MicrobesOnline Operon Predictions for Flavobacteria bacterium BBFL7

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
2856054	2856055	BBFL7_01106	BBFL7_01107			FALSE	0.241	101.000	0.000	NA		NA
2856055	2856056	BBFL7_01107	BBFL7_01108			TRUE	0.995	3.000	0.566	1.000	Y	NA
2856058	2856059	BBFL7_01110	BBFL7_01111			TRUE	0.891	1.000	0.000	1.000		NA
2856059	2856060	BBFL7_01111	BBFL7_01112			FALSE	0.393	63.000	0.000	1.000		NA
2856061	2856062	BBFL7_01113	BBFL7_01114			TRUE	0.975	0.000	0.140	1.000		NA
2856062	2856063	BBFL7_01114	BBFL7_01115			TRUE	0.517	116.000	0.220	1.000	N	NA
2856063	2856064	BBFL7_01115	BBFL7_01116			TRUE	0.874	16.000	0.214	NA	N	NA
2856064	2856065	BBFL7_01116	BBFL7_01117			TRUE	0.519	108.000	0.192	NA	N	NA
2856065	2856066	BBFL7_01117	BBFL7_01118			FALSE	0.464	36.000	0.000	NA		NA
2856066	2856067	BBFL7_01118	BBFL7_01119			TRUE	0.632	14.000	0.000	NA		NA
2856067	2856068	BBFL7_01119	BBFL7_01120			FALSE	0.109	164.000	0.000	1.000		NA
2856068	2856069	BBFL7_01120	BBFL7_01121			TRUE	0.828	5.000	0.013	1.000		NA
2856069	2856070	BBFL7_01121	BBFL7_01122			FALSE	0.442	50.000	0.000	1.000		NA
2856070	2856071	BBFL7_01122	BBFL7_01123			FALSE	0.072	132.000	0.000	1.000	N	NA
2856071	2856072	BBFL7_01123	BBFL7_01124			TRUE	0.596	29.000	0.010	1.000		NA
2856073	2856074	BBFL7_01125	BBFL7_01126			TRUE	0.991	-3.000	0.682	NA		NA
2856075	2856076	BBFL7_01127	BBFL7_01128			TRUE	0.758	7.000	0.032	1.000	N	NA
2856076	2856077	BBFL7_01128	BBFL7_01129			TRUE	0.767	11.000	0.053	1.000	N	NA
2856078	2856079	BBFL7_01130	BBFL7_01131			TRUE	0.998	5.000	0.708	0.004	Y	NA
2856079	2856080	BBFL7_01131	BBFL7_01132			TRUE	0.982	48.000	0.279	0.004	Y	NA
2856080	2856081	BBFL7_01132	BBFL7_01133			TRUE	0.996	5.000	0.288	0.004	Y	NA
2856081	2856082	BBFL7_01133	BBFL7_01134			TRUE	0.999	3.000	0.773	0.004	Y	NA
2856082	2856083	BBFL7_01134	BBFL7_01135			TRUE	0.999	0.000	0.747	0.004	Y	NA
2856084	2856085	BBFL7_01136	BBFL7_01137			TRUE	0.847	28.000	0.154	NA		NA
2856085	2856086	BBFL7_01137	BBFL7_01138			TRUE	0.880	4.000	0.034	NA		NA
2856086	2856087	BBFL7_01138	BBFL7_01139			FALSE	0.099	135.000	0.022	NA	N	NA
2856089	2856090	BBFL7_01141	BBFL7_01142			TRUE	0.780	41.000	0.143	NA		NA
2856092	2856093	BBFL7_01144	BBFL7_01145			TRUE	0.892	-3.000	0.000	NA		NA
2856094	2856095	BBFL7_01146	BBFL7_01147			TRUE	0.998	1.000	0.360	0.002	Y	NA
2856096	2856097	BBFL7_01148	BBFL7_01149			TRUE	0.890	5.000	0.055	NA		NA
2856099	2856100	BBFL7_01151	BBFL7_01152			FALSE	0.399	60.000	0.033	1.000	N	NA
2856100	2856101	BBFL7_01152	BBFL7_01153			FALSE	0.439	58.000	0.041	1.000	N	NA
2856101	2856102	BBFL7_01153	BBFL7_01154			FALSE	0.010	629.000	0.000	1.000	N	NA
2856104	2856105	BBFL7_01156	BBFL7_01157			FALSE	0.335	36.000	0.008	1.000	N	NA
2856106	2856107	BBFL7_01158	BBFL7_01159			FALSE	0.274	90.000	0.000	NA		NA
2856107	2856108	BBFL7_01159	BBFL7_01160			TRUE	0.943	62.000	0.531	0.054		NA
2856109	2856110	BBFL7_01161	BBFL7_01162			TRUE	0.475	35.000	0.000	NA		NA
2856110	2856111	BBFL7_01162	BBFL7_01163			FALSE	0.442	50.000	0.000	1.000		NA
2856112	2856113	BBFL7_01164	BBFL7_01165			TRUE	0.964	-3.000	0.087	NA		NA
2856113	2856114	BBFL7_01165	BBFL7_01166			TRUE	0.720	8.000	0.000	NA		NA
2856114	2856115	BBFL7_01166	BBFL7_01167			FALSE	0.368	59.000	0.000	NA		NA
2856116	2856117	BBFL7_01168	BBFL7_01169			TRUE	0.643	13.000	0.000	NA		NA
2856118	2856119	BBFL7_01170	BBFL7_01171			TRUE	0.787	39.000	0.143	NA		NA
2856119	2856120	BBFL7_01171	BBFL7_01172			FALSE	0.157	178.000	0.048	NA		NA
2856120	2856121	BBFL7_01172	BBFL7_01173			TRUE	0.962	-7.000	0.093	NA		NA
2856121	2856122	BBFL7_01173	BBFL7_01174			FALSE	0.338	69.000	0.000	NA		NA
2856124	2856125	BBFL7_01176	BBFL7_01177			TRUE	0.878	22.000	0.174	NA		NA
2856128	2856129	BBFL7_01180	BBFL7_t01181			TRUE	0.830	-100.000	0.000	NA		NA
2856129	2856130	BBFL7_t01181	BBFL7_01182			FALSE	0.020	597.000	0.000	NA		NA
2856134	2856135	BBFL7_01186	BBFL7_01187			TRUE	0.996	3.000	0.826	NA	Y	NA
2856135	2856136	BBFL7_01187	BBFL7_01188			FALSE	0.235	253.000	0.206	NA		NA
2856137	2856138	BBFL7_01189	BBFL7_01190			FALSE	0.028	464.000	0.000	1.000		NA
2856138	2856139	BBFL7_01190	BBFL7_01191			TRUE	0.968	1.000	0.134	NA		NA
2856139	2856140	BBFL7_01191	BBFL7_01192			TRUE	0.974	0.000	0.147	NA		NA
2856140	2856141	BBFL7_01192	BBFL7_01193			TRUE	0.853	3.000	0.000	1.000		NA
2856141	2856142	BBFL7_01193	BBFL7_01194			FALSE	0.347	65.000	0.000	NA		NA
2856142	2856143	BBFL7_01194	BBFL7_01195			TRUE	0.676	11.000	0.000	NA		NA
2856143	2856144	BBFL7_01195	BBFL7_01196			FALSE	0.314	88.000	0.000	1.000		NA
2856144	2856145	BBFL7_01196	BBFL7_01197			FALSE	0.252	97.000	0.000	NA		NA
2856145	2856146	BBFL7_01197	BBFL7_01198			FALSE	0.295	83.000	0.000	NA		NA
2856147	2856148	BBFL7_01199	BBFL7_01200			TRUE	0.997	-7.000	0.900	1.000	Y	NA
2856148	2856149	BBFL7_01200	BBFL7_01201			TRUE	0.833	31.000	0.154	NA		NA
2856149	2856150	BBFL7_01201	BBFL7_01202			TRUE	0.982	2.000	0.353	NA		NA
2856151	2856152	BBFL7_01203	BBFL7_01204			FALSE	0.344	87.000	0.016	NA		NA
2856152	2856153	BBFL7_01204	BBFL7_01205			FALSE	0.185	122.000	0.000	1.000		NA
2856153	2856154	BBFL7_01205	BBFL7_01206			FALSE	0.198	169.000	0.051	1.000		NA
2856155	2856156	BBFL7_01207	BBFL7_01208			TRUE	0.971	92.000	0.509	0.023	Y	NA
2856156	2856157	BBFL7_01208	BBFL7_01209			TRUE	0.623	92.000	0.125	1.000		NA
2856157	2856158	BBFL7_01209	BBFL7_01210			TRUE	0.963	0.000	0.073	1.000		NA
2856158	2856159	BBFL7_01210	BBFL7_01211			FALSE	0.188	114.000	0.000	NA		NA
2856159	2856160	BBFL7_01211	BBFL7_01212			FALSE	0.165	121.000	0.000	NA		NA
2856160	2856161	BBFL7_01212	BBFL7_01213			TRUE	0.793	4.000	0.000	NA		NA
2856161	2856162	BBFL7_01213	BBFL7_01214			FALSE	0.230	104.000	0.000	NA		NA
2856162	2856163	BBFL7_01214	BBFL7_01215			TRUE	0.980	-3.000	0.189	NA		NA
2856165	2856166	BBFL7_01217	BBFL7_01218			TRUE	0.997	2.000	0.231	0.017	Y	NA
2856166	2856167	BBFL7_01218	BBFL7_01219			TRUE	0.646	198.000	0.060	0.023	Y	NA
2856167	2856168	BBFL7_01219	BBFL7_01220			TRUE	0.972	42.000	0.748	1.000	Y	NA
2856168	2856169	BBFL7_01220	BBFL7_01221			FALSE	0.155	124.000	0.000	NA		NA
2856169	2856170	BBFL7_01221	BBFL7_01222			FALSE	0.278	88.000	0.000	NA		NA
2856170	2856171	BBFL7_01222	BBFL7_01223			TRUE	0.875	45.000	0.626	1.000	N	NA
2856171	2856172	BBFL7_01223	BBFL7_01224			FALSE	0.102	158.000	0.000	NA		NA
2856172	2856173	BBFL7_01224	BBFL7_01225			FALSE	0.338	69.000	0.000	NA		NA
2856173	2856174	BBFL7_01225	BBFL7_01226			TRUE	0.590	46.000	0.030	1.000		NA
2856174	2856175	BBFL7_01226	BBFL7_01227			FALSE	0.161	160.000	0.062	1.000	N	NA
2856175	2856176	BBFL7_01227	BBFL7_01228			TRUE	0.896	10.000	0.106	NA		NA
2856177	2856178	BBFL7_01229	BBFL7_01230			TRUE	0.876	35.000	0.281	NA		NA
2856178	2856179	BBFL7_01230	BBFL7_01231			TRUE	0.991	3.000	0.328	0.038		NA
2856179	2856180	BBFL7_01231	BBFL7_01232			TRUE	0.979	4.000	0.571	NA		NA
2856180	2856181	BBFL7_01232	BBFL7_01233			TRUE	0.857	27.000	0.162	NA		NA
2856181	2856182	BBFL7_01233	BBFL7_t01234			FALSE	0.044	271.000	0.000	NA		NA
2856182	2856183	BBFL7_t01234	BBFL7_01235			FALSE	0.414	47.000	0.000	NA		NA
2856183	2856184	BBFL7_01235	BBFL7_01236			TRUE	0.962	-16.000	0.116	1.000		NA
2856184	2856185	BBFL7_01236	BBFL7_01237			TRUE	0.477	47.000	0.015	NA		NA
2856188	2856189	BBFL7_01240	BBFL7_01241			TRUE	0.994	10.000	0.342	0.017	Y	NA
2856189	2856190	BBFL7_01241	BBFL7_01242			TRUE	0.920	-3.000	0.011	1.000		NA
2856190	2856191	BBFL7_01242	BBFL7_01243			TRUE	0.690	57.000	0.090	1.000		NA
2856192	2856193	BBFL7_01244	BBFL7_01245			FALSE	0.251	125.000	0.067	1.000	N	NA
2856193	2856194	BBFL7_01245	BBFL7_01246			TRUE	0.882	-13.000	0.000	1.000		NA
2856194	2856195	BBFL7_01246	BBFL7_01247			TRUE	0.891	1.000	0.000	1.000		NA
2856197	2856198	BBFL7_01249	BBFL7_01250			TRUE	0.872	74.000	0.109	1.000	Y	NA
2856199	2856200	BBFL7_01251	BBFL7_01252			FALSE	0.179	124.000	0.000	1.000		NA
2856200	2856201	BBFL7_01252	BBFL7_01253			FALSE	0.324	85.000	0.000	1.000		NA
2856204	2856205	BBFL7_01256	BBFL7_01257			TRUE	0.941	-3.000	0.036	NA		NA
2856205	2856206	BBFL7_01257	BBFL7_01258			TRUE	0.963	-3.000	0.136	1.000	N	NA
2856207	2856208	BBFL7_01259	BBFL7_01260			TRUE	0.887	12.000	0.123	NA		NA
2856209	2856210	BBFL7_01261	BBFL7_01262			TRUE	0.519	62.000	0.036	NA		NA
2856214	2856215	BBFL7_01266	BBFL7_01267			FALSE	0.054	699.000	0.074	NA		NA
2856215	2856216	BBFL7_01267	BBFL7_01268			TRUE	0.946	54.000	0.273	0.003		NA
2856216	2856217	BBFL7_01268	BBFL7_01269			FALSE	0.307	254.000	0.357	NA		NA
2856217	2856218	BBFL7_01269	BBFL7_01270			TRUE	0.946	-7.000	0.053	NA		NA
2856218	2856219	BBFL7_01270	BBFL7_01271			TRUE	0.717	63.000	0.145	NA		NA
2856219	2856220	BBFL7_01271	BBFL7_01272			TRUE	0.866	4.000	0.027	NA		NA
2856220	2856221	BBFL7_01272	BBFL7_01273			FALSE	0.402	59.000	0.033	1.000	N	NA
2856221	2856222	BBFL7_01273	BBFL7_01274			FALSE	0.062	175.000	0.017	1.000	N	NA
2856222	2856223	BBFL7_01274	BBFL7_01275			TRUE	0.978	0.000	0.154	1.000		NA
2856223	2856224	BBFL7_01275	BBFL7_01276			TRUE	0.969	-7.000	0.115	1.000		NA
2856224	2856225	BBFL7_01276	BBFL7_01277			FALSE	0.278	239.000	0.087	0.037	N	NA
2856227	2856228	BBFL7_01279	BBFL7_01280			TRUE	0.830	0.000	0.009	1.000	N	NA
2856230	2856231	BBFL7_01282	BBFL7_01283			TRUE	0.995	6.000	0.237	0.005	Y	NA
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