MicrobesOnline Operon Predictions for Persephonella marina EX-H1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
7268567	7268568	PERMA_0001	PERMA_0002	groS_1		FALSE	0.383	105.000	0.000	1.000	Y	NA
7268568	7268569	PERMA_0002	PERMA_0003			TRUE	0.663	5.000	0.000	1.000		NA
7268572	7268573	PERMA_0006	PERMA_0007			FALSE	0.101	208.000	0.000	NA		NA
7268574	7268575	PERMA_0008	PERMA_0009			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7268575	7268576	PERMA_0009	PERMA_0010		purN	FALSE	0.143	80.000	0.000	NA		NA
7268576	7268577	PERMA_0010	PERMA_0011	purN		FALSE	0.426	38.000	0.000	1.000		NA
7268577	7268578	PERMA_0011	PERMA_0012		purM	TRUE	0.763	20.000	0.000	1.000		NA
7268580	7268581	PERMA_0013	PERMA_0015			FALSE	0.397	192.000	0.004	NA		NA
7268581	7268582	PERMA_0015	PERMA_0016			TRUE	0.646	-7.000	0.000	NA		NA
7268584	7268585	PERMA_0017	PERMA_0019		engA	FALSE	0.319	44.000	0.000	1.000		NA
7268586	7268587	PERMA_0020	PERMA_0021		mviN	TRUE	0.924	26.000	0.006	NA		NA
7268587	7268588	PERMA_0021	PERMA_0023	mviN		FALSE	0.143	85.000	0.000	1.000		NA
7268590	7268591	PERMA_0024	PERMA_0025			TRUE	0.974	4.000	0.103	1.000		NA
7268591	7268592	PERMA_0025	PERMA_0027			TRUE	0.711	-3.000	0.000	1.000		NA
7268594	7268595	PERMA_0028	PERMA_0029		guaA	FALSE	0.541	14.000	0.000	NA	N	NA
7268595	7268596	PERMA_0029	PERMA_0030	guaA		TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7268596	7268597	PERMA_0030	PERMA_0031			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268597	7268598	PERMA_0031	PERMA_0032			FALSE	0.244	56.000	0.000	1.000		NA
7268598	7268599	PERMA_0032	PERMA_0033			TRUE	0.644	-9.000	0.000	1.000		NA
7268599	7268600	PERMA_0033	PERMA_0034			TRUE	0.915	3.000	0.000	0.018		NA
7268600	7268601	PERMA_0034	PERMA_0035			TRUE	0.955	47.000	0.143	0.018		NA
7268601	7268602	PERMA_0035	PERMA_0036			TRUE	0.990	-3.000	0.048	0.016		NA
7268602	7268603	PERMA_0036	PERMA_0037			TRUE	0.638	8.000	0.000	NA		NA
7268603	7268604	PERMA_0037	PERMA_0038			TRUE	0.664	4.000	0.000	NA		NA
7268604	7268605	PERMA_0038	PERMA_0039			TRUE	0.996	3.000	0.029	0.016	Y	NA
7268605	7268606	PERMA_0039	PERMA_0040			TRUE	0.996	-3.000	0.037	0.016	Y	NA
7268606	7268607	PERMA_0040	PERMA_0041			FALSE	0.070	73.000	0.000	1.000	N	NA
7268607	7268608	PERMA_0041	PERMA_0042			TRUE	0.913	-3.000	0.005	1.000	N	NA
7268608	7268609	PERMA_0042	PERMA_0043		accA	TRUE	0.898	5.000	0.006	1.000	N	NA
7268609	7268610	PERMA_0043	PERMA_0045	accA		TRUE	0.881	-3.000	0.003	1.000	N	NA
7268614	7268615	PERMA_0048	PERMA_0049			FALSE	0.163	72.000	0.000	NA		NA
7268615	7268616	PERMA_0049	PERMA_0050			TRUE	0.995	13.000	0.500	0.004	N	NA
7268616	7268617	PERMA_0050	PERMA_0051		rplU	FALSE	0.054	96.000	0.000	1.000	N	NA
7268617	7268618	PERMA_0051	PERMA_0052	rplU	rpmA	TRUE	0.999	16.000	0.667	0.029	Y	NA
7268619	7268620	PERMA_0053	PERMA_0054	mrdB	mrdA	TRUE	0.951	-13.000	0.161	1.000	N	NA
7268620	7268621	PERMA_0054	PERMA_0055	mrdA		TRUE	0.913	-19.000	0.008	NA		NA
7268621	7268622	PERMA_0055	PERMA_0056		mreC	TRUE	0.776	18.000	0.000	NA		NA
7268622	7268623	PERMA_0056	PERMA_0057	mreC		TRUE	0.940	6.000	0.030	1.000	N	NA
7268624	7268625	PERMA_0058	PERMA_0059	dapA		TRUE	0.581	122.000	0.014	1.000		NA
7268625	7268626	PERMA_0059	PERMA_0060			TRUE	0.978	12.000	0.044	1.000		NA
7268626	7268627	PERMA_0060	PERMA_0061		ribH	TRUE	0.564	44.000	0.002	1.000	N	NA
7268627	7268628	PERMA_0061	PERMA_0062	ribH	nusB	TRUE	0.961	0.000	0.045	1.000	N	NA
7268628	7268629	PERMA_0062	PERMA_0064	nusB		TRUE	0.972	-3.000	0.041	1.000		NA
7268630	7268631	PERMA_0063	PERMA_0065		yajC	FALSE	0.130	91.000	0.000	NA		NA
7268632	7268633	PERMA_0066	PERMA_0067			FALSE	0.182	68.000	0.000	1.000		NA
7268634	7268635	PERMA_0068	PERMA_0069	metF		FALSE	0.202	64.000	0.000	1.000		NA
7268635	7268636	PERMA_0069	PERMA_0070			TRUE	0.971	4.000	0.059	1.000		NA
7268636	7268637	PERMA_0070	PERMA_0071		pheT	FALSE	0.242	252.000	0.002	1.000	N	NA
7268637	7268638	PERMA_0071	PERMA_0072	pheT	pheS	TRUE	0.998	-3.000	0.574	0.001	Y	NA
7268638	7268639	PERMA_0072	PERMA_0073	pheS	rplT	TRUE	0.996	16.000	0.202	1.000	Y	NA
7268639	7268640	PERMA_0073	PERMA_0074	rplT	rpmI	TRUE	0.998	23.000	0.928	0.029	Y	NA
7268641	7268642	PERMA_0075	PERMA_0077			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268643	7268644	PERMA_0076	PERMA_0078	rdgB	ruvC	FALSE	0.413	10.000	0.000	1.000	N	NA
7268644	7268645	PERMA_0078	PERMA_0079	ruvC		TRUE	0.983	0.000	0.277	NA		NA
7268646	7268647	PERMA_0080	PERMA_0081			FALSE	0.518	21.000	0.000	1.000	N	NA
7268647	7268648	PERMA_0081	PERMA_0082		ispH	TRUE	0.988	10.000	0.054	1.000	Y	NA
7268648	7268649	PERMA_0082	PERMA_0083	ispH		TRUE	0.771	14.000	0.000	NA		NA
7268649	7268650	PERMA_0083	PERMA_0084			TRUE	0.641	7.000	0.000	NA		NA
7268650	7268651	PERMA_0084	PERMA_0085			TRUE	0.991	4.000	0.096	1.000	Y	NA
7268651	7268652	PERMA_0085	PERMA_0086			TRUE	0.998	12.000	0.214	0.005	Y	NA
7268652	7268653	PERMA_0086	PERMA_0087			TRUE	0.788	18.000	0.000	1.000		NA
7268653	7268654	PERMA_0087	PERMA_0088		prmC	TRUE	0.631	-10.000	0.000	1.000		NA
7268654	7268655	PERMA_0088	PERMA_0090	prmC	murA	TRUE	0.931	-7.000	0.017	1.000	N	NA
7268656	7268657	PERMA_0089	PERMA_0091	rpoD	aspS	FALSE	0.046	144.000	0.000	1.000	N	NA
7268659	7268660	PERMA_0092	PERMA_0094			FALSE	0.246	53.000	0.000	NA		NA
7268660	7268661	PERMA_0094	PERMA_0095		argH	FALSE	0.223	60.000	0.000	1.000		NA
7268663	7268664	PERMA_0096	PERMA_0098			TRUE	0.711	-3.000	0.000	1.000		NA
7268664	7268665	PERMA_0098	PERMA_0099			TRUE	0.764	19.000	0.000	NA		NA
7268665	7268666	PERMA_0099	PERMA_0100			TRUE	0.963	11.000	0.027	NA		NA
7268666	7268667	PERMA_0100	PERMA_0101			TRUE	0.985	3.000	0.500	NA		NA
7268669	7268670	PERMA_0102	PERMA_0104	ggt		TRUE	0.981	-3.000	0.200	1.000		NA
7268670	7268671	PERMA_0104	PERMA_0105			TRUE	0.631	-10.000	0.000	1.000		NA
7268674	7268675	PERMA_0108	PERMA_0109	gcvH		TRUE	0.994	2.000	0.088	1.000	Y	NA
7268675	7268676	PERMA_0109	PERMA_0110		def_1	TRUE	0.976	0.000	0.364	1.000	N	NA
7268676	7268677	PERMA_0110	PERMA_0111	def_1		FALSE	0.216	59.000	0.000	NA		NA
7268677	7268678	PERMA_0111	PERMA_0112			TRUE	0.977	-3.000	0.104	NA		NA
7268678	7268679	PERMA_0112	PERMA_0113			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268679	7268680	PERMA_0113	PERMA_0114			TRUE	0.980	3.000	0.154	NA		NA
7268681	7268682	PERMA_0115	PERMA_0116			FALSE	0.496	67.000	0.000	1.000	Y	NA
7268682	7268683	PERMA_0116	PERMA_0117			FALSE	0.422	5.000	0.000	1.000	N	NA
7268683	7268684	PERMA_0117	PERMA_0118			TRUE	0.653	24.000	0.000	NA		NA
7268685	7268686	PERMA_0119	PERMA_0120			FALSE	0.409	38.000	0.000	NA		NA
7268686	7268687	PERMA_0120	PERMA_0121			FALSE	0.118	132.000	0.000	1.000		NA
7268687	7268688	PERMA_0121	PERMA_0122			TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7268688	7268689	PERMA_0122	PERMA_0124			TRUE	0.648	5.000	0.000	NA		NA
7268690	7268691	PERMA_0123	PERMA_0125	pdxA		TRUE	0.961	4.000	0.028	NA		NA
7268691	7268692	PERMA_0125	PERMA_0126			TRUE	0.984	-6.000	0.804	NA		NA
7268692	7268693	PERMA_0126	PERMA_0127			TRUE	0.982	10.000	0.790	NA		NA
7268693	7268694	PERMA_0127	PERMA_0128			TRUE	0.978	15.000	0.029	NA		NA
7268694	7268695	PERMA_0128	PERMA_0129			TRUE	0.943	11.000	0.022	1.000	N	NA
7268695	7268696	PERMA_0129	PERMA_0130			TRUE	0.606	76.000	0.007	1.000		NA
7268696	7268697	PERMA_0130	PERMA_0131			TRUE	0.963	3.000	0.014	NA		NA
7268698	7268699	PERMA_0132	PERMA_0133	recJ	ahpC	FALSE	0.337	82.000	0.002	1.000	N	NA
7268699	7268700	PERMA_0133	PERMA_0134	ahpC		TRUE	0.725	947.000	0.429	NA		NA
11452094	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	549.000	0.000	NA		NA
11594457	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	549.000	0.000	NA		NA
11736849	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	549.000	0.000	NA		NA
11452095	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	511.000	0.000	NA		NA
11594458	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	511.000	0.000	NA		NA
11736850	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	511.000	0.000	NA		NA
11452096	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	476.000	0.000	NA		NA
11594459	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	476.000	0.000	NA		NA
11736851	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	476.000	0.000	NA		NA
11452097	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	440.000	0.000	NA		NA
11594460	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	440.000	0.000	NA		NA
11736852	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	440.000	0.000	NA		NA
11452098	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	405.000	0.000	NA		NA
11594461	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	405.000	0.000	NA		NA
11736853	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	405.000	0.000	NA		NA
11452099	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	361.000	0.000	NA		NA
11594462	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	361.000	0.000	NA		NA
11736854	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	361.000	0.000	NA		NA
11452100	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	326.000	0.000	NA		NA
11594463	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	326.000	0.000	NA		NA
11736855	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	326.000	0.000	NA		NA
11452101	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	286.000	0.000	NA		NA
11594464	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	286.000	0.000	NA		NA
11736856	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	286.000	0.000	NA		NA
11452102	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	251.000	0.000	NA		NA
11594465	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	251.000	0.000	NA		NA
11736857	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	251.000	0.000	NA		NA
11452103	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	212.000	0.000	NA		NA
11594466	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	212.000	0.000	NA		NA
11736858	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	212.000	0.000	NA		NA
11452104	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	177.000	0.000	NA		NA
11594467	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	177.000	0.000	NA		NA
11736859	7268700		PERMA_0134			FALSE	NA	177.000	0.000	NA		NA
7268700	7268701	PERMA_0134	PERMA_0135		rpsU	FALSE	0.277	47.000	0.000	NA		NA
7268701	7268702	PERMA_0135	PERMA_0136	rpsU		TRUE	0.887	11.000	0.000	0.045		NA
7268702	7268703	PERMA_0136	PERMA_0137		cvpA	TRUE	0.726	3.000	0.000	1.000		NA
7268703	7268704	PERMA_0137	PERMA_0139	cvpA		TRUE	0.601	-12.000	0.000	NA		NA
7268705	7268706	PERMA_0138	PERMA_0140		rseP	TRUE	0.845	37.000	0.005	NA		NA
7268706	7268707	PERMA_0140	PERMA_0141	rseP	dxr	TRUE	0.982	12.000	0.568	1.000	N	NA
7268707	7268708	PERMA_0141	PERMA_0142	dxr		TRUE	0.925	11.000	0.004	NA		NA
7268708	7268709	PERMA_0142	PERMA_0143			FALSE	0.137	84.000	0.000	NA		NA
7268709	7268710	PERMA_0143	PERMA_0144			TRUE	0.987	16.000	0.004	1.000	Y	NA
7268714	7268715	PERMA_0147	PERMA_0149			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268715	7268716	PERMA_0149	PERMA_0150		cmk	TRUE	0.943	16.000	0.000	1.000	Y	NA
7268716	7268717	PERMA_0150	PERMA_0151	cmk		FALSE	0.552	2.000	0.000	1.000	N	NA
7268717	7268718	PERMA_0151	PERMA_0152		moaD	FALSE	0.495	3.000	0.000	1.000	N	NA
7268718	7268719	PERMA_0152	PERMA_0153	moaD		TRUE	0.975	-10.000	0.006	1.000	Y	NA
7268719	7268720	PERMA_0153	PERMA_0154			TRUE	0.875	50.000	0.700	1.000	N	NA
7268720	7268721	PERMA_0154	PERMA_0155		ilvC	TRUE	0.926	11.000	0.008	1.000	N	NA
7268721	7268722	PERMA_0155	PERMA_0156	ilvC		TRUE	0.692	45.000	0.003	NA		NA
7268722	7268723	PERMA_0156	PERMA_0157		ilvN	TRUE	0.976	-3.000	0.091	NA		NA
7268723	7268724	PERMA_0157	PERMA_0158	ilvN	ilvB	TRUE	0.998	22.000	0.057	0.001	Y	NA
7268724	7268725	PERMA_0158	PERMA_0159	ilvB	trmFO	FALSE	0.295	98.000	0.000	0.008	N	NA
7268725	7268726	PERMA_0159	PERMA_0160	trmFO		FALSE	0.412	8.000	0.000	1.000	N	NA
7268726	7268727	PERMA_0160	PERMA_0161		moaE	FALSE	0.064	78.000	0.000	1.000	N	NA
7268727	7268728	PERMA_0161	PERMA_0162	moaE		TRUE	0.871	10.000	0.004	NA	N	NA
7268728	7268729	PERMA_0162	PERMA_0163			FALSE	0.552	15.000	0.000	NA	N	NA
7268730	7268731	PERMA_0164	PERMA_0166			FALSE	0.495	3.000	0.000	1.000	N	NA
7268732	7268733	PERMA_0165	PERMA_0167			TRUE	0.927	-10.000	0.007	NA		NA
7268733	7268734	PERMA_0167	PERMA_0168			TRUE	0.978	10.000	0.372	NA		NA
7268734	7268735	PERMA_0168	PERMA_0169		tmk	TRUE	0.978	5.000	0.254	1.000		NA
7268738	7268739	PERMA_0172	PERMA_0173			TRUE	0.790	72.000	0.600	1.000	N	NA
7268740	7268741	PERMA_0174	PERMA_0175			TRUE	0.554	-18.000	0.000	NA		NA
7268741	7268742	PERMA_0175	PERMA_0176		tyrS	TRUE	0.782	17.000	0.000	NA		NA
7268743	7268744	PERMA_0177	PERMA_0178		rnr	FALSE	0.505	54.000	0.003	1.000	N	NA
7268744	7268745	PERMA_0178	PERMA_0179	rnr		FALSE	0.047	130.000	0.000	1.000	N	NA
7268745	7268746	PERMA_0179	PERMA_0180			TRUE	0.970	-3.000	0.000	0.015	Y	NA
7268746	7268747	PERMA_0180	PERMA_0181		atpH	TRUE	0.998	13.000	0.132	0.015	Y	NA
7268747	7268748	PERMA_0181	PERMA_0182	atpH	atpA_1	TRUE	0.994	38.000	0.864	0.015	Y	NA
7268748	7268749	PERMA_0182	PERMA_0183	atpA_1	atpG_1	TRUE	0.999	15.000	0.846	0.015	Y	NA
7268749	7268750	PERMA_0183	PERMA_0184	atpG_1	atpD_1	TRUE	0.997	25.000	0.724	0.015	Y	NA
7268750	7268751	PERMA_0184	PERMA_0186	atpD_1		TRUE	0.782	17.000	0.000	NA		NA
7268752	7268753	PERMA_0185	PERMA_0187		ctpA	TRUE	0.978	-3.000	0.017	0.028	N	NA
7268753	7268754	PERMA_0187	PERMA_0188	ctpA		FALSE	0.107	56.000	0.000	1.000	N	NA
7268754	7268755	PERMA_0188	PERMA_0189			FALSE	0.477	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7268756	7268757	PERMA_0190	PERMA_0191	aroC	atpB_1	FALSE	0.333	78.000	0.002	1.000	N	NA
7268757	7268758	PERMA_0191	PERMA_0192	atpB_1		TRUE	0.959	12.000	0.007	1.000		NA
7268758	7268759	PERMA_0192	PERMA_0193			TRUE	0.964	24.000	0.035	1.000		NA
7268759	7268760	PERMA_0193	PERMA_0194		rpmH	TRUE	0.557	98.000	0.008	1.000		NA
7268760	7268761	PERMA_0194	PERMA_0195	rpmH		FALSE	0.432	341.000	0.005	NA		NA
7268761	7268762	PERMA_0195	PERMA_0196			TRUE	0.986	21.000	0.461	NA		NA
7268762	7268763	PERMA_0196	PERMA_0197		trmE	TRUE	0.980	-3.000	0.008	0.051		NA
7268763	7268764	PERMA_0197	PERMA_0198	trmE	rho	TRUE	0.840	40.000	0.009	1.000		NA
7268764	7268765	PERMA_0198	PERMA_0199	rho	rpmE	TRUE	0.697	76.000	0.115	1.000	N	NA
7268765	7268766	PERMA_0199	PERMA_0200	rpmE	prfA	TRUE	0.993	0.000	0.110	1.000	Y	NA
7268766	7268767	PERMA_0200	PERMA_0201	prfA		TRUE	0.641	7.000	0.000	NA		NA
7268767	7268768	PERMA_0201	PERMA_0202			FALSE	0.096	311.000	0.000	NA		NA
7268768	7268769	PERMA_0202	PERMA_0203			TRUE	0.646	-7.000	0.000	NA		NA
7268770	7268771	PERMA_0204	PERMA_0205			TRUE	0.783	16.000	0.000	NA		NA
7268772	7268773	PERMA_0206	PERMA_0207		proS	FALSE	0.120	102.000	0.000	NA		NA
7268773	7268774	PERMA_0207	PERMA_0208	proS		TRUE	0.906	2.000	0.002	1.000	N	NA
7268774	7268775	PERMA_0208	PERMA_0209			TRUE	0.967	3.000	0.087	1.000	N	NA
7268776	7268777	PERMA_0210	PERMA_0211			TRUE	0.977	-7.000	0.273	NA		NA
7268777	7268778	PERMA_0211	PERMA_0212		ychF	FALSE	0.297	45.000	0.000	NA		NA
7268778	7268779	PERMA_0212	PERMA_0213	ychF		FALSE	0.549	64.000	0.003	NA		NA
7268780	7268781	PERMA_0214	PERMA_0215			TRUE	0.751	1.000	0.000	1.000		NA
7268781	7268782	PERMA_0215	PERMA_0216			TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7268782	7268783	PERMA_0216	PERMA_0218			TRUE	0.585	-13.000	0.000	NA		NA
7268786	7268787	PERMA_0219	PERMA_0221			TRUE	0.969	5.000	0.075	NA		NA
7268787	7268788	PERMA_0221	PERMA_0222			TRUE	0.964	4.000	0.033	NA		NA
7268788	7268789	PERMA_0222	PERMA_0223		thrC_1	TRUE	0.970	11.000	0.215	1.000	N	NA
7268790	7268791	PERMA_0224	PERMA_0225	guaB		TRUE	0.771	14.000	0.000	NA		NA
7268791	7268792	PERMA_0225	PERMA_0226			TRUE	0.681	23.000	0.000	NA		NA
7268792	7268793	PERMA_0226	PERMA_0227		pgk	TRUE	0.939	22.000	0.004	NA		NA
7268793	7268794	PERMA_0227	PERMA_0228	pgk		TRUE	0.983	13.000	0.004	1.000	Y	NA
7268794	7268795	PERMA_0228	PERMA_0230		pheA	TRUE	0.913	0.000	0.005	1.000	N	NA
7268797	7268798	PERMA_0231	PERMA_0232	rpsB	tsf	TRUE	0.995	0.000	0.748	1.000	Y	NA
7268798	7268799	PERMA_0232	PERMA_0233	tsf	pyrH	TRUE	0.982	2.000	0.416	1.000	N	NA
7268799	7268800	PERMA_0233	PERMA_0234	pyrH	frr	TRUE	0.737	97.000	0.626	1.000	N	NA
7268800	7268801	PERMA_0234	PERMA_0235	frr		FALSE	0.517	68.000	0.003	NA		NA
7268801	7268802	PERMA_0235	PERMA_0236		nusA	TRUE	0.990	13.000	0.759	NA		NA
7268802	7268803	PERMA_0236	PERMA_0237	nusA		TRUE	0.569	157.000	0.075	NA	N	NA
7268803	7268804	PERMA_0237	PERMA_0238			TRUE	0.990	-12.000	0.223	NA	Y	NA
7268807	7268808	PERMA_0240	PERMA_0242		pnp	FALSE	0.528	1.000	0.000	1.000	N	NA
7268808	7268809	PERMA_0242	PERMA_0243	pnp	rpsO	TRUE	0.979	0.000	0.004	1.000	Y	NA
7268811	7268812	PERMA_0245	PERMA_0246			FALSE	0.097	260.000	0.000	NA		NA
7268812	7268813	PERMA_0246	PERMA_0247			FALSE	0.101	375.000	0.000	1.000		NA
7268813	7268814	PERMA_0247	PERMA_0248			TRUE	0.945	6.000	0.011	NA		NA
7268814	7268815	PERMA_0248	PERMA_0249			TRUE	0.991	18.000	0.821	NA		NA
7268815	7268816	PERMA_0249	PERMA_0250			TRUE	0.944	3.000	0.005	1.000		NA
7268816	7268817	PERMA_0250	PERMA_0251			TRUE	0.976	-3.000	0.003	1.000	Y	NA
7268817	7268818	PERMA_0251	PERMA_0252			FALSE	0.107	155.000	0.000	NA		NA
7268818	7268819	PERMA_0252	PERMA_0253			FALSE	0.094	460.000	0.000	NA		NA
7268820	7268821	PERMA_0254	PERMA_0255			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268821	7268822	PERMA_0255	PERMA_0256			FALSE	0.531	12.000	0.000	1.000	N	NA
7268822	7268823	PERMA_0256	PERMA_0257		thrC_2	FALSE	0.537	69.000	0.008	1.000	N	NA
7268823	7268824	PERMA_0257	PERMA_0258	thrC_2	panE	TRUE	0.930	-3.000	0.008	1.000	N	NA
7268824	7268825	PERMA_0258	PERMA_0259	panE	rph	FALSE	0.099	59.000	0.000	1.000	N	NA
7268825	7268826	PERMA_0259	PERMA_0260	rph	purA	TRUE	0.896	0.000	0.003	1.000	N	NA
7268826	7268827	PERMA_0260	PERMA_0261	purA		TRUE	0.712	3.000	0.000	NA		NA
7268827	7268828	PERMA_0261	PERMA_0262			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7268828	7268829	PERMA_0262	PERMA_0263			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268829	7268830	PERMA_0263	PERMA_0264			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268830	7268831	PERMA_0264	PERMA_0265			TRUE	0.753	38.000	0.000	NA	Y	NA
7268831	7268832	PERMA_0265	PERMA_0266			TRUE	0.643	6.000	0.000	NA		NA
7268832	7268833	PERMA_0266	PERMA_0268		fbp	TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7268834	7268835	PERMA_0267	PERMA_0269			FALSE	0.438	-6.000	0.000	1.000	N	NA
7268836	7268837	PERMA_0270	PERMA_0271	crcB		TRUE	0.954	10.000	0.023	NA		NA
7268837	7268838	PERMA_0271	PERMA_0272			TRUE	0.859	70.000	0.750	NA		NA
7268838	7268839	PERMA_0272	PERMA_0273			FALSE	0.094	480.000	0.000	NA		NA
7268839	7268840	PERMA_0273	PERMA_0274			TRUE	0.901	49.000	0.400	NA		NA
7268840	7268841	PERMA_0274	PERMA_0276		trpE	TRUE	0.840	38.000	0.006	NA		NA
7268842	7268843	PERMA_0275	PERMA_0277	dapE		TRUE	0.936	-3.000	0.011	1.000	N	NA
7268843	7268844	PERMA_0277	PERMA_0278			TRUE	0.704	22.000	0.000	NA		NA
7268844	7268845	PERMA_0278	PERMA_0279			TRUE	0.664	4.000	0.000	NA		NA
7268845	7268846	PERMA_0279	PERMA_0280			TRUE	0.562	30.000	0.000	NA		NA
7268847	7268848	PERMA_0281	PERMA_0282	alaS		FALSE	0.379	39.000	0.000	NA		NA
7268851	7268852	PERMA_0284	PERMA_0286	pyrE		TRUE	0.954	11.000	0.009	1.000		NA
7268853	7268854	PERMA_0287	PERMA_0288	purL		FALSE	0.045	168.000	0.000	1.000	N	NA
7268854	7268855	PERMA_0288	PERMA_0289			TRUE	0.998	-3.000	0.333	0.002	Y	NA
7268855	7268856	PERMA_0289	PERMA_0290			TRUE	0.986	3.000	0.667	NA		NA
7268856	7268857	PERMA_0290	PERMA_0291			FALSE	0.205	61.000	0.000	NA		NA
7268857	7268858	PERMA_0291	PERMA_0293			TRUE	0.601	-12.000	0.000	NA		NA
7268861	7268862	PERMA_0294	PERMA_0296			FALSE	0.290	33.000	0.000	1.000	N	NA
7268862	7268863	PERMA_0296	PERMA_0297		nrdD	TRUE	0.697	82.000	0.178	1.000	N	NA
7268864	7268865	PERMA_0298	PERMA_0299	napA		TRUE	0.994	13.000	0.258	0.054		NA
7268865	7268866	PERMA_0299	PERMA_0300			TRUE	0.987	-10.000	0.167	0.054		NA
7268866	7268867	PERMA_0300	PERMA_0301		napB	TRUE	0.997	-7.000	0.385	0.027	Y	NA
7268867	7268868	PERMA_0301	PERMA_0302	napB		TRUE	0.990	7.000	0.174	0.024		NA
7268868	7268869	PERMA_0302	PERMA_0303			TRUE	0.956	-7.000	0.023	NA		NA
7268869	7268870	PERMA_0303	PERMA_0304			TRUE	0.977	3.000	0.083	NA		NA
7268870	7268871	PERMA_0304	PERMA_0305			FALSE	0.101	205.000	0.000	NA		NA
7268871	7268872	PERMA_0305	PERMA_0306			TRUE	0.760	105.000	0.286	NA		NA
7268872	7268873	PERMA_0306	PERMA_0307			TRUE	0.998	3.000	0.188	0.002	Y	NA
7268873	7268874	PERMA_0307	PERMA_0308			TRUE	0.958	-16.000	0.075	1.000		NA
7268874	7268875	PERMA_0308	PERMA_0309			TRUE	0.969	-12.000	0.151	1.000		NA
7268875	7268876	PERMA_0309	PERMA_0310		cobA	TRUE	0.984	14.000	0.075	1.000		NA
7268876	7268877	PERMA_0310	PERMA_0311	cobA		TRUE	0.948	-3.000	0.028	NA	N	NA
7268877	7268878	PERMA_0311	PERMA_0312			FALSE	0.517	-34.000	0.000	NA		NA
7268878	7268879	PERMA_0312	PERMA_0313			FALSE	0.121	101.000	0.000	NA		NA
7268880	7268881	PERMA_0314	PERMA_0315			TRUE	0.990	14.000	0.667	NA		NA
7268881	7268882	PERMA_0315	PERMA_0316			FALSE	0.098	242.000	0.000	NA		NA
7268882	7268883	PERMA_0316	PERMA_0317			FALSE	0.379	39.000	0.000	NA		NA
7268883	7268884	PERMA_0317	PERMA_0318			TRUE	0.712	3.000	0.000	NA		NA
7268884	7268885	PERMA_0318	PERMA_0319			TRUE	0.982	0.000	0.222	NA		NA
7268885	7268886	PERMA_0319	PERMA_0320			FALSE	0.155	75.000	0.000	NA		NA
7268887	7268888	PERMA_0321	PERMA_0322	aroD		FALSE	0.440	4.000	0.000	1.000	N	NA
7268888	7268889	PERMA_0322	PERMA_0323			TRUE	0.943	15.000	0.005	1.000	N	NA
7268889	7268890	PERMA_0323	PERMA_0324			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268890	7268891	PERMA_0324	PERMA_0325			TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7268894	7268895	PERMA_0328	PERMA_0329			TRUE	0.980	18.000	0.214	NA	N	NA
7268895	7268896	PERMA_0329	PERMA_0330			FALSE	0.068	68.000	0.000	NA	N	NA
7268896	7268897	PERMA_0330	PERMA_0331			TRUE	0.966	8.000	0.054	NA		NA
7268897	7268898	PERMA_0331	PERMA_0332			TRUE	0.988	0.000	1.000	NA		NA
7268899	7268900	PERMA_0333	PERMA_0334	serA		TRUE	0.954	15.000	0.008	1.000	N	NA
7268900	7268901	PERMA_0334	PERMA_0335			TRUE	0.730	21.000	0.000	NA		NA
7268902	7268903	PERMA_0336	PERMA_0337			TRUE	0.972	2.000	0.015	1.000		NA
7268903	7268904	PERMA_0337	PERMA_0338		alr	TRUE	0.910	26.000	0.012	1.000	N	NA
7268905	7268906	PERMA_0339	PERMA_0340			TRUE	0.966	108.000	0.231	0.003	Y	NA
7268906	7268907	PERMA_0340	PERMA_0341			FALSE	0.552	2.000	0.000	1.000	N	NA
7268907	7268908	PERMA_0341	PERMA_0342			FALSE	0.152	43.000	0.000	1.000	N	NA
7268908	7268909	PERMA_0342	PERMA_0343			TRUE	0.961	18.000	0.016	1.000	N	NA
7268909	7268910	PERMA_0343	PERMA_0344			TRUE	0.915	11.000	0.006	1.000	N	NA
7268910	7268911	PERMA_0344	PERMA_0345			TRUE	0.735	40.000	0.006	1.000	N	NA
7268912	7268913	PERMA_0346	PERMA_0347			TRUE	0.738	1.000	0.000	NA		NA
7268914	7268915	PERMA_0349	PERMA_0350		hypA	FALSE	0.097	255.000	0.000	NA		NA
7268916	7268917	PERMA_0351	PERMA_0352			TRUE	0.969	17.000	0.033	NA	N	NA
7268917	7268918	PERMA_0352	PERMA_0353			FALSE	0.110	186.000	0.000	1.000		NA
7268918	7268919	PERMA_0353	PERMA_0354			TRUE	0.639	10.000	0.000	NA		NA
7268919	7268920	PERMA_0354	PERMA_0355		lpxA	TRUE	0.985	-3.000	0.552	NA		NA
7268920	7268921	PERMA_0355	PERMA_0356	lpxA	trxA	TRUE	0.933	10.000	0.006	1.000		NA
7268921	7268922	PERMA_0356	PERMA_0357	trxA		TRUE	0.947	4.000	0.008	1.000		NA
7268922	7268923	PERMA_0357	PERMA_0358			FALSE	0.499	136.000	0.025	1.000	N	NA
7268923	7268924	PERMA_0358	PERMA_0359			TRUE	0.993	0.000	0.175	1.000	Y	NA
7268924	7268925	PERMA_0359	PERMA_0360		queF	FALSE	0.116	140.000	0.000	1.000		NA
7268925	7268926	PERMA_0360	PERMA_0361	queF		TRUE	0.965	2.000	0.008	1.000		NA
7268926	7268927	PERMA_0361	PERMA_0362			FALSE	0.528	1.000	0.000	1.000	N	NA
7268927	7268928	PERMA_0362	PERMA_0363		rnhB	TRUE	0.990	9.000	0.111	1.000	Y	NA
7268928	7268929	PERMA_0363	PERMA_0364	rnhB	rplS	TRUE	0.954	5.000	0.066	1.000	N	NA
7268929	7268930	PERMA_0364	PERMA_0365	rplS		FALSE	0.081	66.000	0.000	1.000	N	NA
7268930	7268931	PERMA_0365	PERMA_0366			TRUE	0.898	12.000	0.002	1.000	N	NA
7268935	7268936	PERMA_0370	PERMA_0371			FALSE	0.526	-28.000	0.000	NA		NA
7268936	7268937	PERMA_0371	PERMA_0372			TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7268937	7268938	PERMA_0372	PERMA_0373		asd	FALSE	0.165	71.000	0.000	NA		NA
7268939	7268940	PERMA_0374	PERMA_0375			TRUE	0.970	10.000	0.100	NA		NA
7268940	7268941	PERMA_0375	PERMA_0376		uppS	TRUE	0.928	-3.000	0.003	1.000		NA
7268941	7268942	PERMA_0376	PERMA_0378	uppS	cdsA_1	TRUE	0.984	-3.000	0.400	1.000		NA
7268943	7268944	PERMA_0377	PERMA_0379			FALSE	0.176	67.000	0.000	NA		NA
7268945	7268946	PERMA_0380	PERMA_0381		uppP	FALSE	0.428	24.000	0.000	1.000	N	NA
7268946	7268947	PERMA_0381	PERMA_0383	uppP		FALSE	0.287	46.000	0.000	NA		NA
7268948	7268949	PERMA_0382	PERMA_0384			FALSE	0.238	55.000	0.000	NA		NA
7268949	7268950	PERMA_0384	PERMA_0385			FALSE	0.259	53.000	0.000	1.000		NA
7268950	7268951	PERMA_0385	PERMA_0386			FALSE	0.477	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7268951	7268952	PERMA_0386	PERMA_0387		leuB	FALSE	0.050	106.000	0.000	1.000	N	NA
7268952	7268953	PERMA_0387	PERMA_0388	leuB	nadC	TRUE	0.875	24.000	0.004	1.000	N	NA
7268953	7268954	PERMA_0388	PERMA_0389	nadC		TRUE	0.925	10.000	0.005	NA		NA
7268956	7268957	PERMA_0391	PERMA_0392		sppA	TRUE	0.595	68.000	0.005	NA		NA
7268957	7268958	PERMA_0392	PERMA_0393	sppA	rbfA	TRUE	0.583	15.000	0.000	1.000	N	NA
7268958	7268959	PERMA_0393	PERMA_0394	rbfA		TRUE	0.977	-3.000	0.113	NA		NA
7268959	7268960	PERMA_0394	PERMA_0395			FALSE	0.464	36.000	0.000	NA		NA
7268960	7268961	PERMA_0395	PERMA_0396			TRUE	0.895	-7.000	0.006	NA	N	NA
7268961	7268962	PERMA_0396	PERMA_0397			TRUE	0.974	1.000	0.145	1.000	N	NA
7268962	7268963	PERMA_0397	PERMA_0398			FALSE	0.481	35.000	0.000	NA		NA
7268963	7268964	PERMA_0398	PERMA_0399		rpsT	TRUE	0.638	8.000	0.000	NA		NA
7268965	7268966	PERMA_0400	PERMA_0401			FALSE	0.050	108.000	0.000	1.000	N	NA
7268967	7268968	PERMA_0402	PERMA_0403	rgy		FALSE	0.069	74.000	0.000	1.000	N	NA
7268969	7268970	PERMA_0404	PERMA_0405			FALSE	0.152	43.000	0.000	1.000	N	NA
7268970	7268971	PERMA_0405	PERMA_0406			TRUE	0.924	1.000	0.005	1.000	N	NA
7268971	7268972	PERMA_0406	PERMA_0407			TRUE	0.751	1.000	0.000	1.000		NA
7268972	7268973	PERMA_0407	PERMA_0408			FALSE	0.234	58.000	0.000	1.000		NA
7268973	7268974	PERMA_0408	PERMA_0409			TRUE	0.970	-3.000	0.165	1.000	N	NA
7268974	7268975	PERMA_0409	PERMA_0410			FALSE	0.115	151.000	0.000	1.000		NA
7268975	7268976	PERMA_0410	PERMA_0411			TRUE	0.939	16.000	0.000	0.021		NA
7268976	7268977	PERMA_0411	PERMA_0412			TRUE	0.997	15.000	0.556	0.003		NA
7268977	7268978	PERMA_0412	PERMA_0413			TRUE	0.893	57.000	0.600	NA		NA
7268978	7268979	PERMA_0413	PERMA_0414			TRUE	0.986	0.000	0.667	NA		NA
7268979	7268980	PERMA_0414	PERMA_0416			FALSE	0.101	205.000	0.000	NA		NA
7268981	7268982	PERMA_0415	PERMA_0417		kdsA	TRUE	0.611	26.000	0.000	NA		NA
7268983	7268984	PERMA_0418	PERMA_0419			FALSE	0.128	94.000	0.000	NA		NA
7268984	7268985	PERMA_0419	PERMA_0420			TRUE	0.628	26.000	0.000	1.000		NA
7268985	7268986	PERMA_0420	PERMA_0421			TRUE	0.903	0.000	0.000	0.032		NA
7268986	7268987	PERMA_0421	PERMA_0422			TRUE	0.860	2.000	0.000	0.085	N	NA
7268987	7268988	PERMA_0422	PERMA_0423		rnhA	FALSE	0.552	2.000	0.000	1.000	N	NA
7268988	7268989	PERMA_0423	PERMA_0424	rnhA	radA	TRUE	0.862	6.000	0.003	1.000	N	NA
7268989	7268990	PERMA_0424	PERMA_0425	radA		TRUE	0.849	5.000	0.002	1.000	N	NA
7268990	7268991	PERMA_0425	PERMA_0426		pyrF	FALSE	0.061	82.000	0.000	1.000	N	NA
7268991	7268992	PERMA_0426	PERMA_0427	pyrF	rpoN	TRUE	0.868	-6.000	0.003	1.000	N	NA
7268992	7268993	PERMA_0427	PERMA_0428	rpoN		TRUE	0.958	-3.000	0.050	NA	N	NA
7268993	7268994	PERMA_0428	PERMA_0429		rplM	TRUE	0.723	75.000	0.002	NA	Y	NA
7268994	7268995	PERMA_0429	PERMA_0430	rplM	rpsI	TRUE	0.998	18.000	0.051	0.026	Y	NA
7268995	7268996	PERMA_0430	PERMA_0431	rpsI	argC	TRUE	0.557	97.000	0.031	1.000	N	NA
7268996	7268997	PERMA_0431	PERMA_0432	argC	rfaE_1	TRUE	0.899	-3.000	0.004	1.000	N	NA
7268997	7268998	PERMA_0432	PERMA_0433	rfaE_1	purS	FALSE	0.237	37.000	0.000	1.000	N	NA
7268998	7268999	PERMA_0433	PERMA_0435	purS	purQ	TRUE	0.998	11.000	0.656	0.002	Y	NA
7269002	7269003	PERMA_0436	PERMA_0438			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269003	7269004	PERMA_0438	PERMA_0439			FALSE	0.251	51.000	0.000	NA		NA
7269004	7269005	PERMA_0439	PERMA_0440			TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
7269005	7269006	PERMA_0440	PERMA_0441			TRUE	0.662	-6.000	0.000	NA		NA
7269006	7269007	PERMA_0441	PERMA_0442			FALSE	0.211	60.000	0.000	NA		NA
7269007	7269008	PERMA_0442	PERMA_0443			FALSE	0.112	128.000	0.000	NA		NA
7269009	7269010	PERMA_0444	PERMA_0445	hemC		FALSE	0.415	7.000	0.000	1.000	N	NA
7269010	7269011	PERMA_0445	PERMA_0446			FALSE	0.477	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7269011	7269012	PERMA_0446	PERMA_0447			FALSE	0.525	33.000	0.000	1.000		NA
7269012	7269013	PERMA_0447	PERMA_0449			TRUE	0.974	-7.000	0.136	1.000		NA
7269015	7269016	PERMA_0450	PERMA_0451			TRUE	0.922	0.000	0.005	1.000	N	NA
7269016	7269017	PERMA_0451	PERMA_0452			FALSE	0.160	73.000	0.000	NA		NA
7269017	7269018	PERMA_0452	PERMA_0453			TRUE	0.980	10.000	0.500	NA		NA
7269018	7269019	PERMA_0453	PERMA_0454		dapB	TRUE	0.940	0.000	0.004	NA		NA
7269019	7269020	PERMA_0454	PERMA_0456	dapB		TRUE	0.926	4.000	0.004	NA		NA
7269021	7269022	PERMA_0455	PERMA_0457		nth	TRUE	0.783	14.000	0.000	1.000		NA
7269022	7269023	PERMA_0457	PERMA_0458	nth		TRUE	0.980	2.000	0.000	0.007	Y	NA
7269023	7269024	PERMA_0458	PERMA_0459			FALSE	0.410	9.000	0.000	1.000	N	NA
7269024	7269025	PERMA_0459	PERMA_0460		hemB	FALSE	0.422	5.000	0.000	1.000	N	NA
7269025	7269026	PERMA_0460	PERMA_0461	hemB		FALSE	0.287	46.000	0.000	NA		NA
7269026	7269027	PERMA_0461	PERMA_0462			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7269027	7269028	PERMA_0462	PERMA_0463			TRUE	0.981	8.000	0.013	1.000	Y	NA
7269028	7269029	PERMA_0463	PERMA_0464			TRUE	0.946	-3.000	0.019	1.000	N	NA
7269029	7269030	PERMA_0464	PERMA_0465		feoB	FALSE	0.552	2.000	0.000	1.000	N	NA
7269030	7269031	PERMA_0465	PERMA_0466	feoB		TRUE	0.986	-10.000	0.046	1.000	Y	NA
7269031	7269032	PERMA_0466	PERMA_0467			FALSE	0.513	86.000	0.004	1.000		NA
7269036	7269037	PERMA_0471	PERMA_0472			FALSE	0.114	119.000	0.000	NA		NA
7269037	7269038	PERMA_0472	PERMA_0473		trpS	FALSE	0.116	113.000	0.000	NA		NA
7269041	7269042	PERMA_0476	PERMA_0477			FALSE	0.094	422.000	0.000	NA		NA
7269042	7269043	PERMA_0477	PERMA_0478			TRUE	0.585	-13.000	0.000	NA		NA
7269043	7269044	PERMA_0478	PERMA_0479			TRUE	0.639	10.000	0.000	NA		NA
7269044	7269045	PERMA_0479	PERMA_0480			FALSE	0.093	611.000	0.000	NA		NA
7269045	7269046	PERMA_0480	PERMA_0481			FALSE	0.439	37.000	0.000	NA		NA
7269046	7269047	PERMA_0481	PERMA_0482			FALSE	0.095	372.000	0.000	NA		NA
7269047	7269048	PERMA_0482	PERMA_0483			FALSE	0.096	300.000	0.000	NA		NA
7269049	7269050	PERMA_0484	PERMA_0485			FALSE	0.097	1125.000	0.000	1.000		NA
7269050	7269051	PERMA_0485	PERMA_0486			FALSE	0.113	125.000	0.000	NA		NA
7269051	7269052	PERMA_0486	PERMA_0487			TRUE	0.704	22.000	0.000	NA		NA
7269052	7269053	PERMA_0487	PERMA_0488			TRUE	0.664	4.000	0.000	NA		NA
7269053	7269054	PERMA_0488	PERMA_0489			TRUE	0.945	-3.000	0.006	NA		NA
7269054	7269055	PERMA_0489	PERMA_0490		cgtA	TRUE	0.730	21.000	0.000	NA		NA
7269055	7269056	PERMA_0490	PERMA_0491	cgtA		FALSE	0.523	56.000	0.000	0.048		NA
7269056	7269057	PERMA_0491	PERMA_0492		rpmB	FALSE	0.438	84.000	0.002	1.000		NA
7269058	7269059	PERMA_0493	PERMA_0494			FALSE	0.476	46.000	0.000	0.030	N	NA
7269059	7269060	PERMA_0494	PERMA_0495		mtnA	TRUE	0.814	73.000	0.006	1.000	Y	NA
7269060	7269061	PERMA_0495	PERMA_0496	mtnA		TRUE	0.963	2.000	0.008	NA		NA
7269061	7269062	PERMA_0496	PERMA_0497		nadB	TRUE	0.968	1.000	0.016	NA		NA
7269062	7269063	PERMA_0497	PERMA_0498	nadB	infC	FALSE	0.281	165.000	0.003	1.000	N	NA
7269063	7269064	PERMA_0498	PERMA_0499	infC		FALSE	0.059	84.000	0.000	1.000	N	NA
7269065	7269066	PERMA_0500	PERMA_0501		trpF	TRUE	0.927	2.000	0.004	1.000	N	NA
7269066	7269067	PERMA_0501	PERMA_0502	trpF		TRUE	0.628	-9.000	0.000	NA		NA
7269067	7269068	PERMA_0502	PERMA_0503			TRUE	0.972	-3.000	0.046	NA		NA
7269068	7269069	PERMA_0503	PERMA_0504			TRUE	0.954	3.000	0.029	1.000	N	NA
7269069	7269070	PERMA_0504	PERMA_0505		leuD	TRUE	0.938	6.000	0.029	1.000	N	NA
7269071	7269072	PERMA_0506	PERMA_0507		fabG	FALSE	0.350	71.000	0.000	0.013	N	NA
7269072	7269073	PERMA_0507	PERMA_0508	fabG	acpP	TRUE	0.992	39.000	0.321	0.007	Y	NA
7269073	7269074	PERMA_0508	PERMA_0509	acpP	fabF	TRUE	0.989	7.000	0.066	1.000	Y	NA
7269074	7269075	PERMA_0509	PERMA_0511	fabF	rnc	TRUE	0.927	-10.000	0.023	1.000	N	NA
7269076	7269077	PERMA_0510	PERMA_0512			TRUE	0.704	22.000	0.000	NA		NA
7269077	7269078	PERMA_0512	PERMA_0513			FALSE	0.191	64.000	0.000	NA		NA
7269078	7269079	PERMA_0513	PERMA_0514			TRUE	0.840	68.000	0.400	NA		NA
7269079	7269080	PERMA_0514	PERMA_0515			FALSE	0.107	155.000	0.000	NA		NA
7269080	7269081	PERMA_0515	PERMA_0516			TRUE	0.776	18.000	0.000	NA		NA
7269081	7269082	PERMA_0516	PERMA_0517			FALSE	0.181	66.000	0.000	NA		NA
7269083	7269084	PERMA_0518	PERMA_0519			TRUE	0.937	13.000	0.000	1.000	Y	NA
7269084	7269085	PERMA_0519	PERMA_0521			TRUE	0.969	1.000	0.016	1.000		NA
7269086	7269087	PERMA_0520	PERMA_0522	ksgA	galU	TRUE	0.886	0.000	0.003	1.000	N	NA
7269087	7269088	PERMA_0522	PERMA_0523	galU	purC	TRUE	0.916	4.000	0.008	1.000	N	NA
7269088	7269089	PERMA_0523	PERMA_0524	purC		TRUE	0.777	13.000	0.000	1.000		NA
7269089	7269090	PERMA_0524	PERMA_0525			FALSE	0.312	45.000	0.000	1.000		NA
7269090	7269091	PERMA_0525	PERMA_0526			TRUE	0.711	-3.000	0.000	1.000		NA
7269093	7269094	PERMA_0528	PERMA_0529			TRUE	0.998	3.000	0.500	0.003	Y	NA
7269094	7269095	PERMA_0529	PERMA_0530			TRUE	0.998	20.000	0.045	0.003	Y	NA
7269095	7269096	PERMA_0530	PERMA_0531			TRUE	0.949	79.000	0.017	0.003	Y	NA
7269096	7269097	PERMA_0531	PERMA_0532		recR	FALSE	0.471	72.000	0.005	1.000	N	NA
7269097	7269098	PERMA_0532	PERMA_0533	recR		TRUE	0.985	-3.000	0.604	NA		NA
7269098	7269099	PERMA_0533	PERMA_0534		dnaX	TRUE	0.940	1.000	0.003	NA		NA
7269099	7269100	PERMA_0534	PERMA_0535	dnaX		TRUE	0.813	56.000	0.036	1.000		NA
7269103	7269104	PERMA_0538	PERMA_0539	miaA	hfq_1	TRUE	0.976	18.000	0.017	1.000		NA
7269104	7269105	PERMA_0539	PERMA_0540	hfq_1	hflX	TRUE	0.956	22.000	0.008	1.000		NA
7269105	7269106	PERMA_0540	PERMA_0541	hflX		TRUE	0.956	2.000	0.005	1.000		NA
7269106	7269107	PERMA_0541	PERMA_0542			TRUE	0.883	-9.000	0.005	1.000	N	NA
7269108	7269109	PERMA_0543	PERMA_0544		hisB	TRUE	0.908	13.000	0.002	1.000	N	NA
7269109	7269110	PERMA_0544	PERMA_0545	hisB		TRUE	0.920	12.000	0.004	1.000	N	NA
7269110	7269111	PERMA_0545	PERMA_0546			FALSE	0.191	64.000	0.000	NA		NA
7269111	7269112	PERMA_0546	PERMA_0547			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269112	7269113	PERMA_0547	PERMA_0548			TRUE	0.968	-3.000	0.029	1.000		NA
7269114	7269115	PERMA_0549	PERMA_0550			TRUE	0.597	27.000	0.000	NA		NA
7269115	7269116	PERMA_0550	PERMA_0551			FALSE	0.257	50.000	0.000	NA		NA
7269116	7269117	PERMA_0551	PERMA_0552			TRUE	0.886	46.000	0.125	NA		NA
7269117	7269118	PERMA_0552	PERMA_0553			FALSE	0.097	260.000	0.000	NA		NA
7269118	7269119	PERMA_0553	PERMA_0554			FALSE	0.115	117.000	0.000	NA		NA
7269121	7269122	PERMA_0556	PERMA_0557	ahcY		TRUE	0.895	28.000	0.004	NA		NA
7269122	7269123	PERMA_0557	PERMA_0558		ilvD	TRUE	0.960	15.000	0.005	NA		NA
7269123	7269124	PERMA_0558	PERMA_0559	ilvD	metK	TRUE	0.928	21.000	0.006	1.000	N	NA
7269124	7269125	PERMA_0559	PERMA_0561	metK		TRUE	0.918	-7.000	0.004	NA		NA
7269126	7269127	PERMA_0560	PERMA_0562	lpdA		TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7269127	7269128	PERMA_0562	PERMA_0563			TRUE	0.782	17.000	0.000	NA		NA
7269128	7269129	PERMA_0563	PERMA_0564			TRUE	0.975	4.000	0.133	NA		NA
7269129	7269130	PERMA_0564	PERMA_0565			TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7269130	7269131	PERMA_0565	PERMA_0566			TRUE	0.966	20.000	0.010	NA		NA
7269131	7269132	PERMA_0566	PERMA_0567			TRUE	0.951	-7.000	0.015	NA		NA
7269132	7269133	PERMA_0567	PERMA_0568		ppsA	TRUE	0.672	98.000	0.222	NA	N	NA
7269133	7269134	PERMA_0568	PERMA_0569	ppsA	glyS	TRUE	0.906	24.000	0.006	1.000	N	NA
7269134	7269135	PERMA_0569	PERMA_0570	glyS	glyQ	TRUE	0.999	1.000	0.651	0.001	Y	NA
7269135	7269136	PERMA_0570	PERMA_0571	glyQ	truD_1	FALSE	0.196	65.000	0.000	1.000		NA
7269137	7269138	PERMA_0572	PERMA_0573		trpB	FALSE	0.531	12.000	0.000	1.000	N	NA
7269138	7269139	PERMA_0573	PERMA_0574	trpB		TRUE	0.655	10.000	0.000	1.000		NA
7269139	7269140	PERMA_0574	PERMA_0576			FALSE	0.157	78.000	0.000	1.000		NA
7269141	7269142	PERMA_0575	PERMA_0577			TRUE	0.646	-7.000	0.000	NA		NA
7269142	7269143	PERMA_0577	PERMA_0578			TRUE	0.985	3.000	0.500	NA		NA
7269143	7269144	PERMA_0578	PERMA_0579		kdsB	FALSE	0.396	39.000	0.000	1.000		NA
7269144	7269145	PERMA_0579	PERMA_0580	kdsB		FALSE	0.304	44.000	0.000	NA		NA
7269145	7269146	PERMA_0580	PERMA_0581		thiG	FALSE	0.323	42.000	0.000	NA		NA
7269146	7269147	PERMA_0581	PERMA_0582	thiG		TRUE	0.907	28.000	0.005	1.000		NA
7269147	7269148	PERMA_0582	PERMA_0583			TRUE	0.955	11.000	0.011	1.000		NA
7269149	7269150	PERMA_0584	PERMA_0585	fmt		TRUE	0.675	43.000	0.000	1.000	Y	NA
7269150	7269151	PERMA_0585	PERMA_0586		petA	FALSE	0.046	141.000	0.000	1.000	N	NA
7269151	7269152	PERMA_0586	PERMA_0587	petA		TRUE	0.998	13.000	0.093	0.002	Y	NA
7269152	7269153	PERMA_0587	PERMA_0588			TRUE	0.998	0.000	0.103	0.002	Y	NA
7269154	7269155	PERMA_0589	PERMA_0590	proC		FALSE	0.420	-7.000	0.000	1.000	N	NA
7269155	7269156	PERMA_0590	PERMA_0591			FALSE	0.518	21.000	0.000	1.000	N	NA
7269156	7269157	PERMA_0591	PERMA_0592			TRUE	0.969	-7.000	0.062	1.000		NA
7269159	7269160	PERMA_0594	PERMA_0595		argS	TRUE	0.942	2.000	0.003	NA		NA
7269161	7269162	PERMA_0596	PERMA_0597	pyrG	acsA_1	FALSE	0.107	56.000	0.000	1.000	N	NA
7269162	7269163	PERMA_0597	PERMA_0598	acsA_1	hslU	FALSE	0.089	63.000	0.000	1.000	N	NA
7269163	7269164	PERMA_0598	PERMA_0599	hslU		TRUE	0.983	14.000	0.003	0.015		NA
7269164	7269165	PERMA_0599	PERMA_0600			TRUE	0.968	11.000	0.039	NA		NA
7269166	7269167	PERMA_0601	PERMA_0602			FALSE	0.464	36.000	0.000	NA		NA
7269167	7269168	PERMA_0602	PERMA_0603			FALSE	0.108	153.000	0.000	NA		NA
7269168	7269169	PERMA_0603	PERMA_0604		smpB	TRUE	0.627	25.000	0.000	NA		NA
7269170	7269171	PERMA_0605	PERMA_0606		purB	FALSE	0.144	45.000	0.000	1.000	N	NA
7269171	7269172	PERMA_0606	PERMA_0607	purB		FALSE	0.477	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7269173	7269174	PERMA_0608	PERMA_0609		nadE	TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
7269175	7269176	PERMA_0610	PERMA_0611			FALSE	0.287	46.000	0.000	NA		NA
7269176	7269177	PERMA_0611	PERMA_0612			TRUE	0.991	13.000	1.000	NA		NA
7269177	7269178	PERMA_0612	PERMA_0613			TRUE	0.985	1.000	0.286	NA		NA
7269178	7269179	PERMA_0613	PERMA_0614			FALSE	0.181	66.000	0.000	NA		NA
7269180	7269181	PERMA_0615	PERMA_0616	plsY	pgsA_1	TRUE	0.934	-9.000	0.007	1.000		NA
7269181	7269182	PERMA_0616	PERMA_0617	pgsA_1	ftsZ	TRUE	0.887	-3.000	0.003	1.000	N	NA
7269182	7269183	PERMA_0617	PERMA_0618	ftsZ	ftsA	TRUE	0.996	20.000	0.460	1.000	Y	NA
7269183	7269184	PERMA_0618	PERMA_0619	ftsA		TRUE	0.970	4.000	0.389	NA	N	NA
7269184	7269185	PERMA_0619	PERMA_0620			TRUE	0.990	-13.000	0.372	NA	Y	NA
7269185	7269186	PERMA_0620	PERMA_0621		murB	TRUE	0.997	-7.000	0.135	0.006	Y	NA
7269186	7269187	PERMA_0621	PERMA_0622	murB	murG	TRUE	0.972	-13.000	0.007	1.000	Y	NA
7269187	7269188	PERMA_0622	PERMA_0623	murG		TRUE	0.944	-3.000	0.017	1.000	N	NA
7269188	7269189	PERMA_0623	PERMA_0624		murD	TRUE	0.955	-7.000	0.085	1.000	N	NA
7269191	7269192	PERMA_0626	PERMA_0627		gltA	FALSE	0.127	95.000	0.000	NA		NA
7269192	7269193	PERMA_0627	PERMA_0628	gltA	argF	TRUE	0.985	14.000	0.004	1.000	Y	NA
7269193	7269194	PERMA_0628	PERMA_0629	argF	pyrB	TRUE	0.652	91.000	0.002	0.001	N	NA
7269194	7269195	PERMA_0629	PERMA_0630	pyrB		FALSE	0.125	49.000	0.000	1.000	N	NA
7269195	7269196	PERMA_0630	PERMA_0631		truB	FALSE	0.531	12.000	0.000	1.000	N	NA
7269196	7269197	PERMA_0631	PERMA_0632	truB		TRUE	0.950	13.000	0.009	1.000	N	NA
7269197	7269198	PERMA_0632	PERMA_0633		lgt	TRUE	0.910	-3.000	0.005	1.000	N	NA
7269198	7269199	PERMA_0633	PERMA_0634	lgt	def_2	TRUE	0.935	13.000	0.005	1.000	N	NA
7269199	7269200	PERMA_0634	PERMA_0635	def_2	rpe	TRUE	0.975	3.000	0.250	1.000	N	NA
7269202	7269203	PERMA_0636	PERMA_0638			TRUE	0.922	4.000	0.004	NA		NA
7269203	7269204	PERMA_0638	PERMA_0639		lepB	FALSE	0.110	55.000	0.000	1.000	N	NA
7269204	7269205	PERMA_0639	PERMA_0640	lepB		TRUE	0.988	17.000	1.000	1.000	N	NA
7269205	7269206	PERMA_0640	PERMA_0641		purE	FALSE	0.388	-10.000	0.000	1.000	N	NA
7269206	7269207	PERMA_0641	PERMA_0642	purE		FALSE	0.531	12.000	0.000	1.000	N	NA
7269208	7269209	PERMA_0643	PERMA_0644	truA	era	TRUE	0.982	12.000	0.005	0.027		NA
7269209	7269210	PERMA_0644	PERMA_0645	era	mgtE	TRUE	0.952	9.000	0.016	1.000		NA
7269211	7269212	PERMA_0646	PERMA_0647			FALSE	0.228	59.000	0.000	1.000		NA
7269213	7269214	PERMA_0648	PERMA_0649	fabD	bioD	TRUE	0.879	-3.000	0.003	1.000	N	NA
7269214	7269215	PERMA_0649	PERMA_0651	bioD		TRUE	0.960	0.000	0.012	NA		NA
7269216	7269217	PERMA_0650	PERMA_0652			TRUE	0.578	-16.000	0.000	1.000		NA
7269218	7269219	PERMA_0653	PERMA_0654			TRUE	0.916	47.000	0.600	NA		NA
7269219	7269220	PERMA_0654	PERMA_0655			TRUE	0.979	25.000	0.500	NA		NA
7269220	7269221	PERMA_0655	PERMA_0656			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269221	7269222	PERMA_0656	PERMA_0657			TRUE	0.972	-13.000	0.333	NA		NA
7269222	7269223	PERMA_0657	PERMA_0658			TRUE	0.995	18.000	0.167	1.000	Y	NA
7269223	7269224	PERMA_0658	PERMA_0659			TRUE	0.978	27.000	0.583	1.000		NA
7269224	7269225	PERMA_0659	PERMA_0660			TRUE	0.984	15.000	0.095	NA		NA
7269225	7269226	PERMA_0660	PERMA_0661			TRUE	0.968	24.000	0.054	NA		NA
7269226	7269227	PERMA_0661	PERMA_0662			TRUE	0.973	3.000	0.243	NA	N	NA
7269227	7269228	PERMA_0662	PERMA_0663			TRUE	0.985	19.000	0.784	NA	N	NA
7269228	7269229	PERMA_0663	PERMA_0664			TRUE	0.943	37.000	0.156	1.000		NA
7269229	7269230	PERMA_0664	PERMA_0665			TRUE	0.757	36.000	0.000	0.051		NA
7269230	7269231	PERMA_0665	PERMA_0666			FALSE	0.117	137.000	0.000	1.000		NA
7269231	7269232	PERMA_0666	PERMA_0667			TRUE	0.963	30.000	0.125	1.000		NA
7269232	7269233	PERMA_0667	PERMA_0668			FALSE	0.550	148.000	0.013	NA		NA
7269233	7269234	PERMA_0668	PERMA_0669			FALSE	0.093	612.000	0.000	NA		NA
7269234	7269235	PERMA_0669	PERMA_0670			TRUE	0.951	-12.000	0.029	NA		NA
7269235	7269236	PERMA_0670	PERMA_0671			TRUE	0.750	20.000	0.000	NA		NA
7269237	7269238	PERMA_0672	PERMA_0673			FALSE	0.311	43.000	0.000	NA		NA
7269238	7269239	PERMA_0673	PERMA_0674			FALSE	0.290	-22.000	0.000	NA	N	NA
7269239	7269240	PERMA_0674	PERMA_0675		ftsL	TRUE	0.956	11.000	0.012	1.000		NA
7269240	7269241	PERMA_0675	PERMA_0676	ftsL	mraW	TRUE	0.986	2.000	0.227	1.000		NA
7269241	7269242	PERMA_0676	PERMA_0677	mraW		TRUE	0.905	3.000	0.004	1.000	N	NA
7269242	7269243	PERMA_0677	PERMA_0678			TRUE	0.631	-10.000	0.000	1.000		NA
7269243	7269244	PERMA_0678	PERMA_0679			TRUE	0.711	-3.000	0.000	1.000		NA
7269244	7269245	PERMA_0679	PERMA_0680			TRUE	0.791	15.000	0.000	1.000		NA
7269245	7269246	PERMA_0680	PERMA_0681			TRUE	0.980	-3.000	0.800	1.000	N	NA
7269246	7269247	PERMA_0681	PERMA_0682			TRUE	0.988	-15.000	0.200	1.000	Y	NA
7269247	7269248	PERMA_0682	PERMA_0683			TRUE	0.712	3.000	0.000	NA		NA
7269249	7269250	PERMA_0684	PERMA_0685	ileS		TRUE	0.900	-3.000	0.004	1.000	N	NA
7269251	7269252	PERMA_0686	PERMA_0687			TRUE	0.738	1.000	0.000	NA		NA
7269252	7269253	PERMA_0687	PERMA_0688			FALSE	0.251	51.000	0.000	NA		NA
7269254	7269255	PERMA_0689	PERMA_0691			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269256	7269257	PERMA_0690	PERMA_0692			TRUE	0.995	-3.000	0.635	1.000	Y	NA
7269257	7269258	PERMA_0692	PERMA_0693			TRUE	0.994	-3.000	0.470	1.000	Y	NA
7269258	7269259	PERMA_0693	PERMA_0694			TRUE	0.991	-7.000	0.273	0.025		NA
7269260	7269261	PERMA_0695	PERMA_0696			TRUE	0.999	21.000	0.900	0.003	Y	NA
7269261	7269262	PERMA_0696	PERMA_0697			TRUE	0.997	-7.000	0.700	0.051	Y	NA
7269262	7269263	PERMA_0697	PERMA_0698			FALSE	0.155	75.000	0.000	NA		NA
7269263	7269264	PERMA_0698	PERMA_0699			TRUE	0.965	-16.000	0.200	NA		NA
7269264	7269265	PERMA_0699	PERMA_0700			TRUE	0.646	-7.000	0.000	NA		NA
7269265	7269266	PERMA_0700	PERMA_0701			TRUE	0.738	1.000	0.000	NA		NA
7269266	7269267	PERMA_0701	PERMA_0702		moxR	FALSE	0.178	69.000	0.000	1.000		NA
7269267	7269268	PERMA_0702	PERMA_0703	moxR		TRUE	0.982	-3.000	0.333	NA		NA
7269268	7269269	PERMA_0703	PERMA_0705		hypF	FALSE	0.205	61.000	0.000	NA		NA
7269270	7269271	PERMA_0704	PERMA_0706		flhB	FALSE	0.191	64.000	0.000	NA		NA
7269271	7269272	PERMA_0706	PERMA_0707	flhB		TRUE	0.998	1.000	0.353	0.081	Y	NA
7269272	7269273	PERMA_0707	PERMA_0708		fliQ	TRUE	0.992	3.000	0.078	1.000	Y	NA
7269273	7269274	PERMA_0708	PERMA_0709	fliQ	fliP	TRUE	0.995	8.000	0.032	0.012	Y	NA
7269274	7269275	PERMA_0709	PERMA_0710	fliP		TRUE	0.933	26.000	0.008	NA		NA
7269275	7269276	PERMA_0710	PERMA_0711			TRUE	0.981	-7.000	0.600	NA		NA
7269276	7269277	PERMA_0711	PERMA_0712		fliL	TRUE	0.987	9.000	0.024	0.003		NA
7269277	7269278	PERMA_0712	PERMA_0713	fliL		TRUE	0.995	23.000	0.024	0.010	Y	NA
7269278	7269279	PERMA_0713	PERMA_0714			TRUE	0.991	5.000	0.188	NA	Y	NA
7269279	7269280	PERMA_0714	PERMA_0715		fliI	TRUE	0.985	-22.000	0.156	NA	Y	NA
7269280	7269281	PERMA_0715	PERMA_0716	fliI		TRUE	0.972	-40.000	1.000	NA		NA
7269281	7269282	PERMA_0716	PERMA_0717		fliF	TRUE	0.974	2.000	0.024	NA		NA
7269282	7269283	PERMA_0717	PERMA_0718	fliF	fliE	TRUE	0.998	13.000	0.180	0.008	Y	NA
7269283	7269284	PERMA_0718	PERMA_0719	fliE	flgC	TRUE	0.998	22.000	0.271	0.005	Y	NA
7269284	7269285	PERMA_0719	PERMA_0720	flgC	flgB	TRUE	0.997	15.000	0.804	1.000	Y	NA
7269285	7269286	PERMA_0720	PERMA_0721	flgB		TRUE	0.957	-3.000	0.010	1.000		NA
7269286	7269287	PERMA_0721	PERMA_0722			TRUE	0.585	-13.000	0.000	NA		NA
7269287	7269288	PERMA_0722	PERMA_0723			FALSE	0.205	61.000	0.000	NA		NA
7269288	7269289	PERMA_0723	PERMA_0724			TRUE	0.953	4.000	0.045	1.000	N	NA
7269289	7269290	PERMA_0724	PERMA_0725		flhF	TRUE	0.988	11.000	0.382	0.081	N	NA
7269290	7269291	PERMA_0725	PERMA_0726	flhF	flhA	TRUE	0.992	-10.000	0.440	1.000	Y	NA
7269291	7269292	PERMA_0726	PERMA_0727	flhA		TRUE	0.989	1.000	0.020	NA	Y	NA
7269292	7269293	PERMA_0727	PERMA_0728		flgI	TRUE	0.993	10.000	0.625	NA	Y	NA
7269293	7269294	PERMA_0728	PERMA_0729	flgI	flgH	TRUE	0.998	10.000	0.833	0.010	Y	NA
7269294	7269295	PERMA_0729	PERMA_0730	flgH		TRUE	0.627	186.000	0.043	NA		NA
7269295	7269296	PERMA_0730	PERMA_0731		flgG	TRUE	0.967	-19.000	0.319	NA		NA
7269296	7269297	PERMA_0731	PERMA_0732	flgG		TRUE	0.998	16.000	0.148	0.006	Y	NA
7269297	7269298	PERMA_0732	PERMA_0733			TRUE	0.979	54.000	0.074	0.008	Y	NA
7269298	7269299	PERMA_0733	PERMA_0734		fliM	TRUE	0.969	-7.000	0.000	0.003	Y	NA
7269299	7269300	PERMA_0734	PERMA_0735	fliM	fliG	TRUE	0.995	12.000	0.007	0.008	Y	NA
7269300	7269301	PERMA_0735	PERMA_0736	fliG		TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7269301	7269302	PERMA_0736	PERMA_0737			TRUE	0.646	-7.000	0.000	NA		NA
7269302	7269303	PERMA_0737	PERMA_0738			TRUE	0.973	3.000	0.000	0.009	Y	NA
7269303	7269304	PERMA_0738	PERMA_0739			TRUE	0.838	32.000	0.000	1.000	Y	NA
7269304	7269305	PERMA_0739	PERMA_0740			TRUE	0.997	11.000	0.091	0.009	Y	NA
7269305	7269306	PERMA_0740	PERMA_0741			TRUE	0.997	22.000	0.045	0.010	Y	NA
7269306	7269307	PERMA_0741	PERMA_0742			TRUE	0.997	0.000	0.033	0.009	Y	NA
7269307	7269308	PERMA_0742	PERMA_0743			TRUE	0.719	22.000	0.000	1.000		NA
7269308	7269309	PERMA_0743	PERMA_0744			TRUE	0.566	-19.000	0.000	1.000		NA
7269309	7269310	PERMA_0744	PERMA_0745		cheR	TRUE	0.991	-3.000	0.051	1.000	Y	NA
7269312	7269313	PERMA_0747	PERMA_0748			FALSE	0.409	38.000	0.000	NA		NA
7269313	7269314	PERMA_0748	PERMA_0749			FALSE	0.108	146.000	0.000	NA		NA
7269317	7269318	PERMA_0752	PERMA_0753			TRUE	0.985	0.000	0.429	NA		NA
7269318	7269319	PERMA_0753	PERMA_0754			TRUE	0.696	11.000	0.000	1.000		NA
7269319	7269320	PERMA_0754	PERMA_0755			TRUE	0.696	11.000	0.000	1.000		NA
7269320	7269321	PERMA_0755	PERMA_0756			TRUE	0.710	43.000	0.007	1.000	N	NA
7269321	7269322	PERMA_0756	PERMA_0757			FALSE	0.356	153.000	0.000	1.000	Y	NA
7269323	7269324	PERMA_0758	PERMA_0759	mutS		FALSE	0.548	32.000	0.000	1.000		NA
7269325	7269326	PERMA_0760	PERMA_0762	miaB		TRUE	0.981	17.000	0.037	NA		NA
7269327	7269328	PERMA_0761	PERMA_0763		plsX	TRUE	0.996	6.000	0.058	0.007	Y	NA
7269328	7269329	PERMA_0763	PERMA_0764	plsX	rpmF	TRUE	0.980	1.000	0.418	1.000	N	NA
7269332	7269333	PERMA_0767	PERMA_0769			FALSE	0.532	-37.000	0.000	1.000		NA
7269334	7269335	PERMA_0768	PERMA_0770			TRUE	0.954	-3.000	0.009	NA		NA
7269335	7269336	PERMA_0770	PERMA_0771			TRUE	0.980	10.000	0.500	NA		NA
7269336	7269337	PERMA_0771	PERMA_0772			TRUE	0.985	11.000	0.750	NA		NA
7269337	7269338	PERMA_0772	PERMA_0773			TRUE	0.990	14.000	0.750	NA		NA
7269338	7269339	PERMA_0773	PERMA_0774			TRUE	0.890	10.000	0.000	1.000	Y	NA
7269341	7269342	PERMA_0775	PERMA_0777		uvrB	FALSE	0.221	58.000	0.000	NA		NA
7269344	7269345	PERMA_0779	PERMA_0780			TRUE	0.962	2.000	0.007	NA		NA
7269345	7269346	PERMA_0780	PERMA_0781		moaA	FALSE	0.533	66.000	0.007	NA	N	NA
7269346	7269347	PERMA_0781	PERMA_0782	moaA		FALSE	0.116	142.000	0.000	1.000		NA
7269347	7269348	PERMA_0782	PERMA_0783			TRUE	0.929	0.000	0.003	NA		NA
7269349	7269350	PERMA_0784	PERMA_0785	leuS		FALSE	0.166	70.000	0.000	NA		NA
7269350	7269351	PERMA_0785	PERMA_0786			FALSE	0.094	402.000	0.000	NA		NA
7269351	7269352	PERMA_0786	PERMA_0788			TRUE	0.696	11.000	0.000	1.000		NA
7269353	7269354	PERMA_0787	PERMA_0789			TRUE	0.968	31.000	0.400	NA		NA
7269354	7269355	PERMA_0789	PERMA_0790		gidA	TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7269357	7269358	PERMA_0791	PERMA_0793			TRUE	0.585	-13.000	0.000	NA		NA
7269359	7269360	PERMA_0794	PERMA_0795		thiC	FALSE	0.310	105.000	0.003	1.000	N	NA
7269360	7269361	PERMA_0795	PERMA_0796	thiC		FALSE	0.179	40.000	0.000	1.000	N	NA
7269361	7269362	PERMA_0796	PERMA_0797			TRUE	0.990	3.000	0.038	1.000	Y	NA
7269362	7269363	PERMA_0797	PERMA_0798			TRUE	0.935	38.000	0.750	1.000	N	NA
7269363	7269364	PERMA_0798	PERMA_0799			TRUE	0.936	8.000	0.029	NA	N	NA
7269364	7269365	PERMA_0799	PERMA_0800			TRUE	0.983	2.000	0.117	NA		NA
7269367	7269368	PERMA_0802	PERMA_0803			TRUE	0.964	-3.000	0.086	1.000	N	NA
7269368	7269369	PERMA_0803	PERMA_0804			TRUE	0.969	-10.000	0.600	1.000	N	NA
7269369	7269370	PERMA_0804	PERMA_0805			TRUE	0.967	8.000	0.333	1.000	N	NA
7269370	7269371	PERMA_0805	PERMA_0806			FALSE	0.359	-13.000	0.000	1.000	N	NA
7269371	7269372	PERMA_0806	PERMA_0807			TRUE	0.992	2.000	0.077	0.079		NA
7269372	7269373	PERMA_0807	PERMA_0808			TRUE	0.726	3.000	0.000	1.000		NA
7269373	7269374	PERMA_0808	PERMA_0809			TRUE	0.653	9.000	0.000	1.000		NA
7269374	7269375	PERMA_0809	PERMA_0810			FALSE	0.413	10.000	0.000	1.000	N	NA
7269375	7269376	PERMA_0810	PERMA_0811			TRUE	0.996	-3.000	0.017	0.003	Y	NA
7269376	7269377	PERMA_0811	PERMA_0812			FALSE	0.061	82.000	0.000	1.000	N	NA
7269377	7269378	PERMA_0812	PERMA_0813			TRUE	0.986	4.000	1.000	1.000		NA
7269378	7269379	PERMA_0813	PERMA_0814		gspG	FALSE	0.498	35.000	0.000	1.000		NA
7269379	7269380	PERMA_0814	PERMA_0815	gspG		FALSE	0.533	-25.000	0.000	NA		NA
7269380	7269381	PERMA_0815	PERMA_0816			TRUE	0.615	-10.000	0.000	NA		NA
7269381	7269382	PERMA_0816	PERMA_0817			TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7269382	7269383	PERMA_0817	PERMA_0818			TRUE	0.639	10.000	0.000	NA		NA
7269383	7269384	PERMA_0818	PERMA_0819			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269384	7269385	PERMA_0819	PERMA_0820			FALSE	0.168	69.000	0.000	NA		NA
7269385	7269386	PERMA_0820	PERMA_0821			TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
7269386	7269387	PERMA_0821	PERMA_0822			FALSE	0.420	-7.000	0.000	1.000	N	NA
7269387	7269388	PERMA_0822	PERMA_0823		gspD	TRUE	0.984	-13.000	0.043	1.000	Y	NA
7269388	7269389	PERMA_0823	PERMA_0824	gspD		TRUE	0.997	3.000	0.043	0.005	Y	NA
7269389	7269390	PERMA_0824	PERMA_0826			TRUE	0.997	3.000	0.036	0.005	Y	NA
7269391	7269392	PERMA_0825	PERMA_0827			FALSE	0.494	0.000	0.000	1.000	N	NA
7269394	7269395	PERMA_0828	PERMA_0830			TRUE	0.949	-10.000	0.021	NA		NA
7269395	7269396	PERMA_0830	PERMA_0831			TRUE	0.959	10.000	0.031	NA		NA
7269396	7269397	PERMA_0831	PERMA_0832			TRUE	0.561	-16.000	0.000	NA		NA
7269397	7269398	PERMA_0832	PERMA_0833			TRUE	0.981	2.000	0.061	NA		NA
7269399	7269400	PERMA_0834	PERMA_0835			FALSE	0.097	256.000	0.000	NA		NA
7269400	7269401	PERMA_0835	PERMA_0836		acsA_2	TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7269401	7269402	PERMA_0836	PERMA_0837	acsA_2		TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7269402	7269403	PERMA_0837	PERMA_0838			TRUE	0.982	5.000	0.656	NA		NA
7269403	7269404	PERMA_0838	PERMA_0839			TRUE	0.957	32.000	0.113	1.000		NA
7269404	7269405	PERMA_0839	PERMA_0840			TRUE	0.970	2.000	0.050	1.000	N	NA
7269405	7269406	PERMA_0840	PERMA_0841			FALSE	0.160	73.000	0.000	NA		NA
7269406	7269407	PERMA_0841	PERMA_0842			FALSE	0.133	88.000	0.000	NA		NA
7269407	7269408	PERMA_0842	PERMA_0843			TRUE	0.615	-10.000	0.000	NA		NA
7269408	7269409	PERMA_0843	PERMA_0844			FALSE	0.489	34.000	0.000	NA		NA
7269409	7269410	PERMA_0844	PERMA_0845			FALSE	0.098	254.000	0.000	NA		NA
7269410	7269411	PERMA_0845	PERMA_0847			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269412	7269413	PERMA_0846	PERMA_0848			FALSE	0.379	39.000	0.000	NA		NA
7269414	7269415	PERMA_0849	PERMA_0850			TRUE	0.681	23.000	0.000	NA		NA
7269415	7269416	PERMA_0850	PERMA_0851			TRUE	0.971	-13.000	0.250	1.000		NA
7269416	7269417	PERMA_0851	PERMA_0852			FALSE	0.202	64.000	0.000	1.000		NA
7269417	7269418	PERMA_0852	PERMA_0853			TRUE	0.990	-3.000	0.037	1.000	Y	NA
7269418	7269419	PERMA_0853	PERMA_0854			TRUE	0.564	13.000	0.000	1.000	N	NA
7269419	7269420	PERMA_0854	PERMA_0855			TRUE	0.627	25.000	0.000	NA		NA
7269421	7269422	PERMA_0856	PERMA_0857			FALSE	0.187	67.000	0.000	1.000		NA
7269423	7269424	PERMA_0858	PERMA_0859			FALSE	0.520	64.000	0.000	1.000	Y	NA
7269424	7269425	PERMA_0859	PERMA_0861			FALSE	0.477	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7269426	7269427	PERMA_0860	PERMA_0862			FALSE	0.122	100.000	0.000	NA		NA
7269428	7269429	PERMA_0863	PERMA_0865			TRUE	0.970	-13.000	1.000	1.000	N	NA
7269430	7269431	PERMA_0864	PERMA_0866	hisF		FALSE	0.388	-10.000	0.000	1.000	N	NA
7269431	7269432	PERMA_0866	PERMA_0867			FALSE	0.494	0.000	0.000	1.000	N	NA
7269432	7269433	PERMA_0867	PERMA_0868			TRUE	0.968	12.000	0.016	NA		NA
7269433	7269434	PERMA_0868	PERMA_0869			FALSE	0.547	31.000	0.000	NA		NA
7269434	7269435	PERMA_0869	PERMA_0870			FALSE	0.445	-3.000	0.000	NA	N	NA
7269436	7269437	PERMA_0871	PERMA_0873			TRUE	0.990	2.000	0.750	NA		NA
7269441	7269442	PERMA_0876	PERMA_0877			FALSE	0.205	61.000	0.000	NA		NA
7269442	7269443	PERMA_0877	PERMA_0878			TRUE	0.993	-3.000	0.200	1.000	Y	NA
7269443	7269444	PERMA_0878	PERMA_0879			FALSE	0.531	12.000	0.000	1.000	N	NA
7269444	7269445	PERMA_0879	PERMA_0880			FALSE	0.172	68.000	0.000	NA		NA
7269445	7269446	PERMA_0880	PERMA_0881			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7269446	7269447	PERMA_0881	PERMA_0882			FALSE	0.185	65.000	0.000	NA		NA
7269447	7269448	PERMA_0882	PERMA_0883			TRUE	0.653	9.000	0.000	1.000		NA
7269448	7269449	PERMA_0883	PERMA_0884			TRUE	0.725	0.000	0.000	1.000		NA
7269449	7269450	PERMA_0884	PERMA_0885			TRUE	0.991	8.000	0.159	1.000	Y	NA
7269450	7269451	PERMA_0885	PERMA_0886			TRUE	0.965	10.000	0.048	NA		NA
7269451	7269452	PERMA_0886	PERMA_0887			TRUE	0.639	10.000	0.000	NA		NA
7269452	7269453	PERMA_0887	PERMA_0889			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269454	7269455	PERMA_0888	PERMA_0890			TRUE	0.946	2.000	0.009	NA	N	NA
7269455	7269456	PERMA_0890	PERMA_0891			TRUE	0.875	-10.000	0.000	NA	Y	NA
7269457	7269458	PERMA_0892	PERMA_0893			FALSE	0.495	3.000	0.000	1.000	N	NA
7269459	7269460	PERMA_0894	PERMA_0895			TRUE	0.664	4.000	0.000	NA		NA
7269460	7269461	PERMA_0895	PERMA_0896			FALSE	0.226	57.000	0.000	NA		NA
7269463	7269464	PERMA_0897	PERMA_0899			FALSE	0.148	78.000	0.000	NA		NA
7269465	7269466	PERMA_0900	PERMA_0901		bioA	FALSE	0.420	-7.000	0.000	1.000	N	NA
7269469	7269470	PERMA_0904	PERMA_0905	folE		TRUE	0.940	5.000	0.008	NA		NA
7269474	7269475	PERMA_0909	PERMA_0910	dnaA		FALSE	0.104	181.000	0.000	NA		NA
7269475	7269476	PERMA_0910	PERMA_0911			TRUE	0.585	28.000	0.000	NA		NA
7269476	7269477	PERMA_0911	PERMA_0912			TRUE	0.963	1.000	0.008	1.000		NA
7269477	7269478	PERMA_0912	PERMA_0913		leuA	TRUE	0.941	12.000	0.003	1.000		NA
7269478	7269479	PERMA_0913	PERMA_0914	leuA		FALSE	0.052	102.000	0.000	1.000	N	NA
7269479	7269480	PERMA_0914	PERMA_0915		hybA	TRUE	0.980	1.000	0.000	0.003	Y	NA
7269480	7269481	PERMA_0915	PERMA_0916	hybA		TRUE	0.976	2.000	0.125	1.000	N	NA
7269481	7269482	PERMA_0916	PERMA_0917			FALSE	0.123	46.000	0.000	NA	N	NA
7269482	7269483	PERMA_0917	PERMA_0918		hypB	FALSE	0.267	-45.000	0.000	NA	N	NA
7269483	7269484	PERMA_0918	PERMA_0919	hypB		TRUE	0.915	51.000	0.015	1.000	Y	NA
7269484	7269485	PERMA_0919	PERMA_0920			TRUE	0.916	9.000	0.010	1.000	N	NA
7269485	7269486	PERMA_0920	PERMA_0921			FALSE	0.359	-13.000	0.000	1.000	N	NA
7269488	7269489	PERMA_0923	PERMA_0924			FALSE	0.103	188.000	0.000	NA		NA
7269489	7269490	PERMA_0924	PERMA_0925		typA	TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7269491	7269492	PERMA_0926	PERMA_0927		uvrC	TRUE	0.846	-22.000	0.002	NA		NA
7269492	7269493	PERMA_0927	PERMA_0928	uvrC		FALSE	0.244	56.000	0.000	1.000		NA
7269493	7269494	PERMA_0928	PERMA_0929			TRUE	0.655	10.000	0.000	1.000		NA
7269494	7269495	PERMA_0929	PERMA_0931			TRUE	0.664	4.000	0.000	NA		NA
7269498	7269499	PERMA_0932	PERMA_0934		prtC	FALSE	0.064	78.000	0.000	1.000	N	NA
7269501	7269502	PERMA_0935	PERMA_0937			TRUE	0.569	-15.000	0.000	NA		NA
7269504	7269505	PERMA_0938	PERMA_0940		pncB	TRUE	0.956	-3.000	0.038	1.000	N	NA
7269505	7269506	PERMA_0940	PERMA_0941	pncB	murC	TRUE	0.903	-3.000	0.004	1.000	N	NA
7269507	7269508	PERMA_0942	PERMA_0944			TRUE	0.646	98.000	0.028	1.000		NA
7269509	7269510	PERMA_0943	PERMA_0945		sfsA	TRUE	0.954	3.000	0.008	NA		NA
7269510	7269511	PERMA_0945	PERMA_0946	sfsA	hemE	TRUE	0.648	5.000	0.000	NA		NA
7269512	7269513	PERMA_0947	PERMA_0949			TRUE	0.942	31.000	0.000	0.019	Y	NA
7269516	7269517	PERMA_0951	PERMA_0952			TRUE	0.994	-3.000	0.400	1.000	Y	NA
7269517	7269518	PERMA_0952	PERMA_0953			FALSE	0.336	41.000	0.000	NA		NA
7269518	7269519	PERMA_0953	PERMA_0954			FALSE	0.464	36.000	0.000	NA		NA
7269521	7269522	PERMA_0956	PERMA_0957			TRUE	0.985	3.000	0.500	NA		NA
7269522	7269523	PERMA_0957	PERMA_0958			TRUE	0.969	3.000	0.029	NA		NA
7269524	7269525	PERMA_0959	PERMA_0960	metG		TRUE	0.859	10.000	0.003	1.000	N	NA
7269525	7269526	PERMA_0960	PERMA_0961			TRUE	0.994	0.000	0.007	0.010	Y	NA
7269527	7269528	PERMA_0962	PERMA_0963	katG		FALSE	0.066	77.000	0.000	1.000	N	NA
7269528	7269529	PERMA_0963	PERMA_0964		thiO	TRUE	0.901	4.000	0.000	1.000	Y	NA
7269529	7269530	PERMA_0964	PERMA_0965	thiO		TRUE	0.963	9.000	0.040	1.000		NA
7269530	7269531	PERMA_0965	PERMA_0966			TRUE	0.972	-6.000	0.069	1.000		NA
7269532	7269533	PERMA_0967	PERMA_0968			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269533	7269534	PERMA_0968	PERMA_0969			FALSE	0.086	64.000	0.000	1.000	N	NA
7269535	7269536	PERMA_0970	PERMA_0971			TRUE	0.725	0.000	0.000	1.000		NA
7269536	7269537	PERMA_0971	PERMA_0972			TRUE	0.711	-3.000	0.000	1.000		NA
7269537	7269538	PERMA_0972	PERMA_0973			FALSE	0.543	-21.000	0.000	NA		NA
7269538	7269539	PERMA_0973	PERMA_0974			TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7269539	7269540	PERMA_0974	PERMA_0975			TRUE	0.987	1.000	0.500	NA		NA
7269541	7269542	PERMA_0976	PERMA_0977			FALSE	0.145	79.000	0.000	NA		NA
7269542	7269543	PERMA_0977	PERMA_0978			TRUE	0.994	2.000	0.069	1.000	Y	NA
7269543	7269544	PERMA_0978	PERMA_0980			TRUE	0.977	0.000	0.069	1.000		NA
7269545	7269546	PERMA_0979	PERMA_0981		grpE	TRUE	0.998	1.000	0.500	0.008	Y	NA
7269546	7269547	PERMA_0981	PERMA_0982	grpE		TRUE	0.734	65.000	0.026	NA		NA
7269548	7269549	PERMA_0983	PERMA_0984			TRUE	0.964	0.000	0.017	NA		NA
7269549	7269550	PERMA_0984	PERMA_0985			FALSE	0.552	2.000	0.000	1.000	N	NA
7269550	7269551	PERMA_0985	PERMA_0986			FALSE	0.269	35.000	0.000	1.000	N	NA
7269551	7269552	PERMA_0986	PERMA_0987			TRUE	0.615	-10.000	0.000	NA		NA
7269552	7269553	PERMA_0987	PERMA_0988			TRUE	0.712	3.000	0.000	NA		NA
7269553	7269554	PERMA_0988	PERMA_0990			TRUE	0.566	-19.000	0.000	1.000		NA
7269556	7269557	PERMA_0991	PERMA_0992			FALSE	0.495	3.000	0.000	1.000	N	NA
7269558	7269559	PERMA_0993	PERMA_0994			TRUE	0.987	18.000	0.182	NA		NA
7269559	7269560	PERMA_0994	PERMA_0995		murI	TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
7269560	7269561	PERMA_0995	PERMA_0996	murI		TRUE	0.944	2.000	0.003	NA		NA
7269561	7269562	PERMA_0996	PERMA_0997			TRUE	0.701	62.000	0.010	NA		NA
7269562	7269563	PERMA_0997	PERMA_0998			TRUE	0.960	-3.000	0.013	1.000		NA
7269563	7269564	PERMA_0998	PERMA_0999			FALSE	0.051	88.000	0.000	NA	N	NA
7269565	7269566	PERMA_1000	PERMA_1001		purF	FALSE	0.142	81.000	0.000	NA		NA
7269566	7269567	PERMA_1001	PERMA_1003	purF		FALSE	0.412	8.000	0.000	1.000	N	NA
7269569	7269570	PERMA_1004	PERMA_1005			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7269570	7269571	PERMA_1005	PERMA_1007			FALSE	0.200	62.000	0.000	NA		NA
7269572	7269573	PERMA_1006	PERMA_1008			FALSE	0.359	-13.000	0.000	1.000	N	NA
7269574	7269575	PERMA_1009	PERMA_1010		hypC	FALSE	0.197	63.000	0.000	NA		NA
7269575	7269576	PERMA_1010	PERMA_1011	hypC		TRUE	0.585	28.000	0.000	NA		NA
7269576	7269577	PERMA_1011	PERMA_1012			TRUE	0.646	-7.000	0.000	NA		NA
7269577	7269578	PERMA_1012	PERMA_1013		hypD	TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7269578	7269579	PERMA_1013	PERMA_1014	hypD		FALSE	0.102	58.000	0.000	1.000	N	NA
7269579	7269580	PERMA_1014	PERMA_1015			TRUE	0.967	0.000	0.000	0.043	Y	NA
7269580	7269581	PERMA_1015	PERMA_1016		hypE	FALSE	0.090	62.000	0.000	1.000	N	NA
7269581	7269582	PERMA_1016	PERMA_1017	hypE		FALSE	0.438	-6.000	0.000	1.000	N	NA
7269582	7269583	PERMA_1017	PERMA_1019			FALSE	0.216	59.000	0.000	NA		NA
7269588	7269589	PERMA_1022	PERMA_1024			FALSE	0.205	61.000	0.000	NA		NA
7269590	7269591	PERMA_1025	PERMA_1026	rluB		FALSE	0.277	47.000	0.000	NA		NA
7269592	7269593	PERMA_1027	PERMA_1028			TRUE	0.867	60.000	0.357	NA		NA
7269593	7269594	PERMA_1028	PERMA_1029			TRUE	0.974	3.000	0.048	NA		NA
7269594	7269595	PERMA_1029	PERMA_1030			TRUE	0.988	3.000	1.000	NA		NA
7269595	7269596	PERMA_1030	PERMA_1031			TRUE	0.899	60.000	1.000	NA		NA
7269598	7269599	PERMA_1033	PERMA_1034			FALSE	0.221	58.000	0.000	NA		NA
7269599	7269600	PERMA_1034	PERMA_1035			FALSE	0.096	268.000	0.000	NA		NA
7269600	7269601	PERMA_1035	PERMA_1036			TRUE	0.988	3.000	1.000	NA		NA
7269601	7269602	PERMA_1036	PERMA_1037			TRUE	0.832	91.000	1.000	NA		NA
7269602	7269603	PERMA_1037	PERMA_1038			FALSE	0.101	203.000	0.000	NA		NA
7269603	7269604	PERMA_1038	PERMA_1039			TRUE	0.995	2.000	0.283	0.019		NA
7269605	7269606	PERMA_1040	PERMA_1042			FALSE	0.413	10.000	0.000	1.000	N	NA
7269607	7269608	PERMA_1041	PERMA_1043	mraY		TRUE	0.961	1.000	0.007	1.000		NA
7269608	7269609	PERMA_1043	PERMA_1044			TRUE	0.637	9.000	0.000	NA		NA
7269609	7269610	PERMA_1044	PERMA_1045			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269610	7269611	PERMA_1045	PERMA_1046		tpiA	TRUE	0.793	34.000	0.004	1.000	N	NA
7269611	7269612	PERMA_1046	PERMA_1047	tpiA		TRUE	0.980	10.000	0.009	1.000	Y	NA
7269612	7269613	PERMA_1047	PERMA_1048			FALSE	0.323	42.000	0.000	NA		NA
7269613	7269614	PERMA_1048	PERMA_1049			TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7269614	7269615	PERMA_1049	PERMA_1050		atpC_1	TRUE	0.963	2.000	0.007	1.000		NA
7269616	7269617	PERMA_1051	PERMA_1052			TRUE	0.585	-13.000	0.000	NA		NA
7269617	7269618	PERMA_1052	PERMA_1053			TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
7269618	7269619	PERMA_1053	PERMA_1054			FALSE	0.473	64.000	0.004	1.000	N	NA
7269619	7269620	PERMA_1054	PERMA_1055			TRUE	0.907	4.000	0.006	1.000	N	NA
7269620	7269621	PERMA_1055	PERMA_1056			TRUE	0.935	10.000	0.027	1.000	N	NA
7269621	7269622	PERMA_1056	PERMA_1057			TRUE	0.946	-7.000	0.041	1.000	N	NA
7269622	7269623	PERMA_1057	PERMA_1058		hemL	FALSE	0.059	84.000	0.000	1.000	N	NA
7269623	7269624	PERMA_1058	PERMA_1059	hemL		TRUE	0.960	12.000	0.008	NA		NA
7269624	7269625	PERMA_1059	PERMA_1060		nrdR	TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7269629	7269630	PERMA_1064	PERMA_1065		iscS	TRUE	0.970	18.000	0.036	1.000	N	NA
7269632	7269633	PERMA_1067	PERMA_1068			TRUE	0.913	-10.000	0.012	1.000	N	NA
7269633	7269634	PERMA_1068	PERMA_1069			TRUE	0.980	0.000	0.011	0.008	N	NA
7269634	7269635	PERMA_1069	PERMA_1070			TRUE	0.982	0.000	0.214	NA		NA
7269635	7269636	PERMA_1070	PERMA_1071			TRUE	0.965	12.000	0.011	NA		NA
7269636	7269637	PERMA_1071	PERMA_1072		aroE	TRUE	0.951	2.000	0.011	1.000	N	NA
7269638	7269639	PERMA_1073	PERMA_1074			TRUE	0.646	-7.000	0.000	NA		NA
7269639	7269640	PERMA_1074	PERMA_1075		proB	FALSE	0.477	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7269640	7269641	PERMA_1075	PERMA_1076	proB		TRUE	0.940	2.000	0.006	1.000	N	NA
7269641	7269642	PERMA_1076	PERMA_1077			TRUE	0.975	-3.000	0.062	NA		NA
7269642	7269643	PERMA_1077	PERMA_1078			TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
7269643	7269644	PERMA_1078	PERMA_1079			FALSE	0.413	10.000	0.000	1.000	N	NA
7269647	7269648	PERMA_1082	PERMA_1083	efp	accB	TRUE	0.973	12.000	0.120	1.000	N	NA
7269648	7269649	PERMA_1083	PERMA_1084	accB	rfaD	TRUE	0.932	13.000	0.004	1.000	N	NA
7269649	7269650	PERMA_1084	PERMA_1085	rfaD	thrB	TRUE	0.925	1.000	0.005	1.000	N	NA
7269650	7269651	PERMA_1085	PERMA_1087	thrB		FALSE	0.129	100.000	0.000	1.000		NA
7269652	7269653	PERMA_1086	PERMA_1088			TRUE	0.902	5.000	0.002	1.000		NA
7269653	7269654	PERMA_1088	PERMA_1089		mltD	TRUE	0.769	2.000	0.000	1.000		NA
7269657	7269658	PERMA_1092	PERMA_1093	coaBC		FALSE	0.486	22.000	0.000	1.000	N	NA
7269658	7269659	PERMA_1093	PERMA_1094			TRUE	0.993	-10.000	0.688	1.000	Y	NA
7269659	7269660	PERMA_1094	PERMA_1095			FALSE	0.552	2.000	0.000	1.000	N	NA
7269660	7269661	PERMA_1095	PERMA_1096			TRUE	0.655	10.000	0.000	1.000		NA
7269661	7269662	PERMA_1096	PERMA_1098		hemD	TRUE	0.983	-3.000	0.308	1.000		NA
7269664	7269665	PERMA_1099	PERMA_1101			TRUE	0.738	1.000	0.000	NA		NA
7269666	7269667	PERMA_1100	PERMA_1102			FALSE	0.518	21.000	0.000	1.000	N	NA
7269668	7269669	PERMA_1103	PERMA_1104	rpiB	glyA	TRUE	0.964	14.000	0.025	1.000	N	NA
7269669	7269670	PERMA_1104	PERMA_1105	glyA		FALSE	0.401	25.000	0.000	1.000	N	NA
7269670	7269671	PERMA_1105	PERMA_1106		ispF	TRUE	0.931	2.000	0.005	1.000	N	NA
7269671	7269672	PERMA_1106	PERMA_1107	ispF		FALSE	0.549	-19.000	0.000	NA		NA
7269672	7269673	PERMA_1107	PERMA_1109		recG	TRUE	0.902	-13.000	0.004	NA		NA
7269674	7269675	PERMA_1108	PERMA_1110			FALSE	0.044	186.000	0.000	1.000	N	NA
7269677	7269678	PERMA_1111	PERMA_1113			TRUE	0.977	-13.000	0.727	NA		NA
7269678	7269679	PERMA_1113	PERMA_1114			TRUE	0.820	90.000	0.739	NA		NA
7269679	7269680	PERMA_1114	PERMA_1115		panC	TRUE	0.911	9.000	0.003	1.000		NA
7269681	7269682	PERMA_1116	PERMA_1117			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7269682	7269683	PERMA_1117	PERMA_1119			TRUE	0.664	4.000	0.000	NA		NA
7269684	7269685	PERMA_1118	PERMA_1120	hisC_1		FALSE	0.477	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7269685	7269686	PERMA_1120	PERMA_1121			TRUE	0.900	5.000	0.006	1.000	N	NA
7269689	7269690	PERMA_1124	PERMA_1125			TRUE	0.945	-3.000	0.005	1.000		NA
7269691	7269692	PERMA_1126	PERMA_1127			FALSE	0.137	84.000	0.000	NA		NA
7269692	7269693	PERMA_1127	PERMA_1128			FALSE	0.520	-31.000	0.000	NA		NA
7269693	7269694	PERMA_1128	PERMA_1129			TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7269695	7269696	PERMA_1130	PERMA_1131			TRUE	0.984	11.000	0.010	1.000	Y	NA
7269696	7269697	PERMA_1131	PERMA_1132		fumB	TRUE	0.998	11.000	0.262	0.001	Y	NA
7269697	7269698	PERMA_1132	PERMA_1133	fumB		TRUE	0.970	33.000	0.015	1.000	Y	NA
7269698	7269699	PERMA_1133	PERMA_1134		sucD	TRUE	0.996	24.000	0.017	0.001	Y	NA
7269699	7269700	PERMA_1134	PERMA_1135	sucD		FALSE	0.391	99.000	0.000	1.000	Y	NA
7269700	7269701	PERMA_1135	PERMA_1136		orB	TRUE	0.996	33.000	0.316	0.001	Y	NA
7269701	7269702	PERMA_1136	PERMA_1137	orB		FALSE	0.099	234.000	0.000	NA		NA
7269702	7269703	PERMA_1137	PERMA_1138			FALSE	0.092	1082.000	0.000	NA		NA
7269703	7269704	PERMA_1138	PERMA_1139			TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
7269706	7269707	PERMA_1141	PERMA_1142			FALSE	0.092	632.000	0.000	NA		NA
7269711	7269712	PERMA_1146	PERMA_1147			FALSE	0.155	75.000	0.000	NA		NA
7269713	7269714	PERMA_1148	PERMA_1149			FALSE	0.100	217.000	0.000	NA		NA
7269715	7269716	PERMA_1150	PERMA_1151			TRUE	0.639	10.000	0.000	NA		NA
7269716	7269717	PERMA_1151	PERMA_1152			TRUE	0.986	0.000	0.600	NA		NA
7269717	7269718	PERMA_1152	PERMA_1153			FALSE	0.533	-25.000	0.000	NA		NA
7269718	7269719	PERMA_1153	PERMA_1154			TRUE	0.569	-15.000	0.000	NA		NA
7269719	7269720	PERMA_1154	PERMA_1155			FALSE	0.505	-100.000	0.000	NA		NA
7269720	7269721	PERMA_1155	PERMA_1156			FALSE	0.160	73.000	0.000	NA		NA
7269721	7269722	PERMA_1156	PERMA_1157			TRUE	0.910	-3.000	0.000	NA	Y	NA
7269724	7269725	PERMA_1158	PERMA_1160			TRUE	0.972	-3.000	0.009	0.042	N	NA
7269725	7269726	PERMA_1160	PERMA_1161		lon	TRUE	0.946	-3.000	0.018	1.000	N	NA
7269726	7269727	PERMA_1161	PERMA_1162	lon		TRUE	0.991	3.000	0.056	NA	Y	NA
7269727	7269728	PERMA_1162	PERMA_1163		trmD	TRUE	0.803	30.000	0.003	NA	N	NA
7269729	7269730	PERMA_1165	PERMA_1166			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7269730	7269731	PERMA_1166	PERMA_1168			TRUE	0.648	5.000	0.000	NA		NA
7269733	7269734	PERMA_1169	PERMA_1170			TRUE	0.730	21.000	0.000	NA		NA
7269734	7269735	PERMA_1170	PERMA_1171			TRUE	0.638	8.000	0.000	NA		NA
7269735	7269736	PERMA_1171	PERMA_1172			FALSE	0.123	99.000	0.000	NA		NA
7269737	7269738	PERMA_1173	PERMA_1174			TRUE	0.975	11.000	0.500	1.000	N	NA
7269738	7269739	PERMA_1174	PERMA_1175			TRUE	0.949	-7.000	0.014	NA		NA
7269740	7269741	PERMA_1176	PERMA_1177			TRUE	0.638	8.000	0.000	NA		NA
7269741	7269742	PERMA_1177	PERMA_1178			TRUE	0.639	10.000	0.000	NA		NA
7269742	7269743	PERMA_1178	PERMA_1179			FALSE	0.120	104.000	0.000	NA		NA
7269743	7269744	PERMA_1179	PERMA_1180		tuf_1	FALSE	0.409	38.000	0.000	NA		NA
7269744	7269745	PERMA_1180	PERMA_1181	tuf_1	rpmG	TRUE	0.993	21.000	0.099	1.000	Y	NA
7269745	7269746	PERMA_1181	PERMA_1182	rpmG		TRUE	0.637	9.000	0.000	NA		NA
7269746	7269747	PERMA_1182	PERMA_1183		secE	TRUE	0.653	24.000	0.000	NA		NA
7269747	7269748	PERMA_1183	PERMA_1184	secE	nusG	TRUE	0.987	17.000	0.843	1.000	N	NA
7269748	7269749	PERMA_1184	PERMA_1185	nusG	rplK	TRUE	0.971	25.000	0.681	1.000	N	NA
7269749	7269750	PERMA_1185	PERMA_1186	rplK	rplA	TRUE	0.998	3.000	0.838	0.030	Y	NA
7269750	7269751	PERMA_1186	PERMA_1187	rplA	rplJ	TRUE	0.998	17.000	0.302	0.030	Y	NA
7269751	7269752	PERMA_1187	PERMA_1188	rplJ	rplL	TRUE	0.993	39.000	0.884	0.022	Y	NA
7269752	7269753	PERMA_1188	PERMA_1189	rplL	rpoB	TRUE	0.747	125.000	0.223	1.000		NA
7269753	7269754	PERMA_1189	PERMA_1190	rpoB	rpoC	TRUE	0.976	51.000	0.851	0.001		NA
7269754	7269755	PERMA_1190	PERMA_1191	rpoC	rpsL	FALSE	0.507	208.000	0.035	1.000	N	NA
7269755	7269756	PERMA_1191	PERMA_1192	rpsL	rpsG	TRUE	0.998	20.000	0.224	0.005	Y	NA
7269756	7269757	PERMA_1192	PERMA_1193	rpsG	fusA	TRUE	0.944	68.000	0.579	1.000	Y	NA
7269757	7269758	PERMA_1193	PERMA_1194	fusA	tuf_2	TRUE	0.996	33.000	0.400	0.002	Y	NA
7269758	7269759	PERMA_1194	PERMA_1195	tuf_2	rpsJ	TRUE	0.996	16.000	0.318	1.000	Y	NA
7269759	7269760	PERMA_1195	PERMA_1196	rpsJ	rplC	TRUE	0.998	19.000	0.467	0.030	Y	NA
7269760	7269761	PERMA_1196	PERMA_1197	rplC	rplD	TRUE	0.996	27.000	0.361	0.022	Y	NA
7269761	7269762	PERMA_1197	PERMA_1198	rplD	rplW	TRUE	0.995	0.000	0.513	1.000	Y	NA
7269762	7269763	PERMA_1198	PERMA_1199	rplW	rplB	TRUE	0.997	14.000	0.849	1.000	Y	NA
7269763	7269764	PERMA_1199	PERMA_1200	rplB	rpsS	TRUE	0.998	3.000	0.820	0.030	Y	NA
7269764	7269765	PERMA_1200	PERMA_1201	rpsS	rplV	TRUE	0.999	13.000	0.769	0.030	Y	NA
7269765	7269766	PERMA_1201	PERMA_1202	rplV	rpsC	TRUE	0.999	13.000	0.719	0.030	Y	NA
7269766	7269767	PERMA_1202	PERMA_1203	rpsC	rplP	TRUE	0.998	23.000	0.828	0.030	Y	NA
7269767	7269768	PERMA_1203	PERMA_1204	rplP	rpmC	TRUE	0.960	5.000	0.000	0.022	Y	NA
7269768	7269769	PERMA_1204	PERMA_1205	rpmC	rpsQ	TRUE	0.970	0.000	0.000	0.022	Y	NA
7269769	7269770	PERMA_1205	PERMA_1206	rpsQ	rplN	TRUE	0.971	90.000	0.791	0.030	Y	NA
7269770	7269771	PERMA_1206	PERMA_1207	rplN	rplX	TRUE	0.998	4.000	0.810	0.030	Y	NA
7269771	7269772	PERMA_1207	PERMA_1208	rplX		TRUE	0.999	14.000	0.758	0.022	Y	NA
7269772	7269773	PERMA_1208	PERMA_1209		rpsN	TRUE	0.999	16.000	0.496	0.022	Y	NA
7269773	7269774	PERMA_1209	PERMA_1210	rpsN	rpsH	TRUE	0.998	12.000	0.473	0.022	Y	NA
7269774	7269775	PERMA_1210	PERMA_1211	rpsH	rplF	TRUE	0.996	33.000	0.808	0.022	Y	NA
7269775	7269776	PERMA_1211	PERMA_1212	rplF	rplR	TRUE	0.998	23.000	0.815	0.022	Y	NA
7269776	7269777	PERMA_1212	PERMA_1213	rplR	rpsE	TRUE	0.998	12.000	0.814	0.030	Y	NA
7269777	7269778	PERMA_1213	PERMA_1214	rpsE	rpmD	TRUE	0.998	12.000	0.789	0.030	Y	NA
7269778	7269779	PERMA_1214	PERMA_1215	rpmD	rplO	TRUE	0.998	0.000	0.653	0.004	Y	NA
7269779	7269780	PERMA_1215	PERMA_1216	rplO	secY	TRUE	0.970	26.000	0.730	1.000	N	NA
7269780	7269781	PERMA_1216	PERMA_1217	secY		TRUE	0.936	3.000	0.009	1.000	N	NA
7269781	7269782	PERMA_1217	PERMA_1218		map	TRUE	0.956	13.000	0.013	1.000	N	NA
7269782	7269783	PERMA_1218	PERMA_1219	map	infA	TRUE	0.992	11.000	0.160	1.000	Y	NA
7269783	7269784	PERMA_1219	PERMA_1220	infA	rpmJ	TRUE	0.977	10.000	0.257	1.000		NA
7269784	7269785	PERMA_1220	PERMA_1221	rpmJ	rpsM	TRUE	0.995	14.000	0.194	0.022		NA
7269785	7269786	PERMA_1221	PERMA_1222	rpsM	rpsK	TRUE	0.998	24.000	0.810	0.022	Y	NA
7269786	7269787	PERMA_1222	PERMA_1223	rpsK	rpsD	TRUE	0.997	4.000	0.509	0.030	Y	NA
7269787	7269788	PERMA_1223	PERMA_1224	rpsD	rpoA	TRUE	0.900	42.000	0.549	1.000	N	NA
7269788	7269789	PERMA_1224	PERMA_1225	rpoA	rplQ	TRUE	0.987	14.000	0.873	1.000	N	NA
7269789	7269790	PERMA_1225	PERMA_1227	rplQ		TRUE	0.930	3.000	0.003	1.000		NA
7269791	7269792	PERMA_1226	PERMA_1228			TRUE	0.986	-3.000	0.750	NA		NA
7269792	7269793	PERMA_1228	PERMA_1229		ilvE	TRUE	0.971	-3.000	0.041	NA		NA
7269794	7269795	PERMA_1230	PERMA_1231			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269795	7269796	PERMA_1231	PERMA_1233			TRUE	0.960	5.000	0.029	NA		NA
7269799	7269800	PERMA_1235	PERMA_1236			FALSE	0.494	0.000	0.000	1.000	N	NA
7269800	7269801	PERMA_1236	PERMA_1237			FALSE	0.192	66.000	0.000	1.000		NA
7269801	7269802	PERMA_1237	PERMA_1238			FALSE	0.117	136.000	0.000	1.000		NA
7269804	7269805	PERMA_1240	PERMA_1241	lepA		FALSE	0.212	62.000	0.000	1.000		NA
7269805	7269806	PERMA_1241	PERMA_1242			TRUE	0.987	0.000	0.750	NA		NA
7269806	7269807	PERMA_1242	PERMA_1243			TRUE	0.987	1.000	0.429	NA		NA
7269807	7269808	PERMA_1243	PERMA_1244			TRUE	0.639	10.000	0.000	NA		NA
7269808	7269809	PERMA_1244	PERMA_1245			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269809	7269810	PERMA_1245	PERMA_1246			TRUE	0.977	12.000	0.044	NA		NA
7269810	7269811	PERMA_1246	PERMA_1247			TRUE	0.966	12.000	0.044	1.000	N	NA
7269811	7269812	PERMA_1247	PERMA_1248			FALSE	0.049	91.000	0.000	NA	N	NA
7269812	7269813	PERMA_1248	PERMA_1249			TRUE	0.947	11.000	0.031	NA	N	NA
7269813	7269814	PERMA_1249	PERMA_1250			FALSE	0.195	39.000	0.000	1.000	N	NA
7269814	7269815	PERMA_1250	PERMA_1251			TRUE	0.994	0.000	0.188	1.000	Y	NA
7269815	7269816	PERMA_1251	PERMA_1252			TRUE	0.970	2.000	0.050	1.000	N	NA
7269816	7269817	PERMA_1252	PERMA_1253			FALSE	0.086	64.000	0.000	1.000	N	NA
7269820	7269821	PERMA_1256	PERMA_1257			TRUE	0.974	13.000	0.000	0.045	Y	NA
7269821	7269822	PERMA_1257	PERMA_1258			TRUE	0.988	15.000	0.281	NA		NA
7269822	7269823	PERMA_1258	PERMA_1259			TRUE	0.984	2.000	0.153	NA		NA
7269823	7269824	PERMA_1259	PERMA_1260			TRUE	0.950	27.000	0.143	NA	N	NA
7269824	7269825	PERMA_1260	PERMA_1261			TRUE	0.993	-12.000	0.867	1.000	Y	NA
7269825	7269826	PERMA_1261	PERMA_1262			TRUE	0.981	-7.000	0.590	NA		NA
7269826	7269827	PERMA_1262	PERMA_1263			TRUE	0.639	10.000	0.000	NA		NA
7269828	7269829	PERMA_1264	PERMA_1265			TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7269832	7269833	PERMA_1268	PERMA_1269	lpxK		TRUE	0.661	52.000	0.004	NA		NA
7269834	7269835	PERMA_1270	PERMA_1271			TRUE	0.622	49.000	0.000	1.000	Y	NA
7269835	7269836	PERMA_1271	PERMA_1272			TRUE	0.966	-7.000	0.000	0.007	Y	NA
7269837	7269838	PERMA_1273	PERMA_1274			FALSE	0.264	49.000	0.000	NA		NA
7269838	7269839	PERMA_1274	PERMA_1275			TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7269839	7269840	PERMA_1275	PERMA_1276			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269840	7269841	PERMA_1276	PERMA_1277			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269841	7269842	PERMA_1277	PERMA_1279			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269844	7269845	PERMA_1280	PERMA_1282			TRUE	0.983	13.000	0.095	NA		NA
7269846	7269847	PERMA_1281	PERMA_1283			TRUE	0.888	10.000	0.005	1.000	N	NA
7269847	7269848	PERMA_1283	PERMA_1284			TRUE	0.963	-6.000	0.129	1.000	N	NA
7269848	7269849	PERMA_1284	PERMA_1285		carA	TRUE	0.900	0.000	0.004	1.000	N	NA
7269850	7269851	PERMA_1286	PERMA_1287	ispE		TRUE	0.648	5.000	0.000	NA		NA
7269851	7269852	PERMA_1287	PERMA_1288			FALSE	0.264	49.000	0.000	NA		NA
7269852	7269853	PERMA_1288	PERMA_1289			TRUE	0.974	18.000	0.056	1.000	N	NA
7269853	7269854	PERMA_1289	PERMA_1290		pth	TRUE	0.998	0.000	0.496	0.036	Y	NA
7269854	7269855	PERMA_1290	PERMA_1291	pth	rpsF	TRUE	0.950	67.000	0.029	0.036	Y	NA
7269855	7269856	PERMA_1291	PERMA_1292	rpsF		TRUE	0.861	11.000	0.002	1.000	N	NA
7269856	7269857	PERMA_1292	PERMA_1293		rpsR	TRUE	0.878	24.000	0.004	1.000	N	NA
7269857	7269858	PERMA_1293	PERMA_1294	rpsR	rplI	TRUE	0.999	15.000	0.499	0.022	Y	NA
7269858	7269859	PERMA_1294	PERMA_1295	rplI	dnaB	FALSE	0.339	110.000	0.004	1.000	N	NA
7269859	7269860	PERMA_1295	PERMA_1296	dnaB		TRUE	0.950	2.000	0.012	NA	N	NA
7269860	7269861	PERMA_1296	PERMA_1297			TRUE	0.912	29.000	0.006	NA		NA
7269861	7269862	PERMA_1297	PERMA_1298		pfkA	TRUE	0.988	3.000	1.000	NA		NA
7269862	7269863	PERMA_1298	PERMA_1299	pfkA		TRUE	0.976	23.000	0.600	1.000	N	NA
7269864	7269865	PERMA_1300	PERMA_1301			FALSE	0.226	57.000	0.000	NA		NA
7269866	7269867	PERMA_1302	PERMA_1303	lnt		FALSE	0.379	39.000	0.000	NA		NA
7269867	7269868	PERMA_1303	PERMA_1304			FALSE	0.123	99.000	0.000	NA		NA
7269868	7269869	PERMA_1304	PERMA_1305			FALSE	0.099	233.000	0.000	NA		NA
7269870	7269871	PERMA_1306	PERMA_1307		hsdR	TRUE	0.988	2.000	0.411	NA		NA
7269871	7269872	PERMA_1307	PERMA_1308	hsdR		TRUE	0.712	3.000	0.000	NA		NA
7269872	7269873	PERMA_1308	PERMA_1309			FALSE	0.506	-49.000	0.000	NA		NA
7269873	7269874	PERMA_1309	PERMA_1310			TRUE	0.646	-7.000	0.000	NA		NA
7269874	7269875	PERMA_1310	PERMA_1311		hsdM	TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
7269875	7269876	PERMA_1311	PERMA_1312	hsdM		FALSE	0.096	261.000	0.000	NA		NA
7269876	7269877	PERMA_1312	PERMA_1313			TRUE	0.776	18.000	0.000	NA		NA
7269877	7269878	PERMA_1313	PERMA_1314			TRUE	0.977	5.000	0.286	NA		NA
7269878	7269879	PERMA_1314	PERMA_1315			FALSE	0.095	375.000	0.000	NA		NA
7269880	7269881	PERMA_1316	PERMA_1317			FALSE	0.354	40.000	0.000	NA		NA
7269881	7269882	PERMA_1317	PERMA_1318			TRUE	0.627	25.000	0.000	NA		NA
7269882	7269883	PERMA_1318	PERMA_1319			FALSE	0.100	218.000	0.000	NA		NA
7269884	7269885	PERMA_1320	PERMA_1321			FALSE	0.133	88.000	0.000	NA		NA
7269885	7269886	PERMA_1321	PERMA_1322			TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7269887	7269888	PERMA_1323	PERMA_1324	tig	clpP	TRUE	0.993	4.000	0.351	1.000	Y	NA
7269888	7269889	PERMA_1324	PERMA_1325	clpP	clpX	TRUE	0.994	3.000	0.352	1.000	Y	NA
7269889	7269890	PERMA_1325	PERMA_1326	clpX	ysxC	TRUE	0.979	2.000	0.043	1.000		NA
7269890	7269891	PERMA_1326	PERMA_1327	ysxC	trpA	FALSE	0.256	54.000	0.000	1.000		NA
7269891	7269892	PERMA_1327	PERMA_1328	trpA	hisH	TRUE	0.913	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
7269892	7269893	PERMA_1328	PERMA_1329	hisH	hemN	FALSE	0.243	90.000	0.000	0.046	N	NA
7269893	7269894	PERMA_1329	PERMA_1330	hemN		TRUE	0.738	1.000	0.000	NA		NA
7269894	7269895	PERMA_1330	PERMA_1331			FALSE	0.323	42.000	0.000	NA		NA
7269895	7269896	PERMA_1331	PERMA_1332		uvrA	FALSE	0.176	67.000	0.000	NA		NA
7269896	7269897	PERMA_1332	PERMA_1333	uvrA	cas_2	FALSE	0.306	1175.000	0.000	NA	Y	NA
11452105	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	2902.000	0.000	NA		NA
11594468	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	2902.000	0.000	NA		NA
11736860	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	2902.000	0.000	NA		NA
11452106	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	2931.000	0.000	NA		NA
11594469	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	2931.000	0.000	NA		NA
11736861	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	2931.000	0.000	NA		NA
11452107	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	2971.000	0.000	NA		NA
11594470	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	2971.000	0.000	NA		NA
11736862	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	2971.000	0.000	NA		NA
11452108	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3000.000	0.000	NA		NA
11594471	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3000.000	0.000	NA		NA
11736863	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3000.000	0.000	NA		NA
11452109	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3036.000	0.000	NA		NA
11594472	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3036.000	0.000	NA		NA
11736864	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3036.000	0.000	NA		NA
11452110	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3065.000	0.000	NA		NA
11594473	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3065.000	0.000	NA		NA
11736865	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3065.000	0.000	NA		NA
11452111	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3102.000	0.000	NA		NA
11594474	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3102.000	0.000	NA		NA
11736866	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3102.000	0.000	NA		NA
11452112	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3131.000	0.000	NA		NA
11594475	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3131.000	0.000	NA		NA
11736867	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3131.000	0.000	NA		NA
11452113	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3169.000	0.000	NA		NA
11594476	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3169.000	0.000	NA		NA
11736868	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3169.000	0.000	NA		NA
11452114	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3198.000	0.000	NA		NA
11594477	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3198.000	0.000	NA		NA
11736869	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3198.000	0.000	NA		NA
11452115	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3234.000	0.000	NA		NA
11594478	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3234.000	0.000	NA		NA
11736870	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3234.000	0.000	NA		NA
11452116	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3263.000	0.000	NA		NA
11594479	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3263.000	0.000	NA		NA
11736871	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3263.000	0.000	NA		NA
11452117	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3299.000	0.000	NA		NA
11594480	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3299.000	0.000	NA		NA
11736872	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3299.000	0.000	NA		NA
11452118	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3328.000	0.000	NA		NA
11594481	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3328.000	0.000	NA		NA
11736873	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3328.000	0.000	NA		NA
11452119	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3364.000	0.000	NA		NA
11594482	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3364.000	0.000	NA		NA
11736874	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3364.000	0.000	NA		NA
11452120	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3393.000	0.000	NA		NA
11594483	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3393.000	0.000	NA		NA
11736875	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3393.000	0.000	NA		NA
11452121	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3427.000	0.000	NA		NA
11594484	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3427.000	0.000	NA		NA
11736876	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3427.000	0.000	NA		NA
11452122	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3456.000	0.000	NA		NA
11594485	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3456.000	0.000	NA		NA
11736877	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3456.000	0.000	NA		NA
11452123	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3491.000	0.000	NA		NA
11594486	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3491.000	0.000	NA		NA
11736878	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3491.000	0.000	NA		NA
11452124	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3520.000	0.000	NA		NA
11594487	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3520.000	0.000	NA		NA
11736879	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3520.000	0.000	NA		NA
11452125	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3554.000	0.000	NA		NA
11594488	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3554.000	0.000	NA		NA
11736880	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3554.000	0.000	NA		NA
11452126	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3583.000	0.000	NA		NA
11594489	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3583.000	0.000	NA		NA
11736881	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3583.000	0.000	NA		NA
11452127	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3621.000	0.000	NA		NA
11594490	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3621.000	0.000	NA		NA
11736882	7269895		PERMA_1331			FALSE	NA	3621.000	0.000	NA		NA
7269897	7269898	PERMA_1333	PERMA_1334	cas_2		TRUE	0.980	0.000	0.143	NA		NA
7269898	7269899	PERMA_1334	PERMA_1335		cst	TRUE	0.976	-7.000	0.218	NA		NA
7269899	7269900	PERMA_1335	PERMA_1336	cst		FALSE	0.165	71.000	0.000	NA		NA
7269900	7269901	PERMA_1336	PERMA_1337		cas5t	FALSE	0.097	257.000	0.000	NA		NA
7269901	7269902	PERMA_1337	PERMA_1338	cas5t		TRUE	0.986	19.000	0.231	NA		NA
7269902	7269903	PERMA_1338	PERMA_1339			FALSE	0.111	129.000	0.000	NA		NA
7269903	7269904	PERMA_1339	PERMA_1340		cas_3	TRUE	0.936	-15.000	0.017	NA		NA
7269905	7269906	PERMA_1341	PERMA_1342			TRUE	0.984	23.000	0.684	NA		NA
7269907	7269908	PERMA_1343	PERMA_1344	cas_4		TRUE	0.995	2.000	0.207	NA	Y	NA
11452128	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	5893.000	0.000	NA		NA
11594491	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	5893.000	0.000	NA		NA
11736883	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	5893.000	0.000	NA		NA
11452129	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	5923.000	0.000	NA		NA
11594492	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	5923.000	0.000	NA		NA
11736884	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	5923.000	0.000	NA		NA
11452130	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	5958.000	0.000	NA		NA
11594493	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	5958.000	0.000	NA		NA
11736885	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	5958.000	0.000	NA		NA
11452131	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	5988.000	0.000	NA		NA
11594494	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	5988.000	0.000	NA		NA
11736886	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	5988.000	0.000	NA		NA
11452132	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6022.000	0.000	NA		NA
11594495	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6022.000	0.000	NA		NA
11736887	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6022.000	0.000	NA		NA
11452133	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6052.000	0.000	NA		NA
11594496	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6052.000	0.000	NA		NA
11736888	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6052.000	0.000	NA		NA
11452134	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6088.000	0.000	NA		NA
11594497	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6088.000	0.000	NA		NA
11736889	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6088.000	0.000	NA		NA
11452135	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6118.000	0.000	NA		NA
11594498	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6118.000	0.000	NA		NA
11736890	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6118.000	0.000	NA		NA
11452136	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6152.000	0.000	NA		NA
11594499	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6152.000	0.000	NA		NA
11736891	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6152.000	0.000	NA		NA
11452137	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6182.000	0.000	NA		NA
11594500	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6182.000	0.000	NA		NA
11736892	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6182.000	0.000	NA		NA
11452138	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6217.000	0.000	NA		NA
11594501	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6217.000	0.000	NA		NA
11736893	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6217.000	0.000	NA		NA
11452139	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6247.000	0.000	NA		NA
11594502	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6247.000	0.000	NA		NA
11736894	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6247.000	0.000	NA		NA
11452140	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6283.000	0.000	NA		NA
11594503	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6283.000	0.000	NA		NA
11736895	7269903		PERMA_1339			FALSE	NA	6283.000	0.000	NA		NA
7269911	7269912	PERMA_1347	PERMA_1348			FALSE	0.116	113.000	0.000	NA		NA
7269914	7269915	PERMA_1350	PERMA_1351			TRUE	0.936	11.000	0.005	NA		NA
7269915	7269916	PERMA_1351	PERMA_1352			TRUE	0.961	-3.000	0.014	1.000		NA
7269916	7269917	PERMA_1352	PERMA_1353			TRUE	0.958	0.000	0.009	NA		NA
7269917	7269918	PERMA_1353	PERMA_1354		lpxB	FALSE	0.243	54.000	0.000	NA		NA
7269919	7269920	PERMA_1355	PERMA_1357	bioB		FALSE	0.152	43.000	0.000	1.000	N	NA
7269921	7269922	PERMA_1356	PERMA_1358			FALSE	0.092	1069.000	0.000	NA		NA
7269922	7269923	PERMA_1358	PERMA_1359			TRUE	0.973	-22.000	0.800	NA		NA
7269923	7269924	PERMA_1359	PERMA_1360			TRUE	0.970	-24.000	0.556	NA		NA
7269924	7269925	PERMA_1360	PERMA_1361			TRUE	0.985	0.000	0.400	1.000		NA
7269925	7269926	PERMA_1361	PERMA_1362			TRUE	0.982	3.000	0.200	NA		NA
7269926	7269927	PERMA_1362	PERMA_1363			TRUE	0.989	1.000	1.000	NA		NA
7269927	7269928	PERMA_1363	PERMA_1364			TRUE	0.562	30.000	0.000	NA		NA
7269928	7269929	PERMA_1364	PERMA_1365			TRUE	0.840	-46.000	0.003	NA		NA
7269930	7269931	PERMA_1366	PERMA_1367	upp		FALSE	0.477	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7269931	7269932	PERMA_1367	PERMA_1368			FALSE	0.552	2.000	0.000	1.000	N	NA
7269932	7269933	PERMA_1368	PERMA_1369			TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7269933	7269934	PERMA_1369	PERMA_1370			TRUE	0.712	3.000	0.000	NA		NA
7269934	7269935	PERMA_1370	PERMA_1371			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269935	7269936	PERMA_1371	PERMA_1373			FALSE	0.523	-30.000	0.000	NA		NA
7269937	7269938	PERMA_1372	PERMA_1374			FALSE	0.092	738.000	0.000	NA		NA
7269938	7269939	PERMA_1374	PERMA_1375			TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
7269939	7269940	PERMA_1375	PERMA_1376			FALSE	0.105	169.000	0.000	NA		NA
7269940	7269941	PERMA_1376	PERMA_1377			FALSE	0.110	136.000	0.000	NA		NA
7269941	7269942	PERMA_1377	PERMA_1378			FALSE	0.547	31.000	0.000	NA		NA
7269942	7269943	PERMA_1378	PERMA_1379			FALSE	0.114	123.000	0.000	NA		NA
7269943	7269944	PERMA_1379	PERMA_1380		surE	FALSE	0.093	482.000	0.000	NA		NA
7269944	7269945	PERMA_1380	PERMA_1381	surE		FALSE	0.172	68.000	0.000	NA		NA
7269945	7269946	PERMA_1381	PERMA_1382			TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7269946	7269947	PERMA_1382	PERMA_1383			TRUE	0.787	41.000	0.005	1.000		NA
7269947	7269948	PERMA_1383	PERMA_1384			TRUE	0.910	-13.000	0.005	NA		NA
7269948	7269949	PERMA_1384	PERMA_1385			TRUE	0.738	1.000	0.000	NA		NA
7269949	7269950	PERMA_1385	PERMA_1386			TRUE	0.929	12.000	0.000	1.000	Y	NA
7269950	7269951	PERMA_1386	PERMA_1387		sdhA	TRUE	0.685	105.000	0.000	0.005	Y	NA
7269951	7269952	PERMA_1387	PERMA_1388	sdhA	purD	FALSE	0.054	96.000	0.000	1.000	N	NA
7269952	7269953	PERMA_1388	PERMA_1389	purD	lysA	TRUE	0.827	27.000	0.003	1.000	N	NA
7269954	7269955	PERMA_1390	PERMA_1391	minC	minD	TRUE	0.996	20.000	0.466	1.000	Y	NA
7269955	7269956	PERMA_1391	PERMA_1392	minD	minE	TRUE	0.995	3.000	0.618	NA	Y	NA
7269956	7269957	PERMA_1392	PERMA_1393	minE	hisG	TRUE	0.897	-3.000	0.004	NA	N	NA
7269957	7269958	PERMA_1393	PERMA_1394	hisG	glmU	TRUE	0.924	2.000	0.004	1.000	N	NA
7269958	7269959	PERMA_1394	PERMA_1395	glmU		TRUE	0.931	-3.000	0.003	1.000		NA
7269959	7269960	PERMA_1395	PERMA_1396		trpD	TRUE	0.908	4.000	0.002	1.000		NA
7269960	7269961	PERMA_1396	PERMA_1397	trpD		TRUE	0.712	3.000	0.000	NA		NA
7269961	7269962	PERMA_1397	PERMA_1399			TRUE	0.765	13.000	0.000	NA		NA
7269963	7269964	PERMA_1398	PERMA_1400			TRUE	0.964	0.000	0.017	NA		NA
7269964	7269965	PERMA_1400	PERMA_1401			TRUE	0.972	14.000	0.045	1.000	N	NA
7269965	7269966	PERMA_1401	PERMA_1402			TRUE	0.984	-3.000	0.382	1.000		NA
7269966	7269967	PERMA_1402	PERMA_1403		acpS	FALSE	0.122	117.000	0.000	1.000		NA
7269967	7269968	PERMA_1403	PERMA_1404	acpS	aroK	TRUE	0.889	-3.000	0.003	1.000	N	NA
7269968	7269969	PERMA_1404	PERMA_1405	aroK		TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7269971	7269972	PERMA_1407	PERMA_1408		queA	TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7269972	7269973	PERMA_1408	PERMA_1409	queA		TRUE	0.978	2.000	0.039	NA		NA
7269973	7269974	PERMA_1409	PERMA_1410		thiE	FALSE	0.379	39.000	0.000	NA		NA
7269975	7269976	PERMA_1411	PERMA_1412	nuoA		TRUE	0.994	-9.000	0.018	0.005	Y	NA
7269976	7269977	PERMA_1412	PERMA_1413			TRUE	0.985	64.000	0.750	0.005	Y	NA
7269977	7269978	PERMA_1413	PERMA_1414			TRUE	0.720	79.000	0.000	0.008	Y	NA
7269978	7269979	PERMA_1414	PERMA_1415			TRUE	0.979	2.000	0.000	0.008	Y	NA
7269979	7269980	PERMA_1415	PERMA_1416			TRUE	0.962	-9.000	0.000	0.008	Y	NA
7269980	7269981	PERMA_1416	PERMA_1417			TRUE	0.998	0.000	0.484	0.005	Y	NA
7269981	7269982	PERMA_1417	PERMA_1418		nuoL	TRUE	0.999	14.000	0.451	0.008	Y	NA
7269982	7269983	PERMA_1418	PERMA_1419	nuoL		TRUE	0.995	12.000	0.004	0.002	Y	NA
7269983	7269984	PERMA_1419	PERMA_1420		nuoN	TRUE	0.972	4.000	0.000	0.002	Y	NA
7269984	7269985	PERMA_1420	PERMA_1421	nuoN	gmk	TRUE	0.921	1.000	0.004	1.000	N	NA
7269985	7269986	PERMA_1421	PERMA_1422	gmk		TRUE	0.898	-7.000	0.002	NA		NA
7269986	7269987	PERMA_1422	PERMA_1423		rpoZ	FALSE	0.354	40.000	0.000	NA		NA
7269987	7269988	PERMA_1423	PERMA_1424	rpoZ		TRUE	0.653	9.000	0.000	1.000		NA
7269988	7269989	PERMA_1424	PERMA_1425			TRUE	0.994	-3.000	0.024	0.090	Y	NA
7269989	7269990	PERMA_1425	PERMA_1426		lysS	FALSE	0.313	64.000	0.000	0.090	N	NA
7269990	7269991	PERMA_1426	PERMA_1427	lysS		FALSE	0.503	66.000	0.005	NA	N	NA
7269991	7269992	PERMA_1427	PERMA_1428		hfq_2	TRUE	0.991	18.000	0.750	NA		NA
7269992	7269993	PERMA_1428	PERMA_1429	hfq_2		TRUE	0.598	99.000	0.014	1.000		NA
7269993	7269994	PERMA_1429	PERMA_1430			FALSE	0.150	77.000	0.000	NA		NA
7269995	7269996	PERMA_1431	PERMA_1432		rpsP	TRUE	0.958	36.000	0.385	1.000		NA
7269996	7269997	PERMA_1432	PERMA_1433	rpsP	ffh	TRUE	0.978	21.000	0.361	1.000	N	NA
7269998	7269999	PERMA_1434	PERMA_1435			TRUE	0.771	14.000	0.000	NA		NA
7269999	7270000	PERMA_1435	PERMA_1436			FALSE	0.547	31.000	0.000	NA		NA
7270000	7270001	PERMA_1436	PERMA_1437			FALSE	0.152	80.000	0.000	1.000		NA
7270001	7270002	PERMA_1437	PERMA_1438		speE	TRUE	0.973	11.000	0.056	1.000		NA
7270002	7270003	PERMA_1438	PERMA_1439	speE		TRUE	0.984	15.000	0.087	NA		NA
7270003	7270004	PERMA_1439	PERMA_1440			FALSE	0.105	166.000	0.000	NA		NA
7270004	7270005	PERMA_1440	PERMA_1441		acnB	FALSE	0.128	93.000	0.000	NA		NA
7270005	7270006	PERMA_1441	PERMA_1442	acnB		FALSE	0.152	80.000	0.000	1.000		NA
7270006	7270007	PERMA_1442	PERMA_1443			FALSE	0.157	78.000	0.000	1.000		NA
7270007	7270008	PERMA_1443	PERMA_1444			FALSE	0.047	129.000	0.000	1.000	N	NA
7270008	7270009	PERMA_1444	PERMA_1445			FALSE	0.097	257.000	0.000	NA		NA
7270010	7270011	PERMA_1446	PERMA_1447			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7270011	7270012	PERMA_1447	PERMA_1448			TRUE	0.561	-16.000	0.000	NA		NA
7270012	7270013	PERMA_1448	PERMA_1449			TRUE	0.712	3.000	0.000	NA		NA
7270013	7270014	PERMA_1449	PERMA_1450			TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7270014	7270015	PERMA_1450	PERMA_1451			TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
7270015	7270016	PERMA_1451	PERMA_1452			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7270016	7270017	PERMA_1452	PERMA_1453			TRUE	0.615	-10.000	0.000	NA		NA
7270017	7270018	PERMA_1453	PERMA_1454			TRUE	0.637	9.000	0.000	NA		NA
7270018	7270019	PERMA_1454	PERMA_1455			TRUE	0.569	-15.000	0.000	NA		NA
7270020	7270021	PERMA_1456	PERMA_1457			FALSE	0.257	50.000	0.000	NA		NA
7270021	7270022	PERMA_1457	PERMA_1458			TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7270022	7270023	PERMA_1458	PERMA_1459			TRUE	0.750	20.000	0.000	NA		NA
7270023	7270024	PERMA_1459	PERMA_1460			TRUE	0.782	17.000	0.000	NA		NA
7270024	7270025	PERMA_1460	PERMA_1461			FALSE	0.102	199.000	0.000	NA		NA
7270025	7270026	PERMA_1461	PERMA_1462			TRUE	0.704	22.000	0.000	NA		NA
7270027	7270028	PERMA_1463	PERMA_1464	clpS	nadD	TRUE	0.648	5.000	0.000	NA		NA
7270028	7270029	PERMA_1464	PERMA_1465	nadD		TRUE	0.868	5.000	0.003	1.000	N	NA
7270030	7270031	PERMA_1466	PERMA_1467			TRUE	0.941	-3.000	0.014	1.000	N	NA
7270031	7270032	PERMA_1467	PERMA_1468		fabZ	TRUE	0.649	49.000	0.006	1.000	N	NA
7270035	7270036	PERMA_1470	PERMA_1472			TRUE	0.987	-13.000	0.111	1.000	Y	NA
7270036	7270037	PERMA_1472	PERMA_1473			TRUE	0.643	6.000	0.000	NA		NA
7270038	7270039	PERMA_1474	PERMA_1475	cysS		TRUE	0.974	2.000	0.094	1.000	N	NA
7270039	7270040	PERMA_1475	PERMA_1476			FALSE	0.118	51.000	0.000	1.000	N	NA
7270040	7270041	PERMA_1476	PERMA_1477			TRUE	0.964	2.000	0.033	NA	N	NA
7270041	7270042	PERMA_1477	PERMA_1478			TRUE	0.981	17.000	0.231	NA	N	NA
7270042	7270043	PERMA_1478	PERMA_1479			FALSE	0.538	118.000	0.033	1.000	N	NA
7270043	7270044	PERMA_1479	PERMA_1480			TRUE	0.995	0.000	0.422	1.000	Y	NA
7270044	7270045	PERMA_1480	PERMA_1481			TRUE	0.983	18.000	0.449	NA	N	NA
7270047	7270048	PERMA_1483	PERMA_1484			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7270048	7270049	PERMA_1484	PERMA_1485			TRUE	0.997	3.000	0.125	0.062	Y	NA
7270049	7270050	PERMA_1485	PERMA_1487			FALSE	0.358	59.000	0.000	0.062	N	NA
7270051	7270052	PERMA_1486	PERMA_1488			TRUE	0.929	12.000	0.005	1.000	N	NA
7270053	7270054	PERMA_1489	PERMA_1490	purT		TRUE	0.637	9.000	0.000	NA		NA
7270054	7270055	PERMA_1490	PERMA_1491			TRUE	0.980	-6.000	0.400	NA		NA
7270055	7270056	PERMA_1491	PERMA_1492			FALSE	0.107	157.000	0.000	NA		NA
7270056	7270057	PERMA_1492	PERMA_1493			FALSE	0.507	33.000	0.000	NA		NA
7270057	7270058	PERMA_1493	PERMA_1494			FALSE	0.221	58.000	0.000	NA		NA
7270058	7270059	PERMA_1494	PERMA_1495			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7270059	7270060	PERMA_1495	PERMA_1496			TRUE	0.638	8.000	0.000	NA		NA
7270060	7270061	PERMA_1496	PERMA_1497			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7270061	7270062	PERMA_1497	PERMA_1498			TRUE	0.913	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
7270063	7270064	PERMA_1499	PERMA_1500		purH	FALSE	0.115	118.000	0.000	NA		NA
7270065	7270066	PERMA_1501	PERMA_1502			TRUE	0.571	507.000	0.029	NA		NA
7270067	7270068	PERMA_1503	PERMA_1504	trmU	pilC	TRUE	0.950	1.000	0.014	1.000	N	NA
7270068	7270069	PERMA_1504	PERMA_1505	pilC		TRUE	0.995	14.000	0.218	1.000	Y	NA
7270069	7270070	PERMA_1505	PERMA_1506			TRUE	0.998	18.000	0.047	0.004	Y	NA
7270071	7270072	PERMA_1507	PERMA_1508	accC_1		TRUE	0.962	-3.000	0.015	1.000		NA
7270072	7270073	PERMA_1508	PERMA_1509			TRUE	0.923	-6.000	0.004	1.000		NA
7270073	7270074	PERMA_1509	PERMA_1510			TRUE	0.554	-18.000	0.000	NA		NA
7270074	7270075	PERMA_1510	PERMA_1511			FALSE	0.336	41.000	0.000	NA		NA
7270075	7270076	PERMA_1511	PERMA_1512		panD	TRUE	0.978	0.000	0.004	1.000	Y	NA
7270076	7270077	PERMA_1512	PERMA_1513	panD		TRUE	0.920	3.000	0.005	1.000	N	NA
7270077	7270078	PERMA_1513	PERMA_1514		ispG	TRUE	0.911	1.000	0.004	1.000	N	NA
7270078	7270079	PERMA_1514	PERMA_1515	ispG		TRUE	0.941	1.000	0.004	NA		NA
7270079	7270080	PERMA_1515	PERMA_1516			TRUE	0.969	-13.000	0.214	NA		NA
7270080	7270081	PERMA_1516	PERMA_1517		argB	TRUE	0.943	1.000	0.004	NA		NA
7270082	7270083	PERMA_1518	PERMA_1519			TRUE	0.655	10.000	0.000	1.000		NA
7270085	7270086	PERMA_1521	PERMA_1522	secA	lspA	TRUE	0.935	76.000	0.023	0.062	Y	NA
7270086	7270087	PERMA_1522	PERMA_1523	lspA		TRUE	0.965	2.000	0.031	1.000	N	NA
7270088	7270089	PERMA_1524	PERMA_1525			TRUE	0.738	1.000	0.000	NA		NA
7270089	7270090	PERMA_1525	PERMA_1526			TRUE	0.643	6.000	0.000	NA		NA
7270090	7270091	PERMA_1526	PERMA_1527			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7270091	7270092	PERMA_1527	PERMA_1528			FALSE	0.176	67.000	0.000	NA		NA
7270092	7270093	PERMA_1528	PERMA_1529			FALSE	0.044	185.000	0.000	1.000	N	NA
7270093	7270094	PERMA_1529	PERMA_1530			FALSE	0.150	77.000	0.000	NA		NA
7270094	7270095	PERMA_1530	PERMA_1531			TRUE	0.712	3.000	0.000	NA		NA
7270095	7270096	PERMA_1531	PERMA_1532			TRUE	0.895	-15.000	0.004	NA		NA
7270096	7270097	PERMA_1532	PERMA_1533			TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7270098	7270099	PERMA_1534	PERMA_1535			FALSE	0.338	306.000	0.000	0.009		NA
7270099	7270100	PERMA_1535	PERMA_1536			FALSE	0.526	-28.000	0.000	NA		NA
7270100	7270101	PERMA_1536	PERMA_1537			TRUE	0.977	9.000	0.333	NA		NA
7270101	7270102	PERMA_1537	PERMA_1538		lexA	TRUE	0.712	3.000	0.000	NA		NA
7270103	7270104	PERMA_1539	PERMA_1540	dnaN	gyrB	TRUE	0.952	49.000	0.114	1.000	Y	NA
7270107	7270108	PERMA_1543	PERMA_1544			TRUE	0.994	2.000	0.093	1.000	Y	NA
7270108	7270109	PERMA_1544	PERMA_1545			FALSE	0.105	232.000	0.000	1.000		NA
7270110	7270111	PERMA_1546	PERMA_1547			FALSE	0.098	243.000	0.000	NA		NA
7270111	7270112	PERMA_1547	PERMA_1548			TRUE	0.712	3.000	0.000	NA		NA
7270112	7270113	PERMA_1548	PERMA_1549			TRUE	0.998	0.000	1.000	0.088	Y	NA
7270113	7270114	PERMA_1549	PERMA_1550			FALSE	0.412	49.000	0.000	0.088	N	NA
7270114	7270115	PERMA_1550	PERMA_1551			TRUE	0.696	11.000	0.000	1.000		NA
7270115	7270116	PERMA_1551	PERMA_1552			TRUE	0.725	0.000	0.000	1.000		NA
7270116	7270117	PERMA_1552	PERMA_1554			TRUE	0.585	-13.000	0.000	NA		NA
7270118	7270119	PERMA_1553	PERMA_1555	secF	secD	TRUE	0.997	10.000	0.051	0.001	Y	NA
7270121	7270122	PERMA_1557	PERMA_1558	pgi	serS	FALSE	0.410	9.000	0.000	1.000	N	NA
7270122	7270123	PERMA_1558	PERMA_1559	serS		TRUE	0.902	10.000	0.003	1.000		NA
7270126	7270127	PERMA_1562	PERMA_1563			TRUE	0.982	-10.000	1.000	NA		NA
7270128	7270129	PERMA_1564	PERMA_1565			TRUE	0.575	29.000	0.000	NA		NA
7270129	7270130	PERMA_1565	PERMA_1566			TRUE	0.925	-16.000	0.011	NA		NA
7270130	7270131	PERMA_1566	PERMA_1567		hpt	TRUE	0.770	38.000	0.006	1.000	N	NA
7270131	7270132	PERMA_1567	PERMA_1568	hpt	rimI	TRUE	0.911	29.000	0.005	1.000		NA
7270132	7270133	PERMA_1568	PERMA_1569	rimI		TRUE	0.725	0.000	0.000	1.000		NA
7270133	7270134	PERMA_1569	PERMA_1570			TRUE	0.643	6.000	0.000	NA		NA
7270135	7270136	PERMA_1571	PERMA_1572		pstS	TRUE	0.986	19.000	0.182	1.000		NA
7270136	7270137	PERMA_1572	PERMA_1573	pstS	pstC	TRUE	0.964	90.000	0.086	0.002	Y	NA
7270137	7270138	PERMA_1573	PERMA_1574	pstC	pstA	TRUE	0.998	6.000	0.537	0.002	Y	NA
7270138	7270139	PERMA_1574	PERMA_1575	pstA	pstB	TRUE	0.999	0.000	0.526	0.002	Y	NA
7270139	7270140	PERMA_1575	PERMA_1576	pstB	phoU	TRUE	0.996	16.000	0.317	NA	Y	NA
7270140	7270141	PERMA_1576	PERMA_1577	phoU		TRUE	0.929	-7.000	0.018	NA	N	NA
7270141	7270142	PERMA_1577	PERMA_1578			TRUE	0.769	2.000	0.000	1.000		NA
7270142	7270143	PERMA_1578	PERMA_1579			TRUE	0.922	-25.000	0.013	1.000		NA
7270143	7270144	PERMA_1579	PERMA_1580			TRUE	0.979	2.000	0.045	NA		NA
7270144	7270145	PERMA_1580	PERMA_1582			TRUE	0.975	14.000	0.019	NA		NA
7270146	7270147	PERMA_1581	PERMA_1583	cysM	ruvA	FALSE	0.159	42.000	0.000	1.000	N	NA
7270148	7270149	PERMA_1584	PERMA_1585			TRUE	0.682	133.000	0.400	1.000	N	NA
7270149	7270150	PERMA_1585	PERMA_1586		glnA	TRUE	0.961	32.000	0.005	1.000	Y	NA
7270150	7270151	PERMA_1586	PERMA_1587	glnA		FALSE	0.130	91.000	0.000	NA		NA
7270151	7270152	PERMA_1587	PERMA_1588			FALSE	0.132	90.000	0.000	NA		NA
7270152	7270153	PERMA_1588	PERMA_1589			TRUE	0.643	6.000	0.000	NA		NA
7270153	7270154	PERMA_1589	PERMA_1590			FALSE	0.297	45.000	0.000	NA		NA
7270154	7270155	PERMA_1590	PERMA_1591			TRUE	0.561	-16.000	0.000	NA		NA
7270155	7270156	PERMA_1591	PERMA_1592		coaE	TRUE	0.859	2.000	0.000	0.087	N	NA
7270156	7270157	PERMA_1592	PERMA_1593	coaE		TRUE	0.913	-3.000	0.002	NA		NA
7270157	7270158	PERMA_1593	PERMA_1595			FALSE	0.526	-28.000	0.000	NA		NA
7270159	7270160	PERMA_1594	PERMA_1596			TRUE	0.954	-3.000	0.009	NA		NA
7270160	7270161	PERMA_1596	PERMA_1597			FALSE	0.041	243.000	0.000	1.000	N	NA
7270161	7270162	PERMA_1597	PERMA_1598			FALSE	0.104	182.000	0.000	NA		NA
7270162	7270163	PERMA_1598	PERMA_1599			TRUE	0.653	24.000	0.000	NA		NA
7270163	7270164	PERMA_1599	PERMA_1600			TRUE	0.958	-3.000	0.012	NA		NA
7270165	7270166	PERMA_1601	PERMA_1602	rumA		FALSE	0.052	100.000	0.000	1.000	N	NA
7270166	7270167	PERMA_1602	PERMA_1603			TRUE	0.661	-7.000	0.000	1.000		NA
7270167	7270168	PERMA_1603	PERMA_1605			TRUE	0.989	-7.000	0.109	0.022		NA
7270169	7270170	PERMA_1604	PERMA_1606			FALSE	0.323	42.000	0.000	NA		NA
7270170	7270171	PERMA_1606	PERMA_1607		gidB	FALSE	0.118	47.000	0.000	NA	N	NA
7270171	7270172	PERMA_1607	PERMA_1608	gidB		TRUE	0.901	-3.000	0.004	1.000	N	NA
7270172	7270173	PERMA_1608	PERMA_1609			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7270173	7270174	PERMA_1609	PERMA_1610			FALSE	0.231	56.000	0.000	NA		NA
7270174	7270175	PERMA_1610	PERMA_1611			TRUE	0.615	-10.000	0.000	NA		NA
7270176	7270177	PERMA_1612	PERMA_1613	corA		TRUE	0.857	49.000	0.064	NA		NA
7270177	7270178	PERMA_1613	PERMA_1614		flgK	FALSE	0.238	55.000	0.000	NA		NA
7270178	7270179	PERMA_1614	PERMA_1615	flgK	flgL	TRUE	0.986	66.000	0.833	0.001	Y	NA
7270180	7270181	PERMA_1616	PERMA_1617		fliS	FALSE	0.529	-27.000	0.000	NA		NA
7270181	7270182	PERMA_1617	PERMA_1618	fliS		TRUE	0.998	14.000	0.056	0.001	Y	NA
7270182	7270183	PERMA_1618	PERMA_1619			TRUE	0.992	5.000	0.298	NA	Y	NA
7270183	7270184	PERMA_1619	PERMA_1620			TRUE	0.908	61.000	0.032	NA	Y	NA
7270184	7270185	PERMA_1620	PERMA_1621			FALSE	0.140	82.000	0.000	NA		NA
7270185	7270186	PERMA_1621	PERMA_1622			TRUE	0.615	-10.000	0.000	NA		NA
7270186	7270187	PERMA_1622	PERMA_1623			TRUE	0.993	-3.000	0.235	1.000	Y	NA
7270187	7270188	PERMA_1623	PERMA_1624		neuC	TRUE	0.991	-7.000	0.131	1.000	Y	NA
7270188	7270189	PERMA_1624	PERMA_1625	neuC		TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7270189	7270190	PERMA_1625	PERMA_1626			TRUE	0.615	-10.000	0.000	NA		NA
7270190	7270191	PERMA_1626	PERMA_1627		neuB	FALSE	0.205	61.000	0.000	NA		NA
7270191	7270192	PERMA_1627	PERMA_1628	neuB		TRUE	0.967	-3.000	0.027	1.000		NA
7270192	7270193	PERMA_1628	PERMA_1629			TRUE	0.711	-3.000	0.000	1.000		NA
7270193	7270194	PERMA_1629	PERMA_1630			TRUE	0.989	-7.000	0.061	1.000	Y	NA
7270194	7270195	PERMA_1630	PERMA_1631			FALSE	0.100	422.000	0.000	1.000		NA
7270196	7270197	PERMA_1632	PERMA_1633			FALSE	0.417	6.000	0.000	1.000	N	NA
7270197	7270198	PERMA_1633	PERMA_1634			TRUE	0.982	19.000	0.003	1.000	Y	NA
7270198	7270199	PERMA_1634	PERMA_1635		accC_2	TRUE	0.932	13.000	0.005	1.000	N	NA
7270199	7270200	PERMA_1635	PERMA_1636	accC_2	eno	TRUE	0.951	13.000	0.009	1.000	N	NA
7270200	7270201	PERMA_1636	PERMA_1637	eno		TRUE	0.902	-46.000	0.032	1.000	N	NA
7270201	7270202	PERMA_1637	PERMA_1639			TRUE	0.871	-48.000	0.004	1.000		NA
7270203	7270204	PERMA_1638	PERMA_1640	argJ		TRUE	0.725	0.000	0.000	1.000		NA
7270204	7270205	PERMA_1640	PERMA_1641			TRUE	0.696	11.000	0.000	1.000		NA
7270205	7270206	PERMA_1641	PERMA_1642			FALSE	0.148	78.000	0.000	NA		NA
7270208	7270209	PERMA_1643	PERMA_1645			TRUE	0.730	21.000	0.000	NA		NA
7270209	7270210	PERMA_1645	PERMA_1646		hisA	TRUE	0.884	3.000	0.003	NA	N	NA
7270210	7270211	PERMA_1646	PERMA_1647	hisA		TRUE	0.655	10.000	0.000	1.000		NA
7270211	7270212	PERMA_1647	PERMA_1648			TRUE	0.943	4.000	0.007	1.000		NA
7270212	7270213	PERMA_1648	PERMA_1649			FALSE	0.336	41.000	0.000	NA		NA
7270214	7270215	PERMA_1650	PERMA_1651			TRUE	0.981	0.000	0.174	NA		NA
7270215	7270216	PERMA_1651	PERMA_1652			TRUE	0.628	26.000	0.000	1.000		NA
7270217	7270218	PERMA_1653	PERMA_1654			TRUE	0.662	-6.000	0.000	NA		NA
7270218	7270219	PERMA_1654	PERMA_1655			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7270219	7270220	PERMA_1655	PERMA_1656			FALSE	0.481	36.000	0.000	1.000		NA
7270220	7270221	PERMA_1656	PERMA_1657			FALSE	0.494	0.000	0.000	1.000	N	NA
7270221	7270222	PERMA_1657	PERMA_1658			FALSE	0.518	21.000	0.000	1.000	N	NA
7270222	7270223	PERMA_1658	PERMA_1659			TRUE	0.973	3.000	0.039	1.000		NA
7270223	7270224	PERMA_1659	PERMA_1660		tatC	FALSE	0.264	49.000	0.000	NA		NA
7270224	7270225	PERMA_1660	PERMA_1661	tatC		TRUE	0.969	-25.000	0.009	NA	Y	NA
7270225	7270226	PERMA_1661	PERMA_1662			FALSE	0.159	42.000	0.000	1.000	N	NA
7270226	7270227	PERMA_1662	PERMA_1663			TRUE	0.901	4.000	0.000	1.000	Y	NA
7270228	7270229	PERMA_1664	PERMA_1665	thiD		TRUE	0.711	-3.000	0.000	1.000		NA
7270229	7270230	PERMA_1665	PERMA_1666			FALSE	0.312	45.000	0.000	1.000		NA
7270231	7270232	PERMA_1667	PERMA_1668		speD_1	FALSE	0.287	46.000	0.000	NA		NA
7270234	7270235	PERMA_1669	PERMA_1671		hemH	TRUE	0.646	-7.000	0.000	NA		NA
7270237	7270238	PERMA_1673	PERMA_1674		dnaG	TRUE	0.922	-3.000	0.006	1.000	N	NA
7270239	7270240	PERMA_1675	PERMA_1676	folP		TRUE	0.973	-7.000	0.133	NA		NA
7270240	7270241	PERMA_1676	PERMA_1677			TRUE	0.601	-12.000	0.000	NA		NA
7270241	7270242	PERMA_1677	PERMA_1678		thrS	FALSE	0.464	36.000	0.000	NA		NA
7270243	7270244	PERMA_1679	PERMA_1681			FALSE	0.102	195.000	0.000	NA		NA
7270245	7270246	PERMA_1682	PERMA_1683	proA		TRUE	0.957	10.000	0.105	1.000	N	NA
7270246	7270247	PERMA_1683	PERMA_1684		panB	TRUE	0.883	0.000	0.002	1.000	N	NA
7270247	7270248	PERMA_1684	PERMA_1686	panB		TRUE	0.860	-7.000	0.003	NA	N	NA
7270249	7270250	PERMA_1685	PERMA_1687	maeB	speD_2	FALSE	0.371	27.000	0.000	1.000	N	NA
7270254	7270255	PERMA_1690	PERMA_1692			TRUE	0.982	4.000	0.545	NA		NA
7270257	7270258	PERMA_1694	PERMA_1695		atpC_2	TRUE	0.989	2.000	0.671	NA		NA
7270258	7270259	PERMA_1695	PERMA_1696	atpC_2	atpD_2	TRUE	0.995	-19.000	0.129	0.010	Y	NA
7270259	7270260	PERMA_1696	PERMA_1697	atpD_2	atpG_2	TRUE	0.971	-3.000	0.000	0.010	Y	NA
7270260	7270261	PERMA_1697	PERMA_1698	atpG_2	atpA_2	TRUE	0.998	-3.000	0.455	0.010	Y	NA
7270261	7270262	PERMA_1698	PERMA_1699	atpA_2		TRUE	0.997	-13.000	0.697	0.010	Y	NA
7270262	7270263	PERMA_1699	PERMA_1700			TRUE	0.998	10.000	0.727	0.010	Y	NA
7270263	7270264	PERMA_1700	PERMA_1701		atpB_2	TRUE	0.999	16.000	0.818	0.011	Y	NA
7270264	7270265	PERMA_1701	PERMA_1702	atpB_2		TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7270265	7270266	PERMA_1702	PERMA_1703			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7270266	7270267	PERMA_1703	PERMA_1704		tkt	TRUE	0.588	17.000	0.000	1.000	N	NA
7270267	7270268	PERMA_1704	PERMA_1705	tkt	aat	FALSE	0.061	82.000	0.000	1.000	N	NA
7270268	7270269	PERMA_1705	PERMA_1706	aat	truD_2	TRUE	0.669	24.000	0.000	1.000		NA
7270270	7270271	PERMA_1707	PERMA_1708		galT	TRUE	0.592	29.000	0.000	1.000		NA
7270271	7270272	PERMA_1708	PERMA_1709	galT		TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
7270272	7270273	PERMA_1709	PERMA_1711			TRUE	0.983	17.000	0.060	NA		NA
7270274	7270275	PERMA_1710	PERMA_1712			FALSE	0.094	438.000	0.000	NA		NA
7270275	7270276	PERMA_1712	PERMA_1713			TRUE	0.935	10.000	0.007	NA		NA
7270276	7270277	PERMA_1713	PERMA_1714			FALSE	0.160	73.000	0.000	NA		NA
7270277	7270278	PERMA_1714	PERMA_1715			TRUE	0.997	30.000	0.371	0.001	Y	NA
7270278	7270279	PERMA_1715	PERMA_1716			TRUE	0.766	115.000	0.007	1.000	Y	NA
7270280	7270281	PERMA_1717	PERMA_1718	leuC		TRUE	0.965	22.000	0.019	NA		NA
7270281	7270282	PERMA_1718	PERMA_1719			TRUE	0.948	-3.000	0.007	NA		NA
7270282	7270283	PERMA_1719	PERMA_1720			TRUE	0.964	-7.000	0.043	NA		NA
7270283	7270284	PERMA_1720	PERMA_1721			TRUE	0.681	23.000	0.000	NA		NA
7270285	7270286	PERMA_1722	PERMA_1723	aroA		TRUE	0.837	8.000	0.002	1.000	N	NA
7270286	7270287	PERMA_1723	PERMA_1724		lptA	TRUE	0.957	0.000	0.009	NA		NA
7270287	7270288	PERMA_1724	PERMA_1725	lptA		TRUE	0.987	1.000	0.459	NA		NA
7270288	7270289	PERMA_1725	PERMA_1726		hemA	TRUE	0.950	3.000	0.006	NA		NA
7270290	7270291	PERMA_1727	PERMA_1728			FALSE	0.549	-19.000	0.000	NA		NA
7270291	7270292	PERMA_1728	PERMA_1729			TRUE	0.771	14.000	0.000	NA		NA
7270292	7270293	PERMA_1729	PERMA_1730			TRUE	0.646	-7.000	0.000	NA		NA
7270293	7270294	PERMA_1730	PERMA_1731			FALSE	0.221	58.000	0.000	NA		NA
7270294	7270295	PERMA_1731	PERMA_1732			FALSE	0.354	40.000	0.000	NA		NA
7270295	7270296	PERMA_1732	PERMA_1733			TRUE	0.955	38.000	0.750	NA		NA
7270296	7270297	PERMA_1733	PERMA_1734			TRUE	0.983	7.000	1.000	NA		NA
7270297	7270298	PERMA_1734	PERMA_1736			TRUE	0.990	2.000	1.000	NA		NA
7270300	7270301	PERMA_1737	PERMA_1738			TRUE	0.959	-7.000	0.118	1.000	N	NA
7270301	7270302	PERMA_1738	PERMA_1739			TRUE	0.823	73.000	0.055	0.085	N	NA
7270302	7270303	PERMA_1739	PERMA_1740		yaeT	FALSE	0.367	393.000	0.008	1.000	N	NA
7270303	7270304	PERMA_1740	PERMA_1741	yaeT		TRUE	0.987	12.000	0.008	1.000	Y	NA
7270304	7270305	PERMA_1741	PERMA_1743		lpxD	TRUE	0.984	-3.000	0.008	1.000	Y	NA
7270306	7270307	PERMA_1742	PERMA_1744			TRUE	0.991	4.000	0.100	1.000	Y	NA
7270309	7270310	PERMA_1745	PERMA_1747			FALSE	0.112	128.000	0.000	NA		NA
7270310	7270311	PERMA_1747	PERMA_1748			FALSE	0.494	0.000	0.000	1.000	N	NA
7270311	7270312	PERMA_1748	PERMA_1749			FALSE	0.110	55.000	0.000	1.000	N	NA
7270312	7270313	PERMA_1749	PERMA_1750			TRUE	0.627	25.000	0.000	NA		NA
7270313	7270314	PERMA_1750	PERMA_1751			TRUE	0.585	-13.000	0.000	NA		NA
7270314	7270315	PERMA_1751	PERMA_1752			TRUE	0.959	-10.000	0.042	NA		NA
7270315	7270316	PERMA_1752	PERMA_1753			FALSE	0.413	10.000	0.000	1.000	N	NA
7270316	7270317	PERMA_1753	PERMA_1754		hslV	TRUE	0.915	4.000	0.007	1.000	N	NA
7270317	7270318	PERMA_1754	PERMA_1755	hslV		TRUE	0.865	-13.000	0.005	NA	N	NA
7270319	7270320	PERMA_1756	PERMA_1757		coaD	TRUE	0.937	-3.000	0.012	1.000	N	NA
7270320	7270321	PERMA_1757	PERMA_1758	coaD		TRUE	0.880	30.000	0.004	NA		NA
7270321	7270322	PERMA_1758	PERMA_1759		holA	TRUE	0.937	0.000	0.004	NA		NA
7270322	7270323	PERMA_1759	PERMA_1760	holA	ruvB	TRUE	0.967	0.000	0.000	0.033	Y	NA
7270323	7270324	PERMA_1760	PERMA_1761	ruvB	nadA	FALSE	0.068	75.000	0.000	1.000	N	NA
7270326	7270327	PERMA_1763	PERMA_1765		cas_5	FALSE	0.058	77.000	0.000	NA	N	NA
7270332	7270333	PERMA_1768	PERMA_1770			FALSE	0.552	2.000	0.000	1.000	N	NA
7270333	7270334	PERMA_1770	PERMA_1771			FALSE	0.092	716.000	0.000	NA		NA
7270334	7270335	PERMA_1771	PERMA_1772			TRUE	0.738	1.000	0.000	NA		NA
7270335	7270336	PERMA_1772	PERMA_1773			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7270336	7270337	PERMA_1773	PERMA_1774			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7270339	7270340	PERMA_1775	PERMA_1777			TRUE	0.561	-16.000	0.000	NA		NA
7270340	7270341	PERMA_1777	PERMA_1778			TRUE	0.646	-7.000	0.000	NA		NA
7270341	7270342	PERMA_1778	PERMA_1779			TRUE	0.628	-9.000	0.000	NA		NA
7270342	7270343	PERMA_1779	PERMA_1780			FALSE	0.439	37.000	0.000	NA		NA
7270343	7270344	PERMA_1780	PERMA_1781			TRUE	0.776	18.000	0.000	NA		NA
7270344	7270345	PERMA_1781	PERMA_1782			TRUE	0.779	15.000	0.000	NA		NA
7270345	7270346	PERMA_1782	PERMA_1783			FALSE	0.243	54.000	0.000	NA		NA
7270346	7270347	PERMA_1783	PERMA_1784			FALSE	0.110	137.000	0.000	NA		NA
7270347	7270348	PERMA_1784	PERMA_1785			FALSE	0.113	125.000	0.000	NA		NA
7270348	7270349	PERMA_1785	PERMA_1786			FALSE	0.102	189.000	0.000	NA		NA
7270349	7270350	PERMA_1786	PERMA_1787			FALSE	0.533	-25.000	0.000	NA		NA
7270350	7270351	PERMA_1787	PERMA_1788			FALSE	0.095	372.000	0.000	NA		NA
7270351	7270352	PERMA_1788	PERMA_1789			FALSE	0.096	338.000	0.000	NA		NA
7270352	7270353	PERMA_1789	PERMA_1790			FALSE	0.372	105.000	0.000	NA	Y	NA
7270353	7270354	PERMA_1790	PERMA_1791			TRUE	0.765	13.000	0.000	NA		NA
7270354	7270355	PERMA_1791	PERMA_1792			TRUE	0.987	-3.000	1.000	NA		NA
7270355	7270356	PERMA_1792	PERMA_1793			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7270356	7270357	PERMA_1793	PERMA_1794			TRUE	0.981	2.000	0.055	1.000		NA
7270357	7270358	PERMA_1794	PERMA_1795			TRUE	0.905	6.000	0.000	0.005		NA
7270358	7270359	PERMA_1795	PERMA_1796			FALSE	0.098	235.000	0.000	NA		NA
7270359	7270360	PERMA_1796	PERMA_1797			TRUE	0.765	13.000	0.000	NA		NA
7270361	7270362	PERMA_1798	PERMA_1799			TRUE	0.597	27.000	0.000	NA		NA
7270362	7270363	PERMA_1799	PERMA_1800			FALSE	0.113	124.000	0.000	NA		NA
7270363	7270364	PERMA_1800	PERMA_1801			FALSE	0.517	-34.000	0.000	NA		NA
7270364	7270365	PERMA_1801	PERMA_1802			TRUE	0.648	5.000	0.000	NA		NA
7270365	7270366	PERMA_1802	PERMA_1803			TRUE	0.730	21.000	0.000	NA		NA
7270366	7270367	PERMA_1803	PERMA_1804			TRUE	0.646	-7.000	0.000	NA		NA
7270367	7270368	PERMA_1804	PERMA_1805			FALSE	0.539	-22.000	0.000	NA		NA
7270368	7270369	PERMA_1805	PERMA_1806			FALSE	0.507	33.000	0.000	NA		NA
7270369	7270370	PERMA_1806	PERMA_1807			TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7270370	7270371	PERMA_1807	PERMA_1808			TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
7270371	7270372	PERMA_1808	PERMA_1809			TRUE	0.664	4.000	0.000	NA		NA
7270372	7270373	PERMA_1809	PERMA_1810			TRUE	0.664	4.000	0.000	NA		NA
7270373	7270374	PERMA_1810	PERMA_1811			TRUE	0.816	82.000	0.500	NA		NA
7270374	7270375	PERMA_1811	PERMA_1812			TRUE	0.976	-18.000	1.000	NA		NA
7270375	7270376	PERMA_1812	PERMA_1813			TRUE	0.974	-16.000	0.667	NA		NA
7270376	7270377	PERMA_1813	PERMA_1814			TRUE	0.988	3.000	1.000	NA		NA
7270377	7270378	PERMA_1814	PERMA_1815			TRUE	0.968	-10.000	0.111	NA		NA
7270378	7270379	PERMA_1815	PERMA_1816			FALSE	0.128	94.000	0.000	NA		NA
7270379	7270380	PERMA_1816	PERMA_1817			FALSE	0.125	97.000	0.000	NA		NA
7270380	7270381	PERMA_1817	PERMA_1818			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7270381	7270382	PERMA_1818	PERMA_1819			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7270382	7270383	PERMA_1819	PERMA_1820			TRUE	0.641	7.000	0.000	NA		NA
7270383	7270384	PERMA_1820	PERMA_1821			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7270384	7270385	PERMA_1821	PERMA_1822			TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7270385	7270386	PERMA_1822	PERMA_1823			TRUE	0.765	13.000	0.000	NA		NA
7270386	7270387	PERMA_1823	PERMA_1824			FALSE	0.093	620.000	0.000	NA		NA
7270387	7270388	PERMA_1824	PERMA_1825			TRUE	0.712	3.000	0.000	NA		NA
7270388	7270389	PERMA_1825	PERMA_1826			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7270389	7270390	PERMA_1826	PERMA_1827			FALSE	0.520	-31.000	0.000	NA		NA
7270393	7270394	PERMA_1829	PERMA_1831			TRUE	0.726	3.000	0.000	1.000		NA
7270394	7270395	PERMA_1831	PERMA_1832			TRUE	0.597	27.000	0.000	NA		NA
7270396	7270397	PERMA_1833	PERMA_1834			TRUE	0.973	0.000	0.043	NA		NA
7270397	7270398	PERMA_1834	PERMA_1835			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7270398	7270399	PERMA_1835	PERMA_1836			FALSE	0.211	60.000	0.000	NA		NA
7270401	7270402	PERMA_1838	PERMA_1839			FALSE	0.126	96.000	0.000	NA		NA
7270403	7270404	PERMA_1840	PERMA_1841	ligA	deoC	FALSE	0.422	5.000	0.000	1.000	N	NA
7270404	7270405	PERMA_1841	PERMA_1842	deoC	prmA	TRUE	0.698	-34.000	0.000	0.038	N	NA
7270405	7270406	PERMA_1842	PERMA_1843	prmA		TRUE	0.970	2.000	0.014	NA		NA
7270406	7270407	PERMA_1843	PERMA_1844			TRUE	0.976	13.000	0.028	NA		NA
7270407	7270408	PERMA_1844	PERMA_1845		dnaJ	TRUE	0.968	16.000	0.028	1.000	N	NA
7270408	7270409	PERMA_1845	PERMA_1846	dnaJ	hisD	FALSE	0.072	72.000	0.000	1.000	N	NA
7270410	7270411	PERMA_1847	PERMA_1848		accD	TRUE	0.943	1.000	0.004	NA		NA
7270411	7270412	PERMA_1848	PERMA_1849	accD	mobB	TRUE	0.928	2.000	0.004	1.000	N	NA
7270412	7270413	PERMA_1849	PERMA_1850	mobB		TRUE	0.897	33.000	0.029	1.000	N	NA
7270413	7270414	PERMA_1850	PERMA_1851			TRUE	0.924	-16.000	0.038	1.000	N	NA
7270414	7270415	PERMA_1851	PERMA_1852			TRUE	0.792	41.000	0.018	1.000	N	NA
7270415	7270416	PERMA_1852	PERMA_1853			TRUE	0.656	7.000	0.000	1.000		NA
7270416	7270417	PERMA_1853	PERMA_1854		bioW	TRUE	0.725	0.000	0.000	1.000		NA
7270417	7270418	PERMA_1854	PERMA_1855	bioW		TRUE	0.646	-7.000	0.000	NA		NA
7270418	7270419	PERMA_1855	PERMA_1856			TRUE	0.615	-10.000	0.000	NA		NA
7270419	7270420	PERMA_1856	PERMA_1857			TRUE	0.943	37.000	0.163	1.000		NA
7270420	7270421	PERMA_1857	PERMA_1858			FALSE	0.101	201.000	0.000	NA		NA
7270421	7270422	PERMA_1858	PERMA_1859			FALSE	0.211	60.000	0.000	NA		NA
7270422	7270423	PERMA_1859	PERMA_1860			FALSE	0.104	173.000	0.000	NA		NA
7270423	7270424	PERMA_1860	PERMA_1861			TRUE	0.615	-10.000	0.000	NA		NA
7270424	7270425	PERMA_1861	PERMA_1862			FALSE	0.096	339.000	0.000	NA		NA
7270425	7270426	PERMA_1862	PERMA_1863			TRUE	0.986	-3.000	0.750	NA		NA
7270426	7270427	PERMA_1863	PERMA_1864			FALSE	0.106	163.000	0.000	NA		NA
7270427	7270428	PERMA_1864	PERMA_1865			TRUE	0.725	223.000	0.300	NA		NA
7270428	7270429	PERMA_1865	PERMA_1866			FALSE	0.238	55.000	0.000	NA		NA
7270429	7270430	PERMA_1866	PERMA_1867			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7270430	7270431	PERMA_1867	PERMA_1868			FALSE	0.103	187.000	0.000	NA		NA
7270431	7270432	PERMA_1868	PERMA_1869			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7270433	7270434	PERMA_1870	PERMA_1871			TRUE	0.638	8.000	0.000	NA		NA
7270435	7270436	PERMA_1872	PERMA_1873	mtnB		TRUE	0.971	13.000	0.013	1.000		NA
7270436	7270437	PERMA_1873	PERMA_1874			TRUE	0.655	10.000	0.000	1.000		NA
7270437	7270438	PERMA_1874	PERMA_1875		thiS	TRUE	0.787	43.000	0.027	1.000	N	NA
7270438	7270439	PERMA_1875	PERMA_1877	thiS	hisS	TRUE	0.908	3.000	0.004	1.000	N	NA
7270441	7270442	PERMA_1878	PERMA_1879	tgt		FALSE	0.336	41.000	0.000	NA		NA
7270442	7270443	PERMA_1879	PERMA_1880			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7270443	7270444	PERMA_1880	PERMA_1882			TRUE	0.916	-3.000	0.006	NA	N	NA
7270445	7270446	PERMA_1881	PERMA_1883			TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7270446	7270447	PERMA_1883	PERMA_1884			FALSE	0.155	75.000	0.000	NA		NA
7270447	7270448	PERMA_1884	PERMA_1885			FALSE	0.116	116.000	0.000	NA		NA
7270448	7270449	PERMA_1885	PERMA_1886			TRUE	0.771	14.000	0.000	NA		NA
7270449	7270450	PERMA_1886	PERMA_1887			TRUE	0.765	13.000	0.000	NA		NA
7270450	7270451	PERMA_1887	PERMA_1888			TRUE	0.980	-3.000	0.188	NA		NA
7270451	7270452	PERMA_1888	PERMA_1889			TRUE	0.979	10.000	0.375	1.000		NA
7270452	7270453	PERMA_1889	PERMA_1890			TRUE	0.991	16.000	0.750	NA		NA
7270453	7270454	PERMA_1890	PERMA_1891			TRUE	0.974	27.000	0.375	NA		NA
7270454	7270455	PERMA_1891	PERMA_1892			TRUE	0.765	13.000	0.000	NA		NA
7270455	7270456	PERMA_1892	PERMA_1893			TRUE	0.897	4.000	0.000	0.016		NA
7270456	7270457	PERMA_1893	PERMA_1894			FALSE	0.108	196.000	0.000	1.000		NA
7270458	7270459	PERMA_1895	PERMA_1896			TRUE	0.980	-3.000	0.200	NA		NA
7270459	7270460	PERMA_1896	PERMA_1898			FALSE	0.097	1608.000	0.000	1.000		NA
7270460	7270461	PERMA_1898	PERMA_1899		ribE	TRUE	0.942	3.000	0.004	1.000		NA
7270461	7270462	PERMA_1899	PERMA_1900	ribE		TRUE	0.774	32.000	0.002	1.000	N	NA
7270462	7270463	PERMA_1900	PERMA_1902			TRUE	0.980	-3.000	0.206	NA		NA
7270467	7270468	PERMA_1905	PERMA_1906			FALSE	0.058	86.000	0.000	1.000	N	NA
7270468	7270469	PERMA_1906	PERMA_1908			FALSE	0.277	47.000	0.000	NA		NA
7270471	7270472	PERMA_1909	PERMA_1910			TRUE	0.974	16.000	0.015	NA		NA
7270472	7270473	PERMA_1910	PERMA_1911		gltX	FALSE	0.354	40.000	0.000	NA		NA
7270473	7270474	PERMA_1911	PERMA_1912	gltX		TRUE	0.915	5.000	0.008	1.000	N	NA
7270474	7270475	PERMA_1912	PERMA_1914			TRUE	0.975	-13.000	0.500	NA		NA
7270476	7270477	PERMA_1913	PERMA_1915			TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7270477	7270478	PERMA_1915	PERMA_1916		modB	TRUE	0.973	-3.000	0.286	1.000	N	NA
7270478	7270479	PERMA_1916	PERMA_1917	modB		TRUE	0.980	0.000	0.122	1.000		NA
7270479	7270480	PERMA_1917	PERMA_1918		modA	TRUE	0.964	-13.000	0.098	1.000		NA
7270480	7270481	PERMA_1918	PERMA_1919	modA		TRUE	0.925	51.000	0.010	0.001		NA
7270482	7270483	PERMA_1920	PERMA_1921			TRUE	0.986	-3.000	0.032	0.004	N	NA
7270483	7270484	PERMA_1921	PERMA_1922			FALSE	0.145	84.000	0.000	1.000		NA
7270485	7270486	PERMA_1923	PERMA_1924	smc		FALSE	0.102	58.000	0.000	1.000	N	NA
7270486	7270487	PERMA_1924	PERMA_1925			TRUE	0.942	15.000	0.000	1.000	Y	NA
7270488	7270489	PERMA_1926	PERMA_1927	hisC_2		TRUE	0.931	-3.000	0.004	NA		NA
7270489	7270490	PERMA_1927	PERMA_1928			TRUE	0.779	15.000	0.000	NA		NA
7270491	7270492	PERMA_1929	PERMA_1930	pgsA_2	rfaE_2	TRUE	0.879	-13.000	0.002	1.000		NA
7270492	7270493	PERMA_1930	PERMA_1931	rfaE_2		TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7270493	7270494	PERMA_1931	PERMA_1932			TRUE	0.982	-7.000	0.750	NA		NA
7270494	7270495	PERMA_1932	PERMA_1933			TRUE	0.970	15.000	0.008	1.000		NA
7270495	7270496	PERMA_1933	PERMA_1934			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7270496	7270497	PERMA_1934	PERMA_1935		rrf_2	FALSE	0.145	79.000	0.000	NA		NA
7270497	10729996	PERMA_1935	PERMA_2029	rrf_2		FALSE	0.277	47.000	0.000	NA		NA
7270498	7270499	PERMA_1936	PERMA_1937			FALSE	0.092	632.000	0.000	NA		NA
7270499	7270500	PERMA_1937	PERMA_1938			TRUE	0.653	24.000	0.000	NA		NA
7270501	7270502	PERMA_1939	PERMA_1940			TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
7270502	7270503	PERMA_1940	PERMA_1941			FALSE	0.092	1082.000	0.000	NA		NA
7270503	7270504	PERMA_1941	PERMA_1942			FALSE	0.100	226.000	0.000	NA		NA
7270504	7270505	PERMA_1942	PERMA_1943			FALSE	0.271	48.000	0.000	NA		NA
7270505	7270506	PERMA_1943	PERMA_1944			TRUE	0.764	19.000	0.000	NA		NA
7270506	7270507	PERMA_1944	PERMA_1945		ppa	FALSE	0.354	40.000	0.000	NA		NA
7270507	7270508	PERMA_1945	PERMA_1946	ppa		FALSE	0.118	106.000	0.000	NA		NA
7270508	7270509	PERMA_1946	PERMA_1947		valS	FALSE	0.379	39.000	0.000	NA		NA
7270509	7270510	PERMA_1947	PERMA_1948	valS		FALSE	0.157	74.000	0.000	NA		NA
7270513	7270514	PERMA_1951	PERMA_1952			FALSE	0.078	67.000	0.000	1.000	N	NA
7270514	7270515	PERMA_1952	PERMA_1953			FALSE	0.074	69.000	0.000	1.000	N	NA
7270515	7270516	PERMA_1953	PERMA_1954			TRUE	0.711	-3.000	0.000	1.000		NA
7270516	7270517	PERMA_1954	PERMA_1955			TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7270517	7270518	PERMA_1955	PERMA_1956			TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7270518	7270519	PERMA_1956	PERMA_1957			FALSE	0.512	-42.000	0.000	NA		NA
7270520	7270521	PERMA_1958	PERMA_1959			TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7270521	7270522	PERMA_1959	PERMA_1960			FALSE	0.336	41.000	0.000	NA		NA
7270522	7270523	PERMA_1960	PERMA_1961			FALSE	0.439	37.000	0.000	NA		NA
7270523	7270524	PERMA_1961	PERMA_1962			TRUE	0.783	16.000	0.000	NA		NA
7270526	7270527	PERMA_1963	PERMA_1965			TRUE	0.981	4.000	0.457	NA		NA
7270527	7270528	PERMA_1965	PERMA_1966		rimM	FALSE	0.107	56.000	0.000	1.000	N	NA
7270528	7270529	PERMA_1966	PERMA_1967	rimM		FALSE	0.417	6.000	0.000	1.000	N	NA
7270529	7270530	PERMA_1967	PERMA_1968			TRUE	0.996	-3.000	0.051	0.021	Y	NA
7270530	7270531	PERMA_1968	PERMA_1969			TRUE	0.583	15.000	0.000	1.000	N	NA
7270531	7270532	PERMA_1969	PERMA_1970		ribF	FALSE	0.477	-3.000	0.000	1.000	N	NA
7270532	7270533	PERMA_1970	PERMA_1971	ribF	recX	TRUE	0.926	-3.000	0.003	1.000		NA
7270533	7270534	PERMA_1971	PERMA_1972	recX		TRUE	0.967	-3.000	0.026	1.000		NA
7270534	7270535	PERMA_1972	PERMA_1973		recA	TRUE	0.986	19.000	0.021	0.020	N	NA
7270535	7270536	PERMA_1973	PERMA_1974	recA	gatC	TRUE	0.905	24.000	0.006	1.000	N	NA
7270536	7270537	PERMA_1974	PERMA_1975	gatC	topA	FALSE	0.290	171.000	0.003	1.000	N	NA
7270537	7270538	PERMA_1975	PERMA_1976	topA		TRUE	0.926	3.000	0.002	1.000		NA
7270538	7270539	PERMA_1976	PERMA_1977			FALSE	0.101	343.000	0.000	1.000		NA
7270539	7270540	PERMA_1977	PERMA_1978		prfB	TRUE	0.726	3.000	0.000	1.000		NA
7270540	7270541	PERMA_1978	PERMA_1979	prfB		FALSE	0.145	79.000	0.000	NA		NA
7270541	7270542	PERMA_1979	PERMA_1980			TRUE	0.963	13.000	0.007	NA		NA
7270543	7270544	PERMA_1981	PERMA_1982		glmS	FALSE	0.312	45.000	0.000	1.000		NA
7270544	7270545	PERMA_1982	PERMA_1983	glmS	sat	FALSE	0.042	231.000	0.000	1.000	N	NA
7270545	7270546	PERMA_1983	PERMA_1984	sat		FALSE	0.133	88.000	0.000	NA		NA
7270546	7270547	PERMA_1984	PERMA_1985			TRUE	0.664	4.000	0.000	NA		NA
7270547	7270548	PERMA_1985	PERMA_1986			FALSE	0.375	226.000	0.000	0.004		NA
7270548	7270549	PERMA_1986	PERMA_1987		cysQ	FALSE	0.370	40.000	0.000	1.000		NA
7270549	7270550	PERMA_1987	PERMA_1988	cysQ		TRUE	0.880	-10.000	0.000	1.000	Y	NA
7270550	7270551	PERMA_1988	PERMA_1989		cysC	TRUE	0.943	16.000	0.000	1.000	Y	NA
7270551	7270552	PERMA_1989	PERMA_1990	cysC		TRUE	0.753	12.000	0.000	1.000		NA
7270552	7270553	PERMA_1990	PERMA_1991			TRUE	0.643	6.000	0.000	NA		NA
7270553	7270554	PERMA_1991	PERMA_1992			TRUE	0.771	14.000	0.000	NA		NA
7270554	7270555	PERMA_1992	PERMA_1993		rfbF	TRUE	0.750	20.000	0.000	NA		NA
7270555	7270556	PERMA_1993	PERMA_1994	rfbF		TRUE	0.982	5.000	0.013	1.000	Y	NA
7270556	7270557	PERMA_1994	PERMA_1995		rfbG	TRUE	0.993	-19.000	0.026	0.004	Y	NA
7270557	7270558	PERMA_1995	PERMA_1996	rfbG		TRUE	0.996	15.000	0.247	1.000	Y	NA
7270558	7270559	PERMA_1996	PERMA_1997			TRUE	0.991	1.000	0.035	1.000	Y	NA
7270559	7270560	PERMA_1997	PERMA_1998			TRUE	0.994	20.000	0.111	NA	Y	NA
7270560	7270561	PERMA_1998	PERMA_1999			TRUE	0.648	5.000	0.000	NA		NA
7270561	7270562	PERMA_1999	PERMA_2000			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7270562	7270563	PERMA_2000	PERMA_2001			FALSE	0.520	-31.000	0.000	NA		NA
7270563	7270564	PERMA_2001	PERMA_2002		gmd	FALSE	0.119	128.000	0.000	1.000		NA
7270564	7270565	PERMA_2002	PERMA_2003	gmd		TRUE	0.890	8.000	0.000	1.000	Y	NA
7270565	7270566	PERMA_2003	PERMA_2004			TRUE	0.938	48.000	0.034	1.000	Y	NA
7270566	7270567	PERMA_2004	PERMA_2005			FALSE	0.112	127.000	0.000	NA		NA
7270567	7270568	PERMA_2005	PERMA_2006			TRUE	0.981	1.000	0.100	NA		NA
7270568	7270569	PERMA_2006	PERMA_2007		galE	FALSE	0.106	163.000	0.000	NA		NA
7270569	7270570	PERMA_2007	PERMA_2008	galE		FALSE	0.421	84.000	0.000	1.000	Y	NA
7270570	7270571	PERMA_2008	PERMA_2009			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7270571	7270572	PERMA_2009	PERMA_2010			FALSE	0.523	-30.000	0.000	NA		NA
7270572	7270573	PERMA_2010	PERMA_2011			TRUE	0.569	-15.000	0.000	NA		NA
7270575	7270576	PERMA_2013	PERMA_2014			FALSE	0.191	64.000	0.000	NA		NA
7270576	7270577	PERMA_2014	PERMA_2016			FALSE	0.157	74.000	0.000	NA		NA
7270581	7270582	PERMA_2019	PERMA_2020			TRUE	0.602	-13.000	0.000	1.000		NA
7270582	7270583	PERMA_2020	PERMA_2022			TRUE	0.779	15.000	0.000	NA		NA
7270584	7270585	PERMA_2021	PERMA_2023			FALSE	0.116	116.000	0.000	NA		NA
7270585	7270586	PERMA_2023	PERMA_2024			TRUE	0.864	50.000	0.103	NA		NA
7270586	7270587	PERMA_2024	PERMA_2025			TRUE	0.938	32.000	0.138	1.000	N	NA
7270587	7270588	PERMA_2025	PERMA_2026		groL	FALSE	0.042	226.000	0.000	1.000	N	NA
7270588	7270589	PERMA_2026	PERMA_2027	groL	groS_2	TRUE	0.977	29.000	0.030	0.080		NA
7270589	7268567	PERMA_2027	PERMA_0001	groS_2	groS_1	TRUE	0.904	63.000	0.020	0.006		NA
7268497	7268498	PERMA_A0001	PERMA_A0002			FALSE	0.143	80.000	0.000	NA		NA
7268498	7268499	PERMA_A0002	PERMA_A0003			TRUE	0.585	-13.000	0.000	NA		NA
7268499	7268500	PERMA_A0003	PERMA_A0005			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268501	7268502	PERMA_A0004	PERMA_A0006			TRUE	0.585	-13.000	0.000	NA		NA
7268502	7268503	PERMA_A0006	PERMA_A0007			FALSE	0.287	46.000	0.000	NA		NA
7268503	7268504	PERMA_A0007	PERMA_A0008			FALSE	0.127	95.000	0.000	NA		NA
7268504	7268505	PERMA_A0008	PERMA_A0009			FALSE	0.106	159.000	0.000	NA		NA
7268505	7268506	PERMA_A0009	PERMA_A0010			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268506	7268507	PERMA_A0010	PERMA_A0011			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268507	7268508	PERMA_A0011	PERMA_A0012			TRUE	0.941	18.000	0.000	1.000	Y	NA
7268508	7268509	PERMA_A0012	PERMA_A0013			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268509	7268510	PERMA_A0013	PERMA_A0014			TRUE	0.765	13.000	0.000	NA		NA
7268510	7268511	PERMA_A0014	PERMA_A0015			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268511	7268512	PERMA_A0015	PERMA_A0016			TRUE	0.646	-7.000	0.000	NA		NA
7268512	7268513	PERMA_A0016	PERMA_A0017			FALSE	0.121	101.000	0.000	NA		NA
7268513	7268514	PERMA_A0017	PERMA_A0018			TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7268514	7268515	PERMA_A0018	PERMA_A0019			FALSE	0.103	187.000	0.000	NA		NA
7268515	7268516	PERMA_A0019	PERMA_A0020			FALSE	0.543	-21.000	0.000	NA		NA
7268516	7268517	PERMA_A0020	PERMA_A0021			FALSE	0.514	-37.000	0.000	NA		NA
7268517	7268518	PERMA_A0021	PERMA_A0022			TRUE	0.601	-12.000	0.000	NA		NA
7268518	7268519	PERMA_A0022	PERMA_A0023			FALSE	0.529	-27.000	0.000	NA		NA
7268519	7268520	PERMA_A0023	PERMA_A0024			TRUE	0.561	-16.000	0.000	NA		NA
7268521	7268522	PERMA_A0025	PERMA_A0026			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268522	7268523	PERMA_A0026	PERMA_A0027			TRUE	0.984	6.000	1.000	NA		NA
7268524	7268525	PERMA_A0028	PERMA_A0029			TRUE	0.987	-3.000	1.000	NA		NA
7268525	7268526	PERMA_A0029	PERMA_A0030			TRUE	0.990	2.000	1.000	NA		NA
7268526	7268527	PERMA_A0030	PERMA_A0031			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268527	7268528	PERMA_A0031	PERMA_A0032			TRUE	0.648	5.000	0.000	NA		NA
7268528	7268529	PERMA_A0032	PERMA_A0033			TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7268529	7268530	PERMA_A0033	PERMA_A0034			FALSE	0.277	47.000	0.000	NA		NA
7268530	7268531	PERMA_A0034	PERMA_A0035			FALSE	0.526	-28.000	0.000	NA		NA
7268531	7268532	PERMA_A0035	PERMA_A0036			FALSE	0.533	-25.000	0.000	NA		NA
7268532	7268533	PERMA_A0036	PERMA_A0037		traC	TRUE	0.681	11.000	0.000	NA		NA
7268533	7268534	PERMA_A0037	PERMA_A0038	traC	traV	TRUE	0.615	-10.000	0.000	NA		NA
7268534	7268535	PERMA_A0038	PERMA_A0039	traV		TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268535	7268536	PERMA_A0039	PERMA_A0040			TRUE	0.615	-10.000	0.000	NA		NA
7268536	7268537	PERMA_A0040	PERMA_A0041			TRUE	0.740	12.000	0.000	NA		NA
7268537	7268538	PERMA_A0041	PERMA_A0042			FALSE	0.509	-46.000	0.000	NA		NA
7268538	7268539	PERMA_A0042	PERMA_A0043			FALSE	0.549	-19.000	0.000	NA		NA
7268539	7268540	PERMA_A0043	PERMA_A0044			TRUE	0.697	-3.000	0.000	NA		NA
7268540	7268541	PERMA_A0044	PERMA_A0045		traE	TRUE	0.896	-13.000	0.000	0.001		NA
7268541	7268542	PERMA_A0045	PERMA_A0046	traE	traL	TRUE	0.994	23.000	0.167	0.001		NA
7268542	7268543	PERMA_A0046	PERMA_A0047	traL		TRUE	0.627	25.000	0.000	NA		NA
7268545	7268546	PERMA_A0049	PERMA_A0050			FALSE	0.107	157.000	0.000	NA		NA
7268546	7268547	PERMA_A0050	PERMA_A0051			TRUE	0.648	5.000	0.000	NA		NA
7268547	7268548	PERMA_A0051	PERMA_A0052			FALSE	0.323	42.000	0.000	NA		NA
7268548	7268549	PERMA_A0052	PERMA_A0053			FALSE	0.130	91.000	0.000	NA		NA
7268549	7268550	PERMA_A0053	PERMA_A0054			TRUE	0.764	19.000	0.000	NA		NA
7268550	7268551	PERMA_A0054	PERMA_A0055			TRUE	0.653	24.000	0.000	NA		NA
7268551	7268552	PERMA_A0055	PERMA_A0056			FALSE	0.439	37.000	0.000	NA		NA
7268552	7268553	PERMA_A0056	PERMA_A0057			FALSE	0.093	518.000	0.000	NA		NA
7268553	7268554	PERMA_A0057	PERMA_A0058			TRUE	0.750	20.000	0.000	NA		NA
7268554	7268555	PERMA_A0058	PERMA_A0059			TRUE	0.711	0.000	0.000	NA		NA
7268555	7268556	PERMA_A0059	PERMA_A0060			FALSE	0.134	96.000	0.000	1.000		NA
7268556	7268557	PERMA_A0060	PERMA_A0061			FALSE	0.093	500.000	0.000	NA		NA
7268558	7268559	PERMA_A0062	PERMA_A0063			TRUE	0.756	2.000	0.000	NA		NA
7268559	7268560	PERMA_A0063	PERMA_A0064			TRUE	0.764	19.000	0.000	NA		NA
7268560	7268561	PERMA_A0064	PERMA_A0065			TRUE	0.765	13.000	0.000	NA		NA
7268561	7268562	PERMA_A0065	PERMA_A0066			FALSE	0.117	111.000	0.000	NA		NA
7268562	7268563	PERMA_A0066	PERMA_A0067			TRUE	0.585	-13.000	0.000	NA		NA
7268563	7268564	PERMA_A0067	PERMA_A0068			FALSE	0.094	417.000	0.000	NA		NA
7268564	7268565	PERMA_A0068	PERMA_A0069			TRUE	0.646	-7.000	0.000	NA		NA
7268565	7268566	PERMA_A0069	PERMA_A0070			FALSE	0.539	-22.000	0.000	NA		NA
7268566	7268497	PERMA_A0070	PERMA_A0001			FALSE	0.092	715.000	0.000	NA		NA