MicrobesOnline Operon Predictions for Bacillus anthracis str. A0248

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7684396 7684397 BAA_0001 BAA_0002 dnaA dnaN1 TRUE 0.809 179.000 0.328 1.000 Y NA
 7684397 7684398 BAA_0002 BAA_0003 dnaN1   TRUE 0.671 128.000 0.103 1.000   NA
 7684398 7684399 BAA_0003 BAA_0004   recF TRUE 0.793 13.000 0.209 1.000   NA
 7684399 7684400 BAA_0004 BAA_0005 recF gyrB TRUE 0.943 39.000 0.249 0.004 Y NA
 7684400 7684401 BAA_0005 BAA_0006 gyrB gyrA TRUE 0.950 89.000 0.306 0.001 Y NA
 7684401 7684402 BAA_0006 BAA_0007 gyrA rrs_1 FALSE 0.024 267.000 0.000 NA   NA
 7684402 7684403 BAA_0007 BAA_0008 rrs_1   FALSE 0.308 150.000 0.000 NA   NA
 7684403 7684404 BAA_0008 BAA_0009     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7684404 7684405 BAA_0009 BAA_0011   rrl_1 FALSE 0.379 94.000 0.000 NA   NA
 7684409 7684410 BAA_0014 BAA_0015 guaB dacA TRUE 0.852 105.000 0.304 1.000 N NA
 7684410 7684411 BAA_0015 BAA_0016 dacA   FALSE 0.597 162.000 0.017 1.000 N NA
 7684411 7684412 BAA_0016 BAA_0017     TRUE 0.971 19.000 0.488 NA Y NA
 7684412 7684413 BAA_0017 BAA_0018   serS FALSE 0.053 328.000 0.010 NA N NA
 7684413 7684414 BAA_0018 BAA_0019 serS   FALSE 0.250 157.000 0.000 NA   NA
 7684414 7684415 BAA_0019 BAA_0020     FALSE 0.186 167.000 0.000 NA   NA
 7684416 7684417 BAA_0021 BAA_0022     TRUE 0.982 3.000 0.255 0.001 Y NA
 7684417 7684418 BAA_0022 BAA_0023     TRUE 0.840 126.000 0.058 1.000 N NA
 7684419 7684420 BAA_0024 BAA_0025   srpB FALSE 0.092 193.000 0.000 NA   NA
 7684420 7684421 BAA_0025 BAA_0026 srpB dnaX FALSE 0.127 182.000 0.000 NA   NA
 7684421 7684422 BAA_0026 BAA_0027 dnaX   FALSE 0.606 23.000 0.071 NA   NA
 7684422 7684423 BAA_0027 BAA_0028   recR TRUE 0.871 15.000 0.604 NA   NA
 7684423 7684424 BAA_0028 BAA_0029 recR   TRUE 0.693 15.000 0.071 NA   NA
 7684424 7684425 BAA_0029 BAA_0030   bofA FALSE 0.140 215.000 0.417 NA   NA
 7684425 7684426 BAA_0030 BAA_0031 bofA rrs_2 FALSE 0.033 244.000 0.000 NA   NA
 7684426 7684427 BAA_0031 BAA_0032 rrs_2   FALSE 0.308 150.000 0.000 NA   NA
 7684427 7684428 BAA_0032 BAA_0033     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7684428 7684429 BAA_0033 BAA_0035   rrl_2 FALSE 0.379 94.000 0.000 NA   NA
 7684431 7684432 BAA_0036 BAA_0037 rrf_2   FALSE 0.096 191.000 0.000 NA   NA
 7684432 7684433 BAA_0037 BAA_0038     FALSE 0.546 72.000 0.400 NA   NA
 7684433 7684434 BAA_0038 BAA_0039   tmk TRUE 0.904 2.000 0.009 1.000 N NA
 7684434 7684435 BAA_0039 BAA_0040 tmk holB TRUE 0.778 36.000 0.009 1.000 N NA
 7684435 7684436 BAA_0040 BAA_0041 holB   TRUE 0.831 6.000 0.372 NA   NA
 7684436 7684437 BAA_0041 BAA_0042     TRUE 0.703 15.000 0.183 NA   NA
 7684437 7684438 BAA_0042 BAA_0043     TRUE 0.687 121.000 0.193 1.000   NA
 7684438 7684439 BAA_0043 BAA_0044     FALSE 0.537 -13.000 0.209 1.000   NA
 7684439 7684440 BAA_0044 BAA_0045     FALSE 0.406 -31.000 0.041 1.000   NA
 7684442 7684443 BAA_0047 BAA_0048 metS   FALSE 0.539 166.000 0.221 NA N NA
 7684443 7684444 BAA_0048 BAA_0049     FALSE 0.511 215.000 0.058 NA Y NA
 7684444 7684445 BAA_0049 BAA_0050   ksgA TRUE 0.869 -3.000 0.093 1.000 N NA
 7684445 7684446 BAA_0050 BAA_0051 ksgA   FALSE 0.572 111.000 0.022 NA   NA
 7684446 7684447 BAA_0051 BAA_0052     FALSE 0.055 239.000 0.116 NA   NA
 7684447 7684448 BAA_0052 BAA_0053   sspF FALSE 0.491 92.000 0.163 NA   NA
 7684448 7684449 BAA_0053 BAA_0054 sspF ispE FALSE 0.157 197.000 0.024 1.000   NA
 7684449 7684450 BAA_0054 BAA_0055 ispE purR TRUE 0.713 55.000 0.062 1.000 N NA
 7684450 7684451 BAA_0055 BAA_0056 purR   FALSE 0.326 -13.000 0.000 NA   NA
 7684451 7684452 BAA_0056 BAA_0057     FALSE 0.572 17.000 0.000 NA   NA
 7684452 7684453 BAA_0057 BAA_0058   spoVG TRUE 0.724 153.000 0.377 NA N NA
 7684453 7684454 BAA_0058 BAA_0059 spoVG glmU FALSE 0.220 323.000 0.014 1.000 Y NA
 7684454 7684455 BAA_0059 BAA_0060 glmU prsA TRUE 0.878 19.000 0.069 1.000 N NA
 7684455 7684456 BAA_0060 BAA_0061 prsA spoVC TRUE 0.909 10.000 0.010 1.000 N NA
 7684456 7684457 BAA_0061 BAA_0062 spoVC   FALSE 0.380 71.000 0.033 NA   NA
 7684457 7684458 BAA_0062 BAA_0063   mfd FALSE 0.551 106.000 0.035 NA   NA
 7684458 7684459 BAA_0063 BAA_0064 mfd spoVT TRUE 0.935 136.000 0.026 NA Y NA
 7684459 7684460 BAA_0064 BAA_0065 spoVT   FALSE 0.062 231.000 0.147 NA   NA
 7684460 7684461 BAA_0065 BAA_0066     TRUE 0.783 13.000 0.058 1.000   NA
 7684461 7684462 BAA_0066 BAA_0067     TRUE 0.768 15.000 0.054 1.000   NA
 7684462 7684463 BAA_0067 BAA_0068   yabP FALSE 0.397 59.000 0.108 NA   NA
 7684463 7684464 BAA_0068 BAA_0069 yabP yabQ TRUE 0.873 -3.000 0.774 NA   NA
 7684464 7684465 BAA_0069 BAA_0070 yabQ divIC1 TRUE 0.634 -3.000 0.074 NA   NA
 7684465 7684466 BAA_0070 BAA_0071 divIC1   TRUE 0.773 88.000 0.134 1.000 N NA
 7684466 7684467 BAA_0071 BAA_0072     FALSE 0.225 160.000 0.000 NA   NA
 7684467 7684468 BAA_0072 BAA_0073     TRUE 0.642 10.000 0.000 NA   NA
 7684468 7684469 BAA_0073 BAA_0074   spoIIE FALSE 0.027 257.000 0.000 NA   NA
 7684469 7684470 BAA_0074 BAA_0075 spoIIE tilS FALSE 0.185 234.000 0.041 1.000 N NA
 7684470 7684471 BAA_0075 BAA_0076 tilS hpt TRUE 0.896 -3.000 0.067 0.046 N NA
 7684471 7684472 BAA_0076 BAA_0077 hpt ftsH TRUE 0.767 86.000 0.192 1.000 N NA
 7684472 7684473 BAA_0077 BAA_0078 ftsH coaX FALSE 0.204 225.000 0.029 1.000 N NA
 7684473 7684474 BAA_0078 BAA_0079 coaX hslO TRUE 0.916 7.000 0.060 1.000 N NA
 7684474 7684475 BAA_0079 BAA_0080 hslO cysK1 TRUE 0.825 105.000 0.053 1.000 N NA
 7684475 7684476 BAA_0080 BAA_0081 cysK1 pabB FALSE 0.517 221.000 0.107 1.000 Y NA
 7684476 7684477 BAA_0081 BAA_0082 pabB pabA TRUE 0.986 6.000 0.452 0.016 Y NA
 7684477 7684478 BAA_0082 BAA_0083 pabA pabC TRUE 0.964 -6.000 0.532 1.000 Y NA
 7684478 7684479 BAA_0083 BAA_0084 pabC folP TRUE 0.982 2.000 0.519 1.000 Y NA
 7684479 7684480 BAA_0084 BAA_0085 folP folB TRUE 0.973 1.000 0.176 1.000 Y NA
 7684480 7684481 BAA_0085 BAA_0086 folB folK TRUE 0.962 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 7684481 7684482 BAA_0086 BAA_0087 folK   FALSE 0.604 -48.000 0.027 1.000 N NA
 7684482 7684483 BAA_0087 BAA_0088     TRUE 0.842 24.000 0.016 1.000 N NA
 7684483 7684484 BAA_0088 BAA_0089   lysS TRUE 0.862 160.000 0.021 1.000 Y NA
 7684484 7684485 BAA_0089 BAA_0090 lysS rrs_3 FALSE 0.007 399.000 0.000 NA   NA
 7684485 7684486 BAA_0090 BAA_0092 rrs_3 rrl_3 FALSE 0.141 179.000 0.000 NA   NA
 7684488 7684489 BAA_0093 BAA_0094 rrf_3 ctsR FALSE 0.062 207.000 0.000 NA   NA
 7684489 7684490 BAA_0094 BAA_0095 ctsR   FALSE 0.501 174.000 0.681 NA   NA
 7684490 7684491 BAA_0095 BAA_0096     TRUE 0.939 5.000 0.848 1.000   NA
 7684491 7684492 BAA_0096 BAA_0097     TRUE 0.895 23.000 0.425 1.000 N NA
 7684492 7684493 BAA_0097 BAA_0098   radA TRUE 0.946 97.000 0.062 0.012 Y NA
 7684493 7684494 BAA_0098 BAA_0099 radA   TRUE 0.745 4.000 0.126 NA   NA
 7684494 7684495 BAA_0099 BAA_0100     FALSE 0.300 161.000 0.088 NA   NA
 7684495 7684496 BAA_0100 BAA_0101   ispD TRUE 0.677 17.000 0.108 NA   NA
 7684496 7684497 BAA_0101 BAA_0102 ispD ispF TRUE 0.965 115.000 0.419 1.000 Y NA
 7684497 7684498 BAA_0102 BAA_0103 ispF gltX TRUE 0.715 72.000 0.076 1.000 N NA
 7684498 7684499 BAA_0103 BAA_0104 gltX cysE FALSE 0.035 433.000 0.008 1.000 N NA
 7684499 7684500 BAA_0104 BAA_0105 cysE cysS TRUE 0.748 -19.000 0.039 0.046 N NA
 7684500 7684501 BAA_0105 BAA_0106 cysS   TRUE 0.807 3.000 0.129 1.000   NA
 7684501 7684502 BAA_0106 BAA_0107     TRUE 0.814 -3.000 0.150 0.003   NA
 7684502 7684503 BAA_0107 BAA_0108     TRUE 0.741 4.000 0.109 NA   NA
 7684503 7684504 BAA_0108 BAA_0109   sigH FALSE 0.518 68.000 0.361 NA   NA
 7684504 7684505 BAA_0109 BAA_0110 sigH secE FALSE 0.068 311.000 0.000 1.000 N NA
 7684505 7684506 BAA_0110 BAA_0111 secE nusG TRUE 0.926 132.000 0.843 1.000 N NA
 7684506 7684507 BAA_0111 BAA_0112 nusG rplK TRUE 0.733 168.000 0.681 1.000 N NA
 7684507 7684508 BAA_0112 BAA_0113 rplK rplA TRUE 0.905 178.000 0.838 0.018 Y NA
 7684508 7684509 BAA_0113 BAA_0115 rplA rplJ FALSE 0.553 233.000 0.302 0.018 Y NA
 7684509 7684510 BAA_0115 BAA_0116 rplJ rplL TRUE 0.961 68.000 0.884 0.014 Y NA
 7684510 7684511 BAA_0116 BAA_0117 rplL   TRUE 0.906 75.000 0.050 1.000 Y NA
 7684511 7684512 BAA_0117 BAA_0118   rpoB FALSE 0.091 293.000 0.008 1.000 N NA
 7684512 7684513 BAA_0118 BAA_0119 rpoB rpoC TRUE 0.972 38.000 0.851 0.001 Y NA
 7684513 7684514 BAA_0119 BAA_0120 rpoC   TRUE 0.818 114.000 0.065 NA N NA
 7684514 7684515 BAA_0120 BAA_0121   rpsL TRUE 0.950 115.000 0.239 NA Y NA
 7684515 7684516 BAA_0121 BAA_0122 rpsL rpsG TRUE 0.957 30.000 0.224 0.003 Y NA
 7684516 7684517 BAA_0122 BAA_0123 rpsG fusA TRUE 0.694 208.000 0.579 1.000 Y NA
 7684517 7684518 BAA_0123 BAA_0124 fusA tuf TRUE 0.972 118.000 0.400 0.001 Y NA
 7684518 7684519 BAA_0124 BAA_0125 tuf rpsJ FALSE 0.159 399.000 0.318 1.000 Y NA
 7684519 7684520 BAA_0125 BAA_0126 rpsJ rplC TRUE 0.960 35.000 0.467 0.018 Y NA
 7684520 7684521 BAA_0126 BAA_0127 rplC rplD TRUE 0.973 26.000 0.544 0.014 Y NA
 7684521 7684522 BAA_0127 BAA_0128 rplD rplW TRUE 0.979 0.000 0.307 0.014 Y NA
 7684522 7684523 BAA_0128 BAA_0129 rplW rplB TRUE 0.978 29.000 0.849 0.018 Y NA
 7684523 7684524 BAA_0129 BAA_0130 rplB rpsS TRUE 0.958 61.000 0.820 0.018 Y NA
 7684524 7684525 BAA_0130 BAA_0131 rpsS rplV TRUE 0.985 18.000 0.769 0.018 Y NA
 7684525 7684526 BAA_0131 BAA_0132 rplV rpsC TRUE 0.989 4.000 0.719 0.018 Y NA
 7684526 7684527 BAA_0132 BAA_0133 rpsC rplP TRUE 0.989 2.000 0.828 0.018 Y NA
 7684527 7684528 BAA_0133 BAA_0134 rplP rpmC TRUE 0.969 -10.000 0.802 0.014 Y NA
 7684528 7684529 BAA_0134 BAA_0135 rpmC rpsQ TRUE 0.984 21.000 0.828 0.014 Y NA
 7684529 7684530 BAA_0135 BAA_0136 rpsQ rplN TRUE 0.963 44.000 0.791 0.018 Y NA
 7684530 7684531 BAA_0136 BAA_0137 rplN rplX TRUE 0.939 39.000 0.071 0.018 Y NA
 7684531 7684532 BAA_0137 BAA_0138 rplX rplE TRUE 0.958 27.000 0.057 0.014 Y NA
 7684532 7684533 BAA_0138 BAA_0139 rplE rpsN TRUE 0.963 34.000 0.496 0.014 Y NA
 7684533 7684534 BAA_0139 BAA_0140 rpsN rpsH TRUE 0.967 30.000 0.473 0.014 Y NA
 7684534 7684535 BAA_0140 BAA_0141 rpsH rplF TRUE 0.975 33.000 0.808 0.014 Y NA
 7684535 7684536 BAA_0141 BAA_0142 rplF rplR TRUE 0.976 32.000 0.815 0.014 Y NA
 7684536 7684537 BAA_0142 BAA_0143 rplR rpsE TRUE 0.983 22.000 0.814 0.018 Y NA
 7684537 7684538 BAA_0143 BAA_0144 rpsE rpmD TRUE 0.988 14.000 0.789 0.018 Y NA
 7684538 7684539 BAA_0144 BAA_0145 rpmD rplO TRUE 0.970 34.000 0.653 0.002 Y NA
 7684539 7684540 BAA_0145 BAA_0146 rplO secY1 TRUE 0.953 0.000 0.730 1.000 N NA
 7684540 7684541 BAA_0146 BAA_0147 secY1 adk TRUE 0.726 57.000 0.241 1.000 N NA
 7684541 7684542 BAA_0147 BAA_0148 adk maP1 TRUE 0.913 0.000 0.290 1.000 N NA
 7684542 7684543 BAA_0148 BAA_0149 maP1 infA TRUE 0.905 69.000 0.160 1.000 Y NA
 7684543 7684544 BAA_0149 BAA_0150 infA rpmJ FALSE 0.627 36.000 0.257 1.000   NA
 7684544 7684545 BAA_0150 BAA_0151 rpmJ rpsM TRUE 0.798 22.000 0.194 0.014   NA
 7684545 7684546 BAA_0151 BAA_0152 rpsM rpsK TRUE 0.980 25.000 0.810 0.014 Y NA
 7684546 7684547 BAA_0152 BAA_0153 rpsK rpoA FALSE 0.523 181.000 0.308 1.000 N NA
 7684547 7684548 BAA_0153 BAA_0154 rpoA rplQ TRUE 0.907 36.000 0.873 1.000 N NA
 7684548 7684549 BAA_0154 BAA_0155 rplQ   TRUE 0.820 104.000 0.074 1.000 N NA
 7684549 7684550 BAA_0155 BAA_0156     TRUE 0.944 -24.000 0.713 0.030 Y NA
 7684550 7684551 BAA_0156 BAA_0157     TRUE 0.921 -12.000 0.139 1.000 Y NA
 7684551 7684552 BAA_0157 BAA_0158   truA1 TRUE 0.901 0.000 0.170 1.000 N NA
 7684552 7684553 BAA_0158 BAA_0160 truA1 rplM TRUE 0.899 153.000 0.052 1.000 Y NA
 7684553 7684554 BAA_0160 BAA_0161 rplM rpsI TRUE 0.979 22.000 0.601 0.014 Y NA
 7684554 7684555 BAA_0161 BAA_0162 rpsI   FALSE 0.261 163.000 0.021 NA   NA
 7684555 7684556 BAA_0162 BAA_0163   cwlD FALSE 0.409 67.000 0.211 NA   NA
 7684556 7684557 BAA_0163 BAA_0164 cwlD   TRUE 0.775 145.000 0.211 1.000 N NA
 7684561 7684562 BAA_0168 BAA_0169   rrs_4 FALSE 0.031 250.000 0.000 NA   NA
 7684562 7684563 BAA_0169 BAA_0171 rrs_4 rrl_4 FALSE 0.141 179.000 0.000 NA   NA
 7684565 7684566 BAA_0172 BAA_0173 rrf_4   TRUE 0.645 9.000 0.000 NA   NA
 7684566 7684567 BAA_0173 BAA_0174     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7684567 7684568 BAA_0174 BAA_0175     FALSE 0.529 21.000 0.000 NA   NA
 7684568 7684569 BAA_0175 BAA_0176     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7684569 7684570 BAA_0176 BAA_0177     FALSE 0.572 17.000 0.000 NA   NA
 7684570 7684571 BAA_0177 BAA_0178     FALSE 0.296 66.000 0.000 NA   NA
 7684571 7684572 BAA_0178 BAA_0179     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7684572 7684573 BAA_0179 BAA_0180     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7684573 7684574 BAA_0180 BAA_0181     TRUE 0.647 8.000 0.000 NA   NA
 7684574 7684575 BAA_0181 BAA_0182     FALSE 0.490 112.000 0.000 NA   NA
 7684575 7684576 BAA_0182 BAA_0183     FALSE 0.210 -49.000 0.000 NA   NA
 7684576 7684577 BAA_0183 BAA_0184   rocF FALSE 0.059 210.000 0.000 NA   NA
 7684577 7684578 BAA_0184 BAA_0185 rocF   FALSE 0.032 249.000 0.000 NA   NA
 7684578 7684579 BAA_0185 BAA_0186     TRUE 0.733 -7.000 0.502 NA   NA
 7684579 7684580 BAA_0186 BAA_0187   glmM FALSE 0.535 -7.000 0.150 NA   NA
 7684580 7684581 BAA_0187 BAA_0188 glmM   FALSE 0.415 139.000 0.000 NA   NA
 7684581 7684582 BAA_0188 BAA_0189   glmS FALSE 0.095 192.000 0.000 NA   NA
 7684582 7684583 BAA_0189 BAA_0190 glmS   FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 7684583 7684584 BAA_0190 BAA_0191   gntR FALSE 0.007 407.000 0.000 NA   NA
 7684584 7684585 BAA_0191 BAA_0192 gntR   FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7684585 7684586 BAA_0192 BAA_0193     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7684586 7684587 BAA_0193 BAA_0194   gntP1 FALSE 0.483 120.000 0.000 NA   NA
 7684587 7684588 BAA_0194 BAA_0195 gntP1 yqjI FALSE 0.336 265.000 0.000 1.000 Y NA
 7684588 7684589 BAA_0195 BAA_0196 yqjI   FALSE 0.060 343.000 0.047 1.000 N NA
 7684589 7684590 BAA_0196 BAA_0197     FALSE 0.593 119.000 0.100 NA   NA
 7684591 7684592 BAA_0198 BAA_0199     FALSE 0.035 241.000 0.000 NA   NA
 7684592 7684593 BAA_0199 BAA_0200     TRUE 0.900 0.000 0.750 NA   NA
 7684593 7684594 BAA_0200 BAA_0201     FALSE 0.397 141.000 0.000 NA   NA
 7684594 7684595 BAA_0201 BAA_0202     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684596 7684597 BAA_0203 BAA_0204     FALSE 0.354 40.000 0.000 NA   NA
 7684598 7684599 BAA_0205 BAA_0206     TRUE 0.939 -25.000 0.846 1.000 Y NA
 7684599 7684600 BAA_0206 BAA_0207     TRUE 0.985 13.000 0.880 NA Y NA
 7684600 7684601 BAA_0207 BAA_0209     FALSE 0.075 280.000 0.000 NA N NA
 7684602 7684603 BAA_0210 BAA_0211     FALSE 0.608 112.000 0.137 NA   NA
 7684603 7684604 BAA_0211 BAA_0212     TRUE 0.716 -3.000 0.052 1.000   NA
 7684604 7684605 BAA_0212 BAA_0213     FALSE 0.405 79.000 0.026 NA   NA
 7684605 7684606 BAA_0213 BAA_0214     FALSE 0.185 182.000 0.104 NA   NA
 7684606 7684607 BAA_0214 BAA_0215     FALSE 0.031 251.000 0.000 NA   NA
 7684609 7684610 BAA_0218 BAA_0219     TRUE 0.987 17.000 0.909 0.038 Y NA
 7684610 7684611 BAA_0219 BAA_0220     TRUE 0.863 -43.000 0.233 1.000 Y NA
 7684611 7684612 BAA_0220 BAA_0221     TRUE 0.971 -3.000 0.233 0.003 Y NA
 7684612 7684613 BAA_0221 BAA_0222     TRUE 0.974 14.000 0.292 1.000 Y NA
 7684615 7684616 BAA_0224 BAA_0225     FALSE 0.401 73.000 0.105 NA   NA
 7684616 7684617 BAA_0225 BAA_0226     FALSE 0.448 133.000 0.000 NA   NA
 7684618 7684619 BAA_0227 BAA_0228     FALSE 0.159 388.000 0.000 0.038 Y NA
 7684619 7684620 BAA_0228 BAA_0230     FALSE 0.013 392.000 0.000 1.000   NA
 7684620 7684621 BAA_0230 BAA_0231     FALSE 0.296 68.000 0.000 NA   NA
 7684623 7684624 BAA_0233 BAA_0234   modB FALSE 0.109 287.000 0.000 0.073 N NA
 7684624 7684625 BAA_0234 BAA_0235 modB modA_1 TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7684625 7684626 BAA_0235 BAA_0236 modA_1 modA_2 FALSE 0.447 -6.000 0.000 NA   NA
 7684629 7684630 BAA_0239 BAA_0240     TRUE 0.814 22.000 0.556 NA   NA
 7684630 7684631 BAA_0240 BAA_0241     FALSE 0.009 368.000 0.000 NA   NA
 7684631 7684632 BAA_0241 BAA_0242     FALSE 0.235 159.000 0.000 NA   NA
 7684632 7684633 BAA_0242 BAA_0243     FALSE 0.105 188.000 0.000 NA   NA
 7684633 7684634 BAA_0243 BAA_0244     TRUE 0.741 149.000 0.778 NA   NA
 7684634 7684635 BAA_0244 BAA_0245     TRUE 0.853 119.000 0.778 NA   NA
 7684635 7684636 BAA_0245 BAA_0246     TRUE 0.788 138.000 0.667 NA   NA
 7684636 7684637 BAA_0246 BAA_0247     FALSE 0.005 572.000 0.000 NA   NA
 7684637 7684638 BAA_0247 BAA_0248     FALSE 0.369 59.000 0.019 NA   NA
 7684641 7684642 BAA_0251 BAA_0252     FALSE 0.439 135.000 0.000 NA   NA
 7684647 7684648 BAA_0257 BAA_0258     FALSE 0.017 298.000 0.000 NA   NA
 7684648 7684649 BAA_0258 BAA_0259     TRUE 0.971 109.000 0.444 0.037 Y NA
 7684649 7684650 BAA_0259 BAA_0260     TRUE 0.989 13.000 0.850 0.037 Y NA
 7684650 7684651 BAA_0260 BAA_0261     TRUE 0.987 11.000 0.750 1.000 Y NA
 7684651 7684652 BAA_0261 BAA_0263     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684653 7684654 BAA_0262 BAA_0264     FALSE 0.210 -49.000 0.000 NA   NA
 7684655 7684656 BAA_0265 BAA_0266     FALSE 0.018 290.000 0.000 NA   NA
 7684656 7684657 BAA_0266 BAA_0267   hppD FALSE 0.014 311.000 0.000 NA   NA
 7684657 7684658 BAA_0267 BAA_0268 hppD   TRUE 0.715 64.000 0.118 1.000 N NA
 7684658 7684659 BAA_0268 BAA_0269     TRUE 0.867 -34.000 0.101 1.000 Y NA
 7684659 7684660 BAA_0269 BAA_0270     FALSE 0.163 234.000 0.000 1.000 N NA
 7684660 7684661 BAA_0270 BAA_0271     FALSE 0.008 383.000 0.000 NA   NA
 7684661 7684662 BAA_0271 BAA_0272     FALSE 0.012 335.000 0.000 NA   NA
 7684662 7684663 BAA_0272 BAA_0273   murF FALSE 0.602 61.000 0.044 0.006   NA
 7684663 7684664 BAA_0273 BAA_0274 murF   FALSE 0.080 305.000 0.004 1.000 N NA
 7684664 7684665 BAA_0274 BAA_0276   uvdE_1 TRUE 0.931 97.000 0.013 1.000 Y NA
 7684667 7684668 BAA_0277 BAA_0278 acpS   TRUE 0.738 94.000 0.038 NA N NA
 7684668 7684669 BAA_0278 BAA_0279   dal1 TRUE 0.948 119.000 0.194 NA Y NA
 7684669 7684670 BAA_0279 BAA_0280 dal1   FALSE 0.067 310.000 0.108 NA N NA
 7684670 7684671 BAA_0280 BAA_0281     TRUE 0.908 5.000 0.260 NA N NA
 7684671 7684672 BAA_0281 BAA_0282     TRUE 0.709 68.000 0.045 1.000 N NA
 7684672 7684673 BAA_0282 BAA_0283     FALSE 0.015 370.000 0.215 NA   NA
 7684673 7684674 BAA_0283 BAA_0284     FALSE 0.488 114.000 0.000 NA   NA
 7684674 7684675 BAA_0284 BAA_0285     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7684675 7684676 BAA_0285 BAA_0286     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7684676 7684677 BAA_0286 BAA_0287     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7684677 7684678 BAA_0287 BAA_0288     FALSE 0.316 46.000 0.000 NA   NA
 7684678 7684679 BAA_0288 BAA_0289     FALSE 0.361 88.000 0.000 NA   NA
 7684679 7684680 BAA_0289 BAA_0290     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7684680 7684681 BAA_0290 BAA_0291     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7684681 7684682 BAA_0291 BAA_0292     FALSE 0.385 96.000 0.000 NA   NA
 7684682 7684683 BAA_0292 BAA_0293     TRUE 0.651 5.000 0.000 NA   NA
 7684683 7684684 BAA_0293 BAA_0294     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7684684 7684685 BAA_0294 BAA_0295   rrs_5 FALSE 0.398 99.000 0.000 NA   NA
 7684685 7684686 BAA_0295 BAA_0297 rrs_5 rrl_5 FALSE 0.141 179.000 0.000 NA   NA
 7684688 7684689 BAA_0298 BAA_0299 rrf_5   FALSE 0.629 12.000 0.000 NA   NA
 7684689 7684690 BAA_0299 BAA_0300     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7684690 7684691 BAA_0300 BAA_0301     FALSE 0.159 174.000 0.000 NA   NA
 7684691 7684692 BAA_0301 BAA_0302     FALSE 0.397 -19.000 0.217 NA   NA
 7684692 7684693 BAA_0302 BAA_0303   rimI TRUE 0.783 14.000 0.127 1.000   NA
 7684693 7684694 BAA_0303 BAA_0304 rimI   TRUE 0.776 0.000 0.090 1.000   NA
 7684698 7684699 BAA_0308 BAA_0309 groES groL TRUE 0.957 39.000 0.674 1.000 Y NA
 7684699 7684700 BAA_0309 BAA_0311 groL guaA FALSE 0.035 399.000 0.000 1.000 N NA
 7684700 7684701 BAA_0311 BAA_0313 guaA   FALSE 0.013 385.000 0.000 1.000   NA
 7684701 7684702 BAA_0313 BAA_0314     FALSE 0.573 145.000 0.146 1.000   NA
 7684702 7684703 BAA_0314 BAA_0315     TRUE 0.975 32.000 0.800 0.021 Y NA
 7684703 7684704 BAA_0315 BAA_0316   rrs_6 FALSE 0.013 321.000 0.000 NA   NA
 7684704 7684705 BAA_0316 BAA_0318 rrs_6 rrl_6 FALSE 0.141 179.000 0.000 NA   NA
 7684708 7684709 BAA_0320 BAA_0321     FALSE 0.038 233.000 0.000 NA   NA
 7684709 7684710 BAA_0321 BAA_0322     TRUE 0.631 27.000 0.002 1.000   NA
 7684710 7684711 BAA_0322 BAA_0323     FALSE 0.016 304.000 0.000 NA   NA
 7684713 7684714 BAA_0325 BAA_0326     FALSE 0.296 68.000 0.000 NA   NA
 7684714 7684715 BAA_0326 BAA_0327     FALSE 0.192 166.000 0.000 NA   NA
 7684716 7684717 BAA_0328 BAA_0331 rrs_7 rrl_7 FALSE 0.141 179.000 0.000 NA   NA
 7684717 7684718 BAA_0331 BAA_0332 rrl_7 rrf_7 FALSE 0.303 51.000 0.000 NA   NA
 7684719 7684720 BAA_0333 BAA_0334 uppP   TRUE 0.693 18.000 0.240 NA   NA
 7684720 7684721 BAA_0334 BAA_0335     TRUE 0.668 -7.000 0.400 NA   NA
 7684721 7684722 BAA_0335 BAA_0336     TRUE 0.815 69.000 0.556 1.000 N NA
 7684722 7684723 BAA_0336 BAA_0337     TRUE 0.950 -10.000 0.538 1.000 Y NA
 7684724 7684725 BAA_0338 BAA_0340 rrs_8 rrl_8 FALSE 0.141 179.000 0.000 NA   NA
 7684727 7684728 BAA_0341 BAA_0343 rrf_8 purE FALSE 0.005 699.000 0.000 NA   NA
 7684728 7684729 BAA_0343 BAA_0344 purE purK TRUE 0.970 -3.000 0.038 0.001 Y NA
 7684729 7684730 BAA_0344 BAA_0345 purK purB TRUE 0.961 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 7684730 7684731 BAA_0345 BAA_0346 purB purC TRUE 0.927 89.000 0.072 1.000 Y NA
 7684731 7684732 BAA_0346 BAA_0347 purC purS TRUE 0.956 -7.000 0.460 1.000 Y NA
 7684732 7684733 BAA_0347 BAA_0348 purS purQ TRUE 0.982 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 7684733 7684734 BAA_0348 BAA_0349 purQ purL TRUE 0.937 -16.000 0.346 0.001 Y NA
 7684734 7684735 BAA_0349 BAA_0350 purL purF TRUE 0.912 -15.000 0.223 1.000 Y NA
 7684735 7684736 BAA_0350 BAA_0351 purF purM TRUE 0.953 107.000 0.248 1.000 Y NA
 7684736 7684737 BAA_0351 BAA_0352 purM purN TRUE 0.971 -3.000 0.238 0.002 Y NA
 7684737 7684738 BAA_0352 BAA_0353 purN purH TRUE 0.954 25.000 0.225 1.000 Y NA
 7684738 7684739 BAA_0353 BAA_0354 purH purD TRUE 0.955 122.000 0.238 1.000 Y NA
 7684740 7684741 BAA_0355 BAA_0356     TRUE 0.844 17.000 0.549 NA   NA
 7684741 7684742 BAA_0356 BAA_0357     FALSE 0.059 210.000 0.000 NA   NA
 7684743 7684744 BAA_0358 BAA_0359   pcrA TRUE 0.708 1.000 0.049 NA   NA
 7684744 7684745 BAA_0359 BAA_0360 pcrA ligA TRUE 0.975 16.000 0.103 0.012 Y NA
 7684745 7684746 BAA_0360 BAA_0361 ligA   TRUE 0.644 17.000 0.009 NA   NA
 7684746 7684747 BAA_0361 BAA_0362     TRUE 0.801 96.000 0.800 NA   NA
 7684747 7684748 BAA_0362 BAA_0363     FALSE 0.482 154.000 0.205 1.000   NA
 7684748 7684749 BAA_0363 BAA_0364     FALSE 0.159 186.000 0.051 NA   NA
 7684751 7684752 BAA_0367 BAA_0368     TRUE 0.929 -10.000 0.233 1.000 Y NA
 7684752 7684753 BAA_0368 BAA_0369     TRUE 0.955 22.000 0.233 NA Y NA
 7684754 7684755 BAA_0370 BAA_0371     TRUE 0.713 59.000 0.750 NA   NA
 7684755 7684756 BAA_0371 BAA_0372     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7684756 7684757 BAA_0372 BAA_0373     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7684757 7684758 BAA_0373 BAA_0374     FALSE 0.313 77.000 0.000 NA   NA
 7684759 7684760 BAA_0375 BAA_0376   gatC FALSE 0.026 263.000 0.000 NA   NA
 7684760 7684761 BAA_0376 BAA_0377 gatC gatA TRUE 0.985 16.000 0.643 0.001 Y NA
 7684761 7684762 BAA_0377 BAA_0378 gatA gatB TRUE 0.984 15.000 0.492 0.001 Y NA
 7684762 7684763 BAA_0378 BAA_0379 gatB   FALSE 0.033 471.000 0.034 1.000 N NA
 7684763 7684764 BAA_0379 BAA_0380     FALSE 0.596 140.000 0.028 1.000   NA
 7684764 7684765 BAA_0380 BAA_0381   gabT FALSE 0.534 83.000 0.045 1.000   NA
 7684765 7684766 BAA_0381 BAA_0382 gabT   TRUE 0.888 113.000 0.409 1.000 N NA
 7684766 7684767 BAA_0382 BAA_0383   gabD TRUE 0.885 -7.000 0.583 1.000 N NA
 7684767 7684768 BAA_0383 BAA_0384 gabD   TRUE 0.731 48.000 0.157 1.000 N NA
 7684769 7684770 BAA_0385 BAA_0386 ampS   TRUE 0.860 117.000 0.258 1.000 N NA
 7684770 7684771 BAA_0386 BAA_0387     TRUE 0.929 152.000 0.300 0.006 Y NA
 7684771 7684772 BAA_0387 BAA_0388     FALSE 0.152 240.000 0.000 1.000 N NA
 7684773 7684774 BAA_0390 BAA_0391     TRUE 0.931 97.000 0.008 1.000 Y NA
 7684774 7684775 BAA_0391 BAA_0392     FALSE 0.026 261.000 0.000 NA   NA
 7684775 7684776 BAA_0392 BAA_0393     FALSE 0.022 273.000 0.000 NA   NA
 7684776 7684777 BAA_0393 BAA_0394     FALSE 0.478 95.000 0.043 NA   NA
 7684778 7684779 BAA_0395 BAA_0396     TRUE 0.704 15.000 0.189 NA   NA
 7684782 7684783 BAA_0399 BAA_0400 amhX   FALSE 0.447 152.000 0.263 NA   NA
 7684784 7684785 BAA_0401 BAA_0402 ahpF ahpC TRUE 0.980 15.000 0.551 1.000 Y NA
 7684786 7684787 BAA_0403 BAA_0404   mtnA_1 TRUE 0.798 10.000 0.042 1.000   NA
 7684787 7684788 BAA_0404 BAA_0405 mtnA_1   TRUE 0.704 55.000 0.017 1.000 N NA
 7684789 7684790 BAA_0406 BAA_0407     TRUE 0.981 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 7684790 7684791 BAA_0407 BAA_0408     TRUE 0.932 49.000 0.487 1.000 Y NA
 7684794 7684795 BAA_0411 BAA_0412     FALSE 0.037 236.000 0.000 NA   NA
 7684795 7684796 BAA_0412 BAA_0413     FALSE 0.529 21.000 0.000 NA   NA
 7684796 7684797 BAA_0413 BAA_0414     FALSE 0.201 163.000 0.000 NA   NA
 7684797 7684798 BAA_0414 BAA_0415     FALSE 0.036 237.000 0.000 NA   NA
 7684798 7684799 BAA_0415 BAA_0416     FALSE 0.480 122.000 0.000 NA   NA
 7684799 7684800 BAA_0416 BAA_0417     FALSE 0.327 44.000 0.000 NA   NA
 7684800 7684801 BAA_0417 BAA_0418     FALSE 0.295 62.000 0.000 NA   NA
 7684801 7684802 BAA_0418 BAA_0419     FALSE 0.044 224.000 0.000 NA   NA
 7684804 7684805 BAA_0422 BAA_0423     FALSE 0.584 123.000 0.068 NA   NA
 7684806 7684807 BAA_0424 BAA_0425     TRUE 0.775 144.000 0.053 1.000 N NA
 7684809 7684810 BAA_0427 BAA_0428     TRUE 0.944 95.000 0.130 0.049 Y NA
 7684810 7684811 BAA_0428 BAA_0429     TRUE 0.961 122.000 0.348 1.000 Y NA
 7684811 7684812 BAA_0429 BAA_0430     FALSE 0.557 170.000 0.133 1.000 N NA
 7684813 7684814 BAA_0431 BAA_0432     FALSE 0.157 237.000 0.000 1.000 N NA
 7684814 7684815 BAA_0432 BAA_0433     TRUE 0.816 173.000 0.167 1.000 Y NA
 7684815 7684816 BAA_0433 BAA_0434     TRUE 0.896 5.000 0.610 NA   NA
 7684816 7684817 BAA_0434 BAA_0435     FALSE 0.551 19.000 0.000 NA   NA
 7684817 7684818 BAA_0435 BAA_0436     FALSE 0.453 132.000 0.000 NA   NA
 7684820 7684821 BAA_0439 BAA_0440 thiM thiE TRUE 0.974 17.000 0.061 0.004 Y NA
 7684823 7684824 BAA_0442 BAA_0444     FALSE 0.025 264.000 0.000 NA   NA
 7684824 7684825 BAA_0444 BAA_0445     FALSE 0.445 -31.000 0.364 NA   NA
 7684825 7684826 BAA_0445 BAA_0446     TRUE 0.972 -3.000 0.584 NA Y NA
 7684826 7684827 BAA_0446 BAA_0447     TRUE 0.971 -3.000 0.554 NA Y NA
 7684827 7684828 BAA_0447 BAA_0448     FALSE 0.048 292.000 0.000 0.028   NA
 7684830 7684831 BAA_0450 BAA_0451     TRUE 0.728 11.000 0.065 NA   NA
 7684831 7684832 BAA_0451 BAA_0452     TRUE 0.690 14.000 0.037 NA   NA
 7684832 7684833 BAA_0452 BAA_0453     FALSE 0.020 283.000 0.000 NA   NA
 7684833 7684834 BAA_0453 BAA_0454     TRUE 0.702 67.000 0.714 NA   NA
 7684834 7684835 BAA_0454 BAA_0455     TRUE 0.697 114.000 0.333 NA   NA
 7684835 7684836 BAA_0455 BAA_0456     TRUE 0.721 13.000 0.143 NA   NA
 7684837 7684838 BAA_0457 BAA_0458     FALSE 0.584 109.000 0.068 NA   NA
 7684839 7684840 BAA_0459 BAA_0460   proS1 FALSE 0.010 348.000 0.000 NA   NA
 7684842 7684843 BAA_0462 BAA_0463     TRUE 0.839 129.000 0.145 1.000 N NA
 7684843 7684844 BAA_0463 BAA_0464     TRUE 0.970 24.000 0.364 0.003 Y NA
 7684844 7684845 BAA_0464 BAA_0465     TRUE 0.956 81.000 0.571 0.003 Y NA
 7684845 7684846 BAA_0465 BAA_0466     TRUE 0.755 74.000 0.308 1.000 N NA
 7684846 7684847 BAA_0466 BAA_0467     TRUE 0.638 110.000 0.256 NA   NA
 7684847 7684848 BAA_0467 BAA_0468     TRUE 0.876 19.000 0.727 NA   NA
 7684849 7684850 BAA_0469 BAA_0470     FALSE 0.143 192.000 0.125 NA   NA
 7684851 7684852 BAA_0471 BAA_0472     FALSE 0.299 54.000 0.000 NA   NA
 7684852 7684853 BAA_0472 BAA_0473   yihY FALSE 0.361 39.000 0.000 NA   NA
 7684855 7684856 BAA_0475 BAA_0476     FALSE 0.574 123.000 0.039 NA   NA
 7684856 7684857 BAA_0476 BAA_0477   lepB_1 FALSE 0.038 233.000 0.000 NA   NA
 7684857 7684858 BAA_0477 BAA_0478 lepB_1 sipS1 FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684861 7684862 BAA_0481 BAA_0482     FALSE 0.584 107.000 0.129 NA   NA
 7684862 7684863 BAA_0482 BAA_0483     FALSE 0.381 154.000 0.111 NA   NA
 7684864 7684865 BAA_0484 BAA_0485 cax   FALSE 0.456 82.000 0.212 NA   NA
 7684867 7684868 BAA_0487 BAA_0488   fumA FALSE 0.094 207.000 0.093 NA   NA
 7684868 7684869 BAA_0488 BAA_0489 fumA pdaA TRUE 0.843 127.000 0.185 1.000 N NA
 7684869 7684870 BAA_0489 BAA_0490 pdaA   FALSE 0.295 60.000 0.000 NA   NA
 7684870 7684871 BAA_0490 BAA_0491     FALSE 0.404 34.000 0.000 NA   NA
 7684871 7684872 BAA_0491 BAA_0492     TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7684873 7684874 BAA_0493 BAA_0494     FALSE 0.005 716.000 0.000 NA   NA
 7684875 7684876 BAA_0495 BAA_0496     TRUE 0.867 18.000 0.667 NA   NA
 7684876 7684877 BAA_0496 BAA_0497     FALSE 0.180 168.000 0.000 NA   NA
 7684879 7684880 BAA_0499 BAA_0500     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7684880 7684881 BAA_0500 BAA_0501     FALSE 0.320 45.000 0.000 NA   NA
 7684881 7684882 BAA_0501 BAA_0502     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684882 7684883 BAA_0502 BAA_0503     FALSE 0.435 30.000 0.000 NA   NA
 7684883 7684884 BAA_0503 BAA_0504     TRUE 0.644 -3.000 0.182 NA   NA
 7684884 7684885 BAA_0504 BAA_0505     FALSE 0.332 -31.000 0.182 NA   NA
 7684885 7684886 BAA_0505 BAA_0506     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7684886 7684887 BAA_0506 BAA_0507     FALSE 0.474 25.000 0.000 NA   NA
 7684887 7684888 BAA_0507 BAA_0508     FALSE 0.020 281.000 0.000 NA   NA
 7684888 7684889 BAA_0508 BAA_0509     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7684889 7684890 BAA_0509 BAA_0510     FALSE 0.369 38.000 0.000 NA   NA
 7684890 7684891 BAA_0510 BAA_0511     FALSE 0.308 49.000 0.000 NA   NA
 7684891 7684892 BAA_0511 BAA_0512     FALSE 0.074 200.000 0.000 NA   NA
 7684892 7684893 BAA_0512 BAA_0513     FALSE 0.006 432.000 0.000 NA   NA
 7684893 7684894 BAA_0513 BAA_0514     FALSE 0.327 44.000 0.000 NA   NA
 7684894 7684895 BAA_0514 BAA_0515     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7684895 7684896 BAA_0515 BAA_0516     FALSE 0.348 41.000 0.000 NA   NA
 7684896 7684897 BAA_0516 BAA_0517     FALSE 0.422 32.000 0.000 NA   NA
 7684897 7684898 BAA_0517 BAA_0518     FALSE 0.458 106.000 0.000 NA   NA
 7684898 7684899 BAA_0518 BAA_0519     FALSE 0.046 221.000 0.000 NA   NA
 7684899 7684900 BAA_0519 BAA_0520     FALSE 0.486 116.000 0.000 NA   NA
 7684900 7684901 BAA_0520 BAA_0521     FALSE 0.447 28.000 0.000 NA   NA
 7684901 7684902 BAA_0521 BAA_0522     FALSE 0.013 321.000 0.000 NA   NA
 7684902 7684903 BAA_0522 BAA_0523     FALSE 0.005 589.000 0.000 NA   NA
 7684903 7684904 BAA_0523 BAA_0524     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684904 7684905 BAA_0524 BAA_0525     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684905 7684906 BAA_0525 BAA_0526     FALSE 0.412 101.000 0.000 NA   NA
 7684906 7684907 BAA_0526 BAA_0527     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684907 7684908 BAA_0527 BAA_0528     FALSE 0.023 271.000 0.000 NA   NA
 7684908 7684909 BAA_0528 BAA_0529     FALSE 0.214 -43.000 0.000 NA   NA
 7684909 7684910 BAA_0529 BAA_0530     TRUE 0.647 19.000 0.048 NA   NA
 7684910 7684911 BAA_0530 BAA_0531     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7684911 7684912 BAA_0531 BAA_0532     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684912 7684913 BAA_0532 BAA_0533     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684913 7684914 BAA_0533 BAA_0534     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7684914 7684915 BAA_0534 BAA_0535     FALSE 0.453 132.000 0.000 NA   NA
 7684915 7684916 BAA_0535 BAA_0536     FALSE 0.619 1.000 0.000 NA   NA
 7684916 7684917 BAA_0536 BAA_0537     TRUE 0.651 5.000 0.000 NA   NA
 7684917 7684918 BAA_0537 BAA_0538     FALSE 0.487 111.000 0.000 NA   NA
 7684918 7684919 BAA_0538 BAA_0539     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7684919 7684920 BAA_0539 BAA_0540     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684920 7684921 BAA_0540 BAA_0541     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7684921 7684922 BAA_0541 BAA_0542     FALSE 0.296 66.000 0.000 NA   NA
 7684922 7684923 BAA_0542 BAA_0543     FALSE 0.297 69.000 0.000 NA   NA
 7684923 7684924 BAA_0543 BAA_0544     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7684924 7684925 BAA_0544 BAA_0545     FALSE 0.382 95.000 0.000 NA   NA
 7684925 7684926 BAA_0545 BAA_0546     FALSE 0.300 73.000 0.000 NA   NA
 7684926 7684927 BAA_0546 BAA_0547     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7684930 7684931 BAA_0550 BAA_0551   rocR1 FALSE 0.541 84.000 0.304 NA   NA
 7684932 7684933 BAA_0552 BAA_0553     TRUE 0.795 105.000 0.636 NA   NA
 7684933 7684934 BAA_0553 BAA_0554     TRUE 0.937 96.000 0.259 1.000 Y NA
 7684936 7684937 BAA_0556 BAA_0557     FALSE 0.487 115.000 0.000 NA   NA
 7684938 7684939 BAA_0558 BAA_0559   glsA1 FALSE 0.295 176.000 0.320 NA   NA
 7684940 7684941 BAA_0560 BAA_0561     FALSE 0.569 124.000 0.032 NA   NA
 7684941 7684942 BAA_0561 BAA_0562     FALSE 0.126 255.000 0.000 1.000 N NA
 7684942 7684943 BAA_0562 BAA_0563     FALSE 0.514 154.000 0.385 NA   NA
 7684943 7684944 BAA_0563 BAA_0564     TRUE 0.878 17.000 0.692 NA   NA
 7684944 7684945 BAA_0564 BAA_0565     TRUE 0.668 -19.000 0.667 NA   NA
 7684945 7684946 BAA_0565 BAA_0566     FALSE 0.361 -10.000 0.000 NA   NA
 7684946 7684947 BAA_0566 BAA_0567     FALSE 0.009 366.000 0.000 NA   NA
 7684947 7684948 BAA_0567 BAA_0568     TRUE 0.718 -3.000 0.064 1.000   NA
 7684948 7684949 BAA_0568 BAA_0569     FALSE 0.516 -7.000 0.050 NA   NA
 7684949 7684950 BAA_0569 BAA_0570   pfl FALSE 0.011 340.000 0.000 NA   NA
 7684950 7684951 BAA_0570 BAA_0571 pfl pflA TRUE 0.718 70.000 0.135 1.000 N NA
 7684951 7684952 BAA_0571 BAA_0572 pflA   FALSE 0.033 413.000 0.000 1.000 N NA
 7684953 7684954 BAA_0573 BAA_0574     TRUE 0.777 111.000 0.500 NA   NA
 7684954 7684955 BAA_0574 BAA_0575     FALSE 0.121 242.000 0.000 NA N NA
 7684955 7684956 BAA_0575 BAA_0576     FALSE 0.610 141.000 0.200 1.000   NA
 7684957 7684958 BAA_0577 BAA_0578     TRUE 0.727 10.000 0.045 NA   NA
 7684959 7684960 BAA_0579 BAA_0580   sspK FALSE 0.625 44.000 0.480 NA   NA
 7684969 7684970 BAA_0589 BAA_0590     TRUE 0.667 55.000 0.077 NA N NA
 7684971 7684972 BAA_0591 BAA_0592     FALSE 0.039 261.000 0.066 NA   NA
 7684972 7684973 BAA_0592 BAA_0593   hemL1 FALSE 0.315 200.000 0.036 1.000 N NA
 7684974 7684975 BAA_0594 BAA_0595     TRUE 0.712 -7.000 0.488 NA   NA
 7684975 7684976 BAA_0595 BAA_0596     TRUE 0.872 5.000 0.500 NA   NA
 7684976 7684977 BAA_0596 BAA_0597     FALSE 0.408 73.000 0.188 NA   NA
 7684977 7684978 BAA_0597 BAA_0598   bcP FALSE 0.394 45.000 0.015 NA   NA
 7684978 7684979 BAA_0598 BAA_0599 bcP   FALSE 0.086 298.000 0.005 1.000 N NA
 7684981 7684982 BAA_0601 BAA_0603 rrs_9 rrl_9 FALSE 0.167 172.000 0.000 NA   NA
 7684984 7684985 BAA_0604 BAA_0605 rrf_9   TRUE 0.647 8.000 0.000 NA   NA
 7684985 7684986 BAA_0605 BAA_0606     FALSE 0.619 1.000 0.000 NA   NA
 7684986 7684987 BAA_0606 BAA_0607     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7684987 7684988 BAA_0607 BAA_0608     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7684988 7684989 BAA_0608 BAA_0610     FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7684989 7684990 BAA_0610 BAA_0611     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7684990 7684991 BAA_0611 BAA_0612     TRUE 0.645 9.000 0.000 NA   NA
 7684991 7684992 BAA_0612 BAA_0613     FALSE 0.551 19.000 0.000 NA   NA
 7684992 7684993 BAA_0613 BAA_0614     TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7684993 7684994 BAA_0614 BAA_0615     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7684994 7684995 BAA_0615 BAA_0616     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7684995 7684996 BAA_0616 BAA_0617     FALSE 0.295 63.000 0.000 NA   NA
 7684996 7684997 BAA_0617 BAA_0618     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7684997 7684998 BAA_0618 BAA_0619     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7684998 7684999 BAA_0619 BAA_0620     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7685001 7685002 BAA_0622 BAA_0623     FALSE 0.367 151.000 0.008 NA   NA
 7685002 7685003 BAA_0623 BAA_0624     FALSE 0.010 487.000 0.000 1.000   NA
 7685003 7685004 BAA_0624 BAA_0625     FALSE 0.215 188.000 0.123 1.000   NA
 7685004 7685005 BAA_0625 BAA_0626     FALSE 0.487 115.000 0.000 NA   NA
 7685005 7685006 BAA_0626 BAA_0627     FALSE 0.076 199.000 0.000 NA   NA
 7685006 7685007 BAA_0627 BAA_0628     FALSE 0.431 45.000 0.174 NA   NA
 7685007 7685008 BAA_0628 BAA_0629     FALSE 0.395 59.000 0.097 NA   NA
 7685008 7685009 BAA_0629 BAA_0630     TRUE 0.832 128.000 0.016 1.000 N NA
 7685009 7685010 BAA_0630 BAA_0631     FALSE 0.146 178.000 0.000 NA   NA
 7685010 7685011 BAA_0631 BAA_0632     FALSE 0.301 74.000 0.000 NA   NA
 7685011 7685012 BAA_0632 BAA_0633     FALSE 0.032 446.000 0.683 NA   NA
 7685012 7685013 BAA_0633 BAA_0634     FALSE 0.268 162.000 0.018 NA   NA
 7685013 7685014 BAA_0634 BAA_0635     TRUE 0.635 155.000 0.500 1.000   NA
 7685016 7685017 BAA_0637 BAA_0638     FALSE 0.033 247.000 0.000 NA   NA
 7685017 7685018 BAA_0638 BAA_0639     TRUE 0.842 13.000 0.464 NA   NA
 7685018 7685019 BAA_0639 BAA_0640     FALSE 0.036 237.000 0.000 NA   NA
 7685019 7685020 BAA_0640 BAA_0641     TRUE 0.933 158.000 0.600 0.015 Y NA
 7685020 7685021 BAA_0641 BAA_0642     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7685021 7685022 BAA_0642 BAA_0643     FALSE 0.380 -9.000 0.000 NA   NA
 7685024 7685025 BAA_0645 BAA_0646     FALSE 0.557 135.000 0.125 NA   NA
 7685025 7685026 BAA_0646 BAA_0647     FALSE 0.018 290.000 0.000 NA   NA
 7685026 7685027 BAA_0647 BAA_0648     FALSE 0.005 559.000 0.000 NA   NA
 7685027 7685028 BAA_0648 BAA_0649     TRUE 0.881 -3.000 0.262 1.000 N NA
 7685028 7685029 BAA_0649 BAA_0650     TRUE 0.981 0.000 0.391 0.035 Y NA
 7685029 7685030 BAA_0650 BAA_0651     TRUE 0.984 -3.000 0.848 0.035 Y NA
 7685030 7685031 BAA_0651 BAA_0652     TRUE 0.981 22.000 0.708 0.035 Y NA
 7685031 7685032 BAA_0652 BAA_0653     FALSE 0.011 416.000 0.000 1.000   NA
 7685032 7685033 BAA_0653 BAA_0654     FALSE 0.505 150.000 0.091 1.000   NA
 7685033 7685034 BAA_0654 BAA_0655     TRUE 0.976 -3.000 0.606 1.000 Y NA
 7685034 7685035 BAA_0655 BAA_0656     FALSE 0.062 207.000 0.000 NA   NA
 7685035 7685036 BAA_0656 BAA_0657     TRUE 0.686 44.000 0.600 NA   NA
 7685036 7685037 BAA_0657 BAA_0658     FALSE 0.029 254.000 0.000 NA   NA
 7685037 7685038 BAA_0658 BAA_0659     TRUE 0.916 79.000 0.229 1.000 Y NA
 7685038 7685039 BAA_0659 BAA_0660     TRUE 0.968 -3.000 0.229 0.087 Y NA
 7685039 7685040 BAA_0660 BAA_0661     TRUE 0.853 123.000 0.243 1.000 N NA
 7685040 7685041 BAA_0661 BAA_0662     TRUE 0.925 60.000 0.432 1.000 Y NA
 7685042 7685043 BAA_0663 BAA_0664     TRUE 0.744 116.000 0.429 NA   NA
 7685045 7685046 BAA_0666 BAA_0667     TRUE 0.751 147.000 0.636 1.000   NA
 7685046 7685047 BAA_0667 BAA_0668     TRUE 0.945 66.000 0.727 1.000 Y NA
 7685049 7685050 BAA_0670 BAA_0671   fdhD1 FALSE 0.173 229.000 0.000 1.000 N NA
 7685051 7685052 BAA_0672 BAA_0673     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7685052 7685053 BAA_0673 BAA_0674     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7685053 7685054 BAA_0674 BAA_0675     FALSE 0.250 157.000 0.000 NA   NA
 7685054 7685055 BAA_0675 BAA_0676   ald1 FALSE 0.043 368.000 0.000 1.000 N NA
 7685055 7685056 BAA_0676 BAA_0677 ald1   TRUE 0.974 104.000 0.889 1.000 Y NA
 7685056 7685057 BAA_0677 BAA_0678     FALSE 0.109 267.000 0.000 1.000 N NA
 7685057 7685058 BAA_0678 BAA_0679     TRUE 0.845 25.000 0.203 1.000 N NA
 7685060 7685061 BAA_0681 BAA_0682     TRUE 0.752 3.000 0.231 NA   NA
 7685061 7685062 BAA_0682 BAA_0683     FALSE 0.313 167.000 0.273 NA   NA
 7685064 7685065 BAA_0685 BAA_0686     TRUE 0.889 16.000 0.727 NA   NA
 7685066 7685067 BAA_0687 BAA_0688     FALSE 0.132 235.000 0.000 NA N NA
 7685067 7685068 BAA_0688 BAA_0689     FALSE 0.141 261.000 0.333 NA N NA
 7685069 7685070 BAA_0690 BAA_0691     FALSE 0.548 108.000 0.010 NA   NA
 7685070 7685071 BAA_0691 BAA_0692   aspA1 FALSE 0.470 84.000 0.222 NA   NA
 7685073 7685074 BAA_0694 BAA_0695     TRUE 0.720 115.000 0.261 1.000   NA
 7685075 7685076 BAA_0696 BAA_0697     FALSE 0.039 382.000 0.000 1.000 N NA
 7685077 7685078 BAA_0698 BAA_0699     TRUE 0.971 -3.000 0.273 0.035 Y NA
 7685078 7685079 BAA_0699 BAA_0700     TRUE 0.975 13.000 0.273 1.000 Y NA
 7685081 7685082 BAA_0702 BAA_0703     FALSE 0.320 45.000 0.000 NA   NA
 7685082 7685083 BAA_0703 BAA_0704     FALSE 0.296 66.000 0.000 NA   NA
 7685084 7685085 BAA_0705 BAA_0706     TRUE 0.923 4.000 0.822 NA   NA
 7685085 7685086 BAA_0706 BAA_0707   cls1 TRUE 0.676 128.000 0.156 1.000   NA
 7685087 7685088 BAA_0708 BAA_0709     TRUE 0.698 31.000 0.429 NA   NA
 7685088 7685089 BAA_0709 BAA_0710     FALSE 0.009 359.000 0.000 NA   NA
 7685091 7685092 BAA_0712 BAA_0713 treR treB TRUE 0.813 138.000 0.115 1.000 N NA
 7685092 7685093 BAA_0713 BAA_0714 treB treC TRUE 0.983 14.000 0.650 1.000 Y NA
 7685094 7685095 BAA_0715 BAA_0716 gerKC gerKB TRUE 0.808 -19.000 0.833 0.009   NA
 7685095 7685096 BAA_0716 BAA_0717 gerKB gerKA TRUE 0.687 -19.000 0.412 0.009   NA
 7685097 7685098 BAA_0718 BAA_0719     TRUE 0.720 24.000 0.385 NA   NA
 7685098 7685099 BAA_0719 BAA_0720     TRUE 0.745 128.000 0.462 NA   NA
 7685099 7685100 BAA_0720 BAA_0721     TRUE 0.910 77.000 0.093 1.000 Y NA
 7685100 7685101 BAA_0721 BAA_0722     TRUE 0.978 13.000 0.389 1.000 Y NA
 7685101 7685102 BAA_0722 BAA_0723     TRUE 0.925 63.000 0.280 0.047 Y NA
 7685102 7685103 BAA_0723 BAA_0724     TRUE 0.990 1.000 0.947 0.007 Y NA
 7685103 7685104 BAA_0724 BAA_0725     FALSE 0.618 205.000 0.000 0.068 Y NA
 7685104 7685105 BAA_0725 BAA_0726     TRUE 0.676 -25.000 0.242 1.000 N NA
 7685105 7685106 BAA_0726 BAA_0727     TRUE 0.714 62.000 0.111 1.000 N NA
 7685106 7685107 BAA_0727 BAA_0728     FALSE 0.509 177.000 0.079 1.000 N NA
 7685107 7685108 BAA_0728 BAA_0729     FALSE 0.227 -34.000 0.000 NA   NA
 7685111 7685112 BAA_0732 BAA_0733     TRUE 0.983 12.000 0.538 1.000 Y NA
 7685113 7685114 BAA_0734 BAA_0735     TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7685114 7685115 BAA_0735 BAA_0736     FALSE 0.243 158.000 0.000 NA   NA
 7685115 7685116 BAA_0736 BAA_0737     TRUE 0.826 66.000 0.615 1.000 N NA
 7685116 7685117 BAA_0737 BAA_0738     FALSE 0.048 218.000 0.000 NA   NA
 7685118 7685119 BAA_0739 BAA_0740     TRUE 0.976 15.000 0.195 0.035 Y NA
 7685119 7685120 BAA_0740 BAA_0741     TRUE 0.984 19.000 0.727 0.035 Y NA
 7685120 7685121 BAA_0741 BAA_0742     TRUE 0.912 15.000 0.727 1.000   NA
 7685121 7685122 BAA_0742 BAA_0743     TRUE 0.756 -13.000 0.477 0.003   NA
 7685122 7685123 BAA_0743 BAA_0744   glpT FALSE 0.090 285.000 0.000 1.000 N NA
 7685124 7685125 BAA_0745 BAA_0746     FALSE 0.540 20.000 0.000 NA   NA
 7685125 7685126 BAA_0746 BAA_0747     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7685126 7685127 BAA_0747 BAA_0748   rbsR FALSE 0.422 138.000 0.000 NA   NA
 7685127 7685128 BAA_0748 BAA_0749 rbsR rbsK TRUE 0.901 14.000 0.109 1.000 N NA
 7685128 7685129 BAA_0749 BAA_0750 rbsK rbsD TRUE 0.962 -3.000 0.183 1.000 Y NA
 7685129 7685130 BAA_0750 BAA_0751 rbsD rbsA TRUE 0.974 13.000 0.243 1.000 Y NA
 7685130 7685131 BAA_0751 BAA_0752 rbsA rbsC TRUE 0.984 3.000 0.358 0.001 Y NA
 7685131 7685132 BAA_0752 BAA_0753 rbsC rbsB TRUE 0.984 15.000 0.847 NA Y NA
 7685132 7685133 BAA_0753 BAA_0754 rbsB   TRUE 0.924 35.000 0.032 NA Y NA
 7685133 7685134 BAA_0754 BAA_0755   inhA FALSE 0.023 317.000 0.000 1.000   NA
 7685134 7685135 BAA_0755 BAA_0756 inhA   FALSE 0.013 319.000 0.000 NA   NA
 7685137 7685138 BAA_0758 BAA_0759     FALSE 0.586 119.000 0.059 NA   NA
 7685138 7685139 BAA_0759 BAA_0760   plC FALSE 0.029 254.000 0.000 NA   NA
 7685139 7685140 BAA_0760 BAA_0761 plC sph FALSE 0.419 74.000 0.000 1.000   NA
 7685140 7685141 BAA_0761 BAA_0762 sph   FALSE 0.472 108.000 0.000 NA   NA
 7685141 7685142 BAA_0762 BAA_0763     TRUE 0.822 -12.000 0.571 NA N NA
 7685145 7685146 BAA_0766 BAA_0767     TRUE 0.827 133.000 0.085 1.000 N NA
 7685147 7685148 BAA_0768 BAA_0769     TRUE 0.856 113.000 0.233 1.000 N NA
 7685148 7685149 BAA_0769 BAA_0770     TRUE 0.723 -7.000 0.500 NA   NA
 7685149 7685150 BAA_0770 BAA_0771     TRUE 0.750 117.000 0.438 NA   NA
 7685152 7685153 BAA_0773 BAA_0774 brnQ1   FALSE 0.550 136.000 0.121 NA   NA
 7685154 7685155 BAA_0775 BAA_0776     FALSE 0.189 182.000 0.171 NA   NA
 7685156 7685157 BAA_0777 BAA_0778     TRUE 0.857 132.000 0.750 1.000   NA
 7685157 7685158 BAA_0778 BAA_0779     TRUE 0.832 5.000 0.375 NA   NA
 7685159 7685160 BAA_0780 BAA_0781     TRUE 0.703 15.000 0.125 NA   NA
 7685160 7685161 BAA_0781 BAA_0782     FALSE 0.471 90.000 0.062 NA   NA
 7685161 7685162 BAA_0782 BAA_0783   qoxD FALSE 0.231 222.000 0.000 0.068 N NA
 7685162 7685163 BAA_0783 BAA_0784 qoxD qoxC TRUE 0.988 1.000 0.959 1.000 Y NA
 7685163 7685164 BAA_0784 BAA_0785 qoxC qoxB TRUE 0.989 14.000 0.957 0.038 Y NA
 7685164 7685165 BAA_0785 BAA_0786 qoxB qoxA TRUE 0.951 34.000 0.234 0.007 Y NA
 7685166 7685167 BAA_0787 BAA_0788     TRUE 0.823 133.000 0.727 NA   NA
 7685167 7685168 BAA_0788 BAA_0789     TRUE 0.780 2.000 0.286 NA   NA
 7685168 7685169 BAA_0789 BAA_0790     TRUE 0.805 -3.000 0.500 NA   NA
 7685169 7685170 BAA_0790 BAA_0791   gerLA TRUE 0.765 112.000 0.353 1.000   NA
 7685170 7685171 BAA_0791 BAA_0792 gerLA gerLB TRUE 0.937 1.000 0.706 0.009   NA
 7685171 7685172 BAA_0792 BAA_0793 gerLB gerLC TRUE 0.878 8.000 0.235 0.009   NA
 7685172 7685173 BAA_0793 BAA_0794 gerLC   TRUE 0.861 12.000 0.500 NA   NA
 7685174 7685175 BAA_0795 BAA_0796     TRUE 0.727 -22.000 0.556 0.003   NA
 7685175 7685176 BAA_0796 BAA_0797     TRUE 0.746 -3.000 0.250 1.000   NA
 7685177 7685178 BAA_0798 BAA_0799     TRUE 0.906 71.000 0.206 1.000 Y NA
 7685178 7685179 BAA_0799 BAA_0800     TRUE 0.991 3.000 0.907 0.002 Y NA
 7685179 7685180 BAA_0800 BAA_0801     FALSE 0.158 186.000 0.048 NA   NA
 7685182 7685183 BAA_0803 BAA_0805 rrs_10 rrl_10 FALSE 0.141 179.000 0.000 NA   NA
 7685185 7685186 BAA_0806 BAA_0807 rrf_10   TRUE 0.651 5.000 0.000 NA   NA
 7685186 7685187 BAA_0807 BAA_0808     TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7685187 7685188 BAA_0808 BAA_0809     TRUE 0.651 5.000 0.000 NA   NA
 7685188 7685189 BAA_0809 BAA_0810     FALSE 0.604 14.000 0.000 NA   NA
 7685189 7685190 BAA_0810 BAA_0811     FALSE 0.465 26.000 0.000 NA   NA
 7685190 7685191 BAA_0811 BAA_0812     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7685191 7685192 BAA_0812 BAA_0813     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7685192 7685193 BAA_0813 BAA_0814     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7685193 7685194 BAA_0814 BAA_0815     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7685194 7685195 BAA_0815 BAA_0816     FALSE 0.572 17.000 0.000 NA   NA
 7685195 7685196 BAA_0816 BAA_0817     FALSE 0.298 55.000 0.000 NA   NA
 7685196 7685197 BAA_0817 BAA_0818     FALSE 0.540 20.000 0.000 NA   NA
 7685197 7685198 BAA_0818 BAA_0819     TRUE 0.638 3.000 0.000 NA   NA
 7685198 7685199 BAA_0819 BAA_0820     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7685199 7685200 BAA_0820 BAA_0821     TRUE 0.647 8.000 0.000 NA   NA
 7685200 7685201 BAA_0821 BAA_0822     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7685201 7685202 BAA_0822 BAA_0823     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7685202 7685203 BAA_0823 BAA_0824     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7685203 7685204 BAA_0824 BAA_0825     FALSE 0.439 135.000 0.000 NA   NA
 7685204 7685205 BAA_0825 BAA_0826     FALSE 0.017 295.000 0.000 NA   NA
 7685206 7685207 BAA_0827 BAA_0828     TRUE 0.844 15.000 0.500 NA   NA
 7685207 7685208 BAA_0828 BAA_0829     TRUE 0.917 6.000 0.750 NA   NA
 7685209 7685210 BAA_0832 BAA_0833     TRUE 0.651 -31.000 0.145 1.000 N NA
 7685210 7685211 BAA_0833 BAA_0834     TRUE 0.986 0.000 0.826 1.000 Y NA
 7685211 7685212 BAA_0834 BAA_0835     TRUE 0.969 -3.000 0.135 0.034 Y NA
 7685212 7685213 BAA_0835 BAA_0836   tenI TRUE 0.911 11.000 0.054 1.000 N NA
 7685213 7685214 BAA_0836 BAA_0837 tenI thiO TRUE 0.811 -7.000 0.194 1.000 N NA
 7685214 7685215 BAA_0837 BAA_0838 thiO thiS TRUE 0.898 16.000 0.239 1.000 N NA
 7685215 7685216 BAA_0838 BAA_0839 thiS thiG TRUE 0.975 3.000 0.054 1.000 Y NA
 7685216 7685217 BAA_0839 BAA_0840 thiG   TRUE 0.949 -7.000 0.012 0.027 Y NA
 7685217 7685218 BAA_0840 BAA_0841   thiD1 TRUE 0.969 16.000 0.195 1.000 Y NA
 7685218 7685219 BAA_0841 BAA_0843 thiD1   FALSE 0.006 442.000 0.000 NA   NA
 7685219 7685220 BAA_0843 BAA_0844     FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7685220 7685221 BAA_0844 BAA_0845     FALSE 0.617 30.000 0.286 NA   NA
 7685221 7685222 BAA_0845 BAA_0847   kdpA FALSE 0.005 547.000 0.000 NA   NA
 7685222 7685223 BAA_0847 BAA_0848 kdpA kdpB TRUE 0.978 14.000 0.035 0.001 Y NA
 7685223 7685224 BAA_0848 BAA_0849 kdpB kdpC TRUE 0.988 17.000 0.877 0.001 Y NA
 7685224 7685225 BAA_0849 BAA_0850 kdpC kdpD FALSE 0.577 63.000 0.066 0.100   NA
 7685227 7685228 BAA_0852 BAA_0853     TRUE 0.801 129.000 0.500 1.000   NA
 7685228 7685229 BAA_0853 BAA_0854     FALSE 0.346 170.000 0.357 NA   NA
 7685231 7685232 BAA_0856 BAA_0857     FALSE 0.296 67.000 0.000 NA   NA
 7685232 7685233 BAA_0857 BAA_0858     FALSE 0.474 126.000 0.000 NA   NA
 7685233 7685234 BAA_0858 BAA_0859     FALSE 0.448 105.000 0.000 NA   NA
 7685235 7685236 BAA_0860 BAA_0861 scrK scrB TRUE 0.962 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 7685236 7685237 BAA_0861 BAA_0862 scrB scrA TRUE 0.966 18.000 0.100 1.000 Y NA
 7685237 7685238 BAA_0862 BAA_0863 scrA scrR TRUE 0.837 129.000 0.113 1.000 N NA
 7685238 7685239 BAA_0863 BAA_0864 scrR   FALSE 0.587 118.000 0.056 NA   NA
 7685239 7685240 BAA_0864 BAA_0865     FALSE 0.409 73.000 0.148 NA   NA
 7685240 7685241 BAA_0865 BAA_0866     TRUE 0.855 13.000 0.073 0.005   NA
 7685241 7685242 BAA_0866 BAA_0867     FALSE 0.276 166.000 0.127 NA   NA
 7685242 7685243 BAA_0867 BAA_0868     TRUE 0.708 117.000 0.364 NA   NA
 7685243 7685244 BAA_0868 BAA_0869     FALSE 0.316 46.000 0.000 NA   NA
 7685244 7685245 BAA_0869 BAA_0870     FALSE 0.483 120.000 0.000 NA   NA
 7685245 7685246 BAA_0870 BAA_0871   gerYC FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7685246 7685247 BAA_0871 BAA_0872 gerYC gerYA TRUE 0.854 84.000 0.867 0.009   NA
 7685247 7685248 BAA_0872 BAA_0873 gerYA   FALSE 0.476 125.000 0.000 NA   NA
 7685248 7685249 BAA_0873 BAA_0874     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7685250 7685251 BAA_0875 BAA_0876   spoVR FALSE 0.569 116.000 0.019 NA   NA
 7685251 7685252 BAA_0876 BAA_0877 spoVR   FALSE 0.489 -7.000 0.007 NA   NA
 7685252 7685253 BAA_0877 BAA_0878     FALSE 0.265 -22.000 0.000 NA   NA
 7685255 7685256 BAA_0880 BAA_0881     TRUE 0.837 134.000 0.800 NA   NA
 7685256 7685257 BAA_0881 BAA_0882     FALSE 0.088 209.000 0.057 NA   NA
 7685257 7685258 BAA_0882 BAA_0883     FALSE 0.169 186.000 0.143 NA   NA
 7685258 7685259 BAA_0883 BAA_0884     FALSE 0.480 89.000 0.127 NA   NA
 7685259 7685260 BAA_0884 BAA_0885     FALSE 0.621 39.000 0.286 1.000   NA
 7685260 7685261 BAA_0885 BAA_0886     TRUE 0.635 32.000 0.207 1.000   NA
 7685261 7685262 BAA_0886 BAA_0887     FALSE 0.313 77.000 0.000 NA   NA
 7685262 7685263 BAA_0887 BAA_0888     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7685263 7685264 BAA_0888 BAA_0889     FALSE 0.295 61.000 0.000 NA   NA
 7685264 7685265 BAA_0889 BAA_0890     FALSE 0.404 34.000 0.000 NA   NA
 7685266 7685267 BAA_0891 BAA_0892     TRUE 0.733 146.000 0.667 NA   NA
 7685269 7685270 BAA_0894 BAA_0895     FALSE 0.482 121.000 0.000 NA   NA
 7685270 7685271 BAA_0895 BAA_0896     FALSE 0.335 43.000 0.000 NA   NA
 7685272 7685273 BAA_0897 BAA_0898     FALSE 0.503 73.000 0.149 1.000   NA
 7685273 7685274 BAA_0898 BAA_0899   celC1 TRUE 0.888 112.000 0.149 0.006 N NA
 7685274 7685275 BAA_0899 BAA_0900 celC1 celA1 TRUE 0.989 2.000 0.778 0.006 Y NA
 7685275 7685276 BAA_0900 BAA_0901 celA1 celB1 TRUE 0.957 83.000 0.583 0.006 Y NA
 7685276 7685277 BAA_0901 BAA_0902 celB1   FALSE 0.599 -24.000 0.583 NA   NA
 7685277 7685278 BAA_0902 BAA_0903     TRUE 0.755 -10.000 0.700 NA   NA
 7685279 7685280 BAA_0904 BAA_0905     FALSE 0.025 571.000 0.000 1.000 N NA
 7685280 7685281 BAA_0905 BAA_0906     TRUE 0.961 -12.000 0.889 1.000 Y NA
 7685281 7685282 BAA_0906 BAA_0907     TRUE 0.947 -3.000 0.889 1.000 N NA
 7685283 7685284 BAA_0908 BAA_0909     FALSE 0.365 89.000 0.000 NA   NA
 7685284 7685285 BAA_0909 BAA_0910     FALSE 0.435 30.000 0.000 NA   NA
 7685285 7685286 BAA_0910 BAA_0911     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7685287 7685288 BAA_0912 BAA_0913 brnQ2 cotJC FALSE 0.198 219.000 0.000 1.000 N NA
 7685288 7685289 BAA_0913 BAA_0914 cotJC cotJB TRUE 0.835 13.000 0.438 NA   NA
 7685289 7685290 BAA_0914 BAA_0915 cotJB cotJA TRUE 0.876 9.000 0.516 NA   NA
 7685291 7685292 BAA_0916 BAA_0917     TRUE 0.738 15.000 0.259 NA   NA
 7685294 7685295 BAA_0920 BAA_0921     TRUE 0.821 11.000 0.368 NA   NA
 7685295 7685296 BAA_0921 BAA_0922     TRUE 0.748 105.000 0.500 NA   NA
 7685296 7685297 BAA_0922 BAA_0923     TRUE 0.851 21.000 0.667 NA   NA
 7685297 7685298 BAA_0923 BAA_0924     FALSE 0.004 838.000 0.000 NA   NA
 7685298 7685299 BAA_0924 BAA_0925     FALSE 0.581 80.000 0.400 NA   NA
 7685299 7685300 BAA_0925 BAA_0926     TRUE 0.869 13.000 0.556 NA   NA
 7685302 7685303 BAA_0928 BAA_0929     TRUE 0.848 126.000 0.778 NA   NA
 7685303 7685304 BAA_0929 BAA_0930     FALSE 0.595 30.000 0.259 NA   NA
 7685304 7685305 BAA_0930 BAA_0931     FALSE 0.591 156.000 0.156 0.001   NA
 7685305 7685306 BAA_0931 BAA_0932     TRUE 0.751 25.000 0.344 1.000   NA
 7685306 7685307 BAA_0932 BAA_0933     FALSE 0.603 49.000 0.357 1.000   NA
 7685307 7685308 BAA_0933 BAA_0934     FALSE 0.305 161.000 0.113 NA   NA
 7685308 7685309 BAA_0934 BAA_0935     FALSE 0.519 156.000 0.429 NA   NA
 7685309 7685310 BAA_0935 BAA_0936     FALSE 0.615 75.000 0.500 NA   NA
 7685312 7685313 BAA_0938 BAA_0939     TRUE 0.831 129.000 0.027 1.000 N NA
 7685313 7685314 BAA_0939 BAA_0940     FALSE 0.045 359.000 0.000 1.000 N NA
 7685314 7685315 BAA_0940 BAA_0941     TRUE 0.990 3.000 0.846 0.066 Y NA
 7685315 7685316 BAA_0941 BAA_0942     TRUE 0.892 133.000 0.538 1.000 N NA
 7685316 7685317 BAA_0942 BAA_0943   blT FALSE 0.273 202.000 0.000 1.000 N NA
 7685319 7685320 BAA_0945 BAA_0946     TRUE 0.698 20.000 0.267 NA   NA
 7685323 7685324 BAA_0949 BAA_0950     FALSE 0.036 238.000 0.000 NA   NA
 7685324 7685325 BAA_0950 BAA_0951     TRUE 0.691 24.000 0.176 1.000   NA
 7685325 7685326 BAA_0951 BAA_0952     FALSE 0.329 193.000 0.160 NA N NA
 7685326 7685327 BAA_0952 BAA_0953     TRUE 0.713 61.000 0.320 NA N NA
 7685328 7685329 BAA_0955 BAA_0956 racE1   FALSE 0.562 113.000 0.005 NA   NA
 7685331 7685332 BAA_0958 BAA_0959     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7685332 7685333 BAA_0959 BAA_0960     FALSE 0.629 12.000 0.000 NA   NA
 7685333 7685334 BAA_0960 BAA_0961     FALSE 0.022 273.000 0.000 NA   NA
 7685334 7685335 BAA_0961 BAA_0962     TRUE 0.939 -22.000 0.594 0.034 Y NA
 7685335 7685336 BAA_0962 BAA_0963     TRUE 0.961 29.000 0.481 1.000 Y NA
 7685339 7685340 BAA_0966 BAA_0967     TRUE 0.830 21.000 0.583 NA   NA
 7685341 7685342 BAA_0968 BAA_0969     FALSE 0.596 142.000 0.321 NA   NA
 7685343 7685344 BAA_0970 BAA_0971     TRUE 0.810 22.000 0.545 NA   NA
 7685345 7685346 BAA_0972 BAA_0973 alsS alsD TRUE 0.907 17.000 0.323 1.000 N NA
 7685347 7685348 BAA_0974 BAA_0975     FALSE 0.587 22.000 0.005 NA   NA
 7685349 7685350 BAA_0976 BAA_0977     FALSE 0.006 494.000 0.000 NA   NA
 7685351 7685352 BAA_0978 BAA_0979     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7685353 7685354 BAA_0980 BAA_0981     FALSE 0.082 315.000 0.000 0.078 N NA
 7685356 7685357 BAA_0983 BAA_0984     FALSE 0.011 343.000 0.000 NA   NA
 7685357 7685358 BAA_0984 BAA_0985     FALSE 0.009 359.000 0.000 NA   NA
 7685359 7685360 BAA_0986 BAA_0987   secA1 TRUE 0.852 15.000 0.519 NA   NA
 7685361 7685362 BAA_0988 BAA_0989   csaB FALSE 0.482 142.000 0.040 NA   NA
 7685362 7685363 BAA_0989 BAA_0990 csaB sap FALSE 0.005 676.000 0.000 NA   NA
 7685363 7685364 BAA_0990 BAA_0991 sap eag FALSE 0.005 722.000 0.000 NA   NA
 7685365 7685366 BAA_0992 BAA_0993     TRUE 0.718 25.000 0.400 NA   NA
 7685367 7685368 BAA_0994 BAA_0995     TRUE 0.812 10.000 0.333 NA   NA
 7685370 7685371 BAA_0997 BAA_0998     FALSE 0.031 250.000 0.000 NA   NA
 7685373 7685374 BAA_1000 BAA_1001     FALSE 0.152 240.000 0.000 1.000 N NA
 7685374 7685375 BAA_1001 BAA_1002     TRUE 0.828 133.000 0.318 NA N NA
 7685377 7685378 BAA_1004 BAA_1005     TRUE 0.963 20.000 0.109 1.000 Y NA
 7685378 7685379 BAA_1005 BAA_1006     FALSE 0.008 386.000 0.000 NA   NA
 7685379 7685380 BAA_1006 BAA_1007     FALSE 0.004 739.000 0.000 NA   NA
 7685380 7685381 BAA_1007 BAA_1008     FALSE 0.007 411.000 0.000 NA   NA
 7685381 7685382 BAA_1008 BAA_1009     FALSE 0.474 52.000 0.286 NA   NA
 7685384 7685385 BAA_1011 BAA_1012     TRUE 0.952 60.000 0.688 0.034 Y NA
 7685385 7685386 BAA_1012 BAA_1013     TRUE 0.990 7.000 0.786 0.034 Y NA
 7685386 7685387 BAA_1013 BAA_1014     FALSE 0.456 27.000 0.000 NA   NA
 7685387 7685388 BAA_1014 BAA_1015     FALSE 0.301 52.000 0.000 NA   NA
 7685388 7685389 BAA_1015 BAA_1016     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7685389 7685390 BAA_1016 BAA_1017     FALSE 0.005 640.000 0.000 NA   NA
 7685390 7685391 BAA_1017 BAA_1018     FALSE 0.173 170.000 0.000 NA   NA
 7685391 7685392 BAA_1018 BAA_1019     FALSE 0.617 37.000 0.375 NA   NA
 7685392 7685393 BAA_1019 BAA_1020     FALSE 0.313 -15.000 0.000 NA   NA
 7685393 7685394 BAA_1020 BAA_1021     FALSE 0.296 68.000 0.000 NA   NA
 7685396 7685397 BAA_1023 BAA_1024     TRUE 0.985 19.000 0.833 0.084 Y NA
 7685397 7685398 BAA_1024 BAA_1025     TRUE 0.867 -3.000 0.611 1.000   NA
 7685398 7685399 BAA_1025 BAA_1026     FALSE 0.074 221.000 0.000 1.000   NA
 7685399 7685400 BAA_1026 BAA_1027     TRUE 0.795 100.000 0.026 1.000 N NA
 7685400 7685401 BAA_1027 BAA_1028     TRUE 0.639 -25.000 0.684 NA   NA
 7685403 7685404 BAA_1030 BAA_1031     TRUE 0.924 4.000 0.833 NA   NA
 7685404 7685405 BAA_1031 BAA_1032     TRUE 0.856 9.000 0.455 NA   NA
 7685405 7685406 BAA_1032 BAA_1033     FALSE 0.455 54.000 0.267 NA   NA
 7685406 7685407 BAA_1033 BAA_1034     FALSE 0.113 201.000 0.200 NA   NA
 7685407 7685408 BAA_1034 BAA_1035     FALSE 0.624 -3.000 0.041 NA   NA
 7685408 7685409 BAA_1035 BAA_1036     FALSE 0.412 33.000 0.000 NA   NA
 7685409 7685410 BAA_1036 BAA_1037     FALSE 0.472 127.000 0.000 NA   NA
 7685410 7685411 BAA_1037 BAA_1038     FALSE 0.515 22.000 0.000 NA   NA
 7685413 7685414 BAA_1040 BAA_1041     FALSE 0.010 353.000 0.000 NA   NA
 7685417 7685418 BAA_1044 BAA_1045     FALSE 0.618 -3.000 0.030 NA   NA
 7685418 7685419 BAA_1045 BAA_1046     FALSE 0.501 -7.000 0.023 NA   NA
 7685419 7685420 BAA_1046 BAA_1047     FALSE 0.073 201.000 0.000 NA   NA
 7685423 7685424 BAA_1050 BAA_1051     FALSE 0.597 117.000 0.109 NA   NA
 7685425 7685426 BAA_1052 BAA_1053     TRUE 0.726 58.000 0.244 1.000 N NA
 7685426 7685427 BAA_1053 BAA_1054     FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 7685428 7685429 BAA_1055 BAA_1056     FALSE 0.022 272.000 0.000 NA   NA
 7685429 7685430 BAA_1056 BAA_1057   pssA TRUE 0.706 44.000 0.000 1.000 N NA
 7685430 7685431 BAA_1057 BAA_1058 pssA   TRUE 0.664 24.000 0.013 1.000   NA
 7685431 7685432 BAA_1058 BAA_1059     FALSE 0.018 293.000 0.000 NA   NA
 7685432 7685433 BAA_1059 BAA_1060     FALSE 0.010 358.000 0.000 NA   NA
 7685434 7685435 BAA_1061 BAA_1062     TRUE 0.931 20.000 0.625 1.000 N NA
 7685438 7685439 BAA_1065 BAA_1066     FALSE 0.066 204.000 0.000 NA   NA
 7685440 7685441 BAA_1067 BAA_1068     FALSE 0.489 113.000 0.000 NA   NA
 7685441 7685442 BAA_1068 BAA_1069     FALSE 0.057 211.000 0.000 NA   NA
 7685443 7685444 BAA_1070 BAA_1071     FALSE 0.007 412.000 0.000 NA   NA
 7685444 7685445 BAA_1071 BAA_1072     FALSE 0.005 555.000 0.000 NA   NA
 7685449 7685450 BAA_1076 BAA_1077     FALSE 0.510 141.000 0.114 NA   NA
 7685450 7685451 BAA_1077 BAA_1078     TRUE 0.841 14.000 0.486 NA   NA
 7685453 7685454 BAA_1080 BAA_1081     TRUE 0.754 51.000 0.875 NA   NA
 7685454 7685455 BAA_1081 BAA_1082     FALSE 0.620 76.000 0.500 NA   NA
 7685457 7685458 BAA_1084 BAA_1085 rsbV rsbW TRUE 0.987 7.000 0.714 1.000 Y NA
 7685458 7685459 BAA_1085 BAA_1086 rsbW sigB TRUE 0.814 -34.000 0.838 1.000 N NA
 7685459 7685460 BAA_1086 BAA_1087 sigB   TRUE 0.709 70.000 0.038 1.000 N NA
 7685460 7685461 BAA_1087 BAA_1088     FALSE 0.507 176.000 0.032 1.000 N NA
 7685462 7685463 BAA_1089 BAA_1090     TRUE 0.968 17.000 0.169 1.000 Y NA
 7685463 7685464 BAA_1090 BAA_1091     FALSE 0.102 206.000 0.000 1.000   NA
 7685465 7685466 BAA_1092 BAA_1093     TRUE 0.711 40.000 0.600 NA   NA
 7685466 7685467 BAA_1093 BAA_1094     FALSE 0.202 214.000 0.600 NA   NA
 7685467 7685468 BAA_1094 BAA_1095     FALSE 0.380 143.000 0.000 NA   NA
 7685468 7685469 BAA_1095 BAA_1096     FALSE 0.012 335.000 0.000 NA   NA
 7685470 7685471 BAA_1097 BAA_1098     FALSE 0.589 118.000 0.068 NA   NA
 7685471 7685472 BAA_1098 BAA_1099     FALSE 0.463 129.000 0.000 NA   NA
 7685475 7685476 BAA_1102 BAA_1103     TRUE 0.726 -3.000 0.330 NA   NA
 7685476 7685477 BAA_1103 BAA_1104     FALSE 0.295 60.000 0.000 NA   NA
 7685477 7685478 BAA_1104 BAA_1105     FALSE 0.027 259.000 0.000 NA   NA
 7685478 7685479 BAA_1105 BAA_1106     FALSE 0.180 168.000 0.000 NA   NA
 7685479 7685480 BAA_1106 BAA_1107     FALSE 0.525 42.000 0.291 NA   NA
 7685480 7685481 BAA_1107 BAA_1108     FALSE 0.271 177.000 0.016 1.000   NA
 7685481 7685482 BAA_1108 BAA_1109     TRUE 0.671 58.000 0.133 NA N NA
 7685482 7685483 BAA_1109 BAA_1110     FALSE 0.007 417.000 0.000 NA   NA
 7685483 7685484 BAA_1110 BAA_1111     FALSE 0.558 44.000 0.368 NA   NA
 7685484 7685485 BAA_1111 BAA_1112     FALSE 0.044 224.000 0.000 NA   NA
 7685485 7685486 BAA_1112 BAA_1113     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7685486 7685487 BAA_1113 BAA_1114     FALSE 0.042 228.000 0.000 NA   NA
 7685487 7685488 BAA_1114 BAA_1115     FALSE 0.584 141.000 0.292 NA   NA
 7685488 7685489 BAA_1115 BAA_1116     FALSE 0.234 174.000 0.167 NA   NA
 7685489 7685490 BAA_1116 BAA_1117     FALSE 0.009 360.000 0.000 NA   NA
 7685490 7685491 BAA_1117 BAA_1118   glpP TRUE 0.935 98.000 0.083 1.000 Y NA
 7685491 7685492 BAA_1118 BAA_1119 glpP glpF FALSE 0.200 229.000 0.083 1.000 N NA
 7685492 7685493 BAA_1119 BAA_1120 glpF glpK TRUE 0.899 14.000 0.057 1.000 N NA
 7685493 7685494 BAA_1120 BAA_1121 glpK glpD TRUE 0.958 134.000 0.013 0.001 Y NA
 7685496 7685497 BAA_1123 BAA_1124     FALSE 0.043 255.000 0.080 NA   NA
 7685497 7685498 BAA_1124 BAA_1125     TRUE 0.982 5.000 0.533 NA Y NA
 7685498 7685499 BAA_1125 BAA_1126     TRUE 0.924 8.000 0.389 NA N NA
 7685501 7685502 BAA_1128 BAA_1129     FALSE 0.388 162.000 0.333 NA   NA
 7685502 7685503 BAA_1129 BAA_1130     TRUE 0.909 23.000 0.333 0.005 N NA
 7685504 7685505 BAA_1131 BAA_1132     TRUE 0.674 88.000 0.500 NA   NA
 7685505 7685506 BAA_1132 BAA_1133   prsA1 FALSE 0.014 378.000 0.000 1.000   NA
 7685507 7685508 BAA_1134 BAA_1135     FALSE 0.016 301.000 0.000 NA   NA
 7685509 7685510 BAA_1136 BAA_1137 hpr   FALSE 0.025 299.000 0.063 NA   NA
 7685510 7685511 BAA_1137 BAA_1138     FALSE 0.217 178.000 0.137 NA   NA
 7685512 7685513 BAA_1139 BAA_1140 ecsA ecsB TRUE 0.794 -7.000 0.271 NA N NA
 7685513 7685514 BAA_1140 BAA_1141 ecsB ecsC TRUE 0.765 14.000 0.292 NA   NA
 7685516 7685517 BAA_1143 BAA_1144     TRUE 0.916 3.000 0.778 NA   NA
 7685517 7685518 BAA_1144 BAA_1145     TRUE 0.753 80.000 0.778 NA   NA
 7685518 7685519 BAA_1145 BAA_1146     FALSE 0.540 20.000 0.000 NA   NA
 7685519 7685520 BAA_1146 BAA_1147     FALSE 0.249 -25.000 0.000 NA   NA
 7685520 7685521 BAA_1147 BAA_1148     FALSE 0.448 105.000 0.000 NA   NA
 7685521 7685522 BAA_1148 BAA_1149     TRUE 0.743 10.000 0.150 NA   NA
 7685522 7685523 BAA_1149 BAA_1150     FALSE 0.005 710.000 0.000 NA   NA
 7685523 7685524 BAA_1150 BAA_1151     FALSE 0.005 692.000 0.000 NA   NA
 7685526 7685527 BAA_1153 BAA_1154     FALSE 0.016 303.000 0.000 NA   NA
 7685527 7685528 BAA_1154 BAA_1155     FALSE 0.510 74.000 0.333 NA   NA
 7685528 7685529 BAA_1155 BAA_1156     TRUE 0.732 50.000 0.778 NA   NA
 7685531 7685532 BAA_1158 BAA_1159 pbpF hemE TRUE 0.664 156.000 0.020 1.000 N NA
 7685532 7685533 BAA_1159 BAA_1160 hemE hemH1 TRUE 0.971 15.000 0.131 1.000 Y NA
 7685533 7685534 BAA_1160 BAA_1161 hemH1 hemY1 TRUE 0.963 20.000 0.069 1.000 Y NA
 7685536 7685537 BAA_1163 BAA_1165     FALSE 0.294 152.000 0.000 NA   NA
 7685539 7685540 BAA_1166 BAA_1167 blaI   TRUE 0.978 -3.000 0.833 NA Y NA
 7685540 7685541 BAA_1167 BAA_1168     FALSE 0.488 214.000 0.000 NA Y NA
 7685541 7685542 BAA_1168 BAA_1169     FALSE 0.055 212.000 0.000 NA   NA
 7685542 7685543 BAA_1169 BAA_1170     FALSE 0.565 144.000 0.300 NA   NA
 7685543 7685544 BAA_1170 BAA_1171     TRUE 0.790 37.000 0.778 NA   NA
 7685546 7685547 BAA_1173 BAA_1174     FALSE 0.036 238.000 0.000 NA   NA
 7685549 7685550 BAA_1176 BAA_1177     TRUE 0.810 10.000 0.200 1.000   NA
 7685550 7685551 BAA_1177 BAA_1178     FALSE 0.044 255.000 0.098 NA   NA
 7685551 7685552 BAA_1178 BAA_1179     FALSE 0.621 162.000 0.778 NA   NA
 7685552 7685553 BAA_1179 BAA_1180     FALSE 0.617 113.000 0.222 NA   NA
 7685553 7685554 BAA_1180 BAA_1181     FALSE 0.623 90.000 0.400 NA   NA
 7685554 7685555 BAA_1181 BAA_1182     FALSE 0.013 326.000 0.000 NA   NA
 7685555 7685556 BAA_1182 BAA_1183     TRUE 0.647 8.000 0.000 NA   NA
 7685556 7685557 BAA_1183 BAA_1184     FALSE 0.441 29.000 0.000 NA   NA
 7685557 7685558 BAA_1184 BAA_1185     FALSE 0.297 56.000 0.000 NA   NA
 7685558 7685559 BAA_1185 BAA_1186     TRUE 0.783 -7.000 0.667 NA   NA
 7685559 7685560 BAA_1186 BAA_1187     FALSE 0.304 75.000 0.000 NA   NA
 7685560 7685561 BAA_1187 BAA_1188     FALSE 0.013 327.000 0.000 NA   NA
 7685561 7685562 BAA_1188 BAA_1189     FALSE 0.294 152.000 0.000 NA   NA
 7685562 7685563 BAA_1189 BAA_1190     FALSE 0.006 461.000 0.000 NA   NA
 7685563 7685564 BAA_1190 BAA_1191     TRUE 0.642 10.000 0.000 NA   NA
 7685566 7685567 BAA_1193 BAA_1194     FALSE 0.337 147.000 0.000 NA   NA
 7685567 7685568 BAA_1194 BAA_1195     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7685568 7685569 BAA_1195 BAA_1196     FALSE 0.051 216.000 0.000 NA   NA
 7685570 7685571 BAA_1197 BAA_1198     TRUE 0.819 6.000 0.333 NA   NA
 7685572 7685573 BAA_1199 BAA_1200     FALSE 0.475 60.000 0.294 NA   NA
 7685573 7685574 BAA_1200 BAA_1201     FALSE 0.299 183.000 0.429 NA   NA
 7685575 7685576 BAA_1202 BAA_1203     TRUE 0.983 10.000 0.533 1.000 Y NA
 7685577 7685578 BAA_1204 BAA_1205     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7685578 7685579 BAA_1205 BAA_1206     FALSE 0.407 140.000 0.000 NA   NA
 7685579 7685580 BAA_1206 BAA_1207     TRUE 0.827 12.000 0.400 NA   NA
 7685580 7685581 BAA_1207 BAA_1208     FALSE 0.515 135.000 0.009 NA   NA
 7685581 7685582 BAA_1208 BAA_1209     TRUE 0.843 137.000 0.022 0.094 N NA
 7685582 7685583 BAA_1209 BAA_1210     FALSE 0.129 213.000 0.000 0.094   NA
 7685583 7685584 BAA_1210 BAA_1211     TRUE 0.631 78.000 0.500 NA   NA
 7685586 7685587 BAA_1213 BAA_1214     FALSE 0.011 340.000 0.000 NA   NA
 7685587 7685588 BAA_1214 BAA_1215   aceB FALSE 0.166 184.000 0.044 NA   NA
 7685588 7685589 BAA_1215 BAA_1216 aceB aceA TRUE 0.955 24.000 0.084 1.000 Y NA
 7685591 7685592 BAA_1218 BAA_1219 cspA1   FALSE 0.419 102.000 0.000 NA   NA
 7685594 7685595 BAA_1221 BAA_1222     FALSE 0.031 274.000 0.033 NA   NA
 7685595 7685596 BAA_1222 BAA_1223   sipT FALSE 0.428 57.000 0.246 NA   NA
 7685596 7685597 BAA_1223 BAA_1224 sipT addB TRUE 0.848 117.000 0.086 1.000 N NA
 7685597 7685598 BAA_1224 BAA_1225 addB addA TRUE 0.976 -3.000 0.408 0.003 Y NA
 7685598 7685599 BAA_1225 BAA_1226 addA   TRUE 0.841 13.000 0.035 0.041   NA
 7685600 7685601 BAA_1227 BAA_1228 gerPF1 gerPE FALSE 0.458 43.000 0.222 NA   NA
 7685601 7685602 BAA_1228 BAA_1229 gerPE gerPD TRUE 0.753 16.000 0.296 NA   NA
 7685602 7685603 BAA_1229 BAA_1230 gerPD gerPC TRUE 0.712 7.000 0.003 NA   NA
 7685603 7685604 BAA_1230 BAA_1231 gerPC gerPB FALSE 0.359 67.000 0.003 NA   NA
 7685604 7685605 BAA_1231 BAA_1232 gerPB gerPA TRUE 0.914 15.000 0.889 NA   NA
 7685605 7685606 BAA_1232 BAA_1233 gerPA   FALSE 0.389 97.000 0.000 NA   NA
 7685608 7685609 BAA_1235 BAA_1236   rocD FALSE 0.544 106.000 0.023 NA   NA
 7685612 7685613 BAA_1239 BAA_1240 asnO1 hemH2 FALSE 0.386 189.000 0.011 1.000 N NA
 7685613 7685614 BAA_1240 BAA_1241 hemH2 katB TRUE 0.701 60.000 0.013 1.000 N NA
 7685615 7685616 BAA_1242 BAA_1243     FALSE 0.297 70.000 0.000 NA   NA
 7685617 7685618 BAA_1244 BAA_1245     FALSE 0.050 251.000 0.000 1.000   NA
 7685620 7685621 BAA_1247 BAA_1248     FALSE 0.184 184.000 0.000 1.000   NA
 7685622 7685623 BAA_1249 BAA_1250 prsA2   TRUE 0.743 129.000 0.467 NA   NA
 7685625 7685626 BAA_1252 BAA_1253     TRUE 0.915 1.000 0.826 NA   NA
 7685626 7685627 BAA_1253 BAA_1254     TRUE 0.722 106.000 0.429 NA   NA
 7685628 7685629 BAA_1255 BAA_1256   clpB FALSE 0.057 211.000 0.000 NA   NA
 7685631 7685632 BAA_1258 BAA_1259     FALSE 0.408 48.000 0.065 NA   NA
 7685632 7685633 BAA_1259 BAA_1260     TRUE 0.741 6.000 0.065 NA   NA
 7685633 7685634 BAA_1260 BAA_1261   fabH FALSE 0.008 391.000 0.000 NA   NA
 7685634 7685635 BAA_1261 BAA_1262 fabH fabF TRUE 0.955 32.000 0.076 0.001 Y NA
 7685635 7685636 BAA_1262 BAA_1263 fabF   TRUE 0.801 107.000 0.039 NA N NA
 7685636 7685637 BAA_1263 BAA_1264     FALSE 0.588 143.000 0.321 NA   NA
 7685638 7685639 BAA_1265 BAA_1266 trpS   FALSE 0.007 398.000 0.000 NA   NA
 7685640 7685641 BAA_1267 BAA_1268     TRUE 0.959 128.000 0.031 0.032 Y NA
 7685641 7685642 BAA_1268 BAA_1269     TRUE 0.969 -3.000 0.165 0.032 Y NA
 7685642 7685643 BAA_1269 BAA_1270     TRUE 0.980 19.000 0.706 1.000 Y NA
 7685643 7685644 BAA_1270 BAA_1271     TRUE 0.792 -7.000 0.375 0.003   NA
 7685648 7685649 BAA_1275 BAA_1276   spx FALSE 0.006 478.000 0.000 NA   NA
 7685651 7685652 BAA_1278 BAA_1279 mecA cls2 TRUE 0.715 73.000 0.314 NA N NA
 7685652 7685653 BAA_1279 BAA_1280 cls2   FALSE 0.450 82.000 0.189 NA   NA
 7685653 7685654 BAA_1280 BAA_1281   pepF1 FALSE 0.547 51.000 0.398 NA   NA
 7685655 7685656 BAA_1282 BAA_1283     FALSE 0.040 230.000 0.000 NA   NA
 7685656 7685657 BAA_1283 BAA_1284     TRUE 0.710 0.000 0.138 NA   NA
 7685657 7685658 BAA_1284 BAA_1285     FALSE 0.257 181.000 0.063 1.000   NA
 7685659 7685660 BAA_1286 BAA_1287     FALSE 0.608 31.000 0.283 NA   NA
 7685660 7685661 BAA_1287 BAA_1288     TRUE 0.895 19.000 0.725 1.000   NA
 7685661 7685662 BAA_1288 BAA_1289     TRUE 0.928 16.000 0.480 1.000 N NA
 7685663 7685664 BAA_1290 BAA_1291     FALSE 0.007 408.000 0.000 NA   NA
 7685664 7685665 BAA_1291 BAA_1292     FALSE 0.397 141.000 0.000 NA   NA
 7685665 7685666 BAA_1292 BAA_1293     FALSE 0.304 75.000 0.000 NA   NA
 7685666 7685667 BAA_1293 BAA_1294     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7685667 7685668 BAA_1294 BAA_1295     FALSE 0.380 143.000 0.000 NA   NA
 7685668 7685669 BAA_1295 BAA_1296     TRUE 0.767 7.000 0.242 NA   NA
 7685669 7685670 BAA_1296 BAA_1297     TRUE 0.679 128.000 0.212 1.000   NA
 7685670 7685671 BAA_1297 BAA_1298   bclA FALSE 0.597 123.000 0.154 NA   NA
 7685672 7685673 BAA_1299 BAA_1300     FALSE 0.291 180.000 0.250 1.000   NA
 7685673 7685674 BAA_1300 BAA_1301     TRUE 0.641 138.000 0.222 1.000   NA
 7685674 7685675 BAA_1301 BAA_1302     TRUE 0.784 -3.000 0.444 NA   NA
 7685675 7685676 BAA_1302 BAA_1303     TRUE 0.844 13.000 0.471 NA   NA
 7685676 7685677 BAA_1303 BAA_1304     TRUE 0.833 15.000 0.471 NA   NA
 7685677 7685678 BAA_1304 BAA_1305   rfbC TRUE 0.976 9.000 0.096 1.000 Y NA
 7685678 7685679 BAA_1305 BAA_1306 rfbC rfbB TRUE 0.968 17.000 0.183 1.000 Y NA
 7685679 7685680 BAA_1306 BAA_1307 rfbB rfbD TRUE 0.980 12.000 0.088 0.002 Y NA
 7685680 7685681 BAA_1307 BAA_1308 rfbD fabI TRUE 0.844 109.000 0.082 1.000 N NA
 7685681 7685682 BAA_1308 BAA_1309 fabI   FALSE 0.298 162.000 0.129 NA   NA
 7685684 7685685 BAA_1311 BAA_1312     TRUE 0.751 111.000 0.438 NA   NA
 7685686 7685687 BAA_1313 BAA_1314   cotZ2 FALSE 0.180 168.000 0.000 NA   NA
 7685687 7685688 BAA_1314 BAA_1315 cotZ2   TRUE 0.769 143.000 0.700 NA   NA
 7685688 7685689 BAA_1315 BAA_1316     FALSE 0.625 100.000 0.222 1.000   NA
 7685689 7685690 BAA_1316 BAA_1317     TRUE 0.803 2.000 0.213 1.000   NA
 7685690 7685691 BAA_1317 BAA_1318     TRUE 0.773 93.000 0.287 NA N NA
 7685692 7685693 BAA_1319 BAA_1320     FALSE 0.475 149.000 0.267 NA   NA
 7685694 7685695 BAA_1321 BAA_1322     FALSE 0.036 271.000 0.130 NA   NA
 7685696 7685697 BAA_1323 BAA_1324   trpE FALSE 0.009 370.000 0.000 NA   NA
 7685697 7685698 BAA_1324 BAA_1325 trpE   TRUE 0.974 -3.000 0.293 0.001 Y NA
 7685698 7685699 BAA_1325 BAA_1326   trpD TRUE 0.961 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 7685699 7685700 BAA_1326 BAA_1327 trpD   TRUE 0.975 2.000 0.216 1.000 Y NA
 7685700 7685701 BAA_1327 BAA_1328   trpF TRUE 0.973 -3.000 0.264 0.001 Y NA
 7685701 7685702 BAA_1328 BAA_1329 trpF trpB TRUE 0.976 -3.000 0.375 0.001 Y NA
 7685702 7685703 BAA_1329 BAA_1330 trpB trpA TRUE 0.982 4.000 0.248 0.001 Y NA
 7685703 7685704 BAA_1330 BAA_1331 trpA   FALSE 0.376 75.000 0.015 NA   NA
 7685704 7685705 BAA_1331 BAA_1332     FALSE 0.602 115.000 0.119 NA   NA
 7685705 7685706 BAA_1332 BAA_1333     FALSE 0.491 92.000 0.167 NA   NA
 7685710 7685711 BAA_1337 BAA_1338     FALSE 0.624 102.000 0.098 1.000   NA
 7685711 7685712 BAA_1338 BAA_1339     FALSE 0.481 145.000 0.208 NA   NA
 7685713 7685714 BAA_1340 BAA_1341     TRUE 0.894 17.000 0.786 NA   NA
 7685714 7685715 BAA_1341 BAA_1342     TRUE 0.867 -3.000 0.733 NA   NA
 7685715 7685716 BAA_1342 BAA_1343   odhB FALSE 0.555 125.000 0.014 NA   NA
 7685716 7685717 BAA_1343 BAA_1344 odhB odhA TRUE 0.967 136.000 0.667 1.000 Y NA
 7685718 7685719 BAA_1345 BAA_1346     TRUE 0.925 3.000 0.875 NA   NA
 7685719 7685720 BAA_1346 BAA_1347     TRUE 0.800 29.000 0.667 NA   NA
 7685720 7685721 BAA_1347 BAA_1348     TRUE 0.799 135.000 0.667 NA   NA
 7685721 7685722 BAA_1348 BAA_1349     FALSE 0.006 441.000 0.000 NA   NA
 7685722 7685723 BAA_1349 BAA_1350     FALSE 0.439 135.000 0.000 NA   NA
 7685723 7685724 BAA_1350 BAA_1351     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7685724 7685725 BAA_1351 BAA_1352     FALSE 0.369 38.000 0.000 NA   NA
 7685726 7685727 BAA_1353 BAA_1354     FALSE 0.102 189.000 0.000 NA   NA
 7685727 7685728 BAA_1354 BAA_1355     FALSE 0.032 278.000 0.103 NA   NA
 7685729 7685730 BAA_1356 BAA_1357     TRUE 0.656 156.000 0.700 NA   NA
 7685730 7685731 BAA_1357 BAA_1358   sipW FALSE 0.300 195.000 0.320 0.030   NA
 7685731 7685732 BAA_1358 BAA_1359 sipW   FALSE 0.492 63.000 0.320 NA   NA
 7685732 7685733 BAA_1359 BAA_1360     FALSE 0.621 162.000 0.778 NA   NA
 7685733 7685734 BAA_1360 BAA_1361   calY FALSE 0.007 398.000 0.000 NA   NA
 7685736 7685737 BAA_1363 BAA_1364     FALSE 0.312 172.000 0.069 1.000   NA
 7685737 7685738 BAA_1364 BAA_1365   potA FALSE 0.179 227.000 0.000 1.000 N NA
 7685738 7685739 BAA_1365 BAA_1366 potA potB TRUE 0.984 -3.000 0.789 0.032 Y NA
 7685739 7685740 BAA_1366 BAA_1367 potB potC TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7685740 7685741 BAA_1367 BAA_1368 potC potD FALSE 0.361 39.000 0.000 NA   NA
 7685741 7685742 BAA_1368 BAA_1369 potD   TRUE 0.735 60.000 0.267 1.000 N NA
 7685742 7685743 BAA_1369 BAA_1370     TRUE 0.756 111.000 0.333 1.000   NA
 7685743 7685744 BAA_1370 BAA_1371     FALSE 0.628 101.000 0.333 NA   NA
 7685744 7685745 BAA_1371 BAA_1372     FALSE 0.506 99.000 0.089 NA   NA
 7685745 7685746 BAA_1372 BAA_1373     FALSE 0.481 92.000 0.089 NA   NA
 7685747 7685748 BAA_1374 BAA_1375     FALSE 0.006 466.000 0.000 NA   NA
 7685748 7685749 BAA_1375 BAA_1376   glcD TRUE 0.968 -3.000 0.342 1.000 Y NA
 7685749 7685750 BAA_1376 BAA_1377 glcD   TRUE 0.856 118.000 0.247 1.000 N NA
 7685751 7685752 BAA_1378 BAA_1379     TRUE 0.740 -7.000 0.543 NA   NA
 7685752 7685753 BAA_1379 BAA_1380     TRUE 0.985 4.000 0.621 1.000 Y NA
 7685753 7685754 BAA_1380 BAA_1381     FALSE 0.117 261.000 0.000 1.000 N NA
 7685754 7685755 BAA_1381 BAA_1382     FALSE 0.594 168.000 0.395 NA N NA
 7685755 7685756 BAA_1382 BAA_1383     TRUE 0.983 17.000 0.947 NA Y NA
 7685756 7685757 BAA_1383 BAA_1384     TRUE 0.914 0.000 0.500 0.001   NA
 7685757 7685758 BAA_1384 BAA_1385   comC TRUE 0.671 113.000 0.022 1.000   NA
 7685758 7685759 BAA_1385 BAA_1386 comC   FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7685759 7685760 BAA_1386 BAA_1387     FALSE 0.274 -21.000 0.000 NA   NA
 7685761 7685762 BAA_1388 BAA_1389     FALSE 0.582 204.000 0.000 1.000 Y NA
 7685762 7685763 BAA_1389 BAA_1391     FALSE 0.294 295.000 0.000 0.062 Y NA
 7685763 7685764 BAA_1391 BAA_1392     TRUE 0.801 115.000 0.455 1.000   NA
 7685764 7685765 BAA_1392 BAA_1393     TRUE 0.736 148.000 0.615 1.000   NA
 7685765 7685766 BAA_1393 BAA_1394     TRUE 0.771 102.000 0.615 NA   NA
 7685766 7685767 BAA_1394 BAA_1395     FALSE 0.501 43.000 0.273 NA   NA
 7685768 7685769 BAA_1396 BAA_1397   phbB FALSE 0.591 150.000 0.450 NA   NA
 7685769 7685770 BAA_1397 BAA_1398 phbB phaC TRUE 0.939 83.000 0.161 0.001 Y NA
 7685770 7685771 BAA_1398 BAA_1399 phaC   TRUE 0.788 96.000 0.113 1.000 N NA
 7685771 7685772 BAA_1399 BAA_1400     TRUE 0.848 24.000 0.096 1.000 N NA
 7685774 7685775 BAA_1402 BAA_1403     FALSE 0.041 229.000 0.000 NA   NA
 7685775 7685776 BAA_1403 BAA_1404     FALSE 0.271 155.000 0.000 NA   NA
 7685776 7685777 BAA_1404 BAA_1405     FALSE 0.326 -13.000 0.000 NA   NA
 7685777 7685778 BAA_1405 BAA_1406     FALSE 0.398 99.000 0.000 NA   NA
 7685778 7685779 BAA_1406 BAA_1407   phnX FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7685779 7685780 BAA_1407 BAA_1408 phnX   TRUE 0.857 16.000 0.315 0.073   NA
 7685780 7685781 BAA_1408 BAA_1409     TRUE 0.955 -3.000 0.029 NA Y NA
 7685781 7685782 BAA_1409 BAA_1410     TRUE 0.709 41.000 0.029 NA N NA
 7685782 7685783 BAA_1410 BAA_1411     FALSE 0.491 162.000 0.500 NA   NA
 7685783 7685784 BAA_1411 BAA_1412     FALSE 0.260 156.000 0.000 NA   NA
 7685784 7685785 BAA_1412 BAA_1413     FALSE 0.361 -10.000 0.000 NA   NA
 7685785 7685786 BAA_1413 BAA_1414     FALSE 0.441 29.000 0.000 NA   NA
 7685786 7685787 BAA_1414 BAA_1415     FALSE 0.019 286.000 0.000 NA   NA
 7685787 7685788 BAA_1415 BAA_1416     FALSE 0.447 -6.000 0.000 NA   NA
 7685788 7685789 BAA_1416 BAA_1417     FALSE 0.474 126.000 0.000 NA   NA
 7685793 7685794 BAA_1421 BAA_1422     FALSE 0.573 161.000 0.129 NA N NA
 7685794 7685795 BAA_1422 BAA_1423     FALSE 0.529 139.000 0.114 NA   NA
 7685795 7685796 BAA_1423 BAA_1424     TRUE 0.689 103.000 0.417 NA   NA
 7685798 7685799 BAA_1427 BAA_1428     TRUE 0.774 0.000 0.062 1.000   NA
 7685799 7685800 BAA_1428 BAA_1429   queE TRUE 0.828 -7.000 0.280 1.000 N NA
 7685800 7685801 BAA_1429 BAA_1430 queE   TRUE 0.739 19.000 0.101 1.000   NA
 7685803 7685804 BAA_1432 BAA_1433     FALSE 0.482 89.000 0.140 NA   NA
 7685806 7685807 BAA_1435 BAA_1436     FALSE 0.588 27.000 0.229 NA   NA
 7685807 7685808 BAA_1436 BAA_1437   nrdI FALSE 0.006 477.000 0.000 NA   NA
 7685808 7685809 BAA_1437 BAA_1438 nrdI   FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7685809 7685810 BAA_1438 BAA_1439     FALSE 0.056 241.000 0.000 1.000   NA
 7685810 7685811 BAA_1439 BAA_1440   nrdE FALSE 0.508 95.000 0.000 1.000   NA
 7685811 7685812 BAA_1440 BAA_1441 nrdE nrdF TRUE 0.967 94.000 0.625 0.001 Y NA
 7685812 7685813 BAA_1441 BAA_1442 nrdF   FALSE 0.206 217.000 0.000 1.000 N NA
 7685813 7685814 BAA_1442 BAA_1443     TRUE 0.884 -3.000 0.280 1.000 N NA
 7685814 7685815 BAA_1443 BAA_1444     TRUE 0.875 -3.000 0.778 NA   NA
 7685815 7685816 BAA_1444 BAA_1445     TRUE 0.894 15.000 0.727 NA   NA
 7685816 7685817 BAA_1445 BAA_1446     TRUE 0.837 0.000 0.471 NA   NA
 7685817 7685818 BAA_1446 BAA_1447     FALSE 0.097 203.000 0.040 NA   NA
 7685819 7685820 BAA_1448 BAA_1449     FALSE 0.570 101.000 0.258 NA   NA
 7685821 7685822 BAA_1450 BAA_1451     FALSE 0.535 -7.000 0.194 NA   NA
 7685822 7685823 BAA_1451 BAA_1452     FALSE 0.472 87.000 0.127 NA   NA
 7685826 7685827 BAA_1455 BAA_1456 dltD dltC TRUE 0.718 -3.000 0.064 1.000   NA
 7685827 7685828 BAA_1456 BAA_1457 dltC dltB FALSE 0.535 69.000 0.387 NA   NA
 7685828 7685829 BAA_1457 BAA_1458 dltB dltA TRUE 0.890 -3.000 0.435 NA N NA
 7685829 7685830 BAA_1458 BAA_1459 dltA   TRUE 0.866 13.000 0.549 NA   NA
 7685831 7685832 BAA_1460 BAA_1461 amaA   FALSE 0.042 227.000 0.000 NA   NA
 7685832 7685833 BAA_1461 BAA_1462     FALSE 0.620 -7.000 0.316 NA   NA
 7685833 7685834 BAA_1462 BAA_1463     TRUE 0.730 25.000 0.421 NA   NA
 7685834 7685835 BAA_1463 BAA_1464     TRUE 0.634 100.000 0.357 NA   NA
 7685838 7685839 BAA_1467 BAA_1468     TRUE 0.862 19.000 0.667 NA   NA
 7685839 7685840 BAA_1468 BAA_1469     FALSE 0.374 74.000 0.018 NA   NA
 7685842 7685843 BAA_1471 BAA_1472     FALSE 0.372 67.000 0.022 NA   NA
 7685844 7685845 BAA_1473 BAA_1474     FALSE 0.429 137.000 0.000 NA   NA
 7685849 7685850 BAA_1478 BAA_1479     TRUE 0.762 85.000 0.750 NA   NA
 7685851 7685852 BAA_1480 BAA_1481     FALSE 0.603 118.000 0.195 NA   NA
 7685853 7685854 BAA_1482 BAA_1483   ilvE1 FALSE 0.601 120.000 0.150 NA   NA
 7685854 7685855 BAA_1483 BAA_1484 ilvE1 ilvB FALSE 0.232 307.000 0.000 1.000 Y NA
 7685855 7685856 BAA_1484 BAA_1485 ilvB ilvN TRUE 0.972 -3.000 0.249 0.001 Y NA
 7685856 7685857 BAA_1485 BAA_1486 ilvN ilvC1 TRUE 0.960 27.000 0.130 0.002 Y NA
 7685857 7685858 BAA_1486 BAA_1487 ilvC1 leuA TRUE 0.974 2.000 0.103 1.000 Y NA
 7685858 7685859 BAA_1487 BAA_1488 leuA leuB TRUE 0.931 78.000 0.041 0.001 Y NA
 7685859 7685860 BAA_1488 BAA_1489 leuB leuC TRUE 0.978 0.000 0.080 0.001 Y NA
 7685860 7685861 BAA_1489 BAA_1490 leuC leuD TRUE 0.935 -22.000 0.477 0.001 Y NA
 7685861 7685862 BAA_1490 BAA_1491 leuD hisZ FALSE 0.224 311.000 0.000 1.000 Y NA
 7685862 7685863 BAA_1491 BAA_1492 hisZ hisG TRUE 0.911 -24.000 0.239 0.003 Y NA
 7685863 7685864 BAA_1492 BAA_1493 hisG hisD TRUE 0.981 12.000 0.254 0.003 Y NA
 7685864 7685865 BAA_1493 BAA_1494 hisD hisB TRUE 0.977 0.000 0.096 0.003 Y NA
 7685865 7685866 BAA_1494 BAA_1495 hisB hisH TRUE 0.979 1.000 0.125 0.003 Y NA
 7685866 7685867 BAA_1495 BAA_1496 hisH hisA TRUE 0.902 -27.000 0.124 0.003 Y NA
 7685867 7685868 BAA_1496 BAA_1497 hisA hisF TRUE 0.968 -6.000 0.433 0.003 Y NA
 7685868 7685869 BAA_1497 BAA_1498 hisF hisE FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7685869 7685870 BAA_1498 BAA_1499 hisE hisI TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7685870 7685871 BAA_1499 BAA_1500 hisI   TRUE 0.979 12.000 0.016 0.003 Y NA
 7685871 7685872 BAA_1500 BAA_1501     TRUE 0.714 68.000 0.750 NA   NA
 7685872 7685873 BAA_1501 BAA_1502     FALSE 0.507 99.000 0.096 NA   NA
 7685874 7685875 BAA_1503 BAA_1504     FALSE 0.448 182.000 0.011 1.000 N NA
 7685876 7685877 BAA_1505 BAA_1507   lysA FALSE 0.006 457.000 0.000 NA   NA
 7685877 7685878 BAA_1507 BAA_1509 lysA   FALSE 0.017 297.000 0.000 NA   NA
 7685878 7685879 BAA_1509 BAA_1510   cysH FALSE 0.431 87.000 0.011 NA   NA
 7685879 7685880 BAA_1510 BAA_1511 cysH sat TRUE 0.768 39.000 0.065 1.000 N NA
 7685880 7685881 BAA_1511 BAA_1512 sat cysC TRUE 0.979 13.000 0.101 0.001 Y NA
 7685881 7685882 BAA_1512 BAA_1513 cysC   TRUE 0.974 12.000 0.067 1.000 Y NA
 7685882 7685883 BAA_1513 BAA_1514     TRUE 0.895 11.000 0.647 NA   NA
 7685883 7685884 BAA_1514 BAA_1515   cysG FALSE 0.532 87.000 0.281 NA   NA
 7685884 7685885 BAA_1515 BAA_1516 cysG   TRUE 0.829 2.000 0.281 1.000   NA
 7685885 7685886 BAA_1516 BAA_1517     FALSE 0.540 -25.000 0.375 1.000   NA
 7685886 7685887 BAA_1517 BAA_1518     FALSE 0.011 419.000 0.000 1.000   NA
 7685889 7685890 BAA_1520 BAA_1521     TRUE 0.635 68.000 0.556 NA   NA
 7685890 7685891 BAA_1521 BAA_1523     FALSE 0.013 322.000 0.000 NA   NA
 7685891 7685892 BAA_1523 BAA_1524     FALSE 0.059 229.000 0.046 NA   NA
 7685892 7685893 BAA_1524 BAA_1525     FALSE 0.628 51.000 0.514 NA   NA
 7685893 7685894 BAA_1525 BAA_1526     FALSE 0.585 107.000 0.135 NA   NA
 7685894 7685895 BAA_1526 BAA_1527     TRUE 0.700 0.000 0.080 NA   NA
 7685895 7685896 BAA_1527 BAA_1528     TRUE 0.985 -3.000 0.853 0.018 Y NA
 7685896 7685897 BAA_1528 BAA_1529     FALSE 0.555 133.000 0.075 NA   NA
 7685898 7685899 BAA_1530 BAA_1531 brnQ3   FALSE 0.021 837.000 0.000 1.000 N NA
 7685902 7685903 BAA_1534 BAA_1535     FALSE 0.595 115.000 0.092 NA   NA
 7685903 7685904 BAA_1535 BAA_1536   hmp FALSE 0.303 160.000 0.049 NA   NA
 7685907 7685908 BAA_1539 BAA_1540     TRUE 0.690 118.000 0.136 1.000   NA
 7685908 7685909 BAA_1540 BAA_1541     TRUE 0.970 12.000 0.100 NA Y NA
 7685911 7685912 BAA_1543 BAA_1544     FALSE 0.007 396.000 0.000 NA   NA
 7685912 7685913 BAA_1544 BAA_1545     FALSE 0.098 190.000 0.000 NA   NA
 7685913 7685914 BAA_1545 BAA_1546     FALSE 0.380 -9.000 0.000 NA   NA
 7685916 7685917 BAA_1548 BAA_1549     TRUE 0.773 120.000 0.500 NA   NA
 7685917 7685918 BAA_1549 BAA_1550     TRUE 0.765 108.000 0.389 1.000   NA
 7685918 7685919 BAA_1550 BAA_1551   deoD TRUE 0.657 157.000 0.040 1.000 N NA
 7685920 7685921 BAA_1552 BAA_1553     FALSE 0.008 393.000 0.000 NA   NA
 7685923 7685924 BAA_1555 BAA_1556     TRUE 0.769 22.000 0.435 NA   NA
 7685924 7685925 BAA_1556 BAA_1557     FALSE 0.569 106.000 0.101 NA   NA
 7685925 7685926 BAA_1557 BAA_1558     TRUE 0.850 113.000 0.101 1.000 N NA
 7685926 7685927 BAA_1558 BAA_1559   spmA TRUE 0.654 -7.000 0.252 1.000   NA
 7685927 7685928 BAA_1559 BAA_1560 spmA   TRUE 0.847 -3.000 0.655 NA   NA
 7685928 7685929 BAA_1560 BAA_1561   rluB FALSE 0.027 290.000 0.063 NA   NA
 7685929 7685930 BAA_1561 BAA_1562 rluB resA TRUE 0.784 95.000 0.069 1.000 N NA
 7685930 7685931 BAA_1562 BAA_1563 resA resB TRUE 0.953 122.000 0.306 NA Y NA
 7685931 7685932 BAA_1563 BAA_1564 resB resC TRUE 0.969 15.000 0.278 NA Y NA
 7685932 7685933 BAA_1564 BAA_1565 resC resD FALSE 0.129 267.000 0.178 1.000 N NA
 7685933 7685934 BAA_1565 BAA_1566 resD resE TRUE 0.980 0.000 0.511 1.000 Y NA
 7685934 7685935 BAA_1566 BAA_1567 resE   TRUE 0.702 138.000 0.046 0.096   NA
 7685935 7685936 BAA_1567 BAA_1568     FALSE 0.555 85.000 0.108 1.000   NA
 7685940 7685941 BAA_1573 BAA_1574   recQ1 FALSE 0.469 -10.000 0.103 NA   NA
 7685941 7685942 BAA_1574 BAA_1575 recQ1   TRUE 0.710 0.000 0.192 NA   NA
 7685942 7685943 BAA_1575 BAA_1576     TRUE 0.699 23.000 0.320 NA   NA
 7685943 7685944 BAA_1576 BAA_1577     FALSE 0.296 67.000 0.000 NA   NA
 7685944 7685945 BAA_1577 BAA_1578     FALSE 0.233 -33.000 0.000 NA   NA
 7685945 7685946 BAA_1578 BAA_1579     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7685946 7685947 BAA_1579 BAA_1580     TRUE 0.765 78.000 0.417 NA N NA
 7685947 7685948 BAA_1580 BAA_1581   gudB FALSE 0.106 269.000 0.222 NA N NA
 7685948 7685949 BAA_1581 BAA_1582 gudB   FALSE 0.453 79.000 0.233 NA   NA
 7685949 7685950 BAA_1582 BAA_1583     TRUE 0.767 93.000 0.700 NA   NA
 7685950 7685951 BAA_1583 BAA_1584     FALSE 0.330 80.000 0.000 NA   NA
 7685951 7685952 BAA_1584 BAA_1585     FALSE 0.173 170.000 0.000 NA   NA
 7685954 7685955 BAA_1587 BAA_1588 cmk rpsA FALSE 0.066 334.000 0.047 1.000 N NA
 7685955 7685956 BAA_1588 BAA_1589 rpsA   TRUE 0.903 13.000 0.061 1.000 N NA
 7685958 7685959 BAA_1591 BAA_1592     TRUE 0.749 -7.000 0.567 NA   NA
 7685959 7685960 BAA_1592 BAA_1593     TRUE 0.842 -3.000 0.633 NA   NA
 7685960 7685961 BAA_1593 BAA_1594   engA FALSE 0.555 125.000 0.014 NA   NA
 7685961 7685962 BAA_1594 BAA_1595 engA gpsA TRUE 0.736 19.000 0.068 1.000   NA
 7685962 7685963 BAA_1595 BAA_1596 gpsA   FALSE 0.580 117.000 0.039 NA   NA
 7685963 7685964 BAA_1596 BAA_1597     FALSE 0.024 267.000 0.000 NA   NA
 7685964 7685965 BAA_1597 BAA_1598     TRUE 0.719 65.000 0.771 NA   NA
 7685965 7685966 BAA_1598 BAA_1599   spoIVA FALSE 0.051 243.000 0.081 NA   NA
 7685966 7685967 BAA_1599 BAA_1600 spoIVA hup1 FALSE 0.016 299.000 0.000 NA   NA
 7685967 7685968 BAA_1600 BAA_1601 hup1 folE TRUE 0.848 121.000 0.154 1.000 N NA
 7685968 7685969 BAA_1601 BAA_1602 folE   FALSE 0.059 261.000 0.114 1.000   NA
 7685969 7685970 BAA_1602 BAA_1603   menG TRUE 0.840 30.000 0.708 1.000   NA
 7685970 7685971 BAA_1603 BAA_1604 menG hepT TRUE 0.957 32.000 0.476 1.000 Y NA
 7685971 7685972 BAA_1604 BAA_1605 hepT   TRUE 0.841 125.000 0.054 1.000 N NA
 7685972 7685973 BAA_1605 BAA_1606   aroC1 FALSE 0.113 271.000 0.002 1.000 N NA
 7685973 7685974 BAA_1606 BAA_1607 aroC1 aroB TRUE 0.978 0.000 0.110 0.001 Y NA
 7685974 7685975 BAA_1607 BAA_1608 aroB hisC1 TRUE 0.947 132.000 0.009 1.000 Y NA
 7685975 7685976 BAA_1608 BAA_1609 hisC1   FALSE 0.023 313.000 0.000 1.000   NA
 7685976 7685977 BAA_1609 BAA_1610     FALSE 0.533 74.000 0.375 NA   NA
 7685977 7685978 BAA_1610 BAA_1611     FALSE 0.629 154.000 0.583 NA   NA
 7685978 7685979 BAA_1611 BAA_1612   qcrA TRUE 0.702 144.000 0.540 NA   NA
 7685979 7685980 BAA_1612 BAA_1613 qcrA qcrB TRUE 0.903 1.000 0.447 0.034   NA
 7685980 7685981 BAA_1613 BAA_1614 qcrB qcrC FALSE 0.628 44.000 0.095 0.034   NA
 7685981 7685982 BAA_1614 BAA_1615 qcrC   FALSE 0.593 111.000 0.069 NA   NA
 7685982 7685983 BAA_1615 BAA_1616     FALSE 0.576 26.000 0.104 NA   NA
 7685983 7685984 BAA_1616 BAA_1617     FALSE 0.583 108.000 0.104 NA   NA
 7685984 7685985 BAA_1617 BAA_1618     FALSE 0.351 -22.000 0.050 NA   NA
 7685985 7685986 BAA_1618 BAA_1619     FALSE 0.502 102.000 0.020 NA   NA
 7685988 7685989 BAA_1621 BAA_1622   dapB TRUE 0.692 0.000 0.044 NA   NA
 7685989 7685990 BAA_1622 BAA_1623 dapB mgsA TRUE 0.918 15.000 0.044 0.037 N NA
 7685990 7685991 BAA_1623 BAA_1624 mgsA   TRUE 0.723 12.000 0.081 NA   NA
 7685991 7685992 BAA_1624 BAA_1625     TRUE 0.649 -3.000 0.210 NA   NA
 7685992 7685993 BAA_1625 BAA_1626     TRUE 0.744 -13.000 0.126 1.000 N NA
 7685993 7685994 BAA_1626 BAA_1627   birA TRUE 0.733 -15.000 0.134 1.000 N NA
 7685996 7685997 BAA_1629 BAA_1630 panB panC TRUE 0.976 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 7685997 7685998 BAA_1630 BAA_1631 panC panD TRUE 0.977 13.000 0.342 1.000 Y NA
 7685998 7685999 BAA_1631 BAA_1632 panD   TRUE 0.834 129.000 0.053 1.000 N NA
 7685999 7686000 BAA_1632 BAA_1633     FALSE 0.046 251.000 0.056 NA   NA
 7686000 7686001 BAA_1633 BAA_1634     TRUE 0.795 8.000 0.289 NA   NA
 7686001 7686002 BAA_1634 BAA_1635   aspB TRUE 0.761 19.000 0.367 NA   NA
 7686002 7686003 BAA_1635 BAA_1636 aspB dnaD TRUE 0.814 122.000 0.072 NA N NA
 7686003 7686004 BAA_1636 BAA_1637 dnaD nth TRUE 0.964 16.000 0.075 NA Y NA
 7686004 7686005 BAA_1637 BAA_1638 nth   TRUE 0.725 4.000 0.034 NA   NA
 7686006 7686007 BAA_1639 BAA_1640   recU FALSE 0.485 66.000 0.056 1.000   NA
 7686010 7686011 BAA_1643 BAA_1644     TRUE 0.694 16.000 0.148 NA   NA
 7686013 7686014 BAA_1646 BAA_1647     FALSE 0.462 155.000 0.318 NA   NA
 7686014 7686015 BAA_1647 BAA_1648     FALSE 0.393 56.000 0.074 NA   NA
 7686015 7686016 BAA_1648 BAA_1649     TRUE 0.735 98.000 0.579 NA   NA
 7686016 7686017 BAA_1649 BAA_1650     FALSE 0.354 86.000 0.000 NA   NA
 7686017 7686018 BAA_1650 BAA_1651     FALSE 0.146 178.000 0.000 NA   NA
 7686018 7686019 BAA_1651 BAA_1652     FALSE 0.365 62.000 0.014 NA   NA
 7686019 7686020 BAA_1652 BAA_1653     FALSE 0.572 138.000 0.250 NA   NA
 7686020 7686021 BAA_1653 BAA_1654     TRUE 0.835 106.000 0.118 1.000 N NA
 7686021 7686022 BAA_1654 BAA_1655     FALSE 0.436 46.000 0.000 1.000   NA
 7686024 7686025 BAA_1657 BAA_1659 maP2   FALSE 0.119 198.000 0.115 NA   NA
 7686025 7686026 BAA_1659 BAA_1660   xpt TRUE 0.669 15.000 0.014 NA   NA
 7686026 7686027 BAA_1660 BAA_1661 xpt pbuX TRUE 0.976 4.000 0.056 1.000 Y NA
 7686029 7686030 BAA_1663 BAA_1664     FALSE 0.087 195.000 0.000 NA   NA
 7686032 7686033 BAA_1666 BAA_1667     FALSE 0.619 22.000 0.069 NA   NA
 7686033 7686034 BAA_1667 BAA_1668     TRUE 0.724 3.000 0.046 NA   NA
 7686034 7686035 BAA_1668 BAA_1669     FALSE 0.485 117.000 0.000 NA   NA
 7686035 7686036 BAA_1669 BAA_1670     FALSE 0.515 22.000 0.000 NA   NA
 7686038 7686039 BAA_1672 BAA_1673     FALSE 0.361 88.000 0.000 NA   NA
 7686039 7686040 BAA_1673 BAA_1674     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686040 7686041 BAA_1674 BAA_1676     FALSE 0.005 693.000 0.000 NA   NA
 7686041 7686042 BAA_1676 BAA_1677     TRUE 0.666 131.000 0.157 1.000   NA
 7686042 7686043 BAA_1677 BAA_1678     FALSE 0.014 357.000 0.039 NA   NA
 7686043 7686044 BAA_1678 BAA_1679     FALSE 0.012 337.000 0.000 NA   NA
 7686044 7686045 BAA_1679 BAA_1680     TRUE 0.957 1.000 0.750 1.000 N NA
 7686045 7686046 BAA_1680 BAA_1681     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7686046 7686047 BAA_1681 BAA_1682     FALSE 0.159 174.000 0.000 NA   NA
 7686047 7686048 BAA_1682 BAA_1683     FALSE 0.551 19.000 0.000 NA   NA
 7686048 7686049 BAA_1683 BAA_1684     TRUE 0.703 43.000 0.625 NA   NA
 7686049 7686050 BAA_1684 BAA_1685     TRUE 0.870 4.000 0.500 NA   NA
 7686050 7686051 BAA_1685 BAA_1686     FALSE 0.331 -25.000 0.046 NA   NA
 7686051 7686052 BAA_1686 BAA_1687     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686052 7686053 BAA_1687 BAA_1688     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686053 7686054 BAA_1688 BAA_1689     FALSE 0.377 93.000 0.000 NA   NA
 7686059 7686060 BAA_1694 BAA_1695   rnhA TRUE 0.813 8.000 0.133 1.000   NA
 7686060 7686061 BAA_1695 BAA_1696 rnhA   TRUE 0.713 70.000 0.076 1.000 N NA
 7686062 7686063 BAA_1698 BAA_1699     FALSE 0.489 144.000 0.200 NA   NA
 7686063 7686064 BAA_1699 BAA_1700     TRUE 0.894 13.000 0.680 NA   NA
 7686065 7686066 BAA_1701 BAA_1702   cspB1 TRUE 0.814 120.000 0.619 NA   NA
 7686067 7686068 BAA_1703 BAA_1704     FALSE 0.489 71.000 0.308 NA   NA
 7686068 7686069 BAA_1704 BAA_1705     TRUE 0.811 20.000 0.500 NA   NA
 7686069 7686070 BAA_1705 BAA_1706     FALSE 0.484 80.000 0.259 NA   NA
 7686070 7686071 BAA_1706 BAA_1707     FALSE 0.044 224.000 0.000 NA   NA
 7686071 7686072 BAA_1707 BAA_1708     TRUE 0.853 3.000 0.455 NA   NA
 7686072 7686073 BAA_1708 BAA_1709     FALSE 0.293 187.000 0.364 1.000   NA
 7686073 7686074 BAA_1709 BAA_1710     TRUE 0.635 85.000 0.444 NA   NA
 7686076 7686077 BAA_1712 BAA_1713     FALSE 0.478 124.000 0.000 NA   NA
 7686077 7686078 BAA_1713 BAA_1714     TRUE 0.820 139.000 0.250 1.000 N NA
 7686080 7686081 BAA_1716 BAA_1717     FALSE 0.304 -37.000 0.100 NA   NA
 7686081 7686082 BAA_1717 BAA_1718     FALSE 0.543 146.000 0.300 NA   NA
 7686082 7686083 BAA_1718 BAA_1719     FALSE 0.035 273.000 0.143 NA   NA
 7686083 7686084 BAA_1719 BAA_1720     FALSE 0.412 51.000 0.190 NA   NA
 7686085 7686086 BAA_1721 BAA_1722     FALSE 0.566 125.000 0.031 NA   NA
 7686086 7686087 BAA_1722 BAA_1723     TRUE 0.739 20.000 0.333 NA   NA
 7686087 7686088 BAA_1723 BAA_1724     FALSE 0.579 129.000 0.118 NA   NA
 7686088 7686089 BAA_1724 BAA_1725     TRUE 0.748 8.000 0.147 NA   NA
 7686089 7686090 BAA_1725 BAA_1726     FALSE 0.424 167.000 0.444 NA   NA
 7686091 7686092 BAA_1727 BAA_1728   hfq1 TRUE 0.726 54.000 0.778 NA   NA
 7686094 7686095 BAA_1730 BAA_1731     FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7686095 7686096 BAA_1731 BAA_1732     TRUE 0.722 151.000 0.143 1.000 N NA
 7686096 7686097 BAA_1732 BAA_1733     FALSE 0.459 130.000 0.000 NA   NA
 7686097 7686098 BAA_1733 BAA_1734     FALSE 0.240 -30.000 0.000 NA   NA
 7686098 7686099 BAA_1734 BAA_1735     FALSE 0.159 174.000 0.000 NA   NA
 7686099 7686100 BAA_1735 BAA_1736     FALSE 0.532 30.000 0.042 NA   NA
 7686100 7686101 BAA_1736 BAA_1737     TRUE 0.854 28.000 0.889 NA   NA
 7686102 7686103 BAA_1738 BAA_1739 cheR   FALSE 0.320 45.000 0.000 NA   NA
 7686104 7686105 BAA_1740 BAA_1741     TRUE 0.669 17.000 0.056 NA   NA
 7686105 7686106 BAA_1741 BAA_1742     TRUE 0.656 18.000 0.045 NA   NA
 7686106 7686107 BAA_1742 BAA_1743     FALSE 0.064 205.000 0.000 NA   NA
 7686107 7686108 BAA_1743 BAA_1744     FALSE 0.217 -40.000 0.000 NA   NA
 7686108 7686109 BAA_1744 BAA_1745     FALSE 0.540 20.000 0.000 NA   NA
 7686109 7686110 BAA_1745 BAA_1746     TRUE 0.963 23.000 0.000 0.001 Y NA
 7686110 7686111 BAA_1746 BAA_1747     FALSE 0.361 -10.000 0.000 NA   NA
 7686111 7686112 BAA_1747 BAA_1748   flgB FALSE 0.009 370.000 0.000 NA   NA
 7686112 7686113 BAA_1748 BAA_1749 flgB flgC TRUE 0.985 21.000 0.804 0.002 Y NA
 7686113 7686114 BAA_1749 BAA_1750 flgC   TRUE 0.974 17.000 0.068 0.002 Y NA
 7686114 7686115 BAA_1750 BAA_1751     FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7686115 7686116 BAA_1751 BAA_1752     FALSE 0.387 36.000 0.000 NA   NA
 7686116 7686117 BAA_1752 BAA_1753   fliG FALSE 0.604 14.000 0.000 NA   NA
 7686117 7686118 BAA_1753 BAA_1754 fliG   FALSE 0.621 -13.000 0.471 NA   NA
 7686118 7686119 BAA_1754 BAA_1755     TRUE 0.645 -3.000 0.129 NA   NA
 7686119 7686120 BAA_1755 BAA_1756     FALSE 0.485 117.000 0.000 NA   NA
 7686120 7686121 BAA_1756 BAA_1757     FALSE 0.361 39.000 0.000 NA   NA
 7686121 7686122 BAA_1757 BAA_1758     TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7686122 7686123 BAA_1758 BAA_1759     FALSE 0.303 51.000 0.000 NA   NA
 7686123 7686124 BAA_1759 BAA_1760     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7686124 7686125 BAA_1760 BAA_1761     FALSE 0.628 22.000 0.117 NA   NA
 7686125 7686126 BAA_1761 BAA_1762     FALSE 0.416 50.000 0.195 NA   NA
 7686126 7686127 BAA_1762 BAA_1763     FALSE 0.015 308.000 0.000 NA   NA
 7686127 7686128 BAA_1763 BAA_1764     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686128 7686129 BAA_1764 BAA_1765     FALSE 0.476 125.000 0.000 NA   NA
 7686129 7686130 BAA_1765 BAA_1766     FALSE 0.380 -9.000 0.000 NA   NA
 7686130 7686131 BAA_1766 BAA_1767     FALSE 0.005 637.000 0.000 NA   NA
 7686131 7686132 BAA_1767 BAA_1768     FALSE 0.004 1079.000 0.000 NA   NA
 7686132 7686133 BAA_1768 BAA_1769     FALSE 0.313 -15.000 0.000 NA   NA
 7686133 7686134 BAA_1769 BAA_1770     FALSE 0.284 -19.000 0.000 NA   NA
 7686134 7686135 BAA_1770 BAA_1771     FALSE 0.078 198.000 0.000 NA   NA
 7686135 7686136 BAA_1771 BAA_1772     FALSE 0.486 116.000 0.000 NA   NA
 7686136 7686137 BAA_1772 BAA_1773     FALSE 0.038 233.000 0.000 NA   NA
 7686137 7686138 BAA_1773 BAA_1774     FALSE 0.004 2476.000 0.000 NA   NA
 7686138 7686139 BAA_1774 BAA_1775     FALSE 0.015 310.000 0.000 NA   NA
 7686139 7686140 BAA_1775 BAA_1776     FALSE 0.080 197.000 0.000 NA   NA
 7686140 7686141 BAA_1776 BAA_1777     FALSE 0.412 101.000 0.000 NA   NA
 7686141 7686142 BAA_1777 BAA_1778     FALSE 0.308 76.000 0.000 NA   NA
 7686142 7686143 BAA_1778 BAA_1779     FALSE 0.014 311.000 0.000 NA   NA
 7686145 7686146 BAA_1781 BAA_1782     FALSE 0.406 100.000 0.000 NA   NA
 7686146 7686147 BAA_1782 BAA_1783     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7686147 7686148 BAA_1783 BAA_1784     FALSE 0.465 26.000 0.000 NA   NA
 7686148 7686149 BAA_1784 BAA_1785     TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7686149 7686150 BAA_1785 BAA_1786     TRUE 0.819 13.000 0.400 NA   NA
 7686150 7686151 BAA_1786 BAA_1787     TRUE 0.633 -3.000 0.073 NA   NA
 7686151 7686152 BAA_1787 BAA_1788     TRUE 0.951 34.000 0.162 0.003 Y NA
 7686152 7686153 BAA_1788 BAA_1789   fliR TRUE 0.974 16.000 0.181 0.087 Y NA
 7686153 7686154 BAA_1789 BAA_1790 fliR   TRUE 0.980 11.000 0.259 0.087 Y NA
 7686154 7686155 BAA_1790 BAA_1791   flhA TRUE 0.965 24.000 0.207 0.003 Y NA
 7686155 7686156 BAA_1791 BAA_1792 flhA   FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7686156 7686157 BAA_1792 BAA_1793     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7686157 7686158 BAA_1793 BAA_1794     FALSE 0.335 43.000 0.000 NA   NA
 7686158 7686159 BAA_1794 BAA_1795     FALSE 0.604 118.000 0.200 NA   NA
 7686159 7686160 BAA_1795 BAA_1796     TRUE 0.852 18.000 0.600 NA   NA
 7686160 7686161 BAA_1796 BAA_1797     TRUE 0.775 -7.000 0.133 NA N NA
 7686161 7686162 BAA_1797 BAA_1798     FALSE 0.603 -9.000 0.338 NA   NA
 7686162 7686163 BAA_1798 BAA_1799     FALSE 0.383 63.000 0.044 NA   NA
 7686163 7686164 BAA_1799 BAA_1800     FALSE 0.554 88.000 0.300 NA   NA
 7686164 7686165 BAA_1800 BAA_1801     TRUE 0.723 -7.000 0.500 NA   NA
 7686166 7686167 BAA_1802 BAA_1803     TRUE 0.798 3.000 0.051 1.000   NA
 7686167 7686168 BAA_1803 BAA_1804     FALSE 0.198 189.000 0.034 1.000   NA
 7686168 7686169 BAA_1804 BAA_1805     FALSE 0.511 67.000 0.231 1.000   NA
 7686170 7686171 BAA_1806 BAA_1807     TRUE 0.781 106.000 0.571 NA   NA
 7686173 7686174 BAA_1809 BAA_1810     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7686174 7686175 BAA_1810 BAA_1811     TRUE 0.988 13.000 0.750 0.030 Y NA
 7686175 7686176 BAA_1811 BAA_1812     TRUE 0.911 0.000 0.278 1.000 N NA
 7686176 7686177 BAA_1812 BAA_1813     TRUE 0.664 21.000 0.241 NA   NA
 7686179 7686180 BAA_1815 BAA_1816     FALSE 0.436 160.000 0.375 NA   NA
 7686180 7686181 BAA_1816 BAA_1817     TRUE 0.771 102.000 0.500 1.000   NA
 7686181 7686182 BAA_1817 BAA_1818     FALSE 0.413 51.000 0.143 NA   NA
 7686182 7686183 BAA_1818 BAA_1819     FALSE 0.331 159.000 0.143 NA   NA
 7686183 7686184 BAA_1819 BAA_1820     FALSE 0.604 90.000 0.368 NA   NA
 7686185 7686186 BAA_1821 BAA_1822     FALSE 0.412 33.000 0.000 NA   NA
 7686186 7686187 BAA_1822 BAA_1823     FALSE 0.300 -16.000 0.000 NA   NA
 7686187 7686188 BAA_1823 BAA_1824     FALSE 0.227 -34.000 0.000 NA   NA
 7686191 7686192 BAA_1827 BAA_1828     TRUE 0.845 -3.000 0.643 NA   NA
 7686194 7686195 BAA_1830 BAA_1831     FALSE 0.128 194.000 0.049 NA   NA
 7686196 7686197 BAA_1832 BAA_1833     TRUE 0.889 17.000 0.194 1.000 N NA
 7686197 7686198 BAA_1833 BAA_1834     FALSE 0.178 183.000 0.097 NA   NA
 7686199 7686200 BAA_1835 BAA_1836     TRUE 0.901 14.000 0.750 NA   NA
 7686200 7686201 BAA_1836 BAA_1837     FALSE 0.606 113.000 0.125 NA   NA
 7686201 7686202 BAA_1837 BAA_1838     FALSE 0.379 94.000 0.000 NA   NA
 7686202 7686203 BAA_1838 BAA_1839   nhaC2 FALSE 0.419 102.000 0.000 NA   NA
 7686203 7686204 BAA_1839 BAA_1840 nhaC2 fumC FALSE 0.378 256.000 0.003 1.000 Y NA
 7686205 7686206 BAA_1841 BAA_1842     FALSE 0.039 231.000 0.000 NA   NA
 7686207 7686208 BAA_1843 BAA_1844     FALSE 0.398 99.000 0.000 NA   NA
 7686208 7686209 BAA_1844 BAA_1845     FALSE 0.456 27.000 0.000 NA   NA
 7686211 7686212 BAA_1847 BAA_1848     FALSE 0.589 108.000 0.125 NA   NA
 7686212 7686213 BAA_1848 BAA_1849     TRUE 0.906 5.000 0.250 NA N NA
 7686213 7686214 BAA_1849 BAA_1850   ccdA1 TRUE 0.892 54.000 0.171 NA Y NA
 7686214 7686215 BAA_1850 BAA_1851 ccdA1   TRUE 0.966 19.000 0.241 1.000 Y NA
 7686215 7686216 BAA_1851 BAA_1852     TRUE 0.728 18.000 0.011 1.000   NA
 7686218 7686219 BAA_1854 BAA_1855     TRUE 0.638 3.000 0.000 NA   NA
 7686219 7686220 BAA_1855 BAA_1856   dsdA FALSE 0.089 194.000 0.000 NA   NA
 7686220 7686221 BAA_1856 BAA_1857 dsdA   FALSE 0.452 146.000 0.065 NA   NA
 7686222 7686223 BAA_1858 BAA_1859     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686223 7686224 BAA_1859 BAA_1860     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686224 7686225 BAA_1860 BAA_1861     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686226 7686227 BAA_1862 BAA_1863     TRUE 0.991 5.000 0.857 0.017 Y NA
 7686227 7686228 BAA_1863 BAA_1864     TRUE 0.932 118.000 0.667 0.092 N NA
 7686228 7686229 BAA_1864 BAA_1865     TRUE 0.752 38.000 0.250 NA N NA
 7686229 7686230 BAA_1865 BAA_1866     TRUE 0.971 2.000 0.227 NA Y NA
 7686230 7686231 BAA_1866 BAA_1867     TRUE 0.830 105.000 0.160 1.000 N NA
 7686233 7686234 BAA_1869 BAA_1870   aspA2 TRUE 0.920 25.000 0.700 1.000 N NA
 7686234 7686235 BAA_1870 BAA_1871 aspA2 malS TRUE 0.828 76.000 0.583 1.000 N NA
 7686235 7686236 BAA_1871 BAA_1872 malS   TRUE 0.671 75.000 0.500 1.000   NA
 7686236 7686237 BAA_1872 BAA_1873     TRUE 0.908 3.000 0.600 1.000   NA
 7686237 7686238 BAA_1873 BAA_1874     TRUE 0.955 118.000 0.113 1.000 Y NA
 7686240 7686241 BAA_1876 BAA_1877 asnA   FALSE 0.388 142.000 0.000 NA   NA
 7686241 7686242 BAA_1877 BAA_1878     FALSE 0.112 186.000 0.000 NA   NA
 7686243 7686244 BAA_1879 BAA_1880   dapG1 FALSE 0.010 350.000 0.000 NA   NA
 7686245 7686246 BAA_1882 BAA_1883     FALSE 0.457 131.000 0.000 NA   NA
 7686246 7686247 BAA_1883 BAA_1884     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7686247 7686248 BAA_1884 BAA_1885     TRUE 0.841 6.000 0.400 NA   NA
 7686250 7686251 BAA_1887 BAA_1888     FALSE 0.174 254.000 0.000 0.004 N NA
 7686251 7686252 BAA_1888 BAA_1889     TRUE 0.674 196.000 0.333 NA Y NA
 7686252 7686253 BAA_1889 BAA_1890     FALSE 0.570 29.000 0.222 NA   NA
 7686255 7686256 BAA_1892 BAA_1893     FALSE 0.369 90.000 0.000 NA   NA
 7686256 7686257 BAA_1893 BAA_1894     FALSE 0.025 266.000 0.000 NA   NA
 7686257 7686258 BAA_1894 BAA_1895     FALSE 0.265 -22.000 0.000 NA   NA
 7686260 7686261 BAA_1897 BAA_1898     FALSE 0.010 484.000 0.000 1.000   NA
 7686262 7686263 BAA_1899 BAA_1900     FALSE 0.122 183.000 0.000 NA   NA
 7686264 7686265 BAA_1901 BAA_1902 fsR cysK2 TRUE 0.892 11.000 0.059 NA N NA
 7686265 7686266 BAA_1902 BAA_1903 cysK2   FALSE 0.519 77.000 0.143 1.000   NA
 7686266 7686267 BAA_1903 BAA_1904     TRUE 0.790 93.000 0.778 NA   NA
 7686271 7686272 BAA_1908 BAA_1909     FALSE 0.309 181.000 0.412 NA   NA
 7686272 7686273 BAA_1909 BAA_1910     TRUE 0.794 11.000 0.300 NA   NA
 7686273 7686274 BAA_1910 BAA_1911     FALSE 0.409 -16.000 0.188 NA   NA
 7686274 7686275 BAA_1911 BAA_1912     FALSE 0.006 464.000 0.000 NA   NA
 7686277 7686278 BAA_1914 BAA_1915     FALSE 0.107 187.000 0.000 NA   NA
 7686279 7686280 BAA_1916 BAA_1917 msrA1   TRUE 0.783 92.000 0.194 1.000 N NA
 7686281 7686282 BAA_1918 BAA_1919 ilvE2 ilvB2 TRUE 0.956 23.000 0.017 1.000 Y NA
 7686282 7686283 BAA_1919 BAA_1920 ilvB2   TRUE 0.808 -3.000 0.006 0.001   NA
 7686283 7686284 BAA_1920 BAA_1921   ilvC2 TRUE 0.751 15.000 0.003 1.000   NA
 7686284 7686285 BAA_1921 BAA_1922 ilvC2 ilvD TRUE 0.927 47.000 0.022 0.002 Y NA
 7686285 7686286 BAA_1922 BAA_1923 ilvD ilvA TRUE 0.940 32.000 0.012 1.000 Y NA
 7686288 7686289 BAA_1925 BAA_1926     TRUE 0.669 16.000 0.032 NA   NA
 7686289 7686290 BAA_1926 BAA_1927     FALSE 0.333 168.000 0.075 1.000   NA
 7686292 7686293 BAA_1929 BAA_1930     FALSE 0.007 425.000 0.000 NA   NA
 7686293 7686294 BAA_1930 BAA_1931     TRUE 0.795 128.000 0.588 NA   NA
 7686294 7686295 BAA_1931 BAA_1932     FALSE 0.092 211.000 0.000 1.000   NA
 7686295 7686296 BAA_1932 BAA_1933     FALSE 0.569 28.000 0.207 NA   NA
 7686296 7686297 BAA_1933 BAA_1934     FALSE 0.394 72.000 0.069 NA   NA
 7686299 7686300 BAA_1936 BAA_1937     FALSE 0.005 572.000 0.000 NA   NA
 7686300 7686301 BAA_1937 BAA_1938     FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 7686301 7686302 BAA_1938 BAA_1939     TRUE 0.654 135.000 0.333 NA   NA
 7686302 7686303 BAA_1939 BAA_1940     FALSE 0.395 67.000 0.095 NA   NA
 7686303 7686304 BAA_1940 BAA_1941     FALSE 0.047 288.000 0.000 0.068   NA
 7686306 7686307 BAA_1943 BAA_1944     FALSE 0.096 191.000 0.000 NA   NA
 7686307 7686308 BAA_1944 BAA_1945     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686308 7686309 BAA_1945 BAA_1946     FALSE 0.020 282.000 0.000 NA   NA
 7686315 7686316 BAA_1953 BAA_1954     FALSE 0.300 73.000 0.000 NA   NA
 7686316 7686317 BAA_1954 BAA_1955     FALSE 0.005 594.000 0.000 NA   NA
 7686317 7686318 BAA_1955 BAA_1956     TRUE 0.833 32.000 0.500 0.002   NA
 7686318 7686319 BAA_1956 BAA_1957     FALSE 0.472 108.000 0.000 NA   NA
 7686319 7686320 BAA_1957 BAA_1958     FALSE 0.007 396.000 0.000 NA   NA
 7686320 7686321 BAA_1958 BAA_1959     FALSE 0.046 358.000 0.000 1.000 N NA
 7686321 7686322 BAA_1959 BAA_1960   deoC FALSE 0.084 306.000 0.077 1.000 N NA
 7686322 7686323 BAA_1960 BAA_1961 deoC   TRUE 0.942 103.000 0.026 1.000 Y NA
 7686323 7686324 BAA_1961 BAA_1962   pyn1 TRUE 0.951 25.000 0.031 1.000 Y NA
 7686324 7686325 BAA_1962 BAA_1963 pyn1 cdd1 TRUE 0.936 34.000 0.031 1.000 Y NA
 7686325 7686326 BAA_1963 BAA_1964 cdd1   FALSE 0.342 42.000 0.000 NA   NA
 7686329 7686330 BAA_1967 BAA_1968     TRUE 0.757 52.000 0.750 1.000   NA
 7686331 7686332 BAA_1969 BAA_1970     TRUE 0.842 118.000 0.027 1.000 N NA
 7686332 7686333 BAA_1970 BAA_1971     FALSE 0.024 606.000 0.000 1.000 N NA
 7686335 7686336 BAA_1973 BAA_1974 topB2   FALSE 0.035 269.000 0.065 NA   NA
 7686338 7686339 BAA_1976 BAA_1977     FALSE 0.035 240.000 0.000 NA   NA
 7686339 7686340 BAA_1977 BAA_1978   brnQ FALSE 0.313 -15.000 0.000 NA   NA
 7686340 7686341 BAA_1978 BAA_1979 brnQ   FALSE 0.346 84.000 0.000 NA   NA
 7686341 7686342 BAA_1979 BAA_1980     FALSE 0.299 54.000 0.000 NA   NA
 7686342 7686343 BAA_1980 BAA_1982     FALSE 0.490 112.000 0.000 NA   NA
 7686343 7686344 BAA_1982 BAA_1983     TRUE 0.812 113.000 0.600 NA   NA
 7686345 7686346 BAA_1984 BAA_1985     FALSE 0.162 187.000 0.158 NA   NA
 7686347 7686348 BAA_1986 BAA_1987     TRUE 0.957 121.000 0.389 NA Y NA
 7686348 7686349 BAA_1987 BAA_1988     TRUE 0.674 72.000 0.158 NA N NA
 7686349 7686350 BAA_1988 BAA_1989     FALSE 0.599 58.000 0.123 0.032   NA
 7686350 7686351 BAA_1989 BAA_1990     TRUE 0.683 127.000 0.333 NA   NA
 7686351 7686352 BAA_1990 BAA_1991     FALSE 0.607 112.000 0.128 NA   NA
 7686352 7686353 BAA_1991 BAA_1992     FALSE 0.209 179.000 0.128 NA   NA
 7686355 7686356 BAA_1994 BAA_1995     FALSE 0.607 104.000 0.273 NA   NA
 7686358 7686359 BAA_1997 BAA_1998     TRUE 0.903 13.000 0.052 1.000 N NA
 7686359 7686360 BAA_1998 BAA_1999     TRUE 0.983 5.000 0.333 0.068 Y NA
 7686360 7686361 BAA_1999 BAA_2000     TRUE 0.966 15.000 0.121 NA Y NA
 7686361 7686362 BAA_2000 BAA_2001     FALSE 0.405 182.000 0.054 NA N NA
 7686362 7686363 BAA_2001 BAA_2002     TRUE 0.956 90.000 0.750 NA Y NA
 7686363 7686364 BAA_2002 BAA_2003     TRUE 0.947 -22.000 0.708 0.023 Y NA
 7686364 7686365 BAA_2003 BAA_2004     TRUE 0.978 22.000 0.746 1.000 Y NA
 7686365 7686366 BAA_2004 BAA_2005     TRUE 0.954 50.000 0.687 0.029 Y NA
 7686368 7686369 BAA_2007 BAA_2008     FALSE 0.489 37.000 0.111 NA   NA
 7686369 7686370 BAA_2008 BAA_2009     TRUE 0.911 2.000 0.647 1.000   NA
 7686370 7686371 BAA_2009 BAA_2010     TRUE 0.639 94.000 0.286 1.000   NA
 7686371 7686372 BAA_2010 BAA_2011     TRUE 0.833 118.000 0.259 NA N NA
 7686372 7686373 BAA_2011 BAA_2012   cydA1 FALSE 0.077 618.000 0.000 NA Y NA
 7686373 7686374 BAA_2012 BAA_2013 cydA1 cydB1 TRUE 0.928 -13.000 0.051 0.032 Y NA
 7686374 7686375 BAA_2013 BAA_2014 cydB1   TRUE 0.972 0.000 0.151 1.000 Y NA
 7686375 7686376 BAA_2014 BAA_2015     TRUE 0.980 3.000 0.168 0.004 Y NA
 7686376 7686377 BAA_2015 BAA_2016     FALSE 0.018 290.000 0.000 NA   NA
 7686377 7686378 BAA_2016 BAA_2017     FALSE 0.599 91.000 0.353 NA   NA
 7686380 7686381 BAA_2019 BAA_2020     FALSE 0.054 245.000 0.000 1.000   NA
 7686381 7686382 BAA_2020 BAA_2021     FALSE 0.004 916.000 0.000 NA   NA
 7686384 7686385 BAA_2023 BAA_2024     FALSE 0.515 22.000 0.000 NA   NA
 7686385 7686386 BAA_2024 BAA_2025     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7686386 7686387 BAA_2025 BAA_2026     TRUE 0.962 30.000 0.538 1.000 Y NA
 7686389 7686390 BAA_2028 BAA_2029     FALSE 0.485 117.000 0.000 NA   NA
 7686390 7686391 BAA_2029 BAA_2030     FALSE 0.397 141.000 0.000 NA   NA
 7686391 7686392 BAA_2030 BAA_2031     FALSE 0.603 118.000 0.136 NA   NA
 7686392 7686393 BAA_2031 BAA_2032     FALSE 0.297 69.000 0.000 NA   NA
 7686393 7686394 BAA_2032 BAA_2033     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7686396 7686397 BAA_2035 BAA_2036   hom1 FALSE 0.007 964.000 0.000 1.000   NA
 7686397 7686398 BAA_2036 BAA_2037 hom1 thrC TRUE 0.939 -7.000 0.021 1.000 Y NA
 7686398 7686399 BAA_2037 BAA_2038 thrC thrB TRUE 0.962 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 7686399 7686400 BAA_2038 BAA_2039 thrB   FALSE 0.560 120.000 0.011 NA   NA
 7686400 7686401 BAA_2039 BAA_2040     FALSE 0.050 217.000 0.000 NA   NA
 7686401 7686402 BAA_2040 BAA_2041     FALSE 0.064 205.000 0.000 NA   NA
 7686402 7686403 BAA_2041 BAA_2042     FALSE 0.328 160.000 0.222 NA   NA
 7686403 7686404 BAA_2042 BAA_2043     TRUE 0.719 11.000 0.038 NA   NA
 7686404 7686405 BAA_2043 BAA_2044     TRUE 0.921 -21.000 0.472 1.000 Y NA
 7686405 7686406 BAA_2044 BAA_2045     TRUE 0.808 101.000 0.129 1.000 N NA
 7686406 7686407 BAA_2045 BAA_2046     TRUE 0.699 15.000 0.111 NA   NA
 7686407 7686408 BAA_2046 BAA_2047     FALSE 0.315 160.000 0.111 NA   NA
 7686408 7686409 BAA_2047 BAA_2048     FALSE 0.591 98.000 0.049 1.000   NA
 7686409 7686410 BAA_2048 BAA_2049   asbA FALSE 0.032 285.000 0.000 1.000   NA
 7686410 7686411 BAA_2049 BAA_2050 asbA asbB TRUE 0.925 65.000 0.163 0.001 Y NA
 7686411 7686412 BAA_2050 BAA_2051 asbB asbC TRUE 0.925 -13.000 0.310 1.000 Y NA
 7686412 7686413 BAA_2051 BAA_2052 asbC asbD FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686413 7686414 BAA_2052 BAA_2053 asbD asbE FALSE 0.486 24.000 0.000 NA   NA
 7686414 7686415 BAA_2053 BAA_2054 asbE asbF TRUE 0.631 38.000 0.412 NA   NA
 7686415 7686416 BAA_2054 BAA_2055 asbF   FALSE 0.593 126.000 0.137 NA   NA
 7686416 7686417 BAA_2055 BAA_2056     FALSE 0.186 167.000 0.000 NA   NA
 7686417 7686418 BAA_2056 BAA_2057     FALSE 0.319 78.000 0.000 NA   NA
 7686418 7686419 BAA_2057 BAA_2058     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686422 7686423 BAA_2061 BAA_2062     TRUE 0.769 91.000 0.714 NA   NA
 7686424 7686425 BAA_2063 BAA_2064     FALSE 0.589 146.000 0.375 NA   NA
 7686425 7686426 BAA_2064 BAA_2065     FALSE 0.436 104.000 0.000 NA   NA
 7686426 7686427 BAA_2065 BAA_2066     FALSE 0.422 32.000 0.000 NA   NA
 7686429 7686430 BAA_2068 BAA_2069     FALSE 0.427 103.000 0.000 NA   NA
 7686430 7686431 BAA_2069 BAA_2070     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686431 7686432 BAA_2070 BAA_2071     FALSE 0.485 117.000 0.000 NA   NA
 7686432 7686433 BAA_2071 BAA_2072     FALSE 0.078 275.000 0.000 NA N NA
 7686435 7686436 BAA_2074 BAA_2075     FALSE 0.384 203.000 0.429 1.000 N NA
 7686437 7686438 BAA_2076 BAA_2077     TRUE 0.796 85.000 0.889 NA   NA
 7686439 7686440 BAA_2078 BAA_2079   rsgA_1 FALSE 0.196 180.000 0.091 NA   NA
 7686440 7686441 BAA_2079 BAA_2080 rsgA_1   FALSE 0.103 205.000 0.000 1.000   NA
 7686441 7686442 BAA_2080 BAA_2081     FALSE 0.307 197.000 0.667 NA   NA
 7686442 7686443 BAA_2081 BAA_2082     FALSE 0.023 269.000 0.000 NA   NA
 7686445 7686446 BAA_2084 BAA_2085 dps1   FALSE 0.579 107.000 0.111 NA   NA
 7686446 7686447 BAA_2085 BAA_2086     FALSE 0.043 225.000 0.000 NA   NA
 7686448 7686449 BAA_2087 BAA_2088     TRUE 0.739 106.000 0.467 NA   NA
 7686450 7686451 BAA_2089 BAA_2090     TRUE 0.862 85.000 0.636 1.000 N NA
 7686455 7686456 BAA_2094 BAA_2095     FALSE 0.217 -40.000 0.000 NA   NA
 7686458 7686459 BAA_2097 BAA_2098     FALSE 0.005 566.000 0.000 NA   NA
 7686459 7686460 BAA_2098 BAA_2099     FALSE 0.004 2229.000 0.000 NA   NA
 7686464 7686465 BAA_2103 BAA_2104     TRUE 0.756 116.000 0.333 1.000   NA
 7686467 7686468 BAA_2106 BAA_2107 ogt1   FALSE 0.482 95.000 0.054 NA   NA
 7686468 7686469 BAA_2107 BAA_2108     FALSE 0.498 77.000 0.296 NA   NA
 7686469 7686470 BAA_2108 BAA_2109   fosB1 TRUE 0.891 59.000 0.129 NA Y NA
 7686470 7686471 BAA_2109 BAA_2110 fosB1   FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7686471 7686472 BAA_2110 BAA_2111     TRUE 0.728 13.000 0.000 1.000   NA
 7686474 7686475 BAA_2113 BAA_2114 cotH   TRUE 0.799 106.000 0.062 NA N NA
 7686475 7686476 BAA_2114 BAA_2115     FALSE 0.552 105.000 0.062 NA   NA
 7686476 7686477 BAA_2115 BAA_2116     TRUE 0.732 103.000 0.500 NA   NA
 7686477 7686478 BAA_2116 BAA_2117     FALSE 0.221 185.000 0.033 1.000   NA
 7686478 7686479 BAA_2117 BAA_2118     FALSE 0.111 199.000 0.053 NA   NA
 7686479 7686480 BAA_2118 BAA_2119     TRUE 0.925 4.000 0.841 NA   NA
 7686480 7686481 BAA_2119 BAA_2120     FALSE 0.128 196.000 0.195 NA   NA
 7686481 7686482 BAA_2120 BAA_2121     FALSE 0.007 421.000 0.000 NA   NA
 7686482 7686483 BAA_2121 BAA_2122     FALSE 0.422 32.000 0.000 NA   NA
 7686483 7686484 BAA_2122 BAA_2123     FALSE 0.404 34.000 0.000 NA   NA
 7686484 7686485 BAA_2123 BAA_2124     FALSE 0.107 187.000 0.000 NA   NA
 7686485 7686486 BAA_2124 BAA_2125     FALSE 0.551 102.000 0.227 NA   NA
 7686487 7686488 BAA_2126 BAA_2127     TRUE 0.711 2.000 0.034 NA   NA
 7686488 7686489 BAA_2127 BAA_2128     FALSE 0.060 209.000 0.000 NA   NA
 7686490 7686491 BAA_2129 BAA_2130   brnQ4 FALSE 0.007 424.000 0.000 NA   NA
 7686491 7686492 BAA_2130 BAA_2131 brnQ4 csaA FALSE 0.477 67.000 0.032 1.000   NA
 7686492 7686493 BAA_2131 BAA_2132 csaA   TRUE 0.649 18.000 0.032 NA   NA
 7686495 7686496 BAA_2134 BAA_2135 spoIIP   FALSE 0.100 224.000 0.214 1.000   NA
 7686496 7686497 BAA_2135 BAA_2136     TRUE 0.947 12.000 0.571 1.000 N NA
 7686497 7686498 BAA_2136 BAA_2137     TRUE 0.798 24.000 0.444 1.000   NA
 7686498 7686499 BAA_2137 BAA_2138     FALSE 0.275 185.000 0.286 1.000   NA
 7686501 7686502 BAA_2140 BAA_2141     TRUE 0.973 3.000 0.259 NA Y NA
 7686502 7686503 BAA_2141 BAA_2142     TRUE 0.831 107.000 0.021