MicrobesOnline Operon Predictions for Yersinia pestis Z176003

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10386470 10386471 YPZ3_0001 YPZ3_0002   asnC TRUE 0.564 93.000 0.165 1.000 N NA
 10386473 10386474 YPZ3_0004 YPZ3_0005     TRUE 0.991 4.000 0.443 NA   NA
 10386475 10386476 YPZ3_0006 YPZ3_0007 kup   FALSE 0.010 205.000 0.010 1.000 N NA
 10386476 10386477 YPZ3_0007 YPZ3_0008   rbsK TRUE 0.880 51.000 0.010 1.000 Y NA
 10386478 10386479 YPZ3_0009 YPZ3_0010     TRUE 0.590 128.000 0.133 1.000   NA
 10386480 10386481 YPZ3_r1 YPZ3_t1     FALSE 0.281 181.000 0.000 NA   NA
 10386481 10386482 YPZ3_t1 YPZ3_r2     FALSE 0.149 253.000 0.000 NA   NA
 10386482 10386483 YPZ3_r2 YPZ3_r3     FALSE 0.425 110.000 0.000 NA   NA
 10386483 10386484 YPZ3_r3 YPZ3_0011   y1062 FALSE 0.017 503.000 0.000 NA   NA
 10386485 10386486 YPZ3_0012 YPZ3_0013 mobB   TRUE 0.997 -27.000 0.064 0.003 Y NA
 10386487 10386488 YPZ3_0014 YPZ3_0015   dsbA TRUE 0.891 28.000 0.111 NA   NA
 10386488 10386489 YPZ3_0015 YPZ3_0016 dsbA polA FALSE 0.015 492.000 0.000 1.000   NA
 10386489 10386490 YPZ3_0016 YPZ3_0017 polA   FALSE 0.274 358.000 0.000 0.088 Y NA
 10386492 10386493 YPZ3_0019 YPZ3_0020   hemN TRUE 0.441 183.000 0.107 NA   NA
 10386494 10386495 YPZ3_0021 YPZ3_0022 ntrC ntrB TRUE 0.998 8.000 0.587 0.084 Y NA
 10386495 10386496 YPZ3_0022 YPZ3_0023 ntrB glnA FALSE 0.042 253.000 0.053 1.000 N NA
 10386497 10386498 YPZ3_0024 YPZ3_0025 bipA   FALSE 0.045 322.000 0.007 1.000   NA
 10386498 10386499 YPZ3_0025 YPZ3_0026   rbn TRUE 0.718 37.000 0.031 1.000   NA
 10386499 10386500 YPZ3_0026 YPZ3_0027 rbn   TRUE 0.922 7.000 0.069 1.000   NA
 10386501 10386502 YPZ3_0028 YPZ3_0029     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10386504 10386505 YPZ3_0031 YPZ3_0032     TRUE 0.743 148.000 0.257 NA   NA
 10386507 10386508 YPZ3_0034 YPZ3_0035 recG   TRUE 0.858 1.000 0.076 1.000 N NA
 10386508 10386509 YPZ3_0035 YPZ3_0036   spoT TRUE 0.665 39.000 0.095 1.000 N NA
 10386509 10386510 YPZ3_0036 YPZ3_0037 spoT gmk FALSE 0.006 350.000 0.000 1.000 N NA
 10386512 10386513 YPZ3_0039 YPZ3_0040     FALSE 0.032 403.000 0.000 NA   NA
 10386514 10386515 YPZ3_0041 YPZ3_0042 rph pyrE FALSE 0.261 167.000 0.108 1.000 N NA
 10386516 10386517 YPZ3_0043 YPZ3_0044   dut FALSE 0.349 167.000 0.060 1.000   NA
 10386517 10386518 YPZ3_0044 YPZ3_0045 dut dfp TRUE 0.976 -19.000 0.201 1.000 N NA
 10386519 10386520 YPZ3_0046 YPZ3_0047 radC mutM FALSE 0.023 761.000 0.000 1.000 Y NA
 10386521 10386522 YPZ3_0048 YPZ3_0049 coaD kdtX TRUE 0.655 -3.000 0.023 NA N NA
 10386522 10386523 YPZ3_0049 YPZ3_0050 kdtX kdtA TRUE 0.986 1.000 0.083 NA Y NA
 10386523 10386524 YPZ3_0050 YPZ3_0051 kdtA rfaC FALSE 0.089 420.000 0.028 1.000 Y NA
 10386524 10386525 YPZ3_0051 YPZ3_0052 rfaC rfaF TRUE 0.998 0.000 0.205 0.001 Y NA
 10386525 10386526 YPZ3_0052 YPZ3_0053 rfaF rfaD TRUE 0.964 31.000 0.146 1.000 Y NA
 10386527 10386528 YPZ3_0054 YPZ3_0055 kbl tdh TRUE 0.986 10.000 0.547 1.000 N NA
 10386529 10386530 YPZ3_0056 YPZ3_0057     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.004   NA
 10386530 10386531 YPZ3_0057 YPZ3_0058     TRUE 0.878 24.000 0.088 1.000   NA
 10386531 10386532 YPZ3_0058 YPZ3_0059     TRUE 0.925 10.000 0.170 1.000 N NA
 10386533 10386534 YPZ3_0060 YPZ3_0061   secB FALSE 0.034 455.000 0.158 NA N NA
 10386534 10386535 YPZ3_0061 YPZ3_0062 secB gpsA TRUE 0.967 0.000 0.206 1.000 N NA
 10386535 10386536 YPZ3_0062 YPZ3_0063 gpsA cysE TRUE 0.474 263.000 0.429 1.000 N NA
 10386539 10386540 YPZ3_0066 YPZ3_0067 cpxA cpxR TRUE 0.999 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 10386541 10386542 YPZ3_0068 YPZ3_0069 cpxP   FALSE 0.008 678.000 0.000 NA   NA
 10386542 10386543 YPZ3_0069 YPZ3_0070   fieF FALSE 0.013 562.000 0.000 NA   NA
 10386543 10386544 YPZ3_0070 YPZ3_0071 fieF pfkA FALSE 0.036 218.000 0.040 1.000 N NA
 10386544 10386545 YPZ3_0071 YPZ3_0072 pfkA sbp1 FALSE 0.052 221.000 0.049 1.000 N NA
 10386546 10386547 YPZ3_0073 YPZ3_0074     FALSE 0.230 322.000 0.000 NA Y NA
 10386547 10386548 YPZ3_0074 YPZ3_0075     FALSE 0.164 66.000 0.000 1.000 N NA
 10386548 10386549 YPZ3_0075 YPZ3_0076     TRUE 0.993 -3.000 0.353 NA   NA
 10386551 10386552 YPZ3_0078 YPZ3_0079     FALSE 0.340 180.000 0.058 NA   NA
 10386554 10386555 YPZ3_0081 YPZ3_0082 fpr glpX FALSE 0.304 155.000 0.117 1.000 N NA
 10386555 10386556 YPZ3_0082 YPZ3_0083 glpX glpK FALSE 0.014 192.000 0.025 1.000 N NA
 10386556 10386557 YPZ3_0083 YPZ3_0084 glpK glpF FALSE 0.013 177.000 0.013 1.000 N NA
 10386557 10386558 YPZ3_0084 YPZ3_0085 glpF   FALSE 0.001 1075.000 0.000 1.000 N NA
 10386558 10386559 YPZ3_0085 YPZ3_0086     FALSE 0.008 334.000 0.000 1.000 N NA
 10386559 10386560 YPZ3_0086 YPZ3_0087     TRUE 0.996 -7.000 0.250 1.000 Y NA
 10386562 10386563 YPZ3_0089 YPZ3_0090   menA TRUE 0.747 193.000 0.158 NA Y NA
 10386563 10386564 YPZ3_0090 YPZ3_0091 menA hslU FALSE 0.048 236.000 0.051 1.000 N NA
 10386564 10386565 YPZ3_0091 YPZ3_0092 hslU hslV TRUE 0.988 71.000 0.752 1.000 Y NA
 10386565 10386566 YPZ3_0092 YPZ3_0093 hslV ftsN TRUE 0.465 100.000 0.122 NA N NA
 10386566 10386567 YPZ3_0093 YPZ3_0094 ftsN cytR TRUE 0.824 66.000 0.245 NA N NA
 10386567 10386568 YPZ3_0094 YPZ3_0095 cytR priA FALSE 0.002 353.000 0.013 1.000 N NA
 10386568 10386569 YPZ3_0095 YPZ3_0096 priA   FALSE 0.005 1001.000 0.000 NA   NA
 10386569 10386570 YPZ3_0096 YPZ3_0097   metJ FALSE 0.053 349.000 0.000 NA   NA
 10386571 10386572 YPZ3_0098 YPZ3_0099   metL TRUE 0.909 173.000 0.428 1.000 Y NA
 10386572 10386573 YPZ3_0099 YPZ3_0100 metL metF FALSE 0.415 233.000 0.017 1.000 Y NA
 10386574 10386575 YPZ3_0101 YPZ3_0102     TRUE 0.948 54.000 0.167 1.000 Y NA
 10386575 10386576 YPZ3_0102 YPZ3_0103   glpR FALSE 0.169 64.000 0.000 1.000 N NA
 10386576 10386577 YPZ3_0103 YPZ3_0104 glpR   TRUE 0.917 35.000 0.190 1.000   NA
 10386577 10386578 YPZ3_0104 YPZ3_0105     TRUE 0.924 75.000 0.405 1.000   NA
 10386578 10386579 YPZ3_0105 YPZ3_0106   malT FALSE 0.005 375.000 0.000 1.000 N NA
 10386580 10386581 YPZ3_0107 YPZ3_0108     TRUE 0.986 -18.000 0.000 0.023   NA
 10386581 10386582 YPZ3_0108 YPZ3_0109   malQ TRUE 0.992 13.000 0.137 0.023 Y NA
 10386583 10386584 YPZ3_0110 YPZ3_0111     TRUE 0.704 60.000 0.066 1.000   NA
 10386586 10386587 YPZ3_0113 YPZ3_0114 feoB   FALSE 0.001 843.000 0.000 1.000 N NA
 10386588 10386589 YPZ3_0115 YPZ3_0116 greB ompR TRUE 0.843 136.000 0.067 0.083 Y NA
 10386589 10386590 YPZ3_0116 YPZ3_0117 ompR envZ TRUE 0.999 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 10386591 10386592 YPZ3_0118 YPZ3_0119 pckA hslO FALSE 0.064 197.000 0.048 1.000 N NA
 10386592 10386593 YPZ3_0119 YPZ3_0120 hslO hslR FALSE 0.351 163.000 0.140 1.000 N NA
 10386593 10386594 YPZ3_0120 YPZ3_0121 hslR   TRUE 0.813 29.000 0.056 1.000   NA
 10386594 10386595 YPZ3_0121 YPZ3_0122     TRUE 0.538 144.000 0.122 1.000   NA
 10386598 10386599 YPZ3_0125 YPZ3_0126     TRUE 0.998 0.000 0.870 NA   NA
 10386599 10386600 YPZ3_0126 YPZ3_0127     TRUE 0.639 149.000 0.174 NA   NA
 10386602 10386603 YPZ3_0129 YPZ3_0130   aroK FALSE 0.271 349.000 0.319 1.000   NA
 10386603 10386604 YPZ3_0130 YPZ3_0131 aroK aroB TRUE 0.954 57.000 0.208 1.000 Y NA
 10386604 10386605 YPZ3_0131 YPZ3_0132 aroB   FALSE 0.125 254.000 0.022 NA   NA
 10386605 10386606 YPZ3_0132 YPZ3_0133   dam TRUE 0.842 84.000 0.234 NA   NA
 10386606 10386607 YPZ3_0133 YPZ3_0134 dam rpe FALSE 0.022 303.000 0.053 1.000 N NA
 10386607 10386608 YPZ3_0134 YPZ3_0135 rpe gph TRUE 0.955 -7.000 0.050 1.000   NA
 10386608 10386609 YPZ3_0135 YPZ3_0136 gph trpS TRUE 0.961 2.000 0.118 1.000   NA
 10386610 10386611 YPZ3_0137 YPZ3_0138 cysG nirC FALSE 0.268 88.000 0.065 1.000 N NA
 10386611 10386612 YPZ3_0138 YPZ3_0139 nirC nirD TRUE 0.816 203.000 0.283 1.000 Y NA
 10386612 10386613 YPZ3_0139 YPZ3_0140 nirD nirB TRUE 0.999 -3.000 0.829 0.001 N NA
 10386617 10386618 YPZ3_0144 YPZ3_0145     FALSE 0.353 249.000 0.267 1.000 N NA
 10386619 10386620 YPZ3_0146 YPZ3_0147 ppiA   FALSE 0.060 326.000 0.000 1.000   NA
 10386620 10386621 YPZ3_0147 YPZ3_0148   pabA FALSE 0.110 243.000 0.007 1.000   NA
 10386621 10386622 YPZ3_0148 YPZ3_0149 pabA   TRUE 0.753 133.000 0.088 1.000 Y NA
 10386623 10386624 YPZ3_0150 YPZ3_0151   crp TRUE 0.692 86.000 0.111 NA   NA
 10386625 10386626 YPZ3_0152 YPZ3_0153     FALSE 0.436 105.000 0.000 NA   NA
 10386627 10386628 YPZ3_0154 YPZ3_0155 prk   FALSE 0.038 382.000 0.000 NA   NA
 10386629 10386630 YPZ3_0156 YPZ3_0157   tauA FALSE 0.035 203.000 0.000 1.000 N NA
 10386630 10386631 YPZ3_0157 YPZ3_0158 tauA tauB TRUE 0.966 9.000 0.023 1.000 Y NA
 10386631 10386632 YPZ3_0158 YPZ3_0159 tauB tauC TRUE 0.999 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 10386632 10386633 YPZ3_0159 YPZ3_0160 tauC tauD TRUE 0.975 -3.000 0.214 1.000 N NA
 10386634 10386635 YPZ3_0161 YPZ3_0162     TRUE 0.528 93.000 0.053 NA   NA
 10386635 10386636 YPZ3_0162 YPZ3_0163     FALSE 0.323 135.000 0.020 NA   NA
 10386636 10386637 YPZ3_0163 YPZ3_0164     TRUE 0.985 -33.000 0.029 0.027   NA
 10386638 10386639 YPZ3_0165 YPZ3_0166   kefB TRUE 0.997 4.000 0.927 1.000   NA
 10386639 10386640 YPZ3_0166 YPZ3_0167 kefB slyD FALSE 0.008 332.000 0.000 1.000 N NA
 10386640 10386641 YPZ3_0167 YPZ3_0168 slyD fkpA FALSE 0.070 754.000 0.000 0.003 Y NA
 10386641 10386642 YPZ3_0168 YPZ3_0169 fkpA   TRUE 0.538 254.000 0.310 NA   NA
 10386642 10386643 YPZ3_0169 YPZ3_0170     TRUE 0.985 0.000 0.220 NA   NA
 10386643 10386644 YPZ3_0170 YPZ3_0171     TRUE 0.999 0.000 0.790 NA Y NA
 10386644 10386645 YPZ3_0171 YPZ3_0172   rpsl FALSE 0.005 445.000 0.000 NA N NA
 10386645 10386646 YPZ3_0172 YPZ3_0173 rpsl rpsG TRUE 0.990 97.000 0.620 0.003 Y NA
 10386646 10386647 YPZ3_0173 YPZ3_0174 rpsG fusA TRUE 0.971 94.000 0.579 1.000 Y NA
 10386647 10386648 YPZ3_0174 YPZ3_0175 fusA tuf TRUE 0.943 73.000 0.005 0.001 Y NA
 10386648 10386649 YPZ3_0175 YPZ3_0176 tuf   FALSE 0.058 152.000 0.000 1.000 N NA
 10386649 10386650 YPZ3_0176 YPZ3_0177   bfr FALSE 0.003 461.000 0.000 1.000 N NA
 10386650 10386651 YPZ3_0177 YPZ3_0178 bfr rpsJ FALSE 0.004 414.000 0.000 1.000 N NA
 10386651 10386652 YPZ3_0178 YPZ3_0179 rpsJ rplC TRUE 0.992 33.000 0.307 0.014 Y NA
 10386652 10386653 YPZ3_0179 YPZ3_0180 rplC rplD TRUE 0.997 17.000 0.486 0.010 Y NA
 10386653 10386654 YPZ3_0180 YPZ3_0181 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.010 Y NA
 10386654 10386655 YPZ3_0181 YPZ3_0182 rplW rplB TRUE 0.999 17.000 0.849 0.014 Y NA
 10386655 10840160 YPZ3_0182 YPZ3_0182a rplB   TRUE 0.999 15.000 0.820 0.014 Y NA
 10840160 10386656 YPZ3_0182a YPZ3_0183   rplV TRUE 0.999 15.000 0.769 0.014 Y NA
 10386656 10386657 YPZ3_0183 YPZ3_0184 rplV rpsC TRUE 0.998 18.000 0.719 0.014 Y NA
 10386657 10386658 YPZ3_0184 YPZ3_0185 rpsC rplP TRUE 0.999 13.000 0.828 0.014 Y NA
 10386658 10840161 YPZ3_0185 YPZ3_0185a rplP   TRUE 1.000 0.000 0.802 0.010 Y NA
 10840161 10386659 YPZ3_0185a YPZ3_0186   rplN FALSE 0.201 435.000 0.000 0.014 Y NA
 10386659 10386660 YPZ3_0186 YPZ3_0187 rplN rplX TRUE 0.999 11.000 0.810 0.014 Y NA
 10386660 10386661 YPZ3_0187 YPZ3_0188 rplX rplE TRUE 0.999 15.000 0.758 0.010 Y NA
 10386661 10386662 YPZ3_0188 YPZ3_0189 rplE rpsN TRUE 0.998 14.000 0.496 0.010 Y NA
 10386662 10386663 YPZ3_0189 YPZ3_0190 rpsN rpsH TRUE 0.995 34.000 0.473 0.010 Y NA
 10386663 10386664 YPZ3_0190 YPZ3_0191 rpsH rplF TRUE 0.999 15.000 0.808 0.010 Y NA
 10386664 10386665 YPZ3_0191 YPZ3_0192 rplF rplR TRUE 0.999 10.000 0.815 0.010 Y NA
 10386665 10386666 YPZ3_0192 YPZ3_0193 rplR rpsE TRUE 0.999 15.000 0.814 0.014 Y NA
 10386666 10386667 YPZ3_0193 YPZ3_0194 rpsE rplO TRUE 0.872 186.000 0.148 0.014 Y NA
 10386667 10386668 YPZ3_0194 YPZ3_0195 rplO secY TRUE 0.992 8.000 0.730 1.000 N NA
 10386668 10386669 YPZ3_0195 YPZ3_0196 secY rpsM FALSE 0.003 298.000 0.011 1.000 N NA
 10386669 10386670 YPZ3_0196 YPZ3_0197 rpsM rpsK TRUE 0.999 17.000 0.810 0.010 Y NA
 10386670 10386671 YPZ3_0197 YPZ3_0198 rpsK rpsD TRUE 0.996 31.000 0.509 0.014 Y NA
 10386671 10386672 YPZ3_0198 YPZ3_0199 rpsD rpoA TRUE 0.973 26.000 0.549 1.000 N NA
 10386672 10386673 YPZ3_0199 YPZ3_0200 rpoA rplQ TRUE 0.984 41.000 0.873 1.000 N NA
 10386673 10386674 YPZ3_0200 YPZ3_0201 rplQ zntR FALSE 0.001 438.000 0.005 1.000 N NA
 10386675 10386676 YPZ3_0202 YPZ3_0203 mscL trkA FALSE 0.018 139.000 0.007 1.000 N NA
 10386676 10386677 YPZ3_0203 YPZ3_0204 trkA   FALSE 0.064 56.000 0.007 1.000 N NA
 10386677 10386678 YPZ3_0204 YPZ3_0205   fmt TRUE 0.941 88.000 0.305 1.000 Y NA
 10386678 10386679 YPZ3_0205 YPZ3_0206 fmt def TRUE 0.979 25.000 0.058 0.017 Y NA
 10386680 10386681 YPZ3_0207 YPZ3_0208   smg TRUE 0.980 -28.000 0.124 NA   NA
 10386681 10386682 YPZ3_0208 YPZ3_0209 smg   TRUE 0.858 101.000 0.331 NA   NA
 10386682 10386683 YPZ3_0209 YPZ3_0210     TRUE 0.939 2.000 0.137 NA N NA
 10386683 10386684 YPZ3_0210 YPZ3_0211   aroE TRUE 0.851 9.000 0.087 NA N NA
 10386685 10386686 YPZ3_0212 YPZ3_0213     TRUE 0.840 16.000 0.000 1.000   NA
 10386686 10386687 YPZ3_0213 YPZ3_0214     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10386689 10386690 YPZ3_0216 YPZ3_0217 actP   TRUE 0.998 -3.000 0.733 NA   NA
 10386690 10386691 YPZ3_0217 YPZ3_0218   acs TRUE 0.849 57.000 0.147 NA   NA
 10386693 10386694 YPZ3_0220 YPZ3_0221     TRUE 0.999 13.000 0.688 0.012 Y NA
 10386695 10386696 YPZ3_0222 YPZ3_0223     TRUE 0.986 2.000 0.268 NA   NA
 10386696 10386697 YPZ3_0223 YPZ3_0224     FALSE 0.029 414.000 0.000 NA   NA
 10386697 10386698 YPZ3_0224 YPZ3_0225     FALSE 0.001 816.000 0.000 1.000 N NA
 10386698 10386699 YPZ3_0225 YPZ3_0226     TRUE 0.919 175.000 0.786 NA   NA
 10386699 10386700 YPZ3_0226 YPZ3_0227     TRUE 0.977 39.000 0.538 NA   NA
 10386700 10386701 YPZ3_0227 YPZ3_0228     TRUE 0.953 -7.000 0.000 NA   NA
 10386701 10386702 YPZ3_0228 YPZ3_0229     TRUE 1.000 -13.000 0.647 0.009 Y NA
 10386702 10386703 YPZ3_0229 YPZ3_0230     TRUE 0.984 -3.000 0.176 NA   NA
 10386703 10386704 YPZ3_0230 YPZ3_0231     TRUE 0.999 -19.000 1.000 NA   NA
 10386704 10386705 YPZ3_0231 YPZ3_0232     TRUE 0.990 -22.000 0.231 NA   NA
 10386705 10386706 YPZ3_0232 YPZ3_0233     TRUE 0.828 127.000 0.154 1.000 Y NA
 10386706 10386707 YPZ3_0233 YPZ3_0234     TRUE 0.458 292.000 0.000 0.080 Y NA
 10386707 10386708 YPZ3_0234 YPZ3_0235     TRUE 0.999 -10.000 0.406 0.080 Y NA
 10386708 10386709 YPZ3_0235 YPZ3_0236     FALSE 0.041 383.000 0.045 NA   NA
 10386711 10386712 YPZ3_0238 YPZ3_0239   metC TRUE 0.917 46.000 0.043 NA Y NA
 10386713 10386714 YPZ3_0240 YPZ3_0241 hmuV hmuU TRUE 0.996 -7.000 0.220 1.000 Y NA
 10386714 10386715 YPZ3_0241 YPZ3_0242 hmuU hmuT TRUE 0.999 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 10386715 10386716 YPZ3_0242 YPZ3_0243 hmuT hmuS TRUE 0.997 -3.000 0.384 1.000 Y NA
 10386716 10386717 YPZ3_0243 YPZ3_0244 hmuS hmuR TRUE 0.751 119.000 0.064 1.000 Y NA
 10386717 10386718 YPZ3_0244 YPZ3_0245 hmuR   FALSE 0.004 415.000 0.000 1.000 N NA
 10386718 10386719 YPZ3_0245 YPZ3_0246     TRUE 0.468 34.000 0.054 1.000 N NA
 10386719 10386720 YPZ3_0246 YPZ3_0247     TRUE 0.791 33.000 0.135 1.000 N NA
 10386720 10386721 YPZ3_0247 YPZ3_0248     FALSE 0.007 341.000 0.000 1.000 N NA
 10386721 10386722 YPZ3_0248 YPZ3_0249     FALSE 0.073 315.000 0.000 NA   NA
 10386722 10386723 YPZ3_0249 YPZ3_0250     FALSE 0.033 397.000 0.000 NA   NA
 10386723 10386724 YPZ3_0250 YPZ3_0251     TRUE 0.993 0.000 0.420 NA   NA
 10386724 10386725 YPZ3_0251 YPZ3_0252     TRUE 0.993 -7.000 0.296 NA   NA
 10386725 10386726 YPZ3_0252 YPZ3_0253     TRUE 0.980 -7.000 0.126 NA   NA
 10386726 10386727 YPZ3_0253 YPZ3_0254     TRUE 0.967 12.000 0.217 1.000   NA
 10386728 10386729 YPZ3_0255 YPZ3_0256 terZ terA TRUE 0.986 0.000 0.054 0.004   NA
 10386729 10386730 YPZ3_0256 YPZ3_0257 terA terB TRUE 0.929 33.000 0.200 NA   NA
 10386730 10386731 YPZ3_0257 YPZ3_0258 terB terC TRUE 0.950 22.000 0.000 NA Y NA
 10386731 10386732 YPZ3_0258 YPZ3_0259 terC terD FALSE 0.169 64.000 0.000 1.000 N NA
 10386732 10386733 YPZ3_0259 YPZ3_0260 terD terE TRUE 0.942 184.000 0.310 0.004 Y NA
 10386733 10386734 YPZ3_0260 YPZ3_0261 terE   FALSE 0.007 713.000 0.000 NA   NA
 10386734 10386735 YPZ3_0261 YPZ3_0262     FALSE 0.152 251.000 0.000 NA   NA
 10386735 10386736 YPZ3_0262 YPZ3_0263     TRUE 0.982 72.000 0.571 NA Y NA
 10386736 10386737 YPZ3_0263 YPZ3_0264     FALSE 0.003 1458.000 0.000 NA   NA
 10386737 10386738 YPZ3_0264 YPZ3_0265     FALSE 0.004 1009.000 0.000 1.000   NA
 10386740 10386741 YPZ3_0267 YPZ3_0268 ubiC ubiA TRUE 0.859 166.000 0.248 NA Y NA
 10386743 10386744 YPZ3_0270 YPZ3_0271 dgkA lexA FALSE 0.422 125.000 0.141 1.000 N NA
 10386748 10386749 YPZ3_0275 YPZ3_0276 dnaB alr TRUE 0.768 97.000 0.317 1.000 N NA
 10386749 10386750 YPZ3_0276 YPZ3_0277 alr tyrB FALSE 0.378 186.000 0.181 1.000 N NA
 10386750 10386751 YPZ3_0277 YPZ3_0278 tyrB   FALSE 0.016 527.000 0.000 NA   NA
 10386754 10386755 YPZ3_0281 YPZ3_0282     TRUE 0.901 14.000 0.063 NA   NA
 10386755 10386756 YPZ3_0282 YPZ3_0283   rhaD TRUE 0.782 67.000 0.041 0.007 N NA
 10386756 10386757 YPZ3_0283 YPZ3_0284 rhaD rhaA TRUE 0.989 13.000 0.247 1.000 Y NA
 10386757 10386758 YPZ3_0284 YPZ3_0285 rhaA rhaB TRUE 0.997 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 10386759 10386760 YPZ3_0286 YPZ3_0287 rhaS rhaR TRUE 0.988 133.000 0.800 0.031 Y NA
 10386761 10386762 YPZ3_0288 YPZ3_0289 rhaT   FALSE 0.005 856.000 0.000 1.000   NA
 10386763 10386764 YPZ3_0290 YPZ3_0291     FALSE 0.008 634.000 0.000 1.000   NA
 10386764 10386765 YPZ3_0291 YPZ3_0292     TRUE 0.928 -3.000 0.100 1.000 N NA
 10386765 10386766 YPZ3_0292 YPZ3_0293     TRUE 0.979 3.000 0.100 0.086   NA
 10386766 10386767 YPZ3_0293 YPZ3_0294     TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 10386767 10386768 YPZ3_0294 YPZ3_0295     TRUE 0.998 5.000 1.000 NA   NA
 10386768 10386769 YPZ3_0295 YPZ3_0296     FALSE 0.034 394.000 0.000 NA   NA
 10386769 10386770 YPZ3_0296 YPZ3_0297     FALSE 0.039 378.000 0.000 NA   NA
 10386770 10386771 YPZ3_0297 YPZ3_0298     TRUE 0.948 -3.000 0.000 NA   NA
 10386771 10386772 YPZ3_0298 YPZ3_0299     TRUE 0.864 15.000 0.000 NA   NA
 10386772 10386773 YPZ3_0299 YPZ3_0300     FALSE 0.008 669.000 0.000 NA   NA
 10386773 10386774 YPZ3_0300 YPZ3_0301     TRUE 0.597 144.000 0.143 NA   NA
 10386774 10386775 YPZ3_0301 YPZ3_0302     TRUE 0.551 79.000 0.000 NA   NA
 10386775 10386776 YPZ3_0302 YPZ3_0303     FALSE 0.361 137.000 0.000 NA   NA
 10386776 10386777 YPZ3_0303 YPZ3_0304     TRUE 0.948 -3.000 0.000 NA   NA
 10386777 10386778 YPZ3_0304 YPZ3_0305     TRUE 0.884 11.000 0.000 NA   NA
 10386778 10386779 YPZ3_0305 YPZ3_0306     TRUE 0.999 -21.000 1.000 NA   NA
 10386779 10386780 YPZ3_0306 YPZ3_0307     TRUE 0.998 3.000 1.000 NA   NA
 10386780 10386781 YPZ3_0307 YPZ3_0308     TRUE 0.980 -3.000 0.143 NA   NA
 10386781 10386782 YPZ3_0308 YPZ3_0309     TRUE 0.955 -16.000 0.000 NA   NA
 10386782 10386783 YPZ3_0309 YPZ3_0310     TRUE 0.953 -7.000 0.000 NA   NA
 10386783 10386784 YPZ3_0310 YPZ3_0311     TRUE 0.530 83.000 0.000 NA   NA
 10386784 10386785 YPZ3_0311 YPZ3_0312     FALSE 0.178 235.000 0.000 NA   NA
 10386785 10386786 YPZ3_0312 YPZ3_0313     FALSE 0.078 311.000 0.000 NA   NA
 10386786 10386787 YPZ3_0313 YPZ3_0314     TRUE 0.880 12.000 0.000 NA   NA
 10386787 10386788 YPZ3_0314 YPZ3_0315     TRUE 0.948 -3.000 0.000 NA   NA
 10386788 10386789 YPZ3_0315 YPZ3_0316     TRUE 0.974 -3.000 0.105 NA   NA
 10386789 10386790 YPZ3_0316 YPZ3_0317     TRUE 0.991 -7.000 0.263 NA   NA
 10386790 10386791 YPZ3_0317 YPZ3_0318     TRUE 0.989 25.000 0.667 NA   NA
 10386791 10386792 YPZ3_0318 YPZ3_0319     TRUE 0.990 0.000 0.312 NA   NA
 10386792 10386793 YPZ3_0319 YPZ3_0320     FALSE 0.004 1291.000 0.000 NA   NA
 10386793 10386794 YPZ3_0320 YPZ3_0321     FALSE 0.278 183.000 0.000 NA   NA
 10386794 10386795 YPZ3_0321 YPZ3_0322     TRUE 0.973 2.000 0.154 NA   NA
 10386795 10386796 YPZ3_0322 YPZ3_0323     TRUE 0.993 11.000 0.611 NA   NA
 10386796 10386797 YPZ3_0323 YPZ3_0324     FALSE 0.036 385.000 0.000 NA   NA
 10386799 10386800 YPZ3_0326 YPZ3_0327     TRUE 0.857 16.000 0.000 NA   NA
 10386800 10386801 YPZ3_0327 YPZ3_0328     FALSE 0.004 1196.000 0.000 NA   NA
 10386801 10386802 YPZ3_0328 YPZ3_0329     FALSE 0.015 533.000 0.000 NA   NA
 10386802 10386803 YPZ3_0329 YPZ3_0330     TRUE 0.490 91.000 0.000 NA   NA
 10386803 10386804 YPZ3_0330 YPZ3_0331     FALSE 0.409 117.000 0.000 NA   NA
 10386804 10386805 YPZ3_0331 YPZ3_0332     TRUE 0.499 89.000 0.000 NA   NA
 10386805 10386806 YPZ3_0332 YPZ3_0333     TRUE 0.858 75.000 0.222 NA   NA
 10386806 10386807 YPZ3_0333 YPZ3_0334     FALSE 0.008 671.000 0.000 NA   NA
 10386807 10386808 YPZ3_0334 YPZ3_0335     FALSE 0.016 508.000 0.000 NA   NA
 10386808 10386809 YPZ3_0335 YPZ3_0336     TRUE 0.999 -7.000 1.000 NA   NA
 10386809 10386810 YPZ3_0336 YPZ3_0337     TRUE 0.995 25.000 0.667 NA Y NA
 10386810 10386811 YPZ3_0337 YPZ3_0338     FALSE 0.001 1193.000 0.000 NA N NA
 10386811 10386812 YPZ3_0338 YPZ3_0339     TRUE 0.570 69.000 0.000 1.000   NA
 10386812 10386813 YPZ3_0339 YPZ3_0340     FALSE 0.029 398.000 0.000 1.000   NA
 10386813 10386814 YPZ3_0340 YPZ3_0341     TRUE 0.953 -6.000 0.000 NA   NA
 10386814 10386815 YPZ3_0341 YPZ3_0342     TRUE 0.970 68.000 0.667 NA   NA
 10386816 10386817 YPZ3_t2 YPZ3_0343     FALSE 0.351 145.000 0.000 NA   NA
 10386818 10386819 YPZ3_0344 YPZ3_0345   hydN TRUE 0.971 23.000 0.222 0.010 N NA
 10386819 10386820 YPZ3_0345 YPZ3_0346 hydN fdhF TRUE 0.980 23.000 0.231 0.039   NA
 10386821 10386822 YPZ3_0347 YPZ3_0348 dsbD   TRUE 0.928 -24.000 0.092 1.000 N NA
 10386822 10386823 YPZ3_0348 YPZ3_0349   dcuA FALSE 0.188 185.000 0.007 1.000   NA
 10386823 10386824 YPZ3_0349 YPZ3_0350 dcuA aspA FALSE 0.330 120.000 0.023 1.000   NA
 10386825 10386826 YPZ3_0351 YPZ3_0352   groEL FALSE 0.011 595.000 0.000 NA   NA
 10386826 10386827 YPZ3_0352 YPZ3_0353 groEL   FALSE 0.010 624.000 0.000 NA   NA
 10386829 10386830 YPZ3_0355 YPZ3_0356 efp sugE FALSE 0.090 100.000 0.000 1.000 N NA
 10386831 10386832 YPZ3_0357 YPZ3_0358 frdD frdC TRUE 0.999 17.000 0.787 0.002 Y NA
 10386832 10386833 YPZ3_0358 YPZ3_0359 frdC frdB TRUE 0.998 17.000 0.454 0.002 Y NA
 10386833 10386834 YPZ3_0359 YPZ3_0360 frdB frdA TRUE 0.999 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 10386836 10386837 YPZ3_0362 YPZ3_0363   psd TRUE 0.797 42.000 0.148 NA N NA
 10386837 10386838 YPZ3_0363 YPZ3_0364 psd   FALSE 0.110 325.000 0.095 1.000   NA
 10386839 10386840 YPZ3_0365 YPZ3_t3 orn   FALSE 0.013 558.000 0.000 NA   NA
 10386842 10386843 YPZ3_0367 YPZ3_0368     TRUE 0.945 11.000 0.118 NA   NA
 10386843 10386844 YPZ3_0368 YPZ3_0369     TRUE 0.537 140.000 0.109 NA   NA
 10386844 10386845 YPZ3_0369 YPZ3_0370   mutL TRUE 0.785 16.000 0.092 1.000 N NA
 10386845 10386846 YPZ3_0370 YPZ3_0371 mutL miaA TRUE 0.973 -7.000 0.188 1.000 N NA
 10386846 10386847 YPZ3_0371 YPZ3_0372 miaA ymr TRUE 0.903 116.000 0.531 1.000   NA
 10386847 10386848 YPZ3_0372 YPZ3_0373 ymr hflX TRUE 0.673 99.000 0.141 1.000   NA
 10386848 10386849 YPZ3_0373 YPZ3_0374 hflX hflK TRUE 0.596 241.000 0.184 0.078   NA
 10386849 10386850 YPZ3_0374 YPZ3_0375 hflK hflC TRUE 1.000 4.000 0.947 0.014 Y NA
 10386850 10386851 YPZ3_0375 YPZ3_0376 hflC purA FALSE 0.001 472.000 0.019 1.000 N NA
 10386851 10386852 YPZ3_0376 YPZ3_0377 purA   FALSE 0.003 330.000 0.010 NA N NA
 10386852 10386853 YPZ3_0377 YPZ3_0378   rnr TRUE 0.452 241.000 0.038 NA Y NA
 10386853 10386854 YPZ3_0378 YPZ3_0379 rnr   TRUE 0.740 119.000 0.147 0.018 N NA
 10386854 10386855 YPZ3_0379 YPZ3_0380   aidB FALSE 0.001 408.000 0.005 1.000 N NA
 10386856 10386857 YPZ3_0381 YPZ3_0382     FALSE 0.059 340.000 0.000 NA   NA
 10386857 10386858 YPZ3_0382 YPZ3_0383     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10386859 10386860 YPZ3_0384 YPZ3_0385     TRUE 0.999 -3.000 0.759 NA Y NA
 10386860 10386861 YPZ3_0385 YPZ3_0386     FALSE 0.001 1024.000 0.000 NA N NA
 10386861 10386862 YPZ3_0386 YPZ3_0387     TRUE 0.708 50.000 0.000 NA   NA
 10386862 10386863 YPZ3_0387 YPZ3_0388     TRUE 0.955 -28.000 0.000 NA   NA
 10386863 10386864 YPZ3_0388 YPZ3_0389     FALSE 0.004 1272.000 0.000 NA   NA
 10386864 10386865 YPZ3_0389 YPZ3_0390     TRUE 0.964 -3.000 0.068 NA   NA
 10386866 10386867 YPZ3_0391 YPZ3_0392     TRUE 0.993 11.000 0.637 NA   NA
 10386868 10386869 YPZ3_0393 YPZ3_0394     TRUE 0.914 2.000 0.000 1.000   NA
 10386870 10386871 YPZ3_0395 YPZ3_0396     TRUE 0.908 93.000 0.000 0.007 Y NA
 10386871 10386872 YPZ3_0396 YPZ3_0397     TRUE 0.769 341.000 0.400 0.008 Y NA
 10386874 10386875 YPZ3_0399 YPZ3_0400     FALSE 0.009 655.000 0.000 NA   NA
 10386875 10386876 YPZ3_0400 YPZ3_0401     TRUE 0.907 56.000 0.062 NA Y NA
 10386876 10386877 YPZ3_0401 YPZ3_0402     TRUE 0.993 59.000 0.844 NA Y NA
 10386877 10386878 YPZ3_0402 YPZ3_0403     TRUE 1.000 -3.000 0.788 0.067 Y NA
 10386878 10386879 YPZ3_0403 YPZ3_0404     TRUE 0.999 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 10386879 10386880 YPZ3_0404 YPZ3_0405     FALSE 0.425 110.000 0.000 NA   NA
 10386881 10386882 YPZ3_0406 YPZ3_0407     TRUE 0.448 171.000 0.200 1.000 N NA
 10386882 10386883 YPZ3_0407 YPZ3_0408     FALSE 0.007 346.000 0.000 1.000 N NA
 10386883 10386884 YPZ3_0408 YPZ3_0409     TRUE 0.941 48.000 0.105 NA Y NA
 10386884 10386885 YPZ3_0409 YPZ3_0410     FALSE 0.015 1200.000 0.000 NA Y NA
 10386885 10386886 YPZ3_0410 YPZ3_0411     TRUE 0.965 0.000 0.185 NA N NA
 10386886 10386887 YPZ3_0411 YPZ3_0412     FALSE 0.001 1496.000 0.000 NA N NA
 10386890 10386891 YPZ3_t4 YPZ3_0415   rsmC FALSE 0.140 257.000 0.000 NA   NA
 10386892 10386893 YPZ3_0416 YPZ3_0417 holD rimI TRUE 0.732 77.000 0.121 1.000   NA
 10386893 10386894 YPZ3_0417 YPZ3_0418 rimI prfC FALSE 0.235 179.000 0.026 1.000   NA
 10386894 10386895 YPZ3_0418 YPZ3_0419 prfC osmY FALSE 0.067 327.000 0.000 NA   NA
 10386895 10386896 YPZ3_0419 YPZ3_0420 osmY   FALSE 0.031 405.000 0.000 NA   NA
 10386896 10386897 YPZ3_0420 YPZ3_0421     TRUE 0.885 16.000 0.057 NA   NA
 10386897 10386898 YPZ3_0421 YPZ3_0422     FALSE 0.002 535.000 0.027 NA N NA
 10386898 10386899 YPZ3_0422 YPZ3_0423   deoC FALSE 0.043 576.000 0.000 1.000 Y NA
 10386899 10386900 YPZ3_0423 YPZ3_0424 deoC   TRUE 0.752 28.000 0.028 1.000   NA
 10386900 10386901 YPZ3_0424 YPZ3_0425     TRUE 0.998 -3.000 0.385 0.001   NA
 10386901 10386902 YPZ3_0425 YPZ3_0426   deoB FALSE 0.371 132.000 0.047 1.000   NA
 10386902 10386903 YPZ3_0426 YPZ3_0427 deoB deoD TRUE 0.782 125.000 0.414 1.000 N NA
 10386905 10386906 YPZ3_0429 YPZ3_0430 serB radA FALSE 0.036 88.000 0.024 1.000 N NA
 10386906 10386907 YPZ3_0430 YPZ3_0431 radA nadR FALSE 0.016 159.000 0.021 1.000 N NA
 10386907 10386908 YPZ3_0431 YPZ3_0432 nadR   FALSE 0.305 157.000 0.000 1.000   NA
 10386909 10386910 YPZ3_0433 YPZ3_0434     TRUE 0.976 0.000 0.007 0.026   NA
 10386910 10386911 YPZ3_0434 YPZ3_0435     FALSE 0.190 183.000 0.005 1.000   NA
 10386911 10386912 YPZ3_0435 YPZ3_0436     TRUE 0.955 15.000 0.290 1.000 N NA
 10386912 10386913 YPZ3_0436 YPZ3_0437     TRUE 0.990 -3.000 0.259 NA   NA
 10386913 10386914 YPZ3_0437 YPZ3_0438     FALSE 0.041 375.000 0.000 NA   NA
 10386915 10386916 YPZ3_0439 YPZ3_0440     FALSE 0.240 236.000 0.167 1.000 N NA
 10386922 10386923 YPZ3_0446 YPZ3_0447 thrA thrB TRUE 0.987 3.000 0.133 1.000 Y NA
 10386923 10386924 YPZ3_0447 YPZ3_0448 thrB thrC TRUE 0.992 4.000 0.233 1.000 Y NA
 10386926 10386927 YPZ3_0450 YPZ3_0451 talB mogA FALSE 0.018 288.000 0.042 1.000 N NA
 10386927 10386928 YPZ3_0451 YPZ3_0452 mogA   FALSE 0.077 128.000 0.039 1.000 N NA
 10386929 10386930 YPZ3_0453 YPZ3_0454     FALSE 0.102 289.000 0.000 NA   NA
 10386931 10386932 YPZ3_0455 YPZ3_0456 dnaK dnaJ TRUE 0.961 112.000 0.236 0.003 Y NA
 10386932 10386933 YPZ3_0456 YPZ3_0457 dnaJ nhaA FALSE 0.007 243.000 0.022 1.000 N NA
 10386933 10386934 YPZ3_0457 YPZ3_0458 nhaA nhaR TRUE 0.671 130.000 0.292 1.000 N NA
 10386934 10386935 YPZ3_0458 YPZ3_0459 nhaR   FALSE 0.005 860.000 0.000 1.000   NA
 10386935 10386936 YPZ3_0459 YPZ3_0460     TRUE 0.926 47.000 0.014 0.001   NA
 10386936 10386937 YPZ3_0460 YPZ3_0461   ileS TRUE 0.946 32.000 0.254 1.000   NA
 10386937 10386938 YPZ3_0461 YPZ3_0462 ileS lspA TRUE 0.730 0.000 0.045 1.000 N NA
 10386938 10386939 YPZ3_0462 YPZ3_0463 lspA slpA TRUE 0.964 -7.000 0.154 1.000 N NA
 10386939 10386940 YPZ3_0463 YPZ3_0464 slpA lytB TRUE 0.996 -19.000 0.626 1.000 N NA
 10386940 10386941 YPZ3_0464 YPZ3_0465 lytB   FALSE 0.008 331.000 0.000 1.000 N NA
 10386941 10386942 YPZ3_0465 YPZ3_0466   dapB FALSE 0.003 453.000 0.000 1.000 N NA
 10386942 10386943 YPZ3_0466 YPZ3_0467 dapB carA FALSE 0.068 473.000 0.034 1.000 Y NA
 10386943 10386944 YPZ3_0467 YPZ3_0468 carA carB TRUE 0.997 16.000 0.345 0.001 Y NA
 10386946 10386947 YPZ3_0470 YPZ3_0471     TRUE 0.998 -3.000 0.704 NA   NA
 10386947 10386948 YPZ3_0471 YPZ3_0472   folA TRUE 0.514 150.000 0.104 NA   NA
 10386948 10386949 YPZ3_0472 YPZ3_0473 folA   FALSE 0.054 161.000 0.000 1.000 N NA
 10386949 10386950 YPZ3_0473 YPZ3_0474     FALSE 0.005 883.000 0.000 NA   NA
 10386951 10386952 YPZ3_0475 YPZ3_0476 apaH apaG TRUE 0.949 17.000 0.267 NA N NA
 10386952 10386953 YPZ3_0476 YPZ3_0477 apaG ksgA TRUE 0.797 14.000 0.078 NA N NA
 10386953 10386954 YPZ3_0477 YPZ3_0478 ksgA pdxA TRUE 0.974 -7.000 0.197 1.000 N NA
 10386954 10386955 YPZ3_0478 YPZ3_0479 pdxA surA TRUE 0.995 -16.000 0.561 1.000 N NA
 10386955 10386956 YPZ3_0479 YPZ3_0480 surA imp TRUE 0.722 68.000 0.182 1.000 N NA
 10386958 10386959 YPZ3_0482 YPZ3_0483 rluA   FALSE 0.004 1223.000 0.000 NA   NA
 10386960 10386961 YPZ3_0484 YPZ3_0485     TRUE 0.997 11.000 1.000 NA   NA
 10386961 10386962 YPZ3_0485 YPZ3_0486     TRUE 0.995 9.000 0.700 NA   NA
 10386962 10386963 YPZ3_0486 YPZ3_0487     TRUE 0.858 163.000 0.500 NA   NA
 10386963 10386964 YPZ3_0487 YPZ3_0488     TRUE 0.970 74.000 0.714 NA   NA
 10386964 10386965 YPZ3_0488 YPZ3_0489     TRUE 0.980 33.000 0.533 NA   NA
 10386965 10386966 YPZ3_0489 YPZ3_0490     TRUE 0.962 62.000 0.533 NA   NA
 10386966 10386967 YPZ3_0490 YPZ3_0491     TRUE 0.981 18.000 0.400 NA   NA
 10386967 10386968 YPZ3_0491 YPZ3_0492     TRUE 0.439 104.000 0.000 NA   NA
 10386968 10386969 YPZ3_0492 YPZ3_0493     TRUE 0.875 13.000 0.000 NA   NA
 10386969 10386970 YPZ3_0493 YPZ3_0494     TRUE 0.813 25.000 0.000 NA   NA
 10386970 10386971 YPZ3_0494 YPZ3_0495     TRUE 0.804 26.000 0.000 NA   NA
 10386971 10386972 YPZ3_0495 YPZ3_0496     TRUE 0.953 -7.000 0.000 NA   NA
 10386972 10386973 YPZ3_0496 YPZ3_0497     FALSE 0.038 382.000 0.000 NA   NA
 10386973 10386974 YPZ3_0497 YPZ3_0498     FALSE 0.401 120.000 0.000 NA   NA
 10386974 10386975 YPZ3_0498 YPZ3_0499     TRUE 0.948 -3.000 0.000 NA   NA
 10386975 10386976 YPZ3_0499 YPZ3_0500     TRUE 0.970 62.000 0.615 NA   NA
 10386976 10386977 YPZ3_0500 YPZ3_0501     TRUE 0.995 22.000 1.000 NA   NA
 10386978 10386979 YPZ3_0502 YPZ3_0503     FALSE 0.200 461.000 0.098 0.084 Y NA
 10386981 10386982 YPZ3_0505 YPZ3_0506   cysU TRUE 0.997 -13.000 0.522 0.020 N NA
 10386982 10386983 YPZ3_0506 YPZ3_0507 cysU   TRUE 0.998 -24.000 0.697 0.085 N NA
 10386983 10386984 YPZ3_0507 YPZ3_0508     FALSE 0.012 886.000 0.014 0.085   NA
 10386986 10386987 YPZ3_0510 YPZ3_0511     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10386987 10386988 YPZ3_0511 YPZ3_0512   leuD FALSE 0.001 580.000 0.000 1.000 N NA
 10386988 10386989 YPZ3_0512 YPZ3_0513 leuD leuC TRUE 0.997 15.000 0.309 0.001 Y NA
 10386989 10386990 YPZ3_0513 YPZ3_0514 leuC   TRUE 0.998 2.000 0.275 0.001 Y NA
 10386990 10386991 YPZ3_0514 YPZ3_0515   leuA TRUE 0.996 3.000 0.126 0.001 Y NA
 10386991 10386992 YPZ3_0515 YPZ3_0516 leuA   FALSE 0.060 147.000 0.000 1.000 N NA
 10386993 10386994 YPZ3_0517 YPZ3_0518 leuO   FALSE 0.003 576.000 0.050 1.000 N NA
 10386994 10386995 YPZ3_0518 YPZ3_0519     FALSE 0.002 484.000 0.000 1.000 N NA
 10386995 10386996 YPZ3_0519 YPZ3_0520   ilvH TRUE 0.998 3.000 0.371 0.002 Y NA
 10386996 10386997 YPZ3_0520 YPZ3_0521 ilvH   FALSE 0.060 148.000 0.000 1.000 N NA
 10386997 10386998 YPZ3_0521 YPZ3_0522   fruR FALSE 0.002 505.000 0.000 1.000 N NA
 10387000 10387001 YPZ3_0524 YPZ3_0525   mraW TRUE 0.995 3.000 0.635 NA   NA
 10387001 10387002 YPZ3_0525 YPZ3_0526 mraW ftsL TRUE 0.978 -3.000 0.227 1.000 N NA
 10387002 10387003 YPZ3_0526 YPZ3_0527 ftsL ftsI TRUE 0.612 66.000 0.124 1.000 N NA
 10387003 10387004 YPZ3_0527 YPZ3_0528 ftsI murE TRUE 0.989 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 10387004 10387005 YPZ3_0528 YPZ3_0529 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 10387005 10387006 YPZ3_0529 YPZ3_0530 murF mraY TRUE 0.999 -6.000 0.309 0.005 Y NA
 10387006 10387007 YPZ3_0530 YPZ3_0531 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.005 Y NA
 10387007 10387008 YPZ3_0531 YPZ3_0532 murD ftsW TRUE 0.994 0.000 0.297 0.003 N NA
 10387008 10387009 YPZ3_0532 YPZ3_0533 ftsW murG TRUE 0.995 -3.000 0.647 1.000 N NA
 10387009 10387010 YPZ3_0533 YPZ3_0534 murG   TRUE 0.914 111.000 0.283 1.000 Y NA
 10387010 10387011 YPZ3_0534 YPZ3_0535   ddl TRUE 0.998 -7.000 0.153 0.005 Y NA
 10387011 10387012 YPZ3_0535 YPZ3_0536 ddl ftsQ TRUE 0.996 2.000 0.372 NA Y NA
 10387012 10387013 YPZ3_0536 YPZ3_0537 ftsQ   TRUE 0.836 93.000 0.389 NA N NA
 10387013 10387014 YPZ3_0537 YPZ3_0538   ftsZ TRUE 0.973 73.000 0.460 1.000 Y NA
 10387014 10387015 YPZ3_0538 YPZ3_0539 ftsZ lpxC TRUE 0.541 85.000 0.134 1.000 N NA
 10387017 10387018 YPZ3_0541 YPZ3_0542   secA TRUE 0.613 78.000 0.065 1.000   NA
 10387018 10387019 YPZ3_0542 YPZ3_0543 secA   FALSE 0.003 295.000 0.003 1.000 N NA
 10387020 10387021 YPZ3_0544 YPZ3_0545     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10387021 10387022 YPZ3_0545 YPZ3_0546     FALSE 0.112 279.000 0.000 NA   NA
 10387022 10387023 YPZ3_0546 YPZ3_0547     FALSE 0.012 585.000 0.000 NA   NA
 10387023 10387024 YPZ3_0547 YPZ3_0548     TRUE 0.976 3.000 0.185 NA   NA
 10387024 10387025 YPZ3_0548 YPZ3_0549     TRUE 0.899 155.000 0.609 NA   NA
 10387025 10387026 YPZ3_0549 YPZ3_0550     TRUE 0.841 226.000 0.684 NA   NA
 10387026 10387027 YPZ3_0550 YPZ3_0551     TRUE 0.976 -3.000 0.118 NA   NA
 10387027 10387028 YPZ3_0551 YPZ3_0552     FALSE 0.113 278.000 0.000 NA   NA
 10387028 10387029 YPZ3_0552 YPZ3_0553   exuR FALSE 0.241 201.000 0.000 NA   NA
 10387029 10387030 YPZ3_0553 YPZ3_0554 exuR exuT TRUE 0.482 263.000 0.433 1.000 N NA
 10387031 10387032 YPZ3_0555 YPZ3_0556 uxaC uxaB TRUE 0.642 199.000 0.095 1.000 Y NA
 10387032 10387033 YPZ3_0556 YPZ3_0557 uxaB uxaA TRUE 0.981 11.000 0.126 1.000 Y NA
 10387033 10387034 YPZ3_0557 YPZ3_0558 uxaA   TRUE 0.558 153.000 0.126 NA   NA
 10387035 10387036 YPZ3_0559 YPZ3_0560   sstT FALSE 0.059 150.000 0.000 1.000 N NA
 10387036 10387037 YPZ3_0560 YPZ3_0561 sstT   FALSE 0.010 586.000 0.000 1.000   NA
 10387037 10387038 YPZ3_0561 YPZ3_0562     FALSE 0.315 203.000 0.072 NA   NA
 10387038 10387039 YPZ3_0562 YPZ3_0563     FALSE 0.174 239.000 0.000 NA   NA
 10387041 10387042 YPZ3_0565 YPZ3_0566 fadH   FALSE 0.194 213.000 0.000 1.000   NA
 10387042 10387043 YPZ3_0566 YPZ3_0567     FALSE 0.030 391.000 0.000 1.000   NA
 10387043 10387044 YPZ3_0567 YPZ3_0568     TRUE 0.974 32.000 0.452 1.000   NA
 10387044 10387045 YPZ3_0568 YPZ3_0569     TRUE 0.983 56.000 0.789 NA   NA
 10387045 10387046 YPZ3_0569 YPZ3_0570     TRUE 0.954 102.000 0.750 NA   NA
 10387046 10387047 YPZ3_0570 YPZ3_0571   terX TRUE 0.934 23.000 0.164 NA   NA
 10387047 10387048 YPZ3_0571 YPZ3_0572 terX terY TRUE 0.929 33.000 0.200 NA   NA
 10387049 10387050 YPZ3_0573 YPZ3_0574     TRUE 0.915 45.000 0.000 NA Y NA
 10387050 10387051 YPZ3_0574 YPZ3_0575     FALSE 0.004 1268.000 0.000 NA   NA
 10387052 10387053 YPZ3_0576 YPZ3_0577 yapF   TRUE 0.653 60.000 0.000 NA   NA
 10387053 10387054 YPZ3_0577 YPZ3_0578     TRUE 0.955 -31.000 0.000 NA   NA
 10387054 10387055 YPZ3_0578 YPZ3_0579     FALSE 0.389 102.000 0.016 NA   NA
 10387056 10387057 YPZ3_0580 YPZ3_0581     TRUE 0.649 149.000 0.030 1.000 Y NA
 10387057 10387058 YPZ3_0581 YPZ3_0582     FALSE 0.249 109.000 0.073 1.000 N NA
 10387058 10387059 YPZ3_0582 YPZ3_0583     FALSE 0.239 149.000 0.089 1.000 N NA
 10387059 10387060 YPZ3_0583 YPZ3_0584     TRUE 0.996 54.000 0.733 0.066 Y NA
 10387060 10387061 YPZ3_0584 YPZ3_0585     TRUE 0.994 0.000 0.105 0.066 Y NA
 10387061 10387062 YPZ3_0585 YPZ3_0586     TRUE 0.994 -3.000 0.375 NA   NA
 10387062 10387063 YPZ3_0586 YPZ3_0587     TRUE 0.954 51.000 0.375 NA   NA
 10387064 10387065 YPZ3_0588 YPZ3_0589     TRUE 0.919 170.000 0.750 NA   NA
 10387065 10387066 YPZ3_0589 YPZ3_0590     TRUE 0.999 -16.000 0.889 NA   NA
 10387067 10387068 YPZ3_0591 YPZ3_0592     FALSE 0.246 276.000 0.222 NA N NA
 10387068 10387069 YPZ3_0592 YPZ3_0593     TRUE 0.875 13.000 0.000 NA   NA
 10387069 10387070 YPZ3_0593 YPZ3_0594     FALSE 0.368 134.000 0.000 NA   NA
 10387070 10387071 YPZ3_0594 YPZ3_0595     TRUE 0.857 16.000 0.000 NA   NA
 10387071 10387072 YPZ3_0595 YPZ3_0596     FALSE 0.318 285.000 0.000 NA Y NA
 10387073 10387074 YPZ3_0597 YPZ3_0598     FALSE 0.136 260.000 0.000 NA   NA
 10387075 10387076 YPZ3_0599 YPZ3_0600     FALSE 0.003 2036.000 0.000 NA   NA
 10387076 10387077 YPZ3_0600 YPZ3_0601     TRUE 0.895 9.000 0.000 NA   NA
 10387077 10387078 YPZ3_0601 YPZ3_0602     TRUE 0.799 27.000 0.000 NA   NA
 10387078 10387079 YPZ3_0602 YPZ3_0603     FALSE 0.106 285.000 0.000 NA   NA
 10387080 10387081 YPZ3_t5 YPZ3_0604     FALSE 0.249 196.000 0.000 NA   NA
 10387081 10387082 YPZ3_0604 YPZ3_0605     TRUE 0.637 158.000 0.299 1.000 N NA
 10387085 10387086 YPZ3_0608 YPZ3_0609 folB uppP FALSE 0.122 274.000 0.128 1.000 N NA
 10387087 10387088 YPZ3_0610 YPZ3_0611 cca   FALSE 0.298 160.000 0.106 NA N NA
 10387089 10387090 YPZ3_0612 YPZ3_0613   glnE FALSE 0.318 171.000 0.053 1.000   NA
 10387090 10387091 YPZ3_0613 YPZ3_0614 glnE rfaE FALSE 0.233 135.000 0.083 1.000 N NA
 10387091 10387092 YPZ3_0614 YPZ3_0615 rfaE asoB FALSE 0.093 37.000 0.012 1.000 N NA
 10387092 10387093 YPZ3_0615 YPZ3_0616 asoB ribB FALSE 0.000 1175.000 0.000 1.000 N NA
 10387093 10387094 YPZ3_0616 YPZ3_0617 ribB   FALSE 0.022 459.000 0.048 1.000   NA
 10387095 10387096 YPZ3_0618 YPZ3_0619     TRUE 0.994 10.000 0.632 NA   NA
 10387096 10387097 YPZ3_0619 YPZ3_0620     TRUE 0.530 301.000 0.480 NA   NA
 10387098 10387099 YPZ3_0621 YPZ3_0622     TRUE 0.973 34.000 0.443 NA   NA
 10387099 10387100 YPZ3_0622 YPZ3_0623   icc TRUE 0.924 82.000 0.433 NA   NA
 10387100 10387101 YPZ3_0623 YPZ3_0624 icc   TRUE 0.993 0.000 0.427 NA   NA
 10387101 10387102 YPZ3_0624 YPZ3_0625   parE TRUE 0.776 102.000 0.217 NA   NA
 10387102 10387103 YPZ3_0625 YPZ3_0626 parE   FALSE 0.254 4.000 0.022 1.000 N NA
 10387105 10387106 YPZ3_0628 YPZ3_0629 parC   FALSE 0.005 427.000 0.043 1.000 N NA
 10387106 10387107 YPZ3_0629 YPZ3_0630   sufI FALSE 0.344 179.000 0.154 1.000 N NA
 10387107 10387108 YPZ3_0630 YPZ3_0631 sufI   FALSE 0.061 308.000 0.025 1.000   NA
 10387108 10387109 YPZ3_0631 YPZ3_0632     TRUE 0.934 -3.000 0.012 NA   NA
 10387110 10387111 YPZ3_0633 YPZ3_0634     FALSE 0.024 419.000 0.000 1.000   NA
 10387113 10387114 YPZ3_0636 YPZ3_0637   metC TRUE 0.592 193.000 0.212 NA   NA
 10387115 10387116 YPZ3_0638 YPZ3_0639     TRUE 0.999 4.000 0.810 0.084 Y NA
 10387117 10387118 YPZ3_0640 YPZ3_0641     TRUE 0.982 25.000 0.500 NA   NA
 10387118 10387119 YPZ3_0641 YPZ3_0642     TRUE 0.955 -16.000 0.000 NA   NA
 10387119 10387120 YPZ3_0642 YPZ3_0643     TRUE 0.983 0.000 0.000 NA Y NA
 10387120 10387121 YPZ3_0643 YPZ3_0644     TRUE 0.997 -16.000 0.273 NA Y NA
 10387121 10387122 YPZ3_0644 YPZ3_0645     TRUE 0.999 -3.000 0.909 NA Y NA
 10387122 10387123 YPZ3_0645 YPZ3_0646     TRUE 0.999 -3.000 0.800 NA Y NA
 10387123 10387124 YPZ3_0646 YPZ3_0647     TRUE 0.992 54.000 0.727 NA Y NA
 10387124 10387125 YPZ3_0647 YPZ3_0648     FALSE 0.258 298.000 0.182 NA   NA
 10387125 10387126 YPZ3_0648 YPZ3_0649     TRUE 0.864 15.000 0.000 NA   NA
 10387126 10387127 YPZ3_0649 YPZ3_0650     TRUE 0.999 -3.000 0.889 NA   NA
 10387127 10387128 YPZ3_0650 YPZ3_0651     TRUE 0.913 52.000 0.222 NA   NA
 10387129 10387130 YPZ3_0652 YPZ3_0653     TRUE 0.738 202.000 0.000 0.033 Y NA
 10387130 10387131 YPZ3_0653 YPZ3_0654     FALSE 0.006 353.000 0.000 1.000 N NA
 10387131 10387132 YPZ3_0654 YPZ3_0655     TRUE 0.952 18.000 0.000 1.000 Y NA
 10387132 10387133 YPZ3_0655 YPZ3_0656     TRUE 0.940 25.000 0.000 1.000 Y NA
 10387136 10387137 YPZ3_0659 YPZ3_0660     TRUE 0.969 8.000 0.000 0.014   NA
 10387137 10387138 YPZ3_0660 YPZ3_0661   flhB TRUE 0.997 -10.000 0.333 0.014   NA
 10387138 10387139 YPZ3_0661 YPZ3_0662 flhB fliR TRUE 0.999 0.000 1.000 1.000 Y NA
 10387139 10387140 YPZ3_0662 YPZ3_0663 fliR fliP FALSE 0.325 275.000 0.000 1.000 Y NA
 10387140 10387141 YPZ3_0663 YPZ3_0664 fliP fliN TRUE 0.997 -3.000 0.368 1.000 Y NA
 10387141 10387142 YPZ3_0664 YPZ3_0665 fliN   TRUE 0.980 -7.000 0.123 NA   NA
 10387143 10387144 YPZ3_0666 YPZ3_0667   fliE TRUE 0.982 17.000 0.576 1.000 N NA
 10387144 10387145 YPZ3_0667 YPZ3_0668 fliE fliF TRUE 0.999 10.000 1.000 0.012 Y NA
 10387145 10387146 YPZ3_0668 YPZ3_0669 fliF   TRUE 1.000 -28.000 0.970 0.012 Y NA
 10387146 10387147 YPZ3_0669 YPZ3_0670   fliH TRUE 0.999 2.000 0.789 NA Y NA
 10387147 10387148 YPZ3_0670 YPZ3_0671 fliH fliI TRUE 0.999 -7.000 0.816 NA Y NA
 10387148 10387149 YPZ3_0671 YPZ3_0672 fliI   TRUE 0.898 4.000 0.035 1.000   NA
 10387150 10387151 YPZ3_0673 YPZ3_0674     FALSE 0.013 502.000 0.014 NA   NA
 10387152 10387153 YPZ3_0675 YPZ3_0676 flgB flgC TRUE 1.000 3.000 0.972 0.007 Y NA
 10387153 10387154 YPZ3_0676 YPZ3_0677 flgC flgD TRUE 0.999 3.000 0.914 NA Y NA
 10387154 10387155 YPZ3_0677 YPZ3_0678 flgD flgE TRUE 0.995 55.000 0.970 NA Y NA
 10387157 10387158 YPZ3_0680 YPZ3_0681   flgG TRUE 0.993 68.000 0.971 1.000 Y NA
 10387158 10387159 YPZ3_0681 YPZ3_0682 flgG flgH TRUE 0.998 35.000 0.941 0.012 Y NA
 10387159 10387160 YPZ3_0682 YPZ3_0683 flgH flgI TRUE 0.988 170.000 0.912 0.014 Y NA
 10387160 10387161 YPZ3_0683 YPZ3_0684 flgI flgK FALSE 0.042 594.000 0.000 0.008   NA
 10387161 10387162 YPZ3_0684 YPZ3_0685 flgK flgL TRUE 0.994 29.000 0.576 0.002   NA
 10387162 10387163 YPZ3_0685 YPZ3_0686 flgL   TRUE 0.993 12.000 0.667 NA   NA
 10387164 10387165 YPZ3_0687 YPZ3_0688     TRUE 0.998 -19.000 0.714 NA   NA
 10387166 10387167 YPZ3_0689 YPZ3_0690 flaA1 flaA2 FALSE 0.170 515.000 0.000 0.002 Y NA
 10387167 10387168 YPZ3_0690 YPZ3_0691 flaA2 flaA3 TRUE 0.605 283.000 0.000 0.002 Y NA
 10387168 10387169 YPZ3_0691 YPZ3_0692 flaA3 fliD TRUE 0.482 220.000 0.000 1.000 Y NA
 10387169 10387170 YPZ3_0692 YPZ3_0693 fliD fliS TRUE 0.999 10.000 0.865 0.004 Y NA
 10387170 10387171 YPZ3_0693 YPZ3_0694 fliS   TRUE 0.938 2.000 0.054 NA   NA
 10387171 10387172 YPZ3_0694 YPZ3_0695     TRUE 0.943 2.000 0.062 NA   NA
 10387172 10387173 YPZ3_0695 YPZ3_0696     TRUE 0.948 39.000 0.296 1.000   NA
 10387173 10387174 YPZ3_0696 YPZ3_0697   fliA TRUE 0.985 6.000 0.333 1.000   NA
 10387174 10387175 YPZ3_0697 YPZ3_0698 fliA motA TRUE 0.978 16.000 0.500 1.000 N NA
 10387175 10387176 YPZ3_0698 YPZ3_0699 motA motB TRUE 0.999 0.000 0.846 1.000 Y NA
 10387176 10387177 YPZ3_0699 YPZ3_0700 motB   FALSE 0.022 460.000 0.000 NA   NA
 10387177 10387178 YPZ3_0700 YPZ3_0701     TRUE 0.948 -3.000 0.000 NA   NA
 10387178 10387179 YPZ3_0701 YPZ3_0702     FALSE 0.003 2129.000 0.000 NA   NA
 10387179 10387180 YPZ3_0702 YPZ3_0703     TRUE 0.948 54.000 0.167 1.000 Y NA
 10387182 10387183 YPZ3_0705 YPZ3_0706     TRUE 0.993 13.000 0.842 1.000 N NA
 10387185 10387186 YPZ3_0708 YPZ3_0709   yapH FALSE 0.005 854.000 0.000 NA   NA
 10387187 10387188 YPZ3_0710 YPZ3_0711     FALSE 0.038 596.000 0.000 0.013   NA
 10387188 10387189 YPZ3_0711 YPZ3_0712     TRUE 0.512 208.000 0.000 0.013   NA
 10387190 10387191 YPZ3_0713 YPZ3_0714     TRUE 0.468 78.000 0.089 NA N NA
 10387191 10387192 YPZ3_0714 YPZ3_0715     FALSE 0.004 388.000 0.000 1.000 N NA
 10387192 10387193 YPZ3_0715 YPZ3_0716     FALSE 0.059 151.000 0.000 1.000 N NA
 10387193 10387194 YPZ3_0716 YPZ3_0717     TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.014   NA
 10387194 10387195 YPZ3_0717 YPZ3_0718     TRUE 0.854 14.000 0.000 1.000   NA
 10387195 10387196 YPZ3_0718 YPZ3_0719     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10387196 10387197 YPZ3_0719 YPZ3_0720   irp2 FALSE 0.033 208.000 0.000 1.000 N NA
 10387197 10387198 YPZ3_0720 YPZ3_0721 irp2   TRUE 0.979 8.000 0.000 0.001   NA
 10387198 10387199 YPZ3_0721 YPZ3_0722     TRUE 0.974 13.000 0.000 0.001   NA
 10387199 10387200 YPZ3_0722 YPZ3_0723     TRUE 0.948 -3.000 0.000 NA   NA
 10387200 10387201 YPZ3_0723 YPZ3_0724     TRUE 0.948 -3.000 0.000 NA   NA
 10387201 10387202 YPZ3_0724 YPZ3_0725     TRUE 0.990 -7.000 0.074 1.000 Y NA
 10387202 10387203 YPZ3_0725 YPZ3_0726     TRUE 0.954 -10.000 0.000 NA   NA
 10387203 10387204 YPZ3_0726 YPZ3_0727     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 10387204 10387205 YPZ3_0727 YPZ3_0728     TRUE 0.995 -7.000 0.000 0.007 Y NA
 10387206 10387207 YPZ3_0729 YPZ3_0730     FALSE 0.025 436.000 0.000 NA   NA
 10387208 10387209 YPZ3_0731 YPZ3_0732 gntP   FALSE 0.004 1226.000 0.000 NA   NA
 10387209 10387210 YPZ3_0732 YPZ3_0733     FALSE 0.409 117.000 0.000 NA   NA
 10387210 10387211 YPZ3_0733 YPZ3_0734     FALSE 0.083 656.000 0.000 0.010 Y NA
 10387211 10387212 YPZ3_0734 YPZ3_0735     FALSE 0.011 586.000 0.000 NA   NA
 10387212 10387213 YPZ3_0735 YPZ3_0736     TRUE 0.804 26.000 0.000 NA   NA
 10387213 10387214 YPZ3_0736 YPZ3_0737     TRUE 0.870 14.000 0.000 NA   NA
 10387214 10387215 YPZ3_0737 YPZ3_0738     FALSE 0.004 1061.000 0.000 NA   NA
 10387216 10387217 YPZ3_0739 YPZ3_0740   cytR FALSE 0.014 282.000 0.000 1.000 N NA
 10387217 10387218 YPZ3_0740 YPZ3_0741 cytR   FALSE 0.000 1347.000 0.000 1.000 N NA
 10387218 10387219 YPZ3_0741 YPZ3_0742     TRUE 0.948 54.000 0.167 1.000 Y NA
 10387221 10387222 YPZ3_0744 YPZ3_0745 iutA iucD TRUE 0.499 72.000 0.100 1.000 N NA
 10387222 10387223 YPZ3_0745 YPZ3_0746 iucD iucC TRUE 0.998 -3.000 0.417 1.000 Y NA
 10387223 10387224 YPZ3_0746 YPZ3_0747 iucC iucB TRUE 0.989 -3.000 0.250 1.000   NA
 10387224 10387225 YPZ3_0747 YPZ3_0748 iucB iucA2 TRUE 0.997 -16.000 0.609 1.000   NA
 10387225 10387226 YPZ3_0748 YPZ3_0749 iucA2 iucA1 TRUE 0.833 93.000 0.000 0.001   NA
 10387228 10387229 YPZ3_0751 YPZ3_0752     FALSE 0.035 377.000 0.000 1.000   NA
 10387232 10387233 YPZ3_0755 YPZ3_0756     FALSE 0.003 3122.000 0.000 NA   NA
 10387233 10387234 YPZ3_0756 YPZ3_0757     TRUE 0.714 49.000 0.000 NA   NA
 10387234 10387235 YPZ3_0757 YPZ3_0758     FALSE 0.409 117.000 0.000 NA   NA
 10387235 10387236 YPZ3_0758 YPZ3_0759     TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 10387236 10387237 YPZ3_0759 YPZ3_0760     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 10387237 10387238 YPZ3_0760 YPZ3_0761     TRUE 0.911 4.000 0.000 NA   NA
 10387238 10387239 YPZ3_0761 YPZ3_0762     FALSE 0.058 388.000 0.083 NA   NA
 10387239 10387240 YPZ3_0762 YPZ3_0763     TRUE 0.964 3.000 0.125 NA   NA
 10387240 10387241 YPZ3_0763 YPZ3_0764     TRUE 0.983 16.000 0.400 NA   NA
 10387241 10387242 YPZ3_0764 YPZ3_0765     TRUE 0.954 -13.000 0.000 NA   NA
 10387242 10387243 YPZ3_0765 YPZ3_0766   insB FALSE 0.025 437.000 0.000 NA   NA
 10387243 10387244 YPZ3_0766 YPZ3_0767 insB   FALSE 0.010 608.000 0.000 NA   NA
 10387246 10387247 YPZ3_0768 YPZ3_0769 speC   FALSE 0.003 556.000 0.000 NA N NA
 10387247 10387248 YPZ3_0769 YPZ3_0770   mglA TRUE 0.990 46.000 0.545 NA Y NA
 10387248 10387249 YPZ3_0770 YPZ3_0771 mglA   TRUE 0.995 33.000 0.727 1.000 Y NA
 10387250 10387251 YPZ3_0772 YPZ3_0773     TRUE 0.842 104.000 0.128 1.000 Y NA
 10387251 10387252 YPZ3_0773 YPZ3_0774     FALSE 0.018 300.000 0.000 NA N NA
 10387252 10387253 YPZ3_0774 YPZ3_0775     FALSE 0.002 633.000 0.000 NA N NA
 10387254 10387255 YPZ3_0776 YPZ3_0777     TRUE 0.963 0.000 0.092 NA   NA
 10387255 10387256 YPZ3_0777 YPZ3_0778     TRUE 0.631 111.000 0.123 NA   NA
 10387256 10387257 YPZ3_0778 YPZ3_0779     TRUE 0.486 112.000 0.059 NA   NA
 10387257 10387258 YPZ3_0779 YPZ3_0780     FALSE 0.007 703.000 0.000 NA   NA
 10387259 10387260 YPZ3_0781 YPZ3_0782     TRUE 0.978 -7.000 0.218 1.000 N NA
 10387260 10387261 YPZ3_0782 YPZ3_0783     TRUE 0.791 22.000 0.016 NA   NA
 10387261 10387262 YPZ3_0783 YPZ3_0784     TRUE 0.972 -15.000 0.081 NA   NA
 10387262 10387263 YPZ3_0784 YPZ3_0785   proC FALSE 0.203 288.000 0.117 NA   NA
 10387263 10387264 YPZ3_0785 YPZ3_0786 proC   TRUE 0.583 133.000 0.125 NA   NA
 10387266 10387267 YPZ3_0788 YPZ3_0789     TRUE 0.945 4.000 0.095 1.000   NA
 10387267 10387268 YPZ3_0789 YPZ3_0790     FALSE 0.194 180.000 0.004 1.000   NA
 10387268 10387269 YPZ3_0790 YPZ3_0791     TRUE 0.979 0.000 0.263 NA N NA
 10387269 10387270 YPZ3_0791 YPZ3_0792   gshB FALSE 0.417 116.000 0.120 NA N NA
 10387270 10387271 YPZ3_0792 YPZ3_0793 gshB   TRUE 0.932 26.000 0.173 NA   NA
 10387271 10387272 YPZ3_0793 YPZ3_0794   endA FALSE 0.410 252.000 0.201 NA   NA
 10387272 10387273 YPZ3_0794 YPZ3_0795 endA sprT TRUE 0.777 98.000 0.210 NA   NA
 10387273 10387274 YPZ3_0795 YPZ3_0796 sprT metK FALSE 0.338 142.000 0.030 NA   NA
 10387275 10387276 YPZ3_0797 YPZ3_0798 speA   FALSE 0.016 160.000 0.006 NA N NA
 10387278 10387279 YPZ3_0800 YPZ3_0801 tktA   FALSE 0.019 257.000 0.000 1.000 N NA
 10387279 10387280 YPZ3_0801 YPZ3_0802   epd FALSE 0.007 341.000 0.000 1.000 N NA
 10387280 10387281 YPZ3_0802 YPZ3_0803 epd pgk TRUE 0.915 103.000 0.070 0.006 Y NA
 10387281 10387282 YPZ3_0803 YPZ3_0804 pgk fbaA TRUE 0.893 120.000 0.056 0.006 Y NA
 10387282 10387283 YPZ3_0804 YPZ3_0805 fbaA   FALSE 0.005 438.000 0.038 NA N NA
 10387283 10387284 YPZ3_0805 YPZ3_0806     FALSE 0.150 263.000 0.049 NA   NA
 10387284 10387285 YPZ3_0806 YPZ3_0807     FALSE 0.361 190.000 0.075 NA   NA
 10387287 10387288 YPZ3_0809 YPZ3_0810 rpiA serA FALSE 0.006 307.000 0.029 1.000 N NA
 10387289 10387290 YPZ3_0811 YPZ3_0812     FALSE 0.044 364.000 0.034 NA   NA
 10387291 10387292 YPZ3_0813 YPZ3_0814   pepP TRUE 0.605 88.000 0.073 NA   NA
 10387292 10387293 YPZ3_0814 YPZ3_0815 pepP ubiH FALSE 0.233 69.000 0.047 1.000 N NA
 10387293 10387294 YPZ3_0815 YPZ3_0816 ubiH visC TRUE 0.973 173.000 0.474 0.001 Y NA
 10387294 10387295 YPZ3_0816 YPZ3_0817 visC gcvT FALSE 0.000 721.000 0.004 1.000 N NA
 10387295 10387296 YPZ3_0817 YPZ3_0818 gcvT gcsH TRUE 0.988 69.000 0.317 0.001 Y NA
 10387296 10387297 YPZ3_0818 YPZ3_0819 gcsH gcvP TRUE 0.778 212.000 0.249 1.000 Y NA
 10387297 10387298 YPZ3_0819 YPZ3_0820 gcvP   FALSE 0.039 378.000 0.000 NA   NA
 10387298 10387299 YPZ3_0820 YPZ3_0821     FALSE 0.004 1210.000 0.000 NA   NA
 10387299 10387300 YPZ3_0821 YPZ3_0822     TRUE 0.439 104.000 0.000 NA   NA
 10387300 10387301 YPZ3_0822 YPZ3_0823     FALSE 0.238 202.000 0.000 NA   NA
 10387301 10387302 YPZ3_0823 YPZ3_0824     FALSE 0.138 258.000 0.000 NA   NA
 10387304 10387305 YPZ3_0826 YPZ3_0827     TRUE 0.945 0.000 0.051 NA   NA
 10387305 10387306 YPZ3_0827 YPZ3_0828   creC TRUE 0.996 25.000 0.776 1.000 Y NA
 10387306 10387307 YPZ3_0828 YPZ3_0829 creC   TRUE 0.727 121.000 0.311 NA N NA
 10387309 10387310 YPZ3_0831 YPZ3_0832 xerD dsbC TRUE 0.639 31.000 0.079 1.000 N NA
 10387310 10387311 YPZ3_0832 YPZ3_0833 dsbC recJ TRUE 0.823 7.000 0.082 1.000 N NA
 10387311 10387312 YPZ3_0833 YPZ3_0834 recJ prfB FALSE 0.003 345.000 0.028 1.000 N NA
 10387312 10387313 YPZ3_0834 YPZ3_0835 prfB lysS TRUE 0.993 10.000 0.162 0.048 Y NA
 10387313 10387314 YPZ3_0835 YPZ3_t7 lysS   FALSE 0.256 194.000 0.000 NA   NA
 10387314 10387315 YPZ3_t7 YPZ3_0836   int FALSE 0.314 166.000 0.000 NA   NA
 10387315 10387316 YPZ3_0836 YPZ3_0837 int   FALSE 0.003 1188.000 0.000 1.000   NA
 10387316 10387317 YPZ3_0837 YPZ3_0838     FALSE 0.069 460.000 0.000 0.029   NA
 10387320 10387321 YPZ3_0841 YPZ3_0842     FALSE 0.143 255.000 0.000 NA   NA
 10387322 10387323 YPZ3_0843 YPZ3_0844     FALSE 0.015 507.000 0.000 1.000   NA
 10387323 10387324 YPZ3_0844 YPZ3_0845     FALSE 0.003 1508.000 0.000 NA   NA
 10387324 10387325 YPZ3_0845 YPZ3_0846     TRUE 0.995 -30.000 0.429 NA   NA
 10387325 10387326 YPZ3_0846 YPZ3_0847     FALSE 0.010 605.000 0.000 NA   NA
 10387326 10387327 YPZ3_0847 YPZ3_0848     FALSE 0.209 217.000 0.000 NA   NA
 10387328 10387329 YPZ3_0849 YPZ3_0850     TRUE 0.953 0.000 0.065 NA   NA
 10387329 10387330 YPZ3_0850 YPZ3_0851     FALSE 0.027 424.000 0.000 NA   NA
 10387330 10387331 YPZ3_0851 YPZ3_0852     FALSE 0.040 376.000 0.000 NA   NA
 10387331 10387332 YPZ3_0852 YPZ3_0853     FALSE 0.006 779.000 0.000 NA   NA
 10387332 10387333 YPZ3_0853 YPZ3_0854     FALSE 0.229 435.000 0.217 NA Y NA
 10387333 10387334 YPZ3_0854 YPZ3_0855     TRUE 0.933 72.000 0.200 1.000 Y NA
 10387334 10387335 YPZ3_0855 YPZ3_0856     FALSE 0.048 549.000 0.000 1.000 Y NA
 10387336 10387337 YPZ3_0857 YPZ3_0858     TRUE 0.970 160.000 0.815 1.000 Y NA
 10387337 10387338 YPZ3_0858 YPZ3_0859     TRUE 0.999 12.000 0.885 0.064 Y NA
 10387338 10387339 YPZ3_0859 YPZ3_0860     TRUE 0.994 5.000 0.308 1.000 Y NA
 10387339 10387340 YPZ3_0860 YPZ3_0861   bgaB TRUE 0.984 51.000 0.190 0.004 Y NA
 10387340 10387341 YPZ3_0861 YPZ3_0862 bgaB   TRUE 0.841 112.000 0.143 1.000 Y NA
 10387344 10387345 YPZ3_0865 YPZ3_0866     TRUE 0.911 151.000 0.341 NA Y NA
 10387347 10387348 YPZ3_0868 YPZ3_0869   agaY TRUE 0.927 24.000 0.148 NA   NA
 10387348 10387349 YPZ3_0869 YPZ3_0870 agaY   TRUE 0.805 109.000 0.261 NA   NA
 10387349 10387350 YPZ3_0870 YPZ3_0871     TRUE 0.942 123.000 0.727 NA   NA
 10387350 10387351 YPZ3_0871 YPZ3_0872     TRUE 0.988 21.000 0.615 1.000   NA
 10387351 10387352 YPZ3_0872 YPZ3_0873     FALSE 0.399 244.000 0.000 0.020   NA
 10387352 10387353 YPZ3_0873 YPZ3_0874   kduD2 TRUE 0.985 16.000 0.462 1.000   NA
 10387353 10387354 YPZ3_0874 YPZ3_0875 kduD2   FALSE 0.038 196.000 0.000 1.000 N NA
 10387354 10387355 YPZ3_0875 YPZ3_0876     TRUE 0.985 3.000 0.104 1.000 Y NA
 10387355 10387356 YPZ3_0876 YPZ3_0877     TRUE 0.994 86.000 0.833 0.009 Y NA
 10387356 10387357 YPZ3_0877 YPZ3_0878     TRUE 1.000 -10.000 0.917 0.009 Y NA
 10387357 10387358 YPZ3_0878 YPZ3_0879   manX TRUE 0.998 47.000 0.909 0.009 Y NA
 10387358 10387359 YPZ3_0879 YPZ3_0880 manX   TRUE 0.873 18.000 0.150 1.000 N NA
 10387359 10387360 YPZ3_0880 YPZ3_0881   agaZ TRUE 0.979 -3.000 0.240 1.000 N NA
 10387360 10387361 YPZ3_0881 YPZ3_0882 agaZ   TRUE 0.981 50.000 0.400 1.000 Y NA
 10387364 10387365 YPZ3_0885 YPZ3_0886     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10387366 10387367 YPZ3_0887 YPZ3_0888     TRUE 0.886 109.000 0.444 1.000   NA
 10387367 10387368 YPZ3_0888 YPZ3_0889     TRUE 0.802 115.000 0.286 1.000   NA
 10387369 10387370 YPZ3_0890 YPZ3_0891     FALSE 0.007 743.000 0.000 NA   NA
 10387370 10387371 YPZ3_0891 YPZ3_0892     TRUE 0.900 170.000 0.667 NA   NA
 10387371 10387372 YPZ3_0892 YPZ3_0893     TRUE 0.961 81.000 0.667 NA   NA
 10387372 10387373 YPZ3_0893 YPZ3_0894     TRUE 0.995 -3.000 0.012 0.002 Y NA
 10387373 10387374 YPZ3_0894 YPZ3_0895   hofF TRUE 0.986 142.000 0.653 0.002 Y NA
 10387374 10387375 YPZ3_0895 YPZ3_0896 hofF   TRUE 0.998 20.000 0.599 0.002 Y NA
 10387375 10387376 YPZ3_0896 YPZ3_0897   gspJ FALSE 0.016 1123.000 0.000 NA Y NA
 10387376 10387377 YPZ3_0897 YPZ3_0898 gspJ   TRUE 0.977 69.000 0.461 NA Y NA
 10387377 10387378 YPZ3_0898 YPZ3_0899     TRUE 0.999 -16.000 0.537 0.074 Y NA
 10387378 10387379 YPZ3_0899 YPZ3_0900     FALSE 0.062 487.000 0.000 1.000 Y NA
 10387381 10387382 YPZ3_0902 YPZ3_0903     FALSE 0.002 553.000 0.000 1.000 N NA
 10387383 10387384 YPZ3_0904 YPZ3_0905     TRUE 0.664 113.000 0.157 1.000   NA
 10387385 10387386 YPZ3_0906 YPZ3_0907     FALSE 0.009 369.000 0.000 NA N NA
 10387390 10387391 YPZ3_0911 YPZ3_0912 bisC aas FALSE 0.003 449.000 0.000 1.000 N NA
 10387391 10387392 YPZ3_0912 YPZ3_0913 aas   TRUE 0.977 -3.000 0.124 NA   NA
 10387393 10387394 YPZ3_0914 YPZ3_0915 tas mutH FALSE 0.001 389.000 0.015 1.000 N NA
 10387395 10387396 YPZ3_0916 YPZ3_0917     FALSE 0.149 19.000 0.012 1.000 N NA
 10387396 10387397 YPZ3_0917 YPZ3_0918   lgt FALSE 0.006 251.000 0.003 1.000 N NA
 10387397 10387398 YPZ3_0918 YPZ3_0919 lgt thyA TRUE 0.926 7.000 0.164 1.000 N NA
 10387398 10387399 YPZ3_0919 YPZ3_0920 thyA   FALSE 0.001 719.000 0.000 1.000 N NA
 10387399 10387400 YPZ3_0920 YPZ3_0921     TRUE 0.986 -10.000 0.000 0.020   NA
 10387400 10387401 YPZ3_0921 YPZ3_0922     TRUE 0.996 0.000 0.667 1.000   NA
 10387401 10387402 YPZ3_0922 YPZ3_0923     FALSE 0.042 235.000 0.000 NA N NA
 10387402 10387403 YPZ3_0923 YPZ3_0924     TRUE 0.994 -3.000 0.373 NA   NA
 10387403 10387404 YPZ3_0924 YPZ3_0925     TRUE 0.980 33.000 0.538 NA   NA
 10387404 10387405 YPZ3_0925 YPZ3_0926   recC FALSE 0.249 135.000 0.076 NA N NA
 10387405 10387406 YPZ3_0926 YPZ3_0927 recC ptrA FALSE 0.413 82.000 0.092 1.000 N NA
 10387406 10387407 YPZ3_0927 YPZ3_0928 ptrA   FALSE 0.196 180.000 0.092 1.000 N NA
 10387407 10387408 YPZ3_0928 YPZ3_0929     TRUE 1.000 0.000 0.688 0.001 Y NA
 10387411 10387412 YPZ3_t8 YPZ3_t9     FALSE 0.393 124.000 0.000 NA   NA
 10387413 10387414 YPZ3_0932 YPZ3_0933     FALSE 0.018 143.000 0.021 1.000 N NA
 10387415 10387416 YPZ3_0934 YPZ3_0935     TRUE 0.824 138.000 0.122 0.002   NA
 10387417 10387418 YPZ3_0936 YPZ3_0937 gcvA   FALSE 0.428 166.000 0.081 NA   NA
 10387418 10387419 YPZ3_0937 YPZ3_0938     TRUE 0.983 -7.000 0.144 NA   NA
 10387420 10387421 YPZ3_0939 YPZ3_0940 xni   FALSE 0.351 260.000 0.178 NA   NA
 10387421 10387422 YPZ3_0940 YPZ3_0941     TRUE 0.451 153.000 0.079 NA   NA
 10387423 10387424 YPZ3_0942 YPZ3_0943 syd   FALSE 0.009 639.000 0.000 NA   NA
 10387424 10387425 YPZ3_0943 YPZ3_0944     FALSE 0.146 254.000 0.000 NA   NA
 10387425 10387426 YPZ3_0944 YPZ3_0945     TRUE 0.995 0.000 0.518 NA   NA
 10387426 10387427 YPZ3_0945 YPZ3_0946     TRUE 0.887 28.000 0.209 1.000 N NA
 10387428 10387429 YPZ3_0947 YPZ3_0948   dapD FALSE 0.391 124.000 0.035 NA   NA
 10387429 10387430 YPZ3_0948 YPZ3_0949 dapD   FALSE 0.219 175.000 0.097 1.000 N NA
 10387430 10387431 YPZ3_0949 YPZ3_0950   ampM TRUE 0.832 60.000 0.243 1.000 N NA
 10387432 10387433 YPZ3_0951 YPZ3_0952   tsf TRUE 0.972 128.000 0.748 1.000 Y NA
 10387433 10387434 YPZ3_0952 YPZ3_0953 tsf pyrH TRUE 0.617 209.000 0.416 1.000 N NA
 10387434 10387435 YPZ3_0953 YPZ3_0954 pyrH frr TRUE 0.862 136.000 0.626 1.000 N NA
 10387435 10387436 YPZ3_0954 YPZ3_0955 frr dxr FALSE 0.022 214.000 0.032 1.000 N NA
 10387436 10387437 YPZ3_0955 YPZ3_0956 dxr   FALSE 0.275 290.000 0.025 1.000 Y NA
 10387437 10387438 YPZ3_0956 YPZ3_0957     TRUE 0.984 43.000 0.400 1.000 Y NA
 10387438 10387439 YPZ3_0957 YPZ3_0958     TRUE 0.652 29.000 0.080 1.000 N NA
 10387439 10387440 YPZ3_0958 YPZ3_0959     TRUE 0.969 37.000 0.204 1.000 Y NA
 10387440 10387441 YPZ3_0959 YPZ3_0960   ompH TRUE 0.905 158.000 0.354 1.000 Y NA
 10387441 10387442 YPZ3_0960 YPZ3_0961 ompH lpxD TRUE 0.999 4.000 0.814 1.000 Y NA
 10387442 10387443 YPZ3_0961 YPZ3_0962 lpxD fabZ TRUE 0.895 158.000 0.796 1.000 N NA
 10387443 10387444 YPZ3_0962 YPZ3_0963 fabZ lpxA TRUE 0.995 4.000 0.850 1.000 N NA
 10387444 10387445 YPZ3_0963 YPZ3_0964 lpxA lpxB TRUE 0.994 4.000 0.289 1.000 Y NA
 10387445 10387446 YPZ3_0964 YPZ3_0965 lpxB rnhB TRUE 0.970 -3.000 0.186 1.000 N NA
 10387446 10387447 YPZ3_0965 YPZ3_0966 rnhB dnaE TRUE 0.775 130.000 0.104 1.000 Y NA
 10387447 10387448 YPZ3_0966 YPZ3_0967 dnaE accA TRUE 0.868 13.000 0.122 1.000 N NA
 10387448 10387449 YPZ3_0967 YPZ3_0968 accA   FALSE 0.012 184.000 0.008 1.000 N NA
 10387449 10387450 YPZ3_0968 YPZ3_0969     FALSE 0.287 2.000 0.015 1.000 N NA
 10387450 10387451 YPZ3_0969 YPZ3_0970     FALSE 0.007 237.000 0.005 1.000 N NA
 10387451 10387452 YPZ3_0970 YPZ3_0971     FALSE 0.004 954.000 0.000 1.000   NA
 10387452 10387453 YPZ3_0971 YPZ3_0972     TRUE 0.947 -21.000 0.034 1.000   NA
 10387453 10387454 YPZ3_0972 YPZ3_0973     TRUE 0.488 85.000 0.027 NA   NA
 10387455 10387456 YPZ3_0974 YPZ3_0975 proS   TRUE 0.474 104.000 0.048 NA   NA
 10387456 10387457 YPZ3_0975 YPZ3_0976   rcsF TRUE 0.989 -3.000 0.247 NA   NA
 10387457 10387458 YPZ3_0976 YPZ3_0977 rcsF   TRUE 0.898 118.000 0.500 NA   NA
 10387458 10387459 YPZ3_0977 YPZ3_0978     TRUE 0.976 64.000 0.411 NA Y NA
 10387459 10387460 YPZ3_0978 YPZ3_0979   abc TRUE 0.990 47.000 0.584 1.000 Y NA
 10387461 10387462 YPZ3_0980 YPZ3_r4     FALSE 0.021 469.000 0.000 NA   NA
 10387462 10387463 YPZ3_r4 YPZ3_t10     FALSE 0.281 181.000 0.000 NA   NA
 10387463 10387464 YPZ3_t10 YPZ3_r5     FALSE 0.149 253.000 0.000 NA   NA
 10387464 10387465 YPZ3_r5 YPZ3_r6     FALSE 0.425 110.000 0.000 NA   NA
 10387465 10387466 YPZ3_r6 YPZ3_t11     FALSE 0.384 126.000 0.000 NA   NA
 10387466 10387467 YPZ3_t11 YPZ3_0981     FALSE 0.046 359.000 0.000 NA   NA
 10387467 10387468 YPZ3_0981 YPZ3_0982     TRUE 0.695 53.000 0.000 NA   NA
 10387468 10387469 YPZ3_0982 YPZ3_0983     FALSE 0.038 382.000 0.000 NA   NA
 10387470 10387471 YPZ3_0984 YPZ3_0985 mltD gloB TRUE 0.666 168.000 0.233 1.000   NA
 10387474 10387475 YPZ3_0988 YPZ3_t12 dnaQ   FALSE 0.417 113.000 0.000 NA   NA
 10387476 10387477 YPZ3_0989 YPZ3_0990     FALSE 0.001 659.000 0.000 1.000 N NA
 10387477 10387478 YPZ3_0990 YPZ3_0991     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10387480 10387481 YPZ3_0993 YPZ3_0994     TRUE 0.948 -3.000 0.000 NA   NA
 10387481 10387482 YPZ3_0994 YPZ3_0995     FALSE 0.005 932.000 0.000 NA   NA
 10387482 10387483 YPZ3_0995 YPZ3_0996     FALSE 0.004 1197.000 0.000 NA   NA
 10387483 10387484 YPZ3_0996 YPZ3_0997     TRUE 0.926 51.000 0.250 NA   NA
 10387484 10387485 YPZ3_0997 YPZ3_0998     TRUE 0.551 79.000 0.000 NA   NA
 10387485 10387486 YPZ3_0998 YPZ3_0999     TRUE 0.653 224.000 0.000 0.079 Y NA
 10387486 10387487 YPZ3_0999 YPZ3_1000   smpB FALSE 0.001 584.000 0.000 1.000 N NA
 10387489 10387490 YPZ3_1002 YPZ3_1003     FALSE 0.133 114.000 0.049 1.000 N NA
 10387490 10387491 YPZ3_1003 YPZ3_1004   ppnK TRUE 0.610 87.000 0.170 1.000 N NA
 10387494 10387495 YPZ3_1007 YPZ3_1008 sdhD sdhA TRUE 0.999 1.000 0.705 0.002 Y NA
 10387495 10387496 YPZ3_1008 YPZ3_1009 sdhA sdhB TRUE 0.996 50.000 0.604 0.002 Y NA
 10387496 10387497 YPZ3_1009 YPZ3_1010 sdhB sucA FALSE 0.188 356.000 0.067 1.000 Y NA
 10387497 10387498 YPZ3_1010 YPZ3_1011 sucA sucB TRUE 0.994 30.000 0.667 1.000 Y NA
 10387498 10387499 YPZ3_1011 YPZ3_1012 sucB sucC TRUE 0.836 113.000 0.136 1.000 Y NA
 10387499 10387500 YPZ3_1012 YPZ3_1013 sucC sucD TRUE 1.000 0.000 0.806 0.001 Y NA
 10387500 10387501 YPZ3_1013 YPZ3_1014 sucD cydA FALSE 0.022 767.000 0.000 1.000 Y NA
 10387501 10387502 YPZ3_1014 YPZ3_1015 cydA cydB TRUE 0.996 15.000 0.348 0.036 Y NA
 10387502 10387503 YPZ3_1015 YPZ3_1016 cydB tolQ FALSE 0.001 957.000 0.000 1.000 N NA
 10387503 10387504 YPZ3_1016 YPZ3_1017 tolQ tolR TRUE 0.998 13.000 0.556 0.081 Y NA
 10387504 10387505 YPZ3_1017 YPZ3_1018 tolR tolA FALSE 0.408 112.000 0.114 NA N NA
 10387505 10387506 YPZ3_1018 YPZ3_1019 tolA tolB FALSE 0.176 120.000 0.051 NA N NA
 10387506 10387507 YPZ3_1019 YPZ3_1020 tolB pal TRUE 0.959 51.000 0.592 1.000 N NA
 10387507 10387508 YPZ3_1020 YPZ3_1021 pal   TRUE 0.928 10.000 0.088 1.000   NA
 10387508 10387509 YPZ3_1021 YPZ3_t13     FALSE 0.263 191.000 0.000 NA   NA
 10387509 10387510 YPZ3_t13 YPZ3_t14     TRUE 0.795 28.000 0.000 NA   NA
 10387510 10387511 YPZ3_t14 YPZ3_r7     TRUE 0.792 29.000 0.000 NA   NA
 10387511 10387512 YPZ3_r7 YPZ3_1022   nadA FALSE 0.043 369.000 0.000 NA   NA
 10387512 10387513 YPZ3_1022 YPZ3_1023 nadA pnuC TRUE 0.687 122.000 0.023 1.000 Y NA
 10387516 10387517 YPZ3_1026 YPZ3_1027     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10387517 10387518 YPZ3_1027 YPZ3_1028   gpmA FALSE 0.005 366.000 0.000 1.000 N NA
 10387518 10387519 YPZ3_1028 YPZ3_1029 gpmA psiF FALSE 0.054 347.000 0.000 NA   NA
 10387519 10387520 YPZ3_1029 YPZ3_1030 psiF   FALSE 0.097 293.000 0.000 NA   NA
 10387520 10387521 YPZ3_1030 YPZ3_1031   galK TRUE 0.891 167.000 0.083 0.001 Y NA
 10387521 10387522 YPZ3_1031 YPZ3_1032 galK galT TRUE 0.997 -3.000 0.370 0.001 N NA
 10387522 10387523 YPZ3_1032 YPZ3_1033 galT galE TRUE 0.966 10.000 0.053 0.001 N NA
 10387523 10387524 YPZ3_1033 YPZ3_1034 galE   FALSE 0.046 360.000 0.000 NA   NA
 10387524 10387525 YPZ3_1034 YPZ3_1035   modF FALSE 0.164 217.000 0.009 NA   NA
 10387525 10387526 YPZ3_1035 YPZ3_1036 modF modE FALSE 0.366 110.000 0.028 1.000   NA
 10387527 10387528 YPZ3_1037 YPZ3_1038 modA modB TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 10387528 10387529 YPZ3_1038 YPZ3_1039 modB modC TRUE 1.000 -6.000 0.537 0.001 Y NA
 10387533 10387534 YPZ3_1043 YPZ3_1044 bioB bioF TRUE 0.997 0.000 0.168 0.003 Y NA
 10387534 10387535 YPZ3_1044 YPZ3_1045 bioF bioC TRUE 0.998 -16.000 0.133 0.003 Y NA
 10387535 10387536 YPZ3_1045 YPZ3_1046 bioC bioD TRUE 0.996 -7.000 0.054 0.003 Y NA
 10387540 10387541 YPZ3_1050 YPZ3_1051 moaA moaC TRUE 0.906 101.000 0.039 0.003 Y NA
 10387541 10387542 YPZ3_1051 YPZ3_1052 moaC   TRUE 0.682 245.000 0.025 0.003 Y NA
 10387542 10387543 YPZ3_1052 YPZ3_1053     FALSE 0.323 144.000 0.025 NA   NA
 10387543 10387544 YPZ3_1053 YPZ3_1054     FALSE 0.274 184.000 0.000 NA   NA
 10387545 10387546 YPZ3_1055 YPZ3_1056 betA betB TRUE 0.981 23.000 0.634 1.000 N NA
 10387546 10387547 YPZ3_1056 YPZ3_1057 betB betI TRUE 0.928 58.000 0.459 1.000 N NA
 10387548 10387549 YPZ3_1058 YPZ3_1059     FALSE 0.016 271.000 0.000 1.000 N NA
 10387551 10387552 YPZ3_1061 YPZ3_1062 xapA   TRUE 0.521 139.000 0.111 1.000   NA
 10387552 10387553 YPZ3_1062 YPZ3_1063   tnp TRUE 0.948 -10.000 0.000 1.000   NA
 10387553 10387554 YPZ3_1063 YPZ3_1064 tnp   FALSE 0.385 113.000 0.000 1.000   NA
 10387556 10387557 YPZ3_1066 YPZ3_1067   hydG TRUE 0.995 -13.000 0.000 0.013 Y NA
 10387557 10387558 YPZ3_1067 YPZ3_1068 hydG nemA1 FALSE 0.007 348.000 0.000 1.000 N NA
 10387561 10387562 YPZ3_1071 YPZ3_1072     TRUE 0.995 13.000 0.609 0.007 N NA
 10387562 10387563 YPZ3_1072 YPZ3_1073   ccmA2 TRUE 0.993 5.000 0.547 1.000   NA
 10387563 10387564 YPZ3_1073 YPZ3_1074 ccmA2 acrA4 TRUE 0.989 14.000 0.545 1.000   NA
 10387564 10387565 YPZ3_1074 YPZ3_1075 acrA4 acrR3 TRUE 0.855 52.000 0.236 1.000 N NA
 10387566 10387567 YPZ3_1076 YPZ3_1077     FALSE 0.003 1581.000 0.000 NA   NA
 10387567 10387568 YPZ3_1077 YPZ3_1078     FALSE 0.010 607.000 0.000 NA   NA
 10387568 10387569 YPZ3_1078 YPZ3_1079     TRUE 0.755 92.000 0.000 0.031   NA
 10387569 10387570 YPZ3_1079 YPZ3_1080   rhlE TRUE 0.914 2.000 0.000 1.000   NA
 10387570 10387571 YPZ3_1080 YPZ3_1081 rhlE   TRUE 0.639 160.000 0.000 1.000 Y NA
 10387571 10387572 YPZ3_1081 YPZ3_1082     FALSE 0.029 415.000 0.000 NA   NA
 10387572 10387573 YPZ3_1082 YPZ3_1083     FALSE 0.096 294.000 0.000 NA   NA
 10387573 10387574 YPZ3_1083 YPZ3_1084   pbpG FALSE 0.001 592.000 0.000 1.000 N NA
 10387578 10387579 YPZ3_1088 YPZ3_1089     FALSE 0.009 641.000 0.000 NA   NA
 10387579 10387580 YPZ3_1089 YPZ3_1090     TRUE 0.997 37.000 0.589 0.002 Y NA
 10387580 10387581 YPZ3_1090 YPZ3_1091     TRUE 0.989 103.000 0.568 0.001 Y NA
 10387581 10387582 YPZ3_1091 YPZ3_1092     TRUE 0.999 3.000 0.491 0.001 Y NA
 10387582 10387583 YPZ3_1092 YPZ3_1093     FALSE 0.160 246.000 0.000 NA   NA
 10387583 10387584 YPZ3_1093 YPZ3_1094     FALSE 0.025 435.000 0.000 NA   NA
 10387584 10387585 YPZ3_1094 YPZ3_1095     TRUE 0.966 124.000 0.654 1.000 Y NA
 10387585 10387586 YPZ3_1095 YPZ3_1096     TRUE 0.999 0.000 0.758 0.063 Y NA
 10387586 10387587 YPZ3_1096 YPZ3_1097     TRUE 0.998 -3.000 0.823 1.000   NA
 10387587 10387588 YPZ3_1097 YPZ3_1098   livF TRUE 0.995 31.000 0.731 0.024   NA
 10387588 10387589 YPZ3_1098 YPZ3_1099 livF   FALSE 0.413 115.000 0.000 NA   NA
 10387589 10387590 YPZ3_1099 YPZ3_1100     TRUE 0.819 24.000 0.000 NA   NA
 10387592 10387593 YPZ3_1102 YPZ3_1103 yehZ1   TRUE 0.652 145.000 0.028 0.012   NA
 10387593 10387594 YPZ3_1103 YPZ3_1104     TRUE 0.668 261.000 0.521 1.000   NA
 10387594 10387595 YPZ3_1104 YPZ3_1105     TRUE 0.998 -3.000 0.489 1.000 Y NA
 10387595 10387596 YPZ3_1105 YPZ3_1106     TRUE 0.998 -3.000 0.542 1.000 Y NA
 10387596 10387597 YPZ3_1106 YPZ3_1107     FALSE 0.051 541.000 0.000 1.000 Y NA
 10387597 10387598 YPZ3_1107 YPZ3_1108     TRUE 0.956 70.000 0.286 1.000 Y NA
 10387599 10387600 YPZ3_1109 YPZ3_1110   ompC2 FALSE 0.030 412.000 0.000 NA   NA
 10387606 10387607 YPZ3_1116 YPZ3_1117 eco nrdB FALSE 0.093 296.000 0.000 NA   NA
 10387607 10387608 YPZ3_1117 YPZ3_1118 nrdB nrdA TRUE 0.993 163.000 1.000 0.001 Y NA
 10387608 10387609 YPZ3_1118 YPZ3_1119 nrdA ubiG FALSE 0.002 494.000 0.000 1.000 N NA
 10387610 10387611 YPZ3_1120 YPZ3_1121 gyrA   FALSE 0.004 281.000 0.013 1.000 N NA
 10387612 10387613 YPZ3_1122 YPZ3_1123 rcsB   TRUE 0.994 3.000 0.558 1.000   NA
 10387613 10387614 YPZ3_1123 YPZ3_1124     TRUE 0.751 168.000 0.070 0.001   NA
 10387614 10387615 YPZ3_1124 YPZ3_1125     FALSE 0.379 99.000 0.093 NA N NA
 10387616 10387617 YPZ3_1126 YPZ3_1127 ompC   FALSE 0.059 151.000 0.000 1.000 N NA
 10387617 10387618 YPZ3_1127 YPZ3_t15     FALSE 0.026 434.000 0.000 NA   NA
 10387618 10387619 YPZ3_t15 YPZ3_t16     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   NA
 10387620 10387621 YPZ3_1128 YPZ3_1129     FALSE 0.023 287.000 0.000 NA N NA
 10387623 10387624 YPZ3_1131 YPZ3_1132 tsr2 pla2 FALSE 0.003 422.000 0.000 1.000 N NA
 10387624 10387625 YPZ3_1132 YPZ3_1133 pla2   FALSE 0.001 620.000 0.000 1.000 N NA
 10387626 10387627 YPZ3_1134 YPZ3_1135     FALSE 0.220 211.000 0.000 NA   NA
 10387627 10387628 YPZ3_1135 YPZ3_1136     TRUE 0.952 -3.000 0.044 NA   NA
 10387628 10387629 YPZ3_1136 YPZ3_1137     TRUE 0.782 83.000 0.015 1.000 Y NA
 10387629 10387630 YPZ3_1137 YPZ3_1138     TRUE 0.998 -24.000 0.400 1.000 Y NA
 10387630 10387631 YPZ3_1138 YPZ3_1139     FALSE 0.005 967.000 0.000 NA   NA
 10387631 10387632 YPZ3_1139 YPZ3_1140     FALSE 0.249 196.000 0.000 NA   NA
 10387632 10387633 YPZ3_1140 YPZ3_1141     TRUE 0.995 22.000 1.000 NA   NA
 10387633 10387634 YPZ3_1141 YPZ3_1142     FALSE 0.027 422.000 0.000 NA   NA
 10387634 10387635 YPZ3_1142 YPZ3_1143     FALSE 0.182 267.000 0.074 NA   NA
 10387635 10387636 YPZ3_1143 YPZ3_1144     TRUE 0.966 -3.000 0.074 NA   NA
 10387636 10387637 YPZ3_1144 YPZ3_1145     TRUE 0.996 16.000 1.000 NA   NA
 10387637 10387638 YPZ3_1145 YPZ3_1146     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA   NA
 10387638 10387639 YPZ3_1146 YPZ3_1147     TRUE 0.998 4.000 1.000 NA   NA
 10387639 10387640 YPZ3_1147 YPZ3_1148     TRUE 0.687 254.000 0.500 NA   NA
 10387640 10387641 YPZ3_1148 YPZ3_1149   stf TRUE 0.463 97.000 0.000 NA   NA
 10387641 10387642 YPZ3_1149 YPZ3_1150 stf   FALSE 0.090 298.000 0.000 NA   NA
 10387642 10387643 YPZ3_1150 YPZ3_1151   bglA FALSE 0.161 291.000 0.000 0.021 N NA
 10387644 10387645 YPZ3_1152 YPZ3_1153     FALSE 0.007 700.000 0.000 NA   NA
 10387645 10387646 YPZ3_1153 YPZ3_1154     TRUE 0.875 13.000 0.000 NA   NA
 10387646 10387647 YPZ3_1154 YPZ3_1155     FALSE 0.048 357.000 0.000 NA   NA
 10387647 10387648 YPZ3_1155 YPZ3_t17     TRUE 0.708 50.000 0.000 NA   NA
 10387648 10387649 YPZ3_t17 YPZ3_1156     FALSE 0.436 105.000 0.000 NA   NA
 10387650 10387651 YPZ3_1157 YPZ3_1158     FALSE 0.345 150.000 0.000 NA   NA
 10387653 10387654 YPZ3_1160 YPZ3_1161 rsuA bcr TRUE 0.451 119.000 0.145 1.000 N NA
 10387654 10387655 YPZ3_1161 YPZ3_1162 bcr   FALSE 0.005 967.000 0.000 NA   NA
 10387656 10387657 YPZ3_1163 YPZ3_1164     TRUE 0.997 2.000 0.758 1.000   NA
 10387657 10387658 YPZ3_1164 YPZ3_1165     TRUE 0.999 0.000 0.833 0.062   NA
 10387658 10387659 YPZ3_1165 YPZ3_1166     TRUE 0.998 10.000 0.848 0.062   NA
 10387659 10387660 YPZ3_1166 YPZ3_1167   rtn1 TRUE 0.864 82.000 0.394 NA N NA
 10387660 10387661 YPZ3_1167 YPZ3_1168 rtn1 spr FALSE 0.018 696.000 0.219 NA N NA
 10387661 10387662 YPZ3_1168 YPZ3_1169 spr   FALSE 0.024 442.000 0.000 NA   NA
 10387662 10387663 YPZ3_1169 YPZ3_1170     TRUE 0.918 59.000 0.275 NA   NA
 10387667 10387668 YPZ3_1174 YPZ3_1175 efp2 mtr TRUE 0.695 62.000 0.153 1.000 N NA
 10387668 10387669 YPZ3_1175 YPZ3_1176 mtr   FALSE 0.001 698.000 0.000 1.000 N NA
 10387669 10387670 YPZ3_1176 YPZ3_1177     TRUE 0.478 11.000 0.000 1.000 N NA
 10387670 10387671 YPZ3_1177 YPZ3_1178     TRUE 0.953 12.000 0.017 0.048   NA
 10387672 10387673 YPZ3_1179 YPZ3_1180     TRUE 0.788 4.000 0.065 1.000 N NA
 10387673 10387674 YPZ3_1180 YPZ3_1181   rpiA TRUE 0.949 20.000 0.000 1.000 Y NA
 10387674 10387675 YPZ3_1181 YPZ3_1182 rpiA   TRUE 0.717 124.000 0.000 NA Y NA
 10387675 10387676 YPZ3_1182 YPZ3_1183     TRUE 0.941 109.000 0.375 NA Y NA
 10387676 10387677 YPZ3_1183 YPZ3_1184     TRUE 0.985 36.000 0.375 1.000 Y NA
 10387679 10387680 YPZ3_1186 YPZ3_1187 fruB fruK TRUE 0.991 -3.000 0.112 1.000 Y NA
 10387680 10387681 YPZ3_1187 YPZ3_1188 fruK fruA TRUE 0.996 15.000 0.562 1.000 Y NA
 10387681 10387682 YPZ3_1188 YPZ3_1189 fruA psaE FALSE 0.009 325.000 0.000 1.000 N NA
 10387682 10387683 YPZ3_1189 YPZ3_1190 psaE   TRUE 0.993 36.000 1.000 NA   NA
 10387683 10387684 YPZ3_1190 YPZ3_1191   psaA FALSE 0.014 545.000 0.000 NA   NA
 10387684 10387685 YPZ3_1191 YPZ3_1192 psaA psaB TRUE 0.853 127.000 0.400 NA   NA
 10387685 10387686 YPZ3_1192 YPZ3_1193 psaB   TRUE 0.800 84.000 0.000 1.000 Y NA
 10387687 10387688 YPZ3_1194 YPZ3_1195 nfo   FALSE 0.328 164.000 0.040 NA   NA
 10387689 10387690 YPZ3_1196 YPZ3_1197   lysP FALSE 0.268 258.000 0.222 1.000 N NA
 10387690 10387691 YPZ3_1197 YPZ3_1198 lysP   FALSE 0.014 286.000 0.000 1.000 N NA
 10387691 10387692 YPZ3_1198 YPZ3_1199     TRUE 0.699 216.000 0.175 1.000 Y NA
 10387692 10387693 YPZ3_1199 YPZ3_1200     TRUE 0.999 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 10387693 10387694 YPZ3_1200 YPZ3_1201     FALSE 0.365 260.000 0.000 1.000 Y NA
 10387695 10387696 YPZ3_1202 YPZ3_1203     FALSE 0.126 154.000 0.056 1.000 N NA
 10387697 10387698 YPZ3_1204 YPZ3_1205     FALSE 0.437 228.000 0.174 NA   NA
 10387698 10387699 YPZ3_1205 YPZ3_1206     TRUE 0.997 -3.000 0.323 NA Y NA
 10387699 10387700 YPZ3_1206 YPZ3_1207     TRUE 0.990 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 10387700 10387701 YPZ3_1207 YPZ3_1208     FALSE 0.008 338.000 0.000 1.000 N NA
 10387702 10387703 YPZ3_1209 YPZ3_1210   deoR FALSE 0.000 1181.000 0.000 1.000 N NA
 10387703 10387704 YPZ3_1210 YPZ3_1211 deoR   FALSE 0.016 230.000 0.030 1.000 N NA
 10387704 10387705 YPZ3_1211 YPZ3_1212     FALSE 0.123 258.000 0.000 1.000   NA
 10387705 10387706 YPZ3_1212 YPZ3_1213     TRUE 0.641 91.000 0.106 1.000   NA
 10387706 10387707 YPZ3_1213 YPZ3_1214     FALSE 0.017 477.000 0.000 1.000   NA
 10387708 10387709 YPZ3_1215 YPZ3_1216   potF FALSE 0.016 518.000 0.000 NA   NA
 10387709 10387710 YPZ3_1216 YPZ3_1217 potF potG TRUE 0.954 171.000 0.679 1.000 Y NA
 10387710 10387711 YPZ3_1217 YPZ3_1218 potG potH TRUE 0.997 25.000 0.857 1.000 Y NA
 10387711 10387712 YPZ3_1218 YPZ3_1219 potH potI TRUE 0.999 -3.000 0.528 0.062 Y NA
 10387712 10387713 YPZ3_1219 YPZ3_1220 potI   TRUE 0.781 125.000 0.264 NA   NA
 10387713 10387714 YPZ3_1220 YPZ3_1221     TRUE 0.712 84.000 0.119 NA   NA
 10387716 10387717 YPZ3_1223 YPZ3_1224     FALSE 0.006 412.000 0.000 NA N NA
 10387717 10387718 YPZ3_1224 YPZ3_1225     FALSE 0.162 233.000 0.000 1.000   NA
 10387718 10387719 YPZ3_1225 YPZ3_1226   btuC1 TRUE 0.984 -39.000 0.000 0.062   NA
 10387719 10387720 YPZ3_1226 YPZ3_1227 btuC1   TRUE 0.942 -3.000 0.000 1.000   NA
 10387720 10387721 YPZ3_1227 YPZ3_1228     TRUE 0.948 -12.000 0.000 1.000   NA
 10387721 10387722 YPZ3_1228 YPZ3_1229     TRUE 0.993 -7.000 0.312 NA   NA
 10387722 10387723 YPZ3_1229 YPZ3_1230     TRUE 0.978 -3.000 0.125 NA   NA
 10387724 10387725 YPZ3_1231 YPZ3_1232 artM artQ TRUE 0.999 0.000 0.714 0.019 Y NA
 10387725 10387726 YPZ3_1232 YPZ3_1233 artQ artI TRUE 0.995 12.000 0.260 0.079 Y NA
 10387726 10387727 YPZ3_1233 YPZ3_1234 artI artP TRUE 0.988 21.000 0.323 1.000 Y NA
 10387727 10387728 YPZ3_1234 YPZ3_1235 artP   FALSE 0.417 244.000 0.000 1.000 Y NA
 10387728 10387729 YPZ3_1235 YPZ3_1236     FALSE 0.261 170.000 0.018 NA   NA
 10387729 10387730 YPZ3_1236 YPZ3_1237     TRUE 0.730 97.000 0.167 NA   NA
 10387730 10387731 YPZ3_1237 YPZ3_1238     TRUE 0.888 100.000 0.022 0.009 Y NA
 10387731 10387732 YPZ3_1238 YPZ3_1239   ltaA TRUE 0.892 -3.000 0.074 1.000 N NA
 10387732 10387733 YPZ3_1239 YPZ3_1240 ltaA poxB FALSE 0.163 349.000 0.031 1.000 Y NA
 10387733 10387734 YPZ3_1240 YPZ3_1241 poxB hcr FALSE 0.018 144.000 0.017 1.000 N NA
 10387734 10387735 YPZ3_1241 YPZ3_1242 hcr hcp TRUE 0.905 114.000 0.085 0.011 Y NA
 10387735 10387736 YPZ3_1242 YPZ3_1243 hcp   FALSE 0.221 202.000 0.028 NA   NA
 10387739 10387740 YPZ3_1246 YPZ3_1247 acrA5   TRUE 0.996 0.000 0.789 1.000 N NA
 10387740 10387741 YPZ3_1247 YPZ3_1248   clpS FALSE 0.005 905.000 0.000 NA   NA
 10387741 10387742 YPZ3_1248 YPZ3_1249 clpS clpA TRUE 0.986 26.000 0.596 NA   NA
 10387742 10387743 YPZ3_1249 YPZ3_1250 clpA   FALSE 0.024 242.000 0.000 1.000 N NA
 10387744 10387745 YPZ3_1251 YPZ3_1252   cydC TRUE 0.509 219.000 0.049 1.000 Y NA
 10387745 10387746 YPZ3_1252 YPZ3_1253 cydC   TRUE 0.999 3.000 0.631 0.007 Y NA
 10387746 10387747 YPZ3_1253 YPZ3_1254   trxB FALSE 0.068 483.000 0.049 1.000 Y NA
 10387748 10387749 YPZ3_1255 YPZ3_1256 lrp ftsK TRUE 0.745 123.000 0.345 1.000 N NA
 10387749 10387750 YPZ3_1256 YPZ3_1257 ftsK lolA TRUE 0.557 193.000 0.305 1.000 N NA
 10387750 10387751 YPZ3_1257 YPZ3_1258 lolA rarA TRUE 0.882 20.000 0.167 1.000 N NA
 10387751 10387752 YPZ3_1258 YPZ3_1259 rarA serS FALSE 0.090 242.000 0.078 1.000 N NA
 10387752 10387753 YPZ3_1259 YPZ3_1260 serS   FALSE 0.032 255.000 0.000 NA N NA
 10387756 10387757 YPZ3_1263 YPZ3_1264 pflB focA TRUE 0.760 56.000 0.172 1.000 N NA
 10387757 10387758 YPZ3_1264 YPZ3_1265 focA   FALSE 0.007 697.000 0.000 NA   NA
 10387759 10387760 YPZ3_1266 YPZ3_1267 ansB   FALSE 0.109 269.000 0.000 1.000   NA
 10387760 10387761 YPZ3_1267 YPZ3_1268     TRUE 0.832 21.000 0.000 NA   NA
 10387761 10387762 YPZ3_1268 YPZ3_1269     FALSE 0.032 403.000 0.000 NA   NA
 10387762 10387763 YPZ3_1269 YPZ3_1270   aroA TRUE 0.625 163.000 0.033 1.000 Y NA
 10387763 10387764 YPZ3_1270 YPZ3_1271 aroA cmk FALSE 0.143 313.000 0.209 1.000 N NA
 10387764 10387765 YPZ3_1271 YPZ3_1272 cmk rpsA TRUE 0.571 174.000 0.281 1.000 N NA
 10387765 10387766 YPZ3_1272 YPZ3_1273 rpsA   FALSE 0.004 892.000 0.000 1.000   NA
 10387766 10387767 YPZ3_1273 YPZ3_1274   msbA TRUE 0.922 36.000 0.075 0.072   NA
 10387767 10387768 YPZ3_1274 YPZ3_1275 msbA lpxK TRUE 0.973 -3.000 0.205 1.000 N NA
 10387770 10387771 YPZ3_1277 YPZ3_1278 kdsB   FALSE 0.039 363.000 0.023 NA   NA
 10387771 10387772 YPZ3_1278 YPZ3_1279   smtA FALSE 0.006 773.000 0.000 NA   NA
 10387772 10387773 YPZ3_1279 YPZ3_1280 smtA mukF TRUE 0.988 -3.000 0.325 NA N NA
 10387773 10387774 YPZ3_1280 YPZ3_1281 mukF   TRUE 0.995 -19.000 0.196 NA Y NA
 10387774 10387775 YPZ3_1281 YPZ3_1282   mukB TRUE 1.000 -3.000 0.786 0.002 Y NA
 10387775 10387776 YPZ3_1282 YPZ3_1283 mukB   FALSE 0.376 165.000 0.000 0.078 N NA
 10387776 10387777 YPZ3_1283 YPZ3_1284     FALSE 0.023 431.000 0.000 1.000   NA
 10387777 10387778 YPZ3_1284 YPZ3_1285     TRUE 0.675 224.000 0.372 NA   NA
 10387778 10387779 YPZ3_1285 YPZ3_1286     TRUE 0.764 61.000 0.089 NA   NA
 10387780 10387781 YPZ3_1287 YPZ3_1288 aspC   FALSE 0.019 257.000 0.000 1.000 N NA
 10387781 10387782 YPZ3_1288 YPZ3_1289   asnS FALSE 0.012 298.000 0.000 1.000 N NA
 10387782 10387783 YPZ3_1289 YPZ3_1290 asnS pncB FALSE 0.002 499.000 0.034 1.000 N NA
 10387784 10387785 YPZ3_1291 YPZ3_1292 pepN pyrD FALSE 0.000 654.000 0.014 1.000 N NA
 10387785 10387786 YPZ3_1292 YPZ3_1293 pyrD   FALSE 0.386 183.000 0.081 NA   NA
 10387788 10387789 YPZ3_1295 YPZ3_1296   uup TRUE 0.918 6.000 0.061 1.000   NA
 10387789 10387790 YPZ3_1296 YPZ3_1297 uup pqiA FALSE 0.429 129.000 0.054 NA   NA
 10387790 10387791 YPZ3_1297 YPZ3_1298 pqiA pqiB TRUE 0.998 -13.000 0.819 NA   NA
 10387791 10387792 YPZ3_1298 YPZ3_1299 pqiB   TRUE 0.996 -3.000 0.531 NA   NA
 10387792 10387793 YPZ3_1299 YPZ3_1300     FALSE 0.012 584.000 0.000 NA   NA
 10387794 10387795 YPZ3_1301 YPZ3_1302 fabF   FALSE 0.417 16.000 0.000 1.000 N NA
 10387795 10387796 YPZ3_1302 YPZ3_1303     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10387796 10387797 YPZ3_1303 YPZ3_1304     TRUE 0.854 14.000 0.000 1.000   NA
 10387797 10387798 YPZ3_1304 YPZ3_1305   fabA FALSE 0.006 700.000 0.000 1.000   NA
 10387798 10387799 YPZ3_1305 YPZ3_1306 fabA   TRUE 0.836 69.000 0.290 1.000 N NA
 10387801 10387802 YPZ3_1308 YPZ3_1309   ompA FALSE 0.062 139.000 0.000 1.000 N NA
 10387802 10387803 YPZ3_1309 YPZ3_1310 ompA sulA FALSE 0.006 358.000 0.000 1.000 N NA
 10387805 10387806 YPZ3_1312 YPZ3_1313     TRUE 0.869 30.000 0.090 NA   NA
 10387808 10387809 YPZ3_1315 YPZ3_1316 mgsA   FALSE 0.335 179.000 0.055 NA   NA
 10387811 10387812 YPZ3_1318 YPZ3_1319     TRUE 0.771 61.000 0.094 NA   NA
 10387812 10387813 YPZ3_1319 YPZ3_1320     FALSE 0.024 424.000 0.000 1.000   NA
 10387814 10387815 YPZ3_t18 YPZ3_1321     FALSE 0.004 1077.000 0.000 NA   NA
 10387815 10387816 YPZ3_1321 YPZ3_1322     FALSE 0.086 300.000 0.000 NA   NA
 10387817 10387818 YPZ3_1323 YPZ3_1324     TRUE 0.472 154.000 0.000 0.020 N NA
 10387819 10387820 YPZ3_1325 YPZ3_1326 fabZ   TRUE 0.991 -10.000 0.083 NA Y NA
 10387820 10387821 YPZ3_1326 YPZ3_1327     TRUE 0.981 2.000 0.056 1.000 Y NA
 10387821 10387822 YPZ3_1327 YPZ3_1328     TRUE 0.991 16.000 0.333 1.000 Y NA
 10387822 10387823 YPZ3_1328 YPZ3_1329     TRUE 0.992 -7.000 0.120 1.000 Y NA
 10387823 10387824 YPZ3_1329 YPZ3_1330     TRUE 0.995 2.000 0.120 0.020 Y NA
 10387824 10387825 YPZ3_1330 YPZ3_1331     TRUE 0.991 3.000 0.051 0.047 Y NA
 10387825 10387826 YPZ3_1331 YPZ3_1332     FALSE 0.253 195.000 0.000 NA   NA
 10387826 10387827 YPZ3_1332 YPZ3_1333     FALSE 0.036 385.000 0.000 NA   NA
 10387827 10387828 YPZ3_1333 YPZ3_1334     FALSE 0.005 989.000 0.000 NA   NA
 10387828 10387829 YPZ3_1334 YPZ3_1335     TRUE 0.714 49.000 0.000 NA   NA
 10387829 10387830 YPZ3_1335 YPZ3_1336     FALSE 0.409 117.000 0.000 NA   NA
 10387830 10387831 YPZ3_1336 YPZ3_1337     TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 10387831 10387832 YPZ3_1337 YPZ3_1338     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 10387832 10387833 YPZ3_1338 YPZ3_1339     TRUE 0.911 4.000 0.000 NA   NA
 10387833 10387834 YPZ3_1339 YPZ3_1340   clpB3 FALSE 0.046 418.000 0.083 NA   NA
 10387834 10387835 YPZ3_1340 YPZ3_1341 clpB3   TRUE 0.978 -3.000 0.125 NA   NA
 10387835 10387836 YPZ3_1341 YPZ3_1342     TRUE 0.864 15.000 0.000 NA   NA
 10387836 10387837 YPZ3_1342 YPZ3_1343     FALSE 0.003 2093.000 0.000 NA   NA
 10387837 10387838 YPZ3_1343 YPZ3_1344     TRUE 0.857 16.000 0.000 NA   NA
 10387838 10387839 YPZ3_1344 YPZ3_1345     TRUE 0.948 -3.000 0.000 NA   NA
 10387839 10387840 YPZ3_1345 YPZ3_1346     FALSE 0.026 430.000 0.000 NA   NA
 10387842 10387843 YPZ3_1348 YPZ3_1349     TRUE 0.997 -3.000 0.625 NA   NA
 10387843 10387844 YPZ3_1349 YPZ3_1350     TRUE 0.864 44.000 0.120 NA   NA
 10387844 10387845 YPZ3_1350 YPZ3_1351     TRUE 0.850 18.000 0.040 NA   NA
 10387845 10387846 YPZ3_1351 YPZ3_1352     TRUE 0.975 15.000 0.286 NA   NA
 10387846 10387847 YPZ3_1352 YPZ3_1353     FALSE 0.201 221.000 0.000 NA   NA
 10387847 10387848 YPZ3_1353 YPZ3_1354     TRUE 0.998 -36.000 0.750 NA   NA
 10387848 10387849 YPZ3_1354 YPZ3_1355     TRUE 0.998 -25.000 0.750 NA   NA
 10387849 10387850 YPZ3_1355 YPZ3_1356     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 10387850 10387851 YPZ3_1356 YPZ3_1357     TRUE 0.813 25.000 0.000 NA   NA
 10387853 10387854 YPZ3_1359 YPZ3_1360     FALSE 0.189 228.000 0.000 NA   NA
 10387855 10387856 YPZ3_1361 YPZ3_1362     FALSE 0.064 136.000 0.000 1.000 N NA
 10387856 10387857 YPZ3_1362 YPZ3_1363   moeA TRUE 0.998 2.000 0.323 0.003 Y NA
 10387857 10387858 YPZ3_1363 YPZ3_1364 moeA   FALSE 0.013 535.000 0.000 1.000   NA
 10387858 10387859 YPZ3_1364 YPZ3_1365     TRUE 0.931 10.000 0.094 1.000   NA
 10387859 10387860 YPZ3_1365 YPZ3_1366     TRUE 0.884 2.000 0.094 1.000 N NA
 10387860 10387861 YPZ3_1366 YPZ3_1367     TRUE 0.994 2.000 0.500 NA   NA
 10387861 10387862 YPZ3_1367 YPZ3_1368     FALSE 0.011 595.000 0.000 NA   NA
 10387862 10387863 YPZ3_1368 YPZ3_1369   adhC TRUE 0.964 21.000 0.273 1.000   NA
 10387863 10387864 YPZ3_1369 YPZ3_1370 adhC   TRUE 0.603 274.000 0.636 1.000 N NA
 10387865 10387866 YPZ3_1371 YPZ3_1372   folE TRUE 0.665 184.000 0.250 NA   NA
 10387866 10387867 YPZ3_1372 YPZ3_1373 folE   TRUE 0.981 55.000 0.719 NA   NA
 10387867 10387868 YPZ3_1373 YPZ3_1374     FALSE 0.006 748.000 0.000 NA   NA
 10387868 10387869 YPZ3_1374 YPZ3_1375   mglA TRUE 0.755 230.000 0.250 NA Y NA
 10387869 10387870 YPZ3_1375 YPZ3_1376 mglA mglC TRUE 0.998 21.000 0.905 1.000 Y NA
 10387871 10387872 YPZ3_1377 YPZ3_1378   sfcA FALSE 0.121 281.000 0.045 NA   NA
 10387872 10387873 YPZ3_1378 YPZ3_1379 sfcA cdd FALSE 0.002 356.000 0.022 1.000 N NA
 10387873 10387874 YPZ3_1379 YPZ3_1380 cdd   FALSE 0.129 326.000 0.198 NA N NA
 10387874 10387875 YPZ3_1380 YPZ3_1381     TRUE 0.993 -3.000 0.340 NA   NA
 10387875 10387876 YPZ3_1381 YPZ3_1382     FALSE 0.144 242.000 0.021 NA   NA
 10387876 10387877 YPZ3_1382 YPZ3_1383     FALSE 0.062 333.000 0.000 NA   NA
 10387877 10387878 YPZ3_1383 YPZ3_1384     TRUE 0.949 18.000 0.177 NA   NA
 10387879 10387880 YPZ3_1385 YPZ3_1386     FALSE 0.311 167.000 0.000 NA   NA
 10387882 10387883 YPZ3_1388 YPZ3_1389   udk FALSE 0.079 245.000 0.073 1.000 N NA
 10387883 10387884 YPZ3_1389 YPZ3_1390 udk dcd TRUE 0.812 105.000 0.098 1.000 Y NA
 10387884 10387885 YPZ3_1390 YPZ3_1391 dcd   FALSE 0.104 205.000 0.057 NA N NA
 10387887 10387888 YPZ3_1393 YPZ3_1394     FALSE 0.341 152.000 0.000 NA   NA
 10387888 10387889 YPZ3_1394 YPZ3_1395   alcA TRUE 0.975 35.000 0.667 1.000 N NA
 10387889 10387890 YPZ3_1395 YPZ3_1396 alcA   TRUE 0.744 0.000 0.000 NA N NA
 10387890 10387891 YPZ3_1396 YPZ3_1397     TRUE 0.786 -3.000 0.000 NA N NA
 10387892 10387893 YPZ3_1398 YPZ3_1399 fepC   TRUE 0.993 27.000 0.583 1.000 Y NA
 10387893 10387894 YPZ3_1399 YPZ3_1400     TRUE 1.000 -13.000 0.818 0.061 Y NA
 10387894 10387895 YPZ3_1400 YPZ3_1401     TRUE 0.998 -3.000 0.455 1.000 Y NA
 10387895 10387896 YPZ3_1401 YPZ3_1402   ysuR TRUE 0.950 90.000 0.364 1.000 Y NA
 10387896 10387897 YPZ3_1402 YPZ3_1403 ysuR   TRUE 0.841 213.000 0.455 0.003 N NA
 10387898 10387899 YPZ3_1404 YPZ3_1405 galU galF TRUE 0.959 84.000 0.111 0.001 Y NA
 10387899 10387900 YPZ3_1405 YPZ3_1406 galF gnd FALSE 0.004 386.000 0.000 1.000 N NA
 10387901 10387902 YPZ3_1407 YPZ3_1408 hisI hisF TRUE 0.999 -6.000 0.430 0.003 Y NA
 10387902 10387903 YPZ3_1408 YPZ3_1409 hisF hisA TRUE 0.999 -18.000 0.433 0.003 Y NA
 10387903 10387904 YPZ3_1409 YPZ3_1410 hisA hisH TRUE 0.996 6.000 0.210 0.003 Y NA
 10387904 10387905 YPZ3_1410 YPZ3_1411 hisH hisB TRUE 0.997 0.000 0.128 0.003 Y NA
 10387905 10387906 YPZ3_1411 YPZ3_1412 hisB hisC TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.003 Y NA
 10387906 10387907 YPZ3_1412 YPZ3_1413 hisC hisD TRUE 0.998 3.000 0.294 0.003 Y NA
 10387907 10387908 YPZ3_1413 YPZ3_1414 hisD hisG TRUE 0.996 4.000 0.171 0.003 Y NA
 10387910 10387911 YPZ3_1416 YPZ3_1417     FALSE 0.123 269.000 0.000 NA   NA
 10387911 10387912 YPZ3_1417 YPZ3_1418     TRUE 0.999 -3.000 0.952 1.000   NA
 10387912 10387913 YPZ3_1418 YPZ3_1419     TRUE 0.989 -42.000 0.000 0.006   NA
 10387914 10387915 YPZ3_1420 YPZ3_1421     FALSE 0.003 460.000 0.000 1.000 N NA
 10387917 10387918 YPZ3_1423 YPZ3_1424     FALSE 0.026 434.000 0.000 NA   NA
 10387918 10387919 YPZ3_1424 YPZ3_1425     FALSE 0.042 371.000 0.000 NA   NA
 10387923 10387924 YPZ3_1429 YPZ3_1430     TRUE 0.990 48.000 0.333 0.046 Y NA
 10387924 10387925 YPZ3_1430 YPZ3_1431     TRUE 0.969 32.000 0.290 0.019 N NA
 10387925 10387926 YPZ3_1431 YPZ3_1432   lldD FALSE 0.012 297.000 0.000 1.000 N NA
 10387929 10387930 YPZ3_1435 YPZ3_1436     TRUE 0.781 36.000 0.136 1.000 N NA
 10387931 10387932 YPZ3_1437 YPZ3_1438     TRUE 0.495 90.000 0.000 NA   NA
 10387933 10387934 YPZ3_t19 YPZ3_1439     FALSE 0.023 446.000 0.000 NA   NA
 10387934 10387935 YPZ3_1439 YPZ3_1440     FALSE 0.019 258.000 0.000 1.000 N NA
 10387935 10387936 YPZ3_1440 YPZ3_1441     TRUE 0.998 20.000 0.905 NA Y NA
 10387936 10387937 YPZ3_1441 YPZ3_1442     TRUE 0.983 124.000 0.947 NA Y NA
 10387939 10387940 YPZ3_1444 YPZ3_1445     TRUE 0.526 78.000 0.000 1.000   NA
 10387944 10387945 YPZ3_1449 YPZ3_1450   yfeD FALSE 0.015 305.000 0.033 NA N NA
 10387945 10387946 YPZ3_1450 YPZ3_1451 yfeD yfeC TRUE 0.999 -3.000 0.525 0.007 Y NA
 10387946 10387947 YPZ3_1451 YPZ3_1452 yfeC yfeB TRUE 0.999 0.000 0.857 1.000 Y NA
 10387947 10387948 YPZ3_1452 YPZ3_1453 yfeB   TRUE 0.999 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 10387951 10387952 YPZ3_1456 YPZ3_1457 thrS infC TRUE 0.733 205.000 0.186 1.000 Y NA
 10387952 10387953 YPZ3_1457 YPZ3_1458 infC rplT FALSE 0.195 332.000 0.000 1.000 Y NA
 10387953 10387954 YPZ3_1458 YPZ3_1459 rplT pheS FALSE 0.147 499.000 0.202 1.000 Y NA
 10387954 10387955 YPZ3_1459 YPZ3_1460 pheS pheT TRUE 0.999 14.000 0.574 0.001 Y NA
 10387955 10387956 YPZ3_1460 YPZ3_1461 pheT   FALSE 0.009 635.000 0.000 NA   NA
 10387956 10387957 YPZ3_1461 YPZ3_1462   btuC2 FALSE 0.317 173.000 0.044 NA   NA
 10387957 10387958 YPZ3_1462 YPZ3_1463 btuC2 btuE TRUE 0.442 70.000 0.084 1.000 N NA
 10387958 10387959 YPZ3_1463 YPZ3_1464 btuE   FALSE 0.341 25.000 0.036 1.000 N NA
 10387959 10387960 YPZ3_1464 YPZ3_1465     FALSE 0.054 350.000 0.129 1.000 N NA
 10387960 10387961 YPZ3_1465 YPZ3_1466   pmrF TRUE 0.998 -13.000 0.378 NA Y NA
 10387961 10387962 YPZ3_1466 YPZ3_1467 pmrF   TRUE 0.995 -3.000 0.220 NA Y NA
 10387962 10387963 YPZ3_1467 YPZ3_1468     TRUE 0.998 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 10387963 10387964 YPZ3_1468 YPZ3_1469     TRUE 0.858 -3.000 0.061 1.000 N NA
 10387964 10387965 YPZ3_1469 YPZ3_1470     TRUE 0.988 -3.000 0.227 1.000   NA
 10387965 10387966 YPZ3_1470 YPZ3_1471     TRUE 0.997 -3.000 0.613 NA   NA
 10387966 10387967 YPZ3_1471 YPZ3_1472   nlpC FALSE 0.199 313.000 0.161 NA   NA
 10387967 10387968 YPZ3_1472 YPZ3_1473 nlpC lplA FALSE 0.311 125.000 0.091 NA N NA
 10387968 10387969 YPZ3_1473 YPZ3_1474 lplA   TRUE 0.552 64.000 0.006 NA   NA
 10387969 10387970 YPZ3_1474 YPZ3_1475     TRUE 0.767 25.000 0.011 NA   NA
 10387971 10387972 YPZ3_1476 YPZ3_1477 aroH   TRUE 0.586 157.000 0.165 1.000   NA
 10387975 10387976 YPZ3_1480 YPZ3_1481     FALSE 0.438 122.000 0.129 NA N NA
 10387976 10387977 YPZ3_1481 YPZ3_1482   sufA FALSE 0.011 595.000 0.000 NA   NA
 10387977 10387978 YPZ3_1482 YPZ3_1483 sufA   TRUE 0.469 99.000 0.041 NA   NA
 10387978 10387979 YPZ3_1483 YPZ3_1484     TRUE 0.908 186.000 0.466 1.000 Y NA
 10387979 10387980 YPZ3_1484 YPZ3_1485     TRUE 0.998 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 10387980 10387981 YPZ3_1485 YPZ3_1486     TRUE 0.971 -3.000 0.193 1.000 N NA
 10387981 10387982 YPZ3_1486 YPZ3_1487     TRUE 0.779 89.000 0.183 NA   NA
 10387982 10387983 YPZ3_1487 YPZ3_1488     FALSE 0.215 271.000 0.103 NA   NA
 10387984 10387985 YPZ3_1489 YPZ3_1490     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10387985 10387986 YPZ3_1490 YPZ3_1491     FALSE 0.042 582.000 0.000 1.000 Y NA
 10387986 10387987 YPZ3_1491 YPZ3_1492   pykF FALSE 0.001 697.000 0.000 1.000 N NA
 10387987 10387988 YPZ3_1492 YPZ3_t20 pykF   FALSE 0.012 576.000 0.000 NA   NA
 10387988 10387989 YPZ3_t20 YPZ3_t21     TRUE 0.653 60.000 0.000 NA   NA
 10387989 10387990 YPZ3_t21 YPZ3_1493     FALSE 0.166 243.000 0.000 NA   NA
 10387992 10387993 YPZ3_1495 YPZ3_1496 cfa   FALSE 0.002 480.000 0.000 1.000 N NA
 10387995 10387996 YPZ3_1498 YPZ3_1499 purR sodB FALSE 0.002 527.000 0.000 1.000 N NA
 10387996 10387997 YPZ3_1499 YPZ3_1500 sodB   FALSE 0.001 378.000 0.015 1.000 N NA
 10387999 10388000 YPZ3_1502 YPZ3_1503   gloA TRUE 0.577 79.000 0.136 1.000 N NA
 10388002 10388003 YPZ3_1505 YPZ3_1506     TRUE 0.825 88.000 0.362 1.000 N NA
 10388003 10388004 YPZ3_1506 YPZ3_1507     FALSE 0.358 223.000 0.128 1.000   NA
 10388005 10388006 YPZ3_1508 YPZ3_1509   slyA FALSE 0.005 798.000 0.000 1.000   NA
 10388008 10388009 YPZ3_1511 YPZ3_1512     TRUE 0.674 55.000 0.034 NA   NA
 10388009 10388010 YPZ3_1512 YPZ3_1513   pdxH TRUE 0.481 91.000 0.034 NA   NA
 10388010 10388011 YPZ3_1513 YPZ3_1514 pdxH tyrS FALSE 0.092 182.000 0.054 1.000 N NA
 10388011 10388012 YPZ3_1514 YPZ3_1515 tyrS   FALSE 0.035 227.000 0.041 1.000 N NA
 10388013 10388014 YPZ3_1516 YPZ3_1517 gst   FALSE 0.006 754.000 0.000 NA   NA
 10388014 10388015 YPZ3_1517 YPZ3_1518     FALSE 0.143 255.000 0.000 NA   NA
 10388015 10388016 YPZ3_1518 YPZ3_1519     FALSE 0.008 682.000 0.000 NA   NA
 10388016 10388017 YPZ3_1519 YPZ3_1520   sapF FALSE 0.035 390.000 0.000 NA   NA
 10388017 10388018 YPZ3_1520 YPZ3_1521 sapF sapD TRUE 0.999 0.000 0.684 0.023 Y NA
 10388018 10388019 YPZ3_1521 YPZ3_1522 sapD sapC TRUE 0.999 0.000 0.667 1.000 Y NA
 10388019 10388020 YPZ3_1522 YPZ3_1523 sapC sapB TRUE 0.998 -13.000 0.284 0.060 Y NA
 10388020 10388021 YPZ3_1523 YPZ3_1524 sapB sapA TRUE 0.992 -3.000 0.264 0.060 N NA
 10388024 10388025 YPZ3_1527 YPZ3_1528 pspA pspC FALSE 0.125 389.000 0.000 NA Y NA
 10388025 10388026 YPZ3_1528 YPZ3_1529 pspC   FALSE 0.242 308.000 0.190 NA   NA
 10388026 10388027 YPZ3_1529 YPZ3_1530     TRUE 0.998 -3.000 0.791 NA   NA
 10388028 10388029 YPZ3_1531 YPZ3_1532     TRUE 0.918 83.000 0.412 NA   NA
 10388031 10388032 YPZ3_1534 YPZ3_1535   tpx FALSE 0.036 202.000 0.000 1.000 N NA
 10388035 10388036 YPZ3_1538 YPZ3_1539 mppA   FALSE 0.009 213.000 0.019 1.000 N NA
 10388037 10388038 YPZ3_1540 YPZ3_1541     FALSE 0.010 312.000 0.000 1.000 N NA
 10388038 10388039 YPZ3_1541 YPZ3_1542     FALSE 0.017 307.000 0.000 NA N NA
 10388039 10388040 YPZ3_1542 YPZ3_1543   nifJ FALSE 0.026 275.000 0.000 NA N NA
 10388044 10388045 YPZ3_1547 YPZ3_1548 hslJ ldhA FALSE 0.144 70.000 0.024 NA N NA
 10388046 10388047 YPZ3_1549 YPZ3_1550     FALSE 0.241 201.000 0.000 NA   NA
 10388051 10388052 YPZ3_1554 YPZ3_1555 hrpA   FALSE 0.001 665.000 0.000 1.000 N NA
 10388054 10388055 YPZ3_1557 YPZ3_1558     TRUE 0.989 26.000 0.676 NA   NA
 10388056 10388057 YPZ3_1559 YPZ3_1560     TRUE 0.864 15.000 0.000 NA   NA
 10388059 10388060 YPZ3_1562 YPZ3_1563     TRUE 0.764 94.000 0.300 1.000 N NA
 10388060 10388061 YPZ3_1563 YPZ3_1564   rstA TRUE 0.957 49.000 0.181 1.000 Y NA
 10388063 10388064 YPZ3_1566 YPZ3_1567     FALSE 0.274 270.000 0.143 NA   NA
 10388065 10388066 YPZ3_1568 YPZ3_1569 pntA   TRUE 0.985 184.000 0.745 0.001 Y NA
 10388067 10388068 YPZ3_1570 YPZ3_1571   fnr TRUE 0.959 135.000 0.619 1.000 Y NA
 10388068 10388069 YPZ3_1571 YPZ3_1572 fnr ogt FALSE 0.152 73.000 0.038 1.000 N NA
 10388070 10388071 YPZ3_1573 YPZ3_1574 phoA   FALSE 0.014 546.000 0.000 NA   NA
 10388071 10388072 YPZ3_1574 YPZ3_1575     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 10388072 10388073 YPZ3_1575 YPZ3_1576     FALSE 0.362 131.000 0.033 NA   NA
 10388074 10388075 YPZ3_1577 YPZ3_1578 ilvN   TRUE 0.998 2.000 0.649 0.002   NA
 10388077 10388078 YPZ3_1580 YPZ3_1581     TRUE 0.993 -3.000 0.333 NA   NA
 10388078 10388079 YPZ3_1581 YPZ3_1582     TRUE 0.735 44.000 0.000 NA   NA
 10388079 10388080 YPZ3_1582 YPZ3_1583     TRUE 0.954 5.000 0.111 NA   NA
 10388081 10388082 YPZ3_1584 YPZ3_1585 amn   FALSE 0.010 610.000 0.000 NA   NA
 10388082 10388083 YPZ3_1585 YPZ3_1586     FALSE 0.352 144.000 0.000 NA   NA
 10388083 10388084 YPZ3_1586 YPZ3_1587     TRUE 0.631 64.000 0.000 NA   NA
 10388084 10388085 YPZ3_1587 YPZ3_1588     FALSE 0.001 600.000 0.000 1.000 N NA
 10388086 10388087 YPZ3_1589 YPZ3_1590 bioD mlc TRUE 0.612 224.000 0.455 1.000 N NA
 10388087 10388088 YPZ3_1590 YPZ3_1591 mlc   TRUE 0.860 214.000 0.408 1.000 Y NA
 10388089 10388090 YPZ3_1592 YPZ3_1593   tus FALSE 0.040 346.000 0.018 1.000   NA
 10388092 10388093 YPZ3_1595 YPZ3_1596 manA   TRUE 0.851 240.000 0.778 NA   NA
 10388094 10388095 YPZ3_1597 YPZ3_1598     FALSE 0.227 206.000 0.000 NA   NA
 10388095 10388096 YPZ3_1598 YPZ3_1599     FALSE 0.256 194.000 0.000 NA   NA
 10388096 10388097 YPZ3_1599 YPZ3_1600   araC TRUE 0.769 128.000 0.276 1.000   NA
 10388097 10388098 YPZ3_1600 YPZ3_1601 araC araH FALSE 0.315 221.000 0.196 1.000 N NA
 10388098 10388099 YPZ3_1601 YPZ3_1602 araH araG TRUE 0.997 18.000 0.451 0.006 Y NA
 10388099 10388100 YPZ3_1602 YPZ3_1603 araG araF TRUE 0.994 98.000 0.917 0.006 Y NA
 10388101 10388102 YPZ3_1604 YPZ3_1605 araB araA FALSE 0.175 84.000 0.046 1.000 N NA
 10388103 10388104 YPZ3_1606 YPZ3_1607     TRUE 0.994 2.000 0.255 0.010   NA
 10388104 10388105 YPZ3_1607 YPZ3_1608     TRUE 0.982 0.000 0.000 0.010   NA
 10388105 10388106 YPZ3_1608 YPZ3_1609     TRUE 0.449 299.000 0.170 1.000 Y NA
 10388107 10388108 YPZ3_1610 YPZ3_1611     TRUE 0.632 128.000 0.148 NA   NA
 10388108 10388109 YPZ3_1611 YPZ3_1612     TRUE 0.999 0.000 0.564 0.034 Y NA
 10388109 10388110 YPZ3_1612 YPZ3_1613   tolA TRUE 0.994 50.000 0.537 0.034 Y NA
 10388112 10388113 YPZ3_1615 YPZ3_1616     TRUE 0.999 10.000 0.924 0.034 Y NA
 10388113 10388114 YPZ3_1616 YPZ3_1617     TRUE 1.000 -3.000 0.908 0.034 Y NA
 10388114 10388115 YPZ3_1617 YPZ3_1618   nth TRUE 0.936 -3.000 0.109 1.000 N NA
 10388116 10388117 YPZ3_1619 YPZ3_1620     TRUE 0.949 38.000 0.103 NA Y NA
 10388118 10388119 YPZ3_1621 YPZ3_1622 rnb cstA FALSE 0.006 350.000 0.000 1.000 N NA
 10388119 10388120 YPZ3_1622 YPZ3_1623 cstA   TRUE 0.982 -7.000 0.143 NA   NA
 10388121 10388122 YPZ3_1624 YPZ3_1625   araD FALSE 0.049 548.000 0.000 1.000 Y NA
 10388122 10388123 YPZ3_1625 YPZ3_1626 araD   FALSE 0.001 825.000 0.000 1.000 N NA
 10388123 10388124 YPZ3_1626 YPZ3_1627   pyrF TRUE 0.732 0.000 0.045 1.000 N NA
 10388124 10388125 YPZ3_1627 YPZ3_1628 pyrF   FALSE 0.005 891.000 0.125 1.000 N NA
 10388125 10388126 YPZ3_1628 YPZ3_1629     TRUE 0.993 7.000 0.576 NA   NA
 10388126 10388127 YPZ3_1629 YPZ3_1630   pgpB TRUE 0.546 169.000 0.143 NA   NA
 10388129 10388130 YPZ3_1632 YPZ3_1633 acnA   FALSE 0.034 391.000 0.000 NA   NA
 10388130 10388131 YPZ3_1633 YPZ3_1634   cysB FALSE 0.061 336.000 0.000 NA   NA
 10388131 10388132 YPZ3_1634 YPZ3_1635 cysB topA FALSE 0.001 397.000 0.008 1.000 N NA
 10388132 10388133 YPZ3_1635 YPZ3_1636 topA sohB FALSE 0.000 789.000 0.006 1.000 N NA
 10388134 10388135 YPZ3_1637 YPZ3_1638   btuR TRUE 0.561 17.000 0.050 1.000 N NA
 10388136 10388137 YPZ3_1639 YPZ3_1640     FALSE 0.230 347.000 0.075 NA Y NA
 10388137 10388138 YPZ3_1640 YPZ3_1641     TRUE 0.971 17.000 0.281 NA   NA
 10388139 10388140 YPZ3_1642 YPZ3_1643 trpE trpG TRUE 1.000 0.000 0.703 0.001 Y NA
 10388140 10388141 YPZ3_1643 YPZ3_1644 trpG   TRUE 0.970 15.000 0.083 1.000 Y NA
 10388141 10388142 YPZ3_1644 YPZ3_1645   trpC TRUE 0.994 4.000 0.293 1.000 Y NA
 10388142 10388143 YPZ3_1645 YPZ3_1646 trpC trpB TRUE 0.948 157.000 0.221 0.001 Y NA
 10388143 10388144 YPZ3_1646 YPZ3_1647 trpB trpA TRUE 1.000 0.000 0.947 0.001 Y NA
 10388144 10388145 YPZ3_1647 YPZ3_1648 trpA   FALSE 0.046 343.000 0.018 NA   NA
 10388148 10388149 YPZ3_1651 YPZ3_1652     TRUE 0.779 32.000 0.000 NA   NA
 10388150 10388151 YPZ3_1653 YPZ3_1654 ispZ   TRUE 0.657 80.000 0.167 NA N NA
 10388151 10388152 YPZ3_1654 YPZ3_1655     FALSE 0.097 148.000 0.000 NA N NA
 10388153 10388154 YPZ3_1656 YPZ3_1657 tonB ail FALSE 0.012 1665.000 0.000 1.000 Y NA
 10388155 10388156 YPZ3_1658 YPZ3_1659 cls   TRUE 0.687 165.000 0.231 NA   NA
 10388157 10388158 YPZ3_1660 YPZ3_1661 oppF oppD TRUE 0.999 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 10388158 10388159 YPZ3_1661 YPZ3_1662 oppD oppC TRUE 0.996 12.000 0.554 1.000 Y NA
 10388159 10388160 YPZ3_1662 YPZ3_1663 oppC oppB TRUE 0.999 19.000 0.870 0.059 Y NA
 10388160 10388161 YPZ3_1663 YPZ3_1664 oppB oppA TRUE 0.943 87.000 0.151 0.059 Y NA
 10388161 10388162 YPZ3_1664 YPZ3_1665 oppA   FALSE 0.001 898.000 0.000 NA N NA
 10388163 10388164 YPZ3_1666 YPZ3_1667 adhE   FALSE 0.002 540.000 0.000 1.000 N NA
 10388164 10388165 YPZ3_1667 YPZ3_1668     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10388168 10388169 YPZ3_1671 YPZ3_1672     FALSE 0.010 307.000 0.000 1.000 N NA
 10388170 10388171 YPZ3_1673 YPZ3_1674     TRUE 0.810 84.000 0.200 NA   NA
 10388175 10388176 YPZ3_1677 YPZ3_1678 xthA nudG FALSE 0.196 98.000 0.056 1.000 N NA
 10388177 10388178 YPZ3_1679 YPZ3_1680 topB selD FALSE 0.213 62.000 0.041 1.000 N NA
 10388178 10388179 YPZ3_1680 YPZ3_1681 selD   FALSE 0.022 225.000 0.033 1.000 N NA
 10388180 10388181 YPZ3_1682 YPZ3_1683 sppA ansA FALSE 0.364 117.000 0.113 1.000 N NA
 10388181 10388182 YPZ3_1683 YPZ3_1684 ansA pncA TRUE 0.475 15.000 0.040 1.000 N NA
 10388183 10388184 YPZ3_1685 YPZ3_1686     TRUE 0.989 -22.000 0.216 NA   NA
 10388185 10388186 YPZ3_1687 YPZ3_1688     FALSE 0.387 314.000 0.154 1.000 Y NA
 10388188 10388189 YPZ3_1690 YPZ3_1691     TRUE 0.882 195.000 0.683 NA   NA
 10388189 10388190 YPZ3_1691 YPZ3_1692     FALSE 0.357 108.000 0.007 NA   NA
 10388192 10388193 YPZ3_1694 YPZ3_1695     FALSE 0.128 265.000 0.000 NA   NA
 10388197 10388198 YPZ3_1699 YPZ3_1700 nhaB   TRUE 0.785 221.000 0.723 1.000 N NA
 10388200 10388201 YPZ3_1702 YPZ3_1703     TRUE 0.824 17.000 0.019 NA   NA
 10388201 10388202 YPZ3_1703 YPZ3_1704     TRUE 0.894 4.000 0.019 NA   NA
 10388202 10388203 YPZ3_1704 YPZ3_1705     FALSE 0.083 305.000 0.000 NA   NA
 10388204 10388205 YPZ3_1706 YPZ3_1707     TRUE 0.884 11.000 0.000 NA   NA
 10388205 10388206 YPZ3_1707 YPZ3_1708     TRUE 0.850 17.000 0.000 NA   NA
 10388206 10388207 YPZ3_1708 YPZ3_1709     TRUE 0.991 0.000 0.333 NA   NA
 10388207 10388208 YPZ3_1709 YPZ3_1710     FALSE 0.012 572.000 0.000 NA   NA
 10388208 10388209 YPZ3_1710 YPZ3_1711     FALSE 0.004 1064.000 0.000 NA   NA
 10388209 10388210 YPZ3_1711 YPZ3_1712     FALSE 0.005 875.000 0.000 NA   NA
 10388210 10388211 YPZ3_1712 YPZ3_1713     FALSE 0.135 261.000 0.000 NA   NA
 10388211 10388212 YPZ3_1713 YPZ3_1714     TRUE 0.996 3.000 0.714 NA   NA
 10388212 10388213 YPZ3_1714 YPZ3_1715     FALSE 0.399 121.000 0.000 NA   NA
 10388213 10388214 YPZ3_1715 YPZ3_1716     FALSE 0.146 254.000 0.000 NA   NA
 10388214 10388215 YPZ3_1716 YPZ3_1717     TRUE 0.962 3.000 0.120 NA   NA
 10388215 10388216 YPZ3_1717 YPZ3_1718     FALSE 0.079 309.000 0.000 NA   NA
 10388216 10388217 YPZ3_1718 YPZ3_1719     TRUE 0.937 13.000 0.111 NA   NA
 10388217 10388218 YPZ3_1719 YPZ3_1720     TRUE 0.939 66.000 0.400 NA   NA
 10388218 10388219 YPZ3_1720 YPZ3_1721     TRUE 0.992 -3.000 0.294 NA   NA
 10388219 10388220 YPZ3_1721 YPZ3_1722     TRUE 0.983 2.000 0.235 NA   NA
 10388220 10388221 YPZ3_1722 YPZ3_1723     TRUE 0.571 253.000 0.333 NA   NA
 10388221 10388222 YPZ3_1723 YPZ3_1724     TRUE 0.921 48.000 0.222 NA   NA
 10388222 10388223 YPZ3_1724 YPZ3_1725     TRUE 0.997 14.000 1.000 NA   NA
 10388223 10388224 YPZ3_1725 YPZ3_1726     TRUE 0.967 122.000 1.000 NA   NA
 10388224 10388225 YPZ3_1726 YPZ3_1727     TRUE 0.927 1.000 0.000 NA   NA
 10388225 10388226 YPZ3_1727 YPZ3_1728     TRUE 0.841 19.000 0.000 NA   NA
 10388226 10388227 YPZ3_1728 YPZ3_1729     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 10388227 10388228 YPZ3_1729 YPZ3_1730     TRUE 0.907 5.000 0.000 NA   NA
 10388228 10388229 YPZ3_1730 YPZ3_1731     TRUE 0.720 48.000 0.000 NA   NA
 10388229 10388230 YPZ3_1731 YPZ3_1732     FALSE 0.153 250.000 0.000 NA   NA
 10388230 10388231 YPZ3_1732 YPZ3_1733     TRUE 0.987 31.000 0.667 NA   NA
 10388231 10388232 YPZ3_1733 YPZ3_1734     FALSE 0.022 457.000 0.000 NA   NA
 10388232 10388233 YPZ3_1734 YPZ3_1735   rzpR FALSE 0.012 546.000 0.000 1.000   NA
 10388233 10388234 YPZ3_1735 YPZ3_1736 rzpR   TRUE 0.949 -15.000 0.000 1.000   NA
 10388234 10388235 YPZ3_1736 YPZ3_1737     FALSE 0.003 1379.000 0.000 NA   NA
 10388235 10388236 YPZ3_1737 YPZ3_1738     FALSE 0.008 661.000 0.000 NA   NA
 10388236 10388237 YPZ3_1738 YPZ3_1739     TRUE 0.577 74.000 0.000 NA   NA
 10388239 10388240 YPZ3_1741 YPZ3_1742     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10388242 10388243 YPZ3_1744 YPZ3_1745     TRUE 0.580 103.000 0.088 NA   NA
 10388243 10388244 YPZ3_1745 YPZ3_1746     FALSE 0.285 71.000 0.046 NA N NA
 10388245 10388246 YPZ3_1747 YPZ3_1748 minC minD TRUE 0.991 25.000 0.466 1.000 Y NA
 10388247 10388248 YPZ3_1749 YPZ3_1750 rnd fadD FALSE 0.292 160.000 0.115 1.000 N NA
 10388248 10388249 YPZ3_1750 YPZ3_1751 fadD   FALSE 0.014 643.000 0.169 1.000 N NA
 10388249 10388250 YPZ3_1751 YPZ3_1752     FALSE 0.020 137.000 0.024 1.000 N NA
 10388250 10388251 YPZ3_1752 YPZ3_1753     FALSE 0.423 72.000 0.082 1.000 N NA
 10388253 10388254 YPZ3_1755 YPZ3_1756     TRUE 1.000 -13.000 0.869 0.068 Y NA
 10388254 10388255 YPZ3_1756 YPZ3_1757   eda FALSE 0.001 715.000 0.000 1.000 N NA
 10388255 10388256 YPZ3_1757 YPZ3_1758 eda zwf FALSE 0.421 242.000 0.034 1.000 Y NA
 10388257 10388258 YPZ3_1759 YPZ3_1760   pykA FALSE 0.008 330.000 0.000 1.000 N NA
 10388259 10388260 YPZ3_1761 YPZ3_1762 msbB   FALSE 0.338 267.000 0.299 1.000 N NA
 10388260 10388261 YPZ3_1762 YPZ3_1763   znuA TRUE 0.451 105.000 0.131 1.000 N NA
 10388262 10388263 YPZ3_1764 YPZ3_1765 znuC znuB TRUE 0.999 -3.000 0.755 1.000 Y NA
 10388264 10388265 YPZ3_1766 YPZ3_1767 ruvB ruvA TRUE 0.979 162.000 0.549 0.002 Y NA
 10388265 10388266 YPZ3_1767 YPZ3_1768 ruvA ruvC TRUE 0.874 283.000 0.451 0.018 Y NA
 10388266 10388267 YPZ3_1768 YPZ3_1769 ruvC   TRUE 0.627 209.000 0.277 NA   NA
 10388267 10388268 YPZ3_1769 YPZ3_1770   ntpA TRUE 0.659 58.000 0.035 NA   NA
 10388268 10388269 YPZ3_1770 YPZ3_1771 ntpA aspS TRUE 0.770 0.000 0.050 1.000 N NA
 10388270 10388271 YPZ3_1772 YPZ3_1773     TRUE 0.492 180.000 0.126 NA   NA
 10388271 10388272 YPZ3_1773 YPZ3_1774     FALSE 0.385 191.000 0.089 NA   NA
 10388272 10388273 YPZ3_1774 YPZ3_1775     TRUE 0.992 -3.000 0.315 NA   NA
 10388274 10388275 YPZ3_1776 YPZ3_1777 cutC   FALSE 0.222 232.000 0.057 NA   NA
 10388277 10388278 YPZ3_1779 YPZ3_1780   fhaC1 TRUE 0.982 150.000 1.000 NA Y NA
 10388278 10388279 YPZ3_1780 YPZ3_1781 fhaC1 mviN FALSE 0.019 480.000 0.000 NA   NA
 10388279 10388280 YPZ3_1781 YPZ3_1782 mviN   FALSE 0.095 267.000 0.022 1.000   NA
 10388280 10388281 YPZ3_1782 YPZ3_1783   rimJ TRUE 0.884 8.000 0.000 1.000   NA
 10388282 10388283 YPZ3_1784 YPZ3_1785     FALSE 0.117 395.000 0.196 NA   NA
 10388284 10388285 YPZ3_1786 YPZ3_1787     TRUE 0.967 37.000 0.417 1.000   NA
 10388287 10388288 YPZ3_1788 YPZ3_1789     TRUE 0.972 14.000 0.375 NA N NA
 10388291 10388292 YPZ3_1792 YPZ3_1793     TRUE 0.999 -3.000 0.400 0.058 Y NA
 10388292 10388293 YPZ3_1793 YPZ3_1794     TRUE 0.999 -3.000 0.440 0.058 Y NA
 10388293 10388294 YPZ3_1794 YPZ3_1795     TRUE 0.992 20.000 0.480 0.058   NA
 10388294 10388295 YPZ3_1795 YPZ3_1796     FALSE 0.076 301.000 0.000 1.000   NA
 10388295 10388296 YPZ3_1796 YPZ3_t24     FALSE 0.355 142.000 0.000 NA   NA
 10388296 10388297 YPZ3_t24 YPZ3_1797   sUL1 FALSE 0.006 836.000 0.000 NA   NA
 10388298 10388299 YPZ3_1798 YPZ3_1799 kdsA   TRUE 0.585 96.000 0.089 1.000   NA
 10388299 10388300 YPZ3_1799 YPZ3_1800     TRUE 0.986 -3.000 0.195 NA   NA
 10388300 10388301 YPZ3_1800 YPZ3_1801     TRUE 0.782 64.000 0.109 NA   NA
 10388301 10388302 YPZ3_1801 YPZ3_1802   prfA TRUE 0.997 0.000 0.229 0.044 Y NA
 10388302 10388303 YPZ3_1802 YPZ3_1803 prfA hemA TRUE 0.939 33.000 0.171 0.044 N NA
 10388304 10388305 YPZ3_1804 YPZ3_1805 lolB   TRUE 0.678 68.000 0.157 1.000 N NA
 10388305 10388306 YPZ3_1805 YPZ3_1806   prsA FALSE 0.015 341.000 0.053 1.000 N NA
 10388306 10388307 YPZ3_1806 YPZ3_1807 prsA pth FALSE 0.000 806.000 0.011 1.000 N NA
 10388307 10388308 YPZ3_1807 YPZ3_1808 pth   TRUE 0.810 164.000 0.184 1.000 Y NA
 10388308 10388309 YPZ3_1808 YPZ3_1809     FALSE 0.005 773.000 0.000 1.000   NA
 10388310 10388311 YPZ3_1810 YPZ3_1811     TRUE 0.613 8.000 0.034 NA N NA
 10388311 10388312 YPZ3_1811 YPZ3_1812     TRUE 0.978 -3.000 0.125 NA   NA
 10388314 10388315 YPZ3_1814 YPZ3_1815     TRUE 0.942 15.000 0.133 NA   NA
 10388315 10388316 YPZ3_1815 YPZ3_1816     FALSE 0.263 191.000 0.000 NA   NA
 10388317 10388318 YPZ3_1817 YPZ3_1818 copR   TRUE 0.999 12.000 0.793 0.001 Y NA
 10388318 10388319 YPZ3_1818 YPZ3_1819     FALSE 0.102 277.000 0.000 1.000   NA
 10388319 10388320 YPZ3_1819 YPZ3_1820     TRUE 0.851 55.000 0.154 1.000   NA
 10388320 10388321 YPZ3_1820 YPZ3_1821     FALSE 0.215 213.000 0.000 NA   NA
 10388321 10388322 YPZ3_1821 YPZ3_1822     FALSE 0.006 791.000 0.000 NA   NA
 10388322 10388323 YPZ3_1822 YPZ3_1823     TRUE 0.904 6.000 0.000 NA   NA
 10388323 10388324 YPZ3_1823 YPZ3_1824     TRUE 0.954 -13.000 0.000 NA   NA
 10388324 10388325 YPZ3_1824 YPZ3_1825     FALSE 0.058 341.000 0.000 NA   NA
 10388325 10388326 YPZ3_1825 YPZ3_1826     TRUE 0.710 105.000 0.000 0.045   NA
 10388327 10388328 YPZ3_1827 YPZ3_1828     FALSE 0.141 247.000 0.000 1.000   NA
 10388331 10388332 YPZ3_1831 YPZ3_1832     FALSE 0.304 170.000 0.000 NA   NA
 10388333 10388334 YPZ3_1833 YPZ3_1834     TRUE 0.983 -3.000 0.167 NA   NA
 10388334 10388335 YPZ3_1834 YPZ3_1835     TRUE 0.948 -3.000 0.000 NA   NA
 10388335 10388336 YPZ3_1835 YPZ3_1836     TRUE 0.927 0.000 0.000 1.000   NA
 10388336 10388337 YPZ3_1836 YPZ3_1837     FALSE 0.171 134.000 0.054 NA N NA
 10388337 10388338 YPZ3_1837 YPZ3_1838     TRUE 0.996 -3.000 0.550 NA   NA
 10388338 10388339 YPZ3_1838 YPZ3_1839     TRUE 0.668 98.000 0.133 1.000   NA
 10388339 10388340 YPZ3_1839 YPZ3_1840     TRUE 0.963 14.000 0.200 NA   NA
 10388340 10388341 YPZ3_1840 YPZ3_1841     TRUE 0.445 137.000 0.067 NA   NA
 10388343 10388344 YPZ3_1843 YPZ3_1844     TRUE 0.954 0.000 0.067 NA   NA
 10388345 10388346 YPZ3_1845 YPZ3_1846 hutC hutI FALSE 0.010 204.000 0.010 1.000 N NA
 10388346 10388347 YPZ3_1846 YPZ3_1847 hutI hutG TRUE 0.586 -3.000 0.031 1.000 N NA
 10388348 10388349 YPZ3_1848 YPZ3_1849     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10388349 10388350 YPZ3_1849 YPZ3_1850     FALSE 0.000 1140.000 0.000 1.000 N NA
 10388350 10388351 YPZ3_1850 YPZ3_1851     TRUE 0.940 25.000 0.000 1.000 Y NA
 10388351 10388352 YPZ3_1851 YPZ3_1852     TRUE 0.994 -7.000 0.000 0.058 Y NA
 10388352 10388353 YPZ3_1852 YPZ3_1853     TRUE 0.930 67.000 0.000 0.058 Y NA
 10388353 10388354 YPZ3_1853 YPZ3_1854     TRUE 0.766 30.000 0.000 1.000   NA
 10388354 10388355 YPZ3_1854 YPZ3_1855     FALSE 0.007 668.000 0.000 1.000   NA
 10388356 10388357 YPZ3_1856 YPZ3_1857     TRUE 0.880 12.000 0.000 NA   NA
 10388358 10388359 YPZ3_1858 YPZ3_1859     TRUE 0.980 0.000 0.000 0.029   NA
 10388359 10388360 YPZ3_1859 YPZ3_1860     TRUE 0.692 48.000 0.000 1.000   NA
 10388361 10388362 YPZ3_1861 YPZ3_1862     FALSE 0.008 675.000 0.000 NA   NA
 10388362 10388363 YPZ3_1862 YPZ3_1863     TRUE 0.905 183.000 0.521 0.073   NA
 10388363 10388364 YPZ3_1863 YPZ3_1864     FALSE 0.203 220.000 0.000 NA   NA
 10388365 10388366 YPZ3_t25 YPZ3_t26     TRUE 0.884 11.000 0.000 NA   NA
 10388366 10388367 YPZ3_t26 YPZ3_t27     TRUE 0.695 53.000 0.000 NA   NA
 10388367 10388368 YPZ3_t27 YPZ3_1865   pgsA FALSE 0.351 145.000 0.000 NA   NA
 10388368 10388369 YPZ3_1865 YPZ3_1866 pgsA uvrC TRUE 0.821 59.000 0.227 1.000 N NA
 10388369 10388370 YPZ3_1866 YPZ3_1867 uvrC uvrY TRUE 0.836 59.000 0.086 0.026 N NA
 10388372 10388373 YPZ3_1869 YPZ3_t28     FALSE 0.008 687.000 0.000 NA   NA
 10388377 10388378 YPZ3_1873 YPZ3_1874     TRUE 0.994 11.000 0.378 NA Y NA
 10388378 10388379 YPZ3_1874 YPZ3_1875     TRUE 0.987 30.000 0.356 NA Y NA
 10388379 10388380 YPZ3_1875 YPZ3_1876   putP FALSE 0.013 333.000 0.000 NA N NA
 10388381 10388382 YPZ3_1877 YPZ3_1878 putA   FALSE 0.006 833.000 0.000 NA   NA
 10388383 10388384 YPZ3_1879 YPZ3_1880     TRUE 0.988 3.000 0.150 1.000 Y NA
 10388384 10388385 YPZ3_1880 YPZ3_1881   fliY TRUE 0.994 0.000 0.100 0.074 Y NA
 10388385 10388386 YPZ3_1881 YPZ3_1882 fliY   TRUE 0.946 124.000 0.469 1.000 Y NA
 10388386 10388387 YPZ3_1882 YPZ3_1883   fliZ FALSE 0.158 262.000 0.062 1.000   NA
 10388387 10388388 YPZ3_1883 YPZ3_1884 fliZ fliA FALSE 0.322 222.000 0.108 1.000   NA
 10388388 10388389 YPZ3_1884 YPZ3_1885 fliA fliC FALSE 0.007 347.000 0.000 1.000 N NA
 10388390 10388391 YPZ3_1886 YPZ3_1887 fliD   TRUE 0.984 68.000 0.284 0.004 Y NA
 10388391 10388392 YPZ3_1887 YPZ3_1888     FALSE 0.001 674.000 0.000 1.000 N NA
 10388392 10388393 YPZ3_1888 YPZ3_1889     FALSE 0.043 354.000 0.000 1.000   NA
 10388393 10388394 YPZ3_1889 YPZ3_1890     TRUE 0.673 149.000 0.200 NA   NA
 10388394 10388395 YPZ3_1890 YPZ3_1891     FALSE 0.258 161.000 0.006 NA   NA
 10388397 10388398 YPZ3_1893 YPZ3_1894 fliF fliG TRUE 0.998 -3.000 0.220 0.011 Y NA
 10388398 10388399 YPZ3_1894 YPZ3_1895 fliG fliH TRUE 0.995 -7.000 0.007 0.006 Y NA
 10388399 10388400 YPZ3_1895 YPZ3_1896 fliH fliI TRUE 0.992 -37.000 0.115 1.000 Y NA
 10388400 10388401 YPZ3_1896 YPZ3_1897 fliI fliJ TRUE 0.797 100.000 0.073 1.000 Y NA
 10388401 10388402 YPZ3_1897 YPZ3_1898 fliJ fliK TRUE 0.999 -3.000 0.317 0.011 Y NA
 10388402 10388403 YPZ3_1898 YPZ3_1899 fliK   TRUE 0.727 174.000 0.119 1.000 Y NA
 10388403 10388404 YPZ3_1899 YPZ3_1900   fliM TRUE 1.000 6.000 0.957 0.002 Y NA
 10388404 10388405 YPZ3_1900 YPZ3_1901 fliM   TRUE 0.985 39.000 0.137 0.002 Y NA
 10388405 10388406 YPZ3_1901 YPZ3_1902   fliO TRUE 0.997 0.000 0.443 1.000 Y NA
 10388406 10388407 YPZ3_1902 YPZ3_1903 fliO fliP TRUE 0.995 -3.000 0.203 1.000 Y NA
 10388407 10388408 YPZ3_1903 YPZ3_1904 fliP fliR FALSE 0.128 379.000 0.000 1.000 Y NA
 10388408 10388409 YPZ3_1904 YPZ3_1905 fliR   FALSE 0.023 434.000 0.000 1.000   NA
 10388410 10388411 YPZ3_1906 YPZ3_1907     TRUE 0.907 49.000 0.000 NA Y NA
 10388411 10388412 YPZ3_1907 YPZ3_1908     TRUE 0.994 3.000 0.286 1.000 Y NA
 10388412 10388413 YPZ3_1908 YPZ3_1909     TRUE 0.866 66.000 0.000 NA Y NA
 10388413 10388414 YPZ3_1909 YPZ3_1910     TRUE 0.997 43.000 1.000 NA Y NA
 10388414 10388415 YPZ3_1910 YPZ3_1911     FALSE 0.343 130.000 0.000 1.000   NA
 10388417 10388418 YPZ3_1913 YPZ3_1914 flgL flgK TRUE 0.927 139.000 0.142 0.002 Y NA
 10388418 10388419 YPZ3_1914 YPZ3_1915 flgK flgJ FALSE 0.415 871.000 0.705 0.004 Y NA
 10388419 10388420 YPZ3_1915 YPZ3_1916 flgJ flgI TRUE 0.994 0.000 0.048 0.013 Y NA
 10388420 10388421 YPZ3_1916 YPZ3_1917 flgI flgH TRUE 0.988 15.000 0.085 0.013 Y NA
 10388421 10388422 YPZ3_1917 YPZ3_1918 flgH flgG TRUE 0.882 144.000 0.268 1.000 Y NA
 10388422 10388423 YPZ3_1918 YPZ3_1919 flgG flgF TRUE 0.998 -19.000 0.420 1.000 Y NA
 10388423 10388424 YPZ3_1919 YPZ3_1920 flgF flgE TRUE 0.987 22.000 0.095 0.007 Y NA
 10388424 10388425 YPZ3_1920 YPZ3_1921 flgE flgD TRUE 0.550 202.000 0.000 NA Y NA
 10388425 10388426 YPZ3_1921 YPZ3_1922 flgD flgC TRUE 0.984 15.000 0.186 NA Y NA
 10388426 10388427 YPZ3_1922 YPZ3_1923 flgC flgB TRUE 0.999 6.000 0.824 0.006 Y NA
 10388428 10388429 YPZ3_1924 YPZ3_1925 flgA flgM TRUE 0.906 151.000 0.330 NA Y NA
 10388429 10388430 YPZ3_1925 YPZ3_1926 flgM flgN TRUE 0.996 19.000 0.361 0.003 Y NA
 10388431 10388432 YPZ3_1927 YPZ3_1928     TRUE 0.495 90.000 0.000 NA   NA
 10388432 10388433 YPZ3_1928 YPZ3_1929   flhE FALSE 0.003 1607.000 0.000 1.000   NA
 10388433 10388434 YPZ3_1929 YPZ3_1930 flhE flhA TRUE 0.986 0.000 0.053 0.003   NA
 10388434 10388435 YPZ3_1930 YPZ3_1931 flhA flhB TRUE 0.998 0.000 0.287 0.012 Y NA
 10388436 10388437 YPZ3_1932 YPZ3_1933     TRUE 0.998 -6.000 0.800 NA   NA
 10388438 10388439 YPZ3_1934 YPZ3_1935     TRUE 0.952 97.000 0.704 NA   NA
 10388439 10388440 YPZ3_1935 YPZ3_1936     TRUE 0.995 3.000 0.613 1.000   NA
 10388440 10388441 YPZ3_1936 YPZ3_1937   ftnA FALSE 0.027 397.000 0.029 1.000   NA
 10388441 10388442 YPZ3_1937 YPZ3_1938 ftnA pip FALSE 0.007 691.000 0.000 1.000   NA
 10388442 10388443 YPZ3_1938 YPZ3_1939 pip ptrB FALSE 0.022 722.000 0.000 0.020   NA
 10388443 10388444 YPZ3_1939 YPZ3_1940 ptrB   FALSE 0.079 310.000 0.000 NA   NA
 10388444 10388445 YPZ3_1940 YPZ3_1941     TRUE 0.521 92.000 0.048 NA   NA
 10388445 10388446 YPZ3_1941 YPZ3_1942     TRUE 0.782 40.000 0.053 NA   NA
 10388446 10388447 YPZ3_1942 YPZ3_1943   dbpA FALSE 0.414 94.000 0.014 NA   NA
 10388448 10388449 YPZ3_1944 YPZ3_1945 purT   FALSE 0.002 548.000 0.000 1.000 N NA
 10388449 10388450 YPZ3_1945 YPZ3_1946     TRUE 0.974 -3.000 0.116 1.000   NA
 10388450 10388451 YPZ3_1946 YPZ3_1947     FALSE 0.061 708.000 0.409 1.000   NA
 10388452 10388453 YPZ3_1948 YPZ3_1949 hpaC hpaB TRUE 0.987 21.000 0.226 0.001   NA
 10388453 10388454 YPZ3_1949 YPZ3_1950 hpaB hpaX FALSE 0.158 68.000 0.000 1.000 N NA
 10388454 10388455 YPZ3_1950 YPZ3_1951 hpaX hpaI TRUE 0.973 26.000 0.175 1.000 Y NA
 10388455 10388456 YPZ3_1951 YPZ3_1952 hpaI hpaH TRUE 0.979 11.000 0.439 1.000 N NA
 10388456 10388457 YPZ3_1952 YPZ3_1953 hpaH hpaF TRUE 0.985 -6.000 0.282 1.000 N NA
 10388457 10388458 YPZ3_1953 YPZ3_1954 hpaF hpaD TRUE 0.968 25.000 0.330 1.000   NA
 10388458 10388459 YPZ3_1954 YPZ3_1955 hpaD hpaE TRUE 0.848 119.000 0.378 1.000   NA
 10388459 10388460 YPZ3_1955 YPZ3_1956 hpaE   TRUE 0.997 -3.000 0.510 0.044 N NA
 10388460 10388461 YPZ3_1956 YPZ3_1957     TRUE 1.000 -3.000 0.618 0.001 Y NA
 10388464 10388465 YPZ3_1960 YPZ3_1961 manX manY TRUE 0.924 92.000 0.064 0.006 Y NA
 10388465 10388466 YPZ3_1961 YPZ3_1962 manY   TRUE 0.991 151.000 0.939 0.006 Y NA
 10388466 10388467 YPZ3_1962 YPZ3_1963     TRUE 0.895 200.000 0.755 NA   NA
 10388467 10388468 YPZ3_1963 YPZ3_1964     FALSE 0.027 429.000 0.000 NA   NA
 10388472 10388473 YPZ3_1968 YPZ3_1969     FALSE 0.003 1461.000 0.000 NA   NA
 10388475 10388476 YPZ3_1971 YPZ3_1972     FALSE 0.001 902.000 0.000 1.000 N NA
 10388476 10388477 YPZ3_1972 YPZ3_1973     FALSE 0.026 103.000 0.021 1.000 N NA
 10388477 10388478 YPZ3_1973 YPZ3_1974     FALSE 0.005 911.000 0.000 NA   NA
 10388478 10388479 YPZ3_1974 YPZ3_t29     FALSE 0.289 178.000 0.000 NA   NA
 10388480 10388481 YPZ3_1975 YPZ3_1976     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10388481 10388482 YPZ3_1976 YPZ3_1977     TRUE 0.915 14.000 0.000 0.046 N NA
 10388482 10388483 YPZ3_1977 YPZ3_1978     FALSE 0.002 475.000 0.000 1.000 N NA
 10388483 10388484 YPZ3_1978 YPZ3_1979   kdgF TRUE 0.720 48.000 0.000 NA   NA
 10388485 10388486 YPZ3_1980 YPZ3_1981 kduI kduD1 TRUE 0.631 92.000 0.192 1.000 N NA
 10388486 10388487 YPZ3_1981 YPZ3_1982 kduD1 pelW FALSE 0.054 336.000 0.000 1.000   NA
 10388487 10388488 YPZ3_1982 YPZ3_1983 pelW   TRUE 0.658 161.000 0.217 1.000   NA
 10388488 10388489 YPZ3_1983 YPZ3_1984     TRUE 1.000 -7.000 0.917 0.057 Y NA
 10388489 10388490 YPZ3_1984 YPZ3_1985     TRUE 0.990 14.000 0.131 0.057 Y NA
 10388490 10388491 YPZ3_1985 YPZ3_1986     TRUE 0.987 16.000 0.101 0.057 Y NA
 10388491 10388492 YPZ3_1986 YPZ3_1987     FALSE 0.226 298.000 0.000 0.057   NA
 10388492 10388493 YPZ3_1987 YPZ3_1988     FALSE 0.019 480.000 0.000 NA   NA
 10388493 10388494 YPZ3_1988 YPZ3_1989     FALSE 0.374 204.000 0.102 NA   NA
 10388495 10388496 YPZ3_1990 YPZ3_1991   kdgR FALSE 0.004 385.000 0.000 1.000 N NA
 10388496 10388497 YPZ3_1991 YPZ3_1992 kdgR ogl FALSE 0.102 187.000 0.059 1.000 N NA
 10388499 10388500 YPZ3_1994 YPZ3_1995     TRUE 0.993 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 10388500 10388501 YPZ3_1995 YPZ3_1996     TRUE 0.993 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 10388501 10388502 YPZ3_1996 YPZ3_1997     TRUE 0.985 82.000 0.750 1.000 Y NA
 10388502 10388503 YPZ3_1997 YPZ3_1998     TRUE 0.951 195.000 0.750 1.000 Y NA
 10388503 10388504 YPZ3_1998 YPZ3_1999     FALSE 0.001 658.000 0.000 1.000 N NA
 10388504 10388505 YPZ3_1999 YPZ3_2000     FALSE 0.035 474.000 0.042 0.020 N NA
 10388505 10388506 YPZ3_2000 YPZ3_2001     TRUE 0.952 20.000 0.304 NA N NA
 10388506 10388507 YPZ3_2001 YPZ3_2002     TRUE 0.825 96.000 0.081 NA Y NA
 10388508 10388509 YPZ3_2003 YPZ3_2004     TRUE 0.999 -31.000 0.840 NA   NA
 10388509 10388510 YPZ3_2004 YPZ3_2005     FALSE 0.019 479.000 0.000 NA   NA
 10388510 10388511 YPZ3_2005 YPZ3_2006     TRUE 0.911 45.000 0.192 NA   NA
 10388511 10388512 YPZ3_2006 YPZ3_2007     FALSE 0.010 609.000 0.000 NA   NA
 10388512 10388513 YPZ3_2007 YPZ3_2008     TRUE 0.973 171.000 0.879 NA Y NA
 10388513 10388514 YPZ3_2008 YPZ3_2009     TRUE 0.907 206.000 0.848 NA   NA
 10388516 10388517 YPZ3_2011 YPZ3_2012     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10388520 10388521 YPZ3_2015 YPZ3_2016     TRUE 0.452 100.000 0.000 NA   NA
 10388521 10388522 YPZ3_2016 YPZ3_2017     TRUE 0.823 23.000 0.000 NA   NA
 10388522 10388523 YPZ3_2017 YPZ3_2018     FALSE 0.002 474.000 0.000 1.000 N NA
 10388523 10388524 YPZ3_2018 YPZ3_2019   cheZ FALSE 0.001 571.000 0.000 1.000 N NA
 10388524 10388525 YPZ3_2019 YPZ3_2020 cheZ cheY TRUE 0.993 10.000 0.333 1.000 Y NA
 10388525 10388526 YPZ3_2020 YPZ3_2021 cheY cheB TRUE 0.967 101.000 0.286 0.010 Y NA
 10388526 10388527 YPZ3_2021 YPZ3_2022 cheB cheR TRUE 0.987 0.000 0.087 1.000 Y NA
 10388527 10388528 YPZ3_2022 YPZ3_2023 cheR tap TRUE 0.688 227.000 0.188 1.000 Y NA
 10388528 10388529 YPZ3_2023 YPZ3_2024 tap cheD TRUE 0.963 184.000 0.429 0.002 Y NA
 10388529 10388530 YPZ3_2024 YPZ3_2025 cheD   FALSE 0.172 241.000 0.000 NA   NA
 10388530 10388531 YPZ3_2025 YPZ3_2026     TRUE 0.602 69.000 0.000 NA   NA
 10388531 10388532 YPZ3_2026 YPZ3_2027     FALSE 0.015 528.000 0.000 NA   NA
 10388532 10388533 YPZ3_2027 YPZ3_2028     FALSE 0.019 475.000 0.000 NA   NA
 10388534 10388535 YPZ3_2029 YPZ3_2030     TRUE 0.991 -3.000 0.400 NA N NA
 10388535 10388536 YPZ3_2030 YPZ3_2031     TRUE 0.976 13.000 0.400 NA N NA
 10388537 10388538 YPZ3_2032 YPZ3_2033 cheW   TRUE 0.969 163.000 0.447 0.004 Y NA
 10388538 10388539 YPZ3_2033 YPZ3_2034   motB TRUE 0.998 17.000 0.913 1.000 Y NA
 10388539 10388540 YPZ3_2034 YPZ3_2035 motB motA TRUE 0.998 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 10388540 10388541 YPZ3_2035 YPZ3_2036 motA   TRUE 0.733 205.000 0.408 1.000   NA
 10388541 10388542 YPZ3_2036 YPZ3_2037   mgtB FALSE 0.003 1543.000 0.000 1.000   NA
 10388542 10388543 YPZ3_2037 YPZ3_2038 mgtB   FALSE 0.044 401.000 0.065 NA   NA
 10388544 10388545 YPZ3_2039 YPZ3_2040     TRUE 0.999 -46.000 0.667 0.008   NA
 10388545 10388546 YPZ3_2040 YPZ3_2041   lacZ FALSE 0.003 1372.000 0.000 1.000   NA
 10388546 10388547 YPZ3_2041 YPZ3_2042 lacZ   FALSE 0.004 408.000 0.000 1.000 N NA
 10388547 10388548 YPZ3_2042 YPZ3_2043     FALSE 0.109 283.000 0.000 NA   NA
 10388548 10388549 YPZ3_2043 YPZ3_2044     FALSE 0.017 506.000 0.000 NA   NA
 10388549 10388550 YPZ3_2044 YPZ3_2045     TRUE 0.513 92.000 0.045 NA   NA
 10388551 10388552 YPZ3_2046 YPZ3_2047     FALSE 0.015 532.000 0.000 NA   NA
 10388553 10388554 YPZ3_2048 YPZ3_2049     FALSE 0.001 920.000 0.000 1.000 N NA
 10388554 10388555 YPZ3_2049 YPZ3_2050     FALSE 0.012 656.000 0.000 0.068 N NA
 10388557 10388558 YPZ3_2052 YPZ3_2053     TRUE 0.972 -7.000 0.182 1.000 N NA
 10388558 10388559 YPZ3_2053 YPZ3_2054     FALSE 0.333 187.000 0.158 1.000 N NA
 10388559 10388560 YPZ3_2054 YPZ3_2055     TRUE 0.872 58.000 0.180 NA   NA
 10388560 10388561 YPZ3_2055 YPZ3_2056   purB TRUE 0.769 61.000 0.093 NA   NA
 10388561 10388562 YPZ3_2056 YPZ3_2057 purB   FALSE 0.177 188.000 0.002 1.000   NA
 10388562 10388563 YPZ3_2057 YPZ3_2058   phoP FALSE 0.198 211.000 0.000 1.000   NA
 10388563 10388564 YPZ3_2058 YPZ3_2059 phoP phoQ TRUE 0.995 54.000 0.940 1.000 Y NA
 10388564 10388565 YPZ3_2059 YPZ3_2060 phoQ   TRUE 0.915 84.000 0.408 NA   NA
 10388566 10388567 YPZ3_2061 YPZ3_2062     FALSE 0.002 330.000 0.019 1.000 N NA
 10388567 10388568 YPZ3_2062 YPZ3_2063     TRUE 0.686 194.000 0.119 1.000 Y NA
 10388568 10388569 YPZ3_2063 YPZ3_2064     TRUE 0.925 19.000 0.225 1.000 N NA
 10388569 10388570 YPZ3_2064 YPZ3_2065     TRUE 0.977 0.000 0.125 0.073 N NA
 10388570 10388571 YPZ3_2065 YPZ3_2066     TRUE 0.988 -7.000 0.175 0.073 N NA
 10388573 10388574 YPZ3_2068 YPZ3_2069     FALSE 0.057 330.000 0.000 1.000   NA
 10388574 10388575 YPZ3_2069 YPZ3_2070     TRUE 0.468 96.000 0.000 NA   NA
 10388575 10388576 YPZ3_2070 YPZ3_2071     TRUE 0.897 8.000 0.000