MicrobesOnline Operon Predictions for Bacillus megaterium DSM319

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

<
 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10370438 10370439 BMD_0001 BMD_0002 dnaA dnaN TRUE 0.802 188.000 0.328 1.000 Y NA
 10370439 10370440 BMD_0002 BMD_0003 dnaN   FALSE 0.498 101.000 0.103 1.000   NA
 10370440 10370441 BMD_0003 BMD_0004   recF TRUE 0.896 15.000 0.209 1.000   NA
 10370441 10370442 BMD_0004 BMD_0005 recF gyrB TRUE 0.784 241.000 0.249 0.003 Y NA
 10370442 10370443 BMD_0005 BMD_0006 gyrB gyrA TRUE 0.915 127.000 0.306 0.001 Y NA
 10370443 10370444 BMD_0006 BMD_0007 gyrA   FALSE 0.002 272.000 0.000 NA   NA
 10370444 10370445 BMD_0007 BMD_0008     FALSE 0.016 75.000 0.000 NA   NA
 10370445 10370446 BMD_0008 BMD_0009     FALSE 0.046 18.000 0.000 NA   NA
 10370446 10370447 BMD_0009 BMD_0010     FALSE 0.009 111.000 0.000 NA   NA
 10370447 10370448 BMD_0010 BMD_0011     FALSE 0.009 112.000 0.000 NA   NA
 10370450 10370451 BMD_0013 BMD_0014 guaB dacA FALSE 0.181 150.000 0.000 1.000 N NA
 10370451 10370452 BMD_0014 BMD_0015 dacA pdxS FALSE 0.158 191.000 0.000 1.000 N NA
 10370452 10370453 BMD_0015 BMD_0016 pdxS pdxT TRUE 0.973 22.000 0.488 NA Y NA
 10370453 10370454 BMD_0016 BMD_0017 pdxT serS FALSE 0.078 323.000 0.010 NA N NA
 10370454 10370455 BMD_0017 BMD_0018 serS   FALSE 0.009 113.000 0.000 NA   NA
 10370456 10370457 BMD_0019 BMD_0020 dck dgk TRUE 0.994 0.000 0.255 0.001 Y NA
 10370457 10370458 BMD_0020 BMD_0021 dgk yaaH FALSE 0.308 144.000 0.058 1.000   NA
 10370458 10370459 BMD_0021 BMD_0022 yaaH   TRUE 0.739 57.000 0.163 1.000   NA
 10370460 10370461 BMD_0023 BMD_0024 tadA dnaX FALSE 0.018 498.000 0.000 1.000 N NA
 10370461 10370462 BMD_0024 BMD_0025 dnaX   TRUE 0.707 20.000 0.071 NA   NA
 10370462 10370463 BMD_0025 BMD_0026   recR TRUE 0.936 16.000 0.604 NA   NA
 10370463 10370464 BMD_0026 BMD_0027 recR   TRUE 0.733 15.000 0.071 NA   NA
 10370464 10370465 BMD_0027 BMD_0028   bofA TRUE 0.637 117.000 0.417 NA   NA
 10370465 10370466 BMD_0028 BMD_0029 bofA   FALSE 0.002 297.000 0.000 NA   NA
 10370466 10370467 BMD_0029 BMD_0030     FALSE 0.003 234.000 0.000 NA   NA
 10370467 10370468 BMD_0030 BMD_0031     FALSE 0.009 113.000 0.000 NA   NA
 10370468 10370469 BMD_0031 BMD_0032     FALSE 0.069 9.000 0.000 NA   NA
 10370469 10370470 BMD_0032 BMD_0033     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10370470 10370471 BMD_0033 BMD_0034     FALSE 0.070 8.000 0.000 NA   NA
 10370471 10370472 BMD_0034 BMD_0035     FALSE 0.056 14.000 0.000 NA   NA
 10370472 10370473 BMD_0035 BMD_0036     FALSE 0.044 24.000 0.000 NA   NA
 10370473 10370474 BMD_0036 BMD_0037     FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10370474 10370475 BMD_0037 BMD_0038     FALSE 0.068 10.000 0.000 NA   NA
 10370475 10370476 BMD_0038 BMD_0039     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10370476 10370477 BMD_0039 BMD_0040     FALSE 0.074 6.000 0.000 NA   NA
 10370477 10370478 BMD_0040 BMD_0041     FALSE 0.012 92.000 0.000 NA   NA
 10370478 10370479 BMD_0041 BMD_0042     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10370479 10370480 BMD_0042 BMD_0043     FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10370480 10370481 BMD_0043 BMD_0044   csfB FALSE 0.007 139.000 0.000 NA   NA
 10370481 10370482 BMD_0044 BMD_0045 csfB   FALSE 0.569 153.000 0.400 NA   NA
 10370482 10370483 BMD_0045 BMD_0046   tmk TRUE 0.843 19.000 0.045 1.000 N NA
 10370483 10370484 BMD_0046 BMD_0047 tmk   FALSE 0.394 64.000 0.038 NA   NA
 10370484 10370485 BMD_0047 BMD_0048   holB FALSE 0.450 34.000 0.021 NA   NA
 10370485 10370486 BMD_0048 BMD_0049 holB yaaT TRUE 0.942 5.000 0.372 NA   NA
 10370486 10370487 BMD_0049 BMD_0050 yaaT yabA TRUE 0.851 15.000 0.183 NA   NA
 10370487 10370488 BMD_0050 BMD_0051 yabA   FALSE 0.620 79.000 0.193 NA   NA
 10370488 10370489 BMD_0051 BMD_0052     TRUE 0.977 -13.000 0.209 1.000   NA
 10370489 10370490 BMD_0052 BMD_0053     TRUE 0.949 -22.000 0.041 1.000   NA
 10370492 10370493 BMD_0055 BMD_0056 metG   TRUE 0.760 72.000 0.221 NA N NA
 10370493 10370494 BMD_0056 BMD_0057   rnmV FALSE 0.470 224.000 0.058 NA Y NA
 10370494 10370495 BMD_0057 BMD_0058 rnmV ksgA TRUE 0.968 -6.000 0.093 1.000 N NA
 10370495 10370496 BMD_0058 BMD_0059 ksgA yabG FALSE 0.289 78.000 0.022 NA   NA
 10370496 10370497 BMD_0059 BMD_0060 yabG   FALSE 0.024 49.000 0.000 NA   NA
 10370497 10370498 BMD_0060 BMD_0061   veg FALSE 0.009 112.000 0.000 NA   NA
 10370498 10370499 BMD_0061 BMD_0062 veg sspF FALSE 0.337 195.000 0.163 NA   NA
 10370499 10370500 BMD_0062 BMD_0063 sspF ispE FALSE 0.197 199.000 0.024 1.000   NA
 10370500 10370501 BMD_0063 BMD_0064 ispE purR TRUE 0.726 57.000 0.062 1.000 N NA
 10370501 10370502 BMD_0064 BMD_0065 purR   TRUE 0.906 22.000 0.227 NA N NA
 10370502 10370503 BMD_0065 BMD_0066   spoVG TRUE 0.652 156.000 0.377 NA N NA
 10370503 10370504 BMD_0066 BMD_0067 spoVG gcaD FALSE 0.543 195.000 0.014 1.000 Y NA
 10370504 10370505 BMD_0067 BMD_0068 gcaD prs TRUE 0.862 19.000 0.069 1.000 N NA
 10370505 10370506 BMD_0068 BMD_0069 prs ctc FALSE 0.351 188.000 0.027 1.000 N NA
 10370506 10370507 BMD_0069 BMD_0070 ctc pth TRUE 0.915 140.000 0.496 0.023 Y NA
 10370507 10370508 BMD_0070 BMD_0071 pth   FALSE 0.398 60.000 0.033 NA   NA
 10370508 10370509 BMD_0071 BMD_0072   mfd FALSE 0.358 70.000 0.035 NA   NA
 10370509 10370510 BMD_0072 BMD_0073 mfd   FALSE 0.007 135.000 0.000 NA   NA
 10370510 10370511 BMD_0073 BMD_0074   spoVT FALSE 0.008 117.000 0.000 NA   NA
 10370511 10370512 BMD_0074 BMD_0075 spoVT yabM FALSE 0.239 230.000 0.147 NA   NA
 10370512 10370513 BMD_0075 BMD_0076 yabM   TRUE 0.812 13.000 0.058 1.000   NA
 10370513 10370514 BMD_0076 BMD_0077     TRUE 0.764 21.000 0.054 1.000   NA
 10370514 10370515 BMD_0077 BMD_0078   yabP FALSE 0.423 100.000 0.108 NA   NA
 10370515 10370516 BMD_0078 BMD_0079 yabP   TRUE 0.982 -3.000 0.774 NA   NA
 10370516 10370517 BMD_0079 BMD_0080   divIC TRUE 0.814 5.000 0.074 NA   NA
 10370517 10370518 BMD_0080 BMD_0081 divIC   TRUE 0.701 89.000 0.134 1.000 N NA
 10370519 10370520 BMD_0082 BMD_0083     FALSE 0.066 11.000 0.000 NA   NA
 10370521 10370522 BMD_0084 BMD_0085 spoIIE   FALSE 0.292 72.000 0.019 NA   NA
 10370522 10370523 BMD_0085 BMD_0086     FALSE 0.332 71.000 0.029 NA   NA
 10370523 10370524 BMD_0086 BMD_0087   tilS FALSE 0.337 97.000 0.018 1.000   NA
 10370524 10370525 BMD_0087 BMD_0088 tilS hpt TRUE 0.905 28.000 0.067 0.043 N NA
 10370525 10370526 BMD_0088 BMD_0089 hpt ftsH TRUE 0.727 94.000 0.192 1.000 N NA
 10370526 10370527 BMD_0089 BMD_0090 ftsH coaX FALSE 0.289 218.000 0.029 1.000 N NA
 10370527 10370528 BMD_0090 BMD_0091 coaX hslO TRUE 0.884 13.000 0.060 1.000 N NA
 10370528 10370529 BMD_0091 BMD_0092 hslO cysK FALSE 0.365 202.000 0.053 1.000 N NA
 10370529 10370530 BMD_0092 BMD_0093 cysK pabB TRUE 0.803 98.000 0.107 1.000 Y NA
 10370530 10370531 BMD_0093 BMD_0094 pabB pabA TRUE 0.994 3.000 0.452 0.018 Y NA
 10370531 10370532 BMD_0094 BMD_0095 pabA pabC TRUE 0.988 5.000 0.532 1.000 Y NA
 10370532 10370533 BMD_0095 BMD_0096 pabC folB TRUE 0.858 22.000 0.000 1.000 Y NA
 10370533 10370534 BMD_0096 BMD_0097 folB folK TRUE 0.980 1.000 0.142 1.000 Y NA
 10370534 10370535 BMD_0097 BMD_0098 folK lysS FALSE 0.074 273.000 0.000 1.000 N NA
 10370535 10370536 BMD_0098 BMD_0099 lysS   FALSE 0.002 289.000 0.000 NA   NA
 10370536 10370537 BMD_0099 BMD_0100     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10370537 10370538 BMD_0100 BMD_0101     FALSE 0.017 66.000 0.000 NA   NA
 10370538 10370539 BMD_0101 BMD_0102   ctsR FALSE 0.003 235.000 0.000 NA   NA
 10370539 10370540 BMD_0102 BMD_0103 ctsR mcsA TRUE 0.892 42.000 0.681 NA   NA
 10370540 10370541 BMD_0103 BMD_0104 mcsA mcsB TRUE 0.977 4.000 0.848 1.000   NA
 10370541 10370542 BMD_0104 BMD_0105 mcsB clpC TRUE 0.952 21.000 0.425 1.000 N NA
 10370542 10370543 BMD_0105 BMD_0106 clpC radA TRUE 0.812 124.000 0.062 0.013 Y NA
 10370543 10370544 BMD_0106 BMD_0107 radA disA TRUE 0.908 4.000 0.126 1.000   NA
 10370544 10370545 BMD_0107 BMD_0108 disA   FALSE 0.271 148.000 0.088 NA   NA
 10370545 10370546 BMD_0108 BMD_0109   ispD TRUE 0.747 26.000 0.108 NA   NA
 10370546 10370547 BMD_0109 BMD_0110 ispD ispF TRUE 0.993 -3.000 0.419 1.000 Y NA
 10370547 10370548 BMD_0110 BMD_0111 ispF gltX FALSE 0.564 106.000 0.076 1.000 N NA
 10370548 10370549 BMD_0111 BMD_0112 gltX cysE FALSE 0.101 336.000 0.008 1.000 N NA
 10370549 10370550 BMD_0112 BMD_0113 cysE cysS TRUE 0.981 -10.000 0.039 0.043 N NA
 10370550 10370551 BMD_0113 BMD_0114 cysS mrnC TRUE 0.893 8.000 0.129 1.000   NA
 10370551 10370552 BMD_0114 BMD_0115 mrnC rlmB TRUE 0.986 -10.000 0.150 0.003   NA
 10370552 10370553 BMD_0115 BMD_0116 rlmB   TRUE 0.872 3.000 0.109 NA   NA
 10370553 10370554 BMD_0116 BMD_0117   sigH TRUE 0.760 69.000 0.361 NA   NA
 10370554 10370555 BMD_0117 BMD_0118 sigH rpmG TRUE 0.813 82.000 0.282 1.000 N NA
 10370555 10370556 BMD_0118 BMD_0119 rpmG secE TRUE 0.753 54.000 0.080 1.000 N NA
 10370556 10370557 BMD_0119 BMD_0120 secE nusG TRUE 0.776 196.000 0.843 1.000 N NA
 10370557 10370558 BMD_0120 BMD_0121 nusG rplK TRUE 0.775 166.000 0.681 1.000 N NA
 10370558 10370559 BMD_0121 BMD_0122 rplK rplA TRUE 0.955 111.000 0.838 0.018 Y NA
 10370559 10370560 BMD_0122 BMD_0123 rplA rplJ TRUE 0.777 250.000 0.302 0.018 Y NA
 10370560 10370561 BMD_0123 BMD_0124 rplJ rplL TRUE 0.985 45.000 0.884 0.014 Y NA
 10370561 10370562 BMD_0124 BMD_0125 rplL   TRUE 0.712 113.000 0.050 1.000 Y NA
 10370562 10370563 BMD_0125 BMD_0126   rpoB FALSE 0.194 246.000 0.008 1.000 N NA
 10370563 10370564 BMD_0126 BMD_0127 rpoB rpoC TRUE 0.981 63.000 0.851 0.002 Y NA
 10370564 10370565 BMD_0127 BMD_0128 rpoC rplGB FALSE 0.464 132.000 0.065 1.000 N NA
 10370565 10370566 BMD_0128 BMD_0129 rplGB rpsL TRUE 0.917 100.000 0.239 0.018 Y NA
 10370566 10370567 BMD_0129 BMD_0130 rpsL rpsG TRUE 0.964 51.000 0.224 0.002 Y NA
 10370567 10370568 BMD_0130 BMD_0131 rpsG fusA TRUE 0.957 58.000 0.579 1.000 Y NA
 10370568 10370569 BMD_0131 BMD_0132 fusA tuf TRUE 0.936 117.000 0.400 0.001 Y NA
 10370569 10370570 BMD_0132 BMD_0133 tuf rpsJ FALSE 0.532 317.000 0.318 1.000 Y NA
 10370570 10370571 BMD_0133 BMD_0134 rpsJ rplC TRUE 0.977 42.000 0.467 0.018 Y NA
 10370571 10370572 BMD_0134 BMD_0135 rplC rplD TRUE 0.986 29.000 0.544 0.014 Y NA
 10370572 10370573 BMD_0135 BMD_0136 rplD rplW TRUE 0.994 0.000 0.307 0.014 Y NA
 10370573 10370574 BMD_0136 BMD_0137 rplW rplB TRUE 0.989 28.000 0.849 0.018 Y NA
 10370574 10370575 BMD_0137 BMD_0138 rplB rpsS TRUE 0.980 58.000 0.820 0.018 Y NA
 10370575 10370576 BMD_0138 BMD_0139 rpsS rplV TRUE 0.991 20.000 0.769 0.018 Y NA
 10370576 10370577 BMD_0139 BMD_0140 rplV rpsC TRUE 0.995 4.000 0.719 0.018 Y NA
 10370577 10370578 BMD_0140 BMD_0141 rpsC rplP TRUE 0.996 3.000 0.828 0.018 Y NA
 10370578 10370579 BMD_0141 BMD_0142 rplP rpmC TRUE 0.998 -10.000 0.802 0.014 Y NA
 10370579 10370580 BMD_0142 BMD_0143 rpmC rpsQ TRUE 0.990 26.000 0.828 0.014 Y NA
 10370580 10370581 BMD_0143 BMD_0144 rpsQ rplN TRUE 0.981 52.000 0.791 0.018 Y NA
 10370581 10370582 BMD_0144 BMD_0145 rplN rplX TRUE 0.933 50.000 0.071 0.018 Y NA
 10370582 10370583 BMD_0145 BMD_0146 rplX rplE TRUE 0.949 32.000 0.057 0.014 Y NA
 10370583 10370584 BMD_0146 BMD_0147 rplE rpsN TRUE 0.982 34.000 0.496 0.014 Y NA
 10370584 10370585 BMD_0147 BMD_0148 rpsN rpsH TRUE 0.983 31.000 0.473 0.014 Y NA
 10370585 10370586 BMD_0148 BMD_0149 rpsH rplF TRUE 0.988 31.000 0.808 0.014 Y NA
 10370586 10370587 BMD_0149 BMD_0150 rplF rplR TRUE 0.987 33.000 0.815 0.014 Y NA
 10370587 10370588 BMD_0150 BMD_0151 rplR rpsE TRUE 0.991 21.000 0.814 0.018 Y NA
 10370588 10370589 BMD_0151 BMD_0152 rpsE rpmD TRUE 0.992 15.000 0.789 0.018 Y NA
 10370589 10370590 BMD_0152 BMD_0153 rpmD rplO TRUE 0.986 34.000 0.653 0.002 Y NA
 10370590 10370591 BMD_0153 BMD_0154 rplO secY TRUE 0.987 0.000 0.730 1.000 N NA
 10370591 10370592 BMD_0154 BMD_0155 secY adk TRUE 0.824 67.000 0.241 1.000 N NA
 10370592 10370593 BMD_0155 BMD_0156 adk map TRUE 0.909 33.000 0.290 1.000 N NA
 10370593 10370594 BMD_0156 BMD_0157 map infA FALSE 0.600 236.000 0.160 1.000 Y NA
 10370594 10370595 BMD_0157 BMD_0158 infA rpsM TRUE 0.777 176.000 0.075 0.018 Y NA
 10370595 10370596 BMD_0158 BMD_0159 rpsM rpsK TRUE 0.991 24.000 0.810 0.014 Y NA
 10370596 10370597 BMD_0159 BMD_0160 rpsK rpoA TRUE 0.654 181.000 0.308 1.000 N NA
 10370597 10370598 BMD_0160 BMD_0161 rpoA rplQ TRUE 0.946 45.000 0.873 1.000 N NA
 10370598 10370599 BMD_0161 BMD_0162 rplQ cbiO1 FALSE 0.464 139.000 0.074 1.000 N NA
 10370599 10370600 BMD_0162 BMD_0163 cbiO1 cbiO2 TRUE 0.999 -24.000 0.713 0.022 Y NA
 10370600 10370601 BMD_0163 BMD_0164 cbiO2 cbiQ TRUE 0.986 -3.000 0.139 1.000 Y NA
 10370601 10370602 BMD_0164 BMD_0165 cbiQ truA TRUE 0.912 19.000 0.170 1.000 N NA
 10370602 10370603 BMD_0165 BMD_0166 truA rplM TRUE 0.640 157.000 0.052 1.000 Y NA
 10370603 10370604 BMD_0166 BMD_0167 rplM rpsI TRUE 0.989 23.000 0.601 0.014 Y NA
 10370604 10370605 BMD_0167 BMD_0168 rpsI   FALSE 0.196 109.000 0.021 NA   NA
 10370605 10370606 BMD_0168 BMD_0169   cwlD TRUE 0.659 71.000 0.211 NA   NA
 10370606 10370607 BMD_0169 BMD_0170 cwlD mrp TRUE 0.751 91.000 0.211 1.000 N NA
 10370608 10370609 BMD_0171 BMD_0172   gerD FALSE 0.006 188.000 0.000 NA   NA
 10370612 10370613 BMD_0175 BMD_0176     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10370613 10370614 BMD_0176 BMD_0177     FALSE 0.023 50.000 0.000 NA   NA
 10370614 10370615 BMD_0177 BMD_0178     FALSE 0.010 104.000 0.000 NA   NA
 10370615 10370616 BMD_0178 BMD_0179     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10370616 10370617 BMD_0179 BMD_0180     FALSE 0.069 9.000 0.000 NA   NA
 10370617 10370618 BMD_0180 BMD_0181     FALSE 0.070 8.000 0.000 NA   NA
 10370618 10370619 BMD_0181 BMD_0182     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10370619 10370620 BMD_0182 BMD_0183     FALSE 0.068 10.000 0.000 NA   NA
 10370620 10370621 BMD_0183 BMD_0184     FALSE 0.046 23.000 0.000 NA   NA
 10370621 10370622 BMD_0184 BMD_0185   argI FALSE 0.006 146.000 0.000 NA   NA
 10370624 10370625 BMD_0187 BMD_0188 sigW rsiW TRUE 0.979 15.000 0.583 NA Y NA
 10370625 10370626 BMD_0188 BMD_0189 rsiW   FALSE 0.140 193.000 0.028 NA   NA
 10370626 10370627 BMD_0189 BMD_0190     TRUE 0.982 -7.000 0.502 NA   NA
 10370627 10370628 BMD_0190 BMD_0191   glmM TRUE 0.769 29.000 0.150 NA   NA
 10370628 10370629 BMD_0191 BMD_0192 glmM glmS FALSE 0.064 431.000 0.030 1.000 N NA
 10370629 10370630 BMD_0192 BMD_0193 glmS   FALSE 0.006 172.000 0.000 NA   NA
 10370630 10370631 BMD_0193 BMD_0194     FALSE 0.007 138.000 0.000 NA   NA
 10370631 10370632 BMD_0194 BMD_0195     FALSE 0.006 144.000 0.000 NA   NA
 10370632 10370633 BMD_0195 BMD_0196     FALSE 0.006 161.000 0.000 NA   NA
 10370633 10370634 BMD_0196 BMD_0197     TRUE 0.931 61.000 0.336 0.008 N NA
 10370634 10370635 BMD_0197 BMD_0198     TRUE 0.887 6.000 0.031 1.000 N NA
 10370635 10370636 BMD_0198 BMD_0199     FALSE 0.166 90.000 0.000 NA N NA
 10370638 10370639 BMD_0201 BMD_0202 mscL   FALSE 0.397 196.000 0.000 1.000 Y NA
 10370639 10370640 BMD_0202 BMD_0203     FALSE 0.151 196.000 0.000 1.000 N NA
 10370640 10370641 BMD_0203 BMD_0204   potA TRUE 0.943 21.000 0.326 1.000 N NA
 10370641 10370642 BMD_0204 BMD_0205 potA potB TRUE 0.998 -10.000 0.928 0.041 Y NA
 10370642 10370643 BMD_0205 BMD_0206 potB potC TRUE 0.994 2.000 0.492 0.041 Y NA
 10370643 10370644 BMD_0206 BMD_0207 potC potD TRUE 0.994 -3.000 0.253 0.041 Y NA
 10370644 10370645 BMD_0207 BMD_0208 potD   FALSE 0.026 219.000 0.000 1.000   NA
 10370645 10370646 BMD_0208 BMD_0209     FALSE 0.040 146.000 0.000 1.000   NA
 10370646 10370647 BMD_0209 BMD_0210     TRUE 0.996 -7.000 0.606 1.000 Y NA
 10370648 10370649 BMD_0211 BMD_0212   apbE TRUE 0.980 -16.000 0.118 1.000 N NA
 10370650 10370651 BMD_0213 BMD_0214 ddl   TRUE 0.861 97.000 0.044 0.005 Y NA
 10370651 10370652 BMD_0214 BMD_0215     FALSE 0.286 197.000 0.004 1.000 N NA
 10370652 10370653 BMD_0215 BMD_0216   uvdE TRUE 0.720 95.000 0.013 1.000 Y NA
 10370655 10370656 BMD_0218 BMD_0219 acpS   FALSE 0.603 59.000 0.038 NA N NA
 10370656 10370657 BMD_0219 BMD_0220   alr TRUE 0.776 114.000 0.194 NA Y NA
 10370657 10370658 BMD_0220 BMD_0221 alr ndoAI FALSE 0.446 201.000 0.108 1.000 N NA
 10370658 10370659 BMD_0221 BMD_0222 ndoAI ndoA TRUE 0.960 5.000 0.260 1.000 N NA
 10370659 10370660 BMD_0222 BMD_0223 ndoA rsbR FALSE 0.357 160.000 0.000 NA Y NA
 10370660 10370661 BMD_0223 BMD_0224 rsbR rsbS TRUE 0.899 3.000 0.000 NA Y NA
 10370661 10370662 BMD_0224 BMD_0225 rsbS rsbT TRUE 0.981 4.000 0.320 NA Y NA
 10370662 10370663 BMD_0225 BMD_0226 rsbT rsbU TRUE 0.981 14.000 0.617 NA Y NA
 10370663 10370664 BMD_0226 BMD_0227 rsbU rsbV TRUE 0.948 60.000 0.440 1.000 Y NA
 10370664 10370665 BMD_0227 BMD_0228 rsbV rsbW TRUE 0.995 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 10370665 10370666 BMD_0228 BMD_0229 rsbW sigB TRUE 0.996 -34.000 0.838 1.000 N NA
 10370666 10370667 BMD_0229 BMD_0230 sigB rsbX TRUE 0.956 0.000 0.243 1.000   NA
 10370667 10370668 BMD_0230 BMD_0231 rsbX   FALSE 0.408 85.000 0.027 1.000   NA
 10370670 10370671 BMD_0233 BMD_0234     FALSE 0.007 135.000 0.000 NA   NA
 10370671 10370672 BMD_0234 BMD_0235     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10370672 10370673 BMD_0235 BMD_0236     FALSE 0.068 10.000 0.000 NA   NA
 10370673 10370674 BMD_0236 BMD_0237     FALSE 0.043 25.000 0.000 NA   NA
 10370674 10370675 BMD_0237 BMD_0238     FALSE 0.036 29.000 0.000 NA   NA
 10370675 10370676 BMD_0238 BMD_0239     FALSE 0.063 12.000 0.000 NA   NA
 10370676 10370677 BMD_0239 BMD_0240     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10370677 10370678 BMD_0240 BMD_0241     FALSE 0.059 13.000 0.000 NA   NA
 10370678 10370679 BMD_0241 BMD_0242     FALSE 0.046 23.000 0.000 NA   NA
 10370679 10370680 BMD_0242 BMD_0243     FALSE 0.012 91.000 0.000 NA   NA
 10370680 10370681 BMD_0243 BMD_0244     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10370681 10370682 BMD_0244 BMD_0245     FALSE 0.013 89.000 0.000 NA   NA
 10370682 10370683 BMD_0245 BMD_0246     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10370683 10370684 BMD_0246 BMD_0247     FALSE 0.016 71.000 0.000 NA   NA
 10370684 10370685 BMD_0247 BMD_0248     FALSE 0.044 24.000 0.000 NA   NA
 10370685 10370686 BMD_0248 BMD_0249     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10370686 10370687 BMD_0249 BMD_0250     FALSE 0.004 221.000 0.000 NA   NA
 10370687 10370688 BMD_0250 BMD_0251     TRUE 0.951 -3.000 0.217 NA   NA
 10370688 10370689 BMD_0251 BMD_0252   rimI TRUE 0.858 15.000 0.127 1.000   NA
 10370689 10370690 BMD_0252 BMD_0253 rimI   TRUE 0.961 -15.000 0.090 1.000   NA
 10370692 10370693 BMD_0255 BMD_0256   tatA FALSE 0.126 54.000 0.000 1.000   NA
 10370693 10370694 BMD_0256 BMD_0257 tatA tatC TRUE 0.823 16.000 0.000 NA Y NA
 10370695 10370696 BMD_0258 BMD_0259     TRUE 0.897 -3.000 0.080 NA   NA
 10370697 10370698 BMD_0260 BMD_0261 groES groEL TRUE 0.952 68.000 0.674 1.000 Y NA
 10370698 10370699 BMD_0261 BMD_0262 groEL   FALSE 0.038 159.000 0.000 1.000   NA
 10370699 10370700 BMD_0262 BMD_0263     TRUE 0.956 12.000 0.714 NA   NA
 10370700 10370701 BMD_0263 BMD_0264     TRUE 0.979 -3.000 0.642 NA   NA
 10370701 10370702 BMD_0264 BMD_0265     FALSE 0.117 265.000 0.007 NA N NA
 10370702 10370703 BMD_0265 BMD_0266   pbuG FALSE 0.009 333.000 0.000 1.000   NA
 10370703 10370704 BMD_0266 BMD_0267 pbuG   FALSE 0.001 381.000 0.000 NA   NA
 10370704 10370705 BMD_0267 BMD_0268     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10370705 10370706 BMD_0268 BMD_0269     FALSE 0.017 66.000 0.000 NA   NA
 10370706 10370707 BMD_0269 BMD_0270     FALSE 0.006 166.000 0.000 NA   NA
 10370707 10370708 BMD_0270 BMD_0271   purE FALSE 0.002 316.000 0.000 NA   NA
 10370708 10370709 BMD_0271 BMD_0272 purE purK TRUE 0.993 -7.000 0.038 0.001 Y NA
 10370709 10370710 BMD_0272 BMD_0273 purK purB TRUE 0.976 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 10370710 10370711 BMD_0273 BMD_0274 purB purC TRUE 0.832 75.000 0.072 1.000 Y NA
 10370711 10370712 BMD_0274 BMD_0275 purC purS TRUE 0.986 8.000 0.460 1.000 Y NA
 10370712 10370713 BMD_0275 BMD_0276 purS purQ TRUE 0.997 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 10370713 10370714 BMD_0276 BMD_0277 purQ purL TRUE 0.998 -16.000 0.346 0.001 Y NA
 10370714 10370715 BMD_0277 BMD_0278 purL purF TRUE 0.994 -24.000 0.223 1.000 Y NA
 10370715 10370716 BMD_0278 BMD_0279 purF purM TRUE 0.960 27.000 0.248 1.000 Y NA
 10370716 10370717 BMD_0279 BMD_0280 purM purN TRUE 0.995 -3.000 0.238 0.002 Y NA
 10370717 10370718 BMD_0280 BMD_0281 purN purH TRUE 0.848 104.000 0.225 1.000 Y NA
 10370718 10370719 BMD_0281 BMD_0282 purH purD TRUE 0.971 14.000 0.238 1.000 Y NA
 10370721 10370722 BMD_0284 BMD_0285     FALSE 0.243 148.000 0.025 1.000   NA
 10370724 10370725 BMD_0287 BMD_0288   pcrA TRUE 0.705 29.000 0.049 1.000   NA
 10370725 10370726 BMD_0288 BMD_0289 pcrA ligA TRUE 0.971 21.000 0.103 0.011 Y NA
 10370726 10370727 BMD_0289 BMD_0290 ligA   FALSE 0.536 14.000 0.005 NA   NA
 10370729 10370730 BMD_0292 BMD_0293 gatC gatA TRUE 0.991 17.000 0.643 0.002 Y NA
 10370730 10370731 BMD_0293 BMD_0294 gatA gatB TRUE 0.991 15.000 0.492 0.002 Y NA
 10370731 10370732 BMD_0294 BMD_0295 gatB   FALSE 0.252 235.000 0.034 1.000 N NA
 10370732 10370733 BMD_0295 BMD_0296   rumA TRUE 0.783 96.000 0.299 1.000 N NA
 10370733 10370734 BMD_0296 BMD_0297 rumA   FALSE 0.156 193.000 0.000 1.000 N NA
 10370734 10370735 BMD_0297 BMD_0298     FALSE 0.015 81.000 0.000 NA   NA
 10370735 10370736 BMD_0298 BMD_0299     FALSE 0.004 217.000 0.000 NA   NA
 10370736 10370737 BMD_0299 BMD_0300     FALSE 0.005 196.000 0.000 NA   NA
 10370737 10370738 BMD_0300 BMD_0301     FALSE 0.056 14.000 0.000 NA   NA
 10370738 10370739 BMD_0301 BMD_0302   med FALSE 0.037 173.000 0.000 1.000   NA
 10370739 10370740 BMD_0302 BMD_0303 med kin TRUE 0.827 24.000 0.115 1.000   NA
 10370742 10370743 BMD_0305 BMD_0306     FALSE 0.003 253.000 0.000 NA   NA
 10370743 10370744 BMD_0306 BMD_0307     FALSE 0.108 64.000 0.000 1.000   NA
 10370744 10370745 BMD_0307 BMD_0308     FALSE 0.368 68.000 0.000 1.000 N NA
 10370747 10370748 BMD_0310 BMD_0311   glnQ FALSE 0.004 467.000 0.000 1.000   NA
 10370748 10370749 BMD_0311 BMD_0312 glnQ glnH TRUE 0.975 22.000 0.389 1.000 Y NA
 10370749 10370750 BMD_0312 BMD_0313 glnH glnM TRUE 0.942 78.000 0.280 0.052 Y NA
 10370750 10370751 BMD_0313 BMD_0314 glnM glnP TRUE 0.993 15.000 0.947 0.008 Y NA
 10370751 10370752 BMD_0314 BMD_0315 glnP   FALSE 0.473 224.000 0.000 0.082 Y NA
 10370752 10370753 BMD_0315 BMD_0316     FALSE 0.007 129.000 0.000 NA   NA
 10370754 10370755 BMD_0317 BMD_0318     FALSE 0.309 134.000 0.000 0.004   NA
 10370755 10370756 BMD_0318 BMD_0319   ykoH TRUE 0.842 73.000 0.533 1.000   NA
 10370756 10370757 BMD_0319 BMD_0320 ykoH ykoG TRUE 0.970 4.000 0.100 1.000 Y NA
 10370757 10370758 BMD_0320 BMD_0321 ykoG   TRUE 0.645 82.000 0.000 1.000 Y NA
 10370758 10370759 BMD_0321 BMD_0322     TRUE 0.996 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 10370760 10370761 BMD_0323 BMD_0324     FALSE 0.029 36.000 0.000 NA   NA
 10370761 10370762 BMD_0324 BMD_0325     TRUE 0.978 2.000 1.000 NA   NA
 10370762 10370763 BMD_0325 BMD_0326     FALSE 0.040 146.000 0.000 1.000   NA
 10370763 10370764 BMD_0326 BMD_0327   ohrA FALSE 0.040 153.000 0.000 1.000   NA
 10370764 10370765 BMD_0327 BMD_0328 ohrA   FALSE 0.025 422.000 0.000 1.000 N NA
 10370765 10370766 BMD_0328 BMD_0329     FALSE 0.109 230.000 0.000 1.000 N NA
 10370776 10370777 BMD_0339 BMD_0340 corA malK FALSE 0.178 155.000 0.000 1.000 N NA
 10370777 10370778 BMD_0340 BMD_0341 malK malR TRUE 0.997 -7.000 0.857 1.000 Y NA
 10370778 10370779 BMD_0341 BMD_0342 malR   FALSE 0.040 141.000 0.000 1.000   NA
 10370779 10370780 BMD_0342 BMD_0343     TRUE 0.991 -13.000 1.000 NA   NA
 10370780 10370781 BMD_0343 BMD_0344   kinC FALSE 0.015 81.000 0.000 NA   NA
 10370781 10370782 BMD_0344 BMD_0345 kinC   FALSE 0.036 366.000 0.000 1.000 N NA
 10370782 10370783 BMD_0345 BMD_0346     FALSE 0.003 251.000 0.000 NA   NA
 10370783 10370784 BMD_0346 BMD_0347     FALSE 0.009 110.000 0.000 NA   NA
 10370784 10370785 BMD_0347 BMD_0348     FALSE 0.019 62.000 0.000 NA   NA
 10370785 10370786 BMD_0348 BMD_0349     FALSE 0.001 372.000 0.000 NA   NA
 10370786 10370787 BMD_0349 BMD_0350     FALSE 0.579 94.000 0.211 NA   NA
 10370787 10370788 BMD_0350 BMD_0351     TRUE 0.952 15.000 0.833 NA   NA
 10370788 10370789 BMD_0351 BMD_0352     TRUE 0.948 13.000 0.623 NA   NA
 10370789 10370790 BMD_0352 BMD_0353     TRUE 0.935 -3.000 0.151 NA   NA
 10370790 10370791 BMD_0353 BMD_0354     TRUE 0.980 -22.000 0.286 NA   NA
 10370793 10370794 BMD_0356 BMD_0357     FALSE 0.058 107.000 0.000 1.000   NA
 10370796 10370797 BMD_0359 BMD_0360     FALSE 0.006 164.000 0.000 NA   NA
 10370799 10370800 BMD_0362 BMD_0363   nos FALSE 0.573 100.000 0.000 1.000 Y NA
 10370801 10370802 BMD_0364 BMD_0365   nsrR FALSE 0.012 90.000 0.000 NA   NA
 10370803 10370804 BMD_0366 BMD_0367 hmp   FALSE 0.203 73.000 0.000 NA N NA
 10370804 10370805 BMD_0367 BMD_0368     FALSE 0.224 144.000 0.059 NA   NA
 10370805 10370806 BMD_0368 BMD_0369     FALSE 0.001 360.000 0.000 NA   NA
 10370807 10370808 BMD_0370 BMD_0371 ade   FALSE 0.001 368.000 0.000 NA   NA
 10370809 10370810 BMD_0372 BMD_0373     FALSE 0.363 40.000 0.008 NA   NA
 10370810 10370811 BMD_0373 BMD_0374   yihY TRUE 0.838 15.000 0.159 NA   NA
 10370812 10370813 BMD_0375 BMD_0376 cadA   FALSE 0.004 225.000 0.000 NA   NA
 10370814 10370815 BMD_0377 BMD_0378     TRUE 0.906 16.000 0.139 1.000 N NA
 10370817 10370818 BMD_0380 BMD_0381 padC   FALSE 0.159 190.000 0.000 1.000 N NA
 10370820 10370821 BMD_0383 BMD_0384 cax   FALSE 0.409 179.000 0.212 NA   NA
 10370823 10370824 BMD_0386 BMD_0387     FALSE 0.264 164.000 0.093 NA   NA
 10370824 10370825 BMD_0387 BMD_0388   pdaA TRUE 0.720 95.000 0.185 1.000 N NA
 10370825 10370826 BMD_0388 BMD_0389 pdaA rumA FALSE 0.360 163.000 0.025 1.000 N NA
 10370826 10370827 BMD_0389 BMD_0390 rumA   FALSE 0.003 251.000 0.000 NA   NA
 10370827 10370828 BMD_0390 BMD_0391     FALSE 0.001 439.000 0.000 NA   NA
 10370828 10370829 BMD_0391 BMD_0392   kin FALSE 0.046 333.000 0.000 1.000 N NA
 10370830 10370831 BMD_0393 BMD_0394     TRUE 0.716 103.000 0.500 NA   NA
 10370831 10370832 BMD_0394 BMD_0395     FALSE 0.041 256.000 0.000 NA N NA
 10370832 10370833 BMD_0395 BMD_0396     TRUE 0.746 62.000 0.200 1.000   NA
 10370842 10370843 BMD_0405 BMD_0406   sspE FALSE 0.416 98.000 0.051 1.000   NA
 10370843 10370844 BMD_0406 BMD_0407 sspE   FALSE 0.006 190.000 0.000 NA   NA
 10370844 10370845 BMD_0407 BMD_0408     FALSE 0.188 196.000 0.058 NA   NA
 10370845 10370846 BMD_0408 BMD_0409   ygaD FALSE 0.369 170.000 0.077 NA N NA
 10370847 10370848 BMD_0410 BMD_0411   gsaB FALSE 0.028 550.000 0.102 NA   NA
 10370849 10370850 BMD_0412 BMD_0413 drrA   TRUE 0.982 -7.000 0.488 NA   NA
 10370850 10370851 BMD_0413 BMD_0414     TRUE 0.957 4.000 0.500 NA   NA
 10370851 10370852 BMD_0414 BMD_0415     FALSE 0.552 94.000 0.188 NA   NA
 10370852 10370853 BMD_0415 BMD_0416     FALSE 0.286 70.000 0.015 NA   NA
 10370853 10370854 BMD_0416 BMD_0417   perR FALSE 0.177 255.000 0.005 1.000 N NA
 10370856 10370857 BMD_0419 BMD_0420     FALSE 0.001 351.000 0.000 NA   NA
 10370857 10370858 BMD_0420 BMD_0421     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10370858 10370859 BMD_0421 BMD_0422     FALSE 0.009 111.000 0.000 NA   NA
 10370859 10370860 BMD_0422 BMD_0423     FALSE 0.069 9.000 0.000 NA   NA
 10370860 10370861 BMD_0423 BMD_0424     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10370861 10370862 BMD_0424 BMD_0425     FALSE 0.046 22.000 0.000 NA   NA
 10370862 10370863 BMD_0425 BMD_0426     FALSE 0.044 24.000 0.000 NA   NA
 10370863 10370864 BMD_0426 BMD_0427     FALSE 0.063 12.000 0.000 NA   NA
 10370864 10370865 BMD_0427 BMD_0428     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10370865 10370866 BMD_0428 BMD_0429     FALSE 0.049 16.000 0.000 NA   NA
 10370866 10370867 BMD_0429 BMD_0430     FALSE 0.041 26.000 0.000 NA   NA
 10370867 10370868 BMD_0430 BMD_0431     FALSE 0.066 11.000 0.000 NA   NA
 10370868 10370869 BMD_0431 BMD_0432     FALSE 0.074 6.000 0.000 NA   NA
 10370869 10370870 BMD_0432 BMD_0433     FALSE 0.034 31.000 0.000 NA   NA
 10370870 10370871 BMD_0433 BMD_0434     FALSE 0.036 29.000 0.000 NA   NA
 10370871 10370872 BMD_0434 BMD_0435     FALSE 0.074 6.000 0.000 NA   NA
 10370872 10370873 BMD_0435 BMD_0436     FALSE 0.031 33.000 0.000 NA   NA
 10370873 10370874 BMD_0436 BMD_0437     FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10370874 10370875 BMD_0437 BMD_0438     FALSE 0.034 31.000 0.000 NA   NA
 10370875 10370876 BMD_0438 BMD_0439     FALSE 0.016 73.000 0.000 NA   NA
 10370878 10370879 BMD_0441 BMD_0442     FALSE 0.616 73.000 0.174 NA   NA
 10370879 10370880 BMD_0442 BMD_0443     FALSE 0.480 80.000 0.097 NA   NA
 10370880 10370881 BMD_0443 BMD_0444     FALSE 0.010 459.000 0.000 NA N NA
 10370881 10370882 BMD_0444 BMD_0445   yhbH FALSE 0.321 325.000 0.683 NA   NA
 10370882 10370883 BMD_0445 BMD_0446 yhbH   FALSE 0.010 105.000 0.000 NA   NA
 10370883 10370884 BMD_0446 BMD_0447     FALSE 0.027 40.000 0.000 NA   NA
 10370884 10370885 BMD_0447 BMD_0448     FALSE 0.013 88.000 0.000 NA   NA
 10370885 10370886 BMD_0448 BMD_0449     FALSE 0.056 227.000 0.000 NA N NA
 10370887 10370888 BMD_0450 BMD_0451 thiC   FALSE 0.002 310.000 0.000 NA   NA
 10370889 10370890 BMD_0452 BMD_0453 uppP   FALSE 0.016 520.000 0.000 1.000 N NA
 10370890 10370891 BMD_0453 BMD_0454   ytvI FALSE 0.004 214.000 0.000 NA   NA
 10370891 10370892 BMD_0454 BMD_0455 ytvI   FALSE 0.006 161.000 0.000 NA   NA
 10370892 10370893 BMD_0455 BMD_0456     FALSE 0.043 25.000 0.000 NA   NA
 10370895 10370896 BMD_0458 BMD_0459     FALSE 0.046 20.000 0.000 NA   NA
 10370896 10370897 BMD_0459 BMD_0460   bioB FALSE 0.181 148.000 0.000 1.000 N NA
 10370897 10370898 BMD_0460 BMD_0461 bioB glpP FALSE 0.094 243.000 0.000 1.000 N NA
 10370898 10370899 BMD_0461 BMD_0462 glpP   FALSE 0.623 21.000 0.000 1.000 N NA
 10370899 10370900 BMD_0462 BMD_0463     TRUE 0.995 -3.000 0.391 0.039 Y NA
 10370900 10370901 BMD_0463 BMD_0464     TRUE 0.997 -3.000 0.848 0.039 Y NA
 10370901 10370902 BMD_0464 BMD_0465     TRUE 0.991 14.000 0.708 0.039 Y NA
 10370902 10370903 BMD_0465 BMD_0466     TRUE 0.676 87.000 0.104 1.000 N NA
 10370903 10370904 BMD_0466 BMD_0467     FALSE 0.001 504.000 0.000 NA   NA
 10370904 10370905 BMD_0467 BMD_0468     TRUE 0.647 94.000 0.292 NA   NA
 10370905 10370906 BMD_0468 BMD_0469     FALSE 0.541 61.000 0.092 NA   NA
 10370906 10370907 BMD_0469 BMD_0470     TRUE 0.917 33.000 0.147 NA Y NA
 10370907 10370908 BMD_0470 BMD_0471     FALSE 0.001 387.000 0.000 NA   NA
 10370908 10370909 BMD_0471 BMD_0472     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10370909 10370910 BMD_0472 BMD_0473     FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10370910 10370911 BMD_0473 BMD_0474     FALSE 0.066 11.000 0.000 NA   NA
 10370911 10370912 BMD_0474 BMD_0475     FALSE 0.006 140.000 0.000 NA   NA
 10370912 10370913 BMD_0475 BMD_0476     FALSE 0.001 346.000 0.000 NA   NA
 10370913 10370914 BMD_0476 BMD_0477   phaZ1 FALSE 0.019 249.000 0.000 1.000   NA
 10370914 10370915 BMD_0477 BMD_0478 phaZ1 yocH FALSE 0.014 279.000 0.000 1.000   NA
 10370915 10370916 BMD_0478 BMD_0479 yocH   FALSE 0.029 209.000 0.000 1.000   NA
 10370916 10370917 BMD_0479 BMD_0480     FALSE 0.004 230.000 0.000 NA   NA
 10370918 10370919 BMD_0481 BMD_0482     FALSE 0.006 161.000 0.000 NA   NA
 10370920 10370921 BMD_0483 BMD_0484   cls FALSE 0.024 478.000 0.000 0.095   NA
 10370921 10370922 BMD_0484 BMD_0485 cls   FALSE 0.006 175.000 0.000 NA   NA
 10370922 10370923 BMD_0485 BMD_0486     FALSE 0.015 76.000 0.000 NA   NA
 10370925 10370926 BMD_0488 BMD_0489     FALSE 0.007 138.000 0.000 NA   NA
 10370928 10370929 BMD_0491 BMD_0492 iolG iolC FALSE 0.088 80.000 0.000 1.000   NA
 10370929 10370930 BMD_0492 BMD_0493 iolC mmsA FALSE 0.312 86.000 0.000 1.000 N NA
 10370930 10370931 BMD_0493 BMD_0494 mmsA iolD FALSE 0.230 113.000 0.000 1.000 N NA
 10370931 10370932 BMD_0494 BMD_0495 iolD   FALSE 0.316 85.000 0.000 1.000 N NA
 10370932 10370933 BMD_0495 BMD_0496     FALSE 0.403 61.000 0.000 1.000 N NA
 10370933 10370934 BMD_0496 BMD_0497   iolB FALSE 0.184 135.000 0.000 1.000 N NA
 10370937 10370938 BMD_0500 BMD_0501     FALSE 0.001 384.000 0.000 NA   NA
 10370939 10370940 BMD_0502 BMD_0503     FALSE 0.001 435.000 0.000 NA   NA
 10370940 10370941 BMD_0503 BMD_0504     FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10370942 10370943 BMD_0505 BMD_0506     TRUE 0.964 22.000 0.667 1.000 N NA
 10370946 10370947 BMD_0509 BMD_0510     FALSE 0.037 167.000 0.000 1.000   NA
 10370947 10370948 BMD_0510 BMD_0511   ftsZ FALSE 0.007 360.000 0.000 1.000   NA
 10370948 10370949 BMD_0511 BMD_0512 ftsZ   FALSE 0.045 337.000 0.000 1.000 N NA
 10370949 10370950 BMD_0512 BMD_0513     FALSE 0.095 72.000 0.000 1.000   NA
 10370951 10370952 BMD_0514 BMD_0515     FALSE 0.006 142.000 0.000 NA   NA
 10370960 10370961 BMD_0523 BMD_0524 lctP ldh TRUE 0.679 69.000 0.000 1.000 Y NA
 10370962 10370963 BMD_0525 BMD_0526     FALSE 0.181 142.000 0.000 1.000 N NA
 10370965 10370966 BMD_0528 BMD_0529     FALSE 0.001 403.000 0.000 NA   NA
 10370966 10370967 BMD_0529 BMD_0530     FALSE 0.001 369.000 0.000 NA   NA
 10370967 10370968 BMD_0530 BMD_0531     FALSE 0.002 317.000 0.000 NA   NA
 10370968 10370969 BMD_0531 BMD_0532   glpP FALSE 0.272 114.000 0.014 1.000   NA
 10370969 10370970 BMD_0532 BMD_0533 glpP glpF FALSE 0.450 178.000 0.083 1.000 N NA
 10370970 10370971 BMD_0533 BMD_0534 glpF glpK TRUE 0.672 68.000 0.057 1.000 N NA
 10370971 10370972 BMD_0534 BMD_0535 glpK glpD TRUE 0.744 188.000 0.010 0.001 Y NA
 10370972 10370973 BMD_0535 BMD_0536 glpD pgcA FALSE 0.404 165.000 0.049 1.000 N NA
 10370974 10370975 BMD_0537 BMD_0538 bioY   FALSE 0.005 211.000 0.000 NA   NA
 10370975 10370976 BMD_0538 BMD_0539     FALSE 0.009 114.000 0.000 NA   NA
 10370977 10370978 BMD_0540 BMD_0541 spoVR   FALSE 0.008 123.000 0.000 NA   NA
 10370978 10370979 BMD_0541 BMD_0542     FALSE 0.017 67.000 0.000 NA   NA
 10370982 10370983 BMD_0545 BMD_0546 tcyC tcyB TRUE 0.970 31.000 0.481 1.000 Y NA
 10370983 10370984 BMD_0546 BMD_0547 tcyB tcyA TRUE 0.998 -25.000 0.594 0.039 Y NA
 10370985 10370986 BMD_0548 BMD_0549 crcB crcB TRUE 0.976 1.000 0.160 NA Y NA
 10370986 10370987 BMD_0549 BMD_0550 crcB   FALSE 0.024 48.000 0.000 NA   NA
 10370987 10370988 BMD_0550 BMD_0551     FALSE 0.001 386.000 0.000 NA   NA
 10370988 10370989 BMD_0551 BMD_0552   thiO TRUE 0.985 -16.000 0.194 1.000 N NA
 10370989 10370990 BMD_0552 BMD_0553 thiO thiS TRUE 0.977 -3.000 0.239 1.000 N NA
 10370990 10370991 BMD_0553 BMD_0554 thiS thiG TRUE 0.958 6.000 0.054 1.000 Y NA
 10370991 10370992 BMD_0554 BMD_0555 thiG thiF TRUE 0.972 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 10370992 10370993 BMD_0555 BMD_0556 thiF thiD TRUE 0.857 23.000 0.000 1.000 Y NA
 10371000 10371001 BMD_0563 BMD_0564 msmX yxkF FALSE 0.527 140.000 0.321 NA   NA
 10371001 10371002 BMD_0564 BMD_0565 yxkF   TRUE 0.644 30.000 0.071 NA   NA
 10371002 10371003 BMD_0565 BMD_0566     FALSE 0.017 67.000 0.000 NA   NA
 10371003 10371004 BMD_0566 BMD_0567     TRUE 0.892 -3.000 0.000 0.038   NA
 10371004 10371005 BMD_0567 BMD_0568     TRUE 0.962 5.000 0.208 0.038   NA
 10371005 10371006 BMD_0568 BMD_0569     TRUE 0.980 -45.000 0.167 1.000   NA
 10371007 10371008 BMD_0570 BMD_0571     FALSE 0.165 181.000 0.036 NA   NA
 10371008 10371009 BMD_0571 BMD_0572     FALSE 0.006 151.000 0.000 NA   NA
 10371009 10371010 BMD_0572 BMD_0573     FALSE 0.007 131.000 0.000 NA   NA
 10371010 10371011 BMD_0573 BMD_0574     FALSE 0.419 116.000 0.000 0.095 N NA
 10371011 10371012 BMD_0574 BMD_0575     TRUE 0.947 6.000 0.000 0.095 Y NA
 10371012 10371013 BMD_0575 BMD_0576     FALSE 0.230 113.000 0.000 1.000 N NA
 10371015 10371016 BMD_0578 BMD_0579 natA natB TRUE 0.978 -7.000 0.382 NA   NA
 10371016 10371017 BMD_0579 BMD_0580 natB   FALSE 0.015 493.000 0.024 NA   NA
 10371017 10371018 BMD_0580 BMD_0581     FALSE 0.502 66.000 0.087 NA   NA
 10371019 10371020 BMD_0582 BMD_0583 prsA   FALSE 0.000 565.000 0.000 NA   NA
 10371022 10371023 BMD_0585 BMD_0586 hpr   FALSE 0.009 114.000 0.000 NA   NA
 10371023 10371024 BMD_0586 BMD_0587     FALSE 0.000 550.000 0.000 NA   NA
 10371024 10371025 BMD_0587 BMD_0588   serC FALSE 0.128 188.000 0.020 NA   NA
 10371026 10371027 BMD_0589 BMD_0590     FALSE 0.046 18.000 0.000 NA   NA
 10371027 10371028 BMD_0590 BMD_0591     FALSE 0.011 304.000 0.000 1.000   NA
 10371030 10371031 BMD_0593 BMD_0594 ecsA ecsB TRUE 0.980 -7.000 0.271 NA N NA
 10371032 10371033 BMD_0595 BMD_0596 ecsC   FALSE 0.397 114.000 0.125 NA   NA
 10371035 10371036 BMD_0598 BMD_0599     FALSE 0.436 84.000 0.083 NA   NA
 10371037 10371038 BMD_0600 BMD_0601   hemE FALSE 0.314 197.000 0.020 1.000 N NA
 10371038 10371039 BMD_0601 BMD_0602 hemE hemH TRUE 0.818 98.000 0.131 1.000 Y NA
 10371039 10371040 BMD_0602 BMD_0603 hemH hemG TRUE 0.668 138.000 0.069 1.000 Y NA
 10371040 10371041 BMD_0603 BMD_0604 hemG   FALSE 0.170 163.000 0.000 1.000 N NA
 10371043 10371044 BMD_0606 BMD_0607   yesM FALSE 0.181 150.000 0.000 1.000 N NA
 10371044 10371045 BMD_0607 BMD_0608 yesM yesN TRUE 0.988 -22.000 0.000 0.024 Y NA
 10371047 10371048 BMD_0610 BMD_0611     TRUE 0.886 16.000 0.200 1.000   NA
 10371048 10371049 BMD_0611 BMD_0612   lcfA FALSE 0.365 170.000 0.000 0.037 N NA
 10371049 10371050 BMD_0612 BMD_0613 lcfA   TRUE 0.871 36.000 0.000 0.094 Y NA
 10371050 10371051 BMD_0613 BMD_0614     FALSE 0.001 427.000 0.000 NA   NA
 10371051 10371052 BMD_0614 BMD_0615     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10371052 10371053 BMD_0615 BMD_0616     FALSE 0.023 50.000 0.000 NA   NA
 10371053 10371054 BMD_0616 BMD_0617     FALSE 0.010 104.000 0.000 NA   NA
 10371054 10371055 BMD_0617 BMD_0618     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371055 10371056 BMD_0618 BMD_0619     FALSE 0.069 9.000 0.000 NA   NA
 10371056 10371057 BMD_0619 BMD_0620     FALSE 0.070 8.000 0.000 NA   NA
 10371057 10371058 BMD_0620 BMD_0621     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371058 10371059 BMD_0621 BMD_0622     FALSE 0.068 10.000 0.000 NA   NA
 10371059 10371060 BMD_0622 BMD_0623     FALSE 0.072 7.000 0.000 NA   NA
 10371060 10371061 BMD_0623 BMD_0624     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371061 10371062 BMD_0624 BMD_0625     FALSE 0.074 6.000 0.000 NA   NA
 10371062 10371063 BMD_0625 BMD_0626     FALSE 0.034 31.000 0.000 NA   NA
 10371063 10371064 BMD_0626 BMD_0627     FALSE 0.038 28.000 0.000 NA   NA
 10371064 10371065 BMD_0627 BMD_0628     FALSE 0.041 26.000 0.000 NA   NA
 10371065 10371066 BMD_0628 BMD_0629     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371066 10371067 BMD_0629 BMD_0630     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371067 10371068 BMD_0630 BMD_0631     FALSE 0.066 11.000 0.000 NA   NA
 10371068 10371069 BMD_0631 BMD_0632     FALSE 0.063 12.000 0.000 NA   NA
 10371069 10371070 BMD_0632 BMD_0633     FALSE 0.072 7.000 0.000 NA   NA
 10371070 10371071 BMD_0633 BMD_0634     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10371071 10371072 BMD_0634 BMD_0635     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371072 10371073 BMD_0635 BMD_0636     FALSE 0.005 210.000 0.000 NA   NA
 10371073 10371074 BMD_0636 BMD_0637   aceA FALSE 0.028 393.000 0.000 1.000 N NA
 10371076 10371077 BMD_0639 BMD_0640     FALSE 0.156 163.000 0.029 NA   NA
 10371077 10371078 BMD_0640 BMD_0641   fabG FALSE 0.000 581.000 0.000 NA   NA
 10371078 10371079 BMD_0641 BMD_0642 fabG addB FALSE 0.079 264.000 0.000 1.000 N NA
 10371079 10371080 BMD_0642 BMD_0643 addB addA TRUE 0.997 -7.000 0.408 0.002 Y NA
 10371080 10371081 BMD_0643 BMD_0644 addA sbcD TRUE 0.857 54.000 0.041 1.000 Y NA
 10371081 10371082 BMD_0644 BMD_0645 sbcD sbcC TRUE 0.993 -3.000 0.669 NA Y NA
 10371082 10371083 BMD_0645 BMD_0646 sbcC   FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10371084 10371085 BMD_0647 BMD_0648 gerPF gerPE FALSE 0.020 60.000 0.000 NA   NA
 10371085 10371086 BMD_0648 BMD_0649 gerPE gerPD TRUE 0.898 13.000 0.259 NA   NA
 10371086 10371087 BMD_0649 BMD_0650 gerPD gerPC TRUE 0.959 -3.000 0.269 NA   NA
 10371087 10371088 BMD_0650 BMD_0651 gerPC gerPB TRUE 0.808 90.000 0.769 NA   NA
 10371088 10371089 BMD_0651 BMD_0652 gerPB gerPA TRUE 0.945 25.000 0.889 NA   NA
 10371090 10371091 BMD_0653 BMD_0654     FALSE 0.411 79.000 0.062 NA   NA
 10371093 10371094 BMD_0656 BMD_0657 asnO crtI FALSE 0.151 317.000 0.045 1.000 N NA
 10371094 10371095 BMD_0657 BMD_0658 crtI crtI TRUE 0.993 -3.000 0.229 0.045 Y NA
 10371095 10371096 BMD_0658 BMD_0659 crtI   TRUE 0.929 59.000 0.800 1.000 N NA
 10371096 10371097 BMD_0659 BMD_0660     FALSE 0.024 428.000 0.000 1.000 N NA
 10371097 10371098 BMD_0660 BMD_0661     FALSE 0.344 77.000 0.000 1.000 N NA
 10371098 10371099 BMD_0661 BMD_0662   rocA FALSE 0.036 368.000 0.000 1.000 N NA
 10371099 10371100 BMD_0662 BMD_0663 rocA rocD FALSE 0.612 24.000 0.000 1.000 N NA
 10371100 10371101 BMD_0663 BMD_0664 rocD rocB FALSE 0.557 104.000 0.000 1.000 Y NA
 10371101 10371102 BMD_0664 BMD_0665 rocB rocC TRUE 0.965 24.000 0.250 1.000 Y NA
 10371103 10371104 BMD_0666 BMD_0667 rocR   FALSE 0.060 105.000 0.000 1.000   NA
 10371104 10371105 BMD_0667 BMD_0668     FALSE 0.006 140.000 0.000 NA   NA
 10371107 10371108 BMD_0670 BMD_0671     TRUE 0.683 53.000 0.161 NA   NA
 10371110 10371111 BMD_0673 BMD_0674     FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10371111 10371112 BMD_0674 BMD_0675     FALSE 0.008 122.000 0.000 NA   NA
 10371115 10371116 BMD_0678 BMD_0679 argC argJ TRUE 0.972 47.000 0.303 0.002 Y NA
 10371116 10371117 BMD_0679 BMD_0680 argJ argB TRUE 0.976 13.000 0.067 0.002 Y NA
 10371117 10371118 BMD_0680 BMD_0681 argB argD TRUE 0.996 -34.000 0.322 1.000 Y NA
 10371118 10371119 BMD_0681 BMD_0682 argD carA TRUE 0.915 71.000 0.286 1.000 Y NA
 10371119 10371120 BMD_0682 BMD_0683 carA carB TRUE 0.998 -7.000 0.714 0.001 Y NA
 10371120 10371121 BMD_0683 BMD_0684 carB argF TRUE 0.975 -3.000 0.027 1.000 Y NA
 10371121 10371122 BMD_0684 BMD_0685 argF   FALSE 0.254 104.000 0.000 1.000 N NA
 10371122 10371123 BMD_0685 BMD_0686     FALSE 0.007 130.000 0.000 NA   NA
 10371123 10371124 BMD_0686 BMD_0687   clpB FALSE 0.153 115.000 0.009 NA   NA
 10371126 10371127 BMD_0689 BMD_0690 galK galT TRUE 0.983 33.000 0.429 0.001 Y NA
 10371128 10371129 BMD_0691 BMD_0692     FALSE 0.005 203.000 0.000 NA   NA
 10371130 10371131 BMD_0693 BMD_0694     FALSE 0.006 182.000 0.000 NA   NA
 10371131 10371132 BMD_0694 BMD_0695     FALSE 0.420 78.000 0.065 NA   NA
 10371132 10371133 BMD_0695 BMD_0696   fabH FALSE 0.001 486.000 0.000 NA   NA
 10371133 10371134 BMD_0696 BMD_0697 fabH fabF TRUE 0.952 40.000 0.076 0.001 Y NA
 10371134 10371135 BMD_0697 BMD_0698 fabF   FALSE 0.415 106.000 0.039 NA N NA
 10371135 10371136 BMD_0698 BMD_0699   appD FALSE 0.056 227.000 0.000 NA N NA
 10371136 10371137 BMD_0699 BMD_0700 appD appF TRUE 0.995 0.000 0.333 0.002 Y NA
 10371137 10371138 BMD_0700 BMD_0701 appF appA TRUE 0.965 44.000 0.600 1.000 Y NA
 10371138 10371139 BMD_0701 BMD_0702 appA appB TRUE 0.953 29.000 0.068 0.038 Y NA
 10371139 10371140 BMD_0702 BMD_0703 appB appC TRUE 0.981 12.000 0.159 0.038 Y NA
 10371140 10371141 BMD_0703 BMD_0704 appC   FALSE 0.002 301.000 0.000 NA   NA
 10371143 10371144 BMD_0706 BMD_0707 oppA oppB TRUE 0.929 98.000 0.318 0.038 Y NA
 10371144 10371145 BMD_0707 BMD_0708 oppB oppC TRUE 0.994 3.000 0.545 0.038 Y NA
 10371145 10371146 BMD_0708 BMD_0709 oppC oppD FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10371146 10371147 BMD_0709 BMD_0710 oppD oppF FALSE 0.182 -7.000 0.000 NA   NA
 10371149 10371150 BMD_0712 BMD_0713   arcD FALSE 0.156 433.000 0.000 0.013 Y NA
 10371150 10371151 BMD_0713 BMD_0714 arcD spxA FALSE 0.025 419.000 0.000 1.000 N NA
 10371151 10371152 BMD_0714 BMD_0715 spxA   FALSE 0.143 202.000 0.000 1.000 N NA
 10371152 10371153 BMD_0715 BMD_0716   madL FALSE 0.005 196.000 0.000 NA   NA
 10371153 10371154 BMD_0716 BMD_0717 madL madM TRUE 0.985 -3.000 0.945 NA   NA
 10371156 10371157 BMD_0719 BMD_0720 mecA cls FALSE 0.526 215.000 0.314 NA N NA
 10371157 10371158 BMD_0720 BMD_0721 cls coiA FALSE 0.456 120.000 0.189 NA   NA
 10371158 10371159 BMD_0721 BMD_0722 coiA pepF FALSE 0.549 164.000 0.398 NA   NA
 10371160 10371161 BMD_0723 BMD_0724     FALSE 0.002 295.000 0.000 NA   NA
 10371161 10371162 BMD_0724 BMD_0725     TRUE 0.825 27.000 0.138 1.000   NA
 10371162 10371163 BMD_0725 BMD_0726     FALSE 0.055 287.000 0.024 NA   NA
 10371163 10371164 BMD_0726 BMD_0727     TRUE 0.899 5.000 0.188 NA   NA
 10371165 10371166 BMD_0728 BMD_0729     TRUE 0.856 28.000 0.283 NA   NA
 10371166 10371167 BMD_0729 BMD_0730     TRUE 0.904 53.000 0.725 1.000   NA
 10371167 10371168 BMD_0730 BMD_0731     TRUE 0.961 15.000 0.480 1.000 N NA
 10371170 10371171 BMD_0733 BMD_0734 mgtE   TRUE 0.679 160.000 0.094 1.000 Y NA
 10371171 10371172 BMD_0734 BMD_0735     FALSE 0.000 523.000 0.000 NA   NA
 10371172 10371173 BMD_0735 BMD_0736     FALSE 0.015 78.000 0.000 NA   NA
 10371174 10371175 BMD_0737 BMD_0738     FALSE 0.007 139.000 0.000 NA   NA
 10371176 10371177 BMD_0739 BMD_0740     FALSE 0.000 567.000 0.000 NA   NA
 10371177 10371178 BMD_0740 BMD_0741     FALSE 0.007 134.000 0.000 NA   NA
 10371179 10371180 BMD_0742 BMD_0743     FALSE 0.020 472.000 0.000 1.000 N NA
 10371182 10371183 BMD_0745 BMD_0746     FALSE 0.410 90.000 0.083 NA   NA
 10371183 10371184 BMD_0746 BMD_0747     TRUE 0.927 6.000 0.213 1.000   NA
 10371184 10371185 BMD_0747 BMD_0748     TRUE 0.773 83.000 0.287 NA N NA
 10371185 10371186 BMD_0748 BMD_0749     FALSE 0.001 477.000 0.000 NA   NA
 10371188 10371189 BMD_0751 BMD_0752     FALSE 0.037 170.000 0.000 1.000   NA
 10371190 10371191 BMD_0753 BMD_0754 gnd gntK TRUE 0.937 26.000 0.095 1.000 Y NA
 10371191 10371192 BMD_0754 BMD_0755 gntK ncs1 FALSE 0.070 279.000 0.000 1.000 N NA
 10371192 10371193 BMD_0755 BMD_0756 ncs1   FALSE 0.075 271.000 0.000 1.000 N NA
 10371193 10371194 BMD_0756 BMD_0757     FALSE 0.006 154.000 0.000 NA   NA
 10371197 10371198 BMD_0760 BMD_0761     TRUE 0.859 21.000 0.000 1.000 Y NA
 10371199 10371200 BMD_0762 BMD_0763   dbpA FALSE 0.006 169.000 0.000 NA   NA
 10371200 10371201 BMD_0763 BMD_0764 dbpA cutC FALSE 0.381 65.000 0.000 1.000 N NA
 10371203 10371204 BMD_0766 BMD_0767     FALSE 0.002 306.000 0.000 NA   NA
 10371204 10371205 BMD_0767 BMD_0768     TRUE 0.945 5.000 0.289 1.000   NA
 10371205 10371206 BMD_0768 BMD_0769   licR FALSE 0.300 300.000 0.000 0.096 Y NA
 10371206 10371207 BMD_0769 BMD_0770 licR licB TRUE 0.675 160.000 0.106 0.008 N NA
 10371207 10371208 BMD_0770 BMD_0771 licB licC TRUE 0.942 14.000 0.000 0.008 Y NA
 10371208 10371209 BMD_0771 BMD_0772 licC licA TRUE 0.942 14.000 0.000 0.008 Y NA
 10371209 10371210 BMD_0772 BMD_0773 licA licH TRUE 0.983 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 10371210 10371211 BMD_0773 BMD_0774 licH lytS FALSE 0.208 122.000 0.000 1.000 N NA
 10371211 10371212 BMD_0774 BMD_0775 lytS lytT TRUE 0.995 2.000 0.538 0.023 Y NA
 10371212 10371213 BMD_0775 BMD_0776 lytT lrgA FALSE 0.455 163.000 0.178 1.000   NA
 10371213 10371214 BMD_0776 BMD_0777 lrgA lrgB TRUE 0.921 34.000 0.869 NA   NA
 10371214 10371215 BMD_0777 BMD_0778 lrgB nasB FALSE 0.005 828.000 0.000 NA N NA
 10371215 10371216 BMD_0778 BMD_0779 nasB nasC TRUE 0.937 20.000 0.138 0.001   NA
 10371220 10371221 BMD_0783 BMD_0784   murF FALSE 0.511 -3.000 0.000 1.000   NA
 10371221 10371222 BMD_0784 BMD_0785 murF aepX TRUE 0.666 14.000 0.000 1.000 N NA
 10371222 10371223 BMD_0785 BMD_0786 aepX aepY TRUE 0.989 -7.000 0.714 1.000   NA
 10371223 10371224 BMD_0786 BMD_0787 aepY   TRUE 0.949 -7.000 0.086 1.000   NA
 10371224 10371225 BMD_0787 BMD_0788     TRUE 0.719 8.000 0.000 1.000 N NA
 10371226 10371227 BMD_0789 BMD_0790 alsD alsS TRUE 0.943 17.000 0.323 1.000 N NA
 10371227 10371228 BMD_0790 BMD_0791 alsS   FALSE 0.000 1262.000 0.000 NA   NA
 10371228 10371229 BMD_0791 BMD_0792     TRUE 0.784 0.000 0.026 NA   NA
 10371229 10371230 BMD_0792 BMD_0793     FALSE 0.013 85.000 0.000 NA   NA
 10371231 10371232 BMD_0794 BMD_0795     FALSE 0.559 58.000 0.094 NA   NA
 10371232 10371233 BMD_0795 BMD_0796   mdcH FALSE 0.005 413.000 0.000 1.000   NA
 10371233 10371234 BMD_0796 BMD_0797 mdcH mdcA TRUE 0.786 38.000 0.047 0.092   NA
 10371234 10371235 BMD_0797 BMD_0798 mdcA mdcB TRUE 0.963 6.000 0.508 1.000   NA
 10371235 10371236 BMD_0798 BMD_0799 mdcB mdcC TRUE 0.934 24.000 0.475 1.000   NA
 10371236 10371237 BMD_0799 BMD_0800 mdcC mdcD TRUE 0.986 -13.000 0.400 1.000   NA
 10371237 10371238 BMD_0800 BMD_0801 mdcD mdcG TRUE 0.949 -12.000 0.062 1.000   NA
 10371239 10371240 BMD_0802 BMD_0803 glnL glnJ TRUE 0.914 5.000 0.000 1.000 Y NA
 10371241 10371242 BMD_0804 BMD_0805 glsA glnT TRUE 0.721 125.000 0.095 1.000 Y NA
 10371243 10371244 BMD_0806 BMD_0807     TRUE 0.971 0.000 0.571 NA   NA
 10371244 10371245 BMD_0807 BMD_0808     FALSE 0.001 379.000 0.000 NA   NA
 10371246 10371247 BMD_0809 BMD_0810     FALSE 0.006 174.000 0.000 NA   NA
 10371247 10371248 BMD_0810 BMD_0811     FALSE 0.006 152.000 0.000 NA   NA
 10371248 10371249 BMD_0811 BMD_0812     FALSE 0.010 462.000 0.000 NA N NA
 10371249 10371250 BMD_0812 BMD_0813     FALSE 0.004 218.000 0.000 NA   NA
 10371250 10371251 BMD_0813 BMD_0814     FALSE 0.001 393.000 0.000 NA   NA
 10371252 10371253 BMD_0815 BMD_0816 yjkA yjkB TRUE 0.862 -3.000 0.047 NA   NA
 10371253 10371254 BMD_0816 BMD_0817 yjkB   FALSE 0.272 98.000 0.000 1.000 N NA
 10371255 10371256 BMD_0818 BMD_0819     TRUE 0.974 1.000 0.727 NA   NA
 10371256 10371257 BMD_0819 BMD_0820   yknY TRUE 0.990 -3.000 0.818 1.000 N NA
 10371257 10371258 BMD_0820 BMD_0821 yknY yknZ TRUE 0.995 -3.000 0.909 NA Y NA
 10371260 10371261 BMD_0823 BMD_0824 folP   FALSE 0.003 252.000 0.000 NA   NA
 10371263 10371264 BMD_0826 BMD_0827     FALSE 0.052 317.000 0.000 1.000 N NA
 10371264 10371265 BMD_0827 BMD_0828   bioY FALSE 0.007 137.000 0.000 NA   NA
 10371265 10371266 BMD_0828 BMD_0829 bioY bioD FALSE 0.515 31.000 0.029 NA   NA
 10371266 10371267 BMD_0829 BMD_0830 bioD bioA TRUE 0.995 -19.000 0.051 0.001 Y NA
 10371270 10371271 BMD_0833 BMD_0834     FALSE 0.181 146.000 0.000 1.000 N NA
 10371272 10371273 BMD_0835 BMD_0836 dctS dctR TRUE 0.990 13.000 1.000 1.000 Y NA
 10371273 10371274 BMD_0836 BMD_0837 dctR glcU FALSE 0.121 220.000 0.000 1.000 N NA
 10371274 10371275 BMD_0837 BMD_0838 glcU gdh FALSE 0.623 18.000 0.000 1.000 N NA
 10371276 10371277 BMD_0839 BMD_0840     TRUE 0.977 -25.000 0.154 1.000   NA
 10371277 10371278 BMD_0840 BMD_0841     TRUE 0.917 13.000 0.333 NA   NA
 10371278 10371279 BMD_0841 BMD_0842     FALSE 0.004 222.000 0.000 NA   NA
 10371279 10371280 BMD_0842 BMD_0843     TRUE 0.984 -10.000 0.500 NA   NA
 10371280 10371281 BMD_0843 BMD_0844     FALSE 0.006 149.000 0.000 NA   NA
 10371283 10371284 BMD_0846 BMD_0847     FALSE 0.003 248.000 0.000 NA   NA
 10371285 10371286 BMD_0848 BMD_0849   ybgG FALSE 0.455 135.000 0.000 1.000 Y NA
 10371286 10371287 BMD_0849 BMD_0850 ybgG   FALSE 0.063 294.000 0.000 1.000 N NA
 10371287 10371288 BMD_0850 BMD_0851     FALSE 0.000 946.000 0.000 NA   NA
 10371288 10371289 BMD_0851 BMD_0852   citM FALSE 0.001 329.000 0.000 NA   NA
 10371289 10371290 BMD_0852 BMD_0853 citM citS FALSE 0.179 154.000 0.000 1.000 N NA
 10371290 10371291 BMD_0853 BMD_0854 citS citT TRUE 0.988 28.000 0.833 0.096 Y NA
 10371291 10371292 BMD_0854 BMD_0855 citT   TRUE 0.942 25.000 0.611 1.000   NA
 10371294 10371295 BMD_0857 BMD_0858     FALSE 0.017 68.000 0.000 NA   NA
 10371296 10371297 BMD_0859 BMD_0860 opuAB opuAA TRUE 0.987 -7.000 0.094 1.000 Y NA
 10371297 10371298 BMD_0860 BMD_0861 opuAA opuAC TRUE 0.911 36.000 0.094 1.000 Y NA
 10371299 10371300 BMD_0862 BMD_0863     FALSE 0.183 136.000 0.000 1.000 N NA
 10371300 10371301 BMD_0863 BMD_0864   rocD TRUE 0.855 26.000 0.081 1.000 N NA
 10371301 10371302 BMD_0864 BMD_0865 rocD speB FALSE 0.489 123.000 0.000 1.000 Y NA
 10371302 10371303 BMD_0865 BMD_0866 speB   FALSE 0.193 300.000 0.000 1.000 Y NA
 10371303 10371304 BMD_0866 BMD_0867     FALSE 0.053 114.000 0.000 1.000   NA
 10371304 10371305 BMD_0867 BMD_0868     FALSE 0.002 308.000 0.000 NA   NA
 10371305 10371306 BMD_0868 BMD_0869     TRUE 0.720 -3.000 0.000 NA N NA
 10371306 10371307 BMD_0869 BMD_0870     FALSE 0.239 109.000 0.000 1.000 N NA
 10371307 10371308 BMD_0870 BMD_0871     TRUE 0.635 16.000 0.000 1.000 N NA
 10371308 10371309 BMD_0871 BMD_0872   yfmC FALSE 0.043 345.000 0.000 1.000 N NA
 10371309 10371310 BMD_0872 BMD_0873 yfmC yfmD TRUE 0.865 80.000 0.143 1.000 Y NA
 10371310 10371311 BMD_0873 BMD_0874 yfmD yfmE TRUE 0.989 6.000 0.280 0.038 Y NA
 10371312 10371313 BMD_0875 BMD_0876     FALSE 0.046 20.000 0.000 NA   NA
 10371314 10371315 BMD_0877 BMD_0878     FALSE 0.247 106.000 0.000 1.000 N NA
 10371315 10371316 BMD_0878 BMD_0879     FALSE 0.000 554.000 0.000 NA   NA
 10371316 10371317 BMD_0879 BMD_0880   murQ FALSE 0.001 403.000 0.000 NA   NA
 10371317 10371318 BMD_0880 BMD_0881 murQ   TRUE 0.960 13.000 0.240 0.004   NA
 10371318 10371319 BMD_0881 BMD_0882   sacP TRUE 0.626 89.000 0.071 1.000 N NA
 10371319 10371320 BMD_0882 BMD_0883 sacP   TRUE 0.975 -3.000 0.357 1.000   NA
 10371320 10371321 BMD_0883 BMD_0884     FALSE 0.004 436.000 0.000 1.000   NA
 10371321 10371322 BMD_0884 BMD_0885     TRUE 0.898 6.000 0.045 1.000 N NA
 10371322 10371323 BMD_0885 BMD_0886     TRUE 0.977 -7.000 0.145 1.000 N NA
 10371323 10371324 BMD_0886 BMD_0887     TRUE 0.995 -3.000 0.826 1.000 Y NA
 10371324 10371325 BMD_0887 BMD_0888     TRUE 0.991 -3.000 0.135 0.038 Y NA
 10371325 10371326 BMD_0888 BMD_0889     FALSE 0.310 87.000 0.000 1.000 N NA
 10371327 10371328 BMD_0890 BMD_0891   hxlA TRUE 0.704 11.000 0.000 1.000 N NA
 10371328 10371329 BMD_0891 BMD_0892 hxlA   FALSE 0.037 269.000 0.000 NA N NA
 10371330 10371331 BMD_0893 BMD_0894     FALSE 0.047 17.000 0.000 NA   NA
 10371332 10371333 BMD_0895 BMD_0896   feoB TRUE 0.929 16.000 0.517 NA   NA
 10371333 10371334 BMD_0896 BMD_0897 feoB   TRUE 0.991 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 10371335 10371336 BMD_0898 BMD_0899     FALSE 0.005 192.000 0.000 NA   NA
 10371336 10371337 BMD_0899 BMD_0900     FALSE 0.011 98.000 0.000 NA   NA
 10371338 10371339 BMD_0901 BMD_0902 rpoN   FALSE 0.279 216.000 0.000 NA Y NA
 10371341 10371342 BMD_0904 BMD_0905   yfiC FALSE 0.008 115.000 0.000 NA   NA
 10371342 10371343 BMD_0905 BMD_0906 yfiC malQ TRUE 0.982 17.000 0.240 0.003 Y NA
 10371345 10371346 BMD_0908 BMD_0909     TRUE 0.912 17.000 0.409 NA   NA
 10371347 10371348 BMD_0910 BMD_0911     FALSE 0.004 215.000 0.000 NA   NA
 10371348 10371349 BMD_0911 BMD_0912     FALSE 0.178 32.000 0.000 1.000   NA
 10371349 10371350 BMD_0912 BMD_0913   dltE FALSE 0.276 122.000 0.000 0.044   NA
 10371351 10371352 BMD_0914 BMD_0915     FALSE 0.110 0.000 0.000 NA   NA
 10371353 10371354 BMD_0916 BMD_0917     FALSE 0.145 43.000 0.000 1.000   NA
 10371354 10371355 BMD_0917 BMD_0918     TRUE 0.870 19.000 0.176 1.000   NA
 10371355 10371356 BMD_0918 BMD_0919     TRUE 0.929 9.000 0.333 NA   NA
 10371356 10371357 BMD_0919 BMD_0920     FALSE 0.006 163.000 0.000 NA   NA
 10371357 10371358 BMD_0920 BMD_0921   rbsR TRUE 0.664 117.000 0.000 0.050 Y NA
 10371358 10371359 BMD_0921 BMD_0922 rbsR rbsK TRUE 0.985 -7.000 0.281 1.000 N NA
 10371359 10371360 BMD_0922 BMD_0923 rbsK rbsD TRUE 0.982 1.000 0.183 1.000 Y NA
 10371360 10371361 BMD_0923 BMD_0924 rbsD rbsA TRUE 0.970 15.000 0.243 1.000 Y NA
 10371361 10371362 BMD_0924 BMD_0925 rbsA rbsC TRUE 0.984 2.000 0.358 0.001   NA
 10371362 10371363 BMD_0925 BMD_0926 rbsC rbsB TRUE 0.961 12.000 0.847 NA   NA
 10371363 10371364 BMD_0926 BMD_0927 rbsB   FALSE 0.001 440.000 0.000 NA   NA
 10371364 10371365 BMD_0927 BMD_0928     FALSE 0.039 156.000 0.000 1.000   NA
 10371365 10371366 BMD_0928 BMD_0929     FALSE 0.010 105.000 0.000 NA   NA
 10371366 10371367 BMD_0929 BMD_0930   araN FALSE 0.008 122.000 0.000 NA   NA
 10371367 10371368 BMD_0930 BMD_0931 araN araP TRUE 0.955 73.000 0.370 0.038 Y NA
 10371368 10371369 BMD_0931 BMD_0932 araP araQ TRUE 0.976 69.000 0.926 0.038 Y NA
 10371369 10371370 BMD_0932 BMD_0933 araQ   TRUE 0.678 52.000 0.000 NA Y NA
 10371372 10371373 BMD_0935 BMD_0936     TRUE 0.794 1.000 0.000 1.000 N NA
 10371373 10371374 BMD_0936 BMD_0937     TRUE 0.895 -10.000 0.000 1.000 N NA
 10371374 10371375 BMD_0937 BMD_0938     FALSE 0.511 -3.000 0.000 1.000   NA
 10371375 10371376 BMD_0938 BMD_0939     TRUE 0.817 11.000 0.000 0.007   NA
 10371376 10371377 BMD_0939 BMD_0940     TRUE 0.913 3.000 0.125 1.000   NA
 10371377 10371378 BMD_0940 BMD_0941     TRUE 0.998 -10.000 0.667 0.015 Y NA
 10371378 10371379 BMD_0941 BMD_0942     FALSE 0.001 454.000 0.000 NA   NA
 10371379 10371380 BMD_0942 BMD_0943     FALSE 0.028 37.000 0.000 NA   NA
 10371380 10371381 BMD_0943 BMD_0944     FALSE 0.059 13.000 0.000 NA   NA
 10371381 10371382 BMD_0944 BMD_0945     FALSE 0.037 361.000 0.000 1.000 N NA
 10371383 10371384 BMD_0946 BMD_0947     FALSE 0.022 54.000 0.000 NA   NA
 10371385 10371386 BMD_0948 BMD_0949     FALSE 0.002 611.000 0.000 1.000   NA
 10371390 10371391 BMD_0953 BMD_0954     FALSE 0.441 52.000 0.000 1.000 N NA
 10371391 10371392 BMD_0954 BMD_0955   aroC TRUE 0.801 67.000 0.019 1.000 Y NA
 10371394 10371395 BMD_0957 BMD_0958 scrA treC TRUE 0.983 16.000 0.650 1.000 Y NA
 10371395 10371396 BMD_0958 BMD_0959 treC treR TRUE 0.818 89.000 0.336 1.000 N NA
 10371396 10371397 BMD_0959 BMD_0960 treR   FALSE 0.039 356.000 0.000 1.000 N NA
 10371397 10371398 BMD_0960 BMD_0961     TRUE 0.998 -10.000 0.596 0.001 Y NA
 10371398 10371399 BMD_0961 BMD_0962     TRUE 0.951 12.000 0.447 1.000   NA
 10371399 10371400 BMD_0962 BMD_0963     TRUE 0.903 10.000 0.158 1.000   NA
 10371404 10371405 BMD_0967 BMD_0968     FALSE 0.010 102.000 0.000 NA   NA
 10371405 10371406 BMD_0968 BMD_0969   bluB FALSE 0.001 465.000 0.000 NA   NA
 10371406 10371407 BMD_0969 BMD_0970 bluB   FALSE 0.006 169.000 0.000 NA   NA
 10371407 10371408 BMD_0970 BMD_0971     FALSE 0.009 109.000 0.000 NA   NA
 10371410 10371411 BMD_0973 BMD_0974     FALSE 0.005 194.000 0.000 NA   NA
 10371411 10371412 BMD_0974 BMD_0975   aroD FALSE 0.000 515.000 0.000 NA   NA
 10371412 10371413 BMD_0975 BMD_0976 aroD   FALSE 0.006 637.000 0.000 NA N NA
 10371413 10371414 BMD_0976 BMD_0977     FALSE 0.124 112.000 0.000 NA N NA
 10371414 10371415 BMD_0977 BMD_0978     TRUE 0.989 0.000 0.500 0.091 N NA
 10371415 10371416 BMD_0978 BMD_0979     FALSE 0.359 152.000 0.000 0.091 N NA
 10371416 10371417 BMD_0979 BMD_0980     FALSE 0.161 92.000 0.000 NA N NA
 10371418 10371419 BMD_0981 BMD_0982 atzF uca TRUE 0.959 15.000 0.437 1.000 N NA
 10371419 10371420 BMD_0982 BMD_0983 uca   TRUE 0.946 17.000 0.835 NA   NA
 10371420 10371421 BMD_0983 BMD_0984     TRUE 0.951 21.000 0.931 NA   NA
 10371421 10371422 BMD_0984 BMD_0985     FALSE 0.002 277.000 0.000 NA   NA
 10371425 10371426 BMD_0988 BMD_0989     FALSE 0.037 172.000 0.000 1.000   NA
 10371426 10371427 BMD_0989 BMD_0990     FALSE 0.018 613.000 0.000 0.044   NA
 10371427 10371428 BMD_0990 BMD_0991     TRUE 0.789 120.000 0.006 0.002 Y NA
 10371428 10371429 BMD_0991 BMD_0992     FALSE 0.004 462.000 0.000 1.000   NA
 10371429 10371430 BMD_0992 BMD_0993     FALSE 0.182 -7.000 0.000 NA   NA
 10371430 10371431 BMD_0993 BMD_0994     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371431 10371432 BMD_0994 BMD_0995     FALSE 0.003 531.000 0.000 1.000   NA
 10371432 10371433 BMD_0995 BMD_0996     FALSE 0.114 61.000 0.000 1.000   NA
 10371434 10371435 BMD_0997 BMD_0998 tatA   FALSE 0.423 74.000 0.000 0.076   NA
 10371435 10371436 BMD_0998 BMD_0999     TRUE 0.996 2.000 0.941 0.076 Y NA
 10371436 10371437 BMD_0999 BMD_1000     FALSE 0.471 43.000 0.000 1.000 N NA
 10371437 10371438 BMD_1000 BMD_1001     FALSE 0.013 85.000 0.000 NA   NA
 10371438 10371439 BMD_1001 BMD_1002     FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10371440 10371441 BMD_1003 BMD_1004 capB capC TRUE 0.798 17.000 0.000 0.001   NA
 10371441 10371442 BMD_1004 BMD_1005 capC capA FALSE 0.149 41.000 0.000 1.000   NA
 10371442 10371443 BMD_1005 BMD_1006 capA   TRUE 0.934 30.000 0.400 1.000 N NA
 10371443 10371444 BMD_1006 BMD_1007     FALSE 0.046 21.000 0.000 NA   NA
 10371444 10371445 BMD_1007 BMD_1008   capD FALSE 0.009 114.000 0.000 NA   NA
 10371447 10371448 BMD_1010 BMD_1011     FALSE 0.001 431.000 0.000 NA   NA
 10371448 10371449 BMD_1011 BMD_1012   had FALSE 0.007 130.000 0.000 NA   NA
 10371450 10371451 BMD_1013 BMD_1014     FALSE 0.006 144.000 0.000 NA   NA
 10371451 10371452 BMD_1014 BMD_1015     FALSE 0.239 19.000 0.000 1.000   NA
 10371453 10371454 BMD_1016 BMD_1017     TRUE 0.652 15.000 0.000 1.000 N NA
 10371454 10371455 BMD_1017 BMD_1018     TRUE 0.969 81.000 0.667 0.008 Y NA
 10371455 10371456 BMD_1018 BMD_1019     TRUE 0.776 56.000 0.296 NA   NA
 10371456 10371457 BMD_1019 BMD_1020     FALSE 0.047 17.000 0.000 NA   NA
 10371457 10371458 BMD_1020 BMD_1021     TRUE 0.627 2.000 0.000 NA N NA
 10371458 10371459 BMD_1021 BMD_1022   licA FALSE 0.436 18.000 0.000 NA N NA
 10371459 10371460 BMD_1022 BMD_1023 licA   FALSE 0.511 -3.000 0.000 1.000   NA
 10371460 10371461 BMD_1023 BMD_1024     FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371461 10371462 BMD_1024 BMD_1025     FALSE 0.029 36.000 0.000 NA   NA
 10371462 10371463 BMD_1025 BMD_1026   murQ FALSE 0.589 84.000 0.182 NA   NA
 10371463 10371464 BMD_1026 BMD_1027 murQ   FALSE 0.037 169.000 0.000 1.000   NA
 10371464 10371465 BMD_1027 BMD_1028     TRUE 0.852 16.000 0.000 0.008 N NA
 10371465 10371466 BMD_1028 BMD_1029     TRUE 0.979 4.000 0.377 0.008   NA
 10371466 10371467 BMD_1029 BMD_1030     FALSE 0.100 68.000 0.000 1.000   NA
 10371467 10371468 BMD_1030 BMD_1031     FALSE 0.007 133.000 0.000 NA   NA
 10371468 10371469 BMD_1031 BMD_1032   rpiA FALSE 0.014 83.000 0.000 NA   NA
 10371472 10371473 BMD_1035 BMD_1036     FALSE 0.009 107.000 0.000 NA   NA
 10371473 10371474 BMD_1036 BMD_1037     FALSE 0.000 566.000 0.000 NA   NA
 10371475 10371476 BMD_1038 BMD_1039     FALSE 0.031 33.000 0.000 NA   NA
 10371477 10371478 BMD_1040 BMD_1041     FALSE 0.007 130.000 0.000 NA   NA
 10371478 10371479 BMD_1041 BMD_1042     FALSE 0.006 185.000 0.000 NA   NA
 10371479 10371480 BMD_1042 BMD_1043     FALSE 0.006 149.000 0.000 NA   NA
 10371481 10371482 BMD_1044 BMD_1045 gatA   TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10371482 10371483 BMD_1045 BMD_1046   galE FALSE 0.147 198.000 0.000 1.000 N NA
 10371483 10371484 BMD_1046 BMD_1047 galE   FALSE 0.004 230.000 0.000 NA   NA
 10371484 10371485 BMD_1047 BMD_1048     FALSE 0.005 206.000 0.000 NA   NA
 10371485 10371486 BMD_1048 BMD_1049     FALSE 0.003 235.000 0.000 NA   NA
 10371486 10371487 BMD_1049 BMD_1050     FALSE 0.004 215.000 0.000 NA   NA
 10371487 10371488 BMD_1050 BMD_1051     FALSE 0.303 204.000 0.000 NA Y NA
 10371490 10371491 BMD_1053 BMD_1054     FALSE 0.394 63.000 0.000 1.000 N NA
 10371493 10371494 BMD_1056 BMD_1057     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10371494 10371495 BMD_1057 BMD_1058     FALSE 0.013 85.000 0.000 NA   NA
 10371497 10371498 BMD_1060 BMD_1061     TRUE 0.991 2.000 0.583 1.000 Y NA
 10371498 10371499 BMD_1061 BMD_1062     FALSE 0.128 215.000 0.000 1.000 N NA
 10371499 10371500 BMD_1062 BMD_1063     FALSE 0.008 116.000 0.000 NA   NA
 10371500 10371501 BMD_1063 BMD_1064     FALSE 0.027 39.000 0.000 NA   NA
 10371501 10371502 BMD_1064 BMD_1065   lytE FALSE 0.001 371.000 0.000 NA   NA
 10371502 10371503 BMD_1065 BMD_1066 lytE lytC FALSE 0.319 197.000 0.000 NA Y NA
 10371503 10371504 BMD_1066 BMD_1067 lytC lytB FALSE 0.125 218.000 0.000 1.000 N NA
 10371504 10371505 BMD_1067 BMD_1068 lytB   FALSE 0.036 183.000 0.000 1.000   NA
 10371505 10371506 BMD_1068 BMD_1069     FALSE 0.001 382.000 0.000 NA   NA
 10371506 10371507 BMD_1069 BMD_1070     FALSE 0.011 95.000 0.000 NA   NA
 10371508 10371509 BMD_1071 BMD_1072   menC FALSE 0.023 432.000 0.000 1.000 N NA
 10371509 10371510 BMD_1072 BMD_1073 menC   TRUE 0.981 -3.000 0.250 0.090   NA
 10371510 10371511 BMD_1073 BMD_1074     FALSE 0.236 23.000 0.000 1.000   NA
 10371512 10371513 BMD_1075 BMD_1076     FALSE 0.350 74.000 0.000 1.000 N NA
 10371513 10371514 BMD_1076 BMD_1077     TRUE 0.701 64.000 0.000 1.000 Y NA
 10371514 10371515 BMD_1077 BMD_1078     FALSE 0.191 131.000 0.000 1.000 N NA
 10371517 10371518 BMD_1080 BMD_1081     FALSE 0.004 224.000 0.000 NA   NA
 10371518 10371519 BMD_1081 BMD_1082     FALSE 0.010 105.000 0.000 NA   NA
 10371519 10371520 BMD_1082 BMD_1083     TRUE 0.904 1.000 0.139 NA   NA
 10371521 10371522 BMD_1084 BMD_1085     FALSE 0.052 15.000 0.000 NA   NA
 10371522 10371523 BMD_1085 BMD_1086     FALSE 0.006 154.000 0.000 NA   NA
 10371524 10371525 BMD_1087 BMD_1088     FALSE 0.002 281.000 0.000 NA   NA
 10371525 10371526 BMD_1088 BMD_1089   folE FALSE 0.418 58.000 0.000 1.000 N NA
 10371526 10371527 BMD_1089 BMD_1090 folE   TRUE 0.851 49.000 0.200 1.000 N NA
 10371529 10371530 BMD_1092 BMD_1093 capB capC TRUE 0.844 12.000 0.000 0.001   NA
 10371530 10371531 BMD_1093 BMD_1094 capC capA FALSE 0.319 10.000 0.000 1.000   NA
 10371531 10371532 BMD_1094 BMD_1095 capA ggt TRUE 0.742 5.000 0.000 1.000 N NA
 10371532 10371533 BMD_1095 BMD_1096 ggt   FALSE 0.231 24.000 0.000 1.000   NA
 10371534 10371535 BMD_1097 BMD_1098   hag FALSE 0.092 324.000 0.000 0.004   NA
 10371535 10371536 BMD_1098 BMD_1099 hag pcp FALSE 0.109 230.000 0.000 1.000 N NA
 10371536 10371537 BMD_1099 BMD_1100 pcp   TRUE 0.899 15.000 0.300 NA   NA
 10371537 10371538 BMD_1100 BMD_1101     TRUE 0.978 1.000 0.939 NA   NA
 10371539 10371540 BMD_1102 BMD_1103     FALSE 0.018 64.000 0.000 NA   NA
 10371542 10371543 BMD_1105 BMD_1106     FALSE 0.016 522.000 0.000 1.000 N NA
 10371544 10371545 BMD_1107 BMD_1108     FALSE 0.001 483.000 0.000 NA   NA
 10371546 10371547 BMD_1109 BMD_1110     FALSE 0.002 1119.000 0.000 1.000   NA
 10371548 10371549 BMD_1111 BMD_1112     FALSE 0.000 1673.000 0.000 NA   NA
 10371550 10371551 BMD_1113 BMD_1114   galU FALSE 0.002 2223.000 0.000 1.000   NA
 10371551 10371552 BMD_1114 BMD_1115 galU   FALSE 0.351 168.000 0.000 NA Y NA
 10371552 10371553 BMD_1115 BMD_1116     FALSE 0.000 789.000 0.000 NA   NA
 10371553 10371554 BMD_1116 BMD_1117     FALSE 0.043 25.000 0.000 NA   NA
 10371554 10371555 BMD_1117 BMD_1118     FALSE 0.008 123.000 0.000 NA   NA
 10371555 10371556 BMD_1118 BMD_1119     FALSE 0.000 601.000 0.000 NA   NA
 10371556 10371557 BMD_1119 BMD_1120     FALSE 0.129 479.000 0.000 0.016 Y NA
 10371557 10371558 BMD_1120 BMD_1121     FALSE 0.145 43.000 0.000 1.000   NA
 10371558 10371559 BMD_1121 BMD_1122     FALSE 0.005 407.000 0.000 1.000   NA
 10371559 10371560 BMD_1122 BMD_1123     FALSE 0.449 149.000 0.000 1.000 Y NA
 10371560 10371561 BMD_1123 BMD_1124     TRUE 0.975 -10.000 0.105 1.000 N NA
 10371561 10371562 BMD_1124 BMD_1125     FALSE 0.051 318.000 0.000 1.000 N NA
 10371562 10371563 BMD_1125 BMD_1126   galU FALSE 0.449 144.000 0.000 1.000 Y NA
 10371565 10371566 BMD_1128 BMD_1129   ywqE FALSE 0.144 227.000 0.018 1.000   NA
 10371566 10371567 BMD_1129 BMD_1130 ywqE   FALSE 0.278 280.000 0.018 NA Y NA
 10371567 10371568 BMD_1130 BMD_1131     FALSE 0.143 101.000 0.000 NA N NA
 10371568 10371569 BMD_1131 BMD_1132   yerD TRUE 0.750 50.000 0.000 1.000 Y NA
 10371571 10371572 BMD_1134 BMD_1135     TRUE 0.880 -3.000 0.061 NA   NA
 10371572 10371573 BMD_1135 BMD_1136     FALSE 0.009 107.000 0.000 NA   NA
 10371573 10371574 BMD_1136 BMD_1137   comK FALSE 0.094 140.000 0.000 NA N NA
 10371576 10371577 BMD_1139 BMD_1140   nasD FALSE 0.003 608.000 0.000 1.000   NA
 10371577 10371578 BMD_1140 BMD_1141 nasD nasE TRUE 0.937 19.000 0.055 0.001 N NA
 10371578 10371579 BMD_1141 BMD_1142 nasE nasF FALSE 0.572 73.000 0.012 1.000 N NA
 10371579 10371580 BMD_1142 BMD_1143 nasF   FALSE 0.602 25.000 0.000 1.000 N NA
 10371580 10371581 BMD_1143 BMD_1144     FALSE 0.010 999.000 0.000 1.000 N NA
 10371581 10371582 BMD_1144 BMD_1145   glcU FALSE 0.121 366.000 0.000 1.000 Y NA
 10371582 10371583 BMD_1145 BMD_1146 glcU   FALSE 0.001 341.000 0.000 NA   NA
 10371583 10371584 BMD_1146 BMD_1147     FALSE 0.001 404.000 0.000 NA   NA
 10371584 10371585 BMD_1147 BMD_1148     FALSE 0.388 3.000 0.000 1.000   NA
 10371585 10371586 BMD_1148 BMD_1149     FALSE 0.055 111.000 0.000 1.000   NA
 10371587 10371588 BMD_1150 BMD_1151     FALSE 0.015 77.000 0.000 NA   NA
 10371591 10371592 BMD_1154 BMD_1155     FALSE 0.006 141.000 0.000 NA   NA
 10371592 10371593 BMD_1155 BMD_1156     FALSE 0.096 2.000 0.000 NA   NA
 10371594 10371595 BMD_1157 BMD_1158     TRUE 0.860 16.000 0.143 1.000   NA
 10371595 10371596 BMD_1158 BMD_1159   nagB TRUE 0.866 58.000 0.286 1.000 N NA
 10371596 10371597 BMD_1159 BMD_1160 nagB nagA TRUE 0.989 3.000 0.139 0.001 Y NA
 10371598 10371599 BMD_1161 BMD_1162 nagE   FALSE 0.012 91.000 0.000 NA   NA
 10371599 10371600 BMD_1162 BMD_1163     FALSE 0.007 130.000 0.000 NA   NA
 10371600 10371601 BMD_1163 BMD_1164     FALSE 0.015 80.000 0.000 NA   NA
 10371603 10371604 BMD_1166 BMD_1167     TRUE 0.894 15.000 0.286 NA   NA
 10371604 10371605 BMD_1167 BMD_1168     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10371605 10371606 BMD_1168 BMD_1169     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10371607 10371608 BMD_1170 BMD_1171     FALSE 0.116 60.000 0.000 1.000   NA
 10371608 10371609 BMD_1171 BMD_1172     FALSE 0.004 228.000 0.000 NA   NA
 10371610 10371611 BMD_1173 BMD_1174     FALSE 0.559 6.000 0.000 NA N NA
 10371614 10371615 BMD_1177 BMD_1178 sipV   FALSE 0.005 205.000 0.000 NA   NA
 10371615 10371616 BMD_1178 BMD_1179     FALSE 0.001 391.000 0.000 NA   NA
 10371619 10371620 BMD_1182 BMD_1183     FALSE 0.005 204.000 0.000 NA   NA
 10371620 10371621 BMD_1183 BMD_1184     FALSE 0.137 48.000 0.000 1.000   NA
 10371621 10371622 BMD_1184 BMD_1185     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10371622 10371623 BMD_1185 BMD_1186     FALSE 0.006 166.000 0.000 NA   NA
 10371623 10371624 BMD_1186 BMD_1187     FALSE 0.006 169.000 0.000 NA   NA
 10371625 10371626 BMD_1188 BMD_1189     FALSE 0.006 154.000 0.000 NA   NA
 10371630 10371631 BMD_1193 BMD_1194 pbuO natK FALSE 0.026 220.000 0.000 1.000   NA
 10371631 10371632 BMD_1194 BMD_1195 natK natR TRUE 0.932 18.000 0.429 1.000   NA
 10371633 10371634 BMD_1196 BMD_1197 natA natB TRUE 0.987 2.000 0.448 NA Y NA
 10371634 10371635 BMD_1197 BMD_1198 natB   FALSE 0.001 381.000 0.000 NA   NA
 10371635 10371636 BMD_1198 BMD_1199     FALSE 0.007 138.000 0.000 NA   NA
 10371636 10371637 BMD_1199 BMD_1200     FALSE 0.031 203.000 0.000 1.000   NA
 10371637 10371638 BMD_1200 BMD_1201   msrAB FALSE 0.179 154.000 0.000 1.000 N NA
 10371639 10371640 BMD_1202 BMD_1203     TRUE 0.977 13.000 0.600 0.010   NA
 10371640 10371641 BMD_1203 BMD_1204     TRUE 0.980 15.000 0.867 0.010   NA
 10371642 10371643 BMD_1205 BMD_1206     FALSE 0.011 752.000 0.000 1.000 N NA
 10371643 10371644 BMD_1206 BMD_1207     TRUE 0.633 145.000 0.000 0.015 Y NA
 10371644 10371645 BMD_1207 BMD_1208     FALSE 0.077 268.000 0.000 1.000 N NA
 10371645 10371646 BMD_1208 BMD_1209   sigI FALSE 0.035 371.000 0.000 1.000 N NA
 10371647 10371648 BMD_1210 BMD_1211   phaP FALSE 0.006 144.000 0.000 NA   NA
 10371648 10371649 BMD_1211 BMD_1212 phaP phaQ FALSE 0.463 169.000 0.273 NA   NA
 10371650 10371651 BMD_1213 BMD_1214   phaR FALSE 0.003 234.000 0.000 NA   NA
 10371651 10371652 BMD_1214 BMD_1215 phaR phaB TRUE 0.767 82.000 0.450 NA   NA
 10371652 10371653 BMD_1215 BMD_1216 phaB phaC TRUE 0.940 77.000 0.161 0.001 Y NA
 10371653 10371654 BMD_1216 BMD_1217 phaC ktrD FALSE 0.014 585.000 0.000 1.000 N NA
 10371654 10371655 BMD_1217 BMD_1218 ktrD   FALSE 0.002 288.000 0.000 NA   NA
 10371655 10371656 BMD_1218 BMD_1219     FALSE 0.089 3.000 0.000 NA   NA
 10371658 10371659 BMD_1221 BMD_1222   pncB FALSE 0.181 139.000 0.000 1.000 N NA
 10371659 10371660 BMD_1222 BMD_1223 pncB nadE TRUE 0.967 36.000 0.194 0.004 Y NA
 10371660 10371661 BMD_1223 BMD_1224 nadE   FALSE 0.034 281.000 0.000 NA N NA
 10371661 10371662 BMD_1224 BMD_1225     TRUE 0.983 18.000 0.947 NA Y NA
 10371662 10371663 BMD_1225 BMD_1226     TRUE 0.995 -22.000 0.447 0.001   NA
 10371663 10371664 BMD_1226 BMD_1227   kinE FALSE 0.035 398.000 0.000 0.097   NA
 10371664 10371665 BMD_1227 BMD_1228 kinE ogt TRUE 0.856 19.000 0.061 1.000 N NA
 10371666 10371667 BMD_1229 BMD_1230   mtnA FALSE 0.007 135.000 0.000 NA   NA
 10371667 10371668 BMD_1230 BMD_1231 mtnA mtnK TRUE 0.739 36.000 0.104 1.000   NA
 10371668 10371669 BMD_1231 BMD_1232 mtnK mtnU FALSE 0.006 378.000 0.000 1.000   NA
 10371670 10371671 BMD_1233 BMD_1234 mtnE mtnW FALSE 0.147 318.000 0.043 1.000 N NA
 10371671 10371672 BMD_1234 BMD_1235 mtnW mtnX TRUE 0.992 -3.000 0.304 0.001 N NA
 10371672 10371673 BMD_1235 BMD_1236 mtnX mtnB TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10371673 10371674 BMD_1236 BMD_1237 mtnB mtnD FALSE 0.249 16.000 0.000 1.000   NA
 10371674 10371675 BMD_1237 BMD_1238 mtnD rbsB FALSE 0.008 123.000 0.000 NA   NA
 10371675 10371676 BMD_1238 BMD_1239 rbsB rbsA TRUE 0.970 17.000 0.403 NA Y NA
 10371676 10371677 BMD_1239 BMD_1240 rbsA rbsC TRUE 0.996 -3.000 0.952 1.000 Y NA
 10371677 10371678 BMD_1240 BMD_1241 rbsC   FALSE 0.079 87.000 0.000 1.000   NA
 10371678 10371679 BMD_1241 BMD_1242     FALSE 0.001 452.000 0.000 NA   NA
 10371680 10371681 BMD_1243 BMD_1244     FALSE 0.174 158.000 0.000 1.000 N NA
 10371682 10371683 BMD_1245 BMD_1246     FALSE 0.515 168.000 0.129 1.000 N NA
 10371687 10371688 BMD_1250 BMD_1251 nhaC   FALSE 0.020 239.000 0.000 1.000   NA
 10371688 10371689 BMD_1251 BMD_1252     FALSE 0.013 88.000 0.000 NA   NA
 10371691 10371692 BMD_1254 BMD_1255   queC FALSE 0.001 345.000 0.000 NA   NA
 10371692 10371693 BMD_1255 BMD_1256 queC queD TRUE 0.879 0.000 0.041 1.000   NA
 10371693 10371694 BMD_1256 BMD_1257 queD queE TRUE 0.986 -7.000 0.307 1.000 N NA
 10371694 10371695 BMD_1257 BMD_1258 queE queF FALSE 0.502 99.000 0.101 1.000   NA
 10371695 10371696 BMD_1258 BMD_1259 queF   FALSE 0.401 69.000 0.008 1.000   NA
 10371697 10371698 BMD_1260 BMD_1261     FALSE 0.002 317.000 0.000 NA   NA
 10371699 10371700 BMD_1262 BMD_1263     FALSE 0.046 18.000 0.000 NA   NA
 10371700 10371701 BMD_1263 BMD_1264     FALSE 0.450 148.000 0.229 NA   NA
 10371701 10371702 BMD_1264 BMD_1265   sleB FALSE 0.002 313.000 0.000 NA   NA
 10371704 10371705 BMD_1267 BMD_1268     FALSE 0.004 231.000 0.000 NA   NA
 10371705 10371706 BMD_1268 BMD_1269     FALSE 0.023 228.000 0.000 1.000   NA
 10371706 10371707 BMD_1269 BMD_1270     FALSE 0.005 205.000 0.000 NA   NA
 10371707 10371708 BMD_1270 BMD_1271     FALSE 0.024 49.000 0.000 NA   NA
 10371709 10371710 BMD_1272 BMD_1273   metH FALSE 0.007 377.000 0.000 1.000   NA
 10371710 10371711 BMD_1273 BMD_1274 metH yitJ TRUE 0.986 1.000 0.045 0.001 Y NA
 10371712 10371713 BMD_1275 BMD_1276     FALSE 0.002 302.000 0.000 NA   NA
 10371713 10371714 BMD_1276 BMD_1277   ribE FALSE 0.234 -19.000 0.000 NA   NA
 10371714 10371715 BMD_1277 BMD_1278 ribE ribAB TRUE 0.928 17.000 0.040 1.000 Y NA
 10371715 10371716 BMD_1278 BMD_1279 ribAB ribH TRUE 0.871 92.000 0.034 0.002 Y NA
 10371716 10371717 BMD_1279 BMD_1280 ribH   FALSE 0.001 443.000 0.000 NA   NA
 10371717 10371718 BMD_1280 BMD_1281     FALSE 0.007 132.000 0.000 NA   NA
 10371718 10371719 BMD_1281 BMD_1282   ptsG FALSE 0.153 272.000 0.071 1.000   NA
 10371719 10371720 BMD_1282 BMD_1283 ptsG ptsH TRUE 0.965 19.000 0.054 0.007 Y NA
 10371720 10371721 BMD_1283 BMD_1284 ptsH ptsI TRUE 0.990 0.000 0.132 0.008 Y NA
 10371722 10371723 BMD_1285 BMD_1286     TRUE 0.987 -3.000 0.840 1.000   NA
 10371723 10371724 BMD_1286 BMD_1287     FALSE 0.004 484.000 0.000 1.000   NA
 10371728 10371729 BMD_1291 BMD_1292   patA FALSE 0.179 153.000 0.000 1.000 N NA
 10371729 10371730 BMD_1292 BMD_1293 patA   FALSE 0.011 97.000 0.000 NA   NA
 10371730 10371731 BMD_1293 BMD_1294     FALSE 0.005 204.000 0.000 NA   NA
 10371731 10371732 BMD_1294 BMD_1295     FALSE 0.009 114.000 0.000 NA   NA
 10371734 10371735 BMD_1297 BMD_1298     FALSE 0.003 256.000 0.000 NA   NA
 10371736 10371737 BMD_1299 BMD_1300 ppx ppk TRUE 0.781 74.000 0.056 NA Y NA
 10371738 10371739 BMD_1301 BMD_1302     FALSE 0.006 146.000 0.000 NA   NA
 10371740 10371741 BMD_1303 BMD_1304     FALSE 0.426 106.000 0.043 NA N NA
 10371741 10371742 BMD_1304 BMD_1305     FALSE 0.345 156.000 0.139 NA   NA
 10371744 10371745 BMD_1307 BMD_1308     FALSE 0.023 383.000 0.017 NA   NA
 10371745 10371746 BMD_1308 BMD_1309     TRUE 0.631 100.000 0.214 1.000   NA
 10371746 10371747 BMD_1309 BMD_1310   dapH FALSE 0.549 130.000 0.121 1.000 N NA
 10371747 10371748 BMD_1310 BMD_1311 dapH dapL FALSE 0.619 145.000 0.372 1.000   NA
 10371748 10371749 BMD_1311 BMD_1312 dapL   FALSE 0.558 57.000 0.091 NA   NA
 10371751 10371752 BMD_1314 BMD_1315     TRUE 0.830 103.000 0.008 0.002 Y NA
 10371752 10371753 BMD_1315 BMD_1316   gnd FALSE 0.161 188.000 0.000 1.000 N NA
 10371753 10371754 BMD_1316 BMD_1317 gnd yknU FALSE 0.075 271.000 0.000 1.000 N NA
 10371754 10371755 BMD_1317 BMD_1318 yknU yknV TRUE 0.993 16.000 0.938 0.003 Y NA
 10371755 10371756 BMD_1318 BMD_1319 yknV ktrC FALSE 0.409 152.000 0.041 1.000 N NA
 10371757 10371758 BMD_1320 BMD_1321 rnjA   TRUE 0.971 0.000 0.576 NA   NA
 10371760 10371761 BMD_1323 BMD_1324 defB   FALSE 0.006 175.000 0.000 NA   NA
 10371762 10371763 BMD_1325 BMD_1326   pdhA FALSE 0.000 581.000 0.000 NA   NA
 10371763 10371764 BMD_1326 BMD_1327 pdhA pdhB TRUE 0.994 4.000 0.484 0.001 Y NA
 10371764 10371765 BMD_1327 BMD_1328 pdhB pdhC TRUE 0.957 103.000 0.883 0.088 Y NA
 10371765 10371766 BMD_1328 BMD_1329 pdhC pdhD TRUE 0.993 4.000 0.948 1.000 Y NA
 10371766 10371767 BMD_1329 BMD_1330 pdhD   FALSE 0.002 294.000 0.000 NA   NA
 10371771 10371772 BMD_1334 BMD_1335     FALSE 0.016 70.000 0.000 NA   NA
 10371774 10371775 BMD_1337 BMD_1338   suhB FALSE 0.295 196.000 0.132 NA   NA
 10371777 10371778 BMD_1340 BMD_1341 bipA   FALSE 0.165 161.000 0.032 NA   NA
 10371779 10371780 BMD_1342 BMD_1343     TRUE 0.848 2.000 0.077 NA   NA
 10371785 10371786 BMD_1348 BMD_1349   ftsW FALSE 0.511 144.000 0.300 NA   NA
 10371786 10371787 BMD_1349 BMD_1350 ftsW pycA FALSE 0.427 134.000 0.046 1.000 N NA
 10371789 10371790 BMD_1352 BMD_1353 ctaB ctaC TRUE 0.627 138.000 0.084 0.074 N NA
 10371790 10371791 BMD_1353 BMD_1354 ctaC ctaD TRUE 0.987 35.000 0.755 0.002 Y NA
 10371791 10371792 BMD_1354 BMD_1355 ctaD ctaE TRUE 0.997 0.000 0.925 0.002 Y NA
 10371792 10371793 BMD_1355 BMD_1356 ctaE ctaF TRUE 0.996 5.000 0.950 0.002 Y NA
 10371793 10371794 BMD_1356 BMD_1357 ctaF ctaG TRUE 0.947 58.000 0.707 0.002   NA
 10371796 10371797 BMD_1359 BMD_1360     FALSE 0.336 191.000 0.155 NA   NA
 10371797 10371798 BMD_1360 BMD_1361   ypjB FALSE 0.013 85.000 0.000 NA   NA
 10371798 10371799 BMD_1361 BMD_1362 ypjB   FALSE 0.424 65.000 0.050 NA   NA
 10371801 10371802 BMD_1364 BMD_1365   dapB TRUE 0.689 14.000 0.044 NA   NA
 10371802 10371803 BMD_1365 BMD_1366 dapB mgsA TRUE 0.932 13.000 0.044 0.038 N NA
 10371803 10371804 BMD_1366 BMD_1367 mgsA   TRUE 0.791 11.000 0.081 NA   NA
 10371804 10371805 BMD_1367 BMD_1368     TRUE 0.930 1.000 0.210 NA   NA
 10371805 10371806 BMD_1368 BMD_1369   cca TRUE 0.900 16.000 0.126 1.000 N NA
 10371806 10371807 BMD_1369 BMD_1370 cca birA TRUE 0.981 -15.000 0.134 1.000 N NA
 10371807 10371808 BMD_1370 BMD_1371 birA panB FALSE 0.330 273.000 0.002 1.000 Y NA
 10371808 10371809 BMD_1371 BMD_1372 panB panC TRUE 0.995 2.000 0.395 0.001 Y NA
 10371809 10371810 BMD_1372 BMD_1373 panC panD TRUE 0.988 1.000 0.342 1.000 Y NA
 10371810 10371811 BMD_1373 BMD_1374 panD   FALSE 0.362 203.000 0.053 1.000 N NA
 10371811 10371812 BMD_1374 BMD_1375     FALSE 0.357 89.000 0.056 NA   NA
 10371812 10371813 BMD_1375 BMD_1376     FALSE 0.006 189.000 0.000 NA   NA
 10371813 10371814 BMD_1376 BMD_1377     FALSE 0.304 12.000 0.000 1.000   NA
 10371814 10371815 BMD_1377 BMD_1378   aspB TRUE 0.624 134.000 0.367 1.000   NA
 10371815 10371816 BMD_1378 BMD_1379 aspB asnS FALSE 0.476 158.000 0.094 1.000 N NA
 10371816 10371817 BMD_1379 BMD_1380 asnS   FALSE 0.219 337.000 0.234 NA N NA
 10371817 10371818 BMD_1380 BMD_1381   nth FALSE 0.617 141.000 0.075 NA Y NA
 10371818 10371819 BMD_1381 BMD_1382 nth   TRUE 0.901 -13.000 0.034 NA   NA
 10371820 10371821 BMD_1383 BMD_1384 ponA recU FALSE 0.571 64.000 0.062 1.000   NA
 10371822 10371823 BMD_1385 BMD_1386     FALSE 0.002 290.000 0.000 NA   NA
 10371823 10371824 BMD_1386 BMD_1387     FALSE 0.025 46.000 0.000 NA   NA
 10371825 10371826 BMD_1388 BMD_1389     FALSE 0.508 127.000 0.263 NA   NA
 10371828 10371829 BMD_1391 BMD_1392     FALSE 0.006 146.000 0.000 NA   NA
 11490342 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4529.000 0.000 NA   NA
 11632705 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4529.000 0.000 NA   NA
 11775097 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4529.000 0.000 NA   NA
 11490343 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4558.000 0.000 NA   NA
 11632706 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4558.000 0.000 NA   NA
 11775098 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4558.000 0.000 NA   NA
 11490344 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4601.000 0.000 NA   NA
 11632707 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4601.000 0.000 NA   NA
 11775099 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4601.000 0.000 NA   NA
 11490345 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4630.000 0.000 NA   NA
 11632708 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4630.000 0.000 NA   NA
 11775100 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4630.000 0.000 NA   NA
 11490346 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4673.000 0.000 NA   NA
 11632709 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4673.000 0.000 NA   NA
 11775101 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4673.000 0.000 NA   NA
 11490347 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4702.000 0.000 NA   NA
 11632710 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4702.000 0.000 NA   NA
 11775102 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4702.000 0.000 NA   NA
 11490348 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4721.000 0.000 NA   NA
 11632711 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4721.000 0.000 NA   NA
 11775103 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4721.000 0.000 NA   NA
 11490349 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4750.000 0.000 NA   NA
 11632712 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4750.000 0.000 NA   NA
 11775104 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4750.000 0.000 NA   NA
 11490350 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4781.000 0.000 NA   NA
 11632713 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4781.000 0.000 NA   NA
 11775105 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4781.000 0.000 NA   NA
 11490351 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4810.000 0.000 NA   NA
 11632714 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4810.000 0.000 NA   NA
 11775106 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4810.000 0.000 NA   NA
 11490352 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4841.000 0.000 NA   NA
 11632715 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4841.000 0.000 NA   NA
 11775107 10371820   BMD_1383   ponA FALSE NA 4841.000 0.000 NA   NA
 10371830 10371831 BMD_1393 BMD_1394 cotH cotB FALSE 0.007 131.000 0.000 NA   NA
 10371831 10371832 BMD_1394 BMD_1395 cotB   FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10371832 10371833 BMD_1395 BMD_1396   metB FALSE 0.001 357.000 0.000 NA   NA
 10371833 10371834 BMD_1396 BMD_1397 metB metC TRUE 0.998 -16.000 0.600 0.006 Y NA
 10371835 10371836 BMD_1398 BMD_1399     FALSE 0.019 63.000 0.000 NA   NA
 10371836 10371837 BMD_1399 BMD_1400     FALSE 0.014 83.000 0.000 NA   NA
 10371837 10371838 BMD_1400 BMD_1401   opuE FALSE 0.034 31.000 0.000 NA   NA
 10371838 10371839 BMD_1401 BMD_1402 opuE   FALSE 0.002 293.000 0.000 NA   NA
 10371840 10371841 BMD_1403 BMD_1404   cspA FALSE 0.002 288.000 0.000 NA   NA
 10371841 10371842 BMD_1404 BMD_1405 cspA   FALSE 0.010 105.000 0.000 NA   NA
 10371843 10371844 BMD_1406 BMD_1407     FALSE 0.006 151.000 0.000 NA   NA
 10371844 10371845 BMD_1407 BMD_1408     FALSE 0.006 150.000 0.000 NA   NA
 10371846 10371847 BMD_1409 BMD_1410     TRUE 0.787 5.000 0.015 1.000   NA
 10371847 10371848 BMD_1410 BMD_1411   cotD FALSE 0.001 347.000 0.000 NA   NA
 10371848 10371849 BMD_1411 BMD_1412 cotD   FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10371849 10371850 BMD_1412 BMD_1413     FALSE 0.249 -25.000 0.000 NA   NA
 10371850 10371851 BMD_1413 BMD_1414   gpsB FALSE 0.200 -10.000 0.000 NA   NA
 10371851 10371852 BMD_1414 BMD_1415 gpsB liaI FALSE 0.000 717.000 0.000 NA   NA
 10371852 10371853 BMD_1415 BMD_1416 liaI liaH TRUE 0.881 37.000 0.514 NA   NA
 10371853 10371854 BMD_1416 BMD_1417 liaH liaF FALSE 0.436 136.000 0.210 NA   NA
 10371854 10371855 BMD_1417 BMD_1418 liaF liaS TRUE 0.980 -3.000 0.679 NA   NA
 10371855 10371856 BMD_1418 BMD_1419 liaS liaR TRUE 0.998 -7.000 0.853 0.022 Y NA
 10371856 10371857 BMD_1419 BMD_1420 liaR malL FALSE 0.187 133.000 0.000 1.000 N NA
 10371857 10371858 BMD_1420 BMD_1421 malL   FALSE 0.081 260.000 0.000 1.000 N NA
 10371860 10371861 BMD_1423 BMD_1424     FALSE 0.023 52.000 0.000 NA   NA
 10371862 10371863 BMD_1425 BMD_1426     TRUE 0.990 15.000 0.600 0.035 Y NA
 10371863 10371864 BMD_1426 BMD_1427     TRUE 0.993 -16.000 0.053 0.035 Y NA
 10371864 10371865 BMD_1427 BMD_1428   msmX TRUE 0.878 37.000 0.000 0.035 Y NA
 10371866 10371867 BMD_1429 BMD_1430     FALSE 0.004 224.000 0.000 NA   NA
 10371867 10371868 BMD_1430 BMD_1431     FALSE 0.560 125.000 0.118 1.000 N NA
 10371868 10371869 BMD_1431 BMD_1432   xpt FALSE 0.129 303.000 0.009 1.000 N NA
 10371869 10371870 BMD_1432 BMD_1433 xpt   TRUE 0.968 2.000 0.056 1.000 Y NA
 10371874 10371875 BMD_1437 BMD_1438     FALSE 0.116 225.000 0.000 1.000 N NA
 10371875 10371876 BMD_1438 BMD_1439     TRUE 0.940 6.000 0.279 1.000   NA
 10371876 10371877 BMD_1439 BMD_1440     FALSE 0.051 375.000 0.029 1.000   NA
 10371877 10371878 BMD_1440 BMD_1441     TRUE 0.698 6.000 0.026 NA   NA
 10371878 10371879 BMD_1441 BMD_1442     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10371879 10371880 BMD_1442 BMD_1443     FALSE 0.010 106.000 0.000 NA   NA
 10371880 10371881 BMD_1443 BMD_1444     FALSE 0.007 131.000 0.000 NA   NA
 10371881 10371882 BMD_1444 BMD_1445     FALSE 0.324 62.000 0.017 NA   NA
 10371884 10371885 BMD_1447 BMD_1448 rnhA   TRUE 0.918 30.000 0.680 NA   NA
 10371885 10371886 BMD_1448 BMD_1449     TRUE 0.849 57.000 0.542 NA   NA
 10371888 10371889 BMD_1451 BMD_1452     FALSE 0.002 303.000 0.000 NA   NA
 10371889 10371890 BMD_1452 BMD_1453     FALSE 0.037 169.000 0.000 1.000   NA
 10371892 10371893 BMD_1455 BMD_1456   dppA FALSE 0.006 141.000 0.000 NA   NA
 10371893 10371894 BMD_1456 BMD_1457 dppA dppB TRUE 0.977 15.000 0.500 NA Y NA
 10371894 10371895 BMD_1457 BMD_1458 dppB dppC TRUE 0.996 2.000 0.909 0.035 Y NA
 10371895 10371896 BMD_1458 BMD_1459 dppC dppD FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10371896 10371897 BMD_1459 BMD_1460 dppD dppE FALSE 0.044 24.000 0.000 NA   NA
 10371897 10371898 BMD_1460 BMD_1461 dppE   TRUE 0.776 89.000 0.333 NA N NA
 10371898 10371899 BMD_1461 BMD_1462     TRUE 0.804 29.000 0.095 NA N NA
 10371899 10371900 BMD_1462 BMD_1463   ykfD TRUE 0.951 13.000 0.400 NA N NA
 10371900 10371901 BMD_1463 BMD_1464 ykfD   TRUE 0.982 -3.000 0.333 1.000 N NA
 10371901 10371902 BMD_1464 BMD_1465     FALSE 0.001 342.000 0.000 NA   NA
 10371902 10371903 BMD_1465 BMD_1466     FALSE 0.009 110.000 0.000 NA   NA
 10371903 10371904 BMD_1466 BMD_1467     FALSE 0.310 87.000 0.000 1.000 N NA
 10371905 10371906 BMD_1468 BMD_1469     FALSE 0.013 89.000 0.000 NA   NA
 10371907 10371908 BMD_1470 BMD_1471     FALSE 0.001 338.000 0.000 NA   NA
 10371909 10371910 BMD_1472 BMD_1473 desR desK TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.021 Y NA
 10371910 10371911 BMD_1473 BMD_1474 desK des TRUE 0.705 123.000 0.294 1.000 N NA
 10371912 10371913 BMD_1475 BMD_1476     FALSE 0.006 157.000 0.000 NA   NA
 10371913 10371914 BMD_1476 BMD_1477   cls FALSE 0.003 258.000 0.000 NA   NA
 10371914 10371915 BMD_1477 BMD_1478 cls   FALSE 0.029 36.000 0.000 NA   NA
 10371915 10371916 BMD_1478 BMD_1479     FALSE 0.013 85.000 0.000 NA   NA
 10371916 10371917 BMD_1479 BMD_1480     FALSE 0.004 218.000 0.000 NA   NA
 10371917 10371918 BMD_1480 BMD_1481     FALSE 0.013 288.000 0.000 1.000   NA
 10371918 10371919 BMD_1481 BMD_1482   galU FALSE 0.459 47.000 0.000 1.000 N NA
 10371919 10371920 BMD_1482 BMD_1483 galU   FALSE 0.254 104.000 0.000 1.000 N NA
 10371922 10371923 BMD_1485 BMD_1486     FALSE 0.006 154.000 0.000 NA   NA
 10371923 10371924 BMD_1486 BMD_1487     FALSE 0.040 155.000 0.000 1.000   NA
 10371924 10371925 BMD_1487 BMD_1488   selA TRUE 0.993 -22.000 0.750 1.000   NA
 10371925 10371926 BMD_1488 BMD_1489 selA   TRUE 0.970 2.000 0.679 NA   NA
 10371926 10371927 BMD_1489 BMD_1490     TRUE 0.850 29.000 0.283 NA   NA
 10371927 10371928 BMD_1490 BMD_1491     TRUE 0.959 12.000 0.333 1.000 N NA
 10371928 10371929 BMD_1491 BMD_1492     FALSE 0.339 79.000 0.000 1.000 N NA
 10371929 10371930 BMD_1492 BMD_1493     FALSE 0.081 85.000 0.000 1.000   NA
 10371930 10371931 BMD_1493 BMD_1494     FALSE 0.046 19.000 0.000 NA   NA
 10371931 10371932 BMD_1494 BMD_1495     FALSE 0.003 252.000 0.000 NA   NA
 10371932 10371933 BMD_1495 BMD_1496     FALSE 0.006 141.000 0.000 NA   NA
 10371933 10371934 BMD_1496 BMD_1497     FALSE 0.181 143.000 0.000 1.000 N NA
 10371934 10371935 BMD_1497 BMD_1498     FALSE 0.143 202.000 0.000 1.000 N NA
 10371935 10371936 BMD_1498 BMD_1499   bsn TRUE 0.974 -3.000 0.200 1.000 N NA
 10371938 10371939 BMD_1501 BMD_1502     FALSE 0.168 34.000 0.000 1.000   NA
 10371939 10371940 BMD_1502 BMD_1503     FALSE 0.398 62.000 0.000 1.000 N NA
 10371940 10371941 BMD_1503 BMD_1504     FALSE 0.141 46.000 0.000 1.000   NA
 10371944 10371945 BMD_1507 BMD_1508 fhuG fhuB TRUE 0.997 -3.000 0.857 0.035 Y NA
 10371945 10371946 BMD_1508 BMD_1509 fhuB fhuD TRUE 0.931 82.000 0.487 1.000 Y NA
 10371946 10371947 BMD_1509 BMD_1510 fhuD fhuC TRUE 0.990 1.000 0.455 1.000 Y NA
 10371948 10371949 BMD_1511 BMD_1512   megL FALSE 0.175 157.000 0.000 1.000 N NA
 10371949 10371950 BMD_1512 BMD_1513 megL   FALSE 0.131 213.000 0.000 1.000 N NA
 10371950 10371951 BMD_1513 BMD_1514     FALSE 0.050 118.000 0.000 1.000   NA
 10371951 10371952 BMD_1514 BMD_1515     FALSE 0.006 143.000 0.000 NA   NA
 10371952 10371953 BMD_1515 BMD_1516     FALSE 0.023 51.000 0.000 NA   NA
 10371955 10371956 BMD_1518 BMD_1519   hxlA FALSE 0.073 202.000 0.000 NA N NA
 10371956 10371957 BMD_1519 BMD_1520 hxlA   FALSE 0.038 360.000 0.000 1.000 N NA
 10371957 10371958 BMD_1520 BMD_1521     TRUE 0.813 31.000 0.000 1.000 Y NA
 10371958 10371959 BMD_1521 BMD_1522     TRUE 0.796 67.000 0.185 1.000 N NA
 10371959 10371960 BMD_1522 BMD_1523   opuAA FALSE 0.333 81.000 0.000 1.000 N NA
 10371960 10371961 BMD_1523 BMD_1524 opuAA opuAB TRUE 0.994 3.000 0.600 0.095 Y NA
 10371961 10371962 BMD_1524 BMD_1525 opuAB opuAC TRUE 0.970 22.000 0.111 0.035 Y NA
 10371962 10371963 BMD_1525 BMD_1526 opuAC pyk FALSE 0.194 130.000 0.000 1.000 N NA
 10371963 10371964 BMD_1526 BMD_1527 pyk   FALSE 0.018 496.000 0.000 1.000 N NA
 10371964 10371965 BMD_1527 BMD_1528     TRUE 0.958 19.000 0.169 1.000 Y NA
 10371966 10371967 BMD_1529 BMD_1530     FALSE 0.163 184.000 0.000 1.000 N NA
 10371968 10371969 BMD_1531 BMD_1532     FALSE 0.167 172.000 0.000 1.000 N NA
 10371969 10371970 BMD_1532 BMD_1533     FALSE 0.158 37.000 0.000 1.000   NA
 10371970 10371971 BMD_1533 BMD_1534   ggt FALSE 0.022 231.000 0.000 1.000   NA
 10371973 10371974 BMD_1536 BMD_1537 sacB sacC TRUE 0.665 98.000 0.250 1.000   NA
 10371974 10371975 BMD_1537 BMD_1538 sacC   FALSE 0.242 108.000 0.000 1.000 N NA
 10371975 10371976 BMD_1538 BMD_1539     FALSE 0.059 302.000 0.000 1.000 N NA
 10371976 10371977 BMD_1539 BMD_1540     FALSE 0.019 479.000 0.000 1.000 N NA
 10371977 10371978 BMD_1540 BMD_1541     TRUE 0.856 38.000 0.165 1.000 N NA
 10371978 10371979 BMD_1541 BMD_1542     FALSE 0.004 212.000 0.000 NA   NA
 10371979 10371980 BMD_1542 BMD_1543     FALSE 0.001 354.000 0.000 NA   NA
 10371980 10371981 BMD_1543 BMD_1544     FALSE 0.003 261.000 0.000 NA   NA
 10371981 10371982 BMD_1544 BMD_1545     FALSE 0.005 205.000 0.000 NA   NA
 10371982 10371983 BMD_1545 BMD_1546     FALSE 0.027 483.000 0.000 0.041   NA
 10371983 10371984 BMD_1546 BMD_1547     FALSE 0.040 152.000 0.000 1.000   NA
 10371984 10371985 BMD_1547 BMD_1548     FALSE 0.261 -37.000 0.000 NA   NA
 10371987 10371988 BMD_1550 BMD_1551     TRUE 0.863 128.000 0.167 0.014 Y NA
 10371988 10371989 BMD_1551 BMD_1552     FALSE 0.016 71.000 0.000 NA   NA
 10371990 10371991 BMD_1553 BMD_1554     FALSE 0.004 228.000 0.000 NA   NA
 10371992 10371993 BMD_1555 BMD_1556     FALSE 0.001 429.000 0.000 NA   NA
 10371997 10371998 BMD_1560 BMD_1561     FALSE 0.006 155.000 0.000 NA   NA
 10371998 10371999 BMD_1561 BMD_1562     FALSE 0.006 158.000 0.000 NA   NA
 10372000 10372001 BMD_1563 BMD_1564 sspA fruR FALSE 0.074 91.000 0.000 1.000   NA
 10372002 10372003 BMD_1565 BMD_1566   cscA TRUE 0.847 13.000 0.094 1.000   NA
 10372003 10372004 BMD_1566 BMD_1567 cscA   FALSE 0.002 274.000 0.000 NA   NA
 10372004 10372005 BMD_1567 BMD_1568   sacB FALSE 0.001 477.000 0.000 NA   NA
 10372005 10372006 BMD_1568 BMD_1569 sacB levR FALSE 0.008 354.000 0.000 1.000   NA
 10372006 10372007 BMD_1569 BMD_1570 levR levD FALSE 0.150 318.000 0.000 0.008 N NA
 10372007 10372008 BMD_1570 BMD_1571 levD levE TRUE 0.997 -3.000 0.750 0.007 Y NA
 10372008 10372009 BMD_1571 BMD_1572 levE levF TRUE 0.994 13.000 1.000 0.007 Y NA
 10372009 10372010 BMD_1572 BMD_1573 levF levG TRUE 0.975 27.000 0.190 0.007 Y NA
 10372010 10372011 BMD_1573 BMD_1574 levG sacC FALSE 0.612 87.000 0.143 1.000   NA
 10372012 10372013 BMD_1575 BMD_1576     TRUE 0.973 28.000 0.182 0.007 Y NA
 10372013 10372014 BMD_1576 BMD_1577     TRUE 0.978 38.000 0.455 0.035 Y NA
 10372015 10372016 BMD_1578 BMD_1579 met metN TRUE 0.986 13.000 0.880 NA Y NA
 10372016 10372017 BMD_1579 BMD_1580 metN met TRUE 0.993 1.000 0.846 1.000 Y NA
 10372018 10372019 BMD_1581 BMD_1582     FALSE 0.113 119.000 0.000 NA N NA
 10372019 10372020 BMD_1582 BMD_1583     FALSE 0.284 47.000 0.000 NA N NA
 10372021 10372022 BMD_1584 BMD_1585 metQ metN TRUE 0.661 57.000 0.000 NA Y NA
 10372022 10372023 BMD_1585 BMD_1586 metN   TRUE 0.997 -61.000 0.487 1.000 Y NA
 10372025 10372026 BMD_1588 BMD_1589     FALSE 0.434 22.000 0.000 NA N NA
 10372026 10372027 BMD_1589 BMD_1590   map FALSE 0.011 432.000 0.000 NA N NA
 10372027 10372028 BMD_1590 BMD_1591 map   FALSE 0.004 212.000 0.000 NA   NA
 10372028 10372029 BMD_1591 BMD_1592     FALSE 0.000 611.000 0.000 NA   NA
 10372031 10372032 BMD_1594 BMD_1595     FALSE 0.028 38.000 0.000 NA   NA
 10372032 10372033 BMD_1595 BMD_1596   hutH FALSE 0.008 355.000 0.000 1.000   NA
 10372033 10372034 BMD_1596 BMD_1597 hutH hutU TRUE 0.972 51.000 0.315 0.001 Y NA
 10372034 10372035 BMD_1597 BMD_1598 hutU hutI TRUE 0.889 17.000 0.110 1.000 N NA
 10372035 10372036 BMD_1598 BMD_1599 hutI hutG TRUE 0.965 -25.000 0.013 1.000 N NA
 10372037 10372038 BMD_1600 BMD_1601     FALSE 0.486 39.000 0.000 1.000 N NA
 10372039 10372040 BMD_1602 BMD_1603   iadA FALSE 0.018 64.000 0.000 NA   NA
 10372040 10372041 BMD_1603 BMD_1604 iadA   FALSE 0.527 93.000 0.025 1.000 N NA
 10372041 10372042 BMD_1604 BMD_1605     FALSE 0.121 220.000 0.000 1.000 N NA
 10372042 10372043 BMD_1605 BMD_1606     FALSE 0.011 425.000 0.000 NA N NA
 10372043 10372044 BMD_1606 BMD_1607     FALSE 0.006 181.000 0.000 NA   NA
 10372046 10372047 BMD_1609 BMD_1610     FALSE 0.022 54.000 0.000 NA   NA
 10372047 10372048 BMD_1610 BMD_1611     FALSE 0.006 145.000 0.000 NA   NA
 10372050 10372051 BMD_1613 BMD_1614     TRUE 0.828 20.000 0.109 1.000   NA
 10372055 10372056 BMD_1618 BMD_1619     FALSE 0.006 161.000 0.000 NA   NA
 10372056 10372057 BMD_1619 BMD_1620     FALSE 0.000 806.000 0.000 NA   NA
 10372057 10372058 BMD_1620 BMD_1621     FALSE 0.001 380.000 0.000 NA   NA
 10372058 10372059 BMD_1621 BMD_1622     FALSE 0.002 972.000 0.000 1.000   NA
 10372059 10372060 BMD_1622 BMD_1623     FALSE 0.002 305.000 0.000 NA   NA
 10372062 10372063 BMD_1625 BMD_1626 lytF   FALSE 0.006 146.000 0.000 NA   NA
 10372064 10372065 BMD_1627 BMD_1628     FALSE 0.002 266.000 0.000 NA   NA
 10372068 10372069 BMD_1631 BMD_1632     FALSE 0.063 12.000 0.000 NA   NA
 10372071 10372072 BMD_1634 BMD_1635     FALSE 0.169 166.000 0.000 1.000 N NA
 10372072 10372073 BMD_1635 BMD_1636     FALSE 0.003 250.000 0.000 NA   NA
 10372074 10372075 BMD_1637 BMD_1638     FALSE 0.003 233.000 0.000 NA   NA
 10372076 10372077 BMD_1639 BMD_1640     FALSE 0.002 283.000 0.000 NA   NA
 10372078 10372079 BMD_1641 BMD_1642 ykoH ykoG TRUE 0.975 -22.000 0.000 1.000 Y NA
 10372079 10372080 BMD_1642 BMD_1643 ykoG   FALSE 0.071 93.000 0.000 1.000   NA
 10372081 10372082 BMD_1644 BMD_1645 ugtP   TRUE 0.961 2.000 0.043 0.018 N NA
 10372082 10372083 BMD_1645 BMD_1646     FALSE 0.003 248.000 0.000 NA   NA
 10372083 10372084 BMD_1646 BMD_1647     FALSE 0.015 76.000 0.000 NA   NA
 10372084 10372085 BMD_1647 BMD_1648     FALSE 0.041 26.000 0.000 NA   NA
 10372086 10372087 BMD_1649 BMD_1650     TRUE 0.749 20.000 0.000 0.009   NA
 10372087 10372088 BMD_1650 BMD_1651     FALSE 0.295 133.000 0.000 0.009   NA
 10372088 10372089 BMD_1651 BMD_1652   cax FALSE 0.026 476.000 0.000 0.071   NA
 10372090 10372091 BMD_1653 BMD_1654     TRUE 0.692 149.000 0.333 1.000 N NA
 10372091 10372092 BMD_1654 BMD_1655   mmsA TRUE 0.789 36.000 0.000 1.000 Y NA
 10372092 10372093 BMD_1655 BMD_1656 mmsA   FALSE 0.033 379.000 0.000 1.000 N NA
 10372093 10372094 BMD_1656 BMD_1657   hisD FALSE 0.068 284.000 0.000 1.000 N NA
 10372094 10372095 BMD_1657 BMD_1658 hisD   FALSE 0.345 218.000 0.000 1.000 Y NA
 10372095 10372096 BMD_1658 BMD_1659     FALSE 0.491 38.000 0.000 1.000 N NA
 10372096 10372097 BMD_1659 BMD_1660     TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 10372100 10372101 BMD_1663 BMD_1664     FALSE 0.000 546.000 0.000 NA   NA
 10372102 10372103 BMD_1665 BMD_1666     FALSE 0.043 345.000 0.000 1.000 N NA
 10372103 10372104 BMD_1666 BMD_1667     FALSE 0.000 689.000 0.000 NA   NA
 10372104 10372105 BMD_1667 BMD_1668   cotF TRUE 0.765 18.000 0.105 NA   NA
 10372105 10372106 BMD_1668 BMD_1669 cotF   FALSE 0.003 258.000 0.000 NA   NA
 10372106 10372107 BMD_1669 BMD_1670     FALSE 0.000 727.000 0.000 NA   NA
 10372113 10372114 BMD_1676 BMD_1677     FALSE 0.004 215.000 0.000 NA   NA
 10372115 10372116 BMD_1678 BMD_1679 qacC qacC TRUE 0.967 0.000 0.000 0.071 Y NA
 10372118 10372119 BMD_1681 BMD_1682   cspA FALSE 0.000 883.000 0.000 NA   NA
 10372121 10372122 BMD_1684 BMD_1685     FALSE 0.113 352.000 0.179 NA   NA
 10372123 10372124 BMD_1686 BMD_1687     FALSE 0.003 253.000 0.000 NA   NA
 10372127 10372128 BMD_1690 BMD_1691   sspH FALSE 0.008 117.000 0.000 NA   NA
 10372129 10372130 BMD_1692 BMD_1693     FALSE 0.019 62.000 0.000 NA   NA
 10372130 10372131 BMD_1693 BMD_1694   dapA FALSE 0.000 565.000 0.000 NA   NA
 10372132 10372133 BMD_1695 BMD_1696     FALSE 0.439 66.000 0.000 0.094   NA
 10372138 10372139 BMD_1701 BMD_1702   nikA FALSE 0.015 552.000 0.000 1.000 N NA
 10372139 10372140 BMD_1702 BMD_1703 nikA nikB TRUE 0.991 17.000 0.833 0.045 Y NA
 10372140 10372141 BMD_1703 BMD_1704 nikB nikC TRUE 0.995 -3.000 0.200 0.001 Y NA
 10372141 10372142 BMD_1704 BMD_1705 nikC nikD TRUE 0.989 17.000 0.429 0.001 Y NA
 10372142 10372143 BMD_1705 BMD_1706 nikD nikE TRUE 0.967 33.000 0.129 0.001 Y NA
 10372143 10372144 BMD_1706 BMD_1707 nikE   FALSE 0.449 102.000 0.006 1.000 N NA
 10372144 10372145 BMD_1707 BMD_1708     FALSE 0.000 581.000 0.000 NA   NA
 10372145 10372146 BMD_1708 BMD_1709     FALSE 0.000 533.000 0.000 NA   NA
 10372146 10372147 BMD_1709 BMD_1710     FALSE 0.244 118.000 0.049 NA   NA
 10372147 10372148 BMD_1710 BMD_1711     FALSE 0.001 506.000 0.000 NA   NA
 10372148 10372149 BMD_1711 BMD_1712     FALSE 0.008 116.000 0.000 NA   NA
 10372149 10372150 BMD_1712 BMD_1713     FALSE 0.001 365.000 0.000 NA   NA
 10372150 10372151 BMD_1713 BMD_1714     FALSE 0.008 120.000 0.000 NA   NA
 10372152 10372153 BMD_1715 BMD_1716     FALSE 0.001 478.000 0.000 NA   NA
 10372154 10372155 BMD_1717 BMD_1718     FALSE 0.004 230.000 0.000 NA   NA
 10372155 10372156 BMD_1718 BMD_1719     FALSE 0.024 227.000 0.000 1.000   NA
 10372158 10372159 BMD_1721 BMD_1722     FALSE 0.304 12.000 0.000 1.000   NA
 10372159 10372160 BMD_1722 BMD_1723     FALSE 0.001 372.000 0.000 NA   NA
 10372163 10372164 BMD_1726 BMD_1727 recA1 arsC FALSE 0.018 492.000 0.000 1.000 N NA
 10372164 10372165 BMD_1727 BMD_1728 arsC arsB FALSE 0.043 25.000 0.000 NA   NA
 10372165 10372166 BMD_1728 BMD_1729 arsB   FALSE 0.046 19.000 0.000 NA   NA
 10372167 10372168 BMD_1730 BMD_1731 cspC   FALSE 0.002 276.000 0.000 NA   NA
 10372168 10372169 BMD_1731 BMD_1732     FALSE 0.003 256.000 0.000 NA   NA
 10372169 10372170 BMD_1732 BMD_1733     FALSE 0.008 115.000 0.000 NA   NA
 10372170 10372171 BMD_1733 BMD_1734     FALSE 0.002 318.000 0.000 NA   NA
 10372171 10372172 BMD_1734 BMD_1735     FALSE 0.039 27.000 0.000 NA   NA
 10372172 10372173 BMD_1735 BMD_1736     FALSE 0.001 500.000 0.000 NA   NA
 10372173 10372174 BMD_1736 BMD_1737     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 10372176 10372177 BMD_1739 BMD_1740     FALSE 0.264 -39.000 0.000 NA   NA
 10372180 10372181 BMD_1743 BMD_1744     TRUE 0.822 101.000 0.462 1.000 N NA
 10372184 10372185 BMD_1747 BMD_1748 gerKA gerKC TRUE 0.996 -10.000 0.889 0.009   NA
 10372185 10372186 BMD_1748 BMD_1749 gerKC gerKB TRUE 0.978 22.000 0.900 0.009   NA
 10372186 10372187 BMD_1749 BMD_1750 gerKB   FALSE 0.222 208.000 0.000 0.009   NA
 10372187 10372188 BMD_1750 BMD_1751     FALSE 0.216 212.000 0.000 0.009   NA
 10372188 10372189 BMD_1751 BMD_1752     FALSE 0.001 485.000 0.000 NA   NA
 10372189 10372190 BMD_1752 BMD_1753     FALSE 0.000 887.000 0.000 NA   NA
 10372191 10372192 BMD_1754 BMD_1755     FALSE 0.000 683.000 0.000 NA   NA
 10372193 10372194 BMD_1756 BMD_1757 gerUC   FALSE 0.010 316.000 0.000 1.000   NA
 10372195 10372196 BMD_1758 BMD_1759   psiE FALSE 0.002 685.000 0.000 1.000   NA
 10372196 10372197 BMD_1759 BMD_1760 psiE   FALSE 0.000 712.000 0.000 NA   NA
 10372198 10372199 BMD_1761 BMD_1762   rsbR FALSE 0.013 89.000 0.000 NA   NA
 10372200 10372201 BMD_1763 BMD_1764 ykoH ykoG TRUE 0.975 -22.000 0.000 1.000 Y NA
 10372201 10372202 BMD_1764 BMD_1765 ykoG   FALSE 0.118 59.000 0.000 1.000   NA
 10372203 10372204 BMD_1766 BMD_1767     FALSE 0.000 520.000 0.000 NA   NA
 10372206 10372207 BMD_1769 BMD_1770   hutH FALSE 0.060 312.000 0.044 NA   NA
 10372207 10372208 BMD_1770 BMD_1771 hutH hutU TRUE 0.862 218.000 0.315 0.001 Y NA
 10372208 10372209 BMD_1771 BMD_1772 hutU hutI TRUE 0.888 20.000 0.110 1.000 N NA
 10372209 10372210 BMD_1772 BMD_1773 hutI hutG TRUE 0.965 -25.000 0.013 1.000 N NA
 10372210 10372211 BMD_1773 BMD_1774 hutG   FALSE 0.131 107.000 0.000 NA N NA
 10372211 10372212 BMD_1774 BMD_1775     FALSE 0.000 753.000 0.000 NA   NA
 10372212 10372213 BMD_1775 BMD_1776     FALSE 0.001 384.000 0.000 NA   NA
 10372213 10372214 BMD_1776 BMD_1777     FALSE 0.002 1890.000 0.000 1.000   NA
 10372214 10372215 BMD_1777 BMD_1778   aspA TRUE 0.875 36.000 0.200 1.000 N NA
 10372216 10372217 BMD_1779 BMD_1780 cotF   FALSE 0.047 17.000 0.000 NA   NA
 10372217 10372218 BMD_1780 BMD_1781     FALSE 0.014 84.000 0.000 NA   NA
 10372219 10372220 BMD_1782 BMD_1783 ysnF   FALSE 0.001 332.000 0.000 NA   NA
 10372220 10372221 BMD_1783 BMD_1784     FALSE 0.001 389.000 0.000 NA   NA
 10372221 10372222 BMD_1784 BMD_1785     FALSE 0.289 82.000 0.024 NA   NA
 10372222 10372223 BMD_1785 BMD_1786     FALSE 0.004 229.000 0.000 NA   NA
 10372225 10372226 BMD_1788 BMD_1789     FALSE 0.000 1847.000 0.000 NA   NA
 10372227 10372228 BMD_1790 BMD_1791     FALSE 0.013 86.000 0.000 NA   NA
 10372229 10372230 BMD_1792 BMD_1793     FALSE 0.003 238.000 0.000 NA   NA
 10372231 10372232 BMD_1794 BMD_1795     FALSE 0.000 768.000 0.000 NA   NA
 10372232 10372233 BMD_1795 BMD_1796     FALSE 0.005 198.000 0.000 NA   NA
 10372234 10372235 BMD_1797 BMD_1798     FALSE 0.000 558.000 0.000 NA   NA
 10372237 10372238 BMD_1800 BMD_1801     FALSE 0.015 78.000 0.000 NA   NA
 10372238 10372239 BMD_1801 BMD_1802     FALSE 0.006 144.000 0.000 NA   NA
 10372241 10372242 BMD_1804 BMD_1805     FALSE 0.000 523.000 0.000 NA   NA
 10372244 10372245 BMD_1807 BMD_1808     FALSE 0.006 154.000 0.000 NA   NA
 10372246 10372247 BMD_1809 BMD_1810     TRUE 0.949 16.000 0.841 NA   NA
 10372247 10372248 BMD_1810 BMD_1811     FALSE 0.007 127.000 0.000 NA   NA
 10372248 10372249 BMD_1811 BMD_1812     FALSE 0.004 223.000 0.000 NA   NA
 10372249 10372250 BMD_1812 BMD_1813     TRUE 0.959 11.000 0.750 NA   NA
 10372251 10372252 BMD_1814 BMD_1815     FALSE 0.001 328.000 0.000 NA   NA
 10372252 10372253 BMD_1815 BMD_1816     FALSE 0.046 19.000 0.000 NA   NA
 10372253 10372254 BMD_1816 BMD_1817     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10372254 10372255 BMD_1817 BMD_1818     FALSE 0.253 -28.000 0.000 NA   NA
 10372256 10372257 BMD_1819 BMD_1820     FALSE 0.002 285.000 0.000 NA   NA
 10372258 10372259 BMD_1821 BMD_1822     FALSE 0.046 23.000 0.000 NA   NA
 10372262 10372263 BMD_1825 BMD_1826 brnQ   FALSE 0.003 493.000 0.000 1.000   NA
 10372264 10372265 BMD_1827 BMD_1828     FALSE 0.056 14.000 0.000 NA   NA
 10372265 10372266 BMD_1828 BMD_1829     FALSE 0.007 133.000 0.000 NA   NA
 10372266 10372267 BMD_1829 BMD_1830     FALSE 0.000 1012.000 0.000 NA   NA
 10372269 10372270 BMD_1832 BMD_1833     TRUE 0.962 60.000 0.333 0.034 Y NA
 10372270 10372271 BMD_1833 BMD_1834     TRUE 0.985 16.000 0.333 0.034 Y NA
 10372271 10372272 BMD_1834 BMD_1835     TRUE 0.995 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 10372272 10372273 BMD_1835 BMD_1836     TRUE 0.998 -7.000 1.000 0.002 Y NA
 10372273 10372274 BMD_1836 BMD_1837     FALSE 0.003 232.000 0.000 NA   NA
 10372274 10372275 BMD_1837 BMD_1838     FALSE 0.009 112.000 0.000 NA   NA
 10372275 10372276 BMD_1838 BMD_1839     FALSE 0.006 176.000 0.000 NA   NA
 10372276 10372277 BMD_1839 BMD_1840     FALSE 0.000 657.000 0.000 NA   NA
 10372277 10372278 BMD_1840 BMD_1841   phaZ3 FALSE 0.019 473.000 0.000 1.000 N NA
 10372278 10372279 BMD_1841 BMD_1842 phaZ3   FALSE 0.000 618.000 0.000 NA   NA
 10372283 10372284 BMD_1846 BMD_1847   tal FALSE 0.020 61.000 0.000 NA   NA
 10372286 10372287 BMD_1849 BMD_1850   mro FALSE 0.006 190.000 0.000 NA   NA
 10372288 10372289 BMD_1851 BMD_1852     FALSE 0.017 66.000 0.000 NA   NA
 10372290 10372291 BMD_1853 BMD_1854     FALSE 0.028 37.000 0.000 NA   NA
 10372295 10372296 BMD_1858 BMD_1859 xylA xylB TRUE 0.876 59.000 0.091 1.000 Y NA
 10372296 10372297 BMD_1859 BMD_1860 xylB xylT FALSE 0.012 302.000 0.000 1.000   NA
 10372297 10372298 BMD_1860 BMD_1861 xylT cyoA FALSE 0.015 747.000 0.000 0.069   NA
 10372298 10372299 BMD_1861 BMD_1862 cyoA cyoB TRUE 0.967 2.000 0.000 0.007 Y NA
 10372299 10372300 BMD_1862 BMD_1863 cyoB cyoC TRUE 0.963 2.000 0.000 0.040 Y NA
 10372300 10372301 BMD_1863 BMD_1864 cyoC cyoD TRUE 0.995 1.000 0.667 0.040 Y NA
 10372301 10372302 BMD_1864 BMD_1865 cyoD   FALSE 0.181 145.000 0.000 1.000 N NA
 10372302 10372303 BMD_1865 BMD_1866     FALSE 0.041 351.000 0.000 1.000 N NA
 10372305 10372306 BMD_1868 BMD_1869     FALSE 0.028 37.000 0.000 NA   NA
 10372306 10372307 BMD_1869 BMD_1870     FALSE 0.003 256.000 0.000 NA   NA
 10372309 10372310 BMD_1872 BMD_1873 acoA acoB TRUE 0.992 19.000 0.804 0.001 Y NA
 10372310 10372311 BMD_1873 BMD_1874 acoB acoC TRUE 0.979 26.000 0.295 0.082 Y NA
 10372311 10372312 BMD_1874 BMD_1875 acoC acoL TRUE 0.972 16.000 0.294 1.000 Y NA
 10372312 10372313 BMD_1875 BMD_1876 acoL acoR FALSE 0.414 265.000 0.259 1.000 N NA
 10372313 10372314 BMD_1876 BMD_1877 acoR bdhA FALSE 0.427 55.000 0.000 1.000 N NA
 10372314 10372315 BMD_1877 BMD_1878 bdhA   FALSE 0.083 426.000 0.000 1.000 Y NA
 10372315 10372316 BMD_1878 BMD_1879     FALSE 0.104 233.000 0.000 1.000 N NA
 10372316 10372317 BMD_1879 BMD_1880     FALSE 0.016 72.000 0.000 NA   NA
 10372318 10372319 BMD_1881 BMD_1882     FALSE 0.000 898.000 0.000 NA   NA
 10372321 10372322 BMD_1884 BMD_1885 yueF tatA FALSE 0.009 110.000 0.000 NA   NA
 10372323 10372324 BMD_1886 BMD_1887     TRUE 0.631 85.000 0.000 1.000 Y NA
 10372324 10372325 BMD_1887 BMD_1888     FALSE 0.008 118.000 0.000 NA   NA
 10372325 10372326 BMD_1888 BMD_1889     FALSE 0.003 243.000 0.000 NA   NA
 10372326 10372327 BMD_1889 BMD_1890     FALSE 0.001 388.000 0.000 NA   NA
 10372327 10372328 BMD_1890 BMD_1891     FALSE 0.004 227.000 0.000 NA   NA
 10372328 10372329 BMD_1891 BMD_1892     FALSE 0.108 381.000 0.000 1.000 Y NA
 10372329 10372330 BMD_1892 BMD_1893     TRUE 0.990 2.000 0.500 1.000 Y NA
 10372330 10372331 BMD_1893 BMD_1894     FALSE 0.009 114.000 0.000 NA   NA
 10372331 10372332 BMD_1894 BMD_1895   copZ TRUE 0.686 15.000 0.048 NA   NA
 10372332 10372333 BMD_1895 BMD_1896 copZ copA TRUE 0.906 86.000 0.077 0.001 Y NA
 10372335 10372336 BMD_1898 BMD_1899     FALSE 0.001 330.000 0.000 NA   NA
 10372336 10372337 BMD_1899 BMD_1900     FALSE 0.002 291.000 0.000 NA   NA
 10372337 10372338 BMD_1900 BMD_1901     FALSE 0.016 75.000 0.000 NA   NA
 10372340 10372341 BMD_1903 BMD_1904     TRUE 0.985 -3.000 0.957 NA   NA
 10372341 10372342 BMD_1904 BMD_1905     FALSE 0.000 587.000 0.000 NA   NA
 10372342 10372343 BMD_1905 BMD_1906   arsB TRUE 0.635 16.000 0.000 1.000 N NA
 10372343 10372344 BMD_1906 BMD_1907 arsB   FALSE 0.077 266.000 0.000 1.000 N NA
 10372344 10372345 BMD_1907 BMD_1908     FALSE 0.121 114.000 0.000 NA N NA
 10372349 10372350 BMD_1912 BMD_1913   zwf FALSE 0.153 39.000 0.000 1.000   NA
 10372352 10372353 BMD_1915 BMD_1916 ycsA   FALSE 0.023 326.000 0.000 NA N NA
 10372355 10372356 BMD_1918 BMD_1919   ribD TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 10372356 10372357 BMD_1919 BMD_1920 ribD   FALSE 0.005 396.000 0.000 1.000   NA
 10372357 10372358 BMD_1920 BMD_1921     FALSE 0.006 151.000 0.000 NA   NA
 10372359 10372360 BMD_1922 BMD_1923     TRUE 0.782 13.000 0.087 NA   NA
 10372361 10372362 BMD_1924 BMD_1925     FALSE 0.017 66.000 0.000 NA   NA
 10372362 10372363 BMD_1925 BMD_1926     FALSE 0.001 376.000 0.000 NA   NA
 10372363 10372364 BMD_1926 BMD_1927     FALSE 0.459 137.000 0.235 NA   NA
 10372366 10372367 BMD_1929 BMD_1930   ply FALSE 0.047 123.000 0.000 1.000   NA
 10372368 10372369 BMD_1931 BMD_1932     FALSE 0.001 465.000 0.000 NA   NA
 10372370 10372371 BMD_1933 BMD_1934     FALSE 0.015 76.000 0.000 NA   NA
 10372375 10372376 BMD_1938 BMD_1939 fhs   FALSE 0.302 274.000 0.355 NA   NA
 10372376 10372377 BMD_1939 BMD_1940     FALSE 0.593 62.000 0.122 NA   NA
 10372377 10372378 BMD_1940 BMD_1941     FALSE 0.271 125.000 0.026 1.000   NA
 10372378 10372379 BMD_1941 BMD_1942   yfmR TRUE 0.941 -19.000 0.031 1.000   NA
 10372379 10372380 BMD_1942 BMD_1943 yfmR   FALSE 0.108 64.000 0.000 1.000   NA
 10372382 10372383 BMD_1945 BMD_1946     FALSE 0.271 132.000 0.081 NA   NA
 10372383 10372384 BMD_1946 BMD_1947     FALSE 0.001 354.000 0.000 NA   NA
 10372384 10372385 BMD_1947 BMD_1948     FALSE 0.006 189.000 0.000 NA   NA
 10372385 10372386 BMD_1948 BMD_1949     FALSE 0.018 483.000 0.000 1.000 N NA
 10372386 10372387 BMD_1949 BMD_1950     FALSE 0.013 89.000 0.000 NA   NA
 10372387 10372388 BMD_1950 BMD_1951   cbiB FALSE 0.078 5.000 0.000 NA   NA
 10372388 10372389 BMD_1951 BMD_1952 cbiB cobD TRUE 0.992 -25.000 0.112 0.006 N NA
 10372389 10372390 BMD_1952 BMD_1953 cobD cobU TRUE 0.941 -3.000 0.031 1.000 N NA
 10372390 10372391 BMD_1953 BMD_1954 cobU cobS TRUE 0.982 -3.000 0.092 1.000 Y NA
 10372391 10372392 BMD_1954 BMD_1955 cobS cobC TRUE 0.972 -42.000 0.028 1.000 N NA
 10372392 10372393 BMD_1955 BMD_1956 cobC   TRUE 0.992 -48.000 0.434 NA N NA
 10372393 10372394 BMD_1956 BMD_1957     TRUE 0.924 -3.000 0.123 NA   NA
 10372394 10372395 BMD_1957 BMD_1958   rarD FALSE 0.041 135.000 0.000 1.000   NA
 10372399 10372400 BMD_1962 BMD_1963 panE   FALSE 0.445 0.000 0.000 1.000   NA
 10372402 10372403 BMD_1965 BMD_1966     FALSE 0.024 47.000 0.000 NA   NA
 10372403 10372404 BMD_1966 BMD_1967     TRUE 0.932 24.000 0.644 NA   NA
 10372404 10372405 BMD_1967 BMD_1968   proI FALSE 0.084 4.000 0.000 NA   NA
 10372407 10372408 BMD_1970 BMD_1971     TRUE 0.966 -3.000 0.333 NA   NA
 10372410 10372411 BMD_1973 BMD_1974   abrB FALSE 0.001 357.000 0.000 NA   NA
 10372415 10372416 BMD_1978 BMD_1979     TRUE 0.936 -3.000 0.154 NA   NA
 10372418 10372419 BMD_1981 BMD_1982     FALSE 0.006 167.000 0.000 NA   NA
 10372419 10372420 BMD_1982 BMD_1983     TRUE 0.896 25.000 0.373 NA   NA
 10372421 10372422 BMD_1984 BMD_1985     FALSE 0.046 22.000 0.000 NA   NA
 10372423 10372424 BMD_1986 BMD_1987     FALSE 0.102 1.000 0.000 NA   NA
 10372425 10372426 BMD_1988 BMD_1989 cvrA ywaD FALSE 0.037 165.000 0.000 1.000   NA
 10372427 10372428 BMD_1990 BMD_1991 kinC   FALSE 0.010 105.000 0.000 NA   NA
 10372428 10372429 BMD_1991 BMD_1992     FALSE 0.001 333.000 0.000 NA   NA
 10372429 10372430 BMD_1992 BMD_1993   pulA FALSE 0.088 80.000 0.000 1.000   NA
 10372430 10372431 BMD_1993 BMD_1994 pulA   FALSE 0.196 129.000 0.000 1.000 N NA
 10372431 10372432 BMD_1994 BMD_1995     FALSE 0.153 195.000 0.000 1.000 N NA
 10372432 10372433 BMD_1995 BMD_1996     FALSE 0.008 120.000 0.000 NA   NA
 10372435 10372436 BMD_1998 BMD_1999 motA motB TRUE 0.993 -7.000 0.257 1.000 Y NA
 10372438 10372439 BMD_2001 BMD_2002     FALSE 0.046 20.000 0.000 NA   NA
 10372443 10372444 BMD_2006 BMD_2007     FALSE 0.062 297.000 0.000 1.000 N NA
 10372444 10372445 BMD_2007 BMD_2008   prsA FALSE 0.592 26.000 0.000 1.000 N NA
 10372445 10372446 BMD_2008 BMD_2009 prsA   FALSE 0.036 365.000 0.000 1.000 N NA
 10372446 10372447 BMD_2009 BMD_2010     TRUE 0.994 -10.000 0.304 1.000 Y NA
 10372447 10372448 BMD_2010 BMD_2011   allB FALSE 0.031 382.000 0.000 1.000 N NA
 10372448 10372449 BMD_2011 BMD_2012 allB dtpT FALSE 0.017 508.000 0.000 1.000 N NA
 10372451 10372452 BMD_2014 BMD_2015     FALSE 0.449 144.000 0.000 1.000 Y NA
 10372453 10372454 BMD_2016 BMD_2017     FALSE 0.005 207.000 0.000 NA   NA
 10372455 10372456 BMD_2018 BMD_2019     FALSE 0.066 11.000 0.000 NA   NA
 10372456 10372457 BMD_2019 BMD_2020     TRUE 0.776 27.000 0.087 1.000   NA
 10372457 10372458 BMD_2020 BMD_2021   tcyK FALSE 0.361 70.000 0.000 1.000 N NA
 10372458 10372459 BMD_2021 BMD_2022 tcyK tcyL TRUE 0.917 75.000 0.125 0.033 Y NA
 10372459 10372460 BMD_2022 BMD_2023 tcyL tcyM TRUE 0.986 28.000 0.476 0.006 Y NA
 10372460 10372461 BMD_2023 BMD_2024 tcyM tcyN TRUE 0.993 -3.000 0.405 1.000 Y NA
 10372461 10372462 BMD_2024 BMD_2025 tcyN   FALSE 0.037 166.000 0.000 1.000   NA
 10372462 10372463 BMD_2025 BMD_2026     FALSE 0.096 2.000 0.000 NA   NA
 10372463 10372464 BMD_2026 BMD_2027     FALSE 0.007 136.000 0.000 NA   NA
 10372464 10372465 BMD_2027 BMD_2028   cwlM FALSE 0.011 97.000 0.000 NA   NA
 10372465 10372466 BMD_2028 BMD_2029 cwlM   FALSE 0.010 106.000 0.000 NA   NA
 10372468 10372469 BMD_2031 BMD_2032     FALSE 0.039 156.000 0.000 1.000   NA
 10372470 10372471 BMD_2033 BMD_2034     FALSE 0.014 84.000 0.000 NA   NA
 10372474 10372475 BMD_2037 BMD_2038     FALSE 0.006 143.000 0.000 NA   NA
 10372475 10372476 BMD_2038 BMD_2039     TRUE 0.989 -13.000 0.714 NA   NA
 10372480 10372481 BMD_2043 BMD_2044     FALSE 0.011 97.000 0.000 NA   NA
 10372481 10372482 BMD_2044 BMD_2045     FALSE 0.020 60.000 0.000 NA   NA
 10372482 10372483 BMD_2045 BMD_2046     FALSE 0.006 148.000 0.000 NA   NA
 10372483 10372484 BMD_2046 BMD_2047     FALSE 0.003 242.000 0.000 NA   NA
 10372485 10372486 BMD_2048 BMD_2049     FALSE 0.007 130.000 0.000 NA   NA
 10372486 10372487 BMD_2049 BMD_2050     FALSE 0.006 142.000 0.000 NA   NA
 10372488 10372489 BMD_2051 BMD_2052   sspH FALSE 0.015 78.000 0.000 NA   NA
 10372490 10372491 BMD_2053 BMD_2054   gltC FALSE 0.006 161.000 0.000 NA   NA
 10372492 10372493 BMD_2055 BMD_2056 gltA gltB TRUE 0.983 17.000 0.222 0.001 Y NA
 10372494 10372495 BMD_2057 BMD_2058     FALSE 0.070 8.000 0.000 NA   NA
 10372496 10372497 BMD_2059 BMD_2060     FALSE 0.003 249.000 0.000 NA   NA
 10372497 10372498 BMD_2060 BMD_2061     FALSE 0.001 344.000 0.000 NA   NA
 10372498 10372499 BMD_2061 BMD_2062     FALSE 0.000 607.000 0.000 NA   NA
 10372499 10372500 BMD_2062 BMD_2063     FALSE 0.212 172.000 0.000 0.080   NA
 10372502 10372503 BMD_2065 BMD_2066     TRUE 0.993 -30.000 0.727 1.000   NA
 10372503 10372504 BMD_2066 BMD_2067   rsbR FALSE 0.038 264.000 0.000 NA N NA
 10372505 10372506 BMD_2068 BMD_2069     FALSE 0.017 69.000 0.000 NA   NA
 10372507 10372508 BMD_2070 BMD_2071     TRUE 0.926 14.000 0.300 1.000   NA
 10372508 10372509 BMD_2071 BMD_2072     TRUE 0.968 -7.000 0.176 1.000   NA
 10372509 10372510 BMD_2072 BMD_2073   gtaB TRUE 0.953 -3.000 0.154 1.000   NA
 10372510 10372511 BMD_2073 BMD_2074 gtaB   FALSE 0.181 145.000 0.000 1.000 N NA
 10372511 10372512 BMD_2074 BMD_2075     TRUE 0.930 2.000 0.000 1.000 Y NA
 10372512 10372513 BMD_2075 BMD_2076     FALSE 0.001 373.000 0.000 NA   NA
 10372513 10372514 BMD_2076 BMD_2077     FALSE 0.001 348.000 0.000 NA   NA
 10372514 10372515 BMD_2077 BMD_2078     FALSE 0.003 253.000 0.000 NA   NA
 10372515 10372516 BMD_2078 BMD_2079   cysT TRUE 0.824 95.000 0.112 0.001 N NA
 10372516 10372517 BMD_2079 BMD_2080 cysT cysW TRUE 0.990 13.000 0.935 0.000 N NA
 10372517 10372518 BMD_2080 BMD_2081 cysW cysA TRUE 0.981 20.000 0.587 1.000 Y NA
 10372518 10372519 BMD_2081 BMD_2082 cysA   FALSE 0.232 112.000 0.000 1.000 N NA
 10372521 10372522 BMD_2084 BMD_2085     FALSE 0.008 123.000 0.000 NA   NA
 10372522 10372523 BMD_2085 BMD_2086     FALSE 0.001 382.000 0.000 NA   NA
 10372523 10372524 BMD_2086 BMD_2087   pfkB TRUE 0.995 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 10372524 10372525 BMD_2087 BMD_2088 pfkB fruA TRUE 0.988 13.000 0.816 1.000 Y NA
 10372525 10372526 BMD_2088 BMD_2089 fruA yclM FALSE 0.151 196.000 0.000 1.000 N NA
 10372526 10372527 BMD_2089 BMD_2090 yclM   FALSE 0.008 117.000 0.000 NA   NA
 10372527 10372528 BMD_2090 BMD_2091   sodC FALSE 0.006 189.000 0.000 NA   NA
 10372528 10372529 BMD_2091 BMD_2092 sodC   FALSE 0.219 117.000 0.000 1.000 N NA
 10372531 10372532 BMD_2094 BMD_2095     TRUE 0.737 13.000 0.016 1.000   NA
 10372532 10372533 BMD_2095 BMD_2096     TRUE 0.666 14.000 0.000 1.000 N NA
 10372535 10372536 BMD_2098 BMD_2099     FALSE 0.002 303.000 0.000 NA   NA
 10372536 10372537 BMD_2099 BMD_2100     FALSE 0.006 177.000 0.000 NA   NA
 10372539 10372540 BMD_2102 BMD_2103     FALSE 0.166 90.000 0.000 NA N NA
 10372540 10372541 BMD_2103 BMD_2104     TRUE 0.783 33.000 0.200 NA   NA
 10372541 10372542 BMD_2104 BMD_2105     FALSE 0.596 203.000 0.217 0.039   NA
 10372542 10372543 BMD_2105 BMD_2106     TRUE 0.882 2.000 0.111 NA   NA
 10372545 10372546 BMD_2108 BMD_2109     FALSE 0.004 227.000 0.000 NA   NA
 10372546 10372547 BMD_2109 BMD_2110     TRUE 0.829 35.000 0.018 0.001   NA
 10372549 10372550 BMD_2112 BMD_2113     FALSE 0.011 314.000 0.000 1.000   NA
 10372550 10372551 BMD_2113 BMD_2114     TRUE 0.654 97.000 0.116 1.000 N NA
 10372551 10372552 BMD_2114 BMD_2115   thiM FALSE 0.034 376.000 0.000 1.000 N NA
 10372552 10372553 BMD_2115 BMD_2116 thiM thiE TRUE 0.973 14.000 0.061 0.004 Y NA
 10372554 10372555 BMD_2117 BMD_2118     FALSE 0.001 439.000 0.000 NA   NA
 10372557 10372558 BMD_2120 BMD_2121     FALSE 0.139 -3.000 0.000 NA   NA
 10372559 10372560 BMD_2122 BMD_2123     FALSE 0.007 132.000 0.000 NA   NA
 10372560 10372561 BMD_2123 BMD_2124     TRUE 0.959 12.000 0.822 NA   NA
 10372561 10372562 BMD_2124 BMD_2125     FALSE 0.147 99.000 0.000 NA N NA
 10372564 10372565 BMD_2127 BMD_2128     FALSE 0.006 147.000 0.000 NA   NA
 10372565 10372566 BMD_2128 BMD_2129     FALSE 0.270 -49.000 0.000 NA   NA
 10372566 10372567 BMD_2129 BMD_2130     FALSE 0.018 65.000 0.000 NA   NA
 10372567 10372568 BMD_2130 BMD_2131   ylmA FALSE 0.622 19.000 0.000 1.000 N NA
 10372569 10372570 BMD_2132 BMD_2133     FALSE 0.010 102.000 0.000 NA   NA
 10372570 10372571 BMD_2133 BMD_2134     FALSE 0.047 332.000 0.000 1.000 N NA
 10372572 10372573 BMD_2135 BMD_2136     FALSE 0.063 12.000 0.000 NA   NA
 10372573 10372574 BMD_2136 BMD_2137     FALSE 0.007 126.000 0.000 NA   NA