MicrobesOnline Operon Predictions for Listeria monocytogenes 08-5578

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10421046 10421047 LM5578_0001 LM5578_0002   rpmH FALSE 0.094 168.000 0.011 NA   NA
 10421047 10421048 LM5578_0002 LM5578_0003 rpmH rnpA TRUE 0.433 90.000 0.787 1.000   NA
 10421048 10421049 LM5578_0003 LM5578_0004 rnpA   TRUE 0.473 41.000 0.052 1.000 N NA
 10421049 10421050 LM5578_0004 LM5578_0005     TRUE 0.956 -3.000 0.106 1.000   NA
 10421050 10421051 LM5578_0005 LM5578_0006     FALSE 0.220 85.000 0.029 NA   NA
 10421053 10421054 LM5578_0008 LM5578_0009     TRUE 0.965 19.000 0.158 1.000 Y NA
 10421054 10421055 LM5578_0009 LM5578_0010     TRUE 0.981 13.000 0.387 1.000 Y NA
 10421055 10421056 LM5578_0010 LM5578_0011     TRUE 0.979 13.000 0.247 1.000 Y NA
 10421056 10421057 LM5578_0011 LM5578_0012     TRUE 0.865 13.000 0.112 NA   NA
 10421059 10421060 LM5578_0014 LM5578_0015     FALSE 0.129 136.000 0.000 NA   NA
 10421061 10421062 LM5578_tRNA01 LM5578_0016     TRUE 0.714 22.000 0.000 NA   NA
 10421063 10421064 LM5578_0017 LM5578_0018     TRUE 0.993 -3.000 0.360 1.000 Y NA
 10421064 10421065 LM5578_0018 LM5578_0019     TRUE 0.906 75.000 0.620 0.039 Y NA
 10421065 10421066 LM5578_0019 LM5578_0020     TRUE 0.998 -13.000 0.805 0.039 Y NA
 10421066 10421067 LM5578_0020 LM5578_0021     TRUE 0.788 19.000 0.205 1.000 N NA
 10421067 10421068 LM5578_0021 LM5578_0022     TRUE 0.828 13.000 0.261 NA N NA
 10421068 10421069 LM5578_0022 LM5578_0023     TRUE 0.535 58.000 0.347 NA   NA
 10421069 10421070 LM5578_0023 LM5578_0024     TRUE 0.965 -3.000 0.292 1.000   NA
 10421070 10421071 LM5578_0024 LM5578_0025     TRUE 0.993 -3.000 0.300 1.000 Y NA
 10421071 10421072 LM5578_0025 LM5578_0026     TRUE 0.963 -3.000 0.231 1.000   NA
 10421072 10421073 LM5578_0026 LM5578_0027     FALSE 0.180 123.000 0.000 1.000   NA
 10421075 10421076 LM5578_0029 LM5578_0030     FALSE 0.328 103.000 0.632 NA   NA
 10421076 10421077 LM5578_0030 LM5578_0031     TRUE 0.858 14.000 0.474 NA N NA
 10421077 10421078 LM5578_0031 LM5578_0032   serC FALSE 0.006 371.000 0.000 NA N NA
 10421078 10421079 LM5578_0032 LM5578_0033 serC   TRUE 0.992 -7.000 0.238 1.000 Y NA
 10421079 10421080 LM5578_0033 LM5578_0034     FALSE 0.237 89.000 0.109 NA   NA
 10421080 10421081 LM5578_0034 LM5578_0035     TRUE 0.881 9.000 0.038 NA   NA
 10421083 10421084 LM5578_0037 LM5578_0038     FALSE 0.081 211.000 0.182 1.000   NA
 10421084 10421085 LM5578_0038 LM5578_0039     TRUE 0.973 0.000 0.909 NA   NA
 10421085 10421086 LM5578_0039 LM5578_0040     TRUE 0.915 16.000 0.750 NA   NA
 10421086 10421087 LM5578_0040 LM5578_0041     FALSE 0.281 88.000 0.258 NA   NA
 10421089 10421090 LM5578_0043 LM5578_0044     TRUE 0.765 24.000 0.196 NA   NA
 10421090 10421091 LM5578_0044 LM5578_0045     TRUE 0.786 20.000 0.065 NA   NA
 10421093 10421094 LM5578_0047 LM5578_0048 trmE gidA TRUE 0.799 25.000 0.266 1.000   NA
 10421094 10421095 LM5578_0048 LM5578_0049 gidA   FALSE 0.103 159.000 0.004 NA   NA
 10421095 10421096 LM5578_0049 LM5578_0050     TRUE 0.648 25.000 0.000 NA   NA
 10421096 10421097 LM5578_0050 LM5578_0051     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10421097 10421098 LM5578_0051 LM5578_0052     FALSE 0.127 137.000 0.000 NA   NA
 10421098 10421099 LM5578_0052 LM5578_0053     FALSE 0.158 113.000 0.000 NA   NA
 10421099 10421100 LM5578_0053 LM5578_0054     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10421100 10421101 LM5578_0054 LM5578_0055     TRUE 0.978 -7.000 1.000 NA   NA
 10421101 10421102 LM5578_0055 LM5578_0056     TRUE 0.958 5.000 0.833 NA   NA
 10421102 10421103 LM5578_0056 LM5578_0057   gidB FALSE 0.113 153.000 0.007 NA   NA
 10421103 10421104 LM5578_0057 LM5578_0058 gidB   FALSE 0.041 202.000 0.003 1.000 N NA
 10421104 10421105 LM5578_0058 LM5578_0059     TRUE 0.945 2.000 0.130 1.000   NA
 10421105 10421106 LM5578_0059 LM5578_0060     TRUE 0.651 34.000 0.041 1.000   NA
 10421106 10421107 LM5578_0060 LM5578_0061     TRUE 0.431 63.000 0.041 1.000   NA
 10421107 10421108 LM5578_0061 LM5578_0062     TRUE 0.932 13.000 0.588 1.000   NA
 10421108 10421109 LM5578_0062 LM5578_0063     TRUE 0.944 25.000 0.270 NA Y NA
 10421109 10421110 LM5578_0063 LM5578_0064     TRUE 0.992 -16.000 0.380 NA Y NA
 10421110 10421111 LM5578_0064 LM5578_0065     TRUE 0.421 172.000 0.057 1.000 Y NA
 10421111 10421112 LM5578_0065 LM5578_0066     TRUE 0.876 12.000 0.098 NA   NA
 10421112 10421113 LM5578_0066 LM5578_0067     FALSE 0.161 195.000 0.833 NA   NA
 10421113 10421114 LM5578_0067 LM5578_0068   parA FALSE 0.048 224.000 0.000 1.000   NA
 10421114 10421115 LM5578_0068 LM5578_0069 parA parB TRUE 0.970 -7.000 0.827 1.000 N NA
 10421115 10421116 LM5578_0069 LM5578_0070 parB   TRUE 0.846 13.000 0.039 NA   NA
 10421116 10421117 LM5578_0070 LM5578_0071   bvrA FALSE 0.079 172.000 0.000 NA   NA
 10421117 10421118 LM5578_0071 LM5578_0072 bvrA bvrB FALSE 0.191 108.000 0.000 1.000   NA
 10421118 10421119 LM5578_0072 LM5578_0073 bvrB bvrC TRUE 0.840 0.000 0.000 NA N NA
 10421119 10421120 LM5578_0073 LM5578_0074 bvrC kat FALSE 0.057 148.000 0.000 NA N NA
 10421120 10421121 LM5578_0074 LM5578_0075 kat   FALSE 0.031 211.000 0.000 1.000 N NA
 10421121 10421122 LM5578_0075 LM5578_0076     FALSE 0.323 150.000 0.170 0.037 N NA
 10421122 10421123 LM5578_0076 LM5578_0077     TRUE 0.993 15.000 0.917 0.032 Y NA
 10421123 10421124 LM5578_0077 LM5578_0078     TRUE 0.936 34.000 0.450 1.000 Y NA
 10421124 10421125 LM5578_0078 LM5578_0079     TRUE 0.988 6.000 0.450 1.000 Y NA
 10421125 10421126 LM5578_0079 LM5578_0080     FALSE 0.085 152.000 0.008 1.000 N NA
 10421126 10421127 LM5578_0080 LM5578_0081     FALSE 0.023 278.000 0.000 NA   NA
 10421129 10421130 LM5578_0083 LM5578_0084     FALSE 0.026 266.000 0.000 NA   NA
 10421130 10421131 LM5578_0084 LM5578_0085     TRUE 0.924 -10.000 0.000 NA   NA
 10421131 10421132 LM5578_0085 LM5578_0086     FALSE 0.334 97.000 0.407 1.000   NA
 10421132 10421133 LM5578_0086 LM5578_0087     TRUE 0.993 -7.000 0.368 1.000 Y NA
 10421135 10421136 LM5578_0089 LM5578_0090     TRUE 0.851 27.000 1.000 NA   NA
 10421136 10421137 LM5578_0090 LM5578_0091     FALSE 0.357 71.000 0.177 NA   NA
 10421137 10421138 LM5578_0091 LM5578_0092     FALSE 0.228 100.000 0.177 NA   NA
 10421139 10421140 LM5578_0093 LM5578_0094     TRUE 0.990 -7.000 0.095 NA Y NA
 10421140 10421141 LM5578_0094 LM5578_0095     TRUE 0.983 12.000 0.524 NA Y NA
 10421141 10421142 LM5578_0095 LM5578_0096     TRUE 0.978 33.000 0.789 0.032 Y NA
 10421142 10421143 LM5578_0096 LM5578_0097     TRUE 0.921 47.000 0.765 1.000 Y NA
 10421144 10421145 LM5578_0098 LM5578_0099     TRUE 0.444 58.000 0.092 NA   NA
 10421147 10421148 LM5578_0101 LM5578_0102 guaB   FALSE 0.090 161.000 0.072 1.000 N NA
 10421148 10421149 LM5578_0102 LM5578_0103   topB TRUE 0.945 24.000 0.058 1.000 Y NA
 10421149 10421150 LM5578_0103 LM5578_0104 topB   FALSE 0.242 109.000 0.096 1.000   NA
 10421150 10421151 LM5578_0104 LM5578_0105     FALSE 0.353 179.000 0.333 0.030   NA
 10421152 10421153 LM5578_0106 LM5578_0107     FALSE 0.023 276.000 0.000 NA   NA
 10421153 10421154 LM5578_0107 LM5578_0108     TRUE 0.998 0.000 0.720 0.010 Y NA
 10421154 10421155 LM5578_0108 LM5578_0109     FALSE 0.082 161.000 0.033 1.000 N NA
 10421155 10421156 LM5578_0109 LM5578_0110     TRUE 0.990 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 10421157 10421158 LM5578_0111 LM5578_0112   serS FALSE 0.021 308.000 0.000 1.000   NA
 10421158 10421159 LM5578_0112 LM5578_0113 serS   TRUE 0.627 20.000 0.014 NA N NA
 10421161 10421162 LM5578_0115 LM5578_0116     FALSE 0.110 143.000 0.049 1.000 N NA
 10421162 10421163 LM5578_0116 LM5578_0117     TRUE 0.788 19.000 0.049 NA   NA
 10421163 10421164 LM5578_0117 LM5578_0118     FALSE 0.277 117.000 0.375 NA   NA
 10421164 10421165 LM5578_0118 LM5578_0119     TRUE 0.951 -10.000 0.180 NA   NA
 10421165 10421166 LM5578_0119 LM5578_0120     TRUE 0.952 -7.000 0.180 NA   NA
 10421166 10421167 LM5578_0120 LM5578_0121     FALSE 0.212 118.000 0.122 NA   NA
 10421167 10421168 LM5578_0121 LM5578_0122     FALSE 0.370 68.000 0.122 NA   NA
 10421169 10421170 LM5578_0123 LM5578_0124     TRUE 0.993 -3.000 0.438 1.000 Y NA
 10421170 10421171 LM5578_0124 LM5578_0125     TRUE 0.992 2.000 0.500 1.000 Y NA
 10421171 10421172 LM5578_0125 LM5578_0126     TRUE 0.872 61.000 0.529 1.000 Y NA
 10421173 10421174 LM5578_0127 LM5578_0128     FALSE 0.377 84.000 0.556 NA   NA
 10421174 10421175 LM5578_0128 LM5578_0129     TRUE 0.920 14.000 0.692 NA   NA
 10421176 10421177 LM5578_0130 LM5578_0132     FALSE 0.014 340.000 0.000 NA   NA
 10421177 10421178 LM5578_0132 LM5578_0133     FALSE 0.191 85.000 0.000 NA   NA
 10421179 10421180 LM5578_0134 LM5578_0135     TRUE 0.960 -3.000 0.520 1.000 N NA
 10421180 10421181 LM5578_0135 LM5578_0136     TRUE 0.562 58.000 0.440 NA   NA
 10421182 10421183 LM5578_0137 LM5578_0138     TRUE 0.555 54.000 0.172 1.000   NA
 10421186 10421187 LM5578_0141 LM5578_0142   cydA FALSE 0.008 382.000 0.000 1.000 N NA
 10421187 10421188 LM5578_0142 LM5578_0143 cydA cydB TRUE 0.997 -13.000 0.153 0.023 Y NA
 10421188 10421189 LM5578_0143 LM5578_0144 cydB cydC TRUE 0.896 42.000 0.151 1.000 Y NA
 10421189 10421190 LM5578_0144 LM5578_0145 cydC cydD TRUE 0.997 -3.000 0.168 0.010 Y NA
 10421190 10421191 LM5578_0145 LM5578_0146 cydD   FALSE 0.172 141.000 0.034 1.000   NA
 10421191 10421192 LM5578_0146 LM5578_0147     TRUE 0.525 43.000 0.044 NA   NA
 10421192 10421193 LM5578_0147 LM5578_0148     FALSE 0.234 116.000 0.200 NA   NA
 10421193 10421194 LM5578_0148 LM5578_0149     TRUE 0.632 58.000 0.750 NA   NA
 10421194 10421195 LM5578_0149 LM5578_0150     FALSE 0.007 545.000 0.000 NA   NA
 10421197 10421198 LM5578_0152 LM5578_0153     FALSE 0.278 135.000 0.588 NA   NA
 10421198 10421199 LM5578_0153 LM5578_0154     TRUE 0.961 3.000 0.706 NA   NA
 10421199 10421200 LM5578_0154 LM5578_0155     TRUE 0.898 18.000 0.706 NA   NA
 10421200 10421201 LM5578_0155 LM5578_0156   dnaX FALSE 0.019 291.000 0.000 NA   NA
 10421201 10421202 LM5578_0156 LM5578_0157 dnaX   TRUE 0.647 30.000 0.071 NA   NA
 10421202 10421203 LM5578_0157 LM5578_0158   recR FALSE 0.327 109.000 0.604 NA   NA
 10421203 10421204 LM5578_0158 LM5578_0159 recR   TRUE 0.836 15.000 0.071 NA   NA
 10421205 10421206 LM5578_0160 LM5578_0161     FALSE 0.232 121.000 0.094 1.000   NA
 10421206 10421207 LM5578_0161 LM5578_0162     FALSE 0.189 119.000 0.000 1.000   NA
 10421207 10421208 LM5578_0162 LM5578_0163     FALSE 0.189 106.000 0.000 1.000   NA
 10421208 10421209 LM5578_0163 LM5578_0164     TRUE 0.941 4.000 0.211 1.000   NA
 10421209 10421210 LM5578_0164 LM5578_0165     TRUE 0.989 22.000 0.316 0.003 Y NA
 10421211 10421212 LM5578_0166 LM5578_0167     FALSE 0.381 53.000 0.045 1.000 N NA
 10421212 10421213 LM5578_0167 LM5578_0168     FALSE 0.182 108.000 0.033 NA   NA
 10421215 10421216 LM5578_0170 LM5578_0171     FALSE 0.005 555.000 0.000 1.000 N NA
 10421216 10421217 LM5578_0171 LM5578_0172     TRUE 0.979 1.000 0.467 0.081 N NA
 10421217 10421218 LM5578_0172 LM5578_0173     TRUE 0.998 -3.000 0.727 0.010 Y NA
 10421218 10421219 LM5578_0173 LM5578_0174     FALSE 0.131 165.000 0.182 NA   NA
 10421220 10421221 LM5578_0175 LM5578_0176     TRUE 0.968 37.000 0.429 0.032 Y NA
 10421221 10421222 LM5578_0176 LM5578_0177     TRUE 0.809 136.000 0.429 0.032 Y NA
 10421223 10421224 LM5578_0178 LM5578_0179 kdpA kdpB TRUE 0.994 12.000 0.112 0.001 Y NA
 10421224 10421225 LM5578_0179 LM5578_0180 kdpB kdpC TRUE 0.996 15.000 0.877 0.001 Y NA
 10421225 10421226 LM5578_0180 LM5578_0181 kdpC   TRUE 0.909 16.000 0.014 0.092 N NA
 10421226 10421227 LM5578_0181 LM5578_0182     TRUE 0.991 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 10421227 10421228 LM5578_0182 LM5578_0183     TRUE 0.570 41.000 0.095 NA   NA
 10421229 10421230 LM5578_0184 LM5578_0185     TRUE 0.913 13.000 0.500 NA   NA
 10421230 10421231 LM5578_0185 LM5578_0186     FALSE 0.074 195.000 0.075 NA   NA
 10421231 10421232 LM5578_0186 LM5578_0187     TRUE 0.912 4.000 0.233 1.000 N NA
 10421233 10421234 LM5578_0188 LM5578_0189     TRUE 0.642 46.000 0.450 NA   NA
 10421234 10421235 LM5578_0189 LM5578_0190     TRUE 0.952 -3.000 0.192 NA   NA
 10421235 10421236 LM5578_0190 LM5578_0191     FALSE 0.342 74.000 0.192 NA   NA
 10421236 10421237 LM5578_0191 LM5578_0192     FALSE 0.012 369.000 0.000 NA   NA
 10421237 10421238 LM5578_0192 LM5578_0193     TRUE 0.892 34.000 0.800 0.037 N NA
 10421238 10421239 LM5578_0193 LM5578_0194     TRUE 0.946 58.000 0.519 0.032 Y NA
 10421239 10421240 LM5578_0194 LM5578_0195     TRUE 0.894 62.000 0.000 0.049 Y NA
 10421240 10421241 LM5578_0195 LM5578_0196     TRUE 0.426 37.000 0.000 1.000 N NA
 10421241 10421242 LM5578_0196 LM5578_0197     TRUE 0.996 2.000 0.241 0.019 Y NA
 10421242 10421243 LM5578_0197 LM5578_0198     FALSE 0.094 195.000 0.414 1.000 N NA
 10421243 10421244 LM5578_0198 LM5578_0199     TRUE 0.989 9.000 0.786 1.000 Y NA
 10421244 10421245 LM5578_0199 LM5578_0200     TRUE 0.949 34.000 0.818 1.000 Y NA
 10421245 10421246 LM5578_0200 LM5578_0201     TRUE 0.991 -3.000 0.061 1.000 Y NA
 10421246 10421247 LM5578_0201 LM5578_0202     FALSE 0.188 134.000 0.034 1.000   NA
 10421247 10421248 LM5578_0202 LM5578_0203     TRUE 0.880 15.000 0.169 1.000   NA
 10421248 10421249 LM5578_0203 LM5578_0204   rpsL FALSE 0.054 193.000 0.037 1.000 N NA
 10421249 10421250 LM5578_0204 LM5578_0205 rpsL rpsG TRUE 0.978 31.000 0.224 0.004 Y NA
 10421250 10421251 LM5578_0205 LM5578_0206 rpsG fus TRUE 0.856 66.000 0.579 1.000 Y NA
 10421251 10421252 LM5578_0206 LM5578_0207 fus tuf TRUE 0.893 109.000 0.400 0.001 Y NA
 10421252 10421253 LM5578_0207 LM5578_0208 tuf   FALSE 0.081 155.000 0.006 1.000 N NA
 10421253 10421254 LM5578_0208 LM5578_0209     FALSE 0.249 194.000 0.471 0.037 N NA
 10421254 10421255 LM5578_0209 LM5578_0210     TRUE 0.996 3.000 0.405 0.032 Y NA
 10421255 10421256 LM5578_0210 LM5578_0211   ulaA TRUE 0.926 27.000 0.595 0.049   NA
 10421256 10421257 LM5578_0211 LM5578_0212 ulaA   TRUE 0.504 70.000 0.484 1.000   NA
 10421257 10421258 LM5578_0212 LM5578_0213     TRUE 0.946 13.000 0.895 1.000   NA
 10421258 10421259 LM5578_0213 LM5578_0214     TRUE 0.951 -40.000 0.245 NA   NA
 10421259 10421260 LM5578_0214 LM5578_0215     TRUE 0.947 1.000 0.264 NA   NA
 10421260 10421261 LM5578_0215 LM5578_0216     FALSE 0.292 79.000 0.136 NA   NA
 10421261 10421262 LM5578_0216 LM5578_0217     TRUE 0.682 28.000 0.103 NA   NA
 10421263 10421264 LM5578_0218 LM5578_0219     FALSE 0.305 90.000 0.222 1.000   NA
 10421264 10421265 LM5578_0219 LM5578_0220     TRUE 0.783 22.000 0.118 NA   NA
 10421265 10421266 LM5578_0220 LM5578_0221     TRUE 0.627 33.000 0.078 NA   NA
 10421266 10421267 LM5578_0221 LM5578_0222     FALSE 0.113 176.000 0.190 NA   NA
 10421268 10421269 LM5578_0223 LM5578_0224     FALSE 0.185 164.000 0.333 1.000   NA
 10421269 10421270 LM5578_0224 LM5578_0225     TRUE 0.765 82.000 0.526 1.000 Y NA
 10421270 10421271 LM5578_0225 LM5578_0226     TRUE 0.786 20.000 0.224 1.000 N NA
 10421271 10421272 LM5578_0226 LM5578_0227   rpsJ FALSE 0.009 361.000 0.000 1.000 N NA
 10421272 10421273 LM5578_0227 LM5578_0228 rpsJ rplC TRUE 0.973 35.000 0.467 0.027 Y NA
 10421273 10421274 LM5578_0228 LM5578_0229 rplC rplD TRUE 0.984 26.000 0.544 0.020 Y NA
 10421274 10421275 LM5578_0229 LM5578_0230 rplD rplW TRUE 0.991 0.000 0.307 1.000 Y NA
 10421275 10421276 LM5578_0230 LM5578_0231 rplW rplB TRUE 0.939 41.000 0.849 1.000 Y NA
 10421276 10421277 LM5578_0231 LM5578_0232 rplB rpsS TRUE 0.970 46.000 0.820 0.027 Y NA
 10421277 10421278 LM5578_0232 LM5578_0233 rpsS rplV TRUE 0.990 21.000 0.769 0.027 Y NA
 10421278 10421279 LM5578_0233 LM5578_0234 rplV rpsC TRUE 0.997 4.000 0.719 0.027 Y NA
 10421279 10421280 LM5578_0234 LM5578_0235 rpsC rplP TRUE 0.997 3.000 0.828 0.027 Y NA
 10421280 10421281 LM5578_0235 LM5578_0236 rplP rpmC TRUE 0.998 -10.000 0.802 0.020 Y NA
 10421281 10421282 LM5578_0236 LM5578_0237 rpmC rpsQ TRUE 0.985 28.000 0.828 0.020 Y NA
 10421282 10421283 LM5578_0237 LM5578_0238 rpsQ rplN TRUE 0.913 80.000 0.791 0.027 Y NA
 10421283 10421284 LM5578_0238 LM5578_0239 rplN rplX TRUE 0.958 38.000 0.071 0.027 Y NA
 10421284 10421285 LM5578_0239 LM5578_0240 rplX rplE TRUE 0.975 27.000 0.057 0.020 Y NA
 10421285 10421286 LM5578_0240 LM5578_0241 rplE rpsN TRUE 0.978 31.000 0.496 0.020 Y NA
 10421286 10421287 LM5578_0241 LM5578_0242 rpsN rpsH TRUE 0.978 31.000 0.473 0.020 Y NA
 10421287 10421288 LM5578_0242 LM5578_0243 rpsH rplF TRUE 0.982 31.000 0.808 0.020 Y NA
 10421288 10421289 LM5578_0243 LM5578_0244 rplF rplR TRUE 0.992 19.000 0.815 0.020 Y NA
 10421289 10421290 LM5578_0244 LM5578_0245 rplR rpsE TRUE 0.990 22.000 0.814 0.027 Y NA
 10421290 10421291 LM5578_0245 LM5578_0246 rpsE rpmD TRUE 0.992 17.000 0.789 0.027 Y NA
 10421291 10421292 LM5578_0246 LM5578_0247 rpmD rplO TRUE 0.966 56.000 0.653 0.003 Y NA
 10421292 10421293 LM5578_0247 LM5578_0248 rplO secY TRUE 0.963 0.000 0.730 1.000 N NA
 10421293 10421294 LM5578_0248 LM5578_0249 secY adk TRUE 0.423 60.000 0.241 1.000 N NA
 10421294 10421295 LM5578_0249 LM5578_0250 adk infA FALSE 0.010 386.000 0.059 1.000 N NA
 10421295 10421296 LM5578_0250 LM5578_0251 infA rpmJ FALSE 0.280 104.000 0.257 1.000   NA
 10421296 10421297 LM5578_0251 LM5578_0252 rpmJ rpsM TRUE 0.954 19.000 0.194 0.020   NA
 10421297 10421298 LM5578_0252 LM5578_0253 rpsM rpsK TRUE 0.989 23.000 0.810 0.020 Y NA
 10421298 10421299 LM5578_0253 LM5578_0254 rpsK rpoA FALSE 0.215 110.000 0.308 1.000 N NA
 10421299 10421300 LM5578_0254 LM5578_0255 rpoA rplQ TRUE 0.899 17.000 0.873 1.000 N NA
 10421300 10421301 LM5578_0255 LM5578_0256 rplQ   FALSE 0.046 208.000 0.000 NA   NA
 10421302 10421303 LM5578_0257 LM5578_0258     FALSE 0.275 119.000 0.238 1.000   NA
 10421304 10421305 LM5578_0259 LM5578_0260     TRUE 0.998 -24.000 0.713 0.028 Y NA
 10421305 10421306 LM5578_0260 LM5578_0261     TRUE 0.986 3.000 0.044 1.000 Y NA
 10421306 10421307 LM5578_0261 LM5578_0262   truA TRUE 0.864 6.000 0.049 1.000 N NA
 10421307 10421308 LM5578_0262 LM5578_0263 truA rplM FALSE 0.337 195.000 0.052 1.000 Y NA
 10421308 10421309 LM5578_0263 LM5578_0264 rplM rpsI TRUE 0.989 22.000 0.601 0.020 Y NA
 10421311 10421312 LM5578_0266 LM5578_0267     TRUE 0.841 22.000 0.250 1.000   NA
 10421314 10421315 LM5578_0269 LM5578_0270     TRUE 0.755 18.000 0.000 NA   NA
 10421315 10421316 LM5578_0270 LM5578_rRNA01     FALSE 0.080 171.000 0.000 NA   NA
 10421316 10421317 LM5578_rRNA01 LM5578_tRNA02     FALSE 0.140 128.000 0.000 NA   NA
 10421317 10421318 LM5578_tRNA02 LM5578_tRNA03     TRUE 0.437 47.000 0.000 NA   NA
 10421318 10421319 LM5578_tRNA03 LM5578_rRNA02     FALSE 0.078 173.000 0.000 NA   NA
 10421319 10421320 LM5578_rRNA02 LM5578_rRNA03     FALSE 0.207 81.000 0.000 NA   NA
 10421320 10421321 LM5578_rRNA03 LM5578_0272     FALSE 0.006 620.000 0.000 NA   NA
 10421321 10421322 LM5578_0272 LM5578_0273     TRUE 0.979 -3.000 0.848 1.000   NA
 10421322 10421323 LM5578_0273 LM5578_0274   clpC TRUE 0.714 29.000 0.425 1.000 N NA
 10421323 10421324 LM5578_0274 LM5578_0275 clpC   TRUE 0.521 146.000 0.062 1.000 Y NA
 10421324 10421325 LM5578_0275 LM5578_0276     FALSE 0.163 134.000 0.056 NA   NA
 10421325 10421326 LM5578_0276 LM5578_0277   ispD TRUE 0.800 20.000 0.108 NA   NA
 10421326 10421327 LM5578_0277 LM5578_0278 ispD ispF TRUE 0.993 -7.000 0.419 1.000 Y NA
 10421327 10421328 LM5578_0278 LM5578_0279 ispF gltX TRUE 0.746 19.000 0.076 1.000 N NA
 10421328 10421329 LM5578_0279 LM5578_0280 gltX cysE FALSE 0.008 398.000 0.008 1.000 N NA
 10421329 10421330 LM5578_0280 LM5578_0281 cysE cysS TRUE 0.953 7.000 0.035 0.052 N NA
 10421330 10421331 LM5578_0281 LM5578_0282 cysS   TRUE 0.934 4.000 0.129 1.000   NA
 10421331 10421332 LM5578_0282 LM5578_0283     TRUE 0.989 0.000 0.150 0.004   NA
 10421332 10421333 LM5578_0283 LM5578_0284     TRUE 0.926 3.000 0.109 NA   NA
 10421333 10421334 LM5578_0284 LM5578_0285   sigH FALSE 0.345 81.000 0.361 NA   NA
 10421334 10421335 LM5578_0285 LM5578_0286 sigH secE FALSE 0.017 273.000 0.000 1.000 N NA
 10421335 10421336 LM5578_0286 LM5578_0287 secE nusG FALSE 0.295 130.000 0.843 1.000 N NA
 10421336 10421337 LM5578_0287 LM5578_0288 nusG   TRUE 0.418 55.000 0.011 NA   NA
 10421337 10421338 LM5578_0288 LM5578_0289   rplK FALSE 0.156 127.000 0.009 NA   NA
 10421338 10421339 LM5578_0289 LM5578_0290 rplK rplA TRUE 0.976 40.000 0.838 0.026 Y NA
 10421339 10421340 LM5578_0290 LM5578_0291 rplA rplJ TRUE 0.473 248.000 0.302 0.026 Y NA
 10421340 10421341 LM5578_0291 LM5578_0292 rplJ rplL TRUE 0.925 79.000 0.884 0.020 Y NA
 10421341 10421342 LM5578_0292 LM5578_0293 rplL   FALSE 0.096 158.000 0.000 NA   NA
 10421342 10421343 LM5578_0293 LM5578_0294     FALSE 0.174 115.000 0.010 NA   NA
 10421343 10421344 LM5578_0294 LM5578_0295     FALSE 0.013 347.000 0.000 NA   NA
 10421344 10421345 LM5578_0295 LM5578_0296     FALSE 0.240 145.000 0.538 NA   NA
 10421345 10421346 LM5578_0296 LM5578_0297     FALSE 0.170 138.000 0.296 1.000 N NA
 10421346 10421347 LM5578_0297 LM5578_0298     TRUE 0.990 18.000 0.690 0.038 Y NA
 10421347 10421348 LM5578_0298 LM5578_0299     TRUE 0.997 2.000 0.793 0.038 Y NA
 10421348 10421349 LM5578_0299 LM5578_0300     TRUE 0.966 15.000 0.000 1.000 Y NA
 10421349 10421350 LM5578_0300 LM5578_0301     TRUE 0.995 1.000 0.000 0.012 Y NA
 10421350 10421351 LM5578_0301 LM5578_0302   rpoB FALSE 0.005 557.000 0.000 1.000 N NA
 10421351 10421352 LM5578_0302 LM5578_0303 rpoB rpoC TRUE 0.829 171.000 0.851 0.002 Y NA
 10421352 10421353 LM5578_0303 LM5578_0304 rpoC   FALSE 0.295 77.000 0.010 1.000   NA
 10421353 10421354 LM5578_0304 LM5578_0305     TRUE 0.544 66.000 0.458 1.000   NA
 10421354 10421355 LM5578_0305 LM5578_0306   inlG FALSE 0.030 274.000 0.000 1.000   NA
 10421355 10421356 LM5578_0306 LM5578_0307 inlG inlC2 TRUE 0.538 138.000 0.333 0.019   NA
 10421356 10421357 LM5578_0307 LM5578_0308 inlC2 inlD FALSE 0.282 208.000 0.333 0.019   NA
 10421357 10421358 LM5578_0308 LM5578_0309 inlD inlE FALSE 0.201 209.000 0.000 0.019   NA
 10421358 10421359 LM5578_0309 LM5578_0310 inlE   FALSE 0.284 136.000 0.455 1.000   NA
 10421359 10421360 LM5578_0310 LM5578_0311     FALSE 0.165 148.000 0.364 1.000 N NA
 10421360 10421361 LM5578_0311 LM5578_0312     TRUE 0.912 7.000 0.545 NA N NA
 10421361 10421362 LM5578_0312 LM5578_0313     FALSE 0.381 72.000 0.647 NA N NA
 10421362 10421363 LM5578_0313 LM5578_0314     FALSE 0.320 84.000 0.529 1.000 N NA
 10421364 10421365 LM5578_0315 LM5578_0316     TRUE 0.933 4.000 0.265 NA   NA
 10421365 10421366 LM5578_0316 LM5578_0317     TRUE 0.413 121.000 0.917 1.000   NA
 10421368 10421369 LM5578_0319 LM5578_0320     FALSE 0.027 259.000 0.000 NA   NA
 10421369 10421370 LM5578_0320 LM5578_0321     TRUE 0.882 17.000 0.308 1.000   NA
 10421373 10421374 LM5578_0324 LM5578_0325     TRUE 0.944 -7.000 0.240 1.000 N NA
 10421375 10421376 LM5578_0326 LM5578_0327     FALSE 0.132 162.000 0.169 NA   NA
 10421376 10421377 LM5578_0327 LM5578_0328     TRUE 0.919 -28.000 0.000 NA   NA
 10421377 10421378 LM5578_0328 LM5578_0329     TRUE 0.631 26.000 0.000 NA   NA
 10421378 10421379 LM5578_0329 LM5578_0330     TRUE 0.995 -3.000 0.846 1.000 Y NA
 10421379 10421380 LM5578_0330 LM5578_0331     TRUE 0.982 15.000 0.880 NA Y NA
 10421381 10421382 LM5578_0332 LM5578_0333     FALSE 0.030 213.000 0.000 1.000 N NA
 10421382 10421383 LM5578_0333 LM5578_0334     TRUE 0.661 185.000 0.597 0.085 Y NA
 10421383 10421384 LM5578_0334 LM5578_0335     TRUE 0.969 -3.000 0.575 NA   NA
 10421384 10421385 LM5578_0335 LM5578_0336     TRUE 0.967 3.000 0.890 NA   NA
 10421385 10421386 LM5578_0336 LM5578_0337     FALSE 0.218 120.000 0.176 NA   NA
 10421386 10421387 LM5578_0337 LM5578_0338     FALSE 0.225 98.000 0.030 1.000   NA
 10421387 10421388 LM5578_0338 LM5578_0339     FALSE 0.006 675.000 0.000 NA   NA
 10421390 10421391 LM5578_0341 LM5578_0342     FALSE 0.043 211.000 0.000 NA   NA
 10421392 10421393 LM5578_0343 LM5578_0344     TRUE 0.480 99.000 0.348 0.036 N NA
 10421393 10421394 LM5578_0344 LM5578_0345     TRUE 0.996 5.000 0.565 0.031 Y NA
 10421394 10421395 LM5578_0345 LM5578_0346     TRUE 0.980 17.000 0.786 1.000 Y NA
 10421395 10421396 LM5578_0346 LM5578_0347     TRUE 0.995 -7.000 0.714 1.000 Y NA
 10421397 10421398 LM5578_0348 LM5578_0349     TRUE 0.712 36.000 0.455 NA   NA
 10421398 10421399 LM5578_0349 LM5578_0350     FALSE 0.047 206.000 0.000 NA   NA
 10421399 10421400 LM5578_0350 LM5578_0351     TRUE 0.917 -43.000 0.000 NA   NA
 10421400 10421401 LM5578_0351 LM5578_0352     TRUE 0.954 -12.000 0.087 1.000   NA
 10421401 10421402 LM5578_0352 LM5578_0353     FALSE 0.049 223.000 0.000 1.000   NA
 10421402 10421403 LM5578_0353 LM5578_0354     TRUE 0.917 -7.000 0.029 1.000 N NA
 10421403 10421404 LM5578_0354 LM5578_0355     TRUE 0.997 -3.000 0.044 0.005 Y NA
 10421404 10421405 LM5578_0355 LM5578_0356     TRUE 0.997 -3.000 0.142 0.005 Y NA
 10421407 10421408 LM5578_0358 LM5578_0359     FALSE 0.090 184.000 0.094 NA   NA
 10421410 10421411 LM5578_0361 LM5578_0362     FALSE 0.034 261.000 0.000 1.000   NA
 10421411 10421412 LM5578_0362 LM5578_0363     TRUE 0.510 164.000 0.778 0.023   NA
 10421412 10421413 LM5578_0363 LM5578_0364     FALSE 0.033 307.000 0.200 1.000   NA
 10421413 10421414 LM5578_0364 LM5578_0365     FALSE 0.305 138.000 0.800 NA   NA
 10421416 10421417 LM5578_0367 LM5578_0368   inlI FALSE 0.009 429.000 0.000 NA   NA
 10421417 10421418 LM5578_0368 LM5578_0369 inlI   FALSE 0.039 221.000 0.000 NA   NA
 10421418 10421419 LM5578_0369 LM5578_0370     FALSE 0.031 248.000 0.000 NA   NA
 10421419 10421420 LM5578_0370 LM5578_0371     FALSE 0.129 136.000 0.000 NA   NA
 10421420 10421421 LM5578_0371 LM5578_0372     FALSE 0.300 105.000 0.500 NA   NA
 10421421 10421422 LM5578_0372 LM5578_0373     FALSE 0.313 79.000 0.200 NA   NA
 10421422 10421423 LM5578_0373 LM5578_0374     FALSE 0.175 169.000 0.500 NA   NA
 10421423 10421424 LM5578_0374 LM5578_0375     FALSE 0.036 229.000 0.000 NA   NA
 10421425 10421426 LM5578_0376 LM5578_0377     TRUE 0.406 66.000 0.167 NA   NA
 10421426 10421427 LM5578_0377 LM5578_0378     TRUE 0.993 2.000 0.750 1.000 Y NA
 10421427 10421428 LM5578_0378 LM5578_0379     TRUE 0.489 47.000 0.192 1.000 N NA
 10421428 10421429 LM5578_0379 LM5578_0380     TRUE 0.720 24.000 0.212 1.000 N NA
 10421429 10421430 LM5578_0380 LM5578_0381     TRUE 0.985 7.000 0.208 1.000 Y NA
 10421430 10421431 LM5578_0381 LM5578_0382     TRUE 0.986 4.000 0.147 1.000 Y NA
 10421431 10421432 LM5578_0382 LM5578_0383     TRUE 0.988 22.000 0.162 0.003 Y NA
 10421432 10421433 LM5578_0383 LM5578_0384     TRUE 0.873 22.000 0.667 NA   NA
 10421433 10421434 LM5578_0384 LM5578_0385     TRUE 0.924 16.000 0.889 NA   NA
 10421434 10421435 LM5578_0385 LM5578_0386     FALSE 0.394 85.000 0.667 NA   NA
 10421436 10421437 LM5578_0387 LM5578_0388     TRUE 0.463 66.000 0.182 1.000   NA
 10421439 10421440 LM5578_0390 LM5578_0391     FALSE 0.339 174.000 0.095 0.023   NA
 10421440 10421441 LM5578_0391 LM5578_0392     FALSE 0.114 199.000 0.308 1.000   NA
 10421441 10421442 LM5578_0392 LM5578_0393     TRUE 0.993 14.000 0.692 0.031 Y NA
 10421442 10421443 LM5578_0393 LM5578_0394     TRUE 0.994 0.000 0.846 1.000 Y NA
 10421443 10421444 LM5578_0394 LM5578_0395     TRUE 0.882 57.000 0.500 1.000 Y NA
 10421445 10421446 LM5578_0396 LM5578_0397     FALSE 0.138 129.000 0.000 NA   NA
 10421446 10421447 LM5578_0397 LM5578_0398     TRUE 0.981 12.000 0.393 NA Y NA
 10421448 10421449 LM5578_0399 LM5578_0400     TRUE 0.989 -3.000 0.040 NA Y NA
 10421449 10421450 LM5578_0400 LM5578_0401     TRUE 0.977 18.000 0.812 NA Y NA
 10421450 10421451 LM5578_0401 LM5578_0402     FALSE 0.196 73.000 0.072 NA N NA
 10421451 10421452 LM5578_0402 LM5578_0403     FALSE 0.182 97.000 0.013 NA   NA
 10421452 10421453 LM5578_0403 LM5578_0404     TRUE 0.545 37.000 0.013 NA   NA
 10421455 10421456 LM5578_0406 LM5578_0407     TRUE 0.995 -7.000 0.857 1.000 Y NA
 10421456 10421457 LM5578_0407 LM5578_0408     TRUE 0.992 18.000 0.846 0.031 Y NA
 10421457 10421458 LM5578_0408 LM5578_0409     FALSE 0.251 89.000 0.167 NA   NA
 10421460 10421461 LM5578_0411 LM5578_0412     FALSE 0.040 219.000 0.000 NA   NA
 10421461 10421462 LM5578_0412 LM5578_0413     TRUE 0.755 18.000 0.000 NA   NA
 10421462 10421463 LM5578_0413 LM5578_0414     FALSE 0.084 168.000 0.000 NA   NA
 10421463 10421464 LM5578_0414 LM5578_0415     FALSE 0.053 200.000 0.000 NA   NA
 10421466 10421467 LM5578_0417 LM5578_0418     TRUE 0.814 13.000 0.071 1.000 N NA
 10421467 10421468 LM5578_0418 LM5578_0419     TRUE 0.967 17.000 0.109 1.000 Y NA
 10421468 10421469 LM5578_0419 LM5578_0420     TRUE 0.849 10.000 0.064 1.000 N NA
 10421469 10421470 LM5578_0420 LM5578_0421     FALSE 0.171 134.000 0.081 NA   NA
 10421470 10421471 LM5578_0421 LM5578_0422     FALSE 0.272 94.000 0.286 NA   NA
 10421473 10421474 LM5578_0424 LM5578_0425     FALSE 0.229 168.000 0.846 NA   NA
 10421474 10421475 LM5578_0425 LM5578_0426     TRUE 0.944 -3.000 0.086 NA   NA
 10421475 10421476 LM5578_0426 LM5578_0427     TRUE 0.599 35.000 0.062 NA   NA
 10421476 10421477 LM5578_0427 LM5578_0428     FALSE 0.236 144.000 0.500 NA   NA
 10421477 10421478 LM5578_0428 LM5578_0429     TRUE 0.653 38.000 0.300 NA   NA
 10421480 10421481 LM5578_0431 LM5578_0432     FALSE 0.114 170.000 0.120 NA   NA
 10421481 10421482 LM5578_0432 LM5578_0433     TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.031 Y NA
 10421482 10421483 LM5578_0433 LM5578_0434     TRUE 0.996 4.000 0.800 0.035 Y NA
 10421483 10421484 LM5578_0434 LM5578_0435     TRUE 0.964 22.000 0.300 1.000 Y NA
 10421484 10421485 LM5578_0435 LM5578_0436     TRUE 0.603 34.000 0.207 1.000 N NA
 10421485 10421486 LM5578_0436 LM5578_0437     FALSE 0.231 126.000 0.276 NA   NA
 10421486 10421487 LM5578_0437 LM5578_0438     TRUE 0.976 -9.000 0.846 NA   NA
 10421487 10421488 LM5578_0438 LM5578_0439     FALSE 0.314 109.000 0.550 NA   NA
 10421488 10421489 LM5578_0439 LM5578_0440     TRUE 0.796 16.000 0.110 1.000 N NA
 10421489 10421490 LM5578_0440 LM5578_0441     TRUE 0.407 69.000 0.120 1.000   NA
 10421490 10421491 LM5578_0441 LM5578_0442     TRUE 0.897 13.000 0.333 NA   NA
 10421491 10421492 LM5578_0442 LM5578_0443     FALSE 0.056 227.000 0.167 NA   NA
 10421493 10421494 LM5578_0444 LM5578_0445     FALSE 0.053 200.000 0.000 NA   NA
 10421495 10421496 LM5578_0446 LM5578_0447     TRUE 0.680 27.000 0.066 NA   NA
 10421496 10421497 LM5578_0447 LM5578_0448     FALSE 0.013 294.000 0.000 1.000 N NA
 10421497 10421498 LM5578_0448 LM5578_0449     FALSE 0.187 154.000 0.571 1.000 N NA
 10421498 10421499 LM5578_0449 LM5578_0450     TRUE 0.936 2.000 0.040 1.000   NA
 10421500 10421501 LM5578_0451 LM5578_0452     FALSE 0.345 80.000 0.333 NA   NA
 10421503 10421504 LM5578_0454 LM5578_0455   lstR TRUE 0.963 -3.000 0.389 NA   NA
 10421504 10421505 LM5578_0455 LM5578_0456 lstR   TRUE 0.934 3.000 0.200 NA   NA
 10421505 10421506 LM5578_0456 LM5578_0457     FALSE 0.080 180.000 0.150 1.000 N NA
 10421507 10421508 LM5578_0458 LM5578_0459     TRUE 0.979 0.000 0.222 0.035 N NA
 10421508 10421509 LM5578_0459 LM5578_0460     TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.031 Y NA
 10421509 10421510 LM5578_0460 LM5578_0461     TRUE 0.993 13.000 0.714 0.035 Y NA
 10421510 10421511 LM5578_0461 LM5578_0462     TRUE 0.980 16.000 0.600 1.000 Y NA
 10421513 10421514 LM5578_0464 LM5578_0465     TRUE 0.890 14.000 0.200 1.000   NA
 10421514 10421515 LM5578_0465 LM5578_0466     FALSE 0.020 285.000 0.000 NA   NA
 10421515 10421516 LM5578_0466 LM5578_0467   inlA FALSE 0.018 298.000 0.000 NA   NA
 10421516 10421517 LM5578_0467 LM5578_0468 inlA inlB TRUE 0.667 85.000 0.375 0.019   NA
 10421519 10421520 LM5578_0470 LM5578_0471     FALSE 0.125 138.000 0.000 NA   NA
 10421524 10421525 LM5578_0475 LM5578_0476     FALSE 0.237 137.000 0.407 NA   NA
 10421525 10421526 LM5578_0476 LM5578_0477     FALSE 0.040 220.000 0.000 NA   NA
 10421526 10421527 LM5578_0477 LM5578_0478     FALSE 0.032 244.000 0.000 NA   NA
 10421527 10421528 LM5578_0478 LM5578_0479     FALSE 0.012 274.000 0.000 NA N NA
 10421528 10421529 LM5578_0479 LM5578_0480     TRUE 0.571 55.000 0.600 1.000 N NA
 10421529 10421530 LM5578_0480 LM5578_0481     TRUE 0.696 97.000 0.400 1.000 Y NA
 10421530 10421531 LM5578_0481 LM5578_0482     TRUE 0.933 12.000 0.667 NA   NA
 10421531 10421532 LM5578_0482 LM5578_0483     FALSE 0.018 298.000 0.000 NA   NA
 10421533 10421534 LM5578_0484 LM5578_0485     TRUE 0.824 21.000 0.250 NA   NA
 10421534 10421535 LM5578_0485 LM5578_0486     FALSE 0.211 118.000 0.119 NA   NA
 10421535 10421536 LM5578_0486 LM5578_0487     TRUE 0.971 -3.000 0.642 NA   NA
 10421536 10421537 LM5578_0487 LM5578_0488     TRUE 0.954 5.000 0.714 NA   NA
 10421538 10421539 LM5578_0489 LM5578_0490     FALSE 0.193 134.000 0.522 NA N NA
 10421539 10421540 LM5578_0490 LM5578_0491     TRUE 0.967 1.000 0.731 NA   NA
 10421540 10421541 LM5578_0491 LM5578_0492     TRUE 0.948 -7.000 0.115 NA   NA
 10421541 10421542 LM5578_0492 LM5578_0493     FALSE 0.007 564.000 0.000 NA   NA
 10421542 10421543 LM5578_0493 LM5578_0494     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10421543 10421544 LM5578_0494 LM5578_0495     FALSE 0.006 707.000 0.000 NA   NA
 10421544 10421545 LM5578_0495 LM5578_0497     FALSE 0.006 616.000 0.000 NA   NA
 10421547 10421548 LM5578_0499 LM5578_0500     FALSE 0.008 469.000 0.000 NA   NA
 10421548 10421549 LM5578_0500 LM5578_0501     FALSE 0.018 300.000 0.000 NA   NA
 10421549 10421550 LM5578_0501 LM5578_0502     FALSE 0.014 333.000 0.000 NA   NA
 10421550 10421551 LM5578_0502 LM5578_0503     FALSE 0.015 326.000 0.000 NA   NA
 10421551 10421552 LM5578_0503 LM5578_0504     FALSE 0.269 110.000 0.344 NA   NA
 10421552 10421553 LM5578_0504 LM5578_0505     FALSE 0.116 151.000 0.009 NA   NA
 10421553 10421554 LM5578_0505 LM5578_0506     FALSE 0.194 90.000 0.011 NA   NA
 10421554 10421555 LM5578_0506 LM5578_0507     FALSE 0.216 158.000 0.600 NA   NA
 10421555 10421556 LM5578_0507 LM5578_0508     FALSE 0.303 169.000 0.014 0.032   NA
 10421556 10421557 LM5578_0508 LM5578_0509   rpmF FALSE 0.274 65.000 0.012 1.000 N NA
 10421557 10421558 LM5578_0509 LM5578_0510 rpmF   FALSE 0.146 92.000 0.011 1.000 N NA
 10421560 10421561 LM5578_0512 LM5578_0513   aroE FALSE 0.175 100.000 0.143 1.000 N NA
 10421561 10421562 LM5578_0513 LM5578_0514 aroE aroD TRUE 0.801 66.000 0.113 1.000 Y NA
 10421563 10421564 LM5578_0515 LM5578_0516     TRUE 0.506 75.000 0.667 1.000   NA
 10421565 10421566 LM5578_0517 LM5578_0518     TRUE 0.447 186.000 0.379 1.000 Y NA
 10421566 10421567 LM5578_0518 LM5578_0519     FALSE 0.337 75.000 0.196 NA   NA
 10421569 10421570 LM5578_0521 LM5578_0522     TRUE 0.995 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 10421570 10421571 LM5578_0522 LM5578_0523     TRUE 0.996 7.000 0.889 0.031 Y NA
 10421571 10421572 LM5578_0523 LM5578_0524     FALSE 0.317 109.000 0.800 1.000 N NA
 10421572 10421573 LM5578_0524 LM5578_0525     TRUE 0.940 4.000 0.556 1.000 N NA
 10421573 10421574 LM5578_0525 LM5578_0526     TRUE 0.517 28.000 0.000 1.000 N NA
 10421574 10421575 LM5578_0526 LM5578_0527     TRUE 0.767 17.000 0.000 NA   NA
 10421575 10421576 LM5578_0527 LM5578_0528     TRUE 0.913 11.000 0.321 NA   NA
 10421576 10421577 LM5578_0528 LM5578_0529     TRUE 0.956 -3.000 0.429 1.000 N NA
 10421577 10421578 LM5578_0529 LM5578_0530     TRUE 0.861 16.000 0.417 1.000 N NA
 10421578 10421579 LM5578_0530 LM5578_0531     TRUE 0.985 15.000 0.000 0.047 Y NA
 10421579 10421580 LM5578_0531 LM5578_0532     FALSE 0.089 140.000 0.000 1.000 N NA
 10421580 10421581 LM5578_0532 LM5578_0533     FALSE 0.005 1107.000 0.000 NA   NA
 11442425 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8297.000 0.000 NA   NA
 11584788 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8297.000 0.000 NA   NA
 11727180 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8297.000 0.000 NA   NA
 11442426 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8326.000 0.000 NA   NA
 11584789 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8326.000 0.000 NA   NA
 11727181 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8326.000 0.000 NA   NA
 11442427 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8361.000 0.000 NA   NA
 11584790 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8361.000 0.000 NA   NA
 11727182 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8361.000 0.000 NA   NA
 11442428 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8390.000 0.000 NA   NA
 11584791 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8390.000 0.000 NA   NA
 11727183 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8390.000 0.000 NA   NA
 11442429 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8426.000 0.000 NA   NA
 11584792 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8426.000 0.000 NA   NA
 11727184 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8426.000 0.000 NA   NA
 11442430 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8455.000 0.000 NA   NA
 11584793 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8455.000 0.000 NA   NA
 11727185 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8455.000 0.000 NA   NA
 11442431 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8490.000 0.000 NA   NA
 11584794 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8490.000 0.000 NA   NA
 11727186 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8490.000 0.000 NA   NA
 11442432 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8519.000 0.000 NA   NA
 11584795 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8519.000 0.000 NA   NA
 11727187 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8519.000 0.000 NA   NA
 11442433 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8553.000 0.000 NA   NA
 11584796 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8553.000 0.000 NA   NA
 11727188 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8553.000 0.000 NA   NA
 11442434 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8582.000 0.000 NA   NA
 11584797 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8582.000 0.000 NA   NA
 11727189 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8582.000 0.000 NA   NA
 11442435 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8617.000 0.000 NA   NA
 11584798 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8617.000 0.000 NA   NA
 11727190 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8617.000 0.000 NA   NA
 11442436 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8646.000 0.000 NA   NA
 11584799 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8646.000 0.000 NA   NA
 11727191 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8646.000 0.000 NA   NA
 11442437 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8682.000 0.000 NA   NA
 11584800 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8682.000 0.000 NA   NA
 11727192 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8682.000 0.000 NA   NA
 11442438 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8711.000 0.000 NA   NA
 11584801 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8711.000 0.000 NA   NA
 11727193 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8711.000 0.000 NA   NA
 11442439 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8746.000 0.000 NA   NA
 11584802 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8746.000 0.000 NA   NA
 11727194 10421571   LM5578_0523     FALSE NA 8746.000 0.000 NA   NA
 10421581 10421582 LM5578_0533 LM5578_0534     FALSE 0.270 89.000 0.231 NA   NA
 10421583 10421584 LM5578_0535 LM5578_0536     TRUE 0.910 4.000 0.058 NA   NA
 10421585 10421586 LM5578_0537 LM5578_0538     FALSE 0.266 98.000 0.167 1.000   NA
 10421587 10421588 LM5578_0539 LM5578_0540     FALSE 0.111 121.000 0.059 NA N NA
 10421588 10421589 LM5578_0540 LM5578_0541     FALSE 0.022 281.000 0.000 NA   NA
 10421590 10421591 LM5578_0542 LM5578_0543     FALSE 0.258 129.000 0.268 1.000   NA
 10421591 10421592 LM5578_0543 LM5578_0544     FALSE 0.063 203.000 0.000 1.000   NA
 10421592 10421593 LM5578_0544 LM5578_0545     TRUE 0.930 48.000 0.028 0.057 Y NA
 10421593 10421594 LM5578_0545 LM5578_0546     TRUE 0.995 -3.000 0.011 0.057 Y NA
 10421594 10421595 LM5578_0546 LM5578_0547     TRUE 0.439 84.000 0.062 0.057 N NA
 10421596 10421597 LM5578_0548 LM5578_0549     FALSE 0.206 88.000 0.167 1.000 N NA
 10421598 10421599 LM5578_0550 LM5578_0551     FALSE 0.258 107.000 0.314 NA   NA
 10421603 10421604 LM5578_0555 LM5578_0556     TRUE 0.955 -7.000 0.219 NA   NA
 10421604 10421605 LM5578_0556 LM5578_0557     TRUE 0.897 11.000 0.180 NA   NA
 10421605 10421606 LM5578_0557 LM5578_0558     TRUE 0.860 16.000 0.230 NA   NA
 10421606 10421607 LM5578_0558 LM5578_0559     TRUE 0.897 13.000 0.333 NA   NA
 10421607 10421608 LM5578_0559 LM5578_0560     TRUE 0.537 60.000 0.244 1.000   NA
 10421608 10421609 LM5578_0560 LM5578_0561     FALSE 0.322 78.000 0.074 1.000   NA
 10421609 10421610 LM5578_0561 LM5578_0562     TRUE 0.881 19.000 0.569 NA   NA
 10421612 10421613 LM5578_0564 LM5578_0565     FALSE 0.223 104.000 0.360 1.000 N NA
 10421613 10421614 LM5578_0565 LM5578_0566     TRUE 0.985 -34.000 0.000 0.006   NA
 10421617 10421618 LM5578_0569 LM5578_0570     FALSE 0.204 111.000 0.258 1.000 N NA
 10421618 10421619 LM5578_0570 LM5578_0571     TRUE 0.987 19.000 0.258 0.030 Y NA
 10421619 10421620 LM5578_0571 LM5578_0572     TRUE 0.988 21.000 0.500 0.030 Y NA
 10421620 10421621 LM5578_0572 LM5578_0573     TRUE 0.830 25.000 0.625 NA   NA
 10421621 10421622 LM5578_0573 LM5578_0574     TRUE 0.543 55.000 0.304 NA   NA
 10421622 10421623 LM5578_0574 LM5578_0575     FALSE 0.019 258.000 0.000 1.000 N NA
 10421624 10421625 LM5578_0576 LM5578_0577     TRUE 0.755 18.000 0.000 NA   NA
 10421625 10421626 LM5578_0577 LM5578_0578     TRUE 0.556 33.000 0.000 NA   NA
 10421626 10421627 LM5578_0578 LM5578_0579     TRUE 0.741 44.000 0.889 NA   NA
 10421627 10421628 LM5578_0579 LM5578_0580     TRUE 0.483 76.000 0.800 NA   NA
 10421630 10421631 LM5578_0582 LM5578_0583     FALSE 0.203 90.000 0.176 1.000 N NA
 10421631 10421632 LM5578_0583 LM5578_0584     FALSE 0.295 129.000 0.833 1.000 N NA
 10421632 10421633 LM5578_0584 LM5578_0585     TRUE 0.997 1.000 0.167 0.003 Y NA
 10421636 10421637 LM5578_0588 LM5578_0589   hisE FALSE 0.054 493.000 0.000 1.000 Y NA
 10421637 10421638 LM5578_0589 LM5578_0590 hisE   TRUE 0.997 1.000 0.152 0.005 Y NA
 10421638 10421639 LM5578_0590 LM5578_0591   hisF TRUE 0.998 -3.000 0.430 0.005 Y NA
 10421639 10421640 LM5578_0591 LM5578_0592 hisF hisA TRUE 0.997 -10.000 0.013 0.005 Y NA
 10421640 10421641 LM5578_0592 LM5578_0593 hisA hisH TRUE 0.997 -21.000 0.051 0.005 Y NA
 10421641 10421642 LM5578_0593 LM5578_0594 hisH hisB TRUE 0.997 1.000 0.125 0.005 Y NA
 10421642 10421643 LM5578_0594 LM5578_0595 hisB hisD TRUE 0.996 1.000 0.096 0.005 Y NA
 10421643 10421644 LM5578_0595 LM5578_0596 hisD hisG TRUE 0.998 -3.000 0.254 0.005 Y NA
 10421644 10421645 LM5578_0596 LM5578_0597 hisG hisZ TRUE 0.997 -3.000 0.239 0.005 Y NA
 10421650 10421651 LM5578_0602 LM5578_0603     TRUE 0.628 44.000 0.545 1.000 N NA
 10421651 10421652 LM5578_0603 LM5578_0604     FALSE 0.009 430.000 0.000 NA   NA
 10421653 10421654 LM5578_0605 LM5578_0606     TRUE 0.899 14.000 0.433 NA   NA
 10421655 10421656 LM5578_0607 LM5578_0608     TRUE 0.877 16.000 0.345 NA   NA
 10421657 10421658 LM5578_0609 LM5578_0610   iap FALSE 0.244 88.000 0.125 NA   NA
 10421659 10421660 LM5578_0611 LM5578_0612     FALSE 0.247 116.000 0.256 NA   NA
 10421660 10421661 LM5578_0612 LM5578_0613     FALSE 0.027 259.000 0.000 NA   NA
 10421661 10421662 LM5578_0613 LM5578_0614     TRUE 0.502 68.000 0.556 NA   NA
 10421662 10421663 LM5578_0614 LM5578_0615     TRUE 0.891 18.000 0.615 NA   NA
 10421663 10421664 LM5578_0615 LM5578_0616     FALSE 0.177 113.000 0.014 NA   NA
 10421664 10421665 LM5578_0616 LM5578_0617     FALSE 0.141 138.000 0.015 NA   NA
 10421665 10421666 LM5578_0617 LM5578_0618     TRUE 0.968 0.000 0.688 NA   NA
 10421666 10421667 LM5578_0618 LM5578_0619     TRUE 0.962 -3.000 0.210 1.000   NA
 10421667 10421668 LM5578_0619 LM5578_0620     FALSE 0.208 128.000 0.194 NA   NA
 10421668 10421669 LM5578_0620 LM5578_0621     FALSE 0.036 228.000 0.000 NA   NA
 10421670 10421671 LM5578_0622 LM5578_0623 metX   TRUE 0.964 17.000 0.027 1.000 Y NA
 10421673 10421674 LM5578_0625 LM5578_0626     FALSE 0.305 76.000 0.117 NA   NA
 10421675 10421676 LM5578_0627 LM5578_0628     TRUE 0.949 -7.000 0.133 NA   NA
 10421676 10421677 LM5578_0628 LM5578_0629     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 10421677 10421678 LM5578_0629 LM5578_0630     FALSE 0.208 103.000 0.115 NA   NA
 10421679 10421680 LM5578_0631 LM5578_0632     TRUE 0.706 52.000 1.000 NA   NA
 10421680 10421681 LM5578_0632 LM5578_0633     FALSE 0.145 147.000 0.077 NA   NA
 10421682 10421683 LM5578_0634 LM5578_0635     TRUE 0.914 8.000 0.419 1.000 N NA
 10421683 10421684 LM5578_0635 LM5578_0636     TRUE 0.998 -3.000 0.784 0.009 Y NA
 10421684 10421685 LM5578_0636 LM5578_0637     FALSE 0.143 116.000 0.159 NA N NA
 10421686 10421687 LM5578_0638 LM5578_0639   acpD FALSE 0.114 161.000 0.000 1.000   NA
 10421688 10421689 LM5578_0640 LM5578_0641     TRUE 0.944 -3.000 0.250 1.000 N NA
 10421689 10421690 LM5578_0641 LM5578_0642     FALSE 0.206 96.000 0.222 1.000 N NA
 10421693 10421694 LM5578_0645 LM5578_0646     FALSE 0.362 80.000 0.389 NA   NA
 10421695 10421696 LM5578_0647 LM5578_0648     TRUE 0.494 56.000 0.185 NA   NA
 10421696 10421697 LM5578_0648 LM5578_0649     FALSE 0.243 97.000 0.204 NA   NA
 10421697 10421698 LM5578_0649 LM5578_0650     FALSE 0.337 86.000 0.440 NA   NA
 10421698 10421699 LM5578_0650 LM5578_0651     TRUE 0.927 16.000 1.000 NA   NA
 10421700 10421701 LM5578_0652 LM5578_0653     TRUE 0.762 31.000 0.353 1.000   NA
 10421701 10421702 LM5578_0653 LM5578_0654     FALSE 0.298 86.000 0.294 NA   NA
 10421703 10421704 LM5578_0655 LM5578_0656     FALSE 0.371 93.000 0.700 NA   NA
 10421704 10421705 LM5578_0656 LM5578_0657     FALSE 0.387 62.000 0.042 NA   NA
 10421705 10421706 LM5578_0657 LM5578_0658     FALSE 0.009 359.000 0.000 1.000 N NA
 10421706 10421707 LM5578_0658 LM5578_0659     TRUE 0.982 2.000 0.538 0.033 N NA
 10421707 10421708 LM5578_0659 LM5578_0660     TRUE 0.997 1.000 0.900 0.033 Y NA
 10421708 10421709 LM5578_0660 LM5578_0661     TRUE 0.990 15.000 0.320 0.033 Y NA
 10421709 10421710 LM5578_0661 LM5578_0662     TRUE 0.944 27.000 0.280 1.000 Y NA
 10421710 10421711 LM5578_0662 LM5578_0663     FALSE 0.339 90.000 0.350 1.000   NA
 10421711 10421712 LM5578_0663 LM5578_0664     FALSE 0.254 105.000 0.306 NA   NA
 10421712 10421713 LM5578_0664 LM5578_0665     TRUE 0.861 14.000 0.161 NA   NA
 10421714 10421715 LM5578_0666 LM5578_0667     TRUE 0.714 22.000 0.000 NA   NA
 10421715 10421716 LM5578_0667 LM5578_0668     FALSE 0.389 55.000 0.000 NA   NA
 10421716 10421717 LM5578_0668 LM5578_0669     TRUE 0.817 13.000 0.000 NA   NA
 10421718 10421719 LM5578_0670 LM5578_0671     FALSE 0.160 99.000 0.000 NA   NA
 10421719 10421720 LM5578_0671 LM5578_0672     FALSE 0.078 173.000 0.000 NA   NA
 10421720 10421721 LM5578_0672 LM5578_0673     TRUE 0.905 2.000 0.000 NA   NA
 10421721 10421722 LM5578_0673 LM5578_0674     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10421722 10421723 LM5578_0674 LM5578_0675     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10421723 10421724 LM5578_0675 LM5578_0676     TRUE 0.803 14.000 0.000 NA   NA
 10421724 10421725 LM5578_0676 LM5578_0677     TRUE 0.858 9.000 0.000 NA   NA
 10421725 10421726 LM5578_0677 LM5578_0678     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10421726 10421727 LM5578_0678 LM5578_0679     TRUE 0.846 11.000 0.000 NA   NA
 10421727 10421728 LM5578_0679 LM5578_0680     TRUE 0.946 13.000 0.000 0.056   NA
 10421728 10421729 LM5578_0680 LM5578_0681     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10421729 10421730 LM5578_0681 LM5578_0682     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10421730 10421731 LM5578_0682 LM5578_0683     TRUE 0.714 22.000 0.000 NA   NA
 10421731 10421732 LM5578_0683 LM5578_0684     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 10421732 10421733 LM5578_0684 LM5578_0685     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 10421733 10421734 LM5578_0685 LM5578_0686     TRUE 0.395 54.000 0.000 NA   NA
 10421734 10421735 LM5578_0686 LM5578_0687     FALSE 0.346 61.000 0.000 NA   NA
 10421735 10421736 LM5578_0687 LM5578_0688     TRUE 0.941 -3.000 0.000 1.000   NA
 10421736 10421737 LM5578_0688 LM5578_0689     FALSE 0.021 282.000 0.000 NA   NA
 10421737 10421738 LM5578_0689 LM5578_0690     TRUE 0.923 -13.000 0.000 NA   NA
 10421738 10421739 LM5578_0690 LM5578_0691     TRUE 0.406 52.000 0.000 NA   NA
 10421739 10421740 LM5578_0691 LM5578_0692     FALSE 0.028 256.000 0.000 NA   NA
 10421740 10421741 LM5578_0692 LM5578_0693     TRUE 0.953 -31.000 0.278 NA   NA
 10421741 10421742 LM5578_0693 LM5578_0694     FALSE 0.044 210.000 0.000 NA   NA
 10421742 10421743 LM5578_0694 LM5578_0695     TRUE 0.967 -3.000 0.500 NA   NA
 10421743 10421744 LM5578_0695 LM5578_0696     FALSE 0.321 64.000 0.000 NA   NA
 10421744 10421745 LM5578_0696 LM5578_0697     TRUE 0.422 49.000 0.000 NA   NA
 10421745 10421746 LM5578_0697 LM5578_0698     TRUE 0.960 -30.000 0.400 NA   NA
 10421746 10421747 LM5578_0698 LM5578_0699     TRUE 0.947 -6.000 0.100 NA   NA
 10421747 10421748 LM5578_0699 LM5578_0700     TRUE 0.924 3.000 0.100 NA   NA
 10421748 10421749 LM5578_0700 LM5578_0701     TRUE 0.729 21.000 0.000 NA   NA
 10421749 10421750 LM5578_0701 LM5578_0702     FALSE 0.176 90.000 0.000 NA   NA
 10421750 10421751 LM5578_0702 LM5578_0703     FALSE 0.195 84.000 0.000 NA   NA
 10421751 10421752 LM5578_0703 LM5578_0704     TRUE 0.755 18.000 0.000 NA   NA
 10421752 10421753 LM5578_0704 LM5578_0705     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 10421753 10421754 LM5578_0705 LM5578_0706     TRUE 0.872 6.000 0.000 NA   NA
 10421754 10421755 LM5578_0706 LM5578_0707     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 10421755 10421756 LM5578_0707 LM5578_0708     TRUE 0.817 13.000 0.000 NA   NA
 10421756 10421757 LM5578_0708 LM5578_0709     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 10421759 10421760 LM5578_0710 LM5578_0711     TRUE 0.934 0.000 0.068 NA   NA
 10421760 10421761 LM5578_0711 LM5578_0712     FALSE 0.161 98.000 0.000 NA   NA
 10421761 10421762 LM5578_0712 LM5578_0713     FALSE 0.016 312.000 0.000 NA   NA
 10421762 10421763 LM5578_0713 LM5578_0714     FALSE 0.369 64.000 0.041 NA   NA
 10421763 10421764 LM5578_0714 LM5578_0715     FALSE 0.033 266.000 0.000 1.000   NA
 10421764 10421765 LM5578_0715 LM5578_0716     FALSE 0.166 96.000 0.000 NA   NA
 10421765 10421766 LM5578_0716 LM5578_0717     TRUE 0.919 -27.000 0.000 NA   NA
 10421766 10421767 LM5578_0717 LM5578_0718     TRUE 0.556 33.000 0.000 NA   NA
 10421769 10421770 LM5578_0720 LM5578_0721     FALSE 0.351 90.000 0.571 NA   NA
 10421772 10421773 LM5578_0723 LM5578_0724     TRUE 0.799 24.000 0.545 1.000 N NA
 10421773 10421774 LM5578_0724 LM5578_0725     TRUE 0.629 43.000 0.174 1.000   NA
 10421774 10421775 LM5578_0725 LM5578_0726     TRUE 0.606 46.000 0.174 1.000   NA
 10421776 10421777 LM5578_0727 LM5578_0728     TRUE 0.950 -13.000 0.183 NA   NA
 10421778 10421779 LM5578_0729 LM5578_0730     TRUE 0.440 68.000 0.333 NA   NA
 10421781 10421782 LM5578_0732 LM5578_0733     TRUE 0.464 52.000 0.052 NA   NA
 10421784 10421785 LM5578_0735 LM5578_0736     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 10421786 10421787 LM5578_0737 LM5578_0738   thiD TRUE 0.472 63.000 0.143 1.000   NA
 10421787 10421788 LM5578_0738 LM5578_0739 thiD   TRUE 0.761 26.000 0.157 1.000   NA
 10421789 10421790 LM5578_0740 LM5578_0741     TRUE 0.948 -3.000 0.139 NA   NA
 10421790 10421791 LM5578_0741 LM5578_0742     TRUE 0.874 10.000 0.029 NA   NA
 10421791 10421792 LM5578_0742 LM5578_0743     FALSE 0.182 114.000 0.024 NA   NA
 10421792 10421793 LM5578_0743 LM5578_0744     TRUE 0.994 -7.000 0.688 1.000 Y NA
 10421793 10421794 LM5578_0744 LM5578_0745     FALSE 0.157 133.000 0.032 NA   NA
 10421794 10421795 LM5578_0745 LM5578_0746     TRUE 0.885 12.000 0.157 NA   NA
 10421795 10421796 LM5578_0746 LM5578_0747     TRUE 0.820 18.000 0.135 NA   NA
 10421796 10421797 LM5578_0747 LM5578_0748     FALSE 0.181 126.000 0.073 NA   NA
 10421797 10421798 LM5578_0748 LM5578_0749     FALSE 0.007 526.000 0.000 NA   NA
 10421798 10421799 LM5578_0749 LM5578_0750     FALSE 0.019 291.000 0.000 NA   NA
 10421800 10421801 LM5578_0751 LM5578_0753     TRUE 0.890 19.000 0.667 NA   NA
 10421802 10421803 LM5578_0754 LM5578_0755   fliP TRUE 0.944 -7.000 0.073 NA   NA
 10421803 10421804 LM5578_0755 LM5578_0756 fliP fliQ TRUE 0.993 13.000 0.162 0.003 Y NA
 10421804 10421805 LM5578_0756 LM5578_0757 fliQ fliR TRUE 0.994 3.000 0.181 0.082 Y NA
 10421805 10421806 LM5578_0757 LM5578_0758 fliR flhB TRUE 0.987 16.000 0.259 0.082 Y NA
 10421806 10421807 LM5578_0758 LM5578_0759 flhB flhA TRUE 0.963 47.000 0.207 0.003 Y NA
 10421807 10421808 LM5578_0759 LM5578_0760 flhA   TRUE 0.984 22.000 0.440 0.082 Y NA
 10421808 10421809 LM5578_0760 LM5578_0761   flgG TRUE 0.990 -3.000 0.045 1.000 Y NA
 10421809 10421810 LM5578_0761 LM5578_0762 flgG   TRUE 0.927 29.000 0.084 1.000 Y NA
 10421810 10421811 LM5578_0762 LM5578_0763     TRUE 0.717 25.000 0.092 NA   NA
 10421811 10421812 LM5578_0763 LM5578_0764     TRUE 0.672 27.000 0.050 NA   NA
 10421812 10421813 LM5578_0764 LM5578_0765   motB TRUE 0.991 -40.000 0.257 1.000 Y NA
 10421813 10421814 LM5578_0765 LM5578_0766 motB   TRUE 0.901 10.000 0.175 NA   NA
 10421814 10421815 LM5578_0766 LM5578_0767     TRUE 0.832 23.000 0.450 NA   NA
 10421815 10421816 LM5578_0767 LM5578_0768     TRUE 0.829 13.000 0.117 1.000 N NA
 10421816 10421817 LM5578_0768 LM5578_0769   flaA FALSE 0.202 238.000 0.000 1.000 Y NA
 10421817 10421818 LM5578_0769 LM5578_0770 flaA cheY FALSE 0.017 275.000 0.000 1.000 N NA
 10421818 10421819 LM5578_0770 LM5578_0771 cheY cheA TRUE 0.987 20.000 0.154 0.011 Y NA
 10421819 10421820 LM5578_0771 LM5578_0772 cheA   TRUE 0.994 10.000 0.059 0.004 Y NA
 10421820 10421821 LM5578_0772 LM5578_0773     TRUE 0.470 43.000 0.000 NA   NA
 10421821 10421822 LM5578_0773 LM5578_0774     TRUE 0.783 16.000 0.000 NA   NA
 10421822 10421823 LM5578_0774 LM5578_0775   flgD TRUE 0.939 2.000 0.064 1.000   NA
 10421823 10421824 LM5578_0775 LM5578_0776 flgD flgE TRUE 0.962 20.000 0.117 1.000 Y NA
 10421824 10421825 LM5578_0776 LM5578_0777 flgE   TRUE 0.972 14.000 0.293 0.006   NA
 10421825 10421826 LM5578_0777 LM5578_0778   fliM TRUE 0.957 21.000 0.079 0.002   NA
 10421826 10421827 LM5578_0778 LM5578_0779 fliM   TRUE 0.997 3.000 0.508 0.002 Y NA
 10421827 10421828 LM5578_0779 LM5578_0780     TRUE 0.896 6.000 0.052 NA   NA
 10421828 10421829 LM5578_0780 LM5578_0781     TRUE 0.883 23.000 0.917 NA   NA
 10421829 10421830 LM5578_0781 LM5578_0782     FALSE 0.199 107.000 0.083 NA   NA
 10421830 10421831 LM5578_0782 LM5578_0783     TRUE 0.886 10.000 0.076 NA   NA
 10421831 10421832 LM5578_0783 LM5578_0784   flgK TRUE 0.887 20.000 0.688 NA   NA
 10421832 10421833 LM5578_0784 LM5578_0785 flgK flgL TRUE 0.995 12.000 0.177 0.001 Y NA
 10421833 10421834 LM5578_0785 LM5578_0786 flgL fliD TRUE 0.982 12.000 0.292 1.000 Y NA
 10421834 10421835 LM5578_0786 LM5578_0787 fliD   TRUE 0.993 19.000 0.608 0.002 Y NA
 10421835 10421836 LM5578_0787 LM5578_0788     TRUE 0.943 -28.000 0.127 NA   NA
 10421836 10421837 LM5578_0788 LM5578_0789   flgB TRUE 0.768 21.000 0.040 NA   NA
 10421837 10421838 LM5578_0789 LM5578_0790 flgB flgC TRUE 0.996 12.000 0.804 0.004 Y NA
 10421838 10421839 LM5578_0790 LM5578_0791 flgC fliE TRUE 0.989 17.000 0.068 0.004 Y NA
 10421839 10421840 LM5578_0791 LM5578_0792 fliE fliF TRUE 0.915 68.000 0.076 0.006 Y NA
 10421840 10421841 LM5578_0792 LM5578_0793 fliF fliG TRUE 0.996 3.000 0.056 0.006 Y NA
 10421841 10421842 LM5578_0793 LM5578_0794 fliG fliH TRUE 0.965 -13.000 0.471 NA   NA
 10421842 10421843 LM5578_0794 LM5578_0795 fliH fliI TRUE 0.948 -3.000 0.129 NA   NA
 10421843 10421844 LM5578_0795 LM5578_0796 fliI   TRUE 0.815 17.000 0.076 NA   NA
 10421844 10421845 LM5578_0796 LM5578_0797     TRUE 0.847 14.000 0.083 NA   NA
 10421845 10421846 LM5578_0797 LM5578_0798     FALSE 0.223 122.000 0.211 NA   NA
 10421846 10421847 LM5578_0798 LM5578_0799     TRUE 0.955 0.000 0.342 NA   NA
 10421849 10421850 LM5578_0801 LM5578_0802     FALSE 0.141 162.000 0.400 1.000 N NA
 10421850 10421851 LM5578_0802 LM5578_0803     TRUE 0.903 13.000 0.391 NA   NA
 10421853 10421854 LM5578_0805 LM5578_0806     FALSE 0.171 101.000 0.005 NA   NA
 10421854 10421855 LM5578_0806 LM5578_0807     FALSE 0.135 113.000 0.014 1.000 N NA
 10421855 10421856 LM5578_0807 LM5578_0808     FALSE 0.238 83.000 0.049 NA   NA
 10421856 10421857 LM5578_0808 LM5578_0809     TRUE 0.854 14.000 0.111 NA   NA
 10421857 10421858 LM5578_0809 LM5578_0810     FALSE 0.114 145.000 0.000 NA   NA
 10421858 10421859 LM5578_0810 LM5578_0811     FALSE 0.017 310.000 0.000 NA   NA
 10421859 10421860 LM5578_0811 LM5578_0812     FALSE 0.029 252.000 0.000 NA   NA
 10421860 10421861 LM5578_0812 LM5578_0813     FALSE 0.019 330.000 0.000 1.000   NA
 10421863 10421864 LM5578_0815 LM5578_0816     TRUE 0.991 -3.000 0.107 1.000 Y NA
 10421864 10421865 LM5578_0816 LM5578_0817     TRUE 0.851 13.000 0.000 1.000   NA
 10421865 10421866 LM5578_0817 LM5578_0818     TRUE 0.721 24.000 0.000 1.000   NA
 10421866 10421867 LM5578_0818 LM5578_0819     TRUE 0.954 20.000 0.000 1.000 Y NA
 10421869 10421870 LM5578_0821 LM5578_0822     TRUE 0.966 -16.000 0.750 1.000 N NA
 10421870 10421871 LM5578_0822 LM5578_0823     TRUE 0.974 -3.000 0.750 NA   NA
 10421871 10421872 LM5578_0823 LM5578_0824     TRUE 0.904 15.000 0.538 NA   NA
 10421872 10421873 LM5578_0824 LM5578_0825     TRUE 0.750 29.000 0.385 NA   NA
 10421875 10421876 LM5578_0827 LM5578_0828     FALSE 0.391 107.000 1.000 NA   NA
 10421876 10421877 LM5578_0828 LM5578_0829     TRUE 0.940 -3.000 0.051 NA   NA
 10421877 10421878 LM5578_0829 LM5578_0830     TRUE 0.941 -7.000 0.051 NA   NA
 10421878 10421879 LM5578_0830 LM5578_0831     TRUE 0.637 55.000 0.667 NA   NA
 10421879 10421880 LM5578_0831 LM5578_0832     FALSE 0.219 96.000 0.100 NA   NA
 10421880 10421881 LM5578_0832 LM5578_0833     FALSE 0.229 126.000 0.267 NA   NA
 10421881 10421882 LM5578_0833 LM5578_0834     FALSE 0.361 81.000 0.409 NA   NA
 10421882 10421883 LM5578_0834 LM5578_0835     FALSE 0.227 115.000 0.175 NA   NA
 10421883 10421884 LM5578_0835 LM5578_0836     TRUE 0.968 -28.000 0.850 1.000 N NA
 10421884 10421885 LM5578_0836 LM5578_0837     TRUE 0.975 -7.000 0.791 NA   NA
 10421885 10421886 LM5578_0837 LM5578_0838     FALSE 0.220 127.000 0.233 NA   NA
 10421886 10421887 LM5578_0838 LM5578_0839     TRUE 0.968 -3.000 0.526 NA   NA
 10421887 10421888 LM5578_0839 LM5578_0840     TRUE 0.913 7.000 0.200 NA   NA
 10421888 10421889 LM5578_0840 LM5578_0841     TRUE 0.894 10.000 0.123 NA   NA
 10421889 10421890 LM5578_0841 LM5578_0842     FALSE 0.019 328.000 0.000 1.000   NA
 10421890 10421891 LM5578_0842 LM5578_0843     FALSE 0.387 66.000 0.010 1.000   NA
 10421891 10421892 LM5578_0843 LM5578_0844     TRUE 0.936 6.000 0.265 1.000   NA
 10421892 10421893 LM5578_0844 LM5578_0845     TRUE 0.417 153.000 0.111 0.025   NA
 10421893 10421894 LM5578_0845 LM5578_0846     TRUE 0.867 17.000 0.194 1.000   NA
 10421894 10421895 LM5578_0846 LM5578_0847     TRUE 0.994 12.000 0.583 0.033 Y NA
 10421895 10421896 LM5578_0847 LM5578_0848     TRUE 0.987 22.000 0.500 0.033 Y NA
 10421896 10421897 LM5578_0848 LM5578_0849     TRUE 0.983 4.000 0.000 1.000 Y NA
 10421899 10421900 LM5578_0851 LM5578_0852     TRUE 0.795 36.000 1.000 NA   NA
 10421902 10421903 LM5578_0854 LM5578_0855     TRUE 0.682 40.000 0.423 NA   NA
 10421905 10421906 LM5578_0857 LM5578_0858     FALSE 0.008 462.000 0.000 NA   NA
 10421909 10421910 LM5578_0861 LM5578_0862     TRUE 0.991 19.000 0.939 0.043 Y NA
 10421910 10421911 LM5578_0862 LM5578_0863     TRUE 0.652 174.000 0.234 0.043 Y NA
 10421911 10421912 LM5578_0863 LM5578_0864     TRUE 0.997 0.000 0.550 0.028 Y NA
 10421912 10421913 LM5578_0864 LM5578_0865     FALSE 0.054 287.000 0.000 0.043 N NA
 10421914 10421915 LM5578_0866 LM5578_0867     FALSE 0.099 193.000 0.421 1.000 N NA
 10421915 10421916 LM5578_0867 LM5578_0868     FALSE 0.026 262.000 0.000 NA   NA
 10421917 10421918 LM5578_0869 LM5578_0870     TRUE 0.703 27.000 0.018 1.000   NA
 10421919 10421920 LM5578_0871 LM5578_0872     FALSE 0.029 252.000 0.000 NA   NA
 10421921 10421922 LM5578_0873 LM5578_0874     FALSE 0.195 115.000 0.059 NA   NA
 10421922 10421923 LM5578_0874 LM5578_0875     FALSE 0.265 84.000 0.026 1.000   NA
 10421923 10421924 LM5578_0875 LM5578_0876     FALSE 0.179 107.000 0.028 NA   NA
 10421926 10421927 LM5578_0878 LM5578_0879     FALSE 0.009 356.000 0.000 1.000 N NA
 10421928 10421929 LM5578_0880 LM5578_0881     FALSE 0.150 152.000 0.155 NA   NA
 10421929 10421930 LM5578_0881 LM5578_0882     FALSE 0.224 128.000 0.113 1.000   NA
 10421931 10421932 LM5578_0883 LM5578_0884     TRUE 0.836 28.000 0.889 NA   NA
 10421933 10421934 LM5578_0885 LM5578_0886     TRUE 0.931 10.000 0.326 1.000   NA
 10421934 10421935 LM5578_0886 LM5578_0887     TRUE 0.998 0.000 0.928 0.033 Y NA
 10421935 10421936 LM5578_0887 LM5578_0888     TRUE 0.997 -3.000 0.492 0.033 Y NA
 10421936 10421937 LM5578_0888 LM5578_0889     TRUE 0.997 -3.000 0.253 0.033 Y NA
 10421937 10421938 LM5578_0889 LM5578_0890     FALSE 0.137 130.000 0.078 1.000 N NA
 10421938 10421939 LM5578_0890 LM5578_0891     TRUE 0.400 68.000 0.073 1.000   NA
 10421939 10421940 LM5578_0891 LM5578_0892     FALSE 0.195 138.000 0.089 1.000   NA
 10421940 10421941 LM5578_0892 LM5578_0893     TRUE 0.465 85.000 0.818 1.000   NA
 10421941 10421942 LM5578_0893 LM5578_0894     FALSE 0.047 227.000 0.000 1.000   NA
 10421942 10421943 LM5578_0894 LM5578_0895     TRUE 0.857 16.000 0.072 1.000   NA
 10421945 10421946 LM5578_0897 LM5578_0898     TRUE 0.873 15.000 0.265 NA   NA
 10421946 10421947 LM5578_0898 LM5578_0899     FALSE 0.238 110.000 0.220 NA   NA
 10421947 10421948 LM5578_0899 LM5578_0900     TRUE 0.851 17.000 0.244 NA   NA
 10421950 10421951 LM5578_0902 LM5578_0903     FALSE 0.338 78.000 0.265 NA   NA
 10421951 10421952 LM5578_0903 LM5578_0904     TRUE 0.555 41.000 0.065 NA   NA
 10421952 10421953 LM5578_0904 LM5578_0905     FALSE 0.045 198.000 0.013 1.000 N NA
 10421953 10421954 LM5578_0905 LM5578_0906     FALSE 0.154 105.000 0.000 NA   NA
 10421954 10421955 LM5578_0906 LM5578_0907     FALSE 0.050 203.000 0.000 NA   NA
 10421955 10421956 LM5578_0907 LM5578_0908   nifJ FALSE 0.052 178.000 0.000 1.000 N NA
 10421957 10421958 LM5578_0909 LM5578_0910 fbp   FALSE 0.246 130.000 0.222 1.000   NA
 10421959 10421960 LM5578_0911 LM5578_0912     FALSE 0.184 192.000 0.727 1.000   NA
 10421960 10421961 LM5578_0912 LM5578_0913     FALSE 0.010 403.000 0.000 NA   NA
 10421961 10421962 LM5578_0913 LM5578_0914     TRUE 0.926 -7.000 0.000 NA   NA
 10421965 10421966 LM5578_0918 LM5578_0919     FALSE 0.218 133.000 0.462 1.000 N NA
 10421967 10421968 LM5578_0920 LM5578_0921     FALSE 0.010 463.000 0.000 1.000   NA
 10421970 10421971 LM5578_0923 LM5578_0924     FALSE 0.014 257.000 0.000 NA N NA
 10421971 10421972 LM5578_0924 LM5578_0925     FALSE 0.127 105.000 0.008 1.000 N NA
 10421972 10421973 LM5578_0925 LM5578_0926     FALSE 0.067 170.000 0.009 1.000 N NA
 10421973 10421974 LM5578_0926 LM5578_0927     TRUE 0.993 -7.000 0.414 1.000 Y NA
 10421976 10421977 LM5578_0929 LM5578_0930     FALSE 0.039 222.000 0.000 NA   NA
 10421977 10421978 LM5578_0930 LM5578_0931     FALSE 0.334 80.000 0.297 NA   NA
 10421978 10421979 LM5578_0931 LM5578_0932     TRUE 0.884 17.000 0.706 1.000 N NA
 10421979 10421980 LM5578_0932 LM5578_0933     TRUE 0.997 3.000 0.941 0.071 Y NA
 10421980 10421981 LM5578_0933 LM5578_0934   ddl FALSE 0.094 150.000 0.027 1.000 N NA
 10421981 10421982 LM5578_0934 LM5578_0935 ddl murF TRUE 0.981 25.000 0.046 0.004 Y NA
 10421982 10421983 LM5578_0935 LM5578_0936 murF   TRUE 0.464 67.000 0.216 1.000   NA
 10421985 10421986 LM5578_0938 LM5578_0939     TRUE 0.998 -3.000 0.733 0.033 Y NA
 10421986 10421987 LM5578_0939 LM5578_0940     TRUE 0.998 -13.000 0.711 0.033 Y NA
 10421987 10421988 LM5578_0940 LM5578_0941     TRUE 0.973 16.000 0.200 1.000 Y NA
 10421988 10421989 LM5578_0941 LM5578_0942     TRUE 0.953 2.000 0.400 NA   NA
 10421989 10421990 LM5578_0942 LM5578_0943     TRUE 0.858 22.000 0.529 NA   NA
 10421990 10421991 LM5578_0943 LM5578_0944     TRUE 0.794 72.000 0.529 NA Y NA
 10421993 10421994 LM5578_0946 LM5578_0947     FALSE 0.009 455.000 0.004 NA   NA
 10421996 10421997 LM5578_0949 LM5578_0950     TRUE 0.783 16.000 0.000 NA   NA
 10421999 10422000 LM5578_0952 LM5578_0953     FALSE 0.033 208.000 0.000 1.000 N NA
 10422000 10422001 LM5578_0953 LM5578_0954     TRUE 0.960 15.000 0.600 0.032 N NA
 10422001 10422002 LM5578_0954 LM5578_0955     TRUE 0.997 1.000 0.733 0.028 Y NA
 10422002 10422003 LM5578_0955 LM5578_0956     TRUE 0.991 20.000 0.786 0.028 Y NA
 10422003 10422004 LM5578_0956 LM5578_0957     TRUE 0.970 21.000 0.440 1.000 Y NA
 10422004 10422005 LM5578_0957 LM5578_0958     TRUE 0.952 0.000 0.480 1.000 N NA
 10422005 10422006 LM5578_0958 LM5578_0959     TRUE 0.832 18.000 0.542 NA N NA
 10422006 10422007 LM5578_0959 LM5578_0960     FALSE 0.184 118.000 0.333 NA N NA
 10422009 10422010 LM5578_0962 LM5578_0963     TRUE 0.955 -7.000 0.216 NA   NA
 10422010 10422011 LM5578_0963 LM5578_0964     FALSE 0.159 149.000 0.170 NA   NA
 10422011 10422012 LM5578_0964 LM5578_0965     TRUE 0.888 2.000 0.017 1.000 N NA
 10422012 10422013 LM5578_0965 LM5578_0966   dal TRUE 0.753 19.000 0.093 1.000 N NA
 10422013 10422014 LM5578_0966 LM5578_0967 dal   FALSE 0.051 206.000 0.108 1.000 N NA
 10422014 10422015 LM5578_0967 LM5578_0968     TRUE 0.963 7.000 0.260 0.053 N NA
 10422015 10422016 LM5578_0968 LM5578_0969   rsbR FALSE 0.177 252.000 0.032 NA Y NA
 10422016 10422017 LM5578_0969 LM5578_0970 rsbR rsbS TRUE 0.984 6.000 0.258 NA Y NA
 10422017 10422018 LM5578_0970 LM5578_0971 rsbS rsbT TRUE 0.988 3.000 0.320 NA Y NA
 10422018 10422019 LM5578_0971 LM5578_0972 rsbT rsbU TRUE 0.975 17.000 0.617 NA Y NA
 10422019 10422020 LM5578_0972 LM5578_0973 rsbU rsbV TRUE 0.591 150.000 0.440 1.000 Y NA
 10422020 10422021 LM5578_0973 LM5578_0974 rsbV rsbW TRUE 0.994 -16.000 0.714 1.000 Y NA
 10422021 10422022 LM5578_0974 LM5578_0975 rsbW sigB TRUE 0.968 -22.000 0.838 1.000 N NA
 10422022 10422023 LM5578_0975 LM5578_0976 sigB rsbX TRUE 0.955 1.000 0.243 1.000   NA
 10422023 10422024 LM5578_0976 LM5578_0977 rsbX   FALSE 0.059 207.000 0.000 1.000   NA
 10422024 10422025 LM5578_0977 LM5578_0978     FALSE 0.204 77.000 0.027 1.000 N NA
 10422025 10422026 LM5578_0978 LM5578_0979     TRUE 0.947 0.000 0.215 NA   NA
 10422026 10422027 LM5578_0979 LM5578_tRNA05     TRUE 0.400 53.000 0.000 NA   NA
 10422027 10422028 LM5578_tRNA05 LM5578_tRNA06     TRUE 0.887 4.000 0.000 NA   NA
 10422028 10422029 LM5578_tRNA06 LM5578_0980     FALSE 0.085 167.000 0.000 NA   NA
 10422029 10422030 LM5578_0980 LM5578_0981     FALSE 0.389 55.000 0.000 NA   NA
 10422030 10422031 LM5578_0981 LM5578_0982     FALSE 0.157 146.000 0.123 NA   NA
 10422031 10422032 LM5578_0982 LM5578_0983     FALSE 0.270 81.000 0.286 1.000 N NA
 10422032 10422033 LM5578_0983 LM5578_tRNA07     FALSE 0.054 198.000 0.000 NA   NA
 10422033 10422034 LM5578_tRNA07 LM5578_tRNA08     TRUE 0.619 27.000 0.000 NA   NA
 10422034 10422035 LM5578_tRNA08 LM5578_0984     FALSE 0.140 128.000 0.000 NA   NA
 10422035 10422036 LM5578_0984 LM5578_0985     FALSE 0.158 115.000 0.000 NA   NA
 10422036 10422037 LM5578_0985 LM5578_0986     FALSE 0.136 131.000 0.000 NA   NA
 10422037 10422038 LM5578_0986 LM5578_0987     TRUE 0.611 36.000 0.010 1.000   NA
 10422038 10422039 LM5578_0987 LM5578_0988     TRUE 0.452 29.000 0.006 NA N NA
 10422041 10422042 LM5578_0990 LM5578_0991     TRUE 0.952 3.000 0.474 NA   NA
 10422042 10422043 LM5578_0991 LM5578_0992     FALSE 0.335 83.000 0.368 NA   NA
 10422043 10422044 LM5578_0992 LM5578_0993     FALSE 0.262 114.000 0.310 NA   NA
 10422044 10422045 LM5578_0993 LM5578_0994     FALSE 0.027 224.000 0.000 1.000 N NA
 10422045 10422046 LM5578_0994 LM5578_0995     FALSE 0.206 143.000 0.533 1.000 N NA
 10422046 10422047 LM5578_0995 LM5578_0996     TRUE 0.995 5.000 0.522 0.032 Y NA
 10422047 10422048 LM5578_0996 LM5578_0997     TRUE 0.993 15.000 0.783 0.032 Y NA
 10422048 10422049 LM5578_0997 LM5578_0998     TRUE 0.979 12.000 0.143 1.000 Y NA
 10422049 10422050 LM5578_0998 LM5578_0999     FALSE 0.258 73.000 0.100 1.000 N NA
 10422050 10422051 LM5578_0999 LM5578_1000     FALSE 0.066 201.000 0.000 1.000   NA
 10422051 10422052 LM5578_1000 LM5578_1001     FALSE 0.204 122.000 0.139 NA   NA
 10422052 10422053 LM5578_1001 LM5578_1002     TRUE 0.905 19.000 0.841 NA   NA
 10422053 10422054 LM5578_1002 LM5578_1003     FALSE 0.205 89.000 0.026 NA   NA
 10422054 10422055 LM5578_1003 LM5578_1004     FALSE 0.143 117.000 0.036 1.000 N NA
 10422055 10422056 LM5578_1004 LM5578_1005     TRUE 0.962 0.000 0.713 1.000 N NA
 10422056 10422057 LM5578_1005 LM5578_1006     TRUE 0.705 23.000 0.110 1.000 N NA
 10422059 10422060 LM5578_1008 LM5578_1009     FALSE 0.069 182.000 0.000 NA   NA
 10422060 10422061 LM5578_1009 LM5578_1010     FALSE 0.105 109.000 0.027 NA N NA
 10422061 10422062 LM5578_1010 LM5578_1011     FALSE 0.361 68.000 0.100 NA   NA
 10422062 10422063 LM5578_1011 LM5578_1012     TRUE 0.782 24.000 0.113 1.000   NA
 10422064 10422065 LM5578_1013 LM5578_1014     FALSE 0.180 125.000 0.066 NA   NA
 10422066 10422067 LM5578_tRNA09 LM5578_1015     FALSE 0.164 97.000 0.000 NA   NA
 10422067 10422068 LM5578_1015 LM5578_1016     TRUE 0.729 21.000 0.077 1.000 N NA
 10422068 10422069 LM5578_1016 LM5578_1017     TRUE 0.800 13.000 0.036 1.000 N NA
 10422070 10422071 LM5578_1018 LM5578_1019     FALSE 0.204 88.000 0.018 NA   NA
 10422071 10422072 LM5578_1019 LM5578_1020     TRUE 0.837 13.000 0.016 NA   NA
 10422072 10422073 LM5578_1020 LM5578_1021     FALSE 0.241 96.000 0.188 NA   NA
 10422073 10422074 LM5578_1021 LM5578_1022     TRUE 0.880 32.000 0.000 0.009   NA
 10422074 10422075 LM5578_1022 LM5578_1023     TRUE 0.885 9.000 0.000 1.000   NA
 10422076 10422077 LM5578_1024 LM5578_1025 fri   FALSE 0.035 233.000 0.000 NA   NA
 10422077 10422078 LM5578_1025 LM5578_1026     FALSE 0.289 113.000 0.409 NA   NA
 10422078 10422079 LM5578_1026 LM5578_1027     TRUE 0.931 10.000 0.481 NA   NA
 10422080 10422081 LM5578_1028 LM5578_1029     TRUE 0.917 -3.000 0.162 NA N NA
 10422083 10422084 LM5578_1031 LM5578_1032     TRUE 0.729 21.000 0.000 NA   NA
 10422085 10422086 LM5578_1033 LM5578_1034     FALSE 0.377 94.000 0.733 NA   NA
 10422086 10422087 LM5578_1034 LM5578_1035     FALSE 0.053 233.000 0.167 NA   NA
 10422087 10422088 LM5578_1035 LM5578_1036     TRUE 0.866 16.000 0.270 NA   NA
 10422088 10422089 LM5578_1036 LM5578_1037     FALSE 0.050 189.000 0.083 NA N NA
 10422089 10422090 LM5578_1037 LM5578_1038     TRUE 0.992 16.000 0.194 0.002 Y NA
 10422090 10422091 LM5578_1038 LM5578_1039     TRUE 0.782 16.000 0.075 1.000 N NA
 10422091 10422092 LM5578_1039 LM5578_1040     FALSE 0.193 120.000 0.245 1.000 N NA
 10422092 10422093 LM5578_1040 LM5578_1041     FALSE 0.176 113.000 0.149 1.000 N NA
 10422093 10422094 LM5578_1041 LM5578_1042     TRUE 0.993 14.000 0.156 0.002 Y NA
 10422094 10422095 LM5578_1042 LM5578_1043   lemA FALSE 0.220 84.000 0.020 NA   NA
 10422095 10422096 LM5578_1043 LM5578_1044 lemA   TRUE 0.788 23.000 0.222 NA   NA
 10422097 10422098 LM5578_1045 LM5578_1046     FALSE 0.053 238.000 0.071 1.000   NA
 10422098 10422099 LM5578_1046 LM5578_1047     TRUE 0.850 17.000 0.096 1.000   NA
 10422100 10422101 LM5578_1048 LM5578_1049   ppnK TRUE 0.815 32.000 0.725 1.000   NA
 10422101 10422102 LM5578_1049 LM5578_1050 ppnK   TRUE 0.844 19.000 0.480 1.000 N NA
 10422102 10422103 LM5578_1050 LM5578_1051     FALSE 0.244 78.000 0.141 1.000 N NA
 10422104 10422105 LM5578_1052 LM5578_1053 dltD dltC TRUE 0.965 0.000 0.409 1.000   NA
 10422105 10422106 LM5578_1053 LM5578_1054 dltC dltB TRUE 0.781 26.000 0.387 NA   NA
 10422106 10422107 LM5578_1054 LM5578_1055 dltB dltA TRUE 0.946 -3.000 0.435 NA N NA
 10422107 10422108 LM5578_1055 LM5578_1056 dltA   TRUE 0.722 37.000 0.549 NA   NA
 10422110 10422111 LM5578_1058 LM5578_1059     TRUE 0.825 18.000 0.159 NA   NA
 10422112 10422113 LM5578_1060 LM5578_1061     FALSE 0.056 198.000 0.086 1.000 N NA
 10422113 10422114 LM5578_1061 LM5578_1062     TRUE 0.971 -3.000 0.860 1.000 N NA
 10422116 10422117 LM5578_1064 LM5578_1065     TRUE 0.827 13.000 0.106 1.000 N NA
 10422117 10422118 LM5578_1065 LM5578_1066     FALSE 0.133 134.000 0.216 NA N NA
 10422118 10422119 LM5578_1066 LM5578_1067     TRUE 0.955 -3.000 0.235 NA   NA
 10422119 10422120 LM5578_1067 LM5578_1068     TRUE 0.952 -3.000 0.189 NA   NA
 10422120 10422121 LM5578_1068 LM5578_1069     TRUE 0.980 -7.000 0.849 1.000   NA
 10422121 10422122 LM5578_1069 LM5578_1070   prfC FALSE 0.267 82.000 0.014 1.000   NA
 10422122 10422123 LM5578_1070 LM5578_1071 prfC   FALSE 0.133 107.000 0.017 1.000 N NA
 10422123 10422124 LM5578_1071 LM5578_1072     TRUE 0.595 52.000 0.625 1.000 N NA
 10422124 10422125 LM5578_1072 LM5578_1073     FALSE 0.015 282.000 0.000 1.000 N NA
 10422125 10422126 LM5578_1073 LM5578_1074     TRUE 0.815 103.000 0.381 0.069 Y NA
 10422126 10422127 LM5578_1074 LM5578_1075     TRUE 0.990 -37.000 0.151 1.000 Y NA
 10422128 10422129 LM5578_1076 LM5578_1077     TRUE 0.721 30.000 0.303 NA   NA
 10422131 10422132 LM5578_1079 LM5578_1080 clpE   FALSE 0.124 162.000 0.115 NA   NA
 10422134 10422135 LM5578_1082 LM5578_1083     FALSE 0.237 110.000 0.214 NA   NA
 10422136 10422137 LM5578_1084 LM5578_1085 ptsH   TRUE 0.996 0.000 0.140 0.031 Y NA
 10422137 10422138 LM5578_1085 LM5578_1086     FALSE 0.215 113.000 0.121 NA   NA
 10422138 10422139 LM5578_1086 LM5578_1087     TRUE 0.852 13.000 0.058 NA   NA
 10422141 10422142 LM5578_1089 LM5578_1090     FALSE 0.017 305.000 0.000 NA   NA
 10422142 10422143 LM5578_1090 LM5578_1091     FALSE 0.060 201.000 0.017 NA   NA
 10422143 10422144 LM5578_1091 LM5578_1092     TRUE 0.991 -3.000 0.214 NA Y NA
 10422144 10422145 LM5578_1092 LM5578_1093     TRUE 0.452 48.000 0.121 1.000 N NA
 10422145 10422146 LM5578_1093 LM5578_1094     TRUE 0.537 64.000 0.372 1.000   NA
 10422148 10422149 LM5578_1096 LM5578_1097 gbuA gbuB TRUE 0.995 -7.000 0.042 0.078 Y NA
 10422149 10422150 LM5578_1097 LM5578_1098 gbuB gbuC TRUE 0.990 14.000 0.179 0.032 Y NA
 10422150 10422151 LM5578_1098 LM5578_1099 gbuC   FALSE 0.188 115.000 0.192 1.000 N NA
 10422151 10422152 LM5578_1099 LM5578_1100     FALSE 0.148 111.000 0.047 1.000 N NA
 10422152 10422153 LM5578_1100 LM5578_1101     FALSE 0.283 81.000 0.031 1.000   NA
 10422153 10422154 LM5578_1101 LM5578_1102     FALSE 0.155 135.000 0.038 NA   NA
 10422154 10422155 LM5578_1102 LM5578_1103     TRUE 0.972 -3.000 0.679 NA   NA
 10422155 10422156 LM5578_1103 LM5578_1104     TRUE 0.998 -3.000 0.853 0.011 Y NA
 10422156 10422157 LM5578_1104 LM5578_1105     TRUE 0.785 19.000 0.194 1.000 N NA
 10422157 10422158 LM5578_1105 LM5578_1106     FALSE 0.149 155.000 0.184 NA   NA
 10422158 10422159 LM5578_1106 LM5578_1107     TRUE 0.977 -3.000 0.900 NA   NA
 10422160 10422161 LM5578_1108 LM5578_1109     FALSE 0.198 109.000 0.076 NA   NA
 10422161 10422162 LM5578_1109 LM5578_1110     TRUE 0.942 7.000 0.576 NA   NA
 10422165 10422166 LM5578_1113 LM5578_1114     TRUE 0.974 16.000 0.245 1.000 Y NA
 10422166 10422167 LM5578_1114 LM5578_1115     TRUE 0.999 -7.000 0.860 0.002 Y NA
 10422167 10422168 LM5578_1115 LM5578_1116     TRUE 0.963 -3.000 0.596 1.000 N NA
 10422168 10422169 LM5578_1116 LM5578_1117     TRUE 0.929 -3.000 0.100 1.000 N NA
 10422169 10422170 LM5578_1117 LM5578_1119     FALSE 0.010 607.000 0.167 NA   NA
 10422171 10422172 LM5578_1120 LM5578_1121     FALSE 0.323 68.000 0.026 NA   NA
 10422172 10422173 LM5578_1121 LM5578_1122     TRUE 0.932 -19.000 0.024 NA   NA
 10422173 10422174 LM5578_1122 LM5578_1123     TRUE 0.938 3.000 0.103 1.000   NA
 10422175 10422176 LM5578_1124 LM5578_1125     FALSE 0.125 95.000 0.000 1.000 N NA
 10422176 10422177 LM5578_1125 LM5578_1126     TRUE 0.997 -21.000 0.000 0.003 Y NA
 10422177 10422178 LM5578_1126 LM5578_1127     TRUE 0.997 -3.000 0.012 0.003 Y NA
 10422178 10422179 LM5578_1127 LM5578_1128     TRUE 0.998 -16.000 0.501 0.003 Y NA
 10422179 10422180 LM5578_1128 LM5578_1129   moaC TRUE 0.993 13.000 0.175 0.003 Y NA
 10422180 10422181 LM5578_1129 LM5578_1130 moaC moaA TRUE 0.977 29.000 0.071 0.003 Y NA
 10422182 10422183 LM5578_1131 LM5578_1132     TRUE 0.977 12.000 0.044 1.000 Y NA
 10422186 10422187 LM5578_1135 LM5578_1136 pdhA pdhB TRUE 0.998 3.000 0.484 0.001 Y NA
 10422187 10422188 LM5578_1136 LM5578_1137 pdhB pdhC TRUE 0.867 111.000 0.883 0.054 Y NA
 10422188 10422189 LM5578_1137 LM5578_1138 pdhC pdhD TRUE 0.992 5.000 0.948 1.000 Y NA
 10422189 10422190 LM5578_1138 LM5578_1139 pdhD   FALSE 0.076 188.000 0.026 NA   NA
 10422190 10422191 LM5578_1139 LM5578_1140     FALSE 0.138 129.000 0.000 NA   NA
 10422191 10422192 LM5578_1140 LM5578_1141     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 10422192 10422193 LM5578_1141 LM5578_1142     TRUE 0.788 22.000 0.145 NA   NA
 10422193 10422194 LM5578_1142 LM5578_1143     FALSE 0.062 142.000 0.000 NA N NA
 10422194 10422195 LM5578_1143 LM5578_1144     TRUE 0.991 -7.000 0.143 1.000 Y NA
 10422195 10422196 LM5578_1144 LM5578_1145     TRUE 0.436 87.000 0.143 0.078 N NA
 10422196 10422197 LM5578_1145 LM5578_1146     TRUE 0.987 13.000 1.000 1.000 Y NA
 10422198 10422199 LM5578_1147 LM5578_1148     FALSE 0.052 201.000 0.000 NA   NA
 10422200 10422201 LM5578_1149 LM5578_1150     FALSE 0.053 192.000 0.024 1.000 N NA
 10422201 10422202 LM5578_1150 LM5578_1151     FALSE 0.088 172.000 0.010 NA   NA
 10422204 10422205 LM5578_1153 LM5578_1154     FALSE 0.127 177.000 0.300 NA   NA
 10422205 10422206 LM5578_1154 LM5578_1155   pycA FALSE 0.021 278.000 0.046 1.000 N NA
 10422206 10422207 LM5578_1155 LM5578_1156 pycA   FALSE 0.092 152.000 0.028 1.000 N NA
 10422207 10422208 LM5578_1156 LM5578_1157     FALSE 0.014 291.000 0.000 1.000 N NA
 10422208 10422209 LM5578_1157 LM5578_1158     TRUE 0.987 12.000 0.808 1.000 Y NA
 10422209 10422210 LM5578_1158 LM5578_1159     FALSE 0.075 177.000 0.087 1.000 N NA
 10422210 10422211 LM5578_1159 LM5578_1160     FALSE 0.030 216.000 0.000 1.000 N NA
 10422213 10422214 LM5578_1162 LM5578_1163     FALSE 0.135 132.000 0.000 NA   NA
 10422214 10422215 LM5578_1163 LM5578_1164     TRUE 0.767 17.000 0.000 NA   NA
 10422215 10422216 LM5578_1164 LM5578_1165     TRUE 0.964 19.000 0.135 1.000 Y NA
 10422216 10422217 LM5578_1165 LM5578_1166     TRUE 0.990 1.000 0.183 1.000 Y NA
 10422217 10422218 LM5578_1166 LM5578_1167     TRUE 0.996 3.000 0.055 0.002 Y NA
 10422218 10422219 LM5578_1167 LM5578_1168     TRUE 0.964 20.000 0.182 1.000 Y NA
 10422219 10422220 LM5578_1168 LM5578_1169   ispD FALSE 0.228 76.000 0.067 1.000 N NA
 10422220 10422221 LM5578_1169 LM5578_1170 ispD   TRUE 0.952 -3.000 0.367 1.000 N NA
 10422221 10422222 LM5578_1170 LM5578_1171   tagB FALSE 0.179 88.000 0.069 1.000 N NA
 10422222 10422223 LM5578_1171 LM5578_1172 tagB tagD TRUE 0.997 1.000 0.244 0.002 Y NA
 10422223 10422224 LM5578_1172 LM5578_1173 tagD   TRUE 0.953 22.000 0.146 NA Y NA
 10422224 10422225 LM5578_1173 LM5578_1174     TRUE 0.968 15.000 0.111 NA Y NA
 10422225 10422226 LM5578_1174 LM5578_1175     FALSE 0.022 209.000 0.000 NA N NA
 10422226 10422227 LM5578_1175 LM5578_1176   nadE TRUE 0.994 12.000 0.194 0.003 Y NA
 10422227 10422228 LM5578_1176 LM5578_1177 nadE   TRUE 0.872 13.000 0.037 1.000   NA
 10422228 10422229 LM5578_1177 LM5578_1178     TRUE 0.481 60.000 0.083 1.000   NA
 10422229 10422230 LM5578_1178 LM5578_1179   guaA FALSE 0.113 129.000 0.004 1.000 N NA
 10422230 10422231 LM5578_1179 LM5578_1180 guaA   FALSE 0.029 218.000 0.000 1.000 N NA
 10422231 10422232 LM5578_1180 LM5578_1181     TRUE 0.984 2.000 0.400 0.052   NA
 10422232 10422233 LM5578_1181 LM5578_1182     FALSE 0.005 1137.000 0.000 NA   NA
 10422233 10422234 LM5578_1182 LM5578_1183     FALSE 0.010 403.000 0.000 NA   NA
 10422236 10422237 LM5578_1187 LM5578_1188     TRUE 0.993 -15.000 1.000 0.020   NA
 10422237 10422238 LM5578_1188 LM5578_1189     FALSE 0.202 82.000 0.000 NA   NA
 10422238 10422239 LM5578_1189 LM5578_1190     FALSE 0.020 285.000 0.000 NA   NA
 10422239 10422240 LM5578_1190 LM5578_1191     FALSE 0.359 105.000 0.800 NA   NA
 10422240 10422241 LM5578_1191 LM5578_1192     TRUE 0.953 -3.000 0.200 NA   NA
 10422241 10422242 LM5578_1192 LM5578_1193     TRUE 0.817 13.000 0.000 NA   NA
 10422242 10422243 LM5578_1193 LM5578_1194     TRUE 0.470 43.000 0.000 NA   NA
 10422243 10422244 LM5578_1194 LM5578_1195     TRUE 0.749 37.000 0.700 NA   NA
 10422244 10422245 LM5578_1195 LM5578_1196     FALSE 0.388 86.000 0.667 NA   NA
 10422245 10422246 LM5578_1196 LM5578_1197     TRUE 0.950 -10.000 0.167 NA   NA
 10422246 10422247 LM5578_1197 LM5578_1198     FALSE 0.011 377.000 0.000 NA   NA
 10422247 10422248 LM5578_1198 LM5578_1199     TRUE 0.718 25.000 0.094 NA   NA
 10422248 10422249 LM5578_1199 LM5578_1200     TRUE 0.949 -10.000 0.161 NA   NA
 10422250 10422251 LM5578_1201 LM5578_1202     TRUE 0.954 -3.000 0.082 1.000   NA
 10422251 10422252 LM5578_1202 LM5578_1203     TRUE 0.952 -3.000 0.057 1.000   NA
 10422253 10422254 LM5578_1204 LM5578_1205     TRUE 0.997 2.000 0.576 0.008 Y NA
 10422256 10422257 LM5578_1207 LM5578_1208     TRUE 0.806 25.000 0.462 NA   NA
 10422260 10422261 LM5578_1211 LM5578_1212     FALSE 0.379 67.000 0.111 NA   NA
 10422261 10422262 LM5578_1212 LM5578_1213     FALSE 0.187 129.000 0.111 NA   NA
 10422263 10422264 LM5578_1214 LM5578_1215     FALSE 0.164 128.000 0.179 1.000 N NA
 10422264 10422265 LM5578_1215 LM5578_1216     TRUE 0.991 -3.000 0.289 NA Y NA
 10422265 10422266 LM5578_1216 LM5578_1217     FALSE 0.128 148.000 0.316 NA N NA
 10422266 10422267 LM5578_1217 LM5578_1218     TRUE 0.988 6.000 0.467 1.000 Y NA
 10422267 10422268 LM5578_1218 LM5578_1219     TRUE 0.648 25.000 0.000 NA   NA
 10422268 10422269 LM5578_1219 LM5578_1220     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10422269 10422270 LM5578_1220 LM5578_1221     TRUE 0.988 2.000 0.046 1.000 Y NA
 10422270 10422271 LM5578_1221 LM5578_1222     TRUE 0.896 1.000 0.023 1.000 N NA
 10422273 10422274 LM5578_1224 LM5578_1225     TRUE 0.924 -7.000 0.200 NA N NA
 10422274 10422275 LM5578_1225 LM5578_1226     TRUE 0.771 19.000 0.150 1.000 N NA
 10422275 10422276 LM5578_1226 LM5578_1227     TRUE 0.928 38.000 0.455 0.001   NA
 10422276 10422277 LM5578_1227 LM5578_1228     TRUE 0.981 17.000 0.759 0.001   NA
 10422277 10422278 LM5578_1228 LM5578_1229     TRUE 0.662 45.000 0.500 NA   NA
 10422278 10422279 LM5578_1229 LM5578_1230     TRUE 0.958 -3.000 0.295 NA   NA
 10422279 10422280 LM5578_1230 LM5578_1231     TRUE 0.903 13.000 0.387 NA   NA
 10422280 10422281 LM5578_1231 LM5578_1232     TRUE 0.958 25.000 0.645 NA Y NA
 10422281 10422282 LM5578_1232 LM5578_1233     TRUE 0.987 4.000 0.364 NA Y NA
 10422282 10422283 LM5578_1233 LM5578_1234     TRUE 0.774 21.000 0.364 NA N NA
 10422283 10422284 LM5578_1234 LM5578_1235     TRUE 0.965 -3.000 0.440 NA   NA
 10422284 10422285 LM5578_1235 LM5578_1236     TRUE 0.939 5.000 0.407 NA   NA
 10422285 10422286 LM5578_1236 LM5578_1237     TRUE 0.873 15.000 0.268 NA   NA
 10422286 10422287 LM5578_1237 LM5578_1238     TRUE 0.892 7.000 0.000 1.000   NA
 10422287 10422288 LM5578_1238 LM5578_1239     TRUE 0.986 16.000 0.000 0.028 Y NA
 10422288 10422289 LM5578_1239 LM5578_1240   glpF TRUE 0.720 28.000 0.407 1.000 N NA
 10422289 10422290 LM5578_1240 LM5578_1241 glpF ackA2 TRUE 0.419 66.000 0.375 1.000 N NA
 10422290 10422291 LM5578_1241 LM5578_1242 ackA2   TRUE 0.864 14.000 0.346 1.000 N NA
 10422291 10422292 LM5578_1242 LM5578_1243     TRUE 0.947 -10.000 0.300 1.000 N NA
 10422292 10422293 LM5578_1243 LM5578_1244   pduQ FALSE 0.005 590.000 0.000 1.000 N NA
 10422293 10422294 LM5578_1244 LM5578_1245 pduQ   FALSE 0.027 224.000 0.000 1.000 N NA
 10422294 10422295 LM5578_1245 LM5578_1246     TRUE 0.993 -7.000 0.388 1.000 Y NA
 10422295 10422296 LM5578_1246 LM5578_1247   eutA FALSE 0.163 89.000 0.163 NA N NA
 10422296 10422297 LM5578_1247 LM5578_1248 eutA eutB TRUE 0.918 42.000 0.636 NA Y NA
 10422297 10422298 LM5578_1248 LM5578_1249 eutB eutC TRUE 0.991 20.000 0.190 0.001 Y NA
 10422298 10422299 LM5578_1249 LM5578_1250 eutC   TRUE 0.968 23.000 0.617 1.000 Y NA
 10422299 10422300 LM5578_1250 LM5578_1251     TRUE 0.850 15.000 0.468 NA N NA
 10422300 10422301 LM5578_1251 LM5578_1252     TRUE 0.991 0.000 0.442 NA Y NA
 10422301 10422302 LM5578_1252 LM5578_1253     TRUE 0.926 32.000 0.349 NA Y NA
 10422302 10422303 LM5578_1253 LM5578_1254     FALSE 0.106 166.000 0.357 NA N NA
 10422303 10422304 LM5578_1254 LM5578_1255     TRUE 0.865 13.000 0.452 NA N NA
 10422304 10422305 LM5578_1255 LM5578_1256     TRUE 0.965 -3.000 0.459 NA   NA
 10422305 10422306 LM5578_1256 LM5578_1257     TRUE 0.899 15.000 0.487 NA   NA
 10422306 10422307 LM5578_1257 LM5578_1258     TRUE 0.992 -7.000 0.385 NA Y NA
 10422307 10422308 LM5578_1258 LM5578_1259     TRUE 0.855 16.000 0.552 NA N NA
 10422308 10422309 LM5578_1259 LM5578_1260     TRUE 0.994 -7.000 0.759 NA Y NA
 10422309 10422310 LM5578_1260 LM5578_1261     FALSE 0.044 210.000 0.000 NA   NA
 10422312 10422313 LM5578_1263 LM5578_1264   cbiA FALSE 0.014 333.000 0.000 NA   NA
 10422313 10422314 LM5578_1264 LM5578_1265 cbiA cobD TRUE 0.997 -3.000 0.124 0.011 Y NA
 10422314 10422315 LM5578_1265 LM5578_1266 cobD cbiC TRUE 0.992 13.000 0.107 0.011 Y NA
 10422315 10422316 LM5578_1266 LM5578_1267 cbiC cbiD TRUE 0.990 16.000 0.168 0.011 Y NA
 10422316 10422317 LM5578_1267 LM5578_1268 cbiD cbiE TRUE 0.997 -3.000 0.126 0.011 Y NA
 10422317 10422318 LM5578_1268 LM5578_1269 cbiE   TRUE 0.998 -10.000 0.300 0.001 Y NA
 10422318 10422319 LM5578_1269 LM5578_1270   cbiF TRUE 0.994 6.000 0.056 0.011 Y NA
 10422319 10422320 LM5578_1270 LM5578_1271 cbiF cbiG TRUE 0.998 -13.000 0.397 0.011 Y NA
 10422320 10422321 LM5578_1271 LM5578_1272 cbiG cbiH TRUE 0.998 -3.000 0.352 0.011 Y NA
 10422321 10422322 LM5578_1272 LM5578_1273 cbiH   TRUE 0.998 -3.000 0.423 0.011 Y NA
 10422322 10422323 LM5578_1273 LM5578_1274     TRUE 0.989 0.000 0.042 1.000 Y NA
 10422323 10422324 LM5578_1274 LM5578_1275   cbiK TRUE 0.991 -3.000 0.084 1.000 Y NA
 10422324 10422325 LM5578_1275 LM5578_1276 cbiK cbiL TRUE 0.991 -7.000 0.048 1.000 Y NA
 10422325 10422326 LM5578_1276 LM5578_1277 cbiL   TRUE 0.983 -3.000 0.058 0.011 N NA
 10422326 10422327 LM5578_1277 LM5578_1278     TRUE 0.998 -3.000 0.861 0.011 Y NA
 10422327 10422328 LM5578_1278 LM5578_1279   cbiQ TRUE 0.998 -37.000 0.804 0.002 Y NA
 10422328 10422329 LM5578_1279 LM5578_1280 cbiQ   TRUE 0.993 13.000 0.152 0.002 Y NA
 10422329 10422330 LM5578_1280 LM5578_1281   cbiP TRUE 0.905 0.000 0.033 1.000 N NA
 10422330 10422331 LM5578_1281 LM5578_1282 cbiP   TRUE 0.985 -36.000 0.021 0.011   NA
 10422332 10422333 LM5578_1283 LM5578_1284     TRUE 0.909 14.000 0.545 NA   NA
 10422334 10422335 LM5578_1285 LM5578_1286     FALSE 0.394 31.000 0.000 NA N NA
 10422335 10422336 LM5578_1286 LM5578_1287     TRUE 0.958 3.000 0.600 NA   NA
 10422336 10422337 LM5578_1287 LM5578_1288     FALSE 0.010 421.000 0.000 NA   NA
 10422337 10422338 LM5578_1288 LM5578_1289     FALSE 0.387 270.000 0.000 0.004 Y NA
 10422338 10422339 LM5578_1289 LM5578_1290     FALSE 0.199 112.000 0.237 1.000 N NA
 10422339 10422340 LM5578_1290 LM5578_1291     TRUE 0.594 26.000 0.022 1.000 N NA
 10422342 10422343 LM5578_1293 LM5578_1294   pheS FALSE 0.006 367.000 0.000 NA N NA
 10422343 10422344 LM5578_1294 LM5578_1295 pheS pheT TRUE 0.998 0.000 0.574 0.001 Y NA
 10422344 10422345 LM5578_1295 LM5578_1296 pheT   FALSE 0.075 161.000 0.009 1.000 N NA
 10422345 10422346 LM5578_1296 LM5578_1297     TRUE 0.877 14.000 0.438 1.000 N NA
 10422346 10422347 LM5578_1297 LM5578_1298     FALSE 0.189 98.000 0.182 1.000 N NA
 10422347 10422348 LM5578_1298 LM5578_1299     TRUE 0.822 16.000 0.000 1.000   NA
 10422348 10422349 LM5578_1299 LM5578_1300     FALSE 0.190 107.000 0.000 1.000   NA
 10422351 10422352 LM5578_1302 LM5578_1303     TRUE 0.937 0.000 0.091 NA   NA
 10422352 10422353 LM5578_1303 LM5578_1304     FALSE 0.253 93.000 0.066 1.000   NA
 10422353 10422354 LM5578_1304 LM5578_1305     TRUE 0.953 23.000 0.114 1.000 Y NA
 10422354 10422355 LM5578_1305 LM5578_1306   trxA FALSE 0.187 81.000 0.031 1.000 N NA
 10422355 10422356 LM5578_1306 LM5578_1307 trxA uvrC FALSE 0.196 76.000 0.008 1.000 N NA
 10422356 10422357 LM5578_1307 LM5578_1308 uvrC   FALSE 0.052 189.000 0.009 1.000 N NA
 10422359 10422360 LM5578_1310 LM5578_1311 racE rph TRUE 0.806 13.000 0.048 1.000 N NA
 10422360 10422361 LM5578_1311 LM5578_1312 rph   TRUE 0.915 4.000 0.262 1.000 N NA
 10422361 10422362 LM5578_1312 LM5578_1313     TRUE 0.589 37.000 0.085 NA   NA
 10422362 10422363 LM5578_1313 LM5578_tRNA10     FALSE 0.158 111.000 0.000 NA   NA
 10422364 10422365 LM5578_1314 LM5578_1315     FALSE 0.148 142.000 0.000 1.000   NA
 10422365 10422366 LM5578_1315 LM5578_1316     TRUE 0.406 52.000 0.000 NA   NA
 10422366 10422367 LM5578_1316 LM5578_1317     TRUE 0.915 17.000 0.857 NA   NA
 10422367 10422368 LM5578_1317 LM5578_1318     FALSE 0.010 401.000 0.000 NA   NA
 10422369 10422370 LM5578_1319 LM5578_1320     TRUE 0.785 22.000 0.132 NA   NA
 10422370 10422371 LM5578_1320 LM5578_1321     FALSE 0.010 423.000 0.000 NA   NA
 10422371 10422372 LM5578_1321 LM5578_1322     FALSE 0.012 366.000 0.000 NA   NA
 10422372 10422373 LM5578_1322 LM5578_1323     FALSE 0.020 286.000 0.000 NA   NA
 10422373 10422374 LM5578_1323 LM5578_1324     TRUE 0.470 43.000 0.000 NA   NA
 10422374 10422375 LM5578_1324 LM5578_1325     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10422375 10422376 LM5578_1325 LM5578_1326     TRUE 0.975 11.000 0.500 0.051   NA
 10422376 10422377 LM5578_1326 LM5578_1327     TRUE 0.973 13.000 0.667 0.051   NA
 10422377 10422378 LM5578_1327 LM5578_1328     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10422378 10422379 LM5578_1328 LM5578_1329     TRUE 0.897 3.000 0.000 NA   NA
 10422379 10422380 LM5578_1329 LM5578_1330     FALSE 0.060 193.000 0.000 NA   NA
 10422380 10422381 LM5578_1330 LM5578_1331     TRUE 0.910 1.000 0.000 NA   NA
 10422381 10422382 LM5578_1331 LM5578_1332     TRUE 0.747 19.000 0.000 NA   NA
 10422382 10422383 LM5578_1332 LM5578_1333     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10422383 10422384 LM5578_1333 LM5578_1334     TRUE 0.918 -30.000 0.000 NA   NA
 10422384 10422385 LM5578_1334 LM5578_1335     FALSE 0.050 203.000 0.000 NA   NA
 10422385 10422386 LM5578_1335 LM5578_1336     TRUE 0.954 3.000 0.500 NA   NA
 10422386 10422387 LM5578_1336 LM5578_1337     TRUE 0.975 -3.000 0.833 NA   NA
 10422387 10422388 LM5578_1337 LM5578_1338     TRUE 0.961 2.000 0.600 NA   NA
 10422388 10422389 LM5578_1338 LM5578_1339     TRUE 0.880 20.000 0.600 NA   NA
 10422389 10422390 LM5578_1339 LM5578_1340     FALSE 0.141 178.000 0.400 NA   NA
 10422390 10422391 LM5578_1340 LM5578_1341     TRUE 0.827 25.000 0.600 NA   NA
 10422391 10422392 LM5578_1341 LM5578_1342     TRUE 0.812 23.000 0.333 NA   NA
 10422392 10422393 LM5578_1342 LM5578_1343     FALSE 0.014 334.000 0.000 NA   NA
 10422393 10422394 LM5578_1343 LM5578_1344     TRUE 0.928 2.000 0.080 NA   NA
 10422394 10422395 LM5578_1344 LM5578_1345     FALSE 0.008 448.000 0.000 NA   NA
 10422395 10422396 LM5578_1345 LM5578_1346     FALSE 0.018 295.000 0.000 NA   NA
 10422396 10422397 LM5578_1346 LM5578_1347     TRUE 0.480 42.000 0.000 NA   NA
 10422397 10422398 LM5578_1347 LM5578_1348     FALSE 0.265 98.000 0.160 1.000   NA
 10422398 10422399 LM5578_1348 LM5578_1349     FALSE 0.007 795.000 0.000 1.000   NA
 10422399 10422400 LM5578_1349 LM5578_1350     TRUE 0.575 50.000 0.312 NA   NA
 10422400 10422401 LM5578_1350 LM5578_1351     TRUE 0.949 -3.000 0.154 NA   NA
 10422403 10422404 LM5578_1353 LM5578_1354     TRUE 0.960 -3.000 0.333 NA   NA
 10422404 10422405 LM5578_1354 LM5578_1355     TRUE 0.783 27.000 0.444 NA   NA
 10422405 10422406 LM5578_1355 LM5578_1356     TRUE 0.920 7.000 0.273 NA   NA
 10422406 10422407 LM5578_1356 LM5578_1357     TRUE 0.938 10.000 0.600 NA   NA
 10422407 10422408 LM5578_1357 LM5578_1358     TRUE 0.965 -16.000 0.500 NA   NA
 10422408 10422409 LM5578_1358 LM5578_1359     TRUE 0.962 -3.000 0.375 NA   NA
 10422409 10422410 LM5578_1359 LM5578_1360     TRUE 0.960 -3.000 0.333 NA   NA
 10422410 10422411 LM5578_1360 LM5578_1361     TRUE 0.876 21.000 0.615 NA   NA
 10422411 10422412 LM5578_1361 LM5578_1362     FALSE 0.376 71.000 0.231 NA   NA
 10422412 10422413 LM5578_1362 LM5578_1363     TRUE 0.646 51.000 0.600 NA   NA
 10422413 10422414 LM5578_1363 LM5578_1364     TRUE 0.930 4.000 0.222 NA   NA
 10422414 10422415 LM5578_1364 LM5578_1365     TRUE 0.924 -12.000 0.000 NA   NA
 10422415 10422416 LM5578_1365 LM5578_1366     TRUE 0.883 13.000 0.222 NA   NA
 10422416 10422417 LM5578_1366 LM5578_1367     TRUE 0.923 -13.000 0.000 NA   NA
 10422417 10422418 LM5578_1367 LM5578_1368     TRUE 0.675 48.000 0.667 NA   NA
 10422418 10422419 LM5578_1368 LM5578_1369     TRUE 0.958 0.000 0.400 NA   NA
 10422419 10422420 LM5578_1369 LM5578_1370     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 10422420 10422421 LM5578_1370 LM5578_1371     FALSE 0.154 104.000 0.000 NA   NA
 10422422 10422423 LM5578_1372 LM5578_1373     FALSE 0.047 206.000 0.000 NA   NA
 10422427 10422428 LM5578_1377 LM5578_1378     FALSE 0.186 154.000 0.364 NA   NA
 10422431 10422432 LM5578_1381 LM5578_1382     TRUE 0.716 25.000 0.086 NA   NA
 10422432 10422433 LM5578_1382 LM5578_1383     FALSE 0.115 168.000 0.106 NA   NA
 10422434 10422435 LM5578_1384 LM5578_1385     TRUE 0.955 -3.000 0.239 NA   NA
 10422437 10422438 LM5578_1387 LM5578_1388     TRUE 0.546 67.000 0.692 NA   NA
 10422438 10422439 LM5578_1388 LM5578_1389     FALSE 0.320 98.000 0.538 NA   NA
 10422439 10422440 LM5578_1389 LM5578_1390     TRUE 0.835 25.000 0.667 NA   NA
 10422442 10422443 LM5578_1392 LM5578_1393     TRUE 0.976 19.000 0.650 1.000 Y NA
 10422447 10422448 LM5578_1397 LM5578_1398 proA proB TRUE 0.998 -16.000 0.281 0.002 Y NA
 10422448 10422449 LM5578_1398 LM5578_1399 proB   FALSE 0.145 136.000 0.015 NA   NA
 10422449 10422450 LM5578_1399 LM5578_1400     FALSE 0.329 81.000 0.306 NA   NA
 10422451 10422452 LM5578_1401 LM5578_1402     FALSE 0.240 119.000 0.100 1.000   NA
 10422452 10422453 LM5578_1402 LM5578_1403     TRUE 0.889 18.000 0.600 NA   NA
 10422453 10422454 LM5578_1403 LM5578_1404     FALSE 0.026 262.000 0.000 NA   NA
 10422454 10422455 LM5578_1404 LM5578_1405   tig FALSE 0.214 115.000 0.014 1.000   NA
 10422455 10422456 LM5578_1405 LM5578_1406 tig clpX TRUE 0.668 185.000 0.033 0.003 Y NA
 10422456 10422457 LM5578_1406 LM5578_1407 clpX   FALSE 0.128 119.000 0.009 1.000 N NA
 10422457 10422458 LM5578_1407 LM5578_1408     TRUE 0.984 35.000 0.643 0.001 Y NA
 10422458 10422459 LM5578_1408 LM5578_1409     TRUE 0.913 102.000 0.769 0.001 Y NA
 10422459 10422460 LM5578_1409 LM5578_1410   rbgA TRUE 0.896 10.000 0.023 1.000   NA
 10422460 10422461 LM5578_1410 LM5578_1411 rbgA rnhB TRUE 0.958 -3.000 0.148 1.000   NA
 10422461 10422462 LM5578_1411 LM5578_1412 rnhB   TRUE 0.557 134.000 0.037 1.000 Y NA
 10422462 10422463 LM5578_1412 LM5578_1413   topA FALSE 0.202 272.000 0.238 1.000 Y NA
 10422463 10422464 LM5578_1413 LM5578_1414 topA gid FALSE 0.353 63.000 0.137 1.000 N NA
 10422464 10422465 LM5578_1414 LM5578_1415 gid codV FALSE 0.022 283.000 0.105 1.000 N NA
 10422465 10422466 LM5578_1415 LM5578_1416 codV clpQ TRUE 0.744 21.000 0.113 1.000 N NA
 10422466 10422467 LM5578_1416 LM5578_1417 clpQ hslU TRUE 0.984 14.000 0.752 1.000 Y NA
 10422467 10422468 LM5578_1417 LM5578_1418 hslU codY TRUE 0.749 21.000 0.131 1.000 N NA
 10422468 10422469 LM5578_1418 LM5578_1419 codY   FALSE 0.233 103.000 0.076 1.000   NA
 10422469 10422470 LM5578_1419 LM5578_1420     TRUE 0.755 23.000 0.096 NA   NA
 10422470 10422471 LM5578_1420 LM5578_1421     TRUE 0.925 3.000 0.105 NA   NA
 10422473 10422474 LM5578_1423 LM5578_1424   parE FALSE 0.083 181.000 0.030 NA   NA
 10422474 10422475 LM5578_1424 LM5578_1425 parE parC TRUE 0.998 -3.000 0.552 0.002 Y NA
 10422475 10422476 LM5578_1425 LM5578_1426 parC   FALSE 0.176 83.000 0.026 1.000 N NA
 10422476 10422477 LM5578_1426 LM5578_1427     FALSE 0.019 327.000 0.000 1.000   NA
 10422477 10422478 LM5578_1427 LM5578_1428     FALSE 0.014 332.000 0.000 NA   NA
 10422480 10422481 LM5578_1430 LM5578_1431   glpD FALSE 0.210 233.000 0.000 1.000 Y NA
 10422481 10422482 LM5578_1431 LM5578_1432 glpD miaA FALSE 0.120 126.000 0.011 1.000 N NA
 10422482 10422483 LM5578_1432 LM5578_1433 miaA   FALSE 0.252 123.000 0.192 1.000   NA
 10422483 10422484 LM5578_1433 LM5578_1434     FALSE 0.208 105.000 0.014 1.000   NA
 10422484 10422485 LM5578_1434 LM5578_1435     TRUE 0.953 -7.000 0.065 1.000   NA
 10422485 10422486 LM5578_1435 LM5578_1436   glnR FALSE 0.047 203.000 0.046 1.000 N NA
 10422486 10422487 LM5578_1436 LM5578_1437 glnR glnA FALSE 0.303 71.000 0.192 1.000 N NA
 10422487 10422488 LM5578_1437 LM5578_1438 glnA   FALSE 0.143 144.000 0.212 1.000 N NA
 10422489 10422490 LM5578_1439 LM5578_1440     TRUE 0.484 30.000 0.043 NA N NA
 10422491 10422492 LM5578_1441 LM5578_1442     FALSE 0.326 92.000 0.480 NA   NA
 10422492 10422493 LM5578_1442 LM5578_1443   tkt FALSE 0.219 147.000 0.440 NA   NA
 10422493 10422494 LM5578_1443 LM5578_1444 tkt   FALSE 0.050 221.000 0.000 1.000   NA
 10422495 10422496 LM5578_1445 LM5578_1447     FALSE 0.008 553.000 0.026 NA   NA
 10422496 10422497 LM5578_1447 LM5578_1448     TRUE 0.773 22.000 0.087 NA   NA
 10422497 10422498 LM5578_1448 LM5578_1449     TRUE 0.951 10.000 0.692 1.000   NA
 10422498 10422499 LM5578_1449 LM5578_1450     TRUE 0.956 -10.000 0.123 1.000   NA
 10422499 10422500 LM5578_1450 LM5578_1451     TRUE 0.945 -16.000 0.137 NA   NA
 10422501 10422502 LM5578_1452 LM5578_1453 smbA frr TRUE 0.959 0.000 0.626 1.000 N NA
 10422502 10422503 LM5578_1453 LM5578_1454 frr   FALSE 0.062 227.000 0.409 1.000 N NA
 10422503 10422504 LM5578_1454 LM5578_1455   cdsA TRUE 0.974 14.000 0.113 1.000 Y NA
 10422504 10422505 LM5578_1455 LM5578_1456 cdsA   TRUE 0.971 15.000 0.071 1.000 Y NA
 10422505 10422506 LM5578_1456 LM5578_1457     TRUE 0.892 14.000 0.568 1.000 N NA
 10422506 10422507 LM5578_1457 LM5578_1458   proS TRUE 0.506 40.000 0.095 1.000 N NA
 10422507 10422508 LM5578_1458 LM5578_1459 proS polC FALSE 0.384 105.000 0.070 0.043 N NA
 10422508 10422509 LM5578_1459 LM5578_1460 polC   FALSE 0.087 182.000 0.059 NA   NA
 10422509 10422510 LM5578_1460 LM5578_1461   nusA TRUE 0.806 30.000 0.759 NA   NA
 10422510 10422511 LM5578_1461 LM5578_1462 nusA   TRUE 0.974 15.000 0.323 NA Y NA
 10422511 10422512 LM5578_1462 LM5578_1463     TRUE 0.945 -7.000 0.408 NA N NA
 10422512 10422513 LM5578_1463 LM5578_1464   infB TRUE 0.957 23.000 0.223 1.000 Y NA
 10422513 10422514 LM5578_1464 LM5578_1465 infB   TRUE 0.695 27.000 0.102 NA   NA
 10422514 10422515 LM5578_1465 LM5578_1466   rbfA TRUE 0.826 17.000 0.113 NA   NA
 10422515 10422516 LM5578_1466 LM5578_1467 rbfA truB TRUE 0.650 94.000 0.111 1.000 Y NA
 10422516 10422517 LM5578_1467 LM5578_1468 truB ribC FALSE 0.352 70.000 0.308 1.000 N NA
 10422517 10422518 LM5578_1468 LM5578_1469 ribC rpsO FALSE 0.137 137.000 0.119 1.000 N NA
 10422518 10422519 LM5578_1469 LM5578_1470 rpsO pnpA FALSE 0.258 249.000 0.335 1.000 Y NA
 10422520 10422521 LM5578_1471 LM5578_1472     FALSE 0.103 161.000 0.014 NA   NA
 10422521 10422522 LM5578_1472 LM5578_1473     TRUE 0.647 28.000 0.031 NA   NA
 10422523 10422524 LM5578_1474 LM5578_1475 rpmG   FALSE 0.361 56.000 0.045 1.000 N NA
 10422524 10422525 LM5578_1475 LM5578_1476     FALSE 0.226 99.000 0.037 1.000   NA
 10422525 10422526 LM5578_1476 LM5578_1477     TRUE 0.899 13.000 0.347 NA   NA
 10422526 10422527 LM5578_1477 LM5578_1478     TRUE 0.811 25.000 0.496 NA   NA
 10422527 10422528 LM5578_1478 LM5578_1479     FALSE 0.164 134.000 0.058 NA   NA
 10422529 10422530 LM5578_1480 LM5578_1481     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10422530 10422531 LM5578_1481 LM5578_1482     TRUE 0.931 -37.000 0.036 NA   NA
 10422531 10422532 LM5578_1482 LM5578_1483     TRUE 0.936 -13.000 0.036 NA   NA
 10422532 10422533 LM5578_1483 LM5578_1484     TRUE 0.960 -3.000 0.320 NA   NA
 10422533 10422534 LM5578_1484 LM5578_1485   comGB TRUE 0.996 14.000 0.861 0.001 Y NA
 10422534 10422535 LM5578_1485 LM5578_1486 comGB comGA TRUE 0.994 -22.000 0.639 1.000 Y NA
 10422536 10422537 LM5578_1487 LM5578_1488     TRUE 0.992 16.000 0.092 0.001 Y NA
 10422537 10422538 LM5578_1488 LM5578_1489     TRUE 0.998 -3.000 0.316 0.001 Y NA
 10422539 10422540 LM5578_1490 LM5578_1491     FALSE 0.377 62.000 0.029 NA   NA
 10422540 10422541 LM5578_1491 LM5578_1492     TRUE 0.869 13.000 0.140 NA   NA
 10422542 10422543 LM5578_1493 LM5578_1494   efp FALSE 0.175 103.000 0.160 1.000 N NA
 10422543 10422544 LM5578_1494 LM5578_1495 efp   FALSE 0.102 159.000 0.120 1.000 N NA
 10422544 10422545 LM5578_1495 LM5578_1496     TRUE 0.973 14.000 0.086 1.000 Y NA
 10422545 10422546 LM5578_1496 LM5578_1497     TRUE 0.941 4.000 0.373 NA   NA
 10422546 10422547 LM5578_1497 LM5578_1498   nusB TRUE 0.610 31.000 0.023 NA   NA
 10422547 10422548 LM5578_1498 LM5578_1499 nusB folD FALSE 0.159 96.000 0.056 1.000 N NA
 10422548 10422549 LM5578_1499 LM5578_1500 folD xseA TRUE 0.737 19.000 0.058 1.000 N NA
 10422549 10422550 LM5578_1500 LM5578_1501 xseA   TRUE 0.998 -10.000 0.412 0.001 Y NA
 10422550 10422551 LM5578_1501 LM5578_1502     TRUE 0.902 3.000 0.100 1.000 N NA
 10422551 10422552 LM5578_1502 LM5578_1503   cspL FALSE 0.057 199.000 0.108 1.000 N NA
 10422552 10422553 LM5578_1503 LM5578_1504 cspL tktB FALSE 0.035 215.000 0.015 1.000 N NA
 10422553 10422554 LM5578_1504 LM5578_1505 tktB   TRUE 0.938 -3.000 0.189 1.000 N NA
 10422554 10422555 LM5578_1505 LM5578_1506     FALSE 0.060 191.000 0.064 1.000 N NA
 10422555 10422556 LM5578_1506 LM5578_1507   recN TRUE 0.678 23.000 0.056 1.000 N NA
 10422556 10422557 LM5578_1507 LM5578_1508 recN   FALSE 0.117 129.000 0.013 1.000 N NA
 10422557 10422558 LM5578_1508 LM5578_1509   buk TRUE 0.657 137.000 0.562 1.000 Y NA
 10422558 10422559 LM5578_1509 LM5578_1511 buk   TRUE 0.691 154.000 0.078 0.042 Y NA
 10422559 10422560 LM5578_1511 LM5578_1512     TRUE 0.956 25.000 0.414 1.000 Y NA
 10422560 10422561 LM5578_1512 LM5578_1513     TRUE 0.991 17.000 0.897 0.051 Y NA
 10422561 10422562 LM5578_1513 LM5578_1514     TRUE 0.979 31.000 0.882 0.051 Y NA
 10422564 10422565 LM5578_1516 LM5578_1517     FALSE 0.103 145.000 0.035 1.000 N NA
 10422565 10422566 LM5578_1517 LM5578_1518   lisR FALSE 0.054 191.000 0.025 1.000 N NA
 10422566 10422567 LM5578_1518 LM5578_1519 lisR lisK TRUE 0.993 -3.000 0.438 1.000 Y NA
 10422568 10422569 LM5578_1520 LM5578_1521     TRUE 0.771 37.000 0.833 NA   NA
 10422569 10422570 LM5578_1521 LM5578_1522     FALSE 0.249 86.000 0.115 NA   NA
 10422571 10422572 LM5578_1523 LM5578_1524     TRUE 0.631 29.000 0.026 NA   NA
 10422574 10422575 LM5578_1526 LM5578_1527     FALSE 0.126 152.000 0.042 NA   NA
 10422577 10422578 LM5578_1529 LM5578_1530 tcsA   FALSE 0.017 385.000 0.048 1.000   NA
 10422578 10422579 LM5578_1530 LM5578_1531     TRUE 0.971 -7.000 0.438 1.000   NA
 10422579 10422580 LM5578_1531 LM5578_1532     TRUE 0.992 -3.000 0.720 0.030   NA
 10422580 10422581 LM5578_1532 LM5578_1533     FALSE 0.236 118.000 0.077 1.000   NA
 10422581 10422582 LM5578_1533 LM5578_1534     TRUE 0.994 -19.000 0.872 0.005   NA
 10422582 10422583 LM5578_1534 LM5578_1535     FALSE 0.346 92.000 0.397 1.000   NA
 10422583 10422584 LM5578_1535 LM5578_1536     TRUE 0.587 51.000 0.213 1.000   NA
 10422584 10422585 LM5578_1536 LM5578_1537     FALSE 0.263 90.000 0.077 1.000   NA
 10422585 10422586 LM5578_1537 LM5578_1538   cinA TRUE 0.415 69.000 0.151 1.000   NA
 10422586 10422587 LM5578_1538 LM5578_1539 cinA recA FALSE 0.040 273.000 0.083 1.000   NA
 10422587 10422588 LM5578_1539 LM5578_1540 recA   FALSE 0.025 301.000 0.018 1.000   NA
 10422588 10422589 LM5578_1540 LM5578_1541     FALSE 0.215 114.000 0.016 1.000   NA
 10422589 10422590 LM5578_1541 LM5578_1542     TRUE 0.910 6.000 0.026 1.000   NA
 10422590 10422591 LM5578_1542 LM5578_1543     TRUE 0.799 17.000 0.031 NA   NA
 10422591 10422592 LM5578_1543 LM5578_1544   mutS FALSE 0.183 110.000 0.031 NA   NA
 10422592 10422593 LM5578_1544 LM5578_1545 mutS mutL TRUE 0.991 20.000 0.220 0.001 Y NA
 10422593 10422594 LM5578_1545 LM5578_1546 mutL   TRUE 0.736 17.000 0.020 1.000 N NA
 10422594 10422595 LM5578_1546 LM5578_1547   pflB FALSE 0.007 426.000 0.000 1.000 N NA
 10422595 10422596 LM5578_1547 LM5578_1548 pflB pflC FALSE 0.247 77.000 0.135 1.000 N NA
 10422598 10422599 LM5578_1550 LM5578_1551     FALSE 0.140 128.000 0.000 NA   NA
 10422599 10422600 LM5578_1551 LM5578_1552     TRUE 0.767 17.000 0.000 NA   NA
 10422600 10422601 LM5578_1552 LM5578_1553     TRUE 0.402 41.000 0.000 1.000 N NA
 10422602 10422603 LM5578_1554 LM5578_1555     FALSE 0.114 186.000 0.140 1.000   NA
 10422605 10422606 LM5578_1557 LM5578_1558     FALSE 0.306 70.000 0.029 NA   NA
 10422606 10422607 LM5578_1558 LM5578_1559     TRUE 0.795 19.000 0.068 NA   NA
 10422607 10422608 LM5578_1559 LM5578_1560     TRUE 0.415 64.000 0.152 NA   NA
 10422608 10422609 LM5578_1560 LM5578_1561     TRUE 0.794 17.000 0.021 NA   NA
 10422610 10422611 LM5578_1562 LM5578_1563     TRUE 0.979 -3.000 0.218 0.074 N NA
 10422612 10422613 LM5578_1564 LM5578_1565     FALSE 0.284 139.000 0.700 NA   NA
 10422613 10422614 LM5578_1565 LM5578_1566   opuCD TRUE 0.557 113.000 0.636 0.030 N NA
 10422614 10422615 LM5578_1566 LM5578_1567 opuCD opuCC TRUE 0.969 15.000 0.909 0.030 N NA
 10422615 10422616 LM5578_1567 LM5578_1568 opuCC opuCB TRUE 0.987 2.000 0.909 0.030 N NA
 10422616 10422617 LM5578_1568 LM5578_1569 opuCB opuCA TRUE 0.996 4.000 0.727 0.074 Y NA
 10422617 10422618 LM5578_1569 LM5578_1570 opuCA   FALSE 0.019 293.000 0.000 NA   NA
 10422618 10422619 LM5578_1570 LM5578_1571     FALSE 0.030 249.000 0.000 NA   NA
 10422621 10422622 LM5578_1573 LM5578_1574     TRUE 0.704 53.000 0.786 1.000   NA
 10422622 10422623 LM5578_1574 LM5578_1575     FALSE 0.291 89.000 0.167 1.000   NA
 10422623 10422624 LM5578_1575 LM5578_1576   dapA TRUE 0.803 20.000 0.014 1.000   NA
 10422624 10422625 LM5578_1576 LM5578_1577 dapA   TRUE 0.971 15.000 0.085 1.000 Y NA
 10422625 10422626 LM5578_1577 LM5578_1578     TRUE 0.978 12.000 0.091 1.000 Y NA
 10422626 10422627 LM5578_1578 LM5578_1579     FALSE 0.254 72.000 0.000 NA   NA
 10422627 10422628 LM5578_1579 LM5578_1580     TRUE 0.714 22.000 0.000 NA   NA
 10422628 10422629 LM5578_1580 LM5578_1581   sod FALSE 0.158 130.000 0.169 1.000 N NA
 10422630 10422631 LM5578_1582 LM5578_1583   ispG FALSE 0.174 113.000 0.008 NA   NA
 10422631 10422632 LM5578_1583 LM5578_1584 ispG   FALSE 0.387 36.000 0.007 NA N NA
 10422632 10422633 LM5578_1584 LM5578_1585     TRUE 0.961 -9.000 0.338 NA   NA
 10422634 10422635 LM5578_1586 LM5578_1587   zurR FALSE 0.133 137.000 0.102 1.000 N NA
 10422635 10422636 LM5578_1587 LM5578_1588 zurR zurM TRUE 0.993 -19.000 0.480 1.000 Y NA
 10422636 10422637 LM5578_1588 LM5578_1589 zurM zurA TRUE 0.989 -25.000 0.037 1.000 Y NA
 10422637 10422638 LM5578_1589 LM5578_1590 zurA   FALSE 0.086 143.000 0.000 1.000 N NA
 10422638 10422639 LM5578_1590 LM5578_1591     TRUE 0.754 16.000 0.019 1.000 N NA
 10422639 10422640 LM5578_1591 LM5578_1592     TRUE 0.972 15.000 0.104 1.000 Y NA
 10422642 10422643 LM5578_1594 LM5578_1595     TRUE 0.925 -3.000 0.000 NA   NA
 10422643 10422644 LM5578_1595 LM5578_1596   rpoD TRUE 0.410 68.000 0.239 NA   NA
 10422644 10422645 LM5578_1596 LM5578_1597 rpoD dnaG FALSE 0.205 95.000 0.209 1.000 N NA
 10422645 10422646 LM5578_1597 LM5578_1598 dnaG   TRUE 0.773 20.000 0.033 NA   NA
 10422646 10422647 LM5578_1598 LM5578_1599     FALSE 0.075 190.000 0.029 NA   NA
 10422647 10422648 LM5578_1599 LM5578_1600   glyS TRUE 0.577 34.000 0.013 NA   NA
 10422648 10422649 LM5578_1600 LM5578_1601 glyS glyQ TRUE 0.998 -7.000 0.651 0.001 Y NA
 10422649 10422650 LM5578_1601 LM5578_1602 glyQ recO FALSE 0.019 282.000 0.036 1.000 N NA
 10422652 10422653 LM5578_1604 LM5578_1605 era   TRUE 0.948 -3.000 0.019 1.000   NA
 10422653 10422654 LM5578_1605 LM5578_1606     TRUE 0.655 25.000 0.090 1.000 N NA
 10422654 10422655 LM5578_1606 LM5578_1607     TRUE 0.944 -22.000 0.123 NA   NA
 10422655 10422656 LM5578_1607 LM5578_1608     TRUE 0.840 17.000 0.182 NA   NA
 10422656 10422657 LM5578_1608 LM5578_1609     TRUE 0.873 16.000 0.172 1.000   NA
 10422657 10422658 LM5578_1609 LM5578_1610     FALSE 0.093 188.000 0.027 1.000   NA
 10422658 10422659 LM5578_1610 LM5578_1611   rpsU TRUE 0.972 11.000 0.150 0.025   NA
 10422659 10422660 LM5578_1611 LM5578_1612 rpsU   FALSE 0.063 198.000 0.019 NA   NA
 10422660 10422661 LM5578_1612 LM5578_1613   prmA TRUE 0.945 1.000 0.227 NA   NA
 10422661 10422662 LM5578_1613 LM5578_1614 prmA dnaJ FALSE 0.269 73.000 0.133 1.000 N NA
 10422662 10422663 LM5578_1614 LM5578_1615 dnaJ dnaK TRUE 0.825 142.000 0.196 0.002 Y NA
 10422663 10422664 LM5578_1615 LM5578_1616 dnaK grpE TRUE 0.974 34.000 0.224 0.005 Y NA
 10422664 10422665 LM5578_1616 LM5578_1617 grpE hrcA TRUE 0.565 42.000 0.286 1.000 N NA
 10422665 10422666 LM5578_1617 LM5578_1618 hrcA hemN FALSE 0.114 147.000 0.082 1.000 N NA
 10422666 10422667 LM5578_1618 LM5578_1619 hemN   FALSE 0.133 89.000 0.000 1.000 N NA
 10422671 10422672 LM5578_1623 LM5578_1624 holA comEC TRUE 0.431 68.000 0.163 1.000   NA
 10422672 10422673 LM5578_1624 LM5578_1625 comEC comEB TRUE 0.647 35.000 0.055 1.000   NA
 10422673 10422674 LM5578_1625 LM5578_1626 comEB comEA FALSE 0.262 72.000 0.095 1.000 N NA
 10422674 10422675 LM5578_1626 LM5578_1627 comEA   FALSE 0.217 103.000 0.033 1.000   NA
 10422675 10422676 LM5578_1627 LM5578_1628     TRUE 0.464 55.000 0.085 NA   NA
 10422676 10422677 LM5578_1628 LM5578_1629     TRUE 0.915 5.000 0.149 NA   NA
 10422677 10422678 LM5578_1629 LM5578_1630     TRUE 0.992 -13.000 0.199 1.000 Y NA
 10422678 10422679 LM5578_1630 LM5578_1631     TRUE 0.730 18.000 0.150 NA N NA
 10422679 10422680 LM5578_1631 LM5578_1632     TRUE 0.893 0.000 0.089 NA N NA
 10422680 10422681 LM5578_1632 LM5578_1633     TRUE 0.870 20.000 0.336 1.000   NA
 10422681 10422682 LM5578_1633 LM5578_1634     TRUE 0.973 -3.000 0.555 1.000   NA
 10422683 10422684 LM5578_1635 LM5578_1636     FALSE 0.158 100.000 0.000 NA   NA
 10422684 10422685 LM5578_1636 LM5578_1637     FALSE 0.050 203.000 0.000 NA   NA
 10422686 10422687 LM5578_1638 LM5578_1639     TRUE 0.470 50.000 0.041 NA   NA
 10422687 10422688 LM5578_1639 LM5578_1640     TRUE 0.521 45.000 0.065 NA   NA
 10422690 10422691 LM5578_1642 LM5578_1643 udk   TRUE 0.950 -3.000 0.039 1.000   NA
 10422691 10422692 LM5578_1643 LM5578_1644     FALSE 0.308 77.000 0.154 NA   NA
 10422694 10422695 LM5578_1646 LM5578_1647     TRUE 0.908 16.000 0.651 NA   NA
 10422695 10422696 LM5578_1647 LM5578_1648     TRUE 0.943 6.000 0.537 NA   NA
 10422696 10422697 LM5578_1648 LM5578_1649   alaS FALSE 0.230 92.000 0.110 NA   NA
 10422697 10422698 LM5578_1649 LM5578_1650 alaS   FALSE 0.006 448.000 0.000 1.000 N NA
 10422698 10422699 LM5578_1650 LM5578_1651     TRUE 0.988 9.000 0.565 1.000 Y NA
 10422700 10422701 LM5578_1652 LM5578_1653     TRUE 0.994 -3.000 0.586 1.000 Y NA
 10422702 10422703 LM5578_1654 LM5578_1655     TRUE 0.643 28.000 0.174 1.000 N NA
 10422703 10422704 LM5578_1655 LM5578_1656     TRUE 0.846 11.000 0.000 NA   NA
 10422704 10422705 LM5578_1656 LM5578_1657     FALSE 0.156 118.000 0.000 NA   NA
 10422705 10422706 LM5578_1657 LM5578_1658     TRUE 0.744 19.000 0.072 1.000 N NA
 10422706 10422707 LM5578_1658 LM5578_1659     FALSE 0.008 380.000 0.000 1.000 N NA
 10422708 10422709 LM5578_1660 LM5578_1661     FALSE 0.016 245.000 0.000 NA N NA
 10422709 10422710 LM5578_1661 LM5578_1662     TRUE 0.848 14.000 0.259 1.000 N NA
 10422710 10422711 LM5578_1662 LM5578_1663     FALSE 0.204 150.000 0.407 NA   NA
 10422712 10422713 LM5578_1664 LM5578_1665 aspS hisS TRUE 0.995 3.000 0.161 0.042 Y NA
 10422715 10422716 LM5578_1667 LM5578_1668   relA TRUE 0.812 16.000 0.177 1.000 N NA
 10422716 10422717 LM5578_1668 LM5578_1669 relA apt FALSE 0.046 206.000 0.068 1.000 N NA
 10422717 10422718 LM5578_1669 LM5578_1670 apt   TRUE 0.931 -10.000 0.128 1.000 N NA
 10422718 10422719 LM5578_1670 LM5578_1671     TRUE 0.747 22.000 0.026 NA   NA
 10422719 10422720 LM5578_1671 LM5578_1672     FALSE 0.201 96.000 0.048 NA   NA
 10422720 10422721 LM5578_1672 LM5578_1673     FALSE 0.229 101.000 0.185 NA   NA
 10422721 10422722 LM5578_1673 LM5578_1674     FALSE 0.132 143.000 0.013 NA   NA
 10422722 10422723 LM5578_1674 LM5578_1675   tgt TRUE 0.590 34.000 0.325 NA N NA
 10422723 10422724 LM5578_1675 LM5578_1676 tgt   TRUE 0.907 87.000 0.360 0.001 Y NA
 10422724 10422725 LM5578_1676 LM5578_1677   ruvB TRUE 0.885 4.000 0.069 1.000 N NA
 10422725 10422726 LM5578_1677 LM5578_1678 ruvB ruvA TRUE 0.994 16.000 0.549 0.002 Y NA
 10422726 10422727 LM5578_1678 LM5578_1679 ruvA   FALSE 0.121 124.000 0.010 1.000 N NA
 10422727 10422728 LM5578_1679 LM5578_1680     FALSE 0.294 70.000 0.012 NA   NA
 10422728 10422729 LM5578_1680 LM5578_1681     FALSE 0.177 111.000 0.016 NA   NA
 10422729 10422730 LM5578_1681 LM5578_1682   obgE TRUE 0.536 46.000 0.012 1.000   NA
 10422730 10422731 LM5578_1682 LM5578_1683 obgE glpK FALSE 0.127 160.000 0.010 1.000   NA
 10422731 10422732 LM5578_1683 LM5578_1684 glpK   FALSE 0.259 75.000 0.131 1.000 N NA
 10422732 10422733 LM5578_1684 LM5578_1685   rpmA FALSE 0.008 367.000 0.000 1.000 N NA
 10422733 10422734 LM5578_1685 LM5578_1686 rpmA   TRUE 0.972 14.000 0.203 NA Y NA
 10422734 10422735 LM5578_1686 LM5578_1687   rplU TRUE 0.962 19.000 0.208 NA Y NA
 10422735 10422736 LM5578_1687 LM5578_1688 rplU   TRUE 0.705 157.000 0.011 0.020 Y NA
 10422736 10422737 LM5578_1688 LM5578_1689   minD TRUE 0.396 52.000 0.060 1.000 N NA
 10422737 10422738 LM5578_1689 LM5578_1690 minD minC TRUE 0.990 3.000 0.368 1.000 Y NA
 10422738 10422739 LM5578_1690 LM5578_1691 minC mreD FALSE 0.077 178.000 0.106 1.000 N NA
 10422739 10422740 LM5578_1691 LM5578_1692 mreD mreC TRUE 0.997 3.000 0.550 0.003 Y NA
 10422740 10422741 LM5578_1692 LM5578_1693 mreC mreB FALSE 0.344 86.000 0.689 1.000 N NA
 10422741 10422742 LM5578_1693 LM5578_1694 mreB radC FALSE 0.006 452.000 0.000 1.000 N NA
 10422742 10422743 LM5578_1694 LM5578_1695 radC comC TRUE 0.811 12.000 0.019 1.000 N NA
 10422743 10422744 LM5578_1695 LM5578_1696 comC   FALSE 0.232 80.000 0.008 NA   NA
 10422744 10422745 LM5578_1696 LM5578_1697   folC TRUE 0.717 25.000 0.091 NA   NA
 10422745 10422746 LM5578_1697 LM5578_1698 folC valS FALSE 0.316 62.000 0.041 1.000 N NA
 10422746 10422747 LM5578_1698 LM5578_1699 valS hemL FALSE 0.011 323.000 0.000 1.000 N NA
 10422747 10422748 LM5578_1699 LM5578_1700 hemL hemB TRUE 0.993 13.000 0.126 0.002 Y NA
 10422748 10422749 LM5578_1700 LM5578_1701 hemB hemD TRUE 0.997 -3.000 0.042 0.002 Y NA
 10422749 10422750 LM5578_1701 LM5578_1702 hemD hemC TRUE 0.997 -3.000 0.020 0.002 Y NA
 10422750 10422751 LM5578_1702 LM5578_1703 hemC hemA TRUE 0.996 4.000 0.016 0.002 Y NA
 10422751 10422752 LM5578_1703 LM5578_1704 hemA   FALSE 0.194 128.000 0.020 1.000   NA
 10422752 10422753 LM5578_1704 LM5578_1705   thrS FALSE 0.207 108.000 0.010 1.000   NA
 10422753 10422754 LM5578_1705 LM5578_1706 thrS dnaI FALSE 0.009 350.000 0.000 1.000 N NA
 10422754 10422755 LM5578_1706 LM5578_1707 dnaI dnaB TRUE 0.988 10.000 0.817 NA Y NA
 10422755 10422756 LM5578_1707 LM5578_1708 dnaB   TRUE 0.847 6.000 0.109 NA N NA
 10422756 10422757 LM5578_1708 LM5578_1709     FALSE 0.152 78.000 0.024 NA N NA
 10422757 10422758 LM5578_1709 LM5578_1710   mutM TRUE 0.915 -40.000 0.066 1.000 N NA
 10422758 10422759 LM5578_1710 LM5578_1711 mutM polA TRUE 0.947 24.000 0.101 1.000 Y NA
 10422759 10422760 LM5578_1711 LM5578_1712 polA citC FALSE 0.070 166.000 0.008 1.000 N NA
 10422760 10422761 LM5578_1712 LM5578_1713 citC citZ TRUE 0.963 20.000 0.140 1.000 Y NA
 10422761 10422762 LM5578_1713 LM5578_1714 citZ   TRUE 0.576 36.000 0.039 NA   NA
 10422762 10422763 LM5578_1714 LM5578_1715   fxsA FALSE 0.118 157.000 0.043 NA   NA
 10422763 10422764 LM5578_1715 LM5578_1716 fxsA pykA FALSE 0.237 118.000 0.082 1.000   NA
 10422764 10422765 LM5578_1716 LM5578_1717 pykA pfkA TRUE 0.410 283.000 0.261 0.005 Y NA
 10422765 10422766 LM5578_1717 LM5578_1718 pfkA accA FALSE 0.019 284.000 0.047 1.000 N NA
 10422766 10422767 LM5578_1718 LM5578_1719 accA accD TRUE 0.998 -10.000 0.234 0.001 Y NA
 10422767 10422768 LM5578_1719 LM5578_1720 accD dnaE FALSE 0.341 122.000 0.003 0.048 N NA
 10422768 10422769 LM5578_1720 LM5578_1721 dnaE   FALSE 0.245 122.000 0.159 1.000   NA
 10422769 10422770 LM5578_1721 LM5578_1722     TRUE 0.858 18.000 0.189 1.000   NA
 10422770 10422771 LM5578_1722 LM5578_1723     TRUE 0.891 11.000 0.024 1.000   NA
 10422775 10422776 LM5578_1727 LM5578_1728 ackA   TRUE 0.933 0.000 0.217 1.000 N NA
 10422778 10422779 LM5578_1730 LM5578_1731     FALSE 0.385 62.000 0.040 NA   NA
 10422779 10422780 LM5578_1731 LM5578_1732     TRUE 0.794 20.000 0.087 NA   NA
 10422782 10422783 LM5578_1734 LM5578_1735 argF argD TRUE 0.990 -3.000 0.037 1.000 Y NA
 10422783 10422784 LM5578_1735 LM5578_1736 argD argB TRUE 0.993 -3.000 0.322 1.000 Y NA
 10422784 10422785 LM5578_1736 LM5578_1737 argB argJ TRUE 0.993 13.000 0.067 0.002 Y NA
 10422785 10422786 LM5578_1737 LM5578_1738 argJ argC TRUE 0.993 16.000 0.303 0.002 Y NA
 10422786 10422787 LM5578_1738 LM5578_1739 argC   FALSE 0.206 174.000 0.013 0.042 N NA
 10422787 10422788 LM5578_1739 LM5578_1740     TRUE 0.937 2.000 0.349 1.000 N NA
 10422788 10422789 LM5578_1740 LM5578_1741     FALSE 0.172 127.000 0.201 1.000 N NA
 10422790 10422791 LM5578_1742 LM5578_1743   rpsD FALSE 0.025 212.000 0.005 NA N NA
 10422792 10422793 LM5578_1744 LM5578_1745   tyrS FALSE 0.022 280.000 0.000 NA   NA
 10422793 10422794 LM5578_1745 LM5578_1746 tyrS ccpA FALSE 0.013 292.000 0.000 1.000 N NA
 10422794 10422795 LM5578_1746 LM5578_1747 ccpA   FALSE 0.029 235.000 0.017 1.000 N NA
 10422795 10422796 LM5578_1747 LM5578_1748     FALSE 0.039 221.000 0.000 NA   NA
 10422796 10422797 LM5578_1748 LM5578_1749     TRUE 0.795 22.000 0.175 NA   NA
 10422799 10422800 LM5578_1751 LM5578_1752   murC FALSE 0.095 145.000 0.010 1.000 N NA
 10422800 10422801 LM5578_1752 LM5578_1753 murC   FALSE 0.086 295.000 0.017 0.004 N NA
 10422801 10422802 LM5578_1753 LM5578_1754     FALSE 0.030 310.000 0.143 1.000   NA
 10422802 10422803 LM5578_1754 LM5578_1755     TRUE 0.942 6.000 0.511 NA   NA
 10422803 10422804 LM5578_1755 LM5578_1756     TRUE 0.731 35.000 0.500 NA   NA
 10422804 10422805 LM5578_1756 LM5578_1757     FALSE 0.218 112.000 0.140 NA   NA
 10422805 10422806 LM5578_1757 LM5578_1758     TRUE 0.951 -25.000 0.224 NA   NA
 10422808 10422809 LM5578_1760 LM5578_1761     FALSE 0.199 110.000 0.074 NA   NA
 10422809 10422810 LM5578_1761 LM5578_1762   trmB TRUE 0.486 61.000 0.117 1.000   NA
 10422810 10422811 LM5578_1762 LM5578_1763 trmB   TRUE 0.907 7.000 0.154 NA   NA
 10422811 10422812 LM5578_1763 LM5578_1764     FALSE 0.022 209.000 0.000 NA N NA
 10422812 10422813 LM5578_1764 LM5578_1765     TRUE 0.947 -3.000 0.297 1.000 N NA
 10422813 10422814 LM5578_1765 LM5578_1766   daaA FALSE 0.027 225.000 0.000 1.000 N NA
 10422814 10422815 LM5578_1766 LM5578_1767 daaA   TRUE 0.678 113.000 0.347 1.000 Y NA
 10422815 10422816 LM5578_1767 LM5578_1768     FALSE 0.292 75.000 0.224 1.000 N NA
 10422818 10422819 LM5578_1770 LM5578_1771     TRUE 0.956 10.000 0.833 1.000   NA
 10422819 10422820 LM5578_1771 LM5578_1772     TRUE 0.763 111.000 0.900 0.001   NA
 10422820 10422821 LM5578_1772 LM5578_1773     TRUE 0.412 85.000 0.750 NA   NA
 10422821 10422822 LM5578_1773 LM5578_1774   trpA FALSE 0.294 71.000 0.024 NA   NA
 10422822 10422823 LM5578_1774 LM5578_1775 trpA trpB TRUE 0.998 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 10422823 10422824 LM5578_1775 LM5578_1776 trpB trpF TRUE 0.997 3.000 0.375 0.001 Y NA
 10422824 10422825 LM5578_1776 LM5578_1777 trpF trpC TRUE 0.998 -3.000 0.264 0.001 Y NA
 10422825 10422826 LM5578_1777 LM5578_1778 trpC trpD TRUE 0.992 -3.000 0.216 1.000 Y NA
 10422826 10422827 LM5578_1778 LM5578_1779 trpD trpG TRUE 0.989 -28.000 0.018 1.000 Y NA
 10422827 10422828 LM5578_1779 LM5578_1780 trpG trpE TRUE 0.998 -3.000 0.321 0.001 Y NA
 10422829 10422830 LM5578_1781 LM5578_1782     FALSE 0.337 123.000 0.750 NA   NA
 10422830 10422831 LM5578_1782 LM5578_1783     FALSE 0.392 84.000 0.625 NA   NA
 10422831 10422832 LM5578_1783 LM5578_1784     TRUE 0.969 -3.000 0.579 NA   NA
 10422833 10422834 LM5578_1785 LM5578_1786     TRUE 0.884 -3.000 0.019 NA N NA
 10422834 10422835 LM5578_1786 LM5578_1787     TRUE 0.838 13.000 0.017 NA   NA
 10422835 10422836 LM5578_1787 LM5578_1788   citB FALSE 0.177 101.000 0.015 NA   NA
 10422836 10422837 LM5578_1788 LM5578_1789 citB   TRUE 0.751 8.000 0.000 NA N NA
 10422837 10422838 LM5578_1789 LM5578_1790     TRUE 0.470 43.000 0.000 NA   NA
 10422838 10422839 LM5578_1790 LM5578_1791     TRUE 0.941 0.000 0.132 NA   NA
 10422839 10422840 LM5578_1791 LM5578_1792     TRUE 0.629 84.000 0.023 NA Y NA
 10422840 10422841 LM5578_1792 LM5578_1793     TRUE 0.994 -3.000 0.669 NA Y NA
 10422843 10422844 LM5578_1795 LM5578_1796     FALSE 0.033 237.000 0.000 NA   NA
 10422844 10422845 LM5578_1796 LM5578_1797     FALSE 0.166 180.000 0.600 NA   NA
 10422845 10422846 LM5578_1797 LM5578_1798     FALSE 0.166 81.000 0.083 NA N NA
 10422846 10422847 LM5578_1798 LM5578_1799     TRUE 0.998 -16.000 0.911 0.008 Y NA
 10422847 10422848 LM5578_1799 LM5578_1800     FALSE 0.014 337.000 0.000 NA   NA
 10422848 10422849 LM5578_1800 LM5578_1801     TRUE 0.914 15.000 0.667 NA   NA
 10422849 10422850 LM5578_1801 LM5578_1802     FALSE 0.006 794.000 0.000 NA   NA
 10422850 10422851 LM5578_1802 LM5578_1803     TRUE 0.853 18.000 0.308 NA   NA
 10422851 10422852 LM5578_1803 LM5578_1804   tsf FALSE 0.007 574.000 0.000 NA   NA
 10422852 10422853 LM5578_1804 LM5578_1805 tsf rpsB TRUE 0.801 80.000 0.748 1.000 Y NA
 10422853 10422854 LM5578_1805 LM5578_1806 rpsB   FALSE 0.008 488.000 0.000 NA   NA
 10422854 10422855 LM5578_1806 LM5578_1807   leuS FALSE 0.120 141.000 0.000 NA   NA
 10422856 10422857 LM5578_1808 LM5578_1809     TRUE 0.970 -3.000 0.408 1.000   NA
 10422858 10422859 LM5578_1810 LM5578_1811 ansB metK FALSE 0.135 137.000 0.108 1.000 N NA
 10422861 10422862 LM5578_1813 LM5578_1814     FALSE 0.190 103.000 0.000 1.000   NA
 10422862 10422863 LM5578_1814 LM5578_1815     TRUE 0.767 17.000 0.000 NA   NA
 10422863 10422864 LM5578_1815 LM5578_1816     TRUE 0.510 57.000 0.250 NA   NA
 10422865 10422866 LM5578_1817 LM5578_1818     FALSE 0.117 150.000 0.007 NA   NA
 10422867 10422868 LM5578_1819 LM5578_1820 menE menB TRUE 0.965 16.000 0.193 0.001 N NA
 10422868 10422869 LM5578_1820 LM5578_1821 menB   TRUE 0.965 -3.000 0.280 1.000   NA
 10422869 10422870 LM5578_1821 LM5578_1822   menD TRUE 0.958 2.000 0.355 1.000   NA
 10422870 10422871 LM5578_1822 LM5578_1823 menD menF TRUE 0.991 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 10422873 10422874 LM5578_1825 LM5578_1826     TRUE 0.992 -3.000 0.162 1.000 Y NA
 10422874 10422875 LM5578_1826 LM5578_1827     TRUE 0.998 -7.000 0.600 0.004 Y NA
 10422875 10422876 LM5578_1827 LM5578_1828     TRUE 0.952 22.000 0.017 1.000 Y NA
 10422876 10422877 LM5578_1828 LM5578_1829     FALSE 0.010 290.000 0.000 NA N NA
 10422877 10422878 LM5578_1829 LM5578_tRNA11     FALSE 0.299 67.000 0.000 NA   NA
 10422878 10422879 LM5578_tRNA11 LM5578_tRNA12     TRUE 0.872 6.000 0.000 NA   NA
 10422879 10422880 LM5578_tRNA12 LM5578_tRNA13     TRUE 0.535 35.000 0.000 NA   NA
 10422880 10422881 LM5578_tRNA13 LM5578_tRNA14     TRUE 0.865 7.000 0.000 NA   NA
 10422881 10422882 LM5578_tRNA14 LM5578_tRNA15     TRUE 0.631 26.000 0.000 NA   NA
 10422882 10422883 LM5578_tRNA15 LM5578_tRNA16     TRUE 0.669 24.000 0.000 NA   NA
 10422883 10422884 LM5578_tRNA16 LM5578_tRNA17     TRUE 0.590 29.000 0.000 NA   NA
 10422884 10422885 LM5578_tRNA17 LM5578_tRNA18     TRUE 0.878 5.000 0.000 NA   NA
 10422885 10422886 LM5578_tRNA18 LM5578_tRNA19     TRUE 0.878 5.000 0.000 NA   NA
 10422886 10422887 LM5578_tRNA19 LM5578_tRNA20     TRUE 0.470 43.000 0.000 NA   NA
 10422887 10422888 LM5578_tRNA20 LM5578_tRNA21     TRUE 0.689 23.000 0.000 NA   NA
 10422888 10422889 LM5578_tRNA21 LM5578_tRNA22     TRUE 0.835 12.000 0.000 NA   NA
 10422889 10422890 LM5578_tRNA22 LM5578_tRNA23     TRUE 0.470 43.000 0.000 NA   NA
 10422890 10422891 LM5578_tRNA23 LM5578_tRNA24     TRUE 0.689 23.000 0.000 NA   NA
 10422891 10422892 LM5578_tRNA24 LM5578_tRNA25     TRUE 0.846 11.000 0.000 NA   NA
 10422892 10422893 LM5578_tRNA25 LM5578_tRNA26     TRUE 0.853 10.000 0.000 NA   NA
 10422893 10422894 LM5578_tRNA26 LM5578_tRNA27     TRUE 0.794 15.000 0.000 NA   NA
 10422894 10422895 LM5578_tRNA27 LM5578_tRNA28     TRUE 0.783 16.000 0.000 NA   NA
 10422895 10422896 LM5578_tRNA28 LM5578_tRNA29     TRUE 0.872 6.000 0.000 NA   NA
 10422896 10422897 LM5578_tRNA29 LM5578_tRNA30     TRUE 0.480 42.000 0.000 NA   NA
 10422897 10422898 LM5578_tRNA30 LM5578_tRNA31     TRUE 0.858 9.000 0.000 NA   NA
 10422898 10422899 LM5578_tRNA31 LM5578_rRNA04     TRUE 0.803 14.000 0.000 NA   NA
 10422899 10422900 LM5578_rRNA04 LM5578_rRNA05     FALSE 0.202 82.000 0.000 NA   NA
 10422900 10422901 LM5578_rRNA05 LM5578_rRNA06     FALSE 0.031 246.000 0.000 NA   NA
 10422901 10422902 LM5578_rRNA06 LM5578_1830     FALSE 0.009 442.000 0.000 NA   NA
 10422902 10422903 LM5578_1830 LM5578_1831     FALSE 0.219 83.000 0.146 1.000 N NA
 10422904 10422905 LM5578_1832 LM5578_1833 gsaB   FALSE 0.205 107.000 0.102 NA   NA
 10422906 10422907 LM5578_1834 LM5578_1835     FALSE 0.079 155.000 0.088 NA N NA
 10422907 10422908 LM5578_1835 LM5578_1836     TRUE 0.864 4.000 0.010 1.000 N NA
 10422910 10422911 LM5578_1838 LM5578_1839     TRUE 0.853 12.000 0.013 NA   NA