MicrobesOnline Operon Predictions for Rhodococcus opacus B4

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7717660 7717661 ROP_00010 ROP_00020     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717663 7717664 ROP_00040 ROP_00050     TRUE 0.879 0.000 0.000 NA   NA
 7717665 7717666 ROP_00060 ROP_00070     TRUE 0.967 5.000 0.500 NA   NA
 7717667 7717668 ROP_00080 ROP_00090     FALSE 0.157 71.000 0.000 1.000 N NA
 7717668 7717669 ROP_00090 ROP_00100     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717669 7717670 ROP_00100 ROP_00110     FALSE 0.084 91.000 0.000 NA   NA
 7717670 7717671 ROP_00110 ROP_00120     FALSE 0.071 101.000 0.000 NA   NA
 7717672 7717673 ROP_00130 ROP_00140     TRUE 0.995 -3.000 0.500 1.000   NA
 7717674 7717675 ROP_00150 ROP_00160 arsR arsB TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7717675 7717676 ROP_00160 ROP_00170 arsB   TRUE 0.890 0.000 0.000 NA N NA
 7717676 7717677 ROP_00170 ROP_00180   arsC TRUE 0.851 59.000 0.500 NA Y NA
 7717677 7717678 ROP_00180 ROP_00190 arsC   TRUE 0.836 18.000 0.000 NA Y NA
 7717678 7717679 ROP_00190 ROP_00200   arsD TRUE 0.855 21.000 0.400 NA   NA
 7717679 7717680 ROP_00200 ROP_00210 arsD arsA TRUE 0.915 18.000 0.571 1.000   NA
 7717681 7717682 ROP_00220 ROP_00230 nhaA   FALSE 0.028 157.000 0.000 NA   NA
 7717682 7717683 ROP_00230 ROP_00240     FALSE 0.381 26.000 0.000 NA   NA
 7717683 7717684 ROP_00240 ROP_00250     TRUE 0.713 43.000 0.308 1.000 N NA
 7717686 7717687 ROP_00270 ROP_00280     TRUE 0.793 12.000 0.097 1.000 N NA
 7717687 7717688 ROP_00280 ROP_00290     TRUE 0.994 -6.000 0.452 0.064 Y NA
 7717688 7717689 ROP_00290 ROP_00300     FALSE 0.006 348.000 0.000 NA   NA
 7717691 7717692 ROP_00320 ROP_00330     FALSE 0.014 213.000 0.000 NA   NA
 7717692 7717693 ROP_00330 ROP_00340     TRUE 0.993 -3.000 0.383 NA   NA
 7717693 7717694 ROP_00340 ROP_00350     FALSE 0.095 83.000 0.000 NA   NA
 7717694 7717695 ROP_00350 ROP_00360     FALSE 0.104 88.000 0.000 1.000   NA
 7717695 7717696 ROP_00360 ROP_00370     FALSE 0.269 41.000 0.000 NA   NA
 7717696 7717697 ROP_00370 ROP_00380     FALSE 0.174 58.000 0.000 NA   NA
 7717697 7717698 ROP_00380 ROP_00390     FALSE 0.293 37.000 0.000 NA   NA
 7717698 7717699 ROP_00390 ROP_00400     FALSE 0.549 95.000 0.667 NA   NA
 7717699 7717700 ROP_00400 ROP_00410     FALSE 0.105 77.000 0.000 NA   NA
 7717700 7717701 ROP_00410 ROP_00420     TRUE 0.833 2.000 0.000 NA   NA
 7717701 7717702 ROP_00420 ROP_00430     TRUE 0.582 -156.000 0.000 NA   NA
 7717702 7717703 ROP_00430 ROP_00440     FALSE 0.050 125.000 0.000 NA   NA
 7717703 7717704 ROP_00440 ROP_00450     FALSE 0.008 286.000 0.000 NA   NA
 7717704 7717705 ROP_00450 ROP_00460     FALSE 0.006 360.000 0.000 NA   NA
 7717706 7717707 ROP_00470 ROP_00480     FALSE 0.139 67.000 0.000 NA   NA
 7717709 7717710 ROP_00500 ROP_00510     FALSE 0.011 246.000 0.000 NA   NA
 7717710 7717711 ROP_00510 ROP_00520     FALSE 0.029 155.000 0.000 NA   NA
 7717711 7717712 ROP_00520 ROP_00530     FALSE 0.034 145.000 0.000 NA   NA
 7717714 7717715 ROP_00550 ROP_00560     FALSE 0.003 1147.000 0.000 NA   NA
 7717717 7717718 ROP_00580 ROP_00590     FALSE 0.072 100.000 0.000 NA   NA
 7717718 7717719 ROP_00590 ROP_00600     FALSE 0.194 53.000 0.000 NA   NA
 7717721 7717722 ROP_00620 ROP_00630     FALSE 0.098 81.000 0.000 NA   NA
 7717724 7717725 ROP_00650 ROP_00660   acn TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717726 7717727 ROP_00670 ROP_00680 sdhB   FALSE 0.134 68.000 0.000 NA   NA
 7717731 7717732 ROP_00720 ROP_00730     FALSE 0.117 73.000 0.000 NA   NA
 7717732 7717733 ROP_00730 ROP_00740     TRUE 0.696 -13.000 0.000 NA   NA
 7717733 7717734 ROP_00740 ROP_00750   tal FALSE 0.113 138.000 0.000 0.027   NA
 7717734 7717735 ROP_00750 ROP_00760 tal   FALSE 0.121 72.000 0.000 NA   NA
 7717735 7717736 ROP_00760 ROP_00770     FALSE 0.013 221.000 0.000 NA   NA
 7717737 7717738 ROP_00780 ROP_00790   folE FALSE 0.045 130.000 0.000 NA   NA
 7717739 7717740 ROP_00800 ROP_00810     FALSE 0.234 46.000 0.000 NA   NA
 7717741 7717742 ROP_00820 ROP_00830   ctaD TRUE 0.991 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7717742 7717743 ROP_00830 ROP_00840 ctaD   TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717743 7717744 ROP_00840 ROP_00850     FALSE 0.476 17.000 0.000 NA   NA
 7717744 7717745 ROP_00850 ROP_00860     TRUE 0.711 -12.000 0.000 NA   NA
 7717745 7717746 ROP_00860 ROP_00870     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717746 7717747 ROP_00870 ROP_00880     FALSE 0.081 93.000 0.000 NA   NA
 7717749 7717750 ROP_00900 ROP_00910     FALSE 0.127 70.000 0.000 NA   NA
 7717750 7717751 ROP_00910 ROP_00920     FALSE 0.003 711.000 0.000 NA   NA
 7717752 7717753 ROP_00930 ROP_00940     FALSE 0.555 14.000 0.000 1.000   NA
 7717754 7717755 ROP_00950 ROP_00960     FALSE 0.029 154.000 0.000 NA   NA
 7717755 7717756 ROP_00960 ROP_00970     FALSE 0.510 14.000 0.000 NA   NA
 7717756 7717757 ROP_00970 ROP_00980     FALSE 0.050 125.000 0.000 NA   NA
 7717759 7717760 ROP_01010 ROP_01020     FALSE 0.017 203.000 0.000 NA N NA
 7717761 7717762 ROP_01030 ROP_01040     TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7717762 7717763 ROP_01040 ROP_01050     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717763 7717764 ROP_01050 ROP_01060     FALSE 0.510 14.000 0.000 NA   NA
 7717764 7717765 ROP_01060 ROP_01070     TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7717765 7717766 ROP_01070 ROP_01080     FALSE 0.212 59.000 0.000 1.000 N NA
 7717766 7717767 ROP_01080 ROP_01090     FALSE 0.250 44.000 0.000 NA   NA
 7717767 7717768 ROP_01090 ROP_01100     TRUE 0.851 1.000 0.000 NA   NA
 7717768 7717769 ROP_01100 ROP_01110     TRUE 0.897 0.000 0.000 1.000   NA
 7717769 7717770 ROP_01110 ROP_01120     FALSE 0.072 112.000 0.000 1.000   NA
 7717770 7717771 ROP_01120 ROP_01130     TRUE 0.600 54.000 0.000 1.000 Y NA
 7717772 7717773 ROP_01140 ROP_01150     FALSE 0.003 829.000 0.000 NA   NA
 7717774 7717775 ROP_01160 ROP_01170     FALSE 0.220 48.000 0.000 NA   NA
 7717775 7717776 ROP_01170 ROP_01180     FALSE 0.140 75.000 0.000 1.000 N NA
 7717778 7717779 ROP_01200 ROP_01210     FALSE 0.006 417.000 0.000 1.000   NA
 7717779 7717780 ROP_01210 ROP_01220     FALSE 0.033 159.000 0.000 1.000   NA
 7717780 7717781 ROP_01220 ROP_01230     FALSE 0.005 488.000 0.000 1.000   NA
 7717783 7717784 ROP_01250 ROP_01260     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717784 7717785 ROP_01260 ROP_01270     FALSE 0.005 426.000 0.000 NA   NA
 7717788 7717789 ROP_01300 ROP_01310     FALSE 0.006 368.000 0.000 NA   NA
 7717789 7717790 ROP_01310 ROP_01320     FALSE 0.011 273.000 0.000 1.000   NA
 7717790 7717791 ROP_01320 ROP_01330     FALSE 0.003 1169.000 0.000 NA   NA
 7717791 7717792 ROP_01330 ROP_01340     FALSE 0.006 344.000 0.000 NA   NA
 7717792 7717793 ROP_01340 ROP_01350     FALSE 0.003 803.000 0.000 NA   NA
 7717793 7717794 ROP_01350 ROP_01360     FALSE 0.048 127.000 0.000 NA   NA
 7717794 7717795 ROP_01360 ROP_01370     FALSE 0.016 199.000 0.000 NA   NA
 7717796 7717797 ROP_01380 ROP_01390     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717797 7717798 ROP_01390 ROP_01400     FALSE 0.358 29.000 0.000 NA   NA
 7717798 7717799 ROP_01400 ROP_01410     FALSE 0.174 58.000 0.000 NA   NA
 7717799 7717800 ROP_01410 ROP_01420     TRUE 0.741 -9.000 0.000 NA   NA
 7717801 7717802 ROP_01430 ROP_01440     FALSE 0.439 20.000 0.000 NA   NA
 7717802 7717803 ROP_01440 ROP_01450     FALSE 0.439 20.000 0.000 NA   NA
 7717804 7717805 ROP_01460 ROP_01470     TRUE 0.986 2.000 0.667 NA   NA
 7717807 7717808 ROP_01490 ROP_01500     FALSE 0.026 163.000 0.000 NA   NA
 7717809 7717810 ROP_01510 ROP_01520     FALSE 0.030 152.000 0.000 NA   NA
 7717811 7717812 ROP_01530 ROP_01540     FALSE 0.013 224.000 0.000 NA   NA
 7717813 7717814 ROP_01550 ROP_01560 dnaK grpE TRUE 0.972 7.000 0.074 0.004 Y NA
 7717814 7717815 ROP_01560 ROP_01570 grpE dnaJ TRUE 0.603 93.000 0.071 0.004 Y NA
 7717816 7717817 ROP_01580 ROP_01590     FALSE 0.011 246.000 0.000 NA   NA
 7717819 7717820 ROP_01610 ROP_01620     FALSE 0.006 344.000 0.000 NA   NA
 7717820 7717821 ROP_01620 ROP_01630     FALSE 0.439 20.000 0.000 NA   NA
 7717821 7717822 ROP_01630 ROP_01640     FALSE 0.007 314.000 0.000 NA   NA
 7717823 7717824 ROP_01650 ROP_01660 hsp18   FALSE 0.127 70.000 0.000 NA   NA
 7717824 7717825 ROP_01660 ROP_01670     FALSE 0.005 387.000 0.000 NA   NA
 7717826 7717827 ROP_01680 ROP_01690     TRUE 0.951 -3.000 0.000 NA N NA
 7717828 7717829 ROP_01700 ROP_01710     FALSE 0.451 19.000 0.000 NA   NA
 7717830 7717831 ROP_01720 ROP_01730     FALSE 0.084 91.000 0.000 NA   NA
 7717831 7717832 ROP_01730 ROP_01740     FALSE 0.019 182.000 0.000 NA   NA
 7717837 7717838 ROP_01790 ROP_01800     FALSE 0.065 106.000 0.000 NA   NA
 7717838 7717839 ROP_01800 ROP_01810     FALSE 0.084 91.000 0.000 NA   NA
 7717840 7717841 ROP_01820 ROP_01830     FALSE 0.002 3826.000 0.000 NA   NA
 7717842 7717843 ROP_01840 ROP_01850     TRUE 0.606 -73.000 0.000 NA   NA
 7717843 7717844 ROP_01850 ROP_01860     TRUE 0.578 -189.000 0.000 NA   NA
 7717844 7717845 ROP_01860 ROP_01870     FALSE 0.560 -412.000 0.000 NA   NA
 7717845 7717846 ROP_01870 ROP_01880     FALSE 0.013 223.000 0.000 NA   NA
 7717848 7717849 ROP_01900 ROP_01910     TRUE 0.623 -45.000 0.000 NA   NA
 7717849 7717850 ROP_01910 ROP_01920   devR FALSE 0.108 76.000 0.000 NA   NA
 7717850 7717851 ROP_01920 ROP_01930 devR devS TRUE 0.944 49.000 0.667 0.013 Y NA
 7717855 7717856 ROP_01970 ROP_01980     FALSE 0.025 165.000 0.000 NA   NA
 7717856 7717857 ROP_01980 ROP_01990     FALSE 0.293 37.000 0.000 NA   NA
 7717857 7717858 ROP_01990 ROP_02000     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717858 7717859 ROP_02000 ROP_02010     FALSE 0.055 119.000 0.000 NA   NA
 7717861 7717862 ROP_02030 ROP_02040     FALSE 0.510 14.000 0.000 NA   NA
 7717862 7717863 ROP_02040 ROP_02050     FALSE 0.203 51.000 0.000 NA   NA
 7717864 7717865 ROP_02060 ROP_02070     FALSE 0.062 110.000 0.000 NA   NA
 7717866 7717867 ROP_02080 ROP_02090     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717867 7717868 ROP_02090 ROP_02100     FALSE 0.054 121.000 0.000 NA   NA
 7717870 7717871 ROP_02120 ROP_02130     FALSE 0.014 218.000 0.000 NA   NA
 7717871 7717872 ROP_02130 ROP_02140   otsA TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA N NA
 7717873 7717874 ROP_02150 ROP_02160     FALSE 0.020 178.000 0.000 NA   NA
 7717874 7717875 ROP_02160 ROP_02170     TRUE 0.897 0.000 0.000 1.000   NA
 7717875 7717876 ROP_02170 ROP_02180     FALSE 0.048 137.000 0.000 1.000   NA
 7717877 7717878 ROP_02190 ROP_02200 dps   FALSE 0.257 43.000 0.000 NA   NA
 7717878 7717879 ROP_02200 ROP_02210     FALSE 0.226 47.000 0.000 NA   NA
 7717879 7717880 ROP_02210 ROP_02220     FALSE 0.007 327.000 0.000 NA   NA
 7717880 7717881 ROP_02220 ROP_02230     FALSE 0.279 39.000 0.000 NA   NA
 7717881 7717882 ROP_02230 ROP_02240     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717884 7717885 ROP_02260 ROP_02270     FALSE 0.007 314.000 0.000 NA   NA
 7717885 7717886 ROP_02270 ROP_02280     FALSE 0.342 31.000 0.000 NA   NA
 7717887 7717888 ROP_02290 ROP_02300     FALSE 0.011 240.000 0.000 NA   NA
 7717890 7717891 ROP_02320 ROP_02330     TRUE 0.956 5.000 0.375 NA   NA
 7717893 7717894 ROP_02350 ROP_02360     FALSE 0.451 19.000 0.000 NA   NA
 7717895 7717896 ROP_02370 ROP_02380     FALSE 0.274 40.000 0.000 NA   NA
 7717898 7717899 ROP_02400 ROP_02410     FALSE 0.004 516.000 0.000 NA   NA
 7717900 7717901 ROP_02420 ROP_02430   dapA FALSE 0.017 223.000 0.000 1.000 N NA
 7717901 7717902 ROP_02430 ROP_02440 dapA   FALSE 0.214 49.000 0.000 NA   NA
 7717904 7717905 ROP_02460 ROP_02470     TRUE 0.971 -3.000 0.045 NA   NA
 7717905 7717906 ROP_02470 ROP_02480     TRUE 0.892 3.000 0.051 NA   NA
 7717906 7717907 ROP_02480 ROP_02490     TRUE 0.972 -3.000 0.051 NA   NA
 7717908 7717909 ROP_02500 ROP_02510     TRUE 0.999 -3.000 0.577 0.099 Y NA
 7717909 7717910 ROP_02510 ROP_02520     TRUE 0.999 -3.000 0.423 0.001 Y NA
 7717911 7717912 ROP_02530 ROP_02540     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717912 7717913 ROP_02540 ROP_02550     FALSE 0.009 279.000 0.000 NA   NA
 7717913 7717914 ROP_02550 ROP_02560     FALSE 0.092 95.000 0.000 1.000   NA
 7717914 7717915 ROP_02560 ROP_02570     FALSE 0.053 122.000 0.000 NA   NA
 7717915 7717916 ROP_02570 ROP_02580     TRUE 0.571 119.000 1.000 NA   NA
 7717916 7717917 ROP_02580 ROP_02590     FALSE 0.014 216.000 0.000 NA   NA
 7717919 7717920 ROP_02610 ROP_02620   ppm1 FALSE 0.017 224.000 0.000 1.000 N NA
 7717920 7717921 ROP_02620 ROP_02630 ppm1 ppm2 TRUE 0.925 -19.000 0.000 1.000 Y NA
 7717921 7717922 ROP_02630 ROP_02640 ppm2   TRUE 0.928 -10.000 0.041 0.004   NA
 7717922 7717923 ROP_02640 ROP_02650     TRUE 0.618 19.000 0.037 1.000   NA
 7717926 7717927 ROP_02680 ROP_02690     FALSE 0.539 12.000 0.000 NA   NA
 7717927 7717928 ROP_02690 ROP_02700     FALSE 0.020 178.000 0.000 NA   NA
 7717929 7717930 ROP_02710 ROP_02720     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717931 7717932 ROP_02730 ROP_02740     FALSE 0.047 128.000 0.000 NA   NA
 7717932 7717933 ROP_02740 ROP_02750     FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 7717933 7717934 ROP_02750 ROP_02760     FALSE 0.007 311.000 0.000 NA   NA
 7717935 7717936 ROP_02770 ROP_02780     FALSE 0.023 182.000 0.000 1.000   NA
 7717937 7717938 ROP_02790 ROP_02800     FALSE 0.476 23.000 0.015 NA   NA
 7717938 7717939 ROP_02800 ROP_02810     TRUE 0.997 -3.000 0.914 NA   NA
 7717939 7717940 ROP_02810 ROP_02820     FALSE 0.014 220.000 0.000 NA   NA
 7717940 7717941 ROP_02820 ROP_02830     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717944 7717945 ROP_02860 ROP_02870     FALSE 0.293 37.000 0.000 NA   NA
 7717945 7717946 ROP_02870 ROP_02880     TRUE 0.660 7.000 0.000 NA   NA
 7717946 7717947 ROP_02880 ROP_02890     FALSE 0.133 77.000 0.000 1.000 N NA
 7717947 7717948 ROP_02890 ROP_02900     FALSE 0.020 197.000 0.000 1.000   NA
 7717948 7717949 ROP_02900 ROP_02910   cobN FALSE 0.508 18.000 0.000 1.000   NA
 7717950 7717951 ROP_02920 ROP_02930 cobG cobH TRUE 0.795 25.000 0.255 1.000 N NA
 7717951 7717952 ROP_02930 ROP_02940 cobH cobIJ TRUE 0.997 -3.000 0.096 0.006 Y NA
 7717953 7717954 ROP_02950 ROP_02960     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA N NA
 7717956 7717957 ROP_02980 ROP_02990     FALSE 0.124 71.000 0.000 NA   NA
 7717957 7717958 ROP_02990 ROP_03000     FALSE 0.005 444.000 0.000 NA   NA
 7717958 7717959 ROP_03000 ROP_03010     FALSE 0.090 87.000 0.000 NA   NA
 7717959 7717960 ROP_03010 ROP_03020     FALSE 0.072 225.000 0.000 NA Y NA
 7717960 7717961 ROP_03020 ROP_03030     FALSE 0.009 295.000 0.000 NA N NA
 7717962 7717963 ROP_03040 ROP_03050     FALSE 0.547 -1101.000 0.000 NA   NA
 7717964 7717965 ROP_03060 ROP_03070     FALSE 0.044 131.000 0.000 NA   NA
 7717965 7717966 ROP_03070 ROP_03080     FALSE 0.134 68.000 0.000 NA   NA
 7717967 7717968 ROP_03090 ROP_03100     TRUE 0.991 -16.000 0.607 0.047 Y NA
 7717968 7717969 ROP_03100 ROP_03110     TRUE 0.627 28.000 0.077 1.000 N NA
 7717971 7717972 ROP_03130 ROP_03140     FALSE 0.052 123.000 0.000 NA   NA
 7717972 7717973 ROP_03140 ROP_03150     FALSE 0.040 137.000 0.000 NA   NA
 7717976 7717977 ROP_03180 ROP_03190     FALSE 0.047 128.000 0.000 NA   NA
 7717977 7717978 ROP_03190 ROP_03200     TRUE 0.998 -3.000 0.286 0.083 Y NA
 7717978 7717979 ROP_03200 ROP_03210     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717979 7717980 ROP_03210 ROP_03220     TRUE 0.642 50.000 0.333 NA   NA
 7717980 7717981 ROP_03220 ROP_03230     FALSE 0.081 103.000 0.000 1.000   NA
 7717981 7717982 ROP_03230 ROP_03240     FALSE 0.319 42.000 0.000 1.000 N NA
 7717982 7717983 ROP_03240 ROP_03250     TRUE 0.567 -315.000 0.000 NA   NA
 7717984 7717985 ROP_03260 ROP_03270     FALSE 0.005 430.000 0.000 NA   NA
 7717985 7717986 ROP_03270 ROP_03280     FALSE 0.008 291.000 0.000 NA   NA
 7717986 7717987 ROP_03280 ROP_03290     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717987 7717988 ROP_03290 ROP_03300   gvpA TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7717988 7717989 ROP_03300 ROP_03310 gvpA gvpF TRUE 0.990 -3.000 0.250 1.000   NA
 7717989 7717990 ROP_03310 ROP_03320 gvpF   TRUE 0.983 4.000 0.750 NA   NA
 7717990 7717991 ROP_03320 ROP_03330   gvpO TRUE 0.969 7.000 0.714 NA   NA
 7717991 7717992 ROP_03330 ROP_03340 gvpO gvpJ TRUE 0.995 -3.000 0.500 1.000   NA
 7717992 7717993 ROP_03340 ROP_03350 gvpJ gvpL TRUE 0.952 -13.000 0.400 1.000   NA
 7717993 7717994 ROP_03350 ROP_03360 gvpL gvpS TRUE 0.975 4.000 0.500 1.000   NA
 7717994 7717995 ROP_03360 ROP_03370 gvpS gvpK TRUE 0.809 -7.000 0.000 1.000   NA
 7717996 7717997 ROP_03380 ROP_03390     FALSE 0.082 92.000 0.000 NA   NA
 7717997 7717998 ROP_03390 ROP_03400     TRUE 0.969 -3.000 0.020 1.000 N NA
 7718000 7718001 ROP_03420 ROP_03430     TRUE 0.979 -3.000 0.087 NA   NA
 7718004 7718005 ROP_03460 ROP_03470     FALSE 0.005 409.000 0.000 NA   NA
 7718011 7718012 ROP_03530 ROP_03540     TRUE 0.993 0.000 0.895 NA   NA
 7718013 7718014 ROP_03550 ROP_03560     FALSE 0.105 77.000 0.000 NA   NA
 7718014 7718015 ROP_03560 ROP_03570     FALSE 0.085 90.000 0.000 NA   NA
 7718017 7718018 ROP_03590 ROP_03600     FALSE 0.044 131.000 0.000 NA   NA
 7718018 7718019 ROP_03600 ROP_03610     FALSE 0.050 125.000 0.000 NA   NA
 7718019 7718020 ROP_03610 ROP_03620     TRUE 0.858 34.000 0.625 NA   NA
 7718021 7718022 ROP_03630 ROP_03640     FALSE 0.054 121.000 0.000 NA   NA
 7718022 7718023 ROP_03640 ROP_03650     FALSE 0.055 119.000 0.000 NA   NA
 7718025 7718026 ROP_03670 ROP_03680     FALSE 0.088 88.000 0.000 NA   NA
 7718027 7718028 ROP_03690 ROP_03700     FALSE 0.082 92.000 0.000 NA   NA
 7718028 7718029 ROP_03700 ROP_03710     TRUE 0.993 0.000 0.895 NA   NA
 7718029 7718030 ROP_03710 ROP_03720     FALSE 0.072 100.000 0.000 NA   NA
 7718031 7718032 ROP_03730 ROP_03740     FALSE 0.037 142.000 0.000 NA   NA
 7718034 7718035 ROP_03760 ROP_03770     TRUE 0.946 -9.000 0.290 NA   NA
 7718035 7718036 ROP_03770 ROP_03780   mreB FALSE 0.057 117.000 0.000 NA   NA
 7718037 7718038 ROP_03790 ROP_03800     FALSE 0.476 17.000 0.000 NA   NA
 7718038 7718039 ROP_03800 ROP_03810     FALSE 0.005 425.000 0.000 NA   NA
 7718040 7718041 ROP_03820 ROP_03830     FALSE 0.018 187.000 0.000 NA   NA
 7718041 7718042 ROP_03830 ROP_03840     FALSE 0.009 283.000 0.000 NA   NA
 7718042 7718043 ROP_03840 ROP_03850     TRUE 0.728 -16.000 0.000 1.000 N NA
 7718043 7718044 ROP_03850 ROP_03860     FALSE 0.510 14.000 0.000 NA   NA
 7718045 7718046 ROP_03870 ROP_03880 upp   FALSE 0.552 18.000 0.020 NA   NA
 7718046 7718047 ROP_03880 ROP_03890     TRUE 0.988 -3.000 0.212 NA   NA
 7718050 7718051 ROP_03920 ROP_03930   chaA FALSE 0.268 46.000 0.000 1.000   NA
 7718051 7718052 ROP_03930 ROP_03940 chaA   FALSE 0.101 79.000 0.000 NA   NA
 7718054 7718055 ROP_03960 ROP_03970     FALSE 0.242 45.000 0.000 NA   NA
 7718055 7718056 ROP_03970 ROP_03980     FALSE 0.071 101.000 0.000 NA   NA
 7718056 7718057 ROP_03980 ROP_03990     FALSE 0.463 18.000 0.000 NA   NA
 7718057 7718058 ROP_03990 ROP_04000     TRUE 0.696 6.000 0.000 NA   NA
 7718058 7718059 ROP_04000 ROP_04010     FALSE 0.021 175.000 0.000 NA   NA
 7718060 7718061 ROP_04020 ROP_04030     FALSE 0.070 102.000 0.000 NA   NA
 7718063 7718064 ROP_04050 ROP_04060     FALSE 0.042 134.000 0.000 NA   NA
 7718066 7718067 ROP_04080 ROP_04090     FALSE 0.037 142.000 0.000 NA   NA
 7718067 7718068 ROP_04090 ROP_04100     FALSE 0.012 253.000 0.000 1.000   NA
 7718071 7718072 ROP_04130 ROP_04140     FALSE 0.076 97.000 0.000 NA   NA
 7718074 7718075 ROP_04160 ROP_04170     TRUE 0.726 -10.000 0.000 NA   NA
 7718076 7718077 ROP_04180 ROP_04190     FALSE 0.056 118.000 0.000 NA   NA
 7718077 7718078 ROP_04190 ROP_04200     FALSE 0.069 103.000 0.000 NA   NA
 7718078 7718079 ROP_04200 ROP_04210     FALSE 0.007 308.000 0.000 NA   NA
 7718083 7718084 ROP_04250 ROP_04260     FALSE 0.174 58.000 0.000 NA   NA
 7718085 7718086 ROP_04270 ROP_04280     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7718086 7718087 ROP_04280 ROP_04290     TRUE 0.992 -3.000 0.375 NA   NA
 7718087 7718088 ROP_04290 ROP_04300     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 N NA
 7718088 7718089 ROP_04300 ROP_04310     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 7718089 7718090 ROP_04310 ROP_04320     TRUE 0.968 -3.000 0.038 NA   NA
 7718090 7718091 ROP_04320 ROP_04330     FALSE 0.241 63.000 0.025 1.000   NA
 7718091 7718092 ROP_04330 ROP_04340     TRUE 0.998 -3.000 0.417 0.047 Y NA
 7718092 7718093 ROP_04340 ROP_04350     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.047 Y NA
 7718093 7718094 ROP_04350 ROP_04360     TRUE 0.994 -3.000 0.438 1.000   NA
 7718095 7718096 ROP_04370 ROP_04380     TRUE 0.981 2.000 0.500 NA   NA
 7718097 7718098 ROP_04390 ROP_04400     FALSE 0.234 46.000 0.000 NA   NA
 7718098 7718099 ROP_04400 ROP_04410     TRUE 0.997 -3.000 0.750 NA N NA
 7718100 7718101 ROP_04420 ROP_04430     FALSE 0.024 168.000 0.000 NA   NA
 7718101 7718102 ROP_04430 ROP_04440     TRUE 0.978 4.000 0.607 NA   NA
 7718102 7718103 ROP_04440 ROP_04450     FALSE 0.005 396.000 0.000 NA   NA
 7718103 7718104 ROP_04450 ROP_04460     FALSE 0.042 134.000 0.000 NA   NA
 7718104 7718105 ROP_04460 ROP_04470     FALSE 0.003 599.000 0.000 NA   NA
 7718112 7718113 ROP_04540 ROP_04550     FALSE 0.036 158.000 0.000 1.000 N NA
 7718116 7718117 ROP_04580 ROP_04590     TRUE 0.946 0.000 0.074 NA   NA
 7718117 7718118 ROP_04590 ROP_04600     FALSE 0.003 626.000 0.000 NA   NA
 7718119 7718120 ROP_04610 ROP_04620     FALSE 0.020 181.000 0.000 NA   NA
 7718120 7718121 ROP_04620 ROP_04630     FALSE 0.103 78.000 0.000 NA   NA
 7718122 7718123 ROP_04640 ROP_04650     FALSE 0.539 12.000 0.000 NA   NA
 7718123 7718124 ROP_04650 ROP_04660     FALSE 0.076 97.000 0.000 NA   NA
 7718125 7718126 ROP_04670 ROP_04680     TRUE 0.967 0.000 0.182 NA   NA
 7718128 7718129 ROP_04700 ROP_04710     TRUE 0.696 6.000 0.000 NA   NA
 7718130 7718131 ROP_04720 ROP_04730 rpmF rpmJ FALSE 0.140 130.000 0.004 0.011   NA
 7718131 7718132 ROP_04730 ROP_04740 rpmJ   FALSE 0.007 336.000 0.000 NA   NA
 7718133 7718134 ROP_04750 ROP_04760     FALSE 0.065 106.000 0.000 NA   NA
 7718135 7718136 ROP_04770 ROP_04780     FALSE 0.117 73.000 0.000 NA   NA
 7718136 7718137 ROP_04780 ROP_04790     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7718137 7718138 ROP_04790 ROP_04800     FALSE 0.006 362.000 0.000 NA   NA
 7718138 7718139 ROP_04800 ROP_04810     FALSE 0.111 89.000 0.000 1.000 N NA
 7718139 7718140 ROP_04810 ROP_04820     TRUE 0.635 49.000 0.000 1.000 Y NA
 7718140 7718141 ROP_04820 ROP_04830   pcd TRUE 0.817 34.000 0.429 1.000 N NA
 7718141 7718142 ROP_04830 ROP_04840 pcd   TRUE 0.980 1.000 0.429 NA   NA
 7718147 7718148 ROP_04890 ROP_04900     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7718148 7718149 ROP_04900 ROP_04910     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7718149 7718150 ROP_04910 ROP_04920   prpA TRUE 0.980 -7.000 0.618 1.000   NA
 7718152 7718153 ROP_04940 ROP_04950     FALSE 0.318 34.000 0.000 NA   NA
 7718154 7718155 ROP_04960 ROP_04970   rpiA FALSE 0.531 18.000 0.000 1.000 N NA
 7718155 7718156 ROP_04970 ROP_04980 rpiA gph FALSE 0.438 24.000 0.000 1.000   NA
 7718156 7718157 ROP_04980 ROP_04990 gph xylB TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7718157 7718158 ROP_04990 ROP_05000 xylB   TRUE 0.979 -3.000 0.065 1.000 N NA
 7718158 7718159 ROP_05000 ROP_05010     TRUE 0.932 -15.000 0.000 1.000 Y NA
 7718159 7718160 ROP_05010 ROP_05020     TRUE 0.849 -7.000 0.017 1.000   NA
 7718160 7718161 ROP_05020 ROP_05030     FALSE 0.215 55.000 0.000 1.000   NA
 7718161 7718162 ROP_05030 ROP_05040     FALSE 0.469 23.000 0.000 1.000 N NA
 7718162 7718163 ROP_05040 ROP_05050     TRUE 0.781 29.000 0.000 1.000 Y NA
 7718163 7718164 ROP_05050 ROP_05060     TRUE 0.954 4.000 0.000 NA Y NA
 7718164 7718165 ROP_05060 ROP_05070     FALSE 0.010 271.000 0.000 NA N NA
 7718166 7718167 ROP_05080 ROP_05090     FALSE 0.270 48.000 0.000 1.000 N NA
 7718167 7718168 ROP_05090 ROP_05100     FALSE 0.413 30.000 0.000 1.000 N NA
 7718168 7718169 ROP_05100 ROP_05110     FALSE 0.113 82.000 0.000 1.000   NA
 7718169 7718170 ROP_05110 ROP_05120     FALSE 0.286 44.000 0.000 1.000   NA
 7718170 7718171 ROP_05120 ROP_05130   idh TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7718171 7718172 ROP_05130 ROP_05140 idh pyc FALSE 0.202 58.000 0.000 1.000   NA
 7718172 7718173 ROP_05140 ROP_05150 pyc   FALSE 0.231 49.000 0.000 NA N NA
 7718173 7718174 ROP_05150 ROP_05160     FALSE 0.006 399.000 0.000 NA N NA
 7718174 7718175 ROP_05160 ROP_05170   idh TRUE 0.989 0.000 0.583 1.000   NA
 7718175 7718176 ROP_05170 ROP_05180 idh   TRUE 0.993 -3.000 0.350 1.000   NA
 7718176 7718177 ROP_05180 ROP_05190     TRUE 0.992 -3.000 0.300 1.000   NA
 7718177 7718178 ROP_05190 ROP_05200     FALSE 0.029 154.000 0.000 NA   NA
 7718178 7718179 ROP_05200 ROP_05210     TRUE 0.576 55.000 0.000 NA Y NA
 7718179 7718180 ROP_05210 ROP_05220     TRUE 0.972 6.000 0.667 1.000   NA
 7718182 7718183 ROP_05240 ROP_05250 ndh   FALSE 0.327 33.000 0.000 NA   NA
 7718183 7718184 ROP_05250 ROP_05260   mmsA FALSE 0.394 24.000 0.000 NA   NA
 7718184 7718185 ROP_05260 ROP_05270 mmsA   FALSE 0.025 182.000 0.000 1.000 N NA
 7718185 7718186 ROP_05270 ROP_05280     FALSE 0.409 28.000 0.000 1.000   NA
 7718188 7718189 ROP_05300 ROP_05310     FALSE 0.004 483.000 0.000 NA   NA
 7718189 7718190 ROP_05310 ROP_05320     TRUE 0.641 -27.000 0.000 NA   NA
 7718190 7718191 ROP_05320 ROP_05330     FALSE 0.011 244.000 0.000 NA   NA
 7718191 7718192 ROP_05330 ROP_05340     FALSE 0.007 364.000 0.000 1.000   NA
 7718192 7718193 ROP_05340 ROP_05350     FALSE 0.005 392.000 0.000 NA   NA
 7718193 7718194 ROP_05350 ROP_05360     FALSE 0.093 84.000 0.000 NA   NA
 7718195 7718196 ROP_05370 ROP_05380     FALSE 0.405 50.000 0.000 0.091   NA
 7718196 7718197 ROP_05380 ROP_05390     FALSE 0.083 159.000 0.105 1.000   NA
 7718197 7718198 ROP_05390 ROP_05400     TRUE 0.975 4.000 0.105 1.000 Y NA
 7718198 7718199 ROP_05400 ROP_05410     TRUE 0.884 46.000 1.000 1.000 N NA
 7718199 7718200 ROP_05410 ROP_05420     FALSE 0.005 430.000 0.000 NA   NA
 7718200 7718201 ROP_05420 ROP_05430     TRUE 0.644 -25.000 0.000 NA   NA
 7718201 7718202 ROP_05430 ROP_05440     FALSE 0.121 72.000 0.000 NA   NA
 7718205 7718206 ROP_05470 ROP_05480     FALSE 0.058 115.000 0.000 NA   NA
 7718207 7718208 ROP_05490 ROP_05500     FALSE 0.134 68.000 0.000 NA   NA
 7718209 7718210 ROP_05510 ROP_05520     FALSE 0.183 56.000 0.000 NA   NA
 7718210 7718211 ROP_05520 ROP_05530     TRUE 0.851 1.000 0.000 NA   NA
 7718212 7718213 ROP_05540 ROP_05550     FALSE 0.005 406.000 0.000 NA   NA
 7718213 7718214 ROP_05550 ROP_05560     FALSE 0.252 46.000 0.000 NA N NA
 7718214 7718215 ROP_05560 ROP_05570     TRUE 0.664 -18.000 0.000 NA   NA
 7718217 7718218 ROP_05590 ROP_05600     TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7718218 7718219 ROP_05600 ROP_05610     FALSE 0.202 58.000 0.000 1.000   NA
 7718219 7718220 ROP_05610 ROP_05620     FALSE 0.014 220.000 0.000 NA   NA
 7718222 7718223 ROP_05640 ROP_05650 cobK cobM TRUE 0.986 3.000 0.076 0.006 Y NA
 7718223 7718224 ROP_05650 ROP_05660 cobM cobL TRUE 0.997 -3.000 0.065 0.006 Y NA
 7718224 7718225 ROP_05660 ROP_05670 cobL   TRUE 0.993 -3.000 0.364 1.000   NA
 7718227 7718228 ROP_05690 ROP_05700   pepQ FALSE 0.051 129.000 0.000 NA N NA
 7718230 7718231 ROP_05720 ROP_05730     FALSE 0.111 103.000 0.035 NA   NA
 7718231 7718232 ROP_05730 ROP_05740   tatC TRUE 0.763 19.000 0.166 NA N NA
 7718232 7718233 ROP_05740 ROP_05750 tatC tatA FALSE 0.144 72.000 0.008 NA   NA
 7718233 7718234 ROP_05750 ROP_05760 tatA   FALSE 0.117 73.000 0.000 NA   NA
 7718234 7718235 ROP_05760 ROP_05770   pafC TRUE 0.660 7.000 0.000 NA   NA
 7718235 7718236 ROP_05770 ROP_05780 pafC pafB TRUE 0.999 -3.000 0.767 NA Y NA
 7718236 7718237 ROP_05780 ROP_05790 pafB pafA FALSE 0.539 48.000 0.188 NA   NA
 7718239 7718240 ROP_05810 ROP_05820 prcA prcB TRUE 0.999 -3.000 0.797 0.000 Y NA
 7718240 7718241 ROP_05820 ROP_05830 prcB   TRUE 0.995 -3.000 0.512 NA   NA
 7718241 7718242 ROP_05830 ROP_05840     FALSE 0.275 170.000 0.706 NA   NA
 7718242 7718243 ROP_05840 ROP_05850     FALSE 0.110 75.000 0.000 NA   NA
 7718248 7718249 ROP_05900 ROP_05910     TRUE 0.971 -3.000 0.047 NA   NA
 7718250 7718251 ROP_05920 ROP_05930 hisG hisE TRUE 0.840 48.000 0.081 0.002 Y NA
 7718251 7718252 ROP_05930 ROP_05940 hisE   FALSE 0.478 26.000 0.005 1.000 N NA
 7718252 7718253 ROP_05940 ROP_05950     TRUE 0.870 2.000 0.015 NA   NA
 7718253 7718254 ROP_05950 ROP_05960     TRUE 0.611 16.000 0.032 NA   NA
 7718254 7718255 ROP_05960 ROP_05970   metH TRUE 0.859 -7.000 0.024 1.000   NA
 7718256 7718257 ROP_05980 ROP_05990     TRUE 0.968 -3.000 0.038 NA   NA
 7718257 7718258 ROP_05990 ROP_06000   nasD FALSE 0.007 412.000 0.000 1.000 N NA
 7718258 7718259 ROP_06000 ROP_06010 nasD nasE TRUE 0.992 -3.000 0.085 0.001 N NA
 7718259 7718260 ROP_06010 ROP_06020 nasE   FALSE 0.066 124.000 0.000 1.000 N NA
 7718260 7718261 ROP_06020 ROP_06030     FALSE 0.081 93.000 0.000 NA   NA
 7718264 7718265 ROP_06060 ROP_06070     FALSE 0.129 75.000 0.000 1.000   NA
 7718266 7718267 ROP_06080 ROP_06090     FALSE 0.006 358.000 0.000 NA   NA
 7718267 7718268 ROP_06090 ROP_06100     FALSE 0.076 97.000 0.000 NA   NA
 7718268 7718269 ROP_06100 ROP_06110     TRUE 0.985 -3.000 0.174 NA   NA
 7718269 7718270 ROP_06110 ROP_06120     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 7718271 7718272 ROP_06130 ROP_06140 mshC   FALSE 0.422 73.000 0.247 1.000   NA
 7718272 7718273 ROP_06140 ROP_06150     TRUE 0.985 4.000 0.810 NA   NA
 7718273 7718274 ROP_06150 ROP_06160     FALSE 0.397 126.000 0.608 NA   NA
 7718274 7718275 ROP_06160 ROP_06170   uppP FALSE 0.478 41.000 0.071 NA N NA
 7718276 7718277 ROP_06180 ROP_06190   hmuO FALSE 0.146 97.000 0.036 1.000 N NA
 7718277 7718278 ROP_06190 ROP_06200 hmuO hmuT TRUE 0.992 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 7718278 7718279 ROP_06200 ROP_06210 hmuT hmuU TRUE 0.999 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 7718279 7718280 ROP_06210 ROP_06220 hmuU hmuV TRUE 0.997 -3.000 0.292 1.000 Y NA
 7718282 7718283 ROP_06240 ROP_06250     TRUE 0.912 1.000 0.042 NA   NA
 7718283 7718284 ROP_06250 ROP_06260   pyrD TRUE 0.863 11.000 0.236 NA   NA
 7718285 7718286 ROP_06270 ROP_06280     TRUE 0.681 35.000 0.224 NA   NA
 7718287 7718288 ROP_t0010 ROP_06290     FALSE 0.113 74.000 0.000 NA   NA
 7718288 7718289 ROP_06290 ROP_06300     FALSE 0.051 178.000 0.067 1.000   NA
 7718289 7718290 ROP_06300 ROP_06310     FALSE 0.088 88.000 0.000 NA   NA
 7718290 7718291 ROP_06310 ROP_06320     FALSE 0.300 36.000 0.000 NA   NA
 7718291 7718292 ROP_06320 ROP_06330     FALSE 0.010 263.000 0.000 NA   NA
 7718292 7718293 ROP_06330 ROP_06340   glcB FALSE 0.051 133.000 0.000 1.000   NA
 7718293 7718294 ROP_06340 ROP_06350 glcB   FALSE 0.120 127.000 0.089 NA   NA
 7718294 7718295 ROP_06350 ROP_06360     TRUE 0.978 -3.000 0.080 NA   NA
 7718296 7718297 ROP_06370 ROP_06380 gcvP   FALSE 0.008 363.000 0.000 1.000 N NA
 7718297 7718298 ROP_06380 ROP_06390     FALSE 0.013 281.000 0.024 NA   NA
 7718298 7718299 ROP_06390 ROP_06400     FALSE 0.108 144.000 0.133 NA   NA
 7718299 7718300 ROP_06400 ROP_06410   garA TRUE 0.996 -3.000 0.707 NA   NA
 7718300 7718301 ROP_06410 ROP_06420 garA gcvH FALSE 0.036 322.000 0.242 NA N NA
 7718301 7718302 ROP_06420 ROP_06430 gcvH   TRUE 0.752 43.000 0.434 NA   NA
 7718302 7718303 ROP_06430 ROP_06440     TRUE 0.935 8.000 0.409 NA   NA
 7718303 7718304 ROP_06440 ROP_06450     TRUE 0.800 33.000 0.409 NA   NA
 7718304 7718305 ROP_06450 ROP_06460     TRUE 0.957 0.000 0.114 NA   NA
 7718305 7718306 ROP_06460 ROP_06470     FALSE 0.055 133.000 0.000 1.000 N NA
 7718306 7718307 ROP_06470 ROP_06480     FALSE 0.319 42.000 0.000 1.000 N NA
 7718307 7718308 ROP_06480 ROP_06490     FALSE 0.129 79.000 0.000 1.000 N NA
 7718308 7718309 ROP_06490 ROP_06500     FALSE 0.436 32.000 0.026 NA   NA
 7718309 7718310 ROP_06500 ROP_06510     FALSE 0.336 42.000 0.019 NA   NA
 7718316 7718317 ROP_t0020 ROP_06570   engA FALSE 0.090 87.000 0.000 NA   NA
 7718317 7718318 ROP_06570 ROP_06580 engA cmk TRUE 0.989 -3.000 0.060 0.009   NA
 7718318 7718319 ROP_06580 ROP_06590 cmk   TRUE 0.975 -3.000 0.042 1.000 N NA
 7718319 7718320 ROP_06590 ROP_06600   scpB TRUE 0.820 17.000 0.224 NA N NA
 7718320 7718321 ROP_06600 ROP_06610 scpB scpA TRUE 0.995 -3.000 0.570 NA   NA
 7718321 7718322 ROP_06610 ROP_06620 scpA   TRUE 0.928 1.000 0.065 NA   NA
 7718322 7718323 ROP_06620 ROP_06630   nudF FALSE 0.035 160.000 0.000 1.000 N NA
 7718323 7718324 ROP_06630 ROP_06640 nudF pyrG TRUE 0.719 14.000 0.055 1.000 N NA
 7718324 7718325 ROP_06640 ROP_06650 pyrG   FALSE 0.048 142.000 0.014 NA   NA
 7718325 7718326 ROP_06650 ROP_06660     TRUE 0.997 -3.000 0.798 NA   NA
 7718326 7718327 ROP_06660 ROP_06670   recN FALSE 0.214 109.000 0.049 0.080   NA
 7718327 7718328 ROP_06670 ROP_06680 recN ppnK TRUE 0.931 3.000 0.094 1.000 N NA
 7718328 7718329 ROP_06680 ROP_06690 ppnK tlyA TRUE 0.985 -3.000 0.120 1.000 N NA
 7718329 7718330 ROP_06690 ROP_06700 tlyA   TRUE 0.850 2.000 0.003 NA   NA
 7718330 7718331 ROP_06700 ROP_06710     FALSE 0.542 19.000 0.021 NA   NA
 7718331 7718332 ROP_06710 ROP_06720     TRUE 0.995 -3.000 0.500 1.000   NA
 7718332 7718333 ROP_06720 ROP_r0010     FALSE 0.263 42.000 0.000 NA   NA
 7718333 7718334 ROP_r0010 ROP_r0020     FALSE 0.031 150.000 0.000 NA   NA
 7718334 7718335 ROP_r0020 ROP_r0030     FALSE 0.006 342.000 0.000 NA   NA
 7718335 7718336 ROP_r0030 ROP_06730   tyrS FALSE 0.003 609.000 0.000 NA   NA
 7718336 7718337 ROP_06730 ROP_06740 tyrS   TRUE 0.813 9.000 0.067 1.000 N NA
 7718338 7718339 ROP_06750 ROP_06760     TRUE 0.991 0.000 0.089 0.080 Y NA
 7718339 7718340 ROP_06760 ROP_06770     TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7718341 7718342 ROP_06780 ROP_06790     FALSE 0.331 39.000 0.013 NA   NA
 7718342 7718343 ROP_06790 ROP_06800   argH FALSE 0.254 54.000 0.003 1.000 N NA
 7718343 7718344 ROP_06800 ROP_06810 argH argG TRUE 0.987 3.000 0.278 1.000 Y NA
 7718344 7718345 ROP_06810 ROP_06820 argG argR FALSE 0.379 48.000 0.054 NA N NA
 7718345 7718346 ROP_06820 ROP_06830 argR argF TRUE 0.980 -3.000 0.088 NA N NA
 7718346 7718347 ROP_06830 ROP_06840 argF argD TRUE 0.995 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 7718347 7718348 ROP_06840 ROP_06850 argD argB TRUE 0.995 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 7718348 7718349 ROP_06850 ROP_06860 argB argJ TRUE 0.998 -3.000 0.239 0.001 Y NA
 7718349 7718350 ROP_06860 ROP_06870 argJ argC TRUE 0.998 -3.000 0.303 0.001 Y NA
 7718350 7718351 ROP_06870 ROP_06880 argC   FALSE 0.144 69.000 0.003 NA   NA
 7718351 7718352 ROP_06880 ROP_06890   pheT FALSE 0.257 43.000 0.000 NA   NA
 7718352 7718353 ROP_06890 ROP_06900 pheT pheS TRUE 0.903 68.000 0.574 0.000 Y NA
 7718353 7718354 ROP_06900 ROP_06910 pheS   FALSE 0.396 95.000 0.026 1.000 Y NA
 7718354 7718355 ROP_06910 ROP_06920   rplT TRUE 0.857 39.000 0.057 0.009 Y NA
 7718355 7718356 ROP_06920 ROP_06930 rplT rpmI TRUE 0.939 65.000 0.928 0.008 Y NA
 7718356 7718357 ROP_06930 ROP_06940 rpmI infC TRUE 0.888 58.000 0.652 1.000 Y NA
 7718358 7718359 ROP_06950 ROP_06960     FALSE 0.288 51.000 0.028 NA   NA
 7718363 7718364 ROP_07000 ROP_07010     FALSE 0.024 167.000 0.000 NA   NA
 7718364 7718365 ROP_07010 ROP_07020     FALSE 0.033 147.000 0.000 NA   NA
 7718366 7718367 ROP_07030 ROP_07040     FALSE 0.208 188.000 0.667 NA   NA
 7718367 7718368 ROP_07040 ROP_07050   uvrB FALSE 0.363 31.000 0.002 NA   NA
 7718374 7718375 ROP_07110 ROP_07120     TRUE 0.997 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 7718375 7718376 ROP_07120 ROP_07130     TRUE 0.885 21.000 0.000 0.046 Y NA
 7718376 7718377 ROP_07130 ROP_07140     FALSE 0.181 147.000 0.000 1.000 Y NA
 7718380 7718381 ROP_07170 ROP_07180   trxA FALSE 0.279 73.000 0.077 1.000 N NA
 7718383 7718384 ROP_07200 ROP_07210     TRUE 0.993 5.000 0.528 0.046 Y NA
 7718384 7718385 ROP_07210 ROP_07220     TRUE 0.987 -7.000 0.361 1.000 Y NA
 7718385 7718386 ROP_07220 ROP_07230     TRUE 0.999 -3.000 0.582 0.021 Y NA
 7718387 7718388 ROP_07240 ROP_07250     FALSE 0.014 288.000 0.025 NA N NA
 7718391 7718392 ROP_07270 ROP_07280     FALSE 0.065 106.000 0.000 NA   NA
 7718392 7718393 ROP_07280 ROP_07290     FALSE 0.451 19.000 0.000 NA   NA
 7718394 7718395 ROP_07300 ROP_07310     FALSE 0.078 95.000 0.000 NA   NA
 7718395 7718396 ROP_07310 ROP_07320   tesB FALSE 0.203 51.000 0.000 NA   NA
 7718396 7718397 ROP_07320 ROP_07330 tesB pyk TRUE 0.979 1.000 0.361 1.000 N NA
 7718397 7718398 ROP_07330 ROP_07340 pyk gltD FALSE 0.428 37.000 0.022 1.000 N NA
 7718398 7718399 ROP_07340 ROP_07350 gltD gltB TRUE 0.982 -7.000 0.034 0.001 Y NA
 7718399 7718400 ROP_07350 ROP_07360 gltB   FALSE 0.009 275.000 0.000 NA   NA
 7718400 7718401 ROP_07360 ROP_07370   lgt TRUE 0.779 -7.000 0.000 NA   NA
 7718401 7718402 ROP_07370 ROP_07380 lgt trpA TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7718402 7718403 ROP_07380 ROP_07390 trpA trpB TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 7718403 7718404 ROP_07390 ROP_07400 trpB trpC TRUE 0.767 63.000 0.070 0.001 Y NA
 7718404 7718405 ROP_07400 ROP_07410 trpC   FALSE 0.187 87.000 0.070 NA   NA
 7718405 7718406 ROP_07410 ROP_07420   trpE TRUE 0.996 -3.000 0.690 NA   NA
 7718410 7718411 ROP_07460 ROP_07470   hisI FALSE 0.407 31.000 0.002 1.000   NA
 7718411 7718412 ROP_07470 ROP_07480 hisI hisF TRUE 0.999 -3.000 0.430 0.002 Y NA
 7718412 7718413 ROP_07480 ROP_07490 hisF impA TRUE 0.969 -3.000 0.021 1.000 N NA
 7718413 7718414 ROP_07490 ROP_07500 impA hisA TRUE 0.900 10.000 0.266 1.000 N NA
 7718414 7718415 ROP_07500 ROP_07510 hisA   FALSE 0.543 20.000 0.025 NA   NA
 7718415 7718416 ROP_07510 ROP_07520   hisH TRUE 0.961 -3.000 0.019 NA   NA
 7718416 7718417 ROP_07520 ROP_07530 hisH   TRUE 0.788 10.000 0.075 NA N NA
 7718417 7718418 ROP_07530 ROP_07540     TRUE 0.879 0.000 0.000 NA   NA
 7718418 7718419 ROP_07540 ROP_07550   hisB FALSE 0.510 14.000 0.000 NA   NA
 7718419 7718420 ROP_07550 ROP_07560 hisB hisC TRUE 0.998 -3.000 0.341 0.002 Y NA
 7718420 7718421 ROP_07560 ROP_07570 hisC hisD TRUE 0.997 -3.000 0.112 0.002 Y NA
 7718421 7718422 ROP_07570 ROP_07580 hisD fadE FALSE 0.015 234.000 0.000 1.000 N NA
 7718423 7718424 ROP_07590 ROP_07600     FALSE 0.544 17.000 0.000 1.000 N NA
 7718425 7718426 ROP_07610 ROP_07620 nadC nadB TRUE 0.998 -3.000 0.223 0.002 Y NA
 7718426 7718427 ROP_07620 ROP_07630 nadB nadA TRUE 0.998 -3.000 0.210 0.002 Y NA
 7718429 7718430 ROP_07650 ROP_07660     FALSE 0.087 99.000 0.000 1.000   NA
 7718432 7718433 ROP_07680 ROP_07690     FALSE 0.560 11.000 0.000 NA   NA
 7718433 7718434 ROP_07690 ROP_07700   bioB TRUE 0.969 -3.000 0.041 NA   NA
 7718435 7718436 ROP_07710 ROP_07720     FALSE 0.103 78.000 0.000 NA   NA
 7718436 7718437 ROP_07720 ROP_07730     FALSE 0.190 54.000 0.000 NA   NA
 7718437 7718438 ROP_07730 ROP_07740     TRUE 0.981 -3.000 0.105 NA   NA
 7718439 7718440 ROP_07750 ROP_07760     TRUE 0.998 2.000 0.826 0.001 Y NA
 7718440 7718441 ROP_07760 ROP_07770     TRUE 0.934 22.000 0.860 NA   NA
 7718441 7718442 ROP_07770 ROP_07780     TRUE 0.980 -3.000 0.098 NA   NA
 7718443 7718444 ROP_07790 ROP_07800     FALSE 0.426 27.000 0.010 NA   NA
 7718445 7718446 ROP_07810 ROP_07820 bioD bioF TRUE 0.996 -3.000 0.214 1.000 Y NA
 7718447 7718448 ROP_07830 ROP_07840 bioA glgX FALSE 0.249 55.000 0.003 1.000 N NA
 7718448 7718449 ROP_07840 ROP_07850 glgX treY TRUE 0.946 14.000 0.061 0.003 Y NA
 7718449 7718450 ROP_07850 ROP_07860 treY   FALSE 0.413 30.000 0.000 1.000 N NA
 7718451 7718452 ROP_07870 ROP_07880     FALSE 0.223 92.000 0.125 NA   NA
 7718453 7718454 ROP_07890 ROP_07900   treZ FALSE 0.269 41.000 0.000 NA   NA
 7718457 7718458 ROP_07930 ROP_07940 ilvA poxB FALSE 0.374 95.000 0.011 1.000 Y NA
 7718458 7718459 ROP_07940 ROP_07950 poxB   FALSE 0.358 53.000 0.069 NA   NA
 7718461 7718462 ROP_07970 ROP_07980 dnaE   FALSE 0.101 99.000 0.007 1.000   NA
 7718462 7718463 ROP_07980 ROP_07990     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7718463 7718464 ROP_07990 ROP_08000   rluD TRUE 0.833 2.000 0.000 NA   NA
 7718464 7718465 ROP_08000 ROP_08010 rluD lspA TRUE 0.980 -3.000 0.073 1.000 N NA
 7718466 7718467 ROP_08020 ROP_08030     TRUE 0.968 0.000 0.188 NA   NA
 7718468 7718469 ROP_08040 ROP_08050   dinB FALSE 0.031 151.000 0.000 NA   NA
 7718469 7718470 ROP_08050 ROP_08060 dinB ileS FALSE 0.457 32.000 0.014 1.000 N NA
 7718470 7718471 ROP_08060 ROP_08070 ileS   FALSE 0.008 298.000 0.000 NA   NA
 7718471 7718472 ROP_08070 ROP_08080     FALSE 0.250 59.000 0.030 NA   NA
 7718472 7718473 ROP_08080 ROP_08090     FALSE 0.183 103.000 0.114 NA   NA
 7718473 7718474 ROP_08090 ROP_08100     FALSE 0.140 134.000 0.165 NA   NA
 7718474 7718475 ROP_08100 ROP_08110     FALSE 0.552 84.000 0.581 NA   NA
 7718475 7718476 ROP_08110 ROP_08120     TRUE 0.593 23.000 0.061 NA   NA
 7718476 7718477 ROP_08120 ROP_08130   ftsZ TRUE 0.978 -3.000 0.082 NA   NA
 7718477 7718478 ROP_08130 ROP_08140 ftsZ ftsQ FALSE 0.033 218.000 0.067 NA N NA
 7718478 7718479 ROP_08140 ROP_08150 ftsQ murC TRUE 0.995 -3.000 0.134 NA Y NA
 7718479 7718480 ROP_08150 ROP_08160 murC murG TRUE 0.997 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 7718480 7718481 ROP_08160 ROP_08170 murG ftsW TRUE 0.987 -3.000 0.167 1.000 N NA
 7718481 7718482 ROP_08170 ROP_08180 ftsW murD TRUE 0.991 -3.000 0.081 0.002 N NA
 7718482 7718483 ROP_08180 ROP_08190 murD mraY TRUE 0.994 5.000 0.647 0.003 Y NA
 7718483 7718484 ROP_08190 ROP_08200 mraY murF TRUE 0.997 -3.000 0.071 0.003 Y NA
 7718484 7718485 ROP_08200 ROP_08210 murF murE TRUE 0.999 -3.000 0.367 0.001 Y NA
 7718485 7718486 ROP_08210 ROP_08220 murE ftsI FALSE 0.241 210.000 0.333 1.000 Y NA
 7718486 7718487 ROP_08220 ROP_08230 ftsI   TRUE 0.984 -3.000 0.144 NA   NA
 7718487 7718488 ROP_08230 ROP_08240   mraW TRUE 0.965 -3.000 0.028 NA   NA
 7718488 7718489 ROP_08240 ROP_08250 mraW mraZ FALSE 0.180 197.000 0.635 NA   NA
 7718489 7718490 ROP_08250 ROP_08260 mraZ   FALSE 0.004 498.000 0.000 NA   NA
 7718490 7718491 ROP_08260 ROP_08270     FALSE 0.030 233.000 0.081 NA   NA
 7718492 7718493 ROP_08280 ROP_08290   crtO TRUE 0.979 -3.000 0.091 NA   NA
 7718493 7718494 ROP_08290 ROP_08300 crtO   TRUE 0.973 -3.000 0.057 NA   NA
 7718494 7718495 ROP_08300 ROP_08310     FALSE 0.416 32.000 0.019 NA   NA
 7718495 7718496 ROP_08310 ROP_08320     TRUE 0.970 -3.000 0.043 NA   NA
 7718498 7718499 ROP_08340 ROP_08350 crtE crtI TRUE 0.862 9.000 0.138 1.000 N NA
 7718499 7718500 ROP_08350 ROP_08360 crtI mptA FALSE 0.300 59.000 0.057 NA   NA
 7718500 7718501 ROP_08360 ROP_08370 mptA crtB TRUE 0.708 8.000 0.018 NA   NA
 7718504 7718505 ROP_08400 ROP_08410     TRUE 0.702 43.000 0.301 1.000   NA
 7718507 7718508 ROP_08430 ROP_08440   glk FALSE 0.117 131.000 0.074 1.000 N NA
 7718508 7718509 ROP_08440 ROP_08450 glk   FALSE 0.369 71.000 0.188 NA   NA
 7718509 7718510 ROP_08450 ROP_08460     TRUE 0.995 -3.000 0.538 NA   NA
 7718510 7718511 ROP_08460 ROP_08470     TRUE 0.698 42.000 0.316 NA   NA
 7718511 7718512 ROP_08470 ROP_08480     FALSE 0.105 152.000 0.164 NA   NA
 7718514 7718515 ROP_08500 ROP_08510 pimB'   FALSE 0.427 44.000 0.065 NA   NA
 7718515 7718516 ROP_08510 ROP_08520     FALSE 0.450 50.000 0.118 NA   NA
 7718516 7718517 ROP_08520 ROP_08530     FALSE 0.031 395.000 0.000 NA Y NA
 7718518 7718519 ROP_08540 ROP_08550 dnaQ   TRUE 0.982 -3.000 0.114 NA   NA
 7718520 7718521 ROP_08560 ROP_08570 trpD   FALSE 0.261 45.000 0.002 NA   NA
 7718522 7718523 ROP_08580 ROP_08590 ctaE qcrC TRUE 0.622 65.000 0.000 0.094 Y NA
 7718523 7718524 ROP_08590 ROP_08600 qcrC qcrA TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.094 Y NA
 7718524 7718525 ROP_08600 ROP_08610 qcrA qcrB TRUE 0.999 -3.000 0.660 0.059 Y NA
 7718525 7718526 ROP_08610 ROP_08620 qcrB   FALSE 0.011 241.000 0.000 NA   NA
 7718526 7718527 ROP_08620 ROP_08630     TRUE 0.696 -13.000 0.000 NA   NA
 7718528 7718529 ROP_08640 ROP_08650 ctaF ctaC TRUE 0.839 42.000 0.342 0.001   NA
 7718531 7718532 ROP_08670 ROP_08680 adoK iscA FALSE 0.029 179.000 0.021 NA   NA
 7718532 7718533 ROP_08680 ROP_08690 iscA   FALSE 0.052 139.000 0.016 NA   NA
 7718534 7718535 ROP_08700 ROP_08710   cobP FALSE 0.013 320.000 0.041 NA   NA
 7718535 7718536 ROP_08710 ROP_08720 cobP cobU TRUE 0.994 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 7718536 7718537 ROP_08720 ROP_08730 cobU cobV TRUE 0.984 3.000 0.039 0.006 Y NA
 7718538 7718539 ROP_08740 ROP_08750 ilvE gcvT TRUE 0.574 64.000 0.025 1.000 Y NA
 7718542 7718543 ROP_08780 ROP_08790     FALSE 0.414 88.000 0.333 1.000   NA
 7718543 7718544 ROP_08790 ROP_08800   lipB FALSE 0.484 49.000 0.019 0.056   NA
 7718544 7718545 ROP_08800 ROP_08810 lipB lipA TRUE 0.896 53.000 0.319 0.001 Y NA
 7718545 7718546 ROP_08810 ROP_08820 lipA   FALSE 0.214 74.000 0.059 NA   NA
 7718548 7718549 ROP_08840 ROP_08850 glnA   FALSE 0.012 269.000 0.000 1.000 N NA
 7718549 7718550 ROP_08850 ROP_08860     TRUE 0.660 7.000 0.000 NA   NA
 7718550 7718551 ROP_08860 ROP_08870     FALSE 0.072 100.000 0.000 NA   NA
 7718551 7718552 ROP_08870 ROP_08880     TRUE 0.968 -7.000 0.043 1.000 Y NA
 7718552 7718553 ROP_08880 ROP_08890     TRUE 0.993 -3.000 0.042 1.000 Y NA
 7718553 7718554 ROP_08890 ROP_08900     TRUE 0.985 0.000 0.229 0.045 N NA
 7718555 7718556 ROP_08910 ROP_08920   glnE TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7718556 7718557 ROP_08920 ROP_08930 glnE glnA TRUE 0.979 -3.000 0.065 1.000 N NA
 7718557 7718558 ROP_08930 ROP_08940 glnA   FALSE 0.067 117.000 0.000 1.000   NA
 7718559 7718560 ROP_08950 ROP_08960 panB   FALSE 0.250 47.000 0.003 NA   NA
 7718560 7718561 ROP_08960 ROP_08970   pip TRUE 0.937 8.000 0.429 NA   NA
 7718562 7718563 ROP_08980 ROP_08990     FALSE 0.485 31.000 0.042 NA   NA
 7718564 7718565 ROP_09000 ROP_09010     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7718565 7718566 ROP_09010 ROP_09020     FALSE 0.469 23.000 0.000 1.000 N NA
 7718567 7718568 ROP_09030 ROP_rnp0010     FALSE 0.011 241.000 0.000 NA   NA
 7718569 7718570 ROP_09040 ROP_09050   arsB TRUE 0.728 8.000 0.026 NA   NA
 7718571 7718572 ROP_09060 ROP_09070     TRUE 0.993 -3.000 0.422 NA   NA
 7718572 7718573 ROP_09070 ROP_09080     FALSE 0.418 100.000 0.468 NA   NA
 7718573 7718574 ROP_09080 ROP_09090     TRUE 0.982 -3.000 0.121 NA   NA
 7718575 7718576 ROP_09100 ROP_09110   ptpA TRUE 0.809 -13.000 0.029 1.000   NA
 7718576 7718577 ROP_09110 ROP_09120 ptpA   FALSE 0.281 44.000 0.005 NA   NA
 7718579 7718580 ROP_09140 ROP_09150     FALSE 0.009 267.000 0.000 NA   NA
 7718580 7718581 ROP_09150 ROP_09160     FALSE 0.327 33.000 0.000 NA   NA
 7718582 7718583 ROP_t0040 ROP_09170   ahpE FALSE 0.327 33.000 0.000 NA   NA
 7718583 7718584 ROP_09170 ROP_09180 ahpE   TRUE 0.799 44.000 0.575 NA   NA
 7718584 7718585 ROP_09180 ROP_09190     FALSE 0.035 169.000 0.025 NA   NA
 7718586 7718587 ROP_09200 ROP_09210 aceE   FALSE 0.327 76.000 0.169 NA N NA
 7718587 7718588 ROP_09210 ROP_09220   fabD FALSE 0.313 128.000 0.441 NA N NA
 7718588 7718589 ROP_09220 ROP_09230 fabD acpM FALSE 0.453 107.000 0.127 1.000 Y NA
 7718589 7718590 ROP_09230 ROP_09240 acpM fabF TRUE 0.927 9.000 0.030 1.000 Y NA
 7718590 7718591 ROP_09240 ROP_09250 fabF pccB FALSE 0.531 95.000 0.167 1.000 Y NA
 7718592 7718593 ROP_09260 ROP_09270     FALSE 0.172 129.000 0.200 NA   NA
 7718593 7718594 ROP_09270 ROP_09280     FALSE 0.192 94.000 0.070 1.000 N NA
 7718594 7718595 ROP_09280 ROP_09290     FALSE 0.157 111.000 0.100 NA   NA
 7718595 7718596 ROP_09290 ROP_09300     FALSE 0.358 29.000 0.000 NA   NA
 7718596 7718597 ROP_09300 ROP_09310     FALSE 0.099 80.000 0.000 NA   NA
 7718597 7718598 ROP_09310 ROP_t0050     FALSE 0.214 49.000 0.000 NA   NA
 7718600 7718601 ROP_09330 ROP_t0060     FALSE 0.049 126.000 0.000 NA   NA
 7718603 7718604 ROP_09350 ROP_09360 dnaG   FALSE 0.214 49.000 0.000 NA   NA
 7718604 7718605 ROP_09360 ROP_09370   dgt FALSE 0.072 100.000 0.000 NA   NA
 7718605 7718606 ROP_09370 ROP_09380 dgt   TRUE 0.819 9.000 0.099 NA   NA
 7718607 7718608 ROP_09390 ROP_09400     FALSE 0.190 54.000 0.000 NA   NA
 7718610 7718611 ROP_09420 ROP_09430     TRUE 0.915 6.000 0.207 NA N NA
 7718612 7718613 ROP_09440 ROP_09450   uppS TRUE 0.960 -3.000 0.017 NA   NA
 7718613 7718614 ROP_09450 ROP_09460 uppS recO TRUE 0.832 -34.000 0.076 1.000 N NA
 7718614 7718615 ROP_09460 ROP_09470 recO   FALSE 0.171 59.000 0.000 NA   NA
 7718615 7718616 ROP_09470 ROP_09480     FALSE 0.081 93.000 0.000 NA   NA
 7718618 7718619 ROP_09500 ROP_09510   kdpE FALSE 0.438 27.000 0.000 1.000 N NA
 7718619 7718620 ROP_09510 ROP_09520 kdpE kdpD TRUE 0.995 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 7718620 7718621 ROP_09520 ROP_09530 kdpD kdpC TRUE 0.920 -7.000 0.006 0.059 N NA
 7718621 7718622 ROP_09530 ROP_09540 kdpC kdpB TRUE 0.995 7.000 0.877 0.001 Y NA
 7718622 7718623 ROP_09540 ROP_09550 kdpB kdpA TRUE 0.997 -3.000 0.124 0.001 Y NA
 7718623 7718624 ROP_09550 ROP_09560 kdpA   FALSE 0.008 340.000 0.000 1.000   NA
 7718625 7718626 ROP_09570 ROP_09580     FALSE 0.331 40.000 0.000 1.000 N NA
 7718626 7718627 ROP_09580 ROP_09590     TRUE 0.921 4.000 0.100 1.000 N NA
 7718628 7718629 ROP_09600 ROP_09610 era   TRUE 0.860 -7.000 0.037 NA   NA
 7718629 7718630 ROP_09610 ROP_09620     TRUE 0.859 -7.000 0.036 NA   NA
 7718630 7718631 ROP_09620 ROP_09630     TRUE 0.769 22.000 0.222 NA   NA
 7718631 7718632 ROP_09630 ROP_09640     TRUE 0.791 37.000 0.457 NA   NA
 7718632 7718633 ROP_09640 ROP_09650     FALSE 0.024 184.000 0.000 1.000 N NA
 7718633 7718634 ROP_09650 ROP_09660     TRUE 0.660 7.000 0.000 NA   NA
 7718634 7718635 ROP_09660 ROP_09670   dnaJ TRUE 0.909 3.000 0.073 NA   NA
 7718635 7718636 ROP_09670 ROP_09680 dnaJ hrcA FALSE 0.185 88.000 0.064 NA N NA
 7718639 7718640 ROP_09710 ROP_09720 sirA cysH TRUE 0.975 -3.000 0.041 1.000 N NA
 7718640 7718641 ROP_09720 ROP_09730 cysH cysD TRUE 0.993 -3.000 0.046 1.000 Y NA
 7718641 7718642 ROP_09730 ROP_09740 cysD cysN TRUE 0.994 3.000 0.925 0.001 N NA
 7718642 7718643 ROP_09740 ROP_09750 cysN   TRUE 0.864 5.000 0.050 1.000   NA
 7718644 7718645 ROP_09760 ROP_09770     TRUE 0.989 2.000 0.750 1.000 N NA
 7718645 7718646 ROP_09770 ROP_09780     TRUE 0.981 4.000 0.667 NA   NA
 7718646 7718647 ROP_09780 ROP_09790     FALSE 0.318 34.000 0.000 NA   NA
 7718647 7718648 ROP_09790 ROP_09800     TRUE 0.806 -1288.000 0.000 0.005   NA
 7718648 7718649 ROP_09800 ROP_09810     FALSE 0.003 678.000 0.000 NA   NA
 7718649 7718650 ROP_09810 ROP_09820   sigL TRUE 0.996 -3.000 0.697 NA   NA
 7718650 7718651 ROP_09820 ROP_09830 sigL   FALSE 0.053 122.000 0.000 NA   NA
 7718652 7718653 ROP_09840 ROP_09850     FALSE 0.012 231.000 0.000 NA   NA
 7718653 7718654 ROP_09850 ROP_09860   cysD TRUE 0.984 -3.000 0.147 NA   NA
 7718654 7718655 ROP_09860 ROP_09870 cysD cysNC TRUE 0.993 0.000 0.500 0.001 N NA
 7718656 7718657 ROP_09880 ROP_09890     FALSE 0.178 66.000 0.000 1.000 N NA
 7718657 7718658 ROP_09890 ROP_09900   cysA TRUE 0.797 26.000 0.000 1.000 Y NA
 7718658 7718659 ROP_09900 ROP_09910 cysA cysW TRUE 0.995 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 7718659 7718660 ROP_09910 ROP_09920 cysW cysT TRUE 0.994 -3.000 0.177 0.000 N NA
 7718660 7718661 ROP_09920 ROP_09930 cysT subI TRUE 0.711 50.000 0.188 0.002 N NA
 7718661 7718662 ROP_09930 ROP_09940 subI   FALSE 0.005 397.000 0.000 NA   NA
 7718664 7718665 ROP_09960 ROP_09970     FALSE 0.401 65.000 0.154 1.000   NA
 7718665 7718666 ROP_09970 ROP_09980   lepA FALSE 0.261 49.000 0.002 1.000   NA
 7718668 7718669 ROP_10000 ROP_10010   aqpZ FALSE 0.065 119.000 0.000 1.000   NA
 7718669 7718670 ROP_10010 ROP_10020 aqpZ   FALSE 0.299 65.000 0.071 NA N NA
 7718670 7718671 ROP_10020 ROP_10030     TRUE 0.979 -3.000 0.089 NA   NA
 7718671 7718672 ROP_10030 ROP_10040     TRUE 0.931 0.000 0.044 NA   NA
 7718676 7718677 ROP_10080 ROP_10090     FALSE 0.253 48.000 0.000 1.000   NA
 7718679 7718680 ROP_10110 ROP_10120     FALSE 0.060 113.000 0.000 NA   NA
 7718680 7718681 ROP_10120 ROP_10130     FALSE 0.203 51.000 0.000 NA   NA
 7718681 7718682 ROP_10130 ROP_10140     TRUE 0.951 -3.000 0.002 NA   NA
 7718682 7718683 ROP_10140 ROP_10150     FALSE 0.246 70.000 0.065 NA   NA
 7718683 7718684 ROP_10150 ROP_10160     TRUE 0.964 5.000 0.484 NA   NA
 7718684 7718685 ROP_10160 ROP_10170     TRUE 0.926 -13.000 0.245 1.000   NA
 7718685 7718686 ROP_10170 ROP_10180     TRUE 0.970 -3.000 0.045 NA   NA
 7718686 7718687 ROP_10180 ROP_10190   nadD TRUE 0.674 35.000 0.221 NA   NA
 7718687 7718688 ROP_10190 ROP_10200 nadD   FALSE 0.170 65.000 0.007 NA   NA
 7718688 7718689 ROP_10200 ROP_10210     TRUE 0.966 10.000 0.862 NA   NA
 7718689 7718690 ROP_10210 ROP_10220   proA FALSE 0.218 65.000 0.019 1.000   NA
 7718691 7718692 ROP_10230 ROP_10240   proP FALSE 0.014 245.000 0.000 1.000 N NA
 7718692 7718693 ROP_10240 ROP_10250 proP rbsK TRUE 0.957 10.000 0.222 1.000 Y NA
 7718693 7718694 ROP_10250 ROP_10260 rbsK   FALSE 0.221 57.000 0.000 1.000 N NA
 7718694 7718695 ROP_10260 ROP_10270   ectA FALSE 0.049 152.000 0.019 1.000   NA
 7718695 7718696 ROP_10270 ROP_10280 ectA ectB TRUE 0.952 28.000 0.793 0.000   NA
 7718696 7718697 ROP_10280 ROP_10290 ectB ectC TRUE 0.916 18.000 0.572 1.000   NA
 7718697 7718698 ROP_10290 ROP_10300 ectC   TRUE 0.683 10.000 0.013 1.000   NA
 7718698 7718699 ROP_10300 ROP_10310     FALSE 0.481 22.000 0.000 1.000 N NA
 7718700 7718701 ROP_10320 ROP_10330 proB obg TRUE 0.988 -3.000 0.206 1.000   NA
 7718701 7718702 ROP_10330 ROP_10340 obg rpmA FALSE 0.221 143.000 0.335 1.000   NA
 7718702 7718703 ROP_10340 ROP_10350 rpmA rplU TRUE 0.959 43.000 0.667 0.008 Y NA
 7718703 7718704 ROP_10350 ROP_10360 rplU   FALSE 0.173 207.000 0.027 0.009 Y NA
 7718704 7718705 ROP_10360 ROP_10370   ndk FALSE 0.006 459.000 0.000 1.000 N NA
 7718705 7718706 ROP_10370 ROP_10380 ndk   FALSE 0.519 19.000 0.014 NA   NA
 7718706 7718707 ROP_10380 ROP_10390   folC TRUE 0.986 -3.000 0.188 NA   NA
 7718707 7718708 ROP_10390 ROP_10400 folC valS TRUE 0.993 -3.000 0.208 0.078 N NA
 7718708 7718709 ROP_10400 ROP_10410 valS   FALSE 0.178 57.000 0.000 NA   NA
 7718709 7718710 ROP_10410 ROP_10420     FALSE 0.162 61.000 0.000 NA   NA
 7718710 7718711 ROP_10420 ROP_10430     FALSE 0.029 154.000 0.000 NA   NA
 7718712 7718713 ROP_10440 ROP_10450     TRUE 0.664 61.000 0.500 NA   NA
 7718714 7718715 ROP_10460 ROP_10470     FALSE 0.263 49.000 0.000 1.000 N NA
 7718715 7718716 ROP_10470 ROP_10480     FALSE 0.304 63.000 0.061 1.000   NA
 7718716 7718717 ROP_10480 ROP_10490   pcaJ FALSE 0.215 55.000 0.000 1.000   NA
 7718717 7718718 ROP_10490 ROP_10500 pcaJ pcaI TRUE 0.999 -3.000 0.538 0.001 Y NA
 7718719 7718720 ROP_10510 ROP_10520 pcaH pcaG TRUE 0.992 0.000 0.058 0.000 Y NA
 7718720 7718721 ROP_10520 ROP_10530 pcaG pcaB TRUE 0.570 30.000 0.056 1.000 N NA
 7718721 7718722 ROP_10530 ROP_10540 pcaB pcaL TRUE 0.964 -3.000 0.014 1.000   NA
 7718722 7718723 ROP_10540 ROP_10550 pcaL pcaR TRUE 0.985 -3.000 0.133 1.000   NA
 7718723 7718724 ROP_10550 ROP_10560 pcaR pcaF TRUE 0.723 37.000 0.267 1.000 N NA
 7718725 7718726 ROP_10570 ROP_10580   aroE FALSE 0.318 34.000 0.000 NA   NA
 7718727 7718728 ROP_10590 ROP_10600     FALSE 0.066 124.000 0.000 1.000 N NA
 7718729 7718730 ROP_10610 ROP_10620     TRUE 0.972 6.000 0.667 1.000   NA
 7718730 7718731 ROP_10620 ROP_10630     TRUE 0.898 34.000 0.312 NA Y NA
 7718731 7718732 ROP_10630 ROP_10640     FALSE 0.018 187.000 0.000 NA   NA
 7718732 7718733 ROP_10640 ROP_10650     FALSE 0.285 38.000 0.000 NA   NA
 7718734 7718735 ROP_10660 ROP_10670 iolC   TRUE 0.938 -7.000 0.179 1.000   NA
 7718735 7718736 ROP_10670 ROP_10680   iolB TRUE 0.716 22.000 0.128 1.000   NA
 7718736 7718737 ROP_10680 ROP_10690 iolB iolD TRUE 0.672 21.000 0.071 1.000 N NA
 7718737 7718738 ROP_10690 ROP_10700 iolD iolE TRUE 0.806 35.000 0.417 1.000 N NA
 7718738 7718739 ROP_10700 ROP_10710 iolE idh TRUE 0.800 22.000 0.250 1.000   NA
 7718739 7718740 ROP_10710 ROP_10720 idh iolH TRUE 0.948 6.000 0.400 NA   NA
 7718740 7718741 ROP_10720 ROP_10730 iolH mmsA TRUE 0.849 12.000 0.214 NA N NA
 7718741 7718742 ROP_10730 ROP_10740 mmsA ndh FALSE 0.507 67.000 0.000 1.000 Y NA
 7718742 7718743 ROP_10740 ROP_10750 ndh glk TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7718748 7718749 ROP_10800 ROP_10810     FALSE 0.136 71.000 0.000 NA N NA
 7718751 7718752 ROP_10830 ROP_10840     FALSE 0.008 364.000 0.000 1.000 N NA
 7718752 7718753 ROP_10840 ROP_10850   aroQ TRUE 0.949 8.000 0.091 1.000 Y NA
 7718753 7718754 ROP_10850 ROP_10860 aroQ clpX FALSE 0.250 51.000 0.000 1.000 N NA
 7718754 7718755 ROP_10860 ROP_10870 clpX clpP FALSE 0.084 242.000 0.039 1.000 Y NA
 7718755 7718756 ROP_10870 ROP_10880 clpP clpP TRUE 0.912 49.000 0.341 0.001 Y NA
 7718756 7718757 ROP_10880 ROP_10890 clpP tig FALSE 0.206 146.000 0.018 1.000 Y NA
 7718757 7718758 ROP_10890 ROP_t0070 tig   FALSE 0.154 63.000 0.000 NA   NA
 7718759 7718760 ROP_t0080 ROP_10900     FALSE 0.012 233.000 0.000 NA   NA
 7718761 7718762 ROP_10910 ROP_10920   rpiB TRUE 0.944 7.000 0.398 1.000 N NA
 7718765 7718766 ROP_10950 ROP_10960   pepN FALSE 0.137 73.000 0.000 1.000   NA
 7718767 7718768 ROP_10970 ROP_10980 dinB   FALSE 0.305 44.000 0.000 1.000 N NA
 7718770 7718771 ROP_11000 ROP_11010     TRUE 0.927 -13.000 0.265 NA   NA
 7718771 7718772 ROP_11010 ROP_11020     FALSE 0.306 76.000 0.157 NA   NA
 7718773 7718774 ROP_11030 ROP_11040 glbO aglA FALSE 0.264 68.000 0.055 1.000   NA
 7718775 7718776 ROP_11050 ROP_11060     TRUE 0.957 -7.000 0.305 NA   NA
 7718776 7718777 ROP_11060 ROP_11070   gdh TRUE 0.972 -3.000 0.051 NA   NA
 7718777 7718778 ROP_11070 ROP_11080 gdh   FALSE 0.492 109.000 0.667 NA   NA
 7718778 7718779 ROP_11080 ROP_11090     TRUE 0.766 5.000 0.004 NA   NA
 7718779 7718780 ROP_11090 ROP_11100   ssb FALSE 0.092 133.000 0.053 1.000   NA
 7718780 7718781 ROP_11100 ROP_11110 ssb   FALSE 0.046 169.000 0.038 1.000   NA
 7718782 7718783 ROP_11120 ROP_t0090     FALSE 0.174 58.000 0.000 NA   NA
 7718784 7718785 ROP_11130 ROP_11140     FALSE 0.012 229.000 0.000 NA   NA
 7718785 7718786 ROP_11140 ROP_11150     TRUE 0.890 0.000 0.000 NA N NA
 7718787 7718788 ROP_11160 ROP_11170   gdhA FALSE 0.075 103.000 0.000 NA N NA
 7718789 7718790 ROP_11180 ROP_11190     TRUE 0.843 13.000 0.231 NA   NA
 7718790 7718791 ROP_11190 ROP_11200     TRUE 0.903 34.000 0.800 1.000 N NA
 7718792 7718793 ROP_11210 ROP_11220     FALSE 0.519 27.000 0.028 1.000   NA
 7718793 7718794 ROP_11220 ROP_11230     FALSE 0.108 76.000 0.000 NA   NA
 7718796 7718797 ROP_11250 ROP_11260   fadH TRUE 0.743 15.000 0.093 NA N NA
 7718797 7718798 ROP_11260 ROP_11270 fadH   TRUE 0.590 19.000 0.025 1.000   NA
 7718800 7718801 ROP_11290 ROP_t0100 orn   FALSE 0.091 86.000 0.000 NA   NA
 7718805 7718806 ROP_11320 ROP_11330 bcp   FALSE 0.104 103.000 0.009 1.000 N NA
 7718807 7718808 ROP_11340 ROP_11350 acpS fas1 TRUE 0.969 10.000 0.138 0.002 Y NA
 7718809 7718810 ROP_11360 ROP_11370     TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7718810 7718811 ROP_11370 ROP_t0120     FALSE 0.226 47.000 0.000 NA   NA
 7718811 7718812 ROP_t0120 ROP_11380     FALSE 0.047 128.000 0.000 NA   NA
 7718812 7718813 ROP_11380 ROP_11390     TRUE 0.990 -3.000 0.286 NA   NA
 7718814 7718815 ROP_11400 ROP_11410   rph TRUE 0.790 5.000 0.000 1.000 N NA
 7718815 7718816 ROP_11410 ROP_11420 rph   FALSE 0.432 44.000 0.053 1.000   NA
 7718816 7718817 ROP_11420 ROP_11430   cysM FALSE 0.486 27.000 0.016 1.000   NA
 7718817 7718818 ROP_11430 ROP_11440 cysM   FALSE 0.012 342.000 0.032 1.000   NA
 7718818 7718819 ROP_11440 ROP_11450   cysM TRUE 0.598 20.000 0.032 1.000   NA
 7718819 7718820 ROP_11450 ROP_11460 cysM cysO TRUE 0.793 9.000 0.052 1.000 N NA
 7718820 7718821 ROP_11460 ROP_11470 cysO   FALSE 0.333 63.000 0.093 NA   NA
 7718821 7718822 ROP_11470 ROP_11480     FALSE 0.095 121.000 0.044 NA   NA
 7718822 7718823 ROP_11480 ROP_11490     TRUE 0.980 -3.000 0.093 NA   NA
 7718823 7718824 ROP_11490 ROP_11500   clpS TRUE 0.887 37.000 0.823 NA   NA
 7718825 7718826 ROP_11510 ROP_11520 pncB pncA TRUE 0.977 -3.000 0.053 1.000 N NA
 7718826 7718827 ROP_11520 ROP_11530 pncA   TRUE 0.693 10.000 0.009 1.000 N NA
 7718827 7718828 ROP_11530 ROP_11540     FALSE 0.256 76.000 0.000 0.078 N NA
 7718828 7718829 ROP_11540 ROP_11550     TRUE 0.951 -3.000 0.000 NA N NA
 7718831 7718832 ROP_11570 ROP_11580 glgE glgB TRUE 0.994 0.000 0.159 0.003 Y NA
 7718832 7718833 ROP_11580 ROP_11590 glgB   FALSE 0.274 47.000 0.013 NA   NA
 7718835 7718836 ROP_11610 ROP_11620 dgoK dgoA TRUE 0.999 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 7718836 7718837 ROP_11620 ROP_11630 dgoA dgoD FALSE 0.372 52.000 0.052 1.000 N NA
 7718837 7718838 ROP_11630 ROP_11640 dgoD dgoT TRUE 0.831 6.000 0.052 NA N NA
 7718839 7718840 ROP_11650 ROP_11660     FALSE 0.109 119.000 0.057 NA   NA
 7718840 7718841 ROP_11660 ROP_11670     FALSE 0.280 64.000 0.064 NA   NA
 7718842 7718843 ROP_11680 ROP_11690     FALSE 0.362 69.000 0.167 NA   NA
 7718844 7718845 ROP_11700 ROP_11710     TRUE 0.755 17.000 0.141 NA   NA
 7718848 7718849 ROP_11740 ROP_11750     TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7718852 7718853 ROP_r0040 ROP_r0050     FALSE 0.032 149.000 0.000 NA   NA
 7718853 7718854 ROP_r0050 ROP_r0060     FALSE 0.007 335.000 0.000 NA   NA
 7718854 7718855 ROP_r0060 ROP_11780   murA FALSE 0.003 606.000 0.000 NA   NA
 7718857 7718858 ROP_11800 ROP_11810   atpC FALSE 0.457 37.000 0.054 NA   NA
 7718858 7718859 ROP_11810 ROP_11820 atpC atpD TRUE 0.994 7.000 0.837 0.001 Y NA
 7718859 7718860 ROP_11820 ROP_11830 atpD atpG TRUE 0.996 4.000 0.724 0.001 Y NA
 7718860 7718861 ROP_11830 ROP_11840 atpG atpA TRUE 0.961 49.000 0.846 0.001 Y NA
 7718861 7718862 ROP_11840 ROP_11850 atpA atpH TRUE 0.944 63.000 0.864 0.001 Y NA
 7718862 7718863 ROP_11850 ROP_11860 atpH atpF TRUE 0.997 -3.000 0.067 0.001 Y NA
 7718863 7718864 ROP_11860 ROP_11870 atpF atpE TRUE 0.916 10.000 0.121 0.001   NA
 7718864 7718865 ROP_11870 ROP_11880 atpE atpB TRUE 0.716 86.000 0.628 0.001   NA
 7718865 7718866 ROP_11880 ROP_11890 atpB   FALSE 0.014 244.000 0.011 NA   NA
 7718866 7718867 ROP_11890 ROP_11900   wecA FALSE 0.450 48.000 0.105 NA   NA
 7718867 7718868 ROP_11900 ROP_11910 wecA   TRUE 0.989 -3.000 0.248 NA N NA
 7718868 7718869 ROP_11910 ROP_11920   hemK TRUE 0.998 -3.000 0.583 NA Y NA
 7718869 7718870 ROP_11920 ROP_11930 hemK prfA TRUE 0.784 55.000 0.069 0.025 Y NA
 7718870 7718871 ROP_11930 ROP_11940 prfA rpmE FALSE 0.498 93.000 0.110 1.000 Y NA
 7718871 7718872 ROP_11940 ROP_11950 rpmE rho FALSE 0.044 225.000 0.115 1.000 N NA
 7718872 7718873 ROP_11950 ROP_11960 rho thrB FALSE 0.019 329.000 0.000 0.078 N NA
 7718873 7718874 ROP_11960 ROP_11970 thrB thrC TRUE 0.832 45.000 0.221 1.000 Y NA
 7718874 7718875 ROP_11970 ROP_11980 thrC hom TRUE 0.996 -3.000 0.194 1.000 Y NA
 7718875 7718876 ROP_11980 ROP_11990 hom lysA TRUE 0.994 -3.000 0.071 1.000 Y NA
 7718876 7718877 ROP_11990 ROP_12000 lysA argS TRUE 0.980 -3.000 0.071 1.000 N NA
 7718878 7718879 ROP_12010 ROP_12020     TRUE 0.981 -7.000 0.667 NA   NA
 7718882 7718883 ROP_12040 ROP_12050     TRUE 0.751 6.000 0.000 1.000 N NA
 7718883 7718884 ROP_12050 ROP_12060     TRUE 0.622 37.000 0.143 1.000 N NA
 7718884 7718885 ROP_12060 ROP_12070     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.020 Y NA
 7718885 7718886 ROP_12070 ROP_12080     FALSE 0.560 11.000 0.000 NA   NA
 7718886 7718887 ROP_12080 ROP_12090     TRUE 0.973 -7.000 0.500 NA   NA
 7718887 7718888 ROP_12090 ROP_12100     TRUE 0.992 2.000 0.429 1.000 Y NA
 7718888 7718889 ROP_12100 ROP_12110     FALSE 0.253 48.000 0.000 1.000   NA
 7718890 7718891 ROP_12120 ROP_12130     TRUE 0.884 45.000 0.400 1.000 Y NA
 7718891 7718892 ROP_12130 ROP_12140     TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7718892 7718893 ROP_12140 ROP_12150     FALSE 0.051 133.000 0.000 1.000   NA
 7718893 7718894 ROP_12150 ROP_12160     FALSE 0.349 30.000 0.000 NA   NA
 7718897 7718898 ROP_12190 ROP_12200   qsdA TRUE 0.857 2.000 0.000 1.000   NA
 7718898 7718899 ROP_12200 ROP_12210 qsdA   FALSE 0.005 521.000 0.000 1.000   NA
 7718899 7718900 ROP_12210 ROP_12220   cysQ TRUE 0.976 -3.000 0.049 1.000 N NA
 7718900 7718901 ROP_12220 ROP_12230 cysQ cysNC TRUE 0.963 -10.000 0.073 1.000 Y NA
 7718901 7718902 ROP_12230 ROP_12240 cysNC cysD TRUE 0.993 0.000 0.483 0.001 N NA
 7718902 7718903 ROP_12240 ROP_12250 cysD   FALSE 0.266 120.000 0.267 1.000 N NA
 7718904 7718905 ROP_12260 ROP_12270     TRUE 0.902 6.000 0.182 NA   NA
 7718905 7718906 ROP_12270 ROP_12280     TRUE 0.915 20.000 0.625 1.000   NA
 7718908 7718909 ROP_12300 ROP_12310 clpP clpP TRUE 0.996 5.000 0.913 0.001 Y NA
 7718910 7718911 ROP_12320 ROP_12330   fabF FALSE 0.169 65.000 0.000 1.000   NA
 7718913 7718914 ROP_12350 ROP_12360     TRUE 0.992 -3.000 0.333 1.000   NA
 7718915 7718916 ROP_12370 ROP_12380     FALSE 0.074 116.000 0.000 1.000 N NA
 7718918 7718919 ROP_12390 ROP_12400     FALSE 0.231 55.000 0.000 1.000 N NA
 7718920 7718921 ROP_12410 ROP_12420 echA mmsB TRUE 0.998 -3.000 0.417 1.000 Y NA
 7718921 7718922 ROP_12420 ROP_12430 mmsB   TRUE 0.841 33.000 0.096 1.000 Y NA
 7718922 7718923 ROP_12430 ROP_12440   fadE TRUE 0.997 -3.000 0.318 1.000 Y NA
 7718923 7718924 ROP_12440 ROP_12450 fadE mmsA TRUE 0.860 11.000 0.197 1.000 N NA
 7718924 7718925 ROP_12450 ROP_12460 mmsA   FALSE 0.069 115.000 0.000 1.000   NA
 7718925 7718926 ROP_12460 ROP_12470     FALSE 0.342 31.000 0.000 NA   NA
 7718926 7718927 ROP_12470 ROP_12480   cutC FALSE 0.099 80.000 0.000 NA   NA
 7718927 7718928 ROP_12480 ROP_12490 cutC nagB TRUE 0.924 0.000 0.014 1.000 N NA
 7718928 7718929 ROP_12490 ROP_12500 nagB nagA TRUE 0.984 -12.000 0.179 0.000 Y NA
 7718929 7718930 ROP_12500 ROP_12510 nagA ptsI TRUE 0.993 -3.000 0.036 1.000 Y NA
 7718930 7718931 ROP_12510 ROP_12520 ptsI ptsH TRUE 0.999 0.000 1.000 0.001 Y NA
 7718931 7718932 ROP_12520 ROP_12530 ptsH   TRUE 0.990 3.000 0.154 0.001 Y NA
 7718933 7718934 ROP_12540 ROP_12550     TRUE 0.999 -3.000 0.368 0.001 Y NA
 7718935 7718936 ROP_12560 ROP_12570     FALSE 0.084 91.000 0.000 NA   NA
 7718936 7718937 ROP_12570 ROP_12580     FALSE 0.098 81.000 0.000 NA   NA
 7718937 7718938 ROP_12580 ROP_12590     FALSE 0.257 50.000 0.000 1.000 N NA
 7718938 7718939 ROP_12590 ROP_12600     FALSE 0.193 60.000 0.000 1.000   NA
 7718939 7718940 ROP_12600 ROP_12610     TRUE 0.989 -3.000 0.236 1.000   NA
 7718941 7718942 ROP_12620 ROP_12630     FALSE 0.113 74.000 0.000 NA   NA
 7718942 7718943 ROP_12630 ROP_12640     FALSE 0.142 66.000 0.000 NA   NA
 7718945 7718946 ROP_12660 ROP_12670     FALSE 0.009 267.000 0.000 NA   NA
 7718946 7718947 ROP_12670 ROP_12680     TRUE 0.978 -3.000 0.080 NA   NA
 7718947 7718948 ROP_12680 ROP_12690     TRUE 0.876 3.000 0.024 1.000   NA
 7718948 7718949 ROP_12690 ROP_12700     TRUE 0.625 11.000 0.000 1.000 N NA
 7718949 7718950 ROP_12700 ROP_12710     TRUE 0.779 -7.000 0.000 NA   NA
 7718951 7718952 ROP_12720 ROP_12730     FALSE 0.049 126.000 0.000 NA   NA
 7718952 7718953 ROP_12730 ROP_12740     TRUE 0.635 8.000 0.000 NA   NA
 7718956 7718957 ROP_12770 ROP_12780   bkdF FALSE 0.011 239.000 0.000 NA   NA
 7718957 7718958 ROP_12780 ROP_12790 bkdF bkdG TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.001 Y NA
 7718958 7718959 ROP_12790 ROP_12800 bkdG bkdH TRUE 0.969 31.000 1.000 1.000 Y NA
 7718959 7718960 ROP_12800 ROP_12810 bkdH   TRUE 0.757 20.000 0.167 NA N NA
 7718963 7718964 ROP_12840 ROP_12850 pntB pntAB TRUE 0.990 0.000 0.321 0.001   NA
 7718964 7718965 ROP_12850 ROP_12860 pntAB pntAA TRUE 0.995 1.000 0.829 0.001   NA
 7718966 7718967 ROP_12870 ROP_12880     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7718969 7718970 ROP_12900 ROP_12910     TRUE 0.791 7.000 0.049 NA   NA
 7718972 7718973 ROP_12930 ROP_12940     FALSE 0.061 111.000 0.000 NA   NA
 7718973 7718974 ROP_12940 ROP_12950     FALSE 0.145 65.000 0.000 NA   NA
 7718974 7718975 ROP_12950 ROP_12960     TRUE 0.671 -16.000 0.000 NA   NA
 7718975 7718976 ROP_12960 ROP_12970     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7718976 7718977 ROP_12970 ROP_12980     FALSE 0.092 85.000 0.000 NA   NA
 7718979 7718980 ROP_13000 ROP_13010     FALSE 0.043 148.000 0.000 1.000 N NA
 7718980 7718981 ROP_13010 ROP_13020     TRUE 0.964 -3.000 0.020 NA N NA
 7718981 7718982 ROP_13020 ROP_13030     TRUE 0.984 -22.000 0.584 NA Y NA
 7718982 7718983 ROP_13030 ROP_13040     TRUE 0.984 -7.000 0.253 1.000 Y NA
 7718986 7718987 ROP_13070 ROP_13080     TRUE 0.923 -252.000 0.444 NA   NA
 7718987 7718988 ROP_13080 ROP_13090     FALSE 0.006 382.000 0.000 NA   NA
 7718988 7718989 ROP_13090 ROP_13100     TRUE 0.569 -271.000 0.000 NA   NA
 7718989 7718990 ROP_13100 ROP_13110     FALSE 0.439 20.000 0.000 NA   NA
 7718991 7718992 ROP_13120 ROP_13130     TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 7718992 7718993 ROP_13130 ROP_13140     FALSE 0.124 71.000 0.000 NA   NA
 7718993 7718994 ROP_13140 ROP_13150     FALSE 0.037 141.000 0.000 NA   NA
 7718994 7718995 ROP_13150 ROP_13160     TRUE 0.696 6.000 0.000 NA   NA
 7718996 7718997 ROP_13170 ROP_13180     FALSE 0.113 82.000 0.000 1.000   NA
 7718997 7718998 ROP_13180 ROP_13190     TRUE 0.565 15.000 0.000 1.000 N NA
 7718998 7718999 ROP_13190 ROP_13200     TRUE 0.980 0.000 0.286 1.000 N NA
 7719000 7719001 ROP_13210 ROP_13220     TRUE 0.851 44.000 0.250 1.000 Y NA
 7719001 7719002 ROP_13220 ROP_13230     FALSE 0.020 203.000 0.000 1.000 N NA
 7719002 7719003 ROP_13230 ROP_13240     FALSE 0.008 293.000 0.000 NA   NA
 7719004 7719005 ROP_13250 ROP_13260 vdh   TRUE 0.719 7.000 0.000 1.000 N NA
 7719006 7719007 ROP_13270 ROP_13280   ribH2 FALSE 0.481 24.000 0.002 1.000 N NA
 7719008 7719009 ROP_13290 ROP_13300     FALSE 0.098 81.000 0.000 NA   NA
 7719012 7719013 ROP_13330 ROP_13340     TRUE 0.954 -7.000 0.286 NA   NA
 7719013 7719014 ROP_13340 ROP_13350     FALSE 0.049 126.000 0.000 NA   NA
 7719015 7719016 ROP_13360 ROP_13370     FALSE 0.079 94.000 0.000 NA   NA
 7719016 7719017 ROP_13370 ROP_13380     TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.092 Y NA
 7719017 7719018 ROP_13380 ROP_13390     FALSE 0.033 157.000 0.000 1.000   NA
 7719018 7719019 ROP_13390 ROP_13400     TRUE 0.857 2.000 0.000 1.000   NA
 7719020 7719021 ROP_13410 ROP_13420     FALSE 0.257 43.000 0.000 NA   NA
 7719023 7719024 ROP_13440 ROP_13450 ligB   FALSE 0.099 80.000 0.000 NA   NA
 7719024 7719025 ROP_13450 ROP_13460     FALSE 0.476 17.000 0.000 NA   NA
 7719027 7719028 ROP_13480 ROP_13490     FALSE 0.497 15.000 0.000 NA   NA
 7719028 7719029 ROP_13490 ROP_13500     FALSE 0.242 45.000 0.000 NA   NA
 7719029 7719030 ROP_13500 ROP_13510     FALSE 0.025 166.000 0.000 NA   NA
 7719033 7719034 ROP_13540 ROP_13550     FALSE 0.051 133.000 0.000 1.000   NA
 7719034 7719035 ROP_13550 ROP_13560     TRUE 0.991 -3.000 0.330 NA   NA
 7719038 7719039 ROP_13590 ROP_13600     FALSE 0.007 316.000 0.000 NA   NA
 7719039 7719040 ROP_13600 ROP_13610     FALSE 0.510 14.000 0.000 NA   NA
 7719040 7719041 ROP_13610 ROP_13620     FALSE 0.007 322.000 0.000 NA   NA
 7719041 7719042 ROP_13620 ROP_13630     FALSE 0.299 89.000 0.200 NA N NA
 7719042 7719043 ROP_13630 ROP_13640     TRUE 0.979 -3.000 0.077 NA N NA
 7719043 7719044 ROP_13640 ROP_13650     FALSE 0.456 46.000 0.077 1.000   NA
 7719044 7719045 ROP_13650 ROP_13660     FALSE 0.082 92.000 0.000 NA   NA
 7719045 7719046 ROP_13660 ROP_13670     FALSE 0.099 80.000 0.000 NA   NA
 7719048 7719049 ROP_13690 ROP_13700     TRUE 0.733 36.000 0.000 1.000 Y NA
 7719051 7719052 ROP_13720 ROP_13730     FALSE 0.121 72.000 0.000 NA   NA
 7719052 7719053 ROP_13730 ROP_13740     TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7719054 7719055 ROP_13750 ROP_13760     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719055 7719056 ROP_13760 ROP_13770     FALSE 0.014 219.000 0.000 NA   NA
 7719056 7719057 ROP_13770 ROP_13780     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719057 7719058 ROP_13780 ROP_13790     TRUE 0.888 15.000 0.400 NA   NA
 7719058 7719059 ROP_13790 ROP_13800     FALSE 0.464 88.000 0.444 NA   NA
 7719059 7719060 ROP_13800 ROP_13810     TRUE 0.758 49.000 0.556 NA   NA
 7719060 7719061 ROP_13810 ROP_13820     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719061 7719062 ROP_13820 ROP_13830     FALSE 0.004 522.000 0.000 NA   NA
 7719063 7719064 ROP_13840 ROP_13850     FALSE 0.004 489.000 0.000 NA   NA
 7719066 7719067 ROP_13870 ROP_13880     FALSE 0.059 114.000 0.000 NA   NA
 7719067 7719068 ROP_13880 ROP_13890     FALSE 0.413 22.000 0.000 NA   NA
 7719069 7719070 ROP_13900 ROP_13910     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719070 7719071 ROP_13910 ROP_13920     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719071 7719072 ROP_13920 ROP_13930     TRUE 0.600 35.000 0.138 NA   NA
 7719075 7719076 ROP_13960 ROP_13970     FALSE 0.008 304.000 0.000 NA   NA
 7719076 7719077 ROP_13970 ROP_13980     FALSE 0.010 250.000 0.000 NA   NA
 7719078 7719079 ROP_13990 ROP_14000 dinB   FALSE 0.103 78.000 0.000 NA   NA
 7719079 7719080 ROP_14000 ROP_14010     FALSE 0.285 38.000 0.000 NA   NA
 7719080 7719081 ROP_14010 ROP_14020     FALSE 0.014 220.000 0.000 NA   NA
 7719087 7719088 ROP_14080 ROP_14090     FALSE 0.095 83.000 0.000 NA   NA
 7719088 7719089 ROP_14090 ROP_14100     FALSE 0.006 360.000 0.000 NA   NA
 7719091 7719092 ROP_14120 ROP_14130     FALSE 0.024 168.000 0.000 NA   NA
 7719092 7719093 ROP_14130 ROP_14140     FALSE 0.058 116.000 0.000 NA   NA
 7719093 7719094 ROP_14140 ROP_14150     FALSE 0.076 97.000 0.000 NA   NA
 7719094 7719095 ROP_14150 ROP_14160     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 7719095 7719096 ROP_14160 ROP_14170     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719098 7719099 ROP_14190 ROP_14200     FALSE 0.010 282.000 0.000 1.000   NA
 7719104 7719105 ROP_14250 ROP_14260     FALSE 0.270 48.000 0.000 1.000 N NA
 7719108 7719109 ROP_14290 ROP_14300     TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7719109 7719110 ROP_14300 ROP_14310     FALSE 0.025 175.000 0.000 1.000   NA
 7719110 7719111 ROP_14310 ROP_14320     TRUE 0.975 -7.000 0.000 0.020 Y NA
 7719111 7719112 ROP_14320 ROP_14330     TRUE 0.974 -10.000 0.182 1.000 Y NA
 7719112 7719113 ROP_14330 ROP_14340     TRUE 0.960 6.000 0.000 0.044 Y NA
 7719113 7719114 ROP_14340 ROP_14350     TRUE 0.727 51.000 0.000 0.044 Y NA
 7719114 7719115 ROP_14350 ROP_14360     FALSE 0.314 37.000 0.000 NA N NA
 7719115 7719116 ROP_14360 ROP_14370     FALSE 0.034 151.000 0.000 NA N NA
 7719116 7719117 ROP_14370 ROP_14380     FALSE 0.341 34.000 0.000 NA N NA
 7719118 7719119 ROP_14390 ROP_14400 metY   TRUE 0.868 2.000 0.000 1.000 N NA
 7719119 7719120 ROP_14400 ROP_14410     FALSE 0.144 74.000 0.000 1.000 N NA
 7719125 7719126 ROP_14460 ROP_14470     FALSE 0.072 106.000 0.000 NA N NA
 7719126 7719127 ROP_14470 ROP_14480     FALSE 0.162 61.000 0.000 NA   NA
 7719128 7719129 ROP_14490 ROP_14500     FALSE 0.031 156.000 0.000 NA N NA
 7719130 7719131 ROP_14510 ROP_14520 aspA   TRUE 0.569 20.000 0.023 1.000   NA
 7719131 7719132 ROP_14520 ROP_14530     TRUE 0.982 -3.000 0.116 NA   NA
 7719132 7719133 ROP_14530 ROP_14540     TRUE 0.976 -3.000 0.070 NA   NA
 7719133 7719134 ROP_14540 ROP_14550     TRUE 0.951 -3.000 0.000 NA N NA
 7719134 7719135 ROP_14550 ROP_14560     TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.091   NA
 7719139 7719140 ROP_14600 ROP_14610     FALSE 0.098 87.000 0.000 NA N NA
 7719140 7719141 ROP_14610 ROP_14620     FALSE 0.018 209.000 0.000 1.000   NA
 7719142 7719143 ROP_14630 ROP_14640     FALSE 0.539 12.000 0.000 NA   NA
 7719143 7719144 ROP_14640 ROP_14650     FALSE 0.366 28.000 0.000 NA   NA
 7719144 7719145 ROP_14650 ROP_14660     FALSE 0.026 180.000 0.000 1.000 N NA
 7719145 7719146 ROP_14660 ROP_14670     FALSE 0.377 32.000 0.000 1.000   NA
 7719146 7719147 ROP_14670 ROP_14680     FALSE 0.109 84.000 0.000 1.000   NA
 7719147 7719148 ROP_14680 ROP_14690     FALSE 0.286 44.000 0.000 1.000   NA
 7719148 7719149 ROP_14690 ROP_14700     FALSE 0.008 321.000 0.000 1.000   NA
 7719149 7719150 ROP_14700 ROP_14710   cysJ TRUE 0.974 -3.000 0.037 1.000 N NA
 7719150 7719151 ROP_14710 ROP_14720 cysJ   TRUE 0.598 35.000 0.000 0.013 N NA
 7719152 7719153 ROP_14730 ROP_14740     TRUE 0.881 -19.000 0.158 NA N NA
 7719153 7719154 ROP_14740 ROP_14750     TRUE 0.985 0.000 0.050 1.000 Y NA
 7719154 7719155 ROP_14750 ROP_14760     FALSE 0.086 104.000 0.000 1.000 N NA
 7719157 7719158 ROP_14780 ROP_14790     FALSE 0.403 23.000 0.000 NA   NA
 7719158 7719159 ROP_14790 ROP_14800     FALSE 0.025 166.000 0.000 NA   NA
 7719159 7719160 ROP_14800 ROP_14810     TRUE 0.813 -6.000 0.000 NA   NA
 7719162 7719163 ROP_14830 ROP_14840     TRUE 0.991 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7719163 7719164 ROP_14840 ROP_14850   gbsA FALSE 0.221 57.000 0.000 1.000 N NA
 7719164 7719165 ROP_14850 ROP_14860 gbsA betP TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7719165 7719166 ROP_14860 ROP_14870 betP   TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7719166 7719167 ROP_14870 ROP_14880     FALSE 0.008 373.000 0.000 1.000 N NA
 7719168 7719169 ROP_14890 ROP_14900     TRUE 0.987 -3.000 0.208 NA   NA
 7719171 7719172 ROP_14920 ROP_14930     TRUE 0.996 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 7719172 7719173 ROP_14930 ROP_14940   folD TRUE 0.985 -3.000 0.128 1.000 N NA
 7719173 7719174 ROP_14940 ROP_14950 folD purU FALSE 0.077 113.000 0.000 1.000 N NA
 7719176 7719177 ROP_14970 ROP_14980 glyA soxB TRUE 0.995 0.000 0.500 1.000 Y NA
 7719177 7719178 ROP_14980 ROP_14990 soxB soxD TRUE 0.976 20.000 0.500 0.001 Y NA
 7719178 7719179 ROP_14990 ROP_15000 soxD soxA TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.001   NA
 7719179 7719180 ROP_15000 ROP_15010 soxA soxG TRUE 0.992 -7.000 0.833 0.001   NA
 7719180 7719181 ROP_15010 ROP_15020 soxG folP FALSE 0.137 76.000 0.000 1.000 N NA
 7719181 7719182 ROP_15020 ROP_15030 folP   TRUE 0.991 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7719182 7719183 ROP_15030 ROP_15040     FALSE 0.162 154.000 0.000 1.000 Y NA
 7719183 7719184 ROP_15040 ROP_15050   sdaA TRUE 0.991 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7719184 7719185 ROP_15050 ROP_15060 sdaA   TRUE 0.696 -13.000 0.000 NA   NA
 7719186 7719187 ROP_15070 ROP_15080     FALSE 0.507 67.000 0.000 1.000 Y NA
 7719187 7719188 ROP_15080 ROP_15090     FALSE 0.405 75.000 0.227 1.000 N NA
 7719188 7719189 ROP_15090 ROP_15100   proP TRUE 0.610 65.000 0.409 1.000 N NA
 7719189 7719190 ROP_15100 ROP_15110 proP   FALSE 0.009 302.000 0.000 NA N NA
 7719191 7719192 ROP_15120 ROP_15130     TRUE 0.822 31.000 0.400 1.000 N NA
 7719192 7719193 ROP_15130 ROP_15140     FALSE 0.036 143.000 0.000 NA   NA
 7719193 7719194 ROP_15140 ROP_15150     FALSE 0.078 95.000 0.000 NA   NA
 7719194 7719195 ROP_15150 ROP_15160     FALSE 0.047 128.000 0.000 NA   NA
 7719195 7719196 ROP_15160 ROP_15170     FALSE 0.439 20.000 0.000 NA   NA
 7719197 7719198 ROP_15180 ROP_15190 recD recB TRUE 0.997 -3.000 0.120 0.001 Y NA
 7719198 7719199 ROP_15190 ROP_15200 recB recC TRUE 0.997 -3.000 0.076 0.001 Y NA
 7719202 7719203 ROP_15230 ROP_15240     FALSE 0.059 114.000 0.000 NA   NA
 7719204 7719205 ROP_15250 ROP_15260     TRUE 0.875 33.000 0.667 NA   NA
 7719205 7719206 ROP_15260 ROP_15270     TRUE 0.938 5.000 0.250 NA   NA
 7719206 7719207 ROP_15270 ROP_15280     FALSE 0.050 125.000 0.000 NA   NA
 7719207 7719208 ROP_15280 ROP_15290   dak FALSE 0.049 126.000 0.000 NA   NA
 7719208 7719209 ROP_15290 ROP_15300 dak   TRUE 0.653 10.000 0.000 1.000 N NA
 7719209 7719210 ROP_15300 ROP_15310     TRUE 0.983 2.000 0.500 1.000 N NA
 7719210 7719211 ROP_15310 ROP_15320     FALSE 0.384 102.000 0.400 NA N NA
 7719211 7719212 ROP_15320 ROP_15330     FALSE 0.381 29.000 0.000 NA N NA
 7719212 7719213 ROP_15330 ROP_15340     TRUE 0.980 -3.000 0.086 NA N NA
 7719213 7719214 ROP_15340 ROP_15350     TRUE 0.992 -3.000 0.182 0.086   NA
 7719214 7719215 ROP_15350 ROP_15360     TRUE 0.979 0.000 0.154 0.086   NA
 7719215 7719216 ROP_15360 ROP_15370     TRUE 0.991 -3.000 0.154 0.086   NA
 7719216 7719217 ROP_15370 ROP_15380   aroE TRUE 0.993 -3.000 0.333 1.000 N NA
 7719217 7719218 ROP_15380 ROP_15390 aroE   TRUE 0.809 29.000 0.333 1.000 N NA
 7719218 7719219 ROP_15390 ROP_15400     FALSE 0.247 153.000 0.500 NA N NA
 7719221 7719222 ROP_15420 ROP_15430     TRUE 0.853 7.000 0.088 1.000   NA
 7719222 7719223 ROP_15430 ROP_15440     TRUE 0.964 7.000 0.176 1.000 Y NA
 7719223 7719224 ROP_15440 ROP_15450     FALSE 0.192 63.000 0.000 1.000 N NA
 7719225 7719226 ROP_15460 ROP_15470 genK   FALSE 0.408 69.000 0.182 1.000 N NA
 7719226 7719227 ROP_15470 ROP_15480     FALSE 0.344 38.000 0.000 1.000 N NA
 7719228 7719229 ROP_15490 ROP_15500     FALSE 0.244 52.000 0.000 1.000 N NA
 7719230 7719231 ROP_15510 ROP_15520     TRUE 0.992 -3.000 0.300 1.000   NA
 7719232 7719233 ROP_15530 ROP_15540 fadE   TRUE 0.949 15.000 0.286 1.000 Y NA
 7719233 7719234 ROP_15540 ROP_15550     FALSE 0.105 92.000 0.000 1.000 N NA
 7719234 7719235 ROP_15550 ROP_15560     TRUE 0.999 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 7719235 7719236 ROP_15560 ROP_15570   gbsA TRUE 0.869 33.000 0.600 1.000 N NA
 7719239 7719240 ROP_15600 ROP_15610     TRUE 0.807 36.000 0.000 0.086 Y NA
 7719240 7719241 ROP_15610 ROP_15620     FALSE 0.416 49.000 0.000 0.086   NA
 7719241 7719242 ROP_15620 ROP_15630     FALSE 0.308 35.000 0.000 NA   NA
 7719245 7719246 ROP_15660 ROP_15670     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719248 7719249 ROP_15690 ROP_15700     TRUE 0.879 0.000 0.000 NA   NA
 7719252 7719253 ROP_15730 ROP_15740 tcyA tcyB TRUE 0.985 11.000 0.594 0.043 Y NA
 7719253 7719254 ROP_15740 ROP_15750 tcyB tcyC TRUE 0.998 -3.000 0.481 1.000 Y NA
 7719257 7719258 ROP_15780 ROP_15790   fadD FALSE 0.508 18.000 0.000 1.000   NA
 7719258 7719259 ROP_15790 ROP_15800 fadD   TRUE 0.939 -7.000 0.167 1.000 N NA
 7719260 7719261 ROP_15810 ROP_15820     FALSE 0.074 110.000 0.000 1.000   NA
 7719263 7719264 ROP_15840 ROP_15850     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719264 7719265 ROP_15850 ROP_15860     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719265 7719266 ROP_15860 ROP_15870     TRUE 0.996 -3.000 0.633 NA   NA
 7719266 7719267 ROP_15870 ROP_15880     TRUE 0.995 -3.000 0.569 NA   NA
 7719268 7719269 ROP_15890 ROP_15900     FALSE 0.018 186.000 0.000 NA   NA
 7719269 7719270 ROP_15900 ROP_15910     TRUE 0.964 10.000 0.111 0.020 Y NA
 7719271 7719272 ROP_15920 ROP_15930     TRUE 0.997 -3.000 0.242 1.000 Y NA
 7719272 7719273 ROP_15930 ROP_15940     TRUE 0.845 3.000 0.000 1.000 N NA
 7719274 7719275 ROP_15950 ROP_15960     FALSE 0.539 12.000 0.000 NA   NA
 7719275 7719276 ROP_15960 ROP_15970     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719277 7719278 ROP_15980 ROP_15990     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719278 7719279 ROP_15990 ROP_16000     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719279 7719280 ROP_16000 ROP_16010     TRUE 0.954 -7.000 0.286 NA   NA
 7719280 7719281 ROP_16010 ROP_16020     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 7719281 7719282 ROP_16020 ROP_16030     FALSE 0.318 34.000 0.000 NA   NA
 7719283 7719284 ROP_16040 ROP_16050 tuf fusA TRUE 0.800 90.000 0.400 0.001 Y NA
 7719284 7719285 ROP_16050 ROP_16060 fusA rpsG FALSE 0.478 162.000 0.579 1.000 Y NA
 7719285 7719286 ROP_16060 ROP_16070 rpsG rpsL TRUE 0.998 0.000 0.620 0.001 Y NA
 7719286 7719287 ROP_16070 ROP_16080 rpsL   FALSE 0.006 363.000 0.000 NA   NA
 7719287 7719288 ROP_16080 ROP_16090     TRUE 0.984 -3.000 0.154 NA   NA
 7719288 7719289 ROP_16090 ROP_16100     TRUE 0.594 39.000 0.167 NA   NA
 7719289 7719290 ROP_16100 ROP_16110     FALSE 0.375 60.000 0.081 1.000 N NA
 7719290 7719291 ROP_16110 ROP_16120   fadE TRUE 0.928 18.000 0.203 1.000 Y NA
 7719291 7719292 ROP_16120 ROP_16130 fadE accA TRUE 0.999 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 7719292 7719293 ROP_16130 ROP_16140 accA accD TRUE 0.992 10.000 0.875 0.005 Y NA
 7719293 7719294 ROP_16140 ROP_16150 accD fadE TRUE 0.998 -3.000 0.548 1.000 Y NA
 7719294 7719295 ROP_16150 ROP_16160 fadE   TRUE 0.988 0.000 0.562 NA   NA
 7719295 7719296 ROP_16160 ROP_16170     TRUE 0.994 -3.000 0.438 NA   NA
 7719297 7719298 ROP_16180 ROP_16190     FALSE 0.211 56.000 0.000 1.000   NA
 7719298 7719299 ROP_16190 ROP_16200     TRUE 0.782 11.000 0.080 1.000   NA
 7719299 7719300 ROP_16200 ROP_16210   pepN FALSE 0.324 38.000 0.000 1.000   NA
 7719303 7719304 ROP_16240 ROP_16250     FALSE 0.096 82.000 0.000 NA   NA
 7719306 7719307 ROP_16270 ROP_16280     TRUE 0.586 20.000 0.042 NA   NA
 7719307 7719308 ROP_16280 ROP_16290     TRUE 0.869 -16.000 0.115 NA N NA
 7719308 7719309 ROP_16290 ROP_16300     FALSE 0.062 146.000 0.038 NA N NA
 7719309 7719310 ROP_16300 ROP_16310     TRUE 0.994 -3.000 0.444 1.000 N NA
 7719310 7719311 ROP_16310 ROP_16320     FALSE 0.086 104.000 0.000 1.000 N NA
 7719314 7719315 ROP_16350 ROP_16360     TRUE 0.613 10.000 0.000 NA N NA
 7719316 7719317 ROP_16370 ROP_16380     FALSE 0.269 41.000 0.000 NA   NA
 7719317 7719318 ROP_16380 ROP_16390   rpoC FALSE 0.025 165.000 0.000 NA   NA
 7719318 7719319 ROP_16390 ROP_16400 rpoC rpoB TRUE 0.845 118.000 0.851 0.001 Y NA
 7719321 7719322 ROP_16420 ROP_16430     FALSE 0.337 138.000 0.600 NA   NA
 7719322 7719323 ROP_16430 ROP_16440   mce1F FALSE 0.190 54.000 0.000 NA   NA
 7719323 7719324 ROP_16440 ROP_16450 mce1F mce1E TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.007 Y NA
 7719324 7719325 ROP_16450 ROP_16460 mce1E mce1D TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.007 Y NA
 7719325 7719326 ROP_16460 ROP_16470 mce1D mce1C TRUE 0.998 0.000 0.800 0.007 Y NA
 7719326 7719327 ROP_16470 ROP_16480 mce1C mce1B TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.007 Y NA
 7719327 7719328 ROP_16480 ROP_16490 mce1B mce1A TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.007 Y NA
 7719328 7719329 ROP_16490 ROP_16500 mce1A yrbE1B TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA Y NA
 7719329 7719330 ROP_16500 ROP_16510 yrbE1B yrbE1A TRUE 0.993 5.000 0.833 NA Y NA
 7719330 7719331 ROP_16510 ROP_16520 yrbE1A   TRUE 0.770 10.000 0.063 NA N NA
 7719331 7719332 ROP_16520 ROP_16530   rplL FALSE 0.013 277.000 0.006 1.000 N NA
 7719332 7719333 ROP_16530 ROP_16540 rplL rplJ TRUE 0.908 79.000 0.884 0.008 Y NA
 7719335 7719336 ROP_16560 ROP_16570 rplA rplK TRUE 0.794 131.000 0.838 0.010 Y NA
 7719336 7719337 ROP_16570 ROP_16580 rplK nusG TRUE 0.774 60.000 0.681 1.000 N NA
 7719337 7719338 ROP_16580 ROP_16590 nusG secE FALSE 0.212 59.000 0.000 1.000 N NA
 7719338 7719339 ROP_16590 ROP_t0150 secE   TRUE 0.741 5.000 0.000 NA   NA
 7719339 7719340 ROP_t0150 ROP_16600   hadB FALSE 0.019 185.000 0.000 NA   NA
 7719340 7719341 ROP_16600 ROP_16610 hadB hadA TRUE 0.957 -13.000 0.000 0.085 Y NA
 7719341 7719342 ROP_16610 ROP_16620 hadA rpmG FALSE 0.068 122.000 0.000 1.000 N NA
 7719342 7719343 ROP_16620 ROP_t0160 rpmG   FALSE 0.158 62.000 0.000 NA   NA
 7719343 7719344 ROP_t0160 ROP_t0170     FALSE 0.234 46.000 0.000 NA   NA
 7719344 7719345 ROP_t0170 ROP_t0180     FALSE 0.014 218.000 0.000 NA   NA
 7719347 7719348 ROP_16640 ROP_16650 htpX   FALSE 0.075 144.000 0.042 1.000 N NA
 7719350 7719351 ROP_16670 ROP_16680 menH   FALSE 0.192 63.000 0.000 1.000 N NA
 7719351 7719352 ROP_16680 ROP_16690   mgtA FALSE 0.227 56.000 0.000 1.000 N NA
 7719352 7719353 ROP_16690 ROP_16700 mgtA   FALSE 0.422 73.000 0.259 NA   NA
 7719353 7719354 ROP_16700 ROP_16710   menD TRUE 0.973 -3.000 0.055 NA   NA
 7719355 7719356 ROP_16720 ROP_16730     FALSE 0.400 61.000 0.143 NA   NA
 7719357 7719358 ROP_16740 ROP_16750   menC FALSE 0.279 46.000 0.011 NA   NA
 7719358 7719359 ROP_16750 ROP_16760 menC   TRUE 0.745 6.000 0.011 NA   NA
 7719362 7719363 ROP_16790 ROP_16800     TRUE 0.778 4.000 0.000 NA   NA
 7719363 7719364 ROP_16800 ROP_16810   pit FALSE 0.294 80.000 0.167 NA   NA
 7719364 7719365 ROP_16810 ROP_16820 pit   TRUE 0.715 13.000 0.067 NA   NA
 7719365 7719366 ROP_16820 ROP_16830     FALSE 0.226 47.000 0.000 NA   NA
 7719366 7719367 ROP_16830 ROP_16840     TRUE 0.990 3.000 1.000 NA   NA
 7719367 7719368 ROP_16840 ROP_16850   menE TRUE 0.954 -3.000 0.005 NA   NA
 7719368 7719369 ROP_16850 ROP_16860 menE   FALSE 0.036 151.000 0.005 NA   NA
 7719369 7719370 ROP_16860 ROP_16870     FALSE 0.127 120.000 0.080 NA   NA
 7719370 7719371 ROP_16870 ROP_16880     TRUE 0.998 -3.000 0.920 0.075 N NA
 7719372 7719373 ROP_16890 ROP_16900     TRUE 0.935 0.000 0.050 NA   NA
 7719373 7719374 ROP_16900 ROP_16910   lao TRUE 0.644 30.000 0.125 NA N NA
 7719375 7719376 ROP_16920 ROP_16930     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 N NA
 7719379 7719380 ROP_16960 ROP_16970     FALSE 0.210 61.000 0.017 NA   NA
 7719380 7719381 ROP_16970 ROP_16980     TRUE 0.700 7.000 0.000 1.000   NA
 7719381 7719382 ROP_16980 ROP_16990     FALSE 0.169 65.000 0.000 1.000   NA
 7719384 7719385 ROP_17010 ROP_17020     TRUE 0.958 -3.000 0.014 NA   NA
 7719386 7719387 ROP_17030 ROP_17040     FALSE 0.278 92.000 0.200 NA   NA
 7719388 7719389 ROP_17050 ROP_17060   resC FALSE 0.100 95.000 0.000 1.000 N NA
 7719389 7719390 ROP_17060 ROP_17070 resC resB TRUE 0.994 -3.000 0.066 NA Y NA
 7719390 7719391 ROP_17070 ROP_17080 resB ccdA TRUE 0.993 -3.000 0.049 NA Y NA
 7719391 7719392 ROP_17080 ROP_17090 ccdA resA TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 7719392 7719393 ROP_17090 ROP_17100 resA   TRUE 0.967 -3.000 0.027 NA N NA
 7719393 7719394 ROP_17100 ROP_17110   hemL TRUE 0.799 18.000 0.204 NA N NA
 7719394 7719395 ROP_17110 ROP_17120 hemL hpd FALSE 0.083 107.000 0.000 1.000 N NA
 7719398 7719399 ROP_17150 ROP_17160     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719402 7719403 ROP_17190 ROP_17200     TRUE 0.988 -3.000 0.222 NA   NA
 7719403 7719404 ROP_17200 ROP_17210     FALSE 0.011 239.000 0.000 NA   NA
 7719404 7719405 ROP_17210 ROP_17220   hemB FALSE 0.556 29.000 0.065 NA   NA
 7719405 7719406 ROP_17220 ROP_17230 hemB cysGA/hemD TRUE 0.772 73.000 0.429 1.000 Y NA
 7719406 7719407 ROP_17230 ROP_17240 cysGA/hemD hemC FALSE 0.508 76.000 0.044 1.000 Y NA
 7719407 7719408 ROP_17240 ROP_17250 hemC hemA TRUE 0.998 -3.000 0.178 0.001 Y NA
 7719408 7719409 ROP_17250 ROP_17260 hemA rex TRUE 0.988 -3.000 0.048 0.024   NA
 7719409 7719410 ROP_17260 ROP_17270 rex   FALSE 0.024 234.000 0.054 NA   NA
 7719412 7719413 ROP_17290 ROP_17300     TRUE 0.997 -3.000 0.796 1.000 N NA
 7719413 7719414 ROP_17300 ROP_17310     FALSE 0.005 468.000 0.000 1.000   NA
 7719414 7719415 ROP_17310 ROP_17320   proC FALSE 0.188 126.000 0.186 1.000   NA
 7719415 7719416 ROP_17320 ROP_17330 proC   TRUE 0.588 37.000 0.143 NA   NA
 7719416 7719417 ROP_17330 ROP_17340     TRUE 0.980 -3.000 0.095 NA   NA
 7719417 7719418 ROP_17340 ROP_17350     FALSE 0.104 83.000 0.000 NA N NA
 7719418 7719419 ROP_17350 ROP_17360     TRUE 0.849 8.000 0.127 NA   NA
 7719419 7719420 ROP_17360 ROP_17370     TRUE 0.990 -3.000 0.286 NA   NA
 7719421 7719422 ROP_17380 ROP_17390     FALSE 0.127 70.000 0.000 NA   NA
 7719423 7719424 ROP_17400 ROP_17410 regX3 senX3 TRUE 0.998 -3.000 0.437 1.000 Y NA
 7719424 7719425 ROP_17410 ROP_17420 senX3 gpmA FALSE 0.135 150.000 0.196 1.000 N NA
 7719425 7719426 ROP_17420 ROP_17430 gpmA   FALSE 0.372 44.000 0.020 1.000 N NA
 7719426 7719427 ROP_17430 ROP_17440     FALSE 0.239 65.000 0.043 NA   NA
 7719427 7719428 ROP_17440 ROP_17450   mshA TRUE 0.995 -3.000 0.541 NA   NA
 7719428 7719429 ROP_17450 ROP_17460 mshA   FALSE 0.501 31.000 0.035 1.000   NA
 7719429 7719430 ROP_17460 ROP_17470     TRUE 0.618 -54.000 0.000 NA   NA
 7719431 7719432 ROP_17480 ROP_17490     FALSE 0.434 48.000 0.091 NA   NA
 7719432 7719433 ROP_17490 ROP_17500     TRUE 0.869 5.000 0.069 NA   NA
 7719437 7719438 ROP_17540 ROP_17550     FALSE 0.029 173.000 0.000 1.000 N NA
 7719438 7719439 ROP_17550 ROP_17560     TRUE 0.632 10.000 0.000 1.000   NA
 7719440 7719441 ROP_17570 ROP_17580   murB FALSE 0.454 33.000 0.036 NA   NA
 7719442 7719443 ROP_17590 ROP_17600     TRUE 0.688 52.000 0.444 NA   NA
 7719443 7719444 ROP_17600 ROP_17610     TRUE 0.708 22.000 0.143 NA   NA
 7719444 7719445 ROP_17610 ROP_17620     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 7719449 7719450 ROP_17660 ROP_17670   purU TRUE 0.578 14.000 0.000 1.000 N NA
 7719450 7719451 ROP_17670 ROP_17680 purU   FALSE 0.317 39.000 0.000 1.000   NA
 7719452 7719453 ROP_17690 ROP_17700     TRUE 0.775 44.000 0.000 0.053 Y NA
 7719453 7719454 ROP_17700 ROP_17710     FALSE 0.095 83.000 0.000 NA   NA
 7719454 7719455 ROP_17710 ROP_17720     TRUE 0.778 4.000 0.000 NA   NA
 7719456 7719457 ROP_17730 ROP_17740     TRUE 0.819 22.000 0.000 1.000 Y NA
 7719457 7719458 ROP_17740 ROP_17750     FALSE 0.389 33.000 0.000 1.000 N NA
 7719459 7719460 ROP_17760 ROP_17770     TRUE 0.718 17.000 0.000 0.084 N NA
 7719460 7719461 ROP_17770 ROP_17780     FALSE 0.014 218.000 0.000 NA   NA
 7719462 7719463 ROP_17790 ROP_17800   fadE FALSE 0.373 57.000 0.000 0.089 N NA
 7719463 7719464 ROP_17800 ROP_17810 fadE   FALSE 0.051 133.000 0.000 1.000   NA
 7719464 7719465 ROP_17810 ROP_17820     TRUE 0.618 -54.000 0.000 NA   NA
 7719466 7719467 ROP_17830 ROP_17840     TRUE 0.628 50.000 0.000 1.000 Y NA
 7719467 7719468 ROP_17840 ROP_17850     FALSE 0.536 14.000 0.000 NA N NA
 7719468 7719469 ROP_17850 ROP_17860     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719469 7719470 ROP_17860 ROP_17870     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719470 7719471 ROP_17870 ROP_17880     FALSE 0.183 56.000 0.000 NA   NA
 7719471 7719472 ROP_17880 ROP_17890     TRUE 0.951 -3.000 0.000 NA N NA
 7719472 7719473 ROP_17890 ROP_17900     TRUE 0.883 45.000 1.000 NA N NA
 7719475 7719476 ROP_17920 ROP_17930     TRUE 0.991 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7719476 7719477 ROP_17930 ROP_17940     FALSE 0.022 193.000 0.000 1.000 N NA
 7719477 7719478 ROP_17940 ROP_17950     TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7719478 7719479 ROP_17950 ROP_17960     TRUE 0.905 0.000 0.000 1.000 N NA
 7719479 7719480 ROP_17960 ROP_17970     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 7719480 7719481 ROP_17970 ROP_17980     TRUE 0.790 5.000 0.000 1.000 N NA
 7719481 7719482 ROP_17980 ROP_17990     FALSE 0.187 64.000 0.000 1.000 N NA
 7719482 7719483 ROP_17990 ROP_18000     FALSE 0.050 192.000 0.000 0.053 N NA
 7719483 7719484 ROP_18000 ROP_18010     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719484 7719485 ROP_18010 ROP_18020     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719485 7719486 ROP_18020 ROP_18030     TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7719488 7719489 ROP_18050 ROP_18060   mce2F TRUE 0.764 71.000 1.000 NA   NA
 7719489 7719490 ROP_18060 ROP_18070 mce2F mce2E TRUE 0.998 -3.000 0.429 NA Y NA
 7719490 7719491 ROP_18070 ROP_18080 mce2E mce2D TRUE 0.995 2.000 0.714 NA Y NA
 7719491 7719492 ROP_18080 ROP_18090 mce2D mce2C TRUE 0.995 2.000 0.667 NA Y NA
 7719492 7719493 ROP_18090 ROP_18100 mce2C mce2B TRUE 0.941 33.000 0.600 NA Y NA
 7719493 7719494 ROP_18100 ROP_18110 mce2B mce2A TRUE 0.995 -3.000 0.600 NA   NA
 7719494 7719495 ROP_18110 ROP_18120 mce2A yrbE2B TRUE 0.976 5.000 0.667 NA   NA
 7719495 7719496 ROP_18120 ROP_18130 yrbE2B yrbE2A TRUE 0.989 2.000 0.286 NA Y NA
 7719496 7719497 ROP_18130 ROP_18140 yrbE2A   TRUE 0.951 -3.000 0.000 NA N NA
 7719497 7719498 ROP_18140 ROP_18150     FALSE 0.006 435.000 0.000 1.000 N NA
 7719498 7719499 ROP_18150 ROP_18160     FALSE 0.017 226.000 0.000 1.000 N NA
 7719499 7719500 ROP_18160 ROP_18170     FALSE 0.294 40.000 0.000 NA N NA
 7719500 7719501 ROP_18170 ROP_18180     FALSE 0.513 16.000 0.000 NA N NA
 7719501 7719502 ROP_18180 ROP_18190     FALSE 0.016 232.000 0.000 1.000 N NA
 7719502 7719503 ROP_18190 ROP_18200     FALSE 0.025 177.000 0.000 1.000   NA
 7719503 7719504 ROP_18200 ROP_18210     TRUE 0.830 18.000 0.250 1.000   NA
 7719504 7719505 ROP_18210 ROP_18220     FALSE 0.067 135.000 0.032 NA   NA
 7719505 7719506 ROP_18220 ROP_18230     FALSE 0.428 73.000 0.270 NA   NA
 7719506 7719507 ROP_18230 ROP_18240     TRUE 0.954 -7.000 0.282 NA   NA
 7719507 7719508 ROP_18240 ROP_18250     FALSE 0.104 124.000 0.047 1.000   NA
 7719509 7719510 ROP_18260 ROP_18270     FALSE 0.209 50.000 0.000 NA   NA
 7719514 7719515 ROP_18310 ROP_18320     FALSE 0.476 17.000 0.000 NA   NA
 7719515 7719516 ROP_18320 ROP_18330     FALSE 0.037 142.000 0.000 NA   NA
 7719517 7719518 ROP_18340 ROP_18350     FALSE 0.012 233.000 0.000 NA   NA
 7719519 7719520 ROP_18360 ROP_18370   sigF TRUE 0.996 -3.000 0.667 1.000   NA
 7719521 7719522 ROP_18380 ROP_18390   metE FALSE 0.256 84.000 0.004 0.018   NA
 7719522 7719523 ROP_18390 ROP_18400 metE   FALSE 0.363 40.000 0.006 1.000 N NA
 7719523 7719524 ROP_18400 ROP_18410   aceA FALSE 0.113 116.000 0.036 1.000 N NA
 7719525 7719526 ROP_18420 ROP_18430     TRUE 0.764 22.000 0.214 NA   NA
 7719526 7719527 ROP_18430 ROP_18440     FALSE 0.247 75.000 0.071 1.000   NA
 7719527 7719528 ROP_18440 ROP_18450     FALSE 0.010 294.000 0.000 1.000   NA
 7719528 7719529 ROP_18450 ROP_18460     TRUE 0.891 45.000 0.429 1.000 Y NA
 7719529 7719530 ROP_18460 ROP_18470     TRUE 0.999 -3.000 0.888 0.043 Y NA
 7719530 7719531 ROP_18470 ROP_18480     TRUE 0.996 -3.000 0.639 1.000   NA
 7719531 7719532 ROP_18480 ROP_18490     TRUE 0.953 -13.000 0.217 0.019   NA
 7719532 7719533 ROP_18490 ROP_18500     TRUE 0.966 0.000 0.136 1.000 N NA
 7719533 7719534 ROP_18500 ROP_18510     FALSE 0.018 187.000 0.000 NA   NA
 7719534 7719535 ROP_18510 ROP_18520     FALSE 0.318 34.000 0.000 NA   NA
 7719535 7719536 ROP_18520 ROP_18530     FALSE 0.476 71.000 0.000 1.000 Y NA
 7719536 7719537 ROP_18530 ROP_18540     TRUE 0.961 0.000 0.107 1.000 N NA
 7719540 7719541 ROP_18570 ROP_18580   lpd FALSE 0.060 113.000 0.000 NA   NA
 7719543 7719544 ROP_18600 ROP_18610     FALSE 0.113 74.000 0.000 NA   NA
 7719546 7719547 ROP_18630 ROP_18640 groEL   FALSE 0.012 230.000 0.000 NA   NA
 7719547 7719548 ROP_18640 ROP_18650     FALSE 0.037 168.000 0.027 NA   NA
 7719548 7719549 ROP_18650 ROP_18660     FALSE 0.492 21.000 0.000 1.000 N NA
 7719549 7719550 ROP_18660 ROP_18670     TRUE 0.569 13.000 0.000 1.000   NA
 7719551 7719552 ROP_18680 ROP_18690     FALSE 0.100 86.000 0.000 NA N NA
 7719553 7719554 ROP_18700 ROP_18710   hutH FALSE 0.226 47.000 0.000 NA   NA
 7719555 7719556 ROP_18720 ROP_18730     FALSE 0.250 44.000 0.000 NA   NA
 7719556 7719557 ROP_18730 ROP_18740     TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7719557 7719558 ROP_18740 ROP_18750   psd FALSE 0.187 64.000 0.000 1.000 N NA
 7719558 7719559 ROP_18750 ROP_18760 psd pssA TRUE 0.998 -3.000 0.466 1.000 Y NA
 7719559 7719560 ROP_18760 ROP_18770 pssA   FALSE 0.521 28.000 0.025 1.000 N NA
 7719564 7719565 ROP_18810 ROP_18820 mrpA/mrpB mrpC TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.003 Y NA
 7719565 7719566 ROP_18820 ROP_18830 mrpC mrpD TRUE 0.999 -3.000 0.870 0.003 Y NA
 7719566 7719567 ROP_18830 ROP_18840 mrpD mrpE TRUE 0.999 -3.000 0.913 1.000 Y NA
 7719567 7719568 ROP_18840 ROP_18850 mrpE mrpF TRUE 0.998 -3.000 0.287 0.050 Y NA
 7719568 7719569 ROP_18850 ROP_18860 mrpF mrpG TRUE 0.991 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7719570 7719571 ROP_18870 ROP_18880     FALSE 0.317 62.000 0.064 1.000   NA
 7719571 7719572 ROP_18880 ROP_18890   sodC FALSE 0.201 76.000 0.043 1.000   NA
 7719572 7719573 ROP_18890 ROP_18900 sodC   FALSE 0.075 98.000 0.000 NA   NA
 7719573 7719574 ROP_18900 ROP_18910     FALSE 0.528 25.000 0.039 NA   NA
 7719575 7719576 ROP_18920 ROP_18930 def   TRUE 0.964 -10.000 0.488 1.000   NA
 7719576 7719577 ROP_18930 ROP_18940   xthA TRUE 0.569 35.000 0.088 1.000   NA
 7719578 7719579 ROP_18950 ROP_18960     FALSE 0.081 93.000 0.000 NA   NA
 7719580 7719581 ROP_18970 ROP_18980 thiC thiD TRUE 0.944 11.000 0.015 0.005 Y NA
 7719582 7719583 ROP_18990 ROP_19000 cya   FALSE 0.167 125.000 0.143 1.000   NA
 7719583 7719584 ROP_19000 ROP_19010     FALSE 0.108 146.000 0.143 NA   NA
 7719584 7719585 ROP_19010 ROP_19020     TRUE 0.975 0.000 0.250 NA   NA
 7719585 7719586 ROP_19020 ROP_19030   thiG FALSE 0.088 114.000 0.008 1.000 N NA
 7719586 7719587 ROP_19030 ROP_19040 thiG thiS TRUE 0.975 -7.000 0.104 1.000 Y NA
 7719587 7719588 ROP_19040 ROP_19050 thiS thiO TRUE 0.984 3.000 0.625 1.000 N NA
 7719591 7719592 ROP_19080 ROP_19090     TRUE 0.997 -3.000 0.895 NA   NA
 7719592 7719593 ROP_19090 ROP_19100   pknG TRUE 0.984 8.000 0.622 1.000 Y NA
 7719594 7719595 ROP_19110 ROP_19120 ackA pta TRUE 0.987 -3.000 0.185 1.000   NA
 7719595 7719596 ROP_19120 ROP_19130 pta   FALSE 0.166 60.000 0.000 NA   NA
 7719596 7719597 ROP_19130 ROP_19140     TRUE 0.711 -12.000 0.000 NA   NA
 7719601 7719602 ROP_19180 ROP_19190 fdg   FALSE 0.361 56.000 0.080 NA   NA
 7719604 7719605 ROP_19210 ROP_19220     TRUE 0.868 2.000 0.000 1.000 N NA
 7719605 7719606 ROP_19220 ROP_19230     TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7719606 7719607 ROP_19230 ROP_19240     TRUE 0.894 22.000 0.000 0.004 Y NA
 7719607 7719608 ROP_19240 ROP_19250     TRUE 0.915 17.000 0.000 0.005 Y NA
 7719608 7719609 ROP_19250 ROP_19260     TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7719609 7719610 ROP_19260 ROP_19270     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719610 7719611 ROP_19270 ROP_19280     TRUE 0.990 -3.000 0.000 NA Y NA
 7719611 7719612 ROP_19280 ROP_19290     TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7719612 7719613 ROP_19290 ROP_19300     FALSE 0.242 45.000 0.000 NA   NA
 7719613 7719614 ROP_19300 ROP_19310     TRUE 0.990 -3.000 0.000 NA Y NA
 7719614 7719615 ROP_19310 ROP_19320     TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 7719615 7719616 ROP_19320 ROP_19330     TRUE 0.989 -3.000 0.235 NA   NA
 7719616 7719617 ROP_19330 ROP_19340     TRUE 0.980 5.000 0.273 NA Y NA
 7719617 7719618 ROP_19340 ROP_19350     TRUE 0.988 -7.000 1.000 NA   NA
 7719618 7719619 ROP_19350 ROP_19360     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000   NA
 7719619 7719620 ROP_19360 ROP_19370     TRUE 0.989 -7.000 0.250 0.042 Y NA
 7719620 7719621 ROP_19370 ROP_19380     TRUE 0.989 4.000 0.250 0.042 Y NA
 7719621 7719622 ROP_19380 ROP_19390     FALSE 0.006 372.000 0.000 NA N NA
 7719622 7719623 ROP_19390 ROP_19400     TRUE 0.973 16.000 0.667 NA Y NA
 7719623 7719624 ROP_19400 ROP_19410     TRUE 0.990 -3.000 0.000 NA Y NA
 7719624 7719625 ROP_19410 ROP_19420     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719625 7719626 ROP_19420 ROP_19430     TRUE 0.583 12.000 0.000 1.000   NA
 7719626 7719627 ROP_19430 ROP_19440     TRUE 0.746 52.000 0.125 1.000 Y NA
 7719627 7719628 ROP_19440 ROP_19450     FALSE 0.394 24.000 0.000 NA   NA
 7719628 7719629 ROP_19450 ROP_19460     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719630 7719631 ROP_19470 ROP_19480   nagD FALSE 0.429 38.000 0.031 1.000   NA
 7719632 7719633 ROP_19490 ROP_19500     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719635 7719636 ROP_19520 ROP_19530 metZ   TRUE 0.981 -3.000 0.092 NA N NA
 7719636 7719637 ROP_19530 ROP_19540     FALSE 0.433 46.000 0.079 NA   NA
 7719638 7719639 ROP_19550 ROP_19560     FALSE 0.139 126.000 0.097 1.000   NA
 7719640 7719641 ROP_19570 ROP_19580     FALSE 0.076 97.000 0.000 NA   NA
 7719641 7719642 ROP_19580 ROP_19590   purT TRUE 0.957 -3.000 0.013 NA   NA
 7719642 7719643 ROP_19590 ROP_19600 purT   FALSE 0.492 21.000 0.000 1.000 N NA
 7719643 7719644 ROP_19600 ROP_19610   cobF FALSE 0.341 56.000 0.047 1.000 N NA
 7719645 7719646 ROP_19620 ROP_19630 thyA folA TRUE 0.980 0.000 0.295 1.000 N NA
 7719646 7719647 ROP_19630 ROP_19640 folA   FALSE 0.077 107.000 0.007 NA   NA
 7719647 7719648 ROP_19640 ROP_19650     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719648 7719649 ROP_19650 ROP_19660     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719652 7719653 ROP_19690 ROP_19700     TRUE 0.931 44.000 0.667 1.000 Y NA
 7719653 7719654 ROP_19700 ROP_19710     FALSE 0.220 51.000 0.000 NA N NA
 7719654 7719655 ROP_19710 ROP_19720     TRUE 0.576 74.000 0.500 NA N NA
 7719656 7719657 ROP_19730 ROP_19740   hmp TRUE 0.975 2.000 0.367 NA N NA
 7719660 7719661 ROP_19770 ROP_19780   cycA FALSE 0.017 213.000 0.000 1.000   NA
 7719667 7719668 ROP_19830 ROP_19840   rnhA FALSE 0.198 59.000 0.000 1.000   NA
 7719669 7719670 ROP_19850 ROP_19860     FALSE 0.061 128.000 0.000 1.000 N NA
 7719670 7719671 ROP_19860 ROP_19870     TRUE 0.978 -3.000 0.079 NA   NA
 7719671 7719672 ROP_19870 ROP_19880     TRUE 0.914 3.000 0.080 NA   NA
 7719672 7719673 ROP_19880 ROP_19890     TRUE 0.998 -3.000 0.489 1.000 Y NA
 7719673 7719674 ROP_19890 ROP_19900     FALSE 0.250 51.000 0.000 1.000 N NA
 7719674 7719675 ROP_19900 ROP_19910     FALSE 0.023 171.000 0.000 NA   NA
 7719675 7719676 ROP_19910 ROP_19920     FALSE 0.021 177.000 0.000 NA   NA
 7719676 7719677 ROP_19920 ROP_19930     FALSE 0.058 115.000 0.000 NA   NA
 7719677 7719678 ROP_19930 ROP_19940     TRUE 0.974 -3.000 0.061 NA   NA
 7719679 7719680 ROP_19950 ROP_19960     TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7719681 7719682 ROP_19970 ROP_19980     TRUE 0.566 51.000 0.222 1.000   NA
 7719682 7719683 ROP_19980 ROP_19990   echA TRUE 0.992 -3.000 0.333 1.000   NA
 7719683 7719684 ROP_19990 ROP_20000 echA   FALSE 0.270 48.000 0.000 1.000 N NA
 7719684 7719685 ROP_20000 ROP_20010     TRUE 0.994 5.000 0.667 0.098 Y NA
 7719685 7719686 ROP_20010 ROP_20020     FALSE 0.046 144.000 0.000 1.000 N NA
 7719687 7719688 ROP_20030 ROP_20040     TRUE 0.779 -7.000 0.000 NA   NA
 7719688 7719689 ROP_20040 ROP_20050     FALSE 0.090 87.000 0.000 NA   NA
 7719689 7719690 ROP_20050 ROP_20060     TRUE 0.942 18.000 0.286 1.000 Y NA
 7719690 7719691 ROP_20060 ROP_20070     TRUE 0.963 35.000 1.000 NA Y NA
 7719691 7719692 ROP_20070 ROP_20080     TRUE 0.705 85.000 1.000 NA N NA
 7719693 7719694 ROP_20090 ROP_20100 fadE tam FALSE 0.317 39.000 0.000 1.000   NA
 7719695 7719696 ROP_20110 ROP_20120     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 7719696 7719697 ROP_20120 ROP_20130     TRUE 0.995 2.000 0.667 1.000 Y NA
 7719697 7719698 ROP_20130 ROP_20140   kgtP FALSE 0.555 16.000 0.000 1.000 N NA
 7719698 7719699 ROP_20140 ROP_20150 kgtP   FALSE 0.050 139.000 0.000 1.000 N NA
 7719699 7719700 ROP_20150 ROP_20160   gcdH TRUE 0.993 -3.000 0.333 1.000 N NA
 7719702 7719703 ROP_20180 ROP_20190     FALSE 0.234 46.000 0.000 NA   NA
 7719703 7719704 ROP_20190 ROP_20200     FALSE 0.032 149.000 0.000 NA   NA
 7719704 7719705 ROP_20200 ROP_20210     FALSE 0.305 44.000 0.000 1.000 N NA
 7719705 7719706 ROP_20210 ROP_20220     TRUE 0.970 -3.000 0.043 NA   NA
 7719706 7719707 ROP_20220 ROP_20230     TRUE 0.966 -3.000 0.031 NA   NA
 7719707 7719708 ROP_20230 ROP_20240     FALSE 0.124 98.000 0.019 1.000 N NA
 7719708 7719709 ROP_20240 ROP_20250     FALSE 0.167 63.000 0.000 NA N NA
 7719709 7719710 ROP_20250 ROP_20260     TRUE 0.613 10.000 0.000 NA N NA
 7719710 7719711 ROP_20260 ROP_20270     TRUE 0.979 -3.000 0.065 1.000 N NA
 7719711 7719712 ROP_20270 ROP_20280     TRUE 0.993 -7.000 0.500 0.083 Y NA
 7719712 7719713 ROP_20280 ROP_20290     FALSE 0.471 103.000 0.154 NA Y NA
 7719715 7719716 ROP_20310 ROP_20320 speE   TRUE 0.866 5.000 0.065 NA   NA
 7719716 7719717 ROP_20320 ROP_20330     TRUE 0.833 29.000 0.444 NA   NA
 7719717 7719718 ROP_20330 ROP_20340     TRUE 0.989 -3.000 0.242 NA   NA
 7719718 7719719 ROP_20340 ROP_20350     TRUE 0.994 -3.000 0.455 NA   NA
 7719720 7719721 ROP_20360 ROP_20370     FALSE 0.197 174.000 0.000 0.014 Y NA
 7719721 7719722 ROP_20370 ROP_20380     TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7719724 7719725 ROP_20400 ROP_20410     FALSE 0.108 76.000 0.000 NA   NA
 7719727 7719728 ROP_20430 ROP_20440     FALSE 0.183 84.000 0.048 1.000   NA
 7719729 7719730 ROP_20450 ROP_20460 alkA   TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 7719730 7719731 ROP_20460 ROP_20470     TRUE 0.985 -3.000 0.160 NA   NA
 7719731 7719732 ROP_20470 ROP_20480     TRUE 0.997 -3.000 0.680 1.000 N NA
 7719732 7719733 ROP_20480 ROP_20490   ogt TRUE 0.972 -3.000 0.031 1.000 N NA
 7719735 7719736 ROP_20510 ROP_20520     TRUE 0.987 -3.000 0.200 NA   NA
 7719736 7719737 ROP_20520 ROP_20530     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 7719737 7719738 ROP_20530 ROP_20540     FALSE 0.316 100.000 0.250 1.000 N NA
 7719740 7719741 ROP_20560 ROP_20570   fabG TRUE 0.821 4.000 0.000 1.000 N NA
 7719741 7719742 ROP_20570 ROP_20580 fabG   FALSE 0.498 68.000 0.000 1.000 Y NA
 7719742 7719743 ROP_20580 ROP_20590     FALSE 0.067 123.000 0.000 1.000 N NA
 7719743 7719744 ROP_20590 ROP_20600     TRUE 0.835 45.000 0.667 1.000 N NA
 7719744 7719745 ROP_20600 ROP_20610   fadE TRUE 0.935 42.000 0.667 1.000 Y NA
 7719746 7719747 ROP_20620 ROP_20630     FALSE 0.069 103.000 0.000 NA   NA
 7719747 7719748 ROP_20630 ROP_20640     FALSE 0.085 90.000 0.000 NA   NA
 7719748 7719749 ROP_20640 ROP_20650     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719749 7719750 ROP_20650 ROP_20660     TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 7719750 7719751 ROP_20660 ROP_20670     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719751 7719752 ROP_20670 ROP_20680     FALSE 0.476 17.000 0.000 NA   NA
 7719752 7719753 ROP_20680 ROP_20690     TRUE 0.898 0.000 0.007 NA   NA
 7719753 7719754 ROP_20690 ROP_t0200     FALSE 0.158 62.000 0.000 NA   NA
 7719754 7719755 ROP_t0200 ROP_20700     FALSE 0.069 103.000 0.000 NA   NA
 7719755 7719756 ROP_20700 ROP_20710     FALSE 0.157 71.000 0.000 1.000 N NA
 7719756 7719757 ROP_20710 ROP_20720     FALSE 0.203 51.000 0.000 NA   NA
 7719760 7719761 ROP_20750 ROP_20760   gntK FALSE 0.051 138.000 0.000 1.000 N NA
 7719761 7719762 ROP_20760 ROP_20770 gntK   TRUE 0.842 40.000 0.185 1.000 Y NA
 7719764 7719765 ROP_20790 ROP_20800     FALSE 0.016 219.000 0.000 1.000   NA
 7719765 7719766 ROP_20800 ROP_20810   eda TRUE 0.781 29.000 0.000 1.000 Y NA
 7719766 7719767 ROP_20810 ROP_20820 eda edd TRUE 0.974 12.000 0.523 1.000 Y NA
 7719767 7719768 ROP_20820 ROP_20830 edd zwf TRUE 0.993 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 7719770 7719771 ROP_20850 ROP_20860 catC catB TRUE 0.834 17.000 0.231 1.000 N NA
 7719771 7719772 ROP_20860 ROP_20870 catB catA TRUE 0.804 30.000 0.333 1.000 N NA
 7719775 7719776 ROP_20900 ROP_20910     FALSE 0.214 52.000 0.000 NA N NA
 7719778 7719779 ROP_20930 ROP_20940     TRUE 0.884 19.000 0.267 0.087   NA
 7719781 7719782 ROP_20960 ROP_20970     TRUE 0.993 3.000 1.000 0.087 N NA
 7719782 7719783 ROP_20970 ROP_20980   benA FALSE 0.053 180.000 0.000 0.087 N NA
 7719783 7719784 ROP_20980 ROP_20990 benA benB TRUE 0.977 15.000 0.953 0.000 N NA
 7719784 7719785 ROP_20990 ROP_21000 benB benC TRUE 0.913 36.000 0.672 0.087 N NA
 7719785 7719786 ROP_21000 ROP_21010 benC benD TRUE 0.979 -3.000 0.064 1.000 N NA
 7719786 7719787 ROP_21010 ROP_21020 benD benK FALSE 0.446 26.000 0.000 1.000 N NA
 7719788 7719789 ROP_21030 ROP_21040     TRUE 0.999 -3.000 0.832 0.001 Y NA
 7719790 7719791 ROP_21050 ROP_21060     FALSE 0.079 104.000 0.000 1.000   NA
 7719791 7719792 ROP_21060 ROP_21070     FALSE 0.062 110.000 0.000 NA   NA
 7719792 7719793 ROP_21070 ROP_21080   gpsA FALSE 0.069 103.000 0.000 NA   NA
 7719793 7719794 ROP_21080 ROP_21090 gpsA   FALSE 0.053 136.000 0.000 1.000 N NA
 7719795 7719796 ROP_21100 ROP_21110     FALSE 0.358 29.000 0.000 NA   NA
 7719796 7719797 ROP_21110 ROP_21120     FALSE 0.052 132.000 0.000 1.000   NA
 7719798 7719799 ROP_21130 ROP_21140     FALSE 0.224 53.000 0.000 1.000   NA
 7719799 7719800 ROP_21140 ROP_21150     TRUE 0.988 -3.000 0.190 1.000   NA
 7719803 7719804 ROP_21180 ROP_21190     TRUE 0.653 -22.000 0.000 NA   NA
 7719804 7719805 ROP_21190 ROP_21200     TRUE 0.741 5.000 0.000 NA   NA
 7719805 7719806 ROP_21200 ROP_21210     TRUE 0.958 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7719806 7719807 ROP_21210 ROP_21220     TRUE 0.900 17.000 0.000 0.083 Y NA
 7719807 7719808 ROP_21220 ROP_21230     FALSE 0.369 35.000 0.000 1.000 N NA
 7719808 7719809 ROP_21230 ROP_21240     TRUE 0.857 75.000 0.778 1.000 Y NA
 7719809 7719810 ROP_21240 ROP_21250     TRUE 0.999 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 7719810 7719811 ROP_21250 ROP_21260     TRUE 0.763 115.000 0.889 NA Y NA
 7719811 7719812 ROP_21260 ROP_21270   fadE TRUE 0.951 -3.000 0.000 NA N NA
 7719812 7719813 ROP_21270 ROP_21280 fadE   TRUE 0.942 13.000 0.200 1.000 Y NA
 7719813 7719814 ROP_21280 ROP_21290     FALSE 0.014 246.000 0.000 1.000 N NA
 7719814 7719815 ROP_21290 ROP_21300     FALSE 0.070 120.000 0.000 1.000 N NA
 7719815 7719816 ROP_21300 ROP_21310     TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.083   NA
 7719816 7719817 ROP_21310 ROP_21320     TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7719817 7719818 ROP_21320 ROP_21330     FALSE 0.020 197.000 0.000 1.000   NA
 7719819 7719820 ROP_21340 ROP_21350     TRUE 0.990 -3.000 0.267 NA   NA
 7719821 7719822 ROP_21360 ROP_21370     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719822 7719823 ROP_21370 ROP_21380     TRUE 0.851 1.000 0.000 NA   NA
 7719823 7719824 ROP_21380 ROP_21390     TRUE 0.902 6.000 0.182 NA   NA
 7719826 7719827 ROP_21410 ROP_21420     TRUE 0.624 54.000 0.345 NA   NA
 7719827 7719828 ROP_21420 ROP_21430   ssuD FALSE 0.506 20.000 0.000 1.000 N NA
 7719829 7719830 ROP_21440 ROP_21450     FALSE 0.109 163.000 0.182 1.000 N NA
 7719830 7719831 ROP_21450 ROP_21460     TRUE 0.973 -3.000 0.040 1.000   NA
 7719833 7719834 ROP_21480 ROP_21490     TRUE 0.996 -3.000 0.059 0.019 Y NA
 7719834 7719835 ROP_21490 ROP_21500     TRUE 0.708 79.000 0.167 0.019 Y NA
 7719836 7719837 ROP_21510 ROP_21520     FALSE 0.038 140.000 0.000 NA   NA
 7719837 7719838 ROP_21520 ROP_21530     FALSE 0.139 67.000 0.000 NA   NA
 7719838 7719839 ROP_21530 ROP_21540     FALSE 0.425 21.000 0.000 NA   NA
 7719840 7719841 ROP_21550 ROP_21560     TRUE 0.696 6.000 0.000 NA   NA
 7719846 7719847 ROP_21610 ROP_21620     FALSE 0.403 62.000 0.154 NA   NA
 7719848 7719849 ROP_21630 ROP_21640     FALSE 0.025 165.000 0.000 NA   NA
 7719849 7719850 ROP_21640 ROP_21650     FALSE 0.263 42.000 0.000 NA   NA
 7719850 7719851 ROP_21650 ROP_21660     FALSE 0.056 118.000 0.000 NA   NA
 7719852 7719853 ROP_21670 ROP_21680     TRUE 0.954 8.000 0.000 0.005 Y NA
 7719853 7719854 ROP_21680 ROP_21690     TRUE 0.973 10.000 0.200 0.005 Y NA
 7719854 7719855 ROP_21690 ROP_21700     FALSE 0.203 63.000 0.019 NA   NA
 7719855 7719856 ROP_21700 ROP_21710     TRUE 0.991 -3.000 0.296 NA   NA
 7719856 7719857 ROP_21710 ROP_21720     TRUE 0.992 -3.000 0.358 NA   NA
 7719857 7719858 ROP_21720 ROP_21730     TRUE 0.992 -3.000 0.325 1.000   NA
 7719858 7719859 ROP_21730 ROP_21740     TRUE 0.688 13.000 0.052 NA   NA
 7719860 7719861 ROP_21750 ROP_21760     FALSE 0.397 92.000 0.333 1.000   NA
 7719861 7719862 ROP_21760 ROP_21770     FALSE 0.098 81.000 0.000 NA   NA
 7719862 7719863 ROP_21770 ROP_21780     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 7719863 7719864 ROP_21780 ROP_21790     TRUE 0.997 -3.000 0.800 NA   NA
 7719864 7719865 ROP_21790 ROP_21800     FALSE 0.061 111.000 0.000 NA   NA
 7719866 7719867 ROP_21810 ROP_21820     FALSE 0.190 54.000 0.000 NA   NA
 7719868 7719869 ROP_21830 ROP_21840     FALSE 0.049 126.000 0.000 NA   NA
 7719870 7719871 ROP_21850 ROP_21860     TRUE 0.685 47.000 0.348 NA N NA
 7719871 7719872 ROP_21860 ROP_21870     TRUE 0.985 -3.000 0.130 1.000 N NA
 7719873 7719874 ROP_21880 ROP_21890     TRUE 0.717 24.000 0.163 NA N NA
 7719874 7719875 ROP_21890 ROP_21900     TRUE 0.991 -3.000 0.259 1.000 N NA
 7719875 7719876 ROP_21900 ROP_21910     TRUE 0.904 32.000 0.286 1.000 Y NA
 7719878 7719879 ROP_21930 ROP_21940     FALSE 0.008 301.000 0.000 NA   NA
 7719879 7719880 ROP_21940 ROP_21950     TRUE 0.871 5.000 0.057 1.000   NA
 7719882 7719883 ROP_21970 ROP_21980     TRUE 0.589 10.000 0.000 NA   NA
 7719884 7719885 ROP_21990 ROP_22000 aroE shiA FALSE 0.446 26.000 0.000 1.000 N NA
 7719886 7719887 ROP_22010 ROP_22020 gabP   FALSE 0.085 100.000 0.000 1.000   NA
 7719888 7719889 ROP_22030 ROP_22040 plc   FALSE 0.221 57.000 0.000 1.000 N NA
 7719889 7719890 ROP_22040 ROP_22050     FALSE 0.061 253.000 0.000 1.000 Y NA
 7719890 7719891 ROP_22050 ROP_22060     TRUE 0.879 0.000 0.000 NA   NA
 7719891 7719892 ROP_22060 ROP_22070     FALSE 0.226 47.000 0.000 NA   NA
 7719892 7719893 ROP_22070 ROP_22080     TRUE 0.996 3.000 0.750 0.082 Y NA
 7719893 7719894 ROP_22080 ROP_22090     FALSE 0.524 13.000 0.000 NA   NA
 7719894 7719895 ROP_22090 ROP_22100     TRUE 0.851 1.000 0.000 NA   NA
 7719895 7719896 ROP_22100 ROP_22110     FALSE 0.132 119.000 0.000 0.087   NA
 7719898 7719899 ROP_22130 ROP_22140     FALSE 0.531 18.000 0.000 1.000 N NA
 7719899 7719900 ROP_22140 ROP_22150     FALSE 0.027 171.000 0.000 1.000   NA
 7719900 7719901 ROP_22150 ROP_22160     FALSE 0.324 38.000 0.000 1.000   NA
 7719901 7719902 ROP_22160 ROP_22170   kshA FALSE 0.381 29.000 0.000 NA N NA
 7719904 7719905 ROP_22190 ROP_22200     FALSE 0.056 118.000 0.000 NA   NA
 7719906 7719907 ROP_22210 ROP_22220     TRUE 0.711 37.000 0.000 NA Y NA
 7719908 7719909 ROP_22230 ROP_22240     TRUE 0.913 42.000 0.500 1.000 Y NA
 7719909 7719910 ROP_22240 ROP_22250     FALSE 0.315 117.000 0.333 1.000 N NA
 7719910 7719911 ROP_22250 ROP_22260     FALSE 0.035 144.000 0.000 NA   NA
 7719911 7719912 ROP_22260 ROP_22270     FALSE 0.451 19.000 0.000 NA   NA
 7719912 7719913 ROP_22270 ROP_22280     FALSE 0.003 825.000 0.000 NA   NA
 7719913 7719914 ROP_22280 ROP_22290     TRUE 0.997 -3.000 0.700 1.000   NA
 7719915 7719916 ROP_22300 ROP_22310     FALSE 0.257 43.000 0.000 NA   NA
 7719920 7719921 ROP_22350 ROP_22360     TRUE 0.857 2.000 0.000 1.000   NA
 7719921 7719922 ROP_22360 ROP_22370     TRUE 0.894 15.000 0.400 1.000   NA
 7719923 7719924 ROP_22380 ROP_22390     FALSE 0.058 116.000 0.000 NA   NA
 7719925 7719926 ROP_22400 ROP_22410     TRUE 0.658 21.000 0.000 0.087   NA
 7719926 7719927 ROP_22410 ROP_22420   catA TRUE 0.825 21.000 0.000 1.000 Y NA
 7719927 7719928 ROP_22420 ROP_22430 catA   FALSE 0.110 75.000 0.000 NA   NA
 7719929 7719930 ROP_22440 ROP_22450     TRUE 0.958 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 7719930 7719931 ROP_22450 ROP_22460     TRUE 0.990 -3.000 0.000 NA Y NA
 7719931 7719932 ROP_22460 ROP_22470     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719932 7719933 ROP_22470 ROP_22480   fadE TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7719933 7719934 ROP_22480 ROP_22490 fadE   FALSE 0.054 135.000 0.000 1.000 N NA
 7719935 7719936 ROP_22500 ROP_22510     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719936 7719937 ROP_22510 ROP_22520     TRUE 0.946 -3.000 0.000 NA   NA
 7719937 7719938 ROP_22520 ROP_22530     FALSE 0.061 111.000 0.000 NA   NA
 7719938 7719939 ROP_22530 ROP_22540     FALSE 0.194 53.000 0.000 NA   NA
 7719941 7719942 ROP_22560 ROP_22570   alkB FALSE 0.010 263.000 0.000 NA   NA
 7719942 7719943 ROP_22570 ROP_22580 alkB rubA TRUE 0.995 0.000 0.667 0.001   NA
 7719943 7719944 ROP_22580 ROP_22590 rubA rubA TRUE 0.983 2.000 0.000 0.007 Y NA
 7719944 7719945 ROP_22590 ROP_22600 rubA rubB TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.087   NA
 7719945 7719946 ROP_22600 ROP_22610 rubB   TRUE 0.604 11.000 0.000 1.000   NA
 7719947 7719948 ROP_22620 ROP_22630   pobA FALSE 0.012 251.000 0.000 1.000   NA
 7719948 7719949 ROP_22630 ROP_22640 pobA   FALSE 0.238 92.000 0.111 1.000 N NA
 7719949 7719950 ROP_22640 ROP_22650     FALSE 0.544 17.000 0.000 1.000 N NA
 7719951 7719952 ROP_22660 ROP_22670 pcaK   FALSE 0.081 93.000 0.000 NA   NA
 7719952 7719953 ROP_22670 ROP_22680     FALSE 0.358 29.000 0.000 NA   NA
 7719955 7719956 ROP_22700 ROP_22710     FALSE 0.510 14.000 0.000 NA   NA
 7719956 7719957 ROP_22710 ROP_22720     TRUE 0.977 -3.000 0.074 NA   NA
 7719957 7719958 ROP_22720 ROP_22730     FALSE 0.494 77.000 0.412 NA   NA
 7719959 7719960 ROP_22740 ROP_22750     FALSE 0.286 44.000 0.000 1.000   NA
 7719960 7719961 ROP_22750 ROP_22760     TRUE 0.905 0.000 0.000 1.000 N NA
 7719962 7719963 ROP_22770 ROP_22780     FALSE 0.108 76.000 0.000 NA   NA
 7719967 7719968 ROP_22820 ROP_22830     FALSE 0.030 164.000 0.000 1.000   NA
 7719968 7719969 ROP_22830 ROP_22840     TRUE 0.834 -7.000 0.007 1.000   NA
 7719969 7719970 ROP_22840 ROP_22850     TRUE 0.996 -3.000 0.722 NA   NA
 7719970 7719971 ROP_22850 ROP_22860   cfa TRUE 0.976 -3.000 0.067 NA   NA
 7719971 7719972 ROP_22860 ROP_22870 cfa cfa TRUE 0.998 -3.000 0.161 0.001 Y NA
 7719972 7719973 ROP_22870 ROP_22880 cfa   TRUE 0.978 -3.000 0.065 1.000   NA
 7719973 7719974 ROP_22880 ROP_2289