	0.000	1.000	N	NA
3813167	3813168	SpyM51328	SpyM51329			FALSE	0.088	108.000	0.000	1.000	N	NA
3813170	3813171	SpyM51331	SpyM51332	ftsX	ftsE	TRUE	0.995	-16.000	0.431	1.000	Y	NA
3813171	3813172	SpyM51332	SpyM51333	ftsE	prfB	TRUE	0.832	19.000	0.053	1.000	N	NA
3813172	3813173	SpyM51333	SpyM51334	prfB		FALSE	0.254	69.000	0.006	1.000	N	NA
3813173	3813174	SpyM51334	SpyM51335			FALSE	0.023	645.000	0.000	1.000		NA
3813174	3813175	SpyM51335	SpyM51336		kgdA	FALSE	0.160	291.000	0.000	0.039		NA
3813175	3813176	SpyM51336	SpyM51337	kgdA		TRUE	0.972	5.000	0.167	1.000	Y	NA
3813176	3813177	SpyM51337	SpyM51338			TRUE	0.922	29.000	0.094	1.000	Y	NA
3813177	3813178	SpyM51338	SpyM51339		idnO	TRUE	0.896	25.000	0.197	1.000	N	NA
3813179	3813180	SpyM51340	SpyM51341		ugl	TRUE	0.925	0.000	0.120	1.000		NA
3813180	3813181	SpyM51341	SpyM51342	ugl	agaV	TRUE	0.863	36.000	0.200	1.000		NA
3813181	3813182	SpyM51342	SpyM51343	agaV	agaW	TRUE	0.999	19.000	0.933	0.018	Y	NA
3813182	3813183	SpyM51343	SpyM51344	agaW	agaD	TRUE	0.999	-13.000	0.933	0.018	Y	NA
3813183	3813184	SpyM51344	SpyM51345	agaD		TRUE	0.740	87.000	0.375	NA		NA
3813184	3813185	SpyM51345	SpyM51346			TRUE	0.898	64.000	0.562	NA		NA
3813186	3813187	SpyM51347	SpyM51348			FALSE	0.077	230.000	0.000	NA		NA
3813188	3813189	SpyM51349	SpyM51350			FALSE	0.330	72.000	0.000	NA		NA
3813189	3813190	SpyM51350	SpyM51351			FALSE	0.128	151.000	0.000	NA		NA
3813190	3813191	SpyM51351	SpyM51352		murM	TRUE	0.984	0.000	0.500	1.000		NA
3813191	3813192	SpyM51352	SpyM51353	murM	murN	TRUE	0.996	-13.000	0.200	0.009	Y	NA
3813193	3813194	SpyM51354	SpyM51355	tpiA	tuf	FALSE	0.044	240.000	0.003	1.000	N	NA
3813196	3813197	SpyM51357	SpyM51358	ftsW	ppc	FALSE	0.121	140.000	0.028	1.000	N	NA
3813198	3813199	SpyM51359	SpyM51360			TRUE	0.892	-7.000	0.059	1.000	N	NA
3813200	3813201	SpyM51361	SpyM51362			TRUE	0.989	-16.000	0.375	NA		NA
3813202	3813203	SpyM51363	SpyM5s06			FALSE	0.155	128.000	0.000	NA		NA
3813203	3813204	SpyM5s06	SpyM51364			TRUE	0.567	45.000	0.000	NA		NA
3813204	3813205	SpyM51364	SpyM51365			FALSE	0.308	91.000	0.010	NA		NA
3813205	3813206	SpyM51365	SpyM51366			FALSE	0.068	340.000	0.018	NA		NA
3813208	3813209	SpyM51368	SpyM51369	lysS		FALSE	0.143	136.000	0.000	NA		NA
3813210	3813211	SpyM51370	SpyM51371			FALSE	0.086	210.000	0.000	NA		NA
3813211	3813212	SpyM51371	SpyM51372			TRUE	0.871	102.000	0.156	0.002	Y	NA
3813214	3813215	SpyM51374	SpyM51375			TRUE	0.972	-7.000	0.206	NA		NA
3813215	3813216	SpyM51375	SpyM51376		lgt	TRUE	0.899	22.000	0.079	NA		NA
3813216	3813217	SpyM51376	SpyM51377	lgt	hprK	TRUE	0.981	-3.000	0.494	1.000	N	NA
3813217	3813218	SpyM51377	SpyM51378	hprK		FALSE	0.139	365.000	0.017	NA	Y	NA
3813218	3813219	SpyM51378	SpyM51379			TRUE	0.385	64.000	0.000	NA		NA
3813219	3813220	SpyM51379	SpyM51380			TRUE	0.910	-13.000	0.000	NA		NA
3813221	3813222	SpyM51381	SpyM51382			FALSE	0.272	148.000	0.114	NA		NA
3813222	3813223	SpyM51382	SpyM51383			TRUE	0.994	0.000	0.841	NA		NA
3813224	3813225	SpyM51384	SpyM51385	bglA		TRUE	0.984	19.000	0.318	1.000	Y	NA
3813225	3813226	SpyM51385	SpyM51386		licT	TRUE	0.961	2.000	0.259	1.000		NA
3813228	3813229	SpyM51388	SpyM51389	ftsY		TRUE	0.953	0.000	0.007	0.066		NA
3813229	3813230	SpyM51389	SpyM51390			TRUE	0.992	4.000	0.375	0.015		NA
3813231	3813232	SpyM51392	SpyM51393			TRUE	0.971	48.000	0.333	0.051	Y	NA
3813233	3813234	SpyM51394	SpyM51397			TRUE	0.866	13.000	0.000	NA		NA
3813234	3813235	SpyM51397	SpyM51398			TRUE	0.924	-75.000	0.000	NA		NA
3813235	3813236	SpyM51398	SpyM51401			TRUE	0.920	-22.000	0.000	NA		NA
3813236	3813237	SpyM51401	SpyM51403			FALSE	0.033	447.000	0.000	NA		NA
3813237	3813238	SpyM51403	SpyM51404			TRUE	0.597	42.000	0.000	NA		NA
3813238	3813239	SpyM51404	SpyM51405			FALSE	0.204	104.000	0.000	NA		NA
3813239	3813240	SpyM51405	SpyM51406			TRUE	0.978	19.000	0.400	NA		NA
3813240	3813241	SpyM51406	SpyM51407			TRUE	0.969	0.000	0.273	NA		NA
3813242	3813243	SpyM51408	SpyM51409			TRUE	0.982	0.000	0.429	NA		NA
3813243	3813244	SpyM51409	SpyM51410			TRUE	0.898	-9.000	0.000	NA		NA
3813244	3813245	SpyM51410	SpyM51411			FALSE	0.262	85.000	0.000	NA		NA
3813245	3813246	SpyM51411	SpyM51413			TRUE	0.902	-10.000	0.000	NA		NA
3813247	3813248	SpyM51414	SpyM51415			FALSE	0.262	85.000	0.000	NA		NA
3813248	3813249	SpyM51415	SpyM51416			TRUE	0.788	24.000	0.000	NA		NA
3813249	3813250	SpyM51416	SpyM51417			FALSE	0.036	402.000	0.000	NA		NA
3813250	3813251	SpyM51417	SpyM51418			TRUE	0.443	55.000	0.000	NA		NA
3813251	3813252	SpyM51418	SpyM51419			TRUE	0.890	-7.000	0.000	NA		NA
3813252	3813253	SpyM51419	SpyM51420			TRUE	0.856	10.000	0.000	NA		NA
3813253	3813254	SpyM51420	SpyM51421			TRUE	0.890	-7.000	0.000	NA		NA
3813254	3813255	SpyM51421	SpyM51422			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3813255	3813256	SpyM51422	SpyM51423		aroE.2	TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA	N	NA
3813258	3813259	SpyM51425	SpyM51426	smc	rnc	TRUE	0.890	1.000	0.120	1.000	N	NA
3813259	3813260	SpyM51426	SpyM51427	rnc	vicX	FALSE	0.033	443.000	0.002	1.000		NA
3813260	3813261	SpyM51427	SpyM51428	vicX	covS	TRUE	0.885	4.000	0.038	1.000		NA
3813261	3813262	SpyM51428	SpyM51429	covS	covR	TRUE	0.998	-7.000	0.597	0.046	Y	NA
3813262	3813263	SpyM51429	SpyM51430	covR		FALSE	0.171	162.000	0.013	NA		NA
3813263	3813264	SpyM51430	SpyM51431			FALSE	0.327	95.000	0.030	NA		NA
3813264	3813265	SpyM51431	SpyM51432			TRUE	0.997	-43.000	0.576	1.000	Y	NA
3813265	3813266	SpyM51432	SpyM51433			TRUE	0.957	-31.000	0.058	NA		NA
3813266	3813267	SpyM51433	SpyM51434		glpF2	TRUE	0.617	135.000	0.429	NA		NA
3813267	3813268	SpyM51434	SpyM51435	glpF2		TRUE	0.997	18.000	0.857	0.051		NA
3813268	3813269	SpyM51435	SpyM51436			TRUE	0.917	0.000	0.099	1.000		NA
3813269	3813270	SpyM51436	SpyM51437			TRUE	0.996	11.000	0.316	0.002	Y	NA
3813271	3813272	SpyM51438	SpyM51439			TRUE	0.985	15.000	0.625	1.000	N	NA
3813273	3813274	SpyM51440	SpyM51441			TRUE	0.904	2.000	0.042	NA		NA
3813274	3813275	SpyM51441	SpyM51442			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3813275	3813276	SpyM51442	SpyM51443		thrS	FALSE	0.158	141.000	0.012	1.000		NA
3813276	3813277	SpyM51443	SpyM5s07	thrS		FALSE	0.123	159.000	0.000	NA		NA
3813277	3813278	SpyM5s07	SpyM51444			TRUE	0.627	38.000	0.000	NA		NA
3813278	3813279	SpyM51444	SpyM51445			TRUE	0.997	2.000	0.413	0.009	Y	NA
3813279	3813280	SpyM51445	SpyM51446		alsA	FALSE	0.136	131.000	0.033	1.000	N	NA
3813281	3813282	SpyM51447	SpyM51448	pepQ		TRUE	0.501	49.000	0.053	1.000	N	NA
3813282	3813283	SpyM51448	SpyM51449		gloA	TRUE	0.832	11.000	0.019	1.000	N	NA
3813283	3813284	SpyM51449	SpyM51450	gloA	csbB	FALSE	0.128	145.000	0.012	NA	N	NA
3813284	3813285	SpyM51450	SpyM51451	csbB		FALSE	0.085	211.000	0.000	NA		NA
3813285	3813286	SpyM51451	SpyM51452			TRUE	0.995	0.000	0.939	NA		NA
3813286	3813287	SpyM51452	SpyM51453		pcp	TRUE	0.856	50.000	0.300	NA		NA
3813288	3813289	SpyM51454	SpyM51455		smpB	TRUE	0.931	6.000	0.000	1.000	Y	NA
3813289	3813290	SpyM51455	SpyM51456	smpB	rnr	TRUE	0.971	3.000	0.143	0.028	N	NA
3813290	3813291	SpyM51456	SpyM51457	rnr	secG	FALSE	0.241	94.000	0.064	1.000	N	NA
3813291	3813292	SpyM51457	SpyM51458A	secG	rpmG	TRUE	0.468	46.000	0.012	1.000	N	NA
3813292	3813293	SpyM51458A	SpyM51458	rpmG	pmrA	TRUE	0.827	-3.000	0.012	1.000	N	NA
3813293	3813294	SpyM51458	SpyM51459	pmrA		FALSE	0.180	122.000	0.007	1.000		NA
3813294	3813295	SpyM51459	SpyM51460		coaE	FALSE	0.080	190.000	0.000	1.000		NA
3813295	3813296	SpyM51460	SpyM51461	coaE	fpg	TRUE	0.877	-3.000	0.066	1.000	N	NA
3813296	3813297	SpyM51461	SpyM51462	fpg		FALSE	0.121	172.000	0.004	1.000		NA
3813298	3813299	SpyM51463	SpyM51464			FALSE	0.031	523.000	0.000	NA		NA
3813300	3813301	SpyM51465	SpyM51466			TRUE	0.567	45.000	0.000	NA		NA
3813301	3813302	SpyM51466	SpyM51467			FALSE	0.064	257.000	0.000	NA		NA
3813302	3813303	SpyM51467	SpyM51468			FALSE	0.110	179.000	0.000	NA		NA
3813303	3813304	SpyM51468	SpyM51469			TRUE	0.947	50.000	0.667	NA		NA
3813304	3813305	SpyM51469	SpyM51470			FALSE	0.052	294.000	0.000	NA		NA
3813305	3813306	SpyM51470	SpyM51471			TRUE	0.979	13.000	0.333	NA		NA
3813308	3813309	SpyM51474	SpyM51475			TRUE	0.987	15.000	0.500	NA		NA
3813311	3813312	SpyM51477	SpyM51478		era	TRUE	0.840	20.000	0.007	1.000		NA
3813312	3813313	SpyM51478	SpyM51479	era	dgk	FALSE	0.248	120.000	0.063	1.000		NA
3813313	3813314	SpyM51479	SpyM51480	dgk		TRUE	0.950	-19.000	0.035	NA		NA
3813314	3813315	SpyM51480	SpyM51481			FALSE	0.151	159.000	0.003	NA		NA
3813315	3813316	SpyM51481	SpyM51482			TRUE	0.500	46.000	0.005	NA	N	NA
3813316	3813317	SpyM51482	SpyM51483			FALSE	0.152	159.000	0.004	NA		NA
3813317	3813318	SpyM51483	SpyM51484			FALSE	0.047	315.000	0.000	NA		NA
3813318	3813319	SpyM51484	SpyM51485			FALSE	0.161	156.000	0.023	1.000		NA
3813319	3813320	SpyM51485	SpyM51486		msrA	TRUE	0.921	-3.000	0.080	1.000		NA
3813320	3813321	SpyM51486	SpyM51487	msrA		TRUE	0.427	73.000	0.016	NA		NA
3813321	3813322	SpyM51487	SpyM51488		frr	FALSE	0.258	109.000	0.012	NA		NA
3813322	3813323	SpyM51488	SpyM51489	frr	pyrH	TRUE	0.967	29.000	0.626	1.000	N	NA
3813323	3813324	SpyM51489	SpyM51490	pyrH	rplA	FALSE	0.026	322.000	0.002	1.000	N	NA
3813324	3813325	SpyM51490	SpyM51491	rplA	rplK	TRUE	0.971	106.000	0.838	0.032	Y	NA
3813329	3813330	SpyM51495	SpyM51496	mtsC	mtsB	TRUE	0.966	1.000	0.130	1.000	Y	NA
3813330	3813331	SpyM51496	SpyM51497	mtsB	mtsA	TRUE	0.765	64.000	0.135	1.000	Y	NA
3813333	3813334	SpyM51499	SpyM51500		mtn	FALSE	0.128	151.000	0.000	NA		NA
3813334	3813335	SpyM51500	SpyM51501	mtn		TRUE	0.893	20.000	0.041	NA		NA
3813335	3813336	SpyM51501	SpyM51502			TRUE	0.904	0.000	0.025	NA		NA
3813336	3813337	SpyM51502	SpyM51503		gcaD	TRUE	0.648	31.000	0.015	1.000	N	NA
3813337	3813338	SpyM51503	SpyM51504	gcaD		FALSE	0.070	174.000	0.002	1.000	N	NA
3813338	3813339	SpyM51504	SpyM51505			FALSE	0.035	333.000	0.000	1.000		NA
3813339	3813340	SpyM51505	SpyM51506		fabG	TRUE	0.429	76.000	0.067	1.000		NA
3813340	3813341	SpyM51506	SpyM51507	fabG		TRUE	0.994	-7.000	0.710	NA		NA
3813343	3813344	SpyM51509	SpyM51510			TRUE	0.585	43.000	0.000	NA		NA
3813346	3813347	SpyM51512	SpyM51513	nrdE	nrdI	TRUE	0.999	-33.000	1.000	NA	Y	NA
3813347	3813348	SpyM51513	SpyM51514	nrdI	nrdF	TRUE	0.994	4.000	0.643	NA	Y	NA
3813348	3813349	SpyM51514	SpyM51515	nrdF	metG	FALSE	0.013	495.000	0.000	1.000	N	NA
3813349	3813350	SpyM51515	SpyM51516	metG		FALSE	0.071	243.000	0.000	NA		NA
3813350	3813351	SpyM51516	SpyM51517			FALSE	0.206	103.000	0.000	NA		NA
3813351	3813352	SpyM51517	SpyM51518		cspA	FALSE	0.032	490.000	0.000	NA		NA
3813352	3813353	SpyM51518	SpyM51519	cspA	lctO	FALSE	0.049	266.000	0.000	1.000		NA
3813357	3813358	SpyM51523	SpyM51524			TRUE	0.799	27.000	0.005	NA		NA
3813358	3813359	SpyM51524	SpyM51525			TRUE	0.907	5.000	0.043	NA		NA
3813359	3813360	SpyM51525	SpyM51526			TRUE	0.890	-7.000	0.000	NA		NA
3813360	3813361	SpyM51526	SpyM51527		holB	TRUE	0.835	19.000	0.000	NA		NA
3813361	3813362	SpyM51527	SpyM51528	holB	tdk	TRUE	0.948	18.000	0.254	1.000	N	NA
3813362	3813363	SpyM51528	SpyM51529	tdk		FALSE	0.068	249.000	0.000	NA		NA
3813363	3813364	SpyM51529	SpyM51530		clpP	FALSE	0.061	495.000	0.065	NA		NA
3813364	3813365	SpyM51530	SpyM51531	clpP	upp	FALSE	0.055	224.000	0.010	1.000	N	NA
3813365	3813366	SpyM51531	SpyM51532	upp		FALSE	0.120	167.000	0.002	1.000		NA
3813367	3813368	SpyM51533	SpyM51534	murE	fhuC	FALSE	0.073	246.000	0.062	1.000	N	NA
3813368	3813369	SpyM51534	SpyM51535	fhuC	fhuD	TRUE	0.994	26.000	0.889	1.000	Y	NA
3813369	3813370	SpyM51535	SpyM51536	fhuD	fhuB	TRUE	0.976	11.000	0.179	1.000	Y	NA
3813370	3813371	SpyM51536	SpyM51537	fhuB	fhuG	TRUE	0.999	-3.000	0.857	0.031	Y	NA
3813372	3813373	SpyM51538	SpyM51539		ppaC	TRUE	0.412	76.000	0.015	NA		NA
3813373	3813374	SpyM51539	SpyM51540	ppaC	pflC	FALSE	0.130	131.000	0.023	1.000	N	NA
3813374	3813375	SpyM51540	SpyM51541	pflC		TRUE	0.421	78.000	0.028	NA		NA
3813375	3813376	SpyM51541	SpyM51542			FALSE	0.221	133.000	0.023	NA		NA
3813376	3813377	SpyM51542	SpyM51543			TRUE	0.936	39.000	0.408	NA		NA
3813377	3813378	SpyM51543	SpyM51544			FALSE	0.077	293.000	0.050	1.000		NA
3813378	3813379	SpyM51544	SpyM51545			TRUE	0.988	2.000	0.600	NA		NA
3813379	3813380	SpyM51545	SpyM5s08			FALSE	0.299	79.000	0.000	NA		NA
3813380	3813381	SpyM5s08	SpyM51546			FALSE	0.193	109.000	0.000	NA		NA
3813381	3813382	SpyM51546	SpyM51547			FALSE	0.136	178.000	0.002	NA		NA
3813382	3813383	SpyM51547	SpyM51548		rluB	TRUE	0.898	0.000	0.014	NA		NA
3813383	3813384	SpyM51548	SpyM51549	rluB	scpB	TRUE	0.410	121.000	0.224	NA	N	NA
3813384	3813385	SpyM51549	SpyM51550	scpB	scpA	TRUE	0.990	-3.000	0.570	NA		NA
3813385	3813386	SpyM51550	SpyM51551	scpA	xerD	TRUE	0.900	0.000	0.017	NA		NA
3813386	3813387	SpyM51551	SpyM51552	xerD		TRUE	0.931	-3.000	0.111	1.000		NA
3813387	3813388	SpyM51552	SpyM51553			TRUE	0.916	-3.000	0.065	1.000		NA
3813388	3813389	SpyM51553	SpyM51554			TRUE	0.954	-21.000	0.085	1.000		NA
3813389	3813390	SpyM51554	SpyM51555		glr	TRUE	0.855	-3.000	0.034	1.000	N	NA
3813390	3813391	SpyM51555	SpyM51556	glr		FALSE	0.161	178.000	0.014	NA		NA
3813391	3813392	SpyM51556	SpyM51557			FALSE	0.112	178.000	0.000	NA		NA
3813392	3813393	SpyM51557	SpyM51558			TRUE	0.940	15.000	0.123	NA		NA
3813393	3813394	SpyM51558	SpyM51559			TRUE	0.703	39.000	0.043	1.000		NA
3813395	3813396	SpyM51560	SpyM51561			TRUE	0.421	82.000	0.154	1.000	N	NA
3813397	3813398	SpyM51562	SpyM51563	greA		TRUE	0.502	73.000	0.079	NA		NA
3813398	3813399	SpyM51563	SpyM51564			FALSE	0.347	118.000	0.120	NA		NA
3813399	3813400	SpyM51564	SpyM51565		murC	TRUE	0.605	46.000	0.014	1.000		NA
3813400	3813401	SpyM51565	SpyM51566	murC		TRUE	0.703	40.000	0.013	NA		NA
3813401	3813402	SpyM51566	SpyM51567			FALSE	0.191	242.000	0.151	NA		NA
3813402	3813403	SpyM51567	SpyM51568		engA	FALSE	0.092	207.000	0.004	1.000		NA
3813403	3813404	SpyM51568	SpyM51569	engA	dnaI	TRUE	0.420	63.000	0.008	1.000		NA
3813404	3813405	SpyM51569	SpyM51570	dnaI		TRUE	0.997	1.000	0.817	NA	Y	NA
3813405	3813406	SpyM51570	SpyM51571			TRUE	0.944	-13.000	0.109	NA	N	NA
3813406	3813407	SpyM51571	SpyM51572		csrS	FALSE	0.072	215.000	0.007	NA	N	NA
3813407	3813408	SpyM51572	SpyM51573	csrS	csrR	TRUE	0.996	6.000	0.438	0.063	Y	NA
3813408	3813409	SpyM51573	SpyM51574	csrR		FALSE	0.089	267.000	0.014	NA		NA
3813409	3813410	SpyM51574	SpyM51575		htpX	FALSE	0.092	234.000	0.002	NA		NA
3813410	3813411	SpyM51575	SpyM51576	htpX		TRUE	0.839	47.000	0.222	NA		NA
3813412	3813413	SpyM51577	SpyM51578	gidB		FALSE	0.249	70.000	0.006	1.000	N	NA
3813413	3813414	SpyM51578	SpyM51579			TRUE	0.998	10.000	0.490	0.003	Y	NA
3813417	3813418	SpyM51582	SpyM51583			TRUE	0.997	1.000	0.938	1.000	Y	NA
3813418	3813419	SpyM51583	SpyM51584			FALSE	0.168	250.000	0.000	NA	Y	NA
3813419	3813420	SpyM51584	SpyM51585			FALSE	0.027	328.000	0.000	NA	N	NA
3813420	3813421	SpyM51585	SpyM51586			FALSE	0.091	203.000	0.000	NA		NA
3813421	3813422	SpyM51586	SpyM51587			FALSE	0.041	482.000	0.003	NA		NA
3813422	3813423	SpyM51587	SpyM51588			FALSE	0.136	254.000	0.094	NA		NA
3813423	3813424	SpyM51588	SpyM51589			TRUE	0.706	48.000	0.085	NA		NA
3813424	3813425	SpyM51589	SpyM51590			TRUE	0.917	24.000	0.149	NA		NA
3813425	3813426	SpyM51590	SpyM51591		nadD	TRUE	0.980	-3.000	0.199	1.000	Y	NA
3813426	3813427	SpyM51591	SpyM51592	nadD		TRUE	0.538	69.000	0.150	NA	N	NA
3813427	3813428	SpyM51592	SpyM51593			TRUE	0.864	26.000	0.068	NA		NA
3813428	3813429	SpyM51593	SpyM51594			TRUE	0.986	0.000	0.555	1.000		NA
3813429	3813430	SpyM51594	SpyM51595		comX2	FALSE	0.024	559.000	0.000	1.000		NA
3813430	3813431	SpyM51595	SpyM5t59	comX2		TRUE	0.882	-4.000	0.000	NA		NA
3813431	3813432	SpyM5t59	SpyM5t60			FALSE	0.290	80.000	0.000	NA		NA
3813432	3813433	SpyM5t60	SpyM5r16			TRUE	0.841	3.000	0.000	NA		NA
3813433	3813434	SpyM5r16	SpyM5r17			FALSE	0.272	83.000	0.000	NA		NA
3813434	3813435	SpyM5r17	SpyM5t61			FALSE	0.051	298.000	0.000	NA		NA
3813435	3813436	SpyM5t61	SpyM5r18			TRUE	0.489	50.000	0.000	NA		NA
3813436	3813437	SpyM5r18	SpyM51596			FALSE	0.038	386.000	0.000	NA		NA
3813438	3813439	SpyM51597	SpyM51598			TRUE	0.993	13.000	0.087	0.001	Y	NA
3813439	3813440	SpyM51598	SpyM51599			TRUE	0.983	13.000	0.022	0.049	Y	NA
3813441	3813442	SpyM51600A	SpyM51601		salR	FALSE	0.100	190.000	0.000	NA		NA
3813442	3813443	SpyM51601	SpyM51602	salR	salK	TRUE	0.998	-19.000	0.704	NA	Y	NA
3813443	3813444	SpyM51602	SpyM51603	salK	salY	TRUE	0.613	40.000	0.000	NA		NA
3813444	3813445	SpyM51603	SpyM51604	salY	salX	TRUE	0.807	2.000	0.000	1.000		NA
3813445	3813446	SpyM51604	SpyM51605	salX		TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		NA
3813446	3813447	SpyM51605	SpyM51606		salA	FALSE	0.266	84.000	0.000	NA		NA
3813447	3813448	SpyM51606	SpyM51607	salA	lacG	FALSE	0.025	504.000	0.000	1.000		NA
3813448	3813449	SpyM51607	SpyM51608	lacG	lacE	TRUE	0.443	88.000	0.000	1.000	Y	NA
3813449	3813450	SpyM51608	SpyM51609	lacE	lacF	TRUE	0.991	0.000	0.150	0.013	Y	NA
3813450	3813451	SpyM51609	SpyM51610	lacF	lacD2	TRUE	0.992	24.000	0.667	1.000	Y	NA
3813451	3813452	SpyM51610	SpyM51611	lacD2	lacC2	TRUE	0.984	4.000	0.000	0.002	Y	NA
3813452	3813453	SpyM51611	SpyM51612	lacC2	lacB2	TRUE	0.723	48.000	0.000	1.000	Y	NA
3813453	3813454	SpyM51612	SpyM51613	lacB2	lacA2	TRUE	0.954	35.000	0.000	0.003	Y	NA
3813457	3813458	SpyM51615	SpyM51616			TRUE	0.902	-10.000	0.000	NA		NA
3813458	3813459	SpyM51616	SpyM51617			FALSE	0.216	98.000	0.000	NA		NA
3813460	3813461	SpyM51619	SpyM51620	rpsI	rplM	TRUE	0.997	21.000	0.601	0.024	Y	NA
3813461	3813462	SpyM51620	SpyM51621	rplM		FALSE	0.034	218.000	0.000	1.000	N	NA
3813462	3813463	SpyM51621	SpyM51622			TRUE	0.922	-3.000	0.051	NA		NA
3813463	3813464	SpyM51622	SpyM51623			FALSE	0.143	136.000	0.000	NA		NA
3813464	3813465	SpyM51623	SpyM51624			FALSE	0.325	97.000	0.036	NA		NA
3813465	3813466	SpyM51624	SpyM51625			TRUE	0.929	4.000	0.109	NA		NA
3813466	3813467	SpyM51625	SpyM51626			TRUE	0.595	47.000	0.003	NA		NA
3813467	3813468	SpyM51626	SpyM51627			FALSE	0.097	196.000	0.000	NA		NA
3813468	3813469	SpyM51627	SpyM51628		cysS	TRUE	0.947	-7.000	0.129	1.000		NA
3813469	3813470	SpyM51628	SpyM51629	cysS		TRUE	0.778	28.000	0.002	NA		NA
3813470	3813471	SpyM51629	SpyM51630			TRUE	0.866	13.000	0.000	NA		NA
3813471	3813472	SpyM51630	SpyM51631		cysE	FALSE	0.075	236.000	0.000	NA		NA
3813472	3813473	SpyM51631	SpyM51632	cysE		TRUE	0.931	9.000	0.097	NA		NA
3813473	3813474	SpyM51632	SpyM51633		comR	TRUE	0.919	-7.000	0.009	NA		NA
3813474	3813475	SpyM51633	SpyM51634	comR		FALSE	0.024	280.000	0.000	1.000	N	NA
3813475	3813476	SpyM51634	SpyM51635		ulaA	TRUE	0.908	13.000	0.056	1.000		NA
3813476	3813477	SpyM51635	SpyM51636	ulaA		TRUE	0.977	27.000	0.241	0.021		NA
3813477	3813478	SpyM51636	SpyM51637			TRUE	0.975	-7.000	0.048	0.013	N	NA
3813478	3813479	SpyM51637	SpyM51638		rpsO	FALSE	0.017	352.000	0.000	1.000	N	NA
3813479	3813480	SpyM51638	SpyM51639	rpsO		FALSE	0.124	158.000	0.000	NA		NA
3813481	3813482	SpyM51640	SpyM51641		def	FALSE	0.211	101.000	0.000	NA		NA
3813483	3813484	SpyM51642	SpyM51643			TRUE	0.593	131.000	0.414	1.000		NA
3813484	3813485	SpyM51643	SpyM51644		polC	FALSE	0.163	110.000	0.020	1.000	N	NA
3813485	3813486	SpyM51644	SpyM51645	polC	drpA	FALSE	0.219	254.000	0.070	0.043	N	NA
3813486	3813487	SpyM51645	SpyM51646	drpA	eep	FALSE	0.117	198.000	0.095	1.000	N	NA
3813487	3813488	SpyM51646	SpyM51647	eep		FALSE	0.304	73.000	0.040	1.000	N	NA
3813488	3813489	SpyM51647	SpyM51648		uppS	TRUE	0.969	13.000	0.113	1.000	Y	NA
3813489	3813490	SpyM51648	SpyM51649	uppS	yajC	FALSE	0.071	219.000	0.007	NA	N	NA
3813490	3813491	SpyM51649	SpyM51650	yajC		FALSE	0.151	116.000	0.006	NA	N	NA
3813491	3813492	SpyM51650	SpyM51651			FALSE	0.082	142.000	0.000	NA	N	NA
3813492	3813493	SpyM51651	SpyM51652		dexB	TRUE	0.603	198.000	0.049	0.007	Y	NA
3813493	3813494	SpyM51652	SpyM51653	dexB	msmK	TRUE	0.542	129.000	0.171	1.000	Y	NA
3813494	3813495	SpyM51653	SpyM51654	msmK	lrp	FALSE	0.057	298.000	0.071	1.000	N	NA
3813497	3813498	SpyM51657	SpyM51658		relA	TRUE	0.930	15.000	0.177	1.000	N	NA
3813498	3813499	SpyM51658	SpyM51659	relA	scl	FALSE	0.057	240.000	0.000	1.000		NA
3813501	3813502	SpyM51661	SpyM51662			TRUE	0.842	83.000	0.610	1.000		NA
3813502	3813503	SpyM51662	SpyM51663			FALSE	0.042	355.000	0.000	NA		NA
3813503	3813504	SpyM51663	SpyM51664		prmA	TRUE	0.964	0.000	0.227	NA		NA
3813504	3813505	SpyM51664	SpyM51665	prmA		TRUE	0.434	71.000	0.013	NA		NA
3813506	3813507	SpyM51666	SpyM51667			FALSE	0.045	185.000	0.000	1.000	N	NA
3813507	3813508	SpyM51667	SpyM51668		trpG	TRUE	0.865	33.000	0.009	1.000	Y	NA
3813508	3813509	SpyM51668	SpyM51669	trpG		TRUE	0.654	33.000	0.035	1.000	N	NA
3813509	3813510	SpyM51669	SpyM5t62			FALSE	0.055	286.000	0.000	NA		NA
3813510	3813511	SpyM5t62	SpyM51670			FALSE	0.136	141.000	0.000	NA		NA
3813511	3813512	SpyM51670	SpyM51671			TRUE	0.382	55.000	0.000	1.000		NA
3813512	3813513	SpyM51671	SpyM51672		smeZ	FALSE	0.054	249.000	0.000	1.000		NA
3813513	3813514	SpyM51672	SpyM51673	smeZ	dppA	FALSE	0.022	729.000	0.000	1.000		NA
3813514	3813515	SpyM51673	SpyM51674	dppA	dppB	TRUE	0.642	113.000	0.000	0.030	Y	NA
3813515	3813516	SpyM51674	SpyM51675	dppB	dppC	TRUE	0.999	-3.000	1.000	0.030	Y	NA
3813516	3813517	SpyM51675	SpyM51676	dppC	dppD	TRUE	0.987	12.000	0.333	1.000	Y	NA
3813517	3813518	SpyM51676	SpyM51677	dppD	dppE	TRUE	0.999	-16.000	0.750	0.023	Y	NA
3813519	3813520	SpyM51678	SpyM51679			FALSE	0.118	169.000	0.000	NA		NA
3813520	3813521	SpyM51679	SpyM51680		lmb	TRUE	0.994	13.000	0.800	NA		NA
3813521	3813522	SpyM51680	SpyM51681	lmb	scpA	FALSE	0.050	263.000	0.000	1.000		NA
3813522	3813523	SpyM51681	SpyM51682	scpA	emm5	FALSE	0.171	369.000	0.000	0.006		NA
3813523	3813524	SpyM51682	SpyM51683	emm5	mga	FALSE	0.106	184.000	0.000	NA		NA
3813526	3813527	SpyM51685	SpyM51686		isp	TRUE	0.944	78.000	1.000	NA		NA
3813527	3813528	SpyM51686	SpyM51687	isp		TRUE	0.483	102.000	0.200	1.000		NA
3813528	3813529	SpyM51687	SpyM51688			TRUE	0.993	-3.000	0.500	1.000	Y	NA
3813529	3813530	SpyM51688	SpyM51689			TRUE	0.510	94.000	0.267	1.000	N	NA
3813530	3813531	SpyM51689	SpyM51690			TRUE	0.992	13.000	0.467	1.000	Y	NA
3813531	3813532	SpyM51690	SpyM51691			TRUE	0.985	-13.000	0.385	NA	N	NA
3813532	3813533	SpyM51691	SpyM51692			FALSE	0.202	424.000	0.333	NA		NA
3813533	3813534	SpyM51692	SpyM51693			FALSE	0.132	147.000	0.000	NA		NA
3813536	3813537	SpyM51695	SpyM51696	prsA2		TRUE	0.434	56.000	0.000	NA		NA
3813537	3813538	SpyM51696	SpyM51697			FALSE	0.198	107.000	0.000	NA		NA
3813538	3813539	SpyM51697	SpyM51698		speB	TRUE	0.971	2.000	0.000	0.001		NA
3813539	3813540	SpyM51698	SpyM51699	speB		FALSE	0.060	272.000	0.000	NA		NA
3813541	3813542	SpyM51700	SpyM51701		ropB	FALSE	0.056	284.000	0.000	NA		NA
3813545	3813546	SpyM51704	SpyM51705	gldA	fsa	TRUE	0.671	57.000	0.211	1.000	N	NA
3813546	3813547	SpyM51705	SpyM51706	fsa	pflD	TRUE	0.971	13.000	0.368	1.000	N	NA
3813547	3813548	SpyM51706	SpyM51707	pflD		FALSE	0.127	211.000	0.132	1.000	N	NA
3813548	3813549	SpyM51707	SpyM51708			TRUE	0.999	10.000	0.889	0.012	Y	NA
3813549	3813550	SpyM51708	SpyM51709			TRUE	0.998	28.000	0.889	0.012	Y	NA
3813550	3813551	SpyM51709	SpyM51710			FALSE	0.067	287.000	0.091	1.000	N	NA
3813551	3813552	SpyM51710	SpyM51711			TRUE	0.976	16.000	0.188	1.000	Y	NA
3813554	3813555	SpyM51713	SpyM51714	secE	rpmG	TRUE	0.881	14.000	0.080	1.000	N	NA
3813555	3813556	SpyM51714	SpyM51715	rpmG	pbp2A	TRUE	0.592	49.000	0.111	1.000	N	NA
3813556	3813557	SpyM51715	SpyM51716	pbp2A		TRUE	0.681	39.000	0.062	NA	N	NA
3813558	3813559	SpyM51716A	SpyM51717			TRUE	0.450	77.000	0.056	NA		NA
3813561	3813562	SpyM51719	SpyM51719A			FALSE	0.056	282.000	0.000	NA		NA
3813563	3813564	SpyM51720	SpyM51721		groEL	FALSE	0.069	248.000	0.000	NA		NA
3813564	3813565	SpyM51721	SpyM51722	groEL	groES	TRUE	0.976	36.000	0.160	0.006	Y	NA
3813565	3813566	SpyM51722	SpyM51723	groES	clpC	FALSE	0.309	178.000	0.036	1.000	Y	NA
3813566	3813567	SpyM51723	SpyM51724	clpC	ctsR	TRUE	0.941	0.000	0.188	NA	N	NA
3813567	3813568	SpyM51724	SpyM51725	ctsR	csp	FALSE	0.285	196.000	0.013	NA	Y	NA
3813568	3813569	SpyM51725	SpyM5t63	csp		FALSE	0.031	509.000	0.000	NA		NA
3813570	3813571	SpyM51726	SpyM51727	ahpC	ahpF	TRUE	0.991	21.000	0.551	1.000	Y	NA
3813573	3813574	SpyM51729	SpyM51730	hutU		TRUE	0.595	88.000	0.086	1.000	Y	NA
3813574	3813575	SpyM51730	SpyM51731			TRUE	0.971	11.000	0.143	1.000	Y	NA
3813575	3813576	SpyM51731	SpyM51732		fhs2	TRUE	0.828	18.000	0.038	1.000	N	NA
3813576	3813577	SpyM51732	SpyM51733	fhs2		TRUE	0.880	22.000	0.038	NA		NA
3813577	3813578	SpyM51733	SpyM51734			FALSE	0.145	220.000	0.062	NA		NA
3813578	3813579	SpyM51734	SpyM51735		hutH	TRUE	0.947	12.000	0.006	1.000	Y	NA
3813579	3813580	SpyM51735	SpyM51736	hutH	hutG	TRUE	0.574	186.000	0.000	0.002	Y	NA
3813581	3813582	SpyM51737	SpyM51738			TRUE	0.842	18.000	0.000	NA		NA
3813583	3813584	SpyM51739	SpyM51740	rpsB	tsf	TRUE	0.869	134.000	0.748	1.000	Y	NA
3813585	3813586	SpyM51741	SpyM51742	pepO	treA	FALSE	0.037	208.000	0.000	1.000	N	NA
3813586	3813587	SpyM51742	SpyM51743	treA		TRUE	0.944	67.000	0.650	1.000	Y	NA
3813590	3813591	SpyM51746	SpyM51747			TRUE	0.597	42.000	0.000	NA		NA
3813592	3813593	SpyM51748	SpyM51749	nrdG		TRUE	0.941	0.000	0.159	1.000		NA
3813593	3813594	SpyM51749	SpyM51750			TRUE	0.895	9.000	0.041	1.000		NA
3813594	3813595	SpyM51750	SpyM51751			TRUE	0.821	29.000	0.041	NA		NA
3813595	3813596	SpyM51751	SpyM51752		nrdD	FALSE	0.190	182.000	0.062	NA		NA
3813596	3813597	SpyM51752	SpyM51753	nrdD		FALSE	0.343	97.000	0.057	NA		NA
3813597	3813598	SpyM51753	SpyM51754			FALSE	0.035	413.000	0.000	NA		NA
3813598	3813599	SpyM51754	SpyM51755			TRUE	0.991	12.000	0.651	NA		NA
3813599	3813600	SpyM51755	SpyM51756			TRUE	0.989	-3.000	0.537	NA		NA
3813600	3813601	SpyM51756	SpyM51757		spxA	FALSE	0.276	113.000	0.032	NA		NA
3813601	3813602	SpyM51757	SpyM51758	spxA	recA	FALSE	0.033	291.000	0.004	1.000	N	NA
3813602	3813603	SpyM51758	SpyM51759	recA	cinA	TRUE	0.370	89.000	0.083	1.000		NA
3813603	3813604	SpyM51759	SpyM51760	cinA	tag	TRUE	0.384	69.000	0.011	1.000		NA
3813604	3813605	SpyM51760	SpyM51761	tag	ruvA	TRUE	0.949	10.000	0.012	1.000	Y	NA
3813605	3813606	SpyM51761	SpyM51762	ruvA	lmrP	TRUE	0.851	2.000	0.005	1.000		NA
3813606	3813607	SpyM51762	SpyM51763	lmrP	mutL	TRUE	0.866	11.000	0.006	1.000		NA
3813607	3813608	SpyM51763	SpyM51764	mutL		FALSE	0.224	95.000	0.000	NA		NA
3813608	3813609	SpyM51764	SpyM51765			FALSE	0.044	338.000	0.000	NA		NA
3813609	3813610	SpyM51765	SpyM51766			TRUE	0.761	26.000	0.000	NA		NA
3813610	3813611	SpyM51766	SpyM51767			FALSE	0.033	351.000	0.000	1.000		NA
3813612	3813613	SpyM51768	SpyM51769			FALSE	0.052	294.000	0.000	NA		NA
3813613	3813614	SpyM51769	SpyM51770			TRUE	0.991	0.000	0.667	NA		NA
3813614	3813615	SpyM51770	SpyM51771			TRUE	0.861	12.000	0.000	NA		NA
3813615	3813616	SpyM51771	SpyM51772			TRUE	0.841	3.000	0.000	NA		NA
3813616	3813617	SpyM51772	SpyM51773			TRUE	0.992	1.000	0.714	NA		NA
3813617	3813618	SpyM51773	SpyM51774			TRUE	0.986	20.000	0.571	NA		NA
3813618	3813619	SpyM51774	SpyM51774A			FALSE	0.047	314.000	0.000	NA		NA
3813619	3813620	SpyM51774A	SpyM51774B			TRUE	0.995	6.000	1.000	NA		NA
3813620	3813621	SpyM51774B	SpyM51775			FALSE	0.211	101.000	0.000	NA		NA
3813621	3813622	SpyM51775	SpyM51776			FALSE	0.318	74.000	0.000	NA		NA
3813622	3813623	SpyM51776	SpyM51777			FALSE	0.035	404.000	0.000	NA		NA
3813623	3813624	SpyM51777	SpyM51778			TRUE	0.922	-25.000	0.000	NA		NA
3813624	3813625	SpyM51778	SpyM51779			FALSE	0.092	202.000	0.000	NA		NA
3813626	3813627	SpyM51780	SpyM51781	mutS		TRUE	0.945	-13.000	0.031	NA		NA
3813627	3813628	SpyM51781	SpyM51782		argR	FALSE	0.220	143.000	0.054	NA		NA
3813629	3813630	SpyM51783	SpyM51784	argS		FALSE	0.363	88.000	0.032	NA		NA
3813631	3813632	SpyM51785	SpyM51786			TRUE	0.964	43.000	0.667	NA		NA
3813632	3813633	SpyM51786	SpyM51787			TRUE	0.939	20.000	0.156	NA		NA
3813633	3813634	SpyM51787	SpyM51788		aspS	TRUE	0.927	-7.000	0.016	NA		NA
3813634	3813635	SpyM51788	SpyM51789	aspS	hisS	TRUE	0.432	338.000	0.161	0.041	Y	NA
3813636	3813637	SpyM51790	SpyM51791	rpmF	rpmG	TRUE	0.983	16.000	0.012	0.030	Y	NA
3813637	3813638	SpyM51791	SpyM51792	rpmG	cadD	FALSE	0.033	281.000	0.000	NA	N	NA
3813638	3813639	SpyM51792	SpyM51793	cadD	cadC	TRUE	0.994	12.000	0.875	NA	N	NA
3813639	3813640	SpyM51793	SpyM51794	cadC		TRUE	0.800	23.000	0.000	NA		NA
3813640	3813641	SpyM51794	SpyM51795			FALSE	0.366	66.000	0.000	NA		NA
3813641	3813642	SpyM51795	SpyM51796			TRUE	0.997	-10.000	1.000	NA		NA
3813643	3813644	SpyM51797	SpyM51798			FALSE	0.355	68.000	0.000	NA		NA
3813647	3813648	SpyM51800A	SpyM51801			TRUE	0.984	-13.000	0.300	NA		NA
3813648	3813649	SpyM51801	SpyM51802			TRUE	0.981	-3.000	0.350	NA		NA
3813652	3813653	SpyM51805	SpyM51806	rpsD	veg	FALSE	0.028	729.000	0.000	NA		NA
3813653	3813654	SpyM51806	SpyM51807	veg	dnaC	TRUE	0.903	17.000	0.030	NA		NA
3813654	3813655	SpyM51807	SpyM51808	dnaC	rplI	TRUE	0.767	30.000	0.100	1.000	N	NA
3813655	3813656	SpyM51808	SpyM51809	rplI		TRUE	0.906	-3.000	0.119	1.000	N	NA
3813656	3813657	SpyM51809	SpyM51810		gidA	FALSE	0.183	90.000	0.011	1.000	N	NA
3813657	3813658	SpyM51810	SpyM51811	gidA		TRUE	0.458	53.000	0.000	NA		NA
3813658	3813659	SpyM51811	SpyM51812		trmU	FALSE	0.028	707.000	0.000	NA		NA
3813660	3813661	SpyM51813	SpyM51814	sdhB	sdhA	TRUE	0.996	12.000	0.221	0.001	Y	NA
3813662	3813663	SpyM51815	SpyM51816			FALSE	0.031	371.000	0.000	1.000		NA
3813663	3813664	SpyM51816	SpyM51817			TRUE	0.977	-7.000	0.136	1.000	Y	NA
3813664	3813665	SpyM51817	SpyM51818			TRUE	0.999	-24.000	0.713	0.022	Y	NA
3813665	3813666	SpyM51818	SpyM51819		pgsA	TRUE	0.807	2.000	0.015	1.000	N	NA
3813666	3813667	SpyM51819	SpyM51820	pgsA		TRUE	0.916	14.000	0.077	1.000		NA
3813667	3813668	SpyM51820	SpyM51821			TRUE	0.721	50.000	0.156	1.000		NA
3813668	3813669	SpyM51821	SpyM51822			TRUE	0.998	2.000	0.872	0.004		NA
3813669	3813670	SpyM51822	SpyM51823			FALSE	0.062	265.000	0.000	NA		NA
3813671	3813672	SpyM51824	SpyM51825	hasA	hasB	TRUE	0.867	36.000	0.048	1.000	Y	NA
3813672	3813673	SpyM51825	SpyM51826	hasB	hasC1	FALSE	0.222	182.000	0.000	1.000	Y	NA
3813673	3813674	SpyM51826	SpyM51827	hasC1		FALSE	0.038	308.000	0.000	1.000		NA
3813674	3813675	SpyM51827	SpyM51828		recF	TRUE	0.953	2.000	0.209	1.000		NA
3813676	3813677	SpyM51829	SpyM51830		guaB	FALSE	0.038	203.000	0.000	1.000	N	NA
3813677	3813678	SpyM51830	SpyM51831	guaB	trpS	FALSE	0.028	308.000	0.002	1.000	N	NA
3813678	3813679	SpyM51831	SpyM5s09	trpS		TRUE	0.774	25.000	0.000	NA		NA
3813680	3813681	SpyM51832	SpyM51833			TRUE	0.415	79.000	0.027	NA		NA
3813681	3813682	SpyM51833	SpyM51834			TRUE	0.393	83.000	0.040	NA		NA
3813683	3813684	SpyM5t64	SpyM5t65			TRUE	0.668	34.000	0.000	NA		NA
3813684	3813685	SpyM5t65	SpyM51835			TRUE	0.919	-21.000	0.000	NA		NA
3813688	3813689	SpyM51837	SpyM51838	htrA		FALSE	0.348	59.000	0.015	1.000	N	NA
3813689	3811783	SpyM51838	SpyM50001		dnaA	FALSE	0.054	203.000	0.002	1.000	N	NA