MicrobesOnline Operon Predictions for Rickettsiella grylli

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3985674 3985675 RICGR_0001 RICGR_0002     TRUE 0.907 0.000 0.000 0.072   NA
 3985677 3985678 RICGR_0004 RICGR_0005     FALSE 0.029 577.000 0.000 NA   NA
 3985679 3985680 RICGR_0006 RICGR_0007     TRUE 0.803 -22.000 0.000 NA   NA
 3985680 3985681 RICGR_0007 RICGR_0008     FALSE 0.061 207.000 0.000 NA   NA
 3985681 3985682 RICGR_0008 RICGR_0009     FALSE 0.102 154.000 0.000 NA   NA
 3985682 3985683 RICGR_0009 RICGR_0010     FALSE 0.088 168.000 0.000 NA   NA
 3985683 3985684 RICGR_0010 RICGR_0011     TRUE 0.502 22.000 0.000 NA   NA
 3985684 3985685 RICGR_0011 RICGR_0012     TRUE 0.780 -39.000 0.000 NA   NA
 3985686 3985687 RICGR_0013 RICGR_0014     FALSE 0.122 139.000 0.000 NA   NA
 3985687 3985688 RICGR_0014 RICGR_0015     FALSE 0.034 363.000 0.000 NA   NA
 3985688 3985689 RICGR_0015 RICGR_0016     FALSE 0.300 75.000 0.000 NA   NA
 3985689 3985690 RICGR_0016 RICGR_0017     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 3985690 3985691 RICGR_0017 RICGR_0018     TRUE 0.808 -19.000 0.000 NA   NA
 3985691 3985692 RICGR_0018 RICGR_0019     FALSE 0.046 264.000 0.000 NA   NA
 3985693 3985694 RICGR_0020 RICGR_0021     FALSE 0.040 289.000 0.000 NA   NA
 3985694 3985695 RICGR_0021 RICGR_0022     FALSE 0.038 293.000 0.000 NA   NA
 3985695 3985696 RICGR_0022 RICGR_0023     TRUE 0.831 2.000 0.000 1.000   NA
 3985696 3985697 RICGR_0023 RICGR_0024     TRUE 0.998 5.000 0.530 NA Y NA
 3985697 3985698 RICGR_0024 RICGR_0025     TRUE 0.997 1.000 0.562 NA   NA
 3985698 3985699 RICGR_0025 RICGR_0026   ttg2D TRUE 0.982 -3.000 0.091 NA   NA
 3985699 3985700 RICGR_0026 RICGR_0027 ttg2D   TRUE 0.964 6.000 0.064 NA   NA
 3985700 3985701 RICGR_0027 RICGR_0028   murA FALSE 0.391 134.000 0.011 NA   NA
 3985702 3985703 RICGR_0029 RICGR_0030     FALSE 0.058 244.000 0.000 1.000 N NA
 3985704 3985705 RICGR_0031 RICGR_0032     FALSE 0.162 194.000 0.000 1.000 Y NA
 3985705 3985706 RICGR_0032 RICGR_0033   xylT TRUE 0.440 103.000 0.000 1.000 Y NA
 3985706 3985707 RICGR_0033 RICGR_0034 xylT   TRUE 0.485 26.000 0.000 1.000 N NA
 3985707 3985708 RICGR_0034 RICGR_0035     TRUE 0.964 63.000 0.333 0.049 N NA
 3985709 3985710 RICGR_0036 RICGR_0037     FALSE 0.044 272.000 0.000 NA   NA
 3985710 3985711 RICGR_0037 RICGR_0038     FALSE 0.055 222.000 0.000 NA   NA
 3985712 3985713 RICGR_0039 RICGR_0040   iscA FALSE 0.236 98.000 0.000 NA   NA
 3985713 3985714 RICGR_0040 RICGR_0041 iscA   FALSE 0.085 170.000 0.000 NA   NA
 3985714 3985715 RICGR_0041 RICGR_0042     TRUE 0.741 8.000 0.000 NA   NA
 3985717 3985718 RICGR_0044 RICGR_0045   grxC FALSE 0.354 37.000 0.000 NA N NA
 3985718 3985719 RICGR_0045 RICGR_0046 grxC secB TRUE 0.815 4.000 0.000 1.000 N NA
 3985719 3985720 RICGR_0046 RICGR_0047 secB coaE TRUE 0.760 9.000 0.000 1.000 N NA
 3985720 3985721 RICGR_0047 RICGR_0048 coaE   FALSE 0.152 125.000 0.000 NA   NA
 3985721 3985722 RICGR_0048 RICGR_0049     FALSE 0.086 169.000 0.000 NA   NA
 3985722 3985723 RICGR_0049 RICGR_0050   parE TRUE 0.937 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3985725 3985726 RICGR_1568 RICGR_0054     FALSE 0.057 213.000 0.000 NA   NA
 3985727 3985728 RICGR_0053 RICGR_0055   metG TRUE 0.773 30.000 0.014 1.000 N NA
 3985729 3985730 RICGR_0056 RICGR_0057 mrp dcd TRUE 0.952 16.000 0.112 1.000 N NA
 3985732 3985733 RICGR_0059 RICGR_0060   pckA FALSE 0.281 83.000 0.000 NA   NA
 3985734 3985735 RICGR_0062 RICGR_0063     TRUE 0.756 7.000 0.000 NA   NA
 3985735 3985736 RICGR_0063 RICGR_0064     TRUE 0.998 -3.000 0.642 NA   NA
 3985737 3985738 RICGR_0065 RICGR_0066 dapA   FALSE 0.214 104.000 0.000 NA   NA
 3985738 3985739 RICGR_0066 RICGR_1569     TRUE 0.712 10.000 0.000 NA   NA
 3985741 3985742 RICGR_0069 RICGR_0070 cioA cydB TRUE 0.988 1.000 0.041 0.045 Y NA
 3985743 3985744 RICGR_0071 RICGR_0072     FALSE 0.347 36.000 0.000 NA   NA
 3985745 3985746 RICGR_0073 RICGR_0074 def fmt TRUE 0.978 -3.000 0.003 0.068 Y NA
 3985746 3985747 RICGR_0074 RICGR_0075 fmt sun TRUE 0.997 -7.000 0.305 1.000 Y NA
 3985747 3985748 RICGR_0075 RICGR_0076 sun argS FALSE 0.233 158.000 0.000 1.000 Y NA
 3985748 3985749 RICGR_0076 RICGR_0077 argS   TRUE 0.973 1.000 0.052 NA N NA
 3985749 3985750 RICGR_0077 RICGR_0078   hslV TRUE 0.823 89.000 0.122 NA N NA
 3985750 3985751 RICGR_0078 RICGR_0079 hslV hslU TRUE 0.993 28.000 0.752 1.000 Y NA
 3985751 3985752 RICGR_0079 RICGR_0080 hslU   TRUE 0.963 8.000 0.070 1.000   NA
 3985753 3985754 RICGR_0081 RICGR_0082 tyrS   TRUE 0.831 2.000 0.000 1.000   NA
 3985755 3985756 RICGR_0083 RICGR_0084     TRUE 0.726 9.000 0.000 NA   NA
 3985756 3985757 RICGR_0084 RICGR_0085     TRUE 0.712 10.000 0.000 NA   NA
 3985758 3985759 RICGR_0086 RICGR_0087     TRUE 0.998 -3.000 0.575 NA   NA
 3985760 3985761 RICGR_0088 RICGR_0089     FALSE 0.307 88.000 0.000 1.000 N NA
 3985761 3985762 RICGR_0089 RICGR_0090   hemC TRUE 0.653 16.000 0.000 1.000 N NA
 3985763 3985764 RICGR_0091 RICGR_0092 nth   TRUE 0.500 77.000 0.000 0.012   NA
 3985765 3985766 RICGR_0093 RICGR_0094 rpsO   TRUE 0.949 107.000 0.335 1.000 Y NA
 3985766 3985767 RICGR_0094 RICGR_0095     TRUE 0.841 0.000 0.000 NA N NA
 3985767 3985768 RICGR_0095 RICGR_1570     TRUE 0.612 16.000 0.000 NA   NA
 3985768 3985769 RICGR_1570 RICGR_0097     FALSE 0.094 160.000 0.000 NA   NA
 3985769 3985770 RICGR_0097 RICGR_0098   carA TRUE 0.798 3.000 0.000 NA   NA
 3985770 3985771 RICGR_0098 RICGR_0099 carA carB TRUE 0.770 6.000 0.000 NA   NA
 3985771 3985772 RICGR_0099 RICGR_0100 carB pyrB FALSE 0.279 84.000 0.000 NA   NA
 3985772 3985773 RICGR_0100 RICGR_0101 pyrB pyrI TRUE 0.985 21.000 0.197 0.002 Y NA
 3985773 3985774 RICGR_0101 RICGR_0102 pyrI pyrC TRUE 0.974 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 3985775 3985776 RICGR_0103 RICGR_0104     TRUE 0.998 0.000 0.765 1.000   NA
 3985776 3985777 RICGR_0104 RICGR_0105   hemD TRUE 0.998 -21.000 0.600 1.000 Y NA
 3985778 3985779 RICGR_0106 RICGR_0107 pgk pyk TRUE 0.979 -3.000 0.002 0.009 Y NA
 3985782 3985783 RICGR_0110 RICGR_0111     TRUE 0.798 3.000 0.000 NA   NA
 3985784 3985785 RICGR_0112 RICGR_1571 smpB   FALSE 0.309 71.000 0.000 NA   NA
 3985785 3985786 RICGR_1571 RICGR_0113     FALSE 0.091 165.000 0.000 NA   NA
 3985786 3985787 RICGR_0113 RICGR_0115     TRUE 0.882 30.000 0.102 NA N NA
 3985788 3985789 RICGR_0114 RICGR_0116     FALSE 0.232 99.000 0.000 NA   NA
 3985789 3985790 RICGR_0116 RICGR_0117   guaB TRUE 0.930 86.000 0.190 0.002   NA
 3985791 3985792 RICGR_0118 RICGR_0119     FALSE 0.198 110.000 0.000 NA   NA
 3985792 3985793 RICGR_0119 RICGR_0120     FALSE 0.063 229.000 0.000 1.000 N NA
 3985793 3985794 RICGR_0120 RICGR_0121     TRUE 0.988 -7.000 0.156 1.000   NA
 3985794 3985795 RICGR_0121 RICGR_0122     TRUE 0.892 23.000 0.067 1.000   NA
 3985795 3985796 RICGR_0122 RICGR_0123   hisS TRUE 0.825 3.000 0.000 1.000 N NA
 3985796 3985797 RICGR_0123 RICGR_0124 hisS   TRUE 0.993 -7.000 0.259 NA   NA
 3985797 3985798 RICGR_0124 RICGR_0125   yfgL TRUE 0.993 12.000 0.492 NA   NA
 3985798 3985799 RICGR_0125 RICGR_0126 yfgL   TRUE 0.989 -27.000 0.203 1.000   NA
 3985802 3985803 RICGR_0128 RICGR_0130     FALSE 0.316 45.000 0.000 NA   NA
 3985803 3985804 RICGR_0130 RICGR_0131   hisC FALSE 0.355 66.000 0.000 1.000 N NA
 3985807 3985808 RICGR_0134 RICGR_0135     FALSE 0.346 54.000 0.000 1.000 N NA
 3985808 3985809 RICGR_0135 RICGR_0136     TRUE 0.494 42.000 0.000 0.041   NA
 3985811 3985812 RICGR_0138 RICGR_0139     FALSE 0.312 49.000 0.000 NA   NA
 3985812 3985813 RICGR_0139 RICGR_0140     FALSE 0.311 51.000 0.000 NA   NA
 3985815 3985816 RICGR_0142 RICGR_0143     TRUE 0.823 1.000 0.000 NA   NA
 3985816 3985817 RICGR_0143 RICGR_0144     TRUE 0.782 -37.000 0.000 NA   NA
 3985817 3985818 RICGR_0144 RICGR_0145     TRUE 0.429 27.000 0.000 NA   NA
 3985818 3985819 RICGR_0145 RICGR_0146     FALSE 0.198 110.000 0.000 NA   NA
 3985821 3985822 RICGR_0148 RICGR_0149     TRUE 0.833 0.000 0.000 NA   NA
 3985822 3985823 RICGR_0149 RICGR_0150     FALSE 0.052 234.000 0.000 NA   NA
 3985823 3985824 RICGR_0150 RICGR_0151     TRUE 0.524 21.000 0.000 NA   NA
 3985824 3985825 RICGR_0151 RICGR_0152     TRUE 0.798 3.000 0.000 NA   NA
 3985825 3985826 RICGR_0152 RICGR_0153     FALSE 0.300 75.000 0.000 NA   NA
 3985826 3985827 RICGR_0153 RICGR_0154     TRUE 0.546 20.000 0.000 NA   NA
 3985827 3985828 RICGR_0154 RICGR_1572     FALSE 0.030 545.000 0.000 NA   NA
 3985829 3985830 RICGR_0156 RICGR_0157     FALSE 0.040 284.000 0.000 NA   NA
 3985830 3985831 RICGR_0157 RICGR_0158     TRUE 0.681 12.000 0.000 NA   NA
 3985831 3985832 RICGR_0158 RICGR_0159     TRUE 0.553 48.000 0.000 0.004   NA
 3985832 3985833 RICGR_0159 RICGR_0160     FALSE 0.049 243.000 0.000 NA   NA
 3985834 3985835 RICGR_0161 RICGR_0162   ileS FALSE 0.095 173.000 0.000 1.000 N NA
 3985835 3985836 RICGR_0162 RICGR_0163 ileS lspA TRUE 0.988 -7.000 0.147 1.000 N NA
 3985836 3985837 RICGR_0163 RICGR_0164 lspA   TRUE 0.909 0.000 0.000 0.082 N NA
 3985837 3985838 RICGR_0164 RICGR_0165     TRUE 0.834 -7.000 0.000 NA   NA
 3985838 3985839 RICGR_0165 RICGR_0166   rfaC FALSE 0.363 34.000 0.000 NA   NA
 3985839 3985840 RICGR_0166 RICGR_0167 rfaC priA FALSE 0.338 75.000 0.000 1.000 N NA
 3985840 3985841 RICGR_0167 RICGR_0168 priA sdaA FALSE 0.341 74.000 0.000 1.000 N NA
 3985842 3985843 RICGR_0169 RICGR_0170   mutS TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3985843 3985844 RICGR_0170 RICGR_0171 mutS folB FALSE 0.089 177.000 0.000 1.000 N NA
 3985844 3985845 RICGR_0171 RICGR_0172 folB gloB FALSE 0.071 197.000 0.000 1.000   NA
 3985845 3985846 RICGR_0172 RICGR_0173 gloB   FALSE 0.342 67.000 0.000 1.000   NA
 3985846 3985847 RICGR_0173 RICGR_0174   psd TRUE 0.557 62.000 0.000 1.000 Y NA
 3985848 3985849 RICGR_0175 RICGR_0176     TRUE 0.629 15.000 0.000 NA   NA
 3985849 3985850 RICGR_0176 RICGR_0177     FALSE 0.293 78.000 0.000 NA   NA
 3985850 3985851 RICGR_0177 RICGR_0178     FALSE 0.250 93.000 0.000 NA   NA
 3985851 3985852 RICGR_0178 RICGR_0179     FALSE 0.083 185.000 0.000 1.000 N NA
 3985852 3985853 RICGR_0179 RICGR_0180   pdhA TRUE 0.805 45.000 0.065 1.000 N NA
 3985853 3985854 RICGR_0180 RICGR_0181 pdhA   TRUE 0.999 -7.000 0.458 0.003 Y NA
 3985854 3985855 RICGR_0181 RICGR_0182     TRUE 0.999 -3.000 0.556 0.046 Y NA
 3985855 3985856 RICGR_0182 RICGR_0183   ksgA TRUE 0.787 7.000 0.000 1.000 N NA
 3985857 3985858 RICGR_0184 RICGR_0185     FALSE 0.114 143.000 0.000 NA   NA
 3985859 3985860 RICGR_0186 RICGR_0188 gidA mfd TRUE 0.636 17.000 0.000 1.000 N NA
 3985861 3985862 RICGR_0187 RICGR_0189     TRUE 0.838 22.000 0.014 1.000 N NA
 3985862 3985863 RICGR_0189 RICGR_0190     FALSE 0.135 133.000 0.000 NA   NA
 3985863 3985864 RICGR_0190 RICGR_0191   rpe TRUE 0.712 10.000 0.000 NA   NA
 3985864 3985865 RICGR_0191 RICGR_0192 rpe   TRUE 0.944 0.000 0.003 1.000 N NA
 3985866 3985867 RICGR_0193 RICGR_0195 kdtA ribE TRUE 0.774 8.000 0.000 1.000 N NA
 3985868 3985869 RICGR_0194 RICGR_0196     FALSE 0.122 139.000 0.000 NA   NA
 3985869 3985870 RICGR_0196 RICGR_0197     FALSE 0.170 119.000 0.000 NA   NA
 3985874 3985875 RICGR_0201 RICGR_0202     FALSE 0.034 364.000 0.000 NA   NA
 3985876 3985877 RICGR_0203 RICGR_0204     FALSE 0.320 42.000 0.000 NA   NA
 3985877 3985878 RICGR_0204 RICGR_0205     TRUE 0.797 -25.000 0.000 NA   NA
 3985878 3985879 RICGR_0205 RICGR_0206     FALSE 0.089 167.000 0.000 NA   NA
 3985879 3985880 RICGR_0206 RICGR_0207     TRUE 0.502 22.000 0.000 NA   NA
 3985880 3985881 RICGR_0207 RICGR_0208     FALSE 0.028 769.000 0.000 NA   NA
 3985881 3985882 RICGR_0208 RICGR_0210     TRUE 0.594 17.000 0.000 NA   NA
 3985883 3985884 RICGR_0209 RICGR_0211 asnB   TRUE 0.756 7.000 0.000 NA   NA
 3985884 3985885 RICGR_0211 RICGR_0212     FALSE 0.314 47.000 0.000 NA   NA
 3985885 3985886 RICGR_0212 RICGR_0213     TRUE 0.859 8.000 0.000 0.046 N NA
 3985886 3985887 RICGR_0213 RICGR_0214     TRUE 0.848 -10.000 0.000 1.000 N NA
 3985887 3985888 RICGR_0214 RICGR_0215     TRUE 0.803 -22.000 0.000 NA   NA
 3985888 3985889 RICGR_0215 RICGR_0216   glyA TRUE 0.778 -40.000 0.000 NA   NA
 3985890 3985891 RICGR_0217 RICGR_0218     TRUE 0.619 18.000 0.000 1.000 N NA
 3985891 3985892 RICGR_0218 RICGR_0219     FALSE 0.049 273.000 0.000 1.000   NA
 3985892 3985893 RICGR_0219 RICGR_0220     FALSE 0.038 307.000 0.000 NA   NA
 3985893 3985894 RICGR_0220 RICGR_0221     TRUE 0.502 22.000 0.000 NA   NA
 3985895 3985896 RICGR_0222 RICGR_0223   gidB FALSE 0.205 107.000 0.000 NA   NA
 3985896 3985897 RICGR_0223 RICGR_0224 gidB dapB TRUE 0.433 31.000 0.000 1.000 N NA
 3985897 3985898 RICGR_0224 RICGR_0225 dapB   FALSE 0.092 163.000 0.000 NA   NA
 3985901 3985902 RICGR_0228 RICGR_0229     TRUE 0.973 16.000 0.088 0.080 Y NA
 3985902 3985903 RICGR_0229 RICGR_0230     TRUE 0.867 66.000 0.088 0.080 N NA
 3985903 3985904 RICGR_0230 RICGR_0231     TRUE 0.439 80.000 0.000 0.080   NA
 3985905 3985906 RICGR_0232 RICGR_0233   gmk FALSE 0.383 35.000 0.000 1.000   NA
 3985906 3985907 RICGR_0233 RICGR_0234 gmk   TRUE 0.991 4.000 0.276 NA   NA
 3985908 3985909 RICGR_0235 RICGR_0236 rph   FALSE 0.088 178.000 0.000 1.000 N NA
 3985910 3985911 RICGR_0237 RICGR_0238   murB FALSE 0.159 123.000 0.000 NA   NA
 3985911 3985912 RICGR_0238 RICGR_0239 murB murC TRUE 0.994 1.000 0.136 0.010 Y NA
 3985912 3985913 RICGR_0239 RICGR_0240 murC   FALSE 0.302 85.000 0.000 1.000   NA
 3985913 3985914 RICGR_0240 RICGR_0241   ftsW TRUE 0.850 -7.000 0.000 1.000   NA
 3985914 3985915 RICGR_0241 RICGR_0242 ftsW murD TRUE 0.996 0.000 0.297 0.007 N NA
 3985915 3985916 RICGR_0242 RICGR_0243 murD trmU TRUE 0.753 17.000 0.000 0.058 N NA
 3985916 3985917 RICGR_0243 RICGR_0244 trmU   FALSE 0.107 159.000 0.000 1.000   NA
 3985917 3985918 RICGR_0244 RICGR_0245   cyoE TRUE 0.954 14.000 0.099 1.000   NA
 3985918 3985919 RICGR_0245 RICGR_0246 cyoE   FALSE 0.130 134.000 0.000 NA   NA
 3985920 3985921 RICGR_0247 RICGR_0249     FALSE 0.297 76.000 0.000 NA   NA
 3985922 3985923 RICGR_0248 RICGR_0250     TRUE 0.989 6.000 0.255 NA   NA
 3985923 3985924 RICGR_0250 RICGR_0251     TRUE 0.998 -3.000 0.722 NA   NA
 3985924 3985925 RICGR_0251 RICGR_0252     TRUE 0.750 72.000 0.041 NA   NA
 3985925 3985926 RICGR_0252 RICGR_0253     TRUE 0.969 80.000 0.536 1.000 N NA
 3985926 3985927 RICGR_0253 RICGR_0254   ctaD TRUE 0.989 8.000 0.268 1.000 N NA
 3985927 3985928 RICGR_0254 RICGR_0255 ctaD coxB TRUE 0.999 -16.000 0.741 0.004 Y NA
 3985928 3985929 RICGR_0255 RICGR_0256 coxB   TRUE 0.688 61.000 0.000 0.008 Y NA
 3985930 3985931 RICGR_0257 RICGR_0258     FALSE 0.131 138.000 0.000 NA N NA
 3985931 3985932 RICGR_0258 RICGR_0259     FALSE 0.344 55.000 0.000 1.000 N NA
 3985933 3985934 RICGR_0260 RICGR_0261 rho trx FALSE 0.315 272.000 0.087 1.000   NA
 3985934 3985935 RICGR_0261 RICGR_0262 trx   FALSE 0.353 40.000 0.000 1.000   NA
 3985936 3985937 RICGR_1575 RICGR_1576 rrs   FALSE 0.045 270.000 0.000 NA   NA
 3985937 3985938 RICGR_1576 RICGR_1577     FALSE 0.309 71.000 0.000 NA   NA
 3985938 3985939 RICGR_1577 RICGR_1578   rrl FALSE 0.029 579.000 0.000 NA   NA
 3985939 3985940 RICGR_1578 RICGR_1579 rrl rrf FALSE 0.039 290.000 0.000 NA   NA
 3985940 3985941 RICGR_1579 RICGR_0268 rrf queA FALSE 0.063 197.000 0.000 NA   NA
 3985941 3985942 RICGR_0268 RICGR_0269 queA yajC FALSE 0.279 89.000 0.000 NA N NA
 3985942 3985943 RICGR_0269 RICGR_0270 yajC secD TRUE 0.955 7.000 0.007 NA Y NA
 3985943 3985944 RICGR_0270 RICGR_0272 secD secF TRUE 0.967 17.000 0.030 0.002 Y NA
 3985946 3985947 RICGR_0273 RICGR_0274   tgt TRUE 0.848 13.000 0.000 1.000 Y NA
 3985949 3985950 RICGR_0276 RICGR_0277 kdsB   TRUE 0.895 17.000 0.023 NA N NA
 3985951 3985952 RICGR_0278 RICGR_0279     TRUE 0.485 26.000 0.000 1.000 N NA
 3985953 3985954 RICGR_0280 RICGR_0281     FALSE 0.319 59.000 0.000 NA N NA
 3985954 3985955 RICGR_0281 RICGR_0282     TRUE 0.681 12.000 0.000 NA   NA
 3985955 3985956 RICGR_0282 RICGR_0283     FALSE 0.210 105.000 0.000 NA   NA
 3985956 3985957 RICGR_0283 RICGR_0284     FALSE 0.309 52.000 0.000 NA   NA
 3985957 3985958 RICGR_0284 RICGR_0285     TRUE 0.783 -36.000 0.000 NA   NA
 3985958 3985959 RICGR_0285 RICGR_0286     TRUE 0.546 20.000 0.000 NA   NA
 3985959 3985960 RICGR_0286 RICGR_0287     FALSE 0.082 172.000 0.000 NA   NA
 3985960 3985961 RICGR_0287 RICGR_0288     TRUE 0.803 -22.000 0.000 NA   NA
 3985961 3985962 RICGR_0288 RICGR_0289     TRUE 0.576 18.000 0.000 NA   NA
 3985962 3985963 RICGR_0289 RICGR_0290     FALSE 0.059 208.000 0.000 NA   NA
 3985965 3985966 RICGR_0292 RICGR_0293     TRUE 0.484 23.000 0.000 NA   NA
 3985972 3985973 RICGR_1580 RICGR_0300     FALSE 0.032 424.000 0.000 NA   NA
 3985979 3985980 RICGR_0307 RICGR_0308     FALSE 0.072 182.000 0.000 NA   NA
 3985980 3985981 RICGR_0308 RICGR_0309     TRUE 0.819 -13.000 0.000 NA   NA
 3985981 3985982 RICGR_0309 RICGR_0310     FALSE 0.307 72.000 0.000 NA   NA
 3985984 3985985 RICGR_0314 RICGR_0315     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 3985985 3985986 RICGR_0315 RICGR_0316     TRUE 0.468 24.000 0.000 NA   NA
 3985986 3985987 RICGR_0316 RICGR_0317     FALSE 0.089 167.000 0.000 NA   NA
 3985987 3985988 RICGR_0317 RICGR_0318     TRUE 0.502 22.000 0.000 NA   NA
 3985988 3985989 RICGR_0318 RICGR_0319     FALSE 0.039 292.000 0.000 NA   NA
 3985989 3985990 RICGR_0319 RICGR_0320     FALSE 0.076 177.000 0.000 NA   NA
 3985992 3985993 RICGR_0322 RICGR_0324     TRUE 0.824 -10.000 0.000 NA   NA
 3985995 3985996 RICGR_0325 RICGR_0326     FALSE 0.080 173.000 0.000 NA   NA
 3985996 3985997 RICGR_0326 RICGR_0327     TRUE 0.834 -7.000 0.000 NA   NA
 3985997 3985998 RICGR_0327 RICGR_0328     TRUE 0.758 20.000 0.000 NA Y NA
 3985998 3985999 RICGR_0328 RICGR_0329     TRUE 0.756 7.000 0.000 NA   NA
 3985999 3986000 RICGR_0329 RICGR_0330     TRUE 0.824 -10.000 0.000 NA   NA
 3986000 3986001 RICGR_0330 RICGR_0331     TRUE 0.833 0.000 0.000 NA   NA
 3986001 3986002 RICGR_0331 RICGR_0332     TRUE 0.756 7.000 0.000 NA   NA
 3986002 3986003 RICGR_0332 RICGR_0333     TRUE 0.924 -10.000 0.000 NA Y NA
 3986003 3986004 RICGR_0333 RICGR_0334     TRUE 0.647 14.000 0.000 NA   NA
 3986004 3986005 RICGR_0334 RICGR_0335     FALSE 0.281 83.000 0.000 NA   NA
 3986005 3986006 RICGR_0335 RICGR_0336     FALSE 0.329 39.000 0.000 NA   NA
 3986006 3986007 RICGR_0336 RICGR_0337     FALSE 0.344 55.000 0.000 1.000 N NA
 3986009 3986010 RICGR_0339 RICGR_0340     FALSE 0.140 132.000 0.000 NA   NA
 3986010 3986011 RICGR_0340 RICGR_0341     TRUE 0.775 -43.000 0.000 NA   NA
 3986012 3986013 RICGR_0342 RICGR_0343     FALSE 0.159 123.000 0.000 NA   NA
 3986013 3986014 RICGR_0343 RICGR_0344     FALSE 0.147 126.000 0.000 NA   NA
 3986016 3986017 RICGR_0346 RICGR_0347     TRUE 0.996 11.000 0.316 0.003 Y NA
 3986017 3986018 RICGR_0347 RICGR_0348   gcvH TRUE 0.997 2.000 0.249 0.003 Y NA
 3986018 3986019 RICGR_0348 RICGR_0349 gcvH gcvT TRUE 0.981 37.000 0.317 0.003 Y NA
 3986019 3986020 RICGR_0349 RICGR_0350 gcvT   FALSE 0.278 96.000 0.000 1.000 N NA
 3986020 3986021 RICGR_0350 RICGR_0351     TRUE 0.999 -3.000 0.827 1.000 N NA
 3986022 3986023 RICGR_0352 RICGR_0353     TRUE 0.995 -13.000 0.233 1.000 Y NA
 3986023 3986024 RICGR_0353 RICGR_0354     TRUE 0.997 -43.000 0.379 1.000 Y NA
 3986025 3986026 RICGR_0355 RICGR_0356     TRUE 0.986 98.000 0.564 0.002 Y NA
 3986027 3986028 RICGR_0357 RICGR_0359   xth TRUE 0.774 8.000 0.000 1.000 N NA
 3986029 3986030 RICGR_0358 RICGR_0360     FALSE 0.334 38.000 0.000 NA   NA
 3986032 3986033 RICGR_0361 RICGR_0363 clpA icd FALSE 0.053 271.000 0.000 1.000 N NA
 3986033 3986034 RICGR_0363 RICGR_0364 icd   FALSE 0.232 99.000 0.000 NA   NA
 3986036 3986037 RICGR_0365 RICGR_0367     FALSE 0.304 57.000 0.000 NA   NA
 3986038 3986039 RICGR_0368 RICGR_0369     TRUE 0.919 21.000 0.092 NA   NA
 3986039 3986040 RICGR_0369 RICGR_0370     TRUE 0.833 0.000 0.000 NA   NA
 3986041 3986042 RICGR_0371 RICGR_0372     FALSE 0.356 44.000 0.000 1.000 N NA
 3986042 3986043 RICGR_0372 RICGR_0373   mutY TRUE 0.883 70.000 0.150 1.000 N NA
 3986043 3986044 RICGR_0373 RICGR_0374 mutY   TRUE 0.748 41.000 0.033 NA   NA
 3986044 3986045 RICGR_0374 RICGR_0375     TRUE 0.834 -7.000 0.000 NA   NA
 3986046 3986047 RICGR_0376 RICGR_0377     TRUE 0.798 3.000 0.000 NA   NA
 3986047 3986048 RICGR_0377 RICGR_0379     TRUE 0.703 13.000 0.000 1.000 N NA
 3986049 3986050 RICGR_0378 RICGR_0380 miaA mutL TRUE 0.987 -28.000 0.188 1.000 N NA
 3986050 3986051 RICGR_0380 RICGR_0381 mutL   FALSE 0.355 66.000 0.000 1.000 N NA
 3986051 3986052 RICGR_0381 RICGR_0382     FALSE 0.208 106.000 0.000 NA   NA
 3986052 3986053 RICGR_0382 RICGR_0383     TRUE 0.484 23.000 0.000 NA   NA
 3986053 3986054 RICGR_0383 RICGR_0384     FALSE 0.285 81.000 0.000 NA   NA
 3986055 3986056 RICGR_0385 RICGR_0386 glyA nrdR TRUE 0.887 19.000 0.024 NA N NA
 3986056 3986057 RICGR_0386 RICGR_0387 nrdR nusB TRUE 0.970 -25.000 0.012 NA Y NA
 3986057 3986058 RICGR_0387 RICGR_0388 nusB thiL TRUE 0.946 29.000 0.225 1.000 N NA
 3986058 3986059 RICGR_0388 RICGR_0389 thiL pgpA TRUE 0.911 72.000 0.206 1.000 N NA
 3986060 3986061 RICGR_0390 RICGR_0391     TRUE 0.994 -3.000 0.307 NA   NA
 3986061 3986062 RICGR_0391 RICGR_0392   nadD TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 3986062 3986063 RICGR_0392 RICGR_0393 nadD holA TRUE 0.935 2.000 0.003 1.000 N NA
 3986063 3986064 RICGR_0393 RICGR_0394 holA   TRUE 0.985 7.000 0.199 NA N NA
 3986066 3986067 RICGR_0395 RICGR_0397 leuS lnt FALSE 0.253 171.000 0.005 1.000 N NA
 3986067 3986068 RICGR_0397 RICGR_0398 lnt   TRUE 0.505 61.000 0.000 0.032 N NA
 3986069 3986070 RICGR_0399 RICGR_0400 ccmA   TRUE 0.988 54.000 0.503 0.006 Y NA
 3986070 3986071 RICGR_0400 RICGR_0402     TRUE 0.989 43.000 0.501 0.003 Y NA
 3986073 3986074 RICGR_0403 RICGR_0404 kdsA eno TRUE 0.896 10.000 0.004 1.000 N NA
 3986074 3986075 RICGR_0404 RICGR_0406 eno   TRUE 0.809 5.000 0.000 1.000 N NA
 3986078 3986079 RICGR_0408 RICGR_0409 lolD   TRUE 0.919 -7.000 0.000 0.037 N NA
 3986079 3986080 RICGR_0409 RICGR_0410     FALSE 0.233 108.000 0.000 1.000 N NA
 3986080 3986081 RICGR_0410 RICGR_0411   udk TRUE 0.946 -19.000 0.007 1.000 N NA
 3986082 3986083 RICGR_0412 RICGR_0413 ccmF   TRUE 0.999 12.000 1.000 0.006 Y NA
 3986083 3986084 RICGR_0413 RICGR_0414     TRUE 0.994 12.000 0.375 NA Y NA
 3986085 3986086 RICGR_0415 RICGR_0416     FALSE 0.030 527.000 0.000 NA   NA
 3986089 3986090 RICGR_1581 RICGR_0420     FALSE 0.309 71.000 0.000 NA   NA
 3986090 3986091 RICGR_0420 RICGR_0421     FALSE 0.030 496.000 0.000 NA   NA
 3986092 3986093 RICGR_0422 RICGR_0423     FALSE 0.179 116.000 0.000 NA   NA
 3986094 3986095 RICGR_0424 RICGR_0425 rpsF rpsR TRUE 0.975 73.000 0.319 0.037 Y NA
 3986095 3986096 RICGR_0425 RICGR_0426 rpsR   FALSE 0.371 171.000 0.034 NA   NA
 3986096 3986097 RICGR_0426 RICGR_0427   rplI TRUE 0.723 79.000 0.034 NA   NA
 3986097 3986098 RICGR_0427 RICGR_0428 rplI dnaB TRUE 0.538 147.000 0.074 1.000 N NA
 3986098 3986099 RICGR_0428 RICGR_0429 dnaB alr TRUE 0.995 -3.000 0.317 1.000 N NA
 3986099 3986100 RICGR_0429 RICGR_0430 alr   TRUE 0.813 -16.000 0.000 NA   NA
 3986101 3986102 RICGR_0431 RICGR_0432     FALSE 0.284 82.000 0.000 NA   NA
 3986103 3986104 RICGR_0433 RICGR_0434     TRUE 0.972 24.000 0.329 NA   NA
 3986104 3986105 RICGR_0434 RICGR_0435     TRUE 0.997 -3.000 0.396 1.000 N NA
 3986105 3986106 RICGR_0435 RICGR_0436     TRUE 0.927 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 3986106 3986107 RICGR_0436 RICGR_0437     TRUE 0.905 -45.000 0.000 1.000 Y NA
 3986109 3986110 RICGR_0439 RICGR_0440   radA TRUE 0.857 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3986111 3986112 RICGR_0441 RICGR_0442     FALSE 0.202 172.000 0.000 1.000 Y NA
 3986112 3986113 RICGR_0442 RICGR_0443   nuc FALSE 0.110 157.000 0.000 1.000   NA
 3986113 3986114 RICGR_0443 RICGR_0444 nuc   FALSE 0.043 273.000 0.000 NA   NA
 3986116 3986117 RICGR_0446 RICGR_0447     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 3986118 3986119 RICGR_0448 RICGR_0449     FALSE 0.284 82.000 0.000 NA   NA
 3986119 3986120 RICGR_0449 RICGR_0450     FALSE 0.037 318.000 0.000 NA   NA
 3986120 3986121 RICGR_0450 RICGR_0451     FALSE 0.270 88.000 0.000 NA   NA
 3986121 3986122 RICGR_0451 RICGR_0453   traF FALSE 0.096 159.000 0.000 NA   NA
 3986123 3986124 RICGR_0452 RICGR_0454     TRUE 0.756 7.000 0.000 NA   NA
 3986124 3986125 RICGR_0454 RICGR_0455     TRUE 0.800 -24.000 0.000 NA   NA
 3986125 3986126 RICGR_0455 RICGR_0456     TRUE 0.647 14.000 0.000 NA   NA
 3986126 3986127 RICGR_0456 RICGR_0457     TRUE 0.429 27.000 0.000 NA   NA
 3986127 3986128 RICGR_0457 RICGR_0458   trbL TRUE 0.696 11.000 0.000 NA   NA
 3986128 3986129 RICGR_0458 RICGR_0459 trbL trbJ TRUE 0.856 11.000 0.000 NA Y NA
 3986129 3986130 RICGR_0459 RICGR_0460 trbJ   TRUE 0.929 -7.000 0.000 NA Y NA
 3986130 3986131 RICGR_0460 RICGR_0461     TRUE 0.712 10.000 0.000 NA   NA
 3986131 3986132 RICGR_0461 RICGR_0462     TRUE 0.712 10.000 0.000 NA   NA
 3986132 3986133 RICGR_0462 RICGR_0463     TRUE 0.647 14.000 0.000 NA   NA
 3986133 3986134 RICGR_0463 RICGR_0464     FALSE 0.031 435.000 0.000 NA   NA
 3986134 3986135 RICGR_0464 RICGR_0465     TRUE 0.834 -7.000 0.000 NA   NA
 3986135 3986136 RICGR_0465 RICGR_0466     FALSE 0.027 1046.000 0.000 NA   NA
 3986136 3986137 RICGR_0466 RICGR_0467     FALSE 0.281 83.000 0.000 NA   NA
 3986137 3986138 RICGR_0467 RICGR_0468     TRUE 0.798 3.000 0.000 NA   NA
 3986138 3986139 RICGR_0468 RICGR_0469     FALSE 0.372 33.000 0.000 NA   NA
 3986141 3986142 RICGR_1582 RICGR_0472     FALSE 0.315 46.000 0.000 NA   NA
 3986142 3986143 RICGR_0472 RICGR_0473     FALSE 0.256 92.000 0.000 NA   NA
 3986147 3986148 RICGR_0477 RICGR_0478     FALSE 0.080 173.000 0.000 NA   NA
 3986148 3986149 RICGR_0478 RICGR_0479     FALSE 0.241 97.000 0.000 NA   NA
 3986151 3986152 RICGR_0481 RICGR_0482 metF metE TRUE 0.983 -22.000 0.009 0.003 Y NA
 3986154 3986155 RICGR_0484 RICGR_0485   gpmI FALSE 0.089 177.000 0.000 1.000 N NA
 3986155 3986156 RICGR_0485 RICGR_0486 gpmI   TRUE 0.547 22.000 0.000 1.000 N NA
 3986156 3986157 RICGR_0486 RICGR_0487   lgt TRUE 0.472 73.000 0.000 0.072 N NA
 3986157 3986158 RICGR_0487 RICGR_0488 lgt   TRUE 0.838 -6.000 0.000 NA   NA
 3986158 3986159 RICGR_0488 RICGR_0489     TRUE 0.833 0.000 0.000 NA   NA
 3986159 3986160 RICGR_0489 RICGR_0490   mltB TRUE 0.996 -16.000 0.298 NA Y NA
 3986160 3986161 RICGR_0490 RICGR_0491 mltB mrdB TRUE 0.964 10.000 0.096 NA N NA
 3986162 3986163 RICGR_0492 RICGR_0493     FALSE 0.313 48.000 0.000 NA   NA
 3986163 3986164 RICGR_0493 RICGR_0494   bph FALSE 0.152 125.000 0.000 NA   NA
 3986165 3986166 RICGR_0495 RICGR_0496     TRUE 0.813 2.000 0.000 NA   NA
 3986167 3986168 RICGR_0497 RICGR_0498     TRUE 0.988 69.000 0.688 1.000 Y NA
 3986168 3986169 RICGR_0498 RICGR_0499   hemH TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3986169 3986170 RICGR_0499 RICGR_0500 hemH   TRUE 0.576 18.000 0.000 NA   NA
 3986172 3986173 RICGR_0502 RICGR_0503     FALSE 0.338 51.000 0.000 1.000   NA
 3986173 3986174 RICGR_0503 RICGR_0504     FALSE 0.263 90.000 0.000 NA   NA
 3986175 3986176 RICGR_0505 RICGR_0506     FALSE 0.304 57.000 0.000 NA   NA
 3986176 3986177 RICGR_0506 RICGR_0507     TRUE 0.780 5.000 0.000 NA   NA
 3986177 3986178 RICGR_0507 RICGR_0508   rpoH TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 3986186 3986187 RICGR_0516 RICGR_0517   feoB TRUE 0.996 -9.000 0.455 NA   NA
 3986188 3986189 RICGR_0518 RICGR_0519     TRUE 0.987 88.000 0.569 0.006 Y NA
 3986189 3986190 RICGR_0519 RICGR_0520   mraY TRUE 0.976 63.000 0.309 0.009 Y NA
 3986190 3986191 RICGR_0520 RICGR_0521 mraY   TRUE 0.420 28.000 0.000 NA   NA
 3986197 3986198 RICGR_0527 RICGR_0528     FALSE 0.285 81.000 0.000 NA   NA
 3986198 3986199 RICGR_0528 RICGR_0529     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 3986199 3986200 RICGR_0529 RICGR_0530     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 3986201 3986202 RICGR_0531 RICGR_0532 pqqE   TRUE 0.977 1.000 0.015 0.003   NA
 3986202 3986203 RICGR_0532 RICGR_0533   pqqC TRUE 0.981 -3.000 0.018 0.003   NA
 3986203 3986204 RICGR_0533 RICGR_0534 pqqC pqqB TRUE 0.998 13.000 0.825 0.003   NA
 3986204 3986205 RICGR_0534 RICGR_0535 pqqB   FALSE 0.034 361.000 0.000 NA   NA
 3986205 3986206 RICGR_0535 RICGR_0536     TRUE 0.454 25.000 0.000 NA   NA
 3986206 3986207 RICGR_0536 RICGR_0537     FALSE 0.263 90.000 0.000 NA   NA
 3986207 3986208 RICGR_0537 RICGR_0538     TRUE 0.410 29.000 0.000 NA   NA
 3986208 3986209 RICGR_0538 RICGR_0539     FALSE 0.329 39.000 0.000 NA   NA
 3986209 3986210 RICGR_0539 RICGR_0540     TRUE 0.768 -48.000 0.000 NA   NA
 3986211 3986212 RICGR_0541 RICGR_0542     FALSE 0.142 131.000 0.000 NA   NA
 3986212 3986213 RICGR_0542 RICGR_0543     FALSE 0.317 43.000 0.000 NA   NA
 3986213 3986214 RICGR_0543 RICGR_0544     TRUE 0.780 5.000 0.000 NA   NA
 3986215 3986216 RICGR_0545 RICGR_0546     FALSE 0.080 188.000 0.000 1.000 N NA
 3986217 3986218 RICGR_0547 RICGR_0548     FALSE 0.041 283.000 0.000 NA   NA
 3986219 3986220 RICGR_0549 RICGR_0550     TRUE 0.786 -34.000 0.000 NA   NA
 3986221 3986222 RICGR_0551 RICGR_0552     TRUE 0.696 11.000 0.000 NA   NA
 3986223 3986224 RICGR_0553 RICGR_0554     TRUE 0.798 3.000 0.000 NA   NA
 3986224 3986225 RICGR_0554 RICGR_0555     TRUE 0.800 -24.000 0.000 NA   NA
 3986228 3986229 RICGR_0559 RICGR_0560     TRUE 0.990 13.000 0.400 NA   NA
 3986229 3986230 RICGR_0560 RICGR_0561     FALSE 0.210 105.000 0.000 NA   NA
 3986230 3986231 RICGR_0561 RICGR_0562     TRUE 0.857 0.000 0.000 1.000 N NA
 3986231 3986232 RICGR_0562 RICGR_0563     TRUE 0.618 133.000 0.042 0.067 N NA
 3986232 3986233 RICGR_0563 RICGR_0564   aceE TRUE 0.742 58.000 0.028 1.000 N NA
 3986233 3986234 RICGR_0564 RICGR_0565 aceE   TRUE 0.947 69.000 0.167 0.039 Y NA
 3986234 3986235 RICGR_0565 RICGR_0566   lpdA TRUE 0.979 72.000 0.463 1.000 Y NA
 3986236 3986237 RICGR_0567 RICGR_0568     FALSE 0.372 33.000 0.000 NA   NA
 3986237 3986238 RICGR_0568 RICGR_0569   recG FALSE 0.090 166.000 0.000 NA   NA
 3986239 3986240 RICGR_0570 RICGR_0571 accB accC TRUE 0.981 32.000 0.275 0.002 Y NA
 3986240 3986241 RICGR_0571 RICGR_0572 accC prmA TRUE 0.983 5.000 0.152 1.000 N NA
 3986241 3986242 RICGR_0572 RICGR_0573 prmA hemA TRUE 0.858 8.000 0.000 0.050 N NA
 3986243 3986244 RICGR_0574 RICGR_0575     FALSE 0.128 135.000 0.000 NA   NA
 3986246 3986247 RICGR_0577 RICGR_0578     TRUE 0.956 5.000 0.033 NA   NA
 3986247 3986248 RICGR_0578 RICGR_0579     TRUE 0.995 -10.000 0.250 NA Y NA
 3986248 3986249 RICGR_0579 RICGR_0580     TRUE 0.982 52.000 0.556 NA Y NA
 3986250 3986251 RICGR_0581 RICGR_0582 prfA   FALSE 0.306 59.000 0.000 NA   NA
 3986251 3986252 RICGR_0582 RICGR_0583   hemK FALSE 0.316 44.000 0.000 NA   NA
 3986256 3986257 RICGR_0587 RICGR_0588     FALSE 0.270 186.000 0.013 1.000 N NA
 3986258 3986259 RICGR_0589 RICGR_0590   dotB TRUE 0.857 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3986259 3986260 RICGR_0590 RICGR_0591 dotB   TRUE 0.995 -25.000 0.364 NA   NA
 3986260 3986261 RICGR_0591 RICGR_0592     TRUE 0.968 98.000 0.667 NA   NA
 3986261 3986262 RICGR_0592 RICGR_0593     TRUE 0.569 79.000 0.004 NA   NA
 3986263 3986264 RICGR_0594 RICGR_0596 ftsY   TRUE 0.619 18.000 0.000 1.000 N NA
 3986268 3986269 RICGR_0599 RICGR_0600     FALSE 0.157 124.000 0.000 NA   NA
 3986270 3986271 RICGR_0601 RICGR_0602     TRUE 0.919 2.000 0.000 NA Y NA
 3986271 3986272 RICGR_0602 RICGR_0603     FALSE 0.220 111.000 0.000 1.000 N NA
 3986272 3986273 RICGR_0603 RICGR_0604     FALSE 0.058 212.000 0.000 NA   NA
 3986273 3986274 RICGR_0604 RICGR_0605     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 3986274 3986275 RICGR_0605 RICGR_0606     FALSE 0.202 108.000 0.000 NA   NA
 3986275 3986276 RICGR_0606 RICGR_0607     FALSE 0.329 39.000 0.000 NA   NA
 3986277 3986278 RICGR_0608 RICGR_0609     FALSE 0.315 67.000 0.000 NA   NA
 3986278 3986279 RICGR_0609 RICGR_0610     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 3986279 3986280 RICGR_0610 RICGR_0611     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 3986280 3986281 RICGR_0611 RICGR_0612     FALSE 0.227 101.000 0.000 NA   NA
 3986281 3986282 RICGR_0612 RICGR_0613     FALSE 0.082 172.000 0.000 NA   NA
 3986283 3986284 RICGR_0614 RICGR_0615     TRUE 0.788 -33.000 0.000 NA   NA
 3986285 3986286 RICGR_1584 RICGR_0617   rplU FALSE 0.250 93.000 0.000 NA   NA
 3986286 3986287 RICGR_0617 RICGR_0618 rplU rpmA TRUE 0.998 15.000 0.667 0.034 Y NA
 3986287 3986288 RICGR_0618 RICGR_0619 rpmA   TRUE 0.950 55.000 0.335 1.000   NA
 3986290 3986291 RICGR_0621 RICGR_0622   hda TRUE 0.766 47.000 0.045 NA   NA
 3986293 3986294 RICGR_0624 RICGR_0625 rpsB tsf TRUE 0.999 4.000 0.748 1.000 Y NA
 3986294 3986295 RICGR_0625 RICGR_0626 tsf pyrH FALSE 0.066 216.000 0.000 1.000 N NA
 3986295 3986296 RICGR_0626 RICGR_0627 pyrH frr TRUE 0.945 -3.000 0.003 1.000 N NA
 3986296 3986297 RICGR_0627 RICGR_0628 frr uppS TRUE 0.992 11.000 0.409 1.000 N NA
 3986297 3986298 RICGR_0628 RICGR_0629 uppS cdsA TRUE 0.961 -13.000 0.002 1.000 Y NA
 3986298 3986299 RICGR_0629 RICGR_0630 cdsA dxr TRUE 0.968 -3.000 0.002 1.000 Y NA
 3986299 3986300 RICGR_0630 RICGR_0631 dxr yaeT TRUE 0.455 111.000 0.004 1.000 N NA
 3986300 3986301 RICGR_0631 RICGR_0632 yaeT   TRUE 0.984 26.000 0.354 1.000 Y NA
 3986301 3986302 RICGR_0632 RICGR_0633   lpxD TRUE 0.975 126.000 0.814 1.000 Y NA
 3986302 3986303 RICGR_0633 RICGR_0634 lpxD fabZ TRUE 0.979 91.000 0.796 1.000 N NA
 3986303 3986304 RICGR_0634 RICGR_0635 fabZ lpxA TRUE 0.998 -49.000 0.850 1.000 N NA
 3986304 3986305 RICGR_0635 RICGR_0636 lpxA lpxB TRUE 0.996 -16.000 0.289 1.000 Y NA
 3986305 3986306 RICGR_0636 RICGR_0638 lpxB rnhB TRUE 0.896 57.000 0.186 1.000 N NA
 3986308 3986309 RICGR_1585 RICGR_1586 rrs   FALSE 0.045 270.000 0.000 NA   NA
 3986309 3986310 RICGR_1586 RICGR_1587     FALSE 0.309 71.000 0.000 NA   NA
 3986310 3986311 RICGR_1587 RICGR_1588   rrl FALSE 0.029 579.000 0.000 NA   NA
 3986311 3986312 RICGR_1588 RICGR_1589 rrl rrf FALSE 0.039 290.000 0.000 NA   NA
 3986312 3986313 RICGR_1589 RICGR_0644 rrf   FALSE 0.104 152.000 0.000 NA   NA
 3986313 3986314 RICGR_0644 RICGR_0645     FALSE 0.390 31.000 0.000 NA   NA
 3986315 3986316 RICGR_0646 RICGR_0647     FALSE 0.122 139.000 0.000 NA   NA
 3986317 3986318 RICGR_0648 RICGR_0649     TRUE 0.999 -9.000 0.507 0.006 Y NA
 3986318 3986319 RICGR_0649 RICGR_0650   nuoC TRUE 0.998 2.000 0.328 0.006 Y NA
 3986319 3986320 RICGR_0650 RICGR_0651 nuoC nuoD TRUE 0.998 8.000 0.483 0.012 Y NA
 3986320 3986321 RICGR_0651 RICGR_0652 nuoD   TRUE 0.998 -3.000 0.355 0.007 Y NA
 3986321 3986322 RICGR_0652 RICGR_0653   nuoF TRUE 0.998 -10.000 0.343 0.007 Y NA
 3986322 3986323 RICGR_0653 RICGR_0654 nuoF nuoG TRUE 0.991 24.000 0.395 0.012 Y NA
 3986323 3986324 RICGR_0654 RICGR_0655 nuoG   TRUE 0.999 -10.000 0.515 0.012 Y NA
 3986324 3986325 RICGR_0655 RICGR_0656     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.012 Y NA
 3986325 3986326 RICGR_0656 RICGR_0657   nuoJ TRUE 0.984 64.000 0.442 0.012 Y NA
 3986326 3986327 RICGR_0657 RICGR_0658 nuoJ   TRUE 0.999 -3.000 0.484 0.006 Y NA
 3986327 3986328 RICGR_0658 RICGR_0659     TRUE 0.998 6.000 0.451 0.012 Y NA
 3986328 3986329 RICGR_0659 RICGR_0660   nuoM TRUE 0.983 20.000 0.175 0.003 Y NA
 3986329 3986330 RICGR_0660 RICGR_0661 nuoM nuoN TRUE 0.998 -3.000 0.340 0.003 Y NA
 3986330 3986331 RICGR_0661 RICGR_0662 nuoN   TRUE 0.546 20.000 0.000 NA   NA
 3986331 3986332 RICGR_0662 RICGR_0663     FALSE 0.236 98.000 0.000 NA   NA
 3986332 3986333 RICGR_0663 RICGR_0664   prfB FALSE 0.033 381.000 0.000 NA   NA
 3986333 3986334 RICGR_0664 RICGR_0665 prfB lysS FALSE 0.279 84.000 0.000 NA   NA
 3986335 3986336 RICGR_0666 RICGR_0667 rpmG rpmB TRUE 0.990 15.000 0.332 0.033   NA
 3986336 3986337 RICGR_0667 RICGR_0668 rpmB radC TRUE 0.599 64.000 0.003 1.000 N NA
 3986337 3986338 RICGR_0668 RICGR_0669 radC   FALSE 0.293 78.000 0.000 NA   NA
 3986338 3986339 RICGR_0669 RICGR_0670   proS FALSE 0.307 54.000 0.000 NA   NA
 3986340 3986341 RICGR_0671 RICGR_0672     FALSE 0.069 186.000 0.000 NA   NA
 3986341 3986342 RICGR_0672 RICGR_0673   aspS TRUE 0.795 28.000 0.020 NA   NA
 3986342 3986343 RICGR_0673 RICGR_0674 aspS   FALSE 0.106 149.000 0.000 NA   NA
 3986343 3986344 RICGR_0674 RICGR_0675     FALSE 0.315 68.000 0.000 NA   NA
 3986344 3986345 RICGR_0675 RICGR_0676   ruvC TRUE 0.994 0.000 0.277 1.000   NA
 3986345 3986346 RICGR_0676 RICGR_0677 ruvC ruvA TRUE 0.999 -3.000 0.451 0.010 Y NA
 3986347 3986348 RICGR_0678 RICGR_0679     FALSE 0.098 157.000 0.000 NA   NA
 3986349 3986350 RICGR_0680 RICGR_0681 ruvB tolQ TRUE 0.501 110.000 0.007 1.000 N NA
 3986350 3986351 RICGR_0681 RICGR_0682 tolQ tolR TRUE 0.999 -10.000 0.556 0.033 Y NA
 3986351 3986352 RICGR_0682 RICGR_0683 tolR   TRUE 0.974 52.000 0.460 0.067 N NA
 3986352 3986353 RICGR_0683 RICGR_0684     FALSE 0.048 245.000 0.000 NA   NA
 3986353 3986354 RICGR_0684 RICGR_0685     TRUE 0.828 -9.000 0.000 NA   NA
 3986354 3986355 RICGR_0685 RICGR_0686     FALSE 0.042 279.000 0.000 NA   NA
 3986355 3986356 RICGR_0686 RICGR_0687     TRUE 0.810 -18.000 0.000 NA   NA
 3986356 3986357 RICGR_0687 RICGR_0688     TRUE 0.833 0.000 0.000 NA   NA
 3986357 3986358 RICGR_0688 RICGR_0689   tolB TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3986358 3986359 RICGR_0689 RICGR_0690 tolB   TRUE 0.975 56.000 0.592 1.000   NA
 3986359 3986360 RICGR_0690 RICGR_0691     TRUE 0.986 11.000 0.278 1.000   NA
 3986360 3986361 RICGR_0691 RICGR_0692   truA FALSE 0.226 107.000 0.000 1.000   NA
 3986361 3986362 RICGR_0692 RICGR_0693 truA   FALSE 0.128 146.000 0.000 1.000 N NA
 3986362 3986363 RICGR_0693 RICGR_0694     TRUE 0.999 -10.000 0.789 1.000 Y NA
 3986363 3986364 RICGR_0694 RICGR_0695     TRUE 0.997 -22.000 0.286 0.022 Y NA
 3986364 3986365 RICGR_0695 RICGR_0696     TRUE 0.984 0.000 0.010 0.022 Y NA
 3986365 3986366 RICGR_0696 RICGR_0697   accD FALSE 0.255 102.000 0.000 1.000 N NA
 3986366 3986367 RICGR_0697 RICGR_0698 accD   TRUE 0.996 -16.000 0.383 1.000 N NA
 3986367 3986368 RICGR_0698 RICGR_0699     FALSE 0.314 69.000 0.000 NA   NA
 3986368 3986369 RICGR_0699 RICGR_0700     FALSE 0.061 203.000 0.000 NA   NA
 3986369 3986370 RICGR_0700 RICGR_0701     TRUE 0.445 30.000 0.000 1.000 N NA
 3986370 3986371 RICGR_0701 RICGR_0702     FALSE 0.199 115.000 0.000 1.000   NA
 3986371 3986372 RICGR_0702 RICGR_0703     TRUE 0.729 18.000 0.000 0.067   NA
 3986372 3986373 RICGR_0703 RICGR_0704     FALSE 0.111 145.000 0.000 NA   NA
 3986373 3986374 RICGR_0704 RICGR_0705   pyrF TRUE 0.823 1.000 0.000 NA   NA
 3986374 3986375 RICGR_0705 RICGR_0706 pyrF cmk TRUE 0.970 -9.000 0.005 1.000 Y NA
 3986375 3986376 RICGR_0706 RICGR_0707 cmk rpsA TRUE 0.909 98.000 0.281 1.000 N NA
 3986376 3986377 RICGR_0707 RICGR_0708 rpsA   FALSE 0.042 278.000 0.000 NA   NA
 3986377 3986378 RICGR_0708 RICGR_0709     TRUE 0.752 40.000 0.033 NA   NA
 3986378 3986379 RICGR_0709 RICGR_0710     FALSE 0.046 264.000 0.000 NA   NA
 3986379 3986380 RICGR_0710 RICGR_0711     FALSE 0.323 41.000 0.000 NA   NA
 3986382 3986383 RICGR_0713 RICGR_0714     FALSE 0.325 40.000 0.000 NA   NA
 3986383 3986384 RICGR_0714 RICGR_0715     FALSE 0.309 52.000 0.000 NA   NA
 3986384 3986385 RICGR_0715 RICGR_0716     FALSE 0.185 113.000 0.000 NA   NA
 3986385 3986386 RICGR_0716 RICGR_0717     FALSE 0.035 355.000 0.000 NA   NA
 3986386 3986387 RICGR_0717 RICGR_0718     TRUE 0.995 18.000 1.000 NA   NA
 3986387 3986388 RICGR_0718 RICGR_0719     TRUE 0.987 48.000 1.000 NA   NA
 3986389 3986390 RICGR_0720 RICGR_0721     FALSE 0.314 47.000 0.000 NA   NA
 3986391 3986392 RICGR_0722 RICGR_0723     TRUE 0.441 26.000 0.000 NA   NA
 3986394 3986395 RICGR_0725 RICGR_0726     FALSE 0.036 323.000 0.000 NA   NA
 3986395 3986396 RICGR_0726 RICGR_0727     TRUE 0.813 2.000 0.000 NA   NA
 3986396 3986397 RICGR_0727 RICGR_0728     FALSE 0.320 42.000 0.000 NA   NA
 3986397 3986398 RICGR_0728 RICGR_0729     TRUE 0.647 14.000 0.000 NA   NA
 3986398 3986399 RICGR_0729 RICGR_0730     TRUE 0.576 20.000 0.000 1.000   NA
 3986399 3986400 RICGR_0730 RICGR_0731     FALSE 0.116 142.000 0.000 NA   NA
 3986400 3986401 RICGR_0731 RICGR_0732     FALSE 0.041 281.000 0.000 NA   NA
 3986401 3986402 RICGR_0732 RICGR_0733     TRUE 0.997 -3.000 0.500 NA   NA
 3986402 3986403 RICGR_0733 RICGR_0734     FALSE 0.035 444.000 0.000 1.000   NA
 3986403 3986404 RICGR_0734 RICGR_0735     TRUE 0.468 24.000 0.000 NA   NA
 3986404 3986405 RICGR_0735 RICGR_0736     TRUE 0.681 12.000 0.000 NA   NA
 3986408 3986409 RICGR_0739 RICGR_0740     FALSE 0.033 381.000 0.000 NA   NA
 3986413 3986414 RICGR_0744 RICGR_0745     FALSE 0.070 191.000 0.000 NA N NA
 3986414 3986415 RICGR_0745 RICGR_0746     TRUE 0.760 9.000 0.000 1.000 N NA
 3986415 3986416 RICGR_0746 RICGR_0747     TRUE 0.991 -6.000 0.110 1.000 Y NA
 3986416 3986417 RICGR_0747 RICGR_0748   tmk TRUE 0.992 -7.000 0.211 1.000 N NA
 3986419 3986420 RICGR_0750 RICGR_0751   fabF TRUE 0.968 -3.000 0.019 1.000   NA
 3986420 3986421 RICGR_0751 RICGR_0752 fabF acpP TRUE 0.971 71.000 0.346 1.000 Y NA
 3986421 3986422 RICGR_0752 RICGR_0753 acpP fabG TRUE 0.935 137.000 0.321 0.007 Y NA
 3986422 3986423 RICGR_0753 RICGR_0754 fabG fabD TRUE 0.997 10.000 0.432 0.007 Y NA
 3986423 3986424 RICGR_0754 RICGR_0755 fabD   TRUE 0.954 51.000 0.182 0.007 Y NA
 3986424 3986425 RICGR_0755 RICGR_0756   plsX TRUE 0.999 -3.000 0.380 0.007 Y NA
 3986425 3986426 RICGR_0756 RICGR_0757 plsX rpmF TRUE 0.993 9.000 0.418 1.000 N NA
 3986426 3986427 RICGR_0757 RICGR_0758 rpmF   FALSE 0.313 80.000 0.000 1.000   NA
 3986427 3986428 RICGR_0758 RICGR_0759   coaD TRUE 0.974 4.000 0.088 1.000   NA
 3986428 3986429 RICGR_0759 RICGR_0760 coaD ubiA TRUE 0.561 50.000 0.000 1.000 Y NA
 3986430 3986431 RICGR_0761 RICGR_0762     TRUE 0.463 92.000 0.000 0.007   NA
 3986431 3986432 RICGR_0762 RICGR_0763     FALSE 0.191 169.000 0.000 0.007   NA
 3986432 3986433 RICGR_0763 RICGR_0764     FALSE 0.174 285.000 0.000 0.007 Y NA
 3986435 3986436 RICGR_0766 RICGR_0767     FALSE 0.143 198.000 0.000 0.007   NA
 3986438 3986439 RICGR_0769 RICGR_0770     FALSE 0.037 320.000 0.000 NA   NA
 3986442 3986443 RICGR_0773 RICGR_0774     FALSE 0.109 146.000 0.000 NA   NA
 3986443 3986444 RICGR_0774 RICGR_1590     FALSE 0.152 125.000 0.000 NA   NA
 3986444 3986445 RICGR_1590 RICGR_0776     FALSE 0.295 77.000 0.000 NA   NA
 3986445 3986446 RICGR_0776 RICGR_0777   pheT TRUE 0.985 8.000 0.208 1.000 N NA
 3986446 3986447 RICGR_0777 RICGR_0778 pheT pheS TRUE 0.999 2.000 0.574 0.002 Y NA
 3986447 3986448 RICGR_0778 RICGR_0779 pheS   FALSE 0.304 56.000 0.000 NA   NA
 3986448 3986449 RICGR_0779 RICGR_0780     TRUE 0.938 -7.000 0.003 NA   NA
 3986449 3986450 RICGR_0780 RICGR_0781     FALSE 0.165 120.000 0.000 NA   NA
 3986450 3986451 RICGR_0781 RICGR_0782     FALSE 0.270 88.000 0.000 NA   NA
 3986451 3986452 RICGR_0782 RICGR_1591     FALSE 0.323 41.000 0.000 NA   NA
 3986452 3986453 RICGR_1591 RICGR_1592     TRUE 0.546 20.000 0.000 NA   NA
 3986453 3986454 RICGR_1592 RICGR_1593     FALSE 0.144 127.000 0.000 NA   NA
 3986454 3986455 RICGR_1593 RICGR_0787   pgsA FALSE 0.334 38.000 0.000 NA   NA
 3986455 3986456 RICGR_0787 RICGR_0788 pgsA uvrC TRUE 0.863 110.000 0.227 1.000 N NA
 3986456 3986457 RICGR_0788 RICGR_0789 uvrC   FALSE 0.071 183.000 0.000 NA   NA
 3986457 3986458 RICGR_0789 RICGR_0790     TRUE 0.833 0.000 0.000 NA   NA
 3986460 3986461 RICGR_0791 RICGR_1594     FALSE 0.354 35.000 0.000 NA   NA
 3986461 3986462 RICGR_1594 RICGR_0794     FALSE 0.035 345.000 0.000 NA   NA
 3986462 3986463 RICGR_0794 RICGR_0795     FALSE 0.273 87.000 0.000 NA   NA
 3986463 3986464 RICGR_0795 RICGR_0796     FALSE 0.183 114.000 0.000 NA   NA
 3986464 3986465 RICGR_0796 RICGR_0797   rnr TRUE 0.915 47.000 0.147 0.027 N NA
 3986465 3986466 RICGR_0797 RICGR_0798 rnr   TRUE 0.792 -28.000 0.000 NA   NA
 3986466 3986467 RICGR_0798 RICGR_0799     FALSE 0.170 119.000 0.000 NA   NA
 3986468 3986469 RICGR_0800 RICGR_0801 lolB ispE TRUE 0.984 4.000 0.157 1.000 N NA
 3986469 3986470 RICGR_0801 RICGR_1595 ispE   TRUE 0.806 -21.000 0.000 NA   NA
 3986470 3986471 RICGR_1595 RICGR_0803   prsA FALSE 0.320 42.000 0.000 NA   NA
 3986472 3986473 RICGR_0804 RICGR_0805     FALSE 0.372 33.000 0.000 NA   NA
 3986473 3986474 RICGR_0805 RICGR_0806     FALSE 0.315 66.000 0.000 NA   NA
 3986475 3986476 RICGR_0807 RICGR_0808   pth TRUE 0.998 6.000 0.496 0.051 Y NA
 3986476 3986477 RICGR_0808 RICGR_0809 pth ychF TRUE 0.990 6.000 0.184 1.000 Y NA
 3986477 3986478 RICGR_0809 RICGR_0810 ychF   FALSE 0.191 111.000 0.000 NA   NA
 3986479 3986480 RICGR_0811 RICGR_0812   sucD TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 3986480 3986481 RICGR_0812 RICGR_0813 sucD   TRUE 0.994 42.000 0.806 0.002 Y NA
 3986481 3986482 RICGR_0813 RICGR_0814   sucB TRUE 0.897 90.000 0.136 1.000 Y NA
 3986482 3986483 RICGR_0814 RICGR_0815 sucB sucA TRUE 0.991 31.000 0.667 1.000 Y NA
 3986483 3986484 RICGR_0815 RICGR_0816 sucA   FALSE 0.363 34.000 0.000 NA   NA
 3986484 3986485 RICGR_0816 RICGR_0817     TRUE 0.786 -34.000 0.000 NA   NA
 3986485 3986486 RICGR_0817 RICGR_0818   sdhA TRUE 0.991 59.000 0.604 0.003 Y NA
 3986486 3986487 RICGR_0818 RICGR_0819 sdhA sdhD TRUE 0.999 -25.000 0.705 0.003 Y NA
 3986487 3986488 RICGR_0819 RICGR_0820 sdhD sdhC TRUE 0.999 -6.000 0.453 0.002 Y NA
 3986488 3986489 RICGR_0820 RICGR_0821 sdhC   FALSE 0.054 264.000 0.000 1.000 N NA
 3986489 3986490 RICGR_0821 RICGR_0822   scpB TRUE 0.816 120.000 0.210 NA N NA
 3986491 3986492 RICGR_0823 RICGR_0824   thiE TRUE 0.961 -10.000 0.000 0.005 Y NA
 3986492 3986493 RICGR_0824 RICGR_0825 thiE thiD TRUE 0.947 6.000 0.000 0.005 Y NA
 3986493 3986494 RICGR_0825 RICGR_0826 thiD   TRUE 0.825 -15.000 0.000 NA N NA
 3986494 3986495 RICGR_0826 RICGR_0827     FALSE 0.079 174.000 0.000 NA   NA
 3986497 3986498 RICGR_0829 RICGR_0830     TRUE 0.979 -16.000 0.098 NA   NA
 3986499 3986500 RICGR_0831 RICGR_0832     FALSE 0.119 140.000 0.000 NA   NA
 3986501 3986502 RICGR_0833 RICGR_0834     FALSE 0.071 185.000 0.000 NA   NA
 3986503 3986504 RICGR_0835 RICGR_0836 cysS gltX TRUE 0.978 -16.000 0.021 1.000 Y NA
 3986505 3986506 RICGR_0837 RICGR_0838 lpxH   FALSE 0.314 47.000 0.000 NA   NA
 3986507 3986508 RICGR_0839 RICGR_0840 cvpA pyrE FALSE 0.244 102.000 0.000 1.000   NA
 3986508 3986509 RICGR_0840 RICGR_0841 pyrE gyrA TRUE 0.512 24.000 0.000 1.000 N NA
 3986509 3986510 RICGR_0841 RICGR_0842 gyrA   FALSE 0.036 332.000 0.000 NA   NA
 3986512 3986513 RICGR_0844 RICGR_1597     FALSE 0.073 180.000 0.000 NA   NA
 3986513 3986514 RICGR_1597 RICGR_0846     FALSE 0.256 92.000 0.000 NA   NA
 3986514 3986515 RICGR_0846 RICGR_0847   gltX FALSE 0.198 110.000 0.000 NA   NA
 3986515 3986516 RICGR_0847 RICGR_0848 gltX   TRUE 0.499 85.000 0.000 NA Y NA
 3986517 3986518 RICGR_0849 RICGR_0850 ispZ   TRUE 0.978 6.000 0.133 NA N NA
 3986519 3986520 RICGR_0851 RICGR_0852     FALSE 0.305 58.000 0.000 NA   NA
 3986520 3986521 RICGR_0852 RICGR_0853     FALSE 0.275 86.000 0.000 NA   NA
 3986521 3986522 RICGR_0853 RICGR_0854     TRUE 0.982 13.000 0.267 NA   NA
 3986522 3986523 RICGR_0854 RICGR_0855     TRUE 0.991 13.000 0.429 NA   NA
 3986523 3986524 RICGR_0855 RICGR_0856     FALSE 0.354 35.000 0.000 NA   NA
 3986524 3986525 RICGR_0856 RICGR_0857     TRUE 0.987 42.000 1.000 NA   NA
 3986525 3986526 RICGR_0857 RICGR_0858     TRUE 0.997 6.000 0.600 NA   NA
 3986526 3986527 RICGR_0858 RICGR_0859     TRUE 0.939 33.000 0.250 NA   NA
 3986527 3986528 RICGR_0859 RICGR_0860     TRUE 0.989 5.000 0.250 NA   NA
 3986528 3986529 RICGR_0860 RICGR_0861     TRUE 0.998 4.000 1.000 NA   NA
 3986529 3986530 RICGR_0861 RICGR_0862     FALSE 0.363 34.000 0.000 NA   NA
 3986530 3986531 RICGR_0862 RICGR_0863     FALSE 0.034 365.000 0.000 NA   NA
 3986531 3986532 RICGR_0863 RICGR_0864     TRUE 0.911 99.000 0.308 NA   NA
 3986532 3986533 RICGR_0864 RICGR_0865     TRUE 0.949 103.000 0.500 NA   NA
 3986533 3986534 RICGR_0865 RICGR_0866     TRUE 0.546 20.000 0.000 NA   NA
 3986534 3986535 RICGR_0866 RICGR_0867     FALSE 0.306 59.000 0.000 NA   NA
 3986538 3986539 RICGR_0870 RICGR_0871     FALSE 0.032 424.000 0.000 NA   NA
 3986539 3986540 RICGR_0871 RICGR_0872   sufB TRUE 0.981 -3.000 0.078 1.000 N NA
 3986540 3986541 RICGR_0872 RICGR_0873 sufB sufC TRUE 0.980 44.000 0.466 1.000 Y NA
 3986541 3986542 RICGR_0873 RICGR_0874 sufC sufD TRUE 0.997 5.000 0.482 1.000 Y NA
 3986542 3986543 RICGR_0874 RICGR_0875 sufD   TRUE 0.977 -3.000 0.049 1.000 N NA
 3986543 3986544 RICGR_0875 RICGR_0876     TRUE 0.973 2.000 0.055 1.000 N NA
 3986544 3986545 RICGR_0876 RICGR_0877     TRUE 0.967 -25.000 0.042 1.000   NA
 3986545 3986546 RICGR_0877 RICGR_0878     TRUE 0.741 43.000 0.023 1.000   NA
 3986546 3986547 RICGR_0878 RICGR_0879     FALSE 0.052 231.000 0.000 NA   NA
 3986548 3986549 RICGR_0880 RICGR_0881     FALSE 0.300 75.000 0.000 NA   NA
 3986549 3986550 RICGR_0881 RICGR_0882     FALSE 0.047 253.000 0.000 NA   NA
 3986550 3986551 RICGR_0882 RICGR_0883   gshB FALSE 0.308 77.000 0.000 NA N NA
 3986551 3986552 RICGR_0883 RICGR_0884 gshB   TRUE 0.980 4.000 0.120 1.000   NA
 3986552 3986553 RICGR_0884 RICGR_0885     FALSE 0.180 115.000 0.000 NA   NA
 3986554 3986555 RICGR_0886 RICGR_0887     TRUE 0.833 0.000 0.000 NA   NA
 3986556 3986557 RICGR_0888 RICGR_0889   era FALSE 0.375 36.000 0.000 1.000   NA
 3986557 3986558 RICGR_0889 RICGR_0890 era rnc TRUE 0.946 24.000 0.127 0.025   NA
 3986558 3986559 RICGR_0890 RICGR_0891 rnc lepB TRUE 0.757 111.000 0.117 1.000 N NA
 3986559 3986560 RICGR_0891 RICGR_0892 lepB lepA TRUE 0.946 24.000 0.187 1.000 N NA
 3986560 3986561 RICGR_0892 RICGR_0893 lepA   FALSE 0.331 57.000 0.000 1.000   NA
 3986562 3986563 RICGR_0894 RICGR_0895   lysA TRUE 0.977 0.000 0.071 NA   NA
 3986563 3986564 RICGR_0895 RICGR_0897 lysA dapF TRUE 0.983 14.000 0.104 0.004 Y NA
 3986565 3986566 RICGR_0896 RICGR_0898 fumC   FALSE 0.204 117.000 0.000 1.000 N NA
 3986566 3986567 RICGR_0898 RICGR_0899     FALSE 0.347 36.000 0.000 NA   NA
 3986567 3986568 RICGR_0899 RICGR_0900     FALSE 0.313 48.000 0.000 NA   NA
 3986568 3986569 RICGR_0900 RICGR_0901     FALSE 0.035 352.000 0.000 NA   NA
 3986569 3986570 RICGR_0901 RICGR_0902     FALSE 0.035 352.000 0.000 NA   NA
 3986570 3986571 RICGR_0902 RICGR_0903     FALSE 0.064 194.000 0.000 NA   NA
 3986571 3986572 RICGR_0903 RICGR_0904     TRUE 0.741 8.000 0.000 NA   NA
 3986572 3986573 RICGR_0904 RICGR_0905     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 3986573 3986574 RICGR_0905 RICGR_0906   mraW TRUE 0.993 -3.000 0.227 1.000 N NA
 3986574 3986575 RICGR_0906 RICGR_0907 mraW mraZ TRUE 0.996 9.000 0.635 NA   NA
 3986577 3986578 RICGR_0908 RICGR_0910     FALSE 0.214 104.000 0.000 NA   NA
 3986578 3986579 RICGR_0910 RICGR_0911     TRUE 0.951 -10.000 0.011 NA   NA
 3986579 3986580 RICGR_0911 RICGR_0912     FALSE 0.390 31.000 0.000 NA   NA
 3986580 3986581 RICGR_0912 RICGR_0913     FALSE 0.309 62.000 0.000 NA   NA
 3986581 3986582 RICGR_0913 RICGR_0914   guaC TRUE 0.414 33.000 0.000 1.000 N NA
 3986583 3986584 RICGR_0915 RICGR_0916 polI   FALSE 0.090 283.000 0.000 0.022   NA
 3986584 3986585 RICGR_0916 RICGR_0917   hflX TRUE 0.987 -7.000 0.141 1.000   NA
 3986585 3986586 RICGR_0917 RICGR_0918 hflX   TRUE 0.567 238.000 0.184 0.060   NA
 3986586 3986587 RICGR_0918 RICGR_0919     TRUE 0.999 -3.000 0.947 1.000 Y NA
 3986587 3986588 RICGR_0919 RICGR_0920   purA TRUE 0.719 65.000 0.019 1.000 N NA
 3986592 3986593 RICGR_0924 RICGR_0925 gmd   TRUE 0.974 -3.000 0.043 NA   NA
 3986593 3986594 RICGR_0925 RICGR_0926     TRUE 0.484 23.000 0.000 NA   NA
 3986594 3986595 RICGR_0926 RICGR_0928     FALSE 0.263 90.000 0.000 NA   NA
 3986597 3986598 RICGR_0931 RICGR_0932     FALSE 0.300 75.000 0.000 NA   NA
 3986601 3986602 RICGR_0934 RICGR_0936     FALSE 0.124 138.000 0.000 NA   NA
 3986602 3986603 RICGR_0936 RICGR_0937     FALSE 0.354 35.000 0.000 NA   NA
 3986603 3986604 RICGR_0937 RICGR_0938     TRUE 0.842 92.000 0.076 NA Y NA
 3986605 3986606 RICGR_0939 RICGR_0940     FALSE 0.329 39.000 0.000 NA   NA
 3986607 3986608 RICGR_0941 RICGR_0942 pyrG   TRUE 0.813 2.000 0.000 NA   NA
 3986608 3986609 RICGR_0942 RICGR_0943     TRUE 0.988 -16.000 0.188 NA   NA
 3986611 3986612 RICGR_0945 RICGR_0946     TRUE 0.686 14.000 0.000 1.000 N NA
 3986612 3986613 RICGR_0946 RICGR_0947     TRUE 0.688 46.000 0.000 0.013 Y NA
 3986613 3986614 RICGR_0947 RICGR_0948     FALSE 0.135 133.000 0.000 NA   NA
 3986614 3986615 RICGR_0948 RICGR_0949     FALSE 0.214 104.000 0.000 NA   NA
 3986615 3986616 RICGR_0949 RICGR_0950   msbA TRUE 0.770 -46.000 0.000 NA   NA
 3986616 3986617 RICGR_0950 RICGR_0951 msbA   TRUE 0.429 27.000 0.000 NA   NA
 3986617 3986618 RICGR_0951 RICGR_0952     FALSE 0.246 94.000 0.000 NA   NA
 3986618 3986619 RICGR_0952 RICGR_0953     FALSE 0.068 187.000 0.000 NA   NA
 3986621 3986622 RICGR_0954 RICGR_0956     TRUE 0.973 -10.000 0.011 NA Y NA
 3986622 3986623 RICGR_0956 RICGR_0957     TRUE 0.689 132.000 0.050 1.000 Y NA
 3986623 3986624 RICGR_0957 RICGR_0958     FALSE 0.106 149.000 0.000 NA   NA
 3986624 3986625 RICGR_0958 RICGR_0959     TRUE 0.833 0.000 0.000 NA   NA
 3986625 3986626 RICGR_0959 RICGR_0960     FALSE 0.030 501.000 0.000 NA   NA
 3986626 3986627 RICGR_0960 RICGR_0961   mreD FALSE 0.284 91.000 0.000 1.000   NA
 3986627 3986628 RICGR_0961 RICGR_0962 mreD mreC TRUE 0.998 9.000 0.550 0.005 Y NA
 3986628 3986629 RICGR_0962 RICGR_0963 mreC   TRUE 0.980 76.000 0.689 1.000 N NA
 3986630 3986631 RICGR_0964 RICGR_0965 gatC   TRUE 0.998 16.000 0.643 0.002 Y NA
 3986631 3986632 RICGR_0965 RICGR_0966   gatB TRUE 0.998 9.000 0.492 0.002 Y NA
 3986632 3986633 RICGR_0966 RICGR_0967 gatB miaB TRUE 0.890 8.000 0.000 1.000 Y NA
 3986633 3986634 RICGR_0967 RICGR_0968 miaB   TRUE 0.992 -3.000 0.220 1.000 N NA
 3986634 3986635 RICGR_0968 RICGR_0969     TRUE 0.995 -34.000 0.457 NA   NA
 3986635 3986636 RICGR_0969 RICGR_0970     TRUE 0.985 -19.000 0.150 NA   NA
 3986636 3986637 RICGR_0970 RICGR_0971     TRUE 0.848 10.000 0.000 0.035 N NA
 3986638 3986639 RICGR_0972 RICGR_0973     FALSE 0.288 80.000 0.000 NA   NA
 3986641 3986642 RICGR_0974 RICGR_0976     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 3986643 3986644 RICGR_0977 RICGR_0978     TRUE 0.756 7.000 0.000 NA   NA
 3986646 3986647 RICGR_0980 RICGR_0981   smc FALSE 0.076 188.000 0.000 1.000   NA
 3986647 3986648 RICGR_0981 RICGR_0982 smc   TRUE 0.706 145.000 0.115 0.017   NA
 3986648 3986649 RICGR_0982 RICGR_0983   ligA TRUE 0.983 -7.000 0.106 1.000   NA
 3986649 3986650 RICGR_0983 RICGR_0984 ligA   FALSE 0.165 120.000 0.000 NA   NA
 3986650 3986651 RICGR_0984 RICGR_0985     FALSE 0.311 63.000 0.000 NA   NA
 3986651 3986652 RICGR_0985 RICGR_0987     TRUE 0.992 0.000 0.143 1.000 Y NA
 3986653 3986654 RICGR_0986 RICGR_0988     FALSE 0.185 113.000 0.000 NA   NA
 3986657 3986658 RICGR_1599 RICGR_1600   srpB TRUE 0.647 14.000 0.000 NA   NA
 3986658 3986659 RICGR_1600 RICGR_0992 srpB   FALSE 0.312 49.000 0.000 NA   NA
 3986659 3986660 RICGR_0992 RICGR_0993     TRUE 0.746 229.000 0.411 NA   NA
 3986660 3986661 RICGR_0993 RICGR_0995   recR TRUE 0.979 37.000 0.604 NA   NA
 3986662 3986663 RICGR_0994 RICGR_0996 rplT rpmI TRUE 0.995 34.000 0.928 0.030 Y NA
 3986663 3986664 RICGR_0996 RICGR_0997 rpmI infC TRUE 0.987 46.000 0.652 1.000 Y NA
 3986664 3986665 RICGR_0997 RICGR_0998 infC thrS TRUE 0.922 87.000 0.186 1.000 Y NA
 3986665 3986666 RICGR_0998 RICGR_1601 thrS   TRUE 0.629 15.000 0.000 NA   NA
 3986666 3986667 RICGR_1601 RICGR_1000   uvrB FALSE 0.227 101.000 0.000 NA   NA
 3986669 3986670 RICGR_1001 RICGR_1003   rpmE TRUE 0.528 94.000 0.004 1.000 N NA
 3986671 3986672 RICGR_1004 RICGR_1005     TRUE 0.838 -6.000 0.000 NA   NA
 3986672 3986673 RICGR_1005 RICGR_1006   parC FALSE 0.122 139.000 0.000 NA   NA
 3986673 3986674 RICGR_1006 RICGR_1007 parC   TRUE 0.528 23.000 0.000 1.000 N NA
 3986675 3986676 RICGR_1008 RICGR_1009     FALSE 0.077 176.000 0.000 NA   NA
 3986677 3986678 RICGR_1010 RICGR_1602     FALSE 0.051 238.000 0.000 NA   NA
 3986679 3986680 RICGR_1012 RICGR_1013     FALSE 0.066 219.000 0.000 1.000 N NA
 3986682 3986683 RICGR_1603 RICGR_1016     FALSE 0.267 89.000 0.000 NA   NA
 3986683 3986684 RICGR_1016 RICGR_1017     FALSE 0.162 121.000 0.000 NA   NA
 3986684 3986685 RICGR_1017 RICGR_1018   serS TRUE 0.681 12.000 0.000 NA   NA
 3986687 3986688 RICGR_1020 RICGR_1021     FALSE 0.111 145.000 0.000 NA   NA
 3986688 3986689 RICGR_1021 RICGR_1022     TRUE 0.484 23.000 0.000 NA   NA
 3986689 3986690 RICGR_1022 RICGR_1023     FALSE 0.096 159.000 0.000 NA   NA
 3986690 3986691 RICGR_1023 RICGR_1024     TRUE 0.833 0.000 0.000 NA   NA
 3986691 3986692 RICGR_1024 RICGR_1025   ald TRUE 0.934 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 3986692 3986693 RICGR_1025 RICGR_1026 ald   FALSE 0.077 192.000 0.000 1.000 N NA
 3986693 3986694 RICGR_1026 RICGR_1027     TRUE 0.857 79.000 0.137 1.000   NA
 3986694 3986695 RICGR_1027 RICGR_1028   rpsU TRUE 0.890 3.000 0.000 0.048   NA
 3986698 3986699 RICGR_1031 RICGR_1032 orn efp FALSE 0.314 137.000 0.003 1.000 N NA
 3986700 3986701 RICGR_1033 RICGR_1034   truB FALSE 0.054 225.000 0.000 NA   NA
 3986701 3986702 RICGR_1034 RICGR_1035 truB rbfA TRUE 0.965 73.000 0.318 1.000 Y NA
 3986702 3986703 RICGR_1035 RICGR_1036 rbfA infB TRUE 0.998 0.000 0.530 1.000 Y NA
 3986703 3986704 RICGR_1036 RICGR_1037 infB   TRUE 0.813 2.000 0.000 NA   NA
 3986704 3986705 RICGR_1037 RICGR_1038     FALSE 0.313 64.000 0.000 NA   NA
 3986705 3986706 RICGR_1038 RICGR_1039     TRUE 0.995 15.000 0.759 NA   NA
 3986706 3986707 RICGR_1039 RICGR_1604     FALSE 0.304 73.000 0.000 NA   NA
 3986707 3986708 RICGR_1604 RICGR_1041     FALSE 0.093 161.000 0.000 NA   NA
 3986708 3986709 RICGR_1041 RICGR_1042     TRUE 0.429 27.000 0.000 NA   NA
 3986709 3986710 RICGR_1042 RICGR_1043     TRUE 0.833 0.000 0.000 NA   NA
 3986710 3986711 RICGR_1043 RICGR_1044   asd FALSE 0.293 78.000 0.000 NA   NA
 3986711 3986712 RICGR_1044 RICGR_1045 asd prmB TRUE 0.904 -16.000 0.000 0.043 N NA
 3986714 3986715 RICGR_1047 RICGR_1048 rplQ rpoA TRUE 0.997 14.000 0.873 1.000 N NA
 3986715 3986716 RICGR_1048 RICGR_1049 rpoA rpsD TRUE 0.994 12.000 0.549 1.000 N NA
 3986716 3986717 RICGR_1049 RICGR_1050 rpsD rpsK TRUE 0.949 153.000 0.509 0.039 Y NA
 3986717 3986718 RICGR_1050 RICGR_1051 rpsK rpsM TRUE 0.993 46.000 0.810 0.029 Y NA
 3986718 3986719 RICGR_1051 RICGR_1052 rpsM rpmJ TRUE 0.691 186.000 0.194 0.029   NA
 3986719 3986720 RICGR_1052 RICGR_1053 rpmJ   TRUE 0.810 80.000 0.089 1.000   NA
 3986720 3986721 RICGR_1053 RICGR_1054   rplO TRUE 0.998 6.000 0.730 1.000 N NA
 3986721 3986722 RICGR_1054 RICGR_1055 rplO rpmD TRUE 0.999 3.000 0.653 0.005 Y NA
 3986722 3986723 RICGR_1055 RICGR_1056 rpmD rpsE TRUE 0.998 16.000 0.789 0.039 Y NA
 3986723 3986724 RICGR_1056 RICGR_1057 rpsE rplR TRUE 0.997 19.000 0.814 0.039 Y NA
 3986724 3986725 RICGR_1057 RICGR_1058 rplR   TRUE 0.998 17.000 0.815 0.029 Y NA
 3986725 3986726 RICGR_1058 RICGR_1059   rpsH TRUE 0.997 21.000 0.808 0.029 Y NA
 3986726 3986727 RICGR_1059 RICGR_1060 rpsH   TRUE 0.992 15.000 0.295 0.029 Y NA
 3986727 3986728 RICGR_1060 RICGR_1061     TRUE 0.996 6.000 0.309 0.029 Y NA
 3986728 3986729 RICGR_1061 RICGR_1062   rplX TRUE 0.998 17.000 0.758 0.029 Y NA
 3986729 3986730 RICGR_1062 RICGR_1063 rplX rplN TRUE 0.999 11.000 0.810 0.039 Y NA
 3986730 3986731 RICGR_1063 RICGR_1064 rplN   TRUE 0.998 12.000 0.791 0.039 Y NA
 3986731 3986732 RICGR_1064 RICGR_1065   rpmC TRUE 0.999 -3.000 0.828 0.029 Y NA
 3986732 3986733 RICGR_1065 RICGR_1066 rpmC rplP TRUE 0.999 0.000 0.802 0.029 Y NA
 3986733 3986734 RICGR_1066 RICGR_1067 rplP rpsC TRUE 0.994 38.000 0.828 0.039 Y NA
 3986734 3986735 RICGR_1067 RICGR_1068 rpsC rplV TRUE 0.999 3.000 0.719 0.039 Y NA
 3986735 3986736 RICGR_1068 RICGR_1069 rplV rpsS TRUE 0.997 20.000 0.769 0.039 Y NA
 3986736 3986737 RICGR_1069 RICGR_1070 rpsS rplB TRUE 0.996 26.000 0.820 0.039 Y NA
 3986737 3986738 RICGR_1070 RICGR_1071 rplB rplW TRUE 0.997 16.000 0.849 1.000 Y NA
 3986738 3986739 RICGR_1071 RICGR_1072 rplW rplD TRUE 0.998 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 3986739 3986740 RICGR_1072 RICGR_1073 rplD rplC TRUE 0.986 51.000 0.486 0.029 Y NA
 3986740 3986741 RICGR_1073 RICGR_1074 rplC rpsJ TRUE 0.975 38.000 0.307 0.039 Y NA
 3986741 3986742 RICGR_1074 RICGR_1075 rpsJ tuf TRUE 0.988 19.000 0.318 1.000 Y NA
 3986742 3986743 RICGR_1075 RICGR_1076 tuf fusA TRUE 0.993 22.000 0.400 0.003 Y NA
 3986743 3986744 RICGR_1076 RICGR_1077 fusA rpsG TRUE 0.989 31.000 0.579 1.000 Y NA
 3986744 3986745 RICGR_1077 RICGR_1078 rpsG rpsL TRUE 0.995 26.000 0.620 0.006 Y NA
 3986745 3986746 RICGR_1078 RICGR_1079 rpsL   FALSE 0.032 406.000 0.000 NA   NA
 3986746 3986747 RICGR_1079 RICGR_1080   rpoC FALSE 0.047 262.000 0.000 NA   NA
 3986747 3986748 RICGR_1080 RICGR_1081 rpoC rpoB TRUE 0.996 22.000 0.851 0.001   NA
 3986748 3986749 RICGR_1081 RICGR_1082 rpoB rplL TRUE 0.681 173.000 0.223 1.000   NA
 3986749 3986750 RICGR_1082 RICGR_1083 rplL   TRUE 0.994 40.000 0.884 0.029 Y NA
 3986750 3986751 RICGR_1083 RICGR_1084   rplA TRUE 0.752 308.000 0.302 0.039 Y NA
 3986751 3986752 RICGR_1084 RICGR_1085 rplA rplK TRUE 0.999 2.000 0.838 0.039 Y NA
 3986752 3986753 RICGR_1085 RICGR_1086 rplK nusG TRUE 0.881 200.000 0.681 1.000 N NA
 3986753 3986754 RICGR_1086 RICGR_1087 nusG   TRUE 0.994 21.000 0.843 1.000 N NA
 3986754 3986755 RICGR_1087 RICGR_1605     FALSE 0.066 190.000 0.000 NA   NA
 3986755 3986756 RICGR_1605 RICGR_1606     FALSE 0.183 114.000 0.000 NA   NA
 3986756 3986757 RICGR_1606 RICGR_1607     FALSE 0.300 75.000 0.000 NA   NA
 3986757 3986758 RICGR_1607 RICGR_1608     FALSE 0.108 147.000 0.000 NA   NA
 3986760 3986761 RICGR_1092 RICGR_1094 rocD   TRUE 0.968 7.000 0.019 1.000 Y NA
 3986763 3986764 RICGR_1096 RICGR_1097     TRUE 0.756 7.000 0.000 NA   NA
 3986765 3986766 RICGR_1098 RICGR_1099   pgi TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3986766 3986767 RICGR_1099 RICGR_1100 pgi   FALSE 0.158 130.000 0.000 1.000   NA
 3986767 3986768 RICGR_1100 RICGR_1101     FALSE 0.072 182.000 0.000 NA   NA
 3986768 3986769 RICGR_1101 RICGR_1103     TRUE 0.665 13.000 0.000 NA   NA
 3986771 3986772 RICGR_1104 RICGR_1105     TRUE 0.681 12.000 0.000 NA   NA
 3986773 3986774 RICGR_1106 RICGR_1107     FALSE 0.317 43.000 0.000 NA   NA
 3986774 3986775 RICGR_1107 RICGR_1108     TRUE 0.998 0.000 0.750 NA   NA
 3986776 3986777 RICGR_1109 RICGR_1110     TRUE 0.813 2.000 0.000 NA   NA
 3986777 3986778 RICGR_1110 RICGR_1111     FALSE 0.354 35.000 0.000 NA   NA
 3986778 3986779 RICGR_1111 RICGR_1112   dxs TRUE 0.454 25.000 0.000 NA   NA
 3986779 3986780 RICGR_1112 RICGR_1113 dxs secA FALSE 0.354 68.000 0.000 1.000 N NA
 3986780 3986781 RICGR_1113 RICGR_1114 secA map TRUE 0.464 28.000 0.000 1.000 N NA
 3986781 3986782 RICGR_1114 RICGR_1115 map dapD TRUE 0.609 107.000 0.021 1.000 N NA
 3986782 3986783 RICGR_1115 RICGR_1116 dapD   FALSE 0.347 36.000 0.000 NA   NA
 3986784 3986785 RICGR_1609 RICGR_1118     TRUE 0.681 12.000 0.000 NA   NA
 3986785 3986786 RICGR_1118 RICGR_1119   tpiA TRUE 0.941 25.000 0.184 1.000 N NA
 3986786 3986787 RICGR_1119 RICGR_1120 tpiA   FALSE 0.349 149.000 0.000 0.033 Y NA
 3986788 3986789 RICGR_1121 RICGR_1122 grpE dnaK TRUE 0.890 83.000 0.049 0.010 Y NA
 3986789 3986790 RICGR_1122 RICGR_1123 dnaK dnaJ TRUE 0.940 111.000 0.236 0.006 Y NA
 3986790 3986791 RICGR_1123 RICGR_1124 dnaJ   TRUE 0.544 92.000 0.004 1.000 N NA
 3986791 3986792 RICGR_1124 RICGR_1125     FALSE 0.250 93.000 0.000 NA   NA
 3986794 3986795 RICGR_1127 RICGR_1128   galU TRUE 0.929 1.000 0.000 1.000 Y NA
 3986797 3986798 RICGR_1130 RICGR_1131   rnhA TRUE 0.850 -7.000 0.000 1.000   NA
 3986799 3986800 RICGR_1132 RICGR_1133 lpxC ftsZ TRUE 0.983 3.000 0.134 1.000 N NA
 3986800 3986801 RICGR_1133 RICGR_1134 ftsZ ftsA TRUE 0.867 29.000 0.016 1.000 Y NA
 3986801 3986802 RICGR_1134 RICGR_1135 ftsA   FALSE 0.387 152.000 0.019 NA N NA
 3986802 3986803 RICGR_1135 RICGR_1136     FALSE 0.064 207.000 0.000 NA N NA
 3986803 3986804 RICGR_1136 RICGR_1137     FALSE 0.068 213.000 0.000 1.000 N NA
 3986804 3986805 RICGR_1137 RICGR_1138     TRUE 0.499 38.000 0.000 0.096 N NA
 3986805 3986806 RICGR_1138 RICGR_1139     FALSE 0.106 166.000 0.000 1.000 N NA
 3986807 3986808 RICGR_1140 RICGR_1141 ubiG   TRUE 0.991 4.000 0.259 1.000   NA
 3986808 3986809 RICGR_1141 RICGR_1142     FALSE 0.295 77.000 0.000 NA   NA
 3986810 3986811 RICGR_1143 RICGR_1144 minE minD TRUE 0.999 -3.000 0.618 NA Y NA
 3986812 3986813 RICGR_1145 RICGR_1146 recO   FALSE 0.109 162.000 0.000 1.000 N NA
 3986813 3986814 RICGR_1146 RICGR_1147     FALSE 0.344 55.000 0.000 1.000 N NA
 3986814 3986815 RICGR_1147 RICGR_1148   groS FALSE 0.051 274.000 0.000 1.000 N NA
 3986815 3986816 RICGR_1148 RICGR_1149 groS groL TRUE 0.703 40.000 0.000 0.010 Y NA
 3986816 3986817 RICGR_1149 RICGR_1150 groL   FALSE 0.305 133.000 0.000 1.000 Y NA
 3986818 3986819 RICGR_1151 RICGR_1152     TRUE 0.782 -37.000 0.000 NA   NA
 3986819 3986820 RICGR_1152 RICGR_1153     FALSE 0.227 101.000 0.000 NA   NA
 3986820 3986821 RICGR_1153 RICGR_1154     FALSE 0.244 95.000 0.000 NA   NA
 3986821 3986822 RICGR_1154 RICGR_1155     FALSE 0.057 214.000 0.000 NA   NA
 3986822 3986823 RICGR_1155 RICGR_1156     TRUE 0.972 83.000 0.615 NA   NA
 3986823 3986824 RICGR_1156 RICGR_1157     TRUE 0.977 -3.000 0.057 NA   NA
 3986824 3986825 RICGR_1157 RICGR_1158     FALSE 0.241 97.000 0.000 NA   NA
 3986826 3986827 RICGR_1159 RICGR_1160     TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.056   NA
 3986827 3986828 RICGR_1160 RICGR_1161     TRUE 0.674 14.000 0.000 1.000   NA
 3986829 3986830 RICGR_1162 RICGR_1163     FALSE 0.372 33.000 0.000 NA   NA
 3986830 3986831 RICGR_1163 RICGR_1164     FALSE 0.077 176.000 0.000 NA   NA
 3986831 3986832 RICGR_1164 RICGR_1165     FALSE 0.118 141.000 0.000 NA   NA
 3986833 3986834 RICGR_1166 RICGR_1167     TRUE 0.989 -7.000 0.168 1.000   NA
 3986835 3986836 RICGR_1168 RICGR_1169     FALSE 0.241 97.000 0.000 NA   NA
 3986836 3986837 RICGR_1169 RICGR_1170     TRUE 0.972 26.000 0.349 NA   NA
 3986838 3986839 RICGR_1171 RICGR_1172 ffh rpsP TRUE 0.841 159.000 0.361 1.000 N NA
 3986839 3986840 RICGR_1172 RICGR_1173 rpsP rimM TRUE 0.980 66.000 0.342 0.029 Y NA
 3986840 3986841 RICGR_1173 RICGR_1174 rimM trmD TRUE 0.999 0.000 0.672 1.000 Y NA
 3986841 3986842 RICGR_1174 RICGR_1175 trmD rplS TRUE 0.996 15.000 0.567 1.000 Y NA
 3986842 3986843 RICGR_1175 RICGR_1176 rplS   TRUE 0.683 63.000 0.011 1.000 N NA
 3986848 3986849 RICGR_1181 RICGR_1182     FALSE 0.050 242.000 0.000 NA   NA
 3986849 3986850 RICGR_1182 RICGR_1183     FALSE 0.119 140.000 0.000 NA   NA
 3986850 3986851 RICGR_1183 RICGR_1184   gltA TRUE 0.770 -46.000 0.000 NA   NA
 3986854 3986855 RICGR_1187 RICGR_1188   rumA TRUE 0.953 -12.000 0.009 1.000 N NA
 3986855 3986856 RICGR_1188 RICGR_1189 rumA dacB TRUE 0.800 6.000 0.000 1.000 N NA
 3986856 3986857 RICGR_1189 RICGR_1190 dacB   FALSE 0.285 93.000 0.000 1.000 N NA
 3986857 3986858 RICGR_1190 RICGR_1191   xseA FALSE 0.329 79.000 0.000 1.000 N NA
 3986859 3986860 RICGR_1192 RICGR_1193 topA   TRUE 0.994 3.000 0.238 1.000 Y NA
 3986860 3986861 RICGR_1193 RICGR_1194   ppa FALSE 0.132 144.000 0.000 1.000 N NA
 3986862 3986863 RICGR_1195 RICGR_1196     FALSE 0.127 136.000 0.000 NA   NA
 3986863 3986864 RICGR_1196 RICGR_1197     TRUE 0.594 17.000 0.000 NA   NA
 3986864 3986865 RICGR_1197 RICGR_1198   valS TRUE 0.976 -30.000 0.089 1.000 N NA
 3986865 3986866 RICGR_1198 RICGR_1199 valS dnaQ FALSE 0.343 57.000 0.000 1.000 N NA
 3986866 3986867 RICGR_1199 RICGR_1200 dnaQ nhaA TRUE 0.787 7.000 0.000 1.000 N NA
 3986870 3986871 RICGR_1203 RICGR_1204 hemE   TRUE 0.770 6.000 0.000 NA   NA
 3986871 3986872 RICGR_1204 RICGR_1205     FALSE 0.308 53.000 0.000 NA   NA
 3986872 3986873 RICGR_1205 RICGR_1206     TRUE 0.995 12.000 0.668 NA   NA
 3986873 3986874 RICGR_1206 RICGR_1207     TRUE 0.834 -7.000 0.000 NA   NA
 3986874 3986875 RICGR_1207 RICGR_1208     FALSE 0.317 43.000 0.000 NA   NA
 3986878 3986879 RICGR_1211 RICGR_1212     TRUE 0.999 0.000 0.741 1.000 Y NA
 3986879 3986880 RICGR_1212 RICGR_1213     TRUE 0.993 -15.000 0.196 NA Y NA
 3986880 3986881 RICGR_1213 RICGR_1215     FALSE 0.185 117.000 0.000 NA N NA
 3986882 3986883 RICGR_1214 RICGR_1216     TRUE 0.741 8.000 0.000 NA   NA
 3986884 3986885 RICGR_1217 RICGR_1218     TRUE 0.978 9.000 0.172 NA   NA
 3986885 3986886 RICGR_1218 RICGR_1219   gmhA TRUE 0.991 -3.000 0.187 1.000 N NA
 3986887 3986888 RICGR_1220 RICGR_1221     TRUE 0.503 179.000 0.125 NA   NA
 3986888 3986889 RICGR_1221 RICGR_1222     TRUE 0.989 -9.000 0.188 NA   NA
 3986889 3986890 RICGR_1222 RICGR_1223     FALSE 0.295 77.000 0.000 NA   NA
 3986890 3986891 RICGR_1223 RICGR_1224     TRUE 0.780 -39.000 0.000 NA   NA
 3986891 3986892 RICGR_1224 RICGR_1225     FALSE 0.165 120.000 0.000 NA   NA
 3986892 3986893 RICGR_1225 RICGR_1226     FALSE 0.305 55.000 0.000 NA   NA
 3986894 3986895 RICGR_1227 RICGR_1228     TRUE 0.721 11.000 0.000 1.000   NA
 3986897 3986898 RICGR_1611 RICGR_1231     FALSE 0.334 38.000 0.000 NA   NA
 3986898 3986899 RICGR_1231 RICGR_1232     TRUE 0.647 14.000 0.000 NA   NA
 3986899 3986900 RICGR_1232 RICGR_1234   lpxK TRUE 0.833 0.000 0.000 NA   NA
 3986903 3986904 RICGR_1236 RICGR_1237     TRUE 0.770 6.000 0.000 NA   NA
 3986904 3986905 RICGR_1237 RICGR_1238     TRUE 0.804 16.000 0.000 NA Y NA
 3986906 3986907 RICGR_1239 RICGR_1240     FALSE 0.317 43.000 0.000 NA   NA
 3986907 3986908 RICGR_1240 RICGR_1241   trmB TRUE 0.813 2.000 0.000 NA   NA
 3986909 3986910 RICGR_1242 RICGR_1243     FALSE 0.317 43.000 0.000 NA   NA
 3986910 3986911 RICGR_1243 RICGR_1244     TRUE 0.833 0.000 0.000 NA   NA
 3986911 3986912 RICGR_1244 RICGR_1245     TRUE 0.647 14.000 0.000 NA   NA
 3986912 3986913 RICGR_1245 RICGR_1246     FALSE 0.050 242.000 0.000 NA   NA
 3986913 3986914 RICGR_1246 RICGR_1247     FALSE 0.054 224.000 0.000 NA   NA
 3986914 3986915 RICGR_1247 RICGR_1248     FALSE 0.036 343.000 0.000 NA   NA
 3986916 3986917 RICGR_1249 RICGR_1250     FALSE 0.401 30.000 0.000 NA   NA
 3986917 3986918 RICGR_1250 RICGR_1251     FALSE 0.372 33.000 0.000 NA   NA
 3986918 3986919 RICGR_1251 RICGR_1252     TRUE 0.562 19.000 0.000 NA   NA
 3986920 3986921 RICGR_1253 RICGR_1254   galE FALSE 0.410 32.000 0.000 1.000   NA
 3986921 3986922 RICGR_1254 RICGR_1255 galE   FALSE 0.325 40.000 0.000 NA   NA
 3986922 3986923 RICGR_1255 RICGR_1256     TRUE 0.756 7.000 0.000 NA   NA
 3986923 3986924 RICGR_1256 RICGR_1257     TRUE 0.833 28.000 0.042 NA   NA
 3986924 3986925 RICGR_1257 RICGR_1612     FALSE 0.033 368.000 0.000 NA   NA
 3986925 3986926 RICGR_1612 RICGR_1259   csrA FALSE 0.311 51.000 0.000 NA   NA
 3986926 3986927 RICGR_1259 RICGR_1260 csrA   TRUE 0.437 182.000 0.079 1.000 N NA
 3986927 3986928 RICGR_1260 RICGR_1261   alaS TRUE 0.845 32.000 0.065 1.000 N NA
 3986929 3986930 RICGR_1262 RICGR_1263 gyrB   FALSE 0.282 88.000 0.000 NA N NA
 3986930 3986931 RICGR_1263 RICGR_1264     TRUE 0.770 6.000 0.000 NA   NA
 3986936 3986937 RICGR_1269 RICGR_1270     FALSE 0.201 118.000 0.000 1.000 N NA
 3986937 3986938 RICGR_1270 RICGR_1271     TRUE 0.986 1.000 0.024 0.057 Y NA
 3986938 3986939 RICGR_1271 RICGR_1272     TRUE 0.996 15.000 0.571 1.000 Y NA
 3986941 3986942 RICGR_1274 RICGR_1275     FALSE 0.120 143.000 0.000 NA N NA
 3986943 3986944 RICGR_1276 RICGR_1277 mpl ribD TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3986944 3986945 RICGR_1277 RICGR_1278 ribD   TRUE 0.825 42.000 0.002 0.003 Y NA
 3986945 3986946 RICGR_1278 RICGR_1279   ribH TRUE 0.964 13.000 0.008 0.003 Y NA
 3986947 3986948 RICGR_1280 RICGR_1281     FALSE 0.339 50.000 0.000 1.000   NA
 3986948 3986949 RICGR_1281 RICGR_1282   ribF FALSE 0.331 56.000 0.000 1.000   NA
 3986949 3986950 RICGR_1282 RICGR_1283 ribF mviN TRUE 0.993 -7.000 0.169 0.002   NA
 3986950 3986951 RICGR_1283 RICGR_1284 mviN   TRUE 0.857 -3.000 0.000 1.000   NA
 3986951 3986952 RICGR_1284 RICGR_1285     TRUE 0.993 -7.000 0.263 NA N NA
 3986955 3986956 RICGR_1288 RICGR_1289     TRUE 0.687 67.000 0.000 0.018 Y NA
 3986956 3986957 RICGR_1289 RICGR_1290   rrmJ TRUE 0.827 -13.000 0.000 NA N NA
 3986957 3986958 RICGR_1290 RICGR_1291 rrmJ ftsH TRUE 0.489 125.000 0.019 NA N NA
 3986958 3986959 RICGR_1291 RICGR_1292 ftsH glmM TRUE 0.755 31.000 0.012 1.000 N NA
 3986962 3986963 RICGR_1295 RICGR_1296     FALSE 0.113 154.000 0.000 1.000   NA
 3986963 3986964 RICGR_1296 RICGR_1297     FALSE 0.292 92.000 0.000 1.000 N NA
 3986964 3986965 RICGR_1297 RICGR_1298   trxB TRUE 0.485 26.000 0.000 1.000 N NA
 3986967 3986968 RICGR_1300 RICGR_1301   cysQ TRUE 0.453 29.000 0.000 1.000 N NA
 3986968 3986969 RICGR_1301 RICGR_1302 cysQ   TRUE 0.502 22.000 0.000 NA   NA
 3986971 3986972 RICGR_1304 RICGR_1614     FALSE 0.170 119.000 0.000 NA   NA
 3986972 3986973 RICGR_1614 RICGR_1615     TRUE 0.576 18.000 0.000 NA   NA
 3986973 3986974 RICGR_1615 RICGR_1307     FALSE 0.315 46.000 0.000 NA   NA
 3986974 3986975 RICGR_1307 RICGR_1308   lon TRUE 0.498 111.000 0.008 1.000 N NA
 3986975 3986976 RICGR_1308 RICGR_1309 lon clpX TRUE 0.980 22.000 0.201 0.092 Y NA
 3986976 3986977 RICGR_1309 RICGR_1310 clpX clpP TRUE 0.971 73.000 0.352 1.000 Y NA
 3986977 3986978 RICGR_1310 RICGR_1311 clpP tig TRUE 0.965 90.000 0.351 1.000 Y NA
 3986978 3986979 RICGR_1311 RICGR_1616 tig   FALSE 0.334 38.000 0.000 NA   NA
 3986979 3986980 RICGR_1616 RICGR_1313   hemB FALSE 0.316 45.000 0.000 NA   NA
 3986981 3986982 RICGR_1314 RICGR_1315 rplM rpsI TRUE 0.999 3.000 0.601 0.028 Y NA
 3986982 3986983 RICGR_1315 RICGR_1316 rpsI petA TRUE 0.637 70.000 0.006 1.000 N NA
 3986983 3986984 RICGR_1316 RICGR_1317 petA   TRUE 0.937 118.000 0.233 0.002 Y NA
 3986984 3986985 RICGR_1317 RICGR_1318   petC TRUE 0.999 -12.000 0.630 0.002 Y NA
 3986985 3986986 RICGR_1318 RICGR_1319 petC   TRUE 0.959 49.000 0.370 1.000 N NA
 3986986 3986987 RICGR_1319 RICGR_1320   sspB TRUE 0.998 1.000 0.831 NA   NA
 3986987 3986988 RICGR_1320 RICGR_1321 sspB   TRUE 0.813 2.000 0.000 NA   NA
 3986988 3986989 RICGR_1321 RICGR_1322     TRUE 0.978 -3.000 0.055 1.000 N NA
 3986989 3986990 RICGR_1322 RICGR_1323     TRUE 0.466 57.000 0.000 0.092 N NA
 3986992 3986993 RICGR_1617 RICGR_1618     FALSE 0.222 102.000 0.000 NA   NA
 3986993 3986994 RICGR_1618 RICGR_1619     TRUE 0.468 24.000 0.000 NA   NA
 3986994 3986995 RICGR_1619 RICGR_1328     FALSE 0.028 797.000 0.000 NA   NA
 3986995 3986996 RICGR_1328 RICGR_1329     TRUE 0.998 -3.000 0.676 NA   NA
 3986996 3986997 RICGR_1329 RICGR_1330     FALSE 0.048 251.000 0.000 NA   NA
 3986997 3986998 RICGR_1330 RICGR_1620     FALSE 0.037 319.000 0.000 NA   NA
 3987000 3987001 RICGR_1333 RICGR_1334     FALSE 0.315 68.000 0.000 NA   NA
 3987002 3987003 RICGR_1337 RICGR_1338     FALSE 0.341 37.000 0.000 NA   NA
 3987003 3987004 RICGR_1338 RICGR_1339     FALSE 0.032 387.000 0.000 NA   NA
 3987004 3987005 RICGR_1339 RICGR_1340     FALSE 0.086 169.000 0.000 NA   NA
 3987005 3987006 RICGR_1340 RICGR_1341     FALSE 0.314 85.000 0.000 1.000 N NA
 3987006 3987007 RICGR_1341 RICGR_1342     TRUE 0.547 35.000 0.000 0.032   NA
 3987007 3987008 RICGR_1342 RICGR_1343     TRUE 0.817 3.000 0.000 1.000   NA
 3987008 3987009 RICGR_1343 RICGR_1344     TRUE 0.792 -28.000 0.000 NA   NA
 3987011 3987012 RICGR_1346 RICGR_1347     TRUE 0.440 29.000 0.000 1.000   NA
 3987012 3987013 RICGR_1347 RICGR_1348     FALSE 0.075 189.000 0.000 1.000   NA
 3987013 3987014 RICGR_1348 RICGR_1349     FALSE 0.311 63.000 0.000 NA   NA
 3987014 3987015 RICGR_1349 RICGR_1350     FALSE 0.143 128.000 0.000 NA   NA
 3987015 3987016 RICGR_1350 RICGR_1351     FALSE 0.341 37.000 0.000 NA   NA
 3987018 3987019 RICGR_1353 RICGR_1354     FALSE 0.336 125.000 0.000 1.000 Y NA
 3987019 3987020 RICGR_1354 RICGR_1355     TRUE 0.497 104.000 0.004 1.000 N NA
 3987020 3987021 RICGR_1355 RICGR_1356   xseB TRUE 0.966 3.000 0.035 1.000 N NA
 3987022 3987023 RICGR_1357 RICGR_1358     TRUE 0.997 10.000 0.598 0.004   NA
 3987024 3987025 RICGR_1359 RICGR_1360   hemL FALSE 0.222 102.000 0.000 NA   NA
 3987025 3987026 RICGR_1360 RICGR_1361 hemL   FALSE 0.354 35.000 0.000 NA   NA
 3987027 3987028 RICGR_1362 RICGR_1363 mrdA rpsT FALSE 0.182 124.000 0.000 1.000 N NA
 3987029 3987030 RICGR_1364 RICGR_1365     TRUE 0.692 13.000 0.000 1.000   NA
 3987030 3987031 RICGR_1365 RICGR_1366     TRUE 0.805 -43.000 0.000 1.000 N NA
 3987033 3987034 RICGR_1367 RICGR_1369     FALSE 0.336 76.000 0.000 1.000 N NA
 3987034 3987035 RICGR_1369 RICGR_1370   accA TRUE 0.433 31.000 0.000 1.000 N NA
 3987035 3987036 RICGR_1370 RICGR_1371 accA   TRUE 0.798 3.000 0.000 NA   NA
 3987038 3987039 RICGR_1373 RICGR_1374     TRUE 0.983 0.000 0.111 NA   NA
 3987039 3987040 RICGR_1374 RICGR_1375     FALSE 0.031 443.000 0.000 NA   NA
 3987041 3987042 RICGR_1376 RICGR_1377     TRUE 0.774 8.000 0.000 1.000 N NA
 3987042 3987043 RICGR_1377 RICGR_1378     TRUE 0.938 8.000 0.000 0.005 Y NA
 3987043 3987044 RICGR_1378 RICGR_1379   tkt FALSE 0.343 57.000 0.000 1.000 N NA
 3987044 3987045 RICGR_1379 RICGR_1380 tkt gap TRUE 0.963 10.000 0.022 1.000 Y NA
 3987045 3987046 RICGR_1380 RICGR_1381 gap rpoZ FALSE 0.157 133.000 0.000 1.000 N NA
 3987046 3987047 RICGR_1381 RICGR_1382 rpoZ   TRUE 0.978 25.000 0.291 1.000 Y NA
 3987048 3987049 RICGR_1383 RICGR_1384 panC panB TRUE 0.998 -49.000 0.395 0.001 Y NA
 3987049 3987050 RICGR_1384 RICGR_1385 panB coaBC FALSE 0.368 175.000 0.006 1.000 Y NA
 3987050 3987051 RICGR_1385 RICGR_1386 coaBC   FALSE 0.307 60.000 0.000 NA   NA
 3987051 3987052 RICGR_1386 RICGR_1387     FALSE 0.161 122.000 0.000 NA   NA
 3987052 3987053 RICGR_1387 RICGR_1388     FALSE 0.088 174.000 0.000 1.000   NA
 3987053 3987054 RICGR_1388 RICGR_1389     FALSE 0.129 254.000 0.000 0.001   NA
 3987054 3987055 RICGR_1389 RICGR_1390     FALSE 0.032 599.000 0.000 1.000   NA
 3987056 3987057 RICGR_1391 RICGR_1392   argD TRUE 0.924 11.000 0.015 1.000 N NA
 3987057 3987058 RICGR_1392 RICGR_1393 argD   TRUE 0.963 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 3987058 3987059 RICGR_1393 RICGR_1394     FALSE 0.315 66.000 0.000 NA   NA
 3987059 3987060 RICGR_1394 RICGR_1395     FALSE 0.059 208.000 0.000 NA   NA
 3987060 3987061 RICGR_1395 RICGR_1396   xth TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3987061 3987062 RICGR_1396 RICGR_1397 xth   TRUE 0.696 11.000 0.000 NA   NA
 3987062 3987063 RICGR_1397 RICGR_1398     FALSE 0.320 42.000 0.000 NA   NA
 3987063 3987064 RICGR_1398 RICGR_1399     TRUE 0.834 -7.000 0.000 NA   NA
 3987066 3987067 RICGR_1401 RICGR_1402   engB TRUE 0.612 16.000 0.000 NA   NA
 3987067 3987068 RICGR_1402 RICGR_1403 engB   FALSE 0.201 109.000 0.000 NA   NA
 3987068 3987069 RICGR_1403 RICGR_1404     FALSE 0.054 223.000 0.000 NA   NA
 3987069 3987070 RICGR_1404 RICGR_1405     TRUE 0.997 14.000 1.000 1.000 N NA
 3987070 3987071 RICGR_1405 RICGR_1406     FALSE 0.352 64.000 0.000 1.000 N NA
 3987071 3987072 RICGR_1406 RICGR_1407     TRUE 0.529 134.000 0.051 NA   NA
 3987072 3987073 RICGR_1407 RICGR_1408     TRUE 0.993 10.000 0.459 NA   NA
 3987073 3987074 RICGR_1408 RICGR_1409     TRUE 0.997 -7.000 0.543 NA   NA
 3987074 3987075 RICGR_1409 RICGR_1410   raiA FALSE 0.066 211.000 0.000 1.000   NA
 3987075 3987076 RICGR_1410 RICGR_1411 raiA purB TRUE 0.569 21.000 0.000 1.000 N NA
 3987078 3987079 RICGR_1413 RICGR_1414     TRUE 0.484 93.000 0.000 1.000 Y NA
 3987080 3987081 RICGR_1415 RICGR_1416     TRUE 0.792 -28.000 0.000 NA   NA
 3987081 3987082 RICGR_1416 RICGR_1417     FALSE 0.341 65.000 0.000 1.000   NA
 3987082 3987083 RICGR_1417 RICGR_1418     FALSE 0.339 70.000 0.000 1.000   NA
 3987083 3987084 RICGR_1418 RICGR_1419     FALSE 0.344 58.000 0.000 1.000 N NA
 3987084 3987085 RICGR_1419 RICGR_1420     FALSE 0.314 65.000 0.000 NA   NA
 3987086 3987087 RICGR_1421 RICGR_1422   rpiA FALSE 0.222 102.000 0.000 NA   NA
 3987088 3987089 RICGR_1423 RICGR_1424 ahcY metK TRUE 0.859 126.000 0.114 0.003 Y NA
 3987089 3987090 RICGR_1424 RICGR_1425 metK   FALSE 0.157 133.000 0.000 1.000 N NA
 3987090 3987091 RICGR_1425 RICGR_1426     TRUE 1.000 -6.000 1.000 0.018 Y NA
 3987091 3987092 RICGR_1426 RICGR_1427     FALSE 0.100 155.000 0.000 NA   NA
 3987092 3987093 RICGR_1427 RICGR_1428   tdk FALSE 0.116 142.000 0.000 NA   NA
 3987095 3987096 RICGR_1430 RICGR_1431     FALSE 0.309 62.000 0.000 NA   NA
 3987096 3987097 RICGR_1431 RICGR_1432     FALSE 0.332 55.000 0.000 1.000   NA
 3987097 3987098 RICGR_1432 RICGR_1433     TRUE 0.447 236.000 0.140 1.000   NA
 3987098 3987099 RICGR_1433 RICGR_1434   murI FALSE 0.313 80.000 0.000 1.000   NA
 3987099 3987100 RICGR_1434 RICGR_1435 murI   TRUE 0.736 10.000 0.000 1.000   NA
 3987100 3987101 RICGR_1435 RICGR_1436     FALSE 0.350 41.000 0.000 1.000   NA
 3987101 3987102 RICGR_1436 RICGR_1437     FALSE 0.040 287.000 0.000 NA   NA
 3987102 3987103 RICGR_1437 RICGR_1438   lolA FALSE 0.065 193.000 0.000 NA   NA
 3987103 3987104 RICGR_1438 RICGR_1439 lolA bioD TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3987104 3987105 RICGR_1439 RICGR_1440 bioD bioC TRUE 0.781 48.000 0.008 0.003 N NA
 3987105 3987106 RICGR_1440 RICGR_1441 bioC   TRUE 0.987 -3.000 0.133 1.000 N NA
 3987106 3987107 RICGR_1441 RICGR_1442   bioB TRUE 0.993 -9.000 0.168 1.000 Y NA
 3987107 3987108 RICGR_1442 RICGR_1443 bioB   TRUE 0.549 74.000 0.000 1.000 Y NA
 3987110 3987111 RICGR_1444 RICGR_1446   rpoS TRUE 0.524 21.000 0.000 NA   NA
 3987111 3987112 RICGR_1446 RICGR_1447 rpoS   FALSE 0.055 219.000 0.000 NA   NA
 3987112 3987113 RICGR_1447 RICGR_1448   surE TRUE 0.966 2.000 0.038 NA   NA
 3987113 3987114 RICGR_1448 RICGR_1449 surE   TRUE 0.813 2.000 0.000 NA   NA
 3987114 3987115 RICGR_1449 RICGR_1450     FALSE 0.128 135.000 0.000 NA   NA
 3987115 3987116 RICGR_1450 RICGR_1451     TRUE 0.779 -48.000 0.000 NA N NA
 3987116 3987117 RICGR_1451 RICGR_1452     TRUE 0.841 -3.000 0.000 NA   NA
 3987118 3987119 RICGR_1453 RICGR_1454 lipB lipA TRUE 0.956 120.000 0.319 0.001 Y NA
 3987119 3987120 RICGR_1454 RICGR_1455 lipA   TRUE 0.940 0.000 0.003 1.000 N NA
 3987121 3987122 RICGR_1456 RICGR_1457     FALSE 0.048 247.000 0.000 NA   NA
 3987122 3987123 RICGR_1457 RICGR_1458     TRUE 0.833 0.000 0.000 NA   NA
 3987123 3987124 RICGR_1458 RICGR_1459     FALSE 0.309 71.000 0.000 NA   NA
 3987126 3987127 RICGR_1461 RICGR_1462   speB FALSE 0.390 31.000 0.000 NA   NA
 3987127 3987128 RICGR_1462 RICGR_1463 speB   TRUE 0.669 15.000 0.000 1.000 N NA
 3987128 3987129 RICGR_1463 RICGR_1464     TRUE 0.894 25.000 0.081 1.000 N NA
 3987129 3987130 RICGR_1464 RICGR_1465     FALSE 0.041 321.000 0.000 1.000   NA
 3987130 3987131 RICGR_1465 RICGR_1466     TRUE 0.901 11.000 0.008 NA   NA
 3987132 3987133 RICGR_1467 RICGR_1468   rfaF TRUE 0.865 65.000 0.138 NA   NA
 3987134 3987135 RICGR_1469 RICGR_1470 trmE   TRUE 0.985 13.000 0.221 0.052   NA
 3987135 3987136 RICGR_1470 RICGR_1471   rnpA FALSE 0.394 236.000 0.105 1.000 N NA
 3987136 3987137 RICGR_1471 RICGR_1472 rnpA rpmH TRUE 0.997 14.000 0.787 0.001   NA
 3987138 3987139 RICGR_1473 RICGR_1474   dnaA FALSE 0.032 382.000 0.000 NA   NA
 3987139 3987140 RICGR_1474 RICGR_1475 dnaA dnaN TRUE 0.995 8.000 0.328 1.000 Y NA
 3987140 3987141 RICGR_1475 RICGR_1476 dnaN   TRUE 0.995 7.000 0.318 1.000 Y NA
 3987141 3987142 RICGR_1476 RICGR_1477     TRUE 0.703 13.000 0.000 1.000 N NA
 3987143 3987144 RICGR_1478 RICGR_1621     FALSE 0.320 42.000 0.000 NA   NA
 3987146 3987147 RICGR_1481 RICGR_1482     FALSE 0.312 70.000 0.000 NA   NA
 3987147 3987148 RICGR_1482 RICGR_1483     FALSE 0.214 104.000 0.000 NA   NA
 3987148 3987149 RICGR_1483 RICGR_1484     TRUE 0.796 53.000 0.074 NA   NA
 3987149 3987150 RICGR_1484 RICGR_1485     FALSE 0.308 61.000 0.000 NA   NA
 3987151 3987152 RICGR_1486 RICGR_1487     FALSE 0.197 119.000 0.000 1.000 N NA
 3987152 3987153 RICGR_1487 RICGR_1488   ptsP FALSE 0.220 111.000 0.000 1.000 N NA
 3987153 3987154 RICGR_1488 RICGR_1489 ptsP   TRUE 0.881 6.000 0.000 0.039 N NA
 3987155 3987156 RICGR_1490 RICGR_1491   recX FALSE 0.338 63.000 0.000 1.000   NA
 3987156 3987157 RICGR_1491 RICGR_1492 recX recA TRUE 0.989 9.000 0.296 1.000   NA
 3987158 3987159 RICGR_1493 RICGR_1494   rfaD TRUE 0.996 -3.000 0.191 0.011 Y NA
 3987159 3987160 RICGR_1494 RICGR_1495 rfaD   TRUE 0.615 74.000 0.006 1.000   NA
 3987161 3987162 RICGR_1496 RICGR_1497     FALSE 0.346 60.000 0.000 1.000 N NA
 3987163 3987164 RICGR_1498 RICGR_1499   atpB TRUE 0.991 9.000 0.330 1.000   NA
 3987164 3987165 RICGR_1499 RICGR_1500 atpB   TRUE 0.993 28.000 0.557 0.006 Y NA
 3987165 3987166 RICGR_1500 RICGR_1501   atpF TRUE 0.995 26.000 0.666 0.006 Y NA
 3987166 3987167 RICGR_1501 RICGR_1502 atpF atpH TRUE 0.997 0.000 0.242 0.006 Y NA
 3987167 3987168 RICGR_1502 RICGR_1503 atpH atpA TRUE 0.998 16.000 0.864 0.006 Y NA
 3987168 3987169 RICGR_1503 RICGR_1504 atpA atpG TRUE 0.999 8.000 0.846 0.006 Y NA
 3987169 3987170 RICGR_1504 RICGR_1505 atpG atpD TRUE 0.993 38.000 0.724 0.006 Y NA
 3987170 3987171 RICGR_1505 RICGR_1506 atpD atpC TRUE 0.998 16.000 0.837 0.006 Y NA
 3987171 3987172 RICGR_1506 RICGR_1507 atpC glmU TRUE 0.709 105.000 0.067 1.000 N NA
 3987173 3987174 RICGR_1508 RICGR_1509     FALSE 0.325 70.000 0.000 NA N NA
 3987175 3987176 RICGR_1510 RICGR_1511     FALSE 0.264 97.000 0.000 1.000   NA
 3987177 3987178 RICGR_1512 RICGR_1513 acnB glyS FALSE 0.262 100.000 0.000 1.000 N NA
 3987178 3987179 RICGR_1513 RICGR_1514 glyS typA FALSE 0.220 111.000 0.000 1.000 N NA
 3987180 3987181 RICGR_1515 RICGR_1516     FALSE 0.152 125.000 0.000 NA   NA
 3987181 3987182 RICGR_1516 RICGR_1517     TRUE 0.963 15.000 0.145 1.000   NA
 3987182 3987183 RICGR_1517 RICGR_1518   ubiB TRUE 0.997 0.000 0.432 1.000   NA
 3987183 3987184 RICGR_1518 RICGR_1519 ubiB   TRUE 0.454 25.000 0.000 NA   NA
 3987184 3987185 RICGR_1519 RICGR_1520     TRUE 0.775 -43.000 0.000 NA   NA
 3987185 3987186 RICGR_1520 RICGR_1521     TRUE 0.454 25.000 0.000 NA   NA
 3987186 3987187 RICGR_1521 RICGR_1522     TRUE 0.726 9.000 0.000 NA   NA
 3987187 3987188 RICGR_1522 RICGR_1523   ispH FALSE 0.142 139.000 0.000 1.000 N NA
 3987188 3987189 RICGR_1523 RICGR_1524 ispH   FALSE 0.042 275.000 0.000 NA   NA
 3987189 3987190 RICGR_1524 RICGR_1525     FALSE 0.029 578.000 0.000 NA   NA
 3987190 3987191 RICGR_1525 RICGR_1526     FALSE 0.140 132.000 0.000 NA   NA
 3987191 3987192 RICGR_1526 RICGR_1527     TRUE 0.468 24.000 0.000 NA   NA
 3987192 3987193 RICGR_1527 RICGR_1528     TRUE 0.576 18.000 0.000 NA   NA
 3987194 3987195 RICGR_1530 RICGR_1532     FALSE 0.176 117.000 0.000 NA   NA
 3987195 3987196 RICGR_1532 RICGR_1533     FALSE 0.028 900.000 0.000 NA   NA
 3987196 3987197 RICGR_1533 RICGR_1534     FALSE 0.288 80.000 0.000 NA   NA
 3987197 3987198 RICGR_1534 RICGR_1535     FALSE 0.302 74.000 0.000 NA   NA
 3987198 3987199 RICGR_1535 RICGR_1536     TRUE 0.912 0.000 0.000 0.044   NA
 3987201 3987202 RICGR_1538 RICGR_1539     FALSE 0.029 577.000 0.000 NA   NA
 3987203 3987204 RICGR_1540 RICGR_1541     FALSE 0.061 207.000 0.000 NA   NA
 3987204 3987205 RICGR_1541 RICGR_1542     FALSE 0.102 154.000 0.000 NA   NA
 3987205 3987206 RICGR_1542 RICGR_1543     FALSE 0.088 168.000 0.000 NA   NA
 3987206 3987207 RICGR_1543 RICGR_1544     FALSE 0.339 70.000 0.000 1.000   NA
 3987207 3987208 RICGR_1544 RICGR_1545     FALSE 0.341 65.000 0.000 1.000   NA
 3987208 3987209 RICGR_1545 RICGR_1546     TRUE 0.792 -28.000 0.000 NA   NA
 3987210 3987211 RICGR_1547 RICGR_1548     TRUE 0.484 93.000 0.000 1.000 Y NA
 3987213 3987214 RICGR_1550 RICGR_1551 purB raiA TRUE 0.569 21.000 0.000 1.000 N NA
 3987214 3987215 RICGR_1551 RICGR_1552 raiA   FALSE 0.066 211.000 0.000 1.000   NA
 3987215 3987216 RICGR_1552 RICGR_1553     TRUE 0.834 -7.000 0.000 NA   NA
 3987216 3987217 RICGR_1553 RICGR_1554     TRUE 0.712 10.000 0.000 NA   NA
 3987220 3987221 RICGR_1557 RICGR_1558 tdk   FALSE 0.116 142.000 0.000 NA   NA
 3987221 3987222 RICGR_1558 RICGR_1559     FALSE 0.100 155.000 0.000 NA   NA
 3987222 3987223 RICGR_1559 RICGR_1560     TRUE 1.000 -6.000 1.000 0.017 Y NA
 3987223 3987224 RICGR_1560 RICGR_1561   metK FALSE 0.157 133.000 0.000 1.000 N NA
 3987224 3987225 RICGR_1561 RICGR_1562 metK ahcY TRUE 0.859 126.000 0.114 0.003 Y NA
 3987226 3987227 RICGR_1563 RICGR_1564 rpiA   FALSE 0.222 102.000 0.000 NA   NA
 3987228 3987229 RICGR_1565 RICGR_1566     FALSE 0.314 65.000 0.000 NA   NA
 3987229 3987230 RICGR_1566 RICGR_1567     FALSE 0.332 58.000 0.000 1.000   NA