MicrobesOnline Operon Predictions for Listeria monocytogenes 08-5923

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10383288 10383289 LM5923_0001 LM5923_0002   rpmH FALSE 0.083 168.000 0.011 NA   NA
 10383289 10383290 LM5923_0002 LM5923_0003 rpmH rnpA TRUE 0.437 90.000 0.787 1.000   NA
 10383290 10383291 LM5923_0003 LM5923_0004 rnpA   TRUE 0.470 41.000 0.052 1.000 N NA
 10383291 10383292 LM5923_0004 LM5923_0005     TRUE 0.956 -3.000 0.106 1.000   NA
 10383292 10383293 LM5923_0005 LM5923_0006     FALSE 0.206 85.000 0.029 NA   NA
 10383295 10383296 LM5923_0008 LM5923_0009     TRUE 0.971 19.000 0.158 1.000 Y NA
 10383296 10383297 LM5923_0009 LM5923_0010     TRUE 0.985 13.000 0.387 1.000 Y NA
 10383297 10383298 LM5923_0010 LM5923_0011     TRUE 0.983 13.000 0.247 1.000 Y NA
 10383298 10383299 LM5923_0011 LM5923_0012     TRUE 0.874 13.000 0.112 NA   NA
 10383301 10383302 LM5923_0014 LM5923_0015     FALSE 0.102 136.000 0.000 NA   NA
 10383303 10383304 LM5923_tRNA01 LM5923_0016     TRUE 0.655 22.000 0.000 NA   NA
 10383305 10383306 LM5923_0017 LM5923_0018     TRUE 0.993 -3.000 0.360 1.000 Y NA
 10383306 10383307 LM5923_0018 LM5923_0019     TRUE 0.913 75.000 0.620 0.039 Y NA
 10383307 10383308 LM5923_0019 LM5923_0020     TRUE 0.998 -13.000 0.805 0.039 Y NA
 10383308 10383309 LM5923_0020 LM5923_0021     TRUE 0.824 19.000 0.205 1.000 N NA
 10383309 10383310 LM5923_0021 LM5923_0022     TRUE 0.859 13.000 0.261 NA N NA
 10383310 10383311 LM5923_0022 LM5923_0023     TRUE 0.487 58.000 0.347 NA   NA
 10383311 10383312 LM5923_0023 LM5923_0024     TRUE 0.964 -3.000 0.292 1.000   NA
 10383312 10383313 LM5923_0024 LM5923_0025     TRUE 0.993 -3.000 0.300 1.000 Y NA
 10383313 10383314 LM5923_0025 LM5923_0026     TRUE 0.962 -3.000 0.231 1.000   NA
 10383314 10383315 LM5923_0026 LM5923_0027     FALSE 0.157 123.000 0.000 1.000   NA
 10383317 10383318 LM5923_0029 LM5923_0030     FALSE 0.319 103.000 0.632 NA   NA
 10383318 10383319 LM5923_0030 LM5923_0031     TRUE 0.884 14.000 0.474 NA N NA
 10383319 10383320 LM5923_0031 LM5923_0032   serC FALSE 0.005 371.000 0.000 NA N NA
 10383320 10383321 LM5923_0032 LM5923_0033 serC   TRUE 0.993 -7.000 0.238 1.000 Y NA
 10383321 10383322 LM5923_0033 LM5923_0034     FALSE 0.229 89.000 0.109 NA   NA
 10383322 10383323 LM5923_0034 LM5923_0035     TRUE 0.873 9.000 0.038 NA   NA
 10383325 10383326 LM5923_0037 LM5923_0038     FALSE 0.081 211.000 0.182 1.000   NA
 10383326 10383327 LM5923_0038 LM5923_0039     TRUE 0.971 0.000 0.909 NA   NA
 10383327 10383328 LM5923_0039 LM5923_0040     TRUE 0.923 16.000 0.750 NA   NA
 10383328 10383329 LM5923_0040 LM5923_0041     FALSE 0.271 88.000 0.258 NA   NA
 10383331 10383332 LM5923_0043 LM5923_0044     TRUE 0.741 24.000 0.196 NA   NA
 10383332 10383333 LM5923_0044 LM5923_0045     TRUE 0.782 20.000 0.065 NA   NA
 10383335 10383336 LM5923_0047 LM5923_0048 trmE gidA TRUE 0.784 25.000 0.266 1.000   NA
 10383336 10383337 LM5923_0048 LM5923_0049 gidA   FALSE 0.091 159.000 0.004 NA   NA
 10383337 10383338 LM5923_0049 LM5923_0050     TRUE 0.565 25.000 0.000 NA   NA
 10383338 10383339 LM5923_0050 LM5923_0051     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 10383339 10383340 LM5923_0051 LM5923_0052     FALSE 0.101 137.000 0.000 NA   NA
 10383340 10383341 LM5923_0052 LM5923_0053     FALSE 0.124 113.000 0.000 NA   NA
 10383341 10383342 LM5923_0053 LM5923_0054     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 10383342 10383343 LM5923_0054 LM5923_0055     TRUE 0.978 -7.000 1.000 NA   NA
 10383343 10383344 LM5923_0055 LM5923_0056     TRUE 0.956 5.000 0.833 NA   NA
 10383344 10383345 LM5923_0056 LM5923_0057   gidB FALSE 0.100 153.000 0.007 NA   NA
 10383345 10383346 LM5923_0057 LM5923_0058 gidB   FALSE 0.047 202.000 0.003 1.000 N NA
 10383346 10383347 LM5923_0058 LM5923_0059     TRUE 0.943 2.000 0.130 1.000   NA
 10383347 10383348 LM5923_0059 LM5923_0060     TRUE 0.602 34.000 0.041 1.000   NA
 10383348 10383349 LM5923_0060 LM5923_0061     TRUE 0.405 63.000 0.041 1.000   NA
 10383349 10383350 LM5923_0061 LM5923_0062     TRUE 0.939 13.000 0.588 1.000   NA
 10383350 10383351 LM5923_0062 LM5923_0063     TRUE 0.943 25.000 0.270 NA Y NA
 10383351 10383352 LM5923_0063 LM5923_0064     TRUE 0.993 -16.000 0.380 NA Y NA
 10383352 10383353 LM5923_0064 LM5923_0065     TRUE 0.447 172.000 0.057 1.000 Y NA
 10383353 10383354 LM5923_0065 LM5923_0066     TRUE 0.880 12.000 0.098 NA   NA
 10383354 10383355 LM5923_0066 LM5923_0067     FALSE 0.158 195.000 0.833 NA   NA
 10383355 10383356 LM5923_0067 LM5923_0068   parA FALSE 0.042 224.000 0.000 1.000   NA
 10383356 10383357 LM5923_0068 LM5923_0069 parA parB TRUE 0.975 -7.000 0.827 1.000 N NA
 10383357 10383358 LM5923_0069 LM5923_0070 parB   TRUE 0.852 13.000 0.039 NA   NA
 10383358 10383359 LM5923_0070 LM5923_0071   bvrA FALSE 0.062 172.000 0.000 NA   NA
 10383359 10383360 LM5923_0071 LM5923_0072 bvrA bvrB FALSE 0.165 108.000 0.000 1.000   NA
 10383360 10383361 LM5923_0072 LM5923_0073 bvrB bvrC TRUE 0.821 0.000 0.000 NA N NA
 10383361 10383362 LM5923_0073 LM5923_0074 bvrC kat FALSE 0.052 148.000 0.000 NA N NA
 10383362 10383363 LM5923_0074 LM5923_0075 kat   FALSE 0.032 211.000 0.000 1.000 N NA
 10383363 10383364 LM5923_0075 LM5923_0076     FALSE 0.344 150.000 0.170 0.038 N NA
 10383364 10383365 LM5923_0076 LM5923_0077     TRUE 0.995 15.000 0.917 0.033 Y NA
 10383365 10383366 LM5923_0077 LM5923_0078     TRUE 0.930 34.000 0.450 1.000 Y NA
 10383366 10383367 LM5923_0078 LM5923_0079     TRUE 0.989 6.000 0.450 1.000 Y NA
 10383367 10383368 LM5923_0079 LM5923_0080     FALSE 0.095 152.000 0.008 1.000 N NA
 10383368 10383369 LM5923_0080 LM5923_0081     FALSE 0.018 278.000 0.000 NA   NA
 10383371 10383372 LM5923_0083 LM5923_0084     FALSE 0.020 266.000 0.000 NA   NA
 10383372 10383373 LM5923_0084 LM5923_0085     TRUE 0.912 -10.000 0.000 NA   NA
 10383373 10383374 LM5923_0085 LM5923_0086     FALSE 0.335 97.000 0.407 1.000   NA
 10383374 10383375 LM5923_0086 LM5923_0087     TRUE 0.994 -7.000 0.368 1.000 Y NA
 10383377 10383378 LM5923_0089 LM5923_0090     TRUE 0.830 27.000 1.000 NA   NA
 10383378 10383379 LM5923_0090 LM5923_0091     FALSE 0.336 71.000 0.177 NA   NA
 10383379 10383380 LM5923_0091 LM5923_0092     FALSE 0.218 100.000 0.177 NA   NA
 10383381 10383382 LM5923_0093 LM5923_0094     TRUE 0.991 -7.000 0.095 NA Y NA
 10383382 10383383 LM5923_0094 LM5923_0095     TRUE 0.985 12.000 0.524 NA Y NA
 10383383 10383384 LM5923_0095 LM5923_0096     TRUE 0.976 33.000 0.789 0.033 Y NA
 10383384 10383385 LM5923_0096 LM5923_0097     TRUE 0.916 47.000 0.765 1.000 Y NA
 10383386 10383387 LM5923_0098 LM5923_0099     TRUE 0.399 58.000 0.092 NA   NA
 10383389 10383390 LM5923_0101 LM5923_0102 guaB   FALSE 0.106 161.000 0.072 1.000 N NA
 10383390 10383391 LM5923_0102 LM5923_0103   topB TRUE 0.947 24.000 0.058 1.000 Y NA
 10383391 10383392 LM5923_0103 LM5923_0104 topB   FALSE 0.239 109.000 0.096 1.000   NA
 10383392 10383393 LM5923_0104 LM5923_0105     FALSE 0.353 179.000 0.333 0.031   NA
 10383394 10383395 LM5923_0106 LM5923_0107     FALSE 0.018 276.000 0.000 NA   NA
 10383395 10383396 LM5923_0107 LM5923_0108     TRUE 0.998 0.000 0.720 0.010 Y NA
 10383396 10383397 LM5923_0108 LM5923_0109     FALSE 0.095 161.000 0.033 1.000 N NA
 10383397 10383398 LM5923_0109 LM5923_0110     TRUE 0.990 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 10383399 10383400 LM5923_0111 LM5923_0112   serS FALSE 0.018 308.000 0.000 1.000   NA
 10383400 10383401 LM5923_0112 LM5923_0113 serS   TRUE 0.656 20.000 0.014 NA N NA
 10383403 10383404 LM5923_0115 LM5923_0116     FALSE 0.129 143.000 0.049 1.000 N NA
 10383404 10383405 LM5923_0116 LM5923_0117     TRUE 0.790 19.000 0.049 NA   NA
 10383405 10383406 LM5923_0117 LM5923_0118     FALSE 0.264 117.000 0.375 NA   NA
 10383406 10383407 LM5923_0118 LM5923_0119     TRUE 0.952 -10.000 0.180 NA   NA
 10383407 10383408 LM5923_0119 LM5923_0120     TRUE 0.952 -7.000 0.180 NA   NA
 10383408 10383409 LM5923_0120 LM5923_0121     FALSE 0.202 118.000 0.122 NA   NA
 10383409 10383410 LM5923_0121 LM5923_0122     FALSE 0.346 68.000 0.122 NA   NA
 10383411 10383412 LM5923_0123 LM5923_0124     TRUE 0.994 -3.000 0.438 1.000 Y NA
 10383412 10383413 LM5923_0124 LM5923_0125     TRUE 0.992 2.000 0.500 1.000 Y NA
 10383413 10383414 LM5923_0125 LM5923_0126     TRUE 0.870 61.000 0.529 1.000 Y NA
 10383415 10383416 LM5923_0127 LM5923_0128     FALSE 0.368 84.000 0.556 NA   NA
 10383416 10383417 LM5923_0128 LM5923_0129     TRUE 0.927 14.000 0.692 NA   NA
 10383418 10383419 LM5923_0130 LM5923_0131     TRUE 0.960 0.000 0.524 NA   NA
 10383419 10383420 LM5923_0131 LM5923_0132     TRUE 0.911 -43.000 0.000 NA   NA
 10383420 10383421 LM5923_0132 LM5923_0133     FALSE 0.155 85.000 0.000 NA   NA
 10383422 10383423 LM5923_0134 LM5923_0135     TRUE 0.964 -3.000 0.520 1.000 N NA
 10383423 10383424 LM5923_0135 LM5923_0136     TRUE 0.516 58.000 0.440 NA   NA
 10383425 10383426 LM5923_0137 LM5923_0138     TRUE 0.515 54.000 0.172 1.000   NA
 10383429 10383430 LM5923_0141 LM5923_0142   cydA FALSE 0.008 382.000 0.000 1.000 N NA
 10383430 10383431 LM5923_0142 LM5923_0143 cydA cydB TRUE 0.997 -13.000 0.153 0.024 Y NA
 10383431 10383432 LM5923_0143 LM5923_0144 cydB cydC TRUE 0.887 42.000 0.151 1.000 Y NA
 10383432 10383433 LM5923_0144 LM5923_0145 cydC cydD TRUE 0.997 -3.000 0.168 0.010 Y NA
 10383433 10383434 LM5923_0145 LM5923_0146 cydD   FALSE 0.169 141.000 0.034 1.000   NA
 10383434 10383435 LM5923_0146 LM5923_0147     TRUE 0.462 43.000 0.044 NA   NA
 10383435 10383436 LM5923_0147 LM5923_0148     FALSE 0.220 116.000 0.200 NA   NA
 10383436 10383437 LM5923_0148 LM5923_0149     TRUE 0.592 58.000 0.750 NA   NA
 10383437 10383438 LM5923_0149 LM5923_0150     FALSE 0.006 545.000 0.000 NA   NA
 10383440 10383441 LM5923_0152 LM5923_0153     FALSE 0.270 135.000 0.588 NA   NA
 10383441 10383442 LM5923_0153 LM5923_0154     TRUE 0.959 3.000 0.706 NA   NA
 10383442 10383443 LM5923_0154 LM5923_0155     TRUE 0.905 18.000 0.706 NA   NA
 10383443 10383444 LM5923_0155 LM5923_0156   dnaX FALSE 0.015 291.000 0.000 NA   NA
 10383444 10383445 LM5923_0156 LM5923_0157 dnaX   TRUE 0.594 30.000 0.071 NA   NA
 10383445 10383446 LM5923_0157 LM5923_0158   recR FALSE 0.313 109.000 0.604 NA   NA
 10383446 10383447 LM5923_0158 LM5923_0159 recR   TRUE 0.847 15.000 0.071 NA   NA
 10383448 10383449 LM5923_0160 LM5923_0161     FALSE 0.232 121.000 0.094 1.000   NA
 10383449 10383450 LM5923_0161 LM5923_0162     FALSE 0.165 119.000 0.000 1.000   NA
 10383450 10383451 LM5923_0162 LM5923_0163     FALSE 0.164 106.000 0.000 1.000   NA
 10383451 10383452 LM5923_0163 LM5923_0164     TRUE 0.938 4.000 0.211 1.000   NA
 10383452 10383453 LM5923_0164 LM5923_0165     TRUE 0.990 22.000 0.316 0.003 Y NA
 10383454 10383455 LM5923_0166 LM5923_0167     TRUE 0.386 53.000 0.045 1.000 N NA
 10383455 10383456 LM5923_0167 LM5923_0168     FALSE 0.167 108.000 0.033 NA   NA
 10383458 10383459 LM5923_0170 LM5923_0171     FALSE 0.005 555.000 0.000 1.000 N NA
 10383459 10383460 LM5923_0171 LM5923_0172     TRUE 0.981 1.000 0.467 0.081 N NA
 10383460 10383461 LM5923_0172 LM5923_0173     TRUE 0.998 -3.000 0.727 0.010 Y NA
 10383461 10383462 LM5923_0173 LM5923_0174     FALSE 0.124 165.000 0.182 NA   NA
 10383463 10383464 LM5923_0175 LM5923_0176     TRUE 0.965 37.000 0.429 0.032 Y NA
 10383464 10383465 LM5923_0176 LM5923_0177     TRUE 0.823 136.000 0.429 0.032 Y NA
 10383466 10383467 LM5923_0178 LM5923_0179 kdpA kdpB TRUE 0.995 12.000 0.112 0.001 Y NA
 10383467 10383468 LM5923_0179 LM5923_0180 kdpB kdpC TRUE 0.997 15.000 0.877 0.001 Y NA
 10383468 10383469 LM5923_0180 LM5923_0181 kdpC   TRUE 0.926 16.000 0.014 0.093 N NA
 10383469 10383470 LM5923_0181 LM5923_0182     TRUE 0.992 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 10383470 10383471 LM5923_0182 LM5923_0183     TRUE 0.510 41.000 0.095 NA   NA
 10383472 10383473 LM5923_0184 LM5923_0185     TRUE 0.919 13.000 0.500 NA   NA
 10383473 10383474 LM5923_0185 LM5923_0186     FALSE 0.071 195.000 0.075 NA   NA
 10383474 10383475 LM5923_0186 LM5923_0187     TRUE 0.921 4.000 0.233 1.000 N NA
 10383476 10383477 LM5923_0188 LM5923_0189     TRUE 0.588 46.000 0.450 NA   NA
 10383477 10383478 LM5923_0189 LM5923_0190     TRUE 0.948 -3.000 0.192 NA   NA
 10383478 10383479 LM5923_0190 LM5923_0191     FALSE 0.324 74.000 0.192 NA   NA
 10383479 10383480 LM5923_0191 LM5923_0192     FALSE 0.009 369.000 0.000 NA   NA
 10383480 10383481 LM5923_0192 LM5923_0193     TRUE 0.883 34.000 0.800 0.037 N NA
 10383481 10383482 LM5923_0193 LM5923_0194     TRUE 0.944 58.000 0.519 0.032 Y NA
 10383482 10383483 LM5923_0194 LM5923_0195     TRUE 0.884 62.000 0.000 0.050 Y NA
 10383483 10383484 LM5923_0195 LM5923_0196     TRUE 0.383 37.000 0.000 1.000 N NA
 10383484 10383485 LM5923_0196 LM5923_0197     TRUE 0.996 2.000 0.241 0.020 Y NA
 10383485 10383486 LM5923_0197 LM5923_0198     FALSE 0.107 195.000 0.414 1.000 N NA
 10383486 10383487 LM5923_0198 LM5923_0199     TRUE 0.990 9.000 0.786 1.000 Y NA
 10383487 10383488 LM5923_0199 LM5923_0200     TRUE 0.945 34.000 0.818 1.000 Y NA
 10383488 10383489 LM5923_0200 LM5923_0201     TRUE 0.991 -3.000 0.061 1.000 Y NA
 10383489 10383490 LM5923_0201 LM5923_0202     FALSE 0.185 134.000 0.034 1.000   NA
 10383490 10383491 LM5923_0202 LM5923_0203     TRUE 0.893 15.000 0.169 1.000   NA
 10383491 10383492 LM5923_0203 LM5923_0204   rpsL FALSE 0.064 193.000 0.037 1.000 N NA
 10383492 10383493 LM5923_0204 LM5923_0205 rpsL rpsG TRUE 0.976 31.000 0.224 0.004 Y NA
 10383493 10383494 LM5923_0205 LM5923_0206 rpsG fus TRUE 0.859 66.000 0.579 1.000 Y NA
 10383494 10383495 LM5923_0206 LM5923_0207 fus tuf TRUE 0.899 109.000 0.400 0.001 Y NA
 10383495 10383496 LM5923_0207 LM5923_0208 tuf   FALSE 0.091 155.000 0.006 1.000 N NA
 10383496 10383497 LM5923_0208 LM5923_0209     FALSE 0.271 194.000 0.471 0.037 N NA
 10383497 10383498 LM5923_0209 LM5923_0210     TRUE 0.996 3.000 0.405 0.032 Y NA
 10383498 10383499 LM5923_0210 LM5923_0211   ulaA TRUE 0.916 27.000 0.595 0.050   NA
 10383499 10383500 LM5923_0211 LM5923_0212 ulaA   TRUE 0.496 70.000 0.484 1.000   NA
 10383500 10383501 LM5923_0212 LM5923_0213     TRUE 0.953 13.000 0.895 1.000   NA
 10383501 10383502 LM5923_0213 LM5923_0214     TRUE 0.956 -40.000 0.245 NA   NA
 10383502 10383503 LM5923_0214 LM5923_0215     TRUE 0.942 1.000 0.264 NA   NA
 10383503 10383504 LM5923_0215 LM5923_0216     FALSE 0.281 79.000 0.136 NA   NA
 10383504 10383505 LM5923_0216 LM5923_0217     TRUE 0.638 28.000 0.103 NA   NA
 10383506 10383507 LM5923_0218 LM5923_0219     FALSE 0.304 90.000 0.222 1.000   NA
 10383507 10383508 LM5923_0219 LM5923_0220     TRUE 0.772 22.000 0.118 NA   NA
 10383508 10383509 LM5923_0220 LM5923_0221     TRUE 0.569 33.000 0.078 NA   NA
 10383509 10383510 LM5923_0221 LM5923_0222     FALSE 0.108 176.000 0.190 NA   NA
 10383511 10383512 LM5923_0223 LM5923_0224     FALSE 0.184 164.000 0.333 1.000   NA
 10383512 10383513 LM5923_0224 LM5923_0225     TRUE 0.782 82.000 0.526 1.000 Y NA
 10383513 10383514 LM5923_0225 LM5923_0226     TRUE 0.815 20.000 0.224 1.000 N NA
 10383514 10383515 LM5923_0226 LM5923_0227   rpsJ FALSE 0.009 361.000 0.000 1.000 N NA
 10383515 10383516 LM5923_0227 LM5923_0228 rpsJ rplC TRUE 0.970 35.000 0.467 0.027 Y NA
 10383516 10383517 LM5923_0228 LM5923_0229 rplC rplD TRUE 0.983 26.000 0.544 0.020 Y NA
 10383517 10383518 LM5923_0229 LM5923_0230 rplD rplW TRUE 0.992 0.000 0.307 1.000 Y NA
 10383518 10383519 LM5923_0230 LM5923_0231 rplW rplB TRUE 0.934 41.000 0.849 1.000 Y NA
 10383519 10383520 LM5923_0231 LM5923_0232 rplB rpsS TRUE 0.967 46.000 0.820 0.027 Y NA
 10383520 10383521 LM5923_0232 LM5923_0233 rpsS rplV TRUE 0.991 21.000 0.769 0.027 Y NA
 10383521 10383522 LM5923_0233 LM5923_0234 rplV rpsC TRUE 0.997 4.000 0.719 0.027 Y NA
 10383522 10383523 LM5923_0234 LM5923_0235 rpsC rplP TRUE 0.997 3.000 0.828 0.027 Y NA
 10383523 10383524 LM5923_0235 LM5923_0236 rplP rpmC TRUE 0.998 -10.000 0.802 0.020 Y NA
 10383524 10383525 LM5923_0236 LM5923_0237 rpmC rpsQ TRUE 0.984 28.000 0.828 0.020 Y NA
 10383525 10383526 LM5923_0237 LM5923_0238 rpsQ rplN TRUE 0.921 80.000 0.791 0.027 Y NA
 10383526 10383527 LM5923_0238 LM5923_0239 rplN rplX TRUE 0.954 38.000 0.071 0.027 Y NA
 10383527 10383528 LM5923_0239 LM5923_0240 rplX rplE TRUE 0.974 27.000 0.057 0.020 Y NA
 10383528 10383529 LM5923_0240 LM5923_0241 rplE rpsN TRUE 0.977 31.000 0.496 0.020 Y NA
 10383529 10383530 LM5923_0241 LM5923_0242 rpsN rpsH TRUE 0.976 31.000 0.473 0.020 Y NA
 10383530 10383531 LM5923_0242 LM5923_0243 rpsH rplF TRUE 0.981 31.000 0.808 0.020 Y NA
 10383531 10383532 LM5923_0243 LM5923_0244 rplF rplR TRUE 0.993 19.000 0.815 0.020 Y NA
 10383532 10383533 LM5923_0244 LM5923_0245 rplR rpsE TRUE 0.991 22.000 0.814 0.027 Y NA
 10383533 10383534 LM5923_0245 LM5923_0246 rpsE rpmD TRUE 0.994 17.000 0.789 0.027 Y NA
 10383534 10383535 LM5923_0246 LM5923_0247 rpmD rplO TRUE 0.964 56.000 0.653 0.003 Y NA
 10383535 10383536 LM5923_0247 LM5923_0248 rplO secY TRUE 0.966 0.000 0.730 1.000 N NA
 10383536 10383537 LM5923_0248 LM5923_0249 secY adk TRUE 0.428 60.000 0.241 1.000 N NA
 10383537 10383538 LM5923_0249 LM5923_0250 adk infA FALSE 0.012 386.000 0.059 1.000 N NA
 10383538 10383539 LM5923_0250 LM5923_0251 infA rpmJ FALSE 0.277 104.000 0.257 1.000   NA
 10383539 10383540 LM5923_0251 LM5923_0252 rpmJ rpsM TRUE 0.957 19.000 0.194 0.020   NA
 10383540 10383541 LM5923_0252 LM5923_0253 rpsM rpsK TRUE 0.990 23.000 0.810 0.020 Y NA
 10383541 10383542 LM5923_0253 LM5923_0254 rpsK rpoA FALSE 0.236 110.000 0.308 1.000 N NA
 10383542 10383543 LM5923_0254 LM5923_0255 rpoA rplQ TRUE 0.921 17.000 0.873 1.000 N NA
 10383543 10383544 LM5923_0255 LM5923_0256 rplQ   FALSE 0.036 208.000 0.000 NA   NA
 10383545 10383546 LM5923_0257 LM5923_0258     FALSE 0.273 119.000 0.238 1.000   NA
 10383547 10383548 LM5923_0259 LM5923_0260     TRUE 0.998 -24.000 0.713 0.028 Y NA
 10383548 10383549 LM5923_0260 LM5923_0261     TRUE 0.987 3.000 0.044 1.000 Y NA
 10383549 10383550 LM5923_0261 LM5923_0262   truA TRUE 0.882 6.000 0.049 1.000 N NA
 10383550 10383551 LM5923_0262 LM5923_0263 truA rplM FALSE 0.362 195.000 0.052 1.000 Y NA
 10383551 10383552 LM5923_0263 LM5923_0264 rplM rpsI TRUE 0.990 22.000 0.601 0.020 Y NA
 10383554 10383555 LM5923_0266 LM5923_0267     TRUE 0.838 22.000 0.250 1.000   NA
 10383557 10383558 LM5923_0269 LM5923_0270     TRUE 0.728 18.000 0.000 NA   NA
 10383558 10383559 LM5923_0270 LM5923_rRNA01     FALSE 0.063 171.000 0.000 NA   NA
 10383559 10383560 LM5923_rRNA01 LM5923_tRNA02     FALSE 0.111 128.000 0.000 NA   NA
 10383560 10383561 LM5923_tRNA02 LM5923_tRNA03     FALSE 0.334 47.000 0.000 NA   NA
 10383561 10383562 LM5923_tRNA03 LM5923_rRNA02     FALSE 0.061 173.000 0.000 NA   NA
 10383562 10383563 LM5923_rRNA02 LM5923_rRNA03     FALSE 0.168 81.000 0.000 NA   NA
 10383563 10383564 LM5923_rRNA03 LM5923_0271     FALSE 0.005 620.000 0.000 NA   NA
 10383564 10383565 LM5923_0271 LM5923_0272     TRUE 0.979 -3.000 0.848 1.000   NA
 10383565 10383566 LM5923_0272 LM5923_0273   clpC TRUE 0.709 29.000 0.425 1.000 N NA
 10383566 10383567 LM5923_0273 LM5923_0274 clpC   TRUE 0.547 146.000 0.062 1.000 Y NA
 10383567 10383568 LM5923_0274 LM5923_0275     FALSE 0.154 134.000 0.056 NA   NA
 10383568 10383569 LM5923_0275 LM5923_0276   ispD TRUE 0.798 20.000 0.108 NA   NA
 10383569 10383570 LM5923_0276 LM5923_0277 ispD ispF TRUE 0.994 -7.000 0.419 1.000 Y NA
 10383570 10383571 LM5923_0277 LM5923_0278 ispF gltX TRUE 0.793 19.000 0.076 1.000 N NA
 10383571 10383572 LM5923_0278 LM5923_0279 gltX cysE FALSE 0.009 398.000 0.008 1.000 N NA
 10383572 10383573 LM5923_0279 LM5923_0280 cysE cysS TRUE 0.956 7.000 0.035 0.053 N NA
 10383573 10383574 LM5923_0280 LM5923_0281 cysS   TRUE 0.932 4.000 0.129 1.000   NA
 10383574 10383575 LM5923_0281 LM5923_0282     TRUE 0.988 0.000 0.150 0.004   NA
 10383575 10383576 LM5923_0282 LM5923_0283     TRUE 0.919 3.000 0.109 NA   NA
 10383576 10383577 LM5923_0283 LM5923_0284   sigH FALSE 0.333 81.000 0.361 NA   NA
 10383577 10383578 LM5923_0284 LM5923_0285 sigH secE FALSE 0.018 273.000 0.000 1.000 N NA
 10383578 10383579 LM5923_0285 LM5923_0286 secE nusG FALSE 0.322 130.000 0.843 1.000 N NA
 10383579 10383580 LM5923_0286 LM5923_0287 nusG   FALSE 0.355 55.000 0.011 NA   NA
 10383580 10383581 LM5923_0287 LM5923_0288   rplK FALSE 0.138 127.000 0.009 NA   NA
 10383581 10383582 LM5923_0288 LM5923_0289 rplK rplA TRUE 0.973 40.000 0.838 0.027 Y NA
 10383582 10383583 LM5923_0289 LM5923_0290 rplA rplJ TRUE 0.491 248.000 0.302 0.027 Y NA
 10383583 10383584 LM5923_0290 LM5923_0291 rplJ rplL TRUE 0.931 79.000 0.884 0.020 Y NA
 10383584 10383585 LM5923_0291 LM5923_0292 rplL   FALSE 0.076 158.000 0.000 NA   NA
 10383585 10383586 LM5923_0292 LM5923_0293     FALSE 0.154 115.000 0.010 NA   NA
 10383586 10383587 LM5923_0293 LM5923_0294     FALSE 0.010 347.000 0.000 NA   NA
 10383587 10383588 LM5923_0294 LM5923_0295     FALSE 0.232 145.000 0.538 NA   NA
 10383588 10383589 LM5923_0295 LM5923_0296     FALSE 0.192 138.000 0.296 1.000 N NA
 10383589 10383590 LM5923_0296 LM5923_0297     TRUE 0.992 18.000 0.690 0.038 Y NA
 10383590 10383591 LM5923_0297 LM5923_0298     TRUE 0.997 2.000 0.793 0.038 Y NA
 10383591 10383592 LM5923_0298 LM5923_0299     TRUE 0.971 15.000 0.000 1.000 Y NA
 10383592 10383593 LM5923_0299 LM5923_0300     TRUE 0.995 1.000 0.000 0.012 Y NA
 10383593 10383594 LM5923_0300 LM5923_0301   rpoB FALSE 0.005 557.000 0.000 1.000 N NA
 10383594 10383595 LM5923_0301 LM5923_0302 rpoB rpoC TRUE 0.843 171.000 0.851 0.002 Y NA
 10383595 10383596 LM5923_0302 LM5923_0303 rpoC   FALSE 0.283 77.000 0.010 1.000   NA
 10383596 10383597 LM5923_0303 LM5923_0304     TRUE 0.525 66.000 0.458 1.000   NA
 10383597 10383598 LM5923_0304 LM5923_0305   inlG FALSE 0.026 274.000 0.000 1.000   NA
 10383598 10383599 LM5923_0305 LM5923_0306 inlG inlC2 TRUE 0.532 138.000 0.333 0.020   NA
 10383599 10383600 LM5923_0306 LM5923_0307 inlC2 inlD FALSE 0.278 208.000 0.333 0.020   NA
 10383600 10383601 LM5923_0307 LM5923_0308 inlD inlE FALSE 0.184 209.000 0.000 0.020   NA
 10383601 10383602 LM5923_0308 LM5923_0309 inlE   FALSE 0.283 136.000 0.455 1.000   NA
 10383602 10383603 LM5923_0309 LM5923_0310     FALSE 0.185 148.000 0.364 1.000 N NA
 10383603 10383604 LM5923_0310 LM5923_0311     TRUE 0.919 7.000 0.545 NA N NA
 10383604 10383605 LM5923_0311 LM5923_0312     TRUE 0.399 72.000 0.647 NA N NA
 10383605 10383606 LM5923_0312 LM5923_0313     FALSE 0.351 84.000 0.529 1.000 N NA
 10383607 10383608 LM5923_0314 LM5923_0315     TRUE 0.927 4.000 0.265 NA   NA
 10383608 10383609 LM5923_0315 LM5923_0316     TRUE 0.414 121.000 0.917 1.000   NA
 10383611 10383612 LM5923_0318 LM5923_0319     FALSE 0.021 259.000 0.000 NA   NA
 10383612 10383613 LM5923_0319 LM5923_0320     TRUE 0.895 17.000 0.308 1.000   NA
 10383616 10383617 LM5923_0323 LM5923_0324     TRUE 0.954 -7.000 0.240 1.000 N NA
 10383618 10383619 LM5923_0325 LM5923_0326     FALSE 0.125 162.000 0.169 NA   NA
 10383619 10383620 LM5923_0326 LM5923_0327     TRUE 0.911 -28.000 0.000 NA   NA
 10383620 10383621 LM5923_0327 LM5923_0328     TRUE 0.542 26.000 0.000 NA   NA
 10383621 10383622 LM5923_0328 LM5923_0329     TRUE 0.995 -3.000 0.846 1.000 Y NA
 10383622 10383623 LM5923_0329 LM5923_0330     TRUE 0.986 15.000 0.880 NA Y NA
 10383624 10383625 LM5923_0331 LM5923_0332     FALSE 0.031 213.000 0.000 1.000 N NA
 10383625 10383626 LM5923_0332 LM5923_0333     TRUE 0.684 185.000 0.597 0.086 Y NA
 10383626 10383627 LM5923_0333 LM5923_0334     TRUE 0.967 -3.000 0.575 NA   NA
 10383627 10383628 LM5923_0334 LM5923_0335     TRUE 0.965 3.000 0.890 NA   NA
 10383628 10383629 LM5923_0335 LM5923_0336     FALSE 0.207 120.000 0.176 NA   NA
 10383629 10383630 LM5923_0336 LM5923_0337     FALSE 0.221 98.000 0.030 1.000   NA
 10383630 10383631 LM5923_0337 LM5923_0338     FALSE 0.005 675.000 0.000 NA   NA
 10383633 10383634 LM5923_0340 LM5923_0341     FALSE 0.034 211.000 0.000 NA   NA
 10383635 10383636 LM5923_0342 LM5923_0343     TRUE 0.505 99.000 0.348 0.037 N NA
 10383636 10383637 LM5923_0343 LM5923_0344     TRUE 0.996 5.000 0.565 0.032 Y NA
 10383637 10383638 LM5923_0344 LM5923_0345     TRUE 0.985 17.000 0.786 1.000 Y NA
 10383638 10383639 LM5923_0345 LM5923_0346     TRUE 0.995 -7.000 0.714 1.000 Y NA
 10383640 10383641 LM5923_0347 LM5923_0348     TRUE 0.660 36.000 0.455 NA   NA
 10383641 10383642 LM5923_0348 LM5923_0349     FALSE 0.037 206.000 0.000 NA   NA
 10383642 10383643 LM5923_0349 LM5923_0350     TRUE 0.911 -43.000 0.000 NA   NA
 10383643 10383644 LM5923_0350 LM5923_0351     TRUE 0.958 -12.000 0.087 1.000   NA
 10383644 10383645 LM5923_0351 LM5923_0352     FALSE 0.042 223.000 0.000 1.000   NA
 10383645 10383646 LM5923_0352 LM5923_0353     TRUE 0.932 -7.000 0.029 1.000 N NA
 10383646 10383647 LM5923_0353 LM5923_0354     TRUE 0.997 -3.000 0.044 0.005 Y NA
 10383647 10383648 LM5923_0354 LM5923_0355     TRUE 0.997 -3.000 0.142 0.005 Y NA
 10383650 10383651 LM5923_0357 LM5923_0358     FALSE 0.087 184.000 0.094 NA   NA
 10383653 10383654 LM5923_0360 LM5923_0361     FALSE 0.029 261.000 0.000 1.000   NA
 10383654 10383655 LM5923_0361 LM5923_0362     TRUE 0.514 164.000 0.778 0.021   NA
 10383655 10383656 LM5923_0362 LM5923_0363     FALSE 0.033 307.000 0.200 1.000   NA
 10383656 10383657 LM5923_0363 LM5923_0364     FALSE 0.298 138.000 0.800 NA   NA
 10383659 10383660 LM5923_0366 LM5923_0367   inlI FALSE 0.007 429.000 0.000 NA   NA
 10383660 10383661 LM5923_0367 LM5923_0368 inlI   FALSE 0.031 221.000 0.000 NA   NA
 10383661 10383662 LM5923_0368 LM5923_0369     FALSE 0.024 248.000 0.000 NA   NA
 10383662 10383663 LM5923_0369 LM5923_0370     FALSE 0.102 136.000 0.000 NA   NA
 10383663 10383664 LM5923_0370 LM5923_0371     FALSE 0.288 105.000 0.500 NA   NA
 10383664 10383665 LM5923_0371 LM5923_0372     FALSE 0.299 79.000 0.200 NA   NA
 10383665 10383666 LM5923_0372 LM5923_0373     FALSE 0.168 169.000 0.500 NA   NA
 10383666 10383667 LM5923_0373 LM5923_0374     FALSE 0.028 229.000 0.000 NA   NA
 10383668 10383669 LM5923_0375 LM5923_0376     TRUE 0.373 66.000 0.167 NA   NA
 10383669 10383670 LM5923_0376 LM5923_0377     TRUE 0.993 2.000 0.750 1.000 Y NA
 10383670 10383671 LM5923_0377 LM5923_0378     TRUE 0.481 47.000 0.192 1.000 N NA
 10383671 10383672 LM5923_0378 LM5923_0379     TRUE 0.737 24.000 0.212 1.000 N NA
 10383672 10383673 LM5923_0379 LM5923_0380     TRUE 0.986 7.000 0.208 1.000 Y NA
 10383673 10383674 LM5923_0380 LM5923_0381     TRUE 0.987 4.000 0.147 1.000 Y NA
 10383674 10383675 LM5923_0381 LM5923_0382     TRUE 0.989 22.000 0.162 0.003 Y NA
 10383675 10383676 LM5923_0382 LM5923_0383     TRUE 0.867 22.000 0.667 NA   NA
 10383676 10383677 LM5923_0383 LM5923_0384     TRUE 0.931 16.000 0.889 NA   NA
 10383677 10383678 LM5923_0384 LM5923_0385     TRUE 0.386 85.000 0.667 NA   NA
 10383679 10383680 LM5923_0386 LM5923_0387     TRUE 0.441 66.000 0.182 1.000   NA
 10383682 10383683 LM5923_0389 LM5923_0390     FALSE 0.341 174.000 0.095 0.023   NA
 10383683 10383684 LM5923_0390 LM5923_0391     FALSE 0.114 199.000 0.308 1.000   NA
 10383684 10383685 LM5923_0391 LM5923_0392     TRUE 0.994 14.000 0.692 0.032 Y NA
 10383685 10383686 LM5923_0392 LM5923_0393     TRUE 0.995 0.000 0.846 1.000 Y NA
 10383686 10383687 LM5923_0393 LM5923_0394     TRUE 0.878 57.000 0.500 1.000 Y NA
 10383688 10383689 LM5923_0395 LM5923_0396     FALSE 0.110 129.000 0.000 NA   NA
 10383689 10383690 LM5923_0396 LM5923_0397     TRUE 0.984 12.000 0.393 NA Y NA
 10383691 10383692 LM5923_0398 LM5923_0399     TRUE 0.989 -3.000 0.040 NA Y NA
 10383692 10383693 LM5923_0399 LM5923_0400     TRUE 0.981 18.000 0.812 NA Y NA
 10383693 10383694 LM5923_0400 LM5923_0401     FALSE 0.217 73.000 0.072 NA N NA
 10383694 10383695 LM5923_0401 LM5923_0402     FALSE 0.166 97.000 0.013 NA   NA
 10383695 10383696 LM5923_0402 LM5923_0403     TRUE 0.467 37.000 0.013 NA   NA
 10383698 10383699 LM5923_0405 LM5923_0406     TRUE 0.996 -7.000 0.857 1.000 Y NA
 10383699 10383700 LM5923_0406 LM5923_0407     TRUE 0.993 18.000 0.846 0.032 Y NA
 10383700 10383701 LM5923_0407 LM5923_0408     FALSE 0.240 89.000 0.167 NA   NA
 10383703 10383704 LM5923_0410 LM5923_0411     FALSE 0.032 219.000 0.000 NA   NA
 10383704 10383705 LM5923_0411 LM5923_0412     TRUE 0.728 18.000 0.000 NA   NA
 10383705 10383706 LM5923_0412 LM5923_0413     FALSE 0.066 168.000 0.000 NA   NA
 10383706 10383707 LM5923_0413 LM5923_0414     FALSE 0.042 200.000 0.000 NA   NA
 10383709 10383710 LM5923_0416 LM5923_0417     TRUE 0.857 13.000 0.071 1.000 N NA
 10383710 10383711 LM5923_0417 LM5923_0418     TRUE 0.974 17.000 0.109 1.000 Y NA
 10383711 10383712 LM5923_0418 LM5923_0419     TRUE 0.873 10.000 0.064 1.000 N NA
 10383712 10383713 LM5923_0419 LM5923_0420     FALSE 0.163 134.000 0.081 NA   NA
 10383713 10383714 LM5923_0420 LM5923_0421     FALSE 0.262 94.000 0.286 NA   NA
 10383716 10383717 LM5923_0423 LM5923_0424     FALSE 0.224 168.000 0.846 NA   NA
 10383717 10383718 LM5923_0424 LM5923_0425     TRUE 0.940 -3.000 0.086 NA   NA
 10383718 10383719 LM5923_0425 LM5923_0426     TRUE 0.536 35.000 0.062 NA   NA
 10383719 10383720 LM5923_0426 LM5923_0427     FALSE 0.228 144.000 0.500 NA   NA
 10383720 10383721 LM5923_0427 LM5923_0428     TRUE 0.595 38.000 0.300 NA   NA
 10383723 10383724 LM5923_0430 LM5923_0431     FALSE 0.109 170.000 0.120 NA   NA
 10383724 10383725 LM5923_0431 LM5923_0432     TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.031 Y NA
 10383725 10383726 LM5923_0432 LM5923_0433     TRUE 0.997 4.000 0.800 0.036 Y NA
 10383726 10383727 LM5923_0433 LM5923_0434     TRUE 0.967 22.000 0.300 1.000 Y NA
 10383727 10383728 LM5923_0434 LM5923_0435     TRUE 0.592 34.000 0.207 1.000 N NA
 10383728 10383729 LM5923_0435 LM5923_0436     FALSE 0.220 126.000 0.276 NA   NA
 10383729 10383730 LM5923_0436 LM5923_0437     TRUE 0.977 -9.000 0.846 NA   NA
 10383730 10383731 LM5923_0437 LM5923_0438     FALSE 0.301 109.000 0.550 NA   NA
 10383731 10383732 LM5923_0438 LM5923_0439     TRUE 0.843 16.000 0.110 1.000 N NA
 10383732 10383733 LM5923_0439 LM5923_0440     TRUE 0.398 69.000 0.120 1.000   NA
 10383733 10383734 LM5923_0440 LM5923_0441     TRUE 0.903 13.000 0.333 NA   NA
 10383734 10383735 LM5923_0441 LM5923_0442     FALSE 0.053 227.000 0.167 NA   NA
 10383736 10383737 LM5923_0443 LM5923_0444     FALSE 0.042 200.000 0.000 NA   NA
 10383738 10383739 LM5923_0445 LM5923_0446     TRUE 0.639 27.000 0.066 NA   NA
 10383739 10383740 LM5923_0446 LM5923_0447     FALSE 0.013 294.000 0.000 1.000 N NA
 10383740 10383741 LM5923_0447 LM5923_0448     FALSE 0.208 154.000 0.571 1.000 N NA
 10383741 10383742 LM5923_0448 LM5923_0449     TRUE 0.933 2.000 0.040 1.000   NA
 10383743 10383744 LM5923_0450 LM5923_0451     FALSE 0.333 80.000 0.333 NA   NA
 10383746 10383747 LM5923_0453 LM5923_0454   lstR TRUE 0.960 -3.000 0.389 NA   NA
 10383747 10383748 LM5923_0454 LM5923_0455 lstR   TRUE 0.928 3.000 0.200 NA   NA
 10383748 10383749 LM5923_0455 LM5923_0456     FALSE 0.094 180.000 0.150 1.000 N NA
 10383750 10383751 LM5923_0457 LM5923_0458     TRUE 0.980 0.000 0.222 0.036 N NA
 10383751 10383752 LM5923_0458 LM5923_0459     TRUE 0.996 -3.000 0.000 0.031 Y NA
 10383752 10383753 LM5923_0459 LM5923_0460     TRUE 0.995 13.000 0.714 0.036 Y NA
 10383753 10383754 LM5923_0460 LM5923_0461     TRUE 0.984 16.000 0.600 1.000 Y NA
 10383756 10383757 LM5923_0463 LM5923_0464     TRUE 0.902 14.000 0.200 1.000   NA
 10383757 10383758 LM5923_0464 LM5923_0465     FALSE 0.016 285.000 0.000 NA   NA
 10383758 10383759 LM5923_0465 LM5923_0466   inlA FALSE 0.014 298.000 0.000 NA   NA
 10383759 10383760 LM5923_0466 LM5923_0467 inlA inlB TRUE 0.667 85.000 0.375 0.019   NA
 10383762 10383763 LM5923_0469 LM5923_0470     FALSE 0.099 138.000 0.000 NA   NA
 10383767 10383768 LM5923_0474 LM5923_0475     FALSE 0.228 137.000 0.407 NA   NA
 10383768 10383769 LM5923_0475 LM5923_0476     FALSE 0.031 220.000 0.000 NA   NA
 10383769 10383770 LM5923_0476 LM5923_0477     FALSE 0.025 244.000 0.000 NA   NA
 10383770 10383771 LM5923_0477 LM5923_0478     FALSE 0.011 274.000 0.000 NA N NA
 10383771 10383772 LM5923_0478 LM5923_0479     TRUE 0.569 55.000 0.600 1.000 N NA
 10383772 10383773 LM5923_0479 LM5923_0480     TRUE 0.717 97.000 0.400 1.000 Y NA
 10383773 10383774 LM5923_0480 LM5923_0481     TRUE 0.936 12.000 0.667 NA   NA
 10383774 10383775 LM5923_0481 LM5923_0482     FALSE 0.014 298.000 0.000 NA   NA
 10383776 10383777 LM5923_0483 LM5923_0484     TRUE 0.817 21.000 0.250 NA   NA
 10383777 10383778 LM5923_0484 LM5923_0485     FALSE 0.202 118.000 0.119 NA   NA
 10383778 10383779 LM5923_0485 LM5923_0486     TRUE 0.969 -3.000 0.642 NA   NA
 10383779 10383780 LM5923_0486 LM5923_0487     TRUE 0.951 5.000 0.714 NA   NA
 10383781 10383782 LM5923_0488 LM5923_0489     FALSE 0.208 134.000 0.522 NA N NA
 10383782 10383783 LM5923_0489 LM5923_0490     TRUE 0.965 1.000 0.731 NA   NA
 10383783 10383784 LM5923_0490 LM5923_0491     TRUE 0.948 -7.000 0.115 NA   NA
 10383784 10383785 LM5923_0491 LM5923_0492     FALSE 0.005 564.000 0.000 NA   NA
 10383785 10383786 LM5923_0492 LM5923_0493     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 10383786 10383787 LM5923_0493 LM5923_0494     FALSE 0.005 707.000 0.000 NA   NA
 10383787 10383788 LM5923_0494 LM5923_0496     FALSE 0.005 616.000 0.000 NA   NA
 10383790 10383791 LM5923_0498 LM5923_0499     FALSE 0.006 469.000 0.000 NA   NA
 10383791 10383792 LM5923_0499 LM5923_0500     FALSE 0.014 300.000 0.000 NA   NA
 10383792 10383793 LM5923_0500 LM5923_0501     FALSE 0.011 333.000 0.000 NA   NA
 10383793 10383794 LM5923_0501 LM5923_0502     FALSE 0.012 326.000 0.000 NA   NA
 10383794 10383795 LM5923_0502 LM5923_0503     FALSE 0.254 110.000 0.344 NA   NA
 10383795 10383796 LM5923_0503 LM5923_0504     FALSE 0.103 151.000 0.009 NA   NA
 10383796 10383797 LM5923_0504 LM5923_0505     FALSE 0.176 90.000 0.011 NA   NA
 10383797 10383798 LM5923_0505 LM5923_0506     FALSE 0.209 158.000 0.600 NA   NA
 10383798 10383799 LM5923_0506 LM5923_0507     FALSE 0.302 169.000 0.014 0.031   NA
 10383799 10383800 LM5923_0507 LM5923_0508   rpmF FALSE 0.285 65.000 0.012 1.000 N NA
 10383800 10383801 LM5923_0508 LM5923_0509 rpmF   FALSE 0.165 92.000 0.011 1.000 N NA
 10383803 10383804 LM5923_0511 LM5923_0512   aroE FALSE 0.203 100.000 0.143 1.000 N NA
 10383804 10383805 LM5923_0512 LM5923_0513 aroE aroD TRUE 0.806 66.000 0.113 1.000 Y NA
 10383806 10383807 LM5923_0514 LM5923_0515     TRUE 0.505 75.000 0.667 1.000   NA
 10383808 10383809 LM5923_0516 LM5923_0517     TRUE 0.473 186.000 0.379 1.000 Y NA
 10383809 10383810 LM5923_0517 LM5923_0518     FALSE 0.321 75.000 0.196 NA   NA
 10383812 10383813 LM5923_0520 LM5923_0521     TRUE 0.996 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 10383813 10383814 LM5923_0521 LM5923_0522     TRUE 0.996 7.000 0.889 0.031 Y NA
 10383814 10383815 LM5923_0522 LM5923_0523     FALSE 0.341 109.000 0.800 1.000 N NA
 10383815 10383816 LM5923_0523 LM5923_0524     TRUE 0.946 4.000 0.556 1.000 N NA
 10383816 10383817 LM5923_0524 LM5923_0525     TRUE 0.484 28.000 0.000 1.000 N NA
 10383817 10383818 LM5923_0525 LM5923_0526     TRUE 0.744 17.000 0.000 NA   NA
 10383818 10383819 LM5923_0526 LM5923_0527     TRUE 0.913 11.000 0.321 NA   NA
 10383819 10383820 LM5923_0527 LM5923_0528     TRUE 0.960 -3.000 0.429 1.000 N NA
 10383820 10383821 LM5923_0528 LM5923_0529     TRUE 0.891 16.000 0.417 1.000 N NA
 10383821 10383822 LM5923_0529 LM5923_0530     TRUE 0.987 15.000 0.000 0.048 Y NA
 10383822 10383823 LM5923_0530 LM5923_0531     FALSE 0.090 140.000 0.000 1.000 N NA
 10383823 10383824 LM5923_0531 LM5923_0532     FALSE 0.004 1107.000 0.000 NA   NA
 11481332 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8297.000 0.000 NA   NA
 11623695 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8297.000 0.000 NA   NA
 11766087 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8297.000 0.000 NA   NA
 11481333 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8326.000 0.000 NA   NA
 11623696 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8326.000 0.000 NA   NA
 11766088 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8326.000 0.000 NA   NA
 11481334 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8361.000 0.000 NA   NA
 11623697 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8361.000 0.000 NA   NA
 11766089 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8361.000 0.000 NA   NA
 11481335 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8390.000 0.000 NA   NA
 11623698 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8390.000 0.000 NA   NA
 11766090 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8390.000 0.000 NA   NA
 11481336 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8426.000 0.000 NA   NA
 11623699 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8426.000 0.000 NA   NA
 11766091 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8426.000 0.000 NA   NA
 11481337 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8455.000 0.000 NA   NA
 11623700 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8455.000 0.000 NA   NA
 11766092 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8455.000 0.000 NA   NA
 11481338 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8490.000 0.000 NA   NA
 11623701 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8490.000 0.000 NA   NA
 11766093 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8490.000 0.000 NA   NA
 11481339 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8519.000 0.000 NA   NA
 11623702 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8519.000 0.000 NA   NA
 11766094 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8519.000 0.000 NA   NA
 11481340 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8553.000 0.000 NA   NA
 11623703 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8553.000 0.000 NA   NA
 11766095 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8553.000 0.000 NA   NA
 11481341 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8582.000 0.000 NA   NA
 11623704 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8582.000 0.000 NA   NA
 11766096 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8582.000 0.000 NA   NA
 11481342 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8617.000 0.000 NA   NA
 11623705 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8617.000 0.000 NA   NA
 11766097 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8617.000 0.000 NA   NA
 11481343 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8646.000 0.000 NA   NA
 11623706 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8646.000 0.000 NA   NA
 11766098 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8646.000 0.000 NA   NA
 11481344 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8682.000 0.000 NA   NA
 11623707 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8682.000 0.000 NA   NA
 11766099 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8682.000 0.000 NA   NA
 11481345 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8711.000 0.000 NA   NA
 11623708 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8711.000 0.000 NA   NA
 11766100 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8711.000 0.000 NA   NA
 11481346 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8746.000 0.000 NA   NA
 11623709 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8746.000 0.000 NA   NA
 11766101 10383814   LM5923_0522     FALSE NA 8746.000 0.000 NA   NA
 10383824 10383825 LM5923_0532 LM5923_0533     FALSE 0.259 89.000 0.231 NA   NA
 10383826 10383827 LM5923_0534 LM5923_0535     TRUE 0.902 4.000 0.058 NA   NA
 10383828 10383829 LM5923_0536 LM5923_0537     FALSE 0.266 98.000 0.167 1.000   NA
 10383830 10383831 LM5923_0538 LM5923_0539     FALSE 0.125 121.000 0.059 NA N NA
 10383831 10383832 LM5923_0539 LM5923_0540     FALSE 0.017 281.000 0.000 NA   NA
 10383833 10383834 LM5923_0541 LM5923_0542     FALSE 0.256 129.000 0.268 1.000   NA
 10383834 10383835 LM5923_0542 LM5923_0543     FALSE 0.055 203.000 0.000 1.000   NA
 10383835 10383836 LM5923_0543 LM5923_0544     TRUE 0.924 48.000 0.028 0.052 Y NA
 10383836 10383837 LM5923_0544 LM5923_0545     TRUE 0.996 -3.000 0.011 0.052 Y NA
 10383837 10383838 LM5923_0545 LM5923_0546     TRUE 0.470 84.000 0.062 0.052 N NA
 10383839 10383840 LM5923_0547 LM5923_0548     FALSE 0.234 88.000 0.167 1.000 N NA
 10383841 10383842 LM5923_0549 LM5923_0550     FALSE 0.244 107.000 0.314 NA   NA
 10383846 10383847 LM5923_0554 LM5923_0555     TRUE 0.954 -7.000 0.219 NA   NA
 10383847 10383848 LM5923_0555 LM5923_0556     TRUE 0.895 11.000 0.180 NA   NA
 10383848 10383849 LM5923_0556 LM5923_0557     TRUE 0.869 16.000 0.230 NA   NA
 10383849 10383850 LM5923_0557 LM5923_0558     TRUE 0.903 13.000 0.333 NA   NA
 10383850 10383851 LM5923_0558 LM5923_0559     TRUE 0.504 60.000 0.244 1.000   NA
 10383851 10383852 LM5923_0559 LM5923_0560     FALSE 0.323 78.000 0.074 1.000   NA
 10383852 10383853 LM5923_0560 LM5923_0561     TRUE 0.885 19.000 0.569 NA   NA
 10383855 10383856 LM5923_0563 LM5923_0564     FALSE 0.247 104.000 0.360 1.000 N NA
 10383856 10383857 LM5923_0564 LM5923_0565     TRUE 0.986 -34.000 0.000 0.006   NA
 10383860 10383861 LM5923_0568 LM5923_0569     FALSE 0.225 111.000 0.258 1.000 N NA
 10383861 10383862 LM5923_0569 LM5923_0570     TRUE 0.989 19.000 0.258 0.030 Y NA
 10383862 10383863 LM5923_0570 LM5923_0571     TRUE 0.989 21.000 0.500 0.030 Y NA
 10383863 10383864 LM5923_0571 LM5923_0572     TRUE 0.812 25.000 0.625 NA   NA
 10383864 10383865 LM5923_0572 LM5923_0573     TRUE 0.494 55.000 0.304 NA   NA
 10383865 10383866 LM5923_0573 LM5923_0574     FALSE 0.020 258.000 0.000 1.000 N NA
 10383867 10383868 LM5923_0575 LM5923_0576     TRUE 0.728 18.000 0.000 NA   NA
 10383868 10383869 LM5923_0576 LM5923_0577     TRUE 0.444 33.000 0.000 NA   NA
 10383869 10383870 LM5923_0577 LM5923_0578     TRUE 0.698 44.000 0.889 NA   NA
 10383870 10383871 LM5923_0578 LM5923_0579     TRUE 0.473 76.000 0.800 NA   NA
 10383873 10383874 LM5923_0581 LM5923_0582     FALSE 0.230 90.000 0.176 1.000 N NA
 10383874 10383875 LM5923_0582 LM5923_0583     FALSE 0.321 129.000 0.833 1.000 N NA
 10383875 10383876 LM5923_0583 LM5923_0584     TRUE 0.997 1.000 0.167 0.003 Y NA
 10383879 10383880 LM5923_0587 LM5923_0588   hisE FALSE 0.057 493.000 0.000 1.000 Y NA
 10383880 10383881 LM5923_0588 LM5923_0589 hisE   TRUE 0.997 1.000 0.152 0.005 Y NA
 10383881 10383882 LM5923_0589 LM5923_0590   hisF TRUE 0.998 -3.000 0.430 0.005 Y NA
 10383882 10383883 LM5923_0590 LM5923_0591 hisF hisA TRUE 0.997 -10.000 0.013 0.005 Y NA
 10383883 10383884 LM5923_0591 LM5923_0592 hisA hisH TRUE 0.997 -21.000 0.051 0.005 Y NA
 10383884 10383885 LM5923_0592 LM5923_0593 hisH hisB TRUE 0.997 1.000 0.125 0.005 Y NA
 10383885 10383886 LM5923_0593 LM5923_0594 hisB hisD TRUE 0.997 1.000 0.096 0.005 Y NA
 10383886 10383887 LM5923_0594 LM5923_0595 hisD hisG TRUE 0.998 -3.000 0.254 0.005 Y NA
 10383887 10383888 LM5923_0595 LM5923_0596 hisG hisZ TRUE 0.998 -3.000 0.239 0.005 Y NA
 10383893 10383894 LM5923_0601 LM5923_0602     TRUE 0.616 44.000 0.545 1.000 N NA
 10383894 10383895 LM5923_0602 LM5923_0603     FALSE 0.007 430.000 0.000 NA   NA
 10383896 10383897 LM5923_0604 LM5923_0605     TRUE 0.907 14.000 0.433 NA   NA
 10383898 10383899 LM5923_0606 LM5923_0607     TRUE 0.886 16.000 0.345 NA   NA
 10383900 10383901 LM5923_0608 LM5923_0609   iap FALSE 0.236 88.000 0.125 NA   NA
 10383902 10383903 LM5923_0610 LM5923_0611     FALSE 0.234 116.000 0.256 NA   NA
 10383903 10383904 LM5923_0611 LM5923_0612     FALSE 0.021 259.000 0.000 NA   NA
 10383904 10383905 LM5923_0612 LM5923_0613     TRUE 0.477 68.000 0.556 NA   NA
 10383905 10383906 LM5923_0613 LM5923_0614     TRUE 0.898 18.000 0.615 NA   NA
 10383906 10383907 LM5923_0614 LM5923_0615     FALSE 0.158 113.000 0.014 NA   NA
 10383907 10383908 LM5923_0615 LM5923_0616     FALSE 0.128 138.000 0.015 NA   NA
 10383908 10383909 LM5923_0616 LM5923_0617     TRUE 0.965 0.000 0.688 NA   NA
 10383909 10383910 LM5923_0617 LM5923_0618     TRUE 0.961 -3.000 0.210 1.000   NA
 10383910 10383911 LM5923_0618 LM5923_0619     FALSE 0.196 128.000 0.194 NA   NA
 10383911 10383912 LM5923_0619 LM5923_0620     FALSE 0.028 228.000 0.000 NA   NA
 10383913 10383914 LM5923_0621 LM5923_0622 metX   TRUE 0.971 17.000 0.027 1.000 Y NA
 10383916 10383917 LM5923_0624 LM5923_0625     FALSE 0.294 76.000 0.117 NA   NA
 10383918 10383919 LM5923_0626 LM5923_0627     TRUE 0.949 -7.000 0.133 NA   NA
 10383919 10383920 LM5923_0627 LM5923_0628     TRUE 0.911 -7.000 0.000 NA   NA
 10383920 10383921 LM5923_0628 LM5923_0629     FALSE 0.200 103.000 0.115 NA   NA
 10383922 10383923 LM5923_0630 LM5923_0631     TRUE 0.666 52.000 1.000 NA   NA
 10383923 10383924 LM5923_0631 LM5923_0632     FALSE 0.138 147.000 0.077 NA   NA
 10383925 10383926 LM5923_0633 LM5923_0634     TRUE 0.924 8.000 0.419 1.000 N NA
 10383926 10383927 LM5923_0634 LM5923_0635     TRUE 0.998 -3.000 0.784 0.009 Y NA
 10383927 10383928 LM5923_0635 LM5923_0636     FALSE 0.156 116.000 0.159 NA N NA
 10383929 10383930 LM5923_0637 LM5923_0638   acpD FALSE 0.099 161.000 0.000 1.000   NA
 10383931 10383932 LM5923_0639 LM5923_0640     TRUE 0.950 -3.000 0.250 1.000 N NA
 10383932 10383933 LM5923_0640 LM5923_0641     FALSE 0.232 96.000 0.222 1.000 N NA
 10383936 10383937 LM5923_0644 LM5923_0645     FALSE 0.350 80.000 0.389 NA   NA
 10383938 10383939 LM5923_0646 LM5923_0647     TRUE 0.442 56.000 0.185 NA   NA
 10383939 10383940 LM5923_0647 LM5923_0648     FALSE 0.232 97.000 0.204 NA   NA
 10383940 10383941 LM5923_0648 LM5923_0649     FALSE 0.328 86.000 0.440 NA   NA
 10383941 10383942 LM5923_0649 LM5923_0650     TRUE 0.934 16.000 1.000 NA   NA
 10383943 10383944 LM5923_0651 LM5923_0652     TRUE 0.727 31.000 0.353 1.000   NA
 10383944 10383945 LM5923_0652 LM5923_0653     FALSE 0.288 86.000 0.294 NA   NA
 10383946 10383947 LM5923_0654 LM5923_0655     FALSE 0.363 93.000 0.700 NA   NA
 10383947 10383948 LM5923_0655 LM5923_0656     FALSE 0.346 62.000 0.042 NA   NA
 10383948 10383949 LM5923_0656 LM5923_0657     FALSE 0.009 359.000 0.000 1.000 N NA
 10383949 10383950 LM5923_0657 LM5923_0658     TRUE 0.983 2.000 0.538 0.034 N NA
 10383950 10383951 LM5923_0658 LM5923_0659     TRUE 0.998 1.000 0.900 0.034 Y NA
 10383951 10383952 LM5923_0659 LM5923_0660     TRUE 0.992 15.000 0.320 0.034 Y NA
 10383952 10383953 LM5923_0660 LM5923_0661     TRUE 0.943 27.000 0.280 1.000 Y NA
 10383953 10383954 LM5923_0661 LM5923_0662     FALSE 0.339 90.000 0.350 1.000   NA
 10383954 10383955 LM5923_0662 LM5923_0663     FALSE 0.242 105.000 0.306 NA   NA
 10383955 10383956 LM5923_0663 LM5923_0664     TRUE 0.870 14.000 0.161 NA   NA
 10383958 10383959 LM5923_0665 LM5923_0666     TRUE 0.928 0.000 0.068 NA   NA
 10383959 10383960 LM5923_0666 LM5923_0667     FALSE 0.130 98.000 0.000 NA   NA
 10383960 10383961 LM5923_0667 LM5923_0668     FALSE 0.013 312.000 0.000 NA   NA
 10383961 10383962 LM5923_0668 LM5923_0669     FALSE 0.332 64.000 0.041 NA   NA
 10383962 10383963 LM5923_0669 LM5923_0670     FALSE 0.028 266.000 0.000 1.000   NA
 10383963 10383964 LM5923_0670 LM5923_0671     FALSE 0.134 96.000 0.000 NA   NA
 10383964 10383965 LM5923_0671 LM5923_0672     TRUE 0.911 -27.000 0.000 NA   NA
 10383965 10383966 LM5923_0672 LM5923_0673     TRUE 0.444 33.000 0.000 NA   NA
 10383968 10383969 LM5923_0675 LM5923_0676     FALSE 0.342 90.000 0.571 NA   NA
 10383971 10383972 LM5923_0678 LM5923_0679     TRUE 0.810 24.000 0.545 1.000 N NA
 10383972 10383973 LM5923_0679 LM5923_0680     TRUE 0.582 43.000 0.174 1.000   NA
 10383973 10383974 LM5923_0680 LM5923_0681     TRUE 0.559 46.000 0.174 1.000   NA
 10383975 10383976 LM5923_0682 LM5923_0683     TRUE 0.952 -13.000 0.183 NA   NA
 10383977 10383978 LM5923_0684 LM5923_0685     TRUE 0.413 68.000 0.333 NA   NA
 10383980 10383981 LM5923_0687 LM5923_0688     TRUE 0.410 52.000 0.052 NA   NA
 10383983 10383984 LM5923_0690 LM5923_0691     TRUE 0.911 -7.000 0.000 NA   NA
 10383985 10383986 LM5923_0692 LM5923_0693   thiD TRUE 0.449 63.000 0.143 1.000   NA
 10383986 10383987 LM5923_0693 LM5923_0694 thiD   TRUE 0.740 26.000 0.157 1.000   NA
 10383988 10383989 LM5923_0695 LM5923_0696     TRUE 0.945 -3.000 0.139 NA   NA
 10383989 10383990 LM5923_0696 LM5923_0697     TRUE 0.866 10.000 0.029 NA   NA
 10383990 10383991 LM5923_0697 LM5923_0698     FALSE 0.165 114.000 0.024 NA   NA
 10383991 10383992 LM5923_0698 LM5923_0699     TRUE 0.995 -7.000 0.688 1.000 Y NA
 10383992 10383993 LM5923_0699 LM5923_0700     FALSE 0.146 133.000 0.032 NA   NA
 10383993 10383994 LM5923_0700 LM5923_0701     TRUE 0.888 12.000 0.157 NA   NA
 10383994 10383995 LM5923_0701 LM5923_0702     TRUE 0.830 18.000 0.135 NA   NA
 10383995 10383996 LM5923_0702 LM5923_0703     FALSE 0.173 126.000 0.073 NA   NA
 10383996 10383997 LM5923_0703 LM5923_0704     FALSE 0.006 526.000 0.000 NA   NA
 10383997 10383998 LM5923_0704 LM5923_0705     FALSE 0.015 291.000 0.000 NA   NA
 10383999 10384000 LM5923_0706 LM5923_0708     TRUE 0.894 19.000 0.667 NA   NA
 10384001 10384002 LM5923_0709 LM5923_0710   fliP TRUE 0.944 -7.000 0.073 NA   NA
 10384002 10384003 LM5923_0710 LM5923_0711 fliP fliQ TRUE 0.994 13.000 0.162 0.003 Y NA
 10384003 10384004 LM5923_0711 LM5923_0712 fliQ fliR TRUE 0.995 3.000 0.181 0.084 Y NA
 10384004 10384005 LM5923_0712 LM5923_0713 fliR flhB TRUE 0.990 16.000 0.259 0.084 Y NA
 10384005 10384006 LM5923_0713 LM5923_0714 flhB flhA TRUE 0.959 47.000 0.207 0.003 Y NA
 10384006 10384007 LM5923_0714 LM5923_0715 flhA   TRUE 0.985 22.000 0.440 0.084 Y NA
 10384007 10384008 LM5923_0715 LM5923_0716   flgG TRUE 0.991 -3.000 0.045 1.000 Y NA
 10384008 10384009 LM5923_0716 LM5923_0717 flgG   TRUE 0.923 29.000 0.084 1.000 Y NA
 10384009 10384010 LM5923_0717 LM5923_0718     TRUE 0.688 25.000 0.092 NA   NA
 10384010 10384011 LM5923_0718 LM5923_0719     TRUE 0.629 27.000 0.050 NA   NA
 10384011 10384012 LM5923_0719 LM5923_0720   motB TRUE 0.993 -40.000 0.257 1.000 Y NA
 10384012 10384013 LM5923_0720 LM5923_0721 motB   TRUE 0.897 10.000 0.175 NA   NA
 10384013 10384014 LM5923_0721 LM5923_0722     TRUE 0.819 23.000 0.450 NA   NA
 10384014 10384015 LM5923_0722 LM5923_0723     TRUE 0.869 13.000 0.117 1.000 N NA
 10384015 10384016 LM5923_0723 LM5923_0724   flaA FALSE 0.205 238.000 0.000 1.000 Y NA
 10384016 10384017 LM5923_0724 LM5923_0725 flaA cheY FALSE 0.017 275.000 0.000 1.000 N NA
 10384017 10384018 LM5923_0725 LM5923_0726 cheY cheA TRUE 0.989 20.000 0.154 0.011 Y NA
 10384018 10384019 LM5923_0726 LM5923_0727 cheA   TRUE 0.995 10.000 0.059 0.004 Y NA
 10384019 10384020 LM5923_0727 LM5923_0728     FALSE 0.362 43.000 0.000 NA   NA
 10384020 10384021 LM5923_0728 LM5923_0729     TRUE 0.762 16.000 0.000 NA   NA
 10384021 10384022 LM5923_0729 LM5923_0730   flgD TRUE 0.936 2.000 0.064 1.000   NA
 10384022 10384023 LM5923_0730 LM5923_0731 flgD flgE TRUE 0.967 20.000 0.117 1.000 Y NA
 10384023 10384024 LM5923_0731 LM5923_0732 flgE   TRUE 0.975 14.000 0.293 0.007   NA
 10384024 10384025 LM5923_0732 LM5923_0733   fliM TRUE 0.958 21.000 0.079 0.002   NA
 10384025 10384026 LM5923_0733 LM5923_0734 fliM   TRUE 0.998 3.000 0.508 0.002 Y NA
 10384026 10384027 LM5923_0734 LM5923_0735     TRUE 0.888 6.000 0.052 NA   NA
 10384027 10384028 LM5923_0735 LM5923_0736     TRUE 0.876 23.000 0.917 NA   NA
 10384028 10384029 LM5923_0736 LM5923_0737     FALSE 0.188 107.000 0.083 NA   NA
 10384029 10384030 LM5923_0737 LM5923_0738     TRUE 0.883 10.000 0.076 NA   NA
 10384030 10384031 LM5923_0738 LM5923_0739   flgK TRUE 0.887 20.000 0.688 NA   NA
 10384031 10384032 LM5923_0739 LM5923_0740 flgK flgL TRUE 0.996 12.000 0.177 0.001 Y NA
 10384032 10384033 LM5923_0740 LM5923_0741 flgL fliD TRUE 0.985 12.000 0.292 1.000 Y NA
 10384033 10384034 LM5923_0741 LM5923_0742 fliD   TRUE 0.994 19.000 0.608 0.002 Y NA
 10384034 10384035 LM5923_0742 LM5923_0743     TRUE 0.949 -28.000 0.127 NA   NA
 10384035 10384036 LM5923_0743 LM5923_0744   flgB TRUE 0.756 21.000 0.040 NA   NA
 10384036 10384037 LM5923_0744 LM5923_0745 flgB flgC TRUE 0.997 12.000 0.804 0.004 Y NA
 10384037 10384038 LM5923_0745 LM5923_0746 flgC fliE TRUE 0.992 17.000 0.068 0.004 Y NA
 10384038 10384039 LM5923_0746 LM5923_0747 fliE fliF TRUE 0.918 68.000 0.076 0.007 Y NA
 10384039 10384040 LM5923_0747 LM5923_0748 fliF fliG TRUE 0.996 3.000 0.056 0.007 Y NA
 10384040 10384041 LM5923_0748 LM5923_0749 fliG fliH TRUE 0.967 -13.000 0.471 NA   NA
 10384041 10384042 LM5923_0749 LM5923_0750 fliH fliI TRUE 0.944 -3.000 0.129 NA   NA
 10384042 10384043 LM5923_0750 LM5923_0751 fliI   TRUE 0.827 17.000 0.076 NA   NA
 10384043 10384044 LM5923_0751 LM5923_0752     TRUE 0.857 14.000 0.083 NA   NA
 10384044 10384045 LM5923_0752 LM5923_0753     FALSE 0.212 122.000 0.211 NA   NA
 10384045 10384046 LM5923_0753 LM5923_0754     TRUE 0.951 0.000 0.342 NA   NA
 10384048 10384049 LM5923_0756 LM5923_0757     FALSE 0.159 162.000 0.400 1.000 N NA
 10384049 10384050 LM5923_0757 LM5923_0758     TRUE 0.910 13.000 0.391 NA   NA
 10384052 10384053 LM5923_0760 LM5923_0761     FALSE 0.153 101.000 0.005 NA   NA
 10384053 10384054 LM5923_0761 LM5923_0762     FALSE 0.150 113.000 0.014 1.000 N NA
 10384054 10384055 LM5923_0762 LM5923_0763     FALSE 0.227 83.000 0.049 NA   NA
 10384055 10384056 LM5923_0763 LM5923_0764     TRUE 0.864 14.000 0.111 NA   NA
 10384056 10384057 LM5923_0764 LM5923_0765     FALSE 0.091 145.000 0.000 NA   NA
 10384057 10384058 LM5923_0765 LM5923_0766     FALSE 0.013 310.000 0.000 NA   NA
 10384058 10384059 LM5923_0766 LM5923_0767     FALSE 0.023 252.000 0.000 NA   NA
 10384059 10384060 LM5923_0767 LM5923_0768     FALSE 0.016 330.000 0.000 1.000   NA
 10384062 10384063 LM5923_0770 LM5923_0771     TRUE 0.992 -3.000 0.107 1.000 Y NA
 10384063 10384064 LM5923_0771 LM5923_0772     TRUE 0.847 13.000 0.000 1.000   NA
 10384064 10384065 LM5923_0772 LM5923_0773     TRUE 0.674 24.000 0.000 1.000   NA
 10384065 10384066 LM5923_0773 LM5923_0774     TRUE 0.956 20.000 0.000 1.000 Y NA
 10384068 10384069 LM5923_0776 LM5923_0777     TRUE 0.974 -16.000 0.750 1.000 N NA
 10384069 10384070 LM5923_0777 LM5923_0778     TRUE 0.972 -3.000 0.750 NA   NA
 10384070 10384071 LM5923_0778 LM5923_0779     TRUE 0.912 15.000 0.538 NA   NA
 10384071 10384072 LM5923_0779 LM5923_0780     TRUE 0.708 29.000 0.385 NA   NA
 10384074 10384075 LM5923_0782 LM5923_0783     TRUE 0.380 107.000 1.000 NA   NA
 10384075 10384076 LM5923_0783 LM5923_0784     TRUE 0.935 -3.000 0.051 NA   NA
 10384076 10384077 LM5923_0784 LM5923_0785     TRUE 0.940 -7.000 0.051 NA   NA
 10384077 10384078 LM5923_0785 LM5923_0786     TRUE 0.594 55.000 0.667 NA   NA
 10384078 10384079 LM5923_0786 LM5923_0787     FALSE 0.211 96.000 0.100 NA   NA
 10384079 10384080 LM5923_0787 LM5923_0788     FALSE 0.218 126.000 0.267 NA   NA
 10384080 10384081 LM5923_0788 LM5923_0789     FALSE 0.350 81.000 0.409 NA   NA
 10384081 10384082 LM5923_0789 LM5923_0790     FALSE 0.213 115.000 0.175 NA   NA
 10384082 10384083 LM5923_0790 LM5923_0791     TRUE 0.976 -28.000 0.850 1.000 N NA
 10384083 10384084 LM5923_0791 LM5923_0792     TRUE 0.975 -7.000 0.791 NA   NA
 10384084 10384085 LM5923_0792 LM5923_0793     FALSE 0.209 127.000 0.233 NA   NA
 10384085 10384086 LM5923_0793 LM5923_0794     TRUE 0.966 -3.000 0.526 NA   NA
 10384086 10384087 LM5923_0794 LM5923_0795     TRUE 0.907 7.000 0.200 NA   NA
 10384087 10384088 LM5923_0795 LM5923_0796     TRUE 0.892 10.000 0.123 NA   NA
 10384088 10384089 LM5923_0796 LM5923_0797     FALSE 0.016 328.000 0.000 1.000   NA
 10384089 10384090 LM5923_0797 LM5923_0798     FALSE 0.357 66.000 0.010 1.000   NA
 10384090 10384091 LM5923_0798 LM5923_0799     TRUE 0.935 6.000 0.265 1.000   NA
 10384091 10384092 LM5923_0799 LM5923_0800     TRUE 0.417 153.000 0.111 0.025   NA
 10384092 10384093 LM5923_0800 LM5923_0801     TRUE 0.880 17.000 0.194 1.000   NA
 10384093 10384094 LM5923_0801 LM5923_0802     TRUE 0.995 12.000 0.583 0.034 Y NA
 10384094 10384095 LM5923_0802 LM5923_0803     TRUE 0.988 22.000 0.500 0.034 Y NA
 10384095 10384096 LM5923_0803 LM5923_0804     TRUE 0.983 4.000 0.000 1.000 Y NA
 10384098 10384099 LM5923_0806 LM5923_0807     TRUE 0.756 36.000 1.000 NA   NA
 10384101 10384102 LM5923_0809 LM5923_0810     TRUE 0.627 40.000 0.423 NA   NA
 10384104 10384105 LM5923_0812 LM5923_0813     FALSE 0.006 462.000 0.000 NA   NA
 10384108 10384109 LM5923_0816 LM5923_0817     TRUE 0.992 19.000 0.939 0.045 Y NA
 10384109 10384110 LM5923_0817 LM5923_0818     TRUE 0.672 174.000 0.234 0.045 Y NA
 10384110 10384111 LM5923_0818 LM5923_0819     TRUE 0.997 0.000 0.550 0.029 Y NA
 10384111 10384112 LM5923_0819 LM5923_0820     FALSE 0.055 287.000 0.000 0.045 N NA
 10384113 10384114 LM5923_0821 LM5923_0822     FALSE 0.113 193.000 0.421 1.000 N NA
 10384114 10384115 LM5923_0822 LM5923_0823     FALSE 0.020 262.000 0.000 NA   NA
 10384116 10384117 LM5923_0824 LM5923_0825     TRUE 0.668 27.000 0.018 1.000   NA
 10384118 10384119 LM5923_0826 LM5923_0827     FALSE 0.023 252.000 0.000 NA   NA
 10384120 10384121 LM5923_0828 LM5923_0829     FALSE 0.183 115.000 0.059 NA   NA
 10384121 10384122 LM5923_0829 LM5923_0830     FALSE 0.260 84.000 0.026 1.000   NA
 10384122 10384123 LM5923_0830 LM5923_0831     FALSE 0.164 107.000 0.028 NA   NA
 10384125 10384126 LM5923_0833 LM5923_0834     FALSE 0.009 356.000 0.000 1.000 N NA
 10384127 10384128 LM5923_0835 LM5923_0836     FALSE 0.142 152.000 0.155 NA   NA
 10384128 10384129 LM5923_0836 LM5923_0837     FALSE 0.225 128.000 0.113 1.000   NA
 10384130 10384131 LM5923_0838 LM5923_0839     TRUE 0.810 28.000 0.889 NA   NA
 10384132 10384133 LM5923_0840 LM5923_0841     TRUE 0.932 10.000 0.326 1.000   NA
 10384133 10384134 LM5923_0841 LM5923_0842     TRUE 0.998 0.000 0.928 0.034 Y NA
 10384134 10384135 LM5923_0842 LM5923_0843     TRUE 0.997 -3.000 0.492 0.034 Y NA
 10384135 10384136 LM5923_0843 LM5923_0844     TRUE 0.997 -3.000 0.253 0.034 Y NA
 10384136 10384137 LM5923_0844 LM5923_0845     FALSE 0.160 130.000 0.078 1.000 N NA
 10384137 10384138 LM5923_0845 LM5923_0846     TRUE 0.387 68.000 0.073 1.000   NA
 10384138 10384139 LM5923_0846 LM5923_0847     FALSE 0.196 138.000 0.089 1.000   NA
 10384139 10384140 LM5923_0847 LM5923_0848     TRUE 0.468 85.000 0.818 1.000   NA
 10384140 10384141 LM5923_0848 LM5923_0849     FALSE 0.041 227.000 0.000 1.000   NA
 10384141 10384142 LM5923_0849 LM5923_0850     TRUE 0.873 16.000 0.072 1.000   NA
 10384144 10384145 LM5923_0852 LM5923_0853     TRUE 0.882 15.000 0.265 NA   NA
 10384145 10384146 LM5923_0853 LM5923_0854     FALSE 0.223 110.000 0.220 NA   NA
 10384146 10384147 LM5923_0854 LM5923_0855     TRUE 0.860 17.000 0.244 NA   NA
 10384149 10384150 LM5923_0857 LM5923_0858     FALSE 0.325 78.000 0.265 NA   NA
 10384150 10384151 LM5923_0858 LM5923_0859     TRUE 0.493 41.000 0.065 NA   NA
 10384151 10384152 LM5923_0859 LM5923_0860     FALSE 0.052 198.000 0.013 1.000 N NA
 10384152 10384153 LM5923_0860 LM5923_0861     FALSE 0.122 105.000 0.000 NA   NA
 10384153 10384154 LM5923_0861 LM5923_0862     FALSE 0.039 203.000 0.000 NA   NA
 10384154 10384155 LM5923_0862 LM5923_0863   nifJ FALSE 0.053 178.000 0.000 1.000 N NA
 10384156 10384157 LM5923_0864 LM5923_0865 fbp   FALSE 0.243 130.000 0.222 1.000   NA
 10384158 10384159 LM5923_0866 LM5923_0867     FALSE 0.187 192.000 0.727 1.000   NA
 10384159 10384160 LM5923_0867 LM5923_0868     FALSE 0.008 403.000 0.000 NA   NA
 10384160 10384161 LM5923_0868 LM5923_0869     TRUE 0.911 -7.000 0.000 NA   NA
 10384164 10384165 LM5923_0872 LM5923_0873     FALSE 0.241 133.000 0.462 1.000 N NA
 10384166 10384167 LM5923_0874 LM5923_0875     FALSE 0.009 463.000 0.000 1.000   NA
 10384169 10384170 LM5923_0877 LM5923_0878     FALSE 0.013 257.000 0.000 NA N NA
 10384170 10384171 LM5923_0878 LM5923_0879     FALSE 0.141 105.000 0.008 1.000 N NA
 10384171 10384172 LM5923_0879 LM5923_0880     FALSE 0.075 170.000 0.009 1.000 N NA
 10384172 10384173 LM5923_0880 LM5923_0881     TRUE 0.994 -7.000 0.414 1.000 Y NA
 10384175 10384176 LM5923_0883 LM5923_0884     FALSE 0.030 222.000 0.000 NA   NA
 10384176 10384177 LM5923_0884 LM5923_0885     FALSE 0.322 80.000 0.297 NA   NA
 10384177 10384178 LM5923_0885 LM5923_0886     TRUE 0.909 17.000 0.706 1.000 N NA
 10384178 10384179 LM5923_0886 LM5923_0887     TRUE 0.997 3.000 0.941 0.072 Y NA
 10384179 10384180 LM5923_0887 LM5923_0888   ddl FALSE 0.108 150.000 0.027 1.000 N NA
 10384180 10384181 LM5923_0888 LM5923_0889 ddl murF TRUE 0.981 25.000 0.046 0.004 Y NA
 10384181 10384182 LM5923_0889 LM5923_0890 murF   TRUE 0.445 67.000 0.216 1.000   NA
 10384184 10384185 LM5923_0892 LM5923_0893     TRUE 0.998 -3.000 0.733 0.034 Y NA
 10384185 10384186 LM5923_0893 LM5923_0894     TRUE 0.998 -13.000 0.711 0.034 Y NA
 10384186 10384187 LM5923_0894 LM5923_0895     TRUE 0.978 16.000 0.200 1.000 Y NA
 10384187 10384188 LM5923_0895 LM5923_0896     TRUE 0.948 2.000 0.400 NA   NA
 10384188 10384189 LM5923_0896 LM5923_0897     TRUE 0.851 22.000 0.529 NA   NA
 10384189 10384190 LM5923_0897 LM5923_0898     TRUE 0.802 72.000 0.529 NA Y NA
 10384192 10384193 LM5923_0900 LM5923_0901     FALSE 0.008 455.000 0.004 NA   NA
 10384195 10384196 LM5923_0903 LM5923_0904     TRUE 0.762 16.000 0.000 NA   NA
 10384198 10384199 LM5923_0906 LM5923_0907     FALSE 0.033 208.000 0.000 1.000 N NA
 10384199 10384200 LM5923_0907 LM5923_0908     TRUE 0.968 15.000 0.600 0.033 N NA
 10384200 10384201 LM5923_0908 LM5923_0909     TRUE 0.997 1.000 0.733 0.029 Y NA
 10384201 10384202 LM5923_0909 LM5923_0910     TRUE 0.992 20.000 0.786 0.029 Y NA
 10384202 10384203 LM5923_0910 LM5923_0911     TRUE 0.973 21.000 0.440 1.000 Y NA
 10384203 10384204 LM5923_0911 LM5923_0912     TRUE 0.956 0.000 0.480 1.000 N NA
 10384204 10384205 LM5923_0912 LM5923_0913     TRUE 0.860 18.000 0.542 NA N NA
 10384205 10384206 LM5923_0913 LM5923_0914     FALSE 0.197 118.000 0.333 NA N NA
 10384208 10384209 LM5923_0916 LM5923_0917     TRUE 0.954 -7.000 0.216 NA   NA
 10384209 10384210 LM5923_0917 LM5923_0918     FALSE 0.151 149.000 0.170 NA   NA
 10384210 10384211 LM5923_0918 LM5923_0919     TRUE 0.898 2.000 0.017 1.000 N NA
 10384211 10384212 LM5923_0919 LM5923_0920   dal TRUE 0.799 19.000 0.093 1.000 N NA
 10384212 10384213 LM5923_0920 LM5923_0921 dal   FALSE 0.060 206.000 0.108 1.000 N NA
 10384213 10384214 LM5923_0921 LM5923_0922     TRUE 0.967 7.000 0.260 0.049 N NA
 10384214 10384215 LM5923_0922 LM5923_0923   rsbR FALSE 0.185 252.000 0.032 NA Y NA
 10384215 10384216 LM5923_0923 LM5923_0924 rsbR rsbS TRUE 0.985 6.000 0.258 NA Y NA
 10384216 10384217 LM5923_0924 LM5923_0925 rsbS rsbT TRUE 0.988 3.000 0.320 NA Y NA
 10384217 10384218 LM5923_0925 LM5923_0926 rsbT rsbU TRUE 0.980 17.000 0.617 NA Y NA
 10384218 10384219 LM5923_0926 LM5923_0927 rsbU rsbV TRUE 0.614 150.000 0.440 1.000 Y NA
 10384219 10384220 LM5923_0927 LM5923_0928 rsbV rsbW TRUE 0.995 -16.000 0.714 1.000 Y NA
 10384220 10384221 LM5923_0928 LM5923_0929 rsbW sigB TRUE 0.976 -22.000 0.838 1.000 N NA
 10384221 10384222 LM5923_0929 LM5923_0930 sigB rsbX TRUE 0.953 1.000 0.243 1.000   NA
 10384222 10384223 LM5923_0930 LM5923_0931 rsbX   FALSE 0.051 207.000 0.000 1.000   NA
 10384223 10384224 LM5923_0931 LM5923_0932     FALSE 0.231 77.000 0.027 1.000 N NA
 10384224 10384225 LM5923_0932 LM5923_0933     TRUE 0.942 0.000 0.215 NA   NA
 10384225 10384226 LM5923_0933 LM5923_tRNA05     FALSE 0.306 53.000 0.000 NA   NA
 10384226 10384227 LM5923_tRNA05 LM5923_tRNA06     TRUE 0.854 4.000 0.000 NA   NA
 10384227 10384228 LM5923_tRNA06 LM5923_0934     FALSE 0.067 167.000 0.000 NA   NA
 10384228 10384229 LM5923_0934 LM5923_0935     FALSE 0.299 55.000 0.000 NA   NA
 10384229 10384230 LM5923_0935 LM5923_0936     FALSE 0.150 146.000 0.123 NA   NA
 10384230 10384231 LM5923_0936 LM5923_0937     FALSE 0.301 81.000 0.286 1.000 N NA
 10384231 10384232 LM5923_0937 LM5923_tRNA07     FALSE 0.043 198.000 0.000 NA   NA
 10384232 10384233 LM5923_tRNA07 LM5923_tRNA08     TRUE 0.525 27.000 0.000 NA   NA
 10384233 10384234 LM5923_tRNA08 LM5923_0938     FALSE 0.111 128.000 0.000 NA   NA
 10384234 10384235 LM5923_0938 LM5923_0939     FALSE 0.125 115.000 0.000 NA   NA
 10384235 10384236 LM5923_0939 LM5923_0940     FALSE 0.108 131.000 0.000 NA   NA
 10384236 10384237 LM5923_0940 LM5923_0941     TRUE 0.549 36.000 0.010 1.000   NA
 10384237 10384238 LM5923_0941 LM5923_0942     TRUE 0.427 29.000 0.006 NA N NA
 10384240 10384241 LM5923_0944 LM5923_0945     TRUE 0.948 3.000 0.474 NA   NA
 10384241 10384242 LM5923_0945 LM5923_0946     FALSE 0.324 83.000 0.368 NA   NA
 10384242 10384243 LM5923_0946 LM5923_0947     FALSE 0.248 114.000 0.310 NA   NA
 10384243 10384244 LM5923_0947 LM5923_0948     FALSE 0.028 224.000 0.000 1.000 N NA
 10384244 10384245 LM5923_0948 LM5923_0949     FALSE 0.229 143.000 0.533 1.000 N NA
 10384245 10384246 LM5923_0949 LM5923_0950     TRUE 0.996 5.000 0.522 0.033 Y NA
 10384246 10384247 LM5923_0950 LM5923_0951     TRUE 0.994 15.000 0.783 0.033 Y NA
 10384247 10384248 LM5923_0951 LM5923_0952     TRUE 0.983 12.000 0.143 1.000 Y NA
 10384248 10384249 LM5923_0952 LM5923_0953     FALSE 0.291 73.000 0.100 1.000 N NA
 10384249 10384250 LM5923_0953 LM5923_0954     FALSE 0.057 201.000 0.000 1.000   NA
 10384250 10384251 LM5923_0954 LM5923_0955     FALSE 0.195 122.000 0.139 NA   NA
 10384251 10384252 LM5923_0955 LM5923_0956     TRUE 0.909 19.000 0.841 NA   NA
 10384252 10384253 LM5923_0956 LM5923_0957     FALSE 0.191 89.000 0.026 NA   NA
 10384253 10384254 LM5923_0957 LM5923_0958     FALSE 0.163 117.000 0.036 1.000 N NA
 10384254 10384255 LM5923_0958 LM5923_0959     TRUE 0.965 0.000 0.713 1.000 N NA
 10384255 10384256 LM5923_0959 LM5923_0960     TRUE 0.733 23.000 0.110 1.000 N NA
 10384258 10384259 LM5923_0962 LM5923_0963     FALSE 0.054 182.000 0.000 NA   NA
 10384259 10384260 LM5923_0963 LM5923_0964     FALSE 0.114 109.000 0.027 NA N NA
 10384260 10384261 LM5923_0964 LM5923_0965     FALSE 0.337 68.000 0.100 NA   NA
 10384261 10384262 LM5923_0965 LM5923_0966     TRUE 0.772 24.000 0.113 1.000   NA
 10384263 10384264 LM5923_0967 LM5923_0968     FALSE 0.171 125.000 0.066 NA   NA
 10384265 10384266 LM5923_tRNA09 LM5923_0969     FALSE 0.132 97.000 0.000 NA   NA
 10384266 10384267 LM5923_0969 LM5923_0970     TRUE 0.765 21.000 0.077 1.000 N NA
 10384267 10384268 LM5923_0970 LM5923_0971     TRUE 0.843 13.000 0.036 1.000 N NA
 10384269 10384270 LM5923_0972 LM5923_0973     FALSE 0.188 88.000 0.018 NA   NA
 10384270 10384271 LM5923_0973 LM5923_0974     TRUE 0.840 13.000 0.016 NA   NA
 10384271 10384272 LM5923_0974 LM5923_0975     FALSE 0.230 96.000 0.188 NA   NA
 10384272 10384273 LM5923_0975 LM5923_0976     TRUE 0.848 32.000 0.000 0.008   NA
 10384273 10384274 LM5923_0976 LM5923_0977     TRUE 0.869 9.000 0.000 1.000   NA
 10384275 10384276 LM5923_0978 LM5923_0979 fri   FALSE 0.027 233.000 0.000 NA   NA
 10384276 10384277 LM5923_0979 LM5923_0980     FALSE 0.274 113.000 0.409 NA   NA
 10384277 10384278 LM5923_0980 LM5923_0981     TRUE 0.929 10.000 0.481 NA   NA
 10384279 10384280 LM5923_0982 LM5923_0983     TRUE 0.924 -3.000 0.162 NA N NA
 10384282 10384283 LM5923_0985 LM5923_0986     TRUE 0.677 21.000 0.000 NA   NA
 10384284 10384285 LM5923_0987 LM5923_0988     FALSE 0.370 94.000 0.733 NA   NA
 10384285 10384286 LM5923_0988 LM5923_0989     FALSE 0.050 233.000 0.167 NA   NA
 10384286 10384287 LM5923_0989 LM5923_0990     TRUE 0.875 16.000 0.270 NA   NA
 10384287 10384288 LM5923_0990 LM5923_0991     FALSE 0.057 189.000 0.083 NA N NA
 10384288 10384289 LM5923_0991 LM5923_0992     TRUE 0.993 16.000 0.194 0.003 Y NA
 10384289 10384290 LM5923_0992 LM5923_0993     TRUE 0.832 16.000 0.075 1.000 N NA
 10384290 10384291 LM5923_0993 LM5923_0994     FALSE 0.217 120.000 0.245 1.000 N NA
 10384291 10384292 LM5923_0994 LM5923_0995     FALSE 0.198 113.000 0.149 1.000 N NA
 10384292 10384293 LM5923_0995 LM5923_0996     TRUE 0.994 14.000 0.156 0.002 Y NA
 10384293 10384294 LM5923_0996 LM5923_0997   lemA FALSE 0.204 84.000 0.020 NA   NA
 10384294 10384295 LM5923_0997 LM5923_0998 lemA   TRUE 0.771 23.000 0.222 NA   NA
 10384296 10384297 LM5923_0999 LM5923_1000     FALSE 0.054 238.000 0.071 1.000   NA
 10384297 10384298 LM5923_1000 LM5923_1001     TRUE 0.867 17.000 0.096 1.000   NA
 10384299 10384300 LM5923_1002 LM5923_1003   ppnK TRUE 0.787 32.000 0.725 1.000   NA
 10384300 10384301 LM5923_1003 LM5923_1004 ppnK   TRUE 0.871 19.000 0.480 1.000 N NA
 10384301 10384302 LM5923_1004 LM5923_1005     FALSE 0.277 78.000 0.141 1.000 N NA
 10384303 10384304 LM5923_1006 LM5923_1007 dltD dltC TRUE 0.964 0.000 0.409 1.000   NA
 10384304 10384305 LM5923_1007 LM5923_1008 dltC dltB TRUE 0.752 26.000 0.387 NA   NA
 10384305 10384306 LM5923_1008 LM5923_1009 dltB dltA TRUE 0.950 -3.000 0.435 NA N NA
 10384306 10384307 LM5923_1009 LM5923_1010 dltA   TRUE 0.672 37.000 0.549 NA   NA
 10384309 10384310 LM5923_1012 LM5923_1013     TRUE 0.833 18.000 0.159 NA   NA
 10384311 10384312 LM5923_1014 LM5923_1015     FALSE 0.066 198.000 0.086 1.000 N NA
 10384312 10384313 LM5923_1015 LM5923_1016     TRUE 0.974 -3.000 0.860 1.000 N NA
 10384315 10384316 LM5923_1018 LM5923_1019     TRUE 0.866 13.000 0.106 1.000 N NA
 10384316 10384317 LM5923_1019 LM5923_1020     FALSE 0.145 134.000 0.216 NA N NA
 10384317 10384318 LM5923_1020 LM5923_1021     TRUE 0.951 -3.000 0.235 NA   NA
 10384318 10384319 LM5923_1021 LM5923_1022     TRUE 0.948 -3.000 0.189 NA   NA
 10384319 10384320 LM5923_1022 LM5923_1023     TRUE 0.981 -7.000 0.849 1.000   NA
 10384320 10384321 LM5923_1023 LM5923_1024   prfC FALSE 0.259 82.000 0.014 1.000   NA
 10384321 10384322 LM5923_1024 LM5923_1025 prfC   FALSE 0.149 107.000 0.017 1.000 N NA
 10384322 10384323 LM5923_1025 LM5923_1026     TRUE 0.589 52.000 0.625 1.000 N NA
 10384323 10384324 LM5923_1026 LM5923_1027     FALSE 0.016 282.000 0.000 1.000 N NA
 10384324 10384325 LM5923_1027 LM5923_1028     TRUE 0.829 103.000 0.381 0.070 Y NA
 10384325 10384326 LM5923_1028 LM5923_1029     TRUE 0.993 -37.000 0.151 1.000 Y NA
 10384327 10384328 LM5923_1030 LM5923_1031     TRUE 0.674 30.000 0.303 NA   NA
 10384330 10384331 LM5923_1033 LM5923_1034 clpE   FALSE 0.119 162.000 0.115 NA   NA
 10384333 10384334 LM5923_1036 LM5923_1037     FALSE 0.222 110.000 0.214 NA   NA
 10384335 10384336 LM5923_1038 LM5923_1039 ptsH   TRUE 0.996 0.000 0.140 0.032 Y NA
 10384336 10384337 LM5923_1039 LM5923_1040     FALSE 0.203 113.000 0.121 NA   NA
 10384337 10384338 LM5923_1040 LM5923_1041     TRUE 0.860 13.000 0.058 NA   NA
 10384340 10384341 LM5923_1043 LM5923_1044     FALSE 0.013 305.000 0.000 NA   NA
 10384341 10384342 LM5923_1044 LM5923_1045     FALSE 0.054 201.000 0.017 NA   NA
 10384342 10384343 LM5923_1045 LM5923_1046     TRUE 0.991 -3.000 0.214 NA Y NA
 10384343 10384344 LM5923_1046 LM5923_1047     TRUE 0.452 48.000 0.121 1.000 N NA
 10384344 10384345 LM5923_1047 LM5923_1048     TRUE 0.514 64.000 0.372 1.000   NA
 10384347 10384348 LM5923_1050 LM5923_1051 gbuA gbuB TRUE 0.996 -7.000 0.042 0.080 Y NA
 10384348 10384349 LM5923_1051 LM5923_1052 gbuB gbuC TRUE 0.992 14.000 0.179 0.033 Y NA
 10384349 10384350 LM5923_1052 LM5923_1053 gbuC   FALSE 0.208 115.000 0.192 1.000 N NA
 10384350 10384351 LM5923_1053 LM5923_1054     FALSE 0.168 111.000 0.047 1.000 N NA
 10384351 10384352 LM5923_1054 LM5923_1055     FALSE 0.280 81.000 0.031 1.000   NA
 10384352 10384353 LM5923_1055 LM5923_1056     FALSE 0.145 135.000 0.038 NA   NA
 10384353 10384354 LM5923_1056 LM5923_1057     TRUE 0.970 -3.000 0.679 NA   NA
 10384354 10384355 LM5923_1057 LM5923_1058     TRUE 0.998 -3.000 0.853 0.011 Y NA
 10384355 10384356 LM5923_1058 LM5923_1059     TRUE 0.821 19.000 0.194 1.000 N NA
 10384356 10384357 LM5923_1059 LM5923_1060     FALSE 0.141 155.000 0.184 NA   NA
 10384357 10384358 LM5923_1060 LM5923_1061     TRUE 0.976 -3.000 0.900 NA   NA
 10384359 10384360 LM5923_1062 LM5923_1063     FALSE 0.186 109.000 0.076 NA   NA
 10384360 10384361 LM5923_1063 LM5923_1064     TRUE 0.939 7.000 0.576 NA   NA
 10384364 10384365 LM5923_1067 LM5923_1068     TRUE 0.979 16.000 0.245 1.000 Y NA
 10384365 10384366 LM5923_1068 LM5923_1069     TRUE 0.999 -7.000 0.860 0.002 Y NA
 10384366 10384367 LM5923_1069 LM5923_1070     TRUE 0.967 -3.000 0.596 1.000 N NA
 10384367 10384368 LM5923_1070 LM5923_1071     TRUE 0.939 -3.000 0.100 1.000 N NA
 10384368 10384369 LM5923_1071 LM5923_1073     FALSE 0.010 607.000 0.167 NA   NA
 10384370 10384371 LM5923_1074 LM5923_1075     FALSE 0.291 68.000 0.026 NA   NA
 10384371 10384372 LM5923_1075 LM5923_1076     TRUE 0.934 -19.000 0.024 NA   NA
 10384372 10384373 LM5923_1076 LM5923_1077     TRUE 0.936 3.000 0.103 1.000   NA
 10384374 10384375 LM5923_1078 LM5923_1079     FALSE 0.127 95.000 0.000 1.000 N NA
 10384375 10384376 LM5923_1079 LM5923_1080     TRUE 0.997 -21.000 0.000 0.003 Y NA
 10384376 10384377 LM5923_1080 LM5923_1081     TRUE 0.997 -3.000 0.012 0.003 Y NA
 10384377 10384378 LM5923_1081 LM5923_1082     TRUE 0.998 -16.000 0.501 0.003 Y NA
 10384378 10384379 LM5923_1082 LM5923_1083   moaC TRUE 0.994 13.000 0.175 0.003 Y NA
 10384379 10384380 LM5923_1083 LM5923_1084 moaC moaA TRUE 0.976 29.000 0.071 0.003 Y NA
 10384381 10384382 LM5923_1085 LM5923_1086     TRUE 0.981 12.000 0.044 1.000 Y NA
 10384385 10384386 LM5923_1089 LM5923_1090 pdhA pdhB TRUE 0.998 3.000 0.484 0.001 Y NA
 10384386 10384387 LM5923_1090 LM5923_1091 pdhB pdhC TRUE 0.874 111.000 0.883 0.055 Y NA
 10384387 10384388 LM5923_1091 LM5923_1092 pdhC pdhD TRUE 0.992 5.000 0.948 1.000 Y NA
 10384388 10384389 LM5923_1092 LM5923_1093 pdhD   FALSE 0.070 188.000 0.026 NA   NA
 10384389 10384390 LM5923_1093 LM5923_1094     FALSE 0.110 129.000 0.000 NA   NA
 10384390 10384391 LM5923_1094 LM5923_1095     TRUE 0.888 0.000 0.000 NA   NA
 10384391 10384392 LM5923_1095 LM5923_1096     TRUE 0.777 22.000 0.145 NA   NA
 10384392 10384393 LM5923_1096 LM5923_1097     FALSE 0.057 142.000 0.000 NA N NA
 10384393 10384394 LM5923_1097 LM5923_1098     TRUE 0.993 -7.000 0.143 1.000 Y NA
 10384394 10384395 LM5923_1098 LM5923_1099     TRUE 0.466 87.000 0.143 0.080 N NA
 10384395 10384396 LM5923_1099 LM5923_1100     TRUE 0.990 13.000 1.000 1.000 Y NA
 10384397 10384398 LM5923_1101 LM5923_1102     FALSE 0.041 201.000 0.000 NA   NA
 10384399 10384400 LM5923_1103 LM5923_1104     FALSE 0.062 192.000 0.024 1.000 N NA
 10384400 10384401 LM5923_1104 LM5923_1105     FALSE 0.078 172.000 0.010 NA   NA
 10384403 10384404 LM5923_1107 LM5923_1108     FALSE 0.122 177.000 0.300 NA   NA
 10384404 10384405 LM5923_1108 LM5923_1109   pycA FALSE 0.025 278.000 0.046 1.000 N NA
 10384405 10384406 LM5923_1109 LM5923_1110 pycA   FALSE 0.106 152.000 0.028 1.000 N NA
 10384406 10384407 LM5923_1110 LM5923_1111     FALSE 0.014 291.000 0.000 1.000 N NA
 10384407 10384408 LM5923_1111 LM5923_1112     TRUE 0.990 12.000 0.808 1.000 Y NA
 10384408 10384409 LM5923_1112 LM5923_1113     FALSE 0.089 177.000 0.087 1.000 N NA
 10384409 10384410 LM5923_1113 LM5923_1114     FALSE 0.030 216.000 0.000 1.000 N NA
 10384412 10384413 LM5923_1116 LM5923_1117     FALSE 0.107 132.000 0.000 NA   NA
 10384413 10384414 LM5923_1117 LM5923_1118     TRUE 0.744 17.000 0.000 NA   NA
 10384414 10384415 LM5923_1118 LM5923_1119     TRUE 0.970 19.000 0.135 1.000 Y NA
 10384415 10384416 LM5923_1119 LM5923_1120     TRUE 0.990 1.000 0.183 1.000 Y NA
 10384416 10384417 LM5923_1120 LM5923_1121     TRUE 0.996 3.000 0.055 0.002 Y NA
 10384417 10384418 LM5923_1121 LM5923_1122     TRUE 0.969 20.000 0.182 1.000 Y NA
 10384418 10384419 LM5923_1122 LM5923_1123   ispD FALSE 0.261 76.000 0.067 1.000 N NA
 10384419 10384420 LM5923_1123 LM5923_1124 ispD   TRUE 0.957 -3.000 0.367 1.000 N NA
 10384420 10384421 LM5923_1124 LM5923_1125   tagB FALSE 0.208 88.000 0.069 1.000 N NA
 10384421 10384422 LM5923_1125 LM5923_1126 tagB tagD TRUE 0.997 1.000 0.244 0.002 Y NA
 10384422 10384423 LM5923_1126 LM5923_1127 tagD   TRUE 0.955 22.000 0.146 NA Y NA
 10384423 10384424 LM5923_1127 LM5923_1128     TRUE 0.974 15.000 0.111 NA Y NA
 10384424 10384425 LM5923_1128 LM5923_1129     FALSE 0.021 209.000 0.000 NA N NA
 10384425 10384426 LM5923_1129 LM5923_1130   nadE TRUE 0.995 12.000 0.194 0.003 Y NA
 10384426 10384427 LM5923_1130 LM5923_1131 nadE   TRUE 0.884 13.000 0.037 1.000   NA
 10384427 10384428 LM5923_1131 LM5923_1132     TRUE 0.451 60.000 0.083 1.000   NA
 10384428 10384429 LM5923_1132 LM5923_1133   guaA FALSE 0.125 129.000 0.004 1.000 N NA
 10384429 10384430 LM5923_1133 LM5923_1134 guaA   FALSE 0.030 218.000 0.000 1.000 N NA
 10384430 10384431 LM5923_1134 LM5923_1135     TRUE 0.984 2.000 0.400 0.048   NA
 10384431 10384432 LM5923_1135 LM5923_1136     FALSE 0.004 1137.000 0.000 NA   NA
 10384432 10384433 LM5923_1136 LM5923_1137     FALSE 0.008 403.000 0.000 NA   NA
 10384435 10384436 LM5923_1140 LM5923_1141     TRUE 0.994 -15.000 1.000 0.018   NA
 10384436 10384437 LM5923_1141 LM5923_1142     FALSE 0.164 82.000 0.000 NA   NA
 10384437 10384438 LM5923_1142 LM5923_1143     FALSE 0.016 285.000 0.000 NA   NA
 10384438 10384439 LM5923_1143 LM5923_1144     FALSE 0.349 105.000 0.800 NA   NA
 10384439 10384440 LM5923_1144 LM5923_1145     TRUE 0.949 -3.000 0.200 NA   NA
 10384440 10384441 LM5923_1145 LM5923_1146     TRUE 0.796 13.000 0.000 NA   NA
 10384441 10384442 LM5923_1146 LM5923_1147     FALSE 0.362 43.000 0.000 NA   NA
 10384442 10384443 LM5923_1147 LM5923_1148     TRUE 0.704 37.000 0.700 NA   NA
 10384443 10384444 LM5923_1148 LM5923_1149     TRUE 0.381 86.000 0.667 NA   NA
 10384444 10384445 LM5923_1149 LM5923_1150     TRUE 0.951 -10.000 0.167 NA   NA
 10384445 10384446 LM5923_1150 LM5923_1151     FALSE 0.009 377.000 0.000 NA   NA
 10384446 10384447 LM5923_1151 LM5923_1152     TRUE 0.689 25.000 0.094 NA   NA
 10384447 10384448 LM5923_1152 LM5923_1153     TRUE 0.951 -10.000 0.161 NA   NA
 10384449 10384450 LM5923_1154 LM5923_1155     TRUE 0.954 -3.000 0.082 1.000   NA
 10384450 10384451 LM5923_1155 LM5923_1156     TRUE 0.951 -3.000 0.057 1.000   NA
 10384452 10384453 LM5923_1157 LM5923_1158     TRUE 0.997 2.000 0.576 0.009 Y NA
 10384455 10384456 LM5923_1160 LM5923_1161     TRUE 0.784 25.000 0.462 NA   NA
 10384459 10384460 LM5923_1164 LM5923_1165     FALSE 0.352 67.000 0.111 NA   NA
 10384460 10384461 LM5923_1165 LM5923_1166     FALSE 0.179 129.000 0.111 NA   NA
 10384462 10384463 LM5923_1167 LM5923_1168     FALSE 0.185 128.000 0.179 1.000 N NA
 10384463 10384464 LM5923_1168 LM5923_1169     TRUE 0.992 -3.000 0.289 NA Y NA
 10384464 10384465 LM5923_1169 LM5923_1170     FALSE 0.140 148.000 0.316 NA N NA
 10384465 10384466 LM5923_1170 LM5923_1171     TRUE 0.989 6.000 0.467 1.000 Y NA
 10384466 10384467 LM5923_1171 LM5923_1172     TRUE 0.565 25.000 0.000 NA   NA
 10384467 10384468 LM5923_1172 LM5923_1173     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 10384468 10384469 LM5923_1173 LM5923_1174     TRUE 0.988 2.000 0.046 1.000 Y NA
 10384469 10384470 LM5923_1174 LM5923_1175     TRUE 0.906 1.000 0.023 1.000 N NA
 10384472 10384473 LM5923_1177 LM5923_1178     TRUE 0.935 -7.000 0.200 NA N NA
 10384473 10384474 LM5923_1178 LM5923_1179     TRUE 0.811 19.000 0.150 1.000 N NA
 10384474 10384475 LM5923_1179 LM5923_1180     TRUE 0.914 38.000 0.455 0.001   NA
 10384475 10384476 LM5923_1180 LM5923_1181     TRUE 0.983 17.000 0.759 0.001   NA
 10384476 10384477 LM5923_1181 LM5923_1182     TRUE 0.609 45.000 0.500 NA   NA
 10384477 10384478 LM5923_1182 LM5923_1183     TRUE 0.955 -3.000 0.295 NA   NA
 10384478 10384479 LM5923_1183 LM5923_1184     TRUE 0.909 13.000 0.387 NA   NA
 10384479 10384480 LM5923_1184 LM5923_1185     TRUE 0.957 25.000 0.645 NA Y NA
 10384480 10384481 LM5923_1185 LM5923_1186     TRUE 0.988 4.000 0.364 NA Y NA
 10384481 10384482 LM5923_1186 LM5923_1187     TRUE 0.792 21.000 0.364 NA N NA
 10384482 10384483 LM5923_1187 LM5923_1188     TRUE 0.962 -3.000 0.440 NA   NA
 10384483 10384484 LM5923_1188 LM5923_1189     TRUE 0.935 5.000 0.407 NA   NA
 10384484 10384485 LM5923_1189 LM5923_1190     TRUE 0.882 15.000 0.268 NA   NA
 10384485 10384486 LM5923_1190 LM5923_1191     TRUE 0.874 7.000 0.000 1.000   NA
 10384486 10384487 LM5923_1191 LM5923_1192     TRUE 0.988 16.000 0.000 0.028 Y NA
 10384487 10384488 LM5923_1192 LM5923_1193   glpF TRUE 0.719 28.000 0.407 1.000 N NA
 10384488 10384489 LM5923_1193 LM5923_1194 glpF ackA2 TRUE 0.434 66.000 0.375 1.000 N NA
 10384489 10384490 LM5923_1194 LM5923_1195 ackA2   TRUE 0.893 14.000 0.346 1.000 N NA
 10384490 10384491 LM5923_1195 LM5923_1196     TRUE 0.957 -10.000 0.300 1.000 N NA
 10384491 10384492 LM5923_1196 LM5923_1197   pduQ FALSE 0.005 590.000 0.000 1.000 N NA
 10384492 10384493 LM5923_1197 LM5923_1198 pduQ   FALSE 0.028 224.000 0.000 1.000 N NA
 10384493 10384494 LM5923_1198 LM5923_1199     TRUE 0.994 -7.000 0.388 1.000 Y NA
 10384494 10384495 LM5923_1199 LM5923_1200   eutA FALSE 0.180 89.000 0.163 NA N NA
 10384495 10384496 LM5923_1200 LM5923_1201 eutA eutB TRUE 0.909 42.000 0.636 NA Y NA
 10384496 10384497 LM5923_1201 LM5923_1202 eutB eutC TRUE 0.992 20.000 0.190 0.001 Y NA
 10384497 10384498 LM5923_1202 LM5923_1203 eutC   TRUE 0.970 23.000 0.617 1.000 Y NA
 10384498 10384499 LM5923_1203 LM5923_1204     TRUE 0.878 15.000 0.468 NA N NA
 10384499 10384500 LM5923_1204 LM5923_1205     TRUE 0.991 0.000 0.442 NA Y NA
 10384500 10384501 LM5923_1205 LM5923_1206     TRUE 0.918 32.000 0.349 NA Y NA
 10384501 10384502 LM5923_1206 LM5923_1207     FALSE 0.116 166.000 0.357 NA N NA
 10384502 10384503 LM5923_1207 LM5923_1208     TRUE 0.889 13.000 0.452 NA N NA
 10384503 10384504 LM5923_1208 LM5923_1209     TRUE 0.963 -3.000 0.459 NA   NA
 10384504 10384505 LM5923_1209 LM5923_1210     TRUE 0.908 15.000 0.487 NA   NA
 10384505 10384506 LM5923_1210 LM5923_1211     TRUE 0.993 -7.000 0.385 NA Y NA
 10384506 10384507 LM5923_1211 LM5923_1212     TRUE 0.882 16.000 0.552 NA N NA
 10384507 10384508 LM5923_1212 LM5923_1213     TRUE 0.995 -7.000 0.759 NA Y NA
 10384508 10384509 LM5923_1213 LM5923_1214     FALSE 0.035 210.000 0.000 NA   NA
 10384511 10384512 LM5923_1216 LM5923_1217   cbiA FALSE 0.011 333.000 0.000 NA   NA
 10384512 10384513 LM5923_1217 LM5923_1218 cbiA cobD TRUE 0.997 -3.000 0.124 0.011 Y NA
 10384513 10384514 LM5923_1218 LM5923_1219 cobD cbiC TRUE 0.993 13.000 0.107 0.011 Y NA
 10384514 10384515 LM5923_1219 LM5923_1220 cbiC cbiD TRUE 0.992 16.000 0.168 0.011 Y NA
 10384515 10384516 LM5923_1220 LM5923_1221 cbiD cbiE TRUE 0.997 -3.000 0.126 0.011 Y NA
 10384516 10384517 LM5923_1221 LM5923_1222 cbiE   TRUE 0.998 -10.000 0.300 0.001 Y NA
 10384517 10384518 LM5923_1222 LM5923_1223   cbiF TRUE 0.995 6.000 0.056 0.011 Y NA
 10384518 10384519 LM5923_1223 LM5923_1224 cbiF cbiG TRUE 0.998 -13.000 0.397 0.011 Y NA
 10384519 10384520 LM5923_1224 LM5923_1225 cbiG cbiH TRUE 0.998 -3.000 0.352 0.011 Y NA
 10384520 10384521 LM5923_1225 LM5923_1226 cbiH   TRUE 0.998 -3.000 0.423 0.011 Y NA
 10384521 10384522 LM5923_1226 LM5923_1227     TRUE 0.990 0.000 0.042 1.000 Y NA
 10384522 10384523 LM5923_1227 LM5923_1228   cbiK TRUE 0.992 -3.000 0.084 1.000 Y NA
 10384523 10384524 LM5923_1228 LM5923_1229 cbiK cbiL TRUE 0.992 -7.000 0.048 1.000 Y NA
 10384524 10384525 LM5923_1229 LM5923_1230 cbiL   TRUE 0.984 -3.000 0.058 0.011 N NA
 10384525 10384526 LM5923_1230 LM5923_1231     TRUE 0.998 -3.000 0.861 0.011 Y NA
 10384526 10384527 LM5923_1231 LM5923_1232   cbiQ TRUE 0.999 -37.000 0.804 0.002 Y NA
 10384527 10384528 LM5923_1232 LM5923_1233 cbiQ   TRUE 0.995 13.000 0.152 0.002 Y NA
 10384528 10384529 LM5923_1233 LM5923_1234   cbiP TRUE 0.915 0.000 0.033 1.000 N NA
 10384529 10384530 LM5923_1234 LM5923_1235 cbiP   TRUE 0.987 -36.000 0.021 0.011   NA
 10384531 10384532 LM5923_1236 LM5923_1237     TRUE 0.917 14.000 0.545 NA   NA
 10384533 10384534 LM5923_1238 LM5923_1239     FALSE 0.332 31.000 0.000 NA N NA
 10384534 10384535 LM5923_1239 LM5923_1240     TRUE 0.954 3.000 0.600 NA   NA
 10384535 10384536 LM5923_1240 LM5923_1241     FALSE 0.008 421.000 0.000 NA   NA
 10384536 10384537 LM5923_1241 LM5923_1242     TRUE 0.400 270.000 0.000 0.003 Y NA
 10384537 10384538 LM5923_1242 LM5923_1243     FALSE 0.220 112.000 0.237 1.000 N NA
 10384538 10384539 LM5923_1243 LM5923_1244     TRUE 0.605 26.000 0.022 1.000 N NA
 10384541 10384542 LM5923_1246 LM5923_1247   pheS FALSE 0.005 367.000 0.000 NA N NA
 10384542 10384543 LM5923_1247 LM5923_1248 pheS pheT TRUE 0.998 0.000 0.574 0.001 Y NA
 10384543 10384544 LM5923_1248 LM5923_1249 pheT   FALSE 0.085 161.000 0.009 1.000 N NA
 10384544 10384545 LM5923_1249 LM5923_1250     TRUE 0.903 14.000 0.438 1.000 N NA
 10384545 10384546 LM5923_1250 LM5923_1251     FALSE 0.213 98.000 0.182 1.000 N NA
 10384546 10384547 LM5923_1251 LM5923_1252     TRUE 0.820 16.000 0.000 1.000   NA
 10384547 10384548 LM5923_1252 LM5923_1253     FALSE 0.164 107.000 0.000 1.000   NA
 10384550 10384551 LM5923_1255 LM5923_1256     TRUE 0.931 0.000 0.091 NA   NA
 10384551 10384552 LM5923_1256 LM5923_1257     FALSE 0.254 93.000 0.066 1.000   NA
 10384552 10384553 LM5923_1257 LM5923_1258     TRUE 0.956 23.000 0.114 1.000 Y NA
 10384553 10384554 LM5923_1258 LM5923_1259   trxA FALSE 0.214 81.000 0.031 1.000 N NA
 10384554 10384555 LM5923_1259 LM5923_1260 trxA uvrC FALSE 0.216 76.000 0.008 1.000 N NA
 10384555 10384556 LM5923_1260 LM5923_1261 uvrC   FALSE 0.059 189.000 0.009 1.000 N NA
 10384558 10384559 LM5923_1263 LM5923_1264 racE rph TRUE 0.849 13.000 0.048 1.000 N NA
 10384559 10384560 LM5923_1264 LM5923_1265 rph   TRUE 0.924 4.000 0.262 1.000 N NA
 10384560 10384561 LM5923_1265 LM5923_1266     TRUE 0.528 37.000 0.085 NA   NA
 10384561 10384562 LM5923_1266 LM5923_tRNA10     FALSE 0.124 111.000 0.000 NA   NA
 10384563 10384564 LM5923_1267 LM5923_1268     FALSE 0.129 142.000 0.000 1.000   NA
 10384564 10384565 LM5923_1268 LM5923_1269     FALSE 0.310 52.000 0.000 NA   NA
 10384565 10384566 LM5923_1269 LM5923_1270     TRUE 0.923 17.000 0.857 NA   NA
 10384566 10384567 LM5923_1270 LM5923_1271     FALSE 0.008 401.000 0.000 NA   NA
 10384568 10384569 LM5923_1272 LM5923_1273     TRUE 0.775 22.000 0.132 NA   NA
 10384569 10384570 LM5923_1273 LM5923_1274     FALSE 0.007 423.000 0.000 NA   NA
 10384570 10384571 LM5923_1274 LM5923_1275     FALSE 0.009 366.000 0.000 NA   NA
 10384571 10384572 LM5923_1275 LM5923_1276     FALSE 0.016 286.000 0.000 NA   NA
 10384572 10384573 LM5923_1276 LM5923_1277     FALSE 0.362 43.000 0.000 NA   NA
 10384573 10384574 LM5923_1277 LM5923_1278     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 10384574 10384575 LM5923_1278 LM5923_1279     TRUE 0.976 11.000 0.500 0.047   NA
 10384575 10384576 LM5923_1279 LM5923_1280     TRUE 0.976 13.000 0.667 0.047   NA
 10384576 10384577 LM5923_1280 LM5923_1281     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 10384577 10384578 LM5923_1281 LM5923_1282     TRUE 0.866 3.000 0.000 NA   NA
 10384578 10384579 LM5923_1282 LM5923_1283     FALSE 0.047 193.000 0.000 NA   NA
 10384579 10384580 LM5923_1283 LM5923_1284     TRUE 0.881 1.000 0.000 NA   NA
 10384580 10384581 LM5923_1284 LM5923_1285     TRUE 0.711 19.000 0.000 NA   NA
 10384581 10384582 LM5923_1285 LM5923_1286     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 10384582 10384583 LM5923_1286 LM5923_1287     TRUE 0.911 -30.000 0.000 NA   NA
 10384583 10384584 LM5923_1287 LM5923_1288     FALSE 0.039 203.000 0.000 NA   NA
 10384584 10384585 LM5923_1288 LM5923_1289     TRUE 0.950 3.000 0.500 NA   NA
 10384585 10384586 LM5923_1289 LM5923_1290     TRUE 0.974 -3.000 0.833 NA   NA
 10384586 10384587 LM5923_1290 LM5923_1291     TRUE 0.958 2.000 0.600 NA   NA
 10384587 10384588 LM5923_1291 LM5923_1292     TRUE 0.879 20.000 0.600 NA   NA
 10384588 10384589 LM5923_1292 LM5923_1293     FALSE 0.136 178.000 0.400 NA   NA
 10384589 10384590 LM5923_1293 LM5923_1294     TRUE 0.808 25.000 0.600 NA   NA
 10384590 10384591 LM5923_1294 LM5923_1295     TRUE 0.797 23.000 0.333 NA   NA
 10384591 10384592 LM5923_1295 LM5923_1296     FALSE 0.011 334.000 0.000 NA   NA
 10384592 10384593 LM5923_1296 LM5923_1297     TRUE 0.921 2.000 0.080 NA   NA
 10384593 10384594 LM5923_1297 LM5923_1298     FALSE 0.007 448.000 0.000 NA   NA
 10384594 10384595 LM5923_1298 LM5923_1299     FALSE 0.014 295.000 0.000 NA   NA
 10384595 10384596 LM5923_1299 LM5923_1300     FALSE 0.371 42.000 0.000 NA   NA
 10384596 10384597 LM5923_1300 LM5923_1301     FALSE 0.265 98.000 0.160 1.000   NA
 10384597 10384598 LM5923_1301 LM5923_1302     FALSE 0.007 795.000 0.000 1.000   NA
 10384598 10384599 LM5923_1302 LM5923_1303     TRUE 0.520 50.000 0.312 NA   NA
 10384599 10384600 LM5923_1303 LM5923_1304     TRUE 0.946 -3.000 0.154 NA   NA
 10384602 10384603 LM5923_1306 LM5923_1307     TRUE 0.957 -3.000 0.333 NA   NA
 10384603 10384604 LM5923_1307 LM5923_1308     TRUE 0.752 27.000 0.444 NA   NA
 10384604 10384605 LM5923_1308 LM5923_1309     TRUE 0.915 7.000 0.273 NA   NA
 10384605 10384606 LM5923_1309 LM5923_1310     TRUE 0.937 10.000 0.600 NA   NA
 10384606 10384607 LM5923_1310 LM5923_1311     TRUE 0.968 -16.000 0.500 NA   NA
 10384607 10384608 LM5923_1311 LM5923_1312     TRUE 0.960 -3.000 0.375 NA   NA
 10384608 10384609 LM5923_1312 LM5923_1313     TRUE 0.957 -3.000 0.333 NA   NA
 10384609 10384610 LM5923_1313 LM5923_1314     TRUE 0.873 21.000 0.615 NA   NA
 10384610 10384611 LM5923_1314 LM5923_1315     FALSE 0.356 71.000 0.231 NA   NA
 10384611 10384612 LM5923_1315 LM5923_1316     TRUE 0.598 51.000 0.600 NA   NA
 10384612 10384613 LM5923_1316 LM5923_1317     TRUE 0.923 4.000 0.222 NA   NA
 10384613 10384614 LM5923_1317 LM5923_1318     TRUE 0.912 -12.000 0.000 NA   NA
 10384614 10384615 LM5923_1318 LM5923_1319     TRUE 0.889 13.000 0.222 NA   NA
 10384615 10384616 LM5923_1319 LM5923_1320     TRUE 0.912 -13.000 0.000 NA   NA
 10384616 10384617 LM5923_1320 LM5923_1321     TRUE 0.626 48.000 0.667 NA   NA
 10384617 10384618 LM5923_1321 LM5923_1322     TRUE 0.954 0.000 0.400 NA   NA
 10384618 10384619 LM5923_1322 LM5923_1323     TRUE 0.888 0.000 0.000 NA   NA
 10384619 10384620 LM5923_1323 LM5923_1324     FALSE 0.122 104.000 0.000 NA   NA
 10384621 10384622 LM5923_1325 LM5923_1326     FALSE 0.037 206.000 0.000 NA   NA
 10384626 10384627 LM5923_1330 LM5923_1331     FALSE 0.178 154.000 0.364 NA   NA
 10384630 10384631 LM5923_1334 LM5923_1335     TRUE 0.686 25.000 0.086 NA   NA
 10384631 10384632 LM5923_1335 LM5923_1336     FALSE 0.110 168.000 0.106 NA   NA
 10384633 10384634 LM5923_1337 LM5923_1338     TRUE 0.952 -3.000 0.239 NA   NA
 10384636 10384637 LM5923_1340 LM5923_1341     TRUE 0.520 67.000 0.692 NA   NA
 10384637 10384638 LM5923_1341 LM5923_1342     FALSE 0.312 98.000 0.538 NA   NA
 10384638 10384639 LM5923_1342 LM5923_1343     TRUE 0.817 25.000 0.667 NA   NA
 10384641 10384642 LM5923_1345 LM5923_1346     TRUE 0.980 19.000 0.650 1.000 Y NA
 10384646 10384647 LM5923_1350 LM5923_1351 proA proB TRUE 0.998 -16.000 0.281 0.002 Y NA
 10384647 10384648 LM5923_1351 LM5923_1352 proB   FALSE 0.132 136.000 0.015 NA   NA
 10384648 10384649 LM5923_1352 LM5923_1353     FALSE 0.317 81.000 0.306 NA   NA
 10384650 10384651 LM5923_1354 LM5923_1355     FALSE 0.240 119.000 0.100 1.000   NA
 10384651 10384652 LM5923_1355 LM5923_1356     TRUE 0.897 18.000 0.600 NA   NA
 10384652 10384653 LM5923_1356 LM5923_1357     FALSE 0.020 262.000 0.000 NA   NA
 10384653 10384654 LM5923_1357 LM5923_1358   tig FALSE 0.204 115.000 0.014 1.000   NA
 10384654 10384655 LM5923_1358 LM5923_1359 tig clpX TRUE 0.687 185.000 0.033 0.003 Y NA
 10384655 10384656 LM5923_1359 LM5923_1360 clpX   FALSE 0.142 119.000 0.009 1.000 N NA
 10384656 10384657 LM5923_1360 LM5923_1361     TRUE 0.982 35.000 0.643 0.001 Y NA
 10384657 10384658 LM5923_1361 LM5923_1362     TRUE 0.921 102.000 0.769 0.001 Y NA
 10384658 10384659 LM5923_1362 LM5923_1363   rbgA TRUE 0.895 10.000 0.023 1.000   NA
 10384659 10384660 LM5923_1363 LM5923_1364 rbgA rnhB TRUE 0.957 -3.000 0.148 1.000   NA
 10384660 10384661 LM5923_1364 LM5923_1365 rnhB   TRUE 0.579 134.000 0.037 1.000 Y NA
 10384661 10384662 LM5923_1365 LM5923_1366   topA FALSE 0.220 272.000 0.238 1.000 Y NA
 10384662 10384663 LM5923_1366 LM5923_1367 topA gid FALSE 0.371 63.000 0.137 1.000 N NA
 10384663 10384664 LM5923_1367 LM5923_1368 gid codV FALSE 0.027 283.000 0.105 1.000 N NA
 10384664 10384665 LM5923_1368 LM5923_1369 codV clpQ TRUE 0.779 21.000 0.113 1.000 N NA
 10384665 10384666 LM5923_1369 LM5923_1370 clpQ hslU TRUE 0.987 14.000 0.752 1.000 Y NA
 10384666 10384667 LM5923_1370 LM5923_1371 hslU codY TRUE 0.782 21.000 0.131 1.000 N NA
 10384667 10384668 LM5923_1371 LM5923_1372 codY   FALSE 0.233 103.000 0.076 1.000   NA
 10384668 10384669 LM5923_1372 LM5923_1373     TRUE 0.738 23.000 0.096 NA   NA
 10384669 10384670 LM5923_1373 LM5923_1374     TRUE 0.919 3.000 0.105 NA   NA
 10384672 10384673 LM5923_1376 LM5923_1377   parE FALSE 0.077 181.000 0.030 NA   NA
 10384673 10384674 LM5923_1377 LM5923_1378 parE parC TRUE 0.998 -3.000 0.552 0.002 Y NA
 10384674 10384675 LM5923_1378 LM5923_1379 parC   FALSE 0.201 83.000 0.026 1.000 N NA
 10384675 10384676 LM5923_1379 LM5923_1380     FALSE 0.016 327.000 0.000 1.000   NA
 10384676 10384677 LM5923_1380 LM5923_1381     FALSE 0.011 332.000 0.000 NA   NA
 10384679 10384680 LM5923_1383 LM5923_1384   glpD FALSE 0.213 233.000 0.000 1.000 Y NA
 10384680 10384681 LM5923_1384 LM5923_1385 glpD miaA FALSE 0.134 126.000 0.011 1.000 N NA
 10384681 10384682 LM5923_1385 LM5923_1386 miaA   FALSE 0.249 123.000 0.192 1.000   NA
 10384682 10384683 LM5923_1386 LM5923_1387     FALSE 0.199 105.000 0.014 1.000   NA
 10384683 10384684 LM5923_1387 LM5923_1388     TRUE 0.956 -7.000 0.065 1.000   NA
 10384684 10384685 LM5923_1388 LM5923_1389   glnR FALSE 0.055 203.000 0.046 1.000 N NA
 10384685 10384686 LM5923_1389 LM5923_1390 glnR glnA FALSE 0.329 71.000 0.192 1.000 N NA
 10384686 10384687 LM5923_1390 LM5923_1391 glnA   FALSE 0.162 144.000 0.212 1.000 N NA
 10384688 10384689 LM5923_1392 LM5923_1393     TRUE 0.475 30.000 0.043 NA N NA
 10384690 10384691 LM5923_1394 LM5923_1395     FALSE 0.317 92.000 0.480 NA   NA
 10384691 10384692 LM5923_1395 LM5923_1396   tkt FALSE 0.210 147.000 0.440 NA   NA
 10384692 10384693 LM5923_1396 LM5923_1397 tkt   FALSE 0.043 221.000 0.000 1.000   NA
 10384694 10384695 LM5923_1398 LM5923_1400     FALSE 0.008 553.000 0.026 NA   NA
 10384695 10384696 LM5923_1400 LM5923_1401     TRUE 0.762 22.000 0.087 NA   NA
 10384696 10384697 LM5923_1401 LM5923_1402     TRUE 0.952 10.000 0.692 1.000   NA
 10384697 10384698 LM5923_1402 LM5923_1403     TRUE 0.960 -10.000 0.123 1.000   NA
 10384698 10384699 LM5923_1403 LM5923_1404     TRUE 0.949 -16.000 0.137 NA   NA
 10384700 10384701 LM5923_1405 LM5923_1406 smbA frr TRUE 0.962 0.000 0.626 1.000 N NA
 10384701 10384702 LM5923_1406 LM5923_1407 frr   FALSE 0.070 227.000 0.409 1.000 N NA
 10384702 10384703 LM5923_1407 LM5923_1408   cdsA TRUE 0.979 14.000 0.113 1.000 Y NA
 10384703 10384704 LM5923_1408 LM5923_1409 cdsA   TRUE 0.977 15.000 0.071 1.000 Y NA
 10384704 10384705 LM5923_1409 LM5923_1410     TRUE 0.915 14.000 0.568 1.000 N NA
 10384705 10384706 LM5923_1410 LM5923_1411   proS TRUE 0.503 40.000 0.095 1.000 N NA
 10384706 10384707 LM5923_1411 LM5923_1412 proS polC TRUE 0.410 105.000 0.070 0.043 N NA
 10384707 10384708 LM5923_1412 LM5923_1413 polC   FALSE 0.083 182.000 0.059 NA   NA
 10384708 10384709 LM5923_1413 LM5923_1414   nusA TRUE 0.772 30.000 0.759 NA   NA
 10384709 10384710 LM5923_1414 LM5923_1415 nusA   TRUE 0.978 15.000 0.323 NA Y NA
 10384710 10384711 LM5923_1415 LM5923_1416     TRUE 0.953 -7.000 0.408 NA N NA
 10384711 10384712 LM5923_1416 LM5923_1417   infB TRUE 0.959 23.000 0.223 1.000 Y NA
 10384712 10384713 LM5923_1417 LM5923_1418 infB   TRUE 0.656 27.000 0.102 NA   NA
 10384713 10384714 LM5923_1418 LM5923_1419   rbfA TRUE 0.838 17.000 0.113 NA   NA
 10384714 10384715 LM5923_1419 LM5923_1420 rbfA truB TRUE 0.675 94.000 0.111 1.000 Y NA
 10384715 10384716 LM5923_1420 LM5923_1421 truB ribC TRUE 0.377 70.000 0.308 1.000 N NA
 10384716 10384717 LM5923_1421 LM5923_1422 ribC rpsO FALSE 0.159 137.000 0.119 1.000 N NA
 10384717 10384718 LM5923_1422 LM5923_1423 rpsO pnpA FALSE 0.276 249.000 0.335 1.000 Y NA
 10384719 10384720 LM5923_1424 LM5923_1425     FALSE 0.093 161.000 0.014 NA   NA
 10384720 10384721 LM5923_1425 LM5923_1426     TRUE 0.592 28.000 0.031 NA   NA
 10384722 10384723 LM5923_1427 LM5923_1428 rpmG   FALSE 0.369 56.000 0.045 1.000 N NA
 10384723 10384724 LM5923_1428 LM5923_1429     FALSE 0.224 99.000 0.037 1.000   NA
 10384724 10384725 LM5923_1429 LM5923_1430     TRUE 0.905 13.000 0.347 NA   NA
 10384725 10384726 LM5923_1430 LM5923_1431     TRUE 0.790 25.000 0.496 NA   NA
 10384726 10384727 LM5923_1431 LM5923_1432     FALSE 0.156 134.000 0.058 NA   NA
 10384728 10384729 LM5923_1433 LM5923_1434     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 10384729 10384730 LM5923_1434 LM5923_1435     TRUE 0.937 -37.000 0.036 NA   NA
 10384730 10384731 LM5923_1435 LM5923_1436     TRUE 0.938 -13.000 0.036 NA   NA
 10384731 10384732 LM5923_1436 LM5923_1437     TRUE 0.957 -3.000 0.320 NA   NA
 10384732 10384733 LM5923_1437 LM5923_1438   comGB TRUE 0.997 14.000 0.861 0.001 Y NA
 10384733 10384734 LM5923_1438 LM5923_1439 comGB comGA TRUE 0.995 -22.000 0.639 1.000 Y NA
 10384735 10384736 LM5923_1440 LM5923_1441     TRUE 0.994 16.000 0.092 0.001 Y NA
 10384736 10384737 LM5923_1441 LM5923_1442     TRUE 0.998 -3.000 0.316 0.001 Y NA
 10384738 10384739 LM5923_1443 LM5923_1444     FALSE 0.333 62.000 0.029 NA   NA
 10384739 10384740 LM5923_1444 LM5923_1445     TRUE 0.877 13.000 0.140 NA   NA
 10384741 10384742 LM5923_1446 LM5923_1447   efp FALSE 0.199 103.000 0.160 1.000 N NA
 10384742 10384743 LM5923_1447 LM5923_1448 efp   FALSE 0.120 159.000 0.120 1.000 N NA
 10384743 10384744 LM5923_1448 LM5923_1449     TRUE 0.979 14.000 0.086 1.000 Y NA
 10384744 10384745 LM5923_1449 LM5923_1450     TRUE 0.937 4.000 0.373 NA   NA
 10384745 10384746 LM5923_1450 LM5923_1451   nusB TRUE 0.543 31.000 0.023 NA   NA
 10384746 10384747 LM5923_1451 LM5923_1452 nusB folD FALSE 0.185 96.000 0.056 1.000 N NA
 10384747 10384748 LM5923_1452 LM5923_1453 folD xseA TRUE 0.784 19.000 0.058 1.000 N NA
 10384748 10384749 LM5923_1453 LM5923_1454 xseA   TRUE 0.998 -10.000 0.412 0.001 Y NA
 10384749 10384750 LM5923_1454 LM5923_1455     TRUE 0.913 3.000 0.100 1.000 N NA
 10384750 10384751 LM5923_1455 LM5923_1456   cspL FALSE 0.068 199.000 0.108 1.000 N NA
 10384751 10384752 LM5923_1456 LM5923_1457 cspL tktB FALSE 0.041 215.000 0.015 1.000 N NA
 10384752 10384753 LM5923_1457 LM5923_1458 tktB   TRUE 0.945 -3.000 0.189 1.000 N NA
 10384753 10384754 LM5923_1458 LM5923_1459     FALSE 0.072 191.000 0.064 1.000 N NA
 10384754 10384755 LM5923_1459 LM5923_1460   recN TRUE 0.708 23.000 0.056 1.000 N NA
 10384755 10384756 LM5923_1460 LM5923_1461 recN   FALSE 0.132 129.000 0.013 1.000 N NA
 10384756 10384757 LM5923_1461 LM5923_1462   buk TRUE 0.679 137.000 0.562 1.000 Y NA
 10384757 10384758 LM5923_1462 LM5923_1463 buk   TRUE 0.990 15.000 0.078 0.043 Y NA
 10384758 10384759 LM5923_1463 LM5923_1464     TRUE 0.957 25.000 0.414 1.000 Y NA
 10384759 10384760 LM5923_1464 LM5923_1465     TRUE 0.993 17.000 0.897 0.052 Y NA
 10384760 10384761 LM5923_1465 LM5923_1466     TRUE 0.977 31.000 0.882 0.052 Y NA
 10384763 10384764 LM5923_1468 LM5923_1469     FALSE 0.120 145.000 0.035 1.000 N NA
 10384764 10384765 LM5923_1469 LM5923_1470   lisR FALSE 0.064 191.000 0.025 1.000 N NA
 10384765 10384766 LM5923_1470 LM5923_1471 lisR lisK TRUE 0.994 -3.000 0.438 1.000 Y NA
 10384767 10384768 LM5923_1472 LM5923_1473     TRUE 0.728 37.000 0.833 NA   NA
 10384768 10384769 LM5923_1473 LM5923_1474     FALSE 0.242 86.000 0.115 NA   NA
 10384770 10384771 LM5923_1475 LM5923_1476     TRUE 0.570 29.000 0.026 NA   NA
 10384773 10384774 LM5923_1478 LM5923_1479     FALSE 0.118 152.000 0.042 NA   NA
 10384776 10384777 LM5923_1481 LM5923_1482 tcsA   FALSE 0.017 385.000 0.048 1.000   NA
 10384777 10384778 LM5923_1482 LM5923_1483     TRUE 0.972 -7.000 0.438 1.000   NA
 10384778 10384779 LM5923_1483 LM5923_1484     TRUE 0.992 -3.000 0.720 0.031   NA
 10384779 10384780 LM5923_1484 LM5923_1485     FALSE 0.234 118.000 0.077 1.000   NA
 10384780 10384781 LM5923_1485 LM5923_1486     TRUE 0.995 -19.000 0.872 0.005   NA
 10384781 10384782 LM5923_1486 LM5923_1487     FALSE 0.346 92.000 0.397 1.000   NA
 10384782 10384783 LM5923_1487 LM5923_1488     TRUE 0.545 51.000 0.213 1.000   NA
 10384783 10384784 LM5923_1488 LM5923_1489     FALSE 0.264 90.000 0.077 1.000   NA
 10384784 10384785 LM5923_1489 LM5923_1490   cinA TRUE 0.404 69.000 0.151 1.000   NA
 10384785 10384786 LM5923_1490 LM5923_1491 cinA recA FALSE 0.041 273.000 0.083 1.000   NA
 10384786 10384787 LM5923_1491 LM5923_1492 recA   FALSE 0.024 301.000 0.018 1.000   NA
 10384787 10384788 LM5923_1492 LM5923_1493     FALSE 0.205 114.000 0.016 1.000   NA
 10384788 10384789 LM5923_1493 LM5923_1494     TRUE 0.906 6.000 0.026 1.000   NA
 10384789 10384790 LM5923_1494 LM5923_1495     TRUE 0.806 17.000 0.031 NA   NA
 10384790 10384791 LM5923_1495 LM5923_1496   mutS FALSE 0.167 110.000 0.031 NA   NA
 10384791 10384792 LM5923_1496 LM5923_1497 mutS mutL TRUE 0.992 20.000 0.220 0.001 Y NA
 10384792 10384793 LM5923_1497 LM5923_1498 mutL   TRUE 0.788 17.000 0.020 1.000 N NA
 10384793 10384794 LM5923_1498 LM5923_1499   pflB FALSE 0.007 426.000 0.000 1.000 N NA
 10384794 10384795 LM5923_1499 LM5923_1500 pflB pflC FALSE 0.281 77.000 0.135 1.000 N NA
 10384797 10384798 LM5923_1502 LM5923_1503     FALSE 0.111 128.000 0.000 NA   NA
 10384798 10384799 LM5923_1503 LM5923_1504     TRUE 0.744 17.000 0.000 NA   NA
 10384799 10384800 LM5923_1504 LM5923_1505     FALSE 0.361 41.000 0.000 1.000 N NA
 10384801 10384802 LM5923_1506 LM5923_1507     FALSE 0.115 186.000 0.140 1.000   NA
 10384804 10384805 LM5923_1509 LM5923_1510     FALSE 0.281 70.000 0.029 NA   NA
 10384805 10384806 LM5923_1510 LM5923_1511     TRUE 0.798 19.000 0.068 NA   NA
 10384806 10384807 LM5923_1511 LM5923_1512     TRUE 0.381 64.000 0.152 NA   NA
 10384807 10384808 LM5923_1512 LM5923_1513     TRUE 0.799 17.000 0.021 NA   NA
 10384809 10384810 LM5923_1514 LM5923_1515     TRUE 0.981 -3.000 0.218 0.075 N NA
 10384811 10384812 LM5923_1516 LM5923_1517     FALSE 0.277 139.000 0.700 NA   NA
 10384812 10384813 LM5923_1517 LM5923_1518   opuCD TRUE 0.575 113.000 0.636 0.031 N NA
 10384813 10384814 LM5923_1518 LM5923_1519 opuCD opuCC TRUE 0.975 15.000 0.909 0.031 N NA
 10384814 10384815 LM5923_1519 LM5923_1520 opuCC opuCB TRUE 0.988 2.000 0.909 0.031 N NA
 10384815 10384816 LM5923_1520 LM5923_1521 opuCB opuCA TRUE 0.996 4.000 0.727 0.075 Y NA
 10384816 10384817 LM5923_1521 LM5923_1522 opuCA   FALSE 0.015 293.000 0.000 NA   NA
 10384817 10384818 LM5923_1522 LM5923_1523     FALSE 0.024 249.000 0.000 NA   NA
 10384820 10384821 LM5923_1525 LM5923_1526     TRUE 0.673 53.000 0.786 1.000   NA
 10384821 10384822 LM5923_1526 LM5923_1527     FALSE 0.290 89.000 0.167 1.000   NA
 10384822 10384823 LM5923_1527 LM5923_1528   dapA TRUE 0.801 20.000 0.014 1.000   NA
 10384823 10384824 LM5923_1528 LM5923_1529 dapA   TRUE 0.977 15.000 0.085 1.000 Y NA
 10384824 10384825 LM5923_1529 LM5923_1530     TRUE 0.982 12.000 0.091 1.000 Y NA
 10384825 10384826 LM5923_1530 LM5923_1531     FALSE 0.205 72.000 0.000 NA   NA
 10384826 10384827 LM5923_1531 LM5923_1532     TRUE 0.655 22.000 0.000 NA   NA
 10384827 10384828 LM5923_1532 LM5923_1533   sod FALSE 0.178 130.000 0.169 1.000 N NA
 10384829 10384830 LM5923_1534 LM5923_1535   ispG FALSE 0.152 113.000 0.008 NA   NA
 10384830 10384831 LM5923_1535 LM5923_1536 ispG   FALSE 0.356 36.000 0.007 NA N NA
 10384831 10384832 LM5923_1536 LM5923_1537     TRUE 0.962 -9.000 0.338 NA   NA
 10384833 10384834 LM5923_1538 LM5923_1539   zurR FALSE 0.155 137.000 0.102 1.000 N NA
 10384834 10384835 LM5923_1539 LM5923_1540 zurR zurM TRUE 0.995 -19.000 0.480 1.000 Y NA
 10384835 10384836 LM5923_1540 LM5923_1541 zurM zurA TRUE 0.992 -25.000 0.037 1.000 Y NA
 10384836 10384837 LM5923_1541 LM5923_1542 zurA   FALSE 0.087 143.000 0.000 1.000 N NA
 10384837 10384838 LM5923_1542 LM5923_1543     TRUE 0.803 16.000 0.019 1.000 N NA
 10384838 10384839 LM5923_1543 LM5923_1544     TRUE 0.978 15.000 0.104 1.000 Y NA
 10384841 10384842 LM5923_1546 LM5923_1547     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 10384842 10384843 LM5923_1547 LM5923_1548   rpoD TRUE 0.382 68.000 0.239 NA   NA
 10384843 10384844 LM5923_1548 LM5923_1549 rpoD dnaG FALSE 0.230 95.000 0.209 1.000 N NA
 10384844 10384845 LM5923_1549 LM5923_1550 dnaG   TRUE 0.765 20.000 0.033 NA   NA
 10384845 10384846 LM5923_1550 LM5923_1551     FALSE 0.069 190.000 0.029 NA   NA
 10384846 10384847 LM5923_1551 LM5923_1552   glyS TRUE 0.499 34.000 0.013 NA   NA
 10384847 10384848 LM5923_1552 LM5923_1553 glyS glyQ TRUE 0.999 -7.000 0.651 0.001 Y NA
 10384848 10384849 LM5923_1553 LM5923_1554 glyQ recO FALSE 0.023 282.000 0.036 1.000 N NA
 10384851 10384852 LM5923_1556 LM5923_1557 era   TRUE 0.945 -3.000 0.019 1.000   NA
 10384852 10384853 LM5923_1557 LM5923_1558     TRUE 0.675 25.000 0.090 1.000 N NA
 10384853 10384854 LM5923_1558 LM5923_1559     TRUE 0.949 -22.000 0.123 NA   NA
 10384854 10384855 LM5923_1559 LM5923_1560     TRUE 0.848 17.000 0.182 NA   NA
 10384855 10384856 LM5923_1560 LM5923_1561     TRUE 0.887 16.000 0.172 1.000   NA
 10384856 10384857 LM5923_1561 LM5923_1562     FALSE 0.092 188.000 0.027 1.000   NA
 10384857 10384858 LM5923_1562 LM5923_1563   rpsU TRUE 0.974 11.000 0.150 0.025   NA
 10384858 10384859 LM5923_1563 LM5923_1564 rpsU   FALSE 0.057 198.000 0.019 NA   NA
 10384859 10384860 LM5923_1564 LM5923_1565   prmA TRUE 0.939 1.000 0.227 NA   NA
 10384860 10384861 LM5923_1565 LM5923_1566 prmA dnaJ FALSE 0.301 73.000 0.133 1.000 N NA
 10384861 10384862 LM5923_1566 LM5923_1567 dnaJ dnaK TRUE 0.836 142.000 0.196 0.002 Y NA
 10384862 10384863 LM5923_1567 LM5923_1568 dnaK grpE TRUE 0.971 34.000 0.224 0.005 Y NA
 10384863 10384864 LM5923_1568 LM5923_1569 grpE hrcA TRUE 0.555 42.000 0.286 1.000 N NA
 10384864 10384865 LM5923_1569 LM5923_1570 hrcA hemN FALSE 0.133 147.000 0.082 1.000 N NA
 10384865 10384866 LM5923_1570 LM5923_1571 hemN   FALSE 0.135 89.000 0.000 1.000 N NA
 10384870 10384871 LM5923_1575 LM5923_1576 holA comEC TRUE 0.416 68.000 0.163 1.000   NA
 10384871 10384872 LM5923_1576 LM5923_1577 comEC comEB TRUE 0.601 35.000 0.055 1.000   NA
 10384872 10384873 LM5923_1577 LM5923_1578 comEB comEA FALSE 0.294 72.000 0.095 1.000 N NA
 10384873 10384874 LM5923_1578 LM5923_1579 comEA   FALSE 0.213 103.000 0.033 1.000   NA
 10384874 10384875 LM5923_1579 LM5923_1580     TRUE 0.417 55.000 0.085 NA   NA
 10384875 10384876 LM5923_1580 LM5923_1581     TRUE 0.909 5.000 0.149 NA   NA
 10384876 10384877 LM5923_1581 LM5923_1582     TRUE 0.993 -13.000 0.199 1.000 Y NA
 10384877 10384878 LM5923_1582 LM5923_1583     TRUE 0.775 18.000 0.150 NA N NA
 10384878 10384879 LM5923_1583 LM5923_1584     TRUE 0.902 0.000 0.089 NA N NA
 10384879 10384880 LM5923_1584 LM5923_1585     TRUE 0.873 20.000 0.336 1.000   NA
 10384880 10384881 LM5923_1585 LM5923_1586     TRUE 0.973 -3.000 0.555 1.000   NA
 10384882 10384883 LM5923_1587 LM5923_1588     FALSE 0.128 100.000 0.000 NA   NA
 10384883 10384884 LM5923_1588 LM5923_1589     FALSE 0.039 203.000 0.000 NA   NA
 10384885 10384886 LM5923_1590 LM5923_1591     TRUE 0.411 50.000 0.041 NA   NA
 10384886 10384887 LM5923_1591 LM5923_1592     TRUE 0.461 45.000 0.065 NA   NA
 10384889 10384890 LM5923_1594 LM5923_1595 udk   TRUE 0.949 -3.000 0.039 1.000   NA
 10384890 10384891 LM5923_1595 LM5923_1596     FALSE 0.295 77.000 0.154 NA   NA
 10384893 10384894 LM5923_1598 LM5923_1599     TRUE 0.916 16.000 0.651 NA   NA
 10384894 10384895 LM5923_1599 LM5923_1600     TRUE 0.940 6.000 0.537 NA   NA
 10384895 10384896 LM5923_1600 LM5923_1601   alaS FALSE 0.223 92.000 0.110 NA   NA
 10384896 10384897 LM5923_1601 LM5923_1602 alaS   FALSE 0.006 448.000 0.000 1.000 N NA
 10384897 10384898 LM5923_1602 LM5923_1603     TRUE 0.989 9.000 0.565 1.000 Y NA
 10384899 10384900 LM5923_1604 LM5923_1605     TRUE 0.994 -3.000 0.586 1.000 Y NA
 10384901 10384902 LM5923_1606 LM5923_1607     TRUE 0.645 28.000 0.174 1.000 N NA
 10384902 10384903 LM5923_1607 LM5923_1608     TRUE 0.816 11.000 0.000 NA   NA
 10384903 10384904 LM5923_1608 LM5923_1609     FALSE 0.124 118.000 0.000 NA   NA
 10384904 10384905 LM5923_1609 LM5923_1610     TRUE 0.791 19.000 0.072 1.000 N NA
 10384905 10384906 LM5923_1610 LM5923_1611     FALSE 0.008 380.000 0.000 1.000 N NA
 10384907 10384908 LM5923_1612 LM5923_1613     FALSE 0.014 245.000 0.000 NA N NA
 10384908 10384909 LM5923_1613 LM5923_1614     TRUE 0.881 14.000 0.259 1.000 N NA
 10384909 10384910 LM5923_1614 LM5923_1615     FALSE 0.196 150.000 0.407 NA   NA
 10384911 10384912 LM5923_1616 LM5923_1617 aspS hisS TRUE 0.995 3.000 0.161 0.043 Y NA
 10384914 10384915 LM5923_1619 LM5923_1620   relA TRUE 0.853 16.000 0.177 1.000 N NA
 10384915 10384916 LM5923_1620 LM5923_1621 relA apt FALSE 0.056 206.000 0.068 1.000 N NA
 10384916 10384917 LM5923_1621 LM5923_1622 apt   TRUE 0.946 -10.000 0.128 1.000 N NA
 10384917 10384918 LM5923_1622 LM5923_1623     TRUE 0.726 22.000 0.026 NA   NA
 10384918 10384919 LM5923_1623 LM5923_1624     FALSE 0.191 96.000 0.048 NA   NA
 10384919 10384920 LM5923_1624 LM5923_1625     FALSE 0.219 101.000 0.185 NA   NA
 10384920 10384921 LM5923_1625 LM5923_1626     FALSE 0.118 143.000 0.013 NA   NA
 10384921 10384922 LM5923_1626 LM5923_1627   tgt TRUE 0.567 34.000 0.325 NA N NA
 10384922 10384923 LM5923_1627 LM5923_1628 tgt   TRUE 0.915 87.000 0.360 0.001 Y NA
 10384923 10384924 LM5923_1628 LM5923_1629   ruvB TRUE 0.899 4.000 0.069 1.000 N NA
 10384924 10384925 LM5923_1629 LM5923_1630 ruvB ruvA TRUE 0.995 16.000 0.549 0.002 Y NA
 10384925 10384926 LM5923_1630 LM5923_1631 ruvA   FALSE 0.135 124.000 0.010 1.000 N NA
 10384926 10384927 LM5923_1631 LM5923_1632     FALSE 0.263 70.000 0.012 NA   NA
 10384927 10384928 LM5923_1632 LM5923_1633     FALSE 0.159 111.000 0.016 NA   NA
 10384928 10384929 LM5923_1633 LM5923_1634   obgE TRUE 0.478 46.000 0.012 1.000   NA
 10384929 10384930 LM5923_1634 LM5923_1635 obgE glpK FALSE 0.121 160.000 0.010 1.000   NA
 10384930 10384931 LM5923_1635 LM5923_1636 glpK   FALSE 0.292 75.000 0.131 1.000 N NA
 10384931 10384932 LM5923_1636 LM5923_1637   rpmA FALSE 0.009 367.000 0.000 1.000 N NA
 10384932 10384933 LM5923_1637 LM5923_1638 rpmA   TRUE 0.977 14.000 0.203 NA Y NA
 10384933 10384934 LM5923_1638 LM5923_1639   rplU TRUE 0.967 19.000 0.208 NA Y NA
 10384934 10384935 LM5923_1639 LM5923_1640 rplU   TRUE 0.716 157.000 0.011 0.021 Y NA
 10384935 10384936 LM5923_1640 LM5923_1641   minD TRUE 0.401 52.000 0.060 1.000 N NA
 10384936 10384937 LM5923_1641 LM5923_1642 minD minC TRUE 0.991 3.000 0.368 1.000 Y NA
 10384937 10384938 LM5923_1642 LM5923_1643 minC mreD FALSE 0.091 178.000 0.106 1.000 N NA
 10384938 10384939 LM5923_1643 LM5923_1644 mreD mreC TRUE 0.997 3.000 0.550 0.003 Y NA
 10384939 10384940 LM5923_1644 LM5923_1645 mreC mreB TRUE 0.376 86.000 0.689 1.000 N NA
 10384940 10384941 LM5923_1645 LM5923_1646 mreB radC FALSE 0.006 452.000 0.000 1.000 N NA
 10384941 10384942 LM5923_1646 LM5923_1647 radC comC TRUE 0.844 12.000 0.019 1.000 N NA
 10384942 10384943 LM5923_1647 LM5923_1648 comC   FALSE 0.209 80.000 0.008 NA   NA
 10384943 10384944 LM5923_1648 LM5923_1649   folC TRUE 0.688 25.000 0.091 NA   NA
 10384944 10384945 LM5923_1649 LM5923_1650 folC valS FALSE 0.331 62.000 0.041 1.000 N NA
 10384945 10384946 LM5923_1650 LM5923_1651 valS hemL FALSE 0.011 323.000 0.000 1.000 N NA
 10384946 10384947 LM5923_1651 LM5923_1652 hemL hemB TRUE 0.995 13.000 0.126 0.002 Y NA
 10384947 10384948 LM5923_1652 LM5923_1653 hemB hemD TRUE 0.998 -3.000 0.042 0.002 Y NA
 10384948 10384949 LM5923_1653 LM5923_1654 hemD hemC TRUE 0.997 -3.000 0.020 0.002 Y NA
 10384949 10384950 LM5923_1654 LM5923_1655 hemC hemA TRUE 0.996 4.000 0.016 0.002 Y NA
 10384950 10384951 LM5923_1655 LM5923_1656 hemA   FALSE 0.188 128.000 0.020 1.000   NA
 10384951 10384952 LM5923_1656 LM5923_1657   thrS FALSE 0.195 108.000 0.010 1.000   NA
 10384952 10384953 LM5923_1657 LM5923_1658 thrS dnaI FALSE 0.009 350.000 0.000 1.000 N NA
 10384953 10384954 LM5923_1658 LM5923_1659 dnaI dnaB TRUE 0.989 10.000 0.817 NA Y NA
 10384954 10384955 LM5923_1659 LM5923_1660 dnaB   TRUE 0.863 6.000 0.109 NA N NA
 10384955 10384956 LM5923_1660 LM5923_1661     FALSE 0.167 78.000 0.024 NA N NA
 10384956 10384957 LM5923_1661 LM5923_1662   mutM TRUE 0.939 -40.000 0.066 1.000 N NA
 10384957 10384958 LM5923_1662 LM5923_1663 mutM polA TRUE 0.949 24.000 0.101 1.000 Y NA
 10384958 10384959 LM5923_1663 LM5923_1664 polA citC FALSE 0.079 166.000 0.008 1.000 N NA
 10384959 10384960 LM5923_1664 LM5923_1665 citC citZ TRUE 0.968 20.000 0.140 1.000 Y NA
 10384960 10384961 LM5923_1665 LM5923_1666 citZ   TRUE 0.509 36.000 0.039 NA   NA
 10384961 10384962 LM5923_1666 LM5923_1667   fxsA FALSE 0.111 157.000 0.043 NA   NA
 10384962 10384963 LM5923_1667 LM5923_1668 fxsA pykA FALSE 0.236 118.000 0.082 1.000   NA
 10384963 10384964 LM5923_1668 LM5923_1669 pykA pfkA TRUE 0.434 283.000 0.261 0.005 Y NA
 10384964 10384965 LM5923_1669 LM5923_1670 pfkA accA FALSE 0.023 284.000 0.047 1.000 N NA
 10384965 10384966 LM5923_1670 LM5923_1671 accA accD TRUE 0.998 -10.000 0.234 0.001 Y NA
 10384966 10384967 LM5923_1671 LM5923_1672 accD dnaE FALSE 0.358 122.000 0.003 0.045 N NA
 10384967 10384968 LM5923_1672 LM5923_1673 dnaE   FALSE 0.243 122.000 0.159 1.000   NA
 10384968 10384969 LM5923_1673 LM5923_1674     TRUE 0.870 18.000 0.189 1.000   NA
 10384969 10384970 LM5923_1674 LM5923_1675     TRUE 0.892 11.000 0.024 1.000   NA
 10384974 10384975 LM5923_1679 LM5923_1680 ackA   TRUE 0.939 0.000 0.217 1.000 N NA
 10384977 10384978 LM5923_1682 LM5923_1683     FALSE 0.344 62.000 0.040 NA   NA
 10384978 10384979 LM5923_1683 LM5923_1684     TRUE 0.791 20.000 0.087 NA   NA
 10384981 10384982 LM5923_1686 LM5923_1687 argF argD TRUE 0.991 -3.000 0.037 1.000 Y NA
 10384982 10384983 LM5923_1687 LM5923_1688 argD argB TRUE 0.993 -3.000 0.322 1.000 Y NA
 10384983 10384984 LM5923_1688 LM5923_1689 argB argJ TRUE 0.994 13.000 0.067 0.002 Y NA
 10384984 10384985 LM5923_1689 LM5923_1690 argJ argC TRUE 0.994 16.000 0.303 0.002 Y NA
 10384985 10384986 LM5923_1690 LM5923_1691 argC   FALSE 0.221 174.000 0.013 0.042 N NA
 10384986 10384987 LM5923_1691 LM5923_1692     TRUE 0.942 2.000 0.349 1.000 N NA
 10384987 10384988 LM5923_1692 LM5923_1693     FALSE 0.193 127.000 0.201 1.000 N NA
 10384989 10384990 LM5923_1694 LM5923_1695   rpsD FALSE 0.026 212.000 0.005 NA N NA
 10384991 10384992 LM5923_1696 LM5923_1697   tyrS FALSE 0.017 280.000 0.000 NA   NA
 10384992 10384993 LM5923_1697 LM5923_1698 tyrS ccpA FALSE 0.014 292.000 0.000 1.000 N NA
 10384993 10384994 LM5923_1698 LM5923_1699 ccpA   FALSE 0.033 235.000 0.017 1.000 N NA
 10384994 10384995 LM5923_1699 LM5923_1700     FALSE 0.031 221.000 0.000 NA   NA
 10384995 10384996 LM5923_1700 LM5923_1701     TRUE 0.782 22.000 0.175 NA   NA
 10384998 10384999 LM5923_1703 LM5923_1704   murC FALSE 0.106 145.000 0.010 1.000 N NA
 10384999 10385000 LM5923_1704 LM5923_1705 murC   FALSE 0.088 295.000 0.017 0.005 N NA
 10385000 10385001 LM5923_1705 LM5923_1706     FALSE 0.030 310.000 0.143 1.000   NA
 10385001 10385002 LM5923_1706 LM5923_1707     TRUE 0.939 6.000 0.511 NA   NA
 10385002 10385003 LM5923_1707 LM5923_1708     TRUE 0.681 35.000 0.500 NA   NA
 10385003 10385004 LM5923_1708 LM5923_1709     FALSE 0.205 112.000 0.140 NA   NA
 10385004 10385005 LM5923_1709 LM5923_1710     TRUE 0.955 -25.000 0.224 NA   NA
 10385007 10385008 LM5923_1712 LM5923_1713     FALSE 0.187 110.000 0.074 NA   NA
 10385008 10385009 LM5923_1713 LM5923_1714   trmB TRUE 0.459 61.000 0.117 1.000   NA
 10385009 10385010 LM5923_1714 LM5923_1715 trmB   TRUE 0.901 7.000 0.154 NA   NA
 10385010 10385011 LM5923_1715 LM5923_1716     FALSE 0.021 209.000 0.000 NA N NA
 10385011 10385012 LM5923_1716 LM5923_1717     TRUE 0.953 -3.000 0.297 1.000 N NA
 10385012 10385013 LM5923_1717 LM5923_1718   daaA FALSE 0.027 225.000 0.000 1.000 N NA
 10385013 10385014 LM5923_1718 LM5923_1719 daaA   TRUE 0.694 113.000 0.347 1.000 Y NA
 10385014 10385015 LM5923_1719 LM5923_1720     FALSE 0.321 75.000 0.224 1.000 N NA
 10385017 10385018 LM5923_1722 LM5923_1723     TRUE 0.957 10.000 0.833 1.000   NA
 10385018 10385019 LM5923_1723 LM5923_1724     TRUE 0.760 111.000 0.900 0.001   NA
 10385019 10385020 LM5923_1724 LM5923_1725     TRUE 0.405 85.000 0.750 NA   NA
 10385020 10385021 LM5923_1725 LM5923_1726   trpA FALSE 0.269 71.000 0.024 NA   NA
 10385021 10385022 LM5923_1726 LM5923_1727 trpA trpB TRUE 0.998 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 10385022 10385023 LM5923_1727 LM5923_1728 trpB trpF TRUE 0.997 3.000 0.375 0.002 Y NA
 10385023 10385024 LM5923_1728 LM5923_1729 trpF trpC TRUE 0.998 -3.000 0.264 0.002 Y NA
 10385024 10385025 LM5923_1729 LM5923_1730 trpC trpD TRUE 0.993 -3.000 0.216 1.000 Y NA
 10385025 10385026 LM5923_1730 LM5923_1731 trpD trpG TRUE 0.991 -28.000 0.018 1.000 Y NA
 10385026 10385027 LM5923_1731 LM5923_1732 trpG trpE TRUE 0.998 -3.000 0.321 0.001 Y NA
 10385028 10385029 LM5923_1733 LM5923_1734     FALSE 0.329 123.000 0.750 NA   NA
 10385029 10385030 LM5923_1734 LM5923_1735     TRUE 0.383 84.000 0.625 NA   NA
 10385030 10385031 LM5923_1735 LM5923_1736     TRUE 0.968 -3.000 0.579 NA   NA
 10385032 10385033 LM5923_1737 LM5923_1738     TRUE 0.892 -3.000 0.019 NA N NA
 10385033 10385034 LM5923_1738 LM5923_1739     TRUE 0.840 13.000 0.017 NA   NA
 10385034 10385035 LM5923_1739 LM5923_1740   citB FALSE 0.162 101.000 0.015 NA   NA
 10385035 10385036 LM5923_1740 LM5923_1741 citB   TRUE 0.733 8.000 0.000 NA N NA
 10385036 10385037 LM5923_1741 LM5923_1742     FALSE 0.362 43.000 0.000 NA   NA
 10385037 10385038 LM5923_1742 LM5923_1743     TRUE 0.935 0.000 0.132 NA   NA
 10385038 10385039 LM5923_1743 LM5923_1744     TRUE 0.642 84.000 0.023 NA Y NA
 10385039 10385040 LM5923_1744 LM5923_1745     TRUE 0.994 -3.000 0.669 NA Y NA
 10385042 10385043 LM5923_1747 LM5923_1748     FALSE 0.026 237.000 0.000 NA   NA
 10385043 10385044 LM5923_1748 LM5923_1749     FALSE 0.161 180.000 0.600 NA   NA
 10385044 10385045 LM5923_1749 LM5923_1750     FALSE 0.187 81.000 0.083 NA N NA
 10385045 10385046 LM5923_1750 LM5923_1751     TRUE 0.999 -16.000 0.911 0.008 Y NA
 10385046 10385047 LM5923_1751 LM5923_1752     FALSE 0.010 337.000 0.000 NA   NA
 10385047 10385048 LM5923_1752 LM5923_1753     TRUE 0.922 15.000 0.667 NA   NA
 10385048 10385049 LM5923_1753 LM5923_1754     FALSE 0.005 794.000 0.000 NA   NA
 10385049 10385050 LM5923_1754 LM5923_1755     TRUE 0.861 18.000 0.308 NA   NA
 10385050 10385051 LM5923_1755 LM5923_1756   tsf FALSE 0.005 574.000 0.000 NA   NA
 10385051 10385052 LM5923_1756 LM5923_1757 tsf rpsB TRUE 0.818 80.000 0.748 1.000 Y NA
 10385052 10385053 LM5923_1757 LM5923_1758 rpsB   FALSE 0.006 488.000 0.000 NA   NA
 10385053 10385054 LM5923_1758 LM5923_1759   leuS FALSE 0.095 141.000 0.000 NA   NA
 10385055 10385056 LM5923_1760 LM5923_1761     TRUE 0.969 -3.000 0.408 1.000   NA
 10385057 10385058 LM5923_1762 LM5923_1763 ansB metK FALSE 0.157 137.000 0.108 1.000 N NA
 10385060 10385061 LM5923_1765 LM5923_1766     FALSE 0.166 103.000 0.000 1.000   NA
 10385061 10385062 LM5923_1766 LM5923_1767     TRUE 0.744 17.000 0.000 NA   NA
 10385062 10385063 LM5923_1767 LM5923_1768     TRUE 0.460 57.000 0.250 NA   NA
 10385064 10385065 LM5923_1769 LM5923_1770     FALSE 0.104 150.000 0.007 NA   NA
 10385066 10385067 LM5923_1771 LM5923_1772 menE menB TRUE 0.969 16.000 0.193 0.002 N NA
 10385067 10385068 LM5923_1772 LM5923_1773 menB   TRUE 0.964 -3.000 0.280 1.000   NA
 10385068 10385069 LM5923_1773 LM5923_1774   menD TRUE 0.956 2.000 0.355 1.000   NA
 10385069 10385070 LM5923_1774 LM5923_1775 menD menF TRUE 0.992 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 10385072 10385073 LM5923_1777 LM5923_1778     TRUE 0.992 -3.000 0.162 1.000 Y NA
 10385073 10385074 LM5923_1778 LM5923_1779     TRUE 0.998 -7.000 0.600 0.005 Y NA
 10385074 10385075 LM5923_1779 LM5923_1780     TRUE 0.955 22.000 0.017 1.000 Y NA
 10385075 10385076 LM5923_1780 LM5923_1781     FALSE 0.009 290.000 0.000 NA N NA
 10385076 10385077 LM5923_1781 LM5923_tRNA11     FALSE 0.235 67.000 0.000 NA   NA
 10385077 10385078 LM5923_tRNA11 LM5923_tRNA12     TRUE 0.838 6.000 0.000 NA   NA
 10385078 10385079 LM5923_tRNA12 LM5923_tRNA13     TRUE 0.422 35.000 0.000 NA   NA
 10385079 10385080 LM5923_tRNA13 LM5923_tRNA14     TRUE 0.831 7.000 0.000 NA   NA
 10385080 10385081 LM5923_tRNA14 LM5923_tRNA15     TRUE 0.542 26.000 0.000 NA   NA
 10385081 10385082 LM5923_tRNA15 LM5923_tRNA16     TRUE 0.593 24.000 0.000 NA   NA
 10385082 10385083 LM5923_tRNA16 LM5923_tRNA17     TRUE 0.486 29.000 0.000 NA   NA
 10385083 10385084 LM5923_tRNA17 LM5923_tRNA18     TRUE 0.845 5.000 0.000 NA   NA
 10385084 10385085 LM5923_tRNA18 LM5923_tRNA19     TRUE 0.845 5.000 0.000 NA   NA
 10385085 10385086 LM5923_tRNA19 LM5923_tRNA20     FALSE 0.362 43.000 0.000 NA   NA
 10385086 10385087 LM5923_tRNA20 LM5923_tRNA21     TRUE 0.622 23.000 0.000 NA   NA
 10385087 10385088 LM5923_tRNA21 LM5923_tRNA22     TRUE 0.810 12.000 0.000 NA   NA
 10385088 10385089 LM5923_tRNA22 LM5923_tRNA23     FALSE 0.362 43.000 0.000 NA   NA
 10385089 10385090 LM5923_tRNA23 LM5923_tRNA24     TRUE 0.622 23.000 0.000 NA   NA
 10385090 10385091 LM5923_tRNA24 LM5923_tRNA25     TRUE 0.816 11.000 0.000 NA   NA
 10385091 10385092 LM5923_tRNA25 LM5923_tRNA26     TRUE 0.821 10.000 0.000 NA   NA
 10385092 10385093 LM5923_tRNA26 LM5923_tRNA27     TRUE 0.774 15.000 0.000 NA   NA
 10385093 10385094 LM5923_tRNA27 LM5923_tRNA28     FALSE 0.348 45.000 0.000 NA   NA
 10385094 10385095 LM5923_tRNA28 LM5923_tRNA29     TRUE 0.838 6.000 0.000 NA   NA
 10385095 10385096 LM5923_tRNA29 LM5923_tRNA30     FALSE 0.371 42.000 0.000 NA   NA
 10385096 10385097 LM5923_tRNA30 LM5923_tRNA31     TRUE 0.824 9.000 0.000 NA   NA
 10385097 10385098 LM5923_tRNA31 LM5923_rRNA04     TRUE 0.783 14.000 0.000 NA   NA
 10385098 10385099 LM5923_rRNA04 LM5923_rRNA05     FALSE 0.164 82.000 0.000 NA   NA
 10385099 10385100 LM5923_rRNA05 LM5923_rRNA06     FALSE 0.024 246.000 0.000 NA   NA
 10385100 10385101 LM5923_rRNA06 LM5923_1782     FALSE 0.007 442.000 0.000 NA   NA
 10385101 10385102 LM5923_1782 LM5923_1783     FALSE 0.250 83.000 0.146 1.000 N NA
 10385103 10385104 LM5923_1784 LM5923_1785 gsaB   FALSE 0.194 107.000 0.102 NA   NA
 10385105 10385106 LM5923_1786 LM5923_1787     FALSE 0.090 155.000 0.088 NA N NA
 10385106 10385107 LM5923_1787 LM5923_1788     TRUE 0.876 4.000 0.010 1.000 N NA
 10385109 10385110 LM5923_1790 LM5923_1791     TRUE 0.848 12.000 0.013 NA   NA
 10385110 10385111 LM5923_1791 LM5923_1792   recX TRUE 0.903 2.000 0.015 NA   NA
 10385113 10385114 LM5923_1794 LM5923_1795     TRUE 0.635 27.000 0.059 NA   NA
 10385117 10385118 LM5923_1798 LM5923_1799     TRUE 0.726 28.000 0.400 NA   NA
 10385119 10385120 LM5923_1800 LM5923_1801     TRUE 0.750 29.000 0.579 NA   NA
 10385120 10385121 LM5923_1801 LM5923_1802     FALSE 0.114 125.000 0.000 NA   NA
 10385121 10385122 LM5923_1802 LM5923_1803     TRUE 0.744 17.000 0.000 NA   NA
 10385122 10385123 LM5923_1803 LM5923_1804     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 10385123 10385124 LM5923_1804 LM5923_1805     TRUE 0.805 11.000 0.000 1.000 N NA
 10385124 10385125 LM5923_1805 LM5923_1806     FALSE 0.355 44.000 0.000 NA   NA
 10385125 10385126 LM5923_1806 LM5923_1807     FALSE 0.040 202.000 0.000 NA   NA
 10385126 10385127 LM5923_1807 LM5923_1808     TRUE 0.812 25.000 0.625 NA   NA
 10385127 10385128 LM5923_1808 LM5923_1809     TRUE 0.967 0.000 0.750 NA   NA
 10385128 10385129 LM5923_1809 LM5923_1810     FALSE 0.157 256.000 0.000 0.002   NA
 10385129 10385130 LM5923_1810 LM5923_1811     FALSE 0.008 550.000 0.000 1.000   NA
 10385130 10385131 LM5923_1811 LM5923_1812     FALSE 0.005 642.000 0.000 NA   NA
 10385131 10385132 LM5923_1812 LM5923_1813     FALSE 0.185 77.000 0.000 NA   NA
 10385132 10385133 LM5923_1813 LM5923_1814     FALSE 0.372 55.000 0.039 1.000 N NA
 10385133 10385134 LM5923_1814 LM5923_1815     FALSE 0.007 614.000 0.000 1.000   NA
 10385134 10385135 LM5923_1815 LM5923_1816     TRUE 0.836 14.000 0.000 1.000   NA
 10385135 10385136 LM5923_1816 LM5923_1817     TRUE 0.561 30.000 0.000 1.000   NA
 10385136 10385137 LM5923_1817 LM5923_1818     TRUE 0.829 15.000 0.000 1.000   NA
 10385137 10385138 LM5923_1818 LM5923_1819     FALSE 0.123 103.000 0.000 NA   NA
 10385138 10385139 LM5923_1819 LM5923_1820     FALSE 0.125 116.000 0.000 NA   NA
 10385139 10385140 LM5923_1820 LM5923_1821     FALSE 0.325 79.000 0.286 NA   NA
 10385140 10385141 LM5923_1821 LM5923_1822     FALSE 0.008 395.000 0.000 NA   NA
 10385141 10385142 LM5923_1822 LM5923_1823     TRUE 0.796 13.000 0.000 NA   NA
 10385142 10385143 LM5923_1823 LM5923_1824     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 10385143 10385144 LM5923_1824 LM5923_1825     FALSE 0.189 76.000 0.000 NA   NA
 10385144 10385145 LM5923_1825 LM5923_1826     TRUE 0.935 7.000 0.500 NA   NA
 10385145 10385146 LM5923_1826 LM5923_1827     TRUE 0.637 32.000 0.250 NA   NA
 10385146 10385147 LM5923_1827 LM5923_1828     FALSE 0.012 638.000 0.375 NA   NA
 10385147 10385148 LM5923_1828 LM5923_1829     TRUE 0.958 -7.000 0.286 NA   NA
 10385148 10385149 LM5923_1829 LM5923_1830     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 10385149 10385150 LM5923_1830 LM5923_1831     TRUE 0.889 13.000 0.222 NA   NA
 10385150 10385151 LM5923_1831 LM5923_1832     TRUE 0.957 -3.000 0.333 NA   NA
 10385151 10385152 LM5923_1832 LM5923_1833     FALSE 0.006 501.000 0.000 NA   NA
 10385152 10385153 LM5923_1833 LM5923_1834     FALSE 0.025 242.000 0.000 NA   NA
 10385153 10385154 LM5923_1834 LM5923_1835     FALSE 0.141 91.000 0.000 NA   NA
 10385154 10385155 LM5923_1835 LM5923_1836     FALSE 0.215 70.000 0.000 NA   NA
 10385155 10385156 LM5923_1836 LM5923_1837     FALSE 0.260 95.000 0.286 NA   NA
 10385156 10385157 LM5923_1837 LM5923_1838     TRUE 0.960 -3.000 0.375 NA   NA
 10385157 10385158 LM5923_1838 LM5923_1839     TRUE 0.669 33.000 0.375 NA   NA
 10385158 10385159 LM5923_1839 LM5923_1840     TRUE 0.942 6.000 0.571 NA   NA
 10385159 10385160 LM5923_1840 LM5923_1841     TRUE 0.967 -3.000 0.571 NA   NA
 10385160 10385161 LM5923_1841 LM5923_1842     TRUE 0.956 -6.000 0.286 1.000 N NA
 10385161 10385162 LM5923_1842 LM5923_1843     TRUE 0.935 1.000 0.400 NA N NA
 10385162 10385163 LM5923_1843 LM5923_1844     TRUE 0.486 29.000 0.000 NA   NA
 10385163 10385164 LM5923_1844 LM5923_1845     FALSE 0.007 427.000 0.000 NA   NA
 10385164 10385165 LM5923_1845 LM5923_1846     TRUE 0.393 38.000 0.000 NA   NA
 10385165 10385166 LM5923_1846 LM5923_1847     TRUE 0.763 27.000 0.500 NA   NA
 10385166 10385167 LM5923_1847 LM5923_1848     FALSE 0.315 51.000 0.000 NA   NA
 10385167 10385168 LM5923_1848 LM5923_1849