MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia coli ED1a

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5893668 5893669 ECED1_0001 ECED1_0002 thrA thrB TRUE 0.995 2.000 0.133 1.000 Y NA
 5893669 5893670 ECED1_0002 ECED1_0003 thrB thrC TRUE 0.997 1.000 0.233 1.000 Y NA
 5893670 5893671 ECED1_0003 ECED1_0004 thrC yaaX FALSE 0.017 214.000 0.003 NA   NA
 5893672 5893673 ECED1_0005 ECED1_0006 yaaA yaaJ FALSE 0.193 70.000 0.028 NA   NA
 5893674 5893675 ECED1_0008 ECED1_0009 talB mogA FALSE 0.065 115.000 0.042 1.000 N NA
 5893676 5893677 ECED1_0010 ECED1_0011 yaaH htpY FALSE 0.083 149.000 0.043 NA   NA
 5893677 5893678 ECED1_0011 ECED1_0012 htpY yaaI TRUE 0.967 26.000 0.500 NA   NA
 5893679 5893680 ECED1_0013 ECED1_misc_RNA_1 dnaK   TRUE 0.960 1.000 0.000 NA   NA
 5893680 5893681 ECED1_misc_RNA_1 ECED1_0014   dnaJ TRUE 0.960 0.000 0.000 NA   NA
 5893681 5893682 ECED1_0014 ECED1_misc_RNA_2 dnaJ sokC FALSE 0.014 306.000 0.000 NA   NA
 5893682 5893683 ECED1_misc_RNA_2 ECED1_0015 sokC   FALSE 0.006 512.000 0.000 NA   NA
 5893683 5893684 ECED1_0015 ECED1_0016     TRUE 0.971 -16.000 0.571 NA   NA
 5893684 5893685 ECED1_0016 ECED1_0017     FALSE 0.185 123.000 0.000 NA   NA
 5893685 5893686 ECED1_0017 ECED1_0018   nhaA FALSE 0.029 235.000 0.000 NA   NA
 5893686 5893687 ECED1_0018 ECED1_0019 nhaA nhaR TRUE 0.608 60.000 0.292 1.000 N NA
 5893689 5893690 ECED1_0021 ECED1_0022 yaaY ribF TRUE 0.900 8.000 0.019 NA   NA
 5893690 5893691 ECED1_0022 ECED1_0023 ribF ileS TRUE 0.753 43.000 0.254 1.000 N NA
 5893691 5893692 ECED1_0023 ECED1_0024 ileS lspA TRUE 0.876 0.000 0.045 1.000 N NA
 5893692 5893693 ECED1_0024 ECED1_0025 lspA fkpB FALSE 0.246 108.000 0.154 1.000 N NA
 5893693 5893694 ECED1_0025 ECED1_0026 fkpB ispH TRUE 0.995 2.000 0.626 1.000 N NA
 5893694 5893695 ECED1_0026 ECED1_0027 ispH rihC FALSE 0.051 66.000 0.028 NA N NA
 5893695 5893696 ECED1_0027 ECED1_0028 rihC   TRUE 0.907 23.000 0.167 NA   NA
 5893696 5893697 ECED1_0028 ECED1_0029   dapB FALSE 0.105 161.000 0.000 1.000   NA
 5893697 5893698 ECED1_0029 ECED1_0030 dapB carA FALSE 0.028 456.000 0.034 1.000 Y NA
 5893698 5893699 ECED1_0030 ECED1_0031 carA carB TRUE 0.996 18.000 0.345 0.001 Y NA
 5893702 5893703 ECED1_0034 ECED1_0035 caiE caiD TRUE 0.956 6.000 0.000 1.000   NA
 5893703 5893704 ECED1_0035 ECED1_0036 caiD caiC TRUE 0.720 106.000 0.000 0.022 Y NA
 5893704 5893705 ECED1_0036 ECED1_0037 caiC caiB TRUE 0.557 58.000 0.154 0.022 N NA
 5893705 5893706 ECED1_0037 ECED1_0038 caiB caiA TRUE 0.561 128.000 0.529 1.000 N NA
 5893706 5893707 ECED1_0038 ECED1_0039 caiA caiT TRUE 0.695 31.000 0.118 1.000 N NA
 5893708 5893709 ECED1_0040 ECED1_0041 fixA fixB TRUE 0.995 15.000 0.231 0.012 Y NA
 5893709 5893710 ECED1_0041 ECED1_0042 fixB fixC TRUE 0.871 51.000 0.000 0.053 Y NA
 5893710 5893711 ECED1_0042 ECED1_0043 fixC fixX TRUE 0.996 -3.000 0.167 0.053 Y NA
 5893711 5893712 ECED1_0043 ECED1_0044 fixX yaaU FALSE 0.235 59.000 0.000 1.000 N NA
 5893712 5893713 ECED1_0044 ECED1_0045 yaaU kefF FALSE 0.244 108.000 0.000 1.000   NA
 5893713 5893714 ECED1_0045 ECED1_0046 kefF kefC TRUE 0.986 -7.000 0.560 1.000   NA
 5893714 5893715 ECED1_0046 ECED1_0047 kefC folA FALSE 0.006 192.000 0.012 1.000 N NA
 5893715 5893716 ECED1_0047 ECED1_0048 folA   FALSE 0.300 86.000 0.000 1.000   NA
 5893716 5893717 ECED1_0048 ECED1_0049     TRUE 0.962 3.000 0.000 1.000   NA
 5893718 5893719 ECED1_0050 ECED1_0051 apaH apaG TRUE 0.977 7.000 0.267 NA N NA
 5893719 5893720 ECED1_0051 ECED1_0052 apaG ksgA TRUE 0.910 3.000 0.078 NA N NA
 5893720 5893721 ECED1_0052 ECED1_0053 ksgA pdxA TRUE 0.966 -3.000 0.197 1.000 N NA
 5893721 5893722 ECED1_0053 ECED1_0054 pdxA surA TRUE 0.994 0.000 0.561 1.000 N NA
 5893722 5893723 ECED1_0054 ECED1_0055 surA imp TRUE 0.512 53.000 0.182 1.000 N NA
 5893725 5893726 ECED1_0057 ECED1_0058 rluA hepA TRUE 0.975 12.000 0.294 1.000 N NA
 5893726 5893727 ECED1_0058 ECED1_0059 hepA polB TRUE 0.475 164.000 0.098 0.086 Y NA
 5893727 5893728 ECED1_0059 ECED1_0060 polB araD FALSE 0.049 75.000 0.018 1.000 N NA
 5893728 5893729 ECED1_0060 ECED1_0061 araD araA FALSE 0.065 285.000 0.017 1.000 Y NA
 5893729 5893730 ECED1_0061 ECED1_0062 araA araB TRUE 0.941 11.000 0.138 1.000 N NA
 5893731 5893732 ECED1_0063 ECED1_0064 araC   FALSE 0.006 512.000 0.000 NA   NA
 5893732 5893733 ECED1_0064 ECED1_0065     TRUE 0.950 7.000 0.000 NA   NA
 5893733 5893734 ECED1_0065 ECED1_0066   yabI FALSE 0.103 155.000 0.000 NA   NA
 5893735 5893736 ECED1_0067 ECED1_0068 thiQ thiP TRUE 0.970 -16.000 0.522 0.018 N NA
 5893736 5893737 ECED1_0068 ECED1_0069 thiP tbpA TRUE 0.972 -24.000 0.697 0.078 N NA
 5893737 5893738 ECED1_0069 ECED1_misc_RNA_3 tbpA   TRUE 0.731 31.000 0.000 NA   NA
 5893738 5893739 ECED1_misc_RNA_3 ECED1_0070   sgrR TRUE 0.704 34.000 0.000 NA   NA
 5893741 5893742 ECED1_0071 ECED1_0072 leuD leuC TRUE 0.998 11.000 0.309 0.001 Y NA
 5893742 5893743 ECED1_0072 ECED1_0073 leuC leuB TRUE 0.998 3.000 0.275 0.002 Y NA
 5893743 5893744 ECED1_0073 ECED1_0074 leuB leuA TRUE 0.997 0.000 0.126 0.002 Y NA
 5893744 5893745 ECED1_0074 ECED1_5276 leuA leuL FALSE 0.340 93.000 0.010 0.002   NA
 5893746 5893747 ECED1_0075 ECED1_0076 leuO insA TRUE 0.449 51.000 0.000 NA   NA
 5893747 5893748 ECED1_0076 ECED1_0077 insA insB TRUE 0.861 -81.000 0.000 0.026 Y NA
 5893748 5893749 ECED1_0077 ECED1_0078 insB leuO FALSE 0.158 132.000 0.000 NA   NA
 5893749 5893750 ECED1_0078 ECED1_0079 leuO ilvI FALSE 0.013 318.000 0.000 NA   NA
 5893750 5893751 ECED1_0079 ECED1_0080 ilvI ilvH TRUE 0.999 3.000 0.371 0.002 Y NA
 5893751 5893752 ECED1_0080 ECED1_0081 ilvH fruR FALSE 0.032 180.000 0.063 1.000 N NA
 5893752 5893753 ECED1_0081 ECED1_0082 fruR mraZ FALSE 0.005 602.000 0.000 NA   NA
 5893753 5893754 ECED1_0082 ECED1_0083 mraZ mraW TRUE 0.996 2.000 0.635 NA   NA
 5893754 5893755 ECED1_0083 ECED1_0084 mraW ftsL TRUE 0.973 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5893755 5893756 ECED1_0084 ECED1_0085 ftsL ftsI TRUE 0.891 16.000 0.124 1.000 N NA
 5893756 5893757 ECED1_0085 ECED1_0086 ftsI murE TRUE 0.955 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 5893757 5893758 ECED1_0086 ECED1_0087 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 5893758 5893759 ECED1_0087 ECED1_0088 murF mraY TRUE 0.996 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 5893759 5893760 ECED1_0088 ECED1_0089 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.004 Y NA
 5893760 5893761 ECED1_0089 ECED1_0090 murD ftsW TRUE 0.992 0.000 0.297 0.003 N NA
 5893761 5893762 ECED1_0090 ECED1_0091 ftsW murG TRUE 0.994 -3.000 0.647 1.000 N NA
 5893762 5893763 ECED1_0091 ECED1_0092 murG murC TRUE 0.913 54.000 0.283 1.000 Y NA
 5893763 5893764 ECED1_0092 ECED1_0093 murC ddlB TRUE 0.990 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 5893764 5893765 ECED1_0093 ECED1_0094 ddlB ftsQ TRUE 0.998 2.000 0.372 NA Y NA
 5893765 5893766 ECED1_0094 ECED1_0095 ftsQ ftsA TRUE 0.986 -3.000 0.389 NA N NA
 5893766 5893767 ECED1_0095 ECED1_0096 ftsA ftsZ TRUE 0.935 61.000 0.460 1.000 Y NA
 5893767 5893768 ECED1_0096 ECED1_0097 ftsZ lpxC FALSE 0.231 101.000 0.134 1.000 N NA
 5893768 5893769 ECED1_0097 ECED1_0098 lpxC secM FALSE 0.036 231.000 0.000 1.000   NA
 5893769 5893770 ECED1_0098 ECED1_0099 secM secA FALSE 0.355 62.000 0.065 1.000   NA
 5893770 5893771 ECED1_0099 ECED1_0100 secA mutT TRUE 0.423 60.000 0.168 1.000 N NA
 5893772 5893773 ECED1_0101 ECED1_0102 yacF coaE TRUE 0.970 0.000 0.110 NA   NA
 5893775 5893776 ECED1_0104 ECED1_0105 hofC hofB TRUE 0.994 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 5893776 5893777 ECED1_0105 ECED1_0106 hofB ppdD TRUE 0.998 10.000 0.556 NA Y NA
 5893777 5893778 ECED1_0106 ECED1_0107 ppdD nadC FALSE 0.002 204.000 0.015 NA N NA
 5893779 5893780 ECED1_0108 ECED1_0109 ampD ampE TRUE 0.996 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 5893782 5893783 ECED1_0111 ECED1_0112     TRUE 0.962 3.000 0.000 1.000   NA
 5893783 5893784 ECED1_0112 ECED1_0113     FALSE 0.084 168.000 0.000 NA   NA
 5893784 5893785 ECED1_0113 ECED1_0114     TRUE 0.960 1.000 0.000 NA   NA
 5893785 5893786 ECED1_0114 ECED1_0115     FALSE 0.086 167.000 0.000 NA   NA
 5893786 5893787 ECED1_0115 ECED1_0116     TRUE 0.501 48.000 0.000 NA   NA
 5893787 5893788 ECED1_0116 ECED1_0117   pdhR FALSE 0.007 456.000 0.000 1.000   NA
 5893790 5893791 ECED1_0118 ECED1_0119 aceE aceF TRUE 0.992 15.000 0.220 1.000 Y NA
 5893791 5893792 ECED1_0119 ECED1_0120 aceF lpd TRUE 0.536 208.000 0.463 1.000 Y NA
 5893794 5893795 ECED1_0122 ECED1_0123 acnB yacL FALSE 0.071 175.000 0.068 NA   NA
 5893796 5893797 ECED1_0124 ECED1_0125 speD speE TRUE 0.988 16.000 0.162 1.000 Y NA
 5893797 5893798 ECED1_0125 ECED1_0126 speE yacC TRUE 0.600 106.000 0.354 NA   NA
 5893803 5893804 ECED1_0131 ECED1_0133 yadG yadH TRUE 0.999 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 5893804 5893805 ECED1_0133 ECED1_0134 yadH yadI FALSE 0.065 105.000 0.037 1.000 N NA
 5893805 5893806 ECED1_0134 ECED1_0135 yadI yadE TRUE 0.857 64.000 0.222 1.000 Y NA
 5893809 5893810 ECED1_0138 ECED1_0139 panC panB TRUE 0.998 12.000 0.395 0.001 Y NA
 5893810 5893811 ECED1_0139 ECED1_0140 panB   FALSE 0.209 112.000 0.000 NA   NA
 5893811 5893812 ECED1_0140 ECED1_0141     FALSE 0.017 286.000 0.000 NA   NA
 5893812 5893813 ECED1_0141 ECED1_0142     TRUE 0.983 27.000 0.571 0.007   NA
 5893813 5893814 ECED1_0142 ECED1_0143     TRUE 0.997 6.000 0.571 0.007   NA
 5893814 5893815 ECED1_0143 ECED1_0144   htrE TRUE 0.988 17.000 0.571 1.000   NA
 5893815 5893816 ECED1_0144 ECED1_0145 htrE ecpD TRUE 0.994 35.000 1.000 1.000 Y NA
 5893816 5893817 ECED1_0145 ECED1_0146 ecpD yadN TRUE 0.890 109.000 0.500 1.000 Y NA
 5893817 5893818 ECED1_0146 ECED1_0147 yadN folK FALSE 0.006 340.000 0.000 1.000 N NA
 5893818 5893819 ECED1_0147 ECED1_0148 folK pcnB TRUE 0.974 -3.000 0.234 1.000 N NA
 5893819 5893820 ECED1_0148 ECED1_0149 pcnB yadB TRUE 0.927 39.000 0.131 1.000 Y NA
 5893820 5893821 ECED1_0149 ECED1_0150 yadB dksA TRUE 0.791 37.000 0.231 1.000 N NA
 5893821 5893822 ECED1_0150 ECED1_0151 dksA sfsA FALSE 0.122 178.000 0.151 NA   NA
 5893822 5893823 ECED1_0151 ECED1_0152 sfsA ligT TRUE 0.875 15.000 0.045 NA   NA
 5893824 5893825 ECED1_0153 ECED1_0154 hrpB mrcB FALSE 0.282 94.000 0.158 1.000 N NA
 5893825 5893826 ECED1_0154 ECED1_0156 mrcB fhuA FALSE 0.019 220.000 0.000 1.000 N NA
 5893826 5893827 ECED1_0156 ECED1_0157 fhuA fhuC TRUE 0.875 51.000 0.156 1.000 Y NA
 5893827 5893828 ECED1_0157 ECED1_0158 fhuC fhuD TRUE 0.991 0.000 0.031 1.000 Y NA
 5893828 5893829 ECED1_0158 ECED1_0159 fhuD fhuB TRUE 0.991 -3.000 0.000 1.000 Y NA
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 5893834 5893835 ECED1_0165 ECED1_0166 btuF pfs TRUE 0.788 -7.000 0.073 1.000 N NA
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 5894002 5894003 ECED1_0334 ECED1_0335 insB ecpA TRUE 0.743 30.000 0.000 NA   NA
 5894003 5894004 ECED1_0335 ECED1_0336 ecpA yagY TRUE 0.779 57.000 0.385 NA   NA
 5894004 5894005 ECED1_0336 ECED1_0337 yagY yagX TRUE 0.939 26.000 0.308 NA   NA
 5894005 5894006 ECED1_0337 ECED1_0338 yagX yagW TRUE 0.837 -10.000 0.000 NA   NA
 5894006 5894007 ECED1_0338 ECED1_0339 yagW   TRUE 0.899 -6.000 0.000 NA   NA
 5894008 5894009 ECED1_0340 ECED1_0341 ykgB ykgI TRUE 0.906 12.000 0.043 NA   NA
 5894009 5894010 ECED1_0341 ECED1_0342 ykgI ykgC TRUE 0.781 109.000 0.667 NA   NA
 5894011 5894012 ECED1_0343 ECED1_0344 ykgD ykgE FALSE 0.003 527.000 0.000 NA N NA
 5894012 5894013 ECED1_0344 ECED1_0345 ykgE ykgF TRUE 0.996 11.000 0.286 NA Y NA
 5894013 5894014 ECED1_0345 ECED1_0346 ykgF ykgG TRUE 0.982 -7.000 0.286 0.001   NA
 5894015 5894016 ECED1_0347 ECED1_0348   ykgH TRUE 0.680 -28.000 0.000 NA   NA
 5894016 5894017 ECED1_0348 ECED1_0349 ykgH   FALSE 0.065 184.000 0.000 NA   NA
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 5894021 5894022 ECED1_0353 ECED1_0354 yahJ   FALSE 0.021 264.000 0.000 NA   NA
 5894022 5894023 ECED1_0354 ECED1_0355     FALSE 0.025 251.000 0.000 NA   NA
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 5894027 5894028 ECED1_0359 ECED1_tRNA6 yahK   FALSE 0.006 552.000 0.000 NA   NA
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 5894046 5894047 ECED1_0377 ECED1_0378 mhpC mhpD TRUE 0.987 10.000 0.300 1.000   NA
 5894047 5894048 ECED1_0378 ECED1_0379 mhpD mhpF TRUE 0.998 -3.000 0.444 1.000 Y NA
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 5894053 5894054 ECED1_0384 ECED1_0385 frmA frmR TRUE 0.950 35.000 0.531 NA   NA
 5894054 5894055 ECED1_0385 ECED1_0387 frmR yaiO FALSE 0.060 189.000 0.000 NA   NA
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 5894128 5894129 ECED1_0460 ECED1_0461 tig clpP FALSE 0.341 246.000 0.351 1.000 Y NA
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 5894139 5894140 ECED1_0470 ECED1_0471 cof ybaO FALSE 0.346 -75.000 0.020 1.000   NA
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 5894151 5894152 ECED1_0481 ECED1_0482 ylaC maa FALSE 0.259 116.000 0.101 1.000   NA
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 5894173 5894174 ECED1_0503 ECED1_0504   ushA TRUE 0.948 -3.000 0.000 NA   NA
 5894175 5894176 ECED1_misc_RNA_10 ECED1_0505 rybC ybaK FALSE 0.277 85.000 0.000 NA   NA
 5894179 5894180 ECED1_0508 ECED1_0509   ybaQ TRUE 0.885 36.000 0.286 NA   NA
 5894182 5894183 ECED1_0511 ECED1_0512 ybaS ybaT TRUE 0.990 3.000 0.028 1.000 Y NA
 5894183 5894184 ECED1_0512 ECED1_0513 ybaT cueR FALSE 0.103 125.000 0.000 1.000 N NA
 5894185 5894186 ECED1_0514 ECED1_0515   ybbJ FALSE 0.194 118.000 0.000 NA   NA
 5894186 5894187 ECED1_0515 ECED1_0516 ybbJ ybbK TRUE 0.997 0.000 0.313 NA Y NA
 5894188 5894189 ECED1_0517 ECED1_0518 ybbL ybbM TRUE 0.650 -13.000 0.012 NA   NA
 5894190 5894191 ECED1_0519 ECED1_0520 ybbN ybbO TRUE 0.466 61.000 0.118 1.000   NA
 5894191 5894192 ECED1_0520 ECED1_0521 ybbO tesA TRUE 0.849 -10.000 0.072 1.000   NA
 5894193 5894194 ECED1_0522 ECED1_0523 ybbA ybbP TRUE 0.998 -3.000 0.535 NA Y NA
 5894195 5894196 ECED1_0524 ECED1_0525 ybbB ybbS FALSE 0.168 69.000 0.012 NA   NA
 5894197 5894198 ECED1_0526 ECED1_0527 allA allR TRUE 0.768 78.000 0.625 1.000 N NA
 5894198 5894199 ECED1_0527 ECED1_0528 allR gcl TRUE 0.955 0.000 0.054 1.000   NA
 5894199 5894200 ECED1_0528 ECED1_0529 gcl glxR FALSE 0.260 100.000 0.000 1.000   NA
 5894200 5894201 ECED1_0529 ECED1_0530 glxR ybbW FALSE 0.045 170.000 0.000 1.000 N NA
 5894201 5894202 ECED1_0530 ECED1_0531 ybbW allB TRUE 0.515 153.000 0.161 1.000 Y NA
 5894202 5894203 ECED1_0531 ECED1_0532 allB ybbY TRUE 0.850 56.000 0.161 1.000 Y NA
 5894203 5894204 ECED1_0532 ECED1_0533 ybbY glxK TRUE 0.842 22.000 0.133 1.000 N NA
 5894205 5894206 ECED1_0534 ECED1_0535 ylbA allC TRUE 0.930 11.000 0.059 NA   NA
 5894206 5894207 ECED1_0535 ECED1_0536 allC allD TRUE 0.882 22.000 0.174 1.000 N NA
 5894208 5894209 ECED1_0537 ECED1_0538 fdrA ylbE TRUE 0.991 10.000 0.412 NA   NA
 5894209 5894210 ECED1_0538 ECED1_0539 ylbE ylbF TRUE 0.982 11.000 0.265 NA   NA
 5894210 5894211 ECED1_0539 ECED1_0540 ylbF ybcF TRUE 0.990 -3.000 0.375 NA   NA
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 5894213 5894214 ECED1_0542 ECED1_0543 purE   FALSE 0.119 96.000 0.002 NA   NA
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 5894219 5894220 ECED1_0548 ECED1_0549 ybcJ folD TRUE 0.955 2.000 0.055 1.000   NA
 5894221 5894222 ECED1_0550 ECED1_tRNA7     TRUE 0.715 33.000 0.000 NA   NA
 5894223 5894224 ECED1_0551 ECED1_0552 intD intD TRUE 0.566 -52.000 0.000 NA   NA
 5894226 5894227 ECED1_0554 ECED1_0555 ybcY insB FALSE 0.006 541.000 0.000 1.000   NA
 5894227 5894228 ECED1_0555 ECED1_0556 insB insA TRUE 0.862 -81.000 0.000 0.024 Y NA
 5894228 5894229 ECED1_0556 ECED1_0557 insA ompT FALSE 0.403 55.000 0.000 NA   NA
 5894229 5894230 ECED1_0557 ECED1_0558 ompT ybcH FALSE 0.005 659.000 0.000 NA   NA
 5894230 5894231 ECED1_0558 ECED1_0559 ybcH nfrA TRUE 0.995 1.000 0.500 NA   NA
 5894231 5894232 ECED1_0559 ECED1_0560 nfrA nfrB TRUE 0.803 -13.000 0.000 NA   NA
 5894232 5894233 ECED1_0560 ECED1_0561 nfrB nfrB TRUE 0.763 28.000 0.000 NA   NA
 5894233 5894234 ECED1_0561 ECED1_0562 nfrB cusS FALSE 0.115 150.000 0.000 NA   NA
 5894234 5894235 ECED1_0562 ECED1_0563 cusS cusR TRUE 0.997 -10.000 0.600 0.001 Y NA
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 5894237 5894238 ECED1_0565 ECED1_0566 cusF cusB TRUE 0.901 16.000 0.000 NA   NA
 5894238 5894239 ECED1_0566 ECED1_0567 cusB cusA TRUE 0.988 12.000 0.500 1.000 N NA
 5894239 5894240 ECED1_0567 ECED1_0568 cusA pheP FALSE 0.331 66.000 0.000 0.085 N NA
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 5894242 5894243 ECED1_0570 ECED1_0571 nfnB ybdF TRUE 0.755 79.000 0.500 NA   NA
 5894243 5894244 ECED1_0571 ECED1_0572 ybdF ybdJ FALSE 0.281 80.000 0.000 NA   NA
 5894244 5894245 ECED1_0572 ECED1_0573 ybdJ ybdK FALSE 0.324 66.000 0.000 NA   NA
 5894247 5894248 ECED1_0576 ECED1_0577 entD fepA FALSE 0.088 166.000 0.000 NA   NA
 5894248 5894249 ECED1_0577 ECED1_0578 fepA fepA TRUE 0.955 4.000 0.000 NA   NA
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 5894252 5894253 ECED1_0582 ECED1_0583 entF fepE FALSE 0.026 247.000 0.000 NA   NA
 5894253 5894254 ECED1_0583 ECED1_0584 fepE fepE TRUE 0.494 -70.000 0.000 NA   NA
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 5894266 5894267 ECED1_0596 ECED1_0597 cstA ybdD FALSE 0.207 113.000 0.000 NA   NA
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 5894272 5894273 ECED1_0602 ECED1_0603 ybdO dsbG FALSE 0.039 169.000 0.067 1.000 N NA
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 5894282 5894283 ECED1_0612 ECED1_0613 citF citE TRUE 0.963 11.000 0.000 0.001 N NA
 5894283 5894284 ECED1_0613 ECED1_0614 citE citD TRUE 0.995 -3.000 0.537 0.001 N NA
 5894284 5894285 ECED1_0614 ECED1_0615 citD citC TRUE 0.983 15.000 0.000 1.000 Y NA
 5894286 5894287 ECED1_0616 ECED1_0617 citA citB TRUE 0.918 -31.000 0.000 1.000 Y NA
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 5894320 5894321 ECED1_0650 ECED1_0651 ybeY ybeZ TRUE 0.992 -3.000 0.457 NA   NA
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 5894343 5894344 ECED1_0667 ECED1_0668 ybfE ybfF FALSE 0.364 140.000 0.276 NA   NA
 5894345 5894346 ECED1_0669 ECED1_0670 seqA pgm TRUE 0.808 26.000 0.151 1.000 N NA
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 5894351 5894352 ECED1_0675 ECED1_0676 kdpC kdpB TRUE 1.000 9.000 0.877 0.001 Y NA
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 5894354 5894355 ECED1_0678 ECED1_0679 ybfA ybgA TRUE 0.477 101.000 0.231 NA   NA
 5894355 5894356 ECED1_0679 ECED1_0680 ybgA phr TRUE 0.898 -3.000 0.019 NA   NA
 5894358 5894359 ECED1_0682 ECED1_0683 ybgI ybgJ TRUE 0.787 23.000 0.050 NA   NA
 5894359 5894360 ECED1_0683 ECED1_0684 ybgJ ybgK TRUE 0.994 -6.000 0.379 NA Y NA
 5894360 5894361 ECED1_0684 ECED1_0685 ybgK ybgL TRUE 0.930 -10.000 0.211 NA   NA
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 11561573 5894533   ECED1_0850     FALSE NA 1177.000 0.000 NA   NA
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 5894862 5894863 ECED1_1175 ECED1_1176 phoH   FALSE 0.005 589.000 0.000 NA   NA
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 5895033 5895034 ECED1_1343 ECED1_1344   treA FALSE 0.015 295.000 0.000 NA   NA
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 5895214 5895215 ECED1_1522 ECED1_1523 ycjR ycjS TRUE 0.989 10.000 0.347 NA   NA
 5895215 5895216 ECED1_1523 ECED1_1524 ycjS ycjT TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000   NA
 5895216 5895217 ECED1_1524 ECED1_1525 ycjT ycjU TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000   NA
 5895217 5895218 ECED1_1525 ECED1_1526 ycjU ycjV TRUE 0.940 14.000 0.103 1.000   NA
 5895218 5895219 ECED1_1526 ECED1_1527 ycjV ompG TRUE 0.844 45.000 0.222 0.050   NA
 5895221 5895222 ECED1_1529 ECED1_1530 ycjX ycjF TRUE 0.997 -3.000 0.791 NA   NA
 5895222 5895223 ECED1_1530 ECED1_1531 ycjF tyrR FALSE 0.182 148.000 0.137 NA   NA
 5895226 5895227 ECED1_1534 ECED1_1535 mpaA ymjC FALSE 0.017 231.000 0.000 1.000 N NA
 5895227 5895228 ECED1_1535 ECED1_1536 ymjC ycjY FALSE 0.299 71.000 0.000 NA   NA
 5895228 5895229 ECED1_1536 ECED1_1537 ycjY ycjY FALSE 0.403 55.000 0.000 NA   NA
 5895229 5895230 ECED1_1537 ECED1_1538 ycjY ycjY TRUE 0.674 36.000 0.000 NA   NA
 5895231 5895232 ECED1_1539 ECED1_1540 ycjZ mppA FALSE 0.006 337.000 0.000 1.000 N NA
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 5895236 5895237 ECED1_1544 ECED1_1545 fnr ogt FALSE 0.028 195.000 0.000 1.000 N NA
 5895237 5895238 ECED1_1545 ECED1_1546 ogt   TRUE 0.941 11.000 0.000 NA   NA
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 5895242 5895243 ECED1_1549 ECED1_1550   ydaL FALSE 0.053 195.000 0.000 NA   NA
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 5895246 5895247 ECED1_1553 ECED1_misc_RNA_24   C0343 FALSE 0.327 -118.000 0.000 NA   NA
 5895247 5895248 ECED1_misc_RNA_24 ECED1_1554 C0343 dbpA FALSE 0.290 74.000 0.000 NA   NA
 5895249 5895250 ECED1_1555 ECED1_1556 ydaO intR TRUE 0.435 52.000 0.000 NA   NA
 5895250 5895251 ECED1_1556 ECED1_1557 intR   FALSE 0.004 1546.000 0.000 NA   NA
 5895251 5895252 ECED1_1557 ECED1_1558   uspF FALSE 0.293 89.000 0.000 1.000   NA
 5895252 5895253 ECED1_1558 ECED1_1559 uspF ompN FALSE 0.136 141.000 0.000 NA   NA
 5895253 5895254 ECED1_1559 ECED1_1560 ompN ompN TRUE 0.837 -10.000 0.000 NA   NA
 5895258 5895259 ECED1_1563 ECED1_1564 hslJ ldhA FALSE 0.106 111.000 0.000 NA N NA
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 5895261 5895262 ECED1_1566 ECED1_1567 ynbE ydbL TRUE 0.996 8.000 0.726 NA   NA
 5895262 5895263 ECED1_1567 ECED1_1568 ydbL ydbA FALSE 0.009 376.000 0.000 NA   NA
 5895263 5895264 ECED1_1568 ECED1_1569 ydbA ydbC FALSE 0.036 219.000 0.000 NA   NA
 5895266 5895267 ECED1_1571 ECED1_1572 hrpA ydcF FALSE 0.019 273.000 0.000 NA   NA
 5895267 5895268 ECED1_1572 ECED1_1573 ydcF aldA FALSE 0.033 197.000 0.040 NA   NA
 5895272 5895273 ECED1_1576 ECED1_1577 ydcA trg FALSE 0.100 157.000 0.000 NA   NA
 5895275 5895276 ECED1_1579 ECED1_1580 ydcJ mdoD FALSE 0.024 255.000 0.000 NA   NA
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 5895282 5895283 ECED1_1586 ECED1_1587 tehB ydcL FALSE 0.016 303.000 0.088 NA   NA
 5895285 5895286 ECED1_1589 ECED1_1590 ydcN ydcP FALSE 0.179 73.000 0.000 1.000 N NA
 5895288 5895289 ECED1_1592 ECED1_1593 ydcQ ydcR FALSE 0.282 79.000 0.000 NA   NA
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 5895294 5895295 ECED1_1598 ECED1_1599 ydcW ydcX FALSE 0.013 314.000 0.000 NA   NA
 5895295 5895296 ECED1_1599 ECED1_1600 ydcX ydcY FALSE 0.276 86.000 0.000 NA   NA
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 5895304 5895305 ECED1_1608 ECED1_1609 yncG yncG TRUE 0.925 13.000 0.000 NA   NA
 5895305 5895306 ECED1_1609 ECED1_1610 yncG   FALSE 0.004 843.000 0.000 NA   NA
 5895306 5895307 ECED1_1610 ECED1_1611     TRUE 0.593 -46.000 0.000 NA   NA
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