MicrobesOnline Operon Predictions for Lactococcus lactis subsp. lactis KF147

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10454306 10454307 LLKF_0001 LLKF_0002 dnaA dnaN TRUE 0.886 157.000 0.328 1.000 Y NA
 10454307 10454308 LLKF_0002 LLKF_0003 dnaN rexB TRUE 0.857 106.000 0.000 0.067 Y NA
 10454308 10454309 LLKF_0003 LLKF_0004 rexB rexA TRUE 0.997 -7.000 0.070 0.002 Y NA
 10454309 10454310 LLKF_0004 LLKF_0005 rexA   TRUE 0.735 37.000 0.000 NA   NA
 10454312 10454313 LLKF_0007 LLKF_0008 yyaL yabB FALSE 0.190 112.000 0.000 1.000 N NA
 10454313 10454314 LLKF_0008 LLKF_0009 yabB yabC FALSE 0.249 257.000 0.000 NA   NA
 10454314 10454315 LLKF_0009 LLKF_0010 yabC yabD TRUE 0.882 13.000 0.000 NA   NA
 10454315 10454316 LLKF_0010 LLKF_0011 yabD yabE TRUE 0.980 22.000 0.520 NA   NA
 10454316 10454317 LLKF_0011 LLKF_0012 yabE yabF FALSE 0.135 203.000 0.000 1.000 N NA
 10454317 10454318 LLKF_0012 LLKF_0013 yabF pth TRUE 0.621 18.000 0.000 1.000 N NA
 10454318 10454319 LLKF_0013 LLKF_0014 pth mfd TRUE 0.937 1.000 0.137 1.000 N NA
 10454319 10454320 LLKF_0014 LLKF_0015 mfd yacI FALSE 0.403 159.000 0.000 NA   NA
 10454320 10454321 LLKF_0015 LLKF_0016 yacI yacB TRUE 0.429 119.000 0.000 NA   NA
 10454321 10454322 LLKF_0016 LLKF_0017 yacB divIC TRUE 0.692 29.000 0.053 1.000 N NA
 10454322 10454323 LLKF_0017 LLKF_0018 divIC yacD TRUE 0.906 0.000 0.000 1.000   NA
 10454323 10454324 LLKF_0018 LLKF_0019 yacD yacG FALSE 0.413 138.000 0.000 NA   NA
 10454324 10454325 LLKF_0019 LLKF_0020 yacG tilS TRUE 0.897 -3.000 0.014 NA N NA
 10454325 10454326 LLKF_0020 LLKF_0021 tilS hpt TRUE 0.982 -19.000 0.067 0.065 N NA
 10454326 10454327 LLKF_0021 LLKF_0022 hpt ftsH TRUE 0.443 206.000 0.192 1.000 N NA
 10454327 10454328 LLKF_0022 LLKF_t0001 ftsH trnE FALSE 0.306 220.000 0.000 NA   NA
 10454328 10454329 LLKF_t0001 LLKF_t0002 trnE trnS TRUE 0.915 5.000 0.000 NA   NA
 10454329 10454330 LLKF_t0002 LLKF_t0003 trnS trnM TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 10454330 10454331 LLKF_t0003 LLKF_t0004 trnM trnF TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 10454331 10454332 LLKF_t0004 LLKF_t0005 trnF trnG TRUE 0.898 11.000 0.000 NA   NA
 10454332 10454333 LLKF_t0005 LLKF_t0006 trnG trnI TRUE 0.875 14.000 0.000 NA   NA
 10454333 10454334 LLKF_t0006 LLKF_r0001 trnI rrfA TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 10454334 10454335 LLKF_r0001 LLKF_t0007 rrfA trnN TRUE 0.915 5.000 0.000 NA   NA
 10454335 10454336 LLKF_t0007 LLKF_0023 trnN mtlA FALSE 0.412 150.000 0.000 NA   NA
 10454336 10454337 LLKF_0023 LLKF_0024 mtlA mtlR TRUE 0.956 60.000 0.336 0.016 N NA
 10454337 10454338 LLKF_0024 LLKF_0025 mtlR mtlF TRUE 0.920 49.000 0.131 0.016 N NA
 10454338 10454339 LLKF_0025 LLKF_0026 mtlF mtlD TRUE 0.707 138.000 0.062 1.000 Y NA
 10454339 10454340 LLKF_0026 LLKF_0027 mtlD   TRUE 0.430 117.000 0.000 NA   NA
 10454340 10454341 LLKF_0027 LLKF_0028   yafE FALSE 0.245 259.000 0.000 NA   NA
 10454341 10454342 LLKF_0028 LLKF_0029 yafE yafF TRUE 0.516 77.000 0.000 NA   NA
 10454344 10454345 LLKF_0031 LLKF_t0008 yafC trnK TRUE 0.448 107.000 0.000 NA   NA
 10454345 10454346 LLKF_t0008 LLKF_0032 trnK araT FALSE 0.411 151.000 0.000 NA   NA
 10454346 10454347 LLKF_0032 LLKF_0033 araT recO FALSE 0.213 99.000 0.012 1.000 N NA
 10454347 10454348 LLKF_0033 LLKF_0034 recO   FALSE 0.346 114.000 0.000 1.000   NA
 10454349 10454350 LLKF_0035 LLKF_0036 pdhD pdhC TRUE 0.968 194.000 0.948 1.000 Y NA
 10454350 10454351 LLKF_0036 LLKF_0037 pdhC pdhB TRUE 1.000 -7.000 0.883 0.072 Y NA
 10454351 10454352 LLKF_0037 LLKF_0038 pdhB pdhA TRUE 0.999 3.000 0.484 0.001 Y NA
 10454352 10454353 LLKF_0038 LLKF_0039 pdhA lplL FALSE 0.321 89.000 0.039 1.000 N NA
 10454353 10454354 LLKF_0039 LLKF_0040 lplL gdpD FALSE 0.138 199.000 0.000 1.000 N NA
 10454354 10454355 LLKF_0040 LLKF_0041 gdpD yagB FALSE 0.411 81.000 0.000 1.000   NA
 10454355 10454356 LLKF_0041 LLKF_0042 yagB trpS FALSE 0.341 117.000 0.000 1.000   NA
 10454357 10454358 LLKF_0043 LLKF_0044 osmC yagE FALSE 0.167 161.000 0.000 1.000 N NA
 10454358 10454359 LLKF_0044 LLKF_0045 yagE yahC TRUE 0.544 70.000 0.000 NA   NA
 10454360 10454361 LLKF_0046 LLKF_0047 plsX yahA FALSE 0.368 103.000 0.000 1.000   NA
 10454361 10454362 LLKF_0047 LLKF_0048 yahA yahG FALSE 0.334 126.000 0.000 1.000   NA
 10454362 10454363 LLKF_0048 LLKF_0049 yahG   FALSE 0.176 313.000 0.000 NA   NA
 10454363 10454364 LLKF_0049 LLKF_0050     TRUE 0.819 22.000 0.000 NA   NA
 10454364 10454365 LLKF_0050 LLKF_0051   yrbI FALSE 0.367 189.000 0.000 NA   NA
 10454365 10454366 LLKF_0051 LLKF_0052 yrbI cysD FALSE 0.162 274.000 0.000 1.000   NA
 10454366 10454367 LLKF_0052 LLKF_0053 cysD yahI FALSE 0.110 226.000 0.000 1.000 N NA
 10454368 10454369 LLKF_0054 LLKF_0055 yahB   TRUE 0.421 128.000 0.000 NA   NA
 10454369 10454370 LLKF_0055 LLKF_0056   yahD TRUE 0.772 31.000 0.000 NA   NA
 10454370 10454371 LLKF_0056 LLKF_0057 yahD yaiA TRUE 0.659 51.000 0.000 NA   NA
 10454371 10454372 LLKF_0057 LLKF_0058 yaiA yaiB TRUE 0.912 11.000 0.025 NA   NA
 10454373 10454374 LLKF_0059 LLKF_0060 rpmG rpmF TRUE 0.967 30.000 0.012 0.034 Y NA
 10454376 10454377 LLKF_0062 LLKF_0063 parB cshA FALSE 0.340 56.000 0.000 1.000 N NA
 10454377 10454378 LLKF_0063 LLKF_0064 cshA ybaH TRUE 0.557 44.000 0.047 1.000 N NA
 10454379 10454380 LLKF_0065 LLKF_0066 ybaA ybaB TRUE 0.779 30.000 0.000 NA   NA
 10454380 10454381 LLKF_0066 LLKF_0067 ybaB ybaC TRUE 0.418 131.000 0.000 NA   NA
 10454381 10454382 LLKF_0067 LLKF_0068 ybaC ybaC TRUE 0.946 -58.000 0.000 NA   NA
 10454382 10454383 LLKF_0068 LLKF_0069 ybaC ybaD TRUE 0.729 38.000 0.000 NA   NA
 10454383 10454384 LLKF_0069 LLKF_0070 ybaD prmA TRUE 0.875 14.000 0.000 NA   NA
 10454384 10454385 LLKF_0070 LLKF_0071 prmA ybaF TRUE 0.780 100.000 0.227 NA   NA
 10454385 10454386 LLKF_0071 LLKF_0072 ybaF ybaG TRUE 0.785 29.000 0.000 NA   NA
 10454386 10454387 LLKF_0072 LLKF_0073 ybaG relA FALSE 0.136 201.000 0.000 1.000 N NA
 10454389 10454390 LLKF_0075 LLKF_0076 ybbA ybbB TRUE 0.945 -7.000 0.000 NA   NA
 10454390 10454391 LLKF_0076 LLKF_0077 ybbB ybbC TRUE 0.922 3.000 0.000 NA   NA
 10454391 10454392 LLKF_0077 LLKF_0078 ybbC ybbD FALSE 0.325 140.000 0.000 1.000   NA
 10454392 10454393 LLKF_0078 LLKF_0079 ybbD ybbE FALSE 0.173 150.000 0.000 1.000 N NA
 10454394 10454395 LLKF_0080 LLKF_0081 rmaD acpD TRUE 0.783 35.000 0.058 1.000   NA
 10454396 10454397 LLKF_0082 LLKF_0083 secA aroF FALSE 0.177 129.000 0.000 1.000 N NA
 10454397 10454398 LLKF_0083 LLKF_0084 aroF ptsH FALSE 0.093 251.000 0.000 1.000 N NA
 10454398 10454399 LLKF_0084 LLKF_0085 ptsH ptsI TRUE 0.997 3.000 0.240 0.016 Y NA
 10454399 10454400 LLKF_0085 LLKF_0086 ptsI ybcC FALSE 0.401 163.000 0.000 NA   NA
 10454404 10454405 LLKF_0089 LLKF_0090 sugE blt TRUE 0.571 122.000 0.000 0.071 N NA
 10454405 10454406 LLKF_0090 LLKF_0091 blt   FALSE 0.413 139.000 0.000 NA   NA
 10454406 10454407 LLKF_0091 LLKF_0092     FALSE 0.098 525.000 0.000 NA   NA
 10454407 10454408 LLKF_0092 LLKF_0093     TRUE 0.891 12.000 0.000 NA   NA
 10454408 10454409 LLKF_0093 LLKF_0094     TRUE 0.808 0.000 0.000 1.000 N NA
 10454409 10454410 LLKF_0094 LLKF_0095     TRUE 0.967 -10.000 0.111 1.000   NA
 10454410 10454411 LLKF_0095 LLKF_0096     TRUE 0.756 22.000 0.000 1.000   NA
 10454413 10454414 LLKF_0098 LLKF_0099   ribA TRUE 0.880 5.000 0.000 1.000   NA
 10454414 10454415 LLKF_0099 LLKF_0100 ribA   TRUE 0.790 2.000 0.000 1.000 N NA
 10454415 10454416 LLKF_0100 LLKF_0101   tmk TRUE 0.827 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10454416 10454417 LLKF_0101 LLKF_0102 tmk pyrF TRUE 0.972 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10454417 10454418 LLKF_0102 LLKF_0103 pyrF   TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 10454419 10454420 LLKF_0104 LLKF_0105   tnpB TRUE 0.907 9.000 0.000 NA   NA
 10454420 10454421 LLKF_0105 LLKF_0106 tnpB tnpA TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.065 Y NA
 10454424 10454425 LLKF_0108 LLKF_0109 argG argH TRUE 0.970 31.000 0.278 1.000 Y NA
 10454427 10454428 LLKF_0111 LLKF_0112 ybdA rnpA FALSE 0.172 152.000 0.000 1.000 N NA
 10454428 10454429 LLKF_0112 LLKF_0113 rnpA yidC TRUE 0.906 -3.000 0.052 1.000 N NA
 10454429 10454430 LLKF_0113 LLKF_0114 yidC ybdD TRUE 0.616 89.000 0.106 1.000   NA
 10454430 10454431 LLKF_0114 LLKF_0115 ybdD rpmH FALSE 0.304 132.000 0.002 1.000   NA
 10454431 10454432 LLKF_0115 LLKF_0116 rpmH ybdE FALSE 0.254 208.000 0.000 1.000   NA
 10454432 10454433 LLKF_0116 LLKF_0117 ybdE ybeA FALSE 0.168 320.000 0.000 NA   NA
 10454433 10454434 LLKF_0117 LLKF_0118 ybeA ybeB TRUE 0.974 0.000 0.144 NA   NA
 10454434 10454435 LLKF_0118 LLKF_0119 ybeB ybeC TRUE 0.596 152.000 0.094 NA   NA
 10454436 10454437 LLKF_0120 LLKF_0121 ybeH cbr TRUE 0.487 94.000 0.000 NA   NA
 10454437 10454438 LLKF_0121 LLKF_0122 cbr ybeI TRUE 0.830 20.000 0.000 NA   NA
 10454438 10454439 LLKF_0122 LLKF_0123 ybeI dltE TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 10454441 10454442 LLKF_0125 LLKF_0126 glgB ybeM TRUE 0.422 127.000 0.000 NA   NA
 10454443 10454444 LLKF_0127 LLKF_0128 ybeF ybeF TRUE 0.436 114.000 0.000 NA   NA
 10454444 10454445 LLKF_0128 LLKF_0129 ybeF   TRUE 0.430 117.000 0.000 NA   NA
 10454445 10454446 LLKF_0129 LLKF_0130     FALSE 0.141 358.000 0.000 NA   NA
 10454446 10454447 LLKF_0130 LLKF_0131   epsX FALSE 0.076 2103.000 0.000 NA   NA
 10454447 10454448 LLKF_0131 LLKF_0132 epsX epsA TRUE 0.633 40.000 0.000 1.000   NA
 10454448 10454449 LLKF_0132 LLKF_0133 epsA epsB TRUE 0.734 10.000 0.000 1.000 N NA
 10454449 10454450 LLKF_0133 LLKF_0134 epsB epsC FALSE 0.347 55.000 0.000 1.000 N NA
 10454450 10454451 LLKF_0134 LLKF_0135 epsC epsD TRUE 0.929 22.000 0.000 NA Y NA
 10454451 10454452 LLKF_0135 LLKF_0136 epsD epsE TRUE 0.789 66.000 0.000 NA Y NA
 10454452 10454453 LLKF_0136 LLKF_0137 epsE epsF TRUE 0.623 58.000 0.000 NA   NA
 10454453 10454454 LLKF_0137 LLKF_0138 epsF epsG TRUE 0.875 14.000 0.000 NA   NA
 10454454 10454455 LLKF_0138 LLKF_0139 epsG epsH TRUE 0.930 1.000 0.000 NA   NA
 10454455 10454456 LLKF_0139 LLKF_0140 epsH epsI TRUE 0.735 37.000 0.000 NA   NA
 10454456 10454457 LLKF_0140 LLKF_0141 epsI epsJ TRUE 0.945 -7.000 0.000 NA   NA
 10454457 10454458 LLKF_0141 LLKF_0142 epsJ epsK FALSE 0.144 349.000 0.000 NA   NA
 10454461 10454462 LLKF_t0011 LLKF_0145 trnT tgt TRUE 0.584 63.000 0.000 NA   NA
 10454464 10454465 LLKF_0147 LLKF_0148 ybfD ybfE FALSE 0.382 181.000 0.000 NA   NA
 10454466 10454467 LLKF_0149 LLKF_0150 ybfB ybfC FALSE 0.399 165.000 0.000 NA   NA
 10454467 10454468 LLKF_0150 LLKF_0151 ybfC ybgA TRUE 0.891 12.000 0.000 NA   NA
 10454468 10454469 LLKF_0151 LLKF_0152 ybgA ybgB FALSE 0.354 197.000 0.000 NA   NA
 10454469 10454470 LLKF_0152 LLKF_0153 ybgB aspC TRUE 0.550 69.000 0.000 NA   NA
 10454470 10454471 LLKF_0153 LLKF_0154 aspC codY FALSE 0.193 153.000 0.015 1.000 N NA
 10454471 10454472 LLKF_0154 LLKF_0155 codY gatC FALSE 0.029 625.000 0.000 1.000 N NA
 10454472 10454473 LLKF_0155 LLKF_0156 gatC gatA TRUE 0.999 0.000 0.643 0.002 Y NA
 10454473 10454474 LLKF_0156 LLKF_0157 gatA ybgD TRUE 0.769 4.000 0.000 1.000 N NA
 10454474 10454475 LLKF_0157 LLKF_0158 ybgD gatB TRUE 0.752 7.000 0.000 1.000 N NA
 10454475 10454476 LLKF_0158 LLKF_0159 gatB ybgE TRUE 0.479 224.000 0.000 1.000 Y NA
 10454477 10454478 LLKF_0160 LLKF_0161 matE cspE FALSE 0.164 168.000 0.000 1.000 N NA
 10454479 10454480 LLKF_0162 LLKF_0163 ybhA ybhB TRUE 0.943 -10.000 0.037 1.000   NA
 10454480 10454481 LLKF_0163 LLKF_0164 ybhB ybhC TRUE 0.467 100.000 0.000 NA   NA
 10454481 10454482 LLKF_0164 LLKF_0165 ybhC ybhD FALSE 0.126 391.000 0.000 NA   NA
 10454482 10454483 LLKF_0165 LLKF_0166 ybhD ybhE FALSE 0.111 333.000 0.000 1.000   NA
 10454483 10454484 LLKF_0166 LLKF_0167 ybhE celB FALSE 0.380 98.000 0.000 1.000   NA
 10454484 10454485 LLKF_0167 LLKF_0168 celB   TRUE 0.700 125.000 0.176 NA   NA
 10454485 10454486 LLKF_0168 LLKF_0169     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10454486 10454487 LLKF_0169 LLKF_0170   bglS TRUE 0.416 132.000 0.000 NA   NA
 10454487 10454488 LLKF_0170 LLKF_0171 bglS dut FALSE 0.289 64.000 0.000 1.000 N NA
 10454488 10454489 LLKF_0171 LLKF_0172 dut   FALSE 0.127 390.000 0.000 NA   NA
 10454489 10454490 LLKF_0172 LLKF_0173     FALSE 0.159 330.000 0.000 NA   NA
 10454490 10454491 LLKF_0173 LLKF_0174   ybiB FALSE 0.252 255.000 0.000 NA   NA
 10454491 10454492 LLKF_0174 LLKF_0175 ybiB ybiC TRUE 0.978 15.000 0.347 NA   NA
 10454492 10454493 LLKF_0175 LLKF_0176 ybiC ybiD FALSE 0.383 194.000 0.016 NA   NA
 10454493 10454494 LLKF_0176 LLKF_0177 ybiD ybiE FALSE 0.198 246.000 0.000 1.000   NA
 10454494 10454495 LLKF_0177 LLKF_0178 ybiE preA FALSE 0.172 151.000 0.000 1.000 N NA
 10454495 10454496 LLKF_0178 LLKF_0179 preA ybiG TRUE 0.900 223.000 0.562 1.000 Y NA
 10454497 10454498 LLKF_0180 LLKF_0181 ybiHJ ybiK FALSE 0.210 281.000 0.000 NA   NA
 10454498 10454499 LLKF_0181 LLKF_0182 ybiK feoB TRUE 0.946 -13.000 0.000 NA   NA
 10454499 10454500 LLKF_0182 LLKF_0183 feoB feoA TRUE 0.976 102.000 0.871 1.000 Y NA
 10454502 10454503 LLKF_0185 LLKF_0186 ybjJ ybjK TRUE 0.994 0.000 0.567 NA   NA
 10454503 10454504 LLKF_0186 LLKF_0187 ybjK rpmB FALSE 0.291 273.000 0.044 NA   NA
 10454505 10454506 LLKF_0188 LLKF_0189 ybjB rmlA FALSE 0.363 192.000 0.000 NA   NA
 10454506 10454507 LLKF_0189 LLKF_0190 rmlA ybjD TRUE 0.675 48.000 0.000 NA   NA
 10454507 10454508 LLKF_0190 LLKF_0191 ybjD rmlC TRUE 0.602 61.000 0.000 NA   NA
 10454508 10454509 LLKF_0191 LLKF_0192 rmlC ybjF TRUE 0.934 0.000 0.000 NA   NA
 10454509 10454510 LLKF_0192 LLKF_0193 ybjF rmlB TRUE 0.706 42.000 0.000 NA   NA
 10454510 10454511 LLKF_0193 LLKF_0194 rmlB rmlD TRUE 0.979 86.000 0.273 0.003 Y NA
 10454511 10454512 LLKF_0194 LLKF_0195 rmlD rgpA TRUE 0.604 134.000 0.000 1.000 Y NA
 10454512 10454513 LLKF_0195 LLKF_0196 rgpA rgpB TRUE 0.909 8.000 0.000 NA   NA
 10454513 10454514 LLKF_0196 LLKF_0197 rgpB rgpC TRUE 0.987 1.000 0.289 NA   NA
 10454514 10454515 LLKF_0197 LLKF_0198 rgpC rgpD TRUE 0.996 0.000 0.500 1.000 Y NA
 10454515 10454516 LLKF_0198 LLKF_0199 rgpD ycaG TRUE 0.945 -7.000 0.000 NA   NA
 10454516 10454517 LLKF_0199 LLKF_0200 ycaG rgpE TRUE 0.859 16.000 0.000 NA   NA
 10454517 10454518 LLKF_0200 LLKF_0201 rgpE rgpF TRUE 0.985 10.000 0.154 NA Y NA
 10454518 10454519 LLKF_0201 LLKF_0202 rgpF ycbA TRUE 0.972 3.000 0.154 NA   NA
 10454519 10454520 LLKF_0202 LLKF_0203 ycbA ycbB TRUE 0.493 90.000 0.000 NA   NA
 10454520 10454521 LLKF_0203 LLKF_0204 ycbB ycbC TRUE 0.995 -3.000 0.568 NA   NA
 10454521 10454522 LLKF_0204 LLKF_0205 ycbC ycbD TRUE 0.946 -16.000 0.000 NA   NA
 10454522 10454523 LLKF_0205 LLKF_0206 ycbD ycbK TRUE 0.906 0.000 0.000 1.000   NA
 10454523 10454524 LLKF_0206 LLKF_0207 ycbK ycbF TRUE 0.916 -3.000 0.000 1.000   NA
 10454524 10454525 LLKF_0207 LLKF_0208 ycbF ycbG TRUE 0.976 0.000 0.000 NA Y NA
 10454525 10454526 LLKF_0208 LLKF_0209 ycbG ycbH TRUE 0.981 -10.000 0.000 NA Y NA
 10454526 10454527 LLKF_0209 LLKF_0210 ycbH ycbI TRUE 0.973 2.000 0.000 NA Y NA
 10454527 10454528 LLKF_0210 LLKF_0211 ycbI ycbJ TRUE 0.891 -3.000 0.000 NA N NA
 10454528 10454529 LLKF_0211 LLKF_0212 ycbJ tagD TRUE 0.723 11.000 0.000 1.000 N NA
 10454531 10454532 LLKF_0214 LLKF_0215 guaB yqeL FALSE 0.326 146.000 0.000 1.000   NA
 10454532 10454533 LLKF_0215 LLKF_0216 yqeL yccE TRUE 0.449 70.000 0.000 1.000   NA
 10454533 10454534 LLKF_0216 LLKF_0217 yccE hflX FALSE 0.406 84.000 0.000 1.000   NA
 10454534 10454535 LLKF_0217 LLKF_0218 hflX yccF TRUE 0.694 45.000 0.000 NA   NA
 10454535 10454536 LLKF_0218 LLKF_0219 yccF nadD TRUE 0.787 47.000 0.150 NA N NA
 10454536 10454537 LLKF_0219 LLKF_0220 nadD yccH TRUE 0.991 -7.000 0.199 1.000 Y NA
 10454537 10454538 LLKF_0220 LLKF_0221 yccH yccI TRUE 0.602 46.000 0.000 1.000   NA
 10454538 10454539 LLKF_0221 LLKF_0222 yccI yccJ FALSE 0.399 166.000 0.000 NA   NA
 10454539 10454540 LLKF_0222 LLKF_0223 yccJ yccK TRUE 0.637 101.000 0.085 NA   NA
 10454540 10454541 LLKF_0223 LLKF_0224 yccK yccL TRUE 0.804 51.000 0.094 NA   NA
 10454541 10454542 LLKF_0224 LLKF_0225 yccL ycdA TRUE 0.544 70.000 0.000 NA   NA
 10454542 10454543 LLKF_0225 LLKF_0226 ycdA ycdB FALSE 0.406 156.000 0.000 NA   NA
 10454543 10454544 LLKF_0226 LLKF_0227 ycdB ycdC TRUE 0.566 66.000 0.000 NA   NA
 10454544 10454545 LLKF_0227 LLKF_0228 ycdC ung TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10454548 10454549 LLKF_0231 LLKF_0232 ycdH ycdH TRUE 0.946 -31.000 0.000 NA   NA
 10454550 10454551 LLKF_0233 LLKF_0234 rmeC rpsU FALSE 0.403 86.000 0.000 1.000   NA
 10454551 10454552 LLKF_0234 LLKF_0235 rpsU ycdJ FALSE 0.330 209.000 0.000 NA   NA
 10454552 10454553 LLKF_0235 LLKF_0236 ycdJ   TRUE 0.915 5.000 0.000 NA   NA
 10454553 10454554 LLKF_0236 LLKF_0237   ycdJC TRUE 0.415 133.000 0.000 NA   NA
 10454554 10454555 LLKF_0237 LLKF_0238 ycdJC yceA TRUE 0.891 12.000 0.000 NA   NA
 10454555 10454556 LLKF_0238 LLKF_0239 yceA yihA TRUE 0.413 141.000 0.000 NA   NA
 10454556 10454557 LLKF_0239 LLKF_0240 yihA yceD TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 10454557 10454558 LLKF_0240 LLKF_0241 yceD yceE TRUE 0.494 89.000 0.000 NA   NA
 10454558 10454559 LLKF_0241 LLKF_0242 yceE pgk FALSE 0.283 190.000 0.000 1.000   NA
 10454559 10454560 LLKF_0242 LLKF_0243 pgk dhaQ TRUE 0.697 77.000 0.000 1.000 Y NA
 10454562 10454563 LLKF_0245 LLKF_0246 dhaK dhaL TRUE 0.998 10.000 0.316 0.003 Y NA
 10454563 10454564 LLKF_0246 LLKF_0247 dhaL dhaM TRUE 0.916 -3.000 0.000 1.000   NA
 10454564 10454565 LLKF_0247 LLKF_0248 dhaM glpF TRUE 0.864 10.000 0.000 1.000   NA
 10454567 10454568 LLKF_0250 LLKF_0251 ycfA ycfBC FALSE 0.226 87.000 0.000 1.000 N NA
 10454568 10454569 LLKF_0251 LLKF_0252 ycfBC ycfD FALSE 0.380 98.000 0.000 1.000   NA
 10454569 10454570 LLKF_0252 LLKF_0253 ycfD fbp FALSE 0.283 191.000 0.000 1.000   NA
 10454570 10454571 LLKF_0253 LLKF_t0012 fbp trnL TRUE 0.518 76.000 0.000 NA   NA
 10454573 10454574 LLKF_0255 LLKF_0256 ycfG ycfH FALSE 0.412 150.000 0.000 NA   NA
 10454575 10454576 LLKF_0257 LLKF_0258     TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 10454577 10454578 LLKF_0259 LLKF_0260 ycfI ycgAB TRUE 0.998 -3.000 0.222 0.010 Y NA
 10454578 10454579 LLKF_0260 LLKF_0261 ycgAB ycgC TRUE 0.477 97.000 0.000 NA   NA
 10454580 10454581 LLKF_0262 LLKF_0263 ycgD luxS FALSE 0.109 339.000 0.000 1.000   NA
 10454582 10454583 LLKF_0264 LLKF_0265 ycgF ycgG TRUE 0.571 65.000 0.000 NA   NA
 10454583 10454584 LLKF_0265 LLKF_0266 ycgG ycgH FALSE 0.314 163.000 0.000 1.000   NA
 10454584 10454585 LLKF_0266 LLKF_0267 ycgH ycgI TRUE 0.429 119.000 0.000 NA   NA
 10454585 10454586 LLKF_0267 LLKF_0268 ycgI ycgJ TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 10454588 10454589 LLKF_0270 LLKF_0271 nrdD nrdG TRUE 0.960 3.000 0.240 1.000 N NA
 10454591 10454592 LLKF_0273 LLKF_t0013 enoA trnM FALSE 0.083 826.000 0.000 NA   NA
 10454592 10454593 LLKF_t0013 LLKF_0274 trnM cspA TRUE 0.462 102.000 0.000 NA   NA
 10454593 10454594 LLKF_0274 LLKF_0275 cspA cspC TRUE 0.418 131.000 0.000 NA   NA
 10454594 10454595 LLKF_0275 LLKF_0276 cspC cspB TRUE 0.791 205.000 0.000 0.063 Y NA
 10454595 10454596 LLKF_0276 LLKF_0277 cspB ymgJ FALSE 0.070 517.000 0.000 1.000   NA
 10454596 10454597 LLKF_0277 LLKF_0278 ymgJ ymgI TRUE 0.954 35.000 0.357 NA   NA
 10454597 10454598 LLKF_0278 LLKF_0279 ymgI ymgH TRUE 0.961 10.000 0.143 NA   NA
 10454598 10454599 LLKF_0279 LLKF_0280 ymgH ymgG TRUE 0.824 21.000 0.000 NA   NA
 10454599 10454600 LLKF_0280 LLKF_0281 ymgG corA TRUE 0.424 125.000 0.000 NA   NA
 10454600 10454601 LLKF_0281 LLKF_0282 corA ceo TRUE 0.641 39.000 0.000 1.000   NA
 10454601 10454602 LLKF_0282 LLKF_0283 ceo   FALSE 0.108 447.000 0.000 NA   NA
 10454604 10454605 LLKF_0285 LLKF_0286 agsE   TRUE 0.830 20.000 0.000 NA   NA
 10454605 10454606 LLKF_0286 LLKF_0287   agsT TRUE 0.492 146.000 0.041 NA   NA
 10454606 10454607 LLKF_0287 LLKF_0288 agsT   TRUE 0.806 12.000 0.000 NA N NA
 10454607 10454608 LLKF_0288 LLKF_0289     FALSE 0.180 308.000 0.000 NA   NA
 10454608 10454609 LLKF_0289 LLKF_0290     TRUE 0.779 30.000 0.000 NA   NA
 10454609 10454610 LLKF_0290 LLKF_0291     FALSE 0.086 752.000 0.000 NA   NA
 10454610 10454611 LLKF_0291 LLKF_0292     TRUE 0.838 19.000 0.000 NA   NA
 10454612 10454613 LLKF_0293 LLKF_0294     TRUE 0.946 -25.000 0.000 NA   NA
 10454613 10454614 LLKF_0294 LLKF_0295     TRUE 0.995 -3.000 0.833 1.000 N NA
 10454614 10454615 LLKF_0295 LLKF_0296     FALSE 0.403 160.000 0.000 NA   NA
 10454615 10454616 LLKF_0296 LLKF_0297     TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 10454617 10454618 LLKF_t0014 LLKF_0298 trnI   TRUE 0.803 25.000 0.000 NA   NA
 10454618 10454619 LLKF_0298 LLKF_0299     TRUE 0.438 113.000 0.000 NA   NA
 10454619 10454620 LLKF_0299 LLKF_0300     FALSE 0.412 150.000 0.000 NA   NA
 10454620 10454621 LLKF_0300 LLKF_0301     TRUE 0.846 18.000 0.000 NA   NA
 10454621 10454622 LLKF_0301 LLKF_0302     TRUE 0.997 4.000 1.000 NA   NA
 10454622 10454623 LLKF_0302 LLKF_0303     TRUE 0.819 22.000 0.000 NA   NA
 10454623 10454624 LLKF_0303 LLKF_0304     TRUE 0.891 12.000 0.000 NA   NA
 10454624 10454625 LLKF_0304 LLKF_0305     FALSE 0.155 332.000 0.000 NA   NA
 10454625 10454626 LLKF_0305 LLKF_0306     TRUE 0.965 -10.000 0.051 NA   NA
 10454626 10454627 LLKF_0306 LLKF_0307     TRUE 0.422 127.000 0.000 NA   NA
 10454627 10454628 LLKF_0307 LLKF_0308     FALSE 0.413 137.000 0.000 NA   NA
 10454628 10454629 LLKF_0308 LLKF_0309     TRUE 0.495 87.000 0.000 NA   NA
 10454629 10454630 LLKF_0309 LLKF_0310     TRUE 0.420 129.000 0.000 NA   NA
 10454630 10454631 LLKF_0310 LLKF_0311     TRUE 0.444 110.000 0.000 NA   NA
 10454631 10454632 LLKF_0311 LLKF_0312     TRUE 0.882 13.000 0.000 NA   NA
 10454632 10454633 LLKF_0312 LLKF_0313     TRUE 0.675 48.000 0.000 NA   NA
 10454633 10454634 LLKF_0313 LLKF_0314     TRUE 0.907 9.000 0.000 NA   NA
 10454634 10454635 LLKF_0314 LLKF_0315     TRUE 0.875 14.000 0.000 NA   NA
 10454635 10454636 LLKF_0315 LLKF_0316     TRUE 0.973 4.000 0.182 NA   NA
 10454636 10454637 LLKF_0316 LLKF_0317     TRUE 0.414 147.000 0.000 NA   NA
 10454637 10454638 LLKF_0317 LLKF_0318     TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 10454638 10454639 LLKF_0318 LLKF_0319     TRUE 0.484 95.000 0.000 NA   NA
 10454639 10454640 LLKF_0319 LLKF_0320     TRUE 0.803 25.000 0.000 NA   NA
 10454640 10454641 LLKF_0320 LLKF_0321   ardA TRUE 0.742 36.000 0.000 NA   NA
 10454641 10454642 LLKF_0321 LLKF_0322 ardA   TRUE 0.791 28.000 0.000 NA   NA
 10454642 10454643 LLKF_0322 LLKF_0323     TRUE 0.934 0.000 0.000 NA   NA
 10454644 10454645 LLKF_0324 LLKF_0325     TRUE 0.946 -19.000 0.000 NA   NA
 10454646 10454647 LLKF_t0015 LLKF_0326 trnS ychD TRUE 0.414 144.000 0.000 NA   NA
 10454647 10454648 LLKF_0326 LLKF_0327 ychD ychE TRUE 0.984 186.000 0.713 0.028 Y NA
 10454648 10454649 LLKF_0327 LLKF_0328 ychE ychF TRUE 0.986 0.000 0.136 1.000 Y NA
 10454649 10454650 LLKF_0328 LLKF_0329 ychF ychG TRUE 0.808 24.000 0.000 NA   NA
 10454650 10454651 LLKF_0329 LLKF_0330 ychG ychH FALSE 0.328 210.000 0.000 NA   NA
 10454651 10454652 LLKF_0330 LLKF_0331 ychH yciA TRUE 0.795 137.000 0.372 1.000   NA
 10454652 10454653 LLKF_0331 LLKF_0332 yciA xynD FALSE 0.337 122.000 0.000 1.000   NA
 10454653 10454654 LLKF_0332 LLKF_t0016 xynD trnR TRUE 0.413 141.000 0.000 NA   NA
 10454654 10454655 LLKF_t0016 LLKF_t0017 trnR trnP FALSE 0.184 304.000 0.000 NA   NA
 10454655 10454656 LLKF_t0017 LLKF_0333 trnP   FALSE 0.412 150.000 0.000 NA   NA
 10454656 10454657 LLKF_0333 LLKF_0334   rpsD FALSE 0.170 319.000 0.000 NA   NA
 10454657 10454658 LLKF_0334 LLKF_0335 rpsD tex FALSE 0.178 127.000 0.000 1.000 N NA
 10454658 10454659 LLKF_0335 LLKF_0336 tex yciD TRUE 0.728 140.000 0.215 NA   NA
 10454659 10454660 LLKF_0336 LLKF_0337 yciD add FALSE 0.220 274.000 0.000 NA   NA
 10454661 10454662 LLKF_0338 LLKF_0339 yciF yciH FALSE 0.306 220.000 0.000 NA   NA
 10454662 10454663 LLKF_0339 LLKF_0340 yciH ycjA TRUE 0.889 173.000 0.576 NA   NA
 10454664 10454665 LLKF_0341 LLKF_0342 ycjB ycjC TRUE 0.936 -46.000 0.026 1.000   NA
 10454665 10454666 LLKF_0342 LLKF_0343 ycjC ycjD TRUE 0.991 -3.000 0.013 0.001   NA
 10454666 10454667 LLKF_0343 LLKF_0344 ycjD gcp TRUE 0.911 3.000 0.030 1.000   NA
 10454667 10454668 LLKF_0344 LLKF_0345 gcp ycjF TRUE 0.934 0.000 0.000 NA   NA
 10454669 10454670 LLKF_0346 LLKF_0347 ycjG ycjH TRUE 0.464 101.000 0.000 NA   NA
 10454671 10454672 LLKF_0348 LLKF_0349 phnD phnC TRUE 0.872 119.000 0.212 NA Y NA
 10454672 10454673 LLKF_0349 LLKF_0350 phnC phnB TRUE 0.998 1.000 0.192 0.002 Y NA
 10454673 10454674 LLKF_0350 LLKF_0351 phnB phnE TRUE 0.997 15.000 0.222 0.001 Y NA
 10454674 10454675 LLKF_0351 LLKF_0352 phnE ycjM TRUE 0.940 6.000 0.182 1.000 N NA
 10454675 10454676 LLKF_0352 LLKF_0353 ycjM tpx FALSE 0.055 327.000 0.000 1.000 N NA
 10454676 10454677 LLKF_0353 LLKF_0354 tpx pepN FALSE 0.162 173.000 0.000 1.000 N NA
 10454678 10454679 LLKF_0355 LLKF_0356 napC napB TRUE 0.471 327.000 0.462 1.000 N NA
 10454679 10454680 LLKF_0356 LLKF_0357 napB ydaE TRUE 0.827 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10454682 10454683 LLKF_0359 LLKF_0360     TRUE 0.415 79.000 0.000 1.000   NA
 10454684 10454685 LLKF_0361 LLKF_0362 ydaG ydbA TRUE 0.999 4.000 0.720 0.010 Y NA
 10454685 10454686 LLKF_0362 LLKF_0363 ydbA murA FALSE 0.158 177.000 0.000 1.000 N NA
 10454686 10454687 LLKF_0363 LLKF_0364 murA ydbC TRUE 0.688 46.000 0.000 NA   NA
 10454689 10454690 LLKF_0366 LLKF_0367     TRUE 0.990 2.000 0.429 NA   NA
 10454691 10454692 LLKF_0368 LLKF_0369 ydbD bioY TRUE 0.808 24.000 0.000 NA   NA
 10454692 10454693 LLKF_0369 LLKF_0370 bioY ydbF TRUE 0.442 111.000 0.000 NA   NA
 10454693 10454694 LLKF_0370 LLKF_0371 ydbF thiA TRUE 0.486 93.000 0.010 NA   NA
 10454695 10454696 LLKF_0372 LLKF_0373 plpA plpB TRUE 0.670 144.000 0.000 NA Y NA
 10454696 10454697 LLKF_0373 LLKF_0374 plpB plpC TRUE 0.685 117.000 0.000 NA Y NA
 10454697 10454698 LLKF_0374 LLKF_0375 plpC plpD TRUE 0.937 19.000 0.000 NA Y NA
 10454698 10454699 LLKF_0375 LLKF_0376 plpD ydcB TRUE 0.707 104.000 0.000 NA Y NA
 10454699 10454700 LLKF_0376 LLKF_0377 ydcB ydcC TRUE 0.999 0.000 0.938 1.000 Y NA
 10454700 10454701 LLKF_0377 LLKF_0378 ydcC cbiQ TRUE 0.675 48.000 0.000 NA   NA
 10454701 10454702 LLKF_0378 LLKF_0379 cbiQ cbiO TRUE 0.871 109.000 0.435 NA   NA
 10454702 10454703 LLKF_0379 LLKF_0380 cbiO cbiQ TRUE 0.993 -7.000 0.530 1.000   NA
 10454703 10454704 LLKF_0380 LLKF_0381 cbiQ ydcG FALSE 0.165 166.000 0.000 1.000 N NA
 10454704 10454705 LLKF_0381 LLKF_0382 ydcG fhuC TRUE 0.839 -76.000 0.000 1.000 N NA
 10454705 10454706 LLKF_0382 LLKF_0383 fhuC fhuB TRUE 0.974 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 10454706 10454707 LLKF_0383 LLKF_0384 fhuB fhuG TRUE 0.990 2.000 0.000 0.038 Y NA
 10454707 10454708 LLKF_0384 LLKF_0385 fhuG fhuD TRUE 0.682 85.000 0.000 1.000 Y NA
 10454708 10454709 LLKF_0385 LLKF_0386 fhuD cmbR FALSE 0.301 62.000 0.000 1.000 N NA
 10454710 10454711 LLKF_0387 LLKF_0388 yddA yddB TRUE 0.882 13.000 0.000 NA   NA
 10454712 10454713 LLKF_0389 LLKF_0390 yddC yddD TRUE 0.669 26.000 0.000 NA N NA
 10454713 10454714 LLKF_0390 LLKF_0391 yddD pmg FALSE 0.243 177.000 0.000 NA N NA
 10454714 10454715 LLKF_0391 LLKF_0392 pmg ahpC FALSE 0.161 174.000 0.000 1.000 N NA
 10454715 10454716 LLKF_0392 LLKF_0393 ahpC ahpF TRUE 0.965 66.000 0.551 1.000 Y NA
 10454716 10454717 LLKF_0393 LLKF_0394 ahpF pbp2B FALSE 0.165 166.000 0.000 1.000 N NA
 10454717 10454718 LLKF_0394 LLKF_0395 pbp2B recR FALSE 0.180 139.000 0.013 1.000 N NA
 10454718 10454719 LLKF_0395 LLKF_0396 recR ddl FALSE 0.184 117.000 0.010 1.000 N NA
 10454719 10454720 LLKF_0396 LLKF_0397 ddl murF TRUE 0.943 75.000 0.046 0.007 Y NA
 10454720 10454721 LLKF_0397 LLKF_0398 murF optS FALSE 0.163 170.000 0.000 1.000 N NA
 10454721 10454722 LLKF_0398 LLKF_0399 optS optA TRUE 0.642 308.000 0.000 0.038 Y NA
 10454722 10454723 LLKF_0399 LLKF_0400 optA optB TRUE 0.896 78.000 0.000 0.038 Y NA
 10454723 10454724 LLKF_0400 LLKF_0401 optB optC TRUE 0.978 16.000 0.134 0.038   NA
 10454724 10454725 LLKF_0401 LLKF_0402 optC optD TRUE 0.980 3.000 0.286 1.000   NA
 10454725 10454726 LLKF_0402 LLKF_0403 optD optF TRUE 0.997 46.000 0.619 0.002 Y NA
 10454726 10454727 LLKF_0403 LLKF_0404 optF prfC FALSE 0.105 230.000 0.000 1.000 N NA
 10454727 10454728 LLKF_0404 LLKF_0405 prfC rheA FALSE 0.402 263.000 0.000 1.000 Y NA
 10454728 10454729 LLKF_0405 LLKF_0406 rheA era FALSE 0.099 364.000 0.000 1.000   NA
 10454729 10454730 LLKF_0406 LLKF_0407 era asnB FALSE 0.380 98.000 0.000 1.000   NA
 10454730 10454731 LLKF_0407 LLKF_0408 asnB mutM FALSE 0.144 194.000 0.000 1.000 N NA
 10454731 10454732 LLKF_0408 LLKF_0409 mutM recA TRUE 0.599 154.000 0.000 1.000 Y NA
 10454733 10454734 LLKF_0410 LLKF_0411 ydgB ydgC TRUE 0.931 69.000 0.000 0.009 Y NA
 10454735 10454736 LLKF_0412 LLKF_0413 ydgD ydgE TRUE 0.995 -13.000 0.500 NA   NA
 10454736 10454737 LLKF_0413 LLKF_0414 ydgE ddi FALSE 0.282 230.000 0.000 NA   NA
 10454739 10454740 LLKF_0416 LLKF_0417 ydgH ydgI FALSE 0.369 188.000 0.000 NA   NA
 10454740 10454741 LLKF_0417 LLKF_0418 ydgI ppnK TRUE 0.996 -13.000 0.725 1.000   NA
 10454741 10454742 LLKF_0418 LLKF_0419 ppnK rluE TRUE 0.946 0.000 0.150 1.000 N NA
 10454744 10454745 LLKF_0421 LLKF_0422 lysQ ydhB TRUE 0.434 115.000 0.000 NA   NA
 10454745 10454746 LLKF_0422 LLKF_0423 ydhB apbE TRUE 0.976 0.000 0.154 NA   NA
 10454747 10454748 LLKF_0424 LLKF_0425 lysS rlrG FALSE 0.138 199.000 0.000 1.000 N NA
 10454750 10454751 LLKF_0427 LLKF_0428 ldhB rlrD FALSE 0.067 294.000 0.000 1.000 N NA
 10454752 10454753 LLKF_0429 LLKF_0430 ydiA thiI FALSE 0.068 290.000 0.000 1.000 N NA
 10454753 10454754 LLKF_0430 LLKF_0431 thiI ydiC FALSE 0.124 214.000 0.000 1.000 N NA
 10454754 10454755 LLKF_0431 LLKF_0432 ydiC ydiD FALSE 0.167 161.000 0.000 1.000 N NA
 10454755 10454756 LLKF_0432 LLKF_0433 ydiD osmC FALSE 0.215 96.000 0.000 1.000 N NA
 10454757 10454758 LLKF_0434 LLKF_0435 nhaP ydiG TRUE 0.491 91.000 0.000 NA   NA
 10454758 10454759 LLKF_0435 LLKF_0436 ydiG tyrS TRUE 0.425 123.000 0.000 NA   NA
 10454761 10454762 LLKF_0438 LLKF_0439 pepA pepA TRUE 0.946 -13.000 0.000 NA   NA
 10454763 10454764 LLKF_0440 LLKF_0441   trxH TRUE 0.706 42.000 0.000 NA   NA
 10454764 10454765 LLKF_0441 LLKF_0442 trxH ydjD TRUE 0.759 86.000 0.239 1.000   NA
 10454765 10454766 LLKF_0442 LLKF_0443 ydjD noxE FALSE 0.314 163.000 0.000 1.000   NA
 10454766 10454767 LLKF_0443 LLKF_0444 noxE ssbA FALSE 0.398 91.000 0.000 1.000   NA
 10454767 10454768 LLKF_0444 LLKF_0445 ssbA groES FALSE 0.380 120.000 0.083 1.000 N NA
 10454768 10454769 LLKF_0445 LLKF_0446 groES groEL TRUE 0.849 88.000 0.160 1.000 Y NA
 10454770 10454771 LLKF_0447 LLKF_0448 yeaA tcsK FALSE 0.383 171.000 0.038 1.000   NA
 10454771 10454772 LLKF_0448 LLKF_0449 tcsK tcsR TRUE 0.999 -7.000 0.597 0.008 Y NA
 10454773 10454774 LLKF_0450 LLKF_0451 tmk holB TRUE 0.616 133.000 0.254 1.000 N NA
 10454774 10454775 LLKF_0451 LLKF_0452 holB yeaC TRUE 0.932 52.000 0.372 NA   NA
 10454775 10454776 LLKF_0452 LLKF_0453 yeaC yeaD TRUE 0.983 -7.000 0.183 NA   NA
 10454776 10454777 LLKF_0453 LLKF_0454 yeaD yeaE TRUE 0.952 0.000 0.043 NA   NA
 10454778 10454779 LLKF_0455 LLKF_0456 yeaF mvaK TRUE 0.584 63.000 0.000 NA   NA
 10454780 10454781 LLKF_0457 LLKF_0458 mvaD mvaK TRUE 0.999 -13.000 0.312 0.004 Y NA
 10454781 10454782 LLKF_0458 LLKF_0459 mvaK idi TRUE 0.628 54.000 0.097 1.000 N NA
 10454782 10454783 LLKF_0459 LLKF_0460 idi sodA FALSE 0.168 158.000 0.000 1.000 N NA
 10454783 10454784 LLKF_0460 LLKF_0461 sodA cstA FALSE 0.094 250.000 0.000 1.000 N NA
 10454784 10454785 LLKF_0461 LLKF_0462 cstA rheB FALSE 0.064 302.000 0.000 1.000 N NA
 10454785 10454786 LLKF_0462 LLKF_0463 rheB yebE TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 10454786 10454787 LLKF_0463 LLKF_0464 yebE yebF TRUE 0.484 95.000 0.000 NA   NA
 10454787 10454788 LLKF_0464 LLKF_0465 yebF ptcB FALSE 0.099 242.000 0.000 1.000 N NA
 10454788 10454789 LLKF_0465 LLKF_0466 ptcB ptcA TRUE 0.987 85.000 0.500 0.013 Y NA
 10454789 10454790 LLKF_0466 LLKF_0467 ptcA yecA FALSE 0.223 91.000 0.000 1.000 N NA
 10454790 10454791 LLKF_0467 LLKF_0468 yecA ptcC FALSE 0.068 292.000 0.000 1.000 N NA
 10454791 10454792 LLKF_0468 LLKF_0469 ptcC bglA TRUE 0.686 82.000 0.000 1.000 Y NA
 10454792 10454793 LLKF_0469 LLKF_0470 bglA yecD FALSE 0.203 286.000 0.000 NA   NA
 10454793 10454794 LLKF_0470 LLKF_t0018 yecD trnC FALSE 0.405 157.000 0.000 NA   NA
 10454794 10454795 LLKF_t0018 LLKF_0471 trnC ligA TRUE 0.414 134.000 0.000 NA   NA
 10454795 10454796 LLKF_0471 LLKF_0472 ligA yecE FALSE 0.180 153.000 0.013 1.000 N NA
 10454796 10454797 LLKF_0472 LLKF_0473 yecE msmK FALSE 0.120 217.000 0.000 1.000 N NA
 10454797 10454798 LLKF_0473 LLKF_0474 msmK nifJ FALSE 0.061 308.000 0.000 1.000 N NA
 10454798 10454799 LLKF_0474 LLKF_0475 nifJ yedA FALSE 0.327 208.000 0.009 NA   NA
 10454799 10454800 LLKF_0475 LLKF_0476 yedA yedB TRUE 0.995 -10.000 0.502 NA   NA
 10454800 10454801 LLKF_0476 LLKF_0477 yedB glmM TRUE 0.860 46.000 0.150 NA   NA
 10454803 10454804 LLKF_0479 LLKF_0480 yedE yedF TRUE 0.951 137.000 0.188 0.013 Y NA
 10454804 10454805 LLKF_0480 LLKF_0481 yedF yeeA TRUE 0.774 68.000 0.038 1.000 Y NA
 10454805 10454806 LLKF_0481 LLKF_0482 yeeA pgmB FALSE 0.326 146.000 0.000 1.000   NA
 10454808 10454809 LLKF_0484 LLKF_0485 yeeC yeeE FALSE 0.332 208.000 0.000 NA   NA
 10454809 10454810 LLKF_0485 LLKF_0486 yeeE yeeF TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10454810 10454811 LLKF_0486 LLKF_0487 yeeF yeeG TRUE 0.737 105.000 0.283 NA N NA
 10454811 10454812 LLKF_0487 LLKF_t0019 yeeG trnR TRUE 0.513 78.000 0.000 NA   NA
 10454812 10454813 LLKF_t0019 LLKF_0488 trnR truA FALSE 0.413 149.000 0.000 NA   NA
 10454813 10454814 LLKF_0488 LLKF_0489 truA thiD TRUE 0.673 33.000 0.058 1.000 N NA
 10454814 10454815 LLKF_0489 LLKF_0490 thiD yeiE TRUE 0.910 49.000 0.276 NA   NA
 10454815 10454816 LLKF_0490 LLKF_0491 yeiE yeiF TRUE 0.980 -19.000 0.149 NA   NA
 10454816 10454817 LLKF_0491 LLKF_0492 yeiF yeiG TRUE 0.930 1.000 0.000 NA   NA
 10454817 10454818 LLKF_0492 LLKF_0493 yeiG pyrG FALSE 0.101 236.000 0.000 1.000 N NA
 10454818 10454819 LLKF_0493 LLKF_0494 pyrG   FALSE 0.173 140.000 0.000 1.000 N NA
 10454820 10454821 LLKF_0495 LLKF_0496 yejC   FALSE 0.146 348.000 0.000 NA   NA
 10454821 10454822 LLKF_0496 LLKF_0497   yejD TRUE 0.472 98.000 0.000 NA   NA
 10454822 10454823 LLKF_0497 LLKF_0498 yejD yejE TRUE 0.946 -16.000 0.000 NA   NA
 10454823 10454824 LLKF_0498 LLKF_0499 yejE dukA TRUE 0.934 0.000 0.000 NA   NA
 10454827 10454828 LLKF_0502 LLKF_0503 yejH yejI TRUE 0.984 -7.000 0.203 NA   NA
 10454828 10454829 LLKF_0503 LLKF_0504 yejI yejJ TRUE 0.827 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10454829 10454830 LLKF_0504 LLKF_0505 yejJ yfaA TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 10454830 10454831 LLKF_0505 LLKF_0506 yfaA hslA TRUE 0.712 105.000 0.156 NA   NA
 10454832 10454833 LLKF_0507 LLKF_0508 yfbM yfbM TRUE 0.946 -132.000 0.000 NA   NA
 10454834 10454835 LLKF_0509 LLKF_0510 ogt adaA TRUE 0.948 14.000 0.000 0.016 N NA
 10454835 10454836 LLKF_0510 LLKF_0511 adaA yfcA FALSE 0.218 95.000 0.000 1.000 N NA
 10454836 10454837 LLKF_0511 LLKF_0512 yfcA yfcB TRUE 0.916 -3.000 0.000 1.000   NA
 10454837 10454838 LLKF_0512 LLKF_0513 yfcB yfcC TRUE 0.584 63.000 0.000 NA   NA
 10454838 10454839 LLKF_0513 LLKF_0514 yfcC yfcD TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10454839 10454840 LLKF_0514 LLKF_0515 yfcD nifZ TRUE 0.436 114.000 0.000 NA   NA
 10454840 10454841 LLKF_0515 LLKF_0516 nifZ yfcF FALSE 0.292 107.000 0.000 NA N NA
 10454842 10454843 LLKF_0517 LLKF_0518 yfcG cysK TRUE 0.511 211.000 0.000 1.000 Y NA
 10454845 10454846 LLKF_0520 LLKF_0521 yfcI ponA TRUE 0.901 1.000 0.000 1.000   NA
 10454846 10454847 LLKF_0521 LLKF_0522 ponA recU TRUE 0.852 68.000 0.319 1.000   NA
 10454848 10454849 LLKF_0523 LLKF_0524 yfdB yfdC TRUE 0.414 145.000 0.000 NA   NA
 10454849 10454850 LLKF_0524 LLKF_0525 yfdC yfdD TRUE 0.751 92.000 0.169 NA   NA
 10454850 10454851 LLKF_0525 LLKF_0526 yfdD yfdE TRUE 0.991 -22.000 0.337 NA   NA
 10454851 10454852 LLKF_0526 LLKF_0527 yfdE murA FALSE 0.223 91.000 0.000 1.000 N NA
 10454852 10454853 LLKF_0527 LLKF_0528 murA yfdG TRUE 0.970 0.000 0.110 NA   NA
 10454853 10454854 LLKF_0528 LLKF_0529 yfdG tig FALSE 0.405 157.000 0.000 NA   NA
 10454854 10454855 LLKF_0529 LLKF_r0002 tig rrsA FALSE 0.116 417.000 0.000 NA   NA
 10454855 10454856 LLKF_r0002 LLKF_t0020 rrsA trnA TRUE 0.472 98.000 0.000 NA   NA
 10454856 10454857 LLKF_t0020 LLKF_r0003 trnA rrlA FALSE 0.413 140.000 0.000 NA   NA
 10454857 10454858 LLKF_r0003 LLKF_r0004 rrlA rrfB TRUE 0.498 85.000 0.000 NA   NA
 10454858 10454859 LLKF_r0004 LLKF_t0021 rrfB trnV TRUE 0.946 -26.000 0.000 NA   NA
 10454859 10454860 LLKF_t0021 LLKF_t0022 trnV trnD TRUE 0.785 29.000 0.000 NA   NA
 10454860 10454861 LLKF_t0022 LLKF_t0023 trnD trnK TRUE 0.853 17.000 0.000 NA   NA
 10454861 10454862 LLKF_t0023 LLKF_t0024 trnK trnL TRUE 0.909 8.000 0.000 NA   NA
 10454862 10454863 LLKF_t0024 LLKF_t0025 trnL trnT TRUE 0.891 12.000 0.000 NA   NA
 10454863 10454864 LLKF_t0025 LLKF_t0026 trnT trnG TRUE 0.803 25.000 0.000 NA   NA
 10454864 10454865 LLKF_t0026 LLKF_t0027 trnG trnR TRUE 0.742 36.000 0.000 NA   NA
 10454865 10454866 LLKF_t0027 LLKF_t0028 trnR trnP TRUE 0.915 5.000 0.000 NA   NA
 10454866 10454867 LLKF_t0028 LLKF_t0029 trnP trnM TRUE 0.697 44.000 0.000 NA   NA
 10454867 10454868 LLKF_t0029 LLKF_t0030 trnM trnM TRUE 0.891 12.000 0.000 NA   NA
 10454868 10454869 LLKF_t0030 LLKF_t0031 trnM trnF TRUE 0.910 7.000 0.000 NA   NA
 10454869 10454870 LLKF_t0031 LLKF_t0032 trnF trnG TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 10454870 10454871 LLKF_t0032 LLKF_t0033 trnG trnI TRUE 0.799 26.000 0.000 NA   NA
 10454871 10454872 LLKF_t0033 LLKF_t0034 trnI trnS TRUE 0.706 42.000 0.000 NA   NA
 10454872 10454873 LLKF_t0034 LLKF_0530 trnS dnaG FALSE 0.385 179.000 0.000 NA   NA
 10454873 10454874 LLKF_0530 LLKF_0531 dnaG rpoD TRUE 0.647 77.000 0.209 1.000 N NA
 10454874 10454875 LLKF_0531 LLKF_0532 rpoD yfeA TRUE 0.857 115.000 0.000 0.049 Y NA
 10454875 10454876 LLKF_0532 LLKF_0533 yfeA gltP FALSE 0.253 165.000 0.000 NA N NA
 10454876 10454877 LLKF_0533 LLKF_0534 gltP yffA FALSE 0.206 285.000 0.000 NA   NA
 10454877 10454878 LLKF_0534 LLKF_0535 yffA clpE TRUE 0.659 51.000 0.000 NA   NA
 10454882 10454883 LLKF_0539 LLKF_0540 yffD uvrB TRUE 0.950 11.000 0.000 1.000 Y NA
 10454883 10454884 LLKF_0540 LLKF_0541 uvrB gltS FALSE 0.141 196.000 0.000 1.000 N NA
 10454884 10454885 LLKF_0541 LLKF_0542 gltS argE TRUE 0.934 15.000 0.000 1.000 Y NA
 10454887 10454888 LLKF_0544 LLKF_0545 fabI yfgC FALSE 0.239 262.000 0.000 NA   NA
 10454888 10454889 LLKF_0545 LLKF_0546 yfgC yfgE TRUE 0.550 69.000 0.000 NA   NA
 10454889 10454890 LLKF_0546 LLKF_0547 yfgE yfgF TRUE 0.946 -19.000 0.000 NA   NA
 10454891 10454892 LLKF_0548 LLKF_0549 yfgG yfgH FALSE 0.304 175.000 0.000 1.000   NA
 10454892 10454893 LLKF_0549 LLKF_0550 yfgH yfgL TRUE 0.479 96.000 0.000 NA   NA
 10454893 10454894 LLKF_0550 LLKF_0551 yfgL dfpA TRUE 0.869 17.000 0.019 NA   NA
 10454894 10454895 LLKF_0551 LLKF_0552 dfpA dfpB TRUE 0.926 -7.000 0.013 1.000   NA
 10454895 10454896 LLKF_0552 LLKF_0553 dfpB xylH FALSE 0.326 146.000 0.000 1.000   NA
 10454897 10454898 LLKF_0554 LLKF_0555 yfgQ yfhA TRUE 0.958 13.000 0.000 0.064   NA
 10454898 10454899 LLKF_0555 LLKF_0556 yfhA yfhB TRUE 0.450 106.000 0.000 NA   NA
 10454899 10454900 LLKF_0556 LLKF_0557 yfhB yfhC FALSE 0.412 150.000 0.000 NA   NA
 10454900 10454901 LLKF_0557 LLKF_0558 yfhC tpsO FALSE 0.353 198.000 0.000 NA   NA
 10454901 10454902 LLKF_0558 LLKF_0559 tpsO yfhF TRUE 0.429 119.000 0.000 NA   NA
 10454902 10454903 LLKF_0559 LLKF_0560 yfhF yfhG TRUE 0.994 4.000 0.688 NA   NA
 10454903 10454904 LLKF_0560 LLKF_0561 yfhG yfhH TRUE 0.979 -3.000 0.210 1.000   NA
 10454904 10454905 LLKF_0561 LLKF_0562 yfhH yfhI TRUE 0.414 147.000 0.000 NA   NA
 10454905 10454906 LLKF_0562 LLKF_0563 yfhI yfhJ TRUE 0.428 120.000 0.000 NA   NA
 10454906 10454907 LLKF_0563 LLKF_0564 yfhJ yfhK FALSE 0.286 229.000 0.000 NA   NA
 10454908 10454909 LLKF_0565 LLKF_0566 yfhL yfiA FALSE 0.405 157.000 0.000 NA   NA
 10454909 10454910 LLKF_0566 LLKF_0567 yfiA umuC TRUE 0.946 -40.000 0.000 NA   NA
 10454910 10454911 LLKF_0567 LLKF_0568 umuC yfiC FALSE 0.068 537.000 0.000 1.000   NA
 10454911 10454912 LLKF_0568 LLKF_0569 yfiC rmaJ FALSE 0.071 514.000 0.000 1.000   NA
 10454913 10454914 LLKF_0570 LLKF_0571 yfiE yfiG FALSE 0.031 528.000 0.000 1.000 N NA
 10454914 10454915 LLKF_0571 LLKF_0572 yfiG yfiH TRUE 0.634 56.000 0.000 NA   NA
 10454915 10454916 LLKF_0572 LLKF_0573 yfiH prfA TRUE 0.846 18.000 0.000 NA   NA
 10454916 10454917 LLKF_0573 LLKF_0574 prfA yfiI TRUE 0.934 0.000 0.000 NA   NA
 10454917 10454918 LLKF_0574 LLKF_0575 yfiI yfiJ TRUE 0.584 63.000 0.000 NA   NA
 10454918 10454919 LLKF_0575 LLKF_0576 yfiJ hemK FALSE 0.196 106.000 0.000 1.000 N NA
 10454919 10454920 LLKF_0576 LLKF_0577 hemK yfiL TRUE 0.679 34.000 0.000 1.000   NA
 10454920 10454921 LLKF_0577 LLKF_0578 yfiL yfjA TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10454921 10454922 LLKF_0578 LLKF_0579 yfjA glyA FALSE 0.180 230.000 0.015 NA N NA
 10454922 10454923 LLKF_0579 LLKF_0580 glyA yfjB FALSE 0.255 161.000 0.000 NA N NA
 10454923 10454924 LLKF_0580 LLKF_0581 yfjB serC FALSE 0.271 127.000 0.000 NA N NA
 10454924 10454925 LLKF_0581 LLKF_0582 serC serA TRUE 0.992 -3.000 0.238 1.000 Y NA
 10454925 10454926 LLKF_0582 LLKF_0583 serA serB TRUE 0.895 24.000 0.003 1.000 Y NA
 10454928 10454929 LLKF_0585 LLKF_0586 yfjD   FALSE 0.362 105.000 0.000 1.000   NA
 10454930 10454931 LLKF_0587 LLKF_0588 yfjE yfjF FALSE 0.325 149.000 0.000 1.000   NA
 10454932 10454933 LLKF_0589 LLKF_0590 yfjG pepM FALSE 0.072 284.000 0.000 1.000 N NA
 10454933 10454934 LLKF_0590 LLKF_0591 pepM ygaB TRUE 0.965 20.000 0.373 1.000   NA
 10454936 10454937 LLKF_0593 LLKF_0594 ygaD ygaE TRUE 0.765 32.000 0.000 NA   NA
 10454937 10454938 LLKF_0594 LLKF_0595 ygaE ygaF TRUE 0.450 106.000 0.000 NA   NA
 10454938 10454939 LLKF_0595 LLKF_0596 ygaF ptsK TRUE 0.457 104.000 0.000 NA   NA
 10454939 10454940 LLKF_0596 LLKF_0597 ptsK lgt TRUE 0.485 64.000 0.064 1.000 N NA
 10454940 10454941 LLKF_0597 LLKF_0598 lgt ygaI TRUE 0.558 169.000 0.079 NA   NA
 10454941 10454942 LLKF_0598 LLKF_0599 ygaI ygaJ TRUE 0.779 30.000 0.000 NA   NA
 10454942 10454943 LLKF_0599 LLKF_0600 ygaJ gnd TRUE 0.415 133.000 0.000 NA   NA
 10454943 10454944 LLKF_0600 LLKF_0601 gnd   FALSE 0.089 329.000 0.000 NA N NA
 10454944 10454945 LLKF_0601 LLKF_0602     TRUE 0.926 2.000 0.000 NA   NA
 10454945 10454946 LLKF_0602 LLKF_0603     TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 10454946 10454947 LLKF_0603 LLKF_0604     TRUE 0.946 -10.000 0.000 NA   NA
 10454947 10454948 LLKF_0604 LLKF_0605     TRUE 0.945 -7.000 0.000 NA   NA
 10454948 10454949 LLKF_0605 LLKF_0606     TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 10454949 10454950 LLKF_0606 LLKF_0607     TRUE 0.722 39.000 0.000 NA   NA
 10454950 10454951 LLKF_0607 LLKF_0608     TRUE 0.946 -22.000 0.000 NA   NA
 10454951 10454952 LLKF_0608 LLKF_0609     TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 10454952 10454953 LLKF_0609 LLKF_0610     TRUE 0.557 252.000 0.000 0.028   NA
 10454953 10454954 LLKF_0610 LLKF_0611     FALSE 0.276 234.000 0.000 NA   NA
 10454954 10454955 LLKF_0611 LLKF_0612     TRUE 0.934 0.000 0.000 NA   NA
 10454955 10454956 LLKF_0612 LLKF_0613     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10454956 10454957 LLKF_0613 LLKF_0614   repC TRUE 0.513 78.000 0.000 NA   NA
 10454957 10454958 LLKF_0614 LLKF_0615 repC   TRUE 0.946 -13.000 0.000 NA   NA
 10454958 10454959 LLKF_0615 LLKF_0616     TRUE 0.882 13.000 0.000 NA   NA
 10454959 10454960 LLKF_0616 LLKF_0617   kupA FALSE 0.146 289.000 0.000 1.000   NA
 10454960 10454961 LLKF_0617 LLKF_0618 kupA kupB TRUE 0.853 225.000 0.000 0.002 Y NA
 10454961 10454962 LLKF_0618 LLKF_0619 kupB ygbB FALSE 0.111 432.000 0.000 NA   NA
 10454962 10454963 LLKF_0619 LLKF_0620 ygbB miaA FALSE 0.413 139.000 0.000 NA   NA
 10454963 10454964 LLKF_0620 LLKF_0621 miaA ygbD TRUE 0.501 83.000 0.000 NA   NA
 10454964 10454965 LLKF_0621 LLKF_0622 ygbD ygbE FALSE 0.395 170.000 0.000 NA   NA
 10454965 10454966 LLKF_0622 LLKF_t0035 ygbE trnR TRUE 0.472 98.000 0.000 NA   NA
 10454966 10454967 LLKF_t0035 LLKF_0623 trnR ygbF FALSE 0.337 205.000 0.000 NA   NA
 10454967 10454968 LLKF_0623 LLKF_t0036 ygbF trnK FALSE 0.405 157.000 0.000 NA   NA
 10454968 10454969 LLKF_t0036 LLKF_0624 trnK rnz TRUE 0.424 125.000 0.000 NA   NA
 10454969 10454970 LLKF_0624 LLKF_0625 rnz ygcA TRUE 0.960 -7.000 0.074 1.000   NA
 10454970 10454971 LLKF_0625 LLKF_0626 ygcA recJ FALSE 0.337 167.000 0.016 1.000   NA
 10454971 10454972 LLKF_0626 LLKF_0627 recJ apt TRUE 0.437 123.000 0.128 1.000 N NA
 10454972 10454973 LLKF_0627 LLKF_0628 apt rpoE FALSE 0.122 216.000 0.000 1.000 N NA
 10454973 10454974 LLKF_0628 LLKF_0629 rpoE ygcC FALSE 0.413 137.000 0.000 NA   NA
 10454974 10454975 LLKF_0629 LLKF_0630 ygcC greA TRUE 0.731 63.000 0.079 NA   NA
 10454975 10454976 LLKF_0630 LLKF_0631 greA ctsR TRUE 0.645 177.000 0.000 NA Y NA
 10454976 10454977 LLKF_0631 LLKF_0632 ctsR clpC TRUE 0.974 -10.000 0.188 NA N NA
 10454977 10454978 LLKF_0632 LLKF_0633 clpC ygdA FALSE 0.264 135.000 0.000 NA N NA
 10454978 10454979 LLKF_0633 LLKF_0634 ygdA enoB FALSE 0.233 186.000 0.000 NA N NA
 10454980 10454981 LLKF_0635 LLKF_0636 ygfA ygfB TRUE 0.890 3.000 0.000 1.000   NA
 10454981 10454982 LLKF_0636 LLKF_0637 ygfB ygfC TRUE 0.848 12.000 0.000 1.000   NA
 10454982 10454983 LLKF_0637 LLKF_0638 ygfC fadD FALSE 0.290 186.000 0.000 1.000   NA
 10454984 10454985 LLKF_0639 LLKF_0640 corA pfl FALSE 0.087 261.000 0.000 1.000 N NA
 10454985 10454986 LLKF_0640 LLKF_0641 pfl coaE FALSE 0.173 138.000 0.000 1.000 N NA
 10454986 10454987 LLKF_0641 LLKF_0642 coaE pmrA TRUE 0.763 3.000 0.007 1.000 N NA
 10454987 10454988 LLKF_0642 LLKF_0643 pmrA rpmG TRUE 0.830 -3.000 0.012 1.000 N NA
 10454988 10454989 LLKF_0643 LLKF_0644 rpmG ftsW FALSE 0.050 341.000 0.000 1.000 N NA
 10454989 10454990 LLKF_0644 LLKF_0645 ftsW pycA FALSE 0.273 106.000 0.035 1.000 N NA
 10454990 10454991 LLKF_0645 LLKF_0646 pycA gltA TRUE 0.614 124.000 0.000 1.000 Y NA
 10454991 10454992 LLKF_0646 LLKF_0647 gltA citB TRUE 0.972 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10454992 10454993 LLKF_0647 LLKF_0648 citB icd TRUE 0.905 21.000 0.004 1.000 Y NA
 10454995 10454996 LLKF_0650 LLKF_0651 yghB yghC FALSE 0.403 159.000 0.000 NA   NA
 10454999 10455000 LLKF_0654 LLKF_0655 brnQ ygiG FALSE 0.204 237.000 0.000 1.000   NA
 10455000 10455001 LLKF_0655 LLKF_0656 ygiG ygiH TRUE 0.934 0.000 0.000 NA   NA
 10455002 10455003 LLKF_0657 LLKF_0658     TRUE 0.867 45.000 0.000 NA Y NA
 10455003 10455004 LLKF_0658 LLKF_0659   celA TRUE 0.641 55.000 0.000 NA   NA
 10455004 10455005 LLKF_0659 LLKF_0660 celA celA FALSE 0.377 185.000 0.000 NA   NA
 10455006 10455007 LLKF_0661 LLKF_0662 scrR scrB TRUE 0.990 -3.000 0.571 1.000 N NA
 10455008 10455009 LLKF_0663 LLKF_0664 scrA scrK TRUE 0.963 13.000 0.062 1.000 Y NA
 10455010 10455011 LLKF_0665 LLKF_0666 ypiB   FALSE 0.382 48.000 0.000 1.000 N NA
 10455012 10455013 LLKF_0667 LLKF_0668 rpiA   TRUE 0.930 -27.000 0.015 1.000   NA
 10455015 10455016 LLKF_0670 LLKF_0671   bglG FALSE 0.092 568.000 0.000 NA   NA
 10455016 10455017 LLKF_0671 LLKF_0672 bglG bglP TRUE 0.633 40.000 0.000 1.000   NA
 10455017 10455018 LLKF_0672 LLKF_0673 bglP pbg TRUE 0.726 69.000 0.000 1.000 Y NA
 10455018 10455019 LLKF_0673 LLKF_0674 pbg bglG FALSE 0.074 469.000 0.000 1.000   NA
 10455019 10455020 LLKF_0674 LLKF_0675 bglG bglP TRUE 0.483 64.000 0.000 1.000   NA
 10455020 10455021 LLKF_0675 LLKF_0676 bglP pbg TRUE 0.938 14.000 0.000 1.000 Y NA
 10455022 10455023 LLKF_0677 LLKF_0678 tnpB tnpA TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.057 Y NA
 10455025 10455026 LLKF_0680 LLKF_0681     TRUE 0.926 2.000 0.000 NA   NA
 10455026 10455027 LLKF_0681 LLKF_0682     TRUE 0.414 147.000 0.000 NA   NA
 10455028 10455029 LLKF_0683 LLKF_0684     TRUE 0.838 19.000 0.000 NA   NA
 10455029 10455030 LLKF_0684 LLKF_0685     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455030 10455031 LLKF_0685 LLKF_0686   binR FALSE 0.176 313.000 0.000 NA   NA
 10455031 10455032 LLKF_0686 LLKF_0687 binR   TRUE 0.749 35.000 0.000 NA   NA
 10455032 10455033 LLKF_0687 LLKF_0688     FALSE 0.110 437.000 0.000 NA   NA
 10455033 10455034 LLKF_0688 LLKF_0689   hsdR FALSE 0.396 169.000 0.000 NA   NA
 10455034 10455035 LLKF_0689 LLKF_0690 hsdR hsdS TRUE 0.944 -6.000 0.000 NA   NA
 10455035 10455036 LLKF_0690 LLKF_0691 hsdS   TRUE 0.544 70.000 0.000 NA   NA
 10455036 10455037 LLKF_0691 LLKF_0692     FALSE 0.413 140.000 0.000 NA   NA
 10455037 10455038 LLKF_0692 LLKF_0693     TRUE 0.859 16.000 0.000 NA   NA
 10455038 10455039 LLKF_0693 LLKF_0694     TRUE 0.979 32.000 0.667 NA   NA
 10455039 10455040 LLKF_0694 LLKF_0695     FALSE 0.113 426.000 0.000 NA   NA
 10455040 10455041 LLKF_0695 LLKF_0696     TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 10455043 10455044 LLKF_0698 LLKF_0699     TRUE 0.772 31.000 0.000 NA   NA
 10455044 10455045 LLKF_0699 LLKF_0700     TRUE 0.655 52.000 0.000 NA   NA
 10455045 10455046 LLKF_0700 LLKF_0701     TRUE 0.414 147.000 0.000 NA   NA
 10455047 10455048 LLKF_0702 LLKF_0703 tnpB tnpA TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.057 Y NA
 10455049 10455050 LLKF_0704 LLKF_0705     FALSE 0.413 139.000 0.000 NA   NA
 10455050 10455051 LLKF_0705 LLKF_0706   ygiI TRUE 0.414 134.000 0.000 NA   NA
 10455051 10455052 LLKF_0706 LLKF_0707 ygiI ygiJ TRUE 0.578 38.000 0.000 NA N NA
 10455052 10455053 LLKF_0707 LLKF_0708 ygiJ ygiK TRUE 0.839 -25.000 0.000 1.000 N NA
 10455053 10455054 LLKF_0708 LLKF_0709 ygiK ksgA FALSE 0.408 111.000 0.093 1.000 N NA
 10455054 10455055 LLKF_0709 LLKF_0710 ksgA pepP FALSE 0.205 101.000 0.000 1.000 N NA
 10455055 10455056 LLKF_0710 LLKF_0711 pepP efp TRUE 0.491 132.000 0.160 1.000 N NA
 10455056 10455057 LLKF_0711 LLKF_0712 efp ygjB TRUE 0.535 96.000 0.031 NA   NA
 10455057 10455058 LLKF_0712 LLKF_0713 ygjB nusB TRUE 0.988 -7.000 0.265 NA   NA
 10455058 10455059 LLKF_0713 LLKF_0714 nusB ygjD FALSE 0.122 216.000 0.000 1.000 N NA
 10455059 10455060 LLKF_0714 LLKF_0715 ygjD glgC TRUE 0.652 101.000 0.000 1.000 Y NA
 10455060 10455061 LLKF_0715 LLKF_0716 glgC glgD TRUE 1.000 -10.000 0.810 0.001 Y NA
 10455061 10455062 LLKF_0716 LLKF_0717 glgD glgA TRUE 0.930 92.000 0.395 1.000 Y NA
 10455062 10455063 LLKF_0717 LLKF_0718 glgA glgP TRUE 0.854 89.000 0.171 1.000 Y NA
 10455063 10455064 LLKF_0718 LLKF_0719 glgP apu TRUE 0.957 90.000 0.186 0.031 Y NA
 10455064 10455065 LLKF_0719 LLKF_0720 apu dtpT FALSE 0.110 226.000 0.000 1.000 N NA
 10455065 10455066 LLKF_0720 LLKF_0721 dtpT cydA FALSE 0.146 715.000 0.000 0.082 N NA
 10455066 10455067 LLKF_0721 LLKF_0722 cydA cydB TRUE 1.000 0.000 0.950 0.022 Y NA
 10455067 10455068 LLKF_0722 LLKF_0723 cydB cydC TRUE 0.430 307.000 0.061 1.000 Y NA
 10455068 10455069 LLKF_0723 LLKF_0724 cydC cydD TRUE 0.997 0.000 0.168 0.009 Y NA
 10455069 10455070 LLKF_0724 LLKF_0725 cydD rmaB FALSE 0.067 294.000 0.000 1.000 N NA
 10455070 10455071 LLKF_0725 LLKF_0726 rmaB hemG TRUE 0.669 26.000 0.000 NA N NA
 10455071 10455072 LLKF_0726 LLKF_0727 hemG yhbF TRUE 0.664 27.000 0.000 NA N NA
 10455072 10455073 LLKF_0727 LLKF_0728 yhbF lmrA TRUE 0.425 85.000 0.071 1.000 N NA
 10455074 10455075 LLKF_0729 LLKF_0730 yhbH yhbI TRUE 0.536 71.000 0.000 NA   NA
 10455075 10455076 LLKF_0730 LLKF_0731 yhbI yhcA FALSE 0.256 207.000 0.000 1.000   NA
 10455076 10455077 LLKF_0731 LLKF_0732 yhcA yhcC TRUE 0.448 107.000 0.000 NA   NA
 10455080 10455081 LLKF_0735 LLKF_0736 metE yhcG FALSE 0.331 130.000 0.000 1.000   NA
 10455081 10455082 LLKF_0736 LLKF_0737 yhcG yhcH TRUE 0.946 -12.000 0.000 NA   NA
 10455082 10455083 LLKF_0737 LLKF_0738 yhcH yhcH TRUE 0.898 11.000 0.000 NA   NA
 10455083 10455084 LLKF_0738 LLKF_0739 yhcH yhcI TRUE 0.853 17.000 0.000 NA   NA
 10455088 10455089 LLKF_0743 LLKF_0744     TRUE 0.495 88.000 0.000 NA   NA
 10455089 10455090 LLKF_0744 LLKF_0745     FALSE 0.163 327.000 0.000 NA   NA
 10455091 10455092 LLKF_0746 LLKF_0747 yhdA menC TRUE 0.895 -3.000 0.013 NA N NA
 10455092 10455093 LLKF_0747 LLKF_0748 menC menE TRUE 0.869 -3.000 0.029 1.000 N NA
 10455093 10455094 LLKF_0748 LLKF_0749 menE menB TRUE 0.886 127.000 0.193 0.002 N NA
 10455094 10455095 LLKF_0749 LLKF_0750 menB menX FALSE 0.326 386.000 0.280 NA N NA
 10455095 10455096 LLKF_0750 LLKF_0751 menX menD TRUE 0.987 -10.000 0.355 NA N NA
 10455096 10455097 LLKF_0751 LLKF_0752 menD menF TRUE 0.905 53.000 0.142 1.000 Y NA
 10455098 10455099 LLKF_0753 LLKF_0754 yhdC yheA TRUE 0.991 7.000 0.342 0.061 N NA
 10455099 10455100 LLKF_0754 LLKF_0755 yheA yheB TRUE 0.779 19.000 0.000 1.000   NA
 10455102 10455103 LLKF_0757 LLKF_0758 yheD yheE TRUE 0.493 90.000 0.000 NA   NA
 10455103 10455104 LLKF_0758 LLKF_0759 yheE yheF TRUE 0.682 61.000 0.043 NA   NA
 10455105 10455106 LLKF_0760 LLKF_0761 thrA yheG FALSE 0.212 230.000 0.000 1.000   NA
 10455106 10455107 LLKF_0761 LLKF_0762 yheG rmaA TRUE 0.923 -10.000 0.000 1.000   NA
 10455108 10455109 LLKF_0763 LLKF_0764 yhfA yhfB FALSE 0.394 94.000 0.000 1.000   NA
 10455109 10455110 LLKF_0764 LLKF_0765 yhfB rplI TRUE 0.941 -3.000 0.119 1.000 N NA
 10455110 10455111 LLKF_0765 LLKF_0766 rplI dnaC TRUE 0.907 6.000 0.100 1.000 N NA
 10455111 10455112 LLKF_0766 LLKF_0767 dnaC yhfC TRUE 0.472 195.000 0.053 NA   NA
 10455112 10455113 LLKF_0767 LLKF_0768 yhfC yhfD TRUE 0.550 69.000 0.000 NA   NA
 10455113 10455114 LLKF_0768 LLKF_0769 yhfD trmB TRUE 0.682 121.000 0.154 NA   NA
 10455114 10455115 LLKF_0769 LLKF_0770 trmB nrdR TRUE 0.429 119.000 0.000 NA   NA
 10455115 10455116 LLKF_0770 LLKF_0771 nrdR dnaB FALSE 0.163 387.000 0.109 NA N NA
 10455116 10455117 LLKF_0771 LLKF_0772 dnaB dnaI TRUE 0.999 0.000 0.817 NA Y NA
 10455117 10455118 LLKF_0772 LLKF_0773 dnaI yhgA TRUE 0.905 -7.000 0.048 1.000 N NA
 10455118 10455119 LLKF_0773 LLKF_0774 yhgA yhgB TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455119 10455120 LLKF_0774 LLKF_0775 yhgB engA TRUE 0.424 107.000 0.002 NA   NA
 10455120 10455121 LLKF_0775 LLKF_0776 engA yhgC FALSE 0.359 106.000 0.000 1.000   NA
 10455121 10455122 LLKF_0776 LLKF_0777 yhgC yhgD FALSE 0.107 448.000 0.000 NA   NA
 10455122 10455123 LLKF_0777 LLKF_0778 yhgD yhgE TRUE 0.416 132.000 0.000 NA   NA
 10455123 10455124 LLKF_0778 LLKF_0779 yhgE srtC TRUE 0.592 62.000 0.000 NA   NA
 10455124 10455125 LLKF_0779 LLKF_0780 srtC yhhB TRUE 0.946 -13.000 0.000 NA   NA
 10455126 10455127 LLKF_0781 LLKF_0782 lrgB lrgA TRUE 0.900 19.000 0.121 1.000   NA
 10455128 10455129 LLKF_0783 LLKF_0784 yhhE nusA TRUE 0.923 165.000 0.759 NA   NA
 10455129 10455130 LLKF_0784 LLKF_0785 nusA yhhG TRUE 0.904 166.000 0.323 NA Y NA
 10455130 10455131 LLKF_0785 LLKF_0786 yhhG ylxQ TRUE 0.983 3.000 0.408 NA N NA
 10455131 10455132 LLKF_0786 LLKF_0787 ylxQ infB TRUE 0.978 21.000 0.223 NA Y NA
 10455132 10455133 LLKF_0787 LLKF_0788 infB rbfA TRUE 0.805 316.000 0.530 1.000 Y NA
 10455133 10455134 LLKF_0788 LLKF_0789 rbfA manA FALSE 0.157 179.000 0.000 1.000 N NA
 10455134 10455135 LLKF_0789 LLKF_0790 manA rmaG FALSE 0.037 419.000 0.000 1.000 N NA
 10455135 10455136 LLKF_0790 LLKF_0791 rmaG fabH TRUE 0.912 0.000 0.070 1.000 N NA
 10455136 10455137 LLKF_0791 LLKF_0792 fabH acpP TRUE 0.832 167.000 0.065 0.007   NA
 10455137 10455138 LLKF_0792 LLKF_0793 acpP fabD TRUE 0.560 280.000 0.010 0.007   NA
 10455138 10455139 LLKF_0793 LLKF_0794 fabD fabG TRUE 0.986 86.000 0.432 0.007 Y NA
 10455139 10455140 LLKF_0794 LLKF_0795 fabG fabF TRUE 0.890 41.000 0.056 1.000 Y NA
 10455140 10455141 LLKF_0795 LLKF_0796 fabF accB TRUE 0.974 7.000 0.074 1.000 Y NA
 10455141 10455142 LLKF_0796 LLKF_0797 accB fabZ TRUE 0.917 127.000 0.047 0.007 Y NA
 10455142 10455143 LLKF_0797 LLKF_0798 fabZ accC FALSE 0.298 394.000 0.045 1.000 Y NA
 10455143 10455144 LLKF_0798 LLKF_0799 accC accD TRUE 0.799 86.000 0.090 1.000 Y NA
 10455144 10455145 LLKF_0799 LLKF_0800 accD accA TRUE 0.999 -7.000 0.234 0.002 Y NA
 10455145 10455146 LLKF_0800 LLKF_0801 accA cblB FALSE 0.176 131.000 0.000 1.000 N NA
 10455146 10455147 LLKF_0801 LLKF_0802 cblB cysK TRUE 0.832 215.000 0.000 0.012 Y NA
 10455147 10455148 LLKF_0802 LLKF_0803 cysK yhjA FALSE 0.286 229.000 0.000 NA   NA
 10455148 10455149 LLKF_0803 LLKF_0804 yhjA yhjB TRUE 0.628 57.000 0.000 NA   NA
 10455149 10455150 LLKF_0804 LLKF_0805 yhjB yhjC TRUE 0.962 11.000 0.000 NA Y NA
 10455150 10455151 LLKF_0805 LLKF_0806 yhjC noxC TRUE 0.980 -3.000 0.163 NA   NA
 10455151 10455152 LLKF_0806 LLKF_0807 noxC yhjE TRUE 0.795 27.000 0.000 NA   NA
 10455152 10455153 LLKF_0807 LLKF_0808 yhjE yhjF TRUE 0.518 76.000 0.000 NA   NA
 10455154 10455155 LLKF_0809 LLKF_0810 rdrA yhjG FALSE 0.218 95.000 0.000 1.000 N NA
 10455155 10455156 LLKF_0810 LLKF_0811 yhjG exoA FALSE 0.230 83.000 0.000 1.000 N NA
 10455157 10455158 LLKF_0812 LLKF_0813 metS yiaA FALSE 0.099 518.000 0.000 NA   NA
 10455158 10455159 LLKF_0813 LLKF_0814 yiaA yiaB TRUE 0.989 17.000 0.710 NA   NA
 10455159 10455160 LLKF_0814 LLKF_0815 yiaB queT FALSE 0.385 341.000 0.200 NA   NA
 10455160 10455161 LLKF_0815 LLKF_0816 queT yiaD TRUE 0.457 104.000 0.000 NA   NA
 10455161 10455162 LLKF_0816 LLKF_0817 yiaD argC FALSE 0.413 140.000 0.000 NA   NA
 10455162 10455163 LLKF_0817 LLKF_0818 argC argJ TRUE 0.998 12.000 0.303 0.003 Y NA
 10455163 10455164 LLKF_0818 LLKF_0819 argJ argD TRUE 0.942 13.000 0.000 1.000 Y NA
 10455164 10455165 LLKF_0819 LLKF_0820 argD argB TRUE 0.971 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 10455165 10455166 LLKF_0820 LLKF_0821 argB argF TRUE 0.891 28.000 0.000 1.000 Y NA
 10455166 10455167 LLKF_0821 LLKF_0822 argF rnc FALSE 0.162 173.000 0.000 1.000 N NA
 10455167 10455168 LLKF_0822 LLKF_0823 rnc smc TRUE 0.946 -10.000 0.120 1.000 N NA
 10455168 10455169 LLKF_0823 LLKF_0824 smc yibC FALSE 0.099 242.000 0.000 1.000 N NA
 10455169 10455170 LLKF_0824 LLKF_0825 yibC yibD TRUE 0.491 91.000 0.000 NA   NA
 10455170 10455171 LLKF_0825 LLKF_0826 yibD yibE TRUE 0.791 28.000 0.000 NA   NA
 10455171 10455172 LLKF_0826 LLKF_0827 yibE yibF TRUE 0.998 -3.000 0.957 NA   NA
 10455174 10455175 LLKF_0829 LLKF_0830 yicB yicC TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 10455175 10455176 LLKF_0830 LLKF_0831 yicC ftsY TRUE 0.592 62.000 0.000 NA   NA
 10455176 10455177 LLKF_0831 LLKF_0832 ftsY prsA FALSE 0.158 177.000 0.000 1.000 N NA
 10455177 10455178 LLKF_0832 LLKF_0833 prsA yicE TRUE 0.432 73.000 0.000 1.000   NA
 10455178 10455179 LLKF_0833 LLKF_0834 yicE leuS TRUE 0.442 71.000 0.000 1.000   NA
 10455179 10455180 LLKF_0834 LLKF_0835 leuS yidA FALSE 0.084 265.000 0.000 1.000 N NA
 10455180 10455181 LLKF_0835 LLKF_0836 yidA yidB FALSE 0.039 414.000 0.000 1.000 N NA
 10455181 10455182 LLKF_0836 LLKF_0837 yidB pbg TRUE 0.911 85.000 0.294 1.000 Y NA
 10455182 10455183 LLKF_0837 LLKF_0838 pbg yidD FALSE 0.190 252.000 0.000 1.000   NA
 10455183 10455184 LLKF_0838 LLKF_0839 yidD yidE FALSE 0.403 160.000 0.000 NA   NA
 10455184 10455185 LLKF_0839 LLKF_0840 yidE noxA TRUE 0.418 131.000 0.000 NA   NA
 10455185 10455186 LLKF_0840 LLKF_0841 noxA noxB TRUE 0.907 144.000 0.000 0.002 Y NA
 10455186 10455187 LLKF_0841 LLKF_0842 noxB sdaB FALSE 0.187 114.000 0.000 1.000 N NA
 10455187 10455188 LLKF_0842 LLKF_0843 sdaB sdaA TRUE 0.996 20.000 0.221 0.001 Y NA
 10455188 10455189 LLKF_0843 LLKF_0844 sdaA copR FALSE 0.181 122.000 0.000 1.000 N NA
 10455189 10455190 LLKF_0844 LLKF_0845 copR copZ TRUE 0.645 16.000 0.000 1.000 N NA
 10455190 10455191 LLKF_0845 LLKF_0846 copZ copA TRUE 0.901 186.000 0.000 0.001 Y NA
 10455192 10455193 LLKF_0847 LLKF_0848 yieH yifA TRUE 0.536 71.000 0.000 NA   NA
 10455194 10455195 LLKF_0849 LLKF_0850 trmU rpsA TRUE 0.511 211.000 0.000 1.000 Y NA
 10455195 10455196 LLKF_0850 LLKF_0851 rpsA udp FALSE 0.172 151.000 0.000 1.000 N NA
 10455196 10455197 LLKF_0851 LLKF_0852 udp pnuC FALSE 0.260 129.000 0.039 1.000 N NA
 10455197 10455198 LLKF_0852 LLKF_0853 pnuC uvrC FALSE 0.218 95.000 0.000 1.000 N NA
 10455198 10455199 LLKF_0853 LLKF_0854 uvrC mutY TRUE 0.590 164.000 0.000 1.000 Y NA
 10455199 10455200 LLKF_0854 LLKF_0855 mutY pepV FALSE 0.256 71.000 0.000 1.000 N NA
 10455200 10455201 LLKF_0855 LLKF_0856 pepV acpS FALSE 0.202 103.000 0.000 1.000 N NA
 10455201 10455202 LLKF_0856 LLKF_0857 acpS alr TRUE 0.666 45.000 0.093 1.000 N NA
 10455202 10455203 LLKF_0857 LLKF_0858 alr yigC FALSE 0.167 161.000 0.000 1.000 N NA
 10455203 10455204 LLKF_0858 LLKF_0859 yigC gshR TRUE 0.677 138.000 0.000 0.008 N NA
 10455204 10455205 LLKF_0859 LLKF_0860 gshR choQ FALSE 0.179 126.000 0.000 1.000 N NA
 10455205 10455206 LLKF_0860 LLKF_0861 choQ choS TRUE 0.827 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10455206 10455207 LLKF_0861 LLKF_0862 choS ycdJ FALSE 0.241 261.000 0.000 NA   NA
 10455207 10455208 LLKF_0862 LLKF_0863 ycdJ   TRUE 0.926 2.000 0.000 NA   NA
 10455208 10455209 LLKF_0863 LLKF_0864     TRUE 0.814 23.000 0.000 NA   NA
 10455209 10455210 LLKF_0864 LLKF_0865     TRUE 0.898 11.000 0.000 NA   NA
 10455210 10455211 LLKF_0865 LLKF_0866     TRUE 0.814 23.000 0.000 NA   NA
 10455212 10455213 LLKF_0867 LLKF_0868 tnpB tnpA TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.055 Y NA
 10455216 10455217 LLKF_0871 LLKF_0872 yihD folD FALSE 0.406 156.000 0.000 NA   NA
 10455217 10455218 LLKF_0872 LLKF_0873 folD xseA FALSE 0.261 167.000 0.045 1.000 N NA
 10455218 10455219 LLKF_0873 LLKF_0874 xseA xseB TRUE 0.999 0.000 0.412 0.001 Y NA
 10455219 10455220 LLKF_0874 LLKF_0875 xseB glxK FALSE 0.412 150.000 0.000 NA   NA
 10455220 10455221 LLKF_0875 LLKF_0876 glxK glxK TRUE 0.909 8.000 0.000 NA   NA
 10455221 10455222 LLKF_0876 LLKF_0877 glxK ispA TRUE 0.503 82.000 0.000 NA   NA
 10455222 10455223 LLKF_0877 LLKF_0878 ispA rrmJ FALSE 0.400 79.000 0.058 1.000 N NA
 10455223 10455224 LLKF_0878 LLKF_0879 rrmJ ahrC TRUE 0.900 -3.000 0.048 1.000 N NA
 10455224 10455225 LLKF_0879 LLKF_0880 ahrC recN FALSE 0.250 131.000 0.037 1.000 N NA
 10455225 10455226 LLKF_0880 LLKF_0881 recN yiiD TRUE 0.491 91.000 0.000 NA   NA
 10455226 10455227 LLKF_0881 LLKF_0882 yiiD yiiE FALSE 0.132 377.000 0.000 NA   NA
 10455227 10455228 LLKF_0882 LLKF_0883 yiiE yiiF TRUE 0.472 98.000 0.000 NA   NA
 10455228 10455229 LLKF_0883 LLKF_0884 yiiF yiiG TRUE 0.928 24.000 0.000 0.060   NA
 10455229 10455230 LLKF_0884 LLKF_0885 yiiG mraW FALSE 0.232 220.000 0.000 1.000   NA
 10455230 10455231 LLKF_0885 LLKF_0886 mraW ftsL TRUE 0.431 158.000 0.077 NA N NA
 10455231 10455232 LLKF_0886 LLKF_0887 ftsL pbpX TRUE 0.989 -3.000 0.456 NA N NA
 10455232 10455233 LLKF_0887 LLKF_0888 pbpX mraY TRUE 0.786 65.000 0.038 1.000 Y NA
 10455233 10455234 LLKF_0888 LLKF_0889 mraY yijB FALSE 0.350 199.000 0.000 NA   NA
 10455234 10455235 LLKF_0889 LLKF_0890 yijB yijC TRUE 0.415 133.000 0.000 NA   NA
 10455235 10455236 LLKF_0890 LLKF_0891 yijC yijD TRUE 0.605 105.000 0.222 1.000 N NA
 10455236 10455237 LLKF_0891 LLKF_0892 yijD mleR FALSE 0.168 158.000 0.000 1.000 N NA
 10455237 10455238 LLKF_0892 LLKF_0893 mleR yijE FALSE 0.203 240.000 0.000 1.000   NA
 10455238 10455239 LLKF_0893 LLKF_0894 yijE rplS FALSE 0.326 141.000 0.000 1.000   NA
 10455239 10455240 LLKF_0894 LLKF_0895 rplS yijF FALSE 0.094 566.000 0.000 NA   NA
 10455240 10455241 LLKF_0895 LLKF_0896 yijF yijG TRUE 0.945 -7.000 0.000 NA   NA
 10455241 10455242 LLKF_0896 LLKF_0897 yijG yijH FALSE 0.293 226.000 0.000 NA   NA
 10455242 10455243 LLKF_0897 LLKF_0898 yijH pnuC FALSE 0.345 202.000 0.000 NA   NA
 10455245 10455246 LLKF_0900 LLKF_0901 yjaB hslB FALSE 0.181 122.000 0.000 1.000 N NA
 10455248 10455249 LLKF_0903 LLKF_0904 yjaE yjaF FALSE 0.374 186.000 0.000 NA   NA
 10455250 10455251 LLKF_0905 LLKF_0906 feuD   TRUE 0.830 20.000 0.000 NA   NA
 10455251 10455252 LLKF_0906 LLKF_0907   feuC TRUE 0.946 -16.000 0.000 NA   NA
 10455252 10455253 LLKF_0907 LLKF_0908 feuC feuB TRUE 0.991 1.000 0.000 0.034 Y NA
 10455253 10455254 LLKF_0908 LLKF_0909 feuB feuA TRUE 0.970 19.000 0.182 1.000 Y NA
 10455255 10455256 LLKF_0910 LLKF_0911     FALSE 0.369 188.000 0.000 NA   NA
 10455256 10455257 LLKF_0911 LLKF_0912     FALSE 0.159 330.000 0.000 NA   NA
 10455257 10455258 LLKF_0912 LLKF_0913   ftsW FALSE 0.054 1813.000 0.000 1.000   NA
 10455258 10455259 LLKF_0913 LLKF_0914 ftsW yjaJ TRUE 0.633 31.000 0.000 NA N NA
 10455259 10455260 LLKF_0914 LLKF_0915 yjaJ rpsN FALSE 0.313 98.000 0.000 NA N NA
 10455260 10455261 LLKF_0915 LLKF_0916 rpsN yjbB FALSE 0.399 166.000 0.000 NA   NA
 10455261 10455262 LLKF_0916 LLKF_0917 yjbB tcsK TRUE 0.996 -3.000 0.679 NA   NA
 10455262 10455263 LLKF_0917 LLKF_0918 tcsK tcsR TRUE 0.999 28.000 0.853 0.008 Y NA
 10455263 10455264 LLKF_0918 LLKF_0919 tcsR yjbC TRUE 0.727 71.000 0.164 1.000   NA
 10455264 10455265 LLKF_0919 LLKF_0920 yjbC ppiB FALSE 0.368 103.000 0.000 1.000   NA
 10455265 10455266 LLKF_0920 LLKF_0921 ppiB yjbE TRUE 0.923 2.000 0.110 1.000 N NA
 10455266 10455267 LLKF_0921 LLKF_0922 yjbE yjbF TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455267 10455268 LLKF_0922 LLKF_0923 yjbF rodA FALSE 0.302 222.000 0.000 NA   NA
 10455268 10455269 LLKF_0923 LLKF_0924 rodA butB FALSE 0.110 226.000 0.000 1.000 N NA
 10455269 10455270 LLKF_0924 LLKF_0925 butB butA TRUE 0.943 26.000 0.000 0.001 N NA
 10455270 10455271 LLKF_0925 LLKF_0926 butA   FALSE 0.220 274.000 0.000 NA   NA
 10455271 10455272 LLKF_0926 LLKF_0927   yjcA TRUE 0.496 86.000 0.000 NA   NA
 10455272 10455273 LLKF_0927 LLKF_0928 yjcA mleS FALSE 0.082 417.000 0.000 1.000   NA
 10455273 10455274 LLKF_0928 LLKF_0929 mleS mleP TRUE 0.934 15.000 0.000 1.000 Y NA
 10455274 10455275 LLKF_0929 LLKF_0930 mleP yjcD FALSE 0.066 296.000 0.000 1.000 N NA
 10455275 10455276 LLKF_0930 LLKF_0931 yjcD yjcE TRUE 0.504 81.000 0.000 NA   NA
 10455276 10455277 LLKF_0931 LLKF_0932 yjcE yjcF TRUE 0.648 54.000 0.000 NA   NA
 10455277 10455278 LLKF_0932 LLKF_0933 yjcF gyrB FALSE 0.332 153.000 0.013 1.000   NA
 10455278 10455279 LLKF_0933 LLKF_0934 gyrB   TRUE 0.453 105.000 0.000 NA   NA
 10455279 10455280 LLKF_0934 LLKF_0935   yjdA FALSE 0.310 218.000 0.000 NA   NA
 10455280 10455281 LLKF_0935 LLKF_0936 yjdA yjdB TRUE 0.415 133.000 0.000 NA   NA
 10455281 10455282 LLKF_0936 LLKF_0937 yjdB yjdC TRUE 0.413 148.000 0.000 NA   NA
 10455282 10455283 LLKF_0937 LLKF_0938 yjdC yjdE TRUE 0.837 -7.000 0.000 1.000 N NA
 10455283 10455284 LLKF_0938 LLKF_0939 yjdE yjdF TRUE 0.993 0.000 0.500 NA   NA
 10455284 10455285 LLKF_0939 LLKF_0940 yjdF tagL FALSE 0.159 330.000 0.000 NA   NA
 10455285 10455286 LLKF_0940 LLKF_0941 tagL tagH TRUE 0.829 57.000 0.000 NA Y NA
 10455286 10455287 LLKF_0941 LLKF_0942 tagH tagG TRUE 0.998 9.000 0.808 NA Y NA
 10455287 10455288 LLKF_0942 LLKF_0943 tagG   TRUE 0.882 13.000 0.000 NA   NA
 10455288 10455289 LLKF_0943 LLKF_0944     TRUE 0.814 23.000 0.000 NA   NA
 10455289 10455290 LLKF_0944 LLKF_0945     TRUE 0.946 -16.000 0.000 NA   NA
 10455290 10455291 LLKF_0945 LLKF_0946     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455291 10455292 LLKF_0946 LLKF_0947   ggaB TRUE 0.765 32.000 0.000 NA   NA
 10455292 10455293 LLKF_0947 LLKF_0948 ggaB   TRUE 0.814 23.000 0.000 NA   NA
 10455293 10455294 LLKF_0948 LLKF_0949   glf TRUE 0.846 18.000 0.000 NA   NA
 10455294 10455295 LLKF_0949 LLKF_0950 glf   TRUE 0.837 -7.000 0.000 1.000 N NA
 10455295 10455296 LLKF_0950 LLKF_0951     TRUE 0.906 0.000 0.000 1.000   NA
 10455296 10455297 LLKF_0951 LLKF_0952     TRUE 0.453 105.000 0.000 NA   NA
 10455297 10455298 LLKF_0952 LLKF_0953   tagD TRUE 0.655 52.000 0.000 NA   NA
 10455298 10455299 LLKF_0953 LLKF_0954 tagD yjfB TRUE 0.735 37.000 0.000 NA   NA
 10455299 10455300 LLKF_0954 LLKF_0955 yjfB tagF TRUE 0.814 23.000 0.000 NA   NA
 10455300 10455301 LLKF_0955 LLKF_0956 tagF tagB TRUE 1.000 -10.000 0.500 0.001 Y NA
 10455301 10455302 LLKF_0956 LLKF_0957 tagB yjfE TRUE 0.705 21.000 0.000 NA N NA
 10455302 10455303 LLKF_0957 LLKF_0958 yjfE deoB FALSE 0.230 188.000 0.000 NA N NA
 10455303 10455304 LLKF_0958 LLKF_0959 deoB yjfG TRUE 0.634 56.000 0.000 NA   NA
 10455304 10455305 LLKF_0959 LLKF_0960 yjfG deoD TRUE 0.536 71.000 0.000 NA   NA
 10455305 10455306 LLKF_0960 LLKF_0961 deoD yjfI FALSE 0.413 140.000 0.000 NA   NA
 10455306 10455307 LLKF_0961 LLKF_0962 yjfI yjfJ TRUE 0.500 84.000 0.000 NA   NA
 10455307 10455308 LLKF_0962 LLKF_0963 yjfJ fhs FALSE 0.406 156.000 0.000 NA   NA
 10455308 10455309 LLKF_0963 LLKF_0964 fhs yjgB FALSE 0.290 109.000 0.000 NA N NA
 10455309 10455310 LLKF_0964 LLKF_0965 yjgB yjgC FALSE 0.264 138.000 0.000 NA N NA
 10455310 10455311 LLKF_0965 LLKF_0966 yjgC yjgD TRUE 0.714 268.000 0.000 0.034 Y NA
 10455311 10455312 LLKF_0966 LLKF_0967 yjgD yjgE TRUE 0.946 12.000 0.000 1.000 Y NA
 10455312 10455313 LLKF_0967 LLKF_0968 yjgE   TRUE 0.989 2.000 0.364 NA   NA
 10455313 10455314 LLKF_0968 LLKF_0969   trxB TRUE 0.562 195.000 0.117 NA   NA
 10455314 10455315 LLKF_0969 LLKF_0970 trxB secG FALSE 0.174 142.000 0.000 1.000 N NA
 10455315 10455316 LLKF_0970 LLKF_0971 secG rnr FALSE 0.196 250.000 0.064 1.000 N NA
 10455316 10455317 LLKF_0971 LLKF_0972 rnr yjgF TRUE 0.621 18.000 0.000 1.000 N NA
 10455317 10455318 LLKF_0972 LLKF_0973 yjgF yjhA TRUE 0.506 80.000 0.000 NA   NA
 10455320 10455321 LLKF_0975 LLKF_0976 yjhC yjhD TRUE 0.900 117.000 0.569 NA   NA
 10455321 10455322 LLKF_0976 LLKF_0977 yjhD yjhE TRUE 0.467 100.000 0.000 NA   NA
 10455322 10455323 LLKF_0977 LLKF_0978 yjhE yjhF TRUE 0.560 67.000 0.000 NA   NA
 10455323 10455324 LLKF_0978 LLKF_0979 yjhF dacB TRUE 0.827 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10455324 10455325 LLKF_0979 LLKF_0980 dacB yjhH TRUE 0.875 14.000 0.000 NA   NA
 10455325 10455326 LLKF_0980 LLKF_0981 yjhH hrcA FALSE 0.303 221.000 0.000 NA   NA
 10455326 10455327 LLKF_0981 LLKF_0982 hrcA grpE TRUE 0.673 30.000 0.051 1.000 N NA
 10455327 10455328 LLKF_0982 LLKF_0983 grpE dnaK TRUE 0.936 73.000 0.026 0.006 Y NA
 10455328 10455329 LLKF_0983 LLKF_0984 dnaK lai FALSE 0.247 212.000 0.000 1.000   NA
 10455329 10455330 LLKF_0984 LLKF_0985 lai yjiB TRUE 0.466 67.000 0.000 1.000   NA
 10455330 10455331 LLKF_0985 LLKF_0986 yjiB fruR FALSE 0.338 121.000 0.000 1.000   NA
 10455331 10455332 LLKF_0986 LLKF_0987 fruR fruB TRUE 0.968 84.000 0.721 1.000 Y NA
 10455332 10455333 LLKF_0987 LLKF_0988 fruB fruA TRUE 0.998 -3.000 0.816 1.000 Y NA
 10455333 10455334 LLKF_0988 LLKF_0989 fruA clsA FALSE 0.226 87.000 0.000 1.000 N NA
 10455334 10455335 LLKF_0989 LLKF_0990 clsA yjiE TRUE 0.506 80.000 0.000 NA   NA
 10455335 10455336 LLKF_0990 LLKF_0991 yjiE yjiF TRUE 0.984 -3.000 0.214 NA   NA
 10455336 10455337 LLKF_0991 LLKF_0992 yjiF yjjA TRUE 0.886 104.000 0.470 NA   NA
 10455339 10455340 LLKF_0994 LLKF_0995 yjjC yjjD TRUE 0.992 11.000 0.821 NA N NA
 10455340 10455341 LLKF_0995 LLKF_0996 yjjD yjjE TRUE 0.413 141.000 0.000 NA   NA
 10455341 10455342 LLKF_0996 LLKF_0997 yjjE yjjF TRUE 0.414 144.000 0.000 NA   NA
 10455343 10455344 LLKF_0998 LLKF_0999 yjjG yjjH FALSE 0.400 164.000 0.000 NA   NA
 10455345 10455346 LLKF_1000 LLKF_1001 prfB ftsE FALSE 0.106 327.000 0.053 1.000 N NA
 10455346 10455347 LLKF_1001 LLKF_1002 ftsE ftsX TRUE 0.996 -7.000 0.431 1.000 Y NA
 10455348 10455349 LLKF_1003 LLKF_1004 nrdF nrdE TRUE 0.945 378.000 0.500 0.001 Y NA
 10455349 10455350 LLKF_1004 LLKF_1005 nrdE nrdI TRUE 0.809 136.000 0.125 NA Y NA
 10455350 10455351 LLKF_1005 LLKF_1006 nrdI ndrH TRUE 0.951 2.000 0.136 NA N NA
 10455351 10455352 LLKF_1006 LLKF_1007 ndrH ykaC FALSE 0.306 174.000 0.000 1.000   NA
 10455353 10455354 LLKF_1008 LLKF_1009 parE ykaE FALSE 0.337 205.000 0.000 NA   NA
 10455354 10455355 LLKF_1009 LLKF_1010 ykaE ykaF TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455355 10455356 LLKF_1010 LLKF_1011 ykaF dnaQ TRUE 0.945 -7.000 0.000 NA   NA
 10455356 10455357 LLKF_1011 LLKF_1012 dnaQ ykbA TRUE 0.916 -3.000 0.000 1.000   NA
 10455357 10455358 LLKF_1012 LLKF_1013 ykbA parC FALSE 0.160 275.000 0.000 1.000   NA
 10455360 10455361 LLKF_1015 LLKF_1016 ribG ribB TRUE 0.996 0.000 0.456 1.000 Y NA
 10455361 10455362 LLKF_1016 LLKF_1017 ribB ribA TRUE 0.968 9.000 0.051 1.000 Y NA
 10455362 10455363 LLKF_1017 LLKF_1018 ribA ribH TRUE 0.986 28.000 0.054 0.003 Y NA
 10455363 10455364 LLKF_1018 LLKF_1019 ribH lspA FALSE 0.202 103.000 0.000 1.000 N NA
 10455364 10455365 LLKF_1019 LLKF_1020 lspA rluD TRUE 0.552 61.000 0.082 1.000 N NA
 10455365 10455366 LLKF_1020 LLKF_1021 rluD ykcE FALSE 0.325 148.000 0.000 1.000   NA
 10455366 10455367 LLKF_1021 LLKF_1022 ykcE ykcF FALSE 0.413 140.000 0.000 NA   NA
 10455367 10455368 LLKF_1022 LLKF_1023 ykcF ykcG TRUE 0.922 3.000 0.000 NA   NA
 10455368 10455369 LLKF_1023 LLKF_1024 ykcG tcsR FALSE 0.272 126.000 0.000 NA N NA
 10455369 10455370 LLKF_1024 LLKF_1025 tcsR ykdA TRUE 0.830 20.000 0.000 NA   NA
 10455370 10455371 LLKF_1025 LLKF_1026 ykdA tcsK TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 10455371 10455372 LLKF_1026 LLKF_1027 tcsK ykdB TRUE 0.948 7.000 0.000 0.078 N NA
 10455372 10455373 LLKF_1027 LLKF_1028 ykdB glmS FALSE 0.156 181.000 0.000 1.000 N NA
 10455373 10455374 LLKF_1028 LLKF_1029 glmS radC FALSE 0.176 131.000 0.000 1.000 N NA
 10455375 10455376 LLKF_1030 LLKF_1031 pp101 pp102 TRUE 0.422 127.000 0.000 NA   NA
 10455376 10455377 LLKF_1031 LLKF_1032 pp102 pp103 TRUE 0.623 58.000 0.000 NA   NA
 10455377 10455378 LLKF_1032 LLKF_1033 pp103 pp104 TRUE 0.891 12.000 0.000 NA   NA
 10455378 10455379 LLKF_1033 LLKF_1034 pp104 pp105 TRUE 0.785 29.000 0.000 NA   NA
 10455380 10455381 LLKF_1035 LLKF_1036 pp106 pp107 TRUE 0.875 14.000 0.000 NA   NA
 10455381 10455382 LLKF_1036 LLKF_1037 pp107 pp108 TRUE 0.926 2.000 0.000 NA   NA
 10455382 10455383 LLKF_1037 LLKF_1038 pp108 pp109 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455383 10455384 LLKF_1038 LLKF_1039 pp109 pp110 TRUE 0.509 79.000 0.000 NA   NA
 10455384 10455385 LLKF_1039 LLKF_1040 pp110 pp111 TRUE 0.891 12.000 0.000 NA   NA
 10455385 10455386 LLKF_1040 LLKF_1041 pp111 pp112 TRUE 0.846 18.000 0.000 NA   NA
 10455386 10455387 LLKF_1041 LLKF_1042 pp112 pp113 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455387 10455388 LLKF_1042 LLKF_1043 pp113 pp114 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455388 10455389 LLKF_1043 LLKF_1044 pp114 pp115 FALSE 0.116 417.000 0.000 NA   NA
 10455389 10455390 LLKF_1044 LLKF_1045 pp115 pp116 TRUE 0.946 -19.000 0.000 NA   NA
 10455390 10455391 LLKF_1045 LLKF_1046 pp116 pp117 TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 10455391 10455392 LLKF_1046 LLKF_1047 pp117 pp118 TRUE 0.907 9.000 0.000 NA   NA
 10455392 10455393 LLKF_1047 LLKF_1048 pp118 pp119 TRUE 0.945 -7.000 0.000 NA   NA
 10455393 10455394 LLKF_1048 LLKF_1049 pp119 pp120 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455394 10455395 LLKF_1049 LLKF_1050 pp120 pp121 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455395 10455396 LLKF_1050 LLKF_1051 pp121 pp122 TRUE 0.945 -7.000 0.000 NA   NA
 10455396 10455397 LLKF_1051 LLKF_1052 pp122 pp123 TRUE 0.945 -7.000 0.000 NA   NA
 10455397 10455398 LLKF_1052 LLKF_1053 pp123 pp124 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455398 10455399 LLKF_1053 LLKF_1054 pp124 pp125 TRUE 0.682 47.000 0.000 NA   NA
 10455399 10455400 LLKF_1054 LLKF_1055 pp125 pp126 FALSE 0.298 224.000 0.000 NA   NA
 10455400 10455401 LLKF_1055 LLKF_1056 pp126 pp127 TRUE 0.422 127.000 0.000 NA   NA
 10455401 10455402 LLKF_1056 LLKF_1057 pp127 pp128 TRUE 0.926 2.000 0.000 NA   NA
 10455402 10455403 LLKF_1057 LLKF_1058 pp128 pp129 TRUE 0.716 40.000 0.000 NA   NA
 10455403 10455404 LLKF_1058 LLKF_1059 pp129 pp130 TRUE 0.945 -7.000 0.000 NA   NA
 10455404 10455405 LLKF_1059 LLKF_1060 pp130 pp131 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455405 10455406 LLKF_1060 LLKF_1061 pp131 pp132 TRUE 0.838 19.000 0.000 NA   NA
 10455406 10455407 LLKF_1061 LLKF_1062 pp132 pp133 FALSE 0.404 158.000 0.000 NA   NA
 10455407 10455408 LLKF_1062 LLKF_1063 pp133 pp134 TRUE 0.742 36.000 0.000 NA   NA
 10455408 10455409 LLKF_1063 LLKF_1064 pp134 pp135 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455409 10455410 LLKF_1064 LLKF_1065 pp135 pp136 TRUE 0.495 88.000 0.000 NA   NA
 10455410 10455411 LLKF_1065 LLKF_1066 pp136 pp137 FALSE 0.198 246.000 0.000 1.000   NA
 10455411 10455412 LLKF_1066 LLKF_1067 pp137 pp138 TRUE 0.621 147.000 0.118 NA   NA
 10455412 10455413 LLKF_1067 LLKF_1068 pp138 pp139 TRUE 0.988 3.000 0.353 NA   NA
 10455413 10455414 LLKF_1068 LLKF_1069 pp139 pp140 FALSE 0.343 203.000 0.000 NA   NA
 10455414 10455415 LLKF_1069 LLKF_1070 pp140 pp141 TRUE 0.842 73.000 0.263 NA   NA
 10455415 10455416 LLKF_1070 LLKF_1071 pp141 pp142 TRUE 0.988 5.000 0.417 NA   NA
 10455416 10455417 LLKF_1071 LLKF_1072 pp142 pp143 TRUE 0.891 12.000 0.000 NA   NA
 10455417 10455418 LLKF_1072 LLKF_1073 pp143 pp144 TRUE 0.926 2.000 0.000 NA   NA
 10455418 10455419 LLKF_1073 LLKF_1074 pp144 pp145 TRUE 0.996 -22.000 0.667 NA   NA
 10455419 10455420 LLKF_1074 LLKF_1075 pp145 pp146 TRUE 0.994 -7.000 0.467 NA   NA
 10455420 10455421 LLKF_1075 LLKF_1076 pp146 pp147 TRUE 0.996 1.000 0.750 NA   NA
 10455421 10455422 LLKF_1076 LLKF_1077 pp147 pp148 TRUE 0.987 11.000 0.444 NA   NA
 10455422 10455423 LLKF_1077 LLKF_1078 pp148 pp149 TRUE 0.898 11.000 0.000 NA   NA
 10455423 10455424 LLKF_1078 LLKF_1079 pp149 pp150 TRUE 0.898 11.000 0.000 NA   NA
 10455424 10455425 LLKF_1079 LLKF_1080 pp150 pp151 TRUE 0.993 15.000 0.833 NA   NA
 10455425 10455426 LLKF_1080 LLKF_1081 pp151 pp152 TRUE 0.985 0.000 0.250 NA   NA
 10455426 10455427 LLKF_1081 LLKF_1082 pp152 pp153 TRUE 0.968 2.000 0.125 NA   NA
 10455427 10455428 LLKF_1082 LLKF_1083 pp153 pp154 TRUE 0.993 0.000 0.500 NA   NA
 10455428 10455429 LLKF_1083 LLKF_1084 pp154 pp155 TRUE 0.830 20.000 0.000 NA   NA
 10455429 10455430 LLKF_1084 LLKF_1085 pp155 pp156 TRUE 0.853 17.000 0.000 NA   NA
 10455430 10455431 LLKF_1085 LLKF_1086 pp156 pp157 TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 10455431 10455432 LLKF_1086 LLKF_1087 pp157 pp158 TRUE 0.504 81.000 0.000 NA   NA
 10455432 10455433 LLKF_1087 LLKF_1088 pp158 pp159 TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 10455435 10455436 LLKF_1090 LLKF_1091 ykhE ykhF FALSE 0.301 178.000 0.000 1.000   NA
 10455436 10455437 LLKF_1091 LLKF_1092 ykhF ykhG FALSE 0.307 173.000 0.000 1.000   NA
 10455437 10455438 LLKF_1092 LLKF_1093 ykhG ykhK FALSE 0.263 247.000 0.000 NA   NA
 10455438 10455439 LLKF_1093 LLKF_1094 ykhK   TRUE 0.882 13.000 0.000 NA   NA
 10455439 10455440 LLKF_1094 LLKF_1095     FALSE 0.102 506.000 0.000 NA   NA
 10455440 10455441 LLKF_1095 LLKF_1096   pyrE FALSE 0.148 343.000 0.000 NA   NA
 10455441 10455442 LLKF_1096 LLKF_1097 pyrE pyrC TRUE 0.580 155.000 0.003 1.000 Y NA
 10455442 10455443 LLKF_1097 LLKF_1098 pyrC dnaD FALSE 0.066 407.000 0.000 NA N NA
 10455443 10455444 LLKF_1098 LLKF_1099 dnaD nth TRUE 0.927 22.000 0.007 NA Y NA
 10455444 10455445 LLKF_1099 LLKF_1100 nth ykiC TRUE 0.942 -7.000 0.006 NA   NA
 10455445 10455446 LLKF_1100 LLKF_1101 ykiC ykiD TRUE 0.988 -3.000 0.283 NA   NA
 10455447 10455448 LLKF_1102 LLKF_1103 ykiE ykiF TRUE 0.426 122.000 0.000 NA   NA
 10455448 10455449 LLKF_1103 LLKF_1104 ykiF ykiG TRUE 0.665 47.000 0.035 1.000   NA
 10455450 10455451 LLKF_1105 LLKF_1106 ykiH ykiI TRUE 0.945 -7.000 0.000 NA   NA
 10455451 10455452 LLKF_1106 LLKF_1107 ykiI rplU FALSE 0.395 170.000 0.000 NA   NA
 10455452 10455453 LLKF_1107 LLKF_1108 rplU ykjA TRUE 0.991 3.000 0.208 NA Y NA
 10455453 10455454 LLKF_1108 LLKF_1109 ykjA rpmA TRUE 0.991 2.000 0.203 NA Y NA
 10455454 10455455 LLKF_1109 LLKF_1110 rpmA mntH FALSE 0.076 276.000 0.000 1.000 N NA
 10455455 10455456 LLKF_1110 LLKF_1111 mntH phoH FALSE 0.204 102.000 0.000 1.000 N NA
 10455456 10455457 LLKF_1111 LLKF_1112 phoH ykjE FALSE 0.330 58.000 0.000 1.000 N NA
 10455457 10455458 LLKF_1112 LLKF_1113 ykjE ykjF FALSE 0.410 152.000 0.000 NA   NA
 10455458 10455459 LLKF_1113 LLKF_1114 ykjF dgkA TRUE 0.958 -16.000 0.035 NA   NA
 10455459 10455460 LLKF_1114 LLKF_1115 dgkA ykjH TRUE 0.875 14.000 0.000 NA   NA
 10455461 10455462 LLKF_1116 LLKF_1117 comFC comFA TRUE 0.967 -3.000 0.130 1.000   NA
 10455463 10455464 LLKF_1118 LLKF_1119 ykjI ykjJ TRUE 0.414 134.000 0.000 NA   NA
 10455464 10455465 LLKF_1119 LLKF_1120 ykjJ ykjK TRUE 0.675 48.000 0.000 NA   NA
 10455465 10455466 LLKF_1120 LLKF_1121 ykjK nucA FALSE 0.353 110.000 0.000 1.000   NA
 10455466 10455467 LLKF_1121 LLKF_1122 nucA glyQ FALSE 0.149 286.000 0.000 1.000   NA
 10455467 10455468 LLKF_1122 LLKF_1123 glyQ glyS TRUE 1.000 0.000 0.651 0.001 Y NA
 10455468 10455469 LLKF_1123 LLKF_1124 glyS ylaC TRUE 0.476 111.000 0.020 NA   NA
 10455469 10455470 LLKF_1124 LLKF_1125 ylaC eriC FALSE 0.326 211.000 0.000 NA   NA
 10455472 10455473 LLKF_1127 LLKF_1128 nadC ylaG TRUE 0.827 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10455473 10455474 LLKF_1128 LLKF_1129 ylaG nadE FALSE 0.311 61.000 0.000 1.000 N NA
 10455474 10455475 LLKF_1129 LLKF_1130 nadE ylbA FALSE 0.177 130.000 0.000 1.000 N NA
 10455475 10455476 LLKF_1130 LLKF_1131 ylbA ylbB TRUE 0.979 4.000 0.438 1.000 N NA
 10455477 10455478 LLKF_1132 LLKF_1133 cobQ ylbD TRUE 0.995 1.000 0.796 1.000   NA
 10455479 10455480 LLKF_1134 LLKF_1135 aldC lepA FALSE 0.072 285.000 0.000 1.000 N NA
 10455480 10455481 LLKF_1135 LLKF_1136 lepA ylbE TRUE 0.733 67.000 0.000 1.000 Y NA
 10455481 10455482 LLKF_1136 LLKF_1137 ylbE ylcA FALSE 0.161 174.000 0.000 1.000 N NA
 10455482 10455483 LLKF_1137 LLKF_1138 ylcA gyrA FALSE 0.110 226.000 0.000 1.000 N NA
 10455483 10455484 LLKF_1138 LLKF_1139 gyrA apbE FALSE 0.229 84.000 0.000 1.000 N NA
 10455484 10455485 LLKF_1139 LLKF_1140 apbE srtA FALSE 0.277 118.000 0.000 NA N NA
 10455485 10455486 LLKF_1140 LLKF_1141 srtA ylcF FALSE 0.289 227.000 0.000 NA   NA
 10455486 10455487 LLKF_1141 LLKF_1142 ylcF ylcF TRUE 0.946 -48.000 0.000 NA   NA
 10455487 10455488 LLKF_1142 LLKF_1143 ylcF lysS TRUE 0.426 122.000 0.000 NA   NA
 10455488 10455489 LLKF_1143 LLKF_1144 lysS yldA TRUE 0.946 -13.000 0.000 NA   NA
 10455491 10455492 LLKF_1146 LLKF_1147 pcrA mutX TRUE 0.913 20.000 0.000 1.000 Y NA
 10455492 10455493 LLKF_1147 LLKF_1148 mutX tag TRUE 0.827 46.000 0.000 1.000 Y NA
 10455493 10455494 LLKF_1148 LLKF_1149 tag yldC TRUE 0.513 78.000 0.000 NA   NA
 10455494 10455495 LLKF_1149 LLKF_1150 yldC frdC FALSE 0.399 165.000 0.000 NA   NA
 10455495 10455496 LLKF_1150 LLKF_1151 frdC yldE FALSE 0.394 171.000 0.000 NA   NA
 10455496 10455497 LLKF_1151 LLKF_1152 yldE truB FALSE 0.413 140.000 0.000 NA   NA
 10455497 10455498 LLKF_1152 LLKF_1153 truB ribF TRUE 0.905 31.000 0.308 1.000 N NA
 10455498 10455499 LLKF_1153 LLKF_1154 ribF ldhX FALSE 0.210 98.000 0.000 1.000 N NA
 10455499 10455500 LLKF_1154 LLKF_1155 ldhX yleB FALSE 0.317 159.000 0.000 1.000   NA
 10455500 10455501 LLKF_1155 LLKF_1156 yleB murQ TRUE 0.982 -7.000 0.234 1.000   NA
 10455501 10455502 LLKF_1156 LLKF_1157 murQ yleDE TRUE 0.912 35.000 0.250 1.000   NA
 10455502 10455503 LLKF_1157 LLKF_1158 yleDE yleF TRUE 0.758 62.000 0.250 1.000 N NA
 10455503 10455504 LLKF_1158 LLKF_1159 yleF tpiA FALSE 0.176 131.000 0.000 1.000 N NA
 10455504 10455505 LLKF_1159 LLKF_1160 tpiA pacA FALSE 0.166 163.000 0.000 1.000 N NA
 10455505 10455506 LLKF_1160 LLKF_1161 pacA ylfA TRUE 0.666 49.000 0.000 NA   NA
 10455506 10455507 LLKF_1161 LLKF_1162 ylfA lbrA FALSE 0.321 215.000 0.000 NA   NA
 10455507 10455508 LLKF_1162 LLKF_1163 lbrA lbrB TRUE 0.974 -18.000 0.154 1.000   NA
 10455508 10455509 LLKF_1163 LLKF_1164 lbrB hemN FALSE 0.156 180.000 0.000 1.000 N NA
 10455509 10455510 LLKF_1164 LLKF_1165 hemN ylfD FALSE 0.390 47.000 0.000 1.000 N NA
 10455510 10455511 LLKF_1165 LLKF_1166 ylfD dcdA FALSE 0.200 104.000 0.000 1.000 N NA
 10455511 10455512 LLKF_1166 LLKF_1167 dcdA ylfFG FALSE 0.213 97.000 0.000 1.000 N NA
 10455512 10455513 LLKF_1167 LLKF_1168 ylfFG ylfH TRUE 0.575 47.000 0.055 1.000 N NA
 10455513 10455514 LLKF_1168 LLKF_1169 ylfH ylfI TRUE 0.841 103.000 0.330 NA   NA
 10455514 10455515 LLKF_1169 LLKF_1170 ylfI guaC FALSE 0.245 259.000 0.000 NA   NA
 10455515 10455516 LLKF_1170 LLKF_1171 guaC xpt FALSE 0.380 272.000 0.009 1.000 Y NA
 10455516 10455517 LLKF_1171 LLKF_1172 xpt pbuX TRUE 0.812 49.000 0.000 1.000 Y NA
 10455518 10455519 LLKF_1173 LLKF_1174 ylgB ylgC TRUE 0.428 120.000 0.000 NA   NA
 10455520 10455521 LLKF_1175 LLKF_1176 dfrA   TRUE 0.952 -3.000 0.030 NA   NA
 10455521 10455522 LLKF_1176 LLKF_1177   clpX TRUE 0.519 76.000 0.012 NA   NA
 10455522 10455523 LLKF_1177 LLKF_1178 clpX engB TRUE 0.941 -3.000 0.043 1.000   NA
 10455523 10455524 LLKF_1178 LLKF_1179 engB folB TRUE 0.558 54.000 0.000 1.000   NA
 10455524 10455525 LLKF_1179 LLKF_1180 folB folKE TRUE 0.690 80.000 0.012 1.000 Y NA
 10455525 10455526 LLKF_1180 LLKF_1181 folKE folP TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 10455526 10455527 LLKF_1181 LLKF_1182 folP folQ TRUE 0.969 3.000 0.286 1.000 N NA
 10455527 10455528 LLKF_1182 LLKF_1183 folQ folC TRUE 0.606 19.000 0.000 1.000 N NA
 10455528 10455529 LLKF_1183 LLKF_1184 folC dukB FALSE 0.177 130.000 0.000 1.000 N NA
 10455529 10455530 LLKF_1184 LLKF_1185 dukB hom FALSE 0.158 177.000 0.000 1.000 N NA
 10455530 10455531 LLKF_1185 LLKF_1186 hom thrB TRUE 0.967 5.000 0.036 1.000 Y NA
 10455531 10455532 LLKF_1186 LLKF_1187 thrB ylhB FALSE 0.254 254.000 0.000 NA   NA
 10455532 10455533 LLKF_1187 LLKF_1188 ylhB murB TRUE 0.701 43.000 0.000 NA   NA
 10455533 10455534 LLKF_1188 LLKF_1189 murB potA FALSE 0.047 652.000 0.041 1.000 N NA
 10455534 10455535 LLKF_1189 LLKF_1190 potA potB TRUE 1.000 -3.000 0.928 0.032 Y NA
 10455535 10455536 LLKF_1190 LLKF_1191 potB potC TRUE 0.999 2.000 0.492 0.032 Y NA
 10455536 10455537 LLKF_1191 LLKF_1192 potC potD TRUE 0.984 48.000 0.253 0.032 Y NA
 10455537 10455538 LLKF_1192 LLKF_1193 potD ysaD FALSE 0.080 966.000 0.000 NA   NA
 10455538 10455539 LLKF_1193 LLKF_1194 ysaD   TRUE 0.530 72.000 0.000 NA   NA
 10455539 10455540 LLKF_1194 LLKF_1195     TRUE 0.946 -19.000 0.000 NA   NA
 10455540 10455541 LLKF_1195 LLKF_1196   quaC FALSE 0.137 366.000 0.000 NA   NA
 10455541 10455542 LLKF_1196 LLKF_t0037 quaC trnM FALSE 0.098 523.000 0.000 NA   NA
 10455542 10455543 LLKF_t0037 LLKF_1197 trnM cspA TRUE 0.462 102.000 0.000 NA   NA
 10455543 10455544 LLKF_1197 LLKF_1198 cspA cspD TRUE 0.415 133.000 0.000 NA   NA
 10455544 10455545 LLKF_1198 LLKF_1199 cspD clsB FALSE 0.036 430.000 0.000 1.000 N NA
 10455545 10455546 LLKF_1199 LLKF_1200 clsB yliI FALSE 0.168 544.000 0.000 0.057 N NA
 10455548 10455549 LLKF_1202 LLKF_1203 yljD rumA FALSE 0.357 195.000 0.000 NA   NA
 10455549 10455550 LLKF_1203 LLKF_1204 rumA yljF TRUE 0.735 37.000 0.000 NA   NA
 10455550 10455551 LLKF_1204 LLKF_1205 yljF yljG TRUE 0.926 2.000 0.000 NA   NA
 10455551 10455552 LLKF_1205 LLKF_1206 yljG yljI TRUE 0.566 66.000 0.000 NA   NA
 10455552 10455553 LLKF_1206 LLKF_1207 yljI yljJ TRUE 0.959 28.000 0.324 NA   NA
 10455553 10455554 LLKF_1207 LLKF_1208 yljJ als FALSE 0.381 155.000 0.033 1.000   NA
 10455554 10455555 LLKF_1208 LLKF_1209 als   FALSE 0.107 452.000 0.000 NA   NA
 10455555 10455556 LLKF_1209 LLKF_1210     FALSE 0.252 255.000 0.000 NA   NA
 10455556 10455557 LLKF_1210 LLKF_1211   npkK FALSE 0.200 289.000 0.000 NA   NA
 10455557 10455558 LLKF_1211 LLKF_1212 npkK npkR TRUE 0.998 -3.000 0.704 1.000 Y NA
 10455558 10455559 LLKF_1212 LLKF_1213 npkR nrpA FALSE 0.178 127.000 0.000 1.000 N NA
 10455559 10455560 LLKF_1213 LLKF_1214 nrpA pksA FALSE 0.056 322.000 0.000 1.000 N NA
 10455560 10455561 LLKF_1214 LLKF_1215 pksA pksB TRUE 0.437 39.000 0.000 1.000 N NA
 10455561 10455562 LLKF_1215 LLKF_1216 pksB pksC TRUE 0.994 0.000 0.000 0.003 Y NA
 10455562 10455563 LLKF_1216 LLKF_1217 pksC   TRUE 0.548 25.000 0.000 1.000 N NA
 10455563 10455564 LLKF_1217 LLKF_1218     TRUE 0.988 15.000 0.571 NA   NA
 10455564 10455565 LLKF_1218 LLKF_1219     TRUE 0.666 49.000 0.000 NA   NA
 10455565 10455566 LLKF_1219 LLKF_1220   npkS TRUE 0.414 147.000 0.000 NA   NA
 10455566 10455567 LLKF_1220 LLKF_1221 npkS nrpB TRUE 0.900 101.000 0.000 0.013 Y NA
 10455567 10455568 LLKF_1221 LLKF_1222 nrpB nrpC TRUE 0.556 24.000 0.000 1.000 N NA
 10455568 10455569 LLKF_1222 LLKF_1223 nrpC   TRUE 0.875 14.000 0.000 NA   NA
 10455569 10455570 LLKF_1223 LLKF_1224     FALSE 0.174 314.000 0.000 NA   NA
 10455570 10455571 LLKF_1224 LLKF_1225     TRUE 0.577 64.000 0.000 NA   NA
 10455571 10455572 LLKF_1225 LLKF_1226     TRUE 0.467 100.000 0.000 NA   NA
 10455572 10455573 LLKF_1226 LLKF_1227     TRUE 0.749 35.000 0.000 NA   NA
 10455573 10455574 LLKF_1227 LLKF_1228     TRUE 0.755 34.000 0.000 NA   NA
 10455574 10455575 LLKF_1228 LLKF_1229     FALSE 0.106 464.000 0.000 NA   NA
 10455575 10455576 LLKF_1229 LLKF_1230     FALSE 0.118 416.000 0.000 NA   NA
 10455576 10455577 LLKF_1230 LLKF_1231     FALSE 0.309 219.000 0.000 NA   NA
 10455577 10455578 LLKF_1231 LLKF_1232     FALSE 0.172 317.000 0.000 NA   NA
 10455578 10455579 LLKF_1232 LLKF_1233     TRUE 0.716 40.000 0.000 NA   NA
 10455579 10455580 LLKF_1233 LLKF_1234     TRUE 0.760 33.000 0.000 NA   NA
 10455580 10455581 LLKF_1234 LLKF_1235     FALSE 0.125 397.000 0.000 NA   NA
 10455581 10455582 LLKF_1235 LLKF_1236   lpxB FALSE 0.062 715.000 0.000 1.000   NA
 10455582 10455583 LLKF_1236 LLKF_1237 lpxB lpxA FALSE 0.111 336.000 0.000 1.000   NA
 10455583 10455584 LLKF_1237 LLKF_1238 lpxA kdpD FALSE 0.147 288.000 0.000 1.000   NA
 10455584 10455585 LLKF_1238 LLKF_1239 kdpD kdpE TRUE 0.993 -10.000 0.243 1.000 Y NA
 10455585 10455586 LLKF_1239 LLKF_1240 kdpE kdpA FALSE 0.051 337.000 0.000 1.000 N NA
 10455586 10455587 LLKF_1240 LLKF_1241 kdpA kdpB TRUE 0.994 9.000 0.018 0.001 Y NA
 10455587 10455588 LLKF_1241 LLKF_1242 kdpB kdpC TRUE 0.999 18.000 0.877 0.001 Y NA
 10455588 10455589 LLKF_1242 LLKF_1243 kdpC ymcE FALSE 0.059 806.000 0.000 1.000   NA
 10455589 10455590 LLKF_1243 LLKF_1244 ymcE ymcF TRUE 0.749 35.000 0.000 NA   NA
 10455590 10455591 LLKF_1244 LLKF_1245 ymcF ymcG TRUE 0.795 27.000 0.000 NA   NA
 10455591 10455592 LLKF_1245 LLKF_1246 ymcG rnr TRUE 0.464 101.000 0.000 NA   NA
 10455592 10455593 LLKF_1246 LLKF_1247 rnr hisC FALSE 0.035 439.000 0.000 1.000 N NA
 10455593 10455594 LLKF_1247 LLKF_1248 hisC hisZ TRUE 0.975 -12.000 0.012 1.000 Y NA
 10455594 10455595 LLKF_1248 LLKF_1249 hisZ hisG TRUE 0.993 -7.000 0.239 1.000 Y NA
 10455595 10455596 LLKF_1249 LLKF_1250 hisG hisD TRUE 0.999 -16.000 0.254 0.006 Y NA
 10455596 10455597 LLKF_1250 LLKF_1251 hisD ymdA TRUE 0.570 51.000 0.000 1.000   NA
 10455597 10455598 LLKF_1251 LLKF_1252 ymdA hisB TRUE 0.916 -3.000 0.000 1.000   NA
 10455598 10455599 LLKF_1252 LLKF_1253 hisB ymdC TRUE 0.827 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10455599 10455600 LLKF_1253 LLKF_1254 ymdC hisH TRUE 0.437 39.000 0.000 1.000 N NA
 10455600 10455601 LLKF_1254 LLKF_1255 hisH hisA TRUE 0.997 1.000 0.124 0.006 Y NA
 10455601 10455602 LLKF_1255 LLKF_1256 hisA hisF TRUE 0.999 -10.000 0.433 0.006 Y NA
 10455602 10455603 LLKF_1256 LLKF_1257 hisF hisI TRUE 0.999 -3.000 0.430 0.006 Y NA
 10455603 10455604 LLKF_1257 LLKF_1258 hisI hisK TRUE 0.993 1.000 0.003 0.006 Y NA
 10455606 10455607 LLKF_1260 LLKF_1261 leuA leuB TRUE 0.993 12.000 0.041 0.002 Y NA
 10455609 10455610 LLKF_1263 LLKF_1264 leuC leuD TRUE 0.998 20.000 0.477 0.001 Y NA
 10455610 10455611 LLKF_1264 LLKF_1265 leuD ymeB TRUE 0.675 14.000 0.000 1.000 N NA
 10455611 10455612 LLKF_1265 LLKF_1266 ymeB ilvD FALSE 0.181 122.000 0.000 1.000 N NA
 10455612 10455613 LLKF_1266 LLKF_1267 ilvD ilvB TRUE 0.992 11.000 0.000 0.002 Y NA
 10455613 10455614 LLKF_1267 LLKF_1268 ilvB ilvH TRUE 0.999 -7.000 0.249 0.001 Y NA
 10455614 10455615 LLKF_1268 LLKF_1269 ilvH ilvC TRUE 0.984 46.000 0.130 0.002 Y NA
 10455615 10455616 LLKF_1269 LLKF_1270 ilvC ilvA TRUE 0.820 56.000 0.033 1.000 Y NA
 10455616 10455617 LLKF_1270 LLKF_1271 ilvA aldB FALSE 0.185 116.000 0.000 1.000 N NA
 10455617 10455618 LLKF_1271 LLKF_1272 aldB aldR TRUE 0.555 41.000 0.000 NA N NA
 10455618 10455619 LLKF_1272 LLKF_1273 aldR dprA FALSE 0.264 146.000 0.000 NA N NA
 10455619 10455620 LLKF_1273 LLKF_1274 dprA topA TRUE 0.708 262.000 0.238 1.000 Y NA
 10455620 10455621 LLKF_1274 LLKF_1275 topA trmFO TRUE 0.562 72.000 0.137 1.000 N NA
 10455622 10455623 LLKF_1276 LLKF_1277 xerC   FALSE 0.103 485.000 0.000 NA   NA
 10455623 10455624 LLKF_1277 LLKF_1278   xerS TRUE 0.500 84.000 0.000 NA   NA
 10455624 10455625 LLKF_1278 LLKF_1279 xerS   FALSE 0.026 848.000 0.000 1.000 N NA
 10455625 10455626 LLKF_1279 LLKF_1280     TRUE 0.490 92.000 0.000 NA   NA
 10455626 10455627 LLKF_1280 LLKF_1281     TRUE 0.946 -28.000 0.000 NA   NA
 10455627 10455628 LLKF_1281 LLKF_1282   paiA TRUE 0.847 19.000 0.014 NA   NA
 10455628 10455629 LLKF_1282 LLKF_1283 paiA   TRUE 0.948 1.000 0.072 1.000   NA
 10455629 10455630 LLKF_1283 LLKF_1284   recA FALSE 0.375 100.000 0.000 1.000   NA
 10455631 10455632 LLKF_1285 LLKF_1286 tnpA tnpB TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.051 Y NA
 10455633 10455634 LLKF_1287 LLKF_1288     TRUE 0.710 41.000 0.000 NA   NA
 10455634 10455635 LLKF_1288 LLKF_1289     TRUE 0.943 3.000 0.042 NA   NA
 10455635 10455636 LLKF_1289 LLKF_1290     TRUE 0.963 -7.000 0.049 NA   NA
 10455636 10455637 LLKF_1290 LLKF_1291     TRUE 0.930 1.000 0.000 NA   NA
 10455637 10455638 LLKF_1291 LLKF_1292     TRUE 0.946 -76.000 0.000 NA   NA
 10455638 10455639 LLKF_1292 LLKF_1293     TRUE 0.859 16.000 0.000 NA   NA
 10455639 10455640 LLKF_1293 LLKF_1294     TRUE 0.874 7.000 0.000 1.000   NA
 10455640 10455641 LLKF_1294 LLKF_1295     TRUE 0.772 31.000 0.000 NA   NA
 10455641 10455642 LLKF_1295 LLKF_1296   nisG FALSE 0.091 640.000 0.000 NA   NA
 10455642 10455643 LLKF_1296 LLKF_1297 nisG nisE TRUE 0.968 -13.000 0.061 NA   NA
 10455643 10455644 LLKF_1297 LLKF_1298 nisE nisF TRUE 0.956 2.000 0.061 NA   NA
 10455644 10455645 LLKF_1298 LLKF_1299 nisF nisK FALSE 0.208 99.000 0.000 1.000 N NA
 10455645 10455646 LLKF_1299 LLKF_1300 nisK nisR TRUE 1.000 -7.000 0.741 0.007 Y NA
 10455646 10455647 LLKF_1300 LLKF_1301 nisR nisP TRUE 0.566 66.000 0.000 NA   NA
 10455647 10455648 LLKF_1301 LLKF_1302 nisP nisP TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 10455648 10455649 LLKF_1302 LLKF_1303 nisP nisP TRUE 0.819 22.000 0.000 NA   NA
 10455649 10455650 LLKF_1303 LLKF_1304 nisP nisI TRUE 0.926 2.000 0.000 NA   NA
 10455650 10455651 LLKF_1304 LLKF_1305 nisI nisC TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455651 10455652 LLKF_1305 LLKF_1306 nisC nisB TRUE 0.550 69.000 0.000 NA   NA
 10455652 10455653 LLKF_1306 LLKF_1307 nisB nisX TRUE 0.416 132.000 0.000 NA   NA
 10455653 10455654 LLKF_1307 LLKF_1308 nisX ltrB FALSE 0.084 781.000 0.000 NA   NA
 10455654 10455655 LLKF_1308 LLKF_1309 ltrB glpF FALSE 0.094 562.000 0.000 NA   NA
 10455655 10455656 LLKF_1309 LLKF_1310 glpF glpD FALSE 0.359 53.000 0.000 1.000 N NA
 10455656 10455657 LLKF_1310 LLKF_1311 glpD glpK TRUE 0.978 36.000 0.010 0.001 Y NA
 10455657 10455658 LLKF_1311 LLKF_1312 glpK ymhA FALSE 0.136 368.000 0.000 NA   NA
 10455658 10455659 LLKF_1312 LLKF_1313 ymhA   FALSE 0.227 270.000 0.000 NA   NA
 10455659 10455660 LLKF_1313 LLKF_1314   nhaP FALSE 0.142 353.000 0.000 NA   NA
 10455660 10455661 LLKF_1314 LLKF_1315 nhaP ymhC FALSE 0.313 217.000 0.000 NA   NA
 10455663 10455664 LLKF_1317 LLKF_1318 lctO aroH FALSE 0.101 235.000 0.000 1.000 N NA
 10455664 10455665 LLKF_1318 LLKF_1319 aroH metF FALSE 0.258 363.000 0.000 1.000 Y NA
 10455665 10455666 LLKF_1319 LLKF_1320 metF metE TRUE 0.997 -10.000 0.050 0.002 Y NA
 10455666 10455667 LLKF_1320 LLKF_1321 metE ymiA FALSE 0.174 145.000 0.000 1.000 N NA
 10455667 10455668 LLKF_1321 LLKF_1322 ymiA mgtA FALSE 0.221 94.000 0.000 1.000 N NA
 10455668 10455669 LLKF_1322 LLKF_1323 mgtA dltD FALSE 0.056 480.000 0.000 NA N NA
 10455669 10455670 LLKF_1323 LLKF_1324 dltD dltC TRUE 0.993 -10.000 0.409 NA   NA
 10455670 10455671 LLKF_1324 LLKF_1325 dltC dltB TRUE 0.946 43.000 0.387 NA   NA
 10455671 10455672 LLKF_1325 LLKF_1326 dltB dltA TRUE 0.987 0.000 0.435 NA N NA
 10455672 10455673 LLKF_1326 LLKF_1327 dltA dltX TRUE 0.979 25.000 0.549 NA   NA
 10455673 10455674 LLKF_1327 LLKF_1328 dltX thiE FALSE 0.366 190.000 0.000 NA   NA
 10455674 10455675 LLKF_1328 LLKF_1329 thiE thiD TRUE 0.996 -10.000 0.024 0.004 Y NA
 10455675 10455676 LLKF_1329 LLKF_1330 thiD thiM TRUE 0.988 14.000 0.007 0.004 Y NA
 10455676 10455677 LLKF_1330 LLKF_1331 thiM ymjE FALSE 0.117 285.000 0.000 NA N NA
 10455677 10455678 LLKF_1331 LLKF_1332 ymjE ymjF TRUE 0.981 -10.000 0.000 NA Y NA
 10455680 10455681 LLKF_1334 LLKF_1335 rplL rplJ TRUE 0.996 70.000 0.884 0.020 Y NA
 10455681 10455682 LLKF_1335 LLKF_1336 rplJ ynaA FALSE 0.302 222.000 0.000 NA   NA
 10455682 10455683 LLKF_1336 LLKF_1337 ynaA ynaB TRUE 0.859 16.000 0.000 NA   NA
 10455683 10455684 LLKF_1337 LLKF_1338 ynaB ynaC FALSE 0.182 121.000 0.000 1.000 N NA
 10455684 10455685 LLKF_1338 LLKF_1339 ynaC ynaD TRUE 1.000 -16.000 0.911 0.008 Y NA
 10455685 10455686 LLKF_1339 LLKF_1340 ynaD ynaE FALSE 0.413 149.000 0.000 NA   NA
 10455686 10455687 LLKF_1340 LLKF_1341 ynaE rluB FALSE 0.286 229.000 0.000 NA   NA
 10455687 10455688 LLKF_1341 LLKF_1342 rluB scpB TRUE 0.978 -67.000 0.224 NA N NA
 10455688 10455689 LLKF_1342 LLKF_1343 scpB scpA TRUE 0.995 -7.000 0.570 NA   NA
 10455689 10455690 LLKF_1343 LLKF_1344 scpA xerD TRUE 0.799 30.000 0.017 NA   NA
 10455690 10455691 LLKF_1344 LLKF_1345 xerD ynbB TRUE 0.976 -22.000 0.111 NA   NA
 10455691 10455692 LLKF_1345 LLKF_1346 ynbB ynbC TRUE 0.813 31.000 0.034 NA   NA
 10455692 10455693 LLKF_1346 LLKF_1347 ynbC ynbD TRUE 0.660 48.000 0.005 NA   NA
 10455693 10455694 LLKF_1347 LLKF_1348 ynbD murI TRUE 0.854 1.000 0.034 1.000 N NA
 10455694 10455695 LLKF_1348 LLKF_1349 murI ynbE TRUE 0.423 155.000 0.014 NA   NA
 10455695 10455696 LLKF_1349 LLKF_1350 ynbE lysA TRUE 0.519 152.000 0.051 NA   NA
 10455696 10455697 LLKF_1350 LLKF_1351 lysA gltD TRUE 0.622 116.000 0.000 1.000 Y NA
 10455697 10455698 LLKF_1351 LLKF_1352 gltD gltB TRUE 0.998 0.000 0.222 0.001 Y NA
 10455702 10455703 LLKF_1356 LLKF_1357 gadB gadC TRUE 0.989 20.000 0.500 1.000 Y NA
 10455703 10455704 LLKF_1357 LLKF_1358 gadC gadR FALSE 0.326 144.000 0.000 1.000   NA
 10455704 10455705 LLKF_1358 LLKF_1359 gadR rnhB FALSE 0.067 553.000 0.000 1.000   NA
 10455705 10455706 LLKF_1359 LLKF_1360 rnhB rbgA TRUE 0.617 112.000 0.148 1.000   NA
 10455706 10455707 LLKF_1360 LLKF_1361 rbgA yndA FALSE 0.227 223.000 0.000 1.000   NA
 10455707 10455708 LLKF_1361 LLKF_1362 yndA yndB TRUE 0.472 98.000 0.000 NA   NA
 10455709 10455710 LLKF_1363 LLKF_1364 rdrB pepPQ TRUE 0.908 -7.000 0.049 1.000 N NA
 10455711 10455712 LLKF_1365 LLKF_1366 yndG   FALSE 0.231 268.000 0.000 NA   NA
 10455712 10455713 LLKF_1366 LLKF_1367     TRUE 0.799 26.000 0.000 NA   NA
 10455713 10455714 LLKF_1367 LLKF_1368   algA FALSE 0.261 204.000 0.000 1.000   NA
 10455714 10455715 LLKF_1368 LLKF_1369 algA pda TRUE 0.888 29.000 0.000 1.000 Y NA
 10455715 10455716 LLKF_1369 LLKF_1370 pda   TRUE 0.984 14.000 0.000 0.027 Y NA
 10455716 10455717 LLKF_1370 LLKF_1371     TRUE 0.965 2.000 0.000 1.000 Y NA
 10455717 10455718 LLKF_1371 LLKF_1372     TRUE 0.992 0.000 0.000 0.031 Y NA
 10455718 10455719 LLKF_1372 LLKF_1373     TRUE 0.995 68.000 0.889 0.031 Y NA
 10455719 10455720 LLKF_1373 LLKF_1374     TRUE 0.727 27.000 0.000 1.000   NA
 10455720 10455721 LLKF_1374 LLKF_1375   dcm FALSE 0.136 301.000 0.000 1.000   NA
 10455721 10455722 LLKF_1375 LLKF_1376 dcm   TRUE 0.957 -3.000 0.042 NA   NA
 10455722 10455723 LLKF_1376 LLKF_1377   dcm TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455723 10455724 LLKF_1377 LLKF_1378 dcm llaIC TRUE 0.827 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10455726 10455727 LLKF_1380 LLKF_1381 pglM   TRUE 0.610 207.000 0.000 0.055   NA
 10455727 10455728 LLKF_1381 LLKF_1382     TRUE 0.475 271.000 0.000 0.055   NA
 10455728 10455729 LLKF_1382 LLKF_1383   mta TRUE 0.684 33.000 0.000 1.000   NA
 10455729 10455730 LLKF_1383 LLKF_1384 mta   TRUE 0.808 24.000 0.000 NA   NA
 10455733 10455734 LLKF_1387 LLKF_1388 rmaF rlrC TRUE 0.864 51.000 0.000 0.042   NA
 10455735 10455736 LLKF_1389 LLKF_1390 yneB yneC TRUE 0.448 107.000 0.000 NA   NA
 10455738 10455739 LLKF_1392 LLKF_1393 arsD arsC TRUE 0.524 59.000 0.000 1.000   NA
 10455739 10455740 LLKF_1393 LLKF_1394 arsC pabBC FALSE 0.149 187.000 0.000 1.000 N NA
 10455740 10455741 LLKF_1394 LLKF_1395 pabBC pabA TRUE 0.993 5.000 0.375 1.000 Y NA
 10455741 10455742 LLKF_1395 LLKF_1396 pabA srtB FALSE 0.042 1024.000 0.000 NA N NA
 10455742 10455743 LLKF_1396 LLKF_1397 srtB csc1A TRUE 0.749 35.000 0.000 NA   NA
 10455743 10455744 LLKF_1397 LLKF_1398 csc1A csc1B FALSE 0.267 243.000 0.000 NA   NA
 10455744 10455745 LLKF_1398 LLKF_1399 csc1B csc1C TRUE 0.765 32.000 0.000 NA   NA
 10455745 10455746 LLKF_1399 LLKF_1400 csc1C csc1B TRUE 0.779 30.000 0.000 NA   NA
 10455746 10455747 LLKF_1400 LLKF_1401 csc1B csc1B TRUE 0.819 22.000 0.000 NA   NA
 10455747 10455748 LLKF_1401 LLKF_1402 csc1B csc1D TRUE 0.808 24.000 0.000 NA   NA
 10455748 10455749 LLKF_1402 LLKF_1403 csc1D   TRUE 0.444 110.000 0.000 NA   NA
 10455749 10455750 LLKF_1403 LLKF_1404     TRUE 0.742 36.000 0.000 NA   NA
 10455750 10455751 LLKF_1404 LLKF_1405   mtsA FALSE 0.220 274.000 0.000 NA   NA
 10455751 10455752 LLKF_1405 LLKF_1406 mtsA mtsC TRUE 0.980 -16.000 0.038 1.000 Y NA
 10455752 10455753 LLKF_1406 LLKF_1407 mtsC mtsB TRUE 0.967 8.000 0.043 1.000 Y NA
 10455755 10455756 LLKF_1409 LLKF_1410 ynfD sbcC TRUE 0.420 129.000 0.000 NA   NA
 10455756 10455757 LLKF_1410 LLKF_1411 sbcC sbcD TRUE 0.998 3.000 0.669 NA Y NA
 10455757 10455758 LLKF_1411 LLKF_1412 sbcD panE FALSE 0.172 152.000 0.000 1.000 N NA
 10455758 10455759 LLKF_1412 LLKF_1413 panE ynfG FALSE 0.137 200.000 0.000 1.000 N NA
 10455759 10455760 LLKF_1413 LLKF_1414 ynfG   FALSE 0.371 187.000 0.000 NA   NA
 10455760 10455761 LLKF_1414 LLKF_1415   ynfH FALSE 0.149 342.000 0.000 NA   NA
 10455761 10455762 LLKF_1415 LLKF_1416 ynfH yngA FALSE 0.118 327.000 0.000 1.000   NA
 10455763 10455764 LLKF_1417 LLKF_1418 yngB   TRUE 0.716 40.000 0.000 NA   NA
 10455764 10455765 LLKF_1418 LLKF_1419   yngE FALSE 0.300 179.000 0.000 1.000   NA
 10455765 10455766 LLKF_1419 LLKF_1420 yngE yngF TRUE 0.991 -7.000 0.438 1.000   NA
 10455766 10455767 LLKF_1420 LLKF_1421 yngF yngG TRUE 0.999 -3.000 0.720 0.031   NA
 10455768 10455769 LLKF_1422 LLKF_1423 ldhL pyk FALSE 0.183 118.000 0.000 1.000 N NA
 10455769 10455770 LLKF_1423 LLKF_1424 pyk pfkA TRUE 0.977 88.000 0.261 0.006 Y NA
 10455770 10455771 LLKF_1424 LLKF_1425 pfkA ynhA TRUE 0.462 102.000 0.000 NA   NA
 10455771 10455772 LLKF_1425 LLKF_1426 ynhA nagA TRUE 0.907 9.000 0.000 NA   NA
 10455772 10455773 LLKF_1426 LLKF_1427 nagA ynhC FALSE 0.248 173.000 0.000 NA N NA
 10455773 10455774 LLKF_1427 LLKF_1428 ynhC ynhD TRUE 0.837 145.000 0.373 NA   NA
 10455775 10455776 LLKF_1429 LLKF_1430 gpsA hasC FALSE 0.411 43.000 0.000 1.000 N NA
 10455776 10455777 LLKF_1430 LLKF_1431 hasC ynhH TRUE 0.536 71.000 0.000 NA   NA
 10455777 10455778 LLKF_1431 LLKF_1432 ynhH hepS TRUE 0.948 -3.000 0.020 NA   NA
 10455778 10455779 LLKF_1432 LLKF_1433 hepS hepS TRUE 0.991 -9.000 0.000 0.001   NA
 10455779 10455780 LLKF_1433 LLKF_1434 hepS gidB TRUE 0.827 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10455781 10455782 LLKF_1435 LLKF_1436 yniC pyrF TRUE 0.926 2.000 0.000 NA   NA
 10455782 10455783 LLKF_1436 LLKF_1437 pyrF pyrD TRUE 0.934 221.000 0.154 0.002 Y NA
 10455783 10455784 LLKF_1437 LLKF_1438 pyrD pyrZ TRUE 0.979 73.000 0.592 0.001 N NA
 10455784 10455785 LLKF_1438 LLKF_1439 pyrZ yniG FALSE 0.040 399.000 0.000 1.000 N NA
 10455785 10455786 LLKF_1439 LLKF_1440 yniG   FALSE 0.166 163.000 0.000 1.000 N NA
 10455786 10455787 LLKF_1440 LLKF_1441     TRUE 0.613 72.000 0.167 1.000 N NA
 10455787 10455788 LLKF_1441 LLKF_1442     TRUE 0.945 -7.000 0.000 NA   NA
 10455788 10455789 LLKF_1442 LLKF_1443     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455789 10455790 LLKF_1443 LLKF_1444     TRUE 0.999 0.000 0.786 0.031 Y NA
 10455790 10455791 LLKF_1444 LLKF_1445     TRUE 0.988 92.000 0.607 0.031 Y NA
 10455791 10455792 LLKF_1445 LLKF_1446     FALSE 0.344 115.000 0.000 1.000   NA
 10455793 10455794 LLKF_1447 LLKF_1448 axe yniH FALSE 0.398 167.000 0.000 NA   NA
 10455794 10455795 LLKF_1448 LLKF_1449 yniH yniI TRUE 0.804 160.000 0.323 NA   NA
 10455795 10455796 LLKF_1449 LLKF_1450 yniI yniJ TRUE 0.993 -3.000 0.447 NA   NA
 10455797 10455798 LLKF_1451 LLKF_1452 rluC carB FALSE 0.038 415.000 0.000 1.000 N NA
 10455798 10455799 LLKF_1452 LLKF_1453 carB gpo FALSE 0.061 312.000 0.000 1.000 N NA
 10455801 10455802 LLKF_1455 LLKF_1456 yoaB yoaD FALSE 0.245 259.000 0.000 NA   NA
 10455802 10455803 LLKF_1456 LLKF_1457 yoaD yoaF FALSE 0.310 218.000 0.000 NA   NA
 10455803 10455804 LLKF_1457 LLKF_1458 yoaF yoaG TRUE 0.413 141.000 0.000 NA   NA
 10455804 10455805 LLKF_1458 LLKF_1459 yoaG yoaG TRUE 0.616 59.000 0.000 NA   NA
 10455806 10455807 LLKF_1460 LLKF_1461 yoaH yoaI FALSE 0.380 182.000 0.000 NA   NA
 10455808 10455809 LLKF_1462 LLKF_1463   yobA TRUE 0.477 97.000 0.000 NA   NA
 10455809 10455810 LLKF_1463 LLKF_1464 yobA   TRUE 0.428 120.000 0.000 NA   NA
 10455810 10455811 LLKF_1464 LLKF_1465   ptp TRUE 0.779 30.000 0.000 NA   NA
 10455811 10455812 LLKF_1465 LLKF_1466 ptp ptp TRUE 0.946 -13.000 0.000 NA   NA
 10455813 10455814 LLKF_t0038 LLKF_1467 trnL pp201 FALSE 0.077 1460.000 0.000 NA   NA
 10455815 10455816 LLKF_t0039 LLKF_1468 trnM pp202 FALSE 0.079 1041.000 0.000 NA   NA
 10455816 10455817 LLKF_1468 LLKF_1469 pp202 pp203 FALSE 0.093 567.000 0.000 NA   NA
 10455817 10455818 LLKF_1469 LLKF_1470 pp203 pp204 TRUE 0.491 91.000 0.000 NA   NA
 10455818 10455819 LLKF_1470 LLKF_1471 pp204 pp205 TRUE 0.459 103.000 0.000 NA   NA
 10455819 10455820 LLKF_1471 LLKF_1472 pp205 pp206 TRUE 0.494 89.000 0.000 NA   NA
 10455820 10455821 LLKF_1472 LLKF_1473 pp206 pp207 FALSE 0.122 403.000 0.000 NA   NA
 10455821 10455822 LLKF_1473 LLKF_1474 pp207 pp208 FALSE 0.278 233.000 0.000 NA   NA
 10455822 10455823 LLKF_1474 LLKF_1475 pp208 pp209 TRUE 0.882 13.000 0.000 NA   NA
 10455823 10455824 LLKF_1475 LLKF_1476 pp209 pp210 TRUE 0.934 0.000 0.000 NA   NA
 10455824 10455825 LLKF_1476 LLKF_1477 pp210 pp211 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455827 10455828 LLKF_1478 LLKF_1479 pp212 pp213 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455828 10455829 LLKF_1479 LLKF_1480 pp213 pp214 FALSE 0.227 270.000 0.000 NA   NA
 10455829 10455830 LLKF_1480 LLKF_1481 pp214 pp215 TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 10455830 10455831 LLKF_1481 LLKF_1482 pp215 pp216 TRUE 0.923 -10.000 0.000 1.000   NA
 10455831 10455832 LLKF_1482 LLKF_1483 pp216 pp217 FALSE 0.260 154.000 0.000 NA N NA
 10455832 10455833 LLKF_1483 LLKF_1484 pp217 pp218 FALSE 0.328 92.000 0.000 NA N NA
 10455833 10455834 LLKF_1484 LLKF_1485 pp218 pp219 TRUE 0.903 10.000 0.000 NA   NA
 10455834 10455835 LLKF_1485 LLKF_1486 pp219 pp220 TRUE 0.926 2.000 0.000 NA   NA
 10455835 10455836 LLKF_1486 LLKF_1487 pp220 pp221 TRUE 0.830 20.000 0.000 NA   NA
 10455836 10455837 LLKF_1487 LLKF_1488 pp221 pp222 TRUE 0.993 0.000 0.500 NA   NA
 10455837 10455838 LLKF_1488 LLKF_1489 pp222 pp223 TRUE 0.934 0.000 0.000 NA   NA
 10455838 10455839 LLKF_1489 LLKF_1490 pp223 pp224 TRUE 0.518 76.000 0.000 NA   NA
 10455839 10455840 LLKF_1490 LLKF_1491 pp224 pp225 FALSE 0.282 230.000 0.000 NA   NA
 10455840 10455841 LLKF_1491 LLKF_1492 pp225 pp226 TRUE 0.932 113.000 0.750 NA   NA
 10455841 10455842 LLKF_1492 LLKF_1493 pp226 pp227 TRUE 0.987 31.000 0.833 NA   NA
 10455842 10455843 LLKF_1493 LLKF_1494 pp227 pp228 TRUE 0.988 -3.000 0.273 NA   NA
 10455843 10455844 LLKF_1494 LLKF_1495 pp228 pp229 TRUE 0.983 2.000 0.250 NA   NA
 10455844 10455845 LLKF_1495 LLKF_1496 pp229 pp230 TRUE 0.991 -25.000 0.333 NA   NA
 10455845 10455846 LLKF_1496 LLKF_1497 pp230 pp231 TRUE 0.967 16.000 0.263 NA   NA
 10455846 10455847 LLKF_1497 LLKF_1498 pp231 pp232 TRUE 0.980 12.000 0.316 NA   NA
 10455847 10455848 LLKF_1498 LLKF_1499 pp232 pp233 TRUE 0.937 43.000 0.333 NA   NA
 10455848 10455849 LLKF_1499 LLKF_1500 pp233 pp234 TRUE 0.992 -3.000 0.429 NA   NA
 10455849 10455850 LLKF_1500 LLKF_1501 pp234 pp235 TRUE 0.988 -13.000 0.250 NA   NA
 10455850 10455851 LLKF_1501 LLKF_1502 pp235 pp236 TRUE 0.995 -10.000 0.500 NA   NA
 10455851 10455852 LLKF_1502 LLKF_1503 pp236 pp237 TRUE 0.703 128.000 0.278 NA N NA
 10455852 10455853 LLKF_1503 LLKF_1504 pp237 pp238 TRUE 0.882 13.000 0.000 NA   NA
 10455855 10455856 LLKF_1505 LLKF_1506 pp239 pp240 TRUE 0.506 80.000 0.000 NA   NA
 10455856 10455857 LLKF_1506 LLKF_1507 pp240 pp241 FALSE 0.087 726.000 0.000 NA   NA
 10455857 10455858 LLKF_1507 LLKF_1508 pp241 pp242 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455858 10455859 LLKF_1508 LLKF_1509 pp242 pp243 TRUE 0.655 52.000 0.000 NA   NA
 10455859 10455860 LLKF_1509 LLKF_1510 pp243 pp244 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455860 10455861 LLKF_1510 LLKF_1511 pp244 pp245 TRUE 0.945 -7.000 0.000 NA   NA
 10455861 10455862 LLKF_1511 LLKF_1512 pp245 pp246 TRUE 0.945 -7.000 0.000 NA   NA
 10455862 10455863 LLKF_1512 LLKF_1513 pp246 pp247 TRUE 0.915 5.000 0.000 NA   NA
 10455863 10455864 LLKF_1513 LLKF_1514 pp247 pp248 TRUE 0.859 16.000 0.000 NA   NA
 10455864 10455865 LLKF_1514 LLKF_1515 pp248 pp249 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455865 10455866 LLKF_1515 LLKF_1516 pp249 pp250 TRUE 0.479 96.000 0.000 NA   NA
 10455866 10455867 LLKF_1516 LLKF_1517 pp250 pp251 TRUE 0.755 34.000 0.000 NA   NA
 10455867 10455868 LLKF_1517 LLKF_1518 pp251 pp252 TRUE 0.946 -22.000 0.000 NA   NA
 10455868 10455869 LLKF_1518 LLKF_1519 pp252 pp253 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455869 10455870 LLKF_1519 LLKF_1520 pp253 pp254 TRUE 0.907 9.000 0.000 NA   NA
 10455870 10455871 LLKF_1520 LLKF_1521 pp254 pp255 TRUE 0.891 12.000 0.000 NA   NA
 10455871 10455872 LLKF_1521 LLKF_1522 pp255 pp256 FALSE 0.259 250.000 0.000 NA   NA
 10455872 10455873 LLKF_1522 LLKF_1523 pp256 pp257 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455873 10455874 LLKF_1523 LLKF_1524 pp257 pp258 TRUE 0.946 -19.000 0.000 NA   NA
 10455874 10455875 LLKF_1524 LLKF_1525 pp258 pp259 TRUE 0.946 -16.000 0.000 NA   NA
 10455875 10455876 LLKF_1525 LLKF_1526 pp259 pp260 TRUE 0.468 265.000 0.000 NA Y NA
 10455876 10455877 LLKF_1526 LLKF_1527 pp260 pp261 TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455877 10455878 LLKF_1527 LLKF_1528 pp261 pp262 TRUE 0.453 105.000 0.000 NA   NA
 10455878 10455879 LLKF_1528 LLKF_1529 pp262 pp263 FALSE 0.183 305.000 0.000 NA   NA
 10455879 10455880 LLKF_1529 LLKF_1530 pp263 pp264 TRUE 0.414 142.000 0.000 NA   NA
 10455880 10455881 LLKF_1530 LLKF_1531 pp264 pp265 TRUE 0.882 13.000 0.000 NA   NA
 10455881 10455882 LLKF_1531 LLKF_1532 pp265 pp266 TRUE 0.926 12.000 0.091 1.000   NA
 10455883 10455884 LLKF_1533 LLKF_1534 pp267 pp268 FALSE 0.092 574.000 0.000 NA   NA
 10455884 10455885 LLKF_1534 LLKF_1535 pp268 pp269 TRUE 0.898 11.000 0.000 NA   NA
 10455885 10455886 LLKF_1535 LLKF_1536 pp269 pp270 FALSE 0.399 166.000 0.000 NA   NA
 10455886 10455887 LLKF_1536 LLKF_1537 pp270 pp271 TRUE 0.602 61.000 0.000 NA   NA
 10455887 10455888 LLKF_1537 LLKF_1538 pp271 pp272 TRUE 0.428 120.000 0.000 NA   NA
 10455890 10455891 LLKF_1540 LLKF_1541 tcsR tcsK TRUE 0.974 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 10455891 10455892 LLKF_1541 LLKF_1542 tcsK yogA TRUE 0.467 100.000 0.000 NA   NA
 10455893 10455894 LLKF_1543 LLKF_1544 rgrB bmpA FALSE 0.281 192.000 0.000 1.000   NA
 10455894 10455895 LLKF_1544 LLKF_1545 bmpA cdd FALSE 0.182 259.000 0.000 1.000   NA
 10455895 10455896 LLKF_1545 LLKF_1546 cdd deoC TRUE 0.982 -13.000 0.051 1.000 Y NA
 10455896 10455897 LLKF_1546 LLKF_1547 deoC yogE TRUE 0.837 13.000 0.000 1.000   NA
 10455897 10455898 LLKF_1547 LLKF_1548 yogE pdp TRUE 0.896 2.000 0.000 1.000   NA
 10455898 10455899 LLKF_1548 LLKF_1549 pdp rsmC TRUE 0.643 31.000 0.044 1.000 N NA
 10455901 10455902 LLKF_1551 LLKF_1552 psiE czcD TRUE 0.558 54.000 0.000 1.000   NA
 10455902 10455903 LLKF_1552 LLKF_1553 czcD yogL FALSE 0.141 296.000 0.000 1.000   NA
 10455903 10455904 LLKF_1553 LLKF_1554 yogL yogM FALSE 0.411 81.000 0.000 1.000   NA
 10455904 10455905 LLKF_1554 LLKF_3003 yogM papS TRUE 0.946 -18.000 0.000 NA   NA
 10455905 10455906 LLKF_3003 LLKF_1555 papS papS TRUE 0.930 1.000 0.000 NA   NA
 10455908 10455909 LLKF_1557 LLKF_1558 yohD busAB FALSE 0.363 192.000 0.000 NA   NA
 10455909 10455910 LLKF_1558 LLKF_1559 busAB busAA TRUE 0.997 -3.000 0.177 0.069 Y NA
 10455910 10455911 LLKF_1559 LLKF_1560 busAA busR FALSE 0.224 211.000 0.052 1.000 N NA
 10455911 10455912 LLKF_1560 LLKF_1561 busR yohH FALSE 0.122 216.000 0.000 1.000 N NA
 10455912 10455913 LLKF_1561 LLKF_1562 yohH yohJ TRUE 0.999 23.000 0.833 0.001 Y NA
 10455913 10455914 LLKF_1562 LLKF_1563 yohJ bglH FALSE 0.028 687.000 0.000 1.000 N NA
 10455914 10455915 LLKF_1563 LLKF_1564 bglH ptbA TRUE 0.818 48.000 0.000 1.000 Y NA
 10455915 10455916 LLKF_1564 LLKF_1565 ptbA bglR TRUE 0.562 107.000 0.095 1.000   NA
 10455916 10455917 LLKF_1565 LLKF_1566 bglR trpA FALSE 0.302 177.000 0.000 1.000   NA
 10455917 10455918 LLKF_1566 LLKF_1567 trpA trpB TRUE 0.999 -3.000 0.248 0.001 Y NA
 10455918 10455919 LLKF_1567 LLKF_1568 trpB yojB FALSE 0.301 62.000 0.000 1.000 N NA
 10455919 10455920 LLKF_1568 LLKF_1569 yojB trpF TRUE 0.837 -7.000 0.000 1.000 N NA
 10455920 10455921 LLKF_1569 LLKF_1570 trpF trpC TRUE 0.999 -10.000 0.264 0.002 Y NA
 10455921 10455922 LLKF_1570 LLKF_1571 trpC trpD TRUE 0.939 47.000 0.216 1.000 Y NA
 10455922 10455923 LLKF_1571 LLKF_1572 trpD trpG TRUE 0.977 -10.000 0.018 1.000 Y NA
 10455923 10455924 LLKF_1572 LLKF_1573 trpG trpE TRUE 0.981 124.000 0.321 0.001 Y NA
 10455924 10455925 LLKF_1573 LLKF_1574 trpE   TRUE 0.662 50.000 0.000 NA   NA
 10455925 10455926 LLKF_1574 LLKF_1575   ypaA FALSE 0.345 202.000 0.000 NA   NA
 10455926 10455927 LLKF_1575 LLKF_1576 ypaA rmaC TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 10455927 10455928 LLKF_1576 LLKF_1577 rmaC ypaC FALSE 0.187 114.000 0.000 1.000 N NA
 10455928 10455929 LLKF_1577 LLKF_1578 ypaC ypaD TRUE 0.518 76.000 0.000 NA   NA
 10455929 10455930 LLKF_1578 LLKF_1579 ypaD ypaE TRUE 0.995 0.000 0.650 NA   NA
 10455931 10455932 LLKF_1580 LLKF_1581 fur ypaH FALSE 0.311 168.000 0.000 1.000   NA
 10455934 10455935 LLKF_1583 LLKF_1584 ypaI potD FALSE 0.261 204.000 0.000 1.000   NA
 10455935 10455936 LLKF_1584 LLKF_1585 potD nirPII TRUE 0.777 131.000 0.133 1.000 Y NA
 10455936 10455937 LLKF_1585 LLKF_1586 nirPII potA TRUE 0.905 28.000 0.028 1.000 Y NA
 10455937 10455938 LLKF_1586 LLKF_1587 potA potB TRUE 0.998 -10.000 0.789 1.000 Y NA
 10455938 10455939 LLKF_1587 LLKF_1588 potB potC TRUE 0.998 2.000 0.286 0.030 Y NA
 10455939 10455940 LLKF_1588 LLKF_1589 potC   TRUE 0.633 110.000 0.000 1.000 Y NA
 10455942 10455943 LLKF_1591 LLKF_3000 corA corA TRUE 0.641 55.000 0.000 NA   NA
 10455943 10455944 LLKF_3000 LLKF_1592 corA ypbC TRUE 0.453 105.000 0.000 NA   NA
 10455945 10455946 LLKF_1593 LLKF_1594     TRUE 0.785 29.000 0.000 NA   NA
 10455946 10455947 LLKF_1594 LLKF_1595     TRUE 0.701 43.000 0.000 NA   NA
 10455947 10455948 LLKF_1595 LLKF_1596     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10455948 10455949 LLKF_1596 LLKF_1597   ostC TRUE 0.432 116.000 0.000 NA   NA
 10455949 10455950 LLKF_1597 LLKF_1598 ostC ostB TRUE 0.993 73.000 0.818 0.030 Y NA
 10455950 10455951 LLKF_1598 LLKF_1599 ostB ostA TRUE 0.999 11.000 0.800 0.030 Y NA
 10455951 10455952 LLKF_1599 LLKF_1600 ostA guaA FALSE 0.064 300.000 0.000 1.000 N NA
 10455952 10455953 LLKF_1600 LLKF_1601 guaA fruK FALSE 0.128 209.000 0.000 1.000 N NA
 10455953 10455954 LLKF_1601 LLKF_1602 fruK glcK TRUE 0.647 103.000 0.000 1.000 Y NA
 10455954 10455955 LLKF_1602 LLKF_1603 glcK ypcA TRUE 0.945 37.000 0.182 1.000 Y NA
 10455955 10455956 LLKF_1603 LLKF_1604 ypcA ypcB TRUE 0.779 30.000 0.000 NA   NA
 10455956 10455957 LLKF_1604 LLKF_1605 ypcB ypcCD TRUE 0.434 115.000 0.000 NA   NA
 10455957 10455958 LLKF_1605 LLKF_1606 ypcCD dexB TRUE 0.907 22.000 0.000 1.000 Y NA
 10455958 10455959 LLKF_1606 LLKF_1607 dexB lnbA TRUE 0.987 -7.000 0.000 0.013   NA
 10455959 10455960 LLKF_1607 LLKF_1608 lnbA ypcG TRUE 0.419 78.000 0.000 1.000   NA
 10455960 10455961 LLKF_1608 LLKF_1609 ypcG ypcH TRUE 0.963 103.000 0.250 0.030 Y NA
 10455961 10455962 LLKF_1609 LLKF_1610 ypcH ypdA TRUE 0.997 56.000 0.917 0.030 Y NA
 10455962 10455963 LLKF_1610 LLKF_1611 ypdA ypdB TRUE 0.972 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10455963 10455964 LLKF_1611 LLKF_1612 ypdB ypdC TRUE 0.888 35.000 0.194 1.000   NA
 10455965 10455966 LLKF_1613 LLKF_1614 rliB ypdD TRUE 0.977 -3.000 0.286 1.000 N NA
 10455967 10455968 LLKF_1615 LLKF_1616 ptk araA TRUE 0.603 149.000 0.000 1.000 Y NA
 10455968 10455969 LLKF_1616 LLKF_1617 araA araD TRUE 0.921 23.000 0.034 1.000 Y NA
 10455969 10455970 LLKF_1617 LLKF_1618 araD araB TRUE 0.958 16.000 0.074 1.000 Y NA
 10455971 10455972 LLKF_1619 LLKF_1620 araT araF TRUE 0.743 24.000 0.000 1.000   NA
 10455972 10455973 LLKF_1620 LLKF_1621 araF araP TRUE 0.950 22.000 0.286 1.000   NA
 10455973 10455974 LLKF_1621 LLKF_1622 araP araR FALSE 0.173 148.000 0.000 1.000 N NA
 10455975 10455976 LLKF_1623 LLKF_1624 xylT xylX FALSE 0.310 169.000 0.000 1.000   NA
 10455976 10455977 LLKF_1624 LLKF_1625 xylX xynB TRUE 0.524 59.000 0.000 1.000   NA
 10455977 10455978 LLKF_1625 LLKF_1626 xynB xynT TRUE 0.957 25.000 0.154 1.000 Y NA
 10455978 10455979 LLKF_1626 LLKF_1627 xynT xylM TRUE 0.794 55.000 0.000 1.000 Y NA
 10455979 10455980 LLKF_1627 LLKF_1628 xylM xylB TRUE 0.962 3.000 0.000 1.000 Y NA
 10455980 10455981 LLKF_1628 LLKF_1629 xylB xylA TRUE 0.838 67.000 0.091 1.000 Y NA
 10455983 10455984 LLKF_1631 LLKF_1632 purK purE TRUE 0.925 108.000 0.000 0.001 Y NA
 10455984 10455985 LLKF_1632 LLKF_1633 purE purD TRUE 0.905 32.000 0.044 1.000 Y NA
 10455986 10455987 LLKF_1634 LLKF_1635 ypfD ypfE FALSE 0.365 104.000 0.000 1.000   NA
 10455988 10455989 LLKF_1636 LLKF_1637 ypfF purH FALSE 0.302 177.000 0.000 1.000   NA
 10455989 10455990 LLKF_1637 LLKF_1638 purH hprT TRUE 0.579 176.000 0.000 1.000 Y NA
 10455990 10455991 LLKF_1638 LLKF_1639 hprT ypgB FALSE 0.173 137.000 0.000 1.000 N NA
 10455993 10455994 LLKF_1641 LLKF_1642 ypgD purN FALSE 0.186 115.000 0.000 1.000 N NA
 10455994 10455995 LLKF_1642 LLKF_1643 purN purM TRUE 0.993 29.000 0.238 0.003 Y NA
 10455995 10455996 LLKF_1643 LLKF_1644 purM clpB FALSE 0.148 189.000 0.000 1.000 N NA
 10455997 10455998 LLKF_1645 LLKF_1646 ypgH ypgH TRUE 0.729 38.000 0.000 NA   NA
 10455998 10455999 LLKF_1646 LLKF_1647 ypgH ypgH FALSE 0.340 204.000 0.000 NA   NA
 10456000 10456001 LLKF_1648 LLKF_1649 yphA purF TRUE 0.442 111.000 0.000 NA   NA
 10456001 10456002 LLKF_1649 LLKF_1650 purF yphC FALSE 0.186 115.000 0.000 1.000 N NA
 10456002 10456003 LLKF_1650 LLKF_1651 yphC purL FALSE 0.190 112.000 0.000 1.000 N NA
 10456003 10456004 LLKF_1651 LLKF_1652 purL purQ TRUE 0.971 220.000 0.346 0.001 Y NA
 10456004 10456005 LLKF_1652 LLKF_1653 purQ purS TRUE 1.000 0.000 0.656 0.001 Y NA
 10456005 10456006 LLKF_1653 LLKF_1654 purS purC TRUE 0.966 56.000 0.460 1.000 Y NA
 10456006 10456007 LLKF_1654 LLKF_1655 purC yphH FALSE 0.326 144.000 0.000 1.000   NA
 10456007 10456008 LLKF_1655 LLKF_1656 yphH yphI TRUE 0.807 16.000 0.000 1.000   NA
 10456008 10456009 LLKF_1656 LLKF_1657 yphI yphJ TRUE 0.837 13.000 0.000 1.000   NA
 10456009 10456010 LLKF_1657 LLKF_1658 yphJ yphK TRUE 0.795 27.000 0.000 NA   NA
 10456010 10456011 LLKF_1658 LLKF_1659 yphK ypiA TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 10456011 10456012 LLKF_1659 LLKF_1660 ypiA ypiB FALSE 0.226 224.000 0.000 1.000   NA
 10456012 10456013 LLKF_1660 LLKF_1661 ypiB rmaI TRUE 0.916 -3.000 0.000 1.000   NA
 10456013 10456014 LLKF_1661 LLKF_1662 rmaI thyA FALSE 0.195 107.000 0.000 1.000 N NA
 10456014 10456015 LLKF_1662 LLKF_1663 thyA ypiE TRUE 0.479 96.000 0.000 NA   NA
 10456015 10456016 LLKF_1663 LLKF_1664 ypiE ypiE TRUE 0.915 5.000 0.000 NA   NA
 10456016 10456017 LLKF_1664 LLKF_1665 ypiE   TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10456017 10456018 LLKF_1665 LLKF_1666   ypiH TRUE 0.760 33.000 0.000 NA   NA
 10456018 10456019 LLKF_1666 LLKF_1667 ypiH ypiJ TRUE 0.501 83.000 0.000 NA   NA
 10456019 10456020 LLKF_1667 LLKF_1668 ypiJ ypiJ TRUE 0.891 12.000 0.000 NA   NA
 10456020 10456021 LLKF_1668 LLKF_1669 ypiJ ypiK TRUE 0.946 -13.000 0.000 NA   NA
 10456021 10456022 LLKF_1669 LLKF_1670 ypiK ypiL FALSE 0.350 199.000 0.000 NA   NA
 10456022 10456023 LLKF_1670 LLKF_1671 ypiL ypjA FALSE 0.383 180.000 0.000 NA   NA
 10456023 10456024 LLKF_1671 LLKF_1672 ypjA ypjB TRUE 0.440 112.000 0.000 NA   NA
 10456024 10456025 LLKF_1672 LLKF_1673 ypjB ypjC TRUE 0.610 60.000 0.000 NA   NA
 10456025 10456026 LLKF_1673 LLKF_1674 ypjC pydA TRUE 0.430 117.000 0.000 NA   NA
 10456028 10456029 LLKF_1676 LLKF_1677 ypjF   TRUE 0.799 26.000 0.000 NA   NA
 10456029 10456030 LLKF_1677 LLKF_1678   ypjG TRUE 0.910 7.000 0.000 NA   NA
 10456030 10456031 LLKF_1678 LLKF_1679 ypjG cmhR FALSE 0.332 128.000 0.000 1.000   NA
 10456031 10456032 LLKF_1679 LLKF_1680 cmhR gldA FALSE 0.210 98.000 0.000 1.000 N NA
 10456032 10456033 LLKF_1680 LLKF_1681 gldA ypjI TRUE 0.459 103.000 0.000 NA   NA
 10456033 10456034 LLKF_1681 LLKF_1682 ypjI pepD TRUE 0.436 114.000 0.000 NA   NA
 10456034 10456035 LLKF_1682 LLKF_1683 pepD papL FALSE 0.185 116.000 0.000 1.000 N NA
 10456035 10456036 LLKF_1683 LLKF_1684 papL yqaB FALSE 0.232 220.000 0.000 1.000   NA
 10456036 10456037 LLKF_1684 LLKF_1685 yqaB dapB TRUE 0.578 49.000 0.000 1.000   NA
 10456037 10456038 LLKF_1685 LLKF_1686 dapB yqaC TRUE 0.464 101.000 0.000 NA   NA
 10456038 10456039 LLKF_1686 LLKF_1687 yqaC yqaD TRUE 0.846 18.000 0.000 NA   NA
 10456039 10456040 LLKF_1687 LLKF_1688 yqaD trmD FALSE 0.335 125.000 0.000 1.000   NA
 10456040 10456041 LLKF_1688 LLKF_1689 trmD rimM TRUE 0.997 5.000 0.672 1.000 Y NA
 10456041 10456042 LLKF_1689 LLKF_1690 rimM yqaG FALSE 0.162 173.000 0.000 1.000 N NA
 10456042 10456043 LLKF_1690 LLKF_1691 yqaG hemH FALSE 0.187 114.000 0.000 1.000 N NA
 10456043 10456044 LLKF_1691 LLKF_1692 hemH yqbA FALSE 0.177 262.000 0.000 1.000   NA
 10456044 10456045 LLKF_1692 LLKF_1693 yqbA rpsP TRUE 0.841 96.000 0.385 1.000   NA
 10456045 10456046 LLKF_1693 LLKF_1694 rpsP mvaA FALSE 0.225 89.000 0.000 1.000 N NA
 10456046 10456047 LLKF_1694 LLKF_1695 mvaA thiL TRUE 0.813 81.000 0.098 1.000 Y NA
 10456049 10456050 LLKF_1697 LLKF_1698 nagB yqbF FALSE 0.410 152.000 0.000 NA   NA
 10456050 10456051 LLKF_1698 LLKF_1699 yqbF yqbF TRUE 0.659 51.000 0.000 NA   NA
 10456051 10456052 LLKF_1699 LLKF_1700 yqbF bglG FALSE 0.081 894.000 0.000 NA   NA
 10456053 10456054 LLKF_1701 LLKF_1702 fptA fptB TRUE 0.997 2.000 0.200 0.010 Y NA
 10456054 10456055 LLKF_1702 LLKF_1703 fptB fptC TRUE 0.998 23.000 0.800 0.010 Y NA
 10456055 10456056 LLKF_1703 LLKF_1704 fptC amn TRUE 0.927 61.000 0.250 1.000 Y NA
 10456057 10456058 LLKF_1705 LLKF_1706 kdgA kdgK TRUE 0.930 23.000 0.048 1.000 Y NA
 10456058 10456059 LLKF_1706 LLKF_1707 kdgK aldE TRUE 0.923 18.000 0.000 1.000 Y NA
 10456059 10456060 LLKF_1707 LLKF_1708 aldE uxaA TRUE 0.758 62.000 0.000 1.000 Y NA
 10456060 10456061 LLKF_1708 LLKF_1709 uxaA uxaB TRUE 0.963 9.000 0.034 1.000 Y NA
 10456061 10456062 LLKF_1709 LLKF_1710 uxaB uxaC TRUE 0.612 127.000 0.000 1.000 Y NA
 10456062 10456063 LLKF_1710 LLKF_1711 uxaC uxaT TRUE 0.827 46.000 0.000 1.000 Y NA
 10456063 10456064 LLKF_1711 LLKF_1712 uxaT uxaR FALSE 0.039 413.000 0.000 1.000 N NA
 10456064 10456065 LLKF_1712 LLKF_1713 uxaR   TRUE 0.509 79.000 0.000 NA   NA
 10456065 10456066 LLKF_1713 LLKF_1714     TRUE 0.487 94.000 0.000 NA   NA
 10456067 10456068 LLKF_1715 LLKF_1716     TRUE 0.628 57.000 0.000 NA   NA
 10456068 10456069 LLKF_1716 LLKF_1717     FALSE 0.256 251.000 0.000 NA   NA
 10456069 10456070 LLKF_1717 LLKF_1718     TRUE 0.918 4.000 0.000 NA   NA
 10456070 10456071 LLKF_1718 LLKF_1719     TRUE 0.934 0.000 0.000 NA   NA
 10456071 10456072 LLKF_1719 LLKF_1720     TRUE 0.970 24.000 0.400 NA   NA
 10456072 10456073 LLKF_1720 LLKF_1721   repRC FALSE 0.261 248.000 0.000 NA   NA
 10456073 10456074 LLKF_1721 LLKF_1722 repRC repRC TRUE 0.795 27.000 0.000 NA   NA
 10456074 10456075 LLKF_1722 LLKF_1723 repRC   TRUE 0.945 -7.000 0.000 NA   NA
 10456075 10456076 LLKF_1723 LLKF_1724     TRUE 0.616 59.000 0.000 NA   NA
 10456076 10456077 LLKF_1724 LLKF_1725     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 10456077 10456078 LLKF_1725 LLKF_1726   queA TRUE 0.414 143.000 0.000 NA   NA
 10456079 10456080 LLKF_1727 LLKF_1728 yqbH csc2A TRUE 0.509 79.000 0.000 NA   NA
 10456080 10456081 LLKF_1728 LLKF_1729 csc2A csc2C TRUE 0.849 123.000 0.400 NA   NA
 10456081 10456082 LLKF_1729 LLKF_1730 csc2C csc2B TRUE 0.735 37.000 0.000 NA   NA
 10456082 10456083 LLKF_1730 LLKF_1731 csc2B csc2B TRUE 0.729 38.000 0.000 NA   NA
 10456083 10456084 LLKF_1731 LLKF_1732 csc2B csc2B TRUE 0.729 38.000 0.000 NA   NA
 10456084 10456085 LLKF_1732 LLKF_1733 csc2B csc2B TRUE 0.785 29.000 0.000 NA   NA
 10456085 10456086 LLKF_1733 LLKF_1734 csc2B csc2D TRUE 0.602 61.000 0.000 NA   NA
 10456088 10456089 LLKF_1736 LLKF_1737 yqcG cgtA TRUE 0.785 28.000 0.009 NA   NA
 10456089 10456090 LLKF_1737 LLKF_1738 cgtA ftsQ FALSE 0.412 150.000 0.000 NA   NA
 10456090 10456091 LLKF_1738 LLKF_1739 ftsQ murG TRUE 0.985 1.000 0.072 NA Y NA
 10456091 10456092 LLKF_1739 LLKF_1740 murG murD TRUE 0.623 210.000 0.060 1.000 Y NA
 10456092 10456093 LLKF_1740 LLKF_1741 murD nirPII FALSE 0.053 331.000 0.000 1.000 N NA
 10456093 10456094 LLKF_1741 LLKF_1742 nirPII amtB TRUE 0.491 132.000 0.160 1.000 N NA
 10456094 10456095 LLKF_1742 LLKF_1743 amtB tcsK TRUE 0.526 183.000 0.000 0.068 N NA
 10456095 10456096 LLKF_1743 LLKF_1744 tcsK tcsR TRUE 0.993 9.000 0.438 1.000 Y NA
 10456096 10456097 LLKF_1744 LLKF_1745 tcsR yqdA TRUE 0.419 156.000 0.014 NA   NA
 10456097 10456098 LLKF_1745 LLKF_1746 yqdA rpmE TRUE 0.418 131.000 0.000 NA   NA
 10456098 10456099 LLKF_1746 LLKF_1747 rpmE yqeA FALSE 0.406 156.000 0.000 NA   NA
 10456099 10456100 LLKF_1747 LLKF_1748 yqeA yqeB TRUE 0.503 82.000 0.000 NA   NA
 10456100 10456101 LLKF_1748 LLKF_1749 yqeB yqeD FALSE 0.313 217.000 0.000 NA   NA
 10456101 10456102 LLKF_1749 LLKF_1750 yqeD yqeD TRUE 0.477 97.000 0.000 NA   NA
 10456102 10456103 LLKF_1750 LLKF_1751 yqeD   FALSE 0.260 249.000 0.000 NA   NA
 10456103 10456104 LLKF_1751 LLKF_1752     TRUE 0.457 104.000 0.000 NA   NA
 10456104 10456105 LLKF_1752 LLKF_1753   carA FALSE 0.121 408.000 0.000 NA   NA
 10456105 10456106 LLKF_1753 LLKF_1754 carA pyrB TRUE 0.756 64.000 0.014 1.000 Y NA
 10456106 10456107 LLKF_1754 LLKF_1755 pyrB pyrP TRUE 0.683 183.000 0.064 1.000 Y NA
 10456107 10456108 LLKF_1755 LLKF_1756 pyrP pyrR TRUE 0.825 95.000 0.140 1.000 Y NA
 10456108 10456109 LLKF_1756 LLKF_1757 pyrR yqeH FALSE 0.241 261.000 0.000 NA   NA
 10456110 10456111 LLKF_1758 LLKF_1759 rarA yqeI TRUE 0.839 -10.000 0.000 1.000 N NA
 10456112 10456113 LLKF_1760 LLKF_1761 proA proB TRUE 0.997 18.000 0.281 0.002 Y NA
 10456113 10456114 LLKF_1761 LLKF_1762 proB yqfA TRUE 0.419 130.000 0.000 NA   NA
 10456114 10456115 LLKF_1762 LLKF_1763 yqfA yqfB TRUE 0.922 15.000 0.069 NA   NA
 10456115 10456116 LLKF_1763 LLKF_1764 yqfB azlD TRUE 0.421 128.000 0.000 NA   NA
 10456116 10456117 LLKF_1764 LLKF_1765 azlD azlC TRUE 0.991 -13.000 0.338 NA   NA
 10456118 10456119 LLKF_1766 LLKF_1767 yqfE yqfF TRUE 0.503 82.000 0.000 NA   NA
 10456119 10456120 LLKF_1767 LLKF_3001 yqfF yqfF TRUE 0.498 85.000 0.000 NA   NA
 10456121 10456122 LLKF_1768 LLKF_1769 ffh yqfG TRUE 0.509 79.000 0.000 NA   NA
 10456122 10456123 LLKF_1769 LLKF_1770 yqfG yqgA TRUE 0.666 49.000 0.000 NA   NA
 10456125 10456126 LLKF_1772 LLKF_1773 dapA   TRUE 0.424 124.000 0.000 NA   NA
 10456126 10456127 LLKF_1773 LLKF_1774   yqgC TRUE 0.946 -13.000 0.000 NA   NA
 10456127 10456128 LLKF_1774 LLKF_1775 yqgC asd TRUE 0.723 11.000 0.000 1.000 N NA
 10456128 10456129 LLKF_1775 LLKF_1776 asd yqgE FALSE 0.218 95.000 0.000 1.000 N NA
 10456129 10456130 LLKF_1776 LLKF_1777 yqgE   FALSE 0.380 182.000 0.000 NA   NA
 10456130 10456131 LLKF_1777 LLKF_1778   yqgF TRUE 0.926 2.000 0.000 NA   NA
 10456131 10456132 LLKF_1778 LLKF_1779 yqgF tkt TRUE 0.484 95.000 0.000 NA   NA
 10456132 10456133 LLKF_1779 LLKF_1780 tkt   FALSE 0.296 182.000 0.000 1.000   NA
 10456133 10456134 LLKF_1780 LLKF_1781     TRUE 0.925 61.000 0.091 0.010   NA
 10456134 10456135 LLKF_1781 LLKF_1782   bglG TRUE 0.989 2.000 0.156 0.010 N NA
 10456135 10456136 LLKF_1782 LLKF_1783 bglG kdgA FALSE 0.161 174.000 0.000 1.000 N NA
 10456136 10456137 LLKF_1783 LLKF_1784 kdgA kdgK TRUE 0.973 3.000 0.048 1.000 Y NA
 10456137 10456138 LLKF_1784 LLKF_1785 kdgK uxaC TRUE 0.972 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10456138 10456139 LLKF_1785 LLKF_1786 uxaC yqhA TRUE 0.972 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10456139