MicrobesOnline Operon Predictions for Wolbachia sp. wRi

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6878634 6878635 WRi_t00030 WRi_000040     TRUE 0.624 33.000 0.000 NA   NA
 6878635 6878636 WRi_000040 WRi_000050     FALSE 0.345 73.000 0.000 NA N NA
 6878636 6878637 WRi_000050 WRi_000060     TRUE 0.998 -7.000 0.579 NA Y NA
 6878637 6878638 WRi_000060 WRi_000070     TRUE 0.992 17.000 0.526 NA Y NA
 6878638 6878639 WRi_000070 WRi_000080     TRUE 0.997 2.000 0.452 1.000 Y NA
 6878639 6878640 WRi_000080 WRi_000090   virD4 TRUE 0.981 31.000 0.405 1.000 Y NA
 6878640 6878641 WRi_000090 WRi_000100 virD4   TRUE 0.525 123.000 0.100 1.000   NA
 6878643 6878644 WRi_000120 WRi_000130 rpsL rpsG TRUE 0.997 6.000 0.620 0.011 Y NA
 6878644 6878645 WRi_000130 WRi_000140 rpsG   TRUE 0.975 22.000 0.114 1.000 Y NA
 6878645 6878646 WRi_000140 WRi_000150     TRUE 0.987 12.000 0.102 0.004 Y NA
 6878646 6878647 WRi_000150 WRi_t00160     TRUE 0.818 14.000 0.000 NA   NA
 6878647 6878648 WRi_t00160 WRi_000170     TRUE 0.857 11.000 0.000 NA   NA
 6878648 6878649 WRi_000170 WRi_000180     TRUE 0.998 -10.000 0.843 1.000   NA
 6878649 6878650 WRi_000180 WRi_000190   rplK TRUE 0.997 3.000 0.681 1.000 N NA
 6878650 6878651 WRi_000190 WRi_000200 rplK rplA TRUE 0.998 5.000 0.838 0.069 Y NA
 6878651 6878652 WRi_000200 WRi_000210 rplA rplJ TRUE 0.991 13.000 0.302 0.069 Y NA
 6878652 6878653 WRi_000210 WRi_000220 rplJ rplL TRUE 0.993 27.000 0.884 0.052 Y NA
 6878653 6878654 WRi_000220 WRi_000230 rplL   TRUE 0.675 59.000 0.008 1.000 N NA
 6878655 6878656 WRi_000240 WRi_000250     TRUE 0.899 6.000 0.000 1.000   NA
 6878657 6878658 WRi_000260 WRi_000270 serS   TRUE 0.693 35.000 0.004 1.000 N NA
 6878660 6878661 WRi_000290 WRi_000300   prsA FALSE 0.018 304.000 0.000 NA   NA
 6878661 6878662 WRi_000300 WRi_000310 prsA   TRUE 0.974 -10.000 0.009 1.000 N NA
 6878663 6878664 WRi_000320 WRi_000330 tolB   TRUE 0.969 6.000 0.015 1.000   NA
 6878664 6878665 WRi_000330 WRi_000340   dnaJ FALSE 0.034 209.000 0.000 1.000   NA
 6878665 6878666 WRi_000340 WRi_t00350 dnaJ   FALSE 0.248 86.000 0.000 NA   NA
 6878666 6878667 WRi_t00350 WRi_000360     FALSE 0.366 67.000 0.000 NA   NA
 6878667 6878668 WRi_000360 WRi_000370     FALSE 0.032 215.000 0.000 NA   NA
 6878668 6878669 WRi_000370 WRi_p00380     FALSE 0.044 197.000 0.000 NA   NA
 6878671 6878672 WRi_p00410 WRi_000415     FALSE 0.061 177.000 0.000 NA   NA
 6878673 6878674 WRi_000420 WRi_000430     TRUE 0.754 61.000 0.019 1.000 N NA
 6878674 6878675 WRi_000430 WRi_000440     FALSE 0.011 695.000 0.000 NA N NA
 6878675 6878676 WRi_000440 WRi_000450     TRUE 0.565 61.000 0.005 NA N NA
 6878676 6878677 WRi_000450 WRi_000460     TRUE 0.996 0.000 0.535 NA   NA
 6878677 6878678 WRi_000460 WRi_000470   nlpD TRUE 0.649 46.000 0.005 1.000   NA
 6878678 6878679 WRi_000470 WRi_000480 nlpD leuS TRUE 0.825 13.000 0.003 1.000   NA
 6878679 6878680 WRi_000480 WRi_000490 leuS   FALSE 0.112 119.000 0.002 1.000   NA
 6878682 6878683 WRi_000510 WRi_000550   pdxJ FALSE 0.009 1205.000 0.000 1.000 N NA
 6878684 6878685 WRi_000560 WRi_000570   rpsI FALSE 0.258 147.000 0.012 NA N NA
 6878685 6878686 WRi_000570 WRi_000580 rpsI rplM TRUE 0.992 11.000 0.231 0.051 Y NA
 6878687 6878688 WRi_000590 WRi_000600     TRUE 0.961 20.000 0.130 NA   NA
 6878688 6878689 WRi_000600 WRi_000610     FALSE 0.298 77.000 0.000 NA   NA
 6878689 6878690 WRi_000610 WRi_000620     FALSE 0.009 788.000 0.000 NA   NA
 6878690 6878691 WRi_000620 WRi_000630     FALSE 0.015 364.000 0.000 NA   NA
 6878691 6878692 WRi_000630 WRi_p00640     FALSE 0.105 137.000 0.000 NA   NA
 6878694 6878695 WRi_000660 WRi_000670     TRUE 0.996 -25.000 0.500 NA   NA
 6878695 6878696 WRi_000670 WRi_000680     TRUE 0.958 36.000 0.400 NA   NA
 6878700 6878701 WRi_p00760 WRi_000770     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6878701 6878702 WRi_000770 WRi_000780     TRUE 0.884 8.000 0.000 NA   NA
 6878702 6878703 WRi_000780 WRi_000790     FALSE 0.011 727.000 0.000 1.000 N NA
 6878703 6878704 WRi_000790 WRi_000800     FALSE 0.012 443.000 0.000 1.000   NA
 6878705 6878706 WRi_000810 WRi_000820 pth   TRUE 0.997 0.000 0.496 0.077 Y NA
 6878708 6878709 WRi_000840 WRi_000850   mraW TRUE 0.988 -3.000 0.089 NA   NA
 6878711 6878712 WRi_000870 WRi_000880 map   FALSE 0.304 133.000 0.012 1.000 N NA
 6878713 6878714 WRi_000890 WRi_000900 def   TRUE 0.975 -10.000 0.010 1.000 N NA
 6878714 6878715 WRi_000900 WRi_000910     FALSE 0.009 919.000 0.000 NA   NA
 6878715 6878716 WRi_000910 WRi_000920     TRUE 0.985 -15.000 0.033 NA   NA
 6878716 6878717 WRi_000920 WRi_000930     TRUE 0.998 -16.000 0.515 0.026 Y NA
 6878717 6878718 WRi_000930 WRi_000940   hemB TRUE 0.956 -7.000 0.005 1.000 N NA
 6878718 6878719 WRi_000940 WRi_000950 hemB   FALSE 0.095 147.000 0.000 NA   NA
 6878719 6878720 WRi_000950 WRi_000960   glyQ TRUE 0.636 45.000 0.005 NA   NA
 6878720 6878721 WRi_000960 WRi_000970 glyQ   TRUE 0.998 4.000 0.651 0.003 Y NA
 6878721 6878722 WRi_000970 WRi_000980   uvrC TRUE 0.938 -16.000 0.003 1.000 N NA
 6878724 6878725 WRi_001000 WRi_001010     TRUE 0.625 117.000 0.176 1.000   NA
 6878725 6878726 WRi_001010 WRi_001020     FALSE 0.081 167.000 0.000 NA   NA
 6878726 6878727 WRi_001020 WRi_001030     FALSE 0.225 91.000 0.000 NA   NA
 6878727 6878728 WRi_001030 WRi_001040     TRUE 0.903 -7.000 0.002 NA   NA
 6878728 6878729 WRi_001040 WRi_001050     TRUE 0.886 7.000 0.003 NA   NA
 6878730 6878731 WRi_001060 WRi_001070     TRUE 0.812 12.000 0.002 NA   NA
 6878731 6878732 WRi_001070 WRi_001080     FALSE 0.011 558.000 0.000 1.000   NA
 6878733 6878734 WRi_001090 WRi_001100     FALSE 0.040 381.000 0.000 0.049 Y NA
 6878735 6878736 WRi_001110 WRi_001120 ruvC coxC TRUE 0.973 1.000 0.011 1.000 N NA
 6878736 6878737 WRi_001120 WRi_001130 coxC   TRUE 0.723 48.000 0.007 NA N NA
 6878737 6878738 WRi_001130 WRi_001140     TRUE 0.913 45.000 0.026 NA Y NA
 6878738 6878739 WRi_001140 WRi_001150     FALSE 0.353 127.000 0.014 1.000 N NA
 6878739 6878740 WRi_001150 WRi_t01160     TRUE 0.412 61.000 0.000 NA   NA
 6878740 6878741 WRi_t01160 WRi_001170   rpmA TRUE 0.869 10.000 0.000 NA   NA
 6878741 6878742 WRi_001170 WRi_001180 rpmA rplU TRUE 0.997 11.000 0.667 0.050 Y NA
 6878742 6878743 WRi_001180 WRi_001190 rplU glmU FALSE 0.009 1214.000 0.000 1.000 N NA
 6878743 6878744 WRi_001190 WRi_001200 glmU pheS TRUE 0.930 1.000 0.000 1.000 N NA
 6878745 6878746 WRi_001210 WRi_001220   ribE FALSE 0.044 182.000 0.002 NA   NA
 6878746 6878747 WRi_001220 WRi_001230 ribE   TRUE 0.477 58.000 0.003 1.000   NA
 6878747 6878748 WRi_001230 WRi_n01240     FALSE 0.092 152.000 0.000 NA   NA
 6878748 6878749 WRi_n01240 WRi_p01250     TRUE 0.923 -2.000 0.000 NA   NA
 6878749 6878750 WRi_p01250 WRi_001260     FALSE 0.039 201.000 0.000 NA   NA
 6878750 6878751 WRi_001260 WRi_001270     TRUE 0.998 -9.000 1.000 NA   NA
 6878751 6878752 WRi_001270 WRi_001280     FALSE 0.068 172.000 0.000 NA   NA
 6878752 6878753 WRi_001280 WRi_001290   ftsK TRUE 0.975 5.000 0.021 1.000   NA
 6878753 6878754 WRi_001290 WRi_001300 ftsK   FALSE 0.056 182.000 0.000 1.000   NA
 6878754 6878755 WRi_001300 WRi_001310     FALSE 0.083 161.000 0.000 NA   NA
 6878755 6878756 WRi_001310 WRi_001320     TRUE 0.877 9.000 0.000 NA   NA
 6878756 6878757 WRi_001320 WRi_001330     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6878757 6878758 WRi_001330 WRi_001340     FALSE 0.044 197.000 0.000 NA   NA
 6878758 6878759 WRi_001340 WRi_001350     FALSE 0.325 197.000 0.222 NA   NA
 6878759 6878760 WRi_001350 WRi_001360     TRUE 0.853 26.000 0.009 NA   NA
 6878760 6878761 WRi_001360 WRi_p01370     FALSE 0.059 179.000 0.000 NA   NA
 6878761 6878762 WRi_p01370 WRi_p01380     FALSE 0.023 270.000 0.000 NA   NA
 6878763 6878764 WRi_p01410 WRi_001420   gyrB FALSE 0.011 531.000 0.000 NA   NA
 6878764 6878765 WRi_001420 WRi_001430 gyrB   FALSE 0.064 175.000 0.000 1.000   NA
 6878765 6878766 WRi_001430 WRi_001440   dnaQ TRUE 0.718 45.000 0.007 1.000   NA
 6878766 6878767 WRi_001440 WRi_001450 dnaQ   TRUE 0.866 25.000 0.010 1.000   NA
 6878768 6878769 WRi_001460 WRi_001470 secB   TRUE 0.900 15.000 0.006 1.000 N NA
 6878769 6878770 WRi_001470 WRi_001480   putA FALSE 0.359 135.000 0.006 1.000 Y NA
 6878771 6878772 WRi_001490 WRi_001500     FALSE 0.017 324.000 0.000 NA   NA
 6878772 6878773 WRi_001500 WRi_001510     FALSE 0.011 544.000 0.000 NA   NA
 6878773 6878774 WRi_001510 WRi_001520     TRUE 0.915 16.000 0.000 0.068 Y NA
 6878774 6878775 WRi_001520 WRi_001530     FALSE 0.223 100.000 0.000 1.000 N NA
 6878775 6878776 WRi_001530 WRi_001540     FALSE 0.025 778.000 0.000 NA Y NA
 6878776 6878777 WRi_001540 WRi_001550     TRUE 0.997 -19.000 0.372 NA Y NA
 6878777 6878778 WRi_001550 WRi_001560     FALSE 0.279 80.000 0.000 NA   NA
 6878778 6878779 WRi_001560 WRi_001570     FALSE 0.045 194.000 0.000 NA   NA
 6878781 6878782 WRi_001590 WRi_t01600 tpiA   TRUE 0.703 25.000 0.000 NA   NA
 6878783 6878784 WRi_001610 WRi_001620 ksgA guaB TRUE 0.637 32.000 0.003 1.000 N NA
 6878784 6878785 WRi_001620 WRi_p01630 guaB   FALSE 0.303 76.000 0.000 NA   NA
 6878785 6878786 WRi_p01630 WRi_001660     FALSE 0.078 168.000 0.000 NA   NA
 6878788 6878789 WRi_001680 WRi_p01690     FALSE 0.057 181.000 0.000 NA   NA
 6878789 6878790 WRi_p01690 WRi_001700     TRUE 0.388 63.000 0.000 NA   NA
 6878790 6878791 WRi_001700 WRi_p01710     FALSE 0.069 171.000 0.000 NA   NA
 6878792 6878793 WRi_001740 WRi_001750     FALSE 0.011 350.000 0.002 1.000   NA
 6878793 6878794 WRi_001750 WRi_001760     FALSE 0.018 312.000 0.003 1.000 N NA
 6878796 6878797 WRi_001780 WRi_001790 mutS   FALSE 0.031 221.000 0.000 NA   NA
 6878797 6878798 WRi_001790 WRi_001800     FALSE 0.052 186.000 0.000 NA   NA
 6878800 6878801 WRi_001820 WRi_001830 guaA   FALSE 0.023 987.000 0.000 1.000 Y NA
 6878801 6878802 WRi_001830 WRi_001840     TRUE 0.820 59.000 0.053 1.000   NA
 6878803 6878804 WRi_r01850 WRi_r01860     FALSE 0.253 85.000 0.000 NA   NA
 6878805 6878806 WRi_001870 WRi_001880     FALSE 0.131 125.000 0.000 NA   NA
 6878806 6878807 WRi_001880 WRi_001890     FALSE 0.248 86.000 0.000 NA   NA
 6878807 6878808 WRi_001890 WRi_001900   rpmH FALSE 0.036 206.000 0.000 NA   NA
 6878809 6878810 WRi_001910 WRi_001920     FALSE 0.218 102.000 0.003 0.067 N NA
 6878810 6878811 WRi_001920 WRi_001930     TRUE 0.997 13.000 0.837 0.011 Y NA
 6878813 6878814 WRi_001950 WRi_001960     FALSE 0.027 237.000 0.000 NA   NA
 6878815 6878816 WRi_p01970 WRi_002000     FALSE 0.253 85.000 0.000 NA   NA
 6878818 6878819 WRi_002020 WRi_002030     TRUE 0.910 0.000 0.002 1.000 N NA
 6878819 6878820 WRi_002030 WRi_002040     FALSE 0.183 114.000 0.000 1.000 N NA
 6878823 6878824 WRi_p02070 WRi_002080     TRUE 0.922 0.000 0.000 NA   NA
 6878824 6878825 WRi_002080 WRi_002090   recO FALSE 0.366 67.000 0.000 NA   NA
 6878826 6878827 WRi_002100 WRi_002110     TRUE 0.984 -28.000 0.029 NA   NA
 6878827 6878828 WRi_002110 WRi_002120     TRUE 0.986 5.000 0.120 NA   NA
 6878828 6878829 WRi_002120 WRi_002130     TRUE 0.734 28.000 0.004 1.000 N NA
 6878831 6878832 WRi_002150 WRi_002160     TRUE 0.388 63.000 0.000 NA   NA
 6878832 6878833 WRi_002160 WRi_002170   pyrE FALSE 0.230 98.000 0.000 1.000 N NA
 6878833 6878834 WRi_002170 WRi_002180 pyrE   TRUE 0.972 4.000 0.013 1.000 N NA
 6878834 6878835 WRi_002180 WRi_002190   pyrC FALSE 0.047 199.000 0.000 1.000 N NA
 6878835 6878836 WRi_002190 WRi_002200 pyrC   FALSE 0.160 115.000 0.000 NA   NA
 6878837 6878838 WRi_002210 WRi_002220     FALSE 0.066 174.000 0.000 NA   NA
 6878838 6878839 WRi_002220 WRi_002230   secF FALSE 0.039 201.000 0.000 NA   NA
 6878841 6878842 WRi_002250 WRi_002260     FALSE 0.009 746.000 0.000 1.000   NA
 6878842 6878843 WRi_002260 WRi_002270   ribH TRUE 0.976 -22.000 0.011 1.000 N NA
 6878843 6878844 WRi_002270 WRi_002280 ribH   TRUE 0.994 0.000 0.347 1.000 N NA
 6878844 6878845 WRi_002280 WRi_002290     FALSE 0.020 294.000 0.000 0.040   NA
 6878846 6878847 WRi_002300 WRi_002310   dut FALSE 0.326 67.000 0.002 NA   NA
 6878847 6878848 WRi_002310 WRi_002320 dut argB FALSE 0.013 703.000 0.004 1.000 N NA
 6878848 6878849 WRi_002320 WRi_002330 argB   TRUE 0.981 5.000 0.046 1.000   NA
 6878852 6878853 WRi_002360 WRi_p02370     FALSE 0.031 222.000 0.000 NA   NA
 6878853 6878854 WRi_p02370 WRi_002400     FALSE 0.066 174.000 0.000 NA   NA
 6878858 6878859 WRi_002440 WRi_002450     TRUE 0.548 67.000 0.006 1.000 N NA
 6878860 6878861 WRi_002460 WRi_002470     FALSE 0.342 70.000 0.000 1.000   NA
 6878861 6878862 WRi_002470 WRi_002480     FALSE 0.087 158.000 0.000 NA   NA
 6878862 6878863 WRi_002480 WRi_002490     FALSE 0.009 870.000 0.000 NA   NA
 6878864 6878865 WRi_002500 WRi_002510     TRUE 0.895 5.000 0.002 1.000 N NA
 6878865 6878866 WRi_002510 WRi_002520     TRUE 0.971 -12.000 0.009 1.000   NA
 6878866 6878867 WRi_002520 WRi_p02530   fumC FALSE 0.013 423.000 0.000 NA   NA
 6878867 6878868 WRi_p02530 WRi_p02540 fumC   FALSE 0.279 80.000 0.000 NA   NA
 6878869 6878870 WRi_002550 WRi_002560     TRUE 0.977 16.000 0.216 NA N NA
 6878870 6878871 WRi_002560 WRi_002570     TRUE 0.492 79.000 0.007 NA N NA
 6878872 6878873 WRi_002580 WRi_p02590 pgsA   FALSE 0.173 112.000 0.000 NA   NA
 6878875 6878876 WRi_002610 WRi_002620     FALSE 0.264 114.000 0.005 NA   NA
 6878876 6878877 WRi_002620 WRi_002630     TRUE 0.978 -3.000 0.016 NA   NA
 6878877 6878878 WRi_002630 WRi_002640     TRUE 0.962 8.000 0.012 1.000 N NA
 6878878 6878879 WRi_002640 WRi_002650     FALSE 0.206 168.000 0.012 NA   NA
 6878879 6878880 WRi_002650 WRi_002660     TRUE 0.965 -19.000 0.007 NA   NA
 6878881 6878882 WRi_002670 WRi_p02680     FALSE 0.029 227.000 0.000 NA   NA
 6878883 6878884 WRi_002690 WRi_002700 gap   TRUE 0.978 -3.000 0.014 NA N NA
 6878886 6878887 WRi_002720 WRi_002730     TRUE 0.971 0.000 0.000 0.024 Y NA
 6878887 6878888 WRi_002730 WRi_002740     TRUE 0.991 -16.000 0.022 1.000 Y NA
 6878889 6878890 WRi_002750 WRi_002760     FALSE 0.011 558.000 0.000 NA   NA
 6878890 6878891 WRi_002760 WRi_002770   pyrF TRUE 0.497 50.000 0.000 NA   NA
 6878891 6878892 WRi_002770 WRi_002780 pyrF   TRUE 0.641 31.000 0.000 NA   NA
 6878892 6878893 WRi_002780 WRi_002790     FALSE 0.086 159.000 0.000 NA   NA
 6878893 6878894 WRi_002790 WRi_p02800     FALSE 0.066 174.000 0.000 NA   NA
 6878894 6878895 WRi_p02800 WRi_002810   valS FALSE 0.103 138.000 0.000 NA   NA
 6878898 6878899 WRi_002840 WRi_002850   pyrG TRUE 0.988 0.000 0.083 1.000 N NA
 6878899 6878900 WRi_002850 WRi_002860 pyrG   TRUE 0.831 26.000 0.002 1.000 Y NA
 6878901 6878902 WRi_002870 WRi_002880     TRUE 0.769 18.000 0.000 NA   NA
 6878902 6878903 WRi_002880 WRi_002890     FALSE 0.024 250.000 0.000 NA   NA
 6878904 6878905 WRi_002900 WRi_002910     FALSE 0.017 334.000 0.000 NA   NA
 6878905 6878906 WRi_002910 WRi_002920     FALSE 0.027 241.000 0.000 1.000   NA
 6878907 6878908 WRi_002930 WRi_002940     FALSE 0.014 388.000 0.000 NA   NA
 6878908 6878909 WRi_002940 WRi_002950     FALSE 0.011 567.000 0.000 1.000   NA
 6878909 6878910 WRi_002950 WRi_002960     FALSE 0.218 80.000 0.002 1.000   NA
 6878911 6878912 WRi_002970 WRi_002980     FALSE 0.024 252.000 0.000 NA   NA
 6878912 6878913 WRi_002980 WRi_p02990     FALSE 0.107 136.000 0.000 NA   NA
 6878913 6878914 WRi_p02990 WRi_p03000     FALSE 0.270 81.000 0.000 NA   NA
 6878915 6878916 WRi_003010 WRi_003020     FALSE 0.261 84.000 0.000 NA   NA
 6878917 6878918 WRi_003030 WRi_003040     FALSE 0.186 103.000 0.000 NA   NA
 6878918 6878919 WRi_003040 WRi_003050     TRUE 0.997 -7.000 0.667 NA   NA
 6878919 6878920 WRi_003050 WRi_003060   gmk TRUE 0.913 -16.000 0.002 NA   NA
 6878920 6878921 WRi_003060 WRi_003070 gmk   FALSE 0.020 287.000 0.000 NA   NA
 6878922 6878923 WRi_003080 WRi_003090 sdhA   FALSE 0.010 746.000 0.000 1.000 N NA
 6878924 6878925 WRi_003100 WRi_003110   pccA TRUE 0.725 64.000 0.021 NA   NA
 6878926 6878927 WRi_003120 WRi_003130     TRUE 0.973 -18.000 0.009 NA N NA
 6878927 6878928 WRi_003130 WRi_003140     TRUE 0.975 6.000 0.020 NA N NA
 6878928 6878929 WRi_003140 WRi_003150     TRUE 0.987 9.000 0.040 0.010 Y NA
 6878929 6878930 WRi_003150 WRi_003160   atpE TRUE 0.992 4.000 0.278 0.010   NA
 6878930 6878931 WRi_003160 WRi_003170 atpE atpB TRUE 0.945 60.000 0.628 0.010   NA
 6878932 6878933 WRi_003180 WRi_003190   pheT FALSE 0.135 113.000 0.002 NA   NA
 6878934 6878935 WRi_003200 WRi_003210     TRUE 0.485 69.000 0.005 NA   NA
 6878937 6878938 WRi_003230 WRi_003240 miaB   FALSE 0.010 612.000 0.000 NA   NA
 6878939 6878940 WRi_003250 WRi_003260 pdhA   FALSE 0.015 409.000 0.000 1.000 N NA
 6878941 6878942 WRi_003270 WRi_003280   aspS FALSE 0.356 62.000 0.002 1.000 N NA
 6878943 6878944 WRi_p03290 WRi_003300   ccmA TRUE 0.911 4.000 0.000 NA   NA
 6878944 6878945 WRi_003300 WRi_003310 ccmA   FALSE 0.009 1027.000 0.000 NA N NA
 6878948 6878949 WRi_p03360 WRi_003370     FALSE 0.037 203.000 0.000 NA   NA
 6878949 6878950 WRi_003370 WRi_t03380     FALSE 0.031 219.000 0.000 NA   NA
 6878951 6878952 WRi_003390 WRi_003400 coaD   TRUE 0.701 69.000 0.023 1.000   NA
 6878953 6878954 WRi_003410 WRi_003420 cdsA uppS TRUE 0.995 -10.000 0.400 1.000   NA
 6878954 6878955 WRi_003420 WRi_003430 uppS frr FALSE 0.264 276.000 0.409 1.000 N NA
 6878955 6878956 WRi_003430 WRi_003440 frr pyrH TRUE 0.995 8.000 0.626 1.000 N NA
 6878956 6878957 WRi_003440 WRi_003450 pyrH tsf TRUE 0.990 11.000 0.416 1.000 N NA
 6878957 6878958 WRi_003450 WRi_003460 tsf rpsB TRUE 0.998 -19.000 0.748 1.000 Y NA
 6878959 6878960 WRi_t03470 WRi_003480     FALSE 0.099 141.000 0.000 NA   NA
 6878960 6878961 WRi_003480 WRi_003490   glmS TRUE 0.428 81.000 0.006 NA N NA
 6878961 6878962 WRi_003490 WRi_003500 glmS   FALSE 0.018 307.000 0.000 1.000   NA
 6878962 6878963 WRi_003500 WRi_003510     FALSE 0.013 438.000 0.000 1.000   NA
 6878963 6878964 WRi_003510 WRi_003520     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6878964 6878965 WRi_003520 WRi_003530     FALSE 0.060 178.000 0.000 NA   NA
 6878966 6878967 WRi_003550 WRi_003560 murB hemC TRUE 0.965 -9.000 0.006 1.000 N NA
 6878970 6878971 WRi_p03590 WRi_003610     FALSE 0.295 78.000 0.000 NA   NA
 6878971 6878972 WRi_003610 WRi_003630   secA FALSE 0.009 883.000 0.000 1.000   NA
 6878973 6878974 WRi_p03640 WRi_003650     TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 6878974 6878975 WRi_003650 WRi_003660     FALSE 0.008 1495.000 0.000 1.000   NA
 6878975 6878976 WRi_003660 WRi_003670     FALSE 0.131 126.000 0.000 1.000   NA
 6878976 6878977 WRi_003670 WRi_003680     FALSE 0.029 229.000 0.000 NA   NA
 6878977 6878978 WRi_003680 WRi_003690     TRUE 0.747 21.000 0.000 NA   NA
 6878978 6878979 WRi_003690 WRi_003700     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6878982 6878983 WRi_003730 WRi_003740     FALSE 0.058 180.000 0.000 NA   NA
 6878986 6878987 WRi_003750 WRi_003760 folD ubiX TRUE 0.995 -16.000 0.120 1.000 Y NA
 6878987 6878988 WRi_003760 WRi_003770 ubiX   TRUE 0.990 -7.000 0.120 NA   NA
 6878988 6878989 WRi_003770 WRi_003780     TRUE 0.931 14.000 0.012 NA   NA
 6878989 6878990 WRi_003780 WRi_003790   argD TRUE 0.446 89.000 0.008 NA N NA
 6878991 6878992 WRi_003800 WRi_p03810 nuoD   FALSE 0.015 370.000 0.000 NA   NA
 6878993 6878994 WRi_003840 WRi_003850 argS   FALSE 0.084 134.000 0.002 NA   NA
 6878994 6878995 WRi_003850 WRi_003860     FALSE 0.241 87.000 0.000 NA   NA
 6878995 6878996 WRi_003860 WRi_003880     FALSE 0.009 898.000 0.000 NA   NA
 6878996 6878997 WRi_003880 WRi_003890     FALSE 0.043 202.000 0.000 NA N NA
 6879003 6879004 WRi_003950 WRi_003960   ubiE TRUE 0.934 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6879004 6879005 WRi_003960 WRi_003970 ubiE lipA TRUE 0.704 54.000 0.000 1.000 Y NA
 6879005 6879006 WRi_003970 WRi_003980 lipA rpmB TRUE 0.959 -7.000 0.005 1.000 N NA
 6879006 6879007 WRi_003980 WRi_003990 rpmB   TRUE 0.610 38.000 0.003 NA   NA
 6879007 6879008 WRi_003990 WRi_004000     FALSE 0.016 339.000 0.000 NA   NA
 6879008 6879009 WRi_004000 WRi_t04010     TRUE 0.618 34.000 0.000 NA   NA
 6879009 6879010 WRi_t04010 WRi_004020   rpsD TRUE 0.869 10.000 0.000 NA   NA
 6879013 6879014 WRi_004050 WRi_p04060     FALSE 0.178 110.000 0.000 NA   NA
 6879014 6879015 WRi_p04060 WRi_004065     FALSE 0.295 78.000 0.000 NA   NA
 6879016 6879017 WRi_004070 WRi_004080     FALSE 0.010 728.000 0.000 1.000 N NA
 6879017 6879018 WRi_004080 WRi_004090     FALSE 0.030 226.000 0.000 NA   NA
 6879018 6879019 WRi_004090 WRi_004100     FALSE 0.009 759.000 0.000 NA   NA
 6879025 6879026 WRi_p04160 WRi_004190   pstB FALSE 0.289 79.000 0.000 NA   NA
 6879026 6879027 WRi_004190 WRi_004200 pstB dapB TRUE 0.972 -3.000 0.009 1.000 N NA
 6879027 6879028 WRi_004200 WRi_004210 dapB   FALSE 0.013 407.000 0.000 1.000   NA
 6879028 6879029 WRi_004210 WRi_004220     FALSE 0.072 170.000 0.000 1.000   NA
 6879029 6879030 WRi_004220 WRi_004230     TRUE 0.869 6.000 0.002 NA   NA
 6879030 6879031 WRi_004230 WRi_004240     FALSE 0.272 132.000 0.011 NA   NA
 6879031 6879032 WRi_004240 WRi_004250     TRUE 0.982 2.000 0.032 NA   NA
 6879032 6879033 WRi_004250 WRi_004260   ispE TRUE 0.933 4.000 0.004 NA   NA
 6879035 6879036 WRi_004280 WRi_004290   radC FALSE 0.062 270.000 0.000 0.042 Y NA
 6879036 6879037 WRi_004290 WRi_004300 radC   TRUE 0.929 -25.000 0.000 NA   NA
 6879037 6879038 WRi_004300 WRi_004310     FALSE 0.010 691.000 0.000 NA   NA
 6879038 6879039 WRi_004310 WRi_t04320     TRUE 0.703 25.000 0.000 NA   NA
 6879040 6879041 WRi_004330 WRi_p04340     FALSE 0.120 131.000 0.000 NA   NA
 6879047 6879048 WRi_004400 WRi_004410     FALSE 0.034 210.000 0.000 1.000   NA
 6879049 6879050 WRi_p04420 WRi_004450     FALSE 0.279 80.000 0.000 NA   NA
 6879050 6879051 WRi_004450 WRi_004460   rpmJ TRUE 0.734 50.000 0.010 1.000   NA
 6879051 6879052 WRi_004460 WRi_004470 rpmJ   TRUE 0.732 50.000 0.010 NA   NA
 6879053 6879054 WRi_004480 WRi_004490 ccmC   FALSE 0.024 276.000 0.000 1.000 N NA
 6879054 6879055 WRi_004490 WRi_p04500     FALSE 0.279 80.000 0.000 NA   NA
 6879055 6879056 WRi_p04500 WRi_004510     FALSE 0.024 252.000 0.000 NA   NA
 6879056 6879057 WRi_004510 WRi_004520   infA FALSE 0.169 113.000 0.000 NA   NA
 6879057 6879058 WRi_004520 WRi_004530 infA   TRUE 0.977 -22.000 0.012 NA N NA
 6879059 6879060 WRi_004540 WRi_004550     FALSE 0.016 347.000 0.000 NA   NA
 6879061 6879062 WRi_004560 WRi_p04570     FALSE 0.009 718.000 0.000 NA   NA
 6879063 6879064 WRi_004580 WRi_004590   groEL FALSE 0.010 683.000 0.000 NA   NA
 6879064 6879065 WRi_004590 WRi_004600 groEL groES TRUE 0.714 101.000 0.036 1.000 Y NA
 6879067 6879068 WRi_004620 WRi_004630 recJ   FALSE 0.045 340.000 0.000 0.042 Y NA
 6879068 6879069 WRi_004630 WRi_004640     FALSE 0.008 1091.000 0.000 1.000   NA
 6879069 6879070 WRi_004640 WRi_004650     TRUE 0.612 35.000 0.000 NA   NA
 6879072 6879073 WRi_004670 WRi_004680 lon clpX TRUE 0.987 16.000 0.201 1.000 Y NA
 6879073 6879074 WRi_004680 WRi_004690 clpX clpP TRUE 0.997 0.000 0.352 1.000 Y NA
 6879074 6879075 WRi_004690 WRi_004700 clpP tig TRUE 0.993 12.000 0.351 1.000 Y NA
 6879075 6879076 WRi_004700 WRi_t04710 tig   FALSE 0.089 156.000 0.000 NA   NA
 6879077 6879078 WRi_004720 WRi_004730   gshb TRUE 0.755 61.000 0.023 NA   NA
 6879082 6879083 WRi_004770 WRi_p04780     FALSE 0.024 250.000 0.000 NA   NA
 6879084 6879085 WRi_004790 WRi_004800   rnhA TRUE 0.977 -7.000 0.014 NA   NA
 6879085 6879086 WRi_004800 WRi_004810 rnhA ctaB FALSE 0.075 177.000 0.003 1.000 N NA
 6879086 6879087 WRi_004810 WRi_004820 ctaB coxA TRUE 0.990 2.000 0.153 0.059 N NA
 6879087 6879088 WRi_004820 WRi_004830 coxA coxB TRUE 0.995 16.000 0.741 0.003 Y NA
 6879088 6879089 WRi_004830 WRi_p04840 coxB   FALSE 0.008 1701.000 0.000 NA   NA
 6879089 6879090 WRi_p04840 WRi_004860     FALSE 0.097 143.000 0.000 NA   NA
 6879091 6879092 WRi_004870 WRi_004880 fabG   FALSE 0.214 96.000 0.000 NA   NA
 6879093 6879094 WRi_004890 WRi_004900     TRUE 0.696 72.000 0.030 1.000   NA
 6879094 6879095 WRi_004900 WRi_004910   greA TRUE 0.968 7.000 0.014 1.000 N NA
 6879095 6879096 WRi_004910 WRi_004920 greA atpA TRUE 0.949 10.000 0.009 1.000 N NA
 6879096 6879097 WRi_004920 WRi_004930 atpA atpH TRUE 0.999 -3.000 0.864 0.010 Y NA
 6879097 6879098 WRi_004930 WRi_004940 atpH   TRUE 0.599 42.000 0.003 1.000 N NA
 6879098 6879099 WRi_004940 WRi_004950   rplQ TRUE 0.732 24.000 0.003 1.000 N NA
 6879099 6879100 WRi_004950 WRi_004960 rplQ rpoA TRUE 0.997 8.000 0.873 1.000 N NA
 6879100 6879101 WRi_004960 WRi_004970 rpoA rpsK TRUE 0.973 22.000 0.308 1.000 N NA
 6879101 6879102 WRi_004970 WRi_004980 rpsK rpsM TRUE 0.993 25.000 0.810 0.042 Y NA
 6879102 6879103 WRi_004980 WRi_004990 rpsM adk TRUE 0.550 90.000 0.017 1.000 N NA
 6879103 6879104 WRi_004990 WRi_005000 adk secY TRUE 0.993 -3.000 0.241 1.000 N NA
 6879104 6879105 WRi_005000 WRi_005010 secY rplO TRUE 0.997 4.000 0.730 1.000 N NA
 6879105 6879106 WRi_005010 WRi_005020 rplO rpsE TRUE 0.994 4.000 0.148 0.056 Y NA
 6879106 6879107 WRi_005020 WRi_005030 rpsE rplR TRUE 0.997 13.000 0.814 0.056 Y NA
 6879107 6879108 WRi_005030 WRi_005040 rplR rplF TRUE 0.998 6.000 0.815 0.042 Y NA
 6879108 6879109 WRi_005040 WRi_005050 rplF rpsH TRUE 0.995 17.000 0.808 0.042 Y NA
 6879109 6879110 WRi_005050 WRi_005060 rpsH rpsN TRUE 0.984 22.000 0.295 0.042 Y NA
 6879110 6879111 WRi_005060 WRi_005070 rpsN rplE TRUE 0.988 17.000 0.309 0.042 Y NA
 6879111 6879112 WRi_005070 WRi_005080 rplE rplX TRUE 0.998 7.000 0.758 0.042 Y NA
 6879112 6879113 WRi_005080 WRi_005090 rplX rplN TRUE 0.999 0.000 0.810 0.056 Y NA
 6879113 6879114 WRi_005090 WRi_005100 rplN rpsQ TRUE 0.996 14.000 0.791 0.056 Y NA
 6879114 6879115 WRi_005100 WRi_005110 rpsQ rpmC TRUE 0.999 -7.000 0.828 0.042 Y NA
 6879115 6879116 WRi_005110 WRi_005120 rpmC rplP TRUE 0.997 12.000 0.802 0.042 Y NA
 6879116 6879117 WRi_005120 WRi_005130 rplP rpsC TRUE 0.996 15.000 0.828 0.056 Y NA
 6879117 6879118 WRi_005130 WRi_005140 rpsC rplV TRUE 0.949 40.000 0.109 0.056 Y NA
 6879118 6879119 WRi_005140 WRi_005150 rplV rpsS TRUE 0.992 6.000 0.119 0.056 Y NA
 6879119 6879120 WRi_005150 WRi_005160 rpsS rplB TRUE 0.998 4.000 0.820 0.056 Y NA
 6879120 6879121 WRi_005160 WRi_005170 rplB rplW TRUE 0.999 2.000 0.849 1.000 Y NA
 6879121 6879122 WRi_005170 WRi_005180 rplW rplD TRUE 0.998 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 6879122 6879123 WRi_005180 WRi_005190 rplD rplC TRUE 0.997 3.000 0.486 0.042 Y NA
 6879123 6879124 WRi_005190 WRi_005200 rplC rpsJ TRUE 0.993 10.000 0.307 0.056 Y NA
 6879124 6879125 WRi_005200 WRi_005210 rpsJ tuf TRUE 0.990 15.000 0.318 1.000 Y NA
 6879125 6879126 WRi_005210 WRi_t05220 tuf   FALSE 0.289 79.000 0.000 NA   NA
 6879126 6879127 WRi_t05220 WRi_t05230     TRUE 0.904 5.000 0.000 NA   NA
 6879127 6879128 WRi_t05230 WRi_005240   carA FALSE 0.160 115.000 0.000 NA   NA
 6879130 6879131 WRi_005260 WRi_005270   glpX TRUE 0.385 101.000 0.009 NA   NA
 6879133 6879134 WRi_005290 WRi_005300   ppdK FALSE 0.162 115.000 0.000 1.000   NA
 6879137 6879138 WRi_005330 WRi_005340     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6879138 6879139 WRi_005340 WRi_005350     TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 6879141 6879142 WRi_005370 WRi_p05380     TRUE 0.447 55.000 0.000 NA   NA
 6879142 6879143 WRi_p05380 WRi_005390     FALSE 0.008 1120.000 0.000 NA   NA
 6879144 6879145 WRi_005400 WRi_p05410     TRUE 0.927 -6.000 0.000 NA   NA
 6879145 6879146 WRi_p05410 WRi_005420     TRUE 0.665 27.000 0.000 NA   NA
 6879146 6879147 WRi_005420 WRi_005440     FALSE 0.016 346.000 0.000 NA   NA
 6879147 6879148 WRi_005440 WRi_005450     TRUE 0.685 26.000 0.000 NA   NA
 6879148 6879149 WRi_005450 WRi_005460     TRUE 0.776 168.000 1.000 NA   NA
 6879149 6879150 WRi_005460 WRi_005470     TRUE 0.991 0.000 0.167 NA   NA
 6879150 6879151 WRi_005470 WRi_005480     TRUE 0.990 3.000 0.167 NA   NA
 6879151 6879152 WRi_005480 WRi_005490     TRUE 0.998 3.000 1.000 NA   NA
 6879152 6879153 WRi_005490 WRi_005500     TRUE 0.988 8.000 0.250 NA   NA
 6879153 6879154 WRi_005500 WRi_005510     TRUE 0.993 -13.000 0.250 NA   NA
 6879154 6879155 WRi_005510 WRi_005520     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6879155 6879156 WRi_005520 WRi_005530     TRUE 0.919 2.000 0.000 NA   NA
 6879156 6879157 WRi_005530 WRi_005540     FALSE 0.207 98.000 0.000 NA   NA
 6879157 6879158 WRi_005540 WRi_005550     TRUE 0.593 38.000 0.000 NA   NA
 6879158 6879159 WRi_005550 WRi_005560     TRUE 0.893 75.000 0.500 NA   NA
 6879159 6879160 WRi_005560 WRi_005570     TRUE 0.997 -3.000 0.667 1.000   NA
 6879160 6879161 WRi_005570 WRi_005580     FALSE 0.186 103.000 0.000 NA   NA
 6879161 6879162 WRi_005580 WRi_005590     TRUE 0.928 -9.000 0.000 NA   NA
 6879162 6879163 WRi_005590 WRi_005600     TRUE 0.561 41.000 0.000 NA   NA
 6879163 6879164 WRi_005600 WRi_005610     TRUE 0.911 4.000 0.000 NA   NA
 6879164 6879165 WRi_005610 WRi_005620     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6879165 6879166 WRi_005620 WRi_005630     TRUE 0.911 4.000 0.000 NA   NA
 6879166 6879167 WRi_005630 WRi_005640     TRUE 0.988 14.000 0.500 NA   NA
 6879167 6879168 WRi_005640 WRi_005650     FALSE 0.147 114.000 0.002 1.000   NA
 6879169 6879170 WRi_005660 WRi_005670     FALSE 0.010 586.000 0.000 NA   NA
 6879170 6879171 WRi_005670 WRi_005680     FALSE 0.046 193.000 0.000 NA   NA
 6879171 6879172 WRi_005680 WRi_005690     FALSE 0.014 395.000 0.000 NA   NA
 6879176 6879177 WRi_005730 WRi_005740     FALSE 0.118 132.000 0.000 1.000   NA
 6879177 6879178 WRi_005740 WRi_005750     TRUE 0.973 -43.000 0.000 1.000 Y NA
 6879178 6879179 WRi_005750 WRi_005760     TRUE 0.922 0.000 0.000 NA   NA
 6879179 6879180 WRi_005760 WRi_005770     TRUE 0.911 4.000 0.000 NA   NA
 6879180 6879181 WRi_005770 WRi_005780     TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 6879181 6879182 WRi_005780 WRi_005790     TRUE 0.928 2.000 0.000 1.000 N NA
 6879182 6879183 WRi_005790 WRi_005800     TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 6879183 6879184 WRi_005800 WRi_005810     FALSE 0.139 128.000 0.000 NA N NA
 6879185 6879186 WRi_005820 WRi_005830     TRUE 0.382 65.000 0.000 1.000   NA
 6879186 6879187 WRi_005830 WRi_005840     FALSE 0.012 484.000 0.000 1.000   NA
 6879187 6879188 WRi_005840 WRi_005850     TRUE 0.692 26.000 0.000 0.030   NA
 6879188 6879189 WRi_005850 WRi_005860     FALSE 0.303 76.000 0.000 NA   NA
 6879189 6879190 WRi_005860 WRi_005870     TRUE 0.909 101.000 1.000 NA   NA
 6879190 6879191 WRi_005870 WRi_005880     TRUE 0.761 170.000 1.000 1.000   NA
 6879196 6879197 WRi_005930 WRi_005940     FALSE 0.101 140.000 0.000 NA   NA
 6879200 6879201 WRi_005970 WRi_005980   trxB FALSE 0.026 264.000 0.000 1.000 N NA
 6879201 6879202 WRi_005980 WRi_005990 trxB   TRUE 0.992 -13.000 0.024 1.000 Y NA
 6879202 6879203 WRi_005990 WRi_006000     FALSE 0.009 949.000 0.000 NA   NA
 6879203 6879204 WRi_006000 WRi_006010     FALSE 0.156 116.000 0.000 NA   NA
 6879205 6879206 WRi_006020 WRi_006030 ribF lspA TRUE 0.978 -3.000 0.013 1.000 N NA
 6879206 6879207 WRi_006030 WRi_006040 lspA   TRUE 0.909 30.000 0.038 0.029   NA
 6879207 6879208 WRi_006040 WRi_006050     TRUE 0.997 -13.000 0.598 0.008   NA
 6879212 6879213 WRi_006090 WRi_006100   smpB FALSE 0.113 121.000 0.002 NA   NA
 6879213 6879214 WRi_006100 WRi_006110 smpB lgt TRUE 0.908 7.000 0.003 1.000 N NA
 6879214 6879215 WRi_006110 WRi_006120 lgt   FALSE 0.010 691.000 0.000 1.000   NA
 6879215 6879216 WRi_006120 WRi_p06130     FALSE 0.015 362.000 0.000 NA   NA
 6879218 6879219 WRi_006150 WRi_006160     TRUE 0.992 5.000 0.333 NA   NA
 6879219 6879220 WRi_006160 WRi_t06170     TRUE 0.818 14.000 0.000 NA   NA
 6879220 6879221 WRi_t06170 WRi_006180   ssb FALSE 0.355 68.000 0.000 NA   NA
 6879221 6879222 WRi_006180 WRi_006190 ssb dapA TRUE 0.509 103.000 0.021 1.000 N NA
 6879224 6879225 WRi_006210 WRi_006220 gltX   FALSE 0.012 545.000 0.000 1.000 N NA
 6879225 6879226 WRi_006220 WRi_006230   rpsF TRUE 0.586 49.000 0.003 1.000 N NA
 6879226 6879227 WRi_006230 WRi_006240 rpsF rpsR TRUE 0.972 0.000 0.003 0.040 Y NA
 6879227 6879228 WRi_006240 WRi_006250 rpsR rplI TRUE 0.996 8.000 0.499 0.040 Y NA
 6879228 6879229 WRi_006250 WRi_006260 rplI purB FALSE 0.038 237.000 0.004 1.000 N NA
 6879229 6879230 WRi_006260 WRi_t06270 purB   TRUE 0.922 0.000 0.000 NA   NA
 6879233 6879234 WRi_006300 WRi_006310   nth FALSE 0.021 277.000 0.000 1.000   NA
 6879234 6879235 WRi_006310 WRi_006320 nth   TRUE 0.763 22.000 0.003 1.000   NA
 6879235 6879236 WRi_006320 WRi_006330     TRUE 0.646 84.000 0.034 1.000   NA
 6879237 6879238 WRi_006340 WRi_006350     TRUE 0.726 23.000 0.000 NA   NA
 6879239 6879240 WRi_006360 WRi_006370 rho   FALSE 0.058 200.000 0.005 NA   NA
 6879243 6879244 WRi_p06400 WRi_p06410     FALSE 0.011 522.000 0.000 NA   NA
 6879244 6879245 WRi_p06410 WRi_006420     FALSE 0.018 308.000 0.000 NA   NA
 6879246 6879247 WRi_006430 WRi_006440     FALSE 0.012 476.000 0.000 NA   NA
 6879247 6879248 WRi_006440 WRi_006450     FALSE 0.009 870.000 0.000 NA   NA
 6879250 6879251 WRi_006470 WRi_006480     TRUE 0.702 40.000 0.005 NA   NA
 6879252 6879253 WRi_006490 WRi_006500 dgt ribD TRUE 0.943 0.000 0.004 1.000 N NA
 6879253 6879254 WRi_006500 WRi_p06510 ribD   FALSE 0.169 113.000 0.000 NA   NA
 6879255 6879256 WRi_006530 WRi_006540 rpe   FALSE 0.173 112.000 0.000 NA   NA
 6879258 6879259 WRi_006560 WRi_006570     TRUE 0.990 1.000 0.158 NA   NA
 6879261 6879262 WRi_006590 WRi_006600     FALSE 0.008 990.000 0.000 NA   NA
 6879262 6879263 WRi_006600 WRi_006610     TRUE 0.987 -45.000 0.039 1.000 N NA
 6879264 6879265 WRi_006620 WRi_p06630 radC   FALSE 0.183 104.000 0.000 NA   NA
 6879267 6879268 WRi_006650 WRi_p06660     TRUE 0.476 52.000 0.000 NA   NA
 6879268 6879269 WRi_p06660 WRi_p06670     FALSE 0.010 591.000 0.000 NA   NA
 6879269 6879270 WRi_p06670 WRi_p06680     TRUE 0.485 51.000 0.000 NA   NA
 6879273 6879274 WRi_006710 WRi_006720     TRUE 0.869 10.000 0.000 NA   NA
 6879275 6879276 WRi_p06730 WRi_006740     FALSE 0.014 392.000 0.000 NA   NA
 6879276 6879277 WRi_006740 WRi_006750     TRUE 0.703 25.000 0.000 NA   NA
 6879277 6879278 WRi_006750 WRi_006760     TRUE 0.633 32.000 0.000 NA   NA
 6879281 6879282 WRi_006790 WRi_006800   hspC2 FALSE 0.033 213.000 0.000 NA   NA
 6879282 6879283 WRi_006800 WRi_006810 hspC2   FALSE 0.012 443.000 0.000 NA   NA
 6879283 6879284 WRi_006810 WRi_006820     TRUE 0.606 36.000 0.000 NA   NA
 6879284 6879285 WRi_006820 WRi_p06840     TRUE 0.412 61.000 0.000 NA   NA
 6879285 6879286 WRi_p06840 WRi_006850     FALSE 0.014 381.000 0.000 NA   NA
 6879286 6879287 WRi_006850 WRi_006860     FALSE 0.015 373.000 0.000 NA   NA
 6879287 6879288 WRi_006860 WRi_006870     FALSE 0.214 96.000 0.000 NA   NA
 6879288 6879289 WRi_006870 WRi_006880     FALSE 0.009 874.000 0.000 NA   NA
 6879289 6879290 WRi_006880 WRi_006890     TRUE 0.975 10.000 0.051 NA   NA
 6879292 6879293 WRi_006910 WRi_006920     TRUE 0.919 2.000 0.000 NA   NA
 6879293 6879294 WRi_006920 WRi_006930     TRUE 0.929 -22.000 0.000 NA   NA
 6879294 6879295 WRi_006930 WRi_006940     TRUE 0.911 4.000 0.000 NA   NA
 6879295 6879296 WRi_006940 WRi_006950     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6879296 6879297 WRi_006950 WRi_006960     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6879297 6879298 WRi_006960 WRi_006970     TRUE 0.781 17.000 0.000 NA   NA
 6879298 6879299 WRi_006970 WRi_006980     TRUE 0.957 22.000 0.133 NA   NA
 6879299 6879300 WRi_006980 WRi_006990     TRUE 0.927 -7.000 0.000 NA   NA
 6879300 6879301 WRi_006990 WRi_007000     TRUE 0.804 15.000 0.000 NA   NA
 6879301 6879302 WRi_007000 WRi_007010     TRUE 0.997 -3.000 0.750 NA   NA
 6879302 6879303 WRi_007010 WRi_007020     TRUE 0.994 6.000 0.500 NA   NA
 6879303 6879304 WRi_007020 WRi_p07030     TRUE 0.846 12.000 0.000 NA   NA
 6879304 6879305 WRi_p07030 WRi_007040     TRUE 0.665 27.000 0.000 NA   NA
 6879305 6879306 WRi_007040 WRi_007060     FALSE 0.009 880.000 0.000 NA   NA
 6879306 6879307 WRi_007060 WRi_007070     TRUE 0.747 21.000 0.000 NA   NA
 6879307 6879308 WRi_007070 WRi_007080     TRUE 0.891 7.000 0.000 NA   NA
 6879308 6879309 WRi_007080 WRi_007090     TRUE 0.869 10.000 0.000 NA   NA
 6879309 6879310 WRi_007090 WRi_007100     TRUE 0.898 6.000 0.000 NA   NA
 6879310 6879311 WRi_007100 WRi_007110     TRUE 0.988 9.000 0.250 NA   NA
 6879311 6879312 WRi_007110 WRi_007120     TRUE 0.993 -13.000 0.250 NA   NA
 6879312 6879313 WRi_007120 WRi_007130     TRUE 0.929 -19.000 0.000 NA   NA
 6879313 6879314 WRi_007130 WRi_007140     TRUE 0.927 -7.000 0.000 NA   NA
 6879314 6879315 WRi_007140 WRi_007150     FALSE 0.261 84.000 0.000 NA   NA
 6879315 6879316 WRi_007150 WRi_007160     TRUE 0.976 26.000 0.500 NA   NA
 6879316 6879317 WRi_007160 WRi_007170     TRUE 0.911 68.000 0.500 NA   NA
 6879317 6879318 WRi_007170 WRi_007180     TRUE 0.997 -3.000 0.667 1.000   NA
 6879318 6879319 WRi_007180 WRi_007190     TRUE 0.994 0.000 0.400 NA   NA
 6879319 6879320 WRi_007190 WRi_007200     TRUE 0.922 0.000 0.000 NA   NA
 6879320 6879321 WRi_007200 WRi_007210     TRUE 0.928 -10.000 0.000 NA   NA
 6879321 6879322 WRi_007210 WRi_p07220     TRUE 0.928 -9.000 0.000 NA   NA
 6879323 6879324 WRi_p07230 WRi_007240     FALSE 0.019 294.000 0.000 NA   NA
 6879325 6879326 WRi_007250 WRi_007260     TRUE 0.965 3.000 0.008 1.000 N NA
 6879326 6879327 WRi_007260 WRi_007270     TRUE 0.979 -7.000 0.015 NA   NA
 6879329 6879330 WRi_t07290 WRi_007300     TRUE 0.633 32.000 0.000 NA   NA
 6879330 6879331 WRi_007300 WRi_007310     FALSE 0.012 437.000 0.000 NA   NA
 6879331 6879332 WRi_007310 WRi_007320     FALSE 0.035 208.000 0.000 1.000   NA
 6879332 6879333 WRi_007320 WRi_007330   era TRUE 0.985 -7.000 0.035 1.000   NA
 6879333 6879334 WRi_007330 WRi_007340 era   FALSE 0.120 131.000 0.000 NA   NA
 6879334 6879335 WRi_007340 WRi_007350   cydB TRUE 0.792 16.000 0.000 NA   NA
 6879335 6879336 WRi_007350 WRi_007360 cydB cydA TRUE 0.994 -7.000 0.095 0.038 Y NA
 6879337 6879338 WRi_007370 WRi_007380     TRUE 0.960 2.000 0.007 1.000   NA
 6879339 6879340 WRi_007390 WRi_007400   tgt FALSE 0.009 725.000 0.000 NA   NA
 6879340 6879341 WRi_007400 WRi_007410 tgt nuoE TRUE 0.945 1.000 0.004 1.000 N NA
 6879342 6879343 WRi_007420 WRi_n07430     FALSE 0.086 159.000 0.000 NA   NA
 6879345 6879346 WRi_007450 WRi_007460 gpsA   TRUE 0.855 20.000 0.005 1.000 N NA
 6879346 6879347 WRi_007460 WRi_007470     TRUE 0.981 -10.000 0.018 1.000   NA
 6879347 6879348 WRi_007470 WRi_007480     TRUE 0.971 43.000 0.700 1.000   NA
 6879349 6879350 WRi_007490 WRi_007500 sdhB   FALSE 0.257 87.000 0.003 NA   NA
 6879350 6879351 WRi_007500 WRi_007510     FALSE 0.023 385.000 0.005 NA   NA
 6879351 6879352 WRi_007510 WRi_007520   ftsZ TRUE 0.960 0.000 0.006 NA   NA
 6879352 6879353 WRi_007520 WRi_007530 ftsZ   FALSE 0.025 249.000 0.000 NA   NA
 6879353 6879354 WRi_007530 WRi_007540     FALSE 0.261 84.000 0.000 NA   NA
 6879354 6879355 WRi_007540 WRi_007550     TRUE 0.938 -70.000 0.000 0.088 N NA
 6879356 6879357 WRi_007560 WRi_007570     TRUE 0.998 -34.000 1.000 NA   NA
 6879358 6879359 WRi_007580 WRi_007590     TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 6879359 6879360 WRi_007590 WRi_007600     TRUE 0.997 -3.000 0.667 NA   NA
 6879360 6879361 WRi_007600 WRi_007610     TRUE 0.718 24.000 0.000 NA   NA
 6879361 6879362 WRi_007610 WRi_007620     TRUE 0.476 52.000 0.000 NA   NA
 6879363 6879364 WRi_007630 WRi_007640     FALSE 0.289 79.000 0.000 NA   NA
 6879364 6879365 WRi_007640 WRi_p07650     TRUE 0.756 20.000 0.000 NA   NA
 6879367 6879368 WRi_007670 WRi_007680 rpsP ispB TRUE 0.869 11.000 0.003 1.000 N NA
 6879368 6879369 WRi_007680 WRi_007690 ispB grpE TRUE 0.560 62.000 0.005 1.000 N NA
 6879369 6879370 WRi_007690 WRi_007700 grpE trpS TRUE 0.792 18.000 0.000 1.000 N NA
 6879371 6879372 WRi_007710 WRi_007720     TRUE 0.984 2.000 0.037 1.000   NA
 6879372 6879373 WRi_007720 WRi_007730     FALSE 0.012 441.000 0.000 1.000   NA
 6879373 6879374 WRi_007730 WRi_007740     TRUE 0.884 8.000 0.000 NA   NA
 6879374 6879375 WRi_007740 WRi_007750     FALSE 0.330 71.000 0.000 NA   NA
 6879375 6879376 WRi_007750 WRi_007760     TRUE 0.911 4.000 0.000 NA   NA
 6879377 6879378 WRi_p07770 WRi_007780     FALSE 0.241 87.000 0.000 NA   NA
 6879378 6879379 WRi_007780 WRi_007790     FALSE 0.010 579.000 0.000 NA   NA
 6879379 6879380 WRi_007790 WRi_007800   proS FALSE 0.190 102.000 0.000 NA   NA
 6879380 6879381 WRi_007800 WRi_007810 proS acpS TRUE 0.975 -3.000 0.011 1.000 N NA
 6879381 6879382 WRi_007810 WRi_007820 acpS   FALSE 0.013 511.000 0.000 1.000 N NA
 11477424 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 430.000 0.000 NA   NA
 11619787 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 430.000 0.000 NA   NA
 11762179 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 430.000 0.000 NA   NA
 11477425 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 454.000 0.000 NA   NA
 11619788 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 454.000 0.000 NA   NA
 11762180 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 454.000 0.000 NA   NA
 11477426 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 511.000 0.000 NA   NA
 11619789 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 511.000 0.000 NA   NA
 11762181 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 511.000 0.000 NA   NA
 11477427 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 535.000 0.000 NA   NA
 11619790 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 535.000 0.000 NA   NA
 11762182 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 535.000 0.000 NA   NA
 11477428 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 579.000 0.000 NA   NA
 11619791 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 579.000 0.000 NA   NA
 11762183 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 579.000 0.000 NA   NA
 11477429 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 603.000 0.000 NA   NA
 11619792 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 603.000 0.000 NA   NA
 11762184 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 603.000 0.000 NA   NA
 11477430 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 653.000 0.000 NA   NA
 11619793 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 653.000 0.000 NA   NA
 11762185 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 653.000 0.000 NA   NA
 11477431 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 677.000 0.000 NA   NA
 11619794 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 677.000 0.000 NA   NA
 11762186 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 677.000 0.000 NA   NA
 11477432 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 721.000 0.000 NA   NA
 11619795 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 721.000 0.000 NA   NA
 11762187 6879380   WRi_007800   proS FALSE NA 721.000 0.000 NA   NA
 6879383 6879384 WRi_007830 WRi_007840     TRUE 0.843 59.000 0.105 NA   NA
 6879384 6879385 WRi_007840 WRi_007850     TRUE 0.530 74.000 0.008 NA   NA
 6879385 6879386 WRi_007850 WRi_007860     TRUE 0.903 18.000 0.010 NA   NA
 6879386 6879387 WRi_007860 WRi_007870     FALSE 0.255 119.000 0.006 NA   NA
 6879390 6879391 WRi_007900 WRi_007910 recG   FALSE 0.008 1033.000 0.000 NA   NA
 6879392 6879393 WRi_007920 WRi_t07930     TRUE 0.735 22.000 0.000 NA   NA
 6879393 6879394 WRi_t07930 WRi_007940   cutA TRUE 0.928 -9.000 0.000 NA   NA
 6879394 6879395 WRi_007940 WRi_p07950 cutA   FALSE 0.011 500.000 0.000 NA   NA
 6879396 6879397 WRi_007960 WRi_007970     FALSE 0.009 735.000 0.000 NA   NA
 6879397 6879398 WRi_007970 WRi_007980   hflK FALSE 0.310 75.000 0.000 NA   NA
 6879398 6879399 WRi_007980 WRi_007990 hflK hflC TRUE 0.999 3.000 0.947 0.013 Y NA
 6879399 6879400 WRi_007990 WRi_008000 hflC   TRUE 0.992 4.000 0.084 0.013 Y NA
 6879400 6879401 WRi_008000 WRi_p08010     FALSE 0.028 231.000 0.000 NA   NA
 6879401 6879402 WRi_p08010 WRi_008020     FALSE 0.016 349.000 0.000 NA   NA
 6879402 6879403 WRi_008020 WRi_008030     FALSE 0.219 94.000 0.000 NA   NA
 6879403 6879404 WRi_008030 WRi_008040     TRUE 0.747 21.000 0.000 NA   NA
 6879404 6879405 WRi_008040 WRi_p08050     FALSE 0.022 272.000 0.000 NA   NA
 6879406 6879407 WRi_008060 WRi_008070 uvrB   FALSE 0.037 397.000 0.000 0.084 Y NA
 6879408 6879409 WRi_p08080 WRi_p08090     TRUE 0.846 12.000 0.000 NA   NA
 6879410 6879411 WRi_008100 WRi_008110     TRUE 0.990 -16.000 0.125 NA   NA
 6879411 6879412 WRi_008110 WRi_008120   fdx TRUE 0.973 8.000 0.029 NA   NA
 6879413 6879414 WRi_008130 WRi_008140 murD   TRUE 0.902 7.000 0.003 1.000   NA
 6879414 6879415 WRi_008140 WRi_p08150     TRUE 0.904 5.000 0.000 NA   NA
 6879415 6879416 WRi_p08150 WRi_p08160     FALSE 0.261 84.000 0.000 NA   NA
 6879417 6879418 WRi_008170 WRi_008180     FALSE 0.172 123.000 0.004 NA   NA
 6879418 6879419 WRi_008180 WRi_008190     TRUE 0.997 -10.000 0.600 NA   NA
 6879419 6879420 WRi_008190 WRi_008200     TRUE 0.957 90.000 1.000 0.004 Y NA
 6879420 6879421 WRi_008200 WRi_008210     TRUE 0.997 -3.000 0.333 0.004 Y NA
 6879421 6879422 WRi_008210 WRi_008220     TRUE 0.997 10.000 0.818 0.004 Y NA
 6879422 6879423 WRi_008220 WRi_008230   virB4 TRUE 0.998 -7.000 0.579 1.000 Y NA
 6879423 6879424 WRi_008230 WRi_008240 virB4 virB3 TRUE 0.997 10.000 0.789 NA Y NA
 6879427 6879428 WRi_008270 WRi_008280   rpmI FALSE 0.214 99.000 0.003 NA   NA
 6879428 6879429 WRi_008280 WRi_008290 rpmI rplT TRUE 0.991 21.000 0.928 0.035   NA
 6879429 6879430 WRi_008290 WRi_008300 rplT fmt TRUE 0.932 13.000 0.003 0.054 Y NA
 6879430 6879431 WRi_008300 WRi_008310 fmt purH FALSE 0.297 81.000 0.000 1.000 N NA
 6879431 6879432 WRi_008310 WRi_t08320 purH   FALSE 0.010 639.000 0.000 NA   NA
 6879432 6879433 WRi_t08320 WRi_008330   pgm TRUE 0.618 34.000 0.000 NA   NA
 6879435 6879436 WRi_008350 WRi_008360 rpmE ppnK TRUE 0.853 39.000 0.018 1.000 N NA
 6879436 6879437 WRi_008360 WRi_008370 ppnK   TRUE 0.554 84.000 0.015 NA   NA
 6879438 6879439 WRi_p08380 WRi_008390   pnp FALSE 0.036 206.000 0.000 NA   NA
 6879439 6879440 WRi_008390 WRi_008400 pnp rpsO TRUE 0.990 15.000 0.335 1.000 Y NA
 6879440 6879441 WRi_008400 WRi_008410 rpsO   TRUE 0.833 13.000 0.000 NA   NA
 6879441 6879442 WRi_008410 WRi_p08420     FALSE 0.248 86.000 0.000 NA   NA
 6879447 6879448 WRi_008480 WRi_008490 pyrB   FALSE 0.023 258.000 0.000 NA   NA
 6879448 6879449 WRi_008490 WRi_008500   lepB FALSE 0.011 505.000 0.000 NA   NA
 6879450 6879451 WRi_008510 WRi_008520 hscA hscB TRUE 0.998 -22.000 0.634 1.000 Y NA
 6879451 6879452 WRi_008520 WRi_008530 hscB   TRUE 0.986 -7.000 0.046 NA   NA
 6879452 6879453 WRi_008530 WRi_008540     TRUE 0.968 13.000 0.056 NA   NA
 6879455 6879456 WRi_008560 WRi_p08570 radA   FALSE 0.009 697.000 0.000 NA   NA
 6879456 6879457 WRi_p08570 WRi_008580     FALSE 0.178 110.000 0.000 NA   NA
 6879457 6879458 WRi_008580 WRi_008600     FALSE 0.355 68.000 0.000 NA   NA
 6879458 6879459 WRi_008600 WRi_008610   folA TRUE 0.977 2.000 0.017 NA   NA
 6879459 6879460 WRi_008610 WRi_008620 folA folKP TRUE 0.980 -6.000 0.005 1.000 Y NA
 6879460 6879461 WRi_008620 WRi_008630 folKP folB TRUE 0.988 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 6879461 6879462 WRi_008630 WRi_008640 folB   TRUE 0.898 40.000 0.012 1.000 Y NA
 6879462 6879463 WRi_008640 WRi_t08650     FALSE 0.315 74.000 0.000 NA   NA
 6879463 6879464 WRi_t08650 WRi_008660   trx TRUE 0.546 43.000 0.000 NA   NA
 6879464 6879465 WRi_008660 WRi_008670 trx   FALSE 0.254 117.000 0.006 1.000   NA
 6879470 6879471 WRi_008720 WRi_008730     TRUE 0.471 96.000 0.013 NA   NA
 6879471 6879472 WRi_008730 WRi_008740   uvrA FALSE 0.010 635.000 0.000 NA   NA
 6879472 6879473 WRi_008740 WRi_008750 uvrA   TRUE 0.447 55.000 0.000 NA   NA
 6879473 6879474 WRi_008750 WRi_008760   comF FALSE 0.156 116.000 0.000 NA   NA
 6879475 6879476 WRi_008770 WRi_008780 murE metC TRUE 0.972 -25.000 0.008 0.043 N NA
 6879476 6879477 WRi_008780 WRi_008790 metC   TRUE 0.970 8.000 0.018 NA N NA
 6879477 6879478 WRi_008790 WRi_008800   dnaK FALSE 0.339 71.000 0.003 NA N NA
 6879478 6879479 WRi_008800 WRi_008810 dnaK   TRUE 0.442 87.000 0.008 1.000 N NA
 6879480 6879481 WRi_008820 WRi_008830 rmpG   TRUE 0.644 26.000 0.002 1.000   NA
 6879483 6879484 WRi_008850 WRi_008860     TRUE 0.982 -3.000 0.022 1.000   NA
 6879484 6879485 WRi_008860 WRi_008870     FALSE 0.010 679.000 0.000 1.000   NA
 6879488 6879489 WRi_008900 WRi_008910     TRUE 0.969 1.000 0.010 NA   NA
 6879489 6879490 WRi_008910 WRi_008920     FALSE 0.222 80.000 0.002 NA   NA
 6879493 6879494 WRi_008950 WRi_p08960     FALSE 0.017 322.000 0.000 NA   NA
 6879496 6879497 WRi_008980 WRi_008990   lysC FALSE 0.015 361.000 0.000 NA   NA
 6879497 6879498 WRi_008990 WRi_p09000 lysC   FALSE 0.220 92.000 0.000 NA   NA
 6879499 6879500 WRi_p09010 WRi_p09020     TRUE 0.857 11.000 0.000 NA   NA
 6879500 6879501 WRi_p09020 WRi_009040     FALSE 0.175 111.000 0.000 NA   NA
 6879502 6879503 WRi_p09060 WRi_009070     TRUE 0.397 62.000 0.000 NA   NA
 6879504 6879505 WRi_009090 WRi_009100 uvrD   FALSE 0.231 128.000 0.007 NA   NA
 6879506 6879507 WRi_009110 WRi_009120 nuoJ nuoK TRUE 0.998 -9.000 0.484 0.006 Y NA
 6879507 6879508 WRi_009120 WRi_009130 nuoK nuoL TRUE 0.996 5.000 0.451 0.017 Y NA
 6879508 6879509 WRi_009130 WRi_009140 nuoL nuoM TRUE 0.996 4.000 0.251 0.006 Y NA
 6879509 6879510 WRi_009140 WRi_009150 nuoM nuoN TRUE 0.997 -3.000 0.453 0.006 Y NA
 6879510 6879511 WRi_009150 WRi_009160 nuoN birA TRUE 0.947 18.000 0.032 1.000 N NA
 6879511 6879512 WRi_009160 WRi_009170 birA   TRUE 0.982 -3.000 0.024 NA   NA
 6879512 6879513 WRi_009170 WRi_009180   ccmE TRUE 0.969 -16.000 0.008 NA   NA
 6879514 6879515 WRi_009190 WRi_009200     TRUE 0.906 102.000 1.000 NA   NA
 6879515 6879516 WRi_009200 WRi_009210     TRUE 0.524 46.000 0.000 NA   NA
 6879516 6879517 WRi_009210 WRi_t09220     FALSE 0.032 216.000 0.000 NA   NA
 6879518 6879519 WRi_t09230 WRi_009240   nuoF TRUE 0.756 20.000 0.000 NA   NA
 6879519 6879520 WRi_009240 WRi_p09250 nuoF   FALSE 0.201 100.000 0.000 NA   NA
 6879521 6879522 WRi_009270 WRi_009280 infC thrS TRUE 0.989 13.000 0.186 1.000 Y NA
 6879522 6879523 WRi_009280 WRi_009290 thrS nuoI FALSE 0.029 304.000 0.004 1.000 N NA
 6879524 6879525 WRi_009300 WRi_t09310 trmE   TRUE 0.515 48.000 0.000 NA   NA
 6879525 6879526 WRi_t09310 WRi_009320     FALSE 0.074 169.000 0.000 NA   NA
 6879527 6879528 WRi_009330 WRi_009340 fabH plsX TRUE 0.972 41.000 0.380 0.007 Y NA
 6879528 6879529 WRi_009340 WRi_009350 plsX rpmF TRUE 0.990 11.000 0.418 1.000 N NA
 6879530 6879531 WRi_009360 WRi_009370     TRUE 0.996 -7.000 0.178 NA Y NA
 6879531 6879532 WRi_009370 WRi_009380     FALSE 0.181 108.000 0.000 NA   NA
 6879532 6879533 WRi_009380 WRi_009390     FALSE 0.029 227.000 0.000 NA   NA
 6879533 6879534 WRi_009390 WRi_009400   dxr TRUE 0.428 66.000 0.004 NA   NA
 6879534 6879535 WRi_009400 WRi_009410 dxr   FALSE 0.020 280.000 0.000 NA   NA
 6879535 6879536 WRi_009410 WRi_009420     FALSE 0.083 161.000 0.000 NA   NA
 6879536 6879537 WRi_009420 WRi_009430     TRUE 0.877 9.000 0.000 NA   NA
 6879537 6879538 WRi_009430 WRi_009440     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6879539 6879540 WRi_009450 WRi_009460 iscS tldD FALSE 0.020 287.000 0.000 NA   NA
 6879541 6879542 WRi_t09470 WRi_009480     FALSE 0.330 71.000 0.000 NA   NA
 6879542 6879543 WRi_009480 WRi_009490     FALSE 0.026 245.000 0.000 NA   NA
 6879543 6879544 WRi_009490 WRi_009500   xth TRUE 0.981 0.000 0.019 1.000 N NA
 6879545 6879546 WRi_009510 WRi_009520   polA TRUE 0.497 50.000 0.000 NA   NA
 6879546 6879547 WRi_009520 WRi_p09530 polA   FALSE 0.026 244.000 0.000 NA   NA
 6879547 6879548 WRi_p09530 WRi_009560     FALSE 0.028 233.000 0.000 NA   NA
 6879548 6879549 WRi_009560 WRi_009570     TRUE 0.898 6.000 0.000 NA   NA
 6879549 6879550 WRi_009570 WRi_009580     FALSE 0.013 410.000 0.000 NA   NA
 6879550 6879551 WRi_009580 WRi_009590     TRUE 0.566 122.000 0.125 NA   NA
 6879551 6879552 WRi_009590 WRi_009600   mnmG TRUE 0.904 9.000 0.003 1.000 N NA
 6879552 6879553 WRi_009600 WRi_t09610 mnmG   FALSE 0.048 192.000 0.000 NA   NA
 6879554 6879555 WRi_009620 WRi_009630 mviN   FALSE 0.018 403.000 0.004 NA   NA
 6879557 6879558 WRi_009640 WRi_p09670     FALSE 0.008 994.000 0.000 NA   NA
 6879558 6879559 WRi_p09670 WRi_009680     TRUE 0.412 61.000 0.000 NA   NA
 6879560 6879561 WRi_009700 WRi_009710     FALSE 0.012 475.000 0.000 NA   NA
 6879562 6879563 WRi_009720 WRi_009730 lipB   TRUE 0.928 0.000 0.003 NA N NA
 6879564 6879565 WRi_009740 WRi_009750     FALSE 0.009 780.000 0.000 NA   NA
 6879565 6879566 WRi_009750 WRi_009760     TRUE 0.937 7.000 0.005 1.000 N NA
 6879566 6879567 WRi_009760 WRi_009770   rplS FALSE 0.023 280.000 0.000 1.000 N NA
 6879567 6879568 WRi_009770 WRi_009780 rplS trmD TRUE 0.998 -16.000 0.567 1.000 Y NA
 6879571 6879572 WRi_009810 WRi_009820     TRUE 0.590 81.000 0.018 NA   NA
 6879574 6879575 WRi_009840 WRi_009850 hemE   FALSE 0.336 70.000 0.002 1.000 N NA
 6879575 6879576 WRi_009850 WRi_009860     FALSE 0.013 480.000 0.000 1.000 N NA
 6879577 6879578 WRi_009870 WRi_009880 gltA rpsT FALSE 0.317 81.000 0.003 1.000 N NA
 6879578 6879579 WRi_009880 WRi_009890 rpsT   TRUE 0.688 52.000 0.007 1.000 N NA
 6879579 6879580 WRi_009890 WRi_009900     TRUE 0.452 56.000 0.003 1.000 N NA
 6879580 6879581 WRi_009900 WRi_009910     TRUE 0.921 -10.000 0.003 NA   NA
 6879581 6879582 WRi_009910 WRi_009920     FALSE 0.036 206.000 0.000 NA   NA
 6879582 6879583 WRi_009920 WRi_009930     TRUE 0.661 130.000 0.362 NA   NA
 6879583 6879584 WRi_009930 WRi_009940     TRUE 0.593 38.000 0.000 NA   NA
 6879587 6879588 WRi_009970 WRi_009980 apaG   FALSE 0.027 235.000 0.000 NA   NA
 6879590 6879591 WRi_009990 WRi_010000     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6879591 6879592 WRi_010000 WRi_010010     TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 6879594 6879595 WRi_010030 WRi_p10040     TRUE 0.447 55.000 0.000 NA   NA
 6879595 6879596 WRi_p10040 WRi_010050     FALSE 0.008 1120.000 0.000 NA   NA
 6879597 6879598 WRi_010060 WRi_p10070     TRUE 0.927 -6.000 0.000 NA   NA
 6879598 6879599 WRi_p10070 WRi_010080     TRUE 0.665 27.000 0.000 NA   NA
 6879599 6879600 WRi_010080 WRi_010100     FALSE 0.016 346.000 0.000 NA   NA
 6879600 6879601 WRi_010100 WRi_010110     TRUE 0.685 26.000 0.000 NA   NA
 6879601 6879602 WRi_010110 WRi_010120     TRUE 0.776 168.000 1.000 NA   NA
 6879602 6879603 WRi_010120 WRi_010130     TRUE 0.991 0.000 0.167 NA   NA
 6879603 6879604 WRi_010130 WRi_010140     TRUE 0.990 3.000 0.167 NA   NA
 6879604 6879605 WRi_010140 WRi_010150     TRUE 0.998 3.000 1.000 NA   NA
 6879605 6879606 WRi_010150 WRi_010160     TRUE 0.988 8.000 0.250 NA   NA
 6879606 6879607 WRi_010160 WRi_010170     TRUE 0.993 -13.000 0.250 NA   NA
 6879607 6879608 WRi_010170 WRi_010180     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6879608 6879609 WRi_010180 WRi_010190     TRUE 0.919 2.000 0.000 NA   NA
 6879609 6879610 WRi_010190 WRi_010200     FALSE 0.207 98.000 0.000 NA   NA
 6879610 6879611 WRi_010200 WRi_010210     TRUE 0.593 38.000 0.000 NA   NA
 6879611 6879612 WRi_010210 WRi_010220     TRUE 0.893 75.000 0.500 NA   NA
 6879612 6879613 WRi_010220 WRi_010230     TRUE 0.997 -3.000 0.667 1.000   NA
 6879613 6879614 WRi_010230 WRi_010240     FALSE 0.186 103.000 0.000 NA   NA
 6879614 6879615 WRi_010240 WRi_010250     TRUE 0.928 -9.000 0.000 NA   NA
 6879615 6879616 WRi_010250 WRi_010260     TRUE 0.561 41.000 0.000 NA   NA
 6879616 6879617 WRi_010260 WRi_010270     TRUE 0.911 4.000 0.000 NA   NA
 6879617 6879618 WRi_010270 WRi_010280     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6879618 6879619 WRi_010280 WRi_010290     TRUE 0.911 4.000 0.000 NA   NA
 6879619 6879620 WRi_010290 WRi_010300     TRUE 0.988 14.000 0.500 NA   NA
 6879620 6879621 WRi_010300 WRi_010310     FALSE 0.147 114.000 0.002 1.000   NA
 6879622 6879623 WRi_010320 WRi_010330     FALSE 0.010 586.000 0.000 NA   NA
 6879623 6879624 WRi_010330 WRi_010340     FALSE 0.046 193.000 0.000 NA   NA
 6879624 6879625 WRi_010340 WRi_010350     FALSE 0.014 395.000 0.000 NA   NA
 6879629 6879630 WRi_010390 WRi_010400     FALSE 0.118 132.000 0.000 1.000   NA
 6879630 6879631 WRi_010400 WRi_010410     TRUE 0.973 -43.000 0.000 1.000 Y NA
 6879631 6879632 WRi_010410 WRi_010420     TRUE 0.922 0.000 0.000 NA   NA
 6879632 6879633 WRi_010420 WRi_010430     TRUE 0.911 4.000 0.000 NA   NA
 6879633 6879634 WRi_010430 WRi_010440     TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 6879634 6879635 WRi_010440 WRi_010450     TRUE 0.928 2.000 0.000 1.000 N NA
 6879635 6879636 WRi_010450 WRi_010460     TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 6879636 6879637 WRi_010460 WRi_010470     FALSE 0.139 128.000 0.000 NA N NA
 6879638 6879639 WRi_010480 WRi_010490     TRUE 0.382 65.000 0.000 1.000   NA
 6879639 6879640 WRi_010490 WRi_010500     FALSE 0.012 484.000 0.000 1.000   NA
 6879640 6879641 WRi_010500 WRi_010510     TRUE 0.692 26.000 0.000 0.024   NA
 6879641 6879642 WRi_010510 WRi_010520     FALSE 0.303 76.000 0.000 NA   NA
 6879642 6879643 WRi_010520 WRi_010530     TRUE 0.909 101.000 1.000 NA   NA
 6879643 6879644 WRi_010530 WRi_010540     TRUE 0.761 170.000 1.000 1.000   NA
 6879647 6879648 WRi_010570 WRi_010580     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6879651 6879652 WRi_010610 WRi_p10620 topA   FALSE 0.021 277.000 0.000 NA   NA
 6879653 6879654 WRi_010630 WRi_010640     FALSE 0.024 276.000 0.000 NA N NA
 6879654 6879655 WRi_010640 WRi_010650     TRUE 0.590 41.000 0.000 NA N NA
 6879658 6879659 WRi_p10680 WRi_010690     FALSE 0.012 468.000 0.000 NA   NA
 6879659 6879660 WRi_010690 WRi_010700     TRUE 0.548 76.000 0.000 NA Y NA
 6879662 6879663 WRi_010720 WRi_010730     FALSE 0.355 68.000 0.000 NA   NA
 6879664 6879665 WRi_t10750 WRi_010760     TRUE 0.665 27.000 0.000 NA   NA
 6879665 6879666 WRi_010760 WRi_010770     TRUE 0.765 53.000 0.016 NA   NA
 6879667 6879668 WRi_010780 WRi_010790     FALSE 0.167 148.000 0.006 1.000   NA
 6879668 6879669 WRi_010790 WRi_010800     TRUE 0.997 2.000 0.400 0.002 Y NA
 6879669 6879670 WRi_010800 WRi_010810     TRUE 0.880 24.000 0.009 0.042 N NA
 6879670 6879671 WRi_010810 WRi_010820   psd TRUE 0.997 -3.000 0.466 0.004 Y NA
 6879671 6879672 WRi_010820 WRi_010830 psd recA FALSE 0.057 188.000 0.000 1.000 N NA
 6879673 6879674 WRi_010840 WRi_p10860     FALSE 0.175 111.000 0.000 NA   NA
 6879674 6879675 WRi_p10860 WRi_010880     TRUE 0.633 32.000 0.000 NA   NA
 6879676 6879677 WRi_010890 WRi_010900 folC   TRUE 0.951 -3.000 0.004 NA N NA
 6879678 6879679 WRi_010910 WRi_010920     TRUE 0.638 54.000 0.006 NA N NA
 6879682 6879683 WRi_010950 WRi_010960     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6879684 6879685 WRi_010970 WRi_010980     TRUE 0.994 4.000 0.411 NA   NA
 6879685 6879686 WRi_010980 WRi_010990     FALSE 0.010 591.000 0.000 NA   NA
 6879686 6879687 WRi_010990 WRi_011000   rpoH FALSE 0.015 400.000 0.000 1.000 N NA
 6879687 6879688 WRi_011000 WRi_011010 rpoH   TRUE 0.992 -7.000 0.188 NA   NA
 6879688 6879689 WRi_011010 WRi_011020   dnaN FALSE 0.178 124.000 0.004 NA   NA
 6879690 6879691 WRi_011030 WRi_011040   truA FALSE 0.227 91.000 0.000 1.000   NA
 6879691 6879692 WRi_011040 WRi_p11050 truA   FALSE 0.323 72.000 0.000 NA   NA
 6879692 6879693 WRi_p11050 WRi_011060   petC FALSE 0.022 275.000 0.000 NA   NA
 6879693 6879694 WRi_011060 WRi_011070 petC petB TRUE 0.395 369.000 0.630 0.002 Y NA
 6879694 6879695 WRi_011070 WRi_011080 petB   FALSE 0.184 105.000 0.000 1.000   NA
 6879698 6879699 WRi_011110 WRi_011120   hisS TRUE 0.951 -3.000 0.004 1.000 N NA
 6879700 6879701 WRi_011130 WRi_011140 surE ffh FALSE 0.008 1125.000 0.000 1.000   NA
 6879701 6879702 WRi_011140 WRi_011150 ffh   TRUE 0.972 -15.000 0.008 1.000 N NA
 6879702 6879703 WRi_011150 WRi_011160     FALSE 0.021 304.000 0.000 1.000 N NA
 6879703 6879704 WRi_011160 WRi_011170   fabZ TRUE 0.713 46.000 0.006 1.000 N NA
 6879704 6879705 WRi_011170 WRi_011180 fabZ   TRUE 0.986 5.000 0.102 1.000 N NA
 6879705 6879706 WRi_011180 WRi_011190     TRUE 0.993 1.000 0.089 1.000 Y NA
 6879706 6879707 WRi_011190 WRi_011200     TRUE 0.982 9.000 0.016 1.000 Y NA
 6879709 6879710 WRi_011220 WRi_011230     TRUE 0.428 73.000 0.005 NA   NA
 6879710 6879711 WRi_011230 WRi_011240   rpsA TRUE 0.775 30.000 0.005 1.000 N NA
 6879713 6879714 WRi_011260 WRi_011270     FALSE 0.017 332.000 0.000 NA   NA
 6879715 6879716 WRi_011280 WRi_011290     TRUE 0.624 33.000 0.000 NA   NA
 6879716 6879717 WRi_011290 WRi_011300   pccB FALSE 0.146 121.000 0.000 NA   NA
 6879719 6879720 WRi_011320 WRi_011330   mutM TRUE 0.928 -34.000 0.003 NA   NA
 6879720 6879721 WRi_011330 WRi_011340 mutM pdxH TRUE 0.802 17.000 0.003 1.000 N NA
 6879723 6879724 WRi_011360 WRi_011370     FALSE 0.344 62.000 0.002 NA   NA
 6879724 6879725 WRi_011370 WRi_011380     FALSE 0.103 123.000 0.002 NA   NA
 6879726 6879727 WRi_011390 WRi_011400 dgkA   FALSE 0.207 98.000 0.000 NA   NA
 6879727 6879728 WRi_011400 WRi_011410     FALSE 0.270 81.000 0.000 NA   NA
 6879728 6879729 WRi_011410 WRi_011420     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6879729 6879730 WRi_011420 WRi_011430   pgk TRUE 0.497 50.000 0.000 NA   NA
 6879731 6879732 WRi_011440 WRi_011450   fabK TRUE 0.983 6.000 0.086 0.011   NA
 6879732 6879733 WRi_011450 WRi_011460 fabK   TRUE 0.501 123.000 0.065 NA   NA
 6879733 6879734 WRi_011460 WRi_011470     TRUE 0.856 102.000 0.667 NA   NA
 6879734 6879735 WRi_011470 WRi_011480     TRUE 0.921 45.000 0.200 NA   NA
 6879735 6879736 WRi_011480 WRi_011490     TRUE 0.992 -19.000 0.200 NA   NA
 6879736 6879737 WRi_011490 WRi_011500     FALSE 0.133 124.000 0.000 NA   NA
 6879739 6879740 WRi_011520 WRi_011530 aceF   FALSE 0.339 70.000 0.000 NA   NA
 6879741 6879742 WRi_011540 WRi_011550   recR TRUE 0.911 4.000 0.000 NA   NA
 6879742 6879743 WRi_011550 WRi_011560 recR ndk FALSE 0.009 1096.000 0.000 1.000 N NA
 6879744 6879745 WRi_011570 WRi_011580   hemH TRUE 0.954 1.000 0.005 NA   NA
 6879745 6879746 WRi_011580 WRi_011590 hemH   TRUE 0.469 71.000 0.005 NA   NA
 6879748 6879749 WRi_011610 WRi_011620 hslV hslU TRUE 0.998 2.000 0.752 1.000 Y NA
 6879750 6879751 WRi_011630 WRi_011640     FALSE 0.256 85.000 0.000 1.000   NA
 6879751 6879752 WRi_011640 WRi_011650     TRUE 0.988 -7.000 0.062 1.000   NA
 6879753 6879754 WRi_011660 WRi_011670 acpP fabF TRUE 0.984 14.000 0.106 1.000 Y NA
 6879754 6879755 WRi_011670 WRi_011680 fabF   FALSE 0.025 249.000 0.000 1.000   NA
 6879757 6879758 WRi_p11700 WRi_011710   murA FALSE 0.089 156.000 0.000 NA   NA
 6879758 6879759 WRi_011710 WRi_011720 murA thyX TRUE 0.939 10.000 0.007 1.000 N NA
 6879759 6879760 WRi_011720 WRi_p11730 thyX   FALSE 0.201 100.000 0.000 NA   NA
 6879761 6879762 WRi_011750 WRi_011770     FALSE 0.211 97.000 0.000 NA   NA
 6879764 6879765 WRi_011790 WRi_011800 petA gyrA FALSE 0.264 87.000 0.003 1.000 N NA
 6879765 6879766 WRi_011800 WRi_t11810 gyrA   TRUE 0.466 53.000 0.000 NA   NA
 6879766 6879767 WRi_t11810 WRi_011820     FALSE 0.011 506.000 0.000 NA   NA
 6879767 6879768 WRi_011820 WRi_011830     FALSE 0.074 169.000 0.000 NA   NA
 6879768 6879769 WRi_011830 WRi_011840     TRUE 0.986 -3.000 0.048 NA   NA
 6879770 6879771 WRi_011850 WRi_011860   dapF TRUE 0.926 -19.000 0.002 1.000 N NA
 6879772 6879773 WRi_011870 WRi_011880 sucD sucC TRUE 0.996 4.000 0.256 0.002 Y NA
 6879773 6879774 WRi_011880 WRi_011890 sucC rpsU TRUE 0.871 38.000 0.028 1.000   NA
 6879774 6879775 WRi_011890 WRi_t11900 rpsU   FALSE 0.040 200.000 0.000 NA   NA
 6879775 6879776 WRi_t11900 WRi_011910     FALSE 0.031 219.000 0.000 NA   NA
 6879776 6879777 WRi_011910 WRi_t11920     TRUE 0.652 29.000 0.000 NA   NA
 6879777 6879778 WRi_t11920 WRi_011930     FALSE 0.347 69.000 0.000 NA   NA
 6879778 6879779 WRi_011930 WRi_011940     TRUE 0.508 49.000 0.000 NA   NA
 6879780 6879781 WRi_011950 WRi_011960     FALSE 0.226 91.000 0.003 1.000 N NA
 6879781 6879782 WRi_011960 WRi_011970     TRUE 0.998 -3.000 0.827 1.000 N NA
 6879784 6879785 WRi_r11990 WRi_012000   sdhC FALSE 0.195 101.000 0.000 NA   NA
 6879785 6879786 WRi_012000 WRi_012010 sdhC sdhD TRUE 0.997 -3.000 0.453 0.002 Y NA
 6879786 6879787 WRi_012010 WRi_012020 sdhD   TRUE 0.438 85.000 0.008 NA   NA
 6879787 6879788 WRi_012020 WRi_012030     TRUE 0.501 113.000 0.032 NA   NA
 6879788 6879789 WRi_012030 WRi_012040     FALSE 0.371 134.000 0.007 1.000 Y NA
 6879789 6879790 WRi_012040 WRi_012050     TRUE 0.984 -7.000 0.030 NA   NA
 6879790 6879791 WRi_012050 WRi_012060     TRUE 0.987 -3.000 0.058 NA   NA
 6879791 6879792 WRi_012060 WRi_012070   atpG FALSE 0.042 199.000 0.000 1.000   NA
 6879792 6879793 WRi_012070 WRi_012080 atpG   TRUE 0.769 19.000 0.003 NA   NA
 6879793 6879794 WRi_012080 WRi_012090     FALSE 0.136 175.000 0.008 NA   NA
 6879794 6879795 WRi_012090 WRi_012100     TRUE 0.972 54.000 0.600 1.000 Y NA
 6879795 6879796 WRi_012100 WRi_012110   clpA FALSE 0.042 204.000 0.000 0.085 N NA
 6879796 6879797 WRi_012110 WRi_012120 clpA   TRUE 0.436 59.000 0.000 1.000   NA
 6879797 6879798 WRi_012120 WRi_012130   fba TRUE 0.565 41.000 0.000 1.000   NA
 6879798 6879799 WRi_012130 WRi_t12140 fba   TRUE 0.898 6.000 0.000 NA   NA
 6879799 6879800 WRi_t12140 WRi_012150   pyrD FALSE 0.143 122.000 0.000 NA   NA
 6879800 6879801 WRi_012150 WRi_012160 pyrD   FALSE 0.270 91.000 0.003 1.000 N NA
 6879802 6879803 WRi_012170 WRi_012180     FALSE 0.178 110.000 0.000 NA   NA
 6879803 6879804 WRi_012180 WRi_012190     FALSE 0.009 888.000 0.000 NA   NA
 6879805 6879806 WRi_012200 WRi_012210     TRUE 0.995 0.000 0.500 NA   NA
 6879806 6879807 WRi_012210 WRi_012220   bfr TRUE 0.780 60.000 0.031 NA   NA
 6879807 6879808 WRi_012220 WRi_012230 bfr   TRUE 0.511 110.000 0.031 NA   NA
 6879809 6879810 WRi_012240 WRi_012250     TRUE 0.982 6.000 0.057 1.000   NA
 6879812 6879813 WRi_012270 WRi_012280   ftsH FALSE 0.091 155.000 0.000 NA   NA
 6879813 6879814 WRi_012280 WRi_012290 ftsH tilS TRUE 0.978 13.000 0.145 0.084 N NA
 6879814 6879815 WRi_012290 WRi_012300 tilS   FALSE 0.058 185.000 0.003 1.000 N NA
 6879816 6879817 WRi_012310 WRi_012320   mreB TRUE 0.810 24.000 0.005 1.000 N NA
 6879817 6879818 WRi_012320 WRi_012330 mreB trmU FALSE 0.020 317.000 0.000 1.000 N NA
 6879818 6879819 WRi_012330 WRi_012340 trmU   FALSE 0.009 950.000 0.000 NA   NA
 6879819 6879820 WRi_012340 WRi_012350   ppa TRUE 0.422 70.000 0.004 NA   NA
 6879820 6879821 WRi_012350 WRi_t12360 ppa   FALSE 0.014 391.000 0.000 NA   NA
 6879821 6879822 WRi_t12360 WRi_012370     FALSE 0.053 185.000 0.000 NA   NA
 6879822 6879823 WRi_012370 WRi_012380     FALSE 0.239 88.000 0.000 1.000   NA
 6879823 6879824 WRi_012380 WRi_012390     TRUE 0.908 -16.000 0.002 1.000   NA
 6879826 6879827 WRi_012410 WRi_012420     TRUE 0.384 116.000 0.014 NA   NA
 6879830 6879831 WRi_012450 WRi_012460     FALSE 0.013 405.000 0.000 NA   NA
 6879831 6879832 WRi_012460 WRi_012470     FALSE 0.078 168.000 0.000 NA   NA
 6879832 6879833 WRi_012470 WRi_012480     TRUE 0.991 0.000 0.167 NA   NA
 6879833 6879834 WRi_012480 WRi_012490     TRUE 0.990 3.000 0.167 NA   NA
 6879834 6879835 WRi_012490 WRi_p12495     TRUE 0.916 3.000 0.000 NA   NA
 6879837 6879838 WRi_012520 WRi_012540     FALSE 0.107 136.000 0.000 NA   NA
 6879838 6879839 WRi_012540 WRi_p12550     TRUE 0.928 -13.000 0.000 NA   NA
 6879839 6879840 WRi_p12550 WRi_012560     TRUE 0.804 15.000 0.000 NA   NA
 6879840 6879841 WRi_012560 WRi_p12570     FALSE 0.012 467.000 0.000 NA   NA
 6879841 6879842 WRi_p12570 WRi_012580     FALSE 0.236 88.000 0.000 NA   NA
 6879842 6879843 WRi_012580 WRi_012590     FALSE 0.201 100.000 0.000 NA   NA
 6879843 6879844 WRi_012590 WRi_012600     FALSE 0.265 83.000 0.000 NA   NA
 6879844 6879845 WRi_012600 WRi_012610     TRUE 0.476 52.000 0.000 NA   NA
 6879845 6879846 WRi_012610 WRi_012620     FALSE 0.366 67.000 0.000 NA   NA
 6879846 6879847 WRi_012620 WRi_012630     FALSE 0.248 86.000 0.000 NA   NA
 6879847 6879848 WRi_012630 WRi_012640     TRUE 0.922 1.000 0.000 1.000   NA
 6879848 6879849 WRi_012640 WRi_012650     TRUE 0.926 -3.000 0.000 1.000   NA
 6879849 6879850 WRi_012650 WRi_012660     TRUE 0.926 -3.000 0.000 1.000   NA
 6879850 6879851 WRi_012660 WRi_012670     TRUE 0.928 -10.000 0.000 NA   NA
 6879851 6879852 WRi_012670 WRi_012680     FALSE 0.019 291.000 0.000 NA   NA
 6879852 6879853 WRi_012680 WRi_012690   ccmB FALSE 0.012 564.000 0.000 1.000 N NA
 6879854 6879855 WRi_012700 WRi_012710     FALSE 0.010 574.000 0.000 NA   NA
 6879855 6879856 WRi_012710 WRi_012720     FALSE 0.017 324.000 0.000 NA   NA
 6879858 6879859 WRi_012740 WRi_012750     TRUE 0.905 -3.000 0.002 1.000   NA
 6879859 6879860 WRi_012750 WRi_012760     TRUE 0.991 -25.000 0.145 1.000 N NA
 6879860 6879861 WRi_012760 WRi_012770   mraY FALSE 0.012 581.000 0.000 1.000 N NA
 6879861 6879862 WRi_012770 WRi_012780 mraY rnhB TRUE 0.871 7.000 0.002 1.000 N NA
 6879863 6879864 WRi_012790 WRi_012800     FALSE 0.052 186.000 0.000 NA   NA
 6879864 6879865 WRi_012800 WRi_012810     TRUE 0.991 3.000 0.199 NA   NA
 6879866 6879867 WRi_012820 WRi_012830   rodA TRUE 0.592 54.000 0.005 1.000 N NA
 6879867 6879868 WRi_012830 WRi_012840 rodA purF TRUE 0.712 26.000 0.000 1.000 N NA
 6879869 6879870 WRi_012850 WRi_012860 mpg ruvB FALSE 0.037 401.000 0.000 0.071 Y NA
 6879870 6879871 WRi_012860 WRi_012870 ruvB ruvA TRUE 0.998 -3.000 0.549 0.004 Y NA
 6879871 6879872 WRi_012870 WRi_012880 ruvA   FALSE 0.009 863.000 0.000 1.000   NA
 6879872 6879873 WRi_012880 WRi_012890   tyrS FALSE 0.009 964.000 0.000 1.000   NA
 6879873 6879874 WRi_012890 WRi_012900 tyrS   FALSE 0.028 232.000 0.000 NA   NA
 6879875 6879876 WRi_012910 WRi_012920     TRUE 0.952 -7.000 0.005 NA   NA
 6879876 6879877 WRi_012920 WRi_012930     TRUE 0.977 -3.000 0.004 NA Y NA
 6879878 6879879 WRi_012940 WRi_012950 mdh nuoC TRUE 0.981 4.000 0.007 1.000 Y NA
 6879879 6879880 WRi_012950 WRi_012960 nuoC nuoB TRUE 0.997 -7.000 0.328 0.005 Y NA
 6879880 6879881 WRi_012960 WRi_012970 nuoB nuoA TRUE 0.997 4.000 0.507 0.005 Y NA
 6879881 6879882 WRi_012970 WRi_012980 nuoA   TRUE 0.847 19.000 0.005 1.000 N NA
 6879882 6879883 WRi_012980 WRi_012990     TRUE 0.921 4.000 0.003 NA   NA
 6879883 6879884 WRi_012990 WRi_013000     TRUE 0.989 17.000 0.667 NA   NA
 6879885 6879886 WRi_013010 WRi_013020 murF   TRUE 0.726 51.000 0.000 1.000 Y NA
 6879888 6879889 WRi_013040 WRi_p13050     TRUE 0.593 38.000 0.000 NA   NA
 6879889 6879890 WRi_p13050 WRi_013060   hemA TRUE 0.378 65.000 0.000 NA   NA
 6879891 6879892 WRi_013070 WRi_013080   efp TRUE 0.978 9.000 0.047 1.000 N NA
 6879892 6879893 WRi_013080 WRi_013090 efp rimM TRUE 0.632 63.000 0.003 1.000 Y NA
 6879893 6879894 WRi_013090 WRi_013100 rimM   TRUE 0.824 15.000 0.000 1.000 N NA
 6879895 6879896 WRi_013110 WRi_013120   bcp FALSE 0.048 190.000 0.002 1.000 N NA
 6879896 6879897 WRi_013120 WRi_013130 bcp recF TRUE 0.833 17.000 0.004 1.000 N NA
 6879898 6879899 WRi_013140 WRi_013150     FALSE 0.034 208.000 0.000 NA   NA
 6879899 6879900 WRi_013150 WRi_013160     TRUE 0.769 18.000 0.000 NA   NA
 6879901 6879902 WRi_p13170 WRi_013180     FALSE 0.030 224.000 0.000 NA   NA
 6879902 6879903 WRi_013180 WRi_013190     FALSE 0.010 924.000 0.000 1.000 N NA
 6879903 6879904 WRi_013190 WRi_013200   carB FALSE 0.010 781.000 0.000 1.000 N NA
 6879904 6879905 WRi_013200 WRi_013210 carB   FALSE 0.082 165.000 0.000 NA   NA
 6879905 6879906 WRi_013210 WRi_p13220     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 6879907 6879908 WRi_013240 WRi_013260   rpoD FALSE 0.111 141.000 0.000 1.000 N NA
 6879908 6879909 WRi_013260 WRi_013270 rpoD   FALSE 0.203 139.000 0.006 1.000 N NA
 6879909 6879910 WRi_013270 WRi_013280     TRUE 0.987 -3.000 0.074 NA   NA
 6879910 6879911 WRi_013280 WRi_013290     TRUE 0.994 -7.000 0.333 NA   NA
 6879911 6879912 WRi_013290 WRi_013300     TRUE 0.995 2.000 0.184 NA Y NA
 6879912 6879913 WRi_013300 WRi_013310     TRUE 0.995 7.000 0.655 1.000   NA
 6879913 6879914 WRi_013310 WRi_013320   rpoZ TRUE 0.713 29.000 0.004 1.000   NA
 6879914 6879915 WRi_013320 WRi_013330 rpoZ   TRUE 0.629 61.000 0.008 1.000   NA
 6879916 6879917 WRi_013340 WRi_013350 purE mutL TRUE 0.902 8.000 0.003 1.000 N NA
 6879917 6879918 WRi_013350 WRi_013360 mutL sucA FALSE 0.010 873.000 0.000 1.000 N NA
 6879918 6879919 WRi_013360 WRi_013370 sucA   FALSE 0.025 246.000 0.000 NA   NA
 6879920 6879921 WRi_013380 WRi_013390     FALSE 0.048 192.000 0.000 NA   NA
 6879922 6879923 WRi_013400 WRi_013410     TRUE 0.857 11.000 0.000 NA   NA
 6879923 6879924 WRi_013410 WRi_013420   ubiD FALSE 0.214 96.000 0.000 NA   NA
 6879924 6879925 WRi_013420 WRi_p13430 ubiD   FALSE 0.010 667.000 0.000 NA   NA
 6879925 6879926 WRi_p13430 WRi_p13440     FALSE 0.289 79.000 0.000 NA   NA
 6879926 6879927 WRi_p13440 WRi_013450     FALSE 0.289 79.000 0.000 NA   NA
 6879928 6879929 WRi_013460 WRi_013470 ubiA   TRUE 0.926 4.000 0.003 1.000 N NA
 6879929 6879930 WRi_013470 WRi_013480   infB TRUE 0.996 10.000 0.530 1.000 Y NA
 6879930 6879931 WRi_013480 WRi_013490 infB nusA TRUE 0.990 10.000 0.342 1.000 N NA
 6879931 6879932 WRi_013490 WRi_013500 nusA   FALSE 0.329 89.000 0.005 NA N NA