MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus gallolyticus UCN34

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10394622 10394623 GALLO_0001 GALLO_0002 dnaA dnaN TRUE 0.601 158.000 0.328 1.000 Y NA
 10394623 10394624 GALLO_0002 GALLO_0003 dnaN   FALSE 0.053 131.000 0.003 1.000 N NA
 10394624 10394625 GALLO_0003 GALLO_0004     TRUE 0.868 12.000 0.015 NA   NA
 10394625 10394626 GALLO_0004 GALLO_0005     FALSE 0.275 134.000 0.064 NA   NA
 10394626 10394627 GALLO_0005 GALLO_0006   pth TRUE 0.826 78.000 0.184 1.000 Y NA
 10394627 10394628 GALLO_0006 GALLO_0007 pth mfd TRUE 0.916 5.000 0.137 1.000 N NA
 10394628 10394629 GALLO_0007 GALLO_0008 mfd   FALSE 0.335 125.000 0.000 1.000 Y NA
 10394629 10394630 GALLO_0008 GALLO_0009     FALSE 0.026 139.000 0.000 1.000 N NA
 10394630 10394631 GALLO_0009 GALLO_0010   divIC TRUE 0.929 -13.000 0.053 1.000 N NA
 10394631 10394632 GALLO_0010 GALLO_0011 divIC   TRUE 0.883 2.000 0.000 NA   NA
 10394632 10394633 GALLO_0011 GALLO_0012     TRUE 0.767 16.000 0.000 NA   NA
 10394633 10394634 GALLO_0012 GALLO_0013     TRUE 0.760 5.000 0.014 1.000 N NA
 10394634 10394635 GALLO_0013 GALLO_0014   hprT TRUE 0.953 5.000 0.067 0.063 N NA
 10394635 10394636 GALLO_0014 GALLO_0015 hprT ftsH TRUE 0.854 22.000 0.192 1.000 N NA
 10394638 10394639 GALLO_r0001 GALLO_t0001 rRNA-16s   TRUE 0.447 63.000 0.000 NA   NA
 10394639 10394640 GALLO_t0001 GALLO_r0002   rRNA-23s FALSE 0.105 147.000 0.000 NA   NA
 10394640 10394641 GALLO_r0002 GALLO_r0003 rRNA-23s rRNA-5s FALSE 0.267 86.000 0.000 NA   NA
 10394641 10394642 GALLO_r0003 GALLO_t0002 rRNA-5s   TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 10394642 10394643 GALLO_t0002 GALLO_t0003     TRUE 0.702 23.000 0.000 NA   NA
 10394643 10394644 GALLO_t0003 GALLO_t0004     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 10394644 10394645 GALLO_t0004 GALLO_t0005     TRUE 0.824 10.000 0.000 NA   NA
 10394645 10394646 GALLO_t0005 GALLO_t0006     TRUE 0.778 15.000 0.000 NA   NA
 10394646 10394647 GALLO_t0006 GALLO_t0007     TRUE 0.767 16.000 0.000 NA   NA
 10394647 10394648 GALLO_t0007 GALLO_t0008     TRUE 0.838 8.000 0.000 NA   NA
 10394648 10394649 GALLO_t0008 GALLO_t0009     TRUE 0.756 17.000 0.000 NA   NA
 10394649 10394650 GALLO_t0009 GALLO_t0010     TRUE 0.848 6.000 0.000 NA   NA
 10394650 10394651 GALLO_t0010 GALLO_t0011     TRUE 0.848 6.000 0.000 NA   NA
 10394651 10394652 GALLO_t0011 GALLO_t0012     TRUE 0.710 22.000 0.000 NA   NA
 10394652 10394653 GALLO_t0012 GALLO_t0013     TRUE 0.695 24.000 0.000 NA   NA
 10394653 10394654 GALLO_t0013 GALLO_t0014     TRUE 0.786 14.000 0.000 NA   NA
 10394654 10394655 GALLO_t0014 GALLO_t0015     TRUE 0.848 6.000 0.000 NA   NA
 10394655 10394656 GALLO_t0015 GALLO_t0016     TRUE 0.756 17.000 0.000 NA   NA
 10394656 10394657 GALLO_t0016 GALLO_t0017     TRUE 0.636 33.000 0.000 NA   NA
 10394657 10394658 GALLO_t0017 GALLO_t0018     TRUE 0.813 11.000 0.000 NA   NA
 10394658 10394659 GALLO_t0018 GALLO_0017   mreC FALSE 0.349 75.000 0.000 NA   NA
 10394659 10394660 GALLO_0017 GALLO_0018 mreC mreD TRUE 0.996 2.000 0.550 0.004   NA
 10394660 10394661 GALLO_0018 GALLO_0019 mreD   FALSE 0.302 102.000 0.021 NA   NA
 10394661 10394662 GALLO_0019 GALLO_0020   prs FALSE 0.290 143.000 0.107 NA   NA
 10394662 10394663 GALLO_0020 GALLO_0021 prs   FALSE 0.240 203.000 0.048 1.000 Y NA
 10394663 10394664 GALLO_0021 GALLO_0022   recO TRUE 0.868 -10.000 0.012 1.000 N NA
 10394664 10394665 GALLO_0022 GALLO_0023 recO plsX FALSE 0.040 172.000 0.011 1.000 N NA
 10394665 10394666 GALLO_0023 GALLO_0024 plsX   TRUE 0.979 17.000 0.017 0.008 Y NA
 10394666 10394667 GALLO_0024 GALLO_0025   purC FALSE 0.093 125.000 0.017 1.000 N NA
 10394667 10394668 GALLO_0025 GALLO_0026 purC purL TRUE 0.852 52.000 0.043 1.000 Y NA
 10394668 10394669 GALLO_0026 GALLO_0027 purL purF FALSE 0.288 169.000 0.024 1.000 Y NA
 10394669 10394670 GALLO_0027 GALLO_0028 purF purM TRUE 0.940 45.000 0.248 1.000 Y NA
 10394670 10394671 GALLO_0028 GALLO_0029 purM purN TRUE 0.998 0.000 0.238 0.003 Y NA
 10394671 10394672 GALLO_0029 GALLO_0030 purN   FALSE 0.186 108.000 0.003 1.000   NA
 10394672 10394673 GALLO_0030 GALLO_0031   purD TRUE 0.502 58.000 0.002 1.000   NA
 10394673 10394674 GALLO_0031 GALLO_0032 purD purD FALSE 0.143 1006.000 0.238 1.000 Y NA
 10394674 10394675 GALLO_0032 GALLO_0033 purD   TRUE 0.929 -10.000 0.000 NA   NA
 10394675 10394676 GALLO_0033 GALLO_0034   purE TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 10394676 10394677 GALLO_0034 GALLO_0035 purE purK TRUE 0.996 -13.000 0.008 0.001 Y NA
 10394677 10394678 GALLO_0035 GALLO_0036 purK   TRUE 0.928 -28.000 0.000 NA   NA
 10394678 10394679 GALLO_0036 GALLO_0037   purB FALSE 0.028 302.000 0.000 NA   NA
 10394679 10394680 GALLO_0037 GALLO_0038 purB   FALSE 0.114 147.000 0.005 1.000   NA
 10394680 10394681 GALLO_0038 GALLO_0039     FALSE 0.011 1242.000 0.000 1.000   NA
 10394681 10394682 GALLO_0039 GALLO_0040     TRUE 0.818 20.000 0.019 NA   NA
 10394682 10394683 GALLO_0040 GALLO_0041     TRUE 0.989 -3.000 0.351 NA   NA
 10394683 10394684 GALLO_0041 GALLO_0042   thrC FALSE 0.004 369.000 0.000 1.000 N NA
 10394684 10394685 GALLO_0042 GALLO_0043 thrC   FALSE 0.148 60.000 0.000 1.000 N NA
 10394685 10394686 GALLO_0043 GALLO_0044     FALSE 0.120 127.000 0.000 1.000   NA
 10394686 10394687 GALLO_0044 GALLO_0045     TRUE 0.954 44.000 0.400 0.075   NA
 10394687 10394688 GALLO_0045 GALLO_0046     TRUE 0.990 0.000 0.000 0.014 Y NA
 10394688 10394689 GALLO_0046 GALLO_0047     TRUE 0.804 73.000 0.000 0.068 Y NA
 10394689 10394690 GALLO_0047 GALLO_0048     FALSE 0.152 121.000 0.000 NA   NA
 10394690 10394691 GALLO_0048 GALLO_0049   rpsJ FALSE 0.025 331.000 0.000 NA   NA
 10394691 10394692 GALLO_0049 GALLO_0050 rpsJ rplC TRUE 0.903 110.000 0.467 0.037 Y NA
 10394692 10394693 GALLO_0050 GALLO_0051 rplC rplD TRUE 0.992 24.000 0.544 0.028 Y NA
 10394693 10394694 GALLO_0051 GALLO_0052 rplD rplW TRUE 0.997 0.000 0.307 0.028 Y NA
 10394694 10394695 GALLO_0052 GALLO_0053 rplW rlbB TRUE 0.996 18.000 0.849 0.033 Y NA
 10394695 10394696 GALLO_0053 GALLO_0054 rlbB rpsS TRUE 0.953 98.000 0.820 0.037 Y NA
 10394696 10394697 GALLO_0054 GALLO_0055 rpsS rplV TRUE 0.996 16.000 0.769 0.037 Y NA
 10394697 10394698 GALLO_0055 GALLO_0056 rplV rspC TRUE 0.996 13.000 0.719 0.037 Y NA
 10394698 10394699 GALLO_0056 GALLO_0057 rspC rlpP TRUE 0.998 4.000 0.828 0.037 Y NA
 10394699 10394700 GALLO_0057 GALLO_0058 rlpP rpmC TRUE 0.997 10.000 0.802 0.028 Y NA
 10394700 10394701 GALLO_0058 GALLO_0059 rpmC rpsQ TRUE 0.994 28.000 0.828 0.028 Y NA
 10394701 10394702 GALLO_0059 GALLO_0060 rpsQ rplN TRUE 0.994 25.000 0.791 0.037 Y NA
 10394702 10394703 GALLO_0060 GALLO_0061 rplN rplX TRUE 0.971 80.000 0.810 0.037 Y NA
 10394703 10394704 GALLO_0061 GALLO_0062 rplX rplE TRUE 0.993 29.000 0.758 0.028 Y NA
 10394704 10394705 GALLO_0062 GALLO_0063 rplE rpsN TRUE 0.993 18.000 0.496 0.028 Y NA
 10394705 10394706 GALLO_0063 GALLO_0064 rpsN rpsH TRUE 0.734 207.000 0.473 0.028 Y NA
 10394706 10394707 GALLO_0064 GALLO_0065 rpsH rplF TRUE 0.907 144.000 0.808 0.028 Y NA
 10394707 10394708 GALLO_0065 GALLO_0066 rplF rplR TRUE 0.950 104.000 0.815 0.028 Y NA
 10394708 10394709 GALLO_0066 GALLO_0067 rplR rpsE TRUE 0.995 19.000 0.814 0.037 Y NA
 10394709 10394710 GALLO_0067 GALLO_0068 rpsE rpmQ TRUE 0.996 15.000 0.789 0.037 Y NA
 10394710 10394711 GALLO_0068 GALLO_0069 rpmQ rplO TRUE 0.922 139.000 0.653 0.005 Y NA
 10394711 10394712 GALLO_0069 GALLO_0070 rplO secY TRUE 0.964 16.000 0.730 1.000 N NA
 10394712 10394713 GALLO_0070 GALLO_0071 secY adk TRUE 0.453 97.000 0.241 1.000 N NA
 10394713 10394714 GALLO_0071 GALLO_0072 adk infA FALSE 0.162 119.000 0.059 1.000 N NA
 10394714 10394715 GALLO_0072 GALLO_0073 infA rpmJ TRUE 0.929 26.000 0.067 1.000 Y NA
 10394715 10394716 GALLO_0073 GALLO_0074 rpmJ rpsM TRUE 0.980 19.000 0.086 0.028 Y NA
 10394716 10394717 GALLO_0074 GALLO_0075 rpsM rpsK TRUE 0.996 18.000 0.810 0.028 Y NA
 10394717 10394718 GALLO_0075 GALLO_0076 rpsK rpoA TRUE 0.814 49.000 0.308 1.000 N NA
 10394718 10394719 GALLO_0076 GALLO_0077 rpoA rplQ TRUE 0.974 15.000 0.873 1.000 N NA
 10394719 10394720 GALLO_0077 GALLO_r0004 rplQ rRNA-16s FALSE 0.013 1244.000 0.000 NA   NA
 10394720 10394721 GALLO_r0004 GALLO_t0019 rRNA-16s   TRUE 0.447 63.000 0.000 NA   NA
 10394721 10394722 GALLO_t0019 GALLO_r0005   rRNA-23s FALSE 0.105 147.000 0.000 NA   NA
 10394722 10394723 GALLO_r0005 GALLO_r0006 rRNA-23s rRNA-5s FALSE 0.267 86.000 0.000 NA   NA
 10394723 10394724 GALLO_r0006 GALLO_t0020 rRNA-5s   TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 10394724 10394725 GALLO_t0020 GALLO_t0021     TRUE 0.767 16.000 0.000 NA   NA
 10394725 10394726 GALLO_t0021 GALLO_t0022     TRUE 0.661 29.000 0.000 NA   NA
 10394726 10394727 GALLO_t0022 GALLO_t0023     TRUE 0.813 11.000 0.000 NA   NA
 10394727 10394728 GALLO_t0023 GALLO_t0024     TRUE 0.824 10.000 0.000 NA   NA
 10394728 10394729 GALLO_t0024 GALLO_t0025     TRUE 0.786 14.000 0.000 NA   NA
 10394729 10394730 GALLO_t0025 GALLO_t0026     TRUE 0.848 6.000 0.000 NA   NA
 10394730 10394731 GALLO_t0026 GALLO_t0027     TRUE 0.746 18.000 0.000 NA   NA
 10394731 10394732 GALLO_t0027 GALLO_t0028     TRUE 0.855 5.000 0.000 NA   NA
 10394732 10394733 GALLO_t0028 GALLO_t0029     TRUE 0.803 12.000 0.000 NA   NA
 10394733 10394734 GALLO_t0029 GALLO_t0030     TRUE 0.813 11.000 0.000 NA   NA
 10394734 10394735 GALLO_t0030 GALLO_t0031     TRUE 0.838 8.000 0.000 NA   NA
 10394735 10394736 GALLO_t0031 GALLO_0078   ispE FALSE 0.017 507.000 0.000 NA   NA
 10394736 10394737 GALLO_0078 GALLO_0079 ispE   FALSE 0.184 76.000 0.008 1.000 N NA
 10394737 10394738 GALLO_0079 GALLO_0080     TRUE 0.965 -3.000 0.192 1.000 N NA
 10394738 10394739 GALLO_0080 GALLO_0081     TRUE 0.997 -10.000 0.673 1.000 Y NA
 10394741 10394742 GALLO_0083 GALLO_0084   rpoB FALSE 0.005 343.000 0.000 1.000 N NA
 10394742 10394743 GALLO_0084 GALLO_0085 rpoB rpoC TRUE 0.906 178.000 0.851 0.003 Y NA
 10394743 10394744 GALLO_0085 GALLO_0086 rpoC   FALSE 0.109 171.000 0.007 NA   NA
 10394744 10394745 GALLO_0086 GALLO_0087     TRUE 0.645 71.000 0.083 NA   NA
 10394745 10394746 GALLO_0087 GALLO_0088     TRUE 0.993 -118.000 0.639 1.000   NA
 10394746 10394747 GALLO_0088 GALLO_0089     TRUE 0.999 0.000 0.861 0.001 Y NA
 10394747 10394748 GALLO_0089 GALLO_0090     TRUE 0.977 -16.000 0.110 NA   NA
 10394748 10394749 GALLO_0090 GALLO_0091     TRUE 0.995 -46.000 0.786 NA   NA
 10394749 10394750 GALLO_0091 GALLO_0092     TRUE 0.987 -46.000 0.250 NA   NA
 10394750 10394751 GALLO_0092 GALLO_0093     TRUE 0.986 -28.000 0.232 NA   NA
 10394751 10394752 GALLO_0093 GALLO_0094     TRUE 0.630 73.000 0.087 NA   NA
 10394752 10394753 GALLO_0094 GALLO_0095   ack TRUE 0.657 53.000 0.130 1.000 N NA
 10394753 10394754 GALLO_0095 GALLO_0096 ack   FALSE 0.122 162.000 0.094 1.000 N NA
 10394754 10394755 GALLO_0096 GALLO_0097     TRUE 0.824 10.000 0.000 NA   NA
 10394755 10394756 GALLO_0097 GALLO_0098     TRUE 0.794 13.000 0.000 NA   NA
 10394756 10394757 GALLO_0098 GALLO_0099     TRUE 0.984 12.000 0.800 NA   NA
 10394758 10394759 GALLO_0100 GALLO_0101 proI   TRUE 0.426 61.000 0.041 1.000 N NA
 10394760 10394761 GALLO_0102 GALLO_0103     TRUE 0.919 -3.000 0.000 NA   NA
 10394761 10394762 GALLO_0103 GALLO_0104     TRUE 0.927 -7.000 0.000 NA   NA
 10394762 10394763 GALLO_0104 GALLO_0105     TRUE 0.804 9.000 0.000 1.000   NA
 10394764 10394765 GALLO_0106 GALLO_0107     TRUE 0.927 -46.000 0.000 NA   NA
 10394766 10394767 GALLO_0108 GALLO_0109 ssbB   FALSE 0.101 150.000 0.000 NA   NA
 10394767 10394768 GALLO_0109 GALLO_0110     TRUE 0.942 3.000 0.057 NA   NA
 10394768 10394769 GALLO_0110 GALLO_0111     FALSE 0.118 128.000 0.000 1.000   NA
 10394769 10394770 GALLO_0111 GALLO_0112     FALSE 0.048 199.000 0.000 1.000   NA
 10394770 10394771 GALLO_0112 GALLO_0113     FALSE 0.239 165.000 0.000 NA Y NA
 10394771 10394772 GALLO_0113 GALLO_0114     TRUE 0.990 0.000 0.833 NA N NA
 10394772 10394773 GALLO_0114 GALLO_0115     TRUE 0.999 -3.000 0.941 0.014 Y NA
 10394773 10394774 GALLO_0115 GALLO_0116     TRUE 0.990 -13.000 0.696 1.000 N NA
 10394774 10394775 GALLO_0116 GALLO_0117     TRUE 0.506 166.000 0.217 1.000 Y NA
 10394775 10394776 GALLO_0117 GALLO_0118     TRUE 0.994 19.000 0.643 0.028 Y NA
 10394776 10394777 GALLO_0118 GALLO_0119     TRUE 0.967 77.000 0.643 0.037 Y NA
 10394777 10394778 GALLO_0119 GALLO_0120     TRUE 0.998 2.000 0.905 0.037 Y NA
 10394778 10394779 GALLO_0120 GALLO_0121     TRUE 0.950 28.000 0.476 NA   NA
 10394779 10394780 GALLO_0121 GALLO_0122     FALSE 0.015 596.000 0.000 NA   NA
 10394780 10394781 GALLO_0122 GALLO_0123     TRUE 0.887 0.000 0.000 1.000   NA
 10394781 10394782 GALLO_0123 GALLO_0124   groES FALSE 0.041 213.000 0.000 1.000   NA
 10394782 10394783 GALLO_0124 GALLO_0125 groES groEL TRUE 0.868 68.000 0.160 1.000 Y NA
 10394783 10394784 GALLO_0125 GALLO_0126 groEL   FALSE 0.052 193.000 0.000 1.000   NA
 10394784 10394785 GALLO_0126 GALLO_0127     FALSE 0.014 1146.000 0.000 NA   NA
 10394786 10394787 GALLO_0128 GALLO_0129     TRUE 0.694 58.000 0.056 NA   NA
 10394788 10394789 GALLO_0130 GALLO_0131 pbpF   TRUE 0.638 52.000 0.111 1.000 N NA
 10394789 10394790 GALLO_0131 GALLO_0132   secE TRUE 0.441 72.000 0.080 1.000 N NA
 10394790 10394791 GALLO_0132 GALLO_0133 secE nusG FALSE 0.376 200.000 0.843 1.000 N NA
 10394793 10394794 GALLO_0135 GALLO_0136   leuS FALSE 0.111 133.000 0.000 1.000   NA
 10394794 10394795 GALLO_0136 GALLO_0137 leuS   FALSE 0.007 256.000 0.000 1.000 N NA
 10394795 10394796 GALLO_0137 GALLO_0138     FALSE 0.048 217.000 0.000 NA   NA
 10394799 10394800 GALLO_t0032 GALLO_0141     TRUE 0.928 -37.000 0.000 NA   NA
 10394800 10394801 GALLO_0141 GALLO_0142     FALSE 0.255 126.000 0.035 NA   NA
 10394801 10394802 GALLO_0142 GALLO_0143     TRUE 0.923 -10.000 0.047 1.000 N NA
 10394803 10394804 GALLO_0144 GALLO_0145     FALSE 0.061 195.000 0.000 NA   NA
 10394804 10394805 GALLO_0145 GALLO_0146   prmA TRUE 0.470 63.000 0.004 1.000   NA
 10394805 10394806 GALLO_0146 GALLO_0147 prmA   TRUE 0.978 1.000 0.227 NA   NA
 10394806 10394807 GALLO_0147 GALLO_0148     FALSE 0.120 163.000 0.008 NA   NA
 10394807 10394808 GALLO_0148 GALLO_0149     FALSE 0.032 266.000 0.048 1.000 N NA
 10394808 10394809 GALLO_0149 GALLO_0150     TRUE 0.743 104.000 0.610 NA   NA
 10394810 10394811 GALLO_0151 GALLO_0152     FALSE 0.156 108.000 0.027 NA N NA
 10394812 10394813 GALLO_0153 GALLO_0154     TRUE 0.967 17.000 0.000 0.022 Y NA
 10394815 10394816 GALLO_0156 GALLO_0157     TRUE 0.783 53.000 0.286 1.000 N NA
 10394816 10394817 GALLO_0157 GALLO_0158     FALSE 0.090 76.000 0.000 1.000 N NA
 10394818 10394819 GALLO_0159 GALLO_0160 panD panC TRUE 0.983 13.000 0.342 1.000 Y NA
 10394819 10394820 GALLO_0160 GALLO_0161 panC panB TRUE 0.994 24.000 0.395 0.001 Y NA
 10394820 10394821 GALLO_0161 GALLO_0162 panB   FALSE 0.056 186.000 0.000 1.000   NA
 10394822 10394823 GALLO_0163 GALLO_0164     TRUE 0.914 114.000 0.607 0.043 Y NA
 10394823 10394824 GALLO_0164 GALLO_0165     TRUE 0.998 0.000 0.786 0.043 Y NA
 10394824 10394825 GALLO_0165 GALLO_0166     TRUE 0.628 34.000 0.000 NA   NA
 10394825 10394826 GALLO_0166 GALLO_0167     TRUE 0.919 -3.000 0.000 NA   NA
 10394826 10394827 GALLO_0167 GALLO_0168     FALSE 0.090 76.000 0.000 1.000 N NA
 10394827 10394828 GALLO_0168 GALLO_0169     TRUE 0.946 34.000 0.167 NA Y NA
 10394828 10394829 GALLO_0169 GALLO_0170     TRUE 0.610 9.000 0.000 NA N NA
 10394829 10394830 GALLO_0170 GALLO_0171     TRUE 0.389 16.000 0.000 1.000 N NA
 10394830 10394831 GALLO_0171 GALLO_0172   relA FALSE 0.006 278.000 0.000 1.000 N NA
 10394831 10394832 GALLO_0172 GALLO_0173 relA   TRUE 0.668 60.000 0.177 1.000 N NA
 10394832 10394833 GALLO_0173 GALLO_0174     FALSE 0.104 89.000 0.003 1.000 N NA
 10394833 10394834 GALLO_0174 GALLO_0175     FALSE 0.233 101.000 0.071 1.000 N NA
 10394836 10394837 GALLO_0177 GALLO_0178     TRUE 0.995 17.000 0.333 0.001 Y NA
 10394837 10394838 GALLO_0178 GALLO_0179     TRUE 0.986 12.000 0.400 1.000 Y NA
 10394838 10394839 GALLO_0179 GALLO_0180     TRUE 0.999 7.000 0.833 0.001 Y NA
 10394839 10394840 GALLO_0180 GALLO_0181     TRUE 0.919 13.000 0.000 1.000 Y NA
 10394840 10394841 GALLO_0181 GALLO_0182     TRUE 0.989 14.000 0.143 0.022 Y NA
 10394841 10394842 GALLO_0182 GALLO_0183     TRUE 0.983 36.000 0.357 0.037 Y NA
 10394842 10394843 GALLO_0183 GALLO_0184     FALSE 0.383 110.000 0.000 1.000 Y NA
 10394843 10394844 GALLO_0184 GALLO_0185     FALSE 0.045 205.000 0.000 1.000   NA
 10394844 10394845 GALLO_0185 GALLO_0186     TRUE 0.780 11.000 0.000 1.000   NA
 10394845 10394846 GALLO_0186 GALLO_0187     TRUE 0.981 13.000 0.300 1.000 Y NA
 10394846 10394847 GALLO_0187 GALLO_0188     TRUE 0.586 242.000 0.300 0.030 Y NA
 10394847 10394848 GALLO_0188 GALLO_0189     TRUE 0.844 31.000 0.000 1.000 Y NA
 10394850 10394851 GALLO_0191 GALLO_0192     TRUE 0.993 -3.000 0.286 1.000 Y NA
 10394851 10394852 GALLO_0192 GALLO_0193     TRUE 0.991 13.000 0.275 0.043 Y NA
 10394852 10394853 GALLO_0193 GALLO_0194     TRUE 0.997 13.000 0.925 0.043 Y NA
 10394853 10394854 GALLO_0194 GALLO_0195     FALSE 0.104 389.000 0.050 1.000 Y NA
 10394854 10394855 GALLO_0195 GALLO_0196     TRUE 0.643 119.000 0.000 0.019 Y NA
 10394857 10394858 GALLO_0198 GALLO_0199 galK galT TRUE 0.986 20.000 0.107 0.003 Y NA
 10394858 10394859 GALLO_0199 GALLO_0200 galT galE2 TRUE 0.981 10.000 0.204 0.003 N NA
 10394860 10394861 GALLO_0201 GALLO_0202     TRUE 0.928 -31.000 0.000 NA   NA
 10394862 10394863 GALLO_0203 GALLO_0204   yajC FALSE 0.221 96.000 0.000 NA   NA
 10394863 10394864 GALLO_0204 GALLO_0205 yajC uppS FALSE 0.058 154.000 0.007 NA N NA
 10394864 10394865 GALLO_0205 GALLO_0206 uppS cdsA TRUE 0.966 13.000 0.113 1.000 Y NA
 10394865 10394866 GALLO_0206 GALLO_0207 cdsA   FALSE 0.177 101.000 0.040 1.000 N NA
 10394866 10394867 GALLO_0207 GALLO_0208   proS FALSE 0.123 162.000 0.095 1.000 N NA
 10394867 10394868 GALLO_0208 GALLO_0209 proS polC FALSE 0.215 179.000 0.070 0.060 N NA
 10394868 10394869 GALLO_0209 GALLO_0210 polC   FALSE 0.110 114.000 0.020 1.000 N NA
 10394869 10394870 GALLO_0210 GALLO_0211     TRUE 0.628 107.000 0.414 1.000   NA
 10394871 10394872 GALLO_0212 GALLO_0213     FALSE 0.033 272.000 0.000 NA   NA
 10394872 10394873 GALLO_0213 GALLO_0214     FALSE 0.364 68.000 0.034 1.000 N NA
 10394874 10394875 GALLO_0215 GALLO_0216     TRUE 0.426 13.000 0.000 1.000 N NA
 10394876 10394877 GALLO_0217 GALLO_0218     TRUE 0.746 18.000 0.000 NA   NA
 10394878 10394879 GALLO_0219 GALLO_0220 rpsO   FALSE 0.004 485.000 0.000 1.000 N NA
 10394879 10394880 GALLO_0220 GALLO_0221     FALSE 0.369 73.000 0.000 NA   NA
 10394880 10394881 GALLO_0221 GALLO_0222     TRUE 0.794 13.000 0.000 NA   NA
 10394881 10394882 GALLO_0222 GALLO_0223   pnpA FALSE 0.046 204.000 0.000 1.000   NA
 10394882 10394883 GALLO_0223 GALLO_0224 pnpA   TRUE 0.654 44.000 0.009 NA   NA
 10394883 10394884 GALLO_0224 GALLO_0225   cysE TRUE 0.910 16.000 0.097 NA   NA
 10394884 10394885 GALLO_0225 GALLO_0226 cysE cysS TRUE 0.719 59.000 0.035 0.060 N NA
 10394885 10394886 GALLO_0226 GALLO_0227 cysS   TRUE 0.976 -7.000 0.129 1.000   NA
 10394886 10394887 GALLO_0227 GALLO_0228     TRUE 0.915 63.000 0.150 0.006   NA
 10394887 10394888 GALLO_0228 GALLO_0229     TRUE 0.784 52.000 0.109 NA   NA
 10394888 10394889 GALLO_0229 GALLO_0230     FALSE 0.164 163.000 0.036 NA   NA
 10394889 10394890 GALLO_0230 GALLO_0231     FALSE 0.073 178.000 0.000 NA   NA
 10394890 10394891 GALLO_0231 GALLO_0232   panE FALSE 0.309 135.000 0.250 1.000 N NA
 10394891 10394892 GALLO_0232 GALLO_0233 panE rplM FALSE 0.011 203.000 0.000 1.000 N NA
 10394892 10394893 GALLO_0233 GALLO_0234 rplM rpsI TRUE 0.993 23.000 0.601 0.027 Y NA
 10394893 10394894 GALLO_0234 GALLO_r0007 rpsI rRNA-16s FALSE 0.015 583.000 0.000 NA   NA
 10394894 10394895 GALLO_r0007 GALLO_t0033 rRNA-16s   TRUE 0.447 63.000 0.000 NA   NA
 10394895 10394896 GALLO_t0033 GALLO_r0008   rRNA-23s FALSE 0.105 147.000 0.000 NA   NA
 10394896 10394897 GALLO_r0008 GALLO_r0009 rRNA-23s rRNA-5s FALSE 0.267 86.000 0.000 NA   NA
 10394897 10394898 GALLO_r0009 GALLO_t0034 rRNA-5s   TRUE 0.855 5.000 0.000 NA   NA
 10394898 10394899 GALLO_t0034 GALLO_t0035     TRUE 0.702 23.000 0.000 NA   NA
 10394899 10394900 GALLO_t0035 GALLO_t0036     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 10394900 10394901 GALLO_t0036 GALLO_t0037     TRUE 0.824 10.000 0.000 NA   NA
 10394901 10394902 GALLO_t0037 GALLO_t0038     TRUE 0.778 15.000 0.000 NA   NA
 10394902 10394903 GALLO_t0038 GALLO_t0039     TRUE 0.767 16.000 0.000 NA   NA
 10394903 10394904 GALLO_t0039 GALLO_t0040     TRUE 0.838 8.000 0.000 NA   NA
 10394904 10394905 GALLO_t0040 GALLO_t0041     TRUE 0.756 17.000 0.000 NA   NA
 10394905 10394906 GALLO_t0041 GALLO_t0042     TRUE 0.848 6.000 0.000 NA   NA
 10394906 10394907 GALLO_t0042 GALLO_r0010   rRNA-16s FALSE 0.145 126.000 0.000 NA   NA
 10394907 10394908 GALLO_r0010 GALLO_t0043 rRNA-16s   TRUE 0.447 63.000 0.000 NA   NA
 10394908 10394909 GALLO_t0043 GALLO_r0011   rRNA-23s FALSE 0.105 147.000 0.000 NA   NA
 10394909 10394910 GALLO_r0011 GALLO_r0012 rRNA-23s rRNA-5s FALSE 0.267 86.000 0.000 NA   NA
 10394910 10394911 GALLO_r0012 GALLO_t0044 rRNA-5s   TRUE 0.855 5.000 0.000 NA   NA
 10394911 10394912 GALLO_t0044 GALLO_0235   comX1 FALSE 0.090 161.000 0.000 NA   NA
 10394912 10394913 GALLO_0235 GALLO_0236 comX1   FALSE 0.098 140.000 0.000 1.000   NA
 10394913 10394914 GALLO_0236 GALLO_0237     TRUE 0.979 12.000 0.569 NA   NA
 10394914 10394915 GALLO_0237 GALLO_0238     FALSE 0.067 224.000 0.012 NA   NA
 10394915 10394916 GALLO_0238 GALLO_0239     TRUE 0.967 -16.000 0.174 1.000 N NA
 10394916 10394917 GALLO_0239 GALLO_0240     TRUE 0.962 -3.000 0.174 1.000 N NA
 10394917 10394918 GALLO_0240 GALLO_0241   hrcA FALSE 0.062 135.000 0.009 1.000 N NA
 10394918 10394919 GALLO_0241 GALLO_0242 hrcA grpE TRUE 0.563 43.000 0.051 1.000 N NA
 10394919 10394920 GALLO_0242 GALLO_0243 grpE dnaK TRUE 0.871 83.000 0.026 0.006 Y NA
 10394920 10394921 GALLO_0243 GALLO_0244 dnaK   FALSE 0.152 120.000 0.000 NA   NA
 10394921 10394922 GALLO_0244 GALLO_0245   dnaJ FALSE 0.227 107.000 0.005 NA   NA
 10394922 10394923 GALLO_0245 GALLO_0246 dnaJ truA FALSE 0.062 119.000 0.004 1.000 N NA
 10394923 10394924 GALLO_0246 GALLO_0247 truA pdxK TRUE 0.942 -10.000 0.058 NA N NA
 10394924 10394925 GALLO_0247 GALLO_0248 pdxK   TRUE 0.988 -13.000 0.276 NA   NA
 10394925 10394926 GALLO_0248 GALLO_0249     TRUE 0.885 29.000 0.149 NA   NA
 10394928 10394929 GALLO_0251 GALLO_0252 tig rpoE FALSE 0.026 191.000 0.005 1.000 N NA
 10394929 10394930 GALLO_0252 GALLO_0253 rpoE pyrG FALSE 0.023 273.000 0.029 1.000 N NA
 10394930 10394931 GALLO_0253 GALLO_0254 pyrG   FALSE 0.133 117.000 0.000 1.000   NA
 10394931 10394932 GALLO_0254 GALLO_t0045     TRUE 0.518 53.000 0.000 NA   NA
 10394932 10394933 GALLO_t0045 GALLO_0255   fba FALSE 0.050 213.000 0.000 NA   NA
 10394933 10394934 GALLO_0255 GALLO_t0046 fba   FALSE 0.172 111.000 0.000 NA   NA
 10394934 10394935 GALLO_t0046 GALLO_0256     FALSE 0.040 242.000 0.000 NA   NA
 10394935 10394936 GALLO_0256 GALLO_0257     TRUE 0.612 37.000 0.000 NA   NA
 10394936 10394937 GALLO_0257 GALLO_0258     FALSE 0.063 191.000 0.000 NA   NA
 10394937 10394938 GALLO_0258 GALLO_0259     TRUE 0.928 -22.000 0.000 NA   NA
 10394938 10394939 GALLO_0259 GALLO_0260     FALSE 0.381 72.000 0.000 NA   NA
 10394939 10394940 GALLO_0260 GALLO_0261     TRUE 0.843 7.000 0.000 NA   NA
 10394940 10394941 GALLO_0261 GALLO_0262     TRUE 0.929 -13.000 0.000 NA   NA
 10394941 10394942 GALLO_0262 GALLO_0263     TRUE 0.919 -3.000 0.000 NA   NA
 10394942 10394943 GALLO_0263 GALLO_0264     TRUE 0.724 20.000 0.000 NA   NA
 10394943 10394944 GALLO_0264 GALLO_0265     TRUE 0.927 -7.000 0.000 NA   NA
 10394944 10394945 GALLO_0265 GALLO_0266     TRUE 0.927 -7.000 0.000 NA   NA
 10394945 10394946 GALLO_0266 GALLO_0267     TRUE 0.724 20.000 0.000 NA   NA
 10394946 10394947 GALLO_0267 GALLO_0268     FALSE 0.147 125.000 0.000 NA   NA
 10394947 10394948 GALLO_0268 GALLO_0269     FALSE 0.027 313.000 0.000 NA   NA
 10394948 10394949 GALLO_0269 GALLO_0270     FALSE 0.130 134.000 0.000 NA   NA
 10394949 10394950 GALLO_0270 GALLO_0271     TRUE 0.774 66.000 0.000 0.008   NA
 10394950 10394951 GALLO_0271 GALLO_0272     FALSE 0.201 211.000 0.000 0.008   NA
 10394951 10394952 GALLO_0272 GALLO_0273     FALSE 0.039 244.000 0.000 NA   NA
 10394952 10394953 GALLO_0273 GALLO_0274     TRUE 0.823 104.000 1.000 NA   NA
 10394953 10394954 GALLO_0274 GALLO_0275     TRUE 0.924 59.000 0.667 NA   NA
 10394954 10394955 GALLO_0275 GALLO_0276     TRUE 0.617 36.000 0.000 NA   NA
 10394955 10394956 GALLO_0276 GALLO_0277     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 10394956 10394957 GALLO_0277 GALLO_0278     FALSE 0.036 259.000 0.000 NA   NA
 10394957 10394958 GALLO_0278 GALLO_0279     TRUE 0.989 -52.000 0.333 NA   NA
 10394958 10394959 GALLO_0279 GALLO_0280     TRUE 0.883 2.000 0.000 NA   NA
 10394959 10394960 GALLO_0280 GALLO_0281     TRUE 0.778 15.000 0.000 NA   NA
 10394960 10394961 GALLO_0281 GALLO_0282     TRUE 0.599 39.000 0.000 NA   NA
 10394961 10394962 GALLO_0282 GALLO_0283     TRUE 0.872 3.000 0.000 NA   NA
 10394962 10394963 GALLO_0283 GALLO_0284     TRUE 0.893 1.000 0.000 NA   NA
 10394963 10394964 GALLO_0284 GALLO_0285     TRUE 0.929 -16.000 0.000 NA   NA
 10394964 10394965 GALLO_0285 GALLO_0286     TRUE 0.734 19.000 0.000 NA   NA
 10394965 10394966 GALLO_0286 GALLO_0287     TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 10394966 10394967 GALLO_0287 GALLO_0288     TRUE 0.973 19.000 0.667 NA   NA
 10394967 10394968 GALLO_0288 GALLO_0289     TRUE 0.993 0.000 0.750 NA   NA
 10394968 10394969 GALLO_0289 GALLO_0290     FALSE 0.019 410.000 0.000 NA   NA
 10394969 10394970 GALLO_0290 GALLO_0291     FALSE 0.331 77.000 0.000 NA   NA
 10394970 10394971 GALLO_0291 GALLO_0292     TRUE 0.512 54.000 0.000 NA   NA
 10394971 10394972 GALLO_0292 GALLO_0293     TRUE 0.702 23.000 0.000 NA   NA
 10394972 10394973 GALLO_0293 GALLO_0294     TRUE 0.726 53.000 0.081 1.000   NA
 10394973 10394974 GALLO_0294 GALLO_0295     TRUE 0.737 49.000 0.054 NA   NA
 10394974 10394975 GALLO_0295 GALLO_0296     FALSE 0.027 313.000 0.000 NA   NA
 10394975 10394976 GALLO_0296 GALLO_0297     TRUE 0.992 -28.000 0.500 NA   NA
 10394976 10394977 GALLO_0297 GALLO_0298     FALSE 0.188 105.000 0.000 NA   NA
 10394977 10394978 GALLO_0298 GALLO_0299     TRUE 0.824 10.000 0.000 NA   NA
 10394978 10394979 GALLO_0299 GALLO_0300     FALSE 0.028 300.000 0.000 NA   NA
 10394979 10394980 GALLO_0300 GALLO_0301   rpmB FALSE 0.020 409.000 0.000 NA   NA
 10394980 10394981 GALLO_0301 GALLO_0302 rpmB   FALSE 0.288 117.000 0.044 NA   NA
 10394981 10394982 GALLO_0302 GALLO_0303     TRUE 0.991 0.000 0.567 NA   NA
 10394982 10394983 GALLO_0303 GALLO_0304   ilvD FALSE 0.028 266.000 0.000 1.000   NA
 10394983 10394984 GALLO_0304 GALLO_0305 ilvD ilvB TRUE 0.802 134.000 0.089 0.002 Y NA
 10394984 10394985 GALLO_0305 GALLO_0306 ilvB ilvH TRUE 0.998 -7.000 0.249 0.002 Y NA
 10394985 10394986 GALLO_0306 GALLO_0307 ilvH ilvC TRUE 0.955 70.000 0.130 0.002 Y NA
 10394986 10394987 GALLO_0307 GALLO_0308 ilvC ilvA TRUE 0.423 133.000 0.033 1.000 Y NA
 10394987 10394988 GALLO_0308 GALLO_0309 ilvA   FALSE 0.029 215.000 0.017 1.000 N NA
 10394989 10394990 GALLO_0310 GALLO_0311     FALSE 0.217 97.000 0.000 NA   NA
 10394990 10394991 GALLO_0311 GALLO_0312     FALSE 0.075 176.000 0.000 NA   NA
 10394991 10394992 GALLO_0312 GALLO_0313     TRUE 0.996 0.000 0.758 1.000 Y NA
 10394993 10394994 GALLO_0314 GALLO_0315   uppP TRUE 0.792 52.000 0.118 NA   NA
 10394994 10394995 GALLO_0315 GALLO_0316 uppP mecA FALSE 0.343 101.000 0.132 NA N NA
 10394995 10394996 GALLO_0316 GALLO_0317 mecA   TRUE 0.965 2.000 0.267 NA N NA
 10394996 10394997 GALLO_0317 GALLO_0318   sufC FALSE 0.093 114.000 0.013 1.000 N NA
 10394997 10394998 GALLO_0318 GALLO_0319 sufC sufD TRUE 0.823 74.000 0.139 1.000 Y NA
 10394998 10394999 GALLO_0319 GALLO_0320 sufD sufS TRUE 0.981 2.000 0.606 1.000 N NA
 10394999 10395000 GALLO_0320 GALLO_0321 sufS   TRUE 0.978 -13.000 0.292 1.000 N NA
 10395000 10395001 GALLO_0321 GALLO_0322   sufB TRUE 0.975 13.000 0.152 0.002 N NA
 10395003 10395004 GALLO_0324 GALLO_0325     TRUE 0.694 111.000 0.021 0.041 Y NA
 10395004 10395005 GALLO_0325 GALLO_0326     TRUE 0.973 11.000 0.134 0.041   NA
 10395005 10395006 GALLO_0326 GALLO_0327     TRUE 0.958 12.000 0.286 1.000   NA
 10395006 10395007 GALLO_0327 GALLO_0328     TRUE 0.999 0.000 0.619 0.001 Y NA
 10395007 10395008 GALLO_0328 GALLO_r0013   rRNA-16s FALSE 0.017 508.000 0.000 NA   NA
 10395008 10395009 GALLO_r0013 GALLO_t0047 rRNA-16s   TRUE 0.447 63.000 0.000 NA   NA
 10395009 10395010 GALLO_t0047 GALLO_r0014   rRNA-23s FALSE 0.105 147.000 0.000 NA   NA
 10395010 10395011 GALLO_r0014 GALLO_r0015 rRNA-23s rRNA-5s FALSE 0.267 86.000 0.000 NA   NA
 10395011 10395012 GALLO_r0015 GALLO_t0048 rRNA-5s   TRUE 0.855 5.000 0.000 NA   NA
 10395012 10395013 GALLO_t0048 GALLO_0329     FALSE 0.093 158.000 0.000 NA   NA
 10395014 10395015 GALLO_0330 GALLO_0331     FALSE 0.004 449.000 0.000 1.000 N NA
 10395016 10395017 GALLO_0332 GALLO_0333     FALSE 0.251 211.000 0.083 0.066   NA
 10395017 10395018 GALLO_0333 GALLO_0334     FALSE 0.218 116.000 0.098 1.000 N NA
 10395018 10395019 GALLO_0334 GALLO_0335     TRUE 0.890 3.000 0.070 1.000 N NA
 10395019 10395020 GALLO_0335 GALLO_0336   acpA TRUE 0.881 63.000 0.065 0.007   NA
 10395020 10395021 GALLO_0336 GALLO_0337 acpA   FALSE 0.306 163.000 0.216 1.000   NA
 10395021 10395022 GALLO_0337 GALLO_0338   fabD TRUE 0.705 61.000 0.099 1.000   NA
 10395022 10395023 GALLO_0338 GALLO_0339 fabD fabG TRUE 0.996 10.000 0.432 0.007 Y NA
 10395023 10395024 GALLO_0339 GALLO_0340 fabG fabF TRUE 0.819 63.000 0.056 1.000 Y NA
 10395024 10395025 GALLO_0340 GALLO_0341 fabF accB TRUE 0.984 0.000 0.074 1.000 Y NA
 10395025 10395026 GALLO_0341 GALLO_0342 accB fabZ TRUE 0.995 -3.000 0.047 0.007 Y NA
 10395026 10395027 GALLO_0342 GALLO_0343 fabZ accC TRUE 0.597 96.000 0.045 1.000 Y NA
 10395027 10395028 GALLO_0343 GALLO_0344 accC accD TRUE 0.971 9.000 0.090 1.000 Y NA
 10395028 10395029 GALLO_0344 GALLO_0345 accD accA TRUE 0.998 -3.000 0.234 0.002 Y NA
 10395030 10395031 GALLO_0346 GALLO_0347 serS   FALSE 0.047 251.000 0.003 NA   NA
 10395031 10395032 GALLO_0347 GALLO_0348     TRUE 0.853 77.000 0.583 NA   NA
 10395032 10395033 GALLO_0348 GALLO_0349     TRUE 0.683 26.000 0.000 NA   NA
 10395033 10395034 GALLO_0349 GALLO_0350     FALSE 0.091 160.000 0.000 NA   NA
 10395034 10395035 GALLO_0350 GALLO_0351     FALSE 0.021 328.000 0.000 1.000   NA
 10395036 10395037 GALLO_0352 GALLO_0353     TRUE 0.501 145.000 0.400 NA   NA
 10395037 10395038 GALLO_0353 GALLO_0354     FALSE 0.377 105.000 0.068 NA   NA
 10395038 10395039 GALLO_0354 GALLO_0355     FALSE 0.094 185.000 0.008 NA   NA
 10395039 10395040 GALLO_0355 GALLO_0356     TRUE 0.962 -7.000 0.033 NA   NA
 10395040 10395041 GALLO_0356 GALLO_0357     TRUE 0.942 11.000 0.283 NA N NA
 10395042 10395043 GALLO_0358 GALLO_0359     TRUE 0.966 -3.000 0.063 NA   NA
 10395044 10395045 GALLO_0360 GALLO_0361     TRUE 0.950 2.000 0.167 NA N NA
 10395045 10395046 GALLO_0361 GALLO_0362     TRUE 0.573 65.000 0.107 NA N NA
 10395046 10395047 GALLO_0362 GALLO_0363     TRUE 0.975 0.000 0.154 NA   NA
 10395047 10395048 GALLO_0363 GALLO_t0049     TRUE 0.580 42.000 0.000 NA   NA
 10395048 10395049 GALLO_t0049 GALLO_0364     FALSE 0.048 217.000 0.000 NA   NA
 10395049 10395050 GALLO_0364 GALLO_0365     TRUE 0.518 6.000 0.000 1.000 N NA
 10395050 10395051 GALLO_0365 GALLO_0366     TRUE 0.990 -13.000 0.115 1.000 Y NA
 10395051 10395052 GALLO_0366 GALLO_0367     TRUE 0.987 -3.000 0.300 NA   NA
 10395052 10395053 GALLO_0367 GALLO_0368     FALSE 0.056 204.000 0.000 NA   NA
 10395053 10395054 GALLO_0368 GALLO_0369   nusA TRUE 0.850 85.000 0.759 NA   NA
 10395054 10395055 GALLO_0369 GALLO_0370 nusA   TRUE 0.977 20.000 0.323 NA Y NA
 10395055 10395056 GALLO_0370 GALLO_0371     TRUE 0.985 -7.000 0.408 NA N NA
 10395056 10395057 GALLO_0371 GALLO_0372   infB TRUE 0.971 20.000 0.223 NA Y NA
 10395057 10395058 GALLO_0372 GALLO_0373 infB rbfA FALSE 0.237 856.000 0.530 1.000 Y NA
 10395058 10395059 GALLO_0373 GALLO_0374 rbfA   FALSE 0.043 105.000 0.000 1.000 N NA
 10395059 10395060 GALLO_0374 GALLO_0375     TRUE 0.989 -24.000 0.000 0.057 Y NA
 10395060 10395061 GALLO_0375 GALLO_0376     FALSE 0.228 93.000 0.000 NA   NA
 10395061 10395062 GALLO_0376 GALLO_0377     TRUE 0.794 13.000 0.000 NA   NA
 10395062 10395063 GALLO_0377 GALLO_0378     FALSE 0.115 142.000 0.000 NA   NA
 10395063 10395064 GALLO_0378 GALLO_0379     TRUE 0.717 24.000 0.064 1.000 N NA
 10395064 10395065 GALLO_0379 GALLO_0380     TRUE 0.968 22.000 0.000 0.004 Y NA
 10395065 10395066 GALLO_0380 GALLO_0381     FALSE 0.196 103.000 0.000 NA   NA
 10395066 10395067 GALLO_0381 GALLO_0382     TRUE 0.937 3.000 0.047 NA   NA
 10395068 10395069 GALLO_0383 GALLO_0384     TRUE 0.893 1.000 0.000 NA   NA
 10395069 10395070 GALLO_0384 GALLO_0385     FALSE 0.332 150.000 0.000 0.011   NA
 10395072 10395073 GALLO_0387 GALLO_0388     TRUE 0.848 6.000 0.000 NA   NA
 10395074 10395075 GALLO_0389 GALLO_0390   nagA FALSE 0.166 135.000 0.090 1.000 N NA
 10395075 10395076 GALLO_0390 GALLO_0391 nagA glyQ FALSE 0.004 434.000 0.000 1.000 N NA
 10395076 10395077 GALLO_0391 GALLO_0392 glyQ glyS TRUE 0.999 0.000 0.651 0.001 Y NA
 10395077 10395078 GALLO_0392 GALLO_0393 glyS   FALSE 0.118 179.000 0.020 NA   NA
 10395078 10395079 GALLO_0393 GALLO_0394     FALSE 0.120 139.000 0.000 NA   NA
 10395079 10395080 GALLO_0394 GALLO_0395     TRUE 0.978 -10.000 0.029 0.026 N NA
 10395080 10395081 GALLO_0395 GALLO_0396     TRUE 0.968 15.000 0.000 0.028 Y NA
 10395081 10395082 GALLO_0396 GALLO_0397     TRUE 0.988 6.000 0.052 0.028 Y NA
 10395082 10395083 GALLO_0397 GALLO_0398     TRUE 0.937 28.000 0.091 0.035   NA
 10395083 10395084 GALLO_0398 GALLO_0399     TRUE 0.751 14.000 0.000 1.000   NA
 10395084 10395085 GALLO_0399 GALLO_0400   tkt TRUE 0.485 90.000 0.000 1.000 Y NA
 10395085 10395086 GALLO_0400 GALLO_0401 tkt   FALSE 0.118 140.000 0.000 NA   NA
 10395086 10395087 GALLO_0401 GALLO_0402     TRUE 0.925 16.000 0.136 NA   NA
 10395087 10395088 GALLO_0402 GALLO_0403     TRUE 0.977 5.000 0.341 NA   NA
 10395089 10395090 GALLO_0404 GALLO_0405     TRUE 0.445 137.000 0.500 1.000 N NA
 10395091 10395092 GALLO_0406 GALLO_0407   proB FALSE 0.040 109.000 0.000 1.000 N NA
 10395092 10395093 GALLO_0407 GALLO_0408 proB proA TRUE 0.994 15.000 0.281 0.002 Y NA
 10395093 10395094 GALLO_0408 GALLO_0409 proA mraW FALSE 0.039 150.000 0.003 1.000 N NA
 10395094 10395095 GALLO_0409 GALLO_0410 mraW ftsL TRUE 0.894 3.000 0.077 1.000 N NA
 10395095 10395096 GALLO_0410 GALLO_0411 ftsL pbpB TRUE 0.960 10.000 0.456 1.000 N NA
 10395096 10395097 GALLO_0411 GALLO_0412 pbpB mraY TRUE 0.964 7.000 0.038 1.000 Y NA
 10395097 10395098 GALLO_0412 GALLO_0413 mraY   FALSE 0.026 199.000 0.007 1.000 N NA
 10395098 10395099 GALLO_0413 GALLO_0414     FALSE 0.056 186.000 0.036 1.000 N NA
 10395099 10395100 GALLO_0414 GALLO_0415     TRUE 0.915 75.000 0.143 0.040 Y NA
 10395100 10395101 GALLO_0415 GALLO_0416     TRUE 0.993 0.000 0.310 1.000 Y NA
 10395101 10395102 GALLO_0416 GALLO_0417     TRUE 0.704 91.000 0.364 NA   NA
 10395102 10395103 GALLO_0417 GALLO_0418     TRUE 0.723 64.000 0.117 NA   NA
 10395104 10395105 GALLO_0419 GALLO_0420     FALSE 0.021 190.000 0.000 NA N NA
 10395105 10395106 GALLO_0420 GALLO_0421     FALSE 0.041 240.000 0.000 NA   NA
 10395106 10395107 GALLO_0421 GALLO_0422     TRUE 0.504 56.000 0.000 NA   NA
 10395109 10395110 GALLO_0424 GALLO_0425     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 10395110 10395111 GALLO_0425 GALLO_0426     FALSE 0.080 172.000 0.000 NA   NA
 10395111 10395112 GALLO_0426 GALLO_0427     TRUE 0.617 36.000 0.000 NA   NA
 10395112 10395113 GALLO_0427 GALLO_0428     TRUE 0.914 -19.000 0.000 1.000   NA
 10395114 10395115 GALLO_0429 GALLO_0430     TRUE 0.498 57.000 0.000 NA   NA
 10395115 10395116 GALLO_0430 GALLO_0431     FALSE 0.052 211.000 0.000 NA   NA
 10395118 10395119 GALLO_0433 GALLO_0434     TRUE 0.599 39.000 0.000 NA   NA
 10395119 10395120 GALLO_0434 GALLO_0435     TRUE 0.979 10.000 0.500 NA   NA
 10395120 10395121 GALLO_0435 GALLO_0436     TRUE 0.929 -13.000 0.000 NA   NA
 10395121 10395122 GALLO_0436 GALLO_0437     TRUE 0.929 -13.000 0.000 NA   NA
 10395122 10395123 GALLO_0437 GALLO_0438     TRUE 0.778 15.000 0.000 NA   NA
 10395123 10395124 GALLO_0438 GALLO_0439     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 10395124 10395125 GALLO_0439 GALLO_0440     TRUE 0.927 27.000 0.281 NA   NA
 10395125 10395126 GALLO_0440 GALLO_0441     TRUE 0.849 11.000 0.004 NA   NA
 10395126 10395127 GALLO_0441 GALLO_0442     TRUE 0.936 13.000 0.002 NA Y NA
 10395127 10395128 GALLO_0442 GALLO_0443     FALSE 0.030 287.000 0.000 NA   NA
 10395128 10395129 GALLO_0443 GALLO_0444     FALSE 0.062 251.000 0.018 NA   NA
 10395129 10395130 GALLO_0444 GALLO_0445     TRUE 0.959 -3.000 0.037 NA   NA
 10395130 10395131 GALLO_0445 GALLO_0446     TRUE 0.927 -7.000 0.000 NA   NA
 10395131 10395132 GALLO_0446 GALLO_0447     TRUE 0.919 -3.000 0.000 NA   NA
 10395132 10395133 GALLO_0447 GALLO_0448     FALSE 0.023 352.000 0.000 NA   NA
 10395133 10395134 GALLO_0448 GALLO_0449     FALSE 0.021 395.000 0.000 NA   NA
 10395134 10395135 GALLO_0449 GALLO_0450     TRUE 0.919 -3.000 0.000 NA   NA
 10395135 10395136 GALLO_0450 GALLO_0451     TRUE 0.794 13.000 0.000 NA   NA
 10395136 10395137 GALLO_0451 GALLO_0452     TRUE 0.929 -19.000 0.000 NA   NA
 10395137 10395138 GALLO_0452 GALLO_t0050     FALSE 0.026 317.000 0.000 NA   NA
 10395138 10395139 GALLO_t0050 GALLO_0453     FALSE 0.078 173.000 0.000 NA   NA
 10395139 10395140 GALLO_0453 GALLO_0454     TRUE 0.965 13.000 0.333 NA   NA
 10395140 10395141 GALLO_0454 GALLO_0455     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 10395141 10395142 GALLO_0455 GALLO_0456     TRUE 0.778 15.000 0.000 NA   NA
 10395142 10395143 GALLO_0456 GALLO_0457     TRUE 0.962 18.000 0.429 NA   NA
 10395143 10395144 GALLO_0457 GALLO_0458     TRUE 0.919 -3.000 0.000 NA   NA
 10395144 10395145 GALLO_0458 GALLO_0459     TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA   NA
 10395145 10395146 GALLO_0459 GALLO_0460     TRUE 0.988 8.000 0.800 NA   NA
 10395146 10395147 GALLO_0460 GALLO_0461     TRUE 0.881 15.000 0.041 NA   NA
 10395147 10395148 GALLO_0461 GALLO_0462     TRUE 0.676 62.000 0.062 NA   NA
 10395148 10395149 GALLO_0462 GALLO_0463     TRUE 0.746 75.000 0.235 NA   NA
 10395149 10395150 GALLO_0463 GALLO_0464     TRUE 0.724 20.000 0.000 NA   NA
 10395150 10395151 GALLO_0464 GALLO_0465     TRUE 0.786 14.000 0.000 NA   NA
 10395151 10395152 GALLO_0465 GALLO_0466     TRUE 0.786 14.000 0.000 NA   NA
 10395152 10395153 GALLO_0466 GALLO_0467     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 10395153 10395154 GALLO_0467 GALLO_0468     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 10395154 10395155 GALLO_0468 GALLO_0469     TRUE 0.929 -10.000 0.000 NA   NA
 10395155 10395156 GALLO_0469 GALLO_0470     TRUE 0.734 19.000 0.000 NA   NA
 10395156 10395157 GALLO_0470 GALLO_0471     TRUE 0.919 -3.000 0.000 NA   NA
 10395157 10395158 GALLO_0471 GALLO_0472     TRUE 0.848 6.000 0.000 NA   NA
 10395158 10395159 GALLO_0472 GALLO_0473     FALSE 0.028 299.000 0.000 NA   NA
 10395159 10395160 GALLO_0473 GALLO_0474     TRUE 0.972 4.000 0.231 NA   NA
 10395160 10395161 GALLO_0474 GALLO_0475     FALSE 0.037 251.000 0.000 NA   NA
 10395161 10395162 GALLO_0475 GALLO_0476   pncB FALSE 0.004 954.000 0.000 NA N NA
 10395162 10395163 GALLO_0476 GALLO_0477 pncB nadE TRUE 0.998 -3.000 0.194 0.005 Y NA
 10395163 10395164 GALLO_0477 GALLO_0478 nadE   FALSE 0.028 219.000 0.017 1.000 N NA
 10395165 10395166 GALLO_0479 GALLO_0480 ponA recU TRUE 0.987 -4.000 0.319 1.000   NA
 10395167 10395168 GALLO_0481 GALLO_0482     TRUE 0.658 127.000 0.579 NA   NA
 10395168 10395169 GALLO_0482 GALLO_0483     FALSE 0.015 630.000 0.000 NA   NA
 10395169 10395170 GALLO_0483 GALLO_0484     FALSE 0.232 128.000 0.029 NA   NA
 10395170 10395171 GALLO_0484 GALLO_0485     FALSE 0.029 296.000 0.000 NA   NA
 10395173 10395174 GALLO_0487 GALLO_0488   gmk FALSE 0.045 252.000 0.010 1.000   NA
 10395174 10395175 GALLO_0488 GALLO_0489 gmk rpoZ TRUE 0.916 27.000 0.471 1.000 N NA
 10395175 10395176 GALLO_0489 GALLO_0490 rpoZ priA FALSE 0.328 122.000 0.032 0.055 N NA
 10395176 10395177 GALLO_0490 GALLO_0491 priA fmt TRUE 0.458 61.000 0.052 1.000 N NA
 10395177 10395178 GALLO_0491 GALLO_0492 fmt   TRUE 0.995 -10.000 0.305 1.000 Y NA
 10395178 10395179 GALLO_0492 GALLO_0493   stp TRUE 0.655 38.000 0.074 1.000 N NA
 10395179 10395180 GALLO_0493 GALLO_0494 stp prkC TRUE 0.996 0.000 0.704 1.000 Y NA
 10395180 10395181 GALLO_0494 GALLO_0495 prkC   FALSE 0.302 111.000 0.039 NA   NA
 10395181 10395182 GALLO_0495 GALLO_0496     TRUE 0.994 -3.000 0.679 NA   NA
 10395182 10395183 GALLO_0496 GALLO_0497     TRUE 0.999 -16.000 0.853 0.013 Y NA
 10395183 10395184 GALLO_0497 GALLO_0498     TRUE 0.408 119.000 0.164 1.000   NA
 10395184 10395185 GALLO_0498 GALLO_0499     TRUE 0.972 0.000 0.151 1.000   NA
 10395186 10395187 GALLO_0500 GALLO_0501 cysK   FALSE 0.290 104.000 0.033 1.000   NA
 10395188 10395189 GALLO_0502 GALLO_0503     TRUE 0.973 -3.000 0.130 1.000   NA
 10395189 10395190 GALLO_0503 GALLO_0504     TRUE 0.588 76.000 0.080 NA   NA
 10395190 10395191 GALLO_0504 GALLO_r0016   rRNA-16s FALSE 0.017 510.000 0.000 NA   NA
 10395191 10395192 GALLO_r0016 GALLO_t0051 rRNA-16s   TRUE 0.447 63.000 0.000 NA   NA
 10395192 10395193 GALLO_t0051 GALLO_r0017   rRNA-23s FALSE 0.105 147.000 0.000 NA   NA
 10395193 10395194 GALLO_r0017 GALLO_r0018 rRNA-23s rRNA-5s FALSE 0.267 86.000 0.000 NA   NA
 10395194 10395195 GALLO_r0018 GALLO_t0052 rRNA-5s   TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 10395195 10395196 GALLO_t0052 GALLO_t0053     TRUE 0.702 23.000 0.000 NA   NA
 10395196 10395197 GALLO_t0053 GALLO_t0054     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 10395197 10395198 GALLO_t0054 GALLO_t0055     TRUE 0.824 10.000 0.000 NA   NA
 10395198 10395199 GALLO_t0055 GALLO_t0056     TRUE 0.778 15.000 0.000 NA   NA
 10395199 10395200 GALLO_t0056 GALLO_t0057     TRUE 0.689 25.000 0.000 NA   NA
 10395200 10395201 GALLO_t0057 GALLO_t0058     TRUE 0.813 11.000 0.000 NA   NA
 10395202 10395203 GALLO_0505 GALLO_0506     TRUE 0.678 59.000 0.051 NA   NA
 10395203 10395204 GALLO_0506 GALLO_0507   recX TRUE 0.387 87.000 0.025 NA   NA
 10395205 10395206 GALLO_0508 GALLO_0509     TRUE 0.887 0.000 0.000 1.000   NA
 10395207 10395208 GALLO_0510 GALLO_0511     TRUE 0.601 58.000 0.000 0.054 N NA
 10395208 10395209 GALLO_0511 GALLO_0512     TRUE 0.990 -24.000 0.000 0.054 Y NA
 10395209 10395210 GALLO_0512 GALLO_0513     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 10395210 10395211 GALLO_0513 GALLO_0514     FALSE 0.169 112.000 0.000 NA   NA
 10395212 10395213 GALLO_0515 GALLO_0516     FALSE 0.143 112.000 0.000 1.000   NA
 10395213 10395214 GALLO_0516 GALLO_t0059     FALSE 0.143 127.000 0.000 NA   NA
 10395215 10395216 GALLO_0517 GALLO_0518     FALSE 0.120 127.000 0.000 1.000   NA
 10395216 10395217 GALLO_0518 GALLO_0519     FALSE 0.018 383.000 0.000 1.000   NA
 10395217 10395218 GALLO_0519 GALLO_0520     TRUE 0.559 46.000 0.000 NA   NA
 10395218 10395219 GALLO_0520 GALLO_0521     FALSE 0.143 127.000 0.000 NA   NA
 10395220 10395221 GALLO_0522 GALLO_0523     FALSE 0.015 648.000 0.000 NA   NA
 10395221 10395222 GALLO_0523 GALLO_0524     TRUE 0.975 2.000 0.214 NA   NA
 10395222 10395223 GALLO_0524 GALLO_0525     FALSE 0.031 247.000 0.000 1.000   NA
 10395223 10395224 GALLO_0525 GALLO_0526     TRUE 0.912 -7.000 0.000 1.000   NA
 10395224 10395225 GALLO_0526 GALLO_0527     TRUE 0.957 0.000 0.053 NA   NA
 10395225 10395226 GALLO_0527 GALLO_0528   valS TRUE 0.845 13.000 0.008 NA   NA
 10395226 10395227 GALLO_0528 GALLO_0529 valS   FALSE 0.020 336.000 0.000 1.000   NA
 10395227 10395228 GALLO_0529 GALLO_0530     FALSE 0.061 195.000 0.000 NA   NA
 10395228 10395229 GALLO_0530 GALLO_0531     FALSE 0.163 114.000 0.000 NA   NA
 10395231 10395232 GALLO_0533 GALLO_0534     FALSE 0.024 349.000 0.000 NA   NA
 10395233 10395234 GALLO_0535 GALLO_0536     FALSE 0.078 173.000 0.000 NA   NA
 10395235 10395236 GALLO_0537 GALLO_0538   coaD TRUE 0.882 33.000 0.367 1.000 N NA
 10395236 10395237 GALLO_0538 GALLO_0539 coaD   TRUE 0.928 -22.000 0.052 1.000 N NA
 10395237 10395238 GALLO_0539 GALLO_0540     FALSE 0.138 129.000 0.000 NA   NA
 10395238 10395239 GALLO_0540 GALLO_0541     FALSE 0.069 184.000 0.000 NA   NA
 10395239 10395240 GALLO_0541 GALLO_0542     FALSE 0.120 139.000 0.000 NA   NA
 10395240 10395241 GALLO_0542 GALLO_0543     FALSE 0.169 112.000 0.000 NA   NA
 10395241 10395242 GALLO_0543 GALLO_0544     TRUE 0.930 32.000 0.347 NA   NA
 10395242 10395243 GALLO_0544 GALLO_0545     TRUE 0.800 22.000 0.016 NA   NA
 10395243 10395244 GALLO_0545 GALLO_0546     TRUE 0.912 3.000 0.012 NA   NA
 10395244 10395245 GALLO_0546 GALLO_0547     FALSE 0.322 175.000 0.045 NA Y NA
 10395245 10395246 GALLO_0547 GALLO_0548     TRUE 0.999 -10.000 0.911 0.012 Y NA
 10395246 10395247 GALLO_0548 GALLO_0549     FALSE 0.068 341.000 0.000 1.000 Y NA
 10395247 10395248 GALLO_0549 GALLO_0550     TRUE 0.977 -3.000 0.136 NA   NA
 10395248 10395249 GALLO_0550 GALLO_0551     TRUE 0.990 0.000 0.500 NA   NA
 10395249 10395250 GALLO_0551 GALLO_0552     TRUE 0.999 2.000 0.857 0.012 Y NA
 10395252 10395253 GALLO_0554 GALLO_0555     TRUE 0.986 -19.000 0.237 NA   NA
 10395253 10395254 GALLO_0555 GALLO_0556     TRUE 0.995 -10.000 0.833 NA   NA
 10395254 10395255 GALLO_0556 GALLO_0557     TRUE 0.987 4.000 0.623 NA   NA
 10395255 10395256 GALLO_0557 GALLO_0558     TRUE 0.956 7.000 0.151 NA   NA
 10395256 10395257 GALLO_0558 GALLO_0559     FALSE 0.267 86.000 0.000 NA   NA
 10395257 10395258 GALLO_0559 GALLO_0560     TRUE 0.803 12.000 0.000 NA   NA
 10395258 10395259 GALLO_0560 GALLO_0561     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 10395259 10395260 GALLO_0561 GALLO_0562     TRUE 0.929 -10.000 0.000 NA   NA
 10395260 10395261 GALLO_0562 GALLO_0563     TRUE 0.919 -3.000 0.000 NA   NA
 10395261 10395262 GALLO_0563 GALLO_0565     FALSE 0.018 468.000 0.000 NA   NA
 10395262 10395263 GALLO_0565 GALLO_0566     FALSE 0.166 113.000 0.000 NA   NA
 10395263 10395264 GALLO_0566 GALLO_0567     TRUE 0.883 2.000 0.000 NA   NA
 10395264 10395265 GALLO_0567 GALLO_0568     TRUE 0.813 11.000 0.000 NA   NA
 10395265 10395266 GALLO_0568 GALLO_0569     TRUE 0.778 15.000 0.000 NA   NA
 10395266 10395267 GALLO_0569 GALLO_0570     TRUE 0.883 2.000 0.000 NA   NA
 10395267 10395268 GALLO_0570 GALLO_0571     TRUE 0.927 -46.000 0.000 NA   NA
 10395268 10395269 GALLO_0571 GALLO_0572     TRUE 0.962 45.000 1.000 NA   NA
 10395269 10395270 GALLO_0572 GALLO_0573     FALSE 0.045 224.000 0.000 NA   NA
 10395270 10395271 GALLO_0573 GALLO_0574     FALSE 0.260 87.000 0.000 NA   NA
 10395272 10395273 GALLO_0575 GALLO_0576     TRUE 0.929 -10.000 0.000 NA   NA
 10395274 10395275 GALLO_0577 GALLO_0578     FALSE 0.014 919.000 0.000 NA   NA
 10395275 10395276 GALLO_0578 GALLO_0579     FALSE 0.132 133.000 0.000 NA   NA
 10395276 10395277 GALLO_0579 GALLO_0580     TRUE 0.401 70.000 0.000 NA   NA
 10395277 10395278 GALLO_0580 GALLO_0581     FALSE 0.092 159.000 0.000 NA   NA
 10395278 10395279 GALLO_0581 GALLO_0582     FALSE 0.015 704.000 0.000 NA   NA
 10395279 10395280 GALLO_0582 GALLO_0583   trpE TRUE 0.942 14.000 0.022 1.000 Y NA
 10395280 10395281 GALLO_0583 GALLO_0584 trpE trpG TRUE 0.999 -3.000 0.321 0.001 Y NA
 10395281 10395282 GALLO_0584 GALLO_0585 trpG trpD TRUE 0.938 15.000 0.018 1.000 Y NA
 10395282 10395283 GALLO_0585 GALLO_0586 trpD trpC TRUE 0.992 -3.000 0.216 1.000 Y NA
 10395283 10395284 GALLO_0586 GALLO_0587 trpC trpF TRUE 0.998 -13.000 0.264 0.002 Y NA
 10395284 10395285 GALLO_0587 GALLO_0588 trpF trpB TRUE 0.999 -3.000 0.375 0.002 Y NA
 10395285 10395286 GALLO_0588 GALLO_0589 trpB trpA TRUE 0.997 4.000 0.248 0.001 Y NA
 10395287 10395288 GALLO_0590 GALLO_0591     FALSE 0.369 83.000 0.000 0.079 N NA
 10395289 10395290 GALLO_0592 GALLO_0593     FALSE 0.175 171.000 0.058 NA   NA
 10395290 10395291 GALLO_0593 GALLO_0594   glcK TRUE 0.992 -7.000 0.496 NA   NA
 10395291 10395292 GALLO_0594 GALLO_0595 glcK   TRUE 0.852 11.000 0.064 NA N NA
 10395292 10395293 GALLO_0595 GALLO_0596     TRUE 0.778 15.000 0.000 NA   NA
 10395293 10395294 GALLO_0596 GALLO_0597     FALSE 0.075 176.000 0.000 NA   NA
 10395294 10395295 GALLO_0597 GALLO_0598     FALSE 0.221 122.000 0.015 NA   NA
 10395295 10395296 GALLO_0598 GALLO_0599   murD FALSE 0.192 123.000 0.006 NA   NA
 10395296 10395297 GALLO_0599 GALLO_0600 murD murG TRUE 0.975 3.000 0.060 1.000 Y NA
 10395297 10395298 GALLO_0600 GALLO_0601 murG ftsQ TRUE 0.983 1.000 0.072 NA Y NA
 10395298 10395299 GALLO_0601 GALLO_0602 ftsQ ftsA TRUE 0.416 136.000 0.389 NA N NA
 10395299 10395300 GALLO_0602 GALLO_0603 ftsA ftsZ TRUE 0.979 21.000 0.460 1.000 Y NA
 10395300 10395301 GALLO_0603 GALLO_0604 ftsZ   TRUE 0.947 0.000 0.030 NA   NA
 10395301 10395302 GALLO_0604 GALLO_0605     TRUE 0.942 15.000 0.194 NA   NA
 10395302 10395303 GALLO_0605 GALLO_0606     TRUE 0.980 4.000 0.370 NA   NA
 10395303 10395304 GALLO_0606 GALLO_0607     TRUE 0.967 8.000 0.287 1.000   NA
 10395304 10395305 GALLO_0607 GALLO_0608   divIVA TRUE 0.981 11.000 0.579 NA   NA
 10395305 10395306 GALLO_0608 GALLO_0609 divIVA ileS FALSE 0.018 311.000 0.012 NA N NA
 10395307 10395308 GALLO_0610 GALLO_0611     TRUE 0.672 72.000 0.114 NA   NA
 10395308 10395309 GALLO_0611 GALLO_0612     FALSE 0.038 280.000 0.079 1.000 N NA
 10395309 10395310 GALLO_0612 GALLO_0613     FALSE 0.116 141.000 0.000 NA   NA
 10395310 10395311 GALLO_0613 GALLO_0614     TRUE 0.865 28.000 0.105 NA   NA
 10395312 10395313 GALLO_0615 GALLO_0616 argF   FALSE 0.250 135.000 0.052 NA   NA
 10395313 10395314 GALLO_0616 GALLO_0617     FALSE 0.076 254.000 0.044 NA   NA
 10395314 10395315 GALLO_0617 GALLO_0618     TRUE 0.996 0.000 0.640 1.000 Y NA
 10395315 10395316 GALLO_0618 GALLO_0619     FALSE 0.015 367.000 0.022 1.000 N NA
 10395316 10395317 GALLO_0619 GALLO_0620     TRUE 0.998 -3.000 0.871 1.000 Y NA
 10395317 10395318 GALLO_0620 GALLO_0621     TRUE 0.933 5.000 0.057 NA   NA
 10395318 10395319 GALLO_0621 GALLO_0622   folD FALSE 0.143 147.000 0.009 NA   NA
 10395319 10395320 GALLO_0622 GALLO_0623 folD   TRUE 0.912 -3.000 0.030 NA N NA
 10395320 10395321 GALLO_0623 GALLO_0624     FALSE 0.041 238.000 0.000 NA   NA
 10395321 10395322 GALLO_0624 GALLO_0625     TRUE 0.716 21.000 0.000 NA   NA
 10395322 10395323 GALLO_0625 GALLO_0626     FALSE 0.305 75.000 0.000 1.000   NA
 10395323 10395324 GALLO_0626 GALLO_0627     FALSE 0.017 396.000 0.000 1.000   NA
 10395324 10395325 GALLO_0627 GALLO_0628     TRUE 0.999 -10.000 0.412 0.001 Y NA
 10395325 10395326 GALLO_0628 GALLO_0629   ispA TRUE 0.934 0.000 0.100 1.000 N NA
 10395326 10395327 GALLO_0629 GALLO_0630 ispA   TRUE 0.929 -7.000 0.058 1.000 N NA
 10395327 10395328 GALLO_0630 GALLO_0631     TRUE 0.925 -13.000 0.048 1.000 N NA
 10395328 10395329 GALLO_0631 GALLO_0632   recN TRUE 0.752 14.000 0.037 1.000 N NA
 10395329 10395330 GALLO_0632 GALLO_0633 recN   FALSE 0.160 137.000 0.006 NA   NA
 10395330 10395331 GALLO_0633 GALLO_0634     TRUE 0.984 -7.000 0.203 NA   NA
 10395331 10395332 GALLO_0634 GALLO_0635     TRUE 0.995 -31.000 0.828 NA   NA
 10395332 10395333 GALLO_0635 GALLO_0636   hup TRUE 0.549 95.000 0.156 NA   NA
 10395333 10395334 GALLO_0636 GALLO_0637 hup   FALSE 0.066 187.000 0.000 NA   NA
 10395334 10395335 GALLO_0637 GALLO_0638     FALSE 0.019 412.000 0.000 NA   NA
 10395336 10395337 GALLO_0639 GALLO_0640 pyrD   FALSE 0.047 100.000 0.000 1.000 N NA
 10395338 10395339 GALLO_0641 GALLO_0642     TRUE 0.568 3.000 0.000 1.000 N NA
 10395339 10395340 GALLO_0642 GALLO_0643     TRUE 0.416 159.000 0.000 0.064 Y NA
 10395340 10395341 GALLO_0643 GALLO_0644   gpmA FALSE 0.010 217.000 0.000 1.000 N NA
 10395343 10395344 GALLO_0646 GALLO_0647     FALSE 0.169 197.000 0.107 NA   NA
 10395344 10395345 GALLO_0647 GALLO_0648   pbp2b FALSE 0.095 155.000 0.000 NA   NA
 10395345 10395346 GALLO_0648 GALLO_0649 pbp2b recR FALSE 0.264 69.000 0.013 1.000 N NA
 10395346 10395347 GALLO_0649 GALLO_0650 recR ddl FALSE 0.020 239.000 0.010 1.000 N NA
 10395349 10395350 GALLO_0652 GALLO_0653 murF   TRUE 0.794 13.000 0.000 NA   NA
 10395350 10395351 GALLO_0653 GALLO_0654   prfC FALSE 0.100 151.000 0.000 NA   NA
 10395351 10395352 GALLO_0654 GALLO_0655 prfC   FALSE 0.057 402.000 0.000 1.000 Y NA
 10395353 10395354 GALLO_0656 GALLO_0657     TRUE 0.983 -37.000 0.209 1.000   NA
 10395355 10395356 GALLO_0658 GALLO_0659   comEA FALSE 0.135 95.000 0.014 1.000 N NA
 10395356 10395357 GALLO_0659 GALLO_0660 comEA comEC TRUE 0.990 -7.000 0.130 0.063   NA
 10395357 10395358 GALLO_0660 GALLO_0661 comEC holA TRUE 0.679 74.000 0.163 1.000   NA
 10395358 10395359 GALLO_0661 GALLO_0662 holA sodA FALSE 0.143 89.000 0.012 1.000 N NA
 10395359 10395360 GALLO_0662 GALLO_0663 sodA   FALSE 0.099 152.000 0.000 NA   NA
 10395362 10395363 GALLO_0665 GALLO_0666   nagB FALSE 0.141 128.000 0.000 NA   NA
 10395363 10395364 GALLO_0666 GALLO_0667 nagB rluB FALSE 0.329 76.000 0.051 1.000 N NA
 10395364 10395365 GALLO_0667 GALLO_0668 rluB   TRUE 0.642 55.000 0.020 NA   NA
 10395365 10395366 GALLO_0668 GALLO_0669     TRUE 0.984 -10.000 0.204 NA   NA
 10395366 10395367 GALLO_0669 GALLO_0670     TRUE 0.458 74.000 0.022 1.000   NA
 10395367 10395368 GALLO_0670 GALLO_0671     TRUE 0.968 22.000 0.273 0.060   NA
 10395368 10395369 GALLO_0671 GALLO_0672     TRUE 0.571 54.000 0.012 1.000   NA
 10395369 10395370 GALLO_0672 GALLO_0673     FALSE 0.364 69.000 0.000 1.000   NA
 10395370 10395371 GALLO_0673 GALLO_0674   alaS FALSE 0.004 370.000 0.000 1.000 N NA
 10395371 10395372 GALLO_0674 GALLO_0675 alaS   TRUE 0.559 46.000 0.000 NA   NA
 10395372 10395373 GALLO_0675 GALLO_0676     FALSE 0.099 152.000 0.000 NA   NA
 10395373 10395374 GALLO_0676 GALLO_0677     TRUE 0.969 12.000 0.429 1.000   NA
 10395374 10395375 GALLO_0677 GALLO_0678     FALSE 0.012 201.000 0.000 1.000 N NA
 10395375 10395376 GALLO_0678 GALLO_0679     TRUE 0.980 -10.000 0.136 NA   NA
 10395376 10395377 GALLO_0679 GALLO_0680   argC FALSE 0.122 138.000 0.000 NA   NA
 10395377 10395378 GALLO_0680 GALLO_0681 argC argJ TRUE 0.969 72.000 0.303 0.003 Y NA
 10395378 10395379 GALLO_0681 GALLO_0682 argJ argB TRUE 0.989 14.000 0.067 0.003 Y NA
 10395379 10395380 GALLO_0682 GALLO_0683 argB argD TRUE 0.969 26.000 0.322 1.000 Y NA
 10395380 10395381 GALLO_0683 GALLO_0684 argD   FALSE 0.177 99.000 0.000 1.000   NA
 10395381 10395382 GALLO_0684 GALLO_0685     FALSE 0.107 273.000 0.000 0.027   NA
 10395382 10395383 GALLO_0685 GALLO_0686     TRUE 0.923 18.000 0.154 NA   NA
 10395385 10395386 GALLO_0688 GALLO_0689     FALSE 0.243 90.000 0.000 NA   NA
 10395386 10395387 GALLO_0689 GALLO_0690     FALSE 0.022 365.000 0.000 NA   NA
 10395387 10395388 GALLO_0690 GALLO_0691     TRUE 0.989 -3.000 0.362 NA   NA
 10395388 10395389 GALLO_0691 GALLO_0692   ribD FALSE 0.016 522.000 0.000 NA   NA
 10395389 10395390 GALLO_0692 GALLO_0693 ribD ribE TRUE 0.994 0.000 0.456 1.000 Y NA
 10395390 10395391 GALLO_0693 GALLO_0694 ribE ribA TRUE 0.970 1.000 0.011 1.000 Y NA
 10395391 10395392 GALLO_0694 GALLO_0695 ribA ribH TRUE 0.985 12.000 0.010 0.003 Y NA
 10395392 10395393 GALLO_0695 GALLO_0696 ribH   FALSE 0.025 326.000 0.000 NA   NA
 10395395 10395396 GALLO_0698 GALLO_0699     FALSE 0.081 154.000 0.000 1.000   NA
 10395396 10395397 GALLO_0699 GALLO_0700     FALSE 0.042 235.000 0.000 NA   NA
 10395397 10395398 GALLO_0700 GALLO_0701     TRUE 0.893 1.000 0.000 NA   NA
 10395398 10395399 GALLO_0701 GALLO_0702     TRUE 0.669 28.000 0.000 NA   NA
 10395400 10395401 GALLO_0703 GALLO_0704   nrdF FALSE 0.034 268.000 0.000 NA   NA
 10395401 10395402 GALLO_0704 GALLO_0705 nrdF nrdE TRUE 0.562 576.000 0.500 0.001 Y NA
 10395402 10395403 GALLO_0705 GALLO_0706 nrdE   TRUE 0.825 66.000 0.562 1.000 N NA
 10395404 10395405 GALLO_0707 GALLO_0708 citB citA TRUE 0.962 4.000 0.013 1.000 Y NA
 10395405 10395406 GALLO_0708 GALLO_0709 citA icd TRUE 0.942 29.000 0.140 1.000 Y NA
 10395406 10395407 GALLO_0709 GALLO_0710 icd   FALSE 0.314 80.000 0.000 NA   NA
 10395407 10395408 GALLO_0710 GALLO_0711     FALSE 0.029 290.000 0.000 NA   NA
 10395408 10395409 GALLO_0711 GALLO_0712     TRUE 0.973 1.000 0.200 1.000   NA
 10395409 10395410 GALLO_0712 GALLO_0713     TRUE 0.599 39.000 0.000 NA   NA
 10395410 10395411 GALLO_0713 GALLO_0714     FALSE 0.381 72.000 0.000 NA   NA
 10395412 10395413 GALLO_0715 GALLO_0716     TRUE 0.855 5.000 0.000 NA   NA
 10395414 10395415 GALLO_0717 GALLO_0718     FALSE 0.249 89.000 0.000 NA   NA
 10395415 10395416 GALLO_0718 GALLO_0719     TRUE 0.683 26.000 0.000 NA   NA
 10395416 10395417 GALLO_0719 GALLO_0720     FALSE 0.032 273.000 0.000 NA   NA
 10395417 10395418 GALLO_0720 GALLO_0721     TRUE 0.978 14.000 0.636 NA   NA
 10395418 10395419 GALLO_0721 GALLO_0722     TRUE 0.964 20.000 0.500 NA   NA
 10395419 10395420 GALLO_0722 GALLO_0723     TRUE 0.953 29.000 0.577 1.000   NA
 10395420 10395421 GALLO_0723 GALLO_0724     TRUE 0.989 0.000 0.474 NA   NA
 10395421 10395422 GALLO_0724 GALLO_0725     TRUE 0.994 -10.000 0.583 NA   NA
 10395422 10395423 GALLO_0725 GALLO_0726     TRUE 0.994 -13.000 0.667 NA   NA
 10395423 10395424 GALLO_0726 GALLO_0727     TRUE 0.947 27.000 0.417 NA   NA
 10395424 10395425 GALLO_0727 GALLO_0728   galE TRUE 0.622 35.000 0.000 NA   NA
 10395425 10395426 GALLO_0728 GALLO_0729 galE   FALSE 0.080 172.000 0.000 NA   NA
 10395426 10395427 GALLO_0729 GALLO_0730     TRUE 0.983 -3.000 0.214 NA   NA
 10395427 10395428 GALLO_0730 GALLO_0731     TRUE 0.991 -3.000 0.470 NA   NA
 10395428 10395429 GALLO_0731 GALLO_0732     TRUE 0.793 23.000 0.015 NA   NA
 10395430 10395431 GALLO_0733 GALLO_0734     TRUE 0.778 15.000 0.000 NA   NA
 10395432 10395433 GALLO_0735 GALLO_0736     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 10395433 10395434 GALLO_0736 GALLO_0737     FALSE 0.083 169.000 0.000 NA   NA
 10395434 10395435 GALLO_0737 GALLO_0738     FALSE 0.052 211.000 0.000 NA   NA
 10395435 10395436 GALLO_0738 GALLO_0739     TRUE 0.622 35.000 0.000 NA   NA
 10395436 10395437 GALLO_0739 GALLO_0740     FALSE 0.078 173.000 0.000 NA   NA
 10395438 10395439 GALLO_0741 GALLO_0742 rpmE   FALSE 0.130 160.000 0.020 1.000   NA
 10395439 10395440 GALLO_0742 GALLO_0743     TRUE 0.919 -3.000 0.000 NA   NA
 10395441 10395442 GALLO_0744 GALLO_0745 ptsH ptsI TRUE 0.995 5.000 0.240 0.026 Y NA
 10395442 10395443 GALLO_0745 GALLO_0746 ptsI   FALSE 0.016 403.000 0.035 1.000 N NA
 10395443 10395444 GALLO_0746 GALLO_0747     FALSE 0.177 185.000 0.000 1.000 Y NA
 10395444 10395445 GALLO_0747 GALLO_0748     FALSE 0.005 306.000 0.000 1.000 N NA
 10395447 10395448 GALLO_0750 GALLO_0751 udk   FALSE 0.094 156.000 0.000 NA   NA
 10395450 10395451 GALLO_0753 GALLO_0754     TRUE 0.958 10.000 0.033 1.000 Y NA
 10395451 10395452 GALLO_0754 GALLO_0755     TRUE 0.972 11.000 0.000 0.037 Y NA
 10395452 10395453 GALLO_0755 GALLO_0756     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.037 Y NA
 10395453 10395454 GALLO_0756 GALLO_0757     TRUE 0.927 11.000 0.000 1.000 Y NA
 10395454 10395455 GALLO_0757 GALLO_0758   leuA FALSE 0.004 389.000 0.000 1.000 N NA
 10395455 10395456 GALLO_0758 GALLO_0759 leuA leuB TRUE 0.947 51.000 0.005 0.002 Y NA
 10395456 10395457 GALLO_0759 GALLO_0760 leuB   TRUE 0.941 -3.000 0.007 NA   NA
 10395457 10395458 GALLO_0760 GALLO_0761   leuC TRUE 0.683 46.000 0.018 NA   NA
 10395458 10395459 GALLO_0761 GALLO_0762 leuC leuD TRUE 0.997 13.000 0.477 0.001 Y NA
 10395459 10395460 GALLO_0762 GALLO_0763 leuD   FALSE 0.035 148.000 0.000 NA N NA
 10395460 10395461 GALLO_0763 GALLO_0764   dnaX TRUE 0.897 0.000 0.030 NA N NA
 10395461 10395462 GALLO_0764 GALLO_0765 dnaX   TRUE 0.838 69.000 0.000 0.051 Y NA
 10395462 10395463 GALLO_0765 GALLO_0766     TRUE 0.990 -24.000 0.000 0.051 Y NA
 10395463 10395464 GALLO_0766 GALLO_0767     FALSE 0.023 362.000 0.000 NA   NA
 10395468 10395469 GALLO_0771 GALLO_0772   murAB FALSE 0.043 230.000 0.000 NA   NA
 10395469 10395470 GALLO_0772 GALLO_0773 murAB   FALSE 0.274 85.000 0.052 1.000 N NA
 10395470 10395471 GALLO_0773 GALLO_0774     TRUE 0.981 -7.000 0.342 1.000 N NA
 10395471 10395472 GALLO_0774 GALLO_0775   map FALSE 0.348 118.000 0.235 1.000 N NA
 10395472 10395473 GALLO_0775 GALLO_0776 map   TRUE 0.982 2.000 0.373 1.000   NA
 10395475 10395476 GALLO_0778 GALLO_0779   ligA FALSE 0.251 105.000 0.010 NA   NA
 10395476 10395477 GALLO_0779 GALLO_0780 ligA   TRUE 0.593 19.000 0.013 1.000 N NA
 10395477 10395478 GALLO_0780 GALLO_0781     TRUE 0.799 18.000 0.088 1.000 N NA
 10395478 10395479 GALLO_0781 GALLO_0782     TRUE 0.926 70.000 0.067 0.016 Y NA
 10395479 10395480 GALLO_0782 GALLO_0783     TRUE 0.998 2.000 0.317 0.002 Y NA
 10395480 10395481 GALLO_0783 GALLO_0784     TRUE 0.999 -10.000 0.810 0.001 Y NA
 10395481 10395482 GALLO_0784 GALLO_0785     TRUE 0.995 -3.000 0.395 1.000 Y NA
 10395482 10395483 GALLO_0785 GALLO_0786     TRUE 0.965 18.000 0.171 1.000 Y NA
 10395483 10395484 GALLO_0786 GALLO_0787   atpE FALSE 0.023 303.000 0.000 1.000   NA
 10395484 10395485 GALLO_0787 GALLO_0788 atpE atpB TRUE 0.956 39.000 0.189 0.009   NA
 10395485 10395486 GALLO_0788 GALLO_0789 atpB atpF TRUE 0.976 22.000 0.032 0.009 Y NA
 10395486 10395487 GALLO_0789 GALLO_0790 atpF atpH TRUE 0.997 0.000 0.222 0.007 Y NA
 10395487 10395488 GALLO_0790 GALLO_0791 atpH atpA TRUE 0.997 16.000 0.864 0.007 Y NA
 10395488 10395489 GALLO_0791 GALLO_0792 atpA atpG TRUE 0.997 15.000 0.846 0.007 Y NA
 10395489 10395490 GALLO_0792 GALLO_0793 atpG atpD TRUE 0.985 67.000 0.724 0.007 Y NA
 10395490 10395491 GALLO_0793 GALLO_0794 atpD atpC TRUE 0.998 13.000 0.837 0.007 Y NA
 10395491 10395492 GALLO_0794 GALLO_0795 atpC   TRUE 0.611 65.000 0.039 NA   NA
 10395492 10395493 GALLO_0795 GALLO_0796   murAA TRUE 0.831 63.000 0.279 NA   NA
 10395493 10395494 GALLO_0796 GALLO_0797 murAA   TRUE 0.957 3.000 0.110 NA   NA
 10395494 10395495 GALLO_0797 GALLO_0798     TRUE 0.513 115.000 0.237 NA   NA
 10395495 10395496 GALLO_0798 GALLO_0799   pheS FALSE 0.049 197.000 0.000 1.000   NA
 10395496 10395497 GALLO_0799 GALLO_0800 pheS   TRUE 0.661 36.000 0.009 1.000   NA
 10395497 10395498 GALLO_0800 GALLO_0801   pheT TRUE 0.431 71.000 0.007 1.000   NA
 10395498 10395499 GALLO_0801 GALLO_0802 pheT rexB FALSE 0.021 150.000 0.000 1.000 N NA
 10395499 10395500 GALLO_0802 GALLO_0803 rexB rexA TRUE 0.997 -10.000 0.070 0.003 Y NA
 10395502 10395503 GALLO_0805 GALLO_0806     TRUE 0.786 14.000 0.000 NA   NA
 10395505 10395506 GALLO_0808 GALLO_0809 MiaA   FALSE 0.176 139.000 0.027 1.000   NA
 10395506 10395507 GALLO_0809 GALLO_0810     TRUE 0.927 -7.000 0.000 NA   NA
 10395507 10395508 GALLO_0810 GALLO_0811   rnz TRUE 0.593 40.000 0.000 NA   NA
 10395508 10395509 GALLO_0811 GALLO_0812 rnz   TRUE 0.965 -3.000 0.074 1.000   NA
 10395509 10395510 GALLO_0812 GALLO_0813   recJ TRUE 0.660 42.000 0.016 1.000   NA
 10395510 10395511 GALLO_0813 GALLO_0814 recJ   FALSE 0.070 167.000 0.000 1.000   NA
 10395511 10395512 GALLO_0814 GALLO_0815     FALSE 0.058 200.000 0.000 NA   NA
 10395513 10395514 GALLO_0816 GALLO_0817     FALSE 0.212 98.000 0.000 NA   NA
 10395515 10395516 GALLO_0818 GALLO_0819 bsh   TRUE 0.756 17.000 0.000 NA   NA
 10395516 10395517 GALLO_0819 GALLO_0820     FALSE 0.081 171.000 0.000 NA   NA
 10395517 10395518 GALLO_0820 GALLO_0821     TRUE 0.984 2.000 0.713 1.000 N NA
 10395518 10395519 GALLO_0821 GALLO_0822     TRUE 0.649 42.000 0.085 1.000 N NA
 10395519 10395520 GALLO_0822 GALLO_0823   apt FALSE 0.017 168.000 0.000 1.000 N NA
 10395520 10395521 GALLO_0823 GALLO_0824 apt metA FALSE 0.090 107.000 0.009 1.000 N NA
 10395521 10395522 GALLO_0824 GALLO_0825 metA dnaD FALSE 0.201 91.000 0.021 NA N NA
 10395522 10395523 GALLO_0825 GALLO_0826 dnaD nth TRUE 0.975 0.000 0.007 NA Y NA
 10395523 10395524 GALLO_0826 GALLO_0827 nth   TRUE 0.513 64.000 0.006 NA   NA
 10395524 10395525 GALLO_0827 GALLO_0828     TRUE 0.988 -13.000 0.283 NA   NA
 10395525 10395526 GALLO_0828 GALLO_0829   rmlA FALSE 0.066 187.000 0.000 NA   NA
 10395526 10395527 GALLO_0829 GALLO_0830 rmlA rmlC TRUE 0.988 0.000 0.149 1.000 Y NA
 10395527 10395528 GALLO_0830 GALLO_0831 rmlC rmlB TRUE 0.569 173.000 0.350 1.000 Y NA
 10395528 10395529 GALLO_0831 GALLO_0832 rmlB   FALSE 0.122 138.000 0.000 NA   NA
 10395529 10395530 GALLO_0832 GALLO_0833     FALSE 0.152 120.000 0.000 NA   NA
 10395530 10395531 GALLO_0833 GALLO_0834     TRUE 0.447 93.000 0.074 NA   NA
 10395531 10395532 GALLO_0834 GALLO_0835     TRUE 0.989 -10.000 0.324 NA   NA
 10395532 10395533 GALLO_0835 GALLO_0836     FALSE 0.025 282.000 0.000 1.000   NA
 10395533 10395534 GALLO_0836 GALLO_0837     FALSE 0.047 100.000 0.000 1.000 N NA
 10395534 10395535 GALLO_0837 GALLO_0838   alsS FALSE 0.004 391.000 0.000 1.000 N NA
 10395535 10395536 GALLO_0838 GALLO_0839 alsS alsD FALSE 0.296 79.000 0.044 1.000 N NA
 10395536 10395537 GALLO_0839 GALLO_0840 alsD   FALSE 0.003 560.000 0.000 1.000 N NA
 10395538 10395539 GALLO_0841 GALLO_0842 fbp   FALSE 0.111 144.000 0.000 NA   NA
 10395539 10395540 GALLO_0842 GALLO_0843     TRUE 0.925 -6.000 0.000 NA   NA
 10395541 10395542 GALLO_0844 GALLO_0845     TRUE 0.906 16.000 0.000 1.000 Y NA
 10395542 10395543 GALLO_0845 GALLO_0846     TRUE 0.911 15.000 0.000 1.000 Y NA
 10395543 10395544 GALLO_0846 GALLO_0847     TRUE 0.644 72.000 0.000 1.000 Y NA
 10395544 10395545 GALLO_0847 GALLO_0848     TRUE 0.715 -22.000 0.000 1.000 N NA
 10395545 10395546 GALLO_0848 GALLO_0849     TRUE 0.716 -10.000 0.000 1.000 N NA
 10395546 10395547 GALLO_0849 GALLO_0850     FALSE 0.026 318.000 0.000 NA   NA
 10395547 10395548 GALLO_0850 GALLO_0851     TRUE 0.951 21.000 0.368 NA   NA
 10395548 10395549 GALLO_0851 GALLO_0852     TRUE 0.995 -3.000 0.895 1.000   NA
 10395549 10395550 GALLO_0852 GALLO_0853     FALSE 0.099 152.000 0.000 NA   NA
 10395550 10395551 GALLO_0853 GALLO_0854     TRUE 0.843 7.000 0.000 NA   NA
 10395551 10395552 GALLO_0854 GALLO_0855     TRUE 0.883 2.000 0.000 NA   NA
 10395552 10395553 GALLO_0855 GALLO_0856     TRUE 0.927 -78.000 0.000 NA   NA
 10395553 10395554 GALLO_0856 GALLO_0857     TRUE 0.929 -10.000 0.000 NA   NA
 10395554 10395555 GALLO_0857 GALLO_0858     FALSE 0.044 227.000 0.000 NA   NA
 10395555 10395556 GALLO_0858 GALLO_0859     FALSE 0.078 157.000 0.000 1.000   NA
 10395556 10395557 GALLO_0859 GALLO_0860     FALSE 0.307 92.000 0.019 1.000   NA
 10395557 10395558 GALLO_0860 GALLO_0861     TRUE 0.510 46.000 0.000 1.000   NA
 10395558 10395559 GALLO_0861 GALLO_0862     TRUE 0.677 81.000 0.200 NA   NA
 10395559 10395560 GALLO_0862 GALLO_0863     FALSE 0.041 236.000 0.000 NA   NA
 10395560 10395561 GALLO_0863 GALLO_0864     TRUE 0.922 -7.000 0.048 1.000 N NA
 10395561 10395562 GALLO_0864 GALLO_0865     TRUE 0.998 0.000 0.325 0.011 Y NA
 10395562 10395563 GALLO_0865 GALLO_0866     FALSE 0.133 132.000 0.000 NA   NA
 10395563 10395564 GALLO_0866 GALLO_0867   acoA FALSE 0.118 140.000 0.000 NA   NA
 10395564 10395565 GALLO_0867 GALLO_0868 acoA   TRUE 0.995 32.000 0.769 0.001 Y NA
 10395565 10395566 GALLO_0868 GALLO_0869     TRUE 0.980 15.000 0.077 0.058 Y NA
 10395566 10395567 GALLO_0869 GALLO_0870     TRUE 0.498 146.000 0.136 1.000 Y NA
 10395567 10395568 GALLO_0870 GALLO_0871     FALSE 0.017 171.000 0.000 1.000 N NA
 10395568 10395569 GALLO_0871 GALLO_0872     TRUE 0.999 -7.000 0.870 0.036 Y NA
 10395569 10395570 GALLO_0872 GALLO_0873     TRUE 0.998 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 10395570 10395571 GALLO_0873 GALLO_0874     TRUE 0.934 21.000 0.055 1.000 Y NA
 10395573 10395574 GALLO_0876 GALLO_0877     FALSE 0.048 99.000 0.000 1.000 N NA
 10395575 10395576 GALLO_0878 GALLO_0879     TRUE 0.490 58.000 0.000 NA   NA
 10395576 10395577 GALLO_0879 GALLO_0880     FALSE 0.097 154.000 0.000 NA   NA
 10395578 10395579 GALLO_0881 GALLO_0882     TRUE 0.990 -7.000 0.386 NA   NA
 10395579 10395580 GALLO_0882 GALLO_0883     TRUE 0.929 4.000 0.038 NA   NA
 10395580 10395581 GALLO_0883 GALLO_0884     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 10395581 10395582 GALLO_0884 GALLO_0885     FALSE 0.249 89.000 0.000 NA   NA
 10395582 10395583 GALLO_0885 GALLO_0886     FALSE 0.111 133.000 0.000 1.000   NA
 10395583 10395584 GALLO_0886 GALLO_0887     FALSE 0.051 97.000 0.000 1.000 N NA
 10395584 10395585 GALLO_0887 GALLO_0888     FALSE 0.039 141.000 0.000 NA N NA
 10395585 10395586 GALLO_0888 GALLO_0889     FALSE 0.176 109.000 0.000 NA   NA
 10395587 10395588 GALLO_0890 GALLO_0891     FALSE 0.033 272.000 0.000 NA   NA
 10395588 10395589 GALLO_0891 GALLO_0892     TRUE 0.949 31.000 0.500 NA   NA
 10395590 10395591 GALLO_0893 GALLO_0894     FALSE 0.043 230.000 0.000 NA   NA
 10395591 10395592 GALLO_0894 GALLO_0895     TRUE 0.746 18.000 0.000 NA   NA
 10395593 10395594 GALLO_0896 GALLO_0897     FALSE 0.136 130.000 0.000 NA   NA
 10395595 10395596 GALLO_0898 GALLO_0899     TRUE 0.919 -3.000 0.000 NA   NA
 10395596 10395597 GALLO_0899 GALLO_0900     TRUE 0.965 -7.000 0.047 NA   NA
 10395597 10395598 GALLO_0900 GALLO_0901     TRUE 0.490 58.000 0.000 NA   NA
 10395598 10395599 GALLO_0901 GALLO_0902     TRUE 0.516 61.000 0.010 1.000   NA
 10395599 10395600 GALLO_0902 GALLO_0903     FALSE 0.042 235.000 0.000 NA   NA
 10395600 10395601 GALLO_0903 GALLO_0904     FALSE 0.089 162.000 0.000 NA   NA
 10395601 10395602 GALLO_0904 GALLO_0905     TRUE 0.617 36.000 0.000 NA   NA
 10395602 10395603 GALLO_0905 GALLO_0906     FALSE 0.271 152.000 0.118 NA   NA
 10395603 10395604 GALLO_0906 GALLO_0907     TRUE 0.843 23.000 0.051 NA   NA
 10395604 10395605 GALLO_0907 GALLO_0908     TRUE 0.893 1.000 0.000 NA   NA
 10395605 10395606 GALLO_0908 GALLO_0909     TRUE 0.734 19.000 0.000 NA   NA
 10395606 10395607 GALLO_0909 GALLO_0910     FALSE 0.181 98.000 0.000 1.000   NA
 10395607 10395608 GALLO_0910 GALLO_0911     TRUE 0.917 12.000 0.095 1.000   NA
 10395608 10395609 GALLO_0911 GALLO_0912     FALSE 0.196 103.000 0.000 NA   NA
 10395609 10395610 GALLO_0912 GALLO_0913     TRUE 0.669 28.000 0.000 NA   NA
 10395610 10395611 GALLO_0913 GALLO_0914     FALSE 0.111 144.000 0.000 NA   NA
 10395611 10395612 GALLO_0914 GALLO_0915     FALSE 0.023 354.000 0.000 NA   NA
 10395612 10395613 GALLO_0915 GALLO_0916     FALSE 0.087 165.000 0.000 NA   NA
 10395613 10395614 GALLO_0916 GALLO_0917     TRUE 0.942 6.000 0.000 1.000 Y NA
 10395614 10395615 GALLO_0917 GALLO_0918     TRUE 0.957 2.000 0.000 1.000 Y NA
 10395615 10395616 GALLO_0918 GALLO_0919     TRUE 0.984 4.000 0.000 0.018 Y NA
 10395616 10395617 GALLO_0919 GALLO_0920     FALSE 0.086 92.000 0.000 NA N NA
 10395617 10395618 GALLO_0920 GALLO_0921     TRUE 0.518 53.000 0.000 NA   NA
 10395619 10395620 GALLO_0922 GALLO_0923     TRUE 0.454 75.000 0.000 0.055 N NA
 10395621 10395622 GALLO_0924 GALLO_0925     FALSE 0.056 204.000 0.000 NA   NA
 10395624 10395625 GALLO_0927 GALLO_0928 uvrC   TRUE 0.929 -13.000 0.000 NA   NA
 10395625 10395626 GALLO_0928 GALLO_0929     FALSE 0.145 126.000 0.000 NA   NA
 10395626 10395627 GALLO_0929 GALLO_0930     FALSE 0.093 158.000 0.000 NA   NA
 10395627 10395628 GALLO_0930 GALLO_0931     FALSE 0.184 161.000 0.179 1.000 N NA
 10395628 10395629 GALLO_0931 GALLO_0932     FALSE 0.228 90.000 0.031 NA N NA
 10395633 10395634 GALLO_0936 GALLO_0937   drm FALSE 0.291 164.000 0.018 1.000 Y NA
 10395634 10395635 GALLO_0937 GALLO_0938 drm punA TRUE 0.933 10.000 0.240 1.000 N NA
 10395635 10395636 GALLO_0938 GALLO_0939 punA   TRUE 0.842 51.000 0.029 1.000 Y NA
 10395636 10395637 GALLO_0939 GALLO_0940     TRUE 0.716 -16.000 0.000 1.000 N NA
 10395637 10395638 GALLO_0940 GALLO_0941   deoD TRUE 0.898 -43.000 0.027 1.000 N NA
 10395638 10395639 GALLO_0941 GALLO_0942 deoD   TRUE 0.968 0.000 0.107 NA   NA
 10395641 10395642 GALLO_0944 GALLO_0945 cpsA cpsB TRUE 0.982 1.000 0.583 1.000 N NA
 10395642 10395643 GALLO_0945 GALLO_0946 cpsB cpsC TRUE 0.992 9.000 0.636 1.000 Y NA
 10395643 10395644 GALLO_0946 GALLO_0947 cpsC cpsD TRUE 0.969 15.000 0.800 1.000 N NA
 10395644 10395645 GALLO_0947 GALLO_0948 cpsD cpsE TRUE 0.671 39.000 0.067 NA N NA
 10395645 10395646 GALLO_0948 GALLO_0949 cpsE cpsF TRUE 0.921 33.000 0.067 NA Y NA
 10395646 10395647 GALLO_0949 GALLO_0950 cpsF cpsH TRUE 0.573 43.000 0.000 NA   NA
 10395647 10395648 GALLO_0950 GALLO_0951 cpsH cpsI TRUE 0.947 6.000 0.105 NA   NA
 10395648 10395649 GALLO_0951 GALLO_0952 cpsI cpsJ TRUE 0.883 2.000 0.000 NA   NA
 10395649 10395650 GALLO_0952 GALLO_0953 cpsJ cpsK TRUE 0.927 -7.000 0.000 NA   NA
 10395650 10395651 GALLO_0953 GALLO_0954 cpsK cpsL TRUE 0.986 -7.000 0.065 0.074   NA
 10395651 10395652 GALLO_0954 GALLO_0955 cpsL cpsM TRUE 0.794 10.000 0.000 1.000   NA
 10395653 10395654 GALLO_0956 GALLO_0957     TRUE 0.734 19.000 0.000 NA   NA
 10395655 10395656 GALLO_0958 GALLO_0959     TRUE 0.996 2.000 0.200 0.018 Y NA
 10395656 10395657 GALLO_0959 GALLO_0960     TRUE 0.995 25.000 0.800 0.023 Y NA
 10395657 10395658 GALLO_0960 GALLO_0961     TRUE 0.931 52.000 0.250 1.000 Y NA
 10395658 10395659 GALLO_0961 GALLO_0962     FALSE 0.044 228.000 0.000 NA   NA
 10395659 10395660 GALLO_0962 GALLO_0963     TRUE 0.481 59.000 0.000 NA   NA
 10395660 10395661 GALLO_0963 GALLO_0964     TRUE 0.990 -24.000 0.000 0.050 Y NA
 10395663 10395664 GALLO_0966 GALLO_0967 pyrK pyrD TRUE 0.969 10.000 0.592 1.000 N NA
 10395664 10395665 GALLO_0967 GALLO_0968 pyrD pyrF TRUE 0.626 220.000 0.154 0.003 Y NA
 10395665 10395666 GALLO_0968 GALLO_0969 pyrF   TRUE 0.580 45.000 0.003 1.000   NA
 10395666 10395667 GALLO_0969 GALLO_0970   pyrE TRUE 0.573 48.000 0.004 1.000   NA
 10395667 10395668 GALLO_0970 GALLO_0971 pyrE   FALSE 0.319 79.000 0.000 NA   NA
 10395668 10395669 GALLO_0971 GALLO_0972   ung TRUE 0.746 18.000 0.000 NA   NA
 10395669 10395670 GALLO_0972 GALLO_0973 ung   TRUE 0.759 13.000 0.000 1.000   NA
 10395670 10395671 GALLO_0973 GALLO_0974   pyrC TRUE 0.809 8.000 0.000 1.000   NA
 10395673 10395674 GALLO_0976 GALLO_0977 parE   TRUE 0.833 16.000 0.012 NA   NA
 10395674 10395675 GALLO_0977 GALLO_0978   parC TRUE 0.803 12.000 0.000 NA   NA
 10395675 10395676 GALLO_0978 GALLO_0979 parC   FALSE 0.183 127.000 0.086 1.000 N NA
 10395676 10395677 GALLO_0979 GALLO_0980     TRUE 0.690 67.000 0.095 NA   NA
 10395677 10395678 GALLO_0980 GALLO_t0060     TRUE 0.457 62.000 0.000 NA   NA
 10395678 10395679 GALLO_t0060 GALLO_t0061     TRUE 0.628 34.000 0.000 NA   NA
 10395679 10395680 GALLO_t0061 GALLO_0981     FALSE 0.147 125.000 0.000 NA   NA
 10395680 10395681 GALLO_0981 GALLO_t0062     FALSE 0.381 72.000 0.000 NA   NA
 10395682 10395683 GALLO_0982 GALLO_0983     TRUE 0.975 -7.000 0.121 1.000   NA
 10395683 10395684 GALLO_0983 GALLO_0984     FALSE 0.078 173.000 0.000 NA   NA
 10395684 10395685 GALLO_0984 GALLO_0985     FALSE 0.048 620.000 0.114 NA   NA
 10395685 10395686 GALLO_0985 GALLO_0986     TRUE 0.979 9.000 0.471 NA   NA
 10395686 10395687 GALLO_0986 GALLO_0987     TRUE 0.972 2.000 0.412 1.000 N NA
 10395688 10395689 GALLO_0988 GALLO_0989 dnaE pfkA FALSE 0.313 91.000 0.098 1.000 N NA
 10395689 10395690 GALLO_0989 GALLO_0990 pfkA pyk TRUE 0.948 82.000 0.261 0.005 Y NA
 10395690 10395691 GALLO_0990 GALLO_0991 pyk sip FALSE 0.051 369.000 0.072 1.000   NA
 10395691 10395692 GALLO_0991 GALLO_0992 sip glmS FALSE 0.073 197.000 0.011 1.000   NA
 10395692 10395693 GALLO_0992 GALLO_0993 glmS   FALSE 0.006 526.000 0.003 1.000 N NA
 10395693 10395694 GALLO_0993 GALLO_0994     TRUE 0.963 26.000 0.336 0.025 N NA
 10395694 10395695 GALLO_0994 GALLO_0995     TRUE 0.977 3.000 0.131 0.025 N NA
 10395695 10395696 GALLO_0995 GALLO_0996   mtlD TRUE 0.941 19.000 0.062 1.000 Y NA
 10395696 10395697 GALLO_0996 GALLO_0997 mtlD   FALSE 0.029 186.000 0.007 1.000 N NA
 10395697 10395698 GALLO_0997 GALLO_0998     FALSE 0.042 186.000 0.018 1.000 N NA
 10395698 10395699 GALLO_0998 GALLO_0999     TRUE 0.970 12.000 0.130 1.000 Y NA
 10395699 10395700 GALLO_0999 GALLO_1000     TRUE 0.953 24.000 0.154 1.000 Y NA
 10395701 10395702 GALLO_1001 GALLO_1002     FALSE 0.209 174.000 0.060 0.074 N NA
 10395703 10395704 GALLO_1003 GALLO_1004     TRUE 0.921 64.000 0.333 1.000 Y NA
 10395704 10395705 GALLO_1004 GALLO_1005     TRUE 0.998 3.000 0.667 0.026 Y NA
 10395705 10395706 GALLO_1005 GALLO_1006     TRUE 0.999 -7.000 0.500 0.026 Y NA
 10395706 10395707 GALLO_1006 GALLO_1007     FALSE 0.176 109.000 0.000 NA   NA
 10395707 10395708 GALLO_1007 GALLO_1008     TRUE 0.843 7.000 0.000 NA   NA
 10395708 10395709 GALLO_1008 GALLO_1009   radC FALSE 0.194 47.000 0.000 1.000 N NA
 10395710 10395711 GALLO_1010 GALLO_1011     FALSE 0.255 146.000 0.083 NA   NA
 10395711 10395712 GALLO_1011 GALLO_1012     TRUE 0.970 2.000 0.166 NA   NA
 10395712 10395713 GALLO_1012 GALLO_1013   prs TRUE 0.972 8.000 0.089 1.000 Y NA
 10395713 10395714 GALLO_1013 GALLO_1014 prs   TRUE 0.557 86.000 0.145 1.000   NA
 10395715 10395716 GALLO_1015 GALLO_1016     TRUE 0.994 -25.000 0.725 1.000   NA
 10395716 10395717 GALLO_1016 GALLO_1017     TRUE 0.958 -3.000 0.150 1.000 N NA
 10395717 10395718 GALLO_1017 GALLO_1018   pta TRUE 0.781 17.000 0.067 1.000 N NA
 10395718 10395719 GALLO_1018 GALLO_1019 pta   TRUE 0.543 68.000 0.031 1.000   NA
 10395721 10395722 GALLO_1021 GALLO_1022     FALSE 0.070 167.000 0.000 1.000   NA
 10395723 10395724 GALLO_1023 GALLO_1024     TRUE 0.965 14.000 0.667 1.000 N NA
 10395727 10395728 GALLO_1027 GALLO_1028     TRUE 0.756 17.000 0.000 NA   NA
 10395728 10395729 GALLO_1028 GALLO_1029   xpt FALSE 0.022 373.000 0.000 NA   NA
 10395729 10395730 GALLO_1029 GALLO_1030 xpt   TRUE 0.975 2.000 0.046 1.000 Y NA
 10395731 10395732 GALLO_1031 GALLO_1032     FALSE 0.380 134.000 0.189 1.000   NA
 10395732 10395733 GALLO_1032 GALLO_1033     FALSE 0.188 105.000 0.000 NA   NA
 10395734 10395735 GALLO_1034 GALLO_1035 tdk prfA TRUE 0.617 39.000 0.062 1.000 N NA
 10395735 10395736 GALLO_1035 GALLO_1036 prfA   TRUE 0.993 0.000 0.084 0.049 Y NA
 10395736 10395737 GALLO_1036 GALLO_1037     TRUE 0.985 -7.000 0.029 NA Y NA
 10395737 10395738 GALLO_1037 GALLO_1038   glyA FALSE 0.144 104.000 0.015 NA N NA
 10395738 10395739 GALLO_1038 GALLO_1039 glyA   TRUE 0.803 45.000 0.103 NA   NA
 10395739 10395740 GALLO_1039 GALLO_1040     TRUE 0.971 0.000 0.128 NA   NA
 10395740 10395741 GALLO_1040 GALLO_1041     FALSE 0.313 40.000 0.000 NA N NA
 10395741 10395742 GALLO_1041 GALLO_1042     TRUE 0.999 2.000 0.895 0.011 Y NA
 10395746 10395747 GALLO_1046 GALLO_1047     TRUE 0.960 20.000 0.500 1.000   NA
 10395747 10395748 GALLO_1047 GALLO_1048     TRUE 0.999 -7.000 0.600 0.018 Y NA
 10395748 10395749 GALLO_1048 GALLO_1049     TRUE 0.749 88.000 0.150 1.000 Y NA
 10395749 10395750 GALLO_1049 GALLO_1050   guaA FALSE 0.023 146.000 0.000 1.000 N NA
 10395750 10395751 GALLO_1050 GALLO_1051 guaA   FALSE 0.006 288.000 0.000 1.000 N NA
 10395751 10395752 GALLO_1051 GALLO_1052     FALSE 0.033 271.000 0.000 NA   NA
 10395752 10395753 GALLO_1052 GALLO_1053     TRUE 0.987 -3.000 0.312 NA   NA
 10395753 10395754 GALLO_1053 GALLO_1054   rggA FALSE 0.024 296.000 0.000 1.000   NA
 10395754 10395755 GALLO_1054 GALLO_1055 rggA gtfA TRUE 0.415 61.000 0.000 1.000   NA
 10395755 10395756 GALLO_1055 GALLO_1056 gtfA rggB FALSE 0.019 349.000 0.000 1.000   NA
 10395756 10395757 GALLO_1056 GALLO_1057 rggB gtfB FALSE 0.195 93.000 0.000 1.000   NA
 10395757 10395758 GALLO_1057 GALLO_1058 gtfB   FALSE 0.069 169.000 0.000 1.000   NA
 10395758 10395759 GALLO_1058 GALLO_1059     TRUE 0.465 90.000 0.000 0.073   NA
 10395759 10395760 GALLO_1059 GALLO_1060     FALSE 0.225 95.000 0.000 NA   NA
 10395760 10395761 GALLO_1060 GALLO_1061     TRUE 0.464 61.000 0.000 NA   NA
 10395761 10395762 GALLO_1061 GALLO_1062     FALSE 0.111 144.000 0.000 NA   NA
 10395762 10395763 GALLO_1062 GALLO_1063     FALSE 0.050 213.000 0.000 NA   NA
 10395763 10395764 GALLO_1063 GALLO_1064     TRUE 0.995 -3.000 0.390 NA Y NA
 10395764 10395765 GALLO_1064 GALLO_1065     FALSE 0.135 63.000 0.000 1.000 N NA
 10395765 10395766 GALLO_1065 GALLO_1066     FALSE 0.192 104.000 0.000 NA   NA
 10395766 10395767 GALLO_1066 GALLO_1067     TRUE 0.883 2.000 0.000 NA   NA
 10395767 10395768 GALLO_1067 GALLO_1068     TRUE 0.929 -10.000 0.000 NA   NA
 10395768 10395769 GALLO_1068 GALLO_1069     TRUE 0.929 -16.000 0.000 NA   NA
 10395769 10395770 GALLO_1069 GALLO_1070     TRUE 0.642 32.000 0.000 NA   NA
 10395772 10395773 GALLO_1072 GALLO_1073     TRUE 0.855 5.000 0.000 NA   NA
 10395773 10395774 GALLO_1073 GALLO_1074     TRUE 0.716 21.000 0.000 NA   NA
 10395775 10395776 GALLO_1075 GALLO_1076     TRUE 0.994 -7.000 0.615 NA   NA
 10395777 10395778 GALLO_1077 GALLO_1078   ffh TRUE 0.698 71.000 0.151 1.000   NA
 10395780 10395781 GALLO_1080 GALLO_1081     TRUE 0.996 -3.000 0.118 0.011 Y NA
 10395781 10395782 GALLO_1081 GALLO_1082     TRUE 0.778 15.000 0.000 NA   NA
 10395782 10395783 GALLO_1082 GALLO_1083     TRUE 0.870 73.000 0.571 NA   NA
 10395783 10395784 GALLO_1083 GALLO_1084     TRUE 0.981 -7.000 0.182 1.000   NA
 10395784 10395785 GALLO_1084 GALLO_1085   xerC FALSE 0.021 319.000 0.000 1.000   NA
 10395786 10395787 GALLO_1086 GALLO_1087     TRUE 0.539 84.000 0.000 1.000 Y NA
 10395787 10395788 GALLO_1087 GALLO_1088     TRUE 0.997 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 10395788 10395789 GALLO_1088 GALLO_1089     TRUE 0.476 88.000 0.094 1.000   NA
 10395789 10395790 GALLO_1089 GALLO_1090     TRUE 0.992 2.000 0.855 1.000   NA
 10395790 10395791 GALLO_1090 GALLO_1091     FALSE 0.018 496.000 0.000 NA   NA
 10395791 10395792 GALLO_1091 GALLO_1092   gid TRUE 0.636 33.000 0.000 NA   NA
 10395792 10395793 GALLO_1092 GALLO_1093 gid   FALSE 0.074 177.000 0.000 NA   NA
 10395793 10395794 GALLO_1093 GALLO_1094     TRUE 0.756 17.000 0.000 NA   NA
 10395794 10395795 GALLO_1094 GALLO_1095     TRUE 0.982 0.000 0.250 NA   NA
 10395795 10395796 GALLO_1095 GALLO_1096   topA FALSE 0.128 148.000 0.003 NA   NA
 10395796 10395797 GALLO_1096 GALLO_1097 topA   TRUE 0.773 95.000 0.238 1.000 Y NA
 10395797 10395798 GALLO_1097 GALLO_1098     FALSE 0.377 75.000 0.005 1.000   NA
 10395798 10395799 GALLO_1098 GALLO_1099   rnhB TRUE 0.890 2.000 0.003 1.000   NA
 10395799 10395800 GALLO_1099 GALLO_1100 rnhB   TRUE 0.979 -13.000 0.148 1.000   NA
 10395802 10395803 GALLO_1102 GALLO_1103     FALSE 0.018 456.000 0.000 NA   NA
 10395803 10395804 GALLO_1103 GALLO_1104     TRUE 0.993 -7.000 0.000 0.011 Y NA
 10395804 10395805 GALLO_1104 GALLO_1105     TRUE 0.539 50.000 0.000 NA   NA
 10395805 10395806 GALLO_1105 GALLO_1106     TRUE 0.969 -7.000 0.061 NA   NA
 10395806 10395807 GALLO_1106 GALLO_1107     TRUE 0.944 3.000 0.061 NA   NA
 10395807 10395808 GALLO_1107 GALLO_1108     TRUE 0.497 98.000 0.000 0.026   NA
 10395808 10395809 GALLO_1108 GALLO_1109     FALSE 0.158 170.000 0.040 NA   NA
 10395809 10395810 GALLO_1109 GALLO_1110     TRUE 0.977 -3.000 0.142 NA   NA
 10395812 10395813 GALLO_1112 GALLO_1113 dapA asd TRUE 0.589 103.000 0.063 1.000 Y NA
 10395813 10395814 GALLO_1113 GALLO_1114 asd   FALSE 0.005 338.000 0.000 1.000 N NA
 10395814 10395815 GALLO_1114 GALLO_1115     FALSE 0.203 120.000 0.094 1.000 N NA
 10395815 10395816 GALLO_1115 GALLO_1116     FALSE 0.109 134.000 0.000 1.000   NA
 10395816 10395817 GALLO_1116 GALLO_1117     TRUE 0.588 41.000 0.000 NA   NA
 10395817 10395818 GALLO_1117 GALLO_1118     TRUE 0.628 34.000 0.000 NA   NA
 10395818 10395819 GALLO_1118 GALLO_1119     TRUE 0.988 -19.000 0.300 NA   NA
 10395820 10395821 GALLO_1120 GALLO_1121     TRUE 0.944 -7.000 0.013 1.000   NA
 10395821 10395822 GALLO_1121 GALLO_1122     FALSE 0.259 112.000 0.019 NA   NA
 10395822 10395823 GALLO_1122 GALLO_1123     FALSE 0.112 243.000 0.098 NA   NA
 10395824 10395825 GALLO_1124 GALLO_1125     FALSE 0.075 175.000 0.000 NA   NA
 10395825 10395826 GALLO_1125 GALLO_1126     FALSE 0.379 88.000 0.024 NA   NA
 10395826 10395827 GALLO_1126 GALLO_1127   srtA TRUE 0.496 58.000 0.039 NA N NA
 10395827 10395828 GALLO_1127 GALLO_1128 srtA gyrA TRUE 0.836 2.000 0.013 NA N NA
 10395830 10395831 GALLO_1130 GALLO_1131 nox   FALSE 0.114 130.000 0.000 1.000   NA
 10395831 10395832 GALLO_1131 GALLO_1132     TRUE 0.990 -24.000 0.000 0.049 Y NA
 10395832 10395833 GALLO_1132 GALLO_1133     FALSE 0.336 72.000 0.000 1.000   NA
 10395833 10395834 GALLO_1133 GALLO_1134     TRUE 0.996 2.000 0.720 0.034   NA
 10395834 10395835 GALLO_1134 GALLO_1135     TRUE 0.990 -7.000 0.438 1.000   NA
 10395835 10395836 GALLO_1135 GALLO_1136     FALSE 0.109 164.000 0.012 1.000   NA
 10395836 10395837 GALLO_1136 GALLO_1137   dra FALSE 0.054 189.000 0.000 1.000   NA
 10395837 10395838 GALLO_1137 GALLO_1138 dra   FALSE 0.003 491.000 0.000 1.000 N NA
 10395839 10395840 GALLO_1139 GALLO_1140 coaA rpsT FALSE 0.194 81.000 0.014 1.000 N NA
 10395841 10395842 GALLO_1141 GALLO_1142     TRUE 0.997 -10.000 0.606 1.000 Y NA
 10395842 10395843 GALLO_1142 GALLO_1143     FALSE 0.062 198.000 0.061 1.000 N NA
 10395843 10395844 GALLO_1143 GALLO_1144     FALSE 0.061 223.000 0.067 NA N NA
 10395844 10395845 GALLO_1144 GALLO_1145     TRUE 0.973 31.000 0.413 NA Y NA
 10395845 10395846 GALLO_1145 GALLO_1146     TRUE 0.997 12.000 0.542 0.002 Y NA
 10395846 10395847 GALLO_1146 GALLO_1147     TRUE 0.997 11.000 0.490 0.004 Y NA
 10395847 10395848 GALLO_1147 GALLO_1148     TRUE 0.999 -10.000 0.907 0.004 Y NA
 10395848 10395849 GALLO_1148 GALLO_1149     TRUE 0.980 10.000 0.206 1.000 Y NA
 10395849 10395850 GALLO_1149 GALLO_1150     FALSE 0.340 143.000 0.303 NA N NA
 10395850 10395851 GALLO_1150 GALLO_1151     FALSE 0.113 143.000 0.000 NA   NA
 10395851 10395852 GALLO_1151 GALLO_1152     FALSE 0.051 212.000 0.000 NA   NA
 10395852 10395853 GALLO_1152 GALLO_1153     TRUE 0.794 13.000 0.000 NA   NA
 10395853 10395854 GALLO_1153 GALLO_1154     FALSE 0.158 117.000 0.000 NA   NA
 10395854 10395855 GALLO_1154 GALLO_1155     FALSE 0.103 137.000 0.000 1.000   NA
 10395855 10395856 GALLO_1155 GALLO_1156     FALSE 0.036 114.000 0.000 1.000 N NA
 10395856 10395857 GALLO_1156 GALLO_1157     FALSE 0.361 18.000 0.000 1.000 N NA
 10395857 10395858 GALLO_1157 GALLO_1158     TRUE 0.990 -10.000 0.337 NA   NA
 10395858 10395859 GALLO_1158 GALLO_1159     FALSE 0.355 143.000 0.169 NA   NA
 10395859 10395860 GALLO_1159 GALLO_1160   ribF TRUE 0.443 43.000 0.017 1.000 N NA
 10395860 10395861 GALLO_1160 GALLO_1161 ribF   TRUE 0.924 16.000 0.308 1.000 N NA
 10395861 10395862 GALLO_1161 GALLO_1162     FALSE 0.288 86.000 0.005 1.000   NA
 10395862 10395863 GALLO_1162 GALLO_1163     TRUE 0.986 -7.000 0.229 NA   NA
 10395863 10395864 GALLO_1163 GALLO_1164     FALSE 0.297 82.000 0.000 NA   NA
 10395864 10395865 GALLO_1164 GALLO_1165     TRUE 0.527 52.000 0.000 NA   NA
 10395865 10395866 GALLO_1165 GALLO_1166     TRUE 0.465 81.000 0.033 NA   NA
 10395866 10395867 GALLO_1166 GALLO_1167     FALSE 0.058 180.000 0.000 1.000   NA
 10395867 10395868 GALLO_1167 GALLO_1168     TRUE 0.989 -3.000 0.429 1.000   NA
 10395868 10395869 GALLO_1168 GALLO_1169     TRUE 0.991 0.000 0.562 NA   NA
 10395869 10395870 GALLO_1169 GALLO_1170     TRUE 0.519 85.000 0.081 NA   NA
 10395870 10395871 GALLO_1170 GALLO_1171     TRUE 0.996 -7.000 0.576 0.011 N NA
 10395871 10395872 GALLO_1171 GALLO_1172     FALSE 0.011 210.000 0.000 1.000 N NA
 10395872 10395873 GALLO_1172 GALLO_1173     TRUE 0.988 11.000 0.438 1.000 Y NA
 10395875 10395876 GALLO_1175 GALLO_1176     FALSE 0.053 210.000 0.000 NA   NA
 10395876 10395877 GALLO_1176 GALLO_1177     FALSE 0.059 197.000 0.000 NA   NA
 10395877 10395878 GALLO_1177 GALLO_1178   thiE FALSE 0.038 112.000 0.000 1.000 N NA
 10395878 10395879 GALLO_1178 GALLO_1179 thiE thiM TRUE 0.996 -7.000 0.061 0.004 Y NA
 10395879 10395880 GALLO_1179 GALLO_1180 thiM thiD TRUE 0.994 1.000 0.032 0.004 Y NA
 10395880 10395881 GALLO_1180 GALLO_1181 thiD tenA TRUE 0.985 -7.000 0.478 1.000 N NA
 10395881 10395882 GALLO_1181 GALLO_1182 tenA   TRUE 0.915 -13.000 0.000 1.000   NA
 10395882 10395883 GALLO_1182 GALLO_1183     TRUE 0.948 4.000 0.000 0.055   NA
 10395883 10395884 GALLO_1183 GALLO_1184   thiW TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 10395885 10395886 GALLO_1185 GALLO_1186     FALSE 0.026 318.000 0.000 NA   NA
 10395887 10395888 GALLO_1187 GALLO_1188     FALSE 0.041 139.000 0.000 NA N NA
 10395888 10395889 GALLO_1188 GALLO_1189   pdxS TRUE 0.989 12.000 0.488 NA Y NA
 10395890 10395891 GALLO_1190 GALLO_1191     FALSE 0.049 501.000 0.000 1.000 Y NA
 10395892 10395893 GALLO_1192 GALLO_1193     TRUE 0.932 30.000 0.333 NA   NA
 10395893 10395894 GALLO_1193 GALLO_1194     FALSE 0.103 148.000 0.000 NA   NA
 10395894 10395895 GALLO_1194 GALLO_1195     TRUE 0.909 0.000 0.041 NA N NA
 10395895 10395896 GALLO_1195 GALLO_1196     FALSE 0.113 131.000 0.000 1.000   NA
 10395896 10395897 GALLO_1196 GALLO_1197     FALSE 0.166 113.000 0.000 NA   NA
 10395897 10395898 GALLO_1197 GALLO_1198     FALSE 0.127 135.000 0.000 NA   NA
 10395898 10395899 GALLO_1198 GALLO_1199     FALSE 0.306 81.000 0.000 NA   NA
 10395899 10395900 GALLO_1199 GALLO_1200     TRUE 0.805 31.000 0.049 NA   NA
 10395900 10395901 GALLO_1200 GALLO_1201     FALSE 0.071 179.000 0.000 NA   NA
 10395901 10395902 GALLO_1201 GALLO_1202     FALSE 0.266 92.000 0.071 1.000 N NA
 10395902 10395903 GALLO_1202 GALLO_1203     TRUE 0.964 -3.000 0.071 1.000   NA
 10395903 10395904 GALLO_1203 GALLO_1204     TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.019   NA
 10395904 10395905 GALLO_1204 GALLO_1205     FALSE 0.103 137.000 0.000 1.000   NA
 10395905 10395906 GALLO_1205 GALLO_1206     TRUE 0.903 -3.000 0.000 1.000   NA
 10395908 10395909 GALLO_1208 GALLO_1209     TRUE 0.552 90.000 0.167 1.000   NA
 10395909 10395910 GALLO_1209 GALLO_1210     TRUE 0.960 41.000 0.842 NA   NA
 10395910 10395911 GALLO_1210 GALLO_1211     TRUE 0.946 15.000 0.211 NA   NA
 10395911 10395912 GALLO_1211 GALLO_1212     TRUE 0.965 8.000 0.085 0.022 N NA
 10395912 10395913 GALLO_1212 GALLO_1213     TRUE 0.884 49.000 0.128 0.022 N NA
 10395913 10395914 GALLO_1213 GALLO_1214     FALSE 0.037 254.000 0.000 NA   NA
 10395914 10395915 GALLO_1214 GALLO_1215     FALSE 0.169 112.000 0.000 NA   NA
 10395915 10395916 GALLO_1215 GALLO_1216     FALSE 0.062 194.000 0.000 NA   NA
 10395916 10395917 GALLO_1216 GALLO_1217     TRUE 0.579 75.000 0.066 NA   NA
 10395917 10395918 GALLO_1217 GALLO_1218     FALSE 0.205 100.000 0.000 NA   NA
 10395918 10395919 GALLO_1218 GALLO_1219     TRUE 0.949 9.000 0.137 NA   NA
 10395921 10395922 GALLO_1221 GALLO_1222     FALSE 0.019 362.000 0.000 1.000   NA
 10395922 10395923 GALLO_1222 GALLO_1223     FALSE 0.049 197.000 0.000 1.000   NA
 10395923 10395924 GALLO_1223 GALLO_1224     FALSE 0.219 155.000 0.033 0.071 N NA
 10395924 10395925 GALLO_1224 GALLO_1225     TRUE 0.997 -7.000 0.253 0.034 Y NA
 10395925 10395926 GALLO_1225 GALLO_1226     TRUE 0.998 -3.000 0.492 0.034 Y NA
 10395926 10395927 GALLO_1226 GALLO_1227     TRUE 0.999 -37.000 0.928 0.034 Y NA
 10395927 10395928 GALLO_1227 GALLO_1228   murB TRUE 0.635 28.000 0.041 1.000 N NA
 10395928 10395929 GALLO_1228 GALLO_1229 murB folK FALSE 0.070 129.000 0.010 1.000 N NA
 10395929 10395930 GALLO_1229 GALLO_1230 folK folB TRUE 0.990 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 10395930 10395931 GALLO_1230 GALLO_1231 folB folP TRUE 0.834 67.000 0.094 1.000 Y NA
 10395931 10395932 GALLO_1231 GALLO_1232 folP folE TRUE 0.906 38.000 0.073 1.000 Y NA
 10395932 10395933 GALLO_1232 GALLO_1233 folE folC TRUE 0.897 38.000 0.057 1.000 Y NA
 10395933 10395934 GALLO_1233 GALLO_1234 folC   FALSE 0.003 614.000 0.000 1.000 N NA
 10395934 10395935 GALLO_1234 GALLO_1235     TRUE 0.979 34.000 0.671 1.000 Y NA
 10395935 10395936 GALLO_1235 GALLO_1236     TRUE 0.997 -12.000 0.773 1.000 Y NA
 10395936 10395937 GALLO_1236 GALLO_1237     TRUE 0.999 -58.000 0.841 0.012 Y NA
 10395937 10395938 GALLO_1237 GALLO_1238     FALSE 0.103 249.000 0.000 1.000 Y NA
 10395938 10395939 GALLO_1238 GALLO_1239     TRUE 0.729 16.000 0.000 1.000   NA
 10395939 10395940 GALLO_1239 GALLO_1240   thrB TRUE 0.933 -58.000 0.005 1.000   NA
 10395940 10395941 GALLO_1240 GALLO_1241 thrB hom TRUE 0.826 58.000 0.036 1.000 Y NA
 10395947 10395948 GALLO_1247 GALLO_1248 rplL rplJ TRUE 0.986 69.000 0.884 0.021 Y NA
 10395949 10395950 GALLO_1249 GALLO_1250     FALSE 0.041 107.000 0.000 1.000 N NA
 10395950 10395951 GALLO_1250 GALLO_1251     FALSE 0.236 91.000 0.000 NA   NA
 10395952 10395953 GALLO_1252 GALLO_1253     TRUE 0.963 13.000 0.093 1.000 Y NA
 10395953 10395954 GALLO_1253 GALLO_1254     FALSE 0.076 299.000 0.000 0.058   NA
 10395954 10395955 GALLO_1254 GALLO_1255   clpX TRUE 0.889 11.000 0.043 1.000   NA
 10395955 10395956 GALLO_1255 GALLO_1256 clpX   TRUE 0.723 33.000 0.012 NA   NA
 10395956 10395957 GALLO_1256 GALLO_1257   dfrA TRUE 0.854 17.000 0.030 NA   NA
 10395957 10395958 GALLO_1257 GALLO_1258 dfrA ThyA TRUE 0.542 88.000 0.295 1.000 N NA
 10395959 10395960 GALLO_1259 GALLO_1260     TRUE 0.992 -7.000 0.183 1.000 Y NA
 10395960 10395961 GALLO_1260 GALLO_1261     FALSE 0.105 177.000 0.020 1.000   NA
 10395961 10395962 GALLO_1261 GALLO_1262     TRUE 0.978 -10.000 0.146 1.000   NA
 10395963 10395964 GALLO_1263 GALLO_1264     TRUE 0.668 42.000 0.097 1.000 N NA
 10395964 10395965 GALLO_1264 GALLO_1265     TRUE 0.999 -13.000 0.312 0.003 Y NA
 10395965 10395966 GALLO_1265 GALLO_1266     TRUE 0.998 -18.000 0.281 0.002 Y NA
 10395966 10395967 GALLO_1266 GALLO_1267     FALSE 0.009 293.000 0.000 NA N NA
 10395967 10395968 GALLO_1267 GALLO_1268     TRUE 0.942 17.000 0.030 NA Y NA
 10395968 10395969 GALLO_1268 GALLO_1269     FALSE 0.109 145.000 0.000 NA   NA
 10395969 10395970 GALLO_1269 GALLO_1270     TRUE 0.794 10.000 0.000 1.000   NA
 10395970 10395971 GALLO_1270 GALLO_1271     FALSE 0.243 152.000 0.000 1.000 Y NA
 10395971 10395972 GALLO_1271 GALLO_1272     TRUE 0.960 21.000 0.176 1.000 Y NA
 10395972 10395973 GALLO_1272 GALLO_1273     TRUE 0.997 10.000 0.545 0.012 Y NA
 10395973 10395974 GALLO_1273 GALLO_1274     TRUE 0.995 10.000 0.455 0.034 Y NA
 10395974 10395975 GALLO_1274 GALLO_1275     TRUE 0.447 27.000 0.005 1.000 N NA
 10395975 10395976 GALLO_1275 GALLO_1276     FALSE 0.094 157.000 0.000 NA   NA
 10395977 10395978 GALLO_1277 GALLO_1278     FALSE 0.374 67.000 0.000 1.000   NA
 10395979 10395980 GALLO_1279 GALLO_1280     TRUE 0.991 9.000 0.533 1.000 Y NA
 10395980 10395981 GALLO_1280 GALLO_1281     TRUE 0.964 30.000 0.800 1.000   NA
 10395981 10395982 GALLO_1281 GALLO_1282     FALSE 0.105 136.000 0.000 1.000   NA
 10395982 10395983 GALLO_1282 GALLO_1283     TRUE 0.997 -7.000 0.778 1.000 Y NA
 10395983 10395984 GALLO_1283 GALLO_1284     TRUE 0.935 13.000 0.312 1.000 N NA
 10395984 10395985 GALLO_1284 GALLO_1285     TRUE 0.994 -10.000 0.435 0.034 N NA
 10395985 10395986 GALLO_1285 GALLO_1286     TRUE 0.716 -10.000 0.000 1.000 N NA
 10395986 10395987 GALLO_1286 GALLO_1287     TRUE 0.974 -10.000 0.231 1.000 N NA
 10395987 10395988 GALLO_1287 GALLO_1288     FALSE 0.007 266.000 0.000 1.000 N NA
 10395988 10395989 GALLO_1288 GALLO_1289     TRUE 0.999 -10.000 1.000 0.010 Y NA
 10395989 10395990 GALLO_1289 GALLO_1290     TRUE 0.956 4.000 0.296 1.000 N NA
 10395990 10395991 GALLO_1290 GALLO_1291     FALSE 0.273 175.000 0.028 0.005 N NA
 10395991 10395992 GALLO_1291 GALLO_1292     TRUE 0.688 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10395992 10395993 GALLO_1292 GALLO_1293     FALSE 0.007 267.000 0.000 1.000 N NA
 10395995 10395996 GALLO_1295 GALLO_1296     TRUE 0.914 13.000 0.101 1.000   NA
 10395996 10395997 GALLO_1296 GALLO_1297     TRUE 0.976 -7.000 0.280 1.000 N NA
 10395997 10395998 GALLO_1297 GALLO_1298     TRUE 0.954 0.000 0.062 1.000   NA
 10395998 10395999 GALLO_1298 GALLO_1299     FALSE 0.033 241.000 0.000 1.000   NA
 10395999 10396000 GALLO_1299 GALLO_1300     TRUE 0.999 3.000 0.846 0.010 Y NA
 10396000 10396001 GALLO_1300 GALLO_1301     FALSE 0.365 78.000 0.008 1.000   NA
 10396001 10396002 GALLO_1301 GALLO_1302   cca TRUE 0.959 -3.000 0.056 1.000   NA
 10396002 10396003 GALLO_1302 GALLO_1303 cca dapB TRUE 0.865 -3.000 0.015 1.000 N NA
 10396003 10396004 GALLO_1303 GALLO_1304 dapB   TRUE 0.724 20.000 0.000 NA   NA
 10396004 10396005 GALLO_1304 GALLO_1305     TRUE 0.958 0.000 0.056 NA   NA
 10396005 10396006 GALLO_1305 GALLO_1306     FALSE 0.138 129.000 0.000 NA   NA
 10396006 10396007 GALLO_1306 GALLO_1307     TRUE 0.504 56.000 0.000 NA   NA
 10396007 10396008 GALLO_1307 GALLO_1308     FALSE 0.004 415.000 0.000 1.000 N NA
 10396008 10396009 GALLO_1308 GALLO_1309     FALSE 0.014 180.000 0.000 1.000 N NA
 10396009 10396010 GALLO_1309 GALLO_1310     FALSE 0.056 91.000 0.000 1.000 N NA
 10396010 10396011 GALLO_1310 GALLO_1311     TRUE 0.682 20.000 0.000 1.000   NA
 10396011 10396012 GALLO_1311 GALLO_1312     TRUE 0.818 49.000 0.000 0.025   NA
 10396012 10396013 GALLO_1312 GALLO_1313     FALSE 0.127 135.000 0.000 NA   NA
 10396013 10396014 GALLO_1313 GALLO_1314     TRUE 0.927 -93.000 0.000 NA   NA
 10396014 10396015 GALLO_1314 GALLO_1315     FALSE 0.054 207.000 0.000 NA   NA
 10396015 10396016 GALLO_1315 GALLO_1316   metE TRUE 0.945 14.000 0.030 1.000 Y NA
 10396016 10396017 GALLO_1316 GALLO_1317 metE   FALSE 0.010 218.000 0.000 1.000 N NA
 10396017 10396018 GALLO_1317 GALLO_1318   fruK TRUE 0.997 -3.000 0.816 1.000 Y NA
 10396018 10396019 GALLO_1318 GALLO_1319 fruK   TRUE 0.997 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 10396019 10396020 GALLO_1319 GALLO_1320     FALSE 0.007 261.000 0.000 1.000 N NA
 10396020 10396021 GALLO_1320 GALLO_1321     TRUE 0.893 1.000 0.000 NA   NA
 10396021 10396022 GALLO_1321 GALLO_1322   trmD TRUE 0.457 62.000 0.000 NA   NA
 10396022 10396023 GALLO_1322 GALLO_1323 trmD rimM TRUE 0.997 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 10396023 10396024 GALLO_1323 GALLO_t0063 rimM   FALSE 0.297 82.000 0.000 NA   NA
 10396024 10396025 GALLO_t0063 GALLO_t0064     TRUE 0.649 31.000 0.000 NA   NA
 10396025 10396026 GALLO_t0064 GALLO_1324     FALSE 0.043 231.000 0.000 NA   NA
 10396026 10396027 GALLO_1324 GALLO_1325   rpsP TRUE 0.941 25.000 0.385 1.000   NA
 10396027 10396028 GALLO_1325 GALLO_1326 rpsP   FALSE 0.097 154.000 0.000 NA   NA
 10396028 10396029 GALLO_1326 GALLO_1327     TRUE 0.778 15.000 0.000 NA   NA
 10396029 10396030 GALLO_1327 GALLO_1328     FALSE 0.071 179.000 0.000 NA   NA
 10396030 10396031 GALLO_1328 GALLO_1329     TRUE 0.734 19.000 0.000 NA   NA
 10396031 10396032 GALLO_1329 GALLO_1330     TRUE 0.797 73.000 0.308 NA   NA
 10396032 10396033 GALLO_1330 GALLO_1331     TRUE 0.994 12.000 0.923 1.000 Y NA
 10396033 10396034 GALLO_1331 GALLO_1332     TRUE 0.991 0.000 0.923 1.000 N NA
 10396034 10396035 GALLO_1332 GALLO_1333   pyrAB FALSE 0.024 244.000 0.017 1.000 N NA
 10396035 10396036 GALLO_1333 GALLO_1334 pyrAB pyrAA TRUE 0.743 169.000 0.117 0.001 Y NA
 10396036 10396037 GALLO_1334 GALLO_1335 pyrAA pyrB TRUE 0.656 79.000 0.014 1.000 Y NA
 10396037 10396038 GALLO_1335 GALLO_1336 pyrB pyrP TRUE 0.972 5.000 0.064 1.000 Y NA
 10396038 10396039 GALLO_1336 GALLO_1337 pyrP pyrR TRUE 0.937 32.000 0.140 1.000 Y NA
 10396039 10396040 GALLO_1337 GALLO_1338 pyrR rluD FALSE 0.034 255.000 0.048 1.000 N NA
 10396040 10396041 GALLO_1338 GALLO_1339 rluD   TRUE 0.944 -16.000 0.082 1.000 N NA
 10396041 10396042 GALLO_1339 GALLO_1340     TRUE 0.950 -3.000 0.119 1.000 N NA
 10396042 10396043 GALLO_1340 GALLO_1341   rpmA FALSE 0.009 221.000 0.000 1.000 N NA
 10396043 10396044 GALLO_1341 GALLO_1342 rpmA   TRUE 0.965 22.000 0.203 NA Y NA
 10396044 10396045 GALLO_1342 GALLO_1343   rplU TRUE 0.978 13.000 0.208 NA Y NA
 10396045 10396046 GALLO_1343 GALLO_1344 rplU   FALSE 0.050 196.000 0.000 1.000   NA
 10396046 10396047 GALLO_1344 GALLO_1345     TRUE 0.945 -9.000 0.013 1.000   NA
 10396047 10396048 GALLO_1345 GALLO_1346   thiI FALSE 0.109 106.000 0.014 1.000 N NA
 10396048 10396049 GALLO_1346 GALLO_1347 thiI   TRUE 0.864 38.000 0.349 1.000 N NA
 10396050 10396051 GALLO_1348 GALLO_1349     TRUE 0.477 139.000 0.308 NA   NA
 10396052 10396053 GALLO_1350 GALLO_1351     FALSE 0.322 98.000 0.022 NA   NA
 10396053 10396054 GALLO_1351 GALLO_1352   tyrA TRUE 0.908 12.000 0.058 NA   NA
 10396054 10396055 GALLO_1352 GALLO_1353 tyrA aroF TRUE 0.629 81.000 0.010 1.000 Y NA
 10396055 10396056 GALLO_1353 GALLO_1354 aroF aroB TRUE 0.995 2.000 0.110 0.003 Y NA
 10396056 10396057 GALLO_1354 GALLO_1355 aroB aroD TRUE 0.900 23.000 0.010 1.000 Y NA
 10396057 10396058 GALLO_1355 GALLO_1356 aroD aroC TRUE 0.996 -10.000 0.500 1.000 Y NA
 10396058 10396059 GALLO_1356 GALLO_1357 aroC   TRUE 0.976 -3.000 0.125 NA   NA
 10396061 10396062 GALLO_1359 GALLO_1360 rplT rpmI TRUE 0.992 52.000 0.928 0.021 Y NA
 10396062 10396063 GALLO_1360 GALLO_1361 rpmI infC TRUE 0.976 38.000 0.652 1.000 Y NA
 10396063 10396064 GALLO_1361 GALLO_1362 infC cmk FALSE 0.042 166.000 0.010 1.000 N NA
 10396064 10396065 GALLO_1362 GALLO_1363 cmk   TRUE 0.729 16.000 0.000 1.000   NA
 10396067 10396068 GALLO_1365 GALLO_1366     TRUE 0.703 54.000 0.051 NA   NA
 10396068 10396069 GALLO_1366 GALLO_1367     FALSE 0.234 113.000 0.013 NA   NA
 10396069 10396070 GALLO_1367 GALLO_1368     TRUE 0.794 13.000 0.000 NA   NA
 10396070 10396071 GALLO_1368 GALLO_1369     FALSE 0.150 122.000 0.000 NA   NA
 10396071 10396072 GALLO_1369 GALLO_1370     TRUE 0.928 -34.000 0.000 NA   NA
 10396072 10396073 GALLO_1370 GALLO_1371     FALSE 0.278 85.000 0.000 NA   NA
 10396073 10396074 GALLO_1371 GALLO_1372     TRUE 0.969 -3.000 0.075 NA   NA
 10396074 10396075 GALLO_1372 GALLO_1373     TRUE 0.929 -16.000 0.000 NA   NA
 10396075 10396076 GALLO_1373 GALLO_1374     TRUE 0.724 20.000 0.000 NA   NA
 10396076 10396077 GALLO_1374 GALLO_1375     TRUE 0.995 -3.000 0.385 NA Y NA
 10396077 10396078 GALLO_1375 GALLO_1376     TRUE 0.991 -3.000 0.154 NA Y NA
 10396078 10396079 GALLO_1376 GALLO_1377     TRUE 0.781 -3.000 0.000 NA N NA
 10396079 10396080 GALLO_1377 GALLO_1378     TRUE 0.982 0.000 0.500 1.000 N NA
 10396080 10396081 GALLO_1378 GALLO_1379     TRUE 0.986 -3.000 0.289 NA   NA
 10396081 10396082 GALLO_1379 GALLO_1380     TRUE 0.988 -10.000 0.289 NA   NA
 10396082 10396083 GALLO_1380 GALLO_1381     FALSE 0.365 212.000 0.212 1.000 Y NA
 10396083 10396084 GALLO_1381 GALLO_1382     FALSE 0.232 92.000 0.000 NA   NA
 10396084 10396085 GALLO_1382 GALLO_1383     FALSE 0.202 101.000 0.000 NA   NA
 10396085 10396086 GALLO_1383 GALLO_1384   sigA TRUE 0.831 24.000 0.044 NA   NA
 10396086 10396087 GALLO_1384 GALLO_1385 sigA dnaG TRUE 0.928 9.000 0.209 1.000 N NA
 10396089 10396090 GALLO_1387 GALLO_1388 rpsU   FALSE 0.025 284.000 0.000 1.000   NA
 10396090 10396091 GALLO_1388 GALLO_1389     FALSE 0.052 192.000 0.000 1.000   NA
 10396091 10396092 GALLO_1389 GALLO_1390     FALSE 0.039 243.000 0.000 NA   NA
 10396094 10396095 GALLO_1392 GALLO_1393     TRUE 0.607 116.000 0.133 1.000 Y NA
 10396095 10396096 GALLO_1393 GALLO_1394     TRUE 0.517 86.000 0.000 1.000 Y NA
 10396096 10396097 GALLO_1394 GALLO_1395     TRUE 0.982 12.000 0.000 0.002 Y NA
 10396097 10396098 GALLO_1395 GALLO_1396     FALSE 0.017 168.000 0.000 1.000 N NA
 10396098 10396099 GALLO_1396 GALLO_1397     TRUE 0.998 -10.000 0.289 0.026 Y NA
 10396099 10396100 GALLO_1397 GALLO_1398     FALSE 0.314 180.000 0.538 1.000 N NA
 10396101 10396102 GALLO_1399 GALLO_1400     TRUE 0.826 130.000 0.690 NA Y NA
 10396102 10396103 GALLO_1400 GALLO_1401     TRUE 0.999 0.000 0.793 0.033 Y NA
 10396104 10396105 GALLO_1402 GALLO_1403     TRUE 0.734 19.000 0.000 NA   NA
 10396105 10396106 GALLO_1403 GALLO_1404   uvrB TRUE 0.838 8.000 0.000 NA   NA
 10396107 10396108 GALLO_1405 GALLO_1406     TRUE 0.993 0.000 0.326 1.000 Y NA
 10396108 10396109 GALLO_1406 GALLO_1407     FALSE 0.058 530.000 0.000 0.025   NA
 10396110 10396111 GALLO_1408 GALLO_1409     FALSE 0.028 410.000 0.009 NA   NA
 10396111 10396112 GALLO_1409 GALLO_1410     FALSE 0.307 92.000 0.011 NA   NA
 10396112 10396113 GALLO_1410 GALLO_1411   rluB TRUE 0.474 82.000 0.043 NA   NA
 10396113 10396114 GALLO_1411 GALLO_1412 rluB   FALSE 0.032 125.000 0.000 1.000 N NA
 10396114 10396115 GALLO_1412 GALLO_1413     FALSE 0.154 387.000 0.000 0.033 Y NA
 10396116 10396117 GALLO_1414 GALLO_1415     TRUE 0.919 -3.000 0.000 NA   NA
 10396118 10396119 GALLO_1416 GALLO_1417     FALSE 0.009 229.000 0.000 1.000 N NA
 10396119 10396120 GALLO_1417 GALLO_1418   guaD FALSE 0.024 143.000 0.000 1.000 N NA
 10396120 10396121 GALLO_1418 GALLO_1419 guaD   FALSE 0.014 723.000 0.000 NA   NA
 10396121 10396122 GALLO_1419 GALLO_1420     TRUE 0.853 25.000 0.069 NA   NA
 10396122 10396123 GALLO_1420 GALLO_1421     TRUE 0.846 14.000 0.103 1.000 N NA
 10396123 10396124 GALLO_1421 GALLO_1422     FALSE 0.018 383.000 0.000 1.000   NA
 10396124 10396125 GALLO_1422 GALLO_1423     TRUE 0.919 -3.000 0.000 NA   NA
 10396125 10396126 GALLO_1423 GALLO_1424     FALSE 0.243 90.000 0.000 NA   NA
 10396126 10396127 GALLO_1424 GALLO_1425     TRUE 0.927 -57.000 0.000 NA   NA
 10396127 10396128 GALLO_1425 GALLO_1426     TRUE 0.551 48.000 0.000 NA   NA
 10396128 10396129 GALLO_1426 GALLO_1427     TRUE 0.636 33.000 0.000 NA   NA
 10396129 10396130 GALLO_1427 GALLO_1428     TRUE 0.655 30.000 0.000 NA   NA
 10396130 10396131 GALLO_1428 GALLO_1429     FALSE 0.089 162.000 0.000 NA   NA
 10396131 10396132 GALLO_1429 GALLO_1430     FALSE 0.257 110.000 0.093 NA N NA
 10396132 10396133 GALLO_1430 GALLO_1431   pheA FALSE 0.229 87.000 0.025 NA N NA
 10396133 10396134 GALLO_1431 GALLO_1432 pheA aroK TRUE 0.981 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 10396134 10396135 GALLO_1432 GALLO_1433 aroK aroE TRUE 0.980 -7.000 0.012 1.000 Y NA
 10396135 10396136 GALLO_1433 GALLO_1434 aroE lepA FALSE 0.009 222.000 0.000 1.000 N NA
 10396136 10396137 GALLO_1434 GALLO_1436 lepA   FALSE 0.013 1245.000 0.000 NA   NA
 11512413 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 4874.000 0.000 NA   NA
 11654776 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 4874.000 0.000 NA   NA
 11797168 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 4874.000 0.000 NA   NA
 11512414 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 4910.000 0.000 NA   NA
 11654777 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 4910.000 0.000 NA   NA
 11797169 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 4910.000 0.000 NA   NA
 11512415 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 4940.000 0.000 NA   NA
 11654778 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 4940.000 0.000 NA   NA
 11797170 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 4940.000 0.000 NA   NA
 11512416 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 4976.000 0.000 NA   NA
 11654779 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 4976.000 0.000 NA   NA
 11797171 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 4976.000 0.000 NA   NA
 11512417 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5006.000 0.000 NA   NA
 11654780 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5006.000 0.000 NA   NA
 11797172 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5006.000 0.000 NA   NA
 11512418 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5042.000 0.000 NA   NA
 11654781 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5042.000 0.000 NA   NA
 11797173 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5042.000 0.000 NA   NA
 11512419 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5072.000 0.000 NA   NA
 11654782 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5072.000 0.000 NA   NA
 11797174 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5072.000 0.000 NA   NA
 11512420 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5108.000 0.000 NA   NA
 11654783 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5108.000 0.000 NA   NA
 11797175 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5108.000 0.000 NA   NA
 11512421 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5138.000 0.000 NA   NA
 11654784 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5138.000 0.000 NA   NA
 11797176 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5138.000 0.000 NA   NA
 11512422 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5174.000 0.000 NA   NA
 11654785 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5174.000 0.000 NA   NA
 11797177 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5174.000 0.000 NA   NA
 11512423 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5204.000 0.000 NA   NA
 11654786 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5204.000 0.000 NA   NA
 11797178 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5204.000 0.000 NA   NA
 11512424 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5240.000 0.000 NA   NA
 11654787 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5240.000 0.000 NA   NA
 11797179 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5240.000 0.000 NA   NA
 11512425 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5270.000 0.000 NA   NA
 11654788 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5270.000 0.000 NA   NA
 11797180 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5270.000 0.000 NA   NA
 11512426 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5306.000 0.000 NA   NA
 11654789 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5306.000 0.000 NA   NA
 11797181 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5306.000 0.000 NA   NA
 11512427 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5336.000 0.000 NA   NA
 11654790 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5336.000 0.000 NA   NA
 11797182 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5336.000 0.000 NA   NA
 11512428 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5372.000 0.000 NA   NA
 11654791 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5372.000 0.000 NA   NA
 11797183 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5372.000 0.000 NA   NA
 11512429 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5402.000 0.000 NA   NA
 11654792 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5402.000 0.000 NA   NA
 11797184 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5402.000 0.000 NA   NA
 11512430 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5438.000 0.000 NA   NA
 11654793 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5438.000 0.000 NA   NA
 11797185 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5438.000 0.000 NA   NA
 11512431 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5468.000 0.000 NA   NA
 11654794 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5468.000 0.000 NA   NA
 11797186 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5468.000 0.000 NA   NA
 11512432 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5504.000 0.000 NA   NA
 11654795 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5504.000 0.000 NA   NA
 11797187 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5504.000 0.000 NA   NA
 11512433 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5533.000 0.000 NA   NA
 11654796 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5533.000 0.000 NA   NA
 11797188 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5533.000 0.000 NA   NA
 11512434 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5569.000 0.000 NA   NA
 11654797 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5569.000 0.000 NA   NA
 11797189 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5569.000 0.000 NA   NA
 11512435 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5599.000 0.000 NA   NA
 11654798 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5599.000 0.000 NA   NA
 11797190 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5599.000 0.000 NA   NA
 11512436 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5635.000 0.000 NA   NA
 11654799 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5635.000 0.000 NA   NA
 11797191 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5635.000 0.000 NA   NA
 11512437 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5665.000 0.000 NA   NA
 11654800 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5665.000 0.000 NA   NA
 11797192 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5665.000 0.000 NA   NA
 11512438 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5701.000 0.000 NA   NA
 11654801 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5701.000 0.000 NA   NA
 11797193 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5701.000 0.000 NA   NA
 11512439 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5730.000 0.000 NA   NA
 11654802 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5730.000 0.000 NA   NA
 11797194 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5730.000 0.000 NA   NA
 11512440 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5766.000 0.000 NA   NA
 11654803 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5766.000 0.000 NA   NA
 11797195 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5766.000 0.000 NA   NA
 11512441 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5796.000 0.000 NA   NA
 11654804 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5796.000 0.000 NA   NA
 11797196 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5796.000 0.000 NA   NA
 11512442 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5832.000 0.000 NA   NA
 11654805 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5832.000 0.000 NA   NA
 11797197 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5832.000 0.000 NA   NA
 11512443 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5862.000 0.000 NA   NA
 11654806 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5862.000 0.000 NA   NA
 11797198 10396132   GALLO_1430     FALSE NA 5862.000 0.000 NA   NA
 10396137 10396138 GALLO_1436 GALLO_1437   cas2 TRUE 0.961 -3.000 0.044 NA   NA
 10396138 10396139 GALLO_1437 GALLO_1438 cas2 cas1 TRUE 0.958 47.000 0.876 NA   NA
 10396139 10396140 GALLO_1438 GALLO_1439 cas1 cas5 FALSE 0.173 173.000 0.062 NA   NA
 10396140 10396141 GALLO_1439 GALLO_1440 cas5 ndk FALSE 0.185 106.000 0.000 NA   NA
 10396141 10396142 GALLO_1440 GALLO_1441 ndk   FALSE 0.014 1102.000 0.000 NA   NA
 11512444 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5188.000 0.000 NA   NA
 11654807 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5188.000 0.000 NA   NA
 11797199 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5188.000 0.000 NA   NA
 11512445 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5224.000 0.000 NA   NA
 11654808 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5224.000 0.000 NA   NA
 11797200 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5224.000 0.000 NA   NA
 11512446 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5254.000 0.000 NA   NA
 11654809 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5254.000 0.000 NA   NA
 11797201 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5254.000 0.000 NA   NA
 11512447 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5290.000 0.000 NA   NA
 11654810 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5290.000 0.000 NA   NA
 11797202 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5290.000 0.000 NA   NA
 11512448 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5320.000 0.000 NA   NA
 11654811 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5320.000 0.000 NA   NA
 11797203 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5320.000 0.000 NA   NA
 11512449 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5356.000 0.000 NA   NA
 11654812 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5356.000 0.000 NA   NA
 11797204 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5356.000 0.000 NA   NA
 11512450 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5386.000 0.000 NA   NA
 11654813 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5386.000 0.000 NA   NA
 11797205 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5386.000 0.000 NA   NA
 11512451 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5422.000 0.000 NA   NA
 11654814 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5422.000 0.000 NA   NA
 11797206 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5422.000 0.000 NA   NA
 11512452 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5452.000 0.000 NA   NA
 11654815 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5452.000 0.000 NA   NA
 11797207 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5452.000 0.000 NA   NA
 11512453 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5488.000 0.000 NA   NA
 11654816 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5488.000 0.000 NA   NA
 11797208 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5488.000 0.000 NA   NA
 11512454 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5518.000 0.000 NA   NA
 11654817 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5518.000 0.000 NA   NA
 11797209 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5518.000 0.000 NA   NA
 11512455 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5554.000 0.000 NA   NA
 11654818 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5554.000 0.000 NA   NA
 11797210 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5554.000 0.000 NA   NA
 11512456 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5584.000 0.000 NA   NA
 11654819 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5584.000 0.000 NA   NA
 11797211 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5584.000 0.000 NA   NA
 11512457 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5620.000 0.000 NA   NA
 11654820 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5620.000 0.000 NA   NA
 11797212 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5620.000 0.000 NA   NA
 11512458 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5650.000 0.000 NA   NA
 11654821 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5650.000 0.000 NA   NA
 11797213 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5650.000 0.000 NA   NA
 11512459 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5686.000 0.000 NA   NA
 11654822 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5686.000 0.000 NA   NA
 11797214 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5686.000 0.000 NA   NA
 11512460 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5716.000 0.000 NA   NA
 11654823 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5716.000 0.000 NA   NA
 11797215 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5716.000 0.000 NA   NA
 11512461 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5752.000 0.000 NA   NA
 11654824 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5752.000 0.000 NA   NA
 11797216 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5752.000 0.000 NA   NA
 11512462 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5782.000 0.000 NA   NA
 11654825 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5782.000 0.000 NA   NA
 11797217 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5782.000 0.000 NA   NA
 11512463 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5818.000 0.000 NA   NA
 11654826 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5818.000 0.000 NA   NA
 11797218 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5818.000 0.000 NA   NA
 11512464 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5848.000 0.000 NA   NA
 11654827 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5848.000 0.000 NA   NA
 11797219 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5848.000 0.000 NA   NA
 11512465 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5884.000 0.000 NA   NA
 11654828 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5884.000 0.000 NA   NA
 11797220 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5884.000 0.000 NA   NA
 11512466 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5914.000 0.000 NA   NA
 11654829 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5914.000 0.000 NA   NA
 11797221 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5914.000 0.000 NA   NA
 11512467 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5950.000 0.000 NA   NA
 11654830 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5950.000 0.000 NA   NA
 11797222 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5950.000 0.000 NA   NA
 11512468 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5980.000 0.000 NA   NA
 11654831 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5980.000 0.000 NA   NA
 11797223 10396138   GALLO_1437   cas2 FALSE NA 5980.000 0.000 NA   NA
 10396142 10396143 GALLO_1441 GALLO_1442     TRUE 0.983 12.000 0.750 NA   NA
 10396143 10396144 GALLO_1442 GALLO_1443     TRUE 0.438 96.000 0.077 NA   NA
 10396144 10396145 GALLO_1443 GALLO_1444     TRUE 0.987 -13.000 0.253 NA   NA
 10396145 10396146 GALLO_1444 GALLO_1445     TRUE 0.995 -3.000 0.876 NA   NA
 10396146 10396147 GALLO_1445 GALLO_1446     TRUE 0.991 0.000 0.546 NA   NA
 10396147 10396148 GALLO_1446 GALLO_1447     FALSE 0.016 560.000 0.000 NA   NA
 10396148 10396149 GALLO_1447 GALLO_1448     TRUE 0.883 2.000 0.000 NA   NA
 10396149 10396150 GALLO_1448 GALLO_1449     TRUE 0.989 -10.000 0.330 NA   NA
 10396150 10396151 GALLO_1449 GALLO_1450     FALSE 0.374 60.000 0.023 1.000 N NA
 10396151 10396152 GALLO_1450 GALLO_1451     TRUE 0.844 0.000 0.015 1.000 N NA
 10396152 10396153 GALLO_1451 GALLO_1452   hemN TRUE 0.862 5.000 0.060 1.000 N NA
 10396153 10396154 GALLO_1452 GALLO_1453 hemN   FALSE 0.042 106.000 0.000 1.000 N NA
 10396154 10396155 GALLO_1453 GALLO_1454     FALSE 0.340 142.000 0.150 NA   NA
 10396155 10396156 GALLO_1454 GALLO_1455     TRUE 0.992 -3.000 0.502 NA   NA
 10396157 10396158 GALLO_1456 GALLO_1457     TRUE 0.991 2.000 0.796 1.000   NA
 10396163 10396164 GALLO_1462 GALLO_1463   hisI' FALSE 0.009 233.000 0.000 1.000 N NA
 10396164 10396165 GALLO_1463 GALLO_1464 hisI' 'hisI TRUE 0.988 20.000 0.152 0.005 Y NA
 10396165 10396166 GALLO_1464 GALLO_1465 'hisI hisF TRUE 0.999 -3.000 0.430 0.005 Y NA
 10396166 10396167 GALLO_1465 GALLO_1466 hisF hisA TRUE 0.997 4.000 0.433 0.005 Y NA
 10396167 10396168 GALLO_1466 GALLO_1467 hisA hisH TRUE 0.968 52.000 0.124 0.005 Y NA
 10396168 10396169 GALLO_1467 GALLO_1468 hisH hisB TRUE 0.947 71.000 0.125 0.005 Y NA
 10396169 10396170 GALLO_1468 GALLO_1469 hisB serB TRUE 0.849 35.000 0.002 1.000 Y NA
 10396170 10396171 GALLO_1469 GALLO_1470 serB hisD TRUE 0.978 -7.000 0.003 1.000 Y NA
 10396171 10396172 GALLO_1470 GALLO_1471 hisD hisG TRUE 0.998 -3.000 0.254 0.005 Y NA
 10396172 10396173 GALLO_1471 GALLO_1472 hisG hisZ TRUE 0.991 0.000 0.239 1.000 Y NA
 10396173 10396174 GALLO_1472 GALLO_1473 hisZ hisC TRUE 0.891 27.000 0.012 1.000 Y NA
 10396174 10396175 GALLO_1473 GALLO_1474 hisC   FALSE 0.003 494.000 0.000 1.000 N NA
 10396175 10396176 GALLO_1474 GALLO_1475     FALSE 0.081 80.000 0.000 1.000 N NA
 10396176 10396177 GALLO_1475 GALLO_1476   gyrB FALSE 0.098 106.000 0.011 1.000 N NA
 10396177 10396178 GALLO_1476 GALLO_1477 gyrB   TRUE 0.917 1.000 0.013 1.000   NA
 10396178 10396179 GALLO_1477 GALLO_1478     TRUE 0.639 102.000 0.385 1.000   NA
 10396179 10396180 GALLO_1478 GALLO_t0065     FALSE 0.040 242.000 0.000 NA   NA
 10396180 10396181 GALLO_t0065 GALLO_1479   rplS TRUE 0.490 58.000 0.000 NA   NA
 10396181 10396182 GALLO_1479 GALLO_1480 rplS   FALSE 0.022 211.000 0.006 1.000 N NA
 10396182 10396183 GALLO_1480 GALLO_1481     TRUE 0.839 14.000 0.094 1.000 N NA
 10396183 10396184 GALLO_1481 GALLO_1482     TRUE 0.763 41.000 0.050 NA   NA
 10396184 10396185 GALLO_1482 GALLO_1483     FALSE 0.212 98.000 0.000 NA   NA
 10396185 10396186 GALLO_1483 GALLO_1484     FALSE 0.012 266.000 0.003 1.000 N NA
 10396186 10396187 GALLO_1484 GALLO_1485     TRUE 0.524 42.000 0.034 1.000 N NA
 10396187 10396188 GALLO_1485 GALLO_1486     FALSE 0.116 141.000 0.000 NA   NA
 10396188 10396189 GALLO_1486 GALLO_1487   asnS FALSE 0.138 129.000 0.000 NA   NA
 10396189 10396190 GALLO_1487 GALLO_1488 asnS   TRUE 0.734 19.000 0.000 NA   NA
 10396190 10396191 GALLO_1488 GALLO_1489     TRUE 0.863 4.000 0.000 NA   NA
 10396191 10396192 GALLO_1489 GALLO_1490     TRUE 0.982 -3.000 0.205 NA   NA
 10396192 10396193 GALLO_1490 GALLO_1491     TRUE 0.922 31.000 0.296 NA   NA
 10396195 10396196 GALLO_1493 GALLO_1494     TRUE 0.792 66.000 0.217 NA   NA
 10396197 10396198 GALLO_1495 GALLO_1496     TRUE 0.919 -3.000 0.000 NA   NA
 10396198 10396199 GALLO_1496 GALLO_1497     TRUE 0.898 3.000 0.004 NA   NA
 10396200 10396201 GALLO_1498 GALLO_1499 ftsX ftsE TRUE 0.996 -37.000 0.431 1.000 Y NA
 10396201 1