MicrobesOnline Operon Predictions for Neisseria meningitidis Z2491

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 141208 141209 NMA0001 NMA0002 NMA0001 nuoL FALSE 0.161 56.000 0.000 1.000 N NA
 141209 141210 NMA0002 NMA0003 nuoL NMA0003 TRUE 0.621 49.000 0.000 NA   NA
 141210 141211 NMA0003 NMA0004 NMA0003 NMA0004 TRUE 0.458 124.000 0.000 NA   NA
 141211 141212 NMA0004 NMA0005 NMA0004 nuoK FALSE 0.265 34.000 0.000 1.000 N NA
 141212 141213 NMA0005 NMA0006 nuoK nuoJ TRUE 1.000 -3.000 0.484 0.005 Y NA
 141213 141214 NMA0006 NMA0007 nuoJ NMA0007 TRUE 0.706 36.000 0.000 NA   NA
 141214 141215 NMA0007 NMA0008 NMA0007 nuoI TRUE 0.763 31.000 0.000 NA   NA
 141215 141216 NMA0008 NMA0009 nuoI nuoH TRUE 0.993 80.000 0.500 0.011 Y NA
 141216 141217 NMA0009 NMA0010 nuoH nuoG TRUE 1.000 3.000 0.515 0.011 Y NA
 141217 141218 NMA0010 NMA0011 nuoG NMA0011 FALSE 0.031 282.000 0.000 1.000 N NA
 141218 141220 NMA0011 NMA0013 NMA0011 NMA0013 FALSE 0.187 286.000 0.000 NA   NA
 141220 141221 NMA0013 NMA0014 NMA0013 nuoF TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 141221 141222 NMA0014 NMA0015 nuoF nuoE TRUE 0.912 390.000 0.343 0.011 Y NA
 141222 141223 NMA0015 NMA0016 nuoE nuoD TRUE 0.999 0.000 0.355 0.011 Y NA
 141223 141224 NMA0016 NMA0017 nuoD nuoC TRUE 0.999 -10.000 0.483 0.011 Y NA
 141224 141225 NMA0017 NMA0018 nuoC nuoB TRUE 0.999 13.000 0.328 0.005 Y NA
 141225 141226 NMA0018 NMA0019 nuoB nuoA TRUE 0.999 -9.000 0.507 0.005 Y NA
 141226 141227 NMA0019 NMA0020 nuoA NMA0020 FALSE 0.019 451.000 0.000 1.000 N NA
 141227 141228 NMA0020 NMA0021 NMA0020 NMA0021 TRUE 0.831 -10.000 0.000 1.000   NA
 141228 141229 NMA0021 NMA0022 NMA0021 NMA0022 FALSE 0.289 199.000 0.000 NA   NA
 141230 141231 NMA0023 NMA0024 NMA0023 NMA0024 FALSE 0.386 154.000 0.000 NA   NA
 141232 141233 NMA0025 NMA0027 NMA0025 uvrD FALSE 0.146 357.000 0.000 NA   NA
 141234 141235 NMA0028 NMA0029 NMA0028 NMA0029 TRUE 0.991 -3.000 0.086 NA Y NA
 141235 141236 NMA0029 NMA0030 NMA0029 NMA0030 TRUE 0.975 -13.000 0.046 NA   NA
 141236 141237 NMA0030 NMA0031 NMA0030 NMA0031 TRUE 0.582 129.000 0.055 1.000   NA
 141237 141238 NMA0031 NMA0032 NMA0031 NMA0032 TRUE 0.509 108.000 0.000 NA   NA
 141238 141239 NMA0032 NMA0033 NMA0032 NMA0033 FALSE 0.205 265.000 0.000 NA   NA
 141240 141241 NMA0035 NMA0036 glnE NMA0036 FALSE 0.336 175.000 0.000 NA   NA
 141241 141242 NMA0036 NMA0037 NMA0036 NMA0037 FALSE 0.219 254.000 0.000 NA   NA
 141242 141243 NMA0037 NMA0038 NMA0037 NMA0038 TRUE 0.598 53.000 0.000 NA   NA
 141243 141244 NMA0038 NMA0039 NMA0038 NMA0039 TRUE 0.558 87.000 0.000 NA   NA
 141244 141247 NMA0039 NMA0042 NMA0039 pyrD FALSE 0.156 333.000 0.000 NA   NA
 141248 141249 NMA0043 NMA0044 acpP fabF TRUE 0.900 167.000 0.346 1.000 Y NA
 141251 141252 NMA0047 NMA0048 NMA0047 pglA FALSE 0.023 356.000 0.000 1.000 N NA
 141254 141256 NMA0050 NMA0052 katA NMA0052 FALSE 0.119 485.000 0.000 NA   NA
 141258 141259 NMA0054 NMA0055 prlC NMA0055 FALSE 0.147 88.000 0.000 1.000 N NA
 141260 141261 NMA0056 NMA0057 gyrB sdaA FALSE 0.027 319.000 0.000 1.000 N NA
 2132889 397454 NMA0059 NMAt01   tRNA-Asp TRUE 0.695 37.000 0.000 NA   NA
 397454 397453 NMAt01 NMAt02 tRNA-Asp tRNA-Val TRUE 0.738 33.000 0.000 NA   NA
 397453 397452 NMAt02 NMAt03 tRNA-Val tRNA-Asp TRUE 0.672 40.000 0.000 NA   NA
 397452 397451 NMAt03 NMAt04 tRNA-Asp tRNA-Val TRUE 0.738 33.000 0.000 NA   NA
 397451 141262 NMAt04 NMA0060 tRNA-Val NMA0060 TRUE 0.565 70.000 0.000 NA   NA
 141263 141264 NMA0061 NMA0062 NMA0061 gapA FALSE 0.052 200.000 0.000 1.000 N NA
 141265 141266 NMA0063 NMA0064 aat fur FALSE 0.347 70.000 0.006 1.000 N NA
 141267 141268 NMA0065 NMA0066 NMA0065 dapB TRUE 0.939 10.000 0.049 1.000 N NA
 141269 141271 NMA0067 NMA0069 NMA0067 lpxB FALSE 0.142 367.000 0.000 NA   NA
 141271 141272 NMA0069 NMA0070 lpxB rluC FALSE 0.155 66.000 0.000 1.000 N NA
 141275 141276 NMA0073 NMA0074 NMA0073 gidA FALSE 0.025 334.000 0.000 1.000 N NA
 141276 141277 NMA0074 NMA0075 gidA rnhB FALSE 0.152 69.000 0.000 1.000 N NA
 141278 141279 NMA0076 NMA0077 NMA0076 gidB TRUE 0.902 99.000 0.339 1.000 N NA
 141279 141280 NMA0077 NMA0078 gidB NMA0078 TRUE 0.541 96.000 0.000 NA   NA
 397397 141281 NMAt05 NMA0079 tRNA-Thr NMA0079 TRUE 0.566 76.000 0.000 NA   NA
 141281 141282 NMA0079 NMA0080 NMA0079 frr FALSE 0.323 181.000 0.000 NA   NA
 141282 141283 NMA0080 NMA0081 frr uppS TRUE 0.939 56.000 0.409 1.000 N NA
 141283 141284 NMA0081 NMA0082 uppS cdsA TRUE 0.997 3.000 0.400 1.000 Y NA
 141284 141285 NMA0082 NMA0083 cdsA dxr TRUE 0.962 56.000 0.372 1.000 Y NA
 141285 141286 NMA0083 NMA0084 dxr NMA0084 TRUE 0.979 35.000 0.568 1.000 N NA
 141286 141287 NMA0084 NMA0085 NMA0084 omp85 TRUE 0.916 57.000 0.204 1.000 Y NA
 141287 141288 NMA0085 NMA0086 omp85 NMA0086 TRUE 0.959 66.000 0.354 1.000 Y NA
 141288 141289 NMA0086 NMA0087 NMA0086 lpxD TRUE 0.995 33.000 0.814 1.000 Y NA
 141289 141290 NMA0087 NMA0088 lpxD fabZ TRUE 0.988 36.000 0.796 1.000 N NA
 141290 141291 NMA0088 NMA0089 fabZ NMA0089 FALSE 0.170 311.000 0.000 NA   NA
 141291 141292 NMA0089 NMA0090 NMA0089 lpxA TRUE 0.659 43.000 0.000 NA   NA
 141292 141293 NMA0090 NMA0091 lpxA NMA0091 FALSE 0.023 357.000 0.000 1.000 N NA
 141293 141294 NMA0091 NMA0092 NMA0091 dadA TRUE 0.490 79.000 0.000 1.000 Y NA
 141294 141295 NMA0092 NMA0093 dadA NMA0093 FALSE 0.062 181.000 0.000 1.000 N NA
 141295 141296 NMA0093 NMA0094 NMA0093 valS FALSE 0.139 97.000 0.000 1.000 N NA
 141296 141297 NMA0094 NMA0095 valS NMA0095 FALSE 0.381 155.000 0.000 NA   NA
 141298 141299 NMA0096 NMA0098 NMA0096 oxyR FALSE 0.113 574.000 0.000 NA   NA
 141299 141300 NMA0098 NMA0099 oxyR minE TRUE 0.952 4.000 0.008 NA N NA
 141300 141301 NMA0099 NMA0100 minE minD TRUE 0.999 4.000 0.618 NA Y NA
 141301 141302 NMA0100 NMA0101 minD minC TRUE 0.989 29.000 0.466 1.000 Y NA
 141302 141303 NMA0101 NMA0102 minC rplQ FALSE 0.084 147.000 0.000 1.000 N NA
 141303 141304 NMA0102 NMA0103 rplQ rpoA TRUE 0.995 24.000 0.873 1.000 N NA
 141304 141305 NMA0103 NMA0104 rpoA rpsD TRUE 0.987 26.000 0.549 1.000 N NA
 141305 141306 NMA0104 NMA0105 rpsD rpsK TRUE 0.998 20.000 0.509 0.045 Y NA
 141306 141307 NMA0105 NMA0106 rpsK rpsM TRUE 0.999 20.000 0.810 0.034 Y NA
 141307 141308 NMA0106 NMA0107 rpsM rpmJ TRUE 0.959 66.000 0.194 0.034   NA
 141308 141309 NMA0107 NMA0108 rpmJ infA TRUE 0.936 21.000 0.104 1.000   NA
 141309 141310 NMA0108 NMA0109 infA secY TRUE 0.961 5.000 0.083 1.000 N NA
 141310 141311 NMA0109 NMA0110 secY rplO TRUE 0.997 12.000 0.730 1.000 N NA
 141311 141312 NMA0110 NMA0111 rplO rpmD TRUE 1.000 2.000 0.653 0.005 Y NA
 141312 141313 NMA0111 NMA0112 rpmD rpsE TRUE 1.000 -7.000 0.789 0.045 Y NA
 141313 141314 NMA0112 NMA0113 rpsE rplR TRUE 0.999 19.000 0.814 0.045 Y NA
 141314 141315 NMA0113 NMA0114 rplR rplF TRUE 1.000 14.000 0.815 0.034 Y NA
 141315 141316 NMA0114 NMA0115 rplF rpsH TRUE 1.000 14.000 0.808 0.034 Y NA
 141316 141317 NMA0115 NMA0116 rpsH rpsN TRUE 0.997 16.000 0.295 0.034 Y NA
 141317 141318 NMA0116 NMA0117 rpsN rplE TRUE 0.999 3.000 0.309 0.034 Y NA
 141318 141319 NMA0117 NMA0118 rplE rplX TRUE 1.000 10.000 0.758 0.034 Y NA
 141319 141320 NMA0118 NMA0119 rplX rplN TRUE 1.000 12.000 0.810 0.045 Y NA
 141320 141321 NMA0119 NMA0120 rplN rpsQ TRUE 0.984 222.000 0.791 0.045 Y NA
 141321 141322 NMA0120 NMA0121 rpsQ rpmC TRUE 1.000 0.000 0.828 0.034 Y NA
 141322 141323 NMA0121 NMA0122 rpmC rplP TRUE 1.000 0.000 0.802 0.034 Y NA
 141323 141324 NMA0122 NMA0123 rplP rpsC TRUE 1.000 -16.000 0.828 0.045 Y NA
 141324 141325 NMA0123 NMA0124 rpsC rplV TRUE 1.000 10.000 0.719 0.045 Y NA
 141325 141326 NMA0124 NMA0125 rplV rpsS TRUE 1.000 9.000 0.769 0.045 Y NA
 141326 141327 NMA0125 NMA0126 rpsS rplB TRUE 1.000 7.000 0.820 0.045 Y NA
 141327 141328 NMA0126 NMA0127 rplB rplW TRUE 1.000 6.000 0.849 0.035 Y NA
 141328 141329 NMA0127 NMA0128 rplW rplD TRUE 0.999 -9.000 0.513 0.034 Y NA
 141329 141330 NMA0128 NMA0129 rplD rplC TRUE 0.999 0.000 0.486 0.034 Y NA
 141330 141331 NMA0129 NMA0131 rplC NMA0131 FALSE 0.109 219.000 0.000 1.000   NA
 141331 141332 NMA0131 NMA0132 NMA0131 NMA0132 TRUE 0.976 9.000 0.000 0.020   NA
 141332 141333 NMA0132 NMA0132A NMA0132 NMA0132A TRUE 0.920 -25.000 0.000 NA   NA
 141333 141334 NMA0132A NMA0133 NMA0132A rpsJ TRUE 0.598 53.000 0.000 NA   NA
 141334 141335 NMA0133 NMA0134 rpsJ tufA1 TRUE 0.886 18.000 0.003 1.000 Y NA
 141335 141336 NMA0134 NMA0135 tufA1 fusA TRUE 0.998 88.000 1.000 0.002 Y NA
 141336 141337 NMA0135 NMA0136 fusA rpsG TRUE 0.879 19.000 0.003 1.000 Y NA
 141337 141338 NMA0136 NMA0137 rpsG rpsL TRUE 0.994 118.000 0.620 0.006 Y NA
 141338 141339 NMA0137 NMA0138 rpsL NMA0138 FALSE 0.329 179.000 0.000 NA   NA
 141339 141340 NMA0138 NMA0139 NMA0138 NMA0139 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 141340 141341 NMA0139 NMA0140 NMA0139 NMA0140 TRUE 0.621 49.000 0.000 NA   NA
 141341 141342 NMA0140 NMA0141 NMA0140 rpoC TRUE 0.548 93.000 0.000 NA   NA
 141342 141343 NMA0141 NMA0142 rpoC rpoB TRUE 0.995 152.000 0.851 0.002   NA
 141343 141344 NMA0142 NMA0143 rpoB rplL TRUE 0.730 191.000 0.223 1.000   NA
 141344 141345 NMA0143 NMA0144 rplL rplJ TRUE 0.997 58.000 0.884 0.034 Y NA
 141345 141346 NMA0144 NMA0145 rplJ rplA TRUE 0.925 230.000 0.302 0.045 Y NA
 141346 141347 NMA0145 NMA0146 rplA rplK TRUE 1.000 0.000 0.838 0.045 Y NA
 141347 141348 NMA0146 NMA0147 rplK nusG TRUE 0.968 101.000 0.681 1.000 N NA
 141348 141349 NMA0147 NMA0148 nusG secE TRUE 0.999 2.000 0.843 1.000 N NA
 141349 397450 NMA0148 NMAt06 secE tRNA-Trp TRUE 0.489 115.000 0.000 NA   NA
 397450 141350 NMAt06 NMA0149 tRNA-Trp tufA2 TRUE 0.939 7.000 0.000 NA   NA
 141350 397449 NMA0149 NMAt07 tufA2 tRNA-Thr TRUE 0.621 49.000 0.000 NA   NA
 397449 397448 NMAt07 NMAt08 tRNA-Thr tRNA-Gly TRUE 0.934 10.000 0.000 NA   NA
 397448 397447 NMAt08 NMAt09 tRNA-Gly tRNA-Tyr TRUE 0.763 31.000 0.000 NA   NA
 397447 141351 NMAt09 NMA0150 tRNA-Tyr NMA0150 TRUE 0.539 97.000 0.000 NA   NA
 141351 141352 NMA0150 NMA0151 NMA0150 NMA0151 FALSE 0.238 123.000 0.000 1.000   NA
 141352 141353 NMA0151 NMA0153 NMA0151 NMA0153 FALSE 0.311 89.000 0.000 1.000   NA
 141354 141355 NMA0154 NMA0155 NMA0154 NMA0155 TRUE 0.860 20.000 0.000 NA   NA
 141356 141357 NMA0156 NMA0157 topA NMA0157 TRUE 0.781 72.000 0.040 NA   NA
 141357 141358 NMA0157 NMA0158 NMA0157 dprA TRUE 0.962 26.000 0.124 NA   NA
 141358 141359 NMA0158 NMA0159 dprA NMA0159 FALSE 0.145 91.000 0.000 1.000 N NA
 141359 141360 NMA0159 NMA0160 NMA0159 NMA0160 TRUE 0.998 -7.000 0.605 1.000 Y NA
 141360 141361 NMA0160 NMA0161 NMA0160 NMA0161 TRUE 0.999 0.000 0.810 NA   NA
 141361 141362 NMA0161 NMA0162 NMA0161 NMA0162 TRUE 0.980 -34.000 0.094 NA   NA
 141362 141363 NMA0162 NMA0163 NMA0162 fmt TRUE 0.944 79.000 0.305 1.000 Y NA
 141363 141364 NMA0163 NMA0164 fmt def TRUE 0.939 87.000 0.105 0.052 Y NA
 141366 141367 NMA0166 NMA0167 NMA0166 pyrI TRUE 0.573 65.000 0.000 NA   NA
 141367 141368 NMA0167 NMA0168 pyrI pyrB TRUE 0.998 10.000 0.197 0.002 Y NA
 141369 141370 NMA0169 NMA0170 NMA0169 NMA0170 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 141370 141371 NMA0170 NMA0171 NMA0170 NMA0171 TRUE 0.453 127.000 0.000 NA   NA
 141371 141372 NMA0171 NMA0171A NMA0171 NMA0171A TRUE 0.565 75.000 0.000 NA   NA
 141372 141374 NMA0171A NMA0173 NMA0171A NMA0173 TRUE 0.924 -19.000 0.000 NA   NA
 141375 141376 NMA0174 NMA0175 NMA0174 NMA0175 TRUE 0.563 83.000 0.000 NA   NA
 141378 141379 NMA0177 NMA0178 pykA NMA0178 FALSE 0.028 310.000 0.000 1.000 N NA
 141380 141382 NMA0179 NMA0181 NMA0179 NMA0181 FALSE 0.134 394.000 0.000 NA   NA
 141382 141383 NMA0181 NMA0182 NMA0181 NMA0182 TRUE 0.930 11.000 0.000 NA   NA
 141383 141384 NMA0182 NMA0183 NMA0182 gltS TRUE 0.535 99.000 0.000 NA   NA
 141384 141385 NMA0183 NMA0184 gltS NMA0184 FALSE 0.110 218.000 0.000 1.000   NA
 141385 141386 NMA0184 NMA0185 NMA0184 lipB FALSE 0.056 369.000 0.000 1.000   NA
 141386 141387 NMA0185 NMA0186 lipB lipA TRUE 0.982 137.000 0.315 0.002 Y NA
 141387 141388 NMA0186 NMA0187 lipA rfbC2 TRUE 0.778 24.000 0.000 1.000 Y NA
 141388 141389 NMA0187 NMA0188 rfbC2 rfbA2 TRUE 0.610 39.000 0.000 1.000 Y NA
 141389 141390 NMA0188 NMA0189 rfbA2 rfbB2 TRUE 0.941 106.000 0.074 0.006 Y NA
 141390 141391 NMA0189 NMA0190 rfbB2 galE2' TRUE 0.812 116.000 0.000 0.008 Y NA
 141391 2132890 NMA0190 NMA0191 galE2'   TRUE 0.565 82.000 0.000 NA   NA
 2132890 2132891 NMA0191 NMA0193     TRUE 0.939 -4.000 0.000 NA   NA
 2132891 141392 NMA0193 NMA0194   NMA0194 TRUE 0.763 31.000 0.000 NA   NA
 141392 141393 NMA0194 NMA0195 NMA0194 ctrD FALSE 0.364 64.000 0.007 1.000 N NA
 141393 141394 NMA0195 NMA0196 ctrD ctrC TRUE 0.997 -3.000 0.418 1.000 Y NA
 141394 141395 NMA0196 NMA0197 ctrC ctrB TRUE 0.994 0.000 0.083 0.091 Y NA
 141395 141396 NMA0197 NMA0198 ctrB ctrA TRUE 0.990 15.000 0.088 0.091 Y NA
 141397 141398 NMA0199 NMA0200 sacA sacB TRUE 0.948 2.000 0.000 NA   NA
 141398 141399 NMA0200 NMA0201 sacB sacC TRUE 0.564 73.000 0.000 NA   NA
 141399 141400 NMA0201 NMA0202 sacC sacD TRUE 0.948 2.000 0.000 NA   NA
 141400 141401 NMA0202 NMA0203 sacD galE TRUE 0.752 45.000 0.000 NA Y NA
 141401 141402 NMA0203 NMA0204 galE rfbB TRUE 0.841 116.000 0.000 0.004 Y NA
 141402 141403 NMA0204 NMA0205 rfbB rfbA TRUE 0.941 106.000 0.074 0.006 Y NA
 141403 141404 NMA0205 NMA0206 rfbA rfbC TRUE 0.610 39.000 0.000 1.000 Y NA
 141405 141406 NMA0207 NMA0209 NMA0207 dnaJ FALSE 0.295 195.000 0.000 NA   NA
 141408 2132892 NMA0211 NMAr01 NMA0211   TRUE 0.706 36.000 0.000 NA   NA
 2132892 2132893 NMAr01 NMAr02     TRUE 0.545 94.000 0.000 NA   NA
 2132893 397446 NMAr02 NMAt10   tRNA-Ala FALSE 0.132 396.000 0.000 NA   NA
 397446 397445 NMAt10 NMAt11 tRNA-Ala tRNA-Ile TRUE 0.939 7.000 0.000 NA   NA
 397445 2132894 NMAt11 NMAr03 tRNA-Ile   TRUE 0.535 99.000 0.000 NA   NA
 2132894 141410 NMAr03 NMA0213   dksA FALSE 0.125 455.000 0.000 NA   NA
 141410 141411 NMA0213 NMA0215 dksA proC FALSE 0.084 147.000 0.000 1.000 N NA
 141411 141412 NMA0215 NMA0216 proC NMA0216 TRUE 0.621 49.000 0.000 NA   NA
 141412 141413 NMA0216 NMA0217 NMA0216 NMA0217 TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 141414 141415 NMA0218 NMA0219 pilT pilU TRUE 0.703 163.000 0.000 0.021 Y NA
 141415 141416 NMA0219 NMA0220 pilU NMA0220 FALSE 0.187 286.000 0.000 NA   NA
 2132895 141419 NMA0222.1 NMA0224 rnpB prfB TRUE 0.496 113.000 0.000 NA   NA
 141419 141420 NMA0224 NMA0225 prfB NMA0225 FALSE 0.284 103.000 0.000 1.000   NA
 141421 141422 NMA0226 NMA0227 NMA0226 NMA0227 TRUE 0.564 74.000 0.000 NA   NA
 141422 141423 NMA0227 NMA0228 NMA0227 NMA0228 TRUE 0.484 116.000 0.000 NA   NA
 141423 141424 NMA0228 NMA0229 NMA0228 NMA0229 TRUE 0.999 -10.000 0.914 NA   NA
 141424 141425 NMA0229 NMA0230 NMA0229 NMA0230 TRUE 0.936 22.000 0.043 NA   NA
 141425 141426 NMA0230 NMA0233 NMA0230 NMA0233 FALSE 0.126 444.000 0.000 NA   NA
 141426 2132896 NMA0233 NMA0235 NMA0233   FALSE 0.121 476.000 0.000 NA   NA
 141428 141429 NMA0237 NMA0238 NMA0237 purD TRUE 0.752 34.000 0.007 NA N NA
 141431 141432 NMA0240 NMA0241 NMA0240 etfA TRUE 0.574 63.000 0.000 NA   NA
 141432 141433 NMA0241 NMA0242 etfA etfB TRUE 0.982 11.000 0.000 0.023 Y NA
 141433 141434 NMA0242 NMA0243 etfB NMA0243 FALSE 0.043 226.000 0.000 1.000 N NA
 141434 141435 NMA0243 NMA0244 NMA0243 pncA FALSE 0.238 37.000 0.000 1.000 N NA
 141439 141440 NMA0248 NMA0249 NMA0248 NMA0249 TRUE 0.945 4.000 0.000 NA   NA
 141440 141441 NMA0249 NMA0250 NMA0249 gltX TRUE 0.565 75.000 0.000 NA   NA
 141441 141442 NMA0250 NMA0251 gltX NMA0251 TRUE 0.484 116.000 0.000 NA   NA
 141442 141443 NMA0251 NMA0252 NMA0251 NMA0252 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 141444 141445 NMA0253 NMA0254 NMA0253 ftsE FALSE 0.054 195.000 0.000 1.000 N NA
 141445 141446 NMA0254 NMA0255 ftsE ftsX TRUE 0.987 -3.000 0.121 1.000 Y NA
 141446 141447 NMA0255 NMA0256 ftsX NMA0256 TRUE 0.429 92.000 0.000 NA N NA
 141448 141449 NMA0257 NMA0258 pgk murA FALSE 0.152 81.000 0.000 1.000 N NA
 141449 397444 NMA0258 NMAt12 murA tRNA-Lys FALSE 0.140 372.000 0.000 NA   NA
 397444 141450 NMAt12 NMA0259 tRNA-Lys NMA0259 TRUE 0.566 69.000 0.000 NA   NA
 141450 141451 NMA0259 NMA0260 NMA0259 NMA0260 TRUE 0.738 33.000 0.000 NA   NA
 141451 141452 NMA0260 NMA0261 NMA0260 kdtA TRUE 0.666 41.000 0.000 NA   NA
 141452 141453 NMA0261 NMA0262 kdtA gnd FALSE 0.156 63.000 0.000 1.000 N NA
 141453 141454 NMA0262 NMA0263 gnd lpxC FALSE 0.014 1186.000 0.000 1.000 N NA
 141454 141455 NMA0263 NMA0264 lpxC pilE FALSE 0.015 927.000 0.000 1.000 N NA
 141455 141456 NMA0264 NMA0265 pilE pilS1 FALSE 0.328 1168.000 0.000 0.007 Y NA
 141456 141457 NMA0265 NMA0266 pilS1 pilS2 TRUE 0.772 140.000 0.000 0.007 Y NA
 141457 141458 NMA0266 NMA0267 pilS2 pilS3 TRUE 0.722 166.000 0.000 0.007 Y NA
 141458 141459 NMA0267 NMA0268 pilS3 pilS4 FALSE 0.348 757.000 0.000 0.007 Y NA
 141459 141460 NMA0268 NMA0269 pilS4 pilS5 TRUE 0.412 416.000 0.000 0.007 Y NA
 141460 141461 NMA0269 NMA0270 pilS5 pilS6 TRUE 0.803 123.000 0.000 0.007 Y NA
 141461 141462 NMA0270 NMA0271 pilS6 pilS7 TRUE 0.813 64.000 0.000 0.007   NA
 141462 141463 NMA0271 NMA0272 pilS7 pilS8 TRUE 0.960 18.000 0.000 0.007   NA
 141463 141464 NMA0272 NMA0273 pilS8 fbp TRUE 0.575 29.000 0.000 1.000   NA
 141464 2132897 NMA0273 NMA0273A fbp   TRUE 0.567 81.000 0.000 NA   NA
 141466 141467 NMA0275 NMA0276 metG glmS TRUE 0.559 116.000 0.000 0.065 N NA
 141470 141471 NMA0280 NMA0281 NMA0280 NMA0281 TRUE 0.965 -3.000 0.000 NA Y NA
 141471 141472 NMA0281 NMA0282 NMA0281 NMA0282 FALSE 0.298 264.000 0.000 NA Y NA
 141473 141474 NMA0283 NMA0284 phnA glmU FALSE 0.152 77.000 0.000 1.000 N NA
 141474 141475 NMA0284 NMA0285 glmU NMA0285 TRUE 0.587 55.000 0.000 NA   NA
 141477 141478 NMA0287 NMA0288 tbpA NMA0288 FALSE 0.142 94.000 0.000 1.000 N NA
 141478 141479 NMA0288 NMA0289 NMA0288 NMA0289 TRUE 0.812 26.000 0.000 NA   NA
 141481 141482 NMA0291 NMA0292 pilA NMA0292 FALSE 0.017 589.000 0.000 1.000 N NA
 141482 2132898 NMA0292 NMA0293 NMA0292 pilC2 FALSE 0.068 632.000 0.000 NA N NA
 141483 141484 NMA0295 NMA0296 NMA0295 NMA0296 TRUE 0.978 109.000 0.575 NA   NA
 141485 141486 NMA0298 NMA0299 NMA0298 NMA0299 TRUE 0.654 112.000 0.000 0.088   NA
 141487 141488 NMA0300 NMA0301 NMA0300 NMA0301 TRUE 0.991 -7.000 0.182 NA   NA
 141488 141489 NMA0301 NMA0303 NMA0301 argG FALSE 0.269 207.000 0.000 NA   NA
 141490 141491 NMA0304 NMA0305 NMA0304 NMA0305 TRUE 0.427 40.000 0.000 1.000   NA
 141491 2132901 NMA0305 NMA0306 NMA0305   FALSE 0.144 362.000 0.000 NA   NA
 5645182 5645183 NMA0307 NMA0307A     TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 5645183 141493 NMA0307A NMA0308   NMA0308 TRUE 0.630 48.000 0.000 NA   NA
 141493 141494 NMA0308 NMA0309 NMA0308 mafB' TRUE 0.942 5.000 0.000 NA   NA
 141494 141495 NMA0309 NMA0310 mafB' NMA0310 TRUE 0.948 1.000 0.000 NA   NA
 141495 141496 NMA0310 NMA0311 NMA0310 NMA0311 FALSE 0.371 159.000 0.000 NA   NA
 141496 141497 NMA0311 NMA0312 NMA0311 NMA0312 TRUE 0.945 4.000 0.000 NA   NA
 141497 141499 NMA0312 NMA0314 NMA0312 NMA0314 TRUE 0.566 76.000 0.000 NA   NA
 141499 141500 NMA0314 NMA0315 NMA0314 mafB' TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 141500 141501 NMA0315 NMA0316 mafB' NMA0316 TRUE 0.535 99.000 0.000 NA   NA
 141501 141502 NMA0316 NMA0317 NMA0316 NMA0317 TRUE 0.833 23.000 0.000 NA   NA
 141502 141503 NMA0317 NMA0318 NMA0317 NMA0318 TRUE 0.846 21.000 0.000 NA   NA
 141503 141504 NMA0318 NMA0319 NMA0318 mafB' TRUE 0.918 -34.000 0.000 NA   NA
 141504 141505 NMA0319 NMA0320 mafB' NMA0320 TRUE 0.530 100.000 0.000 NA   NA
 141505 141506 NMA0320 NMA0321 NMA0320 NMA0321 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 141506 141507 NMA0321 NMA0322 NMA0321 NMA0322 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 141507 141508 NMA0322 NMA0323 NMA0322 NMA0323 TRUE 0.921 13.000 0.000 NA   NA
 141508 141509 NMA0323 NMA0324 NMA0323 mafB TRUE 0.934 10.000 0.000 NA   NA
 141509 141510 NMA0324 NMA0325 mafB mafA TRUE 0.672 40.000 0.000 NA   NA
 141510 141511 NMA0325 NMA0326 mafA pyrH FALSE 0.318 183.000 0.000 NA   NA
 141511 141512 NMA0326 NMA0327 pyrH tsf FALSE 0.171 323.000 0.047 1.000 N NA
 141512 141513 NMA0327 NMA0328 tsf rpsB TRUE 0.979 129.000 0.748 1.000 Y NA
 141513 141514 NMA0328 NMA0329 rpsB NMA0329 FALSE 0.283 201.000 0.000 NA   NA
 141515 141516 NMA0330 NMA0331 NMA0330 NMA0331 FALSE 0.157 61.000 0.000 1.000 N NA
 141516 141517 NMA0331 NMA0333 NMA0331 mqo FALSE 0.046 537.000 0.000 1.000   NA
 141518 141519 NMA0335 NMA0336 NMA0335 NMA0336 TRUE 0.604 52.000 0.000 NA   NA
 141519 141520 NMA0336 NMA0337 NMA0336 map FALSE 0.183 155.000 0.000 1.000   NA
 141520 141521 NMA0337 NMA0338 map NMA0338 TRUE 0.672 40.000 0.000 NA   NA
 141521 141522 NMA0338 NMA0339 NMA0338 NMA0339 TRUE 0.573 65.000 0.000 NA   NA
 141522 141523 NMA0339 NMA0340 NMA0339 lpcA TRUE 0.985 64.000 0.613 NA   NA
 141523 141524 NMA0340 NMA0341 lpcA NMA0341 TRUE 0.982 5.000 0.187 1.000 N NA
 141528 141529 NMA0344A NMA0345 NMA0344A NMA0345 FALSE 0.165 321.000 0.000 NA   NA
 141529 141530 NMA0345 NMA0346 NMA0345 NMA0346 FALSE 0.319 83.000 0.000 1.000   NA
 141530 141531 NMA0346 NMA0347 NMA0346 cysS TRUE 0.837 10.000 0.000 1.000   NA
 141531 141532 NMA0347 NMA0348 cysS NMA0348 FALSE 0.150 83.000 0.000 1.000 N NA
 141532 141533 NMA0348 NMA0349 NMA0348 NMA0349 TRUE 0.928 -13.000 0.000 NA   NA
 141533 141534 NMA0349 NMA0350 NMA0349 NMA0350 TRUE 0.934 10.000 0.000 NA   NA
 397398 397399 NMAt13 NMAt14 tRNA-Pro tRNA-Arg TRUE 0.821 25.000 0.000 NA   NA
 397399 397400 NMAt14 NMAt15 tRNA-Arg tRNA-His TRUE 0.798 28.000 0.000 NA   NA
 397400 141538 NMAt15 NMA0356 tRNA-His NMA0356 FALSE 0.261 211.000 0.000 NA   NA
 141538 141539 NMA0356 NMA0357 NMA0356 birA TRUE 0.916 -3.000 0.004 1.000   NA
 141539 141540 NMA0357 NMA0358 birA NMA0358 TRUE 0.496 113.000 0.000 NA   NA
 141542 141543 NMA0361 NMA0362 thiG NMA0362 TRUE 0.492 214.000 0.064 1.000 Y NA
 141543 141544 NMA0362 NMA0363 NMA0362 thiE FALSE 0.097 422.000 0.000 1.000 Y NA
 141544 141545 NMA0363 NMA0364 thiE NMA0364 TRUE 0.431 21.000 0.000 1.000 N NA
 141545 141546 NMA0364 NMA0365 NMA0364 NMA0365 TRUE 0.881 -94.000 0.018 1.000 N NA
 141548 141549 NMA0367 NMA0368 tldD NMA0368 FALSE 0.222 251.000 0.000 NA   NA
 141549 141551 NMA0368 NMA0370 NMA0368 NMA0370 TRUE 0.559 86.000 0.000 NA   NA
 141551 141552 NMA0370 NMA0371 NMA0370 slyX TRUE 0.970 1.000 0.008 NA   NA
 141555 141556 NMA0374 NMA0375 ppc gpsA FALSE 0.386 123.000 0.000 1.000 Y NA
 141556 141557 NMA0375 NMA0376 gpsA NMA0376 FALSE 0.341 55.000 0.000 1.000   NA
 141557 141558 NMA0376 NMA0377 NMA0376 NMA0377 TRUE 0.930 11.000 0.000 NA   NA
 141558 141559 NMA0377 NMA0378 NMA0377 rplM FALSE 0.143 363.000 0.000 NA   NA
 141559 141560 NMA0378 NMA0379 rplM rpsI TRUE 0.999 10.000 0.601 0.032 Y NA
 141563 141564 NMA0382 NMA0383 NMA0382 petA TRUE 0.648 123.000 0.013 NA   NA
 141564 141565 NMA0383 NMA0384 petA petB TRUE 0.988 19.000 0.029 0.002 Y NA
 141565 141566 NMA0384 NMA0385 petB petC TRUE 1.000 15.000 0.630 0.002 Y NA
 141566 141567 NMA0385 NMA0386 petC NMA0386 FALSE 0.154 339.000 0.000 NA   NA
 141569 141570 NMA0388 NMA0389 NMA0388 hpt FALSE 0.152 69.000 0.000 1.000 N NA
 141570 141571 NMA0389 NMA0390 hpt NMA0390 FALSE 0.152 81.000 0.000 1.000 N NA
 141571 141572 NMA0390 NMA0391 NMA0390 ptsH TRUE 0.986 69.000 0.261 0.004 Y NA
 141572 141573 NMA0391 NMA0392 ptsH ptsI TRUE 0.999 0.000 0.205 0.003 Y NA
 141574 141575 NMA0393 NMA0394 NMA0393 NMA0394 TRUE 0.842 9.000 0.000 1.000   NA
 141575 397443 NMA0394 NMAt16 NMA0394 tRNA-Met FALSE 0.320 182.000 0.000 NA   NA
 141579 141580 NMA0398 NMA0400 porB chpA FALSE 0.014 1245.000 0.000 1.000 N NA
 141580 141581 NMA0400 NMA0401 chpA NMA0401 TRUE 0.997 -6.000 0.264 NA Y NA
 141581 141582 NMA0401 NMA0402 NMA0401 truA FALSE 0.346 123.000 0.000 NA N NA
 141582 141583 NMA0402 NMA0403 truA NMA0403 FALSE 0.089 1408.000 0.000 NA   NA
 141583 141584 NMA0403 NMA0404 NMA0403 nlaB TRUE 0.978 -3.000 0.034 NA   NA
 141584 141585 NMA0404 NMA0405 nlaB NMA0405 TRUE 0.963 29.000 0.310 1.000 N NA
 141585 2132905 NMA0405 NMA0407 NMA0405   TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 141588 141589 NMA0410 NMA0411 ubiG thrB TRUE 0.559 30.000 0.000 1.000   NA
 141590 141591 NMA0412 NMA0413 NMA0412 gntP TRUE 0.818 20.000 0.000 1.000 Y NA
 141592 141593 NMA0414 NMA0415 NMA0414 NMA0415 TRUE 0.730 29.000 0.000 1.000 Y NA
 141593 141594 NMA0415 NMA0416 NMA0415 NMA0416 TRUE 0.944 -3.000 0.045 1.000 N NA
 141594 141595 NMA0416 NMA0417 NMA0416 NMA0417 TRUE 0.796 59.000 0.044 NA   NA
 141595 141596 NMA0417 NMA0418 NMA0417 NMA0418 TRUE 0.959 54.000 0.307 NA   NA
 141596 141597 NMA0418 NMA0419 NMA0418 NMA0419 TRUE 0.564 73.000 0.000 NA   NA
 141597 141598 NMA0419 NMA0420 NMA0419 NMA0420 FALSE 0.375 157.000 0.000 NA   NA
 141598 141599 NMA0420 NMA0421 NMA0420 kdtB TRUE 0.458 124.000 0.000 NA   NA
 141599 141600 NMA0421 NMA0422 kdtB NMA0422 TRUE 0.593 26.000 0.004 1.000 N NA
 141600 2132906 NMA0422 NMAr04 NMA0422   FALSE 0.153 340.000 0.000 NA   NA
 2132906 397401 NMAr04 NMAt17   tRNA-Ile TRUE 0.535 99.000 0.000 NA   NA
 397401 397402 NMAt17 NMAt18 tRNA-Ile tRNA-Ala TRUE 0.939 7.000 0.000 NA   NA
 397402 2132907 NMAt18 NMAr05 tRNA-Ala   FALSE 0.132 396.000 0.000 NA   NA
 2132907 2132908 NMAr05 NMAr06     TRUE 0.545 94.000 0.000 NA   NA
 2132908 141601 NMAr06 NMA0423   NMA0423 TRUE 0.706 36.000 0.000 NA   NA
 141601 141602 NMA0423 NMA0424 NMA0423 NMA0424 TRUE 0.434 88.000 0.000 NA N NA
 141605 141606 NMA0427 NMA0428 NMA0427 NMA0428 TRUE 0.974 14.000 0.059 NA   NA
 141606 141607 NMA0428 NMA0429 NMA0428 vsr TRUE 0.976 4.000 0.024 NA   NA
 141608 141609 NMA0430 NMA0431 NMA0430 NMA0431 FALSE 0.328 66.000 0.000 1.000   NA
 141609 141610 NMA0431 NMA0432 NMA0431 NMA0432 FALSE 0.323 181.000 0.000 NA   NA
 141610 141611 NMA0432 NMA0433 NMA0432 hrpA' TRUE 0.526 101.000 0.000 NA   NA
 141611 141612 NMA0433 NMA0434 hrpA' NMA0434 FALSE 0.138 190.000 0.000 1.000   NA
 141612 141613 NMA0434 NMA0435 NMA0434 argJ FALSE 0.073 163.000 0.000 1.000 N NA
 141613 141614 NMA0435 NMA0436 argJ NMA0436 FALSE 0.154 67.000 0.000 1.000 N NA
 141614 141615 NMA0436 NMA0437 NMA0436 NMA0437 TRUE 0.988 0.000 0.186 1.000   NA
 141615 141617 NMA0437 NMA0439 NMA0437 NMA0439 FALSE 0.405 145.000 0.000 NA   NA
 141617 141618 NMA0439 NMA0440 NMA0439 NMA0440 TRUE 0.958 19.000 0.057 NA   NA
 141620 141621 NMA0442 NMA0444 NMA0442 NMA0444 FALSE 0.101 234.000 0.000 1.000   NA
 141621 141622 NMA0444 NMA0445 NMA0444 purL FALSE 0.302 95.000 0.000 1.000   NA
 141624 141625 NMA0448 NMA0449 NMA0448 NMA0449 TRUE 0.442 131.000 0.000 NA   NA
 141625 141626 NMA0449 NMA0450 NMA0449 NMA0450 TRUE 0.652 45.000 0.000 NA   NA
 141626 141627 NMA0450 NMA0451 NMA0450 NMA0451 TRUE 1.000 17.000 0.870 0.032 Y NA
 141627 141628 NMA0451 NMA0452 NMA0451 fetB TRUE 0.815 271.000 0.356 1.000 Y NA
 141628 141629 NMA0452 NMA0453 fetB fetA FALSE 0.079 698.000 0.000 1.000 Y NA
 141629 141630 NMA0453 NMA0454 fetA thdF FALSE 0.034 1862.000 0.000 1.000   NA
 141631 141632 NMA0455 NMA0456 NMA0455 NMA0456 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 141632 141633 NMA0456 NMA0457 NMA0456 iga2 TRUE 0.432 134.000 0.000 NA   NA
 141634 141635 NMA0458 NMA0459 NMA0458 NMA0459 FALSE 0.330 62.000 0.000 1.000   NA
 141635 141637 NMA0459 NMA0462 NMA0459 polA FALSE 0.038 820.000 0.000 1.000   NA
 141637 141638 NMA0462 NMA0463 polA NMA0463 FALSE 0.085 146.000 0.000 1.000 N NA
 141638 141639 NMA0463 NMA0464 NMA0463 NMA0464 TRUE 0.838 22.000 0.000 NA   NA
 141639 141640 NMA0464 NMA0465 NMA0464 NMA0465 TRUE 0.812 26.000 0.000 NA   NA
 141640 141641 NMA0465 NMA0466 NMA0465 NMA0466 TRUE 0.804 27.000 0.000 NA   NA
 141642 141643 NMA0467 NMA0468 NMA0467 lysA TRUE 0.980 11.000 0.071 NA   NA
 141644 141645 NMA0470 NMA0471 NMA0470 NMA0471 FALSE 0.259 213.000 0.000 NA   NA
 141646 141647 NMA0472 NMA0473 groES groEL TRUE 0.993 93.000 0.538 0.013 Y NA
 141648 141649 NMA0474 NMA0475 hpuB hpuA TRUE 0.763 31.000 0.000 NA   NA
 141651 141652 NMA0477 NMA0478 NMA0477 NMA0478 FALSE 0.035 1385.000 0.000 1.000   NA
 141652 141653 NMA0478 NMA0480 NMA0478 aldA FALSE 0.036 1199.000 0.000 1.000   NA
 141653 141654 NMA0480 NMA0481 aldA NMA0481 TRUE 0.716 35.000 0.000 NA   NA
 141654 141655 NMA0481 NMA0482 NMA0481 NMA0482 TRUE 0.936 9.000 0.000 NA   NA
 141655 141656 NMA0482 NMA0483 NMA0482 NMA0483 FALSE 0.267 208.000 0.000 NA   NA
 141657 141658 NMA0485 NMA0486 NMA0485 NMA0486 TRUE 0.989 48.000 0.530 NA Y NA
 141658 141659 NMA0486 NMA0487 NMA0486 NMA0487 TRUE 0.985 51.000 0.562 NA   NA
 141659 141660 NMA0487 NMA0488 NMA0487 NMA0488 TRUE 0.820 37.000 0.010 NA   NA
 141660 141661 NMA0488 NMA0489 NMA0488 NMA0489 TRUE 0.738 33.000 0.000 NA   NA
 141661 141662 NMA0489 NMA0490 NMA0489 NMA0490 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 141662 141663 NMA0490 NMA0491 NMA0490 NMA0491 TRUE 0.942 5.000 0.000 NA   NA
 141663 141664 NMA0491 NMA0492 NMA0491 NMA0492 TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 141664 141665 NMA0492 NMA0493 NMA0492 NMA0493 TRUE 0.965 -3.000 0.048 1.000   NA
 141667 141668 NMA0495 NMA0496 rpmE cad FALSE 0.118 303.000 0.000 NA N NA
 141668 141669 NMA0496 NMA0497 cad NMA0497 FALSE 0.271 156.000 0.000 NA N NA
 141669 141670 NMA0497 NMA0498 NMA0497 regF FALSE 0.404 102.000 0.000 NA N NA
 141670 141671 NMA0498 NMA0499 regF regG TRUE 0.991 72.000 0.831 NA   NA
 141673 141674 NMA0501 NMA0502 NMA0501 rpsU TRUE 0.910 132.000 0.173 0.048   NA
 141674 141675 NMA0502 NMA0503 rpsU NMA0503 FALSE 0.030 289.000 0.000 1.000 N NA
 141676 141677 NMA0504 NMA0505 NMA0504 NMA0505 TRUE 0.989 2.000 0.135 1.000 Y NA
 141677 141678 NMA0505 NMA0506 NMA0505 NMA0506 TRUE 0.966 90.000 0.308 NA Y NA
 141680 141681 NMA0508 NMA0510 NMA0508 NMA0510 TRUE 0.430 135.000 0.000 NA   NA
 141681 141682 NMA0510 NMA0511 NMA0510 NMA0511 TRUE 0.507 109.000 0.000 NA   NA
 141682 141683 NMA0511 NMA0512 NMA0511 atpI FALSE 0.017 579.000 0.000 1.000 N NA
 141683 141684 NMA0512 NMA0513 atpI atpB TRUE 0.994 -10.000 0.291 1.000 Y NA
 141684 141685 NMA0513 NMA0514 atpB atpE TRUE 0.993 57.000 0.557 0.006   NA
 141685 141686 NMA0514 NMA0515 atpE atpF TRUE 0.995 71.000 0.666 0.006   NA
 141686 141687 NMA0515 NMA0516 atpF atpH TRUE 0.999 5.000 0.242 0.006 Y NA
 141687 141688 NMA0516 NMA0517 atpH atpA TRUE 1.000 11.000 0.864 0.006 Y NA
 141688 141689 NMA0517 NMA0518 atpA atpG TRUE 0.999 25.000 0.846 0.006 Y NA
 141689 141690 NMA0518 NMA0519 atpG atpD TRUE 0.998 38.000 0.724 0.006 Y NA
 141690 141691 NMA0519 NMA0520 atpD atpC TRUE 1.000 11.000 0.837 0.006 Y NA
 141691 141692 NMA0520 NMA0521 atpC glyQ FALSE 0.023 355.000 0.000 1.000 N NA
 141692 141693 NMA0521 NMA0522 glyQ NMA0522 TRUE 0.567 77.000 0.000 NA   NA
 141693 141694 NMA0522 NMA0523 NMA0522 glyS TRUE 0.846 21.000 0.000 NA   NA
 141694 141695 NMA0523 NMA0524 glyS lgtA TRUE 0.453 65.000 0.000 NA N NA
 141695 141696 NMA0524 NMA0525 lgtA lgtB TRUE 0.967 0.000 0.000 NA Y NA
 141696 2132909 NMA0525 NMA0526 lgtB lgtA2' TRUE 0.827 24.000 0.000 NA   NA
 2132909 141697 NMA0526 NMA0527 lgtA2' lgtB2 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 2132910 2132912 NMA0530 NMA0531     FALSE 0.130 414.000 0.000 NA   NA
 141701 141702 NMA0533 NMA0534 fabG guaA FALSE 0.157 62.000 0.000 1.000 N NA
 141702 141703 NMA0534 NMA0535 guaA NMA0535 FALSE 0.134 100.000 0.000 1.000 N NA
 141703 141704 NMA0535 NMA0536 NMA0535 fabD FALSE 0.091 138.000 0.000 1.000 N NA
 141704 141705 NMA0536 NMA0537 fabD NMA0537 FALSE 0.312 186.000 0.000 NA   NA
 141705 141706 NMA0537 NMA0538 NMA0537 fabH TRUE 0.638 47.000 0.000 NA   NA
 141706 141707 NMA0538 NMA0540 fabH NMA0540 FALSE 0.225 250.000 0.000 NA   NA
 141707 141708 NMA0540 NMA0541 NMA0540 NMA0541 TRUE 0.883 18.000 0.000 NA   NA
 141708 141709 NMA0541 NMA0542 NMA0541 plsX TRUE 0.428 136.000 0.000 NA   NA
 141709 141710 NMA0542 NMA0543 plsX NMA0543 FALSE 0.313 88.000 0.000 1.000   NA
 141710 141711 NMA0543 NMA0544 NMA0543 rpmF FALSE 0.065 328.000 0.000 1.000   NA
 141711 141712 NMA0544 NMA0545 rpmF NMA0545 TRUE 0.992 34.000 0.599 NA   NA
 141713 141714 NMA0546 NMA0547 NMA0546 NMA0547 TRUE 0.900 47.000 0.107 NA   NA
 141715 141716 NMA0548 NMA0549 NMA0548 NMA0549 TRUE 0.937 172.000 0.461 NA   NA
 141716 141717 NMA0549 NMA0550 NMA0549 rnpA TRUE 0.998 -3.000 0.540 NA   NA
 141717 141718 NMA0550 NMA0551 rnpA rpmH TRUE 0.999 3.000 0.787 1.000   NA
 141719 141720 NMA0552 NMA0553 dnaA dnaN TRUE 0.951 80.000 0.328 1.000 Y NA
 141721 141722 NMA0554 NMA0555 NMA0554 ppk FALSE 0.161 233.000 0.000 NA N NA
 141722 141723 NMA0555 NMA0556 ppk NMA0556 FALSE 0.344 169.000 0.000 NA   NA
 141723 141724 NMA0556 NMA0557 NMA0556 mlp TRUE 0.939 7.000 0.000 NA   NA
 141725 141726 NMA0559 NMA0560 leuS drg FALSE 0.103 230.000 0.000 1.000   NA
 141726 2132914 NMA0560 NMA0561 drg dam' TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 2132914 141727 NMA0561 NMA0562 dam' NMA0562 FALSE 0.292 198.000 0.000 NA   NA
 141729 141730 NMA0564 NMA0565 NMA0564 NMA0565 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 141730 397442 NMA0565 NMAt19 NMA0565 tRNA-Leu FALSE 0.100 800.000 0.000 NA   NA
 397442 141733 NMAt19 NMA0569 tRNA-Leu secG TRUE 0.915 14.000 0.000 NA   NA
 141733 141734 NMA0569 NMA0570 secG tpi TRUE 0.895 7.000 0.009 1.000 N NA
 141735 141736 NMA0571 NMA0572 NMA0571 NMA0572 FALSE 0.404 102.000 0.000 NA N NA
 141736 141737 NMA0572 NMA0573 NMA0572 NMA0573 TRUE 0.899 80.000 0.200 NA N NA
 141739 141740 NMA0575 NMA0576 NMA0575 NMA0576 TRUE 0.665 114.000 0.000 0.014 N NA
 141740 141741 NMA0576 NMA0577 NMA0576 fetB2 FALSE 0.014 1038.000 0.000 1.000 N NA
 141743 141744 NMA0579 NMA0580 NMA0579 argA FALSE 0.224 201.000 0.000 1.000 Y NA
 141744 141745 NMA0580 NMA0581 argA NMA0581 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 141745 141746 NMA0581 NMA0582 NMA0581 pyrE TRUE 0.564 74.000 0.000 NA   NA
 141746 141747 NMA0582 NMA0583 pyrE NMA0583 FALSE 0.157 62.000 0.000 1.000 N NA
 141747 141748 NMA0583 NMA0584 NMA0583 NMA0584 TRUE 0.975 -6.000 0.096 1.000   NA
 141748 141749 NMA0584 NMA0585 NMA0584 NMA0585 TRUE 0.990 -3.000 0.209 1.000   NA
 141749 141750 NMA0585 NMA0586 NMA0585 NMA0586 TRUE 0.417 140.000 0.000 NA   NA
 141750 141751 NMA0586 NMA0587 NMA0586 fba FALSE 0.161 326.000 0.000 NA   NA
 141752 141753 NMA0588 NMA0589 xerC dxs FALSE 0.149 85.000 0.000 1.000 N NA
 141757 141758 NMA0594 NMA0595 orn prmA TRUE 0.508 18.000 0.000 1.000 N NA
 141758 141759 NMA0595 NMA0596 prmA accC TRUE 0.410 261.000 0.152 1.000 N NA
 141759 141760 NMA0596 NMA0597 accC accB TRUE 0.985 113.000 0.275 0.001 Y NA
 141765 141766 NMA0602 NMA0603 carB NMA0603 TRUE 0.939 7.000 0.000 NA   NA
 141766 141767 NMA0603 NMA0604 NMA0603 NMA0604 TRUE 0.974 3.000 0.013 NA   NA
 141767 141768 NMA0604 NMA0605 NMA0604 NMA0605 FALSE 0.038 851.000 0.000 1.000   NA
 141768 141769 NMA0605 NMA0606 NMA0605 NMA0606 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 141769 141770 NMA0606 NMA0607 NMA0606 NMA0607 TRUE 0.521 103.000 0.000 NA   NA
 141770 141771 NMA0607 NMA0608 NMA0607 carA TRUE 0.645 46.000 0.000 NA   NA
 141771 141772 NMA0608 NMA0609 carA pilC1 FALSE 0.055 2237.000 0.000 NA N NA
 141772 141774 NMA0609 NMA0611 pilC1 NMA0611 FALSE 0.062 930.000 0.000 NA N NA
 397403 141775 NMAt20 NMA0612 tRNA-Lys NMA0612 TRUE 0.568 79.000 0.000 NA   NA
 141775 141776 NMA0612 NMA0613 NMA0612 NMA0613 FALSE 0.024 344.000 0.000 1.000 N NA
 141776 141777 NMA0613 NMA0614 NMA0613 NMA0614 FALSE 0.259 115.000 0.000 1.000   NA
 141777 141778 NMA0614 NMA0615 NMA0614 NMA0615 TRUE 0.733 18.000 0.000 1.000   NA
 141780 141781 NMA0617 NMA0618 fhs NMA0618 FALSE 0.116 115.000 0.000 1.000 N NA
 141781 141782 NMA0618 NMA0619 NMA0618 NMA0619 FALSE 0.036 262.000 0.000 1.000 N NA
 141782 141783 NMA0619 NMA0620 NMA0619 tyrS FALSE 0.157 62.000 0.000 1.000 N NA
 141783 141784 NMA0620 NMA0621 tyrS ribF FALSE 0.267 263.000 0.000 0.060 N NA
 141784 141785 NMA0621 NMA0622 ribF ileS TRUE 0.915 142.000 0.254 0.060 N NA
 141785 141786 NMA0622 NMA0623 ileS lsp FALSE 0.118 1187.000 0.071 1.000 N NA
 141786 141787 NMA0623 NMA0624 lsp lytB TRUE 0.869 29.000 0.019 1.000 Y NA
 141788 2132915 NMA0625 NMA0626 NMA0625   FALSE 0.315 185.000 0.000 NA   NA
 2132915 2132916 NMA0626 NMA0627     TRUE 0.565 75.000 0.000 NA   NA
 2132916 141789 NMA0627 NMA0629   NMA0629 FALSE 0.088 1595.000 0.000 NA   NA
 141789 141790 NMA0629 NMA0630 NMA0629 NMA0630 TRUE 0.999 -7.000 0.876 NA   NA
 141790 141791 NMA0630 NMA0631 NMA0630 NMA0631 TRUE 0.981 67.000 0.546 NA   NA
 141791 141792 NMA0631 NMA0632 NMA0631 dnaE FALSE 0.081 278.000 0.000 1.000   NA
 141794 141795 NMA0633 NMA0634 NMA0633 NMA0634 TRUE 0.919 -28.000 0.000 NA   NA
 141795 141796 NMA0634 NMA0635 NMA0634 NMA0635 FALSE 0.182 296.000 0.000 NA   NA
 141797 141798 NMA0636 NMA0637 avtA pglD TRUE 0.738 56.000 0.000 0.015 N NA
 141798 141799 NMA0637 NMA0638 pglD pglC TRUE 0.814 48.000 0.054 1.000 Y NA
 141799 141800 NMA0638 NMA0639 pglC pglB TRUE 0.863 78.000 0.129 1.000 Y NA
 141800 141801 NMA0639 NMA0640 pglB NMA0640 TRUE 0.915 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 141801 2132917 NMA0640 NMA0641 NMA0640   TRUE 0.963 20.000 0.000 0.015 Y NA
 2132917 141802 NMA0641 NMA0643   NMA0643 FALSE 0.047 500.000 0.000 1.000   NA
 141802 141803 NMA0643 NMA0644 NMA0643 ribD FALSE 0.132 195.000 0.000 1.000   NA
 141803 141804 NMA0644 NMA0645 ribD NMA0645 TRUE 0.969 32.000 0.277 NA N NA
 141804 141805 NMA0645 NMA0646 NMA0645 NMA0646 TRUE 0.777 30.000 0.000 NA   NA
 141805 141806 NMA0646 NMA0647 NMA0646 aroB FALSE 0.214 644.000 0.000 0.036   NA
 141806 141807 NMA0647 NMA0648 aroB aroK TRUE 0.915 80.000 0.208 1.000 Y NA
 141807 141808 NMA0648 NMA0650 aroK pilQ TRUE 0.433 1162.000 0.319 1.000 N NA
 141808 141809 NMA0650 NMA0651 pilQ pilP TRUE 0.998 19.000 0.668 NA Y NA
 141809 141810 NMA0651 NMA0652 pilP pilO TRUE 0.998 18.000 0.680 NA Y NA
 141810 141811 NMA0652 NMA0653 pilO pilN TRUE 0.999 1.000 0.770 NA Y NA
 141811 141812 NMA0653 NMA0654 pilN pilM TRUE 0.999 3.000 0.616 NA Y NA
 141815 141816 NMA0658 NMA0659 cyc NMA0659 FALSE 0.131 277.000 0.000 NA N NA
 141816 141817 NMA0659 NMA0660 NMA0659 NMA0660 TRUE 0.998 -7.000 0.399 NA Y NA
 141817 141818 NMA0660 NMA0661 NMA0660 gcp FALSE 0.402 117.000 0.000 1.000 Y NA
 141820 141821 NMA0663 NMA0664 metK NMA0664 FALSE 0.153 249.000 0.000 NA N NA
 141824 141825 NMA0666 NMA0668 NMA0666 NMA0668 FALSE 0.113 569.000 0.000 NA   NA
 141825 2132919 NMA0668 NMA0669 NMA0668   FALSE 0.254 218.000 0.000 NA   NA
 2132919 141826 NMA0669 NMA0670   NMA0670 TRUE 0.659 43.000 0.000 NA   NA
 141829 141830 NMA0673 NMA0674 NMA0673 secB TRUE 0.961 21.000 0.221 1.000 N NA
 141830 141831 NMA0674 NMA0675 secB recG FALSE 0.149 86.000 0.000 1.000 N NA
 141832 141833 NMA0676 NMA0677 argC NMA0677 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 141835 141836 NMA0679 NMA0680 NMA0679 NMA0680 TRUE 0.936 9.000 0.000 NA   NA
 141836 141837 NMA0680 NMA0681 NMA0680 NMA0681 TRUE 0.936 -7.000 0.000 NA   NA
 141837 2132920 NMA0681 NMA0683 NMA0681   TRUE 0.575 61.000 0.000 NA   NA
 2132920 141838 NMA0683 NMA0684   NMA0684 FALSE 0.103 726.000 0.000 NA   NA
 141838 141839 NMA0684 NMA0685 NMA0684 NMA0685 TRUE 0.907 15.000 0.000 NA   NA
 141839 141840 NMA0685 NMA0687 NMA0685 NMA0687 FALSE 0.131 399.000 0.000 NA   NA
 141840 141841 NMA0687 NMA0688 NMA0687 NMA0688 TRUE 0.623 110.000 0.000 NA Y NA
 141841 141842 NMA0688 NMA0689 NMA0688 NMA0689 TRUE 0.942 5.000 0.000 NA   NA
 141842 141843 NMA0689 NMA0690 NMA0689 NMA0690 FALSE 0.225 250.000 0.000 NA   NA
 141843 141844 NMA0690 NMA0691 NMA0690 NMA0691 TRUE 0.899 16.000 0.000 NA   NA
 141844 141845 NMA0691 NMA0692 NMA0691 NMA0692 FALSE 0.405 145.000 0.000 NA   NA
 141845 141846 NMA0692 NMA0693 NMA0692 NMA0693 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 141846 141847 NMA0693 NMA0694 NMA0693 NMA0694 FALSE 0.308 188.000 0.000 NA   NA
 141847 141848 NMA0694 NMA0695 NMA0694 NMA0695 FALSE 0.277 204.000 0.000 NA   NA
 141848 141849 NMA0695 NMA0696 NMA0695 NMA0696 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 141849 141850 NMA0696 NMA0696A NMA0696 NMA0696A FALSE 0.131 413.000 0.000 NA   NA
 141850 141851 NMA0696A NMA0697 NMA0696A NMA0697 TRUE 0.939 7.000 0.000 NA   NA
 141851 141852 NMA0697 NMA0698 NMA0697 NMA0698 FALSE 0.137 382.000 0.000 NA   NA
 141854 141855 NMA0702 NMA0703 NMA0702 NMA0703 TRUE 0.798 28.000 0.000 NA   NA
 141855 141856 NMA0703 NMA0704 NMA0703 NMA0704 TRUE 0.939 7.000 0.000 NA   NA
 141856 141857 NMA0704 NMA0706 NMA0704 NMA0706 FALSE 0.202 269.000 0.000 NA   NA
 141857 141858 NMA0706 NMA0707 NMA0706 NMA0707 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 397441 141859 NMAt21 NMA0708 tRNA-Pro NMA0708 TRUE 0.567 81.000 0.000 NA   NA
 141859 141860 NMA0708 NMA0709 NMA0708 NMA0709 FALSE 0.159 57.000 0.000 1.000 N NA
 141860 141861 NMA0709 NMA0710 NMA0709 NMA0710 FALSE 0.051 202.000 0.000 1.000 N NA
 141861 141862 NMA0710 NMA0711 NMA0710 nth FALSE 0.171 138.000 0.002 1.000 N NA
 141862 141863 NMA0711 NMA0712 nth NMA0712 TRUE 0.645 46.000 0.000 NA   NA
 141864 141865 NMA0714 NMA0715 NMA0714 NMA0715 FALSE 0.237 291.000 0.000 0.058 N NA
 141866 141867 NMA0716 NMA0717 NMA0716 NMA0717 TRUE 0.991 2.000 0.150 NA   NA
 141869 141870 NMA0719 NMA0720 aspC NMA0720 TRUE 0.565 82.000 0.000 NA   NA
 141872 141873 NMA0722 NMA0723 NMA0722 NMA0723 FALSE 0.084 269.000 0.000 1.000   NA
 141875 141876 NMA0725 NMA0726 adhA NMA0726 FALSE 0.185 289.000 0.000 NA   NA
 141877 141878 NMA0728 NMA0729 NMA0728 NMA0729 TRUE 0.953 66.000 0.258 0.075 N NA
 141881 141882 NMA0732 NMA0733 NMA0732 NMA0733 TRUE 0.511 48.000 0.000 NA N NA
 141882 141883 NMA0733 NMA0734 NMA0733 NMA0734 TRUE 0.863 55.000 0.000 0.011 Y NA
 141883 141885 NMA0734 NMA0736 NMA0734 dnaK FALSE 0.014 1067.000 0.000 1.000 N NA
 141885 141886 NMA0736 NMA0737 dnaK NMA0737 FALSE 0.267 208.000 0.000 NA   NA
 141887 141888 NMA0738 NMA0739 NMA0738 NMA0739 TRUE 0.438 132.000 0.000 NA   NA
 141888 141889 NMA0739 NMA0740 NMA0739 NMA0740 FALSE 0.370 160.000 0.000 NA   NA
 141889 141890 NMA0740 NMA0741 NMA0740 NMA0741 TRUE 0.716 35.000 0.000 NA   NA
 141893 141894 NMA0745 NMA0746 NMA0745 apbE TRUE 0.958 26.000 0.113 NA   NA
 141894 141895 NMA0746 NMA0747 apbE nqrF TRUE 0.910 153.000 0.519 1.000 N NA
 141895 141896 NMA0747 NMA0748 nqrF nqrE TRUE 0.999 14.000 0.551 0.004 Y NA
 141896 141897 NMA0748 NMA0749 nqrE nqrD TRUE 0.998 4.000 0.188 0.004 Y NA
 141897 141898 NMA0749 NMA0750 nqrD nqrC TRUE 0.999 0.000 0.312 0.004 Y NA
 141898 141899 NMA0750 NMA0751 nqrC nqrB TRUE 1.000 -7.000 0.603 0.004 Y NA
 141899 141900 NMA0751 NMA0752 nqrB nqrA TRUE 1.000 3.000 0.854 0.004 Y NA
 141900 141901 NMA0752 NMA0753 nqrA NMA0753 FALSE 0.024 348.000 0.000 1.000 N NA
 141901 141902 NMA0753 NMA0754 NMA0753 NMA0754 FALSE 0.145 358.000 0.000 NA   NA
 141902 141903 NMA0754 NMA0755 NMA0754 NMA0755 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 141903 141904 NMA0755 NMA0756 NMA0755 NMA0756 TRUE 0.638 47.000 0.000 NA   NA
 141906 141907 NMA0758 NMA0759 gcvT gcvH TRUE 0.977 163.000 0.317 0.002 Y NA
 141907 141908 NMA0759 NMA0760 gcvH hemA FALSE 0.081 152.000 0.000 1.000 N NA
 141908 141909 NMA0760 NMA0761 hemA NMA0761 FALSE 0.065 327.000 0.000 1.000   NA
 141909 141910 NMA0761 NMA0762 NMA0761 NMA0762 FALSE 0.347 54.000 0.000 1.000   NA
 141910 141911 NMA0762 NMA0763 NMA0762 NMA0763 TRUE 0.995 28.000 0.963 1.000 N NA
 141911 141913 NMA0763 NMA0765 NMA0763 NMA0765 FALSE 0.173 218.000 0.000 NA N NA
 141914 141915 NMA0766 NMA0767 NMA0766 NMA0767 FALSE 0.226 130.000 0.000 1.000   NA
 141917 141920 NMA0769 NMA0772 NMA0769 NMA0772 FALSE 0.160 686.000 0.000 NA Y NA
 141922 141923 NMA0774 NMA0775 NMA0774 NMA0775 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 141923 141924 NMA0775 NMA0776 NMA0775 NMA0776 TRUE 0.948 2.000 0.000 NA   NA
 141924 141925 NMA0776 NMA0777 NMA0776 NMA0777 TRUE 0.915 -58.000 0.000 NA   NA
 141925 141926 NMA0777 NMA0778 NMA0777 NMA0778 TRUE 0.447 129.000 0.000 NA   NA
 141926 141927 NMA0778 NMA0779 NMA0778 NMA0779 TRUE 0.930 11.000 0.000 NA   NA
 141927 141928 NMA0779 NMA0780 NMA0779 NMA0780 TRUE 0.563 83.000 0.000 NA   NA
 141928 141929 NMA0780 NMA0781 NMA0780 NMA0781 TRUE 0.883 18.000 0.000 NA   NA
 141929 141930 NMA0781 NMA0782 NMA0781 NMA0782 TRUE 0.846 21.000 0.000 NA   NA
 141930 141931 NMA0782 NMA0783 NMA0782 NMA0783 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 141932 141933 NMA0784 NMA0785 NMA0784 NMA0785 TRUE 0.614 50.000 0.000 NA   NA
 141933 141934 NMA0785 NMA0786 NMA0785 NMA0786 TRUE 0.724 34.000 0.000 NA   NA
 141934 141935 NMA0786 NMA0787 NMA0786 NMA0787 TRUE 0.891 17.000 0.000 NA   NA
 141936 141937 NMA0789 NMA0790 NMA0789 NMA0790 TRUE 0.964 77.000 0.400 1.000 Y NA
 141937 141938 NMA0790 NMA0791 NMA0790 NMA0791 TRUE 0.983 36.000 0.465 1.000 Y NA
 141938 141939 NMA0791 NMA0792 NMA0791 rplS FALSE 0.030 288.000 0.000 1.000 N NA
 141939 141940 NMA0792 NMA0793 rplS trmD TRUE 0.997 16.000 0.567 1.000 Y NA
 141940 141941 NMA0793 NMA0794 trmD rimM TRUE 0.999 0.000 0.672 1.000 Y NA
 141941 141942 NMA0794 NMA0795 rimM rpsP TRUE 0.998 16.000 0.342 0.028 Y NA
 141942 141943 NMA0795 NMA0796 rpsP NMA0796 FALSE 0.205 45.000 0.000 1.000 N NA
 141943 141944 NMA0796 NMA0797 NMA0796 NMA0797 FALSE 0.111 118.000 0.000 1.000 N NA
 141944 141945 NMA0797 NMA0798 NMA0797 NMA0798 TRUE 0.966 14.000 0.054 1.000 Y NA
 141945 141947 NMA0798 NMA0800 NMA0798 NMA0800 FALSE 0.213 190.000 0.000 NA N NA
 141947 141948 NMA0800 NMA0801 NMA0800 NMA0801 TRUE 0.931 -10.000 0.000 NA   NA
 141948 141949 NMA0801 NMA0802 NMA0801 NMA0802 TRUE 0.899 16.000 0.000 NA   NA
 141949 141950 NMA0802 NMA0803 NMA0802 tatC TRUE 0.478 53.000 0.000 NA N NA
 141950 141951 NMA0803 NMA0804 tatC NMA0804 TRUE 0.946 14.000 0.000 NA Y NA
 141951 141953 NMA0804 NMA0806 NMA0804 NMA0806 FALSE 0.037 254.000 0.000 1.000 N NA
 141953 141954 NMA0806 NMA0807 NMA0806 hisE TRUE 0.643 72.000 0.079 1.000 N NA
 141954 141955 NMA0807 NMA0808 hisE NMA0808 FALSE 0.341 141.000 0.000 1.000 Y NA
 141955 141956 NMA0808 NMA0810 NMA0808 NMA0810 FALSE 0.093 363.000 0.000 NA N NA
 141957 141958 NMA0811 NMA0812 NMA0811 secD TRUE 0.679 209.000 0.083 NA Y NA
 141958 141959 NMA0812 NMA0813 secD secF TRUE 0.999 4.000 0.332 0.001 Y NA
 141959 141961 NMA0813 NMA0815 secF rpsO FALSE 0.043 223.000 0.000 1.000 N NA
 141961 141962 NMA0815 NMA0816 rpsO NMA0816 FALSE 0.022 381.000 0.000 1.000 N NA
 141962 141963 NMA0816 NMA0817 NMA0816 NMA0817 TRUE 0.867 16.000 0.000 1.000 Y NA
 141963 141964 NMA0817 NMA0818 NMA0817 NMA0818 TRUE 0.986 0.000 0.000 0.028 Y NA
 141964 141965 NMA0818 NMA0819 NMA0818 NMA0819 FALSE 0.378 126.000 0.000 1.000 Y NA
 141966 2132923 NMA0820 NMA0822 amtB   FALSE 0.091 1221.000 0.000 NA   NA
 2132923 2132924 NMA0822 NMA0823     FALSE 0.344 169.000 0.000 NA   NA
 2132924 141969 NMA0823 NMA0825   rho FALSE 0.176 306.000 0.000 NA   NA
 141969 141970 NMA0825 NMA0826 rho ppsA FALSE 0.044 220.000 0.000 1.000 N NA
 141972 141973 NMA0828 NMA0829 NMA0828 NMA0829 TRUE 0.810 13.000 0.000 1.000   NA
 141974 141975 NMA0830 NMA0831 NMA0830 NMA0831 FALSE 0.352 273.000 0.000 0.009 N NA
 141975 141976 NMA0831 NMA0832 NMA0831 NMA0832 FALSE 0.321 133.000 0.000 NA N NA
 141976 141977 NMA0832 NMA0833 NMA0832 NMA0833 TRUE 0.666 41.000 0.000 NA   NA
 141979 141980 NMA0836 NMA0837 prfC hisI FALSE 0.126 107.000 0.000 1.000 N NA
 141980 141981 NMA0837 NMA0838 hisI hisF TRUE 0.959 31.000 0.006 0.006 Y NA
 141981 141982 NMA0838 NMA0839 hisF hisA TRUE 0.988 13.000 0.006 0.006 Y NA
 141982 141983 NMA0839 NMA0840 hisA hisH TRUE 0.983 33.000 0.120 0.006 Y NA
 141983 141984 NMA0840 NMA0841 hisH NMA0841 FALSE 0.098 131.000 0.000 1.000 N NA
 141984 141985 NMA0841 NMA0842 NMA0841 fbpC FALSE 0.059 185.000 0.000 1.000 N NA
 141985 141986 NMA0842 NMA0843 fbpC fbpB TRUE 0.960 21.000 0.037 0.028 N NA
 141986 141987 NMA0843 NMA0844 fbpB fbpA TRUE 0.993 56.000 0.529 0.028 Y NA
 141987 141989 NMA0844 NMA0846 fbpA NMA0846 FALSE 0.222 251.000 0.000 NA   NA
 141989 141990 NMA0846 NMA0847 NMA0846 argH TRUE 0.580 57.000 0.000 NA   NA
 141990 141991 NMA0847 NMA0848 argH galU TRUE 0.486 19.000 0.000 1.000 N NA
 141991 141992 NMA0848 NMA0849 galU NMA0849 FALSE 0.352 28.000 0.000 1.000 N NA
 141992 141993 NMA0849 NMA0850 NMA0849 NMA0850 TRUE 0.936 -7.000 0.000 NA   NA
 141993 141994 NMA0850 NMA0851 NMA0850 ppa TRUE 0.509 108.000 0.000 NA   NA
 141994 141995 NMA0851 NMA0852 ppa ntpA FALSE 0.132 102.000 0.000 1.000 N NA
 397404 141996 NMAt22 NMA0853 tRNA-Pro mafB3 FALSE 0.169 313.000 0.000 NA   NA
 141996 141997 NMA0853 NMA0854 mafB3 NMA0854 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 141997 141998 NMA0854 NMA0855 NMA0854 NMA0855 TRUE 0.568 78.000 0.000 NA   NA
 141998 141999 NMA0855 NMA0856 NMA0855 NMA0856 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 141999 142000 NMA0856 NMA0857 NMA0856 NMA0857 TRUE 0.484 116.000 0.000 NA   NA
 142000 142001 NMA0857 NMA0858 NMA0857 NMA0858 FALSE 0.397 148.000 0.000 NA   NA
 142002 142003 NMA0859 NMA0860 NMA0859 apaH TRUE 0.574 15.000 0.000 1.000 N NA
 142003 142004 NMA0860 NMA0861 apaH NMA0861 TRUE 0.447 78.000 0.000 NA N NA
 142004 142005 NMA0861 NMA0862 NMA0861 nspA FALSE 0.315 136.000 0.000 NA N NA
 142005 142006 NMA0862 NMA0864 nspA NMA0864 FALSE 0.017 586.000 0.000 1.000 N NA
 142006 142007 NMA0864 NMA0865 NMA0864 ligA FALSE 0.279 33.000 0.000 1.000 N NA
 142007 142008 NMA0865 NMA0866 ligA NMA0866 FALSE 0.318 148.000 0.005 1.000   NA
 142008 142009 NMA0866 NMA0867 NMA0866 ampD FALSE 0.134 194.000 0.000 1.000   NA
 142010 142011 NMA0868 NMA0869 NMA0868 tmk TRUE 0.933 60.000 0.209 NA   NA
 142011 142012 NMA0869 NMA0870 tmk maeA FALSE 0.044 222.000 0.000 1.000 N NA
 142012 142014 NMA0870 NMA0872 maeA lpxK FALSE 0.018 547.000 0.000 1.000 N NA
 142014 142015 NMA0872 NMA0873 lpxK NMA0873 FALSE 0.287 200.000 0.000 NA   NA
 142015 142016 NMA0873 NMA0874 NMA0873 NMA0874 TRUE 0.566 69.000 0.000 NA   NA
 142016 142017 NMA0874 NMA0875 NMA0874 kdsB TRUE 0.996 -3.000 0.265 NA   NA
 142017 142018 NMA0875 NMA0876 kdsB NMA0876 TRUE 0.833 23.000 0.000 NA   NA
 142018 142019 NMA0876 NMA0877 NMA0876 NMA0877 TRUE 0.593 54.000 0.000 NA   NA
 142019 142020 NMA0877 NMA0878 NMA0877 NMA0878 TRUE 0.921 -22.000 0.000 NA   NA
 142020 397405 NMA0878 NMAt23 NMA0878 tRNA-Ser TRUE 0.574 63.000 0.000 NA   NA
 397405 142021 NMAt23 NMA0879 tRNA-Ser trpA FALSE 0.128 425.000 0.000 NA   NA
 142021 142022 NMA0879 NMA0880 trpA accD TRUE 0.915 37.000 0.232 1.000 N NA
 142024 142025 NMA0882 NMA0883 NMA0882 NMA0883 TRUE 0.921 13.000 0.000 NA   NA
 142025 142026 NMA0883 NMA0884 NMA0883 pyrC TRUE 0.576 60.000 0.000 NA   NA
 142027 142028 NMA0885 NMA0886 nusB ribE TRUE 0.920 78.000 0.347 1.000 N NA
 142028 142029 NMA0886 NMA0887 ribE NMA0887 TRUE 0.638 47.000 0.000 NA   NA
 142030 142031 NMA0888 NMA0889 rnc era TRUE 0.923 47.000 0.058 0.035   NA
 142032 142033 NMA0890 NMA0891 trpF greB FALSE 0.158 59.000 0.000 1.000 N NA
 142033 142034 NMA0891 NMA0892 greB purF FALSE 0.134 100.000 0.000 1.000 N NA
 142034 142035 NMA0892 NMA0894 purF NMA0894 TRUE 0.727 209.000 0.262 1.000   NA
 142035 142036 NMA0894 NMA0895 NMA0894 tpc TRUE 0.936 -7.000 0.000 NA   NA
 142036 142037 NMA0895 NMA0896 tpc folC TRUE 0.921 13.000 0.000 NA   NA
 142037 142038 NMA0896 NMA0897 folC folI TRUE 0.750 32.000 0.000 NA   NA
 142038 142039 NMA0897 NMA0899 folI NMA0899 TRUE 0.942 5.000 0.000 NA   NA
 142039 142040 NMA0899 NMA0900 NMA0899 NMA0900 TRUE 0.578 58.000 0.000 NA   NA
 142040 142041 NMA0900 NMA0902 NMA0900 ksgA FALSE 0.120 173.000 0.002 1.000 N NA
 142042 142043 NMA0903 NMA0904 NMA0903 trpB FALSE 0.220 185.000 0.000 NA N NA
 142049 142050 NMA0911 NMA0912 NMA0911 NMA0912 TRUE 0.604 52.000 0.000 NA   NA
 142050 142051 NMA0912 NMA0913 NMA0912 holA TRUE 0.992 2.000 0.199 NA N NA
 142051 142052 NMA0913 NMA0914 holA NMA0914 TRUE 0.468 121.000 0.000 NA   NA
 142052 142053 NMA0914 NMA0915 NMA0914 NMA0915 TRUE 0.568 78.000 0.000 NA   NA
 142054 142055 NMA0916 NMA0917 NMA0916 rpoH FALSE 0.119 487.000 0.000 NA   NA
 142055 142056 NMA0917 NMA0918 rpoH lnt FALSE 0.037 255.000 0.000 1.000 N NA
 142056 5645184 NMA0918 NMA0919 lnt   TRUE 0.672 40.000 0.000 NA   NA
 5645185 5645186 NMA0921 NMA0924     FALSE 0.115 546.000 0.000 NA   NA
 142057 142059 NMA0925 NMA0927 NMA0925 hemH FALSE 0.056 191.000 0.000 1.000 N NA
 142059 142060 NMA0927 NMA0928 hemH tgt FALSE 0.151 82.000 0.000 1.000 N NA
 397406 142061 NMAt24 NMA0929 tRNA-Val thrS TRUE 0.593 54.000 0.000 NA   NA
 142061 142062 NMA0929 NMA0930 thrS infC TRUE 0.980 18.000 0.186 1.000 Y NA
 142062 142063 NMA0930 NMA0931 infC rpmI TRUE 0.968 147.000 0.652 1.000 Y NA
 142063 142064 NMA0931 NMA0932 rpmI rplT TRUE 1.000 13.000 0.928 0.027 Y NA
 142064 142065 NMA0932 NMA0933 rplT pheS TRUE 0.581 346.000 0.202 1.000 Y NA
 142065 142066 NMA0933 NMA0935 pheS NMA0935 FALSE 0.333 177.000 0.000 NA   NA
 142066 142067 NMA0935 NMA0936 NMA0935 NMA0936 TRUE 0.998 7.000 0.500 NA   NA
 142067 142068 NMA0936 NMA0937 NMA0936 pheT TRUE 0.706 36.000 0.000 NA   NA
 142068 142069 NMA0937 NMA0938 pheT himA TRUE 0.844 74.000 0.208 1.000 N NA
 142069 142070 NMA0938 NMA0939 himA NMA0939 TRUE 0.948 2.000 0.000 NA   NA
 142070 142071 NMA0939 NMA0940 NMA0939 NMA0940 FALSE 0.158 330.000 0.000 NA   NA
 142071 142072 NMA0940 NMA0941 NMA0940 NMA0941 FALSE 0.215 260.000 0.000 NA   NA
 142072 142073 NMA0941 NMA0942 NMA0941 bioA FALSE 0.259 213.000 0.000 NA   NA
 142073 142074 NMA0942 NMA0943 bioA bioD TRUE 0.996 -3.000 0.051 0.004 Y NA
 142074 142075 NMA0943 NMA0944 bioD NMA0944 TRUE 0.941 15.000 0.000 NA Y NA
 142075 142076 NMA0944 NMA0945 NMA0944 ubiA TRUE 0.983 30.000 0.248 NA Y NA
 142076 142077 NMA0945 NMA0946 ubiA NMA0946 FALSE 0.059 185.000 0.000 1.000 N NA
 142077 142078 NMA0946 NMA0947 NMA0946 NMA0947 TRUE 0.990 4.000 0.177 1.000 Y NA
 142078 142079 NMA0947 NMA0948 NMA0947 NMA0948 TRUE 0.990 -19.000 0.194 NA   NA
 142079 142080 NMA0948 NMA0950 NMA0948 NMA0950 TRUE 0.567 81.000 0.000 NA   NA
 142080 142081 NMA0950 NMA0951 NMA0950 NMA0951 TRUE 0.526 101.000 0.000 NA   NA
 142081 142082 NMA0951 NMA0952 NMA0951 recN FALSE 0.222 184.000 0.000 NA N NA
 142082 397407 NMA0952 NMAt25 recN tRNA-Arg TRUE 0.504 110.000 0.000 NA   NA
 397407 397408 NMAt25 NMAt26 tRNA-Arg tRNA-Glu TRUE 0.883 18.000 0.000 NA   NA
 142085 142086 NMA0955 NMA0956 NMA0955 ubiE TRUE 0.880 43.000 0.074 NA   NA
 142086 142087 NMA0956 NMA0957 ubiE NMA0957 FALSE 0.251 220.000 0.000 NA   NA
 142088 142089 NMA0958 NMA0959 folK NMA0959 TRUE 0.934 10.000 0.000 NA   NA
 142089 142090 NMA0959 NMA0960 NMA0959 NMA0960 TRUE 0.593 54.000 0.000 NA   NA
 142090 142091 NMA0960 NMA0961 NMA0960 hfq FALSE 0.318 85.000 0.000 1.000   NA
 142091 142092 NMA0961 NMA0962 hfq NMA0962 FALSE 0.228 129.000 0.000 1.000   NA
 142093 142094 NMA0963 NMA0964 NMA0963 xerD FALSE 0.311 52.000 0.002 1.000 N NA
 142094 142095 NMA0964 NMA0965 xerD NMA0965 FALSE 0.241 172.000 0.000 NA N NA
 142095 142096 NMA0965 NMA0966 NMA0965 NMA0966 FALSE 0.354 166.000 0.000 NA   NA
 142098 142099 NMA0968 NMA0969 purC pnp FALSE 0.040 237.000 0.000 1.000 N NA
 142100 142101 NMA0970 NMA0971 NMA0970 NMA0971 TRUE 0.915 14.000 0.000 NA   NA
 142102 142103 NMA0972 NMA0973 dapF NMA0973 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142103 142104 NMA0973 NMA0974 NMA0973 cysK FALSE 0.297 194.000 0.000 NA   NA
 142104 142105 NMA0974 NMA0975 cysK NMA0975 FALSE 0.043 587.000 0.000 1.000   NA
 142106 142107 NMA0976 NMA0977 lepB lepA TRUE 0.696 143.000 0.187 1.000 N NA
 142107 142108 NMA0977 NMA0978 lepA pfs FALSE 0.085 145.000 0.000 1.000 N NA
 142109 142110 NMA0979 NMA0980 pilT2 holB TRUE 0.765 34.000 0.000 0.098 N NA
 142110 142111 NMA0980 NMA0981 holB NMA0981 TRUE 0.997 4.000 0.382 NA N NA
 142111 142112 NMA0981 NMA0982 NMA0981 NMA0982 TRUE 0.981 5.000 0.089 NA N NA
 142112 142114 NMA0982 NMA0984 NMA0982 NMA0984 FALSE 0.096 356.000 0.000 NA N NA
 142114 142115 NMA0984 NMA0985 NMA0984 upp FALSE 0.263 106.000 0.004 1.000 N NA
 142115 142116 NMA0985 NMA0986 upp NMA0986 TRUE 0.833 23.000 0.000 NA   NA
 142116 142117 NMA0986 NMA0987 NMA0986 NMA0987 FALSE 0.222 251.000 0.000 NA   NA
 142117 142118 NMA0987 NMA0988 NMA0987 NMA0988 TRUE 0.682 39.000 0.000 NA   NA
 142118 142119 NMA0988 NMA0989 NMA0988 NMA0989 TRUE 0.980 75.000 0.600 1.000 Y NA
 142119 142120 NMA0989 NMA0990 NMA0989 NMA0990 TRUE 0.999 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 142120 142121 NMA0990 NMA0991 NMA0990 hemE TRUE 0.487 75.000 0.000 1.000 Y NA
 142121 142122 NMA0991 NMA0992 hemE radA FALSE 0.127 186.000 0.003 1.000 N NA
 142123 142124 NMA0993 NMA0994 NMA0993 NMA0994 TRUE 0.438 132.000 0.000 NA   NA
 142124 142125 NMA0994 NMA0995 NMA0994 recB TRUE 0.569 39.000 0.000 NA N NA
 142125 142126 NMA0995 NMA0996 recB NMA0996 FALSE 0.161 233.000 0.000 NA N NA
 142127 142128 NMA0997 NMA0999 NMA0997 NMA0999 TRUE 0.999 -10.000 0.594 0.027 Y NA
 142128 142129 NMA0999 NMA1000 NMA0999 NMA1000 TRUE 0.997 10.000 0.481 1.000 Y NA
 142130 142131 NMA1001 NMA1002 pgm ppiB FALSE 0.073 163.000 0.000 1.000 N NA
 142131 142132 NMA1002 NMA1003 ppiB NMA1003 FALSE 0.110 119.000 0.000 1.000 N NA
 142132 5645187 NMA1003 NMA1003A NMA1003   FALSE 0.156 333.000 0.000 NA   NA
 5645187 142133 NMA1003A NMA1004   pth FALSE 0.207 264.000 0.000 NA   NA
 142133 142134 NMA1004 NMA1005 pth NMA1005 TRUE 0.598 53.000 0.000 NA   NA
 142134 142135 NMA1005 NMA1006 NMA1005 NMA1006 TRUE 0.984 -7.000 0.086 NA   NA
 142135 142136 NMA1006 NMA1007 NMA1006 ftsH FALSE 0.179 210.000 0.000 NA N NA
 142136 142137 NMA1007 NMA1008 ftsH ftsJ TRUE 0.816 64.000 0.095 NA N NA
 142138 142140 NMA1009 NMA1011 NMA1009 hemB FALSE 0.246 168.000 0.000 NA N NA
 142142 142144 NMA1013 NMA1015 NMA1013 NMA1015 FALSE 0.128 200.000 0.000 1.000   NA
 142145 142146 NMA1016 NMA1017 NMA1016 NMA1017 FALSE 0.387 25.000 0.000 1.000 N NA
 142146 142147 NMA1017 NMA1018 NMA1017 NMA1018 TRUE 0.860 20.000 0.000 NA   NA
 142147 142148 NMA1018 NMA1019 NMA1018 NMA1019 TRUE 0.611 51.000 0.000 NA   NA
 142148 142149 NMA1019 NMA1020 NMA1019 NMA1020 FALSE 0.163 55.000 0.000 1.000 N NA
 142149 142150 NMA1020 NMA1021 NMA1020 murB TRUE 0.632 12.000 0.000 1.000 N NA
 142150 142151 NMA1021 NMA1022 murB NMA1022 FALSE 0.202 178.000 0.008 1.000 N NA
 142152 142153 NMA1023 NMA1024 NMA1023 purA TRUE 0.747 103.000 0.161 1.000 N NA
 142153 142154 NMA1024 NMA1025 purA NMA1025 TRUE 0.474 119.000 0.000 NA   NA
 142154 142155 NMA1025 NMA1026 NMA1025 NMA1026 TRUE 0.738 33.000 0.000 NA   NA
 142155 142156 NMA1026 NMA1027 NMA1026 NMA1027 TRUE 0.915 14.000 0.000 NA   NA
 142156 142157 NMA1027 NMA1028 NMA1027 NMA1028 TRUE 0.479 117.000 0.000 NA   NA
 142157 142159 NMA1028 NMA1030 NMA1028 NMA1030 FALSE 0.210 263.000 0.000 NA   NA
 142161 142162 NMA1032 NMA1033 adk pyrF FALSE 0.088 526.000 0.000 1.000 Y NA
 142162 142163 NMA1033 NMA1034 pyrF rfaE FALSE 0.342 55.000 0.005 1.000 N NA
 142163 142164 NMA1034 NMA1035 rfaE nmgII FALSE 0.238 37.000 0.000 1.000 N NA
 142164 142165 NMA1035 NMA1036 nmgII nmgI TRUE 0.979 2.000 0.065 NA N NA
 142165 142166 NMA1036 NMA1037 nmgI rfaD TRUE 0.550 41.000 0.000 NA N NA
 142166 142167 NMA1037 NMA1038 rfaD NMA1038 FALSE 0.151 73.000 0.000 1.000 N NA
 142167 142168 NMA1038 NMA1039 NMA1038 NMA1039 TRUE 0.978 -3.000 0.033 NA   NA
 142168 2132925 NMA1039 NMA1040 NMA1039   FALSE 0.354 166.000 0.000 NA   NA
 2132925 2132926 NMA1040 NMA1042     TRUE 0.565 82.000 0.000 NA   NA
 142169 142170 NMA1045 NMA1046 clpA NMA1046 TRUE 0.999 4.000 0.596 NA   NA
 142173 142174 NMA1049 NMA1051 NMA1049 NMA1051 TRUE 0.638 47.000 0.000 NA   NA
 142174 142175 NMA1051 NMA1052 NMA1051 recJ TRUE 0.566 69.000 0.000 NA   NA
 142175 142176 NMA1052 NMA1053 recJ pcnB FALSE 0.029 301.000 0.000 1.000 N NA
 142176 142177 NMA1053 NMA1054 pcnB NMA1054 FALSE 0.343 170.000 0.000 NA   NA
 142178 142180 NMA1056 NMA1058 NMA1056 NMA1058 TRUE 0.419 139.000 0.000 NA   NA
 142182 142183 NMA1060 NMA1061 NMA1060 NMA1061 TRUE 0.572 66.000 0.000 NA   NA
 142183 142184 NMA1061 NMA1062 NMA1061 rdgC TRUE 0.604 52.000 0.000 NA   NA
 142184 142185 NMA1062 NMA1063 rdgC NMA1063 TRUE 0.540 31.000 0.000 1.000   NA
 142185 142186 NMA1063 NMA1064 NMA1063 NMA1064 FALSE 0.356 154.000 0.009 1.000   NA
 142186 142187 NMA1064 NMA1065 NMA1064 hisS TRUE 0.992 1.000 0.259 1.000   NA
 142187 142188 NMA1065 NMA1066 hisS NMA1066 TRUE 0.689 94.000 0.000 0.096   NA
 142188 142190 NMA1066 NMA1068 NMA1066 NMA1068 FALSE 0.190 282.000 0.000 NA   NA
 142190 142191 NMA1068 NMA1070 NMA1068 NMA1070 FALSE 0.347 168.000 0.000 NA   NA
 142191 142192 NMA1070 NMA1071 NMA1070 NMA1071 TRUE 0.489 115.000 0.000 NA   NA
 142192 142193 NMA1071 NMA1072 NMA1071 NMA1072 TRUE 0.578 58.000 0.000 NA   NA
 142193 142194 NMA1072 NMA1073 NMA1072 NMA1073 TRUE 0.925 -18.000 0.000 NA   NA
 142194 142195 NMA1073 NMA1074 NMA1073 NMA1074 FALSE 0.365 163.000 0.000 NA   NA
 142195 142196 NMA1074 NMA1075 NMA1074 NMA1075 FALSE 0.204 266.000 0.000 NA   NA
 142196 142198 NMA1075 NMA1077 NMA1075 NMA1077 FALSE 0.166 320.000 0.000 NA   NA
 142198 142199 NMA1077 NMA1078 NMA1077 NMA1078 TRUE 0.645 46.000 0.000 NA   NA
 142199 142200 NMA1078 NMA1079 NMA1078 NMA1079 TRUE 0.412 142.000 0.000 NA   NA
 142200 142201 NMA1079 NMA1080 NMA1079 NMA1080 FALSE 0.242 229.000 0.000 NA   NA
 142201 142202 NMA1080 NMA1081 NMA1080 NMA1081 TRUE 0.577 59.000 0.000 NA   NA
 142202 142203 NMA1081 NMA1082 NMA1081 NMA1082 FALSE 0.175 307.000 0.000 NA   NA
 142203 142204 NMA1082 NMA1083 NMA1082 NMA1083 TRUE 0.432 134.000 0.000 NA   NA
 142204 142205 NMA1083 NMA1084 NMA1083 NMA1084 TRUE 0.659 43.000 0.000 NA   NA
 142207 142208 NMA1086 NMA1087 NMA1086 NMA1087 FALSE 0.341 55.000 0.000 1.000   NA
 397409 142209 NMAt27 NMA1088 tRNA-Thr panB TRUE 0.412 142.000 0.000 NA   NA
 142209 142210 NMA1088 NMA1089 panB panC TRUE 0.990 123.000 0.395 0.001 Y NA
 142210 142211 NMA1089 NMA1090 panC NMA1090 FALSE 0.168 165.000 0.000 1.000   NA
 142211 142212 NMA1090 NMA1091 NMA1090 NMA1091 TRUE 0.576 140.000 0.067 1.000   NA
 142212 142213 NMA1091 NMA1092 NMA1091 NMA1092 TRUE 0.974 10.000 0.157 1.000 N NA
 142213 397410 NMA1092 NMAt28 NMA1092 tRNA-Gln TRUE 0.937 8.000 0.000 NA   NA
 397410 397411 NMAt28 NMAt29 tRNA-Gln tRNA-Gln TRUE 0.921 13.000 0.000 NA   NA
 397411 397412 NMAt29 NMAt30 tRNA-Gln tRNA-Gln TRUE 0.936 9.000 0.000 NA   NA
 397412 142214 NMAt30 NMA1093 tRNA-Gln prsA FALSE 0.351 167.000 0.000 NA   NA
 142214 142215 NMA1093 NMA1094 prsA NMA1094 TRUE 0.745 67.000 0.122 1.000 N NA
 142218 142219 NMA1097 NMA1098 cysA cysW TRUE 0.998 -3.000 0.587 1.000 Y NA
 142219 142221 NMA1098 NMA1100 cysW cysU TRUE 0.977 378.000 0.935 0.001 N NA
 142222 142223 NMA1101 NMA1102 NMA1101 NMA1102 FALSE 0.157 332.000 0.000 NA   NA
 142225 142226 NMA1105 NMA1106 dnaB NMA1106 FALSE 0.114 309.000 0.000 NA N NA
 142226 142227 NMA1106 NMA1107 NMA1106 NMA1107 TRUE 0.850 30.000 0.000 NA Y NA
 142227 142228 NMA1107 NMA1108 NMA1107 NMA1108 TRUE 0.965 -3.000 0.000 NA Y NA
 142228 142229 NMA1108 NMA1109 NMA1108 NMA1109 TRUE 0.950 -21.000 0.000 NA Y NA
 142229 142230 NMA1109 NMA1110 NMA1109 NMA1110 TRUE 0.956 -10.000 0.000 NA Y NA
 142232 142233 NMA1112 NMA1113 dut NMA1113 FALSE 0.152 76.000 0.000 1.000 N NA
 142233 142234 NMA1113 NMA1114 NMA1113 NMA1114 FALSE 0.212 262.000 0.000 NA   NA
 142234 397413 NMA1114 NMAt31 NMA1114 tRNA-Ser TRUE 0.563 83.000 0.000 NA   NA
 397413 397414 NMAt31 NMAt32 tRNA-Ser tRNA-Ser FALSE 0.259 213.000 0.000 NA   NA
 142235 142236 NMA1115 NMA1116 NMA1115 icd FALSE 0.014 1162.000 0.000 1.000 N NA
 142243 142244 NMA1123 NMA1124 NMA1123 dapA TRUE 0.845 78.000 0.041 NA Y NA
 142246 142247 NMA1127 NMA1128 NMA1127 NMA1128 TRUE 0.570 67.000 0.000 NA   NA
 142247 142248 NMA1128 NMA1129 NMA1128 NMA1129 TRUE 0.942 5.000 0.000 NA   NA
 142248 142249 NMA1129 NMA1130 NMA1129 miaA TRUE 0.926 4.000 0.000 1.000 Y NA
 142249 142250 NMA1130 NMA1131 miaA NMA1131 FALSE 0.138 379.000 0.000 NA   NA
 142253 142254 NMA1134 NMA1135 NMA1134 NMA1135 TRUE 0.479 117.000 0.000 NA   NA
 142254 142255 NMA1135 NMA1136 NMA1135 metX TRUE 0.998 -3.000 0.509 NA   NA
 142255 142256 NMA1136 NMA1137 metX rpmJ2 FALSE 0.042 622.000 0.000 1.000   NA
 142256 142257 NMA1137 NMA1138 rpmJ2 rpmE2 TRUE 0.994 0.000 0.083 0.026   NA
 142258 142259 NMA1139 NMA1140 metF metE TRUE 0.878 139.000 0.009 0.002 Y NA
 142259 142260 NMA1140 NMA1141 metE NMA1141 FALSE 0.032 279.000 0.000 1.000 N NA
 142260 142261 NMA1141 NMA1142 NMA1141 lpdA2 TRUE 0.841 249.000 0.204 0.008 N NA
 142261 142262 NMA1142 NMA1143 lpdA2 sdhC TRUE 0.448 279.000 0.000 0.043 Y NA
 142262 142263 NMA1143 NMA1144 sdhC sdhD TRUE 0.999 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 142263 142264 NMA1144 NMA1145 sdhD sdhA TRUE 1.000 3.000 0.705 0.002 Y NA
 142264 142265 NMA1145 NMA1146 sdhA sdhB TRUE 0.995 120.000 0.604 0.002 Y NA
 142265 142266 NMA1146 NMA1147 sdhB NMA1147 TRUE 0.991 4.000 0.151 NA   NA
 142266 142267 NMA1147 NMA1148 NMA1147 gltA TRUE 0.859 112.000 0.136 NA   NA
 142267 142268 NMA1148 NMA1149 gltA sucA FALSE 0.408 205.000 0.020 1.000 Y NA
 142268 142269 NMA1149 NMA1150 sucA sucB TRUE 0.982 100.000 0.667 1.000 Y NA
 142269 142270 NMA1150 NMA1151 sucB lpdA3 TRUE 0.623 365.000 0.253 1.000 Y NA
 142270 142271 NMA1151 NMA1152 lpdA3 NMA1152 TRUE 0.543 95.000 0.000 NA   NA
 142271 142272 NMA1152 NMA1153 NMA1152 sucC TRUE 0.535 99.000 0.000 NA   NA
 142272 142273 NMA1153 NMA1154 sucC sucD TRUE 1.000 11.000 0.806 0.001 Y NA
 142276 142277 NMA1157 NMA1158 NMA1157 NMA1158 FALSE 0.103 724.000 0.000 NA   NA
 142277 142278 NMA1158 NMA1159 NMA1158 uvrA TRUE 0.580 57.000 0.000 NA   NA
 142282 142283 NMA1163 NMA1164 trpG trpD TRUE 0.843 65.000 0.105 1.000 Y NA
 142285 142286 NMA1167 NMA1168 NMA1167 NMA1168 TRUE 0.933 -9.000 0.000 NA   NA
 142286 142287 NMA1168 NMA1169 NMA1168 NMA1169 TRUE 0.998 5.000 0.400 NA   NA
 142287 142288 NMA1169 NMA1170 NMA1169 NMA1170 TRUE 0.937 8.000 0.000 NA   NA
 142288 142289 NMA1170 NMA1171 NMA1170 NMA1171 TRUE 0.939 7.000 0.000 NA   NA
 142289 142290 NMA1171 NMA1172 NMA1171 NMA1172 TRUE 0.451 128.000 0.000 NA   NA
 142290 142291 NMA1172 NMA1173 NMA1172 NMA1173 TRUE 0.915 -58.000 0.000 NA   NA
 142291 142292 NMA1173 NMA1174 NMA1173 NMA1174 FALSE 0.109 604.000 0.000 NA   NA
 142293 142294 NMA1175 NMA1176 pntB NMA1176 TRUE 0.572 66.000 0.000 NA   NA
 142294 142295 NMA1176 NMA1177 NMA1176 pntA TRUE 0.945 4.000 0.000 NA   NA
 142297 142299 NMA1179 NMA1181 serB NMA1181 TRUE 0.572 66.000 0.000 NA   NA
 142299 142300 NMA1181 NMA1182 NMA1181 purH FALSE 0.360 164.000 0.000 NA   NA
 142300 142302 NMA1182 NMA1185 purH NMA1185 FALSE 0.016 613.000 0.000 1.000 N NA
 142302 142303 NMA1185 NMA1186 NMA1185 NMA1186 TRUE 0.541 96.000 0.000 NA   NA
 142303 142304 NMA1186 NMA1187 NMA1186 NMA1187 TRUE 0.979 -19.000 0.080 NA   NA
 142304 142305 NMA1187 NMA1188 NMA1187 NMA1188 FALSE 0.174 308.000 0.000 NA   NA
 142305 142306 NMA1188 NMA1189 NMA1188 NMA1189 FALSE 0.272 206.000 0.000 NA   NA
 142306 142307 NMA1189 NMA1190 NMA1189 NMA1190 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 142307 142308 NMA1190 NMA1191 NMA1190 NMA1191 TRUE 0.919 -28.000 0.000 NA   NA
 142308 142309 NMA1191 NMA1192 NMA1191 NMA1192 TRUE 0.860 20.000 0.000 NA   NA
 142311 142312 NMA1194 NMA1195 NMA1194 NMA1195 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142312 142313 NMA1195 NMA1196 NMA1195 NMA1196 TRUE 0.926 12.000 0.000 NA   NA
 142313 142314 NMA1196 NMA1197 NMA1196 NMA1197 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142314 142315 NMA1197 NMA1198 NMA1197 NMA1198 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 142316 142317 NMA1199 NMA1200 NMA1199 NMA1200 FALSE 0.096 133.000 0.000 1.000 N NA
 142317 142318 NMA1200 NMA1201 NMA1200 NMA1201 FALSE 0.013 1870.000 0.000 1.000 N NA
 142318 142319 NMA1201 NMA1202 NMA1201 NMA1202 FALSE 0.182 458.000 0.000 0.042 N NA
 142319 142320 NMA1202 NMA1203 NMA1202 NMA1203 TRUE 0.875 135.000 0.200 NA   NA
 142320 142321 NMA1203 NMA1204 NMA1203 NMA1204 FALSE 0.381 155.000 0.000 NA   NA
 142321 142322 NMA1204 NMA1205 NMA1204 dld FALSE 0.183 295.000 0.000 NA   NA
 142323 142324 NMA1206 NMA1207 NMA1206 NMA1207 TRUE 0.740 77.000 0.000 0.010 N NA
 142326 142327 NMA1209 NMA1210 NMA1209 NMA1210 TRUE 0.917 -37.000 0.000 NA   NA
 142327 142328 NMA1210 NMA1211 NMA1210 NMA1211 TRUE 0.604 52.000 0.000 NA   NA
 142328 2132930 NMA1211 NMA1212 NMA1211   TRUE 0.821 25.000 0.000 NA   NA
 142329 142330 NMA1214 NMA1215 NMA1214 NMA1215 TRUE 0.921 13.000 0.000 NA   NA
 142330 142331 NMA1215 NMA1216 NMA1215 NMA1216 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 142331 142332 NMA1216 NMA1217 NMA1216 NMA1217 TRUE 0.550 92.000 0.000 NA   NA
 142333 142336 NMA1218 NMA1221 NMA1218 NMA1221 TRUE 0.860 20.000 0.000 NA   NA
 142336 142337 NMA1221 NMA1222 NMA1221 NMA1222 FALSE 0.173 309.000 0.000 NA   NA
 142337 142338 NMA1222 NMA1223 NMA1222 NMA1223 TRUE 0.652 45.000 0.000 NA   NA
 142338 142339 NMA1223 NMA1224 NMA1223 NMA1224 TRUE 0.926 12.000 0.000 NA   NA
 142340 142341 NMA1225 NMA1226 NMA1225 NMA1226 TRUE 0.788 29.000 0.000 NA   NA
 142341 142342 NMA1226 NMA1227 NMA1226 NMA1227 TRUE 0.559 86.000 0.000 NA   NA
 142342 142343 NMA1227 NMA1228 NMA1227 NMA1228 TRUE 0.582 56.000 0.000 NA   NA
 142343 142344 NMA1228 NMA1229 NMA1228 NMA1229 TRUE 0.999 -3.000 0.667 NA   NA
 142344 142345 NMA1229 NMA1230 NMA1229 NMA1230 TRUE 0.552 90.000 0.000 NA   NA
 142345 142348 NMA1230 NMA1233 NMA1230 NMA1233 FALSE 0.127 440.000 0.000 NA   NA
 142348 142349 NMA1233 NMA1234 NMA1233 NMA1234 TRUE 0.942 5.000 0.000 NA   NA
 408283 142350 NMAs01 NMA1237 ssrA NMA1237 TRUE 0.574 63.000 0.000 NA   NA
 142350 2132933 NMA1237 NMA1239 NMA1237   FALSE 0.120 481.000 0.000 NA   NA
 2132933 2132934 NMA1239 NMA1242     TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 2132934 142351 NMA1242 NMA1243   NMA1243 FALSE 0.168 314.000 0.000 NA   NA
 142351 142352 NMA1243 NMA1244 NMA1243 NMA1244 FALSE 0.278 106.000 0.000 1.000   NA
 142352 142353 NMA1244 NMA1245 NMA1244 purK FALSE 0.391 47.000 0.000 1.000   NA
 142353 142354 NMA1245 NMA1246 purK NMA1246 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142354 142355 NMA1246 NMA1247 NMA1246 trpE TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142355 142356 NMA1247 NMA1248 trpE NMA1248 TRUE 0.502 111.000 0.000 NA   NA
 142356 142357 NMA1248 NMA1249 NMA1248 abcZ TRUE 0.846 21.000 0.000 NA   NA
 142357 142358 NMA1249 NMA1250 abcZ dedA TRUE 0.873 19.000 0.000 NA   NA
 142358 142359 NMA1250 NMA1251 dedA opcA FALSE 0.360 164.000 0.000 NA   NA
 142359 2132935 NMA1251 NMA1252 opcA   FALSE 0.109 598.000 0.000 NA   NA
 142361 142362 NMA1254 NMA1255 glyA ggt FALSE 0.091 481.000 0.000 1.000 Y NA
 142363 142364 NMA1257 NMA1258 NMA1257 NMA1258 TRUE 0.921 -24.000 0.000 NA   NA
 142365 142366 NMA1259 NMA1260 fbp NMA1260 FALSE 0.098 246.000 0.000 1.000   NA
 142366 142367 NMA1260 NMA1261 NMA1260 NMA1261 FALSE 0.313 88.000 0.000 1.000   NA
 142368 142369 NMA1262 NMA1263 folB NMA1263 FALSE 0.265 34.000 0.000 1.000 N NA
 142370 142371 NMA1264 NMA1265 NMA1264 NMA1265 TRUE 0.788 29.000 0.000 NA   NA
 142373 142374 NMA1267 NMA1268 proA proB TRUE 0.999 13.000 0.281 0.003 Y NA
 142375 142376 NMA1270 NMA1272 leuA NMA1272 FALSE 0.287 200.000 0.000 NA   NA
 142377 142378 NMA1273 NMA1274 lgt NMA1274 FALSE 0.151 71.000 0.000 1.000 N NA
 142381 142382 NMA1278 NMA1279 NMA1278 NMA1279 TRUE 0.701 -3.000 0.000 1.000 N NA
 142382 2132936 NMA1279 NMA1280 NMA1279   TRUE 0.652 45.000 0.000 NA   NA
 142385 142386 NMA1283 NMA1284 NMA1283 NMA1284 TRUE 0.868 2.000 0.000 1.000   NA
 142386 142387 NMA1284 NMA1285 NMA1284 NMA1285 TRUE 0.936 9.000 0.000 NA   NA
 142387 142389 NMA1285 NMA1287 NMA1285 NMA1287 TRUE 0.552 90.000 0.000 NA   NA
 142389 142390 NMA1287 NMA1288 NMA1287 NMA1288 TRUE 0.936 -7.000 0.000 NA   NA
 142390 2132938 NMA1288 NMA1288A NMA1288   TRUE 0.948 1.000 0.000 NA   NA
 2132938 142391 NMA1288A NMA1289   NMA1289 TRUE 0.916 -55.000 0.000 NA   NA
 142391 142392 NMA1289 NMA1290 NMA1289 NMA1290 TRUE 0.568 80.000 0.000 NA   NA
 142392 142393 NMA1290 NMA1291 NMA1290 gam TRUE 0.504 110.000 0.000 NA   NA
 142394 142395 NMA1292 NMA1293 NMA1292 NMA1293 TRUE 0.945 4.000 0.000 NA   NA
 142395 142396 NMA1293 NMA1294 NMA1293 NMA1294 TRUE 0.438 132.000 0.000 NA   NA
 142396 142397 NMA1294 NMA1295 NMA1294 NMA1295 FALSE 0.283 201.000 0.000 NA   NA
 142397 142398 NMA1295 NMA1296 NMA1295 NMA1296 TRUE 0.922 -21.000 0.000 NA   NA
 142398 142399 NMA1296 NMA1297 NMA1296 NMA1297 FALSE 0.299 193.000 0.000 NA   NA
 142400 142401 NMA1298 NMA1299 NMA1298 NMA1299 TRUE 0.479 117.000 0.000 NA   NA
 142401 142402 NMA1299 NMA1300 NMA1299 NMA1300 TRUE 0.999 -3.000 0.667 NA   NA
 142402 142403 NMA1300 NMA1301 NMA1300 NMA1301 TRUE 0.489 115.000 0.000 NA   NA
 142403 142404 NMA1301 NMA1302 NMA1301 NMA1302 TRUE 0.979 -19.000 0.080 NA   NA
 142404 142405 NMA1302 NMA1303 NMA1302 NMA1303 FALSE 0.174 308.000 0.000 NA   NA
 142405 142406 NMA1303 NMA1304 NMA1303 NMA1304 FALSE 0.272 206.000 0.000 NA   NA
 142406 142407 NMA1304 NMA1305 NMA1304 NMA1305 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 142407 142408 NMA1305 NMA1306 NMA1305 NMA1306 TRUE 0.919 -28.000 0.000 NA   NA
 142408 142409 NMA1306 NMA1307 NMA1306 NMA1307 TRUE 0.860 20.000 0.000 NA   NA
 142409 142410 NMA1307 NMA1308 NMA1307 NMA1308 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142410 142411 NMA1308 NMA1309 NMA1308 NMA1309 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142411 142412 NMA1309 NMA1310 NMA1309 NMA1310 TRUE 0.926 12.000 0.000 NA   NA
 142412 142413 NMA1310 NMA1311 NMA1310 NMA1311 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142413 142414 NMA1311 NMA1312 NMA1311 NMA1312 TRUE 0.948 2.000 0.000 NA   NA
 142414 142415 NMA1312 NMA1313 NMA1312 NMA1313 TRUE 0.994 21.000 0.485 NA   NA
 142415 142416 NMA1313 NMA1314 NMA1313 NMA1314 TRUE 0.990 0.000 0.121 NA   NA
 142416 142417 NMA1314 NMA1315 NMA1314 NMA1315 TRUE 0.999 -13.000 1.000 NA   NA
 142417 2132939 NMA1315 NMA1318 NMA1315   FALSE 0.101 757.000 0.000 NA   NA
 2132939 142419 NMA1318 NMA1319   NMA1319 TRUE 0.518 104.000 0.000 NA   NA
 142419 142420 NMA1319 NMA1320 NMA1319 NMA1320 TRUE 0.988 -10.000 0.143 NA   NA
 142420 142421 NMA1320 NMA1321 NMA1320 NMA1321 TRUE 0.999 -3.000 0.714 NA   NA
 142421 142422 NMA1321 NMA1322 NMA1321 NMA1322 TRUE 0.904 100.000 0.188 NA   NA
 142422 142423 NMA1322 NMA1323 NMA1322 NMA1323 TRUE 0.999 14.000 1.000 NA   NA
 142423 142424 NMA1323 NMA1324 NMA1323 NMA1324 TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 142424 142425 NMA1324 NMA1325 NMA1324 NMA1325 TRUE 0.930 11.000 0.000 NA   NA
 142425 142428 NMA1325 NMA1328 NMA1325 NMA1328 FALSE 0.094 1078.000 0.000 NA   NA
 142428 142429 NMA1328 NMA1329 NMA1328 NMA1329 TRUE 0.922 -21.000 0.000 NA   NA
 5645188 142431 NMA1331 NMA1332   NMA1332 FALSE 0.127 442.000 0.000 NA   NA
 142431 142432 NMA1332 NMA1334 NMA1332 NMA1334 TRUE 0.999 -3.000 0.740 NA   NA
 142432 142433 NMA1334 NMA1335 NMA1334 NMA1335 TRUE 0.999 7.000 0.625 NA   NA
 142433 142434 NMA1335 NMA1336 NMA1335 NMA1336 FALSE 0.168 165.000 0.000 1.000   NA
 142434 142435 NMA1336 NMA1338 NMA1336 NMA1338 TRUE 0.941 33.000 0.019 0.020   NA
 142435 142436 NMA1338 NMA1339 NMA1338 NMA1339 TRUE 0.611 81.000 0.028 1.000   NA
 142437 142438 NMA1340 NMA1341 NMA1340 NMA1341 FALSE 0.163 323.000 0.000 NA   NA
 142438 142439 NMA1341 NMA1343 NMA1341 NMA1343 FALSE 0.234 237.000 0.000 NA   NA
 142439 142440 NMA1343 NMA1344 NMA1343 fdx TRUE 0.587 55.000 0.000 NA   NA
 142444 142445 NMA1349 NMA1350 accA NMA1350 TRUE 0.722 98.000 0.123 1.000 N NA
 142445 142446 NMA1350 NMA1351 NMA1350 NMA1351 FALSE 0.151 74.000 0.000 1.000 N NA
 142446 142447 NMA1351 NMA1353 NMA1351 NMA1353 TRUE 0.611 51.000 0.000 NA   NA
 142447 142448 NMA1353 NMA1354 NMA1353 NMA1354 TRUE 0.466 122.000 0.000 NA   NA
 142448 142449 NMA1354 NMA1355 NMA1354 NMA1355 TRUE 0.926 12.000 0.000 NA   NA
 142449 142450 NMA1355 NMA1356 NMA1355 mpl TRUE 0.575 62.000 0.000 NA   NA
 142450 142452 NMA1356 NMA1358 mpl bioB FALSE 0.048 207.000 0.000 1.000 N NA
 142453 142454 NMA1359 NMA1360 NMA1359 NMA1360 TRUE 0.458 124.000 0.000 NA   NA
 142454 142455 NMA1360 NMA1361 NMA1360 ilvD FALSE 0.189 283.000 0.000 NA   NA
 142455 142456 NMA1361 NMA1362 ilvD cysI FALSE 0.066 173.000 0.000 1.000 N NA
 142456 142457 NMA1362 NMA1363 cysI cysJ TRUE 0.999 27.000 0.791 0.001 Y NA
 142457 142458 NMA1363 NMA1364 cysJ cysN TRUE 0.967 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 142458 142459 NMA1364 NMA1365 cysN cysD TRUE 0.977 39.000 0.182 0.001 N NA
 142459 142460 NMA1365 NMA1366 cysD cysH TRUE 0.781 38.000 0.011 1.000 Y NA
 142460 142461 NMA1366 NMA1367 cysH cysG TRUE 0.935 16.000 0.011 1.000 Y NA
 142461 142462 NMA1367 NMA1368 cysG NMA1368 FALSE 0.030 297.000 0.000 1.000 N NA
 142463 142464 NMA1369 NMA1370 NMA1369 typA FALSE 0.133 270.000 0.000 NA N NA
 397440 397439 NMAt33 NMAt34 tRNA-Ser tRNA-Leu TRUE 0.682 39.000 0.000 NA   NA
 397439 397438 NMAt34 NMAt35 tRNA-Leu tRNA-Leu TRUE 0.706 36.000 0.000 NA   NA
 142466 142467 NMA1372 NMA1373 guaB NMA1373 FALSE 0.160 327.000 0.000 NA   NA
 142467 142468 NMA1373 NMA1374 NMA1373 glnD TRUE 0.552 91.000 0.000 NA   NA
 142468 142469 NMA1374 NMA1375 glnD NMA1375 FALSE 0.373 49.000 0.000 1.000   NA
 142469 142470 NMA1375 NMA1376 NMA1375 bfrB FALSE 0.066 324.000 0.000 1.000   NA
 142470 142471 NMA1376 NMA1377 bfrB bfrA TRUE 0.998 28.000 0.396 0.001 Y NA
 142471 142472 NMA1377 NMA1378 bfrA lipA FALSE 0.019 464.000 0.000 1.000 N NA
 142472 142473 NMA1378 NMA1379 lipA lipB TRUE 0.999 -7.000 0.319 0.001 Y NA
 142473 142474 NMA1379 NMA1380 lipB NMA1380 TRUE 0.941 53.000 0.219 NA   NA
 142476 142477 NMA1382 NMA1383 NMA1382 NMA1383 TRUE 0.984 15.000 0.091 NA Y NA
 142478 2132940 NMA1384 NMA1385 ung   TRUE 0.558 87.000 0.000 NA   NA
 5645189 142479 NMA1386 NMA1391   NMA1391 TRUE 0.652 45.000 0.000 NA   NA
 142479 2132941 NMA1391 NMA1393 NMA1391   FALSE 0.122 469.000 0.000 NA   NA
 2132941 142480 NMA1393 NMA1394   NMA1394 TRUE 0.567 77.000 0.000 NA   NA
 142481 142482 NMA1395 NMA1396 hom NMA1396 TRUE 0.936 -7.000 0.000 NA   NA
 142483 142484 NMA1397 NMA1398 hupB lon FALSE 0.284 182.000 0.033 1.000 N NA
 142486 142487 NMA1401 NMA1402 recD NMA1402 TRUE 0.625 68.000 0.000 0.089 N NA
 142487 142488 NMA1402 NMA1403 NMA1402 NMA1403 TRUE 0.999 -7.000 0.620 0.033 N NA
 142491 142492 NMA1406 NMA1407 recR NMA1407 FALSE 0.326 67.000 0.000 1.000   NA
 142492 142493 NMA1407 NMA1408 NMA1407 NMA1408 FALSE 0.347 54.000 0.000 1.000   NA
 142494 142495 NMA1409 NMA1410 NMA1409 cca TRUE 0.709 72.000 0.000 0.088   NA
 142495 142496 NMA1410 NMA1411 cca NMA1411 FALSE 0.247 223.000 0.000 NA   NA
 142496 142497 NMA1411 NMA1412 NMA1411 ruvB TRUE 0.565 82.000 0.000 NA   NA
 142500 142501 NMA1415 NMA1416 NMA1415 ribC TRUE 0.845 8.000 0.000 1.000   NA
 142501 142502 NMA1416 NMA1417 ribC NMA1417 FALSE 0.296 163.000 0.000 1.000 Y NA
 142503 142504 NMA1418 NMA1419 NMA1418 NMA1419 TRUE 1.000 -3.000 0.686 0.003 Y NA
 142506 397437 NMA1421 NMAt36 purM tRNA-Leu FALSE 0.117 520.000 0.000 NA   NA
 142508 142509 NMA1424 NMA1425 NMA1424 ribA TRUE 0.936 -7.000 0.000 NA   NA
 142509 2132942 NMA1425 NMA1427 ribA   FALSE 0.347 168.000 0.000 NA   NA
 2132942 142511 NMA1427 NMA1429   ribB FALSE 0.122 464.000 0.000 NA   NA
 2132943 2132944 NMA1430 NMA1432     FALSE 0.373 158.000 0.000 NA   NA
 2132944 142512 NMA1432 NMA1433   NMA1433 FALSE 0.187 286.000 0.000 NA   NA
 142513 142514 NMA1435 NMA1436 NMA1435 NMA1436 TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 142516 142517 NMA1438 NMA1439 NMA1438 NMA1439 FALSE 0.220 252.000 0.000 NA   NA
 142517 142518 NMA1439 NMA1440 NMA1439 thrC TRUE 0.564 73.000 0.000 NA   NA
 142518 142519 NMA1440 NMA1441 thrC NMA1441 TRUE 0.638 47.000 0.000 NA   NA
 142519 142520 NMA1441 NMA1442 NMA1441 fpr FALSE 0.308 188.000 0.000 NA   NA
 142522 142523 NMA1444 NMA1445 NMA1444 NMA1445 TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.050   NA
 142523 142524 NMA1445 NMA1446 NMA1445 NMA1446 TRUE 0.564 74.000 0.000 NA   NA
 142524 142525 NMA1446 NMA1447 NMA1446 NMA1447 FALSE 0.388 153.000 0.000 NA   NA
 142525 142526 NMA1447 NMA1448 NMA1447 radC TRUE 0.564 73.000 0.000 NA   NA
 142526 142527 NMA1448 NMA1449 radC gshA FALSE 0.238 123.000 0.000 1.000   NA
 142528 142529 NMA1450 NMA1451 leuC NMA1451 TRUE 0.539 97.000 0.000 NA   NA
 142529 142530 NMA1451 NMA1452 NMA1451 leuD TRUE 0.575 62.000 0.000 NA   NA
 142530 142531 NMA1452 NMA1453 leuD NMA1453 FALSE 0.065 175.000 0.000 1.000 N NA
 142531 2132945 NMA1453 NMA1454 NMA1453   TRUE 0.899 16.000 0.000 NA   NA
 2132945 142532 NMA1454 NMA1456   leuB TRUE 0.695 37.000 0.000 NA   NA
 142532 142533 NMA1456 NMA1457 leuB NMA1457 FALSE 0.365 163.000 0.000 NA   NA
 142533 142534 NMA1457 NMA1459 NMA1457 aspA FALSE 0.123 461.000 0.000 NA   NA
 142535 142536 NMA1460 NMA1461 NMA1460 NMA1461 TRUE 0.948 2.000 0.000 NA   NA
 142536 142537 NMA1461 NMA1462 NMA1461 NMA1462 FALSE 0.152 179.000 0.000 1.000   NA
 142538 142539 NMA1463 NMA1464 NMA1463 NMA1464 TRUE 0.750 32.000 0.000 NA   NA
 142539 142540 NMA1464 NMA1465 NMA1464 NMA1465 TRUE 0.548 93.000 0.000 NA   NA
 142541 2132946 NMA1466 NMA1467 NMA1466   TRUE 0.899 16.000 0.000 NA   NA
 2132946 142543 NMA1467 NMA1469   ppiA TRUE 0.484 116.000 0.000 NA   NA
 142543 142544 NMA1469 NMA1470 ppiA NMA1470 TRUE 0.573 65.000 0.000 NA   NA
 142544 142545 NMA1470 NMA1471 NMA1470 NMA1471 TRUE 0.984 -12.000 0.103 NA   NA
 142545 142546 NMA1471 NMA1472 NMA1471 NMA1472 FALSE 0.151 71.000 0.000 1.000 N NA
 142546 142547 NMA1472 NMA1473 NMA1472 NMA1473 FALSE 0.103 125.000 0.000 1.000 N NA
 142547 142548 NMA1473 NMA1474 NMA1473 NMA1474 TRUE 0.493 114.000 0.000 NA   NA
 142548 142549 NMA1474 NMA1475 NMA1474 NMA1475 TRUE 0.563 83.000 0.000 NA   NA
 142549 142550 NMA1475 NMA1476 NMA1475 NMA1476 FALSE 0.291 100.000 0.000 1.000   NA
 142551 142552 NMA1478 NMA1479 NMA1478 NMA1479 TRUE 0.994 11.000 0.244 NA   NA
 142552 142553 NMA1479 NMA1480 NMA1479 NMA1480 TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.006   NA
 142558 142559 NMA1485 NMA1486 gcr NMA1486 FALSE 0.364 211.000 0.000 NA Y NA
 142559 142560 NMA1486 NMA1487 NMA1486 NMA1487 TRUE 0.686 65.000 0.000 NA Y NA
 142561 142563 NMA1488 NMA1490 mltB NMA1490 FALSE 0.110 319.000 0.000 NA N NA
 142564 142565 NMA1491 NMA1492 mfd panD FALSE 0.082 149.000 0.000 1.000 N NA
 142565 142566 NMA1492 NMA1493 panD kdsA TRUE 0.416 22.000 0.000 1.000 N NA
 142566 142567 NMA1493 NMA1494 kdsA NMA1494 TRUE 0.907 15.000 0.000 NA   NA
 142567 142568 NMA1494 NMA1495 NMA1494 eno TRUE 0.630 48.000 0.000 NA   NA
 142568 142569 NMA1495 NMA1496 eno NMA1496 TRUE 0.981 14.000 0.241 1.000 N NA
 142570 142571 NMA1497 NMA1498 NMA1497 nrdB FALSE 0.298 198.000 0.046 1.000 N NA
 142571 142572 NMA1498 NMA1499 nrdB NMA1499 FALSE 0.330 61.000 0.000 1.000   NA
 142572 142573 NMA1499 NMA1500 NMA1499 NMA1500 TRUE 0.994 -7.000 0.150 0.049   NA
 142573 142574 NMA1500 NMA1501 NMA1500 nrdA FALSE 0.158 58.000 0.000 1.000 N NA
 142576 142577 NMA1504 NMA1505 plsC fpg FALSE 0.278 88.000 0.003 1.000 N NA
 142577 142578 NMA1505 NMA1506 fpg NMA1506 FALSE 0.358 52.000 0.000 1.000   NA
 142579 142580 NMA1507 NMA1508 NMA1507 NMA1508 FALSE 0.153 68.000 0.000 1.000 N NA
 142580 2132947 NMA1508 NMA1509 NMA1508   FALSE 0.116 544.000 0.000 NA   NA
 2132947 142581 NMA1509 NMA1514   cmk FALSE 0.229 247.000 0.000 NA   NA
 142581 142582 NMA1514 NMA1515 cmk rpsA TRUE 0.784 155.000 0.281 1.000 N NA
 142582 142583 NMA1515 NMA1516 rpsA hip TRUE 0.988 11.000 0.292 1.000 N NA
 142585 142586 NMA1518 NMA1519 adhC esd TRUE 0.993 9.000 0.327 1.000   NA
 142586 142587 NMA1519 NMA1520 esd NMA1520 FALSE 0.135 393.000 0.000 NA   NA
 142587 142588 NMA1520 NMA1521 NMA1520 ndk TRUE 0.577 59.000 0.000 NA   NA
 142588 142589 NMA1521 NMA1522 ndk NMA1522 TRUE 0.716 144.000 0.156 1.000   NA
 142589 142590 NMA1522 NMA1523 NMA1522 NMA1523 TRUE 0.976 3.000 0.086 1.000   NA
 142590 142591 NMA1523 NMA1524 NMA1523 NMA1524 TRUE 0.769 16.000 0.005 1.000 N NA
 142592 142593 NMA1525 NMA1526 clpP tig TRUE 0.953 96.000 0.351 1.000 Y NA
 142593 142594 NMA1526 NMA1527 tig NMA1527 FALSE 0.049 205.000 0.000 1.000 N NA
 142597 142598 NMA1531 NMA1532 NMA1531 pss TRUE 0.564 74.000 0.000 NA   NA
 142598 142599 NMA1532 NMA1533 pss NMA1533 TRUE 0.869 1.000 0.000 1.000   NA
 142600 142601 NMA1534 NMA1535 rplI rpsR TRUE 0.999 17.000 0.499 0.024 Y NA
 142601 142602 NMA1535 NMA1536 rpsR priB TRUE 0.972 7.000 0.128 1.000 N NA
 142602 142603 NMA1536 NMA1537 priB rpsF TRUE 0.975 1.000 0.122 1.000 N NA
 142603 142604 NMA1537 NMA1538 rpsF trxB FALSE 0.077 156.000 0.000 1.000 N NA
 142605 142606 NMA1539 NMA1540 NMA1539 uvrC FALSE 0.163 55.000 0.000 1.000 N NA
 142606 142607 NMA1540 NMA1541 uvrC NMA1541 FALSE 0.099 243.000 0.000 1.000   NA
 142607 142608 NMA1541 NMA1542 NMA1541 NMA1542 FALSE 0.242 122.000 0.000 1.000   NA
 142608 142609 NMA1542 NMA1543 NMA1542 NMA1543 FALSE 0.279 203.000 0.000 NA   NA
 142610 142611 NMA1544 NMA1545 NMA1544 uvrB FALSE 0.324 68.000 0.000 1.000   NA
 142611 142612 NMA1545 NMA1546 uvrB NMA1546 FALSE 0.025 329.000 0.000 1.000 N NA
 142612 142613 NMA1546 NMA1547 NMA1546 NMA1547 TRUE 0.625 120.000 0.000 0.025 N NA
 142615 142616 NMA1549 NMA1550 NMA1549 NMA1550 TRUE 0.948 2.000 0.000 NA   NA
 142616 142617 NMA1550 NMA1551 NMA1550 NMA1551 TRUE 0.993 -7.000 0.263 NA N NA
 142618 142619 NMA1552 NMA1553 NMA1552 proS FALSE 0.156 64.000 0.000 1.000 N NA
 142620 142621 NMA1554 NMA1555 aceE aceF TRUE 0.565 150.000 0.031 1.000 Y NA
 142621 142622 NMA1555 NMA1556 aceF lpdA TRUE 0.969 78.000 0.463 1.000 Y NA
 142623 142624 NMA1557 NMA1558 NMA1557 NMA1558 TRUE 0.424 137.000 0.000 NA   NA
 142624 142625 NMA1558 NMA1559 NMA1558 NMA1559 FALSE 0.037 259.000 0.000 1.000 N NA
 142626 142627 NMA1560 NMA1561 NMA1560 NMA1561 TRUE 0.777 40.000 0.007 NA   NA
 142627 142628 NMA1561 NMA1562 NMA1561 NMA1562 FALSE 0.277 204.000 0.000 NA   NA
 142628 142629 NMA1562 NMA1563 NMA1562 NMA1563 FALSE 0.151 348.000 0.000 NA   NA
 142629 142630 NMA1563 NMA1564 NMA1563 NMA1564 FALSE 0.102 756.000 0.000 NA   NA
 142631 142632 NMA1565 NMA1566 NMA1565 NMA1566 TRUE 0.910 5.000 0.000 NA N NA
 142633 142634 NMA1567 NMA1568 gatC gatA TRUE 0.997 63.000 0.643 0.002 Y NA
 142634 142635 NMA1568 NMA1569 gatA NMA1569 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142635 142636 NMA1569 NMA1570 NMA1569 gatB TRUE 0.718 43.000 0.002 NA   NA
 142636 142637 NMA1570 NMA1571 gatB NMA1571 FALSE 0.144 92.000 0.000 1.000 N NA
 142640 142641 NMA1574 NMA1575 NMA1574 xseA FALSE 0.035 1213.000 0.000 1.000   NA
 142647 142648 NMA1581 NMA1582 NMA1581 NMA1582 TRUE 0.561 85.000 0.000 NA   NA
 142652 142653 NMA1586 NMA1587 rbfA NMA1587 TRUE 0.931 -10.000 0.000 NA   NA
 142653 142654 NMA1587 NMA1588 NMA1587 truB TRUE 0.578 58.000 0.000 NA   NA
 142654 142655 NMA1588 NMA1589 truB NMA1589 FALSE 0.166 320.000 0.000 NA   NA
 142655 142657 NMA1589 NMA1591 NMA1589 NMA1591 TRUE 0.916 -52.000 0.000 NA   NA
 142659 142660 NMA1593 NMA1594 NMA1593 NMA1594 TRUE 0.909 29.000 0.160 1.000 N NA
 142660 142662 NMA1594 NMA1596 NMA1594 NMA1596 TRUE 0.762 261.000 0.448 1.000 N NA
 142662 142663 NMA1596 NMA1597 NMA1596 NMA1597 TRUE 0.988 87.000 0.359 0.002   NA
 142663 142664 NMA1597 NMA1598 NMA1597 hscB TRUE 0.837 263.000 0.500 1.000   NA
 142664 142665 NMA1598 NMA1599 hscB gyrA FALSE 0.138 98.000 0.000 1.000 N NA
 142665 142666 NMA1599 NMA1600 gyrA NMA1600 TRUE 0.493 157.000 0.000 NA Y NA
 142666 142667 NMA1600 NMA1601 NMA1600 NMA1601 FALSE 0.279 203.000 0.000 NA   NA
 142671 142672 NMA1603 NMA1604 NMA1603 pgi1 TRUE 0.915 14.000 0.000 NA   NA
 142672 142673 NMA1604 NMA1605 pgi1 NMA1605 FALSE 0.108 121.000 0.000 1.000 N NA
 142673 142674 NMA1605 NMA1607 NMA1605 glk FALSE 0.180 50.000 0.000 1.000 N NA
 142674 142675 NMA1607 NMA1608 glk pgl TRUE 0.981 -19.000 0.117 1.000 Y NA
 142675 142676 NMA1608 NMA1609 pgl zwf FALSE 0.275 280.000 0.011 1.000 Y NA
 142677 142678 NMA1610 NMA1611 edd eda FALSE 0.258 181.000 0.000 1.000 Y NA
 142681 142683 NMA1614 NMA1616 mutY NMA1616 FALSE 0.365 163.000 0.000 NA   NA
 142683 142684 NMA1616 NMA1617 NMA1616 sodC TRUE 0.564 72.000 0.000 NA   NA
 142685 142687 NMA1618 NMA1620 NMA1618 NMA1620 FALSE 0.106 224.000 0.000 1.000   NA
 142687 142688 NMA1620 NMA1621 NMA1620 NMA1621 FALSE 0.064 800.000 0.000 NA N NA
 142689 142690 NMA1622 NMA1623 NMA1622 NMA1623 TRUE 0.930 11.000 0.000 NA   NA
 142690 142691 NMA1623 NMA1624 NMA1623 NMA1624 TRUE 0.716 35.000 0.000 NA   NA
 142691 142692 NMA1624 NMA1625 NMA1624 NMA1625 TRUE 0.928 -13.000 0.000 NA   NA
 142692 142693 NMA1625 NMA1626 NMA1625 NMA1626 TRUE 0.587 55.000 0.000 NA   NA
 142694 142695 NMA1627 NMA1628 pepN NMA1628 FALSE 0.093 136.000 0.000 1.000 N NA
 142695 142697 NMA1628 NMA1630 NMA1628 NMA1630 FALSE 0.015 749.000 0.000 1.000 N NA
 142697 142698 NMA1630 NMA1631 NMA1630 ruvC FALSE 0.177 51.000 0.000 1.000 N NA
 142698 142699 NMA1631 NMA1632 ruvC fis TRUE 0.928 3.000 0.000 1.000 Y NA
 142699 142700 NMA1632 NMA1633 fis NMA1633 TRUE 0.906 30.000 0.161 1.000 N NA
 142701 142702 NMA1634 NMA1635 NMA1634 NMA1635 FALSE 0.044 575.000 0.000 1.000   NA
 142702 142703 NMA1635 NMA1636 NMA1635 NMA1636 TRUE 0.559 30.000 0.000 1.000   NA
 142705 142706 NMA1638 NMA1639 lysS NMA1639 FALSE 0.078 155.000 0.000 1.000 N NA
 142708 142709 NMA1641 NMA1642 NMA1641 porA FALSE 0.016 613.000 0.000 1.000 N NA
 142709 142710 NMA1642 NMA1643 porA greA FALSE 0.013 3014.000 0.000 1.000 N NA
 142712 142713 NMA1645 NMA1646 NMA1645 NMA1646 FALSE 0.181 209.000 0.000 NA N NA
 142713 142714 NMA1646 NMA1647 NMA1646 NMA1647 FALSE 0.157 61.000 0.000 1.000 N NA
 142715 142716 NMA1648 NMA1649 NMA1648 NMA1649 TRUE 0.993 -3.000 0.194 NA   NA
 142716 142717 NMA1649 NMA1650 NMA1649 NMA1650 TRUE 1.000 -3.000 0.639 0.002   NA
 142718 142719 NMA1651 NMA1652 purE NMA1652 FALSE 0.382 48.000 0.000 1.000   NA
 142719 142720 NMA1652 NMA1653 NMA1652 NMA1653 TRUE 0.868 0.000 0.000 1.000   NA
 142722 142723 NMA1655 NMA1656 mutL dnaZX TRUE 0.774 95.000 0.000 0.086 Y NA
 142723 142724 NMA1656 NMA1657 dnaZX NMA1657 TRUE 0.972 80.000 0.411 NA   NA
 142726 142727 NMA1659 NMA1660 aroD rep TRUE 0.458 20.000 0.000 1.000 N NA
 142728 142730 NMA1661 NMA1663 NMA1661 NMA1663 FALSE 0.097 248.000 0.000 1.000   NA
 397415 397416 NMAt37 NMAt38 tRNA-Arg tRNA-Glu TRUE 0.883 18.000 0.000 NA   NA
 397416 142733 NMAt38 NMA1666 tRNA-Glu NMA1666 FALSE 0.114 559.000 0.000 NA   NA
 142734 142735 NMA1667 NMA1668 NMA1667 NMA1668 TRUE 0.978 3.000 0.030 NA   NA
 142736 142737 NMA1669 NMA1670 tkt fumC FALSE 0.089 141.000 0.000 1.000 N NA
 142738 142739 NMA1671 NMA1672 NMA1671 ssb FALSE 0.022 372.000 0.000 1.000 N NA
 142739 142740 NMA1672 NMA1673 ssb NMA1673 TRUE 0.926 4.000 0.022 1.000 N NA
 142740 142741 NMA1673 NMA1674 NMA1673 NMA1674 TRUE 0.509 108.000 0.000 NA   NA
 142741 142742 NMA1674 NMA1675 NMA1674 NMA1675 FALSE 0.097 910.000 0.000 NA   NA
 142742 2132954 NMA1675 NMA1676 NMA1675 opaD FALSE 0.104 703.000 0.000 NA   NA
 142743 142745 NMA1677 NMA1679 NMA1677 ppx/gppA TRUE 0.479 117.000 0.000 NA   NA
 142747 142748 NMA1681 NMA1682 NMA1681 trpS TRUE 0.941 6.000 0.000 NA   NA
 142750 142751 NMA1684 NMA1685 NMA1684 NMA1685 FALSE 0.311 89.000 0.000 1.000   NA
 142754 142755 NMA1688 NMA1689 NMA1688 NMA1689 FALSE 0.324 68.000 0.000 1.000   NA
 142755 142757 NMA1689 NMA1691 NMA1689 NMA1691 FALSE 0.136 388.000 0.000 NA   NA
 142758 142759 NMA1692 NMA1693 NMA1692 surE FALSE 0.284 103.000 0.000 1.000   NA
 142759 142760 NMA1693 NMA1694 surE NMA1694 TRUE 0.748 17.000 0.000 1.000   NA
 142760 142761 NMA1694 NMA1695 NMA1694 NMA1695 FALSE 0.141 368.000 0.000 NA   NA
 142761 142762 NMA1695 NMA1696 NMA1695 gabD TRUE 0.507 109.000 0.000 NA   NA
 142762 142763 NMA1696 NMA1697 gabD NMA1697 FALSE 0.105 664.000 0.000 NA   NA
 142764 142766 NMA1698 NMA1700 NMA1698 NMA1700 FALSE 0.116 1737.000 0.000 0.062 N NA
 142767 142768 NMA1701 NMA1702 lysC rph FALSE 0.051 202.000 0.000 1.000 N NA
 142768 142769 NMA1702 NMA1703 rph NMA1703 FALSE 0.151 82.000 0.000 1.000 N NA
 142770 142771 NMA1704 NMA1705 NMA1704 NMA1705 FALSE 0.231 245.000 0.000 NA   NA
 142771 142772 NMA1705 NMA1706 NMA1705 pncB TRUE 0.931 -10.000 0.000 NA   NA
 142772 142773 NMA1706 NMA1707 pncB argS FALSE 0.144 92.000 0.000 1.000 N NA
 142773 142774 NMA1707 NMA1708 argS NMA1708 FALSE 0.017 554.000 0.000 1.000 N NA
 142775 142776 NMA1709 NMA1710 NMA1709 NMA1710 FALSE 0.063 179.000 0.000 1.000 N NA
 142776 142777 NMA1710 NMA1711 NMA1710 rpiA FALSE 0.228 39.000 0.000 1.000 N NA
 142777 142778 NMA1711 NMA1712 rpiA NMA1712 FALSE 0.320 77.000 0.005 1.000 N NA
 142778 142779 NMA1712 NMA1713 NMA1712 NMA1713 TRUE 0.985 32.000 0.419 1.000 Y NA
 142779 142780 NMA1713 NMA1714 NMA1713 dnaQ TRUE 0.858 -3.000 0.004 1.000 N NA
 142780 142781 NMA1714 NMA1715 dnaQ NMA1715 FALSE 0.377 156.000 0.000 NA   NA
 142781 142782 NMA1715 NMA1716 NMA1715 NMA1716 TRUE 0.931 -10.000 0.000 NA   NA
 142782 142783 NMA1716 NMA1717 NMA1716 NMA1717 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142787 142788 NMA1721 NMA1722 NMA1721 NMA1722 FALSE 0.152 69.000 0.000 1.000 N NA
 142789 142790 NMA1723 NMA1724 NMA1723 NMA1724 TRUE 0.578 58.000 0.000 NA   NA
 142791 142792 NMA1725 NMA1726 NMA1725 smpB FALSE 0.019 461.000 0.000 1.000 N NA
 142792 142793 NMA1726 NMA1727 smpB rfaF FALSE 0.184 49.000 0.000 1.000 N NA
 142793 397436 NMA1727 NMAt39 rfaF tRNA-Asn TRUE 0.442 131.000 0.000 NA   NA
 397436 142794 NMAt39 NMA1728 tRNA-Asn NMA1728 FALSE 0.301 191.000 0.000 NA   NA
 142796 142797 NMA1730 NMA1731 dapE NMA1731 TRUE 0.493 114.000 0.000 NA   NA
 142797 142798 NMA1731 NMA1732 NMA1731 NMA1732 TRUE 0.724 34.000 0.000 NA   NA
 142798 142799 NMA1732 NMA1733 NMA1732 NMA1733 TRUE 0.543 95.000 0.000 NA   NA
 142801 142802 NMA1735 NMA1736 secA dnaG FALSE 0.085 145.000 0.000 1.000 N NA
 142802 142803 NMA1736 NMA1737 dnaG rpoD TRUE 0.745 187.000 0.299 1.000 N NA
 142803 142804 NMA1737 NMA1738 rpoD NMA1738 FALSE 0.068 168.000 0.000 1.000 N NA
 142805 142806 NMA1739 NMA1740 lbpA lbpB TRUE 0.861 -3.000 0.000 1.000   NA
 142806 142807 NMA1740 NMA1741 lbpB NMA1741 FALSE 0.086 2541.000 0.000 NA   NA
 142807 142808 NMA1741 NMA1742 NMA1741 pyrG FALSE 0.244 226.000 0.000 NA   NA
 142808 142809 NMA1742 NMA1743 pyrG fadD FALSE 0.121 112.000 0.000 1.000 N NA
 142809 142810 NMA1743 NMA1744 fadD trmU FALSE 0.151 71.000 0.000 1.000 N NA
 142810 142811 NMA1744 NMA1745 trmU NMA1745 TRUE 0.567 77.000 0.000 NA   NA
 142811 142812 NMA1745 NMA1746 NMA1745 dgk TRUE 0.424 137.000 0.000 NA   NA
 142812 142813 NMA1746 NMA1747 dgk gshB FALSE 0.027 312.000 0.000 1.000 N NA
 142813 142814 NMA1747 NMA1748 gshB glnS TRUE 0.780 93.000 0.000 0.085 Y NA
 142814 142815 NMA1748 NMA1749 glnS glpR FALSE 0.153 79.000 0.000 1.000 N NA
 142815 142816 NMA1749 NMA1750 glpR NMA1750 TRUE 0.659 43.000 0.000 NA   NA
 142816 142817 NMA1750 NMA1751 NMA1750 NMA1751 FALSE 0.395 149.000 0.000 NA   NA
 142817 142819 NMA1751 NMA1753 NMA1751 NMA1753 FALSE 0.017 569.000 0.000 1.000 N NA
 142819 142820 NMA1753 NMA1754 NMA1753 NMA1754 FALSE 0.305 190.000 0.000 NA   NA
 142820 142821 NMA1754 NMA1755 NMA1754 purN TRUE 0.899 16.000 0.000 NA   NA
 142821 142822 NMA1755 NMA1756 purN NMA1756 FALSE 0.126 107.000 0.000 1.000 N NA
 142822 142823 NMA1756 NMA1757 NMA1756 holC FALSE 0.037 259.000 0.000 1.000 N NA
 142823 142824 NMA1757 NMA1758 holC pepA TRUE 0.949 63.000 0.494 1.000 N NA
 142825 142826 NMA1759 NMA1760 NMA1759 NMA1760 TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.048   NA
 142826 142827 NMA1760 NMA1761 NMA1760 acnB FALSE 0.070 310.000 0.000 1.000   NA
 142827 142828 NMA1761 NMA1762 acnB argF FALSE 0.088 142.000 0.000 1.000 N NA
 142829 142830 NMA1763 NMA1764 ilvC NMA1764 FALSE 0.324 80.000 0.000 1.000   NA
 142830 142831 NMA1764 NMA1765 NMA1764 ilvH FALSE 0.326 67.000 0.000 1.000   NA
 142831 142832 NMA1765 NMA1766 ilvH ilvI TRUE 0.999 11.000 0.371 0.001 Y NA
 142832 397435 NMA1766 NMAt40 ilvI tRNA-Leu FALSE 0.100 760.000 0.000 NA   NA
 142833 142834 NMA1767 NMA1768 NMA1767 hisG FALSE 0.324 79.000 0.000 1.000   NA
 142834 142835 NMA1768 NMA1769 hisG NMA1769 TRUE 0.518 104.000 0.000 NA   NA
 142835 142836 NMA1769 NMA1770 NMA1769 hisD TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142836 142837 NMA1770 NMA1771 hisD hisC TRUE 0.981 46.000 0.165 0.005 Y NA
 142837 142838 NMA1771 NMA1772 hisC hisB TRUE 0.973 180.000 0.341 0.005 Y NA
 142838 142839 NMA1772 NMA1773 hisB NMA1773 FALSE 0.140 95.000 0.000 1.000 N NA
 142839 142840 NMA1773 NMA1774 NMA1773 NMA1774 FALSE 0.032 278.000 0.000 1.000 N NA
 142840 142841 NMA1774 NMA1775 NMA1774 NMA1775 FALSE 0.307 31.000 0.000 1.000 N NA
 142841 142843 NMA1775 NMA1777 NMA1775 NMA1777 FALSE 0.084 269.000 0.000 1.000   NA
 142844 397434 NMA1778 NMAt41 NMA1778 tRNA-Leu TRUE 0.518 104.000 0.000 NA   NA
 397434 397433 NMAt41 NMAt42 tRNA-Leu tRNA-Cys TRUE 0.521 103.000 0.000 NA   NA
 397433 397432 NMAt42 NMAt43 tRNA-Cys tRNA-Gly TRUE 0.812 26.000 0.000 NA   NA
 397432 397431 NMAt43 NMAt44 tRNA-Gly tRNA-Gly TRUE 0.838 22.000 0.000 NA   NA
 397431 397430 NMAt44 NMAt45 tRNA-Gly tRNA-Gly TRUE 0.827 24.000 0.000 NA   NA
 397430 397429 NMAt45 NMAt46 tRNA-Gly tRNA-Gly TRUE 0.812 26.000 0.000 NA   NA
 397429 142845 NMAt46 NMA1779 tRNA-Gly pgsA TRUE 0.568 80.000 0.000 NA   NA
 142845 142847 NMA1779 NMA1781 pgsA NMA1781 FALSE 0.243 227.000 0.000 NA   NA
 142847 142848 NMA1781 NMA1782 NMA1781 NMA1782 FALSE 0.190 282.000 0.000 NA   NA
 142853 142854 NMA1788 NMA1789 alaS NMA1789 TRUE 0.575 62.000 0.000 NA   NA
 142854 142855 NMA1789 NMA1791 NMA1789 NMA1791 FALSE 0.104 709.000 0.000 NA   NA
 142855 142856 NMA1791 NMA1792 NMA1791 NMA1792 FALSE 0.014 1015.000 0.000 1.000 N NA
 142856 142857 NMA1792 NMA1793 NMA1792 NMA1793 TRUE 0.926 12.000 0.000 NA   NA
 142857 142858 NMA1793 NMA1794 NMA1793 NMA1794 TRUE 0.945 4.000 0.000 NA   NA
 142858 142859 NMA1794 NMA1795 NMA1794 NMA1795 FALSE 0.233 238.000 0.000 NA   NA
 142859 142860 NMA1795 NMA1796 NMA1795 NMA1796 TRUE 0.798 28.000 0.000 NA   NA
 142860 142861 NMA1796 NMA1797 NMA1796 tspB FALSE 0.157 332.000 0.000 NA   NA
 142861 142862 NMA1797 NMA1798 tspB NMA1798 FALSE 0.178 303.000 0.000 NA   NA
 142862 142863 NMA1798 NMA1799 NMA1798 NMA1799 TRUE 0.948 1.000 0.000 NA   NA
 142863 142864 NMA1799 NMA1800 NMA1799 NMA1800 FALSE 0.256 215.000 0.000 NA   NA
 142866 142867 NMA1802 NMA1803 parC NMA1803 TRUE 0.919 20.000 0.003 0.084 N NA
 142867 142868 NMA1803 NMA1805 NMA1803 NMA1805 FALSE 0.358 52.000 0.000 1.000   NA
 142868 142869 NMA1805 NMA1806 NMA1805 NMA1806 TRUE 0.518 104.000 0.000 NA   NA
 142871 142872 NMA1808 NMA1809 metZ NMA1809 FALSE 0.180 298.000 0.000 NA   NA
 142873 142874 NMA1810 NMA1811 NMA1810 hisJ TRUE 0.604 52.000 0.000 NA   NA
 142874 142875 NMA1811 NMA1812 hisJ fumA FALSE 0.057 190.000 0.000 1.000 N NA
 142875 142876 NMA1812 NMA1813 fumA trkA FALSE 0.138 98.000 0.000 1.000 N NA
 142876 142877 NMA1813 NMA1814 trkA NMA1814 FALSE 0.029 304.000 0.000 1.000 N NA
 142877 397417 NMA1814 NMAt47 NMA1814 tRNA-Glu TRUE 0.424 137.000 0.000 NA   NA
 397417 142878 NMAt47 NMA1815 tRNA-Glu thiD FALSE 0.090 1302.000 0.000 NA   NA
 142880 142881 NMA1817 NMA1818 rnhA NMA1818 FALSE 0.013 1302.000 0.000 1.000 N NA
 142881 142882 NMA1818 NMA1819 NMA1818 NMA1819 TRUE 0.558 40.000 0.000 NA N NA
 142883 142884 NMA1820 NMA1821 gpxA NMA1821 FALSE 0.091 260.000 0.000 1.000   NA
 142884 142885 NMA1821 NMA1822 NMA1821 NMA1822 FALSE 0.151 348.000 0.000 NA   NA
 142885 142886 NMA1822 NMA1823 NMA1822 NMA1823 TRUE 0.948 1.000 0.000 NA   NA
 142886 142887 NMA1823 NMA1824 NMA1823 NMA1824 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142887 142888 NMA1824 NMA1825 NMA1824 NMA1825 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 142888 142889 NMA1825 NMA1826 NMA1825 NMA1826 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142889 142890 NMA1826 NMA1827 NMA1826 NMA1827 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 142890 142891 NMA1827 NMA1828 NMA1827 NMA1828 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142891 142892 NMA1828 NMA1829 NMA1828 NMA1829 TRUE 0.969 61.000 0.375 NA   NA
 142892 142893 NMA1829 NMA1830 NMA1829 NMA1830 TRUE 0.999 1.000 0.714 NA   NA
 142893 142894 NMA1830 NMA1831 NMA1830 NMA1831 TRUE 0.983 -16.000 0.095 NA   NA
 142894 142895 NMA1831 NMA1832 NMA1831 NMA1832 TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 142895 142896 NMA1832 NMA1833 NMA1832 NMA1833 TRUE 0.451 128.000 0.000 NA   NA
 142896 142897 NMA1833 NMA1834 NMA1833 NMA1834 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142897 142898 NMA1834 NMA1835 NMA1834 NMA1835 TRUE 0.917 -42.000 0.000 NA   NA
 142898 142899 NMA1835 NMA1836 NMA1835 NMA1836 TRUE 0.447 129.000 0.000 NA   NA
 142899 142900 NMA1836 NMA1837 NMA1836 NMA1837 FALSE 0.360 164.000 0.000 NA   NA
 142900 142901 NMA1837 NMA1838 NMA1837 NMA1838 TRUE 0.969 -13.000 0.094 1.000   NA
 142901 142902 NMA1838 NMA1840 NMA1838 NMA1840 FALSE 0.334 176.000 0.000 NA   NA
 142902 142903 NMA1840 NMA1841 NMA1840 NMA1841 TRUE 0.999 14.000 0.714 NA   NA
 142903 142904 NMA1841 NMA1842 NMA1841 NMA1842 TRUE 0.998 0.000 0.429 NA   NA
 142904 142905 NMA1842 NMA1843 NMA1842 NMA1843 TRUE 0.996 -3.000 0.265 NA   NA
 142905 142906 NMA1843 NMA1844 NMA1843 NMA1844 TRUE 0.998 -16.000 0.500 NA   NA
 142906 142907 NMA1844 NMA1845 NMA1844 NMA1845 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142907 142908 NMA1845 NMA1847 NMA1845 NMA1847 TRUE 0.689 38.000 0.000 NA   NA
 142908 142909 NMA1847 NMA1848 NMA1847 NMA1848 TRUE 0.987 22.000 0.295 NA   NA
 142909 142910 NMA1848 NMA1849 NMA1848 NMA1849 TRUE 0.514 209.000 0.045 NA   NA
 142910 142911 NMA1849 NMA1850 NMA1849 NMA1850 TRUE 0.865 104.000 0.133 NA   NA
 142911 142912 NMA1850 NMA1851 NMA1850 NMA1851 TRUE 0.936 -7.000 0.000 NA   NA
 142912 142913 NMA1851 NMA1852 NMA1851 NMA1852 TRUE 0.568 79.000 0.000 NA   NA
 142915 142916 NMA1854 NMA1855 NMA1854 NMA1855 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 142916 142917 NMA1855 NMA1856 NMA1855 NMA1856 TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 142917 142918 NMA1856 NMA1857 NMA1856 NMA1857 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142918 142919 NMA1857 NMA1858 NMA1857 NMA1858 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142921 142922 NMA1860 NMA1861 NMA1860 NMA1861 TRUE 0.860 20.000 0.000 NA   NA
 142922 142923 NMA1861 NMA1862 NMA1861 NMA1862 TRUE 0.919 -28.000 0.000 NA   NA
 142923 142924 NMA1862 NMA1863 NMA1862 NMA1863 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 142924 142925 NMA1863 NMA1864 NMA1863 NMA1864 FALSE 0.272 206.000 0.000 NA   NA
 142925 142926 NMA1864 NMA1865 NMA1864 NMA1865 TRUE 0.438 132.000 0.000 NA   NA
 142926 142927 NMA1865 NMA1866 NMA1865 NMA1866 TRUE 0.926 12.000 0.000 NA   NA
 142927 142928 NMA1866 NMA1867 NMA1866 NMA1867 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142928 142929 NMA1867 NMA1868 NMA1867 hupB2 TRUE 0.763 31.000 0.000 NA   NA
 142929 142930 NMA1868 NMA1869 hupB2 NMA1869 TRUE 0.621 49.000 0.000 NA   NA
 142930 142931 NMA1869 NMA1870 NMA1869 NMA1870 TRUE 0.948 1.000 0.000 NA   NA
 142931 142932 NMA1870 NMA1871 NMA1870 NMA1871 TRUE 0.941 6.000 0.000 NA   NA
 142932 142933 NMA1871 NMA1872 NMA1871 NMA1872 TRUE 0.936 -7.000 0.000 NA   NA
 142933 142934 NMA1872 NMA1873 NMA1872 NMA1873 TRUE 0.919 -28.000 0.000 NA   NA
 142934 142935 NMA1873 NMA1874 NMA1873 NMA1874 TRUE 0.926 -16.000 0.000 NA   NA
 142935 142936 NMA1874 NMA1875 NMA1874 NMA1875 TRUE 0.474 119.000 0.000 NA   NA
 142936 142937 NMA1875 NMA1876 NMA1875 NMA1876 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 142937 142938 NMA1876 NMA1877 NMA1876 NMA1877 TRUE 0.924 -19.000 0.000 NA   NA
 142938 142939 NMA1877 NMA1878 NMA1877 NMA1878 TRUE 0.899 16.000 0.000 NA   NA
 142939 142940 NMA1878 NMA1879 NMA1878 NMA1879 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 142940 142941 NMA1879 NMA1880 NMA1879 NMA1880 TRUE 0.931 -10.000 0.000 NA   NA
 142941 142942 NMA1880 NMA1881 NMA1880 NMA1881 TRUE 0.566 76.000 0.000 NA   NA
 142942 142943 NMA1881 NMA1882 NMA1881 NMA1882 TRUE 0.418 42.000 0.000 1.000   NA
 142943 142944 NMA1882 NMA1883 NMA1882 NMA1883 FALSE 0.324 78.000 0.000 1.000   NA
 142946 142947 NMA1885 NMA1886 NMA1885 nor TRUE 0.945 4.000 0.000 NA   NA
 142948 142949 NMA1887 NMA1888 aniA NMA1888 TRUE 0.807 180.000 0.194 NA   NA
 142949 2132955 NMA1888 NMA1890 NMA1888 opaB FALSE 0.085 2746.000 0.000 NA   NA
 142950 142951 NMA1891 NMA1892 NMA1891 NMA1892 FALSE 0.322 76.000 0.000 1.000   NA
 142951 142952 NMA1892 NMA1894 NMA1892 serC FALSE 0.080 281.000 0.000 1.000   NA
 142953 142954 NMA1895 NMA1896 NMA1895 nusA TRUE 0.999 13.000 0.759 NA   NA
 142954 142955 NMA1896 NMA1897 nusA infB TRUE 0.991 12.000 0.342 1.000 N NA
 142956 142957 NMA1898 NMA1899 NMA1898 NMA1899 TRUE 0.993 62.000 0.904 NA   NA
 142961 142963 NMA1903 NMA1905 NMA1903 NMA1905 FALSE 0.017 580.000 0.000 1.000 N NA
 142966 142967 NMA1907 NMA1908 NMA1907 NMA1908 FALSE 0.409 143.000 0.000 NA   NA
 142967 142968 NMA1908 NMA1909 NMA1908 NMA1909 TRUE 0.998 15.000 0.569 NA   NA
 142968 142969 NMA1909 NMA1911 NMA1909 NMA1911 TRUE 0.454 126.000 0.000 NA   NA
 142969 142970 NMA1911 NMA1912 NMA1911 NMA1912 FALSE 0.192 281.000 0.000 NA   NA
 142971 142972 NMA1913 NMA1914 NMA1913 NMA1914 TRUE 0.500 112.000 0.000 NA   NA
 142973 2132956 NMA1915 NMAr07 NMA1915   TRUE 0.706 36.000 0.000 NA   NA
 2132956 2132957 NMAr07 NMAr08     TRUE 0.545 94.000 0.000 NA   NA
 2132957 397428 NMAr08 NMAt48   tRNA-Ala FALSE 0.132 396.000 0.000 NA   NA
 397428 397427 NMAt48 NMAt49 tRNA-Ala tRNA-Ile TRUE 0.939 7.000 0.000 NA   NA
 397427 2132958 NMAt49 NMAr09 tRNA-Ile   TRUE 0.535 99.000 0.000 NA   NA
 142975 142976 NMA1917 NMA1918 spoT rpoZ TRUE 0.936 93.000 0.291 1.000 Y NA
 142976 142977 NMA1918 NMA1919 rpoZ gmk TRUE 0.946 59.000 0.471 1.000 N NA
 142981 142982 NMA1923 NMA1924 NMA1923 NMA1924 TRUE 0.432 134.000 0.000 NA   NA
 2132959 142983 NMA1925 NMA1927 hmbR hemO FALSE 0.336 175.000 0.000 NA   NA
 142984 142985 NMA1928 NMA1929 NMA1928 NMA1929 TRUE 0.936 -7.000 0.000 NA   NA
 142985 142986 NMA1929 NMA1930 NMA1929 NMA1930 TRUE 0.999 0.000 0.531 NA   NA
 142986 142987 NMA1930 NMA1931 NMA1930 tag TRUE 0.945 4.000 0.000 NA   NA
 142987 142988 NMA1931 NMA1932 tag NMA1932 TRUE 0.649 -10.000 0.000 1.000 N NA
 142988 142989 NMA1932 NMA1933 NMA1932 NMA1933 FALSE 0.197 275.000 0.000 NA   NA
 142989 142990 NMA1933 NMA1934 NMA1933 gcvP TRUE 0.763 31.000 0.000 NA   NA
 142993 142994 NMA1937 NMA1938 tyrB trmA TRUE 0.775 21.000 0.012 1.000 N NA
 142995 142996 NMA1939 NMA1940 aroC NMA1940 TRUE 0.550 92.000 0.000 NA   NA
 142997 142998 NMA1941 NMA1942 parE NMA1942 TRUE 0.612 67.000 0.005 1.000 Y NA
 143000 143001 NMA1944 NMA1945 ldhA prfA FALSE 0.103 125.000 0.000 1.000 N NA
 143001 143002 NMA1945 NMA1946 prfA NMA1946 FALSE 0.397 104.000 0.000 NA N NA
 143002 143003 NMA1946 NMA1947 NMA1946 ans TRUE 0.558 40.000 0.000 NA N NA
 143003 143004 NMA1947 NMA1948 ans NMA1948 TRUE 0.570 67.000 0.000 NA   NA
 143004 143005 NMA1948 NMA1949 NMA1948 NMA1949 TRUE 0.555 88.000 0.000 NA   NA
 143005 143006 NMA1949 NMA1950 NMA1949 dhpS TRUE 0.809 130.000 0.260 1.000 N NA
 143008 143009 NMA1952 NMA1953 NMA1952 NMA1953 TRUE 0.860 20.000 0.000 NA   NA
 143009 143010 NMA1953 NMA1954 NMA1953 NMA1954 TRUE 0.939 7.000 0.000 NA   NA
 143010 143011 NMA1954 NMA1955 NMA1954 NMA1955 FALSE 0.180 298.000 0.000 NA   NA
 143012 143013 NMA1956 NMA1957 NMA1956 fabF2 FALSE 0.185 207.000 0.000 NA N NA
 143013 397419 NMA1957 NMAt51 fabF2 tRNA-Met TRUE 0.593 54.000 0.000 NA   NA
 397419 143014 NMAt51 NMA1958 tRNA-Met lgtF TRUE 0.566 69.000 0.000 NA   NA
 143014 143015 NMA1958 NMA1959 lgtF rfaK TRUE 0.967 1.000 0.000 NA Y NA
 143015 143016 NMA1959 NMA1960 rfaK NMA1960 TRUE 0.682 39.000 0.000 NA   NA
 143016 143017 NMA1960 NMA1961 NMA1960 NMA1961 FALSE 0.332 178.000 0.000 NA   NA
 143018 143019 NMA1962 NMA1963 NMA1962 thyA TRUE 0.842 9.000 0.000 1.000   NA
 143024 143025 NMA1968 NMA1969 mtrE mtrD TRUE 0.980 55.000 0.368 0.022 N NA
 143025 143026 NMA1969 NMA1970 mtrD mtrC TRUE 0.960 12.000 0.105 1.000 N NA
 143030 143031 NMA1974 NMA1975 recC NMA1975 TRUE 0.526 101.000 0.000 NA   NA
 143031 143032 NMA1975 NMA1977 NMA1975 NMA1977 FALSE 0.275 205.000 0.000 NA   NA
 143032 143034 NMA1977 NMA1979 NMA1977 NMA1979 TRUE 0.987 5.000 0.000 0.001   NA
 143034 143035 NMA1979 NMA1980 NMA1979 NMA1980 TRUE 0.997 27.000 0.525 0.001 N NA
 143036 143037 NMA1981 NMA1982 NMA1981 NMA1982 TRUE 0.812 26.000 0.000 NA   NA
 143038 143039 NMA1983 NMA1984 exbD exbB TRUE 0.999 3.000 0.500 0.029 Y NA
 143039 143040 NMA1984 NMA1985 exbB tonB TRUE 0.766 66.000 0.000 0.006 N NA
 143043 143044 NMA1988 NMA1989 NMA1988 NMA1989 TRUE 0.428 136.000 0.000 NA   NA
 143044 143045 NMA1989 NMA1990 NMA1989 grxB FALSE 0.164 322.000 0.000 NA   NA
 143046 2132961 NMA1991 NMA1992 relA   FALSE 0.199 272.000 0.000 NA   NA
 143047 143048 NMA1994 NMA1996 natC natD' FALSE 0.356 266.000 0.000 0.045   NA
 143050 143052 NMA1997 NMA1999 NMA1997 NMA1999 FALSE 0.135 393.000 0.000 NA   NA
 143052 143053 NMA1999 NMA2000 NMA1999 NMA2000 TRUE 0.933 -9.000 0.000 NA   NA
 143053 143054 NMA2000 NMA2001 NMA2000 NMA2001 TRUE 0.998 5.000 0.400 NA   NA
 143054 143055 NMA2001 NMA2002 NMA2001 NMA2002 TRUE 0.937 8.000 0.000 NA   NA
 143055 143056 NMA2002 NMA2003 NMA2002 NMA2003 TRUE 0.939 7.000 0.000 NA   NA
 143056 143057 NMA2003 NMA2004 NMA2003 NMA2004 TRUE 0.496 113.000 0.000 NA   NA
 143057 143058 NMA2004 NMA2005 NMA2004 NMA2005 TRUE 0.926 -16.000 0.000 NA   NA
 397426 143059 NMAt52 NMA2006 tRNA-Asn NMA2006 TRUE 0.548 93.000 0.000 NA   NA
 143059 143060 NMA2006 NMA2007 NMA2006 NMA2007 TRUE 0.993 23.000 0.444 NA   NA
 143060 143061 NMA2007 NMA2008 NMA2007 NMA2008 TRUE 0.999 2.000 0.667 NA   NA
 143061 143062 NMA2008 NMA2009 NMA2008 NMA2009 TRUE 0.926 12.000 0.000 NA   NA
 143062 143063 NMA2009 NMA2010 NMA2009 NMA2010 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 143063 143064 NMA2010 NMA2011 NMA2010 NMA2011 FALSE 0.086 265.000 0.000 1.000   NA
 143064 143065 NMA2011 NMA2012 NMA2011 NMA2012 TRUE 0.979 -12.000 0.065 NA   NA
 143065 143066 NMA2012 NMA2013 NMA2012 bioF TRUE 0.997 10.000 0.389 NA   NA
 143068 143069 NMA2015 NMA2016 NMA2015 speB FALSE 0.054 198.000 0.000 1.000 N NA
 143069 143070 NMA2016 NMA2017 speB speA TRUE 0.666 99.000 0.015 1.000 Y NA
 143070 143071 NMA2017 NMA2018 speA NMA2018 FALSE 0.351 167.000 0.000 NA   NA
 143071 143072 NMA2018 NMA2019 NMA2018 aspS FALSE 0.392 151.000 0.000 NA   NA
 143072 143073 NMA2019 NMA2020 aspS NMA2020 TRUE 0.822 58.000 0.057 NA   NA
 143073 143074 NMA2020 NMA2021 NMA2020 NMA2021 TRUE 0.511 107.000 0.000 NA   NA
 143074 143075 NMA2021 NMA2022 NMA2021 rpsT FALSE 0.153 79.000 0.000 1.000 N NA
 143077 143078 NMA2024 NMA2025 tbpA tbpB TRUE 0.977 87.000 0.667 1.000   NA
 143078 143079 NMA2025 NMA2026 tbpB glr FALSE 0.033 2119.000 0.000 1.000   NA
 143080 143081 NMA2027 NMA2028 NMA2027 amiC TRUE 0.983 -3.000 0.063 NA   NA
 143081 143082 NMA2028 NMA2029 amiC NMA2029 TRUE 0.612 26.000 0.000 1.000   NA
 143083 143084 NMA2030 NMA2031 NMA2030 NMA2031 TRUE 0.621 49.000 0.000 NA   NA
 143084 143085 NMA2031 NMA2032 NMA2031 NMA2032 TRUE 0.936 -7.000 0.000 NA   NA
 143085 143086 NMA2032 NMA2033 NMA2032 acpS FALSE 0.152 77.000 0.000 1.000 N NA
 143086 143088 NMA2033 NMA2035 acpS NMA2035 FALSE 0.126 201.000 0.000 1.000   NA
 143088 143089 NMA2035 NMA2036 NMA2035 NMA2036 TRUE 0.837 10.000 0.000 1.000   NA
 143089 143090 NMA2036 NMA2037 NMA2036 pdxJ FALSE 0.391 47.000 0.000 1.000   NA
 143090 143091 NMA2037 NMA2038 pdxJ recO TRUE 0.932 24.000 0.166 1.000 N NA
 143091 143092 NMA2038 NMA2039 recO pheA FALSE 0.307 31.000 0.000 1.000 N NA
 143092 143093 NMA2039 NMA2040 pheA NMA2040 FALSE 0.228 39.000 0.000 1.000 N NA
 143093 143094 NMA2040 NMA2041 NMA2040 NMA2041 FALSE 0.089 519.000 0.000 1.000 Y NA
 143097 143098 NMA2046 NMA2047 NMA2046 NMA2047 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 143100 143101 NMA2049 NMA2050 NMA2049 ackA2 FALSE 0.094 358.000 0.000 NA N NA
 143101 143102 NMA2050 NMA2051 ackA2 NMA2051 FALSE 0.130 414.000 0.000 NA   NA
 143102 143103 NMA2051 NMA2052 NMA2051 acnA TRUE 0.884 804.000 0.733 NA   NA
 143103 143104 NMA2052 NMA2053 acnA NMA2053 FALSE 0.324 78.000 0.000 1.000   NA
 143104 143105 NMA2053 NMA2054 NMA2053 prpC FALSE 0.176 161.000 0.000 1.000   NA
 143105 143106 NMA2054 NMA2055 prpC prpB TRUE 0.950 86.000 0.502 1.000 N NA
 143106 143107 NMA2055 NMA2056 prpB NMA2056 FALSE 0.042 623.000 0.000 1.000   NA
 143107 143108 NMA2056 NMA2057 NMA2056 ftsZ FALSE 0.208 139.000 0.000 1.000   NA
 143108 143109 NMA2057 NMA2058 ftsZ ftsA TRUE 0.955 119.000 0.460 1.000 Y NA
 143109 143110 NMA2058 NMA2059 ftsA ftsQ TRUE 0.957 86.000 0.389 NA N NA
 143110 143111 NMA2059 NMA2060 ftsQ ddlB TRUE 0.998 -10.000 0.372 NA Y NA
 143111 143112 NMA2060 NMA2061 ddlB murC TRUE 0.963 113.000 0.153 0.005 Y NA
 143112 143113 NMA2061 NMA2062 murC murG TRUE 0.875 158.000 0.283 1.000 Y NA
 143113 143114 NMA2062 NMA2063 murG ftsW TRUE 0.998 4.000 0.647 1.000 N NA
 143114 143115 NMA2063 NMA2064 ftsW murD TRUE 0.956 144.000 0.297 0.005 N NA
 143115 143116 NMA2064 NMA2065 murD NMA2065 FALSE 0.318 85.000 0.000 1.000   NA
 143116 143117 NMA2065 NMA2066 NMA2065 mraY FALSE 0.259 115.000 0.000 1.000   NA
 143117 143118 NMA2066 NMA2067 mraY NMA2067 TRUE 0.545 94.000 0.000 NA   NA
 143118 143119 NMA2067 NMA2068 NMA2067 murF TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 143119 2132965 NMA2068 NMA2069 murF   TRUE 0.451 128.000 0.000 NA   NA
 2132965 143120 NMA2069 NMA2071   murE TRUE 0.833 23.000 0.000 NA   NA
 143120 143121 NMA2071 NMA2072 murE penA TRUE 0.863 25.000 0.008 1.000 Y NA
 143121 143122 NMA2072 NMA2073 penA NMA2073 FALSE 0.330 61.000 0.000 1.000   NA
 143122 143123 NMA2073 NMA2074 NMA2073 NMA2074 TRUE 0.836 -9.000 0.000 1.000   NA
 143123 143124 NMA2074 NMA2075 NMA2074 NMA2075 TRUE 0.999 -3.000 0.635 NA   NA
 143125 397420 NMA2076 NMAt53 NMA2076 tRNA-Met TRUE 0.438 132.000 0.000 NA   NA
 397420 397421 NMAt53 NMAt54 tRNA-Met tRNA-Ala TRUE 0.937 8.000 0.000 NA   NA
 143126 143127 NMA2077 NMA2078 NMA2077 NMA2078 TRUE 0.506 33.000 0.000 1.000   NA
 143127 143128 NMA2078 NMA2079 NMA2078 NMA2079 TRUE 0.947 3.000 0.000 NA   NA
 143128 143129 NMA2079 NMA2080 NMA2079 NMA2080 TRUE 0.409 100.000 0.000 NA N NA
 143129 143130 NMA2080 NMA2081 NMA2080 NMA2081 TRUE 0.947 14.000 0.007 NA   NA
 143131 143132 NMA2083 NMA2084 putP putA FALSE 0.209 251.000 0.040 1.000 N NA
 143133 143134 NMA2085 NMA2086 NMA2085 xthA FALSE 0.187 952.000 0.000 0.045   NA
 143134 143135 NMA2086 NMA2087 xthA NMA2087 TRUE 0.779 60.000 0.000 0.028   NA
 143135 143136 NMA2087 NMA2088 NMA2087 nadC FALSE 0.070 311.000 0.000 1.000   NA
 143136 143137 NMA2088 NMA2089 nadC NMA2089 FALSE 0.228 229.000 0.010 1.000   NA
 143138 143139 NMA2090 NMA2091 nadA NMA2091 FALSE 0.081 151.000 0.000 1.000 N NA
 143139 143140 NMA2091 NMA2092 NMA2091 nadB FALSE 0.184 49.000 0.000 1.000 N NA
 143141 143142 NMA2093 NMA2094 pgm2 mapA' TRUE 0.981 13.000 0.179 1.000   NA
 143142 143143 NMA2094 NMA2095 mapA' NMA2095 FALSE 0.326 67.000 0.000 1.000   NA
 143143 143144 NMA2095 NMA2096 NMA2095 NMA2096 TRUE 0.954 19.000 0.047 NA   NA
 143144 143145 NMA2096 NMA2097 NMA2096 pgm1 FALSE 0.149 353.000 0.000 NA   NA
 143145 143146 NMA2097 NMA2098 pgm1 mapA TRUE 0.981 13.000 0.179 1.000   NA
 143146 143147 NMA2098 NMA2099 mapA galM TRUE 0.672 233.000 0.000 0.001 Y NA
 143147 143148 NMA2099 NMA2100 galM NMA2100 TRUE 0.997 4.000 0.250 NA Y NA
 143150 143151 NMA2102 NMA2103 pgpA thiL TRUE 0.874 -7.000 0.008 1.000 N NA
 143151 143152 NMA2103 NMA2105 thiL rmpM FALSE 0.015 821.000 0.000 1.000 N NA
 143157 143158 NMA2111 NMA2112 NMA2111 mafA2 TRUE 0.471 120.000 0.000 NA   NA
 143158 143159 NMA2112 NMA2113 mafA2 mafB2 TRUE 0.945 4.000 0.000 NA   NA
 143159 143160 NMA2113 NMA2114 mafB2 NMA2114 TRUE 0.907 15.000 0.000 NA   NA
 143160 143161 NMA2114 NMA2115 NMA2114 NMA2115 FALSE 0.395 149.000 0.000 NA   NA
 143161 143162 NMA2115 NMA2116 NMA2115 NMA2116 TRUE 0.921 -22.000 0.000 NA   NA
 143162 143163 NMA2116 NMA2117 NMA2116 NMA2117 FALSE 0.326 180.000 0.000 NA   NA
 143163 143164 NMA2117 NMA2118 NMA2117 NMA2118 TRUE 0.566 69.000 0.000 NA   NA
 143164 143165 NMA2118 NMA2120 NMA2118 NMA2120 FALSE 0.177 305.000 0.000 NA   NA
 143165 143166 NMA2120 NMA2121 NMA2120 NMA2121 TRUE 0.530 100.000 0.000 NA   NA
 143166 143167 NMA2121 NMA2122 NMA2121 NMA2122 FALSE 0.357 165.000 0.000 NA   NA
 143168 143169 NMA2123 NMA2124 NMA2123 NMA2124 TRUE 0.891 17.000 0.000 NA   NA
 143169 143170 NMA2124 NMA2126 NMA2124 NMA2126 FALSE 0.137 387.000 0.000 NA   NA
 143170 143171 NMA2126 NMA2127 NMA2126 NMA2127 TRUE 0.945 -3.000 0.000 NA   NA
 143171 143172 NMA2127 NMA2128 NMA2127 glnA FALSE 0.381 155.000 0.000 NA   NA
 143173 143174 NMA2129 NMA2130 aroE mtgA TRUE 0.980 3.000 0.107 1.000   NA
 397425 143175 NMAt55 NMA2131 tRNA-Phe NMA2131 FALSE 0.301 191.000 0.000 NA   NA
 143175 143176 NMA2131 NMA2132 NMA2131 NMA2132 TRUE 0.987 44.000 0.543 NA   NA
 143176 143177 NMA2132 NMA2133 NMA2132 NMA2133 TRUE 0.997 -19.000 0.459 NA   NA
 143177 143178 NMA2133 NMA2134 NMA2133 NMA2134 TRUE 0.999 -3.000 0.617 NA   NA
 143178 143179 NMA2134 NMA2135 NMA2134 NMA2135 TRUE 0.900 218.000 0.598 1.000   NA
 143180 143181 NMA2136 NMA2137 tal NMA2137 FALSE 0.388 153.000 0.000 NA   NA
 143181 143182 NMA2137 NMA2138 NMA2137 NMA2138 TRUE 0.891 17.000 0.000 NA   NA
 143183 143184 NMA2139 NMA2140 NMA2139 NMA2140 TRUE 0.702 31.000 0.000 1.000 Y NA
 143184 143185 NMA2140 NMA2141 NMA2140 NMA2141 TRUE 0.564 74.000 0.000 NA   NA
 143185 143186 NMA2141 NMA2142 NMA2141 NMA2142 TRUE 0.504 110.000 0.000 NA   NA
 143186 143187 NMA2142 NMA2143 NMA2142 NMA2143 TRUE 0.621 49.000 0.000 NA   NA
 143187 143188 NMA2143 NMA2144 NMA2143 NMA2144 TRUE 0.989 0.000 0.103 NA   NA
 143188 143189 NMA2144 NMA2145 NMA2144 NMA2145 TRUE 0.995 3.000 0.224 NA   NA
 143191 143192 NMA2147 NMA2148 gloA NMA2148 FALSE 0.397 24.000 0.000 1.000 N NA
 143192 143193 NMA2148 NMA2149 NMA2148 NMA2149 TRUE 0.993 11.000 0.229 NA   NA
 143196 143197 NMA2152 NMA2153 fabI dapD FALSE 0.078 155.000 0.000 1.000 N NA
 143197 143198 NMA2153 NMA2154 dapD pgi2 FALSE 0.069 167.000 0.000 1.000 N NA
 143199 143200 NMA2155 NMA2156 pilG pilD TRUE 0.967 74.000 0.454 1.000 Y NA
 143200 143201 NMA2156 NMA2157 pilD NMA2157 TRUE 0.975 2.000 0.122 1.000 N NA
 143201 143202 NMA2157 NMA2158 NMA2157 NMA2158 TRUE 0.950 -7.000 0.033 1.000   NA
 143203 397424 NMA2159 NMAt56 pilF tRNA-Arg FALSE 0.149 353.000 0.000 NA   NA
 397424 143204 NMAt56 NMA2160 tRNA-Arg NMA2160 TRUE 0.860 20.000 0.000 NA   NA
 143204 143205 NMA2160 NMA2161 NMA2160 NMA2161 TRUE 0.942 5.000 0.000 NA   NA
 143206 143207 NMA2162 NMA2163 rplU rpmA TRUE 0.999 25.000 0.667 0.021 Y NA
 143207 143208 NMA2163 NMA2164 rpmA NMA2164 FALSE 0.024 339.000 0.000 1.000 N NA
 143209 143210 NMA2165 NMA2166 rpmG rpmB TRUE 0.994 32.000 0.332 0.021 Y NA
 143210 143212 NMA2166 NMA2168 rpmB emrB FALSE 0.096 250.000 0.000 1.000   NA
 143212 143213 NMA2168 NMA2169 emrB emrA TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000   NA
 143214 143215 NMA2170 NMA2171 NMA2170 NMA2171 TRUE 0.741 77.000 0.015 NA   NA
 143218 143219 NMA2174 NMA2175 NMA2174 vapA FALSE 0.101 236.000 0.000 1.000   NA
 143219 143220 NMA2175 NMA2176 vapA NMA2176 FALSE 0.089 1429.000 0.000 NA   NA
 143221 143222 NMA2177 NMA2178 NMA2177 NMA2178 TRUE 0.957 12.000 0.008 NA   NA
 143223 143224 NMA2179 NMA2180 folA aroG FALSE 0.153 68.000 0.000 1.000 N NA
 143225 143226 NMA2181 NMA2182 NMA2181 NMA2182 TRUE 0.645 46.000 0.000 NA   NA
 143226 2132967 NMA2182 NMA2183 NMA2182 opcB TRUE 0.554 89.000 0.000 NA   NA
 143227 143228 NMA2184 NMA2185 NMA2184 NMA2185 FALSE 0.400 147.000 0.000 NA   NA
 143228 143229 NMA2185 NMA2186 NMA2185 NMA2186 TRUE 0.471 120.000 0.000 NA   NA
 143229 143230 NMA2186 NMA2187 NMA2186 NMA2187 TRUE 0.500 112.000 0.000 NA   NA
 143230 2132968 NMA2187 NMAr10 NMA2187   TRUE 0.706 36.000 0.000 NA   NA
 2132968 2132969 NMAr10 NMAr11     TRUE 0.545 94.000 0.000 NA   NA
 2132969 397423 NMAr11 NMAt57   tRNA-Ala FALSE 0.132 396.000 0.000 NA   NA
 397423 397422 NMAt57 NMAt58 tRNA-Ala tRNA-Ile TRUE 0.939 7.000 0.000 NA   NA
 397422 2132970 NMAt58 NMAr12 tRNA-Ile   TRUE 0.535 99.000 0.000 NA   NA
 2132970 143232 NMAr12 NMA2189   NMA2189 FALSE 0.125 455.000 0.000 NA   NA
 143234 143235 NMA2191 NMA2192 NMA2191 NMA2192 FALSE 0.342 171.000 0.000 NA   NA
 143235 143236 NMA2192 NMA2193 NMA2192 NMA2193 FALSE 0.292 198.000 0.000 NA   NA
 143236 143237 NMA2193 NMA2195 NMA2193 NMA2195 FALSE 0.142 186.000 0.000 1.000   NA
 143237 143238 NMA2195 NMA2196 NMA2195 NMA2196 TRUE 0.621 49.000 0.000 NA   NA
 143239 143240 NMA2197 NMA2198 NMA2197 phr TRUE 0.649 -10.000 0.000 1.000 N NA
 143242 143243 NMA2200 NMA2201 dinG NMA2201 TRUE 0.706 36.000 0.000 NA   NA
 143244 143245 NMA2202 NMA2203 NMA2202 purB FALSE 0.152 81.000 0.000 1.000 N NA
 143245 143246 NMA2203 NMA2204 purB NMA2204 TRUE 0.564 72.000 0.000 NA   NA
 143248 143249 NMA2206 NMA2207 NMA2206 NMA2207 TRUE 0.715 123.000 0.168 1.000 N NA
 143252 143253 NMA2210 NMA2211 NMA2210 NMA2211 TRUE 0.435 133.000 0.000 NA   NA
 143253 143254 NMA2211 NMA2212 NMA2211 trpC TRUE 0.711 51.000 0.005 NA   NA
 143254 143255 NMA2212 NMA2213 trpC recQ FALSE 0.156 65.000 0.000 1.000 N NA
 143256 143257 NMA2214 NMA2215 NMA2214 NMA2215 TRUE 0.566 76.000 0.000 NA   NA
 143257 143258 NMA2215 NMA2216 NMA2215 NMA2216 TRUE 0.955 -166.000 0.010 NA   NA
 143259 143260 NMA2217 NMA2218 NMA2217 NMA2218 TRUE 0.666 65.000 0.045 1.000   NA
 143260 143261 NMA2218 NMA2219 NMA2218 NMA2219 TRUE 0.503 128.000 0.008 NA N NA
 143261 143262 NMA2219 NMA2220 NMA2219 NMA2220 TRUE 0.948 0.000 0.000 NA   NA
 143262 143263 NMA2220 NMA2221 NMA2220 ruvA FALSE 0.321 82.000 0.000 1.000   NA
 143263 143265 NMA2221 NMA2223 ruvA NMA2223 TRUE 0.433 163.000 0.000 0.077 N NA
 143265 143266 NMA2223 NMA2224 NMA2223 NMA2224 TRUE 0.856 5.000 0.000 1.000   NA
 143266 143267 NMA2224 NMA2225 NMA2224 xseB FALSE 0.087 264.000 0.000 1.000   NA
 143267 143268 NMA2225 NMA2226 xseB ispA TRUE 0.974 -16.000 0.177 1.000 N NA
 143269 143270 NMA2227 NMA2228 NMA2227 nuoN TRUE 0.929 61.000 0.202 NA   NA
 143270 143271 NMA2228 NMA2229 nuoN nuoM TRUE 0.999 10.000 0.340 0.002 Y NA
 143271 143272 NMA2229 NMA2230 nuoM NMA2230 TRUE 0.695 37.000 0.000 NA   NA
 143272 141208 NMA2230 NMA0001 NMA2230 NMA0001 TRUE 0.565 75.000 0.000 NA   NA