MicrobesOnline Operon Predictions for Hydrogenobacter thermophilus TK-6

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10375717 10375718 HTH_0001 HTH_0002 dnaA   FALSE 0.294 22.000 0.000 NA   NA
 10375718 10375719 HTH_0002 HTH_0003     TRUE 0.946 2.000 0.056 NA   NA
 10375720 10375721 HTH_0004 HTH_t01     TRUE 0.592 7.000 0.000 NA   NA
 10375722 10375723 HTH_t02 HTH_0005     FALSE 0.533 12.000 0.000 NA   NA
 10375723 10375724 HTH_0005 HTH_0006     TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10375725 10375726 HTH_0007 HTH_0008   amnT1 TRUE 0.800 2.000 0.000 1.000 Y NA
 10375726 10375727 HTH_0008 HTH_0009 amnT1 fabI TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10375727 10375728 HTH_0009 HTH_0010 fabI   TRUE 0.951 13.000 0.185 0.062 N NA
 10375728 10375729 HTH_0010 HTH_0011     TRUE 0.960 4.000 0.222 1.000   NA
 10375729 10375730 HTH_0011 HTH_0012   mobB FALSE 0.581 10.000 0.000 1.000   NA
 10375730 10375731 HTH_0012 HTH_0013 mobB manB FALSE 0.521 3.000 0.000 1.000 N NA
 10375733 10375734 HTH_0014 HTH_0015   hsdR TRUE 0.967 -10.000 0.114 NA   NA
 10375734 10375735 HTH_0015 HTH_0016 hsdR   TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 10375735 10375736 HTH_0016 HTH_0017     TRUE 0.763 -7.000 0.000 NA   NA
 10375736 10375737 HTH_0017 HTH_0018   hsdS TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10375737 10375738 HTH_0018 HTH_0019 hsdS hsdM TRUE 0.990 -7.000 0.135 0.046 Y NA
 10375738 10375739 HTH_0019 HTH_0020 hsdM   TRUE 0.789 3.000 0.000 0.046   NA
 10375740 10375741 HTH_0021 HTH_0022   nusA TRUE 0.992 -6.000 0.759 NA   NA
 10375741 10375742 HTH_0022 HTH_0023 nusA trmA TRUE 0.944 -3.000 0.004 0.031 N NA
 10375742 10375743 HTH_0023 HTH_0024 trmA nrdA FALSE 0.020 223.000 0.000 1.000 N NA
 10375743 10375744 HTH_0024 HTH_0025 nrdA nrdF TRUE 0.985 13.000 0.393 0.002 Y NA
 10375745 10375746 HTH_0026 HTH_0027     TRUE 0.696 -24.000 0.000 0.058   NA
 10375746 10375747 HTH_0027 HTH_0028     TRUE 0.981 0.000 0.333 1.000   NA
 10375747 10375748 HTH_0028 HTH_0029     TRUE 0.988 -3.000 0.600 1.000 N NA
 10375748 10375749 HTH_0029 HTH_0030     TRUE 0.966 -3.000 0.086 1.000 N NA
 10375749 10375750 HTH_0030 HTH_0031     TRUE 0.941 0.000 0.033 1.000 N NA
 10375750 10375751 HTH_0031 HTH_0032     TRUE 0.982 -3.000 0.098 1.000 Y NA
 10375752 10375753 HTH_0033 HTH_0034     FALSE 0.063 57.000 0.000 NA N NA
 10375753 10375754 HTH_0034 HTH_0035     FALSE 0.359 19.000 0.000 1.000   NA
 10375754 10375755 HTH_0035 HTH_0036     FALSE 0.583 9.000 0.000 NA   NA
 10375755 10375756 HTH_0036 HTH_0037   proA FALSE 0.157 28.000 0.000 NA N NA
 10375759 10375760 HTH_0040 HTH_0041 mutS1   TRUE 0.852 -19.000 0.009 1.000   NA
 10375760 10375761 HTH_0041 HTH_0042     TRUE 0.958 -10.000 0.059 1.000   NA
 10375761 10375762 HTH_0042 HTH_0043   pheT FALSE 0.055 193.000 0.002 1.000 N NA
 10375763 10375764 HTH_0044 HTH_0045     TRUE 0.759 3.000 0.000 1.000 Y NA
 10375764 10375765 HTH_0045 HTH_0046     FALSE 0.233 21.000 0.000 1.000 N NA
 10375765 10375766 HTH_0046 HTH_0047     TRUE 0.987 -9.000 0.286 1.000 Y NA
 10375766 10375767 HTH_0047 HTH_0048     TRUE 0.979 2.000 0.214 1.000 Y NA
 10375768 10375769 HTH_0049 HTH_0050 rnhC   FALSE 0.062 76.000 0.000 NA   NA
 10375773 10375774 HTH_0054 HTH_0055     FALSE 0.467 -19.000 0.000 1.000 N NA
 10375774 10375775 HTH_0055 HTH_0056     FALSE 0.159 40.000 0.000 1.000   NA
 10375775 10375776 HTH_0056 HTH_0057     TRUE 0.724 15.000 0.000 0.003   NA
 10375777 10375778 HTH_0058 HTH_0059     FALSE 0.064 73.000 0.000 NA   NA
 10375778 10375779 HTH_0059 HTH_0060     FALSE 0.533 12.000 0.000 NA   NA
 10375779 10375780 HTH_0060 HTH_0061     TRUE 0.920 0.000 0.008 NA   NA
 10375780 10375781 HTH_0061 HTH_0062   bacA TRUE 0.962 0.000 0.062 1.000   NA
 10375781 10375782 HTH_0062 HTH_0063 bacA ftsW FALSE 0.580 2.000 0.000 1.000 N NA
 10375782 10375783 HTH_0063 HTH_0064 ftsW ccmC FALSE 0.481 14.000 0.000 1.000   NA
 10375783 10375784 HTH_0064 HTH_0065 ccmC aroK TRUE 0.909 -10.000 0.007 1.000   NA
 10375785 10375786 HTH_0066 HTH_0067 ndk   FALSE 0.334 -31.000 0.000 1.000 N NA
 10375786 10375787 HTH_0067 HTH_0068   gcpE FALSE 0.479 10.000 0.000 1.000 N NA
 10375787 10375788 HTH_0068 HTH_0069 gcpE nadA TRUE 0.892 -3.000 0.004 1.000 N NA
 10375788 10375789 HTH_0069 HTH_0070 nadA   FALSE 0.128 46.000 0.000 NA   NA
 10375789 10375790 HTH_0070 HTH_0071   phoH TRUE 0.912 -79.000 0.457 NA   NA
 10375791 10375792 HTH_0072 HTH_0073 htpX   TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10375797 10375798 HTH_0078 HTH_0079     FALSE 0.472 10.000 0.000 NA N NA
 10375798 10375799 HTH_0079 HTH_0080     FALSE 0.476 14.000 0.000 NA   NA
 10375799 10375800 HTH_0080 HTH_0081   lysA FALSE 0.050 89.000 0.000 NA   NA
 10375800 10375801 HTH_0081 HTH_0082 lysA pgsA2 FALSE 0.380 14.000 0.000 1.000 N NA
 10375801 10375802 HTH_0082 HTH_0083 pgsA2   TRUE 0.692 -12.000 0.000 NA   NA
 10375802 10375803 HTH_0083 HTH_0084     TRUE 0.916 -9.000 0.006 NA   NA
 10375803 10375804 HTH_0084 HTH_0085   gmhA TRUE 0.958 -3.000 0.008 1.000 Y NA
 10375804 10375805 HTH_0085 HTH_0086 gmhA   FALSE 0.360 -28.000 0.000 1.000 N NA
 10375805 10375806 HTH_0086 HTH_0087   glgP1 FALSE 0.502 6.000 0.000 1.000 N NA
 10375806 10375807 HTH_0087 HTH_0088 glgP1 glgP2 TRUE 0.948 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 10375810 10375811 HTH_0091 HTH_0092 arsA hynS FALSE 0.067 56.000 0.000 1.000 N NA
 10375811 10375812 HTH_0092 HTH_0093 hynS   TRUE 0.984 2.000 0.600 NA   NA
 10375812 10375813 HTH_0093 HTH_0094     TRUE 0.945 13.000 0.273 NA   NA
 10375813 10375814 HTH_0094 HTH_0095   hynL TRUE 0.994 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 10375815 10375816 HTH_0096 HTH_0097 birA bioA TRUE 0.941 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 10375818 10375819 HTH_0099 HTH_0100     TRUE 0.954 0.000 0.041 NA   NA
 10375819 10375820 HTH_0100 HTH_0101     TRUE 0.987 -3.000 0.051 0.032 Y NA
 10375820 10375821 HTH_0101 HTH_0102     TRUE 0.676 2.000 0.000 1.000   NA
 10375821 10375822 HTH_0102 HTH_0103   pgmA FALSE 0.493 -25.000 0.000 1.000   NA
 10375822 10375823 HTH_0103 HTH_0104 pgmA amnT2 TRUE 0.941 -6.000 0.016 1.000 N NA
 10375825 10375826 HTH_0106 HTH_0107   pgk FALSE 0.570 -19.000 0.000 1.000   NA
 10375826 10375827 HTH_0107 HTH_0108 pgk   TRUE 0.747 14.000 0.004 NA   NA
 10375827 10375828 HTH_0108 HTH_0109   trpC TRUE 0.792 12.000 0.005 NA   NA
 10375828 10375829 HTH_0109 HTH_0110 trpC   TRUE 0.651 0.000 0.000 1.000 N NA
 10375829 10375830 HTH_0110 HTH_0111     TRUE 0.957 10.000 0.250 NA   NA
 10375830 10375831 HTH_0111 HTH_0112   mrcA FALSE 0.576 10.000 0.000 NA   NA
 10375832 10375833 HTH_0113 HTH_t03 ispE   TRUE 0.741 -9.000 0.000 NA   NA
 10375833 10375834 HTH_t03 HTH_0114   prsA FALSE 0.254 25.000 0.000 NA   NA
 10375834 10375835 HTH_0114 HTH_0115 prsA ctc TRUE 0.796 19.000 0.056 1.000 N NA
 10375835 10375836 HTH_0115 HTH_0116 ctc pth TRUE 0.994 0.000 0.496 0.047 Y NA
 10375837 10375838 HTH_0117 HTH_0118 tktA nuoG FALSE 0.507 5.000 0.000 1.000 N NA
 10375839 10375840 HTH_0119 HTH_0120 nuoE nuoF TRUE 0.992 -25.000 1.000 0.015 Y NA
 10375840 10375841 HTH_0120 HTH_0121 nuoF   FALSE 0.418 -33.000 0.000 NA   NA
 10375841 10375842 HTH_0121 HTH_0122     FALSE 0.062 75.000 0.000 NA   NA
 10375842 10375843 HTH_0122 HTH_0123   sam1 FALSE 0.410 13.000 0.000 1.000 N NA
 10375843 10375844 HTH_0123 HTH_0124 sam1   TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10375844 10375845 HTH_0124 HTH_0125   prmA TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10375845 10375846 HTH_0125 HTH_0126 prmA   TRUE 0.937 -3.000 0.014 1.000 N NA
 10375846 10375847 HTH_0126 HTH_0127     TRUE 0.718 -10.000 0.000 NA   NA
 10375848 10375849 HTH_0128 HTH_0129     TRUE 0.993 0.000 0.688 1.000 Y NA
 10375849 10375850 HTH_0129 HTH_0130     TRUE 0.876 -19.000 0.028 1.000 N NA
 10375850 10375851 HTH_0130 HTH_0131   dnaJ2 TRUE 0.949 -3.000 0.028 1.000 N NA
 10375852 10375853 HTH_0132 HTH_0133   tehB FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10375854 10375855 HTH_0134 HTH_0135     TRUE 0.892 -13.000 0.008 NA   NA
 10375855 10375856 HTH_0135 HTH_0136   mreC TRUE 0.901 -3.000 0.003 NA   NA
 10375856 10375857 HTH_0136 HTH_0137 mreC mreB TRUE 0.951 -3.000 0.030 1.000 N NA
 10375858 10375859 HTH_0138 HTH_0139 spoT   FALSE 0.309 17.000 0.000 1.000 N NA
 10375859 10375860 HTH_0139 HTH_0140     FALSE 0.239 26.000 0.000 NA   NA
 10375860 10375861 HTH_0140 HTH_0141   dapB TRUE 0.918 -3.000 0.004 NA   NA
 10375861 10375862 HTH_0141 HTH_0142 dapB   TRUE 0.896 -3.000 0.002 NA   NA
 10375863 10375864 HTH_0143 HTH_0144     TRUE 0.984 -19.000 1.000 NA   NA
 10375864 10375865 HTH_0144 HTH_0145   nirE FALSE 0.052 88.000 0.000 1.000   NA
 10375865 10375866 HTH_0145 HTH_0146 nirE nirF TRUE 0.969 -7.000 0.075 1.000   NA
 10375866 10375867 HTH_0146 HTH_0147 nirF nirJ TRUE 0.967 -12.000 0.151 1.000   NA
 10375867 10375868 HTH_0147 HTH_0148 nirJ   TRUE 0.960 -7.000 0.038 1.000   NA
 10375868 10375869 HTH_0148 HTH_0149   nirN TRUE 0.962 -16.000 0.062 0.033   NA
 10375869 10375870 HTH_0149 HTH_0150 nirN nirS TRUE 0.988 0.000 0.188 0.003   NA
 10375870 10375871 HTH_0150 HTH_0151 nirS   FALSE 0.142 68.000 0.000 0.092   NA
 10375871 10375872 HTH_0151 HTH_0152     TRUE 0.767 -16.000 0.000 0.092   NA
 10375872 10375873 HTH_0152 HTH_0153   cyoB TRUE 0.929 0.000 0.000 0.006 Y NA
 10375873 10375874 HTH_0153 HTH_0154 cyoB cyoA TRUE 0.990 13.000 0.667 0.007 Y NA
 10375874 10375875 HTH_0154 HTH_0155 cyoA   TRUE 0.981 2.000 0.500 NA   NA
 10375877 10375878 HTH_0157 HTH_0158   nosY TRUE 0.971 2.000 0.250 NA   NA
 10375878 10375879 HTH_0158 HTH_0159 nosY nosF TRUE 0.956 -15.000 0.133 NA   NA
 10375879 10375880 HTH_0159 HTH_0160 nosF nosD TRUE 0.992 -3.000 0.867 1.000 N NA
 10375880 10375881 HTH_0160 HTH_0161 nosD nosL TRUE 0.978 2.000 0.406 NA   NA
 10375881 10375882 HTH_0161 HTH_0162 nosL   TRUE 0.983 -3.000 0.254 NA   NA
 10375882 10375883 HTH_0162 HTH_0163   nosZ TRUE 0.945 13.000 0.281 NA   NA
 10375883 10375884 HTH_0163 HTH_0164 nosZ   TRUE 0.701 28.000 0.012 0.092   NA
 10375885 10375886 HTH_0165 HTH_0166   lon TRUE 0.691 12.000 0.000 0.024 N NA
 10375886 10375887 HTH_0166 HTH_0167 lon rspU FALSE 0.243 26.000 0.000 1.000   NA
 10375887 10375888 HTH_0167 HTH_0168 rspU   FALSE 0.055 85.000 0.000 1.000   NA
 10375888 10375889 HTH_0168 HTH_0169     FALSE 0.398 17.000 0.000 NA   NA
 10375889 10375890 HTH_0169 HTH_0170     FALSE 0.519 -22.000 0.000 NA   NA
 10375892 10375893 HTH_0172 HTH_0173     TRUE 0.899 -3.000 0.002 NA   NA
 10375895 10375896 HTH_0175 HTH_0176 atpG1 atpD TRUE 0.964 29.000 0.724 0.008 Y NA
 10375896 10375897 HTH_0176 HTH_0177 atpD rph TRUE 0.864 -3.000 0.002 1.000 N NA
 10375898 10375899 HTH_0178 HTH_0179 hisIE   TRUE 0.603 5.000 0.000 NA   NA
 10375899 10375900 HTH_0179 HTH_0180   hslU TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10375900 10375901 HTH_0180 HTH_0181 hslU   TRUE 0.785 -25.000 0.007 NA   NA
 10375903 10375904 HTH_0183 HTH_0184     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10375904 10375905 HTH_0184 HTH_0185   kdpD TRUE 0.763 -7.000 0.000 NA   NA
 10375905 10375906 HTH_0185 HTH_0186 kdpD kdpC TRUE 0.949 -13.000 0.017 0.086   NA
 10375906 10375907 HTH_0186 HTH_0187 kdpC kdpB TRUE 0.995 4.000 0.877 0.002 Y NA
 10375907 10375908 HTH_0187 HTH_0188 kdpB kdpA TRUE 0.975 3.000 0.035 0.002 Y NA
 10375908 10375909 HTH_0188 HTH_0189 kdpA   FALSE 0.326 -55.000 0.000 NA   NA
 10375911 10375912 HTH_0191 HTH_0192 trpF aroD TRUE 0.863 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 10375912 10375913 HTH_0192 HTH_0193 aroD argG TRUE 0.865 3.000 0.002 1.000 Y NA
 10375914 10375915 HTH_0194 HTH_0195     TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 10375915 10375916 HTH_0195 HTH_0196     FALSE 0.303 -97.000 0.000 NA   NA
 10375916 10375917 HTH_0196 HTH_0197   gidA FALSE 0.123 47.000 0.000 NA   NA
 10375917 10375918 HTH_0197 HTH_0198 gidA fdx3 FALSE 0.075 51.000 0.000 1.000 N NA
 10375919 10375920 HTH_t04 HTH_0199   thiC FALSE 0.354 19.000 0.000 NA   NA
 10375921 10375922 HTH_0200 HTH_0201 nlpD ccsB FALSE 0.258 25.000 0.000 1.000   NA
 10375922 10375923 HTH_0201 HTH_0202 ccsB fadD TRUE 0.682 11.000 0.000 0.060 N NA
 10375923 10375924 HTH_0202 HTH_0203 fadD fcbC TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10375924 10375925 HTH_0203 HTH_0204 fcbC   FALSE 0.564 -19.000 0.000 NA   NA
 10375926 10375927 HTH_0205 HTH_0206 ispD   TRUE 0.926 -3.000 0.006 NA   NA
 10375928 10375929 HTH_0207 HTH_0208   mraY TRUE 0.891 2.000 0.007 NA   NA
 10375934 10375935 HTH_0213 HTH_0214   aroC TRUE 0.770 -16.000 0.003 NA N NA
 10375935 10375936 HTH_0214 HTH_0215 aroC rpmB TRUE 0.872 0.000 0.004 1.000 N NA
 10375936 10375937 HTH_0215 HTH_0216 rpmB   FALSE 0.294 22.000 0.000 NA   NA
 10375940 10375941 HTH_0219 HTH_0220     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10375942 10375943 HTH_0221 HTH_0222 ffh   FALSE 0.156 40.000 0.000 NA   NA
 10375945 10375946 HTH_0224 HTH_0225 trxB1 trxA1 TRUE 0.948 0.000 0.027 1.000   NA
 10375946 10375947 HTH_0225 HTH_0226 trxA1   TRUE 0.981 2.000 0.500 1.000   NA
 10375951 10375952 HTH_0230 HTH_0231     TRUE 0.966 -3.000 0.011 0.059   NA
 10375952 10375953 HTH_0231 HTH_0232     TRUE 0.952 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 10375953 10375954 HTH_0232 HTH_0233     TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10375954 10375955 HTH_0233 HTH_0234     TRUE 0.947 -10.000 0.032 1.000   NA
 10375960 10375961 HTH_0239 HTH_0240 cirA   TRUE 0.838 14.000 0.033 NA N NA
 10375961 10375962 HTH_0240 HTH_0241   tonB1 FALSE 0.573 2.000 0.000 NA N NA
 10375963 10375964 HTH_r01 HTH_r02     FALSE 0.171 35.000 0.000 NA   NA
 10375964 10375965 HTH_r02 HTH_0242     FALSE 0.297 -1161.000 0.000 NA   NA
 10375965 10375966 HTH_0242 HTH_t05     FALSE 0.026 2656.000 0.000 NA   NA
 10375966 10375967 HTH_t05 HTH_t06     FALSE 0.328 20.000 0.000 NA   NA
 10375967 10375968 HTH_t06 HTH_r03     FALSE 0.073 68.000 0.000 NA   NA
 10375968 10375969 HTH_r03 HTH_0243     FALSE 0.034 171.000 0.000 NA   NA
 10375970 10375971 HTH_0244 HTH_0245     FALSE 0.032 175.000 0.000 NA   NA
 10375971 10375972 HTH_0245 HTH_0246     TRUE 0.843 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10375972 10375973 HTH_0246 HTH_0247   rnc TRUE 0.809 -28.000 0.023 1.000 N NA
 10375974 10375975 HTH_0248 HTH_0249     TRUE 0.832 -73.000 0.100 NA   NA
 10375975 10375976 HTH_0249 HTH_0250     TRUE 0.759 3.000 0.000 1.000 Y NA
 10375976 10375977 HTH_0250 HTH_0251   recN TRUE 0.971 -7.000 0.029 1.000 Y NA
 10375978 10375979 HTH_0252 HTH_0253 atpA   TRUE 0.907 -3.000 0.003 NA   NA
 10375979 10375980 HTH_0253 HTH_0254     FALSE 0.083 62.000 0.000 NA   NA
 10375980 10375981 HTH_0254 HTH_0255   gspG1 FALSE 0.429 16.000 0.000 1.000   NA
 10375981 10375982 HTH_0255 HTH_0256 gspG1   TRUE 0.877 -16.000 0.010 NA   NA
 10375982 10375983 HTH_0256 HTH_0257     TRUE 0.927 -40.000 0.400 NA   NA
 10375983 10375984 HTH_0257 HTH_0258     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10375984 10375985 HTH_0258 HTH_0259     FALSE 0.583 9.000 0.000 NA   NA
 10375985 10375986 HTH_0259 HTH_0260     TRUE 0.950 -7.000 0.019 1.000   NA
 10375988 10375989 HTH_t07 HTH_0262   accA FALSE 0.328 20.000 0.000 NA   NA
 10375989 10375990 HTH_0262 HTH_0263 accA   TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10375991 10375992 HTH_0264 HTH_0265 secA   FALSE 0.046 99.000 0.000 NA   NA
 10375993 10375994 HTH_0266 HTH_0267     FALSE 0.368 -43.000 0.000 NA   NA
 10375994 10375995 HTH_0267 HTH_0268     FALSE 0.340 -49.000 0.000 NA   NA
 10375995 10375996 HTH_0268 HTH_0269     TRUE 0.934 -12.000 0.025 NA   NA
 10375996 10375997 HTH_0269 HTH_0270     TRUE 0.763 -7.000 0.000 NA   NA
 10375997 10375998 HTH_0270 HTH_0271     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10375998 10375999 HTH_0271 HTH_0272     TRUE 0.763 10.000 0.000 0.035   NA
 10375999 10376000 HTH_0272 HTH_0273   pdxJ FALSE 0.447 25.000 0.000 0.035   NA
 10376000 10376001 HTH_0273 HTH_0274 pdxJ   FALSE 0.294 22.000 0.000 NA   NA
 10376003 10376004 HTH_0276 HTH_0277     TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10376004 10376005 HTH_0277 HTH_0278     FALSE 0.128 46.000 0.000 NA   NA
 10376006 10376007 HTH_t08 HTH_0279     FALSE 0.519 -22.000 0.000 NA   NA
 10376007 10376008 HTH_0279 HTH_0280   def1 TRUE 0.984 -3.000 0.300 1.000   NA
 10376010 10376011 HTH_0282 HTH_0283   norB TRUE 0.935 17.000 0.417 NA   NA
 10376011 10376012 HTH_0283 HTH_0284 norB norC TRUE 0.654 19.000 0.000 0.001   NA
 10376013 10376014 HTH_0285 HTH_0286 resB   FALSE 0.380 -40.000 0.000 NA   NA
 10376014 10376015 HTH_0286 HTH_0287     FALSE 0.376 18.000 0.000 NA   NA
 10376015 10376016 HTH_0287 HTH_0288     TRUE 0.975 1.000 0.069 0.044   NA
 10376016 10376017 HTH_0288 HTH_0289     FALSE 0.038 127.000 0.000 NA   NA
 10376017 10376018 HTH_0289 HTH_0290     FALSE 0.269 24.000 0.000 NA   NA
 10376018 10376019 HTH_0290 HTH_0291     TRUE 0.986 -7.000 0.429 NA   NA
 10376019 10376020 HTH_0291 HTH_0292     TRUE 0.692 -12.000 0.000 NA   NA
 10376020 10376021 HTH_0292 HTH_0293   valS FALSE 0.093 57.000 0.000 NA   NA
 10376021 10376022 HTH_0293 HTH_0294 valS rfaD TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10376022 10376023 HTH_0294 HTH_0295 rfaD argB TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10376023 10376024 HTH_0295 HTH_0296 argB   FALSE 0.032 177.000 0.000 NA   NA
 10376024 10376025 HTH_0296 HTH_0297     TRUE 0.963 11.000 0.400 NA   NA
 10376025 10376026 HTH_0297 HTH_0298   trmD TRUE 0.883 -3.000 0.003 1.000 N NA
 10376026 10376027 HTH_0298 HTH_0299 trmD   TRUE 0.676 2.000 0.000 1.000   NA
 10376027 10376028 HTH_0299 HTH_0300     TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10376030 10376031 HTH_0302 HTH_0303 pilT1 pilC1 TRUE 0.973 3.000 0.218 1.000 Y NA
 10376031 10376032 HTH_0303 HTH_0304 pilC1   FALSE 0.122 35.000 0.000 1.000 N NA
 10376033 10376034 HTH_0305 HTH_0306     TRUE 0.976 -3.000 0.195 1.000 N NA
 10376034 10376035 HTH_0306 HTH_0307   stpK TRUE 0.958 -3.000 0.049 1.000 N NA
 10376035 10376036 HTH_0307 HTH_0308 stpK   FALSE 0.580 2.000 0.000 1.000 N NA
 10376036 10376037 HTH_0308 HTH_0309   dksA2 TRUE 0.931 -3.000 0.011 1.000 N NA
 10376038 10376039 HTH_0310 HTH_0311   ccl TRUE 0.937 0.000 0.013 1.000   NA
 10376039 10376040 HTH_0311 HTH_0312 ccl   TRUE 0.963 0.000 0.067 1.000   NA
 10376041 10376042 HTH_0313 HTH_0314 thrA   FALSE 0.403 13.000 0.000 NA N NA
 10376045 10376046 HTH_0317 HTH_0318 feoA feoB TRUE 0.964 -3.000 0.042 1.000   NA
 10376047 10376048 HTH_0319 HTH_0320 pilC2   TRUE 0.622 1.000 0.000 1.000 N NA
 10376048 10376049 HTH_0320 HTH_0321     FALSE 0.294 22.000 0.000 NA   NA
 10376050 10376051 HTH_0322 HTH_0323     TRUE 0.896 -16.000 0.016 NA   NA
 10376054 10376055 HTH_0326 HTH_0327 rbn kamA TRUE 0.942 -7.000 0.011 1.000   NA
 10376056 10376057 HTH_0328 HTH_0329 hemA   TRUE 0.643 -55.000 0.006 NA   NA
 10376057 10376058 HTH_0329 HTH_0330     TRUE 0.968 -3.000 0.059 NA   NA
 10376058 10376059 HTH_0330 HTH_0331   murA TRUE 0.761 -28.000 0.007 NA   NA
 10376060 10376061 HTH_0332 HTH_0333   pncA FALSE 0.086 131.000 0.004 NA N NA
 10376061 10376062 HTH_0333 HTH_0334 pncA   TRUE 0.821 6.000 0.004 NA   NA
 10376063 10376064 HTH_0335 HTH_0336     FALSE 0.426 -31.000 0.000 NA   NA
 10376064 10376065 HTH_0336 HTH_0337     FALSE 0.587 8.000 0.000 NA   NA
 10376066 10376067 HTH_0338 HTH_0339 hemH smc TRUE 0.685 -7.000 0.000 1.000 N NA
 10376067 10376068 HTH_0339 HTH_0340 smc   FALSE 0.489 7.000 0.000 NA N NA
 10376069 10376070 HTH_0341 HTH_0342     FALSE 0.294 22.000 0.000 NA   NA
 10376070 10376071 HTH_0342 HTH_0343     TRUE 0.980 -3.000 0.190 NA   NA
 10376071 10376072 HTH_0343 HTH_0344   ribF TRUE 0.912 -3.000 0.003 NA   NA
 10376073 10376074 HTH_0345 HTH_0346     TRUE 0.598 6.000 0.000 NA   NA
 10376074 10376075 HTH_0346 HTH_0347     TRUE 0.973 9.000 0.625 1.000 N NA
 10376075 10376076 HTH_0347 HTH_0348     TRUE 0.797 49.000 0.625 NA   NA
 10376076 10376077 HTH_0348 HTH_0349     TRUE 0.966 16.000 0.800 NA   NA
 10376078 10376079 HTH_0350 HTH_0351     TRUE 0.972 -3.000 0.087 NA   NA
 10376080 10376081 HTH_0352 HTH_0353   aspS FALSE 0.580 2.000 0.000 1.000 N NA
 10376082 10376083 HTH_0354 HTH_0355 hpt hisD FALSE 0.479 10.000 0.000 1.000 N NA
 10376083 10376084 HTH_0355 HTH_0356 hisD   TRUE 0.944 -3.000 0.011 NA   NA
 10376084 10376085 HTH_0356 HTH_0357     TRUE 0.603 5.000 0.000 NA   NA
 10376085 10376086 HTH_0357 HTH_0358     TRUE 0.959 -3.000 0.030 1.000   NA
 10376086 10376087 HTH_0358 HTH_0359   acuC1 TRUE 0.975 -3.000 0.107 NA   NA
 10376087 10376088 HTH_0359 HTH_0360 acuC1 purD FALSE 0.479 9.000 0.000 NA N NA
 10376091 10376092 HTH_0363 HTH_0364     TRUE 0.965 0.000 0.027 1.000 Y NA
 10376093 10376094 HTH_0365 HTH_0366 vacB nsd TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10376094 10376095 HTH_0366 HTH_0367 nsd dppC TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10376095 10376096 HTH_0367 HTH_0368 dppC   TRUE 0.928 -3.000 0.006 1.000   NA
 10376096 10376097 HTH_0368 HTH_0369   ribC TRUE 0.930 0.000 0.003 1.000 Y NA
 10376097 10376098 HTH_0369 HTH_0370 ribC   FALSE 0.537 18.000 0.002 NA N NA
 10376099 10376100 HTH_0371 HTH_0372   rplI FALSE 0.204 53.000 0.003 1.000 N NA
 10376100 10376101 HTH_0372 HTH_0373 rplI rpsR TRUE 0.986 12.000 0.499 0.027 Y NA
 10376101 10376102 HTH_0373 HTH_0374 rpsR ssb TRUE 0.720 13.000 0.004 1.000 N NA
 10376102 10376103 HTH_0374 HTH_0375 ssb rpsF TRUE 0.896 -7.000 0.005 1.000 N NA
 10376104 10376105 HTH_0376 HTH_0377   polA TRUE 0.924 -3.000 0.009 1.000 N NA
 10376106 10376107 HTH_0378 HTH_0379   zwf TRUE 0.768 -91.000 0.011 1.000 Y NA
 10376107 10376108 HTH_0379 HTH_0380 zwf gnd TRUE 0.983 -7.000 0.130 1.000 Y NA
 10376109 10376110 HTH_0381 HTH_0382     TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 10376110 10376111 HTH_0382 HTH_0383     FALSE 0.564 -19.000 0.000 NA   NA
 10376112 10376113 HTH_0384 HTH_0385 coxG coxF FALSE 0.455 -28.000 0.000 NA   NA
 10376113 10376114 HTH_0385 HTH_0386 coxF coxM FALSE 0.514 3.000 0.000 NA N NA
 10376114 10376115 HTH_0386 HTH_0387 coxM coxL TRUE 0.978 4.000 0.138 0.086 Y NA
 10376115 10376116 HTH_0387 HTH_0388 coxL coxS TRUE 0.967 14.000 0.188 0.086 Y NA
 10376116 10376117 HTH_0388 HTH_0389 coxS   FALSE 0.021 200.000 0.000 1.000 N NA
 10376117 10376118 HTH_0389 HTH_0390     FALSE 0.510 23.000 0.000 0.019   NA
 10376118 10376119 HTH_0390 HTH_0391     FALSE 0.195 32.000 0.000 1.000   NA
 10376119 10376120 HTH_0391 HTH_0392     FALSE 0.104 87.000 0.000 0.086   NA
 10376120 10376121 HTH_0392 HTH_0393     FALSE 0.037 136.000 0.000 NA   NA
 10376123 10376124 HTH_0395 HTH_0396     FALSE 0.098 55.000 0.000 NA   NA
 10376124 10376125 HTH_0396 HTH_0397     FALSE 0.476 14.000 0.000 NA   NA
 10376126 10376127 HTH_0398 HTH_0399   livK FALSE 0.208 30.000 0.000 NA   NA
 10376127 10376128 HTH_0399 HTH_0400 livK livH TRUE 0.983 -9.000 0.177 NA Y NA
 10376128 10376129 HTH_0400 HTH_0401 livH livM TRUE 0.994 -7.000 0.359 0.018 Y NA
 10376129 10376130 HTH_0401 HTH_0402 livM livG TRUE 0.958 -15.000 0.051 1.000 Y NA
 10376130 10376131 HTH_0402 HTH_0403 livG livF TRUE 0.990 -10.000 0.200 0.016 Y NA
 10376131 10376132 HTH_0403 HTH_0404 livF rlpA1 FALSE 0.032 174.000 0.000 NA   NA
 10376133 10376134 HTH_0405 HTH_0406     TRUE 0.805 -28.000 0.011 NA   NA
 10376135 10376136 HTH_0407 HTH_0408 nuoI2 nuoJ2 TRUE 0.995 -3.000 0.442 0.023 Y NA
 10376136 10376137 HTH_0408 HTH_0409 nuoJ2 nuoK2 TRUE 0.953 -19.000 0.012 0.013 Y NA
 10376137 10376138 HTH_0409 HTH_0410 nuoK2 nuoL3 TRUE 0.966 2.000 0.011 0.023 Y NA
 10376138 10376139 HTH_0410 HTH_0411 nuoL3 nuoM2 TRUE 0.959 5.000 0.011 0.007 Y NA
 10376139 10376140 HTH_0411 HTH_0412 nuoM2 nuoN2 TRUE 0.995 7.000 1.000 0.007 Y NA
 10376140 10376141 HTH_0412 HTH_0413 nuoN2 nuoA1 TRUE 0.963 4.000 0.022 0.023 Y NA
 10376141 10376142 HTH_0413 HTH_0414 nuoA1 nuoD1 TRUE 0.963 5.000 0.018 0.013 Y NA
 10376142 10376143 HTH_0414 HTH_0415 nuoD1 nuoH2 TRUE 0.938 11.000 0.008 0.023 Y NA
 10376144 10376145 HTH_0416 HTH_0417 hisF mutL TRUE 0.738 0.000 0.000 1.000   NA
 10376147 10376148 HTH_0419 HTH_0420 purA hflX TRUE 0.938 0.000 0.002 0.017   NA
 10376148 10376149 HTH_0420 HTH_0421 hflX hfq2 TRUE 0.921 0.000 0.008 1.000   NA
 10376149 10376150 HTH_0421 HTH_0422 hfq2   FALSE 0.083 62.000 0.000 NA   NA
 10376150 10376151 HTH_0422 HTH_0423     TRUE 0.976 -7.000 0.143 NA   NA
 10376151 10376152 HTH_0423 HTH_0424   argD FALSE 0.134 44.000 0.000 NA   NA
 10376152 10376153 HTH_0424 HTH_0425 argD nadE TRUE 0.880 3.000 0.017 1.000 N NA
 10376154 10376155 HTH_0426 HTH_0427     FALSE 0.451 15.000 0.000 NA   NA
 10376156 10376157 HTH_0428 HTH_0429 gspE   TRUE 0.641 -15.000 0.000 NA   NA
 10376157 10376158 HTH_0429 HTH_0430   gspD TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376159 10376160 HTH_0431 HTH_0432 dnaX   TRUE 0.950 -37.000 0.600 NA   NA
 10376160 10376161 HTH_0432 HTH_0433     FALSE 0.049 90.000 0.000 NA   NA
 10376162 10376163 HTH_0434 HTH_0435 purQ purS TRUE 0.997 -3.000 0.656 0.002 Y NA
 10376163 10376164 HTH_0435 HTH_0436 purS   FALSE 0.047 96.000 0.000 NA   NA
 10376164 10376165 HTH_0436 HTH_0437     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376165 10376166 HTH_0437 HTH_0438     FALSE 0.107 51.000 0.000 NA   NA
 10376166 10376167 HTH_0438 HTH_0439   rfaE TRUE 0.664 -25.000 0.003 1.000 N NA
 10376167 10376168 HTH_0439 HTH_0440 rfaE lysC TRUE 0.851 -10.000 0.003 1.000 N NA
 10376171 10376172 HTH_0443 HTH_0444     TRUE 0.952 -19.000 0.222 NA   NA
 10376172 10376173 HTH_0444 HTH_0445     TRUE 0.945 -7.000 0.015 NA   NA
 10376173 10376174 HTH_0445 HTH_0446   cobA1 TRUE 0.953 0.000 0.038 1.000   NA
 10376174 10376175 HTH_0446 HTH_0447 cobA1   TRUE 0.775 -30.000 0.015 1.000 N NA
 10376175 10376176 HTH_0447 HTH_0448   lpdA1 FALSE 0.357 15.000 0.000 1.000 N NA
 10376176 10376177 HTH_0448 HTH_0449 lpdA1   TRUE 0.984 -3.000 0.286 1.000   NA
 10376178 10376179 HTH_0450 HTH_0451     TRUE 0.985 -3.000 0.361 NA   NA
 10376179 10376180 HTH_0451 HTH_0452     TRUE 0.953 -16.000 0.143 1.000   NA
 10376180 10376181 HTH_0452 HTH_0453     TRUE 0.975 0.000 0.190 NA   NA
 10376181 10376182 HTH_0453 HTH_0454   hoxM TRUE 0.896 16.000 0.122 NA   NA
 10376182 10376183 HTH_0454 HTH_0455 hoxM hoxL TRUE 0.990 -3.000 0.347 1.000 Y NA
 10376183 10376184 HTH_0455 HTH_0456 hoxL hoxS TRUE 0.971 26.000 0.750 0.005 Y NA
 10376185 10376186 HTH_0457 HTH_0458     TRUE 0.987 5.000 1.000 NA   NA
 10376186 10376187 HTH_0458 HTH_0459     FALSE 0.041 116.000 0.000 NA   NA
 10376187 10376188 HTH_0459 HTH_0460     TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10376188 10376189 HTH_0460 HTH_0461     TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 10376189 10376190 HTH_0461 HTH_0462   cbiM TRUE 0.888 12.000 0.031 NA   NA
 10376190 10376191 HTH_0462 HTH_0463 cbiM cbiQ TRUE 0.923 -10.000 0.010 NA   NA
 10376191 10376192 HTH_0463 HTH_0464 cbiQ cbiO TRUE 0.963 -7.000 0.045 NA   NA
 10376193 10376194 HTH_0465 HTH_0466 def2   TRUE 0.983 -3.000 0.364 1.000 N NA
 10376195 10376196 HTH_0467 HTH_0468     TRUE 0.921 9.000 0.051 NA   NA
 10376196 10376197 HTH_0468 HTH_0469   phoU FALSE 0.081 48.000 0.000 NA N NA
 10376197 10376198 HTH_0469 HTH_0470 phoU   TRUE 0.941 -3.000 0.018 NA N NA
 10376199 10376200 HTH_0471 HTH_0472     TRUE 0.993 -3.000 0.800 NA   NA
 10376200 10376201 HTH_0472 HTH_0473     FALSE 0.166 36.000 0.000 NA   NA
 10376201 10376202 HTH_0473 HTH_0474   fabD FALSE 0.058 61.000 0.000 NA N NA
 10376202 10376203 HTH_0474 HTH_0475 fabD   TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 10376203 10376204 HTH_0475 HTH_0476   lonB FALSE 0.118 48.000 0.000 NA   NA
 10376204 10376205 HTH_0476 HTH_0477 lonB   TRUE 0.883 2.000 0.006 NA   NA
 10376205 10376206 HTH_0477 HTH_0478     FALSE 0.398 17.000 0.000 NA   NA
 10376206 10376207 HTH_0478 HTH_0479   yqgF TRUE 0.964 -3.000 0.043 NA   NA
 10376207 10376208 HTH_0479 HTH_0480 yqgF   TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376208 10376209 HTH_0480 HTH_0481     FALSE 0.183 33.000 0.000 NA   NA
 10376209 10376210 HTH_0481 HTH_0482   hisS1 TRUE 0.846 -13.000 0.003 NA   NA
 10376211 10376212 HTH_0483 HTH_0484 hemB miaB2 TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10376212 10376213 HTH_0484 HTH_0485 miaB2   TRUE 0.759 14.000 0.005 NA   NA
 10376214 10376215 HTH_0486 HTH_0487     TRUE 0.869 2.000 0.004 NA   NA
 10376216 10376217 HTH_0488 HTH_0489 fabG topA FALSE 0.507 4.000 0.000 1.000 N NA
 10376217 10376218 HTH_0489 HTH_0490 topA draG FALSE 0.568 -13.000 0.000 NA N NA
 10376218 10376219 HTH_0490 HTH_0491 draG hfq1 TRUE 0.974 -10.000 0.200 NA   NA
 10376220 10376221 HTH_0492 HTH_0493 fdx7 rep FALSE 0.051 68.000 0.000 1.000 N NA
 10376221 10376222 HTH_0493 HTH_0494 rep   TRUE 0.687 12.000 0.000 NA Y NA
 10376223 10376224 HTH_0495 HTH_0496     TRUE 0.938 0.000 0.016 NA   NA
 10376225 10376226 HTH_0497 HTH_0498     TRUE 0.993 -9.000 0.635 1.000 Y NA
 10376226 10376227 HTH_0498 HTH_0499     FALSE 0.078 66.000 0.000 1.000   NA
 10376227 10376228 HTH_0499 HTH_0500   folC TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10376228 10376229 HTH_0500 HTH_0501 folC cspC FALSE 0.113 39.000 0.000 1.000 N NA
 10376230 10376231 HTH_0502 HTH_0503     TRUE 0.991 3.000 0.750 0.008   NA
 10376231 10376232 HTH_0503 HTH_0504   tatB FALSE 0.513 24.000 0.000 0.008   NA
 10376232 10376233 HTH_0504 HTH_0505 tatB tatC TRUE 0.706 -46.000 0.009 NA   NA
 10376233 10376234 HTH_0505 HTH_0506 tatC nueM TRUE 0.693 -3.000 0.000 NA N NA
 10376234 10376235 HTH_0506 HTH_0507 nueM   FALSE 0.115 38.000 0.000 1.000 N NA
 10376235 10376236 HTH_0507 HTH_0508     TRUE 0.617 3.000 0.000 NA   NA
 10376237 10376238 HTH_0509 HTH_0510 pgsA1 lnt TRUE 0.693 -19.000 0.000 0.052 N NA
 10376238 10376239 HTH_0510 HTH_0511 lnt   TRUE 0.958 -3.000 0.027 1.000   NA
 10376239 10376240 HTH_0511 HTH_0512     TRUE 0.975 -3.000 0.103 1.000   NA
 10376241 10376242 HTH_0513 HTH_t09 himA   FALSE 0.089 60.000 0.000 NA   NA
 10376243 10376244 HTH_0514 HTH_0515     FALSE 0.086 61.000 0.000 NA   NA
 10376244 10376245 HTH_0515 HTH_0516     TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 10376245 10376246 HTH_0516 HTH_0517     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376246 10376247 HTH_0517 HTH_0518     FALSE 0.506 13.000 0.000 NA   NA
 10376247 10376248 HTH_0518 HTH_0519     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376248 10376249 HTH_0519 HTH_0520     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376249 10376250 HTH_0520 HTH_0521     FALSE 0.503 -24.000 0.000 NA   NA
 10376250 10376251 HTH_0521 HTH_0522     FALSE 0.055 84.000 0.000 NA   NA
 10376253 10376254 HTH_0524 HTH_0525     FALSE 0.139 43.000 0.000 NA   NA
 10376255 10376256 HTH_0527 HTH_0528     TRUE 0.666 -13.000 0.000 NA   NA
 10376256 10376257 HTH_0528 HTH_0529     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376257 10376258 HTH_0529 HTH_0530     TRUE 0.608 17.000 0.000 0.041   NA
 10376258 10376259 HTH_0530 HTH_0531     TRUE 0.864 8.000 0.000 0.014 Y NA
 10376259 10376260 HTH_0531 HTH_0532     FALSE 0.023 172.000 0.000 1.000 N NA
 10376260 10376261 HTH_0532 HTH_0533     FALSE 0.034 159.000 0.000 NA   NA
 10376261 10376262 HTH_0533 HTH_0534     FALSE 0.506 13.000 0.000 NA   NA
 10376262 10376263 HTH_0534 HTH_0535     TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10376264 10376265 HTH_0536 HTH_0537     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376265 10376266 HTH_0537 HTH_0538     TRUE 0.763 -7.000 0.000 NA   NA
 10376266 10376267 HTH_0538 HTH_0539     FALSE 0.043 112.000 0.000 NA   NA
 10376267 10376268 HTH_0539 HTH_0540     FALSE 0.053 86.000 0.000 NA   NA
 10376269 10376270 HTH_0541 HTH_0542     FALSE 0.060 78.000 0.000 NA   NA
 10376270 10376271 HTH_0542 HTH_0543     TRUE 0.718 -10.000 0.000 NA   NA
 10376271 10376272 HTH_0543 HTH_0544     TRUE 0.959 20.000 1.000 NA   NA
 10376272 10376273 HTH_0544 HTH_0545     FALSE 0.033 172.000 0.000 NA   NA
 10376273 10376274 HTH_0545 HTH_0546     FALSE 0.533 12.000 0.000 NA   NA
 10376274 10376275 HTH_0546 HTH_0547     FALSE 0.506 13.000 0.000 NA   NA
 10376275 10376276 HTH_0547 HTH_0548     TRUE 0.870 23.000 0.286 NA   NA
 10376276 10376277 HTH_0548 HTH_0549     FALSE 0.472 90.000 0.286 NA   NA
 10376277 10376278 HTH_0549 HTH_0550     TRUE 0.987 3.000 1.000 NA   NA
 10376278 10376279 HTH_0550 HTH_0551     TRUE 0.987 4.000 1.000 NA   NA
 10376279 10376280 HTH_0551 HTH_0552     FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10376280 10376281 HTH_0552 HTH_0553     TRUE 0.763 -7.000 0.000 NA   NA
 10376281 10376282 HTH_0553 HTH_0554     FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10376282 10376283 HTH_0554 HTH_0555     FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10376283 10376284 HTH_0555 HTH_0556     FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10376284 10376285 HTH_0556 HTH_0557     TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 10376285 10376286 HTH_0557 HTH_0558     TRUE 0.617 3.000 0.000 NA   NA
 10376286 10376287 HTH_0558 HTH_0559     FALSE 0.398 17.000 0.000 NA   NA
 10376287 10376288 HTH_0559 HTH_0560     FALSE 0.476 14.000 0.000 NA   NA
 10376288 10376289 HTH_0560 HTH_0561     TRUE 0.692 -12.000 0.000 NA   NA
 10376289 10376290 HTH_0561 HTH_0562     FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10376290 10376291 HTH_0562 HTH_0563     FALSE 0.564 -19.000 0.000 NA   NA
 10376291 10376292 HTH_0563 HTH_0564     FALSE 0.059 79.000 0.000 NA   NA
 10376292 10376293 HTH_0564 HTH_0565     FALSE 0.145 42.000 0.000 NA   NA
 10376293 10376294 HTH_0565 HTH_0566     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376294 10376295 HTH_0566 HTH_0567     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376295 10376296 HTH_0567 HTH_0568     FALSE 0.052 87.000 0.000 NA   NA
 10376298 10376299 HTH_0570 HTH_0571     FALSE 0.533 12.000 0.000 NA   NA
 10376299 10376300 HTH_0571 HTH_0572     FALSE 0.201 31.000 0.000 NA   NA
 10376300 10376301 HTH_0572 HTH_0573     TRUE 0.984 11.000 1.000 NA   NA
 10376301 10376302 HTH_0573 HTH_0574     TRUE 0.993 0.000 1.000 NA   NA
 10376303 10376304 HTH_0575 HTH_0576 argC rpsI TRUE 0.909 -15.000 0.031 1.000 N NA
 10376304 10376305 HTH_0576 HTH_0577 rpsI rplM TRUE 0.987 -3.000 0.051 0.025 Y NA
 10376307 10376308 HTH_0579 HTH_0580 lipA1   TRUE 0.800 2.000 0.000 1.000 Y NA
 10376308 10376309 HTH_0580 HTH_0581     TRUE 0.714 1.000 0.000 1.000   NA
 10376309 10376310 HTH_0581 HTH_0582     TRUE 0.936 -22.000 0.167 1.000   NA
 10376310 10376311 HTH_0582 HTH_0583     TRUE 0.992 -3.000 0.833 NA N NA
 10376312 10376313 HTH_0584 HTH_0585   pdxA TRUE 0.738 0.000 0.000 1.000   NA
 10376316 10376317 HTH_0588 HTH_0589   asd TRUE 0.888 3.000 0.011 NA   NA
 10376319 10376320 HTH_0591 HTH_0592     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376320 10376321 HTH_0592 HTH_0593   prfB TRUE 0.738 0.000 0.000 1.000   NA
 10376322 10376323 HTH_0594 HTH_0595     FALSE 0.151 41.000 0.000 NA   NA
 10376323 10376324 HTH_0595 HTH_0596     TRUE 0.741 -9.000 0.000 NA   NA
 10376324 10376325 HTH_0596 HTH_0597     FALSE 0.145 42.000 0.000 NA   NA
 10376325 10376326 HTH_0597 HTH_0598   glnS FALSE 0.424 16.000 0.000 NA   NA
 10376326 10376327 HTH_0598 HTH_0599 glnS murG TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10376327 10376328 HTH_0599 HTH_0600 murG galU FALSE 0.162 59.000 0.000 1.000 Y NA
 10376331 10376332 HTH_0603 HTH_0604   metG' FALSE 0.072 70.000 0.000 1.000   NA
 10376332 10376333 HTH_0604 HTH_0605 metG'   FALSE 0.254 25.000 0.000 NA   NA
 10376333 10376334 HTH_0605 HTH_0606     FALSE 0.310 21.000 0.000 NA   NA
 10376334 10376335 HTH_0606 HTH_0607   moeA FALSE 0.357 15.000 0.000 1.000 N NA
 10376335 10376336 HTH_0607 HTH_0608 moeA metK2 FALSE 0.462 11.000 0.000 1.000 N NA
 10376336 10376337 HTH_0608 HTH_0609 metK2 gcvT FALSE 0.258 41.000 0.000 1.000 Y NA
 10376342 10376343 HTH_0614 HTH_0615 dnaB   FALSE 0.054 85.000 0.000 NA   NA
 10376344 10376345 HTH_0616 HTH_0617 metF   TRUE 0.932 -37.000 0.400 NA   NA
 10376345 10376346 HTH_0617 HTH_0618     TRUE 0.709 1.000 0.000 NA   NA
 10376347 10376348 HTH_0619 HTH_0620     FALSE 0.476 14.000 0.000 NA   NA
 10376348 10376349 HTH_0620 HTH_0621     FALSE 0.036 139.000 0.000 NA   NA
 10376351 10376352 HTH_0623 HTH_0624 secG hemK FALSE 0.552 -94.000 0.005 1.000 N NA
 10376352 10376353 HTH_0624 HTH_0625 hemK tlyC TRUE 0.912 -12.000 0.010 NA   NA
 10376353 10376354 HTH_0625 HTH_0626 tlyC radC TRUE 0.802 -49.000 0.043 NA   NA
 10376354 10376355 HTH_0626 HTH_0627 radC   TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376355 10376356 HTH_0627 HTH_0628   ackA TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10376356 10376357 HTH_0628 HTH_0629 ackA folD FALSE 0.502 6.000 0.000 1.000 N NA
 10376357 10376358 HTH_0629 HTH_0630 folD   TRUE 0.796 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 10376360 10376361 HTH_0632 HTH_0633     FALSE 0.537 -21.000 0.000 NA   NA
 10376361 10376362 HTH_0633 HTH_0634     TRUE 0.985 -9.000 0.475 NA   NA
 10376362 10376363 HTH_0634 HTH_0635   potE TRUE 0.653 12.000 0.000 0.075 N NA
 10376363 10376364 HTH_0635 HTH_0636 potE nuc TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10376364 10376365 HTH_0636 HTH_0637 nuc ilvB FALSE 0.049 70.000 0.000 1.000 N NA
 10376365 10376366 HTH_0637 HTH_0638 ilvB ilvH TRUE 0.968 13.000 0.057 0.001 Y NA
 10376366 10376367 HTH_0638 HTH_0639 ilvH pepB TRUE 0.849 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 10376367 10376368 HTH_0639 HTH_t10 pepB   TRUE 0.741 -9.000 0.000 NA   NA
 10376369 10376370 HTH_0640 HTH_0641 nadC   TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 10376371 10376372 HTH_0642 HTH_0643 glgA   TRUE 0.961 -10.000 0.071 1.000   NA
 10376373 10376374 HTH_0644 HTH_0645     FALSE 0.583 9.000 0.000 NA   NA
 10376374 10376375 HTH_0645 HTH_0646     FALSE 0.239 26.000 0.000 NA   NA
 10376376 10376377 HTH_0647 HTH_0648 panC ribH TRUE 0.889 -13.000 0.002 1.000 Y NA
 10376377 10376378 HTH_0648 HTH_0649 ribH nusB TRUE 0.957 -3.000 0.045 1.000 N NA
 10376379 10376380 HTH_0650 HTH_0651 hisA   TRUE 0.603 5.000 0.000 NA   NA
 10376380 10376381 HTH_0651 HTH_0652   rpoE FALSE 0.487 -25.000 0.000 NA   NA
 10376382 10376383 HTH_0653 HTH_0654     FALSE 0.455 -28.000 0.000 NA   NA
 10376383 10376384 HTH_0654 HTH_0655     FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10376384 10376385 HTH_0655 HTH_0656     FALSE 0.048 94.000 0.000 NA   NA
 10376385 10376386 HTH_0656 HTH_0657     FALSE 0.086 61.000 0.000 NA   NA
 10376386 10376387 HTH_0657 HTH_0658     FALSE 0.361 -45.000 0.000 NA   NA
 10376387 10376388 HTH_0658 HTH_0659     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376388 10376389 HTH_0659 HTH_0660     TRUE 0.611 -16.000 0.000 NA   NA
 10376389 10376390 HTH_0660 HTH_0661     FALSE 0.328 20.000 0.000 NA   NA
 10376390 10376391 HTH_0661 HTH_0662     TRUE 0.954 -3.000 0.022 1.000   NA
 10376391 10376392 HTH_0662 HTH_0663   pyrC FALSE 0.508 -55.000 0.003 1.000 N NA
 10376392 10376393 HTH_0663 HTH_0664 pyrC tyrA TRUE 0.873 -7.000 0.003 1.000 N NA
 10376394 10376395 HTH_t11 HTH_0665   oppB FALSE 0.032 175.000 0.000 NA   NA
 10376395 10376396 HTH_0665 HTH_0666 oppB   TRUE 0.962 0.000 0.065 NA   NA
 10376397 10376398 HTH_0667 HTH_0668   panD FALSE 0.115 38.000 0.000 1.000 N NA
 10376398 10376399 HTH_0668 HTH_0669 panD   TRUE 0.943 -10.000 0.004 0.016   NA
 10376400 10376401 HTH_0670 HTH_0671     TRUE 0.976 -16.000 0.500 NA   NA
 10376401 10376402 HTH_0671 HTH_0672   corA TRUE 0.957 -9.000 0.043 NA   NA
 10376402 10376403 HTH_0672 HTH_0673 corA   FALSE 0.391 23.000 0.000 0.074 N NA
 10376403 10376404 HTH_0673 HTH_0674   maf FALSE 0.030 105.000 0.000 NA N NA
 10376404 10376405 HTH_0674 HTH_0675 maf secD FALSE 0.403 13.000 0.000 NA N NA
 10376405 10376406 HTH_0675 HTH_0676 secD kdtA FALSE 0.479 10.000 0.000 1.000 N NA
 10376407 10376408 HTH_0677 HTH_0678     FALSE 0.048 94.000 0.000 NA   NA
 10376408 10376409 HTH_0678 HTH_0679     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376409 10376410 HTH_0679 HTH_0680     TRUE 0.718 -10.000 0.000 NA   NA
 10376410 10376411 HTH_0680 HTH_0681     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376413 10376414 HTH_0683 HTH_0684     TRUE 0.948 -7.000 0.031 1.000 N NA
 10376415 10376416 HTH_0685 HTH_0686     TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 10376416 10376417 HTH_0686 HTH_0687     TRUE 0.831 -10.000 0.000 NA Y NA
 10376417 10376418 HTH_0687 HTH_0688     FALSE 0.462 11.000 0.000 1.000 N NA
 10376418 10376419 HTH_0688 HTH_0689     TRUE 0.820 5.000 0.006 1.000 N NA
 10376419 10376420 HTH_0689 HTH_0690   leuD TRUE 0.921 -7.000 0.009 1.000 N NA
 10376420 10376421 HTH_0690 HTH_0691 leuD frr FALSE 0.248 20.000 0.000 1.000 N NA
 10376421 10376422 HTH_0691 HTH_0692 frr pyrH TRUE 0.955 15.000 0.626 1.000 N NA
 10376422 10376423 HTH_0692 HTH_0693 pyrH tsf TRUE 0.980 0.000 0.416 1.000 N NA
 10376423 10376424 HTH_0693 HTH_0694 tsf rpsB TRUE 0.980 14.000 0.748 1.000 Y NA
 10376424 10376425 HTH_0694 HTH_0695 rpsB   FALSE 0.108 85.000 0.003 1.000 N NA
 10376426 10376427 HTH_0696 HTH_0697 ctaA ctaB TRUE 0.984 -6.000 0.112 1.000 Y NA
 10376427 10376428 HTH_0697 HTH_0698 ctaB   TRUE 0.891 7.000 0.007 0.049 N NA
 10376430 10376431 HTH_0700 HTH_0701   lipA2 TRUE 0.603 5.000 0.000 NA   NA
 10376433 10376434 HTH_0703 HTH_0704     FALSE 0.424 16.000 0.000 NA   NA
 10376434 10376435 HTH_0704 HTH_0705   lpxB TRUE 0.893 1.000 0.005 NA   NA
 10376436 10376437 HTH_0706 HTH_0707 rluA   TRUE 0.863 -13.000 0.004 NA   NA
 10376437 10376438 HTH_0707 HTH_0708   sbcC FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10376438 10376439 HTH_0708 HTH_0709 sbcC sbcD TRUE 0.985 -19.000 0.669 NA Y NA
 10376439 10376440 HTH_0709 HTH_0710 sbcD   TRUE 0.940 -3.000 0.010 NA   NA
 10376440 10376441 HTH_0710 HTH_0711     TRUE 0.913 -10.000 0.008 NA   NA
 10376442 10376443 HTH_0712 HTH_0713 rplN rplX TRUE 0.995 2.000 0.810 0.034 Y NA
 10376443 10376444 HTH_0713 HTH_0714 rplX rplE TRUE 0.997 -3.000 0.758 0.025 Y NA
 10376444 10376445 HTH_0714 HTH_0715 rplE rpsN TRUE 0.986 12.000 0.496 0.025 Y NA
 10376445 10376446 HTH_0715 HTH_0716 rpsN rpsH TRUE 0.984 13.000 0.473 0.025 Y NA
 10376446 10376447 HTH_0716 HTH_0717 rpsH rplF TRUE 0.993 10.000 0.808 0.025 Y NA
 10376447 10376448 HTH_0717 HTH_0718 rplF rplR TRUE 0.992 11.000 0.815 0.025 Y NA
 10376448 10376449 HTH_0718 HTH_0719 rplR rpsE TRUE 0.990 13.000 0.814 0.034 Y NA
 10376449 10376450 HTH_0719 HTH_0720 rpsE rpmD TRUE 0.993 5.000 0.789 0.034 Y NA
 10376450 10376451 HTH_0720 HTH_0721 rpmD rplO TRUE 0.997 -3.000 0.653 0.005 Y NA
 10376451 10376452 HTH_0721 HTH_0722 rplO secY TRUE 0.991 -6.000 0.730 1.000 N NA
 10376452 10376453 HTH_0722 HTH_0723 secY   TRUE 0.919 -3.000 0.008 1.000 N NA
 10376453 10376454 HTH_0723 HTH_0724   map TRUE 0.932 -10.000 0.027 1.000 N NA
 10376454 10376455 HTH_0724 HTH_0725 map infA TRUE 0.985 -7.000 0.160 1.000 Y NA
 10376455 10376456 HTH_0725 HTH_0726 infA rpmJ TRUE 0.932 15.000 0.257 1.000   NA
 10376456 10376457 HTH_0726 HTH_0727 rpmJ rpsM TRUE 0.967 12.000 0.194 0.025   NA
 10376457 10376458 HTH_0727 HTH_0728 rpsM rpsK TRUE 0.992 11.000 0.810 0.025 Y NA
 10376458 10376459 HTH_0728 HTH_0729 rpsK rpsD TRUE 0.993 2.000 0.509 0.034 Y NA
 10376459 10376460 HTH_0729 HTH_0730 rpsD rpoA TRUE 0.960 13.000 0.549 1.000 N NA
 10376460 10376461 HTH_0730 HTH_0731 rpoA rplQ TRUE 0.983 4.000 0.873 1.000 N NA
 10376461 10376462 HTH_0731 HTH_0732 rplQ   TRUE 0.917 -3.000 0.004 1.000   NA
 10376462 10376463 HTH_0732 HTH_0733     TRUE 0.892 0.000 0.003 1.000   NA
 10376463 10376464 HTH_0733 HTH_0734     TRUE 0.761 -22.000 0.003 NA   NA
 10376464 10376465 HTH_0734 HTH_0735     TRUE 0.946 -24.000 0.286 NA   NA
 10376465 10376466 HTH_0735 HTH_0736     TRUE 0.977 0.000 0.222 NA   NA
 10376467 10376468 HTH_0737 HTH_0738 lepB   TRUE 0.619 -39.000 0.002 1.000   NA
 10376470 10376471 HTH_0740 HTH_0741   smtA TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376471 10376472 HTH_0741 HTH_0742 smtA uvrB TRUE 0.652 13.000 0.002 1.000 N NA
 10376472 10376473 HTH_0742 HTH_t12 uvrB   FALSE 0.027 918.000 0.000 NA   NA
 10376474 10376475 HTH_0744 HTH_0745   ksgA TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10376475 10376476 HTH_0745 HTH_0746 ksgA speE TRUE 0.860 -3.000 0.002 1.000 N NA
 10376476 10376477 HTH_0746 HTH_0747 speE metG TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10376477 10376478 HTH_0747 HTH_0748 metG glnE FALSE 0.507 4.000 0.000 1.000 N NA
 10376478 10376479 HTH_0748 HTH_0749 glnE   TRUE 0.693 -3.000 0.000 NA N NA
 10376479 10376480 HTH_0749 HTH_0750   eif TRUE 0.653 -9.000 0.000 NA N NA
 10376481 10376482 HTH_0751 HTH_0752 genX   FALSE 0.490 8.000 0.000 1.000 N NA
 10376482 10376483 HTH_0752 HTH_0753   tpx FALSE 0.119 36.000 0.000 1.000 N NA
 10376484 10376485 HTH_0754 HTH_0755 alr acnA FALSE 0.053 66.000 0.000 1.000 N NA
 10376485 10376486 HTH_0755 HTH_0756 acnA mdh TRUE 0.924 5.000 0.012 1.000 Y NA
 10376486 10376487 HTH_0756 HTH_0757 mdh fumA TRUE 0.903 -19.000 0.010 1.000 Y NA
 10376487 10376488 HTH_0757 HTH_0758 fumA   FALSE 0.049 92.000 0.000 NA   NA
 10376488 10376489 HTH_0758 HTH_0759   infC FALSE 0.442 28.000 0.003 NA   NA
 10376490 10376491 HTH_0760 HTH_0761     TRUE 0.992 -3.000 0.703 NA   NA
 10376491 10376492 HTH_0761 HTH_0762     TRUE 0.969 -7.000 0.077 NA   NA
 10376493 10376494 HTH_0763 HTH_0764     TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10376494 10376495 HTH_0764 HTH_0765     TRUE 0.598 7.000 0.000 1.000   NA
 10376496 10376497 HTH_0766 HTH_0767 lpxD   TRUE 0.962 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 10376497 10376498 HTH_0767 HTH_0768   clpX TRUE 0.665 -22.000 0.002 1.000 N NA
 10376498 10376499 HTH_0768 HTH_0769 clpX clpP TRUE 0.907 25.000 0.352 1.000 Y NA
 10376499 10376500 HTH_0769 HTH_0770 clpP tig TRUE 0.978 -16.000 0.351 1.000 Y NA
 10376502 10376503 HTH_0772 HTH_0773     TRUE 0.940 -3.000 0.010 NA   NA
 10376503 10376504 HTH_0773 HTH_0774   hemE TRUE 0.875 -3.000 0.002 1.000 N NA
 10376505 10376506 HTH_0775 HTH_0776   gph TRUE 0.967 -9.000 0.088 NA   NA
 10376507 10376508 HTH_0777 HTH_0778     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376510 10376511 HTH_0780 HTH_0781     TRUE 0.888 -13.000 0.007 NA   NA
 10376511 10376512 HTH_0781 HTH_0782     FALSE 0.168 119.000 0.011 1.000   NA
 10376512 10376513 HTH_0782 HTH_0783     FALSE 0.107 51.000 0.000 NA   NA
 10376513 10376514 HTH_0783 HTH_0784   dnaC FALSE 0.070 70.000 0.000 NA   NA
 10376515 10376516 HTH_0785 HTH_0786 surE purL FALSE 0.429 16.000 0.000 1.000   NA
 10376516 10376517 HTH_0786 HTH_0787 purL lspA TRUE 0.681 -42.000 0.009 1.000 N NA
 10376517 10376518 HTH_0787 HTH_0788 lspA gatC FALSE 0.187 25.000 0.000 1.000 N NA
 10376518 10376519 HTH_0788 HTH_0789 gatC recA TRUE 0.820 5.000 0.006 1.000 N NA
 10376519 10376520 HTH_0789 HTH_0790 recA pilT2 TRUE 0.887 -28.000 0.021 0.021 N NA
 10376520 10376521 HTH_0790 HTH_0791 pilT2 cmk TRUE 0.933 0.000 0.004 0.021 N NA
 10376522 10376523 HTH_0792 HTH_0793     TRUE 0.608 5.000 0.000 1.000   NA
 10376524 10376525 HTH_0794 HTH_0795   thiE2 FALSE 0.123 47.000 0.000 NA   NA
 10376525 10376526 HTH_0795 HTH_0796 thiE2 exo TRUE 0.939 -3.000 0.016 1.000 N NA
 10376526 10376527 HTH_0796 HTH_0797 exo   FALSE 0.352 -46.000 0.000 NA   NA
 10376527 10376528 HTH_0797 HTH_0798     FALSE 0.183 33.000 0.000 NA   NA
 10376528 10376529 HTH_0798 HTH_0799     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376531 10376532 HTH_0801 HTH_0802 rpmF plsX TRUE 0.980 0.000 0.418 1.000 N NA
 10376532 10376533 HTH_0802 HTH_0803 plsX fabH TRUE 0.986 0.000 0.058 0.006 Y NA
 10376533 10376534 HTH_0803 HTH_0804 fabH   FALSE 0.377 -27.000 0.000 1.000 N NA
 10376536 10376537 HTH_0806 HTH_0807 sorA sorB TRUE 0.945 15.000 0.153 0.078   NA
 10376537 10376538 HTH_0807 HTH_0808 sorB   TRUE 0.590 17.000 0.000 0.078   NA
 10376538 10376539 HTH_0808 HTH_0809     TRUE 0.603 5.000 0.000 NA   NA
 10376540 10376541 HTH_0810 HTH_0811 acrR deoC FALSE 0.161 28.000 0.000 1.000 N NA
 10376541 10376542 HTH_0811 HTH_0812 deoC trxB2 TRUE 0.660 -9.000 0.000 1.000 N NA
 10376542 10376543 HTH_0812 HTH_0813 trxB2 leuA FALSE 0.462 11.000 0.000 1.000 N NA
 10376543 10376544 HTH_0813 HTH_0814 leuA   FALSE 0.114 49.000 0.000 NA   NA
 10376544 10376545 HTH_0814 HTH_0815   soxF2 FALSE 0.576 10.000 0.000 NA   NA
 10376545 10376546 HTH_0815 HTH_0816 soxF2   TRUE 0.956 -25.000 0.455 NA   NA
 10376546 10376547 HTH_0816 HTH_0817   soxF1 TRUE 0.597 71.000 0.182 NA Y NA
 10376547 10376548 HTH_0817 HTH_0818 soxF1 thiE1 FALSE 0.032 94.000 0.000 NA N NA
 10376549 10376550 HTH_t13 HTH_0819   mviN FALSE 0.583 9.000 0.000 NA   NA
 10376551 10376552 HTH_0820 HTH_t14 rpsT   FALSE 0.201 31.000 0.000 NA   NA
 10376554 10376555 HTH_0822 HTH_0823   carB1 TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10376555 10376556 HTH_0823 HTH_0824 carB1   FALSE 0.047 71.000 0.000 1.000 N NA
 10376556 10376557 HTH_0824 HTH_0825   mazG FALSE 0.493 -25.000 0.000 1.000   NA
 10376557 10376558 HTH_0825 HTH_0826 mazG   TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 10376558 10376559 HTH_0826 HTH_0827   moeB TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 10376561 10376562 HTH_0829 HTH_0830     TRUE 0.985 -3.000 0.333 NA   NA
 10376563 10376564 HTH_0831 HTH_0832 gpsA gyrA FALSE 0.199 24.000 0.000 1.000 N NA
 10376566 10376567 HTH_0834 HTH_0835 dinG   FALSE 0.462 11.000 0.000 1.000 N NA
 10376568 10376569 HTH_0836 HTH_0837 icd cfa FALSE 0.020 267.000 0.000 1.000 N NA
 10376571 10376572 HTH_0839 HTH_0840 nfo   TRUE 0.903 -12.000 0.008 1.000   NA
 10376572 10376573 HTH_0840 HTH_0841   ileS FALSE 0.506 24.000 0.003 1.000   NA
 10376573 10376574 HTH_0841 HTH_0842 ileS rpsQ TRUE 0.827 1.000 0.000 1.000 Y NA
 10376574 10376575 HTH_0842 HTH_0843 rpsQ rpmC TRUE 0.996 -3.000 0.828 0.024   NA
 10376575 10376576 HTH_0843 HTH_0844 rpmC rplP TRUE 0.996 -3.000 0.802 0.024   NA
 10376576 10376577 HTH_0844 HTH_0845 rplP rpsC TRUE 0.994 4.000 0.828 0.033 Y NA
 10376577 10376578 HTH_0845 HTH_0846 rpsC rplV TRUE 0.995 1.000 0.719 0.033 Y NA
 10376578 10376579 HTH_0846 HTH_0847 rplV rpsS TRUE 0.992 10.000 0.769 0.033 Y NA
 10376579 10376580 HTH_0847 HTH_0848 rpsS rplB TRUE 0.997 -3.000 0.820 0.033 Y NA
 10376580 10376581 HTH_0848 HTH_0849 rplB rplW TRUE 0.988 11.000 0.849 1.000 Y NA
 10376581 10376582 HTH_0849 HTH_0850 rplW rplD TRUE 0.993 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 10376582 10376583 HTH_0850 HTH_0851 rplD rplC TRUE 0.994 -3.000 0.361 0.024 Y NA
 10376583 10376584 HTH_0851 HTH_0852 rplC rpsJ TRUE 0.990 3.000 0.467 0.033 Y NA
 10376584 10376585 HTH_0852 HTH_0853 rpsJ tufA1 TRUE 0.969 12.000 0.318 1.000 Y NA
 10376585 10376586 HTH_0853 HTH_0854 tufA1 fusA TRUE 0.966 22.000 0.400 0.002 Y NA
 10376586 10376587 HTH_0854 HTH_0855 fusA rpsG TRUE 0.974 14.000 0.579 1.000 Y NA
 10376587 10376588 HTH_0855 HTH_0856 rpsG rpsL TRUE 0.992 0.000 0.224 0.005 Y NA
 10376588 10376589 HTH_0856 HTH_0857 rpsL rpoC TRUE 0.608 30.000 0.035 1.000 N NA
 10376589 10376590 HTH_0857 HTH_0858 rpoC rpoB TRUE 0.997 -3.000 0.851 0.001   NA
 10376590 10376591 HTH_0858 HTH_0859 rpoB rplL FALSE 0.382 134.000 0.223 1.000   NA
 10376591 10376592 HTH_0859 HTH_0860 rplL rplJ TRUE 0.982 15.000 0.884 1.000 Y NA
 10376592 10376593 HTH_0860 HTH_0861 rplJ rplA TRUE 0.971 11.000 0.302 1.000 Y NA
 10376593 10376594 HTH_0861 HTH_0862 rplA rplK TRUE 0.994 6.000 0.838 0.033 Y NA
 10376594 10376595 HTH_0862 HTH_0863 rplK nusG TRUE 0.975 10.000 0.681 1.000 N NA
 10376595 10376596 HTH_0863 HTH_0864 nusG secE TRUE 0.990 0.000 0.843 1.000 N NA
 10376596 10376597 HTH_0864 HTH_t15 secE   FALSE 0.451 15.000 0.000 NA   NA
 10376597 10376598 HTH_t15 HTH_0865   rpmG TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10376598 10376599 HTH_0865 HTH_0866 rpmG tufA2 TRUE 0.949 12.000 0.099 1.000 Y NA
 10376599 10376600 HTH_0866 HTH_t16 tufA2   FALSE 0.376 18.000 0.000 NA   NA
 10376603 10376604 HTH_0868 HTH_0869 rpiB   TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376605 10376606 HTH_0870 HTH_0871   gltS TRUE 0.763 -7.000 0.000 NA   NA
 10376606 10376607 HTH_0871 HTH_0872 gltS   FALSE 0.035 152.000 0.000 NA   NA
 10376607 10376608 HTH_0872 HTH_0873   pyrF FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10376608 10376609 HTH_0873 HTH_0874 pyrF hisH TRUE 0.878 -7.000 0.003 1.000 N NA
 10376609 10376610 HTH_0874 HTH_0875 hisH ccdA TRUE 0.944 1.000 0.055 1.000 N NA
 10376610 10376611 HTH_0875 HTH_0876 ccdA   TRUE 0.676 2.000 0.000 1.000   NA
 10376613 10376614 HTH_0877 HTH_0878     TRUE 0.718 -10.000 0.000 NA   NA
 10376614 10376615 HTH_0878 HTH_0879     FALSE 0.028 306.000 0.000 NA   NA
 10376615 10376616 HTH_0879 HTH_0880     FALSE 0.104 52.000 0.000 NA   NA
 10376616 10376617 HTH_0880 HTH_0881     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376617 10376618 HTH_0881 HTH_0882     FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10376618 10376619 HTH_0882 HTH_0883     TRUE 0.966 -10.000 0.111 NA   NA
 10376619 10376620 HTH_0883 HTH_0884     TRUE 0.993 0.000 1.000 NA   NA
 10376620 10376621 HTH_0884 HTH_0885     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376621 10376622 HTH_0885 HTH_0886     TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10376622 10376623 HTH_0886 HTH_0887     FALSE 0.111 50.000 0.000 NA   NA
 10376623 10376624 HTH_0887 HTH_0888     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376624 10376625 HTH_0888 HTH_0889     TRUE 0.709 1.000 0.000 NA   NA
 10376625 10376626 HTH_0889 HTH_0890     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376626 10376627 HTH_0890 HTH_0891     TRUE 0.603 5.000 0.000 NA   NA
 10376627 10376628 HTH_0891 HTH_0892     TRUE 0.666 -13.000 0.000 NA   NA
 10376628 10376629 HTH_0892 HTH_0893     FALSE 0.089 60.000 0.000 NA   NA
 10376629 10376630 HTH_0893 HTH_0894     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376630 10376631 HTH_0894 HTH_0895     TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10376631 10376632 HTH_0895 HTH_0896     FALSE 0.082 63.000 0.000 NA   NA
 10376632 10376633 HTH_0896 HTH_0897     FALSE 0.533 12.000 0.000 NA   NA
 10376634 10376635 HTH_0898 HTH_0899     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376635 10376636 HTH_0899 HTH_0900     TRUE 0.603 5.000 0.000 NA   NA
 10376636 10376637 HTH_0900 HTH_0901     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376637 10376638 HTH_0901 HTH_0902     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376638 10376639 HTH_0902 HTH_0903     TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 10376639 10376640 HTH_0903 HTH_0904     TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 10376640 10376641 HTH_0904 HTH_0905     FALSE 0.359 19.000 0.000 1.000   NA
 10376641 10376642 HTH_0905 HTH_0906     TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10376642 10376643 HTH_0906 HTH_0907     TRUE 0.592 7.000 0.000 NA   NA
 10376643 10376644 HTH_0907 HTH_0908     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 10376644 10376645 HTH_0908 HTH_0909     FALSE 0.519 -22.000 0.000 NA   NA
 10376645 10376646 HTH_0909 HTH_0910     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376648 10376649 HTH_0912 HTH_0913     TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10376649 10376650 HTH_0913 HTH_0914     FALSE 0.151 41.000 0.000 NA   NA
 10376650 10376651 HTH_0914 HTH_0915     TRUE 0.617 3.000 0.000 NA   NA
 10376651 10376652 HTH_0915 HTH_0916     FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10376652 10376653 HTH_0916 HTH_0917     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376653 10376654 HTH_0917 HTH_0918     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376654 10376655 HTH_0918 HTH_0919     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376655 10376656 HTH_0919 HTH_0920     TRUE 0.709 1.000 0.000 NA   NA
 10376656 10376657 HTH_0920 HTH_0921     FALSE 0.476 14.000 0.000 NA   NA
 10376657 10376658 HTH_0921 HTH_0922     TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10376658 10376659 HTH_0922 HTH_0923     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376659 10376660 HTH_0923 HTH_0924     FALSE 0.426 -31.000 0.000 NA   NA
 10376660 10376661 HTH_0924 HTH_0925     TRUE 0.692 -12.000 0.000 NA   NA
 10376661 10376662 HTH_0925 HTH_0926     FALSE 0.317 -61.000 0.000 NA   NA
 10376662 10376663 HTH_0926 HTH_0927     FALSE 0.028 426.000 0.000 NA   NA
 10376663 10376664 HTH_0927 HTH_0928     FALSE 0.051 89.000 0.000 1.000   NA
 10376664 10376665 HTH_0928 HTH_0929     TRUE 0.756 13.000 0.000 0.005   NA
 10376665 10376666 HTH_0929 HTH_0930     TRUE 0.991 13.000 1.000 0.002   NA
 10376666 10376667 HTH_0930 HTH_0931     TRUE 0.994 3.000 0.667 0.002 Y NA
 10376667 10376668 HTH_0931 HTH_0932   sodC TRUE 0.897 6.000 0.035 1.000 N NA
 10376668 10376669 HTH_0932 HTH_0933 sodC fdhE TRUE 0.952 -3.000 0.035 NA N NA
 10376669 10376670 HTH_0933 HTH_0934 fdhE gcvH1 TRUE 0.975 -3.000 0.174 NA N NA
 10376670 10376671 HTH_0934 HTH_t19 gcvH1   TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10376671 10376672 HTH_t19 HTH_0935     FALSE 0.057 81.000 0.000 NA   NA
 10376672 10376673 HTH_0935 HTH_0936     TRUE 0.974 13.000 0.727 NA   NA
 10376674 10376675 HTH_0937 HTH_0938     TRUE 0.843 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10376675 10376676 HTH_0938 HTH_0939     TRUE 0.651 0.000 0.000 1.000 N NA
 10376676 10376677 HTH_0939 HTH_0940     TRUE 0.694 13.000 0.000 0.070   NA
 10376677 10376678 HTH_0940 HTH_0941     TRUE 0.973 -3.000 0.091 1.000   NA
 10376678 10376679 HTH_0941 HTH_0942     FALSE 0.058 81.000 0.000 1.000   NA
 10376679 10376680 HTH_0942 HTH_0943     FALSE 0.310 21.000 0.000 NA   NA
 10376680 10376681 HTH_0943 HTH_0944   coxA3 FALSE 0.139 43.000 0.000 NA   NA
 10376681 10376682 HTH_0944 HTH_0945 coxA3 coxB3 TRUE 0.996 0.000 0.667 0.006 Y NA
 10376682 10376683 HTH_0945 HTH_0946 coxB3   TRUE 0.992 3.000 1.000 0.074   NA
 10376683 10376684 HTH_0946 HTH_0947   coxC3 TRUE 0.996 -3.000 1.000 0.074   NA
 10376684 10376685 HTH_0947 HTH_0948 coxC3   TRUE 0.661 99.000 1.000 1.000 N NA
 10376686 10376687 HTH_0949 HTH_0950   cysG FALSE 0.580 2.000 0.000 1.000 N NA
 10376687 10376688 HTH_0950 HTH_0951 cysG cysK FALSE 0.479 10.000 0.000 1.000 N NA
 10376688 10376689 HTH_0951 HTH_0952 cysK gltD FALSE 0.400 25.000 0.000 1.000 Y NA
 10376689 10376690 HTH_0952 HTH_0953 gltD   TRUE 0.967 -3.000 0.056 NA   NA
 10376690 10376691 HTH_0953 HTH_0954     TRUE 0.971 -3.000 0.075 NA   NA
 10376691 10376692 HTH_0954 HTH_0955   mraW TRUE 0.843 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10376692 10376693 HTH_0955 HTH_0956 mraW   TRUE 0.916 -3.000 0.004 NA   NA
 10376694 10376695 HTH_0957 HTH_0958 atpG2 tyrS TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10376696 10376697 HTH_t20 HTH_0959     FALSE 0.533 12.000 0.000 NA   NA
 10376697 10376698 HTH_0959 HTH_0960     FALSE 0.486 9.000 0.000 1.000 N NA
 10376698 10376699 HTH_0960 HTH_0961     TRUE 0.977 -7.000 0.235 1.000 N NA
 10376700 10376701 HTH_0962 HTH_t21     FALSE 0.221 28.000 0.000 NA   NA
 10376701 10376702 HTH_t21 HTH_0963     FALSE 0.058 80.000 0.000 NA   NA
 10376704 10376705 HTH_0965 HTH_0966   soxF3 FALSE 0.077 115.000 0.000 NA Y NA
 10376707 10376708 HTH_0968 HTH_0969   era TRUE 0.661 16.000 0.000 0.020   NA
 10376708 10376709 HTH_0969 HTH_0970 era   TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10376709 10376710 HTH_0970 HTH_0971     FALSE 0.098 55.000 0.000 NA   NA
 10376710 10376711 HTH_0971 HTH_0972     FALSE 0.537 -21.000 0.000 NA   NA
 10376711 10376712 HTH_0972 HTH_0973     FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10376712 10376713 HTH_0973 HTH_0974   atpH TRUE 0.831 2.000 0.002 NA   NA
 10376713 10376714 HTH_0974 HTH_0975 atpH atpF2 TRUE 0.992 -3.000 0.132 0.006 Y NA
 10376714 10376715 HTH_0975 HTH_0976 atpF2 atpF1 TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.006 Y NA
 10376715 10376716 HTH_0976 HTH_0977 atpF1   FALSE 0.161 28.000 0.000 1.000 N NA
 10376717 10376718 HTH_0978 HTH_0979 eno   TRUE 0.938 -49.000 0.600 1.000   NA
 10376718 10376719 HTH_0979 HTH_0980   ribD1 TRUE 0.617 -16.000 0.000 1.000   NA
 10376719 10376720 HTH_0980 HTH_0981 ribD1 fmt TRUE 0.861 -3.000 0.002 1.000 N NA
 10376720 10376721 HTH_0981 HTH_0982 fmt   FALSE 0.376 18.000 0.000 NA   NA
 10376721 10376722 HTH_0982 HTH_t22     FALSE 0.123 47.000 0.000 NA   NA
 10376722 10376723 HTH_t22 HTH_t23     FALSE 0.506 13.000 0.000 NA   NA
 10376723 10376724 HTH_t23 HTH_t24     TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 10376724 10376725 HTH_t24 HTH_0983   frdB FALSE 0.221 28.000 0.000 NA   NA
 10376725 10376726 HTH_0983 HTH_0984 frdB   FALSE 0.093 57.000 0.000 NA   NA
 10376727 10376728 HTH_0985 HTH_0986 tldD   TRUE 0.603 5.000 0.000 NA   NA
 10376729 10376730 HTH_0987 HTH_0988 rimM cyc FALSE 0.049 70.000 0.000 1.000 N NA
 10376731 10376732 HTH_0989 HTH_0990     FALSE 0.376 18.000 0.000 NA   NA
 10376732 10376733 HTH_0990 HTH_0991     FALSE 0.258 25.000 0.000 1.000   NA
 10376733 10376734 HTH_0991 HTH_0992     TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10376734 10376735 HTH_0992 HTH_0993     TRUE 0.841 0.000 0.000 NA Y NA
 10376738 10376739 HTH_0996 HTH_0997   rpoZ FALSE 0.533 12.000 0.000 NA   NA
 10376739 10376740 HTH_0997 HTH_0998 rpoZ   FALSE 0.516 -16.000 0.000 1.000 N NA
 10376741 10376742 HTH_0999 HTH_1000     FALSE 0.328 20.000 0.000 NA   NA
 10376742 10376743 HTH_1000 HTH_1001   crcB TRUE 0.951 -3.000 0.017 NA   NA
 10376743 10376744 HTH_1001 HTH_1002 crcB   TRUE 0.947 -9.000 0.023 NA   NA
 10376745 10376746 HTH_1003 HTH_1004 hypB hupS2 TRUE 0.943 -3.000 0.021 1.000 N NA
 10376746 10376747 HTH_1004 HTH_1005 hupS2 hupL2 TRUE 0.997 -10.000 1.000 0.005 Y NA
 10376747 10376748 HTH_1005 HTH_1006 hupL2 hypE FALSE 0.436 12.000 0.000 1.000 N NA
 10376748 10376749 HTH_1006 HTH_1007 hypE hypA TRUE 0.953 2.000 0.080 1.000   NA
 10376749 10376750 HTH_1007 HTH_1008 hypA hypF TRUE 0.936 -10.000 0.018 1.000   NA
 10376751 10376752 HTH_1009 HTH_1010 hupH hupG TRUE 0.969 -9.000 0.103 NA   NA
 10376752 10376753 HTH_1010 HTH_1011 hupG hupD TRUE 0.892 -28.000 0.077 1.000   NA
 10376753 10376754 HTH_1011 HTH_1012 hupD hupC TRUE 0.993 0.000 0.667 1.000 Y NA
 10376754 10376755 HTH_1012 HTH_1013 hupC hupL1 TRUE 0.961 14.000 0.111 0.073 Y NA
 10376755 10376756 HTH_1013 HTH_1014 hupL1 hupS1 TRUE 0.993 3.000 0.611 0.004 Y NA
 10376757 10376758 HTH_1015 HTH_t25 gapA   TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 10376759 10376760 HTH_t26 HTH_1016     TRUE 0.603 5.000 0.000 NA   NA
 10376760 10376761 HTH_1016 HTH_1017   rpsA TRUE 0.829 2.000 0.003 1.000 N NA
 10376761 10376762 HTH_1017 HTH_1018 rpsA   FALSE 0.164 37.000 0.000 NA   NA
 10376762 10376763 HTH_1018 HTH_1019     FALSE 0.029 224.000 0.000 NA   NA
 10376764 10376765 HTH_1020 HTH_1021     FALSE 0.070 70.000 0.000 NA   NA
 10376765 10376766 HTH_1021 HTH_1022     TRUE 0.827 1.000 0.000 1.000 Y NA
 10376766 10376767 HTH_1022 HTH_1023     TRUE 0.945 -13.000 0.091 1.000 N NA
 10376767 10376768 HTH_1023 HTH_1024     TRUE 0.877 -7.000 0.000 0.069   NA
 10376768 10376769 HTH_1024 HTH_1025     TRUE 0.767 -7.000 0.000 1.000   NA
 10376769 10376770 HTH_1025 HTH_1026     TRUE 0.617 3.000 0.000 NA   NA
 10376770 10376771 HTH_1026 HTH_1027     FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10376771 10376772 HTH_1027 HTH_1028     TRUE 0.598 6.000 0.000 NA   NA
 10376772 10376773 HTH_1028 HTH_1029     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376774 10376775 HTH_1030 HTH_1031     FALSE 0.066 72.000 0.000 NA   NA
 10376776 10376777 HTH_1032 HTH_1033     FALSE 0.040 122.000 0.000 NA   NA
 10376777 10376778 HTH_1033 HTH_1034     FALSE 0.044 106.000 0.000 NA   NA
 10376781 10376782 HTH_1037 HTH_1038 priA   TRUE 0.917 -3.000 0.008 NA N NA
 10376782 10376783 HTH_1038 HTH_1039     TRUE 0.917 2.000 0.015 NA   NA
 10376783 10376784 HTH_1039 HTH_1040     TRUE 0.993 -6.000 0.804 NA   NA
 10376784 10376785 HTH_1040 HTH_1041     TRUE 0.987 2.000 0.790 NA   NA
 10376785 10376786 HTH_1041 HTH_1042   sirA1 TRUE 0.959 -3.000 0.029 NA   NA
 10376786 10376787 HTH_1042 HTH_1043 sirA1 pilB TRUE 0.725 27.000 0.095 1.000 N NA
 10376787 10376788 HTH_1043 HTH_1044 pilB panB TRUE 0.893 -7.000 0.004 1.000 N NA
 10376788 10376789 HTH_1044 HTH_1045 panB   TRUE 0.892 -7.000 0.002 NA   NA
 10376789 10376790 HTH_1045 HTH_1046   leuS TRUE 0.813 -16.000 0.003 NA   NA
 10376790 10376791 HTH_1046 HTH_1047 leuS dnaK FALSE 0.099 43.000 0.000 1.000 N NA
 10376791 10376792 HTH_1047 HTH_1048 dnaK   FALSE 0.038 84.000 0.000 1.000 N NA
 10376794 10376795 HTH_1050 HTH_1051   gspG2 FALSE 0.507 4.000 0.000 1.000 N NA
 10376796 10376797 HTH_1052 HTH_1053 cysS trpS TRUE 0.887 -3.000 0.000 0.053   NA
 10376797 10376798 HTH_1053 HTH_1054 trpS   TRUE 0.958 -3.000 0.026 1.000   NA
 10376798 10376799 HTH_1054 HTH_1055     FALSE 0.036 141.000 0.000 1.000   NA
 10376799 10376800 HTH_1055 HTH_1056     FALSE 0.532 34.000 0.000 0.002 Y NA
 10376801 10376802 HTH_1057 HTH_1058     TRUE 0.974 -3.000 0.097 1.000   NA
 10376802 10376803 HTH_1058 HTH_1059     FALSE 0.509 -16.000 0.000 NA N NA
 10376803 10376804 HTH_1059 HTH_1060     FALSE 0.514 3.000 0.000 NA N NA
 10376804 10376805 HTH_1060 HTH_1061     TRUE 0.945 3.000 0.032 1.000 Y NA
 10376805 10376806 HTH_1061 HTH_1062     TRUE 0.996 -3.000 0.429 0.001 Y NA
 10376806 10376807 HTH_1062 HTH_1063     TRUE 0.967 12.000 0.286 1.000 Y NA
 10376808 10376809 HTH_1064 HTH_1065   trpB2 FALSE 0.352 -46.000 0.000 NA   NA
 10376811 10376812 HTH_t27 HTH_1067   minC FALSE 0.328 20.000 0.000 NA   NA
 10376812 10376813 HTH_1067 HTH_1068 minC minD TRUE 0.988 -3.000 0.466 1.000   NA
 10376813 10376814 HTH_1068 HTH_1069 minD minE TRUE 0.985 4.000 0.618 NA Y NA
 10376814 10376815 HTH_1069 HTH_1070 minE   TRUE 0.903 -3.000 0.005 NA N NA
 10376816 10376817 HTH_1071 HTH_1072   rfaG TRUE 0.972 -3.000 0.083 1.000   NA
 10376817 10376818 HTH_1072 HTH_1073 rfaG   TRUE 0.897 -22.000 0.045 1.000   NA
 10376818 10376819 HTH_1073 HTH_1074     TRUE 0.900 -57.000 0.068 0.007   NA
 10376821 10376822 HTH_1076 HTH_1077     FALSE 0.575 27.000 0.010 NA   NA
 10376822 10376823 HTH_1077 HTH_1078   atpC TRUE 0.840 -19.000 0.007 1.000   NA
 10376823 10376824 HTH_1078 HTH_1079 atpC   FALSE 0.039 123.000 0.000 NA   NA
 10376825 10376826 HTH_1080 HTH_1081   metE FALSE 0.436 12.000 0.000 1.000 N NA
 10376826 10376827 HTH_1081 HTH_1082 metE   TRUE 0.622 1.000 0.000 1.000 N NA
 10376828 10376829 HTH_1083 HTH_1084     TRUE 0.969 5.000 0.400 NA   NA
 10376831 10376832 HTH_1086 HTH_1087   folE TRUE 0.945 -3.000 0.011 NA   NA
 10376836 10376837 HTH_1091 HTH_1092   korB TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376837 10376838 HTH_1092 HTH_1093 korB korA TRUE 0.982 14.000 0.316 0.001 Y NA
 10376839 10376840 HTH_1094 HTH_1095 forD forA TRUE 0.938 19.000 0.545 1.000   NA
 10376840 10376841 HTH_1095 HTH_1096 forA forB TRUE 0.977 23.000 0.750 0.004 Y NA
 10376841 10376842 HTH_1096 HTH_1097 forB forG TRUE 0.996 -3.000 0.500 0.004 Y NA
 10376842 10376843 HTH_1097 HTH_1098 forG forE TRUE 0.990 17.000 1.000 0.004 Y NA
 10376843 10376844 HTH_1098 HTH_1099 forE forF TRUE 0.981 2.000 0.500 NA   NA
 10376844 10376845 HTH_1099 HTH_1100 forF cobW TRUE 0.966 4.000 0.333 NA   NA
 10376845 10376846 HTH_1100 HTH_1101 cobW nuoL2 FALSE 0.506 13.000 0.000 NA   NA
 10376846 10376847 HTH_1101 HTH_1102 nuoL2   TRUE 0.911 12.000 0.061 NA   NA
 10376847 10376848 HTH_1102 HTH_1103   glnB4 TRUE 0.984 -3.000 0.288 NA   NA
 10376851 10376852 HTH_1105 HTH_1106     TRUE 0.713 11.000 0.000 1.000 Y NA
 10376852 10376853 HTH_1106 HTH_1107     FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10376853 10376854 HTH_1107 HTH_1108   cobA2 TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376854 10376855 HTH_1108 HTH_1109 cobA2 hemD2 TRUE 0.969 -7.000 0.024 1.000 Y NA
 10376855 10376856 HTH_1109 HTH_1110 hemD2 nasB TRUE 0.871 -16.000 0.013 1.000 N NA
 10376856 10376857 HTH_1110 HTH_1111 nasB nasA TRUE 0.909 2.000 0.022 NA N NA
 10376857 10376858 HTH_1111 HTH_1112 nasA cynS FALSE 0.537 18.000 0.000 NA Y NA
 10376858 10376859 HTH_1112 HTH_1113 cynS glnB5 TRUE 0.902 2.000 0.016 1.000 N NA
 10376859 10376860 HTH_1113 HTH_1114 glnB5 glnB6 TRUE 0.994 -3.000 0.200 0.004 Y NA
 10376860 10376861 HTH_1114 HTH_1115 glnB6 hmp TRUE 0.930 13.000 0.222 1.000 N NA
 10376862 10376863 HTH_1116 HTH_1117 nirB   FALSE 0.058 80.000 0.000 NA   NA
 10376863 10376864 HTH_1117 HTH_1118     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376864 10376865 HTH_1118 HTH_1119   glnB1 FALSE 0.030 235.000 0.000 1.000   NA
 10376865 10376866 HTH_1119 HTH_1120 glnB1 glnB2 TRUE 0.997 -3.000 0.667 0.004 Y NA
 10376866 10376867 HTH_1120 HTH_1121 glnB2 nifT TRUE 0.869 11.000 0.025 1.000 N NA
 10376867 10376868 HTH_1121 HTH_1122 nifT   FALSE 0.506 13.000 0.000 NA   NA
 10376868 10376869 HTH_1122 HTH_1123   fdx4 TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 10376869 10376870 HTH_1123 HTH_1124 fdx4 nifW TRUE 0.933 -12.000 0.022 1.000   NA
 10376870 10376871 HTH_1124 HTH_1125 nifW nifZ TRUE 0.975 -16.000 0.133 0.005   NA
 10376871 10376872 HTH_1125 HTH_1126 nifZ   TRUE 0.882 -25.000 0.043 1.000   NA
 10376873 10376874 HTH_1127 HTH_1128 fdx6 fdx5 TRUE 0.899 -3.000 0.000 0.023   NA
 10376874 10376875 HTH_1128 HTH_1129 fdx5   TRUE 0.971 -3.000 0.080 NA   NA
 10376875 10376876 HTH_1129 HTH_1130     FALSE 0.077 66.000 0.000 NA   NA
 10376876 10376877 HTH_1130 HTH_1131   nifS1 TRUE 0.963 -3.000 0.011 1.000 Y NA
 10376877 10376878 HTH_1131 HTH_1132 nifS1 aor TRUE 0.910 -10.000 0.011 1.000 N NA
 10376878 10376879 HTH_1132 HTH_1133 aor   TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376879 10376880 HTH_1133 HTH_1134     TRUE 0.617 3.000 0.000 NA   NA
 10376881 10376882 HTH_1135 HTH_1136 nifA nifH FALSE 0.023 171.000 0.000 1.000 N NA
 10376882 10376883 HTH_1136 HTH_1137 nifH   FALSE 0.533 12.000 0.000 NA   NA
 10376883 10376884 HTH_1137 HTH_1138     FALSE 0.398 17.000 0.000 NA   NA
 10376884 10376885 HTH_1138 HTH_1139     TRUE 0.603 5.000 0.000 NA   NA
 10376885 10376886 HTH_1139 HTH_1140     TRUE 0.777 -6.000 0.000 NA   NA
 10376886 10376887 HTH_1140 HTH_1141     TRUE 0.954 0.000 0.039 NA   NA
 10376887 10376888 HTH_1141 HTH_1142   nifE TRUE 0.843 11.000 0.013 1.000 N NA
 10376888 10376889 HTH_1142 HTH_1143 nifE nifN TRUE 0.980 -12.000 0.025 0.002 Y NA
 10376889 10376890 HTH_1143 HTH_1144 nifN nifX TRUE 0.981 -3.000 0.037 0.005   NA
 10376891 10376892 HTH_1145 HTH_1146     FALSE 0.472 -27.000 0.000 NA   NA
 10376893 10376894 HTH_1147 HTH_1148     FALSE 0.332 -54.000 0.000 NA   NA
 10376894 10376895 HTH_1148 HTH_1149     FALSE 0.239 26.000 0.000 NA   NA
 10376896 10376897 HTH_1150 HTH_1151 hyfF hyfE TRUE 0.995 -3.000 0.864 NA Y NA
 10376897 10376898 HTH_1151 HTH_1152 hyfE hyfC TRUE 0.923 32.000 0.679 NA Y NA
 10376898 10376899 HTH_1152 HTH_1153 hyfC hyfB TRUE 0.979 -3.000 0.058 1.000 Y NA
 10376900 10376901 HTH_1154 HTH_1155 hycE hycC TRUE 0.990 12.000 0.631 0.011 Y NA
 10376904 10376905 HTH_1157 HTH_1158 nifS2 mrp TRUE 0.955 4.000 0.267 1.000 N NA
 10376907 10376908 HTH_1160 HTH_1161 speC queC1 FALSE 0.258 25.000 0.000 1.000   NA
 10376908 10376909 HTH_1161 HTH_t30 queC1   FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10376909 10376910 HTH_t30 HTH_1162     FALSE 0.279 23.000 0.000 NA   NA
 10376910 10376911 HTH_1162 HTH_1163     TRUE 0.923 5.000 0.044 NA   NA
 10376912 10376913 HTH_1164 HTH_1165   purM TRUE 0.898 -7.000 0.005 1.000 N NA
 10376913 10376914 HTH_1165 HTH_1166 purM   TRUE 0.745 -16.000 0.002 1.000 N NA
 10376914 10376915 HTH_1166 HTH_1167     TRUE 0.956 0.000 0.070 1.000 N NA
 10376915 10376916 HTH_1167 HTH_1168   moaC TRUE 0.735 8.000 0.000 1.000 Y NA
 10376916 10376917 HTH_1168 HTH_1169 moaC   TRUE 0.685 -7.000 0.000 1.000 N NA
 10376918 10376919 HTH_1170 HTH_1171     TRUE 0.738 0.000 0.000 1.000   NA
 10376921 10376922 HTH_1173 HTH_1174     TRUE 0.709 1.000 0.000 NA   NA
 10376922 10376923 HTH_1174 HTH_1175   dut TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 10376923 10376924 HTH_1175 HTH_t31 dut   FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10376924 10376925 HTH_t31 HTH_1176   pnp FALSE 0.368 -43.000 0.000 NA   NA
 10376925 10376926 HTH_1176 HTH_1177 pnp rpsO TRUE 0.990 -3.000 0.335 1.000 Y NA
 10376926 10376927 HTH_1177 HTH_1178 rpsO   FALSE 0.191 32.000 0.000 NA   NA
 10376928 10376929 HTH_1179 HTH_1180     TRUE 0.673 48.000 0.333 NA N NA
 10376929 10376930 HTH_1180 HTH_1181     TRUE 0.966 -3.000 0.050 1.000   NA
 10376931 10376932 HTH_1182 HTH_1183     TRUE 0.862 2.000 0.004 NA   NA
 10376932 10376933 HTH_1183 HTH_1184   moaA FALSE 0.030 199.000 0.000 NA   NA
 10376933 10376934 HTH_1184 HTH_1185 moaA moaE TRUE 0.977 -3.000 0.006 0.005 Y NA
 10376935 10376936 HTH_1186 HTH_1187     FALSE 0.086 61.000 0.000 NA   NA
 10376936 10376937 HTH_1187 HTH_1188     FALSE 0.171 35.000 0.000 NA   NA
 10376938 10376939 HTH_1189 HTH_1190     TRUE 0.974 -3.000 0.100 1.000   NA
 10376940 10376941 HTH_1191 HTH_1192     TRUE 0.963 -3.000 0.042 NA   NA
 10376942 10376943 HTH_1193 HTH_1194 gidB   TRUE 0.896 -3.000 0.002 1.000   NA
 10376945 10376946 HTH_1196 HTH_1197 lgt   FALSE 0.221 28.000 0.000 NA   NA
 10376946 10376947 HTH_1197 HTH_1198   murE TRUE 0.880 -13.000 0.006 NA   NA
 10376947 10376948 HTH_1198 HTH_1199 murE   TRUE 0.693 -3.000 0.000 NA N NA
 10376948 10376949 HTH_1199 HTH_1200   argF TRUE 0.724 10.000 0.000 NA Y NA
 10376950 10376951 HTH_1201 HTH_1202   rimI TRUE 0.863 -16.000 0.007 NA   NA
 10376952 10376953 HTH_1203 HTH_1204 ispA   FALSE 0.533 12.000 0.000 NA   NA
 10376953 10376954 HTH_1204 HTH_1205   uvrC TRUE 0.901 -7.000 0.003 NA   NA
 10376956 10376957 HTH_1207 HTH_1208     FALSE 0.300 -141.000 0.000 NA   NA
 10376957 10376958 HTH_1208 HTH_1209   lpdA2 FALSE 0.174 35.000 0.000 1.000   NA
 10376958 10376959 HTH_1209 HTH_1210 lpdA2   TRUE 0.956 -3.000 0.024 NA   NA
 10376959 10376960 HTH_1210 HTH_1211     FALSE 0.031 187.000 0.000 NA   NA
 10376961 10376962 HTH_1212 HTH_1213 pqqC1 pqqE TRUE 0.982 -7.000 0.038 0.002   NA
 10376962 10376963 HTH_1213 HTH_1214 pqqE pqqC2 TRUE 0.983 -3.000 0.038 0.002   NA
 10376963 10376964 HTH_1214 HTH_1215 pqqC2 pqqB TRUE 0.945 22.000 0.825 1.000   NA
 10376964 10376965 HTH_1215 HTH_1216 pqqB   TRUE 0.598 6.000 0.000 NA   NA
 10376966 10376967 HTH_1217 HTH_1218 pqqD rpmI TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10376968 10376969 HTH_1219 HTH_1220     TRUE 0.981 2.000 0.500 NA   NA
 10376970 10376971 HTH_1221 HTH_1222     TRUE 0.623 50.000 0.164 NA   NA
 10376971 10376972 HTH_1222 HTH_1223     FALSE 0.058 80.000 0.000 NA   NA
 10376978 10376979 HTH_1229 HTH_1230     FALSE 0.396 -37.000 0.000 NA   NA
 10376980 10376981 HTH_1231 HTH_1232 dapA   TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 10376981 10376982 HTH_1232 HTH_1233   rusA TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10376983 10376984 HTH_1234 HTH_1235   acyP TRUE 0.781 -31.000 0.020 1.000 N NA
 10376984 10376985 HTH_1235 HTH_1236 acyP   FALSE 0.376 18.000 0.000 NA   NA
 10376986 10376987 HTH_1237 HTH_1238 lytB   FALSE 0.308 -37.000 0.000 1.000 N NA
 10376987 10376988 HTH_1238 HTH_1239     FALSE 0.093 58.000 0.000 1.000   NA
 10376988 10376989 HTH_1239 HTH_1240     TRUE 0.603 5.000 0.000 NA   NA
 10376989 10376990 HTH_1240 HTH_1241     FALSE 0.424 16.000 0.000 NA   NA
 10376991 10376992 HTH_1242 HTH_1243     FALSE 0.086 61.000 0.000 NA   NA
 10376992 10376993 HTH_1243 HTH_1244   cas2 FALSE 0.018 2612.000 0.000 1.000 N NA
 10376993 10376994 HTH_1244 HTH_1245 cas2 cas1 TRUE 0.974 1.000 0.087 NA Y NA
 10376994 10376995 HTH_1245 HTH_1246 cas1 cas4 TRUE 0.993 -3.000 0.579 NA Y NA
 10376995 10376996 HTH_1246 HTH_1247 cas4 cas3 TRUE 0.977 -10.000 0.258 NA   NA
 10376996 10376997 HTH_1247 HTH_1248 cas3 cas5 TRUE 0.946 -45.000 0.629 NA   NA
 10376997 10376998 HTH_1248 HTH_1249 cas5 csh2 TRUE 0.977 7.000 0.603 NA   NA
 10376998 10376999 HTH_1249 HTH_1250 csh2 csh1 TRUE 0.972 -16.000 0.441 NA   NA
 10376999 10377000 HTH_1250 HTH_1251 csh1 cas6 TRUE 0.949 -16.000 0.129 NA   NA
 10377004 10377005 HTH_1255 HTH_1256 ftsI carA TRUE 0.802 -13.000 0.002 1.000 N NA
 10377005 10377006 HTH_1256 HTH_t32 carA   FALSE 0.506 13.000 0.000 NA   NA
 10377006 10377007 HTH_t32 HTH_t33     FALSE 0.506 13.000 0.000 NA   NA
 10377007 10377008 HTH_t33 HTH_1257     FALSE 0.328 20.000 0.000 NA   NA
 10377008 10377009 HTH_1257 HTH_1258   rpoN TRUE 0.914 -3.000 0.007 1.000 N NA
 10377009 10377010 HTH_1258 HTH_1259 rpoN   FALSE 0.424 16.000 0.000 NA   NA
 10377010 10377011 HTH_1259 HTH_1260     FALSE 0.426 -31.000 0.000 NA   NA
 10377011 10377012 HTH_1260 HTH_1261   hemN1 TRUE 0.963 -3.000 0.065 1.000 N NA
 10377013 10377014 HTH_1262 HTH_1263 grpE   TRUE 0.905 5.000 0.023 1.000   NA
 10377014 10377015 HTH_1263 HTH_1264     TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10377017 10377018 HTH_1266 HTH_1267 hemC   TRUE 0.867 -12.000 0.003 NA   NA
 10377018 10377019 HTH_1267 HTH_1268   amiC TRUE 0.882 -28.000 0.061 NA   NA
 10377020 10377021 HTH_1269 HTH_1270   infB TRUE 0.668 -36.000 0.006 1.000 N NA
 10377021 10377022 HTH_1270 HTH_1271 infB   FALSE 0.479 10.000 0.000 1.000 N NA
 10377022 10377023 HTH_1271 HTH_1272   bioB TRUE 0.939 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 10377023 10377024 HTH_1272 HTH_1273 bioB   FALSE 0.328 20.000 0.000 NA   NA
 10377024 10377025 HTH_1273 HTH_1274     TRUE 0.617 3.000 0.000 NA   NA
 10377025 10377026 HTH_1274 HTH_1275   uspA2 TRUE 0.836 2.000 0.002 1.000   NA
 10377026 10377027 HTH_1275 HTH_1276 uspA2 gyrB TRUE 0.897 -7.000 0.005 1.000 N NA
 10377027 10377028 HTH_1276 HTH_t34 gyrB   FALSE 0.398 17.000 0.000 NA   NA
 10377028 10377029 HTH_t34 HTH_1277     FALSE 0.151 41.000 0.000 NA   NA
 10377029 10377030 HTH_1277 HTH_1278     FALSE 0.123 47.000 0.000 NA   NA
 10377030 10377031 HTH_1278 HTH_1279     FALSE 0.451 15.000 0.000 NA   NA
 10377031 10377032 HTH_1279 HTH_1280     TRUE 0.962 -19.000 0.364 NA   NA
 10377032 10377033 HTH_1280 HTH_1281     TRUE 0.985 0.000 0.043 0.005 Y NA
 10377034 10377035 HTH_1282 HTH_1283 hslV   TRUE 0.709 1.000 0.000 NA   NA
 10377035 10377036 HTH_1283 HTH_1284   rodA TRUE 0.718 -10.000 0.000 NA   NA
 10377036 10377037 HTH_1284 HTH_1285 rodA hemN2 TRUE 0.901 -3.000 0.005 1.000 N NA
 10377037 10377038 HTH_1285 HTH_1286 hemN2   FALSE 0.254 -52.000 0.000 1.000 N NA
 10377038 10377039 HTH_1286 HTH_1287   gcvH2 TRUE 0.937 -7.000 0.018 1.000 N NA
 10377040 10377041 HTH_1288 HTH_1289 selA selB TRUE 0.994 -3.000 0.569 0.001 N NA
 10377041 10377042 HTH_1289 HTH_1290 selB pncB FALSE 0.502 6.000 0.000 1.000 N NA
 10377042 10377043 HTH_1290 HTH_1291 pncB   TRUE 0.592 8.000 0.000 1.000   NA
 10377044 10377045 HTH_1292 HTH_1293 murC recJ TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10377045 10377046 HTH_1293 HTH_1294 recJ   TRUE 0.871 -13.000 0.005 NA   NA
 10377048 10377049 HTH_1296 HTH_1297 thrS   TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10377049 10377050 HTH_1297 HTH_1298   plsC FALSE 0.543 -21.000 0.000 1.000   NA
 10377050 10377051 HTH_1298 HTH_1299 plsC tgt FALSE 0.175 26.000 0.000 1.000 N NA
 10377051 10377052 HTH_1299 HTH_1300 tgt   FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10377052 10377053 HTH_1300 HTH_1301     FALSE 0.066 72.000 0.000 NA   NA
 10377053 10377054 HTH_1301 HTH_1302     TRUE 0.934 -3.000 0.012 1.000 N NA
 10377054 10377055 HTH_1302 HTH_1303   sirA2 TRUE 0.966 -3.000 0.011 0.008 N NA
 10377055 10377056 HTH_1303 HTH_1304 sirA2   TRUE 0.977 -3.000 0.138 NA   NA
 10377056 10377057 HTH_1304 HTH_1305     TRUE 0.953 3.000 0.138 NA   NA
 10377057 10377058 HTH_1305 HTH_1306   aroE TRUE 0.963 -3.000 0.062 1.000 N NA
 10377058 10377059 HTH_1306 HTH_1307 aroE   TRUE 0.598 6.000 0.000 NA   NA
 10377061 10377062 HTH_1309 HTH_1310 lepA recG FALSE 0.479 10.000 0.000 1.000 N NA
 10377063 10377064 HTH_1311 HTH_1312     TRUE 0.674 32.000 0.057 NA   NA
 10377064 10377065 HTH_1312 HTH_1313     TRUE 0.946 -3.000 0.012 1.000   NA
 10377066 10377067 HTH_1314 HTH_1315 guaA   TRUE 0.609 4.000 0.000 1.000   NA
 10377067 10377068 HTH_1315 HTH_1316   rlpA2 TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377069 10377070 HTH_1317 HTH_1318   modB TRUE 0.989 -3.000 0.286 1.000 Y NA
 10377070 10377071 HTH_1318 HTH_1319 modB   TRUE 0.974 -7.000 0.122 1.000   NA
 10377071 10377072 HTH_1319 HTH_1320   modA TRUE 0.968 0.000 0.098 1.000   NA
 10377072 10377073 HTH_1320 HTH_1321 modA   FALSE 0.530 22.000 0.000 0.001 N NA
 10377073 10377074 HTH_1321 HTH_1322     FALSE 0.357 15.000 0.000 1.000 N NA
 10377075 10377076 HTH_1323 HTH_1324     FALSE 0.040 120.000 0.000 NA   NA
 10377077 10377078 HTH_1325 HTH_1326 merA merP TRUE 0.981 11.000 0.500 0.010 N NA
 10377078 10377079 HTH_1326 HTH_1327 merP   TRUE 0.603 5.000 0.000 NA   NA
 10377079 10377080 HTH_1327 HTH_1328     TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 10377081 10377082 HTH_1329 HTH_1330 mobA   TRUE 0.626 -10.000 0.000 NA N NA
 10377082 10377083 HTH_1330 HTH_1331     FALSE 0.263 -46.000 0.000 NA N NA
 10377084 10377085 HTH_1332 HTH_1333 qcrC qcrB TRUE 0.987 2.000 0.103 0.002 Y NA
 10377085 10377086 HTH_1333 HTH_1334 qcrB qcrA TRUE 0.950 13.000 0.013 0.002 Y NA
 10377086 10377087 HTH_1334 HTH_1335 qcrA   FALSE 0.018 447.000 0.000 NA N NA
 10377087 10377088 HTH_1335 HTH_1336     FALSE 0.313 32.000 0.000 NA Y NA
 10377089 10377090 HTH_1337 HTH_1338     TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10377090 10377091 HTH_1338 HTH_1339   sqr FALSE 0.035 149.000 0.000 NA   NA
 10377092 10377093 HTH_1340 HTH_1341 mutS2   FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10377093 10377094 HTH_1341 HTH_1342     FALSE 0.061 77.000 0.000 NA   NA
 10377094 10377095 HTH_1342 HTH_1343     TRUE 0.911 -36.000 0.200 NA   NA
 10377095 10377096 HTH_1343 HTH_1344     TRUE 0.925 -13.000 0.022 1.000   NA
 10377097 10377098 HTH_1345 HTH_1346     TRUE 0.950 -3.000 0.015 1.000   NA
 10377098 10377099 HTH_1346 HTH_1347     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377099 10377100 HTH_1347 HTH_1348     TRUE 0.718 -10.000 0.000 NA   NA
 10377100 10377101 HTH_1348 HTH_1349     FALSE 0.107 41.000 0.000 1.000 N NA
 10377101 10377102 HTH_1349 HTH_1350     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377102 10377103 HTH_1350 HTH_1351   dsbC FALSE 0.100 54.000 0.000 NA   NA
 10377103 10377104 HTH_1351 HTH_1352 dsbC bioF TRUE 0.925 4.000 0.077 1.000 N NA
 10377106 10377107 HTH_1354 HTH_1355     TRUE 0.978 -3.000 0.143 NA   NA
 10377107 10377108 HTH_1355 HTH_1356   dxs TRUE 0.619 21.000 0.006 NA   NA
 10377110 10377111 HTH_1358 HTH_1359     TRUE 0.666 -13.000 0.000 NA   NA
 10377111 10377112 HTH_1359 HTH_1360   dnaG FALSE 0.145 42.000 0.000 NA   NA
 10377112 10377113 HTH_1360 HTH_1361 dnaG citA FALSE 0.290 18.000 0.000 1.000 N NA
 10377113 10377114 HTH_1361 HTH_1362 citA   TRUE 0.853 5.000 0.006 NA   NA
 10377114 10377115 HTH_1362 HTH_1363   prc1 TRUE 0.936 -3.000 0.009 NA   NA
 10377115 10377116 HTH_1363 HTH_1364 prc1 gcp TRUE 0.969 -3.000 0.017 0.016 N NA
 10377118 10377119 HTH_1366 HTH_1367   thrC2 TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 10377119 10377120 HTH_1367 HTH_1368 thrC2 sua5 TRUE 0.693 -3.000 0.000 NA N NA
 10377122 10377123 HTH_1370 HTH_t35     FALSE 0.294 22.000 0.000 NA   NA
 10377124 10377125 HTH_1371 HTH_1372     TRUE 0.610 45.000 0.091 NA   NA
 10377126 10377127 HTH_1373 HTH_1374 atpB atpE TRUE 0.892 32.000 0.119 0.005 Y NA
 10377127 10377128 HTH_1374 HTH_1375 atpE rpmH TRUE 0.839 11.000 0.008 1.000   NA
 10377128 10377129 HTH_1375 HTH_1376 rpmH   TRUE 0.925 -3.000 0.005 NA   NA
 10377129 10377130 HTH_1376 HTH_1377   oxaA TRUE 0.985 0.000 0.461 NA   NA
 10377131 10377132 HTH_1378 HTH_1379 selD   FALSE 0.036 140.000 0.000 NA   NA
 10377133 10377134 HTH_1380 HTH_1381     FALSE 0.061 77.000 0.000 NA   NA
 10377134 10377135 HTH_1381 HTH_1382   moaD2 TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377135 10377136 HTH_1382 HTH_1383 moaD2   TRUE 0.916 -7.000 0.008 1.000 N NA
 10377137 10377138 HTH_1384 HTH_1385     FALSE 0.377 44.000 0.007 NA   NA
 10377138 10377139 HTH_1385 HTH_1386     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377139 10377140 HTH_1386 HTH_1387     FALSE 0.254 25.000 0.000 NA   NA
 10377140 10377141 HTH_1387 HTH_1388   acuC2 TRUE 0.813 20.000 0.059 NA   NA
 10377142 10377143 HTH_1389 HTH_1390     FALSE 0.506 13.000 0.000 NA   NA
 10377143 10377144 HTH_1390 HTH_1391     FALSE 0.151 41.000 0.000 NA   NA
 10377145 10377146 HTH_1392 HTH_1393 cfiA cfiB TRUE 0.936 24.000 0.444 0.003 N NA
 10377146 10377147 HTH_1393 HTH_1394 cfiB   TRUE 0.681 18.000 0.009 1.000 N NA
 10377147 10377148 HTH_1394 HTH_1395     FALSE 0.044 73.000 0.000 1.000 N NA
 10377149 10377150 HTH_1396 HTH_1397   pheA FALSE 0.198 65.000 0.003 NA   NA
 10377151 10377152 HTH_1398 HTH_1399     TRUE 0.753 -28.000 0.006 NA   NA
 10377152 10377153 HTH_1399 HTH_1400   mscS FALSE 0.088 86.000 0.000 0.057 N NA
 10377155 10377156 HTH_1402 HTH_1403     TRUE 0.993 -3.000 0.604 1.000 Y NA
 10377156 10377157 HTH_1403 HTH_1404     TRUE 0.979 13.000 0.887 NA   NA
 10377157 10377158 HTH_1404 HTH_1405     FALSE 0.450 55.000 0.040 NA   NA
 10377158 10377159 HTH_1405 HTH_1406   trmH TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377159 10377160 HTH_1406 HTH_1407 trmH trmU TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10377160 10377161 HTH_1407 HTH_1408 trmU   TRUE 0.959 12.000 0.400 NA   NA
 10377162 10377163 HTH_1409 HTH_1410   ftsY FALSE 0.299 22.000 0.000 1.000   NA
 10377163 10377164 HTH_1410 HTH_1411 ftsY nuoA2 FALSE 0.580 2.000 0.000 1.000 N NA
 10377164 10377165 HTH_1411 HTH_1412 nuoA2 nuoB FALSE 0.564 72.000 0.022 0.009 Y NA
 10377165 10377166 HTH_1412 HTH_1413 nuoB nuoD2 TRUE 0.995 4.000 1.000 0.009 Y NA
 10377166 10377167 HTH_1413 HTH_1414 nuoD2   TRUE 0.709 1.000 0.000 NA   NA
 10377167 10377168 HTH_1414 HTH_1415     TRUE 0.979 -3.000 0.167 NA   NA
 10377169 10377170 HTH_1416 HTH_1417 queC2   TRUE 0.965 -13.000 0.182 NA   NA
 10377171 10377172 HTH_1418 HTH_1419 thrC1   TRUE 0.949 -3.000 0.014 1.000   NA
 10377173 10377174 HTH_1420 HTH_1421 purK frdA TRUE 0.921 0.000 0.013 1.000 N NA
 10377174 10377175 HTH_1421 HTH_1422 frdA   FALSE 0.139 43.000 0.000 NA   NA
 10377175 10377176 HTH_1422 HTH_1423   purB TRUE 0.777 -6.000 0.000 NA   NA
 10377176 10377177 HTH_1423 HTH_1424 purB   FALSE 0.111 50.000 0.000 NA   NA
 10377179 10377180 HTH_1426 HTH_1427 kdsA glyQ TRUE 0.888 -3.000 0.003 1.000 N NA
 10377181 10377182 HTH_1428 HTH_1429 cafA   TRUE 0.890 4.000 0.013 1.000   NA
 10377182 10377183 HTH_1429 HTH_1430     TRUE 0.940 -3.000 0.010 NA   NA
 10377183 10377184 HTH_1430 HTH_1431     TRUE 0.897 -3.000 0.002 NA   NA
 10377184 10377185 HTH_1431 HTH_1432   mglA2 TRUE 0.975 4.000 0.500 1.000   NA
 10377185 10377186 HTH_1432 HTH_1433 mglA2   TRUE 0.990 2.000 1.000 NA   NA
 10377186 10377187 HTH_1433 HTH_1434     FALSE 0.564 -19.000 0.000 NA   NA
 10377187 10377188 HTH_1434 HTH_1435     TRUE 0.833 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 10377188 10377189 HTH_1435 HTH_1436     TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 10377189 10377190 HTH_1436 HTH_1437     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377190 10377191 HTH_1437 HTH_1438     FALSE 0.269 24.000 0.000 NA   NA
 10377191 10377192 HTH_1438 HTH_1439   fur1 FALSE 0.104 52.000 0.000 NA   NA
 10377192 10377193 HTH_1439 HTH_1440 fur1   TRUE 0.798 -21.000 0.008 1.000 N NA
 10377194 10377195 HTH_1441 HTH_1442     TRUE 0.965 -45.000 1.000 NA   NA
 10377195 10377196 HTH_1442 HTH_1443     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 10377196 10377197 HTH_1443 HTH_1444     TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 10377197 10377198 HTH_1444 HTH_1445     TRUE 0.641 -15.000 0.000 NA   NA
 10377198 10377199 HTH_1445 HTH_1446     TRUE 0.981 3.000 0.667 NA   NA
 10377199 10377200 HTH_1446 HTH_1447     FALSE 0.079 65.000 0.000 NA   NA
 10377200 10377201 HTH_1447 HTH_1448   rnhB FALSE 0.047 96.000 0.000 NA   NA
 10377201 10377202 HTH_1448 HTH_1449 rnhB rplS TRUE 0.964 -3.000 0.066 1.000 N NA
 10377202 10377203 HTH_1449 HTH_1450 rplS   FALSE 0.231 27.000 0.000 NA   NA
 10377204 10377205 HTH_1451 HTH_1452 gatA pycA FALSE 0.357 15.000 0.000 1.000 N NA
 10377205 10377206 HTH_1452 HTH_1453 pycA   TRUE 0.980 -3.000 0.286 1.000 N NA
 10377206 10377207 HTH_1453 HTH_1454     TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10377209 10377210 HTH_1456 HTH_1457     TRUE 0.781 -24.000 0.005 1.000   NA
 10377210 10377211 HTH_1457 HTH_1458     TRUE 0.617 -16.000 0.000 1.000   NA
 10377211 10377212 HTH_1458 HTH_1459     TRUE 0.617 3.000 0.000 NA   NA
 10377212 10377213 HTH_1459 HTH_1460   uvrA FALSE 0.476 14.000 0.000 NA   NA
 10377214 10377215 HTH_1461 HTH_1462     TRUE 0.617 3.000 0.000 NA   NA
 10377215 10377216 HTH_1462 HTH_1463     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377217 10377218 HTH_1464 HTH_1465   lpxK TRUE 0.718 -10.000 0.000 NA   NA
 10377218 10377219 HTH_1465 HTH_t36 lpxK   FALSE 0.396 -37.000 0.000 NA   NA
 10377219 10377220 HTH_t36 HTH_1466   lig FALSE 0.576 10.000 0.000 NA   NA
 10377221 10377222 HTH_t37 HTH_1467     FALSE 0.128 46.000 0.000 NA   NA
 10377222 10377223 HTH_1467 HTH_1468   rpoD TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377223 10377224 HTH_1468 HTH_1469 rpoD nfnB FALSE 0.055 65.000 0.000 1.000 N NA
 10377224 10377225 HTH_1469 HTH_1470 nfnB   TRUE 0.671 -13.000 0.000 1.000   NA
 10377227 10377228 HTH_1472 HTH_1473   thrB TRUE 0.625 -37.000 0.004 1.000 N NA
 10377228 10377229 HTH_1473 HTH_1474 thrB   FALSE 0.576 10.000 0.000 NA   NA
 10377230 10377231 HTH_1475 HTH_1476 apbE coxC1 FALSE 0.026 124.000 0.000 1.000 N NA
 10377231 10377232 HTH_1476 HTH_1477 coxC1   TRUE 0.992 4.000 1.000 0.060   NA
 10377232 10377233 HTH_1477 HTH_1478   coxB1 TRUE 0.996 -3.000 1.000 0.060   NA
 10377233 10377234 HTH_1478 HTH_1479 coxB1 coxA1 TRUE 0.973 19.000 0.500 0.021 Y NA
 10377234 10377235 HTH_1479 HTH_1480 coxA1   TRUE 0.992 0.000 0.500 0.021   NA
 10377235 10377236 HTH_1480 HTH_1481     TRUE 0.622 3.000 0.000 1.000   NA
 10377236 10377237 HTH_1481 HTH_1482     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377237 10377238 HTH_1482 HTH_1483     TRUE 0.986 0.000 0.500 NA   NA
 10377238 10377239 HTH_1483 HTH_1484     FALSE 0.529 113.000 0.500 NA   NA
 10377239 10377240 HTH_1484 HTH_1485   coxB2 TRUE 0.943 5.000 0.100 NA   NA
 10377240 10377241 HTH_1485 HTH_1486 coxB2 coxA2 TRUE 0.991 -3.000 0.200 0.004   NA
 10377241 10377242 HTH_1486 HTH_1487 coxA2   TRUE 0.989 2.000 0.571 0.060   NA
 10377242 10377243 HTH_1487 HTH_t38     FALSE 0.376 18.000 0.000 NA   NA
 10377243 10377244 HTH_t38 HTH_1488   trpD FALSE 0.576 10.000 0.000 NA   NA
 10377244 10377245 HTH_1488 HTH_1489 trpD   TRUE 0.910 -3.000 0.003 NA   NA
 10377245 10377246 HTH_1489 HTH_1490     TRUE 0.716 19.000 0.010 NA   NA
 10377248 10377249 HTH_1492 HTH_1493 purN   FALSE 0.151 30.000 0.000 1.000 N NA
 10377249 10377250 HTH_1493 HTH_1494     TRUE 0.993 -13.000 0.456 0.001 Y NA
 10377250 10377251 HTH_1494 HTH_1495     TRUE 0.975 -10.000 0.019 0.039 Y NA
 10377251 10377252 HTH_1495 HTH_1496     TRUE 0.969 1.000 0.051 1.000 Y NA
 10377252 10377253 HTH_1496 HTH_1497     FALSE 0.248 20.000 0.000 1.000 N NA
 10377253 10377254 HTH_1497 HTH_1498   uspA1 TRUE 0.669 17.000 0.006 1.000 N NA
 10377254 10377255 HTH_1498 HTH_1499 uspA1   TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10377255 10377256 HTH_1499 HTH_1500     TRUE 0.738 0.000 0.000 1.000   NA
 10377256 10377257 HTH_1500 HTH_1501     FALSE 0.069 71.000 0.000 1.000   NA
 10377259 10377260 HTH_1503 HTH_1504     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377260 10377261 HTH_1504 HTH_1505     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10377261 10377262 HTH_1505 HTH_1506     FALSE 0.100 54.000 0.000 NA   NA
 10377262 10377263 HTH_1506 HTH_1507     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377263 10377264 HTH_1507 HTH_1508     TRUE 0.987 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 10377264 10377265 HTH_1508 HTH_1509     TRUE 0.982 -3.000 0.333 1.000 N NA
 10377265 10377266 HTH_1509 HTH_1510   sulP TRUE 0.930 -3.000 0.000 0.037 Y NA
 10377267 10377268 HTH_1511 HTH_1512 nadD frdD TRUE 0.763 -7.000 0.000 NA   NA
 10377268 10377269 HTH_1512 HTH_1513 frdD   FALSE 0.171 35.000 0.000 NA   NA
 10377270 10377271 HTH_1514 HTH_1515 trxA2 soxY TRUE 0.617 78.000 0.500 NA   NA
 10377271 10377272 HTH_1515 HTH_1516 soxY soxZ TRUE 0.900 32.000 0.778 NA   NA
 10377272 10377273 HTH_1516 HTH_1517 soxZ soxA1 TRUE 0.932 16.000 0.333 NA   NA
 10377273 10377274 HTH_1517 HTH_1518 soxA1 soxA2 FALSE 0.528 22.000 0.000 0.019   NA
 10377274 10377275 HTH_1518 HTH_1519 soxA2 soxX TRUE 0.709 14.000 0.000 0.019   NA
 10377275 10377276 HTH_1519 HTH_1520 soxX soxB TRUE 0.921 15.000 0.188 1.000   NA
 10377276 10377277 HTH_1520 HTH_1521 soxB   TRUE 0.982 -3.000 0.250 NA   NA
 10377277 10377278 HTH_1521 HTH_1522   soxH TRUE 0.617 3.000 0.000 NA   NA
 10377278 10377279 HTH_1522 HTH_1523 soxH   FALSE 0.359 19.000 0.000 1.000   NA
 10377279 10377280 HTH_1523 HTH_1524     TRUE 0.911 -3.000 0.003 NA   NA
 10377281 10377282 HTH_1525 HTH_1526   leuB TRUE 0.890 -18.000 0.019 NA   NA
 10377282 10377283 HTH_1526 HTH_1527 leuB   TRUE 0.667 13.000 0.000 1.000 Y NA
 10377283 10377284 HTH_1527 HTH_1528   hisC FALSE 0.064 58.000 0.000 1.000 N NA
 10377284 10377285 HTH_1528 HTH_1529 hisC   TRUE 0.926 -3.000 0.006 NA   NA
 10377287 10377288 HTH_1531 HTH_1532 recR   TRUE 0.718 -10.000 0.000 NA   NA
 10377288 10377289 HTH_1532 HTH_1533     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377290 10377291 HTH_1534 HTH_1535   gcvH5 TRUE 0.963 11.000 0.400 NA   NA
 10377291 10377292 HTH_1535 HTH_1536 gcvH5 gcvP TRUE 0.938 0.000 0.005 1.000 Y NA
 10377292 10377293 HTH_1536 HTH_1537 gcvP   FALSE 0.138 32.000 0.000 1.000 N NA
 10377293 10377294 HTH_1537 HTH_1538   neuB TRUE 0.896 -19.000 0.050 1.000 N NA
 10377294 10377295 HTH_1538 HTH_1539 neuB   TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10377295 10377296 HTH_1539 HTH_1540     TRUE 0.982 -16.000 0.678 1.000   NA
 10377296 10377297 HTH_1540 HTH_1541     TRUE 0.962 -7.000 0.072 1.000 N NA
 10377297 10377298 HTH_1541 HTH_1542   clpB FALSE 0.067 56.000 0.000 1.000 N NA
 10377299 10377300 HTH_1543 HTH_1544 engA   TRUE 0.598 7.000 0.000 1.000   NA
 10377300 10377301 HTH_1544 HTH_1545     TRUE 0.918 -10.000 0.015 1.000 N NA
 10377301 10377302 HTH_1545 HTH_1546   trxA3 TRUE 0.945 -3.000 0.011 1.000   NA
 10377302 10377303 HTH_1546 HTH_1547 trxA3   FALSE 0.204 31.000 0.000 1.000   NA
 10377303 10377304 HTH_1547 HTH_1548     FALSE 0.052 67.000 0.000 1.000 N NA
 10377305 10377306 HTH_1549 HTH_1550   nuoH1 FALSE 0.021 195.000 0.000 1.000 N NA
 10377307 10377308 HTH_1551 HTH_1552 porG porB TRUE 0.997 -3.000 0.667 0.003 Y NA
 10377308 10377309 HTH_1552 HTH_1553 porB porA TRUE 0.995 -10.000 0.500 0.003 Y NA
 10377309 10377310 HTH_1553 HTH_1554 porA porD TRUE 0.675 67.000 0.500 1.000   NA
 10377310 10377311 HTH_1554 HTH_1555 porD porE TRUE 0.908 23.000 0.500 NA   NA
 10377313 10377314 HTH_1557 HTH_1558     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377314 10377315 HTH_1558 HTH_1559     FALSE 0.265 19.000 0.000 NA N NA
 10377315 10377316 HTH_1559 HTH_1560     TRUE 0.949 0.000 0.050 1.000 N NA
 10377316 10377317 HTH_1560 HTH_1561     TRUE 0.652 43.000 0.113 1.000   NA
 10377317 10377318 HTH_1561 HTH_1562     TRUE 0.980 4.000 0.656 NA   NA
 10377319 10377320 HTH_1563 HTH_1564 thiS thiG TRUE 0.825 30.000 0.130 1.000 Y NA
 10377320 10377321 HTH_1564 HTH_1565 thiG hemG TRUE 0.976 -3.000 0.005 0.004 Y NA
 10377321 10377322 HTH_1565 HTH_1566 hemG talC FALSE 0.233 21.000 0.000 1.000 N NA
 10377323 10377324 HTH_1567 HTH_1568     TRUE 0.885 2.000 0.006 NA   NA
 10377324 10377325 HTH_1568 HTH_1569     TRUE 0.863 2.000 0.004 NA   NA
 10377325 10377326 HTH_1569 HTH_1570     TRUE 0.985 -12.000 0.600 NA   NA
 10377326 10377327 HTH_1570 HTH_1571   galE TRUE 0.948 8.000 0.143 NA   NA
 10377327 10377328 HTH_1571 HTH_1572 galE clpC FALSE 0.132 33.000 0.000 1.000 N NA
 10377329 10377330 HTH_1573 HTH_1574     FALSE 0.221 28.000 0.000 NA   NA
 10377330 10377331 HTH_1574 HTH_1575     TRUE 0.940 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 10377331 10377332 HTH_1575 HTH_1576     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377333 10377334 HTH_1577 HTH_1578     FALSE 0.410 -36.000 0.000 NA   NA
 10377334 10377335 HTH_1578 HTH_1579     FALSE 0.095 44.000 0.000 1.000 N NA
 10377335 10377336 HTH_1579 HTH_1580     TRUE 0.982 -3.000 0.231 1.000   NA
 10377337 10377338 HTH_1581 HTH_1582 proC   TRUE 0.738 -27.000 0.004 NA   NA
 10377338 10377339 HTH_1582 HTH_1583     FALSE 0.030 203.000 0.000 NA   NA
 10377339 10377340 HTH_1583 HTH_1584   glnB3 FALSE 0.029 113.000 0.000 1.000 N NA
 10377340 10377341 HTH_1584 HTH_1585 glnB3 glnA TRUE 0.713 24.000 0.009 1.000 Y NA
 10377341 10377342 HTH_1585 HTH_1586 glnA amtB FALSE 0.287 49.000 0.007 1.000 N NA
 10377342 10377343 HTH_1586 HTH_1587 amtB   TRUE 0.978 15.000 0.600 0.020   NA
 10377343 10377344 HTH_1587 HTH_1588     TRUE 0.911 4.000 0.027 1.000   NA
 10377344 10377345 HTH_1588 HTH_1589     TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10377345 10377346 HTH_1589 HTH_1590     FALSE 0.164 37.000 0.000 NA   NA
 10377346 10377347 HTH_1590 HTH_t39     FALSE 0.576 10.000 0.000 NA   NA
 10377347 10377348 HTH_t39 HTH_1591     FALSE 0.576 10.000 0.000 NA   NA
 10377348 10377349 HTH_1591 HTH_1592   hisS2 TRUE 0.666 -13.000 0.000 NA   NA
 10377350 10377351 HTH_1593 HTH_1594 metK1 serS FALSE 0.542 16.000 0.000 0.085 N NA
 10377352 10377353 HTH_1595 HTH_1596     FALSE 0.147 30.000 0.000 NA N NA
 10377353 10377354 HTH_1596 HTH_1597     FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10377356 10377357 HTH_1599 HTH_1600     FALSE 0.328 20.000 0.000 NA   NA
 10377357 10377358 HTH_1600 HTH_1601   thiL TRUE 0.906 -3.000 0.003 NA   NA
 10377358 10377359 HTH_1601 HTH_1602 thiL   FALSE 0.479 10.000 0.000 1.000 N NA
 10377359 10377360 HTH_1602 HTH_1603   lplA FALSE 0.050 69.000 0.000 1.000 N NA
 10377361 10377362 HTH_1604 HTH_1605     TRUE 0.777 -6.000 0.000 NA   NA
 10377362 10377363 HTH_1605 HTH_1606     FALSE 0.533 12.000 0.000 NA   NA
 10377364 10377365 HTH_1607 HTH_1608 pmbA   TRUE 0.882 3.000 0.010 NA   NA
 10377365 10377366 HTH_1608 HTH_1609     TRUE 0.993 -3.000 0.800 NA   NA
 10377367 10377368 HTH_1610 HTH_1611 ddpA dxr TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10377368 10377369 HTH_1611 HTH_1612 dxr   TRUE 0.875 -3.000 0.002 1.000 N NA
 10377369 10377370 HTH_1612 HTH_1613   ppa TRUE 0.922 -3.000 0.009 1.000 N NA
 10377373 10377374 HTH_1616 HTH_1617     TRUE 0.983 -9.000 0.111 0.029   NA
 10377374 10377375 HTH_1617 HTH_1618     FALSE 0.564 11.000 0.000 1.000   NA
 10377375 10377376 HTH_1618 HTH_1619     TRUE 0.981 -3.000 0.037 0.005   NA
 10377377 10377378 HTH_1620 HTH_1621 cooA purH FALSE 0.270 19.000 0.000 1.000 N NA
 10377378 10377379 HTH_1621 HTH_1622 purH yajC TRUE 0.693 -3.000 0.000 NA N NA
 10377380 10377381 HTH_1623 HTH_1624 accD   TRUE 0.843 -13.000 0.003 NA   NA
 10377381 10377382 HTH_1624 HTH_1625     TRUE 0.896 -7.000 0.003 NA   NA
 10377383 10377384 HTH_1626 HTH_1627 rpmA rplU TRUE 0.995 2.000 0.667 0.018 Y NA
 10377385 10377386 HTH_1628 HTH_1629     FALSE 0.131 45.000 0.000 NA   NA
 10377386 10377387 HTH_1629 HTH_1630   ilvC FALSE 0.346 34.000 0.002 NA   NA
 10377387 10377388 HTH_1630 HTH_1631 ilvC   TRUE 0.921 -3.000 0.008 1.000 N NA
 10377388 10377389 HTH_1631 HTH_1632   ribD2 TRUE 0.990 -7.000 0.700 1.000 N NA
 10377390 10377391 HTH_1633 HTH_1634     FALSE 0.564 -19.000 0.000 NA   NA
 10377391 10377392 HTH_1634 HTH_1635     FALSE 0.519 -22.000 0.000 NA   NA
 10377393 10377394 HTH_1636 HTH_1637     TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10377396 10377397 HTH_1639 HTH_1640 rfbA rfbB TRUE 0.992 0.000 0.385 0.085 Y NA
 10377397 10377398 HTH_1640 HTH_1641 rfbB secF TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10377398 10377399 HTH_1641 HTH_1642 secF   FALSE 0.258 25.000 0.000 1.000   NA
 10377399 10377400 HTH_1642 HTH_1643   glyS TRUE 0.738 0.000 0.000 1.000   NA
 10377400 10377401 HTH_1643 HTH_1644 glyS ppsA TRUE 0.893 3.000 0.006 0.085 N NA
 10377401 10377402 HTH_1644 HTH_1645 ppsA   TRUE 0.990 -3.000 0.571 NA   NA
 10377402 10377403 HTH_1645 HTH_1646     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377403 10377404 HTH_1646 HTH_1647     TRUE 0.611 -16.000 0.000 NA   NA
 10377404 10377405 HTH_1647 HTH_1648     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377405 10377406 HTH_1648 HTH_1649     TRUE 0.977 -3.000 0.133 NA   NA
 10377406 10377407 HTH_1649 HTH_1650     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377408 10377409 HTH_1651 HTH_1652     TRUE 0.989 -6.000 0.500 1.000   NA
 10377409 10377410 HTH_1652 HTH_1653     TRUE 0.956 -3.000 0.043 1.000 N NA
 10377410 10377411 HTH_1653 HTH_1654     TRUE 0.887 -13.000 0.007 NA   NA
 10377411 10377412 HTH_1654 HTH_1655     TRUE 0.941 -3.000 0.010 NA   NA
 10377412 10377413 HTH_1655 HTH_1656     TRUE 0.963 -3.000 0.041 NA   NA
 10377413 10377414 HTH_1656 HTH_1657     TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 10377414 10377415 HTH_1657 HTH_1658     TRUE 0.985 -3.000 0.333 NA   NA
 10377415 10377416 HTH_1658 HTH_1659     TRUE 0.820 47.000 0.429 NA Y NA
 10377416 10377417 HTH_1659 HTH_1660     FALSE 0.050 89.000 0.000 NA   NA
 10377417 10377418 HTH_1660 HTH_1661     TRUE 0.709 1.000 0.000 NA   NA
 10377418 10377419 HTH_1661 HTH_1662     TRUE 0.709 1.000 0.000 NA   NA
 10377421 10377422 HTH_1664 HTH_1665     TRUE 0.927 -7.000 0.007 NA   NA
 10377422 10377423 HTH_1665 HTH_1666   folP TRUE 0.960 -13.000 0.133 NA   NA
 10377423 10377424 HTH_1666 HTH_1667 folP   FALSE 0.345 -48.000 0.000 NA   NA
 10377425 10377426 HTH_1668 HTH_1669     FALSE 0.207 56.000 0.000 0.029   NA
 10377426 10377427 HTH_1669 HTH_1670     TRUE 0.956 4.000 0.026 0.003   NA
 10377427 10377428 HTH_1670 HTH_1671     FALSE 0.424 16.000 0.000 NA   NA
 10377428 10377429 HTH_1671 HTH_1672   tmk FALSE 0.033 173.000 0.000 NA   NA
 10377429 10377430 HTH_1672 HTH_1673 tmk   FALSE 0.490 8.000 0.000 1.000 N NA
 10377430 10377431 HTH_1673 HTH_1674   pgi FALSE 0.521 3.000 0.000 1.000 N NA
 10377431 10377432 HTH_1674 HTH_1675 pgi terC TRUE 0.900 -3.000 0.005 1.000 N NA
 10377433 10377434 HTH_1676 HTH_1677 tonB2   TRUE 0.826 0.000 0.000 0.054 N NA
 10377434 10377435 HTH_1677 HTH_1678     TRUE 0.985 -10.000 0.065 0.020 Y NA
 10377435 10377436 HTH_1678 HTH_1679     TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 10377437 10377438 HTH_1680 HTH_1681 fdsG fdsB TRUE 0.994 7.000 0.870 0.009 Y NA
 10377438 10377439 HTH_1681 HTH_1682 fdsB fdsA TRUE 0.964 12.000 0.466 1.000   NA
 10377439 10377440 HTH_1682 HTH_1683 fdsA fdsD TRUE 0.979 3.000 0.175 0.004   NA
 10377440 10377441 HTH_1683 HTH_1684 fdsD fdsC TRUE 0.831 -16.000 0.000 0.004   NA
 10377441 10377442 HTH_1684 HTH_1685 fdsC rplT FALSE 0.019 268.000 0.000 1.000 N NA
 10377442 10377443 HTH_1685 HTH_1686 rplT pheS TRUE 0.987 -3.000 0.202 1.000 Y NA
 10377444 10377445 HTH_1687 HTH_1688     TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10377445 10377446 HTH_1688 HTH_1689     FALSE 0.493 -25.000 0.000 1.000   NA
 10377446 10377447 HTH_1689 HTH_1690     TRUE 0.977 -19.000 0.667 NA   NA
 10377447 10377448 HTH_1690 HTH_1691     FALSE 0.145 42.000 0.000 NA   NA
 10377448 10377449 HTH_1691 HTH_1692   czcA TRUE 0.942 -16.000 0.091 NA   NA
 10377449 10377450 HTH_1692 HTH_1693 czcA czcB TRUE 0.975 -3.000 0.182 1.000 N NA
 10377450 10377451 HTH_1693 HTH_1694 czcB czcC TRUE 0.995 -10.000 1.000 1.000 Y NA
 10377452 10377453 HTH_1695 HTH_1696     FALSE 0.310 21.000 0.000 NA   NA
 10377456 10377457 HTH_1699 HTH_t40     FALSE 0.208 30.000 0.000 NA   NA
 10377457 10377458 HTH_t40 HTH_1700     TRUE 0.709 1.000 0.000 NA   NA
 10377458 10377459 HTH_1700 HTH_1701   rpsP TRUE 0.948 14.000 0.385 1.000   NA
 10377459 10377460 HTH_1701 HTH_1702 rpsP   FALSE 0.083 48.000 0.000 1.000 N NA
 10377460 10377461 HTH_1702 HTH_1703   trpA FALSE 0.075 51.000 0.000 1.000 N NA
 10377461 10377462 HTH_1703 HTH_1704 trpA   TRUE 0.729 -30.000 0.009 1.000 N NA
 10377462 10377463 HTH_1704 HTH_1705   accB TRUE 0.772 4.000 0.003 1.000 N NA
 10377463 10377464 HTH_1705 HTH_1706 accB efp TRUE 0.964 0.000 0.120 1.000 N NA
 10377465 10377466 HTH_1707 HTH_1708     FALSE 0.139 43.000 0.000 NA   NA
 10377466 10377467 HTH_1708 HTH_1709   pstS FALSE 0.512 13.000 0.000 1.000   NA
 10377467 10377468 HTH_1709 HTH_1710 pstS pstC TRUE 0.971 13.000 0.086 0.002 Y NA
 10377468 10377469 HTH_1710 HTH_1711 pstC pstA TRUE 0.997 -3.000 0.537 0.002 Y NA
 10377469 10377470 HTH_1711 HTH_1712 pstA pstB TRUE 0.993 3.000 0.526 0.002 Y NA
 10377470 10377471 HTH_1712 HTH_t41 pstB   FALSE 0.398 17.000 0.000 NA   NA
 10377471 10377472 HTH_t41 HTH_1713     FALSE 0.506 13.000 0.000 NA   NA
 10377473 10377474 HTH_1714 HTH_1715     TRUE 0.956 2.000 0.095 NA   NA
 10377474 10377475 HTH_1715 HTH_1716   narH TRUE 0.963 14.000 0.583 NA   NA
 10377475 10377476 HTH_1716 HTH_1717 narH narG TRUE 0.974 12.000 0.083 0.002 Y NA
 10377476 10377477 HTH_1717 HTH_1718 narG   FALSE 0.019 298.000 0.000 1.000 N NA
 10377477 10377478 HTH_1718 HTH_1719     TRUE 0.966 0.000 0.133 1.000 N NA
 10377478 10377479 HTH_1719 HTH_1720     TRUE 0.997 -3.000 0.714 0.054 Y NA
 10377479 10377480 HTH_1720 HTH_1721     TRUE 0.800 2.000 0.000 1.000 Y NA
 10377481 10377482 HTH_1722 HTH_1723 glmS   TRUE 0.592 7.000 0.000 NA   NA
 10377482 10377483 HTH_1723 HTH_1724     TRUE 0.641 -15.000 0.000 NA   NA
 10377483 10377484 HTH_1724 HTH_1725     TRUE 0.763 -7.000 0.000 NA   NA
 10377485 10377486 HTH_1726 HTH_1727     TRUE 0.975 2.000 0.449 NA N NA
 10377486 10377487 HTH_1727 HTH_1728     TRUE 0.991 -3.000 0.422 1.000 Y NA
 10377487 10377488 HTH_1728 HTH_1729     FALSE 0.118 48.000 0.000 NA   NA
 10377488 10377489 HTH_1729 HTH_1730   murF TRUE 0.916 2.000 0.014 NA   NA
 10377491 10377492 HTH_1732 HTH_1733     FALSE 0.042 114.000 0.000 NA   NA
 10377492 10377493 HTH_1733 HTH_1734     TRUE 0.709 1.000 0.000 NA   NA
 10377493 10377494 HTH_1734 HTH_t42     FALSE 0.063 74.000 0.000 NA   NA
 10377494 10377495 HTH_t42 HTH_1735   dfp FALSE 0.559 11.000 0.000 NA   NA
 10377495 10377496 HTH_1735 HTH_1736 dfp   TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10377498 10377499 HTH_1738 HTH_1739 pflA   TRUE 0.974 0.000 0.178 NA   NA
 10377499 10377500 HTH_1739 HTH_1740   sreC FALSE 0.533 12.000 0.000 NA   NA
 10377500 10377501 HTH_1740 HTH_1741 sreC sreB TRUE 0.978 3.000 0.548 NA   NA
 10377501 10377502 HTH_1741 HTH_1742 sreB   FALSE 0.506 13.000 0.000 NA   NA
 10377502 10377503 HTH_1742 HTH_1743     FALSE 0.102 53.000 0.000 NA   NA
 10377503 10377504 HTH_1743 HTH_1744     TRUE 0.709 1.000 0.000 NA   NA
 10377504 10377505 HTH_1744 HTH_1745     TRUE 0.858 1.000 0.000 0.028   NA
 10377505 10377506 HTH_1745 HTH_1746   sreA TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10377506 10377507 HTH_1746 HTH_1747 sreA   FALSE 0.169 102.000 0.000 0.020 Y NA
 10377507 10377508 HTH_1747 HTH_1748     TRUE 0.951 -13.000 0.121 1.000 N NA
 10377508 10377509 HTH_1748 HTH_1749     TRUE 0.727 -40.000 0.009 NA   NA
 10377509 10377510 HTH_1749 HTH_1750     TRUE 0.918 -3.000 0.004 NA   NA
 10377510 10377511 HTH_1750 HTH_1751     TRUE 0.763 -7.000 0.000 NA   NA
 10377512 10377513 HTH_1752 HTH_1753     TRUE 0.896 -10.000 0.005 1.000   NA
 10377513 10377514 HTH_1753 HTH_1754     TRUE 0.873 -22.000 0.024 1.000   NA
 10377515 10377516 HTH_1755 HTH_1756     TRUE 0.983 -3.000 0.286 NA   NA
 10377516 10377517 HTH_1756 HTH_1757     TRUE 0.963 5.000 0.286 NA   NA
 10377517 10377518 HTH_1757 HTH_1758     TRUE 0.916 13.000 0.095 NA   NA
 10377518 10377519 HTH_1758 HTH_1759   mdaB FALSE 0.043 111.000 0.000 NA   NA
 10377519 10377520 HTH_1759 HTH_1760 mdaB   FALSE 0.460 -28.000 0.000 1.000   NA
 10377520 10377521 HTH_1760 HTH_1761     TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10377521 10377522 HTH_1761 HTH_1762     TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 10377522 10377523 HTH_1762 HTH_1763     FALSE 0.451 15.000 0.000 NA   NA
 10377523 10377524 HTH_1763 HTH_1764     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377526 10377527 HTH_1766 HTH_1767     TRUE 0.890 -42.000 0.250 1.000 N NA
 10377527 10377528 HTH_1767 HTH_1768     TRUE 0.717 34.000 0.188 1.000 N NA
 10377529 10377530 HTH_1769 HTH_1770     TRUE 0.963 -3.000 0.041 NA   NA
 10377531 10377532 HTH_1771 HTH_1772 purC   FALSE 0.107 41.000 0.000 1.000 N NA
 10377532 10377533 HTH_1772 HTH_1773     FALSE 0.027 116.000 0.000 NA N NA
 10377533 10377534 HTH_1773 HTH_1774   bioW FALSE 0.055 64.000 0.000 NA N NA
 10377534 10377535 HTH_1774 HTH_1775 bioW   FALSE 0.410 13.000 0.000 1.000 N NA
 10377536 10377537 HTH_1776 HTH_1777 dapF   FALSE 0.090 46.000 0.000 1.000 N NA
 10377537 10377538 HTH_1777 HTH_1778     TRUE 0.957 3.000 0.273 NA N NA
 10377538 10377539 HTH_1778 HTH_1779     TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 10377539 10377540 HTH_1779 HTH_1780     TRUE 0.763 -7.000 0.000 NA   NA
 10377540 10377541 HTH_1780 HTH_1781   arsB TRUE 0.604 4.000 0.000 NA   NA
 10377541 10377542 HTH_1781 HTH_1782 arsB   TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377542 10377543 HTH_1782 HTH_1783     FALSE 0.035 143.000 0.000 NA   NA
 10377543 10377544 HTH_1783 HTH_1784     TRUE 0.955 13.000 0.400 NA   NA
 10377545 10377546 HTH_1785 HTH_1786 ppx   TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377546 10377547 HTH_1786 HTH_1787   nuoN1 TRUE 0.984 -3.000 0.286 1.000   NA
 10377547 10377548 HTH_1787 HTH_1788 nuoN1 nuoM1 TRUE 0.996 3.000 1.000 0.005 Y NA
 10377548 10377549 HTH_1788 HTH_1789 nuoM1 nuoL1 TRUE 0.960 5.000 0.011 0.005 Y NA
 10377549 10377550 HTH_1789 HTH_1790 nuoL1 nuoK1 TRUE 0.968 2.000 0.011 0.015 Y NA
 10377550 10377551 HTH_1790 HTH_1791 nuoK1 nuoJ1 TRUE 0.982 -3.000 0.012 0.008 Y NA
 10377551 10377552 HTH_1791 HTH_1792 nuoJ1 nuoI1 TRUE 0.993 -12.000 0.442 0.015 Y NA
 10377553 10377554 HTH_1793 HTH_1794 groS groL TRUE 0.905 25.000 0.125 0.082 Y NA
 10377555 10377556 HTH_1795 HTH_1796 cdsA uppS TRUE 0.927 -16.000 0.013 1.000 Y NA
 10377556 10377557 HTH_1796 HTH_1797 uppS   TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10377558 10377559 HTH_1798 HTH_1799   murB FALSE 0.115 38.000 0.000 1.000 N NA
 10377559 10377560 HTH_1799 HTH_1800 murB ddlA TRUE 0.965 -34.000 0.135 0.004 Y NA
 10377560 10377561 HTH_1800 HTH_1801 ddlA   TRUE 0.850 3.000 0.005 NA   NA
 10377561 10377562 HTH_1801 HTH_1802   ftsA TRUE 0.979 3.000 0.600 NA   NA
 10377562 10377563 HTH_1802 HTH_1803 ftsA ftsZ TRUE 0.869 11.000 0.004 1.000 Y NA
 10377563 10377564 HTH_1803 HTH_1804 ftsZ   TRUE 0.895 -3.000 0.002 NA   NA
 10377564 10377565 HTH_1804 HTH_1805     FALSE 0.134 44.000 0.000 NA   NA
 10377565 10377566 HTH_1805 HTH_1806     TRUE 0.989 -3.000 0.312 1.000 Y NA
 10377566 10377567 HTH_1806 HTH_1807     TRUE 0.611 -16.000 0.000 NA   NA
 10377567 10377568 HTH_1807 HTH_1808     FALSE 0.317 -61.000 0.000 NA   NA
 10377568 10377569 HTH_1808 HTH_1809     TRUE 0.982 -3.000 0.222 NA   NA
 10377569 10377570 HTH_1809 HTH_1810     TRUE 0.982 -3.000 0.222 NA   NA
 10377570 10377571 HTH_1810 HTH_1811     FALSE 0.025 134.000 0.000 NA N NA
 10377571 10377572 HTH_1811 HTH_1812     TRUE 0.991 -3.000 0.158 0.035 Y NA
 10377572 10377573 HTH_1812 HTH_1813   hypC FALSE 0.055 64.000 0.000 NA N NA
 10377573 10377574 HTH_1813 HTH_1814 hypC hypD TRUE 0.962 -13.000 0.055 NA Y NA
 10377574 10377575 HTH_1814 HTH_1815 hypD hypX TRUE 0.957 -3.000 0.044 1.000 N NA
 10377577 10377578 HTH_1817 HTH_1818   cstA TRUE 0.956 -3.000 0.043 1.000 N NA
 10377578 10377579 HTH_1818 HTH_1819 cstA hisG TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10377580 10377581 HTH_1820 HTH_1821   holB TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10377583 10377584 HTH_t43 HTH_1823     FALSE 0.451 15.000 0.000 NA   NA
 10377584 10377585 HTH_1823 HTH_1824   pulK TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 10377585 10377586 HTH_1824 HTH_1825 pulK   TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377586 10377587 HTH_1825 HTH_1826     TRUE 0.917 -3.000 0.004 NA   NA
 10377587 10377588 HTH_1826 HTH_1827   pulE TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377588 10377589 HTH_1827 HTH_1828 pulE   FALSE 0.507 5.000 0.000 1.000 N NA
 10377589 10377590 HTH_1828 HTH_1829     TRUE 0.775 -3.000 0.000 NA   NA
 10377590 10377591 HTH_1829 HTH_1830   mglA1 FALSE 0.519 -22.000 0.000 NA   NA
 10377591 10377592 HTH_1830 HTH_1831 mglA1 mglB TRUE 0.981 2.000 0.500 NA   NA
 10377592 10377593 HTH_1831 HTH_1832 mglB glyA FALSE 0.178 34.000 0.000 NA   NA
 10377594 10377595 HTH_1833 HTH_1834 argH   TRUE 0.676 2.000 0.000 1.000   NA
 10377596 10377597 HTH_1835 HTH_1836   hisB FALSE 0.243 20.000 0.000 NA N NA
 10377597 10377598 HTH_1836 HTH_1837 hisB holA TRUE 0.790 -13.000 0.002 1.000 N NA
 10377598 10377599 HTH_1837 HTH_1838 holA rho TRUE 0.838 0.000 0.002 1.000 N NA
 10377599 10377600 HTH_1838 HTH_1839 rho trmE TRUE 0.767 16.000 0.009 1.000   NA
 10377600 10377601 HTH_1839 HTH_1840 trmE amnT3 FALSE 0.109 51.000 0.000 1.000   NA
 10377601 10377602 HTH_1840 HTH_1841 amnT3 dksA1 TRUE 0.942 -7.000 0.022 1.000 N NA
 10377603 10377604 HTH_1842 HTH_1843 hemD1   TRUE 0.827 9.000 0.008 1.000 N NA
 10377606 10377607 HTH_1845 HTH_1846 ahpC trxB3 TRUE 0.766 31.000 0.056 1.000 Y NA
 10377608 10377609 HTH_1847 HTH_1848     FALSE 0.424 16.000 0.000 NA   NA
 10377612 10377613 HTH_1851 HTH_1852 adh alaS FALSE 0.581 10.000 0.000 1.000   NA
 10377613 10377614 HTH_1852 HTH_1853 alaS rpmE TRUE 0.868 3.000 0.002 1.000 Y NA
 10377614 10377615 HTH_1853 HTH_1854 rpmE prfA TRUE 0.979 0.000 0.110 1.000 Y NA
 10377616 10377617 HTH_1855 HTH_1856 truB rpoS TRUE 0.909 0.000 0.010 1.000 N NA
 10377617 10377618 HTH_1856 HTH_1857 rpoS htrA TRUE 0.942 5.000 0.152 1.000 N NA
 10377618 10377619 HTH_1857 HTH_1858 htrA bioC TRUE 0.935 -3.000 0.008 1.000   NA
 10377619 10377620 HTH_1858 HTH_1859 bioC bioH TRUE 0.897 -37.000 0.163 NA   NA
 10377620 10377621 HTH_1859 HTH_1860 bioH   TRUE 0.763 -7.000 0.000 NA   NA
 10377621 10377622 HTH_1860 HTH_1861     FALSE 0.169 27.000 0.000 1.000 N NA
 10377622 10377623 HTH_1861 HTH_1862     FALSE 0.588 9.000 0.000 1.000   NA
 10377623 10377624 HTH_1862 HTH_1863   frdE FALSE 0.543 -21.000 0.000 1.000   NA
 10377624 10377625 HTH_1863 HTH_1864 frdE   TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10377625 10377626 HTH_1864 HTH_1865     FALSE 0.537 -21.000 0.000 NA   NA
 10377626 10377627 HTH_1865 HTH_1866   serA FALSE 0.056 62.000 0.000 NA N NA
 10377628 10377629 HTH_1867 HTH_1868   dnaE FALSE 0.429 16.000 0.000 1.000   NA
 10377630 10377631 HTH_1869 HTH_1870     TRUE 0.933 0.000 0.012 NA   NA
 10377631 10377632 HTH_1870 HTH_1871     TRUE 0.961 -3.000 0.036 NA   NA
 10377632 10377633 HTH_1871 HTH_1872     TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10377633 10377634 HTH_1872 HTH_1873     TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10377634 10377635 HTH_1873 HTH_1874   gcvH4 TRUE 0.974 -9.000 0.158 1.000   NA
 10377635 10377636 HTH_1874 HTH_1875 gcvH4   TRUE 0.923 26.000 0.786 NA   NA
 10377636 10377637 HTH_1875 HTH_1876     TRUE 0.981 -3.000 0.214 NA   NA
 10377637 10377638 HTH_1876 HTH_1877   gcvH3 TRUE 0.976 0.000 0.200 NA   NA
 10377638 10377639 HTH_1877 HTH_1878 gcvH3 hdrB1 TRUE 0.921 10.000 0.091 1.000 N NA
 10377639 10377640 HTH_1878 HTH_1879 hdrB1 hdrC1 TRUE 0.994 12.000 0.864 0.002 Y NA
 10377640 10377641 HTH_1879 HTH_1880 hdrC1   TRUE 0.983 4.000 0.760 NA   NA
 10377641 10377642 HTH_1880 HTH_1881   hdrA TRUE 0.990 -3.000 0.600 NA   NA
 10377642 10377643 HTH_1881 HTH_1882 hdrA hdrB2 TRUE 0.918 19.000 0.062 0.002   NA
 10377643 10377644 HTH_1882 HTH_1883 hdrB2 hdrC2 TRUE 0.778 49.000 0.050 0.002 Y NA
 10377644 10377645 HTH_1883 HTH_1884 hdrC2   FALSE 0.326 124.000 0.132 NA   NA
 10377645 10377646 HTH_1884 HTH_1885     TRUE 0.977 13.000 0.833 NA   NA
 10377646 10377647 HTH_1885 HTH_1886   sirA3 TRUE 0.866 14.000 0.034 NA   NA
 10377647 10377648 HTH_1886 HTH_1887 sirA3   FALSE 0.044 108.000 0.000 NA   NA
 10377650 10377651 HTH_1888 HTH_1889     TRUE 0.733 0.000 0.000 NA   NA
 10377651 10377652 HTH_1889 HTH_1890   fdx2 TRUE 0.958 -7.000 0.034 NA   NA
 10377652 10377653 HTH_1890 HTH_1891 fdx2 fdx1 TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 10377653 10377654 HTH_1891 HTH_1892 fdx1 sucD TRUE 0.672 74.000 0.400 NA Y NA
 10377654 10377655 HTH_1892 HTH_1893 sucD sucC TRUE 0.962 12.000 0.025 0.002 Y NA
 10377658 10377659 HTH_1896 HTH_1897   argS FALSE 0.178 34.000 0.000 NA   NA
 10377659 10377660 HTH_1897 HTH_1898 argS   TRUE 0.707 13.000 0.002 NA   NA
 10377660 10377661 HTH_1898 HTH_1899     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 10377661 10377662 HTH_1899 HTH_1900     FALSE 0.357 15.000 0.000 1.000 N NA
 10377663 10377664 HTH_1901 HTH_1902   leuC TRUE 0.611 -16.000 0.000 NA   NA
 10377664 10377665 HTH_1902 HTH_1903 leuC ftsH TRUE 0.912 -9.000 0.009 1.000 N NA
 10377665 10377666 HTH_1903 HTH_1904 ftsH mesJ TRUE 0.802 32.000 0.145 0.081 N NA
 10377666 10377667 HTH_1904 HTH_1905 mesJ   TRUE 0.603 5.000 0.000 NA   NA
 10377667 10377668 HTH_1905 HTH_1906     TRUE 0.671 2.000 0.000 NA   NA
 10377669 10377670 HTH_1907 HTH_1908   frdC TRUE 0.778 -3.000 0.000 1.000   NA
 10377670 10377671 HTH_1908 HTH_1909 frdC   TRUE 0.953 -3.000 0.019 NA   NA
 10377671 10377672 HTH_1909 HTH_1910   lpxA TRUE 0.950 -7.000 0.019 NA   NA
 10377672 10377673 HTH_1910 HTH_1911 lpxA glmU TRUE 0.944 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 10377673 10377674 HTH_1911 HTH_1912 glmU   TRUE 0.699 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10377674 10377675 HTH_1912 HTH_1913   rbfA FALSE 0.496 7.000 0.000 1.000 N NA
 10377675 10377676 HTH_1913 HTH_1914 rbfA   TRUE 0.815 -15.000 0.002 1.000   NA
 10377676 10377677 HTH_1914 HTH_1915     FALSE 0.436 -30.000 0.000 NA   NA
 10377678 10377679 HTH_1916 HTH_1917 murI accC FALSE 0.479 10.000 0.000 1.000 N NA