MicrobesOnline Operon Predictions for Actinobacillus minor 202

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6433019 6433020 AM202_0001 AM202_0002   acr3 FALSE 0.049 236.000 0.000 1.000   NA
 6433020 6433021 AM202_0002 AM202_0003 acr3 arsC TRUE 0.985 0.000 0.176 1.000 Y NA
 6433021 6433022 AM202_0003 AM202_0004 arsC arsR TRUE 0.767 52.000 0.081 1.000 N NA
 6433026 6433027 AM202_0008 AM202_0009 gidB gidA TRUE 0.966 2.000 0.466 1.000 N NA
 6433028 6433029 AM202_0010 AM202_0011     FALSE 0.082 577.000 0.000 NA   NA
 6433029 6433030 AM202_0011 AM202_0012   kpsC FALSE 0.006 144.000 0.000 1.000 N NA
 6433030 6433031 AM202_0012 AM202_0013 kpsC hcsB TRUE 0.996 5.000 0.315 0.003 Y NA
 6433031 6433032 AM202_0013 AM202_0014 hcsB   FALSE 0.006 156.000 0.000 NA N NA
 6433032 6433033 AM202_0014 AM202_0015     TRUE 0.941 -28.000 0.092 NA   NA
 6433033 6433034 AM202_0015 AM202_0016   merP TRUE 0.970 3.000 0.300 1.000   NA
 6433034 6433035 AM202_0016 AM202_0017 merP   FALSE 0.118 81.000 0.000 NA   NA
 6433035 6433036 AM202_0017 AM202_0018   gntR FALSE 0.080 116.000 0.000 NA   NA
 6433038 6433039 AM202_0020 AM202_0021 gntP   FALSE 0.399 215.000 0.000 1.000 Y NA
 6433039 6433040 AM202_0021 AM202_0022     TRUE 0.991 16.000 0.481 1.000 Y NA
 6433040 6433041 AM202_0022 AM202_0023     FALSE 0.181 64.000 0.000 NA   NA
 6433042 6433043 AM202_0024 AM202_0025     FALSE 0.075 216.000 0.000 NA   NA
 6433046 6433047 AM202_0028 AM202_0029     TRUE 0.760 12.000 0.007 NA   NA
 6433047 6433048 AM202_0029 AM202_0030   aspC FALSE 0.094 70.000 0.000 1.000   NA
 6433048 6433049 AM202_0030 AM202_0031 aspC apxIIC FALSE 0.007 405.000 0.000 1.000 N NA
 6433049 6433050 AM202_0031 AM202_0032 apxIIC apxIIA TRUE 0.968 41.000 1.000 1.000   NA
 6433050 6433051 AM202_0032 AM202_0033 apxIIA apxIIB FALSE 0.111 65.000 0.000 1.000   NA
 6433051 6433052 AM202_0033 AM202_0034 apxIIB apxIID TRUE 0.996 13.000 0.426 0.008 Y NA
 6433053 6433054 AM202_0035 AM202_0036 folC accD TRUE 0.901 53.000 0.383 1.000 N NA
 6433055 6433056 AM202_0037 AM202_0038 mazG cpxR FALSE 0.194 107.000 0.006 1.000   NA
 6433056 6433057 AM202_0038 AM202_0039 cpxR cpxA TRUE 0.985 49.000 0.791 1.000 Y NA
 6433057 6433058 AM202_0039 AM202_0040 cpxA   FALSE 0.006 302.000 0.000 1.000 N NA
 6433060 6433061 AM202_0042 AM202_0043   tdk FALSE 0.196 62.000 0.000 NA   NA
 6433062 6433063 AM202_0044 AM202_0045   aroG FALSE 0.150 39.000 0.004 1.000 N NA
 6433063 6433064 AM202_0045 AM202_0046 aroG   FALSE 0.466 109.000 0.023 NA   NA
 6433066 6433067 AM202_0048 AM202_0049   plpD FALSE 0.078 289.000 0.000 NA   NA
 6433067 6433068 AM202_0049 AM202_0050 plpD   FALSE 0.363 64.000 0.013 1.000 N NA
 6433068 6433069 AM202_0050 AM202_0051     FALSE 0.081 544.000 0.000 NA   NA
 6433069 6433070 AM202_0051 AM202_0052     FALSE 0.460 10.000 0.000 NA   NA
 6433070 6433071 AM202_0052 AM202_0053     FALSE 0.100 93.000 0.000 NA   NA
 6433071 6433072 AM202_0053 AM202_0054     FALSE 0.446 13.000 0.000 NA   NA
 6433075 6433076 AM202_0057 AM202_0058     TRUE 0.982 -85.000 0.743 0.048 N NA
 6433076 6433077 AM202_0058 AM202_0059     TRUE 0.989 -7.000 0.857 0.048   NA
 6433080 6433081 AM202_0062 AM202_0063   ftsK FALSE 0.076 134.000 0.000 NA   NA
 6433081 6433082 AM202_0063 AM202_0064 ftsK lrp TRUE 0.961 10.000 0.345 1.000 N NA
 6433082 6433083 AM202_0064 AM202_0065 lrp rnd FALSE 0.250 48.000 0.006 1.000 N NA
 6433085 6433086 AM202_0067 AM202_0068     FALSE 0.098 94.000 0.000 NA   NA
 6433086 6433087 AM202_0068 AM202_0069     FALSE 0.428 17.000 0.000 NA   NA
 6433087 6433088 AM202_0069 AM202_0070     FALSE 0.080 353.000 0.000 NA   NA
 6433088 6433089 AM202_0070 AM202_0071     TRUE 0.758 12.000 0.007 NA   NA
 6433089 6433090 AM202_0071 AM202_0072   rhlB TRUE 0.822 4.000 0.013 NA   NA
 6433090 6433091 AM202_0072 AM202_0073 rhlB topA TRUE 0.497 88.000 0.000 1.000 Y NA
 6433093 6433094 AM202_0075 AM202_0076 argA aroA TRUE 0.504 114.000 0.003 1.000 Y NA
 6433094 6433095 AM202_0076 AM202_0077 aroA   FALSE 0.300 40.000 0.000 NA   NA
 6433095 6433096 AM202_0077 AM202_0078     FALSE 0.438 15.000 0.000 NA   NA
 6433096 6433097 AM202_0078 AM202_0079     FALSE 0.006 264.000 0.000 NA N NA
 6433097 6433098 AM202_0079 AM202_0080   ihfA TRUE 0.616 60.000 0.026 NA N NA
 6433098 6433099 AM202_0080 AM202_0081 ihfA pheT TRUE 0.917 28.000 0.208 1.000 N NA
 6433099 6433100 AM202_0081 AM202_0082 pheT pheS TRUE 0.974 99.000 0.574 0.003 Y NA
 6433101 6433102 AM202_0083 AM202_0084     FALSE 0.054 16.000 0.000 1.000 N NA
 6433103 6433104 AM202_0085 AM202_0086   dnaB TRUE 0.783 38.000 0.020 NA   NA
 6433104 6433105 AM202_0086 AM202_0087 dnaB   FALSE 0.009 86.000 0.000 1.000 N NA
 6433105 6433106 AM202_0087 AM202_0088     TRUE 0.783 41.000 0.021 NA   NA
 6433107 6433108 AM202_0089 AM202_0090 efp   FALSE 0.006 169.000 0.000 1.000 N NA
 6433108 6433109 AM202_0090 AM202_0091     TRUE 0.991 3.000 0.356 1.000 Y NA
 6433109 6433110 AM202_0091 AM202_0092     TRUE 0.996 -3.000 0.870 0.052 Y NA
 6433110 6433111 AM202_0092 AM202_0093     TRUE 0.994 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 6433111 6433112 AM202_0093 AM202_0094     TRUE 0.628 173.000 0.012 NA Y NA
 6433112 6433113 AM202_0094 AM202_0095     TRUE 0.995 11.000 0.937 NA Y NA
 6433113 6433114 AM202_0095 AM202_0096     TRUE 0.681 98.000 0.233 1.000 N NA
 6433114 6433115 AM202_0096 AM202_0097   asnS FALSE 0.006 132.000 0.000 1.000 N NA
 6433116 6433117 AM202_0098 AM202_0099   hpt FALSE 0.114 112.000 0.008 1.000 N NA
 6433117 6433118 AM202_0099 AM202_0100 hpt pepP FALSE 0.022 53.000 0.000 1.000 N NA
 6433118 6433119 AM202_0100 AM202_0101 pepP   FALSE 0.007 719.000 0.000 1.000 N NA
 6433119 6433120 AM202_0101 AM202_0102     TRUE 0.969 17.000 0.303 NA   NA
 6433120 6433121 AM202_0102 AM202_0767     FALSE 0.084 1589.000 0.000 NA   NA
 6433121 6433122 AM202_0767 AM202_103   secG FALSE 0.442 14.000 0.000 NA   NA
 6433122 6433123 AM202_103 AM202_104 secG topB2 FALSE 0.107 142.000 0.008 1.000 N NA
 6433123 6433124 AM202_104 AM202_105 topB2 mepA TRUE 0.580 55.000 0.024 1.000 N NA
 6433124 6433125 AM202_105 AM202_106 mepA   FALSE 0.055 108.000 0.000 1.000   NA
 6433125 6433126 AM202_106 AM202_107     FALSE 0.388 85.000 0.011 NA   NA
 6433126 6433127 AM202_107 AM202_0108   fieF TRUE 0.783 0.000 0.009 NA   NA
 6433127 6433128 AM202_0108 AM202_0109 fieF frr FALSE 0.011 74.000 0.000 1.000 N NA
 6433128 6433129 AM202_0109 AM202_0110 frr pyrH TRUE 0.943 41.000 0.626 1.000 N NA
 6433131 6433132 AM202_0112 AM202_0113 aroC   FALSE 0.271 16.000 0.003 NA N NA
 6433132 6433133 AM202_0113 AM202_0114     TRUE 0.987 18.000 0.222 NA Y NA
 6433133 6433134 AM202_0114 AM202_0115   menE TRUE 0.835 9.000 0.024 NA N NA
 6433134 6433135 AM202_0115 AM202_0116 menE seqA TRUE 0.829 12.000 0.029 1.000 N NA
 6433136 6433137 AM202_0117 AM202_0118   yecO TRUE 0.826 4.000 0.013 NA   NA
 6433138 6433139 AM202_0119 AM202_0120 tsf rpsB TRUE 0.948 106.000 0.748 1.000 Y NA
 6433139 6433140 AM202_0120 AM202_0121 rpsB   FALSE 0.050 269.000 0.000 1.000   NA
 6433140 6433141 AM202_0121 AM202_0122   ftsH FALSE 0.048 206.000 0.000 1.000   NA
 6433141 6433142 AM202_0122 AM202_0123 ftsH rrmJ TRUE 0.884 35.000 0.152 1.000 N NA
 6433143 6433144 AM202_0124 AM202_0125 guaB   FALSE 0.093 99.000 0.000 NA   NA
 6433144 6433145 AM202_0125 AM202_0126     FALSE 0.202 61.000 0.000 NA   NA
 6433145 6433146 AM202_0126 AM202_0127   guaA FALSE 0.428 17.000 0.000 NA   NA
 6433148 6433149 AM202_0129 AM202_0130     FALSE 0.461 9.000 0.000 NA   NA
 6433150 6433151 AM202_0134 AM202_0133 dapD dtd FALSE 0.008 93.000 0.000 1.000 N NA
 6433151 6433152 AM202_0133 AM202_0132 dtd rbn TRUE 0.924 -25.000 0.069 1.000   NA
 6433154 6433155 AM202_0187 AM202_0186     TRUE 0.960 -3.000 0.220 1.000   NA
 6433155 6433156 AM202_0186 AM202_0185     TRUE 0.994 0.000 0.852 1.000 Y NA
 6433156 6433157 AM202_0185 AM202_0184   tpiA FALSE 0.006 186.000 0.000 1.000 N NA
 6433161 6433162 AM202_0180 AM202_0179 miaA birA FALSE 0.059 11.000 0.000 1.000 N NA
 6433162 6433163 AM202_0179 AM202_0178 birA murB TRUE 0.942 9.000 0.211 1.000 N NA
 6433163 6433164 AM202_0178 AM202_0177 murB crp FALSE 0.007 106.000 0.000 1.000 N NA
 6433164 6433165 AM202_0177 AM202_0176 crp   TRUE 0.821 63.000 0.087 NA   NA
 6433165 6433166 AM202_0176 AM202_0175   slmA TRUE 0.932 8.000 0.058 NA   NA
 6433166 6433167 AM202_0175 AM202_0174 slmA dut TRUE 0.887 9.000 0.060 1.000 N NA
 6433167 6433168 AM202_0174 AM202_0173 dut dfp TRUE 0.936 -3.000 0.201 1.000 N NA
 6433170 6433171 AM202_0171 AM202_0170 ftsW murD TRUE 0.977 0.000 0.297 0.010 N NA
 6433171 6433172 AM202_0170 AM202_0169 murD mraY TRUE 0.965 141.000 0.647 0.010 Y NA
 6433172 6433173 AM202_0169 AM202_0168 mraY murF TRUE 0.995 11.000 0.309 0.010 Y NA
 6433175 6433176 AM202_0166 AM202_0165 murE ftsI TRUE 0.960 12.000 0.022 1.000 Y NA
 6433176 6433177 AM202_0165 AM202_0164 ftsI ftsL TRUE 0.854 16.000 0.044 1.000 N NA
 6433177 6433178 AM202_0164 AM202_0163 ftsL mraW TRUE 0.938 16.000 0.227 1.000 N NA
 6433180 6433181 AM202_0161 AM202_0160 dnaG rpsU FALSE 0.444 129.000 0.067 1.000 N NA
 6433181 6433182 AM202_0160 AM202_0159 rpsU rfbB1 FALSE 0.006 145.000 0.000 1.000 N NA
 6433182 6433183 AM202_0159 AM202_0158 rfbB1   FALSE 0.446 118.000 0.000 NA Y NA
 6433183 6433184 AM202_0158 AM202_0157   lsgF TRUE 0.773 34.000 0.015 NA   NA
 6433184 6433185 AM202_0157 AM202_0156 lsgF   TRUE 0.871 -7.000 0.021 NA   NA
 6433185 6433186 AM202_0156 AM202_0155     FALSE 0.331 -7.000 0.000 1.000   NA
 6433186 6433187 AM202_0155 AM202_0154     FALSE 0.447 -3.000 0.000 NA   NA
 6433187 6433188 AM202_0154 AM202_0153     FALSE 0.446 13.000 0.000 NA   NA
 6433188 6433189 AM202_0153 AM202_0152     FALSE 0.459 2.000 0.000 NA   NA
 6433189 6433190 AM202_0152 AM202_0151   orf3 FALSE 0.447 -3.000 0.000 NA   NA
 6433190 6433191 AM202_0151 AM202_0150 orf3   FALSE 0.348 4.000 0.000 1.000   NA
 6433191 6433192 AM202_0150 AM202_0149   wzz TRUE 0.871 12.000 0.000 1.000 Y NA
 6433194 6433195 AM202_0147 AM202_0146 aqpZ   FALSE 0.275 172.000 0.010 NA   NA
 6433195 6433196 AM202_0146 AM202_0145     TRUE 0.634 64.000 0.019 NA   NA
 6433200 6433201 AM202_0141 AM202_0140     TRUE 0.845 10.000 0.017 1.000   NA
 6433201 6433202 AM202_0140 AM202_0139     TRUE 0.877 5.000 0.021 NA   NA
 6433204 6433205 AM202_0137 AM202_0136   aroQ FALSE 0.371 3.000 0.004 NA N NA
 6433205 6433206 AM202_0136 AM202_0135 aroQ bioB FALSE 0.011 160.000 0.003 1.000 N NA
 6433206 6433207 AM202_0135 AM202_0134 bioB dapD FALSE 0.354 56.000 0.004 1.000   NA
 6433208 6433209 AM202_0187 AM202_0188   hugX FALSE 0.393 24.000 0.000 NA   NA
 6433209 6433210 AM202_0188 AM202_0189 hugX hugZ TRUE 0.992 11.000 0.355 NA Y NA
 6433212 6433213 AM202_0191 AM202_0192 metJ   TRUE 0.814 45.000 0.034 NA   NA
 6433213 6433214 AM202_0192 AM202_0193   panF TRUE 0.983 8.000 0.682 NA   NA
 6433216 6433217 AM202_0195 AM202_0196 glpT cof FALSE 0.054 110.000 0.000 1.000   NA
 6433217 6433218 AM202_0196 AM202_0197 cof mgsA FALSE 0.339 12.000 0.000 1.000   NA
 6433219 6433220 AM202_0198 AM202_0199     TRUE 0.774 103.000 0.238 NA   NA
 6433220 6433221 AM202_0199 AM202_0200     TRUE 0.995 19.000 0.429 0.014 Y NA
 6433221 6433222 AM202_0200 AM202_0201     TRUE 0.984 23.000 0.444 0.014   NA
 6433223 6433224 AM202_0232 AM202_0231   ccp FALSE 0.062 96.000 0.000 1.000   NA
 6433226 6433227 AM202_0229 AM202_0228 dapE arsC TRUE 0.953 2.000 0.292 1.000 N NA
 6433227 6433228 AM202_0228 AM202_0227 arsC folP FALSE 0.268 16.000 0.005 1.000 N NA
 6433228 6433229 AM202_0227 AM202_0226 folP rluC FALSE 0.284 0.000 0.005 1.000 N NA
 6433231 6433232 AM202_0224 AM202_0223 napC napB TRUE 0.992 12.000 0.490 1.000 Y NA
 6433232 6433233 AM202_0223 AM202_0222 napB napH TRUE 0.956 112.000 0.316 0.009 Y NA
 6433233 6433234 AM202_0222 AM202_0221 napH napG TRUE 0.991 1.000 0.795 0.009   NA
 6433234 6433235 AM202_0221 AM202_0220 napG napA TRUE 0.841 156.000 0.243 0.009   NA
 6433235 6433236 AM202_0220 AM202_0219 napA   TRUE 0.915 94.000 0.875 0.009 N NA
 6433236 6433237 AM202_0219 AM202_0218   napF TRUE 0.960 0.000 0.209 1.000   NA
 6433239 6433240 AM202_0216 AM202_0215     TRUE 0.920 17.000 0.054 NA   NA
 6433240 6433241 AM202_0215 AM202_0214     TRUE 0.979 13.000 0.500 NA   NA
 6433241 6433242 AM202_0214 AM202_0213     TRUE 0.874 21.000 0.030 1.000   NA
 6433242 6433243 AM202_0213 AM202_0212   surE TRUE 0.898 17.000 0.038 1.000   NA
 6433243 6433244 AM202_0212 AM202_0211 surE truD TRUE 0.964 10.000 0.235 1.000   NA
 6433244 6433245 AM202_0211 AM202_0210 truD pth FALSE 0.054 1401.000 0.000 1.000   NA
 6433245 6433246 AM202_0210 AM202_0209 pth pdxH FALSE 0.014 67.000 0.000 1.000 N NA
 6433246 6433247 AM202_0209 AM202_0208 pdxH   FALSE 0.089 72.000 0.000 1.000   NA
 6433247 6433248 AM202_0208 AM202_0207   srmB FALSE 0.330 14.000 0.000 1.000   NA
 6433248 6433249 AM202_0207 AM202_0206 srmB rraA FALSE 0.007 110.000 0.000 NA N NA
 6433249 6433250 AM202_0206 AM202_0205 rraA hflX FALSE 0.105 89.000 0.000 NA   NA
 6433250 6433251 AM202_0205 AM202_0204 hflX hfq TRUE 0.929 30.000 0.141 1.000   NA
 6433255 6433256 AM202_0232 AM202_0233     FALSE 0.428 82.000 0.013 NA   NA
 6433256 6433257 AM202_0233 AM202_0234     FALSE 0.315 145.000 0.013 NA   NA
 6433258 6433259 AM202_0235 AM202_0236 manA uhpC FALSE 0.186 45.000 0.000 1.000   NA
 6433259 6433260 AM202_0236 AM202_0237 uhpC uhpB TRUE 0.985 6.000 0.929 0.098 N NA
 6433260 6433261 AM202_0237 AM202_0238 uhpB uhpA TRUE 0.996 4.000 0.444 0.006 Y NA
 6433261 6433262 AM202_0238 AM202_0239 uhpA uhpT TRUE 0.755 80.000 0.273 1.000 N NA
 6433262 6433263 AM202_0239 AM202_0240 uhpT dsbA FALSE 0.006 182.000 0.000 1.000 N NA
 6433263 6433264 AM202_0240 AM202_0241 dsbA   TRUE 0.920 44.000 0.196 NA   NA
 6433269 6433270 AM202_0291 AM202_0290 lonH fabA TRUE 0.663 124.000 0.290 1.000 N NA
 6433270 6433271 AM202_0290 AM202_0289 fabA   FALSE 0.416 104.000 0.017 NA   NA
 6433271 6433272 AM202_0289 AM202_0288     TRUE 0.918 -40.000 0.051 NA   NA
 6433272 6433273 AM202_0288 AM202_0287     TRUE 0.935 0.000 0.068 NA   NA
 6433273 6433274 AM202_0287 AM202_0286     TRUE 0.985 -10.000 1.000 NA   NA
 6433274 6433275 AM202_0286 AM202_0285   recC TRUE 0.807 50.000 0.038 NA   NA
 6433275 6433276 AM202_0285 AM202_0284 recC ptrA TRUE 0.904 -3.000 0.092 1.000 N NA
 6433277 6433278 AM202_0283 AM202_0282 putA putP FALSE 0.372 226.000 0.040 1.000 N NA
 6433281 6433282 AM202_0279 AM202_0278     TRUE 0.810 37.000 0.000 NA Y NA
 6433283 6433284 AM202_0277 AM202_0276   sdaC FALSE 0.050 269.000 0.000 1.000   NA
 6433284 6433285 AM202_0276 AM202_0275 sdaC dnaJ FALSE 0.006 240.000 0.000 1.000 N NA
 6433285 6433286 AM202_0275 AM202_0274 dnaJ   FALSE 0.075 219.000 0.000 NA   NA
 6433286 6433287 AM202_0274 AM202_0273   dnaK FALSE 0.406 21.000 0.000 NA   NA
 6433289 6433290 AM202_0271 AM202_0270 zwf cysQ TRUE 0.645 70.000 0.085 1.000 N NA
 6433290 6433291 AM202_0270 AM202_0269 cysQ nudE TRUE 0.794 84.000 0.373 1.000 N NA
 6433292 6433293 AM202_0268 AM202_0267   hslR FALSE 0.440 -10.000 0.000 NA   NA
 6433293 6433294 AM202_0267 AM202_0266 hslR hslO TRUE 0.647 88.000 0.140 1.000 N NA
 6433296 6433297 AM202_0264 AM202_0263     FALSE 0.090 102.000 0.000 NA   NA
 6433298 6433299 AM202_0262 AM202_0261     FALSE 0.075 224.000 0.000 NA   NA
 6433299 6433300 AM202_0261 AM202_0260     FALSE 0.051 19.000 0.000 NA N NA
 6433300 6433301 AM202_0260 AM202_0259   uvrD TRUE 0.888 6.000 0.000 NA Y NA
 6433302 6433303 AM202_0258 AM202_0257     FALSE 0.007 747.000 0.000 1.000 N NA
 6433303 6433304 AM202_0257 AM202_0256     TRUE 0.972 10.000 0.298 NA   NA
 6433304 6433305 AM202_0256 AM202_0255   rpoH FALSE 0.083 1022.000 0.000 NA   NA
 6433306 6433307 AM202_0254 AM202_0253 crr ptsI TRUE 0.954 80.000 0.139 0.008 Y NA
 6433307 6433308 AM202_0253 AM202_0252 ptsI ptsH TRUE 0.964 66.000 0.121 0.008 Y NA
 6433309 6433310 AM202_0251 AM202_0250 thiP thiQ TRUE 0.981 13.000 0.522 0.035 N NA
 6433310 6433311 AM202_0250 AM202_0249 thiQ ptsB FALSE 0.174 131.000 0.013 1.000 N NA
 6433311 6433312 AM202_0249 AM202_0248 ptsB   FALSE 0.167 65.000 0.000 NA   NA
 6433312 6433313 AM202_0248 AM202_0247   comM FALSE 0.094 98.000 0.000 NA   NA
 6433313 6433314 AM202_0247 AM202_0246 comM   FALSE 0.061 98.000 0.000 1.000   NA
 6433315 6433316 AM202_0245 AM202_0244   menD TRUE 0.976 0.000 0.355 NA   NA
 6433318 6433319 AM202_0294 AM202_0295     FALSE 0.167 65.000 0.000 NA   NA
 6433319 6433320 AM202_0295 AM202_0296   xerD FALSE 0.081 114.000 0.000 NA   NA
 6433321 6433322 AM202_0297 AM202_0298 tilS trmE FALSE 0.057 104.000 0.000 1.000   NA
 6433322 6433323 AM202_0298 AM202_0299 trmE oxaA TRUE 0.783 152.000 0.221 0.095   NA
 6433323 6433324 AM202_0299 AM202_0300 oxaA   FALSE 0.034 165.000 0.003 NA N NA
 6433325 6433326 AM202_0301 AM202_0302   pgi FALSE 0.079 122.000 0.000 NA   NA
 6433326 6433327 AM202_0302 AM202_0303 pgi ilvD FALSE 0.403 138.000 0.000 1.000 Y NA
 6433327 6433328 AM202_0303 AM202_0304 ilvD   FALSE 0.011 74.000 0.000 1.000 N NA
 6433329 6433330 AM202_0305 AM202_0306 copA   TRUE 0.955 152.000 0.333 0.006 Y NA
 6433331 6433332 AM202_0307 AM202_0308     FALSE 0.091 101.000 0.000 NA   NA
 6433332 6433333 AM202_0308 AM202_0309   secA TRUE 0.566 92.000 0.031 NA   NA
 6433333 6433334 AM202_0309 AM202_0310 secA   FALSE 0.317 69.000 0.006 1.000   NA
 6433334 6433335 AM202_0310 AM202_0311   mutT TRUE 0.789 -7.000 0.013 1.000   NA
 6433336 6433337 AM202_0312 AM202_0313 nrfG   TRUE 0.992 -13.000 0.464 NA Y NA
 6433337 6433338 AM202_0313 AM202_0314   dsbE TRUE 0.938 23.000 0.115 NA   NA
 6433338 6433339 AM202_0314 AM202_0315 dsbE nrfE TRUE 0.932 11.000 0.071 1.000   NA
 6433340 6433341 AM202_0315 AM202_0316 nrfE   FALSE 0.006 124.000 0.000 1.000 N NA
 6433341 6433342 AM202_0316 AM202_0317   cyaA FALSE 0.006 164.000 0.000 1.000 N NA
 6433345 6433346 AM202_0320 AM202_0321 thyA ftsY FALSE 0.010 79.000 0.000 1.000 N NA
 6433346 6433347 AM202_0321 AM202_0322 ftsY ftsE TRUE 0.608 91.000 0.117 1.000 N NA
 6433347 6433348 AM202_0322 AM202_0323 ftsE ftsX TRUE 0.980 19.000 0.121 1.000 Y NA
 6433349 6433350 AM202_0324 AM202_0325   folB TRUE 0.776 0.000 0.018 NA N NA
 6433352 6433353 AM202_0327 AM202_0328 fur fldA TRUE 0.902 28.000 0.156 1.000 N NA
 6433353 6433354 AM202_0328 AM202_0329 fldA   TRUE 0.977 11.000 0.473 1.000   NA
 6433354 6433355 AM202_0329 AM202_0330   nudC FALSE 0.050 128.000 0.000 1.000   NA
 6433355 6433356 AM202_0330 AM202_0331 nudC rluE TRUE 0.517 -7.000 0.008 1.000 N NA
 6433356 6433357 AM202_0331 AM202_0332 rluE   TRUE 0.768 -3.000 0.008 NA   NA
 6433357 6433358 AM202_0332 AM202_0333     TRUE 0.727 0.000 0.006 NA   NA
 6433360 6433361 AM202_0335 AM202_0336   engB TRUE 0.707 2.000 0.005 NA   NA
 6433361 6433362 AM202_0336 AM202_0337 engB   TRUE 0.785 -3.000 0.004 0.094   NA
 6433362 6433363 AM202_0337 AM202_0338     TRUE 0.789 3.000 0.012 1.000   NA
 6433363 6433364 AM202_0338 AM202_0339     FALSE 0.009 84.000 0.000 1.000 N NA
 6433364 6433365 AM202_0339 AM202_0340   luxS FALSE 0.073 194.000 0.006 1.000 N NA
 6433365 6433366 AM202_0340 AM202_0341 luxS   TRUE 0.732 28.000 0.010 NA   NA
 6433366 6433367 AM202_0341 AM202_0342   msbB FALSE 0.435 -28.000 0.000 NA   NA
 6433367 6433368 AM202_0342 AM202_0343 msbB   TRUE 0.685 2.000 0.000 0.094   NA
 6433368 6433369 AM202_0343 AM202_0344   rnfE FALSE 0.327 15.000 0.000 1.000   NA
 6433369 6433370 AM202_0344 AM202_0345 rnfE   FALSE 0.347 3.000 0.000 1.000   NA
 6433370 6433371 AM202_0345 AM202_0346   rnfG FALSE 0.341 0.000 0.000 1.000   NA
 6433371 6433372 AM202_0346 AM202_0347 rnfG rnfD TRUE 0.997 0.000 0.924 0.045 Y NA
 6433372 6433373 AM202_0347 AM202_0348 rnfD rnfC FALSE 0.417 19.000 0.000 NA   NA
 6433374 6433375 AM202_0348 AM202_0349 rnfC rnfB TRUE 0.995 -25.000 0.537 0.045 Y NA
 6433375 6433376 AM202_0349 AM202_0350 rnfB rnfA TRUE 0.996 0.000 0.564 0.045 Y NA
 6433377 6433378 AM202_0351 AM202_0352     TRUE 0.932 4.000 0.071 1.000   NA
 6433379 6433380 AM202_0353 AM202_0354 ligA zipA TRUE 0.516 277.000 0.106 1.000 N NA
 6433380 6433381 AM202_0354 AM202_0355 zipA utp FALSE 0.057 130.000 0.000 0.094 N NA
 6433381 6433382 AM202_0355 AM202_0356 utp cbiO TRUE 0.810 21.000 0.032 1.000 N NA
 6433383 6433384 AM202_0357 AM202_0358 trmA   FALSE 0.092 100.000 0.000 NA   NA
 6433385 6433386 AM202_0359 AM202_0360     FALSE 0.121 80.000 0.000 NA   NA
 6433386 6433387 AM202_0360 AM202_0361     TRUE 0.632 87.000 0.100 NA N NA
 6433387 6433388 AM202_0361 AM202_0362   hldD FALSE 0.006 165.000 0.000 NA N NA
 6433388 6433389 AM202_0362 AM202_0363 hldD def TRUE 0.636 11.000 0.012 1.000 N NA
 6433390 6433391 AM202_0364 AM202_0365 smf secE FALSE 0.425 111.000 0.000 1.000 Y NA
 6433391 6433392 AM202_0365 AM202_0366 secE nusG TRUE 0.974 14.000 0.843 1.000 N NA
 6433392 6433393 AM202_0366 AM202_0367 nusG rplK TRUE 0.774 239.000 0.681 1.000 N NA
 6433393 6433394 AM202_0367 AM202_0368 rplK rplA TRUE 0.996 5.000 0.838 0.052 Y NA
 6433394 6433395 AM202_0368 AM202_0369 rplA rplJ TRUE 0.939 293.000 0.302 0.052 Y NA
 6433395 6433396 AM202_0369 AM202_0370 rplJ rplL TRUE 0.989 61.000 0.884 0.036 Y NA
 6433397 6433398 AM202_0371 AM202_0372 fucA fucU TRUE 0.970 51.000 0.286 1.000 Y NA
 6433402 6433403 AM202_0376 AM202_0377 thrA thrB TRUE 0.984 10.000 0.133 1.000 Y NA
 6433403 6433404 AM202_0377 AM202_0378 thrB cysK FALSE 0.411 290.000 0.000 1.000 Y NA
 6433404 6433405 AM202_0378 AM202_0379 cysK rho FALSE 0.006 266.000 0.002 1.000 N NA
 6433406 6433407 AM202_0023 AM202_0380   atpI FALSE 0.076 235.000 0.000 NA   NA
 6433407 6433408 AM202_0380 AM202_0381 atpI atpA TRUE 0.986 25.000 0.291 1.000 Y NA
 6433408 6433409 AM202_0381 AM202_0382 atpA atpE TRUE 0.962 139.000 0.557 0.012 Y NA
 6433409 6433410 AM202_0382 AM202_0383 atpE atpF TRUE 0.988 61.000 0.666 0.012 Y NA
 6433410 6433411 AM202_0383 AM202_0384 atpF atpH TRUE 0.993 14.000 0.242 0.012 Y NA
 6433411 6433412 AM202_0384 AM202_0385 atpH atpA TRUE 0.997 13.000 0.864 0.012 Y NA
 6433412 6433413 AM202_0385 AM202_0386 atpA atpG TRUE 0.996 23.000 0.846 0.012 Y NA
 6433413 6433414 AM202_0386 AM202_0387 atpG atpD TRUE 0.996 19.000 0.724 0.012 Y NA
 6433414 6433415 AM202_0387 AM202_0388 atpD atpC TRUE 0.994 39.000 0.837 0.012 Y NA
 6433415 6433416 AM202_0388 AM202_0389 atpC rbsR FALSE 0.018 62.000 0.002 1.000 N NA
 6433416 6433417 AM202_0389 AM202_0390 rbsR rbsD FALSE 0.195 116.000 0.015 1.000 N NA
 6433417 6433418 AM202_0390 AM202_0391 rbsD rbsA TRUE 0.991 10.000 0.337 1.000 Y NA
 6433418 6433419 AM202_0391 AM202_0392 rbsA rbsC TRUE 0.992 12.000 0.504 1.000 Y NA
 6433419 6433420 AM202_0392 AM202_0393 rbsC rbsB TRUE 0.989 41.000 0.847 NA Y NA
 6433420 6433421 AM202_0393 AM202_0394 rbsB rbsK TRUE 0.958 72.000 0.347 NA Y NA
 6433422 6433423 AM202_0395 AM202_0396     FALSE 0.417 19.000 0.000 NA   NA
 6433423 6433424 AM202_0396 AM202_0397   tagI FALSE 0.438 -18.000 0.000 NA   NA
 6433424 6433425 AM202_0397 AM202_0398 tagI   FALSE 0.381 26.000 0.000 NA   NA
 6433426 6433427 AM202_0399 AM202_0400 malQ fucK TRUE 0.586 198.000 0.000 0.021 Y NA
 6433427 6433428 AM202_0400 AM202_0401 fucK fucI TRUE 0.891 187.000 0.269 1.000 Y NA
 6433429 6433430 AM202_0402 AM202_0403     TRUE 0.980 10.000 0.625 1.000   NA
 6433430 6433431 AM202_0403 AM202_0404     TRUE 0.983 10.000 0.740 NA   NA
 6433434 6433435 AM202_0407 AM202_0408     FALSE 0.006 360.000 0.000 NA N NA
 6433435 6433436 AM202_0408 AM202_0409     TRUE 0.990 32.000 0.550 NA Y NA
 6433436 6433437 AM202_0409 AM202_0410     TRUE 0.993 12.000 0.600 1.000 Y NA
 6433438 6433439 AM202_0411 AM202_0412 rpoB rpoC TRUE 0.924 186.000 0.851 0.004   NA
 6433441 6433442 AM202_0414 AM202_0415     TRUE 0.983 0.000 0.727 NA   NA
 6433442 6433443 AM202_0415 AM202_0416   pbpG FALSE 0.103 90.000 0.000 NA   NA
 6433445 6433446 AM202_0418 AM202_0419 rpsJ rplC TRUE 0.991 26.000 0.307 0.051 Y NA
 6433446 6433447 AM202_0419 AM202_0420 rplC rplD TRUE 0.995 16.000 0.486 0.035 Y NA
 6433447 6433448 AM202_0420 AM202_0421 rplD rplW TRUE 0.996 -3.000 0.513 0.035 Y NA
 6433448 6433449 AM202_0421 AM202_0422 rplW rplB TRUE 0.996 20.000 0.849 0.042 Y NA
 6433449 6433450 AM202_0422 AM202_0423 rplB rpsS TRUE 0.995 28.000 0.820 0.051 Y NA
 6433450 6433451 AM202_0423 AM202_0424 rpsS rplV TRUE 0.996 11.000 0.769 0.051 Y NA
 6433451 6433452 AM202_0424 AM202_0425 rplV rpsC TRUE 0.995 18.000 0.719 0.051 Y NA
 6433452 6433453 AM202_0425 AM202_0426 rpsC rplP TRUE 0.996 14.000 0.828 0.051 Y NA
 6433453 6433454 AM202_0426 AM202_0427 rplP rpmC TRUE 0.997 0.000 0.802 0.035 Y NA
 6433454 6433455 AM202_0427 AM202_0428 rpmC rpsQ TRUE 0.997 0.000 0.828 0.035 Y NA
 6433456 6433457 AM202_0429 AM202_0430 trkA rsmB TRUE 0.923 8.000 0.122 1.000 N NA
 6433457 6433458 AM202_0430 AM202_0431 rsmB   FALSE 0.060 2.000 0.000 1.000 N NA
 6433458 6433459 AM202_0431 AM202_0432   selB FALSE 0.055 -16.000 0.000 1.000 N NA
 6433463 6433464 AM202_0435 AM202_0434 glmS   TRUE 0.942 33.000 0.412 1.000 N NA
 6433464 6433465 AM202_0434 AM202_0433   syp FALSE 0.048 144.000 0.000 1.000   NA
 6433466 6433467 AM202_0437 AM202_0438   dnaQ FALSE 0.085 108.000 0.000 NA   NA
 6433467 6433468 AM202_0438 AM202_0439 dnaQ recX FALSE 0.348 6.000 0.000 1.000   NA
 6433468 6433469 AM202_0439 AM202_0440 recX recA TRUE 0.935 43.000 0.296 1.000   NA
 6433469 6433470 AM202_0440 AM202_0441 recA lolE FALSE 0.006 231.000 0.000 1.000 N NA
 6433470 6433471 AM202_0441 AM202_0442 lolE lolD TRUE 0.951 0.000 0.125 0.066 N NA
 6433471 6433472 AM202_0442 AM202_0443 lolD lolC TRUE 0.939 29.000 0.175 0.066 N NA
 6433472 6433473 AM202_0443 AM202_0444 lolC ldhA TRUE 0.509 103.000 0.080 1.000 N NA
 6433473 6433474 AM202_0444 AM202_0445 ldhA yfhL FALSE 0.074 150.000 0.000 NA   NA
 6433474 6433475 AM202_0445 AM202_0446 yfhL narP TRUE 0.774 33.000 0.015 NA   NA
 6433477 6433478 AM202_0448 AM202_0449 parE   FALSE 0.233 113.000 0.006 NA   NA
 6433478 6433479 AM202_0449 AM202_0450   galE TRUE 0.845 65.000 0.160 NA   NA
 6433481 6433482 AM202_0452 AM202_0453 mglC mglA TRUE 0.994 15.000 0.905 1.000 Y NA
 6433482 6433483 AM202_0453 AM202_0454 mglA mglB TRUE 0.949 63.000 0.139 NA Y NA
 6433484 6433485 AM202_0455 AM202_0456   sprT TRUE 0.868 4.000 0.019 NA   NA
 6433485 6433486 AM202_0456 AM202_0457 sprT ndh FALSE 0.373 104.000 0.014 NA   NA
 6433487 6433488 AM202_0458 AM202_0459 valS   FALSE 0.007 676.000 0.000 1.000 N NA
 6433488 6433489 AM202_0459 AM202_0460   hisI FALSE 0.006 128.000 0.000 1.000 N NA
 6433489 6433490 AM202_0460 AM202_0461 hisI   FALSE 0.460 10.000 0.000 NA   NA
 6433490 6433491 AM202_0461 AM202_0462   hisF FALSE 0.132 74.000 0.000 NA   NA
 6433491 6433492 AM202_0462 AM202_0463 hisF hisA TRUE 0.995 -18.000 0.433 0.009 Y NA
 6433492 6433493 AM202_0463 AM202_0464 hisA   FALSE 0.121 64.000 0.000 1.000   NA
 6433493 6433494 AM202_0464 AM202_0465   ureC FALSE 0.082 76.000 0.000 1.000   NA
 6433495 6433496 AM202_0475 AM202_0474 hisG sapF FALSE 0.008 96.000 0.000 1.000 N NA
 6433496 6433497 AM202_0474 AM202_0473 sapF   TRUE 0.651 53.000 0.026 NA N NA
 6433497 6433498 AM202_0473 AM202_0472     TRUE 0.985 0.000 0.880 NA   NA
 6433498 6433499 AM202_0472 AM202_0471     TRUE 0.708 88.000 0.091 NA   NA
 6433499 6433500 AM202_0471 AM202_0470     FALSE 0.454 0.000 0.000 NA   NA
 6433501 6433502 AM202_0469 AM202_0468 scrR   TRUE 0.901 21.000 0.115 1.000 N NA
 6433503 6433504 AM202_0467 AM202_0466 ureA ureB TRUE 0.838 98.000 0.014 0.006 Y NA
 6433504 6433505 AM202_0466 AM202_0465 ureB ureC TRUE 0.805 12.000 0.000 0.006   NA
 6433509 6433510 AM202_0478 AM202_0479     TRUE 0.956 -25.000 0.172 NA   NA
 6433510 6433511 AM202_0479 AM202_0480   gmhA TRUE 0.917 24.000 0.187 1.000 N NA
 6433511 6433512 AM202_0480 AM202_0481 gmhA hly TRUE 0.978 20.000 0.613 NA   NA
 6433514 6433515 AM202_0483 AM202_0484 acrA2   TRUE 0.982 13.000 0.417 0.099   NA
 6433515 6433516 AM202_0484 AM202_0485     TRUE 0.984 2.000 0.292 0.010   NA
 6433516 6433517 AM202_0485 AM202_0486   tolC TRUE 0.971 14.000 0.308 0.065 N NA
 6433517 6433518 AM202_0486 AM202_0487 tolC   FALSE 0.081 78.000 0.000 1.000   NA
 6433518 6433519 AM202_0487 AM202_0488   typA FALSE 0.047 158.000 0.000 1.000   NA
 6433519 6433520 AM202_0488 AM202_0489 typA grxA FALSE 0.066 70.000 0.004 1.000 N NA
 6433522 6433523 AM202_0491 AM202_0492     TRUE 0.855 7.000 0.016 NA   NA
 6433524 6433525 AM202_0493 AM202_0494 murA   TRUE 0.727 93.000 0.258 NA N NA
 6433525 6433526 AM202_0494 AM202_0495     TRUE 0.957 41.000 0.453 NA   NA
 6433526 6433527 AM202_0495 AM202_0496     TRUE 0.974 6.000 0.308 NA   NA
 6433527 6433528 AM202_0496 AM202_0497     TRUE 0.748 102.000 0.188 NA   NA
 6433531 6433532 AM202_0500 AM202_0501 ribD ribE TRUE 0.926 123.000 0.456 1.000 Y NA
 6433532 6433533 AM202_0501 AM202_0502 ribE ribBA TRUE 0.940 48.000 0.051 1.000 Y NA
 6433533 6433534 AM202_0502 AM202_0503 ribBA ribH TRUE 0.944 70.000 0.054 0.004 Y NA
 6433535 6433536 AM202_0504 AM202_0505     FALSE 0.096 96.000 0.000 NA   NA
 6433536 6433537 AM202_0505 AM202_0506     TRUE 0.617 31.000 0.005 NA   NA
 6433538 6433539 AM202_0507 AM202_0508 ndpA smpA TRUE 0.717 69.000 0.049 NA   NA
 6433539 6433540 AM202_0508 AM202_0509 smpA gdhA FALSE 0.006 319.000 0.000 1.000 N NA
 6433541 6433542 AM202_0510 AM202_0511 relA gpmA FALSE 0.006 157.000 0.000 1.000 N NA
 6433543 6433544 AM202_0512 AM202_0513     TRUE 0.938 10.000 0.088 1.000   NA
 6433544 6433545 AM202_0513 AM202_0514     TRUE 0.768 12.000 0.010 1.000   NA
 6433545 6433546 AM202_0514 AM202_0515     TRUE 0.982 9.000 0.575 NA   NA
 6433546 6433547 AM202_0515 AM202_0516   cydD FALSE 0.437 71.000 0.011 NA   NA
 6433548 6433549 AM202_0517 AM202_0518 upp lcfA FALSE 0.055 22.000 0.002 1.000 N NA
 6433549 6433550 AM202_0518 AM202_0519 lcfA rseC TRUE 0.816 2.000 0.022 NA N NA
 6433550 6433551 AM202_0519 AM202_0520 rseC rseB TRUE 0.994 9.000 0.609 NA Y NA
 6433551 6433552 AM202_0520 AM202_0521 rseB rseA TRUE 0.948 185.000 0.856 NA Y NA
 6433552 6433553 AM202_0521 AM202_0522 rseA rpoE TRUE 0.875 74.000 0.705 NA N NA
 6433556 6433557 AM202_0525 AM202_0526 djlA dusC TRUE 0.664 44.000 0.025 1.000 N NA
 6433557 6433558 AM202_0526 AM202_0527 dusC   TRUE 0.859 2.000 0.017 NA   NA
 6433558 6433559 AM202_0527 AM202_0528   hmbR2 FALSE 0.075 142.000 0.000 NA   NA
 6433560 6433561 AM202_0529 AM202_0530   ykgE FALSE 0.084 1461.000 0.000 NA   NA
 6433561 6433562 AM202_0530 AM202_0531 ykgE lctP TRUE 0.929 182.000 0.467 NA Y NA
 6433563 6433564 AM202_0532 AM202_0533     FALSE 0.019 60.000 0.000 1.000 N NA
 6433564 6433565 AM202_0533 AM202_0534   bcp FALSE 0.037 75.000 0.004 1.000 N NA
 6433565 6433566 AM202_0534 AM202_0535 bcp gmhB FALSE 0.284 0.000 0.005 1.000 N NA
 6433566 6433567 AM202_0535 AM202_0536 gmhB queF TRUE 0.819 9.000 0.014 1.000   NA
 6433568 6433569 AM202_0537 AM202_0538   dgkA TRUE 0.786 45.000 0.070 1.000 N NA
 6433570 6433571 AM202_0539 AM202_0540   mnmC FALSE 0.406 256.000 0.000 1.000 Y NA
 6433571 6433572 AM202_0540 AM202_0541 mnmC   FALSE 0.079 122.000 0.000 NA   NA
 6433573 6433574 AM202_0542 AM202_0543 dppA1 dppA2 TRUE 0.960 157.000 0.667 0.045 Y NA
 6433574 6433575 AM202_0543 AM202_0544 dppA2 dppB TRUE 0.825 89.000 0.015 0.045 Y NA
 6433575 6433576 AM202_0544 AM202_0545 dppB dppC TRUE 0.995 25.000 0.779 0.045 Y NA
 6433576 6433577 AM202_0545 AM202_0546 dppC dppD TRUE 0.993 9.000 0.560 1.000 Y NA
 6433577 6433578 AM202_0546 AM202_0547 dppD dppF TRUE 0.996 13.000 0.377 0.003 Y NA
 6433579 6433580 AM202_0548 AM202_0549 groEL groES TRUE 0.941 111.000 0.631 1.000 Y NA
 6433580 6433581 AM202_0549 AM202_0550 groES   FALSE 0.006 134.000 0.000 1.000 N NA
 6433581 6433582 AM202_0550 AM202_0551   pykA FALSE 0.007 432.000 0.000 1.000 N NA
 6433583 6433584 AM202_0552 AM202_0553 sixA dus FALSE 0.006 216.000 0.000 1.000 N NA
 6433584 6433585 AM202_0553 AM202_0554 dus fis TRUE 0.933 7.000 0.161 1.000 N NA
 6433586 6433587 AM202_0555 AM202_0556 irp metE FALSE 0.006 155.000 0.000 1.000 N NA
 6433587 6433588 AM202_0556 AM202_0557 metE   FALSE 0.049 227.000 0.000 1.000   NA
 6433588 6433589 AM202_0557 AM202_0558     TRUE 0.752 0.000 0.007 NA   NA
 6433589 6433590 AM202_0558 AM202_0559     TRUE 0.788 64.000 0.065 NA   NA
 6433590 6433591 AM202_0559 AM202_0560     FALSE 0.482 34.000 0.003 1.000   NA
 6433593 6433594 AM202_0562 AM202_0563   hisS TRUE 0.957 26.000 0.259 NA   NA
 6433594 6433595 AM202_0563 AM202_0564 hisS ispG TRUE 0.611 124.000 0.207 1.000 N NA
 6433595 6433596 AM202_0564 AM202_0565 ispG   TRUE 0.963 10.000 0.233 1.000   NA
 6433600 6433601 AM202_0569 AM202_0570 aspA   FALSE 0.290 132.000 0.011 NA   NA
 6433601 6433602 AM202_0570 AM202_0571   purM FALSE 0.258 74.000 0.003 NA   NA
 6433603 6433604 AM202_0572 AM202_0573 queC   TRUE 0.922 -7.000 0.062 1.000   NA
 6433604 6433605 AM202_0573 AM202_0574     TRUE 0.855 10.000 0.037 1.000 N NA
 6433607 6433608 AM202_0576 AM202_0577 nqrA nqrB TRUE 0.997 3.000 0.854 0.008 Y NA
 6433608 6433609 AM202_0577 AM202_0578 nqrB nqrC TRUE 0.997 0.000 0.603 0.008 Y NA
 6433609 6433610 AM202_0578 AM202_0579 nqrC nqrD TRUE 0.995 0.000 0.312 0.008 Y NA
 6433610 6433611 AM202_0579 AM202_0580 nqrD nqrE TRUE 0.993 2.000 0.188 0.008 Y NA
 6433611 6433612 AM202_0580 AM202_0581 nqrE nqrF TRUE 0.996 11.000 0.551 0.008 Y NA
 6433612 6433613 AM202_0581 AM202_0582 nqrF apbE TRUE 0.743 149.000 0.519 1.000 N NA
 6433613 6433614 AM202_0582 AM202_0583 apbE   TRUE 0.947 14.000 0.113 NA   NA
 6433614 6433615 AM202_0583 AM202_0584   trmU FALSE 0.280 120.000 0.009 NA   NA
 6433615 6433616 AM202_0584 AM202_0585 trmU yibK TRUE 0.867 14.000 0.000 1.000 Y NA
 6433616 6433617 AM202_0585 AM202_0586 yibK   FALSE 0.388 25.000 0.000 NA   NA
 6433617 6433618 AM202_0586 AM202_0587   lpd FALSE 0.301 88.000 0.006 NA   NA
 6433618 6433619 AM202_0587 AM202_0588 lpd   FALSE 0.235 122.000 0.006 NA   NA
 6433619 6433620 AM202_0588 AM202_0589   trpE FALSE 0.084 110.000 0.000 NA   NA
 6433620 6433621 AM202_0589 AM202_0590 trpE trpD TRUE 0.997 15.000 0.703 0.003 Y NA
 6433621 6433622 AM202_0590 AM202_0591 trpD   FALSE 0.007 1106.000 0.000 1.000 N NA
 6433623 6433624 AM202_0592 AM202_0593     TRUE 0.985 0.000 0.375 0.042   NA
 6433626 6433627 AM202_0595 AM202_0596 rluD yajC FALSE 0.006 140.000 0.000 NA N NA
 6433627 6433628 AM202_0596 AM202_0597 yajC secD TRUE 0.822 103.000 0.045 NA Y NA
 6433628 6433629 AM202_0597 AM202_0598 secD secF TRUE 0.994 11.000 0.206 0.003 Y NA
 6433629 6433630 AM202_0598 AM202_0599 secF ftnA FALSE 0.186 148.000 0.015 1.000 N NA
 6433630 6433631 AM202_0599 AM202_0600 ftnA ftnB TRUE 0.995 0.000 0.300 0.003 Y NA
 6433631 6433632 AM202_0600 AM202_0601 ftnB   TRUE 0.492 162.000 0.043 1.000   NA
 6433635 6433636 AM202_0603 AM202_0604 rpsT rplN TRUE 0.551 199.000 0.000 0.049 Y NA
 6433636 6433637 AM202_0604 AM202_0605 rplN rplX TRUE 0.996 11.000 0.810 0.049 Y NA
 6433637 6433638 AM202_0605 AM202_0606 rplX rplE TRUE 0.996 20.000 0.758 0.033 Y NA
 6433638 6433639 AM202_0606 AM202_0607 rplE rpsN TRUE 0.996 12.000 0.496 0.033 Y NA
 6433639 6433640 AM202_0607 AM202_0608 rpsN rpsH TRUE 0.992 37.000 0.473 0.033 Y NA
 6433640 6433641 AM202_0608 AM202_0609 rpsH rplF TRUE 0.996 17.000 0.808 0.033 Y NA
 6433641 6433642 AM202_0609 AM202_0610 rplF rplR TRUE 0.996 15.000 0.815 0.033 Y NA
 6433642 6433643 AM202_0610 AM202_0611 rplR rpsE TRUE 0.996 15.000 0.814 0.049 Y NA
 6433643 6433644 AM202_0611 AM202_0612 rpsE rpmD TRUE 0.996 7.000 0.789 0.049 Y NA
 6433644 6433645 AM202_0612 AM202_0613 rpmD rplO TRUE 0.997 5.000 0.653 0.008 Y NA
 6433645 6433646 AM202_0613 AM202_0614 rplO secY TRUE 0.973 4.000 0.730 1.000 N NA
 6433646 6433647 AM202_0614 AM202_0615 secY rpmJ TRUE 0.922 23.000 0.089 1.000   NA
 6433647 6433648 AM202_0615 AM202_0616 rpmJ rpsM TRUE 0.808 135.000 0.194 0.033   NA
 6433648 6433649 AM202_0616 AM202_0617 rpsM rpsK TRUE 0.996 17.000 0.810 0.033 Y NA
 6433649 6433650 AM202_0617 AM202_0618 rpsK rpsD TRUE 0.993 29.000 0.509 0.049 Y NA
 6433650 6433651 AM202_0618 AM202_0619 rpsD rpoA TRUE 0.890 64.000 0.549 1.000 N NA
 6433651 6433652 AM202_0619 AM202_0620 rpoA rplQ TRUE 0.959 36.000 0.873 1.000 N NA
 6433652 6433653 AM202_0620 AM202_0621 rplQ pgm FALSE 0.006 177.000 0.000 1.000 N NA
 6433653 6433654 AM202_0621 AM202_0622 pgm   FALSE 0.047 186.000 0.000 1.000   NA
 6433654 6433655 AM202_0622 AM202_0623   rpsP FALSE 0.048 197.000 0.000 1.000   NA
 6433655 6433656 AM202_0623 AM202_0624 rpsP rimM TRUE 0.991 35.000 0.342 0.033 Y NA
 6433656 6433657 AM202_0624 AM202_0625 rimM trmD TRUE 0.984 49.000 0.672 1.000 Y NA
 6433657 6433658 AM202_0625 AM202_0626 trmD rplS TRUE 0.990 26.000 0.567 1.000 Y NA
 6433659 6433660 AM202_0627 AM202_0628     FALSE 0.079 121.000 0.000 NA   NA
 6433661 6433662 AM202_0629 AM202_0630     FALSE 0.074 165.000 0.000 NA   NA
 6433662 6433663 AM202_0630 AM202_0631     FALSE 0.080 320.000 0.000 NA   NA
 6433663 6433664 AM202_0631 AM202_0632     FALSE 0.181 64.000 0.000 NA   NA
 6433666 6433667 AM202_0633 AM202_0634 srp54   FALSE 0.050 265.000 0.000 1.000   NA
 6433668 6433669 AM202_0635 AM202_0636 fumC lysA FALSE 0.006 162.000 0.000 1.000 N NA
 6433670 6433671 AM202_0637 AM202_0638 cdaR   TRUE 0.686 122.000 0.290 NA N NA
 6433671 6433672 AM202_0638 AM202_0639   grk TRUE 0.984 10.000 0.136 1.000 Y NA
 6433672 6433673 AM202_0639 AM202_0640 grk kpsF FALSE 0.006 142.000 0.000 1.000 N NA
 6433676 6433677 AM202_0643 AM202_0644   galM FALSE 0.047 163.000 0.000 1.000   NA
 6433677 6433678 AM202_0644 AM202_0645 galM lacZ TRUE 0.957 151.000 0.333 0.003 Y NA
 6433678 6433679 AM202_0645 AM202_0646 lacZ   FALSE 0.075 208.000 0.000 NA   NA
 6433679 6433680 AM202_0646 AM202_0647     TRUE 0.760 9.000 0.007 NA   NA
 6433680 6433681 AM202_0647 AM202_0648   udp FALSE 0.006 207.000 0.000 NA N NA
 6433683 6433684 AM202_0650 AM202_0651   hepA FALSE 0.080 381.000 0.000 NA   NA
 6433684 6433685 AM202_0651 AM202_0652 hepA rluA TRUE 0.687 110.000 0.294 1.000 N NA
 6433686 6433687 AM202_0653 AM202_0654     TRUE 0.803 32.000 0.019 NA   NA
 6433687 6433688 AM202_0654 AM202_0655     FALSE 0.460 75.000 0.013 NA   NA
 6433688 6433689 AM202_0655 AM202_0656   marC FALSE 0.033 38.000 0.000 NA N NA
 6433691 6433692 AM202_0658 AM202_0659 lysS   TRUE 0.540 240.000 0.000 0.067 Y NA
 6433693 6433694 AM202_0660 AM202_0661     TRUE 0.519 50.000 0.006 NA   NA
 6433694 6433695 AM202_0661 AM202_0662     FALSE 0.211 160.000 0.006 NA   NA
 6433697 6433698 AM202_0664 AM202_0665     FALSE 0.074 189.000 0.000 NA   NA
 6433698 6433699 AM202_0665 AM202_0666   nusA TRUE 0.973 34.000 0.759 NA   NA
 6433699 6433700 AM202_0666 AM202_0667 nusA infB TRUE 0.957 15.000 0.342 1.000 N NA
 6433700 6433701 AM202_0667 AM202_0668 infB   FALSE 0.075 217.000 0.000 NA   NA
 6433701 6433702 AM202_0668 AM202_0669   hsdM FALSE 0.296 124.000 0.011 NA   NA
 6433702 6433703 AM202_0669 AM202_0670 hsdM   FALSE 0.107 561.000 0.000 0.039 N NA
 6433703 6433704 AM202_0670 AM202_0671     FALSE 0.111 65.000 0.000 1.000   NA
 6433704 6433705 AM202_0671 AM202_0672   rbfA FALSE 0.047 188.000 0.000 1.000   NA
 6433705 6433706 AM202_0672 AM202_0673 rbfA truB TRUE 0.991 4.000 0.318 1.000 Y NA
 6433707 6433708 AM202_0673 AM202_0674 truB mltB FALSE 0.416 61.000 0.005 NA   NA
 6433708 6433709 AM202_0674 AM202_0675 mltB glgB FALSE 0.006 248.000 0.000 NA N NA
 6433709 6433710 AM202_0675 AM202_0676 glgB glgX TRUE 0.991 9.000 0.098 0.005 Y NA
 6433710 6433711 AM202_0676 AM202_0677 glgX glgC TRUE 0.965 53.000 0.228 1.000 Y NA
 6433711 6433712 AM202_0677 AM202_0678 glgC glgA TRUE 0.959 65.000 0.307 1.000 Y NA
 6433712 6433713 AM202_0678 AM202_0679 glgA glgP TRUE 0.981 30.000 0.228 1.000 Y NA
 6433714 6433715 AM202_0680 AM202_0681 fhuC fhuD TRUE 0.982 2.000 0.109 1.000 Y NA
 6433715 6433716 AM202_0681 AM202_0682 fhuD fhuB TRUE 0.991 -6.000 0.391 1.000 Y NA
 6433716 6433717 AM202_0682 AM202_0683 fhuB fhuA TRUE 0.983 30.000 0.130 0.093 Y NA
 6433718 6433719 AM202_0684 AM202_0685 priA   FALSE 0.059 1.000 0.000 1.000 N NA
 6433719 6433720 AM202_0685 AM202_0686     TRUE 0.925 -7.000 0.026 0.093   NA
 6433720 6433721 AM202_0686 AM202_0687     TRUE 0.986 -6.000 0.600 0.093   NA
 6433721 6433722 AM202_0687 AM202_0688     FALSE 0.385 67.000 0.008 1.000   NA
 6433724 6433725 AM202_0690 AM202_0691     FALSE 0.076 135.000 0.000 NA   NA
 6433726 6433727 AM202_0692 AM202_0693 dinP htpX FALSE 0.394 83.000 0.024 1.000 N NA
 6433727 6433728 AM202_0693 AM202_0694 htpX   FALSE 0.074 174.000 0.000 NA   NA
 6433729 6433730 AM202_0695 AM202_0696   hbpA FALSE 0.051 294.000 0.000 1.000   NA
 6433731 6433732 AM202_0697 AM202_0698   slyB TRUE 0.945 26.000 0.167 NA   NA
 6433732 6433733 AM202_0698 AM202_0699 slyB   TRUE 0.924 23.000 0.075 NA   NA
 6433734 6433735 AM202_0700 AM202_0701 argS yhbZ FALSE 0.110 205.000 0.002 1.000   NA
 6433736 6433737 AM202_0707 AM202_0706 leuC lpxK FALSE 0.006 318.000 0.000 1.000 N NA
 6433737 6433738 AM202_0706 AM202_0705 lpxK   FALSE 0.346 2.000 0.000 1.000   NA
 6433738 6433739 AM202_0705 AM202_0704   clpX FALSE 0.052 114.000 0.000 1.000   NA
 6433739 6433740 AM202_0704 AM202_0703 clpX clpP TRUE 0.991 0.000 0.352 1.000 Y NA
 6433743 6433744 AM202_0707 AM202_0708 leuC leuD FALSE 0.442 14.000 0.000 NA   NA
 6433745 6433746 AM202_0709 AM202_0710   tonB2 FALSE 0.143 70.000 0.000 NA   NA
 6433746 6433747 AM202_0710 AM202_0711 tonB2 exbD2 TRUE 0.983 10.000 0.733 0.092 N NA
 6433747 6433748 AM202_0711 AM202_0712 exbD2 exbB2 TRUE 0.993 40.000 1.000 0.060 Y NA
 6433749 6433750 AM202_0713 AM202_0714 glpE   TRUE 0.506 50.000 0.016 1.000 N NA
 6433750 6433751 AM202_0714 AM202_0715   trxB TRUE 0.846 55.000 0.012 1.000 Y NA
 6433751 6433752 AM202_0715 AM202_0716 trxB kdsB TRUE 0.672 10.000 0.004 0.065 N NA
 6433752 6433753 AM202_0716 AM202_0717 kdsB   FALSE 0.370 81.000 0.009 NA   NA
 6433755 6433756 AM202_0719 AM202_0720     FALSE 0.085 105.000 0.005 NA N NA
 6433756 6433757 AM202_0720 AM202_0721   kdtA TRUE 0.940 2.000 0.008 NA Y NA
 6433757 6433758 AM202_0721 AM202_0722 kdtA coaD TRUE 0.756 -10.000 0.020 1.000 N NA
 6433758 6433759 AM202_0722 AM202_0723 coaD orn FALSE 0.189 0.000 0.004 1.000 N NA
 6433759 6433760 AM202_0723 AM202_0724 orn   TRUE 0.607 34.000 0.006 NA   NA
 6433760 6433761 AM202_0724 AM202_0725   amiB TRUE 0.913 36.000 0.109 NA   NA
 6433762 6433763 AM202_0726 AM202_0727     TRUE 0.916 -7.000 0.099 NA N NA
 6433763 6433764 AM202_0727 AM202_0728   rep TRUE 0.946 5.000 0.000 0.007 Y NA
 6433765 6433766 AM202_0729 AM202_0730 potA potB TRUE 0.994 -10.000 0.789 1.000 Y NA
 6433766 6433767 AM202_0730 AM202_0731 potB potC TRUE 0.993 0.000 0.286 0.042 Y NA
 6433767 6433768 AM202_0731 AM202_0732 potC bolA FALSE 0.025 49.000 0.000 NA N NA
 6433768 6433769 AM202_0732 AM202_0733 bolA   FALSE 0.102 91.000 0.000 NA   NA
 6433769 6433770 AM202_0733 AM202_0734     FALSE 0.075 211.000 0.000 NA   NA
 6433771 6433772 AM202_0735 AM202_0736     FALSE 0.228 36.000 0.000 1.000   NA
 6433773 6433774 AM202_0737 AM202_0738 aroE   FALSE 0.074 173.000 0.000 NA   NA
 6433774 6433775 AM202_0738 AM202_0739     FALSE 0.461 5.000 0.000 NA   NA
 6433775 6433776 AM202_0739 AM202_0740     FALSE 0.375 27.000 0.000 NA   NA
 6433782 6433783 AM202_0748 AM202_0749     FALSE 0.452 12.000 0.000 NA   NA
 6433784 6433785 AM202_0750 AM202_0751     FALSE 0.388 25.000 0.000 NA   NA
 6433785 6433786 AM202_0751 AM202_0752     FALSE 0.363 29.000 0.000 NA   NA
 6433789 6433790 AM202_0755 AM202_0756     FALSE 0.084 1848.000 0.000 NA   NA
 6433792 6433793 AM202_0758 AM202_0759     FALSE 0.423 18.000 0.000 NA   NA
 6433797 6433798 AM202_0763 AM202_0764     FALSE 0.074 196.000 0.000 NA   NA
 6433799 6433800 AM202_0765 AM202_0766     FALSE 0.461 6.000 0.000 NA   NA
 6433801 6433802 AM202_0768 AM202_0769     FALSE 0.219 55.000 0.000 NA   NA
 6433805 6433806 AM202_0772 AM202_0773     FALSE 0.442 14.000 0.000 NA   NA
 6433809 6433810 AM202_0776 AM202_0777     FALSE 0.322 36.000 0.000 NA   NA
 6433810 6433811 AM202_0777 AM202_0778     FALSE 0.282 43.000 0.000 NA   NA
 6433811 6433812 AM202_0778 AM202_0779     FALSE 0.461 4.000 0.000 NA   NA
 6433813 6433814 AM202_0780 AM202_0781     FALSE 0.150 69.000 0.000 NA   NA
 6433815 6433816 AM202_0782 AM202_0783     FALSE 0.406 21.000 0.000 NA   NA
 6433817 6433818 AM202_0784 AM202_0785     FALSE 0.260 48.000 0.000 NA   NA
 6433819 6433820 AM202_0786 AM202_0787     FALSE 0.213 56.000 0.000 NA   NA
 6433821 6433822 AM202_0788 AM202_0789     FALSE 0.282 43.000 0.000 NA   NA
 6433824 6433825 AM202_0791 AM202_0792     FALSE 0.153 68.000 0.000 NA   NA
 11536677 11679040         TRUE NA -32.000 0.000 NA   NA
 11679040 11821432         TRUE NA -32.000 0.000 NA   NA
 11821432 11536678         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11536678 11679041         TRUE NA -32.000 0.000 NA   NA
 11679041 11821433         TRUE NA -32.000 0.000 NA   NA
 11821433 11536679         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11536679 11679042         TRUE NA -32.000 0.000 NA   NA
 11679042 11821434         TRUE NA -32.000 0.000 NA   NA
 11821434 11536680         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11536680 11679043         TRUE NA -43.000 0.000 NA   NA
 11679043 11821435         TRUE NA -43.000 0.000 NA   NA
 11821435 11536681         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11536681 11679044         TRUE NA -19.000 0.000 NA   NA
 11679044 11821436         TRUE NA -19.000 0.000 NA   NA
 11821436 11536682         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11536682 11679045         TRUE NA -46.000 0.000 NA   NA
 11679045 11821437         TRUE NA -46.000 0.000 NA   NA
 11821437 11536683         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11536683 11679046         TRUE NA -19.000 0.000 NA   NA
 11679046 11821438         TRUE NA -19.000 0.000 NA   NA
 11821438 11536684         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11536684 11679047         TRUE NA -45.000 0.000 NA   NA
 11679047 11821439         TRUE NA -45.000 0.000 NA   NA
 11821439 11536685         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11536685 11679048         TRUE NA -19.000 0.000 NA   NA
 11679048 11821440         TRUE NA -19.000 0.000 NA   NA
 11821440 11536686         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11536686 11679049         TRUE NA -45.000 0.000 NA   NA
 11679049 11821441         TRUE NA -45.000 0.000 NA   NA
 11821441 11536687         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11536687 11679050         TRUE NA -19.000 0.000 NA   NA
 11679050 11821442         TRUE NA -19.000 0.000 NA   NA