MicrobesOnline Operon Predictions for Prochlorococcus marinus sp. MED4

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 565331 565332 PMM0001 PMM0002 dnaN   FALSE 0.378 2.000 0.022 NA   NA
 565332 565333 PMM0002 PMM0003   purL FALSE 0.459 4.000 0.039 NA   NA
 565333 565334 PMM0003 PMM0004 purL purF TRUE 0.800 47.000 0.019 1.000 Y NA
 565335 565336 PMM0005 PMM0006     FALSE 0.280 88.000 0.143 1.000 N NA
 565336 565337 PMM0006 PMM0007     FALSE 0.544 5.000 0.042 1.000 N NA
 565338 565339 PMM0008 PMM0009   nusB FALSE 0.334 1.000 0.016 NA   NA
 565339 565340 PMM0009 PMM0010 nusB ftsY FALSE 0.364 59.000 0.013 1.000   NA
 565340 565341 PMM0010 PMM0011 ftsY rsbU FALSE 0.265 68.000 0.013 1.000 N NA
 565341 565342 PMM0011 PMM0012 rsbU argH FALSE 0.333 59.000 0.021 1.000 N NA
 565342 565343 PMM0012 PMM0013 argH   FALSE 0.404 54.000 0.019 1.000   NA
 565345 565346 PMM0015 PMM0016   grpE TRUE 0.714 77.000 0.021 1.000 Y NA
 565346 565347 PMM0016 PMM0017 grpE dnaJ TRUE 0.951 32.000 0.168 0.017 Y NA
 565347 565348 PMM0017 PMM0018 dnaJ   FALSE 0.528 -3.000 0.067 1.000   NA
 565348 565349 PMM0018 PMM0019     TRUE 0.563 -10.000 0.058 1.000   NA
 565350 565351 PMM0020 PMM0021   murB FALSE 0.496 23.000 0.030 NA   NA
 565351 565352 PMM0021 PMM0022 murB murC TRUE 0.977 8.000 0.136 0.009 Y NA
 565354 565355 PMM0024 PMM0025 thiL   FALSE 0.493 -7.000 0.031 1.000 N NA
 565356 565357 PMM0026 PMM0027 efp accB FALSE 0.506 0.000 0.120 1.000 N NA
 565358 565359 PMM0028 PMM0029 pdxA   FALSE 0.451 -7.000 0.020 1.000 N NA
 565361 565362 PMM0031 PMM0032     FALSE 0.062 171.000 0.250 NA   NA
 565362 565363 PMM0032 PMM0033     FALSE 0.336 59.000 0.091 NA   NA
 565366 565367 PMM0036 PMM0037 cbiD guaA FALSE 0.371 49.000 0.023 1.000 N NA
 565367 565368 PMM0037 PMM0038 guaA   FALSE 0.171 45.000 0.000 NA   NA
 565368 565369 PMM0038 PMM0039     FALSE 0.344 91.000 0.300 NA   NA
 565369 1203562 PMM0039       FALSE 0.131 106.000 0.100 NA   NA
 1203562 565370   PMM0040     FALSE 0.366 5.000 0.008 NA   NA
 565371 565372 PMM0041 PMM0042     TRUE 0.823 19.000 0.458 NA   NA
 565372 565373 PMM0042 PMM0043     TRUE 0.985 18.000 0.457 0.004 Y NA
 5163155 565381   PMM0051     FALSE 0.270 -66.000 0.000 NA   NA
 1203563 565383   RNA_43   tmRNA FALSE 0.017 154.000 0.000 NA   NA
 565385 565386 PMM0054 PMM0055     TRUE 0.761 1.000 0.522 NA   NA
 1203523 565387   PMM0056     FALSE 0.397 88.000 0.350 NA   NA
 565387 565388 PMM0056 PMM0057   smc FALSE 0.288 83.000 0.150 NA   NA
 565388 565389 PMM0057 PMM0058 smc   FALSE 0.451 52.000 0.177 NA   NA
 565390 565391 PMM0059 RNA_37   tRNACys1 FALSE 0.262 5.000 0.000 NA   NA
 565393 5163179 PMM0061       FALSE 0.034 116.000 0.000 NA   NA
 565394 565395 PMM0062 PMM0063 psbX   TRUE 0.602 78.000 0.556 NA   NA
 565396 565397 PMM0064 PMM0065 hli2   TRUE 0.889 10.000 0.576 NA   NA
 565397 565398 PMM0065 PMM0066     FALSE 0.496 38.000 0.182 NA   NA
 565398 565399 PMM0066 PMM0067   hit FALSE 0.256 48.000 0.010 NA   NA
 565399 565400 PMM0067 PMM0068 hit def FALSE 0.510 21.000 0.013 1.000 N NA
 565402 565403 PMM0070 PMM0071     FALSE 0.472 0.000 0.081 1.000 N NA
 565403 565404 PMM0071 PMM0072   sufC TRUE 0.942 5.000 0.482 1.000 Y NA
 565404 565405 PMM0072 PMM0073 sufC   TRUE 0.946 22.000 0.466 1.000 Y NA
 565407 1203524 PMM0075       TRUE 0.922 16.000 0.947 NA   NA
 1203524 565408   PMM0076   pgm FALSE 0.320 34.000 0.017 NA   NA
 565408 565409 PMM0076 PMM0077 pgm mgs1 FALSE 0.354 36.000 0.009 1.000 N NA
 565412 565413 PMM0080 PMM0081   cysH TRUE 0.637 19.000 0.026 1.000   NA
 565414 565415 PMM0082 PMM0083   citT TRUE 0.556 60.000 0.296 1.000 N NA
 565415 565416 PMM0083 PMM0084 citT trkG TRUE 0.989 10.000 0.500 0.004 Y NA
 565416 565417 PMM0084 PMM0085 trkG   TRUE 0.983 19.000 0.438 0.004 Y NA
 565419 565420 PMM0087 PMM0088     TRUE 0.741 36.000 0.533 NA   NA
 565421 1203565 PMM0089       FALSE 0.054 155.000 0.128 NA   NA
 565423 565424 PMM0091 PMM0092     FALSE 0.543 105.000 1.000 NA   NA
 565424 565425 PMM0092 PMM0093   hli1 TRUE 0.572 69.000 0.421 NA   NA
 565426 565427 PMM0094 PMM0095   rbn FALSE 0.505 33.000 0.172 NA   NA
 565427 565428 PMM0095 PMM0096 rbn   FALSE 0.420 75.000 0.154 1.000   NA
 565428 565429 PMM0096 PMM0097     FALSE 0.517 3.000 0.096 1.000 N NA
 565429 565430 PMM0097 PMM0098     FALSE 0.552 -7.000 0.128 1.000 N NA
 565431 565432 PMM0099 PMM0100   nadB FALSE 0.372 0.000 0.024 NA   NA
 1203566 565435 PMM102a PMM0103 petL   FALSE 0.444 66.000 0.238 NA   NA
 565435 565436 PMM0103 PMM0104     FALSE 0.451 65.000 0.238 NA   NA
 565436 565437 PMM0104 PMM0105   ribG TRUE 0.673 12.000 0.125 NA   NA
 565437 565438 PMM0105 PMM0106 ribG   TRUE 0.907 -3.000 0.370 1.000 Y NA
 565443 565444 PMM0111 PMM0112   rbfA FALSE 0.515 6.000 0.030 NA   NA
 565444 565445 PMM0112 PMM0113 rbfA hemD FALSE 0.436 -25.000 0.006 1.000 N NA
 565446 565447 PMM0114 PMM0115   crtQ TRUE 0.840 3.000 0.800 NA   NA
 565448 565449 PMM0116 PMM0117     TRUE 0.826 9.000 0.375 NA   NA
 565449 565450 PMM0117 PMM0118     TRUE 0.696 2.000 0.389 NA   NA
 565450 565451 PMM0118 PMM0119     TRUE 0.825 -3.000 0.778 NA   NA
 565454 565455 PMM0122 PMM0123   cysK2 TRUE 0.901 17.000 0.714 1.000 N NA
 565456 565457 PMM0124 PMM0125     FALSE 0.465 2.000 0.117 NA   NA
 565457 565458 PMM0125 RNA_1   tRNA-Asn1 FALSE 0.164 50.000 0.000 NA   NA
 565458 565459 RNA_1 PMM0126 tRNA-Asn1   FALSE 0.004 352.000 0.000 NA   NA
 565462 565463 PMM0129 PMM0130 holB tmk TRUE 0.661 -7.000 0.254 1.000 N NA
 565463 565464 PMM0130 PMM0131 tmk zntA FALSE 0.423 1.000 0.020 1.000 N NA
 565467 565468 PMM0134 PMM0135 rpaB plsX FALSE 0.448 1.000 0.026 1.000 N NA
 565468 565469 PMM0135 PMM0136 plsX fabH TRUE 0.956 54.000 0.380 0.007 Y NA
 565469 565470 PMM0136 PMM0137 fabH fabD TRUE 0.976 15.000 0.043 0.007 Y NA
 565470 565471 PMM0137 PMM0138 fabD plsC TRUE 0.909 5.000 0.218 1.000 Y NA
 565472 565473 PMM0139 PMM0140   ycf34 FALSE 0.531 7.000 0.023 NA   NA
 565474 565475 PMM0141 PMM0142     FALSE 0.426 59.000 0.074 1.000   NA
 565476 565477 PMM0143 PMM0144 crtB,pys pds TRUE 0.892 20.000 0.691 1.000   NA
 565478 565479 PMM0145 PMM0146     TRUE 0.557 -3.000 0.205 NA   NA
 565481 565482 PMM0148 PMM0149   ndhF FALSE 0.388 34.000 0.041 NA   NA
 565482 565483 PMM0149 PMM0150 ndhF ndhD TRUE 0.890 85.000 0.050 0.003 Y NA
 565483 565484 PMM0150 PMM0151 ndhD   FALSE 0.018 231.000 0.009 1.000   NA
 565484 565485 PMM0151 PMM0152     FALSE 0.456 50.000 0.034 1.000   NA
 565488 565489 PMM0155 PMM0156     FALSE 0.549 1.000 0.101 1.000   NA
 565489 565490 PMM0156 PMM0157   ndhE FALSE 0.540 26.000 0.071 1.000 N NA
 565490 565491 PMM0157 PMM0158 ndhE ndhG TRUE 0.976 2.000 0.506 0.004 Y NA
 565491 565492 PMM0158 PMM0159 ndhG ndhI TRUE 0.980 14.000 0.192 0.012 Y NA
 565492 565493 PMM0159 PMM0160 ndhI ndhA TRUE 0.924 70.000 0.242 0.012 Y NA
 565493 565494 PMM0160 PMM0161 ndhA gltA TRUE 0.751 76.000 0.137 1.000 Y NA
 565494 565495 PMM0161 PMM0162 gltA   FALSE 0.250 80.000 0.094 NA   NA
 565498 565499 PMM0165 PMM0166 sui1 cysC FALSE 0.409 44.000 0.047 1.000 N NA
 565505 565506 PMM0172 PMM0173 ndhH   TRUE 0.782 9.000 0.182 1.000   NA
 565507 565508 PMM0174 PMM0175 menE menC TRUE 0.907 -15.000 0.104 0.002 N NA
 565508 565509 PMM0175 PMM0176 menC menA FALSE 0.470 -3.000 0.066 1.000 N NA
 565511 565512 PMM0178 PMM0179 gshB grxC TRUE 0.572 6.000 0.028 1.000 N NA
 565513 565514 PMM0180 PMM0181 prfB   FALSE 0.460 5.000 0.025 NA   NA
 565514 565515 PMM0181 PMM0182     TRUE 0.593 8.000 0.039 NA   NA
 565515 565516 PMM0182 PMM0183   dgkA TRUE 0.659 23.000 0.123 1.000   NA
 565516 565517 PMM0183 PMM0184 dgkA pabA TRUE 0.769 8.000 0.231 1.000 N NA
 565517 565518 PMM0184 PMM0185 pabA   TRUE 0.673 22.000 0.231 NA   NA
 565519 565520 PMM0186 PMM0187 hisC argS FALSE 0.393 0.000 0.015 1.000 N NA
 565520 565521 PMM0187 PMM0188 argS nadC FALSE 0.449 28.000 0.014 1.000 N NA
 565521 565522 PMM0188 PMM0189 nadC thdF FALSE 0.294 76.000 0.014 1.000   NA
 565526 565527 PMM0193 PMM0194 rluD   FALSE 0.482 -3.000 0.018 1.000   NA
 565531 565532 PMM0198 PMM0199   pyrD TRUE 0.579 16.000 0.016 1.000 N NA
 565532 565533 PMM0199 PMM0200 pyrD rnhA TRUE 0.656 15.000 0.031 1.000 N NA
 565533 565534 PMM0200 PMM0201 rnhA rplL FALSE 0.321 46.000 0.008 1.000 N NA
 565534 565535 PMM0201 PMM0202 rplL rplJ TRUE 0.957 29.000 0.884 1.000 Y NA
 565535 565536 PMM0202 PMM0203 rplJ rplA FALSE 0.228 193.000 0.302 1.000 Y NA
 565536 565537 PMM0203 PMM0204 rplA rplK TRUE 0.960 67.000 0.838 0.046 Y NA
 565537 565538 PMM0204 PMM0205 rplK nusG TRUE 0.729 64.000 0.681 1.000 N NA
 565538 565539 PMM0205 PMM0206 nusG secE TRUE 0.756 75.000 0.843 1.000   NA
 565539 565540 PMM0206 PMM0207 secE clpB2 FALSE 0.375 64.000 0.023 1.000   NA
 565542 565543 PMM0209 PMM0210     TRUE 0.772 0.000 0.576 NA   NA
 565545 565546 PMM0212 PMM0213   sbtA FALSE 0.551 4.000 0.152 NA   NA
 565546 565547 PMM0213 PMM0214 sbtA   TRUE 0.560 7.000 0.048 NA   NA
 565548 565549 PMM0215 PMM0216 hemB   FALSE 0.387 56.000 0.033 1.000 N NA
 565549 565550 PMM0216 PMM0217   mutS TRUE 0.666 14.000 0.044 1.000 N NA
 565550 565551 PMM0217 PMM0218 mutS obg FALSE 0.391 44.000 0.008 1.000   NA
 565551 565552 PMM0218 PMM0219 obg   FALSE 0.118 88.000 0.005 NA   NA
 565553 565554 PMM0220 PMM0221   ecm4 FALSE 0.097 126.000 0.152 NA   NA
 565555 565556 PMM0222 PMM0223 aspA psbA FALSE 0.030 166.000 0.000 1.000   NA
 565556 565557 PMM0223 PMM0224 psbA aroC FALSE 0.084 113.000 0.000 1.000   NA
 565558 565559 PMM0225 PMM0226 eda ftsH2 TRUE 0.866 12.000 0.415 1.000 N NA
 565559 565560 PMM0226 PMM0227 ftsH2 cysD FALSE 0.398 47.000 0.061 1.000 N NA
 565560 565561 PMM0227 PMM0228 cysD psbO FALSE 0.348 75.000 0.064 1.000   NA
 565562 565563 PMM0229 PMM0230 dfp   FALSE 0.442 -10.000 0.030 NA   NA
 565564 565565 PMM0231 PMM0232     TRUE 0.581 37.000 0.278 NA   NA
 565566 565567 PMM0233 PMM0234 pyrB   FALSE 0.407 0.000 0.019 1.000 N NA
 565569 1203525 PMM0236   crtR   FALSE 0.274 -782.000 0.000 NA   NA
 565570 565571 RNA_2 PMM0237 tRNAVal2   FALSE 0.090 85.000 0.000 NA   NA
 565571 565572 PMM0237 PMM0238   ileS FALSE 0.335 43.000 0.025 NA   NA
 565577 565578 PMM0243 PMM0244 thy1 dcd TRUE 0.854 2.000 0.042 1.000 Y NA
 565578 565579 PMM0244 PMM0245 dcd   TRUE 0.604 6.000 0.091 1.000 N NA
 565580 565581 PMM0246 PMM0247 ntcA   TRUE 0.727 55.000 0.612 NA   NA
 565581 565582 PMM0247 PMM0248     FALSE 0.401 1.000 0.047 NA   NA
 565583 565584 PMM0249 PMM0250   pth FALSE 0.368 1.000 0.022 NA   NA
 565584 565585 PMM0250 PMM0251 pth psbH FALSE 0.028 188.000 0.006 1.000   NA
 565586 565587 PMM0252 PMM0253 psbN psbI FALSE 0.452 129.000 0.216 0.007   NA
 565587 565588 PMM0253 PMM0254 psbI   TRUE 0.642 15.000 0.107 NA   NA
 565589 565590 PMM0255 PMM0256 leuD leuC TRUE 0.968 -3.000 0.268 0.002 Y NA
 565590 565591 PMM0256 PMM0257 leuC cinA TRUE 0.716 14.000 0.032 1.000   NA
 565591 565592 PMM0257 PMM0258 cinA glyA TRUE 0.554 -31.000 0.018 1.000   NA
 565592 565593 PMM0258 RNA_36 glyA tRNAGly3 FALSE 0.104 79.000 0.000 NA   NA
 565594 565595 PMM0259 PMM0260     TRUE 0.900 10.000 0.667 NA   NA
 565597 565598 PMM0262 PMM0263 sfsA amt1 FALSE 0.029 175.000 0.040 NA   NA
 565598 565599 PMM0263 PMM0264 amt1 lytB FALSE 0.374 90.000 0.286 1.000 N NA
 565599 565600 PMM0264 PMM0265 lytB   FALSE 0.209 95.000 0.143 NA   NA
 5163182 565604   PMM0269     FALSE 0.011 174.000 0.000 NA   NA
 565606 565607 PMM0271 PMM0272 tgt psbK FALSE 0.505 34.000 0.034 1.000   NA
 565608 565609 PMM0273 PMM0274     FALSE 0.350 51.000 0.078 NA   NA
 565609 565610 PMM0274 RNA_35   tRNAGlu1 FALSE 0.348 16.000 0.000 NA   NA
 565611 565612 PMM0275 PMM0276 pyrE   TRUE 0.576 4.000 0.034 1.000   NA
 565614 565615 PMM0278 PMM0279     FALSE 0.430 -3.000 0.020 1.000 N NA
 565616 565617 PMM0280 PMM0281   hisB FALSE 0.403 34.000 0.020 1.000 N NA
 565617 565618 PMM0281 PMM0282 hisB fabI FALSE 0.545 21.000 0.021 1.000 N NA
 565619 565620 PMM0283 PMM0284   degT FALSE 0.443 54.000 0.057 1.000   NA
 565621 565622 PMM0285 PMM0286 phrB   TRUE 0.853 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 565622 565623 PMM0286 PMM0287   folK FALSE 0.396 52.000 0.033 1.000 N NA
 565625 565626 PMM0289 PMM0290     TRUE 0.954 6.000 0.690 NA Y NA
 565628 565629 PMM0292 PMM0293 ndhJ ndhK TRUE 0.970 0.000 0.406 0.004 Y NA
 565629 565630 PMM0293 PMM0294 ndhK ndhC TRUE 0.979 5.000 0.428 0.004 Y NA
 565631 565632 PMM0295 PMM0296 rub   TRUE 0.880 10.000 0.521 NA   NA
 565632 565633 PMM0296 PMM0297   psbE FALSE 0.278 127.000 0.625 NA   NA
 565633 565634 PMM0297 PMM0298 psbE psbF TRUE 0.962 3.000 0.837 0.003   NA
 565634 565635 PMM0298 PMM0299 psbF psbL TRUE 0.980 12.000 0.872 0.006   NA
 565635 565636 PMM0299 PMM0300 psbL psbJ TRUE 0.980 10.000 0.878 0.006   NA
 565639 565640 PMM0303 PMM0304   uvrD TRUE 0.682 8.000 0.025 1.000   NA
 565640 1203569 PMM0304   uvrD   FALSE 0.288 39.000 0.012 NA   NA
 565642 565643 PMM0306 PMM0307 cpeS   TRUE 0.666 -25.000 0.259 NA   NA
 565643 565644 PMM0307 PMM0308     FALSE 0.224 116.000 0.375 NA   NA
 565646 565647 RNA_34 PMM0310 tRNAAla1 xylB FALSE 0.068 95.000 0.000 NA   NA
 565647 565648 PMM0310 PMM0311 xylB metK TRUE 0.611 7.000 0.028 1.000 N NA
 565648 565649 PMM0311 PMM0312 metK rps1a, rpsA1 FALSE 0.064 135.000 0.008 1.000   NA
 565649 565650 PMM0312 PMM0313 rps1a, rpsA1   FALSE 0.100 108.000 0.025 NA   NA
 565650 565651 PMM0313 PMM0314   psbT FALSE 0.120 104.000 0.028 NA   NA
 565651 565652 PMM0314 PMM0315 psbT psbB TRUE 0.946 25.000 0.651 0.068   NA
 5163183 565653   PMM0316   fdx FALSE 0.017 150.000 0.000 NA   NA
 565653 565654 PMM0316 PMM0317 fdx psbM FALSE 0.403 106.000 0.472 1.000   NA
 565654 565655 PMM0317 PMM0318 psbM hemK TRUE 0.745 13.000 0.111 1.000   NA
 565655 565656 PMM0318 PMM0319 hemK sua5 TRUE 0.936 21.000 0.444 NA Y NA
 565656 1294201 PMM0319   sua5   FALSE 0.366 9.000 0.000 NA   NA
 565657 565658 RNA_33 PMM0320 tRNAPro3 minE FALSE 0.130 66.000 0.000 NA   NA
 565658 565659 PMM0320 PMM0321 minE minD TRUE 0.894 3.000 0.347 NA Y NA
 565659 565660 PMM0321 PMM0322 minD minC FALSE 0.540 118.000 0.368 1.000 Y NA
 565660 565661 PMM0322 PMM0323 minC   FALSE 0.525 1.000 0.038 1.000   NA
 565661 565662 PMM0323 PMM0324   ctpA FALSE 0.499 35.000 0.071 1.000   NA
 565663 565664 PMM0325 PMM0326 petB petD TRUE 0.893 43.000 0.471 0.068   NA
 565666 565667 RNA_38 RNA_39 tRNALeu4 16s-rRNA FALSE 0.275 -1464.000 0.000 NA   NA
 565668 565669 RNA_3 RNA_4 tRNAAsp1 tRNASer1 FALSE 0.377 13.000 0.000 NA   NA
 565669 565670 RNA_4 RNA_40 tRNASer1 tRNAIle1 FALSE 0.005 267.000 0.000 NA   NA
 565670 565671 RNA_40 RNA_41 tRNAIle1 tRNAAla2 FALSE 0.136 64.000 0.000 NA   NA
 565672 565673 PMM0328 PMM0329 FPG psaE TRUE 0.602 5.000 0.040 1.000   NA
 565673 565674 PMM0329 PMM0330 psaE   FALSE 0.383 81.000 0.152 1.000   NA
 565674 565675 PMM0330 PMM0331     FALSE 0.487 73.000 0.227 1.000   NA
 565676 565677 PMM0332 PMM0333   rimI FALSE 0.258 88.000 0.026 1.000   NA
 565678 1203573 PMM0334       FALSE 0.006 222.000 0.000 NA   NA
 1203574 1203575         FALSE 0.344 122.000 0.750 NA   NA
 1203576 5163156         FALSE 0.014 159.000 0.000 NA   NA
 1203577 565682   PMM0338     FALSE 0.278 97.000 0.250 NA   NA
 1203526 565683   PMM0339   T8L23.23 FALSE 0.125 116.000 0.167 NA   NA
 565683 1203578 PMM0339   T8L23.23   FALSE 0.207 31.000 0.000 NA   NA
 1203527 565687   PMM0343     TRUE 0.815 -121.000 0.500 NA   NA
 565687 1294203 PMM0343       TRUE 0.557 93.000 0.714 NA   NA
 565689 565690 PMM0345 PMM0346     FALSE 0.371 45.000 0.086 NA   NA
 565691 1203580 PMM0347       TRUE 0.574 5.000 0.150 NA   NA
 1203580 565692   PMM0348     FALSE 0.355 118.000 0.750 NA   NA
 565693 565694 PMM0349 PMM0350     FALSE 0.067 107.000 0.005 NA   NA
 565696 565697 PMM0352 PMM0353     FALSE 0.333 74.000 0.150 NA   NA
 1203582 1203583         FALSE 0.008 201.000 0.000 NA   NA
 565699 1203584 PMM0355       FALSE 0.126 68.000 0.000 NA   NA
 1203584 1203585         FALSE 0.173 44.000 0.000 NA   NA
 5163187 565700   PMM0356     FALSE 0.094 84.000 0.000 NA   NA
 565701 565702 PMM0357 PMM0358   thiD TRUE 0.623 33.000 0.263 1.000 N NA
 1203586 565704   PMM0360     FALSE 0.009 405.000 0.088 NA   NA
 565704 565705 PMM0360 PMM0361     FALSE 0.459 31.000 0.118 NA   NA
 565705 565706 PMM0361 PMM0362     FALSE 0.491 65.000 0.286 NA   NA
 565706 565707 PMM0362 PMM0363     FALSE 0.016 155.000 0.000 NA   NA
 5163188 5163217         FALSE 0.366 9.000 0.000 NA   NA
 565710 565711 PMM0366 PMM0367     FALSE 0.009 341.000 0.000 1.000   NA
 565712 1203529 PMM0368       FALSE 0.018 148.000 0.000 NA   NA
 1203529 5163157         FALSE 0.241 4.000 0.000 NA   NA
 5163157 5163158         FALSE 0.090 85.000 0.000 NA   NA
 5163158 5163159         FALSE 0.189 35.000 0.000 NA   NA
 1203590 1203591         FALSE 0.120 71.000 0.000 NA   NA
 1203591 1203592         FALSE 0.243 28.000 0.000 NA   NA
 1203593 1203530         FALSE 0.008 196.000 0.000 NA   NA
 565713 565714 PMM0369 PMM0370     FALSE 0.003 448.000 0.000 NA   NA
 565714 565715 PMM0370 PMM0371   tauC TRUE 0.854 31.000 0.189 NA Y NA
 565715 565716 PMM0371 PMM0372 tauC tauB TRUE 0.980 17.000 0.162 0.002 Y NA
 565716 565717 PMM0372 PMM0373 tauB cynS TRUE 0.835 33.000 0.021 1.000 Y NA
 565720 565721 PMM0376 PMM0377     FALSE 0.205 1.000 0.000 NA   NA
 565722 5163191 PMM0378       FALSE 0.034 116.000 0.000 NA   NA
 5163191 1203595         FALSE 0.176 42.000 0.000 NA   NA
 1203595 1203596         FALSE 0.202 0.000 0.000 NA   NA
 1203596 1203597         FALSE 0.005 245.000 0.000 NA   NA
 1203597 1203531         FALSE 0.202 0.000 0.000 NA   NA
 1203531 565723   PMM0379     FALSE 0.102 80.000 0.000 NA   NA
 565723 565724 PMM0379 PMM0380     FALSE 0.166 48.000 0.000 NA   NA
 565725 565726 PMM0381 PMM0382     FALSE 0.178 41.000 0.000 NA   NA
 565727 565728 PMM0383 PMM0384   spnII-interrupted-C FALSE 0.005 274.000 0.000 NA   NA
 565728 565729 PMM0384 PMM0385 spnII-interrupted-C   FALSE 0.212 2.000 0.000 NA   NA
 565729 1203533 PMM0385       FALSE 0.276 -1490.000 0.000 NA   NA
 1203533 565730   PMM0386     TRUE 0.594 -16.000 0.182 NA   NA
 1294205 565731   RNA_32   tRNASer4 FALSE 0.026 128.000 0.000 NA   NA
 565731 565732 RNA_32 RNA_31 tRNASer4 tRNASer3 FALSE 0.378 11.000 0.000 NA   NA
 565733 565734 PMM0387 PMM0388 aroD miaE FALSE 0.467 1.000 0.039 1.000 N NA
 565734 565735 PMM0388 PMM0389 miaE cobI/cbiL FALSE 0.548 21.000 0.022 1.000 N NA
 565735 565736 PMM0389 PMM0390 cobI/cbiL   FALSE 0.322 0.000 0.015 NA   NA
 565736 565737 PMM0390 PMM0391     FALSE 0.192 73.000 0.011 NA   NA
 565737 565738 PMM0391 PMM0392   cbiQ FALSE 0.510 0.000 0.029 1.000   NA
 565738 565739 PMM0392 PMM0393 cbiQ   TRUE 0.826 18.000 0.447 NA   NA
 565739 565740 PMM0393 PMM0394     FALSE 0.453 4.000 0.065 NA   NA
 565740 565741 PMM0394 PMM0395     FALSE 0.063 158.000 0.194 NA   NA
 565741 565742 PMM0395 PMM0396   proC TRUE 0.736 8.000 0.224 NA   NA
 565743 565744 PMM0397 PMM0398   recO FALSE 0.182 86.000 0.009 1.000 N NA
 565744 565745 PMM0398 PMM0399 recO deoC FALSE 0.367 1.000 0.007 1.000 N NA
 565745 565746 PMM0399 PMM0400 deoC lrtA FALSE 0.416 9.000 0.017 NA N NA
 565747 565748 PMM0401 PMM0402 lipB fadD FALSE 0.459 31.000 0.029 1.000 N NA
 565748 565749 PMM0402 PMM0403 fadD   TRUE 0.603 58.000 0.388 NA   NA
 565750 1203599 PMM0404       FALSE 0.013 164.000 0.000 NA   NA
 1203534 5163192         FALSE 0.140 62.000 0.000 NA   NA
 5163192 5163218         FALSE 0.108 77.000 0.000 NA   NA
 5163218 565751   PMM0405   pdhC FALSE 0.010 187.000 0.000 NA   NA
 565751 565752 PMM0405 PMM0406 pdhC queA TRUE 0.556 7.000 0.014 1.000 N NA
 565753 565754 PMM0407 PMM0408 cysK1   TRUE 0.865 85.000 0.095 0.024 Y NA
 565754 565755 PMM0408 PMM0409   metB TRUE 0.974 4.000 0.250 0.001 Y NA
 565755 565756 PMM0409 PMM0410 metB rpsD FALSE 0.224 75.000 0.008 1.000 N NA
 565757 565758 PMM0411 PMM0412     FALSE 0.459 5.000 0.025 NA   NA
 565758 565759 PMM0412 PMM0413   murE TRUE 0.717 11.000 0.049 1.000   NA
 565759 565760 PMM0413 PMM0414 murE   FALSE 0.267 82.000 0.014 1.000   NA
 565761 565762 PMM0415 PMM0416     TRUE 0.810 33.000 0.041 0.051 N NA
 565762 1203535 PMM0416       FALSE 0.108 77.000 0.000 NA   NA
 5163193 565763   PMM0417     FALSE 0.010 188.000 0.000 NA   NA
 565765 565766 PMM0419 PMM0420 mqo lepA FALSE 0.358 57.000 0.007 1.000   NA
 565766 565767 PMM0420 PMM0421 lepA dppC FALSE 0.189 83.000 0.006 1.000 N NA
 1203536 565769   PMM0423     FALSE 0.018 203.000 0.028 NA   NA
 565769 565770 PMM0423 PMM0424     FALSE 0.449 3.000 0.084 NA   NA
 565770 565771 PMM0424 PMM0425     FALSE 0.046 132.000 0.017 NA   NA
 1203601 565772   PMM0426   sun FALSE 0.202 60.000 0.004 NA   NA
 565773 565774 PMM0427 PMM0428 mrcB chlG TRUE 0.755 2.000 0.452 1.000 N NA
 565774 565775 PMM0428 PMM0429 chlG   TRUE 0.662 10.000 0.119 NA   NA
 565776 565777 PMM0430 PMM0431 hisF ubiE FALSE 0.362 37.000 0.012 1.000 N NA
 565780 565781 PMM0434 PMM0435 salX ndhB TRUE 0.711 15.000 0.134 1.000 N NA
 565782 565783 PMM0436 PMM0437 topA   FALSE 0.379 3.000 0.020 NA   NA
 565783 565784 PMM0437 PMM0438     FALSE 0.541 23.000 0.105 NA   NA
 565784 565785 PMM0438 PMM0439   cobT TRUE 0.694 15.000 0.155 NA   NA
 565785 565786 PMM0439 PMM0440 cobT   FALSE 0.470 1.000 0.130 NA   NA
 565789 565790 PMM0443 PMM0444   ctaE TRUE 0.602 98.000 1.000 NA   NA
 565790 565791 PMM0444 PMM0445 ctaE ctaD (coxA) TRUE 0.990 13.000 0.500 0.002 Y NA
 565791 565792 PMM0445 PMM0446 ctaD (coxA) ctaC (coxB) TRUE 0.978 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 565793 565794 PMM0447 PMM0448 ctaA ctaB TRUE 0.856 -3.000 0.090 1.000 Y NA
 565794 565795 PMM0448 PMM0449 ctaB ccmA FALSE 0.435 37.000 0.033 1.000 N NA
 565795 565796 PMM0449 PMM0450 ccmA   TRUE 0.602 54.000 0.321 1.000 N NA
 565796 565797 PMM0450 PMM0451     TRUE 0.850 8.000 0.455 NA   NA
 565801 565802 PMM0455 PMM0456   ubiA TRUE 0.670 13.000 0.043 1.000 N NA
 565804 565805 PMM0458 PMM0459   cobM FALSE 0.379 58.000 0.016 1.000   NA
 565805 565806 PMM0459 PMM0460 cobM lgt FALSE 0.492 -7.000 0.061 1.000 N NA
 565806 565807 PMM0460 PMM0461 lgt petA TRUE 0.895 12.000 0.476 1.000   NA
 565807 565808 PMM0461 PMM0462 petA petC TRUE 0.959 5.000 0.881 0.051   NA
 565810 565811 PMM0464 PMM0465 tatC   FALSE 0.202 84.000 0.027 NA   NA
 565811 565812 PMM0465 PMM0466     FALSE 0.377 30.000 0.020 NA   NA
 565814 565815 PMM0468 PMM0469 psaJ psaF TRUE 0.923 31.000 0.455 0.020   NA
 565816 565817 PMM0470 PMM0471 qri7 hli20 FALSE 0.440 6.000 0.015 NA   NA
 565817 565818 PMM0471 PMM0472 hli20 nhaP FALSE 0.038 158.000 0.034 NA   NA
 565819 565820 PMM0473 RNA_30 gltX tRNALys1 FALSE 0.319 18.000 0.000 NA   NA
 565820 565821 RNA_30 PMM0474 tRNALys1   FALSE 0.015 156.000 0.000 NA   NA
 565821 565822 PMM0474 RNA_29   tRNAMet3 FALSE 0.181 39.000 0.000 NA   NA
 565822 565823 RNA_29 PMM0475 tRNAMet3 rplS FALSE 0.157 56.000 0.000 NA   NA
 565823 565824 PMM0475 PMM0476 rplS   FALSE 0.517 15.000 0.013 NA   NA
 565827 565828 PMM0479 PMM0480 pta   TRUE 0.595 26.000 0.177 NA   NA
 565828 565829 PMM0480 PMM0481     FALSE 0.243 68.000 0.021 NA   NA
 565829 1203602 PMM0481       FALSE 0.447 25.000 0.021 NA   NA
 1203602 565830   PMM0482   hflC FALSE 0.236 118.000 0.429 NA   NA
 565831 565832 PMM0483 PMM0484 hemL xthA FALSE 0.010 228.000 0.000 1.000 N NA
 565833 565834 PMM0485 PMM0486     FALSE 0.461 46.000 0.174 NA   NA
 565834 565835 PMM0486 PMM0487     FALSE 0.279 67.000 0.042 NA   NA
 565835 565836 PMM0487 PMM0488     TRUE 0.604 9.000 0.042 NA   NA
 565837 565838 PMM0489 PMM0490 futB, hitB   FALSE 0.479 -37.000 0.053 NA   NA
 565838 565839 PMM0490 PMM0491     FALSE 0.299 46.000 0.020 NA   NA
 565839 565840 PMM0491 PMM0492     FALSE 0.513 7.000 0.020 NA   NA
 565841 565842 PMM0493 PMM0494 cxp ppa FALSE 0.503 63.000 0.246 1.000 N NA
 565843 565844 PMM0495 PMM0496 hemC sigA, rpoD FALSE 0.148 95.000 0.009 1.000 N NA
 565846 565847 PMM0498 PMM0499   argB FALSE 0.399 3.000 0.023 NA   NA
 565847 565848 PMM0499 PMM0500 argB   TRUE 0.601 12.000 0.027 NA   NA
 565851 565852 PMM0503 PMM0504 cobK cutA FALSE 0.469 -3.000 0.031 1.000 N NA
 565853 565854 PMM0505 PMM0506   purA TRUE 0.560 19.000 0.021 1.000 N NA
 565854 565855 PMM0506 PMM0507 purA psb27 FALSE 0.198 82.000 0.022 NA   NA
 565855 565856 PMM0507 PMM0508 psb27 proS FALSE 0.435 27.000 0.023 NA   NA
 565857 565858 PMM0509 PMM0510     FALSE 0.354 87.000 0.273 NA   NA
 565858 565859 PMM0510 PMM0511     FALSE 0.452 -10.000 0.041 NA   NA
 565859 565860 PMM0511 PMM0512   arsC FALSE 0.509 -10.000 0.045 1.000 N NA
 565860 565861 PMM0512 PMM0513 arsC lepB FALSE 0.481 30.000 0.030 1.000 N NA
 565862 565863 PMM0514 PMM0515   gpmB FALSE 0.382 3.000 0.004 1.000 N NA
 565864 565865 PMM0516 PMM0517     FALSE 0.347 86.000 0.250 NA   NA
 565865 565866 PMM0517 PMM0518   ftsI FALSE 0.403 0.000 0.039 NA   NA
 565866 565867 PMM0518 PMM0519 ftsI tal FALSE 0.253 91.000 0.131 1.000 N NA
 565868 565869 PMM0520 PMM0521 fixC frr FALSE 0.440 -3.000 0.022 1.000 N NA
 565869 565870 PMM0521 PMM0522 frr pyrH TRUE 0.830 29.000 0.626 1.000 N NA
 565870 565871 PMM0522 PMM0523 pyrH cobO FALSE 0.057 130.000 0.010 1.000 N NA
 565871 565872 PMM0523 PMM0524 cobO   TRUE 0.833 31.000 0.024 0.039   NA
 565873 565874 PMM0525 PMM0526 hemH ilvH FALSE 0.323 135.000 0.031 1.000 Y NA
 565874 565875 PMM0526 PMM0527 ilvH   FALSE 0.403 58.000 0.149 NA   NA
 565876 565877 PMM0528 PMM0529     TRUE 0.568 11.000 0.020 NA   NA
 565877 565878 PMM0529 PMM0530   rps1b, rpsA2, nbp1 TRUE 0.763 -3.000 0.513 NA   NA
 565879 565880 PMM0531 PMM0532     FALSE 0.354 112.000 0.465 1.000   NA
 565880 565881 PMM0532 PMM0533     TRUE 0.689 110.000 0.659 0.036   NA
 565881 565882 PMM0533 PMM0534   accA TRUE 0.575 4.000 0.033 1.000   NA
 565882 565883 PMM0534 PMM0535 accA   TRUE 0.855 2.000 0.033 1.000 Y NA
 565883 565884 PMM0535 PMM0536   folE FALSE 0.124 155.000 0.348 1.000 N NA
 565888 565889 PMM0540 PMM0541 psaM   FALSE 0.417 90.000 0.395 NA   NA
 565889 565890 PMM0541 PMM0542   por, pcr FALSE 0.521 58.000 0.274 NA   NA
 565891 565892 PMM0543 PMM0544 chlL chlB FALSE 0.242 192.000 0.226 0.003 N NA
 565892 565893 PMM0544 PMM0545 chlB chlN TRUE 0.984 4.000 0.591 0.001 Y NA
 565893 565894 PMM0545 PMM0546 chlN   FALSE 0.039 157.000 0.068 NA   NA
 565897 565898 PMM0549 PMM0550 ccmK rbcL FALSE 0.512 66.000 0.373 NA N NA
 565898 565899 PMM0550 PMM0551 rbcL rbcS TRUE 0.806 90.000 0.392 0.001 N NA
 565899 565900 PMM0551 PMM0552 rbcS csoS2 FALSE 0.467 91.000 0.474 NA   NA
 565900 565901 PMM0552 PMM0553 csoS2 csoS3 TRUE 0.923 8.000 0.925 NA   NA
 565901 565902 PMM0553 PMM0554 csoS3   TRUE 0.874 4.000 0.925 NA   NA
 565902 565903 PMM0554 PMM0555     TRUE 0.938 33.000 0.868 NA Y NA
 565903 565904 PMM0555 PMM0556     FALSE 0.183 101.000 0.147 NA   NA
 565905 565906 PMM0557 PMM0558   tdcF FALSE 0.196 86.000 0.051 NA   NA
 565906 565907 PMM0558 PMM0559 tdcF   FALSE 0.437 25.000 0.020 NA   NA
 565908 565909 PMM0560 PMM0561 hisG   FALSE 0.504 5.000 0.021 1.000 N NA
 565909 565910 PMM0561 PMM0562     TRUE 0.639 0.000 0.222 1.000   NA
 565911 565912 PMM0563 PMM0564     TRUE 0.593 6.000 0.135 NA   NA
 565917 565918 PMM0569 RNA_5 pyrC tRNATrp1 FALSE 0.010 182.000 0.000 NA   NA
 565918 565919 RNA_5 PMM0570 tRNATrp1 ndhL FALSE 0.102 80.000 0.000 NA   NA
 565919 565920 PMM0570 PMM0571 ndhL   TRUE 0.874 4.000 0.925 NA   NA
 565920 565921 PMM0571 PMM0572   trpA TRUE 0.646 39.000 0.375 NA   NA
 565924 565925 PMM0575 PMM0576     TRUE 0.813 -3.000 0.714 NA   NA
 565925 565926 PMM0576 PMM0577     TRUE 0.901 6.000 0.905 NA   NA
 565926 565927 PMM0577 PMM0578   hisI FALSE 0.039 147.000 0.006 1.000 N NA
 565929 565930 PMM0580 PMM0581 clpB petE FALSE 0.361 67.000 0.106 1.000 N NA
 565930 565931 PMM0581 PMM0582 petE   TRUE 0.641 59.000 0.404 1.000 N NA
 565931 565932 PMM0582 PMM0583   hemE TRUE 0.658 9.000 0.032 1.000 N NA
 565932 565933 PMM0583 PMM0584 hemE glgB FALSE 0.083 124.000 0.024 1.000 N NA
 565933 565934 PMM0584 PMM0585 glgB   TRUE 0.567 55.000 0.220 1.000   NA
 565934 565935 PMM0585 PMM0586     TRUE 0.910 9.000 0.760 NA   NA
 565935 565936 PMM0586 PMM0587     TRUE 0.748 55.000 0.684 NA   NA
 565936 565937 PMM0587 PMM0588     TRUE 0.796 9.000 0.317 NA   NA
 565938 565939 PMM0589 PMM0590   proA FALSE 0.189 66.000 0.006 NA   NA
 565939 565940 PMM0590 PMM0591 proA folB TRUE 0.641 10.000 0.023 1.000 N NA
 565940 565941 PMM0591 PMM0592 folB   TRUE 0.636 6.000 0.047 1.000   NA
 565942 565943 PMM0593 PMM0594 prlC ndhD TRUE 0.799 5.000 0.444 1.000 N NA
 565943 565944 PMM0594 PMM0595 ndhD thrB FALSE 0.059 145.000 0.031 1.000 N NA
 565944 565945 PMM0595 PMM0596 thrB glk TRUE 0.577 8.000 0.013 1.000 N NA
 565945 565946 PMM0596 PMM0597 glk thrS TRUE 0.568 10.000 0.006 1.000 N NA
 565946 565947 PMM0597 PMM0598 thrS trpS TRUE 0.944 4.000 0.016 0.056 Y NA
 565947 565948 PMM0598 PMM0599 trpS   FALSE 0.454 -10.000 0.034 NA   NA
 565949 565950 PMM0600 PMM0601     FALSE 0.375 36.000 0.065 NA   NA
 565950 565951 PMM0601 PMM0602     TRUE 0.963 5.000 0.894 1.000 Y NA
 565951 565952 PMM0602 PMM0603     TRUE 0.978 12.000 0.857 1.000 Y NA
 565952 565953 PMM0603 PMM0604     TRUE 0.583 7.000 0.085 NA   NA
 565954 565955 PMM0605 PMM0606   lepB TRUE 0.629 46.000 0.381 NA   NA
 565956 565957 PMM0607 PMM0608 menD menB TRUE 0.963 31.000 0.147 0.001 Y NA
 565957 565958 PMM0608 PMM0609 menB glgA FALSE 0.373 46.000 0.022 1.000 N NA
 565958 565959 PMM0609 PMM0610 glgA murF TRUE 0.761 12.000 0.182 1.000 N NA
 565960 565961 PMM0611 PMM0612 glmU   FALSE 0.320 41.000 0.021 NA   NA
 565961 565962 PMM0612 PMM0613   aroA FALSE 0.412 -30.000 0.017 NA   NA
 565963 565964 PMM0614 PMM0615     FALSE 0.521 31.000 0.051 1.000   NA
 565964 565965 PMM0615 PMM0616   amiC FALSE 0.512 0.000 0.051 1.000   NA
 565965 565966 PMM0616 PMM0617 amiC murI TRUE 0.846 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 565966 565967 PMM0617 PMM0618 murI sds FALSE 0.493 28.000 0.024 1.000 N NA
 565967 565968 PMM0618 PMM0619 sds acs FALSE 0.189 98.000 0.080 1.000 N NA
 565972 565973 PMM0623 PMM0624 hisS   FALSE 0.362 5.000 0.007 NA   NA
 565973 565974 PMM0624 PMM0625     TRUE 0.845 27.000 0.714 NA   NA
 565974 565975 PMM0625 PMM0626     FALSE 0.307 136.000 0.857 NA   NA
 565976 565977 PMM0627 PMM0628 pcb   FALSE 0.196 107.000 0.132 1.000   NA
 565977 565978 PMM0628 PMM0629     FALSE 0.517 39.000 0.211 NA   NA
 565981 565982 PMM0632 PMM0633   crtL2 TRUE 0.789 13.000 0.235 1.000 N NA
 565984 565985 PMM0635 PMM0636 mscS pncA FALSE 0.297 74.000 0.029 1.000 N NA
 565987 565988 PMM0638 PMM0639   stpA TRUE 0.559 29.000 0.059 1.000   NA
 565989 565990 PMM0640 PMM0641     FALSE 0.234 104.000 0.250 NA   NA
 565990 565991 PMM0641 PMM0642   MET17 FALSE 0.335 73.000 0.149 NA   NA
 565991 565992 PMM0642 PMM0643 MET17 metA TRUE 0.926 15.000 0.048 1.000 Y NA
 565993 565994 PMM0644 PMM0645     TRUE 0.834 32.000 0.800 1.000 N NA
 565995 565996 PMM0646 PMM0647     FALSE 0.004 352.000 0.000 NA   NA
 565999 566000 PMM0650 PMM0651     TRUE 0.815 -28.000 0.538 NA   NA
 566000 566001 PMM0651 PMM0652     FALSE 0.009 191.000 0.000 NA   NA
 566001 5163194 PMM0652       FALSE 0.156 57.000 0.000 NA   NA
 5163194 1203606         FALSE 0.193 34.000 0.000 NA   NA
 1203606 566002   PMM0653   gloA FALSE 0.223 3.000 0.000 NA   NA
 566004 566005 PMM0655 PMM0656     TRUE 0.769 30.000 0.500 NA   NA
 566005 1203538 PMM0656       FALSE 0.095 201.000 0.571 NA   NA
 5163161 1203608         FALSE 0.162 53.000 0.000 NA   NA
 1203608 566006   PMM0657     TRUE 0.669 30.000 0.333 NA   NA
 566006 566007 PMM0657 PMM0658   rsuA FALSE 0.004 309.000 0.000 NA   NA
 1203610 1203539         FALSE 0.006 232.000 0.000 NA   NA
 5163195 1203611         FALSE 0.034 116.000 0.000 NA   NA
 566010 566011 PMM0660 PMM0661   nrdJ FALSE 0.282 80.000 0.132 NA   NA
 566012 566013 PMM0662 PMM0663   prfC FALSE 0.453 30.000 0.021 1.000 N NA
 566013 566014 PMM0663 PMM0664 prfC   FALSE 0.390 52.000 0.012 1.000   NA
 566015 566016 PMM0665 PMM0666 hsp33   FALSE 0.421 -10.000 0.009 1.000 N NA
 566017 566018 PMM0667 PMM0668     TRUE 0.835 10.000 0.388 NA   NA
 566018 566019 PMM0668 PMM0669     FALSE 0.513 5.000 0.095 NA   NA
 566020 566021 PMM0670 PMM0671 tesA   TRUE 0.570 51.000 0.264 1.000 N NA
 566021 566022 PMM0671 PMM0672     TRUE 0.954 5.000 0.696 1.000 Y NA
 566022 566023 PMM0672 PMM0673     TRUE 0.939 -3.000 0.690 1.000 Y NA
 566023 566024 PMM0673 PMM0674   aspC TRUE 0.617 1.000 0.238 1.000 N NA
 566025 566026 PMM0675 PMM0676   gcpE FALSE 0.415 34.000 0.022 1.000 N NA
 566026 566027 PMM0676 PMM0677 gcpE   FALSE 0.154 102.000 0.026 1.000 N NA
 566033 5163220 PMM0683   purK   FALSE 0.277 23.000 0.000 NA   NA
 5163220 566034   PMM0684     FALSE 0.168 46.000 0.000 NA   NA
 1203612 566035   PMM0685     FALSE 0.202 0.000 0.000 NA   NA
 566035 1203613 PMM0685       FALSE 0.140 62.000 0.000 NA   NA
 1203614 1203615         FALSE 0.007 217.000 0.000 NA   NA
 1203615 566037   PMM0687     FALSE 0.038 113.000 0.000 NA   NA
 1203617 1203618         TRUE 0.555 69.000 0.400 NA   NA
 1203618 566038   PMM0688     FALSE 0.108 77.000 0.000 NA   NA
 1203619 1203620         FALSE 0.047 106.000 0.000 NA   NA
 1203620 5163200         FALSE 0.023 134.000 0.000 NA   NA
 5163163 1294212         FALSE 0.134 65.000 0.000 NA   NA
 566039 566040 PMM0689 PMM0690 hli22 hli21 FALSE 0.262 5.000 0.000 NA   NA
 566040 1203621 PMM0690   hli21   FALSE 0.012 170.000 0.000 NA   NA
 1203621 1203622         TRUE 0.675 83.000 0.833 NA   NA
 1203622 566041   PMM0691     FALSE 0.029 194.000 0.128 NA   NA
 566041 566042 PMM0691 PMM0692     FALSE 0.017 221.000 0.077 NA   NA
 566042 1203623 PMM0692       TRUE 0.702 -3.000 0.400 NA   NA
 1203623 1203624         TRUE 0.637 49.000 0.400 NA   NA
 1203624 566043   PMM0693     TRUE 0.616 4.000 0.222 NA   NA
 566044 5163164 PMM0694       FALSE 0.036 114.000 0.000 NA   NA
 566045 566046 PMM0695 PMM0696     FALSE 0.005 267.000 0.000 NA   NA
 566046 566047 PMM0696 PMM0697     TRUE 0.839 0.000 0.857 NA   NA
 566047 1203625 PMM0697       FALSE 0.502 100.000 0.714 NA   NA
 1203625 566048   PMM0698     TRUE 0.845 23.000 0.625 NA   NA
 566048 1203626 PMM0698       FALSE 0.004 317.000 0.000 NA   NA
 5163201 566049   PMM0699     FALSE 0.005 251.000 0.000 NA   NA
 566049 566050 PMM0699 PMM0700     TRUE 0.763 15.000 0.250 NA   NA
 1203627 566051   PMM0701     FALSE 0.539 99.000 0.800 NA   NA
 566052 1203628 PMM0702       FALSE 0.440 92.000 0.444 NA   NA
 1203628 566053   PMM0703     FALSE 0.353 117.000 0.714 NA   NA
 566053 1203540 PMM0703       TRUE 0.608 86.000 0.714 NA   NA
 1203540 566054   PMM0704     FALSE 0.027 182.000 0.065 NA   NA
 566054 566055 PMM0704 PMM0705   phoB FALSE 0.007 287.000 0.000 1.000 N NA
 566055 566056 PMM0705 PMM0706 phoB phoR TRUE 0.859 -3.000 0.099 1.000 Y NA
 566057 566058 PMM0707 PMM0708   phoA FALSE 0.108 77.000 0.000 NA   NA
 566058 566059 PMM0708 PMM0709 phoA phoE FALSE 0.031 162.000 0.000 1.000   NA
 566061 566062 PMM0711 PMM0712 chrA mfs FALSE 0.400 31.000 0.030 NA   NA
 566062 566063 PMM0712 PMM0713 mfs gap1 TRUE 0.906 12.000 0.689 NA   NA
 566066 566067 PMM0716 PMM0717 arsA   FALSE 0.079 89.000 0.000 NA   NA
 566068 566069 PMM0718 PMM0719 ptrA   FALSE 0.163 51.000 0.000 NA   NA
 566069 1362703 PMM0719     pseudo FALSE 0.223 3.000 0.000 NA   NA
 1203629 566070   PMM0720     FALSE 0.014 162.000 0.000 NA   NA
 566073 566074 PMM0723 PMM0724 pstC pstA TRUE 0.988 7.000 0.541 0.003 Y NA
 566074 566075 PMM0724 PMM0725 pstA pstB TRUE 0.985 2.000 0.952 0.003 Y NA
 566075 1203631 PMM0725   pstB   FALSE 0.003 392.000 0.000 NA   NA
 566076 566077 PMM0726 PMM0727     FALSE 0.006 221.000 0.000 NA   NA
 566077 566078 PMM0727 PMM0728     TRUE 0.776 1.000 0.460 1.000   NA
 566078 566079 PMM0728 PMM0729     TRUE 0.632 0.000 0.214 1.000   NA
 566079 566080 PMM0729 PMM0730     TRUE 0.835 -3.000 0.751 1.000 N NA
 566080 566081 PMM0730 PMM0731     FALSE 0.379 37.000 0.035 NA   NA
 566081 566082 PMM0731 PMM0732     FALSE 0.489 85.000 0.429 NA   NA
 566082 566083 PMM0732 PMM0733     FALSE 0.176 96.000 0.098 NA   NA
 566083 566084 PMM0733 PMM0734     FALSE 0.052 144.000 0.082 NA   NA
 566085 1203632 PMM0735       FALSE 0.123 69.000 0.000 NA   NA
 1203632 1203541         FALSE 0.106 78.000 0.000 NA   NA
 1203634 566086   PMM0736     TRUE 0.842 10.000 0.400 NA   NA
 566086 1203635 PMM0736       TRUE 0.716 49.000 0.556 NA   NA
 1203635 566087   PMM0737     TRUE 0.581 82.000 0.556 NA   NA
 1203636 566089   PMM0739     FALSE 0.393 42.000 0.098 NA   NA
 566090 1294195 PMM0740   petN   FALSE 0.485 -49.000 0.061 NA   NA
 566095 566096 PMM0745 PMM0746     TRUE 0.916 -3.000 0.352 0.005   NA
 566097 566098 PMM0747 PMM0748 pcyA   TRUE 0.734 -3.000 0.455 NA   NA
 566098 566099 PMM0748 PMM0749     TRUE 0.809 -3.000 0.769 NA N NA
 566099 566100 PMM0749 PMM0750     TRUE 0.973 15.000 0.769 1.000 Y NA
 566100 566101 PMM0750 PMM0751     TRUE 0.875 23.000 0.800 NA   NA
 566101 566102 PMM0751 PMM0752     FALSE 0.494 56.000 0.234 NA   NA
 566102 566103 PMM0752 PMM0753   rpsB FALSE 0.033 151.000 0.017 NA   NA
 566103 566104 PMM0753 PMM0754 rpsB tsf TRUE 0.810 45.000 0.748 1.000   NA
 566104 566105 PMM0754 PMM0755 tsf   FALSE 0.407 6.000 0.008 NA   NA
 566105 566106 PMM0755 PMM0756   recG FALSE 0.351 30.000 0.016 NA   NA
 566106 566107 PMM0756 PMM0757 recG ddpX FALSE 0.371 59.000 0.036 1.000 N NA
 566111 566112 PMM0761 PMM0762   typA FALSE 0.113 113.000 0.011 1.000   NA
 566112 566113 PMM0762 PMM0763 typA   FALSE 0.502 7.000 0.019 NA   NA
 566113 566114 PMM0763 PMM0764     FALSE 0.356 -10.000 0.011 NA   NA
 566114 566115 PMM0764 PMM0765   ccmC FALSE 0.107 113.000 0.008 1.000   NA
 566117 566118 PMM0767 PMM0768 glpX hemA TRUE 0.615 18.000 0.038 1.000 N NA
 566118 566119 PMM0768 PMM0769 hemA glgC FALSE 0.062 139.000 0.027 1.000 N NA
 566119 566120 PMM0769 PMM0770 glgC gnd TRUE 0.581 99.000 0.042 1.000 Y NA
 566120 566121 PMM0770 PMM0771 gnd   TRUE 0.963 -12.000 0.046 0.003 Y NA
 566121 566122 PMM0771 PMM0772     TRUE 0.642 31.000 0.321 NA   NA
 566122 566123 PMM0772 PMM0773     TRUE 0.707 -10.000 0.358 NA   NA
 566124 566125 PMM0774 PMM0775 ilvD   TRUE 0.601 24.000 0.165 NA   NA
 566125 566126 PMM0775 PMM0776   upp FALSE 0.394 30.000 0.023 NA   NA
 566127 566128 PMM0777 PMM0778   cobW TRUE 0.614 10.000 0.033 NA   NA
 566128 1203637 PMM0778   cobW   FALSE 0.165 49.000 0.000 NA   NA
 1203637 566129   PMM0779   purS FALSE 0.120 102.000 0.000 1.000   NA
 566129 566130 PMM0779 PMM0780 purS purQ TRUE 0.980 1.000 0.656 0.002 Y NA
 566131 566132 PMM0781 PMM0782 cbbA   FALSE 0.104 143.000 0.169 1.000   NA
 566132 566133 PMM0782 PMM0783     FALSE 0.426 0.000 0.092 NA   NA
 566133 566134 PMM0783 PMM0784   accD FALSE 0.374 5.000 0.009 NA   NA
 566134 566135 PMM0784 PMM0785 accD prkB FALSE 0.024 184.000 0.010 1.000 N NA
 566135 566136 PMM0785 PMM0786 prkB leuB TRUE 0.644 90.000 0.074 1.000 Y NA
 566136 566137 PMM0786 PMM0787 leuB lpxD FALSE 0.500 29.000 0.052 1.000 N NA
 566137 566138 PMM0787 PMM0788 lpxD proB TRUE 0.652 15.000 0.029 1.000 N NA
 566138 566139 PMM0788 PMM0789 proB   FALSE 0.288 -3.000 0.005 NA   NA
 566139 566140 PMM0789 PMM0790     FALSE 0.485 5.000 0.041 NA   NA
 566140 566141 PMM0790 PMM0791     FALSE 0.391 34.000 0.038 NA   NA
 566141 566142 PMM0791 PMM0792     FALSE 0.412 -3.000 0.042 NA   NA
 566142 566143 PMM0792 PMM0793     TRUE 0.736 1.000 0.467 NA   NA
 566143 566144 PMM0793 PMM0794     FALSE 0.541 24.000 0.111 NA   NA
 566144 566145 PMM0794 PMM0795     TRUE 0.665 15.000 0.131 NA   NA
 566145 566146 PMM0795 PMM0796   hisA FALSE 0.170 80.000 0.011 NA   NA
 566150 566151 PMM0800 PMM0801   ycf39 TRUE 0.675 25.000 0.256 NA   NA
 566151 566152 PMM0801 PMM0802 ycf39 nth FALSE 0.355 36.000 0.010 1.000 N NA
 566155 566156 PMM0805 PMM0806     TRUE 0.778 8.000 0.294 NA   NA
 566157 566158 PMM0807 PMM0808     FALSE 0.203 107.000 0.143 1.000   NA
 1294186 566160   PMM0810     FALSE 0.003 401.000 0.000 NA   NA
 566161 566162 PMM0811 PMM0812     FALSE 0.431 117.000 1.000 NA   NA
 566163 566164 PMM0813 PMM0814     FALSE 0.007 211.000 0.000 NA   NA
 566164 1203640 PMM0814       FALSE 0.004 288.000 0.000 NA   NA
 1203542 566165   PMM0815   hli19 FALSE 0.491 99.000 0.667 NA   NA
 566165 566166 PMM0815 PMM0816 hli19 hli18 FALSE 0.207 31.000 0.000 NA   NA
 566166 566167 PMM0816 PMM0817 hli18 hli17 FALSE 0.202 0.000 0.000 NA   NA
 566167 566168 PMM0817 PMM0818 hli17 hli16 FALSE 0.202 0.000 0.000 NA   NA
 566168 1203543 PMM0818   hli16   FALSE 0.004 377.000 0.000 NA   NA
 1203543 1203641         FALSE 0.257 -25.000 0.000 NA   NA
 1203641 566169   PMM0819     TRUE 0.702 -3.000 0.400 NA   NA
 566169 566170 PMM0819 PMM0820     FALSE 0.143 60.000 0.000 NA   NA
 566170 566171 PMM0820 RNA_27   tRNAArg4 FALSE 0.002 1375.000 0.000 NA   NA
 566171 566172 RNA_27 PMM0821 tRNAArg4 ansA FALSE 0.168 46.000 0.000 NA   NA
 566172 566173 PMM0821 PMM0822 ansA K8K14.9 TRUE 0.836 2.000 0.810 NA   NA
 566173 566174 PMM0822 PMM0823 K8K14.9   TRUE 0.613 10.000 0.033 NA   NA
 566174 566175 PMM0823 PMM0824     FALSE 0.404 -10.000 0.021 NA   NA
 566177 566178 PMM0826 PMM0827     FALSE 0.416 -3.000 0.037 NA   NA
 566179 566180 PMM0828 PMM0829   tpi FALSE 0.296 85.000 0.042 1.000   NA
 566180 566181 PMM0829 PMM0830 tpi folP FALSE 0.532 -16.000 0.039 1.000 N NA
 566183 566184 PMM0832 PMM0833 dapB   FALSE 0.386 1.000 0.027 NA   NA
 566184 566185 PMM0833 PMM0834   ubiH TRUE 0.648 22.000 0.200 NA   NA
 566185 566186 PMM0834 PMM0835 ubiH   TRUE 0.825 6.000 0.485 NA   NA
 566186 566187 PMM0835 PMM0836     FALSE 0.482 38.000 0.171 NA   NA
 566187 566188 PMM0836 PMM0837     TRUE 0.665 2.000 0.343 NA   NA
 566188 566189 PMM0837 PMM0838     TRUE 0.628 68.000 0.500 NA   NA
 1203544 566190   PMM0839   mfd FALSE 0.172 74.000 0.006 NA   NA
 566192 566193 PMM0841 PMM0842 fmt pmbA FALSE 0.348 -3.000 0.018 NA   NA
 566193 566194 PMM0842 PMM0843 pmbA tldD FALSE 0.515 3.000 0.146 NA   NA
 566194 566195 PMM0843 PMM0844 tldD PNIL34,AT103 FALSE 0.376 38.000 0.034 NA   NA
 566195 566196 PMM0844 PMM0845 PNIL34,AT103   FALSE 0.309 84.000 0.181 NA   NA
 566196 566197 PMM0845 PMM0846     FALSE 0.238 77.000 0.051 NA   NA
 566197 566198 PMM0846 PMM0847   vacB FALSE 0.301 63.000 0.073 NA   NA
 566198 566199 PMM0847 PMM0848 vacB   TRUE 0.620 74.000 0.439 1.000   NA
 566199 566200 PMM0848 PMM0849     TRUE 0.837 2.000 0.065 0.053   NA
 566200 566201 PMM0849 PMM0850     FALSE 0.210 -3.000 0.000 NA   NA
 1203545 566202   PMM0851     TRUE 0.579 22.000 0.018 1.000   NA
 566202 566203 PMM0851 PMM0852     FALSE 0.420 2.000 0.035 NA   NA
 566205 566206 PMM0854 PMM0855 ftsH4   FALSE 0.493 35.000 0.172 NA   NA
 1203642 1203643         FALSE 0.152 58.000 0.000 NA   NA
 566208 1203546 PMM0857       TRUE 0.707 63.000 0.667 NA   NA
 1203644 1294193         TRUE 0.555 69.000 0.400 NA   NA
 1203645 1203646         FALSE 0.006 241.000 0.000 NA   NA
 566209 1203547 PMM0858       FALSE 0.005 257.000 0.000 NA   NA
 1203547 1294175         TRUE 0.778 -3.000 0.571 NA   NA
 1294175 566210   PMM0859     FALSE 0.202 0.000 0.000 NA   NA
 566210 1203548 PMM0859       FALSE 0.007 219.000 0.000 NA   NA
 1203548 1203647         FALSE 0.007 213.000 0.000 NA   NA
 1203647 1203648         FALSE 0.013 167.000 0.000 NA   NA
 566213 1203649 PMM0861       FALSE 0.143 60.000 0.000 NA   NA
 566214 566215 RNA_26 PMM0862 tRNAThr2 cspR FALSE 0.003 515.000 0.000 NA   NA
 566215 566216 PMM0862 PMM0863 cspR cobU FALSE 0.519 4.000 0.039 1.000 N NA
 566216 566217 PMM0863 PMM0864 cobU   FALSE 0.548 10.000 0.019 NA   NA
 566219 566220 PMM0866 PMM0867   metG FALSE 0.044 131.000 0.013 NA   NA
 566220 566221 PMM0867 PMM0868 metG   FALSE 0.358 60.000 0.013 1.000   NA
 566221 566222 PMM0868 PMM0869   rpsR FALSE 0.467 40.000 0.027 1.000   NA
 566222 566223 PMM0869 PMM0870 rpsR rpmG TRUE 0.924 9.000 0.037 0.027   NA
 566224 566225 PMM0871 PMM0872 pheT   FALSE 0.071 106.000 0.005 NA   NA
 566227 566228 PMM0874 PMM0875 apa2   FALSE 0.325 58.000 0.035 NA   NA
 566230 566231 PMM0877 PMM0878 metH ilvE TRUE 0.888 25.000 0.036 1.000 Y NA
 566233 566234 PMM0880 PMM0881     FALSE 0.434 -7.000 0.044 NA   NA
 566234 566235 PMM0881 PMM0882   uvrC FALSE 0.234 56.000 0.008 NA   NA
 566235 566236 PMM0882 PMM0883 uvrC   TRUE 0.668 10.000 0.015 1.000   NA
 566238 566239 PMM0885 PMM0886 dacB, pbp   FALSE 0.022 261.000 0.195 NA   NA
 566239 566240 PMM0886 PMM0887   nifS TRUE 0.637 0.000 0.324 NA   NA
 566240 566241 PMM0887 PMM0888 nifS dapF TRUE 0.841 1.000 0.021 1.000 Y NA
 566247 566248 PMM0894 PMM0895     FALSE 0.373 37.000 0.045 NA   NA
 566248 566249 PMM0895 PMM0896   dnaJ2 TRUE 0.727 35.000 0.488 NA   NA
 566249 566250 PMM0896 PMM0897 dnaJ2 dnaK TRUE 0.979 -16.000 0.488 0.007 Y NA
 566250 566251 PMM0897 RNA_25 dnaK tRNAThr1 FALSE 0.006 227.000 0.000 NA   NA
 566252 566253 PMM0898 PMM0899 petF suhB TRUE 0.584 6.000 0.042 1.000 N NA
 566253 566254 PMM0899 PMM0900 suhB hisZ TRUE 0.570 22.000 0.032 1.000 N NA
 566254 566255 PMM0900 PMM0901 hisZ htpG FALSE 0.197 150.000 0.008 0.099 N NA
 566255 566256 PMM0901 PMM0902 htpG rpmB FALSE 0.375 40.000 0.019 1.000 N NA
 566256 566257 PMM0902 PMM0903 rpmB   FALSE 0.528 6.000 0.018 1.000 N NA
 566257 566258 PMM0903 PMM0904     TRUE 0.642 6.000 0.180 NA   NA
 566258 566259 PMM0904 PMM0905     TRUE 0.808 -7.000 0.625 NA   NA
 566259 566260 PMM0905 PMM0906   psaK FALSE 0.542 65.000 0.357 NA   NA
 566262 566263 PMM0908 PMM0909 ilvA   FALSE 0.158 82.000 0.028 NA N NA
 566263 566264 PMM0909 PMM0910     FALSE 0.388 32.000 0.029 NA   NA
 566266 566267 PMM0912 PMM0913 pykF salY TRUE 0.784 -7.000 0.476 1.000 N NA
 566267 566268 PMM0913 PMM0914 salY   TRUE 0.673 15.000 0.140 NA   NA
 566268 566269 PMM0914 PMM0915   lspA TRUE 0.770 -3.000 0.554 NA   NA
 566269 566270 PMM0915 PMM0916 lspA   TRUE 0.603 3.000 0.138 1.000   NA
 566274 566275 PMM0920 PMM0921 glnA   FALSE 0.118 109.000 0.022 1.000 N NA
 566275 566276 PMM0921 PMM0922     TRUE 0.594 21.000 0.137 NA   NA
 566277 566278 PMM0923 PMM0924 rsbW   FALSE 0.470 50.000 0.194 NA   NA
 566279 566280 PMM0925 PMM0926   psb28 FALSE 0.337 56.000 0.077 NA   NA
 566280 566281 PMM0926 PMM0927 psb28   TRUE 0.868 15.000 0.488 NA   NA
 1362704 566282   PMM0928 pseudo secF FALSE 0.319 18.000 0.000 NA   NA
 566282 566283 PMM0928 PMM0929 secF secD TRUE 0.984 26.000 0.516 0.001 Y NA
 566283 566284 PMM0929 PMM0930 secD pdhB FALSE 0.537 4.000 0.091 1.000 N NA
 566284 566285 PMM0930 PMM0931 pdhB   FALSE 0.024 184.000 0.024 NA   NA
 566285 566286 PMM0931 PMM0932   ispE TRUE 0.818 22.000 0.488 NA   NA
 566286 566287 PMM0932 PMM0933 ispE ksgA FALSE 0.414 2.000 0.016 1.000 N NA
 566288 566289 PMM0934 PMM0935     FALSE 0.404 21.000 0.008 NA   NA
 566289 566290 PMM0935 PMM0936   umuD FALSE 0.052 121.000 0.011 NA   NA
 566290 566291 PMM0936 PMM0937 umuD umuC TRUE 0.808 -3.000 0.625 1.000 N NA
 566291 566292 PMM0937 PMM0938 umuC   TRUE 0.779 10.000 0.267 NA   NA
 566294 566295 PMM0940 PMM0941     TRUE 0.737 15.000 0.113 1.000   NA
 566295 566296 PMM0941 PMM0942   ruvA FALSE 0.452 1.000 0.010 1.000   NA
 566296 566297 PMM0942 PMM0943 ruvA rpsO FALSE 0.362 52.000 0.021 1.000 N NA
 566297 566298 PMM0943 PMM0944 rpsO   TRUE 0.616 10.000 0.037 NA   NA
 566299 566300 PMM0945 PMM0946 dnaE gatA FALSE 0.241 79.000 0.019 1.000 N NA
 566300 566301 PMM0946 PMM0947 gatA   FALSE 0.357 33.000 0.022 NA   NA
 566301 566302 PMM0947 PMM0948     FALSE 0.123 104.000 0.031 NA   NA
 566302 566303 PMM0948 PMM0949     TRUE 0.945 13.000 0.150 0.007   NA
 566303 566304 PMM0949 PMM0950     TRUE 0.563 -3.000 0.113 1.000   NA
 566304 566305 PMM0950 PMM0951   carA FALSE 0.383 40.000 0.020 1.000 N NA
 566305 566306 PMM0951 PMM0952 carA   TRUE 0.926 13.000 0.021 1.000 Y NA
 566306 566307 PMM0952 PMM0953     FALSE 0.347 30.000 0.014 NA   NA
 566308 566309 PMM0954 PMM0955   msrA FALSE 0.406 32.000 0.019 1.000 N NA
 566309 566310 PMM0955 RNA_7 msrA tRNALeu1 FALSE 0.243 28.000 0.000 NA   NA
 1294172 1203653         TRUE 0.769 30.000 0.500 NA   NA
 1203653 566313   PMM0958     FALSE 0.291 79.000 0.136 NA   NA
 566313 566314 PMM0958 PMM0959     FALSE 0.317 79.000 0.162 NA   NA
 566314 566315 PMM0959 PMM0960     FALSE 0.525 -3.000 0.050 1.000   NA
 566315 566316 PMM0960 PMM0961     TRUE 0.619 4.000 0.126 1.000   NA
 566318 566319 PMM0963 PMM0964 ureC ureB TRUE 0.985 6.000 0.486 0.002 Y NA
 566319 566320 PMM0964 PMM0965 ureB ureA TRUE 0.981 3.000 0.595 0.002 Y NA
 566320 566321 PMM0965 PMM0966 ureA ureD TRUE 0.907 61.000 0.664 0.005 N NA
 566322 566323 PMM0967 PMM0968 ureE ureF TRUE 0.981 -22.000 0.560 0.005 Y NA
 566323 566324 PMM0968 PMM0969 ureF ureG TRUE 0.979 4.000 0.550 0.005 Y NA
 566324 566325 PMM0969 PMM0970 ureG urtA FALSE 0.094 105.000 0.079 NA N NA
 566325 566326 PMM0970 PMM0971 urtA urtB TRUE 0.791 82.000 0.429 NA Y NA
 566326 566327 PMM0971 PMM0972 urtB urtC TRUE 0.981 0.000 0.888 0.011 Y NA
 566327 566328 PMM0972 PMM0973 urtC urtD TRUE 0.607 -7.000 0.137 1.000   NA
 566328 566329 PMM0973 PMM0974 urtD urtE TRUE 0.880 3.000 0.126 0.016   NA
 1294171 1203654         FALSE 0.277 126.000 0.600 NA   NA
 1203654 1203655         TRUE 0.812 13.000 0.333 NA   NA
 1203656 566330   PMM0975     TRUE 0.745 63.000 0.800 NA   NA
 566330 566331 PMM0975 PMM0976     FALSE 0.203 85.000 0.055 NA   NA
 566331 566332 PMM0976 PMM0977     TRUE 0.790 1.000 0.648 NA   NA
 566332 566333 PMM0977 PMM0978     TRUE 0.588 -3.000 0.239 NA   NA
 566334 566335 PMM0979 PMM0980     TRUE 0.830 -24.000 0.625 NA   NA
 566335 566336 PMM0980 PMM0981     FALSE 0.003 489.000 0.000 NA   NA
 1294197 566338   PMM0983     TRUE 0.902 11.000 0.667 NA   NA
 1203657 1203658         FALSE 0.189 35.000 0.000 NA   NA
 1203658 566339   PMM0984     FALSE 0.006 224.000 0.000 NA   NA
 566339 1203659 PMM0984       TRUE 0.680 76.000 0.750 NA   NA
 1203659 566340   PMM0985     TRUE 0.674 2.000 0.357 NA   NA
 566340 566341 PMM0985 PMM0986     TRUE 0.772 -3.000 0.556 NA   NA
 566341 566342 PMM0986 PMM0987   rpsU FALSE 0.316 90.000 0.250 NA   NA
 566345 566346 PMM0990 PMM0991     FALSE 0.523 6.000 0.043 NA   NA
 566346 1203660 PMM0991       FALSE 0.208 142.000 0.571 NA   NA
 566349 566350 PMM0994 PMM0995     TRUE 0.728 17.000 0.238 NA   NA
 566350 1294190 PMM0995       TRUE 0.594 94.000 0.833 NA   NA
 1294190 566351   PMM0996     TRUE 0.626 89.000 0.833 NA   NA
 566351 1203661 PMM0996       TRUE 0.802 26.000 0.500 NA   NA
 1203661 1203549         TRUE 0.623 69.000 0.500 NA   NA
 566352 1203550 PMM0997       FALSE 0.289 106.000 0.375 NA   NA
 566353 566354 PMM0998 PMM0999     FALSE 0.177 109.000 0.207 NA   NA
 566354 566355 PMM0999 PMM1000     TRUE 0.598 44.000 0.333 NA   NA
 566355 566356 PMM1000 PMM1001     FALSE 0.061 145.000 0.128 NA   NA
 566356 1203551 PMM1001       FALSE 0.013 266.000 0.077 NA   NA
 1203551 566357   PMM1002   pepN FALSE 0.206 71.000 0.015 NA   NA
 1203663 566359   PMM1004   purT FALSE 0.238 79.000 0.038 NA   NA
 566359 566360 PMM1004 PMM1005 purT   FALSE 0.552 18.000 0.032 NA   NA
 566362 566363 PMM1007 PMM1008     FALSE 0.165 49.000 0.000 NA   NA
 566364 566365 PMM1009 PMM1010     FALSE 0.411 19.000 0.006 NA   NA
 1203552 566366   PMM1011     TRUE 0.771 45.000 0.714 NA   NA
 566366 1203664 PMM1011       FALSE 0.468 98.000 0.571 NA   NA
 566367 1203665 PMM1012       FALSE 0.404 55.000 0.140 NA   NA
 1203665 566368   PMM1013     TRUE 0.767 40.000 0.667 NA   NA
 566368 566369 PMM1013 PMM1014     FALSE 0.535 18.000 0.027 NA   NA
 1203666 566371   PMM1016     FALSE 0.338 126.000 0.800 NA   NA
 566373 1294208 PMM1018       FALSE 0.113 167.000 0.444 NA   NA
 1203668 1203669 PMM1018a       FALSE 0.073 92.000 0.000 NA   NA
 1203669 566374   PMM1019     FALSE 0.071 93.000 0.000 NA   NA
 566374 1203670 PMM1019       FALSE 0.171 125.000 0.333 NA   NA
 566375 566376 PMM1020 PMM1021     FALSE 0.079 89.000 0.000 NA   NA
 566376 566377 PMM1021 PMM1022     FALSE 0.053 103.000 0.000 NA   NA
 1362705 1203553     pseudo   FALSE 0.055 102.000 0.000 NA   NA
 1294214 566378   PMM1023     FALSE 0.004 282.000 0.000 NA   NA
 566378 566379 PMM1023 PMM1024     FALSE 0.241 4.000 0.000 NA   NA
 566379 566380 PMM1024 PMM1025     FALSE 0.353 8.000 0.000 NA   NA
 566380 1203673 PMM1025       FALSE 0.176 42.000 0.000 NA   NA
 1203674 1362706       pseudo FALSE 0.027 126.000 0.000 NA   NA
 1362706 566381   PMM1026 pseudo   FALSE 0.008 196.000 0.000 NA   NA
 5163222 5163202         FALSE 0.036 114.000 0.000 NA   NA
 1203675 1203676         FALSE 0.014 160.000 0.000 NA   NA
 1203676 566383   PMM1028     TRUE 0.842 10.000 0.400 NA   NA
 566383 1203677 PMM1028       TRUE 0.629 94.000 1.000 NA   NA
 566387 566388 PMM1032 PMM1033 lraI   FALSE 0.383 87.000 0.214 1.000   NA
 566388 566389 PMM1033 PMM1034     TRUE 0.763 -12.000 0.357 1.000   NA
 5163167 1203680         FALSE 0.012 168.000 0.000 NA   NA
 1203680 566390   PMM1035     FALSE 0.025 129.000 0.000 NA   NA
 566391 566392 PMM1036 PMM1037     TRUE 0.666 -9.000 0.308 NA   NA
 566393 566394 PMM1038 PMM1039     TRUE 0.835 2.000 0.805 NA   NA
 566394 566395 PMM1039 PMM1040     FALSE 0.419 -3.000 0.075 NA   NA
 566395 566396 PMM1040 PMM1041     FALSE 0.343 87.000 0.256 NA   NA
 566396 566397 PMM1041 PMM1042     FALSE 0.343 84.000 0.222 NA   NA
 566398 1203681 PMM1043       TRUE 0.813 -3.000 0.714 NA   NA
 1203681 566399   PMM1044   rbsK TRUE 0.654 13.000 0.109 NA   NA
 566403 566404 PMM1048 PMM1049 dppB ddpA TRUE 0.965 -7.000 0.267 0.011 Y NA
 566404 566405 PMM1049 PMM1050 ddpA   TRUE 0.572 22.000 0.125 NA   NA
 566405 566406 PMM1050 PMM1051   thrA FALSE 0.343 63.000 0.119 NA   NA
 566406 566407 PMM1051 PMM1052 thrA   FALSE 0.498 36.000 0.180 NA   NA
 566407 566408 PMM1052 PMM1053     FALSE 0.269 38.000 0.008 NA   NA
 566408 566409 PMM1053 PMM1054   ruvC TRUE 0.608 10.000 0.016 1.000 N NA
 566409 566410 PMM1054 PMM1055 ruvC chlI FALSE 0.525 5.000 0.026 1.000 N NA
 566410 566411 PMM1055 PMM1056 chlI lasT FALSE 0.011 264.000 0.007 1.000 N NA
 566411 566412 PMM1056 PMM1057 lasT cytM TRUE 0.639 6.000 0.041 1.000   NA
 566414 566415 PMM1059 PMM1060     TRUE 0.605 16.000 0.021 1.000 N NA
 566415 566416 PMM1060 PMM1061   trxA TRUE 0.717 10.000 0.069 1.000   NA
 566416 5163223 PMM1061   trxA   FALSE 0.064 97.000 0.000 NA   NA
 5163223 566417   PMM1062   guaB FALSE 0.147 59.000 0.000 NA   NA
 566418 566419 PMM1063 PMM1064 gyrA crtL1 FALSE 0.487 25.000 0.017 1.000 N NA
 566421 566422 PMM1066 PMM1067 leuA   FALSE 0.117 91.000 0.008 NA   NA
 566424 566425 PMM1069 PMM1070 folD ispA TRUE 0.871 38.000 0.250 1.000 Y NA
 566425 566426 PMM1070 PMM1071 ispA   TRUE 0.737 15.000 0.214 NA   NA
 566427 566428 PMM1072 PMM1073 cobB   TRUE 0.661 11.000 0.167 NA N NA
 566428 566429 PMM1073 PMM1074   zwf TRUE 0.960 8.000 0.583 NA Y NA
 566429 566430 PMM1074 PMM1075 zwf petH FALSE 0.154 114.000 0.117 1.000   NA
 566432 566433 RNA_24 PMM1077 tRNAGly2   FALSE 0.176 42.000 0.000 NA   NA
 566434 566435 PMM1078 PMM1079     TRUE 0.740 69.000 0.850 NA   NA
 566438 566439 PMM1082 PMM1083     FALSE 0.092 110.000 0.000 1.000   NA
 566440 566441 PMM1084 PMM1085 cad cdsA TRUE 0.680 10.000 0.019 1.000   NA
 566442 566443 PMM1086 PMM1087 todF gldA TRUE 0.761 6.000 0.250 1.000   NA
 566443 566444 PMM1087 PMM1088 gldA clpC TRUE 0.781 15.000 0.237 1.000 N NA
 566444 566445 PMM1088 PMM1089 clpC   FALSE 0.041 186.000 0.032 1.000   NA
 566446 566447 PMM1090 PMM1091 lysA   FALSE 0.448 29.000 0.040 NA   NA
 566447 566448 PMM1091 PMM1092   uppS FALSE 0.455 4.000 0.043 NA   NA
 566448 566449 PMM1092 PMM1093 uppS BioB FALSE 0.460 -7.000 0.021 1.000 N NA
 566449 566450 PMM1093 PMM1094 BioB   FALSE 0.382 -3.000 0.024 NA   NA
 566450 566451 PMM1094 PMM1095   F2J10.13 FALSE 0.408 1.000 0.034 NA   NA
 566452 566453 PMM1096 PMM1097   recR FALSE 0.452 3.000 0.021 1.000 N NA
 566455 566456 PMM1099 PMM1100     TRUE 0.632 11.000 0.083 NA   NA
 566456 566457 PMM1100 PMM1101   srmB FALSE 0.518 10.000 0.011 NA   NA
 566457 566458 PMM1101 PMM1102 srmB recD FALSE 0.255 138.000 0.017 0.092   NA
 566458 566459 PMM1102 PMM1103 recD recB TRUE 0.899 2.000 0.120 0.002   NA
 566459 566460 PMM1103 PMM1104 recB   TRUE 0.694 13.000 0.096 1.000 N NA
 566460 566461 PMM1104 PMM1105   recC TRUE 0.674 11.000 0.034 1.000 N NA
 566461 566462 PMM1105 PMM1106 recC   FALSE 0.490 18.000 0.019 NA   NA
 566462 566463 PMM1106 PMM1107   pdxJ TRUE 0.609 10.000 0.046 NA   NA
 566464 566465 PMM1108 PMM1109     TRUE 0.772 0.000 0.459 1.000   NA
 566465 566466 PMM1109 PMM1110     TRUE 0.637 10.000 0.092 NA   NA
 566466 566467 PMM1110 PMM1111     TRUE 0.564 4.000 0.220 NA N NA
 566470 566471 PMM1114 PMM1115   crtH TRUE 0.644 13.000 0.096 NA   NA
 566471 566472 PMM1115 PMM1116 crtH gidA FALSE 0.543 -43.000 0.031 1.000 N NA
 566472 566473 PMM1116 PMM1117 gidA psbY TRUE 0.632 7.000 0.018 1.000   NA
 566474 566475 RNA_8 PMM1118 tRNAArg1 hli4 FALSE 0.003 563.000 0.000 NA   NA
 566476 566477 PMM1119 PMM1120 som   TRUE 0.596 96.000 0.750 1.000   NA
 566477 566478 PMM1120 PMM1121   som FALSE 0.307 137.000 0.750 1.000   NA
 566478 5163203 PMM1121   som   FALSE 0.023 134.000 0.000 NA   NA
 5163203 1203684         FALSE 0.003 417.000 0.000 NA   NA
 1203684 566479   PMM1122   apt FALSE 0.003 423.000 0.000 NA   NA
 566481 1203686 PMM1123   hupE   FALSE 0.489 -58.000 0.048 NA   NA
 1203686 566482   PMM1124     FALSE 0.003 629.000 0.000 NA   NA
 566482 566483 PMM1124 PMM1125     FALSE 0.005 249.000 0.000 NA   NA
 566483 566484 PMM1125 PMM1126     FALSE 0.003 560.000 0.000 NA   NA
 566486 1203689 PMM1128   hli15   FALSE 0.003 534.000 0.000 NA   NA
 1203689 566487   PMM1129     FALSE 0.231 -9.000 0.000 NA   NA
 566487 566488 PMM1129 PMM1130     FALSE 0.090 85.000 0.000 NA   NA
 566489 1203690 PMM1131       FALSE 0.083 87.000 0.000 NA   NA
 1203690 1203691         FALSE 0.286 103.000 0.333 NA   NA
 1203691 1203692         TRUE 0.829 8.000 0.400 NA   NA
 566491 1203693 PMM1133       TRUE 0.589 86.000 0.667 NA   NA
 1203693 1203694         TRUE 0.675 83.000 0.833 NA   NA
 566492 566493 PMM1134 PMM1135   hli14 FALSE 0.004 304.000 0.000 NA   NA
 5163205 1203695         FALSE 0.152 58.000 0.000 NA   NA
 1203695 566494   PMM1136     TRUE 0.803 58.000 1.000 NA   NA
 566494 1203696 PMM1136       FALSE 0.223 3.000 0.000 NA   NA
 1203696 566495   PMM1137     FALSE 0.168 46.000 0.000 NA   NA
 1203697 1203698         TRUE 0.867 3.000 1.000 NA   NA
 566497 566498 PMM1139 PMM1140 acrA polA FALSE 0.411 -3.000 0.017 1.000 N NA
 566498 566499 PMM1140 PMM1141 polA cysS FALSE 0.480 25.000 0.014 1.000 N NA
 566499 566500 PMM1141 PMM1142 cysS dxr FALSE 0.130 98.000 0.007 1.000 N NA
 566500 566501 PMM1142 PMM1143 dxr   FALSE 0.333 6.000 0.016 NA N NA
 566502 566503 PMM1144 PMM1145   pntB TRUE 0.764 -13.000 0.354 1.000   NA
 566503 566504 PMM1145 PMM1146 pntB pntA-2 TRUE 0.949 14.000 0.072 0.002   NA
 566504 566505 PMM1146 PMM1147 pntA-2 pntA TRUE 0.980 16.000 0.829 0.002   NA
 566506 566507 PMM1148 PMM1149     FALSE 0.046 156.000 0.105 NA   NA
 566507 566508 PMM1149 PMM1150     FALSE 0.215 57.000 0.003 NA   NA
 566509 1203554 PMM1151   infA   FALSE 0.085 105.000 0.011 NA   NA
 1203554 566510   PMM1152   ycf39 TRUE 0.623 53.000 0.392 NA   NA
 566510 1203699 PMM1152 PMM1152a ycf39   TRUE 0.656 59.000 0.392 1.000   NA
 566511 566512 PMM1153 PMM1154   ilvN FALSE 0.454 4.000 0.065 NA   NA
 566513 566514 PMM1155 PMM1156 ppiA   FALSE 0.131 123.000 0.122 1.000   NA
 566515 566516 PMM1157 PMM1158 psbD psbC TRUE 0.970 -16.000 0.878 0.002   NA
 566518 566519 PMM1160 PMM1161 cobQ   FALSE 0.514 -3.000 0.026 1.000   NA
 1203700 566521   PMM1163     FALSE 0.267 -49.000 0.000 NA   NA
 566521 1294166 PMM1163       FALSE 0.147 59.000 0.000 NA   NA
 1294166 1203555         FALSE 0.210 -3.000 0.000 NA   NA
 1203555 1203701         TRUE 0.699 -69.000 0.286 NA   NA
 566522 566523 RNA_23 PMM1164 tRNATyr1 afuA FALSE 0.162 52.000 0.000 NA   NA
 566523 566524 PMM1164 PMM1165 afuA glyQ FALSE 0.037 133.000 0.000 1.000 N NA
 566524 566525 PMM1165 PMM1166 glyQ   FALSE 0.095 97.000 0.005 NA   NA
 566525 566526 PMM1166 PMM1167     FALSE 0.510 27.000 0.109 NA   NA
 566526 1203702 PMM1167       FALSE 0.452 3.000 0.087 NA   NA
 566527 566528 PMM1168 PMM1169 F4P13.20   FALSE 0.104 110.000 0.072 NA   NA
 566529 566530 PMM1170 PMM1171   isiB FALSE 0.152 58.000 0.000 NA   NA
 566531 566532 PMM1172 PMM1173     FALSE 0.485 0.000 0.147 NA   NA
 566532 566533 PMM1173 PMM1174     FALSE 0.334 96.000 0.333 NA   NA
 566533 566534 PMM1174 PMM1175     FALSE 0.023 202.000 0.105 NA   NA
 566534 566535 PMM1175 PMM1176     FALSE 0.194 111.000 0.263 NA   NA
 566536 566537 PMM1177 PMM1178     TRUE 0.917 -3.000 0.432 1.000 Y NA
 566537 566538 PMM1178 PMM1179     TRUE 0.678 30.000 0.243 1.000   NA
 566539 566540 PMM1180 PMM1181 sppA aroH TRUE 0.755 8.000 0.207 1.000 N NA
 566540 566541 PMM1181 PMM1182 aroH   FALSE 0.324 66.000 0.114 NA   NA
 566541 566542 PMM1182 PMM1183   rpl34, rpmH FALSE 0.391 31.000 0.027 NA   NA
 566542 566543 PMM1183 PMM1184 rpl34, rpmH rnpA TRUE 0.930 11.000 0.787 1.000   NA
 566543 566544 PMM1184 PMM1185 rnpA   FALSE 0.414 -3.000 0.041 NA   NA
 566544 566545 PMM1185 PMM1186   yidC FALSE 0.260 73.000 0.043 NA   NA
 566545 566546 PMM1186 PMM1187 yidC   FALSE 0.506 21.000 0.012 1.000 N NA
 566546 566547 PMM1187 PMM1188   serS FALSE 0.293 125.000 0.011 0.089 N NA
 566547 566548 PMM1188 PMM1189 serS   TRUE 0.644 10.000 0.024 1.000 N NA
 566548 566549 PMM1189 PMM1190   rpsN FALSE 0.296 66.000 0.020 1.000 N NA
 566549 566550 PMM1190 PMM1191 rpsN pnp FALSE 0.160 191.000 0.019 1.000 Y NA
 566552 566553 PMM1193 PMM1194     FALSE 0.370 22.000 0.002 NA   NA
 566555 566556 PMM1196 RNA_10 manC tRNAArg2 FALSE 0.013 167.000 0.000 NA   NA
 566556 566557 RNA_10 PMM1197 tRNAArg2   FALSE 0.015 156.000 0.000 NA   NA
 566558 566559 PMM1198 PMM1199     FALSE 0.023 133.000 0.000 NA   NA
 566559 566560 PMM1199 PMM1200     FALSE 0.030 122.000 0.000 NA   NA
 566560 566561 PMM1200 PMM1201   rfbB TRUE 0.623 78.000 0.000 NA Y NA
 566561 566562 PMM1201 PMM1202 rfbB   TRUE 0.956 27.000 0.000 0.004 Y NA
 566562 566563 PMM1202 PMM1203   rfbG TRUE 0.976 16.000 0.031 0.004 Y NA
 566563 566564 PMM1203 PMM1204 rfbG ddhA, rfbF TRUE 0.958 20.000 0.624 1.000 Y NA
 566564 566565 PMM1204 PMM1205 ddhA, rfbF   TRUE 0.811 48.000 0.051 1.000 Y NA
 566565 566566 PMM1205 PMM1206     FALSE 0.022 135.000 0.000 NA   NA
 566566 566567 PMM1206 PMM1207     FALSE 0.003 399.000 0.000 NA   NA
 566567 566568 PMM1207 PMM1208   gmd TRUE 0.947 34.000 0.125 0.011 Y NA
 566568 566569 PMM1208 PMM1209 gmd galE TRUE 0.771 106.000 0.000 0.003 Y NA
 566569 566570 PMM1209 PMM1210 galE   TRUE 0.948 51.000 0.200 0.004 Y NA
 566572 566573 PMM1212 PMM1213     FALSE 0.363 4.000 0.011 NA   NA
 566574 566575 PMM1214 PMM1215     FALSE 0.538 -3.000 0.080 1.000   NA
 566575 566576 PMM1215 PMM1216     FALSE 0.542 2.000 0.080 1.000   NA
 566576 566577 PMM1216 PMM1217   gmhA TRUE 0.574 3.000 0.154 1.000 N NA
 566577 566578 PMM1217 PMM1218 gmhA rfaE TRUE 0.715 16.000 0.154 1.000 N NA
 566578 566579 PMM1218 PMM1219 rfaE   TRUE 0.800 69.000 0.222 1.000 Y NA
 566579 566580 PMM1219 PMM1220     TRUE 0.839 24.000 0.000 NA Y NA
 566580 566581 PMM1220 PMM1221     TRUE 0.921 2.000 0.571 NA Y NA
 566581 566582 PMM1221 PMM1222     TRUE 0.805 0.000 0.714 NA   NA
 566582 566583 PMM1222 PMM1223     TRUE 0.736 9.000 0.211 NA   NA
 566586 566587 PMM1226 PMM1227   rfe FALSE 0.003 499.000 0.000 NA   NA
 566588 566589 PMM1228 PMM1229     FALSE 0.058 100.000 0.000 NA   NA
 566589 566590 PMM1229 PMM1230     TRUE 0.800 3.000 0.000 NA Y NA
 566590 566591 PMM1230 PMM1231     FALSE 0.210 -3.000 0.000 NA   NA
 566591 566592 PMM1231 PMM1232     FALSE 0.210 -3.000 0.000 NA   NA
 566592 566593 PMM1232 PMM1233   rfbD FALSE 0.378 1.000 0.000 1.000   NA
 566593 566594 PMM1233 PMM1234 rfbD adhC FALSE 0.448 17.000 0.000 1.000 N NA
 566594 566595 PMM1234 PMM1235 adhC   FALSE 0.300 -3.000 0.000 1.000 N NA
 566595 566596 PMM1235 PMM1236     TRUE 0.981 4.000 0.480 0.002 Y NA
 566596 566597 PMM1236 PMM1237     FALSE 0.210 -3.000 0.000 NA   NA
 566597 566598 PMM1237 PMM1238     FALSE 0.205 1.000 0.000 NA   NA
 566598 566599 PMM1238 PMM1239   hetA FALSE 0.011 175.000 0.000 NA   NA
 566599 566600 PMM1239 PMM1240 hetA   FALSE 0.294 1.000 0.000 1.000 N NA
 566600 566601 PMM1240 PMM1241     FALSE 0.051 499.000 0.000 0.010   NA
 566602 566603 PMM1242 PMM1243     FALSE 0.348 16.000 0.000 NA   NA
 566603 566604 PMM1243 PMM1244     FALSE 0.330 7.000 0.000 NA   NA
 566604 566605 PMM1244 PMM1245     FALSE 0.546 0.000 0.207 NA   NA
 566605 566606 PMM1245 PMM1246     FALSE 0.517 6.000 0.057 NA   NA
 566606 566607 PMM1246 PMM1247     FALSE 0.121 70.000 0.000 NA   NA
 566607 566608 PMM1247 PMM1248     FALSE 0.002 925.000 0.000 NA   NA
 566608 566609 PMM1248 PMM1249     TRUE 0.798 48.000 0.000 0.007   NA
 566609 1203556 PMM1249       FALSE 0.223 3.000 0.000 NA   NA
 1203556 566610   PMM1250     TRUE 0.694 4.000 0.333 NA   NA
 566610 566611 PMM1250 PMM1251     FALSE 0.223 3.000 0.000 NA   NA
 566612 566613 PMM1252 PMM1253     FALSE 0.153 93.000 0.000 1.000   NA
 566614 566615 PMM1254 PMM1255     FALSE 0.237 -10.000 0.000 NA   NA
 566615 566616 PMM1255 RNA_22   tRNALeu3 FALSE 0.234 29.000 0.000 NA   NA
 566616 566617 RNA_22 PMM1256 tRNALeu3   FALSE 0.003 477.000 0.000 NA   NA
 566617 566618 PMM1256 PMM1257     FALSE 0.046 393.000 0.000 NA Y NA
 566619 566620 PMM1258 PMM1259     TRUE 0.953 -46.000 0.000 0.017 Y NA
 566620 566621 PMM1259 PMM1260     TRUE 0.569 93.000 0.000 1.000 Y NA
 566621 566622 PMM1260 PMM1261   ugd TRUE 0.842 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 566623 566624 PMM1262 PMM1263 lexA argF FALSE 0.325 59.000 0.020 1.000 N NA
 566624 566625 PMM1263 PMM1264 argF ftsH3 FALSE 0.476 29.000 0.022 1.000 N NA
 566625 566626 PMM1264 PMM1265 ftsH3 ribD FALSE 0.410 115.000 0.010 0.013 N NA
 566626 566627 PMM1265 PMM1266 ribD   TRUE 0.567 14.000 0.021 NA   NA
 566627 566628 PMM1266 PMM1267     TRUE 0.730 -25.000 0.360 NA   NA
 566630 566631 PMM1269 PMM1270   pheS FALSE 0.250 72.000 0.011 1.000 N NA
 566634 566635 PMM1273 PMM1274 ribF thiE TRUE 0.918 9.000 0.012 1.000 Y NA
 566635 566636 PMM1274 PMM1275 thiE thiS TRUE 0.930 -10.000 0.452 1.000 Y NA
 566636 566637 PMM1275 PMM1276 thiS   FALSE 0.113 113.000 0.119 NA   NA
 566637 566638 PMM1276 PMM1277     TRUE 0.658 67.000 0.571 NA   NA
 566639 566640 PMM1278 PMM1279     FALSE 0.414 -3.000 0.070 NA   NA
 566640 566641 PMM1279 PMM1280   trmD FALSE 0.321 -3.000 0.011 NA   NA
 566641 566642 PMM1280 PMM1281 trmD era TRUE 0.830 1.000 0.010 0.023   NA
 566644 566645 PMM1283 PMM1284   phoH FALSE 0.232 75.000 0.024 NA   NA
 566645 566646 PMM1284 PMM1285 phoH rpsP FALSE 0.392 35.000 0.019 1.000 N NA
 566646 566647 PMM1285 PMM1286 rpsP ffh TRUE 0.628 55.000 0.361 1.000 N NA
 566647 566648 PMM1286 PMM1287 ffh   FALSE 0.400 50.000 0.016 1.000   NA
 566650 566651 PMM1289 PMM1290     FALSE 0.028 141.000 0.021 NA N NA
 566654 566655 PMM1293 PMM1294     FALSE 0.372 75.000 0.096 1.000   NA
 566655 566656 PMM1294 PMM1295     FALSE 0.340 87.000 0.154 1.000   NA
 566657 566658 PMM1296 PMM1297   trpC FALSE 0.304 55.000 0.023 NA   NA
 566658 566659 PMM1297 PMM1298 trpC lpd TRUE 0.665 13.000 0.057 1.000 N NA
 566659 566660 PMM1298 PMM1299 lpd spoU FALSE 0.513 -3.000 0.115 1.000 N NA
 566662 566663 RNA_11 PMM1301 tRNAHis1 argD FALSE 0.272 -72.000 0.000 NA   NA
 566663 566664 PMM1301 PMM1302 argD folC TRUE 0.758 13.000 0.181 1.000 N NA
 566665 566666 PMM1303 PMM1304   codA TRUE 0.585 39.000 0.246 1.000 N NA
 566667 566668 RNA_12 PMM1305 tRNAArg3   FALSE 0.113 75.000 0.000 NA   NA
 566668 566669 PMM1305 PMM1306   ddlA TRUE 0.628 10.000 0.020 1.000 N NA
 566669 566670 PMM1306 PMM1307 ddlA   TRUE 0.613 12.000 0.046 NA   NA
 566670 566671 PMM1307 PMM1308   ftsQ FALSE 0.385 -3.000 0.024 NA   NA
 566671 566672 PMM1308 PMM1309 ftsQ ftsZ FALSE 0.020 178.000 0.067 NA N NA
 566676 566677 PMM1312 PMM1313   clpP4 FALSE 0.379 41.000 0.084 NA   NA
 566677 566678 PMM1313 PMM1314 clpP4 clpP3 TRUE 0.979 34.000 0.745 0.004 Y NA
 566678 566679 PMM1314 PMM1315 clpP3 ilvC FALSE 0.083 117.000 0.019 1.000 N NA
 566679 566680 PMM1315 PMM1316 ilvC cbiB TRUE 0.865 -12.000 0.017 1.000 Y NA
 566680 566681 PMM1316 PMM1317 cbiB hli13 FALSE 0.403 58.000 0.021 1.000   NA
 566681 1203708 PMM1317   hli13   TRUE 0.598 -3.000 0.250 NA   NA
 566682 566683 PMM1318 PMM1319     TRUE 0.784 30.000 0.556 NA   NA
 566683 566684 PMM1319 PMM1320     TRUE 0.812 55.000 1.000 NA   NA
 566684 566685 PMM1320 PMM1321   himA FALSE 0.107 129.000 0.200 NA   NA
 566688 566689 PMM1323 PMM1324 melB   TRUE 0.914 10.000 0.833 NA N NA
 566689 566690 PMM1324 PMM1325     TRUE 0.784 5.000 0.452 NA   NA
 566690 566691 PMM1325 PMM1326     TRUE 0.804 35.000 0.762 NA   NA
 566691 566692 PMM1326 PMM1327     TRUE 0.770 6.000 0.369 NA   NA
 566693 566694 PMM1328 PMM1329 pyrF tyrS TRUE 0.610 7.000 0.027 1.000 N NA
 566694 566695 PMM1329 PMM1330 tyrS   FALSE 0.514 22.000 0.034 NA   NA
 566696 566697 PMM1331 PMM1332   pepB TRUE 0.618 23.000 0.176 NA   NA
 566698 566699 PMM1333 PMM1334   lpxB TRUE 0.631 17.000 0.034 1.000 N NA
 566699 566700 PMM1334 PMM1335 lpxB lpxA TRUE 0.852 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 566700 566701 PMM1335 PMM1336 lpxA fabZ FALSE 0.499 -7.000 0.071 1.000 N NA
 566701 566702 PMM1336 PMM1337 fabZ lpxC TRUE 0.625 18.000 0.083 1.000 N NA
 566702 566703 PMM1337 PMM1338 lpxC   TRUE 0.848 1.000 0.052 1.000 Y NA
 566703 566704 PMM1338 PMM1339   purC FALSE 0.421 39.000 0.058 1.000 N NA
 566705 566706 PMM1340 PMM1341 purD nblS TRUE 0.803 1.000 0.025 0.086 N NA
 566707 566708 PMM1342 PMM1343 kaiC kaiB TRUE 0.809 63.000 0.927 1.000   NA
 566709 566710 PMM1344 PMM1345 rplU rpmA TRUE 0.989 10.000 0.667 0.023 Y NA
 566714 566715 PMM1349 PMM1350 elaC   FALSE 0.230 60.000 0.011 NA   NA
 566716 566717 PMM1351 PMM1352   petF TRUE 0.561 82.000 0.500 NA   NA
 566717 566718 PMM1352 PMM1353 petF prmA FALSE 0.057 144.000 0.027 1.000 N NA
 566718 566719 PMM1353 PMM1354 prmA serA TRUE 0.623 17.000 0.053 1.000 N NA
 566720 566721 PMM1355 PMM1356     TRUE 0.718 1.000 0.442 NA   NA
 566721 566722 PMM1356 RNA_13   tRNAPhe1 FALSE 0.159 55.000 0.000 NA   NA
 566722 566723 RNA_13 PMM1357 tRNAPhe1   FALSE 0.130 66.000 0.000 NA   NA
 566723 566724 PMM1357 PMM1358     TRUE 0.571 -13.000 0.028 1.000   NA
 566724 1203709 PMM1358       FALSE 0.237 76.000 0.028 NA   NA
 566725 566726 PMM1359 PMM1360     FALSE 0.042 155.000 0.043 NA   NA
 566728 1203710 PMM1362       TRUE 0.759 5.000 0.400 NA   NA
 1203710 5163170         FALSE 0.210 -3.000 0.000 NA   NA
 5163170 566729   PMM1363     FALSE 0.202 0.000 0.000 NA   NA
 566730 566731 PMM1364 PMM1365 murD   FALSE 0.088 102.000 0.008 NA   NA
 566732 1203711 PMM1366       FALSE 0.385 96.000 0.400 NA   NA
 1203711 566733   PMM1367     FALSE 0.236 65.000 0.018 NA   NA
 566733 566734 PMM1367 PMM1368     TRUE 0.614 11.000 0.045 NA   NA
 566734 566735 PMM1368 PMM1369     FALSE 0.188 88.000 0.068 NA   NA
 566735 566736 PMM1369 PMM1370     FALSE 0.145 86.000 0.011 NA   NA
 566737 5163171 PMM1371       FALSE 0.269 78.000 0.105 NA   NA
 566738 1294177 PMM1372       FALSE 0.347 89.000 0.286 NA   NA
 1203716 1203717         FALSE 0.446 80.000 0.333 NA   NA
 1203717 1203718         FALSE 0.004 334.000 0.000 NA   NA
 1203718 566739   PMM1373     FALSE 0.320 87.000 0.227 NA   NA
 1294170 566740   PMM1374     FALSE 0.111 161.000 0.400 NA   NA
 566741 1203719 PMM1375       FALSE 0.220 140.000 0.600 NA   NA
 1203719 566742   PMM1376   rbpD FALSE 0.094 155.000 0.286 NA   NA
 566742 566743 PMM1376 PMM1377 rbpD   FALSE 0.132 148.000 0.286 1.000   NA
 566743 566744 PMM1377 PMM1378     FALSE 0.110 126.000 0.143 1.000 N NA
 1203720 1203721         FALSE 0.007 210.000 0.000 NA   NA
 1203721 1203722         TRUE 0.795 -7.000 0.571 NA   NA
 1203722 566745   PMM1379     FALSE 0.058 100.000 0.000 NA   NA
 5163172 566746   PMM1380     FALSE 0.039 112.000 0.000 NA   NA
 566746 566747 PMM1380 PMM1381     FALSE 0.312 54.000 0.024 NA   NA
 566747 1294169 PMM1381       FALSE 0.060 99.000 0.000 NA   NA
 1294169 566748   PMM1382     FALSE 0.009 195.000 0.000 NA   NA
 566749 5163173 PMM1383       FALSE 0.499 9.000 0.009 NA   NA
 566750 566751 PMM1384 PMM1385 hli12 hli11 FALSE 0.202 0.000 0.000 NA   NA
 566751 1203725 PMM1385   hli11   FALSE 0.011 177.000 0.000 NA   NA
 1203725 1203726         FALSE 0.212 2.000 0.000 NA   NA
 1203726 5163174         FALSE 0.069 94.000 0.000 NA   NA
 5163174 1203727         FALSE 0.265 25.000 0.000 NA   NA
 1203728 1294180         FALSE 0.004 327.000 0.000 NA   NA
 1294180 5163209         FALSE 0.043 109.000 0.000 NA   NA
 5163209 5163175         FALSE 0.007 211.000 0.000 NA   NA
 566752 1362707 PMM1386     pseudo FALSE 0.156 57.000 0.000 NA   NA
 1362707 566753   PMM1387 pseudo   FALSE 0.009 193.000 0.000 NA   NA
 1203730 566756   PMM1390   hli10 FALSE 0.005 242.000 0.000 NA   NA
 566757 566758 PMM1391 PMM1392     FALSE 0.068 95.000 0.000 NA   NA
 566761 1203559 PMM1395       FALSE 0.006 241.000 0.000 NA   NA
 1203559 566762   PMM1396   hli9 FALSE 0.491 99.000 0.667 NA   NA
 566762 566763 PMM1396 PMM1397 hli9 hli8 FALSE 0.207 31.000 0.000 NA   NA
 566763 566764 PMM1397 PMM1398 hli8 hli7 FALSE 0.202 0.000 0.000 NA   NA
 566764 566765 PMM1398 PMM1399 hli7 hli6 FALSE 0.202 0.000 0.000 NA   NA
 566765 566766 PMM1399 PMM1400 hli6   FALSE 0.003 434.000 0.000 NA   NA
 566766 1203737 PMM1400       TRUE 0.638 75.000 0.600 NA   NA
 566767 1203738 PMM1401       FALSE 0.184 38.000 0.000 NA   NA
 1203738 566768   PMM1402     FALSE 0.007 206.000 0.000 NA   NA
 1203739 5163210         FALSE 0.011 175.000 0.000 NA   NA
 566769 566770 PMM1403 PMM1404   hli5 FALSE 0.003 457.000 0.000 NA   NA
 566770 566771 PMM1404 PMM1405 hli5   FALSE 0.004 389.000 0.000 NA   NA
 566771 566772 PMM1405 PMM1406     FALSE 0.015 157.000 0.000 NA   NA
 566772 566773 PMM1406 PMM1407     FALSE 0.205 1.000 0.000 NA   NA
 566773 566774 PMM1407 PMM1408     FALSE 0.205 1.000 0.000 NA   NA
 566774 566775 PMM1408 PMM1409     FALSE 0.143 60.000 0.000 NA   NA
 566775 566776 PMM1409 PMM1410     FALSE 0.029 124.000 0.000 NA   NA
 566776 1203560 PMM1410       FALSE 0.205 1.000 0.000 NA   NA
 1203560 5163176         FALSE 0.231 -9.000 0.000 NA   NA
 5163176 1203742         FALSE 0.210 -3.000 0.000 NA   NA
 1203742 1203743         FALSE 0.055 102.000 0.000 NA   NA
 566778 566779 PMM1412 PMM1413     FALSE 0.386 72.000 0.200 NA   NA
 566779 566780 PMM1413 PMM1414     FALSE 0.055 102.000 0.000 NA   NA
 566780 566781 PMM1414 PMM1415     FALSE 0.134 65.000 0.000 NA   NA
 566781 5163177 PMM1415       FALSE 0.015 158.000 0.000 NA   NA
 5163177 566782   PMM1416     FALSE 0.003 498.000 0.000 NA   NA
 5163211 566783   PMM1417     FALSE 0.023 133.000 0.000 NA   NA
 566783 566784 PMM1417 PMM1418     FALSE 0.016 212.000 0.000 1.000   NA
 566784 566785 PMM1418 PMM1419     FALSE 0.102 80.000 0.000 NA   NA
 566785 1203748 PMM1419       FALSE 0.210 -3.000 0.000 NA   NA
 566786 566787 PMM1420 PMM1421     FALSE 0.205 1.000 0.000 NA   NA
 566787 566788 PMM1421 PMM1422     TRUE 0.822 -16.000 0.600 NA   NA
 566788 566789 PMM1422 PMM1423     TRUE 0.594 61.000 0.400 NA   NA
 566789 566790 PMM1423 PMM1424     TRUE 0.698 5.000 0.300 NA   NA
 566791 566792 PMM1425 PMM1426     FALSE 0.006 221.000 0.000 NA   NA
 566792 566793 PMM1426 PMM1427     FALSE 0.140 62.000 0.000 NA   NA
 566793 566794 PMM1427 PMM1428     FALSE 0.004 323.000 0.000 NA   NA
 566796 566797 PMM1430 PMM1431   rpoZ TRUE 0.852 3.000 0.024 0.027   NA
 1203751 566800   PMM1434   gpmI FALSE 0.344 -27.000 0.003 NA   NA
 566800 566801 PMM1434 PMM1435 gpmI secG TRUE 0.595 26.000 0.041 1.000   NA
 566802 566803 PMM1436 PMM1437 groEL groES TRUE 0.976 52.000 0.905 0.010 Y NA
 566804 566805 PMM1438 PMM1439 atpD atpC TRUE 0.977 49.000 0.837 0.004 Y NA
 566806 566807 PMM1440 PMM1441     FALSE 0.143 109.000 0.146 NA   NA
 566807 566808 PMM1441 PMM1442   pepP FALSE 0.325 58.000 0.037 NA   NA
 566809 566810 PMM1443 PMM1444     FALSE 0.427 3.000 0.046 NA   NA
 566810 566811 PMM1444 PMM1445   nadD FALSE 0.443 -3.000 0.006 1.000   NA
 566811 566812 PMM1445 PMM1446 nadD nadE TRUE 0.964 5.000 0.023 0.004 Y NA
 566813 566814 PMM1447 PMM1448     FALSE 0.545 5.000 0.125 NA   NA
 566814 566815 PMM1448 PMM1449   petF FALSE 0.513 -3.000 0.158 NA   NA
 566815 566816 PMM1449 PMM1450 petF atpC TRUE 0.915 15.000 0.003 1.000 Y NA
 566816 566817 PMM1450 PMM1451 atpC atpA TRUE 0.989 21.000 0.846 0.004 Y NA
 566817 566818 PMM1451 PMM1452 atpA atpH TRUE 0.982 32.000 0.864 0.004 Y NA
 566818 566819 PMM1452 PMM1453 atpH atpF TRUE 0.955 0.000 0.132 0.004 Y NA
 566819 566820 PMM1453 PMM1454 atpF atpG TRUE 0.977 -3.000 0.569 0.004 Y NA
 566820 566821 PMM1454 PMM1455 atpG atpE TRUE 0.944 69.000 0.368 0.004 Y NA
 566821 566822 PMM1455 PMM1456 atpE atpB TRUE 0.686 167.000 0.679 0.005 Y NA
 566822 566823 PMM1456 PMM1457 atpB atp1 FALSE 0.437 46.000 0.151 NA   NA
 566824 566825 PMM1458 PMM1459 ftsW ccdA FALSE 0.365 84.000 0.202 1.000 N NA
 566825 566826 PMM1459 PMM1460 ccdA resB TRUE 0.889 1.000 0.371 NA Y NA
 566828 566829 PMM1462 PMM1463   glnB TRUE 0.849 25.000 0.682 NA   NA
 1362708 566831   PMM1465 pseudo purB FALSE 0.138 63.000 0.000 NA   NA
 566831 566832 PMM1465 PMM1466 purB fumC FALSE 0.347 41.000 0.011 1.000 N NA
 566834 566835 PMM1468 PMM1469 bioF   FALSE 0.406 -3.000 0.053 NA   NA
 566835 566836 PMM1469 PMM1470     TRUE 0.555 -10.000 0.163 NA   NA
 566836 566837 PMM1470 PMM1471   BioD TRUE 0.851 -3.000 0.030 1.000 Y NA
 566837 566838 PMM1471 PMM1472 BioD BioA TRUE 0.967 4.000 0.124 0.002 Y NA
 566839 566840 PMM1473 PMM1474     TRUE 0.888 18.000 0.744 NA   NA
 566842 566843 PMM1476 PMM1477   fer TRUE 0.741 7.000 0.163 1.000   NA
 566843 566844 PMM1477 PMM1478 fer   TRUE 0.800 4.000 0.550 NA   NA
 566844 566845 PMM1478 PMM1479     TRUE 0.881 -13.000 1.000 NA   NA
 566845 566846 PMM1479 PMM1480     FALSE 0.030 119.000 0.000 NA   NA
 566846 1203752 PMM1480       FALSE 0.299 20.000 0.000 NA   NA
 1203752 566847   PMM1481     FALSE 0.175 71.000 0.006 NA   NA
 566847 566848 PMM1481 PMM1482   hli3 FALSE 0.372 31.000 0.022 NA   NA
 566848 566849 PMM1482 PMM1483 hli3 rpoC2 TRUE 0.685 50.000 0.476 NA   NA
 566849 566850 PMM1483 PMM1484 rpoC2 rpoC1 TRUE 0.953 34.000 0.031 0.002 Y NA
 566850 566851 PMM1484 PMM1485 rpoC1 rpoB TRUE 0.981 39.000 0.851 0.002 Y NA
 566851 566852 PMM1485 PMM1486 rpoB tatD FALSE 0.006 239.000 0.012 NA N NA
 566852 566853 PMM1486 PMM1487 tatD rpsT FALSE 0.484 7.000 0.034 NA N NA
 566855 566856 PMM1489 PMM1490 rpiA   FALSE 0.329 66.000 0.030 1.000 N NA
 566857 566858 PMM1491 PMM1492   nusA TRUE 0.799 37.000 0.759 NA   NA
 566858 566859 PMM1492 PMM1493 nusA   TRUE 0.882 -3.000 0.323 NA Y NA
 566859 566860 PMM1493 PMM1494   infB FALSE 0.303 73.000 0.171 NA N NA
 566862 566863 PMM1496 PMM1497     TRUE 0.832 36.000 0.172 NA Y NA
 566863 566864 PMM1497 PMM1498     FALSE 0.105 105.000 0.100 NA N NA
 566865 566866 PMM1499 PMM1500     FALSE 0.442 0.000 0.110 NA   NA
 566867 566868 PMM1501 PMM1502 rne rnhB TRUE 0.881 -55.000 0.033 0.021 N NA
 566871 566872 PMM1505 PMM1506     FALSE 0.519 1.000 0.047 1.000   NA
 566872 566873 PMM1506 PMM1507   rpsJ FALSE 0.424 56.000 0.025 1.000   NA
 566873 566874 PMM1507 PMM1508 rpsJ tufA TRUE 0.589 110.000 0.318 1.000 Y NA
 566875 566876 PMM1509 PMM1510 fusA rpsG TRUE 0.730 105.000 0.579 1.000 Y NA
 566876 566877 PMM1510 PMM1511 rpsG rpsL TRUE 0.983 27.000 0.620 0.004 Y NA
 566878 566879 PMM1512 PMM1513 gltB   TRUE 0.632 10.000 0.086 NA   NA
 566881 566882 PMM1515 PMM1516     TRUE 0.827 -16.000 0.625 NA   NA
 566885 566886 PMM1519 PMM1520 psaL psaI TRUE 0.940 30.000 0.583 0.014   NA
 566888 566889 PMM1522 PMM1523   psaB FALSE 0.190 111.000 0.154 1.000   NA
 566891 566892 PMM1525 PMM1526 cobJ hisB FALSE 0.218 98.000 0.062 1.000   NA
 566893 566894 RNA_20 PMM1527 tRNAGly1 alr FALSE 0.140 62.000 0.000 NA   NA
 566896 566897 PMM1529 PMM1530 prfA rpmE TRUE 0.844 35.000 0.110 1.000 Y NA
 566897 566898 PMM1530 PMM1531 rpmE rpsI TRUE 0.975 14.000 0.062 0.021 Y NA
 566898 566899 PMM1531 PMM1532 rpsI rplM TRUE 0.988 10.000 0.601 0.021 Y NA
 566899 566900 PMM1532 PMM1533 rplM truA FALSE 0.418 117.000 0.058 1.000 Y NA
 566900 566901 PMM1533 PMM1534 truA rplQ TRUE 0.837 38.000 0.102 1.000 Y NA
 566901 566902 PMM1534 PMM1535 rplQ rpoA TRUE 0.925 16.000 0.873 1.000 N NA
 566902 566903 PMM1535 PMM1536 rpoA rpsK TRUE 0.605 47.000 0.308 1.000 N NA
 566903 566904 PMM1536 PMM1537 rpsK rpsM TRUE 0.972 49.000 0.810 0.021 Y NA
 566904 566905 PMM1537 PMM1538 rpsM rpmJ TRUE 0.931 46.000 0.086 0.021 Y NA
 566905 566906 PMM1538 PMM1539 rpmJ adk FALSE 0.359 39.000 0.013 1.000 N NA
 566906 566907 PMM1539 PMM1540 adk secY FALSE 0.411 0.000 0.019 1.000 N NA
 566907 566908 PMM1540 PMM1541 secY rplO TRUE 0.828 31.000 0.730 1.000 N NA
 566908 566909 PMM1541 PMM1542 rplO rpsE TRUE 0.960 5.000 0.148 0.028 Y NA
 566909 566910 PMM1542 PMM1543 rpsE rplR TRUE 0.989 16.000 0.814 0.028 Y NA
 566910 566911 PMM1543 PMM1544 rplR rplF TRUE 0.990 15.000 0.815 0.021 Y NA
 566911 566912 PMM1544 PMM1545 rplF rpsH TRUE 0.991 13.000 0.808 0.021 Y NA
 566912 566913 PMM1545 PMM1546 rpsH rplE TRUE 0.975 11.000 0.059 0.021 Y NA
 566913 566914 PMM1546 PMM1547 rplE rplX TRUE 0.954 76.000 0.758 0.021 Y NA
 566914 566915 PMM1547 PMM1548 rplX rplN TRUE 0.977 1.000 0.810 0.028 Y NA
 566915 566916 PMM1548 PMM1549 rplN rpsQ TRUE 0.977 -3.000 0.791 0.028 Y NA
 566916 566917 PMM1549 PMM1550 rpsQ rpmC TRUE 0.990 9.000 0.828 0.021 Y NA
 566917 566918 PMM1550 PMM1551 rpmC rplP TRUE 0.979 -3.000 0.802 0.021 Y NA
 566918 566919 PMM1551 PMM1552 rplP rpsC TRUE 0.990 12.000 0.828 0.028 Y NA
 566919 566920 PMM1552 PMM1553 rpsC rplV TRUE 0.975 0.000 0.719 0.028 Y NA
 566920 566921 PMM1553 PMM1554 rplV rpsS TRUE 0.976 1.000 0.769 0.028 Y NA
 566921 566922 PMM1554 PMM1555 rpsS rplB TRUE 0.972 45.000 0.820 0.028 Y NA
 566922 566923 PMM1555 PMM1556 rplB rplW TRUE 0.991 13.000 0.849 0.021 Y NA
 566923 566924 PMM1556 PMM1557 rplW rplD TRUE 0.972 -3.000 0.513 0.021 Y NA
 566924 566925 PMM1557 PMM1558 rplD rplC TRUE 0.964 -3.000 0.361 0.021 Y NA
 566926 566927 PMM1559 PMM1560   hycB TRUE 0.840 -10.000 0.595 1.000   NA
 566927 566928 PMM1560 RNA_14 hycB tRNAAsn1 FALSE 0.050 105.000 0.000 NA   NA
 566928 566929 RNA_14 PMM1561 tRNAAsn1   FALSE 0.319 18.000 0.000 NA   NA
 566929 566930 PMM1561 PMM1562   recA FALSE 0.082 110.000 0.019 NA   NA
 566931 566932 PMM1563 PMM1564   dinG FALSE 0.462 28.000 0.072 NA   NA
 566940 566941 PMM1572 PMM1573   recF FALSE 0.370 53.000 0.024 1.000 N NA
 566943 566944 PMM1574 PMM1575   ppc TRUE 0.789 4.000 0.500 NA   NA
 566944 566945 PMM1575 PMM1576 ppc   TRUE 0.718 54.000 0.457 1.000   NA
 566945 566946 PMM1576 PMM1577   trpE FALSE 0.517 1.000 0.059 1.000   NA
 566946 566947 PMM1577 PMM1578 trpE psaD FALSE 0.433 60.000 0.091 1.000   NA
 566947 566948 PMM1578 PMM1579 psaD   FALSE 0.297 113.000 0.381 1.000   NA
 566948 566949 PMM1579 PMM1580   rodA FALSE 0.509 -3.000 0.024 1.000   NA
 566949 566950 PMM1580 PMM1581 rodA mrp TRUE 0.901 6.000 0.041 1.000 Y NA
 566954 566955 PMM1585 PMM1586     TRUE 0.783 34.000 0.667 NA   NA
 566956 5163215 RNA_16   tRNAMet1   FALSE 0.005 278.000 0.000 NA   NA
 566957 566958 PMM1587 PMM1588     TRUE 0.769 17.000 0.308 NA   NA
 566958 566959 PMM1588 PMM1589   purM FALSE 0.042 135.000 0.018 NA   NA
 566961 566962 PMM1591 PMM1592 wzb pebB TRUE 0.571 22.000 0.015 1.000   NA
 566962 566963 PMM1592 PMM1593 pebB pebA TRUE 0.960 1.000 0.808 0.001   NA
 566963 566964 PMM1593 PMM1594 pebA ho1 TRUE 0.809 6.000 0.360 1.000   NA
 566964 566965 PMM1594 PMM1595 ho1   TRUE 0.795 58.000 0.900 NA   NA
 566967 566968 PMM1597 PMM1598   galM TRUE 0.644 13.000 0.096 NA   NA
 566968 566969 PMM1598 PMM1599 galM   TRUE 0.854 11.000 0.339 1.000   NA
 566969 566970 PMM1599 PMM1600   kefB TRUE 0.563 43.000 0.179 1.000   NA
 566972 566973 PMM1602 RNA_19   tRNAMet2 FALSE 0.102 80.000 0.000 NA   NA
 566974 566975 RNA_42 PMM1603 rrnA rnc FALSE 0.257 26.000 0.000 NA   NA
 566980 566981 PMM1608 PMM1609 acpP fabF TRUE 0.945 7.000 0.346 1.000 Y NA
 566981 566982 PMM1609 PMM1610 fabF tktA FALSE 0.411 43.000 0.062 1.000 N NA
 566983 566984 PMM1611 PMM1612 thiC   FALSE 0.014 194.000 0.006 NA   NA
 566984 566985 PMM1612 PMM1613     TRUE 0.778 19.000 0.365 NA   NA
 566985 566986 PMM1613 PMM1614     TRUE 0.766 4.000 0.365 1.000   NA
 566986 566987 PMM1614 PMM1615   ruvB FALSE 0.539 -13.000 0.019 1.000   NA
 566989 566990 PMM1617 PMM1618   lysS FALSE 0.438 28.000 0.026 NA   NA
 566990 566991 PMM1618 PMM1619 lysS   FALSE 0.384 51.000 0.027 1.000 N NA
 566991 566992 PMM1619 PMM1620     FALSE 0.066 173.000 0.273 NA   NA
 566992 566993 PMM1620 PMM1621   mreC FALSE 0.377 1.000 0.024 NA   NA
 566993 566994 PMM1621 PMM1622 mreC mreB TRUE 0.599 5.000 0.043 1.000   NA
 566996 566997 PMM1624 PMM1625 dedA sam1 FALSE 0.530 3.000 0.024 1.000   NA
 567001 567002 PMM1629 PMM1630   mgtE FALSE 0.205 101.000 0.135 1.000 N NA
 567002 567003 PMM1630 PMM1631 mgtE   TRUE 0.822 43.000 0.135 0.042   NA
 567003 567004 PMM1631 PMM1632     TRUE 0.883 -3.000 0.278 0.042   NA
 567004 567005 PMM1632 PMM1633     TRUE 0.892 4.000 0.900 1.000   NA
 567005 567006 PMM1633 PMM1634   gyrB FALSE 0.491 -3.000 0.020 1.000   NA
 567007 567008 PMM1635 PMM1636 miaA infC TRUE 0.797 52.000 0.020 1.000 Y NA
 567008 567009 PMM1636 PMM1637 infC   FALSE 0.127 99.000 0.008 1.000 N NA
 567009 567010 PMM1637 PMM1638   cysE TRUE 0.849 7.000 0.452 1.000 N NA
 567013 567014 PMM1641 PMM1642     FALSE 0.260 -27.000 0.000 NA   NA
 567014 567015 PMM1642 RNA_18   tRNALeu2 FALSE 0.034 116.000 0.000 NA   NA
 567015 567016 RNA_18 PMM1643 tRNALeu2 ribH FALSE 0.138 63.000 0.000 NA   NA
 567016 567017 PMM1643 PMM1644 ribH psbZ FALSE 0.458 49.000 0.037 1.000   NA
 567020 567021 PMM1647 PMM1648 holA lysC FALSE 0.359 40.000 0.015 1.000 N NA
 567022 567023 PMM1649 PMM1650 uvrB   FALSE 0.472 30.000 0.009 1.000   NA
 567025 567026 PMM1652 PMM1653   dapA TRUE 0.676 77.000 0.605 1.000   NA
 567026 567027 PMM1653 PMM1654 dapA asd TRUE 0.851 -3.000 0.052 1.000 Y NA
 567028 567029 PMM1655 PMM1656 tig clpP2 TRUE 0.759 66.000 0.025 1.000 Y NA
 567029 567030 PMM1656 PMM1657 clpP2 clpX TRUE 0.810 104.000 0.037 0.004 Y NA
 567030 567031 PMM1657 PMM1658 clpX dnaX TRUE 0.720 58.000 0.008 0.079 N NA
 567032 567033 PMM1659 PMM1660     TRUE 0.596 29.000 0.164 1.000 N NA
 567034 567035 PMM1661 PMM1662 rpmI rplT TRUE 0.981 31.000 0.928 0.021 Y NA
 567035 567036 PMM1662 PMM1663 rplT   FALSE 0.392 39.000 0.002 1.000   NA
 567036 567037 PMM1663 PMM1664   thiG FALSE 0.441 2.000 0.003 1.000   NA
 567037 567038 PMM1664 PMM1665 thiG sqdB FALSE 0.177 167.000 0.009 0.023 N NA
 567038 567039 PMM1665 PMM1666 sqdB   TRUE 0.892 29.000 0.194 1.000 Y NA
 567040 567041 PMM1667 PMM1668   gcvP FALSE 0.051 134.000 0.024 NA   NA
 567041 567042 PMM1668 PMM1669 gcvP gcvH TRUE 0.958 47.000 0.249 0.001 Y NA
 567042 567043 PMM1669 PMM1670 gcvH   TRUE 0.655 9.000 0.060 1.000 N NA
 567043 567044 PMM1670 PMM1671     FALSE 0.487 5.000 0.037 NA   NA
 567045 567046 PMM1672 PMM1673 des9 rplI FALSE 0.473 21.000 0.005 1.000 N NA
 567046 567047 PMM1673 PMM1674 rplI dnaB FALSE 0.364 59.000 0.048 1.000 N NA
 567047 567048 PMM1674 PMM1675 dnaB gidA TRUE 0.603 12.000 0.012 1.000 N NA
 567048 567049 PMM1675 PMM1676 gidA ubiC FALSE 0.312 7.000 0.008 NA N NA
 1203561 567050   PMM1677     FALSE 0.202 86.000 0.040 NA   NA
 567051 567052 PMM1678 PMM1679   lig TRUE 0.552 18.000 0.043 NA   NA
 567052 567053 PMM1679 PMM1680 lig   FALSE 0.064 129.000 0.043 NA   NA
 567054 567055 PMM1681 PMM1682   valS FALSE 0.309 2.000 0.008 NA   NA
 567055 567056 PMM1682 PMM1683 valS   FALSE 0.104 93.000 0.004 NA   NA
 567056 567057 PMM1683 RNA_17   tRNAVal3 FALSE 0.335 17.000 0.000 NA   NA
 567058 567059 PMM1684 PMM1685   speE FALSE 0.464 -3.000 0.011 1.000   NA
 567059 567060 PMM1685 PMM1686 speE speB TRUE 0.854 2.000 0.064 1.000 Y NA
 567060 567061 PMM1686 PMM1687 speB gcvT TRUE 0.790 51.000 0.010 1.000 Y NA
 567061 567062 PMM1687 PMM1688 gcvT aspS TRUE 0.738 59.000 0.018 0.039 N NA
 567062 567063 PMM1688 PMM1689 aspS pyrG FALSE 0.227 75.000 0.008 1.000 N NA
 567063 567064 PMM1689 PMM1690 pyrG nrdG FALSE 0.455 28.000 0.016 1.000 N NA
 567064 567065 PMM1690 PMM1691 nrdG   TRUE 0.771 6.000 0.270 1.000   NA
 567065 567066 PMM1691 PMM1692     TRUE 0.571 -10.000 0.037 1.000   NA
 567066 567067 PMM1692 PMM1693     TRUE 0.875 -3.000 0.180 1.000 Y NA
 567069 567070 PMM1695 PMM1696   ppk TRUE 0.600 19.000 0.037 1.000 N NA
 567070 567071 PMM1696 PMM1697 ppk   FALSE 0.022 198.000 0.019 1.000 N NA
 567071 567072 PMM1697 PMM1698     FALSE 0.064 201.000 0.292 1.000   NA
 567074 567075 PMM1700 PMM1701 acnB eriC TRUE 0.664 10.000 0.062 1.000 N NA
 567079 567080 PMM1705 PMM1706 aroE rpsF FALSE 0.087 110.000 0.006 1.000 N NA
 567081 1203754 PMM1707   argG   FALSE 0.226 52.000 0.004 NA   NA
 567082 567083 PMM1708 PMM1709   mraY FALSE 0.454 -19.000 0.027 NA   NA
 567083 567084 PMM1709 PMM1710 mraY   FALSE 0.522 11.000 0.011 NA   NA
 567085 567086 PMM1711 PMM1712 sps uvrA FALSE 0.016 202.000 0.003 1.000 N NA
 567086 567087 PMM1712 PMM1713 uvrA recN TRUE 0.911 55.000 0.021 0.078 Y NA
 567088 567089 PMM1714 PMM1715     TRUE 0.725 1.000 0.452 NA   NA
 567089 567090 PMM1715 PMM1716   thrC FALSE 0.425 3.000 0.050 NA   NA
 567090 565331 PMM1716 PMM0001 thrC dnaN FALSE 0.006 347.000 0.000 1.000 N NA