MicrobesOnline Operon Predictions for Mycobacterium tuberculosis H37Rv

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
31772	31773	Rv0001	Rv0002	dnaA	dnaN	FALSE	0.104	528.000	0.328	1.000	Y	0.287
31773	31774	Rv0002	Rv0003	dnaN	recF	TRUE	0.925	20.000	0.318	1.000	Y	0.389
31774	31775	Rv0003	Rv0004	recF		TRUE	0.935	-3.000	0.099	NA		0.268
31775	31776	Rv0004	Rv0005		gyrB	FALSE	0.176	126.000	0.022	NA		0.268
31776	31777	Rv0005	Rv0006	gyrB	gyrA	TRUE	0.951	35.000	0.306	0.001	Y	0.123
31777	31778	Rv0006	Rv0007	gyrA		FALSE	0.135	96.000	0.009	NA		0.038
31778	1935657	Rv0007	Rvnt01			FALSE	0.011	59.000	0.000	NA		NA
1935657	1935658	Rvnt01	Rvnt02			FALSE	0.003	152.000	0.000	NA		NA
31781	31782	Rv0010c	Rv0011c			FALSE	0.139	156.000	0.181	NA		0.069
31783	1935659	Rv0012	Rv0013		trpG	FALSE	0.366	37.000	0.098	NA		0.069
31785	31786	Rv0014c	Rv0015c	pknB	pknA	TRUE	0.996	-3.000	0.426	0.005	Y	-0.177
31786	31787	Rv0015c	Rv0016c	pknA	pbpA	TRUE	0.983	-3.000	0.574	1.000	N	0.501
31787	31788	Rv0016c	Rv0017c	pbpA	rodA	TRUE	0.954	-3.000	0.250	1.000	N	0.303
31788	31789	Rv0017c	Rv0018c	rodA	ppp	TRUE	0.920	-3.000	0.145	1.000	N	0.210
31789	31790	Rv0018c	Rv0019c	ppp		TRUE	0.707	89.000	0.216	NA	Y	0.191
31790	31791	Rv0019c	Rv0020c		TB39.8	FALSE	0.280	124.000	0.069	NA		0.614
31792	31793	Rv0021c	Rv0022c		whiB5	FALSE	0.066	142.000	0.000	1.000		0.019
31794	31795	Rv0023	Rv0024			TRUE	0.983	-3.000	0.600	NA		0.277
31795	31796	Rv0024	Rv0025			TRUE	0.807	38.000	0.750	NA		0.236
31796	31797	Rv0025	Rv0026			TRUE	0.672	115.000	1.000	NA		0.155
31797	31798	Rv0026	Rv0027			FALSE	0.444	121.000	0.600	NA		-0.117
31798	31799	Rv0027	Rv0028			TRUE	0.928	8.000	0.800	NA		-0.159
31799	31800	Rv0028	Rv0029			FALSE	0.001	238.000	0.000	NA		-0.262
31800	31801	Rv0029	Rv0030			TRUE	0.753	70.000	1.000	NA		0.005
31801	31802	Rv0030	Rv0031			FALSE	0.268	29.000	0.000	NA		0.220
31802	31803	Rv0031	Rv0032		bioF2	FALSE	0.007	501.000	0.000	NA		0.303
31803	31804	Rv0032	Rv0033	bioF2	acpA	TRUE	0.836	-3.000	0.000	1.000	N	0.305
31804	31805	Rv0033	Rv0034	acpA		TRUE	0.801	-3.000	0.000	NA		0.155
31805	1935661	Rv0034	Rv0035		fadD34	TRUE	0.889	-3.000	0.000	NA		0.351
31807	31808	Rv0036c	Rv0037c			FALSE	0.392	48.000	0.174	NA		0.065
31810	1935662	Rv0039c	Rv0040c		mtc28	TRUE	0.773	82.000	0.875	NA		0.330
31813	31814	Rv0042c	Rv0043c			TRUE	0.574	159.000	0.000	0.035	Y	0.303
31814	31815	Rv0043c	Rv0044c			FALSE	0.251	133.000	0.412	NA	N	-0.053
31815	31816	Rv0044c	Rv0045c			FALSE	0.521	16.000	0.235	NA		-0.213
31816	31817	Rv0045c	Rv0046c		ino1	FALSE	0.395	82.000	0.059	1.000		0.398
31817	31818	Rv0046c	Rv0047c	ino1		TRUE	0.712	61.000	0.608	NA	N	0.825
31818	31819	Rv0047c	Rv0048c			FALSE	0.265	101.000	0.122	NA		0.157
31820	1935663	Rv0049	Rv0050		ponA1	FALSE	0.014	419.000	0.200	NA		-0.019
1935663	31822	Rv0050	Rv0051	ponA1		TRUE	0.919	-3.000	0.204	NA		-0.061
31822	31823	Rv0051	Rv0052			FALSE	0.208	32.000	0.061	NA		-0.169
31823	31824	Rv0052	Rv0053		rpsF	FALSE	0.013	219.000	0.002	NA		-0.090
31824	31825	Rv0053	Rv0054	rpsF	ssb	FALSE	0.202	104.000	0.029	1.000	N	0.288
31825	1935664	Rv0054	Rv0055	ssb	rpsR	FALSE	0.249	42.000	0.030	1.000	N	0.182
1935664	31827	Rv0055	Rv0056	rpsR	rplI	TRUE	0.965	33.000	0.499	0.019	Y	0.543
31827	31828	Rv0056	Rv0057	rplI		FALSE	0.096	29.000	0.000	NA		-0.057
31828	31829	Rv0057	Rv0058		dnaB	TRUE	0.714	-21.000	0.000	NA		0.654
31829	31830	Rv0058	Rv0059	dnaB		FALSE	0.039	180.000	0.000	NA		0.187
31830	31831	Rv0059	Rv0060			TRUE	0.771	17.000	0.317	NA		0.364
31831	31832	Rv0060	Rv0061			FALSE	0.213	24.000	0.000	NA		0.086
31832	1935665	Rv0061	Rv0062		celA1	FALSE	0.036	136.000	0.000	NA		-0.015
1935665	31834	Rv0062	Rv0063	celA1		FALSE	0.001	229.000	0.000	1.000	N	-0.272
31834	31835	Rv0063	Rv0064			FALSE	0.033	258.000	0.000	1.000		0.318
31835	31836	Rv0064	Rv0065			FALSE	0.021	262.000	0.000	NA		0.268
31837	31838	Rv0066c	Rv0067c	icd2		FALSE	0.030	118.000	0.000	1.000	N	0.046
31840	31841	Rv0069c	Rv0070c	sdaA	glyA2	TRUE	0.985	-3.000	0.118	1.000	Y	0.150
31842	31843	Rv0071	Rv0072			FALSE	0.001	431.000	0.000	1.000	N	0.013
31843	31844	Rv0072	Rv0073			TRUE	0.978	3.000	1.000	1.000	N	0.074
31844	31845	Rv0073	Rv0074			FALSE	0.009	80.000	0.000	1.000	N	-0.127
31845	31846	Rv0074	Rv0075			FALSE	0.326	13.000	0.000	1.000	N	0.221
31847	31848	Rv0076c	Rv0077c			FALSE	0.209	64.000	0.000	NA		0.252
31850	31851	Rv0079	Rv0080			TRUE	0.916	-3.000	0.000	NA		0.914
31851	31852	Rv0080	Rv0081			FALSE	0.309	95.000	0.000	1.000		0.914
31852	31853	Rv0081	Rv0082			TRUE	0.852	5.000	0.043	1.000	N	0.744
31853	31854	Rv0082	Rv0083			TRUE	0.996	-3.000	0.085	0.007	Y	0.801
31854	31855	Rv0083	Rv0084		hycD	TRUE	0.984	6.000	0.398	1.000	Y	0.757
31855	31856	Rv0084	Rv0085	hycD	hycP	TRUE	0.978	11.000	0.679	NA	Y	0.702
31856	31857	Rv0085	Rv0086	hycP	hycQ	TRUE	0.997	0.000	0.864	NA	Y	0.701
31857	31858	Rv0086	Rv0087	hycQ	hycE	TRUE	0.999	-3.000	0.659	0.007	Y	0.740
31858	31859	Rv0087	Rv0088	hycE		FALSE	0.376	35.000	0.000	NA		0.581
31859	31860	Rv0088	Rv0089			FALSE	0.087	157.000	0.000	NA		0.335
31860	31861	Rv0089	Rv0090			FALSE	0.069	129.000	0.000	NA		0.104
31861	31862	Rv0090	Rv0091		mtn	FALSE	0.002	434.000	0.000	NA		-0.061
31862	31863	Rv0091	Rv0092	mtn	ctpA	FALSE	0.127	132.000	0.000	1.000	N	0.528
31864	31865	Rv0093c	Rv0094c			FALSE	0.136	47.000	0.000	NA		0.048
31865	31866	Rv0094c	Rv0095c			FALSE	0.048	142.000	0.000	NA		0.061
1935667	31868	Rv0096	Rv0097	PPE1		FALSE	0.515	19.000	0.167	NA	N	0.298
31868	31869	Rv0097	Rv0098			TRUE	0.984	-3.000	0.500	NA		0.783
31869	31870	Rv0098	Rv0099		fadD10	TRUE	0.957	5.000	0.444	NA		0.525
31870	31871	Rv0099	Rv0100	fadD10		TRUE	0.977	5.000	0.800	1.000		0.319
31871	31872	Rv0100	Rv0101		nrp	TRUE	0.956	-18.000	0.364	0.012		0.060
31872	31873	Rv0101	Rv0102	nrp		FALSE	0.044	175.000	0.000	NA		0.201
31878	31879	Rv0107c	Rv0108c	ctpI		FALSE	0.003	354.000	0.000	NA		-0.027
1935669	31881	Rv0109	Rv0110	PE_PGRS1		FALSE	0.122	148.000	0.091	NA		0.097
31881	31882	Rv0110	Rv0111			FALSE	0.021	181.000	0.000	1.000		-0.127
31882	31883	Rv0111	Rv0112		gca	FALSE	0.006	282.000	0.000	1.000	N	0.148
31883	31884	Rv0112	Rv0113	gca	gmhA	FALSE	0.229	74.000	0.000	1.000	N	0.571
31884	31885	Rv0113	Rv0114	gmhA	gmhB	FALSE	0.228	32.000	0.000	1.000	N	0.282
31885	31886	Rv0114	Rv0115	gmhB	hddA	TRUE	0.897	0.000	0.000	1.000		0.286
31891	31892	Rv0120c	Rv0121c	fusA2		FALSE	0.121	137.000	0.009	1.000		0.094
31893	31894	Rv0122	Rv0123			TRUE	0.653	-3.000	0.000	NA		-0.031
31894	1935670	Rv0123	Rv0124		PE_PGRS2	FALSE	0.021	309.000	0.000	NA		0.546
1935670	31896	Rv0124	Rv0125	PE_PGRS2	pepA	FALSE	0.073	152.000	0.000	NA		0.239
31896	31897	Rv0125	Rv0126	pepA	treS	FALSE	0.102	109.000	0.013	1.000	N	0.118
31897	31898	Rv0126	Rv0127	treS		TRUE	0.596	103.000	0.071	NA	Y	0.089
31898	31899	Rv0127	Rv0128			FALSE	0.228	68.000	0.136	NA		-0.127
31902	31903	Rv0131c	Rv0132c	fadE1	fgd2	TRUE	0.572	42.000	0.286	NA	N	0.529
31904	31905	Rv0133	Rv0134		ephF	FALSE	0.003	297.000	0.000	1.000		-0.211
31909	31910	Rv0138	Rv0139			TRUE	0.963	1.000	0.538	NA		-0.097
31910	31911	Rv0139	Rv0140			FALSE	0.039	61.000	0.034	NA		-0.557
31915	31916	Rv0144	Rv0145			TRUE	0.549	89.000	0.571	NA	N	0.212
31916	31917	Rv0145	Rv0146			TRUE	0.920	43.000	0.556	NA	Y	0.587
31917	31918	Rv0146	Rv0147			FALSE	0.459	95.000	0.444	NA	N	0.183
31918	31919	Rv0147	Rv0148			TRUE	0.735	75.000	0.875	1.000	N	0.207
31919	31920	Rv0148	Rv0149			TRUE	0.955	7.000	0.700	1.000	N	0.523
31921	1935672	Rv0150c	Rv0151c		PE1	FALSE	0.003	591.000	0.000	NA		0.059
1935672	1935673	Rv0151c	Rv0152c	PE1	PE2	FALSE	0.487	10.000	0.000	NA		0.190
1935673	31924	Rv0152c	Rv0153c	PE2	ptbB	FALSE	0.008	259.000	0.000	NA		0.018
31924	31925	Rv0153c	Rv0154c	ptbB	fadE2	TRUE	0.865	2.000	0.226	1.000	N	-0.133
31926	31927	Rv0155	Rv0156	pntAa	pntAb	TRUE	0.995	1.000	0.829	0.001		0.026
31927	31928	Rv0156	Rv0157	pntAb	pntB	TRUE	0.991	-3.000	0.321	0.001		0.147
1935675	1935676	Rv0159c	Rv0160c	PE3	PE4	FALSE	0.026	92.000	0.000	NA		-0.121
31934	1935678	Rv0163	Rv0164		TB18.5	FALSE	0.168	54.000	0.020	NA		-0.043
31937	31938	Rv0166	Rv0167	fadD5	yrbE1A	FALSE	0.247	204.000	0.000	NA	Y	0.835
31938	31939	Rv0167	Rv0168	yrbE1A	yrbE1B	TRUE	0.996	2.000	1.000	NA	Y	0.693
31939	1935680	Rv0168	Rv0169	yrbE1B	mce1A	TRUE	0.994	5.000	1.000	NA	Y	0.566
1935680	31941	Rv0169	Rv0170	mce1A	mce1B	TRUE	0.998	-3.000	0.500	0.010	Y	0.628
31941	31942	Rv0170	Rv0171	mce1B	mce1C	TRUE	0.999	-3.000	1.000	0.010	Y	0.669
31942	31943	Rv0171	Rv0172	mce1C	mce1D	TRUE	0.999	-3.000	1.000	0.010	Y	0.578
31943	31944	Rv0172	Rv0173	mce1D	lprK	TRUE	0.998	-3.000	0.500	0.010	Y	0.643
31944	31945	Rv0173	Rv0174	lprK	mce1F	TRUE	0.997	-6.000	0.800	0.010	Y	0.494
31945	31946	Rv0174	Rv0175	mce1F		TRUE	0.638	36.000	0.286	NA		0.356
31946	31947	Rv0175	Rv0176			TRUE	0.985	-3.000	0.750	NA		0.156
31947	31948	Rv0176	Rv0177			TRUE	0.987	-3.000	1.000	NA		0.010
31948	31949	Rv0177	Rv0178			TRUE	0.957	-33.000	1.000	NA		0.302
31950	31951	Rv0179c	Rv0180c	lprO		FALSE	0.442	80.000	0.333	NA		-0.004
31951	31952	Rv0180c	Rv0181c			FALSE	0.106	27.000	0.000	NA		-0.048
31952	31953	Rv0181c	Rv0182c		sigG	FALSE	0.219	17.000	0.000	NA		0.037
1935681	31955	Rv0183	Rv0184			FALSE	0.426	42.000	0.068	NA		0.291
31955	31956	Rv0184	Rv0185			TRUE	0.977	-3.000	0.600	NA		0.033
31956	31957	Rv0185	Rv0186		bglS	FALSE	0.444	45.000	0.273	1.000		-0.226
31957	31958	Rv0186	Rv0187	bglS		FALSE	0.004	361.000	0.000	1.000		-0.089
31958	31959	Rv0187	Rv0188			FALSE	0.014	119.000	0.000	NA		-0.139
31961	31962	Rv0190	Rv0191			FALSE	0.079	128.000	0.125	NA		-0.394
31962	31963	Rv0191	Rv0192			FALSE	0.515	34.000	0.375	NA		-0.264
31963	1935682	Rv0192	Rv0192A			TRUE	0.653	-345.000	0.000	NA		0.970
31965	31966	Rv0194	Rv0195			FALSE	0.008	437.000	0.000	1.000	N	0.482
31966	31967	Rv0195	Rv0196			FALSE	0.378	113.000	0.000	0.058		0.205
31967	31968	Rv0196	Rv0197			TRUE	0.974	0.000	0.276	1.000		0.660
31970	31971	Rv0199	Rv0200			TRUE	0.983	-3.000	1.000	NA		-0.277
31972	31973	Rv0201c	Rv0202c		mmpL11	TRUE	0.979	-3.000	0.750	1.000		-0.383
31977	31978	Rv0206c	Rv0207c	mmpL3		FALSE	0.533	66.000	0.217	NA		0.658
31978	31979	Rv0207c	Rv0208c		trmB	TRUE	0.910	3.000	0.040	NA		0.696
31980	31981	Rv0209	Rv0210			TRUE	0.984	-3.000	0.529	NA		0.483
31981	31982	Rv0210	Rv0211		pckA	FALSE	0.046	184.000	0.026	NA		0.037
31983	31984	Rv0212c	Rv0213c	nadR		TRUE	0.884	-3.000	0.000	1.000	N	0.541
31989	31990	Rv0218	Rv0219			TRUE	0.956	2.000	0.273	NA		0.401
31990	31991	Rv0219	Rv0220		lipC	TRUE	0.700	10.000	0.182	NA		0.007
31991	31992	Rv0220	Rv0221	lipC		TRUE	0.817	44.000	1.000	NA		0.082
31992	31993	Rv0221	Rv0222		echA1	TRUE	0.663	31.000	0.333	NA		0.248
31994	31995	Rv0223c	Rv0224c			FALSE	0.261	99.000	0.104	1.000		-0.002
31997	31998	Rv0226c	Rv0227c			TRUE	0.661	10.000	0.265	NA		-0.413
32000	32001	Rv0229c	Rv0230c		php	TRUE	0.858	-3.000	0.000	NA		0.243
32002	32003	Rv0231	Rv0232	fadE4		FALSE	0.213	135.000	0.250	1.000	N	0.110
32003	32004	Rv0232	Rv0233		nrdB	TRUE	0.974	-3.000	0.357	1.000	N	0.657
1935683	32006	Rv0234c	Rv0235c	gabD1		FALSE	0.221	26.000	0.000	NA		0.145
32006	32007	Rv0235c	Rv0236c			FALSE	0.503	35.000	0.053	NA		0.696
32007	1935684	Rv0236c	Rv0236A			TRUE	0.677	47.000	0.526	NA		0.076
1935685	32009	Rv0237	Rv0238	lpqI		FALSE	0.309	76.000	0.185	1.000	N	0.168
32009	32010	Rv0238	Rv0239			FALSE	0.010	62.000	0.000	NA		-0.420
32010	32011	Rv0239	Rv0240			FALSE	0.059	8.000	0.000	NA		-0.332
32012	32013	Rv0241c	Rv0242c		fabG	TRUE	0.969	11.000	0.412	1.000	Y	0.550
32016	32017	Rv0245	Rv0246			FALSE	0.005	316.000	0.000	NA		0.019
32018	32019	Rv0247c	Rv0248c			TRUE	0.998	1.000	0.826	0.004	Y	0.228
32019	32020	Rv0248c	Rv0249c			TRUE	0.871	31.000	0.860	NA		0.504
32020	32021	Rv0249c	Rv0250c			FALSE	0.158	80.000	0.171	NA		-0.436
32021	32022	Rv0250c	Rv0251c		hsp	FALSE	0.041	145.000	0.091	NA		-0.516
32023	32024	Rv0252	Rv0253	nirB	nirD	TRUE	0.891	26.000	0.286	0.001	N	0.591
32025	1935686	Rv0254c	Rv0255c	cobU	cobQ1	TRUE	0.844	25.000	0.031	1.000	Y	0.421
1935686	1935687	Rv0255c	Rv0256c	cobQ1	PPE2	FALSE	0.314	19.000	0.000	NA	N	0.492
32029	32030	Rv0258c	Rv0259c			FALSE	0.530	25.000	0.071	1.000		0.225
32030	32031	Rv0259c	Rv0260c			TRUE	0.943	-3.000	0.173	1.000		0.126
32031	32032	Rv0260c	Rv0261c		narK3	FALSE	0.085	100.000	0.000	NA	N	0.295
32032	32033	Rv0261c	Rv0262c	narK3	aac	FALSE	0.127	141.000	0.000	NA		0.429
32033	32034	Rv0262c	Rv0263c	aac		TRUE	0.797	10.000	0.101	NA		0.544
32034	32035	Rv0263c	Rv0264c			TRUE	0.955	17.000	0.551	NA	Y	0.677
32035	1935689	Rv0264c	Rv0265c			FALSE	0.116	96.000	0.050	1.000	N	-0.018
1935689	32037	Rv0265c	Rv0266c		oplA	FALSE	0.025	22.000	0.000	1.000	N	-0.037
32039	32040	Rv0268c	Rv0269c			FALSE	0.146	65.000	0.000	NA	N	0.372
32042	32043	Rv0271c	Rv0272c	fadE6		FALSE	0.047	114.000	0.000	NA		-0.020
32043	32044	Rv0272c	Rv0273c			TRUE	0.985	-3.000	0.833	NA		0.003
32048	1935691	Rv0277c	Rv0278c		PE_PGRS3	FALSE	0.010	301.000	0.000	NA		0.186
1935691	1935692	Rv0278c	Rv0279c	PE_PGRS3	PE_PGRS4	FALSE	0.005	250.000	0.000	NA		-0.078
11400659	32045		Rv0274			FALSE	NA	2578.000	0.000	NA		NA
11543022	32045		Rv0274			FALSE	NA	2578.000	0.000	NA		NA
11685414	32045		Rv0274			FALSE	NA	2578.000	0.000	NA		NA
11400660	32045		Rv0274			FALSE	NA	2599.000	0.000	NA		NA
11543023	32045		Rv0274			FALSE	NA	2599.000	0.000	NA		NA
11685415	32045		Rv0274			FALSE	NA	2599.000	0.000	NA		NA
11400661	32045		Rv0274			FALSE	NA	2623.000	0.000	NA		NA
11543024	32045		Rv0274			FALSE	NA	2623.000	0.000	NA		NA
11685416	32045		Rv0274			FALSE	NA	2623.000	0.000	NA		NA
11400662	32045		Rv0274			FALSE	NA	2644.000	0.000	NA		NA
11543025	32045		Rv0274			FALSE	NA	2644.000	0.000	NA		NA
11685417	32045		Rv0274			FALSE	NA	2644.000	0.000	NA		NA
11400663	32045		Rv0274			FALSE	NA	2672.000	0.000	NA		NA
11543026	32045		Rv0274			FALSE	NA	2672.000	0.000	NA		NA
11685418	32045		Rv0274			FALSE	NA	2672.000	0.000	NA		NA
11400664	32045		Rv0274			FALSE	NA	2693.000	0.000	NA		NA
11543027	32045		Rv0274			FALSE	NA	2693.000	0.000	NA		NA
11685419	32045		Rv0274			FALSE	NA	2693.000	0.000	NA		NA
11400665	32045		Rv0274			FALSE	NA	2717.000	0.000	NA		NA
11543028	32045		Rv0274			FALSE	NA	2717.000	0.000	NA		NA
11685420	32045		Rv0274			FALSE	NA	2717.000	0.000	NA		NA
11400666	32045		Rv0274			FALSE	NA	2738.000	0.000	NA		NA
11543029	32045		Rv0274			FALSE	NA	2738.000	0.000	NA		NA
11685421	32045		Rv0274			FALSE	NA	2738.000	0.000	NA		NA
11400667	32045		Rv0274			FALSE	NA	2762.000	0.000	NA		NA
11543030	32045		Rv0274			FALSE	NA	2762.000	0.000	NA		NA
11685422	32045		Rv0274			FALSE	NA	2762.000	0.000	NA		NA
11400668	32045		Rv0274			FALSE	NA	2783.000	0.000	NA		NA
11543031	32045		Rv0274			FALSE	NA	2783.000	0.000	NA		NA
11685423	32045		Rv0274			FALSE	NA	2783.000	0.000	NA		NA
11400669	32045		Rv0274			FALSE	NA	2810.000	0.000	NA		NA
11543032	32045		Rv0274			FALSE	NA	2810.000	0.000	NA		NA
11685424	32045		Rv0274			FALSE	NA	2810.000	0.000	NA		NA
11400670	32045		Rv0274			FALSE	NA	2831.000	0.000	NA		NA
11543033	32045		Rv0274			FALSE	NA	2831.000	0.000	NA		NA
11685425	32045		Rv0274			FALSE	NA	2831.000	0.000	NA		NA
11400671	32045		Rv0274			FALSE	NA	2867.000	0.000	NA		NA
11543034	32045		Rv0274			FALSE	NA	2867.000	0.000	NA		NA
11685426	32045		Rv0274			FALSE	NA	2867.000	0.000	NA		NA
11400672	32045		Rv0274			FALSE	NA	2888.000	0.000	NA		NA
11543035	32045		Rv0274			FALSE	NA	2888.000	0.000	NA		NA
11685427	32045		Rv0274			FALSE	NA	2888.000	0.000	NA		NA
11400673	32045		Rv0274			FALSE	NA	2915.000	0.000	NA		NA
11543036	32045		Rv0274			FALSE	NA	2915.000	0.000	NA		NA
11685428	32045		Rv0274			FALSE	NA	2915.000	0.000	NA		NA
11400674	32045		Rv0274			FALSE	NA	2936.000	0.000	NA		NA
11543037	32045		Rv0274			FALSE	NA	2936.000	0.000	NA		NA
11685429	32045		Rv0274			FALSE	NA	2936.000	0.000	NA		NA
11400675	32045		Rv0274			FALSE	NA	2963.000	0.000	NA		NA
11543038	32045		Rv0274			FALSE	NA	2963.000	0.000	NA		NA
11685430	32045		Rv0274			FALSE	NA	2963.000	0.000	NA		NA
11400676	32045		Rv0274			FALSE	NA	2984.000	0.000	NA		NA
11543039	32045		Rv0274			FALSE	NA	2984.000	0.000	NA		NA
11685431	32045		Rv0274			FALSE	NA	2984.000	0.000	NA		NA
11400677	32045		Rv0274			FALSE	NA	3008.000	0.000	NA		NA
11543040	32045		Rv0274			FALSE	NA	3008.000	0.000	NA		NA
11685432	32045		Rv0274			FALSE	NA	3008.000	0.000	NA		NA
11400678	32045		Rv0274			FALSE	NA	3029.000	0.000	NA		NA
11543041	32045		Rv0274			FALSE	NA	3029.000	0.000	NA		NA
11685433	32045		Rv0274			FALSE	NA	3029.000	0.000	NA		NA
11400679	32045		Rv0274			FALSE	NA	3062.000	0.000	NA		NA
11543042	32045		Rv0274			FALSE	NA	3062.000	0.000	NA		NA
11685434	32045		Rv0274			FALSE	NA	3062.000	0.000	NA		NA
11400680	32045		Rv0274			FALSE	NA	3083.000	0.000	NA		NA
11543043	32045		Rv0274			FALSE	NA	3083.000	0.000	NA		NA
11685435	32045		Rv0274			FALSE	NA	3083.000	0.000	NA		NA
11400681	32045		Rv0274			FALSE	NA	3134.000	0.000	NA		NA
11543044	32045		Rv0274			FALSE	NA	3134.000	0.000	NA		NA
11685436	32045		Rv0274			FALSE	NA	3134.000	0.000	NA		NA
11400682	32045		Rv0274			FALSE	NA	3155.000	0.000	NA		NA
11543045	32045		Rv0274			FALSE	NA	3155.000	0.000	NA		NA
11685437	32045		Rv0274			FALSE	NA	3155.000	0.000	NA		NA
11400683	32045		Rv0274			FALSE	NA	3197.000	0.000	NA		NA
11543046	32045		Rv0274			FALSE	NA	3197.000	0.000	NA		NA
11685438	32045		Rv0274			FALSE	NA	3197.000	0.000	NA		NA
11400684	32045		Rv0274			FALSE	NA	3218.000	0.000	NA		NA
11543047	32045		Rv0274			FALSE	NA	3218.000	0.000	NA		NA
11685439	32045		Rv0274			FALSE	NA	3218.000	0.000	NA		NA
11400685	32045		Rv0274			FALSE	NA	3242.000	0.000	NA		NA
11543048	32045		Rv0274			FALSE	NA	3242.000	0.000	NA		NA
11685440	32045		Rv0274			FALSE	NA	3242.000	0.000	NA		NA
11400686	32045		Rv0274			FALSE	NA	3263.000	0.000	NA		NA
11543049	32045		Rv0274			FALSE	NA	3263.000	0.000	NA		NA
11685441	32045		Rv0274			FALSE	NA	3263.000	0.000	NA		NA
11400687	32045		Rv0274			FALSE	NA	3290.000	0.000	NA		NA
11543050	32045		Rv0274			FALSE	NA	3290.000	0.000	NA		NA
11685442	32045		Rv0274			FALSE	NA	3290.000	0.000	NA		NA
11400688	32045		Rv0274			FALSE	NA	3311.000	0.000	NA		NA
11543051	32045		Rv0274			FALSE	NA	3311.000	0.000	NA		NA
11685443	32045		Rv0274			FALSE	NA	3311.000	0.000	NA		NA
11400689	32045		Rv0274			FALSE	NA	3332.000	0.000	NA		NA
11543052	32045		Rv0274			FALSE	NA	3332.000	0.000	NA		NA
11685444	32045		Rv0274			FALSE	NA	3332.000	0.000	NA		NA
11400690	32045		Rv0274			FALSE	NA	3353.000	0.000	NA		NA
11543053	32045		Rv0274			FALSE	NA	3353.000	0.000	NA		NA
11685445	32045		Rv0274			FALSE	NA	3353.000	0.000	NA		NA
11400691	32045		Rv0274			FALSE	NA	3380.000	0.000	NA		NA
11543054	32045		Rv0274			FALSE	NA	3380.000	0.000	NA		NA
11685446	32045		Rv0274			FALSE	NA	3380.000	0.000	NA		NA
11400692	32045		Rv0274			FALSE	NA	3401.000	0.000	NA		NA
11543055	32045		Rv0274			FALSE	NA	3401.000	0.000	NA		NA
11685447	32045		Rv0274			FALSE	NA	3401.000	0.000	NA		NA
11400693	32045		Rv0274			FALSE	NA	3425.000	0.000	NA		NA
11543056	32045		Rv0274			FALSE	NA	3425.000	0.000	NA		NA
11685448	32045		Rv0274			FALSE	NA	3425.000	0.000	NA		NA
1935693	32052	Rv0280	Rv0281	PPE3		TRUE	0.825	24.000	0.667	NA	N	0.534
32052	32053	Rv0281	Rv0282			FALSE	0.002	224.000	0.000	NA		-0.164
32053	32054	Rv0282	Rv0283			TRUE	0.992	-3.000	1.000	NA		0.524
32054	32055	Rv0283	Rv0284			TRUE	0.989	-3.000	0.750	NA		0.526
32055	1935694	Rv0284	Rv0285		PE5	TRUE	0.969	-3.000	0.333	NA		0.250
1935694	1935695	Rv0285	Rv0286	PE5	PPE4	TRUE	0.952	3.000	0.500	NA		-0.062
1935695	32058	Rv0286	Rv0287	PPE4	esxG	FALSE	0.330	49.000	0.000	NA		0.522
32058	32059	Rv0287	Rv0288	esxG	esxH	FALSE	0.346	30.000	0.000	NA		0.355
32059	32060	Rv0288	Rv0289	esxH		TRUE	0.624	11.000	0.000	NA		0.500
32060	32061	Rv0289	Rv0290			TRUE	0.841	47.000	0.818	NA		0.541
32061	32062	Rv0290	Rv0291		mycP3	TRUE	0.985	-3.000	0.556	NA		0.640
32062	32063	Rv0291	Rv0292	mycP3		TRUE	0.982	-3.000	0.556	NA		0.309
32066	1935696	Rv0295c	Rv0296c			TRUE	0.626	10.000	0.118	NA		-0.037
1935697	32069	Rv0297	Rv0298	PE_PGRS5		FALSE	0.165	143.000	0.000	1.000		0.591
32069	32070	Rv0298	Rv0299			TRUE	0.832	-3.000	0.000	NA		0.201
32070	32071	Rv0299	Rv0300			FALSE	0.217	48.000	0.000	NA		0.219
32071	32072	Rv0300	Rv0301			TRUE	0.980	-3.000	0.444	NA		0.414
32072	32073	Rv0301	Rv0302			FALSE	0.075	136.000	0.000	NA		0.188
32073	32074	Rv0302	Rv0303			TRUE	0.847	-3.000	0.000	1.000	N	0.330
1935698	1935699	Rv0304c	Rv0305c	PPE5	PPE6	TRUE	0.685	56.000	0.000	NA	Y	0.360
32079	32080	Rv0308	Rv0309			FALSE	0.218	102.000	0.067	NA		0.137
32082	32083	Rv0311	Rv0312			FALSE	0.244	155.000	0.333	1.000		-0.031
32083	32084	Rv0312	Rv0313			FALSE	0.030	72.000	0.000	NA		-0.124
32086	32087	Rv0315	Rv0316			FALSE	0.535	49.000	0.286	1.000	N	0.275
32088	1935700	Rv0317c	Rvnt04	glpQ2		FALSE	0.001	261.000	0.000	NA		NA
1935700	1935701	Rvnt04	Rv0318c			FALSE	0.015	31.000	0.000	NA		NA
32090	32091	Rv0319	Rv0320	pcp		FALSE	0.226	72.000	0.000	NA		0.323
32091	32092	Rv0320	Rv0321		dcd	FALSE	0.135	32.000	0.007	NA		-0.122
32092	32093	Rv0321	Rv0322	dcd	udgA	FALSE	0.064	106.000	0.000	1.000	N	0.162
32095	32096	Rv0324	Rv0325			FALSE	0.445	7.000	0.000	NA		0.034
32096	32097	Rv0325	Rv0326			FALSE	0.133	10.000	0.000	NA		-0.127
32100	32101	Rv0329c	Rv0330c			FALSE	0.487	27.000	0.000	1.000		0.715
32102	32103	Rv0331	Rv0332			FALSE	0.100	75.000	0.000	NA		0.043
32103	32104	Rv0332	Rv0333			TRUE	0.654	27.000	0.368	NA		0.070
32104	32105	Rv0333	Rv0334		rmlA	TRUE	0.656	30.000	0.273	NA		0.372
32108	32109	Rv0337c	Rv0338c	aspC		FALSE	0.412	31.000	0.023	1.000	N	0.495
32109	32110	Rv0338c	Rv0339c			FALSE	0.116	109.000	0.057	1.000	N	0.014
32111	32112	Rv0340	Rv0341		iniB	FALSE	0.210	189.000	0.286	NA		0.659
32112	32113	Rv0341	Rv0342	iniB	iniA	TRUE	0.805	37.000	0.500	1.000		0.835
32113	32114	Rv0342	Rv0343	iniA	iniC	TRUE	0.995	-3.000	0.583	0.007		0.675
32118	32119	Rv0347	Rv0348			FALSE	0.133	3.000	0.000	NA		-0.518
32119	32120	Rv0348	Rv0349			TRUE	0.736	3.000	0.000	NA		0.181
32120	32121	Rv0349	Rv0350		dnaK	FALSE	0.041	227.000	0.000	NA		0.432
32121	32122	Rv0350	Rv0351	dnaK	grpE	TRUE	0.996	-3.000	0.074	0.005	Y	0.697
32122	1935704	Rv0351	Rv0352	grpE	dnaJ1	TRUE	0.931	36.000	0.068	0.005	Y	0.743
1935704	32124	Rv0352	Rv0353	dnaJ1	hspR	TRUE	0.932	0.000	0.074	1.000	N	0.532
1935705	1935706	Rv0354c	Rv0355c	PPE7	PPE8	FALSE	0.268	83.000	0.000	NA		0.696
1935706	32127	Rv0355c	Rv0356c	PPE8		FALSE	0.021	151.000	0.000	NA		-0.056
32127	32128	Rv0356c	Rv0357c		purA	TRUE	0.938	-3.000	0.052	NA		0.437
32129	32130	Rv0358	Rv0359			TRUE	0.541	11.000	0.020	NA		0.147
32132	32133	Rv0361	Rv0362		mgtE	FALSE	0.001	222.000	0.000	NA		-0.195
32136	32137	Rv0365c	Rv0366c			TRUE	0.637	25.000	0.000	0.047		0.129
32137	32138	Rv0366c	Rv0367c			FALSE	0.243	29.000	0.000	NA		0.193
32138	32139	Rv0367c	Rv0368c			FALSE	0.242	81.000	0.000	NA		0.417
32139	32140	Rv0368c	Rv0369c			TRUE	0.864	6.000	0.208	NA		0.230
32140	32141	Rv0369c	Rv0370c			FALSE	0.341	101.000	0.250	NA		0.045
32141	32142	Rv0370c	Rv0371c			TRUE	0.951	-3.000	0.200	NA		0.272
32142	32143	Rv0371c	Rv0372c			TRUE	0.975	-3.000	0.333	NA		0.507
32143	32144	Rv0372c	Rv0373c			TRUE	0.784	19.000	0.750	NA	N	-0.033
32144	32145	Rv0373c	Rv0374c			TRUE	0.998	-3.000	0.818	0.068	Y	0.119
32145	32146	Rv0374c	Rv0375c			TRUE	0.986	15.000	0.909	0.068	Y	0.242
32146	32147	Rv0375c	Rv0376c			FALSE	0.408	76.000	0.250	NA	N	0.347
32148	32149	Rv0377	Rv0378			FALSE	0.034	251.000	0.000	NA		0.524
32149	1935707	Rv0378	Rv0379		secE2	FALSE	0.006	119.000	0.000	NA		-0.332
32151	32152	Rv0380c	Rv0381c			FALSE	0.223	96.000	0.055	NA		0.160
32152	1935708	Rv0381c	Rv0382c		pyrE	FALSE	0.358	18.000	0.012	NA		0.097
1935708	32154	Rv0382c	Rv0383c	pyrE		FALSE	0.219	81.000	0.006	NA		0.226
32154	32155	Rv0383c	Rv0384c		clpB	FALSE	0.180	141.000	0.009	NA		0.720
32156	32157	Rv0385	Rv0386			FALSE	0.007	104.000	0.000	1.000	N	-0.221
32158	1935709	Rv0387c	Rv0388c		PPE9	FALSE	0.153	53.000	0.000	NA		0.132
32160	32161	Rv0389	Rv0390	purT		FALSE	0.197	-3.000	0.019	NA	N	-0.195
32161	32162	Rv0390	Rv0391		metZ	TRUE	0.834	-3.000	0.092	NA	N	0.063
32166	32167	Rv0395	Rv0396			TRUE	0.787	6.000	0.000	NA		0.860
32167	32168	Rv0396	Rv0397			FALSE	0.051	74.000	0.000	NA		-0.071
32169	32170	Rv0398c	Rv0399c		lpqK	TRUE	0.737	7.000	0.250	NA		-0.309
32170	32171	Rv0399c	Rv0400c	lpqK	fadE7	FALSE	0.047	10.000	0.000	1.000	N	-0.173
32173	32174	Rv0402c	Rv0403c	mmpL1	mmpS1	TRUE	0.988	-3.000	1.000	NA		0.084
32175	32176	Rv0404	Rv0405	fadD30	pks6	TRUE	0.997	-3.000	1.000	1.000	Y	0.198
32178	32179	Rv0407	Rv0408	fgd1	pta	TRUE	0.767	-7.000	0.021	1.000		0.159
32179	32180	Rv0408	Rv0409	pta	ackA	TRUE	0.792	-7.000	0.185	1.000		-0.160
32181	32182	Rv0410c	Rv0411c	pknG	glnH	TRUE	0.996	0.000	0.622	1.000	Y	0.585
32182	32183	Rv0411c	Rv0412c	glnH		TRUE	0.991	0.000	0.895	NA		0.566
32186	32187	Rv0415	Rv0416	thiO	thiS	TRUE	0.984	-3.000	0.625	1.000	N	0.499
32187	32188	Rv0416	Rv0417	thiS	thiG	TRUE	0.958	-7.000	0.104	1.000	Y	0.187
32188	32189	Rv0417	Rv0418	thiG	lpqL	FALSE	0.007	372.000	0.000	1.000		0.049
32189	32190	Rv0418	Rv0419	lpqL	lpqM	FALSE	0.466	88.000	0.000	0.032		0.178
32191	32192	Rv0420c	Rv0421c			FALSE	0.003	161.000	0.000	NA		-0.343
32192	32193	Rv0421c	Rv0422c		thiD	TRUE	0.811	-3.000	0.059	NA		-0.159
32193	32194	Rv0422c	Rv0423c	thiD	thiC	TRUE	0.901	27.000	0.015	0.006	Y	0.066
32194	32195	Rv0423c	Rv0424c	thiC		FALSE	0.026	152.000	0.000	NA		-0.026
32195	32196	Rv0424c	Rv0425c		ctpH	TRUE	0.692	50.000	0.500	NA		0.234
32196	32197	Rv0425c	Rv0426c	ctpH		TRUE	0.574	52.000	0.250	NA		0.409
32197	32198	Rv0426c	Rv0427c		xthA	FALSE	0.020	201.000	0.015	NA		-0.113
32198	32199	Rv0427c	Rv0428c	xthA		TRUE	0.861	3.000	0.088	NA		0.116
32199	32200	Rv0428c	Rv0429c		def	TRUE	0.977	0.000	0.488	NA		0.263
32201	32202	Rv0430	Rv0431			FALSE	0.448	32.000	0.176	NA		0.101
32202	32203	Rv0431	Rv0432		sodC	TRUE	0.773	33.000	0.500	NA		0.437
32203	32204	Rv0432	Rv0433	sodC		TRUE	0.901	2.000	0.128	1.000		0.023
32204	32205	Rv0433	Rv0434			FALSE	0.420	60.000	0.010	1.000		0.547
32206	32207	Rv0435c	Rv0436c		pssA	TRUE	0.899	-3.000	0.025	1.000	N	0.321
32207	32208	Rv0436c	Rv0437c	pssA	psd	TRUE	0.993	-3.000	0.466	1.000	Y	0.091
32208	1935710	Rv0437c	Rv0438c	psd	moeA2	FALSE	0.011	61.000	0.018	1.000	N	-0.315
1935710	32210	Rv0438c	Rv0439c	moeA2		FALSE	0.418	19.000	0.188	1.000		-0.456
32212	1935711	Rv0441c	Rv0442c		PPE10	FALSE	0.172	27.000	0.000	NA		0.045
32215	32216	Rv0444c	Rv0445c		sigK	FALSE	0.252	44.000	0.091	NA		-0.112
32216	32217	Rv0445c	Rv0446c	sigK		FALSE	0.294	49.000	0.065	1.000		-0.066
32217	32218	Rv0446c	Rv0447c		ufaA1	TRUE	0.674	9.000	0.081	1.000		-0.069
32218	32219	Rv0447c	Rv0448c	ufaA1		TRUE	0.786	-3.000	0.067	NA		-0.230
32219	32220	Rv0448c	Rv0449c			TRUE	0.770	60.000	0.722	NA		0.330
32220	32221	Rv0449c	Rv0450c		mmpL4	FALSE	0.319	40.000	0.007	1.000		0.138
32221	32222	Rv0450c	Rv0451c	mmpL4	mmpS4	TRUE	0.981	-3.000	0.667	NA		0.040
32223	1935712	Rv0452	Rv0453		PPE11	FALSE	0.001	322.000	0.000	NA		-0.129
1935712	32225	Rv0453	Rv0454	PPE11		FALSE	0.007	105.000	0.000	NA		-0.289
32226	32227	Rv0455c	Rv0456c		echA2	FALSE	0.149	68.000	0.039	NA		-0.101
32227	1935713	Rv0456c	Rv0456A	echA2		FALSE	0.001	273.000	0.000	1.000		NA
1935713	32228	Rv0456A	Rv0457c			FALSE	0.001	229.000	0.000	1.000		-0.985
32229	32230	Rv0458	Rv0459			TRUE	0.932	0.000	0.021	NA		0.649
32230	32231	Rv0459	Rv0460			FALSE	0.413	60.000	0.042	NA		0.604
32231	32232	Rv0460	Rv0461			TRUE	0.810	38.000	1.000	NA		-0.029
32232	32233	Rv0461	Rv0462		lpd	FALSE	0.023	64.000	0.017	NA		-0.446
32233	32234	Rv0462	Rv0463	lpd		FALSE	0.514	8.000	0.028	NA		-0.080
32235	32236	Rv0464c	Rv0465c			TRUE	0.966	-3.000	0.286	NA		0.313
32237	1935714	Rv0466	Rv0467		icl	FALSE	0.023	275.000	0.000	1.000	N	0.697
1935714	32239	Rv0467	Rv0468	icl	fadB2	FALSE	0.309	82.000	0.036	1.000	N	0.634
32239	1935715	Rv0468	Rv0469	fadB2	umaA	FALSE	0.172	133.000	0.130	1.000	N	0.217
1935716	1935717	Rv0470c	Rv0470A	pcaA		FALSE	0.004	143.000	0.000	1.000		-0.971
1935717	32242	Rv0470A	Rv0471c			FALSE	0.046	-69.000	0.000	NA		-0.427
32242	32243	Rv0471c	Rv0472c			FALSE	0.418	10.000	0.000	NA		0.093
32244	32245	Rv0473	Rv0474			FALSE	0.098	87.000	0.047	NA		-0.202
32245	32246	Rv0474	Rv0475		hbhA	FALSE	0.041	354.000	0.282	NA		0.301
32246	32247	Rv0475	Rv0476	hbhA		FALSE	0.335	112.000	0.270	NA		0.152
32247	32248	Rv0476	Rv0477			TRUE	0.661	5.000	0.143	NA		-0.389
32248	32249	Rv0477	Rv0478		deoC	TRUE	0.813	0.000	0.030	NA		-0.054
32250	1935718	Rv0479c	Rv0480c			TRUE	0.899	-3.000	0.091	NA		0.036
1935718	32252	Rv0480c	Rv0481c			FALSE	0.021	182.000	0.061	NA		-0.349
32253	32254	Rv0482	Rv0483	murB	lprQ	FALSE	0.104	62.000	0.036	NA		-0.213
32256	32257	Rv0485	Rv0486			FALSE	0.215	48.000	0.082	NA	N	0.129
32257	32258	Rv0486	Rv0487			TRUE	0.961	-3.000	0.541	NA		-0.540
32258	32259	Rv0487	Rv0488			FALSE	0.006	326.000	0.000	NA		0.085
32259	1935719	Rv0488	Rv0489		gpm1	FALSE	0.120	157.000	0.000	1.000		0.376
1935719	32261	Rv0489	Rv0490	gpm1	senX3	FALSE	0.061	174.000	0.196	1.000	N	-0.149
32261	32262	Rv0490	Rv0491	senX3	regX3	FALSE	0.359	228.000	0.437	1.000	Y	-0.018
1935720	1935721	Rv0492c	Rv0492A			TRUE	0.913	-3.000	0.300	NA		NA
1935721	32264	Rv0492A	Rv0493c			TRUE	0.847	-3.000	0.200	NA		NA
32267	32268	Rv0496	Rv0497			TRUE	0.922	-3.000	0.286	NA		-0.291
32268	32269	Rv0497	Rv0498			FALSE	0.410	16.000	0.127	NA		-0.161
32269	32270	Rv0498	Rv0499			FALSE	0.431	16.000	0.076	NA		-0.036
32270	32271	Rv0499	Rv0500		proC	FALSE	0.312	25.000	0.143	1.000		-0.641
32271	1935723	Rv0500	Rv0500A	proC		FALSE	0.306	141.000	0.186	1.000		0.467
1935723	1935724	Rv0500A	Rv0500B			FALSE	0.381	128.000	0.233	NA		0.792
1935724	1935725	Rv0500B	Rv0501		galE2	FALSE	0.345	78.000	0.356	NA		-0.592
1935725	32273	Rv0501	Rv0502	galE2		TRUE	0.946	7.000	0.796	1.000	N	0.178
32274	32275	Rv0503c	Rv0504c	cmaA2		TRUE	0.706	23.000	0.400	1.000		-0.039
32275	1935726	Rv0504c	Rv0505c		serB1	FALSE	0.108	162.000	0.145	1.000		-0.090
32277	32278	Rv0506	Rv0507	mmpS2	mmpL2	TRUE	0.992	-3.000	1.000	NA		0.676
32278	32279	Rv0507	Rv0508	mmpL2		TRUE	0.780	-7.000	0.007	NA		0.337
32279	32280	Rv0508	Rv0509		hemA	FALSE	0.036	50.000	0.012	NA		-0.344
32280	32281	Rv0509	Rv0510	hemA	hemC	TRUE	0.984	10.000	0.178	0.002	Y	0.588
32281	1935727	Rv0510	Rv0511	hemC	hemD	TRUE	0.932	33.000	0.044	0.002	Y	0.413
1935727	32283	Rv0511	Rv0512	hemD	hemB	TRUE	0.932	86.000	0.429	0.002	Y	0.176
32283	32284	Rv0512	Rv0513	hemB		FALSE	0.466	13.000	0.039	NA		0.036
32284	32285	Rv0513	Rv0514			TRUE	0.966	-3.000	0.389	NA		0.080
32285	32286	Rv0514	Rv0515			FALSE	0.007	103.000	0.000	NA		-0.321
32288	32289	Rv0517	Rv0518			FALSE	0.322	132.000	0.333	1.000	N	0.215
32291	1935728	Rv0520	Rv0521			TRUE	0.729	-7.000	0.000	NA		0.342
1935728	1935729	Rv0521	Rv0522		gabP	FALSE	0.134	135.000	0.000	NA		0.386
32295	32296	Rv0524	Rv0525	hemL		TRUE	0.918	0.000	0.204	NA	N	0.224
32296	32297	Rv0525	Rv0526			FALSE	0.383	15.000	0.035	NA	N	0.232
32297	1935730	Rv0526	Rv0527		ccdA	TRUE	0.994	-3.000	0.500	1.000	Y	0.190
1935730	32299	Rv0527	Rv0528	ccdA		TRUE	0.718	33.000	0.131	NA	Y	-0.164
32299	1935731	Rv0528	Rv0529		ccsA	TRUE	0.981	-3.000	0.082	NA	Y	0.084
1935731	32301	Rv0529	Rv0530	ccsA		FALSE	0.347	42.000	0.308	1.000	N	-0.438
32301	32302	Rv0530	Rv0531			FALSE	0.017	205.000	0.000	NA		0.044
32302	1935732	Rv0531	Rv0532		PE_PGRS6	FALSE	0.077	147.000	0.000	NA		0.237
32304	32305	Rv0533c	Rv0534c	fabH	menA	FALSE	0.045	82.000	0.011	1.000	N	-0.102
32306	1935733	Rv0535	Rv0536	pnp	galE3	FALSE	0.197	-3.000	0.008	1.000	N	-0.567
32309	32310	Rv0538	Rv0539			FALSE	0.398	57.000	0.048	NA		0.404
32310	32311	Rv0539	Rv0540			TRUE	0.951	-3.000	0.109	NA		0.503
32312	32313	Rv0541c	Rv0542c		menE	TRUE	0.625	12.000	0.008	NA		0.381
32313	32314	Rv0542c	Rv0543c	menE		FALSE	0.081	69.000	0.024	NA		-0.219
32314	32315	Rv0543c	Rv0544c			FALSE	0.244	60.000	0.000	NA		0.312
32315	32316	Rv0544c	Rv0545c		pitA	TRUE	0.889	-3.000	0.000	NA		0.349
32316	32317	Rv0545c	Rv0546c	pitA		FALSE	0.219	120.000	0.167	NA		0.095
32317	32318	Rv0546c	Rv0547c			FALSE	0.170	63.000	0.069	NA		-0.156
32318	32319	Rv0547c	Rv0548c		menB	FALSE	0.061	96.000	0.008	1.000		-0.366
32319	32320	Rv0548c	Rv0549c	menB		FALSE	0.007	272.000	0.000	NA		0.005
32320	32321	Rv0549c	Rv0550c			TRUE	0.899	-3.000	0.000	NA		0.410
32321	32322	Rv0550c	Rv0551c		fadD8	FALSE	0.006	192.000	0.000	NA		-0.122
32323	32324	Rv0552	Rv0553		menC	TRUE	0.883	-3.000	0.028	1.000		-0.008
32324	32325	Rv0553	Rv0554	menC	bpoC	TRUE	0.962	-3.000	0.038	0.045		-0.083
32325	32326	Rv0554	Rv0555	bpoC	menD	FALSE	0.236	43.000	0.022	1.000		-0.099
32326	32327	Rv0555	Rv0556	menD		TRUE	0.879	-3.000	0.055	NA		0.038
32327	32328	Rv0556	Rv0557		pimB	FALSE	0.339	62.000	0.259	NA		-0.200
32328	1935734	Rv0557	Rv0558	pimB	menH	FALSE	0.363	17.000	0.013	1.000	N	0.209
32330	32331	Rv0559c	Rv0560c			FALSE	0.371	34.000	0.222	NA		-0.189
32331	32332	Rv0560c	Rv0561c			FALSE	0.137	25.000	0.029	1.000	N	-0.107
32333	32334	Rv0562	Rv0563	grcC1	htpX	FALSE	0.153	101.000	0.042	1.000	N	0.150
32335	32336	Rv0564c	Rv0565c	gpsA		FALSE	0.257	61.000	0.133	1.000	N	0.040
32336	32337	Rv0565c	Rv0566c			FALSE	0.255	78.000	0.005	NA		0.295
1935735	32338	Rvnt05	Rv0567			FALSE	0.005	132.000	0.000	NA		NA
32338	32339	Rv0567	Rv0568		cyp135B1	FALSE	0.006	110.000	0.000	1.000	N	-0.289
32339	32340	Rv0568	Rv0569	cyp135B1		FALSE	0.004	135.000	0.000	NA		-0.236
32340	32341	Rv0569	Rv0570		nrdZ	TRUE	0.720	26.000	0.286	NA		0.846
32342	32343	Rv0571c	Rv0572c			FALSE	0.050	224.000	0.000	NA		0.812
32343	32344	Rv0572c	Rv0573c			FALSE	0.008	468.000	0.000	NA		0.371
32344	32345	Rv0573c	Rv0574c			FALSE	0.489	10.000	0.000	NA	N	0.438
32345	32346	Rv0574c	Rv0575c			FALSE	0.032	185.000	0.000	NA	N	0.373
32347	32348	Rv0576	Rv0577		TB27.3	FALSE	0.398	14.000	0.080	NA		-0.154
32352	32353	Rv0581	Rv0582			TRUE	0.863	-3.000	0.182	NA		-0.308
32357	32358	Rv0586	Rv0587		yrbE2A	TRUE	0.861	-3.000	0.019	NA	N	0.324
32358	32359	Rv0587	Rv0588	yrbE2A	yrbE2B	TRUE	0.985	2.000	0.333	NA	Y	0.024
32359	1935737	Rv0588	Rv0589	yrbE2B	mce2A	TRUE	0.990	6.000	1.000	NA	Y	0.214
1935737	32361	Rv0589	Rv0590	mce2A	mce2B	TRUE	0.999	-3.000	1.000	0.009	Y	0.405
32361	1935738	Rv0590	Rv0590A	mce2B		TRUE	0.686	-51.000	0.000	NA		0.873
1935738	32362	Rv0590A	Rv0591		mce2C	FALSE	0.197	-3.000	0.000	NA		NA
32362	32363	Rv0591	Rv0592	mce2C	mce2D	TRUE	0.998	-3.000	0.667	0.009	Y	0.182
32363	32364	Rv0592	Rv0593	mce2D	lprL	TRUE	0.997	-3.000	0.333	0.009	Y	0.213
32364	32365	Rv0593	Rv0594	lprL	mce2F	TRUE	0.996	5.000	0.500	0.009	Y	0.688
32366	32367	Rv0595c	Rv0596c			TRUE	0.905	-3.000	0.000	NA		0.484
32367	32368	Rv0596c	Rv0597c			FALSE	0.008	183.000	0.000	NA		-0.108
32368	32369	Rv0597c	Rv0598c			FALSE	0.002	251.000	0.000	NA		-0.149
32369	32370	Rv0598c	Rv0599c			TRUE	0.978	-3.000	0.400	NA		0.443
32370	1935739	Rv0599c	Rv0600c			FALSE	0.007	104.000	0.000	NA		-0.356
1935739	32372	Rv0600c	Rv0601c			FALSE	0.526	114.000	0.000	0.001		0.193
32372	32373	Rv0601c	Rv0602c		tcrA	FALSE	0.280	44.000	0.000	1.000		0.202
32374	32375	Rv0603	Rv0604		lpqO	FALSE	0.181	72.000	0.000	NA		0.228
32375	32376	Rv0604	Rv0605	lpqO		FALSE	0.001	217.000	0.000	NA		-0.238
32376	32377	Rv0605	Rv0606			TRUE	0.717	2.000	0.000	NA		0.089
32377	32378	Rv0606	Rv0607			FALSE	0.076	54.000	0.000	NA		-0.042
32378	32379	Rv0607	Rv0608			FALSE	0.021	45.000	0.000	NA		-0.159
32379	32380	Rv0608	Rv0609			TRUE	0.939	-3.000	0.273	NA		-0.065
32380	1935740	Rv0609	Rv0609A			FALSE	0.046	-57.000	0.000	NA		-0.925
32381	32382	Rv0610c	Rv0611c			FALSE	0.012	52.000	0.000	NA		-0.178
32385	32386	Rv0614	Rv0615			FALSE	0.197	-3.000	0.000	NA		-0.262
32388	1935741	Rv0617	Rv0618		galTa	FALSE	0.038	129.000	0.000	NA		-0.030
1935741	1935742	Rv0618	Rv0619	galTa	galTb	TRUE	0.921	-57.000	0.000	0.001		0.396
1935742	32391	Rv0619	Rv0620	galTb	galK	TRUE	0.995	-3.000	0.370	0.001		0.748
32391	32392	Rv0620	Rv0621	galK		FALSE	0.014	395.000	0.000	NA		0.671
32392	1935743	Rv0621	Rv0622			FALSE	0.491	104.000	0.333	NA		0.286
1935743	32394	Rv0622	Rv0623			FALSE	0.066	93.000	0.000	NA		-0.010
32394	32395	Rv0623	Rv0624			TRUE	0.937	0.000	0.200	NA		0.178
32397	32398	Rv0626	Rv0627			TRUE	0.986	-3.000	1.000	NA		-0.095
32399	32400	Rv0628c	Rv0629c		recD	FALSE	0.049	93.000	0.000	NA		-0.056
32400	32401	Rv0629c	Rv0630c	recD	recB	TRUE	0.998	-3.000	0.688	0.001	Y	-0.005
32401	32402	Rv0630c	Rv0631c	recB	recC	TRUE	0.998	0.000	0.542	0.001	Y	0.143
32402	32403	Rv0631c	Rv0632c	recC	echA3	FALSE	0.011	277.000	0.000	1.000	N	0.246
32403	32404	Rv0632c	Rv0633c	echA3		FALSE	0.301	49.000	0.067	NA		0.075
32404	32405	Rv0633c	Rv0634c			FALSE	0.051	154.000	0.006	NA		0.004
1935744	1935745	Rv0634A	Rvnt06			FALSE	0.005	130.000	0.000	NA		NA
1935745	1935746	Rvnt06	Rvnt07			FALSE	0.014	37.000	0.000	NA		NA
1935746	1935747	Rvnt07	Rv0634B		rpmG2	FALSE	0.014	36.000	0.000	NA		NA
1935747	32406	Rv0634B	Rv0635	rpmG2		FALSE	0.466	51.000	0.079	NA		0.510
32406	32407	Rv0635	Rv0636			TRUE	0.965	-13.000	0.818	NA		0.522
32407	32408	Rv0636	Rv0637			TRUE	0.992	4.000	0.818	NA	Y	0.183
32408	1935748	Rv0637	Rvnt08			FALSE	0.002	199.000	0.000	NA		NA
1935748	1935749	Rvnt08	Rv0638		secE1	FALSE	0.004	141.000	0.000	NA		NA
1935749	32410	Rv0638	Rv0639	secE1	nusG	FALSE	0.349	32.000	0.006	1.000	N	0.382
32410	32411	Rv0639	Rv0640	nusG	rplK	TRUE	0.713	52.000	0.681	1.000	N	0.181
32411	32412	Rv0640	Rv0641	rplK	rplA	TRUE	0.956	67.000	0.838	0.022	Y	0.046
32413	32414	Rv0642c	Rv0643c	mmaA4	mmaA3	TRUE	0.939	65.000	0.286	0.004	Y	0.607
32414	32415	Rv0643c	Rv0644c	mmaA3	mmaA2	TRUE	0.904	148.000	0.667	0.004	Y	0.369
32415	32416	Rv0644c	Rv0645c	mmaA2	mmaA1	TRUE	0.830	167.000	0.400	0.004	Y	0.642
32416	32417	Rv0645c	Rv0646c	mmaA1	lipG	TRUE	0.733	47.000	0.444	NA		0.614
32417	32418	Rv0646c	Rv0647c	lipG		TRUE	0.820	12.000	0.243	NA		0.817
32419	1935750	Rv0648	Rv0649		fabD2	TRUE	0.987	-3.000	0.857	1.000		-0.029
1935750	32421	Rv0649	Rv0650	fabD2		TRUE	0.846	0.000	0.000	1.000		0.126
32421	32422	Rv0650	Rv0651		rplJ	FALSE	0.002	331.000	0.000	1.000	N	0.013
32422	32423	Rv0651	Rv0652	rplJ	rplL	TRUE	0.980	37.000	0.884	0.017	Y	0.555
32425	32426	Rv0654	Rv0655		mkl	FALSE	0.035	12.000	0.038	NA	N	-0.176
32427	32428	Rv0656c	Rv0657c			FALSE	0.203	95.000	0.000	NA		0.345
32428	32429	Rv0657c	Rv0658c			FALSE	0.009	76.000	0.000	NA		-0.219
32429	32430	Rv0658c	Rv0659c			FALSE	0.001	276.000	0.000	NA		-0.179
32430	32431	Rv0659c	Rv0660c			TRUE	0.782	-13.000	0.000	1.000		0.593
32431	32432	Rv0660c	Rv0661c			FALSE	0.068	110.000	0.000	NA		0.035
32432	32433	Rv0661c	Rv0662c			TRUE	0.582	-3.000	0.000	NA		-0.072
32434	32435	Rv0663	Rv0664	atsD		FALSE	0.025	32.000	0.000	NA		-0.158
32435	32436	Rv0664	Rv0665			TRUE	0.816	-3.000	0.000	NA		0.180
32436	32437	Rv0665	Rv0666			TRUE	0.893	-3.000	0.000	NA		0.368
32437	32438	Rv0666	Rv0667		rpoB	FALSE	0.000	498.000	0.000	NA		-0.163
32438	32439	Rv0667	Rv0668	rpoB	rpoC	TRUE	0.982	45.000	0.851	0.001	Y	0.377
32441	32442	Rv0670	Rv0671	end	lpqP	FALSE	0.015	32.000	0.004	1.000	N	-0.506
32442	32443	Rv0671	Rv0672	lpqP	fadE8	FALSE	0.161	60.000	0.071	1.000	N	-0.067
32443	32444	Rv0672	Rv0673	fadE8	echA4	TRUE	0.959	11.000	0.286	1.000	Y	0.530
32444	32445	Rv0673	Rv0674	echA4		TRUE	0.941	3.000	0.292	NA	N	0.599
32445	1935751	Rv0674	Rv0675		echA5	TRUE	0.924	-3.000	0.083	NA	N	0.557
32447	32448	Rv0676c	Rv0677c	mmpL5	mmpS5	TRUE	0.992	-3.000	1.000	NA		0.815
32450	32451	Rv0679c	Rv0680c			TRUE	0.978	2.000	0.778	NA		0.047
32452	32453	Rv0681	Rv0682		rpsL	FALSE	0.006	249.000	0.000	1.000	N	0.065
32453	32454	Rv0682	Rv0683	rpsL	rpsG	TRUE	0.998	0.000	0.620	0.003	Y	0.390
32454	1935752	Rv0683	Rv0684	rpsG	fusA1	TRUE	0.884	81.000	0.579	1.000	Y	0.315
1935752	32456	Rv0684	Rv0685	fusA1	tuf	TRUE	0.709	231.000	0.400	0.001	Y	0.426
32456	32457	Rv0685	Rv0686	tuf		FALSE	0.127	138.000	0.000	NA		0.394
32457	32458	Rv0686	Rv0687			FALSE	0.157	153.000	0.333	NA		-0.361
32458	32459	Rv0687	Rv0688			TRUE	0.818	14.000	0.214	0.055		-0.140
32460	32461	Rv0689c	Rv0690c			FALSE	0.008	613.000	0.000	NA		0.641
32461	32462	Rv0690c	Rv0691c			TRUE	0.951	-3.000	0.088	NA		0.699
32463	32464	Rv0692	Rv0693		pqqE	TRUE	0.983	-3.000	0.484	NA		0.810
32464	32465	Rv0693	Rv0694	pqqE	lldD1	TRUE	0.980	3.000	0.548	1.000		0.817
32465	32466	Rv0694	Rv0695	lldD1		FALSE	0.167	190.000	0.464	1.000		-0.278
32466	32467	Rv0695	Rv0696			TRUE	0.718	49.000	0.440	NA		0.512
32467	32468	Rv0696	Rv0697			TRUE	0.972	2.000	0.667	NA		0.006
32468	32469	Rv0697	Rv0698			FALSE	0.010	461.000	0.000	NA		0.493
32469	32470	Rv0698	Rv0699			FALSE	0.044	185.000	0.000	NA		0.231
32470	32471	Rv0699	Rv0700		rpsJ	FALSE	0.000	637.000	0.000	NA		-0.159
32471	32472	Rv0700	Rv0701	rpsJ	rplC	TRUE	0.969	17.000	0.467	0.022	Y	0.162
32472	32473	Rv0701	Rv0702	rplC	rplD	TRUE	0.996	0.000	0.361	0.017	Y	0.193
32473	32474	Rv0702	Rv0703	rplD	rplW	TRUE	0.998	0.000	0.513	0.017	Y	0.307
32474	32475	Rv0703	Rv0704	rplW	rplB	TRUE	0.964	93.000	0.849	0.014	Y	0.570
32475	32476	Rv0704	Rv0705	rplB	rpsS	TRUE	0.977	41.000	0.820	0.022	Y	0.549
32476	32477	Rv0705	Rv0706	rpsS	rplV	TRUE	0.999	-3.000	0.769	0.022	Y	0.660
32477	32478	Rv0706	Rv0707	rplV	rpsC	TRUE	0.998	0.000	0.719	0.022	Y	0.561
32478	32479	Rv0707	Rv0708	rpsC	rplP	TRUE	0.998	4.000	0.828	0.022	Y	0.596
32479	32480	Rv0708	Rv0709	rplP	rpmC	TRUE	0.998	0.000	0.802	0.017	Y	0.303
32480	32481	Rv0709	Rv0710	rpmC	rpsQ	TRUE	0.999	-3.000	0.828	0.017	Y	0.346
32481	32482	Rv0710	Rv0711	rpsQ	atsA	FALSE	0.038	169.000	0.005	1.000	N	0.140
32482	32483	Rv0711	Rv0712	atsA		TRUE	0.612	48.000	0.250	NA		0.610
32483	32484	Rv0712	Rv0713			FALSE	0.119	301.000	0.600	NA		0.326
32484	32485	Rv0713	Rv0714		rplN	FALSE	0.001	486.000	0.000	NA		-0.141
32485	32486	Rv0714	Rv0715	rplN	rplX	TRUE	0.998	1.000	0.810	0.022	Y	0.434
32486	32487	Rv0715	Rv0716	rplX	rplE	TRUE	0.998	0.000	0.758	0.017	Y	0.228
32487	1935753	Rv0716	Rv0717	rplE	rpsN1	TRUE	0.994	5.000	0.496	0.017	Y	0.261
1935753	32489	Rv0717	Rv0718	rpsN1	rpsH	TRUE	0.818	164.000	0.473	0.017	Y	0.405
32489	32490	Rv0718	Rv0719	rpsH	rplF	TRUE	0.982	24.000	0.808	0.017	Y	0.393
32490	32491	Rv0719	Rv0720	rplF	rplR	TRUE	0.997	3.000	0.815	0.017	Y	0.043
32491	32492	Rv0720	Rv0721	rplR	rpsE	TRUE	0.982	20.000	0.814	0.022	Y	0.273
32492	32493	Rv0721	Rv0722	rpsE	rpmD	TRUE	0.997	3.000	0.789	0.022	Y	0.264
32493	32494	Rv0722	Rv0723	rpmD	rplO	TRUE	0.999	0.000	0.653	0.002	Y	0.438
32494	32495	Rv0723	Rv0724	rplO	sppA	FALSE	0.106	33.000	0.000	1.000	N	0.108
1935754	32496	Rv0724A	Rv0725c			FALSE	0.042	-327.000	0.000	NA		NA
32496	32497	Rv0725c	Rv0726c			TRUE	0.626	93.000	0.000	NA	Y	0.524
32497	32498	Rv0726c	Rv0727c		fucA	FALSE	0.002	203.000	0.000	NA	N	-0.329
32498	32499	Rv0727c	Rv0728c	fucA	serA2	TRUE	0.918	-3.000	0.058	1.000	N	0.345
32500	32501	Rv0729	Rv0730	xylB		FALSE	0.507	13.000	0.018	1.000		0.030
32503	32504	Rv0732	Rv0733	secY	adk	TRUE	0.924	-3.000	0.057	1.000	N	0.402
32504	1935755	Rv0733	Rv0734	adk	mapA	TRUE	0.970	3.000	0.606	1.000	N	0.295
1935755	32506	Rv0734	Rv0735	mapA	sigL	FALSE	0.088	73.000	0.099	1.000	N	-0.282
32506	32507	Rv0735	Rv0736	sigL		TRUE	0.918	64.000	0.697	NA	Y	0.556
32507	32508	Rv0736	Rv0737			FALSE	0.130	315.000	0.065	NA	Y	0.609
32508	32509	Rv0737	Rv0738			FALSE	0.016	358.000	0.000	NA		0.630
32509	32510	Rv0738	Rv0739			FALSE	0.035	245.000	0.000	NA		0.506
32510	32511	Rv0739	Rv0740			FALSE	0.066	115.000	0.000	NA		0.044
32511	32512	Rv0740	Rv0741			FALSE	0.022	231.000	0.000	NA		0.205
32512	1935756	Rv0741	Rv0742		PE_PGRS8	FALSE	0.098	133.000	0.000	NA		0.233
32514	32515	Rv0743c	Rv0744c			TRUE	0.905	-3.000	0.000	NA		0.472
32516	1935757	Rv0745	Rv0746		PE_PGRS9	FALSE	0.300	20.000	0.000	NA		0.196
1935757	1935758	Rv0746	Rv0747	PE_PGRS9	PE_PGRS10	FALSE	0.010	399.000	0.000	NA		0.319
1935758	32519	Rv0747	Rv0748	PE_PGRS10		FALSE	0.262	91.000	0.000	1.000		0.362
32519	32520	Rv0748	Rv0749			FALSE	0.088	24.000	0.000	NA		-0.084
32522	32523	Rv0751c	Rv0752c	mmsB	fadE9	TRUE	0.929	11.000	0.051	1.000	Y	0.438
32523	32524	Rv0752c	Rv0753c	fadE9	mmsA	TRUE	0.859	7.000	0.197	1.000	N	0.596
1935761	1935762	Rv0755c	Rv0755A	PPE12		FALSE	0.001	302.000	0.000	NA		-0.924
1935762	1935763	Rv0755A	Rvnt09			FALSE	0.006	115.000	0.000	NA		NA
1935763	32527	Rvnt09	Rv0756c			FALSE	0.017	28.000	0.000	NA		NA
32528	32529	Rv0757	Rv0758	phoP	phoR	TRUE	0.965	45.000	0.824	0.051	Y	0.178
32530	32531	Rv0759c	Rv0760c			FALSE	0.284	110.000	0.014	1.000		0.403
32531	1935764	Rv0760c	Rv0761c		adhB	TRUE	0.919	13.000	0.750	1.000		0.250
1935764	32533	Rv0761c	Rv0762c	adhB		FALSE	0.395	99.000	0.400	NA		-0.185
32533	32534	Rv0762c	Rv0763c			TRUE	0.983	3.000	0.800	NA		0.415
32534	32535	Rv0763c	Rv0764c		cyp51	TRUE	0.976	3.000	0.733	NA	N	0.486
32535	32536	Rv0764c	Rv0765c	cyp51		TRUE	0.963	0.000	0.212	1.000		0.351
32536	32537	Rv0765c	Rv0766c		cyp123	TRUE	0.968	0.000	0.231	1.000		0.480
32537	32538	Rv0766c	Rv0767c	cyp123		TRUE	0.973	-3.000	0.571	1.000	N	0.054
32539	32540	Rv0768	Rv0769	aldA		TRUE	0.830	31.000	0.812	1.000	N	0.317
32540	32541	Rv0769	Rv0770			TRUE	0.846	98.000	0.480	1.000	Y	0.282
32541	32542	Rv0770	Rv0771			TRUE	0.980	-3.000	0.560	1.000		0.070
32542	32543	Rv0771	Rv0772		purD	TRUE	0.679	12.000	0.003	1.000		0.420
32544	1935765	Rv0773c	Rv0774c	ggtA		FALSE	0.373	51.000	0.073	1.000		0.116
32548	32549	Rv0777	Rv0778	purB	cyp126	TRUE	0.650	5.000	0.006	1.000	N	0.172
32551	1935766	Rv0780	Rv0781	hemH	ptrBa	TRUE	0.874	-3.000	0.035	1.000		-0.060
1935766	1935767	Rv0781	Rv0782	ptrBa	ptrBb	TRUE	0.901	-211.000	0.031	0.001		0.018
32555	32556	Rv0784	Rv0785			TRUE	0.657	16.000	0.048	1.000		0.398
32558	1935768	Rv0787	Rv0787A			FALSE	0.007	106.000	0.000	NA		NA
1935768	32560	Rv0787A	Rv0788		purQ	TRUE	0.999	-3.000	0.656	0.001	Y	0.532
32561	32562	Rv0789c	Rv0790c			FALSE	0.396	22.000	0.000	NA		0.343
32562	32563	Rv0790c	Rv0791c			TRUE	0.949	-3.000	0.070	NA		0.790
32563	32564	Rv0791c	Rv0792c			TRUE	0.958	-3.000	0.250	NA	N	0.878
32567	32568	Rv0795	Rv0796			TRUE	0.987	-3.000	0.308	0.071		0.293
32568	32569	Rv0796	Rv0797			TRUE	0.847	55.000	0.000	0.071	Y	0.476
32570	32571	Rv0798c	Rv0799c	cfp29		TRUE	0.970	-3.000	0.267	NA		0.633
32572	32573	Rv0800	Rv0801	pepC		TRUE	0.541	12.000	0.038	NA		0.153
32575	32576	Rv0803	Rv0804	purL		TRUE	0.922	-3.000	0.000	1.000		0.427
32576	32577	Rv0804	Rv0805			FALSE	0.005	121.000	0.000	1.000		-0.429
32579	32580	Rv0807	Rv0808		purF	FALSE	0.165	87.000	0.034	NA		0.015
32580	32581	Rv0808	Rv0809	purF	purM	TRUE	0.880	31.000	0.248	1.000	Y	0.405
32582	32583	Rv0810c	Rv0811c			FALSE	0.157	147.000	0.017	NA		0.465
32585	32586	Rv0813c	Rv0814c		sseC2	FALSE	0.134	163.000	0.043	NA		0.416
32586	32587	Rv0814c	Rv0815c	sseC2	cysA2	TRUE	0.982	2.000	0.557	1.000		0.565
32587	32588	Rv0815c	Rv0816c	cysA2	thiX	FALSE	0.027	293.000	0.000	1.000		0.401
32588	32589	Rv0816c	Rv0817c	thiX		TRUE	0.976	-3.000	0.371	NA		0.425
32590	32591	Rv0818	Rv0819			TRUE	0.896	-3.000	0.196	1.000		-0.388
32591	32592	Rv0819	Rv0820		phoT	FALSE	0.261	43.000	0.016	1.000		-0.032
32593	32594	Rv0821c	Rv0822c	phoY2		FALSE	0.499	58.000	0.579	NA	N	-0.234
32594	32595	Rv0822c	Rv0823c			FALSE	0.006	166.000	0.005	NA	N	-0.007
32595	1935771	Rv0823c	Rv0824c		desA1	FALSE	0.338	88.000	0.004	1.000		0.522
1935771	32597	Rv0824c	Rv0825c	desA1		FALSE	0.218	162.000	0.375	1.000		-0.136
32599	32600	Rv0827c	Rv0828c			FALSE	0.089	58.000	0.000	1.000	N	0.137
32601	32602	Rv0829	Rv0830			FALSE	0.091	105.000	0.000	NA		0.083
32603	1935772	Rv0831c	Rvnt10			FALSE	0.008	94.000	0.000	NA		NA
1935773	1935774	Rvnt11	Rvnt12			FALSE	0.014	38.000	0.000	NA		NA
1935774	1935775	Rvnt12	Rvnt13			FALSE	0.016	30.000	0.000	NA		NA
1935775	1935776	Rvnt13	Rv0832		PE_PGRS12	FALSE	0.000	665.000	0.000	NA		NA
1935776	1935777	Rv0832	Rv0833	PE_PGRS12	PE_PGRS13	TRUE	0.853	-3.000	0.000	NA		0.233
32608	32609	Rv0836c	Rv0837c			FALSE	0.285	71.000	0.000	NA		0.566
32610	32611	Rv0838	Rv0839	lpqR		FALSE	0.244	87.000	0.033	1.000	N	0.338
1935779	32614	Rv0841	Rv0842			FALSE	0.001	277.000	0.000	NA		NA
32614	32615	Rv0842	Rv0843			TRUE	0.756	-16.000	0.000	1.000		0.439
32619	1935780	Rv0847	Rv0848	lpqS	cysK2	FALSE	0.031	203.000	0.000	NA		0.213
1935780	32621	Rv0848	Rv0849	cysK2		TRUE	0.978	0.000	0.500	1.000		0.158
32621	32622	Rv0849	Rv0850			TRUE	0.884	-3.000	0.000	NA		0.328
32626	32627	Rv0854	Rv0855		far	TRUE	0.885	6.000	0.333	NA		0.015
32627	32628	Rv0855	Rv0856	far		FALSE	0.178	114.000	0.000	NA		0.412
32628	1935781	Rv0856	Rv0857			FALSE	0.214	28.000	0.000	NA		0.151
32631	32632	Rv0859	Rv0860	fadA	fadB	TRUE	0.993	5.000	0.750	1.000	Y	0.801
32633	32634	Rv0861c	Rv0862c	ercc3		FALSE	0.142	191.000	0.206	NA		0.354
32635	32636	Rv0863	Rv0864		moaC	TRUE	0.704	10.000	0.012	NA		0.393
32636	32637	Rv0864	Rv0865	moaC	mog	TRUE	0.993	-3.000	0.016	0.005	Y	0.099
32637	32638	Rv0865	Rv0866	mog	moaE2	TRUE	0.993	-3.000	0.015	0.005	Y	0.191
32639	32640	Rv0867c	Rv0868c	rpfA	moaD2	FALSE	0.001	448.000	0.000	1.000		-0.291
32640	32641	Rv0868c	Rv0869c	moaD2	moaA2	TRUE	0.981	4.000	0.410	1.000	Y	-0.147
32641	32642	Rv0869c	Rv0870c	moaA2		TRUE	0.642	-3.000	0.026	NA		-0.267
32646	32647	Rv0874c	Rv0875c			FALSE	0.132	100.000	0.000	NA		0.197
32647	32648	Rv0875c	Rv0876c			TRUE	0.967	-3.000	0.432	NA		-0.002
1935783	32651	Rv0878c	Rv0879c	PPE13		FALSE	0.001	278.000	0.000	NA		-0.244
32652	32653	Rv0880	Rv0881			TRUE	0.746	-3.000	0.029	1.000	N	-0.044
32653	32654	Rv0881	Rv0882			TRUE	0.830	-3.000	0.075	NA		-0.169
32655	32656	Rv0883c	Rv0884c		serC	FALSE	0.171	157.000	0.214	NA		0.179
32657	32658	Rv0885	Rv0886		fprB	TRUE	0.917	19.000	0.846	1.000		0.600
32661	32662	Rv0889c	Rv0890c	citA		FALSE	0.090	87.000	0.000	1.000		-0.085
32662	32663	Rv0890c	Rv0891c			TRUE	0.808	2.000	0.000	1.000		0.123
32666	32667	Rv0894	Rv0895			FALSE	0.284	77.000	0.000	NA		0.721
32667	32668	Rv0895	Rv0896		gltA2	FALSE	0.060	173.000	0.000	NA		0.265
32669	32670	Rv0897c	Rv0898c			FALSE	0.421	26.000	0.091	NA		0.103
32671	32672	Rv0899	Rv0900	ompA		TRUE	0.699	13.000	0.286	NA		-0.029
32672	32673	Rv0900	Rv0901			TRUE	0.983	0.000	0.667	NA		0.237
32674	32675	Rv0902c	Rv0903c	prrB	prrA	TRUE	0.960	11.000	0.333	1.000	Y	0.340
32675	32676	Rv0903c	Rv0904c	prrA	accD3	FALSE	0.005	131.000	0.000	1.000	N	-0.082
32677	32678	Rv0905	Rv0906	echA6		TRUE	0.924	6.000	0.314	NA		0.418
32678	32679	Rv0906	Rv0907			FALSE	0.325	74.000	0.171	NA		0.071
32679	32680	Rv0907	Rv0908		ctpE	TRUE	0.930	-3.000	0.119	1.000	N	0.313
32680	32681	Rv0908	Rv0909	ctpE		FALSE	0.003	557.000	0.000	NA		0.063
32681	32682	Rv0909	Rv0910			TRUE	0.855	6.000	0.182	NA		0.243
32682	32683	Rv0910	Rv0911			FALSE	0.097	98.000	0.000	NA		0.079
32683	32684	Rv0911	Rv0912			FALSE	0.357	65.000	0.071	NA		0.275
32685	32686	Rv0913c	Rv0914c			TRUE	0.942	2.000	0.417	NA	N	0.126
32686	1935784	Rv0914c	Rv0915c		PPE14	FALSE	0.008	93.000	0.000	NA	N	-0.004
1935784	1935785	Rv0915c	Rv0916c	PPE14	PE7	FALSE	0.427	15.000	0.000	NA		0.259
32689	32690	Rv0917	Rv0918	betP		FALSE	0.009	343.000	0.000	1.000		0.096
32690	32691	Rv0918	Rv0919			TRUE	0.960	-3.000	0.091	1.000		0.755
1935786	32692	Rvnt14	Rv0920c			FALSE	0.007	104.000	0.000	NA		NA
32693	32694	Rv0921	Rv0922			TRUE	0.958	0.000	0.000	NA	Y	-0.171
32695	1935787	Rv0923c	Rv0924c		mntH	TRUE	0.868	1.000	0.029	NA		0.189
1935787	32697	Rv0924c	Rv0925c	mntH		FALSE	0.098	32.000	0.014	NA		-0.219
32697	32698	Rv0925c	Rv0926c			FALSE	0.281	77.000	0.018	NA		0.297
32698	32699	Rv0926c	Rv0927c			TRUE	0.743	54.000	0.500	1.000		0.362
1935788	32701	Rv0928	Rv0929	pstS3	pstC2	TRUE	0.967	13.000	0.200	0.004	Y	0.175
32701	1935789	Rv0929	Rv0930	pstC2	pstA1	TRUE	0.995	-3.000	0.037	0.004	Y	0.321
32703	1935790	Rv0931c	Rv0932c	pknD	pstS2	TRUE	0.850	22.000	0.667	1.000	N	0.483
32705	1935791	Rv0933	Rv0934	pstB	pstS1	TRUE	0.922	21.000	0.000	0.004	Y	0.237
1935791	1935792	Rv0934	Rv0935	pstS1	pstC1	TRUE	0.972	60.000	1.000	0.004	Y	0.147
1935792	32708	Rv0935	Rv0936	pstC1	pstA2	TRUE	0.997	2.000	0.636	0.004	Y	0.091
32710	32711	Rv0938	Rv0939			TRUE	0.850	-3.000	0.043	1.000	N	0.116
32712	32713	Rv0940c	Rv0941c			FALSE	0.392	85.000	0.182	NA		0.296
32716	32717	Rv0944	Rv0945			TRUE	0.609	6.000	0.082	1.000		-0.540
32718	32719	Rv0946c	Rv0947c	pgi		FALSE	0.005	618.000	0.000	NA		0.283
32719	32720	Rv0947c	Rv0948c			FALSE	0.176	116.000	0.000	NA		0.427
32723	32724	Rv0951	Rv0952	sucC	sucD	TRUE	0.987	13.000	0.382	0.001	Y	0.721
32726	32727	Rv0954	Rv0955			TRUE	0.553	40.000	0.218	NA		0.306
32727	32728	Rv0955	Rv0956		purN	FALSE	0.143	116.000	0.044	NA		0.055
32728	32729	Rv0956	Rv0957	purN	purH	TRUE	0.984	-3.000	0.225	1.000	Y	-0.178
32729	32730	Rv0957	Rv0958	purH		FALSE	0.097	107.000	0.002	1.000	N	0.158
32730	32731	Rv0958	Rv0959			TRUE	0.955	-7.000	0.645	1.000		0.181
32731	32732	Rv0959	Rv0960			FALSE	0.008	272.000	0.000	NA		0.019
32732	32733	Rv0960	Rv0961			FALSE	0.005	146.000	0.000	NA		-0.165
32734	32735	Rv0962c	Rv0963c	lprP		FALSE	0.007	183.000	0.000	NA		-0.115
32735	32736	Rv0963c	Rv0964c			FALSE	0.113	99.000	0.000	NA		0.157
32736	32737	Rv0964c	Rv0965c			FALSE	0.008	100.000	0.000	NA		-0.234
32737	1935794	Rv0965c	Rv0966c			FALSE	0.310	36.000	0.000	NA		0.330
32739	32740	Rv0967	Rv0968			FALSE	0.392	57.000	0.012	NA		0.722
32740	32741	Rv0968	Rv0969		ctpV	TRUE	0.718	56.000	0.500	NA		0.402
32741	32742	Rv0969	Rv0970	ctpV		TRUE	0.988	-3.000	0.667	NA		0.655
32743	32744	Rv0971c	Rv0972c	echA7	fadE12	TRUE	0.991	0.000	0.203	1.000	Y	0.683
32744	32745	Rv0972c	Rv0973c	fadE12	accA2	TRUE	0.997	-3.000	0.812	1.000	Y	0.551
32745	32746	Rv0973c	Rv0974c	accA2	accD2	TRUE	0.997	6.000	0.875	0.003	Y	0.464
32746	32747	Rv0974c	Rv0975c	accD2	fadE13	TRUE	0.993	3.000	0.548	1.000	Y	0.438
32747	32748	Rv0975c	Rv0976c	fadE13		TRUE	0.981	-3.000	0.562	NA		0.244
1935796	1935797	Rv0978c	Rv0979c	PE_PGRS17		FALSE	0.016	314.000	0.000	NA		0.356
32753	32754	Rv0981	Rv0982	mprA	mprB	TRUE	0.998	0.000	0.655	0.007	Y	0.682
32754	32755	Rv0982	Rv0983	mprB	pepD	TRUE	0.627	44.000	0.424	1.000	N	0.213
32755	32756	Rv0983	Rv0984	pepD	moaB2	TRUE	0.963	0.000	0.423	1.000	N	0.117
32758	32759	Rv0986	Rv0987			TRUE	0.947	-7.000	0.210	1.000	Y	-0.303
32759	32760	Rv0987	Rv0988			TRUE	0.824	7.000	0.152	1.000		0.165
32761	32762	Rv0989c	Rv0990c	grcC2		FALSE	0.036	61.000	0.000	NA		-0.118
32762	32763	Rv0990c	Rv0991c			FALSE	0.323	73.000	0.022	NA		0.378
32763	32764	Rv0991c	Rv0992c			FALSE	0.316	74.000	0.041	NA		0.310
32765	1935800	Rv0993	Rv0994	galU	moeA1	FALSE	0.436	77.000	0.196	1.000	N	0.534
1935800	32767	Rv0994	Rv0995	moeA1	rimJ	TRUE	0.644	63.000	0.427	1.000	N	0.522
32767	32768	Rv0995	Rv0996	rimJ		FALSE	0.182	161.000	0.183	NA		0.311
32768	1935801	Rv0996	Rvnt15			FALSE	0.012	51.000	0.000	NA		NA
1935801	32769	Rvnt15	Rv0997			FALSE	0.000	710.000	0.000	NA		NA
32769	32770	Rv0997	Rv0998			FALSE	0.345	24.000	0.000	NA		0.281
32770	32771	Rv0998	Rv0999			FALSE	0.485	18.000	0.000	NA		0.577
32777	32778	Rv1004c	Rv1005c		pabB	FALSE	0.280	74.000	0.006	NA		0.334
32781	32782	Rv1008	Rv1009	tatD	rpfB	FALSE	0.003	208.000	0.008	NA		-0.354
32782	32783	Rv1009	Rv1010	rpfB	ksgA	TRUE	0.788	-27.000	0.008	1.000		0.667
32783	32784	Rv1010	Rv1011	ksgA	ispE	FALSE	0.308	86.000	0.068	1.000	N	0.431
32784	32785	Rv1011	Rv1012	ispE		FALSE	0.210	17.000	0.000	NA		0.026
32785	32786	Rv1012	Rv1013		pks16	FALSE	0.030	204.000	0.000	NA		0.205
32787	32788	Rv1014c	Rv1015c	pth	rplY	TRUE	0.984	13.000	0.496	0.024	Y	0.659
32788	32789	Rv1015c	Rv1016c	rplY	lpqT	FALSE	0.002	217.000	0.000	NA		-0.155
32789	32790	Rv1016c	Rv1017c	lpqT	prsA	FALSE	0.014	36.000	0.000	NA		-0.341
32790	32791	Rv1017c	Rv1018c	prsA	glmU	FALSE	0.130	92.000	0.026	1.000	N	0.072
32791	1935803	Rv1018c	Rvnt16	glmU		FALSE	0.026	16.000	0.000	NA		NA
32792	32793	Rv1019	Rv1020		mfd	TRUE	0.809	59.000	0.013	0.049	Y	0.005
32793	32794	Rv1020	Rv1021	mfd		TRUE	0.774	0.000	0.026	1.000		-0.267
32794	32795	Rv1021	Rv1022		lpqU	FALSE	0.156	88.000	0.000	NA		0.224
32795	32796	Rv1022	Rv1023	lpqU	eno	FALSE	0.008	97.000	0.012	NA	N	-0.084
32796	32797	Rv1023	Rv1024	eno		TRUE	0.771	5.000	0.043	1.000	N	0.227
32797	32798	Rv1024	Rv1025			TRUE	0.734	17.000	0.252	NA		0.377
32798	32799	Rv1025	Rv1026			TRUE	0.841	-9.000	0.243	NA		0.073
32800	32801	Rv1027c	Rv1028c	kdpE	kdpD	TRUE	0.994	-3.000	0.429	1.000	Y	0.390
1935804	32802	Rv1028A	Rv1029	kdpF	kdpA	TRUE	0.976	0.000	0.152	0.001		NA
32802	32803	Rv1029	Rv1030	kdpA	kdpB	TRUE	0.993	-3.000	0.124	0.001	Y	-0.371
32803	32804	Rv1030	Rv1031	kdpB	kdpC	TRUE	0.993	0.000	0.015	0.001	Y	-0.023
32805	32806	Rv1032c	Rv1033c	trcS	trcR	TRUE	0.992	8.000	0.556	0.049	Y	0.585
32806	32807	Rv1033c	Rv1034c	trcR		FALSE	0.018	182.000	0.000	NA	N	0.241
32807	32808	Rv1034c	Rv1035c			FALSE	0.070	68.000	0.000	NA		-0.033
32808	32809	Rv1035c	Rv1036c			FALSE	0.354	34.000	0.000	NA		0.435
32809	32810	Rv1036c	Rv1037c		esxI	FALSE	0.035	111.000	0.000	NA		-0.069
32810	32811	Rv1037c	Rv1038c	esxI	esxJ	FALSE	0.420	27.000	0.000	NA		0.618
32811	1935805	Rv1038c	Rv1039c	esxJ	PPE15	FALSE	0.005	146.000	0.000	NA		-0.164
1935805	1935806	Rv1039c	Rv1040c	PPE15	PE8	TRUE	0.565	77.000	0.667	NA		-0.346
1935806	32814	Rv1040c	Rv1041c	PE8		FALSE	0.000	1196.000	0.000	NA		-0.278
32814	32815	Rv1041c	Rv1042c			TRUE	0.932	-343.000	0.250	NA	Y	0.165
32815	32816	Rv1042c	Rv1043c			FALSE	0.008	282.000	0.000	NA		0.057
32817	32818	Rv1044	Rv1045			FALSE	0.197	-3.000	0.000	NA		-0.237
32822	32823	Rv1049	Rv1050			FALSE	0.396	49.000	0.000	1.000		0.579
1935808	1935809	Rv1054	Rv1055			TRUE	0.873	-3.000	0.000	NA		0.288
1935809	1935810	Rv1055	Rvnt17			FALSE	0.019	23.000	0.000	NA		NA
1935810	32829	Rvnt17	Rv1056			FALSE	0.003	159.000	0.000	NA		NA
32829	32830	Rv1056	Rv1057			FALSE	0.000	1004.000	0.000	NA		-0.205
32830	32831	Rv1057	Rv1058		fadD14	FALSE	0.090	107.000	0.125	NA		-0.597
32831	32832	Rv1058	Rv1059	fadD14		FALSE	0.335	76.000	0.286	1.000		-0.459
32832	32833	Rv1059	Rv1060			FALSE	0.499	53.000	0.286	NA		0.120
32833	32834	Rv1060	Rv1061			TRUE	0.687	34.000	0.333	NA		0.388
32834	32835	Rv1061	Rv1062			TRUE	0.886	5.000	0.250	1.000		-0.041
32836	32837	Rv1063c	Rv1064c		lpqV	FALSE	0.303	81.000	0.016	NA		0.392
32838	32839	Rv1065	Rv1066			TRUE	0.977	-3.000	0.429	NA		0.297
1935811	1935812	Rv1067c	Rv1068c	PE_PGRS19	PE_PGRS20	FALSE	0.006	333.000	0.000	NA		0.099
1935812	32842	Rv1068c	Rv1069c	PE_PGRS20		FALSE	0.005	362.000	0.000	NA		0.079
32842	32843	Rv1069c	Rv1070c		echA8	TRUE	0.964	-3.000	0.259	NA		0.334
32843	32844	Rv1070c	Rv1071c	echA8	echA9	TRUE	0.965	12.000	0.128	0.007	Y	0.218
32845	32846	Rv1072	Rv1073			FALSE	0.167	116.000	0.000	NA		0.381
32847	32848	Rv1074c	Rv1075c	fadA3		FALSE	0.175	53.000	0.000	1.000	N	0.262
32849	1935813	Rv1076	Rv1077	lipU	cbs	FALSE	0.347	57.000	0.017	1.000	N	0.657
1935813	32851	Rv1077	Rv1078	cbs	pra	FALSE	0.087	202.000	0.034	NA		0.546
32851	32852	Rv1078	Rv1079	pra	metB	FALSE	0.457	32.000	0.028	NA		0.437
32853	32854	Rv1080c	Rv1081c	greA		FALSE	0.076	186.000	0.250	NA		-0.242
32855	32856	Rv1082	Rv1083	mca		TRUE	0.749	-3.000	0.099	NA		-0.585
32856	32857	Rv1083	Rv1084			FALSE	0.446	-13.000	0.011	NA		-0.106
32859	1935814	Rv1086	Rv1087		PE_PGRS21	FALSE	0.024	177.000	0.000	NA		0.028
1935814	1935815	Rv1087	Rv1087A	PE_PGRS21		FALSE	0.002	177.000	0.000	NA		NA
1935815	1935816	Rv1087A	Rv1088		PE9	FALSE	0.003	153.000	0.000	NA		NA
1935816	1935817	Rv1088	Rv1089	PE9	PE10	FALSE	0.395	-178.000	0.000	NA		0.089
1935817	1935818	Rv1089	Rv1089A	PE10	celA2a	FALSE	0.000	386.000	0.000	1.000		NA
1935818	32863	Rv1089A	Rv1090	celA2a	celA2b	TRUE	0.847	-22.000	0.000	0.001		NA
32863	1935819	Rv1090	Rv1091	celA2b	PE_PGRS22	FALSE	0.002	415.000	0.000	NA		-0.072
1935820	32867	Rv1093	Rv1094	glyA1	desA2	FALSE	0.322	105.000	0.143	1.000		0.186
32867	32868	Rv1094	Rv1095	desA2	phoH2	FALSE	0.055	211.000	0.046	1.000		0.074
32868	32869	Rv1095	Rv1096	phoH2		FALSE	0.215	87.000	0.108	1.000	N	0.108
32870	32871	Rv1097c	Rv1098c		fumC	TRUE	0.888	-3.000	0.014	NA		0.208
32871	32872	Rv1098c	Rv1099c	fumC		FALSE	0.487	31.000	0.071	1.000	N	0.605
32874	32875	Rv1101c	Rv1102c			FALSE	0.132	112.000	0.000	NA		0.245
32875	32876	Rv1102c	Rv1103c			TRUE	0.973	0.000	0.286	1.000		0.452
32877	1935821	Rv1104	Rv1105			FALSE	0.016	321.000	0.000	NA		0.362
32879	32880	Rv1106c	Rv1107c		xseB	TRUE	0.675	10.000	0.009	1.000	N	0.530
32880	32881	Rv1107c	Rv1108c	xseB	xseA	TRUE	0.994	-10.000	0.412	0.001	Y	0.417
32881	32882	Rv1108c	Rv1109c	xseA		TRUE	0.664	-3.000	0.024	NA		-0.239
32885	32886	Rv1112	Rv1113			FALSE	0.118	88.000	0.000	NA		0.155
32886	32887	Rv1113	Rv1114			TRUE	0.981	-3.000	0.689	NA		0.036
32887	32888	Rv1114	Rv1115			FALSE	0.039	203.000	0.000	NA		0.266
32888	32889	Rv1115	Rv1116			FALSE	0.015	118.000	0.000	NA		-0.135
32891	32892	Rv1118c	Rv1119c			FALSE	0.265	33.000	0.000	NA		0.240
32892	32893	Rv1119c	Rv1120c			TRUE	0.980	-3.000	0.000	0.004		0.457
1935825	32895	Rv1121	Rv1122	zwf1	gnd2	TRUE	0.870	22.000	0.062	1.000	Y	0.469
32897	32898	Rv1124	Rv1125	ephC		TRUE	0.856	5.000	0.070	NA		0.308
32899	32900	Rv1126c	Rv1127c		ppdK	TRUE	0.988	-3.000	0.750	NA		0.366
32900	32901	Rv1127c	Rv1128c	ppdK		FALSE	0.001	213.000	0.000	NA		-0.205
32901	32902	Rv1128c	Rv1129c			FALSE	0.162	102.000	0.000	NA		0.257
32903	32904	Rv1130	Rv1131		gltA1	TRUE	0.971	-3.000	0.216	1.000		0.974
32904	32905	Rv1131	Rv1132	gltA1		FALSE	0.107	12.000	0.000	NA		-0.123
1935827	32909	Rv1135A	Rv1136			FALSE	0.012	50.000	0.000	1.000		NA
32910	32911	Rv1137c	Rv1138c			FALSE	0.511	17.000	0.000	NA		0.694
32911	32912	Rv1138c	Rv1139c			TRUE	0.960	-3.000	0.176	1.000		0.342
32914	32915	Rv1141c	Rv1142c	echA11	echA10	TRUE	0.606	143.000	0.000	0.007	Y	0.008
32916	32917	Rv1143	Rv1144	mcr		TRUE	0.869	12.000	0.636	1.000	N	0.151
32917	32918	Rv1144	Rv1145		mmpL13a	FALSE	0.012	515.000	0.000	1.000		0.542
32918	32919	Rv1145	Rv1146	mmpL13a	mmpL13b	TRUE	0.708	21.000	0.000	0.048		0.247
32919	32920	Rv1146	Rv1147	mmpL13b		FALSE	0.240	133.000	0.080	1.000		0.263
32922	32923	Rv1149	Rv1150			FALSE	0.340	-31.000	0.000	NA		0.005
32926	32927	Rv1153c	Rv1154c	omt		TRUE	0.900	-3.000	0.091	NA		0.039
32928	32929	Rv1155	Rv1156			FALSE	0.007	434.000	0.000	1.000		0.165
32930	32931	Rv1157c	Rv1158c			TRUE	0.835	8.000	0.222	NA		0.232
32933	32934	Rv1160	Rv1161	mutT2	narG	FALSE	0.004	308.000	0.000	1.000	N	0.126
32934	32935	Rv1161	Rv1162	narG	narH	TRUE	0.932	39.000	0.227	0.001	Y	-0.021
32935	32936	Rv1162	Rv1163	narH	narJ	TRUE	0.917	57.000	0.182	0.002	Y	0.204
32936	32937	Rv1163	Rv1164	narJ	narI	TRUE	0.993	3.000	0.059	0.002	Y	0.319
32937	32938	Rv1164	Rv1165	narI	typA	FALSE	0.434	22.000	0.002	1.000	N	0.478
32938	32939	Rv1165	Rv1166	typA	lpqW	FALSE	0.147	98.000	0.025	1.000	N	0.170
32940	1935829	Rv1167c	Rv1168c		PPE17	FALSE	0.131	72.000	0.000	NA	N	0.355
1935829	1935830	Rv1168c	Rv1169c	PPE17	PE11	FALSE	0.498	18.000	0.000	NA		0.739
32943	1935831	Rv1170	Rv1171	mshB		FALSE	0.407	92.000	0.387	NA		-0.146
32947	32948	Rv1174c	Rv1175c	TB8.4	fadH	FALSE	0.061	201.000	0.000	NA		0.542
32948	32949	Rv1175c	Rv1176c	fadH		TRUE	0.929	-3.000	0.093	NA	N	0.661
32950	32951	Rv1177	Rv1178	fdxC		FALSE	0.372	33.000	0.029	1.000	N	0.350
32953	32954	Rv1180	Rv1181	pks3	pks4	TRUE	0.809	43.000	0.333	0.019		0.118
32954	32955	Rv1181	Rv1182	pks4	papA3	TRUE	0.548	53.000	0.250	NA		0.326
32955	32956	Rv1182	Rv1183	papA3	mmpL10	TRUE	0.800	67.000	1.000	NA		0.240
32957	32958	Rv1184c	Rv1185c		fadD21	FALSE	0.076	165.000	0.000	NA		0.339
32958	32959	Rv1185c	Rv1186c	fadD21		FALSE	0.233	177.000	0.000	NA	Y	0.091
32960	32961	Rv1187	Rv1188	rocA		TRUE	0.933	0.000	0.181	1.000	N	0.265
32961	32962	Rv1188	Rv1189		sigI	FALSE	0.009	82.000	0.000	1.000	N	-0.085
32962	32963	Rv1189	Rv1190	sigI		FALSE	0.363	16.000	0.000	NA		0.216
32963	32964	Rv1190	Rv1191			FALSE	0.051	73.000	0.000	NA		-0.072
32964	32965	Rv1191	Rv1192			FALSE	0.064	82.000	0.000	NA		-0.027
32965	32966	Rv1192	Rv1193		fadD36	FALSE	0.451	40.000	0.000	0.041		-0.243
1935833	1935834	Rv1195	Rv1196	PE13	PPE18	FALSE	0.312	47.000	0.000	NA		0.398
1935834	32970	Rv1196	Rv1197	PPE18	esxK	FALSE	0.159	135.000	0.000	NA		0.668
32970	32971	Rv1197	Rv1198	esxK	esxL	FALSE	0.345	51.000	0.000	NA		0.840
32976	32977	Rv1203c	Rv1204c			FALSE	0.116	31.000	0.000	1.000		-0.158
32978	32979	Rv1205	Rv1206		fadD6	TRUE	0.544	50.000	0.324	NA		0.106
32979	32980	Rv1206	Rv1207	fadD6	folP2	FALSE	0.229	66.000	0.172	1.000	N	-0.077
32980	32981	Rv1207	Rv1208	folP2		TRUE	0.800	-3.000	0.136	NA		-0.472
32981	32982	Rv1208	Rv1209			FALSE	0.349	39.000	0.045	NA		0.198
32982	32983	Rv1209	Rv1210		tagA	TRUE	0.893	-3.000	0.013	NA		0.224
32983	32984	Rv1210	Rv1211	tagA		FALSE	0.063	107.000	0.021	NA		-0.185
1935836	32988	Rv1214c	Rv1215c	PE14		FALSE	0.020	134.000	0.000	NA		-0.096
32988	32989	Rv1215c	Rv1216c			FALSE	0.284	28.000	0.080	1.000		-0.280
32989	32990	Rv1216c	Rv1217c			TRUE	0.719	9.000	0.111	NA	N	0.364
32990	32991	Rv1217c	Rv1218c			TRUE	0.946	-3.000	0.185	NA	N	0.815
32991	32992	Rv1218c	Rv1219c			TRUE	0.794	-10.000	0.000	1.000		0.582
32992	32993	Rv1219c	Rv1220c			FALSE	0.153	142.000	0.000	1.000		0.410
32994	32995	Rv1221	Rv1222	sigE		FALSE	0.157	158.000	0.224	NA		0.058
32995	1935837	Rv1222	Rv1223		htrA	TRUE	0.731	67.000	0.607	NA		0.389
1935837	32997	Rv1223	Rv1224	htrA	tatB	TRUE	0.937	2.000	0.242	1.000	N	0.318
32998	32999	Rv1225c	Rv1226c			FALSE	0.209	111.000	0.054	NA		0.217
32999	33000	Rv1226c	Rv1227c			TRUE	0.978	-3.000	0.542	NA		0.187
33002	33003	Rv1229c	Rv1230c	mrp		TRUE	0.674	13.000	0.089	1.000	N	0.535
33003	33004	Rv1230c	Rv1231c			FALSE	0.140	125.000	0.139	NA		-0.108
33004	33005	Rv1231c	Rv1232c			TRUE	0.982	-3.000	0.806	NA		-0.120
33005	33006	Rv1232c	Rv1233c			FALSE	0.010	62.000	0.000	NA		-0.317
33007	33008	Rv1234	Rv1235		lpqY	TRUE	0.558	21.000	0.211	NA		0.069
33008	33009	Rv1235	Rv1236	lpqY	sugA	TRUE	0.996	-3.000	0.252	0.022	Y	0.513
33009	33010	Rv1236	Rv1237	sugA	sugB	TRUE	0.995	5.000	0.723	0.022	Y	0.059
33010	33011	Rv1237	Rv1238	sugB	sugC	TRUE	0.986	5.000	0.191	0.022	Y	0.140
33013	33014	Rv1240	Rv1241	mdh		FALSE	0.263	76.000	0.000	NA		0.474
33014	33015	Rv1241	Rv1242			TRUE	0.990	-3.000	0.800	NA		0.534
33018	33019	Rv1245c	Rv1246c			FALSE	0.123	57.000	0.000	NA		0.052
33019	33020	Rv1246c	Rv1247c			TRUE	0.979	-3.000	0.000	NA	Y	0.348
33020	33021	Rv1247c	Rv1248c		kgd	FALSE	0.014	113.000	0.000	NA	N	0.151
33021	33022	Rv1248c	Rv1249c	kgd		FALSE	0.094	142.000	0.013	NA		0.159
33024	33025	Rv1251c	Rv1252c		lprE	FALSE	0.483	56.000	0.133	NA		0.486
33026	33027	Rv1253	Rv1254	deaD		FALSE	0.197	-3.000	0.006	1.000	N	-0.190
33028	33029	Rv1255c	Rv1256c		cyp130	TRUE	0.976	0.000	0.833	1.000	N	-0.298
33029	33030	Rv1256c	Rv1257c	cyp130		FALSE	0.494	114.000	0.500	1.000	N	0.244
33030	33031	Rv1257c	Rv1258c			TRUE	0.964	-3.000	0.143	1.000		0.755
33032	33033	Rv1259	Rv1260			FALSE	0.539	2.000	0.016	NA	N	0.031
33034	33035	Rv1261c	Rv1262c			TRUE	0.632	5.000	0.136	NA		-0.472
33036	33037	Rv1263	Rv1264	amiB2		FALSE	0.085	75.000	0.000	1.000	N	0.164
33037	33038	Rv1264	Rv1265			FALSE	0.078	173.000	0.000	NA		0.385
33039	33040	Rv1266c	Rv1267c	pknH	embR	FALSE	0.069	341.000	0.000	1.000	Y	0.194
33040	33041	Rv1267c	Rv1268c	embR		FALSE	0.026	311.000	0.000	1.000		0.546
33041	33042	Rv1268c	Rv1269c			FALSE	0.009	223.000	0.000	NA		-0.034
33042	33043	Rv1269c	Rv1270c		lprA	TRUE	0.694	61.000	0.667	NA		0.060
33043	33044	Rv1270c	Rv1271c	lprA		FALSE	0.005	213.000	0.000	NA		-0.118
33044	33045	Rv1271c	Rv1272c			FALSE	0.007	108.000	0.000	NA		-0.246
33045	33046	Rv1272c	Rv1273c			TRUE	0.999	-3.000	1.000	0.004	Y	0.324
33047	33048	Rv1274	Rv1275	lprB	lprC	TRUE	0.982	-3.000	0.692	NA		0.092
33050	33051	Rv1277	Rv1278			TRUE	0.990	-3.000	0.312	NA	Y	0.170
33051	33052	Rv1278	Rv1279			FALSE	0.399	21.000	0.017	NA	N	0.448
33053	33054	Rv1280c	Rv1281c	oppA	oppD	TRUE	0.967	-7.000	0.242	1.000	Y	0.156
33054	33055	Rv1281c	Rv1282c	oppD	oppC	TRUE	0.987	-3.000	0.303	1.000	Y	-0.144
33055	33056	Rv1282c	Rv1283c	oppC	oppB	TRUE	0.998	-3.000	0.846	0.022	Y	0.083
33057	33058	Rv1284	Rv1285		cysD	FALSE	0.310	94.000	0.136	1.000	N	0.312
33058	33059	Rv1285	Rv1286	cysD	cysN	TRUE	0.993	0.000	0.483	0.001	N	0.361
33059	33060	Rv1286	Rv1287	cysN		FALSE	0.322	54.000	0.073	NA	N	0.383
33060	33061	Rv1287	Rv1288			FALSE	0.011	58.000	0.000	NA		-0.275
33061	33062	Rv1288	Rv1289			FALSE	0.012	49.000	0.000	NA		-0.208
33064	1935840	Rv1291c	Rvnt18			FALSE	0.000	359.000	0.000	NA		NA
33065	33066	Rv1292	Rv1293	argS	lysA	TRUE	0.929	-3.000	0.071	1.000	N	0.409
33066	33067	Rv1293	Rv1294	lysA	thrA	TRUE	0.971	4.000	0.071	1.000	Y	0.216
33067	33068	Rv1294	Rv1295	thrA	thrC	TRUE	0.982	-3.000	0.194	1.000	Y	-0.166
33068	33069	Rv1295	Rv1296	thrC	thrB	FALSE	0.288	218.000	0.221	1.000	Y	0.076
33069	33070	Rv1296	Rv1297	thrB	rho	FALSE	0.072	257.000	0.000	0.084	N	0.448
33070	33071	Rv1297	Rv1298	rho	rpmE	FALSE	0.063	151.000	0.115	1.000	N	-0.107
33071	33072	Rv1298	Rv1299	rpmE	prfA	TRUE	0.619	90.000	0.110	1.000	Y	-0.117
33072	33073	Rv1299	Rv1300	prfA	hemK	TRUE	0.986	-3.000	0.069	1.000	Y	0.260
33073	33074	Rv1300	Rv1301	hemK		TRUE	0.948	16.000	0.583	NA	Y	0.216
33074	33075	Rv1301	Rv1302		rfe	FALSE	0.409	84.000	0.248	NA	N	0.483
33075	33076	Rv1302	Rv1303	rfe		FALSE	0.016	257.000	0.000	1.000		0.035
33076	33077	Rv1303	Rv1304		atpB	TRUE	0.761	-7.000	0.021	1.000		0.140
33077	33078	Rv1304	Rv1305	atpB	atpE	TRUE	0.970	49.000	0.557	0.003	Y	0.543
33078	33079	Rv1305	Rv1306	atpE	atpF	TRUE	0.927	31.000	0.012	0.003	Y	0.430
33079	33080	Rv1306	Rv1307	atpF	atpH	TRUE	0.982	7.000	0.008	0.003	Y	0.411
33080	33081	Rv1307	Rv1308	atpH	atpA	TRUE	0.971	45.000	0.864	0.003	Y	-0.059
33081	33082	Rv1308	Rv1309	atpA	atpG	TRUE	0.996	7.000	0.846	0.003	Y	0.405
33082	33083	Rv1309	Rv1310	atpG	atpD	TRUE	0.975	40.000	0.724	0.003	Y	0.278
33083	33084	Rv1310	Rv1311	atpD	atpC	TRUE	0.991	14.000	0.837	0.003	Y	0.348
33084	33085	Rv1311	Rv1312	atpC		TRUE	0.549	8.000	0.054	NA		-0.108
33086	33087	Rv1313c	Rv1314c			FALSE	0.115	166.000	0.000	1.000		0.485
33088	1935841	Rv1315	Rvnr01	murA	rrs	FALSE	0.001	269.000	0.000	NA		NA
1935841	1935842	Rvnr01	Rvnr02	rrs	rrl	FALSE	0.001	276.000	0.000	NA		NA
1935842	1935843	Rvnr02	Rvnr03	rrl	rrf	FALSE	0.007	104.000	0.000	NA		NA
33089	33090	Rv1316c	Rv1317c	ogt	alkA	TRUE	0.995	-3.000	0.093	0.001	Y	0.091
33090	33091	Rv1317c	Rv1318c	alkA		FALSE	0.009	81.000	0.000	1.000	N	-0.259
33091	33092	Rv1318c	Rv1319c			TRUE	0.877	70.000	0.000	0.002	Y	0.411
33092	33093	Rv1319c	Rv1320c			TRUE	0.961	13.000	0.000	0.002	Y	0.451
33094	33095	Rv1321	Rv1322			FALSE	0.491	23.000	0.141	NA		0.140
33096	33097	Rv1323	Rv1324	fadA4		FALSE	0.051	130.000	0.035	1.000	N	-0.079
1935845	33099	Rv1325c	Rv1326c	PE_PGRS24	glgB	FALSE	0.108	152.000	0.000	NA		0.432
33099	1935846	Rv1326c	Rv1327c	glgB	glgE	TRUE	0.979	8.000	0.159	0.004	Y	0.063
33102	1935847	Rv1329c	Rv1330c	dinG		FALSE	0.439	24.000	0.080	1.000	N	0.235
33104	33105	Rv1331	Rv1332	clpS		TRUE	0.936	-40.000	0.823	NA		0.133
33105	33106	Rv1332	Rv1333			FALSE	0.257	17.000	0.093	NA		-0.369
33106	33107	Rv1333	Rv1334			FALSE	0.259	8.000	0.044	NA		-0.487
33107	33108	Rv1334	Rv1335			FALSE	0.402	22.000	0.093	NA		-0.010
33108	33109	Rv1335	Rv1336		cysM	FALSE	0.382	10.000	0.052	1.000	N	-0.098
33109	33110	Rv1336	Rv1337	cysM		TRUE	0.723	-9.000	0.032	1.000		0.026
33110	33111	Rv1337	Rv1338		murI	TRUE	0.916	-3.000	0.024	1.000		0.200
33111	33112	Rv1338	Rv1339	murI		FALSE	0.219	27.000	0.054	1.000		-0.373
33112	33113	Rv1339	Rv1340		rph	TRUE	0.645	17.000	0.053	1.000		0.412
33113	33114	Rv1340	Rv1341	rph		FALSE	0.467	39.000	0.262	1.000	N	0.077
1935848	33116	Rv1342c	Rv1343c		lprD	TRUE	0.972	-3.000	0.286	NA		0.663
33117	33118	Rv1344	Rv1345		fadD33	TRUE	0.973	-7.000	0.286	1.000	Y	0.201
33118	33119	Rv1345	Rv1346	fadD33	fadE14	TRUE	0.987	0.000	0.200	1.000	Y	0.186
1935849	33121	Rvnt19	Rv1348			FALSE	0.001	236.000	0.000	NA		NA
33121	33122	Rv1348	Rv1349			TRUE	0.998	-3.000	0.686	0.004	Y	0.208
33122	33123	Rv1349	Rv1350		fabG	FALSE	0.076	129.000	0.000	1.000	N	0.240
33123	33124	Rv1350	Rv1351	fabG		TRUE	0.770	-3.000	0.000	NA		0.073
33124	33125	Rv1351	Rv1352			FALSE	0.012	203.000	0.000	NA		-0.031
33126	33127	Rv1353c	Rv1354c			FALSE	0.404	20.000	0.000	1.000	N	0.555
33127	33128	Rv1354c	Rv1355c		moeY	TRUE	0.627	9.000	0.000	1.000	N	0.502
33128	33129	Rv1355c	Rv1356c	moeY		TRUE	0.962	-3.000	0.200	NA		0.553
33129	33130	Rv1356c	Rv1357c			FALSE	0.002	473.000	0.000	NA		-0.004
33131	33132	Rv1358	Rv1359			TRUE	0.546	82.000	0.000	0.004		0.140
33132	33133	Rv1359	Rv1360			FALSE	0.001	423.000	0.000	NA	N	0.192
1935850	33135	Rv1361c	Rv1362c	PPE19		FALSE	0.004	315.000	0.000	NA		-0.024
33135	33136	Rv1362c	Rv1363c			TRUE	0.856	-3.000	0.000	NA		0.240
33136	1935851	Rv1363c	Rv1364c			FALSE	0.009	291.000	0.000	NA		0.127
1935851	33138	Rv1364c	Rv1365c		rsfA	FALSE	0.403	139.000	0.000	1.000	Y	0.145
33142	33143	Rv1369c	Rv1370c			TRUE	0.754	51.000	0.308	0.066		0.151
33144	1935852	Rv1371	Rv1372			TRUE	0.911	-3.000	0.028	1.000	N	0.384
1935852	33146	Rv1372	Rv1373			FALSE	0.212	6.000	0.000	1.000		-0.289
33148	33149	Rv1375	Rv1376			TRUE	0.929	-3.000	0.282	NA		-0.186
33150	33151	Rv1377c	Rv1378c			FALSE	0.040	11.000	0.000	NA		-0.470
33152	33153	Rv1379	Rv1380	pyrR	pyrB	TRUE	0.992	-3.000	0.247	1.000	Y	0.558
33153	33154	Rv1380	Rv1381	pyrB	pyrC	TRUE	0.995	-3.000	0.452	1.000	Y	0.600
33154	33155	Rv1381	Rv1382	pyrC		TRUE	0.945	-3.000	0.057	NA		0.627
33155	33156	Rv1382	Rv1383		carA	TRUE	0.912	-3.000	0.050	NA		0.220
33156	1935854	Rv1383	Rv1384	carA	carB	TRUE	0.998	0.000	0.345	0.001	Y	0.406
1935854	33158	Rv1384	Rv1385	carB	pyrF	TRUE	0.986	-3.000	0.075	1.000	Y	0.296
33158	1935855	Rv1385	Rv1386	pyrF	PE15	FALSE	0.009	195.000	0.000	NA		-0.079
1935855	1935856	Rv1386	Rv1387	PE15	PPE20	TRUE	0.988	-3.000	0.667	NA		0.749
1935856	33161	Rv1387	Rv1388	PPE20	mihF	FALSE	0.022	306.000	0.000	NA		0.660
33161	33162	Rv1388	Rv1389	mihF	gmk	FALSE	0.148	135.000	0.054	1.000		0.035
33162	33163	Rv1389	Rv1390	gmk	rpoZ	FALSE	0.527	66.000	0.471	1.000	N	-0.011
33163	33164	Rv1390	Rv1391	rpoZ	dfp	FALSE	0.492	16.000	0.192	1.000	N	-0.020
33164	33165	Rv1391	Rv1392	dfp	metK	FALSE	0.499	128.000	0.059	1.000	Y	-0.031
33166	1935857	Rv1393c	Rv1394c		cyp132	TRUE	0.954	-3.000	0.000	0.059	N	0.311
1935859	33170	Rv1396c	Rv1397c	PE_PGRS25		FALSE	0.020	255.000	0.000	NA		0.226
33170	33171	Rv1397c	Rv1398c			TRUE	0.879	-3.000	0.000	NA		0.312
33171	33172	Rv1398c	Rv1399c		lipH	FALSE	0.155	83.000	0.000	1.000		0.066
33172	33173	Rv1399c	Rv1400c	lipH	lipI	TRUE	0.931	25.000	0.250	0.024	Y	0.035
33174	33175	Rv1401	Rv1402		priA	FALSE	0.147	81.000	0.050	NA		-0.093
33179	33180	Rv1406	Rv1407	fmt	fmu	TRUE	0.993	-3.000	0.305	1.000	Y	0.655
33180	33181	Rv1407	Rv1408	fmu	rpe	FALSE	0.318	25.000	0.056	1.000	N	0.110
33181	33182	Rv1408	Rv1409	rpe	ribG	TRUE	0.906	-3.000	0.028	1.000	N	0.350
33183	33184	Rv1410c	Rv1411c		lprG	TRUE	0.770	6.000	0.143	NA		0.002
33185	33186	Rv1412	Rv1413	ribC		FALSE	0.044	214.000	0.000	NA		0.376
33186	33187	Rv1413	Rv1414			FALSE	0.068	-10.000	0.000	NA		-0.233
33187	33188	Rv1414	Rv1415		ribA2	FALSE	0.007	105.000	0.000	NA		-0.196
33188	33189	Rv1415	Rv1416	ribA2	ribH	TRUE	0.950	15.000	0.041	0.002	Y	0.077
33189	33190	Rv1416	Rv1417	ribH		TRUE	0.922	-3.000	0.014	NA		0.379
33190	33191	Rv1417	Rv1418		lprH	FALSE	0.294	25.000	0.143	NA		-0.260
33191	33192	Rv1418	Rv1419	lprH		FALSE	0.068	180.000	0.000	NA		0.367
33192	33193	Rv1419	Rv1420		uvrC	FALSE	0.213	64.000	0.000	NA		0.259
33193	33194	Rv1420	Rv1421	uvrC		TRUE	0.903	-3.000	0.073	NA		0.102
33194	33195	Rv1421	Rv1422			TRUE	0.963	-3.000	0.259	NA		0.323
33195	33196	Rv1422	Rv1423		whiA	TRUE	0.980	-3.000	0.470	NA		0.377
33199	33200	Rv1426c	Rv1427c	lipO	fadD12	TRUE	0.995	0.000	0.857	1.000	Y	-0.226
33200	33201	Rv1427c	Rv1428c	fadD12		TRUE	0.986	4.000	0.429	1.000	Y	0.181
33202	1935860	Rv1429	Rv1430		PE16	FALSE	0.001	240.000	0.000	NA		-0.236
1935860	33204	Rv1430	Rv1431	PE16		FALSE	0.112	111.000	0.000	NA		0.202
33204	33205	Rv1431	Rv1432			TRUE	0.979	-3.000	0.500	NA		0.257
33205	33206	Rv1432	Rv1433			FALSE	0.013	164.000	0.000	NA		-0.081
33206	33207	Rv1433	Rv1434			TRUE	0.753	7.000	0.000	NA		0.695
33209	33210	Rv1436	Rv1437	gap	pgk	TRUE	0.993	3.000	0.055	0.003	Y	0.481
33210	33211	Rv1437	Rv1438	pgk	tpi	TRUE	0.988	-3.000	0.075	1.000	Y	0.400
33216	33217	Rv1443c	Rv1444c			FALSE	0.006	595.000	0.000	NA		0.332
33217	33218	Rv1444c	Rv1445c		devB	TRUE	0.564	17.000	0.038	NA		0.361
33218	33219	Rv1445c	Rv1446c	devB	opcA	TRUE	0.980	-3.000	0.179	NA	Y	-0.096
33219	33220	Rv1446c	Rv1447c	opcA	zwf2	TRUE	0.677	53.000	0.104	NA	Y	-0.075
33220	33221	Rv1447c	Rv1448c	zwf2	tal	TRUE	0.983	-3.000	0.067	1.000	Y	0.124
33221	33222	Rv1448c	Rv1449c	tal	tkt	TRUE	0.866	17.000	0.090	1.000	Y	0.192
33222	1935863	Rv1449c	Rv1450c	tkt	PE_PGRS27	FALSE	0.010	439.000	0.000	NA		0.472
33229	33230	Rv1456c	Rv1457c			FALSE	0.512	112.000	0.022	0.046		0.373
33230	33231	Rv1457c	Rv1458c			TRUE	0.962	-3.000	0.186	1.000		0.356
33231	33232	Rv1458c	Rv1459c			FALSE	0.380	103.000	0.357	NA		-0.112
1935866	33234	Rv1460	Rv1461			TRUE	0.940	-3.000	0.100	1.000	N	0.498
33234	33235	Rv1461	Rv1462			TRUE	0.987	-3.000	0.266	0.001	N	0.183
33235	33236	Rv1462	Rv1463			TRUE	0.995	-3.000	0.482	1.000	Y	0.450
33236	33237	Rv1463	Rv1464		csd	TRUE	0.922	2.000	0.093	1.000	N	0.637
33237	33238	Rv1464	Rv1465	csd		TRUE	0.960	-3.000	0.249	1.000	N	0.455
33238	33239	Rv1465	Rv1466			TRUE	0.823	-25.000	0.152	NA		0.462
33240	1935867	Rv1467c	Rv1468c	fadE15	PE_PGRS29	FALSE	0.295	107.000	0.222	NA		0.048
33242	33243	Rv1469	Rv1470	ctpD	trxA	FALSE	0.013	44.000	0.018	1.000	N	-0.242
33243	1935868	Rv1470	Rv1471	trxA	trxB1	TRUE	0.964	16.000	0.222	0.003	Y	0.186
1935868	33245	Rv1471	Rv1472	trxB1	echA12	TRUE	0.767	22.000	0.636	1.000	N	0.018
33245	33246	Rv1472	Rv1473	echA12		TRUE	0.565	36.000	0.090	1.000		0.479
33246	1935869	Rv1473	Rv1473A			FALSE	0.452	97.000	0.191	NA		0.975
33247	33248	Rv1474c	Rv1475c		acn	TRUE	0.662	11.000	0.256	1.000	N	-0.081
33249	33250	Rv1476	Rv1477			FALSE	0.001	226.000	0.000	NA		-0.247
33250	33251	Rv1477	Rv1478			TRUE	0.746	11.000	0.250	NA		0.054
33251	1935870	Rv1478	Rv1479		moxR1	FALSE	0.078	139.000	0.120	NA		-0.250
1935870	33253	Rv1479	Rv1480	moxR1		TRUE	0.989	-3.000	0.920	NA		0.261
33253	33254	Rv1480	Rv1481			TRUE	0.920	11.000	0.760	NA		0.167
33256	33257	Rv1483	Rv1484	fabG1	inhA	TRUE	0.887	19.000	0.078	1.000	Y	0.591
33257	33258	Rv1484	Rv1485	inhA	hemZ	TRUE	0.789	6.000	0.038	1.000	N	0.393
33260	33261	Rv1487	Rv1488			TRUE	0.904	22.000	0.259	NA	Y	0.563
33261	1935873	Rv1488	Rv1489			FALSE	0.212	10.000	0.049	NA		-0.652
1935873	1935874	Rv1489	Rv1489A			FALSE	0.395	34.000	0.000	NA		0.976
1935874	33263	Rv1489A	Rv1490			FALSE	0.003	150.000	0.000	NA		NA
33265	33266	Rv1492	Rv1493	mutA	mutB	TRUE	0.996	1.000	0.115	0.001	Y	0.563
33266	33267	Rv1493	Rv1494	mutB		FALSE	0.362	14.000	0.000	NA		0.184
33267	33268	Rv1494	Rv1495			TRUE	0.907	-3.000	0.000	NA		0.522
33268	33269	Rv1495	Rv1496			TRUE	0.878	-3.000	0.000	1.000	N	0.479
33269	33270	Rv1496	Rv1497		lipL	FALSE	0.012	53.000	0.011	1.000	N	-0.418
33271	1935875	Rv1498c	Rv1498A			FALSE	0.048	214.000	0.000	NA		0.441
1935876	33273	Rv1499	Rv1500			FALSE	0.170	45.000	0.000	NA		0.137
33273	33274	Rv1500	Rv1501			FALSE	0.295	12.000	0.167	NA	N	-0.217
33274	33275	Rv1501	Rv1502			FALSE	0.099	213.000	0.105	NA		0.551
33276	33277	Rv1503c	Rv1504c			TRUE	0.967	1.000	0.000	0.015		0.326
33277	33278	Rv1504c	Rv1505c			FALSE	0.199	137.000	0.027	1.000		0.322
33278	33279	Rv1505c	Rv1506c			TRUE	0.706	-3.000	0.004	1.000		-0.271
33279	33280	Rv1506c	Rv1507c			FALSE	0.001	284.000	0.000	NA		-0.260
1935878	33282	Rv1508A	Rv1509			TRUE	0.733	-16.000	0.000	NA		0.709
33282	33283	Rv1509	Rv1510			FALSE	0.057	202.000	0.000	NA		0.471
33283	33284	Rv1510	Rv1511		gmdA	FALSE	0.006	481.000	0.000	NA		0.224
33284	33285	Rv1511	Rv1512	gmdA	epiA	TRUE	0.994	-3.000	0.160	0.003	Y	-0.081
33285	33286	Rv1512	Rv1513	epiA		TRUE	0.674	-3.000	0.000	NA		-0.019
33287	33288	Rv1514c	Rv1515c			FALSE	0.014	35.000	0.000	NA		-0.390
33288	1935879	Rv1515c	Rv1516c			TRUE	0.656	3.000	0.000	NA		0.052
33290	33291	Rv1517	Rv1518			TRUE	0.614	9.000	0.000	NA		0.294
33291	33292	Rv1518	Rv1519			FALSE	0.005	130.000	0.000	NA		-0.236
33292	33293	Rv1519	Rv1520			FALSE	0.185	26.000	0.000	NA		0.056
33293	33294	Rv1520	Rv1521		fadD25	FALSE	0.001	234.000	0.000	NA	N	0.090
33296	33297	Rv1523	Rv1524			FALSE	0.016	30.000	0.000	1.000	N	-0.173
33297	33298	Rv1524	Rv1525		wbbL2	FALSE	0.252	47.000	0.000	NA		0.263
33299	33300	Rv1526c	Rv1527c		pks5	FALSE	0.080	23.000	0.000	1.000	N	0.025
33300	33301	Rv1527c	Rv1528c	pks5	papA4	FALSE	0.002	544.000	0.000	NA		0.014
33302	33303	Rv1529	Rv1530	fadD24	adh	FALSE	0.006	117.000	0.000	1.000	N	-0.286
33303	33304	Rv1530	Rv1531	adh		TRUE	0.943	-3.000	0.300	NA		-0.087
33306	33307	Rv1533	Rv1534			TRUE	0.710	-3.000	0.000	1.000		-0.127
33307	33308	Rv1534	Rv1535			FALSE	0.004	565.000	0.000	NA		0.212
33308	33309	Rv1535	Rv1536		ileS	FALSE	0.022	307.000	0.000	NA		0.608
33309	33310	Rv1536	Rv1537	ileS	dinX	FALSE	0.012	197.000	0.014	1.000	N	-0.084
33312	33313	Rv1539	Rv1540	lspA		TRUE	0.813	-7.000	0.073	1.000	N	0.368
33314	33315	Rv1541c	Rv1542c	lprI	glbN	FALSE	0.087	55.000	0.050	NA		-0.360
33316	33317	Rv1543	Rv1544			TRUE	0.987	5.000	0.750	0.049		0.238
33317	33318	Rv1544	Rv1545			FALSE	0.140	22.000	0.000	NA		-0.028
33318	33319	Rv1545	Rv1546			FALSE	0.293	49.000	0.000	NA		0.363
33319	33320	Rv1546	Rv1547		dnaE1	FALSE	0.188	68.000	0.003	NA		0.149
1935881	33323	Rv1549	Rv1550	fadD11.1	fadD11	TRUE	0.807	-321.000	0.000	0.040		0.091
33323	33324	Rv1550	Rv1551	fadD11	plsB1	TRUE	0.913	14.000	0.333	1.000	Y	-0.175
33324	33325	Rv1551	Rv1552	plsB1	frdA	FALSE	0.000	371.000	0.000	1.000	N	-0.076
33325	33326	Rv1552	Rv1553	frdA	frdB	TRUE	0.997	3.000	0.470	0.003	Y	0.358
33326	33327	Rv1553	Rv1554	frdB	frdC	TRUE	0.998	-3.000	0.454	0.003	Y	0.553
33327	33328	Rv1554	Rv1555	frdC	frdD	TRUE	0.999	-3.000	0.787	0.003	Y	0.639
33328	33329	Rv1555	Rv1556	frdD		FALSE	0.043	68.000	0.000	1.000	N	0.027
33329	33330	Rv1556	Rv1557		mmpL6	FALSE	0.053	139.000	0.000	1.000		-0.057
33330	33331	Rv1557	Rv1558	mmpL6		FALSE	0.047	10.000	0.000	NA		-0.225
33331	33332	Rv1558	Rv1559		ilvA	FALSE	0.281	35.000	0.033	NA		0.054
33332	33333	Rv1559	Rv1560	ilvA		FALSE	0.030	38.000	0.000	NA	N	0.146
33333	33334	Rv1560	Rv1561			FALSE	0.077	6.000	0.000	NA		-0.448
1935882	1935883	Rv1562c	Rv1563c	treZ	treY	TRUE	0.984	-7.000	0.263	0.004	Y	-0.234
1935883	1935884	Rv1563c	Rv1564c	treY	treX	TRUE	0.990	4.000	0.061	0.004	Y	0.312
1935884	33338	Rv1564c	Rv1565c	treX		FALSE	0.411	39.000	0.073	1.000	N	0.345
33338	33339	Rv1565c	Rv1566c			FALSE	0.487	99.000	0.400	NA	N	0.346
33339	33340	Rv1566c	Rv1567c			FALSE	0.038	240.000	0.000	NA		0.539
33341	1935885	Rv1568	Rv1569	bioA	bioF1	TRUE	0.994	-3.000	0.033	0.001	Y	-0.053
1935885	33343	Rv1569	Rv1570	bioF1	bioD	TRUE	0.997	-3.000	0.214	0.001	Y	0.262
33343	33344	Rv1570	Rv1571	bioD		TRUE	0.832	0.000	0.036	1.000		-0.168
33346	33347	Rv1573	Rv1574			FALSE	0.001	206.000	0.000	NA		-0.179
33347	1935887	Rv1574	Rv1575			FALSE	0.357	-42.000	0.000	NA		0.028
33349	33350	Rv1576c	Rv1577c			FALSE	0.059	8.000	0.000	NA		-0.244
33350	33351	Rv1577c	Rv1578c			FALSE	0.036	174.000	0.000	NA		0.140
33351	33352	Rv1578c	Rv1579c			FALSE	0.069	81.000	0.000	NA		-0.018
33352	33353	Rv1579c	Rv1580c			FALSE	0.197	-3.000	0.000	NA		-0.218
33353	33354	Rv1580c	Rv1581c			FALSE	0.344	14.000	0.000	NA		0.164
33354	33355	Rv1581c	Rv1582c			FALSE	0.024	196.000	0.000	NA		0.091
33355	33356	Rv1582c	Rv1583c			TRUE	0.595	0.000	0.000	NA		-0.058
33356	33357	Rv1583c	Rv1584c			TRUE	0.868	-3.000	0.000	NA		0.271
33357	33358	Rv1584c	Rv1585c			FALSE	0.098	56.000	0.000	NA		0.003
33358	33359	Rv1585c	Rv1586c			TRUE	0.769	-3.000	0.000	NA		0.071
33359	1935888	Rv1586c	Rv1587c			FALSE	0.424	-343.000	0.000	NA		0.165
1935888	33361	Rv1587c	Rv1588c			FALSE	0.401	5.000	0.000	NA		-0.058
33362	33363	Rv1589	Rv1590	bioB		TRUE	0.780	1.000	0.041	NA		-0.092
33363	33364	Rv1590	Rv1591			TRUE	0.952	-3.000	0.361	NA		-0.144
33365	33366	Rv1592c	Rv1593c			FALSE	0.104	257.000	0.273	NA		0.734
33367	33368	Rv1594	Rv1595	nadA	nadB	TRUE	0.997	0.000	0.210	0.002	Y	0.665
33368	33369	Rv1595	Rv1596	nadB	nadC	TRUE	0.997	0.000	0.223	0.002	Y	0.696
33369	33370	Rv1596	Rv1597	nadC		FALSE	0.396	49.000	0.000	1.000		0.576
33372	1935889	Rv1599	Rv1600	hisD	hisC1	TRUE	0.996	-3.000	0.112	0.003	Y	0.437
1935889	33374	Rv1600	Rv1601	hisC1	hisB	TRUE	0.998	-3.000	0.341	0.003	Y	0.526
33374	33375	Rv1601	Rv1602	hisB	hisH	TRUE	0.995	-3.000	0.046	0.003	Y	0.392
33375	33376	Rv1602	Rv1603	hisH	hisA	TRUE	0.988	10.000	0.491	0.003	Y	0.161
33376	33377	Rv1603	Rv1604	hisA	impA	TRUE	0.768	8.000	0.266	1.000	N	-0.025
33377	33378	Rv1604	Rv1605	impA	hisF	TRUE	0.786	2.000	0.021	1.000	N	0.158
33378	1935890	Rv1605	Rv1606	hisF	hisI	TRUE	0.998	-3.000	0.430	0.003	Y	0.351
1935890	33380	Rv1606	Rv1607	hisI	chaA	FALSE	0.024	181.000	0.002	1.000	N	0.052
33382	33383	Rv1609	Rv1610	trpE		TRUE	0.955	-10.000	0.690	NA		0.306
33383	33384	Rv1610	Rv1611		trpC	FALSE	0.175	90.000	0.070	NA		-0.050
33384	33385	Rv1611	Rv1612	trpC	trpB	TRUE	0.910	69.000	0.070	0.001	Y	0.350
33385	33386	Rv1612	Rv1613	trpB	trpA	TRUE	0.996	0.000	0.153	0.001	Y	0.204
33386	33387	Rv1613	Rv1614	trpA	lgt	TRUE	0.888	0.000	0.011	1.000	N	0.346
33387	33388	Rv1614	Rv1615	lgt		FALSE	0.003	676.000	0.000	NA		0.119
33388	33389	Rv1615	Rv1616			TRUE	0.765	-10.000	0.111	NA		0.134
33389	33390	Rv1616	Rv1617		pykA	FALSE	0.171	108.000	0.083	1.000		-0.163
33390	33391	Rv1617	Rv1618	pykA	tesB1	TRUE	0.885	8.000	0.361	1.000	N	0.296
33391	33392	Rv1618	Rv1619	tesB1		FALSE	0.408	58.000	0.214	NA		0.084
33393	33394	Rv1620c	Rv1621c	cydC	cydD	TRUE	0.998	-3.000	0.631	0.003	Y	-0.003
33394	33395	Rv1621c	Rv1622c	cydD	cydB	TRUE	0.739	87.000	0.151	1.000	Y	0.315
33395	1935891	Rv1622c	Rv1623c	cydB	cydA	TRUE	0.979	30.000	0.925	0.045	Y	0.389
1935891	33397	Rv1623c	Rv1624c	cydA		FALSE	0.209	111.000	0.104	NA		0.094
33397	1935892	Rv1624c	Rv1625c		cya	TRUE	0.580	29.000	0.176	NA		0.366
1935892	1935893	Rv1625c	Rvnt20	cya		FALSE	0.010	70.000	0.000	NA		NA
33400	33401	Rv1627c	Rv1628c			TRUE	0.987	-3.000	0.850	NA		0.162
33402	33403	Rv1629	Rv1630	polA	rpsA	FALSE	0.039	163.000	0.005	1.000	N	0.125
33403	33404	Rv1630	Rv1631	rpsA	coaE	FALSE	0.252	26.000	0.024	1.000	N	0.096
33406	33407	Rv1633	Rv1634	uvrB		TRUE	0.920	-3.000	0.006	1.000		0.268
1935894	33412	Rv1638A	Rv1639c			TRUE	0.540	16.000	0.000	NA		0.990
33412	33413	Rv1639c	Rv1640c		lysS	FALSE	0.273	59.000	0.057	NA		0.100
33414	33415	Rv1641	Rv1642	infC	rpmI	TRUE	0.929	50.000	0.652	1.000	Y	0.483
33415	33416	Rv1642	Rv1643	rpmI	rplT	TRUE	0.974	62.000	0.928	0.015	Y	0.477
33416	33417	Rv1643	Rv1644	rplT	tsnR	TRUE	0.879	33.000	0.057	0.012	Y	-0.052
1935895	33420	Rv1646	Rv1647	PE17		FALSE	0.288	78.000	0.143	NA		0.052
33420	33421	Rv1647	Rv1648			TRUE	0.662	7.000	0.214	NA		-0.463
33421	33422	Rv1648	Rv1649		pheS	FALSE	0.016	196.000	0.002	NA		-0.100
33422	33423	Rv1649	Rv1650	pheS	pheT	TRUE	0.998	0.000	0.574	0.001	Y	0.248
33425	33426	Rv1652	Rv1653	argC	argJ	TRUE	0.998	-3.000	0.303	0.002	Y	0.723
33426	33427	Rv1653	Rv1654	argJ	argB	TRUE	0.997	-3.000	0.239	0.002	Y	0.714
33427	33428	Rv1654	Rv1655	argB	argD	TRUE	0.989	-3.000	0.105	1.000	Y	0.714
33428	33429	Rv1655	Rv1656	argD	argF	TRUE	0.989	-3.000	0.091	1.000	Y	0.790
33429	33430	Rv1656	Rv1657	argF	argR	TRUE	0.943	-3.000	0.088	1.000	N	0.826
33430	33431	Rv1657	Rv1658	argR	argG	TRUE	0.764	9.000	0.054	1.000	N	0.793
33431	33432	Rv1658	Rv1659	argG	argH	TRUE	0.825	80.000	0.278	1.000	Y	0.474
33432	33433	Rv1659	Rv1660	argH	pks10	FALSE	0.053	109.000	0.003	1.000	N	-0.007
33433	33434	Rv1660	Rv1661	pks10	pks7	TRUE	0.953	83.000	1.000	0.018	Y	-0.012
33434	33435	Rv1661	Rv1662	pks7	pks8	TRUE	0.981	20.000	1.000	0.009	Y	-0.084
33435	33436	Rv1662	Rv1663	pks8	pks17	TRUE	0.991	0.000	0.000	0.009	Y	0.173
33436	33437	Rv1663	Rv1664	pks17	pks9	TRUE	0.977	6.000	0.000	0.005	Y	0.214
33437	33438	Rv1664	Rv1665	pks9	pks11	TRUE	0.873	147.000	0.750	0.018	Y	0.071
33439	33440	Rv1666c	Rv1667c	cyp139		FALSE	0.339	15.000	0.008	1.000		-0.127
33440	33441	Rv1667c	Rv1668c			TRUE	0.943	-6.000	0.008	0.014		0.315
33442	33443	Rv1669	Rv1670			FALSE	0.015	33.000	0.000	NA		-0.354
33443	33444	Rv1670	Rv1671			FALSE	0.508	8.000	0.000	NA		0.157
33445	33446	Rv1672c	Rv1673c			FALSE	0.028	93.000	0.000	NA	N	0.174
33446	33447	Rv1673c	Rv1674c			FALSE	0.017	28.000	0.000	NA	N	-0.456
33447	33448	Rv1674c	Rv1675c			FALSE	0.031	325.000	0.000	0.026	N	0.092
33449	33450	Rv1676	Rv1677		dsbF	TRUE	0.963	-3.000	0.000	0.003		-0.158
33450	33451	Rv1677	Rv1678	dsbF		FALSE	0.007	101.000	0.000	NA		-0.473
33451	33452	Rv1678	Rv1679		fadE16	TRUE	0.789	0.000	0.037	NA		-0.120
33452	33453	Rv1679	Rv1680	fadE16		FALSE	0.507	9.000	0.222	NA	N	-0.249
33453	33454	Rv1680	Rv1681		moeX	TRUE	0.941	-3.000	0.047	NA		0.544
33454	33455	Rv1681	Rv1682	moeX		FALSE	0.109	161.000	0.000	NA		0.746
33455	33456	Rv1682	Rv1683			FALSE	0.029	274.000	0.000	NA		0.572
33456	33457	Rv1683	Rv1684			TRUE	0.823	-7.000	0.013	NA		0.577
33458	33459	Rv1685c	Rv1686c			TRUE	0.959	2.000	0.400	1.000		0.014
33459	33460	Rv1686c	Rv1687c			TRUE	0.870	72.000	0.089	0.080	Y	0.594
33461	33462	Rv1688	Rv1689	mpg	tyrS	FALSE	0.141	12.000	0.067	1.000	N	-0.361
33462	33463	Rv1689	Rv1690	tyrS	lprJ	FALSE	0.002	651.000	0.000	NA		-0.010
33463	33464	Rv1690	Rv1691	lprJ		FALSE	0.079	39.000	0.000	NA		-0.063
33464	33465	Rv1691	Rv1692			TRUE	0.982	-3.000	0.500	1.000		0.266
33465	33466	Rv1692	Rv1693			TRUE	0.887	-3.000	0.083	1.000		-0.145
33466	33467	Rv1693	Rv1694		tlyA	TRUE	0.638	8.000	0.014	1.000		0.004
33467	33468	Rv1694	Rv1695	tlyA	ppnK	TRUE	0.797	0.000	0.120	1.000	N	-0.172
33468	33469	Rv1695	Rv1696	ppnK	recN	TRUE	0.600	14.000	0.094	1.000	N	0.292
33469	33470	Rv1696	Rv1697	recN		FALSE	0.480	96.000	0.049	0.080		0.092
33470	33471	Rv1697	Rv1698			TRUE	0.891	22.000	0.798	NA		0.642
33471	33472	Rv1698	Rv1699		pyrG	FALSE	0.186	140.000	0.014	NA		0.649
33472	33473	Rv1699	Rv1700	pyrG		TRUE	0.854	-7.000	0.055	1.000		0.340
33473	33474	Rv1700	Rv1701			TRUE	0.952	-3.000	0.063	1.000		0.462
33475	33476	Rv1702c	Rv1703c			FALSE	0.001	556.000	0.000	NA		-0.121
33476	33477	Rv1703c	Rv1704c		cycA	FALSE	0.195	65.000	0.000	1.000		0.122
33477	1935897	Rv1704c	Rv1705c	cycA	PPE22	FALSE	0.014	41.000	0.000	NA	N	0.062
1935897	1935898	Rv1705c	Rv1706c	PPE22	PPE23	TRUE	0.654	40.000	0.000	NA	Y	0.091
1935898	1935899	Rv1706c	Rv1706A	PPE23		FALSE	0.000	604.000	0.000	NA		NA
33480	33481	Rv1707	Rv1708			FALSE	0.394	18.000	0.000	1.000	N	0.446
33481	33482	Rv1708	Rv1709			TRUE	0.870	-3.000	0.065	NA		-0.020
33482	33483	Rv1709	Rv1710			TRUE	0.980	-3.000	0.570	NA		0.209
33483	33484	Rv1710	Rv1711			TRUE	0.915	-3.000	0.224	NA	N	0.139
33484	33485	Rv1711	Rv1712		cmk	TRUE	0.897	-3.000	0.042	1.000	N	0.264
33485	33486	Rv1712	Rv1713	cmk	engA	TRUE	0.979	-3.000	0.060	0.014		0.241
33486	33487	Rv1713	Rv1714	engA		FALSE	0.106	174.000	0.000	1.000		0.490
33487	1935900	Rv1714	Rv1715		fadB3	TRUE	0.959	-6.000	0.000	1.000	Y	0.688
1935900	33489	Rv1715	Rv1716	fadB3		TRUE	0.890	3.000	0.105	NA		0.218
33489	33490	Rv1716	Rv1717			TRUE	0.870	0.000	0.000	NA		0.302
33490	33491	Rv1717	Rv1718			FALSE	0.143	53.000	0.000	NA		0.091
33491	33492	Rv1718	Rv1719			FALSE	0.439	14.000	0.000	1.000		0.161
33492	1935901	Rv1719	Rvnt21			FALSE	0.002	193.000	0.000	NA		NA
33493	1935902	Rv1720c	Rv1721c			TRUE	0.946	-3.000	0.167	NA		0.282
33495	33496	Rv1722	Rv1723			TRUE	0.899	-3.000	0.121	1.000	N	0.133
33497	33498	Rv1724c	Rv1725c			TRUE	0.704	-10.000	0.000	NA		0.351
33499	33500	Rv1726	Rv1727			FALSE	0.189	33.000	0.000	NA		0.135
33501	33502	Rv1728c	Rv1729c			TRUE	0.892	-3.000	0.000	NA		0.363
33502	33503	Rv1729c	Rv1730c			FALSE	0.103	123.000	0.000	NA	N	0.525
33505	33506	Rv1732c	Rv1733c			FALSE	0.077	64.000	0.000	NA		-0.026
33506	33507	Rv1733c	Rv1734c			FALSE	0.009	287.000	0.000	NA		0.093
33507	33508	Rv1734c	Rv1735c			FALSE	0.016	275.000	0.000	1.000		0.106
33508	33509	Rv1735c	Rv1736c		narX	FALSE	0.007	440.000	0.000	1.000		0.157
33509	33510	Rv1736c	Rv1737c	narX	narK2	TRUE	0.894	-3.000	0.000	1.000	N	0.951
33513	33514	Rv1740	Rv1741			FALSE	0.416	0.000	0.000	NA		-0.127
33514	33515	Rv1741	Rv1742			TRUE	0.690	8.000	0.000	NA		0.402
33515	33516	Rv1742	Rv1743		pknE	FALSE	0.212	94.000	0.000	NA		0.366
33517	33518	Rv1744c	Rv1745c		idi	FALSE	0.068	-10.000	0.000	NA		-0.527
33519	33520	Rv1746	Rv1747	pknF		FALSE	0.233	62.000	0.000	0.080	N	-0.250
33520	33521	Rv1747	Rv1748			FALSE	0.000	373.000	0.000	NA		-0.286
33522	33523	Rv1749c	Rv1750c		fadD1	FALSE	0.191	84.000	0.000	NA		0.288
33524	33525	Rv1751	Rv1752			FALSE	0.005	127.000	0.000	NA		-0.303
1935904	33527	Rv1753c	Rv1754c	PPE24		FALSE	0.056	204.000	0.000	NA		0.503
33527	33528	Rv1754c	Rv1755c		plcD	FALSE	0.026	184.000	0.000	NA		0.060
33528	33529	Rv1755c	Rv1756c	plcD		FALSE	0.136	49.000	0.000	1.000		-0.075
33529	33530	Rv1756c	Rv1757c			TRUE	0.714	51.000	0.308	0.063		-0.081
33534	33535	Rv1761c	Rv1762c			TRUE	0.985	0.000	1.000	NA		-0.072
33536	33537	Rv1763	Rv1764			TRUE	0.735	51.000	0.308	0.063		0.019
33538	1935906	Rv1765c	Rv1765A			FALSE	0.000	627.000	0.000	1.000		NA
1935907	33540	Rv1766	Rv1767			FALSE	0.079	68.000	0.000	NA		-0.016
33540	1935908	Rv1767	Rv1768		PE_PGRS31	FALSE	0.082	181.000	0.087	NA		0.155
1935908	33542	Rv1768	Rv1769	PE_PGRS31		FALSE	0.156	156.000	0.025	NA		0.571
33542	33543	Rv1769	Rv1770			TRUE	0.770	8.000	0.016	NA		0.472
33543	33544	Rv1770	Rv1771			TRUE	0.943	-3.000	0.016	1.000		0.484
33544	33545	Rv1771	Rv1772			FALSE	0.015	189.000	0.000	NA		-0.025
33547	33548	Rv1774	Rv1775			TRUE	0.945	0.000	0.080	NA		0.557
33551	33552	Rv1778c	Rv1779c			FALSE	0.120	156.000	0.000	NA		0.860
33555	33556	Rv1782	Rv1783			TRUE	0.990	-3.000	1.000	NA		0.223
33556	33557	Rv1783	Rv1784			FALSE	0.119	70.000	0.000	NA		0.075
33559	1935909	Rv1786	Rv1787		PPE25	FALSE	0.001	270.000	0.000	NA	N	-0.087
1935909	1935910	Rv1787	Rv1788	PPE25	PE18	FALSE	0.089	79.000	0.000	NA		0.025
1935910	1935911	Rv1788	Rv1789	PE18	PPE26	TRUE	0.844	14.000	0.667	NA		-0.099
1935911	1935912	Rv1789	Rv1790	PPE26	PPE27	FALSE	0.034	454.000	0.000	NA	Y	0.080
1935912	1935913	Rv1790	Rv1791	PPE27	PE19	FALSE	0.008	427.000	0.000	NA		0.276
1935913	33565	Rv1791	Rv1792	PE19	esxM	FALSE	0.075	144.000	0.000	NA		0.221
33565	1935914	Rv1792	Rv1793	esxM	esxN	FALSE	0.202	51.000	0.000	NA		0.212
1935914	33567	Rv1793	Rv1794	esxN		TRUE	0.602	88.000	0.429	NA		0.378
33567	33568	Rv1794	Rv1795			FALSE	0.022	272.000	0.000	NA		0.315
33568	33569	Rv1795	Rv1796		mycP5	TRUE	0.951	-22.000	1.000	NA		0.114
33569	33570	Rv1796	Rv1797	mycP5		TRUE	0.987	-3.000	1.000	NA		-0.023
33570	33571	Rv1797	Rv1798			TRUE	0.982	-3.000	0.667	NA		0.141
33571	33572	Rv1798	Rv1799		lppT	FALSE	0.001	627.000	0.000	NA		-0.078
33572	1935915	Rv1799	Rv1800	lppT	PPE28	FALSE	0.218	103.000	0.000	NA		0.446
1935915	1935916	Rv1800	Rv1801	PPE28	PPE29	FALSE	0.027	581.000	0.000	NA	Y	0.054
1935916	1935917	Rv1801	Rv1802	PPE29	PPE30	FALSE	0.422	112.000	0.000	NA	Y	-0.023
1935918	33577	Rv1803c	Rv1804c	PE_PGRS32		FALSE	0.022	181.000	0.000	NA		0.022
33577	33578	Rv1804c	Rv1805c			FALSE	0.010	338.000	0.000	NA		0.231
1935919	1935920	Rv1806	Rv1807	PE20	PPE31	FALSE	0.411	27.000	0.000	NA		0.538
1935920	1935921	Rv1807	Rv1808	PPE31	PPE32	FALSE	0.092	324.000	0.000	NA	Y	0.668
1935921	1935922	Rv1808	Rv1809	PPE32	PPE33	TRUE	0.829	132.000	0.667	NA	Y	0.583
1935922	33583	Rv1809	Rv1810	PPE33		FALSE	0.271	245.000	1.000	NA		0.251
33583	33584	Rv1810	Rv1811		mgtC	FALSE	0.077	154.000	0.014	NA		0.135
33585	33586	Rv1812c	Rv1813c			FALSE	0.020	322.000	0.000	NA		0.670
33587	33588	Rv1814	Rv1815	erg3		FALSE	0.134	105.000	0.045	NA		-0.047
33588	33589	Rv1815	Rv1816			FALSE	0.349	63.000	0.000	1.000		0.509
33589	33590	Rv1816	Rv1817			FALSE	0.001	635.000	0.000	1.000	N	0.017
1935923	33592	Rv1818c	Rv1819c	PE_PGRS33		FALSE	0.004	135.000	0.000	NA		-0.266
33593	33594	Rv1820	Rv1821	ilvG	secA2	FALSE	0.133	15.000	0.082	1.000	N	-0.428
33594	33595	Rv1821	Rv1822	secA2	pgsA2	FALSE	0.035	197.000	0.038	1.000	N	0.097
33595	33596	Rv1822	Rv1823	pgsA2		TRUE	0.788	-7.000	0.114	NA		0.116
33596	33597	Rv1823	Rv1824			TRUE	0.763	29.000	0.409	NA		0.584
33597	33598	Rv1824	Rv1825			TRUE	0.787	17.000	0.409	NA		0.246
33598	33599	Rv1825	Rv1826		gcvH	TRUE	0.628	38.000	0.434	NA		-0.001
33599	33600	Rv1826	Rv1827	gcvH	cfp17	FALSE	0.070	240.000	0.242	NA	N	0.399
33600	33601	Rv1827	Rv1828	cfp17		TRUE	0.985	-3.000	0.707	NA	N	0.631
33601	33602	Rv1828	Rv1829			FALSE	0.153	119.000	0.133	NA		-0.076
33602	33603	Rv1829	Rv1830			FALSE	0.010	404.000	0.043	NA		0.115
33603	33604	Rv1830	Rv1831			FALSE	0.244	53.000	0.028	NA		0.083
33604	33605	Rv1831	Rv1832		gcvB	FALSE	0.208	49.000	0.002	NA		0.096
33608	33609	Rv1835c	Rv1836c			FALSE	0.368	16.000	0.000	NA		0.219
33609	33610	Rv1836c	Rv1837c		glcB	FALSE	0.287	120.000	0.089	NA		0.479
33610	33611	Rv1837c	Rv1838c	glcB		FALSE	0.025	276.000	0.000	NA		0.432
33611	33612	Rv1838c	Rv1839c			TRUE	0.915	-3.000	0.000	NA		0.753
33612	1935924	Rv1839c	Rv1840c		PE_PGRS34	FALSE	0.194	59.000	0.000	NA		0.218
1935924	33614	Rv1840c	Rv1841c	PE_PGRS34		FALSE	0.006	163.000	0.000	NA		-0.143
11400694	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5694.000	0.000	NA		NA
11543057	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5694.000	0.000	NA		NA
11685449	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5694.000	0.000	NA		NA
11400695	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5714.000	0.000	NA		NA
11543058	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5714.000	0.000	NA		NA
11685450	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5714.000	0.000	NA		NA
11400696	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5763.000	0.000	NA		NA
11543059	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5763.000	0.000	NA		NA
11685451	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5763.000	0.000	NA		NA
11400697	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5783.000	0.000	NA		NA
11543060	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5783.000	0.000	NA		NA
11685452	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5783.000	0.000	NA		NA
11400698	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5802.000	0.000	NA		NA
11543061	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5802.000	0.000	NA		NA
11685453	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5802.000	0.000	NA		NA
11400699	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5822.000	0.000	NA		NA
11543062	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5822.000	0.000	NA		NA
11685454	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5822.000	0.000	NA		NA
11400700	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5853.000	0.000	NA		NA
11543063	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5853.000	0.000	NA		NA
11685455	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5853.000	0.000	NA		NA
11400701	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5873.000	0.000	NA		NA
11543064	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5873.000	0.000	NA		NA
11685456	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5873.000	0.000	NA		NA
11400702	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5892.000	0.000	NA		NA
11543065	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5892.000	0.000	NA		NA
11685457	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5892.000	0.000	NA		NA
11400703	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5912.000	0.000	NA		NA
11543066	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5912.000	0.000	NA		NA
11685458	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5912.000	0.000	NA		NA
11400704	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5937.000	0.000	NA		NA
11543067	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5937.000	0.000	NA		NA
11685459	33608		Rv1835c			FALSE	NA	5937.000	0.000	NA		NA
33614	33615	Rv1841c	Rv1842c			TRUE	0.993	0.000	0.815	0.038		0.007
33615	33616	Rv1842c	Rv1843c		guaB1	FALSE	0.155	174.000	0.038	0.097		-0.174
33616	1935925	Rv1843c	Rv1844c	guaB1	gnd1	FALSE	0.223	33.000	0.023	1.000	N	0.110
1935925	33618	Rv1844c	Rv1845c	gnd1		FALSE	0.321	30.000	0.023	1.000	N	0.243
33618	33619	Rv1845c	Rv1846c			TRUE	0.901	15.000	0.850	1.000	N	0.271
33620	33621	Rv1847	Rv1848		ureA	FALSE	0.201	49.000	0.222	NA	N	-0.209
33621	33622	Rv1848	Rv1849	ureA	ureB	TRUE	0.995	-3.000	0.052	0.001	Y	0.193
33622	33623	Rv1849	Rv1850	ureB	ureC	TRUE	0.997	0.000	0.486	0.001	Y	-0.136
33623	33624	Rv1850	Rv1851	ureC	ureF	TRUE	0.974	0.000	0.061	0.002	N	0.075
33624	33625	Rv1851	Rv1852	ureF	ureG	TRUE	0.988	11.000	0.439	0.002	Y	0.338
33625	33626	Rv1852	Rv1853	ureG	ureD	TRUE	0.930	8.000	0.032	0.002		0.185
33627	33628	Rv1854c	Rv1855c	ndh		TRUE	0.736	142.000	0.500	1.000	Y	0.253
33628	33629	Rv1855c	Rv1856c			TRUE	0.695	39.000	0.571	1.000	N	0.162
33630	33631	Rv1857	Rv1858	modA	modB	TRUE	0.998	3.000	0.578	0.001	Y	0.365
33631	33632	Rv1858	Rv1859	modB	modC	TRUE	0.903	7.000	0.018	1.000	Y	-0.303
33632	1935926	Rv1859	Rv1860	modC	apa	FALSE	0.400	53.000	0.052	1.000		0.240
1935926	33634	Rv1860	Rv1861	apa		FALSE	0.026	452.000	0.238	1.000		0.220
33634	33635	Rv1861	Rv1862		adhA	FALSE	0.466	74.000	0.189	1.000		0.273
33636	33637	Rv1863c	Rv1864c			TRUE	0.754	-7.000	0.000	NA		0.414
33637	33638	Rv1864c	Rv1865c			TRUE	0.852	-3.000	0.000	1.000		0.115
33639	33640	Rv1866	Rv1867			FALSE	0.023	288.000	0.143	1.000	N	0.119
33640	33641	Rv1867	Rv1868			FALSE	0.308	99.000	0.214	1.000	N	0.189
33642	33643	Rv1869c	Rv1870c			FALSE	0.116	100.000	0.000	1.000		0.000
33643	33644	Rv1870c	Rv1871c			FALSE	0.240	65.000	0.000	NA		0.325
33644	33645	Rv1871c	Rv1872c		lldD2	FALSE	0.197	23.000	0.000	NA		0.052
33646	33647	Rv1873	Rv1874			FALSE	0.259	73.000	0.000	NA		0.423
33647	33648	Rv1874	Rv1875			TRUE	0.793	11.000	0.188	NA		0.413
33648	33649	Rv1875	Rv1876		bfrA	FALSE	0.002	516.000	0.000	1.000		-0.165
33649	33650	Rv1876	Rv1877	bfrA		FALSE	0.309	85.000	0.135	1.000	N	0.283
33650	33651	Rv1877	Rv1878		glnA3	FALSE	0.091	55.000	0.000	1.000	N	0.136
33651	33652	Rv1878	Rv1879	glnA3		TRUE	0.946	3.000	0.364	1.000		-0.014
33653	33654	Rv1880c	Rv1881c	cyp140	lppE	FALSE	0.409	50.000	0.273	NA		-0.127
33654	33655	Rv1881c	Rv1882c	lppE		FALSE	0.264	41.000	0.070	NA		-0.052
33655	33656	Rv1882c	Rv1883c			FALSE	0.326	28.000	0.093	NA		-0.068
33656	33657	Rv1883c	Rv1884c		rpfC	TRUE	0.704	39.000	0.375	NA		0.422
33657	33658	Rv1884c	Rv1885c	rpfC		TRUE	0.578	12.000	0.018	1.000		0.147
33658	33659	Rv1885c	Rv1886c		fbpB	TRUE	0.565	18.000	0.018	NA		0.564
33661	1935927	Rv1888c	Rv1888A			FALSE	0.000	365.000	0.000	NA		-0.995
1935927	33662	Rv1888A	Rv1889c			FALSE	0.013	44.000	0.000	NA		-0.930
33662	33663	Rv1889c	Rv1890c			FALSE	0.265	59.000	0.000	NA		0.353
33664	33665	Rv1891	Rv1892			TRUE	0.799	17.000	0.333	NA		0.579
33665	33666	Rv1892	Rv1893			TRUE	0.899	10.000	0.375	NA		0.544
33669	33670	Rv1896c	Rv1897c			FALSE	0.206	5.000	0.004	NA	N	0.004
33672	33673	Rv1899c	Rv1900c	lppD	lipJ	TRUE	0.778	0.000	0.000	NA		0.121
33676	33677	Rv1903	Rv1904			FALSE	0.017	186.000	0.000	NA		-0.007
33678	33679	Rv1905c	Rv1906c	aao		FALSE	0.512	30.000	0.143	NA		0.264
33679	33680	Rv1906c	Rv1907c			FALSE	0.007	340.000	0.000	NA		0.148
33680	33681	Rv1907c	Rv1908c		katG	TRUE	0.624	7.000	0.000	NA		0.231
33681	33682	Rv1908c	Rv1909c	katG	furA	TRUE	0.829	38.000	0.057	1.000	Y	0.726
33682	33683	Rv1909c	Rv1910c	furA		FALSE	0.160	105.000	0.000	NA		0.271
33683	33684	Rv1910c	Rv1911c		lppC	FALSE	0.130	83.000	0.000	NA		0.172
33684	33685	Rv1911c	Rv1912c	lppC	fadB5	FALSE	0.194	100.000	0.000	NA		0.336
33688	33689	Rv1915	Rv1916	aceAa	aceAb	TRUE	0.981	0.000	0.000	0.001		0.306
1935928	1935929	Rv1917c	Rv1918c	PPE34	PPE35	FALSE	0.040	338.000	0.000	NA	Y	-0.194
1935929	33692	Rv1918c	Rv1919c	PPE35		FALSE	0.005	449.000	0.000	NA		0.166
33695	33696	Rv1922	Rv1923		lipD	TRUE	0.992	-9.000	0.333	0.004	Y	0.481
33701	33702	Rv1928c	Rv1929c			FALSE	0.294	45.000	0.000	NA		0.342
33702	33703	Rv1929c	Rv1930c			FALSE	0.202	12.000	0.000	NA		-0.046
33703	33704	Rv1930c	Rv1931c			FALSE	0.243	18.000	0.000	NA		0.084
33706	33707	Rv1933c	Rv1934c	fadE18	fadE17	TRUE	0.996	2.000	0.800	0.011	Y	-0.496
33707	33708	Rv1934c	Rv1935c	fadE17	echA13	TRUE	0.964	15.000	0.600	1.000	Y	0.380
33709	33710	Rv1936	Rv1937			TRUE	0.983	3.000	0.500	NA	Y	-0.296
33710	33711	Rv1937	Rv1938		ephB	TRUE	0.906	12.000	1.000	1.000		-0.356
33711	33712	Rv1938	Rv1939	ephB		TRUE	0.965	-3.000	0.333	1.000		0.030
33712	1935930	Rv1939	Rv1940		ribA1	TRUE	0.931	-3.000	0.036	1.000		0.252
1935930	33714	Rv1940	Rv1941	ribA1		TRUE	0.892	-3.000	0.036	1.000	N	0.256
33715	33716	Rv1942c	Rv1943c			TRUE	0.984	-3.000	0.750	NA		0.086
33716	33717	Rv1943c	Rv1944c			FALSE	0.465	-3.000	0.000	NA		-0.117
33721	33722	Rv1948c	Rv1949c			TRUE	0.642	11.000	0.000	NA		0.659
33722	33723	Rv1949c	Rv1950c			TRUE	0.682	-36.000	0.000	NA		0.610
33723	33724	Rv1950c	Rv1951c			FALSE	0.163	1.000	0.000	NA		-0.197
33725	33726	Rv1952	Rv1953			TRUE	0.696	-3.000	0.000	NA		-0.002
33728	33729	Rv1955	Rv1956			FALSE	0.013	42.000	0.000	NA		-0.252
33729	33730	Rv1956	Rv1957			TRUE	0.768	-3.000	0.000	1.000		-0.062
33731	33732	Rv1958c	Rv1959c			FALSE	0.078	49.000	0.000	NA		-0.048
33732	33733	Rv1959c	Rv1960c			TRUE	0.969	-3.000	0.385	NA		0.195
33735	33736	Rv1962c	Rv1963c		mce3R	FALSE	0.005	309.000	0.000	NA		0.009
33737	33738	Rv1964	Rv1965	yrbE3A	yrbE3B	TRUE	0.981	10.000	1.000	NA	Y	0.105
33738	1935931	Rv1965	Rv1966	yrbE3B	mce3A	TRUE	0.991	5.000	0.750	NA	Y	0.315
1935931	33740	Rv1966	Rv1967	mce3A	mce3B	TRUE	0.998	-3.000	0.750	0.007	Y	0.018
33740	33741	Rv1967	Rv1968	mce3B	mce3C	TRUE	0.998	-3.000	0.750	0.007	Y	0.085
33741	33742	Rv1968	Rv1969	mce3C	mce3D	TRUE	0.998	-3.000	0.750	0.007	Y	0.185
33742	33743	Rv1969	Rv1970	mce3D	lprM	TRUE	0.998	-3.000	0.500	0.007	Y	0.578
33743	33744	Rv1970	Rv1971	lprM	mce3F	TRUE	0.997	1.000	0.400	0.007	Y	0.495
33744	33745	Rv1971	Rv1972	mce3F		TRUE	0.801	22.000	0.400	NA		0.728
33745	33746	Rv1972	Rv1973			TRUE	0.984	-3.000	0.500	NA		0.796
33746	33747	Rv1973	Rv1974			TRUE	0.579	13.000	0.000	NA		0.598
33747	33748	Rv1974	Rv1975			FALSE	0.501	16.000	0.000	NA		0.452
33750	33751	Rv1977	Rv1978			FALSE	0.011	108.000	0.000	1.000	N	-0.029
33752	33753	Rv1979c	Rv1980c		mpt64	FALSE	0.020	179.000	0.000	NA		-0.002
33753	1935932	Rv1980c	Rv1981c	mpt64	nrdF1	FALSE	0.002	191.000	0.000	NA		-0.471
1935932	33755	Rv1981c	Rv1982c	nrdF1		FALSE	0.022	225.000	0.000	NA		0.192
33757	33758	Rv1984c	Rv1985c	cfp21		FALSE	0.001	430.000	0.000	1.000		-0.230
33759	33760	Rv1986	Rv1987			FALSE	0.004	416.000	0.000	1.000		-0.092
33760	33761	Rv1987	Rv1988			FALSE	0.014	226.000	0.000	1.000		-0.083
33762	33763	Rv1989c	Rv1990c			TRUE	0.985	-3.000	1.000	NA		-0.142
33763	1935934	Rv1990c	Rv1990A			FALSE	0.039	244.000	0.000	NA		0.654
1935934	33764	Rv1990A	Rv1991c			FALSE	0.008	89.000	0.000	NA		-0.694
33764	33765	Rv1991c	Rv1992c		ctpG	FALSE	0.003	342.000	0.000	1.000	N	0.104
33765	33766	Rv1992c	Rv1993c	ctpG		TRUE	0.904	-3.000	0.000	NA		0.466
33766	33767	Rv1993c	Rv1994c			FALSE	0.182	53.000	0.000	NA		0.190
33768	33769	Rv1995	Rv1996			FALSE	0.052	96.000	0.000	NA		-0.045
33769	33770	Rv1996	Rv1997		ctpF	FALSE	0.050	202.000	0.000	1.000	N	0.795
33771	33772	Rv1998c	Rv1999c			FALSE	0.142	95.000	0.000	1.000	N	0.305
33773	33774	Rv2000	Rv2001			FALSE	0.519	10.000	0.118	NA		-0.221
33774	33775	Rv2001	Rv2002		fabG3	FALSE	0.491	76.000	0.000	1.000	Y	-0.293
33776	33777	Rv2003c	Rv2004c			FALSE	0.384	58.000	0.000	1.000		0.824
33777	33778	Rv2004c	Rv2005c			FALSE	0.534	22.000	0.000	1.000		0.858
33780	33781	Rv2007c	Rv2008c	fdxA		FALSE	0.083	189.000	0.000	1.000		0.435
33782	33783	Rv2009	Rv2010			TRUE	0.890	1.000	0.000	NA		0.592
33785	1935936	Rv2012	Rv2013			FALSE	0.003	845.000	0.000	NA		0.174
1935936	1935937	Rv2013	Rv2014			TRUE	0.851	-46.000	0.000	0.012		0.098
33789	33790	Rv2016	Rv2017			FALSE	0.197	-3.000	0.000	NA		-0.186
33790	33791	Rv2017	Rv2018			FALSE	0.003	242.000	0.000	NA		-0.117
33791	33792	Rv2018	Rv2019			TRUE	0.857	-10.000	0.294	NA		0.053
33793	33794	Rv2020c	Rv2021c			FALSE	0.067	85.000	0.000	NA		-0.017
33794	33795	Rv2021c	Rv2022c			TRUE	0.860	9.000	0.375	NA		0.055
33795	33796	Rv2022c	Rv2023c			FALSE	0.129	25.000	0.000	NA		-0.027
33796	1935938	Rv2023c	Rv2023A			FALSE	0.003	160.000	0.000	NA		NA
1935938	33797	Rv2023A	Rv2024c			FALSE	0.050	-33.000	0.000	NA		NA
33797	33798	Rv2024c	Rv2025c			FALSE	0.005	510.000	0.000	1.000		0.121
33798	33799	Rv2025c	Rv2026c			FALSE	0.166	115.000	0.000	1.000	N	0.805
33799	33800	Rv2026c	Rv2027c			TRUE	0.603	40.000	0.000	1.000	Y	-0.236
33800	33801	Rv2027c	Rv2028c			FALSE	0.500	61.000	0.000	1.000	Y	-0.687
33801	33802	Rv2028c	Rv2029c		pfkB	TRUE	0.894	-3.000	0.000	1.000	N	0.946
33802	33803	Rv2029c	Rv2030c	pfkB		TRUE	0.674	17.000	0.050	1.000		0.939
33803	33804	Rv2030c	Rv2031c		hspX	TRUE	0.847	12.000	0.300	NA		0.929
33807	33808	Rv2034	Rv2035			TRUE	0.952	-3.000	0.200	NA		0.281
33808	33809	Rv2035	Rv2036			TRUE	0.907	-3.000	0.150	NA		-0.014
33810	33811	Rv2037c	Rv2038c			TRUE	0.972	2.000	0.444	1.000		0.243
33811	33812	Rv2038c	Rv2039c			TRUE	0.994	3.000	0.211	0.020	Y	0.519
33812	33813	Rv2039c	Rv2040c			TRUE	0.979	-13.000	0.211	0.020	Y	0.059
33813	33814	Rv2040c	Rv2041c			TRUE	0.996	-3.000	0.235	0.020	Y	0.413
33814	33815	Rv2041c	Rv2042c			TRUE	0.701	38.000	0.118	0.027		0.072
33815	33816	Rv2042c	Rv2043c		pncA	TRUE	0.891	0.000	0.005	1.000		0.173
33816	33817	Rv2043c	Rv2044c	pncA		FALSE	0.305	41.000	0.000	NA		0.340
33817	33818	Rv2044c	Rv2045c		lipT	FALSE	0.258	86.000	0.000	NA		0.615
33820	33821	Rv2047c	Rv2048c		pks12	TRUE	0.968	5.000	1.000	1.000	N	0.038
33821	33822	Rv2048c	Rv2049c	pks12		FALSE	0.001	307.000	0.000	NA		-0.189
33824	33825	Rv2051c	Rv2052c	ppm1		FALSE	0.296	158.000	0.041	0.003		-0.170
33825	33826	Rv2052c	Rv2053c			TRUE	0.833	5.000	0.037	1.000		0.198
33828	33829	Rv2055c	Rv2056c	rpsR	rpsN2	TRUE	0.990	1.000	0.024	0.014	Y	0.053
33829	1935939	Rv2056c	Rv2057c	rpsN2	rpmG1	TRUE	0.990	2.000	0.052	0.014	Y	0.087
1935939	33831	Rv2057c	Rv2058c	rpmG1	rpmB2	TRUE	0.997	0.000	0.332	0.014	Y	0.433
33832	33833	Rv2059	Rv2060			TRUE	0.601	-430.000	0.000	1.000		0.262
33834	33835	Rv2061c	Rv2062c		cobN	FALSE	0.144	84.000	0.045	1.000		-0.219
1935940	33837	Rv2063	Rv2064		cobG	FALSE	0.000	387.000	0.000	1.000		NA
33837	33838	Rv2064	Rv2065	cobG	cobH	TRUE	0.843	10.000	0.255	1.000	N	0.562
33838	33839	Rv2065	Rv2066	cobH	cobI	TRUE	0.992	-3.000	0.096	0.008	Y	-0.123
33840	33841	Rv2067c	Rv2068c		blaC	TRUE	0.560	16.000	0.000	1.000		0.427
33843	33844	Rv2070c	Rv2071c	cobK	cobM	TRUE	0.994	-3.000	0.076	0.008	Y	0.163
33844	33845	Rv2071c	Rv2072c	cobM	cobL	TRUE	0.994	-3.000	0.065	0.008	Y	0.284
33845	33846	Rv2072c	Rv2073c	cobL		FALSE	0.530	68.000	0.364	1.000		-0.030
33848	33849	Rv2075c	Rv2076c			FALSE	0.003	158.000	0.000	NA		-0.179
33849	33850	Rv2076c	Rv2077c			FALSE	0.169	35.000	0.000	NA		0.080
33850	1935941	Rv2077c	Rv2077A			FALSE	0.163	1.000	0.000	NA		NA
33851	33852	Rv2078	Rv2079			TRUE	0.933	-18.000	0.500	NA		0.409
33852	33853	Rv2079	Rv2080		lppJ	TRUE	0.713	-19.000	0.000	NA		0.559
33855	33856	Rv2082	Rv2083			TRUE	0.821	-3.000	0.000	NA		0.187
33856	33857	Rv2083	Rv2084			TRUE	0.660	-7.000	0.000	NA		0.228
33857	33858	Rv2084	Rv2085			FALSE	0.261	83.000	0.000	NA		0.593
33858	1935942	Rv2085	Rv2086			TRUE	0.544	-21.000	0.000	NA		0.202
1935942	1935943	Rv2086	Rv2087			FALSE	0.133	78.000	0.000	NA		0.162
1935943	33861	Rv2087	Rv2088		pknJ	FALSE	0.005	187.000	0.000	NA		-0.133
33864	33865	Rv2091c	Rv2092c		helY	FALSE	0.452	42.000	0.105	NA		0.279
33865	33866	Rv2092c	Rv2093c	helY	tatC	FALSE	0.439	49.000	0.166	NA	N	0.594
33866	33867	Rv2093c	Rv2094c	tatC	tatA	TRUE	0.806	17.000	0.031	NA	Y	0.054
33867	33868	Rv2094c	Rv2095c	tatA		FALSE	0.167	68.000	0.110	NA	N	0.035
33868	33869	Rv2095c	Rv2096c			TRUE	0.996	-3.000	0.767	NA	Y	0.283
33869	33870	Rv2096c	Rv2097c			TRUE	0.832	9.000	0.188	NA		0.376
33873	33874	Rv2100	Rv2101		helZ	FALSE	0.014	199.000	0.000	1.000		-0.153
33874	33875	Rv2101	Rv2102	helZ		FALSE	0.390	110.000	0.222	1.000		0.243
33876	33877	Rv2103c	Rv2104c			TRUE	0.940	7.000	0.667	NA		0.128
33878	33879	Rv2105	Rv2106			TRUE	0.984	-3.000	0.308	0.060		0.065
33879	1935944	Rv2106	Rv2107		PE22	FALSE	0.002	633.000	0.000	NA		0.054
1935944	1935945	Rv2107	Rv2108	PE22	PPE36	TRUE	0.854	56.000	1.000	NA		0.840
33882	33883	Rv2109c	Rv2110c	prcA	prcB	TRUE	0.999	-3.000	0.797	0.001	Y	0.199
33883	33884	Rv2110c	Rv2111c	prcB		TRUE	0.968	-3.000	0.512	NA		-0.151
33884	33885	Rv2111c	Rv2112c			TRUE	0.568	113.000	0.706	NA		0.025
33886	33887	Rv2113	Rv2114			TRUE	0.804	11.000	0.200	NA		0.449
33889	33890	Rv2116	Rv2117	lppK		TRUE	0.617	8.000	0.030	NA		0.048
33893	33894	Rv2120c	Rv2121c		hisG	FALSE	0.232	79.000	0.006	1.000		0.140
33894	1935946	Rv2121c	Rv2122c	hisG	hisE	TRUE	0.991	3.000	0.081	0.003	Y	0.063
1935949	33901	Rv2127	Rv2128	ansP1		TRUE	0.865	0.000	0.000	NA		0.283
33902	33903	Rv2129c	Rv2130c		cysS	FALSE	0.278	26.000	0.096	1.000		-0.437
33903	33904	Rv2130c	Rv2131c	cysS	cysQ	FALSE	0.364	58.000	0.082	1.000	N	0.344
33906	33907	Rv2133c	Rv2134c			TRUE	0.943	11.000	0.810	NA		0.473
33907	33908	Rv2134c	Rv2135c			TRUE	0.751	64.000	0.608	NA		0.542
33908	33909	Rv2135c	Rv2136c		uppP	TRUE	0.924	-3.000	0.071	NA	N	0.768
33909	33910	Rv2136c	Rv2137c	uppP		FALSE	0.174	64.000	0.026	NA		-0.021
33911	33912	Rv2138	Rv2139	lppL	pyrD	FALSE	0.014	314.000	0.000	NA		0.275
33913	1935950	Rv2140c	Rv2141c	TB18.6		FALSE	0.522	48.000	0.224	NA		0.257
33917	33918	Rv2144c	Rv2145c		wag31	FALSE	0.204	95.000	0.149	NA		-0.109
33918	33919	Rv2145c	Rv2146c	wag31		FALSE	0.023	268.000	0.114	NA		-0.078
33919	33920	Rv2146c	Rv2147c			FALSE	0.118	162.000	0.165	NA		0.067
33920	33921	Rv2147c	Rv2148c			TRUE	0.978	-3.000	0.581	NA		0.074
33921	33922	Rv2148c	Rv2149c		yfiH	TRUE	0.854	6.000	0.061	NA		0.583
33922	33923	Rv2149c	Rv2150c	yfiH	ftsZ	TRUE	0.764	11.000	0.082	NA		0.607
33923	33924	Rv2150c	Rv2151c	ftsZ	ftsQ	FALSE	0.078	173.000	0.067	1.000	N	0.214
33924	33925	Rv2151c	Rv2152c	ftsQ	murC	TRUE	0.989	-3.000	0.134	1.000	Y	0.495
33925	33926	Rv2152c	Rv2153c	murC	murG	TRUE	0.989	-3.000	0.270	1.000	Y	0.048
33926	33927	Rv2153c	Rv2154c	murG	ftsW	TRUE	0.884	-3.000	0.167	1.000	N	-0.031
33927	33928	Rv2154c	Rv2155c	ftsW	murD	TRUE	0.891	12.000	0.081	0.004	N	0.447
33928	33929	Rv2155c	Rv2156c	murD	murX	TRUE	0.997	2.000	0.647	0.004	Y	0.079
33929	33930	Rv2156c	Rv2157c	murX	murF	TRUE	0.996	-3.000	0.071	0.004	Y	0.863
33930	33931	Rv2157c	Rv2158c	murF	murE	TRUE	0.998	-3.000	0.367	0.001	Y	0.856
33931	33932	Rv2158c	Rv2159c	murE		FALSE	0.456	23.000	0.000	NA		0.641
33932	1935952	Rv2159c	Rv2160A			TRUE	0.715	-22.000	0.000	NA		0.953
1935952	33933	Rv2160A	Rv2160c			TRUE	0.885	-360.000	0.000	0.016		0.969
33933	33934	Rv2160c	Rv2161c			FALSE	0.031	268.000	0.000	NA		0.558
33934	1935953	Rv2161c	Rv2162c		PE_PGRS38	FALSE	0.199	103.000	0.000	NA		0.365
1935953	33936	Rv2162c	Rv2163c	PE_PGRS38	pbpB	FALSE	0.046	210.000	0.000	NA		0.363
33936	33937	Rv2163c	Rv2164c	pbpB		TRUE	0.925	-3.000	0.144	NA		0.154
33937	33938	Rv2164c	Rv2165c		mraW	TRUE	0.936	-3.000	0.028	NA		0.533
33938	33939	Rv2165c	Rv2166c	mraW		FALSE	0.457	158.000	0.635	NA		0.446
33939	33940	Rv2166c	Rv2167c			FALSE	0.008	301.000	0.000	NA		0.101
33940	33941	Rv2167c	Rv2168c			TRUE	0.920	-105.000	0.308	0.059		0.060
33941	33942	Rv2168c	Rv2169c			FALSE	0.053	145.000	0.000	NA		0.134
33943	33944	Rv2170	Rv2171		lppM	FALSE	0.473	96.000	0.250	NA		0.410
33946	33947	Rv2173	Rv2174	idsA2		TRUE	0.913	4.000	0.298	NA		0.043
33950	33951	Rv2177c	Rv2178c		aroG	FALSE	0.004	385.000	0.000	1.000		-0.098
33951	33952	Rv2178c	Rv2179c	aroG		FALSE	0.375	91.000	0.301	1.000		-0.176
33952	33953	Rv2179c	Rv2180c			TRUE	0.683	10.000	0.132	NA		0.058
33955	33956	Rv2182c	Rv2183c			FALSE	0.506	86.000	0.417	NA		0.070
33956	33957	Rv2183c	Rv2184c			TRUE	0.976	-3.000	0.500	NA		0.179
33957	33958	Rv2184c	Rv2185c		TB16.3	FALSE	0.250	120.000	0.184	NA		0.181
33958	33959	Rv2185c	Rv2186c	TB16.3		FALSE	0.214	105.000	0.164	NA		-0.052
1935954	33962	Rv2188c	Rv2189c			FALSE	0.239	97.000	0.258	NA		-0.350
33962	33963	Rv2189c	Rv2190c			TRUE	0.627	95.000	0.471	NA		0.441
33966	33967	Rv2193	Rv2194	ctaE	qcrC	TRUE	0.880	41.000	0.088	0.053	Y	0.179
33967	33968	Rv2194	Rv2195	qcrC	qcrA	TRUE	0.997	-3.000	0.421	0.053	Y	0.541
33968	33969	Rv2195	Rv2196	qcrA	qcrB	TRUE	0.998	-3.000	0.660	0.042	Y	0.360
33970	33971	Rv2197c	Rv2198c		mmpS3	TRUE	0.987	0.000	0.900	NA		0.187
33971	33972	Rv2198c	Rv2199c	mmpS3		FALSE	0.125	186.000	0.092	NA		0.469
33972	33973	Rv2199c	Rv2200c		ctaC	TRUE	0.897	8.000	0.342	NA		0.296
33977	1935955	Rv2204c	Rv2205c			FALSE	0.174	100.000	0.016	NA		0.156
1935956	33980	Rv2206	Rv2207		cobT	FALSE	0.249	79.000	0.095	NA		0.034
33980	33981	Rv2207	Rv2208	cobT	cobS	TRUE	0.992	-3.000	0.039	0.008	Y	-0.042
33981	33982	Rv2208	Rv2209	cobS		FALSE	0.060	158.000	0.003	NA		0.103
33983	33984	Rv2210c	Rv2211c	ilvE	gcvT	TRUE	0.676	72.000	0.025	1.000	Y	0.184
33985	33986	Rv2212	Rv2213		pepB	TRUE	0.596	12.000	0.041	1.000	N	0.330
33988	33989	Rv2215	Rv2216	dlaT		TRUE	0.975	0.000	0.333	1.000		0.350
33989	33990	Rv2216	Rv2217		lipB	TRUE	0.616	53.000	0.019	0.036		0.195
33990	33991	Rv2217	Rv2218	lipB	lipA	TRUE	0.997	-3.000	0.319	0.001	Y	0.033
33991	33992	Rv2218	Rv2219	lipA		FALSE	0.456	27.000	0.059	NA		0.254
33994	33995	Rv2221c	Rv2222c	glnE	glnA2	FALSE	0.108	49.000	0.046	1.000	N	-0.132
33995	33996	Rv2222c	Rv2223c	glnA2		FALSE	0.059	95.000	0.042	NA		-0.339
33996	33997	Rv2223c	Rv2224c			TRUE	0.641	62.000	0.636	NA		-0.068
33998	33999	Rv2225	Rv2226	panB		FALSE	0.049	245.000	0.000	1.000		0.813
34001	34002	Rv2228c	Rv2229c			TRUE	0.973	-3.000	0.422	NA		0.217
34002	34003	Rv2229c	Rv2230c			TRUE	0.970	-3.000	0.468	NA		0.034
34003	34004	Rv2230c	Rv2231c		cobC	TRUE	0.955	-3.000	0.121	NA		0.685
1935959	34007	Rv2232	Rv2234		ptpA	TRUE	0.746	-7.000	0.029	1.000		0.042
34007	34008	Rv2234	Rv2235	ptpA		TRUE	0.913	0.000	0.013	NA		0.348
1935960	34011	Rvnt23	Rv2238c		ahpE	FALSE	0.013	46.000	0.000	NA		NA
34011	34012	Rv2238c	Rv2239c	ahpE		TRUE	0.973	0.000	0.575	NA		-0.021
34012	34013	Rv2239c	Rv2240c			FALSE	0.187	38.000	0.113	NA		-0.362
34014	34015	Rv2241	Rv2242	aceE		FALSE	0.248	60.000	0.169	NA	N	0.083
34015	34016	Rv2242	Rv2243		fabD	FALSE	0.069	239.000	0.441	NA	N	-0.102
34016	34017	Rv2243	Rv2244	fabD	acpM	TRUE	0.786	76.000	0.127	1.000	Y	0.824
34017	34018	Rv2244	Rv2245	acpM	kasA	TRUE	0.989	-3.000	0.089	1.000	Y	0.746
34018	34019	Rv2245	Rv2246	kasA	kasB	TRUE	0.963	31.000	0.400	0.016	Y	0.820
34019	34020	Rv2246	Rv2247	kasB	accD6	TRUE	0.881	31.000	0.222	1.000	Y	0.591
34020	34021	Rv2247	Rv2248	accD6		FALSE	0.143	196.000	0.111	1.000		0.567
34022	1935961	Rv2249c	Rv2250c	glpD1		TRUE	0.949	-6.000	0.727	1.000	N	0.044
1935962	34024	Rv2250A	Rv2251			FALSE	0.043	-256.000	0.000	1.000		NA
34024	34025	Rv2251	Rv2252			TRUE	0.827	-3.000	0.204	1.000	N	-0.374
34025	34026	Rv2252	Rv2253			FALSE	0.193	66.000	0.043	NA		-0.017
34027	34028	Rv2254c	Rv2255c			FALSE	0.318	5.000	0.000	NA		-0.098
34028	34029	Rv2255c	Rv2256c			FALSE	0.064	167.000	0.000	NA		0.277
34029	34030	Rv2256c	Rv2257c			FALSE	0.130	130.000	0.200	NA		-0.271
34030	34031	Rv2257c	Rv2258c			TRUE	0.688	14.000	0.163	1.000	N	0.443
34032	34033	Rv2259	Rv2260	adhE2		TRUE	0.985	0.000	0.538	1.000		0.415
34034	34035	Rv2261c	Rv2262c			TRUE	0.946	6.000	0.000	0.003		0.406
34038	34039	Rv2265	Rv2266		cyp124	FALSE	0.002	175.000	0.000	NA		-0.516
34040	34041	Rv2267c	Rv2268c		cyp128	TRUE	0.900	-3.000	0.000	1.000		0.268
34041	34042	Rv2268c	Rv2269c	cyp128		FALSE	0.167	13.000	0.000	NA		-0.064
34043	34044	Rv2270	Rv2271	lppN		FALSE	0.007	107.000	0.000	NA		-0.539
34044	34045	Rv2271	Rv2272			FALSE	0.191	106.000	0.000	NA		0.368
34045	34046	Rv2272	Rv2273			TRUE	0.899	-3.000	0.190	NA		-0.147
34048	34049	Rv2275	Rv2276		cyp121	TRUE	0.787	-3.000	0.000	NA		0.118
34051	34052	Rv2278	Rv2279			TRUE	0.982	-3.000	0.308	0.058		-0.008
34052	34053	Rv2279	Rv2280			FALSE	0.020	234.000	0.000	1.000	N	0.278
34053	34054	Rv2280	Rv2281		pitB	FALSE	0.001	234.000	0.000	1.000	N	-0.187
34056	34057	Rv2283	Rv2284		lipM	FALSE	0.272	10.000	0.000	NA		-0.034
34057	34058	Rv2284	Rv2285	lipM		FALSE	0.268	33.000	0.000	NA		0.243
34060	34061	Rv2287	Rv2288	yjcE		TRUE	0.912	-3.000	0.000	NA		0.630
34061	34062	Rv2288	Rv2289		cdh	FALSE	0.051	-30.000	0.000	NA		-0.205
34062	34063	Rv2289	Rv2290	cdh	lppO	FALSE	0.037	142.000	0.000	NA		0.010
34063	34064	Rv2290	Rv2291	lppO	sseB	FALSE	0.089	60.000	0.000	NA		-0.008
34065	34066	Rv2292c	Rv2293c			TRUE	0.679	39.000	0.000	0.004		0.198
34067	34068	Rv2294	Rv2295			FALSE	0.006	222.000	0.000	NA		-0.097
34068	34069	Rv2295	Rv2296			FALSE	0.163	94.000	0.000	NA		0.243
34069	34070	Rv2296	Rv2297			FALSE	0.191	32.000	0.000	NA		0.133
34070	34071	Rv2297	Rv2298			FALSE	0.002	192.000	0.000	NA		-0.238
34072	34073	Rv2299c	Rv2300c	htpG		FALSE	0.147	74.000	0.000	1.000		0.019
1935963	34075	Rv2301	Rv2302	cut2		FALSE	0.095	106.000	0.000	NA		0.123
34076	34077	Rv2303c	Rv2304c			FALSE	0.507	-3.000	0.000	NA		-0.102
34078	1935964	Rv2305	Rv2306A			TRUE	0.677	10.000	0.000	NA		0.619
1935964	1935965	Rv2306A	Rv2306B			TRUE	0.554	-213.000	0.000	NA		0.281
34080	1935966	Rv2307c	Rv2307A			FALSE	0.000	532.000	0.000	NA		NA
1935966	1935967	Rv2307A	Rv2307B			FALSE	0.008	85.000	0.000	NA		NA
1935967	1935968	Rv2307B	Rv2307D			FALSE	0.008	93.000	0.000	NA		NA
1935969	34082	Rvnt24	Rv2309c			FALSE	0.077	6.000	0.000	NA		NA
1935970	34083	Rv2309A	Rv2310			FALSE	0.007	103.000	0.000	NA		NA
34083	34084	Rv2310	Rv2311			FALSE	0.223	105.000	0.000	NA		0.536
34084	34085	Rv2311	Rv2312			FALSE	0.210	78.000	0.000	NA		0.305
34086	34087	Rv2313c	Rv2314c			TRUE	0.724	11.000	0.121	NA		0.268
34087	34088	Rv2314c	Rv2315c			TRUE	0.988	-3.000	0.914	NA		0.194
34089	1935971	Rv2316	Rv2317	uspA	uspB	TRUE	0.995	-13.000	0.818	0.019	Y	0.406
1935971	34091	Rv2317	Rv2318	uspB	uspC	TRUE	0.998	-3.000	0.727	0.019	Y	0.006
34092	34093	Rv2319c	Rv2320c		rocE	TRUE	0.978	-3.000	0.444	1.000	N	0.524
34093	34094	Rv2320c	Rv2321c	rocE	rocD2	TRUE	0.929	1.000	0.015	1.000		0.490
34094	34095	Rv2321c	Rv2322c	rocD2	rocD1	TRUE	0.982	0.000	0.000	0.003		0.736
34095	34096	Rv2322c	Rv2323c	rocD1		TRUE	0.951	-3.000	0.038	1.000		0.672
34098	34099	Rv2325c	Rv2326c			TRUE	0.972	-3.000	0.240	1.000		0.613
34100	1935972	Rv2327	Rv2328		PE23	FALSE	0.020	252.000	0.000	1.000		0.093
34102	34103	Rv2329c	Rv2330c	narK1	lppP	FALSE	0.016	234.000	0.000	NA		0.139
34104	1935973	Rv2331	Rv2331A			FALSE	0.226	57.000	0.000	NA		0.258
1935973	1935974	Rv2331A	Rv2332		mez	FALSE	0.394	30.000	0.000	NA		0.540
1935975	34108	Rv2334	Rv2335	cysK1	cysE	TRUE	0.994	4.000	0.133	0.001	Y	0.689
34108	34109	Rv2335	Rv2336	cysE		FALSE	0.008	416.000	0.000	NA		0.270
34110	34111	Rv2337c	Rv2338c		moeW	FALSE	0.165	120.000	0.000	NA		0.410
1935976	1935977	Rv2340c	Rvnt25	PE_PGRS39		FALSE	0.000	499.000	0.000	NA		NA
34114	34115	Rv2341	Rv2342	lppQ		FALSE	0.001	256.000	0.000	NA		-0.218
34116	34117	Rv2343c	Rv2344c	dnaG	dgt	FALSE	0.288	5.000	0.037	1.000	N	-0.232
34119	34120	Rv2346c	Rv2347c	esxO	esxP	FALSE	0.335	51.000	0.000	NA		0.630
34120	34121	Rv2347c	Rv2348c	esxP		FALSE	0.040	135.000	0.000	NA		-0.001
34121	34122	Rv2348c	Rv2349c		plcC	FALSE	0.002	192.000	0.000	NA		-0.171
34122	34123	Rv2349c	Rv2350c	plcC	plcB	TRUE	0.813	83.000	0.000	0.001	Y	-0.033
34123	34124	Rv2350c	Rv2351c	plcB	plcA	FALSE	0.503	218.000	0.000	0.001	Y	0.413
34124	1935978	Rv2351c	Rv2352c	plcA	PPE38	FALSE	0.000	848.000	0.000	NA	N	0.045
1935978	1935979	Rv2352c	Rv2353c	PPE38	PPE39	FALSE	0.000	430.000	0.000	NA		-0.206
34127	34128	Rv2354	Rv2355			TRUE	0.981	-3.000	0.308	0.058		-0.089
1935980	34130	Rv2356c	Rv2357c	PPE40	glyS	FALSE	0.013	138.000	0.000	NA	N	0.168
34131	34132	Rv2358	Rv2359		furB	TRUE	0.960	-3.000	0.021	0.041	N	0.194
34133	34134	Rv2360c	Rv2361c			TRUE	0.768	0.000	0.017	NA		-0.089
34134	34135	Rv2361c	Rv2362c		recO	TRUE	0.705	-7.000	0.076	1.000	N	0.087
1935981	34138	Rv2364c	Rv2365c	era		FALSE	0.074	74.000	0.021	NA		-0.216
34138	34139	Rv2365c	Rv2366c			TRUE	0.730	-28.000	0.025	NA		0.365
34139	34140	Rv2366c	Rv2367c			TRUE	0.923	-3.000	0.222	NA		-0.076
34140	1935982	Rv2367c	Rv2368c		phoH1	TRUE	0.946	4.000	0.457	NA		0.060
1935982	34142	Rv2368c	Rv2369c	phoH1		FALSE	0.450	-28.000	0.000	NA		0.123
34142	34143	Rv2369c	Rv2370c			TRUE	0.857	-3.000	0.000	NA		0.242
34145	34146	Rv2372c	Rv2373c		dnaJ2	TRUE	0.551	14.000	0.073	NA		0.151
34146	34147	Rv2373c	Rv2374c	dnaJ2	hrcA	FALSE	0.160	75.000	0.064	1.000	N	0.003
34149	34150	Rv2376c	Rv2377c	cfp2	mbtH	FALSE	0.008	100.000	0.000	NA		-0.349
34150	34151	Rv2377c	Rv2378c	mbtH	mbtG	FALSE	0.350	-22.000	0.000	NA		0.002
34151	34152	Rv2378c	Rv2379c	mbtG	mbtF	TRUE	0.992	-3.000	0.400	1.000	Y	0.150
34152	34153	Rv2379c	Rv2380c	mbtF	mbtE	TRUE	0.993	-18.000	0.462	0.002	Y	0.709
34153	34154	Rv2380c	Rv2381c	mbtE	mbtD	TRUE	0.735	140.000	0.000	0.005	Y	0.746
34154	34155	Rv2381c	Rv2382c	mbtD	mbtC	TRUE	0.975	0.000	0.000	0.016		0.514
34155	34156	Rv2382c	Rv2383c	mbtC	mbtB	TRUE	0.928	-10.000	0.000	0.016		0.603
34157	1935984	Rv2384	Rv2385	mbtA	mbtJ	TRUE	0.559	96.000	0.095	0.091	N	0.708
34161	34162	Rv2388c	Rv2389c	hemN	rpfD	FALSE	0.140	106.000	0.000	1.000		0.115
34162	34163	Rv2389c	Rv2390c	rpfD		TRUE	0.822	-3.000	0.000	NA		0.188
34164	34165	Rv2391	Rv2392	nirA	cysH	TRUE	0.931	-3.000	0.041	1.000	N	0.801
34165	34166	Rv2392	Rv2393	cysH		TRUE	0.945	-3.000	0.010	1.000		0.736
34166	34167	Rv2393	Rv2394		ggtB	TRUE	0.559	37.000	0.069	1.000		0.600
34167	34168	Rv2394	Rv2395	ggtB		FALSE	0.182	131.000	0.029	NA		0.304
34168	1935986	Rv2395	Rv2396		PE_PGRS41	FALSE	0.000	724.000	0.000	NA		-0.328
1935987	34171	Rv2397c	Rv2398c	cysA1	cysW	TRUE	0.809	17.000	0.087	1.000	Y	-0.217
34171	34172	Rv2398c	Rv2399c	cysW	cysT	TRUE	0.985	-3.000	0.177	0.001	N	0.253
34172	34173	Rv2399c	Rv2400c	cysT	subI	TRUE	0.981	-3.000	0.188	0.003	N	0.171
34176	34177	Rv2403c	Rv2404c	lppR	lepA	TRUE	0.758	-3.000	0.004	NA		-0.056
34180	1935990	Rv2407	Rv2408		PE24	FALSE	0.010	499.000	0.000	NA		0.625
34182	34183	Rv2409c	Rv2410c			TRUE	0.939	0.000	0.089	NA		0.362
34183	34184	Rv2410c	Rv2411c			TRUE	0.880	0.000	0.044	NA		0.110
34186	34187	Rv2413c	Rv2414c			FALSE	0.319	31.000	0.163	NA		-0.166
34187	34188	Rv2414c	Rv2415c			TRUE	0.574	15.000	0.130	NA		0.134
34188	1935991	Rv2415c	Rv2416c		eis	FALSE	0.011	340.000	0.000	1.000		0.173
1935991	34190	Rv2416c	Rv2417c	eis		FALSE	0.004	140.000	0.000	NA		-0.204
34190	34191	Rv2417c	Rv2418c			TRUE	0.638	81.000	0.484	NA		0.352
34191	34192	Rv2418c	Rv2419c			TRUE	0.906	-10.000	0.245	1.000		0.429
34192	34193	Rv2419c	Rv2420c			TRUE	0.922	-3.000	0.045	NA		0.287
34193	34194	Rv2420c	Rv2421c		nadD	TRUE	0.964	-3.000	0.221	NA		0.572
34195	34196	Rv2422	Rv2423			FALSE	0.017	242.000	0.000	NA		0.181
34197	34198	Rv2424c	Rv2425c			FALSE	0.261	89.000	0.000	NA		0.740
34198	34199	Rv2425c	Rv2426c			TRUE	0.985	0.000	0.862	NA		0.041
34199	34200	Rv2426c	Rv2427c		proA	FALSE	0.458	47.000	0.019	1.000		0.434
34200	1935992	Rv2427c	Rv2427Ac	proA	oxyR'	FALSE	0.008	94.000	0.000	NA		NA
34201	34202	Rv2428	Rv2429	ahpC	ahpD	TRUE	0.639	26.000	0.095	1.000		0.800
1935993	1935994	Rv2430c	Rv2431c	PPE41	PE25	FALSE	0.328	47.000	0.000	NA		0.460
1935994	34205	Rv2431c	Rv2432c	PE25		FALSE	0.083	171.000	0.000	NA		0.422
34205	34206	Rv2432c	Rv2433c			TRUE	0.724	-3.000	0.000	NA		0.022
34206	34207	Rv2433c	Rv2434c			TRUE	0.679	-19.000	0.000	NA		0.386
34207	34208	Rv2434c	Rv2435c			TRUE	0.989	-3.000	0.667	0.041	N	-0.011
34209	34210	Rv2436	Rv2437	rbsK		FALSE	0.031	232.000	0.000	1.000	N	0.467
34212	34213	Rv2439c	Rv2440c	proB	obg	TRUE	0.941	0.000	0.206	1.000		0.039
34213	34214	Rv2440c	Rv2441c	obg	rpmA	TRUE	0.620	86.000	0.335	1.000		0.609
34214	34215	Rv2441c	Rv2442c	rpmA	rplU	TRUE	0.987	15.000	0.667	0.013	Y	0.694
34217	34218	Rv2444c	Rv2445c	rne	ndkA	FALSE	0.003	330.000	0.000	1.000	N	0.084
34218	34219	Rv2445c	Rv2446c	ndkA		FALSE	0.343	43.000	0.014	NA		0.268
34219	34220	Rv2446c	Rv2447c		folC	TRUE	0.956	-3.000	0.188	NA		0.368
34220	34221	Rv2447c	Rv2448c	folC	valS	TRUE	0.979	-3.000	0.208	0.072	N	0.378
34221	34222	Rv2448c	Rv2449c	valS		FALSE	0.088	88.000	0.041	NA		-0.210
34222	34223	Rv2449c	Rv2450c		rpfE	FALSE	0.533	90.000	0.333	NA		0.337
34225	34226	Rv2452c	Rv2453c		mobA	FALSE	0.436	24.000	0.000	NA		0.533
34226	34227	Rv2453c	Rv2454c	mobA		TRUE	0.902	2.000	0.053	1.000	N	0.474
34227	34228	Rv2454c	Rv2455c			TRUE	0.999	-3.000	0.832	0.001	Y	0.440
34228	34229	Rv2455c	Rv2456c			FALSE	0.004	232.000	0.000	1.000	N	0.011
34229	34230	Rv2456c	Rv2457c		clpX	FALSE	0.169	16.000	0.002	1.000	N	-0.017
34231	34232	Rv2458	Rv2459	mmuM		FALSE	0.011	167.000	0.000	1.000	N	0.025
34233	1935997	Rv2460c	Rv2461c	clpP2	clpP1	TRUE	0.997	-3.000	0.341	0.001	Y	-0.058
1935997	34235	Rv2461c	Rv2462c	clpP1	tig	TRUE	0.618	117.000	0.018	1.000	Y	0.432
34235	1935998	Rv2462c	Rvnt26	tig		FALSE	0.014	40.000	0.000	NA		NA
1935999	34236	Rvnt27	Rv2463		lipP	FALSE	0.013	44.000	0.000	NA		NA
34237	1936000	Rv2464c	Rv2465c			TRUE	0.897	6.000	0.398	1.000	N	0.138
1936000	34239	Rv2465c	Rv2466c			FALSE	0.432	102.000	0.182	1.000		0.359
34241	34242	Rv2468c	Rv2469c			FALSE	0.050	220.000	0.000	NA		0.624
34243	34244	Rv2470	Rv2471	glbO	aglA	TRUE	0.948	0.000	0.055	1.000		0.472
34244	34245	Rv2471	Rv2472	aglA		FALSE	0.010	68.000	0.000	NA		-0.478
34245	34246	Rv2472	Rv2473			TRUE	0.679	3.000	0.000	NA		0.076
34247	34248	Rv2474c	Rv2475c			TRUE	0.830	6.000	0.305	NA		-0.213
34248	34249	Rv2475c	Rv2476c		gdh	TRUE	0.949	-3.000	0.153	NA		0.337
34249	34250	Rv2476c	Rv2477c	gdh		FALSE	0.252	104.000	0.018	1.000		0.223
34250	34251	Rv2477c	Rv2478c			FALSE	0.109	81.000	0.053	1.000		-0.512
34251	34252	Rv2478c	Rv2479c			TRUE	0.625	49.000	0.000	1.000	Y	-0.057
34252	34253	Rv2479c	Rv2480c			TRUE	0.919	-105.000	0.308	0.057		0.048
34253	34254	Rv2480c	Rv2481c			FALSE	0.000	657.000	0.000	NA		-0.263
34254	34255	Rv2481c	Rv2482c		plsB2	FALSE	0.501	16.000	0.000	NA		0.452
34255	34256	Rv2482c	Rv2483c	plsB2	plsC	TRUE	0.993	-3.000	0.044	0.090	Y	0.401
34256	34257	Rv2483c	Rv2484c	plsC		TRUE	0.932	-3.000	0.044	NA		0.373
34257	34258	Rv2484c	Rv2485c		lipQ	FALSE	0.064	229.000	0.250	NA		-0.031
1936002	34259	Rvnt28	Rv2486		echA14	FALSE	0.007	101.000	0.000	NA		NA
1936003	34261	Rv2487c	Rv2488c	PE_PGRS42		FALSE	0.112	82.000	0.000	NA		0.101
34261	34262	Rv2488c	Rv2489c			TRUE	0.671	-34.000	0.000	NA		0.501
34262	1936004	Rv2489c	Rv2490c		PE_PGRS43	FALSE	0.007	109.000	0.000	NA		-0.239
34264	34265	Rv2491	Rv2492			TRUE	0.759	-10.000	0.000	NA		0.727
34265	34266	Rv2492	Rv2493			FALSE	0.012	53.000	0.000	NA		-0.481
34266	34267	Rv2493	Rv2494			TRUE	0.772	6.000	0.000	NA		0.536
34268	34269	Rv2495c	Rv2496c	pdhC	pdhB	TRUE	0.999	-3.000	1.000	0.090	Y	0.558
34269	34270	Rv2496c	Rv2497c	pdhB	pdhA	TRUE	0.995	11.000	1.000	0.001	Y	0.296
34270	34271	Rv2497c	Rv2498c	pdhA	citE	FALSE	0.038	259.000	0.083	1.000	N	0.306
34271	34272	Rv2498c	Rv2499c	citE		TRUE	0.936	-3.000	0.326	1.000	N	-0.127
34272	34273	Rv2499c	Rv2500c		fadE19	TRUE	0.987	-3.000	0.117	1.000	Y	0.251
34273	34274	Rv2500c	Rv2501c	fadE19	accA1	TRUE	0.966	5.000	0.190	1.000	Y	0.012
34274	34275	Rv2501c	Rv2502c	accA1	accD1	TRUE	0.965	5.000	0.136	1.000	Y	0.089
34275	34276	Rv2502c	Rv2503c	accD1	scoB	TRUE	0.979	-3.000	0.006	1.000	Y	0.128
34276	34277	Rv2503c	Rv2504c	scoB	scoA	TRUE	0.998	-3.000	0.538	0.001	Y	0.014
34277	34278	Rv2504c	Rv2505c	scoA	fadD35	TRUE	0.840	83.000	0.054	0.090	Y	0.490
34279	34280	Rv2506	Rv2507			FALSE	0.158	79.000	0.167	NA		-0.411
34284	1936005	Rv2511	Rvnt29	orn		FALSE	0.012	50.000	0.000	NA		NA
34287	34288	Rv2514c	Rv2515c			TRUE	0.945	6.000	0.726	NA		-0.050
34288	1936006	Rv2515c	Rv2516c			FALSE	0.047	119.000	0.000	1.000		-0.149
1936006	34290	Rv2516c	Rv2517c			TRUE	0.966	-3.000	0.250	NA		0.449
34290	34291	Rv2517c	Rv2518c		lppS	FALSE	0.002	348.000	0.000	NA		-0.066
1936007	1936008	Rvnt30	Rv2519		PE26	FALSE	0.001	219.000	0.000	NA		NA
34295	34296	Rv2522c	Rv2523c		acpS	FALSE	0.197	-3.000	0.036	1.000	N	-0.372
34296	34297	Rv2523c	Rv2524c	acpS	fas	TRUE	0.559	193.000	0.138	0.002	Y	-0.051
34297	34298	Rv2524c	Rv2525c	fas		FALSE	0.006	520.000	0.000	NA		0.303
34299	34300	Rv2526	Rv2527			TRUE	0.915	-3.000	0.000	NA		0.767
34303	1936009	Rv2530c	Rv2530A			FALSE	0.197	-3.000	0.000	NA		NA
1936009	1936010	Rv2530A	Rv2531c			FALSE	0.015	31.000	0.000	1.000		-0.830
1936010	34305	Rv2531c	Rv2532c			FALSE	0.268	72.000	0.143	NA		-0.022
34305	34306	Rv2532c	Rv2533c		nusB	TRUE	0.889	0.000	0.004	NA		0.261
34306	34307	Rv2533c	Rv2534c	nusB	efp	TRUE	0.857	3.000	0.078	1.000	N	0.223
34307	34308	Rv2534c	Rv2535c	efp	pepQ	TRUE	0.775	10.000	0.160	1.000	N	0.410
34310	34311	Rv2537c	Rv2538c	aroD	aroB	TRUE	0.995	-3.000	0.052	0.002	Y	0.233
34311	34312	Rv2538c	Rv2539c	aroB	aroK	TRUE	0.987	-3.000	0.147	1.000	Y	0.221
34312	34313	Rv2539c	Rv2540c	aroK	aroF	TRUE	0.958	4.000	0.041	1.000	Y	-0.062
34314	34315	Rv2541	Rv2542			FALSE	0.012	296.000	0.000	NA		0.210
34315	34316	Rv2542	Rv2543		lppA	FALSE	0.062	127.000	0.000	NA		0.055
34316	34317	Rv2543	Rv2544	lppA	lppB	FALSE	0.525	-3.000	0.000	NA		-0.097
34317	34318	Rv2544	Rv2545	lppB		TRUE	0.913	-3.000	0.000	NA		0.658
34318	34319	Rv2545	Rv2546			FALSE	0.151	93.000	0.000	NA		0.221
34319	34320	Rv2546	Rv2547			FALSE	0.236	39.000	0.000	NA		0.219
34320	34321	Rv2547	Rv2548			FALSE	0.494	-3.000	0.000	NA		-0.107
34322	34323	Rv2549c	Rv2550c			TRUE	0.907	-3.000	0.000	NA		0.520
34323	34324	Rv2550c	Rv2551c			FALSE	0.013	411.000	0.000	1.000		0.329
34324	34325	Rv2551c	Rv2552c		aroE	FALSE	0.289	12.000	0.022	1.000		-0.367
34325	34326	Rv2552c	Rv2553c	aroE		TRUE	0.978	-3.000	0.667	NA		-0.081
34326	34327	Rv2553c	Rv2554c			TRUE	0.827	-7.000	0.039	NA		0.407
34327	34328	Rv2554c	Rv2555c		alaS	TRUE	0.924	1.000	0.103	1.000	N	0.462
34328	34329	Rv2555c	Rv2556c	alaS		FALSE	0.257	91.000	0.011	NA		0.331
34330	34331	Rv2557	Rv2558			FALSE	0.268	85.000	0.000	NA		0.791
34333	34334	Rv2560	Rv2561			FALSE	0.015	357.000	0.000	NA		0.552
34334	34335	Rv2561	Rv2562			FALSE	0.319	56.000	0.000	NA		0.570
34335	34336	Rv2562	Rv2563			FALSE	0.004	143.000	0.000	NA		-0.192
34336	34337	Rv2563	Rv2564		glnQ	FALSE	0.133	3.000	0.000	1.000	N	-0.162
34337	34338	Rv2564	Rv2565	glnQ		FALSE	0.001	277.000	0.000	1.000		-0.447
34338	34339	Rv2565	Rv2566			FALSE	0.040	11.000	0.000	NA		-0.203
34339	34340	Rv2566	Rv2567			TRUE	0.982	0.000	0.667	NA		0.187
34341	34342	Rv2568c	Rv2569c			TRUE	0.784	-7.000	0.046	NA		0.233
34344	34345	Rv2571c	Rv2572c		aspS	FALSE	0.045	53.000	0.000	NA		-0.106
34346	34347	Rv2573	Rv2574			FALSE	0.287	23.000	0.098	NA		-0.211
34347	34348	Rv2574	Rv2575			FALSE	0.254	30.000	0.021	NA		0.010
34353	34354	Rv2580c	Rv2581c	hisS		TRUE	0.937	-3.000	0.051	1.000		0.274
34356	34357	Rv2583c	Rv2584c	relA	apt	FALSE	0.401	31.000	0.051	1.000	N	0.333
34357	34358	Rv2584c	Rv2585c	apt		FALSE	0.007	104.000	0.023	1.000	N	-0.410
34358	34359	Rv2585c	Rv2586c		secF	TRUE	0.830	6.000	0.083	1.000	N	0.443
34359	34360	Rv2586c	Rv2587c	secF	secD	TRUE	0.995	4.000	0.336	0.001	Y	0.233
34360	34361	Rv2587c	Rv2588c	secD	yajC	TRUE	0.551	110.000	0.062	NA	Y	0.071
34362	34363	Rv2589	Rv2590	gabT	fadD9	FALSE	0.245	162.000	0.444	1.000	N	0.123
34363	1936012	Rv2590	Rv2591	fadD9	PE_PGRS44	FALSE	0.002	174.000	0.000	NA		-0.227
34365	34366	Rv2592c	Rv2593c	ruvB	ruvA	TRUE	0.998	-3.000	0.549	0.002	Y	0.091
34366	34367	Rv2593c	Rv2594c	ruvA	ruvC	TRUE	0.998	-3.000	0.451	0.009	Y	0.372
34368	34369	Rv2595	Rv2596			TRUE	0.566	-3.000	0.000	NA		-0.080
34369	34370	Rv2596	Rv2597			FALSE	0.001	217.000	0.000	NA		-0.374
34370	34371	Rv2597	Rv2598			TRUE	0.791	11.000	0.455	NA		-0.277
34371	34372	Rv2598	Rv2599			TRUE	0.892	-3.000	0.242	NA		-0.433
34372	34373	Rv2599	Rv2600			FALSE	0.492	82.000	0.444	NA		-0.067
34373	1936013	Rv2600	Rv2601		speE	TRUE	0.899	-3.000	0.065	NA		0.124
1936013	1936014	Rv2601	Rv2601A	speE		FALSE	0.006	111.000	0.000	1.000		NA
1936014	34375	Rv2601A	Rv2602			TRUE	0.743	-13.000	0.000	NA		0.685
34376	34377	Rv2603c	Rv2604c			FALSE	0.108	133.000	0.055	NA		-0.009
34377	34378	Rv2604c	Rv2605c		tesB2	FALSE	0.176	8.000	0.027	NA	N	-0.068
34378	34379	Rv2605c	Rv2606c	tesB2		FALSE	0.178	29.000	0.014	1.000	N	0.023
34380	1936015	Rv2607	Rv2608	pdxH	PPE42	FALSE	0.004	174.000	0.000	NA	N	0.127
34382	34383	Rv2609c	Rv2610c		pimA	TRUE	0.862	0.000	0.010	1.000	N	0.253
34383	34384	Rv2610c	Rv2611c	pimA		TRUE	0.976	11.000	0.831	1.000	Y	0.017
34384	1936016	Rv2611c	Rv2612c		pgsA1	TRUE	0.983	-3.000	0.737	1.000	N	0.202
1936016	34386	Rv2612c	Rv2613c	pgsA1		TRUE	0.860	-3.000	0.140	1.000	N	-0.070
34386	34387	Rv2613c	Rv2614c		thrS	TRUE	0.877	-7.000	0.208	1.000	N	0.446
34392	34393	Rv2619c	Rv2620c			TRUE	0.715	13.000	0.090	NA		0.532
34393	34394	Rv2620c	Rv2621c			TRUE	0.951	-3.000	0.129	NA		0.451
34395	34396	Rv2622	Rv2623		TB31.7	FALSE	0.169	136.000	0.013	1.000		0.245
34397	34398	Rv2624c	Rv2625c			TRUE	0.612	15.000	0.000	1.000		0.708
34398	34399	Rv2625c	Rv2626c			FALSE	0.379	59.000	0.000	1.000		0.724
34399	34400	Rv2626c	Rv2627c			FALSE	0.010	514.000	0.000	NA		0.876
34401	34402	Rv2628	Rv2629			FALSE	0.018	347.000	0.000	NA		0.869
34402	34403	Rv2629	Rv2630			TRUE	0.887	2.000	0.000	NA		0.866
34403	1936019	Rv2630	Rv2631			FALSE	0.328	140.000	0.279	NA		0.383
34405	34406	Rv2632c	Rv2633c			FALSE	0.124	145.000	0.000	NA		0.499
34406	1936020	Rv2633c	Rv2634c		PE_PGRS46	FALSE	0.025	285.000	0.000	NA		0.532
34408	34409	Rv2635	Rv2636			FALSE	0.163	1.000	0.000	NA		-0.544
34409	34410	Rv2636	Rv2637		dedA	FALSE	0.042	196.000	0.000	NA		0.259
34410	34411	Rv2637	Rv2638	dedA		FALSE	0.020	163.000	0.000	NA		-0.030
34412	34413	Rv2639c	Rv2640c			FALSE	0.210	120.000	0.000	1.000		0.437
34414	34415	Rv2641	Rv2642	cadI		FALSE	0.348	136.000	0.400	NA		0.142
34415	34416	Rv2642	Rv2643		arsC	TRUE	0.983	-3.000	0.600	1.000	N	0.418
34417	1936021	Rv2644c	Rvnt31			FALSE	0.000	647.000	0.000	NA		NA
1936022	1936023	Rvnt32	Rvnt33			FALSE	0.016	30.000	0.000	NA		NA
1936023	1936024	Rvnt33	Rvnt34			FALSE	0.024	17.000	0.000	NA		NA
1936024	34418	Rvnt34	Rv2645			FALSE	0.006	110.000	0.000	NA		NA
34418	34419	Rv2645	Rv2646			TRUE	0.646	-3.000	0.000	NA		-0.036
34419	34420	Rv2646	Rv2647			FALSE	0.006	110.000	0.000	NA		-0.469
34420	34421	Rv2647	Rv2648			FALSE	0.005	133.000	0.000	NA		-0.428
34421	34422	Rv2648	Rv2649			TRUE	0.928	-51.000	0.308	0.056		0.138
34423	34424	Rv2650c	Rv2651c			TRUE	0.615	8.000	0.000	NA		0.254
34424	34425	Rv2651c	Rv2652c			FALSE	0.003	153.000	0.000	NA		-0.231
34425	34426	Rv2652c	Rv2653c			FALSE	0.181	32.000	0.000	NA		0.097
34426	34427	Rv2653c	Rv2654c			FALSE	0.242	80.000	0.000	NA		0.406
34427	34428	Rv2654c	Rv2655c			TRUE	0.858	-3.000	0.000	NA		0.243
34428	34429	Rv2655c	Rv2656c			TRUE	0.970	2.000	0.500	NA		0.221
34429	34430	Rv2656c	Rv2657c			FALSE	0.380	-3.000	0.000	NA		-0.140
34430	34431	Rv2657c	Rv2658c			FALSE	0.208	17.000	0.000	NA		0.024
34431	34432	Rv2658c	Rv2659c			TRUE	0.686	3.000	0.000	NA		0.089
34432	34433	Rv2659c	Rv2660c			FALSE	0.051	145.000	0.000	NA		0.110
34433	34434	Rv2660c	Rv2661c			TRUE	0.798	-3.000	0.000	NA		0.150
34435	34436	Rv2662	Rv2663			FALSE	0.070	99.000	0.000	NA		0.005
34436	34437	Rv2663	Rv2664			FALSE	0.103	11.000	0.000	NA		-0.135
34437	34438	Rv2664	Rv2665			FALSE	0.000	348.000	0.000	NA		-0.195
34438	34439	Rv2665	Rv2666			FALSE	0.224	91.000	0.000	NA		0.405
34439	1936025	Rv2666	Rv2667		clpC2	FALSE	0.308	22.000	0.000	1.000		0.070
1936025	34441	Rv2667	Rv2668	clpC2		FALSE	0.383	79.000	0.150	NA		0.288
34441	34442	Rv2668	Rv2669			FALSE	0.415	29.000	0.051	NA		0.226
34444	34445	Rv2671	Rv2672	ribD		TRUE	0.564	67.000	0.275	NA		0.465
34445	34446	Rv2672	Rv2673			TRUE	0.752	23.000	0.444	NA		0.206
34446	34447	Rv2673	Rv2674			FALSE	0.372	114.000	0.217	NA		0.394
34448	34449	Rv2675c	Rv2676c			TRUE	0.748	-3.000	0.014	NA		-0.116
34449	1936026	Rv2676c	Rv2677c		hemY	TRUE	0.884	6.000	0.158	NA		0.581
1936026	34451	Rv2677c	Rv2678c	hemY	hemE	TRUE	0.996	-3.000	0.049	0.001	Y	0.287
34452	34453	Rv2679	Rv2680	echA15		FALSE	0.057	160.000	0.038	NA		-0.034
34453	34454	Rv2680	Rv2681			TRUE	0.929	2.000	0.115	NA		0.397
34456	34457	Rv2683	Rv2684		arsA	TRUE	0.789	5.000	0.000	1.000		0.257
34457	1936028	Rv2684	Rv2685	arsA	arsB1	TRUE	0.883	80.000	0.000	0.001	Y	0.673
34459	34460	Rv2686c	Rv2687c			TRUE	0.932	-3.000	0.176	NA		0.152
34460	34461	Rv2687c	Rv2688c			TRUE	0.949	-3.000	0.222	NA		0.206
34461	34462	Rv2688c	Rv2689c			FALSE	0.026	195.000	0.004	NA	N	0.244
34462	34463	Rv2689c	Rv2690c			FALSE	0.096	174.000	0.082	NA	N	0.422
1936029	1936030	Rv2691	Rv2692	ceoB	ceoC	TRUE	0.993	-3.000	0.100	0.002	Y	-0.181
34466	34467	Rv2693c	Rv2694c			FALSE	0.482	31.000	0.145	NA		0.220
34469	34470	Rv2696c	Rv2697c		dut	FALSE	0.126	75.000	0.078	NA		-0.266
34475	34476	Rv2702	Rv2703	ppgK	sigA	FALSE	0.306	180.000	0.075	1.000	Y	-0.037
34476	34477	Rv2703	Rv2704	sigA		FALSE	0.248	37.000	0.024	NA	N	0.272
34478	34479	Rv2705c	Rv2706c			TRUE	0.803	-3.000	0.000	NA		0.158
34482	34483	Rv2709	Rv2710		sigB	FALSE	0.122	176.000	0.303	NA		-0.165
34483	34484	Rv2710	Rv2711	sigB	ideR	TRUE	0.696	133.000	0.134	0.040	Y	-0.055
34486	34487	Rv2713	Rv2714	sthA		FALSE	0.032	218.000	0.000	1.000		0.163
34487	34488	Rv2714	Rv2715			TRUE	0.679	59.000	0.538	1.000		0.067
34488	34489	Rv2715	Rv2716			TRUE	0.809	49.000	0.280	0.034		0.381
34490	34491	Rv2717c	Rv2718c			FALSE	0.364	52.000	0.005	NA		0.459
34491	34492	Rv2718c	Rv2719c			FALSE	0.119	163.000	0.012	NA		0.449
34495	34496	Rv2722	Rv2723			FALSE	0.018	26.000	0.000	NA		-0.263
34497	34498	Rv2724c	Rv2725c	fadE20	hflX	FALSE	0.131	136.000	0.003	1.000		0.179
34498	34499	Rv2725c	Rv2726c	hflX	dapF	FALSE	0.421	17.000	0.025	1.000		-0.006
34499	34500	Rv2726c	Rv2727c	dapF	miaA	FALSE	0.457	25.000	0.062	1.000	N	0.331
34500	34501	Rv2727c	Rv2728c	miaA		TRUE	0.847	-3.000	0.043	NA		-0.029
34501	34502	Rv2728c	Rv2729c			FALSE	0.221	109.000	0.000	NA		0.712
34503	34504	Rv2730	Rv2731			FALSE	0.059	8.000	0.000	NA		-0.227
34505	34506	Rv2732c	Rv2733c			TRUE	0.838	-3.000	0.024	NA		-0.002
34508	34509	Rv2735c	Rv2736c		recX	FALSE	0.073	10.000	0.000	NA		-0.160
34509	34510	Rv2736c	Rv2737c	recX	recA	TRUE	0.871	-34.000	0.296	1.000		0.256
34511	34512	Rv2738c	Rv2739c			TRUE	0.647	11.000	0.152	NA		0.028
34513	1936032	Rv2740	Rv2741		PE_PGRS47	FALSE	0.004	232.000	0.000	NA		-0.108
34515	34516	Rv2742c	Rv2743c			FALSE	0.255	72.000	0.167	NA		-0.098
34516	1936033	Rv2743c	Rv2744c		35kd_ag	TRUE	0.740	19.000	0.306	NA		0.339
1936033	34518	Rv2744c	Rv2745c	35kd_ag		FALSE	0.356	130.000	0.260	NA		0.356
34518	34519	Rv2745c	Rv2746c		pgsA3	FALSE	0.096	71.000	0.006	1.000		-0.250
34522	34523	Rv2749	Rv2750			TRUE	0.971	-3.000	0.250	0.042		-0.498
34523	34524	Rv2750	Rv2751			TRUE	0.985	4.000	0.600	NA	Y	-0.129
34525	34526	Rv2752c	Rv2753c		dapA	TRUE	0.797	31.000	0.550	1.000		0.282
34526	34527	Rv2753c	Rv2754c	dapA	thyX	FALSE	0.198	69.000	0.037	1.000	N	0.177
34527	1936034	Rv2754c	Rv2755c	thyX	hsdS.1	FALSE	0.028	244.000	0.000	1.000		0.210
1936034	34529	Rv2755c	Rv2756c	hsdS.1	hsdM	TRUE	0.972	-3.000	0.000	0.055		0.472
34529	34530	Rv2756c	Rv2757c	hsdM		FALSE	0.131	87.000	0.000	NA		0.183
34530	34531	Rv2757c	Rv2758c			TRUE	0.887	-3.000	0.000	NA		0.340
34531	34532	Rv2758c	Rv2759c			FALSE	0.222	26.000	0.000	NA		0.148
34532	34533	Rv2759c	Rv2760c			TRUE	0.984	-3.000	0.750	NA		0.069
34533	34534	Rv2760c	Rv2761c		hsdS	TRUE	0.638	10.000	0.000	NA		0.397
34534	34535	Rv2761c	Rv2762c	hsdS		TRUE	0.722	-3.000	0.000	NA		0.020
34535	34536	Rv2762c	Rv2763c		dfrA	FALSE	0.262	74.000	0.012	NA		0.262
34536	34537	Rv2763c	Rv2764c	dfrA	thyA	FALSE	0.324	71.000	0.295	1.000	N	-0.144
1936035	34540	Rv2766c	Rv2767c	fabG		TRUE	0.797	-3.000	0.000	NA		0.148
34540	1936036	Rv2767c	Rv2768c		PPE43	FALSE	0.007	174.000	0.000	NA		-0.127
1936036	1936037	Rv2768c	Rv2769c	PPE43	PE27	TRUE	0.750	80.000	1.000	NA		0.090
1936037	1936038	Rv2769c	Rv2770c	PE27	PPE44	FALSE	0.018	324.000	0.000	NA		0.526
1936038	34544	Rv2770c	Rv2771c	PPE44		FALSE	0.134	124.000	0.000	NA		0.304
34544	34545	Rv2771c	Rv2772c			FALSE	0.081	86.000	0.000	NA		0.022
34545	34546	Rv2772c	Rv2773c		dapB	FALSE	0.428	12.000	0.027	1.000		-0.157
34546	34547	Rv2773c	Rv2774c	dapB		FALSE	0.334	11.000	0.000	NA		0.043
34549	34550	Rv2776c	Rv2777c			FALSE	0.017	182.000	0.000	NA		-0.020
34550	34551	Rv2777c	Rv2778c			FALSE	0.193	158.000	0.429	NA		-0.307
34551	1936039	Rv2778c	Rv2779c			FALSE	0.178	32.000	0.074	NA		-0.289
34554	34555	Rv2781c	Rv2782c		pepR	FALSE	0.262	61.000	0.010	1.000		0.095
34555	34556	Rv2782c	Rv2783c	pepR	gpsI	TRUE	0.833	-22.000	0.171	1.000		0.279
34556	34557	Rv2783c	Rv2784c	gpsI	lppU	FALSE	0.012	354.000	0.000	NA		0.328
34557	34558	Rv2784c	Rv2785c	lppU	rpsO	FALSE	0.387	13.000	0.004	NA		0.046
34558	34559	Rv2785c	Rv2786c	rpsO	ribF	FALSE	0.119	157.000	0.119	1.000	N	0.221
34560	34561	Rv2787	Rv2788		sirR	FALSE	0.078	85.000	0.000	1.000	N	0.166
34562	34563	Rv2789c	Rv2790c	fadE21	ltp1	TRUE	0.832	26.000	0.011	1.000	Y	0.465
34563	34564	Rv2790c	Rv2791c	ltp1		FALSE	0.024	33.000	0.000	NA	N	0.125
34564	34565	Rv2791c	Rv2792c			TRUE	0.978	0.000	0.000	NA	Y	0.387
34565	34566	Rv2792c	Rv2793c		truB	FALSE	0.002	202.000	0.000	1.000	N	-0.209
34566	34567	Rv2793c	Rv2794c	truB		TRUE	0.909	-3.000	0.034	1.000	N	0.352
34567	34568	Rv2794c	Rv2795c			TRUE	0.919	-3.000	0.203	1.000		-0.196
34568	34569	Rv2795c	Rv2796c		lppV	FALSE	0.130	145.000	0.111	NA		0.064
34569	34570	Rv2796c	Rv2797c	lppV		TRUE	0.868	0.000	0.006	NA		0.196
34570	34571	Rv2797c	Rv2798c			FALSE	0.311	4.000	0.006	NA		-0.266
34572	34573	Rv2799	Rv2800			TRUE	0.694	19.000	0.375	NA		0.007
34574	34575	Rv2801c	Rv2802c			FALSE	0.011	257.000	0.000	NA		0.059
34578	34579	Rv2805	Rv2806			TRUE	0.810	-3.000	0.000	NA		0.168
34579	34580	Rv2806	Rv2807			FALSE	0.002	199.000	0.000	NA		-0.289
34580	34581	Rv2807	Rv2808			FALSE	0.033	234.000	0.000	NA		0.347
34581	34582	Rv2808	Rv2809			FALSE	0.007	105.000	0.000	NA		-0.290
34584	34585	Rv2811	Rv2812			TRUE	0.685	71.000	0.600	NA		0.246
34585	34586	Rv2812	Rv2813			TRUE	0.962	-3.000	0.125	1.000		0.719
11400705	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8662.000	0.000	NA		NA
11543068	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8662.000	0.000	NA		NA
11685460	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8662.000	0.000	NA		NA
11400706	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8698.000	0.000	NA		NA
11543069	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8698.000	0.000	NA		NA
11685461	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8698.000	0.000	NA		NA
11400707	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8736.000	0.000	NA		NA
11543070	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8736.000	0.000	NA		NA
11685462	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8736.000	0.000	NA		NA
11400708	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8772.000	0.000	NA		NA
11543071	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8772.000	0.000	NA		NA
11685463	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8772.000	0.000	NA		NA
11400709	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8812.000	0.000	NA		NA
11543072	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8812.000	0.000	NA		NA
11685464	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8812.000	0.000	NA		NA
11400710	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8848.000	0.000	NA		NA
11543073	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8848.000	0.000	NA		NA
11685465	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8848.000	0.000	NA		NA
11400711	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8888.000	0.000	NA		NA
11543074	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8888.000	0.000	NA		NA
11685466	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8888.000	0.000	NA		NA
11400712	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8924.000	0.000	NA		NA
11543075	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8924.000	0.000	NA		NA
11685467	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8924.000	0.000	NA		NA
11400713	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8961.000	0.000	NA		NA
11543076	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8961.000	0.000	NA		NA
11685468	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8961.000	0.000	NA		NA
11400714	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8997.000	0.000	NA		NA
11543077	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8997.000	0.000	NA		NA
11685469	34574		Rv2801c			FALSE	NA	8997.000	0.000	NA		NA
11400715	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9033.000	0.000	NA		NA
11543078	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9033.000	0.000	NA		NA
11685470	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9033.000	0.000	NA		NA
11400716	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9069.000	0.000	NA		NA
11543079	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9069.000	0.000	NA		NA
11685471	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9069.000	0.000	NA		NA
11400717	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9104.000	0.000	NA		NA
11543080	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9104.000	0.000	NA		NA
11685472	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9104.000	0.000	NA		NA
11400718	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9140.000	0.000	NA		NA
11543081	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9140.000	0.000	NA		NA
11685473	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9140.000	0.000	NA		NA
11400719	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9178.000	0.000	NA		NA
11543082	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9178.000	0.000	NA		NA
11685474	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9178.000	0.000	NA		NA
11400720	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9214.000	0.000	NA		NA
11543083	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9214.000	0.000	NA		NA
11685475	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9214.000	0.000	NA		NA
11400721	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9254.000	0.000	NA		NA
11543084	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9254.000	0.000	NA		NA
11685476	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9254.000	0.000	NA		NA
11400722	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9290.000	0.000	NA		NA
11543085	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9290.000	0.000	NA		NA
11685477	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9290.000	0.000	NA		NA
11400723	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9325.000	0.000	NA		NA
11543086	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9325.000	0.000	NA		NA
11685478	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9325.000	0.000	NA		NA
11400724	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9361.000	0.000	NA		NA
11543087	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9361.000	0.000	NA		NA
11685479	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9361.000	0.000	NA		NA
11400725	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9398.000	0.000	NA		NA
11543088	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9398.000	0.000	NA		NA
11685480	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9398.000	0.000	NA		NA
11400726	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9434.000	0.000	NA		NA
11543089	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9434.000	0.000	NA		NA
11685481	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9434.000	0.000	NA		NA
11400727	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9472.000	0.000	NA		NA
11543090	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9472.000	0.000	NA		NA
11685482	34574		Rv2801c			FALSE	NA	9472.000	0.000	NA		NA
11400728	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1434.000	0.000	NA		NA
11543091	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1434.000	0.000	NA		NA
11685483	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1434.000	0.000	NA		NA
11400729	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1398.000	0.000	NA		NA
11543092	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1398.000	0.000	NA		NA
11685484	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1398.000	0.000	NA		NA
11400730	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1361.000	0.000	NA		NA
11543093	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1361.000	0.000	NA		NA
11685485	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1361.000	0.000	NA		NA
11400731	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1325.000	0.000	NA		NA
11543094	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1325.000	0.000	NA		NA
11685486	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1325.000	0.000	NA		NA
11400732	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1289.000	0.000	NA		NA
11543095	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1289.000	0.000	NA		NA
11685487	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1289.000	0.000	NA		NA
11400733	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1253.000	0.000	NA		NA
11543096	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1253.000	0.000	NA		NA
11685488	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1253.000	0.000	NA		NA
11400734	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1217.000	0.000	NA		NA
11543097	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1217.000	0.000	NA		NA
11685489	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1217.000	0.000	NA		NA
11400735	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1181.000	0.000	NA		NA
11543098	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1181.000	0.000	NA		NA
11685490	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1181.000	0.000	NA		NA
11400736	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1143.000	0.000	NA		NA
11543099	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1143.000	0.000	NA		NA
11685491	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1143.000	0.000	NA		NA
11400737	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1107.000	0.000	NA		NA
11543100	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1107.000	0.000	NA		NA
11685492	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1107.000	0.000	NA		NA
11400738	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1069.000	0.000	NA		NA
11543101	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1069.000	0.000	NA		NA
11685493	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1069.000	0.000	NA		NA
11400739	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1033.000	0.000	NA		NA
11543102	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1033.000	0.000	NA		NA
11685494	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1033.000	0.000	NA		NA
11400740	34588		Rv2815c			FALSE	NA	998.000	0.000	NA		NA
11543103	34588		Rv2815c			FALSE	NA	998.000	0.000	NA		NA
11685495	34588		Rv2815c			FALSE	NA	998.000	0.000	NA		NA
11400741	34588		Rv2815c			FALSE	NA	962.000	0.000	NA		NA
11543104	34588		Rv2815c			FALSE	NA	962.000	0.000	NA		NA
11685496	34588		Rv2815c			FALSE	NA	962.000	0.000	NA		NA
34587	34588	Rv2814c	Rv2815c			TRUE	0.985	-3.000	0.308	0.053		0.174
34588	34589	Rv2815c	Rv2816c			FALSE	0.005	1798.000	0.000	1.000		0.208
11400742	34588		Rv2815c			FALSE	NA	35.000	0.000	NA		NA
11543105	34588		Rv2815c			FALSE	NA	35.000	0.000	NA		NA
11685497	34588		Rv2815c			FALSE	NA	35.000	0.000	NA		NA
11400743	34588		Rv2815c			FALSE	NA	71.000	0.000	NA		NA
11543106	34588		Rv2815c			FALSE	NA	71.000	0.000	NA		NA
11685498	34588		Rv2815c			FALSE	NA	71.000	0.000	NA		NA
11400744	34588		Rv2815c			FALSE	NA	111.000	0.000	NA		NA
11543107	34588		Rv2815c			FALSE	NA	111.000	0.000	NA		NA
11685499	34588		Rv2815c			FALSE	NA	111.000	0.000	NA		NA
11400745	34588		Rv2815c			FALSE	NA	147.000	0.000	NA		NA
11543108	34588		Rv2815c			FALSE	NA	147.000	0.000	NA		NA
11685500	34588		Rv2815c			FALSE	NA	147.000	0.000	NA		NA
11400746	34588		Rv2815c			FALSE	NA	186.000	0.000	NA		NA
11543109	34588		Rv2815c			FALSE	NA	186.000	0.000	NA		NA
11685501	34588		Rv2815c			FALSE	NA	186.000	0.000	NA		NA
11400747	34588		Rv2815c			FALSE	NA	222.000	0.000	NA		NA
11543110	34588		Rv2815c			FALSE	NA	222.000	0.000	NA		NA
11685502	34588		Rv2815c			FALSE	NA	222.000	0.000	NA		NA
11400748	34588		Rv2815c			FALSE	NA	259.000	0.000	NA		NA
11543111	34588		Rv2815c			FALSE	NA	259.000	0.000	NA		NA
11685503	34588		Rv2815c			FALSE	NA	259.000	0.000	NA		NA
11400749	34588		Rv2815c			FALSE	NA	295.000	0.000	NA		NA
11543112	34588		Rv2815c			FALSE	NA	295.000	0.000	NA		NA
11685504	34588		Rv2815c			FALSE	NA	295.000	0.000	NA		NA
11400750	34588		Rv2815c			FALSE	NA	331.000	0.000	NA		NA
11543113	34588		Rv2815c			FALSE	NA	331.000	0.000	NA		NA
11685505	34588		Rv2815c			FALSE	NA	331.000	0.000	NA		NA
11400751	34588		Rv2815c			FALSE	NA	367.000	0.000	NA		NA
11543114	34588		Rv2815c			FALSE	NA	367.000	0.000	NA		NA
11685506	34588		Rv2815c			FALSE	NA	367.000	0.000	NA		NA
11400752	34588		Rv2815c			FALSE	NA	403.000	0.000	NA		NA
11543115	34588		Rv2815c			FALSE	NA	403.000	0.000	NA		NA
11685507	34588		Rv2815c			FALSE	NA	403.000	0.000	NA		NA
11400753	34588		Rv2815c			FALSE	NA	439.000	0.000	NA		NA
11543116	34588		Rv2815c			FALSE	NA	439.000	0.000	NA		NA
11685508	34588		Rv2815c			FALSE	NA	439.000	0.000	NA		NA
11400754	34588		Rv2815c			FALSE	NA	476.000	0.000	NA		NA
11543117	34588		Rv2815c			FALSE	NA	476.000	0.000	NA		NA
11685509	34588		Rv2815c			FALSE	NA	476.000	0.000	NA		NA
11400755	34588		Rv2815c			FALSE	NA	512.000	0.000	NA		NA
11543118	34588		Rv2815c			FALSE	NA	512.000	0.000	NA		NA
11685510	34588		Rv2815c			FALSE	NA	512.000	0.000	NA		NA
11400756	34588		Rv2815c			FALSE	NA	548.000	0.000	NA		NA
11543119	34588		Rv2815c			FALSE	NA	548.000	0.000	NA		NA
11685511	34588		Rv2815c			FALSE	NA	548.000	0.000	NA		NA
11400757	34588		Rv2815c			FALSE	NA	584.000	0.000	NA		NA
11543120	34588		Rv2815c			FALSE	NA	584.000	0.000	NA		NA
11685512	34588		Rv2815c			FALSE	NA	584.000	0.000	NA		NA
11400758	34588		Rv2815c			FALSE	NA	609.000	0.000	NA		NA
11543121	34588		Rv2815c			FALSE	NA	609.000	0.000	NA		NA
11685513	34588		Rv2815c			FALSE	NA	609.000	0.000	NA		NA
11400759	34588		Rv2815c			FALSE	NA	645.000	0.000	NA		NA
11543122	34588		Rv2815c			FALSE	NA	645.000	0.000	NA		NA
11685514	34588		Rv2815c			FALSE	NA	645.000	0.000	NA		NA
11400760	34588		Rv2815c			FALSE	NA	686.000	0.000	NA		NA
11543123	34588		Rv2815c			FALSE	NA	686.000	0.000	NA		NA
11685515	34588		Rv2815c			FALSE	NA	686.000	0.000	NA		NA
11400761	34588		Rv2815c			FALSE	NA	722.000	0.000	NA		NA
11543124	34588		Rv2815c			FALSE	NA	722.000	0.000	NA		NA
11685516	34588		Rv2815c			FALSE	NA	722.000	0.000	NA		NA
11400762	34588		Rv2815c			FALSE	NA	758.000	0.000	NA		NA
11543125	34588		Rv2815c			FALSE	NA	758.000	0.000	NA		NA
11685517	34588		Rv2815c			FALSE	NA	758.000	0.000	NA		NA
11400763	34588		Rv2815c			FALSE	NA	794.000	0.000	NA		NA
11543126	34588		Rv2815c			FALSE	NA	794.000	0.000	NA		NA
11685518	34588		Rv2815c			FALSE	NA	794.000	0.000	NA		NA
11400764	34588		Rv2815c			FALSE	NA	834.000	0.000	NA		NA
11543127	34588		Rv2815c			FALSE	NA	834.000	0.000	NA		NA
11685519	34588		Rv2815c			FALSE	NA	834.000	0.000	NA		NA
11400765	34588		Rv2815c			FALSE	NA	870.000	0.000	NA		NA
11543128	34588		Rv2815c			FALSE	NA	870.000	0.000	NA		NA
11685520	34588		Rv2815c			FALSE	NA	870.000	0.000	NA		NA
11400766	34588		Rv2815c			FALSE	NA	911.000	0.000	NA		NA
11543129	34588		Rv2815c			FALSE	NA	911.000	0.000	NA		NA
11685521	34588		Rv2815c			FALSE	NA	911.000	0.000	NA		NA
11400767	34588		Rv2815c			FALSE	NA	947.000	0.000	NA		NA
11543130	34588		Rv2815c			FALSE	NA	947.000	0.000	NA		NA
11685522	34588		Rv2815c			FALSE	NA	947.000	0.000	NA		NA
11400768	34588		Rv2815c			FALSE	NA	984.000	0.000	NA		NA
11543131	34588		Rv2815c			FALSE	NA	984.000	0.000	NA		NA
11685523	34588		Rv2815c			FALSE	NA	984.000	0.000	NA		NA
11400769	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1020.000	0.000	NA		NA
11543132	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1020.000	0.000	NA		NA
11685524	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1020.000	0.000	NA		NA
11400770	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1055.000	0.000	NA		NA
11543133	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1055.000	0.000	NA		NA
11685525	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1055.000	0.000	NA		NA
11400771	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1091.000	0.000	NA		NA
11543134	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1091.000	0.000	NA		NA
11685526	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1091.000	0.000	NA		NA
11400772	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1128.000	0.000	NA		NA
11543135	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1128.000	0.000	NA		NA
11685527	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1128.000	0.000	NA		NA
11400773	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1164.000	0.000	NA		NA
11543136	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1164.000	0.000	NA		NA
11685528	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1164.000	0.000	NA		NA
11400774	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1202.000	0.000	NA		NA
11543137	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1202.000	0.000	NA		NA
11685529	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1202.000	0.000	NA		NA
11400775	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1238.000	0.000	NA		NA
11543138	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1238.000	0.000	NA		NA
11685530	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1238.000	0.000	NA		NA
11400776	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1275.000	0.000	NA		NA
11543139	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1275.000	0.000	NA		NA
11685531	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1275.000	0.000	NA		NA
11400777	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1311.000	0.000	NA		NA
11543140	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1311.000	0.000	NA		NA
11685532	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1311.000	0.000	NA		NA
11400778	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1346.000	0.000	NA		NA
11543141	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1346.000	0.000	NA		NA
11685533	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1346.000	0.000	NA		NA
11400779	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1382.000	0.000	NA		NA
11543142	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1382.000	0.000	NA		NA
11685534	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1382.000	0.000	NA		NA
11400780	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1421.000	0.000	NA		NA
11543143	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1421.000	0.000	NA		NA
11685535	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1421.000	0.000	NA		NA
11400781	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1457.000	0.000	NA		NA
11543144	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1457.000	0.000	NA		NA
11685536	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1457.000	0.000	NA		NA
11400782	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1491.000	0.000	NA		NA
11543145	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1491.000	0.000	NA		NA
11685537	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1491.000	0.000	NA		NA
11400783	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1527.000	0.000	NA		NA
11543146	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1527.000	0.000	NA		NA
11685538	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1527.000	0.000	NA		NA
11400784	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1563.000	0.000	NA		NA
11543147	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1563.000	0.000	NA		NA
11685539	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1563.000	0.000	NA		NA
11400785	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1599.000	0.000	NA		NA
11543148	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1599.000	0.000	NA		NA
11685540	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1599.000	0.000	NA		NA
11400786	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1640.000	0.000	NA		NA
11543149	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1640.000	0.000	NA		NA
11685541	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1640.000	0.000	NA		NA
11400787	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1676.000	0.000	NA		NA
11543150	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1676.000	0.000	NA		NA
11685542	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1676.000	0.000	NA		NA
11400788	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1714.000	0.000	NA		NA
11543151	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1714.000	0.000	NA		NA
11685543	34588		Rv2815c			FALSE	NA	1714.000	0.000	NA		NA
34589	34590	Rv2816c	Rv2817c			TRUE	0.984	1.000	0.280	NA	Y	0.022
34590	34591	Rv2817c	Rv2818c			TRUE	0.567	13.000	0.000	NA		0.512
34591	34592	Rv2818c	Rv2819c			FALSE	0.152	96.000	0.052	NA		-0.050
34592	34593	Rv2819c	Rv2820c			TRUE	0.993	-3.000	0.597	NA	Y	-0.042
34593	34594	Rv2820c	Rv2821c			TRUE	0.976	-19.000	0.547	NA	Y	0.245
34594	34595	Rv2821c	Rv2822c			TRUE	0.908	10.000	0.453	NA		0.390
34595	34596	Rv2822c	Rv2823c			TRUE	0.960	-3.000	0.347	NA		0.029
34596	34597	Rv2823c	Rv2824c			TRUE	0.827	-3.000	0.102	NA		-0.234
34597	34598	Rv2824c	Rv2825c			FALSE	0.002	178.000	0.000	NA		-0.171
34598	34599	Rv2825c	Rv2826c			FALSE	0.002	170.000	0.000	NA		-0.333
34599	34600	Rv2826c	Rv2827c			FALSE	0.133	3.000	0.000	NA		-0.220
34600	34601	Rv2827c	Rv2828c			FALSE	0.020	305.000	0.000	NA		0.436
34601	34602	Rv2828c	Rv2829c			FALSE	0.013	287.000	0.000	NA		0.217
34602	34603	Rv2829c	Rv2830c			TRUE	0.798	-3.000	0.000	NA		0.149
34605	34606	Rv2832c	Rv2833c	ugpC	ugpB	TRUE	0.991	-7.000	0.467	0.017	Y	0.149
34606	34607	Rv2833c	Rv2834c	ugpB	ugpE	TRUE	0.995	3.000	0.467	0.017	Y	0.102
34607	34608	Rv2834c	Rv2835c	ugpE	ugpA	TRUE	0.997	-3.000	0.389	0.017	Y	0.637
34608	34609	Rv2835c	Rv2836c	ugpA	dinF	FALSE	0.313	87.000	0.006	0.036	N	-0.157
34609	34610	Rv2836c	Rv2837c	dinF		TRUE	0.847	7.000	0.054	1.000		0.462
34610	34611	Rv2837c	Rv2838c		rbfA	TRUE	0.849	-25.000	0.173	1.000		0.391
34611	34612	Rv2838c	Rv2839c	rbfA	infB	TRUE	0.995	0.000	0.530	1.000	Y	0.466
34612	34613	Rv2839c	Rv2840c	infB		FALSE	0.269	86.000	0.171	NA	N	0.247
34613	34614	Rv2840c	Rv2841c		nusA	TRUE	0.664	127.000	0.323	NA	Y	0.148
34614	34615	Rv2841c	Rv2842c	nusA		TRUE	0.990	-3.000	0.759	NA		0.737
34616	34617	Rv2843	Rv2844			TRUE	0.940	-3.000	0.139	NA		0.262
34618	34619	Rv2845c	Rv2846c	proS	efpA	FALSE	0.321	89.000	0.004	1.000		0.420
34619	1936041	Rv2846c	Rv2847c	efpA	cysG	TRUE	0.820	23.000	0.156	0.017		0.248
1936041	34621	Rv2847c	Rv2848c	cysG	cobB	FALSE	0.203	277.000	0.145	1.000	Y	0.422
34621	1936042	Rv2848c	Rv2849c	cobB	cobO	TRUE	0.991	0.000	0.114	0.007	Y	-0.254
1936042	34623	Rv2849c	Rv2850c	cobO		TRUE	0.924	21.000	0.057	0.064	Y	0.325
34623	34624	Rv2850c	Rv2851c			TRUE	0.963	-3.000	0.314	1.000		0.030
34624	34625	Rv2851c	Rv2852c		mqo	FALSE	0.432	59.000	0.119	1.000		0.221
1936043	34627	Rv2853	Rv2854	PE_PGRS48		FALSE	0.088	37.000	0.000	NA		-0.051
34627	1936044	Rv2854	Rv2855		mtr	TRUE	0.679	13.000	0.341	NA	N	-0.001
1936044	34629	Rv2855	Rv2856	mtr	nicT	FALSE	0.201	100.000	0.030	1.000	N	0.262
34630	34631	Rv2857c	Rv2858c		aldC	TRUE	0.991	-3.000	0.839	0.080	N	-0.001
34631	34632	Rv2858c	Rv2859c	aldC		TRUE	0.970	-3.000	0.419	1.000		-0.010
34632	34633	Rv2859c	Rv2860c		glnA4	TRUE	0.618	-19.000	0.157	1.000		-0.529
34633	1936045	Rv2860c	Rv2861c	glnA4	mapB	FALSE	0.003	160.000	0.000	1.000	N	-0.266
1936045	34635	Rv2861c	Rv2862c	mapB		FALSE	0.284	42.000	0.042	NA		0.064
34638	34639	Rv2865	Rv2866			TRUE	0.934	4.000	0.000	NA	Y	-0.077
34640	34641	Rv2867c	Rv2868c		gcpE	FALSE	0.289	56.000	0.018	1.000		0.098
34641	34642	Rv2868c	Rv2869c	gcpE		FALSE	0.312	17.000	0.072	1.000	N	-0.052
34642	1936046	Rv2869c	Rv2870c		dxr	TRUE	0.654	8.000	0.088	1.000	N	0.095
34644	34645	Rv2871	Rv2872			FALSE	0.324	-13.000	0.000	NA		-0.042
34645	34646	Rv2872	Rv2873		mpt83	FALSE	0.105	80.000	0.000	NA		0.064
34646	34647	Rv2873	Rv2874	mpt83	dipZ	FALSE	0.003	280.000	0.000	1.000	N	0.017
34647	34648	Rv2874	Rv2875	dipZ	mpt70	FALSE	0.061	96.000	0.000	1.000	N	0.123
34648	34649	Rv2875	Rv2876	mpt70		FALSE	0.325	52.000	0.000	NA		0.548
1936047	34651	Rv2877c	Rv2878c		mpt53	TRUE	0.994	5.000	1.000	1.000	Y	0.526
34651	34652	Rv2878c	Rv2879c	mpt53		FALSE	0.057	186.000	0.003	NA		0.233
34652	34653	Rv2879c	Rv2880c			FALSE	0.352	-301.000	0.014	NA		-0.115
34653	34654	Rv2880c	Rv2881c		cdsA	FALSE	0.166	23.000	0.033	NA		-0.226
34654	34655	Rv2881c	Rv2882c	cdsA	frr	FALSE	0.389	23.000	0.076	1.000	N	0.168
34655	34656	Rv2882c	Rv2883c	frr	pyrH	FALSE	0.368	172.000	0.626	1.000	N	0.372
34658	34659	Rv2885c	Rv2886c			TRUE	0.951	-3.000	0.000	NA	Y	-0.446
34661	34662	Rv2888c	Rv2889c	amiC	tsf	TRUE	0.951	7.000	0.006	1.000	Y	0.506
34662	34663	Rv2889c	Rv2890c	tsf	rpsB	TRUE	0.978	12.000	0.748	1.000	Y	0.403
34667	34668	Rv2894c	Rv2895c	xerC	viuB	FALSE	0.008	91.000	0.008	NA	N	-0.137
34668	34669	Rv2895c	Rv2896c	viuB		FALSE	0.015	33.000	0.007	NA	N	-0.286
34669	34670	Rv2896c	Rv2897c			TRUE	0.934	-3.000	0.053	1.000	N	0.757
34670	34671	Rv2897c	Rv2898c			TRUE	0.782	0.000	0.050	1.000	N	-0.037
34671	34672	Rv2898c	Rv2899c		fdhD	FALSE	0.034	248.000	0.003	1.000	N	0.502
34672	34673	Rv2899c	Rv2900c	fdhD	fdhF	TRUE	0.997	0.000	0.261	0.000	Y	0.251
34673	34674	Rv2900c	Rv2901c	fdhF		FALSE	0.269	58.000	0.000	NA		0.355
34674	34675	Rv2901c	Rv2902c		rnhB	FALSE	0.301	54.000	0.067	NA		0.137
34675	34676	Rv2902c	Rv2903c	rnhB	lepB	TRUE	0.596	14.000	0.024	1.000	N	0.600
34676	34677	Rv2903c	Rv2904c	lepB	rplS	FALSE	0.029	58.000	0.018	1.000	N	-0.197
34679	34680	Rv2906c	Rv2907c	trmD	rimM	TRUE	0.992	4.000	0.672	1.000	Y	0.232
34680	34681	Rv2907c	Rv2908c	rimM		TRUE	0.785	14.000	0.324	1.000		0.128
34681	34682	Rv2908c	Rv2909c		rpsP	TRUE	0.922	8.000	0.385	1.000		0.355
34682	34683	Rv2909c	Rv2910c	rpsP		FALSE	0.062	184.000	0.002	NA		0.252
34685	34686	Rv2912c	Rv2913c			TRUE	0.939	2.000	0.278	1.000		0.004
34686	34687	Rv2913c	Rv2914c		pknI	FALSE	0.028	69.000	0.000	1.000	N	-0.004
34687	34688	Rv2914c	Rv2915c	pknI		FALSE	0.127	44.000	0.000	1.000	N	0.181
34688	34689	Rv2915c	Rv2916c		ffh	FALSE	0.145	28.000	0.025	1.000	N	-0.069
34691	34692	Rv2918c	Rv2919c	glnD	glnB	FALSE	0.158	58.000	0.055	1.000	N	-0.030
34692	34693	Rv2919c	Rv2920c	glnB	amt	TRUE	0.979	-3.000	0.467	1.000	N	0.595
34693	34694	Rv2920c	Rv2921c	amt	ftsY	FALSE	0.030	365.000	0.004	0.036	N	0.157
34694	1936050	Rv2921c	Rv2922c	ftsY	smc	TRUE	0.652	50.000	0.165	0.011	N	0.105
1936050	1936051	Rv2922c	Rv2922A	smc	acyP	FALSE	0.035	12.000	0.021	1.000	N	-0.666
1936051	34696	Rv2922A	Rv2923c	acyP		TRUE	0.777	-13.000	0.028	1.000	N	0.916
34696	34697	Rv2923c	Rv2924c		fpg	FALSE	0.102	102.000	0.010	1.000	N	0.076
34697	34698	Rv2924c	Rv2925c	fpg	rncS	FALSE	0.004	359.000	0.068	1.000	N	-0.171
34698	34699	Rv2925c	Rv2926c	rncS		TRUE	0.789	-3.000	0.026	NA		-0.103
34699	34700	Rv2926c	Rv2927c			FALSE	0.364	51.000	0.029	NA		0.323
34701	34702	Rv2928	Rv2929	tesA		TRUE	0.730	-13.000	0.000	NA		0.529
34702	1936052	Rv2929	Rv2930		fadD26	FALSE	0.009	416.000	0.000	NA		0.302
1936052	34704	Rv2930	Rv2931	fadD26	ppsA	TRUE	0.997	-3.000	0.667	1.000	Y	0.869
34704	34705	Rv2931	Rv2932	ppsA	ppsB	TRUE	0.999	-3.000	0.667	0.007	Y	0.621
34705	34706	Rv2932	Rv2933	ppsB	ppsC	TRUE	0.998	-3.000	0.500	0.007	Y	0.370
34706	34707	Rv2933	Rv2934	ppsC	ppsD	TRUE	0.999	-3.000	0.833	0.004	Y	0.450
34707	34708	Rv2934	Rv2935	ppsD	ppsE	TRUE	0.993	6.000	0.417	0.007	Y	0.529
34708	34709	Rv2935	Rv2936	ppsE	drrA	TRUE	0.897	11.000	0.500	1.000	N	0.529
34709	34710	Rv2936	Rv2937	drrA	drrB	TRUE	0.991	-3.000	0.750	1.000		0.660
34710	34711	Rv2937	Rv2938	drrB	drrC	TRUE	0.998	-3.000	0.857	0.001		0.737
34711	34712	Rv2938	Rv2939	drrC	papA5	TRUE	0.679	47.000	0.364	NA		0.424
34714	34715	Rv2941	Rv2942	fadD28	mmpL7	TRUE	0.959	-7.000	0.600	1.000		0.305
34715	34716	Rv2942	Rv2943	mmpL7		FALSE	0.003	632.000	0.000	1.000		-0.058
34716	1936053	Rv2943	Rv2943A			TRUE	0.929	0.000	0.000	1.000		0.913
1936053	34717	Rv2943A	Rv2944			TRUE	0.631	-445.000	0.000	0.064		NA
34718	34719	Rv2945c	Rv2946c	lppX	pks1	FALSE	0.353	178.000	0.500	NA		0.770
34719	34720	Rv2946c	Rv2947c	pks1	pks15	TRUE	0.996	-3.000	0.667	0.007		0.738
34720	34721	Rv2947c	Rv2948c	pks15	fadD22	TRUE	0.996	-3.000	0.750	0.007		0.838
34721	34722	Rv2948c	Rv2949c	fadD22		FALSE	0.456	17.000	0.010	NA	N	0.770
34722	34723	Rv2949c	Rv2950c		fadD29	FALSE	0.355	26.000	0.010	NA	N	0.510
34723	34724	Rv2950c	Rv2951c	fadD29		FALSE	0.004	759.000	0.000	NA	N	0.609
34725	34726	Rv2952	Rv2953			FALSE	0.210	26.000	0.000	NA		0.109
34727	34728	Rv2954c	Rv2955c			FALSE	0.052	189.000	0.000	NA		0.310
34729	34730	Rv2956	Rv2957			FALSE	0.326	71.000	0.071	NA		0.239
34731	34732	Rv2958c	Rv2959c			FALSE	0.185	101.000	0.000	1.000	N	0.503
34732	34733	Rv2959c	Rv2960c			FALSE	0.198	115.000	0.000	NA		0.616
34736	34737	Rv2963	Rv2964		purU	FALSE	0.163	73.000	0.012	NA		0.029
34738	34739	Rv2965c	Rv2966c	coaD		FALSE	0.539	86.000	0.367	1.000	N	0.398
34739	34740	Rv2966c	Rv2967c		pca	FALSE	0.067	196.000	0.014	1.000	N	0.489
34740	34741	Rv2967c	Rv2968c	pca		FALSE	0.524	25.000	0.021	NA		0.645
34741	34742	Rv2968c	Rv2969c			TRUE	0.862	6.000	0.257	NA		0.073
34742	34743	Rv2969c	Rv2970c		lipN	FALSE	0.369	97.000	0.421	NA	N	-0.046
1936054	34744	Rv2970A	Rv2971			TRUE	0.923	-3.000	0.000	0.038		-0.894
34745	34746	Rv2972c	Rv2973c		recG	TRUE	0.912	-3.000	0.018	NA		0.294
34746	34747	Rv2973c	Rv2974c	recG		TRUE	0.912	3.000	0.040	1.000		0.368
34747	34748	Rv2974c	Rv2975c			TRUE	0.981	-3.000	0.010	0.000		0.091
34748	34749	Rv2975c	Rv2976c		ung	FALSE	0.007	459.000	0.029	1.000		-0.071
34749	34750	Rv2976c	Rv2977c	ung	thiL	FALSE	0.113	33.000	0.028	1.000	N	-0.105
34750	34751	Rv2977c	Rv2978c	thiL		FALSE	0.197	-3.000	0.000	NA	N	-0.027
34751	34752	Rv2978c	Rv2979c			TRUE	0.975	0.000	0.000	NA	Y	0.250
34754	34755	Rv2981c	Rv2982c	ddl	gpsA	FALSE	0.195	78.000	0.088	1.000	N	0.035
34756	34757	Rv2983	Rv2984		ppk	FALSE	0.092	92.000	0.026	NA		-0.152
34757	34758	Rv2984	Rv2985	ppk	mutT1	FALSE	0.256	83.000	0.056	1.000	N	0.290
34759	34760	Rv2986c	Rv2987c	hupB	leuD	FALSE	0.063	213.000	0.066	1.000	N	0.357
34760	34761	Rv2987c	Rv2988c	leuD	leuC	TRUE	0.978	25.000	0.477	0.000	Y	0.329
1936055	1936056	Rvnt35	Rvnt36			FALSE	0.014	40.000	0.000	NA		NA
1936056	1936057	Rvnt36	Rv2992c		gltX	FALSE	0.009	75.000	0.000	NA		NA
1936057	34766	Rv2992c	Rv2993c	gltX		TRUE	0.880	-3.000	0.070	1.000	N	0.156
34768	1936058	Rv2995c	Rv2996c	leuB	serA1	TRUE	0.859	15.000	0.039	1.000	Y	0.112
34770	34771	Rv2997	Rv2998			FALSE	0.001	274.000	0.000	NA		-0.351
34772	34773	Rv2999	Rv3000	lppY		FALSE	0.186	45.000	0.000	NA		0.171
34774	34775	Rv3001c	Rv3002c	ilvC	ilvN	TRUE	0.936	38.000	0.071	0.001	Y	0.366
34775	1936060	Rv3002c	Rv3003c	ilvN	ilvB1	TRUE	0.997	0.000	0.380	0.001	Y	0.051
34782	34783	Rv3009c	Rv3010c	gatB	pfkA	FALSE	0.147	30.000	0.011	1.000	N	-0.001
34783	34784	Rv3010c	Rv3011c	pfkA	gatA	FALSE	0.110	96.000	0.007	1.000	N	0.117
34784	34785	Rv3011c	Rv3012c	gatA	gatC	TRUE	0.999	-3.000	0.643	0.001	Y	0.435
34787	34788	Rv3014c	Rv3015c	ligA		FALSE	0.108	31.000	0.009	1.000	N	-0.045
34790	1936061	Rv3017c	Rv3018c	esxQ	PPE46	FALSE	0.053	87.000	0.000	NA		-0.049
1936061	1936062	Rv3018c	Rv3018A	PPE46	PE27A	FALSE	0.008	86.000	0.000	NA		NA
1936062	34792	Rv3018A	Rv3019c	PE27A	esxR	FALSE	0.001	296.000	0.000	NA		NA
34792	1936063	Rv3019c	Rv3020c	esxR	esxS	FALSE	0.358	35.000	0.000	NA		0.463
1936063	1936064	Rv3020c	Rv3021c	esxS	PPE47	FALSE	0.013	47.000	0.000	NA		-0.360
1936064	1936065	Rv3021c	Rv3022c	PPE47	PPE48	FALSE	0.472	-12.000	0.000	NA		0.058
1936065	1936066	Rv3022c	Rv3022A	PPE48	PE29	FALSE	0.197	-3.000	0.000	NA		NA
1936066	34796	Rv3022A	Rv3023c	PE29		FALSE	0.000	382.000	0.000	NA		NA
34796	34797	Rv3023c	Rv3024c		trmU	FALSE	0.003	163.000	0.000	1.000	N	-0.443
34797	34798	Rv3024c	Rv3025c	trmU	iscS	TRUE	0.882	-3.000	0.094	1.000	N	0.071
34798	34799	Rv3025c	Rv3026c	iscS		FALSE	0.332	97.000	0.045	0.079	N	-0.084
34799	34800	Rv3026c	Rv3027c			TRUE	0.961	-3.000	0.286	NA		0.217
34800	34801	Rv3027c	Rv3028c		fixB	FALSE	0.037	261.000	0.062	NA		0.239
34801	34802	Rv3028c	Rv3029c	fixB	fixA	TRUE	0.979	39.000	0.877	0.008	Y	0.334
34803	34804	Rv3030	Rv3031			TRUE	0.873	-3.000	0.019	1.000		-0.018
34804	34805	Rv3031	Rv3032			FALSE	0.332	32.000	0.082	1.000		-0.130
34805	34806	Rv3032	Rv3033			FALSE	0.000	602.000	0.000	NA		-0.166
34809	34810	Rv3036c	Rv3037c	TB22.2		FALSE	0.039	73.000	0.034	NA		-0.476
34810	34811	Rv3037c	Rv3038c			FALSE	0.159	135.000	0.112	NA		0.083
34811	34812	Rv3038c	Rv3039c		echA17	TRUE	0.936	11.000	0.292	0.079		0.639
34812	34813	Rv3039c	Rv3040c	echA17		FALSE	0.536	9.000	0.043	1.000		-0.204
34813	34814	Rv3040c	Rv3041c			TRUE	0.869	-3.000	0.024	1.000		-0.043
34814	34815	Rv3041c	Rv3042c		serB2	FALSE	0.028	15.000	0.014	1.000	N	-0.356
34815	34816	Rv3042c	Rv3043c	serB2	ctaD	FALSE	0.363	38.000	0.007	1.000	N	0.500
34817	34818	Rv3044	Rv3045	fecB	adhC	FALSE	0.444	70.000	0.068	1.000		0.439
34819	34820	Rv3046c	Rv3047c			FALSE	0.000	334.000	0.000	NA		-0.179
34820	1936067	Rv3047c	Rv3048c		nrdF2	FALSE	0.153	98.000	0.000	NA		0.230
1936067	34822	Rv3048c	Rv3049c	nrdF2		FALSE	0.133	131.000	0.067	1.000	N	0.187
34822	34823	Rv3049c	Rv3050c			FALSE	0.354	134.000	0.400	1.000	N	0.219
34823	34824	Rv3050c	Rv3051c		nrdE	FALSE	0.184	128.000	0.100	1.000	N	0.240
34824	34825	Rv3051c	Rv3052c	nrdE	nrdI	TRUE	0.782	66.000	0.300	NA	Y	0.124
34825	34826	Rv3052c	Rv3053c	nrdI	nrdH	TRUE	0.632	35.000	0.500	NA	N	0.146
34826	34827	Rv3053c	Rv3054c	nrdH		FALSE	0.003	477.000	0.000	NA		0.072
34828	34829	Rv3055	Rv3056		dinP	FALSE	0.419	10.000	0.060	1.000		-0.633
34830	34831	Rv3057c	Rv3058c			TRUE	0.553	64.000	0.316	1.000		0.156
34833	34834	Rv3060c	Rv3061c		fadE22	FALSE	0.198	49.000	0.000	1.000	N	0.290
34835	34836	Rv3062	Rv3063	ligB	cstA	FALSE	0.004	136.000	0.049	1.000	N	-0.442
1936068	34839	Rv3065	Rv3066	mmr		TRUE	0.952	-3.000	0.143	1.000		0.276
34839	34840	Rv3066	Rv3067			FALSE	0.071	113.000	0.000	NA		0.054
1936069	34841	Rvnt37	Rv3068c		pgmA	FALSE	0.010	67.000	0.000	NA		NA
34842	34843	Rv3069	Rv3070	ccrB	ccrB	TRUE	0.994	-3.000	0.290	0.036	Y	-0.037
34843	34844	Rv3070	Rv3071	ccrB		TRUE	0.916	-3.000	0.226	NA		-0.156
34845	34846	Rv3072c	Rv3073c			FALSE	0.512	7.000	0.000	NA		0.106
34849	1936070	Rv3076	Rv3077			TRUE	0.919	-7.000	0.333	NA		0.295
1936070	34851	Rv3077	Rv3078		hab	FALSE	0.530	1.000	0.000	NA		-0.070
34852	34853	Rv3079c	Rv3080c		pknK	FALSE	0.232	59.000	0.000	NA		0.280
34856	34857	Rv3083	Rv3084		lipR	TRUE	0.846	6.000	0.077	1.000	N	0.979
34857	34858	Rv3084	Rv3085	lipR		TRUE	0.981	-3.000	0.077	0.079		0.937
34858	34859	Rv3085	Rv3086		adhD	TRUE	0.718	31.000	0.000	0.038		0.933
34859	34860	Rv3086	Rv3087	adhD		FALSE	0.386	38.000	0.000	NA		0.964
34860	34861	Rv3087	Rv3088			TRUE	0.973	-3.000	0.286	NA		0.920
34861	34862	Rv3088	Rv3089		fadD13	TRUE	0.992	-3.000	1.000	NA		0.890
34862	34863	Rv3089	Rv3090	fadD13		FALSE	0.000	939.000	0.000	NA	N	-0.397
34863	34864	Rv3090	Rv3091			FALSE	0.307	18.000	0.000	NA		0.192
34865	34866	Rv3092c	Rv3093c			FALSE	0.222	26.000	0.000	NA		0.148
34866	34867	Rv3093c	Rv3094c			TRUE	0.941	-3.000	0.231	NA	N	0.314
34868	34869	Rv3095	Rv3096			FALSE	0.240	98.000	0.000	NA		0.548
1936071	34871	Rv3097c	Rv3098c	PE_PGRS63		FALSE	0.186	119.000	0.000	NA		0.568
34871	1936072	Rv3098c	Rvns02		ssr	FALSE	0.003	151.000	0.000	NA		NA
1936072	34872	Rvns02	Rv3099c	ssr		FALSE	0.085	-6.000	0.000	NA		NA
34872	34873	Rv3099c	Rv3100c		smpB	FALSE	0.161	37.000	0.000	NA		0.066
34873	34874	Rv3100c	Rv3101c	smpB	ftsX	TRUE	0.762	3.000	0.038	1.000	N	0.078
34874	34875	Rv3101c	Rv3102c	ftsX	ftsE	TRUE	0.993	1.000	0.431	1.000	Y	0.421
34875	34876	Rv3102c	Rv3103c	ftsE		TRUE	0.581	44.000	0.010	0.063		0.083
34876	34877	Rv3103c	Rv3104c			TRUE	0.878	2.000	0.096	1.000		-0.054
34877	34878	Rv3104c	Rv3105c		prfB	TRUE	0.635	-10.000	0.013	1.000	N	0.216
34881	1936073	Rv3108	Rv3109		moaA1	FALSE	0.025	149.000	0.000	NA		-0.031
1936073	1936074	Rv3109	Rv3110	moaA1	moaB1	TRUE	0.630	51.000	0.000	1.000	Y	-0.012
1936074	1936075	Rv3110	Rv3111	moaB1	moaC	TRUE	0.973	-3.000	0.000	1.000	Y	0.024
1936075	1936076	Rv3111	Rv3112	moaC	moaD1	TRUE	0.953	17.000	0.175	0.004	Y	0.184
1936076	34886	Rv3112	Rv3113	moaD1		FALSE	0.127	123.000	0.000	1.000		0.182
34886	34887	Rv3113	Rv3114			TRUE	0.540	17.000	0.000	1.000		0.432
34887	34888	Rv3114	Rv3115			FALSE	0.003	162.000	0.000	1.000	N	-0.089
34888	1936077	Rv3115	Rv3116		moeB2	FALSE	0.009	78.000	0.000	1.000	N	-0.239
1936077	34890	Rv3116	Rv3117	moeB2	cysA3	FALSE	0.016	29.000	0.000	1.000	N	-0.066
34890	1936078	Rv3117	Rv3118	cysA3	sseC1	TRUE	0.978	2.000	0.557	1.000		0.249
1936078	1936079	Rv3118	Rv3119	sseC1	moaE1	FALSE	0.344	21.000	0.000	1.000		0.153
1936079	34893	Rv3119	Rv3120	moaE1		TRUE	0.861	-3.000	0.000	1.000		0.157
34893	34894	Rv3120	Rv3121		cyp141	FALSE	0.022	335.000	0.000	1.000		0.493
34894	34895	Rv3121	Rv3122	cyp141		FALSE	0.005	378.000	0.000	NA		0.111
34895	34896	Rv3122	Rv3123			FALSE	0.224	10.000	0.000	NA		-0.069
34896	34897	Rv3123	Rv3124			FALSE	0.011	443.000	0.000	NA		0.673
1936080	34899	Rv3125c	Rv3126c	PPE49		FALSE	0.113	157.000	0.000	NA		0.630
34905	34906	Rv3132c	Rv3133c	devS	devR	TRUE	0.996	-3.000	0.091	0.005	Y	0.786
34906	34907	Rv3133c	Rv3134c	devR		TRUE	0.967	28.000	1.000	1.000	Y	0.937
1936082	1936083	Rv3135	Rv3136	PPE50	PPE51	FALSE	0.137	62.000	0.000	NA		0.114
1936083	34910	Rv3136	Rv3137	PPE51		FALSE	0.006	457.000	0.000	NA	N	0.591
34910	34911	Rv3137	Rv3138		pflA	FALSE	0.412	20.000	0.000	1.000	N	0.627
34911	34912	Rv3138	Rv3139	pflA	fadE24	FALSE	0.149	80.000	0.000	1.000	N	0.287
34912	34913	Rv3139	Rv3140	fadE24	fadE23	TRUE	0.982	21.000	0.604	0.009	Y	0.922
34913	34914	Rv3140	Rv3141	fadE23	fadB4	FALSE	0.076	100.000	0.057	1.000	N	-0.146
34918	34919	Rv3145	Rv3146	nuoA	nuoB	TRUE	0.992	9.000	0.498	0.002	Y	0.358
34919	34920	Rv3146	Rv3147	nuoB	nuoC	TRUE	0.999	-3.000	0.691	0.002	Y	0.440
34920	34921	Rv3147	Rv3148	nuoC	nuoD	TRUE	0.997	0.000	0.299	0.004	Y	0.562
34921	34922	Rv3148	Rv3149	nuoD	nuoE	TRUE	0.996	-3.000	0.161	0.004	Y	0.333
34922	34923	Rv3149	Rv3150	nuoE	nuoF	TRUE	0.996	-3.000	0.163	0.004	Y	0.258
34923	34924	Rv3150	Rv3151	nuoF	nuoG	TRUE	0.999	-3.000	0.753	0.004	Y	0.245
34924	34925	Rv3151	Rv3152	nuoG	nuoH	TRUE	0.806	116.000	0.151	0.004	Y	0.032
34925	34926	Rv3152	Rv3153	nuoH	nuoI	TRUE	0.990	-7.000	0.221	0.004	Y	0.406
34926	34927	Rv3153	Rv3154	nuoI	nuoJ	TRUE	0.996	-3.000	0.210	0.004	Y	0.386
34927	34928	Rv3154	Rv3155	nuoJ	nuoK	TRUE	0.998	-3.000	0.306	0.002	Y	0.634
34928	34929	Rv3155	Rv3156	nuoK	nuoL	TRUE	0.993	11.000	0.790	0.004	Y	0.380
34929	34930	Rv3156	Rv3157	nuoL	nuoM	TRUE	0.997	-3.000	0.373	0.001	Y	0.175
34930	34931	Rv3157	Rv3158	nuoM	nuoN	TRUE	0.997	-3.000	0.257	0.001	Y	0.324
1936085	34933	Rv3159c	Rv3160c	PPE53		FALSE	0.002	175.000	0.000	NA	N	0.014
34933	34934	Rv3160c	Rv3161c			FALSE	0.489	11.000	0.000	1.000	N	0.332
34934	34935	Rv3161c	Rv3162c			FALSE	0.084	70.000	0.000	NA		-0.002
34935	34936	Rv3162c	Rv3163c			TRUE	0.926	-3.000	0.212	NA		-0.029
34936	34937	Rv3163c	Rv3164c		moxR3	TRUE	0.797	30.000	0.744	NA		0.095
34937	34938	Rv3164c	Rv3165c	moxR3		TRUE	0.745	8.000	0.231	NA		-0.128
34938	34939	Rv3165c	Rv3166c			TRUE	0.971	-3.000	0.345	NA		0.265
34939	34940	Rv3166c	Rv3167c			FALSE	0.019	80.000	0.000	NA		-0.146
34941	34942	Rv3168	Rv3169			TRUE	0.968	0.000	0.444	NA		0.046
34942	34943	Rv3169	Rv3170		aofH	FALSE	0.045	143.000	0.000	NA		0.053
34944	34945	Rv3171c	Rv3172c	hpx		FALSE	0.012	137.000	0.000	NA		-0.128
34945	34946	Rv3172c	Rv3173c			FALSE	0.130	79.000	0.000	NA		0.157
34947	34948	Rv3174	Rv3175			TRUE	0.573	15.000	0.000	1.000		0.404
34950	34951	Rv3177	Rv3178			FALSE	0.172	131.000	0.000	NA		0.681
34951	34952	Rv3178	Rv3179			FALSE	0.006	821.000	0.000	NA		0.414
34953	34954	Rv3180c	Rv3181c			TRUE	0.910	3.000	0.286	NA		-0.067
34955	34956	Rv3182	Rv3183			TRUE	0.703	-3.000	0.000	NA		0.004
34956	34957	Rv3183	Rv3184			FALSE	0.004	237.000	0.000	1.000		-0.260
34957	34958	Rv3184	Rv3185			TRUE	0.988	-3.000	0.308	0.050		0.323
34958	34959	Rv3185	Rv3186			FALSE	0.294	222.000	0.308	0.050		0.336
34959	34960	Rv3186	Rv3187			TRUE	0.986	-3.000	0.308	0.050		0.206
34960	34961	Rv3187	Rv3188			FALSE	0.075	273.000	0.000	0.050		0.241
34961	34962	Rv3188	Rv3189			TRUE	0.905	-3.000	0.000	NA		0.475
34963	34964	Rv3190c	Rv3191c			FALSE	0.000	624.000	0.000	NA		-0.352
34964	1936087	Rv3191c	Rvnt38			FALSE	0.000	1025.000	0.000	NA		NA
34966	34967	Rv3193c	Rv3194c			FALSE	0.205	92.000	0.069	1.000		-0.100
34968	34969	Rv3195	Rv3196			TRUE	0.861	6.000	0.072	NA		0.585
1936089	34971	Rv3197A	Rv3198c	whiB7	uvrD2	FALSE	0.000	430.000	0.000	1.000		-0.643
34972	34973	Rv3199c	Rv3200c	nudC		FALSE	0.187	59.000	0.048	1.000	N	0.052
34973	34974	Rv3200c	Rv3201c			FALSE	0.222	62.000	0.110	1.000	N	0.004
34974	34975	Rv3201c	Rv3202c			TRUE	0.998	-3.000	0.493	0.002	Y	0.235
34976	34977	Rv3203	Rv3204	lipV		TRUE	0.967	3.000	0.111	0.030		0.226
34978	1936091	Rv3205c	Rv3206c		moeB1	TRUE	0.669	27.000	0.273	NA		0.364
1936091	34980	Rv3206c	Rv3207c	moeB1		FALSE	0.531	91.000	0.236	1.000		0.618
34984	34985	Rv3211	Rv3212	rhlE		FALSE	0.517	13.000	0.096	NA		-0.025
1936093	34988	Rv3214	Rv3215	gpm2	entC	TRUE	0.912	-3.000	0.167	1.000	N	0.140
34988	34989	Rv3215	Rv3216	entC		FALSE	0.185	148.000	0.170	1.000		0.108
34991	34992	Rv3218	Rv3219		whiB1	FALSE	0.015	280.000	0.000	1.000		0.136
34993	34994	Rv3220c	Rv3221c		TB7.3	FALSE	0.500	17.000	0.102	NA		0.080
34994	1936094	Rv3221c	Rv3221A	TB7.3		FALSE	0.003	285.000	0.046	NA		-0.930
1936094	34995	Rv3221A	Rv3222c			TRUE	0.915	-3.000	0.000	NA		0.867
34995	34996	Rv3222c	Rv3223c		sigH	TRUE	0.876	-3.000	0.000	NA		0.300
34997	1936095	Rv3224	Rv3224A			TRUE	0.544	-64.000	0.000	NA		0.246
1936095	1936096	Rv3224A	Rv3224B			FALSE	0.054	-22.000	0.000	NA		-0.494
34999	35000	Rv3225c	Rv3226c			FALSE	0.070	124.000	0.000	NA		0.087
35001	35002	Rv3227	Rv3228	aroA		TRUE	0.918	-3.000	0.063	1.000		0.087
1936097	35004	Rv3229c	Rv3230c			TRUE	0.687	78.000	0.583	1.000	N	0.533
35004	35005	Rv3230c	Rv3231c			FALSE	0.280	110.000	0.208	NA		0.095
35005	35006	Rv3231c	Rv3232c		pvdS	TRUE	0.928	-3.000	0.029	NA		0.379
35006	35007	Rv3232c	Rv3233c	pvdS		FALSE	0.349	24.000	0.022	NA		0.135
35007	35008	Rv3233c	Rv3234c			TRUE	0.853	3.000	0.000	NA		0.446
1936098	35011	Rv3236c	Rv3237c			TRUE	0.994	5.000	0.889	1.000	Y	0.551
35011	35012	Rv3237c	Rv3238c			FALSE	0.313	61.000	0.136	NA	N	0.287
35012	35013	Rv3238c	Rv3239c			FALSE	0.133	59.000	0.091	NA	N	-0.035
35013	1936099	Rv3239c	Rv3240c		secA1	FALSE	0.108	79.000	0.020	1.000	N	0.010
1936099	35015	Rv3240c	Rv3241c	secA1		FALSE	0.186	79.000	0.094	NA	N	0.169
35015	35016	Rv3241c	Rv3242c			FALSE	0.013	316.000	0.072	NA		-0.038
35016	35017	Rv3242c	Rv3243c			FALSE	0.463	38.000	0.022	NA		0.726
35017	35018	Rv3243c	Rv3244c		lpqB	FALSE	0.154	68.000	0.061	NA		-0.151
35018	35019	Rv3244c	Rv3245c	lpqB	mtrB	TRUE	0.972	0.000	0.418	NA		0.235
35019	35020	Rv3245c	Rv3246c	mtrB	mtrA	TRUE	0.925	50.000	0.772	1.000	Y	0.189
35020	35021	Rv3246c	Rv3247c	mtrA	tmk	FALSE	0.198	70.000	0.021	1.000	N	0.209
35021	35022	Rv3247c	Rv3248c	tmk	sahH	FALSE	0.274	97.000	0.016	1.000	N	0.854
35022	35023	Rv3248c	Rv3249c	sahH		FALSE	0.245	105.000	0.012	1.000	N	0.686
35023	35024	Rv3249c	Rv3250c		rubB	TRUE	0.984	-3.000	0.600	1.000	N	0.598
35024	35025	Rv3250c	Rv3251c	rubB	rubA	TRUE	0.997	5.000	0.750	0.007	Y	0.604
35025	35026	Rv3251c	Rv3252c	rubA	alkB	TRUE	0.990	0.000	0.778	1.000		0.503
35026	35027	Rv3252c	Rv3253c	alkB		TRUE	0.666	109.000	0.778	1.000		0.109
35029	35030	Rv3255c	Rv3256c	manA		TRUE	0.808	8.000	0.198	NA		0.207
35030	35031	Rv3256c	Rv3257c		pmmA	TRUE	0.930	-3.000	0.138	NA		0.195
35031	35032	Rv3257c	Rv3258c	pmmA		TRUE	0.595	102.000	0.460	NA		0.366
35035	35036	Rv3261	Rv3262	fbiA	fbiB	TRUE	0.972	-3.000	0.371	NA		0.275
35036	35037	Rv3262	Rv3263	fbiB		FALSE	0.011	296.000	0.018	1.000		-0.154
1936100	1936101	Rv3264c	Rv3265c	manB	wbbL1	TRUE	0.898	2.000	0.151	NA		0.119
1936101	35040	Rv3265c	Rv3266c	wbbL1	rmlD	TRUE	0.760	11.000	0.354	NA		-0.178
35041	35042	Rv3267	Rv3268			TRUE	0.661	39.000	0.517	NA		-0.053
35042	35043	Rv3268	Rv3269			FALSE	0.168	125.000	0.103	NA		0.040
35043	35044	Rv3269	Rv3270		ctpC	TRUE	0.905	11.000	0.500	NA		0.422
35046	35047	Rv3272	Rv3273			FALSE	0.095	5.000	0.000	1.000	N	-0.187
35048	35049	Rv3274c	Rv3275c	fadE25	purE	FALSE	0.331	25.000	0.009	1.000	N	0.252
35049	35050	Rv3275c	Rv3276c	purE	purK	TRUE	0.995	-3.000	0.141	0.000	Y	-0.026
35052	35053	Rv3278c	Rv3279c		birA	FALSE	0.150	43.000	0.016	NA		-0.109
35054	35055	Rv3280	Rv3281	accD5		TRUE	0.934	-19.000	0.692	NA		0.146
35055	35056	Rv3281	Rv3282		maf	TRUE	0.758	-3.000	0.015	NA		-0.110
35056	35057	Rv3282	Rv3283	maf	sseA	FALSE	0.025	41.000	0.011	NA	N	-0.040
35057	35058	Rv3283	Rv3284	sseA		TRUE	0.972	-3.000	0.351	NA		0.284
35058	35059	Rv3284	Rv3285		accA3	FALSE	0.162	108.000	0.045	NA		0.054
35060	1936102	Rv3286c	Rv3287c	sigF	rsbW	TRUE	0.983	-3.000	0.636	NA	N	0.675
1936102	35062	Rv3287c	Rv3288c	rsbW	usfY	FALSE	0.040	198.000	0.000	NA		0.248
35062	35063	Rv3288c	Rv3289c	usfY		FALSE	0.505	35.000	0.333	NA		-0.178
35063	35064	Rv3289c	Rv3290c		lat	FALSE	0.360	34.000	0.083	NA		0.071
35064	35065	Rv3290c	Rv3291c	lat		FALSE	0.262	51.000	0.224	1.000	N	-0.221
35066	1936103	Rv3292	Rv3293		pcd	FALSE	0.433	27.000	0.103	NA		0.149
35069	35070	Rv3295	Rv3296		lhr	FALSE	0.478	44.000	0.040	1.000		0.387
35070	35071	Rv3296	Rv3297	lhr	nei	TRUE	0.937	4.000	0.352	1.000		0.019
35072	35073	Rv3298c	Rv3299c	lpqC	atsB	FALSE	0.128	27.000	0.000	1.000	N	0.130
35073	35074	Rv3299c	Rv3300c	atsB		FALSE	0.325	20.000	0.015	1.000	N	0.192
35074	35075	Rv3300c	Rv3301c		phoY1	FALSE	0.035	12.000	0.000	NA	N	-0.049
35075	35076	Rv3301c	Rv3302c	phoY1	glpD2	FALSE	0.131	108.000	0.000	NA	N	0.586
35076	35077	Rv3302c	Rv3303c	glpD2	lpdA	TRUE	0.949	15.000	0.071	0.044	Y	0.341
1936105	1936106	Rv3305c	Rv3306c	amiA1	amiB1	TRUE	0.989	-3.000	0.132	0.003		0.662
35081	35082	Rv3307	Rv3308	deoD	pmmB	TRUE	0.828	4.000	0.235	1.000	N	-0.121
35084	35085	Rv3310	Rv3311			TRUE	0.549	24.000	0.100	NA		0.315
35086	1936107	Rv3312c	Rv3312A			FALSE	0.000	375.000	0.000	NA		NA
1936107	35087	Rv3312A	Rv3313c		add	FALSE	0.300	71.000	0.000	NA		0.879
35087	35088	Rv3313c	Rv3314c	add	deoA	TRUE	0.981	0.000	0.062	1.000	Y	0.123
35088	35089	Rv3314c	Rv3315c	deoA	cdd	TRUE	0.987	-3.000	0.221	1.000	Y	0.063
35090	35091	Rv3316	Rv3317	sdhC	sdhD	TRUE	0.997	-3.000	0.157	0.000	Y	0.382
35091	35092	Rv3317	Rv3318	sdhD	sdhA	TRUE	0.897	129.000	0.705	0.002	Y	-0.367
35092	35093	Rv3318	Rv3319	sdhA	sdhB	TRUE	0.998	0.000	0.604	0.002	Y	0.188
35094	35095	Rv3320c	Rv3321c			TRUE	0.826	4.000	0.000	NA		0.435
35095	1936108	Rv3321c	Rv3322c			FALSE	0.005	122.000	0.000	NA		-0.223
1936108	1936109	Rv3322c	Rv3323c		moaX	FALSE	0.197	-3.000	0.000	NA		-0.261
1936109	35098	Rv3323c	Rv3324c	moaX	moaC	TRUE	0.988	1.000	0.025	0.004	Y	-0.300
35098	1936110	Rv3324c	Rv3324A	moaC		FALSE	0.056	-21.000	0.000	NA		NA
35099	35100	Rv3325	Rv3326			TRUE	0.989	-3.000	0.308	0.049		0.365
35100	35101	Rv3326	Rv3327			TRUE	0.812	55.000	0.000	0.049	Y	0.177
35103	35104	Rv3329	Rv3330		dacB1	FALSE	0.161	69.000	0.077	1.000	N	-0.052
35104	35105	Rv3330	Rv3331	dacB1	sugI	FALSE	0.222	96.000	0.074	1.000	N	0.209
35105	35106	Rv3331	Rv3332	sugI	nagA	TRUE	0.982	-3.000	0.054	1.000	Y	0.098
35109	35110	Rv3335c	Rv3336c		trpS	FALSE	0.476	21.000	0.045	1.000		0.128
1936111	35112	Rv3337	Rv3338			TRUE	0.619	-138.000	0.000	NA		0.391
35114	35115	Rv3340	Rv3341	metC	metA	TRUE	0.973	12.000	0.542	1.000	Y	0.712
35115	35116	Rv3341	Rv3342	metA		TRUE	0.948	-3.000	0.136	1.000	N	0.693
1936112	1936113	Rv3343c	Rv3344c	PPE54	PE_PGRS49	FALSE	0.097	49.000	0.000	NA		-0.013
1936113	1936114	Rv3344c	Rv3345c	PE_PGRS49	PE_PGRS50	TRUE	0.647	-280.000	0.000	NA		0.584
1936114	35120	Rv3345c	Rv3346c	PE_PGRS50		FALSE	0.009	424.000	0.000	NA		0.315
11400789	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2491.000	0.000	NA		NA
11543152	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2491.000	0.000	NA		NA
11685544	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2491.000	0.000	NA		NA
11400790	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2439.000	0.000	NA		NA
11543153	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2439.000	0.000	NA		NA
11685545	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2439.000	0.000	NA		NA
11400791	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2416.000	0.000	NA		NA
11543154	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2416.000	0.000	NA		NA
11685546	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2416.000	0.000	NA		NA
11400792	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2358.000	0.000	NA		NA
11543155	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2358.000	0.000	NA		NA
11685547	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2358.000	0.000	NA		NA
11400793	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2335.000	0.000	NA		NA
11543156	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2335.000	0.000	NA		NA
11685548	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2335.000	0.000	NA		NA
11400794	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2292.000	0.000	NA		NA
11543157	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2292.000	0.000	NA		NA
11685549	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2292.000	0.000	NA		NA
11400795	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2269.000	0.000	NA		NA
11543158	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2269.000	0.000	NA		NA
11685550	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2269.000	0.000	NA		NA
11400796	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2190.000	0.000	NA		NA
11543159	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2190.000	0.000	NA		NA
11685551	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2190.000	0.000	NA		NA
11400797	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2167.000	0.000	NA		NA
11543160	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2167.000	0.000	NA		NA
11685552	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2167.000	0.000	NA		NA
11400798	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2133.000	0.000	NA		NA
11543161	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2133.000	0.000	NA		NA
11685553	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2133.000	0.000	NA		NA
11400799	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2110.000	0.000	NA		NA
11543162	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2110.000	0.000	NA		NA
11685554	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2110.000	0.000	NA		NA
11400800	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2049.000	0.000	NA		NA
11543163	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2049.000	0.000	NA		NA
11685555	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2049.000	0.000	NA		NA
11400801	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2026.000	0.000	NA		NA
11543164	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2026.000	0.000	NA		NA
11685556	35120		Rv3346c			FALSE	NA	2026.000	0.000	NA		NA
11400802	35120		Rv3346c			FALSE	NA	1995.000	0.000	NA		NA
11543165	35120		Rv3346c			FALSE	NA	1995.000	0.000	NA		NA
11685557	35120		Rv3346c			FALSE	NA	1995.000	0.000	NA		NA
11400803	35120		Rv3346c			FALSE	NA	1972.000	0.000	NA		NA
11543166	35120		Rv3346c			FALSE	NA	1972.000	0.000	NA		NA
11685558	35120		Rv3346c			FALSE	NA	1972.000	0.000	NA		NA
35120	1936115	Rv3346c	Rv3347c		PPE55	FALSE	0.030	256.000	0.000	NA		0.404
35123	1936116	Rv3349c	Rv3350c		PPE56	FALSE	0.000	919.000	0.000	NA		-0.153
1936116	35125	Rv3350c	Rv3351c	PPE56		FALSE	0.017	244.000	0.000	NA		0.179
35125	35126	Rv3351c	Rv3352c			FALSE	0.267	82.000	0.000	NA		0.628
35126	1936117	Rv3352c	Rv3353c			FALSE	0.004	143.000	0.000	NA		-0.416
35129	35130	Rv3355c	Rv3356c		folD	TRUE	0.970	-3.000	0.453	NA		0.039
35131	35132	Rv3357	Rv3358			TRUE	0.781	-3.000	0.000	NA		0.096
35132	35133	Rv3358	Rv3359			FALSE	0.021	42.000	0.000	NA		-0.161
35133	35134	Rv3359	Rv3360			FALSE	0.176	117.000	0.000	NA		0.438
35135	35136	Rv3361c	Rv3362c			TRUE	0.855	7.000	0.412	NA		-0.228
35136	35137	Rv3362c	Rv3363c			TRUE	0.923	-19.000	0.529	NA		0.235
35137	35138	Rv3363c	Rv3364c			TRUE	0.949	-22.000	0.818	NA		0.230
35138	35139	Rv3364c	Rv3365c			TRUE	0.976	-3.000	0.636	NA		-0.084
35140	1936118	Rv3366	Rv3367	spoU	PE_PGRS51	FALSE	0.000	367.000	0.000	NA		-0.343
35145	35146	Rv3371	Rv3372		otsB2	FALSE	0.133	42.000	0.016	NA		-0.143
35146	35147	Rv3372	Rv3373	otsB2	echA18	FALSE	0.001	237.000	0.000	1.000	N	-0.370
35147	1936119	Rv3373	Rv3374	echA18	echA18.1	TRUE	0.971	1.000	0.000	0.005		0.328
1936119	35149	Rv3374	Rv3375	echA18.1	amiD	TRUE	0.709	5.000	0.000	1.000		0.103
35149	35150	Rv3375	Rv3376	amiD		FALSE	0.027	108.000	0.000	1.000		-0.258
35151	35152	Rv3377c	Rv3378c			FALSE	0.492	5.000	0.000	1.000		-0.143
35152	35153	Rv3378c	Rv3379c		dxs2	TRUE	0.812	9.000	0.000	0.076		0.034
35153	35154	Rv3379c	Rv3380c	dxs2		FALSE	0.031	233.000	0.000	1.000	N	0.469
35154	35155	Rv3380c	Rv3381c			TRUE	0.741	51.000	0.308	0.048		-0.002
35155	1936120	Rv3381c	Rv3382c		lytB1	FALSE	0.042	87.000	0.000	1.000		-0.225
1936120	35157	Rv3382c	Rv3383c	lytB1	idsB	FALSE	0.496	0.000	0.000	1.000	N	0.022
35157	35158	Rv3383c	Rv3384c	idsB		FALSE	0.000	754.000	0.000	NA		-0.404
35158	35159	Rv3384c	Rv3385c			TRUE	0.968	0.000	0.500	NA		-0.059
35160	35161	Rv3386	Rv3387			TRUE	0.859	-10.000	0.000	NA	Y	-0.355
35161	1936121	Rv3387	Rv3388		PE_PGRS52	FALSE	0.027	190.000	0.000	NA		0.116
35164	35165	Rv3390	Rv3391	lpqD	acrA1	FALSE	0.224	46.000	0.077	NA	N	0.159
35168	1936122	Rv3394c	Rv3395c			TRUE	0.974	-3.000	0.636	NA		-0.146
35170	35171	Rv3396c	Rv3397c	guaA	phyA	FALSE	0.035	12.000	0.000	1.000	N	-0.166
35171	1936124	Rv3397c	Rv3398c	phyA	idsA1	FALSE	0.312	29.000	0.000	1.000	N	0.421
35173	35174	Rv3399	Rv3400			FALSE	0.083	64.000	0.000	NA		-0.014
35174	35175	Rv3400	Rv3401			TRUE	0.880	15.000	0.286	0.030		0.073
35176	35177	Rv3402c	Rv3403c			FALSE	0.002	371.000	0.000	NA		-0.049
35177	35178	Rv3403c	Rv3404c			FALSE	0.162	17.000	0.000	NA		-0.028
35178	35179	Rv3404c	Rv3405c			FALSE	0.091	118.000	0.000	1.000		0.010
35180	35181	Rv3406	Rv3407			FALSE	0.014	35.000	0.000	NA	N	-0.382
35181	35182	Rv3407	Rv3408			TRUE	0.573	-3.000	0.000	NA		-0.076
35183	35184	Rv3409c	Rv3410c	choD	guaB3	FALSE	0.064	56.000	0.057	1.000	N	-0.252
35184	35185	Rv3410c	Rv3411c	guaB3	guaB2	TRUE	0.954	20.000	0.056	0.001	Y	0.331
35187	35188	Rv3413c	Rv3414c		sigD	TRUE	0.933	-7.000	0.615	NA		-0.049
35188	35189	Rv3414c	Rv3415c	sigD		TRUE	0.809	18.000	0.706	1.000		-0.267
35191	35192	Rv3417c	Rv3418c	groEL	groES	TRUE	0.952	95.000	0.592	0.003	Y	0.355
35192	35193	Rv3418c	Rv3419c	groES	gcp	FALSE	0.166	267.000	0.004	1.000	Y	0.368
35193	35194	Rv3419c	Rv3420c	gcp	rimI	TRUE	0.918	-3.000	0.056	1.000		0.128
35194	35195	Rv3420c	Rv3421c	rimI		TRUE	0.911	-3.000	0.062	1.000		0.040
35195	35196	Rv3421c	Rv3422c			TRUE	0.935	-3.000	0.217	NA		0.044
35196	35197	Rv3422c	Rv3423c		alr	TRUE	0.929	-3.000	0.028	NA		0.392
35197	35198	Rv3423c	Rv3424c	alr		FALSE	0.001	294.000	0.000	NA		-0.240
1936125	1936126	Rv3425	Rv3426	PPE57	PPE58	FALSE	0.024	267.000	0.000	NA		0.331
35201	35202	Rv3427c	Rv3428c			TRUE	0.717	98.000	0.129	1.000	Y	0.295
35204	35205	Rv3430c	Rv3431c			FALSE	0.071	489.000	0.000	0.048	Y	-0.030
35205	35206	Rv3431c	Rv3432c		gadB	FALSE	0.020	233.000	0.000	1.000	N	0.280
35206	35207	Rv3432c	Rv3433c	gadB		FALSE	0.223	38.000	0.009	NA	N	0.288
35207	35208	Rv3433c	Rv3434c			TRUE	0.896	2.000	0.004	NA		0.469
35208	35209	Rv3434c	Rv3435c			TRUE	0.852	11.000	0.300	NA		0.439
35209	35210	Rv3435c	Rv3436c		glmS	FALSE	0.021	222.000	0.005	NA		0.019
35211	35212	Rv3437	Rv3438			TRUE	0.572	10.000	0.095	NA		-0.101
35213	35214	Rv3439c	Rv3440c			TRUE	0.972	3.000	0.875	NA		-0.209
35214	35215	Rv3440c	Rv3441c		mrsA	FALSE	0.083	48.000	0.009	NA		-0.190
35215	35216	Rv3441c	Rv3442c	mrsA	rpsI	FALSE	0.112	125.000	0.068	1.000	N	0.044
35216	35217	Rv3442c	Rv3443c	rpsI	rplM	TRUE	0.998	-3.000	0.601	0.011	Y	0.425
35217	35218	Rv3443c	Rv3444c	rplM	esxT	FALSE	0.025	234.000	0.000	NA		0.240
35218	35219	Rv3444c	Rv3445c	esxT	esxU	FALSE	0.526	21.000	0.190	NA		0.046
35219	35220	Rv3445c	Rv3446c	esxU		TRUE	0.879	-7.000	0.310	NA		0.020
35220	35221	Rv3446c	Rv3447c			TRUE	0.966	-3.000	0.333	NA		0.199
35222	35223	Rv3448	Rv3449		mycP4	TRUE	0.988	-3.000	0.727	NA		0.433
1936128	35226	Rv3451	Rv3452	cut3	cut4	TRUE	0.856	47.000	0.500	0.076		0.297
35226	35227	Rv3452	Rv3453	cut4		FALSE	0.001	272.000	0.000	NA		-0.279
35227	35228	Rv3453	Rv3454			FALSE	0.238	86.000	0.000	NA		0.446
35229	35230	Rv3455c	Rv3456c	truA	rplQ	TRUE	0.945	-55.000	0.102	1.000	Y	0.433
35230	35231	Rv3456c	Rv3457c	rplQ	rpoA	TRUE	0.837	32.000	0.873	1.000	N	0.306
35231	35232	Rv3457c	Rv3458c	rpoA	rpsD	FALSE	0.383	152.000	0.549	1.000	N	0.285
35232	35233	Rv3458c	Rv3459c	rpsD	rpsK	TRUE	0.987	9.000	0.509	0.014	Y	-0.012
35233	35234	Rv3459c	Rv3460c	rpsK	rpsM	TRUE	0.998	4.000	0.810	0.011	Y	0.488
35234	35235	Rv3460c	Rv3461c	rpsM	rpmJ	FALSE	0.538	216.000	0.086	0.011	Y	0.626
35235	35236	Rv3461c	Rv3462c	rpmJ	infA	TRUE	0.841	33.000	0.067	1.000	Y	0.775
35237	35238	Rv3463	Rv3464		rmlB	FALSE	0.065	73.000	0.000	NA	N	0.222
35238	35239	Rv3464	Rv3465	rmlB	rmlC	TRUE	0.985	2.000	0.250	1.000	Y	0.151
35239	35240	Rv3465	Rv3466	rmlC		FALSE	0.062	83.000	0.000	NA		-0.030
35240	35241	Rv3466	Rv3467			TRUE	0.606	-229.000	0.000	NA		0.374
1936129	35243	Rv3468c	Rv3469c		mhpE	FALSE	0.113	4.000	0.000	1.000	N	-0.152
35243	35244	Rv3469c	Rv3470c	mhpE	ilvB2	TRUE	0.619	61.000	0.000	1.000	Y	0.036
35244	35245	Rv3470c	Rv3471c	ilvB2		FALSE	0.428	6.000	0.000	1.000	N	0.144
35248	35249	Rv3474	Rv3475			TRUE	0.909	-105.000	0.308	0.048		-0.101
1936130	1936131	Rv3477	Rv3478	PE31	PPE60	TRUE	0.878	37.000	1.000	NA		0.614
1936131	1936132	Rv3478	Rv3479	PPE60		FALSE	0.034	213.000	0.000	NA		0.250
35254	35255	Rv3480c	Rv3481c			FALSE	0.160	91.000	0.000	NA		0.234
35255	35256	Rv3481c	Rv3482c			FALSE	0.004	142.000	0.000	NA		-0.240
35256	35257	Rv3482c	Rv3483c			TRUE	0.782	44.000	1.000	NA		-0.128
35262	35263	Rv3488	Rv3489			FALSE	0.208	82.000	0.041	NA		0.095
35263	35264	Rv3489	Rv3490		otsA	TRUE	0.983	0.000	0.800	NA		-0.003
35264	35265	Rv3490	Rv3491	otsA		FALSE	0.163	152.000	0.200	NA		0.113
35266	35267	Rv3492c	Rv3493c			TRUE	0.985	0.000	0.800	NA		0.135
35267	35268	Rv3493c	Rv3494c		mce4F	TRUE	0.987	0.000	0.667	NA		0.523
35268	35269	Rv3494c	Rv3495c	mce4F	lprN	TRUE	0.990	11.000	0.667	0.006	Y	0.224
35269	35270	Rv3495c	Rv3496c	lprN	mce4D	TRUE	0.998	-3.000	0.727	0.006	Y	0.254
35270	35271	Rv3496c	Rv3497c	mce4D	mce4C	TRUE	0.998	-3.000	0.727	0.006	Y	0.157
35271	35272	Rv3497c	Rv3498c	mce4C	mce4B	TRUE	0.995	-10.000	0.667	0.006	Y	0.497
35272	1936133	Rv3498c	Rv3499c	mce4B	mce4A	TRUE	0.998	0.000	0.667	0.006	Y	0.202
1936133	35274	Rv3499c	Rv3500c	mce4A	yrbE4B	TRUE	0.959	20.000	1.000	NA	Y	0.128
35274	35275	Rv3500c	Rv3501c	yrbE4B	yrbE4A	TRUE	0.943	35.000	1.000	NA	Y	0.189
35275	35276	Rv3501c	Rv3502c	yrbE4A	fabG	FALSE	0.138	226.000	0.000	NA	Y	0.100
35276	35277	Rv3502c	Rv3503c	fabG	fdxD	TRUE	0.707	25.000	0.429	1.000	N	0.219
35278	35279	Rv3504	Rv3505	fadE26	fadE27	TRUE	0.985	25.000	0.882	0.008	Y	0.405
35279	35280	Rv3505	Rv3506	fadE27	fadD17	TRUE	0.899	71.000	0.647	1.000	Y	0.260
35280	1936134	Rv3506	Rv3507	fadD17	PE_PGRS53	FALSE	0.093	171.000	0.000	NA		0.593
1936134	1936135	Rv3507	Rv3508	PE_PGRS53	PE_PGRS54	FALSE	0.011	291.000	0.000	NA		0.191
35283	35284	Rv3509c	Rv3510c	ilvX		TRUE	0.950	-3.000	0.167	1.000		0.218
1936136	1936137	Rv3511	Rv3512	PE_PGRS55	PE_PGRS56	TRUE	0.569	-37.000	0.000	NA		0.258
11400844	1936139		Rv3515c		fadD19	FALSE	NA	772.000	0.000	NA		NA
11543207	1936139		Rv3515c		fadD19	FALSE	NA	772.000	0.000	NA		NA
11685599	1936139		Rv3515c		fadD19	FALSE	NA	772.000	0.000	NA		NA
11400845	1936139		Rv3515c		fadD19	FALSE	NA	745.000	0.000	NA		NA
11543208	1936139		Rv3515c		fadD19	FALSE	NA	745.000	0.000	NA		NA
11685600	1936139		Rv3515c		fadD19	FALSE	NA	745.000	0.000	NA		NA
11400846	1936139		Rv3515c		fadD19	FALSE	NA	709.000	0.000	NA		NA
11543209	1936139		Rv3515c		fadD19	FALSE	NA	709.000	0.000	NA		NA
11685601	1936139		Rv3515c		fadD19	FALSE	NA	709.000	0.000	NA		NA
35290	35291	Rv3516	Rv3517	echA19		FALSE	0.360	96.000	0.097	1.000		0.259
35295	35296	Rv3521	Rv3522		ltp4	TRUE	0.886	16.000	0.880	NA		0.045
35296	35297	Rv3522	Rv3523	ltp4	ltp3	TRUE	0.983	17.000	0.880	0.002	Y	-0.216
35297	35298	Rv3523	Rv3524	ltp3		FALSE	0.013	42.000	0.000	1.000		-0.565
35300	35301	Rv3526	Rv3527			TRUE	0.965	6.000	0.727	NA		0.383
35302	35303	Rv3528c	Rv3529c			FALSE	0.000	692.000	0.000	NA		-0.272
35303	35304	Rv3529c	Rv3530c			TRUE	0.988	0.000	0.625	1.000		0.634
35304	35305	Rv3530c	Rv3531c			TRUE	0.968	-3.000	0.273	NA		0.421
1936141	35308	Rv3533c	Rv3534c	PPE62		FALSE	0.145	99.000	0.000	NA	N	0.550
35308	35309	Rv3534c	Rv3535c			TRUE	0.972	-3.000	0.333	1.000	N	0.638
35309	35310	Rv3535c	Rv3536c			TRUE	0.952	11.000	0.231	1.000	Y	0.454
35311	1936142	Rv3537	Rv3538			TRUE	0.990	2.000	0.625	0.035	N	0.496
1936142	1936143	Rv3538	Rv3539		PPE63	FALSE	0.015	137.000	0.000	NA	N	0.178
35314	35315	Rv3540c	Rv3541c	ltp2		TRUE	0.972	0.000	0.500	NA		0.062
35315	35316	Rv3541c	Rv3542c			TRUE	0.990	-3.000	0.889	NA		0.300
35316	35317	Rv3542c	Rv3543c		fadE29	TRUE	0.980	-3.000	0.652	NA		0.058
35317	35318	Rv3543c	Rv3544c	fadE29	fadE28	TRUE	0.994	-15.000	0.696	0.008	Y	0.328
35318	35319	Rv3544c	Rv3545c	fadE28	cyp125	TRUE	0.982	0.000	0.381	0.041	N	0.054
35320	35321	Rv3546	Rv3547	fadA5		FALSE	0.089	112.000	0.000	1.000		-0.022
35322	35323	Rv3548c	Rv3549c			TRUE	0.972	23.000	0.515	0.035	Y	0.385
35324	35325	Rv3550	Rv3551	echA20		TRUE	0.998	0.000	0.647	0.073	Y	0.615
35325	35326	Rv3551	Rv3552			TRUE	0.997	-3.000	0.912	NA	Y	0.598
35326	35327	Rv3552	Rv3553			TRUE	0.683	98.000	0.561	NA		0.740
35327	35328	Rv3553	Rv3554		fdxB	TRUE	0.981	-3.000	0.037	0.041		0.665
35329	35330	Rv3555c	Rv3556c		fadA6	FALSE	0.281	105.000	0.000	1.000		0.695
35330	35331	Rv3556c	Rv3557c	fadA6		TRUE	0.647	65.000	0.423	1.000	N	0.668
35333	35334	Rv3559c	Rv3560c		fadE30	TRUE	0.996	-3.000	0.629	1.000	Y	0.536
35335	35336	Rv3561	Rv3562	fadD3	fadE31	TRUE	0.990	1.000	0.242	1.000	Y	0.925
35336	35337	Rv3562	Rv3563	fadE31	fadE32	TRUE	0.997	-3.000	0.879	0.008		0.820
35337	35338	Rv3563	Rv3564	fadE32	fadE33	TRUE	0.994	-3.000	0.484	0.008		0.845
35338	35339	Rv3564	Rv3565	fadE33	aspB	TRUE	0.918	-3.000	0.024	1.000	N	0.493
1936145	1936146	Rv3566c	Rv3566A	nat		TRUE	0.742	-15.000	0.000	NA		0.969
1936146	35341	Rv3566A	Rv3567c			FALSE	0.001	286.000	0.000	NA		-0.198
35341	35342	Rv3567c	Rv3568c		bphC	TRUE	0.863	15.000	0.520	1.000		0.218
35342	35343	Rv3568c	Rv3569c	bphC	bphD	TRUE	0.993	-3.000	0.733	0.006		-0.167
35343	35344	Rv3569c	Rv3570c	bphD		TRUE	0.909	15.000	0.733	1.000		0.296
35345	35346	Rv3571	Rv3572	hmp		TRUE	0.872	18.000	0.727	NA		0.293
1936147	35351	Rv3576	Rv3577	lppH		FALSE	0.057	191.000	0.000	NA		0.364
35351	35352	Rv3577	Rv3578		arsB2	FALSE	0.487	14.000	0.078	NA		-0.009
35353	1936148	Rv3579c	Rv3580c		cysS	TRUE	0.977	1.000	0.088	1.000	Y	-0.003
1936148	35355	Rv3580c	Rv3581c	cysS	ispF	FALSE	0.033	65.000	0.037	1.000	N	-0.247
35355	35356	Rv3581c	Rv3582c	ispF	ispD	TRUE	0.994	-3.000	0.419	1.000	Y	0.378
35356	35357	Rv3582c	Rv3583c	ispD		FALSE	0.423	17.000	0.068	1.000	N	0.163
35358	35359	Rv3584	Rv3585	lpqE	radA	FALSE	0.232	66.000	0.014	1.000		0.024
35359	35360	Rv3585	Rv3586	radA		TRUE	0.826	5.000	0.126	NA		0.092
35361	35362	Rv3587c	Rv3588c			FALSE	0.456	109.000	0.333	NA		0.255
1936149	35365	Rv3590c	Rv3591c	PE_PGRS58		FALSE	0.006	111.000	0.000	NA		-0.265
35366	35367	Rv3592	Rv3593	TB11.2	lpqF	TRUE	0.787	-22.000	0.160	NA		0.242
35367	35368	Rv3593	Rv3594	lpqF		FALSE	0.086	147.000	0.000	NA		0.271
1936150	1936151	Rv3595c	Rv3596c	PE_PGRS59	clpC1	FALSE	0.153	108.000	0.000	NA		0.273
1936151	35371	Rv3596c	Rv3597c	clpC1	lsr2	FALSE	0.024	277.000	0.000	NA		0.410
35371	35372	Rv3597c	Rv3598c	lsr2	lysS	FALSE	0.376	104.000	0.247	NA		0.208
35372	35373	Rv3598c	Rv3599c	lysS		FALSE	0.035	12.000	0.000	NA		-0.212
35373	35374	Rv3599c	Rv3600c			TRUE	0.783	6.000	0.000	NA		0.706
35374	35375	Rv3600c	Rv3601c		panD	TRUE	0.888	3.000	0.030	1.000	N	0.711
35375	35376	Rv3601c	Rv3602c	panD	panC	TRUE	0.994	0.000	0.342	1.000	Y	0.862
35376	35377	Rv3602c	Rv3603c	panC		TRUE	0.957	-3.000	0.067	1.000		0.862
35377	1936152	Rv3603c	Rv3604c			FALSE	0.042	185.000	0.054	NA		-0.064
1936152	35379	Rv3604c	Rv3605c			FALSE	0.142	209.000	0.237	NA		0.519
35379	35380	Rv3605c	Rv3606c		folK	TRUE	0.907	0.000	0.081	NA		0.163
35380	1936153	Rv3606c	Rv3607c	folK	folB	TRUE	0.982	-3.000	0.075	1.000	Y	0.031
1936153	1936154	Rv3607c	Rv3608c	folB	folP1	TRUE	0.984	-7.000	0.471	1.000	Y	0.311
1936154	35383	Rv3608c	Rv3609c	folP1	folE	TRUE	0.994	-3.000	0.609	1.000	Y	0.092
35383	35384	Rv3609c	Rv3610c	folE	ftsH	TRUE	0.694	16.000	0.212	1.000	N	0.440
35386	35387	Rv3612c	Rv3613c			FALSE	0.267	34.000	0.000	NA		0.245
35387	35388	Rv3613c	Rv3614c			FALSE	0.231	100.000	0.000	NA		0.501
35388	35389	Rv3614c	Rv3615c			TRUE	0.747	116.000	1.000	NA		0.805
35389	35390	Rv3615c	Rv3616c			TRUE	0.809	74.000	1.000	NA		0.365
35391	35392	Rv3617	Rv3618	ephA		TRUE	0.977	-3.000	0.500	NA		0.204
35393	35394	Rv3619c	Rv3620c	esxV	esxW	FALSE	0.298	27.000	0.000	NA		0.244
35394	1936155	Rv3620c	Rv3621c	esxW	PPE65	FALSE	0.077	57.000	0.000	NA		-0.036
1936155	1936156	Rv3621c	Rv3622c	PPE65	PE32	TRUE	0.916	10.000	0.667	NA		0.124
35398	35399	Rv3624c	Rv3625c	hpt	mesJ	TRUE	0.956	-3.000	0.137	0.023	N	-0.209
35399	35400	Rv3625c	Rv3626c	mesJ		TRUE	0.792	-21.000	0.050	NA		0.525
35400	35401	Rv3626c	Rv3627c			TRUE	0.981	-3.000	0.500	NA		0.316
35404	35405	Rv3630	Rv3631			FALSE	0.338	44.000	0.000	NA		0.467
35405	35406	Rv3631	Rv3632			TRUE	0.940	-3.000	0.081	NA		0.347
35406	35407	Rv3632	Rv3633			FALSE	0.053	211.000	0.000	NA		0.502
35409	35410	Rv3635	Rv3636			FALSE	0.005	343.000	0.000	NA		0.040
35410	35411	Rv3636	Rv3637			FALSE	0.004	385.000	0.000	NA		0.038
35411	35412	Rv3637	Rv3638			TRUE	0.979	0.000	0.000	NA	Y	0.467
35413	35414	Rv3639c	Rv3640c			FALSE	0.225	70.000	0.000	NA		0.312
35414	35415	Rv3640c	Rv3641c		fic	FALSE	0.002	176.000	0.000	1.000	N	-0.468
35415	35416	Rv3641c	Rv3642c	fic		TRUE	0.832	11.000	0.250	NA		0.457
1936158	35418	Rvnt39	Rv3644c			FALSE	0.009	79.000	0.000	NA		NA
35420	35421	Rv3646c	Rv3647c	topA		FALSE	0.000	353.000	0.008	NA		-0.395
35421	35422	Rv3647c	Rv3648c		cspA	FALSE	0.370	140.000	0.611	NA		-0.157
35423	1936159	Rv3649	Rv3650		PE33	FALSE	0.089	137.000	0.000	NA		0.231
1936159	35425	Rv3650	Rv3651	PE33		FALSE	0.007	324.000	0.000	NA		0.097
35425	1936160	Rv3651	Rv3652		PE_PGRS60	FALSE	0.000	754.000	0.000	NA		-0.214
1936160	1936161	Rv3652	Rv3653	PE_PGRS60	PE_PGRS61	TRUE	0.742	-6.000	0.000	NA		0.327
35428	35429	Rv3654c	Rv3655c			TRUE	0.819	9.000	0.118	NA		0.520
35429	35430	Rv3655c	Rv3656c			FALSE	0.019	24.000	0.000	NA		-0.359
35430	35431	Rv3656c	Rv3657c			TRUE	0.707	10.000	0.080	NA		0.217
35431	35432	Rv3657c	Rv3658c			TRUE	0.896	24.000	0.323	0.001		0.101
35432	1936162	Rv3658c	Rv3659c			TRUE	0.995	-3.000	0.659	1.000	Y	0.231
1936162	35434	Rv3659c	Rv3660c			TRUE	0.678	102.000	0.776	NA	N	0.422
35436	35437	Rv3662c	Rv3663c		dppD	TRUE	0.930	-3.000	0.104	1.000		0.090
35437	35438	Rv3663c	Rv3664c	dppD	dppC	TRUE	0.983	-3.000	0.725	1.000		-0.046
35438	35439	Rv3664c	Rv3665c	dppC	dppB	TRUE	0.963	56.000	0.811	0.015	Y	0.099
35439	35440	Rv3665c	Rv3666c	dppB	dppA	TRUE	0.993	2.000	0.147	0.015	Y	0.246
35443	35444	Rv3669	Rv3670		ephE	TRUE	0.976	1.000	0.494	NA		0.386
35445	35446	Rv3671c	Rv3672c			TRUE	0.920	6.000	0.367	1.000		0.156
35446	35447	Rv3672c	Rv3673c			FALSE	0.346	132.000	0.304	1.000	N	0.359
35447	1936163	Rv3673c	Rv3674c		nth	TRUE	0.903	0.000	0.022	1.000	N	0.385
35449	35450	Rv3675	Rv3676			FALSE	0.222	99.000	0.116	NA		0.007
35451	35452	Rv3677c	Rv3678c			TRUE	0.806	7.000	0.039	NA		0.436
35452	1936164	Rv3678c	Rv3678A			TRUE	0.634	16.000	0.094	NA		0.340
35453	35454	Rv3679	Rv3680			TRUE	0.999	-3.000	0.709	0.001	Y	0.313
1936166	35457	Rv3682	Rv3683	ponA2		FALSE	0.338	69.000	0.072	1.000		0.156
35457	35458	Rv3683	Rv3684			FALSE	0.399	63.000	0.057	1.000		0.281
35458	1936167	Rv3684	Rvnt40			FALSE	0.010	62.000	0.000	NA		NA
35459	35460	Rv3685c	Rv3686c	cyp137		FALSE	0.398	26.000	0.000	NA		0.432
35460	35461	Rv3686c	Rv3687c		rsfB	FALSE	0.007	240.000	0.000	NA		-0.052
35461	35462	Rv3687c	Rv3688c	rsfB		FALSE	0.018	202.000	0.000	1.000		-0.091
35463	35464	Rv3689	Rv3690			TRUE	0.805	27.000	0.628	NA		0.253
35464	35465	Rv3690	Rv3691			TRUE	0.686	126.000	0.841	NA		0.465
35465	35466	Rv3691	Rv3692		moxR2	TRUE	0.967	-3.000	0.302	NA		0.304
35466	35467	Rv3692	Rv3693	moxR2		FALSE	0.405	134.000	0.648	NA		-0.191
35470	35471	Rv3696c	Rv3697c	glpK		FALSE	0.039	50.000	0.000	NA		-0.122
35472	35473	Rv3698	Rv3699			FALSE	0.399	22.000	0.200	NA		-0.227
35474	35475	Rv3700c	Rv3701c			FALSE	0.340	31.000	0.077	NA		0.021
35475	35476	Rv3701c	Rv3702c			TRUE	0.961	-3.000	0.316	NA		0.151
35476	35477	Rv3702c	Rv3703c			TRUE	0.980	0.000	0.597	NA		0.226
35477	35478	Rv3703c	Rv3704c		gshA	TRUE	0.960	-3.000	0.337	NA		0.038
35478	35479	Rv3704c	Rv3705c	gshA		FALSE	0.136	132.000	0.063	NA		0.061
35479	1936168	Rv3705c	Rv3705A			FALSE	0.370	129.000	0.222	NA		0.870
1936168	35480	Rv3705A	Rv3706c			TRUE	0.678	111.000	0.667	NA		0.948
35480	35481	Rv3706c	Rv3707c			FALSE	0.202	119.000	0.222	NA		-0.121
35481	35482	Rv3707c	Rv3708c		asd	FALSE	0.170	140.000	0.012	NA		0.449
35482	35483	Rv3708c	Rv3709c	asd	ask	TRUE	0.981	1.000	0.119	1.000	Y	0.173
35486	35487	Rv3712	Rv3713		cobQ2	TRUE	0.969	5.000	0.796	1.000		0.044
35488	35489	Rv3714c	Rv3715c		recR	FALSE	0.054	68.000	0.003	1.000		-0.441
35489	35490	Rv3715c	Rv3716c	recR		TRUE	0.911	12.000	0.604	NA		0.483
35493	35494	Rv3719	Rv3720			TRUE	0.834	18.000	0.633	1.000	N	0.295
35495	1936169	Rv3721c	Rv3722c	dnaZX		FALSE	0.281	90.000	0.061	1.000	N	0.368
1936170	35497	Rvnt41	Rv3723			FALSE	0.007	106.000	0.000	NA		NA
35497	1936171	Rv3723	Rv3724A		cut5a	FALSE	0.003	167.000	0.000	NA		-0.951
1936171	1936172	Rv3724A	Rv3724B	cut5a	cut5b	TRUE	0.890	-103.000	0.000	0.016		0.512
1936172	35499	Rv3724B	Rv3725	cut5b		FALSE	0.423	45.000	0.000	1.000		0.882
35499	35500	Rv3725	Rv3726			FALSE	0.014	278.000	0.000	1.000	N	0.324
35500	35501	Rv3726	Rv3727			FALSE	0.058	341.000	0.000	0.035		0.412
35501	35502	Rv3727	Rv3728			FALSE	0.208	110.000	0.036	1.000		0.125
35502	35503	Rv3728	Rv3729			FALSE	0.023	215.000	0.000	1.000		0.012
35505	35506	Rv3731	Rv3732	ligC		FALSE	0.123	100.000	0.000	NA		0.184
35507	35508	Rv3733c	Rv3734c			TRUE	0.661	14.000	0.029	NA		0.730
35509	35510	Rv3735	Rv3736			FALSE	0.148	57.000	0.000	NA		0.129
35510	35511	Rv3736	Rv3737			TRUE	0.822	4.000	0.000	NA		0.409
1936173	1936174	Rv3738c	Rv3739c	PPE66	PPE67	FALSE	0.037	52.000	0.000	NA		-0.123
1936174	35514	Rv3739c	Rv3740c	PPE67		FALSE	0.017	316.000	0.000	NA		0.391
35514	35515	Rv3740c	Rv3741c			TRUE	0.910	0.000	0.000	NA		0.764
35515	35516	Rv3741c	Rv3742c			TRUE	0.915	-3.000	0.000	NA		0.840
35516	35517	Rv3742c	Rv3743c		ctpJ	FALSE	0.164	146.000	0.000	1.000		0.711
35519	1936175	Rv3745c	Rv3746c		PE34	FALSE	0.331	73.000	0.012	NA		0.483
35521	35522	Rv3747	Rv3748			FALSE	0.161	129.000	0.000	NA		0.462
35523	35524	Rv3749c	Rv3750c			FALSE	0.321	68.000	0.000	1.000		0.412
1936176	35526	Rvnt42	Rv3752c			FALSE	0.016	30.000	0.000	NA		NA
35526	35527	Rv3752c	Rv3753c			FALSE	0.266	16.000	0.053	NA		-0.211
35529	35530	Rv3755c	Rv3756c		proZ	TRUE	0.879	6.000	0.136	NA		0.611
35530	35531	Rv3756c	Rv3757c	proZ	proW	TRUE	0.998	-3.000	0.918	0.015	Y	0.018
35531	35532	Rv3757c	Rv3758c	proW	proV	TRUE	0.988	-12.000	0.694	1.000	Y	0.532
35532	35533	Rv3758c	Rv3759c	proV	proX	TRUE	0.769	9.000	0.085	1.000	N	0.457
35535	35536	Rv3761c	Rv3762c	fadE36		FALSE	0.060	79.000	0.000	NA		-0.043
35538	35539	Rv3764c	Rv3765c			TRUE	0.947	71.000	0.742	0.032	Y	0.068
35542	35543	Rv3768	Rv3769			FALSE	0.065	186.000	0.000	NA		0.410
35544	1936177	Rv3770c	Rv3770A			FALSE	0.007	106.000	0.000	NA		-0.190
1936177	1936178	Rv3770A	Rv3770B			TRUE	0.548	15.000	0.000	NA		0.642
1936178	35545	Rv3770B	Rv3771c			FALSE	0.004	135.000	0.000	NA		NA
35545	1936179	Rv3771c	Rvnt43			FALSE	0.004	135.000	0.000	NA		NA
1936179	1936180	Rvnt43	Rvnt44			FALSE	0.015	31.000	0.000	NA		NA
35548	35549	Rv3774	Rv3775	echA21	lipE	TRUE	0.614	12.000	0.148	1.000	N	0.187
35549	35550	Rv3775	Rv3776	lipE		FALSE	0.066	157.000	0.000	1.000		0.109
35553	35554	Rv3779	Rv3780			TRUE	0.903	4.000	0.093	NA		0.441
35554	35555	Rv3780	Rv3781		rfbE	TRUE	0.712	4.000	0.136	NA		-0.339
35555	1936182	Rv3781	Rv3782	rfbE		TRUE	0.950	-3.000	0.303	NA		-0.011
1936182	35557	Rv3782	Rv3783		rfbD	TRUE	0.944	-3.000	0.220	NA		0.166
35557	1936183	Rv3783	Rv3784	rfbD		FALSE	0.257	156.000	0.000	NA	Y	-0.073
1936183	35559	Rv3784	Rv3785			FALSE	0.030	84.000	0.000	NA		-0.113
35560	35561	Rv3786c	Rv3787c			FALSE	0.032	13.000	0.000	NA	N	0.048
35562	35563	Rv3788	Rv3789			FALSE	0.472	109.000	0.300	1.000		0.273
35563	35564	Rv3789	Rv3790			FALSE	0.482	40.000	0.033	1.000		0.386
35564	35565	Rv3790	Rv3791			TRUE	0.961	1.000	0.242	1.000		0.377
35565	35566	Rv3791	Rv3792			TRUE	0.958	3.000	0.543	NA		-0.029
35566	35567	Rv3792	Rv3793		embC	TRUE	0.966	0.000	0.360	NA		0.201
35567	35568	Rv3793	Rv3794	embC	embA	TRUE	0.828	86.000	0.455	0.001		0.079
35568	35569	Rv3794	Rv3795	embA	embB	TRUE	0.991	-3.000	0.400	0.001		-0.074
35569	1936184	Rv3795	Rv3796	embB		FALSE	0.412	68.000	0.182	1.000		0.142
1936184	35571	Rv3796	Rv3797		fadE35	FALSE	0.236	80.000	0.000	1.000		0.248
35571	35572	Rv3797	Rv3798	fadE35		FALSE	0.055	127.000	0.000	1.000	N	0.185
1936185	35574	Rv3799c	Rv3800c	accD4	pks13	TRUE	0.987	-3.000	0.800	1.000	N	0.333
35574	35575	Rv3800c	Rv3801c	pks13	fadD32	TRUE	0.982	7.000	0.520	1.000	Y	0.271
35575	35576	Rv3801c	Rv3802c	fadD32		FALSE	0.079	289.000	0.091	0.071		0.145
35576	1936186	Rv3802c	Rv3803c		fbpD	FALSE	0.121	198.000	0.136	1.000		0.308
1936186	35578	Rv3803c	Rv3804c	fbpD	fbpA	FALSE	0.171	180.000	0.222	NA		0.343
35578	35579	Rv3804c	Rv3805c	fbpA		FALSE	0.001	295.000	0.000	NA		-0.193
35579	35580	Rv3805c	Rv3806c			FALSE	0.203	89.000	0.086	NA		-0.016
35580	35581	Rv3806c	Rv3807c			TRUE	0.808	7.000	0.136	1.000		0.103
35581	35582	Rv3807c	Rv3808c		glfT	TRUE	0.705	29.000	0.500	NA		0.027
35582	35583	Rv3808c	Rv3809c	glfT	glf	TRUE	0.944	-3.000	0.105	NA		0.361
35584	1936187	Rv3810	Rv3811	pirG		FALSE	0.075	205.000	0.269	NA		-0.136
1936187	1936188	Rv3811	Rv3812		PE_PGRS62	FALSE	0.024	154.000	0.000	NA		-0.031
35587	35588	Rv3813c	Rv3814c			TRUE	0.810	15.000	0.154	0.071		0.047
35588	35589	Rv3814c	Rv3815c			TRUE	0.983	18.000	0.750	0.004	Y	0.167
35589	35590	Rv3815c	Rv3816c			TRUE	0.990	4.000	0.267	0.004	Y	-0.158
35591	35592	Rv3817	Rv3818			FALSE	0.127	47.000	0.071	NA		-0.374
35592	35593	Rv3818	Rv3819			TRUE	0.969	-3.000	0.250	1.000		0.349
35595	35596	Rv3821	Rv3822			FALSE	0.272	35.000	0.000	NA		0.254
35597	35598	Rv3823c	Rv3824c	mmpL8	papA1	FALSE	0.170	110.000	0.000	NA		0.342
35598	35599	Rv3824c	Rv3825c	papA1	pks2	FALSE	0.317	51.000	0.000	NA		0.479
35601	35602	Rv3827c	Rv3828c			TRUE	0.981	-3.000	0.000	NA	Y	0.579
35602	35603	Rv3828c	Rv3829c			TRUE	0.617	1.000	0.000	1.000	N	0.123
35603	35604	Rv3829c	Rv3830c			TRUE	0.837	48.000	1.000	1.000	N	0.391
35609	35610	Rv3835	Rv3836			TRUE	0.949	5.000	0.387	NA		0.469
35611	35612	Rv3837c	Rv3838c		pheA	TRUE	0.874	-3.000	0.079	NA	N	0.219
35613	35614	Rv3839	Rv3840			TRUE	0.541	26.000	0.048	NA		0.593
35614	35615	Rv3840	Rv3841		bfrB	FALSE	0.042	198.000	0.042	NA		0.029
35616	35617	Rv3842c	Rv3843c	glpQ1		TRUE	0.637	6.000	0.087	NA		-0.175
35618	35619	Rv3844	Rv3845			FALSE	0.324	15.000	0.000	NA		0.160
35619	35620	Rv3845	Rv3846		sodA	FALSE	0.001	1064.000	0.000	NA		-0.002
35620	35621	Rv3846	Rv3847	sodA		FALSE	0.046	211.000	0.000	NA		0.375
35621	35622	Rv3847	Rv3848			FALSE	0.043	255.000	0.008	NA		0.517
35622	35623	Rv3848	Rv3849			FALSE	0.005	265.000	0.000	1.000		-0.207
35623	35624	Rv3849	Rv3850			FALSE	0.328	118.000	0.148	NA		0.518
35624	35625	Rv3850	Rv3851			FALSE	0.311	12.000	0.000	NA		0.051
35625	35626	Rv3851	Rv3852		hns	FALSE	0.008	107.000	0.000	NA		-0.168
35626	35627	Rv3852	Rv3853	hns	menG	FALSE	0.503	17.000	0.056	NA		0.207
35630	35631	Rv3856c	Rv3857c			FALSE	0.065	9.000	0.000	NA		-0.168
35631	35632	Rv3857c	Rv3858c		gltD	FALSE	0.000	425.000	0.000	NA		-0.189
35632	35633	Rv3858c	Rv3859c	gltD	gltB	TRUE	0.986	-7.000	0.043	0.000	Y	0.191
35634	35635	Rv3860	Rv3861			TRUE	0.789	-3.000	0.000	NA		0.125
35637	35638	Rv3863	Rv3864			FALSE	0.009	243.000	0.000	NA		0.006
35638	35639	Rv3864	Rv3865			TRUE	0.731	88.000	1.000	NA		0.072
35639	35640	Rv3865	Rv3866			TRUE	0.904	3.000	0.200	NA		0.155
35640	35641	Rv3866	Rv3867			FALSE	0.504	39.000	0.200	NA		0.225
35641	35642	Rv3867	Rv3868			TRUE	0.951	-7.000	0.500	NA		0.444
35642	35643	Rv3868	Rv3869			FALSE	0.537	4.000	0.000	NA		-0.006
35643	35644	Rv3869	Rv3870			FALSE	0.188	0.000	0.000	NA		-0.239
35644	35645	Rv3870	Rv3871			TRUE	0.880	103.000	1.000	0.002		-0.084
35645	1936190	Rv3871	Rv3872		PE35	FALSE	0.260	143.000	0.286	NA		0.194
1936190	1936191	Rv3872	Rv3873	PE35	PPE68	TRUE	0.836	31.000	0.667	NA		0.590
1936191	35648	Rv3873	Rv3874	PPE68	esxB	FALSE	0.475	93.000	0.250	NA		0.402
35648	1936192	Rv3874	Rv3875	esxB	esxA	TRUE	0.711	33.000	0.333	NA		0.611
1936192	35650	Rv3875	Rv3876	esxA		FALSE	0.280	114.000	0.250	NA		0.015
35650	35651	Rv3876	Rv3877			TRUE	0.974	-3.000	0.429	NA		0.216
35651	35652	Rv3877	Rv3878			FALSE	0.414	151.000	0.571	NA		0.233
35653	35654	Rv3879c	Rv3880c			FALSE	0.011	417.000	0.000	NA		0.423
35654	35655	Rv3880c	Rv3881c			TRUE	0.914	-3.000	0.002	NA		0.379
35655	35656	Rv3881c	Rv3882c			FALSE	0.364	107.000	0.286	NA		0.096
35656	35657	Rv3882c	Rv3883c		mycP1	TRUE	0.991	-3.000	1.000	NA		0.360
35657	35658	Rv3883c	Rv3884c	mycP1		FALSE	0.007	222.000	0.000	1.000		-0.212
35658	35659	Rv3884c	Rv3885c			FALSE	0.526	70.000	0.500	NA		-0.177
35659	35660	Rv3885c	Rv3886c		mycP2	TRUE	0.989	-3.000	1.000	NA		0.159
35660	35661	Rv3886c	Rv3887c	mycP2		TRUE	0.957	-15.000	1.000	NA		0.128
35661	35662	Rv3887c	Rv3888c			TRUE	0.980	-3.000	0.667	NA		0.020
35662	35663	Rv3888c	Rv3889c			TRUE	0.697	94.000	0.667	NA		0.347
35663	35664	Rv3889c	Rv3890c		esxC	TRUE	0.707	96.000	1.000	NA		-0.007
35664	35665	Rv3890c	Rv3891c	esxC	esxD	TRUE	0.628	36.000	0.400	NA		0.057
35665	1936193	Rv3891c	Rv3892c	esxD	PPE69	FALSE	0.037	112.000	0.000	NA		-0.061
1936193	1936194	Rv3892c	Rv3893c	PPE69	PE36	TRUE	0.783	79.000	1.000	NA		0.246
1936194	35668	Rv3893c	Rv3894c	PE36		FALSE	0.021	267.000	0.000	NA		0.286
35668	35669	Rv3894c	Rv3895c			TRUE	0.972	1.000	0.500	NA		0.212
35669	35670	Rv3895c	Rv3896c			TRUE	0.955	3.000	0.400	NA		0.210
35670	35671	Rv3896c	Rv3897c			FALSE	0.105	157.000	0.000	NA		0.481
35671	35672	Rv3897c	Rv3898c			FALSE	0.518	13.000	0.000	NA		0.349
35672	35673	Rv3898c	Rv3899c			FALSE	0.454	162.000	1.000	NA		-0.016
35673	35674	Rv3899c	Rv3900c			TRUE	0.727	-6.000	0.000	NA		0.295
35674	35675	Rv3900c	Rv3901c			FALSE	0.189	57.000	0.000	NA		0.206
35675	35676	Rv3901c	Rv3902c			FALSE	0.003	551.000	0.000	NA		0.148
35676	35677	Rv3902c	Rv3903c			TRUE	0.709	-3.000	0.000	NA		0.009
35677	35678	Rv3903c	Rv3904c		esxE	TRUE	0.926	5.000	0.429	NA		0.016
35678	35679	Rv3904c	Rv3905c	esxE	esxF	TRUE	0.859	11.000	0.429	NA		0.194
35679	35680	Rv3905c	Rv3906c	esxF		FALSE	0.107	66.000	0.000	NA		0.039
35680	1936195	Rv3906c	Rv3907c		pcnA	FALSE	0.346	25.000	0.078	NA		-0.040
35682	35683	Rv3908	Rv3909			TRUE	0.955	-3.000	0.351	NA		-0.072
35683	35684	Rv3909	Rv3910			TRUE	0.960	-3.000	0.411	NA		-0.100
35684	35685	Rv3910	Rv3911		sigM	TRUE	0.600	35.000	0.306	1.000		0.042
35685	35686	Rv3911	Rv3912	sigM		TRUE	0.776	16.000	0.265	NA		0.600
35686	35687	Rv3912	Rv3913		trxB2	FALSE	0.107	94.000	0.015	NA		-0.071
35687	35688	Rv3913	Rv3914	trxB2	trxC	TRUE	0.980	-3.000	0.025	1.000	Y	0.090
35688	1936196	Rv3914	Rv3915	trxC		FALSE	0.236	110.000	0.237	1.000	N	0.001
35690	1936197	Rv3916c	Rv3917c		parB	FALSE	0.012	290.000	0.013	NA		0.021
1936197	1936198	Rv3917c	Rv3918c	parB	parA	TRUE	0.979	-3.000	0.827	1.000	N	-0.193
1936198	35693	Rv3918c	Rv3919c	parA	gid	TRUE	0.920	-3.000	0.339	1.000	N	-0.434
35693	35694	Rv3919c	Rv3920c	gid		FALSE	0.136	132.000	0.070	1.000		-0.090
35694	35695	Rv3920c	Rv3921c			FALSE	0.408	72.000	0.024	1.000		0.541
35695	35696	Rv3921c	Rv3922c			TRUE	0.768	-16.000	0.010	NA		0.519
35696	35697	Rv3922c	Rv3923c		rnpA	TRUE	0.984	-3.000	0.540	NA		0.493
35697	35698	Rv3923c	Rv3924c	rnpA	rpmH	TRUE	0.890	24.000	0.787	1.000		0.423