MicrobesOnline Operon Predictions for Erwinia amylovora ATCC 49946

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10475950 10475951 EAM_0001 EAM_0002 mioC asnC FALSE 0.103 236.000 0.165 1.000 N NA
 10475951 10475952 EAM_0002 EAM_0003 asnC   FALSE 0.135 118.000 0.014 1.000   NA
 10475952 10475953 EAM_0003 EAM_0004   viaA FALSE 0.180 85.000 0.034 NA   NA
 10475953 10475954 EAM_0004 EAM_0005 viaA ravA TRUE 0.995 -3.000 0.443 NA   NA
 10475956 10475957 EAM_0007 EAM_0008     FALSE 0.017 363.000 0.000 NA   NA
 10475957 10475958 EAM_0008 EAM_0009     FALSE 0.138 162.000 0.000 NA   NA
 10475961 10475962 EAM_0012 EAM_0013 budA budB TRUE 0.932 19.000 0.323 1.000 N NA
 10475964 10475965 EAM_0015 EAM_0016 rbsD rbsA TRUE 0.995 8.000 0.337 1.000 Y NA
 10475965 10475966 EAM_0016 EAM_0017 rbsA rbsC TRUE 0.998 3.000 0.504 1.000 Y NA
 10475966 10475967 EAM_0017 EAM_0018 rbsC rbsB TRUE 0.955 150.000 0.847 NA Y NA
 10475967 10475968 EAM_0018 EAM_0019 rbsB rbsK TRUE 0.916 62.000 0.347 NA Y NA
 10475968 10475969 EAM_0019 EAM_0020 rbsK rbsR TRUE 0.992 3.000 0.500 1.000 N NA
 10475971 10475972 EAM_r001 EAM_t001 16S_rRNA tRNA-Ile FALSE 0.277 59.000 0.000 NA   NA
 10475972 10475973 EAM_t001 EAM_t002 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.153 152.000 0.000 NA   NA
 10475973 10475974 EAM_t002 EAM_r002 tRNA-Ala 23S_rRNA FALSE 0.014 390.000 0.000 NA   NA
 10475974 10475975 EAM_r002 EAM_r003 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.089 197.000 0.000 NA   NA
 10475977 10475978 EAM_0023 EAM_0024   rdoA FALSE 0.218 80.000 0.000 NA   NA
 10475978 10475979 EAM_0024 EAM_0025 rdoA dsbA TRUE 0.502 51.000 0.111 NA   NA
 10475979 10475980 EAM_0025 EAM_0026 dsbA polA FALSE 0.013 411.000 0.000 1.000   NA
 10475982 10475983 EAM_0028 EAM_0029   hemN FALSE 0.083 256.000 0.107 NA   NA
 10475984 10475985 EAM_0030 EAM_0031 glnG glnL TRUE 0.999 8.000 0.587 0.083 Y NA
 10475985 10475986 EAM_0031 EAM_0032 glnL glnA FALSE 0.028 192.000 0.053 1.000 N NA
 10475987 10475988 EAM_0033 EAM_0034 typA   FALSE 0.051 200.000 0.007 1.000   NA
 10475988 10475989 EAM_0034 EAM_0035   rbn TRUE 0.888 4.000 0.031 1.000   NA
 10475989 10475990 EAM_0035 EAM_0036 rbn dtd TRUE 0.946 -3.000 0.069 1.000   NA
 10475990 10475991 EAM_0036 EAM_0037 dtd   FALSE 0.338 60.000 0.065 1.000   NA
 10475992 10475993 EAM_0038 EAM_0039 rluF   FALSE 0.215 83.000 0.000 NA   NA
 10475993 10475994 EAM_0039 EAM_0040     TRUE 0.619 123.000 0.257 NA   NA
 10475994 10475995 EAM_0040 EAM_0041   recG FALSE 0.002 239.000 0.009 1.000 N NA
 10475995 10475996 EAM_0041 EAM_0042 recG trmH TRUE 0.874 0.000 0.076 1.000 N NA
 10475996 10475997 EAM_0042 EAM_0043 trmH spoT FALSE 0.182 95.000 0.095 1.000 N NA
 10475997 10475998 EAM_0043 EAM_0044 spoT rpoZ TRUE 0.981 20.000 0.291 1.000 Y NA
 10475998 10475999 EAM_0044 EAM_0045 rpoZ gmk TRUE 0.823 57.000 0.471 1.000 N NA
 10476003 10476004 EAM_0049 EAM_0050   phnA TRUE 0.449 166.000 0.000 NA Y NA
 10476004 10476005 EAM_0050 EAM_0051 phnA   FALSE 0.022 331.000 0.000 NA   NA
 10476006 10476007 EAM_0052 EAM_0053     TRUE 0.862 -10.000 0.000 NA   NA
 10476007 10476008 EAM_0053 EAM_0054     FALSE 0.187 129.000 0.000 NA   NA
 10476008 10476009 EAM_0054 EAM_0055     FALSE 0.136 163.000 0.000 NA   NA
 10476009 10476010 EAM_0055 EAM_0056     FALSE 0.217 92.000 0.000 NA   NA
 10476010 10476011 EAM_0056 EAM_0057     TRUE 0.953 6.000 0.000 0.061   NA
 10476012 10476013 EAM_0058 EAM_0059     TRUE 0.858 10.000 0.000 NA   NA
 10476014 10476015 EAM_0060 EAM_0061     TRUE 0.825 13.000 0.000 1.000   NA
 10476015 10476016 EAM_0061 EAM_0062     TRUE 0.940 0.000 0.061 NA   NA
 10476017 10476018 EAM_0063 EAM_0064     FALSE 0.042 199.000 0.003 NA   NA
 10476021 10476022 EAM_0067 EAM_0068 rph pyrE FALSE 0.280 56.000 0.108 1.000 N NA
 10476023 10476024 EAM_0069 EAM_0070 slmA dut FALSE 0.084 114.000 0.060 1.000 N NA
 10476024 10476025 EAM_0070 EAM_0071 dut coaBC TRUE 0.928 -19.000 0.201 1.000 N NA
 10476026 10476027 EAM_0072 EAM_0073 radC rpmB FALSE 0.001 297.000 0.002 1.000 N NA
 10476027 10476028 EAM_0073 EAM_0074 rpmB rpmG TRUE 0.992 17.000 0.332 0.017 Y NA
 10476028 10476029 EAM_0074 EAM_0075 rpmG mutM FALSE 0.020 109.000 0.034 1.000 N NA
 10476030 10476031 EAM_0076 EAM_0077 coaD kdtX FALSE 0.331 -3.000 0.023 NA N NA
 10476031 10476032 EAM_0077 EAM_0078 kdtX kdtA TRUE 0.987 1.000 0.083 NA Y NA
 10476034 10476035 EAM_0080 EAM_0081     TRUE 0.994 3.000 0.111 0.019 Y NA
 10476035 10476036 EAM_0081 EAM_0082     TRUE 0.996 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 10476037 10476038 EAM_0083 EAM_0084     TRUE 0.924 2.000 0.000 1.000   NA
 10476039 10476040 EAM_0085 EAM_0086 wabM waaL TRUE 0.899 -6.000 0.000 NA   NA
 10476040 10476041 EAM_0086 EAM_0087 waaL wabK TRUE 0.894 20.000 0.182 NA   NA
 10476041 10476042 EAM_0087 EAM_0088 wabK waaC TRUE 0.983 -3.000 0.024 1.000 Y NA
 10476042 10476043 EAM_0088 EAM_0089 waaC waaF TRUE 0.998 1.000 0.205 0.002 Y NA
 10476043 10476044 EAM_0089 EAM_0090 waaF waaD TRUE 0.974 15.000 0.146 1.000 Y NA
 10476044 10476045 EAM_0090 EAM_0091 waaD   FALSE 0.117 182.000 0.000 1.000   NA
 10476045 10476046 EAM_0091 EAM_0092     TRUE 0.929 7.000 0.088 1.000   NA
 10476047 10476048 EAM_0093 EAM_0094   grxC FALSE 0.109 39.000 0.048 NA N NA
 10476048 10476049 EAM_0094 EAM_0095 grxC secB FALSE 0.031 83.000 0.038 1.000 N NA
 10476049 10476050 EAM_0095 EAM_0096 secB gpsA TRUE 0.975 0.000 0.206 1.000 N NA
 10476050 10476051 EAM_0096 EAM_0097 gpsA cysE TRUE 0.779 63.000 0.429 1.000 N NA
 10476052 10476053 EAM_0098 EAM_0099   cpxA FALSE 0.032 39.000 0.028 1.000 N NA
 10476053 10476054 EAM_0099 EAM_0100 cpxA cpxR TRUE 0.999 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 10476055 10476056 EAM_0101 EAM_0102 cpxP fieF TRUE 0.484 144.000 0.031 NA Y NA
 10476056 10476057 EAM_0102 EAM_0103 fieF pfkA FALSE 0.011 206.000 0.040 1.000 N NA
 10476057 10476058 EAM_0103 EAM_0104 pfkA sbp FALSE 0.044 144.000 0.049 1.000 N NA
 10476058 10476059 EAM_0104 EAM_0105 sbp cdh FALSE 0.014 186.000 0.038 1.000 N NA
 10476060 10476061 EAM_0106 EAM_0107     FALSE 0.010 461.000 0.000 1.000   NA
 10476061 10476062 EAM_0107 EAM_0108     FALSE 0.046 252.000 0.000 NA   NA
 10476062 10476063 EAM_0108 EAM_0109   mqo FALSE 0.163 146.000 0.000 NA   NA
 10476065 10476066 EAM_0111 EAM_0112 tpiA   FALSE 0.222 118.000 0.058 NA   NA
 10476072 10476073 EAM_0118 EAM_0119 glpK glpF FALSE 0.026 44.000 0.023 1.000 N NA
 10476075 10476076 EAM_0121 EAM_0122 rraA hslU FALSE 0.005 180.000 0.003 NA N NA
 10476076 10476077 EAM_0122 EAM_0123 hslU hslV TRUE 0.998 13.000 0.752 1.000 Y NA
 10476077 10476078 EAM_0123 EAM_0124 hslV ftsN FALSE 0.229 91.000 0.122 NA N NA
 10476078 10476079 EAM_0124 EAM_0125 ftsN cytR FALSE 0.356 171.000 0.245 NA N NA
 10476079 10476080 EAM_0125 EAM_0126 cytR priA FALSE 0.003 209.000 0.013 1.000 N NA
 10476081 10476082 EAM_0127 EAM_0128 rpmE   TRUE 0.539 31.000 0.000 NA   NA
 10476082 10476083 EAM_0128 EAM_0129     FALSE 0.316 52.000 0.000 NA   NA
 10476083 10476084 EAM_0129 EAM_0130     TRUE 0.894 5.000 0.000 NA   NA
 10476084 10476085 EAM_0130 EAM_0131     FALSE 0.030 297.000 0.000 NA   NA
 10476087 10476088 EAM_0133 EAM_0134 metB metL TRUE 0.998 3.000 0.428 1.000 Y NA
 10476088 10476089 EAM_0134 EAM_0135 metL metF FALSE 0.175 254.000 0.017 1.000 Y NA
 10476090 10476091 EAM_0136 EAM_0137 ppc argE FALSE 0.015 237.000 0.053 1.000 N NA
 10476092 10476093 EAM_0138 EAM_0139 argB argG TRUE 0.933 30.000 0.029 0.003 Y NA
 10476093 10476094 EAM_0139 EAM_0140 argG argH TRUE 0.864 93.000 0.278 1.000 Y NA
 10476098 10476099 EAM_0144 EAM_0145     TRUE 0.982 -3.000 0.194 NA   NA
 10476101 10476102 EAM_0147 EAM_r004 murI 16S_rRNA FALSE 0.013 404.000 0.000 NA   NA
 10476102 10476103 EAM_r004 EAM_t003 16S_rRNA tRNA-Glu FALSE 0.277 59.000 0.000 NA   NA
 10476103 10476104 EAM_t003 EAM_r005 tRNA-Glu 23S_rRNA FALSE 0.039 267.000 0.000 NA   NA
 10476104 10476105 EAM_r005 EAM_r006 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.089 197.000 0.000 NA   NA
 10476105 10476106 EAM_r006 EAM_t004 5S_rRNA tRNA-Asp FALSE 0.217 95.000 0.000 NA   NA
 10476106 10476107 EAM_t004 EAM_t005 tRNA-Asp tRNA-Trp TRUE 0.843 11.000 0.000 NA   NA
 10476111 10476112 EAM_0151 EAM_0152 ilvG ilvM TRUE 0.999 -3.000 0.943 0.002   NA
 10476112 10476113 EAM_0152 EAM_0153 ilvM ilvE TRUE 0.919 19.000 0.205 1.000   NA
 10476113 10476114 EAM_0153 EAM_0154 ilvE ilvD TRUE 0.693 66.000 0.075 1.000 Y NA
 10476114 10476115 EAM_0154 EAM_0155 ilvD ilvA TRUE 0.984 6.000 0.106 1.000 Y NA
 10476120 10476121 EAM_0160 EAM_0161 gppA rhlB TRUE 0.985 7.000 0.406 1.000 N NA
 10476122 10476123 EAM_0162 EAM_0163 trxA rho FALSE 0.011 369.000 0.087 1.000 N NA
 10476123 10476124 EAM_0163 EAM_0164 rho wecA FALSE 0.007 292.000 0.000 1.000 N NA
 10476124 10476125 EAM_0164 EAM_0165 wecA wzzE TRUE 0.996 27.000 0.735 0.004 Y NA
 10476125 10476126 EAM_0165 EAM_0166 wzzE wecB TRUE 0.988 50.000 0.677 0.004 Y NA
 10476126 10476127 EAM_0166 EAM_0167 wecB wecC TRUE 0.996 5.000 0.348 1.000 Y NA
 10476127 10476128 EAM_0167 EAM_0168 wecC rffG TRUE 0.996 -3.000 0.273 1.000 Y NA
 10476128 10476129 EAM_0168 EAM_0169 rffG rffH TRUE 1.000 -3.000 0.739 0.004 Y NA
 10476129 10476130 EAM_0169 EAM_0170 rffH rffC TRUE 0.514 68.000 0.145 1.000   NA
 10476130 10476131 EAM_0170 EAM_0171 rffC rffA TRUE 0.988 -3.000 0.248 1.000   NA
 10476131 10476132 EAM_0171 EAM_0172 rffA wzxE TRUE 0.984 2.000 0.218 1.000   NA
 10476132 10476133 EAM_0172 EAM_0173 wzxE rffT TRUE 0.997 -3.000 0.605 1.000   NA
 10476133 10476134 EAM_0173 EAM_0174 rffT wzyE TRUE 0.998 -3.000 0.684 1.000   NA
 10476134 10476135 EAM_0174 EAM_0175 wzyE wecG TRUE 0.918 13.000 0.126 1.000   NA
 10476135 10476136 EAM_0175 EAM_t006 wecG tRNA-Arg FALSE 0.111 180.000 0.000 NA   NA
 10476136 10476137 EAM_t006 EAM_t007 tRNA-Arg tRNA-His FALSE 0.219 79.000 0.000 NA   NA
 10476137 10476138 EAM_t007 EAM_t008 tRNA-His tRNA-Leu TRUE 0.732 17.000 0.000 NA   NA
 10476138 10476139 EAM_t008 EAM_t009 tRNA-Leu tRNA-Pro TRUE 0.528 32.000 0.000 NA   NA
 10476139 10476140 EAM_t009 EAM_t010 tRNA-Pro tRNA-Pro FALSE 0.032 289.000 0.000 NA   NA
 10476140 10476141 EAM_t010 EAM_0176 tRNA-Pro   FALSE 0.005 833.000 0.000 NA   NA
 10476142 10476143 EAM_0177 EAM_0178 hemY hemX TRUE 0.991 3.000 0.144 1.000 Y NA
 10476143 10476144 EAM_0178 EAM_0179 hemX hemD TRUE 0.927 149.000 0.600 1.000 Y NA
 10476144 10476145 EAM_0179 EAM_0180 hemD hemC TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.002 Y NA
 10476146 10476147 EAM_0181 EAM_0182 cyaA   FALSE 0.039 105.000 0.000 NA N NA
 10476147 10476148 EAM_0182 EAM_0183   dapF FALSE 0.051 28.000 0.021 NA N NA
 10476148 10476149 EAM_0183 EAM_0184 dapF   TRUE 0.979 -3.000 0.175 NA   NA
 10476149 10476150 EAM_0184 EAM_0185   xerC TRUE 0.998 -3.000 0.714 NA   NA
 10476150 10476151 EAM_0185 EAM_0186 xerC   TRUE 0.994 0.000 0.367 1.000   NA
 10476151 10476152 EAM_0186 EAM_0187   uvrD TRUE 0.514 58.000 0.128 1.000   NA
 10476152 10476153 EAM_0187 EAM_0188 uvrD corA FALSE 0.001 300.000 0.021 1.000 N NA
 10476155 10476156 EAM_0190 EAM_0191 pldA recQ FALSE 0.102 63.000 0.057 1.000 N NA
 10476158 10476159 EAM_0193 EAM_0194 pldB   TRUE 0.882 61.000 0.524 1.000   NA
 10476160 10476161 EAM_0195 EAM_0196 glpT   FALSE 0.014 387.000 0.000 NA   NA
 10476161 10476162 EAM_0196 EAM_0197   metR FALSE 0.122 104.000 0.012 NA   NA
 10476165 10476166 EAM_0200 EAM_0201 udp rmuC FALSE 0.108 175.000 0.041 NA   NA
 10476166 10476167 EAM_0201 EAM_0202 rmuC ubiE FALSE 0.175 135.000 0.047 NA   NA
 10476167 10476168 EAM_0202 EAM_0203 ubiE   TRUE 0.932 13.000 0.145 1.000   NA
 10476168 10476169 EAM_0203 EAM_0204   ubiB TRUE 0.995 -3.000 0.432 1.000   NA
 10476169 10476170 EAM_0204 EAM_0205 ubiB tatA FALSE 0.156 120.000 0.025 1.000   NA
 10476170 10476171 EAM_0205 EAM_0206 tatA tatB TRUE 0.989 4.000 0.130 1.000 Y NA
 10476171 10476172 EAM_0206 EAM_0207 tatB tatC TRUE 0.996 3.000 0.333 NA Y NA
 10476172 10476173 EAM_0207 EAM_0208 tatC tatD FALSE 0.238 76.000 0.121 NA N NA
 10476175 10476176 EAM_0210 EAM_0211 ubiD fre TRUE 0.818 45.000 0.090 NA Y NA
 10476177 10476178 EAM_0212 EAM_0213 fadA fadB TRUE 0.997 11.000 0.607 1.000 Y NA
 10476179 10476180 EAM_0214 EAM_0215 pepQ   TRUE 0.972 0.000 0.127 1.000   NA
 10476180 10476181 EAM_0215 EAM_0216   trkH TRUE 0.863 29.000 0.202 1.000   NA
 10476181 10476182 EAM_0216 EAM_0217 trkH hemG TRUE 0.974 15.000 0.455 1.000 N NA
 10476182 10476183 EAM_0217 EAM_r007 hemG 16S_rRNA FALSE 0.012 409.000 0.000 NA   NA
 10476183 10476184 EAM_r007 EAM_t011 16S_rRNA tRNA-Glu FALSE 0.235 73.000 0.000 NA   NA
 10476184 10476185 EAM_t011 EAM_r008 tRNA-Glu 23S_rRNA FALSE 0.013 400.000 0.000 NA   NA
 10476185 10476186 EAM_r008 EAM_r009 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.089 197.000 0.000 NA   NA
 10476186 10476187 EAM_r009 EAM_0218 5S_rRNA murB FALSE 0.006 699.000 0.000 NA   NA
 10476187 10476188 EAM_0218 EAM_0219 murB birA TRUE 0.975 -3.000 0.211 1.000 N NA
 10476190 10476191 EAM_t012 EAM_t013 tRNA-Thr tRNA-Tyr TRUE 0.751 16.000 0.000 NA   NA
 10476191 10476192 EAM_t013 EAM_t014 tRNA-Tyr tRNA-Gly FALSE 0.067 221.000 0.000 NA   NA
 10476192 10476193 EAM_t014 EAM_t015 tRNA-Gly tRNA-Thr TRUE 0.858 10.000 0.000 NA   NA
 10476193 10476194 EAM_t015 EAM_0221 tRNA-Thr tufB FALSE 0.199 117.000 0.000 NA   NA
 10476194 10476195 EAM_0221 EAM_0222 tufB secE FALSE 0.002 270.000 0.009 1.000 N NA
 10476195 10476196 EAM_0222 EAM_0223 secE nusG TRUE 0.997 2.000 0.843 1.000 N NA
 10476196 10476197 EAM_0223 EAM_0224 nusG rplK TRUE 0.693 194.000 0.681 1.000 N NA
 10476197 10476198 EAM_0224 EAM_0225 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.023 Y NA
 10476198 10476199 EAM_0225 EAM_0226 rplA rplJ TRUE 0.471 346.000 0.302 0.023 Y NA
 10476199 10476200 EAM_0226 EAM_0227 rplJ rplL TRUE 0.986 68.000 0.884 0.017 Y NA
 10476200 10476201 EAM_0227 EAM_0228 rplL rpoB FALSE 0.115 335.000 0.223 1.000   NA
 10476201 10476202 EAM_0228 EAM_0229 rpoB rpoC TRUE 0.966 86.000 0.851 0.001   NA
 10476204 10476205 EAM_0231 EAM_0232     TRUE 0.996 12.000 1.000 NA   NA
 10476205 10476206 EAM_0232 EAM_0233     TRUE 0.999 -7.000 0.750 1.000 Y NA
 10476206 10476207 EAM_0233 EAM_0234     TRUE 0.994 12.000 0.750 NA   NA
 10476207 10476208 EAM_0234 EAM_0235     FALSE 0.085 200.000 0.000 NA   NA
 10476208 10476209 EAM_0235 EAM_0236     FALSE 0.197 235.000 0.000 0.002   NA
 10476209 10476210 EAM_0236 EAM_0237     TRUE 0.995 25.000 1.000 0.002   NA
 10476211 10476212 EAM_0238 EAM_0239   thiE FALSE 0.001 776.000 0.000 1.000 N NA
 10476212 10476213 EAM_0239 EAM_0240 thiE thiC TRUE 0.994 -3.000 0.063 0.005 Y NA
 10476213 10476214 EAM_0240 EAM_0241 thiC rsd FALSE 0.006 318.000 0.000 1.000 N NA
 10476215 10476216 EAM_0242 EAM_0243 nudC hemE FALSE 0.013 199.000 0.040 1.000 N NA
 10476216 10476217 EAM_0243 EAM_0244 hemE nfi FALSE 0.038 35.000 0.028 1.000 N NA
 10476217 10476218 EAM_0244 EAM_0245 nfi   FALSE 0.344 68.000 0.086 NA   NA
 10476218 10476219 EAM_0245 EAM_0246   hupA TRUE 0.555 189.000 0.355 NA   NA
 10476219 10476220 EAM_0246 EAM_0247 hupA   TRUE 0.723 134.000 0.375 NA   NA
 10476221 10476222 EAM_0248 EAM_0249 purD purH TRUE 0.985 15.000 0.238 1.000 Y NA
 10476223 10476224 EAM_r010 EAM_t016 16S_rRNA tRNA-Ile FALSE 0.277 59.000 0.000 NA   NA
 10476224 10476225 EAM_t016 EAM_t017 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.147 156.000 0.000 NA   NA
 10476225 10476226 EAM_t017 EAM_r011 tRNA-Ala 23S_rRNA FALSE 0.014 390.000 0.000 NA   NA
 10476226 10476227 EAM_r011 EAM_r012 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.098 191.000 0.000 NA   NA
 10476227 10476228 EAM_r012 EAM_0250 5S_rRNA metA FALSE 0.045 255.000 0.000 NA   NA
 10476232 10476233 EAM_0254 EAM_0255 pgi   FALSE 0.006 673.000 0.000 NA   NA
 10476233 10476234 EAM_0255 EAM_0256     TRUE 0.608 79.000 0.222 NA   NA
 10476234 10476235 EAM_0256 EAM_0257     TRUE 0.997 -3.000 0.600 NA   NA
 10476235 10476236 EAM_0257 EAM_0258     TRUE 0.940 0.000 0.060 NA   NA
 10476236 10476237 EAM_0258 EAM_0259   psiE FALSE 0.072 215.000 0.000 NA   NA
 10476237 10476238 EAM_0259 EAM_0260 psiE ubiC FALSE 0.093 138.000 0.006 NA   NA
 10476238 10476239 EAM_0260 EAM_0261 ubiC ubiA TRUE 0.995 2.000 0.248 NA Y NA
 10476241 10476242 EAM_0263 EAM_0264 dgkA lexA FALSE 0.283 110.000 0.141 1.000 N NA
 10476242 10476243 EAM_0264 EAM_0265 lexA dinF FALSE 0.007 193.000 0.033 1.000 N NA
 10476243 10476244 EAM_0265 EAM_0266 dinF   FALSE 0.045 214.000 0.021 NA   NA
 10476246 10476247 EAM_0268 EAM_0269 traF   FALSE 0.010 449.000 0.000 NA   NA
 10476247 10476248 EAM_0269 EAM_0270     FALSE 0.013 396.000 0.000 NA   NA
 10476249 10476250 EAM_0271 EAM_0272     TRUE 0.749 30.000 0.125 NA   NA
 10476251 10476252 EAM_0273 EAM_0274     TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 10476253 10476254 EAM_0275 EAM_0276     FALSE 0.201 113.000 0.000 NA   NA
 10476254 10476255 EAM_0276 EAM_0277     FALSE 0.264 62.000 0.000 NA   NA
 10476255 10476256 EAM_0277 EAM_0278     FALSE 0.241 71.000 0.000 NA   NA
 10476256 10476257 EAM_0278 EAM_0279     FALSE 0.305 54.000 0.000 NA   NA
 10476260 10476261 EAM_0282 EAM_0283     TRUE 0.808 -24.000 0.000 NA   NA
 10476261 10476262 EAM_0283 EAM_0284     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 10476262 10476263 EAM_0284 EAM_0285     FALSE 0.217 93.000 0.000 NA   NA
 10476264 10476265 EAM_0286 EAM_0287   gtrB TRUE 0.922 1.000 0.000 NA   NA
 10476265 10476266 EAM_0287 EAM_0288 gtrB   TRUE 0.798 -34.000 0.000 NA   NA
 10476266 10476267 EAM_0288 EAM_0289     FALSE 0.329 51.000 0.000 NA   NA
 10476267 10476268 EAM_0289 EAM_0290     TRUE 0.819 -19.000 0.000 NA   NA
 10476268 10476269 EAM_0290 EAM_0291     FALSE 0.316 52.000 0.000 NA   NA
 10476270 10476271 EAM_0292 EAM_0293 dusA   FALSE 0.185 157.000 0.070 NA   NA
 10476271 10476272 EAM_0293 EAM_0294     TRUE 0.496 35.000 0.000 NA   NA
 10476274 10476275 EAM_0296 EAM_0297 dnaB   FALSE 0.214 99.000 0.000 NA   NA
 10476275 10476276 EAM_0297 EAM_0298   tyrB TRUE 0.628 24.000 0.000 NA   NA
 10476276 10476277 EAM_0298 EAM_0299 tyrB   FALSE 0.112 115.000 0.009 NA   NA
 10476277 10476278 EAM_0299 EAM_0300     TRUE 0.856 3.000 0.018 NA   NA
 10476279 10476280 EAM_0301 EAM_0302     FALSE 0.089 197.000 0.000 NA   NA
 10476280 10476281 EAM_0302 EAM_0303     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10476281 10476282 EAM_0303 EAM_0304     FALSE 0.016 370.000 0.000 NA   NA
 10476282 10476283 EAM_0304 EAM_0305     FALSE 0.203 110.000 0.000 NA   NA
 10476283 10476284 EAM_0305 EAM_0306     FALSE 0.193 124.000 0.000 NA   NA
 10476284 10476285 EAM_0306 EAM_0307   uvrA FALSE 0.037 284.000 0.000 1.000   NA
 10476286 10476287 EAM_0308 EAM_0309 ssb   FALSE 0.002 441.000 0.000 NA N NA
 10476287 10476288 EAM_0309 EAM_0310     FALSE 0.385 45.000 0.000 NA   NA
 10476290 10476291 EAM_0312 EAM_0313     TRUE 0.858 10.000 0.000 NA   NA
 10476295 10476296 EAM_0317 EAM_0318 soxR   FALSE 0.029 41.000 0.028 NA N NA
 10476296 10476297 EAM_0318 EAM_0319     FALSE 0.009 467.000 0.000 NA   NA
 10476297 10476298 EAM_0319 EAM_0320     FALSE 0.294 166.000 0.130 1.000   NA
 10476300 10476301 EAM_0322 EAM_0323     TRUE 0.997 -7.000 0.840 NA   NA
 10476301 10476302 EAM_0323 EAM_0324     FALSE 0.114 141.000 0.022 NA   NA
 10476303 10476304 EAM_0325 EAM_0326 actP   TRUE 0.998 -3.000 0.733 NA   NA
 10476304 10476305 EAM_0326 EAM_0327   acs FALSE 0.148 163.000 0.056 NA   NA
 10476306 10476307 EAM_0328 EAM_0329 gltP aer FALSE 0.004 353.000 0.000 1.000 N NA
 10476310 10476311 EAM_0332 EAM_0333     TRUE 0.870 23.000 0.172 NA   NA
 10476311 10476312 EAM_0333 EAM_0334   sbmA FALSE 0.188 128.000 0.000 NA   NA
 10476313 10476314 EAM_0335 EAM_0336     FALSE 0.047 258.000 0.000 1.000   NA
 10476314 10476315 EAM_0336 EAM_0337     TRUE 0.999 3.000 0.895 0.001   NA
 10476315 10476316 EAM_0337 EAM_0338     TRUE 0.995 11.000 0.579 0.001 N NA
 10476316 10476317 EAM_0338 EAM_0339     FALSE 0.001 621.000 0.000 1.000 N NA
 10476321 10476322 EAM_0343 EAM_0344     FALSE 0.032 139.000 0.000 NA N NA
 10476323 10476324 EAM_0345 EAM_0346     FALSE 0.149 155.000 0.000 NA   NA
 10476324 10476325 EAM_0346 EAM_0347     FALSE 0.039 268.000 0.000 NA   NA
 10476325 10476326 EAM_0347 EAM_0348     FALSE 0.203 110.000 0.000 NA   NA
 10476331 10476332 EAM_0353 EAM_0354 hchA   FALSE 0.082 204.000 0.000 NA   NA
 10476332 10476333 EAM_0354 EAM_0355     TRUE 0.981 16.000 0.600 1.000 N NA
 10476334 10476335 EAM_0356 EAM_0357 gdh   FALSE 0.018 360.000 0.000 NA   NA
 10476337 10476338 EAM_0359 EAM_0360     TRUE 0.984 2.000 0.048 1.000 Y NA
 10476338 10476339 EAM_0360 EAM_0361     TRUE 0.991 11.000 0.667 1.000 N NA
 10476340 10476341 EAM_0362 EAM_0363     TRUE 0.998 5.000 1.000 NA   NA
 10476341 10476342 EAM_0363 EAM_0364     TRUE 0.989 24.000 1.000 NA   NA
 10476342 10476343 EAM_0364 EAM_0365     FALSE 0.063 225.000 0.000 NA   NA
 10476343 10476344 EAM_0365 EAM_0366     FALSE 0.250 67.000 0.000 NA   NA
 10476344 10476345 EAM_0366 EAM_0367     FALSE 0.005 792.000 0.000 NA   NA
 10476345 10476346 EAM_0367 EAM_0368     TRUE 0.973 35.000 0.750 NA   NA
 10476346 10476347 EAM_0368 EAM_0369     TRUE 0.960 18.000 0.333 NA   NA
 10476347 10476348 EAM_0369 EAM_0370     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   NA
 10476348 10476349 EAM_0370 EAM_0371     TRUE 0.998 0.000 0.750 NA   NA
 10476349 10476350 EAM_0371 EAM_0372     TRUE 0.963 33.000 0.600 NA   NA
 10476350 10476351 EAM_0372 EAM_0373   clpB FALSE 0.333 171.000 0.167 NA   NA
 10476351 10476352 EAM_0373 EAM_0374 clpB   FALSE 0.215 86.000 0.000 NA   NA
 10476352 10476353 EAM_0374 EAM_0375     FALSE 0.163 146.000 0.000 NA   NA
 10476353 10476354 EAM_0375 EAM_0376     FALSE 0.215 84.000 0.000 NA   NA
 10476354 10476355 EAM_0376 EAM_0377     FALSE 0.173 139.000 0.000 NA   NA
 10476355 10476356 EAM_0377 EAM_0378     TRUE 0.910 3.000 0.000 NA   NA
 10476356 10476357 EAM_0378 EAM_0379     TRUE 0.997 -7.000 0.750 NA   NA
 10476357 10476358 EAM_0379 EAM_0380     TRUE 0.915 -3.000 0.040 NA   NA
 10476358 10476359 EAM_0380 EAM_0381     FALSE 0.133 155.000 0.040 NA   NA
 10476359 10476360 EAM_0381 EAM_0382     TRUE 0.995 -36.000 1.000 NA   NA
 10476360 10476361 EAM_0382 EAM_0383     TRUE 0.987 26.000 1.000 NA   NA
 10476361 10476362 EAM_0383 EAM_0384     TRUE 0.996 5.000 0.667 NA   NA
 10476362 10476363 EAM_0384 EAM_0385     TRUE 0.917 2.000 0.000 NA   NA
 10476363 10476364 EAM_0385 EAM_0386     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 10476364 10476365 EAM_0386 EAM_0387     FALSE 0.195 122.000 0.000 NA   NA
 10476365 10476366 EAM_0387 EAM_0388     FALSE 0.291 56.000 0.000 NA   NA
 10476366 10476367 EAM_0388 EAM_0389     TRUE 0.859 45.000 0.333 NA   NA
 10476367 10476368 EAM_0389 EAM_0390     FALSE 0.209 104.000 0.000 NA   NA
 10476368 10476369 EAM_0390 EAM_0391     TRUE 0.528 32.000 0.000 NA   NA
 10476369 10476370 EAM_0391 EAM_0393     FALSE 0.120 174.000 0.000 NA   NA
 10476370 10476371 EAM_0393 EAM_0394     FALSE 0.298 55.000 0.000 NA   NA
 10476371 10476372 EAM_0394 EAM_0395     TRUE 0.539 31.000 0.000 NA   NA
 10476372 10476373 EAM_0395 EAM_0396     TRUE 0.772 15.000 0.000 NA   NA
 10476373 10476374 EAM_0396 EAM_0397     FALSE 0.029 301.000 0.000 NA   NA
 10476374 10476375 EAM_0397 EAM_0398     FALSE 0.350 49.000 0.000 NA   NA
 10476375 10476376 EAM_0398 EAM_0399     TRUE 0.776 45.000 0.222 NA   NA
 10476376 10476377 EAM_0399 EAM_0400     FALSE 0.339 50.000 0.000 NA   NA
 10476377 10476378 EAM_0400 EAM_0401     FALSE 0.005 935.000 0.000 NA   NA
 10476378 10476379 EAM_0401 EAM_0402     FALSE 0.005 886.000 0.000 NA   NA
 10476379 10476380 EAM_0402 EAM_0403     FALSE 0.216 97.000 0.000 NA   NA
 10476380 10476381 EAM_0403 EAM_0404     TRUE 0.455 41.000 0.000 1.000   NA
 10476381 10476382 EAM_0404 EAM_0405     TRUE 0.738 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10476383 10476384 EAM_0406 EAM_0407     FALSE 0.046 137.000 0.000 1.000 N NA
 10476384 10476385 EAM_0407 EAM_0408     TRUE 0.738 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10476385 10476386 EAM_0408 EAM_0409     FALSE 0.075 62.000 0.000 1.000 N NA
 10476386 10476387 EAM_0409 EAM_0410     FALSE 0.051 242.000 0.000 NA   NA
 10476388 10476389 EAM_0411 EAM_0412     FALSE 0.013 402.000 0.000 NA   NA
 10476390 10476391 EAM_t018 EAM_0413 tRNA-Phe   FALSE 0.202 111.000 0.000 NA   NA
 10476391 10476392 EAM_0413 EAM_0414   dsbD TRUE 0.899 17.000 0.217 1.000 N NA
 10476392 10476393 EAM_0414 EAM_0415 dsbD dcuA FALSE 0.089 205.000 0.000 1.000   NA
 10476393 10476394 EAM_0415 EAM_0416 dcuA aspA FALSE 0.208 238.000 0.195 1.000   NA
 10476395 10476396 EAM_0417 EAM_0418 fxsA groS FALSE 0.059 219.000 0.040 NA   NA
 10476396 10476397 EAM_0418 EAM_0419 groS groL TRUE 0.985 37.000 0.631 1.000 Y NA
 10476397 10476398 EAM_0419 EAM_0420 groL   FALSE 0.184 150.000 0.062 NA   NA
 10476400 10476401 EAM_0422 EAM_0423 efp avrRpt2 FALSE 0.202 111.000 0.000 NA   NA
 10476401 10476402 EAM_0423 EAM_0424 avrRpt2 ecnB FALSE 0.029 301.000 0.000 NA   NA
 10476405 10476406 EAM_0427 EAM_0428   psd TRUE 0.896 11.000 0.148 NA N NA
 10476406 10476407 EAM_0428 EAM_0429 psd engC FALSE 0.345 97.000 0.095 1.000   NA
 10476408 10476409 EAM_0430 EAM_t019 orn tRNA-Gly FALSE 0.112 179.000 0.000 NA   NA
 10476409 10476410 EAM_t019 EAM_t020 tRNA-Gly tRNA-Gly TRUE 0.539 31.000 0.000 NA   NA
 10476410 10476411 EAM_t020 EAM_t021 tRNA-Gly tRNA-Gly FALSE 0.013 401.000 0.000 NA   NA
 10476411 10476412 EAM_t021 EAM_0431 tRNA-Gly   FALSE 0.006 696.000 0.000 NA   NA
 10476412 10476413 EAM_0431 EAM_0432     TRUE 0.965 -3.000 0.118 NA   NA
 10476413 10476414 EAM_0432 EAM_0433   amiB TRUE 0.964 0.000 0.109 NA   NA
 10476414 10476415 EAM_0433 EAM_0434 amiB mutL TRUE 0.720 15.000 0.092 1.000 N NA
 10476415 10476416 EAM_0434 EAM_0435 mutL miaA TRUE 0.953 -7.000 0.188 1.000 N NA
 10476416 10476417 EAM_0435 EAM_0436 miaA hfq TRUE 0.846 103.000 0.531 1.000   NA
 10476417 10476418 EAM_0436 EAM_0437 hfq hflX FALSE 0.160 231.000 0.141 1.000   NA
 10476418 10476419 EAM_0437 EAM_0438 hflX hflK TRUE 0.646 118.000 0.184 0.080   NA
 10476419 10476420 EAM_0438 EAM_0439 hflK hflC TRUE 1.000 4.000 0.947 0.010 Y NA
 10476420 10476421 EAM_0439 EAM_0440 hflC   TRUE 0.696 137.000 0.348 NA   NA
 10476421 10476422 EAM_0440 EAM_0441   purA FALSE 0.200 122.000 0.051 NA   NA
 10476422 10476423 EAM_0441 EAM_0442 purA   FALSE 0.087 198.000 0.000 NA   NA
 10476423 10476424 EAM_0442 EAM_0443   rnr TRUE 0.732 17.000 0.000 NA   NA
 10476424 10476425 EAM_0443 EAM_0444 rnr rlmB TRUE 0.534 78.000 0.147 0.021 N NA
 10476426 10476427 EAM_0445 EAM_0446     TRUE 0.973 2.000 0.154 NA   NA
 10476428 10476429 EAM_0447 EAM_0448   rpsF FALSE 0.045 208.000 0.005 1.000   NA
 10476429 10476430 EAM_0448 EAM_0449 rpsF priB TRUE 0.903 6.000 0.122 1.000 N NA
 10476430 10476431 EAM_0449 EAM_0450 priB rpsR TRUE 0.917 5.000 0.128 1.000 N NA
 10476431 10476432 EAM_0450 EAM_0451 rpsR rplI TRUE 0.986 39.000 0.499 0.016 Y NA
 10476436 10476437 EAM_0455 EAM_0456 cysQ   FALSE 0.176 137.000 0.000 NA   NA
 10476437 10476438 EAM_0456 EAM_0457     FALSE 0.098 191.000 0.000 NA   NA
 10476440 10476441 EAM_0459 EAM_0460     TRUE 0.996 -3.000 0.575 NA   NA
 10476441 10476442 EAM_0460 EAM_0461     TRUE 0.973 3.000 0.167 NA   NA
 10476450 10476451 EAM_0469 EAM_0470     TRUE 0.751 16.000 0.000 NA   NA
 10476451 10476452 EAM_0470 EAM_0471     TRUE 0.945 0.000 0.069 NA   NA
 10476452 10476453 EAM_0471 EAM_0472     TRUE 0.979 35.000 0.897 NA   NA
 10476453 10476454 EAM_0472 EAM_0473     TRUE 0.995 14.000 0.966 NA   NA
 10476454 10476455 EAM_0473 EAM_0474     TRUE 0.912 46.000 0.475 NA   NA
 10476455 10476456 EAM_0474 EAM_0475     TRUE 0.995 -16.000 0.750 1.000   NA
 10476456 10476457 EAM_0475 EAM_0476     TRUE 0.998 -3.000 0.679 1.000   NA
 10476457 10476458 EAM_0476 EAM_0477     TRUE 0.569 109.000 0.208 1.000   NA
 10476459 10476460 EAM_0478 EAM_0479   diaA TRUE 0.993 11.000 0.613 NA   NA
 10476460 10476461 EAM_0479 EAM_0480 diaA   TRUE 0.830 22.000 0.187 1.000 N NA
 10476461 10476462 EAM_0480 EAM_0481     TRUE 0.934 -42.000 0.172 NA   NA
 10476464 10476465 EAM_0483 EAM_0484     TRUE 0.517 33.000 0.000 NA   NA
 10476465 10476466 EAM_0484 EAM_0485     FALSE 0.241 71.000 0.000 NA   NA
 10476466 10476467 EAM_0485 EAM_0486     FALSE 0.047 250.000 0.000 NA   NA
 10476469 10476470 EAM_0488 EAM_0489     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10476470 10476471 EAM_0489 EAM_0490     FALSE 0.129 168.000 0.000 NA   NA
 10476471 10476472 EAM_0490 EAM_0491     FALSE 0.217 210.000 0.161 NA   NA
 10476472 10476473 EAM_0491 EAM_0492     TRUE 0.982 0.000 0.185 NA   NA
 10476473 10476474 EAM_0492 EAM_0493     TRUE 0.979 2.000 0.185 NA   NA
 10476474 10476475 EAM_0493 EAM_0494     TRUE 0.946 43.000 0.609 NA   NA
 10476475 10476476 EAM_0494 EAM_0495     TRUE 0.824 168.000 0.684 NA   NA
 10476476 10476477 EAM_0495 EAM_0496     TRUE 0.993 -3.000 0.353 NA   NA
 10476477 10476478 EAM_0496 EAM_0497     FALSE 0.010 446.000 0.000 NA   NA
 10476478 10476479 EAM_0497 EAM_0498     FALSE 0.020 347.000 0.000 NA   NA
 10476479 10476480 EAM_0498 EAM_0499   alx FALSE 0.013 235.000 0.000 1.000 N NA
 10476481 10476482 EAM_0500 EAM_0501     TRUE 0.928 1.000 0.000 1.000   NA
 10476482 10476483 EAM_0501 EAM_0502     TRUE 0.935 0.000 0.000 1.000   NA
 10476483 10476484 EAM_0502 EAM_0503     TRUE 0.972 5.000 0.182 1.000   NA
 10476484 10476485 EAM_0503 EAM_0504     TRUE 0.994 -3.000 0.400 NA   NA
 10476488 10476489 EAM_0507 EAM_0508 fadH   FALSE 0.071 216.000 0.000 NA   NA
 10476490 10476491 EAM_0509 EAM_0510     FALSE 0.009 464.000 0.000 NA   NA
 10476491 10476492 EAM_0510 EAM_0511     TRUE 0.999 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 10476492 10476493 EAM_0511 EAM_0512     FALSE 0.054 111.000 0.000 1.000 N NA
 10476493 10476494 EAM_0512 EAM_0512A   pqqA FALSE 0.406 171.000 0.200 1.000   NA
 10476494 10476495 EAM_0512A EAM_0513 pqqA pqqB TRUE 0.492 96.000 0.028 0.002   NA
 10476495 10476496 EAM_0513 EAM_0514 pqqB pqqC TRUE 0.999 -3.000 0.825 0.002   NA
 10476496 10476497 EAM_0514 EAM_0515 pqqC pqqD TRUE 0.995 -3.000 0.246 0.002   NA
 10476497 10476498 EAM_0515 EAM_0516 pqqD pqqE TRUE 0.986 -13.000 0.211 0.002   NA
 10476498 10476499 EAM_0516 EAM_0517 pqqE pqqF TRUE 0.971 4.000 0.030 0.002   NA
 10476499 10476500 EAM_0517 EAM_0518 pqqF   FALSE 0.026 309.000 0.000 NA   NA
 10476500 10476501 EAM_0518 EAM_0519     FALSE 0.229 75.000 0.000 NA   NA
 10476501 10476502 EAM_0519 EAM_0520     FALSE 0.018 357.000 0.000 NA   NA
 10476502 10476503 EAM_0520 EAM_0521   srlA FALSE 0.308 53.000 0.000 NA   NA
 10476503 10476504 EAM_0521 EAM_0522 srlA srlE TRUE 0.972 16.000 0.000 0.006 Y NA
 10476504 10476505 EAM_0522 EAM_0523 srlE srlB TRUE 0.975 15.000 0.000 0.006 Y NA
 10476505 10476506 EAM_0523 EAM_0524 srlB srlD FALSE 0.312 15.000 0.040 1.000 N NA
 10476506 10476507 EAM_0524 EAM_0525 srlD srlM TRUE 0.593 48.000 0.197 NA N NA
 10476507 10476508 EAM_0525 EAM_0526 srlM srlR TRUE 0.787 93.000 0.183 NA Y NA
 10476508 10476509 EAM_0526 EAM_0527 srlR gutQ TRUE 0.992 5.000 0.562 1.000 N NA
 10476511 10476512 EAM_0529 EAM_0530     FALSE 0.216 90.000 0.000 NA   NA
 10476512 10476513 EAM_0530 EAM_0531   rlsC FALSE 0.015 376.000 0.000 NA   NA
 10476513 10476514 EAM_0531 EAM_0532 rlsC   FALSE 0.012 416.000 0.000 NA   NA
 10476514 10476515 EAM_0532 EAM_0533     TRUE 0.858 10.000 0.000 NA   NA
 10476515 10476516 EAM_0533 EAM_0534     TRUE 0.790 -102.000 0.000 NA   NA
 10476516 10476517 EAM_0534 EAM_0535     TRUE 0.810 -22.000 0.000 NA   NA
 10476517 10476518 EAM_0535 EAM_0536     FALSE 0.152 153.000 0.000 NA   NA
 10476518 10476519 EAM_0536 EAM_0537     TRUE 0.858 10.000 0.000 NA   NA
 10476521 10476522 EAM_0539 EAM_0540     TRUE 0.874 8.000 0.000 NA   NA
 10476522 10476523 EAM_0540 EAM_0541     FALSE 0.216 97.000 0.000 NA   NA
 10476525 10476526 EAM_0543 EAM_0544     TRUE 0.551 30.000 0.000 NA   NA
 10476526 10476527 EAM_0544 EAM_0545     FALSE 0.170 141.000 0.000 NA   NA
 10476529 10476530 EAM_0547 EAM_0548     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 10476530 10476531 EAM_0548 EAM_0549     TRUE 0.874 -9.000 0.000 NA   NA
 10476531 10476532 EAM_0549 EAM_0550     TRUE 0.628 24.000 0.000 NA   NA
 10476532 10476533 EAM_0550 EAM_0551     TRUE 0.874 -9.000 0.000 NA   NA
 10476533 10476534 EAM_0551 EAM_0552     TRUE 0.628 24.000 0.000 NA   NA
 10476534 10476535 EAM_0552 EAM_0553     TRUE 0.874 -9.000 0.000 NA   NA
 10476535 10476536 EAM_0553 EAM_0554     TRUE 0.628 24.000 0.000 NA   NA
 10476536 10476537 EAM_0554 EAM_0555     TRUE 0.874 -9.000 0.000 NA   NA
 10476538 10476539 EAM_0556 EAM_t022   tRNA-Met FALSE 0.017 366.000 0.000 NA   NA
 10476540 10476541 EAM_0557 EAM_0558     TRUE 0.563 82.000 0.273 1.000 N NA
 10476541 10476542 EAM_0558 EAM_0559     TRUE 0.911 16.000 0.226 NA N NA
 10476543 10476544 EAM_0560 EAM_0561     FALSE 0.398 77.000 0.120 NA   NA
 10476546 10476547 EAM_0563 EAM_0564     FALSE 0.264 62.000 0.000 NA   NA
 10476549 10476550 EAM_t023 EAM_t024 tRNA-Leu tRNA-Leu TRUE 0.496 35.000 0.000 NA   NA
 10476550 10476551 EAM_t024 EAM_t025 tRNA-Leu tRNA-Leu TRUE 0.473 37.000 0.000 NA   NA
 10476551 10476552 EAM_t025 EAM_0566 tRNA-Leu rsmC FALSE 0.114 178.000 0.000 NA   NA
 10476553 10476554 EAM_0567 EAM_0568 holD rimI TRUE 0.905 -37.000 0.121 1.000   NA
 10476554 10476555 EAM_0568 EAM_0569 rimI   TRUE 0.693 15.000 0.018 1.000   NA
 10476555 10476556 EAM_0569 EAM_0570     FALSE 0.181 134.000 0.000 NA   NA
 10476556 10476557 EAM_0570 EAM_0571     FALSE 0.007 554.000 0.000 NA   NA
 10476557 10476558 EAM_0571 EAM_0572     TRUE 0.960 25.000 0.444 NA   NA
 10476558 10476559 EAM_0572 EAM_0573     TRUE 0.954 20.000 0.333 NA   NA
 10476559 10476560 EAM_0573 EAM_0574     TRUE 0.952 18.000 0.292 NA   NA
 10476560 10476561 EAM_0574 EAM_0575     TRUE 0.994 4.000 0.500 NA   NA
 10476561 10476562 EAM_0575 EAM_0576     TRUE 0.994 11.000 0.667 NA   NA
 10476562 10476563 EAM_0576 EAM_0577     TRUE 0.843 18.000 0.116 NA   NA
 10476563 10476564 EAM_0577 EAM_0578     TRUE 0.832 63.000 0.419 NA   NA
 10476564 10476565 EAM_0578 EAM_0579     TRUE 0.998 4.000 0.917 NA   NA
 10476565 10476566 EAM_0579 EAM_0580     FALSE 0.036 278.000 0.000 NA   NA
 10476566 10476567 EAM_0580 EAM_0581     FALSE 0.219 79.000 0.000 NA   NA
 10476567 10476568 EAM_0581 EAM_0582     TRUE 0.959 -15.000 0.200 NA   NA
 10476568 10476569 EAM_0582 EAM_0583     FALSE 0.174 138.000 0.000 NA   NA
 10476569 10476570 EAM_0583 EAM_0584     FALSE 0.191 126.000 0.000 NA   NA
 10476570 10476571 EAM_0584 EAM_0585     FALSE 0.198 119.000 0.000 NA   NA
 10476571 10476572 EAM_0585 EAM_0586     TRUE 0.999 -3.000 0.714 NA Y NA
 10476572 10476573 EAM_0586 EAM_0587     TRUE 0.985 19.000 0.667 NA   NA
 10476573 10476574 EAM_0587 EAM_0588     TRUE 0.987 10.000 0.400 NA   NA
 10476574 10476575 EAM_0588 EAM_0589     TRUE 0.980 -3.000 0.178 NA   NA
 10476575 10476576 EAM_0589 EAM_0590     TRUE 0.935 19.000 0.244 NA   NA
 10476576 10476577 EAM_0590 EAM_0591     TRUE 0.994 -3.000 0.391 NA   NA
 10476577 10476578 EAM_0591 EAM_0592     TRUE 0.874 97.000 0.609 NA   NA
 10476578 10476579 EAM_0592 EAM_0593     TRUE 0.801 30.000 0.217 1.000 N NA
 10476579 10476580 EAM_0593 EAM_0594     TRUE 0.900 47.000 0.444 NA   NA
 10476580 10476581 EAM_0594 EAM_0595     TRUE 0.642 23.000 0.000 NA   NA
 10476581 10476582 EAM_0595 EAM_0596     TRUE 0.628 24.000 0.000 NA   NA
 10476582 10476583 EAM_0596 EAM_0597     TRUE 0.628 24.000 0.000 NA   NA
 10476583 10476584 EAM_0597 EAM_0598     FALSE 0.037 274.000 0.000 NA   NA
 10476584 10476585 EAM_0598 EAM_0599     TRUE 0.990 -3.000 0.286 NA   NA
 10476585 10476586 EAM_0599 EAM_0600     TRUE 0.980 -10.000 0.286 NA   NA
 10476586 10476587 EAM_0600 EAM_0601     TRUE 0.903 4.000 0.000 NA   NA
 10476587 10476588 EAM_0601 EAM_0602     FALSE 0.108 182.000 0.000 NA   NA
 10476588 10476589 EAM_0602 EAM_0603     FALSE 0.059 232.000 0.000 NA   NA
 10476589 10476590 EAM_0603 EAM_0604     TRUE 0.885 6.000 0.000 NA   NA
 10476592 10476593 EAM_0606 EAM_0607     FALSE 0.112 179.000 0.000 NA   NA
 10476593 10476594 EAM_0607 EAM_0608     FALSE 0.053 62.000 0.000 NA N NA
 10476596 10476597 EAM_0610 EAM_0611 prfC osmY FALSE 0.037 274.000 0.000 NA   NA
 10476597 10476598 EAM_0611 EAM_0612 osmY   FALSE 0.404 123.000 0.140 NA   NA
 10476598 10476599 EAM_0612 EAM_0613     TRUE 0.571 103.000 0.211 NA   NA
 10476599 10476600 EAM_0613 EAM_0614     TRUE 0.934 -3.000 0.057 NA   NA
 10476600 10476601 EAM_0614 EAM_0615   deoC FALSE 0.007 263.000 0.000 NA N NA
 10476601 10476602 EAM_0615 EAM_0616 deoC deoA TRUE 0.507 123.000 0.009 1.000 Y NA
 10476602 10476603 EAM_0616 EAM_0617 deoA deoB FALSE 0.014 64.000 0.016 1.000 N NA
 10476603 10476604 EAM_0617 EAM_0618 deoB deoD TRUE 0.738 74.000 0.414 1.000 N NA
 10476604 10476605 EAM_0618 EAM_0619 deoD   FALSE 0.118 147.000 0.027 NA   NA
 10476607 10476608 EAM_0621 EAM_0622 serB radA FALSE 0.194 10.000 0.024 1.000 N NA
 10476608 10476609 EAM_0622 EAM_0623 radA nadR FALSE 0.021 49.000 0.021 1.000 N NA
 10476609 10476610 EAM_0623 EAM_0624 nadR   FALSE 0.017 365.000 0.000 NA   NA
 10476610 10476611 EAM_0624 EAM_0625     FALSE 0.415 61.000 0.104 NA   NA
 10476614 10476615 EAM_0628 EAM_0629     TRUE 0.917 2.000 0.000 NA   NA
 10476615 10476616 EAM_0629 EAM_0630   deoR FALSE 0.020 349.000 0.000 NA   NA
 10476616 10476617 EAM_0630 EAM_0631 deoR   FALSE 0.208 124.000 0.000 1.000   NA
 10476617 10476618 EAM_0631 EAM_0632     FALSE 0.418 42.000 0.000 NA   NA
 10476619 10476620 EAM_0633 EAM_0634 slt trpR FALSE 0.363 87.000 0.167 1.000 N NA
 10476623 10476624 EAM_0637 EAM_0638   rob FALSE 0.207 106.000 0.000 NA   NA
 10476626 10476627 EAM_0640 EAM_0641 arcA   FALSE 0.037 275.000 0.000 NA   NA
 10476628 10476629 EAM_0642 EAM_0643 thrA thrB TRUE 0.990 3.000 0.133 1.000 Y NA
 10476629 10476630 EAM_0643 EAM_0644 thrB thrC TRUE 0.994 4.000 0.233 1.000 Y NA
 10476632 10476633 EAM_0646 EAM_0647 talB mog FALSE 0.016 195.000 0.042 1.000 N NA
 10476635 10476636 EAM_0649 EAM_0650 dnaK dnaJ TRUE 0.912 108.000 0.236 0.003 Y NA
 10476636 10476637 EAM_0650 EAM_0651 dnaJ   TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 10476637 10476638 EAM_0651 EAM_0652   nhaA FALSE 0.216 88.000 0.000 NA   NA
 10476640 10476641 EAM_0654 EAM_0655 ribF ileS TRUE 0.795 37.000 0.254 1.000 N NA
 10476641 10476642 EAM_0655 EAM_0656 ileS lspA TRUE 0.715 0.000 0.045 1.000 N NA
 10476642 10476643 EAM_0656 EAM_0657 lspA fkpB TRUE 0.944 4.000 0.154 1.000 N NA
 10476643 10476644 EAM_0657 EAM_0658 fkpB ispH TRUE 0.988 -19.000 0.626 1.000 N NA
 10476644 10476645 EAM_0658 EAM_0659 ispH dapB FALSE 0.002 261.000 0.009 1.000 N NA
 10476645 10476646 EAM_0659 EAM_0660 dapB carA FALSE 0.042 470.000 0.034 1.000 Y NA
 10476646 10476647 EAM_0660 EAM_0661 carA carB TRUE 0.996 15.000 0.345 0.001 Y NA
 10476650 10476651 EAM_0664 EAM_0665 apaH apaG TRUE 0.943 14.000 0.267 NA N NA
 10476651 10476652 EAM_0665 EAM_0666 apaG ksgA TRUE 0.851 -3.000 0.078 NA N NA
 10476652 10476653 EAM_0666 EAM_0667 ksgA pdxA TRUE 0.955 -7.000 0.197 1.000 N NA
 10476653 10476654 EAM_0667 EAM_0668 pdxA surA TRUE 0.873 -10.000 0.000 1.000   NA
 10476654 10476655 EAM_0668 EAM_0669 surA imp FALSE 0.326 54.000 0.000 1.000   NA
 10476657 10476658 EAM_0671 EAM_0672 rluA rapA TRUE 0.791 42.000 0.294 1.000 N NA
 10476658 10476659 EAM_0672 EAM_0673 rapA polB TRUE 0.652 171.000 0.098 0.054 Y NA
 10476661 10476662 EAM_0675 EAM_0676 thiQ thiP TRUE 0.992 -16.000 0.522 0.019 N NA
 10476662 10476663 EAM_0676 EAM_0677 thiP tbpA TRUE 0.993 -24.000 0.697 0.068 N NA
 10476663 10476664 EAM_0677 EAM_0678 tbpA   FALSE 0.076 293.000 0.000 0.068   NA
 10476666 10476667 EAM_0680 EAM_0681 leuD leuC TRUE 0.997 10.000 0.309 0.001 Y NA
 10476667 10476668 EAM_0681 EAM_0682 leuC leuB TRUE 0.998 5.000 0.275 0.002 Y NA
 10476668 10476669 EAM_0682 EAM_0683 leuB leuA TRUE 0.996 2.000 0.126 0.002 Y NA
 10476669 10476670 EAM_0683 EAM_0684 leuA leuL TRUE 0.462 94.000 0.010 0.002   NA
 10476671 10476672 EAM_0685 EAM_0686 ilvI ilvH TRUE 0.999 3.000 0.371 0.002 Y NA
 10476672 10476673 EAM_0686 EAM_0687 ilvH fruR FALSE 0.059 163.000 0.063 1.000 N NA
 10476673 10476674 EAM_0687 EAM_0688 fruR   FALSE 0.083 203.000 0.000 NA   NA
 10476674 10476675 EAM_0688 EAM_0689   mraZ FALSE 0.215 87.000 0.000 NA   NA
 10476675 10476676 EAM_0689 EAM_0690 mraZ mraW TRUE 0.996 3.000 0.635 NA   NA
 10476676 10476677 EAM_0690 EAM_0691 mraW ftsL TRUE 0.979 0.000 0.227 1.000 N NA
 10476677 10476678 EAM_0691 EAM_0692 ftsL ftsI TRUE 0.788 16.000 0.124 1.000 N NA
 10476678 10476679 EAM_0692 EAM_0693 ftsI murE TRUE 0.970 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 10476679 10476680 EAM_0693 EAM_0694 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.003 Y NA
 10476680 10476681 EAM_0694 EAM_0695 murF mraY TRUE 0.998 -6.000 0.309 0.005 Y NA
 10476681 10476682 EAM_0695 EAM_0696 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.005 Y NA
 10476682 10476683 EAM_0696 EAM_0697 murD ftsW TRUE 0.994 0.000 0.297 0.004 N NA
 10476683 10476684 EAM_0697 EAM_0698 ftsW murG TRUE 0.994 4.000 0.647 1.000 N NA
 10476684 10476685 EAM_0698 EAM_0699 murG murC TRUE 0.876 73.000 0.283 1.000 Y NA
 10476685 10476686 EAM_0699 EAM_0700 murC ddlB TRUE 0.994 -7.000 0.153 0.005 Y NA
 10476686 10476687 EAM_0700 EAM_0701 ddlB ftsQ TRUE 0.997 2.000 0.372 NA Y NA
 10476687 10476688 EAM_0701 EAM_0702 ftsQ ftsA TRUE 0.990 -3.000 0.389 NA N NA
 10476688 10476689 EAM_0702 EAM_0703 ftsA ftsZ TRUE 0.935 73.000 0.460 1.000 Y NA
 10476689 10476690 EAM_0703 EAM_0704 ftsZ lpxC FALSE 0.275 102.000 0.134 1.000 N NA
 10476692 10476693 EAM_0706 EAM_0707 secM secA FALSE 0.300 72.000 0.065 1.000   NA
 10476693 10476694 EAM_0707 EAM_0708 secA   FALSE 0.207 106.000 0.000 NA   NA
 10476697 10476698 EAM_0711 EAM_0712     TRUE 0.862 -10.000 0.000 NA   NA
 10476698 10476699 EAM_0712 EAM_0713     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10476699 10476700 EAM_0713 EAM_0714     TRUE 0.999 6.000 0.537 0.076 Y NA
 10476700 10476701 EAM_0714 EAM_0715     TRUE 0.998 0.000 0.461 1.000 Y NA
 10476701 10476702 EAM_0715 EAM_0716     TRUE 0.998 0.000 0.569 0.004   NA
 10476702 10476703 EAM_0716 EAM_0717     TRUE 0.998 -3.000 0.605 0.004   NA
 10476703 10476704 EAM_0717 EAM_0718     TRUE 0.997 0.000 0.425 0.004   NA
 10476704 10476705 EAM_0718 EAM_0719     TRUE 0.999 7.000 0.599 0.004 Y NA
 10476705 10476706 EAM_0719 EAM_0720     TRUE 0.999 2.000 0.653 0.004 Y NA
 10476706 10476707 EAM_0720 EAM_0721     TRUE 1.000 0.000 0.776 0.004 Y NA
 10476707 10476708 EAM_0721 EAM_0722     TRUE 0.967 29.000 0.575 NA   NA
 10476708 10476709 EAM_0722 EAM_0723     FALSE 0.131 81.000 0.014 NA   NA
 10476711 10476712 EAM_0725 EAM_0726     TRUE 0.984 11.000 0.356 NA   NA
 10476712 10476713 EAM_0726 EAM_0727   coaE TRUE 0.945 5.000 0.110 NA   NA
 10476715 10476716 EAM_0729 EAM_0730 hofC hofB TRUE 0.998 -7.000 0.571 1.000 Y NA
 10476716 10476717 EAM_0730 EAM_0731 hofB ppdD TRUE 0.999 -3.000 0.556 1.000 Y NA
 10476717 10476718 EAM_0731 EAM_0732 ppdD   FALSE 0.222 78.000 0.000 NA   NA
 10476718 10476719 EAM_0732 EAM_0733     FALSE 0.114 178.000 0.000 NA   NA
 10476720 10476721 EAM_0734 EAM_0735   ampD FALSE 0.308 53.000 0.000 NA   NA
 10476721 10476722 EAM_0735 EAM_0736 ampD ampE TRUE 0.996 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 10476723 10476724 EAM_0737 EAM_0738     FALSE 0.035 282.000 0.000 NA   NA
 10476724 10476725 EAM_0738 EAM_0739     FALSE 0.005 1201.000 0.000 NA   NA
 10476725 10476726 EAM_0739 EAM_0740     FALSE 0.233 88.000 0.000 1.000   NA
 10476726 10476727 EAM_0740 EAM_0741     FALSE 0.005 1382.000 0.000 1.000   NA
 10476727 10476728 EAM_0741 EAM_0742     FALSE 0.233 88.000 0.000 1.000   NA
 10476728 10476729 EAM_0742 EAM_0743     FALSE 0.005 1383.000 0.000 1.000   NA
 10476729 10476730 EAM_0743 EAM_0744     TRUE 0.990 -3.000 0.278 1.000   NA
 10476730 10476731 EAM_0744 EAM_0745   aroP FALSE 0.279 169.000 0.190 1.000 N NA
 10476732 10476733 EAM_0746 EAM_0747 pdhR aceE TRUE 0.483 146.000 0.276 1.000 N NA
 10476733 10476734 EAM_0747 EAM_0748 aceE aceF TRUE 0.983 15.000 0.220 1.000 Y NA
 10476734 10476735 EAM_0748 EAM_0749 aceF lpdA TRUE 0.599 293.000 0.463 1.000 Y NA
 10476735 10476736 EAM_0749 EAM_0750 lpdA   FALSE 0.055 108.000 0.000 1.000 N NA
 10476736 10476737 EAM_0750 EAM_0751     TRUE 0.464 14.000 0.000 1.000 N NA
 10476737 10476738 EAM_0751 EAM_0752     TRUE 0.983 3.000 0.000 1.000 Y NA
 10476738 10476739 EAM_0752 EAM_0753     TRUE 0.843 11.000 0.000 NA   NA
 10476741 10476742 EAM_0755 EAM_0756     TRUE 0.940 0.000 0.061 NA   NA
 10476742 10476743 EAM_0756 EAM_0757     TRUE 0.994 17.000 0.576 1.000 Y NA
 10476745 10476746 EAM_0759 EAM_0760     FALSE 0.239 78.000 0.000 1.000   NA
 10476746 10476747 EAM_0760 EAM_0761     FALSE 0.234 92.000 0.000 1.000   NA
 10476747 10476748 EAM_0761 EAM_0762   cas3 FALSE 0.027 314.000 0.000 1.000   NA
 10476748 10476749 EAM_0762 EAM_0763 cas3   TRUE 0.989 -3.000 0.263 NA   NA
 10476749 10476750 EAM_0763 EAM_0764     TRUE 0.980 -16.000 0.336 NA   NA
 10476750 10476751 EAM_0764 EAM_0765     TRUE 0.972 -3.000 0.138 NA   NA
 10476751 10476752 EAM_0765 EAM_0766     TRUE 0.974 3.000 0.171 NA   NA
 10476752 10476753 EAM_0766 EAM_0767     TRUE 0.989 -3.000 0.282 NA   NA
 10476753 10476754 EAM_0767 EAM_0768     TRUE 0.949 40.000 0.589 NA   NA
 10476754 10476755 EAM_0768 EAM_0769     TRUE 0.995 2.000 0.509 NA   NA
 11422882 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4135.000 0.000 NA   NA
 11565245 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4135.000 0.000 NA   NA
 11707637 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4135.000 0.000 NA   NA
 11422883 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4164.000 0.000 NA   NA
 11565246 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4164.000 0.000 NA   NA
 11707638 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4164.000 0.000 NA   NA
 11422884 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4196.000 0.000 NA   NA
 11565247 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4196.000 0.000 NA   NA
 11707639 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4196.000 0.000 NA   NA
 11422885 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4225.000 0.000 NA   NA
 11565248 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4225.000 0.000 NA   NA
 11707640 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4225.000 0.000 NA   NA
 11422886 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4257.000 0.000 NA   NA
 11565249 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4257.000 0.000 NA   NA
 11707641 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4257.000 0.000 NA   NA
 11422887 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4286.000 0.000 NA   NA
 11565250 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4286.000 0.000 NA   NA
 11707642 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4286.000 0.000 NA   NA
 11422888 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4318.000 0.000 NA   NA
 11565251 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4318.000 0.000 NA   NA
 11707643 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4318.000 0.000 NA   NA
 11422889 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4347.000 0.000 NA   NA
 11565252 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4347.000 0.000 NA   NA
 11707644 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4347.000 0.000 NA   NA
 11422890 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4379.000 0.000 NA   NA
 11565253 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4379.000 0.000 NA   NA
 11707645 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4379.000 0.000 NA   NA
 11422891 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4408.000 0.000 NA   NA
 11565254 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4408.000 0.000 NA   NA
 11707646 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4408.000 0.000 NA   NA
 11422892 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4440.000 0.000 NA   NA
 11565255 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4440.000 0.000 NA   NA
 11707647 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4440.000 0.000 NA   NA
 11422893 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4469.000 0.000 NA   NA
 11565256 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4469.000 0.000 NA   NA
 11707648 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4469.000 0.000 NA   NA
 11422894 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4501.000 0.000 NA   NA
 11565257 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4501.000 0.000 NA   NA
 11707649 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4501.000 0.000 NA   NA
 11422895 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4530.000 0.000 NA   NA
 11565258 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4530.000 0.000 NA   NA
 11707650 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4530.000 0.000 NA   NA
 11422896 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4563.000 0.000 NA   NA
 11565259 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4563.000 0.000 NA   NA
 11707651 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4563.000 0.000 NA   NA
 11422897 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4592.000 0.000 NA   NA
 11565260 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4592.000 0.000 NA   NA
 11707652 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4592.000 0.000 NA   NA
 11422898 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4624.000 0.000 NA   NA
 11565261 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4624.000 0.000 NA   NA
 11707653 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4624.000 0.000 NA   NA
 11422899 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4653.000 0.000 NA   NA
 11565262 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4653.000 0.000 NA   NA
 11707654 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4653.000 0.000 NA   NA
 11422900 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4685.000 0.000 NA   NA
 11565263 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4685.000 0.000 NA   NA
 11707655 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4685.000 0.000 NA   NA
 11422901 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4714.000 0.000 NA   NA
 11565264 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4714.000 0.000 NA   NA
 11707656 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4714.000 0.000 NA   NA
 11422902 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4746.000 0.000 NA   NA
 11565265 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4746.000 0.000 NA   NA
 11707657 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4746.000 0.000 NA   NA
 11422903 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4775.000 0.000 NA   NA
 11565266 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4775.000 0.000 NA   NA
 11707658 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4775.000 0.000 NA   NA
 11422904 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4807.000 0.000 NA   NA
 11565267 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4807.000 0.000 NA   NA
 11707659 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4807.000 0.000 NA   NA
 11422905 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4836.000 0.000 NA   NA
 11565268 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4836.000 0.000 NA   NA
 11707660 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4836.000 0.000 NA   NA
 11422906 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4868.000 0.000 NA   NA
 11565269 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4868.000 0.000 NA   NA
 11707661 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4868.000 0.000 NA   NA
 11422907 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4897.000 0.000 NA   NA
 11565270 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4897.000 0.000 NA   NA
 11707662 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4897.000 0.000 NA   NA
 11422908 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4929.000 0.000 NA   NA
 11565271 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4929.000 0.000 NA   NA
 11707663 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4929.000 0.000 NA   NA
 11422909 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4958.000 0.000 NA   NA
 11565272 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4958.000 0.000 NA   NA
 11707664 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4958.000 0.000 NA   NA
 11422910 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4990.000 0.000 NA   NA
 11565273 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4990.000 0.000 NA   NA
 11707665 10476749   EAM_0763     FALSE NA 4990.000 0.000 NA   NA
 11422911 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5019.000 0.000 NA   NA
 11565274 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5019.000 0.000 NA   NA
 11707666 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5019.000 0.000 NA   NA
 11422912 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5051.000 0.000 NA   NA
 11565275 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5051.000 0.000 NA   NA
 11707667 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5051.000 0.000 NA   NA
 11422913 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5080.000 0.000 NA   NA
 11565276 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5080.000 0.000 NA   NA
 11707668 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5080.000 0.000 NA   NA
 11422914 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5112.000 0.000 NA   NA
 11565277 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5112.000 0.000 NA   NA
 11707669 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5112.000 0.000 NA   NA
 11422915 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5141.000 0.000 NA   NA
 11565278 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5141.000 0.000 NA   NA
 11707670 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5141.000 0.000 NA   NA
 11422916 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5173.000 0.000 NA   NA
 11565279 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5173.000 0.000 NA   NA
 11707671 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5173.000 0.000 NA   NA
 11422917 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5202.000 0.000 NA   NA
 11565280 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5202.000 0.000 NA   NA
 11707672 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5202.000 0.000 NA   NA
 11422918 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5235.000 0.000 NA   NA
 11565281 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5235.000 0.000 NA   NA
 11707673 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5235.000 0.000 NA   NA
 11422919 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5264.000 0.000 NA   NA
 11565282 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5264.000 0.000 NA   NA
 11707674 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5264.000 0.000 NA   NA
 11422920 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5296.000 0.000 NA   NA
 11565283 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5296.000 0.000 NA   NA
 11707675 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5296.000 0.000 NA   NA
 11422921 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5325.000 0.000 NA   NA
 11565284 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5325.000 0.000 NA   NA
 11707676 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5325.000 0.000 NA   NA
 11422922 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5357.000 0.000 NA   NA
 11565285 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5357.000 0.000 NA   NA
 11707677 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5357.000 0.000 NA   NA
 11422923 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5386.000 0.000 NA   NA
 11565286 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5386.000 0.000 NA   NA
 11707678 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5386.000 0.000 NA   NA
 11422924 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5418.000 0.000 NA   NA
 11565287 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5418.000 0.000 NA   NA
 11707679 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5418.000 0.000 NA   NA
 11422925 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5447.000 0.000 NA   NA
 11565288 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5447.000 0.000 NA   NA
 11707680 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5447.000 0.000 NA   NA
 11422926 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5479.000 0.000 NA   NA
 11565289 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5479.000 0.000 NA   NA
 11707681 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5479.000 0.000 NA   NA
 11422927 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5508.000 0.000 NA   NA
 11565290 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5508.000 0.000 NA   NA
 11707682 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5508.000 0.000 NA   NA
 11422928 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5540.000 0.000 NA   NA
 11565291 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5540.000 0.000 NA   NA
 11707683 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5540.000 0.000 NA   NA
 11422929 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5569.000 0.000 NA   NA
 11565292 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5569.000 0.000 NA   NA
 11707684 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5569.000 0.000 NA   NA
 11422930 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5602.000 0.000 NA   NA
 11565293 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5602.000 0.000 NA   NA
 11707685 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5602.000 0.000 NA   NA
 11422931 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5631.000 0.000 NA   NA
 11565294 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5631.000 0.000 NA   NA
 11707686 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5631.000 0.000 NA   NA
 11422932 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5663.000 0.000 NA   NA
 11565295 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5663.000 0.000 NA   NA
 11707687 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5663.000 0.000 NA   NA
 11422933 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5692.000 0.000 NA   NA
 11565296 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5692.000 0.000 NA   NA
 11707688 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5692.000 0.000 NA   NA
 11422934 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5724.000 0.000 NA   NA
 11565297 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5724.000 0.000 NA   NA
 11707689 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5724.000 0.000 NA   NA
 11422935 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5753.000 0.000 NA   NA
 11565298 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5753.000 0.000 NA   NA
 11707690 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5753.000 0.000 NA   NA
 11422936 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5785.000 0.000 NA   NA
 11565299 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5785.000 0.000 NA   NA
 11707691 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5785.000 0.000 NA   NA
 11422937 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5814.000 0.000 NA   NA
 11565300 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5814.000 0.000 NA   NA
 11707692 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5814.000 0.000 NA   NA
 11422938 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5846.000 0.000 NA   NA
 11565301 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5846.000 0.000 NA   NA
 11707693 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5846.000 0.000 NA   NA
 11422939 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5875.000 0.000 NA   NA
 11565302 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5875.000 0.000 NA   NA
 11707694 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5875.000 0.000 NA   NA
 11422940 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5907.000 0.000 NA   NA
 11565303 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5907.000 0.000 NA   NA
 11707695 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5907.000 0.000 NA   NA
 11422941 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5936.000 0.000 NA   NA
 11565304 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5936.000 0.000 NA   NA
 11707696 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5936.000 0.000 NA   NA
 11422942 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5968.000 0.000 NA   NA
 11565305 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5968.000 0.000 NA   NA
 11707697 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5968.000 0.000 NA   NA
 11422943 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5997.000 0.000 NA   NA
 11565306 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5997.000 0.000 NA   NA
 11707698 10476749   EAM_0763     FALSE NA 5997.000 0.000 NA   NA
 11422944 10476749   EAM_0763     FALSE NA 6029.000 0.000 NA   NA
 11565307 10476749   EAM_0763     FALSE NA 6029.000 0.000 NA   NA
 11707699 10476749   EAM_0763     FALSE NA 6029.000 0.000 NA   NA
 11422945 10476749   EAM_0763     FALSE NA 6058.000 0.000 NA   NA
 11565308 10476749   EAM_0763     FALSE NA 6058.000 0.000 NA   NA
 11707700 10476749   EAM_0763     FALSE NA 6058.000 0.000 NA   NA
 11422946 10476749   EAM_0763     FALSE NA 6090.000 0.000 NA   NA
 11565309 10476749   EAM_0763     FALSE NA 6090.000 0.000 NA   NA
 11707701 10476749   EAM_0763     FALSE NA 6090.000 0.000 NA   NA
 10476756 10476757 EAM_0770 EAM_0771     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10476758 10476759 EAM_0772 EAM_0773 acnB   FALSE 0.154 172.000 0.068 NA   NA
 10476760 10476761 EAM_0774 EAM_0775 speD speE TRUE 0.959 22.000 0.162 1.000 Y NA
 10476761 10476762 EAM_0775 EAM_0776 speE   TRUE 0.748 101.000 0.354 NA   NA
 10476765 10476766 EAM_0779 EAM_0780   rcsV FALSE 0.051 242.000 0.000 NA   NA
 10476766 10476767 EAM_0780 EAM_0781 rcsV   FALSE 0.258 64.000 0.000 NA   NA
 10476771 10476772 EAM_0785 EAM_0786     TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.089 Y NA
 10476773 10476774 EAM_0787 EAM_0788 panD panC TRUE 0.914 64.000 0.342 1.000 Y NA
 10476774 10476775 EAM_0788 EAM_0789 panC panB TRUE 0.996 16.000 0.395 0.001 Y NA
 10476775 10476776 EAM_0789 EAM_0790 panB folK TRUE 0.714 78.000 0.117 1.000 Y NA
 10476776 10476777 EAM_0790 EAM_0791 folK pcnB TRUE 0.980 -3.000 0.234 1.000 N NA
 10476777 10476778 EAM_0791 EAM_0792 pcnB gluQ FALSE 0.412 110.000 0.131 1.000   NA
 10476778 10476779 EAM_0792 EAM_0793 gluQ dksA TRUE 0.666 71.000 0.231 1.000   NA
 10476779 10476780 EAM_0793 EAM_0794 dksA sfsA FALSE 0.081 304.000 0.151 NA   NA
 10476780 10476781 EAM_0794 EAM_0795 sfsA ligT TRUE 0.851 10.000 0.045 NA   NA
 10476782 10476783 EAM_0796 EAM_0797 hrpB mrcB FALSE 0.307 127.000 0.158 1.000 N NA
 10476783 10476784 EAM_0797 EAM_0798 mrcB   FALSE 0.159 148.000 0.000 NA   NA
 10476784 10476785 EAM_0798 EAM_0799     TRUE 0.926 13.000 0.143 NA   NA
 10476785 10476786 EAM_0799 EAM_0800     TRUE 0.917 2.000 0.000 NA   NA
 10476788 10476789 EAM_0802 EAM_0803 relB relE TRUE 0.995 -10.000 0.875 NA N NA
 10476789 10476790 EAM_0803 EAM_0804 relE   FALSE 0.065 224.000 0.000 NA   NA
 10476790 10476791 EAM_0804 EAM_0805   fhuA FALSE 0.128 169.000 0.000 NA   NA
 10476791 10476792 EAM_0805 EAM_0806 fhuA fhuC FALSE 0.350 49.000 0.000 NA   NA
 10476792 10476793 EAM_0806 EAM_0807 fhuC fhuD TRUE 0.950 15.000 0.000 1.000 Y NA
 10476793 10476794 EAM_0807 EAM_0808 fhuD fhuB TRUE 0.986 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10476797 10476798 EAM_0811 EAM_0812   mtnN FALSE 0.024 319.000 0.000 NA   NA
 10476799 10476800 EAM_0813 EAM_0814 dgt degP FALSE 0.138 148.000 0.101 1.000 N NA
 10476801 10476802 EAM_0815 EAM_0816   dapD FALSE 0.018 334.000 0.035 NA   NA
 10476802 10476803 EAM_0816 EAM_0817 dapD glnD FALSE 0.184 96.000 0.097 1.000 N NA
 10476803 10476804 EAM_0817 EAM_0818 glnD map TRUE 0.531 94.000 0.243 1.000 N NA
 10476805 10476806 EAM_0819 EAM_0820 rpsB tsf TRUE 0.900 202.000 0.748 1.000 Y NA
 10476806 10476807 EAM_0820 EAM_0821 tsf pyrH TRUE 0.620 156.000 0.416 1.000 N NA
 10476807 10476808 EAM_0821 EAM_0822 pyrH frr TRUE 0.815 123.000 0.626 1.000 N NA
 10476808 10476809 EAM_0822 EAM_0823 frr dxr FALSE 0.010 151.000 0.032 1.000 N NA
 10476809 10476810 EAM_0823 EAM_0824 dxr uppS FALSE 0.403 171.000 0.025 1.000 Y NA
 10476810 10476811 EAM_0824 EAM_0825 uppS cdsA TRUE 0.989 19.000 0.400 1.000 Y NA
 10476811 10476812 EAM_0825 EAM_0826 cdsA ecfE TRUE 0.769 10.000 0.080 1.000 N NA
 10476812 10476813 EAM_0826 EAM_0827 ecfE yaeT TRUE 0.869 55.000 0.204 1.000 Y NA
 10476813 10476814 EAM_0827 EAM_0828 yaeT skp TRUE 0.886 124.000 0.354 1.000 Y NA
 10476814 10476815 EAM_0828 EAM_0829 skp lpxD TRUE 0.999 4.000 0.814 1.000 Y NA
 10476815 10476816 EAM_0829 EAM_0830 lpxD fabZ TRUE 0.819 160.000 0.796 1.000 N NA
 10476816 10476817 EAM_0830 EAM_0831 fabZ lpxA TRUE 0.997 4.000 0.850 1.000 N NA
 10476817 10476818 EAM_0831 EAM_0832 lpxA lpxB TRUE 0.995 4.000 0.289 1.000 Y NA
 10476818 10476819 EAM_0832 EAM_0833 lpxB rnhB TRUE 0.969 -3.000 0.186 1.000 N NA
 10476819 10476820 EAM_0833 EAM_0834 rnhB dnaE TRUE 0.948 19.000 0.104 1.000 Y NA
 10476820 10476821 EAM_0834 EAM_0835 dnaE accA TRUE 0.836 13.000 0.122 1.000 N NA
 10476821 10476822 EAM_0835 EAM_0836 accA ldcC FALSE 0.005 186.000 0.003 1.000 N NA
 10476822 10476823 EAM_0836 EAM_0837 ldcC   TRUE 0.846 29.000 0.010 1.000 Y NA
 10476823 10476824 EAM_0837 EAM_0838   tilS FALSE 0.016 56.000 0.015 1.000 N NA
 10476824 10476825 EAM_0838 EAM_0839 tilS   TRUE 0.679 22.000 0.000 1.000   NA
 10476827 10476828 EAM_0841 EAM_0842     TRUE 0.917 -3.000 0.034 1.000   NA
 10476829 10476830 EAM_0843 EAM_0844   proS FALSE 0.015 383.000 0.000 NA   NA
 10476830 10476831 EAM_0844 EAM_0845 proS   FALSE 0.216 93.000 0.048 NA   NA
 10476831 10476832 EAM_0845 EAM_0846   rcsF TRUE 0.988 -3.000 0.247 NA   NA
 10476832 10476833 EAM_0846 EAM_0847 rcsF metQ TRUE 0.801 135.000 0.500 NA   NA
 10476833 10476834 EAM_0847 EAM_0848 metQ metI TRUE 0.982 38.000 0.411 0.043 Y NA
 10476834 10476835 EAM_0848 EAM_0849 metI metN TRUE 0.998 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 10476836 10476837 EAM_0850 EAM_r013 gmhB 16S_rRNA FALSE 0.012 409.000 0.000 NA   NA
 10476837 10476838 EAM_r013 EAM_t026 16S_rRNA tRNA-Ile FALSE 0.277 59.000 0.000 NA   NA
 10476838 10476839 EAM_t026 EAM_t027 tRNA-Ile tRNA-Ala FALSE 0.147 156.000 0.000 NA   NA
 10476839 10476840 EAM_t027 EAM_r014 tRNA-Ala 23S_rRNA FALSE 0.014 390.000 0.000 NA   NA
 10476840 10476841 EAM_r014 EAM_r015 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.089 197.000 0.000 NA   NA
 10476841 10476842 EAM_r015 EAM_t028 5S_rRNA tRNA-Asp FALSE 0.217 95.000 0.000 NA   NA
 10476842 10476843 EAM_t028 EAM_0851 tRNA-Asp   FALSE 0.108 182.000 0.000 NA   NA
 10476843 10476844 EAM_0851 EAM_0852     TRUE 0.922 1.000 0.000 NA   NA
 10476845 10476846 EAM_0853 EAM_0854 mltD gloB TRUE 0.665 72.000 0.233 1.000   NA
 10476849 10476850 EAM_0857 EAM_t029 dnaQ tRNA-Asp FALSE 0.201 114.000 0.000 NA   NA
 10476852 10476853 EAM_0859 EAM_0860   hyuE TRUE 0.976 0.000 0.220 NA N NA
 10476853 10476854 EAM_0860 EAM_0861 hyuE   TRUE 0.496 44.000 0.143 NA N NA
 10476855 10476856 EAM_0862 EAM_0863     TRUE 0.979 12.000 0.000 0.046 Y NA
 10476858 10476859 EAM_0865 EAM_0866     TRUE 0.983 -3.000 0.203 NA   NA
 10476859 10476860 EAM_0866 EAM_0867     TRUE 0.967 -3.000 0.122 NA   NA
 10476860 10476861 EAM_0867 EAM_0868     TRUE 0.908 13.000 0.121 NA   NA
 10476861 10476862 EAM_0868 EAM_0869     FALSE 0.176 137.000 0.000 NA   NA
 10476862 10476863 EAM_0869 EAM_0870     FALSE 0.072 215.000 0.000 NA   NA
 10476864 10476865 EAM_0871 EAM_0872     FALSE 0.011 251.000 0.000 1.000 N NA
 10476865 10476866 EAM_0872 EAM_0873     TRUE 0.999 12.000 0.765 0.043 Y NA
 10476866 10476867 EAM_0873 EAM_0874     TRUE 0.999 0.000 0.433 0.016 Y NA
 10476867 10476868 EAM_0874 EAM_0875     TRUE 0.996 -19.000 0.532 1.000 Y NA
 10476868 10476869 EAM_0875 EAM_0876     TRUE 0.861 33.000 0.054 1.000 Y NA
 10476869 10476870 EAM_0876 EAM_0877     TRUE 0.991 0.000 0.108 1.000 Y NA
 10476870 10476871 EAM_0877 EAM_0878     TRUE 0.961 -3.000 0.107 NA   NA
 10476871 10476872 EAM_0878 EAM_0879     TRUE 0.984 -3.000 0.208 NA   NA
 10476872 10476873 EAM_0879 EAM_0880     TRUE 0.739 33.000 0.000 0.058   NA
 10476874 10476875 EAM_0881 EAM_0882     TRUE 0.872 -12.000 0.055 1.000   NA
 10476876 10476877 EAM_0883 EAM_0884     TRUE 0.828 12.000 0.000 NA   NA
 10476877 10476878 EAM_0884 EAM_0885     FALSE 0.253 66.000 0.000 NA   NA
 10476878 10476879 EAM_0885 EAM_0886   MasA TRUE 0.965 -3.000 0.174 1.000 N NA
 10476879 10476880 EAM_0886 EAM_0887 MasA   TRUE 0.987 -3.000 0.231 1.000   NA
 10476884 10476885 EAM_0891 EAM_0892 lpcA   FALSE 0.266 235.000 0.229 1.000   NA
 10476889 10476890 EAM_0896 EAM_0897 gpt yafA FALSE 0.178 117.000 0.040 NA   NA
 10476890 10476891 EAM_0897 EAM_0898 yafA crl FALSE 0.281 57.000 0.048 NA   NA
 10476892 10476893 EAM_0899 EAM_0900     FALSE 0.199 117.000 0.000 NA   NA
 10476893 10476894 EAM_0900 EAM_0901   ompN FALSE 0.027 306.000 0.000 NA   NA
 10476895 10476896 EAM_0902 EAM_0903 proB proA TRUE 0.987 10.000 0.026 0.001 Y NA
 10476899 10476900 EAM_0906 EAM_0907     TRUE 0.991 2.000 0.333 NA   NA
 10476903 10476904 EAM_0910 EAM_0911     FALSE 0.226 76.000 0.000 NA   NA
 10476905 10476906 EAM_0912 EAM_0913     FALSE 0.191 126.000 0.000 NA   NA
 10476906 10476907 EAM_0913 EAM_0914     TRUE 0.596 26.000 0.000 NA   NA
 10476909 10476910 EAM_0916 EAM_0917     TRUE 0.996 -7.000 0.235 0.017 Y NA
 10476910 10476911 EAM_0917 EAM_0918     TRUE 0.982 -10.000 0.118 1.000 Y NA
 10476911 10476912 EAM_0918 EAM_0919     TRUE 0.999 -3.000 0.441 0.043 Y NA
 10476912 10476913 EAM_0919 EAM_0920     TRUE 0.998 0.000 0.267 0.043 Y NA
 10476913 10476914 EAM_0920 EAM_0921     FALSE 0.168 143.000 0.000 NA   NA
 10476917 10476918 EAM_0924 EAM_0925   cspA FALSE 0.092 195.000 0.000 NA   NA
 10476920 10476921 EAM_0927 EAM_0928     FALSE 0.120 174.000 0.000 NA   NA
 10476925 10476926 EAM_0932 EAM_0933 aroL   FALSE 0.156 145.000 0.044 NA   NA
 10476926 10476927 EAM_0933 EAM_0934     FALSE 0.030 296.000 0.000 NA   NA
 10476927 10476928 EAM_0934 EAM_0935     FALSE 0.158 193.000 0.095 NA   NA
 10476928 10476929 EAM_0935 EAM_0936     TRUE 0.902 20.000 0.190 NA   NA
 10476929 10476930 EAM_0936 EAM_0937     TRUE 0.913 5.000 0.065 NA   NA
 10476930 10476931 EAM_0937 EAM_0938     FALSE 0.216 81.000 0.049 NA   NA
 10476932 10476933 EAM_0939 EAM_0940 rdgC   FALSE 0.031 172.000 0.000 1.000 N NA
 10476934 10476935 EAM_0941 EAM_0942     FALSE 0.165 155.000 0.057 NA   NA
 10476937 10476938 EAM_0944 EAM_0945     TRUE 0.986 17.000 0.625 NA   NA
 10476938 10476939 EAM_0945 EAM_0946     TRUE 0.998 0.000 0.740 NA   NA
 10476940 10476941 EAM_0947 EAM_0948 sbcC sbcD TRUE 1.000 -3.000 0.669 0.001 Y NA
 10476942 10476943 EAM_0949 EAM_0950 phoB phoR TRUE 0.992 23.000 0.453 0.062 Y NA
 10476943 10476944 EAM_0950 EAM_0951 phoR   TRUE 0.825 19.000 0.168 1.000 N NA
 10476944 10476945 EAM_0951 EAM_0952     FALSE 0.009 270.000 0.000 1.000 N NA
 10476945 10476946 EAM_0952 EAM_0953   brnQ FALSE 0.042 504.000 0.000 1.000 Y NA
 10476946 10476947 EAM_0953 EAM_0954 brnQ proY TRUE 0.828 57.000 0.087 0.064 Y NA
 10476948 10476949 EAM_0955 EAM_0956     FALSE 0.065 190.000 0.014 1.000   NA
 10476951 10476952 EAM_0958 EAM_0959     TRUE 0.862 -10.000 0.000 NA   NA
 10476952 10476953 EAM_0959 EAM_0960   gtrA TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10476954 10476955 EAM_0961 EAM_0962 tgt   TRUE 0.935 18.000 0.325 NA N NA
 10476955 10476956 EAM_0962 EAM_0963   secD TRUE 0.875 28.000 0.045 NA Y NA
 10476956 10476957 EAM_0963 EAM_0964 secD secF TRUE 0.995 11.000 0.206 0.001 Y NA
 10476958 10476959 EAM_0965 EAM_0966     TRUE 0.628 24.000 0.000 NA   NA
 10476960 10476961 EAM_0967 EAM_0968   ribD TRUE 0.975 5.000 0.277 NA N NA
 10476961 10476962 EAM_0968 EAM_0969 ribD ribH TRUE 0.772 88.000 0.034 0.002 Y NA
 10476962 10476963 EAM_0969 EAM_0970 ribH nusB TRUE 0.956 16.000 0.347 1.000 N NA
 10476963 10476964 EAM_0970 EAM_0971 nusB thiL TRUE 0.634 51.000 0.225 1.000 N NA
 10476964 10476965 EAM_0971 EAM_0972 thiL pgpA TRUE 0.961 5.000 0.206 1.000 N NA
 10476966 10476967 EAM_0973 EAM_0974 dxs ispA TRUE 0.932 19.000 0.060 1.000 Y NA
 10476967 10476968 EAM_0974 EAM_0975 ispA xseB TRUE 0.532 0.000 0.035 1.000 N NA
 10476970 10476971 EAM_0977 EAM_0978 thiJ panE TRUE 0.926 -46.000 0.155 NA   NA
 10476973 10476974 EAM_0980 EAM_0981   cyoE FALSE 0.062 131.000 0.061 NA N NA
 10476974 10476975 EAM_0981 EAM_0982 cyoE cyoD TRUE 0.909 14.000 0.118 0.064 N NA
 10476975 10476976 EAM_0982 EAM_0983 cyoD cyoC TRUE 0.999 0.000 0.485 0.030 Y NA
 10476976 10476977 EAM_0983 EAM_0984 cyoC cyoB TRUE 0.999 -10.000 0.697 0.030 Y NA
 10476977 10476978 EAM_0984 EAM_0985 cyoB cyoA TRUE 0.990 5.000 0.041 0.003 Y NA
 10476978 10476979 EAM_0985 EAM_0986 cyoA ampG FALSE 0.007 524.000 0.000 NA   NA
 10476979 10476980 EAM_0986 EAM_0987 ampG   TRUE 0.808 45.000 0.256 NA   NA
 10476981 10476982 EAM_0988 EAM_0989 bolA tig FALSE 0.003 348.000 0.000 NA N NA
 10476982 10476983 EAM_0989 EAM_0990 tig clpP1 FALSE 0.411 336.000 0.351 1.000 Y NA
 10476983 10476984 EAM_0990 EAM_0991 clpP1 clpX1 TRUE 0.899 97.000 0.352 1.000 Y NA
 10476986 10476987 EAM_0993 EAM_0994 clpX2 lon TRUE 0.729 188.000 0.201 0.087 Y NA
 10476987 10476988 EAM_0994 EAM_0995 lon hupB FALSE 0.003 209.000 0.008 1.000 N NA
 10476988 10476989 EAM_0995 EAM_0996 hupB ppiD FALSE 0.016 222.000 0.000 1.000 N NA
 10476989 10476990 EAM_0996 EAM_0997 ppiD   FALSE 0.151 141.000 0.033 1.000   NA
 10476990 10476991 EAM_0997 EAM_0998     FALSE 0.171 105.000 0.027 1.000   NA
 10476992 10476993 EAM_0999 EAM_1000   pagO FALSE 0.233 82.000 0.000 1.000   NA
 10476994 10476995 EAM_1001 EAM_1002   mdlA TRUE 0.578 46.000 0.179 1.000 N NA
 10476995 10476996 EAM_1002 EAM_1003 mdlA mdlB TRUE 1.000 -7.000 0.911 0.001 Y NA
 10476996 10476997 EAM_1003 EAM_1004 mdlB glnK FALSE 0.001 278.000 0.028 1.000 N NA
 10476997 10476998 EAM_1004 EAM_1005 glnK amtB TRUE 0.824 18.000 0.156 1.000 N NA
 10477001 10477002 EAM_1008 EAM_1009   hha FALSE 0.071 216.000 0.000 NA   NA
 10477002 10477003 EAM_1009 EAM_1010 hha   TRUE 0.756 20.000 0.080 NA   NA
 10477003 10477004 EAM_1010 EAM_1011     TRUE 0.712 147.000 0.400 NA   NA
 10477004 10477005 EAM_1011 EAM_1012     FALSE 0.021 341.000 0.000 NA   NA
 10477005 10477006 EAM_1012 EAM_1013     TRUE 0.903 4.000 0.000 NA   NA
 10477006 10477007 EAM_1013 EAM_1014   rpmJ2 TRUE 0.910 3.000 0.000 NA   NA
 10477007 10477008 EAM_1014 EAM_1015 rpmJ2 rpmE2 TRUE 0.959 -12.000 0.083 0.013   NA
 10477008 10477009 EAM_1015 EAM_1016 rpmE2 acrB FALSE 0.041 148.000 0.000 1.000 N NA
 10477009 10477010 EAM_1016 EAM_1017 acrB acrA TRUE 0.968 17.000 0.458 1.000 N NA
 10477012 10477013 EAM_1019 EAM_1020     TRUE 0.454 39.000 0.000 NA   NA
 10477013 10477014 EAM_1020 EAM_1021   priC FALSE 0.125 171.000 0.000 NA   NA
 10477015 10477016 EAM_1022 EAM_1023   apt FALSE 0.130 161.000 0.043 NA   NA
 10477016 10477017 EAM_1023 EAM_1024 apt dnaX FALSE 0.043 227.000 0.088 1.000 N NA
 10477017 10477018 EAM_1024 EAM_1025 dnaX   TRUE 0.849 56.000 0.411 NA   NA
 10477018 10477019 EAM_1025 EAM_1026   recR TRUE 0.997 0.000 0.604 NA   NA
 10477019 10477020 EAM_1026 EAM_1027 recR htpG FALSE 0.011 100.000 0.028 1.000 N NA
 10477022 10477023 EAM_1029 EAM_1030     FALSE 0.308 53.000 0.000 NA   NA
 10477023 10477024 EAM_1030 EAM_1031     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 10477024 10477025 EAM_1031 EAM_1032     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10477025 10477026 EAM_1032 EAM_1033   adk FALSE 0.234 94.000 0.000 1.000   NA
 10477026 10477027 EAM_1033 EAM_1034 adk hemH FALSE 0.010 118.000 0.013 1.000 N NA
 10477027 10477028 EAM_1034 EAM_1035 hemH gsk FALSE 0.011 98.000 0.005 1.000 N NA
 10477028 10477029 EAM_1035 EAM_1036 gsk   FALSE 0.062 227.000 0.000 NA   NA
 10477030 10477031 EAM_1037 EAM_1038   fsr FALSE 0.152 288.000 0.000 NA Y NA
 10477035 10477036 EAM_1042 EAM_1043     FALSE 0.073 178.000 0.022 NA   NA
 10477036 10477037 EAM_1043 EAM_1044   copA FALSE 0.139 81.000 0.018 NA   NA
 10477039 10477040 EAM_1046 EAM_1047     TRUE 0.997 0.000 0.313 NA Y NA
 10477040 10477041 EAM_1047 EAM_1048     TRUE 0.599 133.000 0.075 1.000 Y NA
 10477041 10477042 EAM_1048 EAM_1049     TRUE 0.436 70.000 0.118 1.000   NA
 10477042 10477043 EAM_1049 EAM_1050     FALSE 0.016 373.000 0.000 NA   NA
 10477045 10477046 EAM_1052 EAM_1053     FALSE 0.009 453.000 0.000 NA   NA
 10477048 10477049 EAM_1055 EAM_1056   tesA FALSE 0.141 160.000 0.000 NA   NA
 10477050 10477051 EAM_1057 EAM_1058     TRUE 0.999 -3.000 0.535 1.000 Y NA
 10477052 10477053 EAM_1059 EAM_1060 purK purE TRUE 0.997 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 10477053 10477054 EAM_1060 EAM_1061 purE lpxH FALSE 0.108 148.000 0.016 1.000   NA
 10477054 10477055 EAM_1061 EAM_1062 lpxH ppiB TRUE 0.988 0.000 0.237 1.000   NA
 10477057 10477058 EAM_1064 EAM_1065 adhP   FALSE 0.100 195.000 0.000 1.000   NA
 10477058 10477059 EAM_1065 EAM_1066   folD TRUE 0.940 0.000 0.055 1.000   NA
 10477062 10477063 EAM_1068 EAM_1069     FALSE 0.197 120.000 0.000 NA   NA
 10477063 10477064 EAM_1069 EAM_1070     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10477065 10477066 EAM_1071 EAM_1072     TRUE 0.507 34.000 0.000 NA   NA
 10477068 10477069 EAM_t031 EAM_1074 tRNA-Gly   FALSE 0.398 44.000 0.000 NA   NA
 10477070 10477071 EAM_1075 EAM_1076   osmC FALSE 0.125 171.000 0.000 NA   NA
 10477071 10477072 EAM_1076 EAM_1077 osmC   FALSE 0.125 171.000 0.000 NA   NA
 10477072 10477073 EAM_1077 EAM_1078     TRUE 0.792 14.000 0.000 NA   NA
 10477073 10477074 EAM_1078 EAM_1079     FALSE 0.281 58.000 0.000 NA   NA
 10477074 10477075 EAM_1079 EAM_1080     FALSE 0.184 132.000 0.000 NA   NA
 10477075 10477076 EAM_1080 EAM_1081   ophA TRUE 0.680 55.000 0.033 1.000 Y NA
 10477076 10477077 EAM_1081 EAM_1082 ophA ophB TRUE 0.992 7.000 0.136 0.042 Y NA
 10477077 10477078 EAM_1082 EAM_1083 ophB ophC TRUE 0.847 70.000 0.136 0.042 Y NA
 10477078 10477079 EAM_1083 EAM_1084 ophC   TRUE 0.998 3.000 1.000 1.000   NA
 10477080 10477081 EAM_1085 EAM_1086     FALSE 0.038 272.000 0.000 NA   NA
 10477082 10477083 EAM_1087 EAM_1088   gcd FALSE 0.033 167.000 0.000 1.000 N NA
 10477085 10477086 EAM_1090 EAM_1091 arnB arnC TRUE 0.996 -7.000 0.378 NA Y NA
 10477086 10477087 EAM_1091 EAM_1092 arnC arnA TRUE 0.995 -3.000 0.220 NA Y NA
 10477087 10477088 EAM_1092 EAM_1093 arnA   TRUE 0.998 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 10477088 10477089 EAM_1093 EAM_1094   arnT TRUE 0.441 11.000 0.041 1.000 N NA
 10477089 10477090 EAM_1094 EAM_1095 arnT   TRUE 0.958 -3.000 0.091 1.000   NA
 10477090 10477091 EAM_1095 EAM_1096     TRUE 0.997 0.000 0.613 NA   NA
 10477092 10477093 EAM_1097 EAM_1098     FALSE 0.096 192.000 0.000 NA   NA
 10477093 10477094 EAM_1098 EAM_1099     TRUE 0.999 2.000 0.714 0.029 Y NA
 10477095 10477096 EAM_1100 EAM_1101     FALSE 0.216 90.000 0.000 NA   NA
 10477096 10477097 EAM_1101 EAM_1102     FALSE 0.032 289.000 0.000 NA   NA
 10477098 10477099 EAM_1103 EAM_1104     FALSE 0.127 170.000 0.000 NA   NA
 10477099 10477100 EAM_1104 EAM_1105     TRUE 0.845 -13.000 0.000 NA   NA
 10477101 10477102 EAM_1106 EAM_1107     TRUE 0.993 0.000 0.355 NA   NA
 10477102 10477103 EAM_1107 EAM_1108     TRUE 0.954 -3.000 0.088 NA   NA
 10477103 10477104 EAM_1108 EAM_1109     TRUE 0.995 3.000 0.265 1.000 Y NA
 10477104 10477105 EAM_1109 EAM_1110     FALSE 0.145 157.000 0.000 NA   NA
 10477105 10477106 EAM_1110 EAM_1111     FALSE 0.174 138.000 0.000 NA   NA
 10477106 10477107 EAM_1111 EAM_1112     FALSE 0.035 281.000 0.000 NA   NA
 10477107 10477108 EAM_1112 EAM_1113     TRUE 0.574 28.000 0.000 NA   NA
 10477108 10477109 EAM_1113 EAM_1114     TRUE 0.819 -19.000 0.000 NA   NA
 10477109 10477110 EAM_1114 EAM_1115   pagP FALSE 0.166 144.000 0.000 NA   NA
 10477110 10477111 EAM_1115 EAM_1116 pagP   TRUE 0.650 151.000 0.333 1.000   NA
 10477111 10477112 EAM_1116 EAM_1117     FALSE 0.011 444.000 0.000 1.000   NA
 10477112 10477113 EAM_1117 EAM_1118   tatE TRUE 0.550 105.000 0.196 1.000   NA
 10477114 10477115 EAM_1119 EAM_1120 lipA lipB TRUE 0.858 197.000 0.319 0.001 Y NA
 10477115 10477116 EAM_1120 EAM_1121 lipB   TRUE 0.596 81.000 0.219 NA   NA
 10477116 10477117 EAM_1121 EAM_1122   dacA FALSE 0.182 167.000 0.081 NA   NA
 10477117 10477118 EAM_1122 EAM_1123 dacA rlpA TRUE 0.928 99.000 0.475 NA Y NA
 10477118 10477119 EAM_1123 EAM_1124 rlpA mrdB FALSE 0.161 12.000 0.035 NA N NA
 10477119 10477120 EAM_1124 EAM_1125 mrdB pbpA TRUE 0.594 7.000 0.046 1.000 N NA
 10477120 10477121 EAM_1125 EAM_1126 pbpA   FALSE 0.424 35.000 0.031 NA   NA
 10477121 10477122 EAM_1126 EAM_1127     TRUE 0.987 4.000 0.307 NA   NA
 10477122 10477123 EAM_1127 EAM_1128   nadD FALSE 0.162 111.000 0.032 NA   NA
 10477123 10477124 EAM_1128 EAM_1129 nadD holA TRUE 0.598 -7.000 0.045 1.000 N NA
 10477124 10477125 EAM_1129 EAM_1130 holA rlpB TRUE 0.970 -3.000 0.199 NA N NA
 10477125 10477126 EAM_1130 EAM_1131 rlpB leuS TRUE 0.967 0.000 0.182 NA N NA
 10477128 10477129 EAM_1133 EAM_1134 gltL gltK TRUE 0.998 1.000 0.379 1.000 Y NA
 10477129 10477130 EAM_1134 EAM_1135 gltK gltJ TRUE 1.000 0.000 0.933 0.015 Y NA
 10477130 10477131 EAM_1135 EAM_1136 gltJ gltI FALSE 0.236 294.000 0.000 0.042 Y NA
 10477131 10477132 EAM_1136 EAM_1137 gltI cutE FALSE 0.002 447.000 0.000 1.000 N NA
 10477132 10477133 EAM_1137 EAM_1138 cutE corC TRUE 0.990 9.000 0.557 1.000 N NA
 10477133 10477134 EAM_1138 EAM_1139 corC   FALSE 0.387 143.000 0.150 NA   NA
 10477134 10477135 EAM_1139 EAM_1140     TRUE 0.995 -3.000 0.457 NA   NA
 10477135 10477136 EAM_1140 EAM_1141   miaB FALSE 0.156 241.000 0.220 1.000 N NA
 10477138 10477139 EAM_t032 EAM_t033 tRNA-Gln tRNA-Gln FALSE 0.241 71.000 0.000 NA   NA
 10477139 10477140 EAM_t033 EAM_t034 tRNA-Gln tRNA-Met TRUE 0.843 11.000 0.000 NA   NA
 10477140 10477141 EAM_t034 EAM_t035 tRNA-Met tRNA-Gln TRUE 0.431 41.000 0.000 NA   NA
 10477141 10477142 EAM_t035 EAM_t036 tRNA-Gln tRNA-Leu TRUE 0.642 23.000 0.000 NA   NA
 10477142 10477143 EAM_t036 EAM_t037 tRNA-Leu tRNA-Met TRUE 0.792 14.000 0.000 NA   NA
 10477143 10477144 EAM_t037 EAM_1143 tRNA-Met asnB FALSE 0.068 219.000 0.000 NA   NA
 10477144 10477145 EAM_1143 EAM_1144 asnB nagD FALSE 0.009 266.000 0.000 1.000 N NA
 10477145 10477146 EAM_1144 EAM_1145 nagD nagC TRUE 0.979 5.000 0.047 1.000 Y NA
 10477146 10477147 EAM_1145 EAM_1146 nagC nagA TRUE 0.998 8.000 0.571 1.000 Y NA
 10477147 10477148 EAM_1146 EAM_1147 nagA nagB TRUE 0.974 95.000 0.557 0.001 Y NA
 10477149 10477150 EAM_1148 EAM_1149 nagE glnS FALSE 0.001 357.000 0.006 1.000 N NA
 10477150 10477151 EAM_1149 EAM_1150 glnS mtr FALSE 0.003 413.000 0.000 1.000 N NA
 10477152 10477153 EAM_1151 EAM_1152 fur fldA FALSE 0.025 394.000 0.156 1.000 N NA
 10477153 10477154 EAM_1152 EAM_1153 fldA   TRUE 0.784 141.000 0.473 1.000   NA
 10477154 10477155 EAM_1153 EAM_1154     TRUE 0.589 149.000 0.276 1.000   NA
 10477156 10477157 EAM_1155 EAM_1156 seqA pgm TRUE 0.736 25.000 0.151 1.000 N NA
 10477159 10477160 EAM_1158 EAM_1159     TRUE 0.558 137.000 0.231 NA   NA
 10477160 10477161 EAM_1159 EAM_1160   phrB TRUE 0.669 15.000 0.019 NA   NA
 10477161 10477162 EAM_1160 EAM_1161 phrB   TRUE 0.791 -13.000 0.027 NA   NA
 10477162 10477163 EAM_1161 EAM_1162     FALSE 0.195 124.000 0.050 NA   NA
 10477163 10477164 EAM_1162 EAM_1163     TRUE 0.997 -6.000 0.379 NA Y NA
 10477164 10477165 EAM_1163 EAM_1164     TRUE 0.961 -16.000 0.211 NA   NA
 10477165 10477166 EAM_1164 EAM_1165   pcp FALSE 0.179 66.000 0.017 1.000   NA
 10477166 10477167 EAM_1165 EAM_1166 pcp nei FALSE 0.146 18.000 0.033 1.000 N NA
 10477169 10477170 EAM_1168 EAM_1169 sdhC sdhD TRUE 0.999 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 10477170 10477171 EAM_1169 EAM_1170 sdhD sdhA TRUE 1.000 -3.000 0.705 0.002 Y NA
 10477171 10477172 EAM_1170 EAM_1171 sdhA sdhB TRUE 0.997 18.000 0.604 0.002 Y NA
 10477172 10477173 EAM_1171 EAM_1172 sdhB sucA FALSE 0.285 232.000 0.067 1.000 Y NA
 10477173 10477174 EAM_1172 EAM_1173 sucA sucB TRUE 0.997 14.000 0.667 1.000 Y NA
 10477174 10477175 EAM_1173 EAM_1174 sucB sucC TRUE 0.740 94.000 0.136 1.000 Y NA
 10477175 10477176 EAM_1174 EAM_1175 sucC sucD TRUE 1.000 0.000 0.806 0.001 Y NA
 10477176 10477177 EAM_1175 EAM_1176 sucD   FALSE 0.041 272.000 0.000 1.000   NA
 10477177 10477178 EAM_1176 EAM_1177   tolQ TRUE 0.997 -3.000 0.593 1.000   NA
 10477178 10477179 EAM_1177 EAM_1178 tolQ tolR TRUE 0.997 14.000 0.556 0.056 Y NA
 10477179 10477180 EAM_1178 EAM_1179 tolR tolA TRUE 0.534 30.000 0.114 NA N NA
 10477180 10477181 EAM_1179 EAM_1180 tolA tolB FALSE 0.043 110.000 0.051 NA N NA
 10477181 10477182 EAM_1180 EAM_1181 tolB pal TRUE 0.912 45.000 0.592 1.000 N NA
 10477182 10477183 EAM_1181 EAM_1182 pal   TRUE 0.915 10.000 0.088 1.000   NA
 10477183 10477184 EAM_1182 EAM_t038   tRNA-Lys FALSE 0.135 164.000 0.000 NA   NA
 10477184 10477185 EAM_t038 EAM_t039 tRNA-Lys tRNA-Lys FALSE 0.138 162.000 0.000 NA   NA
 10477185 10477186 EAM_t039 EAM_t040 tRNA-Lys tRNA-Val FALSE 0.141 160.000 0.000 NA   NA
 10477186 10477187 EAM_t040 EAM_t041 tRNA-Val tRNA-Lys TRUE 0.874 8.000 0.000 NA   NA
 10477188 10477189 EAM_1183 EAM_1184     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10477189 10477190 EAM_1184 EAM_1185   ada TRUE 0.751 16.000 0.000 NA   NA
 10477191 10477192 EAM_1186 EAM_1187 ogt nadA FALSE 0.063 180.000 0.003 1.000   NA
 10477192 10477193 EAM_1187 EAM_1188 nadA pnuC TRUE 0.796 11.000 0.023 1.000   NA
 10477194 10477195 EAM_1189 EAM_1190 zitB   FALSE 0.057 244.000 0.057 NA   NA
 10477196 10477197 EAM_1191 EAM_1192 aroG   FALSE 0.005 751.000 0.000 NA   NA
 10477197 10477198 EAM_1192 EAM_1193     FALSE 0.173 139.000 0.000 NA   NA
 10477199 10477200 EAM_1194 EAM_1195 gpmA galM TRUE 0.431 154.000 0.009 1.000 Y NA
 10477200 10477201 EAM_1195 EAM_1196 galM galK TRUE 0.994 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 10477201 10477202 EAM_1196 EAM_1197 galK galT TRUE 0.996 -3.000 0.370 0.001 N NA
 10477202 10477203 EAM_1197 EAM_1198 galT modF FALSE 0.045 264.000 0.000 1.000   NA
 10477203 10477204 EAM_1198 EAM_1199 modF modE FALSE 0.380 72.000 0.023 0.085   NA
 10477205 10477206 EAM_1200 EAM_1201     TRUE 0.585 27.000 0.000 NA   NA
 10477206 10477207 EAM_1201 EAM_1202   modA TRUE 0.874 -9.000 0.000 NA   NA
 10477207 10477208 EAM_1202 EAM_1203 modA modB TRUE 1.000 -3.000 0.627 0.001 Y NA
 10477208 10477209 EAM_1203 EAM_1204 modB modC TRUE 0.999 0.000 0.537 0.001 Y NA
 10477212 10477213 EAM_1207 EAM_1208     TRUE 0.431 41.000 0.000 NA   NA
 10477213 10477214 EAM_1208 EAM_1209   bioA FALSE 0.232 83.000 0.000 1.000   NA
 10477215 10477216 EAM_1210 EAM_1211 bioB bioF TRUE 0.997 0.000 0.168 0.002 Y NA
 10477216 10477217 EAM_1211 EAM_1212 bioF bioC TRUE 0.955 -19.000 0.133 0.002 N NA
 10477217 10477218 EAM_1212 EAM_1213 bioC bioD TRUE 0.950 -7.000 0.054 0.002 N NA
 10477219 10477220 EAM_1214 EAM_1215     FALSE 0.044 256.000 0.000 NA   NA
 10477223 10477224 EAM_1218 EAM_1219 moaA moaB TRUE 0.982 16.000 0.108 0.003 Y NA
 10477224 10477225 EAM_1219 EAM_1220 moaB moaC TRUE 0.995 2.000 0.109 0.003 Y NA
 10477225 10477226 EAM_1220 EAM_1221 moaC moaD TRUE 0.995 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 10477226 10477227 EAM_1221 EAM_1222 moaD moaE TRUE 0.999 2.000 0.501 0.003 Y NA
 10477227 10477228 EAM_1222 EAM_1223 moaE   TRUE 0.851 -3.000 0.003 NA   NA
 10477228 10477229 EAM_1223 EAM_1224     FALSE 0.005 478.000 0.019 NA   NA
 10477229 10477230 EAM_1224 EAM_1225     FALSE 0.009 461.000 0.000 NA   NA
 10477230 10477231 EAM_1225 EAM_1226   rhlE FALSE 0.036 276.000 0.000 NA   NA
 10477231 10477232 EAM_1226 EAM_1227 rhlE dusC TRUE 0.687 54.000 0.033 1.000 Y NA
 10477233 10477234 EAM_1228 EAM_1229     FALSE 0.056 235.000 0.000 NA   NA
 10477234 10477235 EAM_1229 EAM_1230     FALSE 0.213 100.000 0.000 NA   NA
 10477236 10477237 EAM_1231 EAM_1232   pbpG FALSE 0.301 171.000 0.145 NA   NA
 10477237 10477238 EAM_1232 EAM_1233 pbpG   FALSE 0.183 247.000 0.018 1.000 Y NA
 10477239 10477240 EAM_1234 EAM_1235   dld FALSE 0.025 314.000 0.000 NA   NA
 10477241 10477242 EAM_1236 EAM_1237 bglX   FALSE 0.026 307.000 0.000 NA   NA
 10477242 10477243 EAM_1237 EAM_1238   idi FALSE 0.139 161.000 0.000 NA   NA
 10477244 10477245 EAM_1239 EAM_1240     FALSE 0.046 254.000 0.000 NA   NA
 10477245 10477246 EAM_1240 EAM_1241     FALSE 0.229 75.000 0.000 NA   NA
 10477246 10477247 EAM_1241 EAM_1242     FALSE 0.135 79.000 0.016 NA   NA
 10477247 10477248 EAM_1242 EAM_1243     TRUE 0.988 4.000 0.311 NA   NA
 10477248 10477249 EAM_1243 EAM_1244     TRUE 0.998 -3.000 0.722 NA   NA
 10477249 10477250 EAM_1244 EAM_1245     TRUE 0.990 4.000 0.217 0.020   NA
 10477250 10477251 EAM_1245 EAM_1246     TRUE 0.996 -3.000 0.533 NA   NA
 10477251 10477252 EAM_1246 EAM_1247   mlrA TRUE 0.828 12.000 0.000 NA   NA
 10477253 10477254 EAM_1248 EAM_1249     TRUE 0.882 -3.000 0.021 NA   NA
 10477254 10477255 EAM_1249 EAM_1250   dinG FALSE 0.081 212.000 0.000 1.000   NA
 10477255 10477256 EAM_1250 EAM_1251 dinG   FALSE 0.214 23.000 0.041 1.000 N NA
 10477257 10477258 EAM_1252 EAM_1253   hutU FALSE 0.207 125.000 0.000 1.000   NA
 10477258 10477259 EAM_1253 EAM_1254 hutU hutH TRUE 0.993 18.000 0.315 0.001 Y NA
 10477261 10477262 EAM_1256 EAM_1257     TRUE 0.941 -3.000 0.067 NA   NA
 10477263 10477264 EAM_1258 EAM_1259 hutI hutG FALSE 0.331 -3.000 0.019 1.000 N NA
 10477265 10477266 EAM_1260 EAM_1261     FALSE 0.217 93.000 0.000 NA   NA
 10477266 10477267 EAM_1261 EAM_1262     TRUE 0.810 13.000 0.000 NA   NA
 10477267 10477268 EAM_1262 EAM_1263     TRUE 0.819 -19.000 0.000 NA   NA
 10477268 10477269 EAM_1263 EAM_1264     TRUE 0.858 10.000 0.000 NA   NA
 10477271 10477272 EAM_1266 EAM_1267     FALSE 0.093 194.000 0.000 NA   NA
 10477272 10477273 EAM_1267 EAM_1268   glnQ FALSE 0.016 373.000 0.000 NA   NA
 10477273 10477274 EAM_1268 EAM_1269 glnQ glnP TRUE 0.983 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 10477274 10477275 EAM_1269 EAM_1270 glnP glnH TRUE 0.776 106.000 0.103 0.055 Y NA
 10477275 10477276 EAM_1270 EAM_1271 glnH   FALSE 0.158 288.000 0.000 1.000 Y NA
 10477276 10477277 EAM_1271 EAM_1272   dps FALSE 0.037 78.000 0.040 1.000 N NA
 10477277 10477278 EAM_1272 EAM_1273 dps   FALSE 0.018 359.000 0.044 1.000   NA
 10477279 10477280 EAM_1274 EAM_1275 ompX mntR FALSE 0.002 527.000 0.000 1.000 N NA
 10477280 10477281 EAM_1275 EAM_1276 mntR   FALSE 0.010 256.000 0.000 1.000 N NA
 10477281 10477282 EAM_1276 EAM_1277     TRUE 0.994 -3.000 0.415 1.000   NA
 10477282 10477283 EAM_1277 EAM_1278     TRUE 0.978 2.000 0.174 1.000   NA
 10477284 10477285 EAM_1279 EAM_1280     TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 10477286 10477287 EAM_1281 EAM_1282 iolT   FALSE 0.184 141.000 0.000 1.000   NA
 10477288 10477289 EAM_1283 EAM_1284 moeB moeA TRUE 0.998 2.000 0.323 0.003 Y NA
 10477290 10477291 EAM_1285 EAM_1286     TRUE 0.926 -3.000 0.042 1.000   NA
 10477291 10477292 EAM_1286 EAM_1287     TRUE 0.529 29.000 0.033 1.000   NA
 10477292 10477293 EAM_1287 EAM_1288     TRUE 0.992 41.000 0.803 0.041 Y NA
 10477293 10477294 EAM_1288 EAM_1289     TRUE 0.999 10.000 0.689 0.041 Y NA
 10477294 10477295 EAM_1289 EAM_1290     TRUE 0.894 5.000 0.000 NA   NA
 10477295 10477296 EAM_1290 EAM_1291     FALSE 0.255 65.000 0.000 NA   NA
 10477296 10477297 EAM_1291 EAM_1292     FALSE 0.244 70.000 0.000 NA   NA
 10477297 10477298 EAM_1292 EAM_1293   dacC FALSE 0.255 65.000 0.000 NA   NA
 10477299 10477300 EAM_1294 EAM_1295 sdaC   FALSE 0.006 695.000 0.000 1.000   NA
 10477300 10477301 EAM_1295 EAM_1296     FALSE 0.064 232.000 0.000 1.000   NA
 10477301 10477302 EAM_1296 EAM_1297     FALSE 0.017 377.000 0.000 1.000   NA
 10477303 10477304 EAM_1298 EAM_1299   nfsA TRUE 0.943 -16.000 0.159 NA   NA
 10477304 10477305 EAM_1299 EAM_1300 nfsA   FALSE 0.042 261.000 0.000 NA   NA
 10477305 10477306 EAM_1300 EAM_1301   potF FALSE 0.011 428.000 0.000 NA   NA
 10477306 10477307 EAM_1301 EAM_1302 potF potG TRUE 0.953 125.000 0.679 1.000 Y NA
 10477307 10477308 EAM_1302 EAM_1303 potG potH TRUE 0.998 11.000 0.857 1.000 Y NA
 10477308 10477309 EAM_1303 EAM_1304 potH potI TRUE 0.999 -3.000 0.528 0.041 Y NA
 10477309 10477310 EAM_1304 EAM_1305 potI   FALSE 0.215 85.000 0.000 NA   NA
 10477310 10477311 EAM_1305 EAM_1306     FALSE 0.165 145.000 0.000 NA   NA
 10477312 10477313 EAM_1307 EAM_1308 artJ artM TRUE 0.799 132.000 0.143 0.055 Y NA
 10477313 10477314 EAM_1308 EAM_1309 artM artQ TRUE 1.000 0.000 0.714 0.015 Y NA
 10477314 10477315 EAM_1309 EAM_1310 artQ artI TRUE 0.997 4.000 0.260 0.041 Y NA
 10477315 10477316 EAM_1310 EAM_1311 artI artP TRUE 0.997 1.000 0.323 1.000 Y NA
 10477316 10477317 EAM_1311 EAM_1312 artP   FALSE 0.084 201.000 0.000 NA   NA
 10477318 10477319 EAM_1313 EAM_1314     TRUE 0.916 0.000 0.037 NA   NA
 10477320 10477321 EAM_1315 EAM_1316 ltaE poxB TRUE 0.632 64.000 0.031 1.000 Y NA
 10477324 10477325 EAM_1319 EAM_1320   clpS FALSE 0.103 187.000 0.000 NA   NA
 10477325 10477326 EAM_1320 EAM_1321 clpS clpA TRUE 0.968 29.000 0.596 NA   NA
 10477327 10477328 EAM_1322 EAM_1323 infA   FALSE 0.298 55.000 0.000 NA   NA
 10477328 10477329 EAM_1323 EAM_1324   aat FALSE 0.329 51.000 0.000 NA   NA
 10477329 10477330 EAM_1324 EAM_1325 aat cydC TRUE 0.868 31.000 0.049 1.000 Y NA
 10477330 10477331 EAM_1325 EAM_1326 cydC cydD TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.005 Y NA
 10477331 10477332 EAM_1326 EAM_1327 cydD trxB TRUE 0.549 135.000 0.049 1.000 Y NA
 10477333 10477334 EAM_1328 EAM_1329 lrp ftsK TRUE 0.637 119.000 0.345 1.000 N NA
 10477334 10477335 EAM_1329 EAM_1330 ftsK lolA FALSE 0.339 200.000 0.305 1.000 N NA
 10477335 10477336 EAM_1330 EAM_1331 lolA   TRUE 0.935 8.000 0.167 1.000 N NA
 10477336 10477337 EAM_1331 EAM_1332   serS FALSE 0.315 98.000 0.078 0.084 N NA
 10477337 10477338 EAM_1332 EAM_1333 serS   FALSE 0.002 430.000 0.000 NA N NA
 10477339 10477340 EAM_1334 EAM_1335 pflA   FALSE 0.096 192.000 0.000 NA   NA
 10477340 10477341 EAM_1335 EAM_1336     FALSE 0.106 183.000 0.000 NA   NA
 10477342 10477343 EAM_1337 EAM_1338 serC aroA TRUE 0.578 89.000 0.033 1.000 Y NA
 10477343 10477344 EAM_1338 EAM_1339 aroA cmk FALSE 0.398 136.000 0.209 1.000 N NA
 10477344 10477345 EAM_1339 EAM_1340 cmk rpsA TRUE 0.464 154.000 0.281 1.000 N NA
 10477345 10477346 EAM_1340 EAM_1341 rpsA ihfB TRUE 0.588 82.000 0.292 1.000 N NA
 10477346 10477347 EAM_1341 EAM_1342 ihfB   FALSE 0.050 198.000 0.003 1.000   NA
 10477347 10477348 EAM_1342 EAM_1343   msbA TRUE 0.747 37.000 0.075 0.062   NA
 10477348 10477349 EAM_1343 EAM_1344 msbA lpxK TRUE 0.973 -3.000 0.205 1.000 N NA
 10477349 10477350 EAM_1344 EAM_1345 lpxK   FALSE 0.239 257.000 0.263 NA   NA
 10477350 10477351 EAM_1345 EAM_1346   kdsB TRUE 0.989 -3.000 0.265 NA   NA
 10477351 10477352 EAM_1346 EAM_1347 kdsB   FALSE 0.024 270.000 0.023 NA   NA
 10477354 10477355 EAM_1349 EAM_1350 smtA mukF TRUE 0.979 -7.000 0.325 NA N NA
 10477355 10477356 EAM_1350 EAM_1351 mukF mukE TRUE 0.971 8.000 0.036 NA Y NA
 10477356 10477357 EAM_1351 EAM_1352 mukE mukB TRUE 1.000 1.000 0.667 0.001 Y NA
 10477357 10477358 EAM_1352 EAM_1353 mukB   FALSE 0.099 176.000 0.030 1.000   NA
 10477358 10477359 EAM_1353 EAM_1354     TRUE 0.595 179.000 0.372 NA   NA
 10477359 10477360 EAM_1354 EAM_1355     TRUE 0.528 44.000 0.089 NA   NA
 10477361 10477362 EAM_1356 EAM_1357 aspC ompF FALSE 0.014 232.000 0.000 1.000 N NA
 10477362 10477363 EAM_1357 EAM_1358 ompF asnS FALSE 0.007 302.000 0.000 1.000 N NA
 10477363 10477364 EAM_1358 EAM_1359 asnS pncB FALSE 0.012 167.000 0.034 1.000 N NA
 10477366 10477367 EAM_1361 EAM_1362 ssuB ssuC TRUE 0.998 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 10477367 10477368 EAM_1362 EAM_1363 ssuC ssuD TRUE 0.951 11.000 0.226 1.000 N NA
 10477368 10477369 EAM_1363 EAM_1364 ssuD ssuA TRUE 0.959 15.000 0.341 1.000 N NA
 10477369 10477370 EAM_1364 EAM_1365 ssuA ssuE TRUE 0.928 15.000 0.169 1.000   NA
 10477371 10477372 EAM_1366 EAM_1367 pyrD   FALSE 0.147 185.000 0.081 NA   NA
 10477374 10477375 EAM_1369 EAM_1370   uup TRUE 0.906 7.000 0.061 1.000   NA
 10477375 10477376 EAM_1370 EAM_1371 uup pqiA TRUE 0.710 19.000 0.054 NA   NA
 10477376 10477377 EAM_1371 EAM_1372 pqiA pqiB TRUE 0.991 17.000 0.819 NA   NA
 10477377 10477378 EAM_1372 EAM_1373 pqiB   TRUE 0.996 0.000 0.531 NA   NA
 10477379 10477380 EAM_1374 EAM_1375 fabA   TRUE 0.623 70.000 0.290 1.000 N NA
 10477382 10477383 EAM_1377 EAM_1378 ompA sulA FALSE 0.004 350.000 0.000 1.000 N NA
 10477385 10477386 EAM_1380 EAM_1381     TRUE 0.911 10.000 0.090 NA   NA
 10477388 10477389 EAM_1383 EAM_1384 mgsA   FALSE 0.219 79.000 0.000 NA   NA
 10477391 10477392 EAM_1386 EAM_1387     FALSE 0.385 63.000 0.094 NA   NA
 10477394 10477395 EAM_1389 EAM_1390     TRUE 0.445 101.000 0.140 1.000   NA
 10477396 10477397 EAM_t042 EAM_t043 tRNA-Ser tRNA-Ser FALSE 0.049 245.000 0.000 NA   NA
 10477397 10477398 EAM_t043 EAM_1391 tRNA-Ser agp FALSE 0.015 379.000 0.000 NA   NA
 10477399 10477400 EAM_1392 EAM_1393     FALSE 0.351 150.000 0.143 NA   NA
 10477400 10477401 EAM_1393 EAM_1394     TRUE 0.657 22.000 0.000 NA   NA
 10477402 10477403 EAM_1395 EAM_1396     FALSE 0.008 446.000 0.028 1.000   NA
 10477403 10477404 EAM_1396 EAM_1397     TRUE 0.530 25.000 0.028 NA   NA
 10477406 10477407 EAM_1399 EAM_1400   expR FALSE 0.375 46.000 0.000 NA   NA
 10477407 10477408 EAM_1400 EAM_1401 expR   FALSE 0.361 110.000 0.182 NA N NA
 10477409 10477410 EAM_1402 EAM_1403     FALSE 0.303 97.000 0.085 NA   NA
 10477411 10477412 EAM_1404 EAM_1405 uvrY uvrC TRUE 0.964 2.000 0.086 0.013 N NA
 10477412 10477413 EAM_1405 EAM_1406 uvrC pgsA TRUE 0.530 72.000 0.227 1.000 N NA
 10477413 10477414 EAM_1406 EAM_t044 pgsA tRNA-Gly FALSE 0.133 166.000 0.000 NA   NA
 10477414 10477415 EAM_t044 EAM_t045 tRNA-Gly tRNA-Cys FALSE 0.226 76.000 0.000 NA   NA
 10477415 10477416 EAM_t045 EAM_t046 tRNA-Cys tRNA-Leu TRUE 0.751 16.000 0.000 NA   NA
 10477416 10477417 EAM_t046 EAM_1407 tRNA-Leu   FALSE 0.008 474.000 0.000 NA   NA
 10477417 10477418 EAM_1407 EAM_1408     FALSE 0.075 210.000 0.000 NA   NA
 10477418 10477419 EAM_1408 EAM_1409     TRUE 0.969 2.000 0.138 NA   NA
 10477419 10477420 EAM_1409 EAM_1410     TRUE 0.997 0.000 0.578 NA   NA
 10477420 10477421 EAM_1410 EAM_1411     TRUE 0.991 -3.000 0.289 0.082 N NA
 10477421 10477422 EAM_1411 EAM_1412     FALSE 0.060 230.000 0.000 NA   NA
 10477422 10477423 EAM_1412 EAM_1413     TRUE 0.843 11.000 0.000 NA   NA
 10477423 10477424 EAM_1413 EAM_1414     TRUE 0.894 5.000 0.000 NA   NA
 10477424 10477425 EAM_1414 EAM_1415     FALSE 0.075 210.000 0.000 NA   NA
 10477427 10477428 EAM_1417 EAM_1418 mdoG mdoH TRUE 0.989 -7.000 0.469 NA N NA
 10477428 10477429 EAM_1418 EAM_1419 mdoH   FALSE 0.268 174.000 0.135 NA   NA
 10477430 10477431 EAM_1420 EAM_1421 msyB htrB FALSE 0.106 183.000 0.000 NA   NA
 10477433 10477434 EAM_1423 EAM_1424     TRUE 0.737 21.000 0.074 NA   NA
 10477434 10477435 EAM_1424 EAM_1425     FALSE 0.045 255.000 0.000 NA   NA
 10477435 10477436 EAM_1425 EAM_1426     FALSE 0.350 49.000 0.000 NA   NA
 10477436 10477437 EAM_1426 EAM_1427   solA FALSE 0.196 121.000 0.000 NA   NA
 10477437 10477438 EAM_1427 EAM_1428 solA   TRUE 0.788 106.000 0.423 NA   NA
 10477438 10477439 EAM_1428 EAM_1429   dinI FALSE 0.007 523.000 0.000 NA   NA
 10477439 10477440 EAM_1429 EAM_1430 dinI pyrC FALSE 0.178 77.000 0.031 NA   NA
 10477440 10477441 EAM_1430 EAM_1431 pyrC   FALSE 0.134 114.000 0.022 NA   NA
 10477441 10477442 EAM_1431 EAM_1432   grxB FALSE 0.169 142.000 0.000 NA   NA
 10477443 10477444 EAM_1433 EAM_1434 rimJ   FALSE 0.136 163.000 0.000 NA   NA
 10477444 10477445 EAM_1434 EAM_1435   mviN FALSE 0.011 425.000 0.000 NA   NA
 10477446 10477447 EAM_1436 EAM_1437 flgN flgM TRUE 0.998 5.000 0.361 0.005 Y NA
 10477447 10477448 EAM_1437 EAM_1438 flgM flgA TRUE 0.874 108.000 0.330 NA Y NA
 10477449 10477450 EAM_1439 EAM_1440 flgB flgC TRUE 0.994 4.000 0.118 0.006 Y NA
 10477450 10477451 EAM_1440 EAM_1441 flgC flgD TRUE 0.985 12.000 0.186 NA Y NA
 10477451 10477452 EAM_1441 EAM_1442 flgD flgE TRUE 0.850 31.000 0.035 NA Y NA
 10477452 10477453 EAM_1442 EAM_1443 flgE flgF TRUE 0.976 22.000 0.143 0.007 Y NA
 10477453 10477454 EAM_1443 EAM_1444 flgF flgG TRUE 0.996 16.000 0.420 0.002 Y NA
 10477454 10477455 EAM_1444 EAM_1445 flgG flgH TRUE 0.918 90.000 0.268 0.010 Y NA
 10477455 10477456 EAM_1445 EAM_1446 flgH flgI TRUE 0.983 10.000 0.024 0.012 Y NA
 10477456 10477457 EAM_1446 EAM_1447 flgI flgJ TRUE 0.991 0.000 0.012 0.012 Y NA
 10477457 10477458 EAM_1447 EAM_1448 flgJ flgK TRUE 0.974 134.000 0.705 0.005 Y NA
 10477458 10477459 EAM_1448 EAM_1449 flgK flgL TRUE 0.980 21.000 0.142 0.002 Y NA
 10477463 10477464 EAM_1453 EAM_1454   rpmF TRUE 0.988 15.000 0.599 NA   NA
 10477464 10477465 EAM_1454 EAM_1455 rpmF plsX TRUE 0.945 23.000 0.418 1.000 N NA
 10477465 10477466 EAM_1455 EAM_1456 plsX fabH TRUE 0.998 7.000 0.380 0.004 Y NA
 10477466 10477467 EAM_1456 EAM_1457 fabH fabD TRUE 0.966 34.000 0.182 0.004 Y NA
 10477467 10477468 EAM_1457 EAM_1458 fabD fabG TRUE 0.996 15.000 0.432 0.004 Y NA
 10477468 10477469 EAM_1458 EAM_1459 fabG acpP TRUE 0.905 154.000 0.321 0.004 Y NA
 10477469 10477470 EAM_1459 EAM_1460 acpP fabF TRUE 0.897 89.000 0.346 1.000 Y NA
 10477470 10477471 EAM_1460 EAM_1461 fabF pabC FALSE 0.251 176.000 0.187 1.000 N NA
 10477471 10477472 EAM_1461 EAM_1462 pabC   TRUE 0.975 -7.000 0.204 1.000   NA
 10477472 10477473 EAM_1462 EAM_1463   tmk TRUE 0.988 -10.000 0.209 0.001   NA
 10477473 10477474 EAM_1463 EAM_1464 tmk holB TRUE 0.975 -3.000 0.211 1.000 N NA
 10477474 10477475 EAM_1464 EAM_1465 holB   TRUE 0.984 6.000 0.110 NA Y NA
 10477475 10477476 EAM_1465 EAM_1466   ptsG FALSE 0.001 304.000 0.004 NA N NA
 10477476 10477477 EAM_1466 EAM_1467 ptsG   FALSE 0.204 233.000 0.005 1.000 Y NA
 10477477 10477478 EAM_1467 EAM_1468     TRUE 0.595 27.000 0.051 NA   NA
 10477478 10477479 EAM_1468 EAM_1469     TRUE 0.989 12.000 0.516 NA   NA
 10477479 10477480 EAM_1469 EAM_1470     TRUE 0.977 -16.000 0.310 NA   NA
 10477480 10477481 EAM_1470 EAM_1471   nagZ TRUE 0.708 11.000 0.069 1.000 N NA
 10477481 10477482 EAM_1471 EAM_1472 nagZ   FALSE 0.013 403.000 0.000 NA   NA
 10477482 10477483 EAM_1472 EAM_1473   ndh FALSE 0.007 546.000 0.000 NA   NA
 10477483 10477484 EAM_1473 EAM_1474 ndh   FALSE 0.041 303.000 0.071 1.000   NA
 10477485 10477486 EAM_1475 EAM_1476 mfd   FALSE 0.078 208.000 0.000 NA   NA
 10477486 10477487 EAM_1476 EAM_1477   yedP TRUE 0.914 29.000 0.302 NA   NA
 10477488 10477489 EAM_1478 EAM_1479     FALSE 0.051 242.000 0.000 NA   NA
 10477489 10477490 EAM_1479 EAM_1480     FALSE 0.054 237.000 0.000 NA   NA
 10477490 10477491 EAM_1480 EAM_1481     FALSE 0.409 43.000 0.000 NA   NA
 10477492 10477493 EAM_1482 EAM_1483 rcsA   FALSE 0.068 219.000 0.000 NA   NA
 10477493 10477494 EAM_1483 EAM_1484   fliR FALSE 0.091 196.000 0.000 NA   NA
 10477494 10477495 EAM_1484 EAM_1485 fliR fliQ TRUE 0.993 0.000 0.028 0.005 Y NA
 10477495 10477496 EAM_1485 EAM_1486 fliQ fliP TRUE 0.998 16.000 0.827 0.014 Y NA
 10477496 10477497 EAM_1486 EAM_1487 fliP fliO TRUE 0.995 -3.000 0.203 1.000 Y NA
 10477497 10477498 EAM_1487 EAM_1488 fliO fliN TRUE 0.998 1.000 0.443 1.000 Y NA
 10477498 10477499 EAM_1488 EAM_1489 fliN fliM TRUE 0.995 -7.000 0.137 0.002 Y NA
 10477499 10477500 EAM_1489 EAM_1490 fliM fliL TRUE 0.999 10.000 0.957 0.002 Y NA
 10477500 10477501 EAM_1490 EAM_1491 fliL fliK TRUE 0.641 144.000 0.119 1.000 Y NA
 10477501 10477502 EAM_1491 EAM_1492 fliK fliJ TRUE 0.998 -3.000 0.317 0.010 Y NA
 10477502 10477503 EAM_1492 EAM_1493 fliJ fliI TRUE 0.856 27.000 0.006 1.000 Y NA
 10477503 10477504 EAM_1493 EAM_1494 fliI fliH TRUE 0.999 0.000 0.667 1.000 Y NA
 10477504 10477505 EAM_1494 EAM_1495 fliH fliG TRUE 0.986 -7.000 0.005 0.006 Y NA
 10477505 10477506 EAM_1495 EAM_1496 fliG fliF TRUE 0.998 -3.000 0.220 0.010 Y NA
 10477507 10477508 EAM_1497 EAM_1498 fliE   FALSE 0.026 1231.000 0.000 1.000 Y NA
 10477508 10477509 EAM_1498 EAM_1499     FALSE 0.041 264.000 0.000 NA   NA
 10477509 10477510 EAM_1499 EAM_1500     FALSE 0.010 451.000 0.000 NA   NA
 10477510 10477511 EAM_1500 EAM_1501     FALSE 0.023 326.000 0.000 NA   NA
 10477511 10477512 EAM_1501 EAM_1502     TRUE 0.713 18.000 0.000 NA   NA
 10477512 10477513 EAM_1502 EAM_1503     FALSE 0.032 289.000 0.000 NA   NA
 10477515 10477516 EAM_1505 EAM_1506 lolC lolD TRUE 0.972 -7.000 0.175 0.054 N NA
 10477516 10477517 EAM_1506 EAM_1507 lolD lolE TRUE 0.974 0.000 0.125 0.054 N NA
 10477517 10477518 EAM_1507 EAM_1508 lolE   FALSE 0.107 348.000 0.225 1.000   NA
 10477518 10477519 EAM_1508 EAM_1509   cobB FALSE 0.055 323.000 0.119 1.000   NA
 10477522 10477523 EAM_1512 EAM_1513   phoQ TRUE 0.561 199.000 0.408 NA   NA
 10477523 10477524 EAM_1513 EAM_1514 phoQ phoP TRUE 0.999 5.000 0.940 1.000 Y NA
 10477524 10477525 EAM_1514 EAM_1515 phoP purB FALSE 0.009 124.000 0.011 1.000 N NA
 10477525 10477526 EAM_1515 EAM_1516 purB   TRUE 0.703 28.000 0.093 NA   NA
 10477526 10477527 EAM_1516 EAM_1517   trmU TRUE 0.851 26.000 0.180 NA   NA
 10477527 10477528 EAM_1517 EAM_1518 trmU   TRUE 0.476 109.000 0.158 1.000   NA
 10477528 10477529 EAM_1518 EAM_1519   rluE TRUE 0.707 48.000 0.182 1.000   NA
 10477531 10477532 EAM_1521 EAM_1522     FALSE 0.009 483.000 0.000 1.000   NA
 10477532 10477533 EAM_1522 EAM_1523     FALSE 0.153 152.000 0.000 NA   NA
 10477534 10477535 EAM_1524 EAM_1525     TRUE 0.894 5.000 0.000 NA   NA
 10477535 10477536 EAM_1525 EAM_1526     FALSE 0.051 242.000 0.000 NA   NA
 10477537 10477538 EAM_1527 EAM_1528     FALSE 0.185 131.000 0.000 NA   NA
 10477538 10477539 EAM_1528 EAM_1529   ldcA TRUE 0.909 -3.000 0.034 NA   NA
 10477543 10477544 EAM_1533 EAM_1534 treA argC FALSE 0.007 290.000 0.000 1.000 N NA
 10477544 10477545 EAM_1534 EAM_1535 argC   FALSE 0.179 135.000 0.000 NA   NA
 10477545 10477546 EAM_1535 EAM_1536     FALSE 0.350 49.000 0.000 NA   NA
 10477546 10477547 EAM_1536 EAM_1537   fumA FALSE 0.007 562.000 0.000 NA   NA
 10477547 10477548 EAM_1537 EAM_1538 fumA ttdT FALSE 0.224 181.000 0.182 1.000 N NA
 10477549 10477550 EAM_1539 EAM_1540     TRUE 0.549 73.000 0.238 1.000 N NA
 10477551 10477552 EAM_1541 EAM_1542 dcuR dcuS TRUE 0.992 -3.000 0.057 0.058 Y NA
 10477552 10477553 EAM_1542 EAM_1543 dcuS   FALSE 0.018 357.000 0.000 NA   NA
 10477553 10477554 EAM_1543 EAM_1544     TRUE 0.913 16.000 0.167 NA   NA
 10477554 10477555 EAM_1544 EAM_1545     FALSE 0.012 412.000 0.000 NA   NA
 10477555 10477556 EAM_1545 EAM_1546     TRUE 0.798 -34.000 0.000 NA   NA
 10477556 10477557 EAM_1546 EAM_1547     FALSE 0.117 176.000 0.000 NA   NA
 10477557 10477558 EAM_1547 EAM_1548     FALSE 0.039 266.000 0.000 NA   NA
 10477560 10477561 EAM_1550 EAM_1551     TRUE 0.819 -19.000 0.000 NA   NA
 10477561 10477562 EAM_1551 EAM_1552     TRUE 0.976 -10.000 0.238 1.000   NA
 10477562 10477563 EAM_1552 EAM_1553     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 10477563 10477564 EAM_1553 EAM_1554     FALSE 0.409 43.000 0.000 NA   NA
 10477564 10477565 EAM_1554 EAM_1555     TRUE 0.976 -22.000 0.333 NA   NA
 10477566 10477567 EAM_1556 EAM_1557     TRUE 0.897 -7.000 0.000 1.000   NA
 10477567 10477568 EAM_1557 EAM_1558     TRUE 0.985 11.000 0.240 0.013   NA
 10477568 10477569 EAM_1558 EAM_1559     TRUE 0.906 41.000 0.240 0.013   NA
 10477569 10477570 EAM_1559 EAM_1560     TRUE 0.992 -10.000 0.333 0.013   NA
 10477570 10477571 EAM_1560 EAM_1561     TRUE 0.965 17.000 0.333 1.000   NA
 10477571 10477572 EAM_1561 EAM_1562     TRUE 0.980 -16.000 0.333 NA   NA
 10477572 10477573 EAM_1562 EAM_1563     TRUE 0.972 -19.000 0.286 NA   NA
 10477573 10477574 EAM_1563 EAM_1564     TRUE 0.990 -3.000 0.286 NA   NA
 10477574 10477575 EAM_1564 EAM_1565     TRUE 0.982 -7.000 0.083 NA Y NA
 10477575 10477576 EAM_1565 EAM_1566     TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.013 Y NA
 10477576 10477577 EAM_1566 EAM_1567     TRUE 0.999 13.000 1.000 0.060 Y NA
 10477577 10477578 EAM_1567 EAM_1568     TRUE 0.998 8.000 0.682 1.000 Y NA
 10477578 10477579 EAM_1568 EAM_1569     TRUE 0.738 144.000 0.409 1.000   NA
 10477579 10477580 EAM_1569 EAM_1570     TRUE 0.970 -3.000 0.125 1.000   NA
 10477580 10477581 EAM_1570 EAM_1571     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10477581 10477582 EAM_1571 EAM_1572     FALSE 0.246 69.000 0.000 NA   NA
 10477582 10477583 EAM_1572 EAM_1573     FALSE 0.046 254.000 0.000 NA   NA
 10477583 10477584 EAM_1573 EAM_1574     FALSE 0.047 250.000 0.000 NA   NA
 10477584 10477585 EAM_1574 EAM_1575     FALSE 0.015 384.000 0.000 NA   NA
 10477587 10477588 EAM_1577 EAM_1578     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10477588 10477589 EAM_1578 EAM_1579     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10477592 10477593 EAM_1582 EAM_1583 prsA ipk FALSE 0.005 180.000 0.018 1.000 N NA
 10477593 10477594 EAM_1583 EAM_1584 ipk lolB FALSE 0.331 -3.000 0.019 1.000 N NA
 10477595 10477596 EAM_1585 EAM_1586 hemA prfA TRUE 0.784 40.000 0.171 0.037 N NA
 10477596 10477597 EAM_1586 EAM_1587 prfA hemK TRUE 0.998 0.000 0.229 0.037 Y NA
 10477597 10477598 EAM_1587 EAM_1588 hemK sirB2 TRUE 0.960 1.000 0.109 NA   NA
 10477598 10477599 EAM_1588 EAM_1589 sirB2 sirB1 TRUE 0.983 0.000 0.195 NA   NA
 10477599 10477600 EAM_1589 EAM_1590 sirB1 kdsA TRUE 0.670 32.000 0.089 1.000   NA
 10477600 10477601 EAM_1590 EAM_1591 kdsA hslJ FALSE 0.041 87.000 0.000 NA N NA
 10477602 10477603 EAM_1592 EAM_1593 chaA   FALSE 0.189 127.000 0.000 NA   NA
 10477603 10477604 EAM_1593 EAM_1594   scrR TRUE 0.574 28.000 0.000 NA   NA
 10477604 10477605 EAM_1594 EAM_1595 scrR scrB TRUE 0.918 29.000 0.400 1.000 N NA
 10477605 10477606 EAM_1595 EAM_1596 scrB scrA TRUE 0.998 -3.000 0.475 1.000 Y NA
 10477606 10477607 EAM_1596 EAM_1597 scrA scrY TRUE 0.977 35.000 0.275 0.006 Y NA
 10477607 10477608 EAM_1597 EAM_1598 scrY scrK FALSE 0.336 266.000 0.167 1.000 Y NA
 10477610 10477611 EAM_1600 EAM_1601     TRUE 0.943 37.000 0.500 NA   NA
 10477611 10477612 EAM_1601 EAM_1602     TRUE 0.992 13.000 0.667 NA   NA
 10477612 10477613 EAM_1602 EAM_1603     TRUE 0.997 0.000 0.667 NA   NA
 10477616 10477617 EAM_1606 EAM_1607 astC astA TRUE 0.999 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 10477617 10477618 EAM_1607 EAM_1608 astA astD TRUE 0.758 -3.000 0.051 1.000 N NA
 10477618 10477619 EAM_1608 EAM_1609 astD astB TRUE 0.986 -3.000 0.306 1.000 N NA
 10477619 10477620 EAM_1609 EAM_1610 astB astE TRUE 0.688 52.000 0.027 1.000 Y NA
 10477620 10477621 EAM_1610 EAM_1611 astE   TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 10477621 10477622 EAM_1611 EAM_1612   spy FALSE 0.215 85.000 0.000 NA   NA
 10477623 10477624 EAM_1613 EAM_1614 cho nadE FALSE 0.103 150.000 0.013 1.000   NA
 10477624 10477625 EAM_1614 EAM_1615 nadE   FALSE 0.009 126.000 0.007 1.000 N NA
 10477627 10477628 EAM_1617 EAM_1618     FALSE 0.052 239.000 0.000 NA   NA
 10477628 10477629 EAM_1618 EAM_1619     FALSE 0.255 152.000 0.102 NA   NA
 10477629 10477630 EAM_1619 EAM_1620     FALSE 0.155 151.000 0.000 NA   NA
 10477632 10477633 EAM_1622 EAM_1623     FALSE 0.197 96.000 0.041 NA   NA
 10477634 10477635 EAM_1624 EAM_1625     FALSE 0.217 93.000 0.000 NA   NA
 10477637 10477638 EAM_1627 EAM_1628 thrS infC TRUE 0.992 4.000 0.186 1.000 Y NA
 10477638 10477639 EAM_1628 EAM_1629 infC rpmI TRUE 0.956 93.000 0.652 1.000 Y NA
 10477639 10477640 EAM_1629 EAM_1630 rpmI rplT TRUE 0.985 78.000 0.928 0.012 Y NA
 10477640 10477641 EAM_1630 EAM_1631 rplT pheS FALSE 0.231 352.000 0.202 1.000 Y NA
 10477641 10477642 EAM_1631 EAM_1632 pheS pheT TRUE 0.998 15.000 0.574 0.001 Y NA
 10477642 10477643 EAM_1632 EAM_1633 pheT ihfA TRUE 0.962 5.000 0.208 1.000 N NA
 10477643 10477644 EAM_1633 EAM_1634 ihfA   FALSE 0.031 292.000 0.000 NA   NA
 10477644 10477645 EAM_1634 EAM_1635   btuE FALSE 0.025 314.000 0.000 NA   NA
 10477645 10477646 EAM_1635 EAM_1636 btuE nlpC FALSE 0.009 236.000 0.000 NA N NA
 10477646 10477647 EAM_1636 EAM_1637 nlpC   FALSE 0.006 700.000 0.000 NA   NA
 10477647 10477648 EAM_1637 EAM_1638     FALSE 0.197 120.000 0.000 NA   NA
 10477649 10477650 EAM_1639 EAM_1640 hmuV hmuU TRUE 0.993 -7.000 0.220 1.000 Y NA
 10477650 10477651 EAM_1640 EAM_1641 hmuU hmuT TRUE 0.999 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 10477651 10477652 EAM_1641 EAM_1642 hmuT hmuS TRUE 0.998 -3.000 0.384 1.000 Y NA
 10477652 10477653 EAM_1642 EAM_1643 hmuS   FALSE 0.134 165.000 0.000 NA   NA
 10477660 10477661 EAM_1650 EAM_1651 sufA sufB TRUE 0.874 6.000 0.041 NA   NA
 10477661 10477662 EAM_1651 EAM_1652 sufB sufC TRUE 0.953 55.000 0.466 1.000 Y NA
 10477662 10477663 EAM_1652 EAM_1653 sufC sufD TRUE 0.995 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 10477663 10477664 EAM_1653 EAM_1654 sufD sufS TRUE 0.971 -3.000 0.193 1.000 N NA
 10477664 10477665 EAM_1654 EAM_1655 sufS sufE TRUE 0.516 105.000 0.183 NA   NA
 10477666 10477667 EAM_1656 EAM_1657 lpp pykF FALSE 0.006 305.000 0.000 1.000 N NA
 10477667 10477668 EAM_1657 EAM_t047 pykF tRNA-Val FALSE 0.011 428.000 0.000 NA   NA
 10477668 10477669 EAM_t047 EAM_t048 tRNA-Val tRNA-Val FALSE 0.298 55.000 0.000 NA   NA
 10477669 10477670 EAM_t048 EAM_1658 tRNA-Val norM FALSE 0.159 148.000 0.000 NA   NA
 10477672 10477673 EAM_1660 EAM_1661 cfa   FALSE 0.011 246.000 0.000 1.000 N NA
 10477675 10477676 EAM_1663 EAM_1664 purR   FALSE 0.002 403.000 0.000 NA N NA
 10477678 10477679 EAM_1666 EAM_1667 rnt gloA FALSE 0.275 104.000 0.136 1.000 N NA
 10477679 10477680 EAM_1667 EAM_1668 gloA nemA FALSE 0.086 75.000 0.057 1.000 N NA
 10477680 10477681 EAM_1668 EAM_1669 nemA   TRUE 0.978 -97.000 0.362 1.000   NA
 10477681 10477682 EAM_1669 EAM_1670     FALSE 0.174 212.000 0.128 1.000   NA
 10477682 10477683 EAM_1670 EAM_1671     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10477683 10477684 EAM_1671 EAM_1672     TRUE 0.792 14.000 0.000 NA   NA
 10477684 10477685 EAM_1672 EAM_1673     TRUE 0.792 14.000 0.000 NA   NA
 10477686 10477687 EAM_1674 EAM_1675     FALSE 0.202 111.000 0.000 NA   NA
 10477691 10477692 EAM_1679 EAM_1680   pdxH FALSE 0.007 155.000 0.013 NA N NA
 10477692 10477693 EAM_1680 EAM_1681 pdxH tyrS FALSE 0.060 128.000 0.054 1.000 N NA
 10477693 10477694 EAM_1681 EAM_1682 tyrS pdxY FALSE 0.235 73.000 0.000 NA   NA
 10477695 10477696 EAM_1683 EAM_1684 gst tppB FALSE 0.196 286.000 0.344 1.000 N NA
 10477697 10477698 EAM_1685 EAM_1686 betI betB TRUE 0.968 17.000 0.459 1.000 N NA
 10477698 10477699 EAM_1686 EAM_1687 betB betA TRUE 0.919 46.000 0.634 1.000 N NA
 10477700 10477701 EAM_1688 EAM_1689 nth rnfE TRUE 0.923 -3.000 0.109 1.000 N NA
 10477701 10477702 EAM_1689 EAM_1690 rnfE rnfG TRUE 0.999 -7.000 0.908 0.027 Y NA
 10477702 10477703 EAM_1690 EAM_1691 rnfG rnfD TRUE 1.000 0.000 0.924 0.027 Y NA
 10477703 10477704 EAM_1691 EAM_1692 rnfD rnfC TRUE 1.000 1.000 0.814 0.027 Y NA
 10477704 10477705 EAM_1692 EAM_1693 rnfC rnfB TRUE 0.999 -7.000 0.537 0.027 Y NA
 10477705 10477706 EAM_1693 EAM_1694 rnfB rnfA TRUE 0.999 0.000 0.564 0.027 Y NA
 10477706 10477707 EAM_1694 EAM_1695 rnfA   FALSE 0.419 128.000 0.148 NA   NA
 10477707 10477708 EAM_1695 EAM_1696   araA FALSE 0.012 409.000 0.000 NA   NA
 10477708 10477709 EAM_1696 EAM_1697 araA araB TRUE 0.644 4.000 0.046 1.000 N NA
 10477710 10477711 EAM_1698 EAM_1699 araF araG TRUE 0.988 75.000 0.917 0.002 Y NA
 10477711 10477712 EAM_1699 EAM_1700 araG araH TRUE 0.996 18.000 0.451 0.002 Y NA
 10477712 10477713 EAM_1700 EAM_1701 araH araC TRUE 0.928 12.000 0.196 1.000 N NA
 10477713 10477714 EAM_1701 EAM_1702 araC   TRUE 0.680 96.000 0.276 1.000   NA
 10477715 10477716 EAM_1703 EAM_1704 add   FALSE 0.259 159.000 0.113 NA   NA
 10477721 10477722 EAM_1709 EAM_1710   mlc TRUE 0.854 167.000 0.408 1.000 Y NA
 10477722 10477723 EAM_1710 EAM_1711 mlc   TRUE 0.728 120.000 0.455 1.000 N NA
 10477723 10477724 EAM_1711 EAM_1712     FALSE 0.003 425.000 0.000 1.000 N NA
 10477725 10477726 EAM_1713 EAM_1714     TRUE 0.909 49.000 0.500 NA   NA
 10477726 10477727 EAM_1714 EAM_1715   ydfG FALSE 0.097 170.000 0.029 NA   NA
 10477728 10477729 EAM_1716 EAM_1717 guaD dcp FALSE 0.004 355.000 0.000 1.000 N NA
 10477731 10477732 EAM_1719 EAM_1720     FALSE 0.350 49.000 0.000 NA   NA
 10477732 10477733 EAM_1720 EAM_1721     FALSE 0.217 91.000 0.000 NA   NA
 10477733 10477734 EAM_1721 EAM_1722     FALSE 0.339 50.000 0.000 NA   NA
 10477736 10477737 EAM_1724 EAM_1725     FALSE 0.007 566.000 0.000 NA   NA
 10477737 10477738 EAM_1725 EAM_1726     FALSE 0.017 366.000 0.000 NA   NA
 10477739 10477740 EAM_1727 EAM_1728     TRUE 0.668 21.000 0.000 NA   NA
 10477740 10477741 EAM_1728 EAM_1729     TRUE 0.874 8.000 0.000 NA   NA
 10477744 10477745 EAM_1732 EAM_1733   osmB FALSE 0.038 272.000 0.000 NA   NA
 10477745 10477746 EAM_1733 EAM_1734 osmB   FALSE 0.201 113.000 0.000 NA   NA
 10477746 10477747 EAM_1734 EAM_1735     FALSE 0.208 124.000 0.000 1.000   NA
 10477749 10477750 EAM_1737 EAM_1738 phd kil TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10477750 10477751 EAM_1738 EAM_1739 kil   FALSE 0.010 443.000 0.000 NA   NA
 10477751 10477752 EAM_1739 EAM_1740     FALSE 0.189 127.000 0.000 NA   NA
 10477752 10477753 EAM_1740 EAM_1741     TRUE 0.903 4.000 0.000 NA   NA
 10477753 10477754 EAM_1741 EAM_1742   cynT FALSE 0.051 126.000 0.000 1.000 N NA
 10477758 10477759 EAM_1746 EAM_1747 srfA srfB TRUE 0.910 3.000 0.000 NA   NA
 10477759 10477760 EAM_1747 EAM_1748 srfB srfC TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 10477761 10477762 EAM_1749 EAM_1750   pvcB TRUE 0.995 -3.000 0.414 0.027 N NA
 10477762 10477763 EAM_1750 EAM_1751 pvcB pvcA TRUE 0.999 -3.000 0.630 NA Y NA
 10477763 10477764 EAM_1751 EAM_1752 pvcA   FALSE 0.006 283.000 0.000 NA N NA
 10477764 10477765 EAM_1752 EAM_1753     TRUE 0.990 2.000 0.329 NA   NA
 10477765 10477766 EAM_1753 EAM_1754     FALSE 0.181 134.000 0.000 NA   NA
 10477767 10477768 EAM_1755 EAM_1756     FALSE 0.213 246.000 0.000 NA Y NA
 10477771 10477772 EAM_1759 EAM_1760     TRUE 0.939 -7.000 0.105 NA   NA
 10477772 10477773 EAM_1760 EAM_1761     TRUE 0.598 27.000 0.053 NA   NA
 10477773 10477774 EAM_1761 EAM_1762     TRUE 0.629 85.000 0.231 1.000   NA
 10477774 10477775 EAM_1762 EAM_1763   sfnG TRUE 0.897 -7.000 0.000 1.000   NA
 10477775 10477776 EAM_1763 EAM_1764 sfnG msuD TRUE 0.987 11.000 0.000 0.001 Y NA
 10477780 10477781 EAM_1768 EAM_1769     FALSE 0.056 235.000 0.000 NA   NA
 10477781 10477782 EAM_1769 EAM_1770     FALSE 0.191 196.000 0.182 1.000 N NA
 10477782 10477783 EAM_1770 EAM_1771   pcaK FALSE 0.057 103.000 0.000 1.000 N NA
 10477783 10477784 EAM_1771 EAM_1772 pcaK   FALSE 0.002 496.000 0.000 1.000 N NA
 10477787 10477788 EAM_1775 EAM_1776 fnr uspE TRUE 0.948 114.000 0.619 1.000 Y NA
 10477788 10477789 EAM_1776 EAM_1777 uspE   FALSE 0.183 133.000 0.000 NA   NA
 10477789 10477790 EAM_1777 EAM_1778     FALSE 0.055 211.000 0.029 NA   NA
 10477790 10477791 EAM_1778 EAM_1779     TRUE 0.628 24.000 0.000 NA   NA
 10477793 10477794 EAM_1781 EAM_1782   ydgI FALSE 0.198 208.000 0.143 NA   NA
 10477796 10477797 EAM_1784 EAM_1785 rstA   FALSE 0.021 336.000 0.000 NA   NA
 10477797 10477798 EAM_1785 EAM_1786     TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 10477798 10477799 EAM_1786 EAM_1787     TRUE 0.688 23.000 0.062 NA   NA
 10477799 10477800 EAM_1787 EAM_1788     FALSE 0.291 56.000 0.000 NA   NA
 10477801 10477802 EAM_1789 EAM_1790     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10477802 10477803 EAM_1790 EAM_1791     FALSE 0.213 100.000 0.000 NA   NA
 10477803 10477804 EAM_1791 EAM_1792     TRUE 0.751 16.000 0.000 NA   NA
 10477804 10477805 EAM_1792 EAM_1793     FALSE 0.217 93.000 0.000 NA   NA
 10477805 10477806 EAM_1793 EAM_1794     FALSE 0.217 95.000 0.000 NA   NA
 10477806 10477807 EAM_1794 EAM_1795     TRUE 0.843 11.000 0.000 NA   NA
 10477807 10477808 EAM_1795 EAM_1796     TRUE 0.799 -33.000 0.000 NA   NA
 10477808 10477809 EAM_1796 EAM_1797     TRUE 0.679 20.000 0.000 NA   NA
 10477811 10477812 EAM_1799 EAM_1800     TRUE 0.974 4.000 0.182 NA   NA
 10477813 10477814 EAM_1801 EAM_1802   rstB TRUE 0.586 29.000 0.000 1.000   NA
 10477814 10477815 EAM_1802 EAM_1803 rstB   TRUE 0.942 16.000 0.300 1.000 N NA
 10477817 10477818 EAM_1805 EAM_1806 asr   TRUE 0.772 15.000 0.000 NA   NA
 10477818 10477819 EAM_1806 EAM_1807     FALSE 0.199 116.000 0.000 NA   NA
 10477819 10477820 EAM_1807 EAM_1808     FALSE 0.059 91.000 0.000 1.000 N NA
 10477823 10477824 EAM_1811 EAM_1812     FALSE 0.061 229.000 0.000 NA   NA
 10477824 10477825 EAM_1812 EAM_1813     FALSE 0.005 789.000 0.000 NA   NA
 10477825 10477826 EAM_1813 EAM_1814     TRUE 0.995 11.000 0.726 NA   NA
 10477826 10477827 EAM_1814 EAM_1815     TRUE 0.758 -16.000 0.023 NA   NA
 10477831 10477832 EAM_1819 EAM_1820 dbpA   TRUE 0.528 32.000 0.000 NA   NA
 10477833 10477834 EAM_1821 EAM_1822     FALSE 0.214 48.000 0.005 NA   NA
 10477835 10477836 EAM_1823 EAM_1824 palI   FALSE 0.006 307.000 0.000 1.000 N NA
 10477837 10477838 EAM_1825 EAM_1826     FALSE 0.216 90.000 0.000 NA   NA
 10477838 10477839 EAM_1826 EAM_1827     TRUE 0.997 3.000 0.400 1.000 Y NA
 10477839 10477840 EAM_1827 EAM_1828     TRUE 0.987 10.000 0.400 NA   NA
 10477841 10477842 EAM_1829 EAM_1830     FALSE 0.089 197.000 0.000 NA   NA
 10477842 10477843 EAM_1830 EAM_1831   mppA FALSE 0.132 173.000 0.000 1.000   NA
 10477843 10477844 EAM_1831 EAM_1832 mppA   FALSE 0.048 133.000 0.000 1.000 N NA
 10477846 10477847 EAM_1834 EAM_1835 tyrR   FALSE 0.419 105.000 0.137 NA   NA
 10477847 10477848 EAM_1835 EAM_1836     TRUE 0.998 -3.000 0.791 NA   NA
 10477848 10477849 EAM_1836 EAM_1837   pspD TRUE 0.442 41.000 0.052 NA   NA
 10477849 10477850 EAM_1837 EAM_1838 pspD pspC TRUE 0.897 18.000 0.167 NA   NA
 10477850 10477851 EAM_1838 EAM_1839 pspC pspB TRUE 0.998 -3.000 0.913 NA   NA
 10477851 10477852 EAM_1839 EAM_1840 pspB pspA TRUE 0.926 63.000 0.739 NA   NA
 10477853 10477854 EAM_1841 EAM_1842 pspF sapA FALSE 0.162 338.000 0.402 1.000 N NA
 10477854 10477855 EAM_1842 EAM_1843 sapA sapB TRUE 0.990 -3.000 0.264 0.038 N NA
 10477855 10477856 EAM_1843 EAM_1844 sapB sapC TRUE 0.995 -13.000 0.284 0.038 Y NA
 10477856 10477857 EAM_1844 EAM_1845 sapC sapD TRUE 0.999 0.000 0.667 1.000 Y NA
 10477857 10477858 EAM_1845 EAM_1846 sapD sapF TRUE 0.999 0.000 0.684 0.015 Y NA
 10477862 10477863 EAM_1850 EAM_1851     TRUE 0.980 -6.000 0.222 NA   NA
 10477863 10477864 EAM_1851 EAM_1852     TRUE 0.733 154.000 0.444 NA   NA
 10477864 10477865 EAM_1852 EAM_1853     TRUE 0.733 154.000 0.444 NA   NA
 10477865 10477866 EAM_1853 EAM_1854     FALSE 0.025 310.000 0.000 NA   NA
 10477866 10477867 EAM_1854 EAM_1855   rnb FALSE 0.068 85.000 0.053 1.000 N NA
 10477869 10477870 EAM_1857 EAM_1858 osmB   TRUE 0.574 28.000 0.000 NA   NA
 10477870 10477871 EAM_1858 EAM_1859     FALSE 0.179 135.000 0.000 NA   NA
 10477872 10477873 EAM_1860 EAM_1861   pyrF TRUE 0.716 0.000 0.045 1.000 N NA
 10477873 10477874 EAM_1861 EAM_1862 pyrF   FALSE 0.060 246.000 0.125 1.000 N NA
 10477874 10477875 EAM_1862 EAM_1863     TRUE 0.994 7.000 0.576 NA   NA
 10477875 10477876 EAM_1863 EAM_1864   pgpB FALSE 0.279 176.000 0.143 NA   NA
 10477878 10477879 EAM_1866 EAM_1867 acnA   FALSE 0.082 204.000 0.000 NA   NA
 10477879 10477880 EAM_1867 EAM_1868     FALSE 0.286 57.000 0.000 NA   NA
 10477880 10477881 EAM_1868 EAM_1869   cysB FALSE 0.006 680.000 0.000 NA   NA
 10477881 10477882 EAM_1869 EAM_1870 cysB topA FALSE 0.003 212.000 0.008 1.000 N NA
 10477882 10477883 EAM_1870 EAM_1871 topA sohB FALSE 0.000 518.000 0.006 1.000 N NA
 10477885 10477886 EAM_1873 EAM_1874 rluB   FALSE 0.037 275.000 0.000 NA   NA
 10477886 10477887 EAM_1874 EAM_1875     TRUE 0.828 12.000 0.000 NA   NA
 10477887 10477888 EAM_1875 EAM_1876   trpH TRUE 0.990 0.000 0.281 NA   NA
 10477889 10477890 EAM_1877 EAM_1878 trpE trpG TRUE 1.000 0.000 0.703 0.001 Y NA
 10477890 10477891 EAM_1878 EAM_1879 trpG trpD TRUE 0.989 0.000 0.083 1.000 Y NA
 10477891 10477892 EAM_1879 EAM_1880 trpD trpC TRUE 0.996 3.000 0.293 1.000 Y NA
 10477892 10477893 EAM_1880 EAM_1881 trpC trpB TRUE 0.993 15.000 0.221 0.001 Y NA
 10477893 10477894 EAM_1881 EAM_1882 trpB trpA TRUE 1.000 0.000 0.947 0.001 Y NA
 10477894 10477895 EAM_1882 EAM_1883 trpA   FALSE 0.095 151.000 0.018 NA   NA
 10477897 10477898 EAM_1885 EAM_1886   ispZ FALSE 0.258 77.000 0.061 NA   NA
 10477898 10477899 EAM_1886 EAM_1887 ispZ   FALSE 0.367 73.000 0.167 NA N NA
 10477901 10477902 EAM_1889 EAM_1890     FALSE 0.204 109.000 0.000 NA   NA
 10477902 10477903 EAM_1890 EAM_1891   cls FALSE 0.213 100.000 0.000 NA   NA
 10477903 10477904 EAM_1891 EAM_1892 cls   TRUE 0.776 47.000 0.231 NA   NA
 10477905 10477906 EAM_1893 EAM_1894 oppF oppD TRUE 0.999 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 10477906 10477907 EAM_1894 EAM_1895 oppD oppC TRUE 0.996 12.000 0.554 1.000 Y NA
 10477907 10477908 EAM_1895 EAM_1896 oppC oppB TRUE 0.999 14.000 0.870 0.038 Y NA
 10477908 10477909 EAM_1896 EAM_1897 oppB oppA TRUE 0.840 86.000 0.151 0.038 Y NA
 10477909 10477910 EAM_1897 EAM_1898 oppA oppA2 TRUE 0.842 175.000 0.292 0.038 Y NA
 10477910 10477911 EAM_1898 EAM_1899 oppA2   FALSE 0.001 617.000 0.000 NA N NA
 10477912 10477913 EAM_1900 EAM_1901 adhE   FALSE 0.001 2668.000 0.000 1.000 N NA
 10477913 10477914 EAM_1901 EAM_1902     TRUE 0.984 17.000 0.571 1.000   NA
 10477914 10477915 EAM_1902 EAM_1903     TRUE 0.962 0.000 0.095 1.000   NA
 10477915 10477916 EAM_1903 EAM_1904     TRUE 0.981 -3.000 0.182 1.000   NA
 10477918 10477919 EAM_1906 EAM_1907     TRUE 0.993 -3.000 0.353 NA   NA
 10477919 10477920 EAM_1907 EAM_1908     TRUE 0.990 2.000 0.309 NA   NA
 10477920 10477921 EAM_1908 EAM_1909     TRUE 0.957 5.000 0.133 NA   NA
 10477921 10477922 EAM_1909 EAM_1910     FALSE 0.140 139.000 0.033 NA   NA
 10477922 10477923 EAM_1910 EAM_1911     TRUE 0.991 10.000 0.500 NA   NA
 10477923 10477924 EAM_1911 EAM_1912     TRUE 0.928 -7.000 0.087 NA   NA
 10477924 10477925 EAM_1912 EAM_1913     TRUE 0.802 10.000 0.087 1.000 N NA
 10477928 10477929 EAM_1916 EAM_1917 wbnF   TRUE 0.984 15.000 0.227 1.000 Y NA
 10477929 10477930 EAM_1917 EAM_1918   galU TRUE 0.941 28.000 0.157 1.000 Y NA
 10477930 10477931 EAM_1918 EAM_1919 galU hnr FALSE 0.284 195.000 0.235 1.000 N NA
 10477932 10477933 EAM_1920 EAM_1921   purU TRUE 0.792 39.000 0.200 NA   NA
 10477933 10477934 EAM_1921 EAM_t049 purU tRNA-Tyr FALSE 0.163 146.000 0.000 NA   NA
 10477934 10477935 EAM_t049 EAM_1922 tRNA-Tyr xthA FALSE 0.005 999.000 0.000 NA   NA
 10477936 10477937 EAM_1923 EAM_1924   topB TRUE 0.967 -3.000 0.123 NA   NA
 10477937 10477938 EAM_1924 EAM_1925 topB   FALSE 0.011 163.000 0.033 1.000 N NA
 10477939 10477940 EAM_1926 EAM_1927 sppA ansA FALSE 0.196 124.000 0.113 1.000 N NA
 10477940 10477941 EAM_1927 EAM_1928 ansA pncA TRUE 0.471 8.000 0.040 1.000 N NA
 10477942 10477943 EAM_1929 EAM_1930   msrB TRUE 0.974 7.000 0.216 NA   NA
 10477944 10477945 EAM_1931 EAM_1932 gapA   TRUE 0.739 121.000 0.154 1.000 Y NA
 10477946 10477947 EAM_1933 EAM_1934   mipA FALSE 0.281 80.000 0.067 1.000   NA
 10477948 10477949 EAM_1935 EAM_1936     TRUE 0.906 73.000 0.683 NA   NA
 10477949 10477950 EAM_1936 EAM_1937     FALSE 0.067 220.000 0.000 NA   NA
 10477950 10477951 EAM_1937 EAM_1938     TRUE 0.751 16.000 0.000 NA   NA
 10477951 10477952 EAM_1938 EAM_1939     FALSE 0.211 102.000 0.000 NA   NA
 10477952 10477953 EAM_1939 EAM_1940   cvrA FALSE 0.054 237.000 0.000 NA   NA
 10477953 10477954 EAM_1940 EAM_1941 cvrA wbaP FALSE 0.002 436.000 0.000 1.000 N NA
 10477954 10477955 EAM_1941 EAM_1942 wbaP   FALSE 0.337 151.000 0.200 1.000 N NA
 10477956 10477957 EAM_1943 EAM_1944 dadX dadA TRUE 0.721 30.000 0.168 1.000 N NA
 10477961 10477962 EAM_1948 EAM_1949     FALSE 0.364 64.000 0.088 NA   NA
 10477962 10477963 EAM_1949 EAM_1950     FALSE 0.203 110.000 0.000 NA   NA
 10477963 10477964 EAM_1950 EAM_1951     TRUE 0.679 20.000 0.000 NA   NA
 10477965 10477966 EAM_1952 EAM_1953 minC minD TRUE 0.971 42.000 0.466 1.000 Y NA
 10477966 10477967 EAM_1953 EAM_1954 minD minE TRUE 0.998 4.000 0.618 NA Y NA
 10477968 10477969 EAM_1955 EAM_1956 rnd fadD FALSE 0.211 111.000 0.115 1.000 N NA
 10477969 10477970 EAM_1956 EAM_1957 fadD   FALSE 0.155 206.000 0.169 1.000 N NA
 10477970 10477971 EAM_1957 EAM_1958   rpf FALSE 0.015 58.000 0.024 1.000 N NA
 10477971 10477972 EAM_1958 EAM_1959 rpf   FALSE 0.179 61.000 0.082 1.000 N NA
 10477975 10477976 EAM_1962 EAM_1963 pabB   TRUE 0.870 -10.000 0.116 1.000 N NA
 10477976 10477977 EAM_1963 EAM_1964   sdaA TRUE 0.547 177.000 0.409 1.000 N NA
 10477978 10477979 EAM_1965 EAM_1966   rrmA FALSE 0.036 288.000 0.000 1.000   NA
 10477979 10477980 EAM_1966 EAM_1967 rrmA cspC FALSE 0.113 174.000 0.038 1.000   NA
 10477980 10477981 EAM_1967 EAM_1968 cspC   TRUE 0.586 82.000 0.214 NA   NA
 10477981 10477982 EAM_1968 EAM_1969     FALSE 0.009 463.000 0.000 NA   NA
 10477982 10477983 EAM_1969 EAM_1970     TRUE 0.930 21.000 0.250 NA   NA
 10477985 10477986 EAM_1972 EAM_1973   prc FALSE 0.091 223.000 0.042 0.019 N NA
 10477986 10477987 EAM_1973 EAM_1974 prc proQ TRUE 0.917 20.000 0.304 NA N NA
 10477987 10477988 EAM_1974 EAM_1975 proQ   TRUE 0.644 97.000 0.081 NA Y NA
 10477989 10477990 EAM_1976 EAM_1977     TRUE 0.994 -31.000 0.840 NA   NA
 10477990 10477991 EAM_1977 EAM_1978     TRUE 0.741 142.000 0.420 NA   NA
 10477993 10477994 EAM_1980 EAM_1981     FALSE 0.211 102.000 0.000 NA   NA
 10477995 10477996 EAM_1982 EAM_1983     FALSE 0.206 55.000 0.021 NA   NA
 10477996 10477997 EAM_1983 EAM_1984     FALSE 0.008 512.000 0.000 NA   NA
 10477997 10477998 EAM_1984 EAM_1985     FALSE 0.009 465.000 0.000 NA   NA
 10477998 10477999 EAM_1985 EAM_1986     TRUE 0.979 27.000 0.704 NA   NA
 10477999 10478000 EAM_1986 EAM_1987     FALSE 0.011 421.000 0.000 NA   NA
 10478000 10478001 EAM_1987 EAM_1988     TRUE 0.894 5.000 0.000 NA   NA
 10478002 10478003 EAM_1989 EAM_1990 holE exoX FALSE 0.228 146.000 0.074 1.000   NA
 10478009 10478010 EAM_1996 EAM_1997 pykA cmr FALSE 0.310 211.000 0.000 1.000 Y NA
 10478011 10478012 EAM_1998 EAM_1999 msbB   TRUE 0.836 140.000 0.299 1.000 Y NA
 10478012 10478013 EAM_1999 EAM_2000   znuA TRUE 0.867 12.000 0.131 1.000 N NA
 10478014 10478015 EAM_2001 EAM_2002 znuC znuB TRUE 0.999 -7.000 0.755 0.077 Y NA
 10478016 10478017 EAM_2003 EAM_2004 ruvB ruvA TRUE 0.999 9.000 0.549 0.002 Y NA
 10478017 10478018 EAM_2004 EAM_2005 ruvA ruvC TRUE 0.964 70.000 0.451 0.008 Y NA
 10478018 10478019 EAM_2005 EAM_2006 ruvC   TRUE 0.892 32.000 0.277 NA   NA
 10478019 10478020 EAM_2006 EAM_2007   nudB FALSE 0.087 183.000 0.035 NA   NA
 10478020 10478021 EAM_2007 EAM_2008 nudB aspS TRUE 0.760 0.000 0.050 1.000 N NA
 10478022 10478023 EAM_2009 EAM_2010     FALSE 0.403 87.000 0.126 NA   NA
 10478023 10478024 EAM_2010 EAM_2011     TRUE 0.463 50.000 0.089 NA   NA
 10478024 10478025 EAM_2011 EAM_2012     TRUE 0.991 0.000 0.315 NA   NA
 10478032 10478033 EAM_2019 EAM_2020 flhE flhA TRUE 0.991 0.000 0.158 0.005   NA
 10478033 10478034 EAM_2020 EAM_2021 flhA flhB TRUE 0.997 -7.000 0.287 0.013 Y NA
 10478034 10478035 EAM_2021 EAM_2022 flhB cheZ FALSE 0.423 163.000 0.023 1.000 Y NA
 10478035 10478036 EAM_2022 EAM_2023 cheZ cheY TRUE 0.983 14.000 0.200 1.000 Y NA
 10478036 10478037 EAM_2023 EAM_2024 cheY cheB TRUE 0.836 103.000 0.133 0.010 Y NA
 10478037 10478038 EAM_2024 EAM_2025 cheB cheR TRUE 0.983 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 10478038 10478039 EAM_2025 EAM_2026 cheR   TRUE 0.951 28.000 0.188 1.000 Y NA
 10478039 10478040 EAM_2026 EAM_2027     FALSE 0.217 81.000 0.000 NA   NA
 10478040 10478041 EAM_2027 EAM_2028   cheD FALSE 0.009 455.000 0.000 NA   NA
 10478041 10478042 EAM_2028 EAM_2029 cheD cheW TRUE 0.608 175.000 0.000 0.009 Y NA
 10478042 10478043 EAM_2029 EAM_2030 cheW cheA TRUE 0.993 25.000 0.447 0.005 Y NA
 10478043 10478044 EAM_2030 EAM_2031 cheA motB TRUE 0.999 5.000 0.913 1.000 Y NA
 10478044 10478045 EAM_2031 EAM_2032 motB motA TRUE 0.998 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 10478045 10478046 EAM_2032 EAM_2033 motA flhC TRUE 0.754 135.000 0.408 1.000   NA
 10478046 10478047 EAM_2033 EAM_2034 flhC flhD TRUE 0.987 0.000 0.083 0.001   NA
 10478047 10478048 EAM_2034 EAM_2035 flhD otsA FALSE 0.005 975.000 0.000 1.000   NA
 10478048 10478049 EAM_2035 EAM_2036 otsA otsB TRUE 0.985 -25.000 0.068 0.001 Y NA
 10478050 10478051 EAM_2037 EAM_2038     FALSE 0.200 115.000 0.000 NA   NA
 10478051 10478052 EAM_2038 EAM_2039   umuD FALSE 0.143 158.000 0.000 NA   NA
 10478052 10478053 EAM_2039 EAM_2040 umuD umuC TRUE 0.994 3.000 0.571 1.000 N NA
 10478055 10478056 EAM_2042 EAM_2043     FALSE 0.135 95.000 0.017 NA   NA
 10478057 10478058 EAM_2044 EAM_2045     TRUE 0.992 0.000 0.333 NA   NA
 10478058 10478059 EAM_2045 EAM_2046     FALSE 0.043 257.000 0.000 NA   NA
 10478059 10478060 EAM_2046 EAM_2047     FALSE 0.023 324.000 0.000 NA   NA
 10478060 10478061 EAM_2047 EAM_2048     FALSE 0.024 190.000 0.000 1.000 N NA
 10478063 10478064 EAM_2050 EAM_2051     FALSE 0.067 217.000 0.046 NA   NA
 10478067 10478068 EAM_t051 EAM_2053     FALSE 0.045 255.000 0.000 NA   NA
 10478068 10478069 EAM_2053 EAM_2054     FALSE 0.053 238.000 0.000 NA   NA
 10478070 10478071 EAM_2055 EAM_2056 phoH   FALSE 0.316 52.000 0.000 NA   NA
 10478071 10478072 EAM_2056 EAM_2057     FALSE 0.053 238.000 0.000 NA   NA
 10478072 10478073 EAM_2057 EAM_2058     TRUE 0.996 7.000 0.378 NA Y NA
 10478073 10478074 EAM_2058 EAM_2059     TRUE 0.927 57.000 0.356 NA Y NA
 10478074 10478075 EAM_2059 EAM_2060   putP FALSE 0.017 217.000 0.000 1.000 N NA
 10478077 10478078 EAM_2062 EAM_2063   dcyD FALSE 0.052 241.000 0.000 NA   NA
 10478078 10478079 EAM_2063 EAM_2064 dcyD fliZ FALSE 0.215 98.000 0.000 NA   NA
 10478079 10478080 EAM_2064 EAM_2065 fliZ fliA TRUE 0.607 42.000 0.108 1.000   NA
 10478080 10478081 EAM_2065 EAM_2066 fliA   FALSE 0.083 156.000 0.012 NA   NA
 10478081 10478082 EAM_2066 EAM_2067   fliC FALSE 0.239 72.000 0.000 NA   NA
 10478083 10478084 EAM_2068 EAM_2069 fliD fliS TRUE 0.991 18.000 0.284 0.004 Y NA
 10478084 10478085 EAM_2069 EAM_2070 fliS fliT TRUE 0.825 13.000 0.000 1.000   NA
 10478085 10478086 EAM_2070 EAM_2071 fliT amyA FALSE 0.182 143.000 0.000 1.000   NA
 10478087 10478088 EAM_2072 EAM_2073     FALSE 0.078 208.000 0.000 NA   NA
 10478088 10478089 EAM_2073 EAM_2074     FALSE 0.181 134.000 0.000 NA   NA
 10478089 10478090 EAM_2074 EAM_2075     FALSE 0.159 181.000 0.083 NA   NA
 10478090 10478091 EAM_2075 EAM_2076     FALSE 0.330 35.000 0.008 NA   NA
 10478091 10478092 EAM_2076 EAM_2077     TRUE 0.706 12.000 0.008 NA   NA
 10478092 10478093 EAM_2077 EAM_2078     FALSE 0.202 112.000 0.000 NA   NA
 10478093 10478094 EAM_2078 EAM_2079   vsr FALSE 0.114 178.000 0.000 NA   NA
 10478094 10478095 EAM_2079 EAM_2080 vsr ecoRIIM TRUE 0.732 83.000 0.000 0.040 Y NA
 10478098 10478099 EAM_2083 EAM_2084     FALSE 0.263 43.000 0.010 NA   NA
 10478099 10478100 EAM_2084 EAM_t052   tRNA-Asn FALSE 0.214 99.000 0.000 NA   NA
 10478102 10478103 EAM_2086 EAM_2087 katG sitA FALSE 0.146 297.000 0.000 1.000 Y NA
 10478103 10478104 EAM_2087 EAM_2088 sitA sitB TRUE 0.999 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 10478104 10478105 EAM_2088 EAM_2089 sitB sitC TRUE 1.000 0.000 0.857 0.077 Y NA
 10478105 10478106 EAM_2089 EAM_2090 sitC sitD TRUE 0.999 -3.000 0.525 0.004 Y NA
 10478106 10478107 EAM_2090 EAM_t053 sitD tRNA-Asn FALSE 0.060 230.000 0.000 NA   NA
 10478107 10478108 EAM_t053 EAM_2091 tRNA-Asn   FALSE 0.035 279.000 0.000 NA   NA
 10478108 10478109 EAM_2091 EAM_2092     FALSE 0.006 641.000 0.000 NA   NA
 10478109 10478110 EAM_2092 EAM_2093     FALSE 0.019 354.000 0.000 NA   NA
 10478110 10478111 EAM_2093 EAM_2094     FALSE 0.017 364.000 0.000 NA   NA
 10478111 10478112 EAM_2094 EAM_2095     FALSE 0.099 190.000 0.000 NA   NA
 10478112 10478113 EAM_2095 EAM_2096     FALSE 0.216 82.000 0.000 NA   NA
 10478114 10478115 EAM_2097 EAM_2098     TRUE 0.995 -3.000 0.472 1.000   NA
 10478115 10478116 EAM_2098 EAM_2099     TRUE 0.998 12.000 0.558 0.037 Y NA
 10478116 10478117 EAM_2099 EAM_2100     TRUE 0.999 0.000 0.431 0.037 Y NA
 10478118 10478119 EAM_2101 EAM_2102     FALSE 0.007 528.000 0.000 NA   NA
 10478119 10478120 EAM_2102 EAM_2103     FALSE 0.043 258.000 0.000 NA   NA
 10478120 10478121 EAM_2103 EAM_2104     FALSE 0.198 119.000 0.000 NA   NA
 10478121 10478122 EAM_2104 EAM_2105   pehA FALSE 0.029 298.000 0.000 NA   NA
 10478123 10478124 EAM_2106 EAM_2107     FALSE 0.197 120.000 0.000 NA   NA
 10478124 10478125 EAM_2107 EAM_2108     TRUE 0.858 10.000 0.000 NA   NA
 10478127 10478128 EAM_2110 EAM_2111   cbl FALSE 0.038 156.000 0.000 1.000 N NA
 10478128 10478129 EAM_2111 EAM_2112 cbl nac TRUE 0.863 137.000 0.222 0.038 Y NA
 10478131 10478132 EAM_2113 EAM_2114     TRUE 0.974 -10.000 0.231 NA   NA
 10478133 10478134 EAM_2115 EAM_2116     TRUE 0.539 31.000 0.000 NA   NA
 10478134 10478135 EAM_2116 EAM_2117     TRUE 0.894 5.000 0.000 NA   NA
 10478135 10478136 EAM_2117 EAM_2118   amn FALSE 0.008 502.000 0.000 NA   NA
 10478136 10478137 EAM_2118 EAM_2119 amn   FALSE 0.019 206.000 0.000 1.000 N NA
 10478139 10478140 EAM_2121 EAM_t055   tRNA-Asn FALSE 0.215 86.000 0.000 NA   NA
 10478142 10478143 EAM_2123 EAM_2124     TRUE 0.676 25.000 0.070 NA   NA
 10478143 10478144 EAM_2124 EAM_2125     FALSE 0.260 104.000 0.070 NA   NA
 10478144 10478145 EAM_2125 EAM_2126     TRUE 0.986 0.000 0.041 1.000 Y NA
 10478145 10478146 EAM_2126 EAM_2127     TRUE 0.445 26.000 0.003 1.000   NA
 10478146 10478147 EAM_2127 EAM_2128     TRUE 0.713 18.000 0.000 NA   NA
 10478147 10478148 EAM_2128 EAM_2129     TRUE 0.556 20.000 0.019 NA   NA
 10478148 10478149 EAM_2129 EAM_2130     TRUE 0.983 3.000 0.056 1.000 Y NA
 10478149 10478150 EAM_2130 EAM_2131     FALSE 0.138 162.000 0.000 NA   NA
 10478150 10478151 EAM_2131 EAM_2132     FALSE 0.034 283.000 0.000 NA   NA
 10478152 10478153 EAM_2133 EAM_2134     FALSE 0.063 225.000 0.000 NA   NA
 10478153 10478154 EAM_2134 EAM_2135     FALSE 0.388 161.000 0.180 NA   NA
 10478156 10478157 EAM_2137 EAM_2139     FALSE 0.067 221.000 0.000 NA   NA
 10478157 10478158 EAM_2139 EAM_2140     FALSE 0.198 118.000 0.000 NA   NA
 10478159 10478160 EAM_2141 EAM_2142 hisG hisD TRUE 0.995 8.000 0.171 0.003 Y NA
 10478160 10478161 EAM_2142 EAM_2143 hisD hisC TRUE 0.998 -3.000 0.294 0.003 Y NA
 10478161 10478162 EAM_2143 EAM_2144 hisC hisB TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.003 Y NA
 10478162 10478163 EAM_2144 EAM_2145 hisB hisH TRUE 0.996 0.000 0.128 0.003 Y NA
 10478163 10478164 EAM_2145 EAM_2146 hisH hisA TRUE 0.996 5.000 0.210 0.003 Y NA
 10478164 10478165 EAM_2146 EAM_2147 hisA hisF TRUE 0.998 -18.000 0.433 0.003 Y NA
 10478165 10478166 EAM_2147 EAM_2148 hisF hisI TRUE 0.999 -6.000 0.430 0.003 Y NA
 10478166 10478167 EAM_2148 EAM_2149 hisI   FALSE 0.162 55.000 0.002 NA   NA
 10478170 10478171 EAM_2152 EAM_2153 wbbO wbbN TRUE 0.705 14.000 0.022 NA   NA
 10478171 10478172 EAM_2153 EAM_2154 wbbN rfbD TRUE 0.900 -3.000 0.028 NA   NA
 10478172 10478173 EAM_2154 EAM_2155 rfbD wbbM TRUE 0.955 12.000 0.016 1.000 Y NA
 10478173 10478174 EAM_2155 EAM_2156 wbbM rfbB TRUE 0.972 25.000 0.273 1.000 Y NA
 10478174 10478175 EAM_2156 EAM_2157 rfbB rfbA TRUE 0.999 0.000 0.385 0.076 Y NA
 10478175 10478176 EAM_2157 EAM_2158 rfbA   TRUE 0.631 73.000 0.000 1.000 Y NA
 10478176 10478177 EAM_2158 EAM_2159   rfbA TRUE 0.757 120.000 0.000 0.003 Y NA
 10478177 10478178 EAM_2159 EAM_2160 rfbA rfbB TRUE 0.996 2.000 0.143 0.003 Y NA
 10478178 10478179 EAM_2160 EAM_2161 rfbB galE FALSE 0.152 397.000 0.000 0.002 Y NA
 10478179 10478180 EAM_2161 EAM_2162 galE galF TRUE 0.783 55.000 0.111 1.000 Y NA
 10478180 10478181 EAM_2162 EAM_2163 galF amsL FALSE 0.173 148.000 0.000 1.000   NA
 10478181 10478182 EAM_2163 EAM_2164 amsL amsK TRUE 0.956 -3.000 0.087 1.000   NA
 10478182 10478183 EAM_2164 EAM_2165 amsK amsJ TRUE 0.854 5.000 0.027 NA   NA
 10478183 10478184 EAM_2165 EAM_2166 amsJ amsF FALSE 0.115 149.000 0.027 NA   NA
 10478184 10478185 EAM_2166 EAM_2167 amsF amsE FALSE 0.215 87.000 0.000 NA   NA
 10478185 10478186 EAM_2167 EAM_2168 amsE amsD TRUE 0.722 13.000 0.021 NA   NA
 10478186 10478187 EAM_2168 EAM_2169 amsD amsC FALSE 0.133 166.000 0.000 NA   NA
 10478187 10478188 EAM_2169 EAM_2170 amsC amsB TRUE 0.791 31.000 0.154 NA   NA
 10478188 10478189 EAM_2170 EAM_2171 amsB amsA FALSE 0.216 89.000 0.000 NA   NA
 10478189 10478190 EAM_2171 EAM_2172 amsA amsI TRUE 0.989 13.000 0.667 1.000 N NA
 10478190 10478191 EAM_2172 EAM_2173 amsI amsH TRUE 0.963 16.000 0.400 1.000 N NA
 10478191 10478192 EAM_2173 EAM_2174 amsH amsG TRUE 0.585 113.000 0.000 1.000 Y NA
 10478194 10478195 EAM_2176 EAM_2177 asmA dcd FALSE 0.055 129.000 0.057 NA N NA
 10478195 10478196 EAM_2177 EAM_2178 dcd udk TRUE 0.920 26.000 0.098 1.000 Y NA
 10478197 10478198 EAM_2179 EAM_2180     FALSE 0.231 99.000 0.000 1.000   NA
 10478198 10478199 EAM_2180 EAM_2181     FALSE 0.003 210.000 0.019 1.000 N NA
 10478201 10478202 EAM_2183 EAM_2184 mdtA mdtB TRUE 0.996 0.000 0.667 NA N NA
 10478202 10478203 EAM_2184 EAM_2185 mdtB mdtC TRUE 0.987 -3.000 0.062 NA Y NA
 10478203 10478204 EAM_2185 EAM_2186 mdtC baeS FALSE 0.019 262.000 0.070 1.000 N NA
 10478204 10478205 EAM_2186 EAM_2187 baeS baeR TRUE 0.996 15.000 0.591 1.000 Y NA
 10478205 10478206 EAM_2187 EAM_2188 baeR   FALSE 0.145 157.000 0.000 NA   NA
 10478206 10478207 EAM_2188 EAM_2189     FALSE 0.024 320.000 0.000 NA   NA
 10478207 10478208 EAM_2189 EAM_2190     TRUE 0.658 113.000 0.286 NA   NA
 10478208 10478209 EAM_2190 EAM_2191     FALSE 0.117 176.000 0.000 NA   NA
 10478210 10478211 EAM_2192 EAM_2193 thiD thiM TRUE 0.993 -3.000 0.037 0.004 Y NA
 10478211 10478212 EAM_2193 EAM_2194 thiM   FALSE 0.013 396.000 0.000 NA   NA
 10478212 10478213 EAM_2194 EAM_2195     FALSE 0.014 390.000 0.000 NA   NA
 10478214 10478215 EAM_2196 EAM_2197     TRUE 0.484 36.000 0.000 NA   NA
 10478217 10478218 EAM_2199 EAM_2200 metG   FALSE 0.329 61.000 0.062 1.000   NA
 10478218 10478219 EAM_2200 EAM_2201     TRUE 0.988 -7.000 0.340 1.000   NA
 10478219 10478220 EAM_2201 EAM_2202   cdd FALSE 0.392 126.000 0.198 1.000 N NA
 10478220 10478221 EAM_2202 EAM_2203 cdd sfcA FALSE 0.009 133.000 0.022 1.000 N NA
 10478221 10478222 EAM_2203 EAM_2204 sfcA sanA FALSE 0.062 180.000 0.013 NA   NA
 10478223 10478224 EAM_2205 EAM_2206 mglC mglA TRUE 0.996 20.000 0.905 1.000 Y NA
 10478224 10478225 EAM_2206 EAM_2207 mglA mglB TRUE 0.894 55.000 0.250 NA Y NA
 10478225 10478226 EAM_2207 EAM_2208 mglB galS FALSE 0.004 315.000 0.000 NA N NA
 10478226 10478227 EAM_2208 EAM_2209 galS   TRUE 0.768 153.000 0.500 NA   NA
 10478227 10478228 EAM_2209 EAM_2210   folE TRUE 0.901 101.000 0.719 NA   NA
 10478229 10478230 EAM_2211 EAM_2212   adhC TRUE 0.840 91.000 0.636 1.000 N NA
 10478230 10478231 EAM_2212 EAM_2213 adhC   TRUE 0.953 12.000 0.182 1.000   NA
 10478232 10478233 EAM_2214 EAM_2215     FALSE 0.059 95.000 0.000 1.000 N NA
 10478233 10478234 EAM_2215 EAM_2216     TRUE 0.999 0.000 0.833 1.000 Y NA
 10478234 10478235 EAM_2216 EAM_2217   lysP FALSE 0.019 139.000 0.035 1.000 N NA
 10478235 10478236 EAM_2217 EAM_2218 lysP   FALSE 0.080 157.000 0.074 1.000 N NA
 10478237 10478238 EAM_2219 EAM_2220   nfo FALSE 0.230 66.000 0.040 NA   NA
 10478239 10478240 EAM_2221 EAM_2222 fruA fruK TRUE 0.994 17.000 0.562 1.000 Y NA
 10478240 10478241 EAM_2222 EAM_2223 fruK fruB TRUE 0.991 -3.000 0.112 1.000 Y NA
 10478241 10478242 EAM_2223 EAM_2224 fruB   FALSE 0.024 321.000 0.000 NA   NA
 10478243 10478244 EAM_2225 EAM_2226     FALSE 0.171 149.000 0.000 1.000   NA
 10478244 10478245 EAM_2226 EAM_2227   spr FALSE 0.008 489.000 0.000 NA   NA
 10478245 10478246 EAM_2227 EAM_2228 spr rtn FALSE 0.097 287.000 0.219 NA N NA
 10478246 10478247 EAM_2228 EAM_2229 rtn   TRUE 0.689 84.000 0.394 NA N NA
 10478247 10478248 EAM_2229 EAM_2230     TRUE 0.997 12.000 0.848 0.037   NA
 10478248 10478249 EAM_2230 EAM_2231     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.037   NA
 10478249 10478250 EAM_2231 EAM_2232     TRUE 0.998 2.000 0.758 1.000   NA
 10478251 10478252 EAM_2233 EAM_2234   bcr FALSE 0.015 379.000 0.000 NA   NA
 10478252 10478253 EAM_2234 EAM_2235 bcr rsuA FALSE 0.251 31.000 0.055 1.000 N NA
 10478254 10478255 EAM_2236 EAM_2237   rplY FALSE 0.209 127.000 0.024 0.018 N NA
 10478257 10478258 EAM_2239 EAM_2240     TRUE 0.569 22.000 0.027 NA   NA
 10478258 10478259 EAM_2240 EAM_t056   tRNA-Pro FALSE 0.226 76.000 0.000 NA   NA
 10478259 10478260 EAM_t056 EAM_2241 tRNA-Pro   FALSE 0.068 219.000 0.000 NA   NA
 10478262 10478263 EAM_2243 EAM_2244     TRUE 0.482 132.000 0.000 0.002   NA
 10478263 10478264 EAM_2244 EAM_2245     FALSE 0.197 120.000 0.000 NA   NA
 10478264 10478265 EAM_2245 EAM_2246     FALSE 0.005 917.000 0.000 NA   NA
 10478265 10478266 EAM_2246 EAM_2247     FALSE 0.049 245.000 0.000 NA   NA
 10478266 10478267 EAM_2247 EAM_2248     FALSE 0.021 337.000 0.000 NA   NA
 10478267 10478268 EAM_2248 EAM_2249     TRUE 0.903 4.000 0.000 NA   NA
 10478270 10478271 EAM_2251 EAM_2252     TRUE 0.917 2.000 0.000 NA   NA
 10478271 10478272 EAM_2252 EAM_2253     FALSE 0.147 156.000 0.000 NA   NA
 10478272 10478273 EAM_2253 EAM_2254     FALSE 0.244 70.000 0.000 NA   NA
 10478274 10478275 EAM_2255 EAM_2256   alkB FALSE 0.261 63.000 0.000 NA   NA
 10478275 10478276 EAM_2256 EAM_2257 alkB apbE FALSE 0.194 10.000 0.015 NA N NA
 10478279 10478280 EAM_2260 EAM_2261     TRUE 0.792 14.000 0.000 NA   NA
 10478280 10478281 EAM_2261 EAM_2262   rcsB TRUE 0.999 2.000 0.558 1.000 Y NA
 10478282 10478283 EAM_2263 EAM_2264 rcsC gyrA FALSE 0.007 437.000 0.013 0.075 N NA
 10478284 10478285 EAM_2265 EAM_2266 ubiG nrdA FALSE 0.002 493.000 0.000 1.000 N NA
 10478285 10478286 EAM_2266 EAM_2267 nrdA nrdB TRUE 0.989 51.000 0.667 0.001 Y NA
 10478286 10478287 EAM_2267 EAM_2268 nrdB   FALSE 0.288 3.000 0.023 1.000 N NA
 10478287 10478288 EAM_2268 EAM_2269     FALSE 0.231 74.000 0.000 NA   NA
 10478289 10478290 EAM_2270 EAM_2271     FALSE 0.121 173.000 0.000 NA   NA
 10478290 10478291 EAM_2271 EAM_2272     FALSE 0.202 111.000 0.000 NA   NA
 10478291 10478292 EAM_2272 EAM_2273     FALSE 0.197 120.000 0.000 NA   NA
 10478296 10478297 EAM_2277 EAM_2278 elaA   FALSE 0.272 60.000 0.000 NA   NA
 10478297 10478298 EAM_2278 EAM_2279     TRUE 0.868 9.000 0.000 NA   NA
 10478298 10478299 EAM_2279 EAM_2280   nuoN FALSE 0.040 265.000 0.000 NA   NA
 10478299 10478300 EAM_2280 EAM_2281 nuoN nuoM TRUE 0.999 7.000 0.437 0.001 Y NA
 10478300 10478301 EAM_2281 EAM_2282 nuoM nuoL TRUE 0.942 213.000 0.713 0.001 Y NA
 10478301 10478302 EAM_2282 EAM_2283 nuoL nuoK TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.004 Y NA
 10478302 10478303 EAM_2283 EAM_2284 nuoK nuoJ TRUE 0.998 -3.000 0.269 0.002 Y NA
 10478303 10478304 EAM_2284 EAM_2285 nuoJ nuoI TRUE 0.998 11.000 0.428 0.004 Y NA
 10478304 10478305 EAM_2285 EAM_2286 nuoI nuoH TRUE 0.997 13.000 0.423 0.004 Y NA
 10478305 10478306 EAM_2286 EAM_2287 nuoH nuoG TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.004 Y NA
 10478306 10478307 EAM_2287 EAM_2288 nuoG nuoF TRUE 0.930 51.000 0.180 0.004 Y NA
 10478307 10478308 EAM_2288 EAM_2289 nuoF nuoE TRUE 0.997 -3.000 0.186 0.004 Y NA
 10478308 10478309 EAM_2289 EAM_2290 nuoE nuoC TRUE 0.999 3.000 0.407 0.004 Y NA
 10478309 10478310 EAM_2290 EAM_2291 nuoC nuoB TRUE 0.979 119.000 0.691 0.002 Y NA
 10478310 10478311 EAM_2291 EAM_2292 nuoB nuoA TRUE 0.995 18.000 0.377 0.002 Y NA
 10478311 10478312 EAM_2292 EAM_2293 nuoA lrhA FALSE 0.001 668.000 0.000 1.000 N NA
 10478313 10478314 EAM_2294 EAM_2295   yfbR TRUE 0.431 61.000 0.104 1.000   NA
 10478315 10478316 EAM_2296 EAM_2297     FALSE 0.082 204.000 0.000 NA   NA
 10478316 10478317 EAM_2297 EAM_2298     FALSE 0.006 602.000 0.000 NA   NA
 10478317 10478318 EAM_2298 EAM_2299     FALSE 0.008 492.000 0.000 NA   NA
 10478318 10478319 EAM_2299 EAM_2300     FALSE 0.218 80.000 0.000 NA   NA
 10478320 10478321 EAM_2301 EAM_2302 ackA pta TRUE 0.706 207.000 0.634 1.000   NA
 10478322 10478323 EAM_2303 EAM_2304     FALSE 0.175 275.000 0.000 1.000 Y NA
 10478324 10478325 EAM_2305 EAM_2306 puuE   TRUE 0.695 77.000 0.100 1.000 Y NA
 10478325 10478326 EAM_2306 EAM_2307     TRUE 0.763 60.000 0.024 0.037 Y NA
 10478326 10478327 EAM_2307 EAM_2308     TRUE 0.984 11.000 0.072 0.037 Y NA
 10478328 10478329 EAM_2309 EAM_2310     FALSE 0.194 123.000 0.000 NA   NA
 10478329 10478330 EAM_2310 EAM_2311     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 10478332 10478333 EAM_2313 EAM_2314 hisP hisM TRUE 0.998 9.000 0.643 1.000 Y NA
 10478333 10478334 EAM_2314 EAM_2315 hisM hisQ TRUE 1.000 -3.000 0.900 0.013 Y NA
 10478334 10478335 EAM_2315 EAM_2316 hisQ hisJ TRUE 0.934 217.000 0.833 0.037 Y NA
 10478335 10478336 EAM_2316 EAM_2317 hisJ ubiX FALSE 0.009 266.000 0.000 1.000 N NA
 10478336 10478337 EAM_2317 EAM_2318 ubiX purF FALSE 0.091 70.000 0.056 1.000 N NA
 10478337 10478338 EAM_2318 EAM_2319 purF cvpA TRUE 0.867 37.000 0.262 1.000   NA
 10478338 10478339 EAM_2319 EAM_2320 cvpA   TRUE 0.484 36.000 0.000 NA   NA
 10478339 10478340 EAM_2320 EAM_2321   dedD TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 10478340 10478341 EAM_2321 EAM_2322 dedD folC TRUE 0.962 -16.000 0.216 NA   NA
 10478341 10478342 EAM_2322 EAM_2323 folC accD TRUE 0.736 66.000 0.383 1.000 N NA
 10478342 10478343 EAM_2323 EAM_2324 accD   FALSE 0.028 302.000 0.000 NA   NA
 10478343 10478344 EAM_2324 EAM_2325   dedA FALSE 0.019 353.000 0.000 NA   NA
 10478344 10478345 EAM_2325 EAM_2326 dedA truA TRUE 0.496 31.000 0.038 NA   NA
 10478345 10478346 EAM_2326 EAM_2327 truA usg TRUE 0.643 0.000 0.040 1.000 N NA
 10478346 10478347 EAM_2327 EAM_2328 usg pdxB TRUE 0.799 112.000 0.097 0.006 Y NA
 10478347 10478348 EAM_2328 EAM_2329 pdxB   FALSE 0.034 144.000 0.043 1.000 N NA
 10478349 10478350 EAM_2330 EAM_2331   flk FALSE 0.249 167.000 0.118 NA   NA
 10478352 10478353 EAM_2333 EAM_2334     FALSE 0.130 167.000 0.000 NA   NA
 10478354 10478355 EAM_2335 EAM_2336   fabB FALSE 0.006 869.000 0.000 1.000   NA
 10478357 10478358 EAM_2338 EAM_2339     TRUE 0.941 32.000 0.425 NA   NA
 10478358 10478359 EAM_2339 EAM_2340     TRUE 0.468 89.000 0.153 NA   NA
 10478359 10478360 EAM_2340 EAM_2341   mepA TRUE 0.955 10.000 0.160 1.000   NA
 10478360 10478361 EAM_2341 EAM_2342 mepA aroC FALSE 0.250 5.000 0.025 1.000 N NA
 10478361 10478362 EAM_2342 EAM_2343 aroC   TRUE 0.475 25.000 0.081 1.000 N NA
 10478364 10478365 EAM_2345 EAM_2346 sixA fadJ FALSE 0.031 171.000 0.000 1.000 N NA
 10478365 10478366 EAM_2346 EAM_2347 fadJ fadI TRUE 0.998 0.000 0.430 1.000 Y NA
 10478368 10478369 EAM_2349 EAM_2350 vacJ   TRUE 0.762 40.000 0.239 1.000 N NA
 10478369 10478370 EAM_2350 EAM_2351     TRUE 0.999 -3.000 0.727 NA Y NA
 10478370 10478371 EAM_2351 EAM_2352   ccmG TRUE 0.999 -3.000 0.578 NA Y NA
 10478371 10478372 EAM_2352 EAM_2353 ccmG ccmF TRUE 1.000 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 10478372 10478373 EAM_2353 EAM_2354 ccmF ccmE TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 10478373 10478374 EAM_2354 EAM_2355 ccmE ccmD TRUE 0.989 -3.000 0.344 1.000 N NA
 10478374 10478375 EAM_2355 EAM_2356 ccmD ccmC TRUE 0.994 -3.000 0.501 1.000 N NA
 10478375 10478376 EAM_2356 EAM_2357 ccmC ccmB TRUE 0.971 90.000 0.501 0.001 Y NA
 10478376 10478377 EAM_2357 EAM_2358 ccmB ccmA TRUE 0.999 0.000 0.503 0.002 Y NA
 10478378 10478379 EAM_2359 EAM_2360     TRUE 0.869 10.000 0.000 1.000   NA
 10478379 10478380 EAM_2360 EAM_2361     TRUE 0.935 0.000 0.000 1.000   NA
 10478380 10478381 EAM_2361 EAM_2362     TRUE 0.935 0.000 0.000 1.000   NA
 10478381 10478382 EAM_2362 EAM_t057   tRNA-Arg FALSE 0.202 111.000 0.000 NA   NA
 10478384 10478385 EAM_2364 EAM_2365     FALSE 0.179 135.000 0.000 NA   NA
 10478388 10478389 EAM_2368 EAM_2369     FALSE 0.063 225.000 0.000 NA   NA
 10478389 10478390 EAM_2369 EAM_2370     TRUE 0.490 84.000 0.167 NA   NA
 10478392 10478393 EAM_2372 EAM_2373     FALSE 0.125 119.000 0.018 NA   NA
 10478393 10478394 EAM_2373 EAM_2374   glk FALSE 0.015 380.000 0.000 NA   NA
 10478394 10478395 EAM_2374 EAM_2375 glk ipdC TRUE 0.506 166.000 0.075 1.000 Y NA
 10478396 10478397 EAM_2376 EAM_2377     FALSE 0.063 225.000 0.000 NA   NA
 10478400 10478401 EAM_t058 EAM_t059 tRNA-Ala tRNA-Ala FALSE 0.298 55.000 0.000 NA   NA
 10478402 10478403 EAM_2380 EAM_2381     TRUE 0.713 150.000 0.400 1.000   NA
 10478405 10478406 EAM_t060 EAM_t061     FALSE 0.268 61.000 0.000 NA   NA
 10478406 10478407 EAM_t061 EAM_t062   tRNA-Val TRUE 0.496 35.000 0.000 NA   NA
 10478407 10478408 EAM_t062 EAM_t063 tRNA-Val tRNA-Lys TRUE 0.874 8.000 0.000 NA   NA
 10478408 10478409 EAM_t063 EAM_2383 tRNA-Lys flxA FALSE 0.005 736.000 0.000 NA   NA
 10478412 10478413 EAM_2386 EAM_2387   ligA TRUE 0.863 2.000 0.017 NA   NA
 10478413 10478414 EAM_2387 EAM_2388 ligA zipA FALSE 0.013 68.000 0.013 1.000 N NA
 10478415 10478416 EAM_2389 EAM_2390 cysZ cysK FALSE 0.405 218.000 0.122 1.000 Y NA
 10478416 10478417 EAM_2390 EAM_2391 cysK ptsH FALSE 0.001 395.000 0.019 1.000 N NA
 10478417 10478418 EAM_2391 EAM_2392 ptsH ptsI TRUE 0.504 207.000 0.000 0.005 Y NA
 10478418 10478419 EAM_2392 EAM_2393 ptsI crr TRUE 0.871 44.000 0.025 0.005 Y NA
 10478420 10478421 EAM_2394 EAM_2395     TRUE 0.995 -3.000 0.216 1.000 Y NA
 10478421 10478422 EAM_2395 EAM_2396   cysM FALSE 0.005 184.000 0.010 1.000 N NA
 10478422 10478423 EAM_2396 EAM_2397 cysM cysA FALSE 0.059 79.000 0.049 1.000 N NA
 10478423 10478424 EAM_2397 EAM_2398 cysA cysW TRUE 0.988 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 10478424 10478425 EAM_2398 EAM_2399 cysW cysU TRUE 0.998 0.000 0.583 0.001 N NA
 10478425 10478426 EAM_2399 EAM_2400 cysU cysP TRUE 0.997 0.000 0.479 0.001 N NA
 10478426 10478427 EAM_2400 EAM_2401 cysP   FALSE 0.033 286.000 0.000 NA   NA
 10478427 10478428 EAM_2401 EAM_2402     TRUE 0.592 73.000 0.204 NA   NA
 10478428 10478429 EAM_2402 EAM_2403     FALSE 0.255 76.000 0.059 NA   NA
 10478430 10478431 EAM_2404 EAM_2405 amiA hemF FALSE 0.023 47.000 0.025 1.000 N NA
 10478431 10478432 EAM_2405 EAM_2406 hemF   FALSE 0.281 58.000 0.000 NA   NA
 10478432 10478433 EAM_2406 EAM_2407   talA TRUE 0.922 1.000 0.000 NA   NA
 10478433 10478434 EAM_2407 EAM_2408 talA tktB TRUE 0.968 73.000 0.739 1.000 Y NA
 10478435 10478436 EAM_2409 EAM_2410   ansP FALSE 0.299 110.000 0.083 1.000   NA
 10478436 10478437 EAM_2410 EAM_2411 ansP   FALSE 0.023 330.000 0.000 NA   NA
 10478438 10478439 EAM_2412 EAM_2413   narP TRUE 0.890 18.000 0.000 0.011   NA
 10478439 10478440 EAM_2413 EAM_2414 narP acrD FALSE 0.005 222.000 0.034 1.000 N NA
 10478442 10478443 EAM_2416 EAM_2417     FALSE 0.006 614.000 0.000 NA   NA
 10478443 10478444 EAM_2417 EAM_2418   dapE TRUE 0.981 3.000 0.292 1.000 N NA
 10478444 10478445 EAM_2418 EAM_2419 dapE   TRUE 0.782 11.000 0.025 NA   NA
 10478445 10478446 EAM_2419 EAM_2420     FALSE 0.017 367.000 0.000 NA   NA
 10478446 10478447 EAM_2420 EAM_2421     TRUE 0.772 15.000 0.000 NA   NA
 10478447 10478448 EAM_2421 EAM_2422     FALSE 0.042 261.000 0.000 NA   NA
 10478448 10478449 EAM_2422 EAM_2423     TRUE 0.926 13.000 0.143 NA   NA
 10478449 10478450 EAM_2423 EAM_2424     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 10478450 10478451 EAM_2424 EAM_2425     FALSE 0.065 223.000 0.000 NA   NA
 10478451 10478452 EAM_2425 EAM_2426     TRUE 0.917 2.000 0.000 NA   NA
 10478453 10478454 EAM_2427 EAM_2428     FALSE 0.005 796.000 0.000 NA   NA
 10478454 10478455 EAM_2428 EAM_2429     TRUE 0.812 7.000 0.019 NA   NA
 10478455 10478456 EAM_2429 EAM_2430   purC FALSE 0.082 148.000 0.004 NA   NA
 10478456 10478457 EAM_2430 EAM_2431 purC nlpB FALSE 0.004 193.000 0.004 NA N NA
 10478457 10478458 EAM_2431 EAM_2432 nlpB dapA TRUE 0.961 10.000 0.009 NA Y NA
 10478459 10478460 EAM_2433 EAM_2434 gcvR bcp FALSE 0.205 74.000 0.102 1.000 N NA
 10478462 10478463 EAM_2436 EAM_2437     TRUE 0.493 171.000 0.259 NA   NA
 10478464 10478465 EAM_2438 EAM_2439 hda uraA FALSE 0.155 149.000 0.048 NA   NA
 10478465 10478466 EAM_2439 EAM_2440 uraA upp FALSE 0.326 233.000 0.101 1.000 Y NA
 10478467 10478468 EAM_2441 EAM_2442 purM purN TRUE 0.998 -3.000 0.230 0.002 Y NA
 10478469 10478470 EAM_2443 EAM_2444 pstB pstA TRUE 0.998 14.000 0.511 0.002 Y NA
 10478470 10478471 EAM_2444 EAM_2445 pstA pstC TRUE 0.997 -3.000 0.489 0.073   NA
 10478472 10478473 EAM_2446 EAM_2447 ppk ppx TRUE 0.997 6.000 0.486 1.000 Y NA
 10478473 10478474 EAM_2447 EAM_2448 ppx tehB FALSE 0.156 121.000 0.031 NA   NA
 10478476 10478477 EAM_2450 EAM_2451     FALSE 0.011 224.000 0.000 NA N NA
 10478477 10478478 EAM_2451 EAM_2452     TRUE 0.950 18.000 0.103 NA Y NA
 10478478 10478479 EAM_2452 EAM_2453     TRUE 0.828 12.000 0.000 NA   NA
 10478482 10478483 EAM_2456 EAM_2457     FALSE 0.181 134.000 0.000 NA   NA
 10478483 10478484 EAM_2457 EAM_2458     FALSE 0.161 147.000 0.000 NA   NA
 10478484 10478485 EAM_2458 EAM_2459     FALSE 0.185 130.000 0.000 NA   NA
 10478485 10478486 EAM_2459 EAM_2460     FALSE 0.215 86.000 0.000 NA   NA
 10478486 10478487 EAM_2460 EAM_2461     TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 10478487 10478488 EAM_2461 EAM_2462     FALSE 0.135 164.000 0.000 NA   NA
 10478488 10478489 EAM_2462 EAM_2463     TRUE 0.453 75.000 0.000 0.039   NA
 10478489 10478490 EAM_2463 EAM_2464   guaA FALSE 0.007 672.000 0.000 1.000   NA
 10478490 10478491 EAM_2464 EAM_2465 guaA guaB TRUE 0.903 83.000 0.190 0.001 Y NA
 10478492 10478493 EAM_2466 EAM_2467 xseA prt1 FALSE 0.141 88.000 0.010 1.000   NA
 10478493 10478494 EAM_2467 EAM_2468 prt1   TRUE 0.982 -3.000 0.194 NA   NA
 10478497 10478498 EAM_2471 EAM_2472 engA   FALSE 0.279 213.000 0.203 1.000   NA
 10478498 10478499 EAM_2472 EAM_2473     TRUE 0.809 129.000 0.492 1.000   NA
 10478499 10478500 EAM_2473 EAM_2474   hisS TRUE 0.860 38.000 0.259 1.000   NA
 10478500 10478501 EAM_2474 EAM_2475 hisS gcpE FALSE 0.167 226.000 0.207 1.000 N NA
 10478501 10478502 EAM_2475 EAM_2476 gcpE   TRUE 0.835 40.000 0.233 1.000   NA
 10478502 10478503 EAM_2476 EAM_2477     TRUE 0.955 -10.000 0.153 1.000   NA
 10478503 10478504 EAM_2477 EAM_2478     FALSE 0.276 86.000 0.067 1.000   NA
 10478504 10478505 EAM_2478 EAM_2479   ndk FALSE 0.332 171.000 0.156 1.000   NA
 10478507 10478508 EAM_2481 EAM_2482     TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.017 Y NA
 10478508 10478509 EAM_2482 EAM_2483     TRUE 0.950 -10.000 0.000 0.017   NA
 10478509 10478510 EAM_2483 EAM_2484     TRUE 0.997 -7.000 0.600 0.025   NA
 10478510 10478511 EAM_2484 EAM_2485     TRUE 0.925 5.000 0.071 1.000   NA
 10478511 10478512 EAM_2485 EAM_2486     TRUE 0.985 0.000 0.031 1.000 Y NA
 10478512 10478513 EAM_2486 EAM_2487     TRUE 0.624 5.000 0.046 1.000 N NA
 10478513 10478514 EAM_2487 EAM_2488     FALSE 0.065 73.000 0.000 1.000 N NA
 10478514 10478515 EAM_2488 EAM_2489     TRUE 0.874 29.000 0.044 1.000 Y NA
 10478515 10478516 EAM_2489 EAM_2490   sseB FALSE 0.010 435.000 0.000 NA   NA
 10478516 10478517 EAM_2490 EAM_2491 sseB pepB TRUE 0.634 107.000 0.253 NA   NA
 10478517 10478518 EAM_2491 EAM_2492 pepB iscS FALSE 0.337 203.000 0.000 1.000 Y NA
 10478518 10478519 EAM_2492 EAM_2493 iscS   TRUE 0.669 140.000 0.424 1.000 N NA
 10478519 10478520 EAM_2493 EAM_2494     FALSE 0.177 157.000 0.126 1.000 N NA
 10478521 10478522 EAM_2495 EAM_2496 suhB csiE FALSE 0.007 630.000 0.000 1.000   NA
 10478523 10478524 EAM_2497 EAM_2498 glyA glnB FALSE 0.059 427.000 0.000 1.000 Y NA
 10478524 10478525 EAM_2498 EAM_2499 glnB   FALSE 0.269 136.000 0.146 1.000 N NA
 10478525 10478526 EAM_2499 EAM_2500     TRUE 0.901 -3.000 0.029 NA   NA
 10478526 10478527 EAM_2500 EAM_2501     TRUE 0.836 -9.000 0.029 NA   NA
 10478527 10478528 EAM_2501 EAM_2502   purL FALSE 0.002 588.000 0.000 1.000 N NA
 10478530 10478531 EAM_2504 EAM_2505 tadA   FALSE 0.054 150.000 0.062 NA N NA
 10478531 10478532 EAM_2505 EAM_2506     FALSE 0.400 216.000 0.316 NA   NA
 10478533 10478534 EAM_2507 EAM_2508     FALSE 0.013 411.000 0.056 NA   NA
 10478534 10478535 EAM_2508 EAM_2509     TRUE 0.444 40.000 0.000 NA   NA
 10478536 10478537 EAM_2510 EAM_2511 acpS pdxJ TRUE 0.988 0.000 0.326 1.000 N NA
 10478537 10478538 EAM_2511 EAM_2512 pdxJ recO FALSE 0.370 75.000 0.166 1.000 N NA
 10478538 10478539 EAM_2512 EAM_2513 recO era TRUE 0.944 6.000 0.109 1.000   NA
 10478539 10478540 EAM_2513 EAM_2514 era rnc TRUE 0.985 -3.000 0.127 0.031   NA
 10478540 10478541 EAM_2514 EAM_2515 rnc lepB FALSE 0.326 140.000 0.117 1.000   NA
 10478541 10478542 EAM_2515 EAM_2516 lepB lepA TRUE 0.845 30.000 0.187 1.000   NA
 10478542 10478543 EAM_2516 EAM_2517 lepA   FALSE 0.035 281.000 0.000 NA   NA
 10478543 10478544 EAM_2517 EAM_2518     FALSE 0.033 287.000 0.000 NA   NA
 10478544 10478545 EAM_2518 EAM_2519   rseC FALSE 0.012 410.000 0.000 NA   NA
 10478545 10478546 EAM_2519 EAM_2520 rseC rseB TRUE 0.999 -3.000 0.609 NA Y NA
 10478546 10478547 EAM_2520 EAM_2521 rseB rseA TRUE 0.999 0.000 0.856 NA Y NA
 10478547 10478548 EAM_2521 EAM_2522 rseA rpoE TRUE 0.963 31.000 0.705 NA N NA
 10478551 10478552 EAM_2525 EAM_2526 srmB ung FALSE 0.033 659.000 0.000 1.000 Y NA
 10478554 10478555 EAM_2528 EAM_2529 ppnK recN FALSE 0.369 87.000 0.170 1.000 N NA
 10478555 10478556 EAM_2529 EAM_2530 recN smpA FALSE 0.024 191.000 0.049 1.000 N NA
 10478557 10478558 EAM_2531 EAM_2532     TRUE 0.950 -7.000 0.124 NA   NA
 10478560 10478561 EAM_2534 EAM_2535     FALSE 0.024 659.000 0.000 0.002   NA
 10478561 10478562 EAM_2535 EAM_2536   kpsC FALSE 0.224 105.000 0.000 1.000   NA
 10478562 10478563 EAM_2536 EAM_2537 kpsC cheW FALSE 0.004 370.000 0.000 1.000 N NA
 10478563 10478564 EAM_2537 EAM_2538 cheW cheA TRUE 0.993 -3.000 0.043 0.004 Y NA
 10478564 10478565 EAM_2538 EAM_2539 cheA motB TRUE 0.997 -13.000 0.500 1.000 Y NA
 10478565 10478566 EAM_2539 EAM_2540 motB motA TRUE 0.989 -3.000 0.082 1.000 Y NA
 10478566 10478567 EAM_2540 EAM_2541 motA flhC FALSE 0.265 87.000 0.061 1.000   NA
 10478567 10478568 EAM_2541 EAM_2542 flhC flhD TRUE 0.997 1.000 0.400 0.001   NA
 10478568 10478569 EAM_2542 EAM_2543 flhD fliA FALSE 0.012 427.000 0.000 1.000   NA
 10478569 10478570 EAM_2543 EAM_2544 fliA   FALSE 0.006 172.000 0.012 1.000 N NA
 10478570 10478571 EAM_2544 EAM_2545   flgL TRUE 0.935 91.000 0.500 1.000 Y NA
 10478571 10478572 EAM_2545 EAM_2546 flgL flgK TRUE 0.947 25.000 0.023 0.002 Y NA
 10478572 10478573 EAM_2546 EAM_2547 flgK flgJ TRUE 0.978 109.000 0.705 0.004 Y NA
 10478573 10478574 EAM_2547 EAM_2548 flgJ flgI TRUE 0.992 0.000 0.018 0.011 Y NA
 10478574 10478575 EAM_2548 EAM_2549 flgI flgH TRUE 0.989 5.000 0.049 0.011 Y NA
 10478575 10478576 EAM_2549 EAM_2550 flgH flgG TRUE 0.798 65.000 0.049 0.009 Y NA
 10478576 10478577 EAM_2550 EAM_2551 flgG flgF TRUE 0.996 22.000 0.600 0.002 Y NA
 10478577 10478578 EAM_2551 EAM_2552 flgF flgE TRUE 0.998 13.000 0.500 0.006 Y NA
 10478578 10478579 EAM_2552 EAM_2553 flgE flgD TRUE 0.837 35.000 0.047 NA Y NA
 10478579 10478580 EAM_2553 EAM_2554 flgD flgC TRUE 0.982 10.000 0.128 NA Y NA
 10478580 10478581 EAM_2554 EAM_2555 flgC flgB TRUE 0.998 15.000 0.643 0.005 Y NA
 10478582 10478583 EAM_2556 EAM_2557 flgA flgM TRUE 0.892 73.000 0.330 NA Y NA
 10478583 10478584 EAM_2557 EAM_2558 flgM flgN TRUE 0.993 20.000 0.361 0.005 Y NA
 10478585 10478586 EAM_2559 EAM_2560 fliT fliS TRUE 0.988 -7.000 0.338 1.000   NA
 10478586 10478587 EAM_2560 EAM_2561 fliS fliD TRUE 0.872 49.000 0.054 0.004 Y NA
 10478588 10478589 EAM_2562 EAM_2563     FALSE 0.002 467.000 0.000 1.000 N NA
 10478589 10478590 EAM_2563 EAM_2564     TRUE 0.496 35.000 0.000 NA   NA
 10478590 10478591 EAM_2564 EAM_2565     FALSE 0.199 117.000 0.000 NA   NA
 10478592 10478593 EAM_2566 EAM_2567     TRUE 0.870 -10.000 0.116 1.000 N NA
 10478593 10478594 EAM_2567 EAM_2568   fliR FALSE 0.035 162.000 0.000 1.000 N NA
 10478594 10478595 EAM_2568 EAM_2569 fliR fliQ TRUE 0.993 0.000 0.028 0.005 Y NA
 10478595 10478596 EAM_2569 EAM_2570 fliQ fliP TRUE 0.999 10.000 0.827 0.012 Y NA
 10478596 10478597 EAM_2570 EAM_2571 fliP fliO TRUE 0.995 -3.000 0.203 1.000 Y NA
 10478597 10478598 EAM_2571 EAM_2572 fliO fliN TRUE 0.995 0.000 0.443 1.000   NA
 10478598 10478599 EAM_2572 EAM_2573 fliN fliM TRUE 0.956 8.000 0.012 0.002   NA
 10478599 10478600 EAM_2573 EAM_2574 fliM fliL TRUE 0.999 0.000 0.400 0.002 Y NA
 10478600 10478601 EAM_2574 EAM_2575 fliL fliK FALSE 0.150 128.000 0.025 1.000   NA
 10478601 10478602 EAM_2575 EAM_2576 fliK fliJ TRUE 0.996 -3.000 0.317 0.009   NA
 10478602 10478603 EAM_2576 EAM_2577 fliJ fliI TRUE 0.948 17.000 0.073 1.000 Y NA
 10478603 10478604 EAM_2577 EAM_2578 fliI fliH TRUE 0.988 -3.000 0.077 1.000 Y NA
 10478604 10478605 EAM_2578 EAM_2579 fliH fliG TRUE 0.981 -13.000 0.005 0.005 Y NA
 10478605 10478606 EAM_2579 EAM_2580 fliG fliF TRUE 0.998 -3.000 0.220 0.009 Y NA
 10478607 10478608 EAM_2581 EAM_2582 fliE cheR TRUE 0.971 10.000 0.000 1.000 Y NA
 10478608 10478609 EAM_2582 EAM_2583 cheR cheB TRUE 0.983 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 10478609 10478610 EAM_2583 EAM_2584 cheB cheY TRUE 0.905 51.000 0.133 0.009 Y NA
 10478610 10478611 EAM_2584 EAM_2585 cheY cheZ TRUE 0.987 6.000 0.133 1.000 Y NA
 10478611 10478612 EAM_2585 EAM_2586 cheZ flhB TRUE 0.907 19.000 0.012 1.000 Y NA
 10478612 10478613 EAM_2586 EAM_2587 flhB flhA TRUE 0.992 0.000 0.023 0.012 Y NA
 10478613 10478614 EAM_2587 EAM_2588 flhA flhE TRUE 0.997 -3.000 0.400 0.005   NA
 10478614 10478615 EAM_2588 EAM_2589 flhE tsx FALSE 0.011 445.000 0.000 1.000   NA
 10478615 10478616 EAM_2589 EAM_2590 tsx speG FALSE 0.049 130.000 0.000 1.000 N NA
 10478617 10478618 EAM_2591 EAM_2592     FALSE 0.106 183.000 0.000 NA   NA
 10478619 10478620 EAM_2593 EAM_2594   nrdH FALSE 0.163 146.000 0.000 NA   NA
 10478620 10478621 EAM_2594 EAM_2595 nrdH nrdI TRUE 0.988 5.000 0.440 NA N NA
 10478621 10478622 EAM_2595 EAM_2596 nrdI nrdE TRUE 0.958 -27.000 0.054 NA Y NA
 10478622 10478623 EAM_2596 EAM_2597 nrdE nrdF TRUE 0.868 52.000 0.048 0.001 Y NA
 10478623 10478624 EAM_2597 EAM_2598 nrdF proV FALSE 0.003 390.000 0.000 1.000 N NA
 10478624 10478625 EAM_2598 EAM_2599 proV proW TRUE 0.999 -3.000 0.630 0.073 Y NA
 10478625 10478626 EAM_2599 EAM_2600 proW proX TRUE 0.980 66.000 0.695 0.036 Y NA
 10478626 10478627 EAM_2600 EAM_2601 proX   FALSE 0.168 197.000 0.174 NA N NA
 10478627 10478628 EAM_2601 EAM_2602     FALSE 0.117 176.000 0.000 NA   NA
 10478628 10478629 EAM_2602 EAM_2603   emrR TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 10478629 10478630 EAM_2603 EAM_2604 emrR emrA FALSE 0.123 166.000 0.107 1.000 N NA
 10478630 10478631 EAM_2604 EAM_2605 emrA emrB TRUE 0.989 17.000 0.875 1.000 N NA
 10478633 10478634 EAM_2607 EAM_2608 trxC   FALSE 0.352 64.000 0.084 NA   NA
 10478634 10478635 EAM_2608 EAM_2609     TRUE 0.861 32.000 0.222 NA   NA
 10478635 10478636 EAM_2609 EAM_2610   pssA TRUE 0.438 106.000 0.121 0.034 N NA
 10478636 10478637 EAM_2610 EAM_2611 pssA   TRUE 0.439 52.000 0.089 NA   NA
 10478638 10478639 EAM_2612 EAM_r016 kgtP 5S_rRNA FALSE 0.057 234.000 0.000 NA   NA
 10478639 10478640 EAM_r016 EAM_r017 5S_rRNA 23S_rRNA FALSE 0.089 197.000 0.000 NA   NA
 10478640 10478641 EAM_r017 EAM_t064 23S_rRNA tRNA-Ala FALSE 0.014 390.000 0.000 NA   NA
 10478641 10478642 EAM_t064 EAM_t065 tRNA-Ala tRNA-Ile FALSE 0.147 156.000 0.000 NA   NA
 10478642 10478643 EAM_t065 EAM_r018 tRNA-Ile 16S_rRNA FALSE 0.277 59.000 0.000 NA   NA
 10478643 10478644 EAM_r018 EAM_2613 16S_rRNA clpB FALSE 0.008 475.000 0.000 NA   NA
 10478644 10478645 EAM_2613 EAM_2614 clpB   FALSE 0.319 126.000 0.108 NA   NA
 10478645 10478646 EAM_2614 EAM_2615   rluD TRUE 0.979 0.000 0.168 NA   NA
 10478647 10478648 EAM_2616 EAM_2617     FALSE 0.008 362.000 0.004 NA   NA
 10478648 10478649 EAM_2617 EAM_2618   pheA FALSE 0.002 245.000 0.015 NA N NA
 10478650 10478651 EAM_2619 EAM_2620   tyrA TRUE 0.810 13.000 0.000 NA   NA
 10478651 10478652 EAM_2620 EAM_2621 tyrA aroF TRUE 0.970 7.000 0.015 1.000 Y NA
 10478652 10478653 EAM_2621 EAM_2622 aroF   FALSE 0.011 430.000 0.000 NA   NA
 10478654 10478655 EAM_2623 EAM_2624     TRUE 0.517 33.000 0.000 NA   NA
 10478656 10478657 EAM_2625 EAM_2626   rplS FALSE 0.039 278.000 0.000 1.000   NA
 10478657 10478658 EAM_2626 EAM_2627 rplS trmD TRUE 0.961 57.000 0.567 1.000 Y NA
 10478658 10478659 EAM_2627 EAM_2628 trmD rimM TRUE 0.988 36.000 0.672 1.000 Y NA
 10478659 10478660 EAM_2628 EAM_2629 rimM rpsP TRUE 0.997 10.000 0.342 0.011 Y NA
 10478660 10478661 EAM_2629 EAM_2630 rpsP ffh TRUE 0.620 137.000 0.361 1.000 N NA
 10478662 10478663 EAM_2631 EAM_2632 corE corB TRUE 0.785 66.000 0.349 NA   NA
 10478664 10478665 EAM_2633 EAM_2634 luxS gshA FALSE 0.097 161.000 0.087 1.000 N NA
 10478665 10478666 EAM_2634 EAM_2635 gshA   FALSE 0.292 73.000 0.071 NA   NA
 10478666 10478667 EAM_2635 EAM_2636     TRUE 0.941 -3.000 0.067 NA   NA
 10478667 10478668 EAM_2636 EAM_t066   tRNA-Arg FALSE 0.020 346.000 0.000 NA   NA
 10478668 10478669 EAM_t066 EAM_t067 tRNA-Arg tRNA-Arg FALSE 0.286 57.000 0.000 NA   NA
 10478669 10478670 EAM_t067 EAM_t068 tRNA-Arg tRNA-Arg FALSE 0.047 251.000 0.000 NA   NA
 10478670 10478671 EAM_t068 EAM_t069 tRNA-Arg tRNA-Ser TRUE 0.874 8.000 0.000 NA   NA
 10478671 10478672 EAM_t069 EAM_2637 tRNA-Ser csrA FALSE 0.018 358.000 0.000 NA   NA
 10478672 10478673 EAM_2637 EAM_2638 csrA alaS FALSE 0.000 430.000 0.020 1.000 N NA
 10478673 10478674 EAM_2638 EAM_2639 alaS recX FALSE 0.269 136.000 0.085 1.000   NA
 10478674 10478675 EAM_2639 EAM_2640 recX recA FALSE 0.340 233.000 0.296 1.000   NA
 10478675 10478676 EAM_2640 EAM_2641 recA   FALSE 0.295 95.000 0.082 NA   NA
 10478676 10478677 EAM_2641 EAM_2642   mltB FALSE 0.103 158.000 0.026 NA   NA
 10478677 10478678 EAM_2642 EAM_2643 mltB   FALSE 0.026 307.000 0.000 NA   NA
 10478678 10478679 EAM_2643 EAM_2644   dsbA FALSE 0.027 304.000 0.000 NA   NA
 10478679 10478680 EAM_2644 EAM_2645 dsbA   FALSE 0.026 308.000 0.000 NA   NA
 10478680 10478681 EAM_2645 EAM_2646     FALSE 0.136 163.000 0.000 NA   NA
 10478681 10478682 EAM_2646 EAM_2647     FALSE 0.217 94.000 0.000 NA   NA
 10478682 10478683 EAM_2647 EAM_2648     FALSE 0.006 728.000 0.000 NA   NA
 10478683 10478684 EAM_2648 EAM_2649     FALSE 0.224 77.000 0.000 NA   NA
 10478684 10478685 EAM_2649 EAM_2650     TRUE 0.585 27.000 0.000 NA   NA
 10478685 10478686 EAM_2650 EAM_2651     FALSE 0.065 223.000 0.000 NA   NA
 10478686 10478687 EAM_2651 EAM_2652     TRUE 0.922 1.000 0.000 NA   NA
 10478687 10478688 EAM_2652 EAM_2653     FALSE 0.277 59.000 0.000 NA   NA
 10478688 10478689 EAM_2653 EAM_2654     TRUE 0.973 43.000 1.000 NA   NA
 10478689 10478690 EAM_2654 EAM_2655     TRUE 0.971 0.000 0.125 1.000   NA
 10478690 10478691 EAM_2655 EAM_2656     TRUE 0.663 135.000 0.312 1.000   NA
 10478691 10478692 EAM_2656 EAM_2657     TRUE 0.994 13.000 0.300 0.054 Y NA
 10478692 10478693 EAM_2657 EAM_2658     TRUE 0.999 13.000 1.000 0.054 Y NA
 10478693 10478694 EAM_2658 EAM_2659     TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.012 Y NA
 10478694 10478695 EAM_2659 EAM_2660     TRUE 0.973 -13.000 0.083 NA Y NA
 10478695 10478696 EAM_2660 EAM_2661     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10478696 10478697 EAM_2661 EAM_2662     TRUE 0.819 -19.000 0.000 NA   NA
 10478697 10478698 EAM_2662 EAM_2663     TRUE 0.980 -16.000 0.333 NA   NA
 10478698 10478699 EAM_2663 EAM_2664     TRUE 0.965 17.000 0.333 1.000   NA
 10478699 10478700 EAM_2664 EAM_2665     TRUE 0.995 2.000 0.333 0.012   NA
 10478700 10478701 EAM_2665 EAM_2666     TRUE 0.790 48.000 0.240 1.000   NA
 10478701 10478702 EAM_2666 EAM_2667     TRUE 0.957 15.000 0.240 1.000   NA
 10478702 10478703 EAM_2667 EAM_2668     TRUE 0.553 -13.000 0.000 1.000 N NA
 10478704 10478705 EAM_2669 EAM_2670     TRUE 0.990 3.000 0.333 NA   NA
 10478705 10478706 EAM_2670 EAM_2671     TRUE 0.881 48.000 0.231 0.005   NA
 10478706 10478707 EAM_2671 EAM_2672     TRUE 0.997 0.000 0.571 1.000   NA
 10478707 10478708 EAM_2672 EAM_2673     TRUE 0.976 -10.000 0.238 1.000   NA
 10478708 10478709 EAM_2673 EAM_2674     TRUE 0.819 -19.000 0.000 NA   NA
 10478709 10478710 EAM_2674 EAM_2675     TRUE 0.987 26.000 1.000 NA   NA
 10478710 10478711 EAM_2675 EAM_2676     TRUE 0.946 67.000 1.000 NA   NA
 10478714 10478715 EAM_2679 EAM_2680 rpoS nlpD TRUE 0.434 51.000 0.142 1.000 N NA
 10478715 10478716 EAM_2680 EAM_2681 nlpD pcm FALSE 0.008 144.000 0.030 1.000 N NA
 10478716 10478717 EAM_2681 EAM_2682 pcm surE TRUE 0.990 -6.000 0.353 1.000   NA
 10478717 10478718 EAM_2682 EAM_2683 surE truD FALSE 0.101 363.000 0.235 1.000   NA
 10478718 10478719 EAM_2683 EAM_2684 truD ispF TRUE 0.973 4.000 0.173 1.000   NA
 10478719 10478720 EAM_2684 EAM_2685 ispF ispD TRUE 0.994 14.000 0.419 1.000 Y NA
 10478720 10478721 EAM_2685 EAM_2686 ispD ftsB TRUE 0.942 9.000 0.185 1.000 N NA
 10478721 10478722 EAM_2686 EAM_2687 ftsB   FALSE 0.068 194.000 0.028 NA   NA
 10478722 10478723 EAM_2687 EAM_2688   cysC TRUE 0.553 88.000 0.198 NA   NA
 10478723 10478724 EAM_2688 EAM_2689 cysC cysN TRUE 0.997 2.000 0.340 1.000 Y NA
 10478724 10478725 EAM_2689 EAM_2690 cysN cysD TRUE 0.995 10.000 0.574 0.001 N NA
 10478725 10478726 EAM_2690 EAM_2691 cysD cysG TRUE 0.996 10.000 0.417 1.000 Y NA
 10478728 10478729 EAM_2693 EAM_2694 cysH cysI TRUE 0.819 13.000 0.116 1.000 N NA
 10478729 10478730 EAM_2694 EAM_2695 cysI cysJ TRUE 1.000 0.000 0.791 0.001 Y NA
 10478733 10478734 EAM_2698 EAM_2699     TRUE 0.997 -7.000 0.481 1.000 Y NA
 10478734 10478735 EAM_2699 EAM_2700     TRUE 0.816 41.000 0.056 1.000 Y NA
 10478736 10478737 EAM_2701 EAM_2702     FALSE 0.036 159.000 0.000 1.000 N NA
 10478737 10478738 EAM_2702 EAM_2703   eno FALSE 0.019 208.000 0.000 1.000 N NA
 10478738 10478739 EAM_2703 EAM_2704 eno pyrG FALSE 0.109 81.000 0.068 1.000 N NA
 10478739 10478740 EAM_2704 EAM_2705 pyrG mazG FALSE 0.066 200.000 0.025 1.000   NA
 10478740 10478741 EAM_2705 EAM_2706 mazG relA TRUE 0.579 27.000 0.040 1.000   NA
 10478741 10478742 EAM_2706 EAM_2707 relA rumA FALSE 0.388 33.000 0.082 1.000 N NA
 10478744 10478745 EAM_2709 EAM_2710 garK   FALSE 0.055 110.000 0.000 1.000 N NA
 10478745 10478746 EAM_2710 EAM_2711   truC TRUE 0.846 23.000 0.209 1.000 N NA
 10478746 10478747 EAM_2711 EAM_2712 truC   TRUE 0.996 0.000 0.518 NA   NA
 10478747 10478748 EAM_2712 EAM_2713   syd FALSE 0.006 733.000 0.000 NA   NA
 10478749 10478750 EAM_2714 EAM_2715 queF   FALSE 0.219 146.000 0.079 NA   NA
 10478750 10478751 EAM_2715 EAM_2716   xni TRUE 0.799 34.000 0.178 NA   NA
 10478752 10478753 EAM_2717 EAM_2718 mtfA   TRUE 0.960 -7.000 0.144 NA   NA
 10478753 10478754 EAM_2718 EAM_2719   gcvA FALSE 0.290 85.000 0.081 NA   NA
 10478754 10478755 EAM_2719 EAM_2720 gcvA   FALSE 0.019 350.000 0.000 NA   NA
 10478756 10478757 EAM_2721 EAM_2722 csdA   TRUE 0.988 2.000 0.122 0.001   NA
 10478758 10478759 EAM_2723 EAM_2724   mltA FALSE 0.019 51.000 0.005 1.000 N NA
 10478760 10478761 EAM_t070 EAM_t071 tRNA-Met tRNA-Met FALSE 0.222 78.000 0.000 NA   NA
 10478761 10478762 EAM_t071 EAM_t072 tRNA-Met tRNA-Met FALSE 0.385 45.000 0.000 NA   NA
 10478764 10478765 EAM_2726 EAM_2727 argA   FALSE 0.098 191.000 0.000 NA   NA
 10478766 10478767 EAM_2728 EAM_2729 recD recB TRUE 1.000 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 10478767 10478768 EAM_2729 EAM_2730 recB ptrA TRUE 0.905 -3.000 0.092 1.000 N NA
 10478768 10478769 EAM_2730 EAM_2731 ptrA recC FALSE 0.083 183.000 0.092 1.000 N NA
 10478769 10478770 EAM_2731 EAM_2732 recC ppdC FALSE 0.118 75.000 0.076 NA N NA
 10478770 10478771 EAM_2732 EAM_2733 ppdC   TRUE 0.992 -10.000 0.538 NA   NA
 10478771 10478772 EAM_2733 EAM_2734   ppdB TRUE 0.994 0.000 0.373 NA   NA
 10478772 10478773 EAM_2734 EAM_2735 ppdB ppdA TRUE 0.988 -9.000 0.368 NA   NA
 10478775 10478776 EAM_2737 EAM_2738 thyA lgt TRUE 0.961 -3.000 0.164 1.000 N NA
 10478776 10478777 EAM_2738 EAM_2739 lgt ptsP FALSE 0.008 144.000 0.003 1.000 N NA
 10478777 10478778 EAM_2739 EAM_2740 ptsP nudH TRUE 0.492 13.000 0.000 1.000 N NA
 10478779 10478780 EAM_2741 EAM_2742 mutH   FALSE 0.010 115.000 0.017 1.000 N NA
 10478780 10478781 EAM_2742 EAM_2743     FALSE 0.325 160.000 0.143 NA   NA
 10478781 10478782 EAM_2743 EAM_2744   tas FALSE 0.076 204.000 0.043 NA   NA
 10478783 10478784 EAM_2745 EAM_2746   aas TRUE 0.950 -7.000 0.124 NA   NA
 10478786 10478787 EAM_2748 EAM_2749   mdtC FALSE 0.009 454.000 0.000 NA   NA
 10478787 10478788 EAM_2749 EAM_2750 mdtC mdtB TRUE 0.993 -3.000 0.148 NA Y NA
 10478788 10478789 EAM_2750 EAM_2751 mdtB mdtA TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA N NA
 10478789 10478790 EAM_2751 EAM_2752 mdtA ftsI FALSE 0.162 286.000 0.000 1.000 Y NA
 10478791 10478792 EAM_2753 EAM_2754     TRUE 0.930 18.000 0.000 NA Y NA
 10478792 10478793 EAM_2754 EAM_2755     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 10478795 10478796 EAM_2757 EAM_2758     FALSE 0.005 1640.000 0.000 NA   NA
 10478796 10478797 EAM_2758 EAM_2759     TRUE 0.862 -10.000 0.000 NA   NA
 10478797 10478798 EAM_2759 EAM_2760     TRUE 0.810 13.000 0.000 NA   NA
 10478800 10478801 EAM_2762 EAM_2763     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 10478803 10478804 EAM_2765 EAM_2766     FALSE 0.188 128.000 0.000 NA   NA
 10478813 10478814 EAM_2775 EAM_2776 lysS prfB TRUE 0.992 10.000 0.162 0.033 Y NA
 10478814 10478815 EAM_2776 EAM_2777 prfB recJ FALSE 0.001 280.000 0.028 1.000 N NA
 10478815 10478816 EAM_2777 EAM_2778 recJ dsbC TRUE 0.820 6.000 0.082 1.000 N NA
 10478816 10478817 EAM_2778 EAM_2779 dsbC xerD FALSE 0.257 45.000 0.079 1.000 N NA
 10478818 10478819 EAM_2780 EAM_2781 eop2   FALSE 0.008 510.000 0.000 1.000   NA
 10478819 10478820 EAM_2781 EAM_2782   fldB FALSE 0.066 230.000 0.000 1.000   NA
 10478821 10478822 EAM_2783 EAM_2784     FALSE 0.332 56.000 0.061 NA   NA
 10478826 10478827 EAM_2788 EAM_2789   gcvP FALSE 0.011 84.000 0.004 1.000 N NA
 10478827 10478828 EAM_2789 EAM_2790 gcvP gcvH TRUE 0.866 71.000 0.249 1.000 Y NA
 10478828 10478829 EAM_2790 EAM_2791 gcvH gcvT TRUE 0.990 24.000 0.317 0.001 Y NA
 10478829 10478830 EAM_2791 EAM_2792 gcvT visC FALSE 0.000 438.000 0.004 1.000 N NA
 10478830 10478831 EAM_2792 EAM_2793 visC ubiH TRUE 0.998 14.000 0.474 0.001 Y NA
 10478831 10478832 EAM_2793 EAM_2794 ubiH pepP TRUE 0.720 -3.000 0.047 1.000 N NA
 10478832 10478833 EAM_2794 EAM_2795 pepP   FALSE 0.388 52.000 0.073 NA   NA
 10478834 10478835 EAM_2796 EAM_2797     FALSE 0.012 376.000 0.034 NA   NA
 10478836 10478837 EAM_2798 EAM_2799 serA rpiA FALSE 0.001 397.000 0.029 1.000 N NA
 10478839 10478840 EAM_2801 EAM_2802     FALSE 0.264 112.000 0.075 NA   NA
 10478841 10478842 EAM_2803 EAM_2804 ntdA ntdB TRUE 0.921 -16.000 0.021 0.015   NA
 10478842 10478843 EAM_2804 EAM_2805 ntdB ntdC TRUE 0.995 -3.000 0.471 1.000   NA
 10478843 10478844 EAM_2805 EAM_2806 ntdC   TRUE 0.885 6.000 0.000 NA   NA
 10478844 10478845 EAM_2806 EAM_2807     FALSE 0.216 82.000 0.000 NA   NA
 10478846 10478847 EAM_2808 EAM_2809   argO FALSE 0.025 329.000 0.000 1.000   NA
 10478847 10478848 EAM_2809 EAM_2810 argO mscS FALSE 0.219 191.000 0.049 0.071   NA
 10478848 10478849 EAM_2810 EAM_2811 mscS fbaA FALSE 0.014 181.000 0.038 1.000 N NA
 10478849 10478850 EAM_2811 EAM_2812 fbaA pgk TRUE 0.779 84.000 0.056 0.004 Y NA
 10478850 10478851 EAM_2812 EAM_2813 pgk epd TRUE 0.964 22.000 0.070 0.004 Y NA
 10478851 10478852 EAM_2813 EAM_2814 epd tktA FALSE 0.191 264.000 0.000 1.000 Y NA
 10478853 10478854 EAM_2815 EAM_2816     FALSE 0.129 183.000 0.000 0.071 N NA
 10478856 10478857 EAM_2818 EAM_2819     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10478857 10478858 EAM_2819 EAM_2820     FALSE 0.012 410.000 0.000 NA   NA
 10478858 10478859 EAM_2820 EAM_2821     FALSE 0.255 65.000 0.000 NA   NA
 10478859 10478860 EAM_2821 EAM_2822     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10478861 10478862 EAM_2823 EAM_2824 speB   FALSE 0.195 122.000 0.000 NA   NA
 10478862 10478863 EAM_2824 EAM_2825   speA FALSE 0.250 67.000 0.000 NA   NA
 10478864 10478865 EAM_2826 EAM_2827 metK galP FALSE 0.002 431.000 0.000 1.000 N NA
 10478865 10478866 EAM_2827 EAM_2828 galP sprT FALSE 0.057 226.000 0.042 NA   NA
 10478866 10478867 EAM_2828 EAM_2829 sprT endA TRUE 0.545 123.000 0.210 NA   NA
 10478867 10478868 EAM_2829 EAM_2830 endA   TRUE 0.670 54.000 0.201 NA   NA
 10478868 10478869 EAM_2830 EAM_2831   gshB FALSE 0.059 368.000 0.173 NA   NA
 10478869 10478870 EAM_2831 EAM_2832 gshB   FALSE 0.223 90.000 0.120 NA N NA
 10478870 10478871 EAM_2832 EAM_2833     TRUE 0.983 0.000 0.263 NA N NA
 10478871 10478872 EAM_2833 EAM_2834     FALSE 0.045 140.000 0.000 1.000 N NA
 10478872 10478873 EAM_2834 EAM_2835     TRUE 0.891 25.000 0.039 1.000 Y NA
 10478873 10478874 EAM_2835 EAM_2836     FALSE 0.307 83.000 0.143 1.000 N NA
 10478874 10478875 EAM_2836 EAM_2837     TRUE 0.909 83.000 0.750 NA   NA
 10478877 10478878 EAM_2839 EAM_2840     TRUE 0.760 9.000 0.005 NA   NA
 10478878 10478879 EAM_2840 EAM_2841     FALSE 0.109 136.000 0.005 1.000   NA
 10478879 10478880 EAM_2841 EAM_2842     TRUE 0.963 -7.000 0.218 1.000 N NA
 10478881 10478882 EAM_2843 EAM_2844     TRUE 0.427 130.000 0.155 NA   NA
 10478882 10478883 EAM_2844 EAM_2845   trmB TRUE 0.958 0.000 0.092 NA   NA
 10478884 10478885 EAM_2846 EAM_2847 mutY   TRUE 0.914 10.000 0.150 1.000 N NA
 10478885 10478886 EAM_2847 EAM_2848   mltC FALSE 0.354 52.000 0.128 NA N NA
 10478886 10478887 EAM_2848 EAM_2849 mltC   FALSE 0.001 590.000 0.000 NA N NA
 10478889 10478890 EAM_2851 EAM_t073   tRNA-Phe FALSE 0.109 181.000 0.000 NA   NA
 10478891 10478892 EAM_2852 EAM_2853     FALSE 0.022 334.000 0.000 NA   NA
 10478892 10478893 EAM_2853 EAM_2854     TRUE 0.975 2.000 0.167 NA   NA
 10478893 10478894 EAM_2854 EAM_2855     TRUE 0.874 84.000 0.611 NA   NA
 10478894 10478895 EAM_2855 EAM_2856     TRUE 0.994 -3.000 0.385 NA   NA
 10478896 10478897 EAM_2857 EAM_2858     FALSE 0.021 342.000 0.000 NA   NA
 10478898 10478899 EAM_2859 EAM_2860     FALSE 0.007 530.000 0.000 NA   NA
 10478899 10478900 EAM_2860 EAM_2861     FALSE 0.215 87.000 0.000 NA   NA
 10478900 10478901 EAM_2861 EAM_2862     TRUE 0.862 -10.000 0.000 NA   NA
 10478901 10478902 EAM_2862 EAM_2863     TRUE 0.910 3.000 0.000 NA   NA
 10478902 10478903 EAM_2863 EAM_2864     FALSE 0.219 79.000 0.000 NA   NA
 10478903 10478904 EAM_2864 EAM_2865     TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 10478904 10478905 EAM_2865 EAM_2866     TRUE 0.528 32.000 0.000 NA   NA
 10478905 10478906 EAM_2866 EAM_2867     TRUE 0.993 12.000 0.667 NA   NA
 10478906 10478907 EAM_2867 EAM_2868     FALSE 0.078 208.000 0.000 NA   NA
 10478907 10478908 EAM_2868 EAM_2869     FALSE 0.174 138.000 0.000 NA   NA
 10478908 10478909 EAM_2869 EAM_2870   rlsA FALSE 0.015 379.000 0.000 NA   NA
 10478909 10478910 EAM_2870 EAM_2871 rlsA dspF FALSE 0.005 752.000 0.000 NA   NA
 10478910 10478911 EAM_2871 EAM_2872 dspF dspE TRUE 0.914 62.000 0.667 NA   NA
 10478912 10478913 EAM_2873 EAM_2874 hrpW   TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 10478914 10478915 EAM_2875 EAM_2876     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 10478915 10478916 EAM_2876 EAM_2877   hrpN FALSE 0.200 115.000 0.000 NA   NA
 10478916 10478917 EAM_2877 EAM_2878 hrpN hrpV TRUE 0.683 158.000 0.400 NA   NA
 10478917 10478918 EAM_2878 EAM_2879 hrpV hrpT TRUE 0.996 -7.000 0.667 NA   NA
 10478918 10478919 EAM_2879 EAM_2880 hrpT hrcC TRUE 0.978 14.000 0.375 NA   NA
 10478919 10478920 EAM_2880 EAM_2881 hrcC hrpG TRUE 0.989 -7.000 0.375 NA   NA
 10478920 10478921 EAM_2881 EAM_2882 hrpG hrpF TRUE 0.990 -13.000 0.500 NA   NA
 10478921 10478922 EAM_2882 EAM_2883 hrpF hrpE TRUE 0.773 91.000 0.385 NA   NA
 10478922 10478923 EAM_2883 EAM_2884 hrpE hrpD TRUE 0.993 -6.000 0.462 NA   NA
 10478923 10478924 EAM_2884 EAM_2885 hrpD hrcJ TRUE 0.996 2.000 0.600 NA   NA
 10478924 10478925 EAM_2885 EAM_2886 hrcJ hrpB TRUE 0.988 7.000 0.222 0.012   NA
 10478925 10478926 EAM_2886 EAM_2887 hrpB hrpA FALSE 0.405 69.000 0.111 NA   NA
 10478926 10478927 EAM_2887 EAM_2888 hrpA   FALSE 0.206 107.000 0.000 NA   NA
 10478927 10478928 EAM_2888 EAM_2889     TRUE 0.454 39.000 0.000 NA   NA
 10478928 10478929 EAM_2889 EAM_2890     TRUE 0.903 4.000 0.000 NA   NA
 10478929 10478930 EAM_2890 EAM_2891   hrpS FALSE 0.028 308.000 0.000 1.000   NA
 10478930 10478931 EAM_2891 EAM_2892 hrpS hrpY FALSE 0.155 362.000 0.000 0.030 Y NA
 10478931 10478932 EAM_2892 EAM_2893 hrpY hrpX TRUE 0.998 4.000 0.400 0.010 Y NA
 10478932 10478933 EAM_2893 EAM_2894 hrpX hrpL TRUE 0.478 146.000 0.182 0.051 N NA
 10478934 10478935 EAM_2895 EAM_2896 hrpJ hrpI TRUE 0.978 1.000 0.167 1.000   NA
 10478935 10478936 EAM_2896 EAM_2897 hrpI hrpQ TRUE 0.857 -21.000 0.073 NA   NA
 10478936 10478937 EAM_2897 EAM_2898 hrpQ hrcN TRUE 0.925 -6.000 0.073 NA   NA
 10478937 10478938 EAM_2898 EAM_2899 hrcN hrpO TRUE 0.845 -13.000 0.000 NA   NA
 10478938 10478939 EAM_2899 EAM_2900 hrpO hrpP TRUE 0.929 0.000 0.000 NA   NA
 10478939 10478940 EAM_2900 EAM_2901 hrpP hrcQ TRUE 0.994 -3.000 0.400 NA   NA
 10478940 10478941 EAM_2901 EAM_2902 hrcQ hrcR TRUE 0.992 -3.000 0.333 1.000   NA
 10478941 10478942 EAM_2902 EAM_2903 hrcR hrcS TRUE 0.997 8.000 0.318 0.012 Y NA
 10478942 10478943 EAM_2903 EAM_2904 hrcS hrcT TRUE 0.997 2.000 0.273 0.052 Y NA
 10478943 10478944 EAM_2904 EAM_2905 hrcT hrcU TRUE 1.000 2.000 0.875 0.052 Y NA
 10478944 10478945 EAM_2905 EAM_2906 hrcU   FALSE 0.283 62.000 0.000 1.000   NA
 10478945 10478946 EAM_2906 EAM_2907     FALSE 0.291 56.000 0.000 NA   NA
 10478947 10478948 EAM_2908 EAM_2909 hsvC hsvB TRUE 0.699 41.000 0.000 0.015   NA
 10478948 10478949 EAM_2909 EAM_2910 hsvB hsvA FALSE 0.205 127.000 0.000 1.000   NA
 10478949 10478950 EAM_2910 EAM_2911 hsvA hrpK FALSE 0.072 215.000 0.000 NA   NA
 10478950 10478951 EAM_2911 EAM_2912 hrpK   FALSE 0.143 158.000 0.000 NA   NA
 10478954 10478955 EAM_2915 EAM_2916 ampR   FALSE 0.012 244.000 0.000 1.000 N NA
 10478955 10478956 EAM_2916 EAM_2917     TRUE 0.923 46.000 0.531 NA   NA
 10478957 10478958 EAM_2918 EAM_2919     TRUE 0.999 -15.000 0.877 0.010 Y NA
 10478959 10478960 EAM_2920 EAM_2921 mdtJ mdtI TRUE 0.999 -13.000 0.869 0.052 Y NA
 10478960 10478961 EAM_2921 EAM_2922 mdtI   FALSE 0.223 106.000 0.000 1.000   NA
 10478961 10478962 EAM_2922 EAM_2923     FALSE 0.046 260.000 0.000 1.000   NA
 10478962 10478963 EAM_2923 EAM_2924     FALSE 0.216 97.000 0.000 NA   NA
 10478963 10478964 EAM_2924 EAM_2925     FALSE 0.217 94.000 0.000 NA   NA
 10478964 10478965 EAM_2925 EAM_2926     FALSE 0.019 355.000 0.000 NA   NA
 10478965 10478966 EAM_2926 EAM_2927     FALSE 0.112 179.000 0.000 NA   NA
 10478966 10478967 EAM_2927 EAM_2928     TRUE 0.959 22.000 0.375 1.000   NA
 10478969 10478970 EAM_2930 EAM_2931 bglE bglF TRUE 0.996 -3.000 0.136 0.004 Y NA
 10478970 10478971 EAM_2931 EAM_2932 bglF bglI TRUE 0.992 3.000 0.000 0.004 Y NA
 10478971 10478972 EAM_2932 EAM_2933 bglI bglY TRUE 0.741 50.000 0.000 1.000 Y NA
 10478972 10478973 EAM_2933 EAM_2934 bglY bglA TRUE 0.816 68.000 0.000 0.002 Y NA
 10478974 10478975 EAM_2935 EAM_2936 ggt   FALSE 0.241 71.000 0.000 NA   NA
 10478975 10478976 EAM_2936 EAM_2937     FALSE 0.215 84.000 0.000 NA   NA
 10478976 10478977 EAM_2937 EAM_2938     TRUE 0.868 9.000 0.000 NA   NA
 10478977 10478978 EAM_2938 EAM_2939     FALSE 0.059 232.000 0.000 NA   NA
 10478980 10478981 EAM_2941 EAM_2942     FALSE 0.024 190.000 0.000 1.000 N NA
 10478982 10478983 EAM_2943 EAM_2944     TRUE 0.993 -25.000 0.714 NA   NA
 10478987 10478988 EAM_2948 EAM_2949     TRUE 0.946 23.000 0.333 NA   NA
 10478988 10478989 EAM_2949 EAM_2950     TRUE 0.870 25.000 0.188 NA   NA
 10478989 10478990 EAM_2950 EAM_2951     TRUE 0.999 4.000 0.879 NA Y NA
 10478990 10478991 EAM_2951 EAM_2952     TRUE 0.998 -3.000 0.848 NA   NA
 10478991 10478992 EAM_2952 EAM_2953     FALSE 0.043 257.000 0.000 NA   NA
 10478992 10478993 EAM_2953 EAM_2954     FALSE 0.003 379.000 0.000 1.000 N NA
 10478994 10478995 EAM_2955 EAM_2956 exbD exbB TRUE 0.999 6.000 0.810 0.047 Y NA
 10478996 10478997 EAM_2957 EAM_2958 metC   FALSE 0.395 178.000 0.212 NA   NA
 10478998 10478999 EAM_2959 EAM_2960 ddc dat TRUE 0.999 5.000 0.459 0.013 Y NA
 10478999 10479000 EAM_2960 EAM_2961 dat   FALSE 0.019 206.000 0.000 1.000 N NA
 10479002 10479003 EAM_2963 EAM_2964 sufI plsC FALSE 0.336 96.000 0.154 1.000 N NA
 10479003 10479004 EAM_2964 EAM_2965 plsC parC FALSE 0.023 176.000 0.043 1.000 N NA
 10479004 10479005 EAM_2965 EAM_2966 parC   FALSE 0.010 262.000 0.000 1.000 N NA
 10479005 10479006 EAM_2966 EAM_2967     FALSE 0.222 78.000 0.000 NA   NA
 10479007 10479008 EAM_2968 EAM_2969     FALSE 0.007 556.000 0.000 NA   NA
 10479008 10479009 EAM_2969 EAM_2970     FALSE 0.005 1171.000 0.000 NA   NA
 10479009 10479010 EAM_2970 EAM_2971     FALSE 0.147 156.000 0.000 NA   NA
 10479010 10479011 EAM_2971 EAM_2972     TRUE 0.517 33.000 0.000 NA   NA
 10479011 10479012 EAM_2972 EAM_2973     TRUE 0.975 16.000 0.000 0.003 Y NA
 10479012 10479013 EAM_2973 EAM_2974     TRUE 0.906 41.000 0.000 0.003 Y NA
 10479013 10479014 EAM_2974 EAM_2975     TRUE 0.990 -7.000 0.000 0.003 Y NA
 10479014 10479015 EAM_2975 EAM_2976     TRUE 0.925 14.000 0.000 0.012   NA
 10479015 10479016 EAM_2976 EAM_2977     TRUE 0.700 20.000 0.000 1.000   NA
 10479016 10479017 EAM_2977 EAM_2978     FALSE 0.389 45.000 0.050 NA   NA
 10479017 10479018 EAM_2978 EAM_2979     FALSE 0.163 59.000 0.010 NA   NA
 10479018 10479019 EAM_2979 EAM_2980     TRUE 0.886 -3.000 0.014 1.000   NA
 10479019 10479020 EAM_2980 EAM_2981     FALSE 0.197 120.000 0.000 NA   NA
 10479020 10479021 EAM_2981 EAM_2982     FALSE 0.350 49.000 0.000 NA   NA
 10479022 10479023 EAM_2983 EAM_2984 parE   TRUE 0.691 55.000 0.217 NA   NA
 10479023 10479024 EAM_2984 EAM_2985   icc TRUE 0.993 4.000 0.427 NA   NA
 10479024 10479025 EAM_2985 EAM_2986 icc   TRUE 0.800 102.000 0.433 NA   NA
 10479025 10479026 EAM_2986 EAM_2987   nudF TRUE 0.995 -3.000 0.443 NA   NA
 10479027 10479028 EAM_2988 EAM_2989 tolC   TRUE 0.727 166.000 0.480 NA   NA
 10479028 10479029 EAM_2989 EAM_2990     TRUE 0.995 7.000 0.632 NA   NA
 10479030 10479031 EAM_2991 EAM_2992   ribB FALSE 0.154 158.000 0.048 1.000   NA
 10479033 10479034 EAM_2994 EAM_2995 rfaE glnE FALSE 0.144 89.000 0.083 1.000 N NA
 10479034 10479035 EAM_2995 EAM_2996 glnE   TRUE 0.456 42.000 0.053 1.000   NA
 10479036 10479037 EAM_2997 EAM_2998   cca FALSE 0.150 136.000 0.106 NA N NA
 10479038 10479039 EAM_2999 EAM_3000 bacA folB FALSE 0.218 138.000 0.128 1.000 N NA
 10479042 10479043 EAM_3003 EAM_3004 rpsU dnaG FALSE 0.005 418.000 0.067 1.000 N NA
 10479043 10479044 EAM_3004 EAM_3005 dnaG rpoD FALSE 0.113 324.000 0.299 1.000 N NA
 10479045 10479046 EAM_3006 EAM_3007 mug   FALSE 0.017 188.000 0.000 NA N NA
 10479046 10479047 EAM_3007 EAM_3008     FALSE 0.142 159.000 0.000 NA   NA
 10479050 10479051 EAM_3011 EAM_3012   nlpA FALSE 0.035 129.000 0.000 NA N NA
 10479056 10479057 EAM_3017 EAM_3018     TRUE 0.997 4.000 0.800 NA   NA
 10479057 10479058 EAM_3018 EAM_3019     FALSE 0.387 97.000 0.120 NA   NA
 10479058 10479059 EAM_3019 EAM_3020     TRUE 0.881 113.000 0.667 NA   NA
 10479059 10479060 EAM_3020 EAM_3021     TRUE 0.873 37.000 0.286 NA   NA
 10479060 10479061 EAM_3021 EAM_3022     TRUE 0.984 13.000 0.429 NA   NA
 10479061 10479062 EAM_3022 EAM_3023     FALSE 0.241 71.000 0.000 NA   NA
 10479062 10479063 EAM_3023 EAM_3024     FALSE 0.063 225.000 0.000 NA   NA
 10479064 10479065 EAM_3025 EAM_3026     FALSE 0.261 242.000 0.250 NA   NA
 10479065 10479066 EAM_3026 EAM_3027     FALSE 0.205 108.000 0.000 NA   NA
 10479066 10479067 EAM_3027 EAM_3028     FALSE 0.085 200.000 0.000 NA   NA
 10479067 10479068 EAM_3028 EAM_3029     TRUE 0.992 -3.000 0.344 NA   NA
 10479068 10479069 EAM_3029 EAM_3030     TRUE 0.987 -10.000 0.365 1.000   NA
 10479069 10479070 EAM_3030 EAM_3031     TRUE 0.997 0.000 0.623 NA   NA
 10479070 10479071 EAM_3031 EAM_3032     TRUE 0.894 5.000 0.000 NA   NA
 10479072 10479073 EAM_3033 EAM_3034     TRUE 0.955 -3.000 0.091 NA   NA
 10479073 10479074 EAM_3034 EAM_3035     TRUE 0.996 -19.000 0.957 NA   NA
 10479074 10479075 EAM_3035 EAM_3036     TRUE 0.998 5.000 0.917 NA   NA
 10479075 10479076 EAM_3036 EAM_3037     FALSE 0.055 236.000 0.000 NA   NA
 10479076 10479077 EAM_3037 EAM_t074   tRNA-Leu FALSE 0.099 190.000 0.000 NA   NA
 10479078 10479079 EAM_3038 EAM_3039     FALSE 0.125 171.000 0.000 NA   NA
 10479079 10479080 EAM_3039 EAM_3040     TRUE 0.917 2.000 0.000 NA   NA
 10479080 10479081 EAM_3040 EAM_3041     FALSE 0.281 58.000 0.000 NA   NA
 10479082 10479083 EAM_3042 EAM_3043     TRUE 0.998 0.000 0.631 0.052   NA
 10479084 10479085 EAM_3044 EAM_3045 pepA holC TRUE 0.745 125.000 0.494 1.000 N NA
 10479085 10479086 EAM_3045 EAM_3046 holC valS TRUE 0.847 6.000 0.089 1.000 N NA
 10479086 10479087 EAM_3046 EAM_3047 valS   FALSE 0.004 370.000 0.000 1.000 N NA
 10479088 10479089 EAM_3048 EAM_3049 uhpC   TRUE 0.966 14.000 0.091 1.000 Y NA
 10479090 10479091 EAM_3050 EAM_3051     FALSE 0.029 300.000 0.000 NA   NA
 10479093 10479094 EAM_3053 EAM_3054 argI pyrB FALSE 0.063 294.000 0.000 0.003 N NA
 10479094 10479095 EAM_3054 EAM_3055 pyrB pyrI TRUE 0.993 13.000 0.197 0.001 Y NA
 10479095 10479096 EAM_3055 EAM_3056 pyrI   FALSE 0.101 141.000 0.084 NA N NA
 10479097 10479098 EAM_3057 EAM_3058     FALSE 0.234 91.000 0.000 1.000   NA
 10479099 10479100 EAM_3059 EAM_3060 nrdD nrdG FALSE 0.049 1697.000 0.464 1.000 N NA
 10479105 10479106 EAM_3065 EAM_3066 deaD nlpI FALSE 0.131 177.000 0.053 1.000   NA
 10479106 10479107 EAM_3066 EAM_3067 nlpI pnp FALSE 0.246 133.000 0.071 1.000   NA
 10479107 10479108 EAM_3067 EAM_3068 pnp rpsO TRUE 0.457 304.000 0.335 1.000 Y NA
 10479108 10479109 EAM_3068 EAM_3069 rpsO truB TRUE 0.810 108.000 0.211 1.000 Y NA
 10479109 10479110 EAM_3069 EAM_3070 truB rbfA TRUE 0.997 0.000 0.318 1.000 Y NA
 10479110 10479111 EAM_3070 EAM_3071 rbfA infB TRUE 0.873 181.000 0.530 1.000 Y NA
 10479111 10479112 EAM_3071 EAM_3072 infB nusA TRUE 0.916 25.000 0.342 1.000 N NA
 10479112 10479113 EAM_3072 EAM_3073 nusA   TRUE 0.983 25.000 0.759 NA   NA
 10479113 10479114 EAM_3073 EAM_t075   tRNA-Met FALSE 0.076 209.000 0.000 NA   NA
 10479114 10479115 EAM_t075 EAM_t076 tRNA-Met tRNA-Leu FALSE 0.316 52.000 0.000 NA   NA
 10479115 10479116 EAM_t076 EAM_3074 tRNA-Leu secG FALSE 0.350 49.000 0.000 NA   NA
 10479116 10479117 EAM_3074 EAM_3075 secG   FALSE 0.216 97.000 0.000 NA   NA
 10479117 10479118 EAM_3075 EAM_3076   mrsA FALSE 0.215 84.000 0.000 NA   NA
 10479118 10479119 EAM_3076 EAM_3077 mrsA folP TRUE 0.974 5.000 0.260 1.000 N NA
 10479119 10479120 EAM_3077 EAM_3078 folP ftsH TRUE 0.626 85.000 0.325 1.000 N NA
 10479120 10479121 EAM_3078 EAM_3079 ftsH rrmJ FALSE 0.309 115.000 0.152 1.000 N NA
 10479124 10479125 EAM_3082 EAM_3083 dacB basR TRUE 0.877 5.000 0.101 1.000 N NA
 10479125 10479126 EAM_3083 EAM_3084 basR basS TRUE 0.998 0.000 0.381 1.000 Y NA
 10479127 10479128 EAM_3085 EAM_3086     TRUE 0.872 -3.000 0.015 NA   NA
 10479128 10479129 EAM_3086 EAM_3087   rpmA FALSE 0.004 576.000 0.019 NA   NA
 10479129 10479130 EAM_3087 EAM_3088 rpmA rplU TRUE 0.998 16.000 0.667 0.011 Y NA
 10479131 10479132 EAM_3089 EAM_3090 ispB sfsB FALSE 0.006 310.000 0.000 1.000 N NA
 10479133 10479134 EAM_3091 EAM_3092 murA   TRUE 0.542 78.000 0.258 NA N NA
 10479134 10479135 EAM_3092 EAM_3093     TRUE 0.511 227.000 0.453 NA   NA
 10479135 10479136 EAM_3093 EAM_3094     TRUE 0.991 0.000 0.308 NA   NA
 10479136 10479137 EAM_3094 EAM_3095     TRUE 0.954 12.000 0.188 NA   NA
 10479137 10479138 EAM_3095 EAM_3096     TRUE 0.995 5.000 0.562 NA   NA
 10479138 10479139 EAM_3096 EAM_3097     TRUE 0.997 8.000 0.530 NA Y NA
 10479140 10479141 EAM_3098 EAM_3099   kdsD TRUE 0.945 12.000 0.226 1.000 N NA
 10479141 10479142 EAM_3099 EAM_3100 kdsD kdsC TRUE 0.983 19.000 0.598 1.000   NA
 10479142 10479143 EAM_3100 EAM_3101 kdsC   TRUE 0.997 -3.000 0.617 NA   NA
 10479143 10479144 EAM_3101 EAM_3102     TRUE 0.990 -10.000 0.459 NA   NA
 10479144 10479145 EAM_3102 EAM_3103     TRUE 0.994 6.000 0.543 NA   NA
 10479145 10479146 EAM_3103 EAM_3104   rpoN TRUE 0.661 49.000 0.163 1.000   NA
 10479146 10479147 EAM_3104 EAM_3105 rpoN   TRUE 0.980 23.000 0.820 NA N NA
 10479147 10479148 EAM_3105 EAM_3106   ptsN TRUE 0.750 178.000 0.728 NA N NA
 10479148 10479149 EAM_3106 EAM_3107 ptsN   FALSE 0.298 195.000 0.186 NA   NA
 10479149 10479150 EAM_3107 EAM_3108   ptsO TRUE 0.981 -3.000 0.182 NA   NA
 10479151 10479152 EAM_3109 EAM_3110 mtgA arcB FALSE 0.006 790.000 0.000 1.000   NA
 10479153 10479154 EAM_3111 EAM_3112 gltA cysJ FALSE 0.083 39.000 0.037 1.000 N NA
 10479155 10479156 EAM_3113 EAM_3114 sspB sspA TRUE 0.997 5.000 0.831 NA   NA
 10479156 10479157 EAM_3114 EAM_3115 sspA rpsI FALSE 0.001 309.000 0.014 NA N NA
 10479157 10479158 EAM_3115 EAM_3116 rpsI rplM TRUE 0.997 16.000 0.601 0.010 Y NA
 10479158 10479159 EAM_3116 EAM_3117 rplM   FALSE 0.023 245.000 0.003 NA   NA
 10479160 10479161 EAM_3118 EAM_3119 yhcB degQ TRUE 0.446 115.000 0.154 NA   NA
 10479161 10479162 EAM_3119 EAM_3120 degQ degS TRUE 0.905 140.000 0.262 0.002 Y NA
 10479164 10479165 EAM_3122 EAM_3123 argR   FALSE 0.008 496.000 0.000 NA   NA
 10479165 10479166 EAM_3123 EAM_3124     FALSE 0.202 112.000 0.000 NA   NA
 10479167 10479168 EAM_3125 EAM_3126 aaeB aaeA TRUE 0.955 14.000 0.222 NA   NA
 10479168 10479169 EAM_3126 EAM_3127 aaeA aaeX TRUE 0.989 8.000 0.400 NA   NA
 10479171 10479172 EAM_3129 EAM_3130 tldD   FALSE 0.208 109.000 0.050 NA   NA
 10479172 10479173 EAM_3130 EAM_3131   cafA TRUE 0.725 69.000 0.296 NA   NA
 10479173 10479174 EAM_3131 EAM_3132 cafA   TRUE 0.990 2.000 0.417 NA N NA
 10479174 10479175 EAM_3132 EAM_3133   mreD TRUE 0.944 10.000 0.206 NA N NA
 10479175 10479176 EAM_3133 EAM_3134 mreD mreC TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 10479176 10479177 EAM_3134 EAM_3135 mreC mreB TRUE 0.880 70.000 0.689 1.000 N NA
 10479177 10479178 EAM_3135 EAM_3136 mreB   FALSE 0.006 315.000 0.000 1.000 N NA
 10479179 10479180 EAM_3137 EAM_3138     FALSE 0.370 52.000 0.059 1.000   NA
 10479180 10479181 EAM_3138 EAM_3139     TRUE 0.999 2.000 0.790 0.024   NA
 10479181 10479182 EAM_3139 EAM_3140   aroQ FALSE 0.038 224.000 0.006 1.000   NA
 10479182 10479183 EAM_3140 EAM_3141 aroQ accB TRUE 0.892 22.000 0.254 1.000 N NA
 10479183 10479184 EAM_3141 EAM_3142 accB accC TRUE 0.996 12.000 0.275 0.001 Y NA
 10479184 10479185 EAM_3142 EAM_3143 accC   FALSE 0.343 83.000 0.103 NA   NA
 10479185 10479186 EAM_3143 EAM_3144   panF TRUE 0.995 -10.000 0.682 NA   NA
 10479186 10479187 EAM_3144 EAM_3145 panF prmA TRUE 0.426 12.000 0.041 1.000 N NA
 10479187 10479188 EAM_3145 EAM_3146 prmA dusB FALSE 0.126 307.000 0.042 1.000 Y NA
 10479188 10479189 EAM_3146 EAM_3147 dusB fis TRUE 0.741 26.000 0.161 1.000 N NA
 10479191 10479192 EAM_3149 EAM_3150   lpxP FALSE 0.008 475.000 0.000 NA   NA
 10479192 10479193 EAM_3150 EAM_3151 lpxP   FALSE 0.005 333.000 0.000 1.000 N NA
 10479193 10479194 EAM_3151 EAM_3152     TRUE 0.970 67.000 0.548 0.034 Y NA
 10479194 10479195 EAM_3152 EAM_3153     TRUE 0.999 8.000 0.815 0.012 Y NA
 10479195 10479196 EAM_3153 EAM_3154     TRUE 0.998 12.000 0.734 1.000 Y NA
 10479197 10479198 EAM_r019 EAM_t077 5S_rRNA tRNA-Thr TRUE 0.713 18.000 0.000 NA   NA
 10479198 10479199 EAM_t077 EAM_r020 tRNA-Thr 5S_rRNA FALSE 0.409 43.000 0.000 NA   NA
 10479199 10479200 EAM_r020 EAM_r021 5S_rRNA 23S_rRNA FALSE 0.098 191.000 0.000 NA   NA
 10479200 10479201 EAM_r021 EAM_t078 23S_rRNA tRNA-Glu FALSE 0.012 406.000 0.000 NA   NA
 10479201 10479202 EAM_t078 EAM_r022 tRNA-Glu 16S_rRNA FALSE 0.277 59.000 0.000 NA   NA
 10479204 10479205 EAM_3156 EAM_3157   aroE TRUE 0.919 -3.000 0.043 NA   NA
 10479205 10479206 EAM_3157 EAM_3158 aroE   TRUE 0.741 12.000 0.087 NA N NA
 10479206 10479207 EAM_3158 EAM_3159     TRUE 0.896 -10.000 0.137 NA N NA
 10479207 10479208 EAM_3159 EAM_3160   smg TRUE 0.933 26.000 0.331 NA   NA
 10479208 10479209 EAM_3160 EAM_3161 smg smf TRUE 0.929 -13.000 0.124 NA   NA
 10479210 10479211 EAM_3162 EAM_3163 def fmt TRUE 0.950 24.000 0.058 0.017 Y NA
 10479211 10479212 EAM_3163 EAM_3164 fmt rsmB TRUE 0.925 51.000 0.305 1.000 Y NA
 10479212 10479213 EAM_3164 EAM_3165 rsmB trkA FALSE 0.015 59.000 0.007 1.000 N NA
 10479213 10479214 EAM_3165 EAM_3166 trkA mscL FALSE 0.008 144.000 0.007 1.000 N NA
 10479214 10479215 EAM_3166 EAM_3167 mscL   FALSE 0.053 238.000 0.000 NA   NA
 10479215 10479216 EAM_3167 EAM_3168     FALSE 0.272 60.000 0.000 NA   NA
 10479217 10479218 EAM_3169 EAM_3170   zntR TRUE 0.613 75.000 0.219 NA   NA
 10479218 10479219 EAM_3170 EAM_3171 zntR   TRUE 0.959 0.000 0.095 NA   NA
 10479219 10479220 EAM_3171 EAM_3172   rplQ FALSE 0.115 119.000 0.012 NA   NA
 10479220 10479221 EAM_3172 EAM_3173 rplQ rpoA TRUE 0.961 41.000 0.873 1.000 N NA
 10479221 10479222 EAM_3173 EAM_3174 rpoA rpsD TRUE 0.955 26.000 0.549 1.000 N NA
 10479222 10479223 EAM_3174 EAM_3175 rpsD rpsK TRUE 0.990 34.000 0.509 0.014 Y NA
 10479223 10479224 EAM_3175 EAM_3176 rpsK rpsM TRUE 0.998 17.000 0.810 0.010 Y NA
 10479224 10479225 EAM_3176 EAM_3177 rpsM rpmJ TRUE 0.731 147.000 0.086 0.010 Y NA
 10479225 10479226 EAM_3177 EAM_3178 rpmJ secY FALSE 0.097 33.000 0.036 1.000 N NA
 10479226 10479227 EAM_3178 EAM_3179 secY rplO TRUE 0.994 8.000 0.730 1.000 N NA
 10479227 10479228 EAM_3179 EAM_3180 rplO rpmD TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 10479228 10479229 EAM_3180 EAM_3181 rpmD rpsE TRUE 0.999 6.000 0.789 0.014 Y NA
 10479229 10479230 EAM_3181 EAM_3182 rpsE rplR TRUE 0.998 15.000 0.814 0.014 Y NA
 10479230 10479231 EAM_3182 EAM_3183 rplR rplF TRUE 0.999 10.000 0.815 0.010 Y NA
 10479231 10479232 EAM_3183 EAM_3184 rplF rpsH TRUE 0.999 12.000 0.808 0.010 Y NA
 10479232 10479233 EAM_3184 EAM_3185 rpsH rpsN TRUE 0.988 37.000 0.473 0.010 Y NA
 10479233 10479234 EAM_3185 EAM_3186 rpsN rplE TRUE 0.997 14.000 0.496 0.010 Y NA
 10479234 10479235 EAM_3186 EAM_3187 rplE rplX TRUE 0.998 15.000 0.758 0.010 Y NA
 10479235 10479236 EAM_3187 EAM_3188 rplX rplN TRUE 0.999 11.000 0.810 0.014 Y NA
 10479236 10479237 EAM_3188 EAM_3189 rplN rpsQ TRUE 0.965 167.000 0.791 0.014 Y NA
 10479237 10479238 EAM_3189 EAM_3190 rpsQ rpmC TRUE 1.000 0.000 0.828 0.010 Y NA
 10479238 10479239 EAM_3190 EAM_3191 rpmC rplP TRUE 1.000 0.000 0.802 0.010 Y NA
 10479239 10479240 EAM_3191 EAM_3192 rplP rpsC TRUE 0.999 13.000 0.828 0.014 Y NA
 10479240 10479241 EAM_3192 EAM_3193 rpsC rplV TRUE 0.998 18.000 0.719 0.014 Y NA
 10479241 10479242 EAM_3193 EAM_3194 rplV rpsS TRUE 0.998 15.000 0.769 0.014 Y NA
 10479242 10479243 EAM_3194 EAM_3195 rpsS rplB TRUE 0.998 17.000 0.820 0.014 Y NA
 10479243 10479244 EAM_3195 EAM_3196 rplB rplW TRUE 0.911 18.000 0.002 1.000 Y NA
 10479244 10479245 EAM_3196 EAM_3197 rplW rplD TRUE 0.981 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 10479245 10479246 EAM_3197 EAM_3198 rplD rplC TRUE 0.998 11.000 0.486 0.010 Y NA
 10479246 10479247 EAM_3198 EAM_3199 rplC rpsJ TRUE 0.980 33.000 0.307 0.014 Y NA
 10479247 10479248 EAM_3199 EAM_3200 rpsJ tufA FALSE 0.380 332.000 0.318 1.000 Y NA
 10479248 10479249 EAM_3200 EAM_3201 tufA fusA TRUE 0.964 73.000 0.400 0.001 Y NA
 10479249 10479250 EAM_3201 EAM_3202 fusA rpsG TRUE 0.947 95.000 0.579 1.000 Y NA
 10479250 10479251 EAM_3202 EAM_3203 rpsG rpsL TRUE 0.977 97.000 0.620 0.002 Y NA
 10479251 10479252 EAM_3203 EAM_3204 rpsL   FALSE 0.058 127.000 0.058 NA N NA
 10479252 10479253 EAM_3204 EAM_3205     TRUE 0.999 8.000 0.804 NA Y NA
 10479253 10479254 EAM_3205 EAM_3206     TRUE 0.999 0.000 0.790 NA Y NA
 10479254 10479255 EAM_3206 EAM_3207     TRUE 0.986 0.000 0.220 NA   NA
 10479255 10479256 EAM_3207 EAM_3208   fkpA TRUE 0.431 205.000 0.310 NA   NA
 10479258 10479259 EAM_3210 EAM_3211 slyD   TRUE 0.715 139.000 0.370 1.000   NA
 10479259 10479260 EAM_3211 EAM_3212   kefB TRUE 0.843 57.000 0.400 1.000   NA
 10479260 10479261 EAM_3212 EAM_3213 kefB kefG TRUE 0.998 1.000 0.927 1.000   NA
 10479263 10479264 EAM_3215 EAM_3216   tauD FALSE 0.007 590.000 0.000 NA   NA
 10479264 10479265 EAM_3216 EAM_3217 tauD tauC TRUE 0.975 -3.000 0.214 1.000 N NA
 10479265 10479266 EAM_3217 EAM_3218 tauC tauB TRUE 0.999 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 10479266 10479267 EAM_3218 EAM_3219 tauB tauA TRUE 0.944 16.000 0.000 1.000 Y NA
 10479267 10479268 EAM_3219 EAM_3220 tauA   FALSE 0.020 204.000 0.000 1.000 N NA
 10479269 10479270 EAM_3221 EAM_3222     TRUE 0.986 0.000 0.222 NA   NA
 10479270 10479271 EAM_3222 EAM_3223   prkB TRUE 0.681 109.000 0.303 NA   NA
 10479273 10479274 EAM_3225 EAM_3226 crp   TRUE 0.433 61.000 0.111 NA   NA
 10479275 10479276 EAM_3227 EAM_3228 argD pabA TRUE 0.668 87.000 0.088 1.000 Y NA
 10479276 10479277 EAM_3228 EAM_3229 pabA ppiA FALSE 0.080 59.000 0.000 1.000 N NA
 10479279 10479280 EAM_3231 EAM_3232 codA   FALSE 0.226 76.000 0.000 NA   NA
 10479282 10479283 EAM_3234 EAM_3235 trpS gph TRUE 0.950 -7.000 0.118 1.000   NA
 10479283 10479284 EAM_3235 EAM_3236 gph rpe TRUE 0.923 -16.000 0.120 1.000   NA
 10479284 10479285 EAM_3236 EAM_3237 rpe dam FALSE 0.101 38.000 0.040 1.000 N NA
 10479285 10479286 EAM_3237 EAM_3238 dam damX TRUE 0.599 120.000 0.234 NA   NA
 10479286 10479287 EAM_3238 EAM_3239 damX aroB FALSE 0.146 92.000 0.022 NA   NA
 10479287 10479288 EAM_3239 EAM_3240 aroB aroK TRUE 0.876 54.000 0.208 1.000 Y NA
 10479288 10479289 EAM_3240 EAM_3241 aroK hofQ FALSE 0.076 392.000 0.319 1.000 N NA
 10479289 10479290 EAM_3241 EAM_3242 hofQ   TRUE 0.882 -13.000 0.072 NA   NA
 10479290 10479291 EAM_3242 EAM_3243     TRUE 0.929 -10.000 0.111 NA   NA
 10479291 10479292 EAM_3243 EAM_3244     TRUE 0.928 -7.000 0.087 NA   NA
 10479292 10479293 EAM_3244 EAM_3245     TRUE 0.998 0.000 0.870 NA   NA
 10479296 10479297 EAM_3248 EAM_3249   hslR FALSE 0.096 154.000 0.010 1.000   NA
 10479297 10479298 EAM_3249 EAM_3250 hslR hslO TRUE 0.732 23.000 0.140 1.000 N NA
 10479298 10479299 EAM_3250 EAM_3251 hslO pckA FALSE 0.004 368.000 0.048 1.000 N NA
 10479300 10479301 EAM_3252 EAM_3253 envZ ompR TRUE 0.999 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 10479302 10479303 EAM_3254 EAM_3255 greB   TRUE 0.680 129.000 0.123 1.000 Y NA
 10479303 10479304 EAM_3255 EAM_3256     FALSE 0.016 221.000 0.000 1.000 N NA
 10479306 10479307 EAM_3258 EAM_3259 gntX gntY FALSE 0.345 59.000 0.066 1.000   NA
 10479308 10479309 EAM_3260 EAM_3261 malQ malP TRUE 0.978 13.000 0.039 0.012 Y NA
 10479309 10479310 EAM_3261 EAM_3262 malP glpR FALSE 0.305 213.000 0.000 1.000 Y NA
 10479310 10479311 EAM_3262 EAM_3263 glpR glpG TRUE 0.621 62.000 0.190 1.000   NA
 10479311 10479312 EAM_3263 EAM_3264 glpG glpE TRUE 0.776 115.000 0.405 1.000   NA
 10479314 10479315 EAM_3266 EAM_3267     FALSE 0.017 365.000 0.000 NA   NA
 10479315 10479316 EAM_3267 EAM_3268   glgP FALSE 0.121 173.000 0.000 NA   NA
 10479316 10479317 EAM_3268 EAM_3269 glgP glgA TRUE 0.974 21.000 0.228 1.000 Y NA
 10479317 10479318 EAM_3269 EAM_3270 glgA glgC TRUE 0.911 57.000 0.307 1.000 Y NA
 10479318 10479319 EAM_3270 EAM_3271 glgC glgX TRUE 0.987 13.000 0.228 1.000 Y NA
 10479319 10479320 EAM_3271 EAM_3272 glgX glgB TRUE 0.993 0.000 0.020 0.002 Y NA
 10479320 10479321 EAM_3272 EAM_3273 glgB asd FALSE 0.003 427.000 0.000 1.000 N NA
 10479321 10479322 EAM_3273 EAM_3274 asd gntU FALSE 0.388 188.000 0.000 1.000 Y NA
 10479322 10479323 EAM_3274 EAM_3275 gntU gntK TRUE 0.999 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 10479323 10479324 EAM_3275 EAM_3276 gntK gntR FALSE 0.011 255.000 0.000 1.000 N NA
 10479324 10479325 EAM_3276 EAM_3277 gntR   TRUE 0.767 189.000 0.667 NA   NA
 10479329 10479330 EAM_3281 EAM_3282 ugpQ ugpC FALSE 0.331 -3.000 0.016 1.000 N NA
 10479330 10479331 EAM_3282 EAM_3283 ugpC ugpE TRUE 0.997 3.000 0.272 0.034 Y NA
 10479331 10479332 EAM_3283 EAM_3284 ugpE ugpA TRUE 0.998 -3.000 0.306 0.034 Y NA
 10479332 10479333 EAM_3284 EAM_3285 ugpA ugpB TRUE 0.980 84.000 0.793 0.034 Y NA
 10479333 10479334 EAM_3285 EAM_3286 ugpB livF FALSE 0.003 388.000 0.000 1.000 N NA
 10479334 10479335 EAM_3286 EAM_3287 livF livG TRUE 1.000 2.000 0.967 0.013 Y NA
 10479335 10479336 EAM_3287 EAM_3288 livG livM TRUE 0.999 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 10479336 10479337 EAM_3288 EAM_3289 livM livH TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.034 Y NA
 10479337 10479338 EAM_3289 EAM_3290 livH livJ TRUE 0.822 85.000 0.217 1.000 Y NA
 10479340 10479341 EAM_3292 EAM_3293 rpoH ftsX FALSE 0.008 289.000 0.051 1.000 N NA
 10479341 10479342 EAM_3293 EAM_3294 ftsX ftsE TRUE 0.950 20.000 0.121 1.000 Y NA
 10479342 10479343 EAM_3294 EAM_3295 ftsE ftsY TRUE 0.952 6.000 0.117 0.069 N NA
 10479344 10479345 EAM_3296 EAM_3297     TRUE 0.885 -10.000 0.063 NA   NA
 10479345 10479346 EAM_3297 EAM_3298     FALSE 0.201 114.000 0.000 NA   NA
 10479346 10479347 EAM_3298 EAM_3299   zntA TRUE 0.816 93.000 0.325 0.051   NA
 10479349 10479350 EAM_3301 EAM_3302   dcrB FALSE 0.203 143.000 0.066 NA   NA
 10479351 10479352 EAM_3303 EAM_3304 iolE idh FALSE 0.020 335.000 0.036 1.000   NA
 10479352 10479353 EAM_3304 EAM_3305 idh iolD TRUE 0.446 99.000 0.140 1.000   NA
 10479354 10479355 EAM_3306 EAM_3307 iolC   FALSE 0.007 218.000 0.036 1.000 N NA
 10479356 10479357 EAM_3308 EAM_3309 iolB   FALSE 0.164 47.000 0.058 1.000 N NA
 10479358 10479359 EAM_3310 EAM_3311     FALSE 0.022 335.000 0.000 NA   NA
 10479359 10479360 EAM_3311 EAM_3312   proP FALSE 0.008 246.000 0.000 NA N NA
 10479360 10479361 EAM_3312 EAM_3313 proP   FALSE 0.049 255.000 0.000 1.000   NA
 10479363 10479364 EAM_3315 EAM_3316     TRUE 0.868 9.000 0.000 NA   NA
 10479365 10479366 EAM_3317 EAM_3318 agaE   TRUE 0.953 22.000 0.455 NA N NA
 10479366 10479367 EAM_3318 EAM_3319     TRUE 0.944 17.000 0.333 NA N NA
 10479368 10479369 EAM_3320 EAM_3321     FALSE 0.130 167.000 0.000 NA   NA
 10479374 10479375 EAM_3326 EAM_3327   prlC TRUE 0.927 8.000 0.098 NA   NA
 10479377 10479378 EAM_3329 EAM_3330     TRUE 0.917 2.000 0.000 NA   NA
 10479378 10479379 EAM_3330 EAM_3331     FALSE 0.216 88.000 0.000 NA   NA
 10479382 10479383 EAM_3334 EAM_3335 gor   FALSE 0.018 358.000 0.000 NA   NA
 10479383 10479384 EAM_3335 EAM_3336     FALSE 0.008 495.000 0.000 NA   NA
 10479384 10479385 EAM_3336 EAM_3337     FALSE 0.043 259.000 0.000 NA   NA
 10479386 10479387 EAM_3338 EAM_3339 cybB   TRUE 0.703 131.000 0.000 0.023 Y NA
 10479387 10479388 EAM_3339 EAM_3340     TRUE 0.972 9.000 0.136 0.001 N NA
 10479390 10479391 EAM_3342 EAM_3343     FALSE 0.015 382.000 0.000 NA   NA
 10479391 10479392 EAM_3343 EAM_3344     FALSE 0.009 455.000 0.000 NA   NA
 10479392 10479393 EAM_3344 EAM_3345     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10479393 10479394 EAM_3345 EAM_3346     FALSE 0.195 122.000 0.000 NA   NA
 10479394 10479395 EAM_3346 EAM_3347     FALSE 0.258 64.000 0.000 NA   NA
 10479395 10479396 EAM_3347 EAM_3348     FALSE 0.213 100.000 0.000 NA   NA
 10479402 10479403 EAM_3354 EAM_3355     TRUE 0.903 4.000 0.000 NA   NA
 10479403 10479404 EAM_3355 EAM_3356   kdpD FALSE 0.006 645.000 0.000 NA   NA
 10479404 10479405 EAM_3356 EAM_3357 kdpD kdpC TRUE 0.930 10.000 0.100 0.067 N NA
 10479405 10479406 EAM_3357 EAM_3358 kdpC kdpB TRUE 0.999 12.000 0.877 0.001 Y NA
 10479406 10479407 EAM_3358 EAM_3359 kdpB kdpA TRUE 0.988 19.000 0.201 0.001 Y NA
 10479407 10479408 EAM_3359 EAM_3360 kdpA kdpF TRUE 0.993 0.000 0.172 0.001   NA
 10479409 10479410 EAM_3361 EAM_3362     FALSE 0.350 49.000 0.000 NA   NA
 10479410 10479411 EAM_3362 EAM_3363     FALSE 0.115 177.000 0.000 NA   NA
 10479412 10479413 EAM_3364 EAM_3365 prtF prtE TRUE 0.998 3.000 0.375 0.009 Y NA
 10479413 10479414 EAM_3365 EAM_3366 prtE prtD TRUE 0.958 49.000 0.562 0.009   NA
 10479414 10479415 EAM_3366 EAM_3367 prtD inh FALSE 0.404 52.000 0.071 1.000   NA
 10479415 10479416 EAM_3367 EAM_3368 inh prtA TRUE 0.634 25.000 0.000 1.000   NA
 10479417 10479418 EAM_3369 EAM_3370     FALSE 0.005 956.000 0.000 NA   NA
 10479419 10479420 EAM_3371 EAM_3372     FALSE 0.008 517.000 0.000 NA   NA
 10479422 10479423 EAM_3374 EAM_3375 mgtB mgtC FALSE 0.038 303.000 0.065 1.000   NA
 10479425 10479426 EAM_3377 EAM_3378     FALSE 0.141 65.000 0.080 NA N NA
 10479426 10479427 EAM_3378 EAM_3379     FALSE 0.007 596.000 0.000 NA   NA
 10479427 10479428 EAM_3379 EAM_3380   dctA FALSE 0.051 299.000 0.088 1.000   NA
 10479428 10479429 EAM_3380 EAM_3381 dctA   FALSE 0.407 193.000 0.229 0.067 N NA
 10479431 10479432 EAM_3383 EAM_3384 celA   TRUE 0.987 12.000 0.444 1.000   NA
 10479432 10479433 EAM_3384 EAM_3385     TRUE 0.996 3.000 0.360 0.001   NA
 10479433 10479434 EAM_3385 EAM_3386     TRUE 0.994 -10.000 0.360 0.001   NA
 10479434 10479435 EAM_3386 EAM_3387     TRUE 0.999 -3.000 0.643 0.001   NA
 10479435 10479436 EAM_3387 EAM_3388     TRUE 0.753 88.000 0.458 1.000 N NA
 10479436 10479437 EAM_3388 EAM_3389     TRUE 0.979 -9.000 0.250 NA   NA
 10479437 10479438 EAM_3389 EAM_3390   dppF FALSE 0.006 607.000 0.000 NA   NA
 10479438 10479439 EAM_3390 EAM_3391 dppF dppD TRUE 0.999 -10.000 0.500 0.002 Y NA
 10479439 10479440 EAM_3391 EAM_3392 dppD dppC TRUE 0.997 9.000 0.560 1.000 Y NA
 10479440 10479441 EAM_3392 EAM_3393 dppC dppB TRUE 0.999 10.000 0.779 0.033 Y NA
 10479441 10479442 EAM_3393 EAM_3394 dppB dppA TRUE 0.535 205.000 0.087 0.033 Y NA
 10479442 10479443 EAM_3394 EAM_3395 dppA   FALSE 0.007 522.000 0.000 NA   NA
 10479443 10479444 EAM_3395 EAM_3396     FALSE 0.011 429.000 0.000 NA   NA
 10479444 10479445 EAM_3396 EAM_3397     FALSE 0.027 311.000 0.000 1.000   NA
 10479445 10479446 EAM_3397 EAM_3398     FALSE 0.186 99.000 0.100 1.000 N NA
 10479448 10479449 EAM_3400 EAM_3401     TRUE 0.792 14.000 0.000 NA   NA
 10479450 10479451 EAM_3402 EAM_3403     TRUE 0.903 4.000 0.000 NA   NA
 10479451 10479452 EAM_3403 EAM_3404     FALSE 0.195 122.000 0.000 NA   NA
 10479453 10479454 EAM_3405 EAM_3406     TRUE 0.980 -10.000 0.286 NA   NA
 10479455 10479456 EAM_3407 EAM_3408   dalD FALSE 0.268 61.000 0.000 NA   NA
 10479456 10479457 EAM_3408 EAM_3409 dalD   TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10479459 10479460 EAM_3411 EAM_3412 glyQ glyS TRUE 0.999 10.000 0.651 0.000 Y NA
 10479460 10479461 EAM_3412 EAM_3413 glyS   FALSE 0.110 189.000 0.000 1.000   NA
 10479463 10479464 EAM_3415 EAM_3416   mtlA FALSE 0.005 1186.000 0.000 NA   NA
 10479464 10479465 EAM_3416 EAM_3417 mtlA mtlD TRUE 0.869 98.000 0.292 1.000 Y NA
 10479465 10479466 EAM_3417 EAM_3418 mtlD mtlR TRUE 0.523 72.000 0.230 NA N NA
 10479466 10479467 EAM_3418 EAM_3419 mtlR   FALSE 0.231 74.000 0.000 NA   NA
 10479467 10479468 EAM_3419 EAM_3420     FALSE 0.009 472.000 0.000 1.000   NA
 10479471 10479472 EAM_3423 EAM_3424     TRUE 0.984 21.000 0.355 NA Y NA
 10479472 10479473 EAM_3424 EAM_3425     TRUE 0.999 -3.000 0.952 1.000 Y NA
 10479473 10479474 EAM_3425 EAM_3426     FALSE 0.210 103.000 0.000 NA   NA
 10479474 10479475 EAM_3426 EAM_3427   sodA TRUE 0.657 22.000 0.000 NA   NA
 10479475 10479476 EAM_3427 EAM_3428 sodA   FALSE 0.023 194.000 0.000 1.000 N NA
 10479479 10479480 EAM_3431 EAM_3432 fdhE   TRUE 0.979 3.000 0.027 NA Y NA
 10479480 10479481 EAM_3432 EAM_3433   tag FALSE 0.143 33.000 0.000 NA N NA
 10479481 10479482 EAM_3433 EAM_3434 tag   FALSE 0.010 112.000 0.004 1.000 N NA
 10479482 10479483 EAM_3434 EAM_3435     FALSE 0.005 183.000 0.029 1.000 N NA
 10479484 10479485 EAM_3436 EAM_3437   yopH FALSE 0.098 191.000 0.000 NA   NA
 10479486 10479487 EAM_3438 EAM_3439     TRUE 0.995 4.000 0.571 NA   NA
 10479487 10479488 EAM_3439 EAM_3440     TRUE 0.786 79.000 0.175 1.000 Y NA
 10479488 10479489 EAM_3440 EAM_3441   tkrA TRUE 0.483 52.000 0.167 1.000 N NA
 10479489 10479490 EAM_3441 EAM_3442 tkrA   FALSE 0.163 146.000 0.000 NA   NA
 10479490 10479491 EAM_3442 EAM_3443     FALSE 0.139 161.000 0.000 NA   NA
 10479496 10479497 EAM_3448 EAM_3449     FALSE 0.219 79.000 0.000 NA   NA
 10479497 10479498 EAM_3449 EAM_3450   gyrB FALSE 0.020 416.000 0.003 0.068   NA
 10479498 10479499 EAM_3450 EAM_3451 gyrB recF TRUE 0.990 18.000 0.249 0.003 Y NA
 10479499 10479500 EAM_3451 EAM_3452 recF dnaN TRUE 0.753 188.000 0.318 1.000 Y NA
 10479500 10479501 EAM_3452 EAM_3453 dnaN dnaA TRUE 0.996 3.000 0.328 1.000 Y NA
 10479502 10479503 EAM_3454 EAM_3455 rpmH rnpA TRUE 0.990 18.000 0.787 1.000   NA
 10479503 10479504 EAM_3455 EAM_3456 rnpA   TRUE 0.988 -36.000 0.540 NA   NA
 10479504 10479505 EAM_3456 EAM_3457   oxaA TRUE 0.974 19.000 0.461 NA   NA
 10479505 10479506 EAM_3457 EAM_3458 oxaA trmE TRUE 0.604 103.000 0.221 1.000   NA
 10479506 10479507 EAM_3458 EAM_3459 trmE   FALSE 0.180 144.000 0.000 1.000   NA
 10479508 10479509 EAM_3460 EAM_3461     FALSE 0.030 305.000 0.000 1.000   NA
 10479509 10479510 EAM_3461 EAM_3462     FALSE 0.006 598.000 0.000 NA   NA
 10479510 10479511 EAM_3462 EAM_3463   phoU FALSE 0.009 455.000 0.000 NA   NA
 10479511 10479512 EAM_3463 EAM_3464 phoU pstB TRUE 0.984 18.000 0.317 NA Y NA
 10479512 10479513 EAM_3464 EAM_3465 pstB pstA TRUE 0.987 44.000 0.526 0.002 Y NA
 10479513 10479514 EAM_3465 EAM_3466 pstA pstC TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.002 Y NA
 10479514 10479515 EAM_3466 EAM_3467 pstC pstS TRUE 0.872 95.000 0.145 0.002 Y NA
 10479515 10479516 EAM_3467 EAM_3467A pstS rlsB FALSE 0.007 577.000 0.000 1.000   NA
 10479517 10479518 EAM_3468 EAM_3469 lsc   FALSE 0.191 126.000 0.000 NA   NA
 10479518 10479519 EAM_3469 EAM_3470     FALSE 0.019 352.000 0.000 NA   NA
 10479520 10479521 EAM_3471 EAM_3472 glmS glmU TRUE 0.498 157.000 0.055 1.000 Y NA
 10479521 10479522 EAM_3472 EAM_3473 glmU atpC FALSE 0.026 233.000 0.067 1.000 N NA
 10479522 10479523 EAM_3473 EAM_3474 atpC atpD TRUE 0.978 147.000 0.837 0.003 Y NA
 10479523 10479524 EAM_3474 EAM_3475 atpD atpG TRUE 0.973 148.000 0.724 0.003 Y NA
 10479524 10479525 EAM_3475 EAM_3476 atpG atpA TRUE 0.990 55.000 0.846 0.003 Y NA
 10479525 10479526 EAM_3476 EAM_3477 atpA atpH TRUE 0.999 15.000 0.864 0.003 Y NA
 10479526 10479527 EAM_3477 EAM_3478 atpH atpF TRUE 0.993 15.000 0.242 0.003 Y NA
 10479527 10479528 EAM_3478 EAM_3479 atpF atpE TRUE 0.940 104.000 0.666 0.003   NA
 10479528 10479529 EAM_3479 EAM_3480 atpE atpB TRUE 0.957 51.000 0.557 0.003   NA
 10479529 10479530 EAM_3480 EAM_3481 atpB atpI TRUE 0.994 9.000 0.291 1.000 Y NA
 10479530 10479531 EAM_3481 EAM_3482 atpI gidB FALSE 0.000 745.000 0.005 1.000 N NA
 10479531 10479532 EAM_3482 EAM_3483 gidB gidA TRUE 0.993 -3.000 0.466 1.000 N NA
 10479532 10475950 EAM_3483 EAM_0001 gidA mioC FALSE 0.002 499.000 0.000 1.000 N NA
 10475821 10475822 EAM_P101 EAM_P102     FALSE 0.046 252.000 0.000 NA   NA
 10475822 10475823 EAM_P102 EAM_P103     FALSE 0.198 118.000 0.000 NA   NA
 10475823 10475824 EAM_P103 EAM_P104     FALSE 0.028 303.000 0.000 NA   NA
 10475824 10475825 EAM_P104 EAM_P105     TRUE 0.810 -22.000 0.000 NA   NA
 10475826 10475827 EAM_P106 EAM_P107     TRUE 0.802 -28.000 0.000 NA   NA
 10475827 10475828 EAM_P107 EAM_P108     FALSE 0.215 84.000 0.000 NA   NA
 10475828 10475829 EAM_P108 EAM_P109     FALSE 0.034 284.000 0.000 NA   NA
 10475829 10475830 EAM_P109 EAM_P110     FALSE 0.007 596.000 0.000 1.000   NA
 10475832 10475833 EAM_P112 EAM_P113     FALSE 0.020 349.000 0.000 NA   NA
 10475834 10475835 EAM_P114 EAM_P115     TRUE 0.997 -3.000 0.636 NA   NA
 10475836 10475837 EAM_P116 EAM_P117   thiF TRUE 0.574 28.000 0.000 NA   NA
 10475837 10475838 EAM_P117 EAM_P118 thiF thiG TRUE 0.962 16.000 0.003 0.014 Y NA
 10475838 10475839 EAM_P118 EAM_P119 thiG thiS TRUE 0.986 4.000 0.095 1.000 Y NA
 10475839 10475840 EAM_P119 EAM_P120 thiS thiO TRUE 0.989 -3.000 0.351 1.000 N NA
 10475841 10475842 EAM_P121 EAM_P122     TRUE 0.962 34.000 0.605 NA   NA
 10475842 10475843 EAM_P122 EAM_P123     TRUE 0.463 38.000 0.000 NA   NA
 10475843 10475844 EAM_P123 EAM_P124     TRUE 0.885 6.000 0.000 NA   NA
 10475844 10475845 EAM_P124 EAM_P125     TRUE 0.819 -19.000 0.000 NA   NA
 10475846 10475847 EAM_P126 EAM_P127 parG parF TRUE 0.511 108.000 0.176 1.000   NA
 10475848 10475849 EAM_P128 EAM_P129     TRUE 0.825 -18.000 0.000 NA   NA
 10475849 10475850 EAM_P129 EAM_P130     TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 10475850 10475851 EAM_P130 EAM_P131     FALSE 0.217 94.000 0.000 NA   NA
 10475851 10475852 EAM_P131 EAM_P132     FALSE 0.025 330.000 0.000 1.000   NA
 10475855 10475856 EAM_P135 EAM_P136     TRUE 0.885 6.000 0.000 NA   NA
 10475857 10475858 EAM_P137 EAM_P138   msrA FALSE 0.216 88.000 0.000 NA   NA
 10475858 10475859 EAM_P138 EAM_P139 msrA   TRUE 0.832 -16.000 0.000 NA   NA
 10475859 10475860 EAM_P139 EAM_P140     FALSE 0.105 184.000 0.000 NA   NA
 10475860 10475861 EAM_P140 EAM_P141   parA FALSE 0.174 138.000 0.000 NA   NA
 10475863 10475864 EAM_P201 EAM_P202 repA   FALSE 0.040 265.000 0.000 NA   NA
 10475864 10475865 EAM_P202 EAM_P203     FALSE 0.031 291.000 0.000 NA   NA
 10475865 10475866 EAM_P203 EAM_P204     FALSE 0.020 348.000 0.000 NA   NA
 10475866 10475867 EAM_P204 EAM_P205     TRUE 0.528 32.000 0.000 NA   NA
 10475867 10475868 EAM_P205 EAM_P206     TRUE 0.888 -7.000 0.000 NA   NA
 10475868 10475869 EAM_P206 EAM_P207     TRUE 0.551 30.000 0.000 NA   NA
 10475869 10475870 EAM_P207 EAM_P208     TRUE 0.574 28.000 0.000 NA   NA
 10475870 10475871 EAM_P208 EAM_P209     FALSE 0.398 44.000 0.000 NA   NA
 10475871 10475872 EAM_P209 EAM_P210     FALSE 0.052 241.000 0.000 NA   NA
 10475873 10475874 EAM_P211 EAM_P212     FALSE 0.217 94.000 0.000 NA   NA
 10475874 10475875 EAM_P212 EAM_P213     FALSE 0.268 61.000 0.000 NA   NA
 10475875 10475876 EAM_P213 EAM_P214   parA TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10475876 10475877 EAM_P214 EAM_P215 parA samB FALSE 0.013 238.000 0.000 1.000 N NA
 10475877 10475878 EAM_P215 EAM_P216 samB samA TRUE 0.697 3.000 0.000 1.000 N NA
 10475879 10475880 EAM_P217 EAM_P218 stbA stbB TRUE 0.992 6.000 0.455 NA   NA
 10475880 10475881 EAM_P218 EAM_P219 stbB   FALSE 0.316 52.000 0.000 NA   NA
 10475881 10475882 EAM_P219 EAM_P220     TRUE 0.910 3.000 0.000 NA   NA
 10475882 10475883 EAM_P220 EAM_P221     TRUE 0.507 34.000 0.000 NA   NA
 10475883 10475884 EAM_P221 EAM_P222     TRUE 0.473 37.000 0.000 NA   NA
 10475884 10475885 EAM_P222 EAM_P223     TRUE 0.995 -10.000 0.667 NA   NA
 10475885 10475886 EAM_P223 EAM_P224     FALSE 0.023 326.000 0.000 NA   NA
 10475886 10475887 EAM_P224 EAM_P225     FALSE 0.218 80.000 0.000 NA   NA
 10475887 10475888 EAM_P225 EAM_P226     TRUE 0.894 5.000 0.000 NA   NA
 10475888 10475889 EAM_P226 EAM_P227     FALSE 0.217 93.000 0.000 NA   NA
 10475889 10475890 EAM_P227 EAM_P228     FALSE 0.016 373.000 0.000 NA   NA
 10475890 10475891 EAM_P228 EAM_P229     TRUE 0.551 30.000 0.000 NA   NA
 10475891 10475892 EAM_P229 EAM_P230     TRUE 0.484 36.000 0.000 NA   NA
 10475892 10475893 EAM_P230 EAM_P231     FALSE 0.039 267.000 0.000 NA   NA
 10475893 10475894 EAM_P231 EAM_P232   ssb TRUE 0.484 36.000 0.000 NA   NA
 10475894 10475895 EAM_P232 EAM_P233 ssb   FALSE 0.059 83.000 0.000 1.000 N NA
 10475895 10475896 EAM_P233 EAM_P234     TRUE 0.473 37.000 0.000 NA   NA
 10475896 10475897 EAM_P234 EAM_P235     FALSE 0.009 462.000 0.000 NA   NA
 10475897 10475898 EAM_P235 EAM_P236   pemI FALSE 0.219 79.000 0.000 NA   NA
 10475898 10475899 EAM_P236 EAM_P237 pemI pemK TRUE 0.986 1.000 0.231 NA   NA
 10475899 10475900 EAM_P237 EAM_P238 pemK   FALSE 0.006 719.000 0.000 NA   NA
 10475900 10475901 EAM_P238 EAM_P239     FALSE 0.060 231.000 0.000 NA   NA
 10475903 10475904 EAM_P241 EAM_P242     TRUE 0.990 0.000 0.286 NA   NA
 10475904 10475905 EAM_P242 EAM_P243   traJ FALSE 0.204 109.000 0.000 NA   NA
 10475905 10475906 EAM_P243 EAM_P244 traJ traY FALSE 0.061 228.000 0.000 NA   NA
 10475906 10475907 EAM_P244 EAM_P245 traY   FALSE 0.104 185.000 0.000 NA   NA
 10475907 10475908 EAM_P245 EAM_P246     FALSE 0.119 175.000 0.000 NA   NA
 10475908 10475909 EAM_P246 EAM_P247     TRUE 0.539 31.000 0.000 NA   NA
 10475909 10475910 EAM_P247 EAM_P248   pilL FALSE 0.021 343.000 0.000 NA   NA
 10475910 10475911 EAM_P248 EAM_P249 pilL pilN TRUE 0.988 3.000 0.300 NA   NA
 10475911 10475912 EAM_P249 EAM_P250 pilN pilO TRUE 0.996 6.000 0.667 NA   NA
 10475912 10475913 EAM_P250 EAM_P251 pilO   TRUE 0.995 -13.000 0.750 NA   NA
 10475913 10475914 EAM_P251 EAM_P252     TRUE 0.994 13.000 0.750 NA   NA
 10475914 10475915 EAM_P252 EAM_P253     TRUE 0.999 -3.000 0.600 NA Y NA
 10475915 10475916 EAM_P253 EAM_P254   pilS TRUE 0.870 98.000 0.600 NA   NA
 10475916 10475917 EAM_P254 EAM_P255 pilS pilU TRUE 0.690 43.000 0.154 NA   NA
 10475917 10475918 EAM_P255 EAM_P256 pilU pilV TRUE 0.903 4.000 0.000 NA   NA
 10475918 10475919 EAM_P256 EAM_P257 pilV   FALSE 0.272 60.000 0.000 NA   NA
 10475919 10475920 EAM_P257 EAM_P258   pilM FALSE 0.210 103.000 0.000 NA   NA
 10475920 10475921 EAM_P258 EAM_P259 pilM   TRUE 0.998 2.000 0.750 NA   NA
 10475921 10475922 EAM_P259 EAM_P260   pilT1 TRUE 0.990 -15.000 0.500 NA   NA
 10475922 10475923 EAM_P260 EAM_P261 pilT1 pilT2 TRUE 0.751 16.000 0.000 NA   NA
 10475923 10475924 EAM_P261 EAM_P262 pilT2 traH FALSE 0.329 51.000 0.000 NA   NA
 10475924 10475925 EAM_P262 EAM_P263 traH traI TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 10475925 10475926 EAM_P263 EAM_P264 traI traJ TRUE 0.999 0.000 1.000 NA   NA
 10475926 10475927 EAM_P264 EAM_P265 traJ traK TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10475927 10475928 EAM_P265 EAM_P266 traK traC TRUE 0.564 31.000 0.056 NA   NA
 10475928 10475929 EAM_P266 EAM_P267 traC traL TRUE 0.665 23.000 0.056 NA   NA
 10475929 10475930 EAM_P267 EAM_P268 traL traM TRUE 0.994 11.000 0.667 NA   NA
 10475930 10475931 EAM_P268 EAM_P269 traM traN TRUE 0.994 10.000 0.667 NA   NA
 10475931 10475932 EAM_P269 EAM_P270 traN traO TRUE 0.998 3.000 1.000 NA   NA
 10475932 10475933 EAM_P270 EAM_P271 traO traP TRUE 0.998 -7.000 1.000 NA   NA
 10475933 10475934 EAM_P271 EAM_P272 traP traQ TRUE 0.997 10.000 1.000 NA   NA
 10475934 10475935 EAM_P272 EAM_P273 traQ traR FALSE 0.239 72.000 0.000 NA   NA
 10475935 10475936 EAM_P273 EAM_P274 traR traT FALSE 0.208 105.000 0.000 NA   NA
 10475936 10475937 EAM_P274 EAM_P275 traT traU TRUE 0.995 -28.000 1.000 NA   NA
 10475937 10475938 EAM_P275 EAM_P276 traU traW TRUE 0.986 14.000 0.500 NA   NA
 10475938 10475939 EAM_P276 EAM_P277 traW   TRUE 0.713 18.000 0.000 NA   NA
 10475939 10475940 EAM_P277 EAM_P278   traX TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10475940 10475941 EAM_P278 EAM_P279 traX   TRUE 0.732 17.000 0.000 NA   NA
 10475941 10475942 EAM_P279 EAM_P280     TRUE 0.611 25.000 0.000 NA   NA
 10475942 10475943 EAM_P280 EAM_P281   traY FALSE 0.217 92.000 0.000 NA   NA
 10475943 10475944 EAM_P281 EAM_P282 traY excA TRUE 0.809 68.000 0.400 NA   NA
 10475944 10475945 EAM_P282 EAM_P283 excA trbA TRUE 0.769 108.000 0.400 NA   NA
 10475945 10475946 EAM_P283 EAM_P284 trbA trbB TRUE 0.751 16.000 0.000 NA   NA
 10475946 10475947 EAM_P284 EAM_P285 trbB trbC TRUE 0.862 -10.000 0.000 NA   NA
 10475947 10475948 EAM_P285 EAM_P286 trbC   FALSE 0.152 153.000 0.000 NA   NA
 10475948 10475949 EAM_P286 EAM_P287     TRUE 0.444 40.000 0.000 NA   NA
 10475949 10475863 EAM_P287 EAM_P201   repA FALSE 0.152 153.000 0.000 NA   NA