MicrobesOnline Operon Predictions for Bacillus anthracis str. A0248

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7684396 7684397 BAA_0001 BAA_0002 dnaA dnaN1 TRUE 0.809 179.000 0.328 1.000 Y NA
 7684397 7684398 BAA_0002 BAA_0003 dnaN1   TRUE 0.671 128.000 0.103 1.000   NA
 7684398 7684399 BAA_0003 BAA_0004   recF TRUE 0.793 13.000 0.209 1.000   NA
 7684399 7684400 BAA_0004 BAA_0005 recF gyrB TRUE 0.943 39.000 0.249 0.004 Y NA
 7684400 7684401 BAA_0005 BAA_0006 gyrB gyrA TRUE 0.950 89.000 0.306 0.001 Y NA
 7684401 7684402 BAA_0006 BAA_0007 gyrA rrs_1 FALSE 0.024 267.000 0.000 NA   NA
 7684402 7684403 BAA_0007 BAA_0008 rrs_1   FALSE 0.308 150.000 0.000 NA   NA
 7684403 7684404 BAA_0008 BAA_0009     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7684404 7684405 BAA_0009 BAA_0011   rrl_1 FALSE 0.379 94.000 0.000 NA   NA
 7684409 7684410 BAA_0014 BAA_0015 guaB dacA TRUE 0.852 105.000 0.304 1.000 N NA
 7684410 7684411 BAA_0015 BAA_0016 dacA   FALSE 0.597 162.000 0.017 1.000 N NA
 7684411 7684412 BAA_0016 BAA_0017     TRUE 0.971 19.000 0.488 NA Y NA
 7684412 7684413 BAA_0017 BAA_0018   serS FALSE 0.053 328.000 0.010 NA N NA
 7684413 7684414 BAA_0018 BAA_0019 serS   FALSE 0.250 157.000 0.000 NA   NA
 7684414 7684415 BAA_0019 BAA_0020     FALSE 0.186 167.000 0.000 NA   NA
 7684416 7684417 BAA_0021 BAA_0022     TRUE 0.982 3.000 0.255 0.001 Y NA
 7684417 7684418 BAA_0022 BAA_0023     TRUE 0.840 126.000 0.058 1.000 N NA
 7684419 7684420 BAA_0024 BAA_0025   srpB FALSE 0.092 193.000 0.000 NA   NA
 7684420 7684421 BAA_0025 BAA_0026 srpB dnaX FALSE 0.127 182.000 0.000 NA   NA
 7684421 7684422 BAA_0026 BAA_0027 dnaX   FALSE 0.606 23.000 0.071 NA   NA
 7684422 7684423 BAA_0027 BAA_0028   recR TRUE 0.871 15.000 0.604 NA   NA
 7684423 7684424 BAA_0028 BAA_0029 recR   TRUE 0.693 15.000 0.071 NA   NA
 7684424 7684425 BAA_0029 BAA_0030   bofA FALSE 0.140 215.000 0.417 NA   NA
 7684425 7684426 BAA_0030 BAA_0031 bofA rrs_2 FALSE 0.033 244.000 0.000 NA   NA
 7684426 7684427 BAA_0031 BAA_0032 rrs_2   FALSE 0.308 150.000 0.000 NA   NA
 7684427 7684428 BAA_0032 BAA_0033     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7684428 7684429 BAA_0033 BAA_0035   rrl_2 FALSE 0.379 94.000 0.000 NA   NA
 7684431 7684432 BAA_0036 BAA_0037 rrf_2   FALSE 0.096 191.000 0.000 NA   NA
 7684432 7684433 BAA_0037 BAA_0038     FALSE 0.546 72.000 0.400 NA   NA
 7684433 7684434 BAA_0038 BAA_0039   tmk TRUE 0.904 2.000 0.009 1.000 N NA
 7684434 7684435 BAA_0039 BAA_0040 tmk holB TRUE 0.778 36.000 0.009 1.000 N NA
 7684435 7684436 BAA_0040 BAA_0041 holB   TRUE 0.831 6.000 0.372 NA   NA
 7684436 7684437 BAA_0041 BAA_0042     TRUE 0.703 15.000 0.183 NA   NA
 7684437 7684438 BAA_0042 BAA_0043     TRUE 0.687 121.000 0.193 1.000   NA
 7684438 7684439 BAA_0043 BAA_0044     FALSE 0.537 -13.000 0.209 1.000   NA
 7684439 7684440 BAA_0044 BAA_0045     FALSE 0.406 -31.000 0.041 1.000   NA
 7684442 7684443 BAA_0047 BAA_0048 metS   FALSE 0.539 166.000 0.221 NA N NA
 7684443 7684444 BAA_0048 BAA_0049     FALSE 0.511 215.000 0.058 NA Y NA
 7684444 7684445 BAA_0049 BAA_0050   ksgA TRUE 0.869 -3.000 0.093 1.000 N NA
 7684445 7684446 BAA_0050 BAA_0051 ksgA   FALSE 0.572 111.000 0.022 NA   NA
 7684446 7684447 BAA_0051 BAA_0052     FALSE 0.055 239.000 0.116 NA   NA
 7684447 7684448 BAA_0052 BAA_0053   sspF FALSE 0.491 92.000 0.163 NA   NA
 7684448 7684449 BAA_0053 BAA_0054 sspF ispE FALSE 0.157 197.000 0.024 1.000   NA
 7684449 7684450 BAA_0054 BAA_0055 ispE purR TRUE 0.713 55.000 0.062 1.000 N NA
 7684450 7684451 BAA_0055 BAA_0056 purR   FALSE 0.326 -13.000 0.000 NA   NA
 7684451 7684452 BAA_0056 BAA_0057     FALSE 0.572 17.000 0.000 NA   NA
 7684452 7684453 BAA_0057 BAA_0058   spoVG TRUE 0.724 153.000 0.377 NA N NA
 7684453 7684454 BAA_0058 BAA_0059 spoVG glmU FALSE 0.220 323.000 0.014 1.000 Y NA
 7684454 7684455 BAA_0059 BAA_0060 glmU prsA TRUE 0.878 19.000 0.069 1.000 N NA
 7684455 7684456 BAA_0060 BAA_0061 prsA spoVC TRUE 0.909 10.000 0.010 1.000 N NA
 7684456 7684457 BAA_0061 BAA_0062 spoVC   FALSE 0.380 71.000 0.033 NA   NA
 7684457 7684458 BAA_0062 BAA_0063   mfd FALSE 0.551 106.000 0.035 NA   NA
 7684458 7684459 BAA_0063 BAA_0064 mfd spoVT TRUE 0.935 136.000 0.026 NA Y NA
 7684459 7684460 BAA_0064 BAA_0065 spoVT   FALSE 0.062 231.000 0.147 NA   NA
 7684460 7684461 BAA_0065 BAA_0066     TRUE 0.783 13.000 0.058 1.000   NA
 7684461 7684462 BAA_0066 BAA_0067     TRUE 0.768 15.000 0.054 1.000   NA
 7684462 7684463 BAA_0067 BAA_0068   yabP FALSE 0.397 59.000 0.108 NA   NA
 7684463 7684464 BAA_0068 BAA_0069 yabP yabQ TRUE 0.873 -3.000 0.774 NA   NA
 7684464 7684465 BAA_0069 BAA_0070 yabQ divIC1 TRUE 0.634 -3.000 0.074 NA   NA
 7684465 7684466 BAA_0070 BAA_0071 divIC1   TRUE 0.773 88.000 0.134 1.000 N NA
 7684466 7684467 BAA_0071 BAA_0072     FALSE 0.225 160.000 0.000 NA   NA
 7684467 7684468 BAA_0072 BAA_0073     TRUE 0.642 10.000 0.000 NA   NA
 7684468 7684469 BAA_0073 BAA_0074   spoIIE FALSE 0.027 257.000 0.000 NA   NA
 7684469 7684470 BAA_0074 BAA_0075 spoIIE tilS FALSE 0.185 234.000 0.041 1.000 N NA
 7684470 7684471 BAA_0075 BAA_0076 tilS hpt TRUE 0.896 -3.000 0.067 0.046 N NA
 7684471 7684472 BAA_0076 BAA_0077 hpt ftsH TRUE 0.767 86.000 0.192 1.000 N NA
 7684472 7684473 BAA_0077 BAA_0078 ftsH coaX FALSE 0.204 225.000 0.029 1.000 N NA
 7684473 7684474 BAA_0078 BAA_0079 coaX hslO TRUE 0.916 7.000 0.060 1.000 N NA
 7684474 7684475 BAA_0079 BAA_0080 hslO cysK1 TRUE 0.825 105.000 0.053 1.000 N NA
 7684475 7684476 BAA_0080 BAA_0081 cysK1 pabB FALSE 0.517 221.000 0.107 1.000 Y NA
 7684476 7684477 BAA_0081 BAA_0082 pabB pabA TRUE 0.986 6.000 0.452 0.016 Y NA
 7684477 7684478 BAA_0082 BAA_0083 pabA pabC TRUE 0.964 -6.000 0.532 1.000 Y NA
 7684478 7684479 BAA_0083 BAA_0084 pabC folP TRUE 0.982 2.000 0.519 1.000 Y NA
 7684479 7684480 BAA_0084 BAA_0085 folP folB TRUE 0.973 1.000 0.176 1.000 Y NA
 7684480 7684481 BAA_0085 BAA_0086 folB folK TRUE 0.962 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 7684481 7684482 BAA_0086 BAA_0087 folK   FALSE 0.604 -48.000 0.027 1.000 N NA
 7684482 7684483 BAA_0087 BAA_0088     TRUE 0.842 24.000 0.016 1.000 N NA
 7684483 7684484 BAA_0088 BAA_0089   lysS TRUE 0.862 160.000 0.021 1.000 Y NA
 7684484 7684485 BAA_0089 BAA_0090 lysS rrs_3 FALSE 0.007 399.000 0.000 NA   NA
 7684485 7684486 BAA_0090 BAA_0092 rrs_3 rrl_3 FALSE 0.141 179.000 0.000 NA   NA
 7684488 7684489 BAA_0093 BAA_0094 rrf_3 ctsR FALSE 0.062 207.000 0.000 NA   NA
 7684489 7684490 BAA_0094 BAA_0095 ctsR   FALSE 0.501 174.000 0.681 NA   NA
 7684490 7684491 BAA_0095 BAA_0096     TRUE 0.939 5.000 0.848 1.000   NA
 7684491 7684492 BAA_0096 BAA_0097     TRUE 0.895 23.000 0.425 1.000 N NA
 7684492 7684493 BAA_0097 BAA_0098   radA TRUE 0.946 97.000 0.062 0.012 Y NA
 7684493 7684494 BAA_0098 BAA_0099 radA   TRUE 0.745 4.000 0.126 NA   NA
 7684494 7684495 BAA_0099 BAA_0100     FALSE 0.300 161.000 0.088 NA   NA
 7684495 7684496 BAA_0100 BAA_0101   ispD TRUE 0.677 17.000 0.108 NA   NA
 7684496 7684497 BAA_0101 BAA_0102 ispD ispF TRUE 0.965 115.000 0.419 1.000 Y NA
 7684497 7684498 BAA_0102 BAA_0103 ispF gltX TRUE 0.715 72.000 0.076 1.000 N NA
 7684498 7684499 BAA_0103 BAA_0104 gltX cysE FALSE 0.035 433.000 0.008 1.000 N NA
 7684499 7684500 BAA_0104 BAA_0105 cysE cysS TRUE 0.748 -19.000 0.039 0.046 N NA
 7684500 7684501 BAA_0105 BAA_0106 cysS   TRUE 0.807 3.000 0.129 1.000   NA
 7684501 7684502 BAA_0106 BAA_0107     TRUE 0.814 -3.000 0.150 0.003   NA
 7684502 7684503 BAA_0107 BAA_0108     TRUE 0.741 4.000 0.109 NA   NA
 7684503 7684504 BAA_0108 BAA_0109   sigH FALSE 0.518 68.000 0.361 NA   NA
 7684504 7684505 BAA_0109 BAA_0110 sigH secE FALSE 0.068 311.000 0.000 1.000 N NA
 7684505 7684506 BAA_0110 BAA_0111 secE nusG TRUE 0.926 132.000 0.843 1.000 N NA
 7684506 7684507 BAA_0111 BAA_0112 nusG rplK TRUE 0.733 168.000 0.681 1.000 N NA
 7684507 7684508 BAA_0112 BAA_0113 rplK rplA TRUE 0.905 178.000 0.838 0.018 Y NA
 7684508 7684509 BAA_0113 BAA_0115 rplA rplJ FALSE 0.553 233.000 0.302 0.018 Y NA
 7684509 7684510 BAA_0115 BAA_0116 rplJ rplL TRUE 0.961 68.000 0.884 0.014 Y NA
 7684510 7684511 BAA_0116 BAA_0117 rplL   TRUE 0.906 75.000 0.050 1.000 Y NA
 7684511 7684512 BAA_0117 BAA_0118   rpoB FALSE 0.091 293.000 0.008 1.000 N NA
 7684512 7684513 BAA_0118 BAA_0119 rpoB rpoC TRUE 0.972 38.000 0.851 0.001 Y NA
 7684513 7684514 BAA_0119 BAA_0120 rpoC   TRUE 0.818 114.000 0.065 NA N NA
 7684514 7684515 BAA_0120 BAA_0121   rpsL TRUE 0.950 115.000 0.239 NA Y NA
 7684515 7684516 BAA_0121 BAA_0122 rpsL rpsG TRUE 0.957 30.000 0.224 0.003 Y NA
 7684516 7684517 BAA_0122 BAA_0123 rpsG fusA TRUE 0.694 208.000 0.579 1.000 Y NA
 7684517 7684518 BAA_0123 BAA_0124 fusA tuf TRUE 0.972 118.000 0.400 0.001 Y NA
 7684518 7684519 BAA_0124 BAA_0125 tuf rpsJ FALSE 0.159 399.000 0.318 1.000 Y NA
 7684519 7684520 BAA_0125 BAA_0126 rpsJ rplC TRUE 0.960 35.000 0.467 0.018 Y NA
 7684520 7684521 BAA_0126 BAA_0127 rplC rplD TRUE 0.973 26.000 0.544 0.014 Y NA
 7684521 7684522 BAA_0127 BAA_0128 rplD rplW TRUE 0.979 0.000 0.307 0.014 Y NA
 7684522 7684523 BAA_0128 BAA_0129 rplW rplB TRUE 0.978 29.000 0.849 0.018 Y NA
 7684523 7684524 BAA_0129 BAA_0130 rplB rpsS TRUE 0.958 61.000 0.820 0.018 Y NA
 7684524 7684525 BAA_0130 BAA_0131 rpsS rplV TRUE 0.985 18.000 0.769 0.018 Y NA
 7684525 7684526 BAA_0131 BAA_0132 rplV rpsC TRUE 0.989 4.000 0.719 0.018 Y NA
 7684526 7684527 BAA_0132 BAA_0133 rpsC rplP TRUE 0.989 2.000 0.828 0.018 Y NA
 7684527 7684528 BAA_0133 BAA_0134 rplP rpmC TRUE 0.969 -10.000 0.802 0.014 Y NA
 7684528 7684529 BAA_0134 BAA_0135 rpmC rpsQ TRUE 0.984 21.000 0.828 0.014 Y NA
 7684529 7684530 BAA_0135 BAA_0136 rpsQ rplN TRUE 0.963 44.000 0.791 0.018 Y NA
 7684530 7684531 BAA_0136 BAA_0137 rplN rplX TRUE 0.939 39.000 0.071 0.018 Y NA
 7684531 7684532 BAA_0137 BAA_0138 rplX rplE TRUE 0.958 27.000 0.057 0.014 Y NA
 7684532 7684533 BAA_0138 BAA_0139 rplE rpsN TRUE 0.963 34.000 0.496 0.014 Y NA
 7684533 7684534 BAA_0139 BAA_0140 rpsN rpsH TRUE 0.967 30.000 0.473 0.014 Y NA
 7684534 7684535 BAA_0140 BAA_0141 rpsH rplF TRUE 0.975 33.000 0.808 0.014 Y NA
 7684535 7684536 BAA_0141 BAA_0142 rplF rplR TRUE 0.976 32.000 0.815 0.014 Y NA
 7684536 7684537 BAA_0142 BAA_0143 rplR rpsE TRUE 0.983 22.000 0.814 0.018 Y NA
 7684537 7684538 BAA_0143 BAA_0144 rpsE rpmD TRUE 0.988 14.000 0.789 0.018 Y NA
 7684538 7684539 BAA_0144 BAA_0145 rpmD rplO TRUE 0.970 34.000 0.653 0.002 Y NA
 7684539 7684540 BAA_0145 BAA_0146 rplO secY1 TRUE 0.953 0.000 0.730 1.000 N NA
 7684540 7684541 BAA_0146 BAA_0147 secY1 adk TRUE 0.726 57.000 0.241 1.000 N NA
 7684541 7684542 BAA_0147 BAA_0148 adk maP1 TRUE 0.913 0.000 0.290 1.000 N NA
 7684542 7684543 BAA_0148 BAA_0149 maP1 infA TRUE 0.905 69.000 0.160 1.000 Y NA
 7684543 7684544 BAA_0149 BAA_0150 infA rpmJ FALSE 0.627 36.000 0.257 1.000   NA
 7684544 7684545 BAA_0150 BAA_0151 rpmJ rpsM TRUE 0.798 22.000 0.194 0.014   NA
 7684545 7684546 BAA_0151 BAA_0152 rpsM rpsK TRUE 0.980 25.000 0.810 0.014 Y NA
 7684546 7684547 BAA_0152 BAA_0153 rpsK rpoA FALSE 0.523 181.000 0.308 1.000 N NA
 7684547 7684548 BAA_0153 BAA_0154 rpoA rplQ TRUE 0.907 36.000 0.873 1.000 N NA
 7684548 7684549 BAA_0154 BAA_0155 rplQ   TRUE 0.820 104.000 0.074 1.000 N NA
 7684549 7684550 BAA_0155 BAA_0156     TRUE 0.944 -24.000 0.713 0.030 Y NA
 7684550 7684551 BAA_0156 BAA_0157     TRUE 0.921 -12.000 0.139 1.000 Y NA
 7684551 7684552 BAA_0157 BAA_0158   truA1 TRUE 0.901 0.000 0.170 1.000 N NA
 7684552 7684553 BAA_0158 BAA_0160 truA1 rplM TRUE 0.899 153.000 0.052 1.000 Y NA
 7684553 7684554 BAA_0160 BAA_0161 rplM rpsI TRUE 0.979 22.000 0.601 0.014 Y NA
 7684554 7684555 BAA_0161 BAA_0162 rpsI   FALSE 0.261 163.000 0.021 NA   NA
 7684555 7684556 BAA_0162 BAA_0163   cwlD FALSE 0.409 67.000 0.211 NA   NA
 7684556 7684557 BAA_0163 BAA_0164 cwlD   TRUE 0.775 145.000 0.211 1.000 N NA
 7684561 7684562 BAA_0168 BAA_0169   rrs_4 FALSE 0.031 250.000 0.000 NA   NA
 7684562 7684563 BAA_0169 BAA_0171 rrs_4 rrl_4 FALSE 0.141 179.000 0.000 NA   NA
 7684565 7684566 BAA_0172 BAA_0173 rrf_4   TRUE 0.645 9.000 0.000 NA   NA
 7684566 7684567 BAA_0173 BAA_0174     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7684567 7684568 BAA_0174 BAA_0175     FALSE 0.529 21.000 0.000 NA   NA
 7684568 7684569 BAA_0175 BAA_0176     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7684569 7684570 BAA_0176 BAA_0177     FALSE 0.572 17.000 0.000 NA   NA
 7684570 7684571 BAA_0177 BAA_0178     FALSE 0.296 66.000 0.000 NA   NA
 7684571 7684572 BAA_0178 BAA_0179     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7684572 7684573 BAA_0179 BAA_0180     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7684573 7684574 BAA_0180 BAA_0181     TRUE 0.647 8.000 0.000 NA   NA
 7684574 7684575 BAA_0181 BAA_0182     FALSE 0.490 112.000 0.000 NA   NA
 7684575 7684576 BAA_0182 BAA_0183     FALSE 0.210 -49.000 0.000 NA   NA
 7684576 7684577 BAA_0183 BAA_0184   rocF FALSE 0.059 210.000 0.000 NA   NA
 7684577 7684578 BAA_0184 BAA_0185 rocF   FALSE 0.032 249.000 0.000 NA   NA
 7684578 7684579 BAA_0185 BAA_0186     TRUE 0.733 -7.000 0.502 NA   NA
 7684579 7684580 BAA_0186 BAA_0187   glmM FALSE 0.535 -7.000 0.150 NA   NA
 7684580 7684581 BAA_0187 BAA_0188 glmM   FALSE 0.415 139.000 0.000 NA   NA
 7684581 7684582 BAA_0188 BAA_0189   glmS FALSE 0.095 192.000 0.000 NA   NA
 7684582 7684583 BAA_0189 BAA_0190 glmS   FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 7684583 7684584 BAA_0190 BAA_0191   gntR FALSE 0.007 407.000 0.000 NA   NA
 7684584 7684585 BAA_0191 BAA_0192 gntR   FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7684585 7684586 BAA_0192 BAA_0193     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7684586 7684587 BAA_0193 BAA_0194   gntP1 FALSE 0.483 120.000 0.000 NA   NA
 7684587 7684588 BAA_0194 BAA_0195 gntP1 yqjI FALSE 0.336 265.000 0.000 1.000 Y NA
 7684588 7684589 BAA_0195 BAA_0196 yqjI   FALSE 0.060 343.000 0.047 1.000 N NA
 7684589 7684590 BAA_0196 BAA_0197     FALSE 0.593 119.000 0.100 NA   NA
 7684591 7684592 BAA_0198 BAA_0199     FALSE 0.035 241.000 0.000 NA   NA
 7684592 7684593 BAA_0199 BAA_0200     TRUE 0.900 0.000 0.750 NA   NA
 7684593 7684594 BAA_0200 BAA_0201     FALSE 0.397 141.000 0.000 NA   NA
 7684594 7684595 BAA_0201 BAA_0202     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684596 7684597 BAA_0203 BAA_0204     FALSE 0.354 40.000 0.000 NA   NA
 7684598 7684599 BAA_0205 BAA_0206     TRUE 0.939 -25.000 0.846 1.000 Y NA
 7684599 7684600 BAA_0206 BAA_0207     TRUE 0.985 13.000 0.880 NA Y NA
 7684600 7684601 BAA_0207 BAA_0209     FALSE 0.075 280.000 0.000 NA N NA
 7684602 7684603 BAA_0210 BAA_0211     FALSE 0.608 112.000 0.137 NA   NA
 7684603 7684604 BAA_0211 BAA_0212     TRUE 0.716 -3.000 0.052 1.000   NA
 7684604 7684605 BAA_0212 BAA_0213     FALSE 0.405 79.000 0.026 NA   NA
 7684605 7684606 BAA_0213 BAA_0214     FALSE 0.185 182.000 0.104 NA   NA
 7684606 7684607 BAA_0214 BAA_0215     FALSE 0.031 251.000 0.000 NA   NA
 7684609 7684610 BAA_0218 BAA_0219     TRUE 0.987 17.000 0.909 0.038 Y NA
 7684610 7684611 BAA_0219 BAA_0220     TRUE 0.863 -43.000 0.233 1.000 Y NA
 7684611 7684612 BAA_0220 BAA_0221     TRUE 0.971 -3.000 0.233 0.003 Y NA
 7684612 7684613 BAA_0221 BAA_0222     TRUE 0.974 14.000 0.292 1.000 Y NA
 7684615 7684616 BAA_0224 BAA_0225     FALSE 0.401 73.000 0.105 NA   NA
 7684616 7684617 BAA_0225 BAA_0226     FALSE 0.448 133.000 0.000 NA   NA
 7684618 7684619 BAA_0227 BAA_0228     FALSE 0.159 388.000 0.000 0.038 Y NA
 7684619 7684620 BAA_0228 BAA_0230     FALSE 0.013 392.000 0.000 1.000   NA
 7684620 7684621 BAA_0230 BAA_0231     FALSE 0.296 68.000 0.000 NA   NA
 7684623 7684624 BAA_0233 BAA_0234   modB FALSE 0.109 287.000 0.000 0.073 N NA
 7684624 7684625 BAA_0234 BAA_0235 modB modA_1 TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7684625 7684626 BAA_0235 BAA_0236 modA_1 modA_2 FALSE 0.447 -6.000 0.000 NA   NA
 7684629 7684630 BAA_0239 BAA_0240     TRUE 0.814 22.000 0.556 NA   NA
 7684630 7684631 BAA_0240 BAA_0241     FALSE 0.009 368.000 0.000 NA   NA
 7684631 7684632 BAA_0241 BAA_0242     FALSE 0.235 159.000 0.000 NA   NA
 7684632 7684633 BAA_0242 BAA_0243     FALSE 0.105 188.000 0.000 NA   NA
 7684633 7684634 BAA_0243 BAA_0244     TRUE 0.741 149.000 0.778 NA   NA
 7684634 7684635 BAA_0244 BAA_0245     TRUE 0.853 119.000 0.778 NA   NA
 7684635 7684636 BAA_0245 BAA_0246     TRUE 0.788 138.000 0.667 NA   NA
 7684636 7684637 BAA_0246 BAA_0247     FALSE 0.005 572.000 0.000 NA   NA
 7684637 7684638 BAA_0247 BAA_0248     FALSE 0.369 59.000 0.019 NA   NA
 7684641 7684642 BAA_0251 BAA_0252     FALSE 0.439 135.000 0.000 NA   NA
 7684647 7684648 BAA_0257 BAA_0258     FALSE 0.017 298.000 0.000 NA   NA
 7684648 7684649 BAA_0258 BAA_0259     TRUE 0.971 109.000 0.444 0.037 Y NA
 7684649 7684650 BAA_0259 BAA_0260     TRUE 0.989 13.000 0.850 0.037 Y NA
 7684650 7684651 BAA_0260 BAA_0261     TRUE 0.987 11.000 0.750 1.000 Y NA
 7684651 7684652 BAA_0261 BAA_0263     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684653 7684654 BAA_0262 BAA_0264     FALSE 0.210 -49.000 0.000 NA   NA
 7684655 7684656 BAA_0265 BAA_0266     FALSE 0.018 290.000 0.000 NA   NA
 7684656 7684657 BAA_0266 BAA_0267   hppD FALSE 0.014 311.000 0.000 NA   NA
 7684657 7684658 BAA_0267 BAA_0268 hppD   TRUE 0.715 64.000 0.118 1.000 N NA
 7684658 7684659 BAA_0268 BAA_0269     TRUE 0.867 -34.000 0.101 1.000 Y NA
 7684659 7684660 BAA_0269 BAA_0270     FALSE 0.163 234.000 0.000 1.000 N NA
 7684660 7684661 BAA_0270 BAA_0271     FALSE 0.008 383.000 0.000 NA   NA
 7684661 7684662 BAA_0271 BAA_0272     FALSE 0.012 335.000 0.000 NA   NA
 7684662 7684663 BAA_0272 BAA_0273   murF FALSE 0.602 61.000 0.044 0.006   NA
 7684663 7684664 BAA_0273 BAA_0274 murF   FALSE 0.080 305.000 0.004 1.000 N NA
 7684664 7684665 BAA_0274 BAA_0276   uvdE_1 TRUE 0.931 97.000 0.013 1.000 Y NA
 7684667 7684668 BAA_0277 BAA_0278 acpS   TRUE 0.738 94.000 0.038 NA N NA
 7684668 7684669 BAA_0278 BAA_0279   dal1 TRUE 0.948 119.000 0.194 NA Y NA
 7684669 7684670 BAA_0279 BAA_0280 dal1   FALSE 0.067 310.000 0.108 NA N NA
 7684670 7684671 BAA_0280 BAA_0281     TRUE 0.908 5.000 0.260 NA N NA
 7684671 7684672 BAA_0281 BAA_0282     TRUE 0.709 68.000 0.045 1.000 N NA
 7684672 7684673 BAA_0282 BAA_0283     FALSE 0.015 370.000 0.215 NA   NA
 7684673 7684674 BAA_0283 BAA_0284     FALSE 0.488 114.000 0.000 NA   NA
 7684674 7684675 BAA_0284 BAA_0285     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7684675 7684676 BAA_0285 BAA_0286     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7684676 7684677 BAA_0286 BAA_0287     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7684677 7684678 BAA_0287 BAA_0288     FALSE 0.316 46.000 0.000 NA   NA
 7684678 7684679 BAA_0288 BAA_0289     FALSE 0.361 88.000 0.000 NA   NA
 7684679 7684680 BAA_0289 BAA_0290     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7684680 7684681 BAA_0290 BAA_0291     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7684681 7684682 BAA_0291 BAA_0292     FALSE 0.385 96.000 0.000 NA   NA
 7684682 7684683 BAA_0292 BAA_0293     TRUE 0.651 5.000 0.000 NA   NA
 7684683 7684684 BAA_0293 BAA_0294     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7684684 7684685 BAA_0294 BAA_0295   rrs_5 FALSE 0.398 99.000 0.000 NA   NA
 7684685 7684686 BAA_0295 BAA_0297 rrs_5 rrl_5 FALSE 0.141 179.000 0.000 NA   NA
 7684688 7684689 BAA_0298 BAA_0299 rrf_5   FALSE 0.629 12.000 0.000 NA   NA
 7684689 7684690 BAA_0299 BAA_0300     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7684690 7684691 BAA_0300 BAA_0301     FALSE 0.159 174.000 0.000 NA   NA
 7684691 7684692 BAA_0301 BAA_0302     FALSE 0.397 -19.000 0.217 NA   NA
 7684692 7684693 BAA_0302 BAA_0303   rimI TRUE 0.783 14.000 0.127 1.000   NA
 7684693 7684694 BAA_0303 BAA_0304 rimI   TRUE 0.776 0.000 0.090 1.000   NA
 7684698 7684699 BAA_0308 BAA_0309 groES groL TRUE 0.957 39.000 0.674 1.000 Y NA
 7684699 7684700 BAA_0309 BAA_0311 groL guaA FALSE 0.035 399.000 0.000 1.000 N NA
 7684700 7684701 BAA_0311 BAA_0313 guaA   FALSE 0.013 385.000 0.000 1.000   NA
 7684701 7684702 BAA_0313 BAA_0314     FALSE 0.573 145.000 0.146 1.000   NA
 7684702 7684703 BAA_0314 BAA_0315     TRUE 0.975 32.000 0.800 0.021 Y NA
 7684703 7684704 BAA_0315 BAA_0316   rrs_6 FALSE 0.013 321.000 0.000 NA   NA
 7684704 7684705 BAA_0316 BAA_0318 rrs_6 rrl_6 FALSE 0.141 179.000 0.000 NA   NA
 7684708 7684709 BAA_0320 BAA_0321     FALSE 0.038 233.000 0.000 NA   NA
 7684709 7684710 BAA_0321 BAA_0322     TRUE 0.631 27.000 0.002 1.000   NA
 7684710 7684711 BAA_0322 BAA_0323     FALSE 0.016 304.000 0.000 NA   NA
 7684713 7684714 BAA_0325 BAA_0326     FALSE 0.296 68.000 0.000 NA   NA
 7684714 7684715 BAA_0326 BAA_0327     FALSE 0.192 166.000 0.000 NA   NA
 7684716 7684717 BAA_0328 BAA_0331 rrs_7 rrl_7 FALSE 0.141 179.000 0.000 NA   NA
 7684717 7684718 BAA_0331 BAA_0332 rrl_7 rrf_7 FALSE 0.303 51.000 0.000 NA   NA
 7684719 7684720 BAA_0333 BAA_0334 uppP   TRUE 0.693 18.000 0.240 NA   NA
 7684720 7684721 BAA_0334 BAA_0335     TRUE 0.668 -7.000 0.400 NA   NA
 7684721 7684722 BAA_0335 BAA_0336     TRUE 0.815 69.000 0.556 1.000 N NA
 7684722 7684723 BAA_0336 BAA_0337     TRUE 0.950 -10.000 0.538 1.000 Y NA
 7684724 7684725 BAA_0338 BAA_0340 rrs_8 rrl_8 FALSE 0.141 179.000 0.000 NA   NA
 7684727 7684728 BAA_0341 BAA_0343 rrf_8 purE FALSE 0.005 699.000 0.000 NA   NA
 7684728 7684729 BAA_0343 BAA_0344 purE purK TRUE 0.970 -3.000 0.038 0.001 Y NA
 7684729 7684730 BAA_0344 BAA_0345 purK purB TRUE 0.961 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 7684730 7684731 BAA_0345 BAA_0346 purB purC TRUE 0.927 89.000 0.072 1.000 Y NA
 7684731 7684732 BAA_0346 BAA_0347 purC purS TRUE 0.956 -7.000 0.460 1.000 Y NA
 7684732 7684733 BAA_0347 BAA_0348 purS purQ TRUE 0.982 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 7684733 7684734 BAA_0348 BAA_0349 purQ purL TRUE 0.937 -16.000 0.346 0.001 Y NA
 7684734 7684735 BAA_0349 BAA_0350 purL purF TRUE 0.912 -15.000 0.223 1.000 Y NA
 7684735 7684736 BAA_0350 BAA_0351 purF purM TRUE 0.953 107.000 0.248 1.000 Y NA
 7684736 7684737 BAA_0351 BAA_0352 purM purN TRUE 0.971 -3.000 0.238 0.002 Y NA
 7684737 7684738 BAA_0352 BAA_0353 purN purH TRUE 0.954 25.000 0.225 1.000 Y NA
 7684738 7684739 BAA_0353 BAA_0354 purH purD TRUE 0.955 122.000 0.238 1.000 Y NA
 7684740 7684741 BAA_0355 BAA_0356     TRUE 0.844 17.000 0.549 NA   NA
 7684741 7684742 BAA_0356 BAA_0357     FALSE 0.059 210.000 0.000 NA   NA
 7684743 7684744 BAA_0358 BAA_0359   pcrA TRUE 0.708 1.000 0.049 NA   NA
 7684744 7684745 BAA_0359 BAA_0360 pcrA ligA TRUE 0.975 16.000 0.103 0.012 Y NA
 7684745 7684746 BAA_0360 BAA_0361 ligA   TRUE 0.644 17.000 0.009 NA   NA
 7684746 7684747 BAA_0361 BAA_0362     TRUE 0.801 96.000 0.800 NA   NA
 7684747 7684748 BAA_0362 BAA_0363     FALSE 0.482 154.000 0.205 1.000   NA
 7684748 7684749 BAA_0363 BAA_0364     FALSE 0.159 186.000 0.051 NA   NA
 7684751 7684752 BAA_0367 BAA_0368     TRUE 0.929 -10.000 0.233 1.000 Y NA
 7684752 7684753 BAA_0368 BAA_0369     TRUE 0.955 22.000 0.233 NA Y NA
 7684754 7684755 BAA_0370 BAA_0371     TRUE 0.713 59.000 0.750 NA   NA
 7684755 7684756 BAA_0371 BAA_0372     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7684756 7684757 BAA_0372 BAA_0373     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7684757 7684758 BAA_0373 BAA_0374     FALSE 0.313 77.000 0.000 NA   NA
 7684759 7684760 BAA_0375 BAA_0376   gatC FALSE 0.026 263.000 0.000 NA   NA
 7684760 7684761 BAA_0376 BAA_0377 gatC gatA TRUE 0.985 16.000 0.643 0.001 Y NA
 7684761 7684762 BAA_0377 BAA_0378 gatA gatB TRUE 0.984 15.000 0.492 0.001 Y NA
 7684762 7684763 BAA_0378 BAA_0379 gatB   FALSE 0.033 471.000 0.034 1.000 N NA
 7684763 7684764 BAA_0379 BAA_0380     FALSE 0.596 140.000 0.028 1.000   NA
 7684764 7684765 BAA_0380 BAA_0381   gabT FALSE 0.534 83.000 0.045 1.000   NA
 7684765 7684766 BAA_0381 BAA_0382 gabT   TRUE 0.888 113.000 0.409 1.000 N NA
 7684766 7684767 BAA_0382 BAA_0383   gabD TRUE 0.885 -7.000 0.583 1.000 N NA
 7684767 7684768 BAA_0383 BAA_0384 gabD   TRUE 0.731 48.000 0.157 1.000 N NA
 7684769 7684770 BAA_0385 BAA_0386 ampS   TRUE 0.860 117.000 0.258 1.000 N NA
 7684770 7684771 BAA_0386 BAA_0387     TRUE 0.929 152.000 0.300 0.006 Y NA
 7684771 7684772 BAA_0387 BAA_0388     FALSE 0.152 240.000 0.000 1.000 N NA
 7684773 7684774 BAA_0390 BAA_0391     TRUE 0.931 97.000 0.008 1.000 Y NA
 7684774 7684775 BAA_0391 BAA_0392     FALSE 0.026 261.000 0.000 NA   NA
 7684775 7684776 BAA_0392 BAA_0393     FALSE 0.022 273.000 0.000 NA   NA
 7684776 7684777 BAA_0393 BAA_0394     FALSE 0.478 95.000 0.043 NA   NA
 7684778 7684779 BAA_0395 BAA_0396     TRUE 0.704 15.000 0.189 NA   NA
 7684782 7684783 BAA_0399 BAA_0400 amhX   FALSE 0.447 152.000 0.263 NA   NA
 7684784 7684785 BAA_0401 BAA_0402 ahpF ahpC TRUE 0.980 15.000 0.551 1.000 Y NA
 7684786 7684787 BAA_0403 BAA_0404   mtnA_1 TRUE 0.798 10.000 0.042 1.000   NA
 7684787 7684788 BAA_0404 BAA_0405 mtnA_1   TRUE 0.704 55.000 0.017 1.000 N NA
 7684789 7684790 BAA_0406 BAA_0407     TRUE 0.981 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 7684790 7684791 BAA_0407 BAA_0408     TRUE 0.932 49.000 0.487 1.000 Y NA
 7684794 7684795 BAA_0411 BAA_0412     FALSE 0.037 236.000 0.000 NA   NA
 7684795 7684796 BAA_0412 BAA_0413     FALSE 0.529 21.000 0.000 NA   NA
 7684796 7684797 BAA_0413 BAA_0414     FALSE 0.201 163.000 0.000 NA   NA
 7684797 7684798 BAA_0414 BAA_0415     FALSE 0.036 237.000 0.000 NA   NA
 7684798 7684799 BAA_0415 BAA_0416     FALSE 0.480 122.000 0.000 NA   NA
 7684799 7684800 BAA_0416 BAA_0417     FALSE 0.327 44.000 0.000 NA   NA
 7684800 7684801 BAA_0417 BAA_0418     FALSE 0.295 62.000 0.000 NA   NA
 7684801 7684802 BAA_0418 BAA_0419     FALSE 0.044 224.000 0.000 NA   NA
 7684804 7684805 BAA_0422 BAA_0423     FALSE 0.584 123.000 0.068 NA   NA
 7684806 7684807 BAA_0424 BAA_0425     TRUE 0.775 144.000 0.053 1.000 N NA
 7684809 7684810 BAA_0427 BAA_0428     TRUE 0.944 95.000 0.130 0.049 Y NA
 7684810 7684811 BAA_0428 BAA_0429     TRUE 0.961 122.000 0.348 1.000 Y NA
 7684811 7684812 BAA_0429 BAA_0430     FALSE 0.557 170.000 0.133 1.000 N NA
 7684813 7684814 BAA_0431 BAA_0432     FALSE 0.157 237.000 0.000 1.000 N NA
 7684814 7684815 BAA_0432 BAA_0433     TRUE 0.816 173.000 0.167 1.000 Y NA
 7684815 7684816 BAA_0433 BAA_0434     TRUE 0.896 5.000 0.610 NA   NA
 7684816 7684817 BAA_0434 BAA_0435     FALSE 0.551 19.000 0.000 NA   NA
 7684817 7684818 BAA_0435 BAA_0436     FALSE 0.453 132.000 0.000 NA   NA
 7684820 7684821 BAA_0439 BAA_0440 thiM thiE TRUE 0.974 17.000 0.061 0.004 Y NA
 7684823 7684824 BAA_0442 BAA_0444     FALSE 0.025 264.000 0.000 NA   NA
 7684824 7684825 BAA_0444 BAA_0445     FALSE 0.445 -31.000 0.364 NA   NA
 7684825 7684826 BAA_0445 BAA_0446     TRUE 0.972 -3.000 0.584 NA Y NA
 7684826 7684827 BAA_0446 BAA_0447     TRUE 0.971 -3.000 0.554 NA Y NA
 7684827 7684828 BAA_0447 BAA_0448     FALSE 0.048 292.000 0.000 0.028   NA
 7684830 7684831 BAA_0450 BAA_0451     TRUE 0.728 11.000 0.065 NA   NA
 7684831 7684832 BAA_0451 BAA_0452     TRUE 0.690 14.000 0.037 NA   NA
 7684832 7684833 BAA_0452 BAA_0453     FALSE 0.020 283.000 0.000 NA   NA
 7684833 7684834 BAA_0453 BAA_0454     TRUE 0.702 67.000 0.714 NA   NA
 7684834 7684835 BAA_0454 BAA_0455     TRUE 0.697 114.000 0.333 NA   NA
 7684835 7684836 BAA_0455 BAA_0456     TRUE 0.721 13.000 0.143 NA   NA
 7684837 7684838 BAA_0457 BAA_0458     FALSE 0.584 109.000 0.068 NA   NA
 7684839 7684840 BAA_0459 BAA_0460   proS1 FALSE 0.010 348.000 0.000 NA   NA
 7684842 7684843 BAA_0462 BAA_0463     TRUE 0.839 129.000 0.145 1.000 N NA
 7684843 7684844 BAA_0463 BAA_0464     TRUE 0.970 24.000 0.364 0.003 Y NA
 7684844 7684845 BAA_0464 BAA_0465     TRUE 0.956 81.000 0.571 0.003 Y NA
 7684845 7684846 BAA_0465 BAA_0466     TRUE 0.755 74.000 0.308 1.000 N NA
 7684846 7684847 BAA_0466 BAA_0467     TRUE 0.638 110.000 0.256 NA   NA
 7684847 7684848 BAA_0467 BAA_0468     TRUE 0.876 19.000 0.727 NA   NA
 7684849 7684850 BAA_0469 BAA_0470     FALSE 0.143 192.000 0.125 NA   NA
 7684851 7684852 BAA_0471 BAA_0472     FALSE 0.299 54.000 0.000 NA   NA
 7684852 7684853 BAA_0472 BAA_0473   yihY FALSE 0.361 39.000 0.000 NA   NA
 7684855 7684856 BAA_0475 BAA_0476     FALSE 0.574 123.000 0.039 NA   NA
 7684856 7684857 BAA_0476 BAA_0477   lepB_1 FALSE 0.038 233.000 0.000 NA   NA
 7684857 7684858 BAA_0477 BAA_0478 lepB_1 sipS1 FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684861 7684862 BAA_0481 BAA_0482     FALSE 0.584 107.000 0.129 NA   NA
 7684862 7684863 BAA_0482 BAA_0483     FALSE 0.381 154.000 0.111 NA   NA
 7684864 7684865 BAA_0484 BAA_0485 cax   FALSE 0.456 82.000 0.212 NA   NA
 7684867 7684868 BAA_0487 BAA_0488   fumA FALSE 0.094 207.000 0.093 NA   NA
 7684868 7684869 BAA_0488 BAA_0489 fumA pdaA TRUE 0.843 127.000 0.185 1.000 N NA
 7684869 7684870 BAA_0489 BAA_0490 pdaA   FALSE 0.295 60.000 0.000 NA   NA
 7684870 7684871 BAA_0490 BAA_0491     FALSE 0.404 34.000 0.000 NA   NA
 7684871 7684872 BAA_0491 BAA_0492     TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7684873 7684874 BAA_0493 BAA_0494     FALSE 0.005 716.000 0.000 NA   NA
 7684875 7684876 BAA_0495 BAA_0496     TRUE 0.867 18.000 0.667 NA   NA
 7684876 7684877 BAA_0496 BAA_0497     FALSE 0.180 168.000 0.000 NA   NA
 7684879 7684880 BAA_0499 BAA_0500     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7684880 7684881 BAA_0500 BAA_0501     FALSE 0.320 45.000 0.000 NA   NA
 7684881 7684882 BAA_0501 BAA_0502     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684882 7684883 BAA_0502 BAA_0503     FALSE 0.435 30.000 0.000 NA   NA
 7684883 7684884 BAA_0503 BAA_0504     TRUE 0.644 -3.000 0.182 NA   NA
 7684884 7684885 BAA_0504 BAA_0505     FALSE 0.332 -31.000 0.182 NA   NA
 7684885 7684886 BAA_0505 BAA_0506     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7684886 7684887 BAA_0506 BAA_0507     FALSE 0.474 25.000 0.000 NA   NA
 7684887 7684888 BAA_0507 BAA_0508     FALSE 0.020 281.000 0.000 NA   NA
 7684888 7684889 BAA_0508 BAA_0509     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7684889 7684890 BAA_0509 BAA_0510     FALSE 0.369 38.000 0.000 NA   NA
 7684890 7684891 BAA_0510 BAA_0511     FALSE 0.308 49.000 0.000 NA   NA
 7684891 7684892 BAA_0511 BAA_0512     FALSE 0.074 200.000 0.000 NA   NA
 7684892 7684893 BAA_0512 BAA_0513     FALSE 0.006 432.000 0.000 NA   NA
 7684893 7684894 BAA_0513 BAA_0514     FALSE 0.327 44.000 0.000 NA   NA
 7684894 7684895 BAA_0514 BAA_0515     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7684895 7684896 BAA_0515 BAA_0516     FALSE 0.348 41.000 0.000 NA   NA
 7684896 7684897 BAA_0516 BAA_0517     FALSE 0.422 32.000 0.000 NA   NA
 7684897 7684898 BAA_0517 BAA_0518     FALSE 0.458 106.000 0.000 NA   NA
 7684898 7684899 BAA_0518 BAA_0519     FALSE 0.046 221.000 0.000 NA   NA
 7684899 7684900 BAA_0519 BAA_0520     FALSE 0.486 116.000 0.000 NA   NA
 7684900 7684901 BAA_0520 BAA_0521     FALSE 0.447 28.000 0.000 NA   NA
 7684901 7684902 BAA_0521 BAA_0522     FALSE 0.013 321.000 0.000 NA   NA
 7684902 7684903 BAA_0522 BAA_0523     FALSE 0.005 589.000 0.000 NA   NA
 7684903 7684904 BAA_0523 BAA_0524     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684904 7684905 BAA_0524 BAA_0525     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684905 7684906 BAA_0525 BAA_0526     FALSE 0.412 101.000 0.000 NA   NA
 7684906 7684907 BAA_0526 BAA_0527     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684907 7684908 BAA_0527 BAA_0528     FALSE 0.023 271.000 0.000 NA   NA
 7684908 7684909 BAA_0528 BAA_0529     FALSE 0.214 -43.000 0.000 NA   NA
 7684909 7684910 BAA_0529 BAA_0530     TRUE 0.647 19.000 0.048 NA   NA
 7684910 7684911 BAA_0530 BAA_0531     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7684911 7684912 BAA_0531 BAA_0532     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684912 7684913 BAA_0532 BAA_0533     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684913 7684914 BAA_0533 BAA_0534     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7684914 7684915 BAA_0534 BAA_0535     FALSE 0.453 132.000 0.000 NA   NA
 7684915 7684916 BAA_0535 BAA_0536     FALSE 0.619 1.000 0.000 NA   NA
 7684916 7684917 BAA_0536 BAA_0537     TRUE 0.651 5.000 0.000 NA   NA
 7684917 7684918 BAA_0537 BAA_0538     FALSE 0.487 111.000 0.000 NA   NA
 7684918 7684919 BAA_0538 BAA_0539     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7684919 7684920 BAA_0539 BAA_0540     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684920 7684921 BAA_0540 BAA_0541     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7684921 7684922 BAA_0541 BAA_0542     FALSE 0.296 66.000 0.000 NA   NA
 7684922 7684923 BAA_0542 BAA_0543     FALSE 0.297 69.000 0.000 NA   NA
 7684923 7684924 BAA_0543 BAA_0544     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7684924 7684925 BAA_0544 BAA_0545     FALSE 0.382 95.000 0.000 NA   NA
 7684925 7684926 BAA_0545 BAA_0546     FALSE 0.300 73.000 0.000 NA   NA
 7684926 7684927 BAA_0546 BAA_0547     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7684930 7684931 BAA_0550 BAA_0551   rocR1 FALSE 0.541 84.000 0.304 NA   NA
 7684932 7684933 BAA_0552 BAA_0553     TRUE 0.795 105.000 0.636 NA   NA
 7684933 7684934 BAA_0553 BAA_0554     TRUE 0.937 96.000 0.259 1.000 Y NA
 7684936 7684937 BAA_0556 BAA_0557     FALSE 0.487 115.000 0.000 NA   NA
 7684938 7684939 BAA_0558 BAA_0559   glsA1 FALSE 0.295 176.000 0.320 NA   NA
 7684940 7684941 BAA_0560 BAA_0561     FALSE 0.569 124.000 0.032 NA   NA
 7684941 7684942 BAA_0561 BAA_0562     FALSE 0.126 255.000 0.000 1.000 N NA
 7684942 7684943 BAA_0562 BAA_0563     FALSE 0.514 154.000 0.385 NA   NA
 7684943 7684944 BAA_0563 BAA_0564     TRUE 0.878 17.000 0.692 NA   NA
 7684944 7684945 BAA_0564 BAA_0565     TRUE 0.668 -19.000 0.667 NA   NA
 7684945 7684946 BAA_0565 BAA_0566     FALSE 0.361 -10.000 0.000 NA   NA
 7684946 7684947 BAA_0566 BAA_0567     FALSE 0.009 366.000 0.000 NA   NA
 7684947 7684948 BAA_0567 BAA_0568     TRUE 0.718 -3.000 0.064 1.000   NA
 7684948 7684949 BAA_0568 BAA_0569     FALSE 0.516 -7.000 0.050 NA   NA
 7684949 7684950 BAA_0569 BAA_0570   pfl FALSE 0.011 340.000 0.000 NA   NA
 7684950 7684951 BAA_0570 BAA_0571 pfl pflA TRUE 0.718 70.000 0.135 1.000 N NA
 7684951 7684952 BAA_0571 BAA_0572 pflA   FALSE 0.033 413.000 0.000 1.000 N NA
 7684953 7684954 BAA_0573 BAA_0574     TRUE 0.777 111.000 0.500 NA   NA
 7684954 7684955 BAA_0574 BAA_0575     FALSE 0.121 242.000 0.000 NA N NA
 7684955 7684956 BAA_0575 BAA_0576     FALSE 0.610 141.000 0.200 1.000   NA
 7684957 7684958 BAA_0577 BAA_0578     TRUE 0.727 10.000 0.045 NA   NA
 7684959 7684960 BAA_0579 BAA_0580   sspK FALSE 0.625 44.000 0.480 NA   NA
 7684969 7684970 BAA_0589 BAA_0590     TRUE 0.667 55.000 0.077 NA N NA
 7684971 7684972 BAA_0591 BAA_0592     FALSE 0.039 261.000 0.066 NA   NA
 7684972 7684973 BAA_0592 BAA_0593   hemL1 FALSE 0.315 200.000 0.036 1.000 N NA
 7684974 7684975 BAA_0594 BAA_0595     TRUE 0.712 -7.000 0.488 NA   NA
 7684975 7684976 BAA_0595 BAA_0596     TRUE 0.872 5.000 0.500 NA   NA
 7684976 7684977 BAA_0596 BAA_0597     FALSE 0.408 73.000 0.188 NA   NA
 7684977 7684978 BAA_0597 BAA_0598   bcP FALSE 0.394 45.000 0.015 NA   NA
 7684978 7684979 BAA_0598 BAA_0599 bcP   FALSE 0.086 298.000 0.005 1.000 N NA
 7684981 7684982 BAA_0601 BAA_0603 rrs_9 rrl_9 FALSE 0.167 172.000 0.000 NA   NA
 7684984 7684985 BAA_0604 BAA_0605 rrf_9   TRUE 0.647 8.000 0.000 NA   NA
 7684985 7684986 BAA_0605 BAA_0606     FALSE 0.619 1.000 0.000 NA   NA
 7684986 7684987 BAA_0606 BAA_0607     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7684987 7684988 BAA_0607 BAA_0608     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7684988 7684989 BAA_0608 BAA_0610     FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7684989 7684990 BAA_0610 BAA_0611     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7684990 7684991 BAA_0611 BAA_0612     TRUE 0.645 9.000 0.000 NA   NA
 7684991 7684992 BAA_0612 BAA_0613     FALSE 0.551 19.000 0.000 NA   NA
 7684992 7684993 BAA_0613 BAA_0614     TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7684993 7684994 BAA_0614 BAA_0615     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7684994 7684995 BAA_0615 BAA_0616     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7684995 7684996 BAA_0616 BAA_0617     FALSE 0.295 63.000 0.000 NA   NA
 7684996 7684997 BAA_0617 BAA_0618     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7684997 7684998 BAA_0618 BAA_0619     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7684998 7684999 BAA_0619 BAA_0620     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7685001 7685002 BAA_0622 BAA_0623     FALSE 0.367 151.000 0.008 NA   NA
 7685002 7685003 BAA_0623 BAA_0624     FALSE 0.010 487.000 0.000 1.000   NA
 7685003 7685004 BAA_0624 BAA_0625     FALSE 0.215 188.000 0.123 1.000   NA
 7685004 7685005 BAA_0625 BAA_0626     FALSE 0.487 115.000 0.000 NA   NA
 7685005 7685006 BAA_0626 BAA_0627     FALSE 0.076 199.000 0.000 NA   NA
 7685006 7685007 BAA_0627 BAA_0628     FALSE 0.431 45.000 0.174 NA   NA
 7685007 7685008 BAA_0628 BAA_0629     FALSE 0.395 59.000 0.097 NA   NA
 7685008 7685009 BAA_0629 BAA_0630     TRUE 0.832 128.000 0.016 1.000 N NA
 7685009 7685010 BAA_0630 BAA_0631     FALSE 0.146 178.000 0.000 NA   NA
 7685010 7685011 BAA_0631 BAA_0632     FALSE 0.301 74.000 0.000 NA   NA
 7685011 7685012 BAA_0632 BAA_0633     FALSE 0.032 446.000 0.683 NA   NA
 7685012 7685013 BAA_0633 BAA_0634     FALSE 0.268 162.000 0.018 NA   NA
 7685013 7685014 BAA_0634 BAA_0635     TRUE 0.635 155.000 0.500 1.000   NA
 7685016 7685017 BAA_0637 BAA_0638     FALSE 0.033 247.000 0.000 NA   NA
 7685017 7685018 BAA_0638 BAA_0639     TRUE 0.842 13.000 0.464 NA   NA
 7685018 7685019 BAA_0639 BAA_0640     FALSE 0.036 237.000 0.000 NA   NA
 7685019 7685020 BAA_0640 BAA_0641     TRUE 0.933 158.000 0.600 0.015 Y NA
 7685020 7685021 BAA_0641 BAA_0642     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7685021 7685022 BAA_0642 BAA_0643     FALSE 0.380 -9.000 0.000 NA   NA
 7685024 7685025 BAA_0645 BAA_0646     FALSE 0.557 135.000 0.125 NA   NA
 7685025 7685026 BAA_0646 BAA_0647     FALSE 0.018 290.000 0.000 NA   NA
 7685026 7685027 BAA_0647 BAA_0648     FALSE 0.005 559.000 0.000 NA   NA
 7685027 7685028 BAA_0648 BAA_0649     TRUE 0.881 -3.000 0.262 1.000 N NA
 7685028 7685029 BAA_0649 BAA_0650     TRUE 0.981 0.000 0.391 0.035 Y NA
 7685029 7685030 BAA_0650 BAA_0651     TRUE 0.984 -3.000 0.848 0.035 Y NA
 7685030 7685031 BAA_0651 BAA_0652     TRUE 0.981 22.000 0.708 0.035 Y NA
 7685031 7685032 BAA_0652 BAA_0653     FALSE 0.011 416.000 0.000 1.000   NA
 7685032 7685033 BAA_0653 BAA_0654     FALSE 0.505 150.000 0.091 1.000   NA
 7685033 7685034 BAA_0654 BAA_0655     TRUE 0.976 -3.000 0.606 1.000 Y NA
 7685034 7685035 BAA_0655 BAA_0656     FALSE 0.062 207.000 0.000 NA   NA
 7685035 7685036 BAA_0656 BAA_0657     TRUE 0.686 44.000 0.600 NA   NA
 7685036 7685037 BAA_0657 BAA_0658     FALSE 0.029 254.000 0.000 NA   NA
 7685037 7685038 BAA_0658 BAA_0659     TRUE 0.916 79.000 0.229 1.000 Y NA
 7685038 7685039 BAA_0659 BAA_0660     TRUE 0.968 -3.000 0.229 0.087 Y NA
 7685039 7685040 BAA_0660 BAA_0661     TRUE 0.853 123.000 0.243 1.000 N NA
 7685040 7685041 BAA_0661 BAA_0662     TRUE 0.925 60.000 0.432 1.000 Y NA
 7685042 7685043 BAA_0663 BAA_0664     TRUE 0.744 116.000 0.429 NA   NA
 7685045 7685046 BAA_0666 BAA_0667     TRUE 0.751 147.000 0.636 1.000   NA
 7685046 7685047 BAA_0667 BAA_0668     TRUE 0.945 66.000 0.727 1.000 Y NA
 7685049 7685050 BAA_0670 BAA_0671   fdhD1 FALSE 0.173 229.000 0.000 1.000 N NA
 7685051 7685052 BAA_0672 BAA_0673     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7685052 7685053 BAA_0673 BAA_0674     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7685053 7685054 BAA_0674 BAA_0675     FALSE 0.250 157.000 0.000 NA   NA
 7685054 7685055 BAA_0675 BAA_0676   ald1 FALSE 0.043 368.000 0.000 1.000 N NA
 7685055 7685056 BAA_0676 BAA_0677 ald1   TRUE 0.974 104.000 0.889 1.000 Y NA
 7685056 7685057 BAA_0677 BAA_0678     FALSE 0.109 267.000 0.000 1.000 N NA
 7685057 7685058 BAA_0678 BAA_0679     TRUE 0.845 25.000 0.203 1.000 N NA
 7685060 7685061 BAA_0681 BAA_0682     TRUE 0.752 3.000 0.231 NA   NA
 7685061 7685062 BAA_0682 BAA_0683     FALSE 0.313 167.000 0.273 NA   NA
 7685064 7685065 BAA_0685 BAA_0686     TRUE 0.889 16.000 0.727 NA   NA
 7685066 7685067 BAA_0687 BAA_0688     FALSE 0.132 235.000 0.000 NA N NA
 7685067 7685068 BAA_0688 BAA_0689     FALSE 0.141 261.000 0.333 NA N NA
 7685069 7685070 BAA_0690 BAA_0691     FALSE 0.548 108.000 0.010 NA   NA
 7685070 7685071 BAA_0691 BAA_0692   aspA1 FALSE 0.470 84.000 0.222 NA   NA
 7685073 7685074 BAA_0694 BAA_0695     TRUE 0.720 115.000 0.261 1.000   NA
 7685075 7685076 BAA_0696 BAA_0697     FALSE 0.039 382.000 0.000 1.000 N NA
 7685077 7685078 BAA_0698 BAA_0699     TRUE 0.971 -3.000 0.273 0.035 Y NA
 7685078 7685079 BAA_0699 BAA_0700     TRUE 0.975 13.000 0.273 1.000 Y NA
 7685081 7685082 BAA_0702 BAA_0703     FALSE 0.320 45.000 0.000 NA   NA
 7685082 7685083 BAA_0703 BAA_0704     FALSE 0.296 66.000 0.000 NA   NA
 7685084 7685085 BAA_0705 BAA_0706     TRUE 0.923 4.000 0.822 NA   NA
 7685085 7685086 BAA_0706 BAA_0707   cls1 TRUE 0.676 128.000 0.156 1.000   NA
 7685087 7685088 BAA_0708 BAA_0709     TRUE 0.698 31.000 0.429 NA   NA
 7685088 7685089 BAA_0709 BAA_0710     FALSE 0.009 359.000 0.000 NA   NA
 7685091 7685092 BAA_0712 BAA_0713 treR treB TRUE 0.813 138.000 0.115 1.000 N NA
 7685092 7685093 BAA_0713 BAA_0714 treB treC TRUE 0.983 14.000 0.650 1.000 Y NA
 7685094 7685095 BAA_0715 BAA_0716 gerKC gerKB TRUE 0.808 -19.000 0.833 0.009   NA
 7685095 7685096 BAA_0716 BAA_0717 gerKB gerKA TRUE 0.687 -19.000 0.412 0.009   NA
 7685097 7685098 BAA_0718 BAA_0719     TRUE 0.720 24.000 0.385 NA   NA
 7685098 7685099 BAA_0719 BAA_0720     TRUE 0.745 128.000 0.462 NA   NA
 7685099 7685100 BAA_0720 BAA_0721     TRUE 0.910 77.000 0.093 1.000 Y NA
 7685100 7685101 BAA_0721 BAA_0722     TRUE 0.978 13.000 0.389 1.000 Y NA
 7685101 7685102 BAA_0722 BAA_0723     TRUE 0.925 63.000 0.280 0.047 Y NA
 7685102 7685103 BAA_0723 BAA_0724     TRUE 0.990 1.000 0.947 0.007 Y NA
 7685103 7685104 BAA_0724 BAA_0725     FALSE 0.618 205.000 0.000 0.068 Y NA
 7685104 7685105 BAA_0725 BAA_0726     TRUE 0.676 -25.000 0.242 1.000 N NA
 7685105 7685106 BAA_0726 BAA_0727     TRUE 0.714 62.000 0.111 1.000 N NA
 7685106 7685107 BAA_0727 BAA_0728     FALSE 0.509 177.000 0.079 1.000 N NA
 7685107 7685108 BAA_0728 BAA_0729     FALSE 0.227 -34.000 0.000 NA   NA
 7685111 7685112 BAA_0732 BAA_0733     TRUE 0.983 12.000 0.538 1.000 Y NA
 7685113 7685114 BAA_0734 BAA_0735     TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7685114 7685115 BAA_0735 BAA_0736     FALSE 0.243 158.000 0.000 NA   NA
 7685115 7685116 BAA_0736 BAA_0737     TRUE 0.826 66.000 0.615 1.000 N NA
 7685116 7685117 BAA_0737 BAA_0738     FALSE 0.048 218.000 0.000 NA   NA
 7685118 7685119 BAA_0739 BAA_0740     TRUE 0.976 15.000 0.195 0.035 Y NA
 7685119 7685120 BAA_0740 BAA_0741     TRUE 0.984 19.000 0.727 0.035 Y NA
 7685120 7685121 BAA_0741 BAA_0742     TRUE 0.912 15.000 0.727 1.000   NA
 7685121 7685122 BAA_0742 BAA_0743     TRUE 0.756 -13.000 0.477 0.003   NA
 7685122 7685123 BAA_0743 BAA_0744   glpT FALSE 0.090 285.000 0.000 1.000 N NA
 7685124 7685125 BAA_0745 BAA_0746     FALSE 0.540 20.000 0.000 NA   NA
 7685125 7685126 BAA_0746 BAA_0747     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7685126 7685127 BAA_0747 BAA_0748   rbsR FALSE 0.422 138.000 0.000 NA   NA
 7685127 7685128 BAA_0748 BAA_0749 rbsR rbsK TRUE 0.901 14.000 0.109 1.000 N NA
 7685128 7685129 BAA_0749 BAA_0750 rbsK rbsD TRUE 0.962 -3.000 0.183 1.000 Y NA
 7685129 7685130 BAA_0750 BAA_0751 rbsD rbsA TRUE 0.974 13.000 0.243 1.000 Y NA
 7685130 7685131 BAA_0751 BAA_0752 rbsA rbsC TRUE 0.984 3.000 0.358 0.001 Y NA
 7685131 7685132 BAA_0752 BAA_0753 rbsC rbsB TRUE 0.984 15.000 0.847 NA Y NA
 7685132 7685133 BAA_0753 BAA_0754 rbsB   TRUE 0.924 35.000 0.032 NA Y NA
 7685133 7685134 BAA_0754 BAA_0755   inhA FALSE 0.023 317.000 0.000 1.000   NA
 7685134 7685135 BAA_0755 BAA_0756 inhA   FALSE 0.013 319.000 0.000 NA   NA
 7685137 7685138 BAA_0758 BAA_0759     FALSE 0.586 119.000 0.059 NA   NA
 7685138 7685139 BAA_0759 BAA_0760   plC FALSE 0.029 254.000 0.000 NA   NA
 7685139 7685140 BAA_0760 BAA_0761 plC sph FALSE 0.419 74.000 0.000 1.000   NA
 7685140 7685141 BAA_0761 BAA_0762 sph   FALSE 0.472 108.000 0.000 NA   NA
 7685141 7685142 BAA_0762 BAA_0763     TRUE 0.822 -12.000 0.571 NA N NA
 7685145 7685146 BAA_0766 BAA_0767     TRUE 0.827 133.000 0.085 1.000 N NA
 7685147 7685148 BAA_0768 BAA_0769     TRUE 0.856 113.000 0.233 1.000 N NA
 7685148 7685149 BAA_0769 BAA_0770     TRUE 0.723 -7.000 0.500 NA   NA
 7685149 7685150 BAA_0770 BAA_0771     TRUE 0.750 117.000 0.438 NA   NA
 7685152 7685153 BAA_0773 BAA_0774 brnQ1   FALSE 0.550 136.000 0.121 NA   NA
 7685154 7685155 BAA_0775 BAA_0776     FALSE 0.189 182.000 0.171 NA   NA
 7685156 7685157 BAA_0777 BAA_0778     TRUE 0.857 132.000 0.750 1.000   NA
 7685157 7685158 BAA_0778 BAA_0779     TRUE 0.832 5.000 0.375 NA   NA
 7685159 7685160 BAA_0780 BAA_0781     TRUE 0.703 15.000 0.125 NA   NA
 7685160 7685161 BAA_0781 BAA_0782     FALSE 0.471 90.000 0.062 NA   NA
 7685161 7685162 BAA_0782 BAA_0783   qoxD FALSE 0.231 222.000 0.000 0.068 N NA
 7685162 7685163 BAA_0783 BAA_0784 qoxD qoxC TRUE 0.988 1.000 0.959 1.000 Y NA
 7685163 7685164 BAA_0784 BAA_0785 qoxC qoxB TRUE 0.989 14.000 0.957 0.038 Y NA
 7685164 7685165 BAA_0785 BAA_0786 qoxB qoxA TRUE 0.951 34.000 0.234 0.007 Y NA
 7685166 7685167 BAA_0787 BAA_0788     TRUE 0.823 133.000 0.727 NA   NA
 7685167 7685168 BAA_0788 BAA_0789     TRUE 0.780 2.000 0.286 NA   NA
 7685168 7685169 BAA_0789 BAA_0790     TRUE 0.805 -3.000 0.500 NA   NA
 7685169 7685170 BAA_0790 BAA_0791   gerLA TRUE 0.765 112.000 0.353 1.000   NA
 7685170 7685171 BAA_0791 BAA_0792 gerLA gerLB TRUE 0.937 1.000 0.706 0.009   NA
 7685171 7685172 BAA_0792 BAA_0793 gerLB gerLC TRUE 0.878 8.000 0.235 0.009   NA
 7685172 7685173 BAA_0793 BAA_0794 gerLC   TRUE 0.861 12.000 0.500 NA   NA
 7685174 7685175 BAA_0795 BAA_0796     TRUE 0.727 -22.000 0.556 0.003   NA
 7685175 7685176 BAA_0796 BAA_0797     TRUE 0.746 -3.000 0.250 1.000   NA
 7685177 7685178 BAA_0798 BAA_0799     TRUE 0.906 71.000 0.206 1.000 Y NA
 7685178 7685179 BAA_0799 BAA_0800     TRUE 0.991 3.000 0.907 0.002 Y NA
 7685179 7685180 BAA_0800 BAA_0801     FALSE 0.158 186.000 0.048 NA   NA
 7685182 7685183 BAA_0803 BAA_0805 rrs_10 rrl_10 FALSE 0.141 179.000 0.000 NA   NA
 7685185 7685186 BAA_0806 BAA_0807 rrf_10   TRUE 0.651 5.000 0.000 NA   NA
 7685186 7685187 BAA_0807 BAA_0808     TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7685187 7685188 BAA_0808 BAA_0809     TRUE 0.651 5.000 0.000 NA   NA
 7685188 7685189 BAA_0809 BAA_0810     FALSE 0.604 14.000 0.000 NA   NA
 7685189 7685190 BAA_0810 BAA_0811     FALSE 0.465 26.000 0.000 NA   NA
 7685190 7685191 BAA_0811 BAA_0812     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7685191 7685192 BAA_0812 BAA_0813     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7685192 7685193 BAA_0813 BAA_0814     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7685193 7685194 BAA_0814 BAA_0815     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7685194 7685195 BAA_0815 BAA_0816     FALSE 0.572 17.000 0.000 NA   NA
 7685195 7685196 BAA_0816 BAA_0817     FALSE 0.298 55.000 0.000 NA   NA
 7685196 7685197 BAA_0817 BAA_0818     FALSE 0.540 20.000 0.000 NA   NA
 7685197 7685198 BAA_0818 BAA_0819     TRUE 0.638 3.000 0.000 NA   NA
 7685198 7685199 BAA_0819 BAA_0820     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7685199 7685200 BAA_0820 BAA_0821     TRUE 0.647 8.000 0.000 NA   NA
 7685200 7685201 BAA_0821 BAA_0822     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7685201 7685202 BAA_0822 BAA_0823     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7685202 7685203 BAA_0823 BAA_0824     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7685203 7685204 BAA_0824 BAA_0825     FALSE 0.439 135.000 0.000 NA   NA
 7685204 7685205 BAA_0825 BAA_0826     FALSE 0.017 295.000 0.000 NA   NA
 7685206 7685207 BAA_0827 BAA_0828     TRUE 0.844 15.000 0.500 NA   NA
 7685207 7685208 BAA_0828 BAA_0829     TRUE 0.917 6.000 0.750 NA   NA
 7685209 7685210 BAA_0832 BAA_0833     TRUE 0.651 -31.000 0.145 1.000 N NA
 7685210 7685211 BAA_0833 BAA_0834     TRUE 0.986 0.000 0.826 1.000 Y NA
 7685211 7685212 BAA_0834 BAA_0835     TRUE 0.969 -3.000 0.135 0.034 Y NA
 7685212 7685213 BAA_0835 BAA_0836   tenI TRUE 0.911 11.000 0.054 1.000 N NA
 7685213 7685214 BAA_0836 BAA_0837 tenI thiO TRUE 0.811 -7.000 0.194 1.000 N NA
 7685214 7685215 BAA_0837 BAA_0838 thiO thiS TRUE 0.898 16.000 0.239 1.000 N NA
 7685215 7685216 BAA_0838 BAA_0839 thiS thiG TRUE 0.975 3.000 0.054 1.000 Y NA
 7685216 7685217 BAA_0839 BAA_0840 thiG   TRUE 0.949 -7.000 0.012 0.027 Y NA
 7685217 7685218 BAA_0840 BAA_0841   thiD1 TRUE 0.969 16.000 0.195 1.000 Y NA
 7685218 7685219 BAA_0841 BAA_0843 thiD1   FALSE 0.006 442.000 0.000 NA   NA
 7685219 7685220 BAA_0843 BAA_0844     FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7685220 7685221 BAA_0844 BAA_0845     FALSE 0.617 30.000 0.286 NA   NA
 7685221 7685222 BAA_0845 BAA_0847   kdpA FALSE 0.005 547.000 0.000 NA   NA
 7685222 7685223 BAA_0847 BAA_0848 kdpA kdpB TRUE 0.978 14.000 0.035 0.001 Y NA
 7685223 7685224 BAA_0848 BAA_0849 kdpB kdpC TRUE 0.988 17.000 0.877 0.001 Y NA
 7685224 7685225 BAA_0849 BAA_0850 kdpC kdpD FALSE 0.577 63.000 0.066 0.100   NA
 7685227 7685228 BAA_0852 BAA_0853     TRUE 0.801 129.000 0.500 1.000   NA
 7685228 7685229 BAA_0853 BAA_0854     FALSE 0.346 170.000 0.357 NA   NA
 7685231 7685232 BAA_0856 BAA_0857     FALSE 0.296 67.000 0.000 NA   NA
 7685232 7685233 BAA_0857 BAA_0858     FALSE 0.474 126.000 0.000 NA   NA
 7685233 7685234 BAA_0858 BAA_0859     FALSE 0.448 105.000 0.000 NA   NA
 7685235 7685236 BAA_0860 BAA_0861 scrK scrB TRUE 0.962 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 7685236 7685237 BAA_0861 BAA_0862 scrB scrA TRUE 0.966 18.000 0.100 1.000 Y NA
 7685237 7685238 BAA_0862 BAA_0863 scrA scrR TRUE 0.837 129.000 0.113 1.000 N NA
 7685238 7685239 BAA_0863 BAA_0864 scrR   FALSE 0.587 118.000 0.056 NA   NA
 7685239 7685240 BAA_0864 BAA_0865     FALSE 0.409 73.000 0.148 NA   NA
 7685240 7685241 BAA_0865 BAA_0866     TRUE 0.855 13.000 0.073 0.005   NA
 7685241 7685242 BAA_0866 BAA_0867     FALSE 0.276 166.000 0.127 NA   NA
 7685242 7685243 BAA_0867 BAA_0868     TRUE 0.708 117.000 0.364 NA   NA
 7685243 7685244 BAA_0868 BAA_0869     FALSE 0.316 46.000 0.000 NA   NA
 7685244 7685245 BAA_0869 BAA_0870     FALSE 0.483 120.000 0.000 NA   NA
 7685245 7685246 BAA_0870 BAA_0871   gerYC FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7685246 7685247 BAA_0871 BAA_0872 gerYC gerYA TRUE 0.854 84.000 0.867 0.009   NA
 7685247 7685248 BAA_0872 BAA_0873 gerYA   FALSE 0.476 125.000 0.000 NA   NA
 7685248 7685249 BAA_0873 BAA_0874     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7685250 7685251 BAA_0875 BAA_0876   spoVR FALSE 0.569 116.000 0.019 NA   NA
 7685251 7685252 BAA_0876 BAA_0877 spoVR   FALSE 0.489 -7.000 0.007 NA   NA
 7685252 7685253 BAA_0877 BAA_0878     FALSE 0.265 -22.000 0.000 NA   NA
 7685255 7685256 BAA_0880 BAA_0881     TRUE 0.837 134.000 0.800 NA   NA
 7685256 7685257 BAA_0881 BAA_0882     FALSE 0.088 209.000 0.057 NA   NA
 7685257 7685258 BAA_0882 BAA_0883     FALSE 0.169 186.000 0.143 NA   NA
 7685258 7685259 BAA_0883 BAA_0884     FALSE 0.480 89.000 0.127 NA   NA
 7685259 7685260 BAA_0884 BAA_0885     FALSE 0.621 39.000 0.286 1.000   NA
 7685260 7685261 BAA_0885 BAA_0886     TRUE 0.635 32.000 0.207 1.000   NA
 7685261 7685262 BAA_0886 BAA_0887     FALSE 0.313 77.000 0.000 NA   NA
 7685262 7685263 BAA_0887 BAA_0888     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7685263 7685264 BAA_0888 BAA_0889     FALSE 0.295 61.000 0.000 NA   NA
 7685264 7685265 BAA_0889 BAA_0890     FALSE 0.404 34.000 0.000 NA   NA
 7685266 7685267 BAA_0891 BAA_0892     TRUE 0.733 146.000 0.667 NA   NA
 7685269 7685270 BAA_0894 BAA_0895     FALSE 0.482 121.000 0.000 NA   NA
 7685270 7685271 BAA_0895 BAA_0896     FALSE 0.335 43.000 0.000 NA   NA
 7685272 7685273 BAA_0897 BAA_0898     FALSE 0.503 73.000 0.149 1.000   NA
 7685273 7685274 BAA_0898 BAA_0899   celC1 TRUE 0.888 112.000 0.149 0.006 N NA
 7685274 7685275 BAA_0899 BAA_0900 celC1 celA1 TRUE 0.989 2.000 0.778 0.006 Y NA
 7685275 7685276 BAA_0900 BAA_0901 celA1 celB1 TRUE 0.957 83.000 0.583 0.006 Y NA
 7685276 7685277 BAA_0901 BAA_0902 celB1   FALSE 0.599 -24.000 0.583 NA   NA
 7685277 7685278 BAA_0902 BAA_0903     TRUE 0.755 -10.000 0.700 NA   NA
 7685279 7685280 BAA_0904 BAA_0905     FALSE 0.025 571.000 0.000 1.000 N NA
 7685280 7685281 BAA_0905 BAA_0906     TRUE 0.961 -12.000 0.889 1.000 Y NA
 7685281 7685282 BAA_0906 BAA_0907     TRUE 0.947 -3.000 0.889 1.000 N NA
 7685283 7685284 BAA_0908 BAA_0909     FALSE 0.365 89.000 0.000 NA   NA
 7685284 7685285 BAA_0909 BAA_0910     FALSE 0.435 30.000 0.000 NA   NA
 7685285 7685286 BAA_0910 BAA_0911     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7685287 7685288 BAA_0912 BAA_0913 brnQ2 cotJC FALSE 0.198 219.000 0.000 1.000 N NA
 7685288 7685289 BAA_0913 BAA_0914 cotJC cotJB TRUE 0.835 13.000 0.438 NA   NA
 7685289 7685290 BAA_0914 BAA_0915 cotJB cotJA TRUE 0.876 9.000 0.516 NA   NA
 7685291 7685292 BAA_0916 BAA_0917     TRUE 0.738 15.000 0.259 NA   NA
 7685294 7685295 BAA_0920 BAA_0921     TRUE 0.821 11.000 0.368 NA   NA
 7685295 7685296 BAA_0921 BAA_0922     TRUE 0.748 105.000 0.500 NA   NA
 7685296 7685297 BAA_0922 BAA_0923     TRUE 0.851 21.000 0.667 NA   NA
 7685297 7685298 BAA_0923 BAA_0924     FALSE 0.004 838.000 0.000 NA   NA
 7685298 7685299 BAA_0924 BAA_0925     FALSE 0.581 80.000 0.400 NA   NA
 7685299 7685300 BAA_0925 BAA_0926     TRUE 0.869 13.000 0.556 NA   NA
 7685302 7685303 BAA_0928 BAA_0929     TRUE 0.848 126.000 0.778 NA   NA
 7685303 7685304 BAA_0929 BAA_0930     FALSE 0.595 30.000 0.259 NA   NA
 7685304 7685305 BAA_0930 BAA_0931     FALSE 0.591 156.000 0.156 0.001   NA
 7685305 7685306 BAA_0931 BAA_0932     TRUE 0.751 25.000 0.344 1.000   NA
 7685306 7685307 BAA_0932 BAA_0933     FALSE 0.603 49.000 0.357 1.000   NA
 7685307 7685308 BAA_0933 BAA_0934     FALSE 0.305 161.000 0.113 NA   NA
 7685308 7685309 BAA_0934 BAA_0935     FALSE 0.519 156.000 0.429 NA   NA
 7685309 7685310 BAA_0935 BAA_0936     FALSE 0.615 75.000 0.500 NA   NA
 7685312 7685313 BAA_0938 BAA_0939     TRUE 0.831 129.000 0.027 1.000 N NA
 7685313 7685314 BAA_0939 BAA_0940     FALSE 0.045 359.000 0.000 1.000 N NA
 7685314 7685315 BAA_0940 BAA_0941     TRUE 0.990 3.000 0.846 0.066 Y NA
 7685315 7685316 BAA_0941 BAA_0942     TRUE 0.892 133.000 0.538 1.000 N NA
 7685316 7685317 BAA_0942 BAA_0943   blT FALSE 0.273 202.000 0.000 1.000 N NA
 7685319 7685320 BAA_0945 BAA_0946     TRUE 0.698 20.000 0.267 NA   NA
 7685323 7685324 BAA_0949 BAA_0950     FALSE 0.036 238.000 0.000 NA   NA
 7685324 7685325 BAA_0950 BAA_0951     TRUE 0.691 24.000 0.176 1.000   NA
 7685325 7685326 BAA_0951 BAA_0952     FALSE 0.329 193.000 0.160 NA N NA
 7685326 7685327 BAA_0952 BAA_0953     TRUE 0.713 61.000 0.320 NA N NA
 7685328 7685329 BAA_0955 BAA_0956 racE1   FALSE 0.562 113.000 0.005 NA   NA
 7685331 7685332 BAA_0958 BAA_0959     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7685332 7685333 BAA_0959 BAA_0960     FALSE 0.629 12.000 0.000 NA   NA
 7685333 7685334 BAA_0960 BAA_0961     FALSE 0.022 273.000 0.000 NA   NA
 7685334 7685335 BAA_0961 BAA_0962     TRUE 0.939 -22.000 0.594 0.034 Y NA
 7685335 7685336 BAA_0962 BAA_0963     TRUE 0.961 29.000 0.481 1.000 Y NA
 7685339 7685340 BAA_0966 BAA_0967     TRUE 0.830 21.000 0.583 NA   NA
 7685341 7685342 BAA_0968 BAA_0969     FALSE 0.596 142.000 0.321 NA   NA
 7685343 7685344 BAA_0970 BAA_0971     TRUE 0.810 22.000 0.545 NA   NA
 7685345 7685346 BAA_0972 BAA_0973 alsS alsD TRUE 0.907 17.000 0.323 1.000 N NA
 7685347 7685348 BAA_0974 BAA_0975     FALSE 0.587 22.000 0.005 NA   NA
 7685349 7685350 BAA_0976 BAA_0977     FALSE 0.006 494.000 0.000 NA   NA
 7685351 7685352 BAA_0978 BAA_0979     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7685353 7685354 BAA_0980 BAA_0981     FALSE 0.082 315.000 0.000 0.078 N NA
 7685356 7685357 BAA_0983 BAA_0984     FALSE 0.011 343.000 0.000 NA   NA
 7685357 7685358 BAA_0984 BAA_0985     FALSE 0.009 359.000 0.000 NA   NA
 7685359 7685360 BAA_0986 BAA_0987   secA1 TRUE 0.852 15.000 0.519 NA   NA
 7685361 7685362 BAA_0988 BAA_0989   csaB FALSE 0.482 142.000 0.040 NA   NA
 7685362 7685363 BAA_0989 BAA_0990 csaB sap FALSE 0.005 676.000 0.000 NA   NA
 7685363 7685364 BAA_0990 BAA_0991 sap eag FALSE 0.005 722.000 0.000 NA   NA
 7685365 7685366 BAA_0992 BAA_0993     TRUE 0.718 25.000 0.400 NA   NA
 7685367 7685368 BAA_0994 BAA_0995     TRUE 0.812 10.000 0.333 NA   NA
 7685370 7685371 BAA_0997 BAA_0998     FALSE 0.031 250.000 0.000 NA   NA
 7685373 7685374 BAA_1000 BAA_1001     FALSE 0.152 240.000 0.000 1.000 N NA
 7685374 7685375 BAA_1001 BAA_1002     TRUE 0.828 133.000 0.318 NA N NA
 7685377 7685378 BAA_1004 BAA_1005     TRUE 0.963 20.000 0.109 1.000 Y NA
 7685378 7685379 BAA_1005 BAA_1006     FALSE 0.008 386.000 0.000 NA   NA
 7685379 7685380 BAA_1006 BAA_1007     FALSE 0.004 739.000 0.000 NA   NA
 7685380 7685381 BAA_1007 BAA_1008     FALSE 0.007 411.000 0.000 NA   NA
 7685381 7685382 BAA_1008 BAA_1009     FALSE 0.474 52.000 0.286 NA   NA
 7685384 7685385 BAA_1011 BAA_1012     TRUE 0.952 60.000 0.688 0.034 Y NA
 7685385 7685386 BAA_1012 BAA_1013     TRUE 0.990 7.000 0.786 0.034 Y NA
 7685386 7685387 BAA_1013 BAA_1014     FALSE 0.456 27.000 0.000 NA   NA
 7685387 7685388 BAA_1014 BAA_1015     FALSE 0.301 52.000 0.000 NA   NA
 7685388 7685389 BAA_1015 BAA_1016     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7685389 7685390 BAA_1016 BAA_1017     FALSE 0.005 640.000 0.000 NA   NA
 7685390 7685391 BAA_1017 BAA_1018     FALSE 0.173 170.000 0.000 NA   NA
 7685391 7685392 BAA_1018 BAA_1019     FALSE 0.617 37.000 0.375 NA   NA
 7685392 7685393 BAA_1019 BAA_1020     FALSE 0.313 -15.000 0.000 NA   NA
 7685393 7685394 BAA_1020 BAA_1021     FALSE 0.296 68.000 0.000 NA   NA
 7685396 7685397 BAA_1023 BAA_1024     TRUE 0.985 19.000 0.833 0.084 Y NA
 7685397 7685398 BAA_1024 BAA_1025     TRUE 0.867 -3.000 0.611 1.000   NA
 7685398 7685399 BAA_1025 BAA_1026     FALSE 0.074 221.000 0.000 1.000   NA
 7685399 7685400 BAA_1026 BAA_1027     TRUE 0.795 100.000 0.026 1.000 N NA
 7685400 7685401 BAA_1027 BAA_1028     TRUE 0.639 -25.000 0.684 NA   NA
 7685403 7685404 BAA_1030 BAA_1031     TRUE 0.924 4.000 0.833 NA   NA
 7685404 7685405 BAA_1031 BAA_1032     TRUE 0.856 9.000 0.455 NA   NA
 7685405 7685406 BAA_1032 BAA_1033     FALSE 0.455 54.000 0.267 NA   NA
 7685406 7685407 BAA_1033 BAA_1034     FALSE 0.113 201.000 0.200 NA   NA
 7685407 7685408 BAA_1034 BAA_1035     FALSE 0.624 -3.000 0.041 NA   NA
 7685408 7685409 BAA_1035 BAA_1036     FALSE 0.412 33.000 0.000 NA   NA
 7685409 7685410 BAA_1036 BAA_1037     FALSE 0.472 127.000 0.000 NA   NA
 7685410 7685411 BAA_1037 BAA_1038     FALSE 0.515 22.000 0.000 NA   NA
 7685413 7685414 BAA_1040 BAA_1041     FALSE 0.010 353.000 0.000 NA   NA
 7685417 7685418 BAA_1044 BAA_1045     FALSE 0.618 -3.000 0.030 NA   NA
 7685418 7685419 BAA_1045 BAA_1046     FALSE 0.501 -7.000 0.023 NA   NA
 7685419 7685420 BAA_1046 BAA_1047     FALSE 0.073 201.000 0.000 NA   NA
 7685423 7685424 BAA_1050 BAA_1051     FALSE 0.597 117.000 0.109 NA   NA
 7685425 7685426 BAA_1052 BAA_1053     TRUE 0.726 58.000 0.244 1.000 N NA
 7685426 7685427 BAA_1053 BAA_1054     FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 7685428 7685429 BAA_1055 BAA_1056     FALSE 0.022 272.000 0.000 NA   NA
 7685429 7685430 BAA_1056 BAA_1057   pssA TRUE 0.706 44.000 0.000 1.000 N NA
 7685430 7685431 BAA_1057 BAA_1058 pssA   TRUE 0.664 24.000 0.013 1.000   NA
 7685431 7685432 BAA_1058 BAA_1059     FALSE 0.018 293.000 0.000 NA   NA
 7685432 7685433 BAA_1059 BAA_1060     FALSE 0.010 358.000 0.000 NA   NA
 7685434 7685435 BAA_1061 BAA_1062     TRUE 0.931 20.000 0.625 1.000 N NA
 7685438 7685439 BAA_1065 BAA_1066     FALSE 0.066 204.000 0.000 NA   NA
 7685440 7685441 BAA_1067 BAA_1068     FALSE 0.489 113.000 0.000 NA   NA
 7685441 7685442 BAA_1068 BAA_1069     FALSE 0.057 211.000 0.000 NA   NA
 7685443 7685444 BAA_1070 BAA_1071     FALSE 0.007 412.000 0.000 NA   NA
 7685444 7685445 BAA_1071 BAA_1072     FALSE 0.005 555.000 0.000 NA   NA
 7685449 7685450 BAA_1076 BAA_1077     FALSE 0.510 141.000 0.114 NA   NA
 7685450 7685451 BAA_1077 BAA_1078     TRUE 0.841 14.000 0.486 NA   NA
 7685453 7685454 BAA_1080 BAA_1081     TRUE 0.754 51.000 0.875 NA   NA
 7685454 7685455 BAA_1081 BAA_1082     FALSE 0.620 76.000 0.500 NA   NA
 7685457 7685458 BAA_1084 BAA_1085 rsbV rsbW TRUE 0.987 7.000 0.714 1.000 Y NA
 7685458 7685459 BAA_1085 BAA_1086 rsbW sigB TRUE 0.814 -34.000 0.838 1.000 N NA
 7685459 7685460 BAA_1086 BAA_1087 sigB   TRUE 0.709 70.000 0.038 1.000 N NA
 7685460 7685461 BAA_1087 BAA_1088     FALSE 0.507 176.000 0.032 1.000 N NA
 7685462 7685463 BAA_1089 BAA_1090     TRUE 0.968 17.000 0.169 1.000 Y NA
 7685463 7685464 BAA_1090 BAA_1091     FALSE 0.102 206.000 0.000 1.000   NA
 7685465 7685466 BAA_1092 BAA_1093     TRUE 0.711 40.000 0.600 NA   NA
 7685466 7685467 BAA_1093 BAA_1094     FALSE 0.202 214.000 0.600 NA   NA
 7685467 7685468 BAA_1094 BAA_1095     FALSE 0.380 143.000 0.000 NA   NA
 7685468 7685469 BAA_1095 BAA_1096     FALSE 0.012 335.000 0.000 NA   NA
 7685470 7685471 BAA_1097 BAA_1098     FALSE 0.589 118.000 0.068 NA   NA
 7685471 7685472 BAA_1098 BAA_1099     FALSE 0.463 129.000 0.000 NA   NA
 7685475 7685476 BAA_1102 BAA_1103     TRUE 0.726 -3.000 0.330 NA   NA
 7685476 7685477 BAA_1103 BAA_1104     FALSE 0.295 60.000 0.000 NA   NA
 7685477 7685478 BAA_1104 BAA_1105     FALSE 0.027 259.000 0.000 NA   NA
 7685478 7685479 BAA_1105 BAA_1106     FALSE 0.180 168.000 0.000 NA   NA
 7685479 7685480 BAA_1106 BAA_1107     FALSE 0.525 42.000 0.291 NA   NA
 7685480 7685481 BAA_1107 BAA_1108     FALSE 0.271 177.000 0.016 1.000   NA
 7685481 7685482 BAA_1108 BAA_1109     TRUE 0.671 58.000 0.133 NA N NA
 7685482 7685483 BAA_1109 BAA_1110     FALSE 0.007 417.000 0.000 NA   NA
 7685483 7685484 BAA_1110 BAA_1111     FALSE 0.558 44.000 0.368 NA   NA
 7685484 7685485 BAA_1111 BAA_1112     FALSE 0.044 224.000 0.000 NA   NA
 7685485 7685486 BAA_1112 BAA_1113     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7685486 7685487 BAA_1113 BAA_1114     FALSE 0.042 228.000 0.000 NA   NA
 7685487 7685488 BAA_1114 BAA_1115     FALSE 0.584 141.000 0.292 NA   NA
 7685488 7685489 BAA_1115 BAA_1116     FALSE 0.234 174.000 0.167 NA   NA
 7685489 7685490 BAA_1116 BAA_1117     FALSE 0.009 360.000 0.000 NA   NA
 7685490 7685491 BAA_1117 BAA_1118   glpP TRUE 0.935 98.000 0.083 1.000 Y NA
 7685491 7685492 BAA_1118 BAA_1119 glpP glpF FALSE 0.200 229.000 0.083 1.000 N NA
 7685492 7685493 BAA_1119 BAA_1120 glpF glpK TRUE 0.899 14.000 0.057 1.000 N NA
 7685493 7685494 BAA_1120 BAA_1121 glpK glpD TRUE 0.958 134.000 0.013 0.001 Y NA
 7685496 7685497 BAA_1123 BAA_1124     FALSE 0.043 255.000 0.080 NA   NA
 7685497 7685498 BAA_1124 BAA_1125     TRUE 0.982 5.000 0.533 NA Y NA
 7685498 7685499 BAA_1125 BAA_1126     TRUE 0.924 8.000 0.389 NA N NA
 7685501 7685502 BAA_1128 BAA_1129     FALSE 0.388 162.000 0.333 NA   NA
 7685502 7685503 BAA_1129 BAA_1130     TRUE 0.909 23.000 0.333 0.005 N NA
 7685504 7685505 BAA_1131 BAA_1132     TRUE 0.674 88.000 0.500 NA   NA
 7685505 7685506 BAA_1132 BAA_1133   prsA1 FALSE 0.014 378.000 0.000 1.000   NA
 7685507 7685508 BAA_1134 BAA_1135     FALSE 0.016 301.000 0.000 NA   NA
 7685509 7685510 BAA_1136 BAA_1137 hpr   FALSE 0.025 299.000 0.063 NA   NA
 7685510 7685511 BAA_1137 BAA_1138     FALSE 0.217 178.000 0.137 NA   NA
 7685512 7685513 BAA_1139 BAA_1140 ecsA ecsB TRUE 0.794 -7.000 0.271 NA N NA
 7685513 7685514 BAA_1140 BAA_1141 ecsB ecsC TRUE 0.765 14.000 0.292 NA   NA
 7685516 7685517 BAA_1143 BAA_1144     TRUE 0.916 3.000 0.778 NA   NA
 7685517 7685518 BAA_1144 BAA_1145     TRUE 0.753 80.000 0.778 NA   NA
 7685518 7685519 BAA_1145 BAA_1146     FALSE 0.540 20.000 0.000 NA   NA
 7685519 7685520 BAA_1146 BAA_1147     FALSE 0.249 -25.000 0.000 NA   NA
 7685520 7685521 BAA_1147 BAA_1148     FALSE 0.448 105.000 0.000 NA   NA
 7685521 7685522 BAA_1148 BAA_1149     TRUE 0.743 10.000 0.150 NA   NA
 7685522 7685523 BAA_1149 BAA_1150     FALSE 0.005 710.000 0.000 NA   NA
 7685523 7685524 BAA_1150 BAA_1151     FALSE 0.005 692.000 0.000 NA   NA
 7685526 7685527 BAA_1153 BAA_1154     FALSE 0.016 303.000 0.000 NA   NA
 7685527 7685528 BAA_1154 BAA_1155     FALSE 0.510 74.000 0.333 NA   NA
 7685528 7685529 BAA_1155 BAA_1156     TRUE 0.732 50.000 0.778 NA   NA
 7685531 7685532 BAA_1158 BAA_1159 pbpF hemE TRUE 0.664 156.000 0.020 1.000 N NA
 7685532 7685533 BAA_1159 BAA_1160 hemE hemH1 TRUE 0.971 15.000 0.131 1.000 Y NA
 7685533 7685534 BAA_1160 BAA_1161 hemH1 hemY1 TRUE 0.963 20.000 0.069 1.000 Y NA
 7685536 7685537 BAA_1163 BAA_1165     FALSE 0.294 152.000 0.000 NA   NA
 7685539 7685540 BAA_1166 BAA_1167 blaI   TRUE 0.978 -3.000 0.833 NA Y NA
 7685540 7685541 BAA_1167 BAA_1168     FALSE 0.488 214.000 0.000 NA Y NA
 7685541 7685542 BAA_1168 BAA_1169     FALSE 0.055 212.000 0.000 NA   NA
 7685542 7685543 BAA_1169 BAA_1170     FALSE 0.565 144.000 0.300 NA   NA
 7685543 7685544 BAA_1170 BAA_1171     TRUE 0.790 37.000 0.778 NA   NA
 7685546 7685547 BAA_1173 BAA_1174     FALSE 0.036 238.000 0.000 NA   NA
 7685549 7685550 BAA_1176 BAA_1177     TRUE 0.810 10.000 0.200 1.000   NA
 7685550 7685551 BAA_1177 BAA_1178     FALSE 0.044 255.000 0.098 NA   NA
 7685551 7685552 BAA_1178 BAA_1179     FALSE 0.621 162.000 0.778 NA   NA
 7685552 7685553 BAA_1179 BAA_1180     FALSE 0.617 113.000 0.222 NA   NA
 7685553 7685554 BAA_1180 BAA_1181     FALSE 0.623 90.000 0.400 NA   NA
 7685554 7685555 BAA_1181 BAA_1182     FALSE 0.013 326.000 0.000 NA   NA
 7685555 7685556 BAA_1182 BAA_1183     TRUE 0.647 8.000 0.000 NA   NA
 7685556 7685557 BAA_1183 BAA_1184     FALSE 0.441 29.000 0.000 NA   NA
 7685557 7685558 BAA_1184 BAA_1185     FALSE 0.297 56.000 0.000 NA   NA
 7685558 7685559 BAA_1185 BAA_1186     TRUE 0.783 -7.000 0.667 NA   NA
 7685559 7685560 BAA_1186 BAA_1187     FALSE 0.304 75.000 0.000 NA   NA
 7685560 7685561 BAA_1187 BAA_1188     FALSE 0.013 327.000 0.000 NA   NA
 7685561 7685562 BAA_1188 BAA_1189     FALSE 0.294 152.000 0.000 NA   NA
 7685562 7685563 BAA_1189 BAA_1190     FALSE 0.006 461.000 0.000 NA   NA
 7685563 7685564 BAA_1190 BAA_1191     TRUE 0.642 10.000 0.000 NA   NA
 7685566 7685567 BAA_1193 BAA_1194     FALSE 0.337 147.000 0.000 NA   NA
 7685567 7685568 BAA_1194 BAA_1195     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7685568 7685569 BAA_1195 BAA_1196     FALSE 0.051 216.000 0.000 NA   NA
 7685570 7685571 BAA_1197 BAA_1198     TRUE 0.819 6.000 0.333 NA   NA
 7685572 7685573 BAA_1199 BAA_1200     FALSE 0.475 60.000 0.294 NA   NA
 7685573 7685574 BAA_1200 BAA_1201     FALSE 0.299 183.000 0.429 NA   NA
 7685575 7685576 BAA_1202 BAA_1203     TRUE 0.983 10.000 0.533 1.000 Y NA
 7685577 7685578 BAA_1204 BAA_1205     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7685578 7685579 BAA_1205 BAA_1206     FALSE 0.407 140.000 0.000 NA   NA
 7685579 7685580 BAA_1206 BAA_1207     TRUE 0.827 12.000 0.400 NA   NA
 7685580 7685581 BAA_1207 BAA_1208     FALSE 0.515 135.000 0.009 NA   NA
 7685581 7685582 BAA_1208 BAA_1209     TRUE 0.843 137.000 0.022 0.094 N NA
 7685582 7685583 BAA_1209 BAA_1210     FALSE 0.129 213.000 0.000 0.094   NA
 7685583 7685584 BAA_1210 BAA_1211     TRUE 0.631 78.000 0.500 NA   NA
 7685586 7685587 BAA_1213 BAA_1214     FALSE 0.011 340.000 0.000 NA   NA
 7685587 7685588 BAA_1214 BAA_1215   aceB FALSE 0.166 184.000 0.044 NA   NA
 7685588 7685589 BAA_1215 BAA_1216 aceB aceA TRUE 0.955 24.000 0.084 1.000 Y NA
 7685591 7685592 BAA_1218 BAA_1219 cspA1   FALSE 0.419 102.000 0.000 NA   NA
 7685594 7685595 BAA_1221 BAA_1222     FALSE 0.031 274.000 0.033 NA   NA
 7685595 7685596 BAA_1222 BAA_1223   sipT FALSE 0.428 57.000 0.246 NA   NA
 7685596 7685597 BAA_1223 BAA_1224 sipT addB TRUE 0.848 117.000 0.086 1.000 N NA
 7685597 7685598 BAA_1224 BAA_1225 addB addA TRUE 0.976 -3.000 0.408 0.003 Y NA
 7685598 7685599 BAA_1225 BAA_1226 addA   TRUE 0.841 13.000 0.035 0.041   NA
 7685600 7685601 BAA_1227 BAA_1228 gerPF1 gerPE FALSE 0.458 43.000 0.222 NA   NA
 7685601 7685602 BAA_1228 BAA_1229 gerPE gerPD TRUE 0.753 16.000 0.296 NA   NA
 7685602 7685603 BAA_1229 BAA_1230 gerPD gerPC TRUE 0.712 7.000 0.003 NA   NA
 7685603 7685604 BAA_1230 BAA_1231 gerPC gerPB FALSE 0.359 67.000 0.003 NA   NA
 7685604 7685605 BAA_1231 BAA_1232 gerPB gerPA TRUE 0.914 15.000 0.889 NA   NA
 7685605 7685606 BAA_1232 BAA_1233 gerPA   FALSE 0.389 97.000 0.000 NA   NA
 7685608 7685609 BAA_1235 BAA_1236   rocD FALSE 0.544 106.000 0.023 NA   NA
 7685612 7685613 BAA_1239 BAA_1240 asnO1 hemH2 FALSE 0.386 189.000 0.011 1.000 N NA
 7685613 7685614 BAA_1240 BAA_1241 hemH2 katB TRUE 0.701 60.000 0.013 1.000 N NA
 7685615 7685616 BAA_1242 BAA_1243     FALSE 0.297 70.000 0.000 NA   NA
 7685617 7685618 BAA_1244 BAA_1245     FALSE 0.050 251.000 0.000 1.000   NA
 7685620 7685621 BAA_1247 BAA_1248     FALSE 0.184 184.000 0.000 1.000   NA
 7685622 7685623 BAA_1249 BAA_1250 prsA2   TRUE 0.743 129.000 0.467 NA   NA
 7685625 7685626 BAA_1252 BAA_1253     TRUE 0.915 1.000 0.826 NA   NA
 7685626 7685627 BAA_1253 BAA_1254     TRUE 0.722 106.000 0.429 NA   NA
 7685628 7685629 BAA_1255 BAA_1256   clpB FALSE 0.057 211.000 0.000 NA   NA
 7685631 7685632 BAA_1258 BAA_1259     FALSE 0.408 48.000 0.065 NA   NA
 7685632 7685633 BAA_1259 BAA_1260     TRUE 0.741 6.000 0.065 NA   NA
 7685633 7685634 BAA_1260 BAA_1261   fabH FALSE 0.008 391.000 0.000 NA   NA
 7685634 7685635 BAA_1261 BAA_1262 fabH fabF TRUE 0.955 32.000 0.076 0.001 Y NA
 7685635 7685636 BAA_1262 BAA_1263 fabF   TRUE 0.801 107.000 0.039 NA N NA
 7685636 7685637 BAA_1263 BAA_1264     FALSE 0.588 143.000 0.321 NA   NA
 7685638 7685639 BAA_1265 BAA_1266 trpS   FALSE 0.007 398.000 0.000 NA   NA
 7685640 7685641 BAA_1267 BAA_1268     TRUE 0.959 128.000 0.031 0.032 Y NA
 7685641 7685642 BAA_1268 BAA_1269     TRUE 0.969 -3.000 0.165 0.032 Y NA
 7685642 7685643 BAA_1269 BAA_1270     TRUE 0.980 19.000 0.706 1.000 Y NA
 7685643 7685644 BAA_1270 BAA_1271     TRUE 0.792 -7.000 0.375 0.003   NA
 7685648 7685649 BAA_1275 BAA_1276   spx FALSE 0.006 478.000 0.000 NA   NA
 7685651 7685652 BAA_1278 BAA_1279 mecA cls2 TRUE 0.715 73.000 0.314 NA N NA
 7685652 7685653 BAA_1279 BAA_1280 cls2   FALSE 0.450 82.000 0.189 NA   NA
 7685653 7685654 BAA_1280 BAA_1281   pepF1 FALSE 0.547 51.000 0.398 NA   NA
 7685655 7685656 BAA_1282 BAA_1283     FALSE 0.040 230.000 0.000 NA   NA
 7685656 7685657 BAA_1283 BAA_1284     TRUE 0.710 0.000 0.138 NA   NA
 7685657 7685658 BAA_1284 BAA_1285     FALSE 0.257 181.000 0.063 1.000   NA
 7685659 7685660 BAA_1286 BAA_1287     FALSE 0.608 31.000 0.283 NA   NA
 7685660 7685661 BAA_1287 BAA_1288     TRUE 0.895 19.000 0.725 1.000   NA
 7685661 7685662 BAA_1288 BAA_1289     TRUE 0.928 16.000 0.480 1.000 N NA
 7685663 7685664 BAA_1290 BAA_1291     FALSE 0.007 408.000 0.000 NA   NA
 7685664 7685665 BAA_1291 BAA_1292     FALSE 0.397 141.000 0.000 NA   NA
 7685665 7685666 BAA_1292 BAA_1293     FALSE 0.304 75.000 0.000 NA   NA
 7685666 7685667 BAA_1293 BAA_1294     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7685667 7685668 BAA_1294 BAA_1295     FALSE 0.380 143.000 0.000 NA   NA
 7685668 7685669 BAA_1295 BAA_1296     TRUE 0.767 7.000 0.242 NA   NA
 7685669 7685670 BAA_1296 BAA_1297     TRUE 0.679 128.000 0.212 1.000   NA
 7685670 7685671 BAA_1297 BAA_1298   bclA FALSE 0.597 123.000 0.154 NA   NA
 7685672 7685673 BAA_1299 BAA_1300     FALSE 0.291 180.000 0.250 1.000   NA
 7685673 7685674 BAA_1300 BAA_1301     TRUE 0.641 138.000 0.222 1.000   NA
 7685674 7685675 BAA_1301 BAA_1302     TRUE 0.784 -3.000 0.444 NA   NA
 7685675 7685676 BAA_1302 BAA_1303     TRUE 0.844 13.000 0.471 NA   NA
 7685676 7685677 BAA_1303 BAA_1304     TRUE 0.833 15.000 0.471 NA   NA
 7685677 7685678 BAA_1304 BAA_1305   rfbC TRUE 0.976 9.000 0.096 1.000 Y NA
 7685678 7685679 BAA_1305 BAA_1306 rfbC rfbB TRUE 0.968 17.000 0.183 1.000 Y NA
 7685679 7685680 BAA_1306 BAA_1307 rfbB rfbD TRUE 0.980 12.000 0.088 0.002 Y NA
 7685680 7685681 BAA_1307 BAA_1308 rfbD fabI TRUE 0.844 109.000 0.082 1.000 N NA
 7685681 7685682 BAA_1308 BAA_1309 fabI   FALSE 0.298 162.000 0.129 NA   NA
 7685684 7685685 BAA_1311 BAA_1312     TRUE 0.751 111.000 0.438 NA   NA
 7685686 7685687 BAA_1313 BAA_1314   cotZ2 FALSE 0.180 168.000 0.000 NA   NA
 7685687 7685688 BAA_1314 BAA_1315 cotZ2   TRUE 0.769 143.000 0.700 NA   NA
 7685688 7685689 BAA_1315 BAA_1316     FALSE 0.625 100.000 0.222 1.000   NA
 7685689 7685690 BAA_1316 BAA_1317     TRUE 0.803 2.000 0.213 1.000   NA
 7685690 7685691 BAA_1317 BAA_1318     TRUE 0.773 93.000 0.287 NA N NA
 7685692 7685693 BAA_1319 BAA_1320     FALSE 0.475 149.000 0.267 NA   NA
 7685694 7685695 BAA_1321 BAA_1322     FALSE 0.036 271.000 0.130 NA   NA
 7685696 7685697 BAA_1323 BAA_1324   trpE FALSE 0.009 370.000 0.000 NA   NA
 7685697 7685698 BAA_1324 BAA_1325 trpE   TRUE 0.974 -3.000 0.293 0.001 Y NA
 7685698 7685699 BAA_1325 BAA_1326   trpD TRUE 0.961 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 7685699 7685700 BAA_1326 BAA_1327 trpD   TRUE 0.975 2.000 0.216 1.000 Y NA
 7685700 7685701 BAA_1327 BAA_1328   trpF TRUE 0.973 -3.000 0.264 0.001 Y NA
 7685701 7685702 BAA_1328 BAA_1329 trpF trpB TRUE 0.976 -3.000 0.375 0.001 Y NA
 7685702 7685703 BAA_1329 BAA_1330 trpB trpA TRUE 0.982 4.000 0.248 0.001 Y NA
 7685703 7685704 BAA_1330 BAA_1331 trpA   FALSE 0.376 75.000 0.015 NA   NA
 7685704 7685705 BAA_1331 BAA_1332     FALSE 0.602 115.000 0.119 NA   NA
 7685705 7685706 BAA_1332 BAA_1333     FALSE 0.491 92.000 0.167 NA   NA
 7685710 7685711 BAA_1337 BAA_1338     FALSE 0.624 102.000 0.098 1.000   NA
 7685711 7685712 BAA_1338 BAA_1339     FALSE 0.481 145.000 0.208 NA   NA
 7685713 7685714 BAA_1340 BAA_1341     TRUE 0.894 17.000 0.786 NA   NA
 7685714 7685715 BAA_1341 BAA_1342     TRUE 0.867 -3.000 0.733 NA   NA
 7685715 7685716 BAA_1342 BAA_1343   odhB FALSE 0.555 125.000 0.014 NA   NA
 7685716 7685717 BAA_1343 BAA_1344 odhB odhA TRUE 0.967 136.000 0.667 1.000 Y NA
 7685718 7685719 BAA_1345 BAA_1346     TRUE 0.925 3.000 0.875 NA   NA
 7685719 7685720 BAA_1346 BAA_1347     TRUE 0.800 29.000 0.667 NA   NA
 7685720 7685721 BAA_1347 BAA_1348     TRUE 0.799 135.000 0.667 NA   NA
 7685721 7685722 BAA_1348 BAA_1349     FALSE 0.006 441.000 0.000 NA   NA
 7685722 7685723 BAA_1349 BAA_1350     FALSE 0.439 135.000 0.000 NA   NA
 7685723 7685724 BAA_1350 BAA_1351     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7685724 7685725 BAA_1351 BAA_1352     FALSE 0.369 38.000 0.000 NA   NA
 7685726 7685727 BAA_1353 BAA_1354     FALSE 0.102 189.000 0.000 NA   NA
 7685727 7685728 BAA_1354 BAA_1355     FALSE 0.032 278.000 0.103 NA   NA
 7685729 7685730 BAA_1356 BAA_1357     TRUE 0.656 156.000 0.700 NA   NA
 7685730 7685731 BAA_1357 BAA_1358   sipW FALSE 0.300 195.000 0.320 0.030   NA
 7685731 7685732 BAA_1358 BAA_1359 sipW   FALSE 0.492 63.000 0.320 NA   NA
 7685732 7685733 BAA_1359 BAA_1360     FALSE 0.621 162.000 0.778 NA   NA
 7685733 7685734 BAA_1360 BAA_1361   calY FALSE 0.007 398.000 0.000 NA   NA
 7685736 7685737 BAA_1363 BAA_1364     FALSE 0.312 172.000 0.069 1.000   NA
 7685737 7685738 BAA_1364 BAA_1365   potA FALSE 0.179 227.000 0.000 1.000 N NA
 7685738 7685739 BAA_1365 BAA_1366 potA potB TRUE 0.984 -3.000 0.789 0.032 Y NA
 7685739 7685740 BAA_1366 BAA_1367 potB potC TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7685740 7685741 BAA_1367 BAA_1368 potC potD FALSE 0.361 39.000 0.000 NA   NA
 7685741 7685742 BAA_1368 BAA_1369 potD   TRUE 0.735 60.000 0.267 1.000 N NA
 7685742 7685743 BAA_1369 BAA_1370     TRUE 0.756 111.000 0.333 1.000   NA
 7685743 7685744 BAA_1370 BAA_1371     FALSE 0.628 101.000 0.333 NA   NA
 7685744 7685745 BAA_1371 BAA_1372     FALSE 0.506 99.000 0.089 NA   NA
 7685745 7685746 BAA_1372 BAA_1373     FALSE 0.481 92.000 0.089 NA   NA
 7685747 7685748 BAA_1374 BAA_1375     FALSE 0.006 466.000 0.000 NA   NA
 7685748 7685749 BAA_1375 BAA_1376   glcD TRUE 0.968 -3.000 0.342 1.000 Y NA
 7685749 7685750 BAA_1376 BAA_1377 glcD   TRUE 0.856 118.000 0.247 1.000 N NA
 7685751 7685752 BAA_1378 BAA_1379     TRUE 0.740 -7.000 0.543 NA   NA
 7685752 7685753 BAA_1379 BAA_1380     TRUE 0.985 4.000 0.621 1.000 Y NA
 7685753 7685754 BAA_1380 BAA_1381     FALSE 0.117 261.000 0.000 1.000 N NA
 7685754 7685755 BAA_1381 BAA_1382     FALSE 0.594 168.000 0.395 NA N NA
 7685755 7685756 BAA_1382 BAA_1383     TRUE 0.983 17.000 0.947 NA Y NA
 7685756 7685757 BAA_1383 BAA_1384     TRUE 0.914 0.000 0.500 0.001   NA
 7685757 7685758 BAA_1384 BAA_1385   comC TRUE 0.671 113.000 0.022 1.000   NA
 7685758 7685759 BAA_1385 BAA_1386 comC   FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7685759 7685760 BAA_1386 BAA_1387     FALSE 0.274 -21.000 0.000 NA   NA
 7685761 7685762 BAA_1388 BAA_1389     FALSE 0.582 204.000 0.000 1.000 Y NA
 7685762 7685763 BAA_1389 BAA_1391     FALSE 0.294 295.000 0.000 0.062 Y NA
 7685763 7685764 BAA_1391 BAA_1392     TRUE 0.801 115.000 0.455 1.000   NA
 7685764 7685765 BAA_1392 BAA_1393     TRUE 0.736 148.000 0.615 1.000   NA
 7685765 7685766 BAA_1393 BAA_1394     TRUE 0.771 102.000 0.615 NA   NA
 7685766 7685767 BAA_1394 BAA_1395     FALSE 0.501 43.000 0.273 NA   NA
 7685768 7685769 BAA_1396 BAA_1397   phbB FALSE 0.591 150.000 0.450 NA   NA
 7685769 7685770 BAA_1397 BAA_1398 phbB phaC TRUE 0.939 83.000 0.161 0.001 Y NA
 7685770 7685771 BAA_1398 BAA_1399 phaC   TRUE 0.788 96.000 0.113 1.000 N NA
 7685771 7685772 BAA_1399 BAA_1400     TRUE 0.848 24.000 0.096 1.000 N NA
 7685774 7685775 BAA_1402 BAA_1403     FALSE 0.041 229.000 0.000 NA   NA
 7685775 7685776 BAA_1403 BAA_1404     FALSE 0.271 155.000 0.000 NA   NA
 7685776 7685777 BAA_1404 BAA_1405     FALSE 0.326 -13.000 0.000 NA   NA
 7685777 7685778 BAA_1405 BAA_1406     FALSE 0.398 99.000 0.000 NA   NA
 7685778 7685779 BAA_1406 BAA_1407   phnX FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7685779 7685780 BAA_1407 BAA_1408 phnX   TRUE 0.857 16.000 0.315 0.073   NA
 7685780 7685781 BAA_1408 BAA_1409     TRUE 0.955 -3.000 0.029 NA Y NA
 7685781 7685782 BAA_1409 BAA_1410     TRUE 0.709 41.000 0.029 NA N NA
 7685782 7685783 BAA_1410 BAA_1411     FALSE 0.491 162.000 0.500 NA   NA
 7685783 7685784 BAA_1411 BAA_1412     FALSE 0.260 156.000 0.000 NA   NA
 7685784 7685785 BAA_1412 BAA_1413     FALSE 0.361 -10.000 0.000 NA   NA
 7685785 7685786 BAA_1413 BAA_1414     FALSE 0.441 29.000 0.000 NA   NA
 7685786 7685787 BAA_1414 BAA_1415     FALSE 0.019 286.000 0.000 NA   NA
 7685787 7685788 BAA_1415 BAA_1416     FALSE 0.447 -6.000 0.000 NA   NA
 7685788 7685789 BAA_1416 BAA_1417     FALSE 0.474 126.000 0.000 NA   NA
 7685793 7685794 BAA_1421 BAA_1422     FALSE 0.573 161.000 0.129 NA N NA
 7685794 7685795 BAA_1422 BAA_1423     FALSE 0.529 139.000 0.114 NA   NA
 7685795 7685796 BAA_1423 BAA_1424     TRUE 0.689 103.000 0.417 NA   NA
 7685798 7685799 BAA_1427 BAA_1428     TRUE 0.774 0.000 0.062 1.000   NA
 7685799 7685800 BAA_1428 BAA_1429   queE TRUE 0.828 -7.000 0.280 1.000 N NA
 7685800 7685801 BAA_1429 BAA_1430 queE   TRUE 0.739 19.000 0.101 1.000   NA
 7685803 7685804 BAA_1432 BAA_1433     FALSE 0.482 89.000 0.140 NA   NA
 7685806 7685807 BAA_1435 BAA_1436     FALSE 0.588 27.000 0.229 NA   NA
 7685807 7685808 BAA_1436 BAA_1437   nrdI FALSE 0.006 477.000 0.000 NA   NA
 7685808 7685809 BAA_1437 BAA_1438 nrdI   FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7685809 7685810 BAA_1438 BAA_1439     FALSE 0.056 241.000 0.000 1.000   NA
 7685810 7685811 BAA_1439 BAA_1440   nrdE FALSE 0.508 95.000 0.000 1.000   NA
 7685811 7685812 BAA_1440 BAA_1441 nrdE nrdF TRUE 0.967 94.000 0.625 0.001 Y NA
 7685812 7685813 BAA_1441 BAA_1442 nrdF   FALSE 0.206 217.000 0.000 1.000 N NA
 7685813 7685814 BAA_1442 BAA_1443     TRUE 0.884 -3.000 0.280 1.000 N NA
 7685814 7685815 BAA_1443 BAA_1444     TRUE 0.875 -3.000 0.778 NA   NA
 7685815 7685816 BAA_1444 BAA_1445     TRUE 0.894 15.000 0.727 NA   NA
 7685816 7685817 BAA_1445 BAA_1446     TRUE 0.837 0.000 0.471 NA   NA
 7685817 7685818 BAA_1446 BAA_1447     FALSE 0.097 203.000 0.040 NA   NA
 7685819 7685820 BAA_1448 BAA_1449     FALSE 0.570 101.000 0.258 NA   NA
 7685821 7685822 BAA_1450 BAA_1451     FALSE 0.535 -7.000 0.194 NA   NA
 7685822 7685823 BAA_1451 BAA_1452     FALSE 0.472 87.000 0.127 NA   NA
 7685826 7685827 BAA_1455 BAA_1456 dltD dltC TRUE 0.718 -3.000 0.064 1.000   NA
 7685827 7685828 BAA_1456 BAA_1457 dltC dltB FALSE 0.535 69.000 0.387 NA   NA
 7685828 7685829 BAA_1457 BAA_1458 dltB dltA TRUE 0.890 -3.000 0.435 NA N NA
 7685829 7685830 BAA_1458 BAA_1459 dltA   TRUE 0.866 13.000 0.549 NA   NA
 7685831 7685832 BAA_1460 BAA_1461 amaA   FALSE 0.042 227.000 0.000 NA   NA
 7685832 7685833 BAA_1461 BAA_1462     FALSE 0.620 -7.000 0.316 NA   NA
 7685833 7685834 BAA_1462 BAA_1463     TRUE 0.730 25.000 0.421 NA   NA
 7685834 7685835 BAA_1463 BAA_1464     TRUE 0.634 100.000 0.357 NA   NA
 7685838 7685839 BAA_1467 BAA_1468     TRUE 0.862 19.000 0.667 NA   NA
 7685839 7685840 BAA_1468 BAA_1469     FALSE 0.374 74.000 0.018 NA   NA
 7685842 7685843 BAA_1471 BAA_1472     FALSE 0.372 67.000 0.022 NA   NA
 7685844 7685845 BAA_1473 BAA_1474     FALSE 0.429 137.000 0.000 NA   NA
 7685849 7685850 BAA_1478 BAA_1479     TRUE 0.762 85.000 0.750 NA   NA
 7685851 7685852 BAA_1480 BAA_1481     FALSE 0.603 118.000 0.195 NA   NA
 7685853 7685854 BAA_1482 BAA_1483   ilvE1 FALSE 0.601 120.000 0.150 NA   NA
 7685854 7685855 BAA_1483 BAA_1484 ilvE1 ilvB FALSE 0.232 307.000 0.000 1.000 Y NA
 7685855 7685856 BAA_1484 BAA_1485 ilvB ilvN TRUE 0.972 -3.000 0.249 0.001 Y NA
 7685856 7685857 BAA_1485 BAA_1486 ilvN ilvC1 TRUE 0.960 27.000 0.130 0.002 Y NA
 7685857 7685858 BAA_1486 BAA_1487 ilvC1 leuA TRUE 0.974 2.000 0.103 1.000 Y NA
 7685858 7685859 BAA_1487 BAA_1488 leuA leuB TRUE 0.931 78.000 0.041 0.001 Y NA
 7685859 7685860 BAA_1488 BAA_1489 leuB leuC TRUE 0.978 0.000 0.080 0.001 Y NA
 7685860 7685861 BAA_1489 BAA_1490 leuC leuD TRUE 0.935 -22.000 0.477 0.001 Y NA
 7685861 7685862 BAA_1490 BAA_1491 leuD hisZ FALSE 0.224 311.000 0.000 1.000 Y NA
 7685862 7685863 BAA_1491 BAA_1492 hisZ hisG TRUE 0.911 -24.000 0.239 0.003 Y NA
 7685863 7685864 BAA_1492 BAA_1493 hisG hisD TRUE 0.981 12.000 0.254 0.003 Y NA
 7685864 7685865 BAA_1493 BAA_1494 hisD hisB TRUE 0.977 0.000 0.096 0.003 Y NA
 7685865 7685866 BAA_1494 BAA_1495 hisB hisH TRUE 0.979 1.000 0.125 0.003 Y NA
 7685866 7685867 BAA_1495 BAA_1496 hisH hisA TRUE 0.902 -27.000 0.124 0.003 Y NA
 7685867 7685868 BAA_1496 BAA_1497 hisA hisF TRUE 0.968 -6.000 0.433 0.003 Y NA
 7685868 7685869 BAA_1497 BAA_1498 hisF hisE FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7685869 7685870 BAA_1498 BAA_1499 hisE hisI TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7685870 7685871 BAA_1499 BAA_1500 hisI   TRUE 0.979 12.000 0.016 0.003 Y NA
 7685871 7685872 BAA_1500 BAA_1501     TRUE 0.714 68.000 0.750 NA   NA
 7685872 7685873 BAA_1501 BAA_1502     FALSE 0.507 99.000 0.096 NA   NA
 7685874 7685875 BAA_1503 BAA_1504     FALSE 0.448 182.000 0.011 1.000 N NA
 7685876 7685877 BAA_1505 BAA_1507   lysA FALSE 0.006 457.000 0.000 NA   NA
 7685877 7685878 BAA_1507 BAA_1509 lysA   FALSE 0.017 297.000 0.000 NA   NA
 7685878 7685879 BAA_1509 BAA_1510   cysH FALSE 0.431 87.000 0.011 NA   NA
 7685879 7685880 BAA_1510 BAA_1511 cysH sat TRUE 0.768 39.000 0.065 1.000 N NA
 7685880 7685881 BAA_1511 BAA_1512 sat cysC TRUE 0.979 13.000 0.101 0.001 Y NA
 7685881 7685882 BAA_1512 BAA_1513 cysC   TRUE 0.974 12.000 0.067 1.000 Y NA
 7685882 7685883 BAA_1513 BAA_1514     TRUE 0.895 11.000 0.647 NA   NA
 7685883 7685884 BAA_1514 BAA_1515   cysG FALSE 0.532 87.000 0.281 NA   NA
 7685884 7685885 BAA_1515 BAA_1516 cysG   TRUE 0.829 2.000 0.281 1.000   NA
 7685885 7685886 BAA_1516 BAA_1517     FALSE 0.540 -25.000 0.375 1.000   NA
 7685886 7685887 BAA_1517 BAA_1518     FALSE 0.011 419.000 0.000 1.000   NA
 7685889 7685890 BAA_1520 BAA_1521     TRUE 0.635 68.000 0.556 NA   NA
 7685890 7685891 BAA_1521 BAA_1523     FALSE 0.013 322.000 0.000 NA   NA
 7685891 7685892 BAA_1523 BAA_1524     FALSE 0.059 229.000 0.046 NA   NA
 7685892 7685893 BAA_1524 BAA_1525     FALSE 0.628 51.000 0.514 NA   NA
 7685893 7685894 BAA_1525 BAA_1526     FALSE 0.585 107.000 0.135 NA   NA
 7685894 7685895 BAA_1526 BAA_1527     TRUE 0.700 0.000 0.080 NA   NA
 7685895 7685896 BAA_1527 BAA_1528     TRUE 0.985 -3.000 0.853 0.018 Y NA
 7685896 7685897 BAA_1528 BAA_1529     FALSE 0.555 133.000 0.075 NA   NA
 7685898 7685899 BAA_1530 BAA_1531 brnQ3   FALSE 0.021 837.000 0.000 1.000 N NA
 7685902 7685903 BAA_1534 BAA_1535     FALSE 0.595 115.000 0.092 NA   NA
 7685903 7685904 BAA_1535 BAA_1536   hmp FALSE 0.303 160.000 0.049 NA   NA
 7685907 7685908 BAA_1539 BAA_1540     TRUE 0.690 118.000 0.136 1.000   NA
 7685908 7685909 BAA_1540 BAA_1541     TRUE 0.970 12.000 0.100 NA Y NA
 7685911 7685912 BAA_1543 BAA_1544     FALSE 0.007 396.000 0.000 NA   NA
 7685912 7685913 BAA_1544 BAA_1545     FALSE 0.098 190.000 0.000 NA   NA
 7685913 7685914 BAA_1545 BAA_1546     FALSE 0.380 -9.000 0.000 NA   NA
 7685916 7685917 BAA_1548 BAA_1549     TRUE 0.773 120.000 0.500 NA   NA
 7685917 7685918 BAA_1549 BAA_1550     TRUE 0.765 108.000 0.389 1.000   NA
 7685918 7685919 BAA_1550 BAA_1551   deoD TRUE 0.657 157.000 0.040 1.000 N NA
 7685920 7685921 BAA_1552 BAA_1553     FALSE 0.008 393.000 0.000 NA   NA
 7685923 7685924 BAA_1555 BAA_1556     TRUE 0.769 22.000 0.435 NA   NA
 7685924 7685925 BAA_1556 BAA_1557     FALSE 0.569 106.000 0.101 NA   NA
 7685925 7685926 BAA_1557 BAA_1558     TRUE 0.850 113.000 0.101 1.000 N NA
 7685926 7685927 BAA_1558 BAA_1559   spmA TRUE 0.654 -7.000 0.252 1.000   NA
 7685927 7685928 BAA_1559 BAA_1560 spmA   TRUE 0.847 -3.000 0.655 NA   NA
 7685928 7685929 BAA_1560 BAA_1561   rluB FALSE 0.027 290.000 0.063 NA   NA
 7685929 7685930 BAA_1561 BAA_1562 rluB resA TRUE 0.784 95.000 0.069 1.000 N NA
 7685930 7685931 BAA_1562 BAA_1563 resA resB TRUE 0.953 122.000 0.306 NA Y NA
 7685931 7685932 BAA_1563 BAA_1564 resB resC TRUE 0.969 15.000 0.278 NA Y NA
 7685932 7685933 BAA_1564 BAA_1565 resC resD FALSE 0.129 267.000 0.178 1.000 N NA
 7685933 7685934 BAA_1565 BAA_1566 resD resE TRUE 0.980 0.000 0.511 1.000 Y NA
 7685934 7685935 BAA_1566 BAA_1567 resE   TRUE 0.702 138.000 0.046 0.096   NA
 7685935 7685936 BAA_1567 BAA_1568     FALSE 0.555 85.000 0.108 1.000   NA
 7685940 7685941 BAA_1573 BAA_1574   recQ1 FALSE 0.469 -10.000 0.103 NA   NA
 7685941 7685942 BAA_1574 BAA_1575 recQ1   TRUE 0.710 0.000 0.192 NA   NA
 7685942 7685943 BAA_1575 BAA_1576     TRUE 0.699 23.000 0.320 NA   NA
 7685943 7685944 BAA_1576 BAA_1577     FALSE 0.296 67.000 0.000 NA   NA
 7685944 7685945 BAA_1577 BAA_1578     FALSE 0.233 -33.000 0.000 NA   NA
 7685945 7685946 BAA_1578 BAA_1579     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7685946 7685947 BAA_1579 BAA_1580     TRUE 0.765 78.000 0.417 NA N NA
 7685947 7685948 BAA_1580 BAA_1581   gudB FALSE 0.106 269.000 0.222 NA N NA
 7685948 7685949 BAA_1581 BAA_1582 gudB   FALSE 0.453 79.000 0.233 NA   NA
 7685949 7685950 BAA_1582 BAA_1583     TRUE 0.767 93.000 0.700 NA   NA
 7685950 7685951 BAA_1583 BAA_1584     FALSE 0.330 80.000 0.000 NA   NA
 7685951 7685952 BAA_1584 BAA_1585     FALSE 0.173 170.000 0.000 NA   NA
 7685954 7685955 BAA_1587 BAA_1588 cmk rpsA FALSE 0.066 334.000 0.047 1.000 N NA
 7685955 7685956 BAA_1588 BAA_1589 rpsA   TRUE 0.903 13.000 0.061 1.000 N NA
 7685958 7685959 BAA_1591 BAA_1592     TRUE 0.749 -7.000 0.567 NA   NA
 7685959 7685960 BAA_1592 BAA_1593     TRUE 0.842 -3.000 0.633 NA   NA
 7685960 7685961 BAA_1593 BAA_1594   engA FALSE 0.555 125.000 0.014 NA   NA
 7685961 7685962 BAA_1594 BAA_1595 engA gpsA TRUE 0.736 19.000 0.068 1.000   NA
 7685962 7685963 BAA_1595 BAA_1596 gpsA   FALSE 0.580 117.000 0.039 NA   NA
 7685963 7685964 BAA_1596 BAA_1597     FALSE 0.024 267.000 0.000 NA   NA
 7685964 7685965 BAA_1597 BAA_1598     TRUE 0.719 65.000 0.771 NA   NA
 7685965 7685966 BAA_1598 BAA_1599   spoIVA FALSE 0.051 243.000 0.081 NA   NA
 7685966 7685967 BAA_1599 BAA_1600 spoIVA hup1 FALSE 0.016 299.000 0.000 NA   NA
 7685967 7685968 BAA_1600 BAA_1601 hup1 folE TRUE 0.848 121.000 0.154 1.000 N NA
 7685968 7685969 BAA_1601 BAA_1602 folE   FALSE 0.059 261.000 0.114 1.000   NA
 7685969 7685970 BAA_1602 BAA_1603   menG TRUE 0.840 30.000 0.708 1.000   NA
 7685970 7685971 BAA_1603 BAA_1604 menG hepT TRUE 0.957 32.000 0.476 1.000 Y NA
 7685971 7685972 BAA_1604 BAA_1605 hepT   TRUE 0.841 125.000 0.054 1.000 N NA
 7685972 7685973 BAA_1605 BAA_1606   aroC1 FALSE 0.113 271.000 0.002 1.000 N NA
 7685973 7685974 BAA_1606 BAA_1607 aroC1 aroB TRUE 0.978 0.000 0.110 0.001 Y NA
 7685974 7685975 BAA_1607 BAA_1608 aroB hisC1 TRUE 0.947 132.000 0.009 1.000 Y NA
 7685975 7685976 BAA_1608 BAA_1609 hisC1   FALSE 0.023 313.000 0.000 1.000   NA
 7685976 7685977 BAA_1609 BAA_1610     FALSE 0.533 74.000 0.375 NA   NA
 7685977 7685978 BAA_1610 BAA_1611     FALSE 0.629 154.000 0.583 NA   NA
 7685978 7685979 BAA_1611 BAA_1612   qcrA TRUE 0.702 144.000 0.540 NA   NA
 7685979 7685980 BAA_1612 BAA_1613 qcrA qcrB TRUE 0.903 1.000 0.447 0.034   NA
 7685980 7685981 BAA_1613 BAA_1614 qcrB qcrC FALSE 0.628 44.000 0.095 0.034   NA
 7685981 7685982 BAA_1614 BAA_1615 qcrC   FALSE 0.593 111.000 0.069 NA   NA
 7685982 7685983 BAA_1615 BAA_1616     FALSE 0.576 26.000 0.104 NA   NA
 7685983 7685984 BAA_1616 BAA_1617     FALSE 0.583 108.000 0.104 NA   NA
 7685984 7685985 BAA_1617 BAA_1618     FALSE 0.351 -22.000 0.050 NA   NA
 7685985 7685986 BAA_1618 BAA_1619     FALSE 0.502 102.000 0.020 NA   NA
 7685988 7685989 BAA_1621 BAA_1622   dapB TRUE 0.692 0.000 0.044 NA   NA
 7685989 7685990 BAA_1622 BAA_1623 dapB mgsA TRUE 0.918 15.000 0.044 0.037 N NA
 7685990 7685991 BAA_1623 BAA_1624 mgsA   TRUE 0.723 12.000 0.081 NA   NA
 7685991 7685992 BAA_1624 BAA_1625     TRUE 0.649 -3.000 0.210 NA   NA
 7685992 7685993 BAA_1625 BAA_1626     TRUE 0.744 -13.000 0.126 1.000 N NA
 7685993 7685994 BAA_1626 BAA_1627   birA TRUE 0.733 -15.000 0.134 1.000 N NA
 7685996 7685997 BAA_1629 BAA_1630 panB panC TRUE 0.976 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 7685997 7685998 BAA_1630 BAA_1631 panC panD TRUE 0.977 13.000 0.342 1.000 Y NA
 7685998 7685999 BAA_1631 BAA_1632 panD   TRUE 0.834 129.000 0.053 1.000 N NA
 7685999 7686000 BAA_1632 BAA_1633     FALSE 0.046 251.000 0.056 NA   NA
 7686000 7686001 BAA_1633 BAA_1634     TRUE 0.795 8.000 0.289 NA   NA
 7686001 7686002 BAA_1634 BAA_1635   aspB TRUE 0.761 19.000 0.367 NA   NA
 7686002 7686003 BAA_1635 BAA_1636 aspB dnaD TRUE 0.814 122.000 0.072 NA N NA
 7686003 7686004 BAA_1636 BAA_1637 dnaD nth TRUE 0.964 16.000 0.075 NA Y NA
 7686004 7686005 BAA_1637 BAA_1638 nth   TRUE 0.725 4.000 0.034 NA   NA
 7686006 7686007 BAA_1639 BAA_1640   recU FALSE 0.485 66.000 0.056 1.000   NA
 7686010 7686011 BAA_1643 BAA_1644     TRUE 0.694 16.000 0.148 NA   NA
 7686013 7686014 BAA_1646 BAA_1647     FALSE 0.462 155.000 0.318 NA   NA
 7686014 7686015 BAA_1647 BAA_1648     FALSE 0.393 56.000 0.074 NA   NA
 7686015 7686016 BAA_1648 BAA_1649     TRUE 0.735 98.000 0.579 NA   NA
 7686016 7686017 BAA_1649 BAA_1650     FALSE 0.354 86.000 0.000 NA   NA
 7686017 7686018 BAA_1650 BAA_1651     FALSE 0.146 178.000 0.000 NA   NA
 7686018 7686019 BAA_1651 BAA_1652     FALSE 0.365 62.000 0.014 NA   NA
 7686019 7686020 BAA_1652 BAA_1653     FALSE 0.572 138.000 0.250 NA   NA
 7686020 7686021 BAA_1653 BAA_1654     TRUE 0.835 106.000 0.118 1.000 N NA
 7686021 7686022 BAA_1654 BAA_1655     FALSE 0.436 46.000 0.000 1.000   NA
 7686024 7686025 BAA_1657 BAA_1659 maP2   FALSE 0.119 198.000 0.115 NA   NA
 7686025 7686026 BAA_1659 BAA_1660   xpt TRUE 0.669 15.000 0.014 NA   NA
 7686026 7686027 BAA_1660 BAA_1661 xpt pbuX TRUE 0.976 4.000 0.056 1.000 Y NA
 7686029 7686030 BAA_1663 BAA_1664     FALSE 0.087 195.000 0.000 NA   NA
 7686032 7686033 BAA_1666 BAA_1667     FALSE 0.619 22.000 0.069 NA   NA
 7686033 7686034 BAA_1667 BAA_1668     TRUE 0.724 3.000 0.046 NA   NA
 7686034 7686035 BAA_1668 BAA_1669     FALSE 0.485 117.000 0.000 NA   NA
 7686035 7686036 BAA_1669 BAA_1670     FALSE 0.515 22.000 0.000 NA   NA
 7686038 7686039 BAA_1672 BAA_1673     FALSE 0.361 88.000 0.000 NA   NA
 7686039 7686040 BAA_1673 BAA_1674     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686040 7686041 BAA_1674 BAA_1676     FALSE 0.005 693.000 0.000 NA   NA
 7686041 7686042 BAA_1676 BAA_1677     TRUE 0.666 131.000 0.157 1.000   NA
 7686042 7686043 BAA_1677 BAA_1678     FALSE 0.014 357.000 0.039 NA   NA
 7686043 7686044 BAA_1678 BAA_1679     FALSE 0.012 337.000 0.000 NA   NA
 7686044 7686045 BAA_1679 BAA_1680     TRUE 0.957 1.000 0.750 1.000 N NA
 7686045 7686046 BAA_1680 BAA_1681     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7686046 7686047 BAA_1681 BAA_1682     FALSE 0.159 174.000 0.000 NA   NA
 7686047 7686048 BAA_1682 BAA_1683     FALSE 0.551 19.000 0.000 NA   NA
 7686048 7686049 BAA_1683 BAA_1684     TRUE 0.703 43.000 0.625 NA   NA
 7686049 7686050 BAA_1684 BAA_1685     TRUE 0.870 4.000 0.500 NA   NA
 7686050 7686051 BAA_1685 BAA_1686     FALSE 0.331 -25.000 0.046 NA   NA
 7686051 7686052 BAA_1686 BAA_1687     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686052 7686053 BAA_1687 BAA_1688     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686053 7686054 BAA_1688 BAA_1689     FALSE 0.377 93.000 0.000 NA   NA
 7686059 7686060 BAA_1694 BAA_1695   rnhA TRUE 0.813 8.000 0.133 1.000   NA
 7686060 7686061 BAA_1695 BAA_1696 rnhA   TRUE 0.713 70.000 0.076 1.000 N NA
 7686062 7686063 BAA_1698 BAA_1699     FALSE 0.489 144.000 0.200 NA   NA
 7686063 7686064 BAA_1699 BAA_1700     TRUE 0.894 13.000 0.680 NA   NA
 7686065 7686066 BAA_1701 BAA_1702   cspB1 TRUE 0.814 120.000 0.619 NA   NA
 7686067 7686068 BAA_1703 BAA_1704     FALSE 0.489 71.000 0.308 NA   NA
 7686068 7686069 BAA_1704 BAA_1705     TRUE 0.811 20.000 0.500 NA   NA
 7686069 7686070 BAA_1705 BAA_1706     FALSE 0.484 80.000 0.259 NA   NA
 7686070 7686071 BAA_1706 BAA_1707     FALSE 0.044 224.000 0.000 NA   NA
 7686071 7686072 BAA_1707 BAA_1708     TRUE 0.853 3.000 0.455 NA   NA
 7686072 7686073 BAA_1708 BAA_1709     FALSE 0.293 187.000 0.364 1.000   NA
 7686073 7686074 BAA_1709 BAA_1710     TRUE 0.635 85.000 0.444 NA   NA
 7686076 7686077 BAA_1712 BAA_1713     FALSE 0.478 124.000 0.000 NA   NA
 7686077 7686078 BAA_1713 BAA_1714     TRUE 0.820 139.000 0.250 1.000 N NA
 7686080 7686081 BAA_1716 BAA_1717     FALSE 0.304 -37.000 0.100 NA   NA
 7686081 7686082 BAA_1717 BAA_1718     FALSE 0.543 146.000 0.300 NA   NA
 7686082 7686083 BAA_1718 BAA_1719     FALSE 0.035 273.000 0.143 NA   NA
 7686083 7686084 BAA_1719 BAA_1720     FALSE 0.412 51.000 0.190 NA   NA
 7686085 7686086 BAA_1721 BAA_1722     FALSE 0.566 125.000 0.031 NA   NA
 7686086 7686087 BAA_1722 BAA_1723     TRUE 0.739 20.000 0.333 NA   NA
 7686087 7686088 BAA_1723 BAA_1724     FALSE 0.579 129.000 0.118 NA   NA
 7686088 7686089 BAA_1724 BAA_1725     TRUE 0.748 8.000 0.147 NA   NA
 7686089 7686090 BAA_1725 BAA_1726     FALSE 0.424 167.000 0.444 NA   NA
 7686091 7686092 BAA_1727 BAA_1728   hfq1 TRUE 0.726 54.000 0.778 NA   NA
 7686094 7686095 BAA_1730 BAA_1731     FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7686095 7686096 BAA_1731 BAA_1732     TRUE 0.722 151.000 0.143 1.000 N NA
 7686096 7686097 BAA_1732 BAA_1733     FALSE 0.459 130.000 0.000 NA   NA
 7686097 7686098 BAA_1733 BAA_1734     FALSE 0.240 -30.000 0.000 NA   NA
 7686098 7686099 BAA_1734 BAA_1735     FALSE 0.159 174.000 0.000 NA   NA
 7686099 7686100 BAA_1735 BAA_1736     FALSE 0.532 30.000 0.042 NA   NA
 7686100 7686101 BAA_1736 BAA_1737     TRUE 0.854 28.000 0.889 NA   NA
 7686102 7686103 BAA_1738 BAA_1739 cheR   FALSE 0.320 45.000 0.000 NA   NA
 7686104 7686105 BAA_1740 BAA_1741     TRUE 0.669 17.000 0.056 NA   NA
 7686105 7686106 BAA_1741 BAA_1742     TRUE 0.656 18.000 0.045 NA   NA
 7686106 7686107 BAA_1742 BAA_1743     FALSE 0.064 205.000 0.000 NA   NA
 7686107 7686108 BAA_1743 BAA_1744     FALSE 0.217 -40.000 0.000 NA   NA
 7686108 7686109 BAA_1744 BAA_1745     FALSE 0.540 20.000 0.000 NA   NA
 7686109 7686110 BAA_1745 BAA_1746     TRUE 0.963 23.000 0.000 0.001 Y NA
 7686110 7686111 BAA_1746 BAA_1747     FALSE 0.361 -10.000 0.000 NA   NA
 7686111 7686112 BAA_1747 BAA_1748   flgB FALSE 0.009 370.000 0.000 NA   NA
 7686112 7686113 BAA_1748 BAA_1749 flgB flgC TRUE 0.985 21.000 0.804 0.002 Y NA
 7686113 7686114 BAA_1749 BAA_1750 flgC   TRUE 0.974 17.000 0.068 0.002 Y NA
 7686114 7686115 BAA_1750 BAA_1751     FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7686115 7686116 BAA_1751 BAA_1752     FALSE 0.387 36.000 0.000 NA   NA
 7686116 7686117 BAA_1752 BAA_1753   fliG FALSE 0.604 14.000 0.000 NA   NA
 7686117 7686118 BAA_1753 BAA_1754 fliG   FALSE 0.621 -13.000 0.471 NA   NA
 7686118 7686119 BAA_1754 BAA_1755     TRUE 0.645 -3.000 0.129 NA   NA
 7686119 7686120 BAA_1755 BAA_1756     FALSE 0.485 117.000 0.000 NA   NA
 7686120 7686121 BAA_1756 BAA_1757     FALSE 0.361 39.000 0.000 NA   NA
 7686121 7686122 BAA_1757 BAA_1758     TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7686122 7686123 BAA_1758 BAA_1759     FALSE 0.303 51.000 0.000 NA   NA
 7686123 7686124 BAA_1759 BAA_1760     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7686124 7686125 BAA_1760 BAA_1761     FALSE 0.628 22.000 0.117 NA   NA
 7686125 7686126 BAA_1761 BAA_1762     FALSE 0.416 50.000 0.195 NA   NA
 7686126 7686127 BAA_1762 BAA_1763     FALSE 0.015 308.000 0.000 NA   NA
 7686127 7686128 BAA_1763 BAA_1764     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686128 7686129 BAA_1764 BAA_1765     FALSE 0.476 125.000 0.000 NA   NA
 7686129 7686130 BAA_1765 BAA_1766     FALSE 0.380 -9.000 0.000 NA   NA
 7686130 7686131 BAA_1766 BAA_1767     FALSE 0.005 637.000 0.000 NA   NA
 7686131 7686132 BAA_1767 BAA_1768     FALSE 0.004 1079.000 0.000 NA   NA
 7686132 7686133 BAA_1768 BAA_1769     FALSE 0.313 -15.000 0.000 NA   NA
 7686133 7686134 BAA_1769 BAA_1770     FALSE 0.284 -19.000 0.000 NA   NA
 7686134 7686135 BAA_1770 BAA_1771     FALSE 0.078 198.000 0.000 NA   NA
 7686135 7686136 BAA_1771 BAA_1772     FALSE 0.486 116.000 0.000 NA   NA
 7686136 7686137 BAA_1772 BAA_1773     FALSE 0.038 233.000 0.000 NA   NA
 7686137 7686138 BAA_1773 BAA_1774     FALSE 0.004 2476.000 0.000 NA   NA
 7686138 7686139 BAA_1774 BAA_1775     FALSE 0.015 310.000 0.000 NA   NA
 7686139 7686140 BAA_1775 BAA_1776     FALSE 0.080 197.000 0.000 NA   NA
 7686140 7686141 BAA_1776 BAA_1777     FALSE 0.412 101.000 0.000 NA   NA
 7686141 7686142 BAA_1777 BAA_1778     FALSE 0.308 76.000 0.000 NA   NA
 7686142 7686143 BAA_1778 BAA_1779     FALSE 0.014 311.000 0.000 NA   NA
 7686145 7686146 BAA_1781 BAA_1782     FALSE 0.406 100.000 0.000 NA   NA
 7686146 7686147 BAA_1782 BAA_1783     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7686147 7686148 BAA_1783 BAA_1784     FALSE 0.465 26.000 0.000 NA   NA
 7686148 7686149 BAA_1784 BAA_1785     TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7686149 7686150 BAA_1785 BAA_1786     TRUE 0.819 13.000 0.400 NA   NA
 7686150 7686151 BAA_1786 BAA_1787     TRUE 0.633 -3.000 0.073 NA   NA
 7686151 7686152 BAA_1787 BAA_1788     TRUE 0.951 34.000 0.162 0.003 Y NA
 7686152 7686153 BAA_1788 BAA_1789   fliR TRUE 0.974 16.000 0.181 0.087 Y NA
 7686153 7686154 BAA_1789 BAA_1790 fliR   TRUE 0.980 11.000 0.259 0.087 Y NA
 7686154 7686155 BAA_1790 BAA_1791   flhA TRUE 0.965 24.000 0.207 0.003 Y NA
 7686155 7686156 BAA_1791 BAA_1792 flhA   FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7686156 7686157 BAA_1792 BAA_1793     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7686157 7686158 BAA_1793 BAA_1794     FALSE 0.335 43.000 0.000 NA   NA
 7686158 7686159 BAA_1794 BAA_1795     FALSE 0.604 118.000 0.200 NA   NA
 7686159 7686160 BAA_1795 BAA_1796     TRUE 0.852 18.000 0.600 NA   NA
 7686160 7686161 BAA_1796 BAA_1797     TRUE 0.775 -7.000 0.133 NA N NA
 7686161 7686162 BAA_1797 BAA_1798     FALSE 0.603 -9.000 0.338 NA   NA
 7686162 7686163 BAA_1798 BAA_1799     FALSE 0.383 63.000 0.044 NA   NA
 7686163 7686164 BAA_1799 BAA_1800     FALSE 0.554 88.000 0.300 NA   NA
 7686164 7686165 BAA_1800 BAA_1801     TRUE 0.723 -7.000 0.500 NA   NA
 7686166 7686167 BAA_1802 BAA_1803     TRUE 0.798 3.000 0.051 1.000   NA
 7686167 7686168 BAA_1803 BAA_1804     FALSE 0.198 189.000 0.034 1.000   NA
 7686168 7686169 BAA_1804 BAA_1805     FALSE 0.511 67.000 0.231 1.000   NA
 7686170 7686171 BAA_1806 BAA_1807     TRUE 0.781 106.000 0.571 NA   NA
 7686173 7686174 BAA_1809 BAA_1810     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7686174 7686175 BAA_1810 BAA_1811     TRUE 0.988 13.000 0.750 0.030 Y NA
 7686175 7686176 BAA_1811 BAA_1812     TRUE 0.911 0.000 0.278 1.000 N NA
 7686176 7686177 BAA_1812 BAA_1813     TRUE 0.664 21.000 0.241 NA   NA
 7686179 7686180 BAA_1815 BAA_1816     FALSE 0.436 160.000 0.375 NA   NA
 7686180 7686181 BAA_1816 BAA_1817     TRUE 0.771 102.000 0.500 1.000   NA
 7686181 7686182 BAA_1817 BAA_1818     FALSE 0.413 51.000 0.143 NA   NA
 7686182 7686183 BAA_1818 BAA_1819     FALSE 0.331 159.000 0.143 NA   NA
 7686183 7686184 BAA_1819 BAA_1820     FALSE 0.604 90.000 0.368 NA   NA
 7686185 7686186 BAA_1821 BAA_1822     FALSE 0.412 33.000 0.000 NA   NA
 7686186 7686187 BAA_1822 BAA_1823     FALSE 0.300 -16.000 0.000 NA   NA
 7686187 7686188 BAA_1823 BAA_1824     FALSE 0.227 -34.000 0.000 NA   NA
 7686191 7686192 BAA_1827 BAA_1828     TRUE 0.845 -3.000 0.643 NA   NA
 7686194 7686195 BAA_1830 BAA_1831     FALSE 0.128 194.000 0.049 NA   NA
 7686196 7686197 BAA_1832 BAA_1833     TRUE 0.889 17.000 0.194 1.000 N NA
 7686197 7686198 BAA_1833 BAA_1834     FALSE 0.178 183.000 0.097 NA   NA
 7686199 7686200 BAA_1835 BAA_1836     TRUE 0.901 14.000 0.750 NA   NA
 7686200 7686201 BAA_1836 BAA_1837     FALSE 0.606 113.000 0.125 NA   NA
 7686201 7686202 BAA_1837 BAA_1838     FALSE 0.379 94.000 0.000 NA   NA
 7686202 7686203 BAA_1838 BAA_1839   nhaC2 FALSE 0.419 102.000 0.000 NA   NA
 7686203 7686204 BAA_1839 BAA_1840 nhaC2 fumC FALSE 0.378 256.000 0.003 1.000 Y NA
 7686205 7686206 BAA_1841 BAA_1842     FALSE 0.039 231.000 0.000 NA   NA
 7686207 7686208 BAA_1843 BAA_1844     FALSE 0.398 99.000 0.000 NA   NA
 7686208 7686209 BAA_1844 BAA_1845     FALSE 0.456 27.000 0.000 NA   NA
 7686211 7686212 BAA_1847 BAA_1848     FALSE 0.589 108.000 0.125 NA   NA
 7686212 7686213 BAA_1848 BAA_1849     TRUE 0.906 5.000 0.250 NA N NA
 7686213 7686214 BAA_1849 BAA_1850   ccdA1 TRUE 0.892 54.000 0.171 NA Y NA
 7686214 7686215 BAA_1850 BAA_1851 ccdA1   TRUE 0.966 19.000 0.241 1.000 Y NA
 7686215 7686216 BAA_1851 BAA_1852     TRUE 0.728 18.000 0.011 1.000   NA
 7686218 7686219 BAA_1854 BAA_1855     TRUE 0.638 3.000 0.000 NA   NA
 7686219 7686220 BAA_1855 BAA_1856   dsdA FALSE 0.089 194.000 0.000 NA   NA
 7686220 7686221 BAA_1856 BAA_1857 dsdA   FALSE 0.452 146.000 0.065 NA   NA
 7686222 7686223 BAA_1858 BAA_1859     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686223 7686224 BAA_1859 BAA_1860     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686224 7686225 BAA_1860 BAA_1861     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686226 7686227 BAA_1862 BAA_1863     TRUE 0.991 5.000 0.857 0.017 Y NA
 7686227 7686228 BAA_1863 BAA_1864     TRUE 0.932 118.000 0.667 0.092 N NA
 7686228 7686229 BAA_1864 BAA_1865     TRUE 0.752 38.000 0.250 NA N NA
 7686229 7686230 BAA_1865 BAA_1866     TRUE 0.971 2.000 0.227 NA Y NA
 7686230 7686231 BAA_1866 BAA_1867     TRUE 0.830 105.000 0.160 1.000 N NA
 7686233 7686234 BAA_1869 BAA_1870   aspA2 TRUE 0.920 25.000 0.700 1.000 N NA
 7686234 7686235 BAA_1870 BAA_1871 aspA2 malS TRUE 0.828 76.000 0.583 1.000 N NA
 7686235 7686236 BAA_1871 BAA_1872 malS   TRUE 0.671 75.000 0.500 1.000   NA
 7686236 7686237 BAA_1872 BAA_1873     TRUE 0.908 3.000 0.600 1.000   NA
 7686237 7686238 BAA_1873 BAA_1874     TRUE 0.955 118.000 0.113 1.000 Y NA
 7686240 7686241 BAA_1876 BAA_1877 asnA   FALSE 0.388 142.000 0.000 NA   NA
 7686241 7686242 BAA_1877 BAA_1878     FALSE 0.112 186.000 0.000 NA   NA
 7686243 7686244 BAA_1879 BAA_1880   dapG1 FALSE 0.010 350.000 0.000 NA   NA
 7686245 7686246 BAA_1882 BAA_1883     FALSE 0.457 131.000 0.000 NA   NA
 7686246 7686247 BAA_1883 BAA_1884     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7686247 7686248 BAA_1884 BAA_1885     TRUE 0.841 6.000 0.400 NA   NA
 7686250 7686251 BAA_1887 BAA_1888     FALSE 0.174 254.000 0.000 0.004 N NA
 7686251 7686252 BAA_1888 BAA_1889     TRUE 0.674 196.000 0.333 NA Y NA
 7686252 7686253 BAA_1889 BAA_1890     FALSE 0.570 29.000 0.222 NA   NA
 7686255 7686256 BAA_1892 BAA_1893     FALSE 0.369 90.000 0.000 NA   NA
 7686256 7686257 BAA_1893 BAA_1894     FALSE 0.025 266.000 0.000 NA   NA
 7686257 7686258 BAA_1894 BAA_1895     FALSE 0.265 -22.000 0.000 NA   NA
 7686260 7686261 BAA_1897 BAA_1898     FALSE 0.010 484.000 0.000 1.000   NA
 7686262 7686263 BAA_1899 BAA_1900     FALSE 0.122 183.000 0.000 NA   NA
 7686264 7686265 BAA_1901 BAA_1902 fsR cysK2 TRUE 0.892 11.000 0.059 NA N NA
 7686265 7686266 BAA_1902 BAA_1903 cysK2   FALSE 0.519 77.000 0.143 1.000   NA
 7686266 7686267 BAA_1903 BAA_1904     TRUE 0.790 93.000 0.778 NA   NA
 7686271 7686272 BAA_1908 BAA_1909     FALSE 0.309 181.000 0.412 NA   NA
 7686272 7686273 BAA_1909 BAA_1910     TRUE 0.794 11.000 0.300 NA   NA
 7686273 7686274 BAA_1910 BAA_1911     FALSE 0.409 -16.000 0.188 NA   NA
 7686274 7686275 BAA_1911 BAA_1912     FALSE 0.006 464.000 0.000 NA   NA
 7686277 7686278 BAA_1914 BAA_1915     FALSE 0.107 187.000 0.000 NA   NA
 7686279 7686280 BAA_1916 BAA_1917 msrA1   TRUE 0.783 92.000 0.194 1.000 N NA
 7686281 7686282 BAA_1918 BAA_1919 ilvE2 ilvB2 TRUE 0.956 23.000 0.017 1.000 Y NA
 7686282 7686283 BAA_1919 BAA_1920 ilvB2   TRUE 0.808 -3.000 0.006 0.001   NA
 7686283 7686284 BAA_1920 BAA_1921   ilvC2 TRUE 0.751 15.000 0.003 1.000   NA
 7686284 7686285 BAA_1921 BAA_1922 ilvC2 ilvD TRUE 0.927 47.000 0.022 0.002 Y NA
 7686285 7686286 BAA_1922 BAA_1923 ilvD ilvA TRUE 0.940 32.000 0.012 1.000 Y NA
 7686288 7686289 BAA_1925 BAA_1926     TRUE 0.669 16.000 0.032 NA   NA
 7686289 7686290 BAA_1926 BAA_1927     FALSE 0.333 168.000 0.075 1.000   NA
 7686292 7686293 BAA_1929 BAA_1930     FALSE 0.007 425.000 0.000 NA   NA
 7686293 7686294 BAA_1930 BAA_1931     TRUE 0.795 128.000 0.588 NA   NA
 7686294 7686295 BAA_1931 BAA_1932     FALSE 0.092 211.000 0.000 1.000   NA
 7686295 7686296 BAA_1932 BAA_1933     FALSE 0.569 28.000 0.207 NA   NA
 7686296 7686297 BAA_1933 BAA_1934     FALSE 0.394 72.000 0.069 NA   NA
 7686299 7686300 BAA_1936 BAA_1937     FALSE 0.005 572.000 0.000 NA   NA
 7686300 7686301 BAA_1937 BAA_1938     FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 7686301 7686302 BAA_1938 BAA_1939     TRUE 0.654 135.000 0.333 NA   NA
 7686302 7686303 BAA_1939 BAA_1940     FALSE 0.395 67.000 0.095 NA   NA
 7686303 7686304 BAA_1940 BAA_1941     FALSE 0.047 288.000 0.000 0.068   NA
 7686306 7686307 BAA_1943 BAA_1944     FALSE 0.096 191.000 0.000 NA   NA
 7686307 7686308 BAA_1944 BAA_1945     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686308 7686309 BAA_1945 BAA_1946     FALSE 0.020 282.000 0.000 NA   NA
 7686315 7686316 BAA_1953 BAA_1954     FALSE 0.300 73.000 0.000 NA   NA
 7686316 7686317 BAA_1954 BAA_1955     FALSE 0.005 594.000 0.000 NA   NA
 7686317 7686318 BAA_1955 BAA_1956     TRUE 0.833 32.000 0.500 0.002   NA
 7686318 7686319 BAA_1956 BAA_1957     FALSE 0.472 108.000 0.000 NA   NA
 7686319 7686320 BAA_1957 BAA_1958     FALSE 0.007 396.000 0.000 NA   NA
 7686320 7686321 BAA_1958 BAA_1959     FALSE 0.046 358.000 0.000 1.000 N NA
 7686321 7686322 BAA_1959 BAA_1960   deoC FALSE 0.084 306.000 0.077 1.000 N NA
 7686322 7686323 BAA_1960 BAA_1961 deoC   TRUE 0.942 103.000 0.026 1.000 Y NA
 7686323 7686324 BAA_1961 BAA_1962   pyn1 TRUE 0.951 25.000 0.031 1.000 Y NA
 7686324 7686325 BAA_1962 BAA_1963 pyn1 cdd1 TRUE 0.936 34.000 0.031 1.000 Y NA
 7686325 7686326 BAA_1963 BAA_1964 cdd1   FALSE 0.342 42.000 0.000 NA   NA
 7686329 7686330 BAA_1967 BAA_1968     TRUE 0.757 52.000 0.750 1.000   NA
 7686331 7686332 BAA_1969 BAA_1970     TRUE 0.842 118.000 0.027 1.000 N NA
 7686332 7686333 BAA_1970 BAA_1971     FALSE 0.024 606.000 0.000 1.000 N NA
 7686335 7686336 BAA_1973 BAA_1974 topB2   FALSE 0.035 269.000 0.065 NA   NA
 7686338 7686339 BAA_1976 BAA_1977     FALSE 0.035 240.000 0.000 NA   NA
 7686339 7686340 BAA_1977 BAA_1978   brnQ FALSE 0.313 -15.000 0.000 NA   NA
 7686340 7686341 BAA_1978 BAA_1979 brnQ   FALSE 0.346 84.000 0.000 NA   NA
 7686341 7686342 BAA_1979 BAA_1980     FALSE 0.299 54.000 0.000 NA   NA
 7686342 7686343 BAA_1980 BAA_1982     FALSE 0.490 112.000 0.000 NA   NA
 7686343 7686344 BAA_1982 BAA_1983     TRUE 0.812 113.000 0.600 NA   NA
 7686345 7686346 BAA_1984 BAA_1985     FALSE 0.162 187.000 0.158 NA   NA
 7686347 7686348 BAA_1986 BAA_1987     TRUE 0.957 121.000 0.389 NA Y NA
 7686348 7686349 BAA_1987 BAA_1988     TRUE 0.674 72.000 0.158 NA N NA
 7686349 7686350 BAA_1988 BAA_1989     FALSE 0.599 58.000 0.123 0.032   NA
 7686350 7686351 BAA_1989 BAA_1990     TRUE 0.683 127.000 0.333 NA   NA
 7686351 7686352 BAA_1990 BAA_1991     FALSE 0.607 112.000 0.128 NA   NA
 7686352 7686353 BAA_1991 BAA_1992     FALSE 0.209 179.000 0.128 NA   NA
 7686355 7686356 BAA_1994 BAA_1995     FALSE 0.607 104.000 0.273 NA   NA
 7686358 7686359 BAA_1997 BAA_1998     TRUE 0.903 13.000 0.052 1.000 N NA
 7686359 7686360 BAA_1998 BAA_1999     TRUE 0.983 5.000 0.333 0.068 Y NA
 7686360 7686361 BAA_1999 BAA_2000     TRUE 0.966 15.000 0.121 NA Y NA
 7686361 7686362 BAA_2000 BAA_2001     FALSE 0.405 182.000 0.054 NA N NA
 7686362 7686363 BAA_2001 BAA_2002     TRUE 0.956 90.000 0.750 NA Y NA
 7686363 7686364 BAA_2002 BAA_2003     TRUE 0.947 -22.000 0.708 0.023 Y NA
 7686364 7686365 BAA_2003 BAA_2004     TRUE 0.978 22.000 0.746 1.000 Y NA
 7686365 7686366 BAA_2004 BAA_2005     TRUE 0.954 50.000 0.687 0.029 Y NA
 7686368 7686369 BAA_2007 BAA_2008     FALSE 0.489 37.000 0.111 NA   NA
 7686369 7686370 BAA_2008 BAA_2009     TRUE 0.911 2.000 0.647 1.000   NA
 7686370 7686371 BAA_2009 BAA_2010     TRUE 0.639 94.000 0.286 1.000   NA
 7686371 7686372 BAA_2010 BAA_2011     TRUE 0.833 118.000 0.259 NA N NA
 7686372 7686373 BAA_2011 BAA_2012   cydA1 FALSE 0.077 618.000 0.000 NA Y NA
 7686373 7686374 BAA_2012 BAA_2013 cydA1 cydB1 TRUE 0.928 -13.000 0.051 0.032 Y NA
 7686374 7686375 BAA_2013 BAA_2014 cydB1   TRUE 0.972 0.000 0.151 1.000 Y NA
 7686375 7686376 BAA_2014 BAA_2015     TRUE 0.980 3.000 0.168 0.004 Y NA
 7686376 7686377 BAA_2015 BAA_2016     FALSE 0.018 290.000 0.000 NA   NA
 7686377 7686378 BAA_2016 BAA_2017     FALSE 0.599 91.000 0.353 NA   NA
 7686380 7686381 BAA_2019 BAA_2020     FALSE 0.054 245.000 0.000 1.000   NA
 7686381 7686382 BAA_2020 BAA_2021     FALSE 0.004 916.000 0.000 NA   NA
 7686384 7686385 BAA_2023 BAA_2024     FALSE 0.515 22.000 0.000 NA   NA
 7686385 7686386 BAA_2024 BAA_2025     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7686386 7686387 BAA_2025 BAA_2026     TRUE 0.962 30.000 0.538 1.000 Y NA
 7686389 7686390 BAA_2028 BAA_2029     FALSE 0.485 117.000 0.000 NA   NA
 7686390 7686391 BAA_2029 BAA_2030     FALSE 0.397 141.000 0.000 NA   NA
 7686391 7686392 BAA_2030 BAA_2031     FALSE 0.603 118.000 0.136 NA   NA
 7686392 7686393 BAA_2031 BAA_2032     FALSE 0.297 69.000 0.000 NA   NA
 7686393 7686394 BAA_2032 BAA_2033     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7686396 7686397 BAA_2035 BAA_2036   hom1 FALSE 0.007 964.000 0.000 1.000   NA
 7686397 7686398 BAA_2036 BAA_2037 hom1 thrC TRUE 0.939 -7.000 0.021 1.000 Y NA
 7686398 7686399 BAA_2037 BAA_2038 thrC thrB TRUE 0.962 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 7686399 7686400 BAA_2038 BAA_2039 thrB   FALSE 0.560 120.000 0.011 NA   NA
 7686400 7686401 BAA_2039 BAA_2040     FALSE 0.050 217.000 0.000 NA   NA
 7686401 7686402 BAA_2040 BAA_2041     FALSE 0.064 205.000 0.000 NA   NA
 7686402 7686403 BAA_2041 BAA_2042     FALSE 0.328 160.000 0.222 NA   NA
 7686403 7686404 BAA_2042 BAA_2043     TRUE 0.719 11.000 0.038 NA   NA
 7686404 7686405 BAA_2043 BAA_2044     TRUE 0.921 -21.000 0.472 1.000 Y NA
 7686405 7686406 BAA_2044 BAA_2045     TRUE 0.808 101.000 0.129 1.000 N NA
 7686406 7686407 BAA_2045 BAA_2046     TRUE 0.699 15.000 0.111 NA   NA
 7686407 7686408 BAA_2046 BAA_2047     FALSE 0.315 160.000 0.111 NA   NA
 7686408 7686409 BAA_2047 BAA_2048     FALSE 0.591 98.000 0.049 1.000   NA
 7686409 7686410 BAA_2048 BAA_2049   asbA FALSE 0.032 285.000 0.000 1.000   NA
 7686410 7686411 BAA_2049 BAA_2050 asbA asbB TRUE 0.925 65.000 0.163 0.001 Y NA
 7686411 7686412 BAA_2050 BAA_2051 asbB asbC TRUE 0.925 -13.000 0.310 1.000 Y NA
 7686412 7686413 BAA_2051 BAA_2052 asbC asbD FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686413 7686414 BAA_2052 BAA_2053 asbD asbE FALSE 0.486 24.000 0.000 NA   NA
 7686414 7686415 BAA_2053 BAA_2054 asbE asbF TRUE 0.631 38.000 0.412 NA   NA
 7686415 7686416 BAA_2054 BAA_2055 asbF   FALSE 0.593 126.000 0.137 NA   NA
 7686416 7686417 BAA_2055 BAA_2056     FALSE 0.186 167.000 0.000 NA   NA
 7686417 7686418 BAA_2056 BAA_2057     FALSE 0.319 78.000 0.000 NA   NA
 7686418 7686419 BAA_2057 BAA_2058     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686422 7686423 BAA_2061 BAA_2062     TRUE 0.769 91.000 0.714 NA   NA
 7686424 7686425 BAA_2063 BAA_2064     FALSE 0.589 146.000 0.375 NA   NA
 7686425 7686426 BAA_2064 BAA_2065     FALSE 0.436 104.000 0.000 NA   NA
 7686426 7686427 BAA_2065 BAA_2066     FALSE 0.422 32.000 0.000 NA   NA
 7686429 7686430 BAA_2068 BAA_2069     FALSE 0.427 103.000 0.000 NA   NA
 7686430 7686431 BAA_2069 BAA_2070     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686431 7686432 BAA_2070 BAA_2071     FALSE 0.485 117.000 0.000 NA   NA
 7686432 7686433 BAA_2071 BAA_2072     FALSE 0.078 275.000 0.000 NA N NA
 7686435 7686436 BAA_2074 BAA_2075     FALSE 0.384 203.000 0.429 1.000 N NA
 7686437 7686438 BAA_2076 BAA_2077     TRUE 0.796 85.000 0.889 NA   NA
 7686439 7686440 BAA_2078 BAA_2079   rsgA_1 FALSE 0.196 180.000 0.091 NA   NA
 7686440 7686441 BAA_2079 BAA_2080 rsgA_1   FALSE 0.103 205.000 0.000 1.000   NA
 7686441 7686442 BAA_2080 BAA_2081     FALSE 0.307 197.000 0.667 NA   NA
 7686442 7686443 BAA_2081 BAA_2082     FALSE 0.023 269.000 0.000 NA   NA
 7686445 7686446 BAA_2084 BAA_2085 dps1   FALSE 0.579 107.000 0.111 NA   NA
 7686446 7686447 BAA_2085 BAA_2086     FALSE 0.043 225.000 0.000 NA   NA
 7686448 7686449 BAA_2087 BAA_2088     TRUE 0.739 106.000 0.467 NA   NA
 7686450 7686451 BAA_2089 BAA_2090     TRUE 0.862 85.000 0.636 1.000 N NA
 7686455 7686456 BAA_2094 BAA_2095     FALSE 0.217 -40.000 0.000 NA   NA
 7686458 7686459 BAA_2097 BAA_2098     FALSE 0.005 566.000 0.000 NA   NA
 7686459 7686460 BAA_2098 BAA_2099     FALSE 0.004 2229.000 0.000 NA   NA
 7686464 7686465 BAA_2103 BAA_2104     TRUE 0.756 116.000 0.333 1.000   NA
 7686467 7686468 BAA_2106 BAA_2107 ogt1   FALSE 0.482 95.000 0.054 NA   NA
 7686468 7686469 BAA_2107 BAA_2108     FALSE 0.498 77.000 0.296 NA   NA
 7686469 7686470 BAA_2108 BAA_2109   fosB1 TRUE 0.891 59.000 0.129 NA Y NA
 7686470 7686471 BAA_2109 BAA_2110 fosB1   FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7686471 7686472 BAA_2110 BAA_2111     TRUE 0.728 13.000 0.000 1.000   NA
 7686474 7686475 BAA_2113 BAA_2114 cotH   TRUE 0.799 106.000 0.062 NA N NA
 7686475 7686476 BAA_2114 BAA_2115     FALSE 0.552 105.000 0.062 NA   NA
 7686476 7686477 BAA_2115 BAA_2116     TRUE 0.732 103.000 0.500 NA   NA
 7686477 7686478 BAA_2116 BAA_2117     FALSE 0.221 185.000 0.033 1.000   NA
 7686478 7686479 BAA_2117 BAA_2118     FALSE 0.111 199.000 0.053 NA   NA
 7686479 7686480 BAA_2118 BAA_2119     TRUE 0.925 4.000 0.841 NA   NA
 7686480 7686481 BAA_2119 BAA_2120     FALSE 0.128 196.000 0.195 NA   NA
 7686481 7686482 BAA_2120 BAA_2121     FALSE 0.007 421.000 0.000 NA   NA
 7686482 7686483 BAA_2121 BAA_2122     FALSE 0.422 32.000 0.000 NA   NA
 7686483 7686484 BAA_2122 BAA_2123     FALSE 0.404 34.000 0.000 NA   NA
 7686484 7686485 BAA_2123 BAA_2124     FALSE 0.107 187.000 0.000 NA   NA
 7686485 7686486 BAA_2124 BAA_2125     FALSE 0.551 102.000 0.227 NA   NA
 7686487 7686488 BAA_2126 BAA_2127     TRUE 0.711 2.000 0.034 NA   NA
 7686488 7686489 BAA_2127 BAA_2128     FALSE 0.060 209.000 0.000 NA   NA
 7686490 7686491 BAA_2129 BAA_2130   brnQ4 FALSE 0.007 424.000 0.000 NA   NA
 7686491 7686492 BAA_2130 BAA_2131 brnQ4 csaA FALSE 0.477 67.000 0.032 1.000   NA
 7686492 7686493 BAA_2131 BAA_2132 csaA   TRUE 0.649 18.000 0.032 NA   NA
 7686495 7686496 BAA_2134 BAA_2135 spoIIP   FALSE 0.100 224.000 0.214 1.000   NA
 7686496 7686497 BAA_2135 BAA_2136     TRUE 0.947 12.000 0.571 1.000 N NA
 7686497 7686498 BAA_2136 BAA_2137     TRUE 0.798 24.000 0.444 1.000   NA
 7686498 7686499 BAA_2137 BAA_2138     FALSE 0.275 185.000 0.286 1.000   NA
 7686501 7686502 BAA_2140 BAA_2141     TRUE 0.973 3.000 0.259 NA Y NA
 7686502 7686503 BAA_2141 BAA_2142     TRUE 0.831 107.000 0.021 1.000 N NA
 7686503 7686504 BAA_2142 BAA_2143     TRUE 0.866 7.000 0.368 1.000   NA
 7686507 7686508 BAA_2146 BAA_2147     FALSE 0.627 -7.000 0.185 1.000   NA
 7686508 7686509 BAA_2147 BAA_2148     FALSE 0.614 24.000 0.222 NA   NA
 7686510 7686511 BAA_2149 BAA_2150     FALSE 0.545 168.000 0.700 NA   NA
 7686513 7686514 BAA_2152 BAA_2153     FALSE 0.325 148.000 0.000 NA   NA
 7686514 7686515 BAA_2153 BAA_2154     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686517 7686518 BAA_2156 BAA_2157     FALSE 0.274 -21.000 0.000 NA   NA
 7686518 7686519 BAA_2157 BAA_2158     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686519 7686520 BAA_2158 BAA_2159     TRUE 0.712 13.000 0.090 NA   NA
 7686520 7686521 BAA_2159 BAA_2160     FALSE 0.529 21.000 0.000 NA   NA
 7686521 7686522 BAA_2160 BAA_2161     FALSE 0.619 1.000 0.000 NA   NA
 7686522 7686523 BAA_2161 BAA_2162     FALSE 0.313 77.000 0.000 NA   NA
 7686523 7686524 BAA_2162 BAA_2163     FALSE 0.008 381.000 0.000 NA   NA
 7686525 7686526 BAA_2164 BAA_2165     FALSE 0.201 163.000 0.000 NA   NA
 7686526 7686527 BAA_2165 BAA_2166     FALSE 0.022 272.000 0.000 NA   NA
 7686528 7686529 BAA_2167 BAA_2168     FALSE 0.315 161.000 0.216 NA   NA
 7686529 7686530 BAA_2168 BAA_2169     FALSE 0.417 52.000 0.216 NA   NA
 7686530 7686531 BAA_2169 BAA_2170     TRUE 0.754 70.000 0.889 NA   NA
 7686533 7686534 BAA_2172 BAA_2173   fhs TRUE 0.716 64.000 0.200 1.000 N NA
 7686534 7686535 BAA_2173 BAA_2174 fhs   FALSE 0.600 91.000 0.355 NA   NA
 7686535 7686536 BAA_2174 BAA_2175     TRUE 0.643 20.000 0.070 NA   NA
 7686536 7686537 BAA_2175 BAA_2176     FALSE 0.465 143.000 0.026 NA   NA
 7686537 7686538 BAA_2176 BAA_2177     FALSE 0.410 56.000 0.211 NA   NA
 7686539 7686540 BAA_2178 BAA_2179     FALSE 0.572 30.000 0.233 NA   NA
 7686541 7686542 BAA_2180 BAA_2181     TRUE 0.879 -3.000 0.800 NA   NA
 7686543 7686544 BAA_2182 BAA_2183     FALSE 0.451 85.000 0.064 NA   NA
 7686544 7686545 BAA_2183 BAA_2184     FALSE 0.496 98.000 0.064 NA   NA
 7686547 7686548 BAA_2186 BAA_2187     FALSE 0.062 318.000 0.642 NA   NA
 7686548 7686549 BAA_2187 BAA_2188     TRUE 0.895 0.000 0.714 NA   NA
 7686549 7686550 BAA_2188 BAA_2189     FALSE 0.008 389.000 0.000 NA   NA
 7686550 7686551 BAA_2189 BAA_2190     TRUE 0.714 93.000 0.556 NA   NA
 7686552 7686553 BAA_2191 BAA_2192 narG narH TRUE 0.956 -10.000 0.429 0.000 Y NA
 7686553 7686554 BAA_2192 BAA_2193 narH narJ TRUE 0.985 20.000 0.750 0.001 Y NA
 7686554 7686555 BAA_2193 BAA_2194 narJ narI TRUE 0.977 18.000 0.294 0.001 Y NA
 7686555 7686556 BAA_2194 BAA_2195 narI   FALSE 0.057 332.000 0.000 1.000 N NA
 7686556 7686557 BAA_2195 BAA_2196     TRUE 0.878 -3.000 0.250 1.000 N NA
 7686557 7686558 BAA_2196 BAA_2197     FALSE 0.361 -10.000 0.000 NA   NA
 7686560 7686561 BAA_2199 BAA_2200 narA1   TRUE 0.982 18.000 0.778 1.000 Y NA
 7686561 7686562 BAA_2200 BAA_2201   moeA1 TRUE 0.941 43.000 0.500 1.000 Y NA
 7686562 7686563 BAA_2201 BAA_2202 moeA1 moaE1 TRUE 0.927 45.000 0.006 0.004 Y NA
 7686563 7686564 BAA_2202 BAA_2203 moaE1 moaD1 TRUE 0.979 -3.000 0.501 0.004 Y NA
 7686564 7686565 BAA_2203 BAA_2204 moaD1 narK TRUE 0.694 81.000 0.021 NA N NA
 7686565 7686566 BAA_2204 BAA_2205 narK   FALSE 0.010 352.000 0.000 NA   NA
 7686566 7686567 BAA_2205 BAA_2206     FALSE 0.007 405.000 0.000 NA   NA
 7686568 7686569 BAA_2207 BAA_2208     FALSE 0.628 -7.000 0.143 1.000   NA
 7686569 7686570 BAA_2208 BAA_2209     TRUE 0.801 -3.000 0.381 1.000   NA
 7686570 7686571 BAA_2209 BAA_2210   nirD TRUE 0.836 26.000 0.061 1.000 N NA
 7686571 7686572 BAA_2210 BAA_2211 nirD nirB TRUE 0.925 16.000 0.091 0.000 N NA
 7686572 7686573 BAA_2211 BAA_2212 nirB ric FALSE 0.185 212.000 0.000 NA N NA
 7686576 7686577 BAA_2215 BAA_2216     FALSE 0.148 216.000 0.444 NA   NA
 7686579 7686580 BAA_2218 BAA_2219   spoVS1 FALSE 0.006 430.000 0.000 NA   NA
 7686583 7686584 BAA_2222 BAA_2223     FALSE 0.061 208.000 0.000 NA   NA
 7686585 7686586 BAA_2224 BAA_2225     FALSE 0.612 -3.000 0.020 NA   NA
 7686586 7686587 BAA_2225 BAA_2226     TRUE 0.709 -3.000 0.031 1.000   NA
 7686587 7686588 BAA_2226 BAA_2227     FALSE 0.386 76.000 0.022 NA   NA
 7686588 7686589 BAA_2227 BAA_2228     FALSE 0.559 106.000 0.049 NA   NA
 7686589 7686590 BAA_2228 BAA_2229   ssb2 FALSE 0.625 159.000 0.700 NA   NA
 7686591 7686592 BAA_2230 BAA_2231     FALSE 0.419 102.000 0.000 NA   NA
 7686592 7686593 BAA_2231 BAA_2232     FALSE 0.019 286.000 0.000 NA   NA
 7686594 7686595 BAA_2233 BAA_2234     TRUE 0.722 4.000 0.028 NA   NA
 7686595 7686596 BAA_2234 BAA_2235     FALSE 0.430 84.000 0.028 NA   NA
 7686596 7686597 BAA_2235 BAA_2236     FALSE 0.404 50.000 0.081 NA   NA
 7686597 7686598 BAA_2236 BAA_2237   argS1 FALSE 0.016 301.000 0.000 NA   NA
 7686598 7686599 BAA_2237 BAA_2238 argS1   FALSE 0.070 217.000 0.032 NA   NA
 7686599 7686600 BAA_2238 BAA_2239     FALSE 0.585 30.000 0.250 NA   NA
 7686600 7686601 BAA_2239 BAA_2240     FALSE 0.544 137.000 0.118 NA   NA
 7686601 7686602 BAA_2240 BAA_2241     FALSE 0.009 370.000 0.000 NA   NA
 7686602 7686603 BAA_2241 BAA_2242     FALSE 0.308 76.000 0.000 NA   NA
 7686603 7686604 BAA_2242 BAA_2243   ileS1 FALSE 0.008 393.000 0.000 NA   NA
 7686604 7686605 BAA_2243 BAA_2244 ileS1   FALSE 0.062 321.000 0.000 1.000 N NA
 7686607 7686608 BAA_2246 BAA_2247   aspS1 FALSE 0.047 220.000 0.000 NA   NA
 7686608 7686609 BAA_2247 BAA_2248 aspS1   FALSE 0.073 201.000 0.000 NA   NA
 7686609 7686610 BAA_2248 BAA_2249     TRUE 0.726 13.000 0.214 NA   NA
 7686610 7686611 BAA_2249 BAA_2250     TRUE 0.676 29.000 0.375 NA   NA
 7686611 7686612 BAA_2250 BAA_2251     FALSE 0.524 32.000 0.057 NA   NA
 7686612 7686613 BAA_2251 BAA_2252     FALSE 0.575 128.000 0.075 NA   NA
 7686613 7686614 BAA_2252 BAA_2253     FALSE 0.346 84.000 0.000 NA   NA
 7686614 7686615 BAA_2253 BAA_2254     FALSE 0.361 -10.000 0.000 NA   NA
 7686615 7686616 BAA_2254 BAA_2255     FALSE 0.486 24.000 0.000 NA   NA
 7686616 7686617 BAA_2255 BAA_2256     FALSE 0.380 -9.000 0.000 NA   NA
 7686617 7686618 BAA_2256 BAA_2257     FALSE 0.369 90.000 0.000 NA   NA
 7686618 7686619 BAA_2257 BAA_2258     FALSE 0.298 71.000 0.000 NA   NA
 7686619 7686620 BAA_2258 BAA_2259     FALSE 0.036 237.000 0.000 NA   NA
 7686620 7686621 BAA_2259 BAA_2260     FALSE 0.456 27.000 0.000 NA   NA
 7686621 7686622 BAA_2260 BAA_2261     FALSE 0.053 214.000 0.000 NA   NA
 7686622 7686623 BAA_2261 BAA_2262     FALSE 0.489 113.000 0.000 NA   NA
 7686623 7686624 BAA_2262 BAA_2263     TRUE 0.730 -15.000 0.750 NA   NA
 7686624 7686625 BAA_2263 BAA_2264     FALSE 0.235 159.000 0.000 NA   NA
 7686625 7686626 BAA_2264 BAA_2265     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686626 7686627 BAA_2265 BAA_2266     FALSE 0.027 258.000 0.000 NA   NA
 7686627 7686628 BAA_2266 BAA_2267     FALSE 0.604 14.000 0.000 NA   NA
 7686628 7686629 BAA_2267 BAA_2268     FALSE 0.005 560.000 0.000 NA   NA
 7686629 7686630 BAA_2268 BAA_2269     FALSE 0.395 35.000 0.000 NA   NA
 7686630 7686631 BAA_2269 BAA_2270     FALSE 0.006 513.000 0.000 NA   NA
 7686631 7686632 BAA_2270 BAA_2271     FALSE 0.308 49.000 0.000 NA   NA
 7686632 7686633 BAA_2271 BAA_2272     FALSE 0.005 547.000 0.000 NA   NA
 7686633 7686634 BAA_2272 BAA_2273     TRUE 0.876 -3.000 0.240 1.000 N NA
 7686634 7686635 BAA_2273 BAA_2274     TRUE 0.829 129.000 0.015 1.000 N NA
 7686635 7686636 BAA_2274 BAA_2275     TRUE 0.976 4.000 0.100 1.000 Y NA
 7686636 7686637 BAA_2275 BAA_2276     TRUE 0.736 20.000 0.133 1.000   NA
 7686637 7686638 BAA_2276 BAA_2277     TRUE 0.888 109.000 0.667 0.004   NA
 7686638 7686639 BAA_2277 BAA_2278     FALSE 0.009 495.000 0.000 1.000   NA
 7686639 7686640 BAA_2278 BAA_2279     FALSE 0.560 41.000 0.206 1.000   NA
 7686641 7686642 BAA_2280 BAA_2281     FALSE 0.521 33.000 0.095 NA   NA
 7686643 7686644 BAA_2282 BAA_2283     FALSE 0.095 210.000 0.000 1.000   NA
 7686644 7686645 BAA_2283 BAA_2284     TRUE 0.822 53.000 0.583 1.000 N NA
 7686645 7686646 BAA_2284 BAA_2285     TRUE 0.733 148.000 0.032 1.000 N NA
 7686646 7686647 BAA_2285 BAA_2286     FALSE 0.386 75.000 0.032 NA   NA
 7686647 7686648 BAA_2286 BAA_2287     TRUE 0.640 -3.000 0.113 NA   NA
 7686649 7686650 BAA_2288 BAA_2289     FALSE 0.326 -13.000 0.000 NA   NA
 7686650 7686651 BAA_2289 BAA_2290     FALSE 0.435 30.000 0.000 NA   NA
 7686652 7686653 BAA_2291 BAA_2292     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7686653 7686654 BAA_2292 BAA_2293     FALSE 0.212 -45.000 0.000 NA   NA
 7686654 7686655 BAA_2293 BAA_2294     FALSE 0.020 283.000 0.000 NA   NA
 7686655 7686656 BAA_2294 BAA_2295     FALSE 0.557 106.000 0.045 NA   NA
 7686656 7686657 BAA_2295 BAA_2296     FALSE 0.418 80.000 0.038 NA   NA
 7686657 7686658 BAA_2296 BAA_2297     TRUE 0.712 13.000 0.085 NA   NA
 7686659 7686660 BAA_2298 BAA_2299     TRUE 0.669 128.000 0.094 1.000   NA
 7686661 7686662 BAA_2300 BAA_2301 thyA dfrA TRUE 0.891 20.000 0.295 1.000 N NA
 7686662 7686663 BAA_2301 BAA_2302 dfrA pbpC TRUE 0.663 156.000 0.015 1.000 N NA
 7686663 7686664 BAA_2302 BAA_2303 pbpC   FALSE 0.147 243.000 0.000 1.000 N NA
 7686664 7686665 BAA_2303 BAA_2304     TRUE 0.956 112.000 0.206 1.000 Y NA
 7686667 7686668 BAA_2306 BAA_2307     TRUE 0.933 43.000 0.500 NA Y NA
 7686668 7686669 BAA_2307 BAA_2308     FALSE 0.013 322.000 0.000 NA   NA
 7686669 7686670 BAA_2308 BAA_2309     TRUE 0.780 132.000 0.577 NA   NA
 7686674 7686675 BAA_2313 BAA_2314 asnO3   FALSE 0.586 94.000 0.108 1.000   NA
 7686675 7686676 BAA_2314 BAA_2315     TRUE 0.719 43.000 0.667 NA   NA
 7686676 7686677 BAA_2315 BAA_2316     FALSE 0.201 163.000 0.000 NA   NA
 7686677 7686678 BAA_2316 BAA_2317     FALSE 0.351 146.000 0.000 NA   NA
 7686678 7686679 BAA_2317 BAA_2318   dat1 TRUE 0.921 132.000 0.778 1.000 N NA
 7686679 7686680 BAA_2318 BAA_2319 dat1   TRUE 0.799 99.000 0.175 1.000 N NA
 7686680 7686681 BAA_2319 BAA_2320     FALSE 0.027 260.000 0.000 NA   NA
 7686681 7686682 BAA_2320 BAA_2321     TRUE 0.631 128.000 0.263 NA   NA
 7686682 7686683 BAA_2321 BAA_2322     FALSE 0.010 351.000 0.000 NA   NA
 7686685 7686686 BAA_2324 BAA_2325     FALSE 0.061 299.000 0.000 NA N NA
 7686686 7686687 BAA_2325 BAA_2326     TRUE 0.778 151.000 0.400 1.000 N NA
 7686687 7686688 BAA_2326 BAA_2327     TRUE 0.978 14.000 0.250 0.016 Y NA
 7686688 7686689 BAA_2327 BAA_2328     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7686689 7686690 BAA_2328 BAA_2329     TRUE 0.642 10.000 0.000 NA   NA
 7686690 7686691 BAA_2329 BAA_2330     FALSE 0.018 289.000 0.000 NA   NA
 7686692 7686693 BAA_2331 BAA_2332     TRUE 0.978 -3.000 0.500 0.028 Y NA
 7686694 7686695 BAA_2333 BAA_2334     FALSE 0.382 95.000 0.000 NA   NA
 7686695 7686696 BAA_2334 BAA_2335     FALSE 0.281 154.000 0.000 NA   NA
 7686696 7686697 BAA_2335 BAA_2336     FALSE 0.281 154.000 0.000 NA   NA
 7686697 7686698 BAA_2336 BAA_2337     FALSE 0.006 493.000 0.000 NA   NA
 7686698 7686699 BAA_2337 BAA_2338     FALSE 0.335 43.000 0.000 NA   NA
 7686699 7686700 BAA_2338 BAA_2339     FALSE 0.294 152.000 0.000 NA   NA
 7686700 7686701 BAA_2339 BAA_2340     FALSE 0.508 35.000 0.115 NA   NA
 7686701 7686702 BAA_2340 BAA_2341     FALSE 0.482 146.000 0.231 NA   NA
 7686702 7686703 BAA_2341 BAA_2342     TRUE 0.801 2.000 0.150 1.000   NA
 7686703 7686704 BAA_2342 BAA_2343     FALSE 0.399 64.000 0.117 NA   NA
 7686704 7686705 BAA_2343 BAA_2344   proV1 FALSE 0.595 103.000 0.269 NA   NA
 7686705 7686706 BAA_2344 BAA_2345 proV1   TRUE 0.934 4.000 0.218 0.081 N NA
 7686706 7686707 BAA_2345 BAA_2346   arcD FALSE 0.217 214.000 0.000 1.000 N NA
 7686707 7686708 BAA_2346 BAA_2347 arcD   TRUE 0.642 77.000 0.533 NA   NA
 7686708 7686709 BAA_2347 BAA_2348     TRUE 0.705 106.000 0.400 NA   NA
 7686709 7686710 BAA_2348 BAA_2349     FALSE 0.615 -10.000 0.400 NA   NA
 7686710 7686711 BAA_2349 BAA_2350     FALSE 0.021 277.000 0.000 NA   NA
 7686713 7686714 BAA_2352 BAA_2353     TRUE 0.785 133.000 0.333 0.065   NA
 7686718 7686719 BAA_2357 BAA_2358     FALSE 0.217 161.000 0.000 NA   NA
 7686719 7686720 BAA_2358 BAA_2359   atoD TRUE 0.942 -3.000 0.792 1.000 N NA
 7686720 7686721 BAA_2359 BAA_2360 atoD   TRUE 0.963 -15.000 0.760 0.000 Y NA
 7686721 7686722 BAA_2360 BAA_2361     TRUE 0.922 16.000 0.419 1.000 N NA
 7686722 7686723 BAA_2361 BAA_2362     TRUE 0.962 -3.000 0.084 1.000 Y NA
 7686723 7686724 BAA_2362 BAA_2363   rocR2 TRUE 0.825 106.000 0.013 1.000 N NA
 7686724 7686725 BAA_2363 BAA_2364 rocR2 kamA FALSE 0.230 211.000 0.000 1.000 N NA
 7686725 7686726 BAA_2364 BAA_2365 kamA   TRUE 0.643 -3.000 0.124 NA   NA
 7686726 7686727 BAA_2365 BAA_2366     FALSE 0.401 73.000 0.102 NA   NA
 7686727 7686728 BAA_2366 BAA_2367     FALSE 0.140 190.000 0.045 NA   NA
 7686730 7686731 BAA_2369 BAA_2370     TRUE 0.665 111.000 0.286 NA   NA
 7686731 7686732 BAA_2370 BAA_2371     TRUE 0.709 0.000 0.158 NA   NA
 7686732 7686733 BAA_2371 BAA_2372     FALSE 0.418 -18.000 0.237 NA   NA
 7686733 7686734 BAA_2372 BAA_2374     FALSE 0.424 72.000 0.233 NA   NA
 7686735 7686736 BAA_2373 BAA_2375     FALSE 0.093 280.000 0.000 1.000 N NA
 7686736 7686737 BAA_2375 BAA_2376     FALSE 0.451 80.000 0.000 1.000   NA
 7686737 7686738 BAA_2376 BAA_2377     FALSE 0.122 183.000 0.000 NA   NA
 7686738 7686739 BAA_2377 BAA_2378     TRUE 0.660 22.000 0.250 NA   NA
 7686739 7686740 BAA_2378 BAA_2379     FALSE 0.127 182.000 0.000 NA   NA
 7686742 7686743 BAA_2381 BAA_2382     FALSE 0.504 37.000 0.000 1.000   NA
 7686744 7686745 BAA_2383 BAA_2384     FALSE 0.017 298.000 0.000 NA   NA
 7686745 7686746 BAA_2384 BAA_2385     TRUE 0.821 32.000 0.667 1.000   NA
 7686750 7686751 BAA_2389 BAA_2390     FALSE 0.006 468.000 0.000 NA   NA
 7686751 7686752 BAA_2390 BAA_2391     FALSE 0.008 393.000 0.000 NA   NA
 7686754 7686755 BAA_2393 BAA_2394     FALSE 0.013 322.000 0.000 NA   NA
 7686755 7686756 BAA_2394 BAA_2395     TRUE 0.773 120.000 0.500 NA   NA
 7686756 7686757 BAA_2395 BAA_2396   prsA3 FALSE 0.004 1528.000 0.000 NA   NA
 7686757 7686758 BAA_2396 BAA_2397 prsA3   FALSE 0.006 505.000 0.000 NA   NA
 7686758 7686759 BAA_2397 BAA_2398     FALSE 0.116 185.000 0.000 NA   NA
 7686759 7686760 BAA_2398 BAA_2399     FALSE 0.006 430.000 0.000 NA   NA
 7686762 7686763 BAA_2401 BAA_2402     FALSE 0.017 296.000 0.000 NA   NA
 7686763 7686764 BAA_2402 BAA_2403     FALSE 0.007 745.000 0.000 1.000   NA
 7686764 7686765 BAA_2403 BAA_2404     FALSE 0.024 615.000 0.000 1.000 N NA
 7686765 7686766 BAA_2404 BAA_2405     TRUE 0.719 16.000 0.250 NA   NA
 7686766 7686767 BAA_2405 BAA_2406   mmgD FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 7686767 7686768 BAA_2406 BAA_2407 mmgD mmgE FALSE 0.615 99.000 0.216 1.000   NA
 7686768 7686769 BAA_2407 BAA_2408 mmgE prpB TRUE 0.749 19.000 0.218 1.000   NA
 7686771 7686772 BAA_2410 BAA_2411     TRUE 0.977 17.000 0.500 1.000 Y NA
 7686772 7686773 BAA_2411 BAA_2412   mmsA1 TRUE 0.895 37.000 0.545 0.001 N NA
 7686774 7686775 BAA_2413 BAA_2414     FALSE 0.447 184.000 0.167 1.000 N NA
 7686776 7686777 BAA_2415 BAA_2416     FALSE 0.197 184.000 0.250 NA   NA
 7686777 7686778 BAA_2416 BAA_2417     TRUE 0.660 16.000 0.016 NA   NA
 7686778 7686779 BAA_2417 BAA_2418     TRUE 0.975 -3.000 0.669 NA Y NA
 7686779 7686780 BAA_2418 BAA_2420     FALSE 0.027 258.000 0.000 NA   NA
 7686781 7686782 BAA_2419 BAA_2421     FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 7686785 7686786 BAA_2424 BAA_2425     TRUE 0.883 -3.000 0.833 NA   NA
 7686786 7686787 BAA_2425 BAA_2426   bacA FALSE 0.020 584.000 0.000 NA N NA
 7686787 7686788 BAA_2426 BAA_2427 bacA bacC TRUE 0.950 27.000 0.210 1.000 Y NA
 7686788 7686789 BAA_2427 BAA_2428 bacC bacE TRUE 0.981 13.000 0.511 1.000 Y NA
 7686789 7686790 BAA_2428 BAA_2429 bacE bacB TRUE 0.962 32.000 0.581 1.000 Y NA
 7686790 7686791 BAA_2429 BAA_2430 bacB bacF TRUE 0.965 32.000 0.424 0.001 Y NA
 7686791 7686792 BAA_2430 BAA_2431 bacF   TRUE 0.773 -3.000 0.424 NA   NA
 7686792 7686793 BAA_2431 BAA_2432     TRUE 0.811 0.000 0.400 NA   NA
 7686793 7686794 BAA_2432 BAA_2433     TRUE 0.807 34.000 0.229 1.000 N NA
 7686794 7686795 BAA_2433 BAA_2434     FALSE 0.472 36.000 0.025 NA   NA
 7686797 7686798 BAA_2436 BAA_2437     TRUE 0.711 15.000 0.219 NA   NA
 7686799 7686800 BAA_2438 BAA_2439     FALSE 0.179 227.000 0.000 1.000 N NA
 7686800 7686801 BAA_2439 BAA_2441     FALSE 0.006 445.000 0.000 NA   NA
 7686802 7686803 BAA_2442 BAA_2443     FALSE 0.125 205.000 0.286 NA   NA
 7686803 7686804 BAA_2443 BAA_2444     FALSE 0.229 186.000 0.148 1.000   NA
 7686806 7686807 BAA_2446 BAA_2447 thrS1   FALSE 0.029 254.000 0.000 NA   NA
 7686807 7686808 BAA_2447 BAA_2448     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7686808 7686809 BAA_2448 BAA_2449     FALSE 0.629 12.000 0.000 NA   NA
 7686809 7686810 BAA_2449 BAA_2450     FALSE 0.038 270.000 0.000 1.000   NA
 7686810 7686811 BAA_2450 BAA_2451     FALSE 0.046 221.000 0.000 NA   NA
 7686811 7686812 BAA_2451 BAA_2452     FALSE 0.298 55.000 0.000 NA   NA
 7686812 7686813 BAA_2452 BAA_2453     FALSE 0.551 19.000 0.000 NA   NA
 7686813 7686814 BAA_2453 BAA_2454     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7686816 7686817 BAA_2456 BAA_2457     FALSE 0.393 49.000 0.036 NA   NA
 7686817 7686818 BAA_2457 BAA_2458     FALSE 0.351 146.000 0.000 NA   NA
 7686818 7686819 BAA_2458 BAA_2459     FALSE 0.298 71.000 0.000 NA   NA
 7686820 7686821 BAA_2460 BAA_2461     FALSE 0.523 34.000 0.137 NA   NA
 7686822 7686823 BAA_2462 BAA_2463     FALSE 0.004 1199.000 0.000 NA   NA
 7686823 7686824 BAA_2463 BAA_2464     FALSE 0.594 67.000 0.368 1.000   NA
 7686828 7686829 BAA_2468 BAA_2469     FALSE 0.098 208.000 0.000 1.000   NA
 7686829 7686830 BAA_2469 BAA_2470     TRUE 0.715 56.000 0.462 0.018   NA
 7686830 7686831 BAA_2470 BAA_2471     TRUE 0.637 148.000 0.171 0.018   NA
 7686833 7686834 BAA_2473 BAA_2474     FALSE 0.521 34.000 0.179 NA   NA
 7686834 7686835 BAA_2474 BAA_2475     FALSE 0.513 158.000 0.455 NA   NA
 7686835 7686836 BAA_2475 BAA_2476     TRUE 0.754 115.000 0.444 NA   NA
 7686836 7686837 BAA_2476 BAA_2477   hemY2 FALSE 0.605 61.000 0.500 NA   NA
 7686840 7686841 BAA_2480 BAA_2481   cspA2 FALSE 0.572 87.000 0.333 NA   NA
 7686842 7686843 BAA_2482 BAA_2483     FALSE 0.206 -304.000 0.000 NA   NA
 7686843 7686844 BAA_2483 BAA_2484     FALSE 0.221 -36.000 0.000 NA   NA
 7686846 7686847 BAA_2486 BAA_2487     FALSE 0.511 98.000 0.143 NA   NA
 7686848 7686849 BAA_2488 BAA_2489     FALSE 0.007 408.000 0.000 NA   NA
 7686851 7686852 BAA_2491 BAA_2492     FALSE 0.005 595.000 0.000 NA   NA
 7686852 7686853 BAA_2492 BAA_2493     FALSE 0.007 423.000 0.000 NA   NA
 7686854 7686855 BAA_2494 BAA_2495 asd1   FALSE 0.348 166.000 0.058 1.000   NA
 7686855 7686856 BAA_2495 BAA_2496     FALSE 0.471 54.000 0.286 NA   NA
 7686858 7686859 BAA_2498 BAA_2499     FALSE 0.043 261.000 0.000 1.000   NA
 7686859 7686860 BAA_2499 BAA_2500     FALSE 0.514 34.000 0.100 NA   NA
 7686860 7686861 BAA_2500 BAA_2501     FALSE 0.045 222.000 0.000 NA   NA
 7686861 7686862 BAA_2501 BAA_2502     TRUE 0.954 -7.000 0.240 0.004 Y NA
 7686862 7686863 BAA_2502 BAA_2503     FALSE 0.024 604.000 0.000 1.000 N NA
 7686869 7686870 BAA_2509 BAA_2510     FALSE 0.498 95.000 0.127 NA   NA
 7686870 7686871 BAA_2510 BAA_2511     TRUE 0.685 -22.000 0.145 1.000 N NA
 7686872 7686873 BAA_2512 BAA_2513     FALSE 0.092 193.000 0.000 NA   NA
 7686874 7686875 BAA_2514 BAA_2515     FALSE 0.014 314.000 0.000 NA   NA
 7686875 7686876 BAA_2515 BAA_2516     TRUE 0.792 25.000 0.571 NA   NA
 7686878 7686879 BAA_2518 BAA_2519     FALSE 0.351 146.000 0.000 NA   NA
 7686879 7686880 BAA_2519 BAA_2520     TRUE 0.988 12.000 0.667 0.004 Y NA
 7686880 7686881 BAA_2520 BAA_2521     FALSE 0.517 80.000 0.296 NA   NA
 7686881 7686882 BAA_2521 BAA_2522     FALSE 0.580 23.000 0.015 NA   NA
 7686882 7686883 BAA_2522 BAA_2523     TRUE 0.832 21.000 0.004 NA N NA
 7686883 7686884 BAA_2523 BAA_2524     TRUE 0.667 112.000 0.286 NA   NA
 7686884 7686885 BAA_2524 BAA_2525     FALSE 0.437 71.000 0.250 NA   NA
 7686885 7686886 BAA_2525 BAA_2526   tdcB TRUE 0.937 87.000 0.017 0.014 Y NA
 7686890 7686891 BAA_2530 BAA_2531     FALSE 0.455 83.000 0.150 NA   NA
 7686891 7686892 BAA_2531 BAA_2532     FALSE 0.182 182.000 0.075 NA   NA
 7686894 7686895 BAA_2534 BAA_2535     FALSE 0.602 110.000 0.143 NA   NA
 7686895 7686896 BAA_2535 BAA_2536     TRUE 0.707 63.000 0.300 NA N NA
 7686896 7686897 BAA_2536 BAA_2537     TRUE 0.775 139.000 0.167 NA N NA
 7686897 7686898 BAA_2537 BAA_2538     TRUE 0.934 12.000 0.412 1.000 N NA
 7686898 7686899 BAA_2538 BAA_2539     TRUE 0.799 99.000 0.182 1.000 N NA
 7686899 7686900 BAA_2539 BAA_2540     FALSE 0.600 121.000 0.130 NA   NA
 7686900 7686901 BAA_2540 BAA_2541     FALSE 0.011 344.000 0.000 NA   NA
 7686903 7686904 BAA_2543 BAA_2544   gpm FALSE 0.555 168.000 0.023 1.000 N NA
 7686906 7686907 BAA_2546 BAA_2547     TRUE 0.755 113.000 0.444 NA   NA
 7686907 7686908 BAA_2547 BAA_2548     FALSE 0.454 77.000 0.250 NA   NA
 7686909 7686910 BAA_2549 BAA_2550     FALSE 0.009 373.000 0.000 NA   NA
 7686911 7686912 BAA_2551 BAA_2552     FALSE 0.313 77.000 0.000 NA   NA
 7686912 7686913 BAA_2552 BAA_2553   pepD FALSE 0.486 144.000 0.125 NA   NA
 7686914 7686915 BAA_2554 BAA_2555     FALSE 0.012 329.000 0.000 NA   NA
 7686916 7686917 BAA_2556 BAA_2557     FALSE 0.188 222.000 0.000 1.000 N NA
 7686917 7686918 BAA_2557 BAA_2558     TRUE 0.730 -10.000 0.636 NA   NA
 7686920 7686921 BAA_2560 BAA_2561     FALSE 0.313 77.000 0.000 NA   NA
 7686921 7686922 BAA_2561 BAA_2562     FALSE 0.380 -9.000 0.000 NA   NA
 7686922 7686923 BAA_2562 BAA_2563   bla1 FALSE 0.013 327.000 0.000 NA   NA
 7686927 7686928 BAA_2567 BAA_2568     FALSE 0.601 100.000 0.042 1.000   NA
 7686928 7686929 BAA_2568 BAA_2569   mmsA2 TRUE 0.872 39.000 0.667 1.000 N NA
 7686929 7686930 BAA_2569 BAA_2570 mmsA2   FALSE 0.210 -49.000 0.000 NA   NA
 7686930 7686931 BAA_2570 BAA_2571     FALSE 0.441 29.000 0.000 NA   NA
 7686931 7686932 BAA_2571 BAA_2572     FALSE 0.479 123.000 0.000 NA   NA
 7686932 7686933 BAA_2572 BAA_2573     FALSE 0.221 -36.000 0.000 NA   NA
 7686933 7686934 BAA_2573 BAA_2574   fba1 FALSE 0.463 129.000 0.000 NA   NA
 7686934 7686935 BAA_2574 BAA_2575 fba1   TRUE 0.949 106.000 0.069 1.000 Y NA
 7686937 7686938 BAA_2577 BAA_2578     FALSE 0.301 52.000 0.000 NA   NA
 7686938 7686939 BAA_2578 BAA_2579     FALSE 0.015 307.000 0.000 NA   NA
 7686939 7686940 BAA_2579 BAA_2580     FALSE 0.346 84.000 0.000 NA   NA
 7686941 7686942 BAA_2581 BAA_2582     TRUE 0.847 0.000 0.500 NA   NA
 7686947 7686948 BAA_2587 BAA_2588     FALSE 0.016 305.000 0.000 NA   NA
 7686948 7686949 BAA_2588 BAA_2589     FALSE 0.463 129.000 0.000 NA   NA
 7686949 7686950 BAA_2589 BAA_2590     FALSE 0.005 531.000 0.000 NA   NA
 7686951 7686952 BAA_2591 BAA_2592     FALSE 0.008 394.000 0.000 NA   NA
 7686953 7686954 BAA_2593 BAA_2594     FALSE 0.030 445.000 0.000 1.000 N NA
 7686954 7686955 BAA_2594 BAA_2595     FALSE 0.362 145.000 0.000 NA   NA
 7686957 7686958 BAA_2597 BAA_2598     FALSE 0.408 67.000 0.208 NA   NA
 7686958 7686959 BAA_2598 BAA_2599     FALSE 0.590 111.000 0.059 NA   NA
 7686959 7686960 BAA_2599 BAA_2600     FALSE 0.059 210.000 0.000 NA   NA
 7686960 7686961 BAA_2600 BAA_2601     FALSE 0.050 245.000 0.069 NA   NA
 7686961 7686962 BAA_2601 BAA_2602     TRUE 0.946 -3.000 0.713 0.084 N NA
 7686962 7686963 BAA_2602 BAA_2603     TRUE 0.840 25.000 0.049 1.000 N NA
 7686965 7686966 BAA_2605 BAA_2606     FALSE 0.050 217.000 0.000 NA   NA
 7686966 7686967 BAA_2606 BAA_2607     TRUE 0.969 16.000 0.067 1.000 Y NA
 7686967 7686968 BAA_2607 BAA_2608     TRUE 0.812 27.000 0.553 1.000   NA
 7686968 7686969 BAA_2608 BAA_2609   mvaB TRUE 0.889 22.000 0.778 1.000   NA
 7686969 7686970 BAA_2609 BAA_2610 mvaB   TRUE 0.966 5.000 0.690 0.063 N NA
 7686970 7686971 BAA_2610 BAA_2611     TRUE 0.981 3.000 0.426 1.000 Y NA
 7686971 7686972 BAA_2611 BAA_2612     TRUE 0.908 50.000 0.167 1.000 Y NA
 7686972 7686973 BAA_2612 BAA_2613     FALSE 0.015 353.000 0.045 NA   NA
 7686973 7686974 BAA_2613 BAA_2614     FALSE 0.607 121.000 0.219 NA   NA
 7686974 7686975 BAA_2614 BAA_2615     TRUE 0.728 49.000 0.188 1.000 N NA
 7686975 7686976 BAA_2615 BAA_2616     FALSE 0.545 -7.000 0.222 NA   NA
 7686976 7686977 BAA_2616 BAA_2617     TRUE 0.745 3.000 0.214 NA   NA
 7686978 7686979 BAA_2618 BAA_2619     FALSE 0.467 182.000 0.143 1.000 N NA
 7686979 7686980 BAA_2619 BAA_2620     TRUE 0.971 -10.000 0.932 0.016 Y NA
 7686981 7686982 BAA_2621 BAA_2622     FALSE 0.023 269.000 0.000 NA   NA
 7686982 7686983 BAA_2622 BAA_2623     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7686983 7686984 BAA_2623 BAA_2624     TRUE 0.908 17.000 0.333 1.000 N NA
 7686984 7686985 BAA_2624 BAA_2625     FALSE 0.583 94.000 0.091 1.000   NA
 7686985 7686986 BAA_2625 BAA_2626     FALSE 0.590 108.000 0.152 NA   NA
 7686986 7686987 BAA_2626 BAA_2627     FALSE 0.173 170.000 0.000 NA   NA
 7686987 7686988 BAA_2627 BAA_2628     FALSE 0.298 71.000 0.000 NA   NA
 7686988 7686989 BAA_2628 BAA_2629     FALSE 0.010 355.000 0.000 NA   NA
 7686989 7686990 BAA_2629 BAA_2630     FALSE 0.547 137.000 0.167 NA   NA
 7686990 7686991 BAA_2630 BAA_2631     FALSE 0.451 88.000 0.036 NA   NA
 7686991 7686992 BAA_2631 BAA_2632     FALSE 0.427 80.000 0.060 NA   NA
 7686992 7686993 BAA_2632 BAA_2633     FALSE 0.008 382.000 0.000 NA   NA
 7686993 7686994 BAA_2633 BAA_2634     TRUE 0.789 -3.000 0.462 NA   NA
 7686994 7686995 BAA_2634 BAA_2635     FALSE 0.592 35.000 0.304 NA   NA
 7686995 7686996 BAA_2635 BAA_2636     TRUE 0.848 122.000 0.208 1.000 N NA
 7686998 7686999 BAA_2638 BAA_2639     FALSE 0.127 182.000 0.000 NA   NA
 7686999 7687000 BAA_2639 BAA_2640     FALSE 0.305 50.000 0.000 NA   NA
 7687004 7687005 BAA_2644 BAA_2645     FALSE 0.437 71.000 0.250 NA   NA
 7687005 7687006 BAA_2645 BAA_2646     FALSE 0.546 137.000 0.125 NA   NA
 7687008 7687009 BAA_2648 BAA_2649     FALSE 0.047 219.000 0.000 NA   NA
 7687009 7687010 BAA_2649 BAA_2650     FALSE 0.008 376.000 0.000 NA   NA
 7687010 7687011 BAA_2650 BAA_2651     FALSE 0.022 274.000 0.000 NA   NA
 7687011 7687012 BAA_2651 BAA_2652     FALSE 0.249 -25.000 0.000 NA   NA
 7687016 7687017 BAA_2656 BAA_2657     TRUE 0.844 126.000 0.156 1.000 N NA
 7687017 7687018 BAA_2657 BAA_2658     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7687018 7687019 BAA_2658 BAA_2659     FALSE 0.207 -106.000 0.000 NA   NA
 7687021 7687022 BAA_2661 BAA_2662     FALSE 0.487 111.000 0.000 NA   NA
 7687022 7687023 BAA_2662 BAA_2663     FALSE 0.474 25.000 0.000 NA   NA
 7687023 7687024 BAA_2663 BAA_2664     FALSE 0.008 385.000 0.000 NA   NA
 7687024 7687025 BAA_2664 BAA_2665     FALSE 0.014 314.000 0.000 NA   NA
 7687025 7687026 BAA_2665 BAA_2666     FALSE 0.249 -25.000 0.000 NA   NA
 7687026 7687027 BAA_2666 BAA_2667     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7687027 7687028 BAA_2667 BAA_2668     FALSE 0.296 68.000 0.000 NA   NA
 7687030 7687031 BAA_2670 BAA_2671     FALSE 0.361 88.000 0.000 NA   NA
 7687031 7687032 BAA_2671 BAA_2672     TRUE 0.953 122.000 0.038 1.000 Y NA
 7687032 7687033 BAA_2672 BAA_2673   ddlB TRUE 0.912 5.000 0.005 1.000 N NA
 7687033 7687034 BAA_2673 BAA_2675 ddlB tenA FALSE 0.097 275.000 0.000 1.000 N NA
 7687034 7687035 BAA_2675 BAA_2676 tenA   FALSE 0.089 194.000 0.000 NA   NA
 7687035 7687036 BAA_2676 BAA_2677     FALSE 0.402 -39.000 0.333 NA   NA
 7687036 7687037 BAA_2677 BAA_2678     FALSE 0.008 378.000 0.000 NA   NA
 7687037 7687038 BAA_2678 BAA_2679     FALSE 0.346 84.000 0.000 NA   NA
 7687041 7687042 BAA_2682 BAA_2683     FALSE 0.479 109.000 0.000 NA   NA
 7687043 7687044 BAA_2684 BAA_2685     FALSE 0.319 78.000 0.000 NA   NA
 7687044 7687045 BAA_2685 BAA_2686     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7687045 7687046 BAA_2686 BAA_2687     FALSE 0.422 32.000 0.000 NA   NA
 7687046 7687047 BAA_2687 BAA_2688     FALSE 0.472 127.000 0.000 NA   NA
 7687047 7687048 BAA_2688 BAA_2689     TRUE 0.731 141.000 0.556 NA   NA
 7687050 7687051 BAA_2691 BAA_2692     FALSE 0.451 147.000 0.136 NA   NA
 7687051 7687052 BAA_2692 BAA_2693   cypA FALSE 0.319 160.000 0.188 NA   NA
 7687052 7687053 BAA_2693 BAA_2694 cypA   FALSE 0.023 269.000 0.000 NA   NA
 7687053 7687054 BAA_2694 BAA_2695     FALSE 0.461 -10.000 0.056 NA   NA
 7687054 7687055 BAA_2695 BAA_2696     FALSE 0.388 71.000 0.048 NA   NA
 7687057 7687058 BAA_2698 BAA_2699     TRUE 0.841 114.000 0.412 0.008   NA
 7687058 7687059 BAA_2699 BAA_2700     FALSE 0.397 178.000 0.412 1.000   NA
 7687059 7687060 BAA_2700 BAA_2701     FALSE 0.006 477.000 0.000 NA   NA
 7687060 7687061 BAA_2701 BAA_2702     FALSE 0.295 60.000 0.000 NA   NA
 7687061 7687062 BAA_2702 BAA_2703     FALSE 0.044 223.000 0.000 NA   NA
 7687062 7687063 BAA_2703 BAA_2704     FALSE 0.055 337.000 0.000 1.000 N NA
 7687065 7687066 BAA_2707 BAA_2708     TRUE 0.847 11.000 0.435 NA   NA
 7687066 7687067 BAA_2708 BAA_2709     TRUE 0.779 -7.000 0.530 1.000   NA
 7687067 7687068 BAA_2709 BAA_2710     FALSE 0.475 91.000 0.065 NA   NA
 7687069 7687070 BAA_2711 BAA_2712 kinB2   TRUE 0.663 88.000 0.222 0.083   NA
 7687071 7687072 BAA_2713 BAA_2714     FALSE 0.236 171.000 0.062 NA   NA
 7687072 7687073 BAA_2714 BAA_2715     FALSE 0.020 335.000 0.000 1.000   NA
 7687073 7687074 BAA_2715 BAA_2716     FALSE 0.005 535.000 0.000 NA   NA
 7687074 7687075 BAA_2716 BAA_2717     FALSE 0.593 112.000 0.063 NA   NA
 7687075 7687076 BAA_2717 BAA_2718     TRUE 0.806 5.000 0.048 1.000   NA
 7687076 7687077 BAA_2718 BAA_2719     FALSE 0.076 199.000 0.000 NA   NA
 7687077 7687078 BAA_2719 BAA_2720     FALSE 0.114 200.000 0.125 NA   NA
 7687080 7687081 BAA_2722 BAA_2723     FALSE 0.413 75.000 0.127 NA   NA
 7687081 7687082 BAA_2723 BAA_2724     FALSE 0.010 358.000 0.000 NA   NA
 7687084 7687085 BAA_2726 BAA_2727 adP1   FALSE 0.022 699.000 0.000 1.000 N NA
 7687085 7687086 BAA_2727 BAA_2728     TRUE 0.807 113.000 0.471 1.000   NA
 7687088 7687089 BAA_2730 BAA_2731     TRUE 0.777 46.000 0.778 1.000   NA
 7687092 7687093 BAA_2734 BAA_2735     FALSE 0.296 67.000 0.000 NA   NA
 7687094 7687095 BAA_2736 BAA_2737     TRUE 0.941 139.000 0.154 1.000 Y NA
 7687095 7687096 BAA_2737 BAA_2738     FALSE 0.397 141.000 0.000 NA   NA
 7687096 7687097 BAA_2738 BAA_2739     FALSE 0.382 95.000 0.000 NA   NA
 7687097 7687098 BAA_2739 BAA_2740     FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7687098 7687099 BAA_2740 BAA_2741     FALSE 0.171 203.000 0.400 NA   NA
 7687099 7687100 BAA_2741 BAA_2742     FALSE 0.569 102.000 0.250 NA   NA
 7687100 7687101 BAA_2742 BAA_2743     FALSE 0.422 32.000 0.000 NA   NA
 7687101 7687102 BAA_2743 BAA_2744     FALSE 0.020 285.000 0.000 NA   NA
 7687102 7687103 BAA_2744 BAA_2745     FALSE 0.016 301.000 0.000 NA   NA
 7687103 7687104 BAA_2745 BAA_2746     FALSE 0.313 -15.000 0.000 NA   NA
 7687104 7687105 BAA_2746 BAA_2747     FALSE 0.005 634.000 0.000 NA   NA
 7687105 7687106 BAA_2747 BAA_2748   dnaN2 TRUE 0.939 32.000 0.007 1.000 Y NA
 7687106 7687107 BAA_2748 BAA_2749 dnaN2   TRUE 0.955 23.000 0.004 1.000 Y NA
 7687107 7687108 BAA_2749 BAA_2750     FALSE 0.476 98.000 0.021 NA   NA
 7687108 7687109 BAA_2750 BAA_2751     FALSE 0.300 73.000 0.000 NA   NA
 7687111 7687112 BAA_2753 BAA_2754     FALSE 0.583 136.000 0.250 NA   NA
 7687112 7687113 BAA_2754 BAA_2755     FALSE 0.596 119.000 0.111 NA   NA
 7687114 7687115 BAA_2756 BAA_2757     FALSE 0.424 79.000 0.082 NA   NA
 7687115 7687116 BAA_2757 BAA_2758     FALSE 0.465 26.000 0.000 NA   NA
 7687116 7687117 BAA_2758 BAA_2759     FALSE 0.365 89.000 0.000 NA   NA
 7687117 7687118 BAA_2759 BAA_2760     FALSE 0.025 266.000 0.000 NA   NA
 7687118 7687119 BAA_2760 BAA_2761     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7687121 7687122 BAA_2763 BAA_2764     TRUE 0.727 2.000 0.108 NA   NA
 7687122 7687123 BAA_2764 BAA_2765     TRUE 0.677 17.000 0.108 NA   NA
 7687123 7687124 BAA_2765 BAA_2766     TRUE 0.670 64.000 0.171 NA N NA
 7687124 7687125 BAA_2766 BAA_2767     FALSE 0.341 83.000 0.000 NA   NA
 7687125 7687126 BAA_2767 BAA_2768     FALSE 0.227 -34.000 0.000 NA   NA
 7687128 7687129 BAA_2770 BAA_2771     FALSE 0.243 158.000 0.000 NA   NA
 7687129 7687130 BAA_2771 BAA_2772     FALSE 0.447 28.000 0.000 NA   NA
 7687130 7687131 BAA_2772 BAA_2773     FALSE 0.198 181.000 0.179 NA   NA
 7687132 7687133 BAA_2774 BAA_2775     TRUE 0.820 140.000 0.833 NA   NA
 7687134 7687135 BAA_2776 BAA_2777     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7687135 7687136 BAA_2777 BAA_2778     FALSE 0.308 150.000 0.000 NA   NA
 7687136 7687137 BAA_2778 BAA_2779     FALSE 0.109 203.000 0.000 1.000   NA
 7687137 7687138 BAA_2779 BAA_2780     FALSE 0.584 126.000 0.099 NA   NA
 7687138 7687139 BAA_2780 BAA_2781     FALSE 0.436 148.000 0.167 NA   NA
 7687139 7687140 BAA_2781 BAA_2782     FALSE 0.525 139.000 0.097 NA   NA
 7687140 7687141 BAA_2782 BAA_2783     FALSE 0.586 109.000 0.081 NA   NA
 7687141 7687142 BAA_2783 BAA_2784     FALSE 0.537 137.000 0.088 NA   NA
 7687143 7687144 BAA_2785 BAA_2786     FALSE 0.122 202.000 0.250 NA   NA
 7687144 7687145 BAA_2786 BAA_2787     FALSE 0.004 968.000 0.000 NA   NA
 7687145 7687146 BAA_2787 BAA_2788     FALSE 0.227 -34.000 0.000 NA   NA
 7687147 7687148 BAA_2789 BAA_2790     FALSE 0.297 56.000 0.000 NA   NA
 7687148 7687149 BAA_2790 BAA_2791     FALSE 0.436 104.000 0.000 NA   NA
 7687149 7687150 BAA_2791 BAA_2792     FALSE 0.412 33.000 0.000 NA   NA
 7687150 7687151 BAA_2792 BAA_2793     FALSE 0.007 870.000 0.000 1.000   NA
 7687151 7687152 BAA_2793 BAA_2794     FALSE 0.028 485.000 0.000 1.000 N NA
 7687152 7687153 BAA_2794 BAA_2795     FALSE 0.006 460.000 0.000 NA   NA
 7687153 7687154 BAA_2795 BAA_2796     TRUE 0.760 1.000 0.265 NA   NA
 7687154 7687155 BAA_2796 BAA_2797     FALSE 0.110 251.000 0.000 NA N NA
 7687157 7687158 BAA_2799 BAA_2800     FALSE 0.559 135.000 0.143 NA   NA
 7687159 7687160 BAA_2801 BAA_2802     FALSE 0.016 360.000 0.000 1.000   NA
 7687161 7687162 BAA_2803 BAA_2804     FALSE 0.629 12.000 0.000 NA   NA
 7687164 7687165 BAA_2806 BAA_2807     TRUE 0.683 17.000 0.154 NA   NA
 7687165 7687166 BAA_2807 BAA_2808     FALSE 0.517 55.000 0.240 1.000   NA
 7687166 7687167 BAA_2808 BAA_2809     TRUE 0.639 26.000 0.280 NA   NA
 7687167 7687168 BAA_2809 BAA_2810     FALSE 0.608 113.000 0.143 NA   NA
 7687168 7687169 BAA_2810 BAA_2811   ypeB FALSE 0.567 27.000 0.105 NA   NA
 7687169 7687170 BAA_2811 BAA_2812 ypeB sleB TRUE 0.802 16.000 0.408 NA   NA
 7687172 7687173 BAA_2814 BAA_2815   kynA TRUE 0.847 117.000 0.066 1.000 N NA
 7687173 7687174 BAA_2815 BAA_2816 kynA kynB FALSE 0.615 34.000 0.165 1.000   NA
 7687174 7687175 BAA_2816 BAA_2817 kynB kynU TRUE 0.864 3.000 0.382 1.000   NA
 7687179 7687180 BAA_2821 BAA_2822     FALSE 0.530 152.000 0.385 NA   NA
 7687180 7687181 BAA_2822 BAA_2823     TRUE 0.817 137.000 0.750 NA   NA
 7687181 7687182 BAA_2823 BAA_2824     TRUE 0.637 112.000 0.250 NA   NA
 7687182 7687183 BAA_2824 BAA_2825     FALSE 0.598 125.000 0.208 NA   NA
 7687183 7687184 BAA_2825 BAA_2826     TRUE 0.824 18.000 0.500 NA   NA
 7687184 7687185 BAA_2826 BAA_2827     FALSE 0.519 151.000 0.350 NA   NA
 7687185 7687186 BAA_2827 BAA_2828     TRUE 0.924 13.000 0.350 1.000 N NA
 7687188 7687189 BAA_2830 BAA_2831     FALSE 0.599 33.000 0.022 1.000   NA
 7687189 7687190 BAA_2831 BAA_2832     TRUE 0.784 94.000 0.111 1.000 N NA
 7687190 7687191 BAA_2832 BAA_2833     FALSE 0.296 58.000 0.000 NA   NA
 7687191 7687192 BAA_2833 BAA_2834     FALSE 0.515 22.000 0.000 NA   NA
 7687194 7687195 BAA_2836 BAA_2837 acoL acoC TRUE 0.972 16.000 0.294 1.000 Y NA
 7687195 7687196 BAA_2837 BAA_2838 acoC acoB TRUE 0.960 28.000 0.295 0.061 Y NA
 7687196 7687197 BAA_2838 BAA_2839 acoB acoA TRUE 0.987 18.000 0.804 0.001 Y NA
 7687197 7687198 BAA_2839 BAA_2840 acoA   FALSE 0.383 -16.000 0.033 NA   NA
 7687198 7687199 BAA_2840 BAA_2841     FALSE 0.549 31.000 0.150 NA   NA
 7687200 7687201 BAA_2842 BAA_2843     FALSE 0.457 42.000 0.143 NA   NA
 7687202 7687203 BAA_2844 BAA_2845     TRUE 0.783 20.000 0.429 NA   NA
 7687203 7687204 BAA_2845 BAA_2846     FALSE 0.011 421.000 0.000 1.000   NA
 7687204 7687205 BAA_2846 BAA_2847     FALSE 0.487 115.000 0.000 NA   NA
 7687205 7687206 BAA_2847 BAA_2848     FALSE 0.006 477.000 0.000 NA   NA
 7687206 7687207 BAA_2848 BAA_2849   proV2 TRUE 0.949 -7.000 0.094 0.076 Y NA
 7687209 7687210 BAA_2851 BAA_2852 clpP1   TRUE 0.925 22.000 0.647 1.000 N NA
 7687211 7687212 BAA_2853 BAA_2854 fdX rpiA TRUE 0.912 5.000 0.011 1.000 N NA
 7687212 7687213 BAA_2854 BAA_2855 rpiA   TRUE 0.650 108.000 0.011 1.000   NA
 7687214 7687215 BAA_2856 BAA_2857     FALSE 0.011 438.000 0.000 1.000   NA
 7687215 7687216 BAA_2857 BAA_2858     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7687216 7687217 BAA_2858 BAA_2859     FALSE 0.378 37.000 0.000 NA   NA
 7687217 7687218 BAA_2859 BAA_2860     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7687218 7687219 BAA_2860 BAA_2861     FALSE 0.388 66.000 0.055 NA   NA
 7687219 7687220 BAA_2861 BAA_2862     TRUE 0.661 19.000 0.115 NA   NA
 7687220 7687221 BAA_2862 BAA_2863     FALSE 0.458 106.000 0.000 NA   NA
 7687221 7687222 BAA_2863 BAA_2864     FALSE 0.308 76.000 0.000 NA   NA
 7687222 7687223 BAA_2864 BAA_2865     TRUE 0.721 13.000 0.135 NA   NA
 7687224 7687225 BAA_2866 BAA_2867     TRUE 0.752 3.000 0.231 NA   NA
 7687226 7687227 BAA_2868 BAA_2869     FALSE 0.100 207.000 0.000 1.000   NA
 7687227 7687228 BAA_2869 BAA_2870     TRUE 0.855 27.000 0.875 NA   NA
 7687228 7687229 BAA_2870 BAA_2871     TRUE 0.805 -3.000 0.500 NA   NA
 7687229 7687230 BAA_2871 BAA_2872     FALSE 0.362 145.000 0.000 NA   NA
 7687230 7687231 BAA_2872 BAA_2873     FALSE 0.439 135.000 0.000 NA   NA
 7687231 7687232 BAA_2873 BAA_2874     FALSE 0.395 35.000 0.000 NA   NA
 7687232 7687233 BAA_2874 BAA_2875     FALSE 0.483 -13.000 0.262 NA   NA
 7687233 7687234 BAA_2875 BAA_2876     FALSE 0.226 170.000 0.021 NA   NA
 7687234 7687235 BAA_2876 BAA_2877     FALSE 0.363 63.000 0.011 NA   NA
 7687237 7687238 BAA_2879 BAA_2880     FALSE 0.174 185.000 0.156 NA   NA
 7687238 7687239 BAA_2880 BAA_2881   recQ2 FALSE 0.566 26.000 0.050 NA   NA
 7687240 7687241 BAA_2882 BAA_2883     FALSE 0.005 618.000 0.000 NA   NA
 7687242 7687243 BAA_2884 BAA_2885     FALSE 0.398 99.000 0.000 NA   NA
 7687245 7687246 BAA_2887 BAA_2888   ppaC TRUE 0.825 106.000 0.010 1.000 N NA
 7687246 7687247 BAA_2888 BAA_2889 ppaC   FALSE 0.357 162.000 0.018 1.000   NA
 7687247 7687248 BAA_2889 BAA_2890     FALSE 0.086 225.000 0.014 1.000   NA
 7687248 7687249 BAA_2890 BAA_2891     FALSE 0.079 218.000 0.000 1.000   NA
 7687249 7687250 BAA_2891 BAA_2892     TRUE 0.640 103.000 0.206 1.000   NA
 7687250 7687251 BAA_2892 BAA_2893     TRUE 0.874 108.000 0.368 1.000 N NA
 7687251 7687252 BAA_2893 BAA_2894   dapA1 TRUE 0.918 19.000 0.474 1.000 N NA
 7687252 7687253 BAA_2894 BAA_2895 dapA1   TRUE 0.969 23.000 0.474 1.000 Y NA
 7687253 7687254 BAA_2895 BAA_2896     TRUE 0.984 -3.000 0.750 0.001 Y NA
 7687254 7687255 BAA_2896 BAA_2897     TRUE 0.965 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 7687256 7687257 BAA_2898 BAA_2899     FALSE 0.071 202.000 0.000 NA   NA
 7687257 7687258 BAA_2899 BAA_2900     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7687258 7687259 BAA_2900 BAA_2901     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7687260 7687261 BAA_2902 BAA_2903     TRUE 0.746 -12.000 0.722 NA   NA
 7687262 7687263 BAA_2904 BAA_2905     FALSE 0.037 235.000 0.000 NA   NA
 7687266 7687267 BAA_2908 BAA_2909 dltD2   FALSE 0.109 267.000 0.000 1.000 N NA
 7687267 7687268 BAA_2909 BAA_2910     TRUE 0.900 118.000 0.500 1.000 N NA
 7687268 7687269 BAA_2910 BAA_2911     TRUE 0.868 21.000 0.308 NA N NA
 7687269 7687270 BAA_2911 BAA_2912     TRUE 0.914 40.000 0.147 NA Y NA
 7687270 7687271 BAA_2912 BAA_2913   divIC2 FALSE 0.022 738.000 0.000 1.000 N NA
 7687271 7687272 BAA_2913 BAA_2914 divIC2   FALSE 0.007 395.000 0.000 NA   NA
 7687274 7687275 BAA_2916 BAA_2917     FALSE 0.014 312.000 0.000 NA   NA
 7687275 7687276 BAA_2917 BAA_2918     FALSE 0.071 202.000 0.000 NA   NA
 7687278 7687279 BAA_2920 BAA_2921     FALSE 0.149 201.000 0.051 1.000   NA
 7687279 7687280 BAA_2921 BAA_2922     FALSE 0.354 40.000 0.000 NA   NA
 7687282 7687283 BAA_2924 BAA_2925     FALSE 0.023 269.000 0.000 NA   NA
 7687283 7687284 BAA_2925 BAA_2926     FALSE 0.300 53.000 0.000 NA   NA
 7687284 7687285 BAA_2926 BAA_2927     FALSE 0.540 20.000 0.000 NA   NA
 7687285 7687286 BAA_2927 BAA_2928     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7687286 7687287 BAA_2928 BAA_2929     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7687287 7687288 BAA_2929 BAA_2930     FALSE 0.369 38.000 0.000 NA   NA
 7687288 7687289 BAA_2930 BAA_2931     FALSE 0.062 207.000 0.000 NA   NA
 7687289 7687290 BAA_2931 BAA_2932     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7687294 7687295 BAA_2936 BAA_2937     TRUE 0.741 25.000 0.438 NA   NA
 7687295 7687296 BAA_2937 BAA_2938     TRUE 0.862 19.000 0.667 NA   NA
 7687296 7687297 BAA_2938 BAA_2939     TRUE 0.867 14.000 0.577 NA   NA
 7687297 7687298 BAA_2939 BAA_2940     FALSE 0.354 161.000 0.269 NA   NA
 7687300 7687301 BAA_2942 BAA_2943     FALSE 0.597 28.000 0.250 NA   NA
 7687301 7687302 BAA_2943 BAA_2944     FALSE 0.398 99.000 0.000 NA   NA
 7687302 7687303 BAA_2944 BAA_2945     FALSE 0.265 -22.000 0.000 NA   NA
 7687303 7687304 BAA_2945 BAA_2946     TRUE 0.670 78.000 0.583 NA   NA
 7687304 7687305 BAA_2946 BAA_2947     FALSE 0.470 174.000 0.500 1.000   NA
 7687305 7687306 BAA_2947 BAA_2948     TRUE 0.744 78.000 0.778 NA   NA
 7687306 7687307 BAA_2948 BAA_2949     FALSE 0.324 79.000 0.000 NA   NA
 7687307 7687308 BAA_2949 BAA_2950     FALSE 0.083 196.000 0.000 NA   NA
 7687308 7687309 BAA_2950 BAA_2951     TRUE 0.712 152.000 0.750 NA   NA
 7687310 7687311 BAA_2952 BAA_2953     FALSE 0.025 264.000 0.000 NA   NA
 7687311 7687312 BAA_2953 BAA_2954     FALSE 0.005 623.000 0.000 NA   NA
 7687312 7687313 BAA_2954 BAA_2955     FALSE 0.191 181.000 0.080 NA   NA
 7687313 7687314 BAA_2955 BAA_2956     TRUE 0.670 57.000 0.120 NA N NA
 7687314 7687315 BAA_2956 BAA_2957   coaA TRUE 0.741 93.000 0.072 NA N NA
 7687316 7687317 BAA_2958 BAA_2959     FALSE 0.105 188.000 0.000 NA   NA
 7687317 7687318 BAA_2959 BAA_2960     FALSE 0.295 60.000 0.000 NA   NA
 7687318 7687319 BAA_2960 BAA_2961     FALSE 0.412 33.000 0.000 NA   NA
 7687319 7687320 BAA_2961 BAA_2962     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7687320 7687321 BAA_2962 BAA_2963     FALSE 0.240 -30.000 0.000 NA   NA
 7687321 7687322 BAA_2963 BAA_2964     FALSE 0.436 104.000 0.000 NA   NA
 7687322 7687323 BAA_2964 BAA_2965     FALSE 0.478 124.000 0.000 NA   NA
 7687324 7687325 BAA_2966 BAA_2967     TRUE 0.860 28.000 1.000 NA   NA
 7687325 7687326 BAA_2967 BAA_2968     FALSE 0.441 29.000 0.000 NA   NA
 7687326 7687327 BAA_2968 BAA_2969     FALSE 0.456 27.000 0.000 NA   NA
 7687327 7687328 BAA_2969 BAA_2970     FALSE 0.465 26.000 0.000 NA   NA
 7687331 7687332 BAA_2973 BAA_2974 ssuD   TRUE 0.723 77.000 0.034 1.000 N NA
 7687332 7687333 BAA_2974 BAA_2975     TRUE 0.970 17.000 0.000 0.026 Y NA
 7687333 7687334 BAA_2975 BAA_2976     TRUE 0.982 18.000 0.750 1.000 Y NA
 7687334 7687335 BAA_2976 BAA_2977     FALSE 0.042 228.000 0.000 NA   NA
 7687335 7687336 BAA_2977 BAA_2978     TRUE 0.644 -3.000 0.182 NA   NA
 7687336 7687337 BAA_2978 BAA_2979     FALSE 0.059 210.000 0.000 NA   NA
 7687337 7687338 BAA_2979 BAA_2980     FALSE 0.586 104.000 0.250 NA   NA
 7687338 7687339 BAA_2980 BAA_2981     FALSE 0.565 -7.000 0.250 NA   NA
 7687339 7687340 BAA_2981 BAA_2982     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7687340 7687341 BAA_2982 BAA_2983     FALSE 0.548 124.000 0.002 NA   NA
 7687341 7687342 BAA_2983 BAA_2984   aacC7 TRUE 0.654 16.000 0.008 NA   NA
 7687344 7687345 BAA_2986 BAA_2987     TRUE 0.878 21.000 0.800 NA   NA
 7687345 7687346 BAA_2987 BAA_2988     TRUE 0.743 100.000 0.571 NA   NA
 7687346 7687347 BAA_2988 BAA_2989     FALSE 0.625 57.000 0.538 NA   NA
 7687347 7687348 BAA_2989 BAA_2990     FALSE 0.505 70.000 0.333 NA   NA
 7687348 7687349 BAA_2990 BAA_2991     TRUE 0.824 16.000 0.467 NA   NA
 7687349 7687350 BAA_2991 BAA_2992     TRUE 0.962 35.000 0.500 0.016 Y NA
 7687350 7687351 BAA_2992 BAA_2993     TRUE 0.768 16.000 0.179 1.000   NA
 7687351 7687352 BAA_2993 BAA_2994     TRUE 0.682 17.000 0.179 NA   NA
 7687352 7687353 BAA_2994 BAA_2995     FALSE 0.009 366.000 0.000 NA   NA
 7687353 7687354 BAA_2995 BAA_2996     FALSE 0.361 -10.000 0.000 NA   NA
 7687355 7687356 BAA_2997 BAA_2998     FALSE 0.321 160.000 0.200 NA   NA
 7687356 7687357 BAA_2998 BAA_2999     FALSE 0.592 111.000 0.067 NA   NA
 7687358 7687359 BAA_3000 BAA_3001     FALSE 0.009 517.000 0.000 1.000   NA
 7687359 7687360 BAA_3001 BAA_3002     FALSE 0.008 378.000 0.000 NA   NA
 7687360 7687361 BAA_3002 BAA_3003     FALSE 0.019 286.000 0.000 NA   NA
 7687361 7687362 BAA_3003 BAA_3004     FALSE 0.342 42.000 0.000 NA   NA
 7687362 7687363 BAA_3004 BAA_3005     FALSE 0.619 1.000 0.000 NA   NA
 7687363 7687364 BAA_3005 BAA_3006     FALSE 0.029 254.000 0.000 NA   NA
 7687364 7687365 BAA_3006 BAA_3007     FALSE 0.038 270.000 0.000 1.000   NA
 7687365 7687366 BAA_3007 BAA_3008   aroA FALSE 0.205 186.000 0.005 1.000   NA
 7687366 7687367 BAA_3008 BAA_3009 aroA tyrA TRUE 0.967 17.000 0.069 1.000 Y NA
 7687367 7687368 BAA_3009 BAA_3010 tyrA hisC2 TRUE 0.940 -7.000 0.062 1.000 Y NA
 7687368 7687369 BAA_3010 BAA_3011 hisC2 aroC2 TRUE 0.963 19.000 0.007 1.000 Y NA
 7687369 7687370 BAA_3011 BAA_3012 aroC2   FALSE 0.342 285.000 0.000 0.001 Y NA
 7687370 7687371 BAA_3012 BAA_3013     FALSE 0.004 832.000 0.000 NA   NA
 7687371 7687372 BAA_3013 BAA_3014     FALSE 0.327 44.000 0.000 NA   NA
 7687374 7687375 BAA_3016 BAA_3017     TRUE 0.914 17.000 0.231 0.060 N NA
 7687375 7687376 BAA_3017 BAA_3018     TRUE 0.669 20.000 0.231 NA   NA
 7687378 7687379 BAA_3020 BAA_3021     FALSE 0.011 338.000 0.000 NA   NA
 7687379 7687380 BAA_3021 BAA_3022     FALSE 0.361 -10.000 0.000 NA   NA
 7687381 7687382 BAA_3023 BAA_3024     FALSE 0.476 125.000 0.000 NA   NA
 7687385 7687386 BAA_3027 BAA_3028     TRUE 0.978 -3.000 0.844 NA Y NA
 7687388 7687389 BAA_3029 BAA_3031     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7687390 7687391 BAA_3032 BAA_3033     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7687391 7687392 BAA_3033 BAA_3034     FALSE 0.217 161.000 0.000 NA   NA
 7687392 7687393 BAA_3034 BAA_3035     FALSE 0.465 26.000 0.000 NA   NA
 7687393 7687394 BAA_3035 BAA_3036     TRUE 0.976 7.000 0.031 1.000 Y NA
 7687395 7687396 BAA_3037 BAA_3038     FALSE 0.012 337.000 0.000 NA   NA
 7687396 7687397 BAA_3038 BAA_3039     FALSE 0.303 51.000 0.000 NA   NA
 7687397 7687398 BAA_3039 BAA_3040     FALSE 0.341 83.000 0.000 NA   NA
 7687398 7687399 BAA_3040 BAA_3041     FALSE 0.493 97.000 0.071 NA   NA
 7687399 7687400 BAA_3041 BAA_3042     FALSE 0.512 97.000 0.214 NA   NA
 7687400 7687401 BAA_3042 BAA_3043     TRUE 0.654 58.000 0.600 NA   NA
 7687402 7687403 BAA_3044 BAA_3045     FALSE 0.066 204.000 0.000 NA   NA
 7687404 7687405 BAA_3046 BAA_3047 proA proB TRUE 0.960 30.000 0.281 0.002 Y NA
 7687407 7687408 BAA_3049 BAA_3050 rocB   TRUE 0.740 76.000 0.250 1.000 N NA
 7687410 7687411 BAA_3052 BAA_3053     FALSE 0.021 276.000 0.000 NA   NA
 7687411 7687412 BAA_3053 BAA_3054     FALSE 0.022 274.000 0.000 NA   NA
 7687413 7687414 BAA_3055 BAA_3056     TRUE 0.893 11.000 0.636 NA   NA
 7687415 7687416 BAA_3057 BAA_3058     TRUE 0.645 107.000 0.286 NA   NA
 7687416 7687417 BAA_3058 BAA_3059     TRUE 0.743 -3.000 0.364 NA   NA
 7687417 7687418 BAA_3059 BAA_3060     FALSE 0.538 90.000 0.273 NA   NA
 7687418 7687419 BAA_3060 BAA_3061     TRUE 0.976 0.000 0.375 1.000 Y NA
 7687419 7687420 BAA_3061 BAA_3062     FALSE 0.603 163.000 0.133 1.000 N NA
 7687420 7687421 BAA_3062 BAA_3063     TRUE 0.939 0.000 0.533 1.000 N NA
 7687421 7687422 BAA_3063 BAA_3064     TRUE 0.916 15.000 0.333 1.000 N NA
 7687424 7687425 BAA_3066 BAA_3067     TRUE 0.838 8.000 0.400 NA   NA
 7687426 7687427 BAA_3068 BAA_3069     TRUE 0.860 -3.000 0.700 NA   NA
 7687427 7687428 BAA_3069 BAA_3070     FALSE 0.071 202.000 0.000 NA   NA
 7687431 7687432 BAA_3073 BAA_3074     FALSE 0.005 616.000 0.000 NA   NA
 7687432 7687433 BAA_3074 BAA_3075     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7687433 7687434 BAA_3075 BAA_3076     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7687434 7687435 BAA_3076 BAA_3077     FALSE 0.032 249.000 0.000 NA   NA
 7687435 7687436 BAA_3077 BAA_3078     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7687436 7687437 BAA_3078 BAA_3079     FALSE 0.017 298.000 0.000 NA   NA
 7687439 7687440 BAA_3081 BAA_3082     FALSE 0.605 114.000 0.162 NA   NA
 7687440 7687441 BAA_3082 BAA_3083   adP2 FALSE 0.042 370.000 0.000 1.000 N NA
 7687441 7687442 BAA_3083 BAA_3084 adP2   FALSE 0.027 259.000 0.000 NA   NA
 7687442 7687443 BAA_3084 BAA_3085     FALSE 0.087 195.000 0.000 NA   NA
 7687443 7687444 BAA_3085 BAA_3086     FALSE 0.515 22.000 0.000 NA   NA
 7687444 7687445 BAA_3086 BAA_3087     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7687445 7687446 BAA_3087 BAA_3088     TRUE 0.863 -3.000 0.714 NA   NA
 7687446 7687447 BAA_3088 BAA_3089     FALSE 0.531 148.000 0.176 1.000   NA
 7687447 7687448 BAA_3089 BAA_3090     TRUE 0.807 39.000 0.588 0.020   NA
 7687448 7687449 BAA_3090 BAA_3091     TRUE 0.951 19.000 0.882 1.000 N NA
 7687451 7687452 BAA_3093 BAA_3094     FALSE 0.621 22.000 0.087 NA   NA
 7687452 7687453 BAA_3094 BAA_3095     FALSE 0.320 45.000 0.000 NA   NA
 7687455 7687456 BAA_3097 BAA_3098     FALSE 0.617 30.000 0.286 NA   NA
 7687456 7687457 BAA_3098 BAA_3099     TRUE 0.744 -12.000 0.714 NA   NA
 7687457 7687458 BAA_3099 BAA_3100     TRUE 0.875 -12.000 0.750 1.000 N NA
 7687458 7687459 BAA_3100 BAA_3101     FALSE 0.028 479.000 0.000 1.000 N NA
 7687459 7687460 BAA_3101 BAA_3102     FALSE 0.430 186.000 0.182 1.000 N NA
 7687460 7687461 BAA_3102 BAA_3103     TRUE 0.839 0.000 0.364 1.000   NA
 7687461 7687462 BAA_3103 BAA_3104     TRUE 0.937 6.000 0.667 0.074   NA
 7687462 7687463 BAA_3104 BAA_3105     FALSE 0.606 66.000 0.500 NA   NA
 7687463 7687464 BAA_3105 BAA_3106     FALSE 0.062 207.000 0.000 NA   NA
 7687464 7687465 BAA_3106 BAA_3107     TRUE 0.842 25.000 0.096 1.000 N NA
 7687465 7687466 BAA_3107 BAA_3108     TRUE 0.724 49.000 0.082 1.000 N NA
 7687466 7687467 BAA_3108 BAA_3109     TRUE 0.675 18.000 0.194 NA   NA
 7687470 7687471 BAA_3112 BAA_3113     FALSE 0.411 82.000 0.015 NA   NA
 7687474 7687475 BAA_3116 BAA_3117     TRUE 0.973 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 7687475 7687476 BAA_3117 BAA_3118     TRUE 0.662 35.000 0.421 NA   NA
 7687476 7687477 BAA_3118 BAA_3119     FALSE 0.570 100.000 0.263 NA   NA
 7687477 7687478 BAA_3119 BAA_3120     FALSE 0.581 129.000 0.172 NA   NA
 7687478 7687479 BAA_3120 BAA_3121     FALSE 0.116 214.000 0.114 1.000   NA
 7687479 7687480 BAA_3121 BAA_3122     TRUE 0.711 14.000 0.159 NA   NA
 7687480 7687481 BAA_3122 BAA_3123     TRUE 0.687 15.000 0.047 NA   NA
 7687484 7687485 BAA_3127 BAA_3128 lysP   TRUE 0.697 114.000 0.333 NA   NA
 7687485 7687486 BAA_3128 BAA_3129     FALSE 0.506 34.000 0.057 NA   NA
 7687489 7687490 BAA_3132 BAA_3133     FALSE 0.300 -16.000 0.000 NA   NA
 7687490 7687491 BAA_3133 BAA_3134     FALSE 0.297 69.000 0.000 NA   NA
 7687493 7687494 BAA_3136 BAA_3137 lepB_2   FALSE 0.341 83.000 0.000 NA   NA
 7687494 7687495 BAA_3137 BAA_3138     FALSE 0.296 66.000 0.000 NA   NA
 7687497 7687498 BAA_3140 BAA_3141   pcp TRUE 0.717 76.000 0.029 1.000 N NA
 7687498 7687499 BAA_3141 BAA_3142 pcp   FALSE 0.032 248.000 0.000 NA   NA
 7687499 7687500 BAA_3142 BAA_3143     FALSE 0.453 132.000 0.000 NA   NA
 7687500 7687501 BAA_3143 BAA_3144     FALSE 0.482 121.000 0.000 NA   NA
 7687501 7687502 BAA_3144 BAA_3145     TRUE 0.927 2.000 0.939 NA   NA
 7687502 7687503 BAA_3145 BAA_3146     FALSE 0.590 24.000 0.064 NA   NA
 7687503 7687504 BAA_3146 BAA_3147     FALSE 0.320 45.000 0.000 NA   NA
 7687504 7687505 BAA_3147 BAA_3148     FALSE 0.380 -9.000 0.000 NA   NA
 7687505 7687506 BAA_3148 BAA_3149     TRUE 0.907 15.000 0.267 1.000 N NA
 7687506 7687507 BAA_3149 BAA_3150   sipU FALSE 0.146 259.000 0.231 1.000 N NA
 7687507 7687508 BAA_3150 BAA_3151 sipU   TRUE 0.845 24.000 0.038 1.000 N NA
 7687508 7687509 BAA_3151 BAA_3152     FALSE 0.014 315.000 0.000 NA   NA
 7687509 7687510 BAA_3152 BAA_3153     FALSE 0.091 204.000 0.028 NA   NA
 7687512 7687513 BAA_3155 BAA_3156     FALSE 0.384 153.000 0.083 NA   NA
 7687513 7687514 BAA_3156 BAA_3157     FALSE 0.012 331.000 0.000 NA   NA
 7687516 7687517 BAA_3159 BAA_3160     FALSE 0.605 114.000 0.125 NA   NA
 7687517 7687518 BAA_3160 BAA_3161     TRUE 0.737 4.000 0.083 NA   NA
 7687518 7687519 BAA_3161 BAA_3162     FALSE 0.388 160.000 0.033 1.000   NA
 7687519 7687520 BAA_3162 BAA_3163     FALSE 0.331 159.000 0.154 NA   NA
 7687523 7687524 BAA_3166 BAA_3167     FALSE 0.313 -15.000 0.000 NA   NA
 7687525 7687526 BAA_3168 BAA_3169     FALSE 0.605 -10.000 0.383 NA   NA
 7687526 7687527 BAA_3169 BAA_3170   cotF FALSE 0.011 343.000 0.000 NA   NA
 7687528 7687529 BAA_3171 BAA_3172     FALSE 0.545 92.000 0.273 NA   NA
 7687530 7687531 BAA_3173 BAA_3174     FALSE 0.300 73.000 0.000 NA   NA
 7687531 7687532 BAA_3174 BAA_3175     FALSE 0.046 221.000 0.000 NA   NA
 7687532 7687533 BAA_3175 BAA_3176     FALSE 0.087 195.000 0.000 NA   NA
 7687535 7687536 BAA_3178 BAA_3179   sasP2 FALSE 0.028 295.000 0.143 NA   NA
 7687540 7687541 BAA_3183 BAA_3184 aspA3 ansA2 TRUE 0.903 54.000 0.037 1.000 Y NA
 7687542 7687543 BAA_3185 BAA_3186 ansR   FALSE 0.014 314.000 0.000 NA   NA
 7687544 7687545 BAA_3187 BAA_3188     FALSE 0.477 167.000 0.429 1.000   NA
 7687545 7687546 BAA_3188 BAA_3189   brnQ5 FALSE 0.344 274.000 0.000 0.049 Y NA
 7687546 7687547 BAA_3189 BAA_3190 brnQ5 proC2 FALSE 0.626 198.000 0.000 1.000 Y NA
 7687547 7687548 BAA_3190 BAA_3191 proC2   FALSE 0.014 316.000 0.000 NA   NA
 7687548 7687549 BAA_3191 BAA_3192     FALSE 0.308 165.000 0.250 NA   NA
 7687549 7687550 BAA_3192 BAA_3193     FALSE 0.472 108.000 0.000 NA   NA
 7687550 7687551 BAA_3193 BAA_3194     FALSE 0.295 60.000 0.000 NA   NA
 7687551 7687552 BAA_3194 BAA_3195     FALSE 0.010 353.000 0.000 NA   NA
 7687552 7687553 BAA_3195 BAA_3196     FALSE 0.221 -36.000 0.000 NA   NA
 7687553 7687554 BAA_3196 BAA_3197   gerAB FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7687554 7687555 BAA_3197 BAA_3198 gerAB   FALSE 0.456 27.000 0.000 NA   NA
 7687555 7687556 BAA_3198 BAA_3199   gerAA FALSE 0.102 189.000 0.000 NA   NA
 7687556 7687557 BAA_3199 BAA_3200 gerAA   FALSE 0.439 135.000 0.000 NA   NA
 7687557 7687558 BAA_3200 BAA_3201     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7687558 7687559 BAA_3201 BAA_3202     FALSE 0.005 545.000 0.000 NA   NA
 7687559 7687560 BAA_3202 BAA_3203     TRUE 0.651 5.000 0.000 NA   NA
 7687560 7687561 BAA_3203 BAA_3204     FALSE 0.299 54.000 0.000 NA   NA
 7687561 7687562 BAA_3204 BAA_3205   glsA2 FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 7687562 7687563 BAA_3205 BAA_3206 glsA2   FALSE 0.476 125.000 0.000 NA   NA
 7687563 7687564 BAA_3206 BAA_3207     FALSE 0.265 -22.000 0.000 NA   NA
 7687567 7687568 BAA_3210 BAA_3211     FALSE 0.596 24.000 0.100 NA   NA
 7687569 7687570 BAA_3212 BAA_3213     FALSE 0.046 221.000 0.000 NA   NA
 7687570 7687571 BAA_3213 BAA_3214     FALSE 0.023 686.000 0.000 1.000 N NA
 7687571 7687572 BAA_3214 BAA_3215     FALSE 0.615 114.000 0.000 1.000   NA
 7687573 7687574 BAA_3216 BAA_3217     TRUE 0.843 174.000 0.235 0.020 Y NA
 7687574 7687575 BAA_3217 BAA_3218     TRUE 0.729 -3.000 0.206 1.000   NA
 7687575 7687576 BAA_3218 BAA_3219     FALSE 0.008 386.000 0.000 NA   NA
 7687577 7687578 BAA_3220 BAA_3221     FALSE 0.006 491.000 0.000 NA   NA
 7687578 7687579 BAA_3221 BAA_3222     FALSE 0.006 443.000 0.000 NA   NA
 7687579 7687580 BAA_3222 BAA_3223     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7687580 7687581 BAA_3223 BAA_3224     FALSE 0.015 306.000 0.000 NA   NA
 7687581 7687582 BAA_3224 BAA_3225     FALSE 0.387 36.000 0.000 NA   NA
 7687582 7687583 BAA_3225 BAA_3226     TRUE 0.735 86.000 0.667 NA   NA
 7687585 7687586 BAA_3228 BAA_3229     TRUE 0.648 104.000 0.200 1.000   NA
 7687586 7687587 BAA_3229 BAA_3230     TRUE 0.842 113.000 0.010 1.000 N NA
 7687587 7687588 BAA_3230 BAA_3231     FALSE 0.574 165.000 0.004 1.000 N NA
 7687588 7687589 BAA_3231 BAA_3232     FALSE 0.448 81.000 0.136 NA   NA
 7687589 7687590 BAA_3232 BAA_3233     TRUE 0.771 0.000 0.303 NA   NA
 7687590 7687591 BAA_3233 BAA_3234     FALSE 0.005 643.000 0.000 NA   NA
 7687593 7687594 BAA_3236 BAA_3237 menA   FALSE 0.083 196.000 0.000 NA   NA
 7687594 7687595 BAA_3237 BAA_3238   mntA FALSE 0.005 651.000 0.000 NA   NA
 7687595 7687596 BAA_3238 BAA_3239 mntA   TRUE 0.967 18.000 0.173 1.000 Y NA
 7687596 7687597 BAA_3239 BAA_3240     TRUE 0.968 -3.000 0.196 0.078 Y NA
 7687597 7687598 BAA_3240 BAA_3241     FALSE 0.009 373.000 0.000 NA   NA
 7687598 7687599 BAA_3241 BAA_3242     FALSE 0.367 56.000 0.014 NA   NA
 7687601 7687602 BAA_3244 BAA_3245   arsC FALSE 0.617 154.000 0.556 NA   NA
 7687602 7687603 BAA_3245 BAA_3246 arsC arsB TRUE 0.901 26.000 0.556 1.000 N NA
 7687603 7687604 BAA_3246 BAA_3247 arsB   TRUE 0.882 19.000 0.208 1.000 N NA
 7687604 7687605 BAA_3247 BAA_3248   arsR TRUE 0.716 60.000 0.126 1.000 N NA
 7687605 7687606 BAA_3248 BAA_3249 arsR   FALSE 0.006 447.000 0.000 NA   NA
 7687606 7687607 BAA_3249 BAA_3250     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7687607 7687608 BAA_3250 BAA_3251   hscC TRUE 0.717 0.000 0.000 1.000   NA
 7687608 7687609 BAA_3251 BAA_3252 hscC   FALSE 0.006 508.000 0.000 NA   NA
 7687609 7687610 BAA_3252 BAA_3253     FALSE 0.016 305.000 0.000 NA   NA
 7687612 7687613 BAA_3255 BAA_3257     FALSE 0.025 266.000 0.000 NA   NA
 7687614 7687615 BAA_3258 BAA_3259     FALSE 0.552 136.000 0.167 NA   NA
 7687616 7687617 BAA_3260 BAA_3261     FALSE 0.509 140.000 0.056 NA   NA
 7687617 7687618 BAA_3261 BAA_3262     FALSE 0.025 264.000 0.000 NA   NA
 7687618 7687619 BAA_3262 BAA_3263     FALSE 0.007 424.000 0.000 NA   NA
 7687619 7687620 BAA_3263 BAA_3264     FALSE 0.033 416.000 0.000 1.000 N NA
 7687622 7687623 BAA_3266 BAA_3267     FALSE 0.072 218.000 0.065 NA   NA
 7687623 7687624 BAA_3267 BAA_3268     FALSE 0.041 325.000 0.455 NA   NA
 7687624 7687625 BAA_3268 BAA_3269   cypD FALSE 0.091 283.000 0.000 1.000 N NA
 7687625 7687626 BAA_3269 BAA_3270 cypD   FALSE 0.348 41.000 0.000 NA   NA
 7687626 7687627 BAA_3270 BAA_3271     FALSE 0.009 375.000 0.000 NA   NA
 7687629 7687630 BAA_3273 BAA_3274     FALSE 0.011 346.000 0.000 NA   NA
 7687630 7687631 BAA_3274 BAA_3275     TRUE 0.853 3.000 0.455 NA   NA
 7687632 7687633 BAA_3276 BAA_3277     TRUE 0.972 -3.000 0.492 1.000 Y NA
 7687634 7687635 BAA_3278 BAA_3279     FALSE 0.013 325.000 0.000 NA   NA
 7687635 7687636 BAA_3279 BAA_3280     FALSE 0.004 961.000 0.000 NA   NA
 7687638 7687639 BAA_3282 BAA_3283     FALSE 0.010 353.000 0.000 NA   NA
 7687639 7687640 BAA_3283 BAA_3284     FALSE 0.298 55.000 0.000 NA   NA
 7687640 7687641 BAA_3284 BAA_3285     FALSE 0.080 197.000 0.000 NA   NA
 7687641 7687642 BAA_3285 BAA_3286     FALSE 0.447 -6.000 0.000 NA   NA
 7687642 7687643 BAA_3286 BAA_3287     FALSE 0.005 634.000 0.000 NA   NA
 7687643 7687644 BAA_3287 BAA_3288     TRUE 0.905 6.000 0.667 NA   NA
 7687644 7687645 BAA_3288 BAA_3289     FALSE 0.011 341.000 0.000 NA   NA
 7687645 7687646 BAA_3289 BAA_3290     TRUE 0.645 -3.000 0.162 NA   NA
 7687646 7687647 BAA_3290 BAA_3291     TRUE 0.743 -7.000 0.550 NA   NA
 7687647 7687648 BAA_3291 BAA_3292     TRUE 0.738 -3.000 0.233 1.000   NA
 7687648 7687649 BAA_3292 BAA_3293     FALSE 0.313 77.000 0.000 NA   NA
 7687649 7687650 BAA_3293 BAA_3294     FALSE 0.361 -10.000 0.000 NA   NA
 7687650 7687651 BAA_3294 BAA_3295     FALSE 0.025 432.000 0.000 NA N NA
 7687652 7687653 BAA_3296 BAA_3297     FALSE 0.504 150.000 0.316 NA   NA
 7687654 7687655 BAA_3298 BAA_3299     TRUE 0.926 0.000 0.852 1.000   NA
 7687656 7687657 BAA_3300 BAA_3301     FALSE 0.406 70.000 0.156 NA   NA
 7687658 7687659 BAA_3302 BAA_3303     TRUE 0.987 2.000 0.833 1.000 Y NA
 7687659 7687660 BAA_3303 BAA_3304     FALSE 0.448 81.000 0.139 NA   NA
 7687661 7687662 BAA_3305 BAA_3306     FALSE 0.465 26.000 0.000 NA   NA
 7687662 7687663 BAA_3306 BAA_3307     FALSE 0.216 -42.000 0.000 NA   NA
 7687663 7687664 BAA_3307 BAA_3308   paiB1 FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7687665 7687666 BAA_3309 BAA_3310     FALSE 0.006 449.000 0.000 NA   NA
 7687666 7687667 BAA_3310 BAA_3311     FALSE 0.478 38.000 0.103 NA   NA
 7687667 7687668 BAA_3311 BAA_3312     TRUE 0.875 2.000 0.138 0.001   NA
 7687668 7687669 BAA_3312 BAA_3313     TRUE 0.978 -3.000 0.800 NA Y NA
 7687673 7687674 BAA_3317 BAA_3318     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7687674 7687675 BAA_3318 BAA_3319     FALSE 0.004 1084.000 0.000 NA   NA
 7687675 7687676 BAA_3319 BAA_3320     FALSE 0.485 75.000 0.294 NA   NA
 7687676 7687677 BAA_3320 BAA_3321     TRUE 0.848 18.000 0.471 1.000   NA
 7687677 7687678 BAA_3321 BAA_3322     FALSE 0.326 -13.000 0.000 NA   NA
 7687678 7687679 BAA_3322 BAA_3323     FALSE 0.311 48.000 0.000 NA   NA
 7687680 7687681 BAA_3324 BAA_3325     FALSE 0.059 237.000 0.000 1.000   NA
 7687681 7687682 BAA_3325 BAA_3326     TRUE 0.920 0.000 1.000 NA   NA
 7687683 7687684 BAA_3327 BAA_3328     FALSE 0.013 326.000 0.000 NA   NA
 7687685 7687686 BAA_3329 BAA_3330     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7687686 7687687 BAA_3330 BAA_3331     FALSE 0.327 44.000 0.000 NA   NA
 7687688 7687689 BAA_3332 BAA_3333     FALSE 0.005 713.000 0.000 NA   NA
 7687690 7687691 BAA_3334 BAA_3335     FALSE 0.008 387.000 0.000 NA   NA
 7687692 7687693 BAA_3336 BAA_3337     FALSE 0.004 1187.000 0.000 NA   NA
 7687693 7687694 BAA_3337 BAA_3338     FALSE 0.023 271.000 0.000 NA   NA
 7687694 7687695 BAA_3338 BAA_3339     FALSE 0.007 416.000 0.000 NA   NA
 7687695 7687696 BAA_3339 BAA_3340     FALSE 0.054 213.000 0.000 NA   NA
 7687698 7687699 BAA_3342 BAA_3343     FALSE 0.037 355.000 0.000 NA N NA
 7687699 7687700 BAA_3343 BAA_3344   sdaAA1 FALSE 0.232 294.000 0.000 NA Y NA
 7687700 7687701 BAA_3344 BAA_3345 sdaAA1 sdaAB1 TRUE 0.971 23.000 0.324 0.001 Y NA
 7687701 7687702 BAA_3345 BAA_3346 sdaAB1   FALSE 0.004 1005.000 0.000 NA   NA
 7687702 7687703 BAA_3346 BAA_3347     FALSE 0.337 82.000 0.000 NA   NA
 7687703 7687704 BAA_3347 BAA_3348   hypF TRUE 0.703 79.000 0.000 1.000 N NA
 7687704 7687705 BAA_3348 BAA_3349 hypF   TRUE 0.975 11.000 0.079 1.000 Y NA
 7687705 7687706 BAA_3349 BAA_3350     TRUE 0.742 83.000 0.011 1.000 N NA
 7687706 7687707 BAA_3350 BAA_3351     FALSE 0.258 204.000 0.000 1.000 N NA
 7687709 7687710 BAA_3353 BAA_3354     FALSE 0.445 144.000 0.010 NA   NA
 7687710 7687711 BAA_3354 BAA_3355     TRUE 0.706 14.000 0.109 NA   NA
 7687711 7687712 BAA_3355 BAA_3356   serC TRUE 0.974 13.000 0.238 1.000 Y NA
 7687712 7687713 BAA_3356 BAA_3357 serC   FALSE 0.019 286.000 0.000 NA   NA
 7687713 7687714 BAA_3357 BAA_3358     FALSE 0.585 38.000 0.333 NA   NA
 7687714 7687715 BAA_3358 BAA_3359     TRUE 0.766 -10.000 0.733 NA   NA
 7687715 7687716 BAA_3359 BAA_3360     FALSE 0.015 306.000 0.000 NA   NA
 7687716 7687717 BAA_3360 BAA_3361     FALSE 0.476 90.000 0.097 NA   NA
 7687717 7687718 BAA_3361 BAA_3362     FALSE 0.178 181.000 0.023 NA   NA
 7687718 7687719 BAA_3362 BAA_3363     FALSE 0.091 282.000 0.000 1.000 N NA
 7687721 7687722 BAA_3365 BAA_3366     FALSE 0.330 80.000 0.000 NA   NA
 7687722 7687723 BAA_3366 BAA_3367     FALSE 0.018 291.000 0.000 NA   NA
 7687723 7687724 BAA_3367 BAA_3368     FALSE 0.057 211.000 0.000 NA   NA
 7687730 7687731 BAA_3374 BAA_3375     FALSE 0.409 -16.000 0.154 NA   NA
 7687731 7687732 BAA_3375 BAA_3376     FALSE 0.483 141.000 0.025 NA   NA
 7687733 7687734 BAA_3377 BAA_3378     TRUE 0.875 16.000 0.225 NA N NA
 7687734 7687735 BAA_3378 BAA_3379     TRUE 0.828 101.000 0.412 NA N NA
 7687736 7687737 BAA_3380 BAA_3381     FALSE 0.192 181.000 0.095 NA   NA
 7687737 7687738 BAA_3381 BAA_3382     FALSE 0.588 -7.000 0.275 NA   NA
 7687738 7687739 BAA_3382 BAA_3383     TRUE 0.645 -3.000 0.157 NA   NA
 7687740 7687741 BAA_3384 BAA_3385     TRUE 0.642 10.000 0.000 NA   NA
 7687742 7687743 BAA_3386 BAA_3387     TRUE 0.646 -3.000 0.137 NA   NA
 7687743 7687744 BAA_3387 BAA_3388     TRUE 0.897 15.000 0.098 1.000 N NA
 7687744 7687745 BAA_3388 BAA_3389   alo FALSE 0.020 332.000 0.000 1.000   NA
 7687747 7687748 BAA_3391 BAA_3392     TRUE 0.739 -3.000 0.350 NA   NA
 7687748 7687749 BAA_3392 BAA_3393     TRUE 0.762 24.000 0.350 1.000   NA
 7687749 7687750 BAA_3393 BAA_3394     FALSE 0.030 252.000 0.000 NA   NA
 7687752 7687753 BAA_3397 BAA_3398     FALSE 0.178 184.000 0.125 NA   NA
 7687753 7687754 BAA_3398 BAA_3399     FALSE 0.550 66.000 0.412 NA   NA
 7687754 7687755 BAA_3399 BAA_3400     TRUE 0.711 -21.000 0.673 1.000   NA
 7687755 7687756 BAA_3400 BAA_3401     FALSE 0.618 23.000 0.145 NA   NA
 7687756 7687757 BAA_3401 BAA_3402     FALSE 0.520 57.000 0.364 NA   NA
 7687757 7687758 BAA_3402 BAA_3403     FALSE 0.011 339.000 0.000 NA   NA
 7687760 7687761 BAA_3405 BAA_3406     FALSE 0.007 428.000 0.000 NA   NA
 7687761 7687762 BAA_3406 BAA_3407     FALSE 0.071 202.000 0.000 NA   NA
 7687762 7687763 BAA_3407 BAA_3408     TRUE 0.895 11.000 0.133 NA N NA
 7687763 7687764 BAA_3408 BAA_3409     FALSE 0.018 341.000 0.000 1.000   NA
 7687764 7687765 BAA_3409 BAA_3410     FALSE 0.008 620.000 0.000 1.000   NA
 7687766 7687767 BAA_3411 BAA_3412 hisS1   FALSE 0.017 327.000 0.008 NA   NA
 7687767 7687768 BAA_3412 BAA_3413     FALSE 0.025 266.000 0.000 NA   NA
 7687770 7687771 BAA_3415 BAA_3416     FALSE 0.385 154.000 0.125 NA   NA
 7687772 7687773 BAA_3417 BAA_3418 pykA1   FALSE 0.463 93.000 0.028 NA   NA
 7687773 7687774 BAA_3418 BAA_3419     FALSE 0.011 338.000 0.000 NA   NA
 7687774 7687775 BAA_3419 BAA_3420     FALSE 0.405 57.000 0.130 NA   NA
 7687775 7687776 BAA_3420 BAA_3421     TRUE 0.683 -7.000 0.426 NA   NA
 7687776 7687777 BAA_3421 BAA_3422     FALSE 0.472 87.000 0.159 NA   NA
 7687778 7687779 BAA_3423 BAA_3424     FALSE 0.505 -12.000 0.269 NA   NA
 7687780 7687781 BAA_3425 BAA_3426     FALSE 0.224 174.000 0.067 NA   NA
 7687783 7687784 BAA_3428 BAA_3429     FALSE 0.272 180.000 0.136 1.000   NA
 7687785 7687786 BAA_3430 BAA_3431     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7687787 7687788 BAA_3432 BAA_3433     FALSE 0.120 195.000 0.030 NA   NA
 7687788 7687789 BAA_3433 BAA_3434     TRUE 0.662 62.000 0.050 NA N NA
 7687789 7687790 BAA_3434 BAA_3435     TRUE 0.947 123.000 0.200 NA Y NA
 7687790 7687791 BAA_3435 BAA_3436   maa FALSE 0.381 57.000 0.038 NA   NA
 7687791 7687792 BAA_3436 BAA_3437 maa   FALSE 0.015 307.000 0.000 NA   NA
 7687792 7687793 BAA_3437 BAA_3438     FALSE 0.422 32.000 0.000 NA   NA
 7687793 7687794 BAA_3438 BAA_3439     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7687794 7687795 BAA_3439 BAA_3440     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7687795 7687796 BAA_3440 BAA_3441     FALSE 0.313 77.000 0.000 NA   NA
 7687798 7687799 BAA_3443 BAA_3444     FALSE 0.402 64.000 0.179 NA   NA
 7687800 7687801 BAA_3445 BAA_3447     FALSE 0.021 278.000 0.000 NA   NA
 7687802 7687803 BAA_3448 BAA_3449     FALSE 0.548 41.000 0.312 NA   NA
 7687806 7687807 BAA_3452 BAA_3453     TRUE 0.685 77.000 0.636 NA   NA
 7687808 7687809 BAA_3454 BAA_3455     FALSE 0.103 200.000 0.030 NA   NA
 7687809 7687810 BAA_3455 BAA_3456     FALSE 0.485 53.000 0.039 1.000   NA
 7687810 7687811 BAA_3456 BAA_3457     TRUE 0.700 120.000 0.235 1.000   NA
 7687815 7687816 BAA_3461 BAA_3462   gntK TRUE 0.959 122.000 0.316 1.000 Y NA
 7687816 7687817 BAA_3462 BAA_3463 gntK gntP2 TRUE 0.910 56.000 0.263 1.000 Y NA
 7687817 7687818 BAA_3463 BAA_3464 gntP2   FALSE 0.133 390.000 0.000 1.000 Y NA
 7687818 7687819 BAA_3464 BAA_3465   gnd TRUE 0.935 52.000 0.545 1.000 Y NA
 7687819 7687820 BAA_3465 BAA_3466 gnd tkt1 TRUE 0.968 105.000 0.636 1.000 Y NA
 7687820 7687821 BAA_3466 BAA_3467 tkt1 zwf TRUE 0.948 40.000 0.545 1.000 Y NA
 7687821 7687822 BAA_3467 BAA_3468 zwf   FALSE 0.033 351.000 0.000 0.000   NA
 7687822 7687823 BAA_3468 BAA_3469     FALSE 0.572 90.000 0.083 1.000   NA
 7687823 7687824 BAA_3469 BAA_3470     TRUE 0.967 14.000 0.111 NA Y NA
 7687824 7687825 BAA_3470 BAA_3471     FALSE 0.583 126.000 0.094 NA   NA
 7687827 7687828 BAA_3473 BAA_3474     FALSE 0.025 588.000 0.000 1.000 N NA
 7687828 7687829 BAA_3474 BAA_3475     FALSE 0.370 156.000 0.000 1.000   NA
 7687829 7687830 BAA_3475 BAA_3476     FALSE 0.018 343.000 0.000 1.000   NA
 7687830 7687831 BAA_3476 BAA_3477     FALSE 0.014 383.000 0.000 1.000   NA
 7687831 7687832 BAA_3477 BAA_3478     FALSE 0.012 412.000 0.000 1.000   NA
 7687832 7687833 BAA_3478 BAA_3479     TRUE 0.877 17.000 0.571 1.000   NA
 7687833 7687834 BAA_3479 BAA_3480     FALSE 0.009 579.000 0.000 1.000   NA
 7687834 7687835 BAA_3480 BAA_3481     FALSE 0.448 43.000 0.190 NA   NA
 7687837 7687838 BAA_3483 BAA_3484     FALSE 0.004 1153.000 0.000 NA   NA
 7687838 7687839 BAA_3484 BAA_3485     FALSE 0.576 131.000 0.154 NA   NA
 7687839 7687840 BAA_3485 BAA_3486     FALSE 0.284 164.000 0.128 NA   NA
 7687840 7687841 BAA_3486 BAA_3487     FALSE 0.482 76.000 0.286 NA   NA
 7687841 7687842 BAA_3487 BAA_3488     FALSE 0.521 48.000 0.333 NA   NA
 7687844 7687845 BAA_3490 BAA_3491     FALSE 0.412 33.000 0.000 NA   NA
 7687845 7687846 BAA_3491 BAA_3492     FALSE 0.551 19.000 0.000 NA   NA
 7687846 7687847 BAA_3492 BAA_3493   cfa FALSE 0.048 218.000 0.000 NA   NA
 7687847 7687848 BAA_3493 BAA_3494 cfa   FALSE 0.049 323.000 0.000 NA N NA
 7687848 7687849 BAA_3494 BAA_3495     TRUE 0.785 190.000 0.667 NA Y NA
 7687850 7687851 BAA_3496 BAA_3497     FALSE 0.480 79.000 0.262 NA   NA
 7687852 7687853 BAA_3498 BAA_3499     FALSE 0.590 29.000 0.250 NA   NA
 7687853 7687854 BAA_3499 BAA_3500     FALSE 0.597 28.000 0.250 NA   NA
 7687856 7687857 BAA_3502 BAA_3503     TRUE 0.795 12.000 0.093 1.000   NA
 7687857 7687858 BAA_3503 BAA_3504     TRUE 0.827 -3.000 0.300 0.057   NA
 7687858 7687859 BAA_3504 BAA_3505     TRUE 0.804 -3.000 0.238 0.057   NA
 7687859 7687860 BAA_3505 BAA_3506     TRUE 0.778 146.000 0.000 0.057 N NA
 7687860 7687861 BAA_3506 BAA_3507     FALSE 0.439 135.000 0.000 NA   NA
 7687861 7687862 BAA_3507 BAA_3508     FALSE 0.387 36.000 0.000 NA   NA
 7687864 7687865 BAA_3510 BAA_3511     FALSE 0.341 -12.000 0.000 NA   NA
 7687867 7687868 BAA_3513 BAA_3514     FALSE 0.041 229.000 0.000 NA   NA
 7687868 7687869 BAA_3514 BAA_3515     FALSE 0.313 47.000 0.000 NA   NA
 7687869 7687870 BAA_3515 BAA_3516     FALSE 0.146 178.000 0.000 NA   NA
 7687870 7687871 BAA_3516 BAA_3517   sigI TRUE 0.766 -7.000 0.605 NA   NA
 7687871 7687872 BAA_3517 BAA_3518 sigI   FALSE 0.005 570.000 0.000 NA   NA
 7687872 7687873 BAA_3518 BAA_3519     FALSE 0.335 43.000 0.000 NA   NA
 7687873 7687874 BAA_3519 BAA_3520     FALSE 0.011 343.000 0.000 NA   NA
 7687876 7687877 BAA_3522 BAA_3523     FALSE 0.337 147.000 0.000 NA   NA
 7687879 7687880 BAA_3525 BAA_3526     FALSE 0.038 269.000 0.000 1.000   NA
 7687880 7687881 BAA_3526 BAA_3527     TRUE 0.968 1.000 0.860 0.075 N NA
 7687881 7687882 BAA_3527 BAA_3528     FALSE 0.375 155.000 0.186 NA   NA
 7687882 7687883 BAA_3528 BAA_3529     FALSE 0.486 76.000 0.289 NA   NA
 7687883 7687884 BAA_3529 BAA_3530     FALSE 0.025 423.000 0.000 NA N NA
 7687886 7687887 BAA_3532 BAA_3533 bla2   FALSE 0.612 139.000 0.045 1.000   NA
 7687887 7687888 BAA_3533 BAA_3534     FALSE 0.513 35.000 0.130 NA   NA
 7687891 7687892 BAA_3537 BAA_3538     TRUE 0.635 111.000 0.250 NA   NA
 7687893 7687894 BAA_3539 BAA_3540     FALSE 0.021 278.000 0.000 NA   NA
 7687894 7687895 BAA_3540 BAA_3541     FALSE 0.232 172.000 0.056 NA   NA
 7687895 7687896 BAA_3541 BAA_3542     TRUE 0.702 14.000 0.085 NA   NA
 7687897 7687898 BAA_3543 BAA_3544     TRUE 0.806 14.000 0.386 NA   NA
 7687898 7687899 BAA_3544 BAA_3545     FALSE 0.566 105.000 0.159 NA   NA
 7687901 7687902 BAA_3547 BAA_3548     FALSE 0.083 196.000 0.000 NA   NA
 7687903 7687904 BAA_3549 BAA_3550     FALSE 0.031 630.000 0.000 0.047 N NA
 7687906 7687907 BAA_3552 BAA_3553     TRUE 0.777 111.000 0.500 NA   NA
 7687907 7687908 BAA_3553 BAA_3554     FALSE 0.503 58.000 0.333 NA   NA
 7687908 7687909 BAA_3554 BAA_3555     FALSE 0.005 631.000 0.000 NA   NA
 7687909 7687910 BAA_3555 BAA_3556     FALSE 0.008 379.000 0.000 NA   NA
 7687910 7687911 BAA_3556 BAA_3557     TRUE 0.693 16.000 0.178 NA   NA
 7687913 7687914 BAA_3559 BAA_3560     FALSE 0.004 862.000 0.000 NA   NA
 7687916 7687917 BAA_3562 BAA_3563     FALSE 0.047 219.000 0.000 NA   NA
 7687917 7687918 BAA_3563 BAA_3564     FALSE 0.313 -15.000 0.000 NA   NA
 7687918 7687919 BAA_3564 BAA_3565     FALSE 0.515 22.000 0.000 NA   NA
 7687919 7687920 BAA_3565 BAA_3566     TRUE 0.990 1.000 0.909 0.024 Y NA
 7687922 7687923 BAA_3568 BAA_3569     FALSE 0.032 249.000 0.000 NA   NA
 7687923 7687924 BAA_3569 BAA_3570     FALSE 0.023 271.000 0.000 NA   NA
 7687926 7687927 BAA_3572 BAA_3573     TRUE 0.838 18.000 0.545 NA   NA
 7687927 7687928 BAA_3573 BAA_3574     FALSE 0.016 302.000 0.000 NA   NA
 7687930 7687931 BAA_3576 BAA_3577     FALSE 0.521 163.000 0.467 1.000   NA
 7687931 7687932 BAA_3577 BAA_3578     TRUE 0.815 7.000 0.137 1.000   NA
 7687932 7687933 BAA_3578 BAA_3579     FALSE 0.007 399.000 0.000 NA   NA
 7687936 7687937 BAA_3582 BAA_3583   pepF2 FALSE 0.029 254.000 0.000 NA   NA
 7687941 7687942 BAA_3587 BAA_3588     TRUE 0.661 -7.000 0.389 NA   NA
 7687942 7687943 BAA_3588 BAA_3589     FALSE 0.460 94.000 0.020 NA   NA
 7687944 7687945 BAA_3590 BAA_3591     FALSE 0.004 739.000 0.000 NA   NA
 7687945 7687946 BAA_3591 BAA_3592     FALSE 0.249 -25.000 0.000 NA   NA
 7687946 7687947 BAA_3592 BAA_3593     FALSE 0.005 616.000 0.000 NA   NA
 7687948 7687949 BAA_3594 BAA_3595     TRUE 0.892 19.000 0.276 1.000 N NA
 7687949 7687950 BAA_3595 BAA_3596     FALSE 0.185 179.000 0.017 NA   NA
 7687950 7687951 BAA_3596 BAA_3597     FALSE 0.028 256.000 0.000 NA   NA
 7687951 7687952 BAA_3597 BAA_3598     FALSE 0.308 76.000 0.000 NA   NA
 7687952 7687953 BAA_3598 BAA_3599     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7687954 7687955 BAA_3600 BAA_3601 paiB2   TRUE 0.675 135.000 0.375 NA   NA
 7687955 7687956 BAA_3601 BAA_3602     FALSE 0.578 24.000 0.033 NA   NA
 7687956 7687957 BAA_3602 BAA_3603     TRUE 0.705 13.000 0.049 NA   NA
 7687957 7687958 BAA_3603 BAA_3604     TRUE 0.809 5.000 0.074 1.000   NA
 7687958 7687959 BAA_3604 BAA_3605     FALSE 0.352 170.000 0.368 NA   NA
 7687959 7687960 BAA_3605 BAA_3606     FALSE 0.010 348.000 0.000 NA   NA
 7687960 7687961 BAA_3606 BAA_3607     FALSE 0.042 228.000 0.000 NA   NA
 7687961 7687962 BAA_3607 BAA_3608     FALSE 0.010 444.000 0.000 1.000   NA
 7687962 7687963 BAA_3608 BAA_3609     TRUE 0.941 -7.000 0.144 1.000 Y NA
 7687963 7687964 BAA_3609 BAA_3610     TRUE 0.714 20.000 0.021 1.000   NA
 7687964 7687965 BAA_3610 BAA_3611     TRUE 0.781 154.000 0.750 0.056   NA
 7687965 7687966 BAA_3611 BAA_3612     FALSE 0.019 339.000 0.000 1.000   NA
 7687970 7687971 BAA_3616 BAA_3617     FALSE 0.262 175.000 0.263 NA   NA
 7687972 7687973 BAA_3618 BAA_3619     FALSE 0.603 117.000 0.182 NA   NA
 7687974 7687975 BAA_3620 BAA_3621     TRUE 0.727 32.000 0.500 NA   NA
 7687975 7687976 BAA_3621 BAA_3622     FALSE 0.391 149.000 0.019 NA   NA
 7687976 7687977 BAA_3622 BAA_3623   cspB2 FALSE 0.384 190.000 0.033 1.000 N NA
 7687977 7687978 BAA_3623 BAA_3624 cspB2   FALSE 0.050 217.000 0.000 NA   NA
 7687978 7687979 BAA_3624 BAA_3625     TRUE 0.804 17.000 0.429 NA   NA
 7687979 7687980 BAA_3625 BAA_3626     FALSE 0.599 142.000 0.160 1.000   NA
 7687980 7687981 BAA_3626 BAA_3627     FALSE 0.609 86.000 0.280 1.000   NA
 7687981 7687982 BAA_3627 BAA_3628     TRUE 0.644 -3.000 0.175 NA   NA
 7687986 7687987 BAA_3632 BAA_3633   argH1 FALSE 0.490 67.000 0.086 1.000   NA
 7687987 7687988 BAA_3633 BAA_3634 argH1   TRUE 0.775 102.000 0.099 NA N NA
 7687988 7687989 BAA_3634 BAA_3635     TRUE 0.927 117.000 0.889 NA N NA
 7687989 7687990 BAA_3635 BAA_3636     TRUE 0.890 108.000 0.471 1.000 N NA
 7687990 7687991 BAA_3636 BAA_3637     TRUE 0.745 4.000 0.170 NA   NA
 7687995 7687996 BAA_3641 BAA_3642     FALSE 0.501 100.000 0.040 NA   NA
 7687996 7687997 BAA_3642 BAA_3643     FALSE 0.409 80.000 0.023 NA   NA
 7687997 7687998 BAA_3643 BAA_3644     FALSE 0.456 91.000 0.023 NA   NA
 7687998 7687999 BAA_3644 BAA_3645     FALSE 0.232 169.000 0.022 NA   NA
 7687999 7688000 BAA_3645 BAA_3646     FALSE 0.607 43.000 0.429 NA   NA
 7688000 7688001 BAA_3646 BAA_3647     TRUE 0.812 16.000 0.429 NA   NA
 7688001 7688002 BAA_3647 BAA_3648   moaD2 TRUE 0.701 67.000 0.010 1.000 N NA
 7688002 7688003 BAA_3648 BAA_3649 moaD2 moaE2 TRUE 0.987 5.000 0.501 0.003 Y NA
 7688003 7688004 BAA_3649 BAA_3650 moaE2 moeA2 TRUE 0.915 -19.000 0.008 0.003 Y NA
 7688004 7688005 BAA_3650 BAA_3651 moeA2   TRUE 0.984 19.000 0.900 1.000 Y NA
 7688005 7688006 BAA_3651 BAA_3652     TRUE 0.885 25.000 0.429 1.000 N NA
 7688006 7688007 BAA_3652 BAA_3653   narA2 FALSE 0.411 190.000 0.250 1.000 N NA
 7688007 7688008 BAA_3653 BAA_3654 narA2 fdhD2 TRUE 0.901 21.000 0.400 1.000 N NA
 7688008 7688009 BAA_3654 BAA_3655 fdhD2   TRUE 0.843 17.000 0.545 NA   NA
 7688009 7688010 BAA_3655 BAA_3656     TRUE 0.744 116.000 0.429 NA   NA
 7688010 7688011 BAA_3656 BAA_3657     TRUE 0.927 12.000 0.929 NA   NA
 7688011 7688012 BAA_3657 BAA_3658     FALSE 0.334 -31.000 0.143 NA   NA
 7688013 7688014 BAA_3659 BAA_3660 gerSA gerSB TRUE 0.816 -3.000 0.231 0.006   NA
 7688014 7688015 BAA_3660 BAA_3661 gerSB gerSC TRUE 0.950 1.000 0.923 0.006   NA
 7688016 7688017 BAA_3662 BAA_3663     FALSE 0.571 58.000 0.438 NA   NA
 7688017 7688018 BAA_3663 BAA_3664     FALSE 0.612 74.000 0.500 NA   NA
 7688018 7688019 BAA_3664 BAA_3665     FALSE 0.031 251.000 0.000 NA   NA
 7688019 7688020 BAA_3665 BAA_3666     TRUE 0.673 -3.000 0.250 NA   NA
 7688022 7688023 BAA_3668 BAA_3669     TRUE 0.845 113.000 0.026 1.000 N NA
 7688023 7688024 BAA_3669 BAA_3670     FALSE 0.321 286.000 0.000 0.024 Y NA
 7688024 7688025 BAA_3670 BAA_3671     FALSE 0.057 211.000 0.000 NA   NA
 7688025 7688026 BAA_3671 BAA_3672     FALSE 0.300 -16.000 0.000 NA   NA
 7688026 7688027 BAA_3672 BAA_3673     FALSE 0.010 348.000 0.000 NA   NA
 7688027 7688028 BAA_3673 BAA_3674     FALSE 0.448 105.000 0.000 NA   NA
 7688028 7688029 BAA_3674 BAA_3675     FALSE 0.074 200.000 0.000 NA   NA
 7688029 7688030 BAA_3675 BAA_3676     TRUE 0.897 16.000 0.778 NA   NA
 7688030 7688031 BAA_3676 BAA_3677     TRUE 0.908 13.000 0.778 NA   NA
 7688031 7688032 BAA_3677 BAA_3678     FALSE 0.469 128.000 0.000 NA   NA
 7688032 7688033 BAA_3678 BAA_3679     FALSE 0.296 67.000 0.000 NA   NA
 7688033 7688034 BAA_3679 BAA_3680     FALSE 0.303 51.000 0.000 NA   NA
 7688034 7688035 BAA_3680 BAA_3681     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7688035 7688036 BAA_3681 BAA_3682     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7688038 7688039 BAA_3684 BAA_3685   parC FALSE 0.313 170.000 0.035 1.000   NA
 7688039 7688040 BAA_3685 BAA_3686 parC parE TRUE 0.987 2.000 0.552 0.001 Y NA
 7688040 7688041 BAA_3686 BAA_3687 parE   FALSE 0.012 376.000 0.030 NA   NA
 7688041 7688042 BAA_3687 BAA_3688   htrA FALSE 0.404 80.000 0.015 NA   NA
 7688042 7688043 BAA_3688 BAA_3689 htrA   FALSE 0.309 203.000 0.222 1.000 N NA
 7688043 7688044 BAA_3689 BAA_3690     FALSE 0.540 20.000 0.000 NA   NA
 7688044 7688045 BAA_3690 BAA_3691     FALSE 0.274 -21.000 0.000 NA   NA
 7688045 7688046 BAA_3691 BAA_3692     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7688047 7688048 BAA_3693 BAA_3694     FALSE 0.578 109.000 0.048 NA   NA
 7688051 7688052 BAA_3697 BAA_3698 tlp sspN TRUE 0.714 100.000 0.500 NA   NA
 7688052 7688053 BAA_3698 BAA_3699 sspN   TRUE 0.748 44.000 0.773 NA   NA
 7688053 7688054 BAA_3699 BAA_3700     TRUE 0.650 133.000 0.316 NA   NA
 7688058 7688059 BAA_3704 BAA_3705   acnA TRUE 0.840 117.000 0.013 1.000 N NA
 7688061 7688062 BAA_3707 BAA_3708     FALSE 0.551 47.000 0.381 NA   NA
 7688064 7688065 BAA_3710 BAA_3711     FALSE 0.551 58.000 0.412 NA   NA
 7688069 7688070 BAA_3715 BAA_3716     TRUE 0.961 -7.000 0.576 1.000 Y NA
 7688070 7688071 BAA_3716 BAA_3717     FALSE 0.404 66.000 0.144 NA   NA
 7688071 7688072 BAA_3717 BAA_3718   alkK FALSE 0.566 124.000 0.028 NA   NA
 7688072 7688073 BAA_3718 BAA_3719 alkK   FALSE 0.005 597.000 0.000 NA   NA
 7688074 7688075 BAA_3720 BAA_3721     FALSE 0.381 172.000 0.429 NA   NA
 7688078 7688079 BAA_3724 BAA_3725     TRUE 0.663 18.000 0.073 NA   NA
 7688079 7688080 BAA_3725 BAA_3726     TRUE 0.803 16.000 0.286 1.000   NA
 7688084 7688085 BAA_3730 BAA_3731     FALSE 0.591 25.000 0.175 NA   NA
 7688085 7688086 BAA_3731 BAA_3732     FALSE 0.179 342.000 0.000 1.000 Y NA
 7688086 7688087 BAA_3732 BAA_3733     FALSE 0.272 288.000 0.000 1.000 Y NA
 7688087 7688088 BAA_3733 BAA_3734     TRUE 0.778 68.000 0.412 1.000 N NA
 7688088 7688089 BAA_3734 BAA_3735     FALSE 0.025 582.000 0.000 1.000 N NA
 7688089 7688090 BAA_3735 BAA_3736   hutG FALSE 0.143 247.000 0.000 1.000 N NA
 7688090 7688091 BAA_3736 BAA_3737 hutG hutI TRUE 0.694 -21.000 0.171 1.000 N NA
 7688091 7688092 BAA_3737 BAA_3738 hutI hutU TRUE 0.905 13.000 0.110 1.000 N NA
 7688092 7688093 BAA_3738 BAA_3739 hutU hutH TRUE 0.969 24.000 0.315 0.001 Y NA
 7688093 7688094 BAA_3739 BAA_3740 hutH hutP FALSE 0.546 105.000 0.044 NA   NA
 7688096 7688097 BAA_3742 BAA_3743     TRUE 0.731 -3.000 0.333 NA   NA
 7688098 7688099 BAA_3744 BAA_3745     FALSE 0.560 104.000 0.211 NA   NA
 7688102 7688103 BAA_3748 BAA_3749     FALSE 0.061 208.000 0.000 NA   NA
 7688105 7688106 BAA_3751 BAA_3752   ccdA2 TRUE 0.921 91.000 0.200 NA Y NA
 7688106 7688107 BAA_3752 BAA_3753 ccdA2   FALSE 0.064 205.000 0.000 NA   NA
 7688107 7688108 BAA_3753 BAA_3754     FALSE 0.017 297.000 0.000 NA   NA
 7688109 7688110 BAA_3755 BAA_3756     TRUE 0.902 -3.000 0.840 1.000   NA
 7688113 7688114 BAA_3759 BAA_3760     FALSE 0.341 -12.000 0.000 NA   NA
 7688114 7688115 BAA_3760 BAA_3761     FALSE 0.295 61.000 0.000 NA   NA
 7688115 7688116 BAA_3761 BAA_3762     FALSE 0.370 165.000 0.333 NA   NA
 7688116 7688117 BAA_3762 BAA_3763     FALSE 0.331 159.000 0.154 NA   NA
 7688117 7688118 BAA_3763 BAA_3764     FALSE 0.538 70.000 0.389 NA   NA
 7688118 7688119 BAA_3764 BAA_3765     FALSE 0.571 119.000 0.028 NA   NA
 7688119 7688120 BAA_3765 BAA_3766     TRUE 0.989 0.000 0.911 0.003 Y NA
 7688120 7688121 BAA_3766 BAA_3767     TRUE 0.688 124.000 0.214 1.000   NA
 7688121 7688122 BAA_3767 BAA_3768     FALSE 0.436 79.000 0.197 NA   NA
 7688122 7688123 BAA_3768 BAA_3769   tkt2 FALSE 0.404 157.000 0.280 NA   NA
 7688123 7688124 BAA_3769 BAA_3770 tkt2   FALSE 0.037 358.000 0.000 NA N NA
 7688124 7688125 BAA_3770 BAA_3771     FALSE 0.061 299.000 0.000 NA N NA
 7688125 7688126 BAA_3771 BAA_3772     TRUE 0.987 0.000 0.689 0.001 Y NA
 7688126 7688127 BAA_3772 BAA_3773     TRUE 0.982 -3.000 0.654 0.001 Y NA
 7688127 7688128 BAA_3773 BAA_3774     TRUE 0.946 84.000 0.308 0.001 Y NA
 7688129 7688130 BAA_3775 BAA_3776     FALSE 0.629 12.000 0.000 NA   NA
 7688131 7688132 BAA_3777 BAA_3778     FALSE 0.415 46.000 0.078 NA   NA
 7688134 7688135 BAA_3780 BAA_3781     TRUE 0.892 1.000 0.667 NA   NA
 7688135 7688136 BAA_3781 BAA_3782     TRUE 0.783 -7.000 0.667 NA   NA
 7688136 7688137 BAA_3782 BAA_3783     FALSE 0.483 120.000 0.000 NA   NA
 7688137 7688138 BAA_3783 BAA_3784     FALSE 0.006 492.000 0.000 NA   NA
 7688138 7688139 BAA_3784 BAA_3785     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7688139 7688140 BAA_3785 BAA_3786     FALSE 0.015 365.000 0.000 1.000   NA
 7688140 7688141 BAA_3786 BAA_3787     FALSE 0.006 506.000 0.000 NA   NA
 7688143 7688144 BAA_3789 BAA_3790     TRUE 0.638 3.000 0.000 NA   NA
 7688144 7688145 BAA_3790 BAA_3791     FALSE 0.457 131.000 0.000 NA   NA
 7688145 7688146 BAA_3791 BAA_3792     TRUE 0.878 115.000 1.000 NA   NA
 7688146 7688147 BAA_3792 BAA_3793     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7688147 7688148 BAA_3793 BAA_3794     FALSE 0.490 112.000 0.000 NA   NA
 7688148 7688149 BAA_3794 BAA_3795     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7688149 7688150 BAA_3795 BAA_3796     FALSE 0.092 193.000 0.000 NA   NA
 7688150 7688151 BAA_3796 BAA_3797     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7688151 7688152 BAA_3797 BAA_3798     FALSE 0.295 63.000 0.000 NA   NA
 7688152 7688153 BAA_3798 BAA_3799     FALSE 0.342 42.000 0.000 NA   NA
 7688153 7688154 BAA_3799 BAA_3800     FALSE 0.304 75.000 0.000 NA   NA
 7688154 7688155 BAA_3800 BAA_3801     FALSE 0.244 -27.000 0.000 NA   NA
 7688155 7688156 BAA_3801 BAA_3802     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7688156 7688157 BAA_3802 BAA_3803     TRUE 0.711 44.000 0.667 NA   NA
 7688157 7688158 BAA_3803 BAA_3804     TRUE 0.746 5.000 0.111 NA   NA
 7688158 7688159 BAA_3804 BAA_3805     TRUE 0.719 1.000 0.111 NA   NA
 7688159 7688160 BAA_3805 BAA_3806     TRUE 0.895 -3.000 1.000 NA   NA
 7688160 7688161 BAA_3806 BAA_3807     TRUE 0.844 -7.000 1.000 NA   NA
 7688161 7688162 BAA_3807 BAA_3808     TRUE 0.895 -3.000 1.000 NA   NA
 7688162 7688163 BAA_3808 BAA_3809     TRUE 0.931 3.000 1.000 NA   NA
 7688163 7688164 BAA_3809 BAA_3810     TRUE 0.822 37.000 1.000 NA   NA
 7688164 7688165 BAA_3810 BAA_3811     TRUE 0.700 14.000 0.071 NA   NA
 7688165 7688166 BAA_3811 BAA_3812     FALSE 0.310 -34.000 0.071 NA   NA
 7688166 7688167 BAA_3812 BAA_3813     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7688167 7688168 BAA_3813 BAA_3814     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7688168 7688169 BAA_3814 BAA_3815     TRUE 0.643 166.000 1.000 NA   NA
 7688171 7688172 BAA_3817 BAA_3818     FALSE 0.482 121.000 0.000 NA   NA
 7688172 7688173 BAA_3818 BAA_3819     FALSE 0.005 569.000 0.000 NA   NA
 7688173 7688174 BAA_3819 BAA_3820     FALSE 0.487 115.000 0.000 NA   NA
 7688174 7688175 BAA_3820 BAA_3821     FALSE 0.412 33.000 0.000 NA   NA
 7688177 7688178 BAA_3823 BAA_3824     FALSE 0.405 69.000 0.133 NA   NA
 7688178 7688179 BAA_3824 BAA_3825     FALSE 0.316 149.000 0.000 NA   NA
 7688179 7688180 BAA_3825 BAA_3826     FALSE 0.005 569.000 0.000 NA   NA
 7688180 7688181 BAA_3826 BAA_3827     FALSE 0.529 21.000 0.000 NA   NA
 7688181 7688182 BAA_3827 BAA_3828     FALSE 0.010 354.000 0.000 NA   NA
 7688182 7688183 BAA_3828 BAA_3829     FALSE 0.127 182.000 0.000 NA   NA
 7688183 7688184 BAA_3829 BAA_3830     FALSE 0.020 282.000 0.000 NA   NA
 7688184 7688185 BAA_3830 BAA_3831     FALSE 0.295 62.000 0.000 NA   NA
 7688185 7688186 BAA_3831 BAA_3832     FALSE 0.057 211.000 0.000 NA   NA
 7688186 7688187 BAA_3832 BAA_3833     TRUE 0.673 32.000 0.400 NA   NA
 7688189 7688190 BAA_3835 BAA_3836     FALSE 0.166 232.000 0.000 1.000 N NA
 7688190 7688191 BAA_3836 BAA_3837     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7688191 7688192 BAA_3837 BAA_3838     FALSE 0.047 220.000 0.000 NA   NA
 7688192 7688193 BAA_3838 BAA_3839     TRUE 0.805 -3.000 0.500 NA   NA
 7688193 7688194 BAA_3839 BAA_3840     TRUE 0.867 18.000 0.667 NA   NA
 7688194 7688195 BAA_3840 BAA_3841     FALSE 0.424 47.000 0.158 NA   NA
 7688195 7688196 BAA_3841 BAA_3842     TRUE 0.645 -3.000 0.158 NA   NA
 7688196 7688197 BAA_3842 BAA_3843     TRUE 0.736 14.000 0.250 NA   NA
 7688197 7688198 BAA_3843 BAA_3844     TRUE 0.673 -3.000 0.250 NA   NA
 7688198 7688199 BAA_3844 BAA_3845     TRUE 0.705 15.000 0.143 NA   NA
 7688199 7688200 BAA_3845 BAA_3846     TRUE 0.683 71.000 0.667 NA   NA
 7688200 7688201 BAA_3846 BAA_3847     TRUE 0.811 -10.000 1.000 NA   NA
 7688201 7688202 BAA_3847 BAA_3848     TRUE 0.872 0.000 0.600 NA   NA
 7688202 7688203 BAA_3848 BAA_3849     FALSE 0.479 109.000 0.000 NA   NA
 7688203 7688204 BAA_3849 BAA_3850     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7688205 7688206 BAA_3851 BAA_3852     FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7688206 7688207 BAA_3852 BAA_3853     TRUE 0.877 16.000 0.667 NA   NA
 7688207 7688208 BAA_3853 BAA_3854     FALSE 0.342 42.000 0.000 NA   NA
 7688208 7688209 BAA_3854 BAA_3855     FALSE 0.320 45.000 0.000 NA   NA
 7688210 7688211 BAA_3856 BAA_3857 glnA glnR TRUE 0.804 49.000 0.481 1.000 N NA
 7688211 7688212 BAA_3857 BAA_3858 glnR   FALSE 0.520 176.000 0.138 1.000 N NA
 7688212 7688213 BAA_3858 BAA_3859     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7688213 7688214 BAA_3859 BAA_3860   hflX FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7688217 7688218 BAA_3863 BAA_3864     FALSE 0.615 114.000 0.000 1.000   NA
 7688219 7688220 BAA_3865 BAA_3866 hfq2 miaA TRUE 0.715 22.000 0.192 1.000   NA
 7688222 7688223 BAA_3868 BAA_3869     FALSE 0.049 348.000 0.000 1.000 N NA
 7688223 7688224 BAA_3869 BAA_3870   fruB TRUE 0.986 14.000 0.816 1.000 Y NA
 7688224 7688225 BAA_3870 BAA_3871 fruB   TRUE 0.979 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 7688225 7688226 BAA_3871 BAA_3872     FALSE 0.225 160.000 0.000 NA   NA
 7688226 7688227 BAA_3872 BAA_3873     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7688227 7688228 BAA_3873 BAA_3874     FALSE 0.485 117.000 0.000 NA   NA
 7688228 7688229 BAA_3874 BAA_3875     FALSE 0.201 179.000 0.072 NA   NA
 7688229 7688230 BAA_3875 BAA_3876     TRUE 0.865 20.000 0.700 NA   NA
 7688230 7688231 BAA_3876 BAA_3877   gabP TRUE 0.730 112.000 0.400 NA   NA
 7688233 7688234 BAA_3879 BAA_3880     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7688235 7688236 BAA_3881 BAA_3882   hup3 TRUE 0.788 143.000 0.207 1.000 N NA
 7688237 7688238 BAA_3883 BAA_3884     FALSE 0.385 96.000 0.000 NA   NA
 7688238 7688239 BAA_3884 BAA_3885     FALSE 0.105 188.000 0.000 NA   NA
 7688239 7688240 BAA_3885 BAA_3886     FALSE 0.018 292.000 0.000 NA   NA
 7688240 7688241 BAA_3886 BAA_3887     FALSE 0.012 332.000 0.000 NA   NA
 7688241 7688242 BAA_3887 BAA_3888     TRUE 0.853 17.000 0.583 NA   NA
 7688242 7688243 BAA_3888 BAA_3889     TRUE 0.980 15.000 0.545 1.000 Y NA
 7688243 7688244 BAA_3889 BAA_3890     TRUE 0.977 -7.000 0.909 0.023 Y NA
 7688244 7688245 BAA_3890 BAA_3891     FALSE 0.447 28.000 0.000 NA   NA
 7688245 7688246 BAA_3891 BAA_3892     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7688246 7688247 BAA_3892 BAA_3893   exoA FALSE 0.016 300.000 0.000 NA   NA
 7688248 7688249 BAA_3894 BAA_3895 adaA ogt2 TRUE 0.790 -19.000 0.265 0.001 N NA
 7688249 7688250 BAA_3895 BAA_3896 ogt2 alkA TRUE 0.965 -3.000 0.269 1.000 Y NA
 7688253 7688254 BAA_3899 BAA_3900     FALSE 0.295 60.000 0.000 NA   NA
 7688254 7688255 BAA_3900 BAA_3901     FALSE 0.482 121.000 0.000 NA   NA
 7688255 7688256 BAA_3901 BAA_3902     FALSE 0.534 31.000 0.063 NA   NA
 7688256 7688257 BAA_3902 BAA_3903     FALSE 0.144 187.000 0.021 NA   NA
 7688260 7688261 BAA_3906 BAA_3907     FALSE 0.249 -25.000 0.000 NA   NA
 7688262 7688263 BAA_3908 BAA_3909     TRUE 0.893 16.000 0.750 NA   NA
 7688263 7688264 BAA_3909 BAA_3910     TRUE 0.873 24.000 0.750 1.000   NA
 7688264 7688265 BAA_3910 BAA_3911     TRUE 0.787 34.000 0.583 1.000   NA
 7688265 7688266 BAA_3911 BAA_3912     FALSE 0.566 69.000 0.308 1.000   NA
 7688266 7688267 BAA_3912 BAA_3913     FALSE 0.600 24.000 0.114 NA   NA
 7688267 7688268 BAA_3913 BAA_3914     FALSE 0.417 44.000 0.042 NA   NA
 7688268 7688269 BAA_3914 BAA_3915     FALSE 0.010 358.000 0.000 NA   NA
 7688272 7688273 BAA_3918 BAA_3919     FALSE 0.025 264.000 0.000 NA   NA
 7688273 7688274 BAA_3919 BAA_3920     FALSE 0.008 391.000 0.000 NA   NA
 7688277 7688278 BAA_3923 BAA_3924     FALSE 0.213 215.000 0.000 1.000 N NA
 7688278 7688279 BAA_3924 BAA_3925     TRUE 0.956 -12.000 0.741 1.000 Y NA
 7688279 7688280 BAA_3925 BAA_3926     FALSE 0.567 42.000 0.352 NA   NA
 7688280 7688281 BAA_3926 BAA_3927     TRUE 0.855 2.000 0.490 NA   NA
 7688281 7688282 BAA_3927 BAA_3928     TRUE 0.746 4.000 0.163 NA   NA
 7688282 7688283 BAA_3928 BAA_3929   mutL FALSE 0.191 239.000 0.000 0.072 N NA
 7688283 7688284 BAA_3929 BAA_3930 mutL mutS TRUE 0.982 9.000 0.220 0.001 Y NA
 7688284 7688285 BAA_3930 BAA_3931 mutS cotE FALSE 0.172 182.000 0.027 NA   NA
 7688285 7688286 BAA_3931 BAA_3932 cotE   FALSE 0.596 126.000 0.209 NA   NA
 7688286 7688287 BAA_3932 BAA_3933   miaB TRUE 0.729 4.000 0.041 NA   NA
 7688287 7688288 BAA_3933 BAA_3934 miaB   FALSE 0.035 428.000 0.004 1.000 N NA
 7688288 7688289 BAA_3934 BAA_3935     TRUE 0.950 -13.000 0.437 0.000 Y NA
 7688289 7688290 BAA_3935 BAA_3936     FALSE 0.200 228.000 0.041 1.000 N NA
 7688290 7688291 BAA_3936 BAA_3937   spoVS2 FALSE 0.427 60.000 0.247 NA   NA
 7688291 7688292 BAA_3937 BAA_3938 spoVS2   FALSE 0.418 150.000 0.139 NA   NA
 7688292 7688293 BAA_3938 BAA_3939     FALSE 0.296 166.000 0.245 NA   NA
 7688293 7688294 BAA_3939 BAA_3940     FALSE 0.012 483.000 0.018 1.000   NA
 7688294 7688295 BAA_3940 BAA_3941   recA FALSE 0.054 307.000 0.007 0.001   NA
 7688295 7688296 BAA_3941 BAA_3942 recA cinA FALSE 0.564 145.000 0.083 1.000   NA
 7688296 7688297 BAA_3942 BAA_3943 cinA pgsA TRUE 0.726 21.000 0.151 1.000   NA
 7688297 7688298 BAA_3943 BAA_3944 pgsA   FALSE 0.488 64.000 0.077 1.000   NA
 7688298 7688299 BAA_3944 BAA_3945     TRUE 0.788 22.000 0.371 1.000   NA
 7688299 7688300 BAA_3945 BAA_3946     TRUE 0.651 140.000 0.388 NA   NA
 7688300 7688301 BAA_3946 BAA_3947     FALSE 0.548 76.000 0.386 NA   NA
 7688301 7688302 BAA_3947 BAA_3948     TRUE 0.740 104.000 0.397 1.000   NA
 7688302 7688303 BAA_3948 BAA_3949     TRUE 0.948 1.000 0.872 0.005   NA
 7688303 7688304 BAA_3949 BAA_3950     FALSE 0.076 199.000 0.000 NA   NA
 7688304 7688305 BAA_3950 BAA_3951     FALSE 0.453 132.000 0.000 NA   NA
 7688305 7688306 BAA_3951 BAA_3952     FALSE 0.447 28.000 0.000 NA   NA
 7688306 7688307 BAA_3952 BAA_3953     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7688307 7688308 BAA_3953 BAA_3954     TRUE 0.670 109.000 0.042 1.000   NA
 7688308 7688309 BAA_3954 BAA_3955     FALSE 0.574 90.000 0.100 1.000   NA
 7688309 7688310 BAA_3955 BAA_3957     FALSE 0.032 523.000 0.115 1.000 N NA
 7688310 7688311 BAA_3957 BAA_3958     FALSE 0.055 212.000 0.000 NA   NA
 7688311 7688312 BAA_3958 BAA_3959   clpP FALSE 0.604 -3.000 0.009 NA   NA
 7688312 7688313 BAA_3959 BAA_3960 clpP   FALSE 0.627 105.000 0.009 1.000   NA
 7688313 7688314 BAA_3960 BAA_3961   dapA2 FALSE 0.009 766.000 0.014 1.000   NA
 7688314 7688315 BAA_3961 BAA_3962 dapA2 dapG2 TRUE 0.974 12.000 0.085 1.000 Y NA
 7688315 7688316 BAA_3962 BAA_3963 dapG2 asd2 TRUE 0.954 24.000 0.065 1.000 Y NA
 7688316 7688317 BAA_3963 BAA_3964 asd2 spoVFB FALSE 0.480 151.000 0.025 1.000   NA
 7688317 7688318 BAA_3964 BAA_3965 spoVFB spoVFA TRUE 0.826 -3.000 0.450 1.000   NA
 7688318 7688319 BAA_3965 BAA_3966 spoVFA   FALSE 0.045 275.000 0.292 NA   NA
 7688319 7688320 BAA_3966 BAA_3967     FALSE 0.583 127.000 0.104 NA   NA
 7688320 7688321 BAA_3967 BAA_3968     FALSE 0.567 87.000 0.127 1.000   NA
 7688321 7688322 BAA_3968 BAA_3969   pnp TRUE 0.707 152.000 0.048 1.000 N NA
 7688322 7688323 BAA_3969 BAA_3970 pnp ribF FALSE 0.026 531.000 0.000 1.000 N NA
 7688323 7688324 BAA_3970 BAA_3971 ribF truB TRUE 0.776 44.000 0.308 1.000 N NA
 7688324 7688325 BAA_3971 BAA_3972 truB rbfA TRUE 0.925 87.000 0.111 1.000 Y NA
 7688325 7688326 BAA_3972 BAA_3973 rbfA   TRUE 0.689 16.000 0.113 NA   NA
 7688326 7688327 BAA_3973 BAA_3974   infB TRUE 0.638 -3.000 0.102 NA   NA
 7688327 7688328 BAA_3974 BAA_3975 infB   TRUE 0.977 5.000 0.223 1.000 Y NA
 7688328 7688329 BAA_3975 BAA_3976     TRUE 0.917 1.000 0.408 NA N NA
 7688329 7688330 BAA_3976 BAA_3977   nusA TRUE 0.974 12.000 0.323 NA Y NA
 7688330 7688331 BAA_3977 BAA_3978 nusA   TRUE 0.886 18.000 0.759 NA   NA
 7688331 7688332 BAA_3978 BAA_3979   polC FALSE 0.018 333.000 0.059 NA   NA
 7688332 7688333 BAA_3979 BAA_3980 polC proS2 TRUE 0.876 125.000 0.070 0.028 N NA
 7688333 7688334 BAA_3980 BAA_3981 proS2 rasP TRUE 0.847 110.000 0.095 1.000 N NA
 7688334 7688335 BAA_3981 BAA_3982 rasP dxr2 TRUE 0.934 17.000 0.568 1.000 N NA
 7688335 7688336 BAA_3982 BAA_3983 dxr2 cdsA TRUE 0.954 24.000 0.071 1.000 Y NA
 7688336 7688337 BAA_3983 BAA_3984 cdsA uppS TRUE 0.966 18.000 0.113 1.000 Y NA
 7688337 7688338 BAA_3984 BAA_3985 uppS frr TRUE 0.819 86.000 0.409 1.000 N NA
 7688338 7688339 BAA_3985 BAA_3986 frr pyrH2 TRUE 0.953 3.000 0.626 1.000 N NA
 7688339 7688340 BAA_3986 BAA_3987 pyrH2 tsf TRUE 0.779 67.000 0.416 1.000 N NA
 7688340 7688341 BAA_3987 BAA_3988 tsf rpsB TRUE 0.970 104.000 0.748 1.000 Y NA
 7688341 7688342 BAA_3988 BAA_3989 rpsB codY FALSE 0.054 350.000 0.006 1.000 N NA
 7688342 7688343 BAA_3989 BAA_3990 codY hslU TRUE 0.738 78.000 0.131 1.000 N NA
 7688343 7688344 BAA_3990 BAA_3991 hslU hslV TRUE 0.977 23.000 0.752 1.000 Y NA
 7688344 7688345 BAA_3991 BAA_3992 hslV xerC TRUE 0.750 43.000 0.113 1.000 N NA
 7688345 7688346 BAA_3992 BAA_3993 xerC trmFO TRUE 0.713 66.000 0.105 1.000 N NA
 7688346 7688347 BAA_3993 BAA_3994 trmFO topA TRUE 0.724 51.000 0.137 1.000 N NA
 7688347 7688348 BAA_3994 BAA_3995 topA smF FALSE 0.010 348.000 0.000 NA   NA
 7688348 7688349 BAA_3995 BAA_3996 smF sucD FALSE 0.361 88.000 0.000 NA   NA
 7688349 7688350 BAA_3996 BAA_3997 sucD sucC TRUE 0.971 21.000 0.173 0.000 Y NA
 7688350 7688351 BAA_3997 BAA_3998 sucC rnhB FALSE 0.354 194.000 0.015 1.000 N NA
 7688351 7688352 BAA_3998 BAA_3999 rnhB   FALSE 0.505 52.000 0.148 1.000   NA
 7688352 7688353 BAA_3999 BAA_4000   sipS2 TRUE 0.715 21.000 0.049 1.000   NA
 7688353 7688354 BAA_4000 BAA_4001 sipS2 rplS TRUE 0.803 102.000 0.020 1.000 N NA
 7688354 7688355 BAA_4001 BAA_4003 rplS trmD TRUE 0.946 147.000 0.567 1.000 Y NA
 7688355 7688356 BAA_4003 BAA_4004 trmD rimM TRUE 0.983 0.000 0.672 1.000 Y NA
 7688356 7688357 BAA_4004 BAA_4005 rimM   TRUE 0.747 121.000 0.324 1.000   NA
 7688357 7688358 BAA_4005 BAA_4006   rpsP TRUE 0.842 15.000 0.385 1.000   NA
 7688358 7688359 BAA_4006 BAA_4007 rpsP ffh TRUE 0.843 101.000 0.361 1.000 N NA
 7688359 7688360 BAA_4007 BAA_4008 ffh   TRUE 0.791 13.000 0.151 1.000   NA
 7688360 7688361 BAA_4008 BAA_4009   ftsY TRUE 0.649 133.000 0.081 1.000   NA
 7688361 7688362 BAA_4009 BAA_4010 ftsY smC TRUE 0.920 16.000 0.165 0.007 N NA
 7688362 7688363 BAA_4010 BAA_4011 smC rncS TRUE 0.753 147.000 0.120 1.000 N NA
 7688363 7688364 BAA_4011 BAA_4012 rncS acpP TRUE 0.711 59.000 0.068 1.000 N NA
 7688364 7688365 BAA_4012 BAA_4013 acpP fabG TRUE 0.924 70.000 0.100 0.002 Y NA
 7688365 7688366 BAA_4013 BAA_4014 fabG fabD TRUE 0.978 0.000 0.149 0.002 Y NA
 7688366 7688367 BAA_4014 BAA_4015 fabD plsX TRUE 0.977 15.000 0.106 0.002 Y NA
 7688367 7688368 BAA_4015 BAA_4016 plsX   TRUE 0.838 -3.000 0.035 NA N NA
 7688368 7688369 BAA_4016 BAA_4017   recG TRUE 0.741 89.000 0.225 NA N NA
 7688369 7688370 BAA_4017 BAA_4018 recG   FALSE 0.040 290.000 0.074 1.000   NA
 7688370 7688371 BAA_4018 BAA_4019     TRUE 0.808 23.000 0.567 NA   NA
 7688373 7688374 BAA_4021 BAA_4022   rpe TRUE 0.810 139.000 0.166 1.000 N NA
 7688374 7688375 BAA_4022 BAA_4023 rpe rsgA_2 TRUE 0.809 3.000 0.213 1.000   NA
 7688375 7688376 BAA_4023 BAA_4024 rsgA_2   FALSE 0.054 269.000 0.196 1.000   NA
 7688376 7688377 BAA_4024 BAA_4025     TRUE 0.987 9.000 0.704 1.000 Y NA
 7688377 7688378 BAA_4025 BAA_4026     TRUE 0.812 5.000 0.105 1.000   NA
 7688378 7688379 BAA_4026 BAA_4027   sun TRUE 0.815 5.000 0.135 1.000   NA
 7688379 7688380 BAA_4027 BAA_4028 sun fmt TRUE 0.966 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 7688380 7688381 BAA_4028 BAA_4029 fmt def1 TRUE 0.962 24.000 0.031 0.014 Y NA
 7688381 7688382 BAA_4029 BAA_4030 def1 priA TRUE 0.906 12.000 0.029 1.000 N NA
 7688382 7688383 BAA_4030 BAA_4031 priA coaBC TRUE 0.870 -3.000 0.099 1.000 N NA
 7688383 7688384 BAA_4031 BAA_4032 coaBC rpoZ FALSE 0.542 173.000 0.192 1.000 N NA
 7688384 7688385 BAA_4032 BAA_4033 rpoZ   TRUE 0.942 3.000 0.471 1.000 N NA
 7688385 7688386 BAA_4033 BAA_4034     TRUE 0.712 14.000 0.143 NA   NA
 7688386 7688387 BAA_4034 BAA_4035     FALSE 0.404 68.000 0.189 NA   NA
 7688387 7688388 BAA_4035 BAA_4036     FALSE 0.505 101.000 0.037 NA   NA
 7688389 7688390 BAA_4037 BAA_4038     FALSE 0.047 328.000 0.000 NA N NA
 7688391 7688392 BAA_4039 BAA_4040     TRUE 0.863 16.000 0.600 NA   NA
 7688393 7688394 BAA_4041 BAA_4042     FALSE 0.262 167.000 0.100 NA   NA
 7688394 7688395 BAA_4042 BAA_4043     FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7688396 7688397 BAA_4044 BAA_4045 pyrE pyrF TRUE 0.962 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 7688397 7688398 BAA_4045 BAA_4046 pyrF pyrD TRUE 0.931 -15.000 0.154 0.001 Y NA
 7688398 7688399 BAA_4046 BAA_4047 pyrD pyrK TRUE 0.925 -3.000 0.592 1.000 N NA
 7688399 7688400 BAA_4047 BAA_4048 pyrK carB TRUE 0.872 -3.000 0.147 1.000 N NA
 7688400 7688401 BAA_4048 BAA_4049 carB   TRUE 0.932 -15.000 0.117 0.000 Y NA
 7688401 7688402 BAA_4049 BAA_4050   pyrC TRUE 0.962 -3.000 0.155 1.000 Y NA
 7688402 7688403 BAA_4050 BAA_4051 pyrC pyrB TRUE 0.928 -16.000 0.452 1.000 Y NA
 7688403 7688404 BAA_4051 BAA_4053 pyrB uraA TRUE 0.911 149.000 0.064 1.000 Y NA
 7688404 7688405 BAA_4053 BAA_4055 uraA pyrR TRUE 0.920 147.000 0.140 1.000 Y NA
 7688405 7688406 BAA_4055 BAA_4057 pyrR   FALSE 0.297 203.000 0.048 1.000 N NA
 7688406 7688407 BAA_4057 BAA_4058   lspA TRUE 0.913 5.000 0.022 1.000 N NA
 7688407 7688408 BAA_4058 BAA_4059 lspA   TRUE 0.666 125.000 0.038 1.000   NA
 7688408 7688409 BAA_4059 BAA_4060   ileS2 FALSE 0.543 156.000 0.010 0.012   NA
 7688409 7688410 BAA_4060 BAA_4061 ileS2 divIVA FALSE 0.045 348.000 0.012 NA N NA
 7688410 7688411 BAA_4061 BAA_4062 divIVA   TRUE 0.715 90.000 0.579 NA   NA
 7688411 7688412 BAA_4062 BAA_4063     TRUE 0.769 16.000 0.138 1.000   NA
 7688412 7688413 BAA_4063 BAA_4064     TRUE 0.749 7.000 0.158 NA   NA
 7688413 7688414 BAA_4064 BAA_4065     TRUE 0.655 20.000 0.194 NA   NA
 7688414 7688415 BAA_4065 BAA_4066     TRUE 0.631 -3.000 0.061 NA   NA
 7688415 7688416 BAA_4066 BAA_4067     FALSE 0.580 117.000 0.039 NA   NA
 7688416 7688417 BAA_4067 BAA_4068   sigG FALSE 0.302 169.000 0.276 NA   NA
 7688417 7688418 BAA_4068 BAA_4069 sigG sigE TRUE 0.935 158.000 0.602 0.007 Y NA
 7688418 7688419 BAA_4069 BAA_4070 sigE spoIIGA TRUE 0.907 20.000 0.856 1.000   NA
 7688419 7688420 BAA_4070 BAA_4071 spoIIGA ftsZ FALSE 0.052 265.000 0.024 1.000   NA
 7688420 7688421 BAA_4071 BAA_4072 ftsZ ftsA TRUE 0.943 40.000 0.460 1.000 Y NA
 7688421 7688422 BAA_4072 BAA_4073 ftsA   FALSE 0.054 373.000 0.389 NA N NA
 7688422 7688423 BAA_4073 BAA_4074   murB1 TRUE 0.927 99.000 0.070 NA Y NA
 7688423 7688424 BAA_4074 BAA_4075 murB1 murG1 TRUE 0.902 62.000 0.061 1.000 Y NA
 7688424 7688425 BAA_4075 BAA_4076 murG1 spoVE TRUE 0.727 49.000 0.120 1.000 N NA
 7688425 7688426 BAA_4076 BAA_4077 spoVE murD TRUE 0.830 91.000 0.067 0.003 N NA
 7688426 7688427 BAA_4077 BAA_4078 murD mraY TRUE 0.987 1.000 0.647 0.004 Y NA
 7688427 7688428 BAA_4078 BAA_4079 mraY murE TRUE 0.965 23.000 0.025 0.004 Y NA
 7688428 7688429 BAA_4079 BAA_4080 murE   FALSE 0.590 209.000 0.181 1.000 Y NA
 7688429 7688430 BAA_4080 BAA_4081     TRUE 0.936 82.000 0.096 0.002 Y NA
 7688430 7688431 BAA_4081 BAA_4082   ftsL TRUE 0.863 22.000 0.101 1.000 N NA
 7688431 7688432 BAA_4082 BAA_4083 ftsL mraW TRUE 0.892 16.000 0.077 1.000 N NA
 7688432 7688433 BAA_4083 BAA_4084 mraW   FALSE 0.012 371.000 0.003 NA   NA
 7688433 7688434 BAA_4084 BAA_4085   panE2 FALSE 0.425 80.000 0.053 NA   NA
 7688436 7688437 BAA_4087 BAA_4088   rpmF TRUE 0.640 129.000 0.007 1.000   NA
 7688437 7688438 BAA_4088 BAA_4089 rpmF   TRUE 0.649 62.000 0.599 NA   NA
 7688440 7688441 BAA_4091 BAA_4092     FALSE 0.265 -22.000 0.000 NA   NA
 7688441 7688442 BAA_4092 BAA_4093     FALSE 0.486 116.000 0.000 NA   NA
 7688442 7688443 BAA_4093 BAA_4094     TRUE 0.638 3.000 0.000 NA   NA
 7688444 7688445 BAA_4095 BAA_4096     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7688445 7688446 BAA_4096 BAA_4097     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7688447 7688448 BAA_4098 BAA_4099     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7688448 7688449 BAA_4099 BAA_4100     TRUE 0.651 5.000 0.000 NA   NA
 7688449 7688450 BAA_4100 BAA_4101     FALSE 0.260 156.000 0.000 NA   NA
 7688450 7688451 BAA_4101 BAA_4102     FALSE 0.474 25.000 0.000 NA   NA
 7688451 7688452 BAA_4102 BAA_4103     FALSE 0.486 24.000 0.000 NA   NA
 7688452 7688453 BAA_4103 BAA_4104     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7688453 7688454 BAA_4104 BAA_4105     FALSE 0.378 37.000 0.000 NA   NA
 7688454 7688455 BAA_4105 BAA_4106     FALSE 0.296 66.000 0.000 NA   NA
 7688455 7688456 BAA_4106 BAA_4107     FALSE 0.448 105.000 0.000 NA   NA
 7688456 7688457 BAA_4107 BAA_4108     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7688457 7688458 BAA_4108 BAA_4109     TRUE 0.928 2.000 1.000 NA   NA
 7688458 7688459 BAA_4109 BAA_4110     TRUE 0.761 60.000 1.000 NA   NA
 7688459 7688460 BAA_4110 BAA_4111     TRUE 0.921 14.000 1.000 NA   NA
 7688460 7688461 BAA_4111 BAA_4112     TRUE 0.895 -3.000 1.000 NA   NA
 7688463 7688464 BAA_4114 BAA_4115     TRUE 0.645 9.000 0.000 NA   NA
 7688464 7688465 BAA_4115 BAA_4116     FALSE 0.313 77.000 0.000 NA   NA
 7688465 7688466 BAA_4116 BAA_4117     TRUE 0.884 -3.000 0.846 NA   NA
 7688466 7688467 BAA_4117 BAA_4118     TRUE 0.922 11.000 0.846 NA   NA
 7688467 7688468 BAA_4118 BAA_4119     TRUE 0.692 61.000 0.692 NA   NA
 7688468 7688469 BAA_4119 BAA_4120     FALSE 0.391 -19.000 0.200 NA   NA
 7688469 7688470 BAA_4120 BAA_4121     FALSE 0.491 162.000 0.500 NA   NA
 7688470 7688471 BAA_4121 BAA_4122     FALSE 0.407 140.000 0.000 NA   NA
 7688471 7688472 BAA_4122 BAA_4123     FALSE 0.008 388.000 0.000 NA   NA
 7688472 7688473 BAA_4123 BAA_4124     FALSE 0.022 274.000 0.000 NA   NA
 7688473 7688474 BAA_4124 BAA_4125     TRUE 0.653 -3.000 0.000 1.000   NA
 7688474 7688475 BAA_4125 BAA_4126     FALSE 0.529 21.000 0.000 NA   NA
 7688475 7688476 BAA_4126 BAA_4127     FALSE 0.487 115.000 0.000 NA   NA
 7688476 7688477 BAA_4127 BAA_4128     TRUE 0.810 27.000 0.667 NA   NA
 7688477 7688478 BAA_4128 BAA_4129     FALSE 0.372 91.000 0.000 NA   NA
 7688478 7688479 BAA_4129 BAA_4130     FALSE 0.008 386.000 0.000 NA   NA
 7688479 7688480 BAA_4130 BAA_4131     FALSE 0.378 37.000 0.000 NA   NA
 7688480 7688481 BAA_4131 BAA_4132     FALSE 0.004 745.000 0.000 NA   NA
 7688483 7688484 BAA_4134 BAA_4135     FALSE 0.186 167.000 0.000 NA   NA
 7688484 7688485 BAA_4135 BAA_4136   dut FALSE 0.465 26.000 0.000 NA   NA
 7688485 7688486 BAA_4136 BAA_4137 dut   FALSE 0.296 67.000 0.000 NA   NA
 7688486 7688487 BAA_4137 BAA_4138     FALSE 0.300 -16.000 0.000 NA   NA
 7688487 7688488 BAA_4138 BAA_4139     TRUE 0.645 9.000 0.000 NA   NA
 7688488 7688489 BAA_4139 BAA_4140     FALSE 0.479 39.000 0.200 NA   NA
 7688489 7688490 BAA_4140 BAA_4141     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7688490 7688491 BAA_4141 BAA_4142     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7688491 7688492 BAA_4142 BAA_4143     FALSE 0.465 26.000 0.000 NA   NA
 7688492 7688493 BAA_4143 BAA_4144     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7688493 7688494 BAA_4144 BAA_4145     FALSE 0.284 -19.000 0.000 NA   NA
 7688494 7688495 BAA_4145 BAA_4146     TRUE 0.651 5.000 0.000 NA   NA
 7688495 7688496 BAA_4146 BAA_4147     TRUE 0.797 30.000 0.667 NA   NA
 7688496 7688497 BAA_4147 BAA_4148     FALSE 0.296 57.000 0.000 NA   NA
 7688497 7688498 BAA_4148 BAA_4149     FALSE 0.510 52.000 0.333 NA   NA
 7688500 7688501 BAA_4151 BAA_4152     TRUE 0.846 102.000 1.000 NA   NA
 7688501 7688502 BAA_4152 BAA_4153     TRUE 0.819 13.000 0.400 NA   NA
 7688502 7688503 BAA_4153 BAA_4154     FALSE 0.004 870.000 0.000 NA   NA
 7688503 7688504 BAA_4154 BAA_4155     TRUE 0.638 3.000 0.000 NA   NA
 7688504 7688505 BAA_4155 BAA_4156     TRUE 0.795 22.000 0.500 NA   NA
 7688506 7688507 BAA_4157 BAA_4158     FALSE 0.122 193.000 0.014 NA   NA
 7688508 7688509 BAA_4159 BAA_4160     FALSE 0.620 -7.000 0.095 1.000   NA
 7688511 7688512 BAA_4161 BAA_4163 coaD   TRUE 0.862 -3.000 0.009 1.000 N NA
 7688513 7688514 BAA_4165 BAA_4166     FALSE 0.292 -18.000 0.000 NA   NA
 7688515 7688516 BAA_4167 BAA_4168   ylbF FALSE 0.101 253.000 0.500 NA   NA
 7688516 7688517 BAA_4168 BAA_4169 ylbF   FALSE 0.592 117.000 0.078 NA   NA
 7688517 7688518 BAA_4169 BAA_4170     FALSE 0.412 77.000 0.078 NA   NA
 7688518 7688519 BAA_4170 BAA_4171     TRUE 0.921 12.000 0.852 NA   NA
 7688519 7688520 BAA_4171 BAA_4172     FALSE 0.522 146.000 0.276 NA   NA
 7688522 7688523 BAA_4174 BAA_4175     FALSE 0.042 227.000 0.000 NA   NA
 7688523 7688524 BAA_4175 BAA_4176   ctaF TRUE 0.752 86.000 0.707 NA   NA
 7688524 7688525 BAA_4176 BAA_4177 ctaF ctaE TRUE 0.991 4.000 0.950 0.001 Y NA
 7688525 7688526 BAA_4177 BAA_4178 ctaE ctaD TRUE 0.990 0.000 0.925 0.001 Y NA
 7688526 7688527 BAA_4178 BAA_4179 ctaD ctaC TRUE 0.974 34.000 0.755 0.001 Y NA
 7688527 7688528 BAA_4179 BAA_4180 ctaC   TRUE 0.824 94.000 0.084 0.044 N NA
 7688530 7688531 BAA_4182 BAA_4183 pyc   FALSE 0.061 324.000 0.000 1.000 N NA
 7688531 7688532 BAA_4183 BAA_4184     FALSE 0.593 126.000 0.133 NA   NA
 7688534 7688535 BAA_4186 BAA_4187     FALSE 0.065 249.000 0.025 1.000   NA
 7688537 7688538 BAA_4189 BAA_4190     TRUE 0.819 15.000 0.429 NA   NA
 7688538 7688539 BAA_4190 BAA_4191   typA FALSE 0.336 156.000 0.032 NA   NA
 7688541 7688542 BAA_4193 BAA_4194     FALSE 0.588 89.000 0.342 NA   NA
 7688545 7688546 BAA_4197 BAA_4198 speA   FALSE 0.498 75.000 0.068 1.000   NA
 7688547 7688548 BAA_4199 BAA_4200     TRUE 0.661 46.000 0.571 NA   NA
 7688548 7688549 BAA_4200 BAA_4201     TRUE 0.702 60.000 0.714 NA   NA
 7688549 7688550 BAA_4201 BAA_4202     FALSE 0.224 196.000 0.438 NA   NA
 7688552 7688553 BAA_4204 BAA_4205 pdhD pdhC TRUE 0.989 6.000 0.948 1.000 Y NA
 7688553 7688554 BAA_4205 BAA_4206 pdhC pdhB TRUE 0.972 93.000 0.883 0.053 Y NA
 7688554 7688555 BAA_4206 BAA_4207 pdhB pdhA TRUE 0.987 4.000 0.484 0.001 Y NA
 7688556 7688557 BAA_4208 BAA_4209   def2 FALSE 0.435 147.000 0.059 NA   NA
 7688559 7688560 BAA_4211 BAA_4212     TRUE 0.888 5.000 0.576 NA   NA
 7688561 7688562 BAA_4213 BAA_4214     FALSE 0.459 84.000 0.163 NA   NA
 7688562 7688563 BAA_4214 BAA_4215     FALSE 0.028 255.000 0.000 NA   NA
 7688563 7688564 BAA_4215 BAA_4216     FALSE 0.594 62.000 0.372 1.000   NA
 7688564 7688565 BAA_4216 BAA_4217     TRUE 0.718 72.000 0.121 1.000 N NA
 7688565 7688566 BAA_4217 BAA_4218     TRUE 0.926 142.000 0.214 NA Y NA
 7688566 7688567 BAA_4218 BAA_4219     FALSE 0.249 170.000 0.120 NA   NA
 7688567 7688568 BAA_4219 BAA_4220     FALSE 0.596 109.000 0.176 NA   NA
 7688568 7688569 BAA_4220 BAA_4221     FALSE 0.401 75.000 0.074 NA   NA
 7688569 7688570 BAA_4221 BAA_4222     FALSE 0.055 212.000 0.000 NA   NA
 7688572 7688573 BAA_4224 BAA_4225     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7688573 7688574 BAA_4225 BAA_4226     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7688574 7688575 BAA_4226 BAA_4227     FALSE 0.117 256.000 0.043 NA N NA
 7688576 7688577 BAA_4228 BAA_4229     TRUE 0.635 98.000 0.381 NA   NA
 7688578 7688579 BAA_4230 BAA_4231 ppk   TRUE 0.953 109.000 0.056 1.000 Y NA
 7688581 7688582 BAA_4233 BAA_4234     FALSE 0.295 60.000 0.000 NA   NA
 7688582 7688583 BAA_4234 BAA_4235     FALSE 0.006 467.000 0.000 NA   NA
 7688586 7688587 BAA_4238 BAA_4239     TRUE 0.828 92.000 0.500 NA N NA
 7688587 7688588 BAA_4239 BAA_4241   metE FALSE 0.019 618.000 0.000 NA N NA
 7688589 7688590 BAA_4242 BAA_4243 comJ comI TRUE 0.690 37.000 0.500 NA   NA
 7688593 7688594 BAA_4246 BAA_4247     FALSE 0.597 123.000 0.184 NA   NA
 7688595 7688596 BAA_4248 BAA_4249 malR   FALSE 0.269 164.000 0.045 NA   NA
 7688596 7688597 BAA_4249 BAA_4250   malD TRUE 0.737 4.000 0.077 NA   NA
 7688597 7688598 BAA_4250 BAA_4251 malD malC TRUE 0.989 1.000 0.885 0.023 Y NA
 7688598 7688599 BAA_4251 BAA_4252 malC   TRUE 0.950 65.000 0.815 1.000 Y NA
 7688603 7688604 BAA_4256 BAA_4257     FALSE 0.011 341.000 0.000 NA   NA
 7688606 7688607 BAA_4259 BAA_4260     FALSE 0.503 36.000 0.125 NA   NA
 7688609 7688610 BAA_4262 BAA_4263     TRUE 0.805 140.000 0.171 1.000 N NA
 7688610 7688611 BAA_4263 BAA_4264     TRUE 0.738 109.000 0.429 NA   NA
 7688613 7688614 BAA_4266 BAA_4267     FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7688614 7688615 BAA_4267 BAA_4268     TRUE 0.780 17.000 0.375 NA   NA
 7688615 7688616 BAA_4268 BAA_4269     TRUE 0.709 0.000 0.185 NA   NA
 7688618 7688619 BAA_4271 BAA_4272   mtnA_2 FALSE 0.373 75.000 0.011 NA   NA
 7688619 7688620 BAA_4272 BAA_4273 mtnA_2   TRUE 0.722 -3.000 0.104 1.000   NA
 7688620 7688621 BAA_4273 BAA_4275     FALSE 0.026 305.000 0.000 1.000   NA
 7688622 7688623 BAA_4276 BAA_4278   mtnW FALSE 0.179 237.000 0.043 1.000 N NA
 7688623 7688624 BAA_4278 BAA_4279 mtnW mtnX TRUE 0.921 -3.000 0.304 0.000 N NA
 7688624 7688625 BAA_4279 BAA_4280 mtnX   TRUE 0.879 -3.000 0.253 1.000 N NA
 7688625 7688626 BAA_4280 BAA_4281     FALSE 0.452 -22.000 0.087 1.000   NA
 7688626 7688627 BAA_4281 BAA_4282     FALSE 0.015 307.000 0.000 NA   NA
 7688628 7688629 BAA_4283 BAA_4284     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7688629 7688630 BAA_4284 BAA_4285     FALSE 0.299 54.000 0.000 NA   NA
 7688630 7688631 BAA_4285 BAA_4286     FALSE 0.007 426.000 0.000 NA   NA
 7688632 7688633 BAA_4287 BAA_4288     FALSE 0.019 286.000 0.000 NA   NA
 7688633 7688634 BAA_4288 BAA_4289     FALSE 0.359 197.000 0.800 NA   NA
 7688635 7688636 BAA_4290 BAA_4291 ptsI ptsH1 TRUE 0.977 0.000 0.132 0.005 Y NA
 7688636 7688637 BAA_4291 BAA_4292 ptsH1 ptsG TRUE 0.956 135.000 0.054 0.005 Y NA
 7688637 7688638 BAA_4292 BAA_4293 ptsG glcT FALSE 0.019 339.000 0.000 1.000   NA
 7688640 7688641 BAA_4295 BAA_4296   nagB TRUE 0.823 104.000 0.128 1.000 N NA
 7688641 7688642 BAA_4296 BAA_4297 nagB nagA TRUE 0.983 5.000 0.194 0.000 Y NA
 7688642 7688643 BAA_4297 BAA_4298 nagA   FALSE 0.121 209.000 0.028 1.000   NA
 7688643 7688644 BAA_4298 BAA_4299   scpB FALSE 0.395 79.000 0.012 NA   NA
 7688644 7688645 BAA_4299 BAA_4300 scpB scpA FALSE 0.574 158.000 0.570 NA   NA
 7688647 7688648 BAA_4302 BAA_4303 ribT   FALSE 0.388 69.000 0.051 NA   NA
 7688648 7688649 BAA_4303 BAA_4304     FALSE 0.050 236.000 0.015 NA   NA
 7688651 7688652 BAA_4306 BAA_4307   spoVAF FALSE 0.606 97.000 0.219 1.000   NA
 7688652 7688653 BAA_4307 BAA_4308 spoVAF   TRUE 0.702 -13.000 0.650 NA   NA
 7688653 7688654 BAA_4308 BAA_4309   spoVAE_1 TRUE 0.728 24.000 0.400 NA   NA
 7688654 7688655 BAA_4309 BAA_4310 spoVAE_1 spoVAD_1 TRUE 0.922 4.000 0.808 NA   NA
 7688655 7688656 BAA_4310 BAA_4311 spoVAD_1 spoVAC_1 TRUE 0.877 14.000 0.615 NA   NA
 7688656 7688657 BAA_4311 BAA_4312 spoVAC_1 spoVAB TRUE 0.739 15.000 0.260 NA   NA
 7688657 7688658 BAA_4312 BAA_4313 spoVAB spoVAA TRUE 0.840 -7.000 0.923 NA   NA
 7688658 7688659 BAA_4313 BAA_4314 spoVAA   FALSE 0.487 115.000 0.000 NA   NA
 7688659 7688660 BAA_4314 BAA_4315     FALSE 0.256 -24.000 0.000 NA   NA
 7688660 7688661 BAA_4315 BAA_4316   sigF FALSE 0.624 138.000 0.067 1.000   NA
 7688661 7688662 BAA_4316 BAA_4317 sigF spoIIAB TRUE 0.960 13.000 0.842 1.000 N NA
 7688662 7688663 BAA_4317 BAA_4318 spoIIAB spoIIAA TRUE 0.988 1.000 0.669 0.001 Y NA
 7688663 7688664 BAA_4318 BAA_4319 spoIIAA dacF FALSE 0.577 171.000 0.276 1.000 N NA
 7688665 7688666 BAA_4320 BAA_4321     TRUE 0.639 -34.000 0.149 1.000 N NA
 7688666 7688667 BAA_4321 BAA_4322     FALSE 0.477 -10.000 0.133 NA   NA
 7688668 7688669 BAA_4323 BAA_4324     TRUE 0.827 103.000 0.800 NA   NA
 7688670 7688671 BAA_4325 BAA_4326     FALSE 0.543 135.000 0.058 NA   NA
 7688672 7688673 BAA_4327 BAA_4328 corA pyn2 TRUE 0.714 75.000 0.031 1.000 N NA
 7688673 7688674 BAA_4328 BAA_4329 pyn2   TRUE 0.976 8.000 0.084 1.000 Y NA
 7688674 7688675 BAA_4329 BAA_4330   deoB TRUE 0.947 13.000 0.609 1.000 N NA
 7688675 7688676 BAA_4330 BAA_4331 deoB   FALSE 0.007 406.000 0.000 NA   NA
 7688676 7688677 BAA_4331 BAA_4332     FALSE 0.487 144.000 0.167 NA   NA
 7688677 7688678 BAA_4332 BAA_4333     TRUE 0.864 7.000 0.476 NA   NA
 7688678 7688679 BAA_4333 BAA_4334     FALSE 0.615 104.000 0.284 NA   NA
 7688679 7688680 BAA_4334 BAA_4335   spoIIM TRUE 0.683 107.000 0.341 NA   NA
 7688683 7688684 BAA_4338 BAA_4339   lolS FALSE 0.408 54.000 0.140 NA   NA
 7688685 7688686 BAA_4340 BAA_4341     TRUE 0.736 129.000 0.444 NA   NA
 7688686 7688687 BAA_4341 BAA_4342     FALSE 0.532 70.000 0.381 NA   NA
 7688690 7688691 BAA_4345 BAA_4346     TRUE 0.652 132.000 0.059 1.000   NA
 7688692 7688693 BAA_4347 BAA_4348     FALSE 0.608 100.000 0.068 1.000   NA
 7688696 7688697 BAA_4351 BAA_4353   ribD FALSE 0.005 646.000 0.000 NA   NA
 7688697 7688698 BAA_4353 BAA_4354 ribD ribE TRUE 0.926 -18.000 0.456 1.000 Y NA
 7688698 7688699 BAA_4354 BAA_4355 ribE ribBA TRUE 0.972 13.000 0.040 1.000 Y NA
 7688699 7688700 BAA_4355 BAA_4357 ribBA ribH TRUE 0.972 19.000 0.034 0.001 Y NA
 7688701 7688702 BAA_4356 BAA_4358   bioB FALSE 0.159 183.000 0.010 NA   NA
 7688702 7688703 BAA_4358 BAA_4359 bioB   TRUE 0.934 2.000 0.022 0.001 N NA
 7688703 7688704 BAA_4359 BAA_4360     FALSE 0.321 -34.000 0.163 NA   NA
 7688704 7688705 BAA_4360 BAA_4361   bioF TRUE 0.645 -3.000 0.128 NA   NA
 7688705 7688706 BAA_4361 BAA_4362 bioF bioD TRUE 0.896 -34.000 0.107 0.001 Y NA
 7688706 7688707 BAA_4362 BAA_4363 bioD bioA TRUE 0.978 0.000 0.053 0.001 Y NA
 7688707 7688708 BAA_4363 BAA_4364 bioA   FALSE 0.556 123.000 0.012 NA   NA
 7688709 7688710 BAA_4365 BAA_4366   nhaC3 FALSE 0.032 248.000 0.000 NA   NA
 7688712 7688713 BAA_4368 BAA_4369     TRUE 0.783 73.000 0.421 1.000 N NA
 7688714 7688715 BAA_4370 BAA_4371     TRUE 0.654 59.000 0.600 NA   NA
 7688715 7688716 BAA_4371 BAA_4372   argF FALSE 0.176 180.000 0.008 NA   NA
 7688716 7688717 BAA_4372 BAA_4373 argF argD TRUE 0.972 13.000 0.037 1.000 Y NA
 7688717 7688718 BAA_4373 BAA_4374 argD argB TRUE 0.967 -3.000 0.322 1.000 Y NA
 7688718 7688719 BAA_4374 BAA_4375 argB argJ TRUE 0.980 12.000 0.067 0.001 Y NA
 7688719 7688720 BAA_4375 BAA_4376 argJ argC TRUE 0.983 12.000 0.303 0.001 Y NA
 7688722 7688723 BAA_4378 BAA_4379     TRUE 0.642 10.000 0.000 NA   NA
 7688723 7688724 BAA_4379 BAA_4380     FALSE 0.341 -12.000 0.000 NA   NA
 7688726 7688727 BAA_4382 BAA_4383 sdaAA2 sdaAB2 TRUE 0.977 19.000 0.353 0.001 Y NA
 7688727 7688728 BAA_4383 BAA_4384 sdaAB2   FALSE 0.369 38.000 0.000 NA   NA
 7688728 7688729 BAA_4384 BAA_4385   rnz FALSE 0.005 551.000 0.000 NA   NA
 7688731 7688732 BAA_4387 BAA_4388     FALSE 0.042 389.000 0.015 1.000 N NA
 7688732 7688733 BAA_4388 BAA_4389     TRUE 0.838 128.000 0.062 1.000 N NA
 7688733 7688734 BAA_4389 BAA_4390     FALSE 0.010 354.000 0.000 NA   NA
 7688734 7688735 BAA_4390 BAA_4391     FALSE 0.452 67.000 0.267 NA   NA
 7688735 7688736 BAA_4391 BAA_4392     TRUE 0.709 17.000 0.250 NA   NA
 7688736 7688737 BAA_4392 BAA_4393     FALSE 0.500 97.000 0.110 NA   NA
 7688737 7688738 BAA_4393 BAA_4394     TRUE 0.964 -7.000 0.640 1.000 Y NA
 7688738 7688739 BAA_4394 BAA_4395     TRUE 0.943 37.000 0.154 0.030 Y NA
 7688739 7688740 BAA_4395 BAA_4396     TRUE 0.733 12.000 0.148 NA   NA
 7688740 7688741 BAA_4396 BAA_4397     FALSE 0.457 89.000 0.039 NA   NA
 7688741 7688742 BAA_4397 BAA_4398     FALSE 0.587 122.000 0.078 NA   NA
 7688742 7688743 BAA_4398 BAA_4399     FALSE 0.235 159.000 0.000 NA   NA
 7688743 7688744 BAA_4399 BAA_4400     FALSE 0.186 167.000 0.000 NA   NA
 7688744 7688745 BAA_4400 BAA_4401   bfmbB FALSE 0.052 342.000 0.000 1.000 N NA
 7688745 7688746 BAA_4401 BAA_4402 bfmbB bfmbAb TRUE 0.988 16.000 0.882 0.052 Y NA
 7688746 7688747 BAA_4402 BAA_4403 bfmbAb bfmbAa TRUE 0.990 14.000 0.897 0.000 Y NA
 7688747 7688748 BAA_4403 BAA_4404 bfmbAa bfmbC TRUE 0.959 28.000 0.414 1.000 Y NA
 7688748 7688749 BAA_4404 BAA_4405 bfmbC buk TRUE 0.981 5.000 0.172 0.027 Y NA
 7688749 7688750 BAA_4405 BAA_4406 buk   TRUE 0.840 88.000 0.490 1.000 N NA
 7688750 7688751 BAA_4406 BAA_4407   yqiS TRUE 0.849 35.000 0.431 1.000 N NA
 7688751 7688752 BAA_4407 BAA_4408 yqiS   FALSE 0.403 196.000 0.333 1.000 N NA
 7688756 7688757 BAA_4412 BAA_4413   spo0A FALSE 0.017 298.000 0.000 NA   NA
 7688757 7688758 BAA_4413 BAA_4414 spo0A spoIVB FALSE 0.200 252.000 0.393 1.000 N NA
 7688758 7688759 BAA_4414 BAA_4415 spoIVB recN TRUE 0.838 128.000 0.079 1.000 N NA
 7688759 7688760 BAA_4415 BAA_4416 recN argR FALSE 0.124 268.000 0.056 1.000 N NA
 7688760 7688761 BAA_4416 BAA_4417 argR   TRUE 0.782 143.000 0.064 1.000 N NA
 7688761 7688762 BAA_4417 BAA_4418   dxs TRUE 0.916 4.000 0.189 1.000 N NA
 7688762 7688763 BAA_4418 BAA_4419 dxs ispA FALSE 0.258 302.000 0.024 1.000 Y NA
 7688763 7688764 BAA_4419 BAA_4420 ispA xseB TRUE 0.900 0.000 0.100 1.000 N NA
 7688764 7688765 BAA_4420 BAA_4421 xseB xseA TRUE 0.955 -10.000 0.412 0.000 Y NA
 7688765 7688766 BAA_4421 BAA_4422 xseA folD TRUE 0.830 27.000 0.058 1.000 N NA
 7688766 7688767 BAA_4422 BAA_4423 folD nusB TRUE 0.847 24.000 0.056 1.000 N NA
 7688767 7688768 BAA_4423 BAA_4424 nusB   FALSE 0.015 347.000 0.023 NA   NA
 7688768 7688769 BAA_4424 BAA_4425   accC TRUE 0.725 23.000 0.373 NA   NA
 7688769 7688770 BAA_4425 BAA_4426 accC accB TRUE 0.975 17.000 0.086 0.001 Y NA
 7688770 7688771 BAA_4426 BAA_4427 accB   FALSE 0.006 758.000 0.020 NA   NA
 7688771 7688772 BAA_4427 BAA_4428   spoIIIAG TRUE 0.844 16.000 0.509 NA   NA
 7688772 7688773 BAA_4428 BAA_4429 spoIIIAG spoIIIAF TRUE 0.806 -10.000 0.907 NA   NA
 7688773 7688774 BAA_4429 BAA_4430 spoIIIAF spoIIIAE TRUE 0.922 13.000 0.918 NA   NA
 7688774 7688775 BAA_4430 BAA_4431 spoIIIAE spoIIIAD TRUE 0.924 11.000 0.864 NA   NA
 7688775 7688776 BAA_4431 BAA_4432 spoIIIAD spoIIIAC TRUE 0.874 111.000 0.895 NA   NA
 7688776 7688777 BAA_4432 BAA_4433 spoIIIAC spoIIIAB TRUE 0.916 15.000 0.926 NA   NA
 7688777 7688778 BAA_4433 BAA_4434 spoIIIAB spoIIIAA TRUE 0.788 -6.000 0.604 NA   NA
 7688778 7688779 BAA_4434 BAA_4435 spoIIIAA   FALSE 0.560 29.000 0.148 NA   NA
 7688781 7688782 BAA_4437 BAA_4438 efp pepQ1 TRUE 0.865 22.000 0.160 1.000 N NA
 7688782 7688783 BAA_4438 BAA_4439 pepQ1 aroQ TRUE 0.977 5.000 0.168 1.000 Y NA
 7688783 7688784 BAA_4439 BAA_4440 aroQ   FALSE 0.389 53.000 0.044 NA   NA
 7688785 7688786 BAA_4441 BAA_4443     FALSE 0.443 80.000 0.140 NA   NA
 7688787 7688788 BAA_4442 BAA_4444     FALSE 0.491 54.000 0.064 1.000   NA
 7688788 7688789 BAA_4444 BAA_4445   splB TRUE 0.771 145.000 0.110 1.000 N NA
 7688789 7688790 BAA_4445 BAA_4446 splB   FALSE 0.405 79.000 0.027 NA   NA
 7688793 7688794 BAA_4449 BAA_4450     FALSE 0.122 241.000 0.000 NA N NA
 7688794 7688795 BAA_4450 BAA_4451     TRUE 0.955 103.000 0.258 0.040 Y NA
 7688795 7688796 BAA_4451 BAA_4452   sugE1 TRUE 0.735 72.000 0.258 1.000 N NA
 7688796 7688797 BAA_4452 BAA_4453 sugE1 sugE2 TRUE 0.988 2.000 0.727 0.044 Y NA
 7688797 7688798 BAA_4453 BAA_4454 sugE2   TRUE 0.893 16.000 0.750 NA   NA
 7688799 7688800 BAA_4455 BAA_4456     FALSE 0.032 249.000 0.000 NA   NA
 7688800 7688801 BAA_4456 BAA_4457     TRUE 0.774 14.000 0.308 NA   NA
 7688801 7688802 BAA_4457 BAA_4458     TRUE 0.760 33.000 0.600 NA   NA
 7688802 7688803 BAA_4458 BAA_4459     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7688803 7688804 BAA_4459 BAA_4460     FALSE 0.419 102.000 0.000 NA   NA
 7688804 7688805 BAA_4460 BAA_4461     FALSE 0.284 -19.000 0.000 NA   NA
 7688805 7688806 BAA_4461 BAA_4462     TRUE 0.927 4.000 0.292 1.000 N NA
 7688806 7688807 BAA_4462 BAA_4463     TRUE 0.854 117.000 0.778 NA   NA
 7688807 7688808 BAA_4463 BAA_4464     TRUE 0.754 71.000 0.889 NA   NA
 7688808 7688809 BAA_4464 BAA_4465   yqhK FALSE 0.018 293.000 0.000 NA   NA
 7688809 7688810 BAA_4465 BAA_4466 yqhK yqhJ TRUE 0.975 -3.000 0.316 0.000 Y NA
 7688810 7688811 BAA_4466 BAA_4467 yqhJ gcvT TRUE 0.970 21.000 0.092 0.001 Y NA
 7688812 7688813 BAA_4468 BAA_4469     FALSE 0.326 -13.000 0.000 NA   NA
 7688814 7688815 BAA_4470 BAA_4471     FALSE 0.542 98.000 0.250 NA   NA
 7688816 7688817 BAA_4472 BAA_4473     TRUE 0.659 130.000 0.312 NA   NA
 7688818 7688819 BAA_4474 BAA_4475   aroK FALSE 0.600 39.000 0.375 NA   NA
 7688821 7688822 BAA_4476 BAA_4478     FALSE 0.041 229.000 0.000 NA   NA
 7688822 7688823 BAA_4478 BAA_4479     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7688823 7688824 BAA_4479 BAA_4480     TRUE 0.634 90.000 0.417 NA   NA
 7688824 7688825 BAA_4480 BAA_4481   comGD FALSE 0.528 -7.000 0.109 NA   NA
 7688825 7688826 BAA_4481 BAA_4482 comGD comGC TRUE 0.723 -3.000 0.320 NA   NA
 7688826 7688827 BAA_4482 BAA_4483 comGC comGB TRUE 0.990 12.000 0.861 0.001 Y NA
 7688827 7688828 BAA_4483 BAA_4484 comGB comGA TRUE 0.964 -7.000 0.639 1.000 Y NA
 7688829 7688830 BAA_4485 BAA_4486     TRUE 0.738 126.000 0.432 NA   NA
 7688830 7688831 BAA_4486 BAA_4487     FALSE 0.570 108.000 0.045 NA   NA
 7688832 7688833 BAA_4488 BAA_4489     TRUE 0.770 88.000 0.750 NA   NA
 7688835 7688836 BAA_4491 BAA_4492     FALSE 0.441 80.000 0.175 NA   NA
 7688836 7688837 BAA_4492 BAA_4493     FALSE 0.498 95.000 0.175 NA   NA
 7688837 7688838 BAA_4493 BAA_4494   murG2 FALSE 0.459 96.000 0.010 NA   NA
 7688838 7688839 BAA_4494 BAA_4495 murG2 metH TRUE 0.873 19.000 0.013 1.000 N NA
 7688839 7688840 BAA_4495 BAA_4496 metH   TRUE 0.982 5.000 0.045 0.000 Y NA
 7688841 7688842 BAA_4499 BAA_4500 metI   TRUE 0.981 -3.000 0.600 0.004 Y NA
 7688842 7688843 BAA_4500 BAA_4501     FALSE 0.463 129.000 0.000 NA   NA
 7688843 7688844 BAA_4501 BAA_4502     FALSE 0.006 482.000 0.000 NA   NA
 7688845 7688846 BAA_4503 BAA_4504     TRUE 0.715 10.000 0.021 NA   NA
 7688848 7688849 BAA_4506 BAA_4507 glcK   TRUE 0.804 20.000 0.496 NA   NA
 7688849 7688850 BAA_4507 BAA_4508     FALSE 0.512 104.000 0.010 NA   NA
 7688850 7688851 BAA_4508 BAA_4509   rpmG_1 TRUE 0.825 105.000 0.045 1.000 N NA
 7688851 7688852 BAA_4509 BAA_4510 rpmG_1   TRUE 0.702 70.000 0.009 1.000 N NA
 7688852 7688853 BAA_4510 BAA_4511     FALSE 0.032 376.000 0.000 NA N NA
 7688853 7688854 BAA_4511 BAA_4512   pstB TRUE 0.872 156.000 0.118 NA Y NA
 7688854 7688855 BAA_4512 BAA_4513 pstB pstA TRUE 0.959 29.000 0.125 0.001 Y NA
 7688855 7688856 BAA_4513 BAA_4514 pstA pstC TRUE 0.986 2.000 0.485 0.001 Y NA
 7688856 7688857 BAA_4514 BAA_4515 pstC phoX TRUE 0.947 28.000 0.077 1.000 Y NA
 7688857 7688858 BAA_4515 BAA_4516 phoX   FALSE 0.057 332.000 0.000 1.000 N NA
 7688858 7688859 BAA_4516 BAA_4517     FALSE 0.602 110.000 0.157 NA   NA
 7688859 7688860 BAA_4517 BAA_4518   sodA1 FALSE 0.604 116.000 0.157 NA   NA
 7688860 7688861 BAA_4518 BAA_4519 sodA1   FALSE 0.048 218.000 0.000 NA   NA
 7688862 7688863 BAA_4520 BAA_4521     FALSE 0.408 72.000 0.195 NA   NA
 7688863 7688864 BAA_4521 BAA_4522   ispG FALSE 0.331 156.000 0.022 NA   NA
 7688865 7688866 BAA_4523 BAA_4524     TRUE 0.979 14.000 0.480 1.000 Y NA
 7688866 7688867 BAA_4524 BAA_4525     TRUE 0.980 0.000 0.389 0.068 Y NA
 7688867 7688868 BAA_4525 BAA_4526     FALSE 0.101 242.000 0.440 NA   NA
 7688870 7688871 BAA_4528 BAA_4529 nfo   FALSE 0.476 231.000 0.104 1.000 Y NA
 7688871 7688872 BAA_4529 BAA_4530     FALSE 0.012 332.000 0.000 NA   NA
 7688873 7688874 BAA_4531 BAA_4532   ispH FALSE 0.186 167.000 0.000 NA   NA
 7688875 7688876 BAA_4533 BAA_4534     TRUE 0.646 -3.000 0.138 NA   NA
 7688876 7688877 BAA_4534 BAA_4535   cccA FALSE 0.264 166.000 0.057 NA   NA
 7688877 7688878 BAA_4535 BAA_4536 cccA sigA FALSE 0.016 386.000 0.009 1.000   NA
 7688878 7688879 BAA_4536 BAA_4537 sigA dnaG TRUE 0.718 60.000 0.209 1.000 N NA
 7688879 7688880 BAA_4537 BAA_4538 dnaG   FALSE 0.012 331.000 0.000 NA   NA
 7688880 7688881 BAA_4538 BAA_4539     FALSE 0.102 189.000 0.000 NA   NA
 7688881 7688882 BAA_4539 BAA_4540     FALSE 0.404 48.000 0.050 NA   NA
 7688882 7688883 BAA_4540 BAA_4541     TRUE 0.783 30.000 0.621 NA   NA
 7688883 7688884 BAA_4541 BAA_4542   recO TRUE 0.651 108.000 0.013 1.000   NA
 7688884 7688885 BAA_4542 BAA_4543 recO   FALSE 0.486 34.000 0.020 NA   NA
 7688885 7688886 BAA_4543 BAA_4544   era FALSE 0.206 177.000 0.040 NA   NA
 7688886 7688887 BAA_4544 BAA_4545 era cdd2 FALSE 0.621 -7.000 0.098 1.000   NA
 7688887 7688888 BAA_4545 BAA_4546 cdd2 dgkA TRUE 0.804 100.000 0.179 1.000 N NA
 7688888 7688889 BAA_4546 BAA_4547 dgkA   TRUE 0.643 -3.000 0.123 NA   NA
 7688889 7688890 BAA_4547 BAA_4548     TRUE 0.644 -3.000 0.182 NA   NA
 7688890 7688891 BAA_4548 BAA_4549     FALSE 0.187 194.000 0.172 1.000   NA
 7688891 7688892 BAA_4549 BAA_4550     TRUE 0.743 4.000 0.114 NA   NA
 7688892 7688893 BAA_4550 BAA_4551   yqfC FALSE 0.547 177.000 0.851 NA   NA
 7688893 7688894 BAA_4551 BAA_4552 yqfC   FALSE 0.568 109.000 0.029 NA   NA
 7688894 7688895 BAA_4552 BAA_4553   rpsU TRUE 0.839 16.000 0.150 0.013   NA
 7688897 7688898 BAA_4554 BAA_4555     TRUE 0.749 7.000 0.163 NA   NA
 7688898 7688899 BAA_4555 BAA_4556   prmA FALSE 0.479 146.000 0.227 NA   NA
 7688899 7688900 BAA_4556 BAA_4557 prmA dnaJ TRUE 0.826 29.000 0.133 1.000 N NA
 7688900 7688901 BAA_4557 BAA_4558 dnaJ dnaK TRUE 0.671 205.000 0.196 0.001 Y NA
 7688901 7688902 BAA_4558 BAA_4559 dnaK grpE TRUE 0.961 27.000 0.224 0.003 Y NA
 7688902 7688903 BAA_4559 BAA_4560 grpE hrcA TRUE 0.866 115.000 0.286 1.000 N NA
 7688903 7688904 BAA_4560 BAA_4561 hrcA hemN TRUE 0.825 134.000 0.082 1.000 N NA
 7688904 7688905 BAA_4561 BAA_4562 hemN   TRUE 0.667 56.000 0.084 NA N NA
 7688905 7688906 BAA_4562 BAA_4563   lepA TRUE 0.786 132.000 0.007 NA N NA
 7688906 7688907 BAA_4563 BAA_4564 lepA   FALSE 0.075 211.000 0.008 NA   NA
 7688907 7688908 BAA_4564 BAA_4565   gpr TRUE 0.747 0.000 0.265 NA   NA
 7688914 7688915 BAA_4571 BAA_4572 comEB comEA TRUE 0.712 63.000 0.095 1.000 N NA
 7688917 7688918 BAA_4574 BAA_4575     TRUE 0.635 -3.000 0.085 NA   NA
 7688918 7688919 BAA_4575 BAA_4576     TRUE 0.645 -3.000 0.149 NA   NA
 7688919 7688920 BAA_4576 BAA_4577   nadD TRUE 0.927 -10.000 0.199 1.000 Y NA
 7688920 7688921 BAA_4577 BAA_4578 nadD   TRUE 0.801 132.000 0.150 NA N NA
 7688921 7688922 BAA_4578 BAA_4579   aroE TRUE 0.898 5.000 0.089 NA N NA
 7688922 7688923 BAA_4579 BAA_4580 aroE   TRUE 0.824 16.000 0.336 1.000   NA
 7688923 7688924 BAA_4580 BAA_4581     TRUE 0.882 4.000 0.555 NA   NA
 7688926 7688927 BAA_4583 BAA_4584 psd sigK FALSE 0.082 292.000 0.000 1.000 N NA
 7688928 7688929 BAA_4585 BAA_4586     FALSE 0.102 189.000 0.000 NA   NA
 7688930 7688931 BAA_4587 BAA_4588   rpmG_2 FALSE 0.363 71.000 0.007 NA   NA
 7688931 7688932 BAA_4588 BAA_4589 rpmG_2   TRUE 0.758 145.000 0.006 1.000 N NA
 7688933 7688934 BAA_4590 BAA_4591     FALSE 0.164 173.000 0.000 NA   NA
 7688935 7688936 BAA_4592 BAA_4593     FALSE 0.475 55.000 0.292 NA   NA
 7688936 7688937 BAA_4593 BAA_4594     FALSE 0.579 108.000 0.083 NA   NA
 7688938 7688939 BAA_4595 BAA_4596     TRUE 0.877 16.000 0.667 NA   NA
 7688940 7688941 BAA_4597 BAA_4598     FALSE 0.025 265.000 0.000 NA   NA
 7688941 7688942 BAA_4598 BAA_4599     TRUE 0.776 19.000 0.400 NA   NA
 7688943 7688944 BAA_4600 BAA_4601     TRUE 0.716 71.000 0.750 NA   NA
 7688946 7688947 BAA_4603 BAA_4604 vpR   TRUE 0.707 125.000 0.375 NA   NA
 7688947 7688948 BAA_4604 BAA_4605     FALSE 0.006 470.000 0.000 NA   NA
 7688948 7688949 BAA_4605 BAA_4606     TRUE 0.696 -19.000 0.044 1.000 N NA
 7688950 7688951 BAA_4607 BAA_4608     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7688951 7688952 BAA_4608 BAA_4609     FALSE 0.515 22.000 0.000 NA   NA
 7688954 7688955 BAA_4611 BAA_4612     TRUE 0.842 112.000 0.438 0.051   NA
 7688955 7688956 BAA_4612 BAA_4613     FALSE 0.588 57.000 0.081 0.051   NA
 7688956 7688957 BAA_4613 BAA_4614     FALSE 0.015 306.000 0.000 NA   NA
 7688957 7688958 BAA_4614 BAA_4615     FALSE 0.400 -33.000 0.300 NA   NA
 7688958 7688959 BAA_4615 BAA_4616     TRUE 0.928 -13.000 0.360 1.000 Y NA
 7688959 7688960 BAA_4616 BAA_4617     TRUE 0.989 6.000 0.889 1.000 Y NA
 7688960 7688961 BAA_4617 BAA_4618     FALSE 0.358 157.000 0.222 NA   NA
 7688961 7688962 BAA_4618 BAA_4619     TRUE 0.733 127.000 0.429 NA   NA
 7688962 7688963 BAA_4619 BAA_4620     FALSE 0.119 260.000 0.000 1.000 N NA
 7688963 7688964 BAA_4620 BAA_4621   cysM TRUE 0.989 4.000 0.690 0.012 Y NA
 7688964 7688965 BAA_4621 BAA_4622 cysM   TRUE 0.750 83.000 0.048 1.000 N NA
 7688965 7688966 BAA_4622 BAA_4623     TRUE 0.896 15.000 0.057 1.000 N NA
 7688968 7688969 BAA_4625 BAA_4626     FALSE 0.600 117.000 0.119 NA   NA
 7688969 7688970 BAA_4626 BAA_4627   greA TRUE 0.780 93.000 0.070 1.000 N NA
 7688970 7688971 BAA_4627 BAA_4628 greA udk FALSE 0.110 279.000 0.095 1.000 N NA
 7688971 7688972 BAA_4628 BAA_4629 udk   TRUE 0.884 18.000 0.100 1.000 N NA
 7688972 7688973 BAA_4629 BAA_4630     TRUE 0.973 19.000 0.156 0.002 Y NA
 7688973 7688974 BAA_4630 BAA_4631     TRUE 0.813 8.000 0.142 1.000   NA
 7688974 7688975 BAA_4631 BAA_4632     FALSE 0.105 203.000 0.154 NA   NA
 7688975 7688976 BAA_4632 BAA_4633     FALSE 0.076 218.000 0.151 NA   NA
 7688976 7688977 BAA_4633 BAA_4634     TRUE 0.886 13.000 0.651 NA   NA
 7688977 7688978 BAA_4634 BAA_4635     TRUE 0.878 4.000 0.537 NA   NA
 7688978 7688979 BAA_4635 BAA_4636   alaS FALSE 0.418 77.000 0.110 NA   NA
 7688983 7688984 BAA_4640 BAA_4641     TRUE 0.664 19.000 0.125 NA   NA
 7688984 7688985 BAA_4641 BAA_4642     FALSE 0.581 128.000 0.107 NA   NA
 7688985 7688986 BAA_4642 BAA_4643     TRUE 0.641 96.000 0.281 1.000   NA
 7688986 7688987 BAA_4643 BAA_4644   trmU TRUE 0.676 111.000 0.038 1.000   NA
 7688987 7688988 BAA_4644 BAA_4645 trmU   TRUE 0.900 14.000 0.072 1.000 N NA
 7688988 7688989 BAA_4645 BAA_4646     TRUE 0.754 36.000 0.201 NA N NA
 7688990 7688991 BAA_4647 BAA_4648     TRUE 0.674 38.000 0.106 0.028   NA
 7688992 7688993 BAA_4649 BAA_4650   aspS2 FALSE 0.054 350.000 0.008 1.000 N NA
 7688993 7688994 BAA_4650 BAA_4651 aspS2 hisS2 TRUE 0.978 13.000 0.161 0.026 Y NA
 7688994 7688995 BAA_4651 BAA_4652 hisS2   FALSE 0.083 196.000 0.000 NA   NA
 7688995 7688996 BAA_4652 BAA_4653   dtd FALSE 0.144 186.000 0.004 NA   NA
 7688996 7688997 BAA_4653 BAA_4654 dtd relA TRUE 0.885 18.000 0.177 1.000 N NA
 7688997 7688998 BAA_4654 BAA_4655 relA apt FALSE 0.262 211.000 0.068 1.000 N NA
 7688998 7688999 BAA_4655 BAA_4656 apt recJ TRUE 0.731 48.000 0.128 1.000 N NA
 7688999 7689000 BAA_4656 BAA_4657 recJ   TRUE 0.802 102.000 0.015 1.000 N NA
 7689000 7689001 BAA_4657 BAA_4658   secDF TRUE 0.716 151.000 0.060 1.000 N NA
 7689001 7689002 BAA_4658 BAA_4659 secDF   FALSE 0.036 271.000 0.185 NA   NA
 7689006 7689007 BAA_4663 BAA_4664 yajC tgt TRUE 0.829 28.000 0.325 NA N NA
 7689007 7689008 BAA_4664 BAA_4665 tgt queA TRUE 0.983 13.000 0.360 0.000 Y NA
 7689008 7689009 BAA_4665 BAA_4666 queA   TRUE 0.633 20.000 0.039 NA   NA
 7689009 7689010 BAA_4666 BAA_4667   ruvB FALSE 0.623 -3.000 0.040 NA   NA
 7689010 7689011 BAA_4667 BAA_4668 ruvB ruvA TRUE 0.988 6.000 0.549 0.001 Y NA
 7689013 7689014 BAA_4670 BAA_4671     FALSE 0.482 121.000 0.000 NA   NA
 7689014 7689015 BAA_4671 BAA_4672     TRUE 0.638 3.000 0.000 NA   NA
 7689015 7689016 BAA_4672 BAA_4673     FALSE 0.296 67.000 0.000 NA   NA
 7689018 7689019 BAA_4675 BAA_4676   safA FALSE 0.275 179.000 0.320 NA   NA
 7689019 7689020 BAA_4676 BAA_4677 safA nadA FALSE 0.014 375.000 0.000 1.000   NA
 7689020 7689021 BAA_4677 BAA_4678 nadA nadC TRUE 0.956 31.000 0.198 0.002 Y NA
 7689021 7689022 BAA_4678 BAA_4679 nadC nadB TRUE 0.970 20.000 0.014 0.002 Y NA
 7689023 7689024 BAA_4680 BAA_4681     TRUE 0.818 3.000 0.243 1.000   NA
 7689024 7689025 BAA_4681 BAA_4682     FALSE 0.534 82.000 0.057 1.000   NA
 7689026 7689027 BAA_4683 BAA_4684 pheA   FALSE 0.577 97.000 0.025 1.000   NA
 7689027 7689028 BAA_4684 BAA_4685     TRUE 0.826 50.000 0.889 0.064   NA
 7689028 7689029 BAA_4685 BAA_4686     TRUE 0.743 -25.000 0.889 1.000   NA
 7689029 7689030 BAA_4686 BAA_4687     FALSE 0.379 94.000 0.000 NA   NA
 7689030 7689031 BAA_4687 BAA_4688     FALSE 0.346 84.000 0.000 NA   NA
 7689031 7689032 BAA_4688 BAA_4689     TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7689032 7689033 BAA_4689 BAA_4690   obG FALSE 0.586 140.000 0.008 1.000   NA
 7689033 7689034 BAA_4690 BAA_4691 obG   TRUE 0.680 0.000 0.021 NA   NA
 7689034 7689035 BAA_4691 BAA_4692   rpmA FALSE 0.365 64.000 0.013 NA   NA
 7689035 7689036 BAA_4692 BAA_4693 rpmA   TRUE 0.973 4.000 0.203 NA Y NA
 7689036 7689037 BAA_4693 BAA_4694   rplU TRUE 0.970 12.000 0.036 NA Y NA
 7689037 7689038 BAA_4694 BAA_4696 rplU   TRUE 0.840 166.000 0.076 1.000 Y NA
 7689038 7689039 BAA_4696 BAA_4697   spoIVFB FALSE 0.510 68.000 0.229 1.000   NA
 7689039 7689040 BAA_4697 BAA_4698 spoIVFB spoIVFA FALSE 0.543 -7.000 0.219 NA   NA
 7689040 7689041 BAA_4698 BAA_4699 spoIVFA minD TRUE 0.790 134.000 0.060 NA N NA
 7689041 7689042 BAA_4699 BAA_4700 minD minC TRUE 0.979 3.000 0.368 1.000 Y NA
 7689042 7689043 BAA_4700 BAA_4701 minC mreD TRUE 0.789 36.000 0.106 1.000 N NA
 7689043 7689044 BAA_4701 BAA_4702 mreD mreC TRUE 0.985 15.000 0.550 0.001 Y NA
 7689044 7689045 BAA_4702 BAA_4703 mreC mreB TRUE 0.867 42.000 0.689 1.000 N NA
 7689045 7689046 BAA_4703 BAA_4704 mreB radC TRUE 0.631 159.000 0.011 1.000 N NA
 7689046 7689047 BAA_4704 BAA_4705 radC maf TRUE 0.674 47.000 0.023 NA N NA
 7689047 7689048 BAA_4705 BAA_4706 maf   FALSE 0.063 221.000 0.020 NA   NA
 7689048 7689049 BAA_4706 BAA_4707   folC FALSE 0.276 166.000 0.159 NA   NA
 7689049 7689050 BAA_4707 BAA_4708 folC valS TRUE 0.818 94.000 0.041 0.068 N NA
 7689050 7689051 BAA_4708 BAA_4709 valS ysxE FALSE 0.007 396.000 0.000 NA   NA
 7689051 7689052 BAA_4709 BAA_4710 ysxE spoVID FALSE 0.605 63.000 0.500 NA   NA
 7689052 7689053 BAA_4710 BAA_4711 spoVID hemL2 TRUE 0.733 110.000 0.288 1.000   NA
 7689053 7689054 BAA_4711 BAA_4712 hemL2 hemB TRUE 0.978 0.000 0.126 0.001 Y NA
 7689054 7689055 BAA_4712 BAA_4713 hemB hemD TRUE 0.970 21.000 0.061 0.001 Y NA
 7689055 7689056 BAA_4713 BAA_4714 hemD hemC TRUE 0.980 2.000 0.028 0.001 Y NA
 7689056 7689057 BAA_4714 BAA_4715 hemC   TRUE 0.890 16.000 0.040 1.000 N NA
 7689057 7689058 BAA_4715 BAA_4716   hemA TRUE 0.936 18.000 0.613 1.000 N NA
 7689059 7689060 BAA_4717 BAA_4718     TRUE 0.935 3.000 0.400 1.000 N NA
 7689061 7689062 BAA_4719 BAA_4720   lon TRUE 0.717 -3.000 0.055 1.000   NA
 7689062 7689063 BAA_4720 BAA_4721 lon lonB TRUE 0.838 184.000 0.435 0.001 Y NA
 7689063 7689064 BAA_4721 BAA_4722 lonB clpX TRUE 0.957 104.000 0.042 0.001 Y NA
 7689064 7689065 BAA_4722 BAA_4723 clpX tig FALSE 0.419 265.000 0.033 0.002 Y NA
 7689065 7689066 BAA_4723 BAA_4724 tig   FALSE 0.030 311.000 0.011 1.000   NA
 7689066 7689067 BAA_4724 BAA_4725     FALSE 0.120 198.000 0.125 NA   NA
 7689069 7689070 BAA_4727 BAA_4728     FALSE 0.007 407.000 0.000 NA   NA
 7689070 7689071 BAA_4728 BAA_4729     FALSE 0.619 1.000 0.000 NA   NA
 7689071 7689072 BAA_4729 BAA_4730     FALSE 0.484 110.000 0.000 NA   NA
 7689072 7689073 BAA_4730 BAA_4731     TRUE 0.702 14.000 0.085 NA   NA
 7689073 7689074 BAA_4731 BAA_4732   rph TRUE 0.918 12.000 0.262 1.000 N NA
 7689074 7689075 BAA_4732 BAA_4733 rph gerM FALSE 0.559 129.000 0.040 NA   NA
 7689075 7689076 BAA_4733 BAA_4734 gerM racE2 FALSE 0.545 131.000 0.026 NA   NA
 7689076 7689077 BAA_4734 BAA_4735 racE2   FALSE 0.230 211.000 0.000 1.000 N NA
 7689078 7689079 BAA_4736 BAA_4737     FALSE 0.076 199.000 0.000 NA   NA
 7689080 7689081 BAA_4738 BAA_4739     FALSE 0.309 161.000 0.154 NA   NA
 7689081 7689082 BAA_4739 BAA_4740     FALSE 0.375 155.000 0.154 NA   NA
 7689082 7689083 BAA_4740 BAA_4741   gerE FALSE 0.225 174.000 0.075 NA   NA
 7689083 7689084 BAA_4741 BAA_4742 gerE   FALSE 0.587 166.000 0.175 1.000 N NA
 7689084 7689085 BAA_4742 BAA_4743     TRUE 0.850 31.000 0.065 0.063 N NA
 7689085 7689086 BAA_4743 BAA_4744     TRUE 0.781 94.000 0.065 1.000 N NA
 7689086 7689087 BAA_4744 BAA_4745     TRUE 0.974 14.000 0.286 1.000 Y NA
 7689087 7689088 BAA_4745 BAA_4746     TRUE 0.912 110.000 0.600 1.000 N NA
 7689089 7689090 BAA_4747 BAA_4748     TRUE 0.986 16.000 0.765 0.022 Y NA
 7689090 7689091 BAA_4748 BAA_4749     TRUE 0.972 15.000 0.245 1.000 Y NA
 7689091 7689092 BAA_4749 BAA_4750     TRUE 0.982 2.000 0.265 0.001 Y NA
 7689092 7689093 BAA_4750 BAA_4751     FALSE 0.297 70.000 0.000 NA   NA
 7689093 7689094 BAA_4751 BAA_4752     FALSE 0.032 248.000 0.000 NA   NA
 7689094 7689095 BAA_4752 BAA_4753     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7689095 7689096 BAA_4753 BAA_4754     TRUE 0.638 3.000 0.000 NA   NA
 7689096 7689097 BAA_4754 BAA_4755     FALSE 0.040 230.000 0.000 NA   NA
 7689099 7689100 BAA_4757 BAA_4758     FALSE 0.461 144.000 0.035 NA   NA
 7689101 7689102 BAA_4759 BAA_4760     TRUE 0.910 119.000 0.700 NA N NA
 7689102 7689103 BAA_4760 BAA_4761     TRUE 0.927 3.000 0.889 NA   NA
 7689105 7689106 BAA_4763 BAA_4764     FALSE 0.341 -12.000 0.000 NA   NA
 7689106 7689107 BAA_4764 BAA_4765     FALSE 0.361 -10.000 0.000 NA   NA
 7689109 7689110 BAA_4767 BAA_4768   sdhB FALSE 0.525 102.000 0.072 NA   NA
 7689110 7689111 BAA_4768 BAA_4769 sdhB sdhA TRUE 0.956 -7.000 0.231 0.001 Y NA
 7689111 7689112 BAA_4769 BAA_4770 sdhA sdhC TRUE 0.978 14.000 0.184 0.001 Y NA
 7689114 7689115 BAA_4772 BAA_4773 uvrC trx TRUE 0.723 149.000 0.023 1.000 N NA
 7689115 7689116 BAA_4773 BAA_4774 trx etfA FALSE 0.619 212.000 0.055 0.005 Y NA
 7689116 7689117 BAA_4774 BAA_4775 etfA etfB TRUE 0.954 37.000 0.373 0.005 Y NA
 7689117 7689118 BAA_4775 BAA_4776 etfB   TRUE 0.762 79.000 0.275 1.000 N NA
 7689118 7689119 BAA_4776 BAA_4777     TRUE 0.922 12.000 0.294 1.000 N NA
 7689119 7689120 BAA_4777 BAA_4778   fadD TRUE 0.874 106.000 0.406 1.000 N NA
 7689120 7689121 BAA_4778 BAA_4779 fadD   TRUE 0.674 127.000 0.107 1.000   NA
 7689121 7689122 BAA_4779 BAA_4780     FALSE 0.483 119.000 0.000 NA   NA
 7689123 7689124 BAA_4781 BAA_4782     TRUE 0.647 8.000 0.000 NA   NA
 7689124 7689125 BAA_4782 BAA_4783     FALSE 0.594 113.000 0.069 NA   NA
 7689125 7689126 BAA_4783 BAA_4784     FALSE 0.548 137.000 0.190 NA   NA
 7689127 7689128 BAA_4785 BAA_4786     TRUE 0.713 27.000 0.417 NA   NA
 7689128 7689129 BAA_4786 BAA_4787     TRUE 0.634 38.000 0.417 NA   NA
 7689129 7689130 BAA_4787 BAA_4788     FALSE 0.155 189.000 0.200 NA   NA
 7689130 7689131 BAA_4788 BAA_4789     TRUE 0.932 126.000 0.680 0.067 N NA
 7689131 7689132 BAA_4789 BAA_4790     TRUE 0.989 2.000 0.750 0.013 Y NA
 7689133 7689134 BAA_4791 BAA_4792     FALSE 0.619 1.000 0.000 NA   NA
 7689135 7689136 BAA_4793 BAA_4794     FALSE 0.553 90.000 0.020 1.000   NA
 7689138 7689139 BAA_4796 BAA_4797 srtB   TRUE 0.657 32.000 0.373 NA   NA
 7689139 7689140 BAA_4797 BAA_4798     TRUE 0.955 -10.000 0.657 1.000 Y NA
 7689140 7689141 BAA_4798 BAA_4799     TRUE 0.975 28.000 0.877 1.000 Y NA
 7689141 7689142 BAA_4799 BAA_4800     TRUE 0.735 70.000 0.382 NA N NA
 7689142 7689143 BAA_4800 BAA_4801     FALSE 0.474 25.000 0.000 NA   NA
 7689143 7689144 BAA_4801 BAA_4802     FALSE 0.486 24.000 0.000 NA   NA
 7689144 7689145 BAA_4802 BAA_4803   brnQ6 FALSE 0.006 487.000 0.000 NA   NA
 7689145 7689146 BAA_4803 BAA_4804 brnQ6   FALSE 0.029 477.000 0.000 1.000 N NA
 7689146 7689147 BAA_4804 BAA_4805     FALSE 0.338 196.000 0.015 1.000 N NA
 7689147 7689148 BAA_4805 BAA_4806     TRUE 0.963 20.000 0.114 1.000 Y NA
 7689148 7689149 BAA_4806 BAA_4807     FALSE 0.493 53.000 0.066 1.000   NA
 7689149 7689150 BAA_4807 BAA_4808     TRUE 0.724 2.000 0.091 NA   NA
 7689151 7689152 BAA_4809 BAA_4810 rnhC   FALSE 0.008 383.000 0.000 NA   NA
 7689153 7689154 BAA_4811 BAA_4812   asnS FALSE 0.379 94.000 0.000 NA   NA
 7689154 7689155 BAA_4812 BAA_4813 asnS pheT FALSE 0.118 499.000 0.000 0.067 Y NA
 7689155 7689156 BAA_4813 BAA_4814 pheT pheS TRUE 0.983 19.000 0.574 0.000 Y NA
 7689156 7689157 BAA_4814 BAA_4815 pheS   FALSE 0.223 321.000 0.006 1.000 Y NA
 7689158 7689159 BAA_4816 BAA_4817 sspI   FALSE 0.297 162.000 0.175 NA   NA
 7689159 7689160 BAA_4817 BAA_4818     FALSE 0.526 140.000 0.147 NA   NA
 7689160 7689161 BAA_4818 BAA_4819     FALSE 0.354 40.000 0.000 NA   NA
 7689161 7689162 BAA_4819 BAA_4820     FALSE 0.235 159.000 0.000 NA   NA
 7689162 7689163 BAA_4820 BAA_4821     TRUE 0.767 38.000 0.714 NA   NA
 7689164 7689165 BAA_4822 BAA_4823     TRUE 0.869 13.000 0.441 1.000   NA
 7689167 7689168 BAA_4825 BAA_4826     FALSE 0.585 70.000 0.463 NA   NA
 7689168 7689169 BAA_4826 BAA_4827   rplT FALSE 0.006 471.000 0.000 NA   NA
 7689169 7689170 BAA_4827 BAA_4828 rplT rpmI TRUE 0.972 38.000 0.928 0.008 Y NA
 7689170 7689171 BAA_4828 BAA_4829 rpmI infC TRUE 0.975 22.000 0.652 1.000 Y NA
 7689171 7689172 BAA_4829 BAA_4831 infC thrS2 FALSE 0.227 310.000 0.000 1.000 Y NA
 7689172 7689173 BAA_4831 BAA_4832 thrS2   FALSE 0.015 307.000 0.000 NA   NA
 7689173 7689174 BAA_4832 BAA_4833   dnaI FALSE 0.030 281.000 0.048 NA   NA
 7689174 7689175 BAA_4833 BAA_4834 dnaI dnaB_1 TRUE 0.964 34.000 0.817 NA Y NA
 7689175 7689176 BAA_4834 BAA_4835 dnaB_1 nrdR TRUE 0.808 128.000 0.109 NA N NA
 7689176 7689177 BAA_4835 BAA_4836 nrdR speD1 FALSE 0.079 286.000 0.003 NA N NA
 7689177 7689178 BAA_4836 BAA_4837 speD1   FALSE 0.361 155.000 0.060 NA   NA
 7689178 7689179 BAA_4837 BAA_4838   gap1 FALSE 0.463 86.000 0.111 NA   NA
 7689179 7689180 BAA_4838 BAA_4839 gap1 coaE TRUE 0.841 110.000 0.020 1.000 N NA
 7689180 7689181 BAA_4839 BAA_4840 coaE   FALSE 0.386 52.000 0.038 NA   NA
 7689181 7689182 BAA_4840 BAA_4841   mutM FALSE 0.391 73.000 0.050 NA   NA
 7689182 7689183 BAA_4841 BAA_4842 mutM polA TRUE 0.973 13.000 0.101 1.000 Y NA
 7689183 7689184 BAA_4842 BAA_4843 polA phoR FALSE 0.096 287.000 0.006 1.000 N NA
 7689184 7689185 BAA_4843 BAA_4844 phoR phoP TRUE 0.951 -7.000 0.159 0.054 Y NA
 7689185 7689186 BAA_4844 BAA_4845 phoP   FALSE 0.325 148.000 0.000 NA   NA
 7689188 7689189 BAA_4847 BAA_4848   mdh FALSE 0.229 217.000 0.022 1.000 N NA
 7689189 7689190 BAA_4848 BAA_4849 mdh icd TRUE 0.963 20.000 0.115 1.000 Y NA
 7689190 7689191 BAA_4849 BAA_4850 icd citZ TRUE 0.862 161.000 0.140 1.000 Y NA
 7689191 7689192 BAA_4850 BAA_4851 citZ   FALSE 0.011 388.000 0.039 NA   NA
 7689194 7689195 BAA_4853 BAA_4854   pyk FALSE 0.155 200.000 0.082 1.000   NA
 7689195 7689196 BAA_4854 BAA_4855 pyk pfkA TRUE 0.929 54.000 0.261 0.003 Y NA
 7689196 7689197 BAA_4855 BAA_4856 pfkA accA TRUE 0.834 129.000 0.047 1.000 N NA
 7689197 7689198 BAA_4856 BAA_4857 accA accD TRUE 0.940 -12.000 0.234 0.001 Y NA
 7689198 7689199 BAA_4857 BAA_4858 accD   FALSE 0.418 186.000 0.032 1.000 N NA
 7689199 7689200 BAA_4858 BAA_4859     TRUE 0.936 15.000 0.514 1.000 N NA
 7689200 7689201 BAA_4859 BAA_4860   dnaE TRUE 0.823 104.000 0.127 1.000 N NA
 7689202 7689203 BAA_4862 BAA_4863     TRUE 0.795 -3.000 0.481 NA   NA
 7689204 7689205 BAA_4864 BAA_4865     FALSE 0.468 93.000 0.038 NA   NA
 7689207 7689208 BAA_4867 BAA_4868     FALSE 0.133 181.000 0.000 NA   NA
 7689208 7689209 BAA_4868 BAA_4869     FALSE 0.135 194.000 0.120 NA   NA
 7689213 7689214 BAA_4873 BAA_4874     TRUE 0.712 21.000 0.300 NA   NA
 7689216 7689217 BAA_4876 BAA_4877     FALSE 0.008 392.000 0.000 NA   NA
 7689217 7689218 BAA_4877 BAA_4878     FALSE 0.408 73.000 0.160 NA   NA
 7689218 7689219 BAA_4878 BAA_4879     TRUE 0.782 3.000 0.280 NA   NA
 7689219 7689220 BAA_4879 BAA_4880     TRUE 0.746 -3.000 0.368 NA   NA
 7689220 7689221 BAA_4880 BAA_4881     FALSE 0.519 45.000 0.316 NA   NA
 7689222 7689223 BAA_4882 BAA_4883     TRUE 0.835 -3.000 0.600 NA   NA
 7689224 7689225 BAA_4884 BAA_4885 ald2   FALSE 0.217 214.000 0.000 1.000 N NA
 7689229 7689230 BAA_4889 BAA_4890   argH2 FALSE 0.470 99.000 0.006 NA   NA
 7689230 7689231 BAA_4890 BAA_4891 argH2 argG TRUE 0.965 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 7689232 7689233 BAA_4892 BAA_4893     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7689237 7689238 BAA_4897 BAA_4898     FALSE 0.406 72.000 0.125 NA   NA
 7689239 7689240 BAA_4899 BAA_4900 ackA   FALSE 0.092 299.000 0.217 1.000 N NA
 7689240 7689241 BAA_4900 BAA_4901     FALSE 0.321 200.000 0.089 1.000 N NA
 7689241 7689242 BAA_4901 BAA_4902     FALSE 0.521 135.000 0.018 NA   NA
 7689242 7689243 BAA_4902 BAA_4903     TRUE 0.911 13.000 0.800 NA   NA
 7689245 7689246 BAA_4905 BAA_4906     FALSE 0.406 70.000 0.146 NA   NA
 7689246 7689247 BAA_4906 BAA_4907     FALSE 0.546 103.000 0.156 NA   NA
 7689247 7689248 BAA_4907 BAA_4908   sspB FALSE 0.047 278.000 0.111 1.000   NA
 7689248 7689249 BAA_4908 BAA_4909 sspB thiI FALSE 0.515 81.000 0.018 1.000   NA
 7689249 7689250 BAA_4909 BAA_4910 thiI   TRUE 0.934 7.000 0.349 1.000 N NA
 7689250 7689251 BAA_4910 BAA_4911   ezrA FALSE 0.564 169.000 0.201 1.000 N NA
 7689255 7689256 BAA_4915 BAA_4916     FALSE 0.299 72.000 0.000 NA   NA
 7689262 7689263 BAA_4922 BAA_4923 tyrS1   FALSE 0.008 377.000 0.000 NA   NA
 7689263 7689264 BAA_4923 BAA_4924     FALSE 0.375 -19.000 0.059 NA   NA
 7689264 7689265 BAA_4924 BAA_4925     FALSE 0.375 -19.000 0.059 NA   NA
 7689265 7689266 BAA_4925 BAA_4926   acsA FALSE 0.021 278.000 0.000 NA   NA
 7689267 7689268 BAA_4927 BAA_4928 acuA acuB TRUE 0.818 18.000 0.143 0.050   NA
 7689268 7689269 BAA_4928 BAA_4929 acuB acuC TRUE 0.869 -3.000 0.075 1.000 N NA
 7689270 7689271 BAA_4930 BAA_4931     FALSE 0.080 216.000 0.150 NA   NA
 7689271 7689272 BAA_4931 BAA_4932     TRUE 0.986 2.000 0.725 1.000 Y NA
 7689273 7689274 BAA_4933 BAA_4934     FALSE 0.424 80.000 0.049 NA   NA
 7689274 7689275 BAA_4934 BAA_4935   mscL TRUE 0.643 129.000 0.012 1.000   NA
 7689277 7689278 BAA_4937 BAA_4938     TRUE 0.778 82.000 0.857 NA   NA
 7689278 7689279 BAA_4938 BAA_4939     TRUE 0.880 2.000 0.583 NA   NA
 7689280 7689281 BAA_4940 BAA_4941 ccpA   FALSE 0.005 529.000 0.000 NA   NA
 7689281 7689282 BAA_4941 BAA_4942     FALSE 0.590 118.000 0.069 NA   NA
 7689282 7689283 BAA_4942 BAA_4943     TRUE 0.700 0.000 0.079 NA   NA
 7689285 7689286 BAA_4945 BAA_4946     FALSE 0.186 195.000 0.333 NA   NA
 7689286 7689287 BAA_4946 BAA_4947     FALSE 0.482 92.000 0.097 NA   NA
 7689287 7689288 BAA_4947 BAA_4948   murC FALSE 0.325 197.000 0.005 1.000 N NA
 7689288 7689289 BAA_4948 BAA_4949 murC   FALSE 0.145 253.000 0.002 1.000 N NA
 7689289 7689290 BAA_4949 BAA_4950     TRUE 0.712 62.000 0.084 1.000 N NA
 7689290 7689291 BAA_4950 BAA_4951     FALSE 0.045 222.000 0.000 NA   NA
 7689291 7689292 BAA_4951 BAA_4952     FALSE 0.009 435.000 0.034 NA   NA
 7689292 7689293 BAA_4952 BAA_4953     TRUE 0.814 -3.000 0.511 NA   NA
 7689293 7689294 BAA_4953 BAA_4954     FALSE 0.606 59.000 0.500 NA   NA
 7689294 7689295 BAA_4954 BAA_4955     FALSE 0.445 84.000 0.062 NA   NA
 7689295 7689296 BAA_4955 BAA_4956     FALSE 0.052 242.000 0.084 NA   NA
 7689298 7689299 BAA_4958 BAA_4959   trmB FALSE 0.497 70.000 0.117 1.000   NA
 7689301 7689302 BAA_4961 BAA_4962     FALSE 0.164 230.000 0.078 NA N NA
 7689302 7689303 BAA_4962 BAA_4963     TRUE 0.812 138.000 0.086 1.000 N NA
 7689303 7689304 BAA_4963 BAA_4964     FALSE 0.436 104.000 0.000 NA   NA
 7689304 7689305 BAA_4964 BAA_4965     FALSE 0.342 42.000 0.000 NA   NA
 7689307 7689308 BAA_4967 BAA_4968     FALSE 0.543 42.000 0.082 1.000   NA
 7689309 7689310 BAA_4969 BAA_4970     FALSE 0.284 -19.000 0.000 NA   NA
 7689310 7689311 BAA_4970 BAA_4971     FALSE 0.208 -70.000 0.000 NA   NA
 7689312 7689313 BAA_4972 BAA_4973     TRUE 0.827 1.000 0.413 NA   NA
 7689315 7689316 BAA_4975 BAA_4976     TRUE 0.762 2.000 0.258 NA   NA
 7689318 7689319 BAA_4978 BAA_4979 gdH glcU TRUE 0.951 14.000 0.700 1.000 N NA
 7689319 7689320 BAA_4979 BAA_4980 glcU   TRUE 0.810 37.000 0.875 NA   NA
 7689320 7689321 BAA_4980 BAA_4981   moaD3 FALSE 0.456 94.000 0.014 NA   NA
 7689321 7689322 BAA_4981 BAA_4982 moaD3 moaE3 TRUE 0.986 3.000 0.501 0.003 Y NA
 7689322 7689323 BAA_4982 BAA_4983 moaE3 mobB TRUE 0.969 -3.000 0.040 0.003 Y NA
 7689323 7689324 BAA_4983 BAA_4984 mobB moeA3 TRUE 0.901 -30.000 0.200 0.003 Y NA
 7689326 7689327 BAA_4986 BAA_4987     FALSE 0.572 17.000 0.000 NA   NA
 7689327 7689328 BAA_4987 BAA_4988     FALSE 0.487 115.000 0.000 NA   NA
 7689328 7689329 BAA_4988 BAA_4989     FALSE 0.429 137.000 0.000 NA   NA
 7689329 7689330 BAA_4989 BAA_4990     FALSE 0.159 174.000 0.000 NA   NA
 7689330 7689331 BAA_4990 BAA_4991     FALSE 0.300 207.000 0.800 NA   NA
 7689331 7689332 BAA_4991 BAA_4992     FALSE 0.557 78.000 0.381 NA   NA
 7689334 7689335 BAA_4994 BAA_4995     FALSE 0.112 186.000 0.000 NA   NA
 7689336 7689337 BAA_4996 BAA_4997   gerHA FALSE 0.150 189.000 0.100 NA   NA
 7689337 7689338 BAA_4997 BAA_4998 gerHA gerHB TRUE 0.886 18.000 0.450 0.006   NA
 7689338 7689339 BAA_4998 BAA_4999 gerHB gerHC TRUE 0.782 -24.000 0.800 0.006   NA
 7689339 7689340 BAA_4999 BAA_5000 gerHC   TRUE 0.792 91.000 0.800 NA   NA
 7689340 7689341 BAA_5000 BAA_5001     FALSE 0.148 190.000 0.121 NA   NA
 7689344 7689345 BAA_5004 BAA_5005 leuS   FALSE 0.023 475.000 0.000 NA N NA
 7689345 7689346 BAA_5005 BAA_5006     FALSE 0.132 370.000 0.000 NA Y NA
 7689346 7689347 BAA_5006 BAA_5007     TRUE 0.989 4.000 0.875 1.000 Y NA
 7689347 7689348 BAA_5007 BAA_5008     TRUE 0.794 35.000 0.636 1.000   NA
 7689348 7689349 BAA_5008 BAA_5009     FALSE 0.017 350.000 0.000 1.000   NA
 7689349 7689350 BAA_5009 BAA_5010     TRUE 0.801 19.000 0.333 1.000   NA
 7689350 7689351 BAA_5010 BAA_5011     FALSE 0.011 339.000 0.000 NA   NA
 7689351 7689352 BAA_5011 BAA_5012     TRUE 0.644 137.000 0.333 NA   NA
 7689352 7689353 BAA_5012 BAA_5013     TRUE 0.859 16.000 0.583 NA   NA
 7689354 7689355 BAA_5014 BAA_5015     TRUE 0.811 -3.000 0.408 1.000   NA
 7689355 7689356 BAA_5015 BAA_5016     FALSE 0.155 198.000 0.031 1.000   NA
 7689356 7689357 BAA_5016 BAA_5017     TRUE 0.668 19.000 0.208 NA   NA
 7689357 7689358 BAA_5017 BAA_5018     FALSE 0.622 25.000 0.250 NA   NA
 7689358 7689359 BAA_5018 BAA_5019     FALSE 0.490 156.000 0.263 1.000   NA
 7689360 7689361 BAA_5020 BAA_5021     FALSE 0.392 62.000 0.080 NA   NA
 7689364 7689365 BAA_5024 BAA_5025     FALSE 0.545 145.000 0.019 1.000   NA
 7689365 7689366 BAA_5025 BAA_5026     TRUE 0.922 13.000 0.333 1.000 N NA
 7689367 7689368 BAA_5027 BAA_5028     TRUE 0.969 -3.000 0.056 0.003 Y NA
 7689369 7689370 BAA_5029 BAA_5030     TRUE 0.831 7.000 0.375 NA   NA
 7689372 7689373 BAA_5033 BAA_5034   pckA TRUE 0.703 3.000 0.005 NA   NA
 7689376 7689377 BAA_5037 BAA_5038     FALSE 0.016 299.000 0.000 NA   NA
 7689379 7689380 BAA_5040 BAA_5041     TRUE 0.978 -3.000 0.500 0.008 Y NA
 7689382 7689383 BAA_5043 BAA_5044     FALSE 0.265 -22.000 0.000 NA   NA
 7689383 7689384 BAA_5044 BAA_5045     FALSE 0.050 217.000 0.000 NA   NA
 7689384 7689385 BAA_5045 BAA_5046     TRUE 0.923 12.000 0.875 NA   NA
 7689386 7689387 BAA_5047 BAA_5048     TRUE 0.980 12.000 0.528 NA Y NA
 7689387 7689388 BAA_5048 BAA_5049     TRUE 0.971 -7.000 0.876 1.000 Y NA
 7689389 7689390 BAA_5050 BAA_5051     FALSE 0.043 225.000 0.000 NA   NA
 7689392 7689393 BAA_5053 BAA_5054   mutTA FALSE 0.600 112.000 0.101 NA   NA
 7689393 7689394 BAA_5054 BAA_5055 mutTA   FALSE 0.535 85.000 0.292 NA   NA
 7689395 7689396 BAA_5056 BAA_5057     FALSE 0.068 203.000 0.000 NA   NA
 7689400 7689401 BAA_5061 BAA_5062 cydA2 cydB2 TRUE 0.971 -10.000 0.939 0.023 Y NA
 7689402 7689403 BAA_5063 BAA_5064     TRUE 0.712 15.000 0.222 NA   NA
 7689403 7689404 BAA_5064 BAA_5065     FALSE 0.313 -37.000 0.200 NA   NA
 7689405 7689406 BAA_5066 BAA_5067     FALSE 0.182 193.000 0.300 NA   NA
 7689407 7689408 BAA_5068 BAA_5069     FALSE 0.557 98.000 0.263 NA   NA
 7689408 7689409 BAA_5069 BAA_5070     TRUE 0.785 13.000 0.316 NA   NA
 7689409 7689410 BAA_5070 BAA_5071     TRUE 0.696 22.000 0.294 NA   NA
 7689410 7689411 BAA_5071 BAA_5072     TRUE 0.736 81.000 0.706 NA   NA
 7689413 7689414 BAA_5074 BAA_5075   feoB TRUE 0.839 17.000 0.517 NA   NA
 7689414 7689415 BAA_5075 BAA_5076 feoB   TRUE 0.966 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 7689417 7689418 BAA_5079 BAA_5080     TRUE 0.982 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 7689418 7689419 BAA_5080 BAA_5081     TRUE 0.879 40.000 0.875 NA N NA
 7689419 7689420 BAA_5081 BAA_5082     TRUE 0.804 90.000 0.875 NA   NA
 7689420 7689421 BAA_5082 BAA_5083     FALSE 0.150 177.000 0.000 NA   NA
 7689421 7689422 BAA_5083 BAA_5084     FALSE 0.119 184.000 0.000 NA   NA
 7689423 7689424 BAA_5085 BAA_5086 hpt2   FALSE 0.179 235.000 0.015 1.000 N NA
 7689427 7689428 BAA_5089 BAA_5090     TRUE 0.712 18.000 0.262 NA   NA
 7689428 7689429 BAA_5090 BAA_5091     FALSE 0.005 535.000 0.000 NA   NA
 7689429 7689430 BAA_5091 BAA_5092     TRUE 0.689 75.000 0.667 NA   NA
 7689430 7689431 BAA_5092 BAA_5093     FALSE 0.017 297.000 0.000 NA   NA
 7689431 7689432 BAA_5093 BAA_5094     TRUE 0.885 0.000 0.667 NA   NA
 7689432 7689433 BAA_5094 BAA_5095     TRUE 0.741 143.000 0.500 1.000   NA
 7689433 7689434 BAA_5095 BAA_5096     TRUE 0.764 -13.000 0.700 1.000   NA
 7689435 7689436 BAA_5097 BAA_5098     FALSE 0.174 202.000 0.000 0.027   NA
 7689436 7689437 BAA_5098 BAA_5099     TRUE 0.986 3.000 0.727 1.000 Y NA
 7689437 7689438 BAA_5099 BAA_5100     FALSE 0.382 95.000 0.000 NA   NA
 7689438 7689439 BAA_5100 BAA_5101     FALSE 0.350 85.000 0.000 NA   NA
 7689439 7689440 BAA_5101 BAA_5102     FALSE 0.445 134.000 0.000 NA   NA
 7689440 7689441 BAA_5102 BAA_5103     FALSE 0.304 75.000 0.000 NA   NA
 7689441 7689442 BAA_5103 BAA_5104     TRUE 0.882 21.000 0.700 1.000   NA
 7689442 7689443 BAA_5104 BAA_5105     FALSE 0.346 84.000 0.000 NA   NA
 7689443 7689444 BAA_5105 BAA_5106     FALSE 0.448 105.000 0.000 NA   NA
 7689445 7689446 BAA_5107 BAA_5108   gntP3 FALSE 0.521 169.000 0.667 NA   NA
 7689446 7689447 BAA_5108 BAA_5109 gntP3   TRUE 0.755 49.000 0.292 1.000 N NA
 7689447 7689448 BAA_5109 BAA_5110     TRUE 0.918 0.000 0.333 1.000 N NA
 7689448 7689449 BAA_5110 BAA_5111     FALSE 0.594 -7.000 0.283 NA   NA
 7689449 7689450 BAA_5111 BAA_5112     TRUE 0.900 2.000 0.679 NA   NA
 7689450 7689451 BAA_5112 BAA_5113     TRUE 0.723 -22.000 0.750 1.000   NA
 7689451 7689452 BAA_5113 BAA_5114     FALSE 0.012 336.000 0.000 NA   NA
 7689452 7689453 BAA_5114 BAA_5115     TRUE 0.775 21.000 0.429 NA   NA
 7689453 7689454 BAA_5115 BAA_5116     FALSE 0.005 534.000 0.000 NA   NA
 7689454 7689455 BAA_5116 BAA_5117     TRUE 0.879 83.000 0.778 1.000 N NA
 7689455 7689456 BAA_5117 BAA_5118     TRUE 0.974 -7.000 0.778 0.012 Y NA
 7689456 7689457 BAA_5118 BAA_5119     FALSE 0.147 256.000 0.143 1.000 N NA
 7689457 7689458 BAA_5119 BAA_5120     TRUE 0.902 1.000 0.029 1.000 N NA
 7689458 7689459 BAA_5120 BAA_5121   menB FALSE 0.381 204.000 0.193 0.001 N NA
 7689459 7689460 BAA_5121 BAA_5122 menB   FALSE 0.545 70.000 0.280 1.000   NA
 7689460 7689461 BAA_5122 BAA_5123   menD TRUE 0.793 -3.000 0.355 1.000   NA
 7689461 7689462 BAA_5123 BAA_5124 menD menF TRUE 0.962 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 7689463 7689464 BAA_5125 BAA_5126     TRUE 0.857 110.000 0.250 1.000 N NA
 7689466 7689467 BAA_5128 BAA_5129     FALSE 0.248 165.000 0.010 NA   NA
 7689467 7689468 BAA_5129 BAA_5130     FALSE 0.500 77.000 0.300 NA   NA
 7689469 7689470 BAA_5131 BAA_5132 glgP glgA TRUE 0.969 19.000 0.314 1.000 Y NA
 7689470 7689471 BAA_5132 BAA_5133 glgA glgD TRUE 0.944 47.000 0.630 1.000 Y NA
 7689471 7689472 BAA_5133 BAA_5134 glgD glgC TRUE 0.974 19.000 0.210 0.000 Y NA
 7689472 7689473 BAA_5134 BAA_5135 glgC glgB TRUE 0.916 -25.000 0.296 0.001 Y NA
 7689473 7689474 BAA_5135 BAA_5136 glgB ldh2 FALSE 0.021 992.000 0.000 1.000 N NA
 7689474 7689475 BAA_5136 BAA_5137 ldh2   FALSE 0.005 654.000 0.000 NA   NA
 7689475 7689476 BAA_5137 BAA_5138     TRUE 0.651 5.000 0.000 NA   NA
 7689476 7689477 BAA_5138 BAA_5139     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7689477 7689478 BAA_5139 BAA_5140     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7689478 7689479 BAA_5140 BAA_5141     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7689479 7689480 BAA_5141 BAA_5142     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7689480 7689481 BAA_5142 BAA_5143     TRUE 0.642 10.000 0.000 NA   NA
 7689481 7689482 BAA_5143 BAA_5144     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7689482 7689483 BAA_5144 BAA_5145     FALSE 0.615 13.000 0.000 NA   NA
 7689483 7689484 BAA_5145 BAA_5146     FALSE 0.619 1.000 0.000 NA   NA
 7689484 7689485 BAA_5146 BAA_5147     FALSE 0.456 27.000 0.000 NA   NA
 7689485 7689486 BAA_5147 BAA_5148     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7689486 7689487 BAA_5148 BAA_5149     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7689487 7689488 BAA_5149 BAA_5150     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7689488 7689489 BAA_5150 BAA_5151     FALSE 0.629 12.000 0.000 NA   NA
 7689489 7689490 BAA_5151 BAA_5152     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7689490 7689491 BAA_5152 BAA_5153     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7689491 7689492 BAA_5153 BAA_5154     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7689492 7689493 BAA_5154 BAA_5155     FALSE 0.465 26.000 0.000 NA   NA
 7689493 7689494 BAA_5155 BAA_5156     FALSE 0.529 21.000 0.000 NA   NA
 7689494 7689495 BAA_5156 BAA_5157     TRUE 0.645 9.000 0.000 NA   NA
 7689495 7689496 BAA_5157 BAA_5158     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7689496 7689497 BAA_5158 BAA_5159   rrf_11 TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7689497 7689498 BAA_5159 BAA_5160 rrf_11 rrl_11 FALSE 0.419 102.000 0.000 NA   NA
 7689501 7689502 BAA_5163 BAA_5165 sapB   FALSE 0.601 96.000 0.212 1.000   NA
 7689503 7689504 BAA_5164 BAA_5166   pgi FALSE 0.559 108.000 0.027 NA   NA
 7689506 7689507 BAA_5168 BAA_5169 yugI   FALSE 0.150 253.000 0.033 1.000 N NA
 7689507 7689508 BAA_5169 BAA_5170     TRUE 0.947 -3.000 0.894 1.000 N NA
 7689509 7689510 BAA_5171 BAA_5172     TRUE 0.686 110.000 0.117 1.000   NA
 7689513 7689514 BAA_5175 BAA_5176 sodC   FALSE 0.405 69.000 0.163 NA   NA
 7689519 7689520 BAA_5181 BAA_5182     FALSE 0.223 171.000 0.024 NA   NA
 7689520 7689521 BAA_5182 BAA_5183   glyS FALSE 0.381 46.000 0.004 NA   NA
 7689523 7689524 BAA_5185 BAA_5186     FALSE 0.495 51.000 0.308 NA   NA
 7689524 7689525 BAA_5186 BAA_5187     FALSE 0.425 148.000 0.077 NA   NA
 7689526 7689527 BAA_5188 BAA_5189 gtaB   TRUE 0.840 109.000 0.037 1.000 N NA
 7689529 7689530 BAA_5191 BAA_5192 pepA   FALSE 0.542 147.000 0.111 1.000   NA
 7689530 7689531 BAA_5192 BAA_5193     FALSE 0.586 87.000 0.361 NA   NA
 7689531 7689532 BAA_5193 BAA_5194     TRUE 0.673 -3.000 0.250 NA   NA
 7689532 7689533 BAA_5194 BAA_5195     TRUE 0.847 124.000 0.208 1.000 N NA
 7689535 7689536 BAA_5197 BAA_5198     FALSE 0.486 24.000 0.000 NA   NA
 7689537 7689538 BAA_5199 BAA_5200     FALSE 0.211 176.000 0.043 NA   NA
 7689541 7689542 BAA_5203 BAA_5204     FALSE 0.465 107.000 0.000 NA   NA
 7689544 7689545 BAA_5206 BAA_5207   dapF FALSE 0.421 42.000 0.020 NA   NA
 7689545 7689546 BAA_5207 BAA_5208 dapF   FALSE 0.044 244.000 0.002 NA   NA
 7689547 7689548 BAA_5209 BAA_5210     FALSE 0.059 231.000 0.075 NA   NA
 7689548 7689549 BAA_5210 BAA_5211     FALSE 0.392 55.000 0.062 NA   NA
 7689549 7689550 BAA_5211 BAA_5212     FALSE 0.392 -16.000 0.053 NA   NA
 7689551 7689552 BAA_5213 BAA_5214 phnA   FALSE 0.037 236.000 0.000 NA   NA
 7689552 7689553 BAA_5214 BAA_5215     FALSE 0.016 299.000 0.000 NA   NA
 7689554 7689555 BAA_5216 BAA_5217     TRUE 0.792 25.000 0.571 NA   NA
 7689556 7689557 BAA_5218 BAA_5219     TRUE 0.745 114.000 0.429 NA   NA
 7689557 7689558 BAA_5219 BAA_5220     TRUE 0.652 99.000 0.400 NA   NA
 7689558 7689559 BAA_5220 BAA_5221     FALSE 0.408 53.000 0.127 NA   NA
 7689560 7689561 BAA_5222 BAA_5223     FALSE 0.009 435.000 0.019 NA   NA
 7689566 7689567 BAA_5228 BAA_5229     TRUE 0.846 110.000 0.059 1.000 N NA
 7689567 7689568 BAA_5229 BAA_5230     FALSE 0.395 72.000 0.074 NA   NA
 7689569 7689570 BAA_5231 BAA_5232 fbp1   TRUE 0.780 18.000 0.394 NA   NA
 7689570 7689571 BAA_5232 BAA_5233     FALSE 0.009 373.000 0.000 NA   NA
 7689577 7689578 BAA_5239 BAA_5240     FALSE 0.455 75.000 0.259 NA   NA
 7689581 7689582 BAA_5243 BAA_5244     FALSE 0.415 55.000 0.221 NA   NA
 7689582 7689583 BAA_5244 BAA_5245     FALSE 0.425 66.000 0.241 NA   NA
 7689584 7689585 BAA_5246 BAA_5247     FALSE 0.025 264.000 0.000 NA   NA
 7689585 7689586 BAA_5247 BAA_5248     TRUE 0.785 0.000 0.333 NA   NA
 7689587 7689588 BAA_5249 BAA_5250 sufB sufA TRUE 0.796 49.000 0.152 0.001 N NA
 7689588 7689589 BAA_5250 BAA_5251 sufA sufS TRUE 0.797 -10.000 0.292 1.000 N NA
 7689589 7689590 BAA_5251 BAA_5252 sufS sufD TRUE 0.945 0.000 0.606 1.000 N NA
 7689590 7689591 BAA_5252 BAA_5253 sufD sufC TRUE 0.969 16.000 0.139 1.000 Y NA
 7689591 7689592 BAA_5253 BAA_5254 sufC   FALSE 0.125 239.000 0.000 NA N NA
 7689592 7689593 BAA_5254 BAA_5255     TRUE 0.941 73.000 0.750 NA Y NA
 7689593 7689594 BAA_5255 BAA_5256     TRUE 0.948 24.000 0.074 NA Y NA
 7689594 7689595 BAA_5256 BAA_5257     TRUE 0.964 -7.000 0.642 1.000 Y NA
 7689597 7689598 BAA_5260 BAA_5261     FALSE 0.468 155.000 0.131 1.000   NA
 7689598 7689599 BAA_5261 BAA_5262     TRUE 0.883 4.000 0.443 1.000   NA
 7689599 7689600 BAA_5262 BAA_5263   gcvH FALSE 0.032 497.000 0.043 1.000 N NA
 7689600 7689601 BAA_5263 BAA_5264 gcvH   TRUE 0.758 42.000 0.170 1.000 N NA
 7689601 7689602 BAA_5264 BAA_5265     FALSE 0.005 531.000 0.000 NA   NA
 7689602 7689603 BAA_5265 BAA_5266     FALSE 0.459 130.000 0.000 NA   NA
 7689603 7689604 BAA_5266 BAA_5267     FALSE 0.342 42.000 0.000 NA   NA
 7689604 7689605 BAA_5267 BAA_5268     FALSE 0.005 530.000 0.000 NA   NA
 7689605 7689606 BAA_5268 BAA_5269     FALSE 0.300 53.000 0.000 NA   NA
 7689608 7689609 BAA_5271 BAA_5272   ldh3 TRUE 0.707 23.000 0.333 NA   NA
 7689609 7689610 BAA_5272 BAA_5273 ldh3   FALSE 0.033 246.000 0.000 NA   NA
 7689610 7689611 BAA_5273 BAA_5274     TRUE 0.910 14.000 0.828 NA   NA
 7689611 7689612 BAA_5274 BAA_5275     FALSE 0.450 147.000 0.185 NA   NA
 7689612 7689613 BAA_5275 BAA_5276     FALSE 0.005 588.000 0.000 NA   NA
 7689613 7689614 BAA_5276 BAA_5277     TRUE 0.842 4.000 0.289 1.000   NA
 7689614 7689615 BAA_5277 BAA_5278     FALSE 0.627 139.000 0.156 1.000   NA
 7689615 7689616 BAA_5278 BAA_5279     FALSE 0.380 153.000 0.061 NA   NA
 7689616 7689617 BAA_5279 BAA_5280     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7689617 7689618 BAA_5280 BAA_5281     TRUE 0.974 22.000 0.588 1.000 Y NA
 7689619 7689620 BAA_5282 BAA_5283     FALSE 0.361 88.000 0.000 NA   NA
 7689621 7689622 BAA_5284 BAA_5285     FALSE 0.015 310.000 0.000 NA   NA
 7689622 7689623 BAA_5285 BAA_5286     FALSE 0.384 49.000 0.021 NA   NA
 7689623 7689624 BAA_5286 BAA_5287     FALSE 0.398 78.000 0.024 NA   NA
 7689626 7689627 BAA_5289 BAA_5290     FALSE 0.028 256.000 0.000 NA   NA
 7689627 7689628 BAA_5290 BAA_5291     FALSE 0.444 80.000 0.200 NA   NA
 7689628 7689629 BAA_5291 BAA_5292     TRUE 0.853 120.000 0.233 1.000 N NA
 7689629 7689630 BAA_5292 BAA_5293     FALSE 0.008 596.000 0.000 1.000   NA
 7689630 7689631 BAA_5293 BAA_5294   spoIIIJ1 TRUE 0.635 130.000 0.003 1.000   NA
 7689631 7689632 BAA_5294 BAA_5295 spoIIIJ1   TRUE 0.851 29.000 0.889 NA   NA
 7689633 7689634 BAA_5296 BAA_5297     FALSE 0.012 332.000 0.000 NA   NA
 7689635 7689636 BAA_5298 BAA_5299     FALSE 0.505 97.000 0.167 NA   NA
 7689636 7689637 BAA_5299 BAA_5300     TRUE 0.814 13.000 0.389 NA   NA
 7689637 7689638 BAA_5300 BAA_5301     FALSE 0.477 -10.000 0.149 NA   NA
 7689641 7689642 BAA_5304 BAA_5305     TRUE 0.812 31.000 0.727 NA   NA
 7689642 7689643 BAA_5305 BAA_5306     FALSE 0.009 365.000 0.000 NA   NA
 7689643 7689644 BAA_5306 BAA_5307     TRUE 0.926 -22.000 0.571 1.000 Y NA
 7689644 7689645 BAA_5307 BAA_5308     TRUE 0.808 140.000 0.500 0.060   NA
 7689647 7689648 BAA_5310 BAA_5311     FALSE 0.011 414.000 0.000 1.000   NA
 7689648 7689649 BAA_5311 BAA_5312     FALSE 0.602 118.000 0.167 NA   NA
 7689650 7689651 BAA_5313 BAA_5314 nprB   FALSE 0.367 156.000 0.214 NA   NA
 7689651 7689652 BAA_5314 BAA_5315     FALSE 0.474 52.000 0.286 NA   NA
 7689652 7689653 BAA_5315 BAA_5316     TRUE 0.711 113.000 0.364 NA   NA
 7689653 7689654 BAA_5316 BAA_5317     FALSE 0.505 164.000 0.556 NA   NA
 7689654 7689655 BAA_5317 BAA_5318     TRUE 0.961 -12.000 0.875 1.000 Y NA
 7689656 7689657 BAA_5319 BAA_5320   dps2 FALSE 0.221 213.000 0.000 1.000 N NA
 7689657 7689658 BAA_5320 BAA_5321 dps2   FALSE 0.013 319.000 0.000 NA   NA
 7689659 7689660 BAA_5322 BAA_5323     FALSE 0.330 -34.000 0.222 NA   NA
 7689660 7689661 BAA_5323 BAA_5324     FALSE 0.512 30.000 0.010 NA   NA
 7689662 7689663 BAA_5325 BAA_5326     FALSE 0.379 54.000 0.029 NA   NA
 7689663 7689664 BAA_5326 BAA_5327     FALSE 0.325 148.000 0.000 NA   NA
 7689664 7689665 BAA_5327 BAA_5328     FALSE 0.398 99.000 0.000 NA   NA
 7689666 7689667 BAA_5329 BAA_5330     FALSE 0.219 346.000 0.000 0.001 Y NA
 7689667 7689668 BAA_5330 BAA_5331     FALSE 0.101 297.000 0.000 0.060 N NA
 7689668 7689669 BAA_5331 BAA_5332     FALSE 0.238 335.000 0.000 0.001 Y NA
 7689671 7689672 BAA_5334 BAA_5335     FALSE 0.303 51.000 0.000 NA   NA
 7689672 7689673 BAA_5335 BAA_5336     FALSE 0.214 -43.000 0.000 NA   NA
 7689673 7689674 BAA_5336 BAA_5337     FALSE 0.014 312.000 0.000 NA   NA
 7689674 7689675 BAA_5337 BAA_5338     TRUE 0.631 110.000 0.250 NA   NA
 7689675 7689676 BAA_5338 BAA_5339     TRUE 0.777 17.000 0.250 1.000   NA
 7689677 7689678 BAA_5340 BAA_5341     FALSE 0.006 436.000 0.000 NA   NA
 7689678 7689679 BAA_5341 BAA_5342     FALSE 0.516 45.000 0.310 NA   NA
 7689680 7689681 BAA_5343 BAA_5344 tyrS2 murB2 FALSE 0.044 365.000 0.000 1.000 N NA
 7689681 7689682 BAA_5344 BAA_5345 murB2   FALSE 0.013 389.000 0.000 1.000   NA
 7689682 7689683 BAA_5345 BAA_5346     FALSE 0.345 167.000 0.107 1.000   NA
 7689683 7689684 BAA_5346 BAA_5347     FALSE 0.572 26.000 0.083 NA   NA
 7689685 7689686 BAA_5348 BAA_5349     TRUE 0.969 -3.000 0.229 0.060 Y NA
 7689687 7689688 BAA_5350 BAA_5351     TRUE 0.708 79.000 0.667 NA   NA
 7689688 7689689 BAA_5351 BAA_5352   speG FALSE 0.313 158.000 0.027 NA   NA
 7689689 7689690 BAA_5352 BAA_5353 speG   FALSE 0.563 144.000 0.034 1.000   NA
 7689690 7689691 BAA_5353 BAA_5354     FALSE 0.544 50.000 0.385 NA   NA
 7689693 7689694 BAA_5356 BAA_5357     TRUE 0.981 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 7689694 7689695 BAA_5357 BAA_5358     TRUE 0.985 -3.000 0.870 0.021 Y NA
 7689695 7689696 BAA_5358 BAA_5359     TRUE 0.964 20.000 0.150 1.000 Y NA
 7689696 7689697 BAA_5359 BAA_5360     FALSE 0.033 415.000 0.000 1.000 N NA
 7689697 7689698 BAA_5360 BAA_5362   ssrA FALSE 0.007 409.000 0.000 NA   NA
 7689698 7689699 BAA_5362 BAA_5363 ssrA smpB FALSE 0.472 127.000 0.000 NA   NA
 7689701 7689702 BAA_5365 BAA_5366 vacB estA FALSE 0.588 142.000 0.060 1.000   NA
 7689702 7689703 BAA_5366 BAA_5367 estA secG FALSE 0.399 159.000 0.032 1.000   NA
 7689703 7689704 BAA_5367 BAA_5368 secG   TRUE 0.774 95.000 0.008 1.000 N NA
 7689704 7689705 BAA_5368 BAA_5369     TRUE 0.898 -3.000 0.800 1.000   NA
 7689707 7689708 BAA_5371 BAA_5372     FALSE 0.243 158.000 0.000 NA   NA
 7689708 7689709 BAA_5372 BAA_5373     FALSE 0.014 311.000 0.000 NA   NA
 7689709 7689710 BAA_5373 BAA_5374     FALSE 0.242 -28.000 0.000 NA   NA
 7689710 7689711 BAA_5374 BAA_5375     FALSE 0.155 175.000 0.000 NA   NA
 7689711 7689712 BAA_5375 BAA_5376     FALSE 0.105 188.000 0.000 NA   NA
 7689714 7689715 BAA_5378 BAA_5379     FALSE 0.295 60.000 0.000 NA   NA
 7689715 7689716 BAA_5379 BAA_5380     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7689716 7689717 BAA_5380 BAA_5381     FALSE 0.487 111.000 0.000 NA   NA
 7689718 7689719 BAA_5382 BAA_5383     FALSE 0.551 19.000 0.000 NA   NA
 7689719 7689720 BAA_5383 BAA_5384     FALSE 0.007 411.000 0.000 NA   NA
 7689720 7689721 BAA_5384 BAA_5385     FALSE 0.389 97.000 0.000 NA   NA
 7689721 7689722 BAA_5385 BAA_5386     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7689722 7689723 BAA_5386 BAA_5387     FALSE 0.298 55.000 0.000 NA   NA
 7689723 7689724 BAA_5387 BAA_5388     FALSE 0.007 417.000 0.000 NA   NA
 7689724 7689725 BAA_5388 BAA_5389     FALSE 0.242 -28.000 0.000 NA   NA
 7689725 7689726 BAA_5389 BAA_5390     FALSE 0.467 60.000 0.286 NA   NA
 7689726 7689727 BAA_5390 BAA_5391     FALSE 0.357 87.000 0.000 NA   NA
 7689728 7689729 BAA_5392 BAA_5393     FALSE 0.479 123.000 0.000 NA   NA
 7689729 7689730 BAA_5393 BAA_5394   eno TRUE 0.765 144.000 0.003 1.000 N NA
 7689730 7689731 BAA_5394 BAA_5395 eno gpmI TRUE 0.944 31.000 0.136 1.000 Y NA
 7689731 7689732 BAA_5395 BAA_5396 gpmI tpi TRUE 0.962 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 7689732 7689733 BAA_5396 BAA_5397 tpi pgk TRUE 0.941 33.000 0.141 1.000 Y NA
 7689733 7689734 BAA_5397 BAA_5398 pgk gap2 TRUE 0.951 140.000 0.063 0.003 Y NA
 7689734 7689735 BAA_5398 BAA_5399 gap2 cggR TRUE 0.864 27.000 0.348 1.000 N NA
 7689735 7689736 BAA_5399 BAA_5400 cggR   TRUE 0.634 137.000 0.101 1.000   NA
 7689736 7689737 BAA_5400 BAA_5401   sigL TRUE 0.809 10.000 0.145 1.000   NA
 7689737 7689738 BAA_5401 BAA_5402 sigL   FALSE 0.028 255.000 0.000 NA   NA
 7689739 7689740 BAA_5403 BAA_5404     FALSE 0.378 37.000 0.000 NA   NA
 7689740 7689741 BAA_5404 BAA_5405   spoVAC_2 TRUE 0.734 31.000 0.500 NA   NA
 7689741 7689742 BAA_5405 BAA_5406 spoVAC_2 spoVAD_2 FALSE 0.619 1.000 0.000 NA   NA
 7689742 7689743 BAA_5406 BAA_5407 spoVAD_2 spoVAE_2 FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7689743 7689744 BAA_5407 BAA_5408 spoVAE_2   FALSE 0.629 12.000 0.000 NA   NA
 7689744 7689745 BAA_5408 BAA_5409     TRUE 0.760 21.000 0.400 NA   NA
 7689745 7689746 BAA_5409 BAA_5410   clpP2 FALSE 0.034 242.000 0.000 NA   NA
 7689747 7689748 BAA_5411 BAA_5412 ptsH2   FALSE 0.597 24.000 0.101 NA   NA
 7689748 7689749 BAA_5412 BAA_5413     TRUE 0.663 90.000 0.470 NA   NA
 7689749 7689750 BAA_5413 BAA_5414     TRUE 0.751 4.000 0.214 NA   NA
 7689750 7689751 BAA_5414 BAA_5415     TRUE 0.684 21.000 0.263 NA   NA
 7689751 7689752 BAA_5415 BAA_5416     FALSE 0.041 229.000 0.000 NA   NA
 7689752 7689753 BAA_5416 BAA_5417   trxB FALSE 0.278 163.000 0.067 NA   NA
 7689753 7689754 BAA_5417 BAA_5418 trxB   FALSE 0.560 85.000 0.183 1.000   NA
 7689754 7689755 BAA_5418 BAA_5419     FALSE 0.618 140.000 0.169 1.000   NA
 7689755 7689756 BAA_5419 BAA_5420     TRUE 0.787 24.000 0.417 1.000   NA
 7689756 7689757 BAA_5420 BAA_5421   lgt FALSE 0.498 68.000 0.169 1.000   NA
 7689757 7689758 BAA_5421 BAA_5422 lgt hprK TRUE 0.893 25.000 0.494 1.000 N NA
 7689758 7689759 BAA_5422 BAA_5423 hprK   FALSE 0.355 157.000 0.215 NA   NA
 7689759 7689760 BAA_5423 BAA_5424     FALSE 0.598 115.000 0.103 NA   NA
 7689760 7689761 BAA_5424 BAA_5425   uvrA FALSE 0.360 60.000 0.006 NA   NA
 7689761 7689762 BAA_5425 BAA_5426 uvrA uvrB TRUE 0.982 6.000 0.154 0.001 Y NA
 7689762 7689763 BAA_5426 BAA_5427 uvrB   TRUE 0.825 161.000 0.000 NA Y NA
 7689763 7689764 BAA_5427 BAA_5428     FALSE 0.007 418.000 0.000 NA   NA
 7689764 7689765 BAA_5428 BAA_5429     FALSE 0.568 94.000 0.294 NA   NA
 7689765 7689766 BAA_5429 BAA_5430     TRUE 0.709 -3.000 0.294 NA   NA
 7689766 7689767 BAA_5430 BAA_5431     FALSE 0.406 100.000 0.000 NA   NA
 7689767 7689768 BAA_5431 BAA_5432     FALSE 0.489 113.000 0.000 NA   NA
 7689768 7689769 BAA_5432 BAA_5433     TRUE 0.879 -3.000 0.800 NA   NA
 7689769 7689770 BAA_5433 BAA_5434     TRUE 0.745 13.000 0.250 NA   NA
 7689770 7689771 BAA_5434 BAA_5435     FALSE 0.017 335.000 0.023 NA   NA
 7689772 7689773 BAA_5436 BAA_5437     TRUE 0.921 52.000 0.125 0.037 Y NA
 7689773 7689774 BAA_5437 BAA_5438     TRUE 0.872 5.000 0.389 1.000   NA
 7689774 7689775 BAA_5438 BAA_5439     FALSE 0.053 266.000 0.042 1.000   NA
 7689776 7689777 BAA_5440 BAA_5441     FALSE 0.295 65.000 0.000 NA   NA
 7689777 7689778 BAA_5441 BAA_5442     FALSE 0.024 312.000 0.000 1.000   NA
 7689778 7689779 BAA_5442 BAA_5443     TRUE 0.786 110.000 0.224 0.005   NA
 7689779 7689780 BAA_5443 BAA_5444   ftsX TRUE 0.841 119.000 0.021 1.000 N NA
 7689780 7689781 BAA_5444 BAA_5445 ftsX ftsE TRUE 0.943 -10.000 0.431 1.000 Y NA
 7689781 7689782 BAA_5445 BAA_5446 ftsE cccB FALSE 0.086 287.000 0.000 1.000 N NA
 7689782 7689783 BAA_5446 BAA_5447 cccB   FALSE 0.028 255.000 0.000 NA   NA
 7689783 7689784 BAA_5447 BAA_5449   prfB FALSE 0.557 24.000 0.002 NA   NA
 7689784 7689785 BAA_5449 BAA_5450 prfB secA2 TRUE 0.799 100.000 0.052 1.000 N NA
 7689785 7689786 BAA_5450 BAA_5451 secA2 yfiA FALSE 0.090 277.000 0.041 NA N NA
 7689788 7689789 BAA_5453 BAA_5454 cspC comFC TRUE 0.657 121.000 0.008 1.000   NA
 7689789 7689790 BAA_5454 BAA_5455 comFC comFA TRUE 0.782 0.000 0.130 1.000   NA
 7689790 7689791 BAA_5455 BAA_5456 comFA   TRUE 0.798 128.000 0.014 NA N NA
 7689791 7689792 BAA_5456 BAA_5457     FALSE 0.122 252.000 0.010 NA N NA
 7689792 7689793 BAA_5457 BAA_5458     FALSE 0.225 174.000 0.072 NA   NA
 7689794 7689795 BAA_5459 BAA_5460     FALSE 0.390 75.000 0.039 NA   NA
 7689796 7689797 BAA_5461 BAA_5462   ugd TRUE 0.896 75.000 0.000 1.000 Y NA
 7689798 7689799 BAA_5463 BAA_5464     FALSE 0.340 201.000 0.263 1.000 N NA
 7689799 7689800 BAA_5464 BAA_5465     TRUE 0.873 105.000 0.421 1.000 N NA
 7689803 7689804 BAA_5468 BAA_5469   celF TRUE 0.687 50.000 0.350 0.007   NA
 7689804 7689805 BAA_5469 BAA_5470 celF celC2 TRUE 0.981 4.000 0.400 1.000 Y NA
 7689805 7689806 BAA_5470 BAA_5471 celC2 celB2 TRUE 0.861 184.000 0.615 0.003 Y NA
 7689806 7689807 BAA_5471 BAA_5472 celB2 celA2 TRUE 0.971 17.000 0.000 0.003 Y NA
 7689808 7689809 BAA_5473 BAA_5474   speD2 TRUE 0.640 28.000 0.039 1.000   NA
 7689810 7689811 BAA_5475 BAA_5476 celC3 celB3 TRUE 0.978 10.000 0.000 0.003 Y NA
 7689811 7689812 BAA_5476 BAA_5477 celB3 celA3 TRUE 0.987 15.000 0.700 0.003 Y NA
 7689813 7689814 BAA_5478 BAA_5479     FALSE 0.522 149.000 0.192 1.000   NA
 7689814 7689815 BAA_5479 BAA_5480     FALSE 0.582 43.000 0.269 1.000   NA
 7689818 7689819 BAA_5483 BAA_5484     FALSE 0.032 249.000 0.000 NA   NA
 7689819 7689820 BAA_5484 BAA_5485     FALSE 0.297 70.000 0.000 NA   NA
 7689820 7689821 BAA_5485 BAA_5486     FALSE 0.296 57.000 0.000 NA   NA
 7689821 7689822 BAA_5486 BAA_5487     FALSE 0.083 196.000 0.000 NA   NA
 7689823 7689824 BAA_5488 BAA_5489 cydA3   TRUE 0.976 -7.000 0.880 0.022 Y NA
 7689824 7689825 BAA_5489 BAA_5490     FALSE 0.037 391.000 0.000 1.000 N NA
 7689826 7689827 BAA_5491 BAA_5493 thiC lldP2 FALSE 0.075 300.000 0.000 1.000 N NA
 7689829 7689830 BAA_5495 BAA_5496     FALSE 0.390 51.000 0.041 NA   NA
 7689831 7689832 BAA_5497 BAA_5498   dat2 FALSE 0.035 523.000 0.000 0.047 N NA
 7689832 7689833 BAA_5498 BAA_5499 dat2   FALSE 0.057 211.000 0.000 NA   NA
 7689833 7689834 BAA_5499 BAA_5500     FALSE 0.313 77.000 0.000 NA   NA
 7689834 7689835 BAA_5500 BAA_5501     FALSE 0.024 267.000 0.000 NA   NA
 7689835 7689836 BAA_5501 BAA_5502     FALSE 0.050 346.000 0.000 1.000 N NA
 7689836 7689837 BAA_5502 BAA_5503     FALSE 0.006 482.000 0.000 NA   NA
 7689837 7689838 BAA_5503 BAA_5504     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7689838 7689839 BAA_5504 BAA_5505     FALSE 0.469 128.000 0.000 NA   NA
 7689840 7689841 BAA_5506 BAA_5507   opuD2 FALSE 0.035 241.000 0.000 NA   NA
 7689842 7689843 BAA_5508 BAA_5509     TRUE 0.780 80.000 0.889 NA   NA
 7689844 7689845 BAA_5510 BAA_5511     TRUE 0.897 14.000 0.727 NA   NA
 7689845 7689846 BAA_5511 BAA_5512     TRUE 0.917 6.000 0.750 NA   NA
 7689847 7689848 BAA_5513 BAA_5514     TRUE 0.647 -16.000 0.458 1.000   NA
 7689850 7689851 BAA_5516 BAA_5517     FALSE 0.519 56.000 0.361 NA   NA
 7689854 7689855 BAA_5520 BAA_5521     FALSE 0.047 219.000 0.000 NA   NA
 7689855 7689856 BAA_5521 BAA_5522     TRUE 0.850 114.000 0.750 NA   NA
 7689856 7689857 BAA_5522 BAA_5523     TRUE 0.931 -12.000 0.333 1.000 Y NA
 7689857 7689858 BAA_5523 BAA_5524     TRUE 0.915 -3.000 0.500 1.000 N NA
 7689859 7689860 BAA_5525 BAA_5526     TRUE 0.728 1.000 0.211 NA   NA
 7689861 7689862 BAA_5527 BAA_5528     TRUE 0.865 20.000 0.273 NA N NA
 7689862 7689863 BAA_5528 BAA_5529     TRUE 0.881 -3.000 0.818 NA   NA
 7689863 7689864 BAA_5529 BAA_5530     TRUE 0.654 67.000 0.600 NA   NA
 7689864 7689865 BAA_5530 BAA_5531     TRUE 0.984 12.000 0.600 1.000 Y NA
 7689865 7689866 BAA_5531 BAA_5532   galE1 TRUE 0.907 128.000 0.600 1.000 N NA
 7689866 7689867 BAA_5532 BAA_5533 galE1 lytR FALSE 0.455 178.000 0.200 NA N NA
 7689867 7689868 BAA_5533 BAA_5534 lytR fabZ FALSE 0.019 948.000 0.004 NA N NA
 7689868 7689869 BAA_5534 BAA_5535 fabZ   FALSE 0.014 314.000 0.000 NA   NA
 7689871 7689872 BAA_5537 BAA_5538     TRUE 0.980 16.000 0.429 0.063 Y NA
 7689872 7689873 BAA_5538 BAA_5539     TRUE 0.962 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 7689873 7689874 BAA_5539 BAA_5540     FALSE 0.304 75.000 0.000 NA   NA
 7689874 7689875 BAA_5540 BAA_5541     FALSE 0.281 154.000 0.000 NA   NA
 7689875 7689876 BAA_5541 BAA_5542     FALSE 0.419 102.000 0.000 NA   NA
 7689876 7689877 BAA_5542 BAA_5543     FALSE 0.305 50.000 0.000 NA   NA
 7689877 7689878 BAA_5543 BAA_5544     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7689878 7689879 BAA_5544 BAA_5545     FALSE 0.030 253.000 0.000 NA   NA
 7689879 7689880 BAA_5545 BAA_5546     TRUE 0.882 -49.000 0.171 0.008 Y NA
 7689880 7689881 BAA_5546 BAA_5547   mbl FALSE 0.081 294.000 0.000 1.000 N NA
 7689881 7689882 BAA_5547 BAA_5548 mbl spoIIID FALSE 0.352 162.000 0.284 NA   NA
 7689882 7689883 BAA_5548 BAA_5549 spoIIID   FALSE 0.020 279.000 0.000 NA   NA
 7689883 7689884 BAA_5549 BAA_5550     FALSE 0.260 156.000 0.000 NA   NA
 7689884 7689885 BAA_5550 BAA_5551     FALSE 0.494 142.000 0.079 NA   NA
 7689885 7689886 BAA_5551 BAA_5552     FALSE 0.292 162.000 0.105 NA   NA
 7689886 7689887 BAA_5552 BAA_5553     TRUE 0.879 0.000 0.636 NA   NA
 7689887 7689888 BAA_5553 BAA_5554     FALSE 0.127 182.000 0.000 NA   NA
 7689888 7689889 BAA_5554 BAA_5555     FALSE 0.350 85.000 0.000 NA   NA
 7689889 7689890 BAA_5555 BAA_5556   spoIID FALSE 0.469 128.000 0.000 NA   NA
 7689890 7689891 BAA_5556 BAA_5557 spoIID murA1 FALSE 0.291 208.000 0.243 1.000 N NA
 7689891 7689892 BAA_5557 BAA_5558 murA1   FALSE 0.577 40.000 0.346 NA   NA
 7689892 7689893 BAA_5558 BAA_5559     FALSE 0.423 52.000 0.228 NA   NA
 7689893 7689894 BAA_5559 BAA_5560   nuoN FALSE 0.013 366.000 0.047 NA   NA
 7689894 7689895 BAA_5560 BAA_5561 nuoN nuoM TRUE 0.980 2.000 0.128 0.001 Y NA
 7689895 7689896 BAA_5561 BAA_5562 nuoM nuoL TRUE 0.970 -3.000 0.041 0.001 Y NA
 7689896 7689897 BAA_5562 BAA_5563 nuoL nuoK TRUE 0.959 30.000 0.253 0.002 Y NA
 7689897 7689898 BAA_5563 BAA_5564 nuoK nuoJ TRUE 0.968 -7.000 0.506 0.001 Y NA
 7689898 7689899 BAA_5564 BAA_5565 nuoJ nuoI TRUE 0.971 -3.000 0.223 0.002 Y NA
 7689899 7689900 BAA_5565 BAA_5566 nuoI nuoH TRUE 0.961 26.000 0.035 0.002 Y NA
 7689900 7689901 BAA_5566 BAA_5567 nuoH nuoD TRUE 0.979 0.000 0.258 0.002 Y NA
 7689901 7689902 BAA_5567 BAA_5568 nuoD   TRUE 0.982 5.000 0.182 0.002 Y NA
 7689902 7689903 BAA_5568 BAA_5569   nuoB TRUE 0.980 -3.000 0.524 0.001 Y NA
 7689903 7689904 BAA_5569 BAA_5570 nuoB nuoA TRUE 0.947 -9.000 0.091 0.001 Y NA
 7689906 7689907 BAA_5572 BAA_5573     TRUE 0.642 48.000 0.538 NA   NA
 7689907 7689908 BAA_5573 BAA_5574   atpC FALSE 0.553 122.000 0.006 NA   NA
 7689908 7689909 BAA_5574 BAA_5575 atpC atpD TRUE 0.985 21.000 0.837 0.002 Y NA
 7689909 7689910 BAA_5575 BAA_5576 atpD atpG TRUE 0.980 120.000 0.724 0.002 Y NA
 7689910 7689911 BAA_5576 BAA_5577 atpG atpA FALSE 0.408 336.000 0.846 0.002 Y NA
 7689911 7689912 BAA_5577 BAA_5578 atpA atpH TRUE 0.990 12.000 0.864 0.002 Y NA
 7689912 7689913 BAA_5578 BAA_5579 atpH atpF TRUE 0.971 -3.000 0.222 0.002 Y NA
 7689913 7689914 BAA_5579 BAA_5580 atpF atpE TRUE 0.835 128.000 0.402 0.002   NA
 7689914 7689915 BAA_5580 BAA_5581 atpE atpB FALSE 0.626 57.000 0.189 0.002   NA
 7689915 7689916 BAA_5581 BAA_5582 atpB atpI TRUE 0.854 8.000 0.330 1.000   NA
 7689916 7689917 BAA_5582 BAA_5583 atpI   TRUE 0.709 0.000 0.187 NA   NA
 7689917 7689918 BAA_5583 BAA_5584     FALSE 0.546 27.000 0.030 NA   NA
 7689918 7689919 BAA_5584 BAA_5585   upp FALSE 0.009 372.000 0.000 NA   NA
 7689919 7689920 BAA_5585 BAA_5586 upp glyA FALSE 0.116 272.000 0.051 1.000 N NA
 7689920 7689921 BAA_5586 BAA_5587 glyA   FALSE 0.111 217.000 0.145 1.000   NA
 7689921 7689922 BAA_5587 BAA_5588     FALSE 0.519 49.000 0.218 1.000   NA
 7689922 7689923 BAA_5588 BAA_5589     TRUE 0.789 97.000 0.072 1.000 N NA
 7689923 7689924 BAA_5589 BAA_5590     FALSE 0.141 248.000 0.000 1.000 N NA
 7689925 7689926 BAA_5591 BAA_5592     FALSE 0.312 160.000 0.099 NA   NA
 7689927 7689928 BAA_5593 BAA_5594     FALSE 0.039 231.000 0.000 NA   NA
 7689928 7689929 BAA_5594 BAA_5595     FALSE 0.444 78.000 0.230 NA   NA
 7689929 7689930 BAA_5595 BAA_5596     TRUE 0.817 109.000 0.133 NA N NA
 7689930 7689931 BAA_5596 BAA_5597     FALSE 0.415 50.000 0.158 NA   NA
 7689931 7689932 BAA_5597 BAA_5598   hemK FALSE 0.554 104.000 0.178 NA   NA
 7689932 7689933 BAA_5598 BAA_5599 hemK prfA TRUE 0.976 0.000 0.084 0.024 Y NA
 7689933 7689934 BAA_5599 BAA_5600 prfA tdk FALSE 0.134 262.000 0.062 1.000 N NA
 7689934 7689935 BAA_5600 BAA_5601 tdk rpmE TRUE 0.839 109.000 0.028 1.000 N NA
 7689935 7689936 BAA_5601 BAA_5602 rpmE rho FALSE 0.040 404.000 0.049 1.000 N NA
 7689936 7689937 BAA_5602 BAA_5603 rho fbp2 FALSE 0.057 343.000 0.005 1.000 N NA
 7689937 7689938 BAA_5603 BAA_5604 fbp2 murA2 TRUE 0.849 118.000 0.170 1.000 N NA
 7689938 7689939 BAA_5604 BAA_5605 murA2 fba2 FALSE 0.057 332.000 0.000 1.000 N NA
 7689939 7689940 BAA_5605 BAA_5606 fba2 spo0F FALSE 0.125 211.000 0.170 1.000   NA
 7689942 7689943 BAA_5608 BAA_5609 pyrG rpoE FALSE 0.137 258.000 0.029 1.000 N NA
 7689943 7689944 BAA_5609 BAA_5610 rpoE   TRUE 0.892 155.000 0.068 1.000 Y NA
 7689944 7689945 BAA_5610 BAA_5611     TRUE 0.784 65.000 0.432 1.000 N NA
 7689945 7689946 BAA_5611 BAA_5612     TRUE 0.971 22.000 0.270 0.001 Y NA
 7689946 7689947 BAA_5612 BAA_5613     TRUE 0.906 74.000 0.110 1.000 Y NA
 7689947 7689948 BAA_5613 BAA_5614     TRUE 0.908 50.000 0.118 1.000 Y NA
 7689948 7689949 BAA_5614 BAA_5615     TRUE 0.852 111.000 0.205 1.000 N NA
 7689950 7689951 BAA_5616 BAA_5617   uvdE_2 TRUE 0.878 33.000 0.545 1.000 N NA
 7689951 7689952 BAA_5617 BAA_5618 uvdE_2   FALSE 0.035 599.000 0.308 1.000 N NA
 7689953 7689954 BAA_5619 BAA_5620 papR   FALSE 0.369 90.000 0.000 NA   NA
 7689954 7689955 BAA_5620 BAA_5621     FALSE 0.301 52.000 0.000 NA   NA
 7689955 7689956 BAA_5621 BAA_5622     FALSE 0.005 716.000 0.000 NA   NA
 7689956 7689957 BAA_5622 BAA_5623     TRUE 0.985 -3.000 0.867 0.012 Y NA
 7689957 7689958 BAA_5623 BAA_5624     TRUE 0.952 1.000 0.800 NA N NA
 7689958 7689959 BAA_5624 BAA_5625     TRUE 0.956 -3.000 0.136 NA Y NA
 7689962 7689963 BAA_5628 BAA_5629     FALSE 0.395 35.000 0.000 NA   NA
 7689963 7689964 BAA_5629 BAA_5630     FALSE 0.436 104.000 0.000 NA   NA
 7689966 7689967 BAA_5632 BAA_5633     TRUE 0.715 149.000 0.700 NA   NA
 7689968 7689969 BAA_5634 BAA_5635     TRUE 0.747 -16.000 0.857 NA   NA
 7689969 7689970 BAA_5635 BAA_5636     TRUE 0.640 -13.000 0.500 NA   NA
 7689970 7689971 BAA_5636 BAA_5637   argS2 FALSE 0.035 397.000 0.000 1.000 N NA
 7689971 7689972 BAA_5637 BAA_5638 argS2   TRUE 0.700 0.000 0.079 NA   NA
 7689976 7689977 BAA_5642 BAA_5643     FALSE 0.412 -12.000 0.010 NA   NA
 7689977 7689978 BAA_5643 BAA_5644   speE FALSE 0.535 218.000 0.141 1.000 Y NA
 7689978 7689979 BAA_5644 BAA_5645 speE   FALSE 0.416 187.000 0.096 1.000 N NA
 7689979 7689980 BAA_5645 BAA_5646     TRUE 0.919 6.000 0.205 1.000 N NA
 7689980 7689981 BAA_5646 BAA_5647     FALSE 0.542 32.000 0.200 NA   NA
 7689982 7689983 BAA_5648 BAA_5649     TRUE 0.799 100.000 0.051 1.000 N NA
 7689984 7689985 BAA_5650 BAA_5651     FALSE 0.563 26.000 0.044 NA   NA
 7689987 7689988 BAA_5653 BAA_5654     FALSE 0.523 147.000 0.028 1.000   NA
 7689988 7689989 BAA_5654 BAA_5655     TRUE 0.710 192.000 0.250 1.000 Y NA
 7689989 7689990 BAA_5655 BAA_5656     TRUE 0.981 16.000 0.609 1.000 Y NA
 7689990 7689991 BAA_5656 BAA_5657     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7689991 7689992 BAA_5657 BAA_5658     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7689992 7689993 BAA_5658 BAA_5659     FALSE 0.014 312.000 0.000 NA   NA
 7689998 7689999 BAA_5664 BAA_5665     FALSE 0.071 202.000 0.000 NA   NA
 7689999 7690000 BAA_5665 BAA_5666   cwlJ2 FALSE 0.301 174.000 0.069 1.000   NA
 7690000 7690001 BAA_5666 BAA_5667 cwlJ2 gerQ TRUE 0.821 28.000 0.722 NA   NA
 7690002 7690003 BAA_5668 BAA_5669     FALSE 0.382 65.000 0.042 NA   NA
 7690003 7690004 BAA_5669 BAA_5670     TRUE 0.650 7.000 0.000 NA   NA
 7690004 7690005 BAA_5670 BAA_5671     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7690006 7690007 BAA_5672 BAA_5673     FALSE 0.406 173.000 0.062 0.027   NA
 7690007 7690008 BAA_5673 BAA_5674     FALSE 0.059 210.000 0.000 NA   NA
 7690009 7690010 BAA_5675 BAA_5676 ung   TRUE 0.645 20.000 0.088 NA   NA
 7690010 7690011 BAA_5676 BAA_5677     TRUE 0.819 -7.000 0.791 NA   NA
 7690011 7690012 BAA_5677 BAA_5678     TRUE 0.945 -3.000 0.850 1.000 N NA
 7690012 7690013 BAA_5678 BAA_5679     TRUE 0.756 83.000 0.175 1.000 N NA
 7690015 7690016 BAA_5681 BAA_5682 hom2 metA TRUE 0.932 142.000 0.021 1.000 Y NA
 7690016 7690017 BAA_5682 BAA_5683 metA   TRUE 0.904 -16.000 0.051 1.000 Y NA
 7690021 7690022 BAA_5688 BAA_5689     FALSE 0.487 192.000 0.471 1.000 N NA
 7690022 7690023 BAA_5689 BAA_5690     FALSE 0.529 21.000 0.000 NA   NA
 7690023 7690024 BAA_5690 BAA_5691     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7690026 7690027 BAA_5693 BAA_5694     FALSE 0.450 147.000 0.171 NA   NA
 7690027 7690028 BAA_5694 BAA_5695   cstA FALSE 0.548 -7.000 0.229 NA   NA
 7690028 7690029 BAA_5695 BAA_5696 cstA   TRUE 0.964 122.000 0.421 1.000 Y NA
 7690029 7690030 BAA_5696 BAA_5697     FALSE 0.236 210.000 0.000 1.000 N NA
 7690032 7690033 BAA_5699 BAA_5700     TRUE 0.975 16.000 0.083 0.008 Y NA
 7690033 7690034 BAA_5700 BAA_5701     FALSE 0.424 79.000 0.075 NA   NA
 7690035 7690036 BAA_5702 BAA_5703     TRUE 0.629 131.000 0.276 NA   NA
 7690038 7690039 BAA_5705 BAA_5706     FALSE 0.008 385.000 0.000 NA   NA
 7690039 7690040 BAA_5706 BAA_5707     FALSE 0.535 29.000 0.038 NA   NA
 7690040 7690041 BAA_5707 BAA_5708     FALSE 0.117 196.000 0.038 NA   NA
 7690041 7690042 BAA_5708 BAA_5709     FALSE 0.375 92.000 0.000 NA   NA
 7690042 7690043 BAA_5709 BAA_5710     FALSE 0.089 194.000 0.000 NA   NA
 7690045 7690046 BAA_5712 BAA_5713     FALSE 0.582 37.000 0.091 1.000   NA
 7690049 7690050 BAA_5716 BAA_5717 msrAB   TRUE 0.637 11.000 0.000 NA   NA
 7690050 7690051 BAA_5717 BAA_5718     FALSE 0.237 -31.000 0.000 NA   NA
 7690051 7690052 BAA_5718 BAA_5719     FALSE 0.013 327.000 0.000 NA   NA
 7690052 7690053 BAA_5719 BAA_5720     TRUE 0.846 35.000 0.869 1.000   NA
 7690053 7690054 BAA_5720 BAA_5721     TRUE 0.657 133.000 0.178 1.000   NA
 7690054 7690055 BAA_5721 BAA_5722     TRUE 0.937 -22.000 0.538 0.012 Y NA
 7690057 7690058 BAA_5725 BAA_5726   nos FALSE 0.044 363.000 0.000 1.000 N NA
 7690060 7690061 BAA_5728 BAA_5729     TRUE 0.676 109.000 0.073 1.000   NA
 7690063 7690064 BAA_5731 BAA_5732 galE2   FALSE 0.070 225.000 0.000 1.000   NA
 7690066 7690067 BAA_5734 BAA_5735     FALSE 0.208 187.000 0.037 1.000   NA
 7690068 7690069 BAA_5736 BAA_5737 guaC   TRUE 0.820 135.000 0.049 1.000 N NA
 7690070 7690071 BAA_5738 BAA_5739     FALSE 0.162 182.000 0.004 NA   NA
 7690071 7690072 BAA_5739 BAA_5740     FALSE 0.472 36.000 0.025 NA   NA
 7690072 7690073 BAA_5740 BAA_5741     FALSE 0.582 54.000 0.452 NA   NA
 7690073 7690074 BAA_5741 BAA_5742     FALSE 0.486 64.000 0.060 1.000   NA
 7690074 7690075 BAA_5742 BAA_5743     FALSE 0.408 -16.000 0.176 NA   NA
 7690075 7690076 BAA_5743 BAA_5744     TRUE 0.743 -19.000 0.890 NA   NA
 7690076 7690077 BAA_5744 BAA_5745   yycG TRUE 0.723 -9.000 0.575 NA   NA
 7690077 7690078 BAA_5745 BAA_5746 yycG yycF TRUE 0.988 4.000 0.597 0.012 Y NA
 7690078 7690079 BAA_5746 BAA_5747 yycF   FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 7690079 7690080 BAA_5747 BAA_5748     FALSE 0.354 40.000 0.000 NA   NA
 7690080 7690081 BAA_5748 BAA_5749     FALSE 0.584 16.000 0.000 NA   NA
 7690081 7690082 BAA_5749 BAA_5750     FALSE 0.629 12.000 0.000 NA   NA
 7690082 7690083 BAA_5750 BAA_5751   purA FALSE 0.415 139.000 0.000 NA   NA
 7690083 7690084 BAA_5751 BAA_5752 purA dnaB_2 FALSE 0.233 216.000 0.018 1.000 N NA
 7690084 7690085 BAA_5752 BAA_5753 dnaB_2 rplI TRUE 0.826 28.000 0.064 1.000 N NA
 7690085 7690086 BAA_5753 BAA_5754 rplI   TRUE 0.864 -3.000 0.020 1.000 N NA
 7690086 7690087 BAA_5754 BAA_5755     FALSE 0.432 79.000 0.116 NA   NA
 7690087 7690088 BAA_5755 BAA_5756   rpsR FALSE 0.417 78.000 0.069 NA   NA
 7690088 7690089 BAA_5756 BAA_5757 rpsR ssb1 TRUE 0.721 46.000 0.015 1.000 N NA
 7690089 7690090 BAA_5757 BAA_5758 ssb1 rpsF TRUE 0.824 27.000 0.015 1.000 N NA
 7690090 7690091 BAA_5758 BAA_5759 rpsF ychF TRUE 0.694 192.000 0.029 1.000 Y NA
 7690091 7690092 BAA_5759 BAA_5760 ychF   FALSE 0.591 116.000 0.064 NA   NA
 7690092 7690093 BAA_5760 BAA_5761     TRUE 0.643 21.000 0.171 NA   NA
 7690095 7690096 BAA_5763 BAA_5764 spo0J soJ TRUE 0.913 -7.000 0.827 1.000 N NA
 7690096 7690097 BAA_5764 BAA_5765 soJ   FALSE 0.385 191.000 0.069 1.000 N NA
 7690097 7690098 BAA_5765 BAA_5766   gidB TRUE 0.827 105.000 0.089 1.000 N NA
 7690098 7690099 BAA_5766 BAA_5767 gidB gidA TRUE 0.906 22.000 0.466 1.000 N NA
 7690099 7690100 BAA_5767 BAA_5768 gidA trmE FALSE 0.557 47.000 0.266 1.000   NA
 7690100 7690101 BAA_5768 BAA_5769 trmE jag FALSE 0.094 227.000 0.116 1.000   NA
 7690101 7690102 BAA_5769 BAA_5770 jag spoIIIJ2 TRUE 0.719 -3.000 0.071 1.000   NA
 7690102 7690103 BAA_5770 BAA_5771 spoIIIJ2 rnpA TRUE 0.756 40.000 0.025 1.000 N NA
 7690103 7690104 BAA_5771 BAA_5772 rnpA rpmH TRUE 0.778 77.000 0.787 1.000   NA
 7684063 7684064 BAA_B0001 BAA_B0002     FALSE 0.551 19.000 0.000 NA   NA
 7684064 7684065 BAA_B0002 BAA_B0003     FALSE 0.629 12.000 0.000 NA   NA
 7684065 7684066 BAA_B0003 BAA_B0004     FALSE 0.015 308.000 0.000 NA   NA
 7684066 7684067 BAA_B0004 BAA_B0005     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684067 7684068 BAA_B0005 BAA_B0006     FALSE 0.365 89.000 0.000 NA   NA
 7684068 7684069 BAA_B0006 BAA_B0007     FALSE 0.465 26.000 0.000 NA   NA
 7684069 7684070 BAA_B0007 BAA_B0008     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7684070 7684071 BAA_B0008 BAA_B0009     TRUE 0.857 17.000 0.600 NA   NA
 7684071 7684072 BAA_B0009 BAA_B0010     FALSE 0.295 64.000 0.000 NA   NA
 7684072 7684073 BAA_B0010 BAA_B0011     TRUE 0.638 3.000 0.000 NA   NA
 7684073 7684074 BAA_B0011 BAA_B0012     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7684074 7684075 BAA_B0012 BAA_B0013     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7684075 7684076 BAA_B0013 BAA_B0014     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7684076 7684077 BAA_B0014 BAA_B0015     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7684077 7684078 BAA_B0015 BAA_B0016     FALSE 0.308 49.000 0.000 NA   NA
 7684078 7684079 BAA_B0016 BAA_B0017     FALSE 0.436 104.000 0.000 NA   NA
 7684079 7684080 BAA_B0017 BAA_B0018     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7684080 7684081 BAA_B0018 BAA_B0019     FALSE 0.551 19.000 0.000 NA   NA
 7684081 7684082 BAA_B0019 BAA_B0020     FALSE 0.551 19.000 0.000 NA   NA
 7684082 7684083 BAA_B0020 BAA_B0021     TRUE 0.779 40.000 0.800 NA   NA
 7684083 7684084 BAA_B0021 BAA_B0022     TRUE 0.879 -3.000 0.800 NA   NA
 7684084 7684085 BAA_B0022 BAA_B0023     FALSE 0.612 33.000 0.308 NA   NA
 7684085 7684086 BAA_B0023 BAA_B0024     TRUE 0.750 17.000 0.308 NA   NA
 7684086 7684087 BAA_B0024 BAA_B0025     FALSE 0.299 54.000 0.000 NA   NA
 7684087 7684088 BAA_B0025 BAA_B0026     FALSE 0.304 75.000 0.000 NA   NA
 7684088 7684089 BAA_B0026 BAA_B0027     FALSE 0.540 20.000 0.000 NA   NA
 7684089 7684090 BAA_B0027 BAA_B0028     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684090 7684091 BAA_B0028 BAA_B0029     FALSE 0.453 132.000 0.000 NA   NA
 7684091 7684092 BAA_B0029 BAA_B0030     FALSE 0.303 51.000 0.000 NA   NA
 7684094 7684095 BAA_B0032 BAA_B0033     FALSE 0.319 78.000 0.000 NA   NA
 7684095 7684096 BAA_B0033 BAA_B0034     FALSE 0.021 275.000 0.000 NA   NA
 7684096 7684097 BAA_B0034 BAA_B0035     FALSE 0.006 507.000 0.000 NA   NA
 7684097 7684098 BAA_B0035 BAA_B0036     FALSE 0.004 876.000 0.000 NA   NA
 7684098 7684099 BAA_B0036 BAA_B0037     FALSE 0.326 -13.000 0.000 NA   NA
 7684099 7684100 BAA_B0037 BAA_B0038     FALSE 0.380 -9.000 0.000 NA   NA
 7684100 7684101 BAA_B0038 BAA_B0039     FALSE 0.028 256.000 0.000 NA   NA
 7684101 7684102 BAA_B0039 BAA_B0040     FALSE 0.319 78.000 0.000 NA   NA
 7684102 7684103 BAA_B0040 BAA_B0041     FALSE 0.068 203.000 0.000 NA   NA
 7684104 7684105 BAA_B0042 BAA_B0043     FALSE 0.011 338.000 0.000 NA   NA
 7684105 7684106 BAA_B0043 BAA_B0044     TRUE 0.723 -7.000 0.500 NA   NA
 7684106 7684107 BAA_B0044 BAA_B0045     FALSE 0.076 199.000 0.000 NA   NA
 7684107 7684108 BAA_B0045 BAA_B0046     FALSE 0.013 320.000 0.000 NA   NA
 7684108 7684109 BAA_B0046 BAA_B0047     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7684112 7684113 BAA_B0050 BAA_B0051     FALSE 0.447 28.000 0.000 NA   NA
 7684113 7684114 BAA_B0051 BAA_B0052     FALSE 0.009 366.000 0.000 NA   NA
 7684114 7684115 BAA_B0052 BAA_B0053     FALSE 0.208 162.000 0.000 NA   NA
 7684115 7684116 BAA_B0053 BAA_B0054     FALSE 0.005 583.000 0.000 NA   NA
 7684116 7684117 BAA_B0054 BAA_B0055     FALSE 0.620 49.000 0.500 NA   NA
 7684118 7684119 BAA_B0056 BAA_B0057     FALSE 0.008 377.000 0.000 NA   NA
 7684119 7684120 BAA_B0057 BAA_B0058     FALSE 0.006 437.000 0.000 NA   NA
 7684120 7684121 BAA_B0058 BAA_B0059     FALSE 0.380 -9.000 0.000 NA   NA
 7684122 7684123 BAA_B0060 BAA_B0061     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684123 7684124 BAA_B0061 BAA_B0062     FALSE 0.398 99.000 0.000 NA   NA
 7684124 7684125 BAA_B0062 BAA_B0063     FALSE 0.485 117.000 0.000 NA   NA
 7684125 7684126 BAA_B0063 BAA_B0064     FALSE 0.303 51.000 0.000 NA   NA
 7684126 7684127 BAA_B0064 BAA_B0065   acpB FALSE 0.004 1047.000 0.000 NA   NA
 7684129 7684130 BAA_B0067 BAA_B0068 capE capD FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7684130 7684131 BAA_B0068 BAA_B0069 capD capA TRUE 0.902 -3.000 0.400 1.000 N NA
 7684131 7684132 BAA_B0069 BAA_B0071 capA capC TRUE 0.739 12.000 0.000 1.000   NA
 7684132 7684133 BAA_B0071 BAA_B0072 capC capB TRUE 0.832 15.000 0.000 0.000   NA
 7684135 7684136 BAA_B0074 BAA_B0075     FALSE 0.387 36.000 0.000 NA   NA
 7684136 7684137 BAA_B0075 BAA_B0076     FALSE 0.009 373.000 0.000 NA   NA
 7684137 7684138 BAA_B0076 BAA_B0077     FALSE 0.005 699.000 0.000 NA   NA
 7684138 7684139 BAA_B0077 BAA_B0078     FALSE 0.010 353.000 0.000 NA   NA
 7684139 7684140 BAA_B0078 BAA_B0079     FALSE 0.337 147.000 0.000 NA   NA
 7684141 7684142 BAA_B0080 BAA_B0081     FALSE 0.465 26.000 0.000 NA   NA
 7684142 7684143 BAA_B0081 BAA_B0082     FALSE 0.299 72.000 0.000 NA   NA
 7684143 7684144 BAA_B0082 BAA_B0083     FALSE 0.487 111.000 0.000 NA   NA
 7684144 7684145 BAA_B0083 BAA_B0084     FALSE 0.018 290.000 0.000 NA   NA
 7684145 7684146 BAA_B0084 BAA_B0085     FALSE 0.004 1064.000 0.000 NA   NA
 7684146 7684147 BAA_B0085 BAA_B0086   acpA FALSE 0.004 1636.000 0.000 NA   NA
 7684147 7684148 BAA_B0086 BAA_B0087 acpA   FALSE 0.006 515.000 0.000 NA   NA
 7684148 7684149 BAA_B0087 BAA_B0088     FALSE 0.013 319.000 0.000 NA   NA
 7684151 7684152 BAA_B0090 BAA_B0091     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684153 7684154 BAA_B0092 BAA_B0093     FALSE 0.337 147.000 0.000 NA   NA
 7684154 7684155 BAA_B0093 BAA_B0094     FALSE 0.071 202.000 0.000 NA   NA
 7684155 7684156 BAA_B0094 BAA_B0095     FALSE 0.009 371.000 0.000 NA   NA
 7684157 7684158 BAA_B0096 BAA_B0097     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684158 7684159 BAA_B0097 BAA_B0098     FALSE 0.486 24.000 0.000 NA   NA
 7684160 7684161 BAA_B0099 BAA_B0100     FALSE 0.208 162.000 0.000 NA   NA
 7684161 7684162 BAA_B0100 BAA_B0101     FALSE 0.490 112.000 0.000 NA   NA
 7684163 7684164 BAA_B0102 BAA_B0103     FALSE 0.014 316.000 0.000 NA   NA
 7684164 7684165 BAA_B0103 BAA_B0104     FALSE 0.299 72.000 0.000 NA   NA
 7684166 7684167 BAA_B0105 BAA_B0106     FALSE 0.052 215.000 0.000 NA   NA
 7684167 7684168 BAA_B0106 BAA_B0107     FALSE 0.351 146.000 0.000 NA   NA
 7684168 7684169 BAA_B0107 BAA_B0108   topB FALSE 0.298 55.000 0.000 NA   NA
 7684169 7684170 BAA_B0108 BAA_B0109 topB   FALSE 0.008 377.000 0.000 NA   NA
 7684170 7684171 BAA_B0109 BAA_B0110     FALSE 0.330 80.000 0.000 NA   NA
 7684171 7684172 BAA_B0110 BAA_B0111     FALSE 0.515 22.000 0.000 NA   NA
 7684172 7684173 BAA_B0111 BAA_B0112     FALSE 0.295 64.000 0.000 NA   NA
 7684173 7684174 BAA_B0112 BAA_B0113     FALSE 0.380 -9.000 0.000 NA   NA
 7684174 7684175 BAA_B0113 BAA_B0114     FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7684175 7684063 BAA_B0114 BAA_B0001     FALSE 0.327 44.000 0.000 NA   NA
 7684176 7684177 BAA_A0001 BAA_A0002     FALSE 0.029 254.000 0.000 NA   NA
 7684178 7684179 BAA_A0003 BAA_A0004     TRUE 0.852 18.000 0.600 NA   NA
 7684179 7684180 BAA_A0004 BAA_A0005     TRUE 0.857 17.000 0.600 NA   NA
 7684181 7684182 BAA_A0006 BAA_A0007     TRUE 0.686 -16.000 0.667 NA   NA
 7684183 7684184 BAA_A0008 BAA_A0009     TRUE 0.900 0.000 0.750 NA   NA
 7684184 7684185 BAA_A0009 BAA_A0010     FALSE 0.012 336.000 0.000 NA   NA
 7684185 7684186 BAA_A0010 BAA_A0011     TRUE 0.872 17.000 0.667 NA   NA
 7684186 7684187 BAA_A0011 BAA_A0012     FALSE 0.337 147.000 0.000 NA   NA
 7684187 7684188 BAA_A0012 BAA_A0013     FALSE 0.501 23.000 0.000 NA   NA
 7684188 7684189 BAA_A0013 BAA_A0014     FALSE 0.005 604.000 0.000 NA   NA
 7684189 7684190 BAA_A0014 BAA_A0015     TRUE 0.684 72.000 0.667 NA   NA
 7684190 7684191 BAA_A0015 BAA_A0016     TRUE 0.719 16.000 0.250 NA   NA
 7684191 7684192 BAA_A0016 BAA_A0017     FALSE 0.577 103.000 0.250 NA   NA
 7684192 7684193 BAA_A0017 BAA_A0018     TRUE 0.877 16.000 0.667 NA   NA
 7684195 7684196 BAA_A0020 BAA_A0021     FALSE 0.542 64.000 0.400 NA   NA
 7684196 7684197 BAA_A0021 BAA_A0022     FALSE 0.235 159.000 0.000 NA   NA
 7684198 7684199 BAA_A0023 BAA_A0024     FALSE 0.005 609.000 0.000 NA   NA
 7684199 7684200 BAA_A0024 BAA_A0025     FALSE 0.004 1227.000 0.000 NA   NA
 7684201 7684202 BAA_A0026 BAA_A0027     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684204 7684205 BAA_A0029 BAA_A0030     FALSE 0.483 120.000 0.000 NA   NA
 7684205 7684206 BAA_A0030 BAA_A0031     TRUE 0.645 9.000 0.000 NA   NA
 7684206 7684207 BAA_A0031 BAA_A0032     FALSE 0.387 36.000 0.000 NA   NA
 7684207 7684208 BAA_A0032 BAA_A0033     FALSE 0.478 124.000 0.000 NA   NA
 7684208 7684209 BAA_A0033 BAA_A0034     FALSE 0.304 75.000 0.000 NA   NA
 7684209 7684210 BAA_A0034 BAA_A0035     FALSE 0.382 95.000 0.000 NA   NA
 7684212 7684213 BAA_A0037 BAA_A0038     FALSE 0.307 197.000 0.667 NA   NA
 7684213 7684214 BAA_A0038 BAA_A0039     FALSE 0.385 96.000 0.000 NA   NA
 7684214 7684215 BAA_A0039 BAA_A0040     FALSE 0.320 45.000 0.000 NA   NA
 7684215 7684216 BAA_A0040 BAA_A0041     FALSE 0.047 220.000 0.000 NA   NA
 7684216 7684217 BAA_A0041 BAA_A0042     FALSE 0.009 359.000 0.000 NA   NA
 7684217 7684218 BAA_A0042 BAA_A0043     FALSE 0.041 229.000 0.000 NA   NA
 7684219 7684220 BAA_A0044 BAA_A0045     FALSE 0.603 0.000 0.000 NA   NA
 7684221 7684222 BAA_A0046 BAA_A0047     TRUE 0.782 10.000 0.273 NA   NA
 7684222 7684223 BAA_A0047 BAA_A0048     FALSE 0.010 356.000 0.000 NA   NA
 7684223 7684224 BAA_A0048 BAA_A0049     TRUE 0.769 16.000 0.200 1.000   NA
 7684225 7684226 BAA_A0050 BAA_A0051     FALSE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 7684227 7684228 BAA_A0052 BAA_A0053     FALSE 0.007 410.000 0.000 NA   NA
 7684228 7684229 BAA_A0053 BAA_A0054     FALSE 0.303 51.000 0.000 NA   NA
 7684229 7684230 BAA_A0054 BAA_A0055     FALSE 0.416 -7.000 0.000 NA   NA
 7684231 7684232 BAA_A0056 BAA_A0057     FALSE 0.174 186.000 0.000 1.000   NA
 7684233 7684234 BAA_A0058 BAA_A0059     FALSE 0.480 122.000 0.000 NA   NA
 7684234 7684235 BAA_A0059 BAA_A0060     FALSE 0.375 92.000 0.000 NA   NA
 7684236 7684237 BAA_A0061 BAA_A0062     TRUE 0.703 27.000 0.400 NA   NA
 7684237 7684238 BAA_A0062 BAA_A0063     FALSE 0.479 123.000 0.000 NA   NA
 7684239 7684240 BAA_A0064 BAA_A0065     TRUE 0.884 18.000 0.750 NA   NA
 7684240 7684241 BAA_A0065 BAA_A0066     TRUE 0.761 107.000 0.500 NA   NA
 7684241 7684242 BAA_A0066 BAA_A0067   repX FALSE 0.006 437.000 0.000 NA   NA
 7684242 7684243 BAA_A0067 BAA_A0068 repX   FALSE 0.447 28.000 0.000 NA   NA
 7684244 7684245 BAA_A0069 BAA_A0070     FALSE 0.095 192.000 0.000 NA   NA
 7684247 7684248 BAA_A0072 BAA_A0073     FALSE 0.005 710.000 0.000 NA   NA
 7684248 7684249 BAA_A0073 BAA_A0074     TRUE 0.875 20.000 0.750 NA   NA
 7684249 7684250 BAA_A0074 BAA_A0075     TRUE 0.888 17.000 0.750 NA   NA
 7684250 7684251 BAA_A0075 BAA_A0076     TRUE 0.837 26.000 0.750 NA   NA
 7684251 7684252 BAA_A0076 BAA_A0077     FALSE 0.027 257.000 0.000 NA   NA
 7684252 7684253 BAA_A0077 BAA_A0078     FALSE 0.626 155.000 0.600 NA   NA
 7684253 7684254 BAA_A0078 BAA_A0079     TRUE 0.789 132.000 0.600 NA   NA
 7684256 7684257 BAA_A0081 BAA_A0082 cpaB   FALSE 0.023 271.000 0.000 NA   NA
 7684257 7684258 BAA_A0082 BAA_A0083     TRUE 0.948 17.000 0.750 1.000 N NA
 7684258 7684259 BAA_A0083 BAA_A0084     TRUE 0.808 -7.000 0.750 NA   NA
 7684259 7684260 BAA_A0084 BAA_A0085     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7684260 7684261 BAA_A0085 BAA_A0086     FALSE 0.629 2.000 0.000 NA   NA
 7684261 7684262 BAA_A0086 BAA_A0087     FALSE 0.335 43.000 0.000 NA   NA
 7684262 7684263 BAA_A0087 BAA_A0088     FALSE 0.300 73.000 0.000 NA   NA
 7684263 7684264 BAA_A0088 BAA_A0089     FALSE 0.607 69.000 0.500 NA   NA
 7684264 7684265 BAA_A0089 BAA_A0090     TRUE 0.637 32.000 0.333 NA   NA
 7684265 7684266 BAA_A0090 BAA_A0091     FALSE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 7684266 7684267 BAA_A0091 BAA_A0092     FALSE 0.047 220.000 0.000 NA   NA
 7684267 7684268 BAA_A0092 BAA_A0093     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684268 7684269 BAA_A0093 BAA_A0094     FALSE 0.050 217.000 0.000 NA   NA
 7684269 7684270 BAA_A0094 BAA_A0095     FALSE 0.005 528.000 0.000 NA   NA
 7684272 7684273 BAA_A0097 BAA_A0098     TRUE 0.728 138.000 0.500 NA   NA
 7684277 7684278 BAA_A0102 BAA_A0103     TRUE 0.714 67.000 0.750 NA   NA
 7684278 7684279 BAA_A0103 BAA_A0104     FALSE 0.619 1.000 0.000 NA   NA
 7684279 7684280 BAA_A0104 BAA_A0105     TRUE 0.638 3.000 0.000 NA   NA
 7684280 7684281 BAA_A0105 BAA_A0106     FALSE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 7684281 7684282 BAA_A0106 BAA_A0107     FALSE 0.515 22.000 0.000 NA   NA
 7684282 7684283 BAA_A0107 BAA_A0108     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684283 7684284 BAA_A0108 BAA_A0109     FALSE 0.551 19.000 0.000 NA   NA
 7684284 7684285 BAA_A0109 BAA_A0110     FALSE 0.572 17.000 0.000 NA   NA
 7684285 7684286 BAA_A0110 BAA_A0111     FALSE 0.628 157.000 0.667 NA   NA
 7684286 7684287 BAA_A0111 BAA_A0112     TRUE 0.757 -9.000 0.667 NA   NA
 7684287 7684288 BAA_A0112 BAA_A0113     TRUE 0.706 130.000 0.400 NA   NA
 7684288 7684289 BAA_A0113 BAA_A0114     FALSE 0.420 76.000 0.200 NA   NA
 7684290 7684291 BAA_A0115 BAA_A0116     TRUE 0.711 40.000 0.600 NA   NA
 7684293 7684294 BAA_A0118 BAA_A0119     FALSE 0.004 743.000 0.000 NA   NA
 7684294 7684295 BAA_A0119 BAA_A0120     FALSE 0.397 141.000 0.000 NA   NA
 7684296 7684297 BAA_A0121 BAA_A0122     FALSE 0.006 457.000 0.000 NA   NA
 7684297 7684298 BAA_A0122 BAA_A0123     FALSE 0.023 270.000 0.000 NA   NA
 7684299 7684300 BAA_A0124 BAA_A0125     FALSE 0.005 622.000 0.000 NA   NA
 7684301 7684302 BAA_A0126 BAA_A0127     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684302 7684303 BAA_A0127 BAA_A0128     FALSE 0.342 42.000 0.000 NA   NA
 7684303 7684304 BAA_A0128 BAA_A0129     TRUE 0.950 27.000 0.222 1.000 Y NA
 7684304 7684305 BAA_A0129 BAA_A0130     FALSE 0.005 685.000 0.000 NA   NA
 7684305 7684306 BAA_A0130 BAA_A0131     FALSE 0.007 395.000 0.000 NA   NA
 7684306 7684307 BAA_A0131 BAA_A0132     FALSE 0.529 21.000 0.000 NA   NA
 7684307 7684308 BAA_A0132 BAA_A0133     FALSE 0.529 21.000 0.000 NA   NA
 7684310 7684311 BAA_A0135 BAA_A0136     FALSE 0.596 15.000 0.000 NA   NA
 7684312 7684313 BAA_A0137 BAA_A0138     FALSE 0.348 41.000 0.000 NA   NA
 7684313 7684314 BAA_A0138 BAA_A0139     FALSE 0.389 97.000 0.000 NA   NA
 7684314 7684315 BAA_A0139 BAA_A0140     FALSE 0.004 824.000 0.000 NA   NA
 7684315 7684316 BAA_A0140 BAA_A0141     TRUE 0.812 130.000 0.667 NA   NA
 7684316 7684317 BAA_A0141 BAA_A0142     TRUE 0.684 54.000 0.667 NA   NA
 7684318 7684319 BAA_A0143 BAA_A0144   cya FALSE 0.004 1060.000 0.000 NA   NA
 7684319 7684320 BAA_A0144 BAA_A0145 cya apt2 FALSE 0.019 287.000 0.000 NA   NA
 7684321 7684322 BAA_A0146 BAA_A0147     FALSE 0.562 18.000 0.000 NA   NA
 7684322 7684323 BAA_A0147 BAA_A0148     TRUE 0.652 6.000 0.000 NA   NA
 7684323 7684324 BAA_A0148 BAA_A0149     FALSE 0.304 75.000 0.000 NA   NA
 7684324 7684325 BAA_A0149 BAA_A0150     FALSE 0.441 29.000 0.000 NA   NA
 7684325 7684326 BAA_A0150 BAA_A0151   atxA FALSE 0.011 339.000 0.000 NA   NA
 7684329 7684330 BAA_A0154 BAA_A0155     FALSE 0.297 70.000 0.000 NA   NA
 7684330 7684331 BAA_A0155 BAA_A0156     FALSE 0.068 203.000 0.000 NA   NA
 7684333 7684334 BAA_A0158 BAA_A0159   gerXB FALSE 0.021 329.000 0.000 1.000   NA
 7684334 7684335 BAA_A0159 BAA_A0160 gerXB gerXA TRUE 0.826 44.000 0.750 0.005   NA
 7684335 7684336 BAA_A0160 BAA_A0161 gerXA gerXC TRUE 0.869 23.000 0.500 0.005   NA
 7684336 7684337 BAA_A0161 BAA_A0162 gerXC   FALSE 0.341 83.000 0.000 NA   NA
 7684341 7684342 BAA_A0166 BAA_A0167     FALSE 0.016 302.000 0.000 NA   NA
 7684342 7684343 BAA_A0167 BAA_A0168   pagA FALSE 0.009 359.000 0.000 NA   NA
 7684343 7684344 BAA_A0168 BAA_A0169 pagA pagR FALSE 0.007 923.000 0.000 1.000   NA
 7684346 7684347 BAA_A0171 BAA_A0172     FALSE 0.486 24.000 0.000 NA   NA
 7684348 7684349 BAA_A0173 BAA_A0174 lef   FALSE 0.227 -34.000 0.000 NA   NA
 7684350 7684351 BAA_A0175 BAA_A0176     FALSE 0.300 -16.000 0.000 NA   NA
 7684351 7684352 BAA_A0176 BAA_A0177     FALSE 0.300 -16.000 0.000 NA   NA
 7684352 7684353 BAA_A0177 BAA_A0178     FALSE 0.008 379.000 0.000 NA   NA
 7684353 7684354 BAA_A0178 BAA_A0179     FALSE 0.447 28.000 0.000 NA   NA
 7684354 7684355 BAA_A0179 BAA_A0180     FALSE 0.530 -3.000 0.000 NA   NA
 7684356 7684357 BAA_A0181 BAA_A0182     FALSE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 7684357 7684358 BAA_A0182 BAA_A0183     FALSE 0.054 213.000 0.000 NA   NA
 7684359 7684360 BAA_A0184 BAA_A0185     FALSE 0.472 127.000 0.000 NA   NA
 7684360 7684361 BAA_A0185 BAA_A0186     FALSE 0.515 22.000 0.000 NA   NA
 7684363 7684364 BAA_A0188 BAA_A0189     FALSE 0.025 265.000 0.000 NA   NA
 7684364 7684365 BAA_A0189 BAA_A0190     FALSE 0.018 289.000 0.000 NA   NA
 7684365 7684366 BAA_A0190 BAA_A0191     FALSE 0.053 214.000 0.000 NA   NA
 7684366 7684367 BAA_A0191 BAA_A0192     FALSE 0.448 133.000 0.000 NA   NA
 7684367 7684368 BAA_A0192 BAA_A0193     TRUE 0.854 13.000 0.500 NA   NA
 7684369 7684370 BAA_A0194 BAA_A0195     FALSE 0.529 21.000 0.000 NA   NA
 7684370 7684371 BAA_A0195 BAA_A0196     FALSE 0.313 -15.000 0.000 NA   NA
 7684372 7684373 BAA_A0197 BAA_A0198     FALSE 0.233 -33.000 0.000 NA   NA
 7684373 7684374 BAA_A0198 BAA_A0199     FALSE 0.295 64.000 0.000 NA   NA
 7684374 7684375 BAA_A0199 BAA_A0200     FALSE 0.295 63.000 0.000 NA   NA
 7684375 7684376 BAA_A0200 BAA_A0201     FALSE 0.005 653.000 0.000 NA   NA
 7684378 7684379 BAA_A0203 BAA_A0204     FALSE 0.054 244.000 0.000 1.000   NA
 7684380 7684381 BAA_A0205 BAA_A0206     FALSE 0.388 142.000 0.000 NA   NA
 7684381 7684382 BAA_A0206 BAA_A0207     FALSE 0.361 -10.000 0.000 NA   NA
 7684382 7684383 BAA_A0207 BAA_A0208     FALSE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 7684384 7684385 BAA_A0209 BAA_A0210     TRUE 0.731 -3.000 0.333 NA   NA
 7684385 7684386 BAA_A0210 BAA_A0211   hfq FALSE 0.270 193.000 0.500 NA   NA
 7684387 7684388 BAA_A0212 BAA_A0213     FALSE 0.361 88.000 0.000 NA   NA
 7684388 7684389 BAA_A0213 BAA_A0214     FALSE 0.327 44.000 0.000 NA   NA
 7684389 7684390 BAA_A0214 BAA_A0215     FALSE 0.612 74.000 0.500 NA   NA
 7684390 7684391 BAA_A0215 BAA_A0216     TRUE 0.686 52.000 0.667 NA   NA
 7684391 7684392 BAA_A0216 BAA_A0217     FALSE 0.320 45.000 0.000 NA   NA
 7684392 7684393 BAA_A0217 BAA_A0218   topX FALSE 0.155 175.000 0.000 NA   NA
 7684393 7684394 BAA_A0218 BAA_A0219 topX   FALSE 0.005 567.000 0.000 NA   NA
 7684394 7684395 BAA_A0219 BAA_A0220     FALSE 0.397 141.000 0.000 NA   NA