MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudoalteromonas tunicata D2

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2782691 2782692 PTD2_00536 PTD2_00541     TRUE 0.992 0.000 0.000 0.004 Y NA
 2782692 2782693 PTD2_00541 PTD2_00546     TRUE 0.992 0.000 0.000 0.004 Y NA
 2782693 2782694 PTD2_00546 PTD2_00551     TRUE 0.992 0.000 0.000 0.004 Y NA
 2782694 2782695 PTD2_00551 PTD2_00556     TRUE 0.842 -43.000 0.000 0.004 Y NA
 2782695 2782696 PTD2_00556 PTD2_00561     FALSE 0.271 160.000 0.000 1.000 Y NA
 2782696 2782697 PTD2_00561 PTD2_00566     FALSE 0.230 169.000 0.000 1.000 Y NA
 2782697 2782698 PTD2_00566 PTD2_00571     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 2782698 2782699 PTD2_00571 PTD2_00576     FALSE 0.310 168.000 0.000 0.004 Y NA
 2782699 2782700 PTD2_00576 PTD2_00581     FALSE 0.001 841.000 0.000 NA   NA
 2782700 2782701 PTD2_00581 PTD2_00586     FALSE 0.002 552.000 0.000 NA   NA
 2782701 2782702 PTD2_00586 PTD2_00591     FALSE 0.006 320.000 0.000 NA   NA
 2782702 2782703 PTD2_00591 PTD2_00596     FALSE 0.211 65.000 0.000 NA   NA
 2782703 2782704 PTD2_00596 PTD2_00601     FALSE 0.015 237.000 0.000 NA   NA
 2782706 2782707 PTD2_00611 PTD2_00616     FALSE 0.480 24.000 0.000 NA   NA
 2782707 2782708 PTD2_00616 PTD2_00621     FALSE 0.006 309.000 0.000 NA   NA
 2782708 2782709 PTD2_00621 PTD2_00626     FALSE 0.084 140.000 0.000 1.000   NA
 2782710 2782711 PTD2_00631 PTD2_00636     TRUE 0.714 -16.000 0.059 NA   NA
 2782711 2782712 PTD2_00636 PTD2_00641     FALSE 0.040 168.000 0.000 NA   NA
 2782714 2782715 PTD2_00651 PTD2_00656     FALSE 0.092 132.000 0.000 1.000   NA
 2782715 2782716 PTD2_00656 PTD2_00661     FALSE 0.003 389.000 0.000 NA   NA
 2782716 2782717 PTD2_00661 PTD2_00666     FALSE 0.006 312.000 0.000 NA   NA
 2782717 2782718 PTD2_00666 PTD2_00671     FALSE 0.326 -46.000 0.000 NA   NA
 2782721 2782722 PTD2_00686 PTD2_00691     FALSE 0.113 90.000 0.000 NA   NA
 2782723 2782724 PTD2_00696 PTD2_00701     FALSE 0.019 219.000 0.000 NA   NA
 2782725 2782726 PTD2_00706 PTD2_00711     FALSE 0.004 377.000 0.000 NA   NA
 2782727 2782728 PTD2_00716 PTD2_00721     TRUE 0.998 -3.000 0.706 NA   NA
 2782728 2782729 PTD2_00721 PTD2_00726     FALSE 0.018 224.000 0.000 NA   NA
 2782731 2782732 PTD2_00736 PTD2_00741     FALSE 0.004 361.000 0.000 NA   NA
 2782733 2782734 PTD2_00746 PTD2_00751     FALSE 0.002 447.000 0.000 NA   NA
 2782736 2782737 PTD2_00761 PTD2_00766     FALSE 0.001 975.000 0.000 1.000   NA
 2782737 2782738 PTD2_00766 PTD2_00771     TRUE 0.953 12.000 0.000 1.000 Y NA
 2782738 2782739 PTD2_00771 PTD2_00776     FALSE 0.100 113.000 0.000 NA N NA
 2782739 2782740 PTD2_00776 PTD2_00781     TRUE 0.982 -3.000 0.000 NA Y NA
 2782740 2782741 PTD2_00781 PTD2_00786     FALSE 0.477 34.000 0.000 1.000 N NA
 2782741 2782742 PTD2_00786 PTD2_00791     FALSE 0.006 310.000 0.000 NA   NA
 2782742 2782743 PTD2_00791 PTD2_00796     FALSE 0.003 387.000 0.000 NA   NA
 2782743 2782744 PTD2_00796 PTD2_00801     FALSE 0.001 683.000 0.000 NA   NA
 2782744 2782745 PTD2_00801 PTD2_00806     FALSE 0.001 668.000 0.000 NA   NA
 2782745 2782746 PTD2_00806 PTD2_00811     FALSE 0.004 350.000 0.000 NA   NA
 2782748 2782749 PTD2_00821 PTD2_00826     FALSE 0.082 123.000 0.000 NA   NA
 2782749 2782750 PTD2_00826 PTD2_00831     FALSE 0.008 287.000 0.000 NA   NA
 2782750 2782751 PTD2_00831 PTD2_00836     FALSE 0.002 465.000 0.000 NA   NA
 2782751 2782752 PTD2_00836 PTD2_00841     FALSE 0.084 114.000 0.000 NA   NA
 2782752 2782753 PTD2_00841 PTD2_00846     FALSE 0.002 480.000 0.000 NA   NA
 2782753 2782754 PTD2_00846 PTD2_00851     FALSE 0.037 171.000 0.000 NA   NA
 2782754 2782755 PTD2_00851 PTD2_00856     FALSE 0.108 93.000 0.000 NA   NA
 2782755 2782756 PTD2_00856 PTD2_00861     FALSE 0.003 405.000 0.000 NA   NA
 2782756 2782757 PTD2_00861 PTD2_00866     FALSE 0.022 211.000 0.000 NA   NA
 2782757 2782758 PTD2_00866 PTD2_00871     FALSE 0.003 392.000 0.000 NA   NA
 2782758 2782759 PTD2_00871 PTD2_00876     FALSE 0.007 296.000 0.000 NA   NA
 2782760 2782761 PTD2_00881 PTD2_00886     FALSE 0.015 250.000 0.000 1.000   NA
 2782762 2782763 PTD2_00891 PTD2_00896     TRUE 0.993 -3.000 0.318 NA   NA
 2782765 2782766 PTD2_00906 PTD2_00911     FALSE 0.387 35.000 0.000 NA   NA
 2782766 2782767 PTD2_00911 PTD2_00916     FALSE 0.147 140.000 0.036 NA   NA
 2782768 2782769 PTD2_00921 PTD2_00926     FALSE 0.007 304.000 0.000 NA   NA
 2782769 2782770 PTD2_00926 PTD2_00931     FALSE 0.133 89.000 0.000 1.000   NA
 2782772 2782773 PTD2_00941 PTD2_00946     TRUE 0.910 4.000 0.000 1.000   NA
 2782774 2782775 PTD2_00951 PTD2_00956     FALSE 0.138 81.000 0.000 NA   NA
 2782775 2782776 PTD2_00956 PTD2_00961     FALSE 0.221 68.000 0.000 1.000   NA
 2782776 2782777 PTD2_00961 PTD2_00966     FALSE 0.070 141.000 0.000 NA   NA
 2782778 2782779 PTD2_00971 PTD2_00976     TRUE 0.990 12.000 0.541 NA   NA
 2782779 2782780 PTD2_00976 PTD2_00981     TRUE 0.988 -9.000 0.568 NA   NA
 2782780 2782781 PTD2_00981 PTD2_00986     TRUE 0.987 13.000 0.543 NA   NA
 2782781 2782782 PTD2_00986 PTD2_00991     FALSE 0.069 142.000 0.000 NA   NA
 2782782 2782783 PTD2_00991 PTD2_00996     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 2782783 2782784 PTD2_00996 PTD2_01001     TRUE 0.896 53.000 0.375 NA   NA
 2782784 2782785 PTD2_01001 PTD2_01006     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 2782787 2782788 PTD2_01016 PTD2_01021     FALSE 0.002 532.000 0.000 NA   NA
 2782790 2782791 PTD2_01031 PTD2_01036     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 2782791 2782792 PTD2_01036 PTD2_01041     FALSE 0.009 275.000 0.000 NA   NA
 2782793 2782794 PTD2_01046 PTD2_01051     FALSE 0.365 -28.000 0.000 NA   NA
 2782794 2782795 PTD2_01051 PTD2_01056     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2782796 2782797 PTD2_01061 PTD2_01066     FALSE 0.176 71.000 0.000 NA   NA
 2782798 2782799 PTD2_01071 PTD2_01076     FALSE 0.013 251.000 0.000 NA   NA
 2782800 2782801 PTD2_01081 PTD2_01086     FALSE 0.079 143.000 0.000 1.000   NA
 2782801 2782802 PTD2_01086 PTD2_01091     TRUE 0.562 20.000 0.000 1.000   NA
 2782802 2782803 PTD2_01091 PTD2_01096     FALSE 0.371 37.000 0.000 NA   NA
 2782804 2782805 PTD2_01101 PTD2_01106     FALSE 0.002 587.000 0.000 1.000   NA
 2782805 2782806 PTD2_01106 PTD2_01111     FALSE 0.097 240.000 0.000 1.000 Y NA
 2782806 2782807 PTD2_01111 PTD2_01116     TRUE 0.809 207.000 0.667 0.003 Y NA
 2782807 2782808 PTD2_01116 PTD2_01121     FALSE 0.004 394.000 0.000 1.000 N NA
 2782809 2782810 PTD2_01126 PTD2_01131     FALSE 0.017 226.000 0.000 NA   NA
 2782810 2782811 PTD2_01131 PTD2_01136     FALSE 0.016 231.000 0.000 NA   NA
 2782812 2782813 PTD2_01141 PTD2_01146     FALSE 0.066 145.000 0.000 NA   NA
 2782813 2782814 PTD2_01146 PTD2_01151     FALSE 0.039 178.000 0.000 1.000   NA
 2782815 2782816 PTD2_01156 PTD2_01161     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 2782816 2782817 PTD2_01161 PTD2_01166     TRUE 0.990 -3.000 0.015 0.002 Y NA
 2782818 2782819 PTD2_01171 PTD2_01176     FALSE 0.018 223.000 0.000 NA   NA
 2782820 2782821 PTD2_01181 PTD2_01186     FALSE 0.189 69.000 0.000 NA   NA
 2782821 2782822 PTD2_01186 PTD2_01191     FALSE 0.013 250.000 0.000 NA   NA
 2782822 2782823 PTD2_01191 PTD2_01196     FALSE 0.126 84.000 0.000 NA   NA
 2782823 2782824 PTD2_01196 PTD2_01201     TRUE 0.969 -16.000 0.562 NA   NA
 2782824 2782825 PTD2_01201 PTD2_01206     FALSE 0.131 83.000 0.000 NA   NA
 2782826 2782827 PTD2_01211 PTD2_01216     FALSE 0.002 506.000 0.000 NA   NA
 2782827 2782828 PTD2_01216 PTD2_01221     TRUE 0.997 2.000 0.444 NA   NA
 2782828 2782829 PTD2_01221 PTD2_01226     FALSE 0.093 108.000 0.000 NA   NA
 2782829 2782830 PTD2_01226 PTD2_01231     FALSE 0.005 333.000 0.000 NA   NA
 2782830 2782831 PTD2_01231 PTD2_01236     FALSE 0.002 590.000 0.000 1.000   NA
 2782832 2782833 PTD2_01241 PTD2_01246     FALSE 0.022 210.000 0.000 NA   NA
 2782833 2782834 PTD2_01246 PTD2_01251     FALSE 0.093 108.000 0.000 NA   NA
 2782837 2782838 PTD2_01266 PTD2_01271     TRUE 0.895 4.000 0.000 NA   NA
 2782838 2782839 PTD2_01271 PTD2_01276     FALSE 0.401 95.000 0.115 1.000   NA
 2782839 2782840 PTD2_01276 PTD2_01281     TRUE 0.715 26.000 0.019 0.032   NA
 2782840 2782841 PTD2_01281 PTD2_01286     TRUE 0.642 21.000 0.024 NA   NA
 2782842 2782843 PTD2_01291 PTD2_01296     FALSE 0.098 118.000 0.000 NA N NA
 2782843 2782844 PTD2_01296 PTD2_01301     FALSE 0.302 55.000 0.000 NA N NA
 2782844 2782845 PTD2_01301 PTD2_01306     TRUE 0.803 52.000 0.000 0.022 Y NA
 2782846 2782847 PTD2_01311 PTD2_01316     FALSE 0.016 229.000 0.000 NA   NA
 2782847 2782848 PTD2_01316 PTD2_01321     FALSE 0.059 150.000 0.000 NA   NA
 2782852 2782853 PTD2_01341 PTD2_01346     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2782854 2782855 PTD2_01351 PTD2_01356     FALSE 0.038 169.000 0.000 NA   NA
 2782855 2782856 PTD2_01356 PTD2_01361     FALSE 0.007 412.000 0.000 0.020 N NA
 2782856 2782857 PTD2_01361 PTD2_01366     FALSE 0.251 68.000 0.000 1.000 N NA
 2782857 2782858 PTD2_01366 PTD2_01371     TRUE 0.981 13.000 0.400 NA N NA
 2782858 2782859 PTD2_01371 PTD2_01376     FALSE 0.502 84.000 0.000 NA Y NA
 2782859 2782860 PTD2_01376 PTD2_01381     FALSE 0.479 118.000 0.000 0.021 Y NA
 2782860 2782861 PTD2_01381 PTD2_01386     TRUE 0.804 97.000 0.500 1.000 N NA
 2782862 2782863 PTD2_01391 PTD2_01396     FALSE 0.013 260.000 0.000 1.000   NA
 2782863 2782864 PTD2_01396 PTD2_01401     FALSE 0.001 709.000 0.000 NA   NA
 2782864 2782865 PTD2_01401 PTD2_01406     FALSE 0.009 273.000 0.000 NA   NA
 2782865 2782866 PTD2_01406 PTD2_01411     FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 2782866 2782867 PTD2_01411 PTD2_01416     FALSE 0.004 363.000 0.000 NA   NA
 2782867 2782868 PTD2_01416 PTD2_01421     FALSE 0.078 132.000 0.000 NA   NA
 2782868 2782869 PTD2_01421 PTD2_01426     FALSE 0.123 85.000 0.000 NA   NA
 2782869 2782870 PTD2_01426 PTD2_01431     FALSE 0.078 132.000 0.000 NA   NA
 2782870 2782871 PTD2_01431 PTD2_01436     FALSE 0.108 93.000 0.000 NA   NA
 2782871 2782872 PTD2_01436 PTD2_01441     FALSE 0.004 364.000 0.000 NA   NA
 2782872 2782873 PTD2_01441 PTD2_01446     FALSE 0.004 364.000 0.000 NA   NA
 2782875 2782876 PTD2_01456 PTD2_01461     FALSE 0.075 172.000 0.000 0.053   NA
 2782876 2782877 PTD2_01461 PTD2_01466     FALSE 0.245 83.000 0.000 0.053   NA
 2782879 2782880 PTD2_01476 PTD2_01481     FALSE 0.086 147.000 0.000 1.000 N NA
 2782880 2782881 PTD2_01481 PTD2_01486     FALSE 0.135 88.000 0.000 1.000   NA
 2782881 2782882 PTD2_01486 PTD2_01491     TRUE 0.897 -7.000 0.000 0.001   NA
 2782882 2782883 PTD2_01491 PTD2_01496     TRUE 0.987 15.000 0.333 NA Y NA
 2782884 2782885 PTD2_01501 PTD2_01506     FALSE 0.050 158.000 0.000 NA   NA
 2782887 2782888 PTD2_01516 PTD2_01521     FALSE 0.013 251.000 0.000 NA   NA
 2782889 2782890 PTD2_01526 PTD2_01531     FALSE 0.003 423.000 0.000 NA   NA
 2782890 2782891 PTD2_01531 PTD2_01536     FALSE 0.086 112.000 0.000 NA   NA
 2782892 2782893 PTD2_01541 PTD2_01546     TRUE 0.996 6.000 0.571 NA   NA
 2782893 2782894 PTD2_01546 PTD2_01551     FALSE 0.002 446.000 0.000 NA   NA
 2782894 2782895 PTD2_01551 PTD2_01556     FALSE 0.164 80.000 0.000 1.000   NA
 2782895 2782896 PTD2_01556 PTD2_01561     FALSE 0.006 320.000 0.000 NA   NA
 2782896 2782897 PTD2_01561 PTD2_01566     FALSE 0.108 93.000 0.000 NA   NA
 2782897 2782898 PTD2_01566 PTD2_01571     FALSE 0.010 270.000 0.000 NA   NA
 2782902 2782903 PTD2_01591 PTD2_01596     TRUE 0.940 1.000 0.000 1.000 N NA
 2782904 2782905 PTD2_01601 PTD2_01606     FALSE 0.098 114.000 0.000 1.000   NA
 2782907 2782908 PTD2_01616 PTD2_01621     FALSE 0.005 321.000 0.000 NA   NA
 2782908 2782909 PTD2_01621 PTD2_01626     TRUE 0.996 -3.000 0.480 NA   NA
 2782909 2782910 PTD2_01626 PTD2_01631     TRUE 0.984 -3.000 0.167 NA   NA
 2782910 2782911 PTD2_01631 PTD2_01636     FALSE 0.021 213.000 0.000 NA   NA
 2782911 2782912 PTD2_01636 PTD2_01641     TRUE 0.632 14.000 0.000 NA   NA
 2782912 2782913 PTD2_01641 PTD2_01646     FALSE 0.425 29.000 0.000 NA   NA
 2782913 2782914 PTD2_01646 PTD2_01651     TRUE 0.931 1.000 0.000 NA N NA
 2782914 2782915 PTD2_01651 PTD2_01656     TRUE 0.876 5.000 0.000 NA   NA
 2782917 2782918 PTD2_01666 PTD2_01671     FALSE 0.004 347.000 0.000 NA   NA
 2782920 2782921 PTD2_01681 PTD2_01686     FALSE 0.043 216.000 0.000 0.056   NA
 2782921 2782922 PTD2_01686 PTD2_01691     TRUE 0.957 14.000 0.231 1.000   NA
 2782925 2782926 PTD2_01706 PTD2_01711     TRUE 0.995 0.000 0.111 1.000 Y NA
 2782926 2782927 PTD2_01711 PTD2_01716     FALSE 0.238 76.000 0.012 1.000 N NA
 2782932 2782933 PTD2_01741 PTD2_01746     TRUE 0.977 2.000 0.065 1.000 N NA
 2782938 2782939 PTD2_01771 PTD2_01776     TRUE 0.987 11.000 0.372 NA   NA
 2782939 2782940 PTD2_01776 PTD2_01781     TRUE 0.971 22.000 0.516 NA   NA
 2782940 2782941 PTD2_01781 PTD2_01786     TRUE 0.701 19.000 0.032 NA   NA
 2782941 2782942 PTD2_01786 PTD2_01791     FALSE 0.117 100.000 0.000 1.000   NA
 2782945 2782946 PTD2_01806 PTD2_01811     FALSE 0.247 75.000 0.025 NA   NA
 2782946 2782947 PTD2_01811 PTD2_01816     FALSE 0.092 134.000 0.000 NA N NA
 2782949 2782950 PTD2_01826 PTD2_01831     TRUE 0.817 73.000 0.373 NA   NA
 2782950 2782951 PTD2_01831 PTD2_01836     FALSE 0.008 290.000 0.000 NA   NA
 2782951 2782952 PTD2_01836 PTD2_01841     TRUE 0.908 48.000 0.357 1.000   NA
 2782952 2782953 PTD2_01841 PTD2_01846     TRUE 0.995 12.000 0.786 1.000   NA
 2782953 2782954 PTD2_01846 PTD2_01851     TRUE 0.949 64.000 0.333 0.062 Y NA
 2782954 2782955 PTD2_01851 PTD2_01856     TRUE 0.999 3.000 0.455 0.021 Y NA
 2782955 2782956 PTD2_01856 PTD2_01861     TRUE 0.997 10.000 0.933 NA   NA
 2782956 2782957 PTD2_01861 PTD2_01866     FALSE 0.099 101.000 0.000 NA   NA
 2782960 2782961 PTD2_01881 PTD2_01886     TRUE 0.907 23.000 0.031 1.000 Y NA
 2782961 2782962 PTD2_01886 PTD2_01891     FALSE 0.064 154.000 0.000 1.000   NA
 2782963 2782964 PTD2_01896 PTD2_01901     FALSE 0.149 78.000 0.000 NA   NA
 2782964 2782965 PTD2_01901 PTD2_01906     FALSE 0.031 185.000 0.000 NA   NA
 2782965 2782966 PTD2_01906 PTD2_01911     TRUE 0.983 -7.000 0.326 NA   NA
 2782968 2782969 PTD2_01921 PTD2_01926     FALSE 0.001 889.000 0.000 NA   NA
 2782969 2782970 PTD2_01926 PTD2_01931     FALSE 0.005 336.000 0.000 NA   NA
 2782972 2782973 PTD2_01941 PTD2_01946     FALSE 0.010 266.000 0.000 NA   NA
 2782973 2782974 PTD2_01946 PTD2_01951     FALSE 0.001 599.000 0.000 NA   NA
 2782974 2782975 PTD2_01951 PTD2_01956     TRUE 0.917 -6.000 0.000 0.004   NA
 2782975 2782976 PTD2_01956 PTD2_01961     TRUE 0.948 5.000 0.000 0.004   NA
 2782976 2782977 PTD2_01961 PTD2_01966     FALSE 0.108 93.000 0.000 NA   NA
 2782977 2782978 PTD2_01966 PTD2_01971     FALSE 0.013 247.000 0.000 NA   NA
 2782978 2782979 PTD2_01971 PTD2_01976     FALSE 0.066 145.000 0.000 NA   NA
 2782979 2782980 PTD2_01976 PTD2_01981     FALSE 0.082 119.000 0.000 NA   NA
 2782980 2782981 PTD2_01981 PTD2_01986     FALSE 0.110 92.000 0.000 NA   NA
 2782981 2782982 PTD2_01986 PTD2_01991     FALSE 0.055 153.000 0.000 NA   NA
 2782982 2782983 PTD2_01991 PTD2_01996     FALSE 0.026 199.000 0.000 NA   NA
 2782983 2782984 PTD2_01996 PTD2_02001     FALSE 0.332 -42.000 0.000 NA   NA
 2782984 2782985 PTD2_02001 PTD2_02006     FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 2782985 2782986 PTD2_02006 PTD2_02011     FALSE 0.007 292.000 0.000 NA   NA
 2782988 2782989 PTD2_02021 PTD2_02026     TRUE 0.843 8.000 0.000 NA   NA
 2782989 2782990 PTD2_02026 PTD2_02031     FALSE 0.021 213.000 0.000 NA   NA
 2782990 2782991 PTD2_02031 PTD2_02036     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2782993 2782994 PTD2_02046 PTD2_02051     FALSE 0.108 93.000 0.000 NA   NA
 2782995 2782996 PTD2_02056 PTD2_02061     FALSE 0.102 99.000 0.000 NA   NA
 2782997 2782998 PTD2_02066 PTD2_02071     FALSE 0.126 84.000 0.000 NA   NA
 2782998 2782999 PTD2_02071 PTD2_02076     FALSE 0.102 99.000 0.000 NA   NA
 2782999 2783000 PTD2_02076 PTD2_02081     TRUE 0.999 0.000 0.957 1.000   NA
 2783000 2783001 PTD2_02081 PTD2_02086     TRUE 0.836 81.000 0.478 NA N NA
 2783001 2783002 PTD2_02086 PTD2_02091     TRUE 0.998 11.000 0.765 NA Y NA
 2783002 2783003 PTD2_02091 PTD2_02096     TRUE 0.999 2.000 0.667 NA Y NA
 2783003 2783004 PTD2_02096 PTD2_02101     TRUE 0.934 52.000 0.500 1.000 N NA
 2783004 2783005 PTD2_02101 PTD2_02106     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2783005 2783006 PTD2_02106 PTD2_02111     FALSE 0.029 190.000 0.000 NA   NA
 2783008 2783009 PTD2_02121 PTD2_02126     FALSE 0.002 498.000 0.000 1.000   NA
 2783013 2783014 PTD2_02146 PTD2_02151     FALSE 0.097 116.000 0.000 1.000   NA
 2783014 2783015 PTD2_02151 PTD2_02156     FALSE 0.028 207.000 0.000 1.000   NA
 2783015 2783016 PTD2_02156 PTD2_02161     TRUE 0.910 4.000 0.000 1.000   NA
 2783016 2783017 PTD2_02161 PTD2_02166     FALSE 0.119 224.000 0.000 1.000 Y NA
 2783018 2783019 PTD2_02171 PTD2_02176     TRUE 0.988 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 2783020 2783021 PTD2_02181 PTD2_02186     TRUE 0.934 0.000 0.011 NA   NA
 2783021 2783022 PTD2_02186 PTD2_02191     FALSE 0.340 83.000 0.069 NA   NA
 2783022 2783023 PTD2_02191 PTD2_02196     TRUE 0.996 0.000 0.363 NA   NA
 2783024 2783025 PTD2_02201 PTD2_02206     TRUE 0.998 6.000 0.466 1.000 Y NA
 2783025 2783026 PTD2_02206 PTD2_02211     TRUE 0.999 2.000 0.618 NA Y NA
 2783027 2783028 PTD2_02216 PTD2_02221     FALSE 0.471 44.000 0.015 1.000 N NA
 2783028 2783029 PTD2_02221 PTD2_02226     FALSE 0.031 256.000 0.044 1.000   NA
 2783031 2783032 PTD2_02236 PTD2_02241     FALSE 0.124 82.000 0.003 NA   NA
 2783032 2783033 PTD2_02241 PTD2_02246     TRUE 0.981 2.000 0.082 1.000 N NA
 2783033 2783034 PTD2_02246 PTD2_02251   hisG FALSE 0.094 127.000 0.000 1.000   NA
 2783035 2783036 PTD2_02256 PTD2_02261     TRUE 0.996 5.000 0.171 0.003 Y NA
 2783036 2783037 PTD2_02261 PTD2_02266     TRUE 0.995 -7.000 0.294 0.003 Y NA
 2783037 2783038 PTD2_02266 PTD2_02271     TRUE 0.994 13.000 0.341 0.003 Y NA
 2783038 2783039 PTD2_02271 PTD2_02276     TRUE 0.996 -3.000 0.128 0.003 Y NA
 2783039 2783040 PTD2_02276 PTD2_02281     TRUE 0.972 28.000 0.210 0.003 Y NA
 2783040 2783041 PTD2_02281 PTD2_02286     TRUE 0.986 -18.000 0.433 0.003 Y NA
 2783041 2783042 PTD2_02286 PTD2_02291     TRUE 0.999 -3.000 0.430 0.003 Y NA
 2783042 2783043 PTD2_02291 PTD2_02296     FALSE 0.078 115.000 0.003 NA   NA
 2783043 2783044 PTD2_02296 PTD2_02301     FALSE 0.082 119.000 0.000 NA   NA
 2783045 2783046 PTD2_02306 PTD2_02311     FALSE 0.042 173.000 0.000 1.000   NA
 2783047 2783048 PTD2_02316 PTD2_02321     FALSE 0.507 68.000 0.082 1.000   NA
 2783048 2783049 PTD2_02321 PTD2_02326   xni TRUE 0.991 0.000 0.178 1.000   NA
 2783049 2783050 PTD2_02326 PTD2_02331 xni   TRUE 0.750 54.000 0.167 NA   NA
 2783050 2783051 PTD2_02331 PTD2_02336     TRUE 0.981 -3.000 0.143 NA   NA
 2783051 2783052 PTD2_02336 PTD2_02341     FALSE 0.160 147.000 0.055 NA   NA
 2783052 2783053 PTD2_02341 PTD2_02346     FALSE 0.018 431.000 0.000 1.000 Y NA
 2783053 2783054 PTD2_02346 PTD2_02351     TRUE 0.999 0.000 0.371 0.001 Y NA
 2783055 2783056 PTD2_02356 PTD2_02361     FALSE 0.019 421.000 0.000 1.000 Y NA
 2783056 2783057 PTD2_02361 PTD2_02366     FALSE 0.468 -25.000 0.000 1.000 N NA
 2783057 2783058 PTD2_02366 PTD2_02371     TRUE 0.987 13.000 0.222 1.000 Y NA
 2783058 2783059 PTD2_02371 PTD2_02376     TRUE 0.812 -6.000 0.000 NA   NA
 2783059 2783060 PTD2_02376 PTD2_02381     FALSE 0.008 289.000 0.000 NA   NA
 2783061 2783062 PTD2_02386 PTD2_02391     TRUE 0.998 3.000 0.600 NA N NA
 2783062 2783063 PTD2_02391 PTD2_02396     FALSE 0.003 468.000 0.000 NA N NA
 2783065 2783066 PTD2_02406 PTD2_02411     FALSE 0.475 70.000 0.077 1.000   NA
 2783066 2783067 PTD2_02411 PTD2_02416     TRUE 0.999 0.000 0.898 NA N NA
 2783067 2783068 PTD2_02416 PTD2_02421     TRUE 0.789 26.000 0.092 NA   NA
 2783068 2783069 PTD2_02421 PTD2_02426     TRUE 0.965 1.000 0.042 NA   NA
 2783069 2783070 PTD2_02426 PTD2_02431     TRUE 0.641 -22.000 0.048 NA   NA
 2783070 2783071 PTD2_02431 PTD2_02436     TRUE 0.996 -3.000 0.533 NA   NA
 2783071 2783072 PTD2_02436 PTD2_02441     TRUE 0.994 3.000 0.217 0.031   NA
 2783072 2783073 PTD2_02441 PTD2_02446     TRUE 0.998 -3.000 0.722 NA   NA
 2783073 2783074 PTD2_02446 PTD2_02451     TRUE 0.949 -13.000 0.311 NA   NA
 2783074 2783075 PTD2_02451 PTD2_02456     TRUE 0.965 -22.000 0.588 NA   NA
 2783075 2783076 PTD2_02456 PTD2_02461     TRUE 0.994 -3.000 0.387 NA   NA
 2783076 2783077 PTD2_02461 PTD2_02466     TRUE 0.996 0.000 0.395 NA   NA
 2783083 2783084 PTD2_02496 PTD2_02501     FALSE 0.116 88.000 0.000 NA   NA
 2783084 2783085 PTD2_02501 PTD2_02506     FALSE 0.021 212.000 0.000 NA   NA
 2783086 2783087 PTD2_02511 PTD2_02516     TRUE 0.836 12.000 0.022 1.000   NA
 2783087 2783088 PTD2_02516 PTD2_02521     FALSE 0.002 516.000 0.000 1.000   NA
 2783088 2783089 PTD2_02521 PTD2_02526     TRUE 0.989 20.000 0.481 1.000 Y NA
 2783089 2783090 PTD2_02526 PTD2_02531     TRUE 0.974 37.000 0.394 1.000 Y NA
 2783090 2783091 PTD2_02531 PTD2_02536     TRUE 0.955 -13.000 0.118 1.000 Y NA
 2783091 2783092 PTD2_02536 PTD2_02541     TRUE 0.995 -3.000 0.118 0.006 Y NA
 2783092 2783093 PTD2_02541 PTD2_02546     TRUE 0.997 16.000 0.846 0.006 Y NA
 2783093 2783094 PTD2_02546 PTD2_02551     TRUE 0.737 20.000 0.039 1.000   NA
 2783094 2783095 PTD2_02551 PTD2_02556     FALSE 0.003 468.000 0.000 1.000   NA
 2783096 2783097 PTD2_02561 PTD2_02566 argD   TRUE 0.897 48.000 0.120 1.000 Y NA
 2783097 2783098 PTD2_02566 PTD2_02571     TRUE 0.968 13.000 0.240 1.000 N NA
 2783098 2783099 PTD2_02571 PTD2_02576     TRUE 0.551 65.000 0.095 NA   NA
 2783100 2783101 PTD2_02581 PTD2_02586     FALSE 0.042 166.000 0.000 NA   NA
 2783101 2783102 PTD2_02586 PTD2_02591     TRUE 0.812 -6.000 0.000 NA   NA
 2783102 2783103 PTD2_02591 PTD2_02596     TRUE 0.987 0.000 0.135 NA   NA
 2783103 2783104 PTD2_02596 PTD2_02601     TRUE 0.755 69.000 0.235 1.000   NA
 2783107 2783108 PTD2_02616 PTD2_02621     FALSE 0.042 173.000 0.000 1.000   NA
 2783110 2783111 PTD2_02631 PTD2_02636     FALSE 0.004 347.000 0.000 NA   NA
 2783111 2783112 PTD2_02636 PTD2_02641     FALSE 0.155 76.000 0.000 NA   NA
 2783113 2783114 PTD2_02646 PTD2_02651     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   NA
 2783114 2783115 PTD2_02651 PTD2_02656     FALSE 0.467 25.000 0.000 NA   NA
 2783115 2783116 PTD2_02656 PTD2_02661     TRUE 0.895 4.000 0.000 NA   NA
 2783116 2783117 PTD2_02661 PTD2_02666     TRUE 0.533 19.000 0.000 NA   NA
 2783117 2783118 PTD2_02666 PTD2_02671     TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA   NA
 2783118 2783119 PTD2_02671 PTD2_02676     TRUE 0.980 5.000 0.143 NA   NA
 2783119 2783120 PTD2_02676 PTD2_02681     TRUE 0.868 20.000 0.125 NA   NA
 2783120 2783121 PTD2_02681 PTD2_02686     TRUE 0.851 -27.000 0.188 NA   NA
 2783121 2783122 PTD2_02686 PTD2_02691     TRUE 0.997 -3.000 0.667 NA   NA
 2783122 2783123 PTD2_02691 PTD2_02696     TRUE 0.989 0.000 0.167 NA   NA
 2783123 2783124 PTD2_02696 PTD2_02701     TRUE 0.989 0.000 0.167 NA   NA
 2783124 2783125 PTD2_02701 PTD2_02706     TRUE 0.997 -7.000 1.000 NA   NA
 2783125 2783126 PTD2_02706 PTD2_02711     TRUE 0.787 16.000 0.050 NA   NA
 2783126 2783127 PTD2_02711 PTD2_02716     TRUE 0.998 3.000 0.744 NA   NA
 2783127 2783128 PTD2_02716 PTD2_02721     TRUE 0.971 19.000 0.465 NA   NA
 2783128 2783129 PTD2_02721 PTD2_02726     TRUE 0.911 13.000 0.100 NA   NA
 2783129 2783130 PTD2_02726 PTD2_02731     FALSE 0.329 67.000 0.030 NA   NA
 2783130 2783131 PTD2_02731 PTD2_02736     TRUE 0.605 43.000 0.060 NA   NA
 2783132 2783133 PTD2_02741 PTD2_02746     TRUE 0.547 18.000 0.000 NA   NA
 2783133 2783134 PTD2_02746 PTD2_02751     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 2783134 2783135 PTD2_02751 PTD2_02756     FALSE 0.390 40.000 0.000 1.000   NA
 2783135 2783136 PTD2_02756 PTD2_02761     TRUE 0.715 13.000 0.000 1.000   NA
 2783136 2783137 PTD2_02761 PTD2_02766     FALSE 0.087 138.000 0.000 1.000   NA
 2783138 2783139 PTD2_02771 PTD2_02776     FALSE 0.009 288.000 0.000 1.000   NA
 2783139 2783140 PTD2_02776 PTD2_02781     FALSE 0.045 180.000 0.000 1.000 N NA
 2783143 2783144 PTD2_02796 PTD2_02801     TRUE 0.980 -3.000 0.083 0.014   NA
 2783145 2783146 PTD2_02806 PTD2_02811     FALSE 0.076 180.000 0.000 0.041 N NA
 2783148 2783149 PTD2_02821 PTD2_02826     TRUE 0.999 2.000 0.396 0.001 Y NA
 2783149 2783150 PTD2_02826 PTD2_02831     FALSE 0.026 199.000 0.000 NA   NA
 2783150 2783151 PTD2_02831 PTD2_02836     TRUE 0.561 17.000 0.000 NA   NA
 2783151 2783152 PTD2_02836 PTD2_02841     TRUE 0.988 0.000 0.000 1.000 Y NA
 2783152 2783153 PTD2_02841 PTD2_02846     FALSE 0.149 78.000 0.000 NA   NA
 2783153 2783154 PTD2_02846 PTD2_02851     TRUE 0.812 -6.000 0.000 NA   NA
 2783154 2783155 PTD2_02851 PTD2_02856     TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 2783155 2783156 PTD2_02856 PTD2_02861     FALSE 0.001 649.000 0.000 NA   NA
 2783156 2783157 PTD2_02861 PTD2_02866     FALSE 0.003 480.000 0.000 1.000 N NA
 2783157 2783158 PTD2_02866 PTD2_02871     TRUE 0.727 158.000 0.236 0.003 Y NA
 2783159 2783160 PTD2_02876 PTD2_02881     FALSE 0.100 100.000 0.000 NA   NA
 2783161 2783162 PTD2_02886 PTD2_02891     FALSE 0.119 98.000 0.000 1.000   NA
 2783162 2783163 PTD2_02891 PTD2_02896     FALSE 0.384 134.000 0.000 1.000 Y NA
 2783163 2783164 PTD2_02896 PTD2_02901     FALSE 0.037 229.000 0.000 0.093 N NA
 2783164 2783165 PTD2_02901 PTD2_02906     TRUE 0.933 3.000 0.000 1.000 N NA
 2783165 2783166 PTD2_02906 PTD2_02911     FALSE 0.001 773.000 0.000 NA   NA
 2783166 2783167 PTD2_02911 PTD2_02916     TRUE 0.979 -3.000 0.125 NA   NA
 2783167 2783168 PTD2_02916 PTD2_02921     TRUE 0.982 0.000 0.100 NA   NA
 2783168 2783169 PTD2_02921 PTD2_02926     TRUE 0.783 41.000 0.143 NA   NA
 2783169 2783170 PTD2_02926 PTD2_02931     TRUE 1.000 0.000 0.875 1.000 Y NA
 2783170 2783171 PTD2_02931 PTD2_02936     TRUE 0.900 -3.000 0.000 1.000   NA
 2783171 2783172 PTD2_02936 PTD2_02941     TRUE 0.566 -13.000 0.000 1.000   NA
 2783172 2783173 PTD2_02941 PTD2_02946     TRUE 0.954 0.000 0.027 NA   NA
 2783173 2783174 PTD2_02946 PTD2_02951     TRUE 0.952 -3.000 0.039 NA N NA
 2783174 2783175 PTD2_02951 PTD2_02956     TRUE 0.999 -3.000 0.923 NA   NA
 2783176 2783177 PTD2_02961 PTD2_02966     FALSE 0.023 209.000 0.000 NA   NA
 2783177 2783178 PTD2_02966 PTD2_02971     FALSE 0.318 58.000 0.000 1.000 N NA
 2783179 2783180 PTD2_02976 PTD2_02981     FALSE 0.248 64.000 0.000 1.000   NA
 2783180 2783181 PTD2_02981 PTD2_02986     FALSE 0.003 402.000 0.000 1.000   NA
 2783181 2783182 PTD2_02986 PTD2_02991     FALSE 0.150 91.000 0.000 1.000 N NA
 2783183 2783184 PTD2_02996 PTD2_03001     FALSE 0.425 29.000 0.000 NA   NA
 2783184 2783185 PTD2_03001 PTD2_03006     TRUE 0.921 -7.000 0.077 NA   NA
 2783185 2783186 PTD2_03006 PTD2_03011     TRUE 0.805 17.000 0.024 0.030   NA
 2783186 2783187 PTD2_03011 PTD2_03016     FALSE 0.140 86.000 0.000 1.000   NA
 2783190 2783191 PTD2_03031 PTD2_03036     TRUE 0.633 27.000 0.000 0.066   NA
 2783191 2783192 PTD2_03036 PTD2_03041     FALSE 0.435 34.000 0.000 1.000   NA
 2783194 2783195 PTD2_03051 PTD2_03056     FALSE 0.096 141.000 0.000 1.000 N NA
 2783196 2783197 PTD2_03061 PTD2_03066     TRUE 0.837 -10.000 0.059 NA   NA
 2783200 2783201 PTD2_03081 PTD2_03086     TRUE 0.833 70.000 0.357 1.000   NA
 2783204 2783205 PTD2_03101 PTD2_03106     FALSE 0.167 73.000 0.000 NA   NA
 2783205 2783206 PTD2_03106 PTD2_03111     FALSE 0.116 88.000 0.000 NA   NA
 2783206 2783207 PTD2_03111 PTD2_03116     TRUE 0.629 -10.000 0.000 NA   NA
 2783207 2783208 PTD2_03116 PTD2_03121     TRUE 0.578 16.000 0.000 NA   NA
 2783208 2783209 PTD2_03121 PTD2_03126     FALSE 0.125 93.000 0.000 1.000   NA
 2783210 2783211 PTD2_03131 PTD2_03136     FALSE 0.132 102.000 0.000 1.000 N NA
 2783211 2783212 PTD2_03136 PTD2_03141     TRUE 0.862 26.000 0.000 1.000 Y NA
 2783212 2783213 PTD2_03141 PTD2_03146     FALSE 0.004 370.000 0.000 1.000   NA
 2783214 2783215 PTD2_03151 PTD2_03156     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 2783216 2783217 PTD2_03161 PTD2_03166     FALSE 0.110 92.000 0.000 NA   NA
 2783218 2783219 PTD2_03171 PTD2_03176     FALSE 0.352 156.000 0.000 0.050 Y NA
 2783221 2783222 PTD2_03186 PTD2_03191     TRUE 0.527 22.000 0.008 NA   NA
 2783222 2783223 PTD2_03191 PTD2_03196     TRUE 0.828 10.000 0.000 1.000   NA
 2783223 2783224 PTD2_03196 PTD2_03201     FALSE 0.041 167.000 0.000 NA   NA
 2783224 2783225 PTD2_03201 PTD2_03206     FALSE 0.198 67.000 0.000 NA   NA
 2783225 2783226 PTD2_03206 PTD2_03211     TRUE 0.602 15.000 0.000 NA   NA
 2783226 2783227 PTD2_03211 PTD2_03216     FALSE 0.313 47.000 0.000 NA   NA
 2783227 2783228 PTD2_03216 PTD2_03221     FALSE 0.448 49.000 0.022 NA N NA
 2783228 2783229 PTD2_03221 PTD2_03226     FALSE 0.022 210.000 0.000 NA   NA
 2783229 2783230 PTD2_03226 PTD2_03231     FALSE 0.018 225.000 0.000 NA   NA
 2783230 2783231 PTD2_03231 PTD2_03236     TRUE 0.963 12.000 0.188 NA   NA
 2783231 2783232 PTD2_03236 PTD2_03241     FALSE 0.302 49.000 0.000 NA   NA
 2783232 2783233 PTD2_03241 PTD2_03246     FALSE 0.202 71.000 0.000 1.000   NA
 2783235 2783236 PTD2_03256 PTD2_03261     FALSE 0.171 72.000 0.000 NA   NA
 2783236 2783237 PTD2_03261 PTD2_03266     TRUE 0.984 -16.000 0.819 NA   NA
 2783237 2783238 PTD2_03266 PTD2_03271     TRUE 0.874 -7.000 0.037 NA   NA
 2783238 2783239 PTD2_03271 PTD2_03276     FALSE 0.005 360.000 0.000 1.000   NA
 2783240 2783241 PTD2_03281 PTD2_03286     FALSE 0.079 151.000 0.000 1.000 N NA
 2783242 2783243 PTD2_03291 PTD2_03296     FALSE 0.407 32.000 0.000 NA   NA
 2783243 2783244 PTD2_03296 PTD2_03301     TRUE 0.987 4.000 0.017 1.000 Y NA
 2783244 2783245 PTD2_03301 PTD2_03306     FALSE 0.418 30.000 0.000 NA   NA
 2783245 2783246 PTD2_03306 PTD2_03311     FALSE 0.218 64.000 0.000 NA   NA
 2783247 2783248 PTD2_03316 PTD2_03321     TRUE 0.996 -10.000 0.667 1.000 Y NA
 2783248 2783249 PTD2_03321 PTD2_03326     FALSE 0.125 94.000 0.000 NA N NA
 2783249 2783250 PTD2_03326 PTD2_03331     TRUE 1.000 0.000 1.000 NA Y NA
 2783250 2783251 PTD2_03331 PTD2_03336     TRUE 0.748 13.000 0.000 1.000 N NA
 2783252 2783253 PTD2_03341 PTD2_03346     TRUE 0.993 0.000 0.020 0.002 Y NA
 2783253 2783254 PTD2_03346 PTD2_03351     FALSE 0.281 64.000 0.000 1.000 N NA
 2783255 2783256 PTD2_03356 PTD2_03361     FALSE 0.004 412.000 0.000 1.000 N NA
 2783259 2783260 PTD2_03376 PTD2_03381     FALSE 0.267 259.000 0.500 NA   NA
 2783261 2783262 PTD2_03386 PTD2_03391     FALSE 0.018 224.000 0.000 NA   NA
 2783262 2783263 PTD2_03391 PTD2_03396     TRUE 0.629 -10.000 0.000 NA   NA
 2783264 2783265 PTD2_03401 PTD2_03406     FALSE 0.351 47.000 0.000 1.000   NA
 2783267 2783268 PTD2_03416 PTD2_03421     TRUE 0.925 11.000 0.060 1.000 N NA
 2783271 2783272 PTD2_03436 PTD2_03441     TRUE 0.812 -6.000 0.000 NA   NA
 2783272 2783273 PTD2_03441 PTD2_03446     FALSE 0.003 411.000 0.000 NA   NA
 2783273 2783274 PTD2_03446 PTD2_03451     FALSE 0.006 316.000 0.000 NA   NA
 2783275 2783276 PTD2_03456 PTD2_03461     FALSE 0.032 182.000 0.000 NA   NA
 2783277 2783278 PTD2_03466 PTD2_03471     FALSE 0.322 -67.000 0.000 NA   NA
 2783278 2783279 PTD2_03471 PTD2_03476     FALSE 0.029 188.000 0.000 NA   NA
 2783280 2783281 PTD2_03481 PTD2_03486     FALSE 0.351 40.000 0.000 NA   NA
 2783282 2783283 PTD2_03491 PTD2_03496     FALSE 0.001 1191.000 0.000 NA   NA
 2783283 2783284 PTD2_03496 PTD2_03501     FALSE 0.073 139.000 0.000 NA   NA
 2783284 2783285 PTD2_03501 PTD2_03506     TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA   NA
 2783285 2783286 PTD2_03506 PTD2_03511     FALSE 0.364 38.000 0.000 NA   NA
 2783286 2783287 PTD2_03511 PTD2_03516     TRUE 0.524 -13.000 0.000 NA   NA
 2783287 2783288 PTD2_03516 PTD2_03521     FALSE 0.379 36.000 0.000 NA   NA
 2783288 2783289 PTD2_03521 PTD2_03526     FALSE 0.033 179.000 0.000 NA   NA
 2783290 2783291 PTD2_03531 PTD2_03536     FALSE 0.150 119.000 0.030 NA   NA
 2783292 2783293 PTD2_03541 PTD2_03546     FALSE 0.079 130.000 0.000 NA   NA
 2783297 2783298 PTD2_03566 PTD2_03571     FALSE 0.013 247.000 0.000 NA   NA
 2783302 2783303 PTD2_03591 PTD2_03596     FALSE 0.022 232.000 0.000 1.000 N NA
 2783305 2783306 PTD2_03606 PTD2_03611     FALSE 0.033 192.000 0.000 1.000   NA
 2783306 2783307 PTD2_03611 PTD2_03616     TRUE 0.626 25.000 0.023 1.000   NA
 2783307 2783308 PTD2_03616 PTD2_03621     TRUE 0.918 17.000 0.017 1.000 Y NA
 2783309 2783310 PTD2_03626 PTD2_03631     TRUE 0.789 14.000 0.023 1.000 N NA
 2783311 2783312 PTD2_03636 PTD2_03641     FALSE 0.094 127.000 0.000 1.000   NA
 2783312 2783313 PTD2_03641 PTD2_03646     FALSE 0.102 111.000 0.000 1.000   NA
 2783314 2783315 PTD2_03651 PTD2_03656     FALSE 0.070 141.000 0.000 NA   NA
 2783315 2783316 PTD2_03656 PTD2_03661     TRUE 0.842 30.000 0.000 1.000 Y NA
 2783316 2783317 PTD2_03661 PTD2_03666     FALSE 0.372 50.000 0.000 1.000 N NA
 2783317 2783318 PTD2_03666 PTD2_03671     FALSE 0.009 289.000 0.000 1.000   NA
 2783319 2783320 PTD2_03676 PTD2_03681     FALSE 0.013 251.000 0.000 NA   NA
 2783320 2783321 PTD2_03681 PTD2_03686     TRUE 0.908 3.000 0.000 NA   NA
 2783321 2783322 PTD2_03686 PTD2_03691     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 2783322 2783323 PTD2_03691 PTD2_03696     TRUE 0.566 -13.000 0.000 1.000   NA
 2783323 2783324 PTD2_03696 PTD2_03701     TRUE 0.990 9.000 0.250 0.008   NA
 2783324 2783325 PTD2_03701 PTD2_03706     TRUE 0.816 66.000 0.300 1.000   NA
 2783325 2783326 PTD2_03706 PTD2_03711     FALSE 0.003 418.000 0.000 NA   NA
 2783326 2783327 PTD2_03711 PTD2_03716     FALSE 0.002 464.000 0.000 NA   NA
 2783328 2783329 PTD2_03721 PTD2_03726     TRUE 0.994 -10.000 1.000 NA   NA
 2783329 2783330 PTD2_03726 PTD2_03731     TRUE 0.988 -15.000 0.889 NA   NA
 2783330 2783331 PTD2_03731 PTD2_03736     TRUE 0.997 2.000 0.222 1.000 Y NA
 2783331 2783332 PTD2_03736 PTD2_03741     FALSE 0.019 229.000 0.000 1.000   NA
 2783332 2783333 PTD2_03741 PTD2_03746     TRUE 0.915 2.000 0.000 NA   NA
 2783333 2783334 PTD2_03746 PTD2_03751     FALSE 0.467 25.000 0.000 NA   NA
 2783334 2783335 PTD2_03751 PTD2_03756     FALSE 0.013 249.000 0.000 NA   NA
 2783335 2783336 PTD2_03756 PTD2_03761     FALSE 0.015 238.000 0.000 NA   NA
 2783336 2783337 PTD2_03761 PTD2_03766     FALSE 0.004 367.000 0.000 NA   NA
 2783337 2783338 PTD2_03766 PTD2_03771     TRUE 0.906 50.000 0.364 NA N NA
 2783338 2783339 PTD2_03771 PTD2_03776     TRUE 0.999 -7.000 0.886 0.040 Y NA
 2783339 2783340 PTD2_03776 PTD2_03781     FALSE 0.079 130.000 0.000 NA   NA
 2783341 2783342 PTD2_03786 PTD2_03791     TRUE 0.986 3.000 0.000 NA Y NA
 2783342 2783343 PTD2_03791 PTD2_03796     TRUE 0.956 -7.000 0.000 NA Y NA
 2783345 2783346 PTD2_03806 PTD2_03811     TRUE 0.578 16.000 0.000 NA   NA
 2783346 2783347 PTD2_03811 PTD2_03816     FALSE 0.002 740.000 0.000 1.000   NA
 2783347 2783348 PTD2_03816 PTD2_03821     TRUE 0.664 84.000 0.250 NA   NA
 2783348 2783349 PTD2_03821 PTD2_03826     TRUE 0.915 2.000 0.000 NA   NA
 2783349 2783350 PTD2_03826 PTD2_03831     TRUE 1.000 0.000 0.669 0.001 Y NA
 2783350 2783351 PTD2_03831 PTD2_03836     FALSE 0.016 255.000 0.000 1.000 N NA
 2783351 2783352 PTD2_03836 PTD2_03841     FALSE 0.192 79.000 0.000 1.000 N NA
 2783353 2783354 PTD2_03846 PTD2_03851     FALSE 0.050 158.000 0.000 NA   NA
 2783354 2783355 PTD2_03851 PTD2_03856     FALSE 0.176 71.000 0.000 NA   NA
 2783355 2783356 PTD2_03856 PTD2_03861     FALSE 0.014 239.000 0.000 NA   NA
 2783356 2783357 PTD2_03861 PTD2_03866     FALSE 0.453 37.000 0.000 1.000 N NA
 2783359 2783360 PTD2_03876 PTD2_03881     TRUE 0.988 2.000 0.000 1.000 Y NA
 2783363 2783364 PTD2_03896 PTD2_03901     FALSE 0.004 355.000 0.000 NA   NA
 2783365 2783366 PTD2_03906 PTD2_03911     TRUE 0.976 1.000 0.075 NA   NA
 2783366 2783367 PTD2_03911 PTD2_03916     TRUE 0.915 2.000 0.000 NA   NA
 2783368 2783369 PTD2_03921 PTD2_03926     TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 2783371 2783372 PTD2_03936 PTD2_03941     FALSE 0.036 173.000 0.000 NA   NA
 2783372 2783373 PTD2_03941 PTD2_03946     FALSE 0.088 137.000 0.000 1.000   NA
 2783373 2783374 PTD2_03946 PTD2_03951     TRUE 0.979 20.000 0.273 1.000 Y NA
 2783375 2783376 PTD2_03956 PTD2_03961     TRUE 0.872 56.000 0.120 1.000 Y NA
 2783376 2783377 PTD2_03961 PTD2_03966     FALSE 0.461 36.000 0.000 1.000 N NA
 2783377 2783378 PTD2_03966 PTD2_03971     FALSE 0.014 240.000 0.000 NA   NA
 2783378 2783379 PTD2_03971 PTD2_03976     FALSE 0.100 100.000 0.000 NA   NA
 2783379 2783380 PTD2_03976 PTD2_03981     FALSE 0.003 441.000 0.000 1.000   NA
 2783380 2783381 PTD2_03981 PTD2_03986     FALSE 0.009 272.000 0.000 NA   NA
 2783386 2783387 PTD2_04011 PTD2_04016     TRUE 0.883 73.000 0.545 1.000   NA
 2783387 2783388 PTD2_04016 PTD2_04021     TRUE 0.998 1.000 0.600 0.032   NA
 2783390 2783391 PTD2_04031 PTD2_04036     FALSE 0.037 171.000 0.000 NA   NA
 2783391 2783392 PTD2_04036 PTD2_04041     TRUE 0.992 12.000 0.641 NA   NA
 2783392 2783393 PTD2_04041 PTD2_04046     FALSE 0.002 582.000 0.000 NA   NA
 2783393 2783394 PTD2_04046 PTD2_04051     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2783394 2783395 PTD2_04051 PTD2_04056     FALSE 0.454 -16.000 0.000 NA   NA
 2783395 2783396 PTD2_04056 PTD2_04061     FALSE 0.379 36.000 0.000 NA   NA
 2783396 2783397 PTD2_04061 PTD2_04066     FALSE 0.003 380.000 0.000 NA   NA
 2783399 2783400 PTD2_04076 PTD2_04081     FALSE 0.028 192.000 0.000 NA   NA
 2783400 2783401 PTD2_04081 PTD2_04086     FALSE 0.491 23.000 0.000 NA   NA
 2783401 2783402 PTD2_04086 PTD2_04091     FALSE 0.004 374.000 0.000 NA   NA
 2783402 2783403 PTD2_04091 PTD2_04096     FALSE 0.335 43.000 0.000 NA   NA
 2783403 2783404 PTD2_04096 PTD2_04101     FALSE 0.086 112.000 0.000 NA   NA
 2783404 2783405 PTD2_04101 PTD2_04106     TRUE 0.999 -3.000 0.682 1.000 Y NA
 2783405 2783406 PTD2_04106 PTD2_04111     FALSE 0.449 42.000 0.020 NA   NA
 2783406 2783407 PTD2_04111 PTD2_04116     TRUE 0.747 -10.000 0.025 NA   NA
 2783408 2783409 PTD2_04121 PTD2_04126     FALSE 0.353 -31.000 0.000 NA   NA
 2783409 2783410 PTD2_04126 PTD2_04131     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 2783410 2783411 PTD2_04131 PTD2_04136     TRUE 0.656 34.000 0.057 NA   NA
 2783411 2783412 PTD2_04136 PTD2_04141     TRUE 0.566 -13.000 0.000 1.000   NA
 2783413 2783414 PTD2_04146 PTD2_04151     TRUE 0.624 47.000 0.074 NA   NA
 2783416 2783417 PTD2_04161 PTD2_04166     FALSE 0.365 136.000 0.000 NA Y NA
 2783417 2783418 PTD2_04166 PTD2_04171     FALSE 0.008 307.000 0.000 NA N NA
 2783418 2783419 PTD2_04171 PTD2_04176     FALSE 0.067 144.000 0.000 NA   NA
 2783419 2783420 PTD2_04176 PTD2_04181     TRUE 0.998 0.000 0.724 NA   NA
 2783420 2783421 PTD2_04181 PTD2_04186     TRUE 0.944 -31.000 0.483 NA   NA
 2783421 2783422 PTD2_04186 PTD2_04191     TRUE 0.879 44.000 0.259 1.000   NA
 2783425 2783426 PTD2_04206 PTD2_04211     TRUE 0.592 21.000 0.000 1.000 N NA
 2783426 2783427 PTD2_04211 PTD2_04216     TRUE 0.704 -10.000 0.000 1.000 N NA
 2783428 2783429 PTD2_04221 PTD2_04226     FALSE 0.064 146.000 0.000 NA   NA
 2783429 2783430 PTD2_04226 PTD2_04231     FALSE 0.302 49.000 0.000 NA   NA
 2783430 2783431 PTD2_04231 PTD2_04236     FALSE 0.027 218.000 0.000 1.000 N NA
 2783431 2783432 PTD2_04236 PTD2_04241     FALSE 0.009 274.000 0.000 NA   NA
 2783432 2783433 PTD2_04241 PTD2_04246     FALSE 0.335 43.000 0.000 NA   NA
 2783433 2783434 PTD2_04246 PTD2_04251     FALSE 0.097 103.000 0.000 NA   NA
 2783434 2783435 PTD2_04251 PTD2_04256     FALSE 0.016 235.000 0.000 NA   NA
 2783435 2783436 PTD2_04256 PTD2_04261     FALSE 0.471 72.000 0.089 NA   NA
 2783436 2783437 PTD2_04261 PTD2_04266     FALSE 0.096 119.000 0.000 1.000   NA
 2783437 2783438 PTD2_04266 PTD2_04271     FALSE 0.004 391.000 0.000 1.000   NA
 2783438 2783439 PTD2_04271 PTD2_04276     TRUE 0.912 33.000 0.286 NA   NA
 2783439 2783440 PTD2_04276 PTD2_04281     TRUE 0.974 -3.000 0.100 NA   NA
 2783440 2783441 PTD2_04281 PTD2_04286     FALSE 0.003 426.000 0.000 1.000   NA
 2783442 2783443 PTD2_04291 PTD2_04296     TRUE 0.712 55.000 0.143 NA   NA
 2783443 2783444 PTD2_04296 PTD2_04301     FALSE 0.002 433.000 0.000 NA   NA
 2783444 2783445 PTD2_04301 PTD2_04306     TRUE 0.770 11.000 0.000 NA   NA
 2783448 2783449 PTD2_04321 PTD2_04326     TRUE 0.629 -10.000 0.000 NA   NA
 2783450 2783451 PTD2_04331 PTD2_04336     FALSE 0.250 58.000 0.000 NA   NA
 2783451 2783452 PTD2_04336 PTD2_04341     TRUE 0.862 6.000 0.000 NA   NA
 2783453 2783454 PTD2_04346 PTD2_04351     TRUE 0.742 63.000 0.000 0.043 Y NA
 2783454 2783455 PTD2_04351 PTD2_04356     FALSE 0.002 560.000 0.000 1.000   NA
 2783456 2783457 PTD2_04361 PTD2_04366     FALSE 0.146 145.000 0.000 0.052 N NA
 2783457 2783458 PTD2_04366 PTD2_04371     FALSE 0.102 99.000 0.000 NA   NA
 2783460 2783461 PTD2_04381 PTD2_04386     FALSE 0.002 469.000 0.000 NA   NA
 2783461 2783462 PTD2_04386 PTD2_04391     FALSE 0.014 240.000 0.000 NA   NA
 2783465 2783466 PTD2_04406 PTD2_04411     FALSE 0.004 342.000 0.000 NA   NA
 2783468 2783469 PTD2_04421 PTD2_04426     FALSE 0.003 392.000 0.000 NA   NA
 2783469 2783470 PTD2_04426 PTD2_04431     FALSE 0.005 334.000 0.000 NA   NA
 2783470 2783471 PTD2_04431 PTD2_04436     FALSE 0.113 90.000 0.000 NA   NA
 2783471 2783472 PTD2_04436 PTD2_04441     TRUE 0.997 0.000 0.450 1.000 N NA
 2783473 2783474 PTD2_04446 PTD2_04451     FALSE 0.398 39.000 0.000 1.000   NA
 2783474 2783475 PTD2_04451 PTD2_04456     FALSE 0.042 165.000 0.000 NA   NA
 2783476 2783477 PTD2_04461 PTD2_04466     FALSE 0.080 129.000 0.000 NA   NA
 2783477 2783478 PTD2_04466 PTD2_04471     FALSE 0.028 191.000 0.000 NA   NA
 2783478 2783479 PTD2_04471 PTD2_04476     FALSE 0.118 87.000 0.000 NA   NA
 2783479 2783480 PTD2_04476 PTD2_04481     FALSE 0.299 55.000 0.000 1.000   NA
 2783482 2783483 PTD2_04491 PTD2_04496     FALSE 0.003 397.000 0.000 NA   NA
 2783483 2783484 PTD2_04496 PTD2_04501     FALSE 0.039 178.000 0.000 1.000   NA
 2783484 2783485 PTD2_04501 PTD2_04506     TRUE 0.785 -7.000 0.000 1.000   NA
 2783485 2783486 PTD2_04506 PTD2_04511     TRUE 0.810 44.000 0.168 1.000   NA
 2783487 2783488 PTD2_04516 PTD2_04521     TRUE 0.992 15.000 0.400 0.036 Y NA
 2783488 2783489 PTD2_04521 PTD2_04526     FALSE 0.007 333.000 0.000 1.000 N NA
 2783490 2783491 PTD2_04531 PTD2_04536     FALSE 0.001 630.000 0.000 NA   NA
 2783491 2783492 PTD2_04536 PTD2_04541     FALSE 0.002 559.000 0.000 NA   NA
 2783493 2783494 PTD2_10479 PTD2_t14371     FALSE 0.003 420.000 0.000 NA   NA
 2783494 2783495 PTD2_t14371 PTD2_t14369     FALSE 0.425 29.000 0.000 NA   NA
 2783495 2783496 PTD2_t14369 PTD2_10484     FALSE 0.102 99.000 0.000 NA   NA
 2783496 2783497 PTD2_10484 PTD2_10489     TRUE 0.859 17.000 0.098 NA   NA
 2783498 2783499 PTD2_10494 PTD2_10499     FALSE 0.175 77.000 0.000 1.000   NA
 2783504 2783505 PTD2_10524 PTD2_10529     TRUE 0.878 37.000 0.209 1.000 N NA
 2783505 2783506 PTD2_10529 PTD2_10534     TRUE 0.997 2.000 0.518 1.000   NA
 2783507 2783508 PTD2_10539 PTD2_10544     TRUE 0.996 1.000 0.402 NA   NA
 2783510 2783511 PTD2_10554 PTD2_10559     FALSE 0.453 78.000 0.098 NA   NA
 2783511 2783512 PTD2_10559 PTD2_10564     TRUE 0.995 0.000 0.322 NA   NA
 2783515 2783516 PTD2_10579 PTD2_10584     FALSE 0.014 242.000 0.000 NA   NA
 2783516 2783517 PTD2_10584 PTD2_10589     FALSE 0.308 48.000 0.000 NA   NA
 2783517 2783518 PTD2_10589 PTD2_10594     FALSE 0.358 39.000 0.000 NA   NA
 2783518 2783519 PTD2_10594 PTD2_10599     TRUE 0.997 -3.000 0.575 NA   NA
 2783523 2783524 PTD2_10619 PTD2_10624     FALSE 0.112 91.000 0.000 NA   NA
 2783525 2783526 PTD2_10629 PTD2_10634     TRUE 0.995 4.000 0.353 1.000 N NA
 2783527 2783528 PTD2_10639 PTD2_10644     FALSE 0.115 101.000 0.000 1.000   NA
 2783528 2783529 PTD2_10644 PTD2_10649     FALSE 0.132 102.000 0.000 1.000 N NA
 2783531 2783532 PTD2_10659 PTD2_10664     FALSE 0.096 104.000 0.000 NA   NA
 2783533 2783534 PTD2_10669 PTD2_10674     TRUE 0.999 4.000 1.000 NA N NA
 2783535 2783536 PTD2_10679 PTD2_10684     TRUE 0.566 -13.000 0.000 1.000   NA
 2783536 2783537 PTD2_10684 PTD2_10689   carB TRUE 0.856 51.000 0.241 1.000 N NA
 2783537 2783538 PTD2_10689 PTD2_10694 carB   TRUE 0.989 20.000 0.345 0.001 Y NA
 2783538 2783539 PTD2_10694 PTD2_10699     FALSE 0.204 206.000 0.034 1.000 Y NA
 2783543 2783544 PTD2_10719 PTD2_10724     FALSE 0.218 72.000 0.004 1.000 N NA
 2783545 2783546 PTD2_10729 PTD2_10734     FALSE 0.002 483.000 0.000 NA   NA
 2783546 2783547 PTD2_10734 PTD2_10739     FALSE 0.124 81.000 0.002 NA   NA
 2783548 2783549 PTD2_10744 PTD2_10749     TRUE 0.983 13.000 0.118 0.001 Y NA
 2783549 2783550 PTD2_10749 PTD2_10754     FALSE 0.002 538.000 0.000 1.000   NA
 2783550 2783551 PTD2_10754 PTD2_10759     FALSE 0.307 54.000 0.000 1.000   NA
 2783552 2783553 PTD2_10764 PTD2_10769     FALSE 0.007 309.000 0.000 NA N NA
 2783553 2783554 PTD2_10769 PTD2_10774     TRUE 0.974 31.000 0.683 NA   NA
 2783554 2783555 PTD2_10774 PTD2_10779     TRUE 0.986 19.000 0.761 NA   NA
 2783555 2783556 PTD2_10779 PTD2_10784     TRUE 0.852 7.000 0.000 NA   NA
 2783557 2783558 PTD2_10789 PTD2_10794     TRUE 0.999 5.000 0.902 1.000 Y NA
 2783560 2783561 PTD2_10804 PTD2_10809     FALSE 0.088 175.000 0.035 1.000 N NA
 2783561 2783562 PTD2_10809 PTD2_10814     FALSE 0.144 145.000 0.028 1.000 N NA
 2783562 2783563 PTD2_10814 PTD2_10819     TRUE 0.993 11.000 0.604 NA   NA
 2783563 2783564 PTD2_10819 PTD2_10824     TRUE 0.874 64.000 0.411 NA   NA
 2783564 2783565 PTD2_10824 PTD2_10829     TRUE 0.977 4.000 0.088 1.000 N NA
 2783565 2783566 PTD2_10829 PTD2_10834     FALSE 0.060 146.000 0.004 NA   NA
 2783566 2783567 PTD2_10834 PTD2_10839     FALSE 0.256 85.000 0.043 NA   NA
 2783567 2783568 PTD2_10839 PTD2_10844     TRUE 0.999 -3.000 0.914 NA   NA
 2783568 2783569 PTD2_10844 PTD2_10849     TRUE 0.840 71.000 0.406 NA   NA
 2783570 2783571 PTD2_10854 PTD2_10859     FALSE 0.241 65.000 0.000 1.000   NA
 2783574 2783575 PTD2_10874 PTD2_10879     TRUE 0.928 12.000 0.091 1.000   NA
 2783575 2783576 PTD2_10879 PTD2_10884     TRUE 0.999 0.000 0.955 1.000 N NA
 2783576 2783577 PTD2_10884 PTD2_10889     TRUE 0.994 15.000 0.917 0.058   NA
 2783577 2783578 PTD2_10889 PTD2_10894     TRUE 0.999 0.000 0.821 0.019   NA
 2783578 2783579 PTD2_10894 PTD2_10899     TRUE 0.997 6.000 0.750 NA   NA
 2783581 2783582 PTD2_10909 PTD2_10914     FALSE 0.178 76.000 0.000 1.000   NA
 2783582 2783583 PTD2_10914 PTD2_10919     FALSE 0.007 324.000 0.000 1.000 N NA
 2783584 2783585 PTD2_10924 PTD2_10929     FALSE 0.125 93.000 0.000 1.000   NA
 2783585 2783586 PTD2_10929 PTD2_10934     TRUE 0.991 0.000 0.189 1.000   NA
 2783586 2783587 PTD2_10934 PTD2_10939     TRUE 0.997 1.000 0.434 NA   NA
 2783587 2783588 PTD2_10939 PTD2_10944     TRUE 0.946 -3.000 0.032 NA N NA
 2783588 2783589 PTD2_10944 PTD2_10949     FALSE 0.197 112.000 0.048 NA   NA
 2783589 2783590 PTD2_10949 PTD2_10954     TRUE 0.896 -7.000 0.054 NA   NA
 2783591 2783592 PTD2_10959 PTD2_10964     FALSE 0.004 352.000 0.000 NA   NA
 2783592 2783593 PTD2_10964 PTD2_10969     TRUE 0.839 12.000 0.016 1.000 N NA
 2783593 2783594 PTD2_10969 PTD2_10974     FALSE 0.001 938.000 0.000 NA   NA
 2783594 2783595 PTD2_10974 PTD2_10979     FALSE 0.017 226.000 0.000 NA   NA
 2783597 2783598 PTD2_10989 PTD2_10994     FALSE 0.239 87.000 0.000 0.020   NA
 2783598 2783599 PTD2_10994 PTD2_10999     FALSE 0.096 117.000 0.000 1.000   NA
 2783599 2783600 PTD2_10999 PTD2_11004     FALSE 0.179 132.000 0.000 0.004   NA
 2783600 2783601 PTD2_11004 PTD2_11009     FALSE 0.108 93.000 0.000 NA   NA
 2783601 2783602 PTD2_11009 PTD2_11014     FALSE 0.003 393.000 0.000 NA   NA
 2783603 2783604 PTD2_11019 PTD2_11024     TRUE 0.813 14.000 0.000 0.005   NA
 2783604 2783605 PTD2_11024 PTD2_11029     FALSE 0.002 540.000 0.000 NA   NA
 2783606 2783607 PTD2_11034 PTD2_11039     FALSE 0.155 76.000 0.000 NA   NA
 2783609 2783610 PTD2_11049 PTD2_11054     FALSE 0.415 -19.000 0.000 NA   NA
 2783610 2783611 PTD2_11054 PTD2_11059     FALSE 0.005 332.000 0.000 NA   NA
 2783611 2783612 PTD2_11059 PTD2_11064     FALSE 0.001 1037.000 0.000 NA   NA
 2783612 2783613 PTD2_11064 PTD2_11069     TRUE 0.812 -7.000 0.000 1.000 N NA
 2783613 2783614 PTD2_11069 PTD2_11074     TRUE 0.933 -6.000 0.065 NA   NA
 2783614 2783615 PTD2_11074 PTD2_11079     TRUE 0.918 1.000 0.000 NA   NA
 2783615 2783616 PTD2_11079 PTD2_11084     FALSE 0.508 29.000 0.000 1.000 N NA
 2783616 2783617 PTD2_11084 PTD2_11089     TRUE 0.829 9.000 0.000 NA   NA
 2783617 2783618 PTD2_11089 PTD2_11094     TRUE 0.981 15.000 0.512 NA   NA
 2783618 2783619 PTD2_11094 PTD2_11099     TRUE 0.895 5.000 0.000 NA N NA
 2783619 2783620 PTD2_11099 PTD2_11104     TRUE 0.982 -3.000 0.000 NA Y NA
 2783620 2783621 PTD2_11104 PTD2_11109     TRUE 0.996 9.000 0.649 NA   NA
 2783621 2783622 PTD2_11109 PTD2_11114     TRUE 0.632 14.000 0.000 NA   NA
 2783622 2783623 PTD2_11114 PTD2_11119     FALSE 0.427 -25.000 0.000 1.000   NA
 2783623 2783624 PTD2_11119 PTD2_11124     TRUE 0.793 12.000 0.000 1.000 N NA
 2783624 2783625 PTD2_11124 PTD2_11129     TRUE 0.764 12.000 0.000 1.000   NA
 2783625 2783626 PTD2_11129 PTD2_11134     TRUE 0.978 0.000 0.037 0.031   NA
 2783626 2783627 PTD2_11134 PTD2_11139     TRUE 0.934 10.000 0.056 1.000 N NA
 2783627 2783628 PTD2_11139 PTD2_11144     TRUE 0.589 18.000 0.000 1.000   NA
 2783628 2783629 PTD2_11144 PTD2_11149     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2783629 2783630 PTD2_11149 PTD2_11154     TRUE 0.812 -6.000 0.000 NA   NA
 2783631 2783632 PTD2_11159 PTD2_11164     FALSE 0.004 344.000 0.000 NA   NA
 2783633 2783634 PTD2_11169 PTD2_11174     TRUE 0.905 -6.000 0.000 0.043   NA
 2783635 2783636 PTD2_11179 PTD2_11184     TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 2783637 2783638 PTD2_11189 PTD2_11194     FALSE 0.008 286.000 0.000 NA   NA
 2783638 2783639 PTD2_11194 PTD2_11199     FALSE 0.078 133.000 0.000 NA   NA
 2783639 2783640 PTD2_11199 PTD2_11204     FALSE 0.474 85.000 0.125 1.000   NA
 2783640 2783641 PTD2_11204 PTD2_11209     FALSE 0.374 43.000 0.000 1.000   NA
 2783641 2783642 PTD2_11209 PTD2_11214     TRUE 0.988 0.000 0.000 1.000 Y NA
 2783644 2783645 PTD2_11224 PTD2_11229     FALSE 0.002 490.000 0.000 NA   NA
 2783645 2783646 PTD2_11229 PTD2_11234     TRUE 0.693 34.000 0.070 NA   NA
 2783650 2783651 PTD2_11254 PTD2_11259     FALSE 0.452 24.000 0.003 NA   NA
 2783651 2783652 PTD2_11259 PTD2_11264     TRUE 0.821 33.000 0.123 1.000 N NA
 2783652 2783653 PTD2_11264 PTD2_11269     TRUE 0.896 17.000 0.122 1.000 N NA
 2783653 2783654 PTD2_11269 PTD2_11274     TRUE 0.851 59.000 0.104 1.000 Y NA
 2783654 2783655 PTD2_11274 PTD2_11279     TRUE 0.947 -10.000 0.186 1.000 N NA
 2783655 2783656 PTD2_11279 PTD2_11284     TRUE 0.903 72.000 0.289 1.000 Y NA
 2783656 2783657 PTD2_11284 PTD2_11289     TRUE 0.999 3.000 0.850 1.000 N NA
 2783657 2783658 PTD2_11289 PTD2_11294     TRUE 0.989 18.000 0.796 1.000 N NA
 2783658 2783659 PTD2_11294 PTD2_11299     TRUE 1.000 0.000 0.814 1.000 Y NA
 2783659 2783660 PTD2_11299 PTD2_11304     TRUE 0.974 13.000 0.104 1.000 Y NA
 2783660 2783661 PTD2_11304 PTD2_11309     TRUE 0.916 19.000 0.026 1.000 Y NA
 2783661 2783662 PTD2_11309 PTD2_11314     TRUE 0.998 0.000 0.568 1.000 N NA
 2783662 2783663 PTD2_11314 PTD2_11319     TRUE 0.978 -18.000 0.372 1.000 Y NA
 2783663 2783664 PTD2_11319 PTD2_11324     TRUE 0.965 51.000 0.400 1.000 Y NA
 2783664 2783665 PTD2_11324 PTD2_11329   frr TRUE 0.828 78.000 0.409 1.000 N NA
 2783665 2783666 PTD2_11329 PTD2_11334 frr   TRUE 0.971 33.000 0.626 1.000 N NA
 2783666 2783667 PTD2_11334 PTD2_11339   tsf TRUE 0.656 146.000 0.416 1.000 N NA
 2783667 2783668 PTD2_11339 PTD2_11344 tsf   TRUE 0.941 109.000 0.748 1.000 Y NA
 2783669 2783670 PTD2_11349 PTD2_11354     TRUE 0.721 21.000 0.030 1.000 N NA
 2783670 2783671 PTD2_11354 PTD2_11359     TRUE 0.564 25.000 0.007 1.000 N NA
 2783672 2783673 PTD2_11364 PTD2_11369     FALSE 0.334 108.000 0.103 NA   NA
 2783673 2783674 PTD2_11369 PTD2_11374     FALSE 0.197 78.000 0.000 1.000 N NA
 2783676 2783677 PTD2_11384 PTD2_11389     FALSE 0.393 94.000 0.108 1.000   NA
 2783677 2783678 PTD2_11389 PTD2_11394     TRUE 0.990 0.000 0.168 1.000   NA
 2783681 2783682 PTD2_11409 PTD2_11414     TRUE 0.991 48.000 1.000 NA Y NA
 2783683 2783684 PTD2_11419 PTD2_11424     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 2783684 2783685 PTD2_11424 PTD2_11429     TRUE 0.812 -6.000 0.000 NA   NA
 2783685 2783686 PTD2_11429 PTD2_11434     TRUE 0.998 0.000 0.600 NA   NA
 2783686 2783687 PTD2_11434 PTD2_11439     TRUE 0.869 -12.000 0.109 NA   NA
 2783687 2783688 PTD2_11439 PTD2_11444     TRUE 0.993 0.000 0.065 NA Y NA
 2783688 2783689 PTD2_11444 PTD2_11449     FALSE 0.100 114.000 0.000 NA N NA
 2783689 2783690 PTD2_11449 PTD2_11454     TRUE 1.000 2.000 0.775 0.042 Y NA
 2783690 2783691 PTD2_11454 PTD2_11459     TRUE 0.602 26.000 0.014 1.000 N NA
 2783691 2783692 PTD2_11459 PTD2_11464     TRUE 0.998 0.000 0.626 1.000 N NA
 2783692 2783693 PTD2_11464 PTD2_11469     TRUE 0.988 -7.000 0.417 1.000 N NA
 2783693 2783694 PTD2_11469 PTD2_11474     TRUE 0.970 10.000 0.147 1.000 N NA
 2783694 2783695 PTD2_11474 PTD2_11479     TRUE 0.916 31.000 0.254 1.000 N NA
 2783695 2783696 PTD2_11479 PTD2_11484     TRUE 0.758 69.000 0.169 0.001   NA
 2783699 2783700 PTD2_11499 PTD2_11504     TRUE 0.919 96.000 1.000 NA   NA
 2783700 2783701 PTD2_11504 PTD2_11509     FALSE 0.166 109.000 0.030 NA   NA
 2783702 2783703 PTD2_11514 PTD2_11519     FALSE 0.082 123.000 0.000 NA   NA
 2783704 2783705 PTD2_11524 PTD2_11529     FALSE 0.229 105.000 0.046 1.000   NA
 2783711 2783712 PTD2_11559 PTD2_11564     TRUE 0.860 25.000 0.000 NA Y NA
 2783712 2783713 PTD2_11564 PTD2_11569     TRUE 0.802 11.000 0.000 NA N NA
 2783714 2783715 PTD2_11574 PTD2_11579     TRUE 0.533 19.000 0.000 NA   NA
 2783715 2783716 PTD2_11579 PTD2_11584     TRUE 0.915 2.000 0.000 NA   NA
 2783716 2783717 PTD2_11584 PTD2_11589     FALSE 0.436 28.000 0.000 NA   NA
 2783717 2783718 PTD2_11589 PTD2_11594     TRUE 0.679 13.000 0.000 NA   NA
 2783718 2783719 PTD2_11594 PTD2_11599     TRUE 0.533 19.000 0.000 NA   NA
 2783719 2783720 PTD2_11599 PTD2_11604     TRUE 0.996 0.000 0.152 1.000 Y NA
 2783720 2783721 PTD2_11604 PTD2_11609     FALSE 0.058 151.000 0.000 NA   NA
 2783722 2783723 PTD2_11614 PTD2_11619     TRUE 0.508 21.000 0.000 NA   NA
 2783724 2783725 PTD2_11624 PTD2_11629     TRUE 0.850 -31.000 0.000 0.016 Y NA
 2783725 2783726 PTD2_11629 PTD2_11634     TRUE 0.781 -66.000 0.000 1.000 Y NA
 2783726 2783727 PTD2_11634 PTD2_11639     FALSE 0.231 71.000 0.000 1.000 N NA
 2783727 2783728 PTD2_11639 PTD2_11644     FALSE 0.077 135.000 0.000 NA   NA
 2783731 2783732 PTD2_11659 PTD2_11664     FALSE 0.014 269.000 0.000 1.000 N NA
 2783732 2783733 PTD2_11664 PTD2_11669     FALSE 0.014 484.000 0.000 1.000 Y NA
 2783733 2783734 PTD2_11669 PTD2_11674     FALSE 0.231 140.000 0.017 0.001 N NA
 2783734 2783735 PTD2_11674 PTD2_11679     FALSE 0.111 120.000 0.000 1.000 N NA
 2783735 2783736 PTD2_11679 PTD2_11684     TRUE 0.822 -10.000 0.043 NA N NA
 2783736 2783737 PTD2_11684 PTD2_11689     FALSE 0.142 86.000 0.000 NA N NA
 2783737 2783738 PTD2_11689 PTD2_11694     FALSE 0.103 136.000 0.000 1.000 N NA
 2783738 2783739 PTD2_11694 PTD2_11699     FALSE 0.321 92.000 0.065 1.000 N NA
 2783739 2783740 PTD2_11699 PTD2_11704     FALSE 0.324 61.000 0.009 1.000 N NA
 2783741 2783742 PTD2_11709 PTD2_11714     FALSE 0.008 306.000 0.000 1.000   NA
 2783743 2783744 PTD2_11719 PTD2_11724     TRUE 0.766 58.000 0.175 1.000 N NA
 2783745 2783746 PTD2_11729 PTD2_11734     FALSE 0.228 110.000 0.059 NA   NA
 2783746 2783747 PTD2_11734 PTD2_11739     TRUE 0.999 0.000 0.430 1.000 Y NA
 2783748 2783749 PTD2_11744 PTD2_11749     FALSE 0.010 267.000 0.000 NA   NA
 2783749 2783750 PTD2_11749 PTD2_11754     TRUE 0.996 4.000 0.500 NA   NA
 2783750 2783751 PTD2_11754 PTD2_11759     TRUE 0.985 3.000 0.143 NA   NA
 2783751 2783752 PTD2_11759 PTD2_11764     TRUE 0.975 -7.000 0.233 NA   NA
 2783752 2783753 PTD2_11764 PTD2_11769     TRUE 0.934 -3.000 0.027 NA   NA
 2783753 2783754 PTD2_11769 PTD2_11774     TRUE 0.930 -6.000 0.061 NA   NA
 2783754 2783755 PTD2_11774 PTD2_11779     TRUE 0.666 141.000 0.432 NA   NA
 2783755 2783756 PTD2_11779 PTD2_11784     TRUE 0.999 2.000 0.946 NA   NA
 2783756 2783757 PTD2_11784 PTD2_11789     FALSE 0.030 192.000 0.007 NA   NA
 2783760 2783761 PTD2_11804 PTD2_11809     TRUE 0.986 8.000 0.239 NA N NA
 2783761 2783762 PTD2_11809 PTD2_11814     TRUE 0.999 0.000 0.727 NA Y NA
 2783762 2783763 PTD2_11814 PTD2_11819     TRUE 0.997 -3.000 0.578 NA   NA
 2783763 2783764 PTD2_11819 PTD2_11824     TRUE 0.992 -10.000 0.804 1.000   NA
 2783764 2783765 PTD2_11824 PTD2_11829     TRUE 0.998 3.000 0.211 0.002 Y NA
 2783765 2783766 PTD2_11829 PTD2_11834     TRUE 0.994 -3.000 0.344 1.000 N NA
 2783766 2783767 PTD2_11834 PTD2_11839     TRUE 0.972 23.000 0.501 1.000 N NA
 2783767 2783768 PTD2_11839 PTD2_11844     TRUE 0.992 3.000 0.015 0.001 Y NA
 2783768 2783769 PTD2_11844 PTD2_11849     TRUE 0.993 0.000 0.021 0.002 Y NA
 2783770 2783771 PTD2_11854 PTD2_11859     TRUE 0.944 5.000 0.041 NA   NA
 2783772 2783773 PTD2_11864 PTD2_11869     TRUE 0.977 31.000 0.743 NA   NA
 2783773 2783774 PTD2_11869 PTD2_11874     TRUE 0.988 30.000 0.886 0.016   NA
 2783774 2783775 PTD2_11874 PTD2_11879     TRUE 0.996 -3.000 0.454 1.000   NA
 2783775 2783776 PTD2_11879 PTD2_11884     TRUE 0.960 13.000 0.199 1.000 N NA
 2783776 2783777 PTD2_11884 PTD2_11889     TRUE 0.995 9.000 0.248 1.000 Y NA
 2783777 2783778 PTD2_11889 PTD2_11894     TRUE 0.987 -7.000 0.153 1.000 Y NA
 2783778 2783779 PTD2_11894 PTD2_11899     TRUE 0.986 21.000 0.327 0.016 Y NA
 2783779 2783780 PTD2_11899 PTD2_11904     TRUE 0.986 17.000 0.341 1.000 Y NA
 2783780 2783781 PTD2_11904 PTD2_11909     TRUE 0.991 18.000 0.516 1.000 Y NA
 2783781 2783782 PTD2_11909 PTD2_11914     TRUE 0.877 58.000 0.283 0.087 N NA
 2783782 2783783 PTD2_11914 PTD2_11919     TRUE 0.939 47.000 0.482 1.000 N NA
 2783783 2783784 PTD2_11919 PTD2_11924     TRUE 0.984 -7.000 0.241 0.014 N NA
 2783784 2783785 PTD2_11924 PTD2_11929     TRUE 0.968 20.000 0.178 1.000 Y NA
 2783785 2783786 PTD2_11929 PTD2_11934     TRUE 0.838 92.000 0.205 0.011 Y NA
 2783786 2783787 PTD2_11934 PTD2_11939     TRUE 0.980 17.000 0.240 1.000 Y NA
 2783787 2783788 PTD2_11939 PTD2_11944     TRUE 0.999 4.000 0.719 0.002 Y NA
 2783788 2783789 PTD2_11944 PTD2_11949     TRUE 0.999 3.000 0.702 0.011 Y NA
 2783789 2783790 PTD2_11949 PTD2_11954     TRUE 0.995 2.000 0.122 1.000 Y NA
 2783790 2783791 PTD2_11954 PTD2_11959     TRUE 0.998 -3.000 0.443 1.000 Y NA
 2783791 2783792 PTD2_11959 PTD2_11964     TRUE 0.992 40.000 0.741 0.001 Y NA
 2783792 2783793 PTD2_11964 PTD2_11969     TRUE 0.991 13.000 0.241 0.001 Y NA
 2783793 2783794 PTD2_11969 PTD2_11974     TRUE 0.879 66.000 0.182 1.000 Y NA
 2783794 2783795 PTD2_11974 PTD2_11979     TRUE 0.903 85.000 0.317 0.006 Y NA
 2783795 2783796 PTD2_11979 PTD2_11984     TRUE 0.983 13.000 0.127 0.009 Y NA
 2783796 2783797 PTD2_11984 PTD2_11989     TRUE 0.998 3.000 0.248 0.004 Y NA
 2783797 2783798 PTD2_11989 PTD2_11994     TRUE 0.975 38.000 0.320 0.004 Y NA
 2783798 2783799 PTD2_11994 PTD2_11999     TRUE 0.992 -7.000 0.189 0.006 Y NA
 2783799 2783800 PTD2_11999 PTD2_12004     TRUE 0.997 19.000 0.910 0.006 Y NA
 2783800 2783801 PTD2_12004 PTD2_12009     FALSE 0.474 189.000 0.446 1.000 N NA
 2783801 2783802 PTD2_12009 PTD2_12014     TRUE 0.999 -3.000 0.679 1.000 Y NA
 2783802 2783803 PTD2_12014 PTD2_12019     TRUE 0.677 180.000 0.377 1.000 Y NA
 2783803 2783804 PTD2_12019 PTD2_12024     FALSE 0.037 198.000 0.000 1.000 N NA
 2783804 2783805 PTD2_12024 PTD2_12029     FALSE 0.455 61.000 0.000 0.002   NA
 2783806 2783807 PTD2_12034 PTD2_12039     TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 2783808 2783809 PTD2_12044 PTD2_12049     TRUE 0.547 18.000 0.000 NA   NA
 2783809 2783810 PTD2_12049 PTD2_12054     TRUE 0.759 -13.000 0.039 1.000 N NA
 2783810 2783811 PTD2_12054 PTD2_12059     TRUE 0.969 -3.000 0.078 1.000   NA
 2783811 2783812 PTD2_12059 PTD2_12064     TRUE 0.938 9.000 0.054 1.000   NA
 2783812 2783813 PTD2_12064 PTD2_12069     TRUE 0.937 4.000 0.014 1.000 N NA
 2783813 2783814 PTD2_12069 PTD2_12074     TRUE 0.547 18.000 0.000 NA   NA
 2783814 2783815 PTD2_12074 PTD2_12079     TRUE 0.629 -10.000 0.000 NA   NA
 2783815 2783816 PTD2_12079 PTD2_12084     TRUE 0.918 1.000 0.000 NA   NA
 2783816 2783817 PTD2_12084 PTD2_12089     TRUE 0.999 -3.000 0.549 1.000 Y NA
 2783817 2783818 PTD2_12089 PTD2_12094     TRUE 0.992 -6.000 0.190 1.000 Y NA
 2783818 2783819 PTD2_12094 PTD2_12099     TRUE 0.998 -3.000 0.418 1.000 Y NA
 2783819 2783820 PTD2_12099 PTD2_12104     TRUE 0.940 1.000 0.000 1.000 N NA
 2783820 2783821 PTD2_12104 PTD2_12109     FALSE 0.097 103.000 0.000 NA   NA
 2783821 2783822 PTD2_12109 PTD2_12114     FALSE 0.162 74.000 0.000 NA   NA
 2783822 2783823 PTD2_12114 PTD2_12119     TRUE 0.905 16.000 0.000 NA Y NA
 2783823 2783824 PTD2_12119 PTD2_12124     TRUE 0.669 65.000 0.011 NA Y NA
 2783826 2783827 PTD2_12134 PTD2_12139     TRUE 0.764 63.000 0.000 0.002 Y NA
 2783827 2783828 PTD2_12139 PTD2_12144     TRUE 0.979 10.000 0.000 0.001 Y NA
 2783828 2783829 PTD2_12144 PTD2_12149     TRUE 0.999 7.000 0.705 0.002 Y NA
 2783829 2783830 PTD2_12149 PTD2_12154     TRUE 0.649 215.000 0.405 0.009 Y NA
 2783830 2783831 PTD2_12154 PTD2_12159     TRUE 0.996 12.000 0.457 0.009 Y NA
 2783831 2783832 PTD2_12159 PTD2_12164     TRUE 0.997 17.000 0.909 0.006 Y NA
 2783832 2783833 PTD2_12164 PTD2_12169     TRUE 0.991 21.000 0.446 0.001 Y NA
 2783833 2783834 PTD2_12169 PTD2_12174     TRUE 0.943 99.000 0.594 0.004 Y NA
 2783834 2783835 PTD2_12174 PTD2_12179     TRUE 0.996 16.000 0.875 NA Y NA
 2783835 2783836 PTD2_12179 PTD2_12184     TRUE 0.994 13.000 0.478 NA Y NA
 2783836 2783837 PTD2_12184 PTD2_12189     TRUE 1.000 3.000 0.889 0.004 Y NA
 2783837 2783838 PTD2_12189 PTD2_12194     TRUE 0.854 93.000 0.309 1.000 Y NA
 2783838 2783839 PTD2_12194 PTD2_12199     TRUE 0.995 20.000 0.838 1.000 Y NA
 2783840 2783841 PTD2_12204 PTD2_12209     FALSE 0.475 168.000 0.371 NA   NA
 2783841 2783842 PTD2_12209 PTD2_12214     TRUE 0.946 -7.000 0.062 0.002   NA
 2783844 2783845 PTD2_12224 PTD2_12229     FALSE 0.029 188.000 0.000 NA   NA
 2783846 2783847 PTD2_t14367 PTD2_12234     FALSE 0.108 93.000 0.000 NA   NA
 2783848 2783849 PTD2_12239 PTD2_12244     FALSE 0.113 90.000 0.000 NA   NA
 2783850 2783851 PTD2_12249 PTD2_12254     TRUE 0.508 21.000 0.000 NA   NA
 2783851 2783852 PTD2_12254 PTD2_12259     FALSE 0.007 302.000 0.000 NA   NA
 2783852 2783853 PTD2_12259 PTD2_12264     FALSE 0.004 355.000 0.000 NA   NA
 2783853 2783854 PTD2_12264 PTD2_12269     TRUE 0.852 7.000 0.000 NA   NA
 2783856 2783857 PTD2_12279 PTD2_12284     TRUE 0.927 10.000 0.062 NA   NA
 2783857 2783858 PTD2_12284 PTD2_12289     FALSE 0.217 125.000 0.062 NA   NA
 2783858 2783859 PTD2_12289 PTD2_12294     FALSE 0.013 247.000 0.000 NA   NA
 2783859 2783860 PTD2_12294 PTD2_12299     FALSE 0.498 29.000 0.004 1.000 N NA
 2783860 2783861 PTD2_12299 PTD2_12304     TRUE 0.931 15.000 0.164 1.000 N NA
 2783861 2783862 PTD2_12304 PTD2_12309     TRUE 0.715 13.000 0.000 1.000   NA
 2783862 2783863 PTD2_12309 PTD2_12314     FALSE 0.187 74.000 0.000 1.000   NA
 2783863 2783864 PTD2_12314 PTD2_12319     FALSE 0.370 63.000 0.019 1.000 N NA
 2783866 2783867 PTD2_12329 PTD2_12334     FALSE 0.425 76.000 0.068 1.000 N NA
 2783867 2783868 PTD2_12334 PTD2_12339     FALSE 0.087 161.000 0.025 1.000   NA
 2783868 2783869 PTD2_12339 PTD2_12344     TRUE 0.890 -3.000 0.007 NA   NA
 2783869 2783870 PTD2_12344 PTD2_12349     TRUE 0.828 9.000 0.006 NA   NA
 2783870 2783871 PTD2_12349 PTD2_12354     TRUE 0.903 6.000 0.007 1.000 N NA
 2783873 2783874 PTD2_12364 PTD2_12369     FALSE 0.108 130.000 0.000 1.000 N NA
 2783874 2783875 PTD2_12369 PTD2_12374     TRUE 0.828 10.000 0.000 1.000   NA
 2783875 2783876 PTD2_12374 PTD2_12379     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2783876 2783877 PTD2_12379 PTD2_12384     FALSE 0.183 70.000 0.000 NA   NA
 2783877 2783878 PTD2_12384 PTD2_12389     FALSE 0.082 123.000 0.000 NA   NA
 2783880 2783881 PTD2_12399 PTD2_12404     FALSE 0.090 145.000 0.000 1.000 N NA
 2783881 2783882 PTD2_12404 PTD2_12409     FALSE 0.129 105.000 0.000 1.000 N NA
 2783883 2783884 PTD2_12414 PTD2_12419     FALSE 0.454 -16.000 0.000 NA   NA
 2783885 2783886 PTD2_12424 PTD2_12429     FALSE 0.398 123.000 0.000 1.000 Y NA
 2783887 2783888 PTD2_12434 PTD2_12439     FALSE 0.081 124.000 0.000 NA   NA
 2783888 2783889 PTD2_12439 PTD2_12444     FALSE 0.033 178.000 0.000 NA   NA
 2783889 2783890 PTD2_12444 PTD2_12449     FALSE 0.082 141.000 0.000 1.000   NA
 2783890 2783891 PTD2_12449 PTD2_12454     FALSE 0.004 353.000 0.000 NA   NA
 2783892 2783893 PTD2_12459 PTD2_12464     FALSE 0.031 185.000 0.000 NA   NA
 2783893 2783894 PTD2_12464 PTD2_12469     TRUE 0.985 5.000 0.166 1.000 N NA
 2783894 2783895 PTD2_12469 PTD2_12474     TRUE 0.597 65.000 0.109 1.000   NA
 2783895 2783896 PTD2_12474 PTD2_12479     TRUE 0.938 -10.000 0.127 0.042   NA
 2783896 2783897 PTD2_12479 PTD2_12484     TRUE 0.980 4.000 0.117 1.000   NA
 2783897 2783898 PTD2_12484 PTD2_12489     TRUE 0.938 15.000 0.187 1.000   NA
 2783898 2783899 PTD2_12489 PTD2_12494     FALSE 0.388 70.000 0.045 NA N NA
 2783899 2783900 PTD2_12494 PTD2_12499     TRUE 0.999 -3.000 0.609 NA Y NA
 2783900 2783901 PTD2_12499 PTD2_12504     TRUE 0.999 5.000 0.856 NA Y NA
 2783901 2783902 PTD2_12504 PTD2_12509     TRUE 0.998 1.000 0.705 NA N NA
 2783904 2783905 PTD2_12519 PTD2_12524     TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA   NA
 2783906 2783907 PTD2_12529 PTD2_12534     TRUE 0.760 13.000 0.013 1.000   NA
 2783911 2783912 PTD2_12554 PTD2_12559     TRUE 0.953 12.000 0.000 1.000 Y NA
 2783912 2783913 PTD2_12559 PTD2_12564     FALSE 0.153 180.000 0.116 NA   NA
 2783914 2783915 PTD2_12569 PTD2_12574     FALSE 0.135 107.000 0.008 1.000 N NA
 2783915 2783916 PTD2_12574 PTD2_12579     TRUE 0.958 -25.000 0.233 1.000 Y NA
 2783916 2783917 PTD2_12579 PTD2_12584   thrA TRUE 0.990 9.000 0.133 1.000 Y NA
 2783917 2783918 PTD2_12584 PTD2_12589 thrA   FALSE 0.024 227.000 0.000 1.000 N NA
 2783919 2783920 PTD2_12594 PTD2_12599     TRUE 0.876 106.000 0.750 1.000 N NA
 2783922 2783923 PTD2_12609 PTD2_12614     FALSE 0.008 284.000 0.000 NA   NA
 2783927 2783928 PTD2_12634 PTD2_12639     FALSE 0.454 -16.000 0.000 NA   NA
 2783929 2783930 PTD2_12644 PTD2_12649     FALSE 0.249 106.000 0.063 NA   NA
 2783930 2783931 PTD2_12649 PTD2_12654     TRUE 0.830 81.000 0.481 NA   NA
 2783931 2783932 PTD2_12654 PTD2_12659     TRUE 0.779 112.000 0.519 1.000 N NA
 2783932 2783933 PTD2_12659 PTD2_12664     TRUE 0.966 20.000 0.116 0.002 Y NA
 2783933 2783934 PTD2_12664 PTD2_12669     TRUE 0.981 11.000 0.038 0.002 Y NA
 2783934 2783935 PTD2_12669 PTD2_12674     TRUE 0.995 -7.000 0.312 0.002 Y NA
 2783935 2783936 PTD2_12674 PTD2_12679     TRUE 0.995 -7.000 0.324 0.002 Y NA
 2783936 2783937 PTD2_12679 PTD2_12684     TRUE 0.997 3.000 0.130 0.002 Y NA
 2783937 2783938 PTD2_12684 PTD2_12689     FALSE 0.004 391.000 0.000 1.000   NA
 2783938 2783939 PTD2_12689 PTD2_12694     FALSE 0.095 123.000 0.000 1.000   NA
 2783939 2783940 PTD2_12694 PTD2_12699     TRUE 0.983 13.000 0.182 1.000 Y NA
 2783940 2783941 PTD2_12699 PTD2_12704     TRUE 0.999 2.000 0.524 NA Y NA
 2783941 2783942 PTD2_12704 PTD2_12709     FALSE 0.179 97.000 0.022 NA N NA
 2783942 2783943 PTD2_12709 PTD2_12714     FALSE 0.092 179.000 0.050 NA N NA
 2783944 2783945 PTD2_12719 PTD2_12724     TRUE 0.929 24.000 0.248 NA N NA
 2783945 2783946 PTD2_12724 PTD2_12729     TRUE 0.990 5.000 0.244 NA N NA
 2783946 2783947 PTD2_12729 PTD2_12734     TRUE 0.678 67.000 0.167 1.000   NA
 2783949 2783950 PTD2_12744 PTD2_12749     FALSE 0.002 451.000 0.000 NA   NA
 2783951 2783952 PTD2_12754 PTD2_12759     TRUE 0.994 3.000 0.300 NA N NA
 2783952 2783953 PTD2_12759 PTD2_12764     FALSE 0.041 204.000 0.017 1.000   NA
 2783953 2783954 PTD2_12764 PTD2_12769     FALSE 0.079 131.000 0.000 NA   NA
 2783955 2783956 PTD2_12774 PTD2_12779     TRUE 0.870 15.000 0.085 1.000   NA
 2783958 2783959 PTD2_12789 PTD2_12794     TRUE 0.657 24.000 0.021 1.000 N NA
 2783960 2783961 PTD2_12799 PTD2_12804     FALSE 0.081 124.000 0.000 NA   NA
 2783962 2783963 PTD2_12809 PTD2_12814     TRUE 0.905 -3.000 0.012 NA   NA
 2783963 2783964 PTD2_12814 PTD2_12819     FALSE 0.016 256.000 0.000 1.000 N NA
 2783964 2783965 PTD2_12819 PTD2_12824     FALSE 0.468 94.000 0.000 1.000 Y NA
 2783965 2783966 PTD2_12824 PTD2_12829     TRUE 0.992 10.000 0.200 1.000 Y NA
 2783966 2783967 PTD2_12829 PTD2_12834     FALSE 0.014 242.000 0.000 NA   NA
 2783968 2783969 PTD2_12839 PTD2_12844     FALSE 0.123 109.000 0.000 1.000 N NA
 2783969 2783970 PTD2_12844 PTD2_12849     TRUE 0.987 11.000 0.339 1.000 N NA
 2783971 2783972 PTD2_12854 PTD2_12859     TRUE 0.961 2.000 0.000 0.022   NA
 2783972 2783973 PTD2_12859 PTD2_12864     FALSE 0.225 91.000 0.000 0.022   NA
 2783973 2783974 PTD2_12864 PTD2_12869     TRUE 0.789 -10.000 0.000 0.041   NA
 2783976 2783977 PTD2_12879 PTD2_12884     FALSE 0.112 117.000 0.000 1.000 N NA
 2783979 2783980 PTD2_12889 PTD2_12894     FALSE 0.257 53.000 0.003 NA   NA
 2783980 2783981 PTD2_12894 PTD2_12899     FALSE 0.449 56.000 0.027 1.000 N NA
 2783981 2783982 PTD2_12899 PTD2_12904     TRUE 0.785 15.000 0.029 1.000 N NA
 2783983 2783984 PTD2_12909 PTD2_12914     FALSE 0.056 160.000 0.000 1.000   NA
 2783988 2783989 PTD2_12934 PTD2_12939     FALSE 0.474 -27.000 0.013 NA N NA
 2783989 2783990 PTD2_12939 PTD2_12944     FALSE 0.099 135.000 0.004 1.000 N NA
 2783990 2783991 PTD2_12944 PTD2_12949     FALSE 0.469 126.000 0.006 0.038 Y NA
 2783995 2783996 PTD2_12969 PTD2_12974     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2783996 2783997 PTD2_12974 PTD2_t14363     FALSE 0.149 78.000 0.000 NA   NA
 2783999 2784000 PTD2_12984 PTD2_12989 guaA   TRUE 0.793 122.000 0.190 0.001 Y NA
 2784003 2784004 PTD2_13004 PTD2_13009     TRUE 0.829 9.000 0.000 NA   NA
 2784005 2784006 PTD2_13014 PTD2_13019     FALSE 0.495 67.000 0.082 NA   NA
 2784008 2784009 PTD2_13029 PTD2_13034     TRUE 0.749 60.000 0.169 1.000 N NA
 2784009 2784010 PTD2_13034 PTD2_13039     TRUE 0.833 15.000 0.067 NA   NA
 2784010 2784011 PTD2_13039 PTD2_13044     TRUE 0.704 -16.000 0.055 NA   NA
 2784011 2784012 PTD2_13044 PTD2_13049     TRUE 0.948 -16.000 0.353 1.000   NA
 2784012 2784013 PTD2_13049 PTD2_13054     TRUE 0.990 -3.000 0.235 1.000   NA
 2784013 2784014 PTD2_13054 PTD2_13059     TRUE 0.986 -3.000 0.173 1.000   NA
 2784014 2784015 PTD2_13059 PTD2_13064     TRUE 0.998 -3.000 0.419 1.000 Y NA
 2784015 2784016 PTD2_13064 PTD2_13069     TRUE 0.992 0.000 0.185 1.000 N NA
 2784016 2784017 PTD2_13069 PTD2_13074     TRUE 0.607 15.000 0.006 NA   NA
 2784017 2784018 PTD2_13074 PTD2_13079     FALSE 0.452 70.000 0.075 NA   NA
 2784019 2784020 PTD2_13084 PTD2_13089     FALSE 0.118 87.000 0.000 NA   NA
 2784020 2784021 PTD2_13089 PTD2_13094     FALSE 0.176 71.000 0.000 NA   NA
 2784021 2784022 PTD2_13094 PTD2_13099     TRUE 0.995 5.000 0.431 NA   NA
 2784022 2784023 PTD2_13099 PTD2_13104     FALSE 0.126 84.000 0.000 NA   NA
 2784024 2784025 PTD2_13109 PTD2_13114     FALSE 0.146 84.000 0.000 1.000   NA
 2784025 2784026 PTD2_13114 PTD2_13119     FALSE 0.020 218.000 0.000 NA   NA
 2784028 2784029 PTD2_13129 PTD2_13134     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 2784030 2784031 PTD2_13139 PTD2_13144     TRUE 0.912 14.000 0.109 1.000 N NA
 2784032 2784033 PTD2_13149 PTD2_13154     FALSE 0.379 36.000 0.000 NA   NA
 2784035 2784036 PTD2_13164 PTD2_13169     FALSE 0.236 125.000 0.070 NA   NA
 2784036 2784037 PTD2_13169 PTD2_13174     FALSE 0.033 178.000 0.000 NA   NA
 2784037 2784038 PTD2_13174 PTD2_13179     FALSE 0.002 498.000 0.000 NA   NA
 2784038 2784039 PTD2_13179 PTD2_13184     FALSE 0.008 282.000 0.000 NA   NA
 2784039 2784040 PTD2_13184 PTD2_13189     FALSE 0.037 183.000 0.000 1.000   NA
 2784040 2784041 PTD2_13189 PTD2_13194     FALSE 0.035 188.000 0.000 1.000   NA
 2784043 2784044 PTD2_13204 PTD2_13209     FALSE 0.008 310.000 0.000 1.000 N NA
 2784044 2784045 PTD2_13209 PTD2_13214     TRUE 0.882 32.000 0.003 0.002 Y NA
 2784047 2784048 PTD2_13224 PTD2_13229     TRUE 0.980 -16.000 0.741 NA   NA
 2784051 2784052 PTD2_13244 PTD2_13249     FALSE 0.480 24.000 0.000 NA   NA
 2784052 2784053 PTD2_13249 PTD2_13254     TRUE 0.999 0.000 0.778 1.000 Y NA
 2784053 2784054 PTD2_13254 PTD2_13259     FALSE 0.033 192.000 0.000 1.000   NA
 2784054 2784055 PTD2_13259 PTD2_13264     FALSE 0.160 81.000 0.000 1.000   NA
 2784058 2784059 PTD2_13279 PTD2_13284     FALSE 0.031 198.000 0.000 1.000   NA
 2784059 2784060 PTD2_13284 PTD2_13289     FALSE 0.266 161.000 0.000 1.000 Y NA
 2784061 2784062 PTD2_13294 PTD2_13299     FALSE 0.254 162.000 0.151 NA   NA
 2784062 2784063 PTD2_13299 PTD2_13304     TRUE 0.974 12.000 0.231 1.000 N NA
 2784063 2784064 PTD2_13304 PTD2_13309     FALSE 0.429 176.000 0.131 1.000 Y NA
 2784064 2784065 PTD2_13309 PTD2_13314     TRUE 0.993 2.000 0.234 1.000 N NA
 2784065 2784066 PTD2_13314 PTD2_13319     TRUE 0.922 35.000 0.117 1.000 Y NA
 2784066 2784067 PTD2_13319 PTD2_13324     TRUE 0.999 0.000 0.395 0.001 Y NA
 2784067 2784068 PTD2_13324 PTD2_13329     TRUE 0.541 17.000 0.003 NA   NA
 2784069 2784070 PTD2_13334 PTD2_13339     TRUE 0.509 100.000 0.168 1.000 N NA
 2784070 2784071 PTD2_13339 PTD2_13344     TRUE 0.927 86.000 0.453 0.085 Y NA
 2784071 2784072 PTD2_13344 PTD2_13349     FALSE 0.018 284.000 0.023 1.000 N NA
 2784074 2784075 PTD2_13359 PTD2_13364     FALSE 0.328 44.000 0.000 NA   NA
 2784075 2784076 PTD2_13364 PTD2_13369     FALSE 0.337 169.000 0.019 0.005 Y NA
 2784076 2784077 PTD2_13369 PTD2_13374     TRUE 0.789 74.000 0.070 0.005 Y NA
 2784077 2784078 PTD2_13374 PTD2_13379     FALSE 0.033 341.000 0.000 1.000 Y NA
 2784080 2784081 PTD2_13389 PTD2_13394     TRUE 0.789 -9.000 0.024 NA   NA
 2784084 2784085 PTD2_13409 PTD2_13414     FALSE 0.167 137.000 0.030 1.000 N NA
 2784085 2784086 PTD2_13414 PTD2_13419     TRUE 0.933 16.000 0.000 0.030 Y NA
 2784087 2784088 PTD2_13424 PTD2_13429     TRUE 0.987 14.000 0.605 NA   NA
 2784089 2784090 PTD2_13434 PTD2_13439     FALSE 0.017 227.000 0.000 NA   NA
 2784090 2784091 PTD2_13439 PTD2_13444     FALSE 0.007 293.000 0.000 NA   NA
 2784092 2784093 PTD2_13449 PTD2_13454 uppP   TRUE 0.982 -3.000 0.125 1.000 N NA
 2784093 2784094 PTD2_13454 PTD2_13459     TRUE 0.999 1.000 0.500 1.000 Y NA
 2784097 2784098 PTD2_13474 PTD2_13479     TRUE 0.923 23.000 0.173 0.021   NA
 2784098 2784099 PTD2_13479 PTD2_13484     FALSE 0.385 124.000 0.137 1.000   NA
 2784099 2784100 PTD2_13484 PTD2_13489     TRUE 0.602 135.000 0.299 1.000 N NA
 2784100 2784101 PTD2_13489 PTD2_13494     FALSE 0.208 74.000 0.004 1.000 N NA
 2784103 2784104 PTD2_13504 PTD2_13509     TRUE 0.914 18.000 0.161 1.000 N NA
 2784104 2784105 PTD2_13509 PTD2_13514   purH FALSE 0.225 159.000 0.101 1.000 N NA
 2784105 2784106 PTD2_13514 PTD2_13519 purH   FALSE 0.084 120.000 0.006 NA   NA
 2784106 2784107 PTD2_13519 PTD2_13524     TRUE 0.775 11.000 0.007 NA   NA
 2784107 2784108 PTD2_13524 PTD2_13529     FALSE 0.075 149.000 0.002 1.000 N NA
 2784108 2784109 PTD2_13529 PTD2_13534     FALSE 0.404 50.000 0.015 1.000   NA
 2784113 2784114 PTD2_13554 PTD2_13559     TRUE 0.999 3.000 0.791 1.000 Y NA
 2784114 2784115 PTD2_13559 PTD2_13564     TRUE 0.961 4.000 0.041 1.000 N NA
 2784117 2784118 PTD2_13574 PTD2_13579     FALSE 0.056 167.000 0.000 1.000 N NA
 2784119 2784120 PTD2_13584 PTD2_13589     TRUE 0.992 3.000 0.206 1.000 N NA
 2784120 2784121 PTD2_13589 PTD2_13594     TRUE 0.634 25.000 0.018 1.000 N NA
 2784121 2784122 PTD2_13594 PTD2_13599     TRUE 0.945 4.000 0.019 1.000 N NA
 2784123 2784124 PTD2_13604 PTD2_13609     TRUE 0.983 6.000 0.170 1.000 N NA
 2784124 2784125 PTD2_13609 PTD2_13614     TRUE 0.695 39.000 0.036 0.045 N NA
 2784125 2784126 PTD2_13614 PTD2_13619     FALSE 0.229 121.000 0.060 1.000   NA
 2784127 2784128 PTD2_13624 PTD2_13629     FALSE 0.017 317.000 0.051 NA N NA
 2784128 2784129 PTD2_13629 PTD2_13634     TRUE 0.993 -3.000 0.121 NA Y NA
 2784129 2784130 PTD2_13634 PTD2_13639     TRUE 0.773 51.000 0.117 0.098 N NA
 2784132 2784133 PTD2_13649 PTD2_13654     TRUE 0.658 -16.000 0.032 1.000   NA
 2784133 2784134 PTD2_13654 PTD2_13659     TRUE 0.918 1.000 0.000 NA   NA
 2784135 2784136 PTD2_13664 PTD2_13669     FALSE 0.224 63.000 0.000 NA   NA
 2784136 2784137 PTD2_13669 PTD2_13674     FALSE 0.027 404.000 0.000 0.084 Y NA
 2784137 2784138 PTD2_13674 PTD2_13679     TRUE 0.523 111.000 0.200 1.000 N NA
 2784139 2784140 PTD2_13684 PTD2_13689     TRUE 0.997 -3.000 0.248 NA Y NA
 2784142 2784143 PTD2_13699 PTD2_13704     TRUE 0.995 -3.000 0.405 1.000   NA
 2784143 2784144 PTD2_13704 PTD2_13709   tdh FALSE 0.487 75.000 0.089 1.000 N NA
 2784144 2784145 PTD2_13709 PTD2_13714 tdh   TRUE 0.840 88.000 0.547 1.000 N NA
 2784145 2784146 PTD2_13714 PTD2_13719     FALSE 0.122 133.000 0.011 1.000 N NA
 2784146 2784147 PTD2_13719 PTD2_13724     TRUE 0.938 -3.000 0.018 1.000 N NA
 2784149 2784150 PTD2_13734 PTD2_13739     TRUE 0.982 0.000 0.046 0.018 N NA
 2784150 2784151 PTD2_13739 PTD2_13744     FALSE 0.241 60.000 0.000 NA   NA
 2784152 2784153 PTD2_13749 PTD2_13754     TRUE 0.915 4.000 0.012 NA   NA
 2784157 2784158 PTD2_13774 PTD2_13779     TRUE 0.915 -3.000 0.015 NA   NA
 2784158 2784159 PTD2_13779 PTD2_13784     FALSE 0.008 288.000 0.000 NA   NA
 2784159 2784160 PTD2_13784 PTD2_13789     FALSE 0.025 201.000 0.000 NA   NA
 2784161 2784162 PTD2_13794 PTD2_13799     TRUE 0.994 14.000 1.000 NA   NA
 2784162 2784163 PTD2_13799 PTD2_13804     FALSE 0.008 283.000 0.000 NA   NA
 2784163 2784164 PTD2_13804 PTD2_13809     TRUE 0.908 70.000 0.278 1.000 Y NA
 2784164 2784165 PTD2_13809 PTD2_13814     TRUE 0.974 10.000 0.025 1.000 Y NA
 2784165 2784166 PTD2_13814 PTD2_13819     TRUE 0.992 9.000 0.171 1.000 Y NA
 2784166 2784167 PTD2_13819 PTD2_13824     TRUE 0.987 -7.000 0.097 0.002 Y NA
 2784169 2784170 PTD2_13834 PTD2_13839     FALSE 0.005 336.000 0.000 NA   NA
 2784170 2784171 PTD2_13839 PTD2_13844     FALSE 0.481 132.000 0.203 1.000   NA
 2784171 2784172 PTD2_13844 PTD2_13849     TRUE 0.991 11.000 0.492 1.000   NA
 2784172 2784173 PTD2_13849 PTD2_13854     TRUE 0.984 10.000 0.259 1.000   NA
 2784173 2784174 PTD2_13854 PTD2_13859     FALSE 0.384 158.000 0.207 1.000 N NA
 2784174 2784175 PTD2_13859 PTD2_13864     TRUE 0.987 7.000 0.233 1.000   NA
 2784175 2784176 PTD2_13864 PTD2_13869     TRUE 0.984 -3.000 0.153 1.000   NA
 2784176 2784177 PTD2_13869 PTD2_13874     FALSE 0.247 115.000 0.067 1.000   NA
 2784177 2784178 PTD2_13874 PTD2_13879     FALSE 0.198 186.000 0.156 1.000   NA
 2784179 2784180 PTD2_13884 PTD2_13889     TRUE 0.921 3.000 0.000 1.000   NA
 2784181 2784182 PTD2_13894 PTD2_13899     FALSE 0.054 155.000 0.000 NA   NA
 2784182 2784183 PTD2_13899 PTD2_13904     TRUE 0.714 24.000 0.050 NA   NA
 2784183 2784184 PTD2_13904 PTD2_13909     FALSE 0.100 114.000 0.000 NA N NA
 2784184 2784185 PTD2_13909 PTD2_13914     FALSE 0.225 170.000 0.000 1.000 Y NA
 2784185 2784186 PTD2_13914 PTD2_13919     TRUE 0.999 2.000 0.794 1.000 N NA
 2784186 2784187 PTD2_13919 PTD2_13924   hscB TRUE 0.992 22.000 0.634 1.000 Y NA
 2784187 2784188 PTD2_13924 PTD2_13929 hscB   TRUE 0.816 88.000 0.500 1.000   NA
 2784188 2784189 PTD2_13929 PTD2_13934     TRUE 0.992 10.000 0.359 0.001   NA
 2784189 2784190 PTD2_13934 PTD2_13939     TRUE 0.883 67.000 0.448 1.000 N NA
 2784190 2784191 PTD2_13939 PTD2_13944     TRUE 0.963 24.000 0.424 1.000 N NA
 2784191 2784192 PTD2_13944 PTD2_13949     FALSE 0.412 167.000 0.271 1.000 N NA
 2784192 2784193 PTD2_13949 PTD2_13954     TRUE 0.866 40.000 0.208 1.000 N NA
 2784195 2784196 PTD2_13964 PTD2_13969     FALSE 0.328 51.000 0.000 1.000   NA
 2784196 2784197 PTD2_13969 PTD2_13974     FALSE 0.016 242.000 0.000 1.000   NA
 2784197 2784198 PTD2_13974 PTD2_13979     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.034 Y NA
 2784198 2784199 PTD2_13979 PTD2_13984     FALSE 0.196 72.000 0.000 1.000   NA
 2784199 2784200 PTD2_13984 PTD2_13989     FALSE 0.164 80.000 0.000 1.000   NA
 2784200 2784201 PTD2_13989 PTD2_13994     FALSE 0.007 300.000 0.000 NA   NA
 2784201 2784202 PTD2_13994 PTD2_13999     FALSE 0.079 130.000 0.000 NA   NA
 2784202 2784203 PTD2_13999 PTD2_14004     TRUE 0.990 7.000 0.045 0.001 Y NA
 2784203 2784204 PTD2_14004 PTD2_14009     TRUE 0.726 55.000 0.009 NA Y NA
 2784204 2784205 PTD2_14009 PTD2_14014     TRUE 0.912 40.000 0.325 NA N NA
 2784205 2784206 PTD2_14014 PTD2_14019     TRUE 0.612 222.000 0.360 0.001 Y NA
 2784207 2784208 PTD2_14024 PTD2_14029     FALSE 0.061 148.000 0.000 NA   NA
 2784209 2784210 PTD2_14034 PTD2_14039     TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 2784210 2784211 PTD2_14039 PTD2_14044     TRUE 0.989 2.000 0.167 NA   NA
 2784213 2784214 PTD2_14054 PTD2_14059     FALSE 0.136 144.000 0.024 1.000 N NA
 2784214 2784215 PTD2_14059 PTD2_14064     TRUE 0.992 39.000 0.937 1.000 Y NA
 2784215 2784216 PTD2_14064 PTD2_14069     FALSE 0.249 167.000 0.014 NA Y NA
 2784216 2784217 PTD2_14069 PTD2_14074     TRUE 0.836 108.000 0.330 NA Y NA
 2784217 2784218 PTD2_14074 PTD2_14079     TRUE 0.988 33.000 0.511 0.001 Y NA
 2784218 2784219 PTD2_14079 PTD2_14084     TRUE 0.924 54.000 0.489 1.000   NA
 2784223 2784224 PTD2_14104 PTD2_14109     TRUE 0.941 -3.000 0.028 1.000   NA
 2784224 2784225 PTD2_14109 PTD2_14114     TRUE 0.999 0.000 0.688 0.098 N NA
 2784225 2784226 PTD2_14114 PTD2_14119     TRUE 0.970 0.000 0.039 1.000 N NA
 2784226 2784227 PTD2_14119 PTD2_14124     TRUE 0.887 39.000 0.235 1.000 N NA
 2784227 2784228 PTD2_14124 PTD2_14129     FALSE 0.151 83.000 0.000 1.000   NA
 2784231 2784232 PTD2_14144 PTD2_14149     FALSE 0.072 140.000 0.000 NA   NA
 2784232 2784233 PTD2_14149 PTD2_14154     TRUE 0.999 3.000 0.846 NA   NA
 2784234 2784235 PTD2_14159 PTD2_14164     FALSE 0.403 -22.000 0.000 NA   NA
 2784237 2784238 PTD2_14174 PTD2_14179     FALSE 0.172 78.000 0.000 1.000   NA
 2784238 2784239 PTD2_14179 PTD2_14184     TRUE 0.978 -37.000 0.875 NA N NA
 2784239 2784240 PTD2_14184 PTD2_14189     FALSE 0.026 212.000 0.000 NA N NA
 2784240 2784241 PTD2_14189 PTD2_14194     FALSE 0.156 82.000 0.000 1.000   NA
 2784242 2784243 PTD2_14199 PTD2_14204     FALSE 0.284 52.000 0.000 NA   NA
 2784243 2784244 PTD2_14204 PTD2_14209     TRUE 0.523 24.000 0.000 1.000   NA
 2784248 2784249 PTD2_14229 PTD2_14234     FALSE 0.107 131.000 0.000 1.000 N NA
 2784250 2784251 PTD2_14239 PTD2_14244     TRUE 0.629 117.000 0.333 NA   NA
 2784251 2784252 PTD2_14244 PTD2_14249     TRUE 0.996 10.000 0.750 NA   NA
 2784252 2784253 PTD2_14249 PTD2_14254     TRUE 0.775 103.000 0.500 NA   NA
 2784253 2784254 PTD2_14254 PTD2_14259     TRUE 0.747 28.000 0.079 NA   NA
 2784255 2784256 PTD2_14264 PTD2_14269     TRUE 0.998 -3.000 0.680 NA N NA
 2784256 2784257 PTD2_14269 PTD2_14274     FALSE 0.345 98.000 0.088 NA N NA
 2784258 2784259 PTD2_14279 PTD2_14284     FALSE 0.003 384.000 0.000 NA   NA
 2784260 2784261 PTD2_14289 PTD2_14294     TRUE 0.876 -7.000 0.038 NA   NA
 2784263 2784264 PTD2_14304 PTD2_14309     FALSE 0.097 116.000 0.000 1.000   NA
 2784265 2784266 PTD2_14314 PTD2_14319     TRUE 0.998 4.000 0.676 NA   NA
 2784267 2784268 PTD2_14324 PTD2_14329     FALSE 0.115 89.000 0.000 NA   NA
 2784269 2784270 PTD2_14334 PTD2_14339     FALSE 0.009 277.000 0.000 NA   NA
 2784274 2784275 PTD2_r14373 PTD2_r14377     FALSE 0.080 128.000 0.000 NA   NA
 2784275 2784276 PTD2_r14377 PTD2_r14375     FALSE 0.010 270.000 0.000 NA   NA
 2784277 2784278 PTD2_r09339 PTD2_r09337     FALSE 0.080 128.000 0.000 NA   NA
 2784280 2784281 PTD2_06259 PTD2_06264     FALSE 0.218 64.000 0.000 NA   NA
 2784281 2784282 PTD2_06264 PTD2_06269     TRUE 0.931 14.000 0.143 1.000 N NA
 2784282 2784283 PTD2_06269 PTD2_06274     FALSE 0.070 157.000 0.000 1.000 N NA
 2784283 2784284 PTD2_06274 PTD2_06279     TRUE 0.968 10.000 0.000 1.000 Y NA
 2784284 2784285 PTD2_06279 PTD2_06284     FALSE 0.187 124.000 0.048 NA   NA
 2784285 2784286 PTD2_06284 PTD2_06289     FALSE 0.012 253.000 0.000 NA   NA
 2784287 2784288 PTD2_06294 PTD2_06299     FALSE 0.106 94.000 0.000 NA   NA
 2784288 2784289 PTD2_06299 PTD2_06304     FALSE 0.082 117.000 0.000 NA   NA
 2784290 2784291 PTD2_06309 PTD2_06314     TRUE 0.602 15.000 0.000 NA   NA
 2784291 2784292 PTD2_06314 PTD2_06319     TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA   NA
 2784293 2784294 PTD2_06324 PTD2_06329     TRUE 0.958 0.000 0.019 1.000 N NA
 2784295 2784296 PTD2_06334 PTD2_06339     FALSE 0.335 43.000 0.000 NA   NA
 2784296 2784297 PTD2_06339 PTD2_06344     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 2784300 2784301 PTD2_06359 PTD2_06364     FALSE 0.014 239.000 0.000 NA   NA
 2784302 2784303 PTD2_06369 PTD2_06374     FALSE 0.014 692.000 0.000 0.018 Y NA
 2784303 2784304 PTD2_06374 PTD2_06379     FALSE 0.014 688.000 0.000 0.018 Y NA
 2784304 2784305 PTD2_06379 PTD2_06384     FALSE 0.082 122.000 0.000 NA   NA
 2784306 2784307 PTD2_06389 PTD2_06394     FALSE 0.106 94.000 0.000 NA   NA
 2784307 2784308 PTD2_06394 PTD2_06399     TRUE 0.825 35.000 0.010 NA Y NA
 2784308 2784309 PTD2_06399 PTD2_06404     TRUE 0.991 26.000 0.587 0.083 Y NA
 2784309 2784310 PTD2_06404 PTD2_06409     FALSE 0.459 127.000 0.188 NA   NA
 2784310 2784311 PTD2_06409 PTD2_06414   glnA FALSE 0.175 132.000 0.044 NA   NA
 2784311 2784312 PTD2_06414 PTD2_06419 glnA   FALSE 0.142 80.000 0.000 NA   NA
 2784315 2784316 PTD2_06434 PTD2_06439     TRUE 0.852 9.000 0.006 1.000   NA
 2784316 2784317 PTD2_06439 PTD2_06444     TRUE 0.955 4.000 0.010 0.037   NA
 2784320 2784321 PTD2_06459 PTD2_06464     FALSE 0.012 265.000 0.000 1.000   NA
 2784321 2784322 PTD2_06464 PTD2_06469     TRUE 0.980 5.000 0.133 1.000   NA
 2784322 2784323 PTD2_06469 PTD2_06474     TRUE 0.990 0.000 0.014 1.000 Y NA
 2784323 2784324 PTD2_06474 PTD2_06479   dapA TRUE 0.957 12.000 0.012 1.000 Y NA
 2784327 2784328 PTD2_06494 PTD2_06499     TRUE 0.999 -3.000 0.943 0.001   NA
 2784328 2784329 PTD2_06499 PTD2_06504     TRUE 0.804 54.000 0.205 1.000   NA
 2784329 2784330 PTD2_06504 PTD2_06509     TRUE 0.754 71.000 0.075 1.000 Y NA
 2784330 2784331 PTD2_06509 PTD2_06514     TRUE 0.995 2.000 0.106 1.000 Y NA
 2784331 2784332 PTD2_06514 PTD2_06519     FALSE 0.100 138.000 0.009 NA N NA
 2784332 2784333 PTD2_06519 PTD2_06524     FALSE 0.168 112.000 0.034 NA   NA
 2784333 2784334 PTD2_06524 PTD2_06529     TRUE 0.755 13.000 0.016 NA   NA
 2784337 2784338 PTD2_06544 PTD2_06549     FALSE 0.212 138.000 0.053 1.000 N NA
 2784339 2784340 PTD2_06554 PTD2_06559     TRUE 0.990 -16.000 0.909 0.008   NA
 2784347 2784348 PTD2_06594 PTD2_06599     TRUE 0.679 13.000 0.000 NA   NA
 2784348 2784349 PTD2_06599 PTD2_06604     FALSE 0.467 25.000 0.000 NA   NA
 2784350 2784351 PTD2_06609 PTD2_06614     TRUE 0.676 19.000 0.015 1.000 N NA
 2784351 2784352 PTD2_06614 PTD2_06619     FALSE 0.189 113.000 0.000 0.006   NA
 2784352 2784353 PTD2_06619 PTD2_06624     FALSE 0.096 104.000 0.000 NA   NA
 2784355 2784356 PTD2_06634 PTD2_06639     TRUE 0.629 -10.000 0.000 NA   NA
 2784356 2784357 PTD2_06639 PTD2_06644     TRUE 0.962 -3.000 0.066 NA   NA
 2784357 2784358 PTD2_06644 PTD2_06649     TRUE 0.643 -22.000 0.049 NA   NA
 2784358 2784359 PTD2_06649 PTD2_06654     TRUE 0.695 -16.000 0.051 NA   NA
 2784361 2784362 PTD2_06664 PTD2_06669     TRUE 0.945 -3.000 0.031 1.000   NA
 2784362 2784363 PTD2_06669 PTD2_06674     TRUE 0.964 0.000 0.033 1.000   NA
 2784363 2784364 PTD2_06674 PTD2_06679     TRUE 0.998 -7.000 0.740 1.000 Y NA
 2784364 2784365 PTD2_06679 PTD2_06684     TRUE 0.989 1.000 0.169 NA   NA
 2784365 2784366 PTD2_06684 PTD2_06689     TRUE 0.785 156.000 0.789 NA   NA
 2784366 2784367 PTD2_06689 PTD2_06694     TRUE 0.766 49.000 0.158 NA   NA
 2784367 2784368 PTD2_06694 PTD2_06699     TRUE 0.983 4.000 0.000 NA Y NA
 2784368 2784369 PTD2_06699 PTD2_06704     TRUE 0.885 -13.000 0.000 NA Y NA
 2784369 2784370 PTD2_06704 PTD2_06709     TRUE 0.999 0.000 0.871 NA   NA
 2784370 2784371 PTD2_06709 PTD2_06714     TRUE 0.997 4.000 0.548 NA   NA
 2784371 2784372 PTD2_06714 PTD2_06719     TRUE 0.931 -22.000 0.343 NA   NA
 2784372 2784373 PTD2_06719 PTD2_06724     TRUE 0.586 57.000 0.086 NA   NA
 2784373 2784374 PTD2_06724 PTD2_06729     FALSE 0.046 160.000 0.005 NA   NA
 2784374 2784375 PTD2_06729 PTD2_06734     TRUE 0.999 0.000 0.689 1.000 N NA
 2784375 2784376 PTD2_06734 PTD2_06739     TRUE 0.998 -7.000 0.550 0.002 Y NA
 2784376 2784377 PTD2_06739 PTD2_06744     TRUE 0.992 0.000 0.206 NA N NA
 2784377 2784378 PTD2_06744 PTD2_06749     TRUE 0.973 16.000 0.417 NA N NA
 2784378 2784379 PTD2_06749 PTD2_06754     TRUE 0.995 0.000 0.296 NA   NA
 2784379 2784380 PTD2_06754 PTD2_06759     TRUE 0.994 -3.000 0.358 NA   NA
 2784380 2784381 PTD2_06759 PTD2_06764     TRUE 0.960 -10.000 0.259 NA   NA
 2784381 2784382 PTD2_06764 PTD2_06769     TRUE 0.524 -13.000 0.000 NA   NA
 2784382 2784383 PTD2_06769 PTD2_06774     TRUE 0.524 -13.000 0.000 NA   NA
 2784384 2784385 PTD2_06779 PTD2_06784     TRUE 0.960 68.000 0.551 1.000 Y NA
 2784386 2784387 PTD2_06789 PTD2_06794     FALSE 0.063 147.000 0.000 NA   NA
 2784388 2784389 PTD2_06799 PTD2_06804     FALSE 0.193 68.000 0.000 NA   NA
 2784391 2784392 PTD2_06814 PTD2_06819     FALSE 0.412 31.000 0.000 NA   NA
 2784392 2784393 PTD2_06819 PTD2_06824     FALSE 0.142 80.000 0.000 NA   NA
 2784393 2784394 PTD2_06824 PTD2_06829     TRUE 0.976 5.000 0.119 NA   NA
 2784394 2784395 PTD2_06829 PTD2_t09335     FALSE 0.003 397.000 0.000 NA   NA
 2784396 2784397 PTD2_06834 PTD2_06839     FALSE 0.453 53.000 0.034 NA   NA
 2784399 2784400 PTD2_06849 PTD2_06854     FALSE 0.084 170.000 0.039 NA   NA
 2784400 2784401 PTD2_06854 PTD2_06859     FALSE 0.424 177.000 0.333 1.000 N NA
 2784401 2784402 PTD2_06859 PTD2_06864     TRUE 0.985 25.000 0.800 1.000 N NA
 2784403 2784404 PTD2_06869 PTD2_06874     TRUE 0.767 15.000 0.007 0.058   NA
 2784404 2784405 PTD2_06874 PTD2_06879     TRUE 0.561 62.000 0.073 1.000 N NA
 2784405 2784406 PTD2_06879 PTD2_06884     FALSE 0.374 62.000 0.018 1.000 N NA
 2784406 2784407 PTD2_06884 PTD2_06889     FALSE 0.281 70.000 0.018 1.000   NA
 2784407 2784408 PTD2_06889 PTD2_06894     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 2784408 2784409 PTD2_06894 PTD2_06899     FALSE 0.126 84.000 0.000 NA   NA
 2784409 2784410 PTD2_06899 PTD2_06904     TRUE 0.943 0.000 0.017 NA   NA
 2784412 2784413 PTD2_06914 PTD2_06919     FALSE 0.006 312.000 0.000 NA   NA
 2784413 2784414 PTD2_06919 PTD2_06924     FALSE 0.105 108.000 0.004 1.000   NA
 2784416 2784417 PTD2_06934 PTD2_06939     TRUE 0.952 54.000 0.689 NA   NA
 2784417 2784418 PTD2_06939 PTD2_06944     FALSE 0.431 40.000 0.000 1.000 N NA
 2784418 2784419 PTD2_06944 PTD2_06949     FALSE 0.099 101.000 0.000 NA   NA
 2784420 2784421 PTD2_06954 PTD2_06959     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2784421 2784422 PTD2_06959 PTD2_06964     FALSE 0.001 737.000 0.000 NA   NA
 2784422 2784423 PTD2_06964 PTD2_06969     TRUE 0.674 14.000 0.000 NA N NA
 2784423 2784424 PTD2_06969 PTD2_06974     FALSE 0.420 42.000 0.000 1.000 N NA
 2784424 2784425 PTD2_06974 PTD2_06979     FALSE 0.508 29.000 0.000 1.000 N NA
 2784425 2784426 PTD2_06979 PTD2_06984     TRUE 0.715 13.000 0.000 1.000   NA
 2784426 2784427 PTD2_06984 PTD2_06989     TRUE 0.527 54.000 0.022 0.058   NA
 2784427 2784428 PTD2_06989 PTD2_06994     FALSE 0.353 -31.000 0.000 NA   NA
 2784428 2784429 PTD2_06994 PTD2_06999     FALSE 0.499 22.000 0.000 NA   NA
 2784429 2784430 PTD2_06999 PTD2_07004     TRUE 0.793 12.000 0.000 1.000 N NA
 2784430 2784431 PTD2_07004 PTD2_07009     FALSE 0.227 67.000 0.000 1.000   NA
 2784431 2784432 PTD2_07009 PTD2_07014     TRUE 0.953 5.000 0.000 0.001   NA
 2784432 2784433 PTD2_07014 PTD2_07019     TRUE 0.837 -6.000 0.000 1.000   NA
 2784433 2784434 PTD2_07019 PTD2_07024     FALSE 0.178 76.000 0.000 1.000   NA
 2784434 2784435 PTD2_07024 PTD2_07029     TRUE 0.976 45.000 0.853 1.000 N NA
 2784435 2784436 PTD2_07029 PTD2_07034     TRUE 0.748 13.000 0.000 1.000 N NA
 2784438 2784439 PTD2_07044 PTD2_07049     FALSE 0.211 65.000 0.000 NA   NA
 2784439 2784440 PTD2_07049 PTD2_07054     FALSE 0.130 104.000 0.000 1.000 N NA
 2784440 2784441 PTD2_07054 PTD2_07059     FALSE 0.008 283.000 0.000 NA   NA
 2784441 2784442 PTD2_07059 PTD2_07064     FALSE 0.076 143.000 0.009 NA   NA
 2784442 2784443 PTD2_07064 PTD2_07069     TRUE 0.759 66.000 0.209 1.000 N NA
 2784443 2784444 PTD2_07069 PTD2_07074     FALSE 0.061 163.000 0.000 1.000 N NA
 2784444 2784445 PTD2_07074 PTD2_07079     FALSE 0.093 117.000 0.004 1.000   NA
 2784446 2784447 PTD2_07084 PTD2_07089     FALSE 0.454 -16.000 0.000 NA   NA
 2784449 2784450 PTD2_07099 PTD2_07104     FALSE 0.061 148.000 0.000 NA   NA
 2784450 2784451 PTD2_07104 PTD2_07109     FALSE 0.108 130.000 0.000 1.000 N NA
 2784452 2784453 PTD2_07114 PTD2_07119     FALSE 0.002 476.000 0.000 NA   NA
 2784455 2784456 PTD2_07129 PTD2_07134     FALSE 0.388 71.000 0.058 NA   NA
 2784456 2784457 PTD2_07134 PTD2_07139     TRUE 0.968 4.000 0.058 1.000 N NA
 2784457 2784458 PTD2_07139 PTD2_07144     FALSE 0.284 52.000 0.000 NA   NA
 2784459 2784460 PTD2_07149 PTD2_07154     TRUE 0.679 13.000 0.000 NA   NA
 2784460 2784461 PTD2_07154 PTD2_07159     FALSE 0.082 120.000 0.000 NA   NA
 2784461 2784462 PTD2_07159 PTD2_07164     FALSE 0.032 180.000 0.000 NA   NA
 2784462 2784463 PTD2_07164 PTD2_07169     TRUE 0.999 0.000 0.723 NA N NA
 2784464 2784465 PTD2_07174 PTD2_07179     FALSE 0.024 214.000 0.000 1.000   NA
 2784466 2784467 PTD2_07184 PTD2_07189     FALSE 0.103 97.000 0.000 NA   NA
 2784467 2784468 PTD2_07189 PTD2_07194     TRUE 0.554 149.000 0.068 0.002 Y NA
 2784468 2784469 PTD2_07194 PTD2_07199     FALSE 0.391 64.000 0.038 NA   NA
 2784470 2784471 PTD2_07204 PTD2_07209     FALSE 0.019 223.000 0.002 1.000   NA
 2784471 2784472 PTD2_07209 PTD2_07214     TRUE 0.998 12.000 0.601 0.012 Y NA
 2784472 2784473 PTD2_07214 PTD2_07219     FALSE 0.002 541.000 0.006 1.000 N NA
 2784473 2784474 PTD2_07219 PTD2_07224     TRUE 0.998 0.000 0.233 0.001 Y NA
 2784474 2784475 PTD2_07224 PTD2_07229     TRUE 0.999 -3.000 0.630 0.001 Y NA
 2784475 2784476 PTD2_07229 PTD2_07234   sspA TRUE 0.791 82.000 0.370 1.000 N NA
 2784476 2784477 PTD2_07234 PTD2_07239 sspA   TRUE 0.623 211.000 0.831 NA   NA
 2784478 2784479 PTD2_07244 PTD2_07249     TRUE 0.953 -7.000 0.125 NA N NA
 2784479 2784480 PTD2_07249 PTD2_07254     TRUE 0.956 -7.000 0.000 NA Y NA
 2784480 2784481 PTD2_07254 PTD2_07259     FALSE 0.058 151.000 0.000 NA   NA
 2784481 2784482 PTD2_07259 PTD2_07264     TRUE 0.998 0.000 0.613 NA   NA
 2784482 2784483 PTD2_07264 PTD2_07269     TRUE 0.967 12.000 0.187 1.000 N NA
 2784483 2784484 PTD2_07269 PTD2_07274     TRUE 0.622 74.000 0.172 NA   NA
 2784486 2784487 PTD2_07284 PTD2_07289     TRUE 0.991 0.000 0.000 0.033 Y NA
 2784489 2784490 PTD2_07299 PTD2_07304     FALSE 0.031 185.000 0.000 NA   NA
 2784490 2784491 PTD2_07304 PTD2_07309     TRUE 0.992 -3.000 0.298 NA   NA
 2784492 2784493 PTD2_07314 PTD2_07319   mraW TRUE 0.954 47.000 0.635 NA   NA
 2784493 2784494 PTD2_07319 PTD2_07324 mraW   TRUE 0.580 108.000 0.227 1.000 N NA
 2784494 2784495 PTD2_07324 PTD2_07329     TRUE 0.987 -3.000 0.173 1.000 N NA
 2784495 2784496 PTD2_07329 PTD2_07334     TRUE 0.963 -10.000 0.083 1.000 Y NA
 2784496 2784497 PTD2_07334 PTD2_07339     TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 2784497 2784498 PTD2_07339 PTD2_07344     TRUE 0.997 -6.000 0.309 0.003 Y NA
 2784498 2784499 PTD2_07344 PTD2_07349     TRUE 0.999 1.000 0.647 0.003 Y NA
 2784499 2784500 PTD2_07349 PTD2_07354     TRUE 0.995 -3.000 0.297 0.003 N NA
 2784500 2784501 PTD2_07354 PTD2_07359     TRUE 0.997 -3.000 0.647 1.000 N NA
 2784501 2784502 PTD2_07359 PTD2_07364     TRUE 0.981 19.000 0.283 1.000 Y NA
 2784502 2784503 PTD2_07364 PTD2_07369     TRUE 0.996 -3.000 0.153 0.003 Y NA
 2784503 2784504 PTD2_07369 PTD2_07374     TRUE 0.998 2.000 0.372 NA Y NA
 2784504 2784505 PTD2_07374 PTD2_07379     TRUE 0.995 -3.000 0.389 NA N NA
 2784505 2784506 PTD2_07379 PTD2_07384     TRUE 0.988 21.000 0.460 1.000 Y NA
 2784506 2784507 PTD2_07384 PTD2_07389     FALSE 0.490 89.000 0.134 1.000 N NA
 2784509 2784510 PTD2_07399 PTD2_07404     TRUE 0.652 46.000 0.068 1.000 N NA
 2784510 2784511 PTD2_07404 PTD2_07409     TRUE 0.689 68.000 0.168 1.000 N NA
 2784511 2784512 PTD2_07409 PTD2_07414     FALSE 0.197 78.000 0.000 1.000 N NA
 2784512 2784513 PTD2_07414 PTD2_07419     FALSE 0.127 107.000 0.000 1.000 N NA
 2784513 2784514 PTD2_07419 PTD2_07424     FALSE 0.004 399.000 0.000 1.000 N NA
 2784514 2784515 PTD2_07424 PTD2_07429     FALSE 0.070 264.000 0.000 NA Y NA
 2784516 2784517 PTD2_07434 PTD2_07439     FALSE 0.095 124.000 0.000 1.000   NA
 2784520 2784521 PTD2_07454 PTD2_07459     FALSE 0.395 49.000 0.008 1.000 N NA
 2784522 2784523 PTD2_07464 PTD2_07469     TRUE 0.984 -3.000 0.159 NA N NA
 2784524 2784525 PTD2_07474 PTD2_07479     TRUE 0.993 -3.000 0.336 NA   NA
 2784525 2784526 PTD2_07479 PTD2_07484     FALSE 0.281 68.000 0.015 NA N NA
 2784527 2784528 PTD2_07489 PTD2_07494     TRUE 0.890 13.000 0.070 1.000   NA
 2784528 2784529 PTD2_07494 PTD2_07499     TRUE 0.997 13.000 0.752 1.000 Y NA
 2784531 2784532 PTD2_07509 PTD2_07514     FALSE 0.009 314.000 0.018 NA   NA
 2784534 2784535 PTD2_07524 PTD2_07529     TRUE 0.938 3.000 0.019 NA   NA
 2784535 2784536 PTD2_07529 PTD2_t09333     FALSE 0.048 160.000 0.000 NA   NA
 2784537 2784538 PTD2_07534 PTD2_07539     FALSE 0.126 84.000 0.000 NA   NA
 2784538 2784539 PTD2_07539 PTD2_07544     TRUE 0.854 34.000 0.027 NA Y NA
 2784539 2784540 PTD2_07544 PTD2_07549     FALSE 0.416 148.000 0.047 NA Y NA
 2784540 2784541 PTD2_07549 PTD2_07554     TRUE 0.841 82.000 0.219 1.000 Y NA
 2784541 2784542 PTD2_07554 PTD2_07559     FALSE 0.506 153.000 0.057 0.004 Y NA
 2784542 2784543 PTD2_07559 PTD2_07564     FALSE 0.259 168.000 0.154 1.000 N NA
 2784543 2784544 PTD2_07564 PTD2_07569     TRUE 0.997 0.000 0.188 1.000 Y NA
 2784544 2784545 PTD2_07569 PTD2_07574     TRUE 0.998 0.000 0.312 1.000 Y NA
 2784545 2784546 PTD2_07574 PTD2_07579     TRUE 0.895 4.000 0.000 NA   NA
 2784546 2784547 PTD2_07579 PTD2_07584     TRUE 0.524 -13.000 0.000 NA   NA
 2784547 2784548 PTD2_07584 PTD2_07589     TRUE 0.997 -7.000 1.000 NA   NA
 2784548 2784549 PTD2_07589 PTD2_07594     TRUE 0.994 -3.000 0.400 NA   NA
 2784549 2784550 PTD2_07594 PTD2_07599     TRUE 0.993 6.000 0.400 NA   NA
 2784550 2784551 PTD2_07599 PTD2_07604     TRUE 0.997 -7.000 1.000 NA   NA
 2784551 2784552 PTD2_07604 PTD2_07609     TRUE 0.918 1.000 0.000 NA   NA
 2784552 2784553 PTD2_07609 PTD2_07614     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2784553 2784554 PTD2_07614 PTD2_07619     FALSE 0.001 784.000 0.000 1.000   NA
 2784555 2784556 PTD2_07624 PTD2_07629     FALSE 0.205 66.000 0.000 NA   NA
 2784556 2784557 PTD2_07629 PTD2_07634     TRUE 0.602 15.000 0.000 NA   NA
 2784557 2784558 PTD2_07634 PTD2_07639     TRUE 0.785 -7.000 0.000 1.000   NA
 2784559 2784560 PTD2_07644 PTD2_07649     TRUE 0.829 9.000 0.000 NA   NA
 2784560 2784561 PTD2_07649 PTD2_07654     FALSE 0.024 206.000 0.000 NA   NA
 2784561 2784562 PTD2_07654 PTD2_07659     FALSE 0.386 -25.000 0.000 NA   NA
 2784562 2784563 PTD2_07659 PTD2_07664     FALSE 0.411 112.000 0.000 1.000 Y NA
 2784563 2784564 PTD2_07664 PTD2_07669     TRUE 0.989 4.000 0.000 0.003 Y NA
 2784564 2784565 PTD2_07669 PTD2_07674     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2784565 2784566 PTD2_07674 PTD2_07679     TRUE 0.914 -3.000 0.015 NA   NA
 2784566 2784567 PTD2_07679 PTD2_07684     TRUE 0.882 -7.000 0.035 1.000   NA
 2784567 2784568 PTD2_07684 PTD2_07689     TRUE 0.976 -3.000 0.106 1.000   NA
 2784568 2784569 PTD2_07689 PTD2_07694     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2784569 2784570 PTD2_07694 PTD2_07699     TRUE 0.928 2.000 0.000 NA N NA
 2784570 2784571 PTD2_07699 PTD2_07704     TRUE 0.915 2.000 0.000 NA   NA
 2784571 2784572 PTD2_07704 PTD2_07709     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2784572 2784573 PTD2_07709 PTD2_07714     TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA   NA
 2784573 2784574 PTD2_07714 PTD2_07719     FALSE 0.358 39.000 0.000 NA   NA
 2784577 2784578 PTD2_07729 PTD2_07734     TRUE 0.969 -13.000 0.455 NA   NA
 2784578 2784579 PTD2_07734 PTD2_07739     TRUE 0.986 -3.000 0.186 NA   NA
 2784579 2784580 PTD2_07739 PTD2_07744     TRUE 0.669 68.000 0.171 NA   NA
 2784583 2784584 PTD2_07759 PTD2_07764     TRUE 0.777 19.000 0.044 1.000 N NA
 2784584 2784585 PTD2_07764 PTD2_07769     TRUE 0.993 6.000 0.342 1.000 N NA
 2784585 2784586 PTD2_07769 PTD2_07774   thiG TRUE 0.992 3.000 0.064 1.000 Y NA
 2784586 2784587 PTD2_07774 PTD2_07779 thiG   TRUE 0.817 54.000 0.012 0.003 Y NA
 2784587 2784588 PTD2_07779 PTD2_07784     TRUE 0.881 24.000 0.010 1.000 Y NA
 2784588 2784589 PTD2_07784 PTD2_07789     FALSE 0.104 110.000 0.000 1.000   NA
 2784590 2784591 PTD2_07794 PTD2_07799     TRUE 0.549 67.000 0.095 1.000   NA
 2784592 2784593 PTD2_07804 PTD2_t09321     FALSE 0.018 225.000 0.000 NA   NA
 2784593 2784594 PTD2_t09321 PTD2_t09323     FALSE 0.080 129.000 0.000 NA   NA
 2784594 2784595 PTD2_t09323 PTD2_t09325     FALSE 0.001 703.000 0.000 NA   NA
 2784595 2784596 PTD2_t09325 PTD2_t09327     FALSE 0.022 211.000 0.000 NA   NA
 2784596 2784597 PTD2_t09327 PTD2_07809     FALSE 0.118 87.000 0.000 NA   NA
 2784597 2784598 PTD2_07809 PTD2_07814     FALSE 0.365 -28.000 0.000 NA   NA
 2784598 2784599 PTD2_07814 PTD2_07819     FALSE 0.447 138.000 0.000 0.032 Y NA
 2784601 2784602 PTD2_07829 PTD2_07834     FALSE 0.007 299.000 0.000 NA   NA
 2784602 2784603 PTD2_07834 PTD2_07839     FALSE 0.108 93.000 0.000 NA   NA
 2784603 2784604 PTD2_07839 PTD2_07844     FALSE 0.112 91.000 0.000 NA   NA
 2784604 2784605 PTD2_07844 PTD2_07849     TRUE 0.878 17.000 0.118 NA   NA
 2784605 2784606 PTD2_07849 PTD2_07854     TRUE 0.973 5.000 0.109 NA   NA
 2784606 2784607 PTD2_07854 PTD2_07859     TRUE 0.970 6.000 0.092 1.000 N NA
 2784607 2784608 PTD2_07859 PTD2_07864     TRUE 0.977 -7.000 0.188 0.094 N NA
 2784608 2784609 PTD2_07864 PTD2_07869     TRUE 0.860 79.000 0.531 1.000   NA
 2784609 2784610 PTD2_07869 PTD2_07874     TRUE 0.901 17.000 0.141 1.000   NA
 2784610 2784611 PTD2_07874 PTD2_07879     TRUE 0.601 82.000 0.184 1.000   NA
 2784611 2784612 PTD2_07879 PTD2_07884     TRUE 0.999 6.000 0.947 0.011 Y NA
 2784612 2784613 PTD2_07884 PTD2_07889     TRUE 0.876 57.000 0.348 NA   NA
 2784613 2784614 PTD2_07889 PTD2_07894     FALSE 0.096 170.000 0.051 NA   NA
 2784614 2784615 PTD2_07894 PTD2_07899     FALSE 0.081 154.000 0.013 1.000   NA
 2784617 2784618 PTD2_07909 PTD2_07914     TRUE 0.950 14.000 0.147 0.020 N NA
 2784618 2784619 PTD2_07914 PTD2_07919   rpsF FALSE 0.161 212.000 0.017 1.000 Y NA
 2784619 2784620 PTD2_07919 PTD2_07924 rpsF   TRUE 0.890 18.000 0.122 1.000 N NA
 2784620 2784621 PTD2_07924 PTD2_07929     TRUE 0.818 -25.000 0.128 1.000 N NA
 2784621 2784622 PTD2_07929 PTD2_07934     TRUE 0.986 36.000 0.499 0.012 Y NA
 2784622 2784623 PTD2_07934 PTD2_07939     FALSE 0.012 267.000 0.000 NA N NA
 2784623 2784624 PTD2_07939 PTD2_07944     TRUE 0.946 -3.000 0.038 NA   NA
 2784624 2784625 PTD2_07944 PTD2_07949     TRUE 0.823 -9.000 0.034 NA   NA
 2784625 2784626 PTD2_07949 PTD2_07954     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2784626 2784627 PTD2_07954 PTD2_07959     TRUE 0.992 11.000 0.571 NA   NA
 2784627 2784628 PTD2_07959 PTD2_07964     FALSE 0.031 185.000 0.000 NA   NA
 2784628 2784629 PTD2_07964 PTD2_07969     FALSE 0.497 -16.000 0.000 1.000   NA
 2784629 2784630 PTD2_07969 PTD2_07974     TRUE 0.770 11.000 0.000 NA   NA
 2784630 2784631 PTD2_07974 PTD2_07979     FALSE 0.150 125.000 0.030 NA   NA
 2784631 2784632 PTD2_07979 PTD2_07984     TRUE 0.995 3.000 0.317 1.000 N NA
 2784633 2784634 PTD2_07989 PTD2_07994     TRUE 0.898 -3.000 0.009 NA   NA
 2784634 2784635 PTD2_07994 PTD2_07999     FALSE 0.429 88.000 0.112 NA N NA
 2784638 2784639 PTD2_08014 PTD2_08019     TRUE 0.915 2.000 0.000 NA   NA
 2784639 2784640 PTD2_08019 PTD2_08024     TRUE 0.679 13.000 0.000 NA   NA
 2784641 2784642 PTD2_08029 PTD2_08034     FALSE 0.397 64.000 0.000 0.017   NA
 2784643 2784644 PTD2_08039 PTD2_08044     TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA   NA
 2784644 2784645 PTD2_08044 PTD2_08049     TRUE 0.629 -10.000 0.000 NA   NA
 2784645 2784646 PTD2_08049 PTD2_08054     FALSE 0.387 35.000 0.000 NA   NA
 2784646 2784647 PTD2_08054 PTD2_08059     FALSE 0.344 41.000 0.000 NA   NA
 2784647 2784648 PTD2_08059 PTD2_08064     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2784648 2784649 PTD2_08064 PTD2_08069     TRUE 0.679 13.000 0.000 NA   NA
 2784649 2784650 PTD2_08069 PTD2_08074     TRUE 0.829 9.000 0.000 NA   NA
 2784650 2784651 PTD2_08074 PTD2_08079     TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 2784653 2784654 PTD2_08089 PTD2_08094     FALSE 0.313 47.000 0.000 NA   NA
 2784655 2784656 PTD2_08099 PTD2_08104     TRUE 0.998 0.000 0.667 NA   NA
 2784656 2784657 PTD2_08104 PTD2_08109     TRUE 0.959 -3.000 0.061 NA   NA
 2784657 2784658 PTD2_08109 PTD2_08114     TRUE 0.998 0.000 0.636 NA   NA
 2784659 2784660 PTD2_08119 PTD2_08124     TRUE 0.926 43.000 0.400 1.000   NA
 2784660 2784661 PTD2_08124 PTD2_08129     FALSE 0.359 83.000 0.069 1.000   NA
 2784661 2784662 PTD2_08129 PTD2_08134     FALSE 0.331 84.000 0.069 NA   NA
 2784662 2784663 PTD2_08134 PTD2_08139     TRUE 0.959 -3.000 0.061 NA   NA
 2784663 2784664 PTD2_08139 PTD2_08144     TRUE 0.996 -7.000 0.848 NA   NA
 2784664 2784665 PTD2_08144 PTD2_08149     TRUE 0.987 23.000 0.848 NA   NA
 2784665 2784666 PTD2_08149 PTD2_08154     TRUE 0.997 11.000 0.939 NA   NA
 2784666 2784667 PTD2_08154 PTD2_08159     TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 2784667 2784668 PTD2_08159 PTD2_08164     TRUE 0.629 -10.000 0.000 NA   NA
 2784668 2784669 PTD2_08164 PTD2_08169     TRUE 0.743 24.000 0.062 NA   NA
 2784669 2784670 PTD2_08169 PTD2_08174     TRUE 0.972 5.000 0.100 NA   NA
 2784670 2784671 PTD2_08174 PTD2_08179     TRUE 0.997 -3.000 0.645 NA   NA
 2784671 2784672 PTD2_08179 PTD2_08184     TRUE 0.998 -3.000 0.738 NA   NA
 2784672 2784673 PTD2_08184 PTD2_08189     TRUE 0.994 -7.000 0.738 NA   NA
 2784673 2784674 PTD2_08189 PTD2_08194     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2784674 2784675 PTD2_08194 PTD2_08199     TRUE 0.602 15.000 0.000 NA   NA
 2784675 2784676 PTD2_08199 PTD2_08204     TRUE 0.876 5.000 0.000 NA   NA
 2784676 2784677 PTD2_08204 PTD2_08209     TRUE 0.732 12.000 0.000 NA   NA
 2784677 2784678 PTD2_08209 PTD2_08214     TRUE 0.895 4.000 0.000 NA   NA
 2784678 2784679 PTD2_08214 PTD2_08219     TRUE 0.908 3.000 0.000 NA   NA
 2784679 2784680 PTD2_08219 PTD2_08224     TRUE 0.958 -3.000 0.059 NA   NA
 2784680 2784681 PTD2_08224 PTD2_08229     TRUE 0.997 -3.000 0.588 NA   NA
 2784681 2784682 PTD2_08229 PTD2_08234     TRUE 0.743 -27.000 0.100 NA   NA
 2784682 2784683 PTD2_08234 PTD2_08239     FALSE 0.001 652.000 0.000 NA   NA
 2784683 2784684 PTD2_08239 PTD2_08244     FALSE 0.007 298.000 0.000 NA   NA
 2784684 2784685 PTD2_08244 PTD2_08249     FALSE 0.081 125.000 0.000 NA   NA
 2784685 2784686 PTD2_08249 PTD2_08254     TRUE 0.963 2.000 0.041 NA   NA
 2784688 2784689 PTD2_08264 PTD2_08269     FALSE 0.012 254.000 0.000 NA   NA
 2784689 2784690 PTD2_08269 PTD2_08274     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2784690 2784691 PTD2_08274 PTD2_08279     FALSE 0.001 671.000 0.000 NA   NA
 2784691 2784692 PTD2_08279 PTD2_08284     TRUE 0.898 26.000 0.042 NA Y NA
 2784692 2784693 PTD2_08284 PTD2_08289     FALSE 0.292 51.000 0.000 NA   NA
 2784693 2784694 PTD2_08289 PTD2_08294     FALSE 0.211 65.000 0.000 NA   NA
 2784694 2784695 PTD2_08294 PTD2_08299     TRUE 0.912 9.000 0.034 NA   NA
 2784695 2784696 PTD2_08299 PTD2_08304     TRUE 0.989 5.000 0.236 NA   NA
 2784697 2784698 PTD2_08309 PTD2_08314     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2784699 2784700 PTD2_08319 PTD2_08324     FALSE 0.035 201.000 0.000 1.000 N NA
 2784701 2784702 PTD2_08329 PTD2_08334   slmA FALSE 0.079 158.000 0.016 1.000   NA
 2784702 2784703 PTD2_08334 PTD2_08339 slmA   FALSE 0.166 105.000 0.016 1.000 N NA
 2784704 2784705 PTD2_08344 PTD2_08349     FALSE 0.089 137.000 0.000 NA N NA
 2784707 2784708 PTD2_08359 PTD2_08364     TRUE 0.993 13.000 0.332 0.012 Y NA
 2784708 2784709 PTD2_08364 PTD2_08369     FALSE 0.061 148.000 0.000 NA   NA
 2784709 2784710 PTD2_08369 PTD2_08374     FALSE 0.093 108.000 0.000 NA   NA
 2784710 2784711 PTD2_08374 PTD2_08379     FALSE 0.494 -22.000 0.016 NA   NA
 2784711 2784712 PTD2_08379 PTD2_08384     TRUE 0.974 0.000 0.068 NA   NA
 2784712 2784713 PTD2_08384 PTD2_08389     TRUE 0.963 -3.000 0.068 NA   NA
 2784713 2784714 PTD2_08389 PTD2_08394     FALSE 0.154 196.000 0.136 NA   NA
 2784714 2784715 PTD2_08394 PTD2_08399     FALSE 0.466 111.000 0.167 1.000 N NA
 2784716 2784717 PTD2_08404 PTD2_08409     FALSE 0.245 71.000 0.013 1.000   NA
 2784717 2784718 PTD2_08409 PTD2_08414     FALSE 0.126 148.000 0.003 0.092 N NA
 2784718 2784719 PTD2_08414 PTD2_08419     TRUE 0.805 36.000 0.122 1.000 N NA
 2784719 2784720 PTD2_08419 PTD2_08424     TRUE 0.998 8.000 0.454 1.000 Y NA
 2784720 2784721 PTD2_08424 PTD2_08429     TRUE 0.899 97.000 0.362 0.017 Y NA
 2784721 2784722 PTD2_08429 PTD2_08434     TRUE 0.757 115.000 0.169 0.017 Y NA
 2784722 2784723 PTD2_08434 PTD2_08439     FALSE 0.002 528.000 0.000 1.000 N NA
 2784724 2784725 PTD2_08444 PTD2_08449     TRUE 0.910 66.000 0.249 1.000 Y NA
 2784725 2784726 PTD2_08449 PTD2_08454   pdhR FALSE 0.006 446.000 0.029 1.000 N NA
 2784726 2784727 PTD2_08454 PTD2_08459 pdhR   FALSE 0.388 70.000 0.038 1.000 N NA
 2784727 2784728 PTD2_08459 PTD2_08464     TRUE 0.960 12.000 0.018 1.000 Y NA
 2784728 2784729 PTD2_08464 PTD2_08469     TRUE 0.737 177.000 0.463 1.000 Y NA
 2784729 2784730 PTD2_08469 PTD2_08474     FALSE 0.088 111.000 0.000 NA   NA
 2784732 2784733 PTD2_08484 PTD2_08489     TRUE 0.999 0.000 0.374 0.043 Y NA
 2784733 2784734 PTD2_08489 PTD2_08494     TRUE 0.986 -7.000 0.303 0.051 N NA
 2784734 2784735 PTD2_08494 PTD2_08499     TRUE 0.872 13.000 0.056 NA N NA
 2784739 2784740 PTD2_08519 PTD2_08524     TRUE 0.995 19.000 0.667 0.012 Y NA
 2784740 2784741 PTD2_08524 PTD2_08529     FALSE 0.083 344.000 0.335 1.000   NA
 2784741 2784742 PTD2_08529 PTD2_08534     FALSE 0.193 74.000 0.007 1.000   NA
 2784742 2784743 PTD2_08534 PTD2_08539     FALSE 0.237 88.000 0.040 NA   NA
 2784745 2784746 PTD2_08549 PTD2_08554     TRUE 0.932 84.000 0.909 1.000 N NA
 2784747 2784748 PTD2_08559 PTD2_08564     FALSE 0.025 202.000 0.000 NA   NA
 2784748 2784749 PTD2_08564 PTD2_08569     FALSE 0.019 220.000 0.000 NA   NA
 2784750 2784751 PTD2_08574 PTD2_08579     TRUE 0.996 12.000 0.916 1.000   NA
 2784751 2784752 PTD2_08579 PTD2_08584     FALSE 0.187 99.000 0.026 1.000   NA
 2784752 2784753 PTD2_08584 PTD2_08589     FALSE 0.504 110.000 0.184 1.000 N NA
 2784753 2784754 PTD2_08589 PTD2_08594     FALSE 0.095 123.000 0.000 1.000   NA
 2784756 2784757 PTD2_08604 PTD2_08609     FALSE 0.156 88.000 0.000 1.000 N NA
 2784757 2784758 PTD2_08609 PTD2_08614     TRUE 0.929 -10.000 0.008 1.000 Y NA
 2784758 2784759 PTD2_08614 PTD2_08619     TRUE 0.975 11.000 0.006 0.001 Y NA
 2784760 2784761 PTD2_08624 PTD2_08629     TRUE 0.750 27.000 0.076 NA   NA
 2784761 2784762 PTD2_08629 PTD2_08634     TRUE 0.992 0.000 0.220 NA   NA
 2784762 2784763 PTD2_08634 PTD2_08639     TRUE 0.968 10.000 0.152 NA   NA
 2784763 2784764 PTD2_08639 PTD2_08644     TRUE 0.904 13.000 0.092 NA   NA
 2784765 2784766 PTD2_08649 PTD2_08654     TRUE 0.999 3.000 0.436 0.013 Y NA
 2784766 2784767 PTD2_08654 PTD2_08659     FALSE 0.042 165.000 0.000 NA   NA
 2784768 2784769 PTD2_08664 PTD2_08669     TRUE 0.913 32.000 0.263 NA N NA
 2784769 2784770 PTD2_08669 PTD2_08674     TRUE 0.825 28.000 0.120 NA N NA
 2784770 2784771 PTD2_08674 PTD2_08679     TRUE 0.553 84.000 0.173 NA   NA
 2784772 2784773 PTD2_08684 PTD2_08689     TRUE 0.995 -7.000 0.344 0.092 Y NA
 2784775 2784776 PTD2_08699 PTD2_08704     FALSE 0.148 84.000 0.000 NA N NA
 2784779 2784780 PTD2_08719 PTD2_08724     TRUE 0.663 169.000 0.667 NA   NA
 2784780 2784781 PTD2_08724 PTD2_08729   tolC TRUE 0.919 99.000 0.556 1.000 Y NA
 2784782 2784783 PTD2_08734 PTD2_08739     TRUE 0.978 -10.000 0.443 NA   NA
 2784783 2784784 PTD2_08739 PTD2_08744     TRUE 0.967 -13.000 0.433 NA   NA
 2784784 2784785 PTD2_08744 PTD2_08749     TRUE 0.949 -18.000 0.427 NA   NA
 2784785 2784786 PTD2_08749 PTD2_08754     TRUE 0.553 101.000 0.217 NA   NA
 2784786 2784787 PTD2_08754 PTD2_08759     FALSE 0.445 38.000 0.000 1.000 N NA
 2784787 2784788 PTD2_08759 PTD2_08764     FALSE 0.258 67.000 0.000 1.000 N NA
 2784788 2784789 PTD2_08764 PTD2_08769     FALSE 0.195 138.000 0.043 1.000 N NA
 2784789 2784790 PTD2_08769 PTD2_08774     TRUE 0.985 0.000 0.121 NA   NA
 2784790 2784791 PTD2_08774 PTD2_08779     FALSE 0.035 174.000 0.000 NA   NA
 2784794 2784795 PTD2_08794 PTD2_08799     TRUE 0.815 25.000 0.089 1.000 N NA
 2784795 2784796 PTD2_08799 PTD2_08804     TRUE 0.953 37.000 0.494 1.000 N NA
 2784797 2784798 PTD2_08809 PTD2_08814     TRUE 0.998 -3.000 0.631 0.049   NA
 2784801 2784802 PTD2_08824 PTD2_08829     FALSE 0.006 335.000 0.000 1.000   NA
 2784802 2784803 PTD2_08829 PTD2_08834     TRUE 0.933 3.000 0.000 1.000 N NA
 2784804 2784805 PTD2_08839 PTD2_08844     FALSE 0.092 132.000 0.000 1.000   NA
 2784805 2784806 PTD2_08844 PTD2_08849     TRUE 0.894 5.000 0.000 1.000   NA
 2784808 2784809 PTD2_08859 PTD2_08864     FALSE 0.467 61.000 0.000 0.001   NA
 2784809 2784810 PTD2_08864 PTD2_08869     FALSE 0.491 23.000 0.000 NA   NA
 2784810 2784811 PTD2_08869 PTD2_08874     TRUE 0.996 -6.000 0.723 NA   NA
 2784811 2784812 PTD2_08874 PTD2_08879     TRUE 0.997 -3.000 0.596 NA   NA
 2784813 2784814 PTD2_08884 PTD2_08889     FALSE 0.008 293.000 0.000 1.000   NA
 2784815 2784816 PTD2_08894 PTD2_08899     FALSE 0.010 265.000 0.000 NA   NA
 2784816 2784817 PTD2_08899 PTD2_08904     FALSE 0.328 44.000 0.000 NA   NA
 2784819 2784820 PTD2_08914 PTD2_08919     FALSE 0.110 92.000 0.000 NA   NA
 2784821 2784822 PTD2_08924 PTD2_08929     FALSE 0.067 159.000 0.000 1.000 N NA
 2784824 2784825 PTD2_08939 PTD2_08944     FALSE 0.208 127.000 0.050 1.000   NA
 2784825 2784826 PTD2_08944 PTD2_08949     TRUE 0.994 0.000 0.267 NA   NA
 2784826 2784827 PTD2_08949 PTD2_08954   ksgA TRUE 0.774 -16.000 0.078 NA N NA
 2784827 2784828 PTD2_08954 PTD2_08959 ksgA   TRUE 0.992 0.000 0.197 1.000 N NA
 2784828 2784829 PTD2_08959 PTD2_08964     TRUE 0.998 3.000 0.561 1.000 N NA
 2784829 2784830 PTD2_08964 PTD2_08969     TRUE 0.924 18.000 0.182 1.000 N NA
 2784831 2784832 PTD2_08974 PTD2_08979     TRUE 0.997 -3.000 0.642 NA   NA
 2784832 2784833 PTD2_08979 PTD2_08984   djlA TRUE 0.897 -10.000 0.091 1.000 N NA
 2784834 2784835 PTD2_08989 PTD2_08994     FALSE 0.404 124.000 0.160 NA   NA
 2784835 2784836 PTD2_08994 PTD2_08999     FALSE 0.507 67.000 0.070 1.000 N NA
 2784837 2784838 PTD2_09004 PTD2_09009     FALSE 0.322 149.000 0.000 1.000 Y NA
 2784839 2784840 PTD2_09014 PTD2_09019     TRUE 0.679 13.000 0.000 NA   NA
 2784840 2784841 PTD2_09019 PTD2_09024     FALSE 0.241 65.000 0.000 1.000   NA
 2784841 2784842 PTD2_09024 PTD2_09029     FALSE 0.097 103.000 0.000 NA   NA
 2784845 2784846 PTD2_09044 PTD2_09049 zntR   TRUE 0.896 -16.000 0.189 1.000   NA
 2784846 2784847 PTD2_09049 PTD2_09054     FALSE 0.049 166.000 0.000 1.000   NA
 2784847 2784848 PTD2_09054 PTD2_09059     FALSE 0.137 87.000 0.000 1.000   NA
 2784850 2784851 PTD2_09069 PTD2_09074     FALSE 0.484 83.000 0.121 NA N NA
 2784851 2784852 PTD2_09074 PTD2_09079     TRUE 0.978 10.000 0.000 0.007 Y NA
 2784852 2784853 PTD2_09079 PTD2_09084     TRUE 0.981 24.000 0.713 NA   NA
 2784853 2784854 PTD2_09084 PTD2_09089     TRUE 0.987 -10.000 0.620 NA   NA
 2784854 2784855 PTD2_09089 PTD2_09094     FALSE 0.081 127.000 0.000 NA   NA
 2784855 2784856 PTD2_09094 PTD2_09099     FALSE 0.115 137.000 0.020 NA   NA
 2784856 2784857 PTD2_09099 PTD2_09104     TRUE 0.732 12.000 0.000 NA   NA
 2784859 2784860 PTD2_09114 PTD2_09119     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2784860 2784861 PTD2_09119 PTD2_09124     FALSE 0.160 81.000 0.000 1.000   NA
 2784862 2784863 PTD2_09129 PTD2_09134     FALSE 0.487 44.000 0.024 1.000   NA
 2784864 2784865 PTD2_09139 PTD2_09144     FALSE 0.499 22.000 0.000 NA   NA
 2784865 2784866 PTD2_09144 PTD2_09149     FALSE 0.230 62.000 0.000 NA   NA
 2784867 2784868 PTD2_09154 PTD2_09159     FALSE 0.004 360.000 0.000 NA   NA
 2784868 2784869 PTD2_09159 PTD2_09164     FALSE 0.284 52.000 0.000 NA   NA
 2784870 2784871 PTD2_09169 PTD2_09174     FALSE 0.131 83.000 0.000 NA   NA
 2784871 2784872 PTD2_09174 PTD2_09179     TRUE 0.915 2.000 0.000 NA   NA
 2784872 2784873 PTD2_09179 PTD2_09184     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 2784874 2784875 PTD2_09189 PTD2_09194     FALSE 0.150 92.000 0.016 NA   NA
 2784875 2784876 PTD2_09194 PTD2_09199     TRUE 0.922 24.000 0.218 1.000 N NA
 2784876 2784877 PTD2_09199 PTD2_09204     FALSE 0.045 162.000 0.000 NA   NA
 2784877 2784878 PTD2_09204 PTD2_09209     FALSE 0.040 219.000 0.033 NA   NA
 2784879 2784880 PTD2_09214 PTD2_09219     FALSE 0.017 253.000 0.000 1.000 N NA
 2784880 2784881 PTD2_09219 PTD2_09224     FALSE 0.090 167.000 0.032 NA N NA
 2784881 2784882 PTD2_09224 PTD2_09229     TRUE 0.991 5.000 0.277 NA N NA
 2784882 2784883 PTD2_09229 PTD2_09234     TRUE 0.998 4.000 0.456 1.000 Y NA
 2784883 2784884 PTD2_09234 PTD2_09239     TRUE 0.611 71.000 0.004 1.000 Y NA
 2784884 2784885 PTD2_09239 PTD2_09244     TRUE 0.513 111.000 0.004 0.002 Y NA
 2784885 2784886 PTD2_09244 PTD2_09249     TRUE 0.989 10.000 0.347 1.000 N NA
 2784886 2784887 PTD2_09249 PTD2_09254     TRUE 0.875 41.000 0.225 1.000 N NA
 2784887 2784888 PTD2_09254 PTD2_09259     TRUE 0.989 -3.000 0.206 1.000 N NA
 2784888 2784889 PTD2_09259 PTD2_09264     TRUE 0.748 13.000 0.000 1.000 N NA
 2784890 2784891 PTD2_09269 PTD2_09274     TRUE 0.789 111.000 0.246 1.000 Y NA
 2784891 2784892 PTD2_09274 PTD2_09279     TRUE 0.991 1.000 0.177 1.000 N NA
 2784893 2784894 PTD2_09284 PTD2_09289     TRUE 0.975 54.000 0.566 1.000 Y NA
 2784894 2784895 PTD2_09289 PTD2_09294     FALSE 0.131 83.000 0.000 NA   NA
 2784895 2784896 PTD2_09294 PTD2_09299     TRUE 0.829 9.000 0.000 NA   NA
 2784896 2784897 PTD2_09299 PTD2_09304     FALSE 0.284 52.000 0.000 NA   NA
 2784900 2784901 PTD2_19467 PTD2_19472     TRUE 1.000 -3.000 0.875 0.012 Y NA
 2784901 2784902 PTD2_19472 PTD2_19477     FALSE 0.097 121.000 0.000 NA N NA
 2784902 2784903 PTD2_19477 PTD2_19482     FALSE 0.008 288.000 0.000 NA   NA
 2784906 2784907 PTD2_19497 PTD2_19502     TRUE 0.918 1.000 0.000 NA   NA
 2784907 2784908 PTD2_19502 PTD2_19507     TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 2784908 2784909 PTD2_19507 PTD2_19512     TRUE 0.988 3.000 0.167 NA   NA
 2784909 2784910 PTD2_19512 PTD2_19517     TRUE 0.929 39.000 0.400 NA   NA
 2784910 2784911 PTD2_19517 PTD2_19522     FALSE 0.004 380.000 0.000 1.000   NA
 2784911 2784912 PTD2_19522 PTD2_19527     FALSE 0.001 745.000 0.000 NA   NA
 2784913 2784914 PTD2_19532 PTD2_19537     FALSE 0.019 219.000 0.000 NA   NA
 2784915 2784916 PTD2_19542 PTD2_19547     FALSE 0.070 141.000 0.000 NA   NA
 2784917 2784918 PTD2_19552 PTD2_19557     TRUE 0.915 2.000 0.000 NA   NA
 2784920 2784921 PTD2_19567 PTD2_19572     TRUE 0.997 0.000 0.168 1.000 Y NA
 2784921 2784922 PTD2_19572 PTD2_19577     TRUE 0.945 -3.000 0.025 1.000 N NA
 2784922 2784923 PTD2_19577 PTD2_19582     TRUE 0.915 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2784923 2784924 PTD2_19582 PTD2_19587     FALSE 0.019 253.000 0.010 1.000 N NA
 2784930 2784931 PTD2_19617 PTD2_19622     TRUE 0.997 2.000 0.136 0.001 Y NA
 2784931 2784932 PTD2_19622 PTD2_19627     FALSE 0.328 44.000 0.000 NA   NA
 2784932 2784933 PTD2_19627 PTD2_19632     TRUE 0.632 14.000 0.000 NA   NA
 2784933 2784934 PTD2_19632 PTD2_19637     FALSE 0.015 236.000 0.000 NA   NA
 2784936 2784937 PTD2_19647 PTD2_19652     FALSE 0.161 201.000 0.133 1.000 N NA