MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium difficile R20291

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7751907 7751908 CDR20291_3551 CDR20291_3552 rsbW sigB TRUE 0.999 0.000 0.838 1.000 N NA
 7751908 7751909 CDR20291_3552 CDR20291_r27 sigB 16SrRNA TRUE 0.404 86.000 0.000 NA   NA
 7751909 7751910 CDR20291_r27 CDR20291_r18 16SrRNA 23SrRNA FALSE 0.044 253.000 0.000 NA   NA
 7751910 7751911 CDR20291_r18 CDR20291_r19 23SrRNA 5SrRNA TRUE 0.511 62.000 0.000 NA   NA
 7751911 7751912 CDR20291_r19 CDR20291_0001 5SrRNA   FALSE 0.221 127.000 0.000 NA   NA
 7751912 7751913 CDR20291_0001 CDR20291_0002     TRUE 0.884 12.000 0.000 NA   NA
 7751913 7751914 CDR20291_0002 CDR20291_0003   serS1 FALSE 0.009 458.000 0.000 NA N NA
 7751914 7751915 CDR20291_0003 CDR20291_0004 serS1   FALSE 0.111 320.000 0.000 1.000 Y NA
 7751915 10864266 CDR20291_0004 CDR20291_t11     TRUE 0.922 2.000 0.000 NA   NA
 10864266 7751916 CDR20291_t11 CDR20291_0005   dnaH FALSE 0.016 378.000 0.000 NA   NA
 7751916 7751917 CDR20291_0005 CDR20291_0006 dnaH   TRUE 0.935 59.000 0.100 NA   NA
 7751917 7751918 CDR20291_0006 CDR20291_0007   recD TRUE 0.998 13.000 0.604 NA   NA
 7751920 7751921 CDR20291_r01 CDR20291_r02 16SrRNA 23SrRNA TRUE 0.356 97.000 0.000 NA   NA
 7751921 7751922 CDR20291_r02 CDR20291_r03 23SrRNA 5SrRNA FALSE 0.214 129.000 0.000 NA   NA
 7751922 10864267 CDR20291_r03 CDR20291_t22 5SrRNA   TRUE 0.899 8.000 0.000 NA   NA
 10864267 10864268 CDR20291_t22 CDR20291_t44     FALSE 0.295 108.000 0.000 NA   NA
 10864268 10864269 CDR20291_t44 CDR20291_t55     TRUE 0.899 8.000 0.000 NA   NA
 10864269 10864270 CDR20291_t55 CDR20291_t62     TRUE 0.892 10.000 0.000 NA   NA
 10864270 10864271 CDR20291_t62 CDR20291_t63     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   NA
 10864271 10864272 CDR20291_t63 CDR20291_t64     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   NA
 10864272 10864273 CDR20291_t64 CDR20291_t65     TRUE 0.892 10.000 0.000 NA   NA
 10864273 10864274 CDR20291_t65 CDR20291_t01     TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 10864274 10864275 CDR20291_t01 CDR20291_t02     TRUE 0.896 9.000 0.000 NA   NA
 10864275 10864276 CDR20291_t02 CDR20291_t03     TRUE 0.770 30.000 0.000 NA   NA
 10864276 10864277 CDR20291_t03 CDR20291_t04     TRUE 0.899 8.000 0.000 NA   NA
 10864277 10864278 CDR20291_t04 CDR20291_t05     TRUE 0.390 89.000 0.000 NA   NA
 10864278 10864279 CDR20291_t05 CDR20291_t06     TRUE 0.910 4.000 0.000 NA   NA
 10864279 10864280 CDR20291_t06 CDR20291_t07     TRUE 0.902 7.000 0.000 NA   NA
 10864280 10864281 CDR20291_t07 CDR20291_t08     TRUE 0.884 12.000 0.000 NA   NA
 10864281 10864282 CDR20291_t08 CDR20291_t09     TRUE 0.842 24.000 0.000 NA   NA
 10864282 10864283 CDR20291_t09 CDR20291_t10     TRUE 0.899 8.000 0.000 NA   NA
 10864283 10864284 CDR20291_t10 CDR20291_t12     TRUE 0.896 9.000 0.000 NA   NA
 10864284 10864285 CDR20291_t12 CDR20291_t13     TRUE 0.899 8.000 0.000 NA   NA
 10864285 10864286 CDR20291_t13 CDR20291_t14     TRUE 0.902 7.000 0.000 NA   NA
 10864286 10864287 CDR20291_t14 CDR20291_t15     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   NA
 10864287 10864288 CDR20291_t15 CDR20291_t16     TRUE 0.863 16.000 0.000 NA   NA
 10864288 10864289 CDR20291_t16 CDR20291_t17     TRUE 0.899 8.000 0.000 NA   NA
 10864289 10864290 CDR20291_t17 CDR20291_t18     TRUE 0.892 10.000 0.000 NA   NA
 10864290 10864291 CDR20291_t18 CDR20291_t19     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   NA
 10864291 10864292 CDR20291_t19 CDR20291_t20     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   NA
 10864292 10864293 CDR20291_t20 CDR20291_t21     TRUE 0.892 10.000 0.000 NA   NA
 10864293 10864294 CDR20291_t21 CDR20291_t23     TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 10864294 10864295 CDR20291_t23 CDR20291_t24     TRUE 0.892 10.000 0.000 NA   NA
 10864295 10864296 CDR20291_t24 CDR20291_t25     TRUE 0.842 24.000 0.000 NA   NA
 10864296 10864297 CDR20291_t25 CDR20291_t26     TRUE 0.832 25.000 0.000 NA   NA
 10864297 10864298 CDR20291_t26 CDR20291_t27     TRUE 0.892 10.000 0.000 NA   NA
 10864298 10864299 CDR20291_t27 CDR20291_t28     TRUE 0.896 9.000 0.000 NA   NA
 10864299 10864300 CDR20291_t28 CDR20291_t29     TRUE 0.915 3.000 0.000 NA   NA
 10864300 10864301 CDR20291_t29 CDR20291_t30     TRUE 0.910 4.000 0.000 NA   NA
 10864301 10864302 CDR20291_t30 CDR20291_t31     TRUE 0.902 7.000 0.000 NA   NA
 10864302 10864303 CDR20291_t31 CDR20291_t32     TRUE 0.884 12.000 0.000 NA   NA
 10864303 10864304 CDR20291_t32 CDR20291_t34     TRUE 0.863 18.000 0.000 NA   NA
 10864304 10864305 CDR20291_t34 CDR20291_t35     TRUE 0.896 9.000 0.000 NA   NA
 10864305 10864306 CDR20291_t35 CDR20291_t36     TRUE 0.899 8.000 0.000 NA   NA
 10864306 10864307 CDR20291_t36 CDR20291_t37     TRUE 0.899 8.000 0.000 NA   NA
 10864307 10864308 CDR20291_t37 CDR20291_t38     TRUE 0.878 13.000 0.000 NA   NA
 10864308 7751923 CDR20291_t38 CDR20291_0009     TRUE 0.454 75.000 0.000 NA   NA
 7751923 7751924 CDR20291_0009 CDR20291_0010   pyc FALSE 0.026 309.000 0.000 NA   NA
 7751924 7751925 CDR20291_0010 CDR20291_0011 pyc   FALSE 0.049 242.000 0.000 1.000 N NA
 7751925 7751926 CDR20291_0011 CDR20291_0012   ctsR FALSE 0.009 453.000 0.000 NA N NA
 7751926 7751927 CDR20291_0012 CDR20291_0013 ctsR   TRUE 0.999 7.000 0.681 NA   NA
 7751927 7751928 CDR20291_0013 CDR20291_0014     TRUE 0.999 16.000 0.848 1.000   NA
 7751928 7751929 CDR20291_0014 CDR20291_0015   clpC TRUE 0.633 185.000 0.129 1.000 N NA
 7751929 7751930 CDR20291_0015 CDR20291_0016 clpC radA TRUE 0.756 180.000 0.009 0.023 Y NA
 7751930 7751931 CDR20291_0016 CDR20291_0017 radA   TRUE 0.994 3.000 0.126 NA   NA
 7751931 7751932 CDR20291_0017 CDR20291_0018     TRUE 0.886 89.000 0.088 NA   NA
 7751932 7751933 CDR20291_0018 CDR20291_0019     FALSE 0.214 129.000 0.000 NA   NA
 7751935 7751936 CDR20291_0021 CDR20291_0022     TRUE 0.999 22.000 1.000 0.003   NA
 7751936 7751937 CDR20291_0022 CDR20291_0023     TRUE 0.979 97.000 0.333 1.000 Y NA
 7751937 7751938 CDR20291_0023 CDR20291_0024     FALSE 0.012 445.000 0.000 1.000 N NA
 7751938 7751939 CDR20291_0024 CDR20291_0025   acoA TRUE 0.751 32.000 0.000 1.000 N NA
 7751939 7751940 CDR20291_0025 CDR20291_0026 acoA acoB TRUE 0.999 25.000 0.769 0.001 Y NA
 7751940 7751941 CDR20291_0026 CDR20291_0027 acoB acoC TRUE 0.982 13.000 0.000 0.059 Y NA
 7751941 7751942 CDR20291_0027 CDR20291_0028 acoC acoL TRUE 0.433 167.000 0.000 1.000 Y NA
 7751942 7751943 CDR20291_0028 CDR20291_0029 acoL   FALSE 0.013 418.000 0.000 1.000 N NA
 7751943 7751944 CDR20291_0029 CDR20291_0030     TRUE 0.978 -22.000 0.000 0.036 N NA
 7751944 7751945 CDR20291_0030 CDR20291_0031     TRUE 0.749 113.000 0.000 0.031 Y NA
 7751945 7751946 CDR20291_0031 CDR20291_0032     TRUE 0.985 62.000 0.148 0.051 Y NA
 7751946 7751947 CDR20291_0032 CDR20291_0033     TRUE 0.972 35.000 0.111 NA   NA
 7751947 7751948 CDR20291_0033 CDR20291_0034     FALSE 0.122 172.000 0.000 NA   NA
 7751948 7751949 CDR20291_0034 CDR20291_0035     FALSE 0.120 174.000 0.000 1.000 N NA
 7751949 7751950 CDR20291_0035 CDR20291_0036   ispD FALSE 0.050 241.000 0.000 1.000 N NA
 7751950 7751951 CDR20291_0036 CDR20291_0037 ispD ispF TRUE 0.997 -3.000 0.041 1.000 Y NA
 7751951 7751952 CDR20291_0037 CDR20291_0038 ispF proS FALSE 0.080 367.000 0.004 1.000 N NA
 7751952 7751953 CDR20291_0038 CDR20291_0039 proS   TRUE 0.986 35.000 0.006 0.001 Y NA
 7751953 7751954 CDR20291_0039 CDR20291_0040   gltX FALSE 0.057 440.000 0.000 1.000 Y NA
 7751954 7751955 CDR20291_0040 CDR20291_0041 gltX cysS FALSE 0.146 515.000 0.021 1.000 Y NA
 7751955 7751956 CDR20291_0041 CDR20291_0042 cysS   TRUE 0.995 3.000 0.129 1.000   NA
 7751956 7751957 CDR20291_0042 CDR20291_0043     FALSE 0.011 508.000 0.000 1.000   NA
 7751957 7751958 CDR20291_0043 CDR20291_0044     TRUE 0.995 13.000 0.295 1.000 N NA
 7751958 7751959 CDR20291_0044 CDR20291_0045     TRUE 0.807 27.000 0.000 NA   NA
 7751959 7751960 CDR20291_0045 CDR20291_0046     FALSE 0.022 327.000 0.000 NA   NA
 7751960 7751961 CDR20291_0046 CDR20291_0047     FALSE 0.153 166.000 0.000 1.000   NA
 7751961 7751962 CDR20291_0047 CDR20291_0048     TRUE 0.988 4.000 0.032 1.000   NA
 7751962 7751963 CDR20291_0048 CDR20291_0049     TRUE 0.993 3.000 0.109 NA   NA
 7751963 7751964 CDR20291_0049 CDR20291_0050   sigH TRUE 0.979 50.000 0.361 NA   NA
 7751964 7751965 CDR20291_0050 CDR20291_0051 sigH   TRUE 0.862 74.000 0.004 0.063 N NA
 7751965 7751966 CDR20291_0051 CDR20291_0052   rpmG TRUE 0.633 250.000 0.099 1.000 Y NA
 7751966 7751967 CDR20291_0052 CDR20291_0053 rpmG secE TRUE 0.984 26.000 0.100 1.000 N NA
 7751967 7751968 CDR20291_0053 CDR20291_0054 secE nusG TRUE 0.998 20.000 0.843 1.000 N NA
 7751968 7751969 CDR20291_0054 CDR20291_0055 nusG rplK TRUE 0.994 36.000 0.681 1.000 N NA
 7751969 7751970 CDR20291_0055 CDR20291_0056 rplK rplA TRUE 0.997 70.000 0.838 0.021 Y NA
 7751970 7751971 CDR20291_0056 CDR20291_0057 rplA rplJ TRUE 0.886 223.000 0.302 0.021 Y NA
 7751971 7751972 CDR20291_0057 CDR20291_0058 rplJ rplL TRUE 0.998 58.000 0.884 0.015 Y NA
 7751972 7751973 CDR20291_0058 CDR20291_0059 rplL   FALSE 0.014 392.000 0.000 1.000 N NA
 7751973 7751974 CDR20291_0059 CDR20291_0060   rpoB FALSE 0.011 471.000 0.000 1.000 N NA
 7751974 7751975 CDR20291_0060 CDR20291_0061 rpoB rpoC TRUE 0.999 42.000 0.851 0.001 Y NA
 7751975 7751976 CDR20291_0061 CDR20291_0062 rpoC rpsL FALSE 0.196 286.000 0.035 1.000 N NA
 7751976 7751977 CDR20291_0062 CDR20291_0063 rpsL rpsG TRUE 0.968 123.000 0.224 0.003 Y NA
 7751977 7751978 CDR20291_0063 CDR20291_0064 rpsG fusA TRUE 0.995 49.000 0.579 1.000 Y NA
 7751978 7751979 CDR20291_0064 CDR20291_0065 fusA   TRUE 0.991 91.000 0.400 0.002 Y NA
 7751979 7751980 CDR20291_0065 CDR20291_0066   rpsJ TRUE 0.579 373.000 0.318 1.000 Y NA
 7751980 7751981 CDR20291_0066 CDR20291_0067 rpsJ rplC TRUE 0.991 92.000 0.467 0.021 Y NA
 7751981 7751982 CDR20291_0067 CDR20291_0068 rplC rplD TRUE 1.000 0.000 0.544 0.015 Y NA
 7751982 7751983 CDR20291_0068 CDR20291_0069 rplD rplW TRUE 0.999 0.000 0.307 0.015 Y NA
 7751983 7751984 CDR20291_0069 CDR20291_0070 rplW rplB TRUE 0.999 30.000 0.849 0.021 Y NA
 7751984 7751985 CDR20291_0070 CDR20291_0071 rplB rpsS TRUE 0.999 35.000 0.820 0.021 Y NA
 7751985 7751986 CDR20291_0071 CDR20291_0072 rpsS rplV TRUE 0.999 32.000 0.769 0.021 Y NA
 7751986 7751987 CDR20291_0072 CDR20291_0073 rplV rpsC TRUE 0.999 23.000 0.719 0.021 Y NA
 7751987 7751988 CDR20291_0073 CDR20291_0074 rpsC rplP TRUE 0.999 36.000 0.828 0.021 Y NA
 7751988 7751989 CDR20291_0074 CDR20291_0075 rplP rpmC TRUE 1.000 2.000 0.802 0.015 Y NA
 7751989 7751990 CDR20291_0075 CDR20291_0076 rpmC rpsQ TRUE 1.000 24.000 0.828 0.015 Y NA
 7751990 7751991 CDR20291_0076 CDR20291_0077 rpsQ rplN TRUE 0.999 26.000 0.791 0.021 Y NA
 7751991 7751992 CDR20291_0077 CDR20291_0078 rplN rplX TRUE 1.000 21.000 0.810 0.021 Y NA
 7751992 7751993 CDR20291_0078 CDR20291_0079 rplX rplE TRUE 0.999 30.000 0.758 0.015 Y NA
 7751993 7751994 CDR20291_0079 CDR20291_0080 rplE rpsN TRUE 0.999 18.000 0.496 0.015 Y NA
 7751994 7751995 CDR20291_0080 CDR20291_0081 rpsN rpsH TRUE 0.998 33.000 0.473 0.015 Y NA
 7751995 7751996 CDR20291_0081 CDR20291_0082 rpsH rplF TRUE 0.999 31.000 0.808 0.015 Y NA
 7751996 7751997 CDR20291_0082 CDR20291_0083 rplF rplR TRUE 0.999 36.000 0.815 0.015 Y NA
 7751997 7751998 CDR20291_0083 CDR20291_0084 rplR rpsE TRUE 1.000 21.000 0.814 0.021 Y NA
 7751998 7751999 CDR20291_0084 CDR20291_0085 rpsE rpmD TRUE 1.000 15.000 0.789 0.021 Y NA
 7751999 7752000 CDR20291_0085 CDR20291_0086 rpmD rplO TRUE 0.999 33.000 0.653 0.003 Y NA
 7752000 7752001 CDR20291_0086 CDR20291_0087 rplO prlA TRUE 0.992 44.000 0.730 1.000 N NA
 7752001 7752002 CDR20291_0087 CDR20291_0088 prlA adk TRUE 0.997 2.000 0.241 1.000 N NA
 7752002 7752003 CDR20291_0088 CDR20291_0089 adk map1 TRUE 0.997 1.000 0.290 1.000 N NA
 7752003 7752004 CDR20291_0089 CDR20291_0090 map1   TRUE 0.993 13.000 0.185 NA   NA
 7752004 7752005 CDR20291_0090 CDR20291_0091   infA TRUE 0.962 38.000 0.090 NA   NA
 7752005 7752006 CDR20291_0091 CDR20291_0092 infA rpmJ TRUE 0.985 36.000 0.257 1.000   NA
 7752006 7752007 CDR20291_0092 CDR20291_0093 rpmJ rpsM TRUE 0.864 153.000 0.194 0.015   NA
 7752007 7752008 CDR20291_0093 CDR20291_0094 rpsM rpsK TRUE 0.999 36.000 0.810 0.015 Y NA
 7752008 7752009 CDR20291_0094 CDR20291_0095 rpsK rpsD TRUE 0.998 32.000 0.509 0.021 Y NA
 7752009 7752010 CDR20291_0095 CDR20291_0096 rpsD rpoA TRUE 0.977 78.000 0.549 1.000 N NA
 7752010 7752011 CDR20291_0096 CDR20291_0097 rpoA rplQ TRUE 0.999 21.000 0.873 1.000 N NA
 7752011 7752012 CDR20291_0097 CDR20291_0098 rplQ   TRUE 0.778 120.000 0.074 1.000 N NA
 7752012 7752013 CDR20291_0098 CDR20291_0099     TRUE 0.999 33.000 0.713 0.038 Y NA
 7752013 7752014 CDR20291_0099 CDR20291_0100     TRUE 0.981 90.000 0.304 1.000 Y NA
 7752014 7752015 CDR20291_0100 CDR20291_0101   truA1 TRUE 0.992 32.000 0.404 1.000 N NA
 7752015 7752016 CDR20291_0101 CDR20291_0102 truA1   TRUE 0.870 120.000 0.031 1.000 Y NA
 7752016 7752017 CDR20291_0102 CDR20291_0103   rpsI TRUE 0.988 118.000 0.601 0.015 Y NA
 7752017 7752018 CDR20291_0103 CDR20291_0104 rpsI cwlD FALSE 0.058 459.000 0.011 1.000 N NA
 7752018 7752019 CDR20291_0104 CDR20291_r04 cwlD 16SrRNA FALSE 0.096 187.000 0.000 NA   NA
 7752019 10864309 CDR20291_r04 CDR20291_t39 16SrRNA   TRUE 0.819 26.000 0.000 NA   NA
 10864309 7752020 CDR20291_t39 CDR20291_r05   23SrRNA FALSE 0.045 250.000 0.000 NA   NA
 7752020 10864310 CDR20291_r05 CDR20291_t40 23SrRNA   FALSE 0.009 519.000 0.000 NA   NA
 10864310 7752021 CDR20291_t40 CDR20291_r06   16SrRNA TRUE 0.863 18.000 0.000 NA   NA
 7752021 7752022 CDR20291_r06 CDR20291_r07 16SrRNA 23SrRNA FALSE 0.007 610.000 0.000 NA   NA
 7752022 7752023 CDR20291_r07 CDR20291_r08 23SrRNA 5SrRNA TRUE 0.463 73.000 0.000 NA   NA
 7752025 7752026 CDR20291_0106 CDR20291_0107 nrdD nrdG TRUE 0.995 22.000 0.315 1.000 N NA
 7752026 10864311 CDR20291_0107 CDR20291_t41 nrdG   FALSE 0.004 1375.000 0.000 NA   NA
 10864311 7752027 CDR20291_t41 CDR20291_r20   23SrRNA FALSE 0.016 374.000 0.000 NA   NA
 7752027 7752028 CDR20291_r20 CDR20291_r21 23SrRNA 5SrRNA TRUE 0.463 73.000 0.000 NA   NA
 7752028 10864312 CDR20291_r21 CDR20291_t42 5SrRNA   TRUE 0.896 9.000 0.000 NA   NA
 10864312 10864313 CDR20291_t42 CDR20291_t45     FALSE 0.300 107.000 0.000 NA   NA
 10864313 10864314 CDR20291_t45 CDR20291_t46     TRUE 0.899 8.000 0.000 NA   NA
 10864314 10864315 CDR20291_t46 CDR20291_t47     TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 10864315 10864316 CDR20291_t47 CDR20291_t48     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   NA
 10864316 10864317 CDR20291_t48 CDR20291_t49     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   NA
 10864317 10864318 CDR20291_t49 CDR20291_t50     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 10864318 10864319 CDR20291_t50 CDR20291_t51     TRUE 0.892 10.000 0.000 NA   NA
 10864319 7752029 CDR20291_t51 CDR20291_0108     FALSE 0.005 975.000 0.000 NA   NA
 7752029 7752030 CDR20291_0108 CDR20291_0109     TRUE 0.981 66.000 0.502 NA   NA
 7752030 7752031 CDR20291_0109 CDR20291_0110     TRUE 0.938 -3.000 0.000 NA   NA
 7752031 7752032 CDR20291_0110 CDR20291_0111   ptb FALSE 0.120 173.000 0.000 NA   NA
 7752032 7752033 CDR20291_0111 CDR20291_0112 ptb buk TRUE 0.998 22.000 0.275 1.000 Y NA
 7752033 7752034 CDR20291_0112 CDR20291_0113 buk   TRUE 0.952 59.000 0.163 NA   NA
 7752034 7752035 CDR20291_0113 CDR20291_0114     TRUE 0.623 43.000 0.000 NA   NA
 7752035 7752036 CDR20291_0114 CDR20291_0115     TRUE 0.918 29.000 0.000 0.002   NA
 7752036 7752037 CDR20291_0115 CDR20291_0116     TRUE 1.000 0.000 0.822 0.002 Y NA
 7752037 7752038 CDR20291_0116 CDR20291_0117     TRUE 1.000 1.000 0.797 0.002 Y NA
 7752038 7752039 CDR20291_0117 CDR20291_0118     TRUE 0.666 110.000 0.004 1.000 N NA
 7752039 7752040 CDR20291_0118 CDR20291_0119   glmS FALSE 0.219 267.000 0.030 1.000 N NA
 7752040 7752041 CDR20291_0119 CDR20291_0120 glmS   FALSE 0.011 453.000 0.000 1.000 N NA
 7752041 7752042 CDR20291_0120 CDR20291_0121     FALSE 0.010 484.000 0.000 NA   NA
 7752042 7752043 CDR20291_0121 CDR20291_0122   murA TRUE 0.997 3.000 0.346 NA   NA
 7752043 7752044 CDR20291_0122 CDR20291_0123 murA spoIIC TRUE 0.942 87.000 0.243 1.000 N NA
 7752044 7752045 CDR20291_0123 CDR20291_0124 spoIIC   TRUE 0.924 66.000 0.090 1.000 N NA
 7752045 7752046 CDR20291_0124 CDR20291_0125   spoIIID TRUE 0.879 98.000 0.093 1.000   NA
 7752046 7752047 CDR20291_0125 CDR20291_0126 spoIIID mreB1 TRUE 0.729 197.000 0.284 1.000   NA
 7752047 7752048 CDR20291_0126 CDR20291_0127 mreB1 fabZ TRUE 0.980 16.000 0.037 1.000 N NA
 7752050 7752051 CDR20291_0129 CDR20291_0130 metE   FALSE 0.024 316.000 0.000 NA   NA
 7752051 7752052 CDR20291_0130 CDR20291_0131     FALSE 0.039 264.000 0.000 NA   NA
 7752052 7752053 CDR20291_0131 CDR20291_0132     TRUE 0.989 3.000 0.032 1.000   NA
 7752053 7752054 CDR20291_0132 CDR20291_0133     FALSE 0.025 332.000 0.000 1.000   NA
 7752054 7752055 CDR20291_0133 CDR20291_0134     FALSE 0.323 141.000 0.000 0.035 N NA
 7752055 7752056 CDR20291_0134 CDR20291_0135     TRUE 0.975 25.000 0.000 0.030 Y NA
 7752056 7752057 CDR20291_0135 CDR20291_0136     TRUE 0.994 39.000 0.214 0.030 Y NA
 7752057 7752058 CDR20291_0136 CDR20291_0137     TRUE 0.987 11.000 0.048 1.000   NA
 7752058 7752059 CDR20291_0137 CDR20291_0138     TRUE 0.799 96.000 0.021 1.000   NA
 7752059 7752060 CDR20291_0138 CDR20291_0139     TRUE 0.984 48.000 0.137 1.000 Y NA
 7752060 7752061 CDR20291_0139 CDR20291_0140     TRUE 0.917 3.000 0.000 1.000 N NA
 7752061 7752062 CDR20291_0140 CDR20291_0141     FALSE 0.006 553.000 0.000 NA N NA
 7752062 7752063 CDR20291_0141 CDR20291_0142   secA1 TRUE 0.679 132.000 0.050 NA N NA
 7752063 7752064 CDR20291_0142 CDR20291_0143 secA1 prfB TRUE 0.794 106.000 0.048 1.000 N NA
 7752064 7752065 CDR20291_0143 CDR20291_0144 prfB   TRUE 0.557 135.000 0.004 1.000 N NA
 7752065 7752066 CDR20291_0144 CDR20291_0145     TRUE 0.557 148.000 0.018 1.000 N NA
 7752066 7752067 CDR20291_0145 CDR20291_0146     FALSE 0.027 302.000 0.000 NA   NA
 7752067 7752068 CDR20291_0146 CDR20291_0147     FALSE 0.022 329.000 0.000 NA   NA
 7752068 7752069 CDR20291_0147 CDR20291_0148     FALSE 0.191 139.000 0.000 NA   NA
 7752069 7752070 CDR20291_0148 CDR20291_0149     TRUE 0.993 15.000 0.217 NA   NA
 7752070 7752071 CDR20291_0149 CDR20291_0150   rimI TRUE 0.972 38.000 0.127 1.000   NA
 7752071 7752072 CDR20291_0150 CDR20291_0151 rimI gcp TRUE 0.992 6.000 0.090 1.000   NA
 7752072 7752073 CDR20291_0151 CDR20291_0152 gcp hpdB FALSE 0.029 297.000 0.000 1.000 N NA
 7752073 7752074 CDR20291_0152 CDR20291_0153 hpdB hpdC TRUE 0.910 4.000 0.000 NA   NA
 7752074 7752075 CDR20291_0153 CDR20291_0154 hpdC hpdA TRUE 0.957 -37.000 0.000 NA   NA
 7752075 7752076 CDR20291_0154 CDR20291_0155 hpdA   FALSE 0.024 320.000 0.000 NA   NA
 7752078 7752079 CDR20291_0157 CDR20291_0158     FALSE 0.004 1171.000 0.000 NA N NA
 7752079 7752080 CDR20291_0158 CDR20291_0159     FALSE 0.036 273.000 0.000 1.000 N NA
 7752080 7752081 CDR20291_0159 CDR20291_0160     TRUE 0.876 22.000 0.000 1.000   NA
 7752081 7752082 CDR20291_0160 CDR20291_0161     TRUE 0.998 29.000 1.000 NA   NA
 7752082 7752083 CDR20291_0161 CDR20291_0162     TRUE 0.999 16.000 1.000 NA   NA
 7752083 7752084 CDR20291_0162 CDR20291_0163     TRUE 0.564 51.000 0.000 NA   NA
 7752084 7752085 CDR20291_0163 CDR20291_0164     FALSE 0.010 484.000 0.000 NA   NA
 7752086 7752087 CDR20291_0165 CDR20291_0166     TRUE 0.721 37.000 0.000 1.000   NA
 7752087 7752088 CDR20291_0166 CDR20291_0167     FALSE 0.020 369.000 0.000 1.000   NA
 7752090 7752091 CDR20291_0169 CDR20291_0170     TRUE 0.982 16.000 0.038 1.000   NA
 7752092 7752093 CDR20291_0171 CDR20291_0172     FALSE 0.220 139.000 0.000 1.000   NA
 7752095 7752096 CDR20291_0174 CDR20291_0175     FALSE 0.127 170.000 0.000 1.000 N NA
 7752096 7752097 CDR20291_0175 CDR20291_0176     TRUE 0.981 56.000 0.462 NA   NA
 7752097 7752098 CDR20291_0176 CDR20291_0177     TRUE 0.923 98.000 0.222 NA   NA
 7752100 7752101 CDR20291_0179 CDR20291_0180   gluD FALSE 0.214 129.000 0.000 NA   NA
 7752101 7752102 CDR20291_0180 CDR20291_0181 gluD   FALSE 0.087 193.000 0.000 NA   NA
 7752102 7752103 CDR20291_0181 CDR20291_0182     FALSE 0.022 331.000 0.000 NA   NA
 7752103 7752104 CDR20291_0182 CDR20291_0183     FALSE 0.039 264.000 0.000 NA   NA
 7752104 7752105 CDR20291_0183 CDR20291_0184     FALSE 0.014 399.000 0.000 NA   NA
 7752105 7752106 CDR20291_0184 CDR20291_0185   pyrB FALSE 0.024 296.000 0.000 NA N NA
 7752106 7752107 CDR20291_0185 CDR20291_0186 pyrB pyrK TRUE 0.903 39.000 0.003 1.000 N NA
 7752107 7752108 CDR20291_0186 CDR20291_0187 pyrK pyrD TRUE 0.988 47.000 0.592 1.000 N NA
 7752108 7752109 CDR20291_0187 CDR20291_0188 pyrD pyrE TRUE 0.951 85.000 0.060 1.000 Y NA
 7752109 7752110 CDR20291_0188 CDR20291_0189 pyrE   FALSE 0.068 215.000 0.000 1.000 N NA
 7752112 7752113 CDR20291_0191 CDR20291_0192     FALSE 0.029 294.000 0.000 NA   NA
 7752113 7752114 CDR20291_0192 CDR20291_0193   cls TRUE 0.865 18.000 0.000 1.000 N NA
 7752114 7752115 CDR20291_0193 CDR20291_0194 cls groES FALSE 0.088 193.000 0.000 1.000 N NA
 7752115 7752116 CDR20291_0194 CDR20291_0195 groES groEL TRUE 0.998 33.000 0.674 1.000 Y NA
 7752116 7752117 CDR20291_0195 CDR20291_0196 groEL   FALSE 0.047 262.000 0.000 1.000   NA
 7752117 7752118 CDR20291_0196 CDR20291_0197     TRUE 0.416 84.000 0.000 NA   NA
 7752118 7752119 CDR20291_0197 CDR20291_0198   guaA FALSE 0.015 382.000 0.000 NA   NA
 7752119 7752120 CDR20291_0198 CDR20291_0199 guaA   FALSE 0.040 539.000 0.000 1.000 Y NA
 7752122 7752123 CDR20291_0201 CDR20291_0202     TRUE 0.936 126.000 0.069 0.002 Y NA
 7752124 7752125 CDR20291_0203 CDR20291_0204     FALSE 0.026 310.000 0.000 NA   NA
 7752126 7752127 CDR20291_0205 CDR20291_0206     FALSE 0.043 256.000 0.000 1.000 N NA
 7752127 7752128 CDR20291_0206 CDR20291_0207     TRUE 0.999 -3.000 0.538 0.035 N NA
 7752128 7752129 CDR20291_0207 CDR20291_0208     TRUE 1.000 2.000 0.900 0.035 Y NA
 7752129 7752130 CDR20291_0208 CDR20291_0209     TRUE 0.991 67.000 0.320 0.035 Y NA
 7752130 7752131 CDR20291_0209 CDR20291_0210     TRUE 0.357 104.000 0.000 1.000   NA
 7752131 7752132 CDR20291_0210 CDR20291_0211     TRUE 0.437 88.000 0.000 1.000   NA
 7752133 7752134 CDR20291_0212 CDR20291_0213     TRUE 0.999 6.000 0.750 NA   NA
 7752134 7752135 CDR20291_0213 CDR20291_0214     FALSE 0.008 545.000 0.000 NA   NA
 7752136 7752137 CDR20291_0215 CDR20291_0216 purE purC TRUE 0.995 6.000 0.035 1.000 Y NA
 7752137 7752138 CDR20291_0216 CDR20291_0217 purC purF TRUE 0.996 12.000 0.082 1.000 Y NA
 7752138 7752139 CDR20291_0217 CDR20291_0218 purF purG TRUE 0.999 -6.000 0.248 1.000 Y NA
 7752139 7752140 CDR20291_0218 CDR20291_0219 purG purN TRUE 0.999 -6.000 0.238 0.002 Y NA
 7752140 7752141 CDR20291_0219 CDR20291_0220 purN purH TRUE 0.999 -7.000 0.225 1.000 Y NA
 7752141 7752142 CDR20291_0220 CDR20291_0221 purH purD TRUE 0.998 11.000 0.238 1.000 Y NA
 7752142 7752143 CDR20291_0221 CDR20291_0222 purD purL TRUE 0.987 25.000 0.006 1.000 Y NA
 7752143 7752144 CDR20291_0222 CDR20291_0223 purL   FALSE 0.077 206.000 0.000 1.000 N NA
 7752144 7752145 CDR20291_0223 CDR20291_0224     TRUE 0.799 109.000 0.000 0.002 Y NA
 7752145 7752146 CDR20291_0224 CDR20291_0225     TRUE 0.990 37.000 0.139 1.000 Y NA
 7752146 7752147 CDR20291_0225 CDR20291_0226     TRUE 0.981 38.000 0.047 1.000 Y NA
 7752147 7752148 CDR20291_0226 CDR20291_0227     TRUE 0.955 -24.000 0.000 NA   NA
 7752148 7752149 CDR20291_0227 CDR20291_0228     TRUE 0.896 9.000 0.000 NA   NA
 7752149 7752150 CDR20291_0228 CDR20291_0229   fliN TRUE 0.842 24.000 0.000 NA   NA
 7752150 7752151 CDR20291_0229 CDR20291_0230 fliN flgM FALSE 0.184 152.000 0.000 1.000   NA
 7752151 7752152 CDR20291_0230 CDR20291_0231 flgM   TRUE 0.999 5.000 0.421 0.002   NA
 7752152 7752153 CDR20291_0231 CDR20291_0232   flgK TRUE 0.990 18.000 0.038 0.002   NA
 7752153 7752154 CDR20291_0232 CDR20291_0233 flgK flgL TRUE 0.994 19.000 0.093 0.001   NA
 7752154 7752155 CDR20291_0233 CDR20291_0234 flgL   TRUE 0.996 16.000 0.385 NA   NA
 7752155 7752156 CDR20291_0234 CDR20291_0235   csrA TRUE 0.995 -6.000 0.096 NA   NA
 7752156 7752157 CDR20291_0235 CDR20291_0236 csrA fliS1 TRUE 0.975 22.000 0.023 1.000 N NA
 7752157 7752158 CDR20291_0236 CDR20291_0237 fliS1 fliS2 TRUE 0.993 0.000 0.000 0.002 Y NA
 7752158 7752159 CDR20291_0237 CDR20291_0238 fliS2 fliD TRUE 0.999 21.000 0.370 0.002 Y NA
 7752159 7752160 CDR20291_0238 CDR20291_0239 fliD   TRUE 0.985 3.000 0.019 NA   NA
 7752160 7752161 CDR20291_0239 CDR20291_0240   fliC TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 7752161 7752162 CDR20291_0240 CDR20291_0241 fliC   TRUE 0.869 15.000 0.000 1.000 N NA
 7752162 7752163 CDR20291_0241 CDR20291_0242     TRUE 0.864 24.000 0.000 1.000   NA
 7752163 7752164 CDR20291_0242 CDR20291_0243     TRUE 0.944 -7.000 0.000 NA   NA
 7752164 7752165 CDR20291_0243 CDR20291_0244     TRUE 0.986 9.000 0.043 NA   NA
 7752165 7752166 CDR20291_0244 CDR20291_0245     TRUE 0.832 92.000 0.034 1.000   NA
 7752166 7752167 CDR20291_0245 CDR20291_0246     TRUE 0.976 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7752167 7752168 CDR20291_0246 CDR20291_0247     FALSE 0.007 579.000 0.000 1.000 N NA
 7752168 7752169 CDR20291_0247 CDR20291_0248   flgB FALSE 0.006 806.000 0.000 1.000 N NA
 7752169 7752170 CDR20291_0248 CDR20291_0249 flgB flgC TRUE 0.992 26.000 0.010 0.004 Y NA
 7752170 7752171 CDR20291_0249 CDR20291_0250 flgC fliE TRUE 0.998 10.000 0.095 0.004 Y NA
 7752171 7752172 CDR20291_0250 CDR20291_0251 fliE fliF TRUE 0.997 25.000 0.112 0.006 Y NA
 7752172 7752173 CDR20291_0251 CDR20291_0252 fliF fliG TRUE 0.999 13.000 0.477 0.006 Y NA
 7752173 7752174 CDR20291_0252 CDR20291_0253 fliG fliH TRUE 0.999 -19.000 0.308 NA Y NA
 7752174 7752175 CDR20291_0253 CDR20291_0254 fliH fliI TRUE 0.999 4.000 0.379 NA Y NA
 7752175 7752176 CDR20291_0254 CDR20291_0255 fliI fliJ TRUE 0.995 32.000 0.241 1.000 Y NA
 7752176 7752177 CDR20291_0255 CDR20291_0256 fliJ fliK TRUE 0.917 28.000 0.000 0.006   NA
 7752177 7752178 CDR20291_0256 CDR20291_0257 fliK flgD TRUE 0.863 18.000 0.000 NA   NA
 7752178 7752179 CDR20291_0257 CDR20291_0258 flgD flgE TRUE 0.965 27.000 0.023 NA   NA
 7752179 7752180 CDR20291_0258 CDR20291_0259 flgE   TRUE 0.995 13.000 0.077 NA Y NA
 7752180 7752181 CDR20291_0259 CDR20291_0260   motA TRUE 0.999 0.000 0.301 NA Y NA
 7752181 7752182 CDR20291_0260 CDR20291_0261 motA motB TRUE 0.999 -10.000 0.350 1.000 Y NA
 7752182 7752183 CDR20291_0261 CDR20291_0262 motB fliL TRUE 0.998 12.000 0.314 1.000 Y NA
 7752183 7752184 CDR20291_0262 CDR20291_0263 fliL   TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 7752184 7752185 CDR20291_0263 CDR20291_0264   fliP TRUE 0.926 1.000 0.000 NA   NA
 7752185 7752186 CDR20291_0264 CDR20291_0265 fliP fliQ TRUE 0.998 13.000 0.162 0.003 Y NA
 7752186 7752187 CDR20291_0265 CDR20291_0266 fliQ flhB TRUE 0.998 12.000 0.114 0.002 Y NA
 7752187 7752188 CDR20291_0266 CDR20291_0267 flhB flhA TRUE 0.999 9.000 0.207 0.002 Y NA
 7752188 7752189 CDR20291_0267 CDR20291_0268 flhA flhF TRUE 1.000 -22.000 0.440 1.000 Y NA
 7752189 7752190 CDR20291_0268 CDR20291_0269 flhF fleN TRUE 0.998 -3.000 0.382 1.000 N NA
 7752190 7752191 CDR20291_0269 CDR20291_0270 fleN fliA TRUE 0.983 14.000 0.045 1.000 N NA
 7752191 7752192 CDR20291_0270 CDR20291_0271 fliA   TRUE 0.863 16.000 0.000 NA   NA
 7752192 7752193 CDR20291_0271 CDR20291_0272   flgG FALSE 0.071 211.000 0.000 NA   NA
 7752193 7752194 CDR20291_0272 CDR20291_0273 flgG   TRUE 0.997 21.000 0.088 0.004 Y NA
 7752194 7752195 CDR20291_0273 CDR20291_0274   fliM TRUE 0.981 23.000 0.000 0.006 Y NA
 7752195 7752196 CDR20291_0274 CDR20291_0275 fliM fliN TRUE 1.000 3.000 0.508 0.002 Y NA
 7752196 7752197 CDR20291_0275 CDR20291_0276 fliN   TRUE 0.780 32.000 0.000 1.000   NA
 7752197 7752198 CDR20291_0276 CDR20291_0277   htpG FALSE 0.290 116.000 0.000 1.000   NA
 7752198 7752199 CDR20291_0277 CDR20291_0278 htpG dhaT FALSE 0.015 388.000 0.000 1.000 N NA
 7752199 7752200 CDR20291_0278 CDR20291_0279 dhaT spl FALSE 0.057 227.000 0.000 1.000 N NA
 7752200 7752201 CDR20291_0279 CDR20291_0280 spl   FALSE 0.124 182.000 0.000 1.000   NA
 7752201 7752202 CDR20291_0280 CDR20291_0281     TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 7752204 7752205 CDR20291_0283 CDR20291_0284     FALSE 0.013 403.000 0.000 NA   NA
 7752207 7752208 CDR20291_0286 CDR20291_0287     FALSE 0.117 221.000 0.000 0.050 N NA
 7752208 7752209 CDR20291_0287 CDR20291_0288     TRUE 0.999 24.000 0.400 0.038 Y NA
 7752209 7752210 CDR20291_0288 CDR20291_0289     TRUE 0.988 3.000 0.000 0.050 Y NA
 7752210 7752211 CDR20291_0289 CDR20291_0290     TRUE 0.980 18.000 0.000 0.050 Y NA
 7752211 7752212 CDR20291_0290 CDR20291_0291     TRUE 0.970 27.000 0.000 0.050 Y NA
 7752212 7752213 CDR20291_0291 CDR20291_0292     TRUE 0.991 0.000 0.000 0.050 Y NA
 7752213 7752214 CDR20291_0292 CDR20291_0293     TRUE 0.593 47.000 0.000 NA   NA
 7752214 7752215 CDR20291_0293 CDR20291_0294     TRUE 0.500 65.000 0.000 NA   NA
 7752215 7752216 CDR20291_0294 CDR20291_0295     FALSE 0.005 963.000 0.000 1.000 N NA
 7752216 7752217 CDR20291_0295 CDR20291_0296     FALSE 0.080 202.000 0.000 1.000 N NA
 7752217 7752218 CDR20291_0296 CDR20291_0297     TRUE 0.999 -3.000 0.569 NA   NA
 7752218 7752219 CDR20291_0297 CDR20291_0298     FALSE 0.015 383.000 0.000 NA   NA
 7752219 7752220 CDR20291_0298 CDR20291_0299     TRUE 0.478 70.000 0.000 NA   NA
 7752220 7752221 CDR20291_0299 CDR20291_0300     FALSE 0.076 206.000 0.000 NA   NA
 7752221 7752222 CDR20291_0300 CDR20291_0301   rbsR FALSE 0.065 219.000 0.000 1.000 N NA
 7752222 7752223 CDR20291_0301 CDR20291_0302 rbsR rbsK TRUE 0.637 42.000 0.000 1.000 N NA
 7752223 7752224 CDR20291_0302 CDR20291_0303 rbsK rbsB TRUE 0.868 48.000 0.000 NA Y NA
 7752224 7752225 CDR20291_0303 CDR20291_0304 rbsB rbsA TRUE 0.849 54.000 0.000 NA Y NA
 7752225 7752226 CDR20291_0304 CDR20291_0305 rbsA rbsC TRUE 0.990 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 7752226 7752227 CDR20291_0305 CDR20291_0306 rbsC argE FALSE 0.102 184.000 0.000 1.000 N NA
 7752227 7752228 CDR20291_0306 CDR20291_0307 argE   TRUE 0.996 20.000 0.375 NA   NA
 7752228 7752229 CDR20291_0307 CDR20291_0308   abgB1 FALSE 0.120 173.000 0.000 NA   NA
 7752231 7752232 CDR20291_0310 CDR20291_0311     FALSE 0.004 1736.000 0.000 NA   NA
 7752232 7752233 CDR20291_0311 CDR20291_0312     TRUE 0.993 -10.000 0.039 NA   NA
 7752233 7752234 CDR20291_0312 CDR20291_0313     TRUE 0.992 2.000 0.069 NA   NA
 7752238 7752239 CDR20291_0317 CDR20291_0318     TRUE 0.994 23.000 0.286 1.000 N NA
 7752239 7752240 CDR20291_0318 CDR20291_r09   16SrRNA FALSE 0.009 495.000 0.000 NA   NA
 7752240 7752241 CDR20291_r09 CDR20291_r10 16SrRNA 23SrRNA FALSE 0.091 191.000 0.000 NA   NA
 7752241 7752242 CDR20291_r10 CDR20291_r11 23SrRNA 5SrRNA TRUE 0.463 73.000 0.000 NA   NA
 7752242 7752243 CDR20291_r11 CDR20291_0319 5SrRNA   FALSE 0.112 178.000 0.000 NA   NA
 7752243 7752244 CDR20291_0319 CDR20291_0320     TRUE 0.856 22.000 0.000 NA   NA
 7752245 7752246 CDR20291_0321 CDR20291_0322     TRUE 0.991 11.000 0.118 NA   NA
 7752246 7752247 CDR20291_0322 CDR20291_0323     TRUE 0.996 -7.000 0.118 NA   NA
 7752247 7752248 CDR20291_0323 CDR20291_0324     TRUE 0.969 91.000 0.500 1.000 N NA
 7752248 7752249 CDR20291_0324 CDR20291_0325     TRUE 1.000 2.000 0.750 1.000 Y NA
 7752249 7752250 CDR20291_0325 CDR20291_0326     TRUE 0.957 -40.000 0.000 NA   NA
 7752251 7752252 CDR20291_0327 CDR20291_0328     TRUE 0.999 14.000 0.822 NA   NA
 7752252 7752253 CDR20291_0328 CDR20291_0329   cbiM FALSE 0.009 513.000 0.000 NA   NA
 7752253 7752254 CDR20291_0329 CDR20291_0330 cbiM cbiN TRUE 1.000 -10.000 0.861 0.010 Y NA
 7752254 7752255 CDR20291_0330 CDR20291_0331 cbiN cbiQ TRUE 1.000 3.000 0.804 0.001 Y NA
 7752255 7752256 CDR20291_0331 CDR20291_0332 cbiQ cbiO TRUE 0.999 -7.000 0.152 0.002 Y NA
 7752256 7752257 CDR20291_0332 CDR20291_0333 cbiO pcrA FALSE 0.055 231.000 0.000 1.000 N NA
 7752257 7752258 CDR20291_0333 CDR20291_0334 pcrA   TRUE 0.970 17.000 0.005 1.000 N NA
 7752258 7752259 CDR20291_0334 CDR20291_0335     TRUE 0.951 31.000 0.011 1.000   NA
 7752259 7752260 CDR20291_0335 CDR20291_0336   ppiB TRUE 0.902 65.000 0.045 1.000   NA
 7752260 7752261 CDR20291_0336 CDR20291_0337 ppiB   FALSE 0.005 825.000 0.000 NA   NA
 7752264 7752265 CDR20291_0340 CDR20291_0341     TRUE 0.807 27.000 0.000 NA   NA
 7752265 7752266 CDR20291_0341 CDR20291_0342     TRUE 0.901 12.000 0.000 1.000   NA
 7752267 7752268 CDR20291_0343 CDR20291_0344     TRUE 0.967 19.000 0.000 NA Y NA
 7752269 7752270 CDR20291_0345 CDR20291_0346     TRUE 0.832 25.000 0.000 NA   NA
 7752270 7752271 CDR20291_0346 CDR20291_0347     FALSE 0.053 233.000 0.000 NA   NA
 7752272 7752273 CDR20291_0348 CDR20291_0349     TRUE 0.951 -13.000 0.000 NA   NA
 7752273 7752274 CDR20291_0349 CDR20291_0350     TRUE 0.905 51.000 0.025 1.000   NA
 7752274 7752275 CDR20291_0350 CDR20291_0351     TRUE 0.793 110.000 0.050 1.000   NA
 7752275 7752276 CDR20291_0351 CDR20291_0352     TRUE 0.398 87.000 0.000 NA   NA
 7752276 7752277 CDR20291_0352 CDR20291_0353     TRUE 0.725 34.000 0.000 NA   NA
 7752277 7752278 CDR20291_0353 CDR20291_0354     FALSE 0.188 140.000 0.000 NA   NA
 7752278 7752279 CDR20291_0354 CDR20291_0355     TRUE 0.975 28.000 0.062 NA   NA
 7752279 7752280 CDR20291_0355 CDR20291_0356     FALSE 0.055 229.000 0.000 NA   NA
 7752280 7752281 CDR20291_0356 CDR20291_0357     TRUE 0.404 86.000 0.000 NA   NA
 7752281 7752282 CDR20291_0357 CDR20291_0358     TRUE 0.541 55.000 0.000 NA   NA
 7752282 7752283 CDR20291_0358 CDR20291_0359   bglF FALSE 0.096 247.000 0.000 0.098   NA
 7752283 7752284 CDR20291_0359 CDR20291_0360 bglF bglA TRUE 0.998 3.000 0.167 1.000 Y NA
 7752284 7752285 CDR20291_0360 CDR20291_0361 bglA bglG TRUE 0.991 24.000 0.167 1.000   NA
 7752285 7752286 CDR20291_0361 CDR20291_0362 bglG   FALSE 0.009 566.000 0.000 1.000   NA
 7752287 7752288 CDR20291_0363 CDR20291_0364     TRUE 0.976 27.000 0.059 NA   NA
 7752288 7752289 CDR20291_0364 CDR20291_0365   ldhA FALSE 0.017 371.000 0.000 NA   NA
 7752290 7752291 CDR20291_0366 CDR20291_0367 hadA hadI TRUE 0.875 30.000 0.000 0.035 N NA
 7752291 7752292 CDR20291_0367 CDR20291_0368 hadI hadB TRUE 0.878 9.000 0.000 NA N NA
 7752292 7752293 CDR20291_0368 CDR20291_0369 hadB hadC TRUE 1.000 0.000 0.750 NA Y NA
 7752293 7752294 CDR20291_0369 CDR20291_0370 hadC acdB TRUE 0.539 48.000 0.000 NA N NA
 7752294 7752295 CDR20291_0370 CDR20291_0371 acdB etfB1 TRUE 0.997 33.000 0.750 0.048 N NA
 7752295 7752296 CDR20291_0371 CDR20291_0372 etfB1 etfA1 TRUE 1.000 19.000 0.750 0.016 Y NA
 7752296 7752297 CDR20291_0372 CDR20291_0373 etfA1   FALSE 0.010 483.000 0.000 1.000 N NA
 7752299 7752300 CDR20291_0375 CDR20291_0376     TRUE 0.932 0.000 0.000 NA   NA
 7752300 7752301 CDR20291_0376 CDR20291_0377     FALSE 0.005 648.000 0.000 NA N NA
 7752301 7752302 CDR20291_0377 CDR20291_0378     FALSE 0.005 664.000 0.000 NA N NA
 7752302 7752303 CDR20291_0378 CDR20291_0379     FALSE 0.008 523.000 0.000 NA   NA
 7752303 7752304 CDR20291_0379 CDR20291_0380     TRUE 0.398 87.000 0.000 NA   NA
 7752304 7752305 CDR20291_0380 CDR20291_0381     FALSE 0.124 171.000 0.000 NA   NA
 7752306 7752307 CDR20291_0382 CDR20291_0383     TRUE 0.988 -6.000 0.000 1.000 Y NA
 7752308 7752309 CDR20291_0384 CDR20291_0385 rocR   FALSE 0.050 256.000 0.000 1.000   NA
 7752309 7752310 CDR20291_0385 CDR20291_0386     TRUE 0.869 97.000 0.086 NA   NA
 7752310 7752311 CDR20291_0386 CDR20291_0387     TRUE 0.998 -7.000 0.400 NA   NA
 7752311 7752312 CDR20291_0387 CDR20291_0388   oraS TRUE 0.928 78.000 0.143 NA   NA
 7752312 7752313 CDR20291_0388 CDR20291_0389 oraS oraE TRUE 0.999 -6.000 0.867 NA   NA
 7752313 7752314 CDR20291_0389 CDR20291_0390 oraE   TRUE 0.996 0.000 0.143 NA   NA
 7752314 7752315 CDR20291_0390 CDR20291_0391     TRUE 0.952 -15.000 0.000 NA   NA
 7752315 7752316 CDR20291_0391 CDR20291_0392     TRUE 0.737 30.000 0.000 NA N NA
 7752316 7752317 CDR20291_0392 CDR20291_0393     FALSE 0.010 429.000 0.000 NA N NA
 7752317 7752318 CDR20291_0393 CDR20291_0394     FALSE 0.028 298.000 0.000 NA   NA
 7752318 7752319 CDR20291_0394 CDR20291_0395     FALSE 0.007 571.000 0.000 NA   NA
 7752319 7752320 CDR20291_0395 CDR20291_0396     TRUE 0.532 258.000 0.154 0.068   NA
 7752322 7752323 CDR20291_0398 CDR20291_0399     TRUE 0.796 28.000 0.000 NA   NA
 7752323 7752324 CDR20291_0399 CDR20291_0400     FALSE 0.094 344.000 0.000 1.000 Y NA
 7752324 7752325 CDR20291_0400 CDR20291_0401     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 7752326 7752327 CDR20291_0402 CDR20291_0403     TRUE 0.986 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7752327 7752328 CDR20291_0403 CDR20291_0404     TRUE 0.523 145.000 0.000 1.000 Y NA
 7752328 7752329 CDR20291_0404 CDR20291_0405     FALSE 0.021 314.000 0.000 NA N NA
 7752330 7752331 CDR20291_0406 CDR20291_0407     FALSE 0.011 504.000 0.000 1.000   NA
 7752331 7752332 CDR20291_0407 CDR20291_0408     TRUE 1.000 -3.000 0.600 0.006 Y NA
 7752332 7752333 CDR20291_0408 CDR20291_0409     TRUE 0.971 99.000 0.600 1.000   NA
 7752333 7752334 CDR20291_0409 CDR20291_0410   malL TRUE 0.993 14.000 0.188 1.000   NA
 7752334 7752335 CDR20291_0410 CDR20291_0411 malL   TRUE 0.998 5.000 0.176 1.000 Y NA
 7752336 7752337 CDR20291_0412 CDR20291_0413 blaR blaI TRUE 0.999 3.000 0.429 1.000 Y NA
 7752338 7752339 CDR20291_0414 CDR20291_0415     TRUE 0.884 12.000 0.000 NA   NA
 7752339 7752340 CDR20291_0415 CDR20291_0416     TRUE 0.443 68.000 0.000 NA N NA
 7752341 7752342 CDR20291_0417 CDR20291_0418     TRUE 0.819 26.000 0.000 NA   NA
 7752343 7752344 CDR20291_0419 CDR20291_0420   spaF FALSE 0.098 186.000 0.000 NA   NA
 7752344 7752345 CDR20291_0420 CDR20291_0421 spaF spaE TRUE 0.998 -3.000 0.449 NA   NA
 7752345 7752346 CDR20291_0421 CDR20291_0422 spaE spaG TRUE 0.938 -3.000 0.000 NA   NA
 7752346 7752347 CDR20291_0422 CDR20291_0423 spaG spaR TRUE 0.411 85.000 0.000 NA   NA
 7752347 7752348 CDR20291_0423 CDR20291_0424 spaR spaK TRUE 0.970 19.000 0.000 1.000 Y NA
 7752349 7752350 CDR20291_0425 CDR20291_0426     TRUE 0.917 3.000 0.000 1.000 N NA
 7752350 7752351 CDR20291_0426 CDR20291_0427     FALSE 0.037 286.000 0.000 1.000   NA
 7752351 7752352 CDR20291_0427 CDR20291_0428     FALSE 0.074 271.000 0.000 0.097   NA
 7752352 7752353 CDR20291_0428 CDR20291_0429     TRUE 0.980 6.000 0.000 1.000 Y NA
 7752353 7752354 CDR20291_0429 CDR20291_0430     FALSE 0.006 821.000 0.000 1.000   NA
 7752357 7752358 CDR20291_0433 CDR20291_0434     TRUE 0.596 47.000 0.000 1.000 N NA
 7752358 7752359 CDR20291_0434 CDR20291_0435     TRUE 0.967 29.000 0.000 0.029 Y NA
 7752359 7752360 CDR20291_0435 CDR20291_0436     TRUE 0.993 47.000 0.250 0.049 Y NA
 7752360 7752361 CDR20291_0436 CDR20291_0437     TRUE 1.000 24.000 0.875 0.049 Y NA
 7752361 7752362 CDR20291_0437 CDR20291_0438     FALSE 0.011 451.000 0.000 1.000 N NA
 7752362 7752363 CDR20291_0438 CDR20291_0439     TRUE 0.999 -7.000 0.256 1.000 Y NA
 7752363 7752364 CDR20291_0439 CDR20291_0440     FALSE 0.011 401.000 0.000 NA N NA
 7752365 7752366 CDR20291_0441 CDR20291_0442     TRUE 0.626 43.000 0.000 1.000 N NA
 7752367 7752368 CDR20291_0443 CDR20291_0444     TRUE 0.926 1.000 0.000 NA   NA
 7752368 7752369 CDR20291_0444 CDR20291_0445     FALSE 0.058 226.000 0.000 NA   NA
 7752369 7752370 CDR20291_0445 CDR20291_0446     FALSE 0.043 254.000 0.000 NA   NA
 7752370 7752371 CDR20291_0446 CDR20291_0447     TRUE 0.998 -9.000 0.286 1.000   NA
 7752371 7752372 CDR20291_0447 CDR20291_0448     FALSE 0.023 1168.000 0.000 1.000 Y NA
 7752372 7752373 CDR20291_0448 CDR20291_0449     FALSE 0.229 123.000 0.000 NA   NA
 7752374 7752375 CDR20291_0450 CDR20291_0451     TRUE 0.675 35.000 0.000 NA N NA
 7752375 7752376 CDR20291_0451 CDR20291_0452     FALSE 0.018 362.000 0.000 NA   NA
 7752376 7752377 CDR20291_0452 CDR20291_0453     FALSE 0.166 212.000 0.000 0.019   NA
 7752377 7752378 CDR20291_0453 CDR20291_0454     TRUE 0.878 13.000 0.000 NA   NA
 7752378 7752379 CDR20291_0454 CDR20291_0455     TRUE 0.910 4.000 0.000 NA   NA
 7752380 7752381 CDR20291_0456 CDR20291_0457     FALSE 0.117 175.000 0.000 NA   NA
 7752381 7752382 CDR20291_0457 CDR20291_0458   cheB FALSE 0.006 744.000 0.000 NA   NA
 7752382 7752383 CDR20291_0458 CDR20291_0459 cheB cheC TRUE 0.732 162.000 0.016 NA Y NA
 7752383 7752384 CDR20291_0459 CDR20291_0460 cheC cheD TRUE 1.000 -3.000 0.606 NA Y NA
 7752384 7752385 CDR20291_0460 CDR20291_0461 cheD cheW TRUE 0.895 43.000 0.000 1.000 Y NA
 7752385 7752386 CDR20291_0461 CDR20291_0462 cheW   TRUE 0.644 115.000 0.000 1.000 Y NA
 7752386 7752387 CDR20291_0462 CDR20291_0463     TRUE 0.959 26.000 0.000 1.000 Y NA
 7752387 7752388 CDR20291_0463 CDR20291_0464   cheA TRUE 0.867 227.000 0.250 0.005 Y NA
 7752388 7752389 CDR20291_0464 CDR20291_0465 cheA   TRUE 0.999 13.000 0.375 0.005 Y NA
 7752389 7752390 CDR20291_0465 CDR20291_0466   cheR TRUE 0.986 36.000 0.070 1.000 Y NA
 7752390 7752391 CDR20291_0466 CDR20291_0467 cheR   TRUE 0.973 58.000 0.302 1.000   NA
 7752391 7752392 CDR20291_0467 CDR20291_0468     FALSE 0.306 106.000 0.000 NA   NA
 7752392 7752393 CDR20291_0468 CDR20291_0469     TRUE 0.492 67.000 0.000 NA   NA
 7752393 7752394 CDR20291_0469 CDR20291_0470     TRUE 0.377 92.000 0.000 NA   NA
 7752394 7752395 CDR20291_0470 CDR20291_0471     FALSE 0.012 443.000 0.000 NA   NA
 7752395 7752396 CDR20291_0471 CDR20291_0472     FALSE 0.077 205.000 0.000 NA   NA
 7752396 7752397 CDR20291_0472 CDR20291_0473     TRUE 0.999 11.000 0.727 NA Y NA
 7752397 7752398 CDR20291_0473 CDR20291_0474     FALSE 0.066 216.000 0.000 NA   NA
 7752398 7752399 CDR20291_0474 CDR20291_0475     FALSE 0.004 1193.000 0.000 NA   NA
 7752401 7752402 CDR20291_0477 CDR20291_0478 sleB   TRUE 0.836 79.000 0.024 NA   NA
 7752402 7752403 CDR20291_0478 CDR20291_0479   sip2 TRUE 0.837 100.000 0.073 NA N NA
 7752403 7752404 CDR20291_0479 CDR20291_0480 sip2 sip2 TRUE 0.604 166.000 0.000 0.001 Y NA
 7752404 7752405 CDR20291_0480 CDR20291_0481 sip2   TRUE 0.996 10.000 0.333 1.000 N NA
 7752405 7752406 CDR20291_0481 CDR20291_0482     TRUE 0.832 74.000 0.013 1.000 N NA
 7752406 7752407 CDR20291_0482 CDR20291_0483   glsA FALSE 0.007 578.000 0.000 1.000 N NA
 7752407 7752408 CDR20291_0483 CDR20291_0484 glsA   TRUE 0.391 98.000 0.000 1.000   NA
 7752408 7752409 CDR20291_0484 CDR20291_0485   nfo FALSE 0.021 488.000 0.000 0.059   NA
 7752409 7752410 CDR20291_0485 CDR20291_0486 nfo   FALSE 0.052 252.000 0.000 1.000   NA
 7752412 7752413 CDR20291_0488 CDR20291_0489     TRUE 0.807 106.000 0.055 1.000 N NA
 7752413 7752414 CDR20291_0489 CDR20291_0490   nth FALSE 0.030 644.000 0.002 1.000 N NA
 7752414 7752415 CDR20291_0490 CDR20291_0491 nth   FALSE 0.324 194.000 0.005 1.000 N NA
 7752415 7752416 CDR20291_0491 CDR20291_0492     TRUE 0.927 36.000 0.008 NA   NA
 7752416 7752417 CDR20291_0492 CDR20291_0493     FALSE 0.019 356.000 0.000 NA   NA
 7752417 7752418 CDR20291_0493 CDR20291_0494     TRUE 0.525 116.000 0.000 0.001   NA
 7752418 7752419 CDR20291_0494 CDR20291_0495     FALSE 0.012 423.000 0.000 NA   NA
 7752419 7752420 CDR20291_0495 CDR20291_0496     TRUE 0.985 30.000 0.195 NA   NA
 7752420 7752421 CDR20291_0496 CDR20291_0497     TRUE 0.456 180.000 0.026 NA   NA
 7752421 7752422 CDR20291_0497 CDR20291_0498   thrS FALSE 0.006 770.000 0.000 NA   NA
 7752422 7752423 CDR20291_0498 CDR20291_0499 thrS   FALSE 0.006 768.000 0.000 NA   NA
 7752423 7752424 CDR20291_0499 CDR20291_0500     TRUE 0.958 -1823.000 0.000 NA   NA
 7752425 7752426 CDR20291_0501 CDR20291_0502     TRUE 0.944 -7.000 0.000 NA   NA
 7752428 7752429 CDR20291_0504 CDR20291_0505     FALSE 0.300 107.000 0.000 NA   NA
 7752429 7752430 CDR20291_0505 CDR20291_0506     FALSE 0.030 292.000 0.000 NA   NA
 7752431 7752432 CDR20291_0507 CDR20291_0508 gapN   FALSE 0.017 374.000 0.000 1.000 N NA
 7752432 7752433 CDR20291_0508 CDR20291_0509     TRUE 0.997 -3.000 0.250 1.000 N NA
 7752435 7752436 CDR20291_0511 CDR20291_0512     TRUE 0.862 20.000 0.000 NA   NA
 7752436 7752437 CDR20291_0512 CDR20291_0513     FALSE 0.010 473.000 0.000 NA   NA
 7752437 7752438 CDR20291_0513 CDR20291_0514     FALSE 0.006 675.000 0.000 NA   NA
 7752438 7752439 CDR20291_0514 CDR20291_0515     FALSE 0.004 2203.000 0.000 NA   NA
 7752440 7752441 CDR20291_0516 CDR20291_0517     TRUE 0.983 43.000 0.363 NA   NA
 7752441 7752442 CDR20291_0517 CDR20291_0518     FALSE 0.004 1434.000 0.000 NA   NA
 7752443 7752444 CDR20291_0519 CDR20291_0520     TRUE 0.883 18.000 0.000 1.000   NA
 7752444 7752445 CDR20291_0520 CDR20291_0521     FALSE 0.009 519.000 0.000 NA   NA
 7752445 7752446 CDR20291_0521 CDR20291_0522   cotJB1 TRUE 0.932 0.000 0.000 NA   NA
 7752446 7752447 CDR20291_0522 CDR20291_0523 cotJB1 cotJC1 TRUE 0.883 62.000 0.031 NA   NA
 7752447 7752448 CDR20291_0523 CDR20291_0524 cotJC1 ogt1 FALSE 0.006 818.000 0.000 1.000 N NA
 7752450 7752451 CDR20291_0526 CDR20291_0527     FALSE 0.007 571.000 0.000 NA   NA
 7752451 7752452 CDR20291_0527 CDR20291_0528     TRUE 0.362 96.000 0.000 NA   NA
 7752452 7752453 CDR20291_0528 CDR20291_0529     FALSE 0.096 187.000 0.000 NA   NA
 7752453 7752454 CDR20291_0529 CDR20291_0530     TRUE 0.958 -2138.000 0.000 NA   NA
 7752454 7752455 CDR20291_0530 CDR20291_0531     FALSE 0.003 1638.000 0.000 NA N NA
 7752455 7752456 CDR20291_0531 CDR20291_0532     FALSE 0.019 356.000 0.000 NA   NA
 7752457 7752458 CDR20291_0533 CDR20291_0534     TRUE 0.485 440.000 0.333 NA Y NA
 7752458 7752459 CDR20291_0534 CDR20291_0535     FALSE 0.009 596.000 0.000 1.000   NA
 7752459 7752460 CDR20291_0535 CDR20291_0536     TRUE 0.999 -10.000 0.385 1.000   NA
 7752460 7752461 CDR20291_0536 CDR20291_0537     FALSE 0.004 1275.000 0.000 NA   NA
 7752461 7752462 CDR20291_0537 CDR20291_0538     FALSE 0.317 104.000 0.000 NA   NA
 7752462 7752463 CDR20291_0538 CDR20291_0539     TRUE 0.897 57.000 0.000 0.064 Y NA
 7752463 7752464 CDR20291_0539 CDR20291_0540     FALSE 0.112 178.000 0.000 NA   NA
 7752464 7752465 CDR20291_0540 CDR20291_0541     FALSE 0.042 257.000 0.000 NA   NA
 7752465 7752466 CDR20291_0541 CDR20291_0542     FALSE 0.013 419.000 0.000 NA   NA
 7752466 7752467 CDR20291_0542 CDR20291_0543     FALSE 0.006 692.000 0.000 NA   NA
 7752468 7752469 CDR20291_0544 CDR20291_0545     TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 7752469 7752470 CDR20291_0545 CDR20291_0546     FALSE 0.012 434.000 0.000 NA   NA
 7752470 7752471 CDR20291_0546 CDR20291_0547     FALSE 0.006 706.000 0.000 NA   NA
 7752471 7752472 CDR20291_0547 CDR20291_0548     TRUE 0.449 76.000 0.000 NA   NA
 7752472 7752473 CDR20291_0548 CDR20291_0549     FALSE 0.004 1325.000 0.000 NA   NA
 7752473 7752474 CDR20291_0549 CDR20291_0550     TRUE 0.996 -7.000 0.108 NA   NA
 7752474 7752475 CDR20291_0550 CDR20291_0551     FALSE 0.005 923.000 0.000 NA   NA
 7752476 7752477 CDR20291_0552 CDR20291_0553     FALSE 0.095 189.000 0.000 1.000 N NA
 7752478 7752479 CDR20291_0554 CDR20291_0555     FALSE 0.006 589.000 0.000 NA N NA
 7752479 7752480 CDR20291_0555 CDR20291_0556     FALSE 0.023 324.000 0.000 NA   NA
 7752480 7752481 CDR20291_0556 CDR20291_0557     FALSE 0.251 117.000 0.000 NA   NA
 7752481 7752482 CDR20291_0557 CDR20291_0558     FALSE 0.015 385.000 0.000 1.000 N NA
 7752482 7752483 CDR20291_0558 CDR20291_0559     FALSE 0.013 463.000 0.000 1.000   NA
 7752483 7752484 CDR20291_0559 CDR20291_0560     FALSE 0.183 142.000 0.000 NA   NA
 7752484 7752485 CDR20291_0560 CDR20291_0561     FALSE 0.008 551.000 0.000 NA   NA
 7752485 7752486 CDR20291_0561 CDR20291_0562     FALSE 0.109 180.000 0.000 NA   NA
 7752486 7752487 CDR20291_0562 CDR20291_0563     TRUE 0.404 86.000 0.000 NA   NA
 7752487 7752488 CDR20291_0563 CDR20291_0564     TRUE 0.926 1.000 0.000 NA   NA
 7752488 7752489 CDR20291_0564 CDR20291_0565     FALSE 0.022 1435.000 0.000 1.000 Y NA
 7752489 7752490 CDR20291_0565 CDR20291_0566     TRUE 1.000 0.000 0.750 1.000 Y NA
 7752490 7752491 CDR20291_0566 CDR20291_0567     TRUE 0.932 70.000 0.120 1.000 N NA
 7752491 7752492 CDR20291_0567 CDR20291_0568     TRUE 0.999 -3.000 0.667 NA   NA
 7752492 7752493 CDR20291_0568 CDR20291_0569     FALSE 0.011 445.000 0.000 NA   NA
 7752493 7752494 CDR20291_0569 CDR20291_0570     FALSE 0.006 895.000 0.000 1.000   NA
 7752494 7752495 CDR20291_0570 CDR20291_0571     FALSE 0.035 278.000 0.000 1.000 N NA
 7752495 7752496 CDR20291_0571 CDR20291_0572     TRUE 0.997 17.000 0.071 0.001 Y NA
 7752496 7752497 CDR20291_0572 CDR20291_0573     TRUE 0.863 16.000 0.000 NA   NA
 7752497 7752498 CDR20291_0573 CDR20291_0574     FALSE 0.005 1134.000 0.000 NA   NA
 7752498 7752499 CDR20291_0574 CDR20291_0575     TRUE 0.998 -13.000 0.250 1.000 N NA
 7752499 7752500 CDR20291_0575 CDR20291_0576     TRUE 0.998 3.000 0.600 NA   NA
 7752500 7752501 CDR20291_0576 CDR20291_0577     FALSE 0.005 974.000 0.000 NA   NA
 7752501 7752502 CDR20291_0577 CDR20291_0578     FALSE 0.005 1142.000 0.000 1.000   NA
 7752502 7752503 CDR20291_0578 CDR20291_0579   u2 TRUE 0.952 63.000 0.021 1.000 Y NA
 7752503 7752504 CDR20291_0579 CDR20291_0580 u2 u1 FALSE 0.075 207.000 0.000 1.000 N NA
 7752504 7752505 CDR20291_0580 CDR20291_0581 u1 tcdD FALSE 0.026 909.000 0.000 1.000 Y NA
 7752505 7752506 CDR20291_0581 CDR20291_0582 tcdD tcdB FALSE 0.022 331.000 0.000 NA   NA
 7752506 7752507 CDR20291_0582 CDR20291_0583 tcdB tcdE FALSE 0.232 122.000 0.000 NA   NA
 7752507 7752508 CDR20291_0583 CDR20291_0584 tcdE tcdA FALSE 0.006 728.000 0.000 NA   NA
 7752511 7752512 CDR20291_0587 CDR20291_0588   d2 FALSE 0.005 1034.000 0.000 NA   NA
 7752512 7752513 CDR20291_0588 CDR20291_0589 d2 d3 TRUE 0.993 12.000 0.188 NA   NA
 7752513 7752514 CDR20291_0589 CDR20291_0590 d3 d4 TRUE 0.999 0.000 0.500 NA   NA
 7752515 7752516 CDR20291_0591 CDR20291_0592     TRUE 0.996 45.000 0.643 1.000 Y NA
 7752516 7752517 CDR20291_0592 CDR20291_0593     FALSE 0.004 1589.000 0.000 1.000 N NA
 7752517 7752518 CDR20291_0593 CDR20291_0594     FALSE 0.006 745.000 0.000 NA   NA
 7752518 7752519 CDR20291_0594 CDR20291_0595     FALSE 0.016 377.000 0.000 NA   NA
 7752519 7752520 CDR20291_0595 CDR20291_0596     FALSE 0.005 906.000 0.000 NA   NA
 7752520 7752521 CDR20291_0596 CDR20291_0597     FALSE 0.109 180.000 0.000 NA   NA
 7752521 7752522 CDR20291_0597 CDR20291_0598     FALSE 0.066 217.000 0.000 NA   NA
 7752523 7752524 CDR20291_0599 CDR20291_0600     TRUE 0.998 -3.000 0.273 NA   NA
 7752525 7752526 CDR20291_0601 CDR20291_0602     TRUE 0.992 26.000 0.286 NA   NA
 7752526 7752527 CDR20291_0602 CDR20291_0603     FALSE 0.074 207.000 0.000 NA   NA
 7752527 7752528 CDR20291_0603 CDR20291_0604     FALSE 0.018 359.000 0.000 NA   NA
 7752528 7752529 CDR20291_0604 CDR20291_0605     FALSE 0.083 197.000 0.000 NA   NA
 7752529 7752530 CDR20291_0605 CDR20291_0606     TRUE 0.960 38.000 0.083 NA   NA
 7752530 7752531 CDR20291_0606 CDR20291_0607     TRUE 0.915 88.000 0.143 NA   NA
 7752531 7752532 CDR20291_0607 CDR20291_0608     TRUE 0.805 42.000 0.000 0.030   NA
 7752532 7752533 CDR20291_0608 CDR20291_0609     TRUE 0.748 35.000 0.000 1.000   NA
 7752535 7752536 CDR20291_0611 CDR20291_0612 infC rpmI TRUE 0.999 28.000 0.652 1.000 Y NA
 7752536 7752537 CDR20291_0612 CDR20291_0613 rpmI rplT TRUE 0.998 56.000 0.928 0.014 Y NA
 7752537 7752538 CDR20291_0613 CDR20291_0614 rplT   FALSE 0.031 310.000 0.000 1.000   NA
 7752538 7752539 CDR20291_0614 CDR20291_0615     FALSE 0.014 436.000 0.000 1.000   NA
 7752539 7752540 CDR20291_0615 CDR20291_0616     FALSE 0.168 338.000 0.000 0.002 Y NA
 7752540 7752541 CDR20291_0616 CDR20291_0617     FALSE 0.017 388.000 0.000 1.000   NA
 7752542 7752543 CDR20291_0618 CDR20291_0619     FALSE 0.006 671.000 0.000 NA   NA
 7752546 7752547 CDR20291_0622 CDR20291_0623     TRUE 0.850 311.000 0.500 0.003 Y NA
 7752547 7752548 CDR20291_0623 CDR20291_0624     TRUE 0.350 191.000 0.007 1.000 N NA
 7752548 7752549 CDR20291_0624 CDR20291_0625   pheS FALSE 0.101 619.000 0.006 1.000 Y NA
 7752549 7752550 CDR20291_0625 CDR20291_0626 pheS pheT TRUE 0.999 17.000 0.574 0.001 Y NA
 7752550 7752551 CDR20291_0626 CDR20291_0627 pheT   TRUE 0.986 7.000 0.038 NA   NA
 7752551 7752552 CDR20291_0627 CDR20291_0628     FALSE 0.020 342.000 0.000 NA   NA
 7752552 7752553 CDR20291_0628 CDR20291_0629     FALSE 0.009 492.000 0.000 NA   NA
 7752553 7752554 CDR20291_0629 CDR20291_0630     TRUE 0.357 104.000 0.000 1.000   NA
 7752554 7752555 CDR20291_0630 CDR20291_0631     TRUE 0.759 34.000 0.000 1.000   NA
 7752555 7752556 CDR20291_0631 CDR20291_0632     FALSE 0.009 519.000 0.000 1.000 N NA
 7752556 7752557 CDR20291_0632 CDR20291_0633     FALSE 0.062 223.000 0.000 1.000 N NA
 7752561 7752562 CDR20291_0637 CDR20291_0638 argS   FALSE 0.223 254.000 0.021 NA   NA
 7752562 7752563 CDR20291_0638 CDR20291_0639     FALSE 0.019 347.000 0.000 NA   NA
 7752563 7752564 CDR20291_0639 CDR20291_0640     TRUE 0.979 18.000 0.024 1.000   NA
 7752564 7752565 CDR20291_0640 CDR20291_0641     TRUE 0.404 86.000 0.000 NA   NA
 7752565 7752566 CDR20291_0641 CDR20291_0642     FALSE 0.255 116.000 0.000 NA   NA
 7752566 7752567 CDR20291_0642 CDR20291_0643   cooS FALSE 0.035 607.000 0.000 1.000 Y NA
 7752567 7752568 CDR20291_0643 CDR20291_0644 cooS cooC TRUE 0.374 310.000 0.129 0.046 N NA
 7752568 7752569 CDR20291_0644 CDR20291_0645 cooC fhs FALSE 0.234 249.000 0.019 1.000 N NA
 7752569 7752570 CDR20291_0645 CDR20291_0646 fhs fchA TRUE 0.853 105.000 0.095 1.000 N NA
 7752570 7752571 CDR20291_0646 CDR20291_0647 fchA folD TRUE 0.381 92.000 0.000 1.000 N NA
 7752571 7752572 CDR20291_0647 CDR20291_0648 folD   TRUE 0.684 37.000 0.000 NA   NA
 7752572 7752573 CDR20291_0648 CDR20291_0649     TRUE 0.982 36.000 0.229 NA   NA
 7752573 7752574 CDR20291_0649 CDR20291_0650     TRUE 0.918 44.000 0.029 1.000 N NA
 7752574 7752575 CDR20291_0650 CDR20291_0651     TRUE 0.913 56.000 0.052 1.000 N NA
 7752575 7752576 CDR20291_0651 CDR20291_0652     TRUE 0.990 20.000 0.138 1.000 N NA
 7752576 7752577 CDR20291_0652 CDR20291_0653     TRUE 0.997 31.000 0.222 0.003 Y NA
 7752577 7752578 CDR20291_0653 CDR20291_0654     TRUE 0.612 50.000 0.000 1.000   NA
 7752578 7752579 CDR20291_0654 CDR20291_0655     TRUE 0.578 57.000 0.000 1.000   NA
 7752579 7752580 CDR20291_0655 CDR20291_0656   gcvH TRUE 0.808 87.000 0.020 1.000 N NA
 7752580 7752581 CDR20291_0656 CDR20291_0657 gcvH   TRUE 0.642 46.000 0.000 1.000   NA
 7752581 7752582 CDR20291_0657 CDR20291_0658     TRUE 0.925 25.000 0.000 0.022   NA
 7752582 7752583 CDR20291_0658 CDR20291_0659     TRUE 0.984 -15.000 0.000 0.002   NA
 7752583 7752584 CDR20291_0659 CDR20291_0660     TRUE 0.635 47.000 0.000 1.000   NA
 7752584 7752585 CDR20291_0660 CDR20291_0661     TRUE 0.522 151.000 0.011 NA   NA
 7752585 7752586 CDR20291_0661 CDR20291_0662     TRUE 0.983 19.000 0.055 NA   NA
 7752586 7752587 CDR20291_0662 CDR20291_0663     TRUE 0.997 16.000 0.600 NA   NA
 7752587 7752588 CDR20291_0663 CDR20291_0664   hisK FALSE 0.008 540.000 0.000 NA   NA
 7752591 7752592 CDR20291_0667 CDR20291_0668     FALSE 0.145 158.000 0.000 NA   NA
 7752593 7752594 CDR20291_0669 CDR20291_0670 glpK1   TRUE 0.899 41.000 0.004 1.000 N NA
 10864320 7752596 CDR20291_t52 CDR20291_0672     TRUE 0.398 87.000 0.000 NA   NA
 7752596 7752597 CDR20291_0672 CDR20291_0673     TRUE 0.997 15.000 0.144 1.000 Y NA
 7752597 7752598 CDR20291_0673 CDR20291_0674     FALSE 0.112 178.000 0.000 NA   NA
 7752598 7752599 CDR20291_0674 CDR20291_0675     TRUE 0.377 92.000 0.000 NA   NA
 7752599 7752600 CDR20291_0675 CDR20291_0676     TRUE 0.987 53.000 0.643 NA N NA
 7752600 7752601 CDR20291_0676 CDR20291_0677     TRUE 0.448 77.000 0.000 1.000 N NA
 7752601 7752602 CDR20291_0677 CDR20291_0678     FALSE 0.005 1028.000 0.000 1.000 N NA
 7752602 7752603 CDR20291_0678 CDR20291_0679     TRUE 0.991 28.000 0.022 0.039 Y NA
 7752603 7752604 CDR20291_0679 CDR20291_0680     TRUE 0.995 59.000 0.640 1.000 Y NA
 7752604 7752605 CDR20291_0680 CDR20291_0681   iscS1 FALSE 0.032 648.000 0.000 1.000 Y NA
 7752605 7752606 CDR20291_0681 CDR20291_0682 iscS1 thiI TRUE 0.981 46.000 0.349 1.000 N NA
 7752606 7752607 CDR20291_0682 CDR20291_0683 thiI   FALSE 0.160 141.000 0.000 NA N NA
 7752607 7752608 CDR20291_0683 CDR20291_0684     FALSE 0.041 243.000 0.000 NA N NA
 7752608 7752609 CDR20291_0684 CDR20291_0685     FALSE 0.004 1413.000 0.000 1.000 N NA
 7752610 7752611 CDR20291_0686 CDR20291_0687 plfA plfB TRUE 0.547 160.000 0.032 1.000 N NA
 7752612 7752613 CDR20291_0688 CDR20291_0689     TRUE 0.387 91.000 0.000 1.000 N NA
 7752613 7752614 CDR20291_0689 CDR20291_0690     FALSE 0.158 275.000 0.000 1.000 Y NA
 7752614 7752615 CDR20291_0690 CDR20291_0691   gutM TRUE 0.979 5.000 0.000 NA Y NA
 7752615 7752616 CDR20291_0691 CDR20291_0692 gutM gutA TRUE 0.980 29.000 0.116 NA N NA
 7752616 7752617 CDR20291_0692 CDR20291_0693 gutA srlE TRUE 0.946 64.000 0.070 0.028   NA
 7752617 7752618 CDR20291_0693 CDR20291_0694 srlE srlE' TRUE 0.998 25.000 0.667 0.028   NA
 7752618 7752619 CDR20291_0694 CDR20291_0695 srlE' srlB TRUE 0.988 41.000 0.286 0.028   NA
 7752619 7752620 CDR20291_0695 CDR20291_0696 srlB gutD TRUE 0.872 95.000 0.080 1.000 N NA
 7752620 7752621 CDR20291_0696 CDR20291_0697 gutD   FALSE 0.004 993.000 0.000 NA N NA
 7752621 7752622 CDR20291_0697 CDR20291_0698     FALSE 0.058 226.000 0.000 NA   NA
 7752622 7752623 CDR20291_0698 CDR20291_0699   spoIIAA TRUE 0.437 88.000 0.000 1.000   NA
 7752623 7752624 CDR20291_0699 CDR20291_0700 spoIIAA spoIIAB TRUE 1.000 14.000 0.669 0.001 Y NA
 7752624 7752625 CDR20291_0700 CDR20291_0701 spoIIAB sigF TRUE 0.998 23.000 0.842 1.000 N NA
 7752625 7752626 CDR20291_0701 CDR20291_0702 sigF spoVAC FALSE 0.286 280.000 0.078 NA   NA
 7752626 7752627 CDR20291_0702 CDR20291_0703 spoVAC spoVAD TRUE 0.870 154.000 0.386 NA   NA
 7752627 7752628 CDR20291_0703 CDR20291_0704 spoVAD spoVAE TRUE 0.996 14.000 0.386 NA   NA
 7752628 7752629 CDR20291_0704 CDR20291_0705 spoVAE   FALSE 0.104 183.000 0.000 NA   NA
 7752629 7752630 CDR20291_0705 CDR20291_0706     FALSE 0.016 375.000 0.000 NA   NA
 7752630 7752631 CDR20291_0706 CDR20291_0707     TRUE 0.997 15.000 0.500 NA   NA
 7752631 7752632 CDR20291_0707 CDR20291_0708     TRUE 0.951 -13.000 0.000 NA   NA
 7752632 7752633 CDR20291_0708 CDR20291_0709     TRUE 0.613 44.000 0.000 NA   NA
 7752633 7752634 CDR20291_0709 CDR20291_0710     FALSE 0.020 339.000 0.000 NA   NA
 7752635 7752636 CDR20291_0711 CDR20291_0712     FALSE 0.054 233.000 0.000 1.000 N NA
 7752639 7752640 CDR20291_0715 CDR20291_0716     FALSE 0.143 172.000 0.000 1.000   NA
 7752640 7752641 CDR20291_0716 CDR20291_0717     TRUE 0.966 29.000 0.039 NA   NA
 7752643 7752644 CDR20291_0719 CDR20291_0720     TRUE 0.979 8.000 0.002 1.000   NA
 7752644 7752645 CDR20291_0720 CDR20291_0721     TRUE 0.447 86.000 0.000 1.000   NA
 7752645 7752646 CDR20291_0721 CDR20291_0722     FALSE 0.211 282.000 0.030 1.000   NA
 7752647 7752648 CDR20291_0723 CDR20291_0724     TRUE 0.968 0.000 0.000 0.060   NA
 7752649 7752650 CDR20291_0725 CDR20291_0726 nadE   TRUE 0.802 83.000 0.010 NA   NA
 7752652 7752653 CDR20291_0728 CDR20291_0729     TRUE 0.609 45.000 0.000 1.000 N NA
 7752653 7752654 CDR20291_0729 CDR20291_0730   act TRUE 0.452 76.000 0.000 1.000 N NA
 7752654 7752655 CDR20291_0730 CDR20291_0731 act crt1 FALSE 0.015 608.000 0.000 0.034 N NA
 7752655 7752656 CDR20291_0731 CDR20291_0732 crt1   TRUE 0.889 94.000 0.105 1.000 N NA
 7752656 7752657 CDR20291_0732 CDR20291_0733     FALSE 0.197 137.000 0.000 1.000 N NA
 7752657 7752658 CDR20291_0733 CDR20291_0734     TRUE 0.653 40.000 0.000 1.000 N NA
 7752658 7752659 CDR20291_0734 CDR20291_0735     TRUE 0.998 11.000 0.429 0.046 N NA
 7752659 7752660 CDR20291_0735 CDR20291_0736     TRUE 0.999 11.000 0.600 0.016 Y NA
 7752660 7752661 CDR20291_0736 CDR20291_0737     TRUE 0.953 99.000 0.400 1.000 N NA
 7752662 7752663 CDR20291_0738 CDR20291_0739     FALSE 0.127 169.000 0.000 NA   NA
 7752664 7752665 CDR20291_0740 CDR20291_0741   floX TRUE 0.372 94.000 0.000 NA   NA
 7752665 7752666 CDR20291_0741 CDR20291_0742 floX   FALSE 0.134 176.000 0.000 1.000   NA
 7752666 7752667 CDR20291_0742 CDR20291_0743     TRUE 0.406 175.000 0.000 1.000 Y NA
 7752667 7752668 CDR20291_0743 CDR20291_0744     TRUE 0.876 22.000 0.000 1.000   NA
 7752669 7752670 CDR20291_0745 CDR20291_0746     TRUE 0.790 26.000 0.000 NA N NA
 7752671 7752672 CDR20291_0747 CDR20291_0748     TRUE 0.728 312.000 0.400 1.000 Y NA
 7752672 7752673 CDR20291_0748 CDR20291_0749     TRUE 0.824 28.000 0.000 1.000   NA
 7752673 7752674 CDR20291_0749 CDR20291_0750     FALSE 0.008 637.000 0.000 1.000   NA
 7752674 7752675 CDR20291_0750 CDR20291_0751     TRUE 1.000 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 7752675 7752676 CDR20291_0751 CDR20291_0752     FALSE 0.170 148.000 0.000 1.000 N NA
 7752676 7752677 CDR20291_0752 CDR20291_0753     TRUE 0.953 -16.000 0.000 NA   NA
 7752677 7752678 CDR20291_0753 CDR20291_0754     TRUE 0.998 10.000 0.667 NA   NA
 7752678 7752679 CDR20291_0754 CDR20291_0755   rbr FALSE 0.016 377.000 0.000 NA   NA
 7752679 7752680 CDR20291_0755 CDR20291_0756 rbr   TRUE 0.751 32.000 0.000 1.000 N NA
 7752680 7752681 CDR20291_0756 CDR20291_0757   rbo TRUE 0.687 37.000 0.000 1.000 N NA
 7752681 7752682 CDR20291_0757 CDR20291_0758 rbo   TRUE 0.364 127.000 0.000 0.046 N NA
 7752682 7752683 CDR20291_0758 CDR20291_0759     FALSE 0.034 297.000 0.000 1.000   NA
 7752683 7752684 CDR20291_0759 CDR20291_0760     FALSE 0.008 601.000 0.000 1.000   NA
 7752686 7752687 CDR20291_0762 CDR20291_0763     TRUE 0.982 25.000 0.074 1.000 N NA
 7752687 7752688 CDR20291_0763 CDR20291_0764     TRUE 0.995 22.000 0.054 0.054 Y NA
 7752688 7752689 CDR20291_0764 CDR20291_0765     FALSE 0.022 327.000 0.000 1.000 N NA
 7752689 7752690 CDR20291_0765 CDR20291_0766     TRUE 0.759 34.000 0.000 1.000   NA
 7752690 7752691 CDR20291_0766 CDR20291_0767     TRUE 0.476 79.000 0.000 1.000   NA
 7752691 7752692 CDR20291_0767 CDR20291_0768     FALSE 0.109 189.000 0.000 1.000   NA
 7752692 7752693 CDR20291_0768 CDR20291_0769     TRUE 0.796 28.000 0.000 NA   NA
 7752693 7752694 CDR20291_0769 CDR20291_0770     FALSE 0.054 232.000 0.000 NA   NA
 7752694 7752695 CDR20291_0770 CDR20291_0771     TRUE 0.383 99.000 0.000 1.000   NA
 7752695 7752696 CDR20291_0771 CDR20291_0772     FALSE 0.249 128.000 0.000 1.000   NA
 7752696 7752697 CDR20291_0772 CDR20291_0773     TRUE 0.654 44.000 0.000 1.000   NA
 7752697 7752698 CDR20291_0773 CDR20291_0774     TRUE 0.334 101.000 0.000 NA   NA
 7752700 7752701 CDR20291_0776 CDR20291_0777     FALSE 0.055 230.000 0.000 NA   NA
 7752701 7752702 CDR20291_0777 CDR20291_0778     TRUE 0.990 23.000 0.150 NA   NA
 7752702 7752703 CDR20291_0778 CDR20291_0779   abgB2 TRUE 0.416 84.000 0.000 NA   NA
 7752703 7752704 CDR20291_0779 CDR20291_0780 abgB2   TRUE 0.748 35.000 0.000 1.000   NA
 7752705 7752706 CDR20291_0781 CDR20291_0782     TRUE 0.992 3.000 0.074 1.000   NA
 7752707 7752708 CDR20291_0783 CDR20291_0784 oppB oppC TRUE 1.000 -25.000 0.647 0.030 Y NA
 7752708 7752709 CDR20291_0784 CDR20291_0785 oppC oppA TRUE 0.964 113.000 0.167 0.030 Y NA
 7752709 7752710 CDR20291_0785 CDR20291_0786 oppA oppD TRUE 0.992 75.000 0.600 1.000 Y NA
 7752710 7752711 CDR20291_0786 CDR20291_0787 oppD oppF TRUE 0.994 -7.000 0.000 0.002 Y NA
 7752711 7752712 CDR20291_0787 CDR20291_0788 oppF   FALSE 0.018 359.000 0.000 1.000 N NA
 7752712 7752713 CDR20291_0788 CDR20291_0789     FALSE 0.079 215.000 0.000 1.000   NA
 7752713 7752714 CDR20291_0789 CDR20291_0790     FALSE 0.229 135.000 0.000 1.000   NA
 7752714 7752715 CDR20291_0790 CDR20291_0791     TRUE 0.998 16.000 0.143 0.028 Y NA
 7752715 7752716 CDR20291_0791 CDR20291_0792     TRUE 0.997 24.000 0.143 0.032 Y NA
 7752716 7752717 CDR20291_0792 CDR20291_0793     TRUE 0.511 148.000 0.000 1.000 Y NA
 7752717 7752718 CDR20291_0793 CDR20291_0794     FALSE 0.024 317.000 0.000 NA   NA
 7752718 7752719 CDR20291_0794 CDR20291_0795     FALSE 0.077 205.000 0.000 NA   NA
 7752719 7752720 CDR20291_0795 CDR20291_0796     FALSE 0.078 203.000 0.000 NA   NA
 7752722 7752723 CDR20291_0798 CDR20291_0799 modA modB TRUE 0.993 83.000 0.430 0.001 Y NA
 7752723 7752724 CDR20291_0799 CDR20291_0800 modB modC TRUE 0.998 13.000 0.342 1.000 Y NA
 7752724 7752725 CDR20291_0800 CDR20291_0801 modC maa TRUE 0.918 6.000 0.000 1.000   NA
 7752726 7752727 CDR20291_0802 CDR20291_0803     TRUE 0.971 131.000 1.000 NA   NA
 7752727 7752728 CDR20291_0803 CDR20291_0804     TRUE 0.995 1.000 0.118 1.000   NA
 7752728 7752729 CDR20291_0804 CDR20291_0805     FALSE 0.006 809.000 0.000 NA   NA
 7752729 7752730 CDR20291_0805 CDR20291_0806     TRUE 0.986 97.000 1.000 NA   NA
 7752730 7752731 CDR20291_0806 CDR20291_0807     TRUE 0.995 1.000 0.118 1.000   NA
 7752732 7752733 CDR20291_0808 CDR20291_0809   tlpB FALSE 0.005 746.000 0.000 NA N NA
 7752733 7752734 CDR20291_0809 CDR20291_0810 tlpB   FALSE 0.077 191.000 0.000 NA N NA
 7752734 7752735 CDR20291_0810 CDR20291_0811     TRUE 0.966 21.000 0.000 NA Y NA
 7752735 7752736 CDR20291_0811 CDR20291_0812   glgC FALSE 0.006 771.000 0.000 1.000 N NA
 7752736 7752737 CDR20291_0812 CDR20291_0813 glgC glgD TRUE 0.999 2.000 0.309 0.001 Y NA
 7752737 7752738 CDR20291_0813 CDR20291_0814 glgD glgA TRUE 0.995 29.000 0.172 1.000 Y NA
 7752738 7752739 CDR20291_0814 CDR20291_0815 glgA glgP TRUE 0.999 -7.000 0.143 1.000 Y NA
 7752739 7752740 CDR20291_0815 CDR20291_0816 glgP   TRUE 0.999 5.000 0.186 0.029 Y NA
 7752740 7752741 CDR20291_0816 CDR20291_0817     FALSE 0.055 230.000 0.000 1.000 N NA
 7752741 7752742 CDR20291_0817 CDR20291_0818   speA FALSE 0.007 638.000 0.000 1.000 N NA
 7752742 7752743 CDR20291_0818 CDR20291_0819 speA speD TRUE 0.773 87.000 0.000 1.000 Y NA
 7752743 7752744 CDR20291_0819 CDR20291_0820 speD speE TRUE 0.994 30.000 0.161 1.000 Y NA
 7752744 7752745 CDR20291_0820 CDR20291_0821 speE speB TRUE 0.996 11.000 0.077 1.000 Y NA
 7752747 7752748 CDR20291_0823 CDR20291_0824     FALSE 0.104 258.000 0.000 0.015   NA
 7752748 7752749 CDR20291_0824 CDR20291_0825     FALSE 0.232 134.000 0.000 1.000   NA
 7752749 7752750 CDR20291_0825 CDR20291_0826   tlpB FALSE 0.007 642.000 0.000 NA   NA
 7752750 7752751 CDR20291_0826 CDR20291_0827 tlpB   FALSE 0.004 1224.000 0.000 NA   NA
 7752751 7752752 CDR20291_0827 CDR20291_0828     FALSE 0.040 262.000 0.000 NA   NA
 7752752 7752753 CDR20291_0828 CDR20291_0829   dinB FALSE 0.014 390.000 0.000 NA   NA
 7752753 7752754 CDR20291_0829 CDR20291_0830 dinB opuCA FALSE 0.043 256.000 0.000 1.000 N NA
 7752754 7752755 CDR20291_0830 CDR20291_0831 opuCA opuCC TRUE 1.000 -13.000 0.793 0.092 N NA
 7752755 7752756 CDR20291_0831 CDR20291_0832 opuCC   FALSE 0.039 334.000 0.000 0.092 N NA
 7752756 7752757 CDR20291_0832 CDR20291_0833     FALSE 0.215 141.000 0.000 1.000   NA
 7752757 7752758 CDR20291_0833 CDR20291_0834     FALSE 0.015 384.000 0.000 NA   NA
 7752758 7752759 CDR20291_0834 CDR20291_0835     TRUE 0.785 29.000 0.000 NA   NA
 7752759 7752760 CDR20291_0835 CDR20291_0836     TRUE 0.957 34.000 0.045 1.000 N NA
 7752760 7752761 CDR20291_0836 CDR20291_0837     TRUE 0.907 5.000 0.000 NA   NA
 7752761 7752762 CDR20291_0837 CDR20291_0838     FALSE 0.045 250.000 0.000 NA   NA
 7752762 7752763 CDR20291_0838 CDR20291_0839     FALSE 0.322 200.000 0.008 1.000 N NA
 7752763 7752764 CDR20291_0839 CDR20291_0840     TRUE 0.639 118.000 0.008 1.000 N NA
 7752764 7752765 CDR20291_0840 CDR20291_0841     TRUE 0.606 45.000 0.000 NA   NA
 7752765 7752766 CDR20291_0841 CDR20291_0842   leuA FALSE 0.009 518.000 0.000 NA   NA
 7752766 7752767 CDR20291_0842 CDR20291_0843 leuA leuC TRUE 0.887 140.000 0.019 0.001 Y NA
 7752767 7752768 CDR20291_0843 CDR20291_0844 leuC leuD TRUE 0.999 15.000 0.615 0.001 Y NA
 7752768 7752769 CDR20291_0844 CDR20291_0845 leuD leuB TRUE 0.999 7.000 0.191 0.001 Y NA
 7752769 7752770 CDR20291_0845 CDR20291_0846 leuB   FALSE 0.015 363.000 0.000 NA N NA
 7752770 7752771 CDR20291_0846 CDR20291_0847     FALSE 0.014 373.000 0.000 NA N NA
 7752771 7752772 CDR20291_0847 CDR20291_0848   serA TRUE 0.508 240.000 0.110 0.054 N NA
 7752772 7752773 CDR20291_0848 CDR20291_0849 serA   TRUE 0.970 32.000 0.072 NA   NA
 7752773 7752774 CDR20291_0849 CDR20291_0850     FALSE 0.005 818.000 0.000 NA   NA
 7752774 7752775 CDR20291_0850 CDR20291_0851     FALSE 0.101 185.000 0.000 1.000 N NA
 7752775 7752776 CDR20291_0851 CDR20291_0852     TRUE 0.345 106.000 0.000 1.000   NA
 7752776 7752777 CDR20291_0852 CDR20291_0853     TRUE 1.000 -28.000 0.646 0.030   NA
 7752777 7752778 CDR20291_0853 CDR20291_0854     TRUE 0.999 -12.000 0.270 1.000 Y NA
 7752778 7752779 CDR20291_0854 CDR20291_0855     FALSE 0.229 123.000 0.000 NA   NA
 7752779 7752780 CDR20291_0855 CDR20291_0856   fumA FALSE 0.318 197.000 0.006 NA   NA
 7752780 7752781 CDR20291_0856 CDR20291_0857 fumA fumB TRUE 0.999 13.000 0.262 0.001 Y NA
 7752781 7752782 CDR20291_0857 CDR20291_0858 fumB   TRUE 0.940 66.000 0.006 1.000 Y NA
 7752782 7752783 CDR20291_0858 CDR20291_0859     FALSE 0.120 173.000 0.000 NA   NA
 7752783 7752784 CDR20291_0859 CDR20291_0860     FALSE 0.008 526.000 0.000 NA   NA
 7752784 7752785 CDR20291_0860 CDR20291_0861     TRUE 1.000 11.000 0.875 1.000 Y NA
 7752785 7752786 CDR20291_0861 CDR20291_0862     TRUE 0.990 72.000 0.875 1.000 N NA
 7752786 7752787 CDR20291_0862 CDR20291_0863     TRUE 0.999 -3.000 0.875 1.000 N NA
 7752789 7752790 CDR20291_0865 CDR20291_0866   nagA TRUE 0.998 10.000 0.545 1.000 N NA
 7752790 7752791 CDR20291_0866 CDR20291_0867 nagA glmD TRUE 0.985 99.000 0.273 0.001 Y NA
 7752793 7752794 CDR20291_0869 CDR20291_0870     TRUE 1.000 2.000 0.889 1.000 Y NA
 7752794 7752795 CDR20291_0870 CDR20291_0871     TRUE 0.421 205.000 0.000 0.018 Y NA
 7752797 7752798 CDR20291_0873 CDR20291_0874     TRUE 0.999 37.000 0.688 0.004 Y NA
 7752798 7752799 CDR20291_0874 CDR20291_0875     FALSE 0.021 333.000 0.000 NA   NA
 7752799 7752800 CDR20291_0875 CDR20291_0876     FALSE 0.312 105.000 0.000 NA   NA
 7752800 7752801 CDR20291_0876 CDR20291_0877     TRUE 0.863 17.000 0.000 NA   NA
 7752801 7752802 CDR20291_0877 CDR20291_0878     FALSE 0.011 453.000 0.000 NA   NA
 7752802 7752803 CDR20291_0878 CDR20291_0879     FALSE 0.012 436.000 0.000 NA   NA
 7752803 7752804 CDR20291_0879 CDR20291_0880   potA TRUE 0.995 19.000 0.326 1.000 N NA
 7752804 7752805 CDR20291_0880 CDR20291_0881 potA potB TRUE 1.000 2.000 0.928 1.000 Y NA
 7752805 7752806 CDR20291_0881 CDR20291_0882 potB potC TRUE 0.988 105.000 0.492 0.030 Y NA
 7752806 7752807 CDR20291_0882 CDR20291_0883 potC potD TRUE 0.999 0.000 0.131 0.030 Y NA
 7752807 7752808 CDR20291_0883 CDR20291_0884 potD   FALSE 0.012 444.000 0.000 1.000 N NA
 7752808 7752809 CDR20291_0884 CDR20291_0885     TRUE 0.995 -7.000 0.067 1.000   NA
 7752809 7752810 CDR20291_0885 CDR20291_0886     TRUE 0.909 49.000 0.033 NA   NA
 7752810 7752811 CDR20291_0886 CDR20291_0887     TRUE 0.992 23.000 0.230 NA   NA
 7752811 7752812 CDR20291_0887 CDR20291_0888     TRUE 0.576 49.000 0.000 NA   NA
 7752812 7752813 CDR20291_0888 CDR20291_0889   mnaA FALSE 0.128 168.000 0.000 NA   NA
 7752813 7752814 CDR20291_0889 CDR20291_0890 mnaA   TRUE 0.442 78.000 0.000 1.000 N NA
 7752814 7752815 CDR20291_0890 CDR20291_r12   16SrRNA FALSE 0.159 152.000 0.000 NA   NA
 7752815 7752816 CDR20291_r12 CDR20291_r13 16SrRNA 23SrRNA FALSE 0.029 294.000 0.000 NA   NA
 7752816 10864321 CDR20291_r13 CDR20291_t53 23SrRNA   TRUE 0.660 39.000 0.000 NA   NA
 10864321 7752817 CDR20291_t53 CDR20291_r14   5SrRNA TRUE 0.899 8.000 0.000 NA   NA
 7752817 7752818 CDR20291_r14 CDR20291_0891 5SrRNA   FALSE 0.044 253.000 0.000 NA   NA
 7752818 7752819 CDR20291_0891 CDR20291_0892     FALSE 0.081 492.000 0.000 0.004 Y NA
 7752819 7752820 CDR20291_0892 CDR20291_0893     FALSE 0.056 228.000 0.000 NA   NA
 7752820 7752821 CDR20291_0893 CDR20291_0894     TRUE 0.996 -7.000 0.123 NA   NA
 7752821 7752822 CDR20291_0894 CDR20291_0895     TRUE 0.877 109.000 0.154 NA   NA
 7752822 7752823 CDR20291_0895 CDR20291_0896   addB TRUE 0.992 -10.000 0.029 NA   NA
 7752823 7752824 CDR20291_0896 CDR20291_0897 addB addA TRUE 0.999 0.000 0.408 1.000 Y NA
 7752824 7752825 CDR20291_0897 CDR20291_0898 addA sbcD TRUE 0.972 46.000 0.041 1.000 Y NA
 7752825 7752826 CDR20291_0898 CDR20291_0899 sbcD sbcC TRUE 0.999 -25.000 0.669 NA N NA
 7752826 7752827 CDR20291_0899 CDR20291_0900 sbcC   FALSE 0.209 131.000 0.000 NA   NA
 7752827 7752828 CDR20291_0900 CDR20291_0901     FALSE 0.165 149.000 0.000 NA   NA
 7752828 7752829 CDR20291_0901 CDR20291_0902   pepT TRUE 0.384 91.000 0.000 NA   NA
 7752829 7752830 CDR20291_0902 CDR20291_0903 pepT   FALSE 0.041 258.000 0.000 NA   NA
 7752831 7752832 CDR20291_0904 CDR20291_0905     TRUE 0.975 25.000 0.031 1.000   NA
 7752833 7752834 CDR20291_0906 CDR20291_0907     TRUE 0.999 -12.000 0.400 NA   NA
 7752834 7752835 CDR20291_0907 CDR20291_0908     TRUE 0.989 52.000 0.667 NA   NA
 7752835 7752836 CDR20291_0908 CDR20291_0909     TRUE 0.806 79.000 0.008 NA   NA
 7752836 7752837 CDR20291_0909 CDR20291_0910   bcd2 FALSE 0.006 708.000 0.000 NA   NA
 7752837 7752838 CDR20291_0910 CDR20291_0911 bcd2 etfB2 TRUE 0.763 44.000 0.000 0.045 N NA
 7752838 7752839 CDR20291_0911 CDR20291_0912 etfB2 etfA2 TRUE 1.000 19.000 1.000 0.015 Y NA
 7752839 7752840 CDR20291_0912 CDR20291_0913 etfA2 crt2 TRUE 0.865 19.000 0.000 1.000 N NA
 7752840 7752841 CDR20291_0913 CDR20291_0914 crt2 hbd TRUE 0.985 98.000 0.486 1.000 Y NA
 7752841 7752842 CDR20291_0914 CDR20291_0915 hbd thlA1 TRUE 0.959 72.000 0.054 1.000 Y NA
 7752842 7752843 CDR20291_0915 CDR20291_0916 thlA1   FALSE 0.045 252.000 0.000 1.000 N NA
 7752843 7752844 CDR20291_0916 CDR20291_0917     TRUE 0.986 14.000 0.070 NA   NA
 7752846 7752847 CDR20291_0919 CDR20291_0920     TRUE 0.584 48.000 0.000 NA   NA
 7752847 7752848 CDR20291_0920 CDR20291_0921     FALSE 0.106 182.000 0.000 NA   NA
 7752848 7752849 CDR20291_0921 CDR20291_0922     TRUE 0.725 34.000 0.000 NA   NA
 7752849 7752850 CDR20291_0922 CDR20291_0923   ccpA FALSE 0.047 247.000 0.000 NA   NA
 7752852 7752853 CDR20291_0925 CDR20291_0926     FALSE 0.010 478.000 0.000 NA   NA
 7752854 7752855 CDR20291_0927 CDR20291_0928     TRUE 0.637 42.000 0.000 1.000 N NA
 7752856 7752857 CDR20291_0929 CDR20291_0930     TRUE 0.963 29.000 0.029 NA   NA
 7752857 7752858 CDR20291_0930 CDR20291_0931     TRUE 0.974 20.000 0.014 NA   NA
 7752858 7752859 CDR20291_0931 CDR20291_0932     FALSE 0.067 216.000 0.000 1.000 N NA
 7752859 7752860 CDR20291_0932 CDR20291_0933     TRUE 0.996 26.000 0.500 1.000 N NA
 7752860 7752861 CDR20291_0933 CDR20291_0934     TRUE 0.998 4.000 0.400 1.000   NA
 7752861 7752862 CDR20291_0934 CDR20291_0935     TRUE 0.993 0.000 0.057 1.000   NA
 7752862 7752863 CDR20291_0935 CDR20291_0936     TRUE 1.000 11.000 0.800 0.046 Y NA
 7752863 7752864 CDR20291_0936 CDR20291_0937     TRUE 0.999 -16.000 0.103 0.046 Y NA
 7752866 7752867 CDR20291_0939 CDR20291_0940   moeA FALSE 0.071 211.000 0.000 NA   NA
 7752867 7752868 CDR20291_0940 CDR20291_0941 moeA mobB TRUE 0.997 5.000 0.040 0.003 Y NA
 7752868 7752869 CDR20291_0941 CDR20291_0942 mobB   FALSE 0.244 119.000 0.000 1.000 N NA
 7752869 7752870 CDR20291_0942 CDR20291_0943     FALSE 0.043 256.000 0.000 1.000 N NA
 7752870 7752871 CDR20291_0943 CDR20291_0944     FALSE 0.015 363.000 0.000 NA N NA
 7752871 7752872 CDR20291_0944 CDR20291_0945     TRUE 0.979 36.000 0.200 NA   NA
 7752872 7752873 CDR20291_0945 CDR20291_0946   zupT FALSE 0.211 142.000 0.000 1.000   NA
 7752873 7752874 CDR20291_0946 CDR20291_0947 zupT   TRUE 0.362 96.000 0.000 NA   NA
 7752874 7752875 CDR20291_0947 CDR20291_0948     FALSE 0.045 251.000 0.000 NA   NA
 7752875 7752876 CDR20291_0948 CDR20291_0949     TRUE 0.941 -6.000 0.000 NA   NA
 7752876 7752877 CDR20291_0949 CDR20291_0950     FALSE 0.058 226.000 0.000 NA   NA
 7752877 7752878 CDR20291_0950 CDR20291_0951   dhaB1 FALSE 0.064 219.000 0.000 NA   NA
 7752878 7752879 CDR20291_0951 CDR20291_0952 dhaB1 dhaB2 TRUE 0.999 15.000 1.000 0.003 N NA
 7752879 7752880 CDR20291_0952 CDR20291_0953 dhaB2   TRUE 0.882 20.000 0.000 1.000   NA
 7752880 7752881 CDR20291_0953 CDR20291_0954     FALSE 0.156 164.000 0.000 1.000   NA
 7752881 7752882 CDR20291_0954 CDR20291_0955     FALSE 0.134 164.000 0.000 NA   NA
 7752882 7752883 CDR20291_0955 CDR20291_0956     FALSE 0.009 501.000 0.000 NA   NA
 7752883 7752884 CDR20291_0956 CDR20291_0957     FALSE 0.009 506.000 0.000 NA   NA
 7752884 7752885 CDR20291_0957 CDR20291_0958     FALSE 0.068 226.000 0.000 1.000   NA
 7752885 7752886 CDR20291_0958 CDR20291_0959     FALSE 0.005 1073.000 0.000 NA   NA
 7752886 7752887 CDR20291_0959 CDR20291_0960     FALSE 0.143 159.000 0.000 NA   NA
 7752888 7752889 CDR20291_0961 CDR20291_0962     TRUE 0.990 48.000 0.667 NA   NA
 7752889 7752890 CDR20291_0962 CDR20291_0963     TRUE 0.999 16.000 1.000 NA   NA
 7752890 10864322 CDR20291_0963 CDR20291_t54     FALSE 0.004 1376.000 0.000 NA   NA
 7752891 7752892 CDR20291_0964 CDR20291_0965 polA coaE TRUE 0.989 9.000 0.068 1.000 N NA
 7752892 7752893 CDR20291_0965 CDR20291_0966 coaE   TRUE 0.994 -7.000 0.058 NA   NA
 7752893 7752894 CDR20291_0966 CDR20291_0967     TRUE 0.992 0.000 0.055 NA   NA
 7752894 7752895 CDR20291_0967 CDR20291_0968     TRUE 0.910 73.000 0.080 1.000 N NA
 7752895 7752896 CDR20291_0968 CDR20291_0969     FALSE 0.080 201.000 0.000 NA   NA
 7752896 7752897 CDR20291_0969 CDR20291_0970   gloA FALSE 0.056 228.000 0.000 NA   NA
 7752897 7752898 CDR20291_0970 CDR20291_0971 gloA   TRUE 0.612 123.000 0.012 NA N NA
 7752898 7752899 CDR20291_0971 CDR20291_0972     TRUE 0.938 111.000 0.400 NA   NA
 7752899 7752900 CDR20291_0972 CDR20291_0973   rnfC FALSE 0.066 216.000 0.000 NA   NA
 7752900 7752901 CDR20291_0973 CDR20291_0974 rnfC rnfD TRUE 0.997 23.000 0.147 0.045 Y NA
 7752901 7752902 CDR20291_0974 CDR20291_0975 rnfD rnfG TRUE 1.000 0.000 0.678 0.045 Y NA
 7752902 7752903 CDR20291_0975 CDR20291_0976 rnfG rnfE TRUE 0.996 13.000 0.050 0.045 Y NA
 7752903 7752904 CDR20291_0976 CDR20291_0977 rnfE rnfA TRUE 0.997 15.000 0.105 0.045 Y NA
 7752904 7752905 CDR20291_0977 CDR20291_0978 rnfA rnfB TRUE 0.998 16.000 0.221 0.045 Y NA
 7752907 7752908 CDR20291_0980 CDR20291_0981 maf radC TRUE 0.941 45.000 0.074 NA N NA
 7752908 7752909 CDR20291_0981 CDR20291_0982 radC mreB2 TRUE 0.880 70.000 0.040 1.000 N NA
 7752909 7752910 CDR20291_0982 CDR20291_0983 mreB2 mreC TRUE 0.998 10.000 0.689 1.000 N NA
 7752910 7752911 CDR20291_0983 CDR20291_0984 mreC   TRUE 0.998 15.000 0.550 0.003   NA
 7752911 7752912 CDR20291_0984 CDR20291_0985     TRUE 0.990 12.000 0.089 1.000   NA
 7752912 7752913 CDR20291_0985 CDR20291_0986   minC TRUE 0.851 98.000 0.060 1.000   NA
 7752913 7752914 CDR20291_0986 CDR20291_0987 minC divIVB TRUE 0.998 24.000 0.368 1.000 Y NA
 7752914 7752915 CDR20291_0987 CDR20291_0988 divIVB minE TRUE 0.998 18.000 0.347 NA Y NA
 7752915 7752916 CDR20291_0988 CDR20291_0989 minE mrdB TRUE 0.919 85.000 0.013 NA Y NA
 7752916 7752917 CDR20291_0989 CDR20291_0990 mrdB mgsA TRUE 0.908 41.000 0.009 1.000 N NA
 7752917 7752918 CDR20291_0990 CDR20291_0991 mgsA   FALSE 0.008 485.000 0.000 NA N NA
 7752918 7752919 CDR20291_0991 CDR20291_0992     TRUE 0.910 4.000 0.000 NA   NA
 7752919 7752920 CDR20291_0992 CDR20291_0993     FALSE 0.009 504.000 0.000 NA   NA
 7752922 7752923 CDR20291_0995 CDR20291_0996     TRUE 0.998 2.000 0.420 NA   NA
 7752923 7752924 CDR20291_0996 CDR20291_0997   cafA TRUE 0.992 18.000 0.180 NA   NA
 7752924 7752925 CDR20291_0997 CDR20291_0998 cafA rplU TRUE 0.904 101.000 0.018 1.000 Y NA
 7752925 7752926 CDR20291_0998 CDR20291_0999 rplU   TRUE 0.997 15.000 0.208 NA Y NA
 7752926 7752927 CDR20291_0999 CDR20291_1000   rpmA TRUE 0.997 14.000 0.203 NA Y NA
 7752927 7752928 CDR20291_1000 CDR20291_1001 rpmA obg TRUE 0.946 102.000 0.335 1.000   NA
 7752928 7752929 CDR20291_1001 CDR20291_1002 obg   TRUE 0.916 52.000 0.046 NA   NA
 7752929 7752930 CDR20291_1002 CDR20291_1003   hom1 FALSE 0.023 301.000 0.000 NA N NA
 7752931 7752932 CDR20291_1004 CDR20291_1005     FALSE 0.037 268.000 0.000 NA   NA
 7752933 7752934 CDR20291_1006 CDR20291_1007     FALSE 0.246 118.000 0.000 NA   NA
 7752934 7752935 CDR20291_1007 CDR20291_1008   etfB3 TRUE 0.988 17.000 0.098 NA   NA
 7752935 7752936 CDR20291_1008 CDR20291_1009 etfB3 etfA3 TRUE 1.000 14.000 0.875 0.015 Y NA
 7752936 7752937 CDR20291_1009 CDR20291_1010 etfA3   TRUE 1.000 11.000 0.875 0.009 Y NA
 7752939 7752940 CDR20291_1012 CDR20291_1013 ackA   TRUE 0.855 93.000 0.061 NA   NA
 7752940 7752941 CDR20291_1013 CDR20291_1014   rpmF TRUE 0.997 25.000 0.599 NA   NA
 7752941 7752942 CDR20291_1014 CDR20291_1015 rpmF fapR FALSE 0.320 207.000 0.007 1.000   NA
 7752942 7752943 CDR20291_1015 CDR20291_1016 fapR plsX TRUE 0.980 11.000 0.012 1.000   NA
 7752943 7752944 CDR20291_1016 CDR20291_1017 plsX fabH TRUE 0.995 26.000 0.054 0.004 Y NA
 7752944 7752945 CDR20291_1017 CDR20291_1018 fabH fabK TRUE 0.903 109.000 0.216 1.000   NA
 7752945 7752946 CDR20291_1018 CDR20291_1019 fabK fabD TRUE 0.989 16.000 0.099 1.000   NA
 7752946 7752947 CDR20291_1019 CDR20291_1020 fabD fabG TRUE 0.999 0.000 0.149 0.004 Y NA
 7752947 7752948 CDR20291_1020 CDR20291_1021 fabG acpP TRUE 0.973 54.000 0.014 0.004 Y NA
 7752948 7752949 CDR20291_1021 CDR20291_1022 acpP fabF TRUE 0.983 29.000 0.005 1.000 Y NA
 7752949 7752950 CDR20291_1022 CDR20291_1023 fabF   FALSE 0.059 226.000 0.000 1.000 N NA
 7752950 7752951 CDR20291_1023 CDR20291_1024     TRUE 0.942 31.000 0.000 1.000 Y NA
 7752951 7752952 CDR20291_1024 CDR20291_1025     FALSE 0.020 345.000 0.000 NA   NA
 7752952 7752953 CDR20291_1025 CDR20291_1026     TRUE 0.714 35.000 0.000 NA   NA
 7752953 7752954 CDR20291_1026 CDR20291_1027     TRUE 0.876 22.000 0.000 1.000   NA
 7752954 7752955 CDR20291_1027 CDR20291_1028     FALSE 0.028 299.000 0.000 1.000 N NA
 7752955 7752956 CDR20291_1028 CDR20291_1029   fbp TRUE 0.394 89.000 0.000 1.000 N NA
 7752956 7752957 CDR20291_1029 CDR20291_1030 fbp spoIIIAA FALSE 0.071 224.000 0.000 1.000   NA
 7752957 7752958 CDR20291_1030 CDR20291_1031 spoIIIAA spoIIIAB TRUE 0.999 -10.000 0.604 NA   NA
 7752958 7752959 CDR20291_1031 CDR20291_1032 spoIIIAB spoIIIAC TRUE 0.999 2.000 0.926 NA   NA
 7752959 7752960 CDR20291_1032 CDR20291_1033 spoIIIAC spoIIIAD TRUE 0.999 16.000 0.895 NA   NA
 7752960 7752961 CDR20291_1033 CDR20291_1034 spoIIIAD spoIIIAE TRUE 0.987 85.000 0.864 NA   NA
 7752961 7752962 CDR20291_1034 CDR20291_1035 spoIIIAE spoiIIIAF TRUE 0.992 60.000 0.918 NA   NA
 7752962 7752963 CDR20291_1035 CDR20291_1036 spoiIIIAF spoIIIAG TRUE 0.999 12.000 0.907 NA   NA
 7752963 7752964 CDR20291_1036 CDR20291_1037 spoIIIAG spoIIIAH TRUE 0.994 27.000 0.407 NA   NA
 7752964 7752965 CDR20291_1037 CDR20291_1038 spoIIIAH   TRUE 0.845 110.000 0.108 NA   NA
 7752965 7752966 CDR20291_1038 CDR20291_1039   nusB TRUE 0.940 85.000 0.223 NA   NA
 7752966 7752967 CDR20291_1039 CDR20291_1040 nusB gcp TRUE 0.991 -16.000 0.011 1.000 N NA
 7752967 7752968 CDR20291_1040 CDR20291_1041 gcp xseA TRUE 0.989 -3.000 0.012 1.000 N NA
 7752968 7752969 CDR20291_1041 CDR20291_1042 xseA xseB TRUE 1.000 2.000 0.412 0.001 Y NA
 7752969 7752970 CDR20291_1042 CDR20291_1043 xseB ispA TRUE 0.990 3.000 0.053 1.000 N NA
 7752970 7752971 CDR20291_1043 CDR20291_1044 ispA   TRUE 0.964 30.000 0.040 NA   NA
 7752971 7752972 CDR20291_1044 CDR20291_1045   dxs TRUE 0.943 34.000 0.019 NA   NA
 7752972 7752973 CDR20291_1045 CDR20291_1046 dxs   TRUE 0.836 133.000 0.189 1.000 N NA
 7752973 7752974 CDR20291_1046 CDR20291_1047   recN TRUE 0.927 38.000 0.017 1.000 N NA
 7752974 7752975 CDR20291_1047 CDR20291_1048 recN   FALSE 0.067 215.000 0.000 NA   NA
 7752976 7752977 CDR20291_1049 CDR20291_1050   bltD TRUE 0.875 31.000 0.000 0.052   NA
 7752978 7752979 CDR20291_1051 CDR20291_1052 spoIVB spo0A TRUE 0.900 142.000 0.393 1.000   NA
 7752979 7752980 CDR20291_1052 CDR20291_1053 spo0A   FALSE 0.156 413.000 0.099 1.000   NA
 7752980 7752981 CDR20291_1053 CDR20291_1054     TRUE 0.998 18.000 0.798 NA   NA
 7752981 7752982 CDR20291_1054 CDR20291_1055     TRUE 0.993 24.000 0.259 NA   NA
 7752982 7752983 CDR20291_1055 CDR20291_1056     TRUE 0.980 8.000 0.008 NA   NA
 7752983 7752984 CDR20291_1056 CDR20291_1057     TRUE 0.980 5.000 0.004 NA   NA
 7752984 7752985 CDR20291_1057 CDR20291_1058   nudF TRUE 0.989 2.000 0.038 NA   NA
 7752985 7752986 CDR20291_1058 CDR20291_1059 nudF   TRUE 0.826 68.000 0.004 NA   NA
 7752986 7752987 CDR20291_1059 CDR20291_1060   xerD1 TRUE 0.973 12.000 0.003 NA   NA
 7752987 7752988 CDR20291_1060 CDR20291_1061 xerD1 deoB TRUE 0.921 42.000 0.024 1.000 N NA
 7752988 7752989 CDR20291_1061 CDR20291_1062 deoB deoD TRUE 0.959 47.000 0.135 1.000 N NA
 7752989 7752990 CDR20291_1062 CDR20291_1063 deoD deoA TRUE 0.687 189.000 0.031 1.000 Y NA
 7752990 7752991 CDR20291_1063 CDR20291_1064 deoA   FALSE 0.070 213.000 0.000 NA   NA
 7752991 7752992 CDR20291_1064 CDR20291_1065     TRUE 0.545 172.000 0.047 NA   NA
 7752992 7752993 CDR20291_1065 CDR20291_1066     TRUE 0.997 -13.000 0.146 1.000   NA
 7752993 7752994 CDR20291_1066 CDR20291_1067     TRUE 0.849 72.000 0.020 1.000 N NA
 7752995 7752996 CDR20291_1068 CDR20291_1069     FALSE 0.017 392.000 0.000 1.000   NA
 7752997 7752998 CDR20291_1070 CDR20291_1071     FALSE 0.031 310.000 0.000 1.000   NA
 7752998 7752999 CDR20291_1071 CDR20291_1072     TRUE 0.988 -6.000 0.000 1.000 Y NA
 7752999 7753000 CDR20291_1072 CDR20291_1073     FALSE 0.004 3483.000 0.000 NA   NA
 11405331 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 908.000 0.000 NA   NA
 11547694 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 908.000 0.000 NA   NA
 11690086 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 908.000 0.000 NA   NA
 11405332 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 937.000 0.000 NA   NA
 11547695 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 937.000 0.000 NA   NA
 11690087 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 937.000 0.000 NA   NA
 11405333 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 974.000 0.000 NA   NA
 11547696 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 974.000 0.000 NA   NA
 11690088 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 974.000 0.000 NA   NA
 11405334 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1003.000 0.000 NA   NA
 11547697 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1003.000 0.000 NA   NA
 11690089 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1003.000 0.000 NA   NA
 11405335 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1041.000 0.000 NA   NA
 11547698 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1041.000 0.000 NA   NA
 11690090 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1041.000 0.000 NA   NA
 11405336 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1070.000 0.000 NA   NA
 11547699 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1070.000 0.000 NA   NA
 11690091 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1070.000 0.000 NA   NA
 11405337 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1105.000 0.000 NA   NA
 11547700 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1105.000 0.000 NA   NA
 11690092 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1105.000 0.000 NA   NA
 11405338 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1134.000 0.000 NA   NA
 11547701 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1134.000 0.000 NA   NA
 11690093 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1134.000 0.000 NA   NA
 11405339 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1173.000 0.000 NA   NA
 11547702 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1173.000 0.000 NA   NA
 11690094 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1173.000 0.000 NA   NA
 11405340 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1202.000 0.000 NA   NA
 11547703 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1202.000 0.000 NA   NA
 11690095 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1202.000 0.000 NA   NA
 11405341 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1239.000 0.000 NA   NA
 11547704 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1239.000 0.000 NA   NA
 11690096 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1239.000 0.000 NA   NA
 11405342 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1268.000 0.000 NA   NA
 11547705 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1268.000 0.000 NA   NA
 11690097 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1268.000 0.000 NA   NA
 11405343 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1307.000 0.000 NA   NA
 11547706 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1307.000 0.000 NA   NA
 11690098 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1307.000 0.000 NA   NA
 11405344 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1336.000 0.000 NA   NA
 11547707 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1336.000 0.000 NA   NA
 11690099 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1336.000 0.000 NA   NA
 11405345 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1374.000 0.000 NA   NA
 11547708 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1374.000 0.000 NA   NA
 11690100 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1374.000 0.000 NA   NA
 11405346 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1403.000 0.000 NA   NA
 11547709 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1403.000 0.000 NA   NA
 11690101 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1403.000 0.000 NA   NA
 11405347 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1440.000 0.000 NA   NA
 11547710 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1440.000 0.000 NA   NA
 11690102 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1440.000 0.000 NA   NA
 11405348 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1469.000 0.000 NA   NA
 11547711 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1469.000 0.000 NA   NA
 11690103 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1469.000 0.000 NA   NA
 11405349 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1506.000 0.000 NA   NA
 11547712 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1506.000 0.000 NA   NA
 11690104 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1506.000 0.000 NA   NA
 11405350 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1535.000 0.000 NA   NA
 11547713 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1535.000 0.000 NA   NA
 11690105 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1535.000 0.000 NA   NA
 11405351 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1572.000 0.000 NA   NA
 11547714 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1572.000 0.000 NA   NA
 11690106 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1572.000 0.000 NA   NA
 11405352 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1601.000 0.000 NA   NA
 11547715 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1601.000 0.000 NA   NA
 11690107 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1601.000 0.000 NA   NA
 11405353 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1638.000 0.000 NA   NA
 11547716 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1638.000 0.000 NA   NA
 11690108 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1638.000 0.000 NA   NA
 11405354 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1667.000 0.000 NA   NA
 11547717 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1667.000 0.000 NA   NA
 11690109 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1667.000 0.000 NA   NA
 11405355 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1705.000 0.000 NA   NA
 11547718 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1705.000 0.000 NA   NA
 11690110 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1705.000 0.000 NA   NA
 11405356 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1734.000 0.000 NA   NA
 11547719 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1734.000 0.000 NA   NA
 11690111 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1734.000 0.000 NA   NA
 11405357 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1771.000 0.000 NA   NA
 11547720 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1771.000 0.000 NA   NA
 11690112 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1771.000 0.000 NA   NA
 11405358 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1800.000 0.000 NA   NA
 11547721 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1800.000 0.000 NA   NA
 11690113 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1800.000 0.000 NA   NA
 11405359 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1837.000 0.000 NA   NA
 11547722 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1837.000 0.000 NA   NA
 11690114 7752999   CDR20291_1072     FALSE NA 1837.000 0.000 NA   NA
 7753002 7753003 CDR20291_1075 CDR20291_1076     TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 7753004 7753005 CDR20291_1077 CDR20291_1078     FALSE 0.030 292.000 0.000 NA   NA
 7753008 7753009 CDR20291_1081 CDR20291_1082     TRUE 1.000 -16.000 1.000 NA   NA
 7753009 7753010 CDR20291_1082 CDR20291_1083     TRUE 0.998 -7.000 0.400 NA   NA
 7753010 7753011 CDR20291_1083 CDR20291_1084     TRUE 0.999 -10.000 0.600 NA   NA
 7753011 7753012 CDR20291_1084 CDR20291_1085   efp FALSE 0.028 297.000 0.000 NA   NA
 7753012 7753013 CDR20291_1085 CDR20291_1086 efp   TRUE 0.823 92.000 0.037 NA   NA
 7753013 7753014 CDR20291_1086 CDR20291_1087   rnc TRUE 0.423 163.000 0.002 NA   NA
 7753014 7753015 CDR20291_1087 CDR20291_1088 rnc   TRUE 0.972 54.000 0.064 1.000 Y NA
 7753015 7753016 CDR20291_1088 CDR20291_1089   smc TRUE 0.964 28.000 0.027 1.000 N NA
 7753016 7753017 CDR20291_1089 CDR20291_1090 smc ftsY TRUE 0.987 27.000 0.165 1.000 N NA
 7753017 7753018 CDR20291_1090 CDR20291_1091 ftsY   TRUE 0.363 103.000 0.000 1.000   NA
 7753018 7753019 CDR20291_1091 CDR20291_1092   ffh TRUE 0.947 -3.000 0.000 1.000   NA
 7753019 7753020 CDR20291_1092 CDR20291_1093 ffh rpsP TRUE 0.986 38.000 0.361 1.000 N NA
 7753020 7753021 CDR20291_1093 CDR20291_1094 rpsP   TRUE 0.975 65.000 0.385 1.000   NA
 7753021 7753022 CDR20291_1094 CDR20291_1095   rimM TRUE 0.933 108.000 0.324 1.000   NA
 7753022 7753023 CDR20291_1095 CDR20291_1096 rimM trmD TRUE 0.999 9.000 0.672 1.000 Y NA
 7753023 7753024 CDR20291_1096 CDR20291_1097 trmD rplS TRUE 0.941 185.000 0.567 1.000 Y NA
 7753024 7753025 CDR20291_1097 CDR20291_1098 rplS   FALSE 0.164 312.000 0.027 1.000   NA
 7753025 7753026 CDR20291_1098 CDR20291_1099     FALSE 0.032 389.000 0.000 0.056   NA
 7753026 7753027 CDR20291_1099 CDR20291_1100     FALSE 0.045 1118.000 0.000 0.001 Y NA
 7753027 7753028 CDR20291_1100 CDR20291_1101     FALSE 0.008 565.000 0.000 1.000 N NA
 7753028 7753029 CDR20291_1101 CDR20291_1102   rnhB TRUE 0.491 68.000 0.000 1.000 N NA
 7753029 7753030 CDR20291_1102 CDR20291_1103 rnhB   TRUE 0.846 58.000 0.003 1.000 N NA
 7753030 7753031 CDR20291_1103 CDR20291_1104     TRUE 0.496 66.000 0.000 NA   NA
 7753032 7753033 CDR20291_1105 CDR20291_1106     FALSE 0.049 241.000 0.000 NA   NA
 7753033 7753034 CDR20291_1106 CDR20291_1107     TRUE 0.998 3.000 0.400 NA   NA
 7753034 7753035 CDR20291_1107 CDR20291_1108     TRUE 0.999 14.000 1.000 NA   NA
 7753035 7753036 CDR20291_1108 CDR20291_1109     TRUE 0.862 188.000 0.600 1.000 N NA
 7753036 7753037 CDR20291_1109 CDR20291_1110     TRUE 1.000 -16.000 0.800 0.025 Y NA
 7753038 7753039 CDR20291_1111 CDR20291_1112     TRUE 0.976 31.000 0.050 0.060 N NA
 7753039 7753040 CDR20291_1112 CDR20291_1113     TRUE 0.983 19.000 0.053 1.000 N NA
 7753040 7753041 CDR20291_1113 CDR20291_1114   topA TRUE 0.994 33.000 0.238 1.000 Y NA
 7753041 7753042 CDR20291_1114 CDR20291_1115 topA codY TRUE 0.512 165.000 0.025 1.000 N NA
 7753042 7753043 CDR20291_1115 CDR20291_1116 codY   TRUE 0.882 77.000 0.021 0.060 N NA
 7753043 7753044 CDR20291_1116 CDR20291_1117     TRUE 0.984 31.000 0.154 1.000   NA
 7753044 7753045 CDR20291_1117 CDR20291_1118     TRUE 0.714 109.000 0.017 NA   NA
 7753045 7753046 CDR20291_1118 CDR20291_1119   iscS2 TRUE 0.992 9.000 0.125 NA N NA
 7753046 7753047 CDR20291_1119 CDR20291_1120 iscS2   TRUE 0.550 54.000 0.000 1.000 N NA
 7753047 7753048 CDR20291_1120 CDR20291_1121   trmU FALSE 0.031 289.000 0.000 1.000 N NA
 7753048 7753049 CDR20291_1121 CDR20291_1122 trmU alaS FALSE 0.082 449.000 0.000 0.038 Y NA
 7753049 7753050 CDR20291_1122 CDR20291_1123 alaS   TRUE 0.986 25.000 0.110 NA   NA
 7753050 7753051 CDR20291_1123 CDR20291_1124     TRUE 0.980 10.000 0.016 NA   NA
 7753051 7753052 CDR20291_1124 CDR20291_1125     TRUE 0.331 206.000 0.015 NA   NA
 7753052 7753053 CDR20291_1125 CDR20291_1126     TRUE 0.943 78.000 0.217 NA   NA
 7753053 7753054 CDR20291_1126 CDR20291_1127   fur FALSE 0.283 282.000 0.078 NA   NA
 7753056 7753057 CDR20291_1129 CDR20291_1130     FALSE 0.076 206.000 0.000 NA   NA
 7753057 7753058 CDR20291_1130 CDR20291_1131   dacF TRUE 0.546 54.000 0.000 NA   NA
 7753059 7753060 CDR20291_1132 CDR20291_1133     TRUE 0.985 21.000 0.070 NA   NA
 7753061 7753062 CDR20291_1134 CDR20291_1135   scpA TRUE 0.977 30.000 0.092 NA   NA
 7753062 7753063 CDR20291_1135 CDR20291_1136 scpA scpB TRUE 0.998 2.000 0.570 NA   NA
 7753063 7753064 CDR20291_1136 CDR20291_1137 scpB   FALSE 0.138 162.000 0.000 NA   NA
 7753064 7753065 CDR20291_1137 CDR20291_1138     TRUE 0.953 -16.000 0.000 NA   NA
 7753065 7753066 CDR20291_1138 CDR20291_1139     FALSE 0.047 248.000 0.000 NA   NA
 7753066 7753067 CDR20291_1139 CDR20291_1140   pepA TRUE 0.865 16.000 0.000 1.000 N NA
 7753070 7753071 CDR20291_1143 CDR20291_1144     FALSE 0.238 120.000 0.000 NA   NA
 7753072 7753073 CDR20291_1145 CDR20291_1146 acd dnaF FALSE 0.068 215.000 0.000 1.000 N NA
 7753073 7753074 CDR20291_1146 CDR20291_1147 dnaF   TRUE 0.452 204.000 0.059 NA   NA
 7753074 7753075 CDR20291_1147 CDR20291_1148   nusA TRUE 0.996 30.000 0.759 NA   NA
 7753075 7753076 CDR20291_1148 CDR20291_1149 nusA   TRUE 0.999 7.000 0.323 NA Y NA
 7753076 7753077 CDR20291_1149 CDR20291_1150     TRUE 0.999 -10.000 0.408 NA N NA
 7753077 7753078 CDR20291_1150 CDR20291_1151   infB TRUE 0.997 22.000 0.223 NA Y NA
 7753078 7753079 CDR20291_1151 CDR20291_1152 infB rbfA TRUE 0.996 43.000 0.530 1.000 Y NA
 7753079 7753080 CDR20291_1152 CDR20291_1153 rbfA   TRUE 0.998 -46.000 0.173 1.000   NA
 7753080 7753081 CDR20291_1153 CDR20291_1154   truB TRUE 0.994 13.000 0.221 1.000   NA
 7753081 7753082 CDR20291_1154 CDR20291_1155 truB ribC TRUE 0.888 131.000 0.308 1.000 N NA
 7753082 7753083 CDR20291_1155 CDR20291_1156 ribC   TRUE 0.932 0.000 0.000 NA   NA
 7753083 7753084 CDR20291_1156 CDR20291_1157   rpsO TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   NA
 7753084 7753085 CDR20291_1157 CDR20291_1158 rpsO   FALSE 0.195 240.000 0.002 NA   NA
 7753085 7753086 CDR20291_1158 CDR20291_1159   comR TRUE 0.586 125.000 0.003 NA   NA
 7753086 7753087 CDR20291_1159 CDR20291_1160 comR   FALSE 0.255 266.000 0.048 1.000 N NA
 7753087 7753088 CDR20291_1160 CDR20291_1161     TRUE 0.738 158.000 0.127 1.000   NA
 7753088 7753089 CDR20291_1161 CDR20291_1162     TRUE 0.971 35.000 0.104 NA   NA
 7753089 7753090 CDR20291_1162 CDR20291_1163   dapG TRUE 0.993 10.000 0.148 NA   NA
 7753090 7753091 CDR20291_1163 CDR20291_1164 dapG tepA TRUE 0.813 113.000 0.080 1.000 N NA
 7753091 7753092 CDR20291_1164 CDR20291_1165 tepA ftsK TRUE 0.708 123.000 0.042 1.000 N NA
 7753092 7753093 CDR20291_1165 CDR20291_1166 ftsK   TRUE 0.987 3.000 0.028 NA   NA
 7753093 7753094 CDR20291_1166 CDR20291_1167     TRUE 0.941 -6.000 0.000 NA   NA
 7753094 7753095 CDR20291_1167 CDR20291_1168   pgsA TRUE 0.997 -22.000 0.132 1.000 N NA
 7753095 7753096 CDR20291_1168 CDR20291_1169 pgsA recA FALSE 0.172 288.000 0.022 1.000 N NA
 7753096 7753097 CDR20291_1169 CDR20291_1170 recA   TRUE 0.467 176.000 0.018 1.000   NA
 7753097 7753098 CDR20291_1170 CDR20291_1171     FALSE 0.008 635.000 0.000 1.000   NA
 7753099 7753100 CDR20291_1172 CDR20291_1173 sip3 bacA1 TRUE 0.919 22.000 0.000 0.086 N NA
 7753101 7753102 CDR20291_1174 CDR20291_1175 xerD2   TRUE 0.501 144.000 0.002 1.000 N NA
 7753102 7753103 CDR20291_1175 CDR20291_1176     FALSE 0.026 311.000 0.000 1.000 N NA
 7753103 7753104 CDR20291_1176 CDR20291_1177   malX FALSE 0.013 413.000 0.000 1.000 N NA
 7753104 7753105 CDR20291_1177 CDR20291_1178 malX   FALSE 0.144 159.000 0.000 1.000 N NA
 7753105 7753106 CDR20291_1178 CDR20291_1179   glvG TRUE 0.357 133.000 0.000 0.027 N NA
 7753108 7753109 CDR20291_1181 CDR20291_1182   exoA TRUE 0.504 146.000 0.003 1.000 N NA
 7753111 7753112 CDR20291_1184 CDR20291_1185   glnA FALSE 0.214 129.000 0.000 NA   NA
 7753114 7753115 CDR20291_1187 CDR20291_1188     TRUE 0.998 -13.000 0.333 NA   NA
 7753115 7753116 CDR20291_1188 CDR20291_1189     TRUE 0.944 -7.000 0.000 NA   NA
 7753116 7753117 CDR20291_1189 CDR20291_1190     FALSE 0.329 102.000 0.000 NA   NA
 7753117 7753118 CDR20291_1190 CDR20291_1191     FALSE 0.295 108.000 0.000 NA   NA
 7753118 7753119 CDR20291_1191 CDR20291_1192     TRUE 0.922 2.000 0.000 NA   NA
 7753119 7753120 CDR20291_1192 CDR20291_1193     TRUE 0.998 2.000 0.490 NA   NA
 7753120 7753121 CDR20291_1193 CDR20291_1194     TRUE 0.658 135.000 0.038 NA   NA
 7753123 7753124 CDR20291_1196 CDR20291_1197   cspB TRUE 0.628 183.000 0.118 NA   NA
 7753124 7753125 CDR20291_1197 CDR20291_1198 cspB   FALSE 0.015 421.000 0.000 1.000   NA
 7753126 7753127 CDR20291_1199 CDR20291_1200     TRUE 0.384 91.000 0.000 NA   NA
 7753127 7753128 CDR20291_1200 CDR20291_1201     FALSE 0.134 164.000 0.000 NA   NA
 7753128 7753129 CDR20291_1201 CDR20291_1202     TRUE 0.423 82.000 0.000 NA   NA
 7753130 7753131 CDR20291_1203 CDR20291_1204     FALSE 0.312 105.000 0.000 NA   NA
 7753131 7753132 CDR20291_1204 CDR20291_1205     FALSE 0.046 249.000 0.000 NA   NA
 7753132 7753133 CDR20291_1205 CDR20291_1206     TRUE 0.907 5.000 0.000 NA   NA
 7753133 7753134 CDR20291_1206 CDR20291_1207     TRUE 0.873 14.000 0.000 NA   NA
 7753134 7753135 CDR20291_1207 CDR20291_1208     TRUE 0.961 114.000 0.667 NA   NA
 7753135 7753136 CDR20291_1208 CDR20291_1209     TRUE 0.997 27.000 0.667 NA   NA
 7753136 7753137 CDR20291_1209 CDR20291_1210     TRUE 0.956 -27.000 0.000 NA   NA
 7753137 7753138 CDR20291_1210 CDR20291_1211     TRUE 0.932 0.000 0.000 NA   NA
 7753138 7753139 CDR20291_1211 CDR20291_1212     TRUE 0.399 282.000 0.182 NA   NA
 7753139 7753140 CDR20291_1212 CDR20291_1213     TRUE 0.992 16.000 0.182 NA   NA
 7753140 7753141 CDR20291_1213 CDR20291_1214     TRUE 0.999 0.000 1.000 NA   NA
 7753141 7753142 CDR20291_1214 CDR20291_1215     TRUE 1.000 -7.000 1.000 NA   NA
 7753142 7753143 CDR20291_1215 CDR20291_1216     TRUE 0.996 -3.000 0.167 NA   NA
 7753143 7753144 CDR20291_1216 CDR20291_1217     TRUE 0.926 1.000 0.000 NA   NA
 7753144 7753145 CDR20291_1217 CDR20291_1218     TRUE 0.856 22.000 0.000 NA   NA
 7753145 7753146 CDR20291_1218 CDR20291_1219     FALSE 0.045 251.000 0.000 NA   NA
 7753146 7753147 CDR20291_1219 CDR20291_1220     FALSE 0.039 263.000 0.000 NA   NA
 7753148 7753149 CDR20291_1221 CDR20291_1222     FALSE 0.056 228.000 0.000 NA   NA
 7753150 7753151 CDR20291_1223 CDR20291_1224     TRUE 0.862 20.000 0.000 NA   NA
 7753152 7753153 CDR20291_1225 CDR20291_1226     FALSE 0.015 412.000 0.000 1.000   NA
 7753153 7753154 CDR20291_1226 CDR20291_1227     TRUE 0.923 2.000 0.000 1.000 N NA
 7753157 7753158 CDR20291_1230 CDR20291_1231     TRUE 0.973 29.000 0.053 1.000   NA
 7753158 7753159 CDR20291_1231 CDR20291_1232     TRUE 0.997 -16.000 0.137 1.000 N NA
 7753159 7753160 CDR20291_1232 CDR20291_1233     TRUE 0.999 30.000 0.780 NA Y NA
 7753162 7753163 CDR20291_1235 CDR20291_1236     TRUE 0.978 19.000 0.028 NA   NA
 7753163 7753164 CDR20291_1236 CDR20291_1237     TRUE 0.994 13.000 0.250 NA   NA
 7753166 7753167 CDR20291_1239 CDR20291_1240     FALSE 0.076 218.000 0.000 1.000   NA
 7753168 7753169 CDR20291_1241 CDR20291_1242     TRUE 0.842 24.000 0.000 NA   NA
 7753169 7753170 CDR20291_1242 CDR20291_1243     FALSE 0.009 509.000 0.000 NA   NA
 7753170 7753171 CDR20291_1243 CDR20291_1244     TRUE 0.334 101.000 0.000 NA   NA
 7753172 7753173 CDR20291_1245 CDR20291_1246     TRUE 0.474 71.000 0.000 NA   NA
 7753174 7753175 CDR20291_1247 CDR20291_1248   glpQ TRUE 0.787 80.000 0.004 1.000 N NA
 7753176 7753177 CDR20291_1249 CDR20291_1250     FALSE 0.018 363.000 0.000 NA   NA
 7753177 7753178 CDR20291_1250 CDR20291_1251     TRUE 0.997 -13.000 0.141 NA   NA
 7753179 7753180 CDR20291_1252 CDR20291_1253     TRUE 0.819 26.000 0.000 NA   NA
 7753180 7753181 CDR20291_1253 CDR20291_1254     TRUE 0.525 59.000 0.000 NA   NA
 7753181 7753182 CDR20291_1254 CDR20291_1255   ddl TRUE 0.844 24.000 0.000 1.000 N NA
 7753183 7753184 CDR20291_1256 CDR20291_1257     TRUE 0.831 70.000 0.004 1.000   NA
 7753185 7753186 CDR20291_1258 CDR20291_1259     TRUE 0.661 200.000 0.222 NA   NA
 7753188 7753189 CDR20291_1261 CDR20291_1262     FALSE 0.280 111.000 0.000 NA   NA
 7753190 7753191 CDR20291_1263 CDR20291_1264     TRUE 0.492 67.000 0.000 NA   NA
 7753192 7753193 CDR20291_1265 CDR20291_1266     FALSE 0.004 3096.000 0.000 1.000 N NA
 7753193 7753194 CDR20291_1266 CDR20291_1267     FALSE 0.320 240.000 0.000 0.010 Y NA
 7753194 7753195 CDR20291_1267 CDR20291_1268     TRUE 0.966 31.000 0.000 0.010 Y NA
 7753196 7753197 CDR20291_1269 CDR20291_1270     FALSE 0.176 145.000 0.000 NA   NA
 7753198 7753199 CDR20291_1271 CDR20291_1272     FALSE 0.009 505.000 0.000 NA   NA
 7753199 7753200 CDR20291_1272 CDR20291_1273     FALSE 0.074 220.000 0.000 1.000   NA
 7753200 7753201 CDR20291_1273 CDR20291_1274     TRUE 0.870 78.000 0.054 NA N NA
 7753202 7753203 CDR20291_1275 CDR20291_1276     TRUE 0.337 100.000 0.000 NA   NA
 7753204 7753205 CDR20291_1277 CDR20291_1278     TRUE 0.623 43.000 0.000 NA   NA
 7753205 7753206 CDR20291_1278 CDR20291_1279     FALSE 0.130 168.000 0.000 1.000 N NA
 7753207 7753208 CDR20291_1280 CDR20291_1281     TRUE 0.968 3.000 0.000 0.009   NA
 7753210 7753211 CDR20291_1283 CDR20291_1284     TRUE 0.912 166.000 0.667 NA   NA
 7753211 7753212 CDR20291_1284 CDR20291_1285     TRUE 0.968 115.000 0.750 1.000   NA
 7753212 7753213 CDR20291_1285 CDR20291_1286     TRUE 0.981 65.000 0.500 1.000   NA
 7753213 7753214 CDR20291_1286 CDR20291_1287     FALSE 0.239 131.000 0.000 1.000   NA
 7753214 7753215 CDR20291_1287 CDR20291_1288     FALSE 0.124 182.000 0.000 1.000   NA
 7753215 7753216 CDR20291_1288 CDR20291_1289     TRUE 0.999 -7.000 0.869 1.000   NA
 7753216 7753217 CDR20291_1289 CDR20291_1290     FALSE 0.009 520.000 0.000 NA   NA
 7753217 7753218 CDR20291_1290 CDR20291_1291     FALSE 0.049 242.000 0.000 NA   NA
 7753218 7753219 CDR20291_1291 CDR20291_1292     FALSE 0.241 119.000 0.000 NA   NA
 7753219 7753220 CDR20291_1292 CDR20291_1293     TRUE 0.796 28.000 0.000 NA   NA
 7753220 7753221 CDR20291_1293 CDR20291_1294   pabA TRUE 0.844 24.000 0.000 1.000 N NA
 7753221 7753222 CDR20291_1294 CDR20291_1295 pabA pabB TRUE 0.996 2.000 0.032 1.000 Y NA
 7753222 7753223 CDR20291_1295 CDR20291_1296 pabB pabC TRUE 0.997 -10.000 0.008 1.000 Y NA
 7753223 7753224 CDR20291_1296 CDR20291_1297 pabC   TRUE 0.934 34.000 0.008 NA   NA
 7753224 7753225 CDR20291_1297 CDR20291_1298   folE TRUE 0.968 26.000 0.024 NA   NA
 7753225 7753226 CDR20291_1298 CDR20291_1299 folE folP TRUE 0.953 54.000 0.009 1.000 Y NA
 7753226 7753227 CDR20291_1299 CDR20291_1300 folP folB TRUE 0.994 11.000 0.024 1.000 Y NA
 7753227 7753228 CDR20291_1300 CDR20291_1301 folB folK TRUE 0.999 -7.000 0.142 1.000 Y NA
 7753228 7753229 CDR20291_1301 CDR20291_1302 folK   TRUE 0.990 -19.000 0.003 1.000 N NA
 7753229 7753230 CDR20291_1302 CDR20291_1303   dnaG FALSE 0.065 219.000 0.000 1.000 N NA
 7753230 7753231 CDR20291_1303 CDR20291_1304 dnaG rpoD1 TRUE 0.993 18.000 0.209 1.000 N NA
 7753231 7753232 CDR20291_1304 CDR20291_1305 rpoD1   TRUE 0.832 147.000 0.239 NA   NA
 7753232 7753233 CDR20291_1305 CDR20291_1306     TRUE 0.995 14.000 0.283 NA   NA
 7753233 7753234 CDR20291_1306 CDR20291_1307   wrbA TRUE 0.525 59.000 0.000 NA   NA
 7753235 7753236 CDR20291_1308 CDR20291_1309     FALSE 0.018 386.000 0.000 1.000   NA
 7753236 7753237 CDR20291_1309 CDR20291_1310     FALSE 0.312 105.000 0.000 NA   NA
 7753237 7753238 CDR20291_1310 CDR20291_1311     TRUE 0.996 -7.000 0.105 NA   NA
 7753239 7753240 CDR20291_1312 CDR20291_1313     FALSE 0.039 264.000 0.000 NA   NA
 7753240 7753241 CDR20291_1313 CDR20291_1314     TRUE 0.999 -22.000 0.182 1.000 Y NA
 7753241 7753242 CDR20291_1314 CDR20291_1315     TRUE 0.431 80.000 0.000 1.000 N NA
 7753242 7753243 CDR20291_1315 CDR20291_1316     TRUE 1.000 1.000 0.750 1.000 Y NA
 7753243 7753244 CDR20291_1316 CDR20291_1317     FALSE 0.063 221.000 0.000 1.000 N NA
 7753248 7753249 CDR20291_1321 CDR20291_1322     TRUE 0.999 13.000 0.600 0.004 Y NA
 7753249 7753250 CDR20291_1322 CDR20291_1323     FALSE 0.249 118.000 0.000 1.000 N NA
 7753250 7753251 CDR20291_1323 CDR20291_1324     FALSE 0.008 553.000 0.000 NA   NA
 7753251 7753252 CDR20291_1324 CDR20291_1325     FALSE 0.238 120.000 0.000 NA   NA
 7753252 7753253 CDR20291_1325 CDR20291_1326     FALSE 0.010 524.000 0.000 1.000   NA
 7753253 7753254 CDR20291_1326 CDR20291_1327   feoA1 TRUE 0.999 13.000 0.791 0.006   NA
 7753254 7753255 CDR20291_1327 CDR20291_1328 feoA1 feoB1 TRUE 0.995 85.000 0.871 1.000 Y NA
 7753255 7753256 CDR20291_1328 CDR20291_1329 feoB1   TRUE 0.862 20.000 0.000 NA   NA
 7753256 7753257 CDR20291_1329 CDR20291_1330     FALSE 0.109 180.000 0.000 NA   NA
 7753257 7753258 CDR20291_1330 CDR20291_1331   ssuC TRUE 0.411 85.000 0.000 NA   NA
 7753258 7753259 CDR20291_1331 CDR20291_1332 ssuC ssuB TRUE 0.998 -7.000 0.111 1.000 Y NA
 7753259 7753260 CDR20291_1332 CDR20291_1333 ssuB ssuA TRUE 0.990 34.000 0.100 1.000 Y NA
 7753264 7753265 CDR20291_1337 CDR20291_1338     FALSE 0.007 639.000 0.000 NA   NA
 7753265 7753266 CDR20291_1338 CDR20291_1339   metN FALSE 0.007 647.000 0.000 NA   NA
 7753266 7753267 CDR20291_1339 CDR20291_1340 metN metI TRUE 0.999 -7.000 0.178 1.000 Y NA
 7753267 7753268 CDR20291_1340 CDR20291_1341 metI metQ TRUE 0.916 36.000 0.000 NA Y NA
 7753268 7753269 CDR20291_1341 CDR20291_1342 metQ   FALSE 0.144 148.000 0.000 NA N NA
 7753269 7753270 CDR20291_1342 CDR20291_1343     FALSE 0.293 109.000 0.000 1.000 N NA
 7753270 7753271 CDR20291_1343 CDR20291_1344     FALSE 0.005 880.000 0.000 1.000 N NA
 7753271 7753272 CDR20291_1344 CDR20291_1345   proC1 TRUE 0.653 40.000 0.000 1.000 N NA
 7753274 7753275 CDR20291_1347 CDR20291_1348   rpoD2 FALSE 0.037 270.000 0.000 NA   NA
 7753275 7753276 CDR20291_1348 CDR20291_1349 rpoD2   FALSE 0.012 474.000 0.000 1.000   NA
 7753276 7753277 CDR20291_1349 CDR20291_1350   deoC TRUE 0.735 36.000 0.000 1.000   NA
 7753277 7753278 CDR20291_1350 CDR20291_1351 deoC   FALSE 0.105 183.000 0.000 1.000 N NA
 7753278 7753279 CDR20291_1351 CDR20291_1352     TRUE 0.996 4.000 0.273 1.000 N NA
 7753279 7753280 CDR20291_1352 CDR20291_1353     TRUE 0.996 1.000 0.182 NA   NA
 7753282 7753283 CDR20291_1355 CDR20291_1356     TRUE 0.998 -7.000 0.250 NA   NA
 7753283 7753284 CDR20291_1356 CDR20291_1357     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 7753284 7753285 CDR20291_1357 CDR20291_1358     TRUE 0.907 5.000 0.000 NA   NA
 7753286 7753287 CDR20291_1359 CDR20291_1360     FALSE 0.014 390.000 0.000 NA   NA
 7753287 7753288 CDR20291_1360 CDR20291_1361   panC FALSE 0.004 1425.000 0.000 NA   NA
 7753288 7753289 CDR20291_1361 CDR20291_1362 panC panB TRUE 0.999 19.000 0.395 0.001 Y NA
 7753289 7753290 CDR20291_1362 CDR20291_1363 panB   TRUE 0.995 -25.000 0.055 1.000   NA
 7753291 7753292 CDR20291_1364 CDR20291_1365     FALSE 0.031 1613.000 0.000 0.091 Y NA
 11405381 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 924.000 0.000 NA   NA
 11547744 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 924.000 0.000 NA   NA
 11690136 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 924.000 0.000 NA   NA
 11405382 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11547745 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11690137 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11405383 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 859.000 0.000 NA   NA
 11547746 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 859.000 0.000 NA   NA
 11690138 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 859.000 0.000 NA   NA
 11405384 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 822.000 0.000 NA   NA
 11547747 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 822.000 0.000 NA   NA
 11690139 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 822.000 0.000 NA   NA
 11405385 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 793.000 0.000 NA   NA
 11547748 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 793.000 0.000 NA   NA
 11690140 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 793.000 0.000 NA   NA
 11405386 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 755.000 0.000 NA   NA
 11547749 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 755.000 0.000 NA   NA
 11690141 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 755.000 0.000 NA   NA
 11405387 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 726.000 0.000 NA   NA
 11547750 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 726.000 0.000 NA   NA
 11690142 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 726.000 0.000 NA   NA
 11405388 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 688.000 0.000 NA   NA
 11547751 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 688.000 0.000 NA   NA
 11690143 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 688.000 0.000 NA   NA
 11405389 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 659.000 0.000 NA   NA
 11547752 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 659.000 0.000 NA   NA
 11690144 7753292   CDR20291_1365     FALSE NA 659.000 0.000 NA   NA
 7753293 7753294 CDR20291_1366 CDR20291_1367 feoB2 feoA2 TRUE 0.997 26.000 0.267 1.000 Y NA
 7753294 7753295 CDR20291_1367 CDR20291_1368 feoA2   FALSE 0.026 327.000 0.000 1.000   NA
 7753296 7753297 CDR20291_1369 CDR20291_1370   tyrR FALSE 0.010 476.000 0.000 NA   NA
 7753299 7753300 CDR20291_1372 CDR20291_1373     FALSE 0.072 223.000 0.000 1.000   NA
 7753300 7753301 CDR20291_1373 CDR20291_1374     TRUE 0.384 91.000 0.000 NA   NA
 7753301 7753302 CDR20291_1374 CDR20291_1375   pyrC TRUE 0.553 53.000 0.000 NA   NA
 7753303 7753304 CDR20291_1376 CDR20291_1377     TRUE 0.996 3.000 0.044 1.000 Y NA
 7753304 7753305 CDR20291_1377 CDR20291_1378     TRUE 0.986 8.000 0.044 NA N NA
 7753305 7753306 CDR20291_1378 CDR20291_1379     FALSE 0.241 112.000 0.000 NA N NA
 7753306 7753307 CDR20291_1379 CDR20291_1380     TRUE 0.965 24.000 0.000 1.000 Y NA
 7753308 7753309 CDR20291_1381 CDR20291_1382     TRUE 0.959 -13.000 0.000 1.000   NA
 7753309 7753310 CDR20291_1382 CDR20291_1383     FALSE 0.070 225.000 0.000 1.000   NA
 7753312 7753313 CDR20291_1385 CDR20291_1386   aspB TRUE 0.965 0.000 0.000 0.040 N NA
 7753313 7753314 CDR20291_1386 CDR20291_1387 aspB   FALSE 0.018 366.000 0.000 1.000 N NA
 7753314 7753315 CDR20291_1387 CDR20291_1388     TRUE 0.442 78.000 0.000 1.000 N NA
 7753315 7753316 CDR20291_1388 CDR20291_1389     TRUE 0.942 0.000 0.000 1.000   NA
 7753316 7753317 CDR20291_1389 CDR20291_1390     TRUE 0.409 119.000 0.000 0.081   NA
 7753317 7753318 CDR20291_1390 CDR20291_1391     TRUE 0.339 107.000 0.000 1.000   NA
 7753318 7753319 CDR20291_1391 CDR20291_1392     FALSE 0.011 489.000 0.000 1.000   NA
 7753319 7753320 CDR20291_1392 CDR20291_1393     TRUE 0.449 76.000 0.000 NA   NA
 7753322 7753323 CDR20291_1395 CDR20291_1396   hisZ FALSE 0.006 862.000 0.000 1.000   NA
 7753323 7753324 CDR20291_1396 CDR20291_1397 hisZ hisG TRUE 0.997 22.000 0.239 1.000 Y NA
 7753324 7753325 CDR20291_1397 CDR20291_1398 hisG hisC TRUE 0.986 34.000 0.007 0.004 Y NA
 7753325 7753326 CDR20291_1398 CDR20291_1399 hisC hisB TRUE 0.999 3.000 0.341 0.004 Y NA
 7753326 7753327 CDR20291_1399 CDR20291_1400 hisB hisH TRUE 0.999 2.000 0.125 0.004 Y NA
 7753327 7753328 CDR20291_1400 CDR20291_1401 hisH hisA TRUE 0.999 -3.000 0.124 0.004 Y NA
 7753328 7753329 CDR20291_1401 CDR20291_1402 hisA hisF TRUE 1.000 -18.000 0.433 0.004 Y NA
 7753329 7753330 CDR20291_1402 CDR20291_1403 hisF hisI TRUE 0.999 28.000 0.430 0.004 Y NA
 7753330 7753331 CDR20291_1403 CDR20291_1404 hisI   FALSE 0.029 786.000 0.000 1.000 Y NA
 7753331 7753332 CDR20291_1404 CDR20291_1405     FALSE 0.006 755.000 0.000 1.000 N NA
 7753332 7753333 CDR20291_1405 CDR20291_1406     TRUE 0.946 93.000 0.300 1.000 N NA
 7753333 7753334 CDR20291_1406 CDR20291_1407   sigV TRUE 0.562 52.000 0.000 1.000 N NA
 7753334 7753335 CDR20291_1407 CDR20291_1408 sigV   TRUE 0.884 12.000 0.000 NA   NA
 7753335 7753336 CDR20291_1408 CDR20291_1409     TRUE 0.623 43.000 0.000 NA   NA
 7753336 7753337 CDR20291_1409 CDR20291_1410     TRUE 0.634 42.000 0.000 NA   NA
 7753337 7753338 CDR20291_1410 CDR20291_1411     TRUE 0.907 5.000 0.000 NA   NA
 7753338 7753339 CDR20291_1411 CDR20291_1412     FALSE 0.008 531.000 0.000 NA   NA
 7753339 7753340 CDR20291_1412 CDR20291_1413   ilvC FALSE 0.037 270.000 0.000 NA   NA
 7753340 7753341 CDR20291_1413 CDR20291_1414 ilvC ilvB TRUE 0.973 53.000 0.006 0.001 Y NA
 7753342 7753343 CDR20291_1415 CDR20291_1416     TRUE 0.432 79.000 0.000 NA   NA
 7753343 7753344 CDR20291_1416 CDR20291_1417     TRUE 0.996 13.000 0.357 NA   NA
 7753344 7753345 CDR20291_1417 CDR20291_1418     FALSE 0.007 620.000 0.000 NA   NA
 7753346 7753347 CDR20291_1419 CDR20291_1420     FALSE 0.004 1537.000 0.000 NA   NA
 7753347 7753348 CDR20291_1420 CDR20291_1421     TRUE 0.992 12.000 0.143 NA   NA
 7753348 7753349 CDR20291_1421 CDR20291_1422     FALSE 0.013 403.000 0.000 NA   NA
 7753349 7753350 CDR20291_1422 CDR20291_1423     TRUE 0.850 23.000 0.000 NA   NA
 7753350 7753351 CDR20291_1423 CDR20291_1424     TRUE 0.997 0.000 0.250 NA   NA
 7753351 7753352 CDR20291_1424 CDR20291_1425     TRUE 0.884 12.000 0.000 NA   NA
 7753352 7753353 CDR20291_1425 CDR20291_1426     FALSE 0.008 557.000 0.000 NA   NA
 7753353 7753354 CDR20291_1426 CDR20291_1427     FALSE 0.177 154.000 0.000 1.000   NA
 7753354 7753355 CDR20291_1427 CDR20291_1428     FALSE 0.032 283.000 0.000 NA   NA
 7753355 7753356 CDR20291_1428 CDR20291_1429     FALSE 0.030 292.000 0.000 NA   NA
 7753356 7753357 CDR20291_1429 CDR20291_1430     TRUE 0.999 21.000 1.000 NA   NA
 7753357 7753358 CDR20291_1430 CDR20291_1431     TRUE 0.478 70.000 0.000 NA   NA
 7753358 7753359 CDR20291_1431 CDR20291_1432     TRUE 0.962 -22.000 0.000 1.000   NA
 7753359 7753360 CDR20291_1432 CDR20291_1433     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   NA
 7753360 7753361 CDR20291_1433 CDR20291_1434     TRUE 0.949 -10.000 0.000 NA   NA
 7753361 7753362 CDR20291_1434 CDR20291_1435     FALSE 0.024 318.000 0.000 NA   NA
 7753362 7753363 CDR20291_1435 CDR20291_1436     TRUE 0.884 12.000 0.000 NA   NA
 7753363 7753364 CDR20291_1436 CDR20291_1437     FALSE 0.044 253.000 0.000 NA   NA
 7753364 7753365 CDR20291_1437 CDR20291_1438     TRUE 0.997 -6.000 0.250 NA   NA
 7753365 7753366 CDR20291_1438 CDR20291_1439     FALSE 0.016 379.000 0.000 NA   NA
 7753366 7753367 CDR20291_1439 CDR20291_1440     FALSE 0.019 349.000 0.000 NA   NA
 7753367 7753368 CDR20291_1440 CDR20291_1441     FALSE 0.126 170.000 0.000 NA   NA
 7753368 7753369 CDR20291_1441 CDR20291_1442     TRUE 0.863 17.000 0.000 NA   NA
 7753369 7753370 CDR20291_1442 CDR20291_1443     TRUE 0.525 59.000 0.000 NA   NA
 7753370 7753371 CDR20291_1443 CDR20291_1444     TRUE 0.470 72.000 0.000 NA   NA
 7753371 7753372 CDR20291_1444 CDR20291_1445     FALSE 0.020 341.000 0.000 NA   NA
 7753372 7753373 CDR20291_1445 CDR20291_1446     FALSE 0.004 1644.000 0.000 NA   NA
 11405390 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4609.000 0.000 NA   NA
 11547753 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4609.000 0.000 NA   NA
 11690145 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4609.000 0.000 NA   NA
 11405391 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4638.000 0.000 NA   NA
 11547754 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4638.000 0.000 NA   NA
 11690146 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4638.000 0.000 NA   NA
 11405392 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4674.000 0.000 NA   NA
 11547755 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4674.000 0.000 NA   NA
 11690147 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4674.000 0.000 NA   NA
 11405393 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4703.000 0.000 NA   NA
 11547756 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4703.000 0.000 NA   NA
 11690148 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4703.000 0.000 NA   NA
 11405394 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4740.000 0.000 NA   NA
 11547757 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4740.000 0.000 NA   NA
 11690149 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4740.000 0.000 NA   NA
 11405395 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4769.000 0.000 NA   NA
 11547758 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4769.000 0.000 NA   NA
 11690150 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4769.000 0.000 NA   NA
 11405396 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4806.000 0.000 NA   NA
 11547759 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4806.000 0.000 NA   NA
 11690151 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4806.000 0.000 NA   NA
 11405397 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4835.000 0.000 NA   NA
 11547760 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4835.000 0.000 NA   NA
 11690152 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4835.000 0.000 NA   NA
 11405398 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4871.000 0.000 NA   NA
 11547761 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4871.000 0.000 NA   NA
 11690153 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4871.000 0.000 NA   NA
 11405399 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4900.000 0.000 NA   NA
 11547762 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4900.000 0.000 NA   NA
 11690154 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4900.000 0.000 NA   NA
 11405400 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4937.000 0.000 NA   NA
 11547763 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4937.000 0.000 NA   NA
 11690155 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 4937.000 0.000 NA   NA
 7753373 7753374 CDR20291_1446 CDR20291_1447     FALSE 0.005 865.000 0.000 NA   NA
 11405401 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6830.000 0.000 NA   NA
 11547764 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6830.000 0.000 NA   NA
 11690156 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6830.000 0.000 NA   NA
 11405402 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6858.000 0.000 NA   NA
 11547765 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6858.000 0.000 NA   NA
 11690157 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6858.000 0.000 NA   NA
 11405403 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6896.000 0.000 NA   NA
 11547766 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6896.000 0.000 NA   NA
 11690158 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6896.000 0.000 NA   NA
 11405404 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6924.000 0.000 NA   NA
 11547767 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6924.000 0.000 NA   NA
 11690159 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6924.000 0.000 NA   NA
 11405405 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6961.000 0.000 NA   NA
 11547768 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6961.000 0.000 NA   NA
 11690160 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6961.000 0.000 NA   NA
 11405406 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6989.000 0.000 NA   NA
 11547769 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6989.000 0.000 NA   NA
 11690161 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 6989.000 0.000 NA   NA
 11405407 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 7028.000 0.000 NA   NA
 11547770 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 7028.000 0.000 NA   NA
 11690162 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 7028.000 0.000 NA   NA
 11405408 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 7056.000 0.000 NA   NA
 11547771 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 7056.000 0.000 NA   NA
 11690163 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 7056.000 0.000 NA   NA
 11405409 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 7091.000 0.000 NA   NA
 11547772 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 7091.000 0.000 NA   NA
 11690164 7753367   CDR20291_1440     FALSE NA 7091.000 0.000 NA   NA
 7753374 7753375 CDR20291_1447 CDR20291_1448     FALSE 0.193 138.000 0.000 NA   NA
 7753375 7753376 CDR20291_1448 CDR20291_1449     TRUE 0.496 66.000 0.000 NA   NA
 7753376 7753377 CDR20291_1449 CDR20291_1450     TRUE 0.991 17.000 0.154 NA   NA
 7753377 7753378 CDR20291_1450 CDR20291_1451     TRUE 0.899 8.000 0.000 NA   NA
 7753378 7753379 CDR20291_1451 CDR20291_1452     TRUE 0.873 14.000 0.000 NA   NA
 7753379 7753380 CDR20291_1452 CDR20291_1453     TRUE 0.997 5.000 0.320 NA   NA
 7753380 7753381 CDR20291_1453 CDR20291_1454     TRUE 0.998 13.000 0.720 NA   NA
 7753381 7753382 CDR20291_1454 CDR20291_1455     TRUE 0.999 -7.000 0.708 NA   NA
 7753382 7753383 CDR20291_1455 CDR20291_1456     TRUE 0.884 12.000 0.000 NA   NA
 7753383 7753384 CDR20291_1456 CDR20291_1457     TRUE 0.863 17.000 0.000 NA   NA
 7753384 7753385 CDR20291_1457 CDR20291_1458     TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 7753385 7753386 CDR20291_1458 CDR20291_1459     TRUE 0.932 0.000 0.000 NA   NA
 7753386 7753387 CDR20291_1459 CDR20291_1460     TRUE 0.725 34.000 0.000 NA   NA
 7753387 7753388 CDR20291_1460 CDR20291_1461     FALSE 0.023 325.000 0.000 NA   NA
 7753388 7753389 CDR20291_1461 CDR20291_1462     FALSE 0.040 261.000 0.000 NA   NA
 7753389 7753390 CDR20291_1462 CDR20291_1463     TRUE 0.388 79.000 0.000 NA N NA
 7753390 7753391 CDR20291_1463 CDR20291_1464     TRUE 0.414 94.000 0.000 1.000   NA
 7753391 7753392 CDR20291_1464 CDR20291_1465     FALSE 0.006 921.000 0.000 1.000   NA
 7753392 7753393 CDR20291_1465 CDR20291_1466     FALSE 0.120 174.000 0.000 1.000 N NA
 7753395 7753396 CDR20291_1468 CDR20291_1469     TRUE 0.958 -1281.000 0.000 NA   NA
 7753396 7753397 CDR20291_1469 CDR20291_1470     FALSE 0.004 991.000 0.000 NA N NA
 7753399 7753400 CDR20291_1472 CDR20291_1473     FALSE 0.322 110.000 0.000 1.000   NA
 7753400 7753401 CDR20291_1473 CDR20291_1474   pgm1 TRUE 0.885 12.000 0.000 1.000 N NA
 7753401 7753402 CDR20291_1474 CDR20291_1475 pgm1   FALSE 0.080 214.000 0.000 1.000   NA
 7753402 7753403 CDR20291_1475 CDR20291_1476     FALSE 0.010 517.000 0.000 1.000   NA
 7753403 7753404 CDR20291_1476 CDR20291_1477   hom2 FALSE 0.006 709.000 0.000 1.000 N NA
 7753404 7753405 CDR20291_1477 CDR20291_1478 hom2   FALSE 0.267 114.000 0.000 NA   NA
 7753405 7753406 CDR20291_1478 CDR20291_1479   hisD FALSE 0.038 265.000 0.000 NA   NA
 7753407 7753408 CDR20291_1480 CDR20291_1481     FALSE 0.246 118.000 0.000 NA   NA
 7753409 7753410 CDR20291_1482 CDR20291_1483     TRUE 0.999 2.000 0.333 NA Y NA
 7753410 7753411 CDR20291_1483 CDR20291_1484     TRUE 0.998 -7.000 0.333 NA   NA
 7753411 7753412 CDR20291_1484 CDR20291_1485     TRUE 0.996 31.000 0.750 NA   NA
 7753412 7753413 CDR20291_1485 CDR20291_1486     TRUE 0.999 23.000 0.750 1.000 Y NA
 7753413 7753414 CDR20291_1486 CDR20291_1487     TRUE 0.999 21.000 0.750 NA Y NA
 7753414 7753415 CDR20291_1487 CDR20291_1488     FALSE 0.017 372.000 0.000 NA   NA
 7753415 7753416 CDR20291_1488 CDR20291_1489   kdpA FALSE 0.008 550.000 0.000 NA   NA
 7753416 7753417 CDR20291_1489 CDR20291_1490 kdpA kdpB TRUE 0.998 25.000 0.201 0.001 Y NA
 7753417 7753418 CDR20291_1490 CDR20291_1491 kdpB kdpC TRUE 1.000 4.000 0.877 0.001 Y NA
 7753418 7753419 CDR20291_1491 CDR20291_1492 kdpC cysM FALSE 0.052 237.000 0.000 1.000 N NA
 7753419 7753420 CDR20291_1492 CDR20291_1493 cysM cysA TRUE 0.997 18.000 0.065 0.001 Y NA
 7753421 7753422 CDR20291_1494 CDR20291_1495 map2   FALSE 0.083 197.000 0.000 NA   NA
 7753423 7753424 CDR20291_1496 CDR20291_1497   thiD FALSE 0.032 285.000 0.000 1.000 N NA
 7753424 7753425 CDR20291_1497 CDR20291_1498 thiD thiK TRUE 0.995 24.000 0.039 0.005 Y NA
 7753425 7753426 CDR20291_1498 CDR20291_1499 thiK thiE1 TRUE 0.998 23.000 0.190 0.005 Y NA
 7753426 7753427 CDR20291_1499 CDR20291_1500 thiE1   FALSE 0.193 139.000 0.000 1.000 N NA
 7753428 7753429 CDR20291_1501 CDR20291_1502     TRUE 0.998 -12.000 0.321 1.000 N NA
 7753429 7753430 CDR20291_1502 CDR20291_1503     TRUE 0.993 4.000 0.107 NA   NA
 7753431 7753432 CDR20291_1504 CDR20291_1505     TRUE 0.976 54.000 0.348 1.000 N NA
 7753432 7753433 CDR20291_1505 CDR20291_1506     TRUE 0.944 -7.000 0.000 NA   NA
 7753433 7753434 CDR20291_1506 CDR20291_1507     TRUE 0.884 12.000 0.000 NA   NA
 7753434 7753435 CDR20291_1507 CDR20291_1508     TRUE 0.896 9.000 0.000 NA   NA
 7753435 7753436 CDR20291_1508 CDR20291_1509     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 7753436 7753437 CDR20291_1509 CDR20291_1510     FALSE 0.017 366.000 0.000 NA   NA
 7753439 7753440 CDR20291_1512 CDR20291_1513     TRUE 0.999 1.000 0.448 NA Y NA
 7753440 7753441 CDR20291_1513 CDR20291_1514     FALSE 0.005 682.000 0.000 NA N NA
 7753441 7753442 CDR20291_1514 CDR20291_1515     FALSE 0.116 176.000 0.000 1.000 N NA
 7753442 7753443 CDR20291_1515 CDR20291_1516     TRUE 0.998 2.000 0.412 1.000 N NA
 7753443 7753444 CDR20291_1516 CDR20291_1517     TRUE 0.999 -6.000 0.471 NA   NA
 7753444 7753445 CDR20291_1517 CDR20291_1518     FALSE 0.062 222.000 0.000 NA   NA
 7753445 7753446 CDR20291_1518 CDR20291_1519     FALSE 0.077 191.000 0.000 NA N NA
 7753446 7753447 CDR20291_1519 CDR20291_1520     FALSE 0.021 362.000 0.000 1.000   NA
 7753447 7753448 CDR20291_1520 CDR20291_1521     TRUE 0.333 108.000 0.000 1.000   NA
 7753448 7753449 CDR20291_1521 CDR20291_1522   vanR FALSE 0.012 434.000 0.000 1.000 N NA
 7753449 7753450 CDR20291_1522 CDR20291_1523 vanR vanS TRUE 0.988 50.000 0.231 1.000 Y NA
 7753450 7753451 CDR20291_1523 CDR20291_1524 vanS vanG FALSE 0.041 261.000 0.000 1.000 N NA
 7753451 7753452 CDR20291_1524 CDR20291_1525 vanG   TRUE 0.996 0.000 0.015 1.000 Y NA
 7753452 7753453 CDR20291_1525 CDR20291_1526   vanTG TRUE 0.997 18.000 0.174 1.000 Y NA
 7753453 7753454 CDR20291_1526 CDR20291_1527 vanTG   FALSE 0.025 314.000 0.000 NA   NA
 7753455 7753456 CDR20291_1528 CDR20291_1529   sodA TRUE 0.427 80.000 0.000 NA   NA
 7753459 7753460 CDR20291_1532 CDR20291_1533     TRUE 0.950 39.000 0.000 0.002 Y NA
 7753460 7753461 CDR20291_1533 CDR20291_1534     TRUE 0.963 86.000 0.036 0.002 Y NA
 7753461 7753462 CDR20291_1534 CDR20291_1535     TRUE 0.994 -16.000 0.036 1.000 N NA
 7753462 7753463 CDR20291_1535 CDR20291_1536     TRUE 0.970 87.000 0.500 NA   NA
 7753463 7753464 CDR20291_1536 CDR20291_1537     TRUE 0.999 1.000 0.667 NA   NA
 7753464 7753465 CDR20291_1537 CDR20291_1538     TRUE 0.865 64.000 0.026 NA N NA
 7753465 7753466 CDR20291_1538 CDR20291_1539     TRUE 0.999 -22.000 0.325 1.000   NA
 7753466 7753467 CDR20291_1539 CDR20291_1540     TRUE 0.976 54.000 0.358 NA   NA
 7753467 7753468 CDR20291_1540 CDR20291_1541     TRUE 0.989 28.000 0.222 NA   NA
 7753470 7753471 CDR20291_1543 CDR20291_1544     TRUE 0.932 57.000 0.086 NA   NA
 7753471 7753472 CDR20291_1544 CDR20291_1545     FALSE 0.048 247.000 0.000 1.000 N NA
 7753472 7753473 CDR20291_1545 CDR20291_1546     TRUE 1.000 -10.000 0.870 0.025 Y NA
 7753473 7753474 CDR20291_1546 CDR20291_1547     TRUE 1.000 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 7753474 7753475 CDR20291_1547 CDR20291_1548     TRUE 0.971 92.000 0.196 1.000 Y NA
 7753475 7753476 CDR20291_1548 CDR20291_1549     FALSE 0.006 820.000 0.000 1.000 N NA
 7753477 7753478 CDR20291_1550 CDR20291_1551     FALSE 0.323 103.000 0.000 NA   NA
 7753478 7753479 CDR20291_1551 CDR20291_1552   lplA FALSE 0.022 310.000 0.000 NA N NA
 7753480 10864323 CDR20291_1553 CDR20291_t56     FALSE 0.280 111.000 0.000 NA   NA
 10864323 7753481 CDR20291_t56 CDR20291_1554     FALSE 0.054 231.000 0.000 NA   NA
 7753481 7753482 CDR20291_1554 CDR20291_1555     FALSE 0.006 806.000 0.000 NA   NA
 7753482 7753483 CDR20291_1555 CDR20291_1556   gcvPB TRUE 0.999 0.000 0.316 0.001 Y NA
 7753483 7753484 CDR20291_1556 CDR20291_1557 gcvPB   FALSE 0.013 423.000 0.000 1.000 N NA
 7753487 7753488 CDR20291_1560 CDR20291_1561 guaD   FALSE 0.004 2835.000 0.000 1.000 N NA
 7753489 7753490 CDR20291_1562 CDR20291_1563 cysK   FALSE 0.029 295.000 0.000 1.000 N NA
 7753490 7753491 CDR20291_1563 CDR20291_1564     FALSE 0.028 322.000 0.000 1.000   NA
 7753491 7753492 CDR20291_1564 CDR20291_1565     FALSE 0.004 1894.000 0.000 NA   NA
 7753492 7753493 CDR20291_1565 CDR20291_1566     TRUE 0.999 14.000 0.833 NA   NA
 7753493 7753494 CDR20291_1566 CDR20291_1567     TRUE 0.999 6.000 0.833 NA   NA
 7753494 7753495 CDR20291_1567 CDR20291_1568     TRUE 0.870 112.000 0.154 NA   NA
 7753495 7753496 CDR20291_1568 CDR20291_1569     TRUE 1.000 4.000 0.765 1.000 Y NA
 7753496 7753497 CDR20291_1569 CDR20291_1570     TRUE 0.991 11.000 0.118 NA   NA
 7753500 7753501 CDR20291_1573 CDR20291_1574 pcp   TRUE 0.994 21.000 0.300 NA   NA
 7753501 7753502 CDR20291_1574 CDR20291_1575     TRUE 0.999 22.000 0.939 NA   NA
 7753502 7753503 CDR20291_1575 CDR20291_1576     FALSE 0.272 113.000 0.000 NA   NA
 7753503 7753504 CDR20291_1576 CDR20291_1577     FALSE 0.155 153.000 0.000 NA   NA
 7753504 7753505 CDR20291_1577 CDR20291_1578     TRUE 0.997 3.000 0.154 0.007   NA
 7753505 7753506 CDR20291_1578 CDR20291_1579     TRUE 0.963 -25.000 0.000 1.000   NA
 7753507 7753508 CDR20291_1580 CDR20291_1581 iunH   TRUE 0.997 2.000 0.262 NA   NA
 7753508 7753509 CDR20291_1581 CDR20291_1582     TRUE 0.991 8.000 0.095 NA   NA
 7753509 7753510 CDR20291_1582 CDR20291_1583     FALSE 0.221 127.000 0.000 NA   NA
 7753510 7753511 CDR20291_1583 CDR20291_1584     TRUE 0.873 14.000 0.000 NA   NA
 7753511 7753512 CDR20291_1584 CDR20291_1585     TRUE 0.997 26.000 0.667 NA   NA
 7753512 7753513 CDR20291_1585 CDR20291_1586     TRUE 0.978 16.000 0.030 NA   NA
 7753513 7753514 CDR20291_1586 CDR20291_1587     TRUE 1.000 -10.000 0.606 1.000 Y NA
 7753514 7753515 CDR20291_1587 CDR20291_1588   trxA1 TRUE 0.616 150.000 0.043 1.000 N NA
 7753515 7753516 CDR20291_1588 CDR20291_1589 trxA1 trxB1 TRUE 0.997 17.000 0.167 1.000 Y NA
 7753516 7753517 CDR20291_1589 CDR20291_1590 trxB1   FALSE 0.037 270.000 0.000 1.000 N NA
 7753517 7753518 CDR20291_1590 CDR20291_1591     TRUE 0.993 3.000 0.111 NA   NA
 7753519 7753520 CDR20291_1592 CDR20291_1593     TRUE 0.987 39.000 0.409 NA   NA
 7753522 7753523 CDR20291_1595 CDR20291_1596 ribH ribA TRUE 0.939 106.000 0.022 0.001 Y NA
 7753523 7753524 CDR20291_1596 CDR20291_1597 ribA ribB TRUE 0.527 236.000 0.026 1.000 Y NA
 7753524 7753525 CDR20291_1597 CDR20291_1598 ribB ribD TRUE 0.997 34.000 0.456 1.000 Y NA
 7753526 7753527 CDR20291_1599 CDR20291_1600 recQ thiC FALSE 0.057 227.000 0.000 1.000 N NA
 7753527 7753528 CDR20291_1600 CDR20291_1601 thiC thiS TRUE 0.947 54.000 0.003 1.000 Y NA
 7753528 7753529 CDR20291_1601 CDR20291_1602 thiS thiF TRUE 0.996 -7.000 0.115 1.000   NA
 7753529 7753530 CDR20291_1602 CDR20291_1603 thiF thiG TRUE 0.619 186.000 0.054 0.027   NA
 7753530 7753531 CDR20291_1603 CDR20291_1604 thiG thiH TRUE 0.999 17.000 0.277 0.004 Y NA
 7753531 7753532 CDR20291_1604 CDR20291_1605 thiH thiE2 TRUE 0.998 1.000 0.023 0.004 Y NA
 7753532 7753533 CDR20291_1605 CDR20291_1606 thiE2   FALSE 0.120 173.000 0.000 NA   NA
 7753533 7753534 CDR20291_1606 CDR20291_1607     FALSE 0.009 517.000 0.000 NA   NA
 7753534 7753535 CDR20291_1607 CDR20291_1608     TRUE 0.855 25.000 0.000 1.000   NA
 7753535 7753536 CDR20291_1608 CDR20291_1609     TRUE 0.584 48.000 0.000 NA   NA
 7753536 7753537 CDR20291_1609 CDR20291_1610     FALSE 0.110 179.000 0.000 NA   NA
 7753537 7753538 CDR20291_1610 CDR20291_1611   moaB FALSE 0.010 467.000 0.000 NA   NA
 7753538 7753539 CDR20291_1611 CDR20291_1612 moaB moaA TRUE 0.982 47.000 0.034 0.002 Y NA
 7753539 7753540 CDR20291_1612 CDR20291_1613 moaA moaC TRUE 0.998 4.000 0.071 0.002 Y NA
 7753540 7753541 CDR20291_1613 CDR20291_1614 moaC   TRUE 0.934 36.000 0.010 1.000   NA
 7753541 7753542 CDR20291_1614 CDR20291_1615     FALSE 0.007 800.000 0.000 1.000   NA
 7753542 7753543 CDR20291_1615 CDR20291_1616     TRUE 0.978 54.000 0.385 NA   NA
 7753543 7753544 CDR20291_1616 CDR20291_1617     TRUE 0.999 21.000 1.000 NA   NA
 7753545 7753546 CDR20291_1618 CDR20291_1619     FALSE 0.168 148.000 0.000 NA   NA
 7753546 7753547 CDR20291_1619 CDR20291_1620     TRUE 0.507 63.000 0.000 NA   NA
 7753547 7753548 CDR20291_1620 CDR20291_1621     FALSE 0.033 282.000 0.000 NA   NA
 7753548 7753549 CDR20291_1621 CDR20291_1622     TRUE 0.623 43.000 0.000 NA   NA
 7753550 7753551 CDR20291_1623 CDR20291_1624     FALSE 0.046 249.000 0.000 NA   NA
 7753551 7753552 CDR20291_1624 CDR20291_1625     TRUE 0.606 45.000 0.000 NA   NA
 7753553 7753554 CDR20291_1626 CDR20291_1627     FALSE 0.005 1100.000 0.000 1.000 N NA
 7753555 7753556 CDR20291_1628 CDR20291_1629     FALSE 0.280 118.000 0.000 1.000   NA
 7753556 7753557 CDR20291_1629 CDR20291_1630     TRUE 0.937 1.000 0.000 1.000   NA
 7753557 7753558 CDR20291_1630 CDR20291_1631     TRUE 0.991 -10.000 0.006 1.000   NA
 7753559 7753560 CDR20291_1632 CDR20291_1633     TRUE 0.891 14.000 0.000 1.000   NA
 7753561 7753562 CDR20291_1634 CDR20291_1635     TRUE 0.561 87.000 0.000 0.075 N NA
 7753562 7753563 CDR20291_1635 CDR20291_1636     TRUE 0.986 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7753563 7753564 CDR20291_1636 CDR20291_1637   grdG FALSE 0.034 279.000 0.000 NA   NA
 7753564 7753565 CDR20291_1637 CDR20291_1638 grdG grdF TRUE 0.404 86.000 0.000 NA   NA
 7753566 7753567 CDR20291_1639 CDR20291_1640   gltC TRUE 0.360 97.000 0.000 1.000 N NA
 7753568 7753569 CDR20291_1641 CDR20291_1642 add   TRUE 0.470 72.000 0.000 NA   NA
 7753569 7753570 CDR20291_1642 CDR20291_1643     FALSE 0.081 200.000 0.000 NA   NA
 7753570 7753571 CDR20291_1643 CDR20291_1644   hgdC TRUE 0.973 25.000 0.039 NA N NA
 7753571 7753572 CDR20291_1644 CDR20291_1645 hgdC   FALSE 0.090 192.000 0.000 1.000 N NA
 7753572 7753573 CDR20291_1645 CDR20291_1646     FALSE 0.007 753.000 0.000 1.000   NA
 7753573 7753574 CDR20291_1646 CDR20291_1647     TRUE 0.813 114.000 0.074 1.000   NA
 7753574 7753575 CDR20291_1647 CDR20291_1648     TRUE 0.994 -3.000 0.074 NA   NA
 7753575 7753576 CDR20291_1648 CDR20291_1649     TRUE 0.995 -3.000 0.118 NA   NA
 7753576 7753577 CDR20291_1649 CDR20291_1650     TRUE 0.356 97.000 0.000 NA   NA
 7753577 7753578 CDR20291_1650 CDR20291_1651   def1 TRUE 0.999 -28.000 0.529 1.000 N NA
 7753578 7753579 CDR20291_1651 CDR20291_1652 def1   TRUE 0.559 52.000 0.000 NA   NA
 7753579 7753580 CDR20291_1652 CDR20291_1653     TRUE 0.569 50.000 0.000 NA   NA
 7753580 7753581 CDR20291_1653 CDR20291_1654     FALSE 0.017 370.000 0.000 1.000 N NA
 7753581 7753582 CDR20291_1654 CDR20291_1655     FALSE 0.004 1049.000 0.000 NA N NA
 7753582 7753583 CDR20291_1655 CDR20291_1656     TRUE 0.500 65.000 0.000 NA   NA
 7753583 7753584 CDR20291_1656 CDR20291_1657     FALSE 0.038 267.000 0.000 NA   NA
 7753586 7753587 CDR20291_1659 CDR20291_1660     FALSE 0.260 115.000 0.000 NA   NA
 7753587 7753588 CDR20291_1660 CDR20291_1661     FALSE 0.023 324.000 0.000 NA   NA
 7753588 7753589 CDR20291_1661 CDR20291_1662   gapA FALSE 0.007 637.000 0.000 NA   NA
 7753589 7753590 CDR20291_1662 CDR20291_1663 gapA   FALSE 0.014 395.000 0.000 NA   NA
 7753590 7753591 CDR20291_1663 CDR20291_1664     FALSE 0.015 381.000 0.000 NA   NA
 7753591 7753592 CDR20291_1664 CDR20291_1665   ogt2 FALSE 0.167 149.000 0.000 1.000 N NA
 7753592 7753593 CDR20291_1665 CDR20291_1666 ogt2   FALSE 0.255 116.000 0.000 NA   NA
 7753593 7753594 CDR20291_1666 CDR20291_1667     FALSE 0.095 188.000 0.000 NA   NA
 7753594 7753595 CDR20291_1667 CDR20291_1668     FALSE 0.007 631.000 0.000 NA   NA
 7753595 7753596 CDR20291_1668 CDR20291_1669     FALSE 0.010 474.000 0.000 NA   NA
 7753596 7753597 CDR20291_1669 CDR20291_1670     TRUE 0.997 38.000 0.461 0.024 Y NA
 7753597 7753598 CDR20291_1670 CDR20291_1671     TRUE 0.986 32.000 0.039 1.000 Y NA
 7753598 7753599 CDR20291_1671 CDR20291_1672     FALSE 0.028 299.000 0.000 1.000 N NA
 7753599 7753600 CDR20291_1672 CDR20291_1673     FALSE 0.012 436.000 0.000 NA   NA
 7753600 7753601 CDR20291_1673 CDR20291_1674     FALSE 0.036 271.000 0.000 NA   NA
 7753601 7753602 CDR20291_1674 CDR20291_1675     TRUE 0.866 55.000 0.004 1.000   NA
 7753602 7753603 CDR20291_1675 CDR20291_1676     TRUE 0.552 136.000 0.004 NA   NA
 7753603 7753604 CDR20291_1676 CDR20291_1677     TRUE 0.992 -7.000 0.038 NA   NA
 7753604 7753605 CDR20291_1677 CDR20291_1678     TRUE 0.999 3.000 0.472 0.021 Y NA
 7753605 7753606 CDR20291_1678 CDR20291_1679   truA2 TRUE 0.858 22.000 0.000 1.000 N NA
 7753606 7753607 CDR20291_1679 CDR20291_1680 truA2 argG FALSE 0.008 571.000 0.000 1.000 N NA
 7753607 7753608 CDR20291_1680 CDR20291_1681 argG   FALSE 0.066 217.000 0.000 NA   NA
 7753608 7753609 CDR20291_1681 CDR20291_1682     FALSE 0.295 108.000 0.000 NA   NA
 7753610 7753611 CDR20291_1683 CDR20291_1684     TRUE 0.989 3.000 0.041 NA   NA
 7753611 7753612 CDR20291_1684 CDR20291_1685     TRUE 0.356 97.000 0.000 NA   NA
 7753612 7753613 CDR20291_1685 CDR20291_1686     TRUE 0.832 25.000 0.000 NA   NA
 7753613 7753614 CDR20291_1686 CDR20291_1687     FALSE 0.065 218.000 0.000 NA   NA
 7753615 7753616 CDR20291_1688 CDR20291_1689     FALSE 0.012 425.000 0.000 NA   NA
 7753616 7753617 CDR20291_1689 CDR20291_1690     TRUE 0.342 99.000 0.000 NA   NA
 7753618 7753619 CDR20291_1691 CDR20291_1692     TRUE 0.997 3.000 0.190 0.025   NA
 7753621 7753622 CDR20291_1694 CDR20291_1695     TRUE 0.947 40.000 0.000 0.002 Y NA
 7753622 7753623 CDR20291_1695 CDR20291_1696     FALSE 0.011 455.000 0.000 NA   NA
 7753624 7753625 CDR20291_1697 CDR20291_1698     FALSE 0.056 227.000 0.000 NA   NA
 7753625 7753626 CDR20291_1698 CDR20291_1699   scrR FALSE 0.012 384.000 0.000 NA N NA
 7753626 7753627 CDR20291_1699 CDR20291_1700 scrR sacA FALSE 0.021 337.000 0.000 1.000 N NA
 7753627 7753628 CDR20291_1700 CDR20291_1701 sacA scrK TRUE 0.959 26.000 0.000 1.000 Y NA
 7753630 7753631 CDR20291_1703 CDR20291_1704     FALSE 0.023 299.000 0.000 NA N NA
 7753631 7753632 CDR20291_1704 CDR20291_1705     FALSE 0.082 187.000 0.000 NA N NA
 7753632 7753633 CDR20291_1705 CDR20291_1706     FALSE 0.008 531.000 0.000 NA   NA
 7753633 7753634 CDR20291_1706 CDR20291_1707     FALSE 0.051 237.000 0.000 NA   NA
 7753634 7753635 CDR20291_1707 CDR20291_1708     TRUE 0.492 67.000 0.000 NA   NA
 7753635 7753636 CDR20291_1708 CDR20291_1709     FALSE 0.079 202.000 0.000 NA   NA
 7753636 7753637 CDR20291_1709 CDR20291_1710     TRUE 0.982 24.000 0.057 1.000   NA
 7753637 7753638 CDR20291_1710 CDR20291_1711   cmk TRUE 0.889 46.000 0.004 1.000   NA
 7753638 7753639 CDR20291_1711 CDR20291_1712 cmk   TRUE 0.914 51.000 0.042 1.000 N NA
 7753639 7753640 CDR20291_1712 CDR20291_1713   ispH TRUE 0.995 13.000 0.059 1.000 Y NA
 7753640 7753641 CDR20291_1713 CDR20291_1714 ispH   FALSE 0.025 314.000 0.000 NA   NA
 7753641 7753642 CDR20291_1714 CDR20291_1715   ade FALSE 0.027 306.000 0.000 NA   NA
 7753642 7753643 CDR20291_1715 CDR20291_1716 ade bcp FALSE 0.019 352.000 0.000 1.000 N NA
 7753643 7753644 CDR20291_1716 CDR20291_1717 bcp   TRUE 0.981 10.000 0.017 NA   NA
 7753644 7753645 CDR20291_1717 CDR20291_1718     FALSE 0.218 128.000 0.000 NA   NA
 7753645 7753646 CDR20291_1718 CDR20291_1719   cysD FALSE 0.038 266.000 0.000 1.000 N NA
 7753646 7753647 CDR20291_1719 CDR20291_1720 cysD metA TRUE 0.989 30.000 0.051 1.000 Y NA
 7753647 7753648 CDR20291_1720 CDR20291_1721 metA   FALSE 0.010 491.000 0.000 1.000 N NA
 7753648 7753649 CDR20291_1721 CDR20291_1722   ftsH1 TRUE 0.965 31.000 0.050 1.000 N NA
 7753649 7753650 CDR20291_1722 CDR20291_1723 ftsH1 kdpD FALSE 0.113 178.000 0.000 1.000 N NA
 7753650 7753651 CDR20291_1723 CDR20291_1724 kdpD kdpE TRUE 0.999 34.000 1.000 1.000 Y NA
 7753651 7753652 CDR20291_1724 CDR20291_1725 kdpE   FALSE 0.020 339.000 0.000 1.000 N NA
 7753652 7753653 CDR20291_1725 CDR20291_1726     FALSE 0.113 177.000 0.000 NA   NA
 7753653 7753654 CDR20291_1726 CDR20291_1727     FALSE 0.211 130.000 0.000 NA   NA
 7753654 7753655 CDR20291_1727 CDR20291_1728   aroB TRUE 0.994 22.000 0.008 0.001 Y NA
 7753655 7753656 CDR20291_1728 CDR20291_1729 aroB aroA TRUE 0.997 0.000 0.051 1.000 Y NA
 7753656 7753657 CDR20291_1729 CDR20291_1730 aroA aroC TRUE 0.998 -25.000 0.057 1.000 Y NA
 7753657 7753658 CDR20291_1730 CDR20291_1731 aroC pheA TRUE 0.996 3.000 0.026 1.000 Y NA
 7753658 7753659 CDR20291_1731 CDR20291_1732 pheA aroE TRUE 0.961 47.000 0.009 1.000 Y NA
 7753659 7753660 CDR20291_1732 CDR20291_1733 aroE aroK TRUE 0.975 12.000 0.000 1.000 Y NA
 7753660 7753661 CDR20291_1733 CDR20291_1734 aroK tyrC TRUE 0.969 21.000 0.000 1.000 Y NA
 7753661 7753662 CDR20291_1734 CDR20291_1735 tyrC   FALSE 0.044 253.000 0.000 1.000 N NA
 7753662 7753663 CDR20291_1735 CDR20291_1736     TRUE 0.962 33.000 0.000 0.009 Y NA
 7753663 7753664 CDR20291_1736 CDR20291_1737     TRUE 0.863 18.000 0.000 NA   NA
 7753666 7753667 CDR20291_1740 CDR20291_1741     TRUE 0.863 19.000 0.000 NA   NA
 7753667 7753668 CDR20291_1741 CDR20291_1742     TRUE 0.404 86.000 0.000 NA   NA
 7753668 7753669 CDR20291_1742 CDR20291_1744     FALSE 0.004 1561.000 0.000 NA   NA
 7753669 7753670 CDR20291_1744 CDR20291_1745     TRUE 0.997 27.000 0.800 NA   NA
 7753670 7753671 CDR20291_1745 CDR20291_1746     TRUE 0.999 8.000 0.800 NA   NA
 7753673 7753674 CDR20291_1748 CDR20291_1749     TRUE 1.000 6.000 1.000 0.021 Y NA
 7753674 7753675 CDR20291_1749 CDR20291_1750     TRUE 0.967 99.000 0.571 1.000 N NA
 7753675 7753676 CDR20291_1750 CDR20291_1751     TRUE 0.999 -7.000 0.571 NA   NA
 7753676 7753677 CDR20291_1751 CDR20291_1752     TRUE 0.999 3.000 1.000 NA   NA
 7753677 7753678 CDR20291_1752 CDR20291_1753     TRUE 0.996 8.000 0.300 NA   NA
 7753678 7753679 CDR20291_1753 CDR20291_1754     FALSE 0.011 445.000 0.000 NA   NA
 7753679 7753680 CDR20291_1754 CDR20291_1755     TRUE 0.976 102.000 0.500 0.006   NA
 7753680 7753681 CDR20291_1755 CDR20291_1756     TRUE 1.000 -25.000 0.800 0.006   NA
 7753681 7753682 CDR20291_1756 CDR20291_1757     TRUE 0.999 20.000 1.000 NA   NA
 7753682 7753683 CDR20291_1757 CDR20291_1758     FALSE 0.107 181.000 0.000 NA   NA
 7753684 7753685 CDR20291_1759 CDR20291_1760     TRUE 0.998 -3.000 0.455 NA   NA
 7753686 7753687 CDR20291_1761 CDR20291_1762     TRUE 0.973 114.000 0.833 NA   NA
 7753687 7753688 CDR20291_1762 CDR20291_1763     TRUE 0.933 165.000 0.800 NA   NA
 7753688 7753689 CDR20291_1763 CDR20291_1764     FALSE 0.035 277.000 0.000 NA   NA
 7753689 7753690 CDR20291_1764 CDR20291_1765     FALSE 0.006 774.000 0.000 NA   NA
 7753692 7753693 CDR20291_1767 CDR20291_1768     FALSE 0.005 960.000 0.000 NA   NA
 7753693 7753694 CDR20291_1768 CDR20291_1769     FALSE 0.183 142.000 0.000 NA   NA
 7753694 7753695 CDR20291_1769 CDR20291_1770     TRUE 0.999 -40.000 0.600 NA   NA
 7753695 7753696 CDR20291_1770 CDR20291_1771     FALSE 0.009 508.000 0.000 NA   NA
 7753697 7753698 CDR20291_1772 CDR20291_1773     FALSE 0.006 936.000 0.000 1.000   NA
 7753698 7753699 CDR20291_1773 CDR20291_1774     FALSE 0.012 474.000 0.000 1.000   NA
 7753699 7753700 CDR20291_1774 CDR20291_1775     FALSE 0.005 1245.000 0.000 1.000   NA
 7753701 7753702 CDR20291_1776 CDR20291_1777     FALSE 0.008 550.000 0.000 NA   NA
 7753702 7753703 CDR20291_1777 CDR20291_1778     TRUE 0.915 117.000 0.333 NA   NA
 7753703 7753704 CDR20291_1778 CDR20291_1779     TRUE 0.998 -7.000 0.300 1.000 N NA
 7753706 7753707 CDR20291_1781 CDR20291_1782     TRUE 0.998 -7.000 0.375 NA   NA
 7753709 7753710 CDR20291_1784 CDR20291_1785     TRUE 0.807 27.000 0.000 NA   NA
 7753710 7753711 CDR20291_1785 CDR20291_1786     TRUE 0.955 -22.000 0.000 NA   NA
 7753713 7753714 CDR20291_1788 CDR20291_1789     FALSE 0.086 194.000 0.000 NA   NA
 7753714 7753715 CDR20291_1789 CDR20291_1790     FALSE 0.007 619.000 0.000 NA   NA
 7753715 7753716 CDR20291_1790 CDR20291_1791     TRUE 0.999 4.000 0.750 NA   NA
 7753716 7753717 CDR20291_1791 CDR20291_1792     FALSE 0.058 226.000 0.000 NA   NA
 7753717 7753718 CDR20291_1792 CDR20291_1793     TRUE 0.966 95.000 0.500 NA   NA
 7753718 7753719 CDR20291_1793 CDR20291_1794     TRUE 0.411 85.000 0.000 NA   NA
 7753719 7753720 CDR20291_1794 CDR20291_1795     TRUE 0.420 83.000 0.000 NA   NA
 7753720 7753721 CDR20291_1795 CDR20291_1796     TRUE 0.855 25.000 0.000 1.000   NA
 7753721 7753722 CDR20291_1796 CDR20291_1797     FALSE 0.009 573.000 0.000 1.000   NA
 7753722 7753723 CDR20291_1797 CDR20291_1798     TRUE 0.947 -3.000 0.000 1.000   NA
 7753723 7753724 CDR20291_1798 CDR20291_1799     FALSE 0.010 479.000 0.000 NA   NA
 7753726 7753727 CDR20291_1801 CDR20291_1802     TRUE 0.748 161.000 0.167 NA   NA
 7753727 7753728 CDR20291_1802 CDR20291_1803     TRUE 0.991 19.000 0.167 NA   NA
 7753728 7753729 CDR20291_1803 CDR20291_1804     TRUE 0.999 10.000 0.917 1.000 N NA
 7753729 7753730 CDR20291_1804 CDR20291_1805     TRUE 0.999 0.000 0.542 1.000 N NA
 7753730 7753731 CDR20291_1805 CDR20291_1806   vncR TRUE 0.956 98.000 0.409 1.000 N NA
 7753731 7753732 CDR20291_1806 CDR20291_1807 vncR vncS TRUE 1.000 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 7753732 7753733 CDR20291_1807 CDR20291_1808 vncS   FALSE 0.010 524.000 0.000 1.000   NA
 7753733 7753734 CDR20291_1808 CDR20291_1809     FALSE 0.006 742.000 0.000 NA   NA
 7753734 7753735 CDR20291_1809 CDR20291_1810     FALSE 0.004 3733.000 0.000 NA   NA
 7753739 7753740 CDR20291_1814 CDR20291_1815     FALSE 0.009 506.000 0.000 NA   NA
 7753740 7753741 CDR20291_1815 CDR20291_1816     TRUE 0.953 -16.000 0.000 NA   NA
 7753742 7753743 CDR20291_1817 CDR20291_1818     TRUE 0.606 45.000 0.000 NA   NA
 7753743 7753744 CDR20291_1818 CDR20291_1819     FALSE 0.193 139.000 0.000 1.000 N NA
 7753744 7753745 CDR20291_1819 CDR20291_1820     FALSE 0.064 219.000 0.000 NA   NA
 7753746 7753747 CDR20291_1821 CDR20291_1822     TRUE 0.546 54.000 0.000 NA   NA
 7753747 7753748 CDR20291_1822 CDR20291_1823     FALSE 0.109 180.000 0.000 NA   NA
 7753749 7753750 CDR20291_1824 CDR20291_1826     FALSE 0.086 195.000 0.000 1.000 N NA
 7753751 7753752 CDR20291_1827 CDR20291_1828   pduQ FALSE 0.119 174.000 0.000 NA   NA
 7753752 7753753 CDR20291_1828 CDR20291_1829 pduQ pduU FALSE 0.050 241.000 0.000 1.000 N NA
 7753753 7753754 CDR20291_1829 CDR20291_1830 pduU pduV TRUE 0.979 8.000 0.000 1.000 Y NA
 7753754 7753755 CDR20291_1830 CDR20291_1831 pduV   TRUE 0.868 102.000 0.103 1.000 N NA
 7753755 7753756 CDR20291_1831 CDR20291_1832     TRUE 0.999 -7.000 0.388 1.000 Y NA
 7753756 7753757 CDR20291_1832 CDR20291_1833   eutA FALSE 0.086 184.000 0.000 NA N NA
 7753757 7753758 CDR20291_1833 CDR20291_1834 eutA eutB TRUE 0.999 18.000 0.600 NA Y NA
 7753758 7753759 CDR20291_1834 CDR20291_1835 eutB eutC TRUE 0.998 13.000 0.119 0.001 Y NA
 7753759 7753760 CDR20291_1835 CDR20291_1836 eutC eutL TRUE 0.999 20.000 0.617 1.000 Y NA
 7753760 7753761 CDR20291_1836 CDR20291_1837 eutL   TRUE 0.869 11.000 0.000 NA N NA
 7753761 7753762 CDR20291_1837 CDR20291_1838     TRUE 0.981 3.000 0.000 NA Y NA
 7753762 7753763 CDR20291_1838 CDR20291_1839   eutM TRUE 0.951 96.000 0.349 NA   NA
 7753763 7753764 CDR20291_1839 CDR20291_1840 eutM eutT TRUE 0.907 127.000 0.357 NA   NA
 7753764 7753765 CDR20291_1840 CDR20291_1841 eutT   TRUE 0.997 13.000 0.452 NA N NA
 7753765 7753766 CDR20291_1841 CDR20291_1842     TRUE 0.987 42.000 0.459 NA   NA
 7753766 7753767 CDR20291_1842 CDR20291_1843   eutN TRUE 0.997 13.000 0.487 NA   NA
 7753767 7753768 CDR20291_1843 CDR20291_1844 eutN   TRUE 0.999 -7.000 0.385 NA Y NA
 7753768 7753769 CDR20291_1844 CDR20291_1845   eutH TRUE 0.999 0.000 0.552 NA N NA
 7753769 7753770 CDR20291_1845 CDR20291_1846 eutH eutQ TRUE 1.000 2.000 0.759 NA Y NA
 7753770 7753771 CDR20291_1846 CDR20291_1847 eutQ   FALSE 0.008 480.000 0.000 NA N NA
 7753771 7753772 CDR20291_1847 CDR20291_1848     FALSE 0.019 379.000 0.000 1.000   NA
 7753772 7753773 CDR20291_1848 CDR20291_1849     TRUE 0.862 20.000 0.000 NA   NA
 7753773 7753774 CDR20291_1849 CDR20291_1850     TRUE 0.713 32.000 0.000 NA N NA
 7753774 7753775 CDR20291_1850 CDR20291_1851     FALSE 0.006 947.000 0.000 1.000   NA
 7753775 7753776 CDR20291_1851 CDR20291_1852     TRUE 0.953 -7.000 0.000 1.000   NA
 7753776 7753777 CDR20291_1852 CDR20291_1853     FALSE 0.026 329.000 0.000 1.000   NA
 7753778 7753779 CDR20291_1854 CDR20291_1855 dinR   TRUE 0.904 59.000 0.012 0.051 N NA
 7753779 7753780 CDR20291_1855 CDR20291_1856     FALSE 0.023 322.000 0.000 NA   NA
 7753780 7753781 CDR20291_1856 CDR20291_1857     TRUE 0.770 30.000 0.000 NA   NA
 7753781 7753782 CDR20291_1857 CDR20291_1858   spoVS FALSE 0.155 153.000 0.000 NA   NA
 7753782 7753783 CDR20291_1858 CDR20291_1859 spoVS accA FALSE 0.093 189.000 0.000 NA   NA
 7753783 7753784 CDR20291_1859 CDR20291_1860 accA accD TRUE 0.999 21.000 0.234 0.001 Y NA
 7753784 7753785 CDR20291_1860 CDR20291_1861 accD accC TRUE 0.996 15.000 0.090 1.000 Y NA
 7753785 7753786 CDR20291_1861 CDR20291_1862 accC accB TRUE 0.997 16.000 0.071 0.001 Y NA
 7753786 7753787 CDR20291_1862 CDR20291_1863 accB   FALSE 0.037 270.000 0.000 NA   NA
 7753787 7753788 CDR20291_1863 CDR20291_1864     FALSE 0.006 682.000 0.000 NA   NA
 7753788 7753789 CDR20291_1864 CDR20291_1865     FALSE 0.214 129.000 0.000 NA   NA
 7753789 7753790 CDR20291_1865 CDR20291_1866     TRUE 0.342 99.000 0.000 NA   NA
 7753790 7753791 CDR20291_1866 CDR20291_1867     FALSE 0.011 453.000 0.000 NA   NA
 7753791 7753792 CDR20291_1867 CDR20291_1868     FALSE 0.155 153.000 0.000 NA   NA
 7753792 7753793 CDR20291_1868 CDR20291_1869     TRUE 0.990 38.000 0.500 NA   NA
 7753793 7753794 CDR20291_1869 CDR20291_1870     FALSE 0.036 273.000 0.000 1.000 N NA
 7753794 7753795 CDR20291_1870 CDR20291_1871     TRUE 0.996 3.000 0.238 1.000 N NA
 7753795 7753796 CDR20291_1871 CDR20291_1872     FALSE 0.115 220.000 0.000 0.073 N NA
 7753798 7753799 CDR20291_1874 CDR20291_1875     FALSE 0.170 148.000 0.000 1.000 N NA
 7753801 7753802 CDR20291_1877 CDR20291_1878     TRUE 0.997 0.000 0.286 1.000 N NA
 7753802 7753803 CDR20291_1878 CDR20291_1879     TRUE 0.957 77.000 0.286 1.000 N NA
 7753803 7753804 CDR20291_1879 CDR20291_1880     TRUE 1.000 2.000 0.800 1.000 Y NA
 7753805 7753806 CDR20291_1881 CDR20291_1882     FALSE 0.145 158.000 0.000 NA   NA
 7753806 7753807 CDR20291_1882 CDR20291_1883     TRUE 0.991 -19.000 0.000 1.000 Y NA
 7753807 7753808 CDR20291_1883 CDR20291_1884     TRUE 0.426 82.000 0.000 1.000 N NA
 7753808 7753809 CDR20291_1884 CDR20291_1885     TRUE 0.880 13.000 0.000 1.000 N NA
 7753810 7753811 CDR20291_1886 CDR20291_1887     TRUE 0.978 33.000 0.120 1.000   NA
 7753811 7753812 CDR20291_1887 CDR20291_1888     FALSE 0.132 177.000 0.000 1.000   NA
 7753812 7753813 CDR20291_1888 CDR20291_1889     FALSE 0.108 190.000 0.000 1.000   NA
 7753813 7753814 CDR20291_1889 CDR20291_1890     FALSE 0.018 361.000 0.000 NA   NA
 7753814 7753815 CDR20291_1890 CDR20291_1891     TRUE 0.350 193.000 0.011 NA   NA
 7753815 7753816 CDR20291_1891 CDR20291_1892     TRUE 0.884 49.000 0.011 NA   NA
 7753816 7753817 CDR20291_1892 CDR20291_1893     TRUE 0.613 44.000 0.000 NA   NA
 7753817 7753818 CDR20291_1893 CDR20291_1894     TRUE 0.388 90.000 0.000 NA   NA
 7753818 7753819 CDR20291_1894 CDR20291_1895     TRUE 0.507 73.000 0.000 1.000   NA
 7753819 7753820 CDR20291_1895 CDR20291_1896     TRUE 0.487 69.000 0.000 1.000 N NA
 7753820 7753821 CDR20291_1896 CDR20291_1897   hfQ TRUE 0.757 127.000 0.064 1.000   NA
 7753821 7753822 CDR20291_1897 CDR20291_1898 hfQ miaA TRUE 0.887 114.000 0.192 1.000   NA
 7753822 7753823 CDR20291_1898 CDR20291_1899 miaA mutL TRUE 0.986 23.000 0.097 1.000 N NA
 7753823 7753824 CDR20291_1899 CDR20291_1900 mutL mutS TRUE 0.999 11.000 0.220 0.002 Y NA
 7753824 7753825 CDR20291_1900 CDR20291_1901 mutS   FALSE 0.138 163.000 0.000 1.000 N NA
 7753825 7753826 CDR20291_1901 CDR20291_1902     TRUE 1.000 -19.000 0.554 NA Y NA
 7753826 7753827 CDR20291_1902 CDR20291_1903     TRUE 0.999 22.000 0.584 NA Y NA
 7753827 7753828 CDR20291_1903 CDR20291_1904     TRUE 0.991 -25.000 0.006 NA   NA
 7753828 7753829 CDR20291_1904 CDR20291_1905     FALSE 0.004 1283.000 0.000 NA   NA
 7753830 7753831 CDR20291_1906 CDR20291_1907     FALSE 0.011 454.000 0.000 NA   NA
 7753831 7753832 CDR20291_1907 CDR20291_1908     FALSE 0.070 225.000 0.000 1.000   NA
 7753832 7753833 CDR20291_1908 CDR20291_1909     FALSE 0.028 298.000 0.000 NA   NA
 7753834 7753835 CDR20291_1910 CDR20291_1911     FALSE 0.014 395.000 0.000 NA   NA
 7753835 7753836 CDR20291_1911 CDR20291_1912   trpP FALSE 0.005 827.000 0.000 NA   NA
 7753836 7753837 CDR20291_1912 CDR20291_1913 trpP   FALSE 0.005 980.000 0.000 NA   NA
 7753837 7753838 CDR20291_1913 CDR20291_1914     FALSE 0.019 356.000 0.000 NA   NA
 7753839 7753840 CDR20291_1915 CDR20291_1916 cspC   FALSE 0.006 938.000 0.000 1.000   NA
 7753841 7753842 CDR20291_1917 CDR20291_1918     FALSE 0.008 542.000 0.000 NA   NA
 7753842 7753843 CDR20291_1918 CDR20291_1919     FALSE 0.048 244.000 0.000 NA   NA
 7753843 7753844 CDR20291_1919 CDR20291_1920     TRUE 0.999 -19.000 0.667 NA   NA
 7753844 7753845 CDR20291_1920 CDR20291_1921     FALSE 0.006 963.000 0.000 1.000   NA
 7753845 7753846 CDR20291_1921 CDR20291_1922     FALSE 0.206 144.000 0.000 1.000   NA
 7753846 7753847 CDR20291_1922 CDR20291_1923     FALSE 0.105 229.000 0.000 0.049 N NA
 7753849 7753850 CDR20291_1925 CDR20291_1926 fldX ispD FALSE 0.012 476.000 0.000 1.000   NA
 7753850 7753851 CDR20291_1926 CDR20291_1927 ispD ilvD FALSE 0.024 341.000 0.000 1.000   NA
 7753857 7753858 CDR20291_1933 CDR20291_1934 clpB   TRUE 0.910 37.000 0.003 NA   NA
 7753858 7753859 CDR20291_1934 CDR20291_1935     TRUE 0.988 17.000 0.105 NA   NA
 7753860 7753861 CDR20291_1936 CDR20291_1937     TRUE 0.998 -3.000 0.389 1.000 N NA
 7753861 7753862 CDR20291_1937 CDR20291_1938     TRUE 0.932 0.000 0.000 NA   NA
 7753862 7753863 CDR20291_1938 CDR20291_1939     FALSE 0.009 494.000 0.000 NA   NA
 7753863 7753864 CDR20291_1939 CDR20291_1940     FALSE 0.106 191.000 0.000 1.000   NA
 7753864 7753865 CDR20291_1940 CDR20291_1941   racX FALSE 0.140 162.000 0.000 1.000 N NA
 7753866 7753867 CDR20291_1942 CDR20291_1943   argF FALSE 0.221 127.000 0.000 NA   NA
 7753867 7753868 CDR20291_1943 CDR20291_1944 argF argM TRUE 0.678 109.000 0.000 1.000 Y NA
 7753868 7753869 CDR20291_1944 CDR20291_1945 argM argB TRUE 0.985 30.000 0.022 1.000 Y NA
 7753869 7753870 CDR20291_1945 CDR20291_1946 argB argJ TRUE 0.999 15.000 0.239 0.002 Y NA
 7753870 7753871 CDR20291_1946 CDR20291_1947 argJ argC TRUE 0.996 42.000 0.303 0.002 Y NA
 7753871 7753872 CDR20291_1947 CDR20291_1948 argC   FALSE 0.006 690.000 0.000 NA   NA
 7753875 7753876 CDR20291_1951 CDR20291_1952     FALSE 0.005 1022.000 0.000 NA   NA
 7753876 7753877 CDR20291_1952 CDR20291_1953     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 7753878 7753879 CDR20291_1954 CDR20291_1955     FALSE 0.004 1616.000 0.000 NA   NA
 7753879 7753880 CDR20291_1955 CDR20291_1956     FALSE 0.017 394.000 0.000 1.000   NA
 7753880 7753881 CDR20291_1956 CDR20291_1957   rluB TRUE 0.862 58.000 0.005 1.000   NA
 7753883 7753884 CDR20291_1959 CDR20291_1960   lysA FALSE 0.096 199.000 0.000 1.000   NA
 7753884 7753885 CDR20291_1960 CDR20291_1961 lysA lysC TRUE 0.991 18.000 0.016 1.000 Y NA
 7753885 7753886 CDR20291_1961 CDR20291_1962 lysC   FALSE 0.018 361.000 0.000 NA   NA
 7753886 7753887 CDR20291_1962 CDR20291_1963     TRUE 0.506 170.000 0.030 NA   NA
 7753887 7753888 CDR20291_1963 CDR20291_1964     FALSE 0.014 397.000 0.000 NA   NA
 7753888 7753889 CDR20291_1964 CDR20291_1965     FALSE 0.149 156.000 0.000 NA   NA
 7753891 7753892 CDR20291_1967 CDR20291_1968     TRUE 0.978 27.000 0.062 1.000   NA
 7753892 7753893 CDR20291_1968 CDR20291_1969     FALSE 0.021 336.000 0.000 NA   NA
 7753893 7753894 CDR20291_1969 CDR20291_1970     TRUE 0.349 98.000 0.000 NA   NA
 7753898 7753899 CDR20291_1974 CDR20291_1975     FALSE 0.082 199.000 0.000 NA   NA
 7753899 7753900 CDR20291_1975 CDR20291_1976     FALSE 0.024 338.000 0.000 1.000   NA
 7753900 7753901 CDR20291_1976 CDR20291_1977     TRUE 0.938 -3.000 0.000 NA   NA
 7753901 7753902 CDR20291_1977 CDR20291_1978     TRUE 0.878 98.000 0.104 NA   NA
 7753902 7753903 CDR20291_1978 CDR20291_1979     FALSE 0.104 183.000 0.000 NA   NA
 7753903 7753904 CDR20291_1979 CDR20291_1980   xdhA1 FALSE 0.284 103.000 0.000 NA N NA
 7753904 7753905 CDR20291_1980 CDR20291_1981 xdhA1 pucC1 TRUE 0.993 -7.000 0.000 0.023 Y NA
 7753905 7753906 CDR20291_1981 CDR20291_1982 pucC1 pbuX TRUE 0.387 91.000 0.000 1.000 N NA
 7753906 7753907 CDR20291_1982 CDR20291_1983 pbuX   FALSE 0.004 1347.000 0.000 NA   NA
 7753907 7753908 CDR20291_1983 CDR20291_1984   pyrD FALSE 0.055 230.000 0.000 NA   NA
 7753908 7753909 CDR20291_1984 CDR20291_1985 pyrD   TRUE 0.923 36.000 0.000 1.000 Y NA
 7753909 7753910 CDR20291_1985 CDR20291_1986   xdhA2 TRUE 0.927 1.000 0.000 1.000 N NA
 7753910 7753911 CDR20291_1986 CDR20291_1987 xdhA2 pucC2 TRUE 0.993 -10.000 0.000 0.023 Y NA
 7753911 7753912 CDR20291_1987 CDR20291_1988 pucC2 xdhC TRUE 0.997 9.000 0.056 0.035 Y NA
 7753912 7753913 CDR20291_1988 CDR20291_1989 xdhC   TRUE 0.567 51.000 0.000 1.000 N NA
 7753913 7753914 CDR20291_1989 CDR20291_1990     TRUE 0.986 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7753914 7753915 CDR20291_1990 CDR20291_1991     FALSE 0.207 133.000 0.000 1.000 N NA
 7753915 7753916 CDR20291_1991 CDR20291_1992   dpaL1 TRUE 0.594 127.000 0.000 1.000 Y NA
 7753916 7753917 CDR20291_1992 CDR20291_1993 dpaL1   FALSE 0.018 363.000 0.000 NA   NA
 7753917 7753918 CDR20291_1993 CDR20291_1994     TRUE 0.883 83.000 0.069 NA   NA
 7753918 7753919 CDR20291_1994 CDR20291_1995   cutS TRUE 1.000 3.000 0.667 0.035 Y NA
 7753919 7753920 CDR20291_1995 CDR20291_1996 cutS   TRUE 0.514 62.000 0.000 1.000 N NA
 7753920 7753921 CDR20291_1996 CDR20291_1997     TRUE 0.996 46.000 0.667 1.000 Y NA
 7753921 7753922 CDR20291_1997 CDR20291_1998     FALSE 0.230 277.000 0.000 0.023 Y NA
 7753922 7753923 CDR20291_1998 CDR20291_1999     FALSE 0.024 320.000 0.000 1.000 N NA
 7753923 7753924 CDR20291_1999 CDR20291_2000     FALSE 0.018 327.000 0.000 NA N NA
 7753924 7753925 CDR20291_2000 CDR20291_2001     TRUE 0.999 -7.000 0.759 NA   NA
 7753925 7753926 CDR20291_2001 CDR20291_2002     TRUE 0.813 29.000 0.000 1.000   NA
 7753926 7753927 CDR20291_2002 CDR20291_2003     TRUE 0.569 50.000 0.000 NA   NA
 7753927 7753928 CDR20291_2003 CDR20291_2004     TRUE 0.660 39.000 0.000 NA   NA
 7753928 7753929 CDR20291_2004 CDR20291_2005     FALSE 0.031 286.000 0.000 NA   NA
 7753929 7753930 CDR20291_2005 CDR20291_2006     FALSE 0.188 140.000 0.000 NA   NA
 7753930 7753931 CDR20291_2006 CDR20291_2007     TRUE 0.999 4.000 0.200 0.035 Y NA
 7753931 7753932 CDR20291_2007 CDR20291_2008     TRUE 0.999 0.000 0.194 0.035 Y NA
 7753932 7753933 CDR20291_2008 CDR20291_2009     FALSE 0.086 195.000 0.000 1.000 N NA
 7753933 7753934 CDR20291_2009 CDR20291_2010     FALSE 0.006 651.000 0.000 NA   NA
 7753934 7753935 CDR20291_2010 CDR20291_2011     FALSE 0.323 103.000 0.000 NA   NA
 7753935 7753936 CDR20291_2011 CDR20291_2012     TRUE 0.964 47.000 0.167 NA   NA
 7753939 7753940 CDR20291_2015 CDR20291_2016     TRUE 0.676 60.000 0.000 0.071 N NA
 7753943 7753944 CDR20291_2019 CDR20291_2020     FALSE 0.023 323.000 0.000 NA   NA
 7753944 7753945 CDR20291_2020 CDR20291_2021     TRUE 0.999 -16.000 0.214 1.000 Y NA
 7753945 7753946 CDR20291_2021 CDR20291_2022     FALSE 0.142 160.000 0.000 1.000 N NA
 7753949 7753950 CDR20291_2025 CDR20291_2026 thrC thrB TRUE 0.998 10.000 0.233 1.000 Y NA
 7753950 7753951 CDR20291_2026 CDR20291_2027 thrB   FALSE 0.113 187.000 0.000 1.000   NA
 7753958 7753959 CDR20291_2034 CDR20291_2035   ispG FALSE 0.019 348.000 0.000 NA   NA
 7753959 7753960 CDR20291_2035 CDR20291_2036 ispG   TRUE 0.591 183.000 0.092 1.000 N NA
 7753960 7753961 CDR20291_2036 CDR20291_2037   dxr TRUE 0.997 13.000 0.568 1.000 N NA
 7753961 7753962 CDR20291_2037 CDR20291_2038 dxr   FALSE 0.136 164.000 0.000 1.000 N NA
 7753964 7753965 CDR20291_2040 CDR20291_2041   sA FALSE 0.005 824.000 0.000 1.000 N NA
 7753965 7753966 CDR20291_2041 CDR20291_2042 sA uppS TRUE 0.995 13.000 0.055 1.000 Y NA
 7753966 7753967 CDR20291_2042 CDR20291_2043 uppS   TRUE 0.946 29.000 0.003 NA   NA
 7753967 7753968 CDR20291_2043 CDR20291_2044   rrf TRUE 0.981 3.000 0.003 NA   NA
 7753968 7753969 CDR20291_2044 CDR20291_2045 rrf pyrH TRUE 0.997 26.000 0.626 1.000 N NA
 7753969 7753970 CDR20291_2045 CDR20291_2046 pyrH tsf TRUE 0.966 85.000 0.416 1.000 N NA
 7753970 7753971 CDR20291_2046 CDR20291_2047 tsf rpsB TRUE 0.994 79.000 0.748 1.000 Y NA
 7753971 7753972 CDR20291_2047 CDR20291_2048 rpsB   FALSE 0.075 207.000 0.000 1.000 N NA
 7753972 7753973 CDR20291_2048 CDR20291_2049     TRUE 0.923 95.000 0.200 NA   NA
 7753973 7753974 CDR20291_2049 CDR20291_2050     FALSE 0.068 214.000 0.000 NA   NA
 7753976 7753977 CDR20291_2052 CDR20291_2053     FALSE 0.008 537.000 0.000 NA   NA
 7753977 7753978 CDR20291_2053 CDR20291_2054     FALSE 0.048 246.000 0.000 NA   NA
 7753978 7753979 CDR20291_2054 CDR20291_2055     TRUE 0.662 259.000 0.500 NA N NA
 7753979 7753980 CDR20291_2055 CDR20291_2056     FALSE 0.051 239.000 0.000 NA   NA
 7753980 7753981 CDR20291_2056 CDR20291_2057     FALSE 0.006 697.000 0.000 NA   NA
 7753982 7753983 CDR20291_2058 CDR20291_2059     FALSE 0.015 381.000 0.000 NA   NA
 7753983 7753984 CDR20291_2059 CDR20291_2060     TRUE 0.974 15.000 0.011 NA   NA
 7753984 7753985 CDR20291_2060 CDR20291_2061     TRUE 0.946 36.000 0.028 1.000   NA
 7753985 7753986 CDR20291_2061 CDR20291_2062     TRUE 0.999 1.000 0.237 0.001 Y NA
 7753986 7753987 CDR20291_2062 CDR20291_2063     TRUE 0.384 91.000 0.000 NA   NA
 7753988 7753989 CDR20291_2064 CDR20291_2065 gabT   FALSE 0.030 292.000 0.000 NA   NA
 7753989 7753990 CDR20291_2065 CDR20291_2066     FALSE 0.260 115.000 0.000 NA   NA
 7753990 7753991 CDR20291_2066 CDR20291_2067     FALSE 0.145 158.000 0.000 NA   NA
 7753991 7753992 CDR20291_2067 CDR20291_2068     FALSE 0.300 107.000 0.000 NA   NA
 7753992 7753993 CDR20291_2068 CDR20291_2069     TRUE 0.602 52.000 0.000 1.000   NA
 7753995 7753996 CDR20291_2071 CDR20291_2072   msrAB FALSE 0.157 153.000 0.000 1.000 N NA
 7753996 7753997 CDR20291_2072 CDR20291_2073 msrAB   FALSE 0.280 118.000 0.000 1.000   NA
 7753997 7753998 CDR20291_2073 CDR20291_2074   hcp FALSE 0.023 346.000 0.000 1.000   NA
 7753998 7753999 CDR20291_2074 CDR20291_2075 hcp   TRUE 0.958 60.000 0.039 NA Y NA
 7754001 7754002 CDR20291_2077 CDR20291_2078     FALSE 0.007 592.000 0.000 1.000 N NA
 7754002 7754003 CDR20291_2078 CDR20291_2079     FALSE 0.328 109.000 0.000 1.000   NA
 7754003 7754004 CDR20291_2079 CDR20291_2080     FALSE 0.280 118.000 0.000 1.000   NA
 7754004 7754005 CDR20291_2080 CDR20291_2081     TRUE 0.994 60.000 0.429 0.023 Y NA
 7754005 7754006 CDR20291_2081 CDR20291_2082     TRUE 0.332 236.000 0.000 0.006 Y NA
 7754006 7754007 CDR20291_2082 CDR20291_2083     TRUE 1.000 -7.000 0.667 0.023 Y NA
 7754007 7754008 CDR20291_2083 CDR20291_2084     FALSE 0.011 407.000 0.000 NA N NA
 7754008 7754009 CDR20291_2084 CDR20291_2085     TRUE 0.970 14.000 0.000 NA Y NA
 7754011 7754012 CDR20291_2087 CDR20291_2088   csdA FALSE 0.051 237.000 0.000 NA   NA
 7754012 7754013 CDR20291_2088 CDR20291_2089 csdA   FALSE 0.023 325.000 0.000 1.000 N NA
 7754013 7754014 CDR20291_2089 CDR20291_2090     FALSE 0.036 290.000 0.000 1.000   NA
 7754014 7754015 CDR20291_2090 CDR20291_2091     TRUE 0.996 28.000 0.667 NA   NA
 7754015 7754016 CDR20291_2091 CDR20291_2092     FALSE 0.053 234.000 0.000 NA   NA
 7754016 7754017 CDR20291_2092 CDR20291_2093     TRUE 0.584 48.000 0.000 NA   NA
 7754017 7754018 CDR20291_2093 CDR20291_2094   mapA FALSE 0.059 226.000 0.000 1.000 N NA
 7754018 7754019 CDR20291_2094 CDR20291_2095 mapA pgmB TRUE 0.947 -3.000 0.000 1.000   NA
 7754019 7754020 CDR20291_2095 CDR20291_2096 pgmB   FALSE 0.071 224.000 0.000 1.000   NA
 7754020 7754021 CDR20291_2096 CDR20291_2097     FALSE 0.042 258.000 0.000 1.000 N NA
 7754021 7754022 CDR20291_2097 CDR20291_2098     FALSE 0.091 191.000 0.000 NA   NA
 7754022 7754023 CDR20291_2098 CDR20291_2099     TRUE 0.634 42.000 0.000 NA   NA
 7754024 7754025 CDR20291_2100 CDR20291_2101     TRUE 0.336 92.000 0.000 NA N NA
 7754026 7754027 CDR20291_2102 CDR20291_2103     TRUE 0.855 124.000 0.024 1.000 Y NA
 7754027 7754028 CDR20291_2103 CDR20291_2104     TRUE 1.000 3.000 0.797 0.002 Y NA
 7754028 7754029 CDR20291_2104 CDR20291_2105     TRUE 0.995 2.000 0.014 1.000 Y NA
 7754029 7754030 CDR20291_2105 CDR20291_2106     TRUE 0.936 17.000 0.000 0.035   NA
 7754030 7754031 CDR20291_2106 CDR20291_2107     TRUE 0.886 15.000 0.000 1.000   NA
 7754031 7754032 CDR20291_2107 CDR20291_2108     FALSE 0.284 103.000 0.000 NA N NA
 7754033 7754034 CDR20291_2109 CDR20291_2110     TRUE 0.844 24.000 0.000 1.000 N NA
 7754035 7754036 CDR20291_2111 CDR20291_2112     TRUE 0.454 75.000 0.000 NA   NA
 7754036 7754037 CDR20291_2112 CDR20291_2113   aldH FALSE 0.191 139.000 0.000 NA   NA
 7754037 7754038 CDR20291_2113 CDR20291_2114 aldH   FALSE 0.118 312.000 0.000 1.000 Y NA
 7754038 7754039 CDR20291_2114 CDR20291_2115     TRUE 0.979 23.000 0.043 1.000 N NA
 7754039 7754040 CDR20291_2115 CDR20291_2116     FALSE 0.114 233.000 0.000 0.043   NA
 7754040 7754041 CDR20291_2116 CDR20291_2117     FALSE 0.007 719.000 0.000 1.000   NA
 7754041 7754042 CDR20291_2117 CDR20291_2118     TRUE 1.000 2.000 0.933 0.003 Y NA
 7754042 7754043 CDR20291_2118 CDR20291_2119     TRUE 0.907 68.000 0.067 1.000 N NA
 7754043 7754044 CDR20291_2119 CDR20291_2120     FALSE 0.027 305.000 0.000 1.000 N NA
 7754045 7754046 CDR20291_2121 CDR20291_2122     TRUE 0.939 22.000 0.000 0.020   NA
 7754046 7754047 CDR20291_2122 CDR20291_2123     FALSE 0.163 150.000 0.000 NA   NA
 7754050 7754051 CDR20291_2126 CDR20291_2127     TRUE 0.356 97.000 0.000 NA   NA
 7754051 7754052 CDR20291_2127 CDR20291_2128     FALSE 0.081 200.000 0.000 NA   NA
 7754052 7754053 CDR20291_2128 CDR20291_2129   nirC FALSE 0.037 268.000 0.000 NA   NA
 7754053 7754054 CDR20291_2129 CDR20291_2130 nirC asrC TRUE 0.537 57.000 0.000 1.000 N NA
 7754054 7754055 CDR20291_2130 CDR20291_2131 asrC asrB TRUE 1.000 13.000 0.720 0.023 Y NA
 7754055 7754056 CDR20291_2131 CDR20291_2132 asrB asrA TRUE 0.999 1.000 0.750 0.023   NA
 7754056 7754057 CDR20291_2132 CDR20291_2133 asrA   FALSE 0.266 390.000 0.227 1.000   NA
 7754057 7754058 CDR20291_2133 CDR20291_2134     TRUE 0.738 48.000 0.000 0.047 N NA
 7754058 7754059 CDR20291_2134 CDR20291_2135     TRUE 0.995 19.000 0.081 1.000 Y NA
 7754059 7754060 CDR20291_2135 CDR20291_2136     TRUE 0.919 58.000 0.054 1.000   NA
 7754060 7754061 CDR20291_2136 CDR20291_2137     TRUE 0.730 160.000 0.143 NA   NA
 7754061 7754062 CDR20291_2137 CDR20291_2138     TRUE 0.808 130.000 0.148 NA N NA
 7754062 7754063 CDR20291_2138 CDR20291_2139   nanA TRUE 0.989 33.000 0.074 1.000 Y NA
 7754063 7754064 CDR20291_2139 CDR20291_2140 nanA nanE TRUE 0.481 70.000 0.000 1.000 N NA
 7754064 7754065 CDR20291_2140 CDR20291_2141 nanE   FALSE 0.035 273.000 0.000 NA   NA
 7754065 7754066 CDR20291_2141 CDR20291_2142     TRUE 0.856 22.000 0.000 NA   NA
 7754068 7754069 CDR20291_2144 CDR20291_2145 asnS   FALSE 0.010 479.000 0.000 NA   NA
 7754069 7754070 CDR20291_2145 CDR20291_2146   cspC FALSE 0.038 265.000 0.000 NA   NA
 7754070 7754071 CDR20291_2146 CDR20291_2147 cspC cspBA TRUE 0.999 10.000 1.000 0.001   NA
 7754071 7754072 CDR20291_2147 CDR20291_2148 cspBA   FALSE 0.131 166.000 0.000 NA   NA
 7754072 7754073 CDR20291_2148 CDR20291_2149     TRUE 0.996 21.000 0.431 NA   NA
 7754074 7754075 CDR20291_2150 CDR20291_2151     FALSE 0.161 151.000 0.000 NA   NA
 7754076 7754077 CDR20291_2152 CDR20291_2153 kamA   FALSE 0.065 402.000 0.000 1.000 Y NA
 7754081 7754082 CDR20291_2157 CDR20291_2158     TRUE 0.883 18.000 0.000 1.000   NA
 7754084 7754085 CDR20291_2160 CDR20291_2161     FALSE 0.190 253.000 0.000 1.000 Y NA
 7754085 7754086 CDR20291_2161 CDR20291_2162     FALSE 0.011 454.000 0.000 1.000 N NA
 7754086 7754087 CDR20291_2162 CDR20291_2163     FALSE 0.280 111.000 0.000 NA   NA
 7754087 7754088 CDR20291_2163 CDR20291_2164     FALSE 0.008 529.000 0.000 NA   NA
 7754088 7754089 CDR20291_2164 CDR20291_2165     TRUE 0.796 28.000 0.000 NA   NA
 7754089 7754090 CDR20291_2165 CDR20291_2166     FALSE 0.016 380.000 0.000 NA   NA
 7754090 7754091 CDR20291_2166 CDR20291_2167     FALSE 0.007 572.000 0.000 NA   NA
 7754091 7754092 CDR20291_2167 CDR20291_2168   fruK TRUE 0.998 37.000 0.816 1.000 Y NA
 7754092 7754093 CDR20291_2168 CDR20291_2169 fruK   FALSE 0.131 167.000 0.000 1.000 N NA
 7754093 7754094 CDR20291_2169 CDR20291_2170     TRUE 0.885 12.000 0.000 1.000 N NA
 7754096 7754097 CDR20291_2172 CDR20291_2173     FALSE 0.317 104.000 0.000 NA   NA
 7754099 7754100 CDR20291_2175 CDR20291_2176   araD TRUE 0.970 18.000 0.000 1.000 Y NA
 7754100 7754101 CDR20291_2176 CDR20291_2177 araD   TRUE 0.671 75.000 0.000 0.013 N NA
 7754101 7754102 CDR20291_2177 CDR20291_2178     FALSE 0.023 326.000 0.000 1.000 N NA
 7754102 7754103 CDR20291_2178 CDR20291_2179     TRUE 0.871 181.000 0.385 0.035   NA
 7754103 7754104 CDR20291_2179 CDR20291_2180     TRUE 0.949 123.000 0.400 0.021   NA
 7754104 7754105 CDR20291_2180 CDR20291_2181     TRUE 0.999 33.000 0.667 0.024 Y NA
 7754106 7754107 CDR20291_2182 CDR20291_2183     FALSE 0.005 909.000 0.000 NA   NA
 7754107 7754108 CDR20291_2183 CDR20291_2184     TRUE 0.663 108.000 0.000 NA Y NA
 7754108 7754109 CDR20291_2184 CDR20291_2185     FALSE 0.144 278.000 0.000 NA Y NA
 7754109 7754110 CDR20291_2185 CDR20291_2186     TRUE 0.997 -7.000 0.225 NA   NA
 7754111 7754112 CDR20291_2187 CDR20291_2188     TRUE 0.785 187.000 0.087 1.000 Y NA
 7754112 7754113 CDR20291_2188 CDR20291_2189     FALSE 0.013 796.000 0.000 0.049   NA
 7754113 7754114 CDR20291_2189 CDR20291_2190     TRUE 0.612 96.000 0.000 0.008   NA
 7754116 7754117 CDR20291_2192 CDR20291_2193     FALSE 0.034 281.000 0.000 NA   NA
 7754118 7754119 CDR20291_2194 CDR20291_2195     TRUE 0.998 2.000 0.500 NA   NA
 7754120 7754121 CDR20291_2196 CDR20291_2197     TRUE 0.820 72.000 0.000 1.000 Y NA
 7754122 7754123 CDR20291_2199 CDR20291_2200 cspD   FALSE 0.007 635.000 0.000 1.000 N NA
 7754123 7754124 CDR20291_2200 CDR20291_2201   modB TRUE 0.998 10.000 0.556 1.000 N NA
 7754124 7754125 CDR20291_2201 CDR20291_2202 modB   TRUE 0.998 2.000 0.444 1.000 N NA
 7754125 7754126 CDR20291_2202 CDR20291_2203     TRUE 0.995 -13.000 0.067 NA   NA
 7754126 7754127 CDR20291_2203 CDR20291_2204     FALSE 0.025 315.000 0.000 NA   NA
 7754127 7754128 CDR20291_2204 CDR20291_2205     FALSE 0.008 541.000 0.000 NA   NA
 7754128 7754129 CDR20291_2205 CDR20291_2206     TRUE 0.991 -19.000 0.000 1.000 Y NA
 7754130 7754131 CDR20291_2207 CDR20291_2208   rpe TRUE 0.768 110.000 0.000 0.022 Y NA
 7754131 7754132 CDR20291_2208 CDR20291_2209 rpe rpiB1 TRUE 0.909 39.000 0.000 1.000 Y NA
 7754132 7754133 CDR20291_2209 CDR20291_2210 rpiB1 tkt' TRUE 0.406 175.000 0.000 1.000 Y NA
 7754133 7754134 CDR20291_2210 CDR20291_2211 tkt' tkt TRUE 0.998 3.000 0.080 0.001 Y NA
 7754134 7754135 CDR20291_2211 CDR20291_2212 tkt   TRUE 0.829 92.000 0.040 1.000 N NA
 7754135 7754136 CDR20291_2212 CDR20291_2213   gatD TRUE 0.993 0.000 0.000 0.001 Y NA
 7754136 7754137 CDR20291_2213 CDR20291_2214 gatD gatC FALSE 0.213 130.000 0.000 1.000 N NA
 7754137 7754138 CDR20291_2214 CDR20291_2215 gatC gatB TRUE 0.984 59.000 0.111 0.035 Y NA
 7754138 7754139 CDR20291_2215 CDR20291_2216 gatB gatA TRUE 0.984 61.000 0.111 0.021 Y NA
 7754139 7754140 CDR20291_2216 CDR20291_2217 gatA   FALSE 0.016 589.000 0.000 0.024 N NA
 7754140 7754141 CDR20291_2217 CDR20291_2218   tal1 FALSE 0.161 152.000 0.000 1.000 N NA
 7754141 7754142 CDR20291_2218 CDR20291_2219 tal1 xpt TRUE 0.507 64.000 0.000 1.000 N NA
 7754142 7754143 CDR20291_2219 CDR20291_2220 xpt mtlD FALSE 0.015 390.000 0.000 1.000 N NA
 7754143 7754144 CDR20291_2220 CDR20291_2221 mtlD mtlF TRUE 0.998 19.000 0.292 1.000 Y NA
 7754144 7754145 CDR20291_2221 CDR20291_2222 mtlF mtlR TRUE 0.994 30.000 0.336 0.024 N NA
 7754145 7754146 CDR20291_2222 CDR20291_2223 mtlR mtlA TRUE 0.996 26.000 0.336 0.024 N NA
 7754148 7754149 CDR20291_2225 CDR20291_2226     TRUE 0.719 115.000 0.032 NA   NA
 7754149 7754150 CDR20291_2226 CDR20291_2227   abfH FALSE 0.031 287.000 0.000 NA   NA
 7754150 7754151 CDR20291_2227 CDR20291_2228 abfH abfT TRUE 0.970 20.000 0.000 1.000 Y NA
 7754151 7754152 CDR20291_2228 CDR20291_2229 abfT   TRUE 0.842 24.000 0.000 NA   NA
 7754152 7754153 CDR20291_2229 CDR20291_2230   abfD TRUE 0.686 135.000 0.049 NA   NA
 7754153 7754154 CDR20291_2230 CDR20291_2231 abfD sucD FALSE 0.088 193.000 0.000 1.000 N NA
 7754154 7754155 CDR20291_2231 CDR20291_2232 sucD cat1 TRUE 0.994 31.000 0.182 1.000 Y NA
 7754155 7754156 CDR20291_2232 CDR20291_2233 cat1   TRUE 0.988 27.000 0.182 NA   NA
 7754158 7754159 CDR20291_2235 CDR20291_2236     FALSE 0.272 113.000 0.000 NA   NA
 7754159 7754160 CDR20291_2236 CDR20291_2237   grdD FALSE 0.026 310.000 0.000 1.000 N NA
 7754160 7754161 CDR20291_2237 CDR20291_2238 grdD grdC TRUE 0.999 11.000 0.622 0.002   NA
 7754161 7754162 CDR20291_2238 CDR20291_2239 grdC grdB FALSE 0.028 503.000 0.000 0.002   NA
 7754162 7754163 CDR20291_2239 CDR20291_2240 grdB grdA TRUE 0.906 32.000 0.000 0.001   NA
 7754163 7754164 CDR20291_2240 CDR20291_2241 grdA grdE TRUE 0.788 247.000 0.417 0.002   NA
 7754164 7754165 CDR20291_2241 CDR20291_2242 grdE trxA2 TRUE 0.425 269.000 0.161 1.000   NA
 7754165 7754166 CDR20291_2242 CDR20291_2243 trxA2 trxB3 TRUE 0.945 85.000 0.226 1.000   NA
 7754166 7754167 CDR20291_2243 CDR20291_2244 trxB3 grdX TRUE 0.941 96.000 0.286 NA   NA
 7754167 7754168 CDR20291_2244 CDR20291_2245 grdX   FALSE 0.008 546.000 0.000 NA   NA
 7754170 7754171 CDR20291_2247 CDR20291_2248     TRUE 0.986 13.000 0.054 1.000   NA
 7754171 7754172 CDR20291_2248 CDR20291_2249     TRUE 0.953 -18.000 0.000 NA   NA
 7754172 7754173 CDR20291_2249 CDR20291_2250     TRUE 0.842 24.000 0.000 NA   NA
 7754173 7754174 CDR20291_2250 CDR20291_2251     TRUE 0.998 10.000 0.500 NA   NA
 7754174 7754175 CDR20291_2251 CDR20291_2252     TRUE 0.994 5.000 0.158 NA   NA
 7754175 7754176 CDR20291_2252 CDR20291_2253     TRUE 0.985 35.000 0.263 NA   NA
 7754176 7754177 CDR20291_2253 CDR20291_2254     TRUE 0.994 -7.000 0.056 NA   NA
 7754177 7754178 CDR20291_2254 CDR20291_2255     TRUE 0.980 27.000 0.078 NA   NA
 7754178 7754179 CDR20291_2255 CDR20291_2256     FALSE 0.172 147.000 0.000 NA   NA
 7754179 7754180 CDR20291_2256 CDR20291_2257   nadC FALSE 0.042 256.000 0.000 NA   NA
 7754180 7754181 CDR20291_2257 CDR20291_2258 nadC nadB TRUE 0.998 -19.000 0.046 1.000 Y NA
 7754181 7754182 CDR20291_2258 CDR20291_2259 nadB nadA TRUE 0.994 13.000 0.042 1.000 Y NA
 7754183 7754184 CDR20291_2260 CDR20291_2261     FALSE 0.061 223.000 0.000 NA   NA
 7754184 7754185 CDR20291_2261 CDR20291_2262     TRUE 0.931 60.000 0.091 NA   NA
 7754186 7754187 CDR20291_2263 CDR20291_2264     FALSE 0.117 175.000 0.000 NA   NA
 7754187 7754188 CDR20291_2264 CDR20291_2265     TRUE 0.525 59.000 0.000 NA   NA
 7754188 7754189 CDR20291_2265 CDR20291_2266     FALSE 0.065 218.000 0.000 NA   NA
 7754189 7754190 CDR20291_2266 CDR20291_2267   iorB TRUE 0.970 53.000 0.053 1.000 Y NA
 7754190 7754191 CDR20291_2267 CDR20291_2268 iorB iorA TRUE 1.000 2.000 0.766 0.001 Y NA
 7754191 7754192 CDR20291_2268 CDR20291_2269 iorA   TRUE 0.865 19.000 0.000 1.000 N NA
 7754192 7754193 CDR20291_2269 CDR20291_2270     FALSE 0.040 262.000 0.000 1.000 N NA
 7754193 7754194 CDR20291_2270 CDR20291_2271     TRUE 0.979 8.000 0.000 1.000 Y NA
 7754194 7754195 CDR20291_2271 CDR20291_2272     TRUE 0.983 18.000 0.000 0.006 Y NA
 7754195 7754196 CDR20291_2272 CDR20291_2273     FALSE 0.134 164.000 0.000 NA   NA
 7754198 7754199 CDR20291_2275 CDR20291_2276     FALSE 0.048 245.000 0.000 NA   NA
 7754199 7754200 CDR20291_2276 CDR20291_2277     TRUE 0.979 5.000 0.000 NA Y NA
 7754200 7754201 CDR20291_2277 CDR20291_2278     FALSE 0.005 1747.000 0.000 1.000   NA
 7754201 7754202 CDR20291_2278 CDR20291_2279     FALSE 0.224 126.000 0.000 NA   NA
 7754202 7754203 CDR20291_2279 CDR20291_2280     TRUE 0.988 -7.000 0.000 NA Y NA
 7754203 7754204 CDR20291_2280 CDR20291_2281     FALSE 0.007 643.000 0.000 NA   NA
 7754204 7754205 CDR20291_2281 CDR20291_2282     FALSE 0.030 292.000 0.000 NA   NA
 7754205 7754206 CDR20291_2282 CDR20291_2283     FALSE 0.019 354.000 0.000 NA   NA
 7754206 7754207 CDR20291_2283 CDR20291_2284     TRUE 0.615 128.000 0.007 1.000   NA
 7754207 7754208 CDR20291_2284 CDR20291_2285     FALSE 0.143 159.000 0.000 NA   NA
 7754208 7754209 CDR20291_2285 CDR20291_2286     FALSE 0.013 413.000 0.000 NA   NA
 7754209 7754210 CDR20291_2286 CDR20291_2287     FALSE 0.020 370.000 0.000 1.000   NA
 7754210 7754211 CDR20291_2287 CDR20291_2288     TRUE 0.660 39.000 0.000 NA   NA
 7754212 7754213 CDR20291_2289 CDR20291_2290   cotJB2 TRUE 0.990 0.000 0.031 NA   NA
 7754213 7754214 CDR20291_2290 CDR20291_2291 cotJB2 cotJC2 TRUE 0.785 29.000 0.000 NA   NA
 7754215 7754216 CDR20291_2292 CDR20291_2293   dut FALSE 0.034 260.000 0.000 NA N NA
 7754219 7754220 CDR20291_2296 CDR20291_2297     TRUE 0.998 4.000 0.333 0.069 N NA
 7754220 7754221 CDR20291_2297 CDR20291_2298     TRUE 0.728 34.000 0.000 1.000 N NA
 7754222 7754223 CDR20291_2299 CDR20291_2300     FALSE 0.008 556.000 0.000 NA   NA
 7754223 7754224 CDR20291_2300 CDR20291_2301   ppdK FALSE 0.092 190.000 0.000 NA   NA
 7754224 7754225 CDR20291_2301 CDR20291_2302 ppdK   TRUE 0.938 46.000 0.065 NA   NA
 7754225 7754226 CDR20291_2302 CDR20291_2303     TRUE 0.991 7.000 0.089 NA   NA
 7754226 7754227 CDR20291_2303 CDR20291_2304     FALSE 0.012 436.000 0.000 NA   NA
 7754227 7754228 CDR20291_2304 CDR20291_2305   srlB TRUE 0.960 37.000 0.087 NA N NA
 7754228 7754229 CDR20291_2305 CDR20291_2306 srlB   TRUE 0.714 35.000 0.000 NA   NA
 7754229 7754230 CDR20291_2306 CDR20291_2307     TRUE 0.867 69.000 0.028 NA   NA
 7754230 7754231 CDR20291_2307 CDR20291_2308   srlE FALSE 0.276 156.000 0.000 0.026 N NA
 7754231 7754232 CDR20291_2308 CDR20291_2309 srlE srlA TRUE 0.999 13.000 0.250 0.021 Y NA
 7754232 7754233 CDR20291_2309 CDR20291_2310 srlA   FALSE 0.019 376.000 0.000 1.000   NA
 7754233 7754234 CDR20291_2310 CDR20291_2311     FALSE 0.116 185.000 0.000 1.000   NA
 7754234 7754235 CDR20291_2311 CDR20291_2312     FALSE 0.124 182.000 0.000 1.000   NA
 7754235 7754236 CDR20291_2312 CDR20291_2313   acp TRUE 0.581 56.000 0.000 1.000   NA
 7754236 7754237 CDR20291_2313 CDR20291_2314 acp   FALSE 0.006 576.000 0.000 NA N NA
 7754237 7754238 CDR20291_2314 CDR20291_2315     TRUE 0.816 24.000 0.000 NA N NA
 7754238 7754239 CDR20291_2315 CDR20291_2316     TRUE 0.773 30.000 0.000 1.000 N NA
 7754239 7754240 CDR20291_2316 CDR20291_2317     TRUE 0.998 18.000 0.400 1.000 Y NA
 7754240 7754241 CDR20291_2317 CDR20291_2318     TRUE 0.470 157.000 0.000 1.000 Y NA
 7754241 7754242 CDR20291_2318 CDR20291_2319     TRUE 0.999 13.000 0.797 1.000 Y NA
 7754242 7754243 CDR20291_2319 CDR20291_2320     TRUE 0.995 3.000 0.021 1.000 Y NA
 7754243 7754244 CDR20291_2320 CDR20291_2321     TRUE 0.896 29.000 0.000 0.034   NA
 7754244 7754245 CDR20291_2321 CDR20291_2322     FALSE 0.039 283.000 0.000 1.000   NA
 7754247 7754248 CDR20291_2324 CDR20291_2325 glyS glyQ TRUE 1.000 0.000 0.651 0.001 Y NA
 7754248 7754249 CDR20291_2325 CDR20291_2326 glyQ   TRUE 0.439 160.000 0.003 NA   NA
 7754249 7754250 CDR20291_2326 CDR20291_2327   recO TRUE 0.988 -7.000 0.003 NA   NA
 7754250 7754251 CDR20291_2327 CDR20291_2328 recO   FALSE 0.305 194.000 0.002 1.000 N NA
 7754251 7754252 CDR20291_2328 CDR20291_2329   era TRUE 0.978 12.000 0.007 1.000   NA
 7754252 7754253 CDR20291_2329 CDR20291_2330 era d TRUE 0.926 64.000 0.077 1.000   NA
 7754253 7754254 CDR20291_2330 CDR20291_2331 d   TRUE 0.719 119.000 0.040 1.000 N NA
 7754254 7754255 CDR20291_2331 CDR20291_2332     TRUE 0.984 6.000 0.023 NA   NA
 7754255 7754256 CDR20291_2332 CDR20291_2333     TRUE 0.981 57.000 0.457 NA   NA
 7754256 7754257 CDR20291_2333 CDR20291_2334   spoIV TRUE 0.967 38.000 0.114 NA   NA
 7754257 7754258 CDR20291_2334 CDR20291_2335 spoIV   TRUE 0.993 49.000 0.851 NA   NA
 7754258 7754259 CDR20291_2335 CDR20291_2336     FALSE 0.074 207.000 0.000 NA   NA
 7754259 7754260 CDR20291_2336 CDR20291_2337     FALSE 0.074 193.000 0.000 NA N NA
 7754260 7754261 CDR20291_2337 CDR20291_2338   rpsU FALSE 0.317 111.000 0.000 1.000   NA
 7754261 7754262 CDR20291_2338 CDR20291_2339 rpsU rpsU TRUE 0.990 30.000 0.150 0.017   NA
 7754262 7754263 CDR20291_2339 CDR20291_2340 rpsU   TRUE 0.647 163.000 0.071 1.000   NA
 7754263 7754264 CDR20291_2340 CDR20291_2341     TRUE 0.895 43.000 0.006 1.000 N NA
 7754264 7754265 CDR20291_2341 CDR20291_2342     TRUE 0.986 2.000 0.013 NA   NA
 7754265 7754266 CDR20291_2342 CDR20291_2343   prmA TRUE 0.993 19.000 0.227 NA   NA
 7754266 7754267 CDR20291_2343 CDR20291_2344 prmA   FALSE 0.014 441.000 0.000 1.000   NA
 7754267 7754268 CDR20291_2344 CDR20291_2345     TRUE 0.807 27.000 0.000 NA   NA
 7754268 7754269 CDR20291_2345 CDR20291_2346     TRUE 0.863 16.000 0.000 NA   NA
 7754269 7754270 CDR20291_2346 CDR20291_2347     TRUE 0.862 20.000 0.000 NA   NA
 7754270 7754271 CDR20291_2347 CDR20291_2348     TRUE 0.907 5.000 0.000 NA   NA
 7754272 7754273 CDR20291_2349 CDR20291_2350     TRUE 0.998 30.000 1.000 NA   NA
 7754274 7754275 CDR20291_2351 CDR20291_2352   glcK TRUE 0.699 36.000 0.000 NA   NA
 7754275 7754276 CDR20291_2352 CDR20291_2353 glcK dnaJ FALSE 0.005 966.000 0.000 1.000 N NA
 7754276 7754277 CDR20291_2353 CDR20291_2354 dnaJ dnaK TRUE 0.878 211.000 0.196 0.002 Y NA
 7754277 7754278 CDR20291_2354 CDR20291_2355 dnaK grpE TRUE 0.984 92.000 0.224 0.005 Y NA
 7754278 7754279 CDR20291_2355 CDR20291_2356 grpE hrcA TRUE 0.989 30.000 0.286 1.000 N NA
 7754279 7754280 CDR20291_2356 CDR20291_2357 hrcA hemN TRUE 0.891 76.000 0.062 1.000 N NA
 7754280 7754281 CDR20291_2357 CDR20291_2358 hemN   FALSE 0.124 172.000 0.000 1.000 N NA
 7754281 7754282 CDR20291_2358 CDR20291_2359     FALSE 0.054 233.000 0.000 1.000 N NA
 7754282 7754283 CDR20291_2359 CDR20291_2360   lepA TRUE 0.790 76.000 0.002 1.000 N NA
 7754283 7754284 CDR20291_2360 CDR20291_2361 lepA   FALSE 0.033 282.000 0.000 NA   NA
 7754284 7754285 CDR20291_2361 CDR20291_2362   spoIIP TRUE 0.759 31.000 0.000 NA   NA
 7754285 7754286 CDR20291_2362 CDR20291_2363 spoIIP gpr TRUE 0.997 18.000 0.521 NA   NA
 7754286 7754287 CDR20291_2363 CDR20291_2364 gpr   FALSE 0.020 343.000 0.000 NA   NA
 7754287 7754288 CDR20291_2364 CDR20291_2365     TRUE 0.725 34.000 0.000 NA   NA
 7754290 7754291 CDR20291_2367 CDR20291_2368     TRUE 0.907 5.000 0.000 NA   NA
 7754291 7754292 CDR20291_2368 CDR20291_2369     FALSE 0.260 115.000 0.000 NA   NA
 7754292 7754293 CDR20291_2369 CDR20291_2370     TRUE 0.995 9.000 0.217 NA   NA
 7754295 7754296 CDR20291_2372 CDR20291_2373     FALSE 0.011 490.000 0.000 1.000   NA
 7754296 7754297 CDR20291_2373 CDR20291_2374   ung FALSE 0.054 249.000 0.000 1.000   NA
 7754297 7754298 CDR20291_2374 CDR20291_2375 ung   TRUE 0.933 37.000 0.022 NA   NA
 7754300 7754301 CDR20291_2377 CDR20291_2378     TRUE 0.861 54.000 0.000 1.000 Y NA
 7754301 7754302 CDR20291_2378 CDR20291_2379     TRUE 0.722 105.000 0.011 1.000 N NA
 7754302 7754303 CDR20291_2379 CDR20291_2380     TRUE 1.000 25.000 0.875 0.024 Y NA
 7754303 7754304 CDR20291_2380 CDR20291_2381     TRUE 0.903 59.000 0.000 0.021 Y NA
 7754304 7754305 CDR20291_2381 CDR20291_2382     TRUE 0.935 15.000 0.000 0.024 N NA
 7754305 7754306 CDR20291_2382 CDR20291_2383     TRUE 0.397 88.000 0.000 1.000 N NA
 7754308 7754309 CDR20291_2385 CDR20291_2386   selB FALSE 0.151 156.000 0.000 1.000 N NA
 7754309 7754310 CDR20291_2386 CDR20291_2387 selB fdhA TRUE 0.972 114.000 0.569 0.001 N NA
 7754310 7754311 CDR20291_2387 CDR20291_2388 fdhA selD TRUE 0.994 18.000 0.055 1.000 Y NA
 7754311 7754312 CDR20291_2388 CDR20291_2389 selD comE TRUE 0.375 188.000 0.012 1.000 N NA
 7754314 7754315 CDR20291_2391 CDR20291_2392   argH FALSE 0.046 249.000 0.000 NA   NA
 7754315 7754316 CDR20291_2392 CDR20291_2393 argH   FALSE 0.019 377.000 0.000 1.000   NA
 7754318 7754319 CDR20291_2395 CDR20291_2396     FALSE 0.023 325.000 0.000 1.000 N NA
 7754320 7754321 CDR20291_2397 CDR20291_2398     TRUE 0.912 4.000 0.000 1.000 N NA
 7754322 7754323 CDR20291_2399 CDR20291_2400     TRUE 0.593 47.000 0.000 NA   NA
 7754323 7754324 CDR20291_2400 CDR20291_2401     TRUE 0.337 101.000 0.000 1.000 N NA
 7754324 7754325 CDR20291_2401 CDR20291_2402     TRUE 0.992 97.000 0.750 1.000 Y NA
 7754325 7754326 CDR20291_2402 CDR20291_2403     TRUE 0.945 96.000 0.286 1.000   NA
 7754326 7754327 CDR20291_2403 CDR20291_2404     TRUE 0.880 21.000 0.000 1.000   NA
 7754327 7754328 CDR20291_2404 CDR20291_2405     FALSE 0.027 284.000 0.000 NA N NA
 7754328 7754329 CDR20291_2405 CDR20291_2406   tdcB TRUE 0.731 95.000 0.006 NA N NA
 7754330 7754331 CDR20291_2407 CDR20291_2408 aspD   TRUE 0.846 121.000 0.014 1.000 Y NA
 7754332 7754333 CDR20291_2409 CDR20291_2410   leuS FALSE 0.005 820.000 0.000 NA N NA
 7754333 7754334 CDR20291_2410 CDR20291_2411 leuS   FALSE 0.096 354.000 0.010 NA   NA
 7754334 7754335 CDR20291_2411 CDR20291_2412     TRUE 0.851 117.000 0.149 NA   NA
 7754335 7754336 CDR20291_2412 CDR20291_2413   nadD TRUE 0.999 1.000 0.199 1.000 Y NA
 7754337 7754338 CDR20291_2414 CDR20291_2415   gbeA FALSE 0.030 291.000 0.000 NA   NA
 7754339 7754340 CDR20291_2416 CDR20291_2417     TRUE 0.976 78.000 0.500 1.000   NA
 7754340 7754341 CDR20291_2417 CDR20291_2418     TRUE 0.337 100.000 0.000 NA   NA
 7754341 7754342 CDR20291_2418 CDR20291_2419     TRUE 0.988 19.000 0.094 NA   NA
 7754342 7754343 CDR20291_2419 CDR20291_2420     FALSE 0.035 279.000 0.000 1.000 N NA
 7754343 7754344 CDR20291_2420 CDR20291_2421     TRUE 0.945 -7.000 0.000 1.000 N NA
 7754344 7754345 CDR20291_2421 CDR20291_2422     TRUE 0.389 117.000 0.000 0.098 N NA
 7754345 7754346 CDR20291_2422 CDR20291_2423     TRUE 1.000 -6.000 0.500 1.000 Y NA
 7754346 7754347 CDR20291_2423 CDR20291_2424     FALSE 0.033 283.000 0.000 1.000 N NA
 7754347 7754348 CDR20291_2424 CDR20291_2425     FALSE 0.070 213.000 0.000 NA   NA
 7754352 7754353 CDR20291_2429 CDR20291_2430     TRUE 0.998 15.000 0.667 NA   NA
 7754353 7754354 CDR20291_2430 CDR20291_2431     TRUE 0.863 18.000 0.000 NA   NA
 7754354 7754355 CDR20291_2431 CDR20291_2432     TRUE 0.998 -28.000 0.250 NA   NA
 7754355 7754356 CDR20291_2432 CDR20291_2433     TRUE 0.908 5.000 0.000 1.000 N NA
 7754356 7754357 CDR20291_2433 CDR20291_2434     FALSE 0.052 236.000 0.000 NA   NA
 7754357 7754358 CDR20291_2434 CDR20291_2435     TRUE 0.534 57.000 0.000 NA   NA
 7754358 7754359 CDR20291_2435 CDR20291_2436     TRUE 0.999 16.000 0.714 0.022 Y NA
 7754359 7754360 CDR20291_2436 CDR20291_2437     TRUE 0.990 98.000 0.500 0.022 Y NA
 7754360 7754361 CDR20291_2437 CDR20291_2438     FALSE 0.028 323.000 0.000 1.000   NA
 7754361 7754362 CDR20291_2438 CDR20291_2439   tlpB TRUE 0.993 3.000 0.097 1.000   NA
 7754362 7754363 CDR20291_2439 CDR20291_2440 tlpB   TRUE 0.377 133.000 0.000 0.034   NA
 7754363 7754364 CDR20291_2440 CDR20291_2441     TRUE 0.941 13.000 0.000 0.024 N NA
 7754364 7754365 CDR20291_2441 CDR20291_2442     FALSE 0.020 344.000 0.000 NA   NA
 7754365 7754366 CDR20291_2442 CDR20291_2443   coaD TRUE 0.910 4.000 0.000 NA   NA
 7754366 7754367 CDR20291_2443 CDR20291_2444 coaD   TRUE 0.998 2.000 0.367 1.000 N NA
 7754367 7754368 CDR20291_2444 CDR20291_2445   recG TRUE 0.952 59.000 0.014 1.000 Y NA
 7754368 7754369 CDR20291_2445 CDR20291_2446 recG   TRUE 0.930 69.000 0.099 1.000   NA
 7754369 7754370 CDR20291_2446 CDR20291_2447     TRUE 0.997 19.000 0.567 NA   NA
 7754375 7754376 CDR20291_2452 CDR20291_2453     TRUE 0.999 3.000 0.200 0.021 Y NA
 7754376 7754377 CDR20291_2453 CDR20291_2454     TRUE 0.992 114.000 0.800 0.024 Y NA
 7754377 7754378 CDR20291_2454 CDR20291_2455     TRUE 0.968 75.000 0.100 1.000 Y NA
 7754379 7754380 CDR20291_2456 CDR20291_2457     TRUE 0.999 -28.000 0.100 1.000 Y NA
 7754380 7754381 CDR20291_2457 CDR20291_2458     FALSE 0.013 415.000 0.000 1.000 N NA
 7754381 7754382 CDR20291_2458 CDR20291_2459     TRUE 0.584 55.000 0.000 1.000   NA
 7754382 7754383 CDR20291_2459 CDR20291_2460     FALSE 0.239 131.000 0.000 1.000   NA
 7754383 7754384 CDR20291_2460 CDR20291_2461     TRUE 0.994 9.000 0.166 1.000 N NA
 7754384 7754385 CDR20291_2461 CDR20291_2462     TRUE 0.996 5.000 0.213 1.000   NA
 7754385 7754386 CDR20291_2462 CDR20291_2463     TRUE 0.555 62.000 0.000 1.000   NA
 7754386 7754387 CDR20291_2463 CDR20291_2464   stk TRUE 0.700 108.000 0.010 1.000 N NA
 7754387 7754388 CDR20291_2464 CDR20291_2465 stk stp TRUE 0.999 17.000 0.704 1.000 Y NA
 7754388 7754389 CDR20291_2465 CDR20291_2466 stp   TRUE 0.989 20.000 0.105 1.000   NA
 7754389 7754390 CDR20291_2466 CDR20291_2467   rsmB TRUE 0.993 8.000 0.135 1.000   NA
 7754390 7754391 CDR20291_2467 CDR20291_2468 rsmB   TRUE 0.921 62.000 0.076 NA   NA
 7754391 7754392 CDR20291_2468 CDR20291_2469     TRUE 0.889 69.000 0.047 NA   NA
 7754392 7754393 CDR20291_2469 CDR20291_2470   fmt TRUE 0.986 10.000 0.048 NA   NA
 7754393 7754394 CDR20291_2470 CDR20291_2471 fmt def2 TRUE 0.994 15.000 0.007 0.017 Y NA
 7754394 7754395 CDR20291_2471 CDR20291_2472 def2 priA TRUE 0.972 18.000 0.008 1.000 N NA
 7754395 7754396 CDR20291_2472 CDR20291_2473 priA coaBC TRUE 0.411 239.000 0.099 1.000 N NA
 7754396 7754397 CDR20291_2473 CDR20291_2474 coaBC rpoZ TRUE 0.998 -37.000 0.192 1.000 N NA
 7754397 7754398 CDR20291_2474 CDR20291_2475 rpoZ gmk TRUE 0.998 3.000 0.471 1.000 N NA
 7754398 7754399 CDR20291_2475 CDR20291_2476 gmk   TRUE 0.989 30.000 0.276 NA   NA
 7754399 7754400 CDR20291_2476 CDR20291_2477   dapF TRUE 0.983 4.000 0.012 NA   NA
 7754400 7754401 CDR20291_2477 CDR20291_2478 dapF ltaE FALSE 0.141 287.000 0.000 1.000 Y NA
 7754403 7754404 CDR20291_2480 CDR20291_2481   uraA FALSE 0.124 182.000 0.000 1.000   NA
 7754404 7754405 CDR20291_2481 CDR20291_2482 uraA pyrR TRUE 0.597 284.000 0.140 1.000 Y NA
 7754405 7754406 CDR20291_2482 CDR20291_2483 pyrR   FALSE 0.139 359.000 0.048 1.000 N NA
 7754406 7754407 CDR20291_2483 CDR20291_2484   lspA TRUE 0.991 5.000 0.082 1.000 N NA
 7754407 7754408 CDR20291_2484 CDR20291_2485 lspA   FALSE 0.026 310.000 0.000 1.000 N NA
 7754408 7754409 CDR20291_2485 CDR20291_2486     TRUE 0.573 50.000 0.000 1.000 N NA
 7754409 7754410 CDR20291_2486 CDR20291_2487     TRUE 0.367 184.000 0.000 1.000 Y NA
 7754410 7754411 CDR20291_2487 CDR20291_2488     TRUE 0.820 146.000 0.033 1.000 Y NA
 7754411 7754412 CDR20291_2488 CDR20291_2489     TRUE 1.000 5.000 0.744 0.020 Y NA
 7754413 7754414 CDR20291_2490 CDR20291_2491     FALSE 0.017 390.000 0.000 1.000   NA
 7754414 7754415 CDR20291_2491 CDR20291_2492     TRUE 0.989 53.000 0.400 0.002   NA
 7754416 7754417 CDR20291_2493 CDR20291_2494 trpS mtnN TRUE 0.965 23.000 0.004 1.000 N NA
 7754417 7754418 CDR20291_2494 CDR20291_2495 mtnN   FALSE 0.017 374.000 0.000 1.000 N NA
 7754422 7754423 CDR20291_2499 CDR20291_2500     TRUE 0.504 64.000 0.000 NA   NA
 7754423 7754424 CDR20291_2500 CDR20291_2501     FALSE 0.147 157.000 0.000 NA   NA
 7754424 7754425 CDR20291_2501 CDR20291_2502     FALSE 0.004 977.000 0.000 NA N NA
 7754425 7754426 CDR20291_2502 CDR20291_2503     FALSE 0.008 500.000 0.000 NA N NA
 7754426 7754427 CDR20291_2503 CDR20291_2504     TRUE 0.993 35.000 0.579 NA   NA
 7754427 7754428 CDR20291_2504 CDR20291_2505     TRUE 0.993 10.000 0.118 1.000   NA
 7754428 7754429 CDR20291_2505 CDR20291_2506     TRUE 0.994 19.000 0.246 NA   NA
 7754429 7754430 CDR20291_2506 CDR20291_2507     TRUE 0.932 40.000 0.032 NA   NA
 7754430 7754431 CDR20291_2507 CDR20291_2508     TRUE 0.976 10.000 0.004 NA   NA
 7754433 7754434 CDR20291_2510 CDR20291_2511     TRUE 0.997 17.000 0.569 NA   NA
 7754434 7754435 CDR20291_2511 CDR20291_2512     FALSE 0.030 290.000 0.000 NA   NA
 7754435 7754436 CDR20291_2512 CDR20291_2513   spoIVA FALSE 0.101 184.000 0.000 NA   NA
 7754436 7754437 CDR20291_2513 CDR20291_2514 spoIVA   FALSE 0.153 154.000 0.000 NA   NA
 7754437 7754438 CDR20291_2514 CDR20291_2515     FALSE 0.102 184.000 0.000 1.000 N NA
 7754438 7754439 CDR20291_2515 CDR20291_2516     TRUE 0.970 16.000 0.000 1.000 Y NA
 7754441 7754442 CDR20291_2518 CDR20291_2519 glyC   TRUE 0.984 31.000 0.168 1.000   NA
 7754442 7754443 CDR20291_2519 CDR20291_2520     TRUE 0.967 35.000 0.073 1.000   NA
 7754443 7754444 CDR20291_2520 CDR20291_2521     TRUE 0.977 28.000 0.061 1.000   NA
 7754444 7754445 CDR20291_2521 CDR20291_2522     FALSE 0.058 226.000 0.000 NA   NA
 7754445 7754446 CDR20291_2522 CDR20291_2523     TRUE 0.994 2.000 0.105 NA   NA
 7754446 7754447 CDR20291_2523 CDR20291_2524     TRUE 0.995 45.000 1.000 NA   NA
 7754447 7754448 CDR20291_2524 CDR20291_2525     TRUE 0.874 55.000 0.014 NA   NA
 7754448 7754449 CDR20291_2525 CDR20291_2526     TRUE 0.995 29.000 0.110 0.075 Y NA
 7754449 7754450 CDR20291_2526 CDR20291_2527     TRUE 0.976 15.000 0.018 NA   NA
 7754450 7754451 CDR20291_2527 CDR20291_2528     TRUE 0.988 0.000 0.013 NA   NA
 7754451 7754452 CDR20291_2528 CDR20291_2529     TRUE 0.976 22.000 0.025 NA   NA
 7754452 7754453 CDR20291_2529 CDR20291_2530   sigG TRUE 0.926 104.000 0.276 NA   NA
 7754453 7754454 CDR20291_2530 CDR20291_2531 sigG sigE TRUE 0.994 92.000 0.602 0.006 Y NA
 7754454 7754455 CDR20291_2531 CDR20291_2532 sigE spoIIGA TRUE 0.998 25.000 0.856 1.000   NA
 7754455 7754456 CDR20291_2532 CDR20291_2533 spoIIGA   FALSE 0.036 291.000 0.000 1.000   NA
 7754456 7754457 CDR20291_2533 CDR20291_2534   ftsZ FALSE 0.032 284.000 0.000 1.000 N NA
 7754457 7754458 CDR20291_2534 CDR20291_2535 ftsZ sbp TRUE 0.375 187.000 0.011 NA   NA
 7754458 7754459 CDR20291_2535 CDR20291_2536 sbp   TRUE 0.837 99.000 0.061 NA   NA
 7754459 7754460 CDR20291_2536 CDR20291_2537     TRUE 0.989 5.000 0.057 NA   NA
 7754460 7754461 CDR20291_2537 CDR20291_2538     TRUE 0.966 23.000 0.004 NA   NA
 7754461 7754462 CDR20291_2538 CDR20291_2539   murG TRUE 0.438 306.000 0.072 NA Y NA
 7754462 7754463 CDR20291_2539 CDR20291_2540 murG ftsW TRUE 0.989 18.000 0.120 1.000 N NA
 7754463 7754464 CDR20291_2540 CDR20291_2541 ftsW murD TRUE 0.959 52.000 0.067 0.002 N NA
 7754464 7754465 CDR20291_2541 CDR20291_2542 murD mraY TRUE 0.999 19.000 0.647 0.004 Y NA
 7754465 7754466 CDR20291_2542 CDR20291_2543 mraY murF TRUE 0.983 41.000 0.024 0.004 Y NA
 7754466 7754467 CDR20291_2543 CDR20291_2544 murF spoVD TRUE 0.433 167.000 0.000 1.000 Y NA
 7754467 7754468 CDR20291_2544 CDR20291_2545 spoVD   TRUE 0.884 12.000 0.000 NA   NA
 7754468 7754469 CDR20291_2545 CDR20291_2546   mraW FALSE 0.010 486.000 0.000 NA   NA
 7754469 7754470 CDR20291_2546 CDR20291_2547 mraW lgt TRUE 0.980 30.000 0.003 1.000 Y NA
 7754470 7754471 CDR20291_2547 CDR20291_2548 lgt   FALSE 0.147 397.000 0.079 1.000   NA
 7754471 7754472 CDR20291_2548 CDR20291_2549     TRUE 1.000 0.000 0.872 0.003   NA
 7754474 7754475 CDR20291_2551 CDR20291_2552   murE FALSE 0.036 271.000 0.000 1.000 N NA
 7754477 7754478 CDR20291_2554 CDR20291_2555 crr ptsG TRUE 0.892 10.000 0.000 NA   NA
 7754478 7754479 CDR20291_2555 CDR20291_2556 ptsG licT FALSE 0.027 303.000 0.000 NA   NA
 7754479 7754480 CDR20291_2556 CDR20291_2557 licT   FALSE 0.086 208.000 0.000 1.000   NA
 7754480 7754481 CDR20291_2557 CDR20291_2558   appF FALSE 0.184 152.000 0.000 1.000   NA
 7754481 7754482 CDR20291_2558 CDR20291_2559 appF appD TRUE 0.992 1.000 0.000 0.001 Y NA
 7754483 7754484 CDR20291_2560 CDR20291_2561 appA appB TRUE 0.992 106.000 0.688 0.022 Y NA
 7754484 7754485 CDR20291_2561 CDR20291_2562 appB appC TRUE 1.000 3.000 0.786 0.022 Y NA
 7754487 7754488 CDR20291_2564 CDR20291_2565 thlA2 ctfA TRUE 0.978 9.000 0.000 1.000 Y NA
 7754488 7754489 CDR20291_2565 CDR20291_2566 ctfA ctfB TRUE 0.991 0.000 0.000 0.040 Y NA
 7754489 7754490 CDR20291_2566 CDR20291_2567 ctfB bdhA TRUE 0.803 99.000 0.000 0.040 Y NA
 7754490 7754491 CDR20291_2567 CDR20291_2568 bdhA   TRUE 0.514 62.000 0.000 1.000 N NA
 7754491 7754492 CDR20291_2568 CDR20291_2569     FALSE 0.009 497.000 0.000 NA   NA
 7754493 7754494 CDR20291_2570 CDR20291_2571 nifJ   FALSE 0.009 518.000 0.000 1.000 N NA
 7754494 7754495 CDR20291_2571 CDR20291_2572     TRUE 0.514 72.000 0.000 1.000   NA
 7754495 7754496 CDR20291_2572 CDR20291_2573     TRUE 0.996 8.000 0.273 1.000   NA
 7754496 7754497 CDR20291_2573 CDR20291_2574     TRUE 0.970 43.000 0.182 NA   NA
 7754499 7754500 CDR20291_2576 CDR20291_2577 sspA   TRUE 0.819 84.000 0.012 1.000   NA
 7754500 7754501 CDR20291_2577 CDR20291_2578     TRUE 0.761 101.000 0.012 1.000   NA
 7754501 7754502 CDR20291_2578 CDR20291_2579   hpt TRUE 0.433 89.000 0.000 1.000   NA
 7754504 7754505 CDR20291_2581 CDR20291_2582     FALSE 0.225 125.000 0.000 NA   NA
 7754505 7754506 CDR20291_2582 CDR20291_2583   asnA FALSE 0.317 104.000 0.000 NA   NA
 7754506 7754507 CDR20291_2583 CDR20291_2584 asnA   FALSE 0.055 448.000 0.000 1.000 Y NA
 7754507 7754508 CDR20291_2584 CDR20291_2585     FALSE 0.040 281.000 0.000 1.000   NA
 7754508 7754509 CDR20291_2585 CDR20291_2586     TRUE 0.896 61.000 0.034 1.000   NA
 7754509 7754510 CDR20291_2586 CDR20291_2587     TRUE 0.993 2.000 0.014 0.002   NA
 7754512 7754513 CDR20291_2589 CDR20291_2590   brnQ FALSE 0.079 202.000 0.000 NA   NA
 7754513 7754514 CDR20291_2590 CDR20291_2591 brnQ   FALSE 0.186 141.000 0.000 NA   NA
 7754515 7754516 CDR20291_2592 CDR20291_2593     FALSE 0.198 147.000 0.000 1.000   NA
 7754517 7754518 CDR20291_2594 CDR20291_2595     FALSE 0.052 236.000 0.000 NA   NA
 7754518 7754519 CDR20291_2595 CDR20291_2596   ydiB TRUE 0.841 200.000 0.571 1.000   NA
 7754519 7754520 CDR20291_2596 CDR20291_2597 ydiB   TRUE 0.426 82.000 0.000 1.000 N NA
 7754520 7754521 CDR20291_2597 CDR20291_2598     TRUE 0.388 79.000 0.000 NA N NA
 7754523 7754524 CDR20291_2600 CDR20291_2601     FALSE 0.152 155.000 0.000 NA   NA
 7754524 7754525 CDR20291_2601 CDR20291_2602   galE TRUE 0.411 85.000 0.000 NA   NA
 7754525 7754526 CDR20291_2602 CDR20291_2603 galE gtaB TRUE 0.962 25.000 0.000 1.000 Y NA
 7754526 7754527 CDR20291_2603 CDR20291_2604 gtaB   FALSE 0.229 123.000 0.000 NA   NA
 7754527 7754528 CDR20291_2604 CDR20291_2605     TRUE 0.999 -10.000 0.500 NA   NA
 7754528 7754529 CDR20291_2605 CDR20291_2606     TRUE 0.937 122.000 0.500 NA   NA
 10864324 7754531 CDR20291_t57 CDR20291_r22   23SrRNA TRUE 0.650 40.000 0.000 NA   NA
 7754531 7754532 CDR20291_r22 CDR20291_r15 23SrRNA 16SrRNA FALSE 0.145 158.000 0.000 NA   NA
 7754534 7754535 CDR20291_2609 CDR20291_2610     FALSE 0.096 187.000 0.000 NA   NA
 7754535 7754536 CDR20291_2610 CDR20291_2611     TRUE 0.989 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 7754536 7754537 CDR20291_2611 CDR20291_2612     FALSE 0.104 183.000 0.000 NA   NA
 7754537 7754538 CDR20291_2612 CDR20291_2613     TRUE 0.915 3.000 0.000 NA   NA
 7754538 7754539 CDR20291_2613 CDR20291_2614     TRUE 0.997 -9.000 0.087 0.021 N NA
 7754539 7754540 CDR20291_2614 CDR20291_2615   glyA FALSE 0.024 323.000 0.000 1.000 N NA
 7754541 7754542 CDR20291_2616 CDR20291_2617     TRUE 0.998 0.000 0.375 NA   NA
 7754543 7754544 CDR20291_2618 CDR20291_2619     TRUE 0.993 15.000 0.222 NA   NA
 7754544 7754545 CDR20291_2619 CDR20291_2620     TRUE 0.949 43.000 0.077 NA   NA
 7754546 7754547 CDR20291_2621 CDR20291_2622     FALSE 0.195 138.000 0.000 1.000 N NA
 7754547 7754548 CDR20291_2622 CDR20291_2623   mleN TRUE 0.833 25.000 0.000 1.000 N NA
 7754551 7754552 CDR20291_2626 CDR20291_2627     TRUE 0.891 14.000 0.000 1.000   NA
 7754552 7754553 CDR20291_2627 CDR20291_2628   aspS FALSE 0.011 459.000 0.000 1.000 N NA
 7754553 7754554 CDR20291_2628 CDR20291_2629 aspS hisS TRUE 0.962 74.000 0.028 0.030 Y NA
 7754554 7754555 CDR20291_2629 CDR20291_2630 hisS   TRUE 0.996 -10.000 0.111 1.000 N NA
 7754555 7754556 CDR20291_2630 CDR20291_2631     TRUE 0.935 91.000 0.217 1.000   NA
 7754556 7754557 CDR20291_2631 CDR20291_2632   dtd TRUE 0.980 15.000 0.028 1.000   NA
 7754557 7754558 CDR20291_2632 CDR20291_2633 dtd relA TRUE 0.989 25.000 0.177 1.000 N NA
 7754558 7754559 CDR20291_2633 CDR20291_2634 relA apt TRUE 0.898 74.000 0.068 1.000 N NA
 7754559 7754560 CDR20291_2634 CDR20291_2635 apt recJ TRUE 0.991 13.000 0.128 1.000 N NA
 7754560 7754561 CDR20291_2635 CDR20291_2636 recJ ubiB TRUE 0.978 13.000 0.010 1.000   NA
 7754561 7754562 CDR20291_2636 CDR20291_2637 ubiB   FALSE 0.033 298.000 0.000 1.000   NA
 7754562 7754563 CDR20291_2637 CDR20291_2638     TRUE 0.970 29.000 0.043 1.000   NA
 7754563 7754564 CDR20291_2638 CDR20291_2639   agrD FALSE 0.027 305.000 0.000 NA   NA
 7754564 7754565 CDR20291_2639 CDR20291_2640 agrD agrB TRUE 0.770 30.000 0.000 NA   NA
 7754565 7754566 CDR20291_2640 CDR20291_2641 agrB   FALSE 0.017 368.000 0.000 NA   NA
 7754568 7754569 CDR20291_2643 CDR20291_2644 ptsI ptsH FALSE 0.136 353.000 0.000 0.024 Y NA
 7754569 7754570 CDR20291_2644 CDR20291_2645 ptsH   TRUE 0.838 192.000 0.500 1.000   NA
 7754570 7754571 CDR20291_2645 CDR20291_2646     TRUE 0.530 232.000 0.167 1.000   NA
 7754571 7754572 CDR20291_2646 CDR20291_2647     TRUE 0.650 40.000 0.000 NA   NA
 7754572 7754573 CDR20291_2647 CDR20291_2648     TRUE 0.900 3.000 0.000 NA N NA
 7754573 7754574 CDR20291_2648 CDR20291_2649     FALSE 0.025 315.000 0.000 1.000 N NA
 7754574 7754575 CDR20291_2649 CDR20291_2650   uppS TRUE 0.626 43.000 0.000 1.000 N NA
 7754578 7754579 CDR20291_2653 CDR20291_2654     FALSE 0.133 285.000 0.000 NA Y NA
 7754580 7754581 CDR20291_2655 CDR20291_2656     FALSE 0.027 302.000 0.000 NA   NA
 7754581 7754582 CDR20291_2656 CDR20291_2657     FALSE 0.295 199.000 0.000 NA Y NA
 7754582 7754583 CDR20291_2657 CDR20291_2658     TRUE 0.962 84.000 0.037 0.010 Y NA
 7754583 7754584 CDR20291_2658 CDR20291_2659   rkpK TRUE 0.980 6.000 0.000 1.000 Y NA
 7754584 7754585 CDR20291_2659 CDR20291_2660 rkpK tuaG TRUE 0.998 -22.000 0.034 NA Y NA
 7754585 7754586 CDR20291_2660 CDR20291_2661 tuaG   TRUE 0.902 48.000 0.023 NA   NA
 7754586 7754587 CDR20291_2661 CDR20291_2662     TRUE 0.989 22.000 0.133 NA   NA
 7754587 7754588 CDR20291_2662 CDR20291_2663     TRUE 0.996 29.000 0.286 NA Y NA
 7754588 7754589 CDR20291_2663 CDR20291_2664     TRUE 0.993 0.000 0.063 NA   NA
 7754589 7754590 CDR20291_2664 CDR20291_2665     TRUE 0.987 3.000 0.025 NA   NA
 7754590 7754591 CDR20291_2665 CDR20291_2666     TRUE 0.996 16.000 0.400 NA   NA
 7754591 7754592 CDR20291_2666 CDR20291_2667   manC TRUE 0.973 12.000 0.000 NA Y NA
 7754592 7754593 CDR20291_2667 CDR20291_2668 manC pgm2 TRUE 0.858 22.000 0.000 1.000 N NA
 7754593 7754594 CDR20291_2668 CDR20291_2669 pgm2 mviN TRUE 0.992 42.000 0.667 1.000   NA
 7754594 7754595 CDR20291_2669 CDR20291_2670 mviN   FALSE 0.260 115.000 0.000 NA   NA
 7754595 7754596 CDR20291_2670 CDR20291_2671     TRUE 0.966 95.000 0.500 NA   NA
 7754596 7754597 CDR20291_2671 CDR20291_2672     FALSE 0.271 208.000 0.000 NA Y NA
 7754597 7754598 CDR20291_2672 CDR20291_2673     FALSE 0.045 251.000 0.000 NA   NA
 7754600 7754601 CDR20291_2675 CDR20291_2676   cwp84 FALSE 0.028 297.000 0.000 NA   NA
 7754603 7754604 CDR20291_2678 CDR20291_2679 cwp66   TRUE 0.737 33.000 0.000 NA   NA
 7754604 7754605 CDR20291_2679 CDR20291_2680     FALSE 0.300 107.000 0.000 NA   NA
 7754605 7754606 CDR20291_2680 CDR20291_2681   secA2 FALSE 0.013 415.000 0.000 NA   NA
 7754606 7754607 CDR20291_2681 CDR20291_2682 secA2 slpA FALSE 0.051 237.000 0.000 NA   NA
 7754607 7754608 CDR20291_2682 CDR20291_2683 slpA   FALSE 0.058 226.000 0.000 NA   NA
 7754608 7754609 CDR20291_2683 CDR20291_2684     FALSE 0.064 219.000 0.000 NA   NA
 7754609 7754610 CDR20291_2684 CDR20291_2685     FALSE 0.017 367.000 0.000 NA   NA
 7754610 7754611 CDR20291_2685 CDR20291_2686     FALSE 0.072 210.000 0.000 NA   NA
 7754611 7754612 CDR20291_2686 CDR20291_2687     FALSE 0.015 381.000 0.000 NA   NA
 7754612 7754613 CDR20291_2687 CDR20291_2688     FALSE 0.012 432.000 0.000 NA   NA
 7754613 7754614 CDR20291_2688 CDR20291_2689     FALSE 0.005 835.000 0.000 NA   NA
 7754614 7754615 CDR20291_2689 CDR20291_2690     TRUE 0.946 40.000 0.055 NA   NA
 7754615 7754616 CDR20291_2690 CDR20291_2691   tgt TRUE 0.880 134.000 0.325 NA N NA
 7754616 7754617 CDR20291_2691 CDR20291_2692 tgt   TRUE 0.843 61.000 0.005 NA   NA
 7754617 7754618 CDR20291_2692 CDR20291_2693   queA TRUE 0.975 12.000 0.005 NA   NA
 7754618 7754619 CDR20291_2693 CDR20291_2694 queA ruvB FALSE 0.207 318.000 0.069 1.000 N NA
 7754619 7754620 CDR20291_2694 CDR20291_2695 ruvB ruvA TRUE 0.990 107.000 0.549 0.002 Y NA
 7754620 7754621 CDR20291_2695 CDR20291_2696 ruvA ruvC TRUE 1.000 -7.000 0.451 0.009 Y NA
 7754621 7754622 CDR20291_2696 CDR20291_2697 ruvC   FALSE 0.025 312.000 0.000 NA   NA
 7754623 7754624 CDR20291_2698 CDR20291_2699     FALSE 0.037 268.000 0.000 NA   NA
 7754625 7754626 CDR20291_2700 CDR20291_2701     TRUE 0.474 71.000 0.000 NA   NA
 7754626 7754627 CDR20291_2701 CDR20291_2702   garR TRUE 0.649 136.000 0.034 1.000 N NA
 7754628 7754629 CDR20291_2703 CDR20291_2704     FALSE 0.295 108.000 0.000 NA   NA
 7754629 7754630 CDR20291_2704 CDR20291_2705     FALSE 0.040 262.000 0.000 NA   NA
 7754631 7754632 CDR20291_2706 CDR20291_2707     TRUE 1.000 0.000 0.846 0.003 Y NA
 7754634 7754635 CDR20291_2709 CDR20291_2710     FALSE 0.008 661.000 0.000 1.000   NA
 7754635 7754636 CDR20291_2710 CDR20291_2711     TRUE 0.998 2.000 0.250 0.002   NA
 7754636 7754637 CDR20291_2711 CDR20291_2712     TRUE 0.891 14.000 0.000 1.000   NA
 7754639 7754640 CDR20291_2714 CDR20291_2715     FALSE 0.022 329.000 0.000 1.000 N NA
 7754640 7754641 CDR20291_2715 CDR20291_2716   tlpB FALSE 0.241 112.000 0.000 NA N NA
 7754641 7754642 CDR20291_2716 CDR20291_2717 tlpB   FALSE 0.004 853.000 0.000 NA N NA
 7754642 7754643 CDR20291_2717 CDR20291_2718     TRUE 0.997 2.000 0.267 1.000 N NA
 7754644 7754645 CDR20291_2719 CDR20291_2720     FALSE 0.275 119.000 0.000 1.000   NA
 7754646 7754647 CDR20291_2721 CDR20291_2722     FALSE 0.020 371.000 0.000 1.000   NA
 7754647 7754648 CDR20291_2722 CDR20291_2723     FALSE 0.027 324.000 0.000 1.000   NA
 7754648 7754649 CDR20291_2723 CDR20291_2724     FALSE 0.050 622.000 0.000 0.067 Y NA
 7754649 7754650 CDR20291_2724 CDR20291_2725   glyA FALSE 0.124 172.000 0.000 1.000 N NA
 7754650 7754651 CDR20291_2725 CDR20291_2726 glyA abgT TRUE 0.425 72.000 0.000 NA N NA
 7754651 7754652 CDR20291_2726 CDR20291_2727 abgT   TRUE 0.384 91.000 0.000 NA   NA
 7754652 7754653 CDR20291_2727 CDR20291_2728     FALSE 0.051 239.000 0.000 NA   NA
 7754653 7754654 CDR20291_2728 CDR20291_2729     FALSE 0.032 285.000 0.000 NA   NA
 7754654 7754655 CDR20291_2729 CDR20291_2730     TRUE 0.489 114.000 0.000 0.019   NA
 7754655 7754656 CDR20291_2730 CDR20291_2731   serS2 FALSE 0.036 368.000 0.000 0.096   NA
 7754656 7754657 CDR20291_2731 CDR20291_2732 serS2   FALSE 0.007 817.000 0.000 1.000   NA
 7754660 7754661 CDR20291_2735 CDR20291_2736   rbr TRUE 0.407 86.000 0.000 1.000 N NA
 7754662 7754663 CDR20291_2737 CDR20291_2738     TRUE 0.990 8.000 0.077 NA   NA
 7754663 7754664 CDR20291_2738 CDR20291_2739     TRUE 0.642 41.000 0.000 NA   NA
 7754664 7754665 CDR20291_2739 CDR20291_2740     FALSE 0.018 357.000 0.000 NA   NA
 7754665 7754666 CDR20291_2740 CDR20291_2741     FALSE 0.237 264.000 0.037 1.000 N NA
 7754666 7754667 CDR20291_2741 CDR20291_2742   dltC FALSE 0.077 217.000 0.000 1.000   NA
 7754667 7754668 CDR20291_2742 CDR20291_2743 dltC dltB TRUE 0.996 19.000 0.387 NA   NA
 7754668 7754669 CDR20291_2743 CDR20291_2744 dltB dltA TRUE 0.998 0.000 0.435 NA N NA
 7754669 7754670 CDR20291_2744 CDR20291_2745 dltA dltD TRUE 0.694 121.000 0.033 1.000 N NA
 7754670 7754671 CDR20291_2745 CDR20291_2746 dltD   FALSE 0.036 289.000 0.000 1.000   NA
 7754671 7754672 CDR20291_2746 CDR20291_2747     FALSE 0.115 176.000 0.000 NA   NA
 7754672 7754673 CDR20291_2747 CDR20291_2748     TRUE 0.538 56.000 0.000 NA   NA
 7754673 7754674 CDR20291_2748 CDR20291_2749     TRUE 0.893 29.000 0.000 0.039   NA
 7754674 7754675 CDR20291_2749 CDR20291_2750     FALSE 0.013 463.000 0.000 1.000   NA
 7754675 7754676 CDR20291_2750 CDR20291_2751     FALSE 0.280 111.000 0.000 NA   NA
 7754676 7754677 CDR20291_2751 CDR20291_2752     TRUE 0.996 13.000 0.400 NA   NA
 7754677 7754678 CDR20291_2752 CDR20291_2753     TRUE 0.559 52.000 0.000 NA   NA
 7754678 7754679 CDR20291_2753 CDR20291_2754     FALSE 0.041 261.000 0.000 1.000 N NA
 7754679 7754680 CDR20291_2754 CDR20291_2755     FALSE 0.016 411.000 0.000 1.000   NA
 7754680 7754681 CDR20291_2755 CDR20291_2756     TRUE 0.460 84.000 0.000 1.000   NA
 7754681 7754682 CDR20291_2756 CDR20291_2757     FALSE 0.253 127.000 0.000 1.000   NA
 7754682 7754683 CDR20291_2757 CDR20291_2758     TRUE 0.928 3.000 0.000 1.000   NA
 7754683 7754684 CDR20291_2758 CDR20291_2759     TRUE 0.873 14.000 0.000 NA   NA
 7754684 7754685 CDR20291_2759 CDR20291_2760     FALSE 0.272 113.000 0.000 NA   NA
 7754685 7754686 CDR20291_2760 CDR20291_2761     TRUE 1.000 -3.000 0.643 1.000 Y NA
 7754686 7754687 CDR20291_2761 CDR20291_2762     FALSE 0.180 143.000 0.000 NA   NA
 7754687 7754688 CDR20291_2762 CDR20291_2763   tldD TRUE 0.991 12.000 0.114 NA   NA
 7754689 7754690 CDR20291_2764 CDR20291_2765     FALSE 0.115 177.000 0.000 1.000 N NA
 7754690 7754691 CDR20291_2765 CDR20291_2766   kdgT FALSE 0.043 271.000 0.000 1.000   NA
 7754691 7754692 CDR20291_2766 CDR20291_2767 kdgT uxaA' TRUE 0.880 21.000 0.000 1.000   NA
 7754692 7754693 CDR20291_2767 CDR20291_2768 uxaA' uxaA TRUE 0.998 13.000 0.409 0.001   NA
 7754693 7754694 CDR20291_2768 CDR20291_2769 uxaA   FALSE 0.021 337.000 0.000 1.000 N NA
 7754695 7754696 CDR20291_2770 CDR20291_2771   fhuC TRUE 0.987 12.000 0.061 1.000 N NA
 7754696 7754697 CDR20291_2771 CDR20291_2772 fhuC fhuG TRUE 0.996 15.000 0.121 1.000 Y NA
 7754697 7754698 CDR20291_2772 CDR20291_2773 fhuG fhuB TRUE 0.999 6.000 0.217 0.021 Y NA
 7754698 7754699 CDR20291_2773 CDR20291_2774 fhuB fhuD TRUE 0.988 128.000 0.889 1.000 Y NA
 7754701 7754702 CDR20291_2776 CDR20291_2777 celC   TRUE 0.896 13.000 0.000 1.000   NA
 7754702 7754703 CDR20291_2777 CDR20291_2778   celF TRUE 0.921 26.000 0.000 0.021   NA
 7754703 7754704 CDR20291_2778 CDR20291_2779 celF celB TRUE 0.805 77.000 0.000 1.000 Y NA
 7754704 7754705 CDR20291_2779 CDR20291_2780 celB licB TRUE 0.981 22.000 0.000 0.020 Y NA
 7754705 7754706 CDR20291_2780 CDR20291_2781 licB   FALSE 0.082 200.000 0.000 1.000 N NA
 7754706 7754707 CDR20291_2781 CDR20291_2782     TRUE 0.371 95.000 0.000 1.000 N NA
 7754709 7754710 CDR20291_2784 CDR20291_2785     TRUE 0.996 5.000 0.125 0.021 N NA
 7754710 7754711 CDR20291_2785 CDR20291_2786     TRUE 0.925 96.000 0.111 0.021 N NA
 7754711 7754712 CDR20291_2786 CDR20291_2787   ntpD FALSE 0.078 205.000 0.000 1.000 N NA
 7754712 7754713 CDR20291_2787 CDR20291_2788 ntpD ntpB TRUE 0.999 6.000 0.238 0.004 Y NA
 7754713 7754714 CDR20291_2788 CDR20291_2789 ntpB ntpA TRUE 1.000 -3.000 0.776 0.004 Y NA
 7754714 7754715 CDR20291_2789 CDR20291_2790 ntpA ntpG TRUE 0.985 117.000 0.462 0.004 Y NA
 7754715 7754716 CDR20291_2790 CDR20291_2791 ntpG ntpC TRUE 1.000 -13.000 0.487 0.004 Y NA
 7754716 7754717 CDR20291_2791 CDR20291_2792 ntpC ntpE TRUE 0.999 15.000 0.258 0.004 Y NA
 7754717 7754718 CDR20291_2792 CDR20291_2793 ntpE ntpK TRUE 0.991 52.000 0.489 0.004   NA
 7754718 7754719 CDR20291_2793 CDR20291_2794 ntpK ntpI TRUE 0.999 3.000 0.848 0.004   NA
 7754719 7754720 CDR20291_2794 CDR20291_2795 ntpI   TRUE 0.985 2.000 0.010 NA   NA
 7754720 7754721 CDR20291_2795 CDR20291_2796     FALSE 0.007 630.000 0.000 NA   NA
 7754721 7754722 CDR20291_2796 CDR20291_2797     FALSE 0.260 115.000 0.000 NA   NA
 7754722 7754723 CDR20291_2797 CDR20291_2798     FALSE 0.017 370.000 0.000 NA   NA
 7754723 7754724 CDR20291_2798 CDR20291_2799     FALSE 0.043 254.000 0.000 NA   NA
 7754724 7754725 CDR20291_2799 CDR20291_2800   adhE FALSE 0.035 276.000 0.000 1.000 N NA
 7754727 7754728 CDR20291_2802 CDR20291_2803 dpaB dpaA TRUE 0.995 3.000 0.153 NA   NA
 7754728 7754729 CDR20291_2803 CDR20291_2804 dpaA   TRUE 0.856 22.000 0.000 NA   NA
 7754729 7754730 CDR20291_2804 CDR20291_2805     TRUE 0.999 4.000 0.576 1.000 Y NA
 7754730 7754731 CDR20291_2805 CDR20291_2806   bioY TRUE 0.973 32.000 0.087 NA   NA
 7754733 7754734 CDR20291_2808 CDR20291_2809     FALSE 0.234 121.000 0.000 NA   NA
 7754734 7754735 CDR20291_2809 CDR20291_2810     FALSE 0.005 1991.000 0.000 1.000   NA
 11405460 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2754.000 0.000 NA   NA
 11547823 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2754.000 0.000 NA   NA
 11690215 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2754.000 0.000 NA   NA
 11405461 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2783.000 0.000 NA   NA
 11547824 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2783.000 0.000 NA   NA
 11690216 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2783.000 0.000 NA   NA
 11405462 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2820.000 0.000 NA   NA
 11547825 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2820.000 0.000 NA   NA
 11690217 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2820.000 0.000 NA   NA
 11405463 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2849.000 0.000 NA   NA
 11547826 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2849.000 0.000 NA   NA
 11690218 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2849.000 0.000 NA   NA
 11405464 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2886.000 0.000 NA   NA
 11547827 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2886.000 0.000 NA   NA
 11690219 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2886.000 0.000 NA   NA
 11405465 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2915.000 0.000 NA   NA
 11547828 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2915.000 0.000 NA   NA
 11690220 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2915.000 0.000 NA   NA
 11405466 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2953.000 0.000 NA   NA
 11547829 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2953.000 0.000 NA   NA
 11690221 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2953.000 0.000 NA   NA
 11405467 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2982.000 0.000 NA   NA
 11547830 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2982.000 0.000 NA   NA
 11690222 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 2982.000 0.000 NA   NA
 11405468 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3019.000 0.000 NA   NA
 11547831 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3019.000 0.000 NA   NA
 11690223 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3019.000 0.000 NA   NA
 11405469 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3048.000 0.000 NA   NA
 11547832 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3048.000 0.000 NA   NA
 11690224 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3048.000 0.000 NA   NA
 11405470 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3085.000 0.000 NA   NA
 11547833 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3085.000 0.000 NA   NA
 11690225 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3085.000 0.000 NA   NA
 11405471 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3114.000 0.000 NA   NA
 11547834 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3114.000 0.000 NA   NA
 11690226 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3114.000 0.000 NA   NA
 11405472 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3151.000 0.000 NA   NA
 11547835 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3151.000 0.000 NA   NA
 11690227 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3151.000 0.000 NA   NA
 11405473 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3180.000 0.000 NA   NA
 11547836 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3180.000 0.000 NA   NA
 11690228 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3180.000 0.000 NA   NA
 11405474 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3216.000 0.000 NA   NA
 11547837 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3216.000 0.000 NA   NA
 11690229 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3216.000 0.000 NA   NA
 11405475 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3245.000 0.000 NA   NA
 11547838 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3245.000 0.000 NA   NA
 11690230 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3245.000 0.000 NA   NA
 11405476 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3282.000 0.000 NA   NA
 11547839 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3282.000 0.000 NA   NA
 11690231 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3282.000 0.000 NA   NA
 11405477 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3311.000 0.000 NA   NA
 11547840 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3311.000 0.000 NA   NA
 11690232 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3311.000 0.000 NA   NA
 11405478 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3348.000 0.000 NA   NA
 11547841 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3348.000 0.000 NA   NA
 11690233 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3348.000 0.000 NA   NA
 11405479 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3377.000 0.000 NA   NA
 11547842 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3377.000 0.000 NA   NA
 11690234 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3377.000 0.000 NA   NA
 11405480 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3414.000 0.000 NA   NA
 11547843 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3414.000 0.000 NA   NA
 11690235 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3414.000 0.000 NA   NA
 11405481 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3443.000 0.000 NA   NA
 11547844 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3443.000 0.000 NA   NA
 11690236 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3443.000 0.000 NA   NA
 11405482 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3479.000 0.000 NA   NA
 11547845 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3479.000 0.000 NA   NA
 11690237 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3479.000 0.000 NA   NA
 11405483 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3508.000 0.000 NA   NA
 11547846 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3508.000 0.000 NA   NA
 11690238 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3508.000 0.000 NA   NA
 11405484 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3544.000 0.000 NA   NA
 11547847 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3544.000 0.000 NA   NA
 11690239 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3544.000 0.000 NA   NA
 11405485 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3573.000 0.000 NA   NA
 11547848 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3573.000 0.000 NA   NA
 11690240 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3573.000 0.000 NA   NA
 11405486 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3611.000 0.000 NA   NA
 11547849 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3611.000 0.000 NA   NA
 11690241 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3611.000 0.000 NA   NA
 11405487 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3640.000 0.000 NA   NA
 11547850 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3640.000 0.000 NA   NA
 11690242 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3640.000 0.000 NA   NA
 11405488 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3677.000 0.000 NA   NA
 11547851 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3677.000 0.000 NA   NA
 11690243 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3677.000 0.000 NA   NA
 11405489 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3706.000 0.000 NA   NA
 11547852 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3706.000 0.000 NA   NA
 11690244 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3706.000 0.000 NA   NA
 11405490 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3743.000 0.000 NA   NA
 11547853 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3743.000 0.000 NA   NA
 11690245 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3743.000 0.000 NA   NA
 11405491 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3772.000 0.000 NA   NA
 11547854 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3772.000 0.000 NA   NA
 11690246 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3772.000 0.000 NA   NA
 11405492 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3813.000 0.000 NA   NA
 11547855 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3813.000 0.000 NA   NA
 11690247 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3813.000 0.000 NA   NA
 11405493 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3842.000 0.000 NA   NA
 11547856 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3842.000 0.000 NA   NA
 11690248 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3842.000 0.000 NA   NA
 11405494 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3880.000 0.000 NA   NA
 11547857 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3880.000 0.000 NA   NA
 11690249 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3880.000 0.000 NA   NA
 11405495 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3909.000 0.000 NA   NA
 11547858 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3909.000 0.000 NA   NA
 11690250 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3909.000 0.000 NA   NA
 11405496 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3947.000 0.000 NA   NA
 11547859 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3947.000 0.000 NA   NA
 11690251 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3947.000 0.000 NA   NA
 11405497 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3976.000 0.000 NA   NA
 11547860 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3976.000 0.000 NA   NA
 11690252 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 3976.000 0.000 NA   NA
 11405498 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4012.000 0.000 NA   NA
 11547861 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4012.000 0.000 NA   NA
 11690253 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4012.000 0.000 NA   NA
 11405499 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4041.000 0.000 NA   NA
 11547862 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4041.000 0.000 NA   NA
 11690254 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4041.000 0.000 NA   NA
 11405500 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4079.000 0.000 NA   NA
 11547863 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4079.000 0.000 NA   NA
 11690255 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4079.000 0.000 NA   NA
 11405501 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4108.000 0.000 NA   NA
 11547864 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4108.000 0.000 NA   NA
 11690256 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4108.000 0.000 NA   NA
 11405502 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4145.000 0.000 NA   NA
 11547865 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4145.000 0.000 NA   NA
 11690257 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4145.000 0.000 NA   NA
 11405503 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4174.000 0.000 NA   NA
 11547866 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4174.000 0.000 NA   NA
 11690258 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4174.000 0.000 NA   NA
 11405504 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4210.000 0.000 NA   NA
 11547867 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4210.000 0.000 NA   NA
 11690259 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4210.000 0.000 NA   NA
 11405505 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4239.000 0.000 NA   NA
 11547868 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4239.000 0.000 NA   NA
 11690260 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4239.000 0.000 NA   NA
 11405506 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4275.000 0.000 NA   NA
 11547869 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4275.000 0.000 NA   NA
 11690261 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4275.000 0.000 NA   NA
 11405507 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4304.000 0.000 NA   NA
 11547870 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4304.000 0.000 NA   NA
 11690262 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4304.000 0.000 NA   NA
 11405508 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4343.000 0.000 NA   NA
 11547871 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4343.000 0.000 NA   NA
 11690263 7754730   CDR20291_2805     FALSE NA 4343.000 0.000 NA   NA
 7754735 7754736 CDR20291_2810 CDR20291_2811     TRUE 0.999 -9.000 0.207 NA Y NA
 7754736 7754737 CDR20291_2811 CDR20291_2812     TRUE 0.999 3.000 0.286 NA Y NA
 7754737 7754738 CDR20291_2812 CDR20291_2813     TRUE 0.993 15.000 0.216 NA   NA
 7754738 7754739 CDR20291_2813 CDR20291_2814     TRUE 0.995 11.000 0.250 NA   NA
 7754739 7754740 CDR20291_2814 CDR20291_2815     TRUE 0.998 2.000 0.423 NA   NA
 7754740 7754741 CDR20291_2815 CDR20291_2816     TRUE 0.994 2.000 0.103 NA   NA
 7754741 7754742 CDR20291_2816 CDR20291_2817     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   NA
 7754742 7754743 CDR20291_2817 CDR20291_2818     TRUE 0.394 78.000 0.000 NA N NA
 7754743 7754744 CDR20291_2818 CDR20291_2819     FALSE 0.034 279.000 0.000 NA   NA
 7754744 7754745 CDR20291_2819 CDR20291_2820     TRUE 0.999 0.000 0.750 1.000   NA
 7754745 7754746 CDR20291_2820 CDR20291_2821   bacA2 TRUE 0.976 104.000 0.333 1.000 Y NA
 7754746 7754747 CDR20291_2821 CDR20291_2822 bacA2   TRUE 0.602 248.000 0.222 0.064 N NA
 7754747 7754748 CDR20291_2822 CDR20291_2823     TRUE 1.000 10.000 1.000 1.000 Y NA
 7754748 7754749 CDR20291_2823 CDR20291_2824     FALSE 0.025 314.000 0.000 1.000 N NA
 7754749 7754750 CDR20291_2824 CDR20291_2825     TRUE 0.935 33.000 0.000 1.000 Y NA
 7754750 7754751 CDR20291_2825 CDR20291_2826     TRUE 0.989 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 7754751 7754752 CDR20291_2826 CDR20291_2827     TRUE 0.991 1.000 0.051 NA   NA
 7754752 7754753 CDR20291_2827 CDR20291_2828     FALSE 0.014 395.000 0.000 NA   NA
 7754753 7754754 CDR20291_2828 CDR20291_2829   nrdF TRUE 0.449 76.000 0.000 NA   NA
 7754754 7754755 CDR20291_2829 CDR20291_2830 nrdF nrdE TRUE 1.000 13.000 0.667 0.001 Y NA
 7754757 7754758 CDR20291_2832 CDR20291_2833     TRUE 0.915 3.000 0.000 NA   NA
 7754758 7754759 CDR20291_2833 CDR20291_2834     TRUE 0.958 -1425.000 0.000 NA   NA
 7754759 7754760 CDR20291_2834 CDR20291_2835     FALSE 0.003 1648.000 0.000 NA N NA
 7754760 7754761 CDR20291_2835 CDR20291_2836     FALSE 0.011 462.000 0.000 1.000 N NA
 7754761 7754762 CDR20291_2836 CDR20291_2837     TRUE 0.901 80.000 0.042 0.037 N NA
 7754762 7754763 CDR20291_2837 CDR20291_2838     TRUE 0.916 50.000 0.042 1.000 N NA
 7754763 7754764 CDR20291_2838 CDR20291_2839     TRUE 0.362 156.000 0.000 0.001   NA
 7754764 7754765 CDR20291_2839 CDR20291_2840     TRUE 0.391 98.000 0.000 1.000   NA
 7754766 7754767 CDR20291_2841 CDR20291_2842     FALSE 0.021 333.000 0.000 1.000 N NA
 7754768 7754769 CDR20291_2843 CDR20291_2844     FALSE 0.246 118.000 0.000 NA   NA
 7754769 7754770 CDR20291_2844 CDR20291_2845     FALSE 0.018 365.000 0.000 NA   NA
 7754770 7754771 CDR20291_2845 CDR20291_2846     TRUE 0.743 121.000 0.000 0.003 Y NA
 7754771 7754772 CDR20291_2846 CDR20291_2847     TRUE 0.931 137.000 0.600 NA N NA
 7754772 7754773 CDR20291_2847 CDR20291_2848     FALSE 0.009 469.000 0.000 NA N NA
 7754773 7754774 CDR20291_2848 CDR20291_2849     TRUE 0.980 120.000 0.600 1.000 Y NA
 7754774 7754775 CDR20291_2849 CDR20291_2850     TRUE 0.991 1.000 0.000 0.022 Y NA
 7754775 7754776 CDR20291_2850 CDR20291_2851     TRUE 0.989 3.000 0.000 0.019 Y NA
 7754776 7754777 CDR20291_2851 CDR20291_2852     TRUE 0.968 0.000 0.000 0.022 N NA
 7754779 7754780 CDR20291_2854 CDR20291_2855     TRUE 0.895 105.000 0.171 NA   NA
 7754780 7754781 CDR20291_2855 CDR20291_2856     FALSE 0.127 169.000 0.000 NA   NA
 7754781 7754782 CDR20291_2856 CDR20291_2857     FALSE 0.020 344.000 0.000 NA   NA
 7754782 7754783 CDR20291_2857 CDR20291_2858     FALSE 0.072 210.000 0.000 NA   NA
 7754783 7754784 CDR20291_2858 CDR20291_2859     TRUE 0.807 27.000 0.000 NA   NA
 7754784 7754785 CDR20291_2859 CDR20291_2860     FALSE 0.017 368.000 0.000 NA   NA
 7754785 7754786 CDR20291_2860 CDR20291_2861     TRUE 0.785 29.000 0.000 NA   NA
 7754786 7754787 CDR20291_2861 CDR20291_2862   crr FALSE 0.018 357.000 0.000 NA   NA
 7754787 7754788 CDR20291_2862 CDR20291_2863 crr   TRUE 0.844 24.000 0.000 1.000 N NA
 7754788 7754789 CDR20291_2863 CDR20291_2864   malY TRUE 0.984 18.000 0.062 1.000 N NA
 7754789 7754790 CDR20291_2864 CDR20291_2865 malY malX TRUE 0.994 -7.000 0.062 1.000 N NA
 7754790 7754791 CDR20291_2865 CDR20291_2866 malX   FALSE 0.022 353.000 0.000 1.000   NA
 7754794 7754795 CDR20291_2869 CDR20291_2870     TRUE 0.951 -13.000 0.000 NA   NA
 7754796 7754797 CDR20291_2871 CDR20291_2872     FALSE 0.003 1908.000 0.000 NA N NA
 7754797 7754798 CDR20291_2872 CDR20291_2873     FALSE 0.071 211.000 0.000 NA   NA
 7754798 7754799 CDR20291_2873 CDR20291_2874     TRUE 0.910 4.000 0.000 NA   NA
 7754799 7754800 CDR20291_2874 CDR20291_2875     TRUE 0.884 12.000 0.000 NA   NA
 7754800 7754801 CDR20291_2875 CDR20291_2876   pepI FALSE 0.015 382.000 0.000 NA   NA
 7754803 7754804 CDR20291_2878 CDR20291_2879     FALSE 0.007 612.000 0.000 NA   NA
 7754804 7754805 CDR20291_2879 CDR20291_2880     TRUE 0.839 17.000 0.000 NA N NA
 7754805 7754806 CDR20291_2880 CDR20291_2881     FALSE 0.285 110.000 0.000 NA   NA
 7754806 7754807 CDR20291_2881 CDR20291_2882     TRUE 0.383 99.000 0.000 1.000   NA
 7754807 7754808 CDR20291_2882 CDR20291_2883     TRUE 0.433 224.000 0.074 1.000   NA
 7754808 7754809 CDR20291_2883 CDR20291_2884     TRUE 0.994 89.000 0.667 0.019 Y NA
 7754809 7754810 CDR20291_2884 CDR20291_2885     FALSE 0.040 261.000 0.000 NA   NA
 7754810 7754811 CDR20291_2885 CDR20291_2886     TRUE 0.784 83.000 0.004 NA   NA
 7754811 7754812 CDR20291_2886 CDR20291_2887     FALSE 0.010 430.000 0.000 NA N NA
 7754812 7754813 CDR20291_2887 CDR20291_2888     TRUE 0.999 0.000 0.167 1.000 Y NA
 7754813 7754814 CDR20291_2888 CDR20291_2889     FALSE 0.224 137.000 0.000 1.000   NA
 7754814 7754815 CDR20291_2889 CDR20291_2890     TRUE 0.999 1.000 0.833 1.000   NA
 7754815 7754816 CDR20291_2890 CDR20291_2891     FALSE 0.029 318.000 0.000 1.000   NA
 7754816 7754817 CDR20291_2891 CDR20291_2892     TRUE 0.928 3.000 0.000 1.000   NA
 7754817 7754818 CDR20291_2892 CDR20291_2893     TRUE 0.873 14.000 0.000 NA   NA
 7754818 7754819 CDR20291_2893 CDR20291_2894   glvA TRUE 0.873 14.000 0.000 NA   NA
 7754819 7754820 CDR20291_2894 CDR20291_2895 glvA glvC TRUE 0.995 14.000 0.055 1.000 Y NA
 7754820 7754821 CDR20291_2895 CDR20291_2896 glvC glvR FALSE 0.170 148.000 0.000 1.000 N NA
 7754821 7754822 CDR20291_2896 CDR20291_2897 glvR   FALSE 0.150 167.000 0.000 1.000   NA
 7754822 7754823 CDR20291_2897 CDR20291_2898   xylA FALSE 0.010 522.000 0.000 1.000   NA
 7754823 7754824 CDR20291_2898 CDR20291_2899 xylA xylB TRUE 0.947 69.000 0.020 1.000 Y NA
 7754826 7754827 CDR20291_2901 CDR20291_2902     TRUE 0.997 39.000 0.400 0.019 Y NA
 7754827 7754828 CDR20291_2902 CDR20291_2903     TRUE 1.000 8.000 1.000 0.032 Y NA
 7754828 7754829 CDR20291_2903 CDR20291_2904     TRUE 1.000 -7.000 1.000 0.032 Y NA
 7754829 7754830 CDR20291_2904 CDR20291_2905     TRUE 0.999 0.000 0.222 1.000 Y NA
 7754830 7754831 CDR20291_2905 CDR20291_2906     FALSE 0.006 791.000 0.000 NA   NA
 7754833 7754834 CDR20291_2908 CDR20291_2909     FALSE 0.015 381.000 0.000 NA   NA
 7754834 7754835 CDR20291_2909 CDR20291_2910     TRUE 0.569 50.000 0.000 NA   NA
 7754835 7754836 CDR20291_2910 CDR20291_2911     FALSE 0.006 744.000 0.000 NA   NA
 7754836 7754837 CDR20291_2911 CDR20291_2912     TRUE 0.997 4.000 0.027 0.044 Y NA
 7754837 7754838 CDR20291_2912 CDR20291_2913   agaY FALSE 0.009 510.000 0.000 1.000 N NA
 7754838 7754839 CDR20291_2913 CDR20291_2914 agaY tagT TRUE 0.970 20.000 0.000 1.000 Y NA
 7754839 7754840 CDR20291_2914 CDR20291_2915 tagT tagK TRUE 0.998 3.000 0.130 1.000 Y NA
 7754840 7754841 CDR20291_2915 CDR20291_2916 tagK   TRUE 0.499 66.000 0.000 1.000 N NA
 7754841 7754842 CDR20291_2916 CDR20291_2917     FALSE 0.028 297.000 0.000 NA   NA
 7754842 7754843 CDR20291_2917 CDR20291_2918   ascB TRUE 0.394 88.000 0.000 NA   NA
 7754843 7754844 CDR20291_2918 CDR20291_2919 ascB   TRUE 0.968 22.000 0.000 1.000 Y NA
 7754844 7754845 CDR20291_2919 CDR20291_2920     TRUE 0.999 29.000 0.783 0.022 Y NA
 7754845 7754846 CDR20291_2920 CDR20291_2921     TRUE 0.998 8.000 0.087 0.022 Y NA
 7754848 7754849 CDR20291_2923 CDR20291_2924 garK   FALSE 0.150 282.000 0.000 1.000 Y NA
 7754849 7754850 CDR20291_2924 CDR20291_2925   hrsA TRUE 0.870 144.000 0.073 1.000 Y NA
 7754850 7754851 CDR20291_2925 CDR20291_2926 hrsA   FALSE 0.213 130.000 0.000 1.000 N NA
 7754851 7754852 CDR20291_2926 CDR20291_2927     FALSE 0.128 233.000 0.000 0.020   NA
 7754852 7754853 CDR20291_2927 CDR20291_2928     TRUE 0.953 -7.000 0.000 1.000   NA
 7754854 7754855 CDR20291_2929 CDR20291_2930 treR treA TRUE 0.752 197.000 0.336 1.000 N NA
 7754856 7754857 CDR20291_2931 CDR20291_2932     TRUE 0.682 41.000 0.000 1.000   NA
 7754857 7754858 CDR20291_2932 CDR20291_2933     FALSE 0.057 244.000 0.000 1.000   NA
 7754858 7754859 CDR20291_2933 CDR20291_2934   bglA1 FALSE 0.012 438.000 0.000 1.000 N NA
 7754859 7754860 CDR20291_2934 CDR20291_2935 bglA1   TRUE 0.773 87.000 0.000 1.000 Y NA
 7754860 7754861 CDR20291_2935 CDR20291_2936   bglG1 TRUE 0.921 74.000 0.095 1.000   NA
 7754861 7754862 CDR20291_2936 CDR20291_2937 bglG1   FALSE 0.023 351.000 0.000 1.000   NA
 7754862 7754863 CDR20291_2937 CDR20291_2938     TRUE 0.873 14.000 0.000 NA   NA
 7754863 7754864 CDR20291_2938 CDR20291_2939     FALSE 0.007 595.000 0.000 NA   NA
 7754864 7754865 CDR20291_2939 CDR20291_2940     TRUE 0.998 20.000 0.800 1.000   NA
 7754865 7754866 CDR20291_2940 CDR20291_2941     FALSE 0.046 264.000 0.000 1.000   NA
 7754866 7754867 CDR20291_2941 CDR20291_2942     TRUE 0.909 26.000 0.000 0.063   NA
 7754867 7754868 CDR20291_2942 CDR20291_2943     TRUE 0.944 13.000 0.000 0.037   NA
 7754869 7754870 CDR20291_2944 CDR20291_2945     TRUE 0.821 26.000 0.000 1.000 N NA
 7754871 7754872 CDR20291_2946 CDR20291_2947     FALSE 0.200 135.000 0.000 NA   NA
 7754873 7754874 CDR20291_2948 CDR20291_2949     FALSE 0.007 616.000 0.000 NA   NA
 7754874 7754875 CDR20291_2949 CDR20291_2950     TRUE 0.958 -2096.000 0.000 NA   NA
 7754876 7754877 CDR20291_2951 CDR20291_2952     TRUE 0.955 106.000 0.286 0.009   NA
 7754877 7754878 CDR20291_2952 CDR20291_2953     TRUE 0.989 31.000 0.286 NA   NA
 7754878 7754879 CDR20291_2953 CDR20291_2954   bglA2 FALSE 0.005 1024.000 0.000 NA   NA
 7754879 7754880 CDR20291_2954 CDR20291_2955 bglA2 bglF TRUE 0.970 20.000 0.000 1.000 Y NA
 7754880 7754881 CDR20291_2955 CDR20291_2956 bglF bglG TRUE 0.999 -10.000 0.429 1.000   NA
 7754881 7754882 CDR20291_2956 CDR20291_2957 bglG   FALSE 0.006 723.000 0.000 NA   NA
 7754882 7754883 CDR20291_2957 CDR20291_2958     FALSE 0.089 192.000 0.000 NA   NA
 7754883 7754884 CDR20291_2958 CDR20291_2959   tndX FALSE 0.015 384.000 0.000 1.000 N NA
 7754884 7754885 CDR20291_2959 CDR20291_2960 tndX   FALSE 0.023 1147.000 0.000 1.000 Y NA
 7754885 7754886 CDR20291_2960 CDR20291_2961     FALSE 0.016 380.000 0.000 NA   NA
 7754886 7754887 CDR20291_2961 CDR20291_2962     FALSE 0.005 1192.000 0.000 NA   NA
 7754887 7754888 CDR20291_2962 CDR20291_2963     TRUE 0.998 -28.000 0.222 NA N NA
 7754889 7754890 CDR20291_2964 CDR20291_2965     FALSE 0.009 445.000 0.000 NA N NA
 7754891 7754892 CDR20291_2966 CDR20291_2967     TRUE 0.985 16.000 0.069 1.000 N NA
 7754892 7754893 CDR20291_2967 CDR20291_2968   ascB2 FALSE 0.013 405.000 0.000 1.000 N NA
 7754893 7754894 CDR20291_2968 CDR20291_2969 ascB2   TRUE 0.845 61.000 0.000 1.000 Y NA
 7754894 7754895 CDR20291_2969 CDR20291_2970   bglG2 TRUE 0.792 145.000 0.143 1.000   NA
 7754895 7754896 CDR20291_2970 CDR20291_2971 bglG2   FALSE 0.034 296.000 0.000 1.000   NA
 7754896 7754897 CDR20291_2971 CDR20291_2972   pgmB TRUE 0.699 39.000 0.000 1.000   NA
 7754897 7754898 CDR20291_2972 CDR20291_2973 pgmB   TRUE 0.934 2.000 0.000 1.000   NA
 7754898 7754899 CDR20291_2973 CDR20291_2974   acsB3 TRUE 0.975 26.000 0.000 0.020 Y NA
 7754899 7754900 CDR20291_2974 CDR20291_2975 acsB3   FALSE 0.013 405.000 0.000 1.000 N NA
 7754900 7754901 CDR20291_2975 CDR20291_2976     TRUE 0.340 100.000 0.000 1.000 N NA
 7754901 7754902 CDR20291_2976 CDR20291_2977     TRUE 0.999 -10.000 0.429 0.022 N NA
 7754902 7754903 CDR20291_2977 CDR20291_2978     FALSE 0.080 268.000 0.000 0.022 N NA
 7754903 7754904 CDR20291_2978 CDR20291_2979     TRUE 0.923 36.000 0.000 1.000 Y NA
 7754904 7754905 CDR20291_2979 CDR20291_2980     FALSE 0.008 551.000 0.000 1.000 N NA
 7754905 7754906 CDR20291_2980 CDR20291_2981     TRUE 0.997 2.000 0.154 0.020 N NA
 7754906 7754907 CDR20291_2981 CDR20291_2982     FALSE 0.023 348.000 0.000 1.000   NA
 7754907 7754908 CDR20291_2982 CDR20291_2983     FALSE 0.127 180.000 0.000 1.000   NA
 7754908 7754909 CDR20291_2983 CDR20291_2984     FALSE 0.004 2095.000 0.000 NA   NA
 7754909 7754910 CDR20291_2984 CDR20291_2985     TRUE 0.923 78.000 0.127 NA   NA
 7754910 7754911 CDR20291_2985 CDR20291_2986     FALSE 0.004 985.000 0.000 NA N NA
 7754911 7754912 CDR20291_2986 CDR20291_2987     TRUE 0.951 -13.000 0.000 NA   NA
 7754912 7754913 CDR20291_2987 CDR20291_2988     TRUE 0.998 18.000 0.800 NA   NA
 7754913 7754914 CDR20291_2988 CDR20291_2989     TRUE 0.999 0.000 0.533 NA   NA
 7754914 7754915 CDR20291_2989 CDR20291_2990     FALSE 0.004 1732.000 0.000 NA   NA
 7754915 7754916 CDR20291_2990 CDR20291_2991     TRUE 0.998 0.000 0.333 NA   NA
 7754916 7754917 CDR20291_2991 CDR20291_2992     FALSE 0.004 1331.000 0.000 NA   NA
 7754917 7754918 CDR20291_2992 CDR20291_2993     FALSE 0.047 247.000 0.000 NA   NA
 7754918 7754919 CDR20291_2993 CDR20291_2994     FALSE 0.004 1695.000 0.000 NA   NA
 11405509 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 820.000 0.000 NA   NA
 11547872 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 820.000 0.000 NA   NA
 11690264 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 820.000 0.000 NA   NA
 11405510 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 849.000 0.000 NA   NA
 11547873 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 849.000 0.000 NA   NA
 11690265 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 849.000 0.000 NA   NA
 11405511 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 885.000 0.000 NA   NA
 11547874 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 885.000 0.000 NA   NA
 11690266 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 885.000 0.000 NA   NA
 11405512 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 914.000 0.000 NA   NA
 11547875 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 914.000 0.000 NA   NA
 11690267 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 914.000 0.000 NA   NA
 11405513 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 950.000 0.000 NA   NA
 11547876 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 950.000 0.000 NA   NA
 11690268 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 950.000 0.000 NA   NA
 11405514 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 979.000 0.000 NA   NA
 11547877 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 979.000 0.000 NA   NA
 11690269 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 979.000 0.000 NA   NA
 11405515 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1018.000 0.000 NA   NA
 11547878 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1018.000 0.000 NA   NA
 11690270 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1018.000 0.000 NA   NA
 11405516 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1047.000 0.000 NA   NA
 11547879 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1047.000 0.000 NA   NA
 11690271 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1047.000 0.000 NA   NA
 11405517 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1084.000 0.000 NA   NA
 11547880 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1084.000 0.000 NA   NA
 11690272 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1084.000 0.000 NA   NA
 11405518 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1113.000 0.000 NA   NA
 11547881 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1113.000 0.000 NA   NA
 11690273 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1113.000 0.000 NA   NA
 11405519 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1149.000 0.000 NA   NA
 11547882 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1149.000 0.000 NA   NA
 11690274 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1149.000 0.000 NA   NA
 11405520 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1178.000 0.000 NA   NA
 11547883 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1178.000 0.000 NA   NA
 11690275 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1178.000 0.000 NA   NA
 11405521 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1215.000 0.000 NA   NA
 11547884 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1215.000 0.000 NA   NA
 11690276 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1215.000 0.000 NA   NA
 11405522 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1244.000 0.000 NA   NA
 11547885 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1244.000 0.000 NA   NA
 11690277 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1244.000 0.000 NA   NA
 11405523 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1280.000 0.000 NA   NA
 11547886 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1280.000 0.000 NA   NA
 11690278 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1280.000 0.000 NA   NA
 11405524 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1309.000 0.000 NA   NA
 11547887 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1309.000 0.000 NA   NA
 11690279 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1309.000 0.000 NA   NA
 11405525 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1346.000 0.000 NA   NA
 11547888 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1346.000 0.000 NA   NA
 11690280 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1346.000 0.000 NA   NA
 11405526 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1375.000 0.000 NA   NA
 11547889 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1375.000 0.000 NA   NA
 11690281 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1375.000 0.000 NA   NA
 11405527 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1414.000 0.000 NA   NA
 11547890 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1414.000 0.000 NA   NA
 11690282 7754918   CDR20291_2993     FALSE NA 1414.000 0.000 NA   NA
 7754919 7754920 CDR20291_2994 CDR20291_2995     TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 7754920 7754921 CDR20291_2995 CDR20291_2996     TRUE 0.860 21.000 0.000 NA   NA
 7754921 7754922 CDR20291_2996 CDR20291_2997     TRUE 0.922 2.000 0.000 NA   NA
 7754922 7754923 CDR20291_2997 CDR20291_2998     TRUE 0.947 -9.000 0.000 NA   NA
 7754923 7754924 CDR20291_2998 CDR20291_2999     FALSE 0.010 480.000 0.000 NA   NA
 7754924 7754925 CDR20291_2999 CDR20291_3000     FALSE 0.007 795.000 0.000 1.000   NA
 7754925 7754926 CDR20291_3000 CDR20291_3001     FALSE 0.276 112.000 0.000 NA   NA
 7754926 7754927 CDR20291_3001 CDR20291_3002     TRUE 0.863 16.000 0.000 NA   NA
 7754927 7754928 CDR20291_3002 CDR20291_3003     TRUE 0.910 4.000 0.000 NA   NA
 7754929 7754930 CDR20291_3004 CDR20291_3005     FALSE 0.111 251.000 0.000 0.018   NA
 7754930 7754931 CDR20291_3005 CDR20291_3006     TRUE 0.502 74.000 0.000 1.000   NA
 7754931 7754932 CDR20291_3006 CDR20291_3007     TRUE 0.957 -10.000 0.000 1.000   NA
 7754933 7754934 CDR20291_3008 CDR20291_3009     TRUE 0.807 27.000 0.000 NA   NA
 7754937 7754938 CDR20291_3012 CDR20291_3013     FALSE 0.005 909.000 0.000 NA   NA
 7754939 7754940 CDR20291_3014 CDR20291_3015     TRUE 0.988 29.000 0.222 NA   NA
 7754940 7754941 CDR20291_3015 CDR20291_3016     TRUE 0.998 -3.000 0.444 NA   NA
 7754941 7754942 CDR20291_3016 CDR20291_3017     FALSE 0.008 530.000 0.000 NA   NA
 7754942 7754943 CDR20291_3017 CDR20291_3018   rnr FALSE 0.005 1094.000 0.000 NA   NA
 7754944 7754945 CDR20291_3019 CDR20291_3020     TRUE 0.840 18.000 0.000 NA N NA
 7754945 7754946 CDR20291_3020 CDR20291_3021     TRUE 0.849 106.000 0.095 NA   NA
 7754946 7754947 CDR20291_3021 CDR20291_3022     FALSE 0.012 424.000 0.000 NA   NA
 7754947 7754948 CDR20291_3022 CDR20291_3023     TRUE 0.660 39.000 0.000 NA   NA
 7754949 7754950 CDR20291_3024 CDR20291_3025 secG   FALSE 0.280 118.000 0.000 1.000   NA
 7754950 7754951 CDR20291_3025 CDR20291_3026   eno FALSE 0.007 633.000 0.000 1.000 N NA
 7754951 7754952 CDR20291_3026 CDR20291_3027 eno gpmI FALSE 0.244 588.000 0.136 1.000 Y NA
 7754952 7754953 CDR20291_3027 CDR20291_3028 gpmI tpi TRUE 0.997 9.000 0.138 1.000 Y NA
 7754953 7754954 CDR20291_3028 CDR20291_3029 tpi pgK TRUE 0.995 26.000 0.141 1.000 Y NA
 7754954 7754955 CDR20291_3029 CDR20291_3030 pgK gapB TRUE 0.641 222.000 0.005 0.003 Y NA
 7754955 7754956 CDR20291_3030 CDR20291_3031 gapB cggR TRUE 0.918 60.000 0.067 1.000 N NA
 7754956 7754957 CDR20291_3031 CDR20291_3032 cggR glnF FALSE 0.110 797.000 0.034 1.000 Y NA
 7754957 7754958 CDR20291_3032 CDR20291_3033 glnF xdhA3 FALSE 0.161 152.000 0.000 1.000 N NA
 7754958 7754959 CDR20291_3033 CDR20291_3034 xdhA3   TRUE 0.993 -6.000 0.056 1.000 N NA
 7754959 7754960 CDR20291_3034 CDR20291_3035     TRUE 0.507 283.000 0.072 1.000 Y NA
 7754960 7754961 CDR20291_3035 CDR20291_3036   pbuX TRUE 0.334 192.000 0.000 1.000 Y NA
 7754961 7754962 CDR20291_3036 CDR20291_3037 pbuX   FALSE 0.315 199.000 0.000 1.000 Y NA
 7754962 7754963 CDR20291_3037 CDR20291_3038     TRUE 0.967 28.000 0.033 1.000 N NA
 7754963 7754964 CDR20291_3038 CDR20291_3039     TRUE 0.995 16.000 0.333 1.000 N NA
 7754964 7754965 CDR20291_3039 CDR20291_3040   dpaL2 FALSE 0.100 333.000 0.000 1.000 Y NA
 7754965 7754966 CDR20291_3040 CDR20291_3041 dpaL2   FALSE 0.008 623.000 0.000 1.000   NA
 7754966 7754967 CDR20291_3041 CDR20291_3042     TRUE 0.648 77.000 0.000 0.038   NA
 7754967 7754968 CDR20291_3042 CDR20291_3043   tdcF FALSE 0.011 396.000 0.000 NA N NA
 7754970 7754971 CDR20291_3045 CDR20291_3046     TRUE 0.953 -7.000 0.000 1.000   NA
 7754971 7754972 CDR20291_3046 CDR20291_3047     TRUE 0.963 36.000 0.067 1.000   NA
 7754973 7754974 CDR20291_3048 CDR20291_3049     FALSE 0.034 297.000 0.000 1.000   NA
 7754974 7754975 CDR20291_3049 CDR20291_3050     TRUE 0.999 13.000 0.800 1.000   NA
 7754975 7754976 CDR20291_3050 CDR20291_3051     TRUE 0.800 144.000 0.148 1.000   NA
 7754976 7754977 CDR20291_3051 CDR20291_3052     TRUE 1.000 -28.000 0.704 1.000 Y NA
 7754979 7754980 CDR20291_3054 CDR20291_3055     TRUE 0.941 86.000 0.041 1.000 Y NA
 7754980 7754981 CDR20291_3055 CDR20291_3056     TRUE 0.995 0.000 0.118 1.000 N NA
 7754981 7754982 CDR20291_3056 CDR20291_3057     TRUE 0.774 115.000 0.059 1.000 N NA
 7754982 7754983 CDR20291_3057 CDR20291_3058   cme TRUE 0.749 32.000 0.000 NA   NA
 7754984 7754985 CDR20291_3059 CDR20291_3060     TRUE 0.984 48.000 0.444 NA   NA
 7754985 7754986 CDR20291_3060 CDR20291_3061     TRUE 0.993 0.000 0.074 NA   NA
 7754986 7754987 CDR20291_3061 CDR20291_3062     FALSE 0.025 405.000 0.000 0.088 N NA
 7754987 7754988 CDR20291_3062 CDR20291_3063     TRUE 0.999 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 7754988 7754989 CDR20291_3063 CDR20291_3064     FALSE 0.069 214.000 0.000 1.000 N NA
 7754991 7754992 CDR20291_3066 CDR20291_3067     TRUE 0.995 -16.000 0.069 1.000 N NA
 7754993 7754994 CDR20291_3068 CDR20291_3069     TRUE 0.650 40.000 0.000 NA   NA
 7754994 7754995 CDR20291_3069 CDR20291_3070     TRUE 0.996 -3.000 0.158 NA   NA
 7754996 7754997 CDR20291_3071 CDR20291_3072     FALSE 0.276 112.000 0.000 NA   NA
 7754997 7754998 CDR20291_3072 CDR20291_3073     FALSE 0.022 331.000 0.000 NA   NA
 7754998 7754999 CDR20291_3073 CDR20291_3074     FALSE 0.021 338.000 0.000 1.000 N NA
 7754999 7755000 CDR20291_3074 CDR20291_3075     TRUE 0.995 16.000 0.292 1.000 N NA
 7755000 7755001 CDR20291_3075 CDR20291_3076   snorO FALSE 0.013 414.000 0.000 1.000 N NA
 7755001 7755002 CDR20291_3076 CDR20291_3077 snorO   FALSE 0.008 527.000 0.000 NA   NA
 7755002 7755003 CDR20291_3077 CDR20291_3078   hslO FALSE 0.014 391.000 0.000 NA   NA
 7755003 7755004 CDR20291_3078 CDR20291_3079 hslO   FALSE 0.248 285.000 0.063 1.000 N NA
 7755004 7755005 CDR20291_3079 CDR20291_3080     TRUE 0.996 -124.000 0.056 1.000   NA
 7755005 7755006 CDR20291_3080 CDR20291_3081     FALSE 0.265 122.000 0.000 1.000   NA
 7755006 7755007 CDR20291_3081 CDR20291_3082   sdaB FALSE 0.089 206.000 0.000 1.000   NA
 7755008 7755009 CDR20291_3083 CDR20291_3084 dapA1 asd FALSE 0.207 425.000 0.029 1.000 Y NA
 7755009 7755010 CDR20291_3084 CDR20291_3085 asd dapA2 TRUE 0.876 117.000 0.029 1.000 Y NA
 7755010 7755011 CDR20291_3085 CDR20291_3086 dapA2 dapB1 TRUE 0.950 67.000 0.022 1.000 Y NA
 7755011 7755012 CDR20291_3086 CDR20291_3087 dapB1 dapD TRUE 0.587 224.000 0.036 1.000 Y NA
 7755015 7755016 CDR20291_3090 CDR20291_3091 bclA2 hpt FALSE 0.037 378.000 0.000 0.027   NA
 11405530 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1431.000 0.000 NA   NA
 11547893 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1431.000 0.000 NA   NA
 11690285 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1431.000 0.000 NA   NA
 11405531 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1333.000 0.000 NA   NA
 11547894 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1333.000 0.000 NA   NA
 11690286 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1333.000 0.000 NA   NA
 11405532 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1314.000 0.000 NA   NA
 11547895 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1314.000 0.000 NA   NA
 11690287 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1314.000 0.000 NA   NA
 11405533 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1234.000 0.000 NA   NA
 11547896 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1234.000 0.000 NA   NA
 11690288 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1234.000 0.000 NA   NA
 11405534 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1215.000 0.000 NA   NA
 11547897 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1215.000 0.000 NA   NA
 11690289 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1215.000 0.000 NA   NA
 11405535 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1144.000 0.000 NA   NA
 11547898 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1144.000 0.000 NA   NA
 11690290 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1144.000 0.000 NA   NA
 11405536 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1125.000 0.000 NA   NA
 11547899 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1125.000 0.000 NA   NA
 11690291 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1125.000 0.000 NA   NA
 11405537 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1063.000 0.000 NA   NA
 11547900 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1063.000 0.000 NA   NA
 11690292 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1063.000 0.000 NA   NA
 11405538 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1044.000 0.000 NA   NA
 11547901 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1044.000 0.000 NA   NA
 11690293 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 1044.000 0.000 NA   NA
 11405539 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 991.000 0.000 NA   NA
 11547902 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 991.000 0.000 NA   NA
 11690294 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 991.000 0.000 NA   NA
 11405540 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 972.000 0.000 NA   NA
 11547903 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 972.000 0.000 NA   NA
 11690295 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 972.000 0.000 NA   NA
 11405541 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 910.000 0.000 NA   NA
 11547904 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 910.000 0.000 NA   NA
 11690296 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 910.000 0.000 NA   NA
 11405542 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 891.000 0.000 NA   NA
 11547905 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 891.000 0.000 NA   NA
 11690297 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 891.000 0.000 NA   NA
 11405543 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 820.000 0.000 NA   NA
 11547906 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 820.000 0.000 NA   NA
 11690298 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 820.000 0.000 NA   NA
 11405544 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 801.000 0.000 NA   NA
 11547907 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 801.000 0.000 NA   NA
 11690299 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 801.000 0.000 NA   NA
 11405545 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 757.000 0.000 NA   NA
 11547908 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 757.000 0.000 NA   NA
 11690300 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 757.000 0.000 NA   NA
 11405546 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 738.000 0.000 NA   NA
 11547909 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 738.000 0.000 NA   NA
 11690301 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 738.000 0.000 NA   NA
 11405547 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 676.000 0.000 NA   NA
 11547910 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 676.000 0.000 NA   NA
 11690302 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 676.000 0.000 NA   NA
 11405548 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 657.000 0.000 NA   NA
 11547911 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 657.000 0.000 NA   NA
 11690303 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 657.000 0.000 NA   NA
 11405549 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 622.000 0.000 NA   NA
 11547912 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 622.000 0.000 NA   NA
 11690304 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 622.000 0.000 NA   NA
 11405550 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 603.000 0.000 NA   NA
 11547913 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 603.000 0.000 NA   NA
 11690305 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 603.000 0.000 NA   NA
 11405551 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 568.000 0.000 NA   NA
 11547914 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 568.000 0.000 NA   NA
 11690306 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 568.000 0.000 NA   NA
 11405552 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 549.000 0.000 NA   NA
 11547915 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 549.000 0.000 NA   NA
 11690307 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 549.000 0.000 NA   NA
 11405553 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 523.000 0.000 NA   NA
 11547916 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 523.000 0.000 NA   NA
 11690308 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 523.000 0.000 NA   NA
 11405554 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 504.000 0.000 NA   NA
 11547917 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 504.000 0.000 NA   NA
 11690309 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 504.000 0.000 NA   NA
 11405555 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 469.000 0.000 NA   NA
 11547918 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 469.000 0.000 NA   NA
 11690310 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 469.000 0.000 NA   NA
 11405556 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 450.000 0.000 NA   NA
 11547919 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 450.000 0.000 NA   NA
 11690311 7755016   CDR20291_3091   hpt FALSE NA 450.000 0.000 NA   NA
 7755016 7755017 CDR20291_3091 CDR20291_3092 hpt   FALSE 0.022 328.000 0.000 NA   NA
 7755017 7755018 CDR20291_3092 CDR20291_3093     FALSE 0.012 425.000 0.000 NA   NA
 7755018 7755019 CDR20291_3093 CDR20291_3094     FALSE 0.083 212.000 0.000 1.000   NA
 7755019 7755020 CDR20291_3094 CDR20291_3095     FALSE 0.118 184.000 0.000 1.000   NA
 7755020 7755021 CDR20291_3095 CDR20291_3096     FALSE 0.008 668.000 0.000 1.000   NA
 7755021 7755022 CDR20291_3096 CDR20291_3097   prdF TRUE 0.887 120.000 0.231 1.000   NA
 7755022 7755023 CDR20291_3097 CDR20291_3098 prdF   TRUE 0.862 20.000 0.000 NA   NA
 7755023 7755024 CDR20291_3098 CDR20291_3099     TRUE 0.863 18.000 0.000 NA   NA
 7755024 7755025 CDR20291_3099 CDR20291_3100     TRUE 0.997 15.000 0.250 0.001   NA
 7755025 7755026 CDR20291_3100 CDR20291_3101   prdB TRUE 0.961 80.000 0.150 0.001   NA
 7755026 7755027 CDR20291_3101 CDR20291_3102 prdB   FALSE 0.010 491.000 0.000 NA   NA
 7755027 7755028 CDR20291_3102 CDR20291_3103   prdA TRUE 0.960 81.000 0.333 NA   NA
 7755028 7755029 CDR20291_3103 CDR20291_3104 prdA prdR FALSE 0.014 429.000 0.000 1.000   NA
 7755029 7755030 CDR20291_3104 CDR20291_3105 prdR prdC FALSE 0.006 771.000 0.000 1.000 N NA
 7755030 7755031 CDR20291_3105 CDR20291_3106 prdC   FALSE 0.015 389.000 0.000 1.000 N NA
 7755032 7755033 CDR20291_3107 CDR20291_3108 sspB   FALSE 0.107 181.000 0.000 NA   NA
 7755036 7755037 CDR20291_3111 CDR20291_3112 folC   FALSE 0.235 133.000 0.000 1.000   NA
 7755037 7755038 CDR20291_3112 CDR20291_3113     FALSE 0.006 1046.000 0.000 1.000   NA
 7755038 7755039 CDR20291_3113 CDR20291_3114   valS FALSE 0.012 425.000 0.000 1.000 N NA
 7755039 7755040 CDR20291_3114 CDR20291_3115 valS   FALSE 0.007 639.000 0.000 1.000 N NA
 7755040 7755041 CDR20291_3115 CDR20291_3116     TRUE 0.584 48.000 0.000 NA   NA
 7755041 7755042 CDR20291_3116 CDR20291_3117     TRUE 0.483 69.000 0.000 NA   NA
 7755042 7755043 CDR20291_3117 CDR20291_3118   phoU FALSE 0.120 173.000 0.000 NA   NA
 7755043 7755044 CDR20291_3118 CDR20291_3119 phoU phoT TRUE 0.985 28.000 0.016 NA Y NA
 7755044 7755045 CDR20291_3119 CDR20291_3120 phoT   TRUE 0.999 19.000 0.428 0.001 Y NA
 7755045 7755046 CDR20291_3120 CDR20291_3121     TRUE 0.999 2.000 0.219 0.001 Y NA
 7755046 7755047 CDR20291_3121 CDR20291_3122     FALSE 0.015 382.000 0.000 NA   NA
 7755047 7755048 CDR20291_3122 CDR20291_3123     FALSE 0.010 481.000 0.000 NA   NA
 7755048 7755049 CDR20291_3123 CDR20291_3124     TRUE 0.818 145.000 0.125 0.086 N NA
 7755049 7755050 CDR20291_3124 CDR20291_3125     TRUE 0.999 -24.000 0.333 1.000 Y NA
 7755050 7755051 CDR20291_3125 CDR20291_3126     FALSE 0.120 382.000 0.000 0.014 Y NA
 7755051 7755052 CDR20291_3126 CDR20291_3127     TRUE 0.872 50.000 0.000 1.000 Y NA
 7755052 7755053 CDR20291_3127 CDR20291_3128     TRUE 0.988 72.000 0.375 1.000 Y NA
 7755053 7755054 CDR20291_3128 CDR20291_3129     FALSE 0.005 896.000 0.000 1.000 N NA
 7755054 7755055 CDR20291_3129 CDR20291_3130   pepF FALSE 0.045 252.000 0.000 1.000 N NA
 7755055 7755056 CDR20291_3130 CDR20291_3131 pepF   TRUE 0.922 66.000 0.074 1.000   NA
 7755056 7755057 CDR20291_3131 CDR20291_3132     FALSE 0.161 151.000 0.000 NA   NA
 7755057 7755058 CDR20291_3132 CDR20291_3133     TRUE 0.969 24.000 0.013 NA   NA
 7755059 7755060 CDR20291_3134 CDR20291_3135 feoA3 feoB3 TRUE 0.998 18.000 0.308 1.000 Y NA
 7755061 7755062 CDR20291_3136 CDR20291_3137     TRUE 0.982 48.000 0.375 1.000   NA
 7755062 7755063 CDR20291_3137 CDR20291_3138     TRUE 0.999 26.000 0.750 0.030 Y NA
 7755063 7755064 CDR20291_3138 CDR20291_3139     TRUE 0.937 40.000 0.000 0.030 Y NA
 7755064 7755065 CDR20291_3139 CDR20291_3140     TRUE 1.000 16.000 0.800 0.018 Y NA
 7755065 7755066 CDR20291_3140 CDR20291_3141     TRUE 0.356 132.000 0.000 0.030 N NA
 7755066 7755067 CDR20291_3141 CDR20291_3142   proC2 FALSE 0.007 598.000 0.000 1.000 N NA
 7755067 7755068 CDR20291_3142 CDR20291_3143 proC2 pflD FALSE 0.023 325.000 0.000 1.000 N NA
 7755068 7755069 CDR20291_3143 CDR20291_3144 pflD pflE TRUE 0.999 5.000 0.583 0.002 N NA
 7755069 7755070 CDR20291_3144 CDR20291_3145 pflE   FALSE 0.093 345.000 0.000 1.000 Y NA
 7755070 7755071 CDR20291_3145 CDR20291_3146   pgi FALSE 0.151 156.000 0.000 1.000 N NA
 7755071 7755072 CDR20291_3146 CDR20291_3147 pgi   FALSE 0.039 265.000 0.000 1.000 N NA
 7755072 7755073 CDR20291_3147 CDR20291_3148     FALSE 0.203 145.000 0.000 1.000   NA
 7755073 7755074 CDR20291_3148 CDR20291_3149     TRUE 0.957 -54.000 0.000 NA   NA
 7755074 7755075 CDR20291_3149 CDR20291_3150     TRUE 0.907 5.000 0.000 NA   NA
 7755075 7755076 CDR20291_3150 CDR20291_3151     TRUE 0.425 81.000 0.000 NA   NA
 7755076 7755077 CDR20291_3151 CDR20291_3152     FALSE 0.049 241.000 0.000 NA   NA
 7755077 7755078 CDR20291_3152 CDR20291_3153     TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 7755078 7755079 CDR20291_3153 CDR20291_3154     TRUE 0.926 1.000 0.000 NA   NA
 7755079 7755080 CDR20291_3154 CDR20291_3155     TRUE 0.553 53.000 0.000 NA   NA
 7755080 7755081 CDR20291_3155 CDR20291_3156     TRUE 0.901 54.000 0.036 NA   NA
 7755081 7755082 CDR20291_3156 CDR20291_3157     TRUE 0.861 171.000 0.135 1.000 Y NA
 7755082 7755083 CDR20291_3157 CDR20291_3158     TRUE 0.944 -7.000 0.000 NA   NA
 7755083 7755084 CDR20291_3158 CDR20291_3159     FALSE 0.014 392.000 0.000 NA   NA
 7755086 7755087 CDR20291_3161 CDR20291_3162 engB lon TRUE 0.983 17.000 0.048 1.000   NA
 7755088 7755089 CDR20291_3163 CDR20291_3164 chrA chrA' TRUE 1.000 -12.000 0.455 0.001 Y NA
 7755090 7755091 CDR20291_3165 CDR20291_3166 clpX clpP1 TRUE 0.992 19.000 0.022 1.000 Y NA
 7755091 7755092 CDR20291_3166 CDR20291_3167 clpP1 tig TRUE 0.797 149.000 0.024 1.000 Y NA
 7755092 7755093 CDR20291_3167 CDR20291_3168 tig   TRUE 0.560 137.000 0.003 1.000   NA
 7755093 7755094 CDR20291_3168 CDR20291_3169   rph TRUE 0.986 0.000 0.003 1.000   NA
 7755094 7755095 CDR20291_3169 CDR20291_3170 rph dnaL TRUE 0.443 160.000 0.003 1.000 N NA
 7755095 7755096 CDR20291_3170 CDR20291_3171 dnaL   TRUE 0.374 177.000 0.002 1.000 N NA
 7755096 7755097 CDR20291_3171 CDR20291_3172     FALSE 0.329 102.000 0.000 NA   NA
 7755099 7755100 CDR20291_3174 CDR20291_3175 hydN1 hydA TRUE 0.998 0.000 0.250 0.010   NA
 7755100 7755101 CDR20291_3175 CDR20291_3176 hydA hydN2 TRUE 0.997 25.000 0.400 0.010   NA
 7755101 7755102 CDR20291_3176 CDR20291_3177 hydN2   TRUE 0.530 58.000 0.000 NA   NA
 7755102 7755103 CDR20291_3177 CDR20291_3178   fdhD TRUE 0.888 11.000 0.000 NA   NA
 7755103 7755104 CDR20291_3178 CDR20291_3179 fdhD fdhF TRUE 0.819 49.000 0.000 0.000   NA
 7755104 7755105 CDR20291_3179 CDR20291_3180 fdhF   FALSE 0.006 668.000 0.000 NA   NA
 7755105 7755106 CDR20291_3180 CDR20291_3181     FALSE 0.071 211.000 0.000 NA   NA
 7755107 7755108 CDR20291_3182 CDR20291_3183     TRUE 0.488 68.000 0.000 NA   NA
 7755109 7755110 CDR20291_3184 CDR20291_3185     TRUE 0.999 1.000 1.000 NA   NA
 7755110 7755111 CDR20291_3185 CDR20291_3186     TRUE 0.998 15.000 0.667 NA   NA
 7755111 7755112 CDR20291_3186 CDR20291_3187     TRUE 0.444 77.000 0.000 NA   NA
 7755112 7755113 CDR20291_3187 CDR20291_3187A     TRUE 0.525 59.000 0.000 NA   NA
 7755113 7755114 CDR20291_3187A CDR20291_3188     TRUE 0.884 12.000 0.000 NA   NA
 7755114 7755115 CDR20291_3188 CDR20291_3189     TRUE 0.950 -6.000 0.000 1.000   NA
 7755115 7755116 CDR20291_3189 CDR20291_3190     FALSE 0.015 381.000 0.000 NA   NA
 7755116 7755117 CDR20291_3190 CDR20291_3191     TRUE 0.402 293.000 0.222 NA   NA
 7755117 7755118 CDR20291_3191 CDR20291_3192     FALSE 0.026 309.000 0.000 NA   NA
 7755118 7755119 CDR20291_3192 CDR20291_3193   bclA3 FALSE 0.127 169.000 0.000 NA   NA
 7755119 7755120 CDR20291_3193 CDR20291_3194 bclA3   TRUE 0.476 79.000 0.000 1.000   NA
 7755120 7755121 CDR20291_3194 CDR20291_3195   clpP2 FALSE 0.024 322.000 0.000 1.000 N NA
 7755121 7755122 CDR20291_3195 CDR20291_3196 clpP2   TRUE 0.938 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7755122 7755123 CDR20291_3196 CDR20291_3197     TRUE 0.339 223.000 0.000 0.037 Y NA
 7755127 7755128 CDR20291_3201 CDR20291_3202     TRUE 0.576 49.000 0.000 NA   NA
 7755130 7755131 CDR20291_3204 CDR20291_3205     FALSE 0.022 332.000 0.000 1.000 N NA
 7755131 7755132 CDR20291_3205 CDR20291_3206     FALSE 0.039 264.000 0.000 NA   NA
 7755132 7755133 CDR20291_3206 CDR20291_3207     TRUE 0.991 0.000 0.045 NA   NA
 7755133 7755134 CDR20291_3207 CDR20291_3208     TRUE 0.999 -22.000 0.648 NA   NA
 7755136 7755137 CDR20291_3210 CDR20291_3211     FALSE 0.329 102.000 0.000 NA   NA
 7755137 7755138 CDR20291_3211 CDR20291_3212     FALSE 0.008 536.000 0.000 NA   NA
 7755138 7755139 CDR20291_3212 CDR20291_3213     TRUE 0.938 -3.000 0.000 NA   NA
 7755141 7755142 CDR20291_3215 CDR20291_3216   pykF FALSE 0.118 175.000 0.000 1.000 N NA
 7755142 7755143 CDR20291_3216 CDR20291_3217 pykF pfkA TRUE 0.984 52.000 0.064 0.003 Y NA
 7755143 7755144 CDR20291_3217 CDR20291_3218 pfkA dnaE TRUE 0.358 209.000 0.029 1.000 N NA
 7755144 7755145 CDR20291_3218 CDR20291_3219 dnaE   TRUE 0.513 157.000 0.010 1.000   NA
 7755145 7755146 CDR20291_3219 CDR20291_3220     TRUE 0.977 17.000 0.018 1.000   NA
 7755146 7755147 CDR20291_3220 CDR20291_3221     TRUE 0.831 69.000 0.007 NA   NA
 7755147 7755148 CDR20291_3221 CDR20291_3222     TRUE 0.997 0.000 0.259 NA   NA
 7755148 7755149 CDR20291_3222 CDR20291_3223     TRUE 0.956 31.000 0.026 NA   NA
 7755149 7755150 CDR20291_3223 CDR20291_3224   murB TRUE 0.984 4.000 0.014 1.000 N NA
 7755150 7755151 CDR20291_3224 CDR20291_3225 murB   FALSE 0.053 234.000 0.000 1.000 N NA
 7755152 7755153 CDR20291_3226 CDR20291_3227 cls hymA FALSE 0.024 318.000 0.000 1.000 N NA
 7755153 7755154 CDR20291_3227 CDR20291_3228 hymA hymB TRUE 0.998 17.000 0.154 0.001 Y NA
 7755154 7755155 CDR20291_3228 CDR20291_3229 hymB hymC TRUE 0.996 23.000 0.262 0.001   NA
 7755156 7755157 CDR20291_3230 CDR20291_3231   hprK FALSE 0.124 214.000 0.000 0.086 N NA
 7755157 7755158 CDR20291_3231 CDR20291_3232 hprK uvrC TRUE 0.989 0.000 0.021 1.000 N NA
 7755158 7755159 CDR20291_3232 CDR20291_3233 uvrC uvrA TRUE 0.647 259.000 0.043 0.001 Y NA
 7755159 7755160 CDR20291_3233 CDR20291_3234 uvrA uvrB TRUE 0.998 19.000 0.154 0.001 Y NA
 7755160 7755161 CDR20291_3234 CDR20291_3235 uvrB   FALSE 0.159 163.000 0.000 1.000   NA
 7755161 7755162 CDR20291_3235 CDR20291_3236     TRUE 0.551 63.000 0.000 1.000   NA
 7755162 7755163 CDR20291_3236 CDR20291_3237     TRUE 0.999 25.000 0.750 0.019 Y NA
 7755163 7755164 CDR20291_3237 CDR20291_3238     TRUE 0.932 44.000 0.000 0.019 Y NA
 7755164 7755165 CDR20291_3238 CDR20291_3239     TRUE 0.994 -16.000 0.000 0.019 Y NA
 7755165 7755166 CDR20291_3239 CDR20291_r25   5SrRNA FALSE 0.011 455.000 0.000 NA   NA
 7755166 7755167 CDR20291_r25 CDR20291_r23 5SrRNA 23SrRNA TRUE 0.463 73.000 0.000 NA   NA
 7755167 7755168 CDR20291_r23 CDR20291_r16 23SrRNA 16SrRNA FALSE 0.043 255.000 0.000 NA   NA
 7755168 7755169 CDR20291_r16 CDR20291_3240 16SrRNA   FALSE 0.323 103.000 0.000 NA   NA
 7755169 7755170 CDR20291_3240 CDR20291_3241   hemB TRUE 0.776 153.000 0.019 1.000 Y NA
 7755170 7755171 CDR20291_3241 CDR20291_3242 hemB hemD TRUE 0.994 17.000 0.044 1.000 Y NA
 7755171 7755172 CDR20291_3242 CDR20291_3243 hemD hemC TRUE 0.997 -10.000 0.031 1.000 Y NA
 7755172 7755173 CDR20291_3243 CDR20291_3244 hemC cbiK TRUE 0.945 30.000 0.000 1.000 Y NA
 7755173 7755174 CDR20291_3244 CDR20291_3245 cbiK cbiJ TRUE 0.994 19.000 0.006 0.006 Y NA
 7755174 7755175 CDR20291_3245 CDR20291_3246 cbiJ cbiH TRUE 1.000 -3.000 0.423 0.006 Y NA
 7755175 7755176 CDR20291_3246 CDR20291_3247 cbiH cbiG TRUE 1.000 -3.000 0.352 0.006 Y NA
 7755176 7755177 CDR20291_3247 CDR20291_3248 cbiG cbiF TRUE 1.000 -16.000 0.397 0.006 Y NA
 7755177 7755178 CDR20291_3248 CDR20291_3249 cbiF cbiT TRUE 0.999 -7.000 0.056 0.006 Y NA
 7755178 7755179 CDR20291_3249 CDR20291_3250 cbiT cbiE TRUE 1.000 -10.000 0.300 0.000 Y NA
 7755179 7755180 CDR20291_3250 CDR20291_3251 cbiE cbiD TRUE 0.999 -3.000 0.126 0.006 Y NA
 7755180 7755181 CDR20291_3251 CDR20291_3252 cbiD cbiC TRUE 0.999 9.000 0.168 0.006 Y NA
 7755181 7755182 CDR20291_3252 CDR20291_3253 cbiC   TRUE 0.993 -12.000 0.028 1.000 N NA
 7755182 7755183 CDR20291_3253 CDR20291_3254   cobD TRUE 0.991 2.000 0.060 1.000 N NA
 7755183 7755184 CDR20291_3254 CDR20291_3255 cobD cbiB TRUE 0.953 32.000 0.026 1.000 N NA
 7755184 7755185 CDR20291_3255 CDR20291_3256 cbiB cbiA TRUE 0.999 1.000 0.124 0.006 Y NA
 7755185 7755186 CDR20291_3256 CDR20291_3257 cbiA cbiP TRUE 0.998 0.000 0.021 0.002 Y NA
 7755186 7755187 CDR20291_3257 CDR20291_3258 cbiP   FALSE 0.016 376.000 0.000 1.000 N NA
 7755187 7755188 CDR20291_3258 CDR20291_3259   cobS TRUE 0.975 20.000 0.018 1.000 N NA
 7755188 7755189 CDR20291_3259 CDR20291_3260 cobS cobU TRUE 0.995 10.000 0.046 1.000 Y NA
 7755189 7755190 CDR20291_3260 CDR20291_3261 cobU cobT TRUE 0.998 -22.000 0.031 1.000 Y NA
 7755192 7755193 CDR20291_3263 CDR20291_3264     TRUE 0.994 5.000 0.007 1.000 Y NA
 7755193 7755194 CDR20291_3264 CDR20291_3265     TRUE 0.979 10.000 0.011 1.000 N NA
 7755194 7755195 CDR20291_3265 CDR20291_3266     TRUE 0.999 32.000 1.000 0.018 Y NA
 7755195 7755196 CDR20291_3266 CDR20291_3267     TRUE 0.996 97.000 1.000 0.021 Y NA
 7755196 7755197 CDR20291_3267 CDR20291_3268   celM TRUE 1.000 15.000 1.000 1.000 Y NA
 7755197 7755198 CDR20291_3268 CDR20291_3269 celM   TRUE 0.999 3.000 1.000 1.000 N NA
 7755198 7755199 CDR20291_3269 CDR20291_3270   agaY FALSE 0.023 326.000 0.000 1.000 N NA
 7755199 7755200 CDR20291_3270 CDR20291_3271 agaY agaS TRUE 0.579 49.000 0.000 1.000 N NA
 7755203 7755204 CDR20291_3274 CDR20291_3275   agaA TRUE 0.743 116.000 0.045 1.000 N NA
 7755205 7755206 CDR20291_3276 CDR20291_3277     FALSE 0.049 242.000 0.000 NA   NA
 7755206 7755207 CDR20291_3277 CDR20291_3278     FALSE 0.021 334.000 0.000 NA   NA
 7755208 7755209 CDR20291_3279 CDR20291_3280     FALSE 0.021 333.000 0.000 NA   NA
 7755209 7755210 CDR20291_3280 CDR20291_3281     FALSE 0.014 394.000 0.000 NA   NA
 7755210 7755211 CDR20291_3281 CDR20291_3282     FALSE 0.027 300.000 0.000 NA   NA
 7755211 7755212 CDR20291_3282 CDR20291_3283     FALSE 0.011 454.000 0.000 NA   NA
 7755212 7755213 CDR20291_3283 CDR20291_3284     TRUE 0.368 95.000 0.000 NA   NA
 7755214 7755215 CDR20291_3285 CDR20291_3286     FALSE 0.065 218.000 0.000 NA   NA
 7755215 7755216 CDR20291_3286 CDR20291_3287     FALSE 0.008 529.000 0.000 NA   NA
 7755216 7755217 CDR20291_3287 CDR20291_3288     TRUE 0.978 32.000 0.125 NA   NA
 7755217 7755218 CDR20291_3288 CDR20291_3289     FALSE 0.011 450.000 0.000 NA   NA
 7755218 7755219 CDR20291_3289 CDR20291_3290     FALSE 0.010 477.000 0.000 NA   NA
 7755219 7755220 CDR20291_3290 CDR20291_3291     FALSE 0.098 187.000 0.000 1.000 N NA
 7755222 7755223 CDR20291_3293 CDR20291_3294     FALSE 0.073 208.000 0.000 NA   NA
 7755223 7755224 CDR20291_3294 CDR20291_3295   tkt' FALSE 0.012 423.000 0.000 NA   NA
 7755224 7755225 CDR20291_3295 CDR20291_3296 tkt' tkt TRUE 0.999 2.000 0.167 0.001 Y NA
 7755225 7755226 CDR20291_3296 CDR20291_3297 tkt   TRUE 0.455 171.000 0.013 1.000 N NA
 7755226 7755227 CDR20291_3297 CDR20291_3298     TRUE 0.998 -10.000 0.221 NA   NA
 7755227 7755228 CDR20291_3298 CDR20291_3299   alr TRUE 0.964 33.000 0.057 NA   NA
 7755228 7755229 CDR20291_3299 CDR20291_3300 alr   TRUE 0.867 15.000 0.000 NA   NA
 7755229 7755230 CDR20291_3300 CDR20291_3301     TRUE 0.860 21.000 0.000 NA   NA
 7755230 7755231 CDR20291_3301 CDR20291_3302   acpS TRUE 0.970 15.000 0.003 1.000 N NA
 7755231 7755232 CDR20291_3302 CDR20291_3303 acpS atpC FALSE 0.011 462.000 0.000 1.000 N NA
 7755232 7755233 CDR20291_3303 CDR20291_3304 atpC atpD TRUE 1.000 3.000 0.837 0.004 Y NA
 7755233 7755234 CDR20291_3304 CDR20291_3305 atpD atpG TRUE 1.000 13.000 0.724 0.004 Y NA
 7755234 7755235 CDR20291_3305 CDR20291_3306 atpG atpA TRUE 0.998 64.000 0.846 0.004 Y NA
 7755235 7755236 CDR20291_3306 CDR20291_3307 atpA atpH TRUE 1.000 17.000 0.864 0.004 Y NA
 7755236 7755237 CDR20291_3307 CDR20291_3308 atpH atpF TRUE 0.998 -3.000 0.040 0.004 Y NA
 7755237 7755238 CDR20291_3308 CDR20291_3309 atpF atpE TRUE 0.900 105.000 0.071 0.004   NA
 7755238 7755239 CDR20291_3309 CDR20291_3310 atpE atpB TRUE 0.906 69.000 0.007 0.004   NA
 7755239 7755240 CDR20291_3310 CDR20291_3311 atpB atpI TRUE 0.997 3.000 0.330 1.000   NA
 7755240 7755241 CDR20291_3311 CDR20291_3312 atpI atpZ TRUE 0.992 5.000 0.094 NA   NA
 7755241 7755242 CDR20291_3312 CDR20291_3313 atpZ   TRUE 0.367 185.000 0.007 NA   NA
 7755242 7755243 CDR20291_3313 CDR20291_3314     FALSE 0.058 226.000 0.000 NA   NA
 7755243 7755244 CDR20291_3314 CDR20291_3315   upp FALSE 0.027 300.000 0.000 NA   NA
 7755244 7755245 CDR20291_3315 CDR20291_3316 upp rpiB2 TRUE 0.916 36.000 0.002 1.000 N NA
 7755245 7755246 CDR20291_3316 CDR20291_3317 rpiB2   TRUE 0.864 17.000 0.000 1.000 N NA
 7755246 7755247 CDR20291_3317 CDR20291_3318     TRUE 0.982 17.000 0.056 NA N NA
 7755247 7755248 CDR20291_3318 CDR20291_3319     TRUE 0.987 8.000 0.052 NA N NA
 7755248 7755249 CDR20291_3319 CDR20291_3320   prfA TRUE 0.591 129.000 0.007 1.000 N NA
 7755249 7755250 CDR20291_3320 CDR20291_3321 prfA hemK TRUE 0.981 44.000 0.081 1.000 Y NA
 7755250 7755251 CDR20291_3321 CDR20291_3322 hemK   TRUE 0.988 18.000 0.098 NA   NA
 7755251 7755252 CDR20291_3322 CDR20291_3323   rpmE TRUE 0.753 145.000 0.115 NA   NA
 7755252 7755253 CDR20291_3323 CDR20291_3324 rpmE rho TRUE 0.725 153.000 0.115 1.000 N NA
 7755253 7755254 CDR20291_3324 CDR20291_3325 rho gtaB FALSE 0.009 500.000 0.000 1.000 N NA
 7755254 7755255 CDR20291_3325 CDR20291_3326 gtaB   TRUE 0.911 114.000 0.286 1.000 N NA
 7755255 7755256 CDR20291_3326 CDR20291_3327   spoIIE FALSE 0.023 351.000 0.000 1.000   NA
 7755256 7755257 CDR20291_3327 CDR20291_3328 spoIIE   TRUE 0.883 90.000 0.085 NA   NA
 7755257 7755258 CDR20291_3328 CDR20291_3329     TRUE 0.695 113.000 0.016 NA   NA
 7755258 7755259 CDR20291_3329 CDR20291_3330     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   NA
 7755259 7755260 CDR20291_3330 CDR20291_3331     TRUE 0.926 1.000 0.000 NA   NA
 7755260 7755261 CDR20291_3331 CDR20291_3332     TRUE 0.935 62.000 0.108 NA   NA
 7755261 7755262 CDR20291_3332 CDR20291_3333   hupA TRUE 0.874 63.000 0.024 1.000 N NA
 7755262 7755263 CDR20291_3333 CDR20291_3334 hupA   TRUE 0.806 89.000 0.014 1.000   NA
 7755263 7755264 CDR20291_3334 CDR20291_3335   spoIIIF TRUE 0.813 80.000 0.007 1.000   NA
 7755264 7755265 CDR20291_3335 CDR20291_3336 spoIIIF spoVT FALSE 0.238 120.000 0.000 NA   NA
 7755265 7755266 CDR20291_3336 CDR20291_3337 spoVT prsA TRUE 0.762 106.000 0.039 NA N NA
 7755266 7755267 CDR20291_3337 CDR20291_3338 prsA mfd TRUE 0.851 61.000 0.007 1.000 N NA
 7755267 7755268 CDR20291_3338 CDR20291_3339 mfd pth TRUE 0.990 17.000 0.137 1.000 N NA
 7755268 7755269 CDR20291_3339 CDR20291_3340 pth   TRUE 0.973 14.000 0.003 1.000   NA
 7755269 7755270 CDR20291_3340 CDR20291_3341     TRUE 0.369 102.000 0.000 1.000   NA
 7755270 7755271 CDR20291_3341 CDR20291_3342     TRUE 0.997 -19.000 0.005 1.000 Y NA
 7755271 7755272 CDR20291_3342 CDR20291_3343     TRUE 0.337 100.000 0.000 NA   NA
 7755272 7755273 CDR20291_3343 CDR20291_3344     TRUE 0.860 21.000 0.000 NA   NA
 7755273 7755274 CDR20291_3344 CDR20291_3345     TRUE 0.684 37.000 0.000 NA   NA
 7755274 7755275 CDR20291_3345 CDR20291_3346     TRUE 0.807 27.000 0.000 NA   NA
 7755275 7755276 CDR20291_3346 CDR20291_3347     TRUE 0.944 -7.000 0.000 NA   NA
 7755276 7755277 CDR20291_3347 CDR20291_3348     TRUE 0.979 15.000 0.031 NA   NA
 7755277 7755278 CDR20291_3348 CDR20291_3349     TRUE 0.997 12.000 0.141 1.000 Y NA
 7755278 7755279 CDR20291_3349 CDR20291_3350     TRUE 0.536 142.000 0.000 1.000 Y NA
 7755279 7755280 CDR20291_3350 CDR20291_3351   prs FALSE 0.005 1087.000 0.000 1.000 N NA
 7755280 7755281 CDR20291_3351 CDR20291_3352 prs gcaD TRUE 0.859 95.000 0.069 1.000 N NA
 7755281 7755282 CDR20291_3352 CDR20291_3353 gcaD spoVG FALSE 0.287 210.000 0.000 1.000 Y NA
 7755282 7755283 CDR20291_3353 CDR20291_3354 spoVG purR FALSE 0.151 156.000 0.000 1.000 N NA
 7755285 7755286 CDR20291_3356 CDR20291_3357     TRUE 0.978 70.000 0.500 NA   NA
 7755286 7755287 CDR20291_3357 CDR20291_3358     FALSE 0.217 129.000 0.000 1.000 N NA
 7755287 7755288 CDR20291_3358 CDR20291_3359     TRUE 0.411 85.000 0.000 NA   NA
 7755288 7755289 CDR20291_3359 CDR20291_3360   ksgA TRUE 0.835 66.000 0.006 NA   NA
 7755289 7755290 CDR20291_3360 CDR20291_3361 ksgA   TRUE 0.641 171.000 0.093 1.000 N NA
 7755290 7755291 CDR20291_3361 CDR20291_3362     FALSE 0.090 192.000 0.000 1.000 N NA
 7755291 7755292 CDR20291_3362 CDR20291_3363     FALSE 0.048 766.000 0.000 0.019 Y NA
 7755292 7755293 CDR20291_3363 CDR20291_3364     TRUE 0.995 -24.000 0.000 0.019 Y NA
 7755293 7755294 CDR20291_3364 CDR20291_3365     TRUE 0.993 18.000 0.125 0.019 N NA
 7755294 7755295 CDR20291_3365 CDR20291_3366     TRUE 0.937 1.000 0.000 1.000   NA
 7755295 7755296 CDR20291_3366 CDR20291_3367   phnM TRUE 0.988 4.000 0.037 1.000   NA
 7755296 7755297 CDR20291_3367 CDR20291_3368 phnM phnL TRUE 0.996 1.000 0.016 1.000 Y NA
 7755297 7755298 CDR20291_3368 CDR20291_3369 phnL phnK TRUE 1.000 23.000 0.859 0.022 Y NA
 7755298 7755299 CDR20291_3369 CDR20291_3370 phnK phnJ TRUE 1.000 -7.000 0.883 1.000 Y NA
 7755299 7755300 CDR20291_3370 CDR20291_3371 phnJ phnI TRUE 0.999 20.000 0.880 1.000 Y NA
 7755300 7755301 CDR20291_3371 CDR20291_3372 phnI phnH TRUE 1.000 3.000 0.960 0.001 Y NA
 7755301 7755302 CDR20291_3372 CDR20291_3373 phnH phnG TRUE 1.000 15.000 0.967 0.001 Y NA
 7755302 7755303 CDR20291_3373 CDR20291_3374 phnG   FALSE 0.017 337.000 0.000 NA N NA
 7755303 7755304 CDR20291_3374 CDR20291_3375   metG TRUE 0.985 30.000 0.221 NA N NA
 7755304 7755305 CDR20291_3375 CDR20291_3376 metG spmB FALSE 0.014 396.000 0.000 NA   NA
 7755305 7755306 CDR20291_3376 CDR20291_3377 spmB spmA TRUE 0.998 16.000 0.655 NA   NA
 7755307 7755308 CDR20291_3378 CDR20291_3379     TRUE 0.936 37.000 0.024 1.000 N NA
 7755309 7755310 CDR20291_3380 CDR20291_3381     TRUE 0.850 23.000 0.000 NA   NA
 7755310 7755311 CDR20291_3381 CDR20291_3382     TRUE 0.996 1.000 0.078 0.003   NA
 7755311 7755312 CDR20291_3382 CDR20291_3383     TRUE 0.898 78.000 0.077 NA   NA
 7755312 7755313 CDR20291_3383 CDR20291_3384     TRUE 0.998 -3.000 0.372 NA   NA
 7755313 7755314 CDR20291_3384 CDR20291_3385     TRUE 0.983 3.000 0.006 1.000 N NA
 7755314 7755315 CDR20291_3385 CDR20291_3386   speA TRUE 0.720 116.000 0.034 1.000 N NA
 7755315 7755316 CDR20291_3386 CDR20291_3387 speA   FALSE 0.152 155.000 0.000 NA   NA
 7755316 7755317 CDR20291_3387 CDR20291_r26   5SrRNA FALSE 0.238 120.000 0.000 NA   NA
 7755317 7755318 CDR20291_r26 CDR20291_r24 5SrRNA 23SrRNA TRUE 0.463 73.000 0.000 NA   NA
 7755318 7755319 CDR20291_r24 CDR20291_r17 23SrRNA 16SrRNA FALSE 0.091 191.000 0.000 NA   NA
 7755319 7755320 CDR20291_r17 CDR20291_3388 16SrRNA   FALSE 0.086 194.000 0.000 NA   NA
 7755320 7755321 CDR20291_3388 CDR20291_3389   lysS FALSE 0.062 222.000 0.000 NA   NA
 7755321 7755322 CDR20291_3389 CDR20291_3390 lysS greA TRUE 0.988 15.000 0.098 1.000 N NA
 7755322 7755323 CDR20291_3390 CDR20291_3391 greA dusB TRUE 0.728 109.000 0.022 1.000 N NA
 7755323 7755324 CDR20291_3391 CDR20291_3392 dusB   TRUE 0.691 137.000 0.054 1.000 N NA
 7755324 7755325 CDR20291_3392 CDR20291_3393     TRUE 0.977 19.000 0.025 NA   NA
 7755325 7755326 CDR20291_3393 CDR20291_3394     TRUE 0.590 157.000 0.044 NA   NA
 7755326 7755327 CDR20291_3394 CDR20291_3395   birA TRUE 0.989 -7.000 0.012 NA N NA
 7755327 7755328 CDR20291_3395 CDR20291_3396 birA ftsH2 FALSE 0.128 314.000 0.012 1.000 N NA
 7755328 7755329 CDR20291_3396 CDR20291_3397 ftsH2   TRUE 0.991 10.000 0.051 0.085 N NA
 7755329 7755330 CDR20291_3397 CDR20291_3398     TRUE 0.347 183.000 0.002 NA   NA
 7755330 7755331 CDR20291_3398 CDR20291_3399   murI TRUE 0.976 17.000 0.024 NA   NA
 7755331 7755332 CDR20291_3399 CDR20291_3400 murI   FALSE 0.093 202.000 0.000 1.000   NA
 7755332 7755333 CDR20291_3400 CDR20291_3401   spoIIR TRUE 0.955 30.000 0.020 NA   NA
 7755333 7755334 CDR20291_3401 CDR20291_3402 spoIIR   TRUE 0.711 145.000 0.079 NA   NA
 7755334 7755335 CDR20291_3402 CDR20291_3403   ipk TRUE 0.995 -16.000 0.057 1.000 N NA
 7755335 7755336 CDR20291_3403 CDR20291_3404 ipk   TRUE 0.813 88.000 0.018 1.000   NA
 7755336 7755337 CDR20291_3404 CDR20291_3405   veg TRUE 0.874 94.000 0.082 NA   NA
 7755337 7755338 CDR20291_3405 CDR20291_3406 veg   TRUE 0.744 148.000 0.116 NA   NA
 7755338 7755339 CDR20291_3406 CDR20291_3407     TRUE 0.416 84.000 0.000 NA   NA
 7755339 7755340 CDR20291_3407 CDR20291_3408     FALSE 0.285 110.000 0.000 NA   NA
 7755340 7755341 CDR20291_3408 CDR20291_3409     TRUE 0.892 10.000 0.000 NA   NA
 7755341 7755342 CDR20291_3409 CDR20291_3410     TRUE 0.834 115.000 0.115 NA   NA
 7755342 7755343 CDR20291_3410 CDR20291_3411     FALSE 0.115 176.000 0.000 NA   NA
 7755343 7755344 CDR20291_3411 CDR20291_3412     TRUE 0.998 17.000 0.750 NA   NA
 7755344 7755345 CDR20291_3412 CDR20291_3413     TRUE 0.997 15.000 0.500 NA   NA
 7755345 7755346 CDR20291_3413 CDR20291_3414     FALSE 0.245 111.000 0.000 NA N NA
 7755346 7755347 CDR20291_3414 CDR20291_3415   mdeA TRUE 0.519 51.000 0.000 NA N NA
 7755347 7755348 CDR20291_3415 CDR20291_3416 mdeA   FALSE 0.008 559.000 0.000 1.000 N NA
 7755351 7755352 CDR20291_3419 CDR20291_3420     TRUE 0.994 0.000 0.082 NA   NA
 7755352 7755353 CDR20291_3420 CDR20291_3421     TRUE 0.862 21.000 0.000 1.000 N NA
 7755354 7755355 CDR20291_3422 CDR20291_3423     TRUE 1.000 0.000 0.700 1.000 Y NA
 7755355 7755356 CDR20291_3423 CDR20291_3424     TRUE 0.970 83.000 0.333 0.084 N NA
 7755356 7755357 CDR20291_3424 CDR20291_3425     TRUE 1.000 -13.000 0.583 1.000 Y NA
 7755357 7755358 CDR20291_3425 CDR20291_3426   pyrAB1 FALSE 0.009 500.000 0.000 1.000 N NA
 7755358 7755359 CDR20291_3426 CDR20291_3427 pyrAB1 pyrAA1 TRUE 0.817 193.000 0.054 0.001 Y NA
 7755359 7755360 CDR20291_3427 CDR20291_3428 pyrAA1 pyrAB2 TRUE 0.778 213.000 0.054 0.001 Y NA
 7755360 7755361 CDR20291_3428 CDR20291_3429 pyrAB2 pyrAA2 TRUE 0.983 53.000 0.054 0.001 Y NA
 7755361 7755362 CDR20291_3429 CDR20291_3430 pyrAA2 pyrF TRUE 0.986 26.000 0.004 1.000 Y NA
 7755362 7755363 CDR20291_3430 CDR20291_3431 pyrF   FALSE 0.016 376.000 0.000 NA   NA
 7755363 7755364 CDR20291_3431 CDR20291_3432     TRUE 0.842 24.000 0.000 NA   NA
 7755366 7755367 CDR20291_3434 CDR20291_3435     TRUE 0.998 -28.000 0.075 0.001   NA
 7755367 7755368 CDR20291_3435 CDR20291_3436   luxS TRUE 0.991 -10.000 0.008 1.000   NA
 7755368 7755369 CDR20291_3436 CDR20291_3437 luxS   FALSE 0.039 282.000 0.000 1.000   NA
 7755369 7755370 CDR20291_3437 CDR20291_3438     TRUE 0.999 17.000 0.932 1.000   NA
 7755370 7755371 CDR20291_3438 CDR20291_3439     TRUE 0.752 134.000 0.085 1.000 N NA
 7755373 7755374 CDR20291_3441 CDR20291_3442     TRUE 0.844 26.000 0.000 1.000   NA
 7755374 7755375 CDR20291_3442 CDR20291_3443     TRUE 0.363 103.000 0.000 1.000   NA
 7755375 7755376 CDR20291_3443 CDR20291_3444     FALSE 0.188 150.000 0.000 1.000   NA
 7755376 7755377 CDR20291_3444 CDR20291_3445     TRUE 0.339 107.000 0.000 1.000   NA
 7755377 7755378 CDR20291_3445 CDR20291_3446     FALSE 0.211 142.000 0.000 1.000   NA
 7755378 7755379 CDR20291_3446 CDR20291_3447     TRUE 0.996 22.000 0.465 1.000 N NA
 7755379 7755380 CDR20291_3447 CDR20291_3448     FALSE 0.084 196.000 0.000 NA   NA
 7755380 7755381 CDR20291_3448 CDR20291_3449     FALSE 0.225 125.000 0.000 NA   NA
 7755381 7755382 CDR20291_3449 CDR20291_3450     FALSE 0.035 273.000 0.000 NA   NA
 7755385 7755386 CDR20291_3453 CDR20291_3454     FALSE 0.059 225.000 0.000 NA   NA
 7755386 7755387 CDR20291_3454 CDR20291_3455     FALSE 0.005 1014.000 0.000 NA   NA
 7755387 7755388 CDR20291_3455 CDR20291_3456     TRUE 0.832 25.000 0.000 NA   NA
 7755388 7755389 CDR20291_3456 CDR20291_3457     TRUE 0.699 36.000 0.000 NA   NA
 7755389 7755390 CDR20291_3457 CDR20291_3458     FALSE 0.285 110.000 0.000 NA   NA
 7755390 7755391 CDR20291_3458 CDR20291_3459     FALSE 0.040 280.000 0.000 1.000   NA
 7755391 7755392 CDR20291_3459 CDR20291_3460     FALSE 0.183 142.000 0.000 NA   NA
 7755392 7755393 CDR20291_3460 CDR20291_3461     FALSE 0.025 314.000 0.000 NA   NA
 7755393 7755394 CDR20291_3461 CDR20291_3462     FALSE 0.031 286.000 0.000 NA   NA
 7755394 7755395 CDR20291_3462 CDR20291_3463     TRUE 0.999 16.000 1.000 NA   NA
 7755395 7755396 CDR20291_3463 CDR20291_3464     FALSE 0.010 489.000 0.000 NA   NA
 7755396 7755397 CDR20291_3464 CDR20291_3465     TRUE 0.932 0.000 0.000 NA   NA
 7755397 7755398 CDR20291_3465 CDR20291_3466     TRUE 0.938 -3.000 0.000 NA   NA
 7755398 7755399 CDR20291_3466 CDR20291_3467     TRUE 0.863 16.000 0.000 NA   NA
 7755399 7755400 CDR20291_3467 CDR20291_3468     FALSE 0.070 213.000 0.000 NA   NA
 7755400 7755401 CDR20291_3468 CDR20291_3469     TRUE 0.470 72.000 0.000 NA   NA
 7755401 7755402 CDR20291_3469 CDR20291_3470     TRUE 0.978 29.000 0.074 1.000   NA
 7755402 7755403 CDR20291_3470 CDR20291_3471     TRUE 0.999 -3.000 0.593 NA   NA
 7755403 7755404 CDR20291_3471 CDR20291_3472     TRUE 0.999 -3.000 0.611 NA   NA
 7755404 7755405 CDR20291_3472 CDR20291_3473     TRUE 0.884 12.000 0.000 NA   NA
 7755405 7755406 CDR20291_3473 CDR20291_3474     FALSE 0.005 881.000 0.000 NA   NA
 7755406 7755407 CDR20291_3474 CDR20291_3475   int-Tn FALSE 0.260 115.000 0.000 NA   NA
 7755408 7755409 CDR20291_3476 CDR20291_3477     TRUE 0.452 76.000 0.000 1.000 N NA
 7755409 7755410 CDR20291_3477 CDR20291_3478     FALSE 0.112 166.000 0.000 NA N NA
 7755410 7755411 CDR20291_3478 CDR20291_3479     FALSE 0.004 1376.000 0.000 NA N NA
 7755413 7755414 CDR20291_3481 CDR20291_3482     FALSE 0.112 178.000 0.000 NA   NA
 7755414 7755415 CDR20291_3482 CDR20291_3483     FALSE 0.165 149.000 0.000 NA   NA
 7755415 7755416 CDR20291_3483 CDR20291_3484   phnA FALSE 0.008 570.000 0.000 NA   NA
 7755416 7755417 CDR20291_3484 CDR20291_3485 phnA   FALSE 0.095 189.000 0.000 1.000 N NA
 7755417 7755418 CDR20291_3485 CDR20291_3486     TRUE 0.994 5.000 0.154 NA   NA
 7755418 7755419 CDR20291_3486 CDR20291_3487   kdgA FALSE 0.013 415.000 0.000 NA   NA
 7755419 7755420 CDR20291_3487 CDR20291_3488 kdgA   TRUE 0.896 106.000 0.182 1.000 N NA
 7755420 7755421 CDR20291_3488 CDR20291_3489     TRUE 0.999 5.000 0.300 1.000 Y NA
 7755421 7755422 CDR20291_3489 CDR20291_3490     TRUE 0.982 34.000 0.182 1.000   NA
 7755422 7755423 CDR20291_3490 CDR20291_3491     TRUE 0.997 27.000 0.545 0.029   NA
 7755423 7755424 CDR20291_3491 CDR20291_3492     TRUE 0.997 15.000 0.333 0.021 N NA
 7755424 7755425 CDR20291_3492 CDR20291_3493     FALSE 0.008 567.000 0.000 NA   NA
 7755425 7755426 CDR20291_3493 CDR20291_3494     TRUE 0.749 32.000 0.000 NA   NA
 7755426 7755427 CDR20291_3494 CDR20291_3495     TRUE 0.944 -7.000 0.000 NA   NA
 7755427 7755428 CDR20291_3495 CDR20291_3496     TRUE 0.519 60.000 0.000 NA   NA
 7755428 7755429 CDR20291_3496 CDR20291_3497     TRUE 0.796 28.000 0.000 NA   NA
 7755431 7755432 CDR20291_3499 CDR20291_3500     TRUE 0.997 5.000 0.283 1.000   NA
 7755432 7755433 CDR20291_3500 CDR20291_3501     TRUE 0.990 50.000 0.679 1.000   NA
 7755433 7755434 CDR20291_3501 CDR20291_3502     TRUE 0.998 18.000 0.750 1.000   NA
 7755434 7755435 CDR20291_3502 CDR20291_3503     TRUE 0.934 2.000 0.000 1.000   NA
 7755435 7755436 CDR20291_3503 CDR20291_3504     FALSE 0.224 137.000 0.000 1.000   NA
 7755436 7755437 CDR20291_3504 CDR20291_3505     FALSE 0.061 224.000 0.000 1.000 N NA
 7755437 7755438 CDR20291_3505 CDR20291_3506     FALSE 0.070 213.000 0.000 1.000 N NA
 7755438 7755439 CDR20291_3506 CDR20291_3507     TRUE 0.924 48.000 0.000 0.018 Y NA
 7755439 7755440 CDR20291_3507 CDR20291_3508     FALSE 0.165 149.000 0.000 NA   NA
 7755440 7755441 CDR20291_3508 CDR20291_3509     TRUE 0.488 68.000 0.000 NA   NA
 7755441 7755442 CDR20291_3509 CDR20291_3510     TRUE 0.896 13.000 0.000 1.000   NA
 7755442 7755443 CDR20291_3510 CDR20291_3511     TRUE 0.369 102.000 0.000 1.000   NA
 7755444 7755445 CDR20291_3512 CDR20291_3513     TRUE 0.998 9.000 0.600 NA   NA
 10864325 10864326 CDR20291_t58 CDR20291_t60     FALSE 0.267 114.000 0.000 NA   NA
 10864326 10864327 CDR20291_t60 CDR20291_t61     TRUE 0.902 7.000 0.000 NA   NA
 10864327 7755446 CDR20291_t61 CDR20291_3514   purA FALSE 0.023 325.000 0.000 NA   NA
 7755446 7755447 CDR20291_3514 CDR20291_3515 purA   TRUE 0.423 82.000 0.000 NA   NA
 7755447 7755448 CDR20291_3515 CDR20291_3516   dnaB FALSE 0.077 205.000 0.000 NA   NA
 7755448 7755449 CDR20291_3516 CDR20291_3517 dnaB rplI TRUE 0.988 19.000 0.100 1.000 N NA
 7755449 7755450 CDR20291_3517 CDR20291_3518 rplI   TRUE 0.995 1.000 0.119 1.000 N NA
 7755450 7755451 CDR20291_3518 CDR20291_3519     TRUE 0.994 11.000 0.210 NA   NA
 7755451 7755452 CDR20291_3519 CDR20291_3520     TRUE 0.967 38.000 0.116 NA   NA
 7755452 7755453 CDR20291_3520 CDR20291_3521   rpsR TRUE 0.569 143.000 0.015 NA   NA
 7755453 7755454 CDR20291_3521 CDR20291_3522 rpsR ssb TRUE 0.968 19.000 0.003 1.000 N NA
 7755454 7755455 CDR20291_3522 CDR20291_3523 ssb rpsF TRUE 0.911 37.000 0.003 1.000 N NA
 7755455 7755456 CDR20291_3523 CDR20291_3524 rpsF   FALSE 0.069 214.000 0.000 1.000 N NA
 7755456 7755457 CDR20291_3524 CDR20291_3525     TRUE 0.726 103.000 0.010 NA   NA
 7755457 7755458 CDR20291_3525 CDR20291_3526     TRUE 0.975 15.000 0.015 NA   NA
 7755458 7755459 CDR20291_3526 CDR20291_3527     TRUE 0.463 73.000 0.000 NA   NA
 7755459 7755460 CDR20291_3527 CDR20291_3528     TRUE 0.498 75.000 0.000 1.000   NA
 7755462 7755463 CDR20291_3530 CDR20291_3531   spo0J TRUE 0.936 33.000 0.006 1.000 N NA
 7755463 7755464 CDR20291_3531 CDR20291_3532 spo0J soj TRUE 0.999 2.000 0.827 1.000 N NA
 7755464 7755465 CDR20291_3532 CDR20291_3533 soj   TRUE 0.926 54.000 0.069 1.000 N NA
 7755465 7755466 CDR20291_3533 CDR20291_3534     TRUE 0.621 175.000 0.089 1.000 N NA
 7755466 7755467 CDR20291_3534 CDR20291_3535   gidA TRUE 0.999 -16.000 0.466 1.000 N NA
 7755467 7755468 CDR20291_3535 CDR20291_3536 gidA trmE TRUE 0.943 95.000 0.266 1.000   NA
 7755468 7755469 CDR20291_3536 CDR20291_3537 trmE jag TRUE 0.882 103.000 0.116 1.000   NA
 7755469 7755470 CDR20291_3537 CDR20291_3538 jag oxaA1 TRUE 0.983 38.000 0.254 1.000   NA
 7755470 7755471 CDR20291_3538 CDR20291_3539 oxaA1   TRUE 0.993 32.000 0.461 NA   NA
 7755471 7755472 CDR20291_3539 CDR20291_3540   rnpA TRUE 0.966 98.000 0.540 NA   NA
 7755472 7755473 CDR20291_3540 CDR20291_3541 rnpA rpmH TRUE 0.986 78.000 0.787 1.000   NA