MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium difficile CD196

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7748312 7748313 CD196_0001 CD196_0002 dnaA dnaN TRUE 0.961 140.000 0.328 1.000 Y NA
 7748313 7748314 CD196_0002 CD196_0003 dnaN   TRUE 0.788 137.000 0.103 1.000   NA
 7748314 7748315 CD196_0003 CD196_0004   recF TRUE 0.993 18.000 0.209 1.000   NA
 7748315 7748316 CD196_0004 CD196_0005 recF gyrB TRUE 0.999 1.000 0.249 0.004 Y NA
 7748316 7748317 CD196_0005 CD196_0006 gyrB gyrA TRUE 0.999 20.000 0.306 0.001 Y NA
 7748317 7748318 CD196_0006 CD196_0007 gyrA   TRUE 0.516 69.000 0.000 NA   NA
 7748318 7748319 CD196_0007 CD196_0008     TRUE 0.933 0.000 0.000 NA   NA
 7748319 7748320 CD196_0008 CD196_0009   rsbV TRUE 0.972 18.000 0.024 NA   NA
 7748320 7748321 CD196_0009 CD196_0010 rsbV rsbW TRUE 1.000 4.000 0.714 1.000 Y NA
 7748321 7748322 CD196_0010 CD196_0011 rsbW sigB TRUE 0.999 0.000 0.838 1.000 N NA
 7748322 7748323 CD196_0011 CD196_r28 sigB 16SrRNA TRUE 0.427 86.000 0.000 NA   NA
 7748323 7748324 CD196_r28 CD196_t001 16SrRNA   TRUE 0.837 25.000 0.000 NA   NA
 7748324 7748325 CD196_t001 CD196_r21   23SrRNA FALSE 0.047 254.000 0.000 NA   NA
 7748325 7748326 CD196_r21 CD196_r22 23SrRNA 5SrRNA TRUE 0.551 62.000 0.000 NA   NA
 7748326 7748327 CD196_r22 CD196_0012 5SrRNA   FALSE 0.235 127.000 0.000 NA   NA
 7748327 7748328 CD196_0012 CD196_0013     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 7748328 7748329 CD196_0013 CD196_0014   serS1 FALSE 0.010 458.000 0.000 NA N NA
 7748329 7748330 CD196_0014 CD196_0015 serS1   FALSE 0.120 320.000 0.000 1.000 Y NA
 7748330 7748331 CD196_0015 CD196_t002     TRUE 0.926 1.000 0.000 NA   NA
 7748331 7748332 CD196_t002 CD196_0016   dnaH FALSE 0.018 382.000 0.000 NA   NA
 7748332 7748333 CD196_0016 CD196_0017 dnaH   TRUE 0.946 59.000 0.100 NA   NA
 7748333 7748334 CD196_0017 CD196_0018   recD TRUE 0.998 13.000 0.604 NA   NA
 7748336 7748337 CD196_r01 CD196_r02 16SrRNA 23SrRNA TRUE 0.369 97.000 0.000 NA   NA
 7748337 7748338 CD196_r02 CD196_r03 23SrRNA 5SrRNA FALSE 0.227 129.000 0.000 NA   NA
 7748338 7748339 CD196_r03 CD196_t003 5SrRNA   TRUE 0.893 7.000 0.000 NA   NA
 7748339 7748340 CD196_t003 CD196_t004     TRUE 0.882 10.000 0.000 NA   NA
 7748340 7748341 CD196_t004 CD196_t005     TRUE 0.842 16.000 0.000 NA   NA
 7748341 7748342 CD196_t005 CD196_t006     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7748342 7748343 CD196_t006 CD196_t007     TRUE 0.860 13.000 0.000 NA   NA
 7748343 7748344 CD196_t007 CD196_t008     TRUE 0.887 9.000 0.000 NA   NA
 7748344 7748345 CD196_t008 CD196_t009     TRUE 0.887 9.000 0.000 NA   NA
 7748345 7748346 CD196_t009 CD196_t010     TRUE 0.860 13.000 0.000 NA   NA
 7748346 7748347 CD196_t010 CD196_t011     TRUE 0.848 18.000 0.000 NA   NA
 7748347 7748348 CD196_t011 CD196_t012     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 7748348 7748349 CD196_t012 CD196_t013     TRUE 0.771 33.000 0.000 NA   NA
 7748349 7748350 CD196_t013 CD196_t014     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7748350 7748351 CD196_t014 CD196_t015     TRUE 0.395 92.000 0.000 NA   NA
 7748351 7748352 CD196_t015 CD196_t016     TRUE 0.893 7.000 0.000 NA   NA
 7748352 7748353 CD196_t016 CD196_t017     TRUE 0.882 10.000 0.000 NA   NA
 7748353 7748354 CD196_t017 CD196_t018     TRUE 0.845 15.000 0.000 NA   NA
 7748354 7748355 CD196_t018 CD196_t019     TRUE 0.823 27.000 0.000 NA   NA
 7748355 7748356 CD196_t019 CD196_t020     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7748356 7748357 CD196_t020 CD196_t021     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 7748357 7748358 CD196_t021 CD196_t022     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7748358 7748359 CD196_t022 CD196_t023     TRUE 0.882 10.000 0.000 NA   NA
 7748359 7748360 CD196_t023 CD196_t024     TRUE 0.887 9.000 0.000 NA   NA
 7748360 7748361 CD196_t024 CD196_t025     TRUE 0.842 16.000 0.000 NA   NA
 7748361 7748362 CD196_t025 CD196_t026     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7748362 7748363 CD196_t026 CD196_t027     TRUE 0.860 13.000 0.000 NA   NA
 7748363 7748364 CD196_t027 CD196_t028     TRUE 0.887 9.000 0.000 NA   NA
 7748364 7748365 CD196_t028 CD196_t029     TRUE 0.887 9.000 0.000 NA   NA
 7748365 7748366 CD196_t029 CD196_t030     TRUE 0.860 13.000 0.000 NA   NA
 7748366 7748367 CD196_t030 CD196_t031     TRUE 0.848 18.000 0.000 NA   NA
 7748367 7748368 CD196_t031 CD196_t032     TRUE 0.860 13.000 0.000 NA   NA
 7748368 7748369 CD196_t032 CD196_t033     TRUE 0.823 27.000 0.000 NA   NA
 7748369 7748370 CD196_t033 CD196_t034     TRUE 0.817 28.000 0.000 NA   NA
 7748370 7748371 CD196_t034 CD196_t035     TRUE 0.860 13.000 0.000 NA   NA
 7748371 7748372 CD196_t035 CD196_t036     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 7748372 7748373 CD196_t036 CD196_t037     TRUE 0.896 6.000 0.000 NA   NA
 7748373 7748374 CD196_t037 CD196_t038     TRUE 0.893 7.000 0.000 NA   NA
 7748374 7748375 CD196_t038 CD196_t039     TRUE 0.882 10.000 0.000 NA   NA
 7748375 7748376 CD196_t039 CD196_t040     TRUE 0.845 15.000 0.000 NA   NA
 7748376 7748377 CD196_t040 CD196_t041     TRUE 0.854 21.000 0.000 NA   NA
 7748377 7748378 CD196_t041 CD196_t042     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 7748378 7748379 CD196_t042 CD196_t043     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7748379 7748380 CD196_t043 CD196_t044     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7748380 7748381 CD196_t044 CD196_t045     TRUE 0.842 16.000 0.000 NA   NA
 7748381 7748382 CD196_t045 CD196_0021     TRUE 0.460 79.000 0.000 NA   NA
 7748382 7748383 CD196_0021 CD196_0022   pyc FALSE 0.030 309.000 0.000 NA   NA
 7748383 7748384 CD196_0022 CD196_0023 pyc   FALSE 0.047 242.000 0.000 1.000 N NA
 7748384 7748385 CD196_0023 CD196_0024   ctsR FALSE 0.010 453.000 0.000 NA N NA
 7748385 7748386 CD196_0024 CD196_0025 ctsR   TRUE 0.999 7.000 0.681 NA   NA
 7748386 7748387 CD196_0025 CD196_0026     TRUE 0.999 16.000 0.848 1.000   NA
 7748387 7748388 CD196_0026 CD196_0027   clpC TRUE 0.648 185.000 0.129 1.000 N NA
 7748388 7748389 CD196_0027 CD196_0028 clpC radA TRUE 0.759 180.000 0.009 0.022 Y NA
 7748389 7748390 CD196_0028 CD196_0029 radA   TRUE 0.994 3.000 0.126 NA   NA
 7748390 7748391 CD196_0029 CD196_0030     TRUE 0.894 89.000 0.088 NA   NA
 7748391 7748392 CD196_0030 CD196_0031     FALSE 0.227 129.000 0.000 NA   NA
 7748394 7748395 CD196_0033 CD196_0034     TRUE 0.999 22.000 1.000 0.004   NA
 7748395 7748396 CD196_0034 CD196_0035     TRUE 0.984 97.000 0.333 1.000 Y NA
 7748396 7748397 CD196_0035 CD196_0036     FALSE 0.013 445.000 0.000 1.000 N NA
 7748397 7748398 CD196_0036 CD196_0037   acoA TRUE 0.762 32.000 0.000 1.000 N NA
 7748398 7748399 CD196_0037 CD196_0038 acoA acoB TRUE 1.000 25.000 0.769 0.001 Y NA
 7748399 7748400 CD196_0038 CD196_0039 acoB acoC TRUE 0.978 13.000 0.000 0.060 Y NA
 7748400 7748401 CD196_0039 CD196_0040 acoC acoL TRUE 0.445 167.000 0.000 1.000 Y NA
 7748401 7748402 CD196_0040 CD196_0041 acoL   FALSE 0.014 418.000 0.000 1.000 N NA
 7748402 7748403 CD196_0041 CD196_0042     TRUE 0.980 -22.000 0.000 0.036 N NA
 7748403 7748404 CD196_0042 CD196_0043     TRUE 0.757 113.000 0.000 0.031 Y NA
 7748404 7748405 CD196_0043 CD196_0044     TRUE 0.988 62.000 0.148 0.051 Y NA
 7748405 7748406 CD196_0044 CD196_0045     TRUE 0.977 35.000 0.111 NA   NA
 7748406 7748407 CD196_0045 CD196_0046     FALSE 0.133 172.000 0.000 NA   NA
 7748407 7748408 CD196_0046 CD196_0047     FALSE 0.117 174.000 0.000 1.000 N NA
 7748408 7748409 CD196_0047 CD196_0048   ispD FALSE 0.048 241.000 0.000 1.000 N NA
 7748409 7748410 CD196_0048 CD196_0049 ispD ispF TRUE 0.997 -3.000 0.041 1.000 Y NA
 7748410 7748411 CD196_0049 CD196_0050 ispF proS FALSE 0.079 367.000 0.004 1.000 N NA
 7748411 7748412 CD196_0050 CD196_0051 proS   TRUE 0.988 35.000 0.006 0.001 Y NA
 7748412 7748413 CD196_0051 CD196_0052   gltX FALSE 0.067 440.000 0.000 1.000 Y NA
 7748413 7748414 CD196_0052 CD196_0053 gltX cysS FALSE 0.169 515.000 0.021 1.000 Y NA
 7748414 7748415 CD196_0053 CD196_0054 cysS   TRUE 0.994 3.000 0.129 1.000   NA
 7748415 7748416 CD196_0054 CD196_0055     FALSE 0.013 508.000 0.000 1.000   NA
 7748416 7748417 CD196_0055 CD196_0056     TRUE 0.995 13.000 0.295 1.000 N NA
 7748417 7748418 CD196_0056 CD196_0057     TRUE 0.823 27.000 0.000 NA   NA
 7748418 7748419 CD196_0057 CD196_0058     FALSE 0.025 327.000 0.000 NA   NA
 7748419 7748420 CD196_0058 CD196_0059     FALSE 0.141 166.000 0.000 NA   NA
 7748420 7748421 CD196_0059 CD196_0060     TRUE 0.904 4.000 0.000 NA   NA
 7748421 7748422 CD196_0060 CD196_0061     TRUE 0.993 3.000 0.109 NA   NA
 7748422 7748423 CD196_0061 CD196_0062   sigH TRUE 0.985 50.000 0.361 NA   NA
 7748423 7748424 CD196_0062 CD196_0063 sigH   TRUE 0.858 74.000 0.004 0.062 N NA
 7748424 7748425 CD196_0063 CD196_0064   rpmG TRUE 0.653 250.000 0.099 1.000 Y NA
 7748425 7748426 CD196_0064 CD196_0065 rpmG secE TRUE 0.984 26.000 0.100 1.000 N NA
 7748426 7748427 CD196_0065 CD196_0066 secE nusG TRUE 0.999 20.000 0.843 1.000 N NA
 7748427 7748428 CD196_0066 CD196_0067 nusG rplK TRUE 0.996 36.000 0.681 1.000 N NA
 7748428 7748429 CD196_0067 CD196_0068 rplK rplA TRUE 0.998 70.000 0.838 0.021 Y NA
 7748429 7748430 CD196_0068 CD196_0069 rplA rplJ TRUE 0.908 223.000 0.302 0.021 Y NA
 7748430 7748431 CD196_0069 CD196_0070 rplJ rplL TRUE 0.999 58.000 0.884 0.015 Y NA
 7748431 7748432 CD196_0070 CD196_0071 rplL   FALSE 0.015 392.000 0.000 1.000 N NA
 7748432 7748433 CD196_0071 CD196_0072   rpoB FALSE 0.012 471.000 0.000 1.000 N NA
 7748433 7748434 CD196_0072 CD196_0073 rpoB rpoC TRUE 0.999 42.000 0.851 0.001 Y NA
 7748434 7748435 CD196_0073 CD196_0074 rpoC rpsL FALSE 0.192 286.000 0.035 1.000 N NA
 7748435 7748436 CD196_0074 CD196_0075 rpsL rpsG TRUE 0.974 123.000 0.224 0.003 Y NA
 7748436 7748437 CD196_0075 CD196_0076 rpsG fusA TRUE 0.997 49.000 0.579 1.000 Y NA
 7748437 7748438 CD196_0076 CD196_0077 fusA tufB TRUE 0.993 91.000 0.400 0.002 Y NA
 7748438 7748439 CD196_0077 CD196_0078 tufB rpsJ TRUE 0.655 373.000 0.318 1.000 Y NA
 7748439 7748440 CD196_0078 CD196_0079 rpsJ rplC TRUE 0.993 92.000 0.467 0.021 Y NA
 7748440 7748441 CD196_0079 CD196_0080 rplC rplD TRUE 1.000 0.000 0.544 0.015 Y NA
 7748441 7748442 CD196_0080 CD196_0081 rplD rplW TRUE 1.000 0.000 0.307 0.015 Y NA
 7748442 7748443 CD196_0081 CD196_0082 rplW rplB TRUE 1.000 30.000 0.849 0.021 Y NA
 7748443 7748444 CD196_0082 CD196_0083 rplB rpsS TRUE 0.999 35.000 0.820 0.021 Y NA
 7748444 7748445 CD196_0083 CD196_0084 rpsS rplV TRUE 0.999 32.000 0.769 0.021 Y NA
 7748445 7748446 CD196_0084 CD196_0085 rplV rpsC TRUE 1.000 23.000 0.719 0.021 Y NA
 7748446 7748447 CD196_0085 CD196_0086 rpsC rplP TRUE 0.999 36.000 0.828 0.021 Y NA
 7748447 7748448 CD196_0086 CD196_0087 rplP rpmC TRUE 1.000 2.000 0.802 0.015 Y NA
 7748448 7748449 CD196_0087 CD196_0088 rpmC rpsQ TRUE 1.000 24.000 0.828 0.015 Y NA
 7748449 7748450 CD196_0088 CD196_0089 rpsQ rplN TRUE 1.000 26.000 0.791 0.021 Y NA
 7748450 7748451 CD196_0089 CD196_0090 rplN rplX TRUE 1.000 21.000 0.810 0.021 Y NA
 7748451 7748452 CD196_0090 CD196_0091 rplX rplE TRUE 0.999 30.000 0.758 0.015 Y NA
 7748452 7748453 CD196_0091 CD196_0092 rplE rpsN TRUE 0.999 18.000 0.496 0.015 Y NA
 7748453 7748454 CD196_0092 CD196_0093 rpsN rpsH TRUE 0.999 33.000 0.473 0.015 Y NA
 7748454 7748455 CD196_0093 CD196_0094 rpsH rplF TRUE 1.000 31.000 0.808 0.015 Y NA
 7748455 7748456 CD196_0094 CD196_0095 rplF rplR TRUE 0.999 36.000 0.815 0.015 Y NA
 7748456 7748457 CD196_0095 CD196_0096 rplR rpsE TRUE 1.000 21.000 0.814 0.021 Y NA
 7748457 7748458 CD196_0096 CD196_0097 rpsE rpmD TRUE 1.000 15.000 0.789 0.021 Y NA
 7748458 7748459 CD196_0097 CD196_0098 rpmD rplO TRUE 0.999 33.000 0.653 0.003 Y NA
 7748459 7748460 CD196_0098 CD196_0099 rplO prlA TRUE 0.995 44.000 0.730 1.000 N NA
 7748460 7748461 CD196_0099 CD196_0100 prlA adk TRUE 0.997 2.000 0.241 1.000 N NA
 7748461 7748462 CD196_0100 CD196_0101 adk map1 TRUE 0.997 1.000 0.290 1.000 N NA
 7748462 7748463 CD196_0101 CD196_0102 map1   TRUE 0.992 13.000 0.185 NA   NA
 7748463 7748464 CD196_0102 CD196_0103   infA TRUE 0.968 38.000 0.090 NA   NA
 7748464 7748465 CD196_0103 CD196_0104 infA rpmJ TRUE 0.988 36.000 0.257 1.000   NA
 7748465 7748466 CD196_0104 CD196_0105 rpmJ rpsM TRUE 0.880 153.000 0.194 0.015   NA
 7748466 7748467 CD196_0105 CD196_0106 rpsM rpsK TRUE 0.999 36.000 0.810 0.015 Y NA
 7748467 7748468 CD196_0106 CD196_0107 rpsK rpsD TRUE 0.999 32.000 0.509 0.021 Y NA
 7748468 7748469 CD196_0107 CD196_0108 rpsD rpoA TRUE 0.983 78.000 0.549 1.000 N NA
 7748469 7748470 CD196_0108 CD196_0109 rpoA rplQ TRUE 0.999 21.000 0.873 1.000 N NA
 7748470 7748471 CD196_0109 CD196_0110 rplQ   TRUE 0.779 120.000 0.074 1.000 N NA
 7748471 7748472 CD196_0110 CD196_0111     TRUE 0.999 33.000 0.713 0.038 Y NA
 7748472 7748473 CD196_0111 CD196_0112     TRUE 0.985 90.000 0.304 1.000 Y NA
 7748473 7748474 CD196_0112 CD196_0113   truA1 TRUE 0.994 32.000 0.404 1.000 N NA
 7748474 7748475 CD196_0113 CD196_0114 truA1   TRUE 0.871 120.000 0.031 1.000 Y NA
 7748475 7748476 CD196_0114 CD196_0115   rpsI TRUE 0.992 118.000 0.601 0.015 Y NA
 7748476 7748477 CD196_0115 CD196_0116 rpsI cwlD FALSE 0.061 459.000 0.011 1.000 N NA
 7748477 7748478 CD196_0116 CD196_r04 cwlD 16SrRNA FALSE 0.104 187.000 0.000 NA   NA
 7748478 7748479 CD196_r04 CD196_r05 16SrRNA 23SrRNA FALSE 0.048 253.000 0.000 NA   NA
 7748479 7748480 CD196_r05 CD196_r06 23SrRNA 5SrRNA TRUE 0.451 81.000 0.000 NA   NA
 7748480 7748481 CD196_r06 CD196_t046 5SrRNA   TRUE 0.893 7.000 0.000 NA   NA
 7748481 7748482 CD196_t046 CD196_t047     TRUE 0.891 8.000 0.000 NA   NA
 7748482 7748483 CD196_t047 CD196_t048     TRUE 0.887 9.000 0.000 NA   NA
 7748483 7748484 CD196_t048 CD196_t049     TRUE 0.887 9.000 0.000 NA   NA
 7748484 7748485 CD196_t049 CD196_t050     TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 7748485 7748486 CD196_t050 CD196_t051     TRUE 0.848 18.000 0.000 NA   NA
 7748486 7748487 CD196_t051 CD196_t052     TRUE 0.860 13.000 0.000 NA   NA
 7748487 7748488 CD196_t052 CD196_t053     TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 7748488 7748489 CD196_t053 CD196_t054     TRUE 0.860 13.000 0.000 NA   NA
 7748489 7748490 CD196_t054 CD196_t055     TRUE 0.845 15.000 0.000 NA   NA
 7748490 7748491 CD196_t055 CD196_t056     TRUE 0.896 6.000 0.000 NA   NA
 7748491 7748492 CD196_t056 CD196_t057     TRUE 0.854 21.000 0.000 NA   NA
 7748492 7748493 CD196_t057 CD196_t058     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 7748493 7748494 CD196_t058 CD196_t059     TRUE 0.412 89.000 0.000 NA   NA
 7748494 7748495 CD196_t059 CD196_t060     TRUE 0.542 64.000 0.000 NA   NA
 7748495 7748496 CD196_t060 CD196_t061     TRUE 0.882 10.000 0.000 NA   NA
 7748496 7748497 CD196_t061 CD196_t062     TRUE 0.893 7.000 0.000 NA   NA
 7748497 7748498 CD196_t062 CD196_t063     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7748498 7748499 CD196_t063 CD196_r07   16SrRNA TRUE 0.851 22.000 0.000 NA   NA
 7748499 7748500 CD196_r07 CD196_r08 16SrRNA 23SrRNA FALSE 0.019 373.000 0.000 NA   NA
 7748500 7748501 CD196_r08 CD196_r09 23SrRNA 5SrRNA TRUE 0.493 73.000 0.000 NA   NA
 7748503 7748504 CD196_0118 CD196_0119 nrdD nrdG TRUE 0.995 22.000 0.315 1.000 N NA
 7748504 7748505 CD196_0119 CD196_r10 nrdG 16SrRNA FALSE 0.009 688.000 0.000 NA   NA
 7748505 7748506 CD196_r10 CD196_t064 16SrRNA   TRUE 0.837 25.000 0.000 NA   NA
 7748506 7748507 CD196_t064 CD196_r11   23SrRNA FALSE 0.019 378.000 0.000 NA   NA
 7748507 7748508 CD196_r11 CD196_r12 23SrRNA 5SrRNA TRUE 0.493 73.000 0.000 NA   NA
 7748508 7748509 CD196_r12 CD196_t065 5SrRNA   TRUE 0.891 8.000 0.000 NA   NA
 7748509 7748510 CD196_t065 CD196_t066     TRUE 0.887 9.000 0.000 NA   NA
 7748510 7748511 CD196_t066 CD196_t067     TRUE 0.842 16.000 0.000 NA   NA
 7748511 7748512 CD196_t067 CD196_t068     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7748512 7748513 CD196_t068 CD196_t069     TRUE 0.848 18.000 0.000 NA   NA
 7748513 7748514 CD196_t069 CD196_t070     TRUE 0.887 9.000 0.000 NA   NA
 7748514 7748515 CD196_t070 CD196_t071     TRUE 0.887 9.000 0.000 NA   NA
 7748515 7748516 CD196_t071 CD196_t072     TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 7748516 7748517 CD196_t072 CD196_t073     TRUE 0.860 13.000 0.000 NA   NA
 7748517 7748518 CD196_t073 CD196_0121     FALSE 0.007 976.000 0.000 NA   NA
 7748518 7748519 CD196_0121 CD196_0122     TRUE 0.987 66.000 0.502 NA   NA
 7748519 7748520 CD196_0122 CD196_0123     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7748520 7748521 CD196_0123 CD196_0124   ptb FALSE 0.131 173.000 0.000 NA   NA
 7748521 7748522 CD196_0124 CD196_0125 ptb buk TRUE 0.998 22.000 0.275 1.000 Y NA
 7748522 7748523 CD196_0125 CD196_0126 buk   TRUE 0.962 59.000 0.163 NA   NA
 7748523 7748524 CD196_0126 CD196_0127     TRUE 0.666 43.000 0.000 NA   NA
 7748524 7748525 CD196_0127 CD196_0128     TRUE 0.928 29.000 0.000 0.002   NA
 7748525 7748526 CD196_0128 CD196_0129     TRUE 1.000 0.000 0.822 0.002 Y NA
 7748526 7748527 CD196_0129 CD196_0130     TRUE 1.000 1.000 0.797 0.002 Y NA
 7748527 7748528 CD196_0130 CD196_0131     TRUE 0.640 110.000 0.004 1.000 N NA
 7748528 7748529 CD196_0131 CD196_0132   glmS FALSE 0.211 267.000 0.030 1.000 N NA
 7748529 7748530 CD196_0132 CD196_0133 glmS   FALSE 0.012 453.000 0.000 1.000 N NA
 7748530 7748531 CD196_0133 CD196_0134     FALSE 0.013 477.000 0.000 NA   NA
 7748531 7748532 CD196_0134 CD196_0135   murA TRUE 0.998 3.000 0.346 NA   NA
 7748532 7748533 CD196_0135 CD196_0136 murA spoIIC TRUE 0.950 87.000 0.243 1.000 N NA
 7748533 7748534 CD196_0136 CD196_0137 spoIIC   TRUE 0.930 66.000 0.090 1.000 N NA
 7748534 7748535 CD196_0137 CD196_0138   spoIIID TRUE 0.883 98.000 0.093 1.000   NA
 7748535 7748536 CD196_0138 CD196_0139 spoIIID mreB1 TRUE 0.769 197.000 0.284 1.000   NA
 7748536 7748537 CD196_0139 CD196_0140 mreB1 fabZ TRUE 0.973 16.000 0.037 1.000 N NA
 7748539 7748540 CD196_0142 CD196_0143 metE   FALSE 0.028 316.000 0.000 NA   NA
 7748540 7748541 CD196_0143 CD196_0144     FALSE 0.042 264.000 0.000 NA   NA
 7748541 7748542 CD196_0144 CD196_0145     TRUE 0.987 3.000 0.032 1.000   NA
 7748542 7748543 CD196_0145 CD196_0146     FALSE 0.028 332.000 0.000 1.000   NA
 7748543 7748544 CD196_0146 CD196_0147     FALSE 0.317 141.000 0.000 0.035 N NA
 7748544 7748545 CD196_0147 CD196_0148     TRUE 0.976 25.000 0.000 0.030 Y NA
 7748545 7748546 CD196_0148 CD196_0149     TRUE 0.995 39.000 0.214 0.030 Y NA
 7748546 7748547 CD196_0149 CD196_0150     TRUE 0.984 11.000 0.048 1.000   NA
 7748547 7748548 CD196_0150 CD196_0151     TRUE 0.792 96.000 0.021 1.000   NA
 7748548 7748549 CD196_0151 CD196_0152     TRUE 0.987 48.000 0.137 1.000 Y NA
 7748549 7748550 CD196_0152 CD196_0153     TRUE 0.901 3.000 0.000 1.000 N NA
 7748550 7748551 CD196_0153 CD196_0154     FALSE 0.008 553.000 0.000 NA N NA
 7748551 7748552 CD196_0154 CD196_0155   secA1 TRUE 0.675 132.000 0.050 NA N NA
 7748552 7748553 CD196_0155 CD196_0156 secA1 prfB TRUE 0.785 106.000 0.048 1.000 N NA
 7748553 7748554 CD196_0156 CD196_0157 prfB   TRUE 0.531 135.000 0.004 1.000 N NA
 7748554 7748555 CD196_0157 CD196_0158     TRUE 0.535 148.000 0.018 1.000 N NA
 7748555 7748556 CD196_0158 CD196_0159     FALSE 0.030 302.000 0.000 NA   NA
 7748556 7748557 CD196_0159 CD196_0160     FALSE 0.025 329.000 0.000 NA   NA
 7748557 7748558 CD196_0160 CD196_0161     FALSE 0.201 139.000 0.000 NA   NA
 7748558 7748559 CD196_0161 CD196_0162     TRUE 0.992 15.000 0.217 NA   NA
 7748559 7748560 CD196_0162 CD196_0163   rimI TRUE 0.976 38.000 0.127 1.000   NA
 7748560 7748561 CD196_0163 CD196_0164 rimI gcp TRUE 0.991 6.000 0.090 1.000   NA
 7748561 7748562 CD196_0164 CD196_0165 gcp hpdB FALSE 0.028 297.000 0.000 1.000 N NA
 7748562 7748563 CD196_0165 CD196_0166 hpdB hpdC TRUE 0.904 4.000 0.000 NA   NA
 7748563 7748564 CD196_0166 CD196_0167 hpdC hpdA TRUE 0.965 -37.000 0.000 NA   NA
 7748564 7748565 CD196_0167 CD196_0168 hpdA   FALSE 0.027 320.000 0.000 NA   NA
 7748567 7748568 CD196_0170 CD196_0171     FALSE 0.005 1172.000 0.000 NA N NA
 7748568 7748569 CD196_0171 CD196_0172     FALSE 0.035 273.000 0.000 1.000 N NA
 7748569 7748570 CD196_0172 CD196_0173     TRUE 0.868 22.000 0.000 1.000   NA
 7748570 7748571 CD196_0173 CD196_0174     TRUE 0.999 29.000 1.000 NA   NA
 7748571 7748572 CD196_0174 CD196_0175     TRUE 0.999 16.000 1.000 NA   NA
 7748572 7748573 CD196_0175 CD196_0176     TRUE 0.613 51.000 0.000 NA   NA
 7748573 7748574 CD196_0176 CD196_0177     FALSE 0.012 484.000 0.000 NA   NA
 7748575 7748576 CD196_0178 CD196_0179     TRUE 0.747 37.000 0.000 1.000   NA
 7748576 7748577 CD196_0179 CD196_0180     FALSE 0.023 369.000 0.000 1.000   NA
 7748579 7748580 CD196_0182 CD196_0183     TRUE 0.976 16.000 0.038 1.000   NA
 7748581 7748582 CD196_0184 CD196_0185     FALSE 0.225 139.000 0.000 1.000   NA
 7748584 7748585 CD196_0187 CD196_0188     FALSE 0.123 170.000 0.000 1.000 N NA
 7748585 7748586 CD196_0188 CD196_0189     TRUE 0.988 56.000 0.462 NA   NA
 7748586 7748587 CD196_0189 CD196_0190     TRUE 0.933 98.000 0.222 NA   NA
 7748589 7748590 CD196_0192 CD196_0193   gluD FALSE 0.227 129.000 0.000 NA   NA
 7748590 7748591 CD196_0193 CD196_0194 gluD   FALSE 0.094 193.000 0.000 NA   NA
 7748591 7748592 CD196_0194 CD196_0195     FALSE 0.025 331.000 0.000 NA   NA
 7748592 7748593 CD196_0195 CD196_0195A     FALSE 0.042 264.000 0.000 NA   NA
 7748593 7748594 CD196_0195A CD196_0196     FALSE 0.015 428.000 0.000 NA   NA
 7748594 7748595 CD196_0196 CD196_0197   pyrB FALSE 0.024 296.000 0.000 NA N NA
 7748595 7748596 CD196_0197 CD196_0198 pyrB pyrK TRUE 0.902 39.000 0.003 1.000 N NA
 7748596 7748597 CD196_0198 CD196_0199 pyrK pyrD TRUE 0.992 47.000 0.592 1.000 N NA
 7748597 7748598 CD196_0199 CD196_0200 pyrD pyrE TRUE 0.954 85.000 0.060 1.000 Y NA
 7748598 7748599 CD196_0200 CD196_0201 pyrE   FALSE 0.065 215.000 0.000 1.000 N NA
 7748601 7748602 CD196_0203 CD196_0204     FALSE 0.032 294.000 0.000 NA   NA
 7748602 7748603 CD196_0204 CD196_0205   cls TRUE 0.833 18.000 0.000 1.000 N NA
 7748603 7748604 CD196_0205 CD196_0206 cls groES FALSE 0.085 193.000 0.000 1.000 N NA
 7748604 7748605 CD196_0206 CD196_0207 groES groEL TRUE 0.999 33.000 0.674 1.000 Y NA
 7748605 7748606 CD196_0207 CD196_0208 groEL   FALSE 0.050 262.000 0.000 1.000   NA
 7748606 7748607 CD196_0208 CD196_0209     TRUE 0.441 84.000 0.000 NA   NA
 7748607 7748608 CD196_0209 CD196_0211   guaA FALSE 0.018 382.000 0.000 NA   NA
 7748608 7748609 CD196_0211 CD196_0212 guaA   FALSE 0.051 539.000 0.000 1.000 Y NA
 7748611 7748612 CD196_0214 CD196_0215     TRUE 0.941 126.000 0.069 0.002 Y NA
 7748613 7748614 CD196_0216 CD196_0217     FALSE 0.029 310.000 0.000 NA   NA
 7748615 7748616 CD196_0218 CD196_0219     FALSE 0.041 256.000 0.000 1.000 N NA
 7748616 7748617 CD196_0219 CD196_0220     TRUE 0.999 -3.000 0.538 0.035 N NA
 7748617 7748618 CD196_0220 CD196_0221     TRUE 1.000 2.000 0.900 0.035 Y NA
 7748618 7748619 CD196_0221 CD196_0222     TRUE 0.994 67.000 0.320 0.035 Y NA
 7748619 7748620 CD196_0222 CD196_0223     TRUE 0.362 104.000 0.000 1.000   NA
 7748620 7748621 CD196_0223 CD196_0224     TRUE 0.451 88.000 0.000 1.000   NA
 7748622 7748623 CD196_0225 CD196_0226     TRUE 0.999 6.000 0.750 NA   NA
 7748623 7748624 CD196_0226 CD196_0227     FALSE 0.011 545.000 0.000 NA   NA
 7748625 7748626 CD196_0228 CD196_0229 purE purC TRUE 0.994 6.000 0.035 1.000 Y NA
 7748626 7748627 CD196_0229 CD196_0230 purC purF TRUE 0.995 12.000 0.082 1.000 Y NA
 7748627 7748628 CD196_0230 CD196_0231 purF purG TRUE 0.999 -6.000 0.248 1.000 Y NA
 7748628 7748629 CD196_0231 CD196_0232 purG purN TRUE 1.000 -6.000 0.238 0.002 Y NA
 7748629 7748630 CD196_0232 CD196_0233 purN purH TRUE 0.999 -7.000 0.225 1.000 Y NA
 7748630 7748631 CD196_0233 CD196_0234 purH purD TRUE 0.998 11.000 0.238 1.000 Y NA
 7748631 7748632 CD196_0234 CD196_0235 purD purL TRUE 0.987 25.000 0.006 1.000 Y NA
 7748632 7748633 CD196_0235 CD196_0236 purL   FALSE 0.073 206.000 0.000 1.000 N NA
 7748633 7748634 CD196_0236 CD196_0237     TRUE 0.806 109.000 0.000 0.002 Y NA
 7748634 7748635 CD196_0237 CD196_0238     TRUE 0.992 37.000 0.139 1.000 Y NA
 7748635 7748636 CD196_0238 CD196_0239     TRUE 0.983 38.000 0.047 1.000 Y NA
 7748636 7748637 CD196_0239 CD196_0240     TRUE 0.963 -24.000 0.000 NA   NA
 7748637 7748638 CD196_0240 CD196_0241     TRUE 0.887 9.000 0.000 NA   NA
 7748638 7748639 CD196_0241 CD196_0242   fliN TRUE 0.843 24.000 0.000 NA   NA
 7748639 7748640 CD196_0242 CD196_0243 fliN flgM FALSE 0.189 152.000 0.000 1.000   NA
 7748640 7748641 CD196_0243 CD196_0244 flgM   TRUE 0.999 5.000 0.421 0.002   NA
 7748641 7748642 CD196_0244 CD196_0245   flgK TRUE 0.988 18.000 0.038 0.002   NA
 7748642 7748643 CD196_0245 CD196_0246 flgK flgL TRUE 0.993 19.000 0.093 0.001   NA
 7748643 7748644 CD196_0246 CD196_0247 flgL   TRUE 0.996 16.000 0.385 NA   NA
 7748644 7748645 CD196_0247 CD196_0248   csrA TRUE 0.995 -6.000 0.096 NA   NA
 7748645 7748646 CD196_0248 CD196_0249 csrA fliS1 TRUE 0.970 22.000 0.023 1.000 N NA
 7748646 7748647 CD196_0249 CD196_0250 fliS1 fliS2 TRUE 0.993 0.000 0.000 0.002 Y NA
 7748647 7748648 CD196_0250 CD196_0251 fliS2 fliD TRUE 0.999 21.000 0.370 0.002 Y NA
 7748648 7748649 CD196_0251 CD196_0252 fliD   TRUE 0.983 3.000 0.019 NA   NA
 7748649 7748650 CD196_0252 CD196_0253   fliC TRUE 0.845 15.000 0.000 NA   NA
 7748650 7748651 CD196_0253 CD196_0254 fliC   TRUE 0.829 15.000 0.000 1.000 N NA
 7748651 7748652 CD196_0254 CD196_0255     TRUE 0.861 24.000 0.000 1.000   NA
 7748652 7748653 CD196_0255 CD196_0256     TRUE 0.949 -7.000 0.000 NA   NA
 7748653 7748654 CD196_0256 CD196_0257     TRUE 0.984 9.000 0.043 NA   NA
 7748654 7748655 CD196_0257 CD196_0258     TRUE 0.830 92.000 0.034 1.000   NA
 7748655 7748656 CD196_0258 CD196_0259     TRUE 0.972 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7748656 7748657 CD196_0259 CD196_0260     FALSE 0.009 579.000 0.000 1.000 N NA
 7748657 7748658 CD196_0260 CD196_0261   flgB FALSE 0.007 806.000 0.000 1.000 N NA
 7748658 7748659 CD196_0261 CD196_0262 flgB flgC TRUE 0.992 26.000 0.010 0.004 Y NA
 7748659 7748660 CD196_0262 CD196_0263 flgC fliE TRUE 0.998 10.000 0.095 0.004 Y NA
 7748660 7748661 CD196_0263 CD196_0264 fliE fliF TRUE 0.997 25.000 0.112 0.006 Y NA
 7748661 7748662 CD196_0264 CD196_0265 fliF fliG TRUE 0.999 13.000 0.477 0.006 Y NA
 7748662 7748663 CD196_0265 CD196_0266 fliG fliH TRUE 1.000 -19.000 0.308 NA Y NA
 7748663 7748664 CD196_0266 CD196_0267 fliH fliI TRUE 0.999 4.000 0.379 NA Y NA
 7748664 7748665 CD196_0267 CD196_0268 fliI fliJ TRUE 0.996 32.000 0.241 1.000 Y NA
 7748665 7748666 CD196_0268 CD196_0269 fliJ fliK TRUE 0.925 28.000 0.000 0.006   NA
 7748666 7748667 CD196_0269 CD196_0270 fliK flgD TRUE 0.848 18.000 0.000 NA   NA
 7748667 7748668 CD196_0270 CD196_0271 flgD flgE TRUE 0.966 27.000 0.023 NA   NA
 7748668 7748669 CD196_0271 CD196_0272 flgE   TRUE 0.995 13.000 0.077 NA Y NA
 7748669 7748670 CD196_0272 CD196_0273   motA TRUE 0.999 0.000 0.301 NA Y NA
 7748670 7748671 CD196_0273 CD196_0274 motA motB TRUE 1.000 -10.000 0.350 1.000 Y NA
 7748671 7748672 CD196_0274 CD196_0275 motB fliL TRUE 0.998 12.000 0.314 1.000 Y NA
 7748672 7748673 CD196_0275 CD196_0276 fliL   TRUE 0.845 15.000 0.000 NA   NA
 7748673 7748674 CD196_0276 CD196_0277   fliP TRUE 0.926 1.000 0.000 NA   NA
 7748674 7748675 CD196_0277 CD196_0278 fliP fliQ TRUE 0.998 13.000 0.162 0.003 Y NA
 7748675 7748676 CD196_0278 CD196_0279 fliQ flhB TRUE 0.998 12.000 0.114 0.002 Y NA
 7748676 7748677 CD196_0279 CD196_0280 flhB flhA TRUE 0.999 9.000 0.207 0.002 Y NA
 7748677 7748678 CD196_0280 CD196_0281 flhA flhF TRUE 1.000 -22.000 0.440 1.000 Y NA
 7748678 7748679 CD196_0281 CD196_0282 flhF fleN TRUE 0.999 -3.000 0.382 1.000 N NA
 7748679 7748680 CD196_0282 CD196_0283 fleN fliA TRUE 0.978 14.000 0.045 1.000 N NA
 7748680 7748681 CD196_0283 CD196_0284 fliA   TRUE 0.842 16.000 0.000 NA   NA
 7748681 7748682 CD196_0284 CD196_0285   flgG FALSE 0.077 211.000 0.000 NA   NA
 7748682 7748683 CD196_0285 CD196_0286 flgG   TRUE 0.997 21.000 0.088 0.004 Y NA
 7748683 7748684 CD196_0286 CD196_0287   fliM TRUE 0.980 23.000 0.000 0.006 Y NA
 7748684 7748685 CD196_0287 CD196_0288 fliM fliN TRUE 1.000 3.000 0.508 0.002 Y NA
 7748685 7748686 CD196_0288 CD196_0289 fliN   TRUE 0.805 32.000 0.000 1.000   NA
 7748686 7748687 CD196_0289 CD196_0290   htpG FALSE 0.298 116.000 0.000 1.000   NA
 7748687 7748688 CD196_0290 CD196_0291 htpG dhaT FALSE 0.016 388.000 0.000 1.000 N NA
 7748688 7748689 CD196_0291 CD196_0292 dhaT spl FALSE 0.055 227.000 0.000 1.000 N NA
 7748689 7748690 CD196_0292 CD196_0293 spl   FALSE 0.130 182.000 0.000 1.000   NA
 7748690 7748691 CD196_0293 CD196_0294     TRUE 0.845 15.000 0.000 NA   NA
 7748693 7748694 CD196_0296 CD196_0297     FALSE 0.016 403.000 0.000 NA   NA
 7748696 7748697 CD196_0299 CD196_0300     FALSE 0.115 221.000 0.000 0.049 N NA
 7748697 7748698 CD196_0300 CD196_0301     TRUE 0.999 24.000 0.400 0.038 Y NA
 7748698 7748699 CD196_0301 CD196_0302     TRUE 0.987 3.000 0.000 0.049 Y NA
 7748699 7748700 CD196_0302 CD196_0303     TRUE 0.977 18.000 0.000 0.049 Y NA
 7748700 7748701 CD196_0303 CD196_0304     TRUE 0.972 27.000 0.000 0.049 Y NA
 7748701 7748702 CD196_0304 CD196_0305     TRUE 0.991 0.000 0.000 0.049 Y NA
 7748702 7748703 CD196_0305 CD196_0306     TRUE 0.641 47.000 0.000 NA   NA
 7748703 7748704 CD196_0306 CD196_0307     TRUE 0.537 65.000 0.000 NA   NA
 7748704 7748705 CD196_0307 CD196_0308     FALSE 0.007 963.000 0.000 1.000 N NA
 7748705 7748706 CD196_0308 CD196_0309     FALSE 0.077 202.000 0.000 1.000 N NA
 7748706 7748707 CD196_0309 CD196_0310     TRUE 0.999 -3.000 0.569 NA   NA
 7748707 7748708 CD196_0310 CD196_0311     FALSE 0.018 383.000 0.000 NA   NA
 7748708 7748709 CD196_0311 CD196_0312     TRUE 0.509 70.000 0.000 NA   NA
 7748709 7748710 CD196_0312 CD196_0313     FALSE 0.082 206.000 0.000 NA   NA
 7748710 7748711 CD196_0313 CD196_0314   rbsR FALSE 0.062 219.000 0.000 1.000 N NA
 7748711 7748712 CD196_0314 CD196_0315 rbsR rbsK TRUE 0.650 42.000 0.000 1.000 N NA
 7748712 7748713 CD196_0315 CD196_0316 rbsK rbsB TRUE 0.887 48.000 0.000 NA Y NA
 7748713 7748714 CD196_0316 CD196_0317 rbsB rbsA TRUE 0.870 54.000 0.000 NA Y NA
 7748714 7748715 CD196_0317 CD196_0318 rbsA rbsC TRUE 0.992 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 7748715 7748716 CD196_0318 CD196_0319 rbsC argE FALSE 0.099 184.000 0.000 1.000 N NA
 7748716 7748717 CD196_0319 CD196_0320 argE   TRUE 0.996 20.000 0.375 NA   NA
 7748717 7748718 CD196_0320 CD196_0321   abgB1 FALSE 0.131 173.000 0.000 NA   NA
 7748720 7748721 CD196_0323 CD196_0324     FALSE 0.007 1736.000 0.000 NA   NA
 7748721 7748722 CD196_0324 CD196_0325     TRUE 0.994 -10.000 0.039 NA   NA
 7748722 7748723 CD196_0325 CD196_0326     TRUE 0.991 2.000 0.069 NA   NA
 7748727 7748728 CD196_0330 CD196_0331     TRUE 0.994 23.000 0.286 1.000 N NA
 7748728 7748729 CD196_0331 CD196_r13   16SrRNA FALSE 0.012 495.000 0.000 NA   NA
 7748729 7748730 CD196_r13 CD196_r14 16SrRNA 23SrRNA FALSE 0.035 285.000 0.000 NA   NA
 7748730 7748731 CD196_r14 CD196_r15 23SrRNA 5SrRNA TRUE 0.493 73.000 0.000 NA   NA
 7748731 7748732 CD196_r15 CD196_0332 5SrRNA   FALSE 0.121 178.000 0.000 NA   NA
 7748732 7748733 CD196_0332 CD196_0333     TRUE 0.851 22.000 0.000 NA   NA
 7748734 7748735 CD196_0334 CD196_0335     TRUE 0.991 11.000 0.118 NA   NA
 7748735 7748736 CD196_0335 CD196_0336     TRUE 0.996 -7.000 0.118 NA   NA
 7748736 7748737 CD196_0336 CD196_0337     TRUE 0.976 91.000 0.500 1.000 N NA
 7748737 7748738 CD196_0337 CD196_0338     TRUE 1.000 2.000 0.750 1.000 Y NA
 7748738 7748739 CD196_0338 CD196_0339     TRUE 0.965 -40.000 0.000 NA   NA
 7748740 7748741 CD196_0340 CD196_0341     TRUE 0.999 14.000 0.822 NA   NA
 7748741 7748742 CD196_0341 CD196_0343   cbiM FALSE 0.011 513.000 0.000 NA   NA
 7748742 7748743 CD196_0343 CD196_0344 cbiM cbiN TRUE 1.000 -10.000 0.861 0.010 Y NA
 7748743 7748744 CD196_0344 CD196_0345 cbiN cbiQ TRUE 1.000 3.000 0.804 0.001 Y NA
 7748744 7748745 CD196_0345 CD196_0346 cbiQ cbiO TRUE 0.999 -7.000 0.152 0.002 Y NA
 7748745 7748746 CD196_0346 CD196_0347 cbiO pcrA FALSE 0.053 231.000 0.000 1.000 N NA
 7748746 7748747 CD196_0347 CD196_0348 pcrA   TRUE 0.958 17.000 0.005 1.000 N NA
 7748747 7748748 CD196_0348 CD196_0349     TRUE 0.955 31.000 0.011 1.000   NA
 7748748 7748749 CD196_0349 CD196_0350   ppiB TRUE 0.909 65.000 0.045 1.000   NA
 7748749 7748750 CD196_0350 CD196_0351 ppiB   FALSE 0.008 825.000 0.000 NA   NA
 7748753 7748754 CD196_0354 CD196_0355     TRUE 0.823 27.000 0.000 NA   NA
 7748754 7748755 CD196_0355 CD196_0356     TRUE 0.884 12.000 0.000 1.000   NA
 7748756 7748757 CD196_0357 CD196_0358     TRUE 0.964 19.000 0.000 NA Y NA
 7748758 7748759 CD196_0359 CD196_0360     TRUE 0.837 25.000 0.000 NA   NA
 7748759 7748760 CD196_0360 CD196_0361     FALSE 0.057 233.000 0.000 NA   NA
 7748761 7748762 CD196_0362 CD196_0363     TRUE 0.958 -13.000 0.000 NA   NA
 7748762 7748763 CD196_0363 CD196_0364     TRUE 0.914 51.000 0.025 1.000   NA
 7748763 7748764 CD196_0364 CD196_0365     TRUE 0.793 110.000 0.050 1.000   NA
 7748764 7748765 CD196_0365 CD196_0366     TRUE 0.421 87.000 0.000 NA   NA
 7748765 7748766 CD196_0366 CD196_0367     TRUE 0.759 34.000 0.000 NA   NA
 7748766 7748767 CD196_0367 CD196_0368     FALSE 0.199 140.000 0.000 NA   NA
 7748767 7748768 CD196_0368 CD196_0369     TRUE 0.977 28.000 0.062 NA   NA
 7748768 7748769 CD196_0369 CD196_0370     FALSE 0.060 229.000 0.000 NA   NA
 7748769 7748770 CD196_0370 CD196_0371     TRUE 0.427 86.000 0.000 NA   NA
 7748770 7748771 CD196_0371 CD196_0372     TRUE 0.587 55.000 0.000 NA   NA
 7748771 7748772 CD196_0372 CD196_0373   bglF FALSE 0.101 247.000 0.000 0.096   NA
 7748772 7748773 CD196_0373 CD196_0374 bglF bglA TRUE 0.998 3.000 0.167 1.000 Y NA
 7748773 7748774 CD196_0374 CD196_0375 bglA bglG TRUE 0.991 24.000 0.167 1.000   NA
 7748774 7748775 CD196_0375 CD196_0376 bglG   FALSE 0.012 566.000 0.000 1.000   NA
 7748776 7748777 CD196_0377 CD196_0378     TRUE 0.978 27.000 0.059 NA   NA
 7748777 7748778 CD196_0378 CD196_0379   ldhA FALSE 0.020 371.000 0.000 NA   NA
 7748779 7748780 CD196_0380 CD196_0381 hadA hadI TRUE 0.885 30.000 0.000 0.035 N NA
 7748780 7748781 CD196_0381 CD196_0382 hadI hadB TRUE 0.856 9.000 0.000 NA N NA
 7748781 7748782 CD196_0382 CD196_0383 hadB hadC TRUE 1.000 0.000 0.750 NA Y NA
 7748782 7748783 CD196_0383 CD196_0384 hadC acdB TRUE 0.565 48.000 0.000 NA N NA
 7748783 7748784 CD196_0384 CD196_0385 acdB etfB1 TRUE 0.998 33.000 0.750 0.048 N NA
 7748784 7748785 CD196_0385 CD196_0386 etfB1 etfA1 TRUE 1.000 19.000 0.750 0.016 Y NA
 7748785 7748786 CD196_0386 CD196_0387 etfA1   FALSE 0.011 483.000 0.000 1.000 N NA
 7748788 7748789 CD196_0389 CD196_0391     TRUE 0.933 0.000 0.000 NA   NA
 7748789 7748790 CD196_0391 CD196_0390     TRUE 0.966 -1755.000 0.000 NA   NA
 7748790 7748791 CD196_0390 CD196_0392     FALSE 0.007 655.000 0.000 NA N NA
 7748791 7748792 CD196_0392 CD196_0393     FALSE 0.011 523.000 0.000 NA   NA
 7748792 7748793 CD196_0393 CD196_0394     TRUE 0.421 87.000 0.000 NA   NA
 7748793 7748794 CD196_0394 CD196_0395     FALSE 0.135 171.000 0.000 NA   NA
 7748795 7748796 CD196_0396 CD196_0397     TRUE 0.988 -6.000 0.000 1.000 Y NA
 7748797 7748798 CD196_0398 CD196_0399 rocR   FALSE 0.052 256.000 0.000 1.000   NA
 7748798 7748799 CD196_0399 CD196_0400     TRUE 0.875 97.000 0.086 NA   NA
 7748799 7748800 CD196_0400 CD196_0401     TRUE 0.999 -7.000 0.400 NA   NA
 7748800 7748801 CD196_0401 CD196_0402   oraS TRUE 0.938 78.000 0.143 NA   NA
 7748801 7748802 CD196_0402 CD196_0403 oraS oraE TRUE 1.000 -6.000 0.867 NA   NA
 7748802 7748803 CD196_0403 CD196_0404 oraE   TRUE 0.996 0.000 0.143 NA   NA
 7748803 7748804 CD196_0404 CD196_0405     TRUE 0.959 -15.000 0.000 NA   NA
 7748804 7748805 CD196_0405 CD196_0406     TRUE 0.753 30.000 0.000 NA N NA
 7748805 7748806 CD196_0406 CD196_0407     FALSE 0.011 429.000 0.000 NA N NA
 7748806 7748807 CD196_0407 CD196_0408     FALSE 0.031 298.000 0.000 NA   NA
 7748807 7748808 CD196_0408 CD196_0409     FALSE 0.010 571.000 0.000 NA   NA
 7748808 7748809 CD196_0409 CD196_0410     TRUE 0.566 258.000 0.154 0.065   NA
 7748811 7748812 CD196_0412 CD196_0413     TRUE 0.817 28.000 0.000 NA   NA
 7748812 7748813 CD196_0413 CD196_0414     FALSE 0.103 344.000 0.000 1.000 Y NA
 7748813 7748814 CD196_0414 CD196_0415     TRUE 1.000 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 7748815 7748816 CD196_0416 CD196_0417     TRUE 0.986 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7748816 7748817 CD196_0417 CD196_0418     TRUE 0.530 145.000 0.000 1.000 Y NA
 7748817 7748818 CD196_0418 CD196_0419     FALSE 0.021 314.000 0.000 NA N NA
 7748819 7748820 CD196_0420 CD196_0421     FALSE 0.013 504.000 0.000 1.000   NA
 7748820 7748821 CD196_0421 CD196_0422     TRUE 1.000 -3.000 0.600 0.006 Y NA
 7748821 7748822 CD196_0422 CD196_0423     TRUE 0.979 99.000 0.600 1.000   NA
 7748822 7748823 CD196_0423 CD196_0424   malL TRUE 0.992 14.000 0.188 1.000   NA
 7748823 7748824 CD196_0424 CD196_0425 malL   TRUE 0.998 5.000 0.176 1.000 Y NA
 7748825 7748826 CD196_0426 CD196_0427 blaR blaI TRUE 0.999 3.000 0.429 1.000 Y NA
 7748827 7748828 CD196_0428 CD196_0429     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 7748828 7748829 CD196_0429 CD196_0430     TRUE 0.452 68.000 0.000 NA N NA
 7748830 7748831 CD196_0431 CD196_0432     TRUE 0.830 26.000 0.000 NA   NA
 7748832 7748833 CD196_0433 CD196_0434   spaF FALSE 0.106 186.000 0.000 NA   NA
 7748833 7748834 CD196_0434 CD196_0435 spaF spaE TRUE 0.999 -3.000 0.449 NA   NA
 7748834 7748835 CD196_0435 CD196_0436 spaE spaG TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7748835 7748836 CD196_0436 CD196_0437 spaG spaR TRUE 0.435 85.000 0.000 NA   NA
 7748836 7748837 CD196_0437 CD196_0438 spaR spaK TRUE 0.966 19.000 0.000 1.000 Y NA
 7748838 7748839 CD196_0439 CD196_0440     TRUE 0.901 3.000 0.000 1.000 N NA
 7748839 7748840 CD196_0440 CD196_0441     FALSE 0.039 286.000 0.000 1.000   NA
 7748840 7748841 CD196_0441 CD196_0442     FALSE 0.079 271.000 0.000 0.095   NA
 7748841 7748842 CD196_0442 CD196_0443     TRUE 0.977 6.000 0.000 1.000 Y NA
 7748842 7748843 CD196_0443 CD196_0444     FALSE 0.009 821.000 0.000 1.000   NA
 7748846 7748847 CD196_0447 CD196_0448     TRUE 0.614 47.000 0.000 1.000 N NA
 7748847 7748848 CD196_0448 CD196_0449     TRUE 0.971 29.000 0.000 0.029 Y NA
 7748848 7748849 CD196_0449 CD196_0450     TRUE 0.995 47.000 0.250 0.048 Y NA
 7748849 7748850 CD196_0450 CD196_0451     TRUE 1.000 24.000 0.875 0.048 Y NA
 7748850 7748851 CD196_0451 CD196_0452     FALSE 0.012 451.000 0.000 1.000 N NA
 7748851 7748852 CD196_0452 CD196_0453     TRUE 0.999 -7.000 0.256 1.000 Y NA
 7748852 7748853 CD196_0453 CD196_0454     FALSE 0.012 401.000 0.000 NA N NA
 7748854 7748855 CD196_0455 CD196_0456     TRUE 0.640 43.000 0.000 1.000 N NA
 7748856 7748857 CD196_0457 CD196_0458     TRUE 0.926 1.000 0.000 NA   NA
 7748857 7748858 CD196_0458 CD196_0459     FALSE 0.062 226.000 0.000 NA   NA
 7748858 7748859 CD196_0459 CD196_0460     FALSE 0.047 254.000 0.000 NA   NA
 7748859 7748860 CD196_0460 CD196_0461     TRUE 0.999 -9.000 0.286 1.000   NA
 7748860 7748861 CD196_0461 CD196_0462     FALSE 0.034 1168.000 0.000 1.000 Y NA
 7748861 7748862 CD196_0462 CD196_0463     FALSE 0.243 123.000 0.000 NA   NA
 7748863 7748864 CD196_0464 CD196_0465     TRUE 0.691 35.000 0.000 NA N NA
 7748864 7748865 CD196_0465 CD196_0466     FALSE 0.021 362.000 0.000 NA   NA
 7748865 7748866 CD196_0466 CD196_0467     FALSE 0.174 212.000 0.000 0.019   NA
 7748866 7748867 CD196_0467 CD196_0468     TRUE 0.860 13.000 0.000 NA   NA
 7748867 7748868 CD196_0468 CD196_0469     TRUE 0.904 4.000 0.000 NA   NA
 7748869 7748870 CD196_0471 CD196_0472     FALSE 0.127 175.000 0.000 NA   NA
 7748870 7748871 CD196_0472 CD196_0473   cheB FALSE 0.009 744.000 0.000 NA   NA
 7748871 7748872 CD196_0473 CD196_0474 cheB cheC TRUE 0.732 162.000 0.016 NA Y NA
 7748872 7748873 CD196_0474 CD196_0475 cheC cheD TRUE 1.000 -3.000 0.606 NA Y NA
 7748873 7748874 CD196_0475 CD196_0476 cheD cheW TRUE 0.908 43.000 0.000 1.000 Y NA
 7748874 7748875 CD196_0476 CD196_0477 cheW   TRUE 0.652 115.000 0.000 1.000 Y NA
 7748875 7748876 CD196_0477 CD196_0478     TRUE 0.960 26.000 0.000 1.000 Y NA
 7748876 7748877 CD196_0478 CD196_0479   cheA TRUE 0.890 227.000 0.250 0.005 Y NA
 7748877 7748878 CD196_0479 CD196_0480 cheA   TRUE 0.999 13.000 0.375 0.005 Y NA
 7748878 7748879 CD196_0480 CD196_0481   cheR TRUE 0.988 36.000 0.070 1.000 Y NA
 7748879 7748880 CD196_0481 CD196_0482 cheR   TRUE 0.476 333.000 0.302 1.000   NA
 7748880 7748881 CD196_0482 CD196_0483     FALSE 0.318 106.000 0.000 NA   NA
 7748881 7748882 CD196_0483 CD196_0484     TRUE 0.526 67.000 0.000 NA   NA
 7748882 7748883 CD196_0484 CD196_0485     TRUE 0.395 92.000 0.000 NA   NA
 7748883 7748884 CD196_0485 CD196_0486     FALSE 0.014 443.000 0.000 NA   NA
 7748884 7748885 CD196_0486 CD196_0487     FALSE 0.083 205.000 0.000 NA   NA
 7748885 7748886 CD196_0487 CD196_0488     TRUE 0.999 11.000 0.727 NA Y NA
 7748886 7748887 CD196_0488 CD196_0489     FALSE 0.071 216.000 0.000 NA   NA
 7748887 7748888 CD196_0489 CD196_0490     FALSE 0.007 1193.000 0.000 NA   NA
 7748890 7748891 CD196_0493 CD196_0494 sleB   TRUE 0.840 79.000 0.024 NA   NA
 7748891 7748892 CD196_0494 CD196_0495   sip2 TRUE 0.836 100.000 0.073 NA N NA
 7748892 7748893 CD196_0495 CD196_0496 sip2 sip2 TRUE 0.620 166.000 0.000 0.001 Y NA
 7748893 7748894 CD196_0496 CD196_0497 sip2   TRUE 0.996 10.000 0.333 1.000 N NA
 7748894 7748895 CD196_0497 CD196_0498     TRUE 0.826 74.000 0.013 1.000 N NA
 7748895 7748896 CD196_0498 CD196_0499   glsA FALSE 0.010 525.000 0.000 1.000 N NA
 7748896 7748897 CD196_0499 CD196_0500 glsA   TRUE 0.395 98.000 0.000 1.000   NA
 7748897 7748898 CD196_0500 CD196_0501   nfo FALSE 0.026 488.000 0.000 0.058   NA
 7748898 7748899 CD196_0501 CD196_0502 nfo   FALSE 0.055 252.000 0.000 1.000   NA
 7748901 7748902 CD196_0504 CD196_0505     TRUE 0.800 106.000 0.055 1.000 N NA
 7748902 7748903 CD196_0505 CD196_0506   nth FALSE 0.035 644.000 0.002 1.000 N NA
 7748903 7748904 CD196_0506 CD196_0507 nth   FALSE 0.305 194.000 0.005 1.000 N NA
 7748904 7748905 CD196_0507 CD196_0508     TRUE 0.931 36.000 0.008 NA   NA
 7748905 7748906 CD196_0508 CD196_0509     FALSE 0.021 356.000 0.000 NA   NA
 7748906 7748907 CD196_0509 CD196_0510     TRUE 0.539 116.000 0.000 0.001   NA
 7748907 7748908 CD196_0510 CD196_0511     FALSE 0.015 423.000 0.000 NA   NA
 7748908 7748909 CD196_0511 CD196_0512     TRUE 0.989 30.000 0.195 NA   NA
 7748909 7748910 CD196_0512 CD196_0513     TRUE 0.459 180.000 0.026 NA   NA
 7748910 7748911 CD196_0513 CD196_0514   thrS FALSE 0.008 770.000 0.000 NA   NA
 7748911 7748912 CD196_0514 CD196_0515 thrS   FALSE 0.008 768.000 0.000 NA   NA
 7748912 7748913 CD196_0515 CD196_0516     TRUE 0.966 -1823.000 0.000 NA   NA
 7748914 7748915 CD196_0518 CD196_0519     TRUE 0.949 -7.000 0.000 NA   NA
 7748917 7748918 CD196_0521 CD196_0522     FALSE 0.312 107.000 0.000 NA   NA
 7748918 7748919 CD196_0522 CD196_0523     FALSE 0.033 292.000 0.000 NA   NA
 7748920 7748921 CD196_0524 CD196_0525 gapN   FALSE 0.017 374.000 0.000 1.000 N NA
 7748921 7748922 CD196_0525 CD196_0526     TRUE 0.998 -3.000 0.250 1.000 N NA
 7748924 7748925 CD196_0528 CD196_0529     TRUE 0.854 20.000 0.000 NA   NA
 7748925 7748926 CD196_0529 CD196_0531     FALSE 0.013 473.000 0.000 NA   NA
 7748926 7748927 CD196_0531 CD196_0530     TRUE 0.966 -2191.000 0.000 NA   NA
 7748927 7748928 CD196_0530 CD196_0532     FALSE 0.006 2203.000 0.000 NA   NA
 7748929 7748930 CD196_0533 CD196_0534     TRUE 0.988 43.000 0.363 NA   NA
 7748930 7748931 CD196_0534 CD196_0535     FALSE 0.007 1434.000 0.000 NA   NA
 7748932 7748933 CD196_0536 CD196_0537     TRUE 0.866 18.000 0.000 1.000   NA
 7748933 7748934 CD196_0537 CD196_0538     FALSE 0.011 519.000 0.000 NA   NA
 7748934 7748935 CD196_0538 CD196_0539   cotJB1 TRUE 0.933 0.000 0.000 NA   NA
 7748935 7748936 CD196_0539 CD196_0540 cotJB1 cotJC1 TRUE 0.892 62.000 0.031 NA   NA
 7748936 7748937 CD196_0540 CD196_0541 cotJC1 ogt1 FALSE 0.007 818.000 0.000 1.000 N NA
 7748939 7748940 CD196_0542A CD196_0543     FALSE 0.010 571.000 0.000 NA   NA
 7748940 7748941 CD196_0543 CD196_0544     TRUE 0.376 96.000 0.000 NA   NA
 7748941 7748942 CD196_0544 CD196_0545     FALSE 0.104 187.000 0.000 NA   NA
 7748942 7748943 CD196_0545 CD196_0546     TRUE 0.966 -2138.000 0.000 NA   NA
 7748943 7748944 CD196_0546 CD196_0547     FALSE 0.005 1638.000 0.000 NA N NA
 7748944 7748945 CD196_0547 CD196_0548     FALSE 0.021 356.000 0.000 NA   NA
 7748946 7748947 CD196_0549 CD196_0550     TRUE 0.583 440.000 0.333 NA Y NA
 7748947 7748948 CD196_0550 CD196_0551     FALSE 0.011 596.000 0.000 1.000   NA
 7748948 7748949 CD196_0551 CD196_0552     TRUE 0.999 -10.000 0.385 1.000   NA
 7748949 7748950 CD196_0552 CD196_0554     FALSE 0.007 1275.000 0.000 NA   NA
 7748950 7748951 CD196_0554 CD196_0555     FALSE 0.330 104.000 0.000 NA   NA
 7748951 7748952 CD196_0555 CD196_0556     TRUE 0.910 57.000 0.000 0.061 Y NA
 7748952 7748953 CD196_0556 CD196_0557     FALSE 0.121 178.000 0.000 NA   NA
 7748953 7748954 CD196_0557 CD196_0558     FALSE 0.045 257.000 0.000 NA   NA
 7748954 7748955 CD196_0558 CD196_0559     FALSE 0.015 419.000 0.000 NA   NA
 7748955 7748956 CD196_0559 CD196_0561     FALSE 0.009 692.000 0.000 NA   NA
 7748957 7748958 CD196_0562 CD196_0563     TRUE 0.845 15.000 0.000 NA   NA
 7748958 7748959 CD196_0563 CD196_0564     FALSE 0.015 434.000 0.000 NA   NA
 7748959 7748960 CD196_0564 CD196_0565     FALSE 0.009 706.000 0.000 NA   NA
 7748960 7748961 CD196_0565 CD196_0566     TRUE 0.479 76.000 0.000 NA   NA
 7748961 7748962 CD196_0566 CD196_0567     FALSE 0.007 1325.000 0.000 NA   NA
 7748962 7748963 CD196_0567 CD196_0568     TRUE 0.996 -7.000 0.108 NA   NA
 7748963 7748964 CD196_0568 CD196_0569     FALSE 0.008 923.000 0.000 NA   NA
 7748965 7748966 CD196_0570 CD196_0571     FALSE 0.091 189.000 0.000 1.000 N NA
 7748967 7748968 CD196_0572 CD196_0573     FALSE 0.010 463.000 0.000 NA N NA
 7748968 7748969 CD196_0573 CD196_0574     FALSE 0.026 324.000 0.000 NA   NA
 7748969 7748970 CD196_0574 CD196_0575     FALSE 0.265 117.000 0.000 NA   NA
 7748970 7748971 CD196_0575 CD196_0576     FALSE 0.016 385.000 0.000 1.000 N NA
 7748971 7748972 CD196_0576 CD196_0577     FALSE 0.015 463.000 0.000 1.000   NA
 7748972 7748973 CD196_0577 CD196_0578     FALSE 0.193 142.000 0.000 NA   NA
 7748973 7748974 CD196_0578 CD196_0579     FALSE 0.010 551.000 0.000 NA   NA
 7748974 7748975 CD196_0579 CD196_0580     FALSE 0.118 180.000 0.000 NA   NA
 7748975 7748976 CD196_0580 CD196_0581     TRUE 0.427 86.000 0.000 NA   NA
 7748976 7748977 CD196_0581 CD196_0582     TRUE 0.926 1.000 0.000 NA   NA
 7748977 7748978 CD196_0582 CD196_0583     FALSE 0.032 1435.000 0.000 1.000 Y NA
 7748978 7748979 CD196_0583 CD196_0584     TRUE 1.000 0.000 0.750 1.000 Y NA
 7748979 7748980 CD196_0584 CD196_0585     TRUE 0.938 70.000 0.120 1.000 N NA
 7748980 7748981 CD196_0585 CD196_0586     TRUE 0.999 -3.000 0.667 NA   NA
 7748981 7748982 CD196_0586 CD196_0587     FALSE 0.014 445.000 0.000 NA   NA
 7748982 7748983 CD196_0587 CD196_0588     FALSE 0.009 895.000 0.000 1.000   NA
 7748983 7748984 CD196_0588 CD196_0589     FALSE 0.034 278.000 0.000 1.000 N NA
 7748984 7748985 CD196_0589 CD196_0590     TRUE 0.997 17.000 0.071 0.001 Y NA
 7748985 7748986 CD196_0590 CD196_0591     TRUE 0.842 16.000 0.000 NA   NA
 7748986 7748987 CD196_0591 CD196_0592     FALSE 0.007 1134.000 0.000 NA   NA
 7748987 7748988 CD196_0592 CD196_0593     TRUE 0.998 -13.000 0.250 1.000 N NA
 7748988 7748989 CD196_0593 CD196_0594     TRUE 0.999 3.000 0.600 NA   NA
 7748989 7748990 CD196_0594 CD196_0595     FALSE 0.007 974.000 0.000 NA   NA
 7748990 7748991 CD196_0595 CD196_0596     FALSE 0.008 1142.000 0.000 1.000   NA
 7748991 7748992 CD196_0596 CD196_0597   cdu2 TRUE 0.955 63.000 0.021 1.000 Y NA
 7748992 7748993 CD196_0597 CD196_0598 cdu2 cdu1 FALSE 0.072 207.000 0.000 1.000 N NA
 7748993 7748994 CD196_0598 CD196_0599 cdu1 tcdD FALSE 0.037 909.000 0.000 1.000 Y NA
 7748994 7748995 CD196_0599 CD196_0600 tcdD tcdB FALSE 0.025 331.000 0.000 NA   NA
 7748995 7748996 CD196_0600 CD196_0601 tcdB tcdE FALSE 0.246 122.000 0.000 NA   NA
 7748996 7748997 CD196_0601 CD196_0602 tcdE tcdA FALSE 0.009 728.000 0.000 NA   NA
 7749000 7749001 CD196_0605 CD196_0606   cdd2 FALSE 0.007 1034.000 0.000 NA   NA
 7749001 7749002 CD196_0606 CD196_0607 cdd2 cdd3 TRUE 0.993 12.000 0.188 NA   NA
 7749002 7749003 CD196_0607 CD196_0608 cdd3 cdd4 TRUE 0.999 0.000 0.500 NA   NA
 7749004 7749005 CD196_0609 CD196_0610     TRUE 0.998 45.000 0.643 1.000 Y NA
 7749005 7749006 CD196_0610 CD196_0611     FALSE 0.006 1589.000 0.000 1.000 N NA
 7749006 7749007 CD196_0611 CD196_0612     FALSE 0.009 745.000 0.000 NA   NA
 7749007 7749008 CD196_0612 CD196_0613     FALSE 0.019 377.000 0.000 NA   NA
 7749008 7749009 CD196_0613 CD196_0614     FALSE 0.008 906.000 0.000 NA   NA
 7749009 7749010 CD196_0614 CD196_0615     FALSE 0.118 180.000 0.000 NA   NA
 7749010 7749011 CD196_0615 CD196_0616     FALSE 0.070 217.000 0.000 NA   NA
 7749012 7749013 CD196_0617 CD196_0618     TRUE 0.998 -3.000 0.273 NA   NA
 7749014 7749015 CD196_0619 CD196_0620     TRUE 0.994 26.000 0.286 NA   NA
 7749015 7749016 CD196_0620 CD196_0621     FALSE 0.080 207.000 0.000 NA   NA
 7749016 7749017 CD196_0621 CD196_0622     FALSE 0.021 359.000 0.000 NA   NA
 7749017 7749018 CD196_0622 CD196_0623     FALSE 0.090 197.000 0.000 NA   NA
 7749018 7749019 CD196_0623 CD196_0624     TRUE 0.966 38.000 0.083 NA   NA
 7749019 7749020 CD196_0624 CD196_0625     TRUE 0.925 88.000 0.143 NA   NA
 7749020 7749021 CD196_0625 CD196_0626     TRUE 0.829 42.000 0.000 0.030   NA
 7749021 7749022 CD196_0626 CD196_0627     TRUE 0.774 35.000 0.000 1.000   NA
 7749024 7749025 CD196_0629 CD196_0630 infC rpmI TRUE 0.999 28.000 0.652 1.000 Y NA
 7749025 7749026 CD196_0630 CD196_0631 rpmI rplT TRUE 0.999 56.000 0.928 0.014 Y NA
 7749026 7749027 CD196_0631 CD196_0632 rplT   FALSE 0.034 310.000 0.000 1.000   NA
 7749027 7749028 CD196_0632 CD196_0633     FALSE 0.017 436.000 0.000 1.000   NA
 7749028 7749029 CD196_0633 CD196_0634     FALSE 0.186 338.000 0.000 0.002 Y NA
 7749029 7749030 CD196_0634 CD196_0635     FALSE 0.020 388.000 0.000 1.000   NA
 7749031 7749032 CD196_0636 CD196_0637     FALSE 0.009 671.000 0.000 NA   NA
 7749035 7749036 CD196_0640 CD196_0641     TRUE 0.893 311.000 0.500 0.003 Y NA
 7749036 7749037 CD196_0641 CD196_0642     FALSE 0.331 191.000 0.007 1.000 N NA
 7749037 7749038 CD196_0642 CD196_0643   pheS FALSE 0.123 619.000 0.006 1.000 Y NA
 7749038 7749039 CD196_0643 CD196_0644 pheS pheT TRUE 0.999 17.000 0.574 0.001 Y NA
 7749039 7749040 CD196_0644 CD196_0645 pheT   TRUE 0.984 7.000 0.038 NA   NA
 7749040 7749041 CD196_0645 CD196_0646     FALSE 0.023 342.000 0.000 NA   NA
 7749041 7749042 CD196_0646 CD196_0647     FALSE 0.012 492.000 0.000 NA   NA
 7749042 7749043 CD196_0647 CD196_0648     TRUE 0.362 104.000 0.000 1.000   NA
 7749043 7749044 CD196_0648 CD196_0649     TRUE 0.784 34.000 0.000 1.000   NA
 7749044 7749045 CD196_0649 CD196_0650     FALSE 0.010 519.000 0.000 1.000 N NA
 7749045 7749046 CD196_0650 CD196_0651     FALSE 0.059 223.000 0.000 1.000 N NA
 7749050 7749051 CD196_0655 CD196_0656 argS   FALSE 0.224 254.000 0.021 NA   NA
 7749051 7749052 CD196_0656 CD196_0657     FALSE 0.022 347.000 0.000 NA   NA
 7749052 7749053 CD196_0657 CD196_0658     TRUE 0.973 18.000 0.024 1.000   NA
 7749053 7749054 CD196_0658 CD196_0659     TRUE 0.427 86.000 0.000 NA   NA
 7749054 7749055 CD196_0659 CD196_0660     FALSE 0.269 116.000 0.000 NA   NA
 7749055 7749056 CD196_0660 CD196_0661   cooS FALSE 0.046 607.000 0.000 1.000 Y NA
 7749056 7749057 CD196_0661 CD196_0662 cooS cooC TRUE 0.399 310.000 0.129 0.046 N NA
 7749057 7749058 CD196_0662 CD196_0663 cooC fhs FALSE 0.221 249.000 0.019 1.000 N NA
 7749058 7749059 CD196_0663 CD196_0664 fhs fchA TRUE 0.853 105.000 0.095 1.000 N NA
 7749059 7749060 CD196_0664 CD196_0665 fchA folD TRUE 0.368 92.000 0.000 1.000 N NA
 7749060 7749061 CD196_0665 CD196_0666 folD   TRUE 0.720 37.000 0.000 NA   NA
 7749061 7749062 CD196_0666 CD196_0667     TRUE 0.986 36.000 0.229 NA   NA
 7749062 7749063 CD196_0667 CD196_0669     TRUE 0.922 44.000 0.029 1.000 N NA
 7749063 7749064 CD196_0669 CD196_0670     TRUE 0.919 56.000 0.052 1.000 N NA
 7749064 7749065 CD196_0670 CD196_0671     TRUE 0.989 20.000 0.138 1.000 N NA
 7749065 7749066 CD196_0671 CD196_0672     TRUE 0.998 31.000 0.222 0.003 Y NA
 7749066 7749067 CD196_0672 CD196_0673     TRUE 0.651 50.000 0.000 1.000   NA
 7749067 7749068 CD196_0673 CD196_0674     TRUE 0.613 57.000 0.000 1.000   NA
 7749068 7749069 CD196_0674 CD196_0675   gcvH TRUE 0.798 87.000 0.020 1.000 N NA
 7749069 7749070 CD196_0675 CD196_0676 gcvH   TRUE 0.679 46.000 0.000 1.000   NA
 7749070 7749071 CD196_0676 CD196_0677     TRUE 0.926 25.000 0.000 0.022   NA
 7749071 7749072 CD196_0677 CD196_0678     TRUE 0.986 -15.000 0.000 0.002   NA
 7749072 7749073 CD196_0678 CD196_0679     TRUE 0.673 47.000 0.000 1.000   NA
 7749073 7749074 CD196_0679 CD196_0680     TRUE 0.515 151.000 0.011 NA   NA
 7749074 7749075 CD196_0680 CD196_0681     TRUE 0.981 19.000 0.055 NA   NA
 7749075 7749076 CD196_0681 CD196_0682     TRUE 0.998 16.000 0.600 NA   NA
 7749076 7749077 CD196_0682 CD196_0683   hisK FALSE 0.011 540.000 0.000 NA   NA
 7749080 7749081 CD196_0686 CD196_0687     FALSE 0.154 158.000 0.000 NA   NA
 7749082 7749083 CD196_0688 CD196_0689 glpK1   TRUE 0.900 41.000 0.004 1.000 N NA
 7749085 7749086 CD196_t080 CD196_0691     TRUE 0.403 91.000 0.000 NA   NA
 7749086 7749087 CD196_0691 CD196_0692     TRUE 0.996 15.000 0.144 1.000 Y NA
 7749087 7749088 CD196_0692 CD196_0693     FALSE 0.121 178.000 0.000 NA   NA
 7749088 7749089 CD196_0693 CD196_0694     TRUE 0.395 92.000 0.000 NA   NA
 7749089 7749090 CD196_0694 CD196_0695     TRUE 0.991 53.000 0.643 NA N NA
 7749090 7749091 CD196_0695 CD196_0696     TRUE 0.445 77.000 0.000 1.000 N NA
 7749091 7749092 CD196_0696 CD196_0697     FALSE 0.006 1028.000 0.000 1.000 N NA
 7749092 7749093 CD196_0697 CD196_0698     TRUE 0.991 28.000 0.022 0.039 Y NA
 7749093 7749094 CD196_0698 CD196_0699     TRUE 0.997 59.000 0.640 1.000 Y NA
 7749094 7749095 CD196_0699 CD196_0700   iscS1 FALSE 0.043 648.000 0.000 1.000 Y NA
 7749095 7749096 CD196_0700 CD196_0701 iscS1 thiI TRUE 0.986 46.000 0.349 1.000 N NA
 7749096 7749097 CD196_0701 CD196_0702 thiI   FALSE 0.155 141.000 0.000 NA N NA
 7749097 7749098 CD196_0702 CD196_0703     FALSE 0.040 243.000 0.000 NA N NA
 7749098 7749099 CD196_0703 CD196_0704     FALSE 0.006 1413.000 0.000 1.000 N NA
 7749100 7749101 CD196_0705 CD196_0706 plfA plfB TRUE 0.532 160.000 0.032 1.000 N NA
 7749102 7749103 CD196_0707 CD196_0708     TRUE 0.376 91.000 0.000 1.000 N NA
 7749103 7749104 CD196_0708 CD196_0709     FALSE 0.166 275.000 0.000 1.000 Y NA
 7749104 7749105 CD196_0709 CD196_0710   gutM TRUE 0.976 5.000 0.000 NA Y NA
 7749105 7749106 CD196_0710 CD196_0711 gutM gutA TRUE 0.982 29.000 0.116 NA N NA
 7749106 7749107 CD196_0711 CD196_0712 gutA srlE TRUE 0.952 64.000 0.070 0.028   NA
 7749107 7749108 CD196_0712 CD196_0713 srlE srlE' TRUE 0.999 25.000 0.667 0.028   NA
 7749108 7749109 CD196_0713 CD196_0714 srlE' srlB TRUE 0.991 41.000 0.286 0.028   NA
 7749109 7749110 CD196_0714 CD196_0715 srlB gutD TRUE 0.871 95.000 0.080 1.000 N NA
 7749110 7749111 CD196_0715 CD196_0716 gutD   FALSE 0.006 993.000 0.000 NA N NA
 7749111 7749112 CD196_0716 CD196_0717     FALSE 0.062 226.000 0.000 NA   NA
 7749112 7749113 CD196_0717 CD196_0718   spoIIAA TRUE 0.451 88.000 0.000 1.000   NA
 7749113 7749114 CD196_0718 CD196_0719 spoIIAA spoIIAB TRUE 1.000 14.000 0.669 0.001 Y NA
 7749114 7749115 CD196_0719 CD196_0720 spoIIAB sigF TRUE 0.999 23.000 0.842 1.000 N NA
 7749115 7749116 CD196_0720 CD196_0721 sigF spoVAC FALSE 0.304 280.000 0.078 NA   NA
 7749116 7749117 CD196_0721 CD196_0722 spoVAC spoVAD TRUE 0.897 154.000 0.386 NA   NA
 7749117 7749118 CD196_0722 CD196_0723 spoVAD spoVAE TRUE 0.996 14.000 0.386 NA   NA
 7749118 7749119 CD196_0723 CD196_0724 spoVAE   FALSE 0.112 183.000 0.000 NA   NA
 7749119 7749120 CD196_0724 CD196_0725     FALSE 0.019 375.000 0.000 NA   NA
 7749120 7749121 CD196_0725 CD196_0726     TRUE 0.997 15.000 0.500 NA   NA
 7749121 7749122 CD196_0726 CD196_0727     TRUE 0.958 -13.000 0.000 NA   NA
 7749122 7749123 CD196_0727 CD196_0728     TRUE 0.657 44.000 0.000 NA   NA
 7749123 7749124 CD196_0728 CD196_0729     FALSE 0.023 339.000 0.000 NA   NA
 7749125 7749126 CD196_0730 CD196_0731     FALSE 0.051 233.000 0.000 1.000 N NA
 7749129 7749130 CD196_0734 CD196_0735     FALSE 0.150 172.000 0.000 1.000   NA
 7749130 7749131 CD196_0735 CD196_0736     TRUE 0.969 29.000 0.039 NA   NA
 7749133 7749134 CD196_0738 CD196_0739     TRUE 0.974 8.000 0.002 1.000   NA
 7749134 7749135 CD196_0739 CD196_0740     TRUE 0.462 86.000 0.000 1.000   NA
 7749135 7749136 CD196_0740 CD196_0741     FALSE 0.213 282.000 0.030 1.000   NA
 7749137 7749138 CD196_0742 CD196_0743     TRUE 0.968 0.000 0.000 0.059   NA
 7749139 7749140 CD196_0744 CD196_0745 nadE   TRUE 0.802 83.000 0.010 NA   NA
 7749142 7749143 CD196_0747 CD196_0748     TRUE 0.625 45.000 0.000 1.000 N NA
 7749143 7749144 CD196_0748 CD196_0749   act TRUE 0.450 76.000 0.000 1.000 N NA
 7749144 7749145 CD196_0749 CD196_0750 act crt1 FALSE 0.018 608.000 0.000 0.033 N NA
 7749145 7749146 CD196_0750 CD196_0751 crt1   TRUE 0.892 94.000 0.105 1.000 N NA
 7749146 7749147 CD196_0751 CD196_0752     FALSE 0.188 137.000 0.000 1.000 N NA
 7749147 7749148 CD196_0752 CD196_0753     TRUE 0.665 40.000 0.000 1.000 N NA
 7749148 7749149 CD196_0753 CD196_0754     TRUE 0.998 11.000 0.429 0.046 N NA
 7749149 7749150 CD196_0754 CD196_0755     TRUE 1.000 11.000 0.600 0.015 Y NA
 7749150 7749151 CD196_0755 CD196_0756     TRUE 0.961 99.000 0.400 1.000 N NA
 7749152 7749153 CD196_0757 CD196_0758     FALSE 0.137 169.000 0.000 NA   NA
 7749154 7749155 CD196_0759 CD196_0760   floX TRUE 0.387 94.000 0.000 NA   NA
 7749155 7749156 CD196_0760 CD196_0761 floX   FALSE 0.141 176.000 0.000 1.000   NA
 7749156 7749157 CD196_0761 CD196_0762     TRUE 0.419 175.000 0.000 1.000 Y NA
 7749157 7749158 CD196_0762 CD196_0763     TRUE 0.868 22.000 0.000 1.000   NA
 7749159 7749160 CD196_0764 CD196_0765     TRUE 0.786 26.000 0.000 NA N NA
 7749161 7749162 CD196_0766 CD196_0767     TRUE 0.787 312.000 0.400 1.000 Y NA
 7749162 7749163 CD196_0767 CD196_0768     TRUE 0.838 28.000 0.000 1.000   NA
 7749163 7749164 CD196_0768 CD196_0769     FALSE 0.019 637.000 0.000 0.099   NA
 7749164 7749165 CD196_0769 CD196_0770     TRUE 1.000 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 7749165 7749166 CD196_0770 CD196_0771     FALSE 0.162 148.000 0.000 1.000 N NA
 7749166 7749167 CD196_0771 CD196_0772     TRUE 0.960 -16.000 0.000 NA   NA
 7749167 7749168 CD196_0772 CD196_0773     TRUE 0.999 10.000 0.667 NA   NA
 7749168 7749169 CD196_0773 CD196_0774   rbr FALSE 0.019 377.000 0.000 NA   NA
 7749169 7749170 CD196_0774 CD196_0775 rbr   TRUE 0.762 32.000 0.000 1.000 N NA
 7749170 7749171 CD196_0775 CD196_0776   rbo TRUE 0.696 37.000 0.000 1.000 N NA
 7749171 7749172 CD196_0776 CD196_0777 rbo   TRUE 0.360 127.000 0.000 0.046 N NA
 7749172 7749173 CD196_0777 CD196_0778     FALSE 0.036 297.000 0.000 1.000   NA
 7749173 7749174 CD196_0778 CD196_0779     FALSE 0.011 601.000 0.000 1.000   NA
 7749176 7749177 CD196_0781 CD196_0782     TRUE 0.982 25.000 0.074 1.000 N NA
 7749177 7749178 CD196_0782 CD196_0783     TRUE 0.995 22.000 0.054 0.054 Y NA
 7749178 7749179 CD196_0783 CD196_0784     FALSE 0.023 327.000 0.000 1.000 N NA
 7749179 7749180 CD196_0784 CD196_0785     TRUE 0.784 34.000 0.000 1.000   NA
 7749180 7749181 CD196_0785 CD196_0786     TRUE 0.495 79.000 0.000 1.000   NA
 7749181 7749182 CD196_0786 CD196_0787     FALSE 0.115 189.000 0.000 1.000   NA
 7749182 7749183 CD196_0787 CD196_0788     TRUE 0.817 28.000 0.000 NA   NA
 7749183 7749184 CD196_0788 CD196_0789     FALSE 0.058 232.000 0.000 NA   NA
 7749184 7749185 CD196_0789 CD196_0790     TRUE 0.388 99.000 0.000 1.000   NA
 7749185 7749186 CD196_0790 CD196_0791     FALSE 0.257 128.000 0.000 1.000   NA
 7749186 7749187 CD196_0791 CD196_0792     TRUE 0.689 44.000 0.000 1.000   NA
 7749187 7749188 CD196_0792 CD196_0793     TRUE 0.346 101.000 0.000 NA   NA
 7749190 7749191 CD196_0795 CD196_0796     FALSE 0.059 230.000 0.000 NA   NA
 7749191 7749192 CD196_0796 CD196_0797     TRUE 0.990 23.000 0.150 NA   NA
 7749192 7749193 CD196_0797 CD196_0798   abgB2 TRUE 0.441 84.000 0.000 NA   NA
 7749193 7749194 CD196_0798 CD196_0799 abgB2   TRUE 0.774 35.000 0.000 1.000   NA
 7749195 7749196 CD196_0800 CD196_0801     TRUE 0.992 3.000 0.074 1.000   NA
 7749197 7749198 CD196_0802 CD196_0803 oppB oppC TRUE 1.000 -25.000 0.647 0.030 Y NA
 7749198 7749199 CD196_0803 CD196_0804 oppC oppA TRUE 0.969 113.000 0.167 0.030 Y NA
 7749199 7749200 CD196_0804 CD196_0805 oppA oppD TRUE 0.995 75.000 0.600 1.000 Y NA
 7749200 7749201 CD196_0805 CD196_0806 oppD oppF TRUE 0.994 -7.000 0.000 0.002 Y NA
 7749201 7749202 CD196_0806 CD196_0807 oppF   FALSE 0.021 359.000 0.000 NA   NA
 7749202 7749203 CD196_0807 CD196_0809     FALSE 0.072 215.000 0.000 NA   NA
 7749203 7749204 CD196_0809 CD196_0810     FALSE 0.236 135.000 0.000 1.000   NA
 7749204 7749205 CD196_0810 CD196_0811     TRUE 0.997 16.000 0.143 0.028 Y NA
 7749205 7749206 CD196_0811 CD196_0812     TRUE 0.997 24.000 0.143 0.032 Y NA
 7749206 7749207 CD196_0812 CD196_0813     TRUE 0.518 148.000 0.000 1.000 Y NA
 7749207 7749208 CD196_0813 CD196_0814     FALSE 0.027 317.000 0.000 NA   NA
 7749208 7749209 CD196_0814 CD196_0815     FALSE 0.083 205.000 0.000 NA   NA
 7749209 7749210 CD196_0815 CD196_0816     FALSE 0.084 203.000 0.000 NA   NA
 7749212 7749213 CD196_0818 CD196_0819 modA modB TRUE 0.995 83.000 0.430 0.001 Y NA
 7749213 7749214 CD196_0819 CD196_0820 modB modC TRUE 0.998 13.000 0.342 1.000 Y NA
 7749214 7749215 CD196_0820 CD196_0821 modC maa TRUE 0.908 6.000 0.000 1.000   NA
 7749216 7749217 CD196_0822 CD196_0823     TRUE 0.982 131.000 1.000 NA   NA
 7749217 7749218 CD196_0823 CD196_0824     TRUE 0.995 1.000 0.118 1.000   NA
 7749218 7749219 CD196_0824 CD196_0825     FALSE 0.008 809.000 0.000 NA   NA
 7749219 7749220 CD196_0825 CD196_0826     TRUE 0.991 97.000 1.000 NA   NA
 7749220 7749221 CD196_0826 CD196_0827     TRUE 0.995 1.000 0.118 1.000   NA
 7749222 7749223 CD196_0828 CD196_0829   tlpB FALSE 0.006 746.000 0.000 NA N NA
 7749223 7749224 CD196_0829 CD196_0830 tlpB   FALSE 0.076 191.000 0.000 NA N NA
 7749224 7749225 CD196_0830 CD196_0831     TRUE 0.964 21.000 0.000 NA Y NA
 7749225 7749226 CD196_0831 CD196_0832   glgC FALSE 0.007 771.000 0.000 1.000 N NA
 7749226 7749227 CD196_0832 CD196_0833 glgC glgD TRUE 0.999 2.000 0.309 0.001 Y NA
 7749227 7749228 CD196_0833 CD196_0834 glgD glgA TRUE 0.996 29.000 0.172 1.000 Y NA
 7749228 7749229 CD196_0834 CD196_0835 glgA glgP TRUE 0.999 -7.000 0.143 1.000 Y NA
 7749229 7749230 CD196_0835 CD196_0836 glgP   TRUE 0.999 5.000 0.186 0.029 Y NA
 7749230 7749231 CD196_0836 CD196_0837     FALSE 0.053 230.000 0.000 1.000 N NA
 7749231 7749232 CD196_0837 CD196_0838   speA FALSE 0.008 638.000 0.000 1.000 N NA
 7749232 7749233 CD196_0838 CD196_0839 speA speD TRUE 0.783 87.000 0.000 1.000 Y NA
 7749233 7749234 CD196_0839 CD196_0840 speD speE TRUE 0.995 30.000 0.161 1.000 Y NA
 7749234 7749235 CD196_0840 CD196_0841 speE speB TRUE 0.996 11.000 0.077 1.000 Y NA
 7749237 7749238 CD196_0843 CD196_0844     FALSE 0.111 258.000 0.000 0.015   NA
 7749238 7749239 CD196_0844 CD196_0846     FALSE 0.239 134.000 0.000 1.000   NA
 7749239 7749240 CD196_0846 CD196_0845   tlpB FALSE 0.009 642.000 0.000 NA   NA
 7749240 7749241 CD196_0845 CD196_0847 tlpB   FALSE 0.007 1224.000 0.000 NA   NA
 7749241 7749242 CD196_0847 CD196_0848     FALSE 0.043 262.000 0.000 NA   NA
 7749242 7749243 CD196_0848 CD196_0849   dinB FALSE 0.017 390.000 0.000 NA   NA
 7749243 7749244 CD196_0849 CD196_0850 dinB opuCA FALSE 0.041 256.000 0.000 1.000 N NA
 7749244 7749245 CD196_0850 CD196_0851 opuCA opuCC TRUE 1.000 -13.000 0.793 0.090 N NA
 7749245 7749246 CD196_0851 CD196_0852 opuCC   FALSE 0.041 334.000 0.000 0.090 N NA
 7749246 7749247 CD196_0852 CD196_0853     FALSE 0.219 141.000 0.000 1.000   NA
 7749247 7749248 CD196_0853 CD196_0854     FALSE 0.018 384.000 0.000 NA   NA
 7749248 7749249 CD196_0854 CD196_0855     TRUE 0.810 29.000 0.000 NA   NA
 7749249 7749250 CD196_0855 CD196_0856     TRUE 0.960 34.000 0.045 1.000 N NA
 7749250 7749251 CD196_0856 CD196_0857     TRUE 0.900 5.000 0.000 NA   NA
 7749251 7749252 CD196_0857 CD196_0858     FALSE 0.049 250.000 0.000 NA   NA
 7749252 7749253 CD196_0858 CD196_0859     FALSE 0.304 200.000 0.008 1.000 N NA
 7749253 7749254 CD196_0859 CD196_0860     TRUE 0.617 118.000 0.008 1.000 N NA
 7749254 7749255 CD196_0860 CD196_0861     TRUE 0.652 45.000 0.000 NA   NA
 7749255 7749256 CD196_0861 CD196_0862   leuA FALSE 0.011 518.000 0.000 NA   NA
 7749256 7749257 CD196_0862 CD196_0863 leuA leuC TRUE 0.887 140.000 0.019 0.001 Y NA
 7749257 7749258 CD196_0863 CD196_0864 leuC leuD TRUE 1.000 15.000 0.615 0.001 Y NA
 7749258 7749259 CD196_0864 CD196_0865 leuD leuB TRUE 0.999 7.000 0.191 0.001 Y NA
 7749259 7749260 CD196_0865 CD196_0866 leuB   FALSE 0.016 363.000 0.000 NA N NA
 7749260 7749261 CD196_0866 CD196_0867     FALSE 0.015 373.000 0.000 NA N NA
 7749261 7749262 CD196_0867 CD196_0868   serA TRUE 0.521 240.000 0.110 0.054 N NA
 7749262 7749263 CD196_0868 CD196_0869 serA   TRUE 0.974 32.000 0.072 NA   NA
 7749263 7749264 CD196_0869 CD196_0870     FALSE 0.008 818.000 0.000 NA   NA
 7749264 7749265 CD196_0870 CD196_0871     FALSE 0.097 185.000 0.000 1.000 N NA
 7749265 7749266 CD196_0871 CD196_0872     TRUE 0.349 106.000 0.000 1.000   NA
 7749266 7749267 CD196_0872 CD196_0873     TRUE 1.000 -28.000 0.646 0.030   NA
 7749267 7749268 CD196_0873 CD196_0874     TRUE 0.999 -12.000 0.270 1.000 Y NA
 7749268 7749269 CD196_0874 CD196_0875     FALSE 0.270 123.000 0.000 1.000   NA
 7749269 7749270 CD196_0875 CD196_0876   fumA FALSE 0.330 197.000 0.006 1.000   NA
 7749270 7749271 CD196_0876 CD196_0877 fumA fumB TRUE 0.999 13.000 0.262 0.001 Y NA
 7749271 7749272 CD196_0877 CD196_0878 fumB   TRUE 0.943 66.000 0.006 1.000 Y NA
 7749272 7749273 CD196_0878 CD196_0879     FALSE 0.131 173.000 0.000 NA   NA
 7749273 7749274 CD196_0879 CD196_0880     FALSE 0.011 526.000 0.000 NA   NA
 7749274 7749275 CD196_0880 CD196_0881     TRUE 1.000 11.000 0.875 1.000 Y NA
 7749275 7749276 CD196_0881 CD196_0882     TRUE 0.994 72.000 0.875 1.000 N NA
 7749276 7749277 CD196_0882 CD196_0883     TRUE 1.000 -3.000 0.875 1.000 N NA
 7749279 7749280 CD196_0885 CD196_0886   nagA TRUE 0.998 10.000 0.545 1.000 N NA
 7749280 7749281 CD196_0886 CD196_0887 nagA glmD TRUE 0.988 99.000 0.273 0.001 Y NA
 7749283 7749284 CD196_0889 CD196_0890     TRUE 1.000 2.000 0.889 1.000 Y NA
 7749284 7749285 CD196_0890 CD196_0891     TRUE 0.435 205.000 0.000 0.018 Y NA
 7749287 7749288 CD196_0893 CD196_0894     TRUE 0.999 37.000 0.688 0.004 Y NA
 7749288 7749289 CD196_0894 CD196_0895     FALSE 0.024 333.000 0.000 NA   NA
 7749289 7749290 CD196_0895 CD196_0896     FALSE 0.325 105.000 0.000 NA   NA
 7749290 7749291 CD196_0896 CD196_0897     TRUE 0.844 17.000 0.000 NA   NA
 7749291 7749292 CD196_0897 CD196_0898     FALSE 0.014 453.000 0.000 NA   NA
 7749292 7749293 CD196_0898 CD196_0899     FALSE 0.014 436.000 0.000 NA   NA
 7749293 7749294 CD196_0899 CD196_0900   potA TRUE 0.995 19.000 0.326 1.000 N NA
 7749294 7749295 CD196_0900 CD196_0901 potA potB TRUE 1.000 2.000 0.928 1.000 Y NA
 7749295 7749296 CD196_0901 CD196_0902 potB potC TRUE 0.991 105.000 0.492 0.030 Y NA
 7749296 7749297 CD196_0902 CD196_0903 potC potD TRUE 0.999 0.000 0.131 0.030 Y NA
 7749297 7749298 CD196_0903 CD196_0904 potD   FALSE 0.013 444.000 0.000 1.000 N NA
 7749298 7749299 CD196_0904 CD196_0905     TRUE 0.995 -7.000 0.067 1.000   NA
 7749299 7749300 CD196_0905 CD196_0906     TRUE 0.920 49.000 0.033 NA   NA
 7749300 7749301 CD196_0906 CD196_0907     TRUE 0.993 23.000 0.230 NA   NA
 7749301 7749302 CD196_0907 CD196_0908     TRUE 0.921 49.000 0.035 NA   NA
 7749302 7749303 CD196_0908 CD196_0909   mnaA FALSE 0.189 152.000 0.000 1.000   NA
 7749303 7749304 CD196_0909 CD196_0910 mnaA   TRUE 0.439 78.000 0.000 1.000 N NA
 7749304 7749305 CD196_0910 CD196_r16   16SrRNA FALSE 0.168 152.000 0.000 NA   NA
 7749305 7749306 CD196_r16 CD196_r17 16SrRNA 23SrRNA FALSE 0.032 294.000 0.000 NA   NA
 7749306 7749307 CD196_r17 CD196_t074 23SrRNA   TRUE 0.708 38.000 0.000 NA   NA
 7749307 7749308 CD196_t074 CD196_r29   5SrRNA TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 7749308 7749309 CD196_r29 CD196_0911 5SrRNA   FALSE 0.048 253.000 0.000 NA   NA
 7749309 7749310 CD196_0911 CD196_0912     FALSE 0.100 492.000 0.000 0.004 Y NA
 7749310 7749311 CD196_0912 CD196_0913     FALSE 0.060 228.000 0.000 NA   NA
 7749311 7749312 CD196_0913 CD196_0915     TRUE 0.997 -7.000 0.123 NA   NA
 7749312 7749313 CD196_0915 CD196_0916     TRUE 0.889 109.000 0.154 NA   NA
 7749313 7749314 CD196_0916 CD196_0917   addB TRUE 0.993 -10.000 0.029 NA   NA
 7749314 7749315 CD196_0917 CD196_0918 addB addA TRUE 0.999 0.000 0.408 1.000 Y NA
 7749315 7749316 CD196_0918 CD196_0919 addA sbcD TRUE 0.976 46.000 0.041 1.000 Y NA
 7749316 7749317 CD196_0919 CD196_0920 sbcD sbcC TRUE 1.000 -25.000 0.669 NA N NA
 7749317 7749318 CD196_0920 CD196_0921 sbcC   FALSE 0.221 131.000 0.000 NA   NA
 7749318 7749319 CD196_0921 CD196_0922     FALSE 0.175 149.000 0.000 NA   NA
 7749319 7749320 CD196_0922 CD196_0923   pepT TRUE 0.403 91.000 0.000 NA   NA
 7749320 7749321 CD196_0923 CD196_0924 pepT   FALSE 0.045 258.000 0.000 NA   NA
 7749322 7749323 CD196_0925 CD196_0926     TRUE 0.974 25.000 0.031 1.000   NA
 7749324 7749325 CD196_0927 CD196_0928     TRUE 0.999 -12.000 0.400 NA   NA
 7749325 7749326 CD196_0928 CD196_0929     TRUE 0.993 52.000 0.667 NA   NA
 7749326 7749327 CD196_0929 CD196_0930     TRUE 0.807 79.000 0.008 NA   NA
 7749327 7749328 CD196_0930 CD196_0931   bcd2 FALSE 0.009 708.000 0.000 NA   NA
 7749328 7749329 CD196_0931 CD196_0932 bcd2 etfB2 TRUE 0.780 44.000 0.000 0.045 N NA
 7749329 7749330 CD196_0932 CD196_0933 etfB2 etfA2 TRUE 1.000 19.000 1.000 0.015 Y NA
 7749330 7749331 CD196_0933 CD196_0934 etfA2 crt2 TRUE 0.837 19.000 0.000 1.000 N NA
 7749331 7749332 CD196_0934 CD196_0935 crt2 hbd TRUE 0.989 98.000 0.486 1.000 Y NA
 7749332 7749333 CD196_0935 CD196_0936 hbd thlA1 TRUE 0.962 72.000 0.054 1.000 Y NA
 7749333 7749334 CD196_0936 CD196_0937 thlA1   FALSE 0.043 252.000 0.000 1.000 N NA
 7749334 7749335 CD196_0937 CD196_0938     TRUE 0.983 14.000 0.070 NA   NA
 7749337 7749338 CD196_0940 CD196_0941     TRUE 0.633 48.000 0.000 NA   NA
 7749338 7749339 CD196_0941 CD196_0942     FALSE 0.115 182.000 0.000 NA   NA
 7749339 7749340 CD196_0942 CD196_0943     TRUE 0.759 34.000 0.000 NA   NA
 7749340 7749341 CD196_0943 CD196_0944   ccpA FALSE 0.051 247.000 0.000 NA   NA
 7749343 7749344 CD196_0947 CD196_0948     FALSE 0.013 478.000 0.000 NA   NA
 7749345 7749346 CD196_0949 CD196_0950     TRUE 0.650 42.000 0.000 1.000 N NA
 7749347 7749348 CD196_0951 CD196_0952     TRUE 0.966 29.000 0.029 NA   NA
 7749348 7749349 CD196_0952 CD196_0953     TRUE 0.969 20.000 0.014 NA   NA
 7749349 7749350 CD196_0953 CD196_0954     FALSE 0.064 216.000 0.000 1.000 N NA
 7749350 7749351 CD196_0954 CD196_0955     TRUE 0.997 26.000 0.500 1.000 N NA
 7749351 7749352 CD196_0955 CD196_0956     TRUE 0.998 4.000 0.400 1.000   NA
 7749352 7749353 CD196_0956 CD196_0957     TRUE 0.993 0.000 0.057 1.000   NA
 7749353 7749354 CD196_0957 CD196_0958     TRUE 1.000 11.000 0.800 0.045 Y NA
 7749354 7749355 CD196_0958 CD196_0959     TRUE 0.999 -16.000 0.103 0.045 Y NA
 7749357 7749358 CD196_0961 CD196_0962   moeA FALSE 0.077 211.000 0.000 NA   NA
 7749358 7749359 CD196_0962 CD196_0963 moeA mobB TRUE 0.997 5.000 0.040 0.003 Y NA
 7749359 7749360 CD196_0963 CD196_0964 mobB   FALSE 0.235 119.000 0.000 1.000 N NA
 7749360 7749361 CD196_0964 CD196_0965     FALSE 0.041 256.000 0.000 1.000 N NA
 7749361 7749362 CD196_0965 CD196_0966     FALSE 0.016 363.000 0.000 NA N NA
 7749362 7749363 CD196_0966 CD196_0967     TRUE 0.984 36.000 0.200 NA   NA
 7749363 7749364 CD196_0967 CD196_0968   zupT FALSE 0.216 142.000 0.000 1.000   NA
 7749364 7749365 CD196_0968 CD196_0969 zupT   TRUE 0.376 96.000 0.000 NA   NA
 7749365 7749366 CD196_0969 CD196_0970     FALSE 0.049 251.000 0.000 NA   NA
 7749366 7749367 CD196_0970 CD196_0971     TRUE 0.945 -6.000 0.000 NA   NA
 7749367 7749368 CD196_0971 CD196_0972     FALSE 0.062 226.000 0.000 NA   NA
 7749368 7749369 CD196_0972 CD196_0973   dhaB1 FALSE 0.068 219.000 0.000 NA   NA
 7749369 7749370 CD196_0973 CD196_0974 dhaB1 dhaB2 TRUE 0.999 15.000 1.000 0.003 N NA
 7749370 7749371 CD196_0974 CD196_0975 dhaB2   TRUE 0.871 20.000 0.000 1.000   NA
 7749371 7749372 CD196_0975 CD196_0976     FALSE 0.162 164.000 0.000 1.000   NA
 7749372 7749373 CD196_0976 CD196_0977     FALSE 0.144 164.000 0.000 NA   NA
 7749373 7749374 CD196_0977 CD196_0978     FALSE 0.012 501.000 0.000 NA   NA
 7749374 7749375 CD196_0978 CD196_0979     FALSE 0.012 506.000 0.000 NA   NA
 7749375 7749376 CD196_0979 CD196_0980     FALSE 0.071 226.000 0.000 1.000   NA
 7749376 7749377 CD196_0980 CD196_0981     FALSE 0.007 1073.000 0.000 NA   NA
 7749377 7749378 CD196_0981 CD196_0982     FALSE 0.152 159.000 0.000 NA   NA
 7749379 7749380 CD196_0983 CD196_0984     TRUE 0.994 48.000 0.667 NA   NA
 7749380 7749381 CD196_0984 CD196_0985     TRUE 0.999 16.000 1.000 NA   NA
 7749381 7749382 CD196_0985 CD196_t075     FALSE 0.007 1378.000 0.000 NA   NA
 7749383 7749384 CD196_0986 CD196_0987 polA coaE TRUE 0.987 9.000 0.068 1.000 N NA
 7749384 7749385 CD196_0987 CD196_0988 coaE   TRUE 0.994 -7.000 0.058 NA   NA
 7749385 7749386 CD196_0988 CD196_0989     TRUE 0.992 0.000 0.055 NA   NA
 7749386 7749387 CD196_0989 CD196_0990     TRUE 0.914 73.000 0.080 1.000 N NA
 7749387 7749388 CD196_0990 CD196_0991     FALSE 0.086 201.000 0.000 NA   NA
 7749388 7749389 CD196_0991 CD196_0992   gloA FALSE 0.060 228.000 0.000 NA   NA
 7749389 7749390 CD196_0992 CD196_0993 gloA   TRUE 0.595 123.000 0.012 NA N NA
 7749390 7749391 CD196_0993 CD196_0994     TRUE 0.952 111.000 0.400 NA   NA
 7749391 7749392 CD196_0994 CD196_0995   rnfC FALSE 0.071 216.000 0.000 NA   NA
 7749392 7749393 CD196_0995 CD196_0996 rnfC rnfD TRUE 0.997 23.000 0.147 0.045 Y NA
 7749393 7749394 CD196_0996 CD196_0997 rnfD rnfG TRUE 1.000 0.000 0.678 0.045 Y NA
 7749394 7749395 CD196_0997 CD196_0998 rnfG rnfE TRUE 0.995 13.000 0.050 0.045 Y NA
 7749395 7749396 CD196_0998 CD196_0999 rnfE rnfA TRUE 0.997 15.000 0.105 0.045 Y NA
 7749396 7749397 CD196_0999 CD196_1000 rnfA rnfB TRUE 0.998 16.000 0.221 0.045 Y NA
 7749399 7749400 CD196_1002 CD196_1003 maf radC TRUE 0.948 45.000 0.074 NA N NA
 7749400 7749401 CD196_1003 CD196_1004 radC mreB2 TRUE 0.880 70.000 0.040 1.000 N NA
 7749401 7749402 CD196_1004 CD196_1005 mreB2 mreC TRUE 0.999 10.000 0.689 1.000 N NA
 7749402 7749403 CD196_1005 CD196_1006 mreC   TRUE 0.999 15.000 0.550 0.003   NA
 7749403 7749404 CD196_1006 CD196_1007     TRUE 0.989 12.000 0.089 1.000   NA
 7749404 7749405 CD196_1007 CD196_1008   minC TRUE 0.852 98.000 0.060 1.000   NA
 7749405 7749406 CD196_1008 CD196_1009 minC divIVB TRUE 0.998 24.000 0.368 1.000 Y NA
 7749406 7749407 CD196_1009 CD196_1010 divIVB minE TRUE 0.998 18.000 0.347 NA Y NA
 7749407 7749408 CD196_1010 CD196_1011 minE mrdB TRUE 0.921 85.000 0.013 NA Y NA
 7749408 7749409 CD196_1011 CD196_1012 mrdB mgsA TRUE 0.909 41.000 0.009 1.000 N NA
 7749409 7749410 CD196_1012 CD196_1013 mgsA   FALSE 0.009 485.000 0.000 NA N NA
 7749410 7749411 CD196_1013 CD196_1014     TRUE 0.904 4.000 0.000 NA   NA
 7749411 7749412 CD196_1014 CD196_1015     FALSE 0.012 504.000 0.000 NA   NA
 7749414 7749415 CD196_1017 CD196_1018     TRUE 0.998 2.000 0.420 NA   NA
 7749415 7749416 CD196_1018 CD196_1019   cafA TRUE 0.991 18.000 0.180 NA   NA
 7749416 7749417 CD196_1019 CD196_1020 cafA rplU TRUE 0.901 101.000 0.018 1.000 Y NA
 7749417 7749418 CD196_1020 CD196_1021 rplU   TRUE 0.997 15.000 0.208 NA Y NA
 7749418 7749419 CD196_1021 CD196_1022   rpmA TRUE 0.997 14.000 0.203 NA Y NA
 7749419 7749420 CD196_1022 CD196_1023 rpmA obg TRUE 0.956 102.000 0.335 1.000   NA
 7749420 7749421 CD196_1023 CD196_1024 obg   TRUE 0.926 52.000 0.046 NA   NA
 7749421 7749422 CD196_1024 CD196_1025   hom1 FALSE 0.023 301.000 0.000 NA N NA
 7749423 7749424 CD196_1026 CD196_1027     FALSE 0.041 268.000 0.000 NA   NA
 7749425 7749426 CD196_1028 CD196_1029     FALSE 0.261 118.000 0.000 NA   NA
 7749426 7749427 CD196_1029 CD196_1030   etfB3 TRUE 0.986 17.000 0.098 NA   NA
 7749427 7749428 CD196_1030 CD196_1031 etfB3 etfA3 TRUE 1.000 14.000 0.875 0.015 Y NA
 7749428 7749429 CD196_1031 CD196_1032 etfA3   TRUE 1.000 11.000 0.875 0.009 Y NA
 7749431 7749432 CD196_1034 CD196_1035 ackA   TRUE 0.859 93.000 0.061 NA   NA
 7749432 7749433 CD196_1035 CD196_1036   rpmF TRUE 0.997 25.000 0.599 NA   NA
 7749433 7749434 CD196_1036 CD196_1037 rpmF fapR FALSE 0.311 207.000 0.007 1.000   NA
 7749434 7749435 CD196_1037 CD196_1038 fapR plsX TRUE 0.976 11.000 0.012 1.000   NA
 7749435 7749436 CD196_1038 CD196_1039 plsX fabH TRUE 0.995 26.000 0.054 0.004 Y NA
 7749436 7749437 CD196_1039 CD196_1040 fabH fabK TRUE 0.915 109.000 0.216 1.000   NA
 7749437 7749438 CD196_1040 CD196_1041 fabK fabD TRUE 0.987 16.000 0.099 1.000   NA
 7749438 7749439 CD196_1041 CD196_1042 fabD fabG TRUE 0.467 545.000 0.149 0.004 Y NA
 7749439 7749440 CD196_1042 CD196_1043 fabG acpP TRUE 0.976 54.000 0.014 0.004 Y NA
 7749440 7749441 CD196_1043 CD196_1044 acpP fabF TRUE 0.984 29.000 0.005 1.000 Y NA
 7749441 7749442 CD196_1044 CD196_1045 fabF   FALSE 0.056 226.000 0.000 1.000 N NA
 7749442 7749443 CD196_1045 CD196_1046     TRUE 0.950 31.000 0.000 1.000 Y NA
 7749443 7749444 CD196_1046 CD196_1047     FALSE 0.023 345.000 0.000 NA   NA
 7749444 7749445 CD196_1047 CD196_1048     TRUE 0.748 35.000 0.000 NA   NA
 7749445 7749446 CD196_1048 CD196_1049     TRUE 0.868 22.000 0.000 1.000   NA
 7749446 7749447 CD196_1049 CD196_1050     FALSE 0.028 299.000 0.000 1.000 N NA
 7749447 7749448 CD196_1050 CD196_1051   fbp TRUE 0.384 89.000 0.000 1.000 N NA
 7749448 7749449 CD196_1051 CD196_1052 fbp spoIIIAA FALSE 0.074 224.000 0.000 1.000   NA
 7749449 7749450 CD196_1052 CD196_1053 spoIIIAA spoIIIAB TRUE 0.999 -10.000 0.604 NA   NA
 7749450 7749451 CD196_1053 CD196_1054 spoIIIAB spoIIIAC TRUE 1.000 2.000 0.926 NA   NA
 7749451 7749452 CD196_1054 CD196_1055 spoIIIAC spoIIIAD TRUE 0.999 16.000 0.895 NA   NA
 7749452 7749453 CD196_1055 CD196_1056 spoIIIAD spoIIIAE TRUE 0.992 85.000 0.864 NA   NA
 7749453 7749454 CD196_1056 CD196_1057 spoIIIAE spoiIIIAF TRUE 0.996 60.000 0.918 NA   NA
 7749454 7749455 CD196_1057 CD196_1058 spoiIIIAF spoIIIAG TRUE 0.999 12.000 0.907 NA   NA
 7749455 7749456 CD196_1058 CD196_1059 spoIIIAG spoIIIAH TRUE 0.996 27.000 0.407 NA   NA
 7749456 7749457 CD196_1059 CD196_1060 spoIIIAH   TRUE 0.855 110.000 0.108 NA   NA
 7749457 7749458 CD196_1060 CD196_1061   nusB TRUE 0.951 85.000 0.223 NA   NA
 7749458 7749459 CD196_1061 CD196_1062 nusB gcp TRUE 0.991 -16.000 0.011 1.000 N NA
 7749459 7749460 CD196_1062 CD196_1063 gcp xseA TRUE 0.987 -3.000 0.012 1.000 N NA
 7749460 7749461 CD196_1063 CD196_1064 xseA xseB TRUE 1.000 2.000 0.412 0.001 Y NA
 7749461 7749462 CD196_1064 CD196_1065 xseB ispA TRUE 0.988 3.000 0.053 1.000 N NA
 7749462 7749463 CD196_1065 CD196_1066 ispA   TRUE 0.968 30.000 0.040 NA   NA
 7749463 7749464 CD196_1066 CD196_1067   dxs TRUE 0.947 34.000 0.019 NA   NA
 7749464 7749465 CD196_1067 CD196_1068 dxs   TRUE 0.849 133.000 0.189 1.000 N NA
 7749465 7749466 CD196_1068 CD196_1069   recN TRUE 0.928 38.000 0.017 1.000 N NA
 7749466 7749467 CD196_1069 CD196_1070 recN   FALSE 0.072 215.000 0.000 NA   NA
 7749468 7749469 CD196_1071 CD196_1072   bltD TRUE 0.892 31.000 0.000 0.053   NA
 7749470 7749471 CD196_1073 CD196_1074 spoIVB spo0A TRUE 0.921 142.000 0.393 1.000   NA
 7749471 7749472 CD196_1074 CD196_1075 spo0A   FALSE 0.182 413.000 0.099 1.000   NA
 7749472 7749473 CD196_1075 CD196_1076     TRUE 0.999 18.000 0.798 NA   NA
 7749473 7749474 CD196_1076 CD196_1077     TRUE 0.994 24.000 0.259 NA   NA
 7749474 7749475 CD196_1077 CD196_1078     TRUE 0.976 8.000 0.008 NA   NA
 7749475 7749476 CD196_1078 CD196_1079     TRUE 0.975 5.000 0.004 NA   NA
 7749476 7749477 CD196_1079 CD196_1080   nudF TRUE 0.988 2.000 0.038 NA   NA
 7749477 7749478 CD196_1080 CD196_1081 nudF   TRUE 0.829 68.000 0.004 NA   NA
 7749478 7749479 CD196_1081 CD196_1082   xerD1 TRUE 0.965 12.000 0.003 NA   NA
 7749479 7749480 CD196_1082 CD196_1083 xerD1 deoB TRUE 0.923 42.000 0.024 1.000 N NA
 7749480 7749481 CD196_1083 CD196_1084 deoB deoD TRUE 0.965 47.000 0.135 1.000 N NA
 7749481 7749482 CD196_1084 CD196_1085 deoD deoA TRUE 0.691 189.000 0.031 1.000 Y NA
 7749482 7749483 CD196_1085 CD196_1086 deoA   FALSE 0.075 213.000 0.000 NA   NA
 7749483 7749484 CD196_1086 CD196_1087     TRUE 0.556 172.000 0.047 NA   NA
 7749484 7749485 CD196_1087 CD196_1088     TRUE 0.998 -13.000 0.146 1.000   NA
 7749485 7749486 CD196_1088 CD196_1089     TRUE 0.845 72.000 0.020 1.000 N NA
 7749487 7749488 CD196_1090 CD196_1091     FALSE 0.019 392.000 0.000 1.000   NA
 7749489 7749490 CD196_1092 CD196_1093     FALSE 0.034 310.000 0.000 1.000   NA
 7749490 7749491 CD196_1093 CD196_1094     TRUE 0.988 -6.000 0.000 1.000 Y NA
 7749491 7749492 CD196_1094 CD196_1095     FALSE 0.006 3479.000 0.000 NA   NA
 11536407 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2782.000 0.000 NA   NA
 11678770 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2782.000 0.000 NA   NA
 11821162 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2782.000 0.000 NA   NA
 11536408 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2811.000 0.000 NA   NA
 11678771 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2811.000 0.000 NA   NA
 11821163 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2811.000 0.000 NA   NA
 11536409 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2848.000 0.000 NA   NA
 11678772 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2848.000 0.000 NA   NA
 11821164 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2848.000 0.000 NA   NA
 11536410 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2877.000 0.000 NA   NA
 11678773 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2877.000 0.000 NA   NA
 11821165 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2877.000 0.000 NA   NA
 11536411 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2915.000 0.000 NA   NA
 11678774 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2915.000 0.000 NA   NA
 11821166 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2915.000 0.000 NA   NA
 11536412 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2944.000 0.000 NA   NA
 11678775 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2944.000 0.000 NA   NA
 11821167 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2944.000 0.000 NA   NA
 11536413 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2979.000 0.000 NA   NA
 11678776 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2979.000 0.000 NA   NA
 11821168 7749489   CD196_1092     FALSE NA 2979.000 0.000 NA   NA
 11536414 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3008.000 0.000 NA   NA
 11678777 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3008.000 0.000 NA   NA
 11821169 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3008.000 0.000 NA   NA
 11536415 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3047.000 0.000 NA   NA
 11678778 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3047.000 0.000 NA   NA
 11821170 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3047.000 0.000 NA   NA
 11536416 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3076.000 0.000 NA   NA
 11678779 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3076.000 0.000 NA   NA
 11821171 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3076.000 0.000 NA   NA
 11536417 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3113.000 0.000 NA   NA
 11678780 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3113.000 0.000 NA   NA
 11821172 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3113.000 0.000 NA   NA
 11536418 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3142.000 0.000 NA   NA
 11678781 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3142.000 0.000 NA   NA
 11821173 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3142.000 0.000 NA   NA
 11536419 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3181.000 0.000 NA   NA
 11678782 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3181.000 0.000 NA   NA
 11821174 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3181.000 0.000 NA   NA
 11536420 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3210.000 0.000 NA   NA
 11678783 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3210.000 0.000 NA   NA
 11821175 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3210.000 0.000 NA   NA
 11536421 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3244.000 0.000 NA   NA
 11678784 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3244.000 0.000 NA   NA
 11821176 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3244.000 0.000 NA   NA
 11536422 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3273.000 0.000 NA   NA
 11678785 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3273.000 0.000 NA   NA
 11821177 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3273.000 0.000 NA   NA
 11536423 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3310.000 0.000 NA   NA
 11678786 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3310.000 0.000 NA   NA
 11821178 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3310.000 0.000 NA   NA
 11536424 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3339.000 0.000 NA   NA
 11678787 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3339.000 0.000 NA   NA
 11821179 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3339.000 0.000 NA   NA
 11536425 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3376.000 0.000 NA   NA
 11678788 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3376.000 0.000 NA   NA
 11821180 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3376.000 0.000 NA   NA
 11536426 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3405.000 0.000 NA   NA
 11678789 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3405.000 0.000 NA   NA
 11821181 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3405.000 0.000 NA   NA
 11536427 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3442.000 0.000 NA   NA
 11678790 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3442.000 0.000 NA   NA
 11821182 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3442.000 0.000 NA   NA
 11536428 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3471.000 0.000 NA   NA
 11678791 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3471.000 0.000 NA   NA
 11821183 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3471.000 0.000 NA   NA
 11536429 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3508.000 0.000 NA   NA
 11678792 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3508.000 0.000 NA   NA
 11821184 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3508.000 0.000 NA   NA
 11536430 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3537.000 0.000 NA   NA
 11678793 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3537.000 0.000 NA   NA
 11821185 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3537.000 0.000 NA   NA
 11536431 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3575.000 0.000 NA   NA
 11678794 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3575.000 0.000 NA   NA
 11821186 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3575.000 0.000 NA   NA
 11536432 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3604.000 0.000 NA   NA
 11678795 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3604.000 0.000 NA   NA
 11821187 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3604.000 0.000 NA   NA
 11536433 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3641.000 0.000 NA   NA
 11678796 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3641.000 0.000 NA   NA
 11821188 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3641.000 0.000 NA   NA
 11536434 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3670.000 0.000 NA   NA
 11678797 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3670.000 0.000 NA   NA
 11821189 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3670.000 0.000 NA   NA
 11536435 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3707.000 0.000 NA   NA
 11678798 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3707.000 0.000 NA   NA
 11821190 7749489   CD196_1092     FALSE NA 3707.000 0.000 NA   NA
 7749494 7749495 CD196_1097 CD196_1098     TRUE 0.845 15.000 0.000 NA   NA
 7749496 7749497 CD196_1099 CD196_1100     FALSE 0.033 292.000 0.000 NA   NA
 7749500 7749501 CD196_1103 CD196_1104     TRUE 1.000 -16.000 1.000 NA   NA
 7749501 7749502 CD196_1104 CD196_1105     TRUE 0.999 -7.000 0.400 NA   NA
 7749502 7749503 CD196_1105 CD196_1106     TRUE 0.999 -10.000 0.600 NA   NA
 7749503 7749504 CD196_1106 CD196_1107   efp FALSE 0.032 297.000 0.000 NA   NA
 7749504 7749505 CD196_1107 CD196_1108 efp   TRUE 0.824 92.000 0.037 NA   NA
 7749505 7749506 CD196_1108 CD196_1109   rnc TRUE 0.413 163.000 0.002 NA   NA
 7749506 7749507 CD196_1109 CD196_1110 rnc   TRUE 0.976 54.000 0.064 1.000 Y NA
 7749507 7749508 CD196_1110 CD196_1111   smc TRUE 0.964 28.000 0.027 1.000 N NA
 7749508 7749509 CD196_1111 CD196_1112 smc ftsY TRUE 0.988 27.000 0.165 1.000 N NA
 7749509 7749510 CD196_1112 CD196_1113 ftsY   TRUE 0.368 103.000 0.000 1.000   NA
 7749510 7749511 CD196_1113 CD196_1114   ffh TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000   NA
 7749511 7749512 CD196_1114 CD196_1115 ffh rpsP TRUE 0.993 31.000 0.361 1.000 N NA
 7749512 7749513 CD196_1115 CD196_1116 rpsP   TRUE 0.982 65.000 0.385 1.000   NA
 7749513 7749514 CD196_1116 CD196_1117   rimM TRUE 0.945 108.000 0.324 1.000   NA
 7749514 7749515 CD196_1117 CD196_1118 rimM trmD TRUE 1.000 9.000 0.672 1.000 Y NA
 7749515 7749516 CD196_1118 CD196_1119 trmD rplS TRUE 0.958 185.000 0.567 1.000 Y NA
 7749516 7749517 CD196_1119 CD196_1120 rplS   FALSE 0.168 312.000 0.027 1.000   NA
 7749517 7749518 CD196_1120 CD196_1121     FALSE 0.037 389.000 0.000 0.055   NA
 7749518 7749519 CD196_1121 CD196_1122     FALSE 0.066 1120.000 0.000 0.001 Y NA
 7749519 7749520 CD196_1122 CD196_1123     FALSE 0.009 565.000 0.000 1.000 N NA
 7749520 7749521 CD196_1123 CD196_1124   rnhB TRUE 0.493 68.000 0.000 1.000 N NA
 7749521 7749522 CD196_1124 CD196_1125 rnhB   TRUE 0.846 58.000 0.003 1.000 N NA
 7749522 7749523 CD196_1125 CD196_1126     TRUE 0.532 66.000 0.000 NA   NA
 7749524 7749525 CD196_1127 CD196_1128     FALSE 0.053 241.000 0.000 NA   NA
 7749525 7749526 CD196_1128 CD196_1129     TRUE 0.998 3.000 0.400 NA   NA
 7749526 7749527 CD196_1129 CD196_1130     TRUE 0.999 14.000 1.000 NA   NA
 7749527 7749528 CD196_1130 CD196_1131     TRUE 0.895 188.000 0.600 1.000 N NA
 7749528 7749529 CD196_1131 CD196_1132     TRUE 1.000 -16.000 0.800 0.023 Y NA
 7749530 7749531 CD196_1133 CD196_1134     TRUE 0.978 31.000 0.050 0.058 N NA
 7749531 7749532 CD196_1134 CD196_1135     TRUE 0.979 19.000 0.053 1.000 N NA
 7749532 7749533 CD196_1135 CD196_1136   topA TRUE 0.996 33.000 0.238 1.000 Y NA
 7749533 7749534 CD196_1136 CD196_1137 topA codY TRUE 0.497 165.000 0.025 1.000 N NA
 7749534 7749535 CD196_1137 CD196_1138 codY   TRUE 0.880 77.000 0.021 0.058 N NA
 7749535 7749536 CD196_1138 CD196_1139     TRUE 0.987 31.000 0.154 1.000   NA
 7749536 7749537 CD196_1139 CD196_1140     TRUE 0.708 109.000 0.017 NA   NA
 7749537 7749538 CD196_1140 CD196_1141   iscS2 TRUE 0.991 9.000 0.125 NA N NA
 7749538 7749539 CD196_1141 CD196_1142 iscS2   TRUE 0.566 54.000 0.000 1.000 N NA
 7749539 7749540 CD196_1142 CD196_1143   trmU FALSE 0.030 289.000 0.000 1.000 N NA
 7749540 7749541 CD196_1143 CD196_1144 trmU alaS FALSE 0.098 449.000 0.000 0.038 Y NA
 7749541 7749542 CD196_1144 CD196_1145 alaS   TRUE 0.986 25.000 0.110 NA   NA
 7749542 7749543 CD196_1145 CD196_1146     TRUE 0.976 10.000 0.016 NA   NA
 7749543 7749544 CD196_1146 CD196_1147     FALSE 0.328 206.000 0.015 NA   NA
 7749544 7749545 CD196_1147 CD196_1148     TRUE 0.953 78.000 0.217 NA   NA
 7749545 7749546 CD196_1148 CD196_1149   fur FALSE 0.301 282.000 0.078 NA   NA
 7749548 7749549 CD196_1151 CD196_1152     FALSE 0.082 206.000 0.000 NA   NA
 7749549 7749550 CD196_1152 CD196_1153   dacF TRUE 0.594 54.000 0.000 NA   NA
 7749551 7749552 CD196_1154 CD196_1155     TRUE 0.984 21.000 0.070 NA   NA
 7749553 7749554 CD196_1156 CD196_1157   scpA TRUE 0.980 30.000 0.092 NA   NA
 7749554 7749555 CD196_1157 CD196_1158 scpA scpB TRUE 0.999 2.000 0.570 NA   NA
 7749555 7749556 CD196_1158 CD196_1159 scpB   FALSE 0.148 162.000 0.000 NA   NA
 7749556 7749557 CD196_1159 CD196_1160     TRUE 0.960 -16.000 0.000 NA   NA
 7749557 7749558 CD196_1160 CD196_1161     FALSE 0.051 248.000 0.000 NA   NA
 7749558 7749559 CD196_1161 CD196_1162   pepA TRUE 0.826 16.000 0.000 1.000 N NA
 7749562 7749563 CD196_1165 CD196_1166     FALSE 0.252 120.000 0.000 NA   NA
 7749564 7749565 CD196_1167 CD196_1168 acd dnaF FALSE 0.065 215.000 0.000 1.000 N NA
 7749565 7749566 CD196_1168 CD196_1169 dnaF   TRUE 0.464 204.000 0.059 NA   NA
 7749566 7749567 CD196_1169 CD196_1170   nusA TRUE 0.998 30.000 0.759 NA   NA
 7749567 7749568 CD196_1170 CD196_1171 nusA   TRUE 0.999 7.000 0.323 NA Y NA
 7749568 7749569 CD196_1171 CD196_1172     TRUE 0.999 -10.000 0.408 NA N NA
 7749569 7749570 CD196_1172 CD196_1173   infB TRUE 0.997 22.000 0.223 NA Y NA
 7749570 7749571 CD196_1173 CD196_1174 infB rbfA TRUE 0.997 43.000 0.530 1.000 Y NA
 7749571 7749572 CD196_1174 CD196_1175 rbfA   TRUE 0.998 -46.000 0.173 1.000   NA
 7749572 7749573 CD196_1175 CD196_1176   truB TRUE 0.994 13.000 0.221 1.000   NA
 7749573 7749574 CD196_1176 CD196_1177 truB ribC TRUE 0.905 131.000 0.308 1.000 N NA
 7749574 7749575 CD196_1177 CD196_1178 ribC   TRUE 0.933 0.000 0.000 NA   NA
 7749575 7749576 CD196_1178 CD196_1179   rpsO TRUE 0.896 6.000 0.000 NA   NA
 7749576 7749577 CD196_1179 CD196_1180 rpsO   FALSE 0.190 240.000 0.002 NA   NA
 7749577 7749578 CD196_1180 CD196_1181   comR TRUE 0.578 125.000 0.003 NA   NA
 7749578 7749579 CD196_1181 CD196_1182 comR   FALSE 0.251 266.000 0.048 1.000 N NA
 7749579 7749580 CD196_1182 CD196_1183     TRUE 0.756 158.000 0.127 1.000   NA
 7749580 7749581 CD196_1183 CD196_1184     TRUE 0.976 35.000 0.104 NA   NA
 7749581 7749582 CD196_1184 CD196_1185   dapG TRUE 0.993 10.000 0.148 NA   NA
 7749582 7749583 CD196_1185 CD196_1186 dapG tepA TRUE 0.813 113.000 0.080 1.000 N NA
 7749583 7749584 CD196_1186 CD196_1187 tepA ftsK TRUE 0.700 123.000 0.042 1.000 N NA
 7749584 7749585 CD196_1187 CD196_1188 ftsK   TRUE 0.985 3.000 0.028 NA   NA
 7749585 7749586 CD196_1188 CD196_1189     TRUE 0.945 -6.000 0.000 NA   NA
 7749586 7749587 CD196_1189 CD196_1190   pgsA TRUE 0.997 -22.000 0.132 1.000 N NA
 7749587 7749588 CD196_1190 CD196_1191 pgsA recA FALSE 0.165 288.000 0.022 1.000 N NA
 7749588 7749589 CD196_1191 CD196_1192 recA   TRUE 0.464 176.000 0.018 1.000   NA
 7749589 7749590 CD196_1192 CD196_1193     FALSE 0.011 635.000 0.000 1.000   NA
 7749591 7749592 CD196_1194 CD196_1195 sip3 bacA1 TRUE 0.909 22.000 0.000 0.084 N NA
 7749593 7749594 CD196_1196 CD196_1197 xerD2   TRUE 0.472 144.000 0.002 1.000 N NA
 7749594 7749595 CD196_1197 CD196_1198     FALSE 0.026 311.000 0.000 1.000 N NA
 7749595 7749596 CD196_1198 CD196_1199   malX FALSE 0.014 413.000 0.000 1.000 N NA
 7749596 7749597 CD196_1199 CD196_1200 malX   FALSE 0.138 159.000 0.000 1.000 N NA
 7749597 7749598 CD196_1200 CD196_1201   glvG TRUE 0.354 133.000 0.000 0.027 N NA
 7749600 7749601 CD196_1203 CD196_1204   exoA TRUE 0.476 146.000 0.003 1.000 N NA
 7749603 7749604 CD196_1206 CD196_1207   glnA FALSE 0.227 129.000 0.000 NA   NA
 7749606 7749607 CD196_1209 CD196_1210     TRUE 0.999 -13.000 0.333 NA   NA
 7749607 7749608 CD196_1210 CD196_1211     TRUE 0.949 -7.000 0.000 NA   NA
 7749608 7749609 CD196_1211 CD196_1212     TRUE 0.341 102.000 0.000 NA   NA
 7749609 7749610 CD196_1212 CD196_1213     FALSE 0.308 108.000 0.000 NA   NA
 7749610 7749611 CD196_1213 CD196_1214     TRUE 0.919 2.000 0.000 NA   NA
 7749611 7749612 CD196_1214 CD196_1215     TRUE 0.999 2.000 0.490 NA   NA
 7749612 7749613 CD196_1215 CD196_1216     TRUE 0.660 135.000 0.038 NA   NA
 7749615 7749616 CD196_1218 CD196_1219   cspB TRUE 0.654 183.000 0.118 NA   NA
 7749616 7749617 CD196_1219 CD196_1220 cspB   FALSE 0.018 421.000 0.000 1.000   NA
 7749618 7749619 CD196_1221 CD196_1222     TRUE 0.403 91.000 0.000 NA   NA
 7749619 7749620 CD196_1222 CD196_1223     FALSE 0.144 164.000 0.000 NA   NA
 7749620 7749621 CD196_1223 CD196_1224     TRUE 0.448 82.000 0.000 NA   NA
 7749622 7749623 CD196_1225 CD196_1226     FALSE 0.325 105.000 0.000 NA   NA
 7749623 7749624 CD196_1226 CD196_1227     FALSE 0.050 249.000 0.000 NA   NA
 7749624 7749625 CD196_1227 CD196_1228     TRUE 0.900 5.000 0.000 NA   NA
 7749625 7749626 CD196_1228 CD196_1229     TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 7749626 7749627 CD196_1229 CD196_1230     TRUE 0.973 114.000 0.667 NA   NA
 7749627 7749628 CD196_1230 CD196_1231     TRUE 0.998 27.000 0.667 NA   NA
 7749628 7749629 CD196_1231 CD196_1232     TRUE 0.964 -27.000 0.000 NA   NA
 7749629 7749630 CD196_1232 CD196_1233     TRUE 0.933 0.000 0.000 NA   NA
 7749630 7749631 CD196_1233 CD196_1234     TRUE 0.439 282.000 0.182 NA   NA
 7749631 7749632 CD196_1234 CD196_1235     TRUE 0.991 16.000 0.182 NA   NA
 7749632 7749633 CD196_1235 CD196_1236     TRUE 1.000 0.000 1.000 NA   NA
 7749633 7749634 CD196_1236 CD196_1237     TRUE 1.000 -7.000 1.000 NA   NA
 7749634 7749635 CD196_1237 CD196_1238     TRUE 0.997 -3.000 0.167 NA   NA
 7749635 7749636 CD196_1238 CD196_1239     TRUE 0.926 1.000 0.000 NA   NA
 7749636 7749637 CD196_1239 CD196_1240     TRUE 0.851 22.000 0.000 NA   NA
 7749637 7749638 CD196_1240 CD196_1241     FALSE 0.049 251.000 0.000 NA   NA
 7749638 7749639 CD196_1241 CD196_1242     FALSE 0.043 263.000 0.000 NA   NA
 7749640 7749641 CD196_1243 CD196_1244     FALSE 0.060 228.000 0.000 NA   NA
 7749642 7749643 CD196_1245 CD196_1246     TRUE 0.854 20.000 0.000 NA   NA
 7749644 7749645 CD196_1247 CD196_1248     FALSE 0.018 412.000 0.000 1.000   NA
 7749645 7749646 CD196_1248 CD196_1249     TRUE 0.910 2.000 0.000 1.000 N NA
 7749649 7749650 CD196_1252 CD196_1253     TRUE 0.975 29.000 0.053 1.000   NA
 7749650 7749651 CD196_1253 CD196_1254     TRUE 0.997 -16.000 0.137 1.000 N NA
 7749651 7749652 CD196_1254 CD196_1255     TRUE 0.999 30.000 0.780 NA Y NA
 7749654 7749655 CD196_1258 CD196_1259     TRUE 0.974 19.000 0.028 NA   NA
 7749655 7749656 CD196_1259 CD196_1260     TRUE 0.994 13.000 0.250 NA   NA
 7749658 7749659 CD196_1262 CD196_1263     FALSE 0.079 218.000 0.000 1.000   NA
 7749660 7749661 CD196_1264 CD196_1265     TRUE 0.843 24.000 0.000 NA   NA
 7749661 7749662 CD196_1265 CD196_1266     FALSE 0.012 509.000 0.000 NA   NA
 7749662 7749663 CD196_1266 CD196_1267     TRUE 0.346 101.000 0.000 NA   NA
 7749664 7749665 CD196_1268 CD196_1269     TRUE 0.505 71.000 0.000 NA   NA
 7749666 7749667 CD196_1270 CD196_1271   glpQ TRUE 0.775 80.000 0.004 1.000 N NA
 7749668 7749669 CD196_1272 CD196_1273     FALSE 0.021 363.000 0.000 NA   NA
 7749669 7749670 CD196_1273 CD196_1274     TRUE 0.997 -13.000 0.141 NA   NA
 7749671 7749672 CD196_1275 CD196_1276     TRUE 0.830 26.000 0.000 NA   NA
 7749672 7749673 CD196_1276 CD196_1277     TRUE 0.568 59.000 0.000 NA   NA
 7749673 7749674 CD196_1277 CD196_1278   ddl TRUE 0.827 24.000 0.000 1.000 N NA
 7749675 7749676 CD196_1279 CD196_1280     TRUE 0.831 70.000 0.004 1.000   NA
 7749677 7749678 CD196_1281 CD196_1282     TRUE 0.701 200.000 0.222 NA   NA
 7749680 7749681 CD196_1284 CD196_1285     FALSE 0.293 111.000 0.000 NA   NA
 7749682 7749683 CD196_1286 CD196_1287     TRUE 0.526 67.000 0.000 NA   NA
 7749684 7749685 CD196_1288 CD196_1289     FALSE 0.006 3096.000 0.000 1.000 N NA
 7749685 7749686 CD196_1289 CD196_1290     FALSE 0.333 240.000 0.000 0.010 Y NA
 7749686 7749687 CD196_1290 CD196_1291     TRUE 0.971 31.000 0.000 0.010 Y NA
 7749688 7749689 CD196_1292 CD196_1293     FALSE 0.186 145.000 0.000 NA   NA
 7749690 7749691 CD196_1294 CD196_1295     FALSE 0.012 505.000 0.000 NA   NA
 7749691 7749692 CD196_1295 CD196_1296     FALSE 0.077 220.000 0.000 1.000   NA
 7749692 7749693 CD196_1296 CD196_1297     TRUE 0.873 78.000 0.054 NA N NA
 7749694 7749695 CD196_1298 CD196_1299     TRUE 0.349 100.000 0.000 NA   NA
 7749696 7749697 CD196_1300 CD196_1301     TRUE 0.666 43.000 0.000 NA   NA
 7749697 7749698 CD196_1301 CD196_1302     FALSE 0.125 168.000 0.000 1.000 N NA
 7749699 7749700 CD196_1303 CD196_1304     TRUE 0.965 3.000 0.000 0.009   NA
 7749702 7749703 CD196_1306 CD196_1307     TRUE 0.938 166.000 0.667 NA   NA
 7749703 7749704 CD196_1307 CD196_1308     TRUE 0.979 115.000 0.750 1.000   NA
 7749704 7749705 CD196_1308 CD196_1309     TRUE 0.987 65.000 0.500 1.000   NA
 7749705 7749706 CD196_1309 CD196_1310     FALSE 0.247 131.000 0.000 1.000   NA
 7749706 7749707 CD196_1310 CD196_1311     FALSE 0.130 182.000 0.000 1.000   NA
 7749707 7749708 CD196_1311 CD196_1312     TRUE 1.000 -7.000 0.869 1.000   NA
 7749708 7749709 CD196_1312 CD196_1313     FALSE 0.011 520.000 0.000 NA   NA
 7749709 7749710 CD196_1313 CD196_1314     FALSE 0.053 242.000 0.000 NA   NA
 7749710 7749711 CD196_1314 CD196_1315     FALSE 0.256 119.000 0.000 NA   NA
 7749711 7749712 CD196_1315 CD196_1316     TRUE 0.817 28.000 0.000 NA   NA
 7749712 7749713 CD196_1316 CD196_1317   pabA TRUE 0.827 24.000 0.000 1.000 N NA
 7749713 7749714 CD196_1317 CD196_1318 pabA pabB TRUE 0.996 2.000 0.032 1.000 Y NA
 7749714 7749715 CD196_1318 CD196_1319 pabB pabC TRUE 0.997 -10.000 0.008 1.000 Y NA
 7749715 7749716 CD196_1319 CD196_1320 pabC   TRUE 0.939 34.000 0.008 NA   NA
 7749716 7749717 CD196_1320 CD196_1321   folE TRUE 0.968 26.000 0.024 NA   NA
 7749717 7749718 CD196_1321 CD196_1322 folE folP TRUE 0.957 54.000 0.009 1.000 Y NA
 7749718 7749719 CD196_1322 CD196_1323 folP folB TRUE 0.992 11.000 0.024 1.000 Y NA
 7749719 7749720 CD196_1323 CD196_1324 folB folK TRUE 0.999 -7.000 0.142 1.000 Y NA
 7749720 7749721 CD196_1324 CD196_1325 folK   TRUE 0.990 -19.000 0.003 1.000 N NA
 7749721 7749722 CD196_1325 CD196_1326   dnaG FALSE 0.062 219.000 0.000 1.000 N NA
 7749722 7749723 CD196_1326 CD196_1327 dnaG rpoD1 TRUE 0.992 18.000 0.209 1.000 N NA
 7749723 7749724 CD196_1327 CD196_1328 rpoD1   TRUE 0.856 147.000 0.239 NA   NA
 7749724 7749725 CD196_1328 CD196_1329     TRUE 0.994 14.000 0.283 NA   NA
 7749725 7749726 CD196_1329 CD196_1330   wrbA TRUE 0.568 59.000 0.000 NA   NA
 7749727 7749728 CD196_1331 CD196_1332     FALSE 0.020 386.000 0.000 1.000   NA
 7749728 7749729 CD196_1332 CD196_1333     FALSE 0.325 105.000 0.000 NA   NA
 7749729 7749730 CD196_1333 CD196_1334     TRUE 0.996 -7.000 0.105 NA   NA
 7749731 7749732 CD196_1335 CD196_1336     FALSE 0.042 264.000 0.000 NA   NA
 7749732 7749733 CD196_1336 CD196_1337     TRUE 0.999 -22.000 0.182 1.000 Y NA
 7749733 7749734 CD196_1337 CD196_1338     TRUE 0.426 80.000 0.000 1.000 N NA
 7749734 7749735 CD196_1338 CD196_1339     TRUE 1.000 1.000 0.750 1.000 Y NA
 7749735 7749736 CD196_1339 CD196_1340     FALSE 0.060 221.000 0.000 1.000 N NA
 7749740 7749741 CD196_1344 CD196_1345     TRUE 1.000 13.000 0.600 0.004 Y NA
 7749741 7749742 CD196_1345 CD196_1346     FALSE 0.239 118.000 0.000 1.000 N NA
 7749742 7749743 CD196_1346 CD196_1347     FALSE 0.010 552.000 0.000 NA   NA
 7749743 7749744 CD196_1347 CD196_1348     FALSE 0.252 120.000 0.000 NA   NA
 7749744 7749745 CD196_1348 CD196_1349     FALSE 0.013 524.000 0.000 1.000   NA
 7749745 7749746 CD196_1349 CD196_1350   feoA1 TRUE 0.999 13.000 0.791 0.006   NA
 7749746 7749747 CD196_1350 CD196_1351 feoA1 feoB1 TRUE 0.997 85.000 0.871 1.000 Y NA
 7749747 7749748 CD196_1351 CD196_1352 feoB1   TRUE 0.854 20.000 0.000 NA   NA
 7749748 7749749 CD196_1352 CD196_1353     FALSE 0.118 180.000 0.000 NA   NA
 7749749 7749750 CD196_1353 CD196_1354   ssuC TRUE 0.435 85.000 0.000 NA   NA
 7749750 7749751 CD196_1354 CD196_1355 ssuC ssuB TRUE 0.999 -7.000 0.111 1.000 Y NA
 7749751 7749752 CD196_1355 CD196_1356 ssuB ssuA TRUE 0.992 34.000 0.100 1.000 Y NA
 7749756 7749757 CD196_1360 CD196_1361     FALSE 0.009 639.000 0.000 NA   NA
 7749757 7749758 CD196_1361 CD196_1362   metN FALSE 0.009 647.000 0.000 NA   NA
 7749758 7749759 CD196_1362 CD196_1363 metN metI TRUE 0.999 -7.000 0.178 1.000 Y NA
 7749759 7749760 CD196_1363 CD196_1364 metI metQ TRUE 0.927 36.000 0.000 NA Y NA
 7749760 7749761 CD196_1364 CD196_1365 metQ   FALSE 0.141 148.000 0.000 NA N NA
 7749761 7749762 CD196_1365 CD196_1366     FALSE 0.280 109.000 0.000 1.000 N NA
 7749762 7749763 CD196_1366 CD196_1367     FALSE 0.007 880.000 0.000 1.000 N NA
 7749763 7749764 CD196_1367 CD196_1368   proC1 TRUE 0.665 40.000 0.000 1.000 N NA
 7749766 7749767 CD196_1370 CD196_1371   rpoD2 FALSE 0.040 270.000 0.000 NA   NA
 7749767 7749768 CD196_1371 CD196_1372 rpoD2   FALSE 0.015 474.000 0.000 1.000   NA
 7749768 7749769 CD196_1372 CD196_1373   deoC TRUE 0.761 36.000 0.000 1.000   NA
 7749769 7749770 CD196_1373 CD196_1374 deoC   FALSE 0.101 183.000 0.000 1.000 N NA
 7749770 7749771 CD196_1374 CD196_1375     TRUE 0.996 4.000 0.273 1.000 N NA
 7749771 7749772 CD196_1375 CD196_1376     TRUE 0.996 1.000 0.182 NA   NA
 7749774 7749775 CD196_1378 CD196_1379     TRUE 0.998 -7.000 0.250 NA   NA
 7749775 7749776 CD196_1379 CD196_1380     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7749776 7749777 CD196_1380 CD196_1381     TRUE 0.900 5.000 0.000 NA   NA
 7749778 7749779 CD196_1382 CD196_1383     FALSE 0.017 390.000 0.000 NA   NA
 7749779 7749780 CD196_1383 CD196_1384   panC FALSE 0.007 1425.000 0.000 NA   NA
 7749780 7749781 CD196_1384 CD196_1385 panC panB TRUE 0.999 19.000 0.395 0.001 Y NA
 7749781 7749782 CD196_1385 CD196_1386 panB   TRUE 0.996 -25.000 0.055 1.000   NA
 7749783 7749784 CD196_1387 CD196_1388     FALSE 0.046 1613.000 0.000 0.087 Y NA
 7749785 7749786 CD196_1389 CD196_1390 feoB2 feoA2 TRUE 0.997 26.000 0.267 1.000 Y NA
 7749786 7749787 CD196_1390 CD196_1391 feoA2   FALSE 0.029 327.000 0.000 1.000   NA
 7749788 7749789 CD196_1392 CD196_1393   tyrR FALSE 0.013 476.000 0.000 NA   NA
 7749791 7749792 CD196_1395 CD196_1396     FALSE 0.075 223.000 0.000 1.000   NA
 7749792 7749793 CD196_1396 CD196_1397     TRUE 0.403 91.000 0.000 NA   NA
 7749793 7749794 CD196_1397 CD196_1398   pyrC TRUE 0.601 53.000 0.000 NA   NA
 7749795 7749796 CD196_1399 CD196_1400     TRUE 0.996 3.000 0.044 1.000 Y NA
 7749796 7749797 CD196_1400 CD196_1401     TRUE 0.983 8.000 0.044 NA N NA
 7749797 7749798 CD196_1401 CD196_1402     FALSE 0.235 112.000 0.000 NA N NA
 7749798 7749799 CD196_1402 CD196_1403     TRUE 0.964 24.000 0.000 1.000 Y NA
 7749800 7749801 CD196_1404 CD196_1405     TRUE 0.963 -13.000 0.000 1.000   NA
 7749801 7749802 CD196_1405 CD196_1406     FALSE 0.073 225.000 0.000 1.000   NA
 7749804 7749805 CD196_1408 CD196_1409   aspB TRUE 0.963 0.000 0.000 0.040 N NA
 7749805 7749806 CD196_1409 CD196_1410 aspB   FALSE 0.018 366.000 0.000 1.000 N NA
 7749806 7749807 CD196_1410 CD196_1411     TRUE 0.439 78.000 0.000 1.000 N NA
 7749807 7749808 CD196_1411 CD196_1412     TRUE 0.942 0.000 0.000 1.000   NA
 7749808 7749809 CD196_1412 CD196_1413     TRUE 0.421 119.000 0.000 0.080   NA
 7749809 7749810 CD196_1413 CD196_1414     TRUE 0.349 106.000 0.000 1.000   NA
 7749810 7749811 CD196_1414 CD196_1415     FALSE 0.014 489.000 0.000 1.000   NA
 7749811 7749812 CD196_1415 CD196_1416     TRUE 0.479 76.000 0.000 NA   NA
 7749814 7749815 CD196_1418 CD196_1419   hisZ FALSE 0.009 862.000 0.000 1.000   NA
 7749815 7749816 CD196_1419 CD196_1420 hisZ hisG TRUE 0.998 22.000 0.239 1.000 Y NA
 7749816 7749817 CD196_1420 CD196_1421 hisG hisC TRUE 0.988 34.000 0.007 0.004 Y NA
 7749817 7749818 CD196_1421 CD196_1422 hisC hisB TRUE 0.999 3.000 0.341 0.004 Y NA
 7749818 7749819 CD196_1422 CD196_1423 hisB hisH TRUE 0.999 2.000 0.125 0.004 Y NA
 7749819 7749820 CD196_1423 CD196_1424 hisH hisA TRUE 0.999 -3.000 0.124 0.004 Y NA
 7749820 7749821 CD196_1424 CD196_1425 hisA hisF TRUE 1.000 -18.000 0.433 0.004 Y NA
 7749821 7749822 CD196_1425 CD196_1426 hisF hisI TRUE 0.999 28.000 0.430 0.004 Y NA
 7749822 7749823 CD196_1426 CD196_1427 hisI   FALSE 0.040 786.000 0.000 1.000 Y NA
 7749823 7749824 CD196_1427 CD196_1428     FALSE 0.008 754.000 0.000 1.000 N NA
 7749824 7749825 CD196_1428 CD196_1429     TRUE 0.954 93.000 0.300 1.000 N NA
 7749825 7749826 CD196_1429 CD196_1430   sigV TRUE 0.580 52.000 0.000 1.000 N NA
 7749826 7749827 CD196_1430 CD196_1431 sigV   TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 7749827 7749828 CD196_1431 CD196_1432     TRUE 0.666 43.000 0.000 NA   NA
 7749828 7749829 CD196_1432 CD196_1433     TRUE 0.675 42.000 0.000 NA   NA
 7749829 7749830 CD196_1433 CD196_1434     TRUE 0.900 5.000 0.000 NA   NA
 7749830 7749831 CD196_1434 CD196_1435     FALSE 0.011 531.000 0.000 NA   NA
 7749831 7749832 CD196_1435 CD196_1436   ilvC FALSE 0.040 270.000 0.000 NA   NA
 7749832 7749833 CD196_1436 CD196_1437 ilvC ilvB TRUE 0.976 53.000 0.006 0.001 Y NA
 7749834 7749835 CD196_1438 CD196_1439     TRUE 0.460 79.000 0.000 NA   NA
 7749835 7749836 CD196_1439 CD196_1440     TRUE 0.996 13.000 0.357 NA   NA
 7749836 7749837 CD196_1440 CD196_1441     FALSE 0.010 620.000 0.000 NA   NA
 7749838 7749839 CD196_1442 CD196_1443     TRUE 0.896 6.000 0.000 NA   NA
 7749839 7749840 CD196_1443 CD196_1444     TRUE 0.964 -28.000 0.000 NA   NA
 7749840 7749841 CD196_1444 CD196_1445     FALSE 0.007 1073.000 0.000 NA   NA
 7749841 7749842 CD196_1445 CD196_1446     TRUE 0.991 12.000 0.143 NA   NA
 7749842 7749843 CD196_1446 CD196_1447     FALSE 0.016 403.000 0.000 NA   NA
 7749843 7749844 CD196_1447 CD196_1448     TRUE 0.847 23.000 0.000 NA   NA
 7749844 7749845 CD196_1448 CD196_1449     TRUE 0.997 0.000 0.250 NA   NA
 7749845 7749846 CD196_1449 CD196_1450     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 7749846 7749847 CD196_1450 CD196_1451     FALSE 0.010 557.000 0.000 NA   NA
 7749847 7749848 CD196_1451 CD196_1452     FALSE 0.182 154.000 0.000 1.000   NA
 7749848 7749849 CD196_1452 CD196_1453     FALSE 0.036 283.000 0.000 NA   NA
 7749849 7749850 CD196_1453 CD196_1454     FALSE 0.033 292.000 0.000 NA   NA
 7749850 7749851 CD196_1454 CD196_1455     TRUE 0.999 21.000 1.000 NA   NA
 7749851 7749852 CD196_1455 CD196_1456     TRUE 0.509 70.000 0.000 NA   NA
 7749852 7749853 CD196_1456 CD196_1457     TRUE 0.967 -22.000 0.000 1.000   NA
 7749853 7749854 CD196_1457 CD196_1458     TRUE 0.896 6.000 0.000 NA   NA
 7749854 7749855 CD196_1458 CD196_1459     TRUE 0.955 -10.000 0.000 NA   NA
 7749855 7749856 CD196_1459 CD196_1460     FALSE 0.027 318.000 0.000 NA   NA
 7749856 7749857 CD196_1460 CD196_1461     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 7749857 7749858 CD196_1461 CD196_1462     FALSE 0.048 253.000 0.000 NA   NA
 7749858 7749859 CD196_1462 CD196_1463     TRUE 0.998 -6.000 0.250 NA   NA
 7749859 7749860 CD196_1463 CD196_1464     FALSE 0.019 379.000 0.000 NA   NA
 7749860 7749861 CD196_1464 CD196_1465     FALSE 0.022 349.000 0.000 NA   NA
 7749861 7749862 CD196_1465 CD196_1466     FALSE 0.136 170.000 0.000 NA   NA
 7749862 7749863 CD196_1466 CD196_1467     TRUE 0.844 17.000 0.000 NA   NA
 7749863 7749864 CD196_1467 CD196_1468     TRUE 0.568 59.000 0.000 NA   NA
 7749864 7749865 CD196_1468 CD196_1469     TRUE 0.500 72.000 0.000 NA   NA
 7749865 7749866 CD196_1469 CD196_1470     FALSE 0.023 341.000 0.000 NA   NA
 7749866 7749867 CD196_1470 CD196_1471     FALSE 0.007 1644.000 0.000 NA   NA
 11536466 7749856   CD196_1460     FALSE NA 8507.000 0.000 NA   NA
 11678829 7749856   CD196_1460     FALSE NA 8507.000 0.000 NA   NA
 11821221 7749856   CD196_1460     FALSE NA 8507.000 0.000 NA   NA
 11536467 7749856   CD196_1460     FALSE NA 8536.000 0.000 NA   NA
 11678830 7749856   CD196_1460     FALSE NA 8536.000 0.000 NA   NA
 11821222 7749856   CD196_1460     FALSE NA 8536.000 0.000 NA   NA
 11536468 7749856   CD196_1460     FALSE NA 8572.000 0.000 NA   NA
 11678831 7749856   CD196_1460     FALSE NA 8572.000 0.000 NA   NA
 11821223 7749856   CD196_1460     FALSE NA 8572.000 0.000 NA   NA
 11536469 7749856   CD196_1460     FALSE NA 8601.000 0.000 NA   NA
 11678832 7749856   CD196_1460     FALSE NA 8601.000 0.000 NA   NA
 11821224 7749856   CD196_1460     FALSE NA 8601.000 0.000 NA   NA
 11536470 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2474.000 0.000 NA   NA
 11678833 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2474.000 0.000 NA   NA
 11821225 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2474.000 0.000 NA   NA
 11536471 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2437.000 0.000 NA   NA
 11678834 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2437.000 0.000 NA   NA
 11821226 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2437.000 0.000 NA   NA
 11536472 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2408.000 0.000 NA   NA
 11678835 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2408.000 0.000 NA   NA
 11821227 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2408.000 0.000 NA   NA
 11536473 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2372.000 0.000 NA   NA
 11678836 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2372.000 0.000 NA   NA
 11821228 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2372.000 0.000 NA   NA
 11536474 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2343.000 0.000 NA   NA
 11678837 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2343.000 0.000 NA   NA
 11821229 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2343.000 0.000 NA   NA
 11536475 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2306.000 0.000 NA   NA
 11678838 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2306.000 0.000 NA   NA
 11821230 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2306.000 0.000 NA   NA
 11536476 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2277.000 0.000 NA   NA
 11678839 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2277.000 0.000 NA   NA
 11821231 7749868   CD196_1472     FALSE NA 2277.000 0.000 NA   NA
 7749867 7749868 CD196_1471 CD196_1472     FALSE 0.008 865.000 0.000 NA   NA
 11536477 7749868   CD196_1472     FALSE NA 385.000 0.000 NA   NA
 11678840 7749868   CD196_1472     FALSE NA 385.000 0.000 NA   NA
 11821232 7749868   CD196_1472     FALSE NA 385.000 0.000 NA   NA
 11536478 7749868   CD196_1472     FALSE NA 347.000 0.000 NA   NA
 11678841 7749868   CD196_1472     FALSE NA 347.000 0.000 NA   NA
 11821233 7749868   CD196_1472     FALSE NA 347.000 0.000 NA   NA
 11536479 7749868   CD196_1472     FALSE NA 319.000 0.000 NA   NA
 11678842 7749868   CD196_1472     FALSE NA 319.000 0.000 NA   NA
 11821234 7749868   CD196_1472     FALSE NA 319.000 0.000 NA   NA
 11536480 7749868   CD196_1472     FALSE NA 282.000 0.000 NA   NA
 11678843 7749868   CD196_1472     FALSE NA 282.000 0.000 NA   NA
 11821235 7749868   CD196_1472     FALSE NA 282.000 0.000 NA   NA
 11536481 7749868   CD196_1472     FALSE NA 254.000 0.000 NA   NA
 11678844 7749868   CD196_1472     FALSE NA 254.000 0.000 NA   NA
 11821236 7749868   CD196_1472     FALSE NA 254.000 0.000 NA   NA
 11536482 7749868   CD196_1472     FALSE NA 215.000 0.000 NA   NA
 11678845 7749868   CD196_1472     FALSE NA 215.000 0.000 NA   NA
 11821237 7749868   CD196_1472     FALSE NA 215.000 0.000 NA   NA
 11536483 7749868   CD196_1472     FALSE NA 187.000 0.000 NA   NA
 11678846 7749868   CD196_1472     FALSE NA 187.000 0.000 NA   NA
 11821238 7749868   CD196_1472     FALSE NA 187.000 0.000 NA   NA
 11536484 7749868   CD196_1472     FALSE NA 152.000 0.000 NA   NA
 11678847 7749868   CD196_1472     FALSE NA 152.000 0.000 NA   NA
 11821239 7749868   CD196_1472     FALSE NA 152.000 0.000 NA   NA
 11536485 7749868   CD196_1472     FALSE NA 123.000 0.000 NA   NA
 11678848 7749868   CD196_1472     FALSE NA 123.000 0.000 NA   NA
 11821240 7749868   CD196_1472     FALSE NA 123.000 0.000 NA   NA
 7749868 7749869 CD196_1472 CD196_1473     FALSE 0.203 138.000 0.000 NA   NA
 7749869 7749870 CD196_1473 CD196_1474     TRUE 0.532 66.000 0.000 NA   NA
 7749870 7749871 CD196_1474 CD196_1475     TRUE 0.990 17.000 0.154 NA   NA
 7749871 7749872 CD196_1475 CD196_1476     TRUE 0.891 8.000 0.000 NA   NA
 7749872 7749873 CD196_1476 CD196_1477     TRUE 0.851 14.000 0.000 NA   NA
 7749873 7749874 CD196_1477 CD196_1478     TRUE 0.997 5.000 0.320 NA   NA
 7749874 7749875 CD196_1478 CD196_1479     TRUE 0.998 13.000 0.720 NA   NA
 7749875 7749876 CD196_1479 CD196_1480     TRUE 0.999 -7.000 0.708 NA   NA
 7749876 7749877 CD196_1480 CD196_1481     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 7749877 7749878 CD196_1481 CD196_1482     TRUE 0.844 17.000 0.000 NA   NA
 7749878 7749879 CD196_1482 CD196_1483     TRUE 0.845 15.000 0.000 NA   NA
 7749879 7749880 CD196_1483 CD196_1484     TRUE 0.933 0.000 0.000 NA   NA
 7749880 7749881 CD196_1484 CD196_1485     TRUE 0.759 34.000 0.000 NA   NA
 7749881 7749882 CD196_1485 CD196_1486     FALSE 0.026 325.000 0.000 NA   NA
 7749882 7749883 CD196_1486 CD196_1487     FALSE 0.044 261.000 0.000 NA   NA
 7749883 7749884 CD196_1487 CD196_1488     TRUE 0.391 79.000 0.000 NA N NA
 7749884 7749885 CD196_1488 CD196_1489     TRUE 0.421 94.000 0.000 1.000   NA
 7749885 7749886 CD196_1489 CD196_1490     FALSE 0.009 921.000 0.000 1.000   NA
 7749886 7749887 CD196_1490 CD196_1491     FALSE 0.117 174.000 0.000 1.000 N NA
 7749889 7749890 CD196_1493 CD196_1494     TRUE 0.965 -1281.000 0.000 NA   NA
 7749890 7749891 CD196_1494 CD196_1495     FALSE 0.006 991.000 0.000 NA N NA
 7749893 7749894 CD196_1497 CD196_1498     FALSE 0.328 110.000 0.000 1.000   NA
 7749894 7749895 CD196_1498 CD196_1499   pgm1 TRUE 0.855 12.000 0.000 1.000 N NA
 7749895 7749896 CD196_1499 CD196_1500 pgm1   FALSE 0.084 214.000 0.000 1.000   NA
 7749896 7749897 CD196_1500 CD196_1501     FALSE 0.013 517.000 0.000 1.000   NA
 7749897 7749898 CD196_1501 CD196_1502   hom2 FALSE 0.008 709.000 0.000 1.000 N NA
 7749898 7749899 CD196_1502 CD196_1503 hom2   FALSE 0.280 114.000 0.000 NA   NA
 7749899 7749900 CD196_1503 CD196_1504   hisD FALSE 0.042 265.000 0.000 NA   NA
 7749901 7749902 CD196_1505 CD196_1506     FALSE 0.261 118.000 0.000 NA   NA
 7749903 7749904 CD196_1507 CD196_1508     TRUE 0.999 2.000 0.333 NA Y NA
 7749904 7749905 CD196_1508 CD196_1509     TRUE 0.999 -7.000 0.333 NA   NA
 7749905 7749906 CD196_1509 CD196_1510     TRUE 0.998 31.000 0.750 NA   NA
 7749906 7749907 CD196_1510 CD196_1511     TRUE 0.999 23.000 0.750 1.000 Y NA
 7749907 7749908 CD196_1511 CD196_1512     TRUE 0.999 21.000 0.750 NA Y NA
 7749908 7749909 CD196_1512 CD196_1513     FALSE 0.020 372.000 0.000 NA   NA
 7749909 7749910 CD196_1513 CD196_1514   kdpA FALSE 0.010 550.000 0.000 NA   NA
 7749910 7749911 CD196_1514 CD196_1515 kdpA kdpB TRUE 0.998 25.000 0.201 0.001 Y NA
 7749911 7749912 CD196_1515 CD196_1516 kdpB kdpC TRUE 1.000 4.000 0.877 0.001 Y NA
 7749912 7749913 CD196_1516 CD196_1517 kdpC cysM FALSE 0.050 237.000 0.000 1.000 N NA
 7749913 7749914 CD196_1517 CD196_1518 cysM cysA TRUE 0.997 18.000 0.065 0.001 Y NA
 7749915 7749916 CD196_1519 CD196_1520 map2   FALSE 0.090 197.000 0.000 NA   NA
 7749917 7749918 CD196_1521 CD196_1522   thiD FALSE 0.031 285.000 0.000 1.000 N NA
 7749918 7749919 CD196_1522 CD196_1523 thiD thiK TRUE 0.995 24.000 0.039 0.005 Y NA
 7749919 7749920 CD196_1523 CD196_1524 thiK thiE1 TRUE 0.998 23.000 0.190 0.005 Y NA
 7749920 7749921 CD196_1524 CD196_1525 thiE1   FALSE 0.184 139.000 0.000 1.000 N NA
 7749922 7749923 CD196_1526 CD196_1527     TRUE 0.999 -12.000 0.321 1.000 N NA
 7749923 7749924 CD196_1527 CD196_1528     TRUE 0.992 4.000 0.107 NA   NA
 7749925 7749926 CD196_1529 CD196_1530     TRUE 0.983 54.000 0.348 1.000 N NA
 7749926 7749927 CD196_1530 CD196_1531     TRUE 0.949 -7.000 0.000 NA   NA
 7749927 7749928 CD196_1531 CD196_1532     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 7749928 7749929 CD196_1532 CD196_1533     TRUE 0.887 9.000 0.000 NA   NA
 7749929 7749930 CD196_1533 CD196_1534     TRUE 0.876 11.000 0.000 NA   NA
 7749930 7749931 CD196_1534 CD196_1535     FALSE 0.020 366.000 0.000 NA   NA
 7749933 7749934 CD196_1537 CD196_1538     TRUE 0.999 1.000 0.448 NA Y NA
 7749934 7749935 CD196_1538 CD196_1539     FALSE 0.007 682.000 0.000 NA N NA
 7749935 7749936 CD196_1539 CD196_1540     FALSE 0.113 176.000 0.000 1.000 N NA
 7749936 7749937 CD196_1540 CD196_1541     TRUE 0.998 2.000 0.412 1.000 N NA
 7749937 7749938 CD196_1541 CD196_1542     TRUE 0.999 -6.000 0.471 NA   NA
 7749938 7749939 CD196_1542 CD196_1543     FALSE 0.067 222.000 0.000 NA   NA
 7749939 7749940 CD196_1543 CD196_1544     FALSE 0.076 191.000 0.000 NA N NA
 7749940 7749941 CD196_1544 CD196_1545     FALSE 0.024 362.000 0.000 1.000   NA
 7749941 7749942 CD196_1545 CD196_1546     TRUE 0.339 108.000 0.000 1.000   NA
 7749942 7749943 CD196_1546 CD196_1547   vanR FALSE 0.013 434.000 0.000 1.000 N NA
 7749943 7749944 CD196_1547 CD196_1548 vanR vanS TRUE 0.991 50.000 0.231 1.000 Y NA
 7749944 7749945 CD196_1548 CD196_1549 vanS vanG FALSE 0.039 261.000 0.000 1.000 N NA
 7749945 7749946 CD196_1549 CD196_1550 vanG   TRUE 0.996 0.000 0.015 1.000 Y NA
 7749946 7749947 CD196_1550 CD196_1551   vanTG TRUE 0.997 18.000 0.174 1.000 Y NA
 7749947 7749948 CD196_1551 CD196_1552 vanTG   FALSE 0.028 314.000 0.000 NA   NA
 7749949 7749950 CD196_1553 CD196_1554   sodA TRUE 0.454 80.000 0.000 NA   NA
 7749953 7749954 CD196_1557 CD196_1558     TRUE 0.957 39.000 0.000 0.002 Y NA
 7749954 7749955 CD196_1558 CD196_1559     TRUE 0.965 86.000 0.036 0.002 Y NA
 7749955 7749956 CD196_1559 CD196_1560     TRUE 0.994 -16.000 0.036 1.000 N NA
 7749956 7749957 CD196_1560 CD196_1561     TRUE 0.979 87.000 0.500 NA   NA
 7749957 7749958 CD196_1561 CD196_1562     TRUE 0.999 1.000 0.667 NA   NA
 7749958 7749959 CD196_1562 CD196_1563     TRUE 0.868 64.000 0.026 NA N NA
 7749959 7749960 CD196_1563 CD196_1564