MicrobesOnline Operon Predictions for Staphylococcus aureus aureus COL

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 911483 911484 SACOL0001 SACOL0002 dnaA dnaN FALSE 0.433 278.000 0.328 1.000 Y NA
 911484 911485 SACOL0002 SACOL0003 dnaN   FALSE 0.062 381.000 0.103 1.000   NA
 911485 911486 SACOL0003 SACOL0004     TRUE 0.964 -3.000 0.209 1.000   NA
 911486 911487 SACOL0004 SACOL0005   gyrB TRUE 0.982 10.000 0.249 0.006 Y NA
 911487 911488 SACOL0005 SACOL0006 gyrB gyrA TRUE 0.975 37.000 0.306 0.002 Y NA
 911490 911491 SACOL0008 SACOL0009 hutH serS FALSE 0.071 379.000 0.000 0.062 N NA
 911491 911492 SACOL0009 SACOL0010 serS   FALSE 0.010 650.000 0.000 NA N NA
 911492 911493 SACOL0010 SACOL0011     TRUE 0.969 -3.000 0.338 NA   NA
 911493 911494 SACOL0011 SACOL0012     FALSE 0.018 342.000 0.000 NA   NA
 911494 911495 SACOL0012 SACOL0013     FALSE 0.037 306.000 0.011 NA   NA
 911495 911496 SACOL0013 SACOL0014     TRUE 0.764 15.000 0.039 NA   NA
 911496 911497 SACOL0014 SACOL0015   rplI TRUE 0.921 -3.000 0.008 1.000 N NA
 911497 911498 SACOL0015 SACOL0016 rplI dnaB TRUE 0.804 32.000 0.064 1.000 N NA
 911498 911499 SACOL0016 SACOL0017 dnaB   FALSE 0.181 76.000 0.000 NA   NA
 911499 911500 SACOL0017 SACOL0018   purA FALSE 0.129 110.000 0.000 NA   NA
 911500 911501 SACOL0018 SACOL_tRNA-Glu-1 purA   FALSE 0.011 430.000 0.000 NA   NA
 911501 911502 SACOL_tRNA-Glu-1 SACOL_tRNA-Asp-1     TRUE 0.563 8.000 0.000 NA   NA
 911502 911503 SACOL_tRNA-Asp-1 SACOL0019   yycF FALSE 0.007 620.000 0.000 NA   NA
 911503 911504 SACOL0019 SACOL0020 yycF yycG TRUE 0.988 13.000 0.597 0.014 Y NA
 911504 911505 SACOL0020 SACOL0021 yycG yycH TRUE 0.983 -7.000 0.575 NA   NA
 911505 911506 SACOL0021 SACOL0022 yycH yycI TRUE 0.975 1.000 0.890 NA   NA
 911506 911507 SACOL0022 SACOL0023 yycI yycJ FALSE 0.063 390.000 0.176 NA   NA
 911507 911508 SACOL0023 SACOL0024 yycJ   FALSE 0.067 228.000 0.000 1.000   NA
 911510 911511 SACOL0026 SACOL0027     FALSE 0.012 415.000 0.000 NA   NA
 911513 911514 SACOL0029 SACOL0030     FALSE 0.244 98.000 0.024 NA   NA
 911514 911515 SACOL0030 SACOL0031     FALSE 0.008 549.000 0.000 NA   NA
 911515 911516 SACOL0031 SACOL0032   maoC TRUE 0.702 97.000 0.500 1.000 N NA
 911518 911519 SACOL0034 SACOL0035 mecR1   TRUE 0.879 -28.000 0.000 NA   NA
 911520 911521 SACOL0036 SACOL0037     FALSE 0.104 136.000 0.000 NA   NA
 911521 911522 SACOL0037 SACOL0038     TRUE 0.761 15.000 0.036 NA   NA
 911522 911523 SACOL0038 SACOL0039     TRUE 0.687 2.000 0.000 NA   NA
 911523 911524 SACOL0039 SACOL0040     TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 911524 911525 SACOL0040 SACOL0041   ccrB FALSE 0.010 466.000 0.000 NA   NA
 911525 911526 SACOL0041 SACOL0042 ccrB ccrA1 TRUE 0.600 22.000 0.000 NA   NA
 911526 911527 SACOL0042 SACOL0043 ccrA1   FALSE 0.319 188.000 0.000 NA Y NA
 911527 911528 SACOL0043 SACOL0044     TRUE 0.975 0.000 0.750 NA   NA
 911530 911531 SACOL0046 SACOL0047     TRUE 0.850 19.000 0.053 1.000   NA
 911532 911533 SACOL0048 SACOL0049     TRUE 0.945 24.000 0.667 NA   NA
 911533 911534 SACOL0049 SACOL0050   pls FALSE 0.075 216.000 0.000 1.000   NA
 911534 911535 SACOL0050 SACOL0051 pls   FALSE 0.169 124.000 0.000 1.000   NA
 911536 911537 SACOL0052 SACOL0054     TRUE 0.591 23.000 0.000 NA   NA
 911538 911539 SACOL0057 SACOL0058     FALSE 0.100 147.000 0.000 NA   NA
 911540 911541 SACOL0059 SACOL0061     FALSE 0.076 215.000 0.000 1.000   NA
 911541 911542 SACOL0061 SACOL0062     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 911543 911544 SACOL0063 SACOL0064     TRUE 0.620 31.000 0.000 1.000   NA
 911544 911545 SACOL0064 SACOL0065     TRUE 0.727 19.000 0.000 1.000   NA
 911546 911547 SACOL0066 SACOL0067     FALSE 0.024 299.000 0.000 NA   NA
 911548 911549 SACOL0068 SACOL0069     FALSE 0.329 49.000 0.000 NA   NA
 911550 911551 SACOL0070 SACOL0071     TRUE 0.896 -7.000 0.000 1.000   NA
 911554 911555 SACOL0074 SACOL0075     FALSE 0.011 434.000 0.000 NA   NA
 911555 911556 SACOL0075 SACOL0076     FALSE 0.031 267.000 0.000 NA   NA
 911556 911557 SACOL0076 SACOL0077     FALSE 0.292 57.000 0.000 NA   NA
 911557 911558 SACOL0077 SACOL0078   plc FALSE 0.053 205.000 0.000 NA   NA
 911558 911559 SACOL0078 SACOL0079 plc   FALSE 0.044 221.000 0.000 NA   NA
 911559 911560 SACOL0079 SACOL0080     FALSE 0.315 52.000 0.000 NA   NA
 911560 911561 SACOL0080 SACOL0081     FALSE 0.247 64.000 0.000 NA   NA
 911561 911562 SACOL0081 SACOL0082     FALSE 0.552 13.000 0.000 NA   NA
 911562 911563 SACOL0082 SACOL0083     FALSE 0.227 67.000 0.000 NA   NA
 911563 911564 SACOL0083 SACOL0084     FALSE 0.105 133.000 0.000 NA   NA
 911564 911565 SACOL0084 SACOL0085     FALSE 0.151 151.000 0.000 1.000   NA
 911565 911566 SACOL0085 SACOL0086     TRUE 0.783 2.000 0.000 1.000   NA
 911566 911567 SACOL0086 SACOL0087     FALSE 0.082 168.000 0.000 NA   NA
 911568 911569 SACOL0088 SACOL0089     FALSE 0.020 326.000 0.000 NA   NA
 911569 911570 SACOL0089 SACOL0090     FALSE 0.074 174.000 0.000 NA   NA
 911571 911572 SACOL0091 SACOL0092     FALSE 0.062 190.000 0.000 NA   NA
 911572 911573 SACOL0092 SACOL0093     FALSE 0.032 262.000 0.000 NA   NA
 911574 911575 SACOL0095 SACOL0096 spa sarS FALSE 0.020 421.000 0.000 1.000   NA
 911575 911576 SACOL0096 SACOL0097 sarS sirC FALSE 0.025 369.000 0.000 1.000   NA
 911576 911577 SACOL0097 SACOL0098 sirC sirB TRUE 0.990 -3.000 0.091 0.048 Y NA
 911577 911578 SACOL0098 SACOL0099 sirB sirA TRUE 0.961 16.000 0.111 1.000 Y NA
 911579 911580 SACOL0100 SACOL0101     TRUE 0.972 9.000 0.333 1.000 Y NA
 911580 911581 SACOL0101 SACOL0102     TRUE 0.915 21.000 0.171 1.000 N NA
 911581 911582 SACOL0102 SACOL0103     TRUE 0.973 -7.000 0.171 1.000 N NA
 911582 911583 SACOL0103 SACOL0104     TRUE 0.983 -10.000 0.278 1.000 N NA
 911583 911584 SACOL0104 SACOL0105     TRUE 0.997 -19.000 0.172 0.001 Y NA
 911584 911585 SACOL0105 SACOL0106     TRUE 0.988 -25.000 0.355 1.000 N NA
 911585 911586 SACOL0106 SACOL0107     TRUE 0.956 0.000 0.185 1.000 N NA
 911586 911587 SACOL0107 SACOL0108     TRUE 0.855 4.000 0.037 1.000 N NA
 911587 911588 SACOL0108 SACOL0109     FALSE 0.057 196.000 0.000 NA   NA
 911588 911589 SACOL0109 SACOL0110     FALSE 0.325 50.000 0.000 NA   NA
 911589 911590 SACOL0110 SACOL0111     FALSE 0.050 212.000 0.000 NA   NA
 911590 911591 SACOL0111 SACOL0112     FALSE 0.101 144.000 0.000 NA   NA
 911591 911592 SACOL0112 SACOL0113     FALSE 0.173 79.000 0.000 NA   NA
 911592 911593 SACOL0113 SACOL0114     TRUE 0.981 -37.000 0.000 NA Y NA
 911593 911594 SACOL0114 SACOL0115     FALSE 0.271 210.000 0.000 NA Y NA
 911594 911595 SACOL0115 SACOL0116     TRUE 0.873 -19.000 0.000 NA   NA
 911595 911596 SACOL0116 SACOL0117     TRUE 0.859 -10.000 0.000 NA   NA
 911596 911597 SACOL0117 SACOL0118   sodA1 FALSE 0.050 268.000 0.000 1.000   NA
 911597 911598 SACOL0118 SACOL0119 sodA1   FALSE 0.025 368.000 0.000 1.000   NA
 911600 911601 SACOL0121 SACOL0122 deoD1   TRUE 0.873 7.000 0.100 1.000 N NA
 911601 911602 SACOL0122 SACOL0123   deoC1 FALSE 0.380 81.000 0.013 1.000 N NA
 911602 911603 SACOL0123 SACOL0124 deoC1 deoB TRUE 0.860 28.000 0.000 0.060 N NA
 911604 911605 SACOL0125 SACOL0126     TRUE 0.997 -3.000 0.689 0.002 Y NA
 911605 911606 SACOL0126 SACOL0127     TRUE 0.995 2.000 0.654 0.002 Y NA
 911606 911607 SACOL0127 SACOL0128     TRUE 0.739 214.000 0.308 0.002 Y NA
 911608 911609 SACOL0129 SACOL0130     TRUE 0.605 51.000 0.091 NA   NA
 911609 911610 SACOL0130 SACOL0132     FALSE 0.008 527.000 0.000 NA   NA
 911610 911611 SACOL0132 SACOL0134     FALSE 0.006 761.000 0.000 NA   NA
 911611 911612 SACOL0134 SACOL0135     FALSE 0.011 450.000 0.000 NA   NA
 911612 911613 SACOL0135 SACOL0136   cap5A FALSE 0.038 345.000 0.000 1.000 N NA
 911613 911614 SACOL0136 SACOL0137 cap5A cap5B TRUE 0.775 16.000 0.000 1.000 N NA
 911614 911615 SACOL0137 SACOL0138 cap5B cap5C TRUE 0.797 3.000 0.000 1.000 N NA
 911615 911616 SACOL0138 SACOL0139 cap5C cap5D TRUE 0.984 20.000 0.667 1.000 Y NA
 911616 911617 SACOL0139 SACOL0140 cap5D cap5E TRUE 0.995 -10.000 1.000 0.019   NA
 911617 911618 SACOL0140 SACOL0141 cap5E cap5F TRUE 0.761 13.000 0.019 1.000   NA
 911618 911619 SACOL0141 SACOL0142 cap5F cap5G TRUE 0.981 4.000 0.477 1.000 Y NA
 911619 911620 SACOL0142 SACOL0143 cap5G cap5H TRUE 0.798 3.000 0.005 1.000   NA
 911620 911621 SACOL0143 SACOL0144 cap5H cap5I TRUE 0.673 5.000 0.002 NA   NA
 911621 911622 SACOL0144 SACOL0145 cap5I cap5J TRUE 0.899 14.000 0.000 NA Y NA
 911622 911623 SACOL0145 SACOL0146 cap5J cap5K TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 911623 911624 SACOL0146 SACOL0147 cap5K cap5L TRUE 0.715 1.000 0.000 NA   NA
 911624 911625 SACOL0147 SACOL0148 cap5L cap5M TRUE 0.917 11.000 0.015 NA Y NA
 911625 911626 SACOL0148 SACOL0149 cap5M cap5N TRUE 0.984 0.000 0.297 NA Y NA
 911626 911627 SACOL0149 SACOL0150 cap5N cap5O TRUE 0.817 54.000 0.009 1.000 Y NA
 911627 911628 SACOL0150 SACOL0151 cap5O cap5P TRUE 0.888 47.000 0.105 1.000 Y NA
 911629 911630 SACOL0152 SACOL0153     TRUE 0.568 7.000 0.000 NA   NA
 911631 911632 SACOL0154 SACOL0155 aldA1   FALSE 0.015 646.000 0.000 1.000 N NA
 911634 911635 SACOL0157 SACOL0158     FALSE 0.018 342.000 0.000 NA   NA
 911635 911636 SACOL0158 SACOL0159     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 911636 911637 SACOL0159 SACOL0160     TRUE 0.817 13.000 0.032 1.000 N NA
 911637 911638 SACOL0160 SACOL0161     FALSE 0.046 217.000 0.000 NA   NA
 911638 911639 SACOL0161 SACOL0162     FALSE 0.075 173.000 0.000 NA   NA
 911639 911640 SACOL0162 SACOL0163     FALSE 0.023 386.000 0.000 1.000   NA
 911640 911641 SACOL0163 SACOL0164     FALSE 0.035 447.000 0.049 1.000   NA
 911641 911642 SACOL0164 SACOL0165     TRUE 0.929 13.000 0.333 1.000 N NA
 911643 911644 SACOL0166 SACOL0167   argB FALSE 0.034 255.000 0.000 NA   NA
 911644 911645 SACOL0167 SACOL0168 argB argJ TRUE 0.972 16.000 0.008 0.004 Y NA
 911645 911646 SACOL0168 SACOL0169 argJ argC1 TRUE 0.985 12.000 0.303 0.004 Y NA
 911646 911647 SACOL0169 SACOL0170 argC1 rocD1 TRUE 0.863 39.000 0.004 1.000 Y NA
 911647 911648 SACOL0170 SACOL0171 rocD1 brnQ1 FALSE 0.231 253.000 0.000 1.000 Y NA
 911648 911649 SACOL0171 SACOL0172 brnQ1 entB FALSE 0.061 276.000 0.000 1.000 N NA
 911649 911650 SACOL0172 SACOL0173 entB ipdC FALSE 0.209 127.000 0.000 1.000 N NA
 911653 911654 SACOL0176 SACOL0177     TRUE 0.966 -3.000 0.234 1.000   NA
 911654 911655 SACOL0177 SACOL0178     TRUE 0.905 12.000 0.250 1.000   NA
 911655 911656 SACOL0178 SACOL0179     TRUE 0.904 3.000 0.100 1.000 N NA
 911656 911657 SACOL0179 SACOL0180     FALSE 0.014 688.000 0.000 1.000 N NA
 911657 911658 SACOL0180 SACOL0181     FALSE 0.053 205.000 0.000 NA   NA
 911658 911659 SACOL0181 SACOL0182     TRUE 0.939 2.000 0.295 NA   NA
 911659 911660 SACOL0182 SACOL0183     TRUE 0.866 -13.000 0.000 NA   NA
 911662 911663 SACOL0185 SACOL0186     TRUE 0.990 6.000 0.833 0.048 Y NA
 911663 911664 SACOL0186 SACOL0187     TRUE 0.980 17.000 0.833 0.048   NA
 911664 911665 SACOL0187 SACOL0188   ggt FALSE 0.522 38.000 0.000 1.000   NA
 911666 911667 SACOL0189 SACOL0190     FALSE 0.062 190.000 0.000 NA   NA
 911668 911669 SACOL0191 SACOL0192     FALSE 0.023 383.000 0.000 1.000   NA
 911669 911670 SACOL0192 SACOL0193     TRUE 0.950 13.000 0.000 0.048 Y NA
 911670 911671 SACOL0193 SACOL0194     TRUE 0.992 3.000 0.800 0.048 Y NA
 911671 911672 SACOL0194 SACOL0195     TRUE 0.994 2.000 0.909 0.048 Y NA
 911672 911673 SACOL0195 SACOL0196     FALSE 0.278 74.000 0.000 1.000   NA
 911673 911674 SACOL0196 SACOL0197     TRUE 0.866 25.000 0.000 0.029   NA
 911674 911675 SACOL0197 SACOL0198     TRUE 0.606 55.000 0.111 NA   NA
 911678 911679 SACOL0201 SACOL0202     TRUE 0.985 -7.000 0.167 0.014   NA
 911679 911680 SACOL0202 SACOL0203     TRUE 0.965 -3.000 0.167 1.000 N NA
 911681 911682 SACOL0204 SACOL0205 pflB pflA TRUE 0.896 23.000 0.135 1.000 N NA
 911682 911683 SACOL0205 SACOL0206 pflA   FALSE 0.137 104.000 0.000 NA   NA
 911683 911684 SACOL0206 SACOL0207     FALSE 0.399 38.000 0.000 NA   NA
 911686 911687 SACOL0209 SACOL0210     FALSE 0.010 466.000 0.000 NA   NA
 911688 911689 SACOL0211 SACOL0212     TRUE 0.975 30.000 0.588 1.000 Y NA
 911689 911690 SACOL0212 SACOL0213     FALSE 0.417 186.000 0.012 1.000 Y NA
 911690 911691 SACOL0213 SACOL0214     TRUE 0.646 112.000 0.046 1.000 Y NA
 911691 911692 SACOL0214 SACOL0215     TRUE 0.965 26.000 0.046 0.070 Y NA
 911694 911695 SACOL0217 SACOL0218     FALSE 0.056 198.000 0.000 NA   NA
 911695 911696 SACOL0218 SACOL0219     FALSE 0.092 157.000 0.000 NA   NA
 911696 911697 SACOL0219 SACOL0220     TRUE 0.941 26.000 0.667 NA   NA
 911699 911700 SACOL0223 SACOL0224     TRUE 0.558 27.000 0.000 NA   NA
 911701 911702 SACOL0225 SACOL0228     FALSE 0.040 339.000 0.000 1.000 N NA
 911702 911703 SACOL0228 SACOL0229     TRUE 0.993 -15.000 0.308 0.015 N NA
 911703 911704 SACOL0229 SACOL0230     TRUE 0.980 23.000 0.148 0.012 Y NA
 911706 911707 SACOL0232 SACOL0233   gutB TRUE 0.900 18.000 0.103 1.000 N NA
 911707 911708 SACOL0233 SACOL0234 gutB   TRUE 0.883 2.000 0.103 NA   NA
 911708 911709 SACOL0234 SACOL0235     TRUE 0.863 24.000 0.158 NA   NA
 911709 911710 SACOL0235 SACOL0236     FALSE 0.018 528.000 0.000 1.000 N NA
 911710 911711 SACOL0236 SACOL0237     TRUE 0.983 -7.000 0.367 1.000 N NA
 911711 911712 SACOL0237 SACOL0238     TRUE 0.905 22.000 0.148 1.000 N NA
 911712 911713 SACOL0238 SACOL0239     FALSE 0.183 428.000 0.000 0.003 Y NA
 911713 911714 SACOL0239 SACOL0240     FALSE 0.061 276.000 0.000 1.000 N NA
 911714 911715 SACOL0240 SACOL0241     TRUE 0.983 -7.000 0.367 1.000 N NA
 911715 911716 SACOL0241 SACOL0242     TRUE 0.905 22.000 0.148 1.000 N NA
 911716 911717 SACOL0242 SACOL0243     TRUE 0.737 36.000 0.125 NA   NA
 911717 911718 SACOL0243 SACOL0244   scdA FALSE 0.102 140.000 0.000 NA   NA
 911718 911719 SACOL0244 SACOL0245 scdA lytS FALSE 0.051 247.000 0.000 NA N NA
 911719 911720 SACOL0245 SACOL0246 lytS lytR TRUE 0.991 3.000 0.538 0.014 Y NA
 911720 911721 SACOL0246 SACOL0247 lytR lrgA FALSE 0.467 113.000 0.178 1.000   NA
 911721 911722 SACOL0247 SACOL0248 lrgA lrgB TRUE 0.990 -7.000 0.869 1.000   NA
 911724 911725 SACOL0250 SACOL0251   bglA TRUE 0.931 16.000 0.000 1.000 Y NA
 911726 911727 SACOL0252 SACOL0253   rbsK FALSE 0.072 251.000 0.000 1.000 N NA
 911727 911728 SACOL0253 SACOL0254 rbsK   TRUE 0.932 28.000 0.030 1.000 Y NA
 911728 911729 SACOL0254 SACOL0255     TRUE 0.976 15.000 0.045 0.002 Y NA
 911729 911730 SACOL0255 SACOL0257     FALSE 0.083 232.000 0.000 1.000 N NA
 911731 911732 SACOL0258 SACOL0259     FALSE 0.325 50.000 0.000 NA   NA
 911732 911733 SACOL0259 SACOL0260     FALSE 0.042 228.000 0.000 NA   NA
 911735 911736 SACOL0262 SACOL0263   lytM FALSE 0.036 308.000 0.000 1.000   NA
 911737 911738 SACOL0264 SACOL0265     TRUE 0.949 14.000 0.833 NA   NA
 911738 911739 SACOL0265 SACOL0266     TRUE 0.978 -3.000 0.571 NA   NA
 911739 911740 SACOL0266 SACOL0267     TRUE 0.717 68.000 0.429 NA   NA
 911741 911742 SACOL0268 SACOL0269     FALSE 0.447 34.000 0.000 NA   NA
 911744 911745 SACOL0271 SACOL0272     FALSE 0.307 84.000 0.041 NA   NA
 911745 911746 SACOL0272 SACOL0273     TRUE 0.952 0.000 0.286 NA   NA
 911746 911747 SACOL0273 SACOL0274     TRUE 0.977 -28.000 0.237 NA   NA
 911747 911748 SACOL0274 SACOL0275     TRUE 0.946 13.000 0.833 NA   NA
 911748 911749 SACOL0275 SACOL0276   yukA TRUE 0.946 22.000 0.623 NA   NA
 911749 911750 SACOL0276 SACOL0277 yukA   FALSE 0.516 30.000 0.000 NA   NA
 911750 911751 SACOL0277 SACOL0278     TRUE 0.613 16.000 0.000 NA   NA
 911751 911752 SACOL0278 SACOL0279     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 911752 911753 SACOL0279 SACOL0280     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 911753 911754 SACOL0280 SACOL0281     TRUE 0.559 10.000 0.000 NA   NA
 911754 911755 SACOL0281 SACOL0282     TRUE 0.557 11.000 0.000 NA   NA
 911755 911756 SACOL0282 SACOL0283     FALSE 0.052 208.000 0.000 NA   NA
 911756 911757 SACOL0283 SACOL0284     FALSE 0.100 147.000 0.000 NA   NA
 911757 911758 SACOL0284 SACOL0285     FALSE 0.104 136.000 0.000 NA   NA
 911758 911759 SACOL0285 SACOL0286     FALSE 0.105 132.000 0.000 NA   NA
 911759 911760 SACOL0286 SACOL0287     TRUE 0.895 11.000 0.286 NA   NA
 911760 911761 SACOL0287 SACOL0288     TRUE 0.557 11.000 0.000 NA   NA
 911761 911762 SACOL0288 SACOL0289     TRUE 0.557 11.000 0.000 NA   NA
 911762 911763 SACOL0289 SACOL0290     FALSE 0.051 210.000 0.000 NA   NA
 911763 911764 SACOL0290 SACOL0291     FALSE 0.007 586.000 0.000 NA   NA
 911764 911765 SACOL0291 SACOL0292     TRUE 0.894 12.000 0.286 NA   NA
 911765 911766 SACOL0292 SACOL0293     TRUE 0.895 11.000 0.286 NA   NA
 911766 911767 SACOL0293 SACOL0294     TRUE 0.895 11.000 0.286 NA   NA
 911767 911768 SACOL0294 SACOL0295     TRUE 0.895 11.000 0.286 NA   NA
 911768 911769 SACOL0295 SACOL0296     TRUE 0.895 11.000 0.286 NA   NA
 911769 911770 SACOL0296 SACOL0297     TRUE 0.895 11.000 0.286 NA   NA
 911770 911771 SACOL0297 SACOL0299     FALSE 0.007 623.000 0.000 NA   NA
 911771 911772 SACOL0299 SACOL0300     FALSE 0.096 153.000 0.000 NA   NA
 911773 911774 SACOL0301 SACOL0302   brnQ2 FALSE 0.097 216.000 0.000 1.000 N NA
 911775 911776 SACOL0303 SACOL0305     FALSE 0.056 249.000 0.000 1.000   NA
 911776 911777 SACOL0305 SACOL0306     TRUE 0.929 13.000 0.333 1.000 N NA
 911777 911778 SACOL0306 SACOL0307   pfoR FALSE 0.074 208.000 0.000 NA N NA
 911778 911779 SACOL0307 SACOL0308 pfoR   FALSE 0.112 343.000 0.000 NA Y NA
 911779 911780 SACOL0308 SACOL0309     TRUE 0.965 -25.000 0.085 NA N NA
 911780 911781 SACOL0309 SACOL0310     TRUE 0.724 11.000 0.008 NA N NA
 911782 911783 SACOL0311 SACOL0312   nanA TRUE 0.911 40.000 0.130 1.000 Y NA
 911789 911790 SACOL0318 SACOL0319 int   FALSE 0.216 194.000 0.000 0.054   NA
 911790 911791 SACOL0319 SACOL0320     FALSE 0.176 78.000 0.000 NA   NA
 911791 911792 SACOL0320 SACOL0321     FALSE 0.094 155.000 0.000 NA   NA
 911793 911794 SACOL0322 SACOL0323     TRUE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 911796 911797 SACOL0325 SACOL0326     TRUE 0.715 1.000 0.000 NA   NA
 911797 911798 SACOL0326 SACOL0327     FALSE 0.382 40.000 0.000 NA   NA
 911804 911805 SACOL0333 SACOL0334     FALSE 0.552 13.000 0.000 NA   NA
 911805 911806 SACOL0334 SACOL0335     FALSE 0.153 90.000 0.000 NA   NA
 911806 911807 SACOL0335 SACOL0336     TRUE 0.588 5.000 0.000 NA   NA
 911807 911808 SACOL0336 SACOL0337     TRUE 0.559 10.000 0.000 NA   NA
 911808 911809 SACOL0337 SACOL0338     TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 911809 911810 SACOL0338 SACOL0339   ssb1 TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 911810 911811 SACOL0339 SACOL0340 ssb1   TRUE 0.941 14.000 0.667 NA   NA
 911811 911812 SACOL0340 SACOL0341     TRUE 0.879 -28.000 0.000 NA   NA
 911812 911813 SACOL0341 SACOL0342     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 911813 911814 SACOL0342 SACOL0343     TRUE 0.957 -3.000 0.222 NA   NA
 911814 911815 SACOL0343 SACOL0344     TRUE 0.957 -3.000 0.222 NA   NA
 911815 911816 SACOL0344 SACOL0345     TRUE 0.957 3.000 0.667 NA   NA
 911816 911817 SACOL0345 SACOL0346     TRUE 0.559 10.000 0.000 NA   NA
 911817 911818 SACOL0346 SACOL0347     TRUE 0.946 -3.000 0.000 0.054   NA
 911818 911819 SACOL0347 SACOL0348     TRUE 0.588 5.000 0.000 NA   NA
 911819 911820 SACOL0348 SACOL0349     TRUE 0.715 1.000 0.000 NA   NA
 911820 911821 SACOL0349 SACOL0350     TRUE 0.555 12.000 0.000 NA   NA
 911821 911822 SACOL0350 SACOL0351     TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 911822 911823 SACOL0351 SACOL0352     TRUE 0.563 14.000 0.000 NA   NA
 911823 911824 SACOL0352 SACOL0353     TRUE 0.643 3.000 0.000 NA   NA
 911824 911825 SACOL0353 SACOL0354     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 911825 911826 SACOL0354 SACOL0355     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 911826 911827 SACOL0355 SACOL0356     TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 911827 911828 SACOL0356 SACOL0357   dut TRUE 0.588 5.000 0.000 NA   NA
 911828 911829 SACOL0357 SACOL0358 dut   FALSE 0.412 37.000 0.000 NA   NA
 911829 911830 SACOL0358 SACOL0359     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 911830 911831 SACOL0359 SACOL0360     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 911831 911832 SACOL0360 SACOL0361     TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 911832 911833 SACOL0361 SACOL0362     TRUE 0.707 68.000 0.400 NA   NA
 911833 911834 SACOL0362 SACOL0363     TRUE 0.881 -43.000 0.000 NA   NA
 911834 911835 SACOL0363 SACOL0364     FALSE 0.552 13.000 0.000 NA   NA
 911835 911836 SACOL0364 SACOL0365     FALSE 0.143 157.000 0.000 1.000   NA
 911836 911837 SACOL0365 SACOL0366     FALSE 0.107 129.000 0.000 NA   NA
 911837 911838 SACOL0366 SACOL0367     TRUE 0.970 -10.000 0.200 NA   NA
 911838 911839 SACOL0367 SACOL0368     TRUE 0.948 5.000 0.692 NA   NA
 911839 911840 SACOL0368 SACOL0369     TRUE 0.990 -16.000 0.846 NA   NA
 911840 911841 SACOL0369 SACOL0370     TRUE 0.948 12.000 0.846 NA   NA
 911841 911842 SACOL0370 SACOL0371     FALSE 0.214 69.000 0.000 NA   NA
 911842 911843 SACOL0371 SACOL0372     TRUE 0.555 12.000 0.000 NA   NA
 911843 911844 SACOL0372 SACOL0373     TRUE 0.961 -3.000 0.250 NA   NA
 911844 911845 SACOL0373 SACOL0374     TRUE 0.934 1.000 0.222 NA   NA
 911845 911846 SACOL0374 SACOL0375     TRUE 0.899 35.000 0.615 NA   NA
 911846 911847 SACOL0375 SACOL0376     FALSE 0.435 92.000 0.154 NA   NA
 911847 911848 SACOL0376 SACOL0377     TRUE 0.775 58.000 0.400 NA   NA
 911848 911849 SACOL0377 SACOL0378     TRUE 0.833 42.000 0.400 NA   NA
 911849 911850 SACOL0378 SACOL0379     TRUE 0.563 14.000 0.000 NA   NA
 911850 911851 SACOL0379 SACOL0380     TRUE 0.928 0.000 0.154 NA   NA
 911851 911852 SACOL0380 SACOL0381     TRUE 0.955 9.000 1.000 NA   NA
 911852 911853 SACOL0381 SACOL0382     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 911853 911854 SACOL0382 SACOL0383     TRUE 0.613 16.000 0.000 NA   NA
 911854 911855 SACOL0383 SACOL0384     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 911855 911856 SACOL0384 SACOL0385     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 911856 911857 SACOL0385 SACOL0386     TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 911857 911858 SACOL0386 SACOL0387     FALSE 0.347 46.000 0.000 NA   NA
 911858 911859 SACOL0387 SACOL0388     FALSE 0.104 136.000 0.000 NA   NA
 911859 911860 SACOL0388 SACOL0389     TRUE 0.555 12.000 0.000 NA   NA
 911860 911861 SACOL0389 SACOL0390     FALSE 0.006 770.000 0.000 NA   NA
 911862 911863 SACOL0391 SACOL0392     TRUE 0.553 73.000 0.000 0.066 N NA
 911864 911865 SACOL0393 SACOL0394     FALSE 0.124 114.000 0.000 NA   NA
 911865 911866 SACOL0394 SACOL0395     TRUE 0.924 34.000 0.571 1.000 N NA
 911866 911867 SACOL0395 SACOL0396     TRUE 0.898 1.000 0.107 NA   NA
 911867 911868 SACOL0396 SACOL0397     TRUE 0.976 -10.000 0.286 NA   NA
 911868 911869 SACOL0397 SACOL0398     TRUE 0.984 -22.000 0.250 1.000 N NA
 911869 911870 SACOL0398 SACOL0399     FALSE 0.046 315.000 0.000 1.000 N NA
 911871 911872 SACOL0400 SACOL0401     TRUE 0.951 15.000 0.182 0.011   NA
 911872 911873 SACOL0401 SACOL0402     TRUE 0.980 2.000 0.026 0.011 Y NA
 911873 911874 SACOL0402 SACOL0403     TRUE 0.955 5.000 0.182 0.015 N NA
 911875 911876 SACOL0404 SACOL0405     TRUE 0.740 107.000 0.800 1.000 N NA
 911876 911877 SACOL0405 SACOL0406     FALSE 0.137 104.000 0.000 NA   NA
 911879 911880 SACOL0408 SACOL0409     FALSE 0.252 80.000 0.000 1.000   NA
 911880 911881 SACOL0409 SACOL0410     TRUE 0.909 14.000 0.259 1.000   NA
 911883 911884 SACOL0412 SACOL0413     FALSE 0.170 80.000 0.000 NA   NA
 911884 911885 SACOL0413 SACOL0414     FALSE 0.044 268.000 0.000 NA N NA
 911885 911886 SACOL0414 SACOL0415     TRUE 0.993 -3.000 0.812 NA Y NA
 911886 911887 SACOL0415 SACOL0416     TRUE 0.989 -19.000 0.119 NA Y NA
 911888 911889 SACOL0417 SACOL0418     TRUE 0.899 62.000 0.393 NA Y NA
 911889 911890 SACOL0418 SACOL0419     FALSE 0.131 109.000 0.000 NA   NA
 911891 911892 SACOL0420 SACOL0421     TRUE 0.936 -3.000 0.115 NA   NA
 911892 911893 SACOL0421 SACOL0422     TRUE 0.849 25.000 0.143 NA   NA
 911893 911894 SACOL0422 SACOL0424     TRUE 0.967 0.000 0.371 1.000   NA
 911897 911898 SACOL0427 SACOL0428   metE FALSE 0.482 43.000 0.011 NA   NA
 911898 911899 SACOL0428 SACOL0429 metE   TRUE 0.979 -3.000 0.030 1.000 Y NA
 911899 911900 SACOL0429 SACOL0430     TRUE 0.993 -31.000 0.162 1.000 Y NA
 911900 911901 SACOL0430 SACOL0431     TRUE 0.997 -3.000 0.600 0.002 Y NA
 911902 911903 SACOL0432 SACOL0433     FALSE 0.225 157.000 0.007 1.000 N NA
 911903 911904 SACOL0433 SACOL0434     TRUE 0.836 30.000 0.171 NA   NA
 911904 911905 SACOL0434 SACOL0435     TRUE 0.779 12.000 0.064 NA   NA
 911907 911908 SACOL0437 SACOL0438 rpsF ssb2 TRUE 0.815 21.000 0.007 1.000 N NA
 911908 911909 SACOL0438 SACOL0439 ssb2 rpsR TRUE 0.569 52.000 0.007 1.000 N NA
 911910 911911 SACOL0440 SACOL0441     FALSE 0.391 39.000 0.000 NA   NA
 911912 911913 SACOL0442 SACOL0443     FALSE 0.015 369.000 0.000 NA   NA
 911913 911914 SACOL0443 SACOL0444     FALSE 0.067 181.000 0.000 NA   NA
 911916 911917 SACOL0446 SACOL0447     FALSE 0.019 426.000 0.000 1.000   NA
 911918 911919 SACOL0448 SACOL0449     FALSE 0.034 255.000 0.000 NA   NA
 911919 911920 SACOL0449 SACOL0450     FALSE 0.197 73.000 0.000 NA   NA
 911920 911921 SACOL0450 SACOL0451   ahpF FALSE 0.173 79.000 0.000 NA   NA
 911921 911922 SACOL0451 SACOL0452 ahpF ahpC TRUE 0.983 16.000 0.551 1.000 Y NA
 911924 911925 SACOL0454 SACOL0455     FALSE 0.006 977.000 0.000 NA   NA
 911925 911926 SACOL0455 SACOL0456     TRUE 0.668 118.000 0.857 NA   NA
 911926 911927 SACOL0456 SACOL0457     TRUE 0.628 143.000 0.857 NA   NA
 911928 911929 SACOL0458 SACOL0459 xpt pbuX TRUE 0.972 0.000 0.037 1.000 Y NA
 911929 911930 SACOL0459 SACOL0460 pbuX guaB TRUE 0.928 38.000 1.000 1.000   NA
 911930 911931 SACOL0460 SACOL0461 guaB guaA TRUE 0.920 25.000 0.007 0.001   NA
 911932 911933 SACOL0462 SACOL0463     FALSE 0.013 393.000 0.000 NA   NA
 911933 911934 SACOL0463 SACOL0464     FALSE 0.055 399.000 0.000 0.052   NA
 911934 911935 SACOL0464 SACOL0465     FALSE 0.033 261.000 0.000 NA   NA
 911935 911936 SACOL0465 SACOL0466     FALSE 0.008 524.000 0.000 NA   NA
 911936 911937 SACOL0466 SACOL0467     TRUE 0.618 19.000 0.000 NA   NA
 911938 911939 SACOL0468 SACOL0469     FALSE 0.123 286.000 0.000 0.015   NA
 911939 911940 SACOL0469 SACOL0470     FALSE 0.120 291.000 0.000 0.015   NA
 911940 911941 SACOL0470 SACOL0471     FALSE 0.117 119.000 0.000 NA   NA
 911941 911942 SACOL0471 SACOL0472     FALSE 0.131 109.000 0.000 NA   NA
 911942 911943 SACOL0472 SACOL0473     FALSE 0.072 380.000 0.000 0.015   NA
 911943 911944 SACOL0473 SACOL0474     FALSE 0.077 366.000 0.000 0.015   NA
 911946 911947 SACOL0476 SACOL0477 hsdM1   TRUE 0.992 -7.000 0.083 0.052 Y NA
 911947 911948 SACOL0477 SACOL0478     FALSE 0.023 383.000 0.000 1.000   NA
 911948 911949 SACOL0478 SACOL0479     TRUE 0.712 22.000 0.000 1.000   NA
 911951 911952 SACOL0481 SACOL0482     FALSE 0.477 32.000 0.000 NA   NA
 911952 911953 SACOL0482 SACOL0483     FALSE 0.209 70.000 0.000 NA   NA
 911953 911954 SACOL0483 SACOL0484     FALSE 0.071 176.000 0.000 NA   NA
 911954 911955 SACOL0484 SACOL0485     TRUE 0.618 19.000 0.000 NA   NA
 911955 911956 SACOL0485 SACOL0486     FALSE 0.068 180.000 0.000 NA   NA
 911956 911957 SACOL0486 SACOL0487     TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 911957 911958 SACOL0487 SACOL0488     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 911958 911959 SACOL0488 SACOL0489     TRUE 0.618 19.000 0.000 NA   NA
 911961 911962 SACOL0491 SACOL0494   nuoF FALSE 0.006 1588.000 0.000 NA   NA
 911962 911963 SACOL0494 SACOL0495 nuoF   TRUE 0.898 13.000 0.303 NA   NA
 911963 911964 SACOL0495 SACOL0496     FALSE 0.224 162.000 0.076 NA   NA
 911966 911967 SACOL0498 SACOL0499     TRUE 0.848 37.000 0.273 1.000   NA
 911967 911968 SACOL0499 SACOL0500     FALSE 0.129 110.000 0.000 NA   NA
 911968 911969 SACOL0500 SACOL0501     FALSE 0.041 230.000 0.000 NA   NA
 911969 911970 SACOL0501 SACOL0502     FALSE 0.117 217.000 0.024 1.000   NA
 911970 911971 SACOL0502 SACOL0503     TRUE 0.998 -16.000 0.690 0.019 Y NA
 911971 911972 SACOL0503 SACOL0504     FALSE 0.052 294.000 0.000 1.000 N NA
 911972 911973 SACOL0504 SACOL0505     TRUE 0.981 4.000 0.487 1.000 Y NA
 911973 911974 SACOL0505 SACOL0506     TRUE 0.829 37.000 0.000 NA Y NA
 911974 911975 SACOL0506 SACOL0507     FALSE 0.020 332.000 0.000 NA   NA
 911977 911978 SACOL0509 SACOL0510     TRUE 0.971 -10.000 0.150 1.000   NA
 911979 911980 SACOL0511 SACOL0512     TRUE 0.985 -3.000 0.957 NA   NA
 911980 911981 SACOL0512 SACOL0513   gltC FALSE 0.311 121.000 0.106 NA   NA
 911982 911983 SACOL0514 SACOL0515 gltB gltD TRUE 0.987 18.000 0.222 0.002 Y NA
 911983 911984 SACOL0515 SACOL_tRNA-Ser-1 gltD   FALSE 0.030 269.000 0.000 NA   NA
 911984 911985 SACOL_tRNA-Ser-1 SACOL0516     FALSE 0.010 471.000 0.000 NA   NA
 911985 911986 SACOL0516 SACOL0517     TRUE 0.928 64.000 0.650 1.000 Y NA
 911986 911987 SACOL0517 SACOL0518     TRUE 0.936 25.000 0.336 1.000 N NA
 911987 911988 SACOL0518 SACOL0519     FALSE 0.011 639.000 0.000 1.000   NA
 911988 911989 SACOL0519 SACOL0520   dnaX FALSE 0.549 69.000 0.103 1.000   NA
 911989 911990 SACOL0520 SACOL0521 dnaX   FALSE 0.348 90.000 0.071 NA   NA
 911990 911991 SACOL0521 SACOL0522   recR TRUE 0.938 7.000 0.604 NA   NA
 911991 911992 SACOL0522 SACOL_Sa16SA recR rrsA FALSE 0.006 853.000 0.000 NA   NA
 911992 911993 SACOL_Sa16SA SACOL_Sa23SA rrsA rrlA FALSE 0.016 365.000 0.000 NA   NA
 911993 911994 SACOL_Sa23SA SACOL_Sa5SA rrlA rrfA FALSE 0.197 73.000 0.000 NA   NA
 911994 911995 SACOL_Sa5SA SACOL0523 rrfA   FALSE 0.006 883.000 0.000 NA   NA
 911995 911996 SACOL0523 SACOL0524   tmk TRUE 0.868 2.000 0.010 1.000 N NA
 911996 911997 SACOL0524 SACOL0525 tmk   TRUE 0.731 28.000 0.038 NA   NA
 911997 911998 SACOL0525 SACOL0526     FALSE 0.086 214.000 0.021 NA   NA
 911998 911999 SACOL0526 SACOL0527     TRUE 0.954 1.000 0.372 NA   NA
 911999 912000 SACOL0527 SACOL0528     TRUE 0.893 17.000 0.183 NA   NA
 912000 912001 SACOL0528 SACOL0529     FALSE 0.133 274.000 0.193 NA   NA
 912001 912002 SACOL0529 SACOL0530     TRUE 0.972 -7.000 0.209 1.000   NA
 912002 912003 SACOL0530 SACOL0531     TRUE 0.874 2.000 0.041 1.000   NA
 912005 912006 SACOL0533 SACOL0534 metS   TRUE 0.866 31.000 0.221 NA N NA
 912006 912007 SACOL0534 SACOL0535     FALSE 0.499 167.000 0.058 NA Y NA
 912007 912008 SACOL0535 SACOL0536   ksgA TRUE 0.865 11.000 0.093 1.000 N NA
 912008 912009 SACOL0536 SACOL0537 ksgA   FALSE 0.263 100.000 0.035 NA   NA
 912009 912010 SACOL0537 SACOL0538   ispE FALSE 0.052 310.000 0.046 NA   NA
 912010 912011 SACOL0538 SACOL0539 ispE purR TRUE 0.851 14.000 0.062 1.000 N NA
 912011 912012 SACOL0539 SACOL0540 purR   TRUE 0.919 17.000 0.227 NA N NA
 912012 912013 SACOL0540 SACOL0541   spoVG FALSE 0.546 72.000 0.131 NA N NA
 912013 912014 SACOL0541 SACOL0542 spoVG   FALSE 0.062 190.000 0.000 NA   NA
 912014 912015 SACOL0542 SACOL0543   glmU TRUE 0.591 23.000 0.000 NA   NA
 912015 912016 SACOL0543 SACOL0544 glmU prsA FALSE 0.340 147.000 0.069 1.000 N NA
 912016 912017 SACOL0544 SACOL0545 prsA rplY FALSE 0.276 150.000 0.027 1.000 N NA
 912017 912018 SACOL0545 SACOL0546 rplY pth TRUE 0.558 311.000 0.496 0.034 Y NA
 912018 912019 SACOL0546 SACOL0547 pth mfd TRUE 0.947 0.000 0.137 1.000 N NA
 912019 912020 SACOL0547 SACOL0548 mfd   TRUE 0.948 -10.000 0.033 1.000   NA
 912020 912021 SACOL0548 SACOL0549     TRUE 0.914 0.000 0.058 1.000   NA
 912021 912022 SACOL0549 SACOL0550     TRUE 0.933 -3.000 0.054 1.000   NA
 912022 912023 SACOL0550 SACOL0551     TRUE 0.877 18.000 0.053 1.000 N NA
 912023 912024 SACOL0551 SACOL0552     FALSE 0.482 105.000 0.134 1.000 N NA
 912024 912025 SACOL0552 SACOL0553     FALSE 0.209 180.000 0.031 1.000 N NA
 912025 912026 SACOL0553 SACOL0554   hpt TRUE 0.927 5.000 0.067 0.055 N NA
 912026 912027 SACOL0554 SACOL0555 hpt   FALSE 0.204 257.000 0.192 1.000 N NA
 912027 912028 SACOL0555 SACOL0556     FALSE 0.343 229.000 0.041 1.000 Y NA
 912028 912029 SACOL0556 SACOL0557   cysK FALSE 0.241 179.000 0.053 1.000 N NA
 912029 912030 SACOL0557 SACOL0558 cysK folP FALSE 0.121 216.000 0.005 1.000 N NA
 912030 912031 SACOL0558 SACOL0559 folP folB TRUE 0.987 -22.000 0.024 1.000 Y NA
 912031 912032 SACOL0559 SACOL0560 folB folK TRUE 0.986 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 912032 912033 SACOL0560 SACOL0561 folK   FALSE 0.013 394.000 0.000 NA   NA
 912033 912034 SACOL0561 SACOL0562   lysS FALSE 0.309 53.000 0.000 NA   NA
 912034 912035 SACOL0562 SACOL_Sa5SG lysS rrfG FALSE 0.008 558.000 0.000 NA   NA
 912035 912036 SACOL_Sa5SG SACOL_tRNA-Ala-1 rrfG   FALSE 0.552 13.000 0.000 NA   NA
 912036 912037 SACOL_tRNA-Ala-1 SACOL_Sa16SB   rrsB FALSE 0.112 122.000 0.000 NA   NA
 912037 912038 SACOL_Sa16SB SACOL_tRNA-Ile-1 rrsB   FALSE 0.148 93.000 0.000 NA   NA
 912038 912039 SACOL_tRNA-Ile-1 SACOL_Sa23SB   rrlB FALSE 0.082 168.000 0.000 NA   NA
 912039 912040 SACOL_Sa23SB SACOL_Sa5SB rrlB rrfB FALSE 0.197 73.000 0.000 NA   NA
 912040 912041 SACOL_Sa5SB SACOL_Sa16SC rrfB rrsC FALSE 0.050 212.000 0.000 NA   NA
 912041 912042 SACOL_Sa16SC SACOL_Sa23SC rrsC rrlC FALSE 0.024 303.000 0.000 NA   NA
 912042 912043 SACOL_Sa23SC SACOL_Sa5SC rrlC rrfC FALSE 0.197 73.000 0.000 NA   NA
 912045 912046 SACOL0564 SACOL0565     TRUE 0.978 4.000 0.488 NA Y NA
 912048 912049 SACOL0567 SACOL0568 ctsR   TRUE 0.954 19.000 0.681 NA   NA
 912049 912050 SACOL0568 SACOL0569     TRUE 0.991 -10.000 0.848 1.000   NA
 912050 912051 SACOL0569 SACOL0570   clpC TRUE 0.563 14.000 0.000 NA   NA
 912051 912052 SACOL0570 SACOL0572 clpC radA FALSE 0.009 487.000 0.000 NA   NA
 912052 912053 SACOL0572 SACOL0573 radA   TRUE 0.781 25.000 0.056 NA   NA
 912053 912054 SACOL0573 SACOL0574   gltX FALSE 0.014 557.000 0.021 NA   NA
 912054 912055 SACOL0574 SACOL0575 gltX cysE FALSE 0.032 429.000 0.008 1.000 N NA
 912055 912056 SACOL0575 SACOL0576 cysE cysS TRUE 0.981 -16.000 0.039 0.054 N NA
 912056 912057 SACOL0576 SACOL0577 cysS   TRUE 0.963 -7.000 0.129 1.000   NA
 912057 912058 SACOL0577 SACOL0578     TRUE 0.944 8.000 0.150 0.004   NA
 912058 912059 SACOL0578 SACOL0579     TRUE 0.913 0.000 0.109 NA   NA
 912059 912060 SACOL0579 SACOL0580     FALSE 0.305 81.000 0.036 NA   NA
 912060 912061 SACOL0580 SACOL0581   secE FALSE 0.046 314.000 0.000 1.000 N NA
 912061 912062 SACOL0581 SACOL0582 secE nusG TRUE 0.960 13.000 0.843 1.000 N NA
 912062 912063 SACOL0582 SACOL0583 nusG rplK TRUE 0.585 172.000 0.681 1.000 N NA
 912063 912064 SACOL0583 SACOL0584 rplK rplA TRUE 0.811 208.000 0.838 0.030 Y NA
 912064 912065 SACOL0584 SACOL0585 rplA rplJ TRUE 0.575 272.000 0.302 0.030 Y NA
 912065 912066 SACOL0585 SACOL0586 rplJ rplL TRUE 0.980 43.000 0.884 0.023 Y NA
 912066 912067 SACOL0586 SACOL0587 rplL   FALSE 0.499 175.000 0.050 1.000 Y NA
 912067 912068 SACOL0587 SACOL0588   rpoB FALSE 0.127 215.000 0.008 1.000 N NA
 912068 912069 SACOL0588 SACOL0589 rpoB rpoC TRUE 0.919 137.000 0.851 0.002 Y NA
 912069 912070 SACOL0589 SACOL0590 rpoC   FALSE 0.287 137.000 0.065 NA N NA
 912070 912071 SACOL0590 SACOL0591   rpsL TRUE 0.759 98.000 0.239 NA Y NA
 912071 912072 SACOL0591 SACOL0592 rpsL rpsG TRUE 0.930 66.000 0.224 0.004 Y NA
 912072 912073 SACOL0592 SACOL0593 rpsG fusA TRUE 0.823 123.000 0.579 1.000 Y NA
 912073 912074 SACOL0593 SACOL0594 fusA tuf TRUE 0.755 217.000 0.400 0.002 Y NA
 912076 912077 SACOL0596 SACOL0597     FALSE 0.031 266.000 0.000 NA   NA
 912077 912078 SACOL0597 SACOL0598     FALSE 0.089 160.000 0.000 NA   NA
 912078 912079 SACOL0598 SACOL0599     FALSE 0.099 214.000 0.000 1.000 N NA
 912079 912080 SACOL0599 SACOL0600   ilvE FALSE 0.042 335.000 0.000 1.000 N NA
 912080 912081 SACOL0600 SACOL0601 ilvE   TRUE 0.878 -27.000 0.000 NA   NA
 912081 912082 SACOL0601 SACOL0602     FALSE 0.137 104.000 0.000 NA   NA
 912083 912084 SACOL0603 SACOL0604     TRUE 0.996 -7.000 0.255 0.002 Y NA
 912085 912086 SACOL0605 SACOL0606     FALSE 0.099 148.000 0.000 NA   NA
 912086 912087 SACOL0606 SACOL0607     TRUE 0.898 21.000 0.159 1.000   NA
 912087 912088 SACOL0607 SACOL0608   sdrC FALSE 0.018 430.000 0.000 1.000   NA
 912088 912089 SACOL0608 SACOL0609 sdrC sdrD FALSE 0.085 367.000 0.000 0.004   NA
 912089 912090 SACOL0609 SACOL0610 sdrD sdrE FALSE 0.073 394.000 0.000 0.004   NA
 912090 912091 SACOL0610 SACOL0611 sdrE   FALSE 0.179 119.000 0.000 1.000   NA
 912092 912093 SACOL0612 SACOL0613     FALSE 0.044 282.000 0.000 1.000   NA
 912093 912094 SACOL0613 SACOL0614     TRUE 0.711 13.000 0.026 NA   NA
 912094 912095 SACOL0614 SACOL0615     TRUE 0.939 14.000 0.644 NA   NA
 912096 912097 SACOL0616 SACOL0617 nagB   TRUE 0.891 77.000 0.600 1.000 Y NA
 912097 912098 SACOL0617 SACOL0618     TRUE 0.973 2.000 0.667 1.000 N NA
 912098 912099 SACOL0618 SACOL0619     FALSE 0.207 104.000 0.000 1.000   NA
 912099 912100 SACOL0619 SACOL0620   proP FALSE 0.014 502.000 0.000 1.000   NA
 912100 912101 SACOL0620 SACOL0621 proP   FALSE 0.013 544.000 0.000 1.000   NA
 912101 912102 SACOL0621 SACOL0622   atoB TRUE 0.988 2.000 0.576 1.000 Y NA
 912102 912103 SACOL0622 SACOL0623 atoB   TRUE 0.961 -25.000 0.101 NA   NA
 912103 912104 SACOL0623 SACOL0624     TRUE 0.948 3.000 0.500 NA   NA
 912105 912106 SACOL0625 SACOL0626   thiD1 FALSE 0.009 507.000 0.000 NA   NA
 912107 912108 SACOL0627 SACOL0628 ung   TRUE 0.972 1.000 0.800 NA   NA
 912108 912109 SACOL0628 SACOL0629     FALSE 0.185 133.000 0.024 NA   NA
 912109 912110 SACOL0629 SACOL0630     FALSE 0.194 121.000 0.021 NA   NA
 912111 912112 SACOL0631 SACOL0632     TRUE 0.953 13.000 1.000 NA   NA
 912112 912113 SACOL0632 SACOL0633     FALSE 0.008 549.000 0.000 NA   NA
 912114 912115 SACOL0634 SACOL0635 pta   TRUE 0.912 3.000 0.123 1.000 N NA
 912115 912116 SACOL0635 SACOL0636   mvk FALSE 0.016 587.000 0.000 1.000 N NA
 912116 912117 SACOL0636 SACOL0637 mvk mvaD TRUE 0.986 5.000 0.281 0.004 Y NA
 912117 912118 SACOL0637 SACOL0638 mvaD   TRUE 0.985 13.000 0.312 0.004 Y NA
 912118 912119 SACOL0638 SACOL0639     FALSE 0.137 177.000 0.030 NA   NA
 912120 912121 SACOL0640 SACOL0641     TRUE 0.964 -13.000 0.103 NA N NA
 912122 912123 SACOL0642 SACOL0643     FALSE 0.010 466.000 0.000 NA   NA
 912123 912124 SACOL0643 SACOL0644     TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 912124 912125 SACOL0644 SACOL0645     FALSE 0.108 126.000 0.000 NA   NA
 912125 912126 SACOL0645 SACOL0646     FALSE 0.156 88.000 0.000 NA   NA
 912126 912127 SACOL0646 SACOL0647     FALSE 0.185 75.000 0.000 NA   NA
 912127 912128 SACOL0647 SACOL0648     FALSE 0.057 196.000 0.000 NA   NA
 912128 912129 SACOL0648 SACOL0649     FALSE 0.106 131.000 0.000 NA   NA
 912129 912130 SACOL0649 SACOL0650     FALSE 0.340 47.000 0.000 NA   NA
 912130 912131 SACOL0650 SACOL0651     FALSE 0.010 453.000 0.000 NA   NA
 912131 912132 SACOL0651 SACOL0652     FALSE 0.123 115.000 0.000 NA   NA
 912132 912133 SACOL0652 SACOL0653     FALSE 0.412 37.000 0.000 NA   NA
 912133 912134 SACOL0653 SACOL0654     FALSE 0.039 235.000 0.000 NA   NA
 912134 912135 SACOL0654 SACOL0655     FALSE 0.030 270.000 0.000 NA   NA
 912135 912136 SACOL0655 SACOL0656     FALSE 0.135 211.000 0.071 NA   NA
 912136 912137 SACOL0656 SACOL0657     FALSE 0.080 169.000 0.000 NA   NA
 912137 912138 SACOL0657 SACOL0658     FALSE 0.382 40.000 0.000 NA   NA
 912138 912139 SACOL0658 SACOL0659     TRUE 0.710 28.000 0.028 NA   NA
 912139 912140 SACOL0659 SACOL0660     FALSE 0.009 499.000 0.000 NA   NA
 912140 912141 SACOL0660 SACOL0661     FALSE 0.185 75.000 0.000 NA   NA
 912141 912142 SACOL0661 SACOL0662     FALSE 0.165 81.000 0.000 NA   NA
 912142 912143 SACOL0662 SACOL0663   argS TRUE 0.924 -3.000 0.079 NA   NA
 912143 912144 SACOL0663 SACOL0664 argS   FALSE 0.037 389.000 0.004 1.000 N NA
 912144 912145 SACOL0664 SACOL0665     FALSE 0.032 379.000 0.000 1.000 N NA
 912145 912146 SACOL0665 SACOL0666     TRUE 0.580 148.000 0.046 1.000 Y NA
 912146 912147 SACOL0666 SACOL0667     TRUE 0.820 55.000 0.412 1.000   NA
 912147 912148 SACOL0667 SACOL0668     TRUE 0.993 -16.000 0.412 0.020   NA
 912148 912149 SACOL0668 SACOL0669     TRUE 0.556 136.000 0.556 NA   NA
 912149 912150 SACOL0669 SACOL0670     FALSE 0.513 162.000 0.571 NA   NA
 912150 912151 SACOL0670 SACOL0671     FALSE 0.371 169.000 0.286 NA   NA
 912152 912153 SACOL0672 SACOL0673 sarA   FALSE 0.099 148.000 0.000 NA   NA
 912153 912154 SACOL0673 SACOL0675     FALSE 0.007 681.000 0.000 NA   NA
 912154 912155 SACOL0675 SACOL0676     FALSE 0.040 231.000 0.000 NA   NA
 912155 912156 SACOL0676 SACOL0677     TRUE 0.907 17.000 0.233 NA   NA
 912157 912158 SACOL0678 SACOL0679     TRUE 0.967 19.000 0.857 1.000   NA
 912158 912159 SACOL0679 SACOL0680     TRUE 0.995 -13.000 0.636 NA Y NA
 912159 912160 SACOL0680 SACOL0681     TRUE 0.992 -3.000 0.636 NA Y NA
 912160 912161 SACOL0681 SACOL0682     TRUE 0.998 -10.000 1.000 0.003 Y NA
 912161 912162 SACOL0682 SACOL0684     TRUE 0.988 1.000 0.500 1.000 Y NA
 912162 912163 SACOL0684 SACOL0685     TRUE 0.995 -3.000 0.429 0.072 Y NA
 912163 912164 SACOL0685 SACOL0686     TRUE 0.994 -25.000 0.273 1.000 Y NA
 912164 912165 SACOL0686 SACOL0687     FALSE 0.139 340.000 0.000 1.000 Y NA
 912166 912167 SACOL0688 SACOL0689     TRUE 0.986 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 912167 912168 SACOL0689 SACOL0690     TRUE 0.991 -6.000 0.286 1.000 Y NA
 912173 912174 SACOL0695 SACOL0696   tagB TRUE 0.818 99.000 0.138 0.087 Y NA
 912174 912175 SACOL0696 SACOL0697 tagB tagX TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 912175 912176 SACOL0697 SACOL0698 tagX tagD FALSE 0.256 63.000 0.000 NA   NA
 912178 912179 SACOL0700 SACOL0701 abcA   FALSE 0.080 359.000 0.000 0.052 N NA
 912179 912180 SACOL0701 SACOL0702     FALSE 0.034 255.000 0.000 NA   NA
 912180 912181 SACOL0702 SACOL0703     FALSE 0.070 178.000 0.000 NA   NA
 912181 912182 SACOL0703 SACOL0704     FALSE 0.027 282.000 0.000 NA   NA
 912182 912183 SACOL0704 SACOL0705     TRUE 0.934 36.000 0.179 1.000 Y NA
 912183 912184 SACOL0705 SACOL0706     TRUE 0.997 -3.000 0.857 0.042 Y NA
 912184 912185 SACOL0706 SACOL0707     FALSE 0.080 237.000 0.000 1.000 N NA
 912185 912186 SACOL0707 SACOL0708     TRUE 0.972 42.000 0.316 0.001 Y NA
 912186 912187 SACOL0708 SACOL0709     TRUE 0.967 -7.000 0.155 1.000   NA
 912187 912188 SACOL0709 SACOL0710     FALSE 0.538 116.000 0.385 NA   NA
 912188 912189 SACOL0710 SACOL0711     FALSE 0.010 456.000 0.000 NA   NA
 912189 912190 SACOL0711 SACOL0712     FALSE 0.354 151.000 0.135 1.000   NA
 912190 912191 SACOL0712 SACOL0713     FALSE 0.020 329.000 0.000 NA   NA
 912193 912194 SACOL0715 SACOL0716     TRUE 0.893 7.000 0.208 NA N NA
 912194 912195 SACOL0716 SACOL0717     TRUE 0.996 -7.000 0.958 1.000 Y NA
 912195 912196 SACOL0717 SACOL0718     FALSE 0.496 144.000 0.250 1.000 N NA
 912196 912197 SACOL0718 SACOL0720     TRUE 0.989 -10.000 0.714 1.000   NA
 912197 912198 SACOL0720 SACOL0721     FALSE 0.006 725.000 0.000 NA   NA
 912198 912199 SACOL0721 SACOL0722     TRUE 0.939 16.000 0.033 NA Y NA
 912201 912202 SACOL0724 SACOL0725     FALSE 0.006 697.000 0.000 NA   NA
 912202 912203 SACOL0725 SACOL0726   sarX TRUE 0.760 80.000 0.875 NA   NA
 912203 912204 SACOL0726 SACOL0727 sarX   FALSE 0.087 190.000 0.002 NA   NA
 912204 912205 SACOL0727 SACOL0728     TRUE 0.826 0.000 0.009 NA   NA
 912205 912206 SACOL0728 SACOL0730     FALSE 0.017 353.000 0.000 NA   NA
 912206 912207 SACOL0730 SACOL0731     FALSE 0.335 116.000 0.114 NA   NA
 912207 912208 SACOL0731 SACOL0733     FALSE 0.114 339.000 0.159 1.000 N NA
 912208 912209 SACOL0733 SACOL0734     TRUE 0.896 -3.000 0.034 NA   NA
 912211 912212 SACOL0736 SACOL0737     FALSE 0.227 67.000 0.000 NA   NA
 912212 912213 SACOL0737 SACOL0738     FALSE 0.436 138.000 0.286 NA   NA
 912213 912214 SACOL0738 SACOL0739     FALSE 0.325 80.000 0.043 NA   NA
 912215 912216 SACOL0740 SACOL0741     TRUE 0.797 2.000 0.017 NA   NA
 912216 912217 SACOL0741 SACOL0742     TRUE 0.736 3.000 0.007 NA   NA
 912217 912218 SACOL0742 SACOL0743   bacA FALSE 0.076 172.000 0.000 NA   NA
 912219 912220 SACOL0744 SACOL0745     TRUE 0.994 -3.000 0.222 0.005 Y NA
 912222 912223 SACOL0747 SACOL0748     FALSE 0.214 103.000 0.012 NA   NA
 912223 912224 SACOL0748 SACOL0749     TRUE 0.566 35.000 0.012 NA   NA
 912224 912225 SACOL0749 SACOL0750     FALSE 0.027 283.000 0.000 NA   NA
 912225 912226 SACOL0750 SACOL0751     FALSE 0.359 86.000 0.010 1.000 N NA
 912227 912228 SACOL0752 SACOL0753     FALSE 0.065 186.000 0.000 NA   NA
 912229 912230 SACOL0754 SACOL0755 norA   FALSE 0.025 293.000 0.000 NA   NA
 912230 912231 SACOL0755 SACOL0756     FALSE 0.115 174.000 0.010 NA   NA
 912231 912232 SACOL0756 SACOL0757     FALSE 0.157 250.000 0.004 0.056   NA
 912232 912233 SACOL0757 SACOL0758   fruK TRUE 0.982 -3.000 0.063 1.000 Y NA
 912233 912234 SACOL0758 SACOL0759 fruK   TRUE 0.576 6.000 0.000 NA   NA
 912234 912235 SACOL0759 SACOL0761   nagA FALSE 0.022 308.000 0.000 NA   NA
 912235 912236 SACOL0761 SACOL0762 nagA   FALSE 0.070 221.000 0.000 1.000   NA
 912236 912237 SACOL0762 SACOL0763     FALSE 0.166 222.000 0.100 1.000   NA
 912237 912238 SACOL0763 SACOL0764     FALSE 0.284 132.000 0.100 NA   NA
 912239 912240 SACOL0765 SACOL0766 saeS saeR TRUE 0.990 0.000 0.500 1.000 Y NA
 912240 912241 SACOL0766 SACOL0767 saeR   TRUE 0.978 -25.000 0.250 NA   NA
 912241 912242 SACOL0767 SACOL0768     FALSE 0.018 342.000 0.000 NA   NA
 912242 912243 SACOL0768 SACOL0769     FALSE 0.027 280.000 0.000 NA   NA
 912243 912244 SACOL0769 SACOL0770     FALSE 0.337 99.000 0.080 NA   NA
 912244 912245 SACOL0770 SACOL0771     TRUE 0.940 4.000 0.307 1.000 N NA
 912245 912246 SACOL0771 SACOL0772     TRUE 0.874 2.000 0.041 1.000   NA
 912247 912248 SACOL0773 SACOL0774 pabA   TRUE 0.870 -16.000 0.000 NA   NA
 912248 912249 SACOL0774 SACOL0776     FALSE 0.016 360.000 0.000 NA   NA
 912249 912250 SACOL0776 SACOL0777     TRUE 0.997 -16.000 0.194 0.002 Y NA
 912250 912251 SACOL0777 SACOL0778     FALSE 0.020 474.000 0.000 1.000 N NA
 912251 912252 SACOL0778 SACOL0779     FALSE 0.046 277.000 0.000 1.000   NA
 912252 912253 SACOL0779 SACOL0780   recQ1 TRUE 0.771 12.000 0.022 1.000   NA
 912253 912254 SACOL0780 SACOL0781 recQ1   FALSE 0.137 222.000 0.029 1.000 N NA
 912254 912255 SACOL0781 SACOL0783   opuBB TRUE 0.984 -7.000 0.382 1.000 N NA
 912255 912256 SACOL0783 SACOL0784 opuBB hisC FALSE 0.120 240.000 0.027 1.000 N NA
 912256 912257 SACOL0784 SACOL0785 hisC   FALSE 0.056 351.000 0.102 NA   NA
 912257 912258 SACOL0785 SACOL0786     FALSE 0.125 113.000 0.000 NA   NA
 912259 912260 SACOL0787 SACOL0788     FALSE 0.118 270.000 0.057 1.000 N NA
 912260 912261 SACOL0788 SACOL0789     FALSE 0.030 341.000 0.000 1.000   NA
 912261 912262 SACOL0789 SACOL0790     TRUE 0.776 20.000 0.005 1.000   NA
 912263 912264 SACOL0790.1 SACOL0791   nrdI FALSE 0.098 150.000 0.000 NA   NA
 912264 912265 SACOL0791 SACOL0792 nrdI nrdE TRUE 0.998 -37.000 0.533 0.001 Y NA
 912265 912266 SACOL0792 SACOL0793 nrdE nrdF TRUE 0.936 118.000 0.875 0.001 Y NA
 912266 912267 SACOL0793 SACOL0794 nrdF   FALSE 0.105 133.000 0.000 NA   NA
 912267 912268 SACOL0794 SACOL0796     FALSE 0.010 471.000 0.000 NA   NA
 912268 912269 SACOL0796 SACOL0797     TRUE 0.998 -13.000 0.870 0.042 Y NA
 912269 912270 SACOL0797 SACOL0798     TRUE 0.995 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 912270 912271 SACOL0798 SACOL0799     TRUE 0.604 119.000 0.031 1.000 Y NA
 912272 912273 SACOL0800 SACOL0801   murB TRUE 0.808 18.000 0.014 1.000   NA
 912273 912274 SACOL0801 SACOL0802 murB   FALSE 0.173 127.000 0.014 NA   NA
 912275 912276 SACOL0803 SACOL0804     FALSE 0.235 154.000 0.069 NA   NA
 912276 912277 SACOL0804 SACOL0805     FALSE 0.012 425.000 0.000 NA   NA
 912278 912279 SACOL0806 SACOL0807 pepT   TRUE 0.832 14.000 0.127 NA   NA
 912279 912280 SACOL0807 SACOL0808     TRUE 0.963 18.000 0.875 NA   NA
 912280 912281 SACOL0808 SACOL0809     FALSE 0.148 196.000 0.067 NA   NA
 912284 912285 SACOL0812 SACOL0813     FALSE 0.081 364.000 0.214 NA   NA
 912285 912286 SACOL0813 SACOL0814     TRUE 0.963 -7.000 0.130 1.000   NA
 912286 912287 SACOL0814 SACOL0815     FALSE 0.531 61.000 0.080 NA   NA
 912287 912288 SACOL0815 SACOL0816   secA FALSE 0.035 414.000 0.041 NA N NA
 912288 912289 SACOL0816 SACOL0817 secA   FALSE 0.368 42.000 0.000 NA   NA
 912289 912290 SACOL0817 SACOL0818   prfB FALSE 0.080 169.000 0.000 NA   NA
 912290 912291 SACOL0818 SACOL0819 prfB   FALSE 0.095 154.000 0.000 NA   NA
 912291 912292 SACOL0819 SACOL0820     FALSE 0.099 148.000 0.000 NA   NA
 912292 912293 SACOL0820 SACOL0821     FALSE 0.159 174.000 0.010 1.000   NA
 912293 912294 SACOL0821 SACOL0822     TRUE 0.929 -3.000 0.093 NA   NA
 912294 912295 SACOL0822 SACOL0823   uvrB FALSE 0.048 263.000 0.007 NA   NA
 912295 912296 SACOL0823 SACOL0824 uvrB uvrA TRUE 0.982 8.000 0.154 0.001 Y NA
 912296 912297 SACOL0824 SACOL0825 uvrA hprK FALSE 0.020 607.000 0.002 1.000 N NA
 912297 912298 SACOL0825 SACOL0826 hprK lgt TRUE 0.949 6.000 0.494 1.000 N NA
 912298 912299 SACOL0826 SACOL0827 lgt   TRUE 0.808 8.000 0.045 1.000   NA
 912299 912300 SACOL0827 SACOL0828     TRUE 0.885 8.000 0.169 1.000   NA
 912300 912301 SACOL0828 SACOL0829   trxB TRUE 0.647 67.000 0.183 1.000   NA
 912301 912302 SACOL0829 SACOL0830 trxB   FALSE 0.016 710.000 0.050 NA   NA
 912302 912303 SACOL0830 SACOL0831     TRUE 0.956 -3.000 0.214 NA   NA
 912303 912304 SACOL0831 SACOL0832     TRUE 0.587 110.000 0.470 NA   NA
 912310 912311 SACOL0837 SACOL0838 gapR gapA1 TRUE 0.681 53.000 0.076 1.000 N NA
 912311 912312 SACOL0838 SACOL0839 gapA1 pgk TRUE 0.702 139.000 0.006 0.006 Y NA
 912312 912313 SACOL0839 SACOL0840 pgk tpiA TRUE 0.685 122.000 0.141 1.000 Y NA
 912313 912314 SACOL0840 SACOL0841 tpiA pgm TRUE 0.968 3.000 0.138 1.000 Y NA
 912314 912315 SACOL0841 SACOL0842 pgm eno TRUE 0.667 130.000 0.136 1.000 Y NA
 912315 912316 SACOL0842 SACOL0843 eno   FALSE 0.028 340.000 0.005 NA   NA
 912316 912317 SACOL0843 SACOL0844   secG FALSE 0.313 67.000 0.007 NA   NA
 912317 912318 SACOL0844 SACOL0845 secG est FALSE 0.289 116.000 0.032 1.000   NA
 912318 912319 SACOL0845 SACOL0846 est   TRUE 0.747 34.000 0.060 1.000   NA
 912319 912320 SACOL0846 SACOL0847   smpB TRUE 0.950 22.000 0.143 0.023 N NA
 912320 912321 SACOL0847 SACOL_SatmRNA1 smpB   FALSE 0.151 91.000 0.000 NA   NA
 912321 912322 SACOL_SatmRNA1 SACOL0848     FALSE 0.021 325.000 0.000 NA   NA
 912323 912324 SACOL0849 SACOL0850     TRUE 0.613 16.000 0.000 NA   NA
 912324 912325 SACOL0850 SACOL0851     FALSE 0.061 192.000 0.000 NA   NA
 912326 912327 SACOL0853 SACOL0854     TRUE 0.563 8.000 0.000 NA   NA
 912327 912328 SACOL0854 SACOL0855     FALSE 0.102 139.000 0.000 NA   NA
 912328 912329 SACOL0855 SACOL0856   clfA FALSE 0.051 263.000 0.000 1.000   NA
 912329 912330 SACOL0856 SACOL0857 clfA   FALSE 0.044 221.000 0.000 NA   NA
 912330 912331 SACOL0857 SACOL0858   empbp FALSE 0.017 351.000 0.000 NA   NA
 912331 912332 SACOL0858 SACOL0859 empbp   FALSE 0.019 335.000 0.000 NA   NA
 912332 912333 SACOL0859 SACOL0860   nuc FALSE 0.019 341.000 0.000 NA   NA
 912333 912334 SACOL0860 SACOL0861 nuc   FALSE 0.035 357.000 0.000 1.000 N NA
 912335 912336 SACOL0862 SACOL0863     TRUE 0.815 62.000 0.667 NA   NA
 912336 912337 SACOL0863 SACOL0864     FALSE 0.156 88.000 0.000 NA   NA
 912337 912338 SACOL0864 SACOL0865     FALSE 0.013 405.000 0.000 NA   NA
 912338 912339 SACOL0865 SACOL0866     FALSE 0.023 305.000 0.000 NA   NA
 912339 912340 SACOL0866 SACOL0868     FALSE 0.105 132.000 0.000 NA   NA
 912342 912343 SACOL0870 SACOL0871     FALSE 0.380 155.000 0.167 1.000   NA
 912343 912344 SACOL0871 SACOL0872     FALSE 0.021 399.000 0.000 1.000   NA
 912345 912346 SACOL0873 SACOL0874 aroD   FALSE 0.393 83.000 0.022 1.000 N NA
 912348 912349 SACOL0876 SACOL0877   gcvH FALSE 0.411 158.000 0.170 1.000 N NA
 912349 912350 SACOL0877 SACOL0879 gcvH   FALSE 0.070 179.000 0.000 NA   NA
 912350 912351 SACOL0879 SACOL0880     FALSE 0.006 742.000 0.000 NA   NA
 912351 912352 SACOL0880 SACOL0881     TRUE 0.980 -7.000 0.443 NA   NA
 912352 912353 SACOL0881 SACOL0882     FALSE 0.035 250.000 0.000 NA   NA
 912353 912354 SACOL0882 SACOL0883     TRUE 0.995 -7.000 0.642 1.000 Y NA
 912354 912355 SACOL0883 SACOL0884     TRUE 0.953 18.000 0.085 NA Y NA
 912356 912357 SACOL0885 SACOL0886   sek FALSE 0.232 89.000 0.000 1.000   NA
 912357 912358 SACOL0886 SACOL0887 sek sei TRUE 0.881 24.000 0.000 0.014   NA
 912358 912359 SACOL0887 SACOL0888 sei   FALSE 0.209 70.000 0.000 NA   NA
 912359 912360 SACOL0888 SACOL0889     TRUE 0.628 17.000 0.000 NA   NA
 912360 912361 SACOL0889 SACOL0890     TRUE 0.894 12.000 0.286 NA   NA
 912362 912363 SACOL0891 SACOL0892     TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 912363 912364 SACOL0892 SACOL0893     TRUE 0.953 12.000 1.000 NA   NA
 912364 912365 SACOL0893 SACOL0894     TRUE 0.988 -7.000 1.000 NA   NA
 912365 912366 SACOL0894 SACOL0895     TRUE 0.643 3.000 0.000 NA   NA
 912366 912367 SACOL0895 SACOL0896     FALSE 0.247 64.000 0.000 NA   NA
 912367 912368 SACOL0896 SACOL0897     TRUE 0.965 17.000 1.000 NA   NA
 912368 912369 SACOL0897 SACOL0898     FALSE 0.024 301.000 0.000 NA   NA
 912369 912370 SACOL0898 SACOL0899     TRUE 0.973 2.000 1.000 NA   NA
 912370 912371 SACOL0899 SACOL0900     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 912371 912372 SACOL0900 SACOL0901     FALSE 0.009 517.000 0.000 NA   NA
 912372 912373 SACOL0901 SACOL0902     TRUE 0.555 12.000 0.000 NA   NA
 912373 912374 SACOL0902 SACOL0903     TRUE 0.627 18.000 0.000 NA   NA
 912374 912375 SACOL0903 SACOL0904     FALSE 0.320 51.000 0.000 NA   NA
 912375 912376 SACOL0904 SACOL0905     TRUE 0.643 3.000 0.000 NA   NA
 912376 912377 SACOL0905 SACOL0906     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 912377 912378 SACOL0906 SACOL0907   seb FALSE 0.036 308.000 0.000 1.000   NA
 912380 912381 SACOL0909 SACOL0910     FALSE 0.206 71.000 0.000 NA   NA
 912381 912382 SACOL0910 SACOL0911     TRUE 0.866 -13.000 0.000 NA   NA
 912382 912383 SACOL0911 SACOL0912     FALSE 0.006 831.000 0.000 NA   NA
 912385 912386 SACOL0914 SACOL0915   sufD TRUE 0.740 98.000 0.139 1.000 Y NA
 912386 912387 SACOL0915 SACOL0916 sufD   TRUE 0.687 115.000 0.606 1.000 N NA
 912387 912388 SACOL0916 SACOL0917     TRUE 0.983 -10.000 0.292 1.000 N NA
 912388 912389 SACOL0917 SACOL0918   sufB TRUE 0.640 151.000 0.152 0.002 N NA
 912389 912390 SACOL0918 SACOL0919 sufB   FALSE 0.064 187.000 0.000 NA   NA
 912392 912393 SACOL0921 SACOL0922     TRUE 0.803 14.000 0.085 NA   NA
 912393 912394 SACOL0922 SACOL0924     FALSE 0.136 213.000 0.079 NA   NA
 912394 912395 SACOL0924 SACOL0925     TRUE 0.897 13.000 0.303 NA   NA
 912395 912396 SACOL0925 SACOL0926     TRUE 0.916 27.000 0.299 1.000   NA
 912396 912397 SACOL0926 SACOL0927   lipA FALSE 0.369 84.000 0.012 1.000 N NA
 912397 912398 SACOL0927 SACOL0928 lipA   FALSE 0.192 121.000 0.021 NA   NA
 912400 912401 SACOL0930 SACOL0931     TRUE 0.946 0.000 0.237 NA   NA
 912401 912402 SACOL0931 SACOL0932     TRUE 0.889 33.000 0.082 0.059 N NA
 912402 912403 SACOL0932 SACOL0933     FALSE 0.034 254.000 0.000 NA   NA
 912403 912404 SACOL0933 SACOL0934     FALSE 0.333 48.000 0.000 NA   NA
 912404 912405 SACOL0934 SACOL0935   dltA TRUE 0.944 16.000 0.549 NA   NA
 912405 912406 SACOL0935 SACOL0936 dltA dltB TRUE 0.977 -3.000 0.435 NA N NA
 912406 912407 SACOL0936 SACOL0937 dltB dltC TRUE 0.934 18.000 0.387 NA   NA
 912407 912408 SACOL0937 SACOL0938 dltC dltD TRUE 0.918 -3.000 0.064 NA   NA
 912412 912413 SACOL0942 SACOL0943     TRUE 0.675 13.000 0.012 NA   NA
 912413 912414 SACOL0943 SACOL0944     FALSE 0.010 454.000 0.000 NA   NA
 912414 912415 SACOL0944 SACOL0945     FALSE 0.379 131.000 0.097 1.000 N NA
 912415 912416 SACOL0945 SACOL0946     FALSE 0.034 411.000 0.025 1.000   NA
 912416 912417 SACOL0946 SACOL0947     TRUE 0.806 19.000 0.052 NA   NA
 912418 912419 SACOL0948 SACOL0949   mnhG FALSE 0.253 249.000 0.364 NA N NA
 912419 912420 SACOL0949 SACOL0950 mnhG mnhF TRUE 0.994 -22.000 0.244 1.000 Y NA
 912420 912421 SACOL0950 SACOL0951 mnhF mnhE TRUE 0.995 0.000 0.829 0.069 Y NA
 912421 912422 SACOL0951 SACOL0952 mnhE mnhD TRUE 0.995 2.000 0.842 0.005 Y NA
 912422 912423 SACOL0952 SACOL0953 mnhD mnhC TRUE 0.996 -7.000 0.211 0.003 Y NA
 912423 912424 SACOL0953 SACOL0954 mnhC mnhB TRUE 0.980 0.000 0.195 NA Y NA
 912424 912425 SACOL0954 SACOL0955 mnhB mnhA TRUE 0.993 -7.000 0.439 NA Y NA
 912425 912426 SACOL0955 SACOL0956 mnhA kapB FALSE 0.387 131.000 0.206 NA   NA
 912427 912428 SACOL0957 SACOL0958     FALSE 0.063 416.000 0.110 1.000 N NA
 912428 912429 SACOL0958 SACOL0959     FALSE 0.054 362.000 0.027 1.000 N NA
 912429 912430 SACOL0959 SACOL0960   rocD2 FALSE 0.048 308.000 0.000 1.000 N NA
 912430 912431 SACOL0960 SACOL0961 rocD2 gluD TRUE 0.620 109.000 0.019 1.000 Y NA
 912432 912433 SACOL0962 SACOL0963   argH FALSE 0.096 242.000 0.003 1.000 N NA
 912433 912434 SACOL0963 SACOL0964 argH argG TRUE 0.993 -10.000 0.278 1.000 Y NA
 912434 912435 SACOL0964 SACOL0965 argG   FALSE 0.100 145.000 0.000 NA   NA
 912436 912437 SACOL0966 SACOL0967 pgi   FALSE 0.030 325.000 0.005 NA   NA
 912437 912438 SACOL0967 SACOL0968   spsA TRUE 0.839 5.000 0.115 NA   NA
 912438 912439 SACOL0968 SACOL0969 spsA spsB TRUE 0.984 7.000 0.184 0.001 Y NA
 912439 912440 SACOL0969 SACOL0970 spsB rexB FALSE 0.297 160.000 0.057 1.000 N NA
 912440 912441 SACOL0970 SACOL0971 rexB rexA TRUE 0.994 1.000 0.408 0.002 Y NA
 912441 912442 SACOL0971 SACOL0973 rexA   FALSE 0.303 166.000 0.075 1.000 N NA
 912442 912443 SACOL0973 SACOL0974     FALSE 0.040 329.000 0.028 NA   NA
 912444 912445 SACOL0975 SACOL0976     TRUE 0.735 52.000 0.171 1.000   NA
 912446 912447 SACOL0977 SACOL0978     FALSE 0.008 547.000 0.000 NA   NA
 912447 912448 SACOL0978 SACOL0979   clpB FALSE 0.112 203.000 0.000 1.000 N NA
 912450 912451 SACOL0981 SACOL0982     TRUE 0.907 -16.000 0.000 NA N NA
 912451 912452 SACOL0982 SACOL0983     TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 912452 912453 SACOL0983 SACOL0984     TRUE 0.870 -16.000 0.000 NA   NA
 912453 912454 SACOL0984 SACOL0985     FALSE 0.022 311.000 0.000 NA   NA
 912456 912457 SACOL0987 SACOL0988 fabH fabF TRUE 0.914 12.000 0.000 1.000 Y NA
 912459 912460 SACOL0990 SACOL0991   oppB TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 912460 912461 SACOL0991 SACOL0992 oppB oppC TRUE 0.986 0.000 0.062 0.039 Y NA
 912461 912462 SACOL0992 SACOL0993 oppC oppD TRUE 0.988 17.000 0.857 1.000 Y NA
 912462 912463 SACOL0993 SACOL0994 oppD oppF TRUE 0.995 -10.000 0.121 0.002 Y NA
 912463 912464 SACOL0994 SACOL0995 oppF   TRUE 0.961 18.000 0.091 1.000 Y NA
 912464 912465 SACOL0995 SACOL0996     FALSE 0.449 212.000 0.000 0.039 Y NA
 912465 912466 SACOL0996 SACOL0997     TRUE 0.800 51.000 0.000 1.000 Y NA
 912466 912467 SACOL0997 SACOL0998     TRUE 0.991 3.000 0.333 0.001 Y NA
 912467 912468 SACOL0998 SACOL0999     TRUE 0.985 -7.000 0.045 1.000 Y NA
 912468 912469 SACOL0999 SACOL1000     TRUE 0.975 12.000 0.159 0.039 Y NA
 912471 912472 SACOL1002 SACOL1003     FALSE 0.051 371.000 0.063 NA N NA
 912472 912473 SACOL1003 SACOL1004     FALSE 0.301 121.000 0.098 NA   NA
 912473 912474 SACOL1004 SACOL1005   pepF TRUE 0.601 48.000 0.075 NA   NA
 912475 912476 SACOL1006 SACOL1007     TRUE 0.854 23.000 0.138 NA   NA
 912476 912477 SACOL1007 SACOL1008     FALSE 0.371 104.000 0.063 1.000   NA
 912478 912479 SACOL1009 SACOL1010   relA1 TRUE 0.918 17.000 0.283 NA   NA
 912479 912480 SACOL1010 SACOL1011 relA1   TRUE 0.964 17.000 0.725 1.000   NA
 912480 912481 SACOL1011 SACOL1012     TRUE 0.981 -3.000 0.480 1.000 N NA
 912481 912482 SACOL1012 SACOL1013   mgtE TRUE 0.913 21.000 0.163 1.000 N NA
 912482 912483 SACOL1013 SACOL1014 mgtE   TRUE 0.559 10.000 0.000 NA   NA
 912483 912484 SACOL1014 SACOL1016   fabI FALSE 0.028 278.000 0.000 NA   NA
 912486 912487 SACOL1018 SACOL1019     FALSE 0.142 142.000 0.000 NA N NA
 912487 912488 SACOL1019 SACOL1020     FALSE 0.334 194.000 0.287 NA N NA
 912489 912490 SACOL1021 SACOL1022   ypfP TRUE 0.984 -22.000 0.239 1.000 N NA
 912491 912492 SACOL1023 SACOL1024 murE   TRUE 0.898 -7.000 0.012 NA   NA
 912492 912493 SACOL1024 SACOL1025   prfC TRUE 0.826 0.000 0.009 NA   NA
 912493 912494 SACOL1025 SACOL1026 prfC   FALSE 0.050 302.000 0.000 1.000 N NA
 912494 912495 SACOL1026 SACOL1027     FALSE 0.280 59.000 0.000 NA   NA
 912495 912496 SACOL1027 SACOL1028   htrA FALSE 0.170 80.000 0.000 NA   NA
 912496 912497 SACOL1028 SACOL1030 htrA   TRUE 0.897 17.000 0.096 1.000 N NA
 912497 912498 SACOL1030 SACOL1031     FALSE 0.345 139.000 0.068 1.000 N NA
 912499 912500 SACOL_tRNA-Ser-2 SACOL_tRNA-Asn-1     TRUE 0.643 3.000 0.000 NA   NA
 912500 912501 SACOL_tRNA-Asn-1 SACOL1032     FALSE 0.102 142.000 0.000 NA   NA
 912504 912505 SACOL1035 SACOL1036     TRUE 0.870 15.000 0.167 NA   NA
 912505 912506 SACOL1036 SACOL1037     FALSE 0.030 272.000 0.000 NA   NA
 912506 912507 SACOL1037 SACOL1038     FALSE 0.006 966.000 0.000 NA   NA
 912507 912508 SACOL1038 SACOL1039     TRUE 0.643 3.000 0.000 NA   NA
 912508 912509 SACOL1039 SACOL1040     TRUE 0.976 -3.000 0.500 NA   NA
 912511 912512 SACOL1042 SACOL1043     TRUE 0.576 6.000 0.000 NA   NA
 912515 912516 SACOL1046 SACOL1047     FALSE 0.247 64.000 0.000 NA   NA
 912519 912520 SACOL1050 SACOL1051     FALSE 0.178 77.000 0.000 NA   NA
 912520 912521 SACOL1051 SACOL1052   menD TRUE 0.991 -13.000 0.142 1.000 Y NA
 912521 912522 SACOL1052 SACOL1053 menD   TRUE 0.984 -13.000 0.355 NA N NA
 912522 912523 SACOL1053 SACOL1054   menB TRUE 0.976 -7.000 0.280 NA N NA
 912524 912525 SACOL1055 SACOL1056 sspC sspB1 FALSE 0.522 38.000 0.000 1.000   NA
 912525 912526 SACOL1056 SACOL1057 sspB1 sspA FALSE 0.482 82.000 0.000 0.030   NA
 912526 912527 SACOL1057 SACOL1058 sspA   FALSE 0.066 528.000 0.000 1.000 Y NA
 912527 912528 SACOL1058 SACOL1059     FALSE 0.288 196.000 0.158 1.000 N NA
 912530 912531 SACOL1062 SACOL1063 atl   FALSE 0.067 228.000 0.000 1.000   NA
 912531 912532 SACOL1063 SACOL1064     FALSE 0.456 155.000 0.364 NA   NA
 912532 912533 SACOL1064 SACOL1065     TRUE 0.873 48.000 0.800 NA   NA
 912535 912536 SACOL1067 SACOL1068 qoxD qoxC TRUE 0.985 9.000 0.959 1.000 Y NA
 912536 912537 SACOL1068 SACOL1069 qoxC qoxA TRUE 0.998 -10.000 0.957 0.029 Y NA
 912537 912538 SACOL1069 SACOL1070 qoxA qoxB TRUE 0.995 0.000 0.489 0.004 Y NA
 912538 912539 SACOL1070 SACOL1071 qoxB   FALSE 0.008 572.000 0.000 NA   NA
 912539 912540 SACOL1071 SACOL1072   folD FALSE 0.006 806.000 0.000 NA   NA
 912541 912542 SACOL1073 SACOL1074 purE purK TRUE 0.994 -13.000 0.008 0.001 Y NA
 912542 912543 SACOL1074 SACOL1075 purK purC TRUE 0.943 4.000 0.015 1.000 Y NA
 912543 912544 SACOL1075 SACOL1076 purC purS TRUE 0.990 0.000 0.460 1.000 Y NA
 912544 912545 SACOL1076 SACOL1077 purS purQ TRUE 0.995 2.000 0.656 0.001 Y NA
 912545 912546 SACOL1077 SACOL1078 purQ purL TRUE 0.997 -7.000 0.346 0.001 Y NA
 912546 912547 SACOL1078 SACOL1079 purL purF TRUE 0.993 -21.000 0.223 1.000 Y NA
 912547 912548 SACOL1079 SACOL1080 purF purM TRUE 0.992 -7.000 0.248 1.000 Y NA
 912548 912549 SACOL1080 SACOL1081 purM purN TRUE 0.988 3.000 0.238 0.003 Y NA
 912549 912550 SACOL1081 SACOL1082 purN purH TRUE 0.969 15.000 0.225 1.000 Y NA
 912550 912551 SACOL1082 SACOL1083 purH purD TRUE 0.971 22.000 0.238 1.000 Y NA
 912552 912553 SACOL1084 SACOL1085     TRUE 0.984 -7.000 0.469 1.000   NA
 912553 912554 SACOL1085 SACOL1086     TRUE 0.896 15.000 0.241 NA   NA
 912554 912555 SACOL1086 SACOL1087     FALSE 0.007 647.000 0.000 NA   NA
 912556 912557 SACOL1088 SACOL1089     FALSE 0.029 425.000 0.050 NA   NA
 912557 912558 SACOL1089 SACOL1090     TRUE 0.597 54.000 0.100 NA   NA
 912558 912559 SACOL1090 SACOL1091   ptsH FALSE 0.206 154.000 0.047 NA   NA
 912559 912560 SACOL1091 SACOL1092 ptsH ptsI TRUE 0.979 3.000 0.054 0.013 Y NA
 912562 912563 SACOL1094 SACOL1095 cydA cydB TRUE 0.997 -3.000 0.778 0.029 Y NA
 912563 912564 SACOL1095 SACOL1096 cydB   FALSE 0.443 133.000 0.163 1.000 N NA
 912565 912566 SACOL1097 SACOL1098     FALSE 0.104 134.000 0.000 NA   NA
 912566 912567 SACOL1098 SACOL1099     TRUE 0.971 0.000 0.576 NA   NA
 912567 912568 SACOL1099 SACOL1100   def1 FALSE 0.018 481.000 0.025 NA   NA
 912569 912570 SACOL1101 SACOL1102   pdhA FALSE 0.170 171.000 0.046 NA   NA
 912570 912571 SACOL1102 SACOL1103 pdhA pdhB TRUE 0.991 4.000 0.484 0.002 Y NA
 912571 912572 SACOL1103 SACOL1104 pdhB pdhC TRUE 0.933 91.000 0.883 0.057 Y NA
 912572 912573 SACOL1104 SACOL1105 pdhC pdhD TRUE 0.987 4.000 0.948 1.000 Y NA
 912573 912574 SACOL1105 SACOL1106 pdhD   FALSE 0.228 168.000 0.096 NA   NA
 912574 912575 SACOL1106 SACOL1107     FALSE 0.196 144.000 0.034 NA   NA
 912575 912576 SACOL1107 SACOL1108     TRUE 0.928 13.000 0.326 1.000 N NA
 912576 912577 SACOL1108 SACOL1109     TRUE 0.998 -7.000 0.928 0.039 Y NA
 912577 912578 SACOL1109 SACOL1110     TRUE 0.987 6.000 0.492 0.039 Y NA
 912578 912579 SACOL1110 SACOL1111     TRUE 0.991 0.000 0.253 0.039 Y NA
 912579 912580 SACOL1111 SACOL1112     FALSE 0.429 74.000 0.089 NA   NA
 912580 912581 SACOL1112 SACOL1113     FALSE 0.027 283.000 0.000 NA   NA
 912582 912583 SACOL1114 SACOL1115     FALSE 0.139 184.000 0.041 NA   NA
 912587 912588 SACOL1119 SACOL1120     TRUE 0.914 2.000 0.173 NA   NA
 912589 912590 SACOL1121 SACOL1122     FALSE 0.022 314.000 0.000 NA   NA
 912590 912591 SACOL1122 SACOL1123   pyc FALSE 0.017 554.000 0.000 1.000 N NA
 912593 912594 SACOL1125 SACOL1126 ctaB   TRUE 0.731 25.000 0.027 NA   NA
 912594 912595 SACOL1126 SACOL1127     FALSE 0.050 212.000 0.000 NA   NA
 912595 912596 SACOL1127 SACOL1128     FALSE 0.325 50.000 0.000 NA   NA
 912596 912597 SACOL1128 SACOL1129     TRUE 0.918 16.000 0.301 NA   NA
 912601 912602 SACOL1133 SACOL1134   kdtB TRUE 0.961 2.000 0.367 1.000 N NA
 912604 912605 SACOL1136 SACOL1137   rpmF TRUE 0.699 80.000 0.599 NA   NA
 912606 912607 SACOL1138 SACOL1140 isdB isdA FALSE 0.508 203.000 0.000 0.009 Y NA
 912608 912609 SACOL1141 SACOL1142 isdC isdD TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 912609 912610 SACOL1142 SACOL1143 isdD   TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 912610 912611 SACOL1143 SACOL1144     TRUE 0.984 13.000 0.877 1.000 Y NA
 912611 912612 SACOL1144 SACOL1145   srtB FALSE 0.263 62.000 0.000 NA   NA
 912612 912613 SACOL1145 SACOL1146 srtB   TRUE 0.813 19.000 0.058 NA   NA
 912613 912614 SACOL1146 SACOL1147     FALSE 0.023 384.000 0.000 1.000   NA
 912614 912615 SACOL1147 SACOL1148   pheS FALSE 0.127 381.000 0.006 1.000 Y NA
 912615 912616 SACOL1148 SACOL1149 pheS pheT TRUE 0.996 0.000 0.574 0.001 Y NA
 912618 912619 SACOL1151 SACOL1152     TRUE 0.891 1.000 0.091 NA   NA
 912619 912620 SACOL1152 SACOL1153     FALSE 0.481 73.000 0.066 1.000   NA
 912620 912621 SACOL1153 SACOL1154     TRUE 0.953 10.000 0.114 1.000 Y NA
 912621 912622 SACOL1154 SACOL1155   trxA FALSE 0.171 173.000 0.018 1.000   NA
 912624 912625 SACOL1157 SACOL1158 uvrC sdhC FALSE 0.044 324.000 0.000 1.000 N NA
 912625 912626 SACOL1158 SACOL1159 sdhC sdhA TRUE 0.955 52.000 0.184 0.001 Y NA
 912626 912627 SACOL1159 SACOL1160 sdhA sdhB TRUE 0.993 0.000 0.231 0.001 Y NA
 912627 912628 SACOL1160 SACOL1161 sdhB murI FALSE 0.100 236.000 0.002 1.000 N NA
 912628 912629 SACOL1161 SACOL1162 murI   TRUE 0.821 12.000 0.034 1.000 N NA
 912629 912630 SACOL1162 SACOL1163     TRUE 0.956 -7.000 0.085 1.000   NA
 912630 912631 SACOL1163 SACOL1164     FALSE 0.009 489.000 0.000 NA   NA
 912631 912632 SACOL1164 SACOL1165     FALSE 0.077 171.000 0.000 NA   NA
 912634 912635 SACOL1167 SACOL1168   efb FALSE 0.033 259.000 0.000 NA   NA
 912635 912636 SACOL1168 SACOL1169 efb   FALSE 0.095 154.000 0.000 NA   NA
 912636 912637 SACOL1169 SACOL1170     FALSE 0.012 426.000 0.000 NA   NA
 912638 912639 SACOL1171 SACOL1172     FALSE 0.007 622.000 0.000 NA   NA
 912639 912640 SACOL1172 SACOL1173   hlY FALSE 0.009 477.000 0.000 NA   NA
 912641 912642 SACOL1174 SACOL1175     TRUE 0.870 -16.000 0.000 NA   NA
 11516848 912641   SACOL1174     FALSE NA 337.000 0.000 NA   NA
 11659211 912641   SACOL1174     FALSE NA 337.000 0.000 NA   NA
 11801603 912641   SACOL1174     FALSE NA 337.000 0.000 NA   NA
 11516849 912641   SACOL1174     FALSE NA 356.000 0.000 NA   NA
 11659212 912641   SACOL1174     FALSE NA 356.000 0.000 NA   NA
 11801604 912641   SACOL1174     FALSE NA 356.000 0.000 NA   NA
 11516850 912641   SACOL1174     FALSE NA 393.000 0.000 NA   NA
 11659213 912641   SACOL1174     FALSE NA 393.000 0.000 NA   NA
 11801605 912641   SACOL1174     FALSE NA 393.000 0.000 NA   NA
 11516851 912641   SACOL1174     FALSE NA 412.000 0.000 NA   NA
 11659214 912641   SACOL1174     FALSE NA 412.000 0.000 NA   NA
 11801606 912641   SACOL1174     FALSE NA 412.000 0.000 NA   NA
 11516852 912641   SACOL1174     FALSE NA 449.000 0.000 NA   NA
 11659215 912641   SACOL1174     FALSE NA 449.000 0.000 NA   NA
 11801607 912641   SACOL1174     FALSE NA 449.000 0.000 NA   NA
 11516853 912641   SACOL1174     FALSE NA 468.000 0.000 NA   NA
 11659216 912641   SACOL1174     FALSE NA 468.000 0.000 NA   NA
 11801608 912641   SACOL1174     FALSE NA 468.000 0.000 NA   NA
 11516854 912641   SACOL1174     FALSE NA 505.000 0.000 NA   NA
 11659217 912641   SACOL1174     FALSE NA 505.000 0.000 NA   NA
 11801609 912641   SACOL1174     FALSE NA 505.000 0.000 NA   NA
 912645 912646 SACOL1178 SACOL1179     FALSE 0.450 108.000 0.000 0.013   NA
 912646 912647 SACOL1179 SACOL1180     FALSE 0.478 95.000 0.000 0.013   NA
 912648 912649 SACOL1181 SACOL1182 arcB1 arcC1 TRUE 0.987 23.000 1.000 1.000 Y NA
 912649 912650 SACOL1182 SACOL1183 arcC1   FALSE 0.119 172.000 0.000 1.000   NA
 912654 912655 SACOL1186 SACOL1187     TRUE 0.909 57.000 0.500 0.013   NA
 912655 912656 SACOL1187 SACOL1188     FALSE 0.169 124.000 0.000 1.000   NA
 912658 912659 SACOL1190 SACOL1191   mraZ FALSE 0.181 144.000 0.025 NA   NA
 912659 912660 SACOL1191 SACOL1192 mraZ   TRUE 0.949 16.000 0.635 NA   NA
 912660 912661 SACOL1192 SACOL1193     TRUE 0.844 29.000 0.077 1.000 N NA
 912661 912662 SACOL1193 SACOL1194   pbp1 TRUE 0.989 -19.000 0.456 1.000 N NA
 912662 912663 SACOL1194 SACOL1195 pbp1 mraY FALSE 0.237 292.000 0.038 1.000 Y NA
 912663 912664 SACOL1195 SACOL1196 mraY murD TRUE 0.994 2.000 0.647 0.007 Y NA
 912664 912665 SACOL1196 SACOL1197 murD divIB TRUE 0.930 16.000 0.008 NA Y NA
 912665 912666 SACOL1197 SACOL1198 divIB ftsA TRUE 0.601 106.000 0.389 NA N NA
 912666 912667 SACOL1198 SACOL1199 ftsA ftsZ TRUE 0.965 33.000 0.460 1.000 Y NA
 912667 912668 SACOL1199 SACOL1200 ftsZ   FALSE 0.096 260.000 0.082 NA   NA
 912668 912669 SACOL1200 SACOL1201     TRUE 0.822 18.000 0.061 NA   NA
 912669 912670 SACOL1201 SACOL1202   ylmF TRUE 0.953 -3.000 0.194 NA   NA
 912670 912671 SACOL1202 SACOL1203 ylmF ylmG TRUE 0.911 12.000 0.370 NA   NA
 912671 912672 SACOL1203 SACOL1204 ylmG ylmH TRUE 0.556 110.000 0.287 1.000   NA
 912672 912673 SACOL1204 SACOL1205 ylmH   TRUE 0.940 24.000 0.579 NA   NA
 912673 912674 SACOL1205 SACOL1206   ileS FALSE 0.093 221.000 0.012 NA N NA
 912674 912675 SACOL1206 SACOL1207 ileS   FALSE 0.042 290.000 0.000 1.000   NA
 912675 912676 SACOL1207 SACOL1208   lspA FALSE 0.044 824.000 0.250 1.000   NA
 912676 912677 SACOL1208 SACOL1209 lspA   TRUE 0.895 0.000 0.008 1.000 N NA
 912677 912678 SACOL1209 SACOL1210   pyrR FALSE 0.050 400.000 0.048 1.000 N NA
 912678 912679 SACOL1210 SACOL1211 pyrR uraA FALSE 0.448 218.000 0.140 1.000 Y NA
 912679 912680 SACOL1211 SACOL1212 uraA pyrB TRUE 0.942 28.000 0.064 1.000 Y NA
 912680 912681 SACOL1212 SACOL1213 pyrB pyrC TRUE 0.982 18.000 0.452 1.000 Y NA
 912681 912682 SACOL1213 SACOL1214 pyrC carA TRUE 0.975 2.000 0.155 1.000 Y NA
 912682 912683 SACOL1214 SACOL1215 carA carB TRUE 0.995 -7.000 0.117 0.001 Y NA
 912683 912684 SACOL1215 SACOL1216 carB pyrF TRUE 0.614 110.000 0.018 1.000 Y NA
 912684 912685 SACOL1216 SACOL1217 pyrF pyrE TRUE 0.967 0.000 0.006 1.000 Y NA
 912685 912686 SACOL1217 SACOL1218 pyrE   FALSE 0.516 30.000 0.000 NA   NA
 912686 912687 SACOL1218 SACOL1219     FALSE 0.011 437.000 0.000 NA   NA
 912689 912690 SACOL1221 SACOL1222 gmk rpoZ TRUE 0.975 0.000 0.471 1.000 N NA
 912690 912691 SACOL1222 SACOL1223 rpoZ coaBC FALSE 0.284 210.000 0.192 1.000 N NA
 912691 912692 SACOL1223 SACOL1224 coaBC priA TRUE 0.939 0.000 0.099 1.000 N NA
 912692 912693 SACOL1224 SACOL1225 priA   FALSE 0.009 506.000 0.000 NA   NA
 912695 912696 SACOL1227 SACOL1228 def2 fmt TRUE 0.991 -7.000 0.031 0.030 Y NA
 912696 912697 SACOL1228 SACOL1229 fmt sun TRUE 0.990 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 912697 912698 SACOL1229 SACOL1230 sun   TRUE 0.901 3.000 0.135 1.000   NA
 912698 912699 SACOL1230 SACOL1231     TRUE 0.855 7.000 0.105 1.000   NA
 912699 912700 SACOL1231 SACOL1232     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 912700 912701 SACOL1232 SACOL1234     FALSE 0.042 228.000 0.000 NA   NA
 912701 912702 SACOL1234 SACOL1235   rpe TRUE 0.862 1.000 0.013 1.000   NA
 912702 912703 SACOL1235 SACOL1236 rpe   TRUE 0.809 7.000 0.019 1.000 N NA
 912705 912706 SACOL1239 SACOL1240     TRUE 0.940 15.000 0.567 NA   NA
 912706 912707 SACOL1240 SACOL1241   recG FALSE 0.206 190.000 0.074 1.000   NA
 912707 912708 SACOL1241 SACOL1242 recG   FALSE 0.178 203.000 0.078 NA N NA
 912708 912709 SACOL1242 SACOL1243   plsX TRUE 0.773 5.000 0.020 NA N NA
 912709 912710 SACOL1243 SACOL1244 plsX fabD TRUE 0.994 -7.000 0.106 0.005 Y NA
 912710 912711 SACOL1244 SACOL1245 fabD fabG1 TRUE 0.995 -7.000 0.149 0.005 Y NA
 912713 912714 SACOL1247 SACOL1248 acpP rnc FALSE 0.389 116.000 0.068 1.000 N NA
 912714 912715 SACOL1248 SACOL1250 rnc   FALSE 0.387 147.000 0.120 1.000 N NA
 912715 912716 SACOL1250 SACOL1251     TRUE 0.978 0.000 0.165 0.010 N NA
 912716 912717 SACOL1251 SACOL1252     TRUE 0.963 -13.000 0.081 1.000   NA
 912717 912718 SACOL1252 SACOL1253   ffh TRUE 0.878 26.000 0.151 1.000   NA
 912718 912719 SACOL1253 SACOL1254 ffh rpsP FALSE 0.110 435.000 0.361 1.000 N NA
 912719 912720 SACOL1254 SACOL1255 rpsP rimM TRUE 0.770 188.000 0.342 0.020 Y NA
 912720 912721 SACOL1255 SACOL1256 rimM trmD TRUE 0.992 0.000 0.672 1.000 Y NA
 912721 912722 SACOL1256 SACOL1257 trmD rplS TRUE 0.853 103.000 0.567 1.000 Y NA
 912724 912725 SACOL1260 SACOL1261   rnhB TRUE 0.973 -16.000 0.148 1.000   NA
 912725 912726 SACOL1261 SACOL1262 rnhB sucC FALSE 0.323 109.000 0.015 1.000 N NA
 912726 912727 SACOL1262 SACOL1263 sucC sucD TRUE 0.985 22.000 0.173 0.001 Y NA
 912727 912728 SACOL1263 SACOL1264 sucD lytN FALSE 0.160 194.000 0.034 1.000   NA
 912728 912729 SACOL1264 SACOL1265 lytN eprH TRUE 0.936 28.000 0.500 1.000   NA
 912729 912730 SACOL1265 SACOL1266 eprH   FALSE 0.149 173.000 0.000 1.000 N NA
 912730 912731 SACOL1266 SACOL1267   topA TRUE 0.620 180.000 0.238 1.000 Y NA
 912731 912732 SACOL1267 SACOL1268 topA gid FALSE 0.383 156.000 0.137 1.000 N NA
 912732 912733 SACOL1268 SACOL1269 gid xerC FALSE 0.062 417.000 0.105 1.000 N NA
 912733 912734 SACOL1269 SACOL1270 xerC hslV TRUE 0.956 -3.000 0.113 1.000 N NA
 912734 912735 SACOL1270 SACOL1271 hslV hslU TRUE 0.930 66.000 0.752 1.000 Y NA
 912735 912736 SACOL1271 SACOL1272 hslU codY TRUE 0.889 25.000 0.131 1.000 N NA
 912736 912737 SACOL1272 SACOL1274 codY rpsB FALSE 0.050 342.000 0.006 1.000 N NA
 912737 912738 SACOL1274 SACOL1275 rpsB   FALSE 0.447 34.000 0.000 NA   NA
 912738 912739 SACOL1275 SACOL1276   tsf FALSE 0.434 35.000 0.000 NA   NA
 912739 912740 SACOL1276 SACOL1277 tsf pyrH TRUE 0.585 137.000 0.416 1.000 N NA
 912740 912741 SACOL1277 SACOL1278 pyrH frr TRUE 0.963 19.000 0.626 1.000 N NA
 912741 912742 SACOL1278 SACOL1279 frr uppS FALSE 0.157 373.000 0.409 1.000 N NA
 912742 912743 SACOL1279 SACOL1280 uppS cdsA TRUE 0.954 7.000 0.113 1.000 Y NA
 912743 912744 SACOL1280 SACOL1281 cdsA   FALSE 0.133 237.000 0.040 1.000 N NA
 912744 912745 SACOL1281 SACOL1282   proS TRUE 0.890 20.000 0.095 1.000 N NA
 912745 912746 SACOL1282 SACOL1283 proS   FALSE 0.233 264.000 0.070 0.047 N NA
 912746 912747 SACOL1283 SACOL1284     FALSE 0.067 290.000 0.059 NA   NA
 912747 912748 SACOL1284 SACOL1285     TRUE 0.954 21.000 0.759 NA   NA
 912748 912749 SACOL1285 SACOL1286     TRUE 0.972 21.000 0.323 NA Y NA
 912749 912750 SACOL1286 SACOL1287     TRUE 0.976 -3.000 0.408 NA N NA
 912750 912751 SACOL1287 SACOL1288   infB TRUE 0.969 5.000 0.223 1.000 Y NA
 912751 912752 SACOL1288 SACOL1289 infB rbfA FALSE 0.332 386.000 0.530 1.000 Y NA
 912752 912753 SACOL1289 SACOL1290 rbfA truB TRUE 0.579 169.000 0.111 1.000 Y NA
 912753 912754 SACOL1290 SACOL1291 truB ribF TRUE 0.936 15.000 0.308 1.000 N NA
 912754 912755 SACOL1291 SACOL1292 ribF rpsO FALSE 0.442 115.000 0.119 1.000 N NA
 912755 912756 SACOL1292 SACOL1293 rpsO pnp FALSE 0.299 370.000 0.335 1.000 Y NA
 912756 912757 SACOL1293 SACOL1294 pnp   FALSE 0.031 338.000 0.000 1.000   NA
 912757 912758 SACOL1294 SACOL1295     FALSE 0.098 247.000 0.031 1.000   NA
 912758 912759 SACOL1295 SACOL1296     TRUE 0.889 5.000 0.115 1.000 N NA
 912759 912760 SACOL1296 SACOL1297     TRUE 0.810 31.000 0.093 1.000   NA
 912760 912761 SACOL1297 SACOL1298     TRUE 0.991 0.000 0.872 0.005   NA
 912761 912762 SACOL1298 SACOL1299     TRUE 0.968 0.000 0.397 1.000   NA
 912762 912763 SACOL1299 SACOL1300     TRUE 0.589 105.000 0.114 0.055   NA
 912763 912764 SACOL1300 SACOL1301     TRUE 0.904 19.000 0.163 1.000   NA
 912764 912765 SACOL1301 SACOL1302   pgsA TRUE 0.655 34.000 0.009 1.000   NA
 912765 912766 SACOL1302 SACOL1303 pgsA   FALSE 0.195 227.000 0.151 1.000   NA
 912766 912767 SACOL1303 SACOL1304     FALSE 0.276 165.000 0.083 1.000   NA
 912767 912768 SACOL1304 SACOL1305     FALSE 0.042 354.000 0.018 1.000   NA
 912770 912771 SACOL1307 SACOL1308     FALSE 0.231 140.000 0.021 1.000   NA
 912771 912772 SACOL1308 SACOL1309     TRUE 0.994 1.000 0.437 0.001 Y NA
 912772 912773 SACOL1309 SACOL1310     FALSE 0.147 94.000 0.000 NA   NA
 912773 912774 SACOL1310 SACOL1312   miaB FALSE 0.143 134.000 0.002 NA   NA
 912774 912775 SACOL1312 SACOL1313 miaB   TRUE 0.854 1.000 0.041 NA   NA
 912775 912776 SACOL1313 SACOL1314     TRUE 0.804 27.000 0.091 NA   NA
 912776 912777 SACOL1314 SACOL1315   hexA FALSE 0.034 303.000 0.003 NA   NA
 912777 912778 SACOL1315 SACOL1316 hexA hexB TRUE 0.983 13.000 0.220 0.002 Y NA
 912778 912779 SACOL1316 SACOL1317 hexB glpP TRUE 0.815 6.000 0.020 1.000 N NA
 912779 912780 SACOL1317 SACOL1319 glpP glpF FALSE 0.047 465.000 0.083 1.000 N NA
 912780 912781 SACOL1319 SACOL1320 glpF glpK FALSE 0.340 129.000 0.057 1.000 N NA
 912781 912782 SACOL1320 SACOL1321 glpK glpD TRUE 0.725 158.000 0.013 0.001 Y NA
 912782 912783 SACOL1321 SACOL1322 glpD   FALSE 0.278 150.000 0.029 1.000 N NA
 912783 912784 SACOL1322 SACOL1323   miaA TRUE 0.852 18.000 0.025 1.000 N NA
 912784 912785 SACOL1323 SACOL1324 miaA   TRUE 0.784 15.000 0.016 1.000   NA
 912787 912788 SACOL1326 SACOL1327     TRUE 0.859 19.000 0.065 1.000   NA
 912788 912789 SACOL1327 SACOL1328   glnR FALSE 0.133 243.000 0.046 1.000 N NA
 912789 912790 SACOL1328 SACOL1329 glnR femC TRUE 0.896 19.000 0.103 1.000 N NA
 912790 912791 SACOL1329 SACOL1331 femC   FALSE 0.009 493.000 0.000 NA   NA
 912791 912792 SACOL1331 SACOL1332     FALSE 0.007 689.000 0.000 NA   NA
 912792 912793 SACOL1332 SACOL1333     FALSE 0.025 294.000 0.000 NA   NA
 912793 912794 SACOL1333 SACOL1334     FALSE 0.006 701.000 0.000 NA   NA
 912794 912795 SACOL1334 SACOL1335     FALSE 0.011 428.000 0.000 NA   NA
 912795 912796 SACOL1335 SACOL1336     FALSE 0.009 512.000 0.000 NA   NA
 912796 912797 SACOL1336 SACOL1337     FALSE 0.460 33.000 0.000 NA   NA
 912797 912798 SACOL1337 SACOL1338     TRUE 0.715 1.000 0.000 NA   NA
 912798 912799 SACOL1338 SACOL1339     FALSE 0.053 205.000 0.000 NA   NA
 912799 912800 SACOL1339 SACOL1340     FALSE 0.114 121.000 0.000 NA   NA
 912800 912801 SACOL1340 SACOL1341     FALSE 0.106 130.000 0.000 NA   NA
 912801 912802 SACOL1341 SACOL1342     FALSE 0.347 46.000 0.000 NA   NA
 912802 912803 SACOL1342 SACOL1344     FALSE 0.019 337.000 0.000 NA   NA
 912803 912804 SACOL1344 SACOL1345     FALSE 0.151 91.000 0.000 NA   NA
 912804 912805 SACOL1345 SACOL1346     TRUE 0.557 11.000 0.000 NA   NA
 912805 912806 SACOL1346 SACOL1347     TRUE 0.805 50.000 0.400 NA   NA
 912806 912807 SACOL1347 SACOL1348     TRUE 0.568 7.000 0.000 NA   NA
 912809 912810 SACOL1350 SACOL1351   cls1 TRUE 0.815 58.000 0.571 NA   NA
 912810 912811 SACOL1351 SACOL1352 cls1   FALSE 0.252 175.000 0.057 1.000 N NA
 912811 912812 SACOL1352 SACOL1353     TRUE 0.985 -31.000 0.136 0.096   NA
 912812 912813 SACOL1353 SACOL1354     TRUE 0.969 4.000 0.500 0.096   NA
 912813 912814 SACOL1354 SACOL1355     TRUE 0.997 -3.000 0.857 0.011 Y NA
 912814 912815 SACOL1355 SACOL1356     FALSE 0.029 273.000 0.000 NA   NA
 912815 912816 SACOL1356 SACOL1357     FALSE 0.274 60.000 0.000 NA   NA
 912820 912821 SACOL1361 SACOL1362   hom FALSE 0.176 78.000 0.000 NA   NA
 912821 912822 SACOL1362 SACOL1363 hom thrC TRUE 0.937 6.000 0.021 1.000 Y NA
 912822 912823 SACOL1363 SACOL1364 thrC thrB TRUE 0.979 2.000 0.221 1.000 Y NA
 912823 912824 SACOL1364 SACOL1365 thrB   TRUE 0.680 58.000 0.013 0.095   NA
 912825 912826 SACOL1366 SACOL1367     FALSE 0.368 218.000 0.667 NA   NA
 912827 912828 SACOL1368 SACOL1369 kataA rpmG1 FALSE 0.332 91.000 0.006 1.000 N NA
 912828 912829 SACOL1369 SACOL1370 rpmG1 rpsN1 FALSE 0.202 454.000 0.052 0.019 Y NA
 912829 912830 SACOL1370 SACOL1371 rpsN1 guaC FALSE 0.242 157.000 0.015 1.000 N NA
 912834 912835 SACOL1375 SACOL1376     FALSE 0.377 136.000 0.200 NA   NA
 912835 912836 SACOL1376 SACOL1377   tkt FALSE 0.435 121.000 0.240 NA   NA
 912836 912837 SACOL1377 SACOL1378 tkt   FALSE 0.045 278.000 0.000 1.000   NA
 912837 912838 SACOL1378 SACOL1379     TRUE 0.866 -13.000 0.000 NA   NA
 912838 912839 SACOL1379 SACOL1380     FALSE 0.147 94.000 0.000 NA   NA
 912839 912840 SACOL1380 SACOL1381   sbcD FALSE 0.210 124.000 0.010 NA N NA
 912840 912841 SACOL1381 SACOL1382 sbcD sbcC TRUE 0.982 4.000 0.669 NA Y NA
 912843 912844 SACOL1384 SACOL1385 opuD1 acnA FALSE 0.012 892.000 0.000 1.000 N NA
 912844 912845 SACOL1385 SACOL1386 acnA   FALSE 0.156 180.000 0.015 1.000   NA
 912846 912847 SACOL1387 SACOL1388     FALSE 0.023 376.000 0.008 NA   NA
 912848 912849 SACOL1389 SACOL1390 parE parC TRUE 0.996 0.000 0.552 0.002 Y NA
 912849 912850 SACOL1390 SACOL1392 parC   FALSE 0.073 250.000 0.000 1.000 N NA
 912850 912851 SACOL1392 SACOL1393     FALSE 0.042 485.000 0.119 1.000   NA
 912851 912852 SACOL1393 SACOL1394     TRUE 0.877 -25.000 0.000 NA   NA
 912852 912853 SACOL1394 SACOL1395     TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 912853 912854 SACOL1395 SACOL1396   fmtC FALSE 0.016 481.000 0.018 NA   NA
 912860 912861 SACOL1402 SACOL1403   trpE FALSE 0.019 492.000 0.000 1.000 N NA
 912861 912862 SACOL1403 SACOL1404 trpE trpG TRUE 0.991 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 912862 912863 SACOL1404 SACOL1405 trpG trpD TRUE 0.931 6.000 0.006 1.000 Y NA
 912863 912864 SACOL1405 SACOL1406 trpD trpC TRUE 0.979 2.000 0.216 1.000 Y NA
 912864 912865 SACOL1406 SACOL1407 trpC trpF TRUE 0.995 -3.000 0.264 0.002 Y NA
 912865 912866 SACOL1407 SACOL1408 trpF trpB TRUE 0.997 -7.000 0.375 0.002 Y NA
 912866 912867 SACOL1408 SACOL1409 trpB trpA TRUE 0.996 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 912867 912868 SACOL1409 SACOL1410 trpA femA FALSE 0.056 283.000 0.000 1.000 N NA
 912868 912869 SACOL1410 SACOL1411 femA   TRUE 0.994 19.000 1.000 0.005 Y NA
 912869 912870 SACOL1411 SACOL1412     FALSE 0.011 683.000 0.000 1.000   NA
 912871 912872 SACOL1413 SACOL1414     FALSE 0.169 124.000 0.000 1.000   NA
 912872 912873 SACOL1414 SACOL1415     TRUE 0.992 -7.000 0.059 0.021 Y NA
 912873 912874 SACOL1415 SACOL1416     TRUE 0.995 -13.000 0.353 1.000 Y NA
 912874 912875 SACOL1416 SACOL1417     TRUE 0.997 -7.000 0.647 0.037 Y NA
 912875 912876 SACOL1417 SACOL1418     FALSE 0.105 304.000 0.182 NA   NA
 912878 912879 SACOL1420 SACOL1421     TRUE 0.956 7.000 0.182 NA Y NA
 912879 912880 SACOL1421 SACOL1422     TRUE 0.949 47.000 0.125 0.002 Y NA
 912880 912881 SACOL1422 SACOL1423     TRUE 0.994 2.000 0.485 0.002 Y NA
 912881 912882 SACOL1423 SACOL1424     FALSE 0.479 191.000 0.077 1.000 Y NA
 912885 912886 SACOL1427 SACOL1428   lysC FALSE 0.010 860.000 0.000 1.000   NA
 912886 912887 SACOL1428 SACOL1429 lysC asd TRUE 0.841 64.000 0.119 1.000 Y NA
 912887 912888 SACOL1429 SACOL1430 asd dapA TRUE 0.959 2.000 0.015 1.000 Y NA
 912888 912889 SACOL1430 SACOL1431 dapA dapB TRUE 0.977 -3.000 0.014 1.000 Y NA
 912889 912890 SACOL1431 SACOL1432 dapB dapD TRUE 0.938 27.000 0.036 1.000 Y NA
 912890 912891 SACOL1432 SACOL1433 dapD   FALSE 0.531 143.000 0.372 1.000   NA
 912891 912892 SACOL1433 SACOL1434     TRUE 0.837 5.000 0.058 1.000   NA
 912892 912893 SACOL1434 SACOL1435   lysA TRUE 0.947 -10.000 0.008 1.000 N NA
 912894 912895 SACOL1436 SACOL1437     FALSE 0.056 197.000 0.000 NA   NA
 912895 912896 SACOL1437 SACOL1438     FALSE 0.226 171.000 0.105 NA   NA
 912897 912898 SACOL1439 SACOL1440     TRUE 0.823 19.000 0.067 NA   NA
 912898 912899 SACOL1440 SACOL1441     TRUE 0.883 32.000 0.373 NA   NA
 912900 912901 SACOL1442 SACOL1443   brnQ3 FALSE 0.017 353.000 0.000 NA   NA
 912901 912902 SACOL1443 SACOL1444 brnQ3   FALSE 0.175 225.000 0.136 NA N NA
 912902 912903 SACOL1444 SACOL1445     TRUE 0.948 14.000 0.822 NA   NA
 912903 912904 SACOL1445 SACOL1446     FALSE 0.242 181.000 0.156 NA   NA
 912904 912905 SACOL1446 SACOL1447     TRUE 0.881 29.000 0.280 NA   NA
 912905 912906 SACOL1447 SACOL1448   sucB FALSE 0.007 580.000 0.000 NA   NA
 912906 912907 SACOL1448 SACOL1449 sucB sucA TRUE 0.981 14.000 0.667 1.000 Y NA
 912907 912908 SACOL1449 SACOL1450 sucA arlS FALSE 0.071 284.000 0.006 1.000 N NA
 912908 912909 SACOL1450 SACOL1451 arlS arlR TRUE 0.995 -3.000 0.438 0.075 Y NA
 912909 912910 SACOL1451 SACOL1452 arlR   FALSE 0.029 788.000 0.000 0.075 N NA
 912910 912911 SACOL1452 SACOL1453   murG TRUE 0.843 17.000 0.016 1.000 N NA
 912911 912912 SACOL1453 SACOL1454 murG   TRUE 0.555 12.000 0.000 NA   NA
 912912 912913 SACOL1454 SACOL1455     FALSE 0.013 400.000 0.000 NA   NA
 912913 912914 SACOL1455 SACOL1456     FALSE 0.135 192.000 0.045 NA   NA
 912914 912915 SACOL1456 SACOL1457     TRUE 0.901 0.000 0.080 NA   NA
 912915 912916 SACOL1457 SACOL1459     TRUE 0.555 12.000 0.000 NA   NA
 912916 912917 SACOL1459 SACOL1460     TRUE 0.880 -31.000 0.000 NA   NA
 912917 912918 SACOL1460 SACOL1461   folA TRUE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 912918 912919 SACOL1461 SACOL1462 folA thyA FALSE 0.365 200.000 0.295 1.000 N NA
 912919 912920 SACOL1462 SACOL1464 thyA   FALSE 0.017 424.000 0.003 NA   NA
 912920 912921 SACOL1464 SACOL1465     TRUE 0.613 16.000 0.000 NA   NA
 912921 912922 SACOL1465 SACOL1466     TRUE 0.787 38.000 0.000 0.007   NA
 912922 912923 SACOL1466 SACOL1467     TRUE 0.854 12.000 0.167 NA   NA
 912927 912928 SACOL1472 SACOL1475 ebh   FALSE 0.021 398.000 0.000 1.000   NA
 912928 912929 SACOL1475 SACOL1476     FALSE 0.143 157.000 0.000 1.000   NA
 912929 912930 SACOL1476 SACOL1477   ilvA1 TRUE 0.907 31.000 0.006 1.000 Y NA
 912930 912931 SACOL1477 SACOL1478 ilvA1 ald1 TRUE 0.640 95.000 0.012 1.000 Y NA
 912931 912932 SACOL1478 SACOL1479 ald1   FALSE 0.020 475.000 0.000 1.000 N NA
 912932 912933 SACOL1479 SACOL1480     TRUE 0.721 20.000 0.000 1.000   NA
 912935 912936 SACOL1482 SACOL1483     FALSE 0.161 84.000 0.000 NA   NA
 912936 912937 SACOL1483 SACOL1484     FALSE 0.011 651.000 0.000 1.000   NA
 912937 912938 SACOL1484 SACOL1485     TRUE 0.935 14.000 0.579 NA   NA
 912938 912939 SACOL1485 SACOL1486     TRUE 0.960 -7.000 0.165 NA   NA
 912940 912941 SACOL1488 SACOL1489   recU TRUE 0.873 -19.000 0.000 NA   NA
 912941 912942 SACOL1489 SACOL1490 recU pbp2 TRUE 0.973 -3.000 0.319 1.000   NA
 912943 912944 SACOL1491 SACOL1492   nth TRUE 0.695 5.000 0.009 NA   NA
 912944 912945 SACOL1492 SACOL1493 nth   TRUE 0.986 -10.000 0.075 NA Y NA
 912945 912946 SACOL1493 SACOL1494   asnS FALSE 0.123 328.000 0.234 NA N NA
 912946 912947 SACOL1494 SACOL1495 asnS   FALSE 0.130 322.000 0.030 0.094 N NA
 912947 912948 SACOL1495 SACOL1496   birA TRUE 0.869 24.000 0.074 1.000 N NA
 912948 912949 SACOL1496 SACOL1497 birA papS TRUE 0.956 -13.000 0.023 1.000 N NA
 912949 912950 SACOL1497 SACOL1498 papS   TRUE 0.892 5.000 0.126 1.000 N NA
 912950 912951 SACOL1498 SACOL1499     FALSE 0.088 229.000 0.038 NA   NA
 912951 912952 SACOL1499 SACOL1500     FALSE 0.033 337.000 0.013 NA   NA
 912952 912953 SACOL1500 SACOL1501     TRUE 0.627 45.000 0.083 NA   NA
 912953 912954 SACOL1501 SACOL1502     TRUE 0.959 -10.000 0.127 NA   NA
 912954 912955 SACOL1502 SACOL1503     TRUE 0.911 14.000 0.353 NA   NA
 912955 912956 SACOL1503 SACOL1504   aroA TRUE 0.789 7.000 0.007 1.000 N NA
 912956 912957 SACOL1504 SACOL1505 aroA aroB TRUE 0.942 10.000 0.051 1.000 Y NA
 912957 912958 SACOL1505 SACOL1506 aroB aroC TRUE 0.979 26.000 0.110 0.002 Y NA
 912958 912959 SACOL1506 SACOL1507 aroC   FALSE 0.014 386.000 0.000 NA   NA
 912959 912960 SACOL1507 SACOL1508     FALSE 0.530 29.000 0.000 NA   NA
 912960 912961 SACOL1508 SACOL1509     FALSE 0.300 55.000 0.000 NA   NA
 912961 912962 SACOL1509 SACOL1510     FALSE 0.426 92.000 0.054 1.000 N NA
 912962 912963 SACOL1510 SACOL1511     TRUE 0.960 2.000 0.020 1.000 Y NA
 912963 912964 SACOL1511 SACOL1512     TRUE 0.739 3.000 0.008 NA   NA
 912964 912965 SACOL1512 SACOL1513   hup FALSE 0.011 431.000 0.000 NA   NA
 912965 912966 SACOL1513 SACOL1514 hup gpsA FALSE 0.223 171.000 0.025 1.000 N NA
 912966 912967 SACOL1514 SACOL1515 gpsA   TRUE 0.866 17.000 0.068 1.000   NA
 912967 912968 SACOL1515 SACOL1516   rpsA FALSE 0.118 222.000 0.032 1.000   NA
 912968 912969 SACOL1516 SACOL1518 rpsA cmk FALSE 0.025 712.000 0.047 1.000 N NA
 912971 912972 SACOL1520 SACOL1521     FALSE 0.088 161.000 0.000 NA   NA
 912972 912973 SACOL1521 SACOL1522     FALSE 0.109 125.000 0.000 NA   NA
 912973 912974 SACOL1522 SACOL1523   recQ2 FALSE 0.149 153.000 0.000 1.000   NA
 912974 912975 SACOL1523 SACOL1524 recQ2   TRUE 0.984 -10.000 0.508 NA   NA
 912977 912978 SACOL1526 SACOL1528     FALSE 0.007 597.000 0.000 NA   NA
 912978 912979 SACOL1528 SACOL1529     TRUE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 912979 912980 SACOL1529 SACOL1530     TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 912980 912981 SACOL1530 SACOL1531     FALSE 0.118 118.000 0.000 NA   NA
 912981 912982 SACOL1531 SACOL1532     FALSE 0.151 91.000 0.000 NA   NA
 912982 912983 SACOL1532 SACOL1533     TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 912983 912984 SACOL1533 SACOL1534   srrB FALSE 0.023 305.000 0.000 NA   NA
 912984 912985 SACOL1534 SACOL1535 srrB srrA TRUE 0.991 -19.000 0.111 1.000 Y NA
 912985 912986 SACOL1535 SACOL1536 srrA rluB FALSE 0.319 133.000 0.046 1.000 N NA
 912986 912987 SACOL1536 SACOL1537 rluB scpB TRUE 0.972 -7.000 0.224 NA N NA
 912987 912988 SACOL1537 SACOL1538 scpB scpA TRUE 0.983 -7.000 0.570 NA   NA
 912990 912991 SACOL1540 SACOL1541 xerD   TRUE 0.633 49.000 0.029 1.000 N NA
 912991 912992 SACOL1541 SACOL1542     FALSE 0.341 105.000 0.021 1.000 N NA
 912994 912995 SACOL1544 SACOL1545     TRUE 0.613 16.000 0.000 NA   NA
 912998 912999 SACOL1549 SACOL1550 zwf   FALSE 0.112 203.000 0.000 1.000 N NA
 913000 913001 SACOL1551 SACOL1552 malA malR TRUE 0.957 16.000 0.500 1.000 N NA
 913001 913002 SACOL1552 SACOL1553 malR   FALSE 0.094 194.000 0.000 1.000   NA
 913002 913003 SACOL1553 SACOL1554   gnd FALSE 0.072 219.000 0.000 1.000   NA
 913003 913004 SACOL1554 SACOL1555 gnd   FALSE 0.510 68.000 0.035 1.000 N NA
 913006 913007 SACOL1557 SACOL1558     TRUE 0.811 14.000 0.097 NA   NA
 913007 913008 SACOL1558 SACOL1559     FALSE 0.197 73.000 0.000 NA   NA
 913008 913009 SACOL1559 SACOL1560     FALSE 0.068 180.000 0.000 NA   NA
 913009 913010 SACOL1560 SACOL1561     TRUE 0.990 13.000 0.882 0.053 Y NA
 913010 913011 SACOL1561 SACOL1562     TRUE 0.997 0.000 0.897 0.001 Y NA
 913011 913012 SACOL1562 SACOL1563   lpdA TRUE 0.980 16.000 0.414 1.000 Y NA
 913012 913013 SACOL1563 SACOL1564 lpdA recN FALSE 0.229 151.000 0.002 1.000 N NA
 913013 913014 SACOL1564 SACOL1565 recN argR TRUE 0.872 16.000 0.056 1.000 N NA
 913014 913015 SACOL1565 SACOL1566 argR ispA FALSE 0.024 432.000 0.000 1.000 N NA
 913015 913016 SACOL1566 SACOL1567 ispA xseB TRUE 0.973 -22.000 0.100 1.000 N NA
 913016 913017 SACOL1567 SACOL1568 xseB xseA TRUE 0.997 -7.000 0.412 0.001 Y NA
 913017 913018 SACOL1568 SACOL1569 xseA nusB TRUE 0.836 17.000 0.011 1.000 N NA
 913018 913019 SACOL1569 SACOL1570 nusB   TRUE 0.708 60.000 0.265 NA   NA
 913019 913020 SACOL1570 SACOL1571   accC TRUE 0.922 15.000 0.373 NA   NA
 913020 913021 SACOL1571 SACOL1572 accC accB TRUE 0.989 0.000 0.086 0.003 Y NA
 913021 913022 SACOL1572 SACOL1573 accB   FALSE 0.017 355.000 0.000 NA   NA
 913022 913023 SACOL1573 SACOL1574     FALSE 0.131 109.000 0.000 NA   NA
 913023 913024 SACOL1574 SACOL1575     FALSE 0.295 56.000 0.000 NA   NA
 913024 913025 SACOL1575 SACOL1576     TRUE 0.568 7.000 0.000 NA   NA
 913025 913026 SACOL1576 SACOL1577     TRUE 0.859 -10.000 0.000 NA   NA
 913026 913027 SACOL1577 SACOL1578     TRUE 0.588 5.000 0.000 NA   NA
 913027 913028 SACOL1578 SACOL1579     FALSE 0.305 54.000 0.000 NA   NA
 913028 913029 SACOL1579 SACOL1580     FALSE 0.434 35.000 0.000 NA   NA
 913029 913030 SACOL1580 SACOL1581     TRUE 0.555 12.000 0.000 NA   NA
 913030 913031 SACOL1581 SACOL1582     TRUE 0.588 5.000 0.000 NA   NA
 913031 913032 SACOL1582 SACOL1583     FALSE 0.269 61.000 0.000 NA   NA
 913032 913033 SACOL1583 SACOL1584     FALSE 0.072 175.000 0.000 NA   NA
 913033 913034 SACOL1584 SACOL1585     TRUE 0.563 14.000 0.000 NA   NA
 913034 913035 SACOL1585 SACOL1586     FALSE 0.097 151.000 0.000 NA   NA
 913035 913036 SACOL1586 SACOL1587   efp FALSE 0.013 395.000 0.000 NA   NA
 913036 913037 SACOL1587 SACOL1588 efp   TRUE 0.898 26.000 0.160 1.000 N NA
 913038 913039 SACOL1589 SACOL1590     TRUE 0.955 14.000 1.000 NA   NA
 913042 913043 SACOL1593 SACOL1594     TRUE 0.997 -7.000 0.316 0.001 Y NA
 913043 913044 SACOL1594 SACOL1595   gcvT TRUE 0.982 20.000 0.092 0.001 Y NA
 913044 913045 SACOL1595 SACOL1596 gcvT aroK FALSE 0.516 159.000 0.019 1.000 Y NA
 913045 913046 SACOL1596 SACOL1597 aroK   FALSE 0.098 233.000 0.029 NA N NA
 913046 913047 SACOL1597 SACOL1598     FALSE 0.283 204.000 0.000 NA Y NA
 913047 913048 SACOL1598 SACOL1599   comGC TRUE 0.980 -22.000 0.000 NA Y NA
 913048 913049 SACOL1599 SACOL1600 comGC   TRUE 0.984 14.000 0.861 1.000 Y NA
 913049 913050 SACOL1600 SACOL1601     TRUE 0.996 -28.000 0.639 1.000 Y NA
 913050 913051 SACOL1601 SACOL1602     FALSE 0.536 52.000 0.015 1.000   NA
 913051 913052 SACOL1602 SACOL1603     TRUE 0.874 -3.000 0.015 NA   NA
 913052 913053 SACOL1603 SACOL1604   glk TRUE 0.852 0.000 0.024 NA   NA
 913053 913054 SACOL1604 SACOL1605 glk   TRUE 0.975 -3.000 0.496 NA   NA
 913054 913055 SACOL1605 SACOL1606     TRUE 0.949 -19.000 0.058 NA   NA
 913055 913056 SACOL1606 SACOL1607     TRUE 0.735 12.000 0.006 1.000   NA
 913056 913057 SACOL1607 SACOL1608   rpmG2 FALSE 0.178 209.000 0.045 1.000 N NA
 913057 913058 SACOL1608 SACOL1609 rpmG2 pbp3 FALSE 0.316 113.000 0.019 1.000 N NA
 913058 913059 SACOL1609 SACOL1610 pbp3 sodA2 FALSE 0.389 121.000 0.085 1.000 N NA
 913059 913060 SACOL1610 SACOL1611 sodA2   FALSE 0.202 276.000 0.000 1.000 Y NA
 913060 913061 SACOL1611 SACOL1612     TRUE 0.995 -13.000 0.480 1.000 Y NA
 913061 913062 SACOL1612 SACOL1613     TRUE 0.943 42.000 0.148 0.092 Y NA
 913062 913063 SACOL1613 SACOL1614   nfo FALSE 0.270 126.000 0.012 1.000 N NA
 913063 913064 SACOL1614 SACOL1615 nfo   TRUE 0.951 10.000 0.104 1.000 Y NA
 913064 913065 SACOL1615 SACOL1616     FALSE 0.231 114.000 0.032 NA   NA
 913065 913066 SACOL1616 SACOL1617     TRUE 0.923 3.000 0.283 NA   NA
 913066 913067 SACOL1617 SACOL1618   rpoD FALSE 0.413 131.000 0.239 NA   NA
 913067 913068 SACOL1618 SACOL1619 rpoD dnaG FALSE 0.259 224.000 0.209 1.000 N NA
 913068 913069 SACOL1619 SACOL1620 dnaG   FALSE 0.380 61.000 0.011 NA   NA
 913069 913070 SACOL1620 SACOL1621     TRUE 0.936 11.000 0.621 NA   NA
 913072 913073 SACOL1623 SACOL1624   era TRUE 0.872 22.000 0.108 1.000   NA
 913073 913074 SACOL1624 SACOL1625 era cdd TRUE 0.916 1.000 0.098 1.000   NA
 913074 913075 SACOL1625 SACOL1626 cdd dgkA TRUE 0.872 11.000 0.108 1.000 N NA
 913075 913076 SACOL1626 SACOL1627 dgkA   TRUE 0.735 3.000 0.007 NA   NA
 913076 913077 SACOL1627 SACOL1628     TRUE 0.959 1.000 0.457 NA   NA
 913077 913078 SACOL1628 SACOL1629     FALSE 0.020 331.000 0.000 NA   NA
 913078 913079 SACOL1629 SACOL1630     TRUE 0.816 17.000 0.055 NA   NA
 913079 913080 SACOL1630 SACOL1631     TRUE 0.914 18.000 0.258 NA   NA
 913080 913081 SACOL1631 SACOL1632   rpsU FALSE 0.071 220.000 0.011 NA   NA
 913081 913082 SACOL1632 SACOL1633 rpsU   FALSE 0.061 293.000 0.016 1.000   NA
 913082 913083 SACOL1633 SACOL1634     TRUE 0.858 7.000 0.163 NA   NA
 913083 913084 SACOL1634 SACOL1635   prmA TRUE 0.927 2.000 0.227 NA   NA
 913084 913085 SACOL1635 SACOL1636 prmA dnaJ TRUE 0.903 4.000 0.133 1.000 N NA
 913085 913086 SACOL1636 SACOL1637 dnaJ dnaK TRUE 0.836 136.000 0.196 0.002 Y NA
 913086 913087 SACOL1637 SACOL1638 dnaK grpE TRUE 0.921 69.000 0.224 0.005 Y NA
 913087 913088 SACOL1638 SACOL1639 grpE hrcA TRUE 0.896 32.000 0.286 1.000 N NA
 913088 913089 SACOL1639 SACOL1640 hrcA   FALSE 0.442 100.000 0.082 1.000 N NA
 913089 913090 SACOL1640 SACOL1641   lepA FALSE 0.029 530.000 0.032 1.000 N NA
 913092 913093 SACOL1643 SACOL1644     TRUE 0.705 57.000 0.163 1.000   NA
 913093 913094 SACOL1644 SACOL1645     TRUE 0.579 59.000 0.055 1.000   NA
 913094 913095 SACOL1645 SACOL1646   comEA FALSE 0.393 122.000 0.095 1.000 N NA
 913095 913096 SACOL1646 SACOL1647 comEA   TRUE 0.647 40.000 0.033 1.000   NA
 913096 913097 SACOL1647 SACOL1648     TRUE 0.851 3.000 0.085 NA   NA
 913097 913098 SACOL1648 SACOL1649     TRUE 0.915 1.000 0.149 NA   NA
 913098 913099 SACOL1649 SACOL1650   nadD TRUE 0.992 -10.000 0.199 1.000 Y NA
 913099 913100 SACOL1650 SACOL1651 nadD   TRUE 0.903 3.000 0.150 NA N NA
 913100 913101 SACOL1651 SACOL1652   aroE TRUE 0.860 4.000 0.089 NA N NA
 913101 913102 SACOL1652 SACOL1653 aroE   TRUE 0.925 14.000 0.336 1.000   NA
 913102 913103 SACOL1653 SACOL1654     TRUE 0.970 1.000 0.555 1.000   NA
 913103 913104 SACOL1654 SACOL1655   mtn TRUE 0.803 20.000 0.019 1.000   NA
 913106 913107 SACOL1657 SACOL1658     FALSE 0.016 462.000 0.000 1.000   NA
 913107 913108 SACOL1658 SACOL1659     FALSE 0.042 289.000 0.000 1.000   NA
 913108 913109 SACOL1659 SACOL1660     TRUE 0.836 13.000 0.084 1.000   NA
 913109 913110 SACOL1660 SACOL1661     TRUE 0.916 0.000 0.062 1.000   NA
 913110 913111 SACOL1661 SACOL1662     TRUE 0.972 14.000 0.031 0.002 Y NA
 913111 913112 SACOL1662 SACOL1663     TRUE 0.965 2.000 0.429 1.000 N NA
 913112 913113 SACOL1663 SACOL1664     TRUE 0.996 -10.000 0.184 0.002 Y NA
 913113 913114 SACOL1664 SACOL1665   greA FALSE 0.044 326.000 0.000 1.000 N NA
 913114 913115 SACOL1665 SACOL1666 greA udk TRUE 0.861 28.000 0.095 1.000 N NA
 913115 913116 SACOL1666 SACOL1667 udk   TRUE 0.939 0.000 0.100 1.000 N NA
 913116 913117 SACOL1667 SACOL1668     TRUE 0.982 12.000 0.156 0.001 Y NA
 913117 913118 SACOL1668 SACOL1669     TRUE 0.905 3.000 0.142 1.000   NA
 913118 913119 SACOL1669 SACOL1670     FALSE 0.026 285.000 0.000 NA   NA
 913119 913120 SACOL1670 SACOL1671     TRUE 0.945 15.000 0.651 NA   NA
 913120 913121 SACOL1671 SACOL1672     TRUE 0.943 4.000 0.537 NA   NA
 913121 913122 SACOL1672 SACOL1673   alaS FALSE 0.550 63.000 0.110 NA   NA
 913122 913123 SACOL1673 SACOL1674 alaS   FALSE 0.038 343.000 0.000 1.000 N NA
 913123 913124 SACOL1674 SACOL1675     TRUE 0.947 2.000 0.281 1.000   NA
 913124 913125 SACOL1675 SACOL1676   trmU FALSE 0.030 462.000 0.038 1.000   NA
 913125 913126 SACOL1676 SACOL1677 trmU   TRUE 0.922 1.000 0.072 1.000 N NA
 913128 913129 SACOL1679 SACOL1680     FALSE 0.382 40.000 0.000 NA   NA
 913129 913130 SACOL1680 SACOL1681     FALSE 0.139 100.000 0.000 NA   NA
 913132 913133 SACOL1683 SACOL1685   aspS FALSE 0.029 461.000 0.008 1.000 N NA
 913133 913134 SACOL1685 SACOL1686 aspS hisS TRUE 0.980 16.000 0.161 0.045 Y NA
 913134 913135 SACOL1686 SACOL1687 hisS   FALSE 0.022 461.000 0.000 1.000 N NA
 913135 913136 SACOL1687 SACOL1688     TRUE 0.923 -3.000 0.010 1.000 N NA
 913136 913137 SACOL1688 SACOL1689   relA2 TRUE 0.899 12.000 0.177 1.000 N NA
 913137 913138 SACOL1689 SACOL1690 relA2 apt FALSE 0.050 428.000 0.068 1.000 N NA
 913138 913139 SACOL1690 SACOL1691 apt recJ TRUE 0.898 22.000 0.128 1.000 N NA
 913139 913140 SACOL1691 SACOL1692 recJ   FALSE 0.143 203.000 0.007 1.000 N NA
 913140 913141 SACOL1692 SACOL1693   yajC FALSE 0.196 275.000 0.005 NA Y NA
 913141 913142 SACOL1693 SACOL1694 yajC tgt TRUE 0.933 19.000 0.325 NA N NA
 913142 913143 SACOL1694 SACOL1695 tgt queA TRUE 0.989 23.000 0.360 0.001 Y NA
 913143 913144 SACOL1695 SACOL1696 queA ruvB TRUE 0.911 2.000 0.069 1.000 N NA
 913144 913145 SACOL1696 SACOL1697 ruvB ruvA TRUE 0.986 32.000 0.549 0.002 Y NA
 913145 913146 SACOL1697 SACOL1698 ruvA   TRUE 0.751 14.000 0.009 1.000   NA
 913146 913147 SACOL1698 SACOL1699     TRUE 0.776 10.000 0.024 1.000   NA
 913147 913148 SACOL1699 SACOL1700   rpmA FALSE 0.139 355.000 0.335 1.000   NA
 913148 913149 SACOL1700 SACOL1701 rpmA   TRUE 0.956 12.000 0.203 NA Y NA
 913149 913150 SACOL1701 SACOL1702   rplU TRUE 0.960 6.000 0.208 NA Y NA
 913150 913151 SACOL1702 SACOL1703 rplU   FALSE 0.210 167.000 0.008 1.000 N NA
 913151 913152 SACOL1703 SACOL1704   mreC TRUE 0.996 0.000 0.550 0.002 Y NA
 913152 913153 SACOL1704 SACOL1705 mreC   FALSE 0.013 393.000 0.000 NA   NA
 913153 913154 SACOL1705 SACOL1706     FALSE 0.009 474.000 0.000 NA   NA
 913154 913155 SACOL1706 SACOL1707   radC FALSE 0.386 68.000 0.037 NA   NA
 913155 913156 SACOL1707 SACOL1708 radC   TRUE 0.896 -3.000 0.000 1.000 N NA
 913156 913157 SACOL1708 SACOL1709   folC FALSE 0.063 270.000 0.000 1.000 N NA
 913157 913158 SACOL1709 SACOL1710 folC valS TRUE 0.879 13.000 0.006 0.091 N NA
 913160 913161 SACOL1712 SACOL1714   hemL1 FALSE 0.122 196.000 0.039 NA   NA
 913161 913162 SACOL1714 SACOL1715 hemL1 hemB TRUE 0.948 48.000 0.126 0.002 Y NA
 913162 913163 SACOL1715 SACOL1716 hemB hemD TRUE 0.981 3.000 0.042 0.002 Y NA
 913163 913164 SACOL1716 SACOL1717 hemD hemC TRUE 0.974 22.000 0.020 0.002 Y NA
 913164 913165 SACOL1717 SACOL1718 hemC   TRUE 0.691 42.000 0.040 1.000 N NA
 913165 913166 SACOL1718 SACOL1719   hemA TRUE 0.959 22.000 0.613 1.000 N NA
 913166 913167 SACOL1719 SACOL1720 hemA   FALSE 0.112 217.000 0.020 1.000   NA
 913167 913168 SACOL1720 SACOL1721   clpX FALSE 0.253 154.000 0.043 1.000   NA
 913168 913169 SACOL1721 SACOL1722 clpX tig TRUE 0.745 151.000 0.033 0.002 Y NA
 913169 913170 SACOL1722 SACOL1723 tig   FALSE 0.138 163.000 0.012 NA   NA
 913170 913171 SACOL1723 SACOL1724     TRUE 0.893 19.000 0.195 NA   NA
 913171 913172 SACOL1724 SACOL1725   rplT FALSE 0.198 142.000 0.004 1.000   NA
 913172 913173 SACOL1725 SACOL1726 rplT rpmI TRUE 0.978 47.000 0.928 0.019 Y NA
 913173 913174 SACOL1726 SACOL1727 rpmI infC TRUE 0.978 29.000 0.652 1.000 Y NA
 913174 913175 SACOL1727 SACOL1728 infC   FALSE 0.106 229.000 0.004 1.000 N NA
 913175 913176 SACOL1728 SACOL1729   thrS FALSE 0.025 426.000 0.000 1.000 N NA
 913176 913177 SACOL1729 SACOL1731 thrS dnaI FALSE 0.058 413.000 0.000 0.091 N NA
 913177 913178 SACOL1731 SACOL1732 dnaI   TRUE 0.991 0.000 0.817 NA Y NA
 913178 913179 SACOL1732 SACOL1733     TRUE 0.915 1.000 0.109 NA N NA
 913179 913180 SACOL1733 SACOL1734   gapA2 FALSE 0.096 210.000 0.004 NA N NA
 913180 913181 SACOL1734 SACOL1735 gapA2 coaE FALSE 0.218 170.000 0.020 1.000 N NA
 913181 913182 SACOL1735 SACOL1736 coaE fpg TRUE 0.878 16.000 0.066 1.000 N NA
 913182 913183 SACOL1736 SACOL1737 fpg polA TRUE 0.960 16.000 0.101 1.000 Y NA
 913183 913184 SACOL1737 SACOL1738 polA   FALSE 0.025 294.000 0.000 NA   NA
 913184 913185 SACOL1738 SACOL1739     FALSE 0.009 499.000 0.000 NA   NA
 913185 913186 SACOL1739 SACOL1740   phoP TRUE 0.992 -3.000 0.159 0.047 Y NA
 913186 913187 SACOL1740 SACOL1741 phoP icd FALSE 0.029 390.000 0.000 1.000 N NA
 913187 913188 SACOL1741 SACOL1742 icd gltA TRUE 0.894 49.000 0.140 1.000 Y NA
 913190 913191 SACOL1744 SACOL1745   pyk FALSE 0.007 641.000 0.000 NA   NA
 913191 913192 SACOL1745 SACOL1746 pyk pfkA TRUE 0.986 22.000 0.261 0.005 Y NA
 913192 913193 SACOL1746 SACOL1747 pfkA accA FALSE 0.114 269.000 0.047 1.000 N NA
 913193 913194 SACOL1747 SACOL1748 accA accD TRUE 0.993 0.000 0.234 0.001 Y NA
 913194 913195 SACOL1748 SACOL1749 accD   FALSE 0.157 195.000 0.010 1.000 N NA
 913195 913196 SACOL1749 SACOL1750   dnaE FALSE 0.059 450.000 0.127 1.000 N NA
 913196 913197 SACOL1750 SACOL1751 dnaE   TRUE 0.898 21.000 0.159 1.000   NA
 913197 913198 SACOL1751 SACOL1752     FALSE 0.137 261.000 0.113 1.000   NA
 913202 913203 SACOL1757 SACOL1758   ald2 FALSE 0.110 124.000 0.000 NA   NA
 913205 913206 SACOL1760 SACOL1761 ackA   TRUE 0.597 88.000 0.217 1.000 N NA
 913206 913207 SACOL1761 SACOL1762     FALSE 0.386 123.000 0.089 1.000 N NA
 913207 913208 SACOL1762 SACOL1763     FALSE 0.281 98.000 0.009 1.000   NA
 913208 913209 SACOL1763 SACOL1764   thiI TRUE 0.580 44.000 0.016 1.000   NA
 913209 913210 SACOL1764 SACOL1765 thiI   TRUE 0.970 0.000 0.349 1.000 N NA
 913213 913214 SACOL1768 SACOL1769   rpsD FALSE 0.070 244.000 0.005 NA N NA
 913216 913217 SACOL1771 SACOL1772     FALSE 0.331 114.000 0.027 1.000 N NA
 913217 913218 SACOL1772 SACOL1773   serA TRUE 0.990 -13.000 0.113 1.000 Y NA
 913219 913220 SACOL1774 SACOL1775     FALSE 0.300 107.000 0.062 NA   NA
 913220 913221 SACOL1775 SACOL1776     FALSE 0.293 128.000 0.025 1.000 N NA
 913225 913226 SACOL1781 SACOL1782   fhs FALSE 0.032 334.000 0.000 1.000   NA
 913226 913227 SACOL1782 SACOL1783 fhs acs FALSE 0.023 440.000 0.000 1.000 N NA
 913228 913229 SACOL1784 SACOL1785 acuA acuC TRUE 0.842 25.000 0.075 1.000   NA
 913230 913231 SACOL1786 SACOL1787 ccpA   FALSE 0.025 540.000 0.017 1.000 N NA
 913231 913232 SACOL1787 SACOL1788     FALSE 0.006 700.000 0.000 NA   NA
 913232 913233 SACOL1788 SACOL1789     TRUE 0.568 74.000 0.222 NA   NA
 913233 913234 SACOL1789 SACOL1790   murC FALSE 0.289 74.000 0.014 NA   NA
 913234 913235 SACOL1790 SACOL1791 murC   TRUE 0.923 24.000 0.017 0.005 N NA
 913235 913236 SACOL1791 SACOL1792     TRUE 0.891 21.000 0.143 1.000   NA
 913236 913237 SACOL1792 SACOL1793     TRUE 0.922 29.000 0.511 NA   NA
 913237 913238 SACOL1793 SACOL1794     TRUE 0.622 100.000 0.500 NA   NA
 913238 913239 SACOL1794 SACOL1795   pepA1 TRUE 0.606 65.000 0.081 1.000 N NA
 913241 913242 SACOL1797 SACOL1798   trmB FALSE 0.038 536.000 0.117 1.000   NA
 913242 913243 SACOL1798 SACOL1799 trmB   TRUE 0.889 15.000 0.154 1.000   NA
 913243 913244 SACOL1799 SACOL1800   dat FALSE 0.017 550.000 0.000 1.000 N NA
 913244 913245 SACOL1800 SACOL1801 dat   TRUE 0.964 4.000 0.143 1.000 Y NA
 913245 913246 SACOL1801 SACOL1802     FALSE 0.006 920.000 0.000 NA   NA
 913246 913247 SACOL1802 SACOL1803     TRUE 0.907 17.000 0.233 NA   NA
 913247 913248 SACOL1803 SACOL1804     TRUE 0.966 -3.000 0.233 1.000   NA
 913250 913251 SACOL1806 SACOL1807     FALSE 0.030 326.000 0.000 NA N NA
 913251 913252 SACOL1807 SACOL1808   leuS TRUE 0.753 22.000 0.007 NA N NA
 913252 913253 SACOL1808 SACOL1809 leuS   FALSE 0.055 288.000 0.000 1.000 N NA
 913254 913255 SACOL1810 SACOL1811     TRUE 0.977 -3.000 0.408 1.000   NA
 913256 913257 SACOL1812 SACOL1813 rot   FALSE 0.012 421.000 0.000 NA   NA
 913257 913258 SACOL1813 SACOL1814     FALSE 0.018 347.000 0.000 NA   NA
 913258 913259 SACOL1814 SACOL1815     TRUE 0.643 3.000 0.000 NA   NA
 913261 913262 SACOL1817 SACOL1818 ribH ribBA TRUE 0.969 13.000 0.022 0.002 Y NA
 913262 913263 SACOL1818 SACOL1819 ribBA ribE TRUE 0.934 11.000 0.026 1.000 Y NA
 913263 913264 SACOL1819 SACOL1820 ribE ribD TRUE 0.977 7.000 0.456 1.000 Y NA
 913264 913265 SACOL1820 SACOL1821 ribD   FALSE 0.009 481.000 0.000 NA   NA
 913266 913267 SACOL1822 SACOL1823 arsR arsB TRUE 0.865 0.000 0.000 1.000 N NA
 913267 913268 SACOL1823 SACOL1824 arsB arsC TRUE 0.786 18.000 0.000 1.000 N NA
 913269 913270 SACOL1825 SACOL1826     FALSE 0.029 276.000 0.000 NA   NA
 913271 913272 SACOL1827 SACOL1828     FALSE 0.382 113.000 0.150 NA   NA
 913276 913277 SACOL1832 SACOL1833 crcB   TRUE 0.989 -3.000 0.069 0.072 Y NA
 913277 913278 SACOL1833 SACOL1834     FALSE 0.012 411.000 0.000 NA   NA
 913279 913280 SACOL1835 SACOL1836     FALSE 0.226 212.000 0.222 NA   NA
 913280 913281 SACOL1836 SACOL1837   metK FALSE 0.242 125.000 0.054 NA   NA
 913283 913284 SACOL1839 SACOL1840     FALSE 0.024 375.000 0.000 1.000   NA
 913284 913285 SACOL1840 SACOL1841     TRUE 0.977 -19.000 0.182 1.000   NA
 913287 913288 SACOL1843 SACOL1844     TRUE 0.835 5.000 0.029 1.000 N NA
 913288 913289 SACOL1844 SACOL1845     FALSE 0.090 159.000 0.000 NA   NA
 913290 913291 SACOL1846 SACOL1847     FALSE 0.165 81.000 0.000 NA   NA
 913291 913292 SACOL1847 SACOL1848     FALSE 0.181 76.000 0.000 NA   NA
 913292 913293 SACOL1848 SACOL1849     FALSE 0.375 41.000 0.000 NA   NA
 913293 913294 SACOL1849 SACOL1850     FALSE 0.143 98.000 0.000 NA   NA
 913295 913296 SACOL1851 SACOL1853     FALSE 0.024 301.000 0.000 NA   NA
 913296 913297 SACOL1853 SACOL1854     TRUE 0.557 11.000 0.000 NA   NA
 913297 913298 SACOL1854 SACOL1855     FALSE 0.139 102.000 0.000 NA   NA
 913298 913299 SACOL1855 SACOL1857     FALSE 0.006 871.000 0.000 NA   NA
 913299 913300 SACOL1857 SACOL1858     FALSE 0.008 521.000 0.000 NA   NA
 913300 913301 SACOL1858 SACOL1859     FALSE 0.053 205.000 0.000 NA   NA
 913301 913302 SACOL1859 SACOL1860     FALSE 0.227 67.000 0.000 NA   NA
 913302 913303 SACOL1860 SACOL1861   hsdS FALSE 0.006 850.000 0.000 NA   NA
 913303 913304 SACOL1861 SACOL1862 hsdS hsdM2 TRUE 0.990 -7.000 0.011 0.041 Y NA
 913304 913305 SACOL1862 SACOL1863 hsdM2   FALSE 0.086 164.000 0.000 NA   NA
 913305 913306 SACOL1863 SACOL1864     FALSE 0.240 65.000 0.000 NA   NA
 913306 913307 SACOL1864 SACOL1865     TRUE 0.816 151.000 0.200 0.004 Y NA
 913307 913308 SACOL1865 SACOL1866     TRUE 0.804 158.000 0.200 0.004 Y NA
 913308 913309 SACOL1866 SACOL1867   splC TRUE 0.841 121.000 0.200 0.004 Y NA
 913309 913310 SACOL1867 SACOL1868 splC splB TRUE 0.943 58.000 0.200 0.004 Y NA
 913310 913311 SACOL1868 SACOL1869 splB splA TRUE 0.834 125.000 0.200 0.004 Y NA
 913313 913314 SACOL1871 SACOL1872 epiG epiE TRUE 0.902 -3.000 0.041 NA   NA
 913314 913315 SACOL1872 SACOL1873 epiE epiF TRUE 0.916 -3.000 0.061 NA   NA
 913315 913316 SACOL1873 SACOL1874 epiF epiP TRUE 0.704 23.000 0.000 1.000   NA
 913316 913317 SACOL1874 SACOL1875 epiP epiD TRUE 0.677 10.000 0.000 1.000   NA
 913317 913318 SACOL1875 SACOL1876 epiD epiC TRUE 0.613 16.000 0.000 NA   NA
 913318 913319 SACOL1876 SACOL1877 epiC epiB TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 913319 913320 SACOL1877 SACOL1878 epiB epiA TRUE 0.646 65.000 0.231 NA   NA
 913322 913323 SACOL1880 SACOL1881 lukD lukE TRUE 0.928 2.000 0.000 0.004   NA
 913324 913325 SACOL1882 SACOL1883     TRUE 0.889 13.000 0.276 NA   NA
 913326 913327 SACOL_tRNA-Ser-3 SACOL_tRNA-Glu-2     FALSE 0.300 55.000 0.000 NA   NA
 913327 913328 SACOL_tRNA-Glu-2 SACOL_tRNA-Asn-2     TRUE 0.687 2.000 0.000 NA   NA
 913328 913329 SACOL_tRNA-Asn-2 SACOL_tRNA-Gly-1     TRUE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 913329 913330 SACOL_tRNA-Gly-1 SACOL_tRNA-His-1     TRUE 0.613 16.000 0.000 NA   NA
 913330 913331 SACOL_tRNA-His-1 SACOL_tRNA-Phe-1     TRUE 0.563 14.000 0.000 NA   NA
 913331 913332 SACOL_tRNA-Phe-1 SACOL_tRNA-Asp-2     TRUE 0.628 17.000 0.000 NA   NA
 913332 913333 SACOL_tRNA-Asp-2 SACOL_tRNA-Met-1     TRUE 0.600 22.000 0.000 NA   NA
 913333 913334 SACOL_tRNA-Met-1 SACOL1885     FALSE 0.010 472.000 0.000 NA   NA
 913336 913337 SACOL1887 SACOL1888 hemG hemH TRUE 0.972 24.000 0.069 0.026 Y NA
 913337 913338 SACOL1888 SACOL1889 hemH hemE TRUE 0.870 58.000 0.131 1.000 Y NA
 913338 913339 SACOL1889 SACOL1890 hemE   TRUE 0.859 -10.000 0.000 NA   NA
 913341 913342 SACOL1892 SACOL1893     TRUE 0.952 -7.000 0.083 NA N NA
 913343 913344 SACOL1894 SACOL1895     FALSE 0.312 142.000 0.137 NA   NA
 913344 913345 SACOL1895 SACOL1896     FALSE 0.031 733.000 0.190 NA   NA
 913345 913346 SACOL1896 SACOL1897     FALSE 0.053 205.000 0.000 NA   NA
 913347 913348 SACOL1898 SACOL1899 cbf1   TRUE 0.965 -3.000 0.291 NA   NA
 913348 913349 SACOL1899 SACOL1900     TRUE 0.979 -10.000 0.330 NA   NA
 913349 913350 SACOL1900 SACOL1902     FALSE 0.020 772.000 0.093 NA   NA
 913350 913351 SACOL1902 SACOL1903     TRUE 0.669 69.000 0.321 NA   NA
 913351 913352 SACOL1903 SACOL1904     FALSE 0.134 179.000 0.029 NA   NA
 913352 913353 SACOL1904 SACOL1905     FALSE 0.226 356.000 0.000 0.014 Y NA
 913353 913354 SACOL1905 SACOL1906     TRUE 0.990 22.000 0.536 0.010 Y NA
 913356 913357 SACOL1908 SACOL1909 fumC   FALSE 0.089 196.000 0.009 NA   NA
 913359 913360 SACOL1911 SACOL1912     TRUE 0.718 25.000 0.021 NA   NA
 913360 913361 SACOL1912 SACOL1913     FALSE 0.247 159.000 0.021 1.000 N NA
 913361 913362 SACOL1913 SACOL1914     TRUE 0.873 5.000 0.077 1.000 N NA
 913362 913363 SACOL1914 SACOL1915     FALSE 0.299 151.000 0.044 1.000 N NA
 913363 913364 SACOL1915 SACOL1916     TRUE 0.992 -13.000 0.154 1.000 Y NA
 913364 913365 SACOL1916 SACOL1917     FALSE 0.121 258.000 0.077 1.000   NA
 913367 913369 SACOL_tRNA-Leu-1 SACOL_tRNA-Gly-2     FALSE 0.046 217.000 0.000 NA   NA
 913369 913370 SACOL_tRNA-Gly-2 SACOL_tRNA-Cys-1     TRUE 0.563 8.000 0.000 NA   NA
 913370 913371 SACOL_tRNA-Cys-1 SACOL_tRNA-Gln-1     TRUE 0.576 6.000 0.000 NA   NA
 913371 913372 SACOL_tRNA-Gln-1 SACOL_tRNA-His-2     TRUE 0.555 12.000 0.000 NA   NA
 913372 913373 SACOL_tRNA-His-2 SACOL_tRNA-Trp-1     TRUE 0.643 3.000 0.000 NA   NA
 913373 913374 SACOL_tRNA-Trp-1 SACOL_tRNA-Tyr-1     TRUE 0.613 16.000 0.000 NA   NA
 913374 913375 SACOL_tRNA-Tyr-1 SACOL_tRNA-Thr-1     TRUE 0.576 6.000 0.000 NA   NA
 913375 913376 SACOL_tRNA-Thr-1 SACOL_tRNA-Phe-2     TRUE 0.563 8.000 0.000 NA   NA
 913376 913377 SACOL_tRNA-Phe-2 SACOL_tRNA-Asp-3     TRUE 0.618 19.000 0.000 NA   NA
 913377 913378 SACOL_tRNA-Asp-3 SACOL_tRNA-Met-2     TRUE 0.559 10.000 0.000 NA   NA
 913378 913379 SACOL_tRNA-Met-2 SACOL_tRNA-Ser-4     TRUE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 913379 913380 SACOL_tRNA-Ser-4 SACOL_tRNA-Asp-4     FALSE 0.391 39.000 0.000 NA   NA
 913380 913381 SACOL_tRNA-Asp-4 SACOL_tRNA-Ser-5     TRUE 0.557 11.000 0.000 NA   NA
 913381 913382 SACOL_tRNA-Ser-5 SACOL_tRNA-Met-3     TRUE 0.559 10.000 0.000 NA   NA
 913382 913383 SACOL_tRNA-Met-3 SACOL_tRNA-Met-4     TRUE 0.566 26.000 0.000 NA   NA
 913383 913384 SACOL_tRNA-Met-4 SACOL_tRNA-Ala-2     TRUE 0.600 22.000 0.000 NA   NA
 913384 913385 SACOL_tRNA-Ala-2 SACOL_tRNA-Pro-1     TRUE 0.627 18.000 0.000 NA   NA
 913385 913386 SACOL_tRNA-Pro-1 SACOL_tRNA-Arg-3     TRUE 0.559 10.000 0.000 NA   NA
 913386 913387 SACOL_tRNA-Arg-3 SACOL_tRNA-Leu-2     TRUE 0.618 19.000 0.000 NA   NA
 913387 913388 SACOL_tRNA-Leu-2 SACOL_tRNA-Gly-3     TRUE 0.557 11.000 0.000 NA   NA
 913388 913389 SACOL_tRNA-Gly-3 SACOL_tRNA-Leu-3     TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 913389 913390 SACOL_tRNA-Leu-3 SACOL_tRNA-Lys-1     TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 913390 913391 SACOL_tRNA-Lys-1 SACOL_tRNA-Thr-2     TRUE 0.576 6.000 0.000 NA   NA
 913391 913392 SACOL_tRNA-Thr-2 SACOL_tRNA-Val-1     TRUE 0.628 17.000 0.000 NA   NA
 913392 913393 SACOL_tRNA-Val-1 SACOL_Sa5SD   rrfD TRUE 0.555 12.000 0.000 NA   NA
 913393 913394 SACOL_Sa5SD SACOL_Sa23SD rrfD rrlD FALSE 0.197 73.000 0.000 NA   NA
 913394 913395 SACOL_Sa23SD SACOL_tRNA-Ala-3 rrlD   FALSE 0.048 214.000 0.000 NA   NA
 913395 913396 SACOL_tRNA-Ala-3 SACOL_tRNA-Ile-2     TRUE 0.618 19.000 0.000 NA   NA
 913396 913397 SACOL_tRNA-Ile-2 SACOL_Sa16SD   rrsD FALSE 0.153 90.000 0.000 NA   NA
 913397 913398 SACOL_Sa16SD SACOL1919 rrsD   FALSE 0.006 740.000 0.000 NA   NA
 913398 913399 SACOL1919 SACOL1920     FALSE 0.516 97.000 0.146 1.000 N NA
 913399 913400 SACOL1920 SACOL1921   bcp TRUE 0.812 6.000 0.017 1.000 N NA
 913401 913402 SACOL1922 SACOL1923 hemL2   FALSE 0.081 293.000 0.102 NA   NA
 913403 913404 SACOL1924 SACOL1925     FALSE 0.089 291.000 0.077 NA N NA
 913404 913405 SACOL1925 SACOL1926   mutY FALSE 0.051 302.000 0.011 NA N NA
 913407 913408 SACOL1928 SACOL1929     TRUE 0.944 9.000 0.727 NA   NA
 913408 913409 SACOL1929 SACOL1930     TRUE 0.878 15.000 0.186 NA   NA
 913409 913410 SACOL1930 SACOL1931     TRUE 0.944 -22.000 0.045 NA   NA
 913410 913411 SACOL1931 SACOL1932     FALSE 0.069 261.000 0.004 1.000   NA
 913411 913412 SACOL1932 SACOL1933     FALSE 0.030 341.000 0.000 1.000   NA
 913412 913413 SACOL1933 SACOL1934     FALSE 0.261 131.000 0.074 NA   NA
 913415 913416 SACOL1936 SACOL1937   pepS TRUE 0.687 90.000 0.545 NA N NA
 913416 913417 SACOL1937 SACOL1938 pepS   TRUE 0.872 3.000 0.125 NA   NA
 913418 913419 SACOL1939 SACOL1940     TRUE 0.682 7.000 0.010 NA   NA
 913419 913420 SACOL1940 SACOL1941     FALSE 0.028 278.000 0.000 NA   NA
 913421 913422 SACOL1942 SACOL1943 vraR vraS TRUE 0.998 -10.000 0.853 0.010 Y NA
 913422 913423 SACOL1943 SACOL1944 vraS   TRUE 0.980 -3.000 0.679 NA   NA
 913423 913424 SACOL1944 SACOL1945     TRUE 0.820 15.000 0.086 NA   NA
 913424 913425 SACOL1945 SACOL1946     FALSE 0.109 217.000 0.051 NA   NA
 913427 913428 SACOL1948 SACOL1949     FALSE 0.530 29.000 0.000 NA   NA
 913428 913429 SACOL1949 SACOL1950     FALSE 0.158 86.000 0.000 NA   NA
 913429 913430 SACOL1950 SACOL1951     TRUE 0.973 2.000 0.796 1.000   NA
 913434 913435 SACOL1955 SACOL1956 dinP   FALSE 0.061 247.000 0.015 NA   NA
 913435 913436 SACOL1956 SACOL1957     FALSE 0.175 170.000 0.047 NA   NA
 913436 913437 SACOL1957 SACOL1958     TRUE 0.662 81.000 0.299 1.000 N NA
 913437 913438 SACOL1958 SACOL1960   gatB FALSE 0.022 769.000 0.034 1.000 N NA
 913438 913439 SACOL1960 SACOL1961 gatB gatA TRUE 0.989 13.000 0.492 0.001 Y NA
 913439 913440 SACOL1961 SACOL1962 gatA gatC TRUE 0.995 2.000 0.643 0.001 Y NA
 913442 913443 SACOL1964 SACOL1965 camS ligA TRUE 0.719 13.000 0.030 NA   NA
 913443 913444 SACOL1965 SACOL1966 ligA pcrA TRUE 0.979 4.000 0.103 0.013 Y NA
 913444 913445 SACOL1966 SACOL1967 pcrA   TRUE 0.933 -3.000 0.054 1.000   NA
 913445 913446 SACOL1967 SACOL1968     FALSE 0.193 172.000 0.031 1.000   NA
 913446 913447 SACOL1968 SACOL1969   purB FALSE 0.254 109.000 0.006 1.000   NA
 913448 913449 SACOL1970 SACOL1971 sspB2   TRUE 0.620 31.000 0.000 1.000   NA
 913450 913451 SACOL1972 SACOL1973     TRUE 0.977 -19.000 0.258 NA   NA
 913451 913452 SACOL1973 SACOL1974   nadE FALSE 0.056 271.000 0.023 NA   NA
 913452 913453 SACOL1974 SACOL1975 nadE   TRUE 0.996 -7.000 0.194 0.001 Y NA
 913454 913455 SACOL1976 SACOL1977   pheA TRUE 0.945 20.000 0.022 1.000 Y NA
 913456 913457 SACOL1978 SACOL1979     FALSE 0.358 43.000 0.000 NA   NA
 913457 913458 SACOL1979 SACOL1980     FALSE 0.085 205.000 0.000 1.000   NA
 913459 913460 SACOL1981 SACOL1982   ppaC TRUE 0.594 53.000 0.020 1.000 N NA
 913467 913468 SACOL1989 SACOL1990     TRUE 0.977 -3.000 0.545 NA   NA
 913468 913469 SACOL1990 SACOL1991     TRUE 0.817 60.000 0.636 NA   NA
 913471 913472 SACOL1993 SACOL1994     TRUE 0.972 0.000 0.615 NA   NA
 913472 913473 SACOL1994 SACOL1995     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 913473 913474 SACOL1995 SACOL1996     TRUE 0.715 1.000 0.000 NA   NA
 913474 913475 SACOL1996 SACOL1997     TRUE 0.975 -3.000 0.292 1.000 N NA
 913475 913476 SACOL1997 SACOL1998     FALSE 0.110 264.000 0.125 NA   NA
 913476 913477 SACOL1998 SACOL1999     FALSE 0.225 243.000 0.333 NA   NA
 913481 913482 SACOL2004 SACOL2006     FALSE 0.351 166.000 0.000 0.004   NA
 913484 913485 SACOL2009 SACOL2010     FALSE 0.342 62.000 0.000 NA N NA
 913487 913488 SACOL2012 SACOL2013     FALSE 0.134 106.000 0.000 NA   NA
 913488 913489 SACOL2013 SACOL2014     FALSE 0.021 318.000 0.000 NA   NA
 913491 913492 SACOL2016 SACOL2017 groEL groES TRUE 0.945 76.000 0.674 0.005 Y NA
 913495 913496 SACOL2020 SACOL2021     FALSE 0.078 361.000 0.138 1.000   NA
 913498 913499 SACOL2023 SACOL2024 agrB agrD TRUE 0.958 -3.000 0.225 NA   NA
 913499 913500 SACOL2024 SACOL2025 agrD argC2 TRUE 0.892 25.000 0.250 NA   NA
 913500 913501 SACOL2025 SACOL2026 argC2 agrA TRUE 0.988 19.000 0.875 1.000 Y NA
 913502 913503 SACOL2028 SACOL2029   cscA TRUE 0.991 -3.000 0.364 1.000 Y NA
 913503 913504 SACOL2029 SACOL2030 cscA scrR FALSE 0.339 149.000 0.070 1.000 N NA
 913504 913505 SACOL2030 SACOL2031 scrR   FALSE 0.247 183.000 0.070 1.000 N NA
 913505 913506 SACOL2031 SACOL2033     FALSE 0.175 207.000 0.040 1.000 N NA
 913506 913507 SACOL2033 SACOL2034     TRUE 0.771 60.000 0.419 NA   NA
 913507 913508 SACOL2034 SACOL2035     FALSE 0.023 304.000 0.000 NA   NA
 913509 913510 SACOL2036 SACOL2037     FALSE 0.063 362.000 0.000 0.087   NA
 913511 913512 SACOL2038 SACOL2039     TRUE 0.957 -7.000 0.090 1.000   NA
 913512 913513 SACOL2039 SACOL2040     TRUE 0.973 -27.000 0.127 1.000   NA
 913513 913514 SACOL2040 SACOL2041     TRUE 0.974 -19.000 0.217 NA   NA
 913515 913516 SACOL2042 SACOL2043 ilvD ilvB TRUE 0.977 28.000 0.089 0.001 Y NA
 913516 913517 SACOL2043 SACOL2044 ilvB   TRUE 0.964 0.000 0.013 0.001   NA
 913517 913518 SACOL2044 SACOL2045   ilvC FALSE 0.204 137.000 0.006 1.000   NA
 913518 913519 SACOL2045 SACOL2046 ilvC leuA TRUE 0.942 30.000 0.103 1.000 Y NA
 913519 913520 SACOL2046 SACOL2047 leuA leuB TRUE 0.978 3.000 0.011 0.002 Y NA
 913520 913521 SACOL2047 SACOL2048 leuB leuC TRUE 0.971 14.000 0.027 0.002 Y NA
 913521 913522 SACOL2048 SACOL2049 leuC leuD TRUE 0.995 1.000 0.477 0.001 Y NA
 913522 913523 SACOL2049 SACOL2050 leuD ilvA2 TRUE 0.956 15.000 0.100 1.000 Y NA
 913524 913525 SACOL_Sa5SE SACOL_Sa23SE rrfE rrlE FALSE 0.197 73.000 0.000 NA   NA
 913525 913526 SACOL_Sa23SE SACOL_Sa16SE rrlE rrsE FALSE 0.008 547.000 0.000 NA   NA
 913526 913527 SACOL_Sa16SE SACOL_tRNA-Gly-4 rrsE   FALSE 0.118 118.000 0.000 NA   NA
 913527 913528 SACOL_tRNA-Gly-4 SACOL_tRNA-Leu-4     TRUE 0.611 20.000 0.000 NA   NA
 913528 913529 SACOL_tRNA-Leu-4 SACOL2052     FALSE 0.007 647.000 0.000 NA   NA
 913529 913530 SACOL2052 SACOL2053     TRUE 0.966 -7.000 0.215 NA   NA
 913530 913531 SACOL2053 SACOL2054   rpoF FALSE 0.124 434.000 0.049 1.000 Y NA
 913531 913532 SACOL2054 SACOL2055 rpoF rsbW TRUE 0.993 -25.000 0.838 1.000 N NA
 913532 913533 SACOL2055 SACOL2056 rsbW rsbV TRUE 0.989 2.000 0.714 1.000 Y NA
 913533 913534 SACOL2056 SACOL2057 rsbV rsbU TRUE 0.806 120.000 0.440 1.000 Y NA
 913534 913535 SACOL2057 SACOL2058 rsbU   FALSE 0.131 350.000 0.000 1.000 Y NA
 913535 913536 SACOL2058 SACOL2059     TRUE 0.900 -3.000 0.039 NA   NA
 913536 913537 SACOL2059 SACOL2060   alr FALSE 0.350 85.000 0.065 NA   NA
 913537 913538 SACOL2060 SACOL2061 alr acpS TRUE 0.611 66.000 0.093 1.000 N NA
 913538 913539 SACOL2061 SACOL2062 acpS   TRUE 0.725 4.000 0.012 NA   NA
 913539 913540 SACOL2062 SACOL2063     TRUE 0.964 -16.000 0.137 NA   NA
 913540 913541 SACOL2063 SACOL2064     TRUE 0.964 -7.000 0.196 NA   NA
 913541 913542 SACOL2064 SACOL2065     FALSE 0.145 96.000 0.000 NA   NA
 913542 913543 SACOL2065 SACOL2066   kdpC TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 913543 913544 SACOL2066 SACOL2067 kdpC kdpB TRUE 0.970 20.000 0.000 0.002 Y NA
 913544 913545 SACOL2067 SACOL2068 kdpB kdpA TRUE 0.971 19.000 0.000 0.002 Y NA
 913545 913546 SACOL2068 SACOL2069 kdpA kdpF TRUE 0.902 24.000 0.000 0.002   NA
 913547 913548 SACOL2070 SACOL2071 kdpD kdpE TRUE 0.962 0.000 0.000 1.000 Y NA
 913549 913550 SACOL2072 SACOL2073   murF FALSE 0.041 517.000 0.000 0.086 N NA
 913550 913551 SACOL2073 SACOL2074 murF   TRUE 0.972 15.000 0.035 0.007 Y NA
 913553 913554 SACOL2076 SACOL2077     FALSE 0.479 128.000 0.333 NA   NA
 913554 913555 SACOL2077 SACOL2078     TRUE 0.734 12.000 0.036 NA   NA
 913556 913557 SACOL2079 SACOL2080 cls2   TRUE 0.896 28.000 0.036 0.024   NA
 913558 913559 SACOL2081 SACOL2082     FALSE 0.008 546.000 0.000 NA   NA
 913559 913560 SACOL2082 SACOL2083   thiE FALSE 0.446 86.000 0.055 1.000 N NA
 913560 913561 SACOL2083 SACOL2084 thiE thiM TRUE 0.985 2.000 0.061 0.003 Y NA
 913561 913562 SACOL2084 SACOL2085 thiM thiD2 TRUE 0.994 -16.000 0.032 0.003 Y NA
 913562 913563 SACOL2085 SACOL2086 thiD2   TRUE 0.986 -7.000 0.478 1.000 N NA
 913563 913564 SACOL2086 SACOL2088     FALSE 0.023 386.000 0.000 1.000   NA
 913564 913565 SACOL2088 SACOL2089     FALSE 0.022 389.000 0.000 1.000   NA
 913567 913568 SACOL2091 SACOL2092 fabZ murAA TRUE 0.762 34.000 0.044 1.000 N NA
 913568 913569 SACOL2092 SACOL2093 murAA   FALSE 0.490 111.000 0.279 NA   NA
 913569 913570 SACOL2093 SACOL2094   atpC FALSE 0.017 562.000 0.039 NA   NA
 913570 913571 SACOL2094 SACOL2095 atpC atpD TRUE 0.993 20.000 0.837 0.004 Y NA
 913571 913572 SACOL2095 SACOL2096 atpD atpG TRUE 0.992 22.000 0.724 0.004 Y NA
 913572 913573 SACOL2096 SACOL2097 atpG atpA TRUE 0.989 31.000 0.846 0.004 Y NA
 913573 913574 SACOL2097 SACOL2098 atpA atpH TRUE 0.993 22.000 0.864 0.004 Y NA
 913574 913575 SACOL2098 SACOL2099 atpH atpF TRUE 0.992 0.000 0.222 0.004 Y NA
 913575 913576 SACOL2099 SACOL2100 atpF atpE TRUE 0.573 198.000 0.402 0.004   NA
 913576 913577 SACOL2100 SACOL2101 atpE atpB TRUE 0.891 43.000 0.189 0.004   NA
 913577 913578 SACOL2101 SACOL2102 atpB   TRUE 0.934 21.000 0.330 1.000   NA
 913578 913579 SACOL2102 SACOL2103     FALSE 0.207 167.000 0.030 1.000   NA
 913579 913580 SACOL2103 SACOL2104   upp TRUE 0.804 24.000 0.008 1.000 N NA
 913580 913581 SACOL2104 SACOL2105 upp glyA TRUE 0.834 28.000 0.051 1.000 N NA
 913581 913582 SACOL2105 SACOL2106 glyA   TRUE 0.841 27.000 0.145 NA   NA
 913582 913583 SACOL2106 SACOL2107     FALSE 0.284 107.000 0.052 NA   NA
 913583 913584 SACOL2107 SACOL2108     TRUE 0.927 -3.000 0.052 NA N NA
 913584 913585 SACOL2108 SACOL2109     TRUE 0.727 75.000 0.072 NA Y NA
 913585 913586 SACOL2109 SACOL2110   prfA TRUE 0.989 -13.000 0.084 1.000 Y NA
 913586 913587 SACOL2110 SACOL2111 prfA tdk TRUE 0.918 1.000 0.062 1.000 N NA
 913587 913588 SACOL2111 SACOL2112 tdk rpmE FALSE 0.059 347.000 0.028 1.000 N NA
 913588 913589 SACOL2112 SACOL2113 rpmE rho FALSE 0.356 118.000 0.049 1.000 N NA
 913589 913590 SACOL2113 SACOL2114 rho   FALSE 0.075 247.000 0.000 1.000 N NA
 913590 913591 SACOL2114 SACOL2115     FALSE 0.197 238.000 0.200 NA N NA
 913591 913592 SACOL2115 SACOL2116   murAB FALSE 0.358 89.000 0.046 NA N NA
 913592 913593 SACOL2116 SACOL2117 murAB fbaA FALSE 0.021 466.000 0.000 1.000 N NA
 913595 913596 SACOL2119 SACOL2120 pyrG rpoE FALSE 0.065 336.000 0.029 1.000 N NA
 913596 913597 SACOL2120 SACOL2121 rpoE   FALSE 0.346 112.000 0.060 1.000   NA
 913599 913600 SACOL2123 SACOL2124     FALSE 0.013 399.000 0.000 NA   NA
 913600 913601 SACOL2124 SACOL2125     TRUE 0.934 0.000 0.121 1.000   NA
 913603 913604 SACOL2127 SACOL2128   pdp TRUE 0.563 14.000 0.000 NA   NA
 913604 913605 SACOL2128 SACOL2129 pdp deoC2 FALSE 0.241 279.000 0.026 1.000 Y NA
 913607 913608 SACOL2131 SACOL2132     FALSE 0.087 200.000 0.009 NA   NA
 913608 913609 SACOL2132 SACOL2133     FALSE 0.015 458.000 0.007 NA   NA
 913609 913610 SACOL2133 SACOL2134     FALSE 0.007 672.000 0.000 NA   NA
 913610 913611 SACOL2134 SACOL2135   manA1 TRUE 0.951 31.000 1.000 1.000   NA
 913611 913612 SACOL2135 SACOL2136 manA1   FALSE 0.018 435.000 0.000 1.000   NA
 913613 913614 SACOL2137 SACOL2138 czrA   TRUE 0.931 2.000 0.139 1.000 N NA
 913614 913615 SACOL2138 SACOL2139     FALSE 0.051 210.000 0.000 NA   NA
 913615 913616 SACOL2139 SACOL2140     TRUE 0.882 -73.000 0.000 NA   NA
 913617 913618 SACOL2141 SACOL2142     FALSE 0.280 59.000 0.000 NA   NA
 913618 913619 SACOL2142 SACOL2143     FALSE 0.009 1086.000 0.000 1.000   NA
 913619 913620 SACOL2143 SACOL2144     TRUE 0.725 56.000 0.188 1.000   NA
 913620 913621 SACOL2144 SACOL2145   glmS FALSE 0.083 232.000 0.000 1.000 N NA
 913622 913623 SACOL2146 SACOL2147     TRUE 0.944 35.000 0.336 0.011 N NA
 913623 913624 SACOL2147 SACOL2148     TRUE 0.936 12.000 0.098 0.011 N NA
 913624 913625 SACOL2148 SACOL2149   mtlD TRUE 0.975 0.000 0.062 1.000 Y NA
 913626 913627 SACOL2150 SACOL2151 fmtB glmM FALSE 0.060 277.000 0.000 1.000 N NA
 913627 913628 SACOL2151 SACOL2152 glmM   TRUE 0.845 27.000 0.150 NA   NA
 913628 913629 SACOL2152 SACOL2153     TRUE 0.958 2.000 0.502 NA   NA
 913629 913630 SACOL2153 SACOL2154   rocF FALSE 0.093 189.000 0.007 NA   NA
 913632 913633 SACOL_tRNA-Lys-2 SACOL_tRNA-Gln-2     TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 913633 913634 SACOL_tRNA-Gln-2 SACOL_tRNA-Tyr-2     TRUE 0.559 10.000 0.000 NA   NA
 913634 913635 SACOL_tRNA-Tyr-2 SACOL_tRNA-Val-2     FALSE 0.516 30.000 0.000 NA   NA
 913635 913636 SACOL_tRNA-Val-2 SACOL_tRNA-Glu-3     TRUE 0.563 8.000 0.000 NA   NA
 913636 913637 SACOL_tRNA-Glu-3 SACOL_tRNA-Asn-3     TRUE 0.687 2.000 0.000 NA   NA
 913637 913638 SACOL_tRNA-Asn-3 SACOL_Sa5SF   rrfF TRUE 0.557 11.000 0.000 NA   NA
 913638 913639 SACOL_Sa5SF SACOL_Sa23SF rrfF rrlF FALSE 0.197 73.000 0.000 NA   NA
 913639 913640 SACOL_Sa23SF SACOL_Sa16SF rrlF rrsF FALSE 0.008 547.000 0.000 NA   NA
 913640 913641 SACOL_Sa16SF SACOL2156 rrsF   FALSE 0.010 456.000 0.000 NA   NA
 913641 913642 SACOL2156 SACOL2157     FALSE 0.389 148.000 0.162 1.000   NA
 913642 913643 SACOL2157 SACOL2158     FALSE 0.180 322.000 0.500 NA   NA
 913643 913644 SACOL2158 SACOL2159     TRUE 0.718 99.000 0.875 NA   NA
 913644 913645 SACOL2159 SACOL2160     FALSE 0.451 177.000 0.162 0.057   NA
 913645 913646 SACOL2160 SACOL2161     TRUE 0.848 19.000 0.051 1.000   NA
 913646 913647 SACOL2161 SACOL2162     TRUE 0.565 44.000 0.044 NA   NA
 913649 913650 SACOL2164 SACOL2165     FALSE 0.063 236.000 0.000 1.000   NA
 913650 913651 SACOL2165 SACOL2166     TRUE 0.994 -3.000 0.280 0.033 Y NA
 913651 913652 SACOL2166 SACOL2167     TRUE 0.977 12.000 0.500 1.000 Y NA
 913652 913653 SACOL2167 SACOL2168     FALSE 0.069 392.000 0.105 1.000 N NA
 913653 913654 SACOL2168 SACOL2169     TRUE 0.937 7.000 0.368 1.000 N NA
 913654 913655 SACOL2169 SACOL2170     TRUE 0.986 -13.000 0.429 1.000   NA
 913656 913657 SACOL2171 SACOL2172     FALSE 0.010 456.000 0.000 NA   NA
 913658 913659 SACOL2173 SACOL2174     FALSE 0.519 63.000 0.083 NA   NA
 913659 913660 SACOL2174 SACOL2175     TRUE 0.812 13.000 0.107 NA   NA
 913660 913661 SACOL2175 SACOL2176   opuD2 FALSE 0.469 163.000 0.455 NA   NA
 913661 913662 SACOL2176 SACOL2177 opuD2   FALSE 0.077 307.000 0.032 1.000 N NA
 913662 913663 SACOL2177 SACOL2178     FALSE 0.279 234.000 0.079 0.015   NA
 913663 913664 SACOL2178 SACOL2179     FALSE 0.059 283.000 0.039 NA   NA
 913664 913665 SACOL2179 SACOL2180   lacG FALSE 0.031 266.000 0.000 NA   NA
 913665 913666 SACOL2180 SACOL2181 lacG lacE TRUE 0.977 18.000 0.300 1.000 Y NA
 913666 913667 SACOL2181 SACOL2182 lacE lacF TRUE 0.995 0.000 0.600 0.008 Y NA
 913667 913668 SACOL2182 SACOL2183 lacF lacD TRUE 0.979 22.000 0.417 1.000 Y NA
 913668 913669 SACOL2183 SACOL2184 lacD lacC TRUE 0.992 4.000 0.556 0.001 Y NA
 913669 913670 SACOL2184 SACOL2185 lacC lacB TRUE 0.980 13.000 0.667 1.000 Y NA
 913670 913671 SACOL2185 SACOL2186 lacB   TRUE 0.993 16.000 0.750 0.001 Y NA
 913671 913672 SACOL2186 SACOL2187     TRUE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 913672 913673 SACOL2187 SACOL2188   lacR FALSE 0.039 237.000 0.000 NA   NA
 913675 913676 SACOL2190 SACOL2191     FALSE 0.032 262.000 0.000 NA   NA
 913676 913677 SACOL2191 SACOL2192     FALSE 0.044 220.000 0.000 NA   NA
 913677 913678 SACOL2192 SACOL2193     FALSE 0.304 70.000 0.000 1.000   NA
 913680 913681 SACOL2195 SACOL2196     FALSE 0.080 211.000 0.000 1.000   NA
 913683 913684 SACOL2198 SACOL2199 budA1 budB TRUE 0.701 37.000 0.022 1.000 N NA
 913686 913687 SACOL2201 SACOL2202     FALSE 0.460 33.000 0.000 NA   NA
 913687 913688 SACOL2202 SACOL2203     FALSE 0.107 129.000 0.000 NA   NA
 913688 913689 SACOL2203 SACOL2204     TRUE 0.715 1.000 0.000 NA   NA
 913689 913690 SACOL2204 SACOL2205     FALSE 0.382 40.000 0.000 NA   NA
 913690 913691 SACOL2205 SACOL2206   rpsI FALSE 0.008 545.000 0.000 NA   NA
 913691 913692 SACOL2206 SACOL2207 rpsI rplM TRUE 0.961 14.000 0.006 0.017 Y NA
 913692 913693 SACOL2207 SACOL2208 rplM truA FALSE 0.336 240.000 0.052 1.000 Y NA
 913693 913694 SACOL2208 SACOL2209 truA   TRUE 0.909 5.000 0.170 1.000 N NA
 913694 913695 SACOL2209 SACOL2210     TRUE 0.990 -10.000 0.139 1.000 Y NA
 913695 913696 SACOL2210 SACOL2211     TRUE 0.997 -3.000 0.713 0.019 Y NA
 913696 913697 SACOL2211 SACOL2212   rplQ FALSE 0.037 538.000 0.074 1.000 N NA
 913697 913698 SACOL2212 SACOL2213 rplQ rpoA TRUE 0.972 17.000 0.873 1.000 N NA
 913698 913699 SACOL2213 SACOL2214 rpoA rpsK TRUE 0.699 75.000 0.308 1.000 N NA
 913699 913700 SACOL2214 SACOL2215 rpsK rpsM TRUE 0.991 24.000 0.810 0.017 Y NA
 913700 913701 SACOL2215 SACOL2216 rpsM rpmJ TRUE 0.951 23.000 0.194 0.017   NA
 913701 913702 SACOL2216 SACOL2217 rpmJ infA TRUE 0.876 32.000 0.257 1.000   NA
 913702 913703 SACOL2217 SACOL2218 infA adk FALSE 0.219 193.000 0.059 1.000 N NA
 913703 913704 SACOL2218 SACOL2219 adk secY TRUE 0.936 17.000 0.241 1.000 N NA
 913704 913705 SACOL2219 SACOL2220 secY rplO TRUE 0.981 0.000 0.730 1.000 N NA
 913705 913706 SACOL2220 SACOL2221 rplO rpmD TRUE 0.993 17.000 0.653 0.003 Y NA
 913706 913707 SACOL2221 SACOL2222 rpmD rpsE TRUE 0.992 17.000 0.789 0.023 Y NA
 913707 913708 SACOL2222 SACOL2223 rpsE rplR TRUE 0.992 21.000 0.814 0.023 Y NA
 913708 913709 SACOL2223 SACOL2224 rplR rplF TRUE 0.988 31.000 0.815 0.017 Y NA
 913709 913710 SACOL2224 SACOL2225 rplF rpsH TRUE 0.991 25.000 0.808 0.017 Y NA
 913710 913711 SACOL2225 SACOL2226 rpsH rpsN2 TRUE 0.982 32.000 0.473 0.017 Y NA
 913711 913712 SACOL2226 SACOL2227 rpsN2 rplE TRUE 0.989 23.000 0.496 0.017 Y NA
 913712 913713 SACOL2227 SACOL2228 rplE rplX TRUE 0.990 27.000 0.758 0.017 Y NA
 913713 913714 SACOL2228 SACOL2229 rplX rplN TRUE 0.983 36.000 0.810 0.023 Y NA
 913714 913715 SACOL2229 SACOL2230 rplN rpsQ TRUE 0.986 32.000 0.791 0.023 Y NA
 913715 913716 SACOL2230 SACOL2231 rpsQ rpmC TRUE 0.991 24.000 0.828 0.017 Y NA
 913716 913717 SACOL2231 SACOL2232 rpmC rplP TRUE 0.998 -10.000 0.802 0.017 Y NA
 913717 913718 SACOL2232 SACOL2233 rplP rpsC TRUE 0.993 3.000 0.828 0.023 Y NA
 913718 913719 SACOL2233 SACOL2234 rpsC rplV TRUE 0.990 24.000 0.719 0.023 Y NA
 913719 913720 SACOL2234 SACOL2235 rplV rpsS TRUE 0.988 29.000 0.769 0.023 Y NA
 913720 913721 SACOL2235 SACOL2236 rpsS rplB TRUE 0.958 67.000 0.820 0.023 Y NA
 913721 913722 SACOL2236 SACOL2237 rplB rplW TRUE 0.986 33.000 0.849 0.018 Y NA
 913722 913723 SACOL2237 SACOL2238 rplW rplD TRUE 0.993 0.000 0.307 0.017 Y NA
 913723 913724 SACOL2238 SACOL2239 rplD rplC TRUE 0.988 27.000 0.544 0.017 Y NA
 913724 913725 SACOL2239 SACOL2240 rplC rpsJ TRUE 0.985 28.000 0.467 0.023 Y NA
 913727 913728 SACOL2242 SACOL2243   topB FALSE 0.344 113.000 0.060 1.000   NA
 913729 913730 SACOL2245 SACOL2246     FALSE 0.161 181.000 0.022 1.000   NA
 913731 913732 SACOL2247 SACOL2248     FALSE 0.077 171.000 0.000 NA   NA
 913733 913734 SACOL2250 SACOL2251     FALSE 0.202 245.000 0.286 NA   NA
 913735 913736 SACOL2252 SACOL2253   femX TRUE 0.684 117.000 0.167 NA Y NA
 913736 913737 SACOL2253 SACOL2255 femX   FALSE 0.007 632.000 0.000 NA   NA
 913738 913739 SACOL2256 SACOL2257     TRUE 0.983 -7.000 0.370 1.000 N NA
 913742 913743 SACOL2260 SACOL2261   moaA FALSE 0.058 195.000 0.000 NA   NA
 11516855 913737   SACOL2255     FALSE NA 2614.000 0.000 NA   NA
 11659218 913737   SACOL2255     FALSE NA 2614.000 0.000 NA   NA
 11801610 913737   SACOL2255     FALSE NA 2614.000 0.000 NA   NA
 11516856 913737   SACOL2255     FALSE NA 2637.000 0.000 NA   NA
 11659219 913737   SACOL2255     FALSE NA 2637.000 0.000 NA   NA
 11801611 913737   SACOL2255     FALSE NA 2637.000 0.000 NA   NA
 11516857 913737   SACOL2255     FALSE NA 2670.000 0.000 NA   NA
 11659220 913737   SACOL2255     FALSE NA 2670.000 0.000 NA   NA
 11801612 913737   SACOL2255     FALSE NA 2670.000 0.000 NA   NA
 11516858 913737   SACOL2255     FALSE NA 2693.000 0.000 NA   NA
 11659221 913737   SACOL2255     FALSE NA 2693.000 0.000 NA   NA
 11801613 913737   SACOL2255     FALSE NA 2693.000 0.000 NA   NA
 11516859 913737   SACOL2255     FALSE NA 2729.000 0.000 NA   NA
 11659222 913737   SACOL2255     FALSE NA 2729.000 0.000 NA   NA
 11801614 913737   SACOL2255     FALSE NA 2729.000 0.000 NA   NA
 11516860 913737   SACOL2255     FALSE NA 2752.000 0.000 NA   NA
 11659223 913737   SACOL2255     FALSE NA 2752.000 0.000 NA   NA
 11801615 913737   SACOL2255     FALSE NA 2752.000 0.000 NA   NA
 11516861 913737   SACOL2255     FALSE NA 2785.000 0.000 NA   NA
 11659224 913737   SACOL2255     FALSE NA 2785.000 0.000 NA   NA
 11801616 913737   SACOL2255     FALSE NA 2785.000 0.000 NA   NA
 913743 913744 SACOL2261 SACOL2262 moaA mobA TRUE 0.974 20.000 0.016 0.003 Y NA
 913744 913745 SACOL2262 SACOL2263 mobA moaD TRUE 0.970 7.000 0.027 0.003 Y NA
 913745 913746 SACOL2263 SACOL2264 moaD moaE TRUE 0.990 6.000 0.501 0.003 Y NA
 913746 913747 SACOL2264 SACOL2265 moaE mobB TRUE 0.972 14.000 0.040 0.003 Y NA
 913747 913748 SACOL2265 SACOL2266 mobB   TRUE 0.994 -3.000 0.200 0.003 Y NA
 913750 913751 SACOL2268 SACOL2269 moaB   TRUE 0.917 31.000 0.023 1.000 Y NA
 913751 913752 SACOL2269 SACOL2270   modC FALSE 0.180 170.000 0.017 1.000   NA
 913752 913753 SACOL2270 SACOL2271 modC modB TRUE 0.875 1.000 0.025 1.000   NA
 913753 913754 SACOL2271 SACOL2272 modB modA TRUE 0.989 14.000 0.430 0.001 Y NA
 913756 913757 SACOL2274 SACOL2275     FALSE 0.355 72.000 0.033 NA   NA
 913757 913758 SACOL2275 SACOL2276     FALSE 0.217 121.000 0.033 NA   NA
 913758 913759 SACOL2276 SACOL2277     FALSE 0.054 399.000 0.059 1.000 N NA
 913759 913760 SACOL2277 SACOL2278     FALSE 0.187 214.000 0.065 1.000 N NA
 913760 913761 SACOL2278 SACOL2279     FALSE 0.095 217.000 0.000 1.000 N NA
 913762 913763 SACOL2280 SACOL2281 ureA ureB TRUE 0.981 14.000 0.135 0.001 Y NA
 913763 913764 SACOL2281 SACOL2282 ureB ureC TRUE 0.992 -3.000 0.045 0.001 Y NA
 913764 913765 SACOL2282 SACOL2283 ureC ureE TRUE 0.947 13.000 0.087 0.001 N NA
 913765 913766 SACOL2283 SACOL2284 ureE ureF TRUE 0.997 -7.000 0.460 0.003 Y NA
 913766 913767 SACOL2284 SACOL2285 ureF ureG TRUE 0.988 13.000 0.439 0.003 Y NA
 913767 913768 SACOL2285 SACOL2286 ureG ureD TRUE 0.994 0.000 0.337 0.003 Y NA
 913769 913770 SACOL2287 SACOL2288 sarR   FALSE 0.011 428.000 0.000 NA   NA
 913770 913771 SACOL2288 SACOL2289   sarY TRUE 0.769 64.000 0.500 NA   NA
 913771 913772 SACOL2289 SACOL2290 sarY   TRUE 0.963 26.000 0.429 0.031   NA
 913774 913775 SACOL2292 SACOL2293 nhaC   TRUE 0.677 95.000 0.500 1.000   NA
 913776 913777 SACOL2294 SACOL2295     FALSE 0.039 237.000 0.000 NA   NA
 913777 913778 SACOL2295 SACOL2296     FALSE 0.016 362.000 0.000 NA   NA
 913779 913780 SACOL2297 SACOL2298     FALSE 0.112 311.000 0.118 1.000 N NA
 913780 913781 SACOL2298 SACOL2299     TRUE 0.951 22.000 0.714 NA   NA
 913781 913782 SACOL2299 SACOL2300     FALSE 0.201 210.000 0.167 NA   NA
 913782 913783 SACOL2300 SACOL2301     TRUE 0.977 0.000 0.846 NA   NA
 913783 913784 SACOL2301 SACOL2302     FALSE 0.007 602.000 0.000 NA   NA
 913784 913785 SACOL2302 SACOL2303     FALSE 0.356 127.000 0.125 NA N NA
 913786 913787 SACOL2304 SACOL2305     FALSE 0.024 356.000 0.000 NA N NA
 913789 913790 SACOL2307 SACOL2308     FALSE 0.011 445.000 0.000 NA   NA
 913792 913793 SACOL2310 SACOL2311     TRUE 0.981 -3.000 0.714 NA   NA
 913794 913795 SACOL2312 SACOL2313     TRUE 0.897 11.000 0.294 NA   NA
 913795 913796 SACOL2313 SACOL2314     FALSE 0.386 75.000 0.025 1.000   NA
 913800 913801 SACOL2318 SACOL2319     FALSE 0.216 167.000 0.077 NA   NA
 913801 913802 SACOL2319 SACOL2320     FALSE 0.042 225.000 0.000 NA   NA
 913802 913803 SACOL2320 SACOL2321     FALSE 0.009 487.000 0.000 NA   NA
 913803 913804 SACOL2321 SACOL2322     FALSE 0.429 111.000 0.137 1.000   NA
 913804 913805 SACOL2322 SACOL2323   hutI FALSE 0.046 277.000 0.000 1.000   NA
 913805 913806 SACOL2323 SACOL2324 hutI hutU TRUE 0.942 0.000 0.110 1.000 N NA
 913807 913808 SACOL2325 SACOL2326   fosB FALSE 0.017 422.000 0.000 NA N NA
 913813 913814 SACOL2331 SACOL2332   galM TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 913814 913815 SACOL2332 SACOL2333 galM   TRUE 0.822 30.000 0.095 1.000   NA
 913815 913816 SACOL2333 SACOL2334     FALSE 0.045 218.000 0.000 NA   NA
 913816 913817 SACOL2334 SACOL2335     TRUE 0.978 -7.000 0.382 NA   NA
 913817 913818 SACOL2335 SACOL2336     FALSE 0.209 70.000 0.000 NA   NA
 913818 913819 SACOL2336 SACOL2338     FALSE 0.256 63.000 0.000 NA   NA
 913820 913821 SACOL2339 SACOL2340   gltS FALSE 0.041 337.000 0.000 1.000 N NA
 913822 913823 SACOL2341 SACOL2342 fni   TRUE 0.761 31.000 0.018 1.000 N NA
 913824 913825 SACOL2343 SACOL2344     TRUE 0.985 -3.000 1.000 NA   NA
 913828 913829 SACOL2347 SACOL2348     TRUE 0.905 13.000 0.206 1.000 N NA
 913831 913832 SACOL2350 SACOL2351 tcaB   FALSE 0.129 110.000 0.000 NA   NA
 913832 913833 SACOL2351 SACOL2352   tcaA FALSE 0.498 31.000 0.000 NA   NA
 913833 913834 SACOL2352 SACOL2353 tcaA tcaR FALSE 0.154 240.000 0.111 1.000   NA
 913835 913836 SACOL2354 SACOL2355     FALSE 0.007 575.000 0.000 NA   NA
 913837 913838 SACOL2356 SACOL2357     TRUE 0.971 0.000 0.364 1.000 N NA
 913839 913840 SACOL2358 SACOL2359     TRUE 0.996 -7.000 0.833 1.000 Y NA
 913840 913841 SACOL2359 SACOL2360     FALSE 0.486 163.000 0.039 NA Y NA
 913841 913842 SACOL2360 SACOL2361     TRUE 0.971 -3.000 0.392 NA   NA
 913843 913844 SACOL2362 SACOL2363 mqo1   FALSE 0.024 381.000 0.000 1.000   NA
 913846 913847 SACOL2365 SACOL2366     FALSE 0.022 314.000 0.000 NA   NA
 913849 913850 SACOL2368 SACOL2369     TRUE 0.758 36.000 0.091 1.000   NA
 913850 913851 SACOL2369 SACOL2371     FALSE 0.273 232.000 0.429 NA   NA
 913854 913855 SACOL2374 SACOL2375     TRUE 0.887 46.000 0.556 1.000 N NA
 913857 913858 SACOL2377 SACOL2378     FALSE 0.006 1488.000 0.000 NA   NA
 913858 913859 SACOL2378 SACOL2379     FALSE 0.299 71.000 0.000 1.000   NA
 913862 913863 SACOL2382 SACOL2383     FALSE 0.304 182.000 0.250 NA   NA
 913864 913865 SACOL2384 SACOL2385 sarZ   FALSE 0.067 216.000 0.000 NA N NA
 913867 913868 SACOL2387 SACOL2388     TRUE 0.874 -21.000 0.000 NA   NA
 913869 913870 SACOL2389 SACOL2390     TRUE 0.992 23.000 0.800 0.009 Y NA
 913870 913871 SACOL2390 SACOL2391     TRUE 0.915 24.000 0.333 NA   NA
 913871 913872 SACOL2391 SACOL2392   narI TRUE 0.835 20.000 0.088 NA   NA
 913872 913873 SACOL2392 SACOL2393 narI narJ TRUE 0.996 -7.000 0.206 0.001 Y NA
 913873 913874 SACOL2393 SACOL2394 narJ narH TRUE 0.999 -22.000 0.933 0.001 Y NA
 913874 913875 SACOL2394 SACOL2395 narH narG TRUE 0.998 -10.000 0.429 0.001 Y NA
 913875 913876 SACOL2395 SACOL2396 narG   FALSE 0.047 310.000 0.000 1.000 N NA
 913876 913877 SACOL2396 SACOL2397   nirD TRUE 0.958 -9.000 0.042 1.000 N NA
 913877 913878 SACOL2397 SACOL2398 nirD nirB TRUE 0.958 4.000 0.091 0.001 N NA
 913878 913879 SACOL2398 SACOL2399 nirB nirR TRUE 0.600 66.000 0.125 1.000   NA
 913879 913880 SACOL2399 SACOL2400 nirR   FALSE 0.065 230.000 0.000 1.000   NA
 913880 913881 SACOL2400 SACOL2401     FALSE 0.064 233.000 0.000 1.000   NA
 913881 913882 SACOL2401 SACOL2402     FALSE 0.009 483.000 0.000 NA   NA
 913882 913883 SACOL2402 SACOL2403     FALSE 0.298 186.000 0.250 NA   NA
 913883 913884 SACOL2403 SACOL2404     FALSE 0.024 295.000 0.000 NA   NA
 913884 913885 SACOL2404 SACOL2405     TRUE 0.904 0.000 0.087 NA   NA
 913885 913886 SACOL2405 SACOL2406     FALSE 0.085 165.000 0.000 NA   NA
 913886 913887 SACOL2406 SACOL2407     TRUE 0.559 10.000 0.000 NA   NA
 913887 913888 SACOL2407 SACOL2408     TRUE 0.841 19.000 0.092 NA   NA
 913890 913891 SACOL2410 SACOL2411     TRUE 0.992 -3.000 0.481 1.000 Y NA
 913891 913892 SACOL2411 SACOL2412     TRUE 0.998 -28.000 0.594 0.032 Y NA
 913892 913893 SACOL2412 SACOL2413     FALSE 0.455 121.000 0.024 0.032   NA
 913895 913896 SACOL2415 SACOL2416 gpm   FALSE 0.044 326.000 0.000 1.000 N NA
 913897 913898 SACOL2418 SACOL2419   hlgA FALSE 0.043 536.000 0.000 0.011   NA
 913898 913899 SACOL2419 SACOL2420 hlgA   FALSE 0.247 64.000 0.000 NA   NA
 913899 913900 SACOL2420 SACOL2421   hlgC FALSE 0.015 379.000 0.000 NA   NA
 913900 913901 SACOL2421 SACOL2422 hlgC hlgB TRUE 0.931 2.000 0.000 0.003   NA
 913902 913903 SACOL2423 SACOL2424   bioW TRUE 0.557 11.000 0.000 NA   NA
 913903 913904 SACOL2424 SACOL2425 bioW   TRUE 0.953 11.000 0.118 1.000 Y NA
 913904 913905 SACOL2425 SACOL2426   bioB TRUE 0.984 -22.000 0.000 1.000 Y NA
 913905 913906 SACOL2426 SACOL2427 bioB bioA TRUE 0.990 2.000 0.176 0.001 Y NA
 913906 913907 SACOL2427 SACOL2428 bioA bioD TRUE 0.995 -22.000 0.051 0.001 Y NA
 913907 913908 SACOL2428 SACOL2429 bioD   FALSE 0.044 221.000 0.000 NA   NA
 913908 913909 SACOL2429 SACOL2430     FALSE 0.156 88.000 0.000 NA   NA
 913909 913910 SACOL2430 SACOL2431     TRUE 0.992 25.000 0.867 0.004 Y NA
 913910 913911 SACOL2431 SACOL2433     FALSE 0.007 628.000 0.000 NA   NA
 913911 913912 SACOL2433 SACOL2434     FALSE 0.104 135.000 0.000 NA   NA
 913913 913914 SACOL2435 SACOL2436     TRUE 0.765 60.000 0.400 NA   NA
 913914 913915 SACOL2436 SACOL2437   bcr FALSE 0.324 182.000 0.286 NA   NA
 913919 913920 SACOL2441 SACOL2442     FALSE 0.551 138.000 0.333 1.000 N NA
 913923 913924 SACOL2446 SACOL2448     FALSE 0.045 322.000 0.000 1.000 N NA
 913924 913925 SACOL2448 SACOL2449     FALSE 0.324 226.000 0.429 1.000   NA
 913925 913926 SACOL2449 SACOL2450     FALSE 0.106 294.000 0.000 0.032   NA
 913926 913927 SACOL2450 SACOL2451     TRUE 0.976 0.000 0.190 0.032 N NA
 913927 913928 SACOL2451 SACOL2452     TRUE 0.961 17.000 0.200 0.032 N NA
 913928 913929 SACOL2452 SACOL2453     TRUE 0.992 -3.000 0.200 0.065 Y NA
 913929 913930 SACOL2453 SACOL2454     FALSE 0.020 327.000 0.000 NA   NA
 913930 913931 SACOL2454 SACOL2456     FALSE 0.043 224.000 0.000 NA   NA
 913931 913932 SACOL2456 SACOL2457     TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 913933 913934 SACOL2458 SACOL2459   pnbA FALSE 0.026 608.000 0.036 1.000 N NA
 913935 913936 SACOL2460 SACOL2461     FALSE 0.021 396.000 0.009 NA   NA
 913936 913937 SACOL2461 SACOL2462     TRUE 0.953 -7.000 0.127 NA   NA
 913937 913938 SACOL2462 SACOL2463   pepA2 FALSE 0.057 248.000 0.000 1.000   NA
 913938 913939 SACOL2463 SACOL2464 pepA2   FALSE 0.017 355.000 0.000 NA   NA
 913939 913940 SACOL2464 SACOL2465     TRUE 0.874 0.000 0.043 NA   NA
 913940 913941 SACOL2465 SACOL2466     FALSE 0.134 106.000 0.000 NA   NA
 913945 913946 SACOL2471 SACOL2472     TRUE 0.908 12.000 0.214 1.000 N NA
 913946 913947 SACOL2472 SACOL2473     TRUE 0.996 -7.000 0.273 0.018 Y NA
 913947 913948 SACOL2473 SACOL2474     TRUE 0.993 -3.000 0.545 1.000 Y NA
 913948 913949 SACOL2474 SACOL2475     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.032 Y NA
 913949 913950 SACOL2475 SACOL2476     TRUE 0.983 13.000 0.353 0.032 Y NA
 913950 913951 SACOL2476 SACOL2477     FALSE 0.397 143.000 0.235 NA   NA
 913951 913952 SACOL2477 SACOL2478     TRUE 0.557 80.000 0.250 NA   NA
 913952 913953 SACOL2478 SACOL2479     TRUE 0.649 11.000 0.004 NA   NA
 913953 913954 SACOL2479 SACOL2480     FALSE 0.099 148.000 0.000 NA   NA
 913954 913955 SACOL2480 SACOL2481     FALSE 0.010 464.000 0.000 NA   NA
 913955 913956 SACOL2481 SACOL2482   fabG2 FALSE 0.032 263.000 0.000 NA   NA
 913958 913959 SACOL2484 SACOL2485     FALSE 0.010 452.000 0.000 NA   NA
 913959 913960 SACOL2485 SACOL2486     TRUE 0.627 18.000 0.000 NA   NA
 913960 913961 SACOL2486 SACOL2487     FALSE 0.031 267.000 0.000 NA   NA
 913961 913962 SACOL2487 SACOL2488     FALSE 0.034 251.000 0.000 NA   NA
 913966 913967 SACOL2493 SACOL2494     FALSE 0.008 536.000 0.000 NA   NA
 913967 913968 SACOL2494 SACOL2495     TRUE 0.957 3.000 0.667 NA   NA
 913968 913969 SACOL2495 SACOL2496     FALSE 0.346 212.000 0.500 NA   NA
 913969 913970 SACOL2496 SACOL2497     TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA   NA
 913970 913971 SACOL2497 SACOL2498     FALSE 0.127 112.000 0.000 NA   NA
 913971 913972 SACOL2498 SACOL2499     FALSE 0.024 303.000 0.000 NA   NA
 913972 913973 SACOL2499 SACOL2500     TRUE 0.991 2.000 0.327 0.015 Y NA
 913974 913975 SACOL2501 SACOL2502     FALSE 0.026 284.000 0.000 NA   NA
 913975 913976 SACOL2502 SACOL2503     FALSE 0.101 144.000 0.000 NA   NA
 913977 913978 SACOL2504 SACOL2505     FALSE 0.014 384.000 0.000 NA   NA
 913978 913979 SACOL2505 SACOL2506   sarT FALSE 0.023 305.000 0.000 NA   NA
 913981 913982 SACOL2508 SACOL2509 galU fnbB FALSE 0.108 180.000 0.000 1.000   NA
 913982 913983 SACOL2509 SACOL2510 fnbB   FALSE 0.088 161.000 0.000 NA   NA
 913983 913984 SACOL2510 SACOL2511   fnbA FALSE 0.013 399.000 0.000 NA   NA
 913984 913985 SACOL2511 SACOL2513 fnbA   FALSE 0.037 242.000 0.000 NA   NA
 913985 913986 SACOL2513 SACOL2514   gntP FALSE 0.477 32.000 0.000 NA   NA
 913986 913987 SACOL2514 SACOL2515 gntP gntK TRUE 0.850 117.000 0.696 1.000 Y NA
 913987 913988 SACOL2515 SACOL2516 gntK gntR TRUE 0.960 24.000 0.680 1.000 N NA
 913988 913989 SACOL2516 SACOL2517 gntR   TRUE 0.718 154.000 0.062 0.031 Y NA
 913989 913990 SACOL2517 SACOL2518     FALSE 0.256 165.000 0.062 1.000   NA
 913990 913991 SACOL2518 SACOL2519     FALSE 0.073 231.000 0.021 NA   NA
 913991 913992 SACOL2519 SACOL2520     FALSE 0.450 67.000 0.062 NA   NA
 913992 913993 SACOL2520 SACOL2521     FALSE 0.013 409.000 0.000 NA   NA
 913995 913996 SACOL2523 SACOL2524     TRUE 0.964 -7.000 0.096 1.000 N NA
 913997 913998 SACOL2525 SACOL2526     TRUE 0.687 2.000 0.000 NA   NA
 913998 913999 SACOL2526 SACOL2527     FALSE 0.015 373.000 0.000 NA   NA
 913999 914000 SACOL2527 SACOL2528     FALSE 0.018 344.000 0.000 NA   NA
 914001 914002 SACOL2529 SACOL2530     TRUE 0.920 22.000 0.333 NA   NA
 914002 914003 SACOL2530 SACOL2531     TRUE 0.687 78.000 0.312 1.000 N NA
 914004 914005 SACOL2532 SACOL2533     FALSE 0.122 171.000 0.000 1.000   NA
 914009 914010 SACOL2537 SACOL2538     TRUE 0.576 6.000 0.000 NA   NA
 914013 914014 SACOL2542 SACOL2543     FALSE 0.263 62.000 0.000 NA   NA
 914014 914015 SACOL2543 SACOL2544   sdaAA TRUE 0.618 19.000 0.000 NA   NA
 914015 914016 SACOL2544 SACOL2545 sdaAA sdaAB TRUE 0.987 14.000 0.324 0.001 Y NA
 914016 914017 SACOL2545 SACOL2546 sdaAB   TRUE 0.948 3.000 0.304 1.000 N NA
 914018 914019 SACOL2547 SACOL2548     FALSE 0.144 156.000 0.000 1.000   NA
 914020 914021 SACOL2549 SACOL2550     FALSE 0.161 133.000 0.000 1.000   NA
 914021 914022 SACOL2550 SACOL2551     TRUE 0.590 42.000 0.047 NA   NA
 914022 914023 SACOL2551 SACOL2552     FALSE 0.015 380.000 0.000 NA   NA
 914023 914024 SACOL2552 SACOL2553     FALSE 0.051 301.000 0.000 1.000 N NA
 914024 914025 SACOL2553 SACOL2554     TRUE 0.837 47.000 0.300 1.000 N NA
 914025 914026 SACOL2554 SACOL2554.1     TRUE 0.953 -7.000 0.070 1.000   NA
 914026 914027 SACOL2554.1 SACOL2555     FALSE 0.078 213.000 0.000 1.000   NA
 914028 914029 SACOL2556 SACOL2557     FALSE 0.014 389.000 0.000 NA   NA
 914030 914031 SACOL2559 SACOL2560     FALSE 0.007 579.000 0.000 NA   NA
 914035 914036 SACOL2564 SACOL2565 feoB   TRUE 0.970 12.000 0.308 1.000 Y NA
 914036 914037 SACOL2565 SACOL2566     FALSE 0.075 216.000 0.000 1.000   NA
 914039 914040 SACOL2568 SACOL2569     FALSE 0.127 112.000 0.000 NA   NA
 914040 914041 SACOL2569 SACOL2570     FALSE 0.098 190.000 0.000 1.000   NA
 914042 914043 SACOL2571 SACOL2572     FALSE 0.038 240.000 0.000 NA   NA
 914043 914044 SACOL2572 SACOL2573     FALSE 0.500 291.000 0.118 0.001 Y NA
 914045 914046 SACOL2574 SACOL2575     TRUE 0.883 23.000 0.100 1.000 N NA
 914046 914047 SACOL2575 SACOL2576   crtN FALSE 0.025 427.000 0.000 1.000 N NA
 914047 914048 SACOL2576 SACOL2577 crtN crtM TRUE 0.958 12.000 0.800 1.000 N NA
 914048 914049 SACOL2577 SACOL2578 crtM   TRUE 0.761 37.000 0.160 NA   NA
 914049 914050 SACOL2578 SACOL2579     TRUE 0.962 -3.000 0.263 NA   NA
 914050 914051 SACOL2579 SACOL2580     TRUE 0.966 -7.000 0.211 NA   NA
 914051 914052 SACOL2580 SACOL2581     FALSE 0.072 175.000 0.000 NA   NA
 914052 914053 SACOL2581 SACOL2582     FALSE 0.016 361.000 0.000 NA   NA
 914053 914054 SACOL2582 SACOL2583     FALSE 0.014 512.000 0.000 1.000   NA
 914054 914055 SACOL2583 SACOL2584   isaA FALSE 0.047 276.000 0.000 1.000   NA
 914055 914056 SACOL2584 SACOL2585 isaA   FALSE 0.012 608.000 0.000 1.000   NA
 914057 914058 SACOL2587 SACOL2588     FALSE 0.056 198.000 0.000 NA   NA
 914058 914059 SACOL2588 SACOL2589     FALSE 0.044 220.000 0.000 NA   NA
 914060 914061 SACOL2590 SACOL2591     TRUE 0.954 17.000 0.500 1.000   NA
 914061 914062 SACOL2591 SACOL2592     TRUE 0.849 20.000 0.111 NA   NA
 914063 914064 SACOL2593 SACOL2594     TRUE 0.982 -7.000 0.333 1.000 N NA
 914064 914065 SACOL2594 SACOL2595     TRUE 0.559 10.000 0.000 NA   NA
 914065 914066 SACOL2595 SACOL2596     TRUE 0.873 -19.000 0.000 NA   NA
 914066 914067 SACOL2596 SACOL2597     TRUE 0.842 20.000 0.100 NA   NA
 914068 914069 SACOL2598 SACOL2599     FALSE 0.507 98.000 0.182 1.000   NA
 914069 914070 SACOL2599 SACOL2600     TRUE 0.929 15.000 0.267 1.000 N NA
 914070 914071 SACOL2600 SACOL2601     FALSE 0.020 334.000 0.000 NA   NA
 914071 914072 SACOL2601 SACOL2602     TRUE 0.863 -12.000 0.000 NA   NA
 914072 914073 SACOL2602 SACOL2603     TRUE 0.946 15.000 0.667 NA   NA
 914073 914074 SACOL2603 SACOL2605     FALSE 0.018 342.000 0.000 NA   NA
 914075 914076 SACOL2606 SACOL2607 pyrD   FALSE 0.135 155.000 0.006 NA   NA
 914081 914082 SACOL2613 SACOL2614 panD panC TRUE 0.984 2.000 0.342 1.000 Y NA
 914082 914083 SACOL2614 SACOL2615 panC panB TRUE 0.997 -7.000 0.395 0.001 Y NA
 914085 914086 SACOL2617 SACOL2618 budA2 ldh2 FALSE 0.059 278.000 0.000 1.000 N NA
 914089 914090 SACOL2621 SACOL2622   fdaB FALSE 0.111 123.000 0.000 NA   NA
 914091 914092 SACOL2623 SACOL2624 mqo2   FALSE 0.011 685.000 0.000 1.000   NA
 914092 914093 SACOL2624 SACOL2625     FALSE 0.170 194.000 0.044 1.000   NA
 914093 914094 SACOL2625 SACOL2626     FALSE 0.242 281.000 0.600 NA   NA
 914094 914095 SACOL2626 SACOL2627   betA FALSE 0.028 278.000 0.000 NA   NA
 914095 914096 SACOL2627 SACOL2628 betA betB FALSE 0.137 261.000 0.072 1.000 N NA
 914097 914098 SACOL2629 SACOL2630     FALSE 0.155 89.000 0.000 NA   NA
 914099 914100 SACOL2631 SACOL2632   cudT FALSE 0.051 264.000 0.000 1.000   NA
 914100 914101 SACOL2632 SACOL2634 cudT nrdG FALSE 0.018 519.000 0.000 1.000 N NA
 914101 914102 SACOL2634 SACOL2635 nrdG nrdD TRUE 0.971 -3.000 0.240 1.000 N NA
 914102 914103 SACOL2635 SACOL2636 nrdD   FALSE 0.075 247.000 0.000 1.000 N NA
 914103 914104 SACOL2636 SACOL2637     FALSE 0.021 322.000 0.000 NA   NA
 914104 914105 SACOL2637 SACOL2638     FALSE 0.181 76.000 0.000 NA   NA
 914105 914106 SACOL2638 SACOL2639   cysJ FALSE 0.428 63.000 0.000 1.000 N NA
 914108 914109 SACOL2641 SACOL2642 gpxA2   FALSE 0.006 695.000 0.000 NA   NA
 914109 914110 SACOL2642 SACOL2643     FALSE 0.007 616.000 0.000 NA   NA
 914110 914111 SACOL2643 SACOL2644     TRUE 0.986 -3.000 0.855 1.000   NA
 914111 914112 SACOL2644 SACOL2645     TRUE 0.785 99.000 0.492 0.080 N NA
 914112 914113 SACOL2645 SACOL2646     TRUE 0.983 11.000 0.812 1.000 Y NA
 914113 914114 SACOL2646 SACOL2647     TRUE 0.764 26.000 0.047 NA   NA
 914116 914117 SACOL2649 SACOL2650     FALSE 0.112 122.000 0.000 NA   NA
 914117 914118 SACOL2650 SACOL2651     FALSE 0.036 245.000 0.000 NA   NA
 914118 914119 SACOL2651 SACOL2652   clfB FALSE 0.122 116.000 0.000 NA   NA
 914119 914120 SACOL2652 SACOL2653 clfB   FALSE 0.028 350.000 0.000 1.000   NA
 914120 914121 SACOL2653 SACOL2654   arcC2 FALSE 0.229 117.000 0.000 1.000 N NA
 914121 914122 SACOL2654 SACOL2655 arcC2 arcD TRUE 0.970 17.000 0.182 1.000 Y NA
 914122 914123 SACOL2655 SACOL2656 arcD arcB2 TRUE 0.601 91.000 0.000 1.000 Y NA
 914123 914124 SACOL2656 SACOL2657 arcB2 arcA TRUE 0.920 33.000 0.062 1.000 Y NA
 914124 914125 SACOL2657 SACOL2658 arcA   FALSE 0.038 347.000 0.000 1.000 N NA
 914125 914126 SACOL2658 SACOL2659   aur FALSE 0.033 367.000 0.000 1.000 N NA
 914126 914127 SACOL2659 SACOL2660 aur isaB FALSE 0.012 424.000 0.000 NA   NA
 914128 914129 SACOL2661 SACOL2662     FALSE 0.038 240.000 0.000 NA   NA
 914129 914130 SACOL2662 SACOL2663     TRUE 0.729 77.000 0.111 0.010 N NA
 914130 914131 SACOL2663 SACOL2664   manA2 TRUE 0.953 14.000 0.111 1.000 Y NA
 914134 914135 SACOL2667 SACOL2668     FALSE 0.245 168.000 0.061 1.000   NA
 914135 914136 SACOL2668 SACOL2669     FALSE 0.037 242.000 0.000 NA   NA
 914136 914137 SACOL2669 SACOL2670     TRUE 0.978 -7.000 0.400 NA   NA
 914137 914138 SACOL2670 SACOL2671     TRUE 0.786 18.000 0.000 1.000 N NA
 914138 914139 SACOL2671 SACOL2672     TRUE 0.859 -10.000 0.000 NA   NA
 914139 914140 SACOL2672 SACOL2673     TRUE 0.875 -22.000 0.000 NA   NA
 914140 914141 SACOL2673 SACOL2674     TRUE 0.859 -10.000 0.000 NA   NA
 914141 914142 SACOL2674 SACOL2675     TRUE 0.642 11.000 0.002 NA   NA
 914142 914143 SACOL2675 SACOL2676     FALSE 0.374 130.000 0.002 0.063   NA
 914143 914144 SACOL2676 SACOL2677     FALSE 0.017 354.000 0.000 NA   NA
 914144 914145 SACOL2677 SACOL2678     FALSE 0.165 81.000 0.000 NA   NA
 914146 914147 SACOL2680 SACOL2681     FALSE 0.095 154.000 0.000 NA   NA
 914148 914149 SACOL2682 SACOL2683     FALSE 0.256 79.000 0.000 1.000   NA
 914149 914150 SACOL2683 SACOL2684     TRUE 0.748 3.000 0.000 1.000   NA
 914150 914151 SACOL2684 SACOL2685   cap1C FALSE 0.063 235.000 0.000 1.000   NA
 914151 914152 SACOL2685 SACOL2686 cap1C cap1B TRUE 0.896 -3.000 0.000 1.000 N NA
 914152 914153 SACOL2686 SACOL2687 cap1B cap1A TRUE 0.904 17.000 0.115 1.000 N NA
 914153 914154 SACOL2687 SACOL2688 cap1A icaR FALSE 0.013 849.000 0.000 1.000 N NA
 914155 914156 SACOL2689 SACOL2690 icaA icaD TRUE 0.989 -36.000 0.625 NA   NA
 914156 914157 SACOL2690 SACOL2691 icaD icaB TRUE 0.983 -3.000 0.833 NA   NA
 914157 914158 SACOL2691 SACOL2692 icaB icaC TRUE 0.873 -19.000 0.000 NA   NA
 914159 914160 SACOL2693 SACOL2694   geh FALSE 0.546 28.000 0.000 NA   NA
 914160 914161 SACOL2694 SACOL2695 geh   FALSE 0.006 721.000 0.000 NA   NA
 914161 914162 SACOL2695 SACOL2696   hisI FALSE 0.089 160.000 0.000 NA   NA
 914162 914163 SACOL2696 SACOL2697 hisI hisF TRUE 0.996 -3.000 0.430 0.003 Y NA
 914163 914164 SACOL2697 SACOL2698 hisF hisA TRUE 0.989 -3.000 0.002 0.003 Y NA
 914164 914165 SACOL2698 SACOL2699 hisA hisH TRUE 0.992 -7.000 0.009 0.003 Y NA
 914165 914166 SACOL2699 SACOL2700 hisH hisB TRUE 0.993 -3.000 0.125 0.003 Y NA
 914166 914167 SACOL2700 SACOL2701 hisB   TRUE 0.995 -31.000 0.341 1.000 Y NA
 914167 914168 SACOL2701 SACOL2702   hisD TRUE 0.942 16.000 0.009 1.000 Y NA
 914168 914169 SACOL2702 SACOL2703 hisD hisG TRUE 0.993 -13.000 0.007 0.003 Y NA
 914169 914170 SACOL2703 SACOL2704 hisG   TRUE 0.969 18.000 0.239 NA Y NA
 914170 914171 SACOL2704 SACOL2705     FALSE 0.023 305.000 0.000 NA   NA
 914171 914172 SACOL2705 SACOL2706     FALSE 0.118 118.000 0.000 NA   NA
 914172 914173 SACOL2706 SACOL2707     FALSE 0.429 47.000 0.000 NA N NA
 914173 914174 SACOL2707 SACOL2708     TRUE 0.980 -3.000 0.530 1.000   NA
 914174 914175 SACOL2708 SACOL2709     TRUE 0.804 53.000 0.435 NA   NA
 914175 914176 SACOL2709 SACOL2710     TRUE 0.765 29.000 0.068 NA   NA
 914179 914180 SACOL2713 SACOL2714   pcp FALSE 0.154 152.000 0.013 NA   NA
 914181 914182 SACOL2715 SACOL2716     TRUE 0.967 -10.000 0.172 NA   NA
 914183 914184 SACOL2717 SACOL2718     FALSE 0.038 238.000 0.000 NA   NA
 914186 914187 SACOL2720 SACOL2721   nixA FALSE 0.165 129.000 0.000 1.000   NA
 914187 914188 SACOL2721 SACOL2722 nixA   FALSE 0.077 243.000 0.000 1.000 N NA
 914190 914191 SACOL2724 SACOL2725     TRUE 0.991 -10.000 0.857 1.000   NA
 914191 914192 SACOL2725 SACOL2726     TRUE 0.657 93.000 0.571 NA   NA
 914192 914193 SACOL2726 SACOL2727     TRUE 0.555 12.000 0.000 NA   NA
 914195 914196 SACOL2729 SACOL2730     FALSE 0.530 29.000 0.000 NA   NA
 914196 914197 SACOL2730 SACOL2731     FALSE 0.013 393.000 0.000 NA   NA
 914198 914199 SACOL2732 SACOL2733     FALSE 0.033 260.000 0.000 NA   NA
 914199 914200 SACOL2733 SACOL2734     TRUE 0.715 83.000 0.714 NA   NA
 914200 914201 SACOL2734 SACOL2735     FALSE 0.010 454.000 0.000 NA   NA
 914201 914202 SACOL2735 SACOL2736   gidB TRUE 0.738 43.000 0.089 1.000 N NA
 914202 914203 SACOL2736 SACOL2737 gidB gidA TRUE 0.975 0.000 0.466 1.000 N NA
 914203 914204 SACOL2737 SACOL2738 gidA trmE TRUE 0.699 67.000 0.266 1.000   NA
 914204 914205 SACOL2738 SACOL2739 trmE rnpA FALSE 0.207 139.000 0.007 1.000   NA
 914205 914206 SACOL2739 SACOL2740 rnpA rpmH TRUE 0.661 127.000 0.787 1.000   NA
 914207 914208 SAA0001 SAA0002 repC tet TRUE 0.585 162.000 0.667 1.000   NA
 914208 914209 SAA0002 SAA0003 tet pre FALSE 0.504 186.000 0.667 1.000   NA