MicrobesOnline Operon Predictions for Acinetobacter sp. ADP1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 587519 587520 ACIAD0001 ACIAD0002 dnaA dnaN FALSE 0.376 236.000 0.328 1.000 Y NA
 587520 587521 ACIAD0002 ACIAD0003 dnaN recF TRUE 0.993 16.000 0.318 1.000 Y NA
 587521 587522 ACIAD0003 ACIAD0004 recF gyrB TRUE 0.973 53.000 0.249 0.005 Y NA
 587526 587527 ACIAD0008 ACIAD0009   adeT FALSE 0.014 249.000 0.000 NA   NA
 587527 587528 ACIAD0009 ACIAD0010 adeT   FALSE 0.109 119.000 0.005 NA   NA
 587530 587531 ACIAD0013 ACIAD0014 tyrS   FALSE 0.006 571.000 0.000 NA   NA
 587531 587532 ACIAD0014 ACIAD0015     FALSE 0.015 242.000 0.000 NA   NA
 587532 587533 ACIAD0015 ACIADrRNA16S_1     FALSE 0.007 534.000 0.000 NA   NA
 587533 587534 ACIADrRNA16S_1 ACIADtRNAIle_1     FALSE 0.248 62.000 0.000 NA   NA
 587534 587535 ACIADtRNAIle_1 ACIADtRNAAla_2     TRUE 0.447 37.000 0.000 NA   NA
 587535 587536 ACIADtRNAAla_2 ACIADrRNA23S_2     FALSE 0.009 344.000 0.000 NA   NA
 587536 587537 ACIADrRNA23S_2 ACIADrRNA5S_3     FALSE 0.023 186.000 0.000 NA   NA
 587537 587538 ACIADrRNA5S_3 ACIAD0017     FALSE 0.025 178.000 0.000 NA   NA
 587538 587539 ACIAD0017 ACIAD0018     FALSE 0.297 54.000 0.000 NA   NA
 587540 587541 ACIAD0019 ACIAD0020   fkpB FALSE 0.221 99.000 0.019 NA   NA
 587541 587542 ACIAD0020 ACIAD0021 fkpB lspA TRUE 0.985 -7.000 0.417 1.000 N NA
 587542 587543 ACIAD0021 ACIAD0022 lspA ileS TRUE 0.968 -7.000 0.147 1.000 N NA
 587543 587544 ACIAD0022 ACIAD0023 ileS ribF TRUE 0.725 65.000 0.254 1.000 N NA
 587545 587546 ACIAD0024 ACIAD0025     FALSE 0.281 45.000 0.000 NA N NA
 587548 587549 ACIAD0027 ACIAD0028     TRUE 0.992 -3.000 0.621 NA N NA
 587549 587550 ACIAD0028 ACIAD0029     TRUE 0.985 13.000 0.442 NA N NA
 587550 587551 ACIAD0029 ACIAD0030     FALSE 0.158 79.000 0.000 NA   NA
 587551 587552 ACIAD0030 ACIAD0031     TRUE 0.958 30.000 0.533 1.000   NA
 587552 587553 ACIAD0031 ACIAD0032     TRUE 0.793 16.000 0.000 1.000 N NA
 587554 587555 ACIAD0034 ACIAD0035 ssuB ssuC TRUE 0.994 4.000 0.094 1.000 Y NA
 587555 587556 ACIAD0035 ACIAD0036 ssuC ssuD TRUE 0.987 -3.000 0.340 1.000 N NA
 587556 587557 ACIAD0036 ACIAD0037 ssuD ssuA TRUE 0.936 23.000 0.186 1.000 N NA
 587557 587558 ACIAD0037 ACIAD0038 ssuA ssuA TRUE 0.991 27.000 0.157 0.002 Y NA
 587558 587559 ACIAD0038 ACIAD0039 ssuA argA FALSE 0.008 373.000 0.000 1.000 N NA
 587559 587560 ACIAD0039 ACIAD0040 argA   FALSE 0.141 112.000 0.009 NA   NA
 587560 587561 ACIAD0040 ACIAD0041     FALSE 0.026 176.000 0.000 NA   NA
 587561 587562 ACIAD0041 ACIAD0042     FALSE 0.027 270.000 0.009 NA   NA
 587562 587563 ACIAD0042 ACIAD0043     TRUE 0.933 31.000 0.098 0.088   NA
 587563 587564 ACIAD0043 ACIAD0044   ubiG TRUE 0.986 -3.000 0.259 1.000   NA
 587566 587567 ACIAD0046 ACIAD0047     TRUE 0.831 94.000 0.042 0.008 Y NA
 587568 587569 ACIAD0048 ACIAD0049     TRUE 0.897 35.000 0.294 1.000 N NA
 587569 587570 ACIAD0049 ACIAD0050   rph FALSE 0.336 68.000 0.005 1.000 N NA
 587570 587571 ACIAD0050 ACIAD0051 rph   FALSE 0.017 224.000 0.000 NA   NA
 587571 587572 ACIAD0051 ACIAD0052     TRUE 0.992 -7.000 0.667 NA   NA
 587572 587573 ACIAD0052 ACIAD0053     TRUE 0.995 2.000 0.667 NA   NA
 587573 587574 ACIAD0053 ACIAD0054     TRUE 0.995 1.000 0.667 NA   NA
 587574 587575 ACIAD0054 ACIAD0055     FALSE 0.012 276.000 0.000 NA   NA
 587575 587576 ACIAD0055 ACIAD0056     FALSE 0.280 57.000 0.000 NA   NA
 587576 587577 ACIAD0056 ACIAD0057     FALSE 0.119 90.000 0.000 NA   NA
 587577 587578 ACIAD0057 ACIAD0058     FALSE 0.183 74.000 0.000 NA   NA
 587578 587579 ACIAD0058 ACIAD0059     TRUE 0.799 -18.000 0.000 NA   NA
 587579 587580 ACIAD0059 ACIAD0060     FALSE 0.011 308.000 0.000 NA   NA
 587580 587581 ACIAD0060 ACIAD0061     TRUE 0.877 10.000 0.000 NA   NA
 587583 587584 ACIAD0063 ACIAD0064 ampD   TRUE 0.506 53.000 0.006 1.000   NA
 587585 587586 ACIAD0065 ACIAD0066 fklB fkpA TRUE 0.992 46.000 0.800 0.005 Y NA
 587586 587587 ACIAD0066 ACIAD0068 fkpA ptk FALSE 0.306 170.000 0.500 1.000 N NA
 587587 587588 ACIAD0068 ACIAD0069 ptk ptp TRUE 0.989 15.000 0.625 1.000 N NA
 587588 587589 ACIAD0069 ACIAD0070 ptp wza TRUE 0.994 -3.000 0.667 1.000 N NA
 587590 587591 ACIAD0072 ACIAD0073 ugd   TRUE 0.745 19.000 0.000 NA   NA
 587591 587592 ACIAD0073 ACIAD0074     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 587592 587593 ACIAD0074 ACIAD0075     TRUE 0.979 -3.000 0.182 NA   NA
 587593 587594 ACIAD0075 ACIAD0076   rmlB TRUE 0.615 30.000 0.000 1.000   NA
 587594 587595 ACIAD0076 ACIAD0078 rmlB rmlD TRUE 0.993 19.000 0.042 0.001 Y NA
 587595 587596 ACIAD0078 ACIAD0079 rmlD rmlA TRUE 0.998 1.000 0.074 0.002 Y NA
 587596 587597 ACIAD0079 ACIAD0080 rmlA rmlC TRUE 0.851 71.000 0.150 1.000 Y NA
 587597 587598 ACIAD0080 ACIAD0081 rmlC   TRUE 0.976 14.000 0.000 1.000 Y NA
 587598 587599 ACIAD0081 ACIAD0082     TRUE 0.939 -10.000 0.042 NA   NA
 587599 587600 ACIAD0082 ACIAD0083     TRUE 0.723 20.000 0.000 NA   NA
 587600 587601 ACIAD0083 ACIAD0084     TRUE 0.723 20.000 0.000 NA   NA
 587601 587602 ACIAD0084 ACIAD0085     TRUE 0.847 13.000 0.000 NA   NA
 587604 587605 ACIAD0087 ACIAD0088     TRUE 0.971 30.000 0.212 1.000 Y NA
 587605 587606 ACIAD0088 ACIAD0089     TRUE 0.915 0.000 0.000 1.000   NA
 587606 587607 ACIAD0089 ACIAD0090     TRUE 0.900 -3.000 0.000 1.000   NA
 587607 587608 ACIAD0090 ACIAD0091     TRUE 0.992 13.000 0.000 0.019 Y NA
 587608 587609 ACIAD0091 ACIAD0092     TRUE 0.997 9.000 0.089 0.019 Y NA
 587609 587610 ACIAD0092 ACIAD0093     TRUE 0.991 -6.000 0.128 NA Y NA
 587610 587611 ACIAD0093 ACIAD0094     TRUE 0.950 -19.000 0.104 NA   NA
 587611 587612 ACIAD0094 ACIAD0095   per TRUE 0.978 4.000 0.086 1.000   NA
 587612 587613 ACIAD0095 ACIAD0096 per   TRUE 0.993 2.000 0.054 1.000 Y NA
 587613 587614 ACIAD0096 ACIAD0098     FALSE 0.054 414.000 0.000 NA Y NA
 587614 587615 ACIAD0098 ACIAD0099   galU TRUE 0.573 80.000 0.000 NA Y NA
 587615 587616 ACIAD0099 ACIAD0100 galU   TRUE 0.985 27.000 0.417 1.000 Y NA
 587616 587617 ACIAD0100 ACIAD0101   pgi TRUE 0.989 -3.000 0.438 1.000 N NA
 587617 587618 ACIAD0101 ACIAD0102 pgi galE TRUE 0.833 -7.000 0.000 1.000 N NA
 587618 587619 ACIAD0102 ACIAD0103 galE   TRUE 0.856 37.000 0.000 NA Y NA
 587620 587621 ACIAD0104 ACIAD0105 manB   FALSE 0.036 143.000 0.000 1.000 N NA
 587622 587623 ACIAD0106 ACIAD0107 lldP lldR TRUE 0.978 24.000 0.652 1.000 N NA
 587623 587624 ACIAD0107 ACIAD0108 lldR lldD TRUE 0.986 -3.000 0.309 1.000 N NA
 587624 587625 ACIAD0108 ACIAD0109 lldD dld TRUE 0.993 4.000 0.053 1.000 Y NA
 587625 587626 ACIAD0109 ACIAD0110 dld   FALSE 0.049 128.000 0.000 NA   NA
 587627 587628 ACIAD0111 ACIAD0112   tyrB FALSE 0.033 154.000 0.000 NA   NA
 587628 587629 ACIAD0112 ACIAD0114 tyrB lrp FALSE 0.006 706.000 0.000 1.000 N NA
 587630 587631 ACIAD0115 ACIAD0116 dadA dadX TRUE 0.776 32.000 0.040 1.000 N NA
 587631 587632 ACIAD0116 ACIAD0117 dadX   TRUE 0.980 12.000 0.250 NA N NA
 587632 587633 ACIAD0117 ACIAD0118   cycA FALSE 0.010 254.000 0.000 NA N NA
 587633 587634 ACIAD0118 ACIAD0119 cycA   FALSE 0.006 527.000 0.000 1.000 N NA
 587634 587635 ACIAD0119 ACIAD0120     FALSE 0.364 115.000 0.000 1.000 Y NA
 587635 587636 ACIAD0120 ACIAD0121     TRUE 0.978 13.000 0.000 1.000 Y NA
 587636 587637 ACIAD0121 ACIAD0122     TRUE 0.996 1.000 0.800 1.000   NA
 587637 587638 ACIAD0122 ACIAD0123     TRUE 0.994 -3.000 0.667 1.000   NA
 587638 587639 ACIAD0123 ACIAD0124     FALSE 0.031 155.000 0.000 1.000 N NA
 587640 587641 ACIAD0125 ACIAD0126   garD TRUE 0.620 52.000 0.052 NA   NA
 587641 587642 ACIAD0126 ACIAD0127 garD gudP TRUE 0.790 69.000 0.026 1.000 Y NA
 587643 587644 ACIAD0128 ACIAD0130 gudD kdgD FALSE 0.204 711.000 0.123 0.087 Y NA
 587644 587645 ACIAD0130 ACIAD0131 kdgD   TRUE 0.894 33.000 0.039 0.087 N NA
 587645 587646 ACIAD0131 ACIAD0132     FALSE 0.017 216.000 0.000 1.000 N NA
 587648 587649 ACIAD0134 ACIAD0135     FALSE 0.043 152.000 0.000 1.000   NA
 587649 587650 ACIAD0135 ACIAD0136     FALSE 0.055 239.000 0.061 1.000 N NA
 587650 587651 ACIAD0136 ACIAD0137     TRUE 0.993 11.000 0.131 1.000 Y NA
 587651 587652 ACIAD0137 ACIAD0138     TRUE 0.978 -3.000 0.131 1.000   NA
 587652 587653 ACIAD0138 ACIAD0139     FALSE 0.232 65.000 0.000 NA   NA
 587654 587655 ACIADtRNAGly_3 ACIADtRNAGly_4     FALSE 0.385 42.000 0.000 NA   NA
 587656 587657 ACIAD0141 ACIAD0142     TRUE 0.847 13.000 0.000 NA   NA
 587657 587658 ACIAD0142 ACIAD0143     TRUE 0.951 12.000 0.033 NA   NA
 587658 587659 ACIAD0143 ACIAD0144     FALSE 0.383 82.000 0.054 NA   NA
 587659 587660 ACIAD0144 ACIAD0145     TRUE 0.954 -7.000 0.071 NA   NA
 587660 587661 ACIAD0145 ACIAD0147     FALSE 0.019 210.000 0.000 NA   NA
 587663 587664 ACIAD0149 ACIAD0150     FALSE 0.068 113.000 0.000 NA   NA
 587664 587665 ACIAD0150 ACIAD0151   guaA FALSE 0.297 54.000 0.000 NA   NA
 587667 587668 ACIAD0154 ACIAD0155     TRUE 0.785 34.000 0.065 NA   NA
 587668 587669 ACIAD0155 ACIAD0156     TRUE 0.800 16.000 0.000 NA   NA
 587669 587670 ACIAD0156 ACIAD0157     FALSE 0.034 151.000 0.000 NA   NA
 587670 587671 ACIAD0157 ACIAD0158     TRUE 0.973 -3.000 0.118 NA   NA
 587671 587672 ACIAD0158 ACIAD0159     TRUE 0.844 66.000 0.088 1.000 Y NA
 587674 587675 ACIAD0161 ACIAD0162     FALSE 0.171 76.000 0.000 NA   NA
 587676 587677 ACIAD0163 ACIAD0164   argS FALSE 0.197 116.000 0.052 NA   NA
 587677 587678 ACIAD0164 ACIAD0165 argS   FALSE 0.033 153.000 0.000 NA   NA
 587679 587680 ACIAD0166 ACIAD0167 sfcA   FALSE 0.043 136.000 0.000 NA   NA
 587680 587681 ACIAD0167 ACIAD0168     TRUE 0.874 -3.000 0.000 NA   NA
 587681 587682 ACIAD0168 ACIAD0169     TRUE 0.898 2.000 0.000 NA   NA
 587682 587683 ACIAD0169 ACIAD0171     FALSE 0.016 230.000 0.000 NA   NA
 587686 587687 ACIAD0174 ACIAD0175 znuB znuC TRUE 0.999 3.000 0.755 0.090 Y NA
 587687 587688 ACIAD0175 ACIAD0176 znuC zur TRUE 0.994 -9.000 0.309 1.000 Y NA
 587689 587690 ACIAD0177 ACIAD0178 znuA atpI FALSE 0.070 174.000 0.023 1.000 N NA
 587690 587691 ACIAD0178 ACIAD0180 atpI atpB TRUE 0.764 104.000 0.291 1.000 Y NA
 587691 587692 ACIAD0180 ACIAD0182 atpB atpE TRUE 0.960 85.000 0.557 0.003 Y NA
 587692 587693 ACIAD0182 ACIAD0183 atpE atpF TRUE 0.992 40.000 0.666 0.003 Y NA
 587693 587694 ACIAD0183 ACIAD0184 atpF atpH TRUE 0.998 12.000 0.242 0.003 Y NA
 587694 587695 ACIAD0184 ACIAD0185 atpH atpA TRUE 0.997 31.000 0.864 0.003 Y NA
 587695 587696 ACIAD0185 ACIAD0186 atpA atpG TRUE 0.980 78.000 0.846 0.003 Y NA
 587696 587697 ACIAD0186 ACIAD0187 atpG atpD TRUE 0.996 31.000 0.724 0.003 Y NA
 587697 587698 ACIAD0187 ACIAD0188 atpD atpC TRUE 0.997 28.000 0.837 0.003 Y NA
 587698 587699 ACIAD0188 ACIAD0189 atpC   FALSE 0.059 144.000 0.002 NA   NA
 587699 587700 ACIAD0189 ACIAD0190     FALSE 0.058 121.000 0.000 NA   NA
 587700 587701 ACIAD0190 ACIAD0191     TRUE 0.847 13.000 0.000 NA   NA
 587702 587703 ACIAD0192 ACIAD0193     FALSE 0.054 192.000 0.018 NA   NA
 587703 587704 ACIAD0193 ACIAD0194     FALSE 0.111 136.000 0.024 1.000 N NA
 587704 587705 ACIAD0194 ACIAD0195     TRUE 0.975 19.000 0.444 1.000 N NA
 587706 587707 ACIAD0196 ACIAD0197     TRUE 0.733 78.000 0.500 NA N NA
 587707 587708 ACIAD0197 ACIAD0198     FALSE 0.008 418.000 0.000 NA   NA
 587708 587709 ACIAD0198 ACIAD0199     TRUE 0.552 34.000 0.000 1.000   NA
 587709 587710 ACIAD0199 ACIAD0200     TRUE 0.975 -7.000 0.000 NA Y NA
 587710 587711 ACIAD0200 ACIAD0201     TRUE 0.874 -3.000 0.000 NA   NA
 587711 587712 ACIAD0201 ACIAD0202     FALSE 0.039 162.000 0.000 1.000   NA
 587712 587713 ACIAD0202 ACIAD0203     FALSE 0.014 252.000 0.000 NA   NA
 587713 587714 ACIAD0203 ACIAD0204     FALSE 0.171 76.000 0.000 NA   NA
 587714 587715 ACIAD0204 ACIAD0205     TRUE 0.448 42.000 0.000 1.000   NA
 587715 587716 ACIAD0205 ACIAD0206     TRUE 0.975 25.000 0.590 1.000   NA
 587716 587717 ACIAD0206 ACIAD0207     TRUE 0.994 13.000 0.359 0.064   NA
 587718 587719 ACIAD0208 ACIAD0209     TRUE 0.690 34.000 0.023 NA N NA
 587719 587720 ACIAD0209 ACIAD0210     TRUE 0.908 18.000 0.017 1.000   NA
 587721 587722 ACIAD0211 ACIAD0212 def   TRUE 0.743 34.000 0.030 NA   NA
 587722 587723 ACIAD0212 ACIAD0214     FALSE 0.199 103.000 0.017 NA   NA
 587723 587724 ACIAD0214 ACIAD0215     FALSE 0.340 48.000 0.000 NA   NA
 587726 587727 ACIAD0217 ACIADrRNA16S_4     FALSE 0.007 480.000 0.000 NA   NA
 587727 587728 ACIADrRNA16S_4 ACIADtRNAIle_5     FALSE 0.248 62.000 0.000 NA   NA
 587728 587729 ACIADtRNAIle_5 ACIADtRNAAla_6     TRUE 0.447 37.000 0.000 NA   NA
 587729 587730 ACIADtRNAAla_6 ACIADrRNA23S_5     FALSE 0.009 344.000 0.000 NA   NA
 587730 587731 ACIADrRNA23S_5 ACIADrRNA5S_6     FALSE 0.023 186.000 0.000 NA   NA
 587731 587732 ACIADrRNA5S_6 ACIAD0219     FALSE 0.030 164.000 0.000 NA   NA
 587732 587733 ACIAD0219 ACIAD0220     FALSE 0.020 206.000 0.000 NA   NA
 587733 587734 ACIAD0220 ACIAD0221     FALSE 0.008 392.000 0.000 NA   NA
 587735 587736 ACIAD0222 ACIAD0223   shiA TRUE 0.857 1.000 0.000 NA N NA
 587736 587737 ACIAD0223 ACIAD0224 shiA   TRUE 0.896 1.000 0.000 NA   NA
 587737 587738 ACIAD0224 ACIAD0225   dinP FALSE 0.131 86.000 0.000 NA   NA
 587738 587739 ACIAD0225 ACIAD0226 dinP   TRUE 0.943 -3.000 0.015 1.000 N NA
 587739 587740 ACIAD0226 ACIAD0228     TRUE 0.806 42.000 0.150 1.000   NA
 587740 587741 ACIAD0228 ACIAD0229     FALSE 0.227 130.000 0.150 NA   NA
 587742 587743 ACIAD0230 ACIAD0231     TRUE 0.614 56.000 0.069 NA   NA
 587743 587744 ACIAD0231 ACIAD0232     TRUE 0.609 49.000 0.033 NA   NA
 587744 587745 ACIAD0232 ACIAD0233     FALSE 0.045 232.000 0.025 NA   NA
 587745 587746 ACIAD0233 ACIAD0234   parC FALSE 0.057 158.000 0.005 1.000 N NA
 587746 587747 ACIAD0234 ACIAD0235 parC fadD FALSE 0.035 147.000 0.000 1.000 N NA
 587749 587750 ACIAD0237 ACIAD0239   ppa FALSE 0.096 127.000 0.006 NA   NA
 587753 587754 ACIAD0242 ACIAD0243     TRUE 0.515 70.000 0.074 NA   NA
 587755 587756 ACIAD0244 ACIAD0245 glnK amtB TRUE 0.691 62.000 0.189 1.000 N NA
 587756 587757 ACIAD0245 ACIAD0246 amtB   FALSE 0.076 123.000 0.004 NA N NA
 587757 587758 ACIAD0246 ACIAD0247   ribD TRUE 0.977 -7.000 0.277 NA N NA
 587758 587759 ACIAD0247 ACIAD0248 ribD   TRUE 0.922 -3.000 0.004 1.000 N NA
 587759 587760 ACIAD0248 ACIAD0249   ribC TRUE 0.500 45.000 0.004 1.000 N NA
 587761 587762 ACIAD0250 ACIAD0251     TRUE 0.623 123.000 0.800 NA   NA
 587762 587763 ACIAD0251 ACIAD0252   holC TRUE 0.665 36.000 0.012 NA   NA
 587763 587764 ACIAD0252 ACIAD0253 holC pepA TRUE 0.987 -7.000 0.494 1.000 N NA
 587765 587766 ACIAD0254 ACIAD0255     TRUE 0.997 0.000 0.631 0.086   NA
 587766 587767 ACIAD0255 ACIAD0256   gpmI FALSE 0.116 122.000 0.004 1.000   NA
 587767 587768 ACIAD0256 ACIAD0257 gpmI   TRUE 0.930 11.000 0.007 1.000 N NA
 587769 587770 ACIAD0258 ACIAD0259 pilR pilS TRUE 0.997 18.000 0.556 0.089 Y NA
 587770 587771 ACIAD0259 ACIAD0260 pilS gacA TRUE 0.976 19.000 0.024 1.000 Y NA
 587773 587774 ACIAD0263 ACIAD0264 thrC hom TRUE 0.900 61.000 0.194 1.000 Y NA
 587774 587775 ACIAD0264 ACIAD0265 hom dsbC FALSE 0.025 176.000 0.000 1.000 N NA
 587775 587776 ACIAD0265 ACIAD0266 dsbC xerD FALSE 0.080 130.000 0.004 1.000 N NA
 587777 587778 ACIAD0267 ACIAD0268     TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 587778 587779 ACIAD0268 ACIAD0269     TRUE 0.922 17.000 0.038 NA   NA
 587779 587780 ACIAD0269 ACIAD0270   murD FALSE 0.072 138.000 0.004 NA   NA
 587780 587781 ACIAD0270 ACIAD0271 murD ftsW TRUE 0.986 22.000 0.297 0.003 N NA
 587782 587783 ACIAD0272 ACIAD0273   dksA TRUE 0.987 5.000 0.231 1.000   NA
 587783 587784 ACIAD0273 ACIAD0274 dksA icc FALSE 0.059 203.000 0.019 1.000   NA
 587784 587785 ACIAD0274 ACIAD0275 icc aspP TRUE 0.978 3.000 0.092 1.000   NA
 587785 587786 ACIAD0275 ACIAD0276 aspP thiC FALSE 0.325 82.000 0.015 1.000   NA
 587787 587788 ACIAD0278 ACIAD0279 tolC phoU FALSE 0.218 91.000 0.018 NA N NA
 587789 587790 ACIAD0282 ACIAD0283   argH TRUE 0.920 10.000 0.006 NA N NA
 587791 587792 ACIAD0284 ACIAD0285 algZ algR TRUE 0.965 58.000 0.775 0.011   NA
 587792 587793 ACIAD0285 ACIAD0286 algR hemC FALSE 0.268 94.000 0.032 1.000 N NA
 587793 587794 ACIAD0286 ACIAD0287 hemC hemD TRUE 0.998 7.000 0.205 0.002 Y NA
 587794 587795 ACIAD0287 ACIAD0288 hemD   TRUE 0.885 9.000 0.000 NA   NA
 587795 587796 ACIAD0288 ACIAD0289     TRUE 0.800 16.000 0.000 NA   NA
 587796 587797 ACIAD0289 ACIAD0290     TRUE 0.985 9.000 0.235 NA   NA
 587797 587798 ACIAD0290 ACIAD0291     FALSE 0.118 207.000 0.158 1.000   NA
 587798 587799 ACIAD0291 ACIAD0292     FALSE 0.038 163.000 0.000 1.000   NA
 587799 587800 ACIAD0292 ACIAD0293     TRUE 0.976 0.000 0.086 1.000   NA
 587800 587801 ACIAD0293 ACIAD0294     TRUE 0.976 41.000 0.575 1.000 Y NA
 587801 587802 ACIAD0294 ACIAD0295     TRUE 0.450 67.000 0.025 NA   NA
 587802 587803 ACIAD0295 ACIAD0296   gph TRUE 0.729 34.000 0.023 NA   NA
 587803 587804 ACIAD0296 ACIAD0297 gph trpE TRUE 0.462 104.000 0.233 1.000   NA
 587804 587805 ACIAD0297 ACIADtRNAThr_7 trpE   FALSE 0.096 99.000 0.000 NA   NA
 587805 587806 ACIADtRNAThr_7 ACIADtRNATyr_8     FALSE 0.267 59.000 0.000 NA   NA
 587806 587807 ACIADtRNATyr_8 ACIADtRNAGly_9     FALSE 0.429 38.000 0.000 NA   NA
 587807 587808 ACIADtRNAGly_9 ACIADtRNAThr_10     TRUE 0.830 14.000 0.000 NA   NA
 587808 587809 ACIADtRNAThr_10 ACIAD0299   tufB FALSE 0.027 171.000 0.000 NA   NA
 587809 587810 ACIAD0299 ACIADtRNATrp_11 tufB   FALSE 0.280 57.000 0.000 NA   NA
 587810 587811 ACIADtRNATrp_11 ACIAD0300   secE FALSE 0.171 76.000 0.000 NA   NA
 587811 587812 ACIAD0300 ACIAD0301 secE nusG TRUE 0.939 8.000 0.006 1.000 N NA
 587812 587813 ACIAD0301 ACIAD0302 nusG rplK TRUE 0.625 114.000 0.681 1.000 N NA
 587813 587814 ACIAD0302 ACIAD0304 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.024 Y NA
 587814 587815 ACIAD0304 ACIAD0305 rplA rplJ TRUE 0.560 240.000 0.302 0.024 Y NA
 587815 587816 ACIAD0305 ACIAD0306 rplJ rplL TRUE 0.993 43.000 0.884 0.018 Y NA
 587816 587817 ACIAD0306 ACIAD0307 rplL rpoB FALSE 0.087 309.000 0.223 1.000   NA
 587817 587818 ACIAD0307 ACIAD0308 rpoB rpoC TRUE 0.985 41.000 0.851 0.001   NA
 587818 587819 ACIAD0308 ACIAD0310 rpoC   FALSE 0.015 247.000 0.000 NA   NA
 587821 587822 ACIAD0312 ACIAD0313     FALSE 0.154 120.000 0.025 NA   NA
 587822 587823 ACIAD0313 ACIAD0314     FALSE 0.054 279.000 0.000 0.085   NA
 587823 587824 ACIAD0314 ACIAD0315     FALSE 0.040 233.000 0.017 NA   NA
 587824 587825 ACIAD0315 ACIAD0316   htpG FALSE 0.142 105.000 0.004 NA   NA
 587827 587828 ACIAD0318 ACIAD0319     FALSE 0.060 118.000 0.000 1.000 N NA
 587828 587829 ACIAD0319 ACIAD0320     FALSE 0.052 124.000 0.000 1.000 N NA
 587829 587830 ACIAD0320 ACIAD0321     TRUE 0.993 9.000 0.000 0.054 Y NA
 587831 587832 ACIAD0323 ACIAD0324     FALSE 0.008 423.000 0.000 NA   NA
 587832 587833 ACIAD0324 ACIAD0328     FALSE 0.015 241.000 0.000 NA   NA
 587836 587837 ACIAD0332 ACIAD0333     FALSE 0.014 250.000 0.000 NA   NA
 587838 587839 ACIAD0334 ACIAD0335 fadA fadB TRUE 0.997 14.000 0.607 1.000 Y NA
 587840 587841 ACIAD0336 ACIAD0337   lpxO FALSE 0.090 166.000 0.039 NA   NA
 587841 587842 ACIAD0337 ACIAD0339 lpxO   FALSE 0.090 176.000 0.059 NA   NA
 587842 587843 ACIAD0339 ACIAD0340   uvrC FALSE 0.181 91.000 0.003 NA   NA
 587843 587844 ACIAD0340 ACIAD0341 uvrC   FALSE 0.159 88.000 0.003 NA N NA
 587844 587845 ACIAD0341 ACIAD0342   pgsA TRUE 0.494 102.000 0.005 NA Y NA
 587845 587846 ACIAD0342 ACIAD0344 pgsA ada FALSE 0.101 115.000 0.002 1.000 N NA
 587846 587847 ACIAD0344 ACIAD0345 ada alkB TRUE 0.989 -3.000 0.027 NA Y NA
 587849 587850 ACIAD0349 ACIAD0350     TRUE 0.982 -16.000 0.429 NA   NA
 587850 587851 ACIAD0350 ACIAD0351     TRUE 0.922 35.000 0.429 NA   NA
 587852 587853 ACIAD0352 ACIAD0353     TRUE 0.977 -7.000 0.263 NA N NA
 587853 587854 ACIAD0353 ACIAD0354   recN FALSE 0.102 116.000 0.007 NA N NA
 587855 587856 ACIAD0355 ACIAD0356     FALSE 0.342 79.000 0.022 NA   NA
 587856 587857 ACIAD0356 ACIAD0357     FALSE 0.157 100.000 0.004 NA   NA
 587857 587858 ACIAD0357 ACIAD0358     FALSE 0.314 41.000 0.000 NA N NA
 587859 587860 ACIAD0359 ACIAD0360 coaE pilD TRUE 0.978 6.000 0.122 1.000 N NA
 587860 587861 ACIAD0360 ACIAD0361 pilD pilC TRUE 0.997 0.000 0.454 1.000 Y NA
 587861 587862 ACIAD0361 ACIAD0362 pilC pilB TRUE 0.992 29.000 0.362 0.016 Y NA
 587863 587864 ACIAD0363 ACIAD0364 tpiA secG TRUE 0.938 10.000 0.009 1.000 N NA
 587864 587865 ACIAD0364 ACIADtRNALeu_12 secG   FALSE 0.280 57.000 0.000 NA   NA
 587865 587866 ACIADtRNALeu_12 ACIADtRNAMet_13     FALSE 0.007 496.000 0.000 NA   NA
 587866 587867 ACIADtRNAMet_13 ACIADtRNAMet_14     FALSE 0.125 88.000 0.000 NA   NA
 587867 587868 ACIADtRNAMet_14 ACIAD0367     FALSE 0.020 203.000 0.000 NA   NA
 587868 587869 ACIAD0367 ACIAD0368   nusA TRUE 0.958 36.000 0.759 NA   NA
 587869 587870 ACIAD0368 ACIAD0369 nusA infB TRUE 0.987 11.000 0.342 1.000 N NA
 587870 587871 ACIAD0369 ACIAD0370 infB rbfA TRUE 0.998 0.000 0.530 1.000 Y NA
 587872 587873 ACIAD0371 ACIAD0372 phaG phaF TRUE 0.999 10.000 0.937 1.000 Y NA
 587873 587874 ACIAD0372 ACIAD0373 phaF phaE TRUE 0.999 -3.000 0.937 0.085 Y NA
 587874 587875 ACIAD0373 ACIAD0374 phaE phaD TRUE 0.999 3.000 0.944 1.000 Y NA
 587875 587876 ACIAD0374 ACIAD0375 phaD phaC TRUE 1.000 0.000 0.976 0.007 Y NA
 587876 587877 ACIAD0375 ACIAD0376 phaC phaAB TRUE 0.999 -3.000 0.881 0.007 Y NA
 587877 587878 ACIAD0376 ACIAD0378 phaAB   FALSE 0.013 328.000 0.000 1.000   NA
 587878 587879 ACIAD0378 ACIAD0379     TRUE 0.986 13.000 0.080 0.054   NA
 587879 587880 ACIAD0379 ACIAD0380   hisIE TRUE 0.940 10.000 0.005 1.000   NA
 587880 587881 ACIAD0380 ACIAD0381 hisIE   FALSE 0.044 169.000 0.002 1.000 N NA
 587881 587882 ACIAD0381 ACIAD0382   ubiB TRUE 0.831 20.000 0.005 NA   NA
 587882 587883 ACIAD0382 ACIAD0383 ubiB   TRUE 0.985 14.000 0.432 NA   NA
 587883 587884 ACIAD0383 ACIAD0384   ubiE TRUE 0.970 13.000 0.145 NA   NA
 587884 587885 ACIAD0384 ACIAD0385 ubiE   FALSE 0.087 134.000 0.008 NA   NA
 587885 587886 ACIAD0385 ACIAD0386     FALSE 0.007 491.000 0.000 NA   NA
 587887 587888 ACIAD0387 ACIAD0388     TRUE 0.728 24.000 0.000 1.000   NA
 587888 587889 ACIAD0388 ACIAD0389     TRUE 0.921 28.000 0.000 1.000 Y NA
 587889 587890 ACIAD0389 ACIAD0390     TRUE 0.918 1.000 0.000 1.000   NA
 587890 587891 ACIAD0390 ACIAD0394   pap FALSE 0.006 944.000 0.000 NA   NA
 587892 587893 ACIAD0395 ACIAD0396 citA   FALSE 0.022 190.000 0.000 NA   NA
 587894 587895 ACIAD0397 ACIAD0398 recC recB TRUE 0.999 7.000 0.542 0.001 Y NA
 587895 587896 ACIAD0398 ACIAD0399 recB recD TRUE 0.901 96.000 0.688 0.001   NA
 587898 587899 ACIAD0401 ACIAD0402 rpsO pnp FALSE 0.353 253.000 0.335 1.000 Y NA
 587899 587900 ACIAD0402 ACIAD0403 pnp   FALSE 0.019 278.000 0.002 1.000 N NA
 587900 587901 ACIAD0403 ACIAD0404   crcB FALSE 0.015 188.000 0.000 NA N NA
 587902 587903 ACIAD0405 ACIAD0406   cbpA TRUE 0.987 12.000 0.388 NA   NA
 587903 587904 ACIAD0406 ACIAD0407 cbpA hslO FALSE 0.335 203.000 0.000 0.004 Y NA
 587904 587905 ACIAD0407 ACIAD0408 hslO kef TRUE 0.805 39.000 0.005 0.084 N NA
 587905 587906 ACIAD0408 ACIAD0409 kef priA FALSE 0.275 74.000 0.003 1.000 N NA
 587907 587908 ACIAD0411 ACIAD0412 xcpS xcpT TRUE 0.999 6.000 0.599 0.006 Y NA
 587908 587909 ACIAD0412 ACIAD0413 xcpT   FALSE 0.013 264.000 0.000 NA   NA
 587909 587910 ACIAD0413 ACIAD0414     FALSE 0.043 136.000 0.000 NA   NA
 587911 587912 ACIAD0415 ACIAD0416 lnt corC TRUE 0.992 -3.000 0.557 1.000 N NA
 587914 587915 ACIAD0418 ACIAD0419 aroE   FALSE 0.206 77.000 0.000 1.000   NA
 587916 587917 ACIAD0420 ACIAD0421     TRUE 0.899 -10.000 0.006 NA   NA
 587917 587918 ACIAD0421 ACIAD0422     FALSE 0.261 98.000 0.023 1.000   NA
 587919 587920 ACIAD0424 ACIAD0425   rpmE2 FALSE 0.013 267.000 0.000 NA   NA
 587920 587921 ACIAD0425 ACIAD0426 rpmE2   FALSE 0.210 92.000 0.008 NA   NA
 587922 587923 ACIAD0427 ACIAD0428     TRUE 0.977 40.000 0.176 0.011 Y NA
 587924 587925 ACIAD0429 ACIAD0431 norM   TRUE 0.775 29.000 0.018 NA   NA
 587929 587930 ACIAD0436 ACIADtRNALys_15 ahpC   FALSE 0.019 211.000 0.000 NA   NA
 587930 587931 ACIADtRNALys_15 ACIADtRNALys_16     FALSE 0.078 109.000 0.000 NA   NA
 587931 587932 ACIADtRNALys_16 ACIAD0437     FALSE 0.058 121.000 0.000 NA   NA
 587932 587933 ACIAD0437 ACIAD0438   rne FALSE 0.170 184.000 0.250 1.000 N NA
 587934 587935 ACIAD0441 ACIAD0442   rluC FALSE 0.046 178.000 0.005 NA   NA
 587935 587936 ACIAD0442 ACIAD0443 rluC   TRUE 0.989 -3.000 0.389 1.000   NA
 587936 587937 ACIAD0443 ACIAD0444     TRUE 0.604 47.000 0.015 1.000   NA
 587937 587938 ACIAD0444 ACIAD0445     TRUE 0.699 52.000 0.116 1.000 N NA
 587939 587940 ACIAD0446 ACIAD0448   hcaR FALSE 0.058 121.000 0.000 NA   NA
 587941 587942 ACIAD0449 ACIAD0450     FALSE 0.286 56.000 0.000 NA   NA
 587945 587946 ACIAD0454 ACIAD0455 ptsP nudH TRUE 0.535 71.000 0.097 1.000 N NA
 587950 587951 ACIAD0460 ACIAD0461     FALSE 0.020 238.000 0.000 1.000   NA
 587951 587952 ACIAD0461 ACIAD0462     FALSE 0.289 95.000 0.047 NA   NA
 587953 587954 ACIAD0463 ACIAD0465 leuC   TRUE 0.889 0.000 0.000 1.000 N NA
 587954 587955 ACIAD0465 ACIAD0466   leuD TRUE 0.738 19.000 0.000 1.000 N NA
 587955 587956 ACIAD0466 ACIAD0468 leuD   FALSE 0.237 111.000 0.068 NA   NA
 587956 587957 ACIAD0468 ACIAD0469   leuB TRUE 0.565 49.000 0.019 NA   NA
 587957 587958 ACIAD0469 ACIAD0471 leuB   FALSE 0.020 203.000 0.000 NA   NA
 587961 587962 ACIAD0474 ACIAD0476 truA   TRUE 0.972 19.000 0.010 1.000 Y NA
 587962 587963 ACIAD0476 ACIAD0477     TRUE 0.635 48.000 0.026 1.000   NA
 587963 587964 ACIAD0477 ACIAD0479   asd FALSE 0.022 226.000 0.000 1.000   NA
 587965 587966 ACIAD0480 ACIAD0481   gltP FALSE 0.006 836.000 0.000 NA   NA
 587967 587968 ACIAD0482 ACIAD0484   htrB FALSE 0.096 267.000 0.000 1.000 Y NA
 587968 587969 ACIAD0484 ACIAD0485 htrB   FALSE 0.017 223.000 0.000 1.000 N NA
 587969 587970 ACIAD0485 ACIAD0486     FALSE 0.087 286.000 0.000 1.000 Y NA
 587970 587971 ACIAD0486 ACIAD0487   uup FALSE 0.040 224.000 0.007 1.000   NA
 587972 587973 ACIAD0488 ACIAD0489     FALSE 0.297 54.000 0.000 NA   NA
 587973 587974 ACIAD0489 ACIAD0492     FALSE 0.027 171.000 0.000 NA   NA
 587974 587975 ACIAD0492 ACIAD0493   topA TRUE 0.583 37.000 0.003 NA   NA
 587975 587976 ACIAD0493 ACIAD0494 topA   FALSE 0.017 221.000 0.000 NA   NA
 587976 587977 ACIAD0494 ACIAD0495     TRUE 0.565 52.000 0.024 NA   NA
 587977 587978 ACIAD0495 ACIAD0496     TRUE 0.545 59.000 0.024 1.000   NA
 587978 587979 ACIAD0496 ACIAD0497     TRUE 0.934 -7.000 0.021 NA   NA
 587979 587980 ACIAD0497 ACIAD0498     FALSE 0.173 119.000 0.037 NA   NA
 587980 587981 ACIAD0498 ACIAD0499     FALSE 0.407 113.000 0.278 NA   NA
 587982 587983 ACIAD0500 ACIAD0501   rpmG FALSE 0.064 141.000 0.003 1.000 N NA
 587983 587984 ACIAD0501 ACIAD0502 rpmG rpmB TRUE 0.998 13.000 0.332 0.018 Y NA
 587984 587985 ACIAD0502 ACIAD0503 rpmB calB FALSE 0.048 167.000 0.004 1.000 N NA
 587986 587987 ACIAD0504 ACIAD0505   purU1 TRUE 0.471 61.000 0.019 1.000 N NA
 587987 587988 ACIAD0505 ACIAD0507 purU1   FALSE 0.010 310.000 0.000 1.000 N NA
 587988 587989 ACIAD0507 ACIAD0508     TRUE 0.933 20.000 0.000 0.016 N NA
 587989 587990 ACIAD0508 ACIAD0509     TRUE 0.993 0.000 0.000 0.076 Y NA
 587991 587992 ACIAD0510 ACIAD0511 msrA   TRUE 0.518 87.000 0.000 NA Y NA
 587994 587995 ACIAD0513 ACIAD0514   folA TRUE 0.868 27.000 0.078 NA   NA
 587995 587996 ACIAD0514 ACIAD0515 folA thyA TRUE 0.925 13.000 0.011 1.000 N NA
 587996 587997 ACIAD0515 ACIAD0516 thyA   FALSE 0.125 111.000 0.004 NA   NA
 587997 587998 ACIAD0516 ACIAD0517     TRUE 0.886 65.000 0.750 NA   NA
 587998 587999 ACIAD0517 ACIAD0518   lgt FALSE 0.120 116.000 0.006 NA   NA
 588001 588002 ACIAD0520 ACIAD0521   tatC FALSE 0.059 178.000 0.015 NA   NA
 588002 588003 ACIAD0521 ACIAD0522 tatC tatB TRUE 0.996 -3.000 0.314 NA Y NA
 588003 588004 ACIAD0522 ACIAD0523 tatB tatA TRUE 0.995 13.000 0.020 0.009 Y NA
 588005 588006 ACIAD0524 ACIAD0525     FALSE 0.078 109.000 0.000 NA   NA
 588007 588008 ACIAD0526 ACIAD0527     TRUE 0.645 35.000 0.003 1.000   NA
 588008 588009 ACIAD0527 ACIAD0528   metW TRUE 0.948 -3.000 0.018 NA   NA
 588009 588010 ACIAD0528 ACIAD0529 metW metX TRUE 0.991 -3.000 0.509 NA   NA
 588010 588011 ACIAD0529 ACIAD0530 metX leuA TRUE 0.645 86.000 0.012 1.000 Y NA
 588011 588012 ACIAD0530 ACIAD0531 leuA piuC FALSE 0.009 451.000 0.000 1.000   NA
 588012 588013 ACIAD0531 ACIAD0532 piuC   FALSE 0.344 112.000 0.163 1.000   NA
 588014 588015 ACIAD0533 ACIAD0534 tig clpP TRUE 0.464 193.000 0.351 1.000 Y NA
 588015 588016 ACIAD0534 ACIAD0535 clpP clpX TRUE 0.981 29.000 0.352 1.000 Y NA
 588016 588017 ACIAD0535 ACIAD0536 clpX   FALSE 0.059 147.000 0.003 NA   NA
 588018 588019 ACIAD0537 ACIAD0538   fumA FALSE 0.073 148.000 0.009 NA   NA
 588021 588022 ACIAD0540 ACIAD0541 pta ack TRUE 0.752 44.000 0.094 1.000   NA
 588023 588024 ACIAD0542 ACIAD0543 edd eda TRUE 0.981 34.000 0.523 1.000 Y NA
 588024 588025 ACIAD0543 ACIAD0544 eda gntT FALSE 0.241 185.000 0.021 1.000 Y NA
 588025 588026 ACIAD0544 ACIAD0545 gntT gntK TRUE 0.993 17.000 0.370 1.000 Y NA
 588026 588027 ACIAD0545 ACIAD0546 gntK   FALSE 0.090 138.000 0.014 1.000 N NA
 588030 588031 ACIAD0550 ACIAD0551   nagZ FALSE 0.100 120.000 0.009 NA N NA
 588032 588033 ACIAD0552 ACIAD0553 prc   FALSE 0.217 183.000 0.008 1.000 Y NA
 588033 588034 ACIAD0553 ACIAD0554     TRUE 0.795 32.000 0.034 1.000   NA
 588034 588035 ACIAD0554 ACIAD0555     TRUE 0.581 54.000 0.024 1.000   NA
 588035 588036 ACIAD0555 ACIAD0556   ndk FALSE 0.189 111.000 0.017 1.000   NA
 588036 588037 ACIAD0556 ACIAD0557 ndk   FALSE 0.283 123.000 0.156 1.000   NA
 588037 588038 ACIAD0557 ACIAD0558   pilF TRUE 0.936 19.000 0.086 1.000   NA
 588038 588039 ACIAD0558 ACIAD0560 pilF   TRUE 0.946 -9.000 0.034 1.000   NA
 588039 588040 ACIAD0560 ACIAD0561   ispG TRUE 0.821 24.000 0.005 1.000   NA
 588040 588041 ACIAD0561 ACIAD0562 ispG hisS TRUE 0.980 -3.000 0.207 1.000 N NA
 588041 588042 ACIAD0562 ACIAD0563 hisS   TRUE 0.914 32.000 0.259 1.000   NA
 588042 588043 ACIAD0563 ACIAD0564     TRUE 0.993 0.000 0.492 1.000   NA
 588043 588044 ACIAD0564 ACIAD0565   engA FALSE 0.150 189.000 0.203 1.000   NA
 588044 588045 ACIAD0565 ACIAD0566 engA   FALSE 0.039 180.000 0.002 NA   NA
 588045 588046 ACIAD0566 ACIAD0567     TRUE 0.989 -12.000 0.636 NA   NA
 588046 588047 ACIAD0567 ACIAD0568     TRUE 0.970 -3.000 0.075 1.000   NA
 588047 588048 ACIAD0568 ACIAD0569     TRUE 0.991 10.000 0.052 0.003   NA
 588048 588049 ACIAD0569 ACIAD0570     TRUE 0.992 0.000 0.422 1.000   NA
 588049 588050 ACIAD0570 ACIAD0571     TRUE 0.993 -7.000 0.758 1.000   NA
 588050 588051 ACIAD0571 ACIAD0572     TRUE 0.957 -3.000 0.034 NA   NA
 588051 588052 ACIAD0572 ACIAD0573     TRUE 0.966 3.000 0.036 NA   NA
 588052 588053 ACIAD0573 ACIAD0574   hutH TRUE 0.991 2.000 0.333 1.000   NA
 588053 588054 ACIAD0574 ACIAD0575 hutH   TRUE 0.983 -10.000 0.413 NA   NA
 588054 588055 ACIAD0575 ACIAD0576     TRUE 0.831 66.000 0.532 NA   NA
 588055 588056 ACIAD0576 ACIAD0577     TRUE 0.995 2.000 0.732 NA   NA
 588056 588057 ACIAD0577 ACIAD0578     TRUE 0.977 16.000 0.329 NA   NA
 588057 588058 ACIAD0578 ACIAD0579     TRUE 0.989 2.000 0.297 NA   NA
 588058 588059 ACIAD0579 ACIAD0580     TRUE 0.991 7.000 0.422 NA   NA
 588059 588060 ACIAD0580 ACIAD0581     TRUE 0.993 -3.000 0.128 NA Y NA
 588060 588061 ACIAD0581 ACIAD0582   fabG TRUE 0.992 -3.000 0.103 NA Y NA
 588061 588062 ACIAD0582 ACIAD0583 fabG fabF TRUE 0.998 0.000 0.486 1.000 Y NA
 588062 588063 ACIAD0583 ACIAD0584 fabF   TRUE 0.941 14.000 0.037 NA   NA
 588063 588064 ACIAD0584 ACIAD0585     TRUE 0.953 22.000 0.250 NA   NA
 588064 588065 ACIAD0585 ACIAD0586     TRUE 0.462 36.000 0.000 NA   NA
 588066 588067 ACIAD0587 ACIAD0588 secF secD TRUE 0.998 9.000 0.171 0.002 Y NA
 588067 588068 ACIAD0588 ACIAD0589 secD   TRUE 0.843 55.000 0.031 NA Y NA
 588068 588069 ACIAD0589 ACIAD0590   tgt TRUE 0.482 103.000 0.325 NA N NA
 588069 588070 ACIAD0590 ACIAD0591 tgt queA TRUE 0.560 319.000 0.360 0.001 Y NA
 588072 588073 ACIADtRNALeu_17 ACIAD0593     FALSE 0.006 593.000 0.000 NA   NA
 588073 588074 ACIAD0593 ACIAD0595     FALSE 0.014 252.000 0.000 NA   NA
 588074 588075 ACIAD0595 ACIAD0596   glnE TRUE 0.889 38.000 0.005 1.000 Y NA
 588075 588076 ACIAD0596 ACIAD0597 glnE ilvE TRUE 0.932 18.000 0.078 1.000 N NA
 588076 588077 ACIAD0597 ACIAD0598 ilvE   TRUE 0.519 47.000 0.015 NA N NA
 588077 588078 ACIAD0598 ACIAD0599     TRUE 0.981 5.000 0.154 NA   NA
 588078 588079 ACIAD0599 ACIAD0600     TRUE 0.989 -3.000 0.400 NA   NA
 588079 588080 ACIAD0600 ACIAD0601     TRUE 0.932 -3.000 0.014 NA N NA
 588080 588081 ACIAD0601 ACIAD0602     TRUE 0.990 6.000 0.014 NA Y NA
 588083 588084 ACIAD0604 ACIAD0605     FALSE 0.119 90.000 0.000 NA   NA
 588084 588085 ACIAD0605 ACIAD0606     TRUE 0.849 -6.000 0.000 NA   NA
 588086 588087 ACIAD0607 ACIAD0608     FALSE 0.429 38.000 0.000 NA   NA
 588087 588088 ACIAD0608 ACIAD0609   aspS FALSE 0.057 149.000 0.003 NA   NA
 588088 588089 ACIAD0609 ACIAD0610 aspS   FALSE 0.185 90.000 0.003 NA   NA
 588090 588091 ACIAD0611 ACIAD0612     FALSE 0.298 210.000 0.000 0.012 Y NA
 588091 588092 ACIAD0612 ACIAD0613     FALSE 0.047 128.000 0.000 1.000 N NA
 588093 588094 ACIAD0614 ACIAD0615     TRUE 0.889 8.000 0.000 NA   NA
 588095 588096 ACIAD0616 ACIAD0618     FALSE 0.053 125.000 0.000 NA   NA
 588096 588097 ACIAD0618 ACIAD0620     FALSE 0.016 232.000 0.000 NA   NA
 588100 588101 ACIAD0623 ACIAD0624 acdA acdB TRUE 0.770 163.000 0.429 0.011 Y NA
 588101 588102 ACIAD0624 ACIAD0625 acdB   FALSE 0.017 224.000 0.000 NA   NA
 588103 588104 ACIAD0626 ACIAD0627 baeS baeR TRUE 0.993 4.000 0.043 1.000 Y NA
 588105 588106 ACIAD0628 ACIAD0629     FALSE 0.075 110.000 0.000 NA   NA
 588106 588107 ACIAD0629 ACIAD0630     TRUE 0.452 57.000 0.008 NA   NA
 588109 588110 ACIAD0632 ACIAD0633     TRUE 0.610 40.000 0.005 1.000   NA
 588110 588111 ACIAD0633 ACIAD0634   btuB FALSE 0.155 110.000 0.005 1.000   NA
 588112 588113 ACIAD0635 ACIAD0636 trpF trpB TRUE 0.999 2.000 0.375 0.002 Y NA
 588113 588114 ACIAD0636 ACIAD0638 trpB   FALSE 0.351 70.000 0.008 NA   NA
 588114 588115 ACIAD0638 ACIAD0639     TRUE 0.683 44.000 0.058 NA   NA
 588117 588118 ACIAD0641 ACIAD0642   trpA FALSE 0.007 427.000 0.000 1.000 N NA
 588118 588119 ACIAD0642 ACIAD0643 trpA accD TRUE 0.982 -3.000 0.232 1.000 N NA
 588119 588120 ACIAD0643 ACIAD0644 accD folC TRUE 0.988 -3.000 0.383 1.000 N NA
 588120 588121 ACIAD0644 ACIAD0645 folC   TRUE 0.937 -3.000 0.009 NA   NA
 588122 588123 ACIAD0646 ACIAD0647     FALSE 0.055 135.000 0.000 1.000   NA
 588124 588125 ACIAD0648 ACIAD0649 secA   FALSE 0.071 155.000 0.011 NA   NA
 588125 588126 ACIAD0649 ACIAD0650   argJ FALSE 0.036 146.000 0.000 NA   NA
 588126 588127 ACIAD0650 ACIAD0651 argJ nadA FALSE 0.068 138.000 0.004 1.000 N NA
 588127 588128 ACIAD0651 ACIADtRNAPro_18 nadA   FALSE 0.047 131.000 0.000 NA   NA
 588128 588129 ACIADtRNAPro_18 ACIADtRNAArg_19     FALSE 0.257 61.000 0.000 NA   NA
 588129 588130 ACIADtRNAArg_19 ACIADtRNAHis_20     FALSE 0.416 39.000 0.000 NA   NA
 588130 588131 ACIADtRNAHis_20 ACIADtRNAPro_21     TRUE 0.897 5.000 0.000 NA   NA
 588132 588133 ACIAD0653 ACIAD0654     TRUE 0.761 18.000 0.000 1.000 N NA
 588133 588134 ACIAD0654 ACIAD0655     TRUE 0.893 7.000 0.000 NA   NA
 588135 588136 ACIADrRNA16S_7 ACIADtRNAIle_22     FALSE 0.248 62.000 0.000 NA   NA
 588136 588137 ACIADtRNAIle_22 ACIADtRNAAla_23     TRUE 0.447 37.000 0.000 NA   NA
 588137 588138 ACIADtRNAAla_23 ACIADrRNA23S_8     FALSE 0.007 434.000 0.000 NA   NA
 588138 588139 ACIADrRNA23S_8 ACIADrRNA5S_9     FALSE 0.022 187.000 0.000 NA   NA
 588139 588140 ACIADrRNA5S_9 ACIAD0657   rpoN FALSE 0.015 241.000 0.000 NA   NA
 588140 588141 ACIAD0657 ACIAD0658 rpoN   FALSE 0.251 154.000 0.333 NA N NA
 588141 588142 ACIAD0658 ACIAD0659     FALSE 0.331 78.000 0.030 NA N NA
 588142 588143 ACIAD0659 ACIAD0660   murA TRUE 0.985 7.000 0.258 NA N NA
 588143 588144 ACIAD0660 ACIAD0661 murA hisG TRUE 0.974 -3.000 0.123 1.000 N NA
 588144 588145 ACIAD0661 ACIAD0663 hisG hisD TRUE 0.500 284.000 0.254 0.004 Y NA
 588145 588146 ACIAD0663 ACIAD0664 hisD hisC TRUE 0.903 80.000 0.087 0.004 Y NA
 588148 588149 ACIAD0666 ACIAD0667     FALSE 0.011 313.000 0.000 NA   NA
 588149 588150 ACIAD0667 ACIAD0668     TRUE 0.984 22.000 0.357 0.082   NA
 588150 588151 ACIAD0668 ACIAD0669     TRUE 0.989 15.000 0.571 1.000   NA
 588151 588153 ACIAD0669 ACIAD0671     FALSE 0.092 276.000 0.231 NA   NA
 588153 588154 ACIAD0671 ACIAD0672     TRUE 0.988 19.000 0.800 NA   NA
 588156 588157 ACIAD0674 ACIAD0675     TRUE 0.890 26.000 0.078 1.000   NA
 588157 588158 ACIAD0675 ACIAD0677     FALSE 0.152 107.000 0.003 1.000   NA
 588158 588159 ACIAD0677 ACIAD0678     TRUE 0.902 13.000 0.003 1.000 N NA
 588159 588160 ACIAD0678 ACIAD0679     TRUE 0.929 -6.000 0.013 NA   NA
 588160 588161 ACIAD0679 ACIAD0681     FALSE 0.113 129.000 0.017 NA   NA
 588161 588162 ACIAD0681 ACIAD0682     TRUE 0.928 -22.000 0.029 1.000   NA
 588164 588165 ACIAD0684 ACIAD0685   rpe TRUE 0.799 -18.000 0.000 NA   NA
 588165 588166 ACIAD0685 ACIAD0686 rpe   FALSE 0.009 374.000 0.000 NA   NA
 588166 588167 ACIAD0686 ACIAD0687   pcoA TRUE 0.851 59.000 0.500 NA   NA
 588167 588168 ACIAD0687 ACIAD0688 pcoA pcoB TRUE 0.968 -13.000 0.000 0.002 N NA
 588168 588169 ACIAD0688 ACIAD0689 pcoB   TRUE 0.939 25.000 0.000 1.000 Y NA
 588169 588170 ACIAD0689 ACIAD0691   sugE FALSE 0.263 137.000 0.000 1.000 Y NA
 588170 588171 ACIAD0691 ACIAD0692 sugE ogt TRUE 0.973 4.000 0.077 1.000 N NA
 588172 588173 ACIAD0693 ACIAD0694     FALSE 0.293 132.000 0.250 NA   NA
 588173 588174 ACIAD0694 ACIAD0695     FALSE 0.403 116.000 0.333 NA N NA
 588176 588177 ACIAD0700 ACIAD0701 lysP rsmC TRUE 0.887 19.000 0.021 1.000 N NA
 588177 588178 ACIAD0701 ACIAD0702 rsmC   FALSE 0.414 64.000 0.013 1.000 N NA
 588179 588180 ACIAD0703 ACIAD0704 typA mscL FALSE 0.012 277.000 0.000 1.000 N NA
 588180 588181 ACIAD0704 ACIAD0705 mscL   FALSE 0.059 156.000 0.005 NA   NA
 588182 588183 ACIAD0706 ACIAD0707 ppiC mutM TRUE 0.665 36.000 0.006 1.000   NA
 588184 588185 ACIAD0708 ACIAD0709     TRUE 0.895 20.000 0.040 1.000 N NA
 588185 588186 ACIAD0709 ACIAD0710     TRUE 0.499 66.000 0.027 1.000   NA
 588187 588188 ACIAD0711 ACIAD0713     FALSE 0.073 328.000 0.200 1.000   NA
 588188 588189 ACIAD0713 ACIAD0714     FALSE 0.020 236.000 0.000 1.000   NA
 588190 588191 ACIAD0715 ACIAD0716 rluA   FALSE 0.191 127.000 0.087 NA   NA
 588191 588192 ACIAD0716 ACIAD0717     FALSE 0.043 135.000 0.000 NA   NA
 588192 588193 ACIAD0717 ACIAD0718     FALSE 0.167 77.000 0.000 NA   NA
 588193 588194 ACIAD0718 ACIAD0719     FALSE 0.226 66.000 0.000 NA   NA
 588194 588195 ACIAD0719 ACIAD0720     FALSE 0.331 48.000 0.000 1.000 N NA
 588195 588196 ACIAD0720 ACIAD0721     FALSE 0.043 136.000 0.000 NA   NA
 588197 588198 ACIAD0722 ACIAD0724 nrdB nrdA TRUE 0.633 329.000 0.564 0.001 Y NA
 588199 588200 ACIAD0726 ACIAD0727 rstA rstB TRUE 0.940 47.000 0.229 1.000 Y NA
 588202 588203 ACIAD0730 ACIAD0731 nuoA nuoB TRUE 0.999 7.000 0.377 0.003 Y NA
 588203 588204 ACIAD0731 ACIAD0733 nuoB nuoCD TRUE 0.972 82.000 0.691 0.003 Y NA
 588204 588205 ACIAD0733 ACIAD0734 nuoCD nuoE TRUE 0.999 10.000 0.407 0.006 Y NA
 588205 588206 ACIAD0734 ACIAD0735 nuoE nuoF TRUE 0.998 -3.000 0.186 0.006 Y NA
 588206 588207 ACIAD0735 ACIAD0736 nuoF nuoG TRUE 0.998 12.000 0.180 0.006 Y NA
 588207 588208 ACIAD0736 ACIAD0737 nuoG nuoH TRUE 0.998 19.000 0.664 0.006 Y NA
 588208 588209 ACIAD0737 ACIAD0738 nuoH nuoI TRUE 0.997 19.000 0.423 0.006 Y NA
 588209 588210 ACIAD0738 ACIAD0739 nuoI nuoJ TRUE 0.999 -3.000 0.428 0.006 Y NA
 588210 588211 ACIAD0739 ACIAD0740 nuoJ nuoK TRUE 0.999 0.000 0.269 0.003 Y NA
 588211 588212 ACIAD0740 ACIAD0741 nuoK nuoL TRUE 0.998 -3.000 0.211 0.006 Y NA
 588212 588213 ACIAD0741 ACIAD0742 nuoL nuoM TRUE 0.999 2.000 0.713 0.002 Y NA
 588213 588214 ACIAD0742 ACIAD0743 nuoM nuoN TRUE 0.998 16.000 0.437 0.002 Y NA
 588214 588215 ACIAD0743 ACIAD0744 nuoN upp FALSE 0.157 98.000 0.004 1.000 N NA
 588215 588216 ACIAD0744 ACIAD0745 upp   FALSE 0.022 185.000 0.000 1.000 N NA
 588220 588221 ACIAD0749 ACIAD0750     FALSE 0.016 229.000 0.000 NA   NA
 588222 588223 ACIAD0752 ACIAD0753     FALSE 0.386 71.000 0.009 1.000   NA
 588223 588224 ACIAD0753 ACIAD0754     TRUE 0.992 10.000 0.000 0.081 Y NA
 588224 588225 ACIAD0754 ACIAD0755     FALSE 0.141 82.000 0.000 1.000 N NA
 588225 588226 ACIAD0755 ACIAD0756     TRUE 0.988 16.000 0.578 1.000   NA
 588226 588227 ACIAD0756 ACIAD0757     TRUE 0.982 -7.000 0.276 1.000   NA
 588228 588229 ACIAD0758 ACIAD0759     FALSE 0.358 44.000 0.000 1.000 N NA
 588229 588230 ACIAD0759 ACIAD0760     FALSE 0.207 113.000 0.052 NA   NA
 588231 588232 ACIAD0761 ACIAD0762     FALSE 0.166 182.000 0.000 1.000 Y NA
 588233 588234 ACIAD0764 ACIAD0765     TRUE 0.988 -7.000 0.500 NA   NA
 588235 588236 ACIAD0766 ACIAD0767     FALSE 0.050 127.000 0.000 NA   NA
 588236 588237 ACIAD0767 ACIAD0768   metG FALSE 0.212 69.000 0.000 NA   NA
 588237 588238 ACIAD0768 ACIAD0769 metG tsx FALSE 0.023 182.000 0.000 1.000 N NA
 588239 588240 ACIAD0770 ACIAD0772     FALSE 0.121 121.000 0.011 NA   NA
 588240 588241 ACIAD0772 ACIAD0773     FALSE 0.056 175.000 0.011 1.000 N NA
 588243 588244 ACIAD0775 ACIAD0776   dcd FALSE 0.192 98.000 0.010 1.000 N NA
 588244 588245 ACIAD0776 ACIAD0777 dcd   FALSE 0.017 223.000 0.000 NA   NA
 588245 588246 ACIAD0777 ACIAD0778     TRUE 0.992 12.000 0.600 NA   NA
 588246 588247 ACIAD0778 ACIAD0779     TRUE 0.993 14.000 0.800 NA   NA
 588247 588248 ACIAD0779 ACIAD0780     TRUE 0.800 16.000 0.000 NA   NA
 588248 588249 ACIAD0780 ACIAD0781     FALSE 0.035 148.000 0.000 NA   NA
 588250 588251 ACIAD0782 ACIAD0783 proS nolG FALSE 0.127 103.000 0.005 NA N NA
 588251 588252 ACIAD0783 ACIAD0784 nolG nolF TRUE 0.904 24.000 0.118 NA N NA
 588252 588253 ACIAD0784 ACIAD0785 nolF   FALSE 0.280 57.000 0.000 NA   NA
 588254 588255 ACIAD0786 ACIAD0787 pilG pilH TRUE 0.994 24.000 0.296 0.010 Y NA
 588255 588256 ACIAD0787 ACIAD0788 pilH pilI TRUE 0.996 4.000 0.266 1.000 Y NA
 588256 588257 ACIAD0788 ACIAD0789 pilI pilJ TRUE 0.944 43.000 0.795 NA   NA
 588257 588258 ACIAD0789 ACIAD0790 pilJ chpA TRUE 0.731 85.000 0.554 NA   NA
 588259 588260 ACIAD0791 ACIAD0792 dapE ecnB FALSE 0.136 119.000 0.007 1.000   NA
 588260 588261 ACIAD0792 ACIAD0793 ecnB   FALSE 0.108 144.000 0.034 NA   NA
 588262 588263 ACIAD0794 ACIAD0795     TRUE 0.949 -7.000 0.050 NA   NA
 588263 588264 ACIAD0795 ACIADtRNAVal_24     FALSE 0.013 257.000 0.000 NA   NA
 588264 588265 ACIADtRNAVal_24 ACIADtRNAAsp_25     TRUE 0.673 24.000 0.000 NA   NA
 588265 588266 ACIADtRNAAsp_25 ACIADtRNAAsp_26     FALSE 0.340 48.000 0.000 NA   NA
 588266 588267 ACIADtRNAAsp_26 ACIADtRNAVal_27     TRUE 0.686 23.000 0.000 NA   NA
 588267 588268 ACIADtRNAVal_27 ACIADtRNAAsp_28     TRUE 0.462 36.000 0.000 NA   NA
 588268 588269 ACIADtRNAAsp_28 ACIADtRNAVal_29     FALSE 0.098 98.000 0.000 NA   NA
 588269 588270 ACIADtRNAVal_29 ACIAD0797     FALSE 0.135 85.000 0.000 NA   NA
 588271 588272 ACIAD0798 ACIAD0799     FALSE 0.051 256.000 0.068 NA   NA
 588272 588273 ACIAD0799 ACIAD0800     FALSE 0.114 157.000 0.068 NA   NA
 588273 588274 ACIAD0800 ACIAD0801     FALSE 0.287 93.000 0.037 NA   NA
 588277 588278 ACIAD0804 ACIAD0805 gltS   FALSE 0.364 115.000 0.000 1.000 Y NA
 588278 588279 ACIAD0805 ACIAD0806     FALSE 0.165 140.000 0.080 1.000   NA
 588280 588281 ACIAD0807 ACIAD0808     FALSE 0.038 143.000 0.000 NA   NA
 588283 588284 ACIAD0810 ACIAD0811     FALSE 0.037 144.000 0.000 NA   NA
 588284 588285 ACIAD0811 ACIAD0812     TRUE 0.999 -3.000 0.571 0.001 Y NA
 588288 588289 ACIAD0815 ACIAD0816     FALSE 0.429 38.000 0.000 NA   NA
 588289 588290 ACIAD0816 ACIAD0817     FALSE 0.398 41.000 0.000 NA   NA
 588290 588291 ACIAD0817 ACIAD0818     TRUE 0.474 35.000 0.000 NA   NA
 588291 588292 ACIAD0818 ACIAD0819     FALSE 0.060 119.000 0.000 NA   NA
 588292 588293 ACIAD0819 ACIAD0820     FALSE 0.011 306.000 0.000 NA   NA
 588293 588294 ACIAD0820 ACIAD0821     FALSE 0.158 79.000 0.000 NA   NA
 588295 588296 ACIAD0822 ACIAD0823 gatB gatA TRUE 0.999 0.000 0.492 0.001 Y NA
 588296 588297 ACIAD0823 ACIAD0824 gatA gatC TRUE 0.989 53.000 0.643 0.001 Y NA
 588298 588299 ACIAD0825 ACIAD0826 mreB mreC TRUE 0.986 19.000 0.689 1.000 N NA
 588299 588300 ACIAD0826 ACIAD0828 mreC mreD TRUE 0.993 35.000 0.550 0.003 Y NA
 588300 588301 ACIAD0828 ACIAD0829 mreD   TRUE 0.983 3.000 0.206 NA N NA
 588301 588302 ACIAD0829 ACIAD0830   cafA TRUE 0.943 28.000 0.417 NA N NA
 588302 588303 ACIAD0830 ACIAD0831 cafA   FALSE 0.085 137.000 0.008 NA   NA
 588304 588305 ACIAD0832 ACIAD0833 wax-dgaT cysH FALSE 0.058 172.000 0.005 1.000   NA
 588307 588308 ACIAD0835 ACIAD0836     FALSE 0.267 59.000 0.000 NA   NA
 588308 588309 ACIAD0836 ACIAD0837     FALSE 0.023 183.000 0.000 NA   NA
 588309 588310 ACIAD0837 ACIAD0838     FALSE 0.081 154.000 0.010 1.000   NA
 588312 588313 ACIAD0840 ACIAD0841     TRUE 0.980 7.000 0.147 1.000 N NA
 588314 588315 ACIAD0842 ACIAD0843     FALSE 0.207 70.000 0.000 NA   NA
 588315 588316 ACIAD0843 ACIAD0844     TRUE 0.874 -3.000 0.000 NA   NA
 588316 588317 ACIAD0844 ACIAD0846     FALSE 0.172 98.000 0.006 1.000 N NA
 588317 588318 ACIAD0846 ACIAD0847     TRUE 0.998 2.000 0.115 0.012 Y NA
 588318 588319 ACIAD0847 ACIAD0848   ligA TRUE 0.486 78.000 0.106 1.000 N NA
 588321 588322 ACIAD0850 ACIAD0851     TRUE 0.898 4.000 0.000 NA   NA
 588322 588323 ACIAD0851 ACIAD0852   bfrA FALSE 0.017 256.000 0.000 1.000   NA
 588323 588324 ACIAD0852 ACIAD0853 bfrA   FALSE 0.017 228.000 0.000 NA   NA
 588326 588327 ACIAD0855 ACIAD0856   bioA FALSE 0.424 58.000 0.006 NA   NA
 588327 588328 ACIAD0856 ACIAD0857 bioA bioF TRUE 0.994 -13.000 0.056 0.014 Y NA
 588328 588329 ACIAD0857 ACIAD0858 bioF   TRUE 0.930 -9.000 0.014 1.000   NA
 588329 588330 ACIAD0858 ACIAD0859   bioD TRUE 0.992 -3.000 0.081 0.002   NA
 588331 588332 ACIAD0860 ACIAD0861     FALSE 0.043 136.000 0.000 NA   NA
 588332 588333 ACIAD0861 ACIAD0862     TRUE 0.688 42.000 0.074 NA N NA
 588333 588334 ACIAD0862 ACIAD0863     TRUE 0.992 -3.000 0.570 NA   NA
 588336 588337 ACIAD0865 ACIAD0866     FALSE 0.255 84.000 0.008 NA   NA
 588338 588339 ACIAD0868 ACIAD0869   rpmF TRUE 0.824 72.000 0.599 NA   NA
 588339 588340 ACIAD0869 ACIAD0870 rpmF fabD FALSE 0.074 154.000 0.014 1.000 N NA
 588340 588341 ACIAD0870 ACIAD0871 fabD fabG TRUE 0.999 -3.000 0.432 0.004 Y NA
 588341 588342 ACIAD0871 ACIAD0872 fabG acpP TRUE 0.997 -22.000 0.321 0.004 Y NA
 588342 588343 ACIAD0872 ACIAD0873 acpP   FALSE 0.045 189.000 0.004 1.000   NA
 588344 588345 ACIAD0874 ACIAD0875   thiD FALSE 0.217 75.000 0.000 1.000   NA
 588346 588347 ACIAD0876 ACIAD0877     FALSE 0.039 161.000 0.000 1.000   NA
 588348 588349 ACIAD0878 ACIAD0879   fabB FALSE 0.023 319.000 0.011 NA   NA
 588350 588351 ACIAD0880 ACIAD0881   rpsL FALSE 0.038 185.000 0.003 NA   NA
 588351 588352 ACIAD0881 ACIAD0883 rpsL rpsG TRUE 0.849 161.000 0.620 0.003 Y NA
 588352 588353 ACIAD0883 ACIAD0884 rpsG fusA TRUE 0.611 178.000 0.579 1.000 Y NA
 588353 588354 ACIAD0884 ACIAD0885 fusA tufA TRUE 0.942 92.000 0.400 0.001 Y NA
 588354 588355 ACIAD0885 ACIAD0886 tufA   FALSE 0.017 257.000 0.000 1.000   NA
 588355 588356 ACIAD0886 ACIAD0887   rimI FALSE 0.043 153.000 0.000 1.000   NA
 588357 588358 ACIAD0888 ACIAD0889   aat TRUE 0.984 25.000 0.285 1.000 Y NA
 588358 588359 ACIAD0889 ACIAD0890 aat trxB TRUE 0.785 73.000 0.046 1.000 Y NA
 588361 588362 ACIAD0892 ACIAD0893   minE FALSE 0.030 246.000 0.008 NA   NA
 588362 588363 ACIAD0893 ACIAD0894 minE minD TRUE 0.998 3.000 0.618 NA Y NA
 588363 588364 ACIAD0894 ACIAD0895 minD minC TRUE 0.967 43.000 0.466 1.000 Y NA
 588364 588365 ACIAD0895 ACIAD0896 minC   FALSE 0.113 124.000 0.011 NA   NA
 588365 588366 ACIAD0896 ACIAD0897     FALSE 0.121 212.000 0.211 NA   NA
 588367 588368 ACIAD0898 ACIAD0900   rep FALSE 0.108 126.000 0.011 1.000 N NA
 588368 588369 ACIAD0900 ACIAD0901 rep dut TRUE 0.772 25.000 0.005 1.000 N NA
 588369 588370 ACIAD0901 ACIAD0902 dut algC FALSE 0.066 192.000 0.039 1.000 N NA
 588370 588371 ACIAD0902 ACIAD0903 algC argB TRUE 0.957 11.000 0.044 1.000 N NA
 588371 588372 ACIAD0903 ACIAD0904 argB   FALSE 0.282 76.000 0.005 NA   NA
 588372 588373 ACIAD0904 ACIAD0905     FALSE 0.227 99.000 0.021 NA   NA
 588373 588374 ACIAD0905 ACIAD0907     FALSE 0.102 96.000 0.000 NA   NA
 588374 588375 ACIAD0907 ACIAD0908     TRUE 0.972 -3.000 0.108 NA   NA
 588378 588379 ACIAD0911 ACIAD0912 pilU pilT TRUE 0.988 37.000 0.436 0.016 Y NA
 588380 588381 ACIAD0913 ACIAD0914     FALSE 0.042 137.000 0.000 NA   NA
 588382 588383 ACIAD0915 ACIAD0916   sbcC FALSE 0.013 211.000 0.000 NA N NA
 588383 588384 ACIAD0916 ACIAD0917 sbcC sbcD TRUE 0.999 10.000 0.669 0.002 Y NA
 588387 588388 ACIAD0920 ACIAD0921     TRUE 0.661 67.000 0.190 NA   NA
 588389 588390 ACIAD0922 ACIAD0923   hemB TRUE 0.800 25.000 0.010 1.000 N NA
 588393 588394 ACIAD0926 ACIAD0927 emrA emrB TRUE 0.995 7.000 0.750 1.000 N NA
 588394 588395 ACIAD0927 ACIAD0929 emrB ggt FALSE 0.019 204.000 0.000 1.000 N NA
 588399 588400 ACIAD0932 ACIAD0933     TRUE 0.510 73.000 0.087 NA   NA
 588400 588401 ACIAD0933 ACIAD0934     TRUE 0.990 -49.000 0.914 NA   NA
 588401 588402 ACIAD0934 ACIAD0935     TRUE 0.959 -3.000 0.043 NA   NA
 588402 588403 ACIAD0935 ACIAD0936     TRUE 0.965 -6.000 0.106 NA   NA
 588405 588406 ACIAD0938 ACIAD0939     FALSE 0.006 923.000 0.000 NA   NA
 588406 588407 ACIAD0939 ACIAD0940     FALSE 0.131 86.000 0.000 NA   NA
 588407 588408 ACIAD0940 ACIAD0941     TRUE 0.898 2.000 0.000 NA   NA
 588408 588409 ACIAD0941 ACIAD0942     FALSE 0.009 370.000 0.000 NA   NA
 588409 588410 ACIAD0942 ACIAD0943     FALSE 0.177 75.000 0.000 NA   NA
 588410 588411 ACIAD0943 ACIAD0944     TRUE 0.885 9.000 0.000 NA   NA
 588411 588412 ACIAD0944 ACIAD0945     TRUE 0.874 -3.000 0.000 NA   NA
 588412 588413 ACIAD0945 ACIAD0946     FALSE 0.257 61.000 0.000 NA   NA
 588413 588414 ACIAD0946 ACIAD0947     TRUE 0.874 -3.000 0.000 NA   NA
 588414 588415 ACIAD0947 ACIAD0948     FALSE 0.131 86.000 0.000 NA   NA
 588415 588416 ACIAD0948 ACIAD0949     TRUE 0.895 6.000 0.000 NA   NA
 588416 588417 ACIAD0949 ACIAD0951     FALSE 0.041 138.000 0.000 NA   NA
 588418 588419 ACIAD0952 ACIAD0953     TRUE 0.994 9.000 0.000 0.050 Y NA
 588421 588422 ACIAD0956 ACIAD0957     TRUE 0.789 -22.000 0.000 NA   NA
 588422 588423 ACIAD0957 ACIAD0958     TRUE 0.994 9.000 0.000 0.050 Y NA
 588423 588424 ACIAD0958 ACIAD0959     FALSE 0.207 70.000 0.000 NA   NA
 588426 588427 ACIAD0961 ACIAD0962     FALSE 0.045 133.000 0.000 NA   NA
 588427 588428 ACIAD0962 ACIAD0963     FALSE 0.210 111.000 0.044 1.000 N NA
 588428 588429 ACIAD0963 ACIAD0964     TRUE 0.937 17.000 0.078 1.000 N NA
 588432 588433 ACIAD0967 ACIAD0968 iciA   TRUE 0.730 88.000 0.000 0.059 Y NA
 588434 588435 ACIAD0969 ACIAD0970     TRUE 0.994 4.000 0.075 1.000 Y NA
 588435 588436 ACIAD0970 ACIAD0971     TRUE 0.997 4.000 0.400 1.000 Y NA
 588439 588440 ACIAD0975 ACIAD0976     FALSE 0.009 370.000 0.000 NA   NA
 588440 588441 ACIAD0976 ACIAD0977     FALSE 0.154 80.000 0.000 NA   NA
 588441 588442 ACIAD0977 ACIAD0978   vanR FALSE 0.028 167.000 0.000 NA   NA
 588443 588444 ACIAD0979 ACIAD0980 vanB vanA TRUE 0.993 3.000 0.085 0.001 N NA
 588444 588445 ACIAD0980 ACIAD0981 vanA   FALSE 0.006 577.000 0.000 NA   NA
 588446 588447 ACIAD0982 ACIAD0983 vanK   TRUE 0.943 32.000 0.154 0.071   NA
 588448 588449 ACIAD0984 ACIAD0985     FALSE 0.013 260.000 0.000 1.000 N NA
 588450 588451 ACIAD0986 ACIAD0987     TRUE 0.984 19.000 0.645 NA   NA
 588451 588452 ACIAD0987 ACIAD0988     TRUE 0.993 9.000 0.588 NA   NA
 588452 588453 ACIAD0988 ACIAD0989     TRUE 0.990 6.000 0.351 1.000 N NA
 588453 588454 ACIAD0989 ACIAD0990     TRUE 0.955 11.000 0.035 NA   NA
 588454 588455 ACIAD0990 ACIAD0991     TRUE 0.976 26.000 0.700 NA   NA
 588455 588456 ACIAD0991 ACIAD0992     TRUE 0.769 67.000 0.320 1.000   NA
 588456 588457 ACIAD0992 ACIAD0993     TRUE 0.849 31.000 0.109 1.000 N NA
 588457 588458 ACIAD0993 ACIAD0994     TRUE 0.569 62.000 0.047 1.000   NA
 588458 588459 ACIAD0994 ACIAD0995     TRUE 0.972 4.000 0.045 1.000   NA
 588459 588460 ACIAD0995 ACIAD0997     TRUE 0.965 12.000 0.067 1.000   NA
 588460 588461 ACIAD0997 ACIAD0998     TRUE 0.978 14.000 0.235 1.000   NA
 588461 588462 ACIAD0998 ACIAD0999     TRUE 0.628 63.000 0.123 1.000 N NA
 588462 588463 ACIAD0999 ACIAD1000     FALSE 0.014 250.000 0.000 NA   NA
 588463 588464 ACIAD1000 ACIAD1001     FALSE 0.037 144.000 0.000 NA   NA
 588465 588466 ACIAD1002 ACIAD1003     FALSE 0.032 179.000 0.000 1.000   NA
 588468 588469 ACIAD1005 ACIAD1006     FALSE 0.237 64.000 0.000 NA   NA
 588469 588470 ACIAD1006 ACIAD1007   mqo FALSE 0.315 60.000 0.000 1.000   NA
 588470 588471 ACIAD1007 ACIAD1008 mqo betA FALSE 0.009 500.000 0.000 1.000   NA
 588471 588472 ACIAD1008 ACIAD1009 betA betB TRUE 0.744 89.000 0.634 1.000 N NA
 588472 588473 ACIAD1009 ACIAD1010 betB betI TRUE 0.987 -7.000 0.459 1.000 N NA
 588474 588475 ACIAD1011 ACIAD1012   betT TRUE 0.660 166.000 0.250 0.058 Y NA
 588475 588476 ACIAD1012 ACIAD1013 betT   TRUE 0.966 13.000 0.143 NA N NA
 588477 588478 ACIAD1014 ACIAD1015   lipA FALSE 0.023 215.000 0.000 1.000   NA
 588479 588480 ACIAD1017 ACIAD1018 acoA acoB TRUE 0.999 16.000 0.804 0.001 Y NA
 588480 588481 ACIAD1018 ACIAD1019 acoB acoC TRUE 0.996 2.000 0.033 0.078 Y NA
 588481 588482 ACIAD1019 ACIAD1020 acoC acoD TRUE 0.995 5.000 0.121 1.000 Y NA
 588482 588483 ACIAD1020 ACIAD1021 acoD   TRUE 0.761 18.000 0.000 1.000 N NA
 588483 588484 ACIAD1021 ACIAD1022   budC TRUE 0.989 10.000 0.105 0.047 N NA
 588484 588485 ACIAD1022 ACIAD1023 budC   FALSE 0.079 289.000 0.000 NA Y NA
 588489 588490 ACIAD1027 ACIAD1028   fbp TRUE 0.588 50.000 0.017 1.000   NA
 588490 588491 ACIAD1028 ACIAD1029 fbp   FALSE 0.011 378.000 0.000 1.000   NA
 588491 588492 ACIAD1029 ACIAD1030     TRUE 0.991 7.000 0.435 1.000 N NA
 588492 588493 ACIAD1030 ACIAD1031     TRUE 0.980 18.000 0.462 NA   NA
 588493 588494 ACIAD1031 ACIAD1032     FALSE 0.027 173.000 0.000 NA   NA
 588494 588495 ACIAD1032 ACIAD1033     FALSE 0.135 84.000 0.000 1.000 N NA
 588495 588496 ACIAD1033 ACIAD1034     TRUE 0.965 -3.000 0.070 NA   NA
 588496 588497 ACIAD1034 ACIAD1035     FALSE 0.267 59.000 0.000 NA   NA
 588498 588499 ACIAD1036 ACIAD1037     FALSE 0.082 106.000 0.000 NA   NA
 588500 588501 ACIAD1038 ACIAD1039   def2 TRUE 0.915 0.000 0.000 1.000   NA
 588501 588502 ACIAD1039 ACIAD1040 def2   FALSE 0.075 161.000 0.019 1.000 N NA
 588504 588505 ACIAD1042 ACIAD1044 fsr   FALSE 0.008 390.000 0.000 1.000 N NA
 588507 588508 ACIAD1046 ACIAD1047   pit FALSE 0.060 119.000 0.000 NA   NA
 588508 588509 ACIAD1047 ACIAD1048 pit dsdA FALSE 0.107 133.000 0.019 1.000 N NA
 588510 588511 ACIAD1049 ACIAD1051     FALSE 0.019 208.000 0.000 NA   NA
 588512 588513 ACIAD1052 ACIAD1053   pfeA FALSE 0.239 158.000 0.015 0.014   NA
 588513 588514 ACIAD1053 ACIAD1054 pfeA   FALSE 0.236 255.000 0.000 0.012 Y NA
 588518 588519 ACIAD1058 ACIAD1059     TRUE 0.997 -3.000 0.535 NA Y NA
 588521 588522 ACIAD1061 ACIAD1062 mtgA ppk FALSE 0.133 122.000 0.009 1.000   NA
 588523 588524 ACIAD1063 ACIAD1064 estR   TRUE 0.938 14.000 0.033 NA   NA
 588524 588525 ACIAD1064 ACIAD1065   rubB TRUE 0.636 56.000 0.083 NA   NA
 588525 588526 ACIAD1065 ACIAD1066 rubB rubA TRUE 0.659 85.000 0.083 0.063   NA
 588526 588527 ACIAD1066 ACIAD1068 rubA   FALSE 0.008 381.000 0.000 NA   NA
 588529 588530 ACIAD1070 ACIAD1071 sodM cobQ FALSE 0.024 179.000 0.000 1.000 N NA
 588531 588532 ACIAD1072 ACIAD1073 cysD cysN TRUE 0.962 53.000 0.574 0.001 N NA
 588534 588535 ACIAD1075 ACIAD1076     FALSE 0.008 406.000 0.000 NA   NA
 588535 588536 ACIAD1076 ACIAD1077     TRUE 0.915 16.000 0.020 NA   NA
 588536 588537 ACIAD1077 ACIAD1078     FALSE 0.040 139.000 0.000 NA   NA
 588537 588538 ACIAD1078 ACIAD1080     TRUE 0.895 6.000 0.000 NA   NA
 588539 588540 ACIAD1081 ACIAD1082     FALSE 0.176 123.000 0.034 1.000   NA
 588541 588542 ACIAD1083 ACIAD1084   aceA FALSE 0.008 405.000 0.000 NA   NA
 588543 588544 ACIAD1085 ACIAD1087     FALSE 0.041 138.000 0.000 NA   NA
 588545 588546 ACIAD1088 ACIAD1089 ureD ureA TRUE 0.836 109.000 0.664 0.003 N NA
 588546 588547 ACIAD1089 ACIAD1090 ureA ureB TRUE 0.998 23.000 0.595 0.001 Y NA
 588547 588548 ACIAD1090 ACIAD1091 ureB ureC TRUE 0.994 31.000 0.486 0.001 Y NA
 588548 588549 ACIAD1091 ACIAD1092 ureC   TRUE 0.755 15.000 0.000 NA N NA
 588549 588550 ACIAD1092 ACIAD1093   ureE TRUE 0.832 10.000 0.000 NA N NA
 588550 588551 ACIAD1093 ACIAD1094 ureE ureF TRUE 0.999 -10.000 0.560 0.003 Y NA
 588551 588552 ACIAD1094 ACIAD1095 ureF ureG TRUE 0.979 64.000 0.550 0.003 Y NA
 588552 588553 ACIAD1095 ACIAD1096 ureG ureJ TRUE 0.989 10.000 0.021 NA Y NA
 588553 588554 ACIAD1096 ACIAD1097 ureJ   FALSE 0.024 180.000 0.000 NA   NA
 588554 588555 ACIAD1097 ACIAD1099     FALSE 0.041 138.000 0.000 NA   NA
 588556 588557 ACIAD1100 ACIAD1101   pbpA TRUE 0.944 0.000 0.008 1.000 N NA
 588558 588559 ACIAD1102 ACIAD1103     TRUE 0.850 64.000 0.571 NA   NA
 588559 588560 ACIAD1103 ACIAD1105   adk FALSE 0.310 81.000 0.017 NA   NA
 588560 588561 ACIAD1105 ACIAD1106 adk   FALSE 0.313 75.000 0.008 NA   NA
 588562 588563 ACIAD1108 ACIAD1109 nth   TRUE 0.932 16.000 0.048 1.000 N NA
 588565 588566 ACIAD1111 ACIAD1112     FALSE 0.029 277.000 0.016 NA   NA
 588566 588567 ACIAD1112 ACIAD1113     FALSE 0.134 112.000 0.007 NA   NA
 588567 588568 ACIAD1113 ACIAD1114     FALSE 0.068 113.000 0.000 NA   NA
 588568 588569 ACIAD1114 ACIAD1115   lon FALSE 0.108 94.000 0.000 NA   NA
 588569 588570 ACIAD1115 ACIAD1116 lon   FALSE 0.136 146.000 0.000 0.080 N NA
 588570 588571 ACIAD1116 ACIAD1117     FALSE 0.028 164.000 0.000 1.000 N NA
 588571 588572 ACIAD1117 ACIAD1118     TRUE 0.980 7.000 0.119 1.000   NA
 588572 588573 ACIAD1118 ACIAD1119     TRUE 0.962 -16.000 0.167 NA   NA
 588573 588574 ACIAD1119 ACIAD1120     TRUE 0.962 -9.000 0.118 NA   NA
 588574 588575 ACIAD1120 ACIAD1121   lip1 FALSE 0.023 215.000 0.000 1.000   NA
 588577 588578 ACIAD1123 ACIAD1124     TRUE 0.929 -3.000 0.005 NA   NA
 588579 588580 ACIAD1125 ACIAD1126   pepP TRUE 0.797 62.000 0.329 1.000   NA
 588580 588581 ACIAD1126 ACIAD1127 pepP ubiH TRUE 0.954 26.000 0.396 1.000 N NA
 588581 588582 ACIAD1127 ACIAD1128 ubiH   TRUE 0.999 -3.000 0.474 0.001 Y NA
 588582 588583 ACIAD1128 ACIAD1129     FALSE 0.066 173.000 0.017 NA   NA
 588585 588586 ACIAD1131 ACIAD1132     TRUE 0.981 0.000 0.172 NA   NA
 588586 588587 ACIAD1132 ACIAD1133     FALSE 0.298 86.000 0.023 NA   NA
 588587 588588 ACIAD1133 ACIAD1134   aesT TRUE 0.920 -10.000 0.017 NA   NA
 588589 588590 ACIAD1135 ACIAD1136     TRUE 0.953 0.000 0.015 NA   NA
 588590 588591 ACIAD1136 ACIAD1137   rnhA-dnaQ FALSE 0.113 116.000 0.005 NA   NA
 588592 588593 ACIAD1138 ACIAD1139     TRUE 0.911 16.000 0.018 1.000 N NA
 588593 588594 ACIAD1139 ACIAD1140     TRUE 0.937 28.000 0.042 0.057   NA
 588594 588595 ACIAD1140 ACIAD1141     TRUE 0.997 0.000 0.500 0.057   NA
 588595 588596 ACIAD1141 ACIAD1142     TRUE 0.824 -25.000 0.000 1.000   NA
 588596 588597 ACIAD1142 ACIAD1143     FALSE 0.115 102.000 0.000 1.000   NA
 588598 588599 ACIADtRNAGlu_30 ACIADtRNAGlu_31     TRUE 0.628 26.000 0.000 NA   NA
 588599 588600 ACIADtRNAGlu_31 ACIAD1144     FALSE 0.054 124.000 0.000 NA   NA
 588600 588601 ACIAD1144 ACIAD1145     FALSE 0.066 114.000 0.000 NA   NA
 588601 588602 ACIAD1145 ACIAD1147     FALSE 0.049 128.000 0.000 NA   NA
 588602 588603 ACIAD1147 ACIADtRNAGlu_32     FALSE 0.033 154.000 0.000 NA   NA
 588603 588604 ACIADtRNAGlu_32 ACIADtRNAGlu_33     FALSE 0.011 290.000 0.000 NA   NA
 588604 588605 ACIADtRNAGlu_33 ACIAD1149   rnt TRUE 0.745 19.000 0.000 NA   NA
 588605 588606 ACIAD1149 ACIAD1150 rnt pyrC TRUE 0.941 -15.000 0.068 1.000 N NA
 588606 588607 ACIAD1150 ACIAD1151 pyrC argG FALSE 0.034 197.000 0.003 1.000 N NA
 588607 588608 ACIAD1151 ACIAD1152 argG   FALSE 0.020 201.000 0.000 1.000 N NA
 588609 588610 ACIAD1154 ACIAD1155   fadH FALSE 0.006 349.000 0.000 NA N NA
 588610 588611 ACIAD1155 ACIADtRNASer_34 fadH   FALSE 0.131 86.000 0.000 NA   NA
 588613 588614 ACIAD1157 ACIAD1158     TRUE 0.984 6.000 0.238 NA N NA
 588614 588615 ACIAD1158 ACIAD1159     TRUE 0.998 -3.000 0.741 NA Y NA
 588615 588616 ACIAD1159 ACIAD1160     TRUE 0.793 13.000 0.000 NA N NA
 588616 588617 ACIAD1160 ACIAD1161     FALSE 0.399 40.000 0.000 1.000 N NA
 588617 588618 ACIAD1161 ACIAD1162     TRUE 0.539 26.000 0.000 NA N NA
 588618 588619 ACIAD1162 ACIAD1163     TRUE 0.543 84.000 0.000 NA Y NA
 588619 588620 ACIAD1163 ACIAD1164     FALSE 0.006 593.000 0.000 NA   NA
 588620 588621 ACIAD1164 ACIAD1165     FALSE 0.083 276.000 0.208 NA   NA
 588621 588622 ACIAD1165 ACIAD1166     FALSE 0.015 295.000 0.000 1.000   NA
 588622 588623 ACIAD1166 ACIAD1167     FALSE 0.165 226.000 0.315 1.000   NA
 588623 588624 ACIAD1167 ACIAD1168   proY FALSE 0.090 163.000 0.022 1.000   NA
 588624 588625 ACIAD1168 ACIAD1169 proY   FALSE 0.048 143.000 0.000 1.000   NA
 588625 588626 ACIAD1169 ACIAD1170     FALSE 0.044 151.000 0.000 1.000   NA
 588626 588627 ACIAD1170 ACIAD1171     TRUE 0.941 42.000 0.748 NA   NA
 588628 588629 ACIAD1172 ACIAD1173     FALSE 0.322 51.000 0.000 NA   NA
 588630 588631 ACIAD1174 ACIAD1175   wecB TRUE 0.920 3.000 0.000 1.000   NA
 588632 588633 ACIAD1176 ACIAD1177     TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 588633 588634 ACIAD1177 ACIAD1178     TRUE 0.874 -3.000 0.000 NA   NA
 588634 588635 ACIAD1178 ACIAD1179     TRUE 0.925 -13.000 0.025 NA   NA
 588635 588636 ACIAD1179 ACIAD1180     TRUE 0.995 0.000 0.750 NA   NA
 588636 588637 ACIAD1180 ACIAD1182   phrB FALSE 0.067 140.000 0.004 NA   NA
 588637 588638 ACIAD1182 ACIAD1183 phrB slyD FALSE 0.014 248.000 0.000 1.000 N NA
 588638 588639 ACIAD1183 ACIAD1184 slyD   FALSE 0.013 258.000 0.000 1.000 N NA
 588640 588641 ACIAD1186 ACIAD1187   idh FALSE 0.020 243.000 0.000 1.000   NA
 588642 588643 ACIAD1188 ACIAD1189     FALSE 0.169 85.000 0.000 1.000   NA
 588644 588645 ACIAD1190 ACIAD1191 icd   FALSE 0.021 233.000 0.000 1.000   NA
 588645 588646 ACIAD1191 ACIAD1192     FALSE 0.136 127.000 0.017 1.000   NA
 588646 588647 ACIAD1192 ACIAD1193     FALSE 0.043 152.000 0.000 1.000   NA
 588647 588648 ACIAD1193 ACIAD1194     FALSE 0.092 111.000 0.000 1.000   NA
 588652 588653 ACIAD1198 ACIAD1199     FALSE 0.037 144.000 0.000 NA   NA
 588653 588654 ACIAD1199 ACIAD1200     FALSE 0.045 130.000 0.000 1.000 N NA
 588654 588655 ACIAD1200 ACIAD1201   hemL TRUE 0.968 30.000 0.173 1.000 Y NA
 588655 588656 ACIAD1201 ACIAD1202 hemL   FALSE 0.306 53.000 0.000 NA   NA
 588656 588657 ACIAD1202 ACIAD1203     FALSE 0.032 155.000 0.000 NA   NA
 588657 588658 ACIAD1203 ACIAD1204   hepA FALSE 0.150 118.000 0.021 1.000 N NA
 588659 588660 ACIAD1205 ACIAD1206 dps   FALSE 0.045 148.000 0.000 1.000   NA
 588661 588662 ACIAD1207 ACIAD1208     TRUE 0.989 15.000 0.615 1.000 N NA
 588664 588665 ACIAD1210 ACIAD1211 dat ddc TRUE 0.999 7.000 0.459 0.014 Y NA
 588665 588666 ACIAD1211 ACIAD1212 ddc   FALSE 0.011 290.000 0.000 1.000 N NA
 588666 588667 ACIAD1212 ACIAD1213   pstC TRUE 0.654 104.000 0.107 1.000 Y NA
 588667 588668 ACIAD1213 ACIAD1214 pstC pstA TRUE 0.999 -3.000 0.485 0.002 Y NA
 588668 588669 ACIAD1214 ACIAD1215 pstA pstB TRUE 0.999 12.000 0.402 0.002 Y NA
 588669 588670 ACIAD1215 ACIAD1216 pstB   FALSE 0.085 151.000 0.020 1.000 N NA
 588671 588672 ACIAD1217 ACIAD1219   purB FALSE 0.216 83.000 0.003 NA   NA
 588672 588673 ACIAD1219 ACIAD1220 purB   TRUE 0.648 56.000 0.093 NA   NA
 588673 588674 ACIAD1220 ACIAD1221   trmU TRUE 0.969 14.000 0.180 NA   NA
 588674 588675 ACIAD1221 ACIAD1222 trmU   TRUE 0.981 5.000 0.158 1.000 N NA
 588675 588676 ACIAD1222 ACIAD1223     FALSE 0.248 62.000 0.000 NA   NA
 588676 588677 ACIAD1223 ACIAD1224     FALSE 0.059 120.000 0.000 NA   NA
 588677 588678 ACIAD1224 ACIAD1225   dacC FALSE 0.251 92.000 0.011 1.000   NA
 588678 588679 ACIAD1225 ACIAD1226 dacC   TRUE 0.441 118.000 0.375 NA   NA
 588680 588681 ACIAD1227 ACIAD1229 surE nlpD FALSE 0.127 131.000 0.018 1.000   NA
 588681 588682 ACIAD1229 ACIAD1230 nlpD   FALSE 0.298 110.000 0.120 1.000 N NA
 588685 588686 ACIAD1233 ACIAD1234   ahpF FALSE 0.056 178.000 0.011 NA   NA
 588688 588689 ACIAD1236 ACIAD1237 mdmC   TRUE 0.642 43.000 0.028 NA   NA
 588689 588690 ACIAD1237 ACIAD1238     FALSE 0.019 209.000 0.000 NA   NA
 588690 588691 ACIAD1238 ACIAD1239     FALSE 0.006 575.000 0.000 NA   NA
 588694 588695 ACIAD1242 ACIAD1243     FALSE 0.008 401.000 0.000 NA   NA
 588695 588696 ACIAD1243 ACIAD1245   add TRUE 0.516 63.000 0.025 1.000   NA
 588698 588699 ACIAD1247 ACIAD1248   rnhB TRUE 0.868 17.000 0.004 NA   NA
 588700 588701 ACIAD1249 ACIAD1250     TRUE 0.989 15.000 0.000 0.049 Y NA
 588701 588702 ACIAD1250 ACIAD1251   csrA TRUE 0.464 35.000 0.000 1.000 N NA
 588702 588703 ACIAD1251 ACIAD1252 csrA lysC FALSE 0.059 246.000 0.079 1.000 N NA
 588703 588704 ACIAD1252 ACIAD1253 lysC alaS TRUE 0.524 66.000 0.065 1.000 N NA
 588705 588706 ACIAD1254 ACIAD1255   gap FALSE 0.125 88.000 0.000 NA   NA
 588706 588707 ACIAD1255 ACIAD1256 gap   FALSE 0.110 93.000 0.000 NA   NA
 588707 588708 ACIAD1256 ACIAD1257   hisZ TRUE 0.774 -31.000 0.000 NA   NA
 588708 588709 ACIAD1257 ACIAD1258 hisZ purA TRUE 0.639 66.000 0.161 1.000 N NA
 588709 588710 ACIAD1258 ACIAD1259 purA   FALSE 0.101 116.000 0.002 NA   NA
 588710 588711 ACIAD1259 ACIAD1260     FALSE 0.137 116.000 0.012 NA   NA
 588712 588713 ACIAD1261 ACIAD1262   vfr FALSE 0.060 161.000 0.008 1.000 N NA
 588714 588715 ACIAD1263 ACIAD1264     FALSE 0.158 106.000 0.009 1.000 N NA
 588715 588716 ACIAD1264 ACIAD1265   clpB FALSE 0.010 326.000 0.000 1.000 N NA
 588716 588717 ACIAD1265 ACIAD1266 clpB ilvD FALSE 0.014 248.000 0.000 1.000 N NA
 588717 588718 ACIAD1266 ACIAD1267 ilvD   FALSE 0.019 209.000 0.000 NA   NA
 588720 588721 ACIAD1269 ACIAD1270   pyrB FALSE 0.044 134.000 0.000 NA   NA
 588721 588722 ACIAD1270 ACIAD1271 pyrB pyrX TRUE 0.996 13.000 0.452 1.000 Y NA
 588722 588723 ACIAD1271 ACIAD1272 pyrX   FALSE 0.035 149.000 0.000 NA   NA
 588723 588724 ACIAD1272 ACIAD1273     FALSE 0.108 94.000 0.000 NA   NA
 588724 588725 ACIAD1273 ACIAD1274     TRUE 0.597 31.000 0.000 1.000   NA
 588725 588726 ACIAD1274 ACIAD1275     FALSE 0.115 91.000 0.000 NA   NA
 588726 588727 ACIAD1275 ACIAD1276     FALSE 0.007 501.000 0.000 NA   NA
 588727 588728 ACIAD1276 ACIAD1277     TRUE 0.900 -3.000 0.000 1.000   NA
 588728 588729 ACIAD1277 ACIAD1279     FALSE 0.328 58.000 0.000 1.000   NA
 588729 588730 ACIAD1279 ACIAD1280     TRUE 0.976 8.000 0.115 1.000 N NA
 588730 588731 ACIAD1280 ACIAD1281     TRUE 0.671 50.000 0.077 NA   NA
 588731 588732 ACIAD1281 ACIAD1282     TRUE 0.981 18.000 0.500 NA   NA
 588734 588735 ACIAD1284 ACIAD1286 astC astA TRUE 0.976 14.000 0.000 1.000 Y NA
 588735 588736 ACIAD1286 ACIAD1287 astA astD TRUE 0.977 3.000 0.103 1.000 N NA
 588736 588737 ACIAD1287 ACIAD1288 astD astB TRUE 0.944 26.000 0.306 1.000 N NA
 588737 588738 ACIAD1288 ACIAD1289 astB astE TRUE 0.980 19.000 0.063 1.000 Y NA
 588739 588740 ACIAD1290 ACIAD1292     FALSE 0.086 104.000 0.000 NA   NA
 588743 588744 ACIAD1295 ACIAD1296     TRUE 0.983 1.000 0.182 NA   NA
 588744 588745 ACIAD1296 ACIAD1297     TRUE 0.980 11.000 0.182 1.000   NA
 588745 588746 ACIAD1297 ACIAD1298     TRUE 0.993 23.000 1.000 0.056 N NA
 588746 588747 ACIAD1298 ACIAD1299   speB FALSE 0.008 408.000 0.000 1.000 N NA
 588747 588748 ACIAD1299 ACIAD1300 speB   FALSE 0.025 176.000 0.000 1.000 N NA
 588748 588749 ACIAD1300 ACIAD1301     FALSE 0.177 74.000 0.000 1.000 N NA
 588754 588755 ACIAD1306 ACIAD1308   thiG FALSE 0.154 80.000 0.000 NA   NA
 588755 588756 ACIAD1308 ACIAD1309 thiG thiS TRUE 0.991 14.000 0.130 1.000 Y NA
 588756 588757 ACIAD1309 ACIAD1310 thiS   TRUE 0.954 13.000 0.058 NA   NA
 588757 588758 ACIAD1310 ACIAD1311   rpoH FALSE 0.156 123.000 0.034 NA   NA
 588758 588759 ACIAD1311 ACIAD1312 rpoH   FALSE 0.095 132.000 0.011 1.000 N NA
 588760 588761 ACIAD1313 ACIAD1314   rhlB TRUE 0.581 102.000 0.025 1.000 Y NA
 588763 588764 ACIAD1316 ACIAD1317   gpsA TRUE 0.936 31.000 0.017 1.000 Y NA
 588764 588765 ACIAD1317 ACIAD1318 gpsA   TRUE 0.567 57.000 0.068 NA N NA
 588765 588766 ACIAD1318 ACIAD1319     TRUE 0.750 29.000 0.020 NA N NA
 588766 588767 ACIAD1319 ACIAD1320     TRUE 0.996 0.000 0.811 1.000   NA
 588767 588768 ACIAD1320 ACIAD1321   pyrD FALSE 0.230 92.000 0.006 1.000   NA
 588768 588769 ACIAD1321 ACIAD1322 pyrD   TRUE 0.467 61.000 0.009 1.000   NA
 588769 588770 ACIAD1322 ACIAD1323   purF TRUE 0.949 25.000 0.262 1.000   NA
 588770 588771 ACIAD1323 ACIAD1324 purF   FALSE 0.307 76.000 0.010 1.000 N NA
 588771 588772 ACIAD1324 ACIAD1326     FALSE 0.429 126.000 0.444 NA   NA
 588772 588773 ACIAD1326 ACIAD1327   tkrA TRUE 0.993 11.000 0.667 NA   NA
 588773 588774 ACIAD1327 ACIAD1328 tkrA   FALSE 0.120 132.000 0.016 1.000   NA
 588774 588775 ACIAD1328 ACIAD1329     FALSE 0.113 92.000 0.000 NA   NA
 588776 588777 ACIAD1330 ACIAD1331   rpsU TRUE 0.934 38.000 0.173 0.025   NA
 588779 588780 ACIAD1333 ACIAD1334     FALSE 0.158 107.000 0.009 NA   NA
 588781 588782 ACIAD1335 ACIAD1336     TRUE 0.971 4.000 0.038 1.000   NA
 588782 588783 ACIAD1336 ACIADtRNALeu_35     FALSE 0.089 103.000 0.000 NA   NA
 588783 588784 ACIADtRNALeu_35 ACIADtRNATrp_36     FALSE 0.322 51.000 0.000 NA   NA
 588784 588785 ACIADtRNATrp_36 ACIADtRNALeu_37     TRUE 0.652 25.000 0.000 NA   NA
 588785 588786 ACIADtRNALeu_37 ACIAD1338     FALSE 0.008 409.000 0.000 NA   NA
 588786 588787 ACIAD1338 ACIAD1339     TRUE 0.830 14.000 0.000 NA   NA
 588787 588788 ACIAD1339 ACIAD1340     FALSE 0.029 165.000 0.000 NA   NA
 588789 588790 ACIAD1341 ACIADtRNAAsn_38     FALSE 0.398 41.000 0.000 NA   NA
 588790 588791 ACIADtRNAAsn_38 ACIAD1342     FALSE 0.075 110.000 0.000 NA   NA
 588792 588793 ACIAD1343 ACIAD1344 aroP   TRUE 0.507 32.000 0.000 1.000 N NA
 588793 588794 ACIAD1344 ACIAD1345     TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 588795 588796 ACIADtRNAAsn_39 ACIADtRNAAsn_40     TRUE 0.889 8.000 0.000 NA   NA
 588796 588797 ACIADtRNAAsn_40 ACIAD1346   sodB FALSE 0.024 180.000 0.000 NA   NA
 588797 588798 ACIAD1346 ACIAD1347 sodB   FALSE 0.038 207.000 0.007 NA   NA
 588800 588801 ACIAD1349 ACIAD1350     TRUE 0.949 15.000 0.077 NA   NA
 588801 588802 ACIAD1350 ACIAD1351     TRUE 0.920 17.000 0.060 NA N NA
 588803 588804 ACIAD1353 ACIAD1354     TRUE 0.814 27.000 0.015 1.000   NA
 588805 588806 ACIAD1355 ACIAD1356     TRUE 0.999 -19.000 0.808 0.003 Y NA
 588806 588807 ACIAD1356 ACIAD1357   ilvA FALSE 0.073 152.000 0.012 1.000 N NA
 588808 588809 ACIAD1358 ACIAD1359 rpiA   TRUE 0.942 0.000 0.006 NA   NA
 588809 588810 ACIAD1359 ACIAD1360   argC FALSE 0.030 162.000 0.000 NA   NA
 588810 588811 ACIAD1360 ACIAD1361 argC   FALSE 0.208 96.000 0.012 NA   NA
 588811 588812 ACIAD1361 ACIAD1362   clpS TRUE 0.879 19.000 0.016 NA   NA
 588812 588813 ACIAD1362 ACIAD1363 clpS clpA TRUE 0.993 10.000 0.596 NA   NA
 588813 588814 ACIAD1363 ACIAD1364 clpA   FALSE 0.441 58.000 0.008 NA   NA
 588815 588816 ACIAD1365 ACIAD1366   argF FALSE 0.029 163.000 0.000 1.000 N NA
 588816 588817 ACIAD1366 ACIAD1367 argF   FALSE 0.163 101.000 0.006 1.000 N NA
 588817 588818 ACIAD1367 ACIAD1368   glnG FALSE 0.144 148.000 0.000 0.057 N NA
 588818 588819 ACIAD1368 ACIAD1369 glnG glnL TRUE 0.998 -13.000 0.587 0.072 Y NA
 588820 588821 ACIAD1371 ACIAD1372   pyrH TRUE 0.482 53.000 0.009 1.000 N NA
 588821 588822 ACIAD1372 ACIAD1373 pyrH frr FALSE 0.351 80.000 0.030 1.000 N NA
 588822 588823 ACIAD1373 ACIAD1374 frr ispU TRUE 0.991 5.000 0.409 1.000 N NA
 588823 588824 ACIAD1374 ACIAD1375 ispU cdsA TRUE 0.991 3.000 0.013 1.000 Y NA
 588824 588825 ACIAD1375 ACIAD1376 cdsA dxr TRUE 0.990 1.000 0.011 1.000 Y NA
 588825 588826 ACIAD1376 ACIAD1377 dxr   TRUE 0.993 5.000 0.568 1.000 N NA
 588826 588827 ACIAD1377 ACIAD1378     TRUE 0.946 41.000 0.204 1.000 Y NA
 588827 588828 ACIAD1378 ACIAD1379     TRUE 0.952 49.000 0.354 1.000 Y NA
 588828 588829 ACIAD1379 ACIAD1380   lpxD TRUE 0.999 4.000 0.814 1.000 Y NA
 588829 588830 ACIAD1380 ACIAD1381 lpxD fabZ TRUE 0.996 4.000 0.796 1.000 N NA
 588830 588831 ACIAD1381 ACIAD1382 fabZ lpxA TRUE 0.995 -3.000 0.850 1.000 N NA
 588834 588835 ACIAD1384 ACIAD1385 recX recA TRUE 0.804 58.000 0.296 1.000   NA
 588835 588836 ACIAD1385 ACIAD1386 recA hslR FALSE 0.051 158.000 0.003 1.000 N NA
 588837 588838 ACIAD1387 ACIAD1388 cysQ   TRUE 0.508 102.000 0.308 NA   NA
 588840 588841 ACIAD1390 ACIAD1391   menG TRUE 0.926 16.000 0.056 NA N NA
 588841 588842 ACIAD1391 ACIAD1392 menG   TRUE 0.788 29.000 0.023 NA   NA
 588842 588843 ACIAD1392 ACIAD1393     FALSE 0.036 146.000 0.000 NA   NA
 588843 588844 ACIAD1393 ACIAD1394     TRUE 0.645 39.000 0.017 NA   NA
 588844 588845 ACIAD1394 ACIAD1395   mfd TRUE 0.867 16.000 0.002 NA   NA
 588845 588846 ACIAD1395 ACIAD1396 mfd   FALSE 0.016 226.000 0.000 1.000 N NA
 588846 588847 ACIAD1396 ACIAD1397     TRUE 0.450 58.000 0.010 1.000 N NA
 588848 588849 ACIAD1398 ACIAD1399 fdx hscA TRUE 0.992 15.000 0.794 1.000 N NA
 588849 588850 ACIAD1399 ACIAD1400 hscA hscB TRUE 0.985 34.000 0.634 1.000 Y NA
 588850 588851 ACIAD1400 ACIAD1402 hscB iscA TRUE 0.729 85.000 0.500 1.000   NA
 588851 588852 ACIAD1402 ACIAD1403 iscA iscU TRUE 0.985 26.000 0.359 0.002   NA
 588852 588853 ACIAD1403 ACIAD1404 iscU iscS TRUE 0.769 72.000 0.448 1.000 N NA
 588853 588854 ACIAD1404 ACIAD1405 iscS iscR TRUE 0.990 2.000 0.424 NA N NA
 588854 588855 ACIAD1405 ACIAD1406 iscR   FALSE 0.111 140.000 0.030 NA   NA
 588856 588857 ACIAD1407 ACIAD1408   hupB FALSE 0.115 164.000 0.080 NA   NA
 588857 588858 ACIAD1408 ACIAD1409 hupB ppiD FALSE 0.167 133.000 0.060 1.000   NA
 588861 588862 ACIAD1412 ACIAD1413     TRUE 0.994 32.000 0.604 0.010 Y NA
 588862 588863 ACIAD1413 ACIAD1414     FALSE 0.020 206.000 0.000 NA   NA
 588863 588864 ACIAD1414 ACIAD1415     FALSE 0.013 270.000 0.000 NA   NA
 588866 588867 ACIAD1417 ACIAD1418 arcD   TRUE 0.995 6.000 0.150 1.000 Y NA
 588867 588868 ACIAD1418 ACIAD1419     FALSE 0.025 176.000 0.000 1.000 N NA
 588868 588869 ACIAD1419 ACIAD1420     TRUE 0.968 5.000 0.029 1.000   NA
 588869 588870 ACIAD1420 ACIAD1421     FALSE 0.034 175.000 0.000 1.000   NA
 588870 588871 ACIAD1421 ACIAD1422     TRUE 0.671 71.000 0.000 1.000 Y NA
 588871 588872 ACIAD1422 ACIAD1423   eptA TRUE 0.919 2.000 0.000 1.000   NA
 588873 588874 ACIAD1424 ACIAD1425 salA salR FALSE 0.051 125.000 0.000 1.000 N NA
 588875 588876 ACIAD1426 ACIAD1427 salE   TRUE 0.534 31.000 0.000 NA   NA
 588876 588877 ACIAD1427 ACIAD1428   areA FALSE 0.152 191.000 0.000 1.000 Y NA
 588877 588878 ACIAD1428 ACIAD1429 areA areB FALSE 0.135 84.000 0.000 1.000 N NA
 588878 588879 ACIAD1429 ACIAD1430 areB areC TRUE 0.985 28.000 0.109 0.044 Y NA
 588879 588880 ACIAD1430 ACIAD1431 areC areR FALSE 0.022 185.000 0.000 1.000 N NA
 588881 588882 ACIAD1433 ACIAD1434   benK TRUE 0.792 38.000 0.000 0.068   NA
 588884 588885 ACIAD1436 ACIAD1437 benA benB TRUE 0.998 -3.000 0.953 0.009 N NA
 588885 588886 ACIAD1437 ACIAD1438 benB benC TRUE 0.920 73.000 0.672 0.060 N NA
 588886 588887 ACIAD1438 ACIAD1439 benC benD TRUE 0.992 19.000 0.574 0.044 N NA
 588887 588888 ACIAD1439 ACIAD1440 benD benE TRUE 0.970 27.000 0.116 1.000 Y NA
 588888 588889 ACIAD1440 ACIAD1442 benE catA FALSE 0.048 615.000 0.000 1.000 Y NA
 588889 588890 ACIAD1442 ACIAD1443 catA   TRUE 0.973 10.000 0.086 1.000   NA
 588890 588891 ACIAD1443 ACIAD1444     TRUE 0.995 -51.000 0.667 0.009   NA
 588893 588894 ACIAD1446 ACIAD1447 catB catC TRUE 0.970 18.000 0.300 1.000 N NA
 588894 588895 ACIAD1447 ACIAD1448 catC catI FALSE 0.115 90.000 0.000 1.000 N NA
 588895 588896 ACIAD1448 ACIAD1449 catI catJ TRUE 0.999 11.000 0.487 0.003 Y NA
 588896 588897 ACIAD1449 ACIAD1450 catJ catF TRUE 0.978 13.000 0.000 1.000 Y NA
 588897 588898 ACIAD1450 ACIAD1451 catF catD TRUE 0.903 10.000 0.000 1.000   NA
 588898 588899 ACIAD1451 ACIAD1452 catD   FALSE 0.015 283.000 0.000 1.000   NA
 588902 588903 ACIAD1455 ACIAD1456     FALSE 0.034 150.000 0.000 NA   NA
 588903 588904 ACIAD1456 ACIAD1457     FALSE 0.177 75.000 0.000 NA   NA
 588905 588906 ACIAD1458 ACIAD1459     FALSE 0.126 97.000 0.000 1.000   NA
 588906 588907 ACIAD1459 ACIAD1460     TRUE 0.878 13.000 0.000 1.000   NA
 588908 588909 ACIAD1461 ACIAD1462     FALSE 0.008 407.000 0.000 NA   NA
 588910 588911 ACIAD1463 ACIAD1464     TRUE 0.927 27.000 0.000 1.000 Y NA
 588911 588912 ACIAD1464 ACIAD1465     TRUE 0.993 -7.000 0.214 1.000 Y NA
 588912 588913 ACIAD1465 ACIAD1467     TRUE 0.985 -3.000 0.286 1.000 N NA
 588915 588916 ACIAD1469 ACIAD1471     TRUE 0.992 1.000 0.500 NA N NA
 588916 588917 ACIAD1471 ACIAD1472     TRUE 0.560 140.000 0.286 NA Y NA
 588917 588918 ACIAD1472 ACIAD1473     FALSE 0.231 193.000 0.444 NA   NA
 588918 588919 ACIAD1473 ACIAD1474     TRUE 0.864 59.000 0.556 NA   NA
 588919 588920 ACIAD1474 ACIAD1477     FALSE 0.332 140.000 0.333 1.000   NA
 588920 588921 ACIAD1477 ACIAD1478   hemO TRUE 0.775 33.000 0.044 NA   NA
 588921 588922 ACIAD1478 ACIAD1479 hemO   TRUE 0.882 29.000 0.132 NA   NA
 588922 588923 ACIAD1479 ACIAD1480     FALSE 0.013 262.000 0.000 NA   NA
 588924 588925 ACIADtRNAGly_41 ACIAD1481   cysS FALSE 0.232 65.000 0.000 NA   NA
 588926 588927 ACIAD1482 ACIAD1483 kdsD kdsC TRUE 0.995 4.000 0.598 1.000   NA
 588927 588928 ACIAD1483 ACIAD1484 kdsC   TRUE 0.936 39.000 0.617 NA   NA
 588928 588929 ACIAD1484 ACIAD1485     TRUE 0.852 56.000 0.459 NA   NA
 588929 588930 ACIAD1485 ACIAD1486     TRUE 0.993 0.000 0.543 NA   NA
 588930 588931 ACIAD1486 ACIAD1487     FALSE 0.013 332.000 0.000 1.000   NA
 588931 588932 ACIAD1487 ACIAD1488     TRUE 0.870 -3.000 0.000 1.000 N NA
 588932 588933 ACIAD1488 ACIAD1489     TRUE 0.997 -3.000 0.778 0.074 N NA
 588933 588934 ACIAD1489 ACIAD1490     FALSE 0.213 100.000 0.010 1.000   NA
 588934 588935 ACIAD1490 ACIAD1491     TRUE 0.581 47.000 0.010 1.000   NA
 588938 588939 ACIAD1495 ACIAD1496     FALSE 0.094 154.000 0.030 NA   NA
 588939 588940 ACIAD1496 ACIAD1498   fdxA FALSE 0.272 127.000 0.200 NA   NA
 588940 588941 ACIAD1498 ACIAD1499 fdxA   FALSE 0.013 325.000 0.000 1.000   NA
 588941 588942 ACIAD1499 ACIAD1500   mutS FALSE 0.017 257.000 0.000 1.000   NA
 588943 588944 ACIAD1501 ACIAD1503     FALSE 0.009 361.000 0.000 NA   NA
 588944 588945 ACIAD1503 ACIAD1504     TRUE 0.985 14.000 0.429 1.000 N NA
 588945 588946 ACIAD1504 ACIAD1505     TRUE 0.909 33.000 0.300 1.000 N NA
 588946 588947 ACIAD1505 ACIAD1506     TRUE 0.864 11.000 0.000 1.000 N NA
 588947 588948 ACIAD1506 ACIAD1507     TRUE 0.994 6.000 0.000 0.055 Y NA
 588948 588949 ACIAD1507 ACIAD1508     TRUE 0.999 -3.000 0.909 0.055 Y NA
 588949 588950 ACIAD1508 ACIAD1509     TRUE 0.995 3.000 0.667 1.000   NA
 588950 588951 ACIAD1509 ACIAD1510     TRUE 0.838 16.000 0.000 1.000   NA
 588953 588954 ACIAD1514 ACIAD1515     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 588954 588955 ACIAD1515 ACIAD1516     FALSE 0.115 167.000 0.000 0.067 N NA
 588955 588956 ACIAD1516 ACIAD1517     FALSE 0.385 42.000 0.000 NA   NA
 588959 588960 ACIAD1520 ACIAD1521 tatC tatB TRUE 0.996 -3.000 0.314 NA Y NA
 588960 588961 ACIAD1521 ACIAD1522 tatB tatA TRUE 0.985 14.000 0.020 1.000 Y NA
 588961 588962 ACIAD1522 ACIAD1523 tatA   FALSE 0.097 97.000 0.000 1.000 N NA
 588962 588963 ACIAD1523 ACIAD1524     TRUE 0.974 35.000 0.375 1.000 Y NA
 588963 588964 ACIAD1524 ACIAD1525     TRUE 0.999 0.000 0.889 0.055 Y NA
 588964 588965 ACIAD1525 ACIAD1526     TRUE 0.994 4.000 0.000 0.055 Y NA
 588966 588967 ACIAD1527 ACIAD1528     FALSE 0.020 197.000 0.000 1.000 N NA
 588967 588968 ACIAD1528 ACIAD1529     TRUE 0.911 25.000 0.000 0.014 N NA
 588968 588969 ACIAD1529 ACIAD1530     TRUE 0.994 0.000 0.000 0.067 Y NA
 588970 588971 ACIAD1531 ACIAD1532     FALSE 0.146 82.000 0.000 NA   NA
 588972 588973 ACIAD1533 ACIAD1534     FALSE 0.251 248.000 0.000 0.011 Y NA
 588973 588974 ACIAD1534 ACIAD1535     TRUE 0.738 19.000 0.000 1.000 N NA
 588975 588976 ACIAD1536 ACIAD1537 citB   TRUE 0.990 -10.000 0.618 NA   NA
 588976 588977 ACIAD1537 ACIAD1539     FALSE 0.214 104.000 0.026 1.000 N NA
 588977 588978 ACIAD1539 ACIAD1540     FALSE 0.192 132.000 0.111 1.000 N NA
 588978 588979 ACIAD1540 ACIAD1541   citA TRUE 0.856 90.000 0.111 0.055 Y NA
 588981 588982 ACIAD1543 ACIAD1545     FALSE 0.071 321.000 0.000 NA Y NA
 588983 588984 ACIAD1547 ACIAD1548     FALSE 0.050 127.000 0.000 NA   NA
 588984 588985 ACIAD1548 ACIAD1549     TRUE 0.900 -3.000 0.000 1.000   NA
 588985 588986 ACIAD1549 ACIAD1550     TRUE 0.898 2.000 0.000 NA   NA
 588986 588987 ACIAD1550 ACIAD1551     FALSE 0.010 342.000 0.000 NA   NA
 588987 588988 ACIAD1551 ACIAD1552     FALSE 0.066 114.000 0.000 NA   NA
 588988 588989 ACIAD1552 ACIAD1553     TRUE 0.874 -3.000 0.000 NA   NA
 588989 588990 ACIAD1553 ACIAD1554     FALSE 0.008 386.000 0.000 NA   NA
 588990 588991 ACIAD1554 ACIAD1556     TRUE 0.951 -12.000 0.085 NA   NA
 588991 588992 ACIAD1556 ACIAD1557     TRUE 0.959 -7.000 0.091 NA   NA
 588992 588993 ACIAD1557 ACIAD1558     TRUE 0.989 -3.000 0.409 NA   NA
 588995 588996 ACIAD1560 ACIAD1561     TRUE 0.995 1.000 0.304 0.059   NA
 588996 588997 ACIAD1561 ACIAD1562     FALSE 0.322 51.000 0.000 NA   NA
 588999 589000 ACIAD1564 ACIAD1565     FALSE 0.008 427.000 0.000 NA   NA
 589000 589001 ACIAD1565 ACIAD1566     TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 589001 589002 ACIAD1566 ACIAD1567     TRUE 0.991 1.000 0.333 1.000   NA
 589002 589003 ACIAD1567 ACIAD1568     TRUE 0.861 -9.000 0.000 1.000   NA
 589003 589004 ACIAD1568 ACIAD1569     TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 589004 589005 ACIAD1569 ACIAD1570     TRUE 0.861 -9.000 0.000 1.000   NA
 589005 589006 ACIAD1570 ACIAD1571   caiD TRUE 0.668 27.000 0.000 1.000   NA
 589006 589007 ACIAD1571 ACIAD1572 caiD   TRUE 0.923 41.000 0.000 0.074 Y NA
 589009 589010 ACIAD1574 ACIAD1575   linC TRUE 0.565 25.000 0.000 NA N NA
 589010 589011 ACIAD1575 ACIAD1576 linC   TRUE 0.864 11.000 0.000 1.000 N NA
 589011 589012 ACIAD1576 ACIAD1577     FALSE 0.030 160.000 0.000 1.000 N NA
 589012 589013 ACIAD1577 ACIAD1578     TRUE 0.910 30.000 0.000 1.000 Y NA
 589013 589014 ACIAD1578 ACIAD1579     TRUE 0.955 20.000 0.000 1.000 Y NA
 589014 589015 ACIAD1579 ACIAD1580     TRUE 0.978 1.000 0.000 0.059   NA
 589016 589017 ACIAD1581 ACIAD1582     FALSE 0.011 285.000 0.000 1.000 N NA
 589017 589018 ACIAD1582 ACIAD1583   srpI TRUE 0.968 -25.000 0.242 NA   NA
 589018 589019 ACIAD1583 ACIAD1584 srpI srpH FALSE 0.014 255.000 0.000 NA   NA
 589019 589020 ACIAD1584 ACIAD1585 srpH   TRUE 0.680 51.000 0.115 NA N NA
 589021 589022 ACIAD1586 ACIAD1587 atsB atsC TRUE 0.997 10.000 0.500 1.000 Y NA
 589022 589023 ACIAD1587 ACIAD1588 atsC   TRUE 0.873 10.000 0.000 1.000 N NA
 589023 589024 ACIAD1588 ACIAD1589     TRUE 0.815 37.000 0.000 0.014 N NA
 589024 589025 ACIAD1589 ACIAD1590     TRUE 0.994 0.000 0.000 0.067 Y NA
 589025 589026 ACIAD1590 ACIAD1591     FALSE 0.022 157.000 0.000 NA N NA
 589026 589027 ACIAD1591 ACIAD1592     FALSE 0.042 120.000 0.000 NA N NA
 589027 589028 ACIAD1592 ACIAD1593   astR FALSE 0.406 39.000 0.000 1.000 N NA
 589028 589029 ACIAD1593 ACIAD1594 astR   TRUE 0.943 36.000 0.000 0.055 Y NA
 589029 589030 ACIAD1594 ACIAD1595   ntaA TRUE 0.825 55.000 0.412 NA N NA
 589030 589031 ACIAD1595 ACIAD1596 ntaA   TRUE 0.979 12.000 0.000 NA Y NA
 589032 589033 ACIAD1597 ACIAD1598   atsA FALSE 0.123 225.000 0.000 1.000 Y NA
 589033 589034 ACIAD1598 ACIAD1599 atsA   FALSE 0.060 118.000 0.000 1.000 N NA
 589035 589036 ACIAD1600 ACIAD1601   astR TRUE 0.479 29.000 0.000 NA N NA
 589038 589039 ACIAD1604 ACIAD1605 mmsA mmsB TRUE 0.997 15.000 0.750 0.001 N NA
 589039 589040 ACIAD1605 ACIAD1606 mmsB   TRUE 0.924 79.000 0.600 1.000 Y NA
 589040 589041 ACIAD1606 ACIAD1607     TRUE 0.796 82.000 0.148 1.000 Y NA
 589041 589042 ACIAD1607 ACIAD1608     TRUE 0.926 53.000 0.222 1.000 Y NA
 589042 589043 ACIAD1608 ACIAD1609     TRUE 0.998 13.000 0.231 0.005 Y NA
 589045 589046 ACIAD1611 ACIAD1612     TRUE 0.782 53.000 0.000 1.000 Y NA
 589046 589047 ACIAD1612 ACIAD1613     TRUE 0.967 17.000 0.000 1.000 Y NA
 589048 589049 ACIAD1614 ACIAD1615   nthB TRUE 0.746 41.000 0.087 NA   NA
 589049 589050 ACIAD1615 ACIAD1616 nthB nthA TRUE 0.939 43.000 0.174 0.001   NA
 589050 589051 ACIAD1616 ACIAD1618 nthA amdA TRUE 0.542 85.000 0.188 1.000   NA
 589051 589052 ACIAD1618 ACIAD1619 amdA   FALSE 0.189 138.000 0.125 NA   NA
 589052 589053 ACIAD1619 ACIAD1620     TRUE 0.790 49.000 0.217 NA   NA
 589056 589057 ACIAD1625 ACIAD1626     FALSE 0.027 196.000 0.000 1.000   NA
 589057 589058 ACIAD1626 ACIAD1627   desC FALSE 0.157 126.000 0.047 1.000 N NA
 589058 589059 ACIAD1627 ACIAD1628 desC   TRUE 0.947 15.000 0.047 1.000   NA
 589059 589060 ACIAD1628 ACIAD1629     TRUE 0.993 13.000 0.722 NA   NA
 589060 589061 ACIAD1629 ACIAD1630   cfa TRUE 0.969 4.000 0.053 NA   NA
 589061 589062 ACIAD1630 ACIAD1631 cfa   TRUE 0.838 34.000 0.103 1.000   NA
 589062 589063 ACIAD1631 ACIAD1632     TRUE 0.983 14.000 0.324 1.000   NA
 589063 589064 ACIAD1632 ACIAD1633     TRUE 0.674 43.000 0.048 1.000 N NA
 589065 589066 ACIAD1634 ACIAD1635     TRUE 0.966 20.000 0.333 NA   NA
 589066 589067 ACIAD1635 ACIAD1636     TRUE 0.912 -27.000 0.025 NA   NA
 589067 589068 ACIAD1636 ACIAD1637     FALSE 0.119 90.000 0.000 NA   NA
 589068 589069 ACIAD1637 ACIAD1638     TRUE 0.610 58.000 0.077 1.000 N NA
 589070 589071 ACIAD1639 ACIAD1640     FALSE 0.335 57.000 0.000 1.000   NA
 589071 589072 ACIAD1640 ACIAD1641     FALSE 0.016 237.000 0.000 NA   NA
 589073 589074 ACIAD1642 ACIAD1643 bacA   FALSE 0.010 331.000 0.000 NA   NA
 589074 589075 ACIAD1643 ACIAD1644     FALSE 0.020 200.000 0.000 NA   NA
 589075 589076 ACIAD1644 ACIAD1645   trmA FALSE 0.014 252.000 0.000 NA   NA
 589076 589077 ACIAD1645 ACIAD1646 trmA putA FALSE 0.009 338.000 0.000 1.000 N NA
 589079 589080 ACIAD1649 ACIAD1650 putP   FALSE 0.008 381.000 0.000 1.000 N NA
 589080 589081 ACIAD1650 ACIAD1651   pcaT FALSE 0.054 122.000 0.000 1.000 N NA
 589081 589082 ACIAD1651 ACIAD1652 pcaT   FALSE 0.010 317.000 0.000 NA   NA
 589082 589083 ACIAD1652 ACIAD1653     TRUE 0.969 10.000 0.085 NA   NA
 589084 589085 ACIAD1654 ACIAD1655 fadH   FALSE 0.154 80.000 0.000 NA   NA
 589086 589087 ACIAD1656 ACIAD1657     FALSE 0.122 89.000 0.000 NA   NA
 589090 589091 ACIAD1660 ACIADrRNA16S_10 gcdH   FALSE 0.007 534.000 0.000 NA   NA
 589091 589092 ACIADrRNA16S_10 ACIADtRNAIle_42     FALSE 0.248 62.000 0.000 NA   NA
 589092 589093 ACIADtRNAIle_42 ACIADtRNAAla_43     TRUE 0.447 37.000 0.000 NA   NA
 589093 589094 ACIADtRNAAla_43 ACIADrRNA23S_11     FALSE 0.009 344.000 0.000 NA   NA
 589094 589095 ACIADrRNA23S_11 ACIADrRNA5S_12     FALSE 0.023 186.000 0.000 NA   NA
 589095 589096 ACIADrRNA5S_12 ACIAD1661     FALSE 0.010 332.000 0.000 NA   NA
 589096 589097 ACIAD1661 ACIAD1662   cysK FALSE 0.252 70.000 0.000 1.000   NA
 589098 589099 ACIAD1663 ACIAD1664     FALSE 0.015 246.000 0.000 NA   NA
 589099 589100 ACIAD1664 ACIAD1665     TRUE 0.993 -3.000 0.595 1.000   NA
 589100 589101 ACIAD1665 ACIAD1666     TRUE 0.830 14.000 0.000 NA   NA
 589101 589102 ACIAD1666 ACIAD1667     TRUE 0.874 -3.000 0.000 NA   NA
 589102 589103 ACIAD1667 ACIAD1668     TRUE 0.974 16.000 0.285 NA   NA
 589103 589104 ACIAD1668 ACIAD1669     TRUE 0.985 20.000 0.215 NA Y NA
 589105 589106 ACIAD1670 ACIAD1671     FALSE 0.036 167.000 0.000 1.000   NA
 589106 589107 ACIAD1671 ACIAD1672     FALSE 0.018 249.000 0.000 1.000   NA
 589108 589109 ACIAD1673 ACIAD1674     TRUE 0.995 -3.000 0.840 NA   NA
 589110 589111 ACIAD1675 ACIAD1676     FALSE 0.212 69.000 0.000 NA   NA
 589111 589112 ACIAD1676 ACIAD1677     TRUE 0.973 9.000 0.094 NA   NA
 589112 589113 ACIAD1677 ACIAD1678     TRUE 0.974 5.000 0.083 NA   NA
 589113 589114 ACIAD1678 ACIAD1679     TRUE 0.897 5.000 0.000 NA   NA
 589115 589116 ACIAD1680 ACIAD1681 etfD mucK FALSE 0.045 131.000 0.000 1.000 N NA
 589117 589118 ACIAD1683 ACIAD1684 caiB dcaS TRUE 0.549 126.000 0.667 1.000 N NA
 589121 589122 ACIAD1688 ACIAD1689 dcaR dcaF FALSE 0.289 113.000 0.133 1.000 N NA
 589122 589123 ACIAD1689 ACIAD1690 dcaF dcaH TRUE 0.990 21.000 0.333 1.000 Y NA
 589123 589124 ACIAD1690 ACIAD1691 dcaH dcaC TRUE 0.888 49.000 0.053 1.000 Y NA
 589124 589125 ACIAD1691 ACIAD1692 dcaC dcaE TRUE 0.976 30.000 0.053 0.073 Y NA
 589126 589127 ACIAD1693 ACIAD1694 dcaA dcaK TRUE 0.797 38.000 0.120 1.000 N NA
 589127 589128 ACIAD1694 ACIAD1695 dcaK dcaI FALSE 0.011 290.000 0.000 1.000 N NA
 589128 589129 ACIAD1695 ACIAD1696 dcaI dcaJ TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.003 Y NA
 589129 589130 ACIAD1696 ACIAD1697 dcaJ dcaP TRUE 0.795 85.000 0.667 1.000   NA
 589130 589131 ACIAD1697 ACIAD1698 dcaP   TRUE 0.985 19.000 0.667 NA   NA
 589133 589134 ACIAD1700 ACIAD1701 acdB   FALSE 0.187 81.000 0.000 1.000   NA
 589136 589137 ACIAD1704 ACIAD1705 pcaI pcaJ TRUE 0.999 11.000 0.487 0.003 Y NA
 589137 589138 ACIAD1705 ACIAD1706 pcaJ pcaF TRUE 0.978 13.000 0.000 1.000 Y NA
 589138 589139 ACIAD1706 ACIAD1707 pcaF pcaB TRUE 0.979 12.000 0.000 0.001 N NA
 589139 589140 ACIAD1707 ACIAD1708 pcaB pcaD TRUE 0.960 -3.000 0.028 1.000   NA
 589140 589141 ACIAD1708 ACIAD1709 pcaD pcaK TRUE 0.979 23.000 0.600 1.000   NA
 589141 589142 ACIAD1709 ACIAD1710 pcaK pcaC TRUE 0.946 16.000 0.065 1.000   NA
 589142 589143 ACIAD1710 ACIAD1711 pcaC pcaH TRUE 0.890 22.000 0.029 1.000   NA
 589143 589144 ACIAD1711 ACIAD1712 pcaH pcaG TRUE 0.999 18.000 0.782 0.001 Y NA
 589144 589145 ACIAD1712 ACIAD1713 pcaG quiB FALSE 0.130 118.000 0.013 1.000 N NA
 589145 589146 ACIAD1713 ACIAD1714 quiB quiC TRUE 0.723 20.000 0.000 NA   NA
 589146 589147 ACIAD1714 ACIAD1715 quiC quiX FALSE 0.217 68.000 0.000 NA   NA
 589147 589148 ACIAD1715 ACIAD1716 quiX quiA FALSE 0.105 208.000 0.158 1.000 N NA
 589149 589150 ACIAD1717 ACIAD1718   pobR FALSE 0.036 167.000 0.000 1.000   NA
 589152 589153 ACIAD1720 ACIAD1721 hcaG   TRUE 0.686 23.000 0.000 NA   NA
 589153 589154 ACIAD1721 ACIAD1722   hcaE FALSE 0.314 52.000 0.000 NA   NA
 589154 589155 ACIAD1722 ACIAD1723 hcaE hcaD TRUE 0.853 76.000 0.750 1.000   NA
 589155 589156 ACIAD1723 ACIAD1724 hcaD hcaC TRUE 0.931 70.000 0.500 1.000 Y NA
 589156 589157 ACIAD1724 ACIAD1725 hcaC hcaB TRUE 0.667 92.000 0.200 0.073 N NA
 589157 589158 ACIAD1725 ACIAD1726 hcaB hcaA TRUE 0.937 37.000 0.241 0.073 N NA
 589159 589160 ACIAD1727 ACIAD1728 hcaK   TRUE 0.888 64.000 0.750 1.000 N NA
 589162 589163 ACIAD1730 ACIAD1731     TRUE 0.848 60.000 0.500 NA   NA
 589163 589164 ACIAD1731 ACIAD1733     FALSE 0.422 92.000 0.000 0.043   NA
 589164 589165 ACIAD1733 ACIAD1734     TRUE 0.857 12.000 0.000 1.000 N NA
 589165 589166 ACIAD1734 ACIAD1735     FALSE 0.041 138.000 0.000 NA   NA
 589167 589168 ACIAD1736 ACIAD1737 accC accB TRUE 0.997 17.000 0.275 0.002 Y NA
 589168 589169 ACIAD1737 ACIAD1738 accB aroQ TRUE 0.926 28.000 0.254 1.000 N NA
 589169 589170 ACIAD1738 ACIAD1740 aroQ   FALSE 0.007 1083.000 0.000 1.000   NA
 589170 589171 ACIAD1740 ACIAD1741     TRUE 0.563 48.000 0.016 NA   NA
 589171 589172 ACIAD1741 ACIAD1742     FALSE 0.022 189.000 0.000 NA   NA
 589172 589173 ACIAD1742 ACIAD1743     FALSE 0.028 170.000 0.000 NA   NA
 589173 589174 ACIAD1743 ACIAD1744   aspA FALSE 0.017 221.000 0.000 1.000 N NA
 589175 589176 ACIAD1745 ACIAD1746     FALSE 0.119 90.000 0.000 NA   NA
 589176 589177 ACIAD1746 ACIAD1747     FALSE 0.021 195.000 0.000 NA   NA
 589178 589179 ACIAD1748 ACIAD1749   cioB FALSE 0.052 138.000 0.000 1.000   NA
 589179 589180 ACIAD1749 ACIAD1750 cioB cioA TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.058 Y NA
 589180 589181 ACIAD1750 ACIAD1751 cioA   FALSE 0.041 138.000 0.000 NA   NA
 589182 589183 ACIAD1753 ACIAD1754 mdcA mdcB TRUE 0.989 -6.000 0.508 1.000 N NA
 589183 589184 ACIAD1754 ACIAD1755 mdcB mdcC TRUE 0.985 -12.000 0.475 NA   NA
 589184 589185 ACIAD1755 ACIAD1756 mdcC mdcD TRUE 0.985 -7.000 0.400 NA   NA
 589185 589186 ACIAD1756 ACIAD1757 mdcD mdcE TRUE 0.994 -3.000 0.700 NA   NA
 589186 589187 ACIAD1757 ACIAD1758 mdcE mdcG TRUE 0.982 -9.000 0.339 NA   NA
 589187 589188 ACIAD1758 ACIAD1759 mdcG mdcH TRUE 0.992 13.000 0.651 1.000   NA
 589188 589189 ACIAD1759 ACIAD1760 mdcH mdcL TRUE 0.784 48.000 0.200 NA   NA
 589189 589190 ACIAD1760 ACIAD1761 mdcL mdcM TRUE 0.994 -7.000 0.945 NA   NA
 589191 589192 ACIAD1762 ACIAD1763 mdcR srpH FALSE 0.419 38.000 0.000 1.000 N NA
 589193 589194 ACIAD1764 ACIAD1765     FALSE 0.007 473.000 0.000 1.000 N NA
 589194 589195 ACIAD1765 ACIAD1766     TRUE 0.923 82.000 0.654 1.000 Y NA
 589195 589196 ACIAD1766 ACIAD1767     TRUE 0.999 7.000 0.758 0.054 Y NA
 589196 589197 ACIAD1767 ACIAD1768     TRUE 0.996 1.000 0.823 1.000   NA
 589197 589198 ACIAD1768 ACIAD1769     TRUE 0.998 10.000 0.731 0.011   NA
 589198 589199 ACIAD1769 ACIAD1770     FALSE 0.011 304.000 0.000 NA   NA
 589199 589200 ACIAD1770 ACIAD1771     TRUE 0.534 31.000 0.000 NA   NA
 589203 589204 ACIAD1774 ACIAD1775 otsA otsB TRUE 0.996 -7.000 0.021 0.001 Y NA
 589205 589206 ACIAD1776 ACIAD1778   fecI FALSE 0.009 529.000 0.000 1.000   NA
 589206 589207 ACIAD1778 ACIAD1779 fecI fecR TRUE 0.795 -6.000 0.000 NA N NA
 589207 589208 ACIAD1779 ACIAD1780 fecR   TRUE 0.557 82.000 0.000 NA Y NA
 589208 589209 ACIAD1780 ACIAD1781     FALSE 0.044 134.000 0.000 NA   NA
 589209 589210 ACIAD1781 ACIAD1782   ppk FALSE 0.010 342.000 0.000 NA   NA
 589210 589211 ACIAD1782 ACIAD1783 ppk   FALSE 0.017 215.000 0.000 1.000 N NA
 589213 589214 ACIADtRNAMet_44 ACIAD1786     FALSE 0.030 164.000 0.000 NA   NA
 589214 589215 ACIAD1786 ACIAD1787   csp FALSE 0.024 182.000 0.000 NA   NA
 589215 589216 ACIAD1787 ACIAD1788 csp   FALSE 0.026 175.000 0.000 NA   NA
 589216 589217 ACIAD1788 ACIAD1789     TRUE 0.874 -3.000 0.000 NA   NA
 589217 589218 ACIAD1789 ACIAD1790     TRUE 0.821 -10.000 0.000 NA   NA
 589219 589220 ACIAD1791 ACIAD1792     TRUE 0.994 9.000 0.000 0.046 Y NA
 589221 589222 ACIAD1794 ACIAD1795     TRUE 0.893 7.000 0.000 NA   NA
 589222 589223 ACIAD1795 ACIAD1796     TRUE 0.847 13.000 0.000 NA   NA
 589223 589224 ACIAD1796 ACIAD1798     FALSE 0.011 311.000 0.000 NA   NA
 589224 589225 ACIAD1798 ACIAD1799     FALSE 0.038 142.000 0.000 NA   NA
 589227 589228 ACIAD1801 ACIAD1802     TRUE 0.989 -15.000 0.625 NA   NA
 589229 589230 ACIAD1803 ACIAD1804     FALSE 0.012 282.000 0.000 NA   NA
 589231 589232 ACIAD1805 ACIAD1806     TRUE 0.996 0.000 0.737 1.000   NA
 589232 589233 ACIAD1806 ACIAD1807     TRUE 0.979 11.000 0.176 1.000   NA
 589233 589234 ACIAD1807 ACIAD1808     TRUE 0.974 15.000 0.214 1.000   NA
 589234 589235 ACIAD1808 ACIAD1809     FALSE 0.193 71.000 0.000 1.000 N NA
 589235 589236 ACIAD1809 ACIAD1810     FALSE 0.024 181.000 0.000 NA   NA
 589237 589238 ACIAD1811 ACIAD1812     FALSE 0.068 113.000 0.000 NA   NA
 589238 589239 ACIAD1812 ACIAD1813     TRUE 0.534 31.000 0.000 NA   NA
 589240 589241 ACIAD1814 ACIAD1815     FALSE 0.037 125.000 0.000 NA N NA
 589243 589244 ACIAD1817 ACIAD1818   alkK FALSE 0.011 287.000 0.000 1.000 N NA
 589244 589245 ACIAD1818 ACIAD1819 alkK   TRUE 0.980 24.000 0.154 1.000 Y NA
 589245 589246 ACIAD1819 ACIAD1820     TRUE 0.981 24.000 0.182 1.000 Y NA
 589246 589247 ACIAD1820 ACIAD1821     TRUE 0.995 0.000 0.182 1.000 Y NA
 589249 589250 ACIAD1824 ACIAD1825     FALSE 0.207 164.000 0.250 1.000 N NA
 589250 589251 ACIAD1825 ACIAD1826   pauA TRUE 0.984 10.000 0.250 1.000 N NA
 589251 589252 ACIAD1826 ACIAD1827 pauA   TRUE 0.903 10.000 0.000 1.000   NA
 589252 589253 ACIAD1827 ACIAD1828     TRUE 0.987 22.000 0.400 0.043   NA
 589253 589254 ACIAD1828 ACIAD1829     TRUE 0.989 14.000 0.000 0.072 Y NA
 589254 589255 ACIAD1829 ACIAD1830     FALSE 0.016 225.000 0.000 1.000 N NA
 589256 589257 ACIAD1831 ACIAD1832     FALSE 0.018 212.000 0.000 NA   NA
 589258 589259 ACIAD1834 ACIAD1835     FALSE 0.042 155.000 0.000 1.000   NA
 589259 589260 ACIAD1835 ACIAD1836     FALSE 0.032 178.000 0.000 1.000   NA
 589260 589261 ACIAD1836 ACIAD1837     TRUE 0.571 29.000 0.000 NA   NA
 589261 589262 ACIAD1837 ACIAD1838     TRUE 0.828 -9.000 0.000 NA   NA
 589262 589263 ACIAD1838 ACIAD1839     FALSE 0.035 148.000 0.000 NA   NA
 589263 589264 ACIAD1839 ACIAD1840     TRUE 0.839 -7.000 0.000 NA   NA
 589264 589265 ACIAD1840 ACIAD1841     FALSE 0.010 338.000 0.000 NA   NA
 589265 589266 ACIAD1841 ACIAD1842     TRUE 0.898 4.000 0.000 NA   NA
 589268 589269 ACIAD1844 ACIAD1845     TRUE 0.898 2.000 0.000 NA   NA
 589270 589271 ACIAD1846 ACIAD1847     TRUE 0.995 0.000 0.667 NA   NA
 589271 589272 ACIAD1847 ACIAD1848     TRUE 0.992 -6.000 0.667 NA   NA
 589273 589274 ACIAD1849 ACIAD1850     FALSE 0.248 62.000 0.000 NA   NA
 589275 589276 ACIAD1851 ACIAD1852     TRUE 0.885 9.000 0.000 NA   NA
 589276 589277 ACIAD1852 ACIAD1853     TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA   NA
 589277 589278 ACIAD1853 ACIAD1854     TRUE 0.898 3.000 0.000 NA   NA
 589278 589279 ACIAD1854 ACIAD1855     FALSE 0.049 128.000 0.000 NA   NA
 589279 589280 ACIAD1855 ACIAD1856     FALSE 0.021 195.000 0.000 NA   NA
 589280 589281 ACIAD1856 ACIAD1857     FALSE 0.014 252.000 0.000 NA   NA
 589281 589282 ACIAD1857 ACIAD1858     TRUE 0.995 0.000 0.667 NA   NA
 589282 589283 ACIAD1858 ACIAD1859     TRUE 0.992 -6.000 0.667 NA   NA
 589284 589285 ACIAD1860 ACIAD1861     FALSE 0.248 62.000 0.000 NA   NA
 589287 589288 ACIAD1864 ACIAD1865     FALSE 0.167 324.000 0.000 0.054 Y NA
 589288 589289 ACIAD1865 ACIAD1866   sstT FALSE 0.020 199.000 0.000 1.000 N NA
 589289 589290 ACIAD1866 ACIAD1867 sstT   TRUE 0.690 39.000 0.033 NA   NA
 589290 589291 ACIAD1867 ACIAD1868     TRUE 0.935 16.000 0.053 NA   NA
 589291 589292 ACIAD1868 ACIAD1869     FALSE 0.056 122.000 0.000 NA   NA
 589294 589295 ACIAD1873 ACIAD1874     TRUE 0.973 0.000 0.089 1.000 N NA
 589295 589296 ACIAD1874 ACIAD1875     TRUE 0.510 70.000 0.073 1.000 N NA
 589296 589297 ACIAD1875 ACIAD1876   gcvH FALSE 0.363 71.000 0.013 1.000 N NA
 589298 589299 ACIAD1878 ACIAD1879 aro adhC FALSE 0.006 547.000 0.000 1.000 N NA
 589299 589300 ACIAD1879 ACIAD1880 adhC   TRUE 0.975 22.000 0.531 NA   NA
 589302 589303 ACIAD1882 ACIAD1883     TRUE 0.898 2.000 0.000 NA   NA
 589303 589304 ACIAD1883 ACIAD1884     TRUE 0.966 8.000 0.049 NA   NA
 589304 589305 ACIAD1884 ACIAD1885     TRUE 0.934 15.000 0.035 NA   NA
 589305 589306 ACIAD1885 ACIAD1886     TRUE 0.902 29.000 0.198 NA   NA
 589308 589309 ACIAD1888 ACIAD1889     FALSE 0.046 132.000 0.000 NA   NA
 589309 589310 ACIAD1889 ACIAD1890   fumC FALSE 0.102 96.000 0.000 NA   NA
 589310 589311 ACIAD1890 ACIAD1891 fumC   FALSE 0.058 149.000 0.003 1.000 N NA
 589312 589313 ACIAD1892 ACIAD1893     TRUE 0.940 45.000 0.790 NA   NA
 589313 589314 ACIAD1893 ACIAD1894     TRUE 0.889 8.000 0.000 NA   NA
 589314 589315 ACIAD1894 ACIAD1895     TRUE 0.673 24.000 0.000 NA   NA
 589318 589319 ACIAD1899 ACIAD1900 modC modB TRUE 0.954 -3.000 0.018 1.000   NA
 589319 589320 ACIAD1900 ACIAD1901 modB modA TRUE 0.999 9.000 0.627 0.001 Y NA
 589320 589321 ACIAD1901 ACIAD1902 modA moeA TRUE 0.864 11.000 0.000 1.000 N NA
 589321 589322 ACIAD1902 ACIAD1903 moeA moaCB TRUE 0.997 0.000 0.006 0.001 Y NA
 589322 589323 ACIAD1903 ACIAD1904 moaCB moaE TRUE 0.991 21.000 0.026 0.001 Y NA
 589323 589324 ACIAD1904 ACIAD1905 moaE   TRUE 0.900 -43.000 0.014 1.000   NA
 589324 589325 ACIAD1905 ACIAD1906   moaA TRUE 0.985 1.000 0.200 1.000   NA
 589325 589326 ACIAD1906 ACIAD1907 moaA mobA FALSE 0.273 128.000 0.000 NA Y NA
 589326 589327 ACIAD1907 ACIAD1908 mobA nasA TRUE 0.866 -24.000 0.009 NA N NA
 589327 589328 ACIAD1908 ACIAD1909 nasA   TRUE 0.909 34.000 0.069 0.057 N NA
 589328 589329 ACIAD1909 ACIAD1910   nasD TRUE 0.987 12.000 0.017 0.001 N NA
 589329 589330 ACIAD1910 ACIAD1911 nasD   TRUE 0.989 10.000 0.413 1.000 N NA
 589331 589332 ACIAD1912 ACIAD1913   nasT FALSE 0.010 323.000 0.000 NA   NA
 589332 589333 ACIAD1913 ACIAD1914 nasT   TRUE 0.933 -13.000 0.060 NA N NA
 589333 589334 ACIAD1914 ACIAD1915     FALSE 0.018 176.000 0.000 NA N NA
 589334 589335 ACIAD1915 ACIAD1916   fdhD TRUE 0.999 -7.000 0.500 0.001 Y NA
 589337 589338 ACIAD1918 ACIAD1919     TRUE 0.762 -45.000 0.000 NA   NA
 589340 589341 ACIAD1921 ACIAD1922 ppiB lpxH TRUE 0.960 20.000 0.237 1.000   NA
 589341 589342 ACIAD1922 ACIAD1923 lpxH nfnB FALSE 0.106 105.000 0.000 1.000   NA
 589343 589344 ACIAD1924 ACIAD1925   fda FALSE 0.287 64.000 0.000 1.000   NA
 589344 589345 ACIAD1925 ACIAD1926 fda   FALSE 0.156 122.000 0.032 NA   NA
 589345 589346 ACIAD1926 ACIAD1927   pgk FALSE 0.056 149.000 0.003 NA   NA
 589347 589348 ACIAD1928 ACIAD1929     TRUE 0.889 8.000 0.000 NA   NA
 589348 589349 ACIAD1929 ACIAD1930     TRUE 0.943 0.000 0.006 NA   NA
 589351 589352 ACIAD1933 ACIAD1934     FALSE 0.064 116.000 0.000 NA   NA
 589353 589354 ACIAD1935 ACIAD1936     FALSE 0.020 166.000 0.000 NA N NA
 589354 589355 ACIAD1936 ACIAD1937   braG FALSE 0.009 260.000 0.000 NA N NA
 589355 589356 ACIAD1937 ACIAD1938 braG   TRUE 0.970 15.000 0.000 NA Y NA
 589356 589357 ACIAD1938 ACIAD1939   braE TRUE 0.969 26.000 0.111 NA Y NA
 589357 589358 ACIAD1939 ACIAD1940 braE   TRUE 0.999 3.000 0.846 0.053 Y NA
 589358 589359 ACIAD1940 ACIAD1941   braF TRUE 0.921 28.000 0.000 1.000 Y NA
 589359 589360 ACIAD1941 ACIAD1942 braF   TRUE 0.889 7.000 0.000 1.000 N NA
 589360 589361 ACIAD1942 ACIAD1943     FALSE 0.133 200.000 0.000 NA Y NA
 589361 589362 ACIAD1943 ACIAD1944     TRUE 0.967 1.000 0.044 NA   NA
 589362 589363 ACIAD1944 ACIAD1945   murB TRUE 0.950 7.000 0.011 NA   NA
 589363 589364 ACIAD1945 ACIAD1946 murB   TRUE 0.867 25.000 0.050 1.000 N NA
 589364 589365 ACIAD1946 ACIAD1948   csp FALSE 0.006 668.000 0.000 1.000 N NA
 589366 589367 ACIAD1949 ACIAD1950     FALSE 0.200 71.000 0.000 NA   NA
 589367 589368 ACIAD1950 ACIAD1951     TRUE 0.981 -3.000 0.185 1.000   NA
 589369 589370 ACIAD1952 ACIAD1953 terZ   TRUE 0.851 33.000 0.135 NA   NA
 589370 589371 ACIAD1953 ACIAD1954     TRUE 0.847 13.000 0.000 NA   NA
 589371 589372 ACIAD1954 ACIAD1955   terE TRUE 0.927 68.000 0.069 0.006 Y NA
 589372 589373 ACIAD1955 ACIAD1956 terE   FALSE 0.153 89.000 0.000 1.000   NA
 589373 589374 ACIAD1956 ACIAD1957   terD TRUE 0.762 61.000 0.238 1.000   NA
 589374 589375 ACIAD1957 ACIAD1958 terD terA FALSE 0.399 104.000 0.000 0.006   NA
 589375 589376 ACIAD1958 ACIAD1959 terA   TRUE 0.864 26.000 0.039 1.000   NA
 589376 589377 ACIAD1959 ACIAD1960     TRUE 0.991 5.000 0.420 NA   NA
 589377 589378 ACIAD1960 ACIAD1961     TRUE 0.969 -16.000 0.222 NA   NA
 589378 589379 ACIAD1961 ACIAD1962     TRUE 0.951 -16.000 0.100 NA   NA
 589379 589380 ACIAD1962 ACIAD1963     TRUE 0.835 43.000 0.217 1.000   NA
 589380 589381 ACIAD1963 ACIAD1964     TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.073   NA
 589381 589382 ACIAD1964 ACIAD1965     TRUE 0.988 -7.000 0.452 1.000   NA
 589382 589383 ACIAD1965 ACIAD1966     TRUE 0.985 22.000 0.789 NA   NA
 589383 589384 ACIAD1966 ACIAD1967     TRUE 0.961 34.000 0.750 NA   NA
 589384 589385 ACIAD1967 ACIAD1968   terX TRUE 0.823 38.000 0.164 NA   NA
 589385 589386 ACIAD1968 ACIAD1969 terX terY TRUE 0.864 35.000 0.200 NA   NA
 589386 589387 ACIAD1969 ACIAD1970 terY dnaX FALSE 0.007 530.000 0.000 NA   NA
 589387 589388 ACIAD1970 ACIAD1971 dnaX smvA FALSE 0.067 142.000 0.005 1.000 N NA
 589390 589391 ACIAD1974 ACIAD1975     TRUE 0.593 62.000 0.067 1.000   NA
 589391 589392 ACIAD1975 ACIAD1976     TRUE 0.784 83.000 0.263 0.070   NA
 589395 589396 ACIAD1979 ACIAD1980   tal TRUE 0.667 73.000 0.250 1.000 N NA
 589396 589397 ACIAD1980 ACIAD1981 tal   TRUE 0.495 74.000 0.087 1.000 N NA
 589397 589398 ACIAD1981 ACIAD1982     FALSE 0.068 112.000 0.000 1.000 N NA
 589399 589400 ACIAD1983 ACIAD1984   mgtA TRUE 0.974 8.000 0.072 1.000   NA
 589400 589401 ACIAD1984 ACIAD1985 mgtA   FALSE 0.095 100.000 0.000 NA   NA
 589401 589402 ACIAD1985 ACIAD1986     FALSE 0.011 294.000 0.000 NA   NA
 589402 589403 ACIAD1986 ACIAD1987   map FALSE 0.037 144.000 0.000 NA   NA
 589404 589405 ACIAD1988 ACIAD1989 braZ   FALSE 0.007 514.000 0.000 NA   NA
 589405 589406 ACIAD1989 ACIAD1990   fruB FALSE 0.007 487.000 0.000 NA   NA
 589406 589407 ACIAD1990 ACIAD1992 fruB fruK TRUE 0.994 6.000 0.101 1.000 Y NA
 589407 589408 ACIAD1992 ACIAD1993 fruK fruA TRUE 0.998 2.000 0.562 1.000 Y NA
 589408 589409 ACIAD1993 ACIAD1995 fruA   FALSE 0.028 167.000 0.000 NA   NA
 589412 589413 ACIAD1998 ACIAD1999 dadA ispD FALSE 0.008 382.000 0.000 1.000 N NA
 589413 589414 ACIAD1999 ACIAD2000 ispD   TRUE 0.957 -34.000 0.185 1.000 N NA
 589414 589415 ACIAD2000 ACIAD2001   eno TRUE 0.683 70.000 0.241 1.000 N NA
 589415 589416 ACIAD2001 ACIAD2002 eno kdsA TRUE 0.789 40.000 0.125 1.000 N NA
 589416 589417 ACIAD2002 ACIAD2003 kdsA pyrG TRUE 0.890 28.000 0.138 1.000 N NA
 589418 589419 ACIAD2004 ACIAD2005     FALSE 0.018 219.000 0.000 NA   NA
 589420 589421 ACIAD2006 ACIAD2007     FALSE 0.006 627.000 0.000 NA   NA
 589421 589422 ACIAD2007 ACIAD2008   pepN FALSE 0.073 121.000 0.000 1.000   NA
 589423 589424 ACIAD2009 ACIAD2010     FALSE 0.232 157.000 0.273 NA   NA
 589424 589425 ACIAD2010 ACIAD2011   thiM TRUE 0.805 25.000 0.010 NA   NA
 589426 589427 ACIAD2012 ACIAD2013     TRUE 0.489 62.000 0.027 1.000 N NA
 589427 589428 ACIAD2013 ACIAD2014     TRUE 0.972 14.000 0.174 1.000   NA
 589429 589430 ACIAD2015 ACIAD2016     FALSE 0.188 179.000 0.308 NA N NA
 589432 589433 ACIAD2018 ACIAD2019 ald1   FALSE 0.036 143.000 0.000 1.000 N NA
 589434 589435 ACIAD2020 ACIAD2021     FALSE 0.075 110.000 0.000 NA   NA
 589436 589437 ACIAD2022 ACIAD2023     TRUE 0.778 76.000 0.581 NA N NA
 589437 589438 ACIAD2023 ACIAD2024     TRUE 0.987 -27.000 0.651 NA   NA
 589438 589439 ACIAD2024 ACIAD2025     FALSE 0.027 171.000 0.000 NA   NA
 589439 589440 ACIAD2025 ACIAD2026     FALSE 0.027 171.000 0.000 NA   NA
 589440 589441 ACIAD2026 ACIAD2027     FALSE 0.367 44.000 0.000 NA   NA
 589442 589443 ACIAD2028 ACIAD2029 aroC   TRUE 0.959 13.000 0.081 1.000 N NA
 589443 589444 ACIAD2029 ACIAD2031     FALSE 0.013 259.000 0.000 NA   NA
 589446 589447 ACIAD2034 ACIAD2035   tkt FALSE 0.011 300.000 0.000 NA   NA
 589454 589455 ACIAD2043 ACIAD2045   bioB TRUE 0.697 67.000 0.005 0.010 N NA
 589455 589456 ACIAD2045 ACIADtRNAMet_45 bioB   FALSE 0.006 1210.000 0.000 NA   NA
 589456 589457 ACIADtRNAMet_45 ACIAD2048     FALSE 0.006 975.000 0.000 NA   NA
 589457 589458 ACIAD2048 ACIAD2049     FALSE 0.092 276.000 0.000 1.000 Y NA
 589458 589459 ACIAD2049 ACIAD2050     FALSE 0.010 398.000 0.000 1.000   NA
 589459 589460 ACIAD2050 ACIAD2052     FALSE 0.060 166.000 0.009 NA   NA
 589463 589464 ACIAD2056 ACIAD2058 gltL gltK TRUE 0.996 15.000 0.581 1.000 Y NA
 589464 589465 ACIAD2058 ACIAD2059 gltK gltJ TRUE 1.000 3.000 0.897 0.010 Y NA
 589465 589466 ACIAD2059 ACIAD2061 gltJ gltI FALSE 0.410 243.000 0.111 0.052 Y NA
 589466 589467 ACIAD2061 ACIAD2062 gltI   FALSE 0.004 611.000 0.000 NA N NA
 589468 589469 ACIAD2064 ACIAD2065     TRUE 0.998 -22.000 0.500 0.009 Y NA
 589469 589470 ACIAD2065 ACIAD2066     TRUE 0.991 0.000 0.452 NA N NA
 589470 589471 ACIAD2066 ACIAD2068   metQ TRUE 0.955 16.000 0.154 NA N NA
 589471 589472 ACIAD2068 ACIAD2069 metQ metN TRUE 0.941 23.000 0.000 NA Y NA
 589472 589473 ACIAD2069 ACIAD2070 metN metI TRUE 0.987 -19.000 0.111 1.000 Y NA
 589473 589474 ACIAD2070 ACIAD2071 metI   FALSE 0.189 88.000 0.003 1.000 N NA
 589474 589475 ACIAD2071 ACIAD2072   sodM FALSE 0.027 167.000 0.000 1.000 N NA
 589475 589476 ACIAD2072 ACIAD2074 sodM   FALSE 0.009 353.000 0.000 NA   NA
 589478 589479 ACIAD2077 ACIAD2078   purT FALSE 0.099 150.000 0.019 1.000   NA
 589479 589480 ACIAD2078 ACIAD2079 purT glnD TRUE 0.859 22.000 0.019 1.000 N NA
 589480 589481 ACIAD2079 ACIAD2080 glnD   TRUE 0.932 27.000 0.257 1.000 N NA
 589482 589483 ACIAD2081 ACIAD2082     FALSE 0.031 158.000 0.000 NA   NA
 589483 589484 ACIAD2082 ACIAD2083     FALSE 0.119 155.000 0.000 0.096 N NA
 589484 589485 ACIAD2083 ACIAD2084     TRUE 0.778 51.000 0.214 1.000 N NA
 589485 589486 ACIAD2084 ACIAD2085   gpo TRUE 0.872 38.000 0.273 1.000 N NA
 589486 589487 ACIAD2085 ACIAD2086 gpo msrB TRUE 0.989 -3.000 0.016 1.000 Y NA
 589488 589489 ACIAD2087 ACIAD2088   aspQ FALSE 0.070 350.000 0.000 1.000 Y NA
 589489 589490 ACIAD2088 ACIAD2089 aspQ dnaE FALSE 0.035 147.000 0.000 1.000 N NA
 589490 589491 ACIAD2089 ACIAD2090 dnaE   FALSE 0.278 56.000 0.000 1.000 N NA
 589491 589492 ACIAD2090 ACIAD2091   cysE TRUE 0.833 -7.000 0.000 1.000 N NA
 589492 589493 ACIAD2091 ACIAD2092 cysE   FALSE 0.430 74.000 0.026 1.000   NA
 589493 589494 ACIAD2092 ACIAD2094     FALSE 0.019 211.000 0.000 NA   NA
 589496 589497 ACIAD2096 ACIAD2097     FALSE 0.274 58.000 0.000 NA   NA
 589497 589498 ACIAD2097 ACIAD2098     FALSE 0.016 238.000 0.000 NA   NA
 589501 589502 ACIAD2101 ACIAD2102   hrpA TRUE 0.916 16.000 0.036 NA N NA
 589504 589505 ACIAD2104 ACIAD2105     TRUE 0.976 20.000 0.500 NA   NA
 589505 589506 ACIAD2105 ACIAD2106     TRUE 0.991 13.000 0.610 NA   NA
 589506 589507 ACIAD2106 ACIAD2107     TRUE 0.993 -10.000 0.923 NA   NA
 589513 589514 ACIAD2114 ACIAD2115     FALSE 0.036 146.000 0.000 NA   NA
 589514 589515 ACIAD2115 ACIAD2116     FALSE 0.022 188.000 0.000 NA   NA
 589515 589516 ACIAD2116 ACIAD2117     FALSE 0.200 71.000 0.000 NA   NA
 589516 589517 ACIAD2117 ACIAD2118     TRUE 0.771 -34.000 0.000 NA   NA
 589517 589518 ACIAD2118 ACIAD2119     TRUE 0.970 -15.000 0.222 NA   NA
 589518 589519 ACIAD2119 ACIAD2120     TRUE 0.893 7.000 0.000 NA   NA
 589519 589520 ACIAD2120 ACIAD2121     TRUE 0.995 -15.000 0.049 0.001 Y NA
 589520 589521 ACIAD2121 ACIAD2122     TRUE 0.965 18.000 0.241 1.000 N NA
 589521 589522 ACIAD2122 ACIAD2123     TRUE 0.986 4.000 0.273 NA N NA
 589522 589523 ACIAD2123 ACIAD2124     TRUE 0.988 -7.000 0.070 NA Y NA
 589523 589524 ACIAD2124 ACIAD2125     FALSE 0.008 710.000 0.000 1.000   NA
 589527 589528 ACIAD2130 ACIAD2131     FALSE 0.128 87.000 0.000 NA   NA
 589529 589530 ACIAD2132 ACIAD2133     TRUE 0.768 18.000 0.000 NA   NA
 589530 589531 ACIAD2133 ACIAD2134     TRUE 0.849 -6.000 0.000 NA   NA
 589531 589532 ACIAD2134 ACIAD2135     FALSE 0.014 255.000 0.000 NA   NA
 589532 589533 ACIAD2135 ACIAD2136     TRUE 0.874 -3.000 0.000 NA   NA
 589533 589534 ACIAD2136 ACIAD2137     FALSE 0.177 75.000 0.000 NA   NA
 589536 589537 ACIAD2140 ACIAD2142     FALSE 0.014 249.000 0.000 NA   NA
 589538 589539 ACIAD2143 ACIAD2144     FALSE 0.010 327.000 0.000 NA   NA
 589540 589541 ACIAD2145 ACIAD2146     TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 589541 589542 ACIAD2146 ACIAD2148     FALSE 0.340 48.000 0.000 NA   NA
 589542 589543 ACIAD2148 ACIAD2149     TRUE 0.898 3.000 0.000 NA   NA
 589543 589544 ACIAD2149 ACIAD2151     FALSE 0.367 44.000 0.000 NA   NA
 589544 589545 ACIAD2151 ACIAD2152     TRUE 0.874 -3.000 0.000 NA   NA
 589545 589546 ACIAD2152 ACIAD2153     TRUE 0.861 12.000 0.000 NA   NA
 589546 589547 ACIAD2153 ACIAD2154     FALSE 0.237 64.000 0.000 NA   NA
 589547 589548 ACIAD2154 ACIAD2155     TRUE 0.975 -3.000 0.130 NA   NA
 589548 589549 ACIAD2155 ACIAD2156     TRUE 0.877 10.000 0.000 NA   NA
 589549 589550 ACIAD2156 ACIAD2157     FALSE 0.055 123.000 0.000 NA   NA
 589550 589551 ACIAD2157 ACIAD2158     FALSE 0.183 74.000 0.000 NA   NA
 589551 589552 ACIAD2158 ACIAD2159     TRUE 0.995 12.000 1.000 NA   NA
 589552 589553 ACIAD2159 ACIAD2160     TRUE 0.972 -18.000 0.250 NA   NA
 589553 589554 ACIAD2160 ACIAD2161     TRUE 0.902 60.000 0.750 NA   NA
 589554 589555 ACIAD2161 ACIAD2162     TRUE 0.986 -10.000 0.500 NA   NA
 589555 589556 ACIAD2162 ACIAD2164     FALSE 0.018 212.000 0.000 NA   NA
 589556 589557 ACIAD2164 ACIAD2165     TRUE 0.981 8.000 0.182 NA   NA
 589557 589558 ACIAD2165 ACIAD2166     TRUE 0.957 14.000 0.091 NA   NA
 589558 589559 ACIAD2166 ACIAD2167     TRUE 0.982 7.000 0.182 NA   NA
 589559 589560 ACIAD2167 ACIAD2168     TRUE 0.973 12.000 0.139 NA   NA
 589560 589561 ACIAD2168 ACIAD2169     FALSE 0.292 55.000 0.000 NA   NA
 589561 589562 ACIAD2169 ACIAD2170     FALSE 0.190 73.000 0.000 NA   NA
 589564 589565 ACIAD2173 ACIAD2174     TRUE 0.835 44.000 0.250 NA   NA
 589565 589566 ACIAD2174 ACIAD2175     TRUE 0.969 9.000 0.074 NA   NA
 589566 589567 ACIAD2175 ACIAD2176     TRUE 0.939 -22.000 0.074 NA   NA
 589567 589568 ACIAD2176 ACIAD2177     TRUE 0.848 60.000 0.500 NA   NA
 589568 589569 ACIAD2177 ACIAD2178     TRUE 0.816 -31.000 0.000 1.000   NA
 589569 589570 ACIAD2178 ACIAD2179     FALSE 0.212 69.000 0.000 NA   NA
 589570 589571 ACIAD2179 ACIAD2180     FALSE 0.011 303.000 0.000 NA   NA
 589571 589572 ACIAD2180 ACIAD2181     FALSE 0.019 210.000 0.000 NA   NA
 589572 589573 ACIAD2181 ACIAD2182     TRUE 0.985 13.000 0.385 NA   NA
 589573 589574 ACIAD2182 ACIAD2183     FALSE 0.171 76.000 0.000 NA   NA
 589574 589575 ACIAD2183 ACIAD2184     TRUE 0.800 16.000 0.000 NA   NA
 589575 589576 ACIAD2184 ACIAD2185     FALSE 0.340 48.000 0.000 NA   NA
 589576 589577 ACIAD2185 ACIAD2186     TRUE 0.849 -6.000 0.000 NA   NA
 589577 589578 ACIAD2186 ACIAD2187     TRUE 0.892 0.000 0.000 NA   NA
 589578 589579 ACIAD2187 ACIAD2188     TRUE 0.806 -15.000 0.000 NA   NA
 589579 589580 ACIAD2188 ACIAD2189     TRUE 0.652 25.000 0.000 NA   NA
 589581 589582 ACIAD2190 ACIAD2191     TRUE 0.897 5.000 0.000 NA   NA
 589582 589583 ACIAD2191 ACIAD2192     TRUE 0.996 3.000 0.833 NA   NA
 589583 589584 ACIAD2192 ACIAD2193     TRUE 0.779 -28.000 0.000 NA   NA
 589584 589585 ACIAD2193 ACIAD2194     FALSE 0.098 98.000 0.000 NA   NA
 589585 589586 ACIAD2194 ACIAD2195     TRUE 0.765 -40.000 0.000 NA   NA
 589586 589587 ACIAD2195 ACIAD2196     TRUE 0.757 -58.000 0.000 NA   NA
 589587 589588 ACIAD2196 ACIAD2197     TRUE 0.874 -3.000 0.000 NA   NA
 589588 589589 ACIAD2197 ACIAD2199     FALSE 0.015 247.000 0.000 NA   NA
 589590 589591 ACIAD2200 ACIADtRNAVal_46     FALSE 0.019 207.000 0.000 NA   NA
 589591 589592 ACIADtRNAVal_46 ACIAD2201     TRUE 0.652 25.000 0.000 NA   NA
 589592 589593 ACIAD2201 ACIAD2202     TRUE 0.995 2.000 0.727 NA   NA
 589593 589594 ACIAD2202 ACIAD2203     TRUE 0.988 18.000 0.739 NA   NA
 589594 589595 ACIAD2203 ACIAD2204     FALSE 0.043 136.000 0.000 NA   NA
 589595 589596 ACIAD2204 ACIAD2205   cstA TRUE 0.629 66.000 0.143 NA   NA
 589596 589597 ACIAD2205 ACIAD2206 cstA efp FALSE 0.046 164.000 0.002 1.000 N NA
 589598 589599 ACIAD2207 ACIAD2208     TRUE 0.920 19.000 0.069 NA   NA
 589599 589600 ACIAD2208 ACIAD2209     TRUE 0.959 25.000 0.400 NA   NA
 589601 589602 ACIAD2210 ACIAD2212 rpmE   FALSE 0.041 203.000 0.004 1.000   NA
 589602 589603 ACIAD2212 ACIAD2213   gloA FALSE 0.236 102.000 0.019 1.000   NA
 589603 589604 ACIAD2213 ACIAD2214 gloA   TRUE 0.959 3.000 0.019 NA   NA
 589606 589607 ACIAD2217 ACIAD2218     TRUE 0.695 32.000 0.009 NA   NA
 589609 589610 ACIAD2220 ACIAD2221 pepD   FALSE 0.339 78.000 0.019 NA   NA
 589610 589611 ACIAD2221 ACIAD2222     FALSE 0.094 123.000 0.004 NA   NA
 589611 589612 ACIAD2222 ACIAD2223   pheA TRUE 0.568 106.000 0.035 1.000 Y NA
 589613 589614 ACIAD2224 ACIAD2225     FALSE 0.040 139.000 0.000 NA   NA
 589615 589616 ACIAD2226 ACIAD2227   dctA FALSE 0.102 162.000 0.059 1.000 N NA
 589618 589619 ACIAD2230 ACIAD2231     TRUE 0.949 -3.000 0.019 NA   NA
 589620 589621 ACIAD2233 ACIAD2234   mrcB TRUE 0.745 19.000 0.000 NA   NA
 589621 589622 ACIAD2234 ACIAD2235 mrcB   TRUE 0.958 11.000 0.028 1.000   NA
 589623 589624 ACIAD2236 ACIAD2238     FALSE 0.009 355.000 0.000 1.000 N NA
 589624 589625 ACIAD2238 ACIAD2239     TRUE 0.999 5.000 0.600 0.094 Y NA
 589625 589626 ACIAD2239 ACIAD2240     TRUE 0.555 108.000 0.429 1.000   NA
 589626 589627 ACIAD2240 ACIAD2241     TRUE 0.536 68.000 0.055 1.000   NA
 589632 589633 ACIAD2246 ACIAD2247     TRUE 0.658 51.000 0.000 0.093 N NA
 589633 589634 ACIAD2247 ACIAD2248   hyu FALSE 0.352 144.000 0.458 1.000 N NA
 589635 589636 ACIAD2249 ACIAD2250   ahpF FALSE 0.061 279.000 0.000 0.055   NA
 589636 589637 ACIAD2250 ACIAD2251 ahpF   FALSE 0.190 73.000 0.000 NA   NA
 589637 589638 ACIAD2251 ACIAD2252     TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 589638 589639 ACIAD2252 ACIAD2254     TRUE 0.954 0.000 0.016 NA   NA
 589639 589640 ACIAD2254 ACIAD2255   glyA FALSE 0.012 278.000 0.000 NA   NA
 589640 589641 ACIAD2255 ACIAD2256 glyA   FALSE 0.032 156.000 0.000 NA   NA
 589642 589643 ACIAD2257 ACIADtRNAArg_47     FALSE 0.007 522.000 0.000 NA   NA
 589643 589644 ACIADtRNAArg_47 ACIAD2259     FALSE 0.018 213.000 0.000 NA   NA
 589644 589645 ACIAD2259 ACIAD2260     TRUE 0.999 0.000 0.688 0.070 Y NA
 589645 589646 ACIAD2260 ACIAD2261     TRUE 0.975 -3.000 0.110 1.000   NA
 589646 589647 ACIAD2261 ACIAD2262     TRUE 0.858 23.000 0.022 NA   NA
 589647 589648 ACIAD2262 ACIAD2263   rodA FALSE 0.044 186.000 0.006 NA   NA
 589648 589649 ACIAD2263 ACIAD2264 rodA mltB TRUE 0.752 38.000 0.096 NA N NA
 589649 589650 ACIAD2264 ACIAD2265 mltB   FALSE 0.027 284.000 0.012 NA   NA
 589650 589651 ACIAD2265 ACIAD2266     FALSE 0.007 464.000 0.000 NA   NA
 589652 589653 ACIAD2267 ACIAD2268   tsf FALSE 0.351 65.000 0.004 NA   NA
 589653 589654 ACIAD2268 ACIAD2269 tsf rpsB TRUE 0.783 136.000 0.748 1.000 Y NA
 589655 589656 ACIAD2271 ACIAD2272 map   FALSE 0.020 199.000 0.000 1.000 N NA
 589658 589659 ACIAD2275 ACIAD2277 lipA   FALSE 0.010 312.000 0.000 1.000 N NA
 589659 589660 ACIAD2277 ACIAD2278     FALSE 0.403 87.000 0.073 1.000   NA
 589664 589665 ACIAD2282 ACIAD2283 sahH metF TRUE 0.466 73.000 0.061 1.000 N NA
 589665 589666 ACIAD2283 ACIAD2284 metF   TRUE 0.870 23.000 0.031 NA   NA
 589666 589667 ACIAD2284 ACIAD2286     FALSE 0.009 343.000 0.000 NA   NA
 589667 589668 ACIAD2286 ACIAD2287     FALSE 0.007 513.000 0.000 NA   NA
 589668 589669 ACIAD2287 ACIAD2288   cca FALSE 0.270 88.000 0.019 1.000 N NA
 589669 589670 ACIAD2288 ACIAD2290 cca cydA FALSE 0.006 861.000 0.000 1.000 N NA
 589670 589671 ACIAD2290 ACIAD2291 cydA cydB TRUE 0.999 -3.000 0.727 0.054 Y NA
 589671 589672 ACIAD2291 ACIAD2292 cydB   TRUE 0.538 64.000 0.060 NA   NA
 589673 589674 ACIAD2293 ACIAD2294     TRUE 0.581 81.000 0.222 NA   NA
 589674 589675 ACIAD2294 ACIAD2295     FALSE 0.020 206.000 0.000 NA   NA
 589675 589676 ACIAD2295 ACIAD2296   ftsY FALSE 0.042 194.000 0.003 1.000   NA
 589677 589678 ACIAD2298 ACIAD2299     TRUE 0.996 15.000 0.598 0.004   NA
 589679 589680 ACIAD2300 ACIAD2301     TRUE 0.675 113.000 0.800 NA   NA
 589681 589682 ACIAD2302 ACIAD2303     FALSE 0.050 127.000 0.000 NA   NA
 589682 589683 ACIAD2303 ACIAD2305     FALSE 0.174 135.000 0.097 NA   NA
 589684 589685 ACIAD2306 ACIAD2307     TRUE 0.987 13.000 0.431 NA   NA
 589685 589686 ACIAD2307 ACIAD2308     TRUE 0.864 22.000 0.020 NA   NA
 589686 589687 ACIAD2308 ACIAD2309     TRUE 0.942 -7.000 0.032 NA   NA
 589687 589688 ACIAD2309 ACIAD2310   rnd TRUE 0.476 74.000 0.073 NA   NA
 589688 589689 ACIAD2310 ACIAD2312 rnd recR FALSE 0.177 189.000 0.018 0.010 N NA
 589689