MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia coli 55989

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5877972 5877973 EC55989_5066 EC55989_0002 thrL thrA FALSE 0.258 81.000 0.043 1.000   NA
 5877973 5877974 EC55989_0002 EC55989_0003 thrA thrB TRUE 0.991 2.000 0.133 1.000 Y NA
 5877974 5877975 EC55989_0003 EC55989_0004 thrB thrC TRUE 0.994 1.000 0.233 1.000 Y NA
 5877975 5877976 EC55989_0004 EC55989_0005 thrC yaaX FALSE 0.015 214.000 0.003 NA   NA
 5877977 5877978 EC55989_0006 EC55989_0007 yaaA yaaJ FALSE 0.230 70.000 0.028 NA   NA
 5877979 5877980 EC55989_0009 EC55989_0010 talB mogA FALSE 0.094 115.000 0.042 1.000 N NA
 5877981 5877982 EC55989_0011 EC55989_0012 yaaH htpY FALSE 0.072 149.000 0.043 NA   NA
 5877982 5877983 EC55989_0012 EC55989_0013 htpY yaaI TRUE 0.960 26.000 0.500 NA   NA
 5877984 5877985 EC55989_0014 EC55989_misc_RNA_1 dnaK tpke11 TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 5877985 5877986 EC55989_misc_RNA_1 EC55989_0015 tpke11 dnaJ TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5877986 5877987 EC55989_0015 EC55989_misc_RNA_2 dnaJ sokC FALSE 0.012 305.000 0.000 NA   NA
 5877987 5877988 EC55989_misc_RNA_2 EC55989_0016 sokC nhaA FALSE 0.006 483.000 0.000 NA   NA
 5877988 5877989 EC55989_0016 EC55989_0017 nhaA nhaR TRUE 0.663 60.000 0.292 1.000 N NA
 5877990 5877991 EC55989_0018 EC55989_0019     TRUE 0.867 13.000 0.000 NA   NA
 5877991 5877992 EC55989_0019 EC55989_0020     FALSE 0.007 409.000 0.000 NA   NA
 5877992 5877993 EC55989_0020 EC55989_0022   rpsT FALSE 0.004 783.000 0.000 NA   NA
 5877994 5877995 EC55989_0023 EC55989_0024 yaaY ribF TRUE 0.838 8.000 0.019 NA   NA
 5877995 5877996 EC55989_0024 EC55989_0025 ribF ileS TRUE 0.775 43.000 0.254 1.000 N NA
 5877996 5877997 EC55989_0025 EC55989_0026 ileS lspA TRUE 0.872 0.000 0.045 1.000 N NA
 5877997 5877998 EC55989_0026 EC55989_0027 lspA fkpB FALSE 0.348 88.000 0.154 1.000 N NA
 5877998 5877999 EC55989_0027 EC55989_0028 fkpB ispH TRUE 0.992 2.000 0.626 1.000 N NA
 5877999 5878000 EC55989_0028 EC55989_0029 ispH rihC FALSE 0.115 66.000 0.028 NA N NA
 5878000 5878001 EC55989_0029 EC55989_0030 rihC dapB FALSE 0.010 167.000 0.003 NA N NA
 5878001 5878002 EC55989_0030 EC55989_0031 dapB carA FALSE 0.034 456.000 0.034 1.000 Y NA
 5878002 5878003 EC55989_0031 EC55989_0032 carA carB TRUE 0.996 18.000 0.345 0.001 Y NA
 5878006 5878007 EC55989_0035 EC55989_0036 caiE caiD TRUE 0.914 6.000 0.000 1.000   NA
 5878007 5878008 EC55989_0036 EC55989_0037 caiD caiC TRUE 0.716 109.000 0.000 0.022 Y NA
 5878008 5878009 EC55989_0037 EC55989_0038 caiC caiB TRUE 0.662 59.000 0.154 0.022 N NA
 5878009 5878010 EC55989_0038 EC55989_0039 caiB caiA TRUE 0.541 129.000 0.529 1.000 N NA
 5878010 5878011 EC55989_0039 EC55989_0040 caiA caiT TRUE 0.719 31.000 0.118 1.000 N NA
 5878012 5878013 EC55989_0041 EC55989_0042 fixA fixB TRUE 0.993 15.000 0.231 0.014 Y NA
 5878013 5878014 EC55989_0042 EC55989_0043 fixB fixC TRUE 0.887 51.000 0.000 0.054 Y NA
 5878014 5878015 EC55989_0043 EC55989_0044 fixC fixX TRUE 0.994 -3.000 0.167 0.054 Y NA
 5878015 5878016 EC55989_0044 EC55989_0045 fixX yaaU FALSE 0.270 59.000 0.000 1.000 N NA
 5878016 5878017 EC55989_0045 EC55989_0046 yaaU kefF FALSE 0.207 108.000 0.000 1.000   NA
 5878017 5878018 EC55989_0046 EC55989_0047 kefF kefC TRUE 0.981 -7.000 0.560 1.000   NA
 5878018 5878019 EC55989_0047 EC55989_0048 kefC folA FALSE 0.013 192.000 0.012 1.000 N NA
 5878020 5878021 EC55989_0049 EC55989_0050 apaH apaG TRUE 0.963 7.000 0.267 NA N NA
 5878021 5878022 EC55989_0050 EC55989_0051 apaG ksgA TRUE 0.887 3.000 0.078 NA N NA
 5878022 5878023 EC55989_0051 EC55989_0052 ksgA pdxA TRUE 0.957 -3.000 0.197 1.000 N NA
 5878023 5878024 EC55989_0052 EC55989_0053 pdxA surA TRUE 0.991 0.000 0.561 1.000 N NA
 5878024 5878025 EC55989_0053 EC55989_0054 surA imp TRUE 0.580 53.000 0.182 1.000 N NA
 5878027 5878028 EC55989_0056 EC55989_0057 rluA hepA TRUE 0.964 12.000 0.294 1.000 N NA
 5878028 5878029 EC55989_0057 EC55989_0058 hepA polB TRUE 0.471 165.000 0.098 0.091 Y NA
 5878029 5878030 EC55989_0058 EC55989_0059 polB araD FALSE 0.114 75.000 0.018 1.000 N NA
 5878030 5878031 EC55989_0059 EC55989_0060 araD araA FALSE 0.259 169.000 0.017 1.000 Y NA
 5878031 5878032 EC55989_0060 EC55989_0061 araA araB TRUE 0.922 11.000 0.138 1.000 N NA
 5878033 5878034 EC55989_0062 EC55989_0063 araC yabI FALSE 0.431 86.000 0.167 NA   NA
 5878035 5878036 EC55989_0064 EC55989_0065 thiQ thiP TRUE 0.969 -16.000 0.522 0.018 N NA
 5878036 5878037 EC55989_0065 EC55989_0066 thiP tbpA TRUE 0.969 -24.000 0.697 0.074 N NA
 5878037 5878038 EC55989_0066 EC55989_misc_RNA_3 tbpA   TRUE 0.661 31.000 0.000 NA   NA
 5878038 5878039 EC55989_misc_RNA_3 EC55989_0067   sgrR TRUE 0.630 34.000 0.000 NA   NA
 5878040 5878041 EC55989_misc_RNA_4 EC55989_0068 sgrS setA TRUE 0.705 28.000 0.000 NA   NA
 5878042 5878043 EC55989_0069 EC55989_0070 leuD leuC TRUE 0.997 11.000 0.309 0.001 Y NA
 5878043 5878044 EC55989_0070 EC55989_0071 leuC leuB TRUE 0.997 3.000 0.275 0.002 Y NA
 5878044 5878045 EC55989_0071 EC55989_0072 leuB leuA TRUE 0.996 0.000 0.126 0.002 Y NA
 5878045 5878046 EC55989_0072 EC55989_misc_RNA_5 leuA   TRUE 0.508 44.000 0.000 NA   NA
 5878046 5878047 EC55989_misc_RNA_5 EC55989_5067   leuL FALSE 0.376 -100.000 0.000 NA   NA
 5878048 5878049 EC55989_0073 EC55989_0074 leuO ilvI FALSE 0.007 318.000 0.000 1.000 N NA
 5878049 5878050 EC55989_0074 EC55989_0075 ilvI ilvH TRUE 0.998 3.000 0.371 0.002 Y NA
 5878050 5878051 EC55989_0075 EC55989_0076 ilvH fruR FALSE 0.038 180.000 0.063 1.000 N NA
 5878051 5878052 EC55989_0076 EC55989_0077 fruR mraZ FALSE 0.005 602.000 0.000 NA   NA
 5878052 5878053 EC55989_0077 EC55989_0078 mraZ mraW TRUE 0.993 2.000 0.635 NA   NA
 5878053 5878054 EC55989_0078 EC55989_0079 mraW ftsL TRUE 0.965 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5878054 5878055 EC55989_0079 EC55989_0080 ftsL ftsI TRUE 0.882 16.000 0.124 1.000 N NA
 5878055 5878056 EC55989_0080 EC55989_0081 ftsI murE TRUE 0.949 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 5878056 5878057 EC55989_0081 EC55989_0082 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 5878057 5878058 EC55989_0082 EC55989_0083 murF mraY TRUE 0.995 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 5878058 5878059 EC55989_0083 EC55989_0084 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.004 Y NA
 5878059 5878060 EC55989_0084 EC55989_0085 murD ftsW TRUE 0.990 0.000 0.297 0.003 N NA
 5878060 5878061 EC55989_0085 EC55989_0086 ftsW murG TRUE 0.991 -3.000 0.647 1.000 N NA
 5878061 5878062 EC55989_0086 EC55989_0087 murG murC TRUE 0.920 54.000 0.283 1.000 Y NA
 5878062 5878063 EC55989_0087 EC55989_0088 murC ddlB TRUE 0.989 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 5878063 5878064 EC55989_0088 EC55989_0089 ddlB ftsQ TRUE 0.996 2.000 0.372 NA Y NA
 5878064 5878065 EC55989_0089 EC55989_0090 ftsQ ftsA TRUE 0.980 -3.000 0.389 NA N NA
 5878065 5878066 EC55989_0090 EC55989_0091 ftsA ftsZ TRUE 0.940 61.000 0.460 1.000 Y NA
 5878066 5878067 EC55989_0091 EC55989_0092 ftsZ lpxC FALSE 0.269 101.000 0.134 1.000 N NA
 5878067 5878068 EC55989_0092 EC55989_0093 lpxC secM FALSE 0.027 231.000 0.000 1.000   NA
 5878068 5878069 EC55989_0093 EC55989_0094 secM secA FALSE 0.397 62.000 0.065 1.000   NA
 5878069 5878070 EC55989_0094 EC55989_0095 secA mutT TRUE 0.503 60.000 0.168 1.000 N NA
 5878071 5878072 EC55989_0096 EC55989_0097 yacF coaE TRUE 0.952 0.000 0.110 NA   NA
 5878074 5878075 EC55989_0099 EC55989_0100 hofC hofB TRUE 0.992 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 5878075 5878076 EC55989_0100 EC55989_0101 hofB ppdD TRUE 0.996 10.000 0.556 NA Y NA
 5878076 5878077 EC55989_0101 EC55989_0102 ppdD nadC FALSE 0.007 203.000 0.015 NA N NA
 5878078 5878079 EC55989_0103 EC55989_0104 ampD ampE TRUE 0.994 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 5878083 5878084 EC55989_0107 EC55989_0108 aceE aceF TRUE 0.988 15.000 0.220 1.000 Y NA
 5878084 5878085 EC55989_0108 EC55989_0109 aceF lpd FALSE 0.235 325.000 0.463 1.000 Y NA
 5878087 5878088 EC55989_0111 EC55989_0112 acnB yacL FALSE 0.061 176.000 0.068 NA   NA
 5878089 5878090 EC55989_0113 EC55989_0114 speD speE TRUE 0.984 16.000 0.162 1.000 Y NA
 5878090 5878091 EC55989_0114 EC55989_0115 speE yacC TRUE 0.569 106.000 0.354 NA   NA
 5878096 5878097 EC55989_0120 EC55989_0122 yadG yadH TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.098 Y NA
 5878097 5878098 EC55989_0122 EC55989_0123 yadH yadI FALSE 0.100 105.000 0.037 1.000 N NA
 5878098 5878099 EC55989_0123 EC55989_0124 yadI yadE TRUE 0.878 64.000 0.222 1.000 Y NA
 5878102 5878103 EC55989_0127 EC55989_0128 panC panB TRUE 0.997 12.000 0.395 0.001 Y NA
 5878103 5878104 EC55989_0128 EC55989_0129 panB   FALSE 0.120 113.000 0.000 1.000 N NA
 5878104 5878105 EC55989_0129 EC55989_0130   yadK TRUE 0.660 53.000 0.000 0.011   NA
 5878105 5878106 EC55989_0130 EC55989_0131 yadK yadL TRUE 0.981 27.000 0.571 0.011   NA
 5878106 5878107 EC55989_0131 EC55989_0132 yadL yadM TRUE 0.992 15.000 0.571 0.011   NA
 5878107 5878108 EC55989_0132 EC55989_0133 yadM htrE TRUE 0.995 17.000 0.571 1.000 Y NA
 5878108 5878109 EC55989_0133 EC55989_0134 htrE ecpD TRUE 0.992 35.000 1.000 1.000 Y NA
 5878109 5878110 EC55989_0134 EC55989_0135 ecpD yadN TRUE 0.884 105.000 0.500 1.000 Y NA
 5878110 5878111 EC55989_0135 EC55989_0136 yadN folK FALSE 0.005 370.000 0.000 1.000 N NA
 5878111 5878112 EC55989_0136 EC55989_0137 folK pcnB TRUE 0.966 -3.000 0.234 1.000 N NA
 5878112 5878113 EC55989_0137 EC55989_0138 pcnB yadB TRUE 0.931 39.000 0.131 1.000 Y NA
 5878113 5878114 EC55989_0138 EC55989_0139 yadB dksA TRUE 0.811 37.000 0.231 1.000 N NA
 5878114 5878115 EC55989_0139 EC55989_0140 dksA sfsA FALSE 0.107 178.000 0.151 NA   NA
 5878115 5878116 EC55989_0140 EC55989_0141 sfsA ligT TRUE 0.832 15.000 0.045 NA   NA
 5878117 5878118 EC55989_0142 EC55989_0143 hrpB mrcB FALSE 0.067 196.000 0.158 1.000 N NA
 5878118 5878119 EC55989_0143 EC55989_0144 mrcB fhuA FALSE 0.018 220.000 0.000 1.000 N NA
 5878119 5878120 EC55989_0144 EC55989_0145 fhuA fhuC TRUE 0.888 51.000 0.156 1.000 Y NA
 5878120 5878121 EC55989_0145 EC55989_0146 fhuC fhuD TRUE 0.986 0.000 0.031 1.000 Y NA
 5878121 5878122 EC55989_0146 EC55989_0147 fhuD fhuB TRUE 0.985 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5878124 5878125 EC55989_0149 EC55989_0151 clcA yadR FALSE 0.194 82.000 0.031 NA   NA
 5878126 5878127 EC55989_0152 EC55989_0153 yadS btuF TRUE 0.814 38.000 0.213 NA   NA
 5878127 5878128 EC55989_0153 EC55989_0154 btuF pfs TRUE 0.793 -7.000 0.073 1.000 N NA
 5878129 5878130 EC55989_0155 EC55989_0156 dgt degP FALSE 0.142 130.000 0.101 1.000 N NA
 5878130 5878131 EC55989_0156 EC55989_0157 degP cdaR FALSE 0.056 155.000 0.080 NA N NA
 5878132 5878133 EC55989_0158 EC55989_0159 yaeH dapD FALSE 0.008 315.000 0.035 NA   NA
 5878133 5878134 EC55989_0159 EC55989_0160 dapD glnD TRUE 0.684 31.000 0.097 1.000 N NA
 5878134 5878135 EC55989_0160 EC55989_0161 glnD map TRUE 0.602 62.000 0.243 1.000 N NA
 5878135 5878136 EC55989_0161 EC55989_0162 map   TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5878137 5878138 EC55989_misc_RNA_7 EC55989_0163 t44 rpsB TRUE 0.723 27.000 0.000 NA   NA
 5878138 5878139 EC55989_0163 EC55989_0164 rpsB tsf TRUE 0.496 258.000 0.748 1.000 Y NA
 5878139 5878140 EC55989_0164 EC55989_0165 tsf pyrH FALSE 0.363 147.000 0.416 1.000 N NA
 5878140 5878141 EC55989_0165 EC55989_0166 pyrH frr FALSE 0.119 292.000 0.626 1.000 N NA
 5878141 5878142 EC55989_0166 EC55989_0167 frr dxr FALSE 0.113 92.000 0.032 1.000 N NA
 5878142 5878143 EC55989_0167 EC55989_0168 dxr ispU FALSE 0.207 186.000 0.025 1.000 Y NA
 5878143 5878144 EC55989_0168 EC55989_0169 ispU cdsA TRUE 0.994 13.000 0.400 1.000 Y NA
 5878144 5878145 EC55989_0169 EC55989_0170 cdsA yaeL TRUE 0.865 12.000 0.080 1.000 N NA
 5878145 5878146 EC55989_0170 EC55989_0171 yaeL yaeT TRUE 0.966 30.000 0.204 1.000 Y NA
 5878146 5878147 EC55989_0171 EC55989_0172 yaeT hlpA TRUE 0.802 122.000 0.354 1.000 Y NA
 5878147 5878148 EC55989_0172 EC55989_0173 hlpA lpxD TRUE 0.998 4.000 0.814 1.000 Y NA
 5878148 5878149 EC55989_0173 EC55989_0174 lpxD fabZ TRUE 0.765 105.000 0.796 1.000 N NA
 5878149 5878150 EC55989_0174 EC55989_0175 fabZ lpxA TRUE 0.994 4.000 0.850 1.000 N NA
 5878150 5878151 EC55989_0175 EC55989_0176 lpxA lpxB TRUE 0.996 0.000 0.289 1.000 Y NA
 5878151 5878152 EC55989_0176 EC55989_0177 lpxB rnhB TRUE 0.956 -3.000 0.186 1.000 N NA
 5878152 5878153 EC55989_0177 EC55989_0178 rnhB dnaE TRUE 0.929 37.000 0.104 1.000 Y NA
 5878153 5878154 EC55989_0178 EC55989_0179 dnaE accA TRUE 0.899 13.000 0.122 1.000 N NA
 5878154 5878155 EC55989_0179 EC55989_0180 accA ldcC FALSE 0.071 99.000 0.010 1.000 N NA
 5878155 5878156 EC55989_0180 EC55989_0181 ldcC yaeR TRUE 0.762 57.000 0.039 NA Y NA
 5878156 5878157 EC55989_0181 EC55989_0182 yaeR tilS FALSE 0.083 65.000 0.015 NA N NA
 5878158 5878159 EC55989_0183 EC55989_0184 rof yaeP TRUE 0.921 -7.000 0.179 NA   NA
 5878160 5878161 EC55989_0185 EC55989_0186 yaeQ yaeJ TRUE 0.901 -3.000 0.034 1.000   NA
 5878161 5878162 EC55989_0186 EC55989_0187 yaeJ nlpE TRUE 0.807 14.000 0.027 NA   NA
 5878162 5878163 EC55989_0187 EC55989_0189 nlpE   FALSE 0.010 250.000 0.000 NA N NA
 5878164 5878165 EC55989_0190 EC55989_0191 yaeF yaeF TRUE 0.493 -69.000 0.000 NA   NA
 5878165 5878166 EC55989_0191 EC55989_0192 yaeF proS TRUE 0.508 44.000 0.000 NA   NA
 5878166 5878167 EC55989_0192 EC55989_0193 proS yaeB FALSE 0.154 112.000 0.048 NA   NA
 5878167 5878168 EC55989_0193 EC55989_0194 yaeB rcsF TRUE 0.973 -3.000 0.247 NA   NA
 5878168 5878169 EC55989_0194 EC55989_0195 rcsF metQ TRUE 0.617 118.000 0.500 NA   NA
 5878169 5878170 EC55989_0195 EC55989_0196 metQ metI TRUE 0.981 40.000 0.411 0.059 Y NA
 5878170 5878171 EC55989_0196 EC55989_0197 metI metN TRUE 0.995 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 5878172 5878173 EC55989_0198 EC55989_16S_3 gmhB   FALSE 0.008 364.000 0.000 NA   NA
 5878173 5878174 EC55989_16S_3 EC55989_tRNA1     FALSE 0.306 69.000 0.000 NA   NA
 5878174 5878175 EC55989_tRNA1 EC55989_tRNA2     TRUE 0.523 43.000 0.000 NA   NA
 5878175 5878176 EC55989_tRNA2 EC55989_23S_3     FALSE 0.046 184.000 0.000 NA   NA
 5878176 5878177 EC55989_23S_3 EC55989_5S_4     FALSE 0.218 94.000 0.000 NA   NA
 5878177 5878178 EC55989_5S_4 EC55989_0204     FALSE 0.187 105.000 0.000 NA   NA
 5878178 5878179 EC55989_0204 EC55989_tRNA3     FALSE 0.319 -163.000 0.000 NA   NA
 5878179 5878180 EC55989_tRNA3 EC55989_0205   dkgB FALSE 0.068 162.000 0.000 NA   NA
 5878184 5878185 EC55989_0208 EC55989_0209 yafD yafE FALSE 0.282 78.000 0.066 NA   NA
 5878186 5878187 EC55989_0210 EC55989_0211 mltD gloB TRUE 0.618 72.000 0.233 1.000   NA
 5878190 5878191 EC55989_0214 EC55989_tRNA4 dnaQ   FALSE 0.120 133.000 0.000 NA   NA
 5878191 5878192 EC55989_tRNA4 EC55989_0216   yafT FALSE 0.010 327.000 0.000 NA   NA
 5878192 5878193 EC55989_0216 EC55989_misc_RNA_9 yafT C0067 FALSE 0.009 342.000 0.000 NA   NA
 5878194 5878195 EC55989_0217 EC55989_0218 yafU   TRUE 0.972 29.000 0.750 NA   NA
 5878195 5878196 EC55989_0218 EC55989_0219     TRUE 0.897 24.000 0.182 NA   NA
 5878196 5878197 EC55989_0219 EC55989_0220     TRUE 0.801 -79.000 0.312 NA   NA
 5878197 5878198 EC55989_0220 EC55989_0221     TRUE 0.986 19.000 0.750 NA   NA
 5878198 5878199 EC55989_0221 EC55989_0222     TRUE 0.938 -61.000 0.711 NA   NA
 5878199 5878200 EC55989_0222 EC55989_0223     TRUE 0.887 -3.000 0.039 NA   NA
 5878200 5878201 EC55989_0223 EC55989_0224     TRUE 0.818 -105.000 0.471 NA   NA
 5878201 5878202 EC55989_0224 EC55989_0225     TRUE 0.992 5.000 0.673 NA   NA
 5878202 5878203 EC55989_0225 EC55989_0226     TRUE 0.994 3.000 0.765 NA   NA
 5878203 5878204 EC55989_0226 EC55989_0227     TRUE 0.995 -3.000 0.862 NA   NA
 5878204 5878205 EC55989_0227 EC55989_0228     TRUE 0.989 4.000 0.510 NA   NA
 5878205 5878206 EC55989_0228 EC55989_0229     TRUE 0.958 -42.000 0.863 NA   NA
 5878206 5878207 EC55989_0229 EC55989_0230     TRUE 0.990 4.000 0.552 NA   NA
 5878207 5878208 EC55989_0230 EC55989_0231     TRUE 0.991 7.000 0.627 NA   NA
 5878208 5878209 EC55989_0231 EC55989_0232     FALSE 0.338 51.000 0.030 NA   NA
 5878209 5878210 EC55989_0232 EC55989_0233     TRUE 0.546 35.000 0.034 NA   NA
 5878211 5878212 EC55989_0234 EC55989_0235     FALSE 0.136 127.000 0.000 NA   NA
 5878212 5878213 EC55989_0235 EC55989_0236     FALSE 0.030 210.000 0.000 NA   NA
 5878213 5878214 EC55989_0236 EC55989_0237     FALSE 0.271 76.000 0.000 NA   NA
 5878214 5878215 EC55989_0237 EC55989_0238   rhsE FALSE 0.317 -166.000 0.000 NA   NA
 5878215 5878216 EC55989_0238 EC55989_0239 rhsE ydcD TRUE 0.698 -16.000 0.000 NA   NA
 5878216 5878217 EC55989_0239 EC55989_0240 ydcD yncI FALSE 0.050 181.000 0.000 NA   NA
 5878217 5878218 EC55989_0240 EC55989_0241 yncI yncM TRUE 0.738 44.000 0.000 0.025   NA
 5878218 5878219 EC55989_0241 EC55989_0242 yncM yhhI FALSE 0.030 314.000 0.000 0.025   NA
 5878223 5878224 EC55989_0246 EC55989_0247 lpcA yafJ FALSE 0.116 206.000 0.229 1.000   NA
 5878225 5878226 EC55989_0248 EC55989_0249 yafK yafQ FALSE 0.073 156.000 0.000 NA   NA
 5878226 5878227 EC55989_0249 EC55989_0250 yafQ dinJ TRUE 0.963 3.000 0.167 NA   NA
 5878229 5878230 EC55989_0252 EC55989_0253     TRUE 0.945 -7.000 0.250 NA   NA
 5878230 5878231 EC55989_0253 EC55989_0254   fhiA FALSE 0.247 84.000 0.000 NA   NA
 5878232 5878233 EC55989_0255 EC55989_0256 mbhA dinB FALSE 0.222 71.000 0.000 1.000 N NA
 5878233 5878234 EC55989_0256 EC55989_0257 dinB yafP TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878236 5878237 EC55989_misc_RNA_10 EC55989_0259 RNAout   FALSE 0.007 386.000 0.000 NA   NA
 5878237 5878238 EC55989_0259 EC55989_0260   prfH TRUE 0.492 111.000 0.303 NA   NA
 5878240 5878241 EC55989_0262 EC55989_0263 gpt frsA FALSE 0.190 92.000 0.040 NA   NA
 5878241 5878242 EC55989_0263 EC55989_0264 frsA crl FALSE 0.333 58.000 0.048 NA   NA
 5878244 5878245 EC55989_0266 EC55989_0267 proB proA TRUE 0.989 12.000 0.026 0.001 Y NA
 5878245 5878246 EC55989_0267 EC55989_tRNA5 proA   FALSE 0.163 115.000 0.000 NA   NA
 5878246 5878247 EC55989_tRNA5 EC55989_0268     FALSE 0.063 167.000 0.000 NA   NA
 5878247 5878248 EC55989_0268 EC55989_0269     FALSE 0.146 123.000 0.000 NA   NA
 5878248 5878249 EC55989_0269 EC55989_0270     FALSE 0.039 195.000 0.000 NA   NA
 5878249 5878250 EC55989_0270 EC55989_0271     TRUE 0.720 79.000 0.087 NA Y NA
 5878250 5878251 EC55989_0271 EC55989_0272     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5878253 5878254 EC55989_0274 EC55989_0275     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5878254 5878255 EC55989_0275 EC55989_0276     TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5878255 5878256 EC55989_0276 EC55989_0277     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878256 5878257 EC55989_0277 EC55989_0278     FALSE 0.006 459.000 0.000 NA   NA
 5878257 5878258 EC55989_0278 EC55989_0279     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878258 5878259 EC55989_0279 EC55989_0280     FALSE 0.113 135.000 0.000 NA   NA
 5878259 5878260 EC55989_0280 EC55989_0281     FALSE 0.324 65.000 0.000 NA   NA
 5878260 5878261 EC55989_0281 EC55989_0283     FALSE 0.006 443.000 0.000 NA   NA
 5878261 5878262 EC55989_0283 EC55989_0284     FALSE 0.250 82.000 0.000 NA   NA
 5878262 5878263 EC55989_0284 EC55989_0285     FALSE 0.005 604.000 0.000 NA   NA
 5878263 5878264 EC55989_0285 EC55989_0286     TRUE 0.977 -7.000 0.519 NA   NA
 5878265 5878266 EC55989_0287 EC55989_0288 yagP yagQ TRUE 0.653 -21.000 0.000 NA   NA
 5878266 5878267 EC55989_0288 EC55989_0289 yagQ yagR TRUE 0.894 10.000 0.111 NA N NA
 5878267 5878268 EC55989_0289 EC55989_0290 yagR yagS TRUE 0.999 -3.000 0.917 0.001 Y NA
 5878268 5878269 EC55989_0290 EC55989_0291 yagS yagT TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.052 Y NA
 5878271 5878272 EC55989_0293 EC55989_0294 yagV yagW TRUE 0.938 -31.000 0.571 NA   NA
 5878272 5878273 EC55989_0294 EC55989_0295 yagW yagX TRUE 0.959 -10.000 0.429 NA   NA
 5878273 5878274 EC55989_0295 EC55989_0296 yagX yagY TRUE 0.930 26.000 0.308 NA   NA
 5878274 5878275 EC55989_0296 EC55989_0297 yagY ecpA TRUE 0.783 58.000 0.385 NA   NA
 5878275 5878276 EC55989_0297 EC55989_0298 ecpA ykgK TRUE 0.717 75.000 0.400 NA   NA
 5878280 5878281 EC55989_0303 EC55989_0304 ykgA ykgB FALSE 0.005 557.000 0.000 NA   NA
 5878281 5878282 EC55989_0304 EC55989_0305 ykgB ykgI TRUE 0.857 12.000 0.043 NA   NA
 5878282 5878283 EC55989_0305 EC55989_0306 ykgI ykgC TRUE 0.741 109.000 0.667 NA   NA
 5878284 5878285 EC55989_0307 EC55989_0308 ykgD ykgE FALSE 0.003 527.000 0.000 NA N NA
 5878285 5878286 EC55989_0308 EC55989_0309 ykgE ykgF TRUE 0.992 11.000 0.286 NA Y NA
 5878286 5878287 EC55989_0309 EC55989_0310 ykgF ykgG TRUE 0.980 -7.000 0.286 0.001   NA
 5878288 5878289 EC55989_0311 EC55989_0312   ykgH TRUE 0.614 -25.000 0.000 NA   NA
 5878289 5878290 EC55989_0312 EC55989_0313 ykgH betA FALSE 0.029 213.000 0.000 NA   NA
 5878290 5878291 EC55989_0313 EC55989_0314 betA betB TRUE 0.985 14.000 0.634 1.000 N NA
 5878291 5878292 EC55989_0314 EC55989_0315 betB betI TRUE 0.976 14.000 0.459 1.000 N NA
 5878293 5878294 EC55989_0316 EC55989_0317 betT   FALSE 0.036 507.000 0.000 1.000 Y NA
 5878294 5878295 EC55989_0317 EC55989_0318   yahA FALSE 0.070 142.000 0.000 1.000 N NA
 5878296 5878297 EC55989_0319 EC55989_0320 yahB yahC FALSE 0.226 92.000 0.000 NA   NA
 5878298 5878299 EC55989_0321 EC55989_0322 yahD yahE TRUE 0.946 40.000 0.667 NA   NA
 5878299 5878300 EC55989_0322 EC55989_0323 yahE yahF TRUE 0.959 -10.000 0.429 NA   NA
 5878300 5878301 EC55989_0323 EC55989_0324 yahF yahG TRUE 0.994 0.000 0.714 NA   NA
 5878301 5878302 EC55989_0324 EC55989_0325 yahG yahI FALSE 0.164 143.000 0.125 NA   NA
 5878302 5878303 EC55989_0325 EC55989_0326 yahI yahJ TRUE 0.965 10.000 0.278 1.000 N NA
 5878303 5878304 EC55989_0326 EC55989_0327 yahJ   FALSE 0.015 269.000 0.000 NA   NA
 5878304 5878305 EC55989_0327 EC55989_0328     FALSE 0.019 251.000 0.000 NA   NA
 5878305 5878306 EC55989_0328 EC55989_0329     TRUE 0.984 34.000 0.571 NA Y NA
 5878306 5878307 EC55989_0329 EC55989_0330     TRUE 0.995 -7.000 0.667 1.000 Y NA
 5878307 5878308 EC55989_0330 EC55989_0331     TRUE 0.994 -33.000 1.000 0.058 Y NA
 5878308 5878309 EC55989_0331 EC55989_0332   yahK FALSE 0.273 87.000 0.000 1.000   NA
 5878309 5878310 EC55989_0332 EC55989_0333 yahK yahL FALSE 0.021 243.000 0.000 NA   NA
 5878310 5878311 EC55989_0333 EC55989_tRNA6 yahL   FALSE 0.009 342.000 0.000 NA   NA
 5878311 5878312 EC55989_tRNA6 EC55989_0334   yahM TRUE 0.764 -10.000 0.000 NA   NA
 5878316 5878317 EC55989_0338 EC55989_0339 prpB prpC TRUE 0.883 45.000 0.502 1.000 N NA
 5878317 5878318 EC55989_0339 EC55989_0340 prpC prpD TRUE 0.858 34.000 0.216 1.000   NA
 5878318 5878319 EC55989_0340 EC55989_0341 prpD prpE TRUE 0.811 40.000 0.038 0.001   NA
 5878319 5878320 EC55989_0341 EC55989_0342 prpE   FALSE 0.004 463.000 0.000 1.000 N NA
 5878320 5878321 EC55989_0342 EC55989_0343   codB FALSE 0.011 262.000 0.000 1.000 N NA
 5878321 5878322 EC55989_0343 EC55989_0344 codB codA TRUE 0.981 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 5878324 5878325 EC55989_0346 EC55989_0347 cynT cynS TRUE 0.936 31.000 0.075 1.000 Y NA
 5878325 5878326 EC55989_0347 EC55989_0348 cynS cynX TRUE 0.923 33.000 0.000 1.000 Y NA
 5878327 5878328 EC55989_0349 EC55989_0350 lacA lacY TRUE 0.634 66.000 0.222 1.000   NA
 5878328 5878329 EC55989_0350 EC55989_0351 lacY lacZ TRUE 0.751 52.000 0.261 1.000   NA
 5878329 5878330 EC55989_0351 EC55989_0352 lacZ lacI FALSE 0.253 123.000 0.174 1.000 N NA
 5878330 5878331 EC55989_0352 EC55989_0353 lacI mhpR TRUE 0.800 77.000 0.000 0.052 Y NA
 5878332 5878333 EC55989_0354 EC55989_0355 mhpA mhpB TRUE 0.992 2.000 0.333 0.005   NA
 5878333 5878334 EC55989_0355 EC55989_0356 mhpB mhpC TRUE 0.982 3.000 0.300 1.000   NA
 5878334 5878335 EC55989_0356 EC55989_0357 mhpC mhpD TRUE 0.976 10.000 0.300 1.000   NA
 5878335 5878336 EC55989_0357 EC55989_0358 mhpD mhpF TRUE 0.997 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 5878336 5878337 EC55989_0358 EC55989_0359 mhpF mhpE TRUE 0.992 -3.000 0.750 1.000 N NA
 5878337 5878338 EC55989_0359 EC55989_0360 mhpE mhpT FALSE 0.356 176.000 0.600 1.000 N NA
 5878338 5878339 EC55989_0360 EC55989_0361 mhpT yaiL FALSE 0.194 102.000 0.000 NA   NA
 5878339 5878340 EC55989_0361 EC55989_0363 yaiL   FALSE 0.019 250.000 0.000 NA   NA
 5878341 5878342 EC55989_0364 EC55989_0365 frmB frmA TRUE 0.618 93.000 0.327 1.000   NA
 5878342 5878343 EC55989_0365 EC55989_0366 frmA frmR TRUE 0.939 35.000 0.531 NA   NA
 5878343 5878344 EC55989_0366 EC55989_0368 frmR yaiO FALSE 0.044 186.000 0.000 NA   NA
 5878344 5878345 EC55989_0368 EC55989_0369 yaiO yaiX TRUE 0.920 2.000 0.000 NA   NA
 5878345 5878346 EC55989_0369 EC55989_0370 yaiX yaiP TRUE 0.602 -151.000 0.214 NA   NA
 5878346 5878347 EC55989_0370 EC55989_0371 yaiP yaiS TRUE 0.962 10.000 0.214 NA   NA
 5878348 5878349 EC55989_0372 EC55989_0373 tauA tauB TRUE 0.977 13.000 0.047 1.000 Y NA
 5878349 5878350 EC55989_0373 EC55989_0374 tauB tauC TRUE 0.998 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 5878350 5878351 EC55989_0374 EC55989_0375 tauC tauD TRUE 0.961 -3.000 0.214 1.000 N NA
 5878353 5878354 EC55989_0378 EC55989_0379   yaiV TRUE 0.936 43.000 0.667 NA   NA
 5878356 5878357 EC55989_0381 EC55989_0382   sbmA TRUE 0.814 20.000 0.000 NA   NA
 5878357 5878358 EC55989_0382 EC55989_0383 sbmA yaiW TRUE 0.867 13.000 0.000 NA   NA
 5878362 5878363 EC55989_0387 EC55989_0388   yaiB FALSE 0.049 182.000 0.000 NA   NA
 5878363 5878364 EC55989_0388 EC55989_0389 yaiB phoA TRUE 0.647 32.000 0.000 NA   NA
 5878365 5878366 EC55989_0390 EC55989_0391 insB insA TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.030 Y NA
 5878367 5878368 EC55989_0392 EC55989_0393 phoA psiF FALSE 0.153 119.000 0.000 NA   NA
 5878368 5878369 EC55989_0393 EC55989_0394 psiF yaiC TRUE 0.476 102.000 0.250 NA   NA
 5878371 5878372 EC55989_0396 EC55989_0397 yaiI aroL FALSE 0.027 183.000 0.007 NA   NA
 5878372 5878373 EC55989_0397 EC55989_0398 aroL yaiA FALSE 0.392 50.000 0.044 NA   NA
 5878373 5878374 EC55989_0398 EC55989_0399 yaiA aroM FALSE 0.017 258.000 0.000 NA   NA
 5878374 5878375 EC55989_0399 EC55989_0400 aroM yaiE FALSE 0.270 72.000 0.049 NA   NA
 5878375 5878376 EC55989_0400 EC55989_0401 yaiE   FALSE 0.017 261.000 0.000 NA   NA
 5878379 5878380 EC55989_0404 EC55989_0405 araJ sbcC FALSE 0.045 126.000 0.030 NA N NA
 5878380 5878381 EC55989_0405 EC55989_0406 sbcC sbcD TRUE 0.992 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 5878382 5878383 EC55989_0407 EC55989_0408 phoB phoR TRUE 0.960 58.000 0.453 0.084 Y NA
 5878385 5878386 EC55989_0410 EC55989_0411 brnQ proY TRUE 0.926 76.000 0.348 0.089 Y NA
 5878386 5878387 EC55989_0411 EC55989_0412 proY malZ FALSE 0.097 156.000 0.123 1.000 N NA
 5878389 5878390 EC55989_0414 EC55989_0415 queA tgt TRUE 0.966 56.000 0.360 0.001 Y NA
 5878390 5878391 EC55989_0415 EC55989_0416 tgt yajC TRUE 0.931 23.000 0.325 NA N NA
 5878391 5878392 EC55989_0416 EC55989_0417 yajC secD TRUE 0.932 28.000 0.045 NA Y NA
 5878392 5878393 EC55989_0417 EC55989_0418 secD secF TRUE 0.995 11.000 0.206 0.001 Y NA
 5878393 5878394 EC55989_0418 EC55989_0419 secF yajD FALSE 0.100 129.000 0.015 1.000   NA
 5878395 5878396 EC55989_0420 EC55989_0421 tsx yajI FALSE 0.012 299.000 0.000 NA   NA
 5878396 5878397 EC55989_0421 EC55989_0422 yajI   TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5878398 5878399 EC55989_0423 EC55989_0424 nrdR ribD TRUE 0.968 4.000 0.277 NA N NA
 5878399 5878400 EC55989_0424 EC55989_0425 ribD ribE TRUE 0.800 89.000 0.034 0.001 Y NA
 5878400 5878401 EC55989_0425 EC55989_0426 ribE nusB TRUE 0.954 20.000 0.347 1.000 N NA
 5878401 5878402 EC55989_0426 EC55989_0427 nusB thiL TRUE 0.494 78.000 0.225 1.000 N NA
 5878402 5878403 EC55989_0427 EC55989_0428 thiL pgpA TRUE 0.810 -22.000 0.206 1.000 N NA
 5878404 5878405 EC55989_0429 EC55989_0430 yajO dxs FALSE 0.155 55.000 0.009 1.000 N NA
 5878405 5878406 EC55989_0430 EC55989_0431 dxs ispA TRUE 0.955 25.000 0.060 1.000 Y NA
 5878406 5878407 EC55989_0431 EC55989_0432 ispA xseB TRUE 0.849 0.000 0.035 1.000 N NA
 5878409 5878410 EC55989_0435 EC55989_0436 yajL panE TRUE 0.740 -37.000 0.155 NA   NA
 5878414 5878415 EC55989_0440 EC55989_0441     TRUE 0.735 -16.000 0.000 1.000   NA
 5878415 5878416 EC55989_0441 EC55989_0442   cyoE FALSE 0.178 119.000 0.000 1.000   NA
 5878416 5878417 EC55989_0442 EC55989_0443 cyoE cyoD TRUE 0.947 12.000 0.118 0.089 N NA
 5878417 5878418 EC55989_0443 EC55989_0444 cyoD cyoC TRUE 0.998 0.000 0.485 0.051 Y NA
 5878418 5878419 EC55989_0444 EC55989_0445 cyoC cyoB TRUE 0.996 -10.000 0.697 0.051 Y NA
 5878419 5878420 EC55989_0445 EC55989_0446 cyoB cyoA TRUE 0.979 22.000 0.041 0.004 Y NA
 5878420 5878421 EC55989_0446 EC55989_0447 cyoA ampG FALSE 0.006 460.000 0.000 NA   NA
 5878421 5878422 EC55989_0447 EC55989_0448 ampG yajG TRUE 0.799 44.000 0.256 NA   NA
 5878423 5878424 EC55989_0449 EC55989_0450 bolA tig FALSE 0.005 344.000 0.000 NA N NA
 5878424 5878425 EC55989_0450 EC55989_0451 tig clpP FALSE 0.319 246.000 0.351 1.000 Y NA
 5878425 5878426 EC55989_0451 EC55989_0452 clpP clpX TRUE 0.790 126.000 0.352 1.000 Y NA
 5878428 5878429 EC55989_0453 EC55989_0454 lon hupB FALSE 0.021 209.000 0.000 1.000 N NA
 5878429 5878430 EC55989_0454 EC55989_0455 hupB ppiD FALSE 0.029 192.000 0.000 1.000 N NA
 5878430 5878431 EC55989_0455 EC55989_0456 ppiD ybaV FALSE 0.037 151.000 0.033 1.000 N NA
 5878431 5878432 EC55989_0456 EC55989_0457 ybaV ybaW FALSE 0.192 94.000 0.027 1.000   NA
 5878433 5878434 EC55989_0458 EC55989_0459 queC ybaE FALSE 0.273 65.000 0.019 1.000   NA
 5878435 5878436 EC55989_0460 EC55989_0461 cof ybaO FALSE 0.406 -75.000 0.020 1.000   NA
 5878436 5878437 EC55989_0461 EC55989_0462 ybaO mdlA TRUE 0.812 30.000 0.179 1.000 N NA
 5878437 5878438 EC55989_0462 EC55989_0463 mdlA mdlB TRUE 0.998 -7.000 0.911 0.005 Y NA
 5878438 5878439 EC55989_0463 EC55989_0464 mdlB glnK FALSE 0.021 181.000 0.028 1.000 N NA
 5878439 5878440 EC55989_0464 EC55989_0465 glnK amtB TRUE 0.787 30.000 0.156 1.000 N NA
 5878444 5878445 EC55989_misc_RNA_12 EC55989_0469 ffs ybaA FALSE 0.175 110.000 0.000 NA   NA
 5878446 5878447 EC55989_0470 EC55989_0471 ylaB ylaC FALSE 0.066 164.000 0.000 NA   NA
 5878447 5878448 EC55989_0471 EC55989_0472 ylaC maa FALSE 0.255 116.000 0.101 1.000   NA
 5878448 5878449 EC55989_0472 EC55989_0473 maa hha FALSE 0.059 171.000 0.000 NA   NA
 5878449 5878450 EC55989_0473 EC55989_0474 hha ybaJ FALSE 0.295 -220.000 0.000 NA   NA
 5878450 5878451 EC55989_0474 EC55989_0475 ybaJ acrB FALSE 0.005 546.000 0.000 NA   NA
 5878451 5878452 EC55989_0475 EC55989_0476 acrB acrA TRUE 0.959 23.000 0.458 1.000 N NA
 5878453 5878454 EC55989_0477 EC55989_0478 acrR kefA FALSE 0.074 128.000 0.000 NA N NA
 5878455 5878456 EC55989_0479 EC55989_0480 ybaM priC TRUE 0.980 14.000 0.474 NA   NA
 5878457 5878458 EC55989_0481 EC55989_0482 ybaN apt FALSE 0.064 153.000 0.043 NA   NA
 5878458 5878459 EC55989_0482 EC55989_0483 apt dnaX FALSE 0.130 129.000 0.088 1.000 N NA
 5878459 5878460 EC55989_0483 EC55989_0484 dnaX ybaB TRUE 0.820 53.000 0.411 NA   NA
 5878460 5878461 EC55989_0484 EC55989_0485 ybaB recR TRUE 0.993 0.000 0.604 NA   NA
 5878461 5878462 EC55989_0485 EC55989_0486 recR htpG FALSE 0.080 110.000 0.028 1.000 N NA
 5878462 5878463 EC55989_0486 EC55989_0487 htpG adk FALSE 0.062 181.000 0.035 0.094 N NA
 5878463 5878464 EC55989_0487 EC55989_0488 adk hemH FALSE 0.007 236.000 0.013 1.000 N NA
 5878467 5878468 EC55989_0491 EC55989_0492 ybaL fsr FALSE 0.011 238.000 0.000 NA N NA
 5878470 5878471 EC55989_misc_RNA_13 EC55989_0494 rybC ybaK FALSE 0.244 85.000 0.000 NA   NA
 5878476 5878477 EC55989_0498 EC55989_0499 ybaS ybaT TRUE 0.984 3.000 0.028 1.000 Y NA
 5878477 5878478 EC55989_0499 EC55989_0500 ybaT cueR FALSE 0.101 125.000 0.000 1.000 N NA
 5878479 5878480 EC55989_0501 EC55989_0502 ybbJ ybbK TRUE 0.996 0.000 0.313 NA Y NA
 5878481 5878482 EC55989_0503 EC55989_0504 ybbL ybbM TRUE 0.833 -13.000 0.127 NA   NA
 5878483 5878484 EC55989_0505 EC55989_0506 ybbN ybbO TRUE 0.510 61.000 0.118 1.000   NA
 5878484 5878485 EC55989_0506 EC55989_0507 ybbO tesA TRUE 0.819 -10.000 0.072 1.000   NA
 5878486 5878487 EC55989_0508 EC55989_0509 ybbA ybbP TRUE 0.997 -3.000 0.535 NA Y NA
 5878487 5878488 EC55989_0509 EC55989_0510 ybbP rhsD FALSE 0.003 430.000 0.000 NA N NA
 5878488 5878489 EC55989_0510 EC55989_0511 rhsD insA TRUE 0.470 34.000 0.000 NA N NA
 5878489 5878490 EC55989_0511 EC55989_0512 insA insB TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.029 Y NA
 5878490 5878491 EC55989_0512 EC55989_0513 insB ybbC FALSE 0.182 107.000 0.000 NA   NA
 5878491 5878492 EC55989_0513 EC55989_0514 ybbC ylbH TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5878492 5878493 EC55989_0514 EC55989_0515 ylbH   TRUE 0.665 -19.000 0.000 NA   NA
 5878494 5878495 EC55989_0516 EC55989_0517     TRUE 0.729 -13.000 0.000 NA   NA
 5878495 5878496 EC55989_0517 EC55989_0518   ybbB FALSE 0.256 80.000 0.000 NA   NA
 5878496 5878497 EC55989_0518 EC55989_0519 ybbB ybbS FALSE 0.202 69.000 0.012 NA   NA
 5878498 5878499 EC55989_0520 EC55989_0521 allA allR TRUE 0.786 78.000 0.625 1.000 N NA
 5878499 5878500 EC55989_0521 EC55989_0522 allR gcl FALSE 0.258 90.000 0.054 1.000   NA
 5878500 5878501 EC55989_0522 EC55989_0523 gcl hyi TRUE 0.893 13.000 0.065 1.000   NA
 5878501 5878502 EC55989_0523 EC55989_0524 hyi glxR FALSE 0.300 100.000 0.154 1.000 N NA
 5878502 5878503 EC55989_0524 EC55989_0525 glxR ybbW FALSE 0.042 169.000 0.000 1.000 N NA
 5878503 5878504 EC55989_0525 EC55989_0526 ybbW allB TRUE 0.857 60.000 0.161 1.000 Y NA
 5878504 5878505 EC55989_0526 EC55989_0527 allB ybbY TRUE 0.867 57.000 0.161 1.000 Y NA
 5878505 5878506 EC55989_0527 EC55989_0528 ybbY glxK TRUE 0.850 22.000 0.133 1.000 N NA
 5878507 5878508 EC55989_0529 EC55989_0530 ylbA allC TRUE 0.887 11.000 0.059 NA   NA
 5878508 5878509 EC55989_0530 EC55989_0531 allC allD TRUE 0.883 22.000 0.174 1.000 N NA
 5878510 5878511 EC55989_0532 EC55989_0533 fdrA ylbE TRUE 0.982 10.000 0.412 NA   NA
 5878511 5878512 EC55989_0533 EC55989_0534 ylbE ylbF TRUE 0.968 11.000 0.265 NA   NA
 5878512 5878513 EC55989_0534 EC55989_0535 ylbF ybcF TRUE 0.984 -3.000 0.375 NA   NA
 5878514 5878515 EC55989_0536 EC55989_0537 purK purE TRUE 0.995 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 5878515 5878516 EC55989_0537 EC55989_0538 purE lpxH FALSE 0.123 118.000 0.016 1.000   NA
 5878516 5878517 EC55989_0538 EC55989_0539 lpxH ppiB TRUE 0.978 3.000 0.237 1.000   NA
 5878519 5878520 EC55989_0541 EC55989_0542 ybcI ybcJ FALSE 0.110 108.000 0.011 NA   NA
 5878520 5878521 EC55989_0542 EC55989_0543 ybcJ folD TRUE 0.931 2.000 0.055 1.000   NA
 5878522 5878523 EC55989_0544 EC55989_0545 sfmA sfmC FALSE 0.152 220.000 0.000 1.000 Y NA
 5878523 5878524 EC55989_0545 EC55989_0546 sfmC sfmD TRUE 0.993 31.000 0.875 1.000 Y NA
 5878524 5878525 EC55989_0546 EC55989_0547 sfmD sfmH TRUE 0.987 43.000 0.875 1.000 Y NA
 5878525 5878526 EC55989_0547 EC55989_0548 sfmH sfmF TRUE 0.999 11.000 0.875 0.011 Y NA
 5878529 5878530 EC55989_0550 EC55989_0551   envY TRUE 0.847 -6.000 0.000 NA   NA
 5878530 5878531 EC55989_0551 EC55989_0552 envY ybcH FALSE 0.048 183.000 0.000 NA   NA
 5878531 5878532 EC55989_0552 EC55989_0553 ybcH nfrA TRUE 0.990 1.000 0.500 NA   NA
 5878532 5878533 EC55989_0553 EC55989_0554 nfrA nfrB TRUE 0.875 -13.000 0.159 1.000   NA
 5878533 5878534 EC55989_0554 EC55989_0555 nfrB yhhI FALSE 0.010 269.000 0.000 1.000 N NA
 5878534 5878535 EC55989_0555 EC55989_0556 yhhI   FALSE 0.190 104.000 0.000 NA   NA
 5878535 5878536 EC55989_0556 EC55989_0557     FALSE 0.163 115.000 0.000 NA   NA
 5878536 5878537 EC55989_0557 EC55989_0558     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878537 5878538 EC55989_0558 EC55989_0559     TRUE 0.814 20.000 0.000 NA   NA
 5878538 5878539 EC55989_0559 EC55989_0560     TRUE 0.900 28.000 0.250 NA   NA
 5878539 5878540 EC55989_0560 EC55989_0561   cusS FALSE 0.004 737.000 0.000 NA   NA
 5878540 5878541 EC55989_0561 EC55989_0562 cusS cusR TRUE 0.993 -22.000 0.600 0.002 Y NA
 5878542 5878543 EC55989_0563 EC55989_0564 cusC cusF TRUE 0.967 24.000 0.500 NA   NA
 5878543 5878544 EC55989_0564 EC55989_0565 cusF cusB TRUE 0.843 16.000 0.000 NA   NA
 5878544 5878545 EC55989_0565 EC55989_0566 cusB cusA TRUE 0.981 12.000 0.500 1.000 N NA
 5878545 5878546 EC55989_0566 EC55989_0567 cusA pheP FALSE 0.277 102.000 0.000 0.088 N NA
 5878547 5878548 EC55989_0568 EC55989_0569 ybdG nfnB FALSE 0.037 108.000 0.012 NA N NA
 5878548 5878549 EC55989_0569 EC55989_0570 nfnB ybdF TRUE 0.709 94.000 0.500 NA   NA
 5878549 5878550 EC55989_0570 EC55989_0571 ybdF ybdJ FALSE 0.324 65.000 0.000 NA   NA
 5878550 5878551 EC55989_0571 EC55989_0572 ybdJ ybdK FALSE 0.318 66.000 0.000 NA   NA
 5878553 5878554 EC55989_0574 EC55989_0575 entD fepA FALSE 0.458 166.000 0.700 1.000 N NA
 5878555 5878556 EC55989_0576 EC55989_0577 fes ybdZ TRUE 0.982 3.000 0.320 NA   NA
 5878556 5878557 EC55989_0577 EC55989_0578 ybdZ entF TRUE 0.926 -3.000 0.080 NA   NA
 5878557 5878558 EC55989_0578 EC55989_0579 entF fepE FALSE 0.019 216.000 0.000 1.000 N NA
 5878559 5878560 EC55989_0580 EC55989_0581 fepC fepG TRUE 0.984 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 5878560 5878561 EC55989_0581 EC55989_0582 fepG fepD TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.056 Y NA
 5878564 5878565 EC55989_0585 EC55989_0586 entC entE TRUE 0.997 10.000 0.667 1.000 Y NA
 5878565 5878566 EC55989_0586 EC55989_0587 entE entB TRUE 0.997 14.000 0.667 1.000 Y NA
 5878566 5878567 EC55989_0587 EC55989_0588 entB entA TRUE 0.986 0.000 0.024 1.000 Y NA
 5878567 5878568 EC55989_0588 EC55989_0589 entA ybdB TRUE 0.986 3.000 0.065 NA Y NA
 5878568 5878569 EC55989_0589 EC55989_0590 ybdB cstA FALSE 0.110 181.000 0.222 NA N NA
 5878569 5878570 EC55989_0590 EC55989_0591 cstA ybdD FALSE 0.214 182.000 0.333 NA   NA
 5878573 5878574 EC55989_0594 EC55989_0595 ibrB ibrA TRUE 0.643 -27.000 0.000 1.000   NA
 5878574 5878575 EC55989_0595 EC55989_0596 ibrA ybdO FALSE 0.365 147.000 0.333 1.000   NA
 5878575 5878576 EC55989_0596 EC55989_0597 ybdO dsbG FALSE 0.024 209.000 0.067 1.000 N NA
 5878577 5878578 EC55989_0598 EC55989_0599 ahpC ahpF TRUE 0.918 129.000 0.551 0.001 Y NA
 5878581 5878582 EC55989_0602 EC55989_0603 rnk rna FALSE 0.008 230.000 0.018 1.000 N NA
 5878582 5878583 EC55989_0603 EC55989_0604 rna citT FALSE 0.070 114.000 0.024 1.000 N NA
 5878583 5878584 EC55989_0604 EC55989_0605 citT citG TRUE 0.618 51.000 0.194 1.000 N NA
 5878584 5878585 EC55989_0605 EC55989_0606 citG citX TRUE 0.976 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 5878585 5878586 EC55989_0606 EC55989_0607 citX citF TRUE 0.872 4.000 0.000 1.000 N NA
 5878586 5878587 EC55989_0607 EC55989_0608 citF citE TRUE 0.954 11.000 0.000 0.001 N NA
 5878587 5878588 EC55989_0608 EC55989_0609 citE citD TRUE 0.994 -3.000 0.537 0.001 N NA
 5878588 5878589 EC55989_0609 EC55989_0610 citD citC TRUE 0.975 15.000 0.000 1.000 Y NA
 5878590 5878591 EC55989_0611 EC55989_0612 citA citB TRUE 0.906 -31.000 0.000 1.000 Y NA
 5878593 5878594 EC55989_0615 EC55989_0616 crcA cspE FALSE 0.256 175.000 0.333 1.000   NA
 5878596 5878597 EC55989_0618 EC55989_0619 ybeM tatE FALSE 0.320 129.000 0.196 1.000   NA
 5878598 5878599 EC55989_0620 EC55989_0621 lipA ybeF FALSE 0.009 209.000 0.005 1.000 N NA
 5878599 5878600 EC55989_0621 EC55989_0622 ybeF lipB FALSE 0.012 259.000 0.000 1.000 N NA
 5878600 5878601 EC55989_0622 EC55989_0623 lipB ybeD FALSE 0.441 101.000 0.219 NA   NA
 5878601 5878602 EC55989_0623 EC55989_0624 ybeD dacA FALSE 0.212 111.000 0.081 NA   NA
 5878602 5878603 EC55989_0624 EC55989_0625 dacA rlpA TRUE 0.774 139.000 0.475 NA Y NA
 5878603 5878604 EC55989_0625 EC55989_0626 rlpA mrdB TRUE 0.712 11.000 0.035 NA N NA
 5878604 5878605 EC55989_0626 EC55989_0627 mrdB mrdA TRUE 0.861 3.000 0.046 1.000 N NA
 5878605 5878606 EC55989_0627 EC55989_0628 mrdA ybeA TRUE 0.582 31.000 0.031 NA   NA
 5878606 5878607 EC55989_0628 EC55989_0629 ybeA ybeB TRUE 0.979 4.000 0.307 NA   NA
 5878607 5878608 EC55989_0629 EC55989_0630 ybeB phpB FALSE 0.017 261.000 0.000 NA   NA
 5878608 5878609 EC55989_0630 EC55989_0631 phpB nadD TRUE 0.692 24.000 0.057 1.000 N NA
 5878609 5878610 EC55989_0631 EC55989_0632 nadD holA TRUE 0.865 2.000 0.045 1.000 N NA
 5878610 5878611 EC55989_0632 EC55989_0633 holA rlpB TRUE 0.961 0.000 0.199 NA N NA
 5878611 5878612 EC55989_0633 EC55989_0634 rlpB leuS TRUE 0.914 15.000 0.182 NA N NA
 5878615 5878616 EC55989_0637 EC55989_0638 ybeR djlB TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878618 5878619 EC55989_0640 EC55989_0641 ybeU djlC TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878620 5878621 EC55989_0642 EC55989_misc_RNA_15 hscC RNAout TRUE 0.786 -9.000 0.000 NA   NA
 5878623 5878624 EC55989_0644 EC55989_0645 hscC rihA FALSE 0.247 84.000 0.000 NA   NA
 5878624 5878625 EC55989_0645 EC55989_0646 rihA gltL FALSE 0.268 118.000 0.195 NA N NA
 5878625 5878626 EC55989_0646 EC55989_0647 gltL gltK TRUE 0.997 0.000 0.379 1.000 Y NA
 5878626 5878627 EC55989_0647 EC55989_0648 gltK gltJ TRUE 0.999 0.000 0.933 0.017 Y NA
 5878627 5878628 EC55989_0648 EC55989_misc_RNA_16 gltJ   TRUE 0.876 12.000 0.000 NA   NA
 5878628 5878629 EC55989_misc_RNA_16 EC55989_0649   gltI TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 5878630 5878631 EC55989_0650 EC55989_0651     TRUE 0.852 15.000 0.000 NA   NA
 5878632 5878633 EC55989_0652 EC55989_0653 lnt ybeX TRUE 0.963 25.000 0.557 1.000 N NA
 5878633 5878634 EC55989_0653 EC55989_0654 ybeX ybeY FALSE 0.392 90.000 0.150 NA   NA
 5878634 5878635 EC55989_0654 EC55989_0655 ybeY ybeZ TRUE 0.987 -3.000 0.457 NA   NA
 5878635 5878636 EC55989_0655 EC55989_0656 ybeZ miaB FALSE 0.342 114.000 0.220 1.000 N NA
 5878638 5878639 EC55989_tRNA94 EC55989_tRNA93     TRUE 0.587 38.000 0.000 NA   NA
 5878639 5878640 EC55989_tRNA93 EC55989_tRNA92     FALSE 0.442 49.000 0.000 NA   NA
 5878640 5878641 EC55989_tRNA92 EC55989_tRNA91     TRUE 0.843 16.000 0.000 NA   NA
 5878641 5878642 EC55989_tRNA91 EC55989_tRNA90     TRUE 0.619 35.000 0.000 NA   NA
 5878642 5878643 EC55989_tRNA90 EC55989_tRNA89     TRUE 0.768 24.000 0.000 NA   NA
 5878643 5878644 EC55989_tRNA89 EC55989_tRNA88     TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 5878644 5878645 EC55989_tRNA88 EC55989_0660   asnB FALSE 0.007 381.000 0.000 NA   NA
 5878645 5878646 EC55989_0660 EC55989_0661 asnB nagD FALSE 0.012 257.000 0.000 1.000 N NA
 5878646 5878647 EC55989_0661 EC55989_0662 nagD nagC TRUE 0.860 48.000 0.070 1.000 Y NA
 5878647 5878648 EC55989_0662 EC55989_0663 nagC nagA TRUE 0.997 9.000 0.571 1.000 Y NA
 5878648 5878649 EC55989_0663 EC55989_0664 nagA nagB TRUE 0.976 60.000 0.557 0.001 Y NA
 5878650 5878651 EC55989_0665 EC55989_0666 nagE glnS FALSE 0.010 203.000 0.006 1.000 N NA
 5878651 5878652 EC55989_0666 EC55989_0667 glnS ybfM FALSE 0.007 446.000 0.000 1.000   NA
 5878652 5878653 EC55989_0667 EC55989_0668 ybfM ybfN FALSE 0.430 50.000 0.000 NA   NA
 5878656 5878657 EC55989_0671 EC55989_0672 fldA ybfE TRUE 0.507 140.000 0.473 1.000   NA
 5878657 5878658 EC55989_0672 EC55989_0673 ybfE ybfF FALSE 0.323 140.000 0.276 NA   NA
 5878659 5878660 EC55989_0674 EC55989_0675 seqA pgm TRUE 0.825 26.000 0.151 1.000 N NA
 5878661 5878662 EC55989_0676 EC55989_0677 potE speF TRUE 0.988 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 5878662 5878663 EC55989_0677 EC55989_0678 speF kdpE FALSE 0.003 690.000 0.000 1.000 N NA
 5878663 5878664 EC55989_0678 EC55989_0679 kdpE kdpD TRUE 0.996 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 5878664 5878665 EC55989_0679 EC55989_0680 kdpD kdpC TRUE 0.837 -7.000 0.100 1.000 N NA
 5878665 5878666 EC55989_0680 EC55989_0681 kdpC kdpB TRUE 0.999 9.000 0.877 0.001 Y NA
 5878666 5878667 EC55989_0681 EC55989_0682 kdpB kdpA TRUE 0.990 23.000 0.201 0.001 Y NA
 5878668 5878669 EC55989_0683 EC55989_0684 ybfA rhsC FALSE 0.021 243.000 0.000 NA   NA
 5878669 5878670 EC55989_0684 EC55989_0685 rhsC ybfB TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5878670 5878671 EC55989_0685 EC55989_0686 ybfB ybfO FALSE 0.156 118.000 0.000 NA   NA
 5878671 5878672 EC55989_0686 EC55989_0687 ybfO ybfC TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878672 5878673 EC55989_0687 EC55989_0688 ybfC yhhI FALSE 0.024 226.000 0.000 NA   NA
 5878673 5878674 EC55989_0688 EC55989_0689 yhhI yhhI FALSE 0.035 201.000 0.000 NA   NA
 5878674 5878675 EC55989_0689 EC55989_0690 yhhI ybgA FALSE 0.087 148.000 0.000 NA   NA
 5878675 5878676 EC55989_0690 EC55989_0691 ybgA phr TRUE 0.859 -3.000 0.019 NA   NA
 5878678 5878679 EC55989_0693 EC55989_0694 ybgI ybgJ TRUE 0.764 23.000 0.050 NA   NA
 5878679 5878680 EC55989_0694 EC55989_0695 ybgJ ybgK TRUE 0.992 -6.000 0.379 NA Y NA
 5878680 5878681 EC55989_0695 EC55989_0696 ybgK ybgL TRUE 0.908 -10.000 0.211 NA   NA
 5878681 5878682 EC55989_0696 EC55989_0697 ybgL nei TRUE 0.599 36.000 0.037 1.000   NA
 5878683 5878684 EC55989_0698 EC55989_0699 abrB ybgO FALSE 0.077 152.000 0.000 NA   NA
 5878684 5878685 EC55989_0699 EC55989_0700 ybgO ybgP TRUE 0.922 -3.000 0.000 1.000   NA
 5878685 5878686 EC55989_0700 EC55989_0701 ybgP ybgQ TRUE 0.961 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 5878686 5878687 EC55989_0701 EC55989_0702 ybgQ   TRUE 0.983 9.000 0.000 1.000 Y NA
 5878687 5878688 EC55989_0702 EC55989_0703   gltA FALSE 0.005 390.000 0.000 1.000 N NA
 5878688 5878689 EC55989_0703 EC55989_0704 gltA   FALSE 0.033 206.000 0.000 NA   NA
 5878690 5878691 EC55989_0705 EC55989_0706 sdhC sdhD TRUE 0.997 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 5878691 5878692 EC55989_0706 EC55989_0707 sdhD sdhA TRUE 0.999 0.000 0.705 0.002 Y NA
 5878692 5878693 EC55989_0707 EC55989_0708 sdhA sdhB TRUE 0.998 16.000 0.604 0.002 Y NA
 5878693 5878694 EC55989_0708 EC55989_0709 sdhB sucA FALSE 0.210 201.000 0.067 1.000 Y NA
 5878694 5878695 EC55989_0709 EC55989_0710 sucA sucB TRUE 0.996 15.000 0.667 1.000 Y NA
 5878695 5878696 EC55989_0710 EC55989_0711 sucB sucC TRUE 0.739 94.000 0.136 1.000 Y NA
 5878696 5878697 EC55989_0711 EC55989_0712 sucC sucD TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 5878697 5878698 EC55989_0712 EC55989_misc_RNA_17 sucD rybD TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 5878700 5878701 EC55989_0714 EC55989_0715 mngA mngB TRUE 0.967 18.000 0.036 1.000 Y NA
 5878701 5878702 EC55989_0715 EC55989_0716 mngB   TRUE 0.751 25.000 0.000 NA   NA
 5878702 5878703 EC55989_0716 EC55989_0718   cydA FALSE 0.005 595.000 0.000 NA   NA
 5878703 5878704 EC55989_0718 EC55989_0719 cydA cydB TRUE 0.984 16.000 0.000 0.050 Y NA
 5878704 5878705 EC55989_0719 EC55989_0720 cydB ybgE FALSE 0.190 128.000 0.100 NA   NA
 5878705 5878706 EC55989_0720 EC55989_0721 ybgE ybgC FALSE 0.115 150.000 0.095 NA   NA
 5878706 5878707 EC55989_0721 EC55989_0722 ybgC tolQ TRUE 0.992 -3.000 0.593 1.000   NA
 5878707 5878708 EC55989_0722 EC55989_0723 tolQ tolR TRUE 0.998 4.000 0.556 0.069 Y NA
 5878708 5878709 EC55989_0723 EC55989_0724 tolR tolA FALSE 0.338 65.000 0.114 NA N NA
 5878709 5878710 EC55989_0724 EC55989_0725 tolA tolB FALSE 0.059 133.000 0.051 NA N NA
 5878710 5878711 EC55989_0725 EC55989_0726 tolB pal TRUE 0.939 35.000 0.592 1.000 N NA
 5878711 5878712 EC55989_0726 EC55989_0727 pal ybgF TRUE 0.929 10.000 0.088 1.000   NA
 5878712 5878713 EC55989_0727 EC55989_tRNA8 ybgF   FALSE 0.065 165.000 0.000 NA   NA
 5878713 5878714 EC55989_tRNA8 EC55989_tRNA9     TRUE 0.611 36.000 0.000 NA   NA
 5878714 5878715 EC55989_tRNA9 EC55989_tRNA10     TRUE 0.916 3.000 0.000 NA   NA
 5878715 5878716 EC55989_tRNA10 EC55989_tRNA11     FALSE 0.081 150.000 0.000 NA   NA
 5878716 5878717 EC55989_tRNA11 EC55989_tRNA12     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5878717 5878718 EC55989_tRNA12 EC55989_tRNA13     FALSE 0.089 147.000 0.000 NA   NA
 5878718 5878719 EC55989_tRNA13 EC55989_tRNA14     TRUE 0.630 34.000 0.000 NA   NA
 5878719 5878720 EC55989_tRNA14 EC55989_0729   nadA FALSE 0.007 405.000 0.000 NA   NA
 5878720 5878721 EC55989_0729 EC55989_0730 nadA pnuC TRUE 0.889 38.000 0.023 1.000 Y NA
 5878722 5878723 EC55989_0731 EC55989_0732 zitB ybgS FALSE 0.167 114.000 0.057 NA   NA
 5878725 5878726 EC55989_0734 EC55989_0735 gpmA galM FALSE 0.155 205.000 0.009 1.000 Y NA
 5878726 5878727 EC55989_0735 EC55989_0736 galM galK TRUE 0.989 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 5878727 5878728 EC55989_0736 EC55989_0737 galK galT TRUE 0.991 4.000 0.370 0.001 N NA
 5878728 5878729 EC55989_0737 EC55989_0738 galT galE TRUE 0.955 10.000 0.053 0.001 N NA
 5878729 5878730 EC55989_0738 EC55989_0739 galE modF FALSE 0.014 261.000 0.023 1.000   NA
 5878730 5878731 EC55989_0739 EC55989_0740 modF   TRUE 0.477 -72.000 0.000 NA   NA
 5878731 5878732 EC55989_0740 EC55989_0741   modE TRUE 0.847 -6.000 0.000 NA   NA
 5878733 5878734 EC55989_0742 EC55989_0743 ybhT modA FALSE 0.073 167.000 0.072 NA   NA
 5878734 5878735 EC55989_0743 EC55989_0744 modA modB TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 5878735 5878736 EC55989_0744 EC55989_0745 modB modC TRUE 0.999 3.000 0.537 0.001 Y NA
 5878740 5878741 EC55989_0749 EC55989_0750 insA insB TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.029 Y NA
 5878741 5878742 EC55989_0750 EC55989_0751 insB ybhH TRUE 0.639 33.000 0.000 NA   NA
 5878742 5878743 EC55989_0751 EC55989_0752 ybhH ybhI FALSE 0.271 76.000 0.000 NA   NA
 5878743 5878744 EC55989_0752 EC55989_0753 ybhI ybhJ FALSE 0.160 183.000 0.300 1.000 N NA
 5878745 5878746 EC55989_0754 EC55989_0755 ybhC int FALSE 0.228 135.000 0.200 1.000 N NA
 5878748 5878749 EC55989_0758 EC55989_0759     FALSE 0.456 99.000 0.222 NA   NA
 5878749 5878750 EC55989_0759 EC55989_0761     TRUE 0.665 -19.000 0.000 NA   NA
 5878750 5878751 EC55989_0761 EC55989_0762     FALSE 0.077 152.000 0.000 NA   NA
 5878751 5878752 EC55989_0762 EC55989_0763     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878752 5878753 EC55989_0763 EC55989_0764     TRUE 0.877 6.000 0.040 NA   NA
 5878753 5878754 EC55989_0764 EC55989_0765     FALSE 0.271 76.000 0.000 NA   NA
 5878754 5878755 EC55989_0765 EC55989_0766     FALSE 0.005 514.000 0.000 NA   NA
 5878756 5878757 EC55989_0767 EC55989_0768 cro   FALSE 0.300 70.000 0.000 NA   NA
 5878757 5878758 EC55989_0768 EC55989_0769     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878758 5878759 EC55989_0769 EC55989_0770     TRUE 0.983 -3.000 0.333 1.000   NA
 5878759 5878760 EC55989_0770 EC55989_0771     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878760 5878761 EC55989_0771 EC55989_0772   emrE FALSE 0.310 68.000 0.000 NA   NA
 5878761 5878762 EC55989_0772 EC55989_0773 emrE ybcK FALSE 0.012 256.000 0.000 1.000 N NA
 5878762 5878763 EC55989_0773 EC55989_0774 ybcK   TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878763 5878764 EC55989_0774 EC55989_0775     TRUE 0.509 -61.000 0.000 NA   NA
 5878764 5878765 EC55989_0775 EC55989_0776     FALSE 0.011 319.000 0.000 NA   NA
 5878765 5878766 EC55989_0776 EC55989_0777   ybcN FALSE 0.039 195.000 0.000 NA   NA
 5878766 5878767 EC55989_0777 EC55989_0778 ybcN ninE TRUE 0.964 0.000 0.154 NA   NA
 5878767 5878768 EC55989_0778 EC55989_0779 ninE ybcO TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5878768 5878769 EC55989_0779 EC55989_0780 ybcO rusA FALSE 0.124 131.000 0.000 NA   NA
 5878769 5878770 EC55989_0780 EC55989_0781 rusA ybcQ FALSE 0.025 223.000 0.000 NA   NA
 5878772 5878773 EC55989_0783 EC55989_0784 essD ybcS TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5878773 5878774 EC55989_0784 EC55989_0785 ybcS   TRUE 0.750 -15.000 0.000 1.000   NA
 5878774 5878775 EC55989_0785 EC55989_0786     FALSE 0.033 206.000 0.000 NA   NA
 5878776 5878777 EC55989_0787 EC55989_0788   ynfO TRUE 0.540 42.000 0.000 NA   NA
 5878778 5878779 EC55989_0789 EC55989_0790 nohB A TRUE 0.614 -25.000 0.000 NA   NA
 5878779 5878780 EC55989_0790 EC55989_0791 A   TRUE 0.496 45.000 0.000 NA   NA
 5878780 5878781 EC55989_0791 EC55989_0792   W TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878781 5878782 EC55989_0792 EC55989_0793 W B TRUE 0.946 -3.000 0.100 1.000   NA
 5878782 5878783 EC55989_0793 EC55989_0794 B C FALSE 0.366 -154.000 0.000 1.000   NA
 5878783 5878784 EC55989_0794 EC55989_0795 C D TRUE 0.923 4.000 0.000 1.000   NA
 5878784 5878785 EC55989_0795 EC55989_0796 D E TRUE 0.690 29.000 0.000 NA   NA
 5878785 5878786 EC55989_0796 EC55989_0797 E fI TRUE 0.916 3.000 0.000 NA   NA
 5878786 5878787 EC55989_0797 EC55989_0798 fI fII TRUE 0.876 12.000 0.000 NA   NA
 5878787 5878788 EC55989_0798 EC55989_0799 fII   TRUE 0.876 12.000 0.000 NA   NA
 5878788 5878789 EC55989_0799 EC55989_0800     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878789 5878790 EC55989_0800 EC55989_0801     TRUE 0.641 -22.000 0.000 NA   NA
 5878790 5878791 EC55989_0801 EC55989_0802     TRUE 0.843 16.000 0.000 NA   NA
 5878791 5878792 EC55989_0802 EC55989_0803     TRUE 0.966 -18.000 0.667 NA   NA
 5878792 5878793 EC55989_0803 EC55989_0804     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5878793 5878794 EC55989_0804 EC55989_0805     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878794 5878795 EC55989_0805 EC55989_0806     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5878795 5878796 EC55989_0806 EC55989_0807     TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5878796 5878797 EC55989_0807 EC55989_0808     FALSE 0.371 -102.000 0.000 NA   NA
 5878797 5878798 EC55989_0808 EC55989_0809     FALSE 0.341 61.000 0.000 NA   NA
 5878798 5878799 EC55989_0809 EC55989_0810     FALSE 0.295 71.000 0.000 NA   NA
 5878799 5878800 EC55989_0810 EC55989_0811     FALSE 0.394 59.000 0.000 1.000   NA
 5878800 5878801 EC55989_0811 EC55989_0812   tfaQ TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5878803 5878804 EC55989_0814 EC55989_0815     FALSE 0.016 265.000 0.000 NA   NA
 5878805 5878806 EC55989_0816 EC55989_0817 ybhB bioA FALSE 0.225 59.000 0.003 NA   NA
 5878807 5878808 EC55989_0818 EC55989_0819 bioB bioF TRUE 0.996 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 5878808 5878809 EC55989_0819 EC55989_0820 bioF bioC TRUE 0.981 -13.000 0.133 0.002 Y NA
 5878809 5878810 EC55989_0820 EC55989_0821 bioC bioD TRUE 0.984 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 5878810 5878811 EC55989_0821 EC55989_0822 bioD uvrB FALSE 0.008 579.000 0.000 0.091 N NA
 5878813 5878814 EC55989_0824 EC55989_0825 moaA moaB TRUE 0.985 22.000 0.108 0.003 Y NA
 5878814 5878815 EC55989_0825 EC55989_0826 moaB moaC TRUE 0.995 3.000 0.109 0.003 Y NA
 5878815 5878816 EC55989_0826 EC55989_0827 moaC moaD TRUE 0.990 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 5878816 5878817 EC55989_0827 EC55989_0828 moaD moaE TRUE 0.999 2.000 0.501 0.003 Y NA
 5878817 5878818 EC55989_0828 EC55989_0829 moaE ybhL FALSE 0.076 137.000 0.025 NA   NA
 5878818 5878819 EC55989_0829 EC55989_0830 ybhL   FALSE 0.073 145.000 0.037 NA   NA
 5878819 5878820 EC55989_0830 EC55989_0831   ybhM FALSE 0.249 70.000 0.037 NA   NA
 5878821 5878822 EC55989_0832 EC55989_0833 ybhN ybhO TRUE 0.934 0.000 0.071 NA   NA
 5878822 5878823 EC55989_0833 EC55989_0834 ybhO ybhP TRUE 0.981 -3.000 0.333 NA   NA
 5878825 5878826 EC55989_0836 EC55989_0837 ybhR ybhS TRUE 0.998 11.000 0.609 0.005 Y NA
 5878826 5878827 EC55989_0837 EC55989_0838 ybhS ybhF TRUE 0.986 -7.000 0.547 0.090   NA
 5878827 5878828 EC55989_0838 EC55989_0839 ybhF ybhG TRUE 0.980 -7.000 0.545 1.000   NA
 5878828 5878829 EC55989_0839 EC55989_0840 ybhG ybiH TRUE 0.973 0.000 0.236 1.000 N NA
 5878832 5878833 EC55989_0843 EC55989_0844 dinG ybiB TRUE 0.556 28.000 0.041 1.000 N NA
 5878833 5878834 EC55989_0844 EC55989_0845 ybiB ybiC FALSE 0.162 141.000 0.000 0.055 N NA
 5878835 5878836 EC55989_0846 EC55989_0847 ybiJ ybiI FALSE 0.011 265.000 0.027 NA   NA
 5878836 5878837 EC55989_0847 EC55989_0848 ybiI ybiX FALSE 0.319 74.000 0.000 1.000   NA
 5878837 5878838 EC55989_0848 EC55989_0849 ybiX fiu TRUE 0.766 42.000 0.171 1.000   NA
 5878838 5878839 EC55989_0849 EC55989_0850 fiu ybiM FALSE 0.016 265.000 0.000 NA   NA
 5878841 5878842 EC55989_0852 EC55989_0853 ybiO glnQ FALSE 0.089 117.000 0.000 NA N NA
 5878842 5878843 EC55989_0853 EC55989_0854 glnQ glnP TRUE 0.984 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 5878843 5878844 EC55989_0854 EC55989_0855 glnP glnH TRUE 0.549 139.000 0.051 0.068 Y NA
 5878844 5878845 EC55989_0855 EC55989_0856 glnH dps FALSE 0.005 404.000 0.000 1.000 N NA
 5878845 5878846 EC55989_0856 EC55989_0857 dps rhtA FALSE 0.010 299.000 0.044 NA   NA
 5878848 5878849 EC55989_0859 EC55989_misc_RNA_18 ybiP rybA FALSE 0.008 355.000 0.000 NA   NA
 5878850 5878851 EC55989_0860 EC55989_0861 mntR ybiR TRUE 0.760 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5878853 5878854 EC55989_0863 EC55989_0865 ybiT   FALSE 0.017 279.000 0.000 1.000   NA
 5878855 5878856 EC55989_0866 EC55989_0867 ybiU ybiV FALSE 0.077 152.000 0.000 NA   NA
 5878856 5878857 EC55989_0867 EC55989_0868 ybiV ybiW FALSE 0.107 146.000 0.000 1.000   NA
 5878857 5878858 EC55989_0868 EC55989_0869 ybiW ybiY TRUE 0.987 6.000 0.316 0.003 N NA
 5878860 5878861 EC55989_0871 EC55989_0872 moeB moeA TRUE 0.998 0.000 0.323 0.003 Y NA
 5878862 5878863 EC55989_0873 EC55989_0874 iaaA yliA TRUE 0.888 20.000 0.104 1.000   NA
 5878863 5878864 EC55989_0874 EC55989_0875 yliA yliB TRUE 0.871 20.000 0.083 1.000   NA
 5878864 5878865 EC55989_0875 EC55989_0876 yliB yliC TRUE 0.998 18.000 0.803 0.055 Y NA
 5878865 5878866 EC55989_0876 EC55989_0877 yliC yliD TRUE 0.999 3.000 0.689 0.055 Y NA
 5878866 5878867 EC55989_0877 EC55989_0878 yliD yliE FALSE 0.028 178.000 0.000 NA N NA
 5878867 5878868 EC55989_0878 EC55989_0879 yliE yliF TRUE 0.981 8.000 0.000 NA Y NA
 5878870 5878871 EC55989_0881 EC55989_0882 bssR yliI FALSE 0.155 111.000 0.047 NA   NA
 5878874 5878875 EC55989_0885 EC55989_0886 deoR ybjG TRUE 0.691 58.000 0.235 1.000   NA
 5878877 5878878 EC55989_0888 EC55989_0889 ybjH ybjI FALSE 0.242 86.000 0.000 NA   NA
 5878878 5878879 EC55989_0889 EC55989_0890 ybjI ybjJ TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5878881 5878882 EC55989_misc_RNA_19 EC55989_0892 rybB ybjL FALSE 0.266 77.000 0.000 NA   NA
 5878885 5878886 EC55989_0895 EC55989_0896 ybjC nfsA TRUE 0.842 -16.000 0.159 NA   NA
 5878886 5878887 EC55989_0896 EC55989_0897 nfsA rimK FALSE 0.261 61.000 0.000 1.000 N NA
 5878887 5878888 EC55989_0897 EC55989_0898 rimK ybjN FALSE 0.251 88.000 0.065 NA   NA
 5878888 5878889 EC55989_0898 EC55989_0899 ybjN potF FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 5878889 5878890 EC55989_0899 EC55989_0900 potF potG TRUE 0.933 95.000 0.679 1.000 Y NA
 5878890 5878891 EC55989_0900 EC55989_0901 potG potH TRUE 0.998 10.000 0.857 1.000 Y NA
 5878891 5878892 EC55989_0901 EC55989_0902 potH potI TRUE 0.996 -7.000 0.528 0.055 Y NA
 5878892 5878893 EC55989_0902 EC55989_0903 potI ybjO TRUE 0.679 60.000 0.264 NA   NA
 5878893 5878894 EC55989_0903 EC55989_0904 ybjO rumB TRUE 0.810 41.000 0.226 NA   NA
 5878895 5878896 EC55989_0905 EC55989_0906 artJ artM FALSE 0.171 292.000 0.143 0.068 Y NA
 5878896 5878897 EC55989_0906 EC55989_0907 artM artQ TRUE 0.999 0.000 0.714 0.016 Y NA
 5878897 5878898 EC55989_0907 EC55989_0908 artQ artI TRUE 0.996 7.000 0.260 0.055 Y NA
 5878898 5878899 EC55989_0908 EC55989_0909 artI artP TRUE 0.990 18.000 0.323 1.000 Y NA
 5878899 5878900 EC55989_0909 EC55989_0910 artP ybjP FALSE 0.034 218.000 0.081 NA   NA
 5878901 5878902 EC55989_0911 EC55989_0912 ybjQ ybjR TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5878903 5878904 EC55989_0913 EC55989_0914 ybjS ybjT TRUE 0.728 99.000 0.022 0.008 Y NA
 5878904 5878905 EC55989_0914 EC55989_0915 ybjT ltaE TRUE 0.867 11.000 0.074 1.000 N NA
 5878905 5878906 EC55989_0915 EC55989_0916 ltaE poxB TRUE 0.903 37.000 0.041 1.000 Y NA
 5878906 5878907 EC55989_0916 EC55989_0917 poxB hcr FALSE 0.050 133.000 0.025 1.000 N NA
 5878907 5878908 EC55989_0917 EC55989_0918 hcr hcp TRUE 0.988 12.000 0.000 0.016 Y NA
 5878908 5878909 EC55989_0918 EC55989_0919 hcp ybjE FALSE 0.095 144.000 0.000 NA   NA
 5878909 5878910 EC55989_0919 EC55989_0920 ybjE aqpZ FALSE 0.004 495.000 0.025 NA   NA
 5878913 5878914 EC55989_0923 EC55989_0924 macA macB TRUE 0.993 -3.000 0.789 1.000 N NA
 5878916 5878917 EC55989_0926 EC55989_0927 clpS clpA TRUE 0.956 31.000 0.596 NA   NA
 5878918 5878919 EC55989_tRNA87 EC55989_0929   infA FALSE 0.018 253.000 0.000 NA   NA
 5878919 5878920 EC55989_0929 EC55989_0930 infA aat FALSE 0.005 285.000 0.020 1.000 N NA
 5878920 5878921 EC55989_0930 EC55989_0931 aat cydC TRUE 0.884 42.000 0.049 1.000 Y NA
 5878921 5878922 EC55989_0931 EC55989_0932 cydC cydD TRUE 0.999 1.000 0.631 0.005 Y NA
 5878922 5878923 EC55989_0932 EC55989_0933 cydD trxB TRUE 0.524 123.000 0.049 1.000 Y NA
 5878924 5878925 EC55989_0934 EC55989_0935 lrp ftsK FALSE 0.378 135.000 0.345 1.000 N NA
 5878925 5878926 EC55989_0935 EC55989_0936 ftsK lolA FALSE 0.247 152.000 0.305 1.000 N NA
 5878926 5878927 EC55989_0936 EC55989_0937 lolA ycaJ TRUE 0.936 11.000 0.167 1.000 N NA
 5878927 5878928 EC55989_0937 EC55989_0938 ycaJ serS FALSE 0.360 91.000 0.078 0.090 N NA
 5878928 5878929 EC55989_0938 EC55989_0939 serS dmsA FALSE 0.015 239.000 0.000 1.000 N NA
 5878929 5878930 EC55989_0939 EC55989_0940 dmsA dmsB TRUE 0.993 11.000 0.172 0.049 Y NA
 5878930 5878931 EC55989_0940 EC55989_0941 dmsB dmsC TRUE 0.985 2.000 0.333 1.000   NA
 5878933 5878934 EC55989_0943 EC55989_0944 ycaD ycaM FALSE 0.016 210.000 0.000 NA N NA
 5878937 5878938 EC55989_0947 EC55989_0948 pflA pflB FALSE 0.044 192.000 0.092 1.000 N NA
 5878938 5878939 EC55989_0948 EC55989_0949 pflB focA TRUE 0.743 55.000 0.345 1.000 N NA
 5878939 5878940 EC55989_0949 EC55989_0950 focA ycaO FALSE 0.007 405.000 0.000 NA   NA
 5878941 5878942 EC55989_0951 EC55989_0952 ycaP serC FALSE 0.022 199.000 0.014 NA   NA
 5878942 5878943 EC55989_0952 EC55989_0953 serC aroA TRUE 0.711 71.000 0.033 1.000 Y NA
 5878943 5878944 EC55989_0953 EC55989_0954 aroA ycaL FALSE 0.017 169.000 0.003 1.000 N NA
 5878944 5878945 EC55989_0954 EC55989_0955 ycaL cmk FALSE 0.016 173.000 0.004 1.000 N NA
 5878945 5878946 EC55989_0955 EC55989_0956 cmk rpsA FALSE 0.420 111.000 0.281 1.000 N NA
 5878946 5878947 EC55989_0956 EC55989_0957 rpsA ihfB FALSE 0.217 160.000 0.292 1.000 N NA
 5878947 5878948 EC55989_0957 EC55989_0958 ihfB ycaI FALSE 0.023 207.000 0.003 1.000   NA
 5878948 5878949 EC55989_0958 EC55989_0959 ycaI msbA TRUE 0.802 37.000 0.075 0.084   NA
 5878949 5878950 EC55989_0959 EC55989_0960 msbA lpxK TRUE 0.959 -3.000 0.205 1.000 N NA
 5878950 5878951 EC55989_0960 EC55989_0961 lpxK ycaQ TRUE 0.473 37.000 0.017 NA   NA
 5878951 5878952 EC55989_0961 EC55989_0962 ycaQ ycaR FALSE 0.291 52.000 0.016 NA   NA
 5878952 5878953 EC55989_0962 EC55989_0963 ycaR kdsB TRUE 0.976 -3.000 0.265 NA   NA
 5878953 5878954 EC55989_0963 EC55989_0964 kdsB ycbJ FALSE 0.049 154.000 0.023 NA   NA
 5878955 5878956 EC55989_0965 EC55989_0966 ycbC   FALSE 0.320 -97.000 0.036 NA   NA
 5878957 5878958 EC55989_0967 EC55989_0968 smtA mukF TRUE 0.974 -3.000 0.325 NA N NA
 5878958 5878959 EC55989_0968 EC55989_0969 mukF mukE TRUE 0.979 8.000 0.036 NA Y NA
 5878959 5878960 EC55989_0969 EC55989_0970 mukE mukB TRUE 0.994 0.000 0.000 0.001 Y NA
 5878960 5878961 EC55989_0970 EC55989_0971 mukB ycbB FALSE 0.020 261.000 0.000 1.000   NA
 5878961 5878962 EC55989_0971 EC55989_0972 ycbB ycbK FALSE 0.243 181.000 0.372 NA   NA
 5878962 5878963 EC55989_0972 EC55989_0973 ycbK ycbL TRUE 0.786 27.000 0.089 NA   NA
 5878964 5878965 EC55989_0975 EC55989_0977   aspC FALSE 0.010 279.000 0.000 1.000 N NA
 5878965 5878966 EC55989_0977 EC55989_0978 aspC ompF FALSE 0.022 185.000 0.036 1.000 N NA
 5878966 5878967 EC55989_0978 EC55989_0979 ompF asnS FALSE 0.003 602.000 0.000 1.000 N NA
 5878967 5878968 EC55989_0979 EC55989_0980 asnS pncB FALSE 0.029 169.000 0.034 1.000 N NA
 5878970 5878971 EC55989_0982 EC55989_0983 ssuB ssuC TRUE 0.997 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 5878971 5878972 EC55989_0983 EC55989_0984 ssuC ssuD TRUE 0.955 11.000 0.226 1.000 N NA
 5878972 5878973 EC55989_0984 EC55989_0985 ssuD ssuA TRUE 0.979 -3.000 0.341 1.000 N NA
 5878973 5878974 EC55989_0985 EC55989_0986 ssuA ssuE TRUE 0.926 -7.000 0.169 1.000   NA
 5878975 5878976 EC55989_0987 EC55989_0988 ycbQ ycbR TRUE 0.916 83.000 0.500 1.000 Y NA
 5878976 5878977 EC55989_0988 EC55989_0989 ycbR ycbS TRUE 0.993 25.000 0.667 1.000 Y NA
 5878977 5878978 EC55989_0989 EC55989_0990 ycbS ycbT TRUE 0.961 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 5878978 5878979 EC55989_0990 EC55989_0991 ycbT ycbU TRUE 0.989 12.000 0.000 0.010 Y NA
 5878979 5878980 EC55989_0991 EC55989_0992 ycbU ycbV TRUE 0.999 8.000 0.667 0.010 Y NA
 5878980 5878981 EC55989_0992 EC55989_0993 ycbV ycbF TRUE 0.993 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 5878981 5878982 EC55989_0993 EC55989_0994 ycbF pyrD FALSE 0.124 111.000 0.000 1.000 N NA
 5878982 5878983 EC55989_0994 EC55989_0995 pyrD ycbW FALSE 0.071 174.000 0.081 NA   NA
 5878985 5878986 EC55989_0997 EC55989_0998 ycbY uup TRUE 0.906 11.000 0.061 1.000   NA
 5878986 5878987 EC55989_0998 EC55989_0999 uup pqiA FALSE 0.122 130.000 0.054 NA   NA
 5878987 5878988 EC55989_0999 EC55989_1000 pqiA pqiB TRUE 0.994 5.000 0.819 NA   NA
 5878988 5878989 EC55989_1000 EC55989_1001 pqiB ymbA TRUE 0.985 12.000 0.531 NA   NA
 5878989 5878990 EC55989_1001 EC55989_1002 ymbA rmf FALSE 0.018 256.000 0.000 NA   NA
 5878991 5878992 EC55989_1003 EC55989_1004 fabA ycbZ TRUE 0.617 69.000 0.290 1.000 N NA
 5878998 5878999 EC55989_1009 EC55989_1010 yccS yccF TRUE 0.867 19.000 0.090 NA   NA
 5879001 5879002 EC55989_1012 EC55989_1013 mgsA yccT FALSE 0.206 96.000 0.055 NA   NA
 5879004 5879005 EC55989_1015 EC55989_1016 yccV yccW FALSE 0.451 58.000 0.094 NA   NA
 5879007 5879008 EC55989_1018 EC55989_1019 tusE yccA FALSE 0.374 91.000 0.140 NA   NA
 5879010 5879011 EC55989_1021 EC55989_1022     TRUE 0.641 -22.000 0.000 NA   NA
 5879011 5879012 EC55989_1022 EC55989_1023     TRUE 0.486 -70.000 0.000 NA   NA
 5879012 5879013 EC55989_1023 EC55989_1024     FALSE 0.211 96.000 0.000 NA   NA
 5879013 5879014 EC55989_1024 EC55989_1025     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879014 5879015 EC55989_1025 EC55989_misc_RNA_21   dicF FALSE 0.300 70.000 0.000 NA   NA
 5879015 5879016 EC55989_misc_RNA_21 EC55989_1026 dicF ydfC FALSE 0.009 341.000 0.000 NA   NA
 5879016 5879017 EC55989_1026 EC55989_1027 ydfC ydfB TRUE 0.677 30.000 0.000 NA   NA
 5879017 5879018 EC55989_1027 EC55989_1028 ydfB ydfA TRUE 0.920 2.000 0.000 NA   NA
 5879018 5879019 EC55989_1028 EC55989_1029 ydfA dicA FALSE 0.032 208.000 0.000 NA   NA
 5879020 5879021 EC55989_1030 EC55989_1031 dicC   TRUE 0.698 -16.000 0.000 NA   NA
 5879021 5879022 EC55989_1031 EC55989_1032     FALSE 0.363 -103.000 0.000 NA   NA
 5879022 5879023 EC55989_1032 EC55989_1033     FALSE 0.300 -211.000 0.000 NA   NA
 5879023 5879024 EC55989_1033 EC55989_1034     TRUE 0.843 16.000 0.000 NA   NA
 5879024 5879025 EC55989_1034 EC55989_1035     TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 5879025 5879026 EC55989_1035 EC55989_1036     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879026 5879027 EC55989_1036 EC55989_1037     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5879027 5879028 EC55989_1037 EC55989_1038     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5879028 5879029 EC55989_1038 EC55989_1039     FALSE 0.129 129.000 0.000 NA   NA
 5879029 5879030 EC55989_1039 EC55989_1040     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5879030 5879031 EC55989_1040 EC55989_1041     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879032 5879033 EC55989_1042 EC55989_1043 insB insA TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.028 Y NA
 5879034 5879035 EC55989_1044 EC55989_1045 rem ydfU FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 5879035 5879036 EC55989_1045 EC55989_1046 ydfU   TRUE 0.921 1.000 0.000 NA   NA
 5879036 5879037 EC55989_1046 EC55989_1047     TRUE 0.922 -3.000 0.000 1.000   NA
 5879037 5879038 EC55989_1047 EC55989_1048     FALSE 0.103 140.000 0.000 NA   NA
 5879038 5879039 EC55989_1048 EC55989_1049     FALSE 0.080 151.000 0.000 NA   NA
 5879039 5879040 EC55989_1049 EC55989_tRNA15     FALSE 0.430 50.000 0.000 NA   NA
 5879040 5879041 EC55989_tRNA15 EC55989_tRNA16     TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5879041 5879042 EC55989_tRNA16 EC55989_tRNA17     TRUE 0.859 14.000 0.000 NA   NA
 5879042 5879043 EC55989_tRNA17 EC55989_1050     FALSE 0.006 490.000 0.000 NA   NA
 5879043 5879044 EC55989_1050 EC55989_1051     TRUE 0.496 45.000 0.000 NA   NA
 5879044 5879045 EC55989_1051 EC55989_1052     TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5879047 5879048 EC55989_1054 EC55989_1055 ydfQ   FALSE 0.263 78.000 0.000 NA   NA
 5879048 5879049 EC55989_1055 EC55989_1056     TRUE 0.665 -19.000 0.000 NA   NA
 5879049 5879050 EC55989_1056 EC55989_1058   rz TRUE 0.843 16.000 0.000 NA   NA
 5879050 5879051 EC55989_1058 EC55989_1059 rz   FALSE 0.006 453.000 0.000 NA   NA
 5879051 5879052 EC55989_1059 EC55989_1060     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879052 5879053 EC55989_1060 EC55989_1061     TRUE 0.601 -27.000 0.000 NA   NA
 5879053 5879054 EC55989_1061 EC55989_1062     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879054 5879055 EC55989_1062 EC55989_1063   clp FALSE 0.341 -202.000 0.000 1.000   NA
 5879055 5879056 EC55989_1063 EC55989_1064 clp   TRUE 0.749 88.000 0.537 NA   NA
 5879056 5879057 EC55989_1064 EC55989_1065     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5879057 5879058 EC55989_1065 EC55989_1066   Z TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879058 5879059 EC55989_1066 EC55989_1067 Z U TRUE 0.867 13.000 0.000 NA   NA
 5879059 5879060 EC55989_1067 EC55989_1068 U   TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5879060 5879061 EC55989_1068 EC55989_1069     TRUE 0.822 19.000 0.000 NA   NA
 5879061 5879062 EC55989_1069 EC55989_1070   T TRUE 0.972 27.000 0.667 NA   NA
 5879062 5879063 EC55989_1070 EC55989_1071 T   TRUE 0.665 -19.000 0.000 NA   NA
 5879063 5879064 EC55989_1071 EC55989_1072     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879064 5879065 EC55989_1072 EC55989_1073     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879065 5879066 EC55989_1073 EC55989_1074     TRUE 0.561 -37.000 0.000 NA   NA
 5879066 5879067 EC55989_1074 EC55989_1075     FALSE 0.371 -102.000 0.000 NA   NA
 5879067 5879068 EC55989_1075 EC55989_1076     FALSE 0.341 61.000 0.000 NA   NA
 5879068 5879069 EC55989_1076 EC55989_1077     FALSE 0.310 68.000 0.000 NA   NA
 5879069 5879070 EC55989_1077 EC55989_1078     FALSE 0.091 152.000 0.000 1.000   NA
 5879070 5879071 EC55989_1078 EC55989_1079     FALSE 0.456 -78.000 0.000 NA   NA
 5879073 5879074 EC55989_1080 EC55989_1081 hyaA hyaB TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 5879074 5879075 EC55989_1081 EC55989_1082 hyaB hyaC TRUE 0.994 19.000 0.355 0.048 Y NA
 5879075 5879076 EC55989_1082 EC55989_1083 hyaC hyaD TRUE 0.992 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 5879076 5879077 EC55989_1083 EC55989_1084 hyaD hyaE TRUE 0.936 -3.000 0.096 NA   NA
 5879077 5879078 EC55989_1084 EC55989_1085 hyaE hyaF TRUE 0.994 -3.000 0.769 NA   NA
 5879078 5879079 EC55989_1085 EC55989_1086 hyaF appC FALSE 0.121 134.000 0.061 NA   NA
 5879079 5879080 EC55989_1086 EC55989_1087 appC appB TRUE 0.992 12.000 0.158 0.048 Y NA
 5879080 5879081 EC55989_1087 EC55989_1088 appB appA FALSE 0.054 185.000 0.000 1.000   NA
 5879082 5879083 EC55989_1089 EC55989_1090 yccC etp TRUE 0.988 20.000 1.000 1.000 N NA
 5879083 5879084 EC55989_1090 EC55989_1091 etp yccZ TRUE 0.974 -12.000 0.750 1.000 N NA
 5879084 5879085 EC55989_1091 EC55989_1092 yccZ ymcA TRUE 0.478 46.000 0.000 NA   NA
 5879085 5879086 EC55989_1092 EC55989_1093 ymcA ymcB TRUE 0.927 0.000 0.060 NA   NA
 5879086 5879087 EC55989_1093 EC55989_1094 ymcB ymcC TRUE 0.991 -3.000 0.600 NA   NA
 5879087 5879088 EC55989_1094 EC55989_1095 ymcC   FALSE 0.250 82.000 0.000 NA   NA
 5879088 5879089 EC55989_1095 EC55989_1096   ymcD FALSE 0.292 -247.000 0.000 NA   NA
 5879089 5879090 EC55989_1096 EC55989_1097 ymcD cspH FALSE 0.006 442.000 0.000 NA   NA
 5879090 5879091 EC55989_1097 EC55989_1098 cspH insB TRUE 0.466 59.000 0.000 0.081 N NA
 5879091 5879092 EC55989_1098 EC55989_1099 insB insA TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.027 Y NA
 5879093 5879094 EC55989_1100 EC55989_1101 cspG gnsA FALSE 0.007 394.000 0.000 NA   NA
 5879095 5879096 EC55989_1102 EC55989_1103 yccM torS FALSE 0.176 72.000 0.000 NA N NA
 5879099 5879100 EC55989_1106 EC55989_1107 torC torA TRUE 0.993 0.000 0.000 0.048 Y NA
 5879100 5879101 EC55989_1107 EC55989_1108 torA torD TRUE 0.967 -3.000 0.077 0.048   NA
 5879102 5879103 EC55989_1109 EC55989_1110 cbpM cbpA TRUE 0.991 0.000 0.512 NA   NA
 5879104 5879105 EC55989_1111 EC55989_1112 yccE agp FALSE 0.013 289.000 0.000 NA   NA
 5879106 5879107 EC55989_1113 EC55989_1114 yccJ wrbA TRUE 0.948 21.000 0.290 NA   NA
 5879108 5879109 EC55989_1115 EC55989_1116   ymdF TRUE 0.498 -67.000 0.000 NA   NA
 5879110 5879111 EC55989_1117 EC55989_1118 rutG rutF TRUE 0.977 21.000 0.533 1.000   NA
 5879111 5879112 EC55989_1118 EC55989_1119 rutF rutE TRUE 0.994 11.000 0.625 0.029   NA
 5879112 5879113 EC55989_1119 EC55989_1120 rutE rutD TRUE 0.969 10.000 0.256 NA   NA
 5879113 5879114 EC55989_1120 EC55989_1121 rutD rutC TRUE 0.981 8.000 0.365 NA   NA
 5879114 5879115 EC55989_1121 EC55989_1122 rutC rutB TRUE 0.976 12.000 0.442 NA N NA
 5879115 5879116 EC55989_1122 EC55989_1123 rutB rutA TRUE 0.991 0.000 0.621 NA N NA
 5879119 5879120 EC55989_1126 EC55989_1127 putP efeU FALSE 0.004 533.000 0.000 1.000 N NA
 5879120 5879121 EC55989_1127 EC55989_1128 efeU efeO TRUE 0.924 58.000 0.356 NA Y NA
 5879121 5879122 EC55989_1128 EC55989_1129 efeO efeB TRUE 0.995 6.000 0.378 NA Y NA
 5879125 5879126 EC55989_1132 EC55989_1133 pgaD pgaC TRUE 0.989 2.000 0.462 NA   NA
 5879126 5879127 EC55989_1133 EC55989_1134 pgaC pgaB TRUE 0.966 -7.000 0.435 1.000 N NA
 5879127 5879128 EC55989_1134 EC55989_1135 pgaB pgaA TRUE 0.992 9.000 0.696 1.000   NA
 5879129 5879130 EC55989_1136 EC55989_1137 insA insB TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.027 Y NA
 5879130 5879131 EC55989_1137 EC55989_1138 insB   TRUE 0.664 51.000 0.000 0.023   NA
 5879131 5879132 EC55989_1138 EC55989_1139   ycdT FALSE 0.030 211.000 0.000 NA   NA
 5879132 5879133 EC55989_1139 EC55989_1140 ycdT ycdT TRUE 0.540 -46.000 0.000 NA   NA
 5879134 5879135 EC55989_1141 EC55989_1142 insF insE TRUE 0.959 -3.000 0.000 0.081   NA
 5879136 5879137 EC55989_1143 EC55989_1144   ycdU TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879139 5879140 EC55989_1146 EC55989_1147 ycdW ycdX TRUE 0.878 55.000 0.169 1.000 Y NA
 5879140 5879141 EC55989_1147 EC55989_1148 ycdX ycdY TRUE 0.962 24.000 0.417 1.000   NA
 5879141 5879142 EC55989_1148 EC55989_1149 ycdY ycdZ FALSE 0.335 102.000 0.145 NA   NA
 5879143 5879144 EC55989_1150 EC55989_1151 csgG csgF TRUE 0.685 27.000 0.043 NA   NA
 5879144 5879145 EC55989_1151 EC55989_1152 csgF csgE TRUE 0.978 25.000 0.723 NA   NA
 5879145 5879146 EC55989_1152 EC55989_1153 csgE csgD TRUE 0.959 5.000 0.176 NA   NA
 5879147 5879148 EC55989_1154 EC55989_1155 csgB csgA TRUE 0.931 41.000 0.333 0.010   NA
 5879148 5879149 EC55989_1155 EC55989_1156 csgA csgC TRUE 0.879 59.000 0.667 NA   NA
 5879149 5879150 EC55989_1156 EC55989_1157 csgC ymdA FALSE 0.023 231.000 0.000 NA   NA
 5879150 5879151 EC55989_1157 EC55989_1158 ymdA ymdB FALSE 0.214 95.000 0.000 NA   NA
 5879151 5879152 EC55989_1158 EC55989_1159 ymdB ymdC TRUE 0.909 2.000 0.046 NA   NA
 5879153 5879154 EC55989_1160 EC55989_1161 mdoC   TRUE 0.496 45.000 0.000 NA   NA
 5879154 5879155 EC55989_1161 EC55989_1162     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5879156 5879157 EC55989_1163 EC55989_1164 mdoG mdoH TRUE 0.965 -7.000 0.469 NA N NA
 5879157 5879158 EC55989_1164 EC55989_1165 mdoH yceK FALSE 0.106 173.000 0.135 NA   NA
 5879159 5879160 EC55989_1166 EC55989_1167 msyB mdtG TRUE 0.638 83.000 0.333 NA   NA
 5879160 5879161 EC55989_1167 EC55989_1168 mdtG lpxL TRUE 0.591 172.000 0.857 0.082 N NA
 5879163 5879164 EC55989_1170 EC55989_1171 yceI yceJ TRUE 0.993 4.000 0.676 NA   NA
 5879164 5879165 EC55989_1171 EC55989_1172 yceJ solA FALSE 0.012 422.000 0.000 0.029 N NA
 5879165 5879166 EC55989_1172 EC55989_1173 solA bssS TRUE 0.580 115.000 0.423 NA   NA
 5879166 5879167 EC55989_1173 EC55989_1174 bssS dinI FALSE 0.013 290.000 0.000 NA   NA
 5879167 5879168 EC55989_1174 EC55989_1175 dinI pyrC FALSE 0.218 74.000 0.031 NA   NA
 5879168 5879169 EC55989_1175 EC55989_1176 pyrC yceB FALSE 0.126 106.000 0.022 NA   NA
 5879169 5879170 EC55989_1176 EC55989_1177 yceB grxB FALSE 0.141 134.000 0.078 NA   NA
 5879170 5879171 EC55989_1177 EC55989_1178 grxB mdtH FALSE 0.322 64.000 0.103 NA N NA
 5879172 5879173 EC55989_1179 EC55989_1180 rimJ yceH TRUE 0.929 11.000 0.116 NA   NA
 5879173 5879174 EC55989_1180 EC55989_1181 yceH mviM TRUE 0.947 2.000 0.103 NA   NA
 5879174 5879175 EC55989_1181 EC55989_1182 mviM mviN FALSE 0.146 110.000 0.022 1.000   NA
 5879176 5879177 EC55989_1183 EC55989_1184 flgN flgM TRUE 0.998 5.000 0.361 0.002 Y NA
 5879177 5879178 EC55989_1184 EC55989_1185 flgM flgA TRUE 0.877 76.000 0.330 NA Y NA
 5879179 5879180 EC55989_1186 EC55989_1187 flgB flgC TRUE 0.999 4.000 0.824 0.003 Y NA
 5879180 5879181 EC55989_1187 EC55989_1188 flgC flgD TRUE 0.988 12.000 0.186 NA Y NA
 5879181 5879182 EC55989_1188 EC55989_1189 flgD flgE TRUE 0.962 25.000 0.116 NA Y NA
 5879182 5879183 EC55989_1189 EC55989_1190 flgE flgF TRUE 0.996 20.000 0.476 0.004 Y NA
 5879183 5879184 EC55989_1190 EC55989_1191 flgF flgG TRUE 0.773 172.000 0.420 0.001 Y NA
 5879184 5879185 EC55989_1191 EC55989_1192 flgG flgH TRUE 0.954 53.000 0.268 0.005 Y NA
 5879185 5879186 EC55989_1192 EC55989_1193 flgH flgI TRUE 0.990 12.000 0.073 0.006 Y NA
 5879186 5879187 EC55989_1193 EC55989_1194 flgI flgJ TRUE 0.993 0.000 0.036 0.006 Y NA
 5879187 5879188 EC55989_1194 EC55989_1195 flgJ flgK TRUE 0.979 66.000 0.705 0.002 Y NA
 5879188 5879189 EC55989_1195 EC55989_1196 flgK flgL TRUE 0.994 12.000 0.142 0.001 Y NA
 5879190 5879191 EC55989_1197 EC55989_misc_RNA_22 rne   TRUE 0.751 25.000 0.000 NA   NA
 5879194 5879195 EC55989_misc_RNA_23 EC55989_1200 sraB yceD TRUE 0.600 37.000 0.000 NA   NA
 5879195 5879196 EC55989_1200 EC55989_1201 yceD rpmF TRUE 0.885 52.000 0.599 NA   NA
 5879196 5879197 EC55989_1201 EC55989_1202 rpmF plsX TRUE 0.665 81.000 0.418 1.000 N NA
 5879197 5879198 EC55989_1202 EC55989_1203 plsX fabH TRUE 0.953 68.000 0.380 0.004 Y NA
 5879198 5879199 EC55989_1203 EC55989_1204 fabH fabD TRUE 0.992 16.000 0.182 0.004 Y NA
 5879199 5879200 EC55989_1204 EC55989_1205 fabD fabG TRUE 0.997 13.000 0.432 0.004 Y NA
 5879200 5879201 EC55989_1205 EC55989_1206 fabG acpP TRUE 0.534 211.000 0.321 0.004 Y NA
 5879201 5879202 EC55989_1206 EC55989_1207 acpP fabF TRUE 0.876 88.000 0.346 1.000 Y NA
 5879202 5879203 EC55989_1207 EC55989_1208 fabF pabC FALSE 0.279 120.000 0.187 1.000 N NA
 5879203 5879204 EC55989_1208 EC55989_1209 pabC yceG TRUE 0.970 3.000 0.204 NA   NA
 5879204 5879205 EC55989_1209 EC55989_1210 yceG tmk TRUE 0.906 -10.000 0.209 NA   NA
 5879205 5879206 EC55989_1210 EC55989_1211 tmk holB TRUE 0.960 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5879206 5879207 EC55989_1211 EC55989_1212 holB ycfH TRUE 0.984 11.000 0.110 NA Y NA
 5879207 5879208 EC55989_1212 EC55989_1213 ycfH ptsG FALSE 0.002 295.000 0.004 NA N NA
 5879210 5879211 EC55989_1215 EC55989_1216 hinT ycfL TRUE 0.911 3.000 0.051 NA   NA
 5879211 5879212 EC55989_1216 EC55989_1217 ycfL ycfM TRUE 0.983 14.000 0.516 NA   NA
 5879212 5879213 EC55989_1217 EC55989_1218 ycfM ycfN TRUE 0.906 -19.000 0.310 NA   NA
 5879213 5879214 EC55989_1218 EC55989_1219 ycfN nagZ TRUE 0.859 11.000 0.069 1.000 N NA
 5879214 5879215 EC55989_1219 EC55989_1220 nagZ ycfP TRUE 0.834 23.000 0.091 NA   NA
 5879215 5879216 EC55989_1220 EC55989_1221 ycfP ndh FALSE 0.007 408.000 0.057 NA   NA
 5879216 5879217 EC55989_1221 EC55989_1222 ndh ycfJ FALSE 0.042 210.000 0.071 1.000   NA
 5879220 5879221 EC55989_1225 EC55989_1226 ycfS mfd FALSE 0.069 144.000 0.006 1.000   NA
 5879221 5879222 EC55989_1226 EC55989_1227 mfd ycfT FALSE 0.096 128.000 0.003 1.000   NA
 5879223 5879224 EC55989_1228 EC55989_1229 lolC lolD TRUE 0.942 -7.000 0.175 0.065 N NA
 5879224 5879225 EC55989_1229 EC55989_1230 lolD lolE TRUE 0.970 0.000 0.125 0.065 N NA
 5879225 5879226 EC55989_1230 EC55989_1231 lolE ycfX TRUE 0.860 29.000 0.225 1.000 N NA
 5879226 5879227 EC55989_1231 EC55989_1232 ycfX cobB TRUE 0.981 16.000 0.119 1.000 Y NA
 5879228 5879229 EC55989_1233 EC55989_1234 ycfZ   FALSE 0.334 63.000 0.000 NA   NA
 5879229 5879230 EC55989_1234 EC55989_1235   potD FALSE 0.442 49.000 0.000 NA   NA
 5879230 5879231 EC55989_1235 EC55989_1236 potD potC TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.053 Y NA
 5879231 5879232 EC55989_1236 EC55989_1237 potC potB TRUE 0.996 -3.000 0.286 0.053 Y NA
 5879232 5879233 EC55989_1237 EC55989_1238 potB potA TRUE 0.997 14.000 0.789 1.000 Y NA
 5879233 5879234 EC55989_1238 EC55989_1239 potA   TRUE 0.653 -21.000 0.000 NA   NA
 5879236 5879237 EC55989_1241 EC55989_1242 ycfD phoQ TRUE 0.718 76.000 0.408 NA   NA
 5879237 5879238 EC55989_1242 EC55989_1243 phoQ phoP TRUE 0.999 0.000 0.940 1.000 Y NA
 5879238 5879239 EC55989_1243 EC55989_1244 phoP purB FALSE 0.020 168.000 0.011 1.000 N NA
 5879239 5879240 EC55989_1244 EC55989_1245 purB hflD TRUE 0.935 4.000 0.093 NA   NA
 5879240 5879241 EC55989_1245 EC55989_1246 hflD trmU TRUE 0.803 36.000 0.180 NA   NA
 5879241 5879242 EC55989_1246 EC55989_1247 trmU ymfB TRUE 0.534 54.000 0.158 1.000 N NA
 5879242 5879243 EC55989_1247 EC55989_1248 ymfB ymfC TRUE 0.945 10.000 0.182 1.000 N NA
 5879245 5879246 EC55989_1250 EC55989_1251 elbA ycgX FALSE 0.004 696.000 0.000 NA   NA
 5879246 5879247 EC55989_1251 EC55989_1252 ycgX ycgE FALSE 0.025 221.000 0.000 NA   NA
 5879247 5879248 EC55989_1252 EC55989_1253 ycgE ycgF FALSE 0.134 205.000 0.333 1.000 N NA
 5879249 5879250 EC55989_1254 EC55989_1255 ycgZ ymgA TRUE 0.523 43.000 0.000 NA   NA
 5879250 5879251 EC55989_1255 EC55989_1256 ymgA ymgB TRUE 0.690 29.000 0.000 NA   NA
 5879251 5879252 EC55989_1256 EC55989_1257 ymgB ymgC FALSE 0.167 113.000 0.000 NA   NA
 5879252 5879253 EC55989_1257 EC55989_1258 ymgC ycgG FALSE 0.010 332.000 0.000 NA   NA
 5879253 5879254 EC55989_1258 EC55989_1259 ycgG ymgF FALSE 0.122 132.000 0.000 NA   NA
 5879254 5879255 EC55989_1259 EC55989_1260 ymgF   FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 5879255 5879256 EC55989_1260 EC55989_1261   insA FALSE 0.032 207.000 0.000 NA   NA
 5879256 5879257 EC55989_1261 EC55989_1262 insA insB TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.027 Y NA
 5879257 5879258 EC55989_1262 EC55989_1263 insB   TRUE 0.886 2.000 0.000 1.000 N NA
 5879259 5879260 EC55989_1264 EC55989_1265 ymgD ymgG TRUE 0.890 10.000 0.000 NA   NA
 5879262 5879263 EC55989_1267 EC55989_1268 minE minD TRUE 0.998 4.000 0.618 NA Y NA
 5879263 5879264 EC55989_1268 EC55989_1269 minD minC TRUE 0.990 24.000 0.466 1.000 Y NA
 5879267 5879268 EC55989_1272 EC55989_1273 ycgL ycgM FALSE 0.290 72.000 0.056 NA   NA
 5879268 5879269 EC55989_1273 EC55989_1274 ycgM ycgN FALSE 0.288 92.000 0.088 NA   NA
 5879270 5879271 EC55989_1275 EC55989_1276 hlyE hlyE FALSE 0.151 120.000 0.000 NA   NA
 5879271 5879272 EC55989_1276 EC55989_1277 hlyE   FALSE 0.207 97.000 0.000 NA   NA
 5879273 5879274 EC55989_misc_RNA_24 EC55989_1278 C0299 umuD FALSE 0.346 60.000 0.000 NA   NA
 5879274 5879275 EC55989_1278 EC55989_1279 umuD umuC TRUE 0.892 0.000 0.000 1.000 N NA
 5879276 5879277 EC55989_1280 EC55989_1281 dsbB nhaB TRUE 0.561 146.000 0.723 1.000 N NA
 5879280 5879281 EC55989_1284 EC55989_1285 dadA dadX TRUE 0.939 10.000 0.168 1.000 N NA
 5879282 5879283 EC55989_1287 EC55989_1288 cvrA ldcA FALSE 0.210 95.000 0.103 NA N NA
 5879286 5879287 EC55989_1291 EC55989_1292 ymgE ycgY FALSE 0.052 178.000 0.000 NA   NA
 5879288 5879289 EC55989_1293 EC55989_1294 treA dhaH FALSE 0.013 320.000 0.000 1.000   NA
 5879289 5879290 EC55989_1294 EC55989_1295 dhaH dhaL TRUE 0.938 11.000 0.118 1.000   NA
 5879290 5879291 EC55989_1295 EC55989_1296 dhaL dhaK TRUE 0.996 11.000 0.226 0.001 Y NA
 5879293 5879294 EC55989_1298 EC55989_1299 ycgV ychF FALSE 0.003 769.000 0.000 1.000 N NA
 5879294 5879295 EC55989_1299 EC55989_1300 ychF pth TRUE 0.703 117.000 0.184 1.000 Y NA
 5879297 5879298 EC55989_1302 EC55989_1303 ychM prsA FALSE 0.062 125.000 0.027 1.000 N NA
 5879298 5879299 EC55989_1303 EC55989_1304 prsA ispE FALSE 0.052 151.000 0.053 1.000 N NA
 5879299 5879300 EC55989_1304 EC55989_1305 ispE lolB TRUE 0.955 0.000 0.157 1.000 N NA
 5879301 5879302 EC55989_1306 EC55989_1307 hemA prfA TRUE 0.818 42.000 0.171 0.042 N NA
 5879302 5879303 EC55989_1307 EC55989_1308 prfA prmC TRUE 0.997 0.000 0.229 0.042 Y NA
 5879303 5879304 EC55989_1308 EC55989_1309 prmC ychQ TRUE 0.942 -3.000 0.109 NA   NA
 5879304 5879305 EC55989_1309 EC55989_1310 ychQ ychA TRUE 0.966 4.000 0.195 NA   NA
 5879305 5879306 EC55989_1310 EC55989_1311 ychA kdsA TRUE 0.720 36.000 0.089 1.000   NA
 5879312 5879313 EC55989_1315 EC55989_1316 chaB chaC FALSE 0.199 137.000 0.140 NA   NA
 5879316 5879317 EC55989_1319 EC55989_1320 narL narX TRUE 0.996 -7.000 0.521 0.014 Y NA
 5879318 5879319 EC55989_1321 EC55989_1322 narK narG FALSE 0.004 516.000 0.000 1.000 N NA
 5879319 5879320 EC55989_1322 EC55989_1323 narG narH TRUE 0.998 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 5879320 5879321 EC55989_1323 EC55989_1324 narH narJ TRUE 0.999 -3.000 0.588 0.003 Y NA
 5879321 5879322 EC55989_1324 EC55989_1325 narJ narI TRUE 0.999 0.000 0.500 0.003 Y NA
 5879322 5879323 EC55989_1325 EC55989_1326 narI   FALSE 0.051 180.000 0.000 NA   NA
 5879324 5879325 EC55989_misc_RNA_27 EC55989_tRNA84 rtt   TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5879325 5879326 EC55989_tRNA84 EC55989_tRNA83     TRUE 0.619 35.000 0.000 NA   NA
 5879326 5879327 EC55989_tRNA83 EC55989_1327   purU FALSE 0.070 160.000 0.000 NA   NA
 5879327 5879328 EC55989_1327 EC55989_1328 purU ychJ TRUE 0.685 50.000 0.200 NA   NA
 5879329 5879330 EC55989_1329 EC55989_1330 rssA rssB FALSE 0.239 92.000 0.048 1.000   NA
 5879330 5879331 EC55989_1330 EC55989_1331 rssB galU FALSE 0.096 202.000 0.235 1.000 N NA
 5879334 5879335 EC55989_1334 EC55989_1335     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5879335 5879336 EC55989_1335 EC55989_1336   ychG TRUE 0.509 -61.000 0.000 NA   NA
 5879336 5879337 EC55989_1336 EC55989_1337 ychG adhE FALSE 0.143 124.000 0.000 NA   NA
 5879340 5879341 EC55989_1340 EC55989_1341 oppA oppB TRUE 0.844 86.000 0.151 0.052 Y NA
 5879341 5879342 EC55989_1341 EC55989_1342 oppB oppC TRUE 0.998 15.000 0.870 0.052 Y NA
 5879342 5879343 EC55989_1342 EC55989_1343 oppC oppD TRUE 0.996 12.000 0.554 1.000 Y NA
 5879343 5879344 EC55989_1343 EC55989_1344 oppD oppF TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 5879345 5879346 EC55989_1345 EC55989_1346 yciU cls TRUE 0.850 35.000 0.231 NA   NA
 5879348 5879349 EC55989_1348 EC55989_1349 kch yciI FALSE 0.012 300.000 0.000 NA   NA
 5879351 5879352 EC55989_1351 EC55989_1352 yciA yciB FALSE 0.272 105.000 0.167 NA N NA
 5879352 5879353 EC55989_1352 EC55989_1353 yciB yciC TRUE 0.688 30.000 0.061 NA   NA
 5879355 5879356 EC55989_1355 EC55989_1356     TRUE 0.840 -22.000 0.000 0.011   NA
 5879356 5879357 EC55989_1356 EC55989_1357     FALSE 0.365 65.000 0.000 1.000   NA
 5879357 5879358 EC55989_1357 EC55989_1358   ydfD FALSE 0.222 93.000 0.000 NA   NA
 5879358 5879359 EC55989_1358 EC55989_1359 ydfD   TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879359 5879360 EC55989_1359 EC55989_misc_RNA_28   dicF FALSE 0.300 70.000 0.000 NA   NA
 5879361 5879362 EC55989_1360 EC55989_1361     TRUE 0.486 -70.000 0.000 NA   NA
 5879363 5879364 EC55989_1362 EC55989_1363     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879364 5879365 EC55989_1363 EC55989_1364   dicA TRUE 0.600 37.000 0.000 NA   NA
 5879366 5879367 EC55989_1365 EC55989_1366     TRUE 0.698 -16.000 0.000 NA   NA
 5879367 5879368 EC55989_1366 EC55989_1367     TRUE 0.468 -73.000 0.000 NA   NA
 5879368 5879369 EC55989_1367 EC55989_1368     TRUE 0.555 41.000 0.000 NA   NA
 5879369 5879370 EC55989_1368 EC55989_1369     FALSE 0.018 253.000 0.000 NA   NA
 5879371 5879372 EC55989_1370 EC55989_1371 ymfD   TRUE 0.995 7.000 1.000 NA   NA
 5879372 5879373 EC55989_1371 EC55989_1372     FALSE 0.057 173.000 0.000 NA   NA
 5879374 5879375 EC55989_1373 EC55989_1374 rem ydfU FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 5879375 5879376 EC55989_1374 EC55989_1375 ydfU   TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5879376 5879377 EC55989_1375 EC55989_1376     FALSE 0.306 -193.000 0.000 NA   NA
 5879377 5879378 EC55989_1376 EC55989_1377   Q TRUE 0.786 -9.000 0.000 NA   NA
 5879378 5879379 EC55989_1377 EC55989_1378 Q   FALSE 0.291 72.000 0.000 NA   NA
 5879379 5879380 EC55989_1378 EC55989_1379     TRUE 0.991 -3.000 0.571 1.000   NA
 5879380 5879381 EC55989_1379 EC55989_1380     FALSE 0.172 111.000 0.000 NA   NA
 5879381 5879382 EC55989_1380 EC55989_tRNA18     FALSE 0.430 50.000 0.000 NA   NA
 5879382 5879383 EC55989_tRNA18 EC55989_tRNA19     FALSE 0.204 98.000 0.000 NA   NA
 5879383 5879384 EC55989_tRNA19 EC55989_1381     FALSE 0.004 977.000 0.000 NA   NA
 5879384 5879385 EC55989_1381 EC55989_1382     FALSE 0.287 73.000 0.000 NA   NA
 5879385 5879386 EC55989_1382 EC55989_1383     TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5879386 5879387 EC55989_1383 EC55989_1384   ydfQ FALSE 0.372 56.000 0.000 NA   NA
 5879387 5879388 EC55989_1384 EC55989_1385 ydfQ Rz TRUE 0.719 -18.000 0.000 1.000   NA
 5879388 5879389 EC55989_1385 EC55989_1386 Rz   FALSE 0.006 417.000 0.000 NA   NA
 5879391 5879392 EC55989_1388 EC55989_1389     FALSE 0.108 138.000 0.000 NA   NA
 5879392 5879393 EC55989_1389 EC55989_1390     TRUE 0.486 -70.000 0.000 NA   NA
 5879393 5879394 EC55989_1390 EC55989_1391     TRUE 0.698 -16.000 0.000 NA   NA
 5879394 5879395 EC55989_1391 EC55989_1392     TRUE 0.922 -3.000 0.000 1.000   NA
 5879395 5879396 EC55989_1392 EC55989_1393     TRUE 0.888 -10.000 0.150 1.000   NA
 5879396 5879397 EC55989_1393 EC55989_1394     TRUE 0.643 37.000 0.000 1.000   NA
 5879397 5879398 EC55989_1394 EC55989_1395     FALSE 0.360 58.000 0.000 NA   NA
 5879398 5879399 EC55989_1395 EC55989_1396     TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5879399 5879400 EC55989_1396 EC55989_1397     TRUE 0.819 -7.000 0.000 NA   NA
 5879400 5879401 EC55989_1397 EC55989_1398     TRUE 0.852 15.000 0.000 NA   NA
 5879401 5879402 EC55989_1398 EC55989_1399     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879402 5879403 EC55989_1399 EC55989_1400     TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5879403 5879404 EC55989_1400 EC55989_1401     TRUE 0.859 14.000 0.000 NA   NA
 5879404 5879405 EC55989_1401 EC55989_1402     TRUE 0.972 27.000 0.667 NA   NA
 5879405 5879406 EC55989_1402 EC55989_1403     TRUE 0.665 -19.000 0.000 NA   NA
 5879406 5879407 EC55989_1403 EC55989_1405     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879407 5879408 EC55989_1405 EC55989_1406     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879408 5879409 EC55989_1406 EC55989_1407     FALSE 0.289 -250.000 0.000 NA   NA
 5879409 5879410 EC55989_1407 EC55989_1408     TRUE 0.927 -102.000 1.000 NA   NA
 5879410 5879411 EC55989_1408 EC55989_1409     FALSE 0.009 343.000 0.000 NA   NA
 5879411 5879412 EC55989_1409 EC55989_1410     FALSE 0.310 68.000 0.000 NA   NA
 5879412 5879413 EC55989_1410 EC55989_1411     FALSE 0.091 152.000 0.000 1.000   NA
 5879413 5879414 EC55989_1411 EC55989_1412   tfaQ TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879417 5879418 EC55989_1415 EC55989_1416 yciE yciF TRUE 0.809 46.000 0.115 0.003   NA
 5879418 5879419 EC55989_1416 EC55989_1417 yciF yciG FALSE 0.242 86.000 0.000 NA   NA
 5879419 5879420 EC55989_1417 EC55989_1418 yciG trpA FALSE 0.007 381.000 0.000 NA   NA
 5879420 5879421 EC55989_1418 EC55989_1419 trpA trpB TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 5879421 5879422 EC55989_1419 EC55989_1420 trpB trpC TRUE 0.995 12.000 0.221 0.001 Y NA
 5879422 5879423 EC55989_1420 EC55989_1421 trpC trpD TRUE 0.995 4.000 0.293 1.000 Y NA
 5879423 5879424 EC55989_1421 EC55989_1422 trpD trpE TRUE 0.993 0.000 0.010 0.001 Y NA
 5879424 5879425 EC55989_1422 EC55989_misc_RNA_29 trpE   TRUE 0.792 22.000 0.000 NA   NA
 5879425 5879426 EC55989_misc_RNA_29 EC55989_5068   trpL TRUE 0.631 -23.000 0.000 NA   NA
 5879427 5879428 EC55989_1423 EC55989_1424 yciV yciO TRUE 0.977 -3.000 0.281 NA   NA
 5879428 5879429 EC55989_1424 EC55989_1425 yciO rluB TRUE 0.729 74.000 0.075 NA Y NA
 5879430 5879431 EC55989_1426 EC55989_1427 btuR yciK TRUE 0.857 -3.000 0.050 1.000 N NA
 5879431 5879432 EC55989_1427 EC55989_1428 yciK   TRUE 0.508 44.000 0.000 NA   NA
 5879435 5879436 EC55989_1431 EC55989_1432   topA FALSE 0.084 123.000 0.003 NA   NA
 5879436 5879437 EC55989_1432 EC55989_1433 topA cysB FALSE 0.009 210.000 0.008 1.000 N NA
 5879437 5879438 EC55989_1433 EC55989_1434 cysB   FALSE 0.012 294.000 0.000 NA   NA
 5879438 5879439 EC55989_1434 EC55989_1435     TRUE 0.956 -18.000 0.556 NA   NA
 5879439 5879440 EC55989_1435 EC55989_1436     FALSE 0.110 137.000 0.000 NA   NA
 5879440 5879441 EC55989_1436 EC55989_1437   acnA FALSE 0.389 54.000 0.000 NA   NA
 5879443 5879444 EC55989_1439 EC55989_1440 pgpB yciS FALSE 0.159 149.000 0.143 NA   NA
 5879444 5879445 EC55989_1440 EC55989_1441 yciS yciM TRUE 0.989 7.000 0.576 NA   NA
 5879445 5879446 EC55989_1441 EC55989_1442 yciM pyrF FALSE 0.056 193.000 0.125 1.000 N NA
 5879446 5879447 EC55989_1442 EC55989_1443 pyrF yciH TRUE 0.872 0.000 0.045 1.000 N NA
 5879448 5879449 EC55989_1444 EC55989_1445 osmB deoT FALSE 0.015 269.000 0.000 NA   NA
 5879449 5879450 EC55989_1445 EC55989_1446 deoT   FALSE 0.388 90.000 0.146 NA   NA
 5879450 5879451 EC55989_1446 EC55989_1447   gmr FALSE 0.234 105.000 0.083 NA   NA
 5879451 5879452 EC55989_1447 EC55989_1448 gmr rnb FALSE 0.015 235.000 0.000 1.000 N NA
 5879452 5879453 EC55989_1448 EC55989_1449 rnb yciW FALSE 0.418 68.000 0.105 NA   NA
 5879453 5879454 EC55989_1449 EC55989_1450 yciW fabI FALSE 0.093 145.000 0.057 NA   NA
 5879454 5879455 EC55989_1450 EC55989_1451 fabI ycjD FALSE 0.009 370.000 0.000 1.000   NA
 5879455 5879456 EC55989_1451 EC55989_1452 ycjD sapF FALSE 0.351 68.000 0.000 1.000   NA
 5879456 5879457 EC55989_1452 EC55989_1453 sapF sapD TRUE 0.999 2.000 0.684 0.015 Y NA
 5879457 5879458 EC55989_1453 EC55989_1454 sapD sapC TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000 Y NA
 5879458 5879459 EC55989_1454 EC55989_1455 sapC sapB TRUE 0.987 -13.000 0.284 0.051 Y NA
 5879459 5879460 EC55989_1455 EC55989_1456 sapB sapA TRUE 0.983 -3.000 0.264 0.051 N NA
 5879460 5879461 EC55989_1456 EC55989_1457 sapA ymjA FALSE 0.011 312.000 0.000 NA   NA
 5879461 5879462 EC55989_1457 EC55989_1458 ymjA puuP FALSE 0.116 134.000 0.000 NA   NA
 5879462 5879463 EC55989_1458 EC55989_1459 puuP puuA FALSE 0.075 303.000 0.000 1.000 Y NA
 5879464 5879465 EC55989_1460 EC55989_1461 puuD puuR TRUE 0.734 27.000 0.046 1.000   NA
 5879465 5879466 EC55989_1461 EC55989_1462 puuR puuC FALSE 0.007 275.000 0.040 1.000 N NA
 5879466 5879467 EC55989_1462 EC55989_1463 puuC puuB TRUE 0.993 2.000 0.500 0.028 N NA
 5879467 5879468 EC55989_1463 EC55989_1464 puuB puuE TRUE 0.925 38.000 0.100 1.000 Y NA
 5879470 5879471 EC55989_1467 EC55989_1468 pspA pspB TRUE 0.907 54.000 0.739 NA   NA
 5879471 5879472 EC55989_1468 EC55989_1469 pspB pspC TRUE 0.996 0.000 0.913 NA   NA
 5879472 5879473 EC55989_1469 EC55989_1470 pspC pspD TRUE 0.952 9.000 0.167 NA   NA
 5879473 5879474 EC55989_1470 EC55989_1471 pspD pspE FALSE 0.425 75.000 0.133 NA   NA
 5879474 5879475 EC55989_1471 EC55989_1472 pspE ycjM FALSE 0.020 212.000 0.000 1.000 N NA
 5879475 5879476 EC55989_1472 EC55989_1473 ycjM ycjN TRUE 0.993 14.000 0.360 1.000 Y NA
 5879476 5879477 EC55989_1473 EC55989_1474 ycjN ycjO TRUE 0.996 21.000 0.620 0.051 Y NA
 5879477 5879478 EC55989_1474 EC55989_1475 ycjO ycjP TRUE 0.996 -13.000 0.805 0.051 Y NA
 5879478 5879479 EC55989_1475 EC55989_1476 ycjP ycjQ TRUE 0.822 31.000 0.205 1.000 N NA
 5879479 5879480 EC55989_1476 EC55989_1477 ycjQ ycjR TRUE 0.933 18.000 0.261 NA N NA
 5879480 5879481 EC55989_1477 EC55989_1478 ycjR ycjS TRUE 0.890 10.000 0.000 NA   NA
 5879481 5879482 EC55989_1478 EC55989_1479 ycjS ycjS TRUE 0.523 43.000 0.000 NA   NA
 5879482 5879483 EC55989_1479 EC55989_1480 ycjS ycjT TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879483 5879484 EC55989_1480 EC55989_1481 ycjT ycjU TRUE 0.922 -3.000 0.000 1.000   NA
 5879484 5879485 EC55989_1481 EC55989_1482 ycjU ycjV TRUE 0.917 14.000 0.103 1.000   NA
 5879485 5879486 EC55989_1482 EC55989_1483 ycjV ompG TRUE 0.784 45.000 0.222 1.000   NA
 5879488 5879489 EC55989_1485 EC55989_1486 ycjX ycjF TRUE 0.994 -3.000 0.791 NA   NA
 5879489 5879490 EC55989_1486 EC55989_1487 ycjF tyrR FALSE 0.158 148.000 0.137 NA   NA
 5879493 5879494 EC55989_1490 EC55989_1491 mpaA ymjC TRUE 0.555 41.000 0.000 NA   NA
 5879494 5879495 EC55989_1491 EC55989_1492 ymjC ycjY FALSE 0.295 71.000 0.000 NA   NA
 5879496 5879497 EC55989_1493 EC55989_1494 ycjZ mppA FALSE 0.006 337.000 0.000 1.000 N NA
 5879500 5879501 EC55989_1497 EC55989_1498 uspE fnr TRUE 0.787 152.000 0.619 1.000 Y NA
 5879501 5879502 EC55989_1498 EC55989_1499 fnr ogt FALSE 0.027 195.000 0.000 1.000 N NA
 5879502 5879503 EC55989_1499 EC55989_1500 ogt abgT TRUE 0.799 11.000 0.000 NA N NA
 5879503 5879504 EC55989_1500 EC55989_1501 abgT   TRUE 0.486 -70.000 0.000 NA   NA
 5879504 5879505 EC55989_1501 EC55989_1502   abgB FALSE 0.404 -87.000 0.000 NA   NA
 5879505 5879506 EC55989_1502 EC55989_1503 abgB abgA TRUE 0.984 0.000 0.128 0.002   NA
 5879507 5879508 EC55989_1504 EC55989_misc_RNA_30 abgR isrA TRUE 0.916 3.000 0.000 NA   NA
 5879508 5879509 EC55989_misc_RNA_30 EC55989_1505 isrA ydaL FALSE 0.059 170.000 0.000 NA   NA
 5879511 5879512 EC55989_1507 EC55989_1508 ydaN   FALSE 0.014 275.000 0.000 NA   NA
 5879512 5879513 EC55989_1508 EC55989_misc_RNA_31   C0343 FALSE 0.347 -118.000 0.000 NA   NA
 5879513 5879514 EC55989_misc_RNA_31 EC55989_1509 C0343 dbpA FALSE 0.281 74.000 0.000 NA   NA
 5879515 5879516 EC55989_1510 EC55989_1511 ydaO uspF FALSE 0.029 176.000 0.000 NA N NA
 5879516 5879517 EC55989_1511 EC55989_1512 uspF ompN FALSE 0.071 141.000 0.000 1.000 N NA
 5879521 5879522 EC55989_1515 EC55989_1516 hslJ ldhA FALSE 0.098 111.000 0.000 NA N NA
 5879523 5879524 EC55989_1517 EC55989_1518 ydbH ynbE TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879524 5879525 EC55989_1518 EC55989_1519 ynbE ydbL TRUE 0.992 8.000 0.726 NA   NA
 5879528 5879529 EC55989_1522 EC55989_1523 tynA maoC FALSE 0.013 248.000 0.000 1.000 N NA
 5879530 5879531 EC55989_1524 EC55989_1525 paaA paaB TRUE 0.993 12.000 0.920 NA   NA
 5879531 5879532 EC55989_1525 EC55989_1526 paaB paaC TRUE 0.994 9.000 0.943 NA   NA
 5879532 5879533 EC55989_1526 EC55989_1527 paaC paaD TRUE 0.991 15.000 0.919 NA   NA
 5879533 5879534 EC55989_1527 EC55989_1528 paaD paaJ TRUE 0.989 8.000 0.571 NA   NA
 5879534 5879535 EC55989_1528 EC55989_1529 paaJ paaF TRUE 0.914 -3.000 0.093 1.000 N NA
 5879535 5879536 EC55989_1529 EC55989_1530 paaF paaG TRUE 0.997 0.000 0.215 0.001 Y NA
 5879536 5879537 EC55989_1530 EC55989_1531 paaG paaH TRUE 0.987 2.000 0.051 1.000 Y NA
 5879537 5879538 EC55989_1531 EC55989_1532 paaH paaI FALSE 0.374 -10.000 0.013 NA N NA
 5879538 5879539 EC55989_1532 EC55989_1533 paaI paaE TRUE 0.866 0.000 0.058 NA N NA
 5879539 5879540 EC55989_1533 EC55989_1534 paaE paaK TRUE 0.906 27.000 0.293 1.000 N NA
 5879540 5879541 EC55989_1534 EC55989_1535 paaK paaX FALSE 0.236 101.000 0.132 NA N NA
 5879541 5879542 EC55989_1535 EC55989_1536 paaX paaY TRUE 0.787 -18.000 0.118 NA   NA
 5879542 5879543 EC55989_1536 EC55989_1537 paaY ydbC FALSE 0.027 230.000 0.000 1.000   NA
 5879543 5879544 EC55989_1537 EC55989_1538 ydbC ydbD FALSE 0.329 64.000 0.000 NA   NA
 5879544 5879545 EC55989_1538 EC55989_1539 ydbD ynbA FALSE 0.059 171.000 0.000 NA   NA
 5879545 5879546 EC55989_1539 EC55989_1540 ynbA ynbB TRUE 0.988 0.000 0.179 0.002   NA
 5879546 5879547 EC55989_1540 EC55989_1541 ynbB ynbC TRUE 0.843 16.000 0.000 NA   NA
 5879547 5879548 EC55989_1541 EC55989_1542 ynbC ynbD TRUE 0.990 14.000 0.285 NA Y NA
 5879550 5879551 EC55989_1544 EC55989_1545 hrpA ydcF FALSE 0.015 272.000 0.000 NA   NA
 5879551 5879552 EC55989_1545 EC55989_1546 ydcF aldA FALSE 0.031 197.000 0.040 NA   NA
 5879558 5879559 EC55989_misc_RNA_34 EC55989_1551 sokB trg FALSE 0.012 299.000 0.000 NA   NA
 5879561 5879562 EC55989_1553 EC55989_1555 ydcJ mdoD FALSE 0.018 255.000 0.000 NA   NA
 5879564 5879565 EC55989_1557 EC55989_1558 ydcH rimL FALSE 0.359 48.000 0.026 NA   NA
 5879567 5879568 EC55989_1560 EC55989_1561 tehA tehB TRUE 0.966 -3.000 0.175 1.000   NA
 5879568 5879569 EC55989_1561 EC55989_1562 tehB ydcL FALSE 0.016 303.000 0.088 NA   NA
 5879570 5879571 EC55989_1563 EC55989_1564     FALSE 0.359 112.000 0.000 0.022   NA
 5879574 5879575 EC55989_1567 EC55989_1568 ydcN ydcP FALSE 0.325 73.000 0.000 1.000   NA
 5879577 5879578 EC55989_1570 EC55989_1571 ydcQ ydcR FALSE 0.295 79.000 0.000 1.000   NA
 5879578 5879579 EC55989_1571 EC55989_1572 ydcR ydcS FALSE 0.122 245.000 0.000 1.000 Y NA
 5879579 5879580 EC55989_1572 EC55989_1573 ydcS ydcT TRUE 0.997 18.000 0.609 0.050 Y NA
 5879580 5879581 EC55989_1573 EC55989_1574 ydcT ydcU TRUE 0.999 1.000 0.643 0.050 Y NA
 5879581 5879582 EC55989_1574 EC55989_1575 ydcU ydcV TRUE 0.997 -10.000 0.821 0.050 Y NA
 5879582 5879583 EC55989_1575 EC55989_1576 ydcV ydcW TRUE 0.907 22.000 0.216 1.000 N NA
 5879583 5879584 EC55989_1576 EC55989_1577 ydcW   FALSE 0.036 210.000 0.000 1.000   NA
 5879584 5879585 EC55989_1577 EC55989_1578   ydcX FALSE 0.005 617.000 0.000 NA   NA
 5879585 5879586 EC55989_1578 EC55989_1579 ydcX ydcY FALSE 0.242 86.000 0.000 NA   NA
 5879587 5879588 EC55989_1580 EC55989_1581 ydcZ yncA TRUE 0.920 -3.000 0.070 NA   NA
 5879589 5879590 EC55989_1582 EC55989_1583 yncB yncC FALSE 0.044 198.000 0.000 1.000   NA
 5879594 5879595 EC55989_1587 EC55989_1588 yncG   FALSE 0.004 1072.000 0.000 NA   NA
 5879595 5879596 EC55989_1588 EC55989_1589   rhsD TRUE 0.629 68.000 0.250 NA   NA
 5879596 5879597 EC55989_1589 EC55989_1590 rhsD   TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879597 5879598 EC55989_1590 EC55989_1591   yhhI FALSE 0.009 336.000 0.000 NA   NA
 5879598 5879599 EC55989_1591 EC55989_1592 yhhI   TRUE 0.579 -33.000 0.000 NA   NA
 5879602 5879603 EC55989_1595 EC55989_1596 yddE narV FALSE 0.295 79.000 0.000 1.000   NA
 5879603 5879604 EC55989_1596 EC55989_1597 narV narW TRUE 0.998 -3.000 0.429 0.003 Y NA
 5879604 5879605 EC55989_1597 EC55989_1598 narW narY TRUE 0.999 0.000 0.714 0.003 Y NA
 5879605 5879606 EC55989_1598 EC55989_1599 narY narZ TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 5879606 5879607 EC55989_1599 EC55989_1601 narZ narU TRUE 0.742 82.000 0.556 1.000 N NA
 5879607 5879608 EC55989_1601 EC55989_1602 narU   FALSE 0.012 324.000 0.000 1.000   NA
 5879608 5879609 EC55989_1602 EC55989_1603   yddL TRUE 0.799 24.000 0.000 1.000   NA
 5879609 5879610 EC55989_1603 EC55989_1604 yddL yddG FALSE 0.039 259.000 0.000 0.094   NA
 5879611 5879612 EC55989_1605 EC55989_1607 fdnG fdnH TRUE 0.997 13.000 0.429 0.002 Y NA
 5879612 5879613 EC55989_1607 EC55989_1608 fdnH fdnI TRUE 0.995 -7.000 0.333 0.002 Y NA
 5879614 5879615 EC55989_1609 EC55989_1610 yddM adhP FALSE 0.345 69.000 0.000 1.000   NA
 5879615 5879616 EC55989_1610 EC55989_1611 adhP sfcA FALSE 0.136 134.000 0.000 1.000   NA
 5879616 5879617 EC55989_1611 EC55989_1612 sfcA bdm FALSE 0.007 396.000 0.000 NA   NA
 5879619 5879620 EC55989_1615 EC55989_1616 ddpF ddpD TRUE 0.992 -7.000 0.219 0.002 Y NA
 5879620 5879621 EC55989_1616 EC55989_1617 ddpD ddpC TRUE 0.995 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 5879621 5879622 EC55989_1617 EC55989_1618 ddpC ddpB TRUE 0.994 -3.000 0.143 0.050 Y NA
 5879622 5879623 EC55989_1618 EC55989_1619 ddpB ddpA TRUE 0.993 2.000 0.091 0.050 Y NA
 5879623 5879624 EC55989_1619 EC55989_1620 ddpA ddpX TRUE 0.865 14.000 0.091 1.000 N NA
 5879624 5879625 EC55989_1620 EC55989_1621 ddpX dos FALSE 0.012 258.000 0.000 1.000 N NA
 5879625 5879626 EC55989_1621 EC55989_1622 dos yddV TRUE 0.982 25.000 0.130 0.004 Y NA
 5879626 5879627 EC55989_1622 EC55989_1623 yddV yddW FALSE 0.009 372.000 0.000 1.000   NA
 5879627 5879628 EC55989_1623 EC55989_1624 yddW gadC FALSE 0.145 131.000 0.000 1.000   NA
 5879628 5879629 EC55989_1624 EC55989_1625 gadC gadB FALSE 0.406 156.000 0.103 1.000 Y NA
 5879629 5879630 EC55989_1625 EC55989_1626 gadB pqqL FALSE 0.010 362.000 0.000 1.000   NA
 5879630 5879631 EC55989_1626 EC55989_1627 pqqL yddB TRUE 0.725 45.000 0.167 1.000   NA
 5879631 5879632 EC55989_1627 EC55989_1628 yddB yddA TRUE 0.776 38.000 0.000 0.063   NA
 5879632 5879633 EC55989_1628 EC55989_1629 yddA ydeM FALSE 0.016 291.000 0.000 1.000   NA
 5879633 5879634 EC55989_1629 EC55989_1630 ydeM ydeN TRUE 0.895 52.000 0.600 1.000   NA
 5879634 5879635 EC55989_1630 EC55989_1631 ydeN ydeO FALSE 0.005 402.000 0.000 1.000 N NA
 5879635 5879636 EC55989_1631 EC55989_1632 ydeO   FALSE 0.276 75.000 0.000 NA   NA
 5879636 5879637 EC55989_1632 EC55989_1633   ydeP FALSE 0.019 248.000 0.000 NA   NA
 5879637 5879638 EC55989_1633 EC55989_1634 ydeP ydeQ FALSE 0.011 334.000 0.000 1.000   NA
 5879638 5879639 EC55989_1634 EC55989_1635 ydeQ ydeR TRUE 0.622 59.000 0.000 0.009   NA
 5879639 5879640 EC55989_1635 EC55989_1636 ydeR ydeS TRUE 0.988 13.000 0.000 0.009 Y NA
 5879640 5879641 EC55989_1636 EC55989_1637 ydeS   TRUE 0.977 14.000 0.000 1.000 Y NA
 5879641 5879642 EC55989_1637 EC55989_1638     TRUE 0.889 42.000 0.000 1.000 Y NA
 5879642 5879643 EC55989_1638 EC55989_1639     FALSE 0.055 352.000 0.000 1.000 Y NA
 5879643 5879644 EC55989_1639 EC55989_1640   yneL FALSE 0.007 408.000 0.000 NA   NA
 5879644 5879645 EC55989_1640 EC55989_1641 yneL hipA FALSE 0.011 318.000 0.000 NA   NA
 5879645 5879646 EC55989_1641 EC55989_1642 hipA hipB TRUE 0.994 0.000 0.675 NA   NA
 5879646 5879647 EC55989_1642 EC55989_1643 hipB   FALSE 0.021 209.000 0.000 1.000 N NA
 5879647 5879648 EC55989_1643 EC55989_1644   lsrK FALSE 0.004 531.000 0.000 1.000 N NA
 5879648 5879649 EC55989_1644 EC55989_1645 lsrK lsrR FALSE 0.192 79.000 0.000 1.000 N NA
 5879650 5879651 EC55989_1646 EC55989_1647 ego lsrC TRUE 0.997 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 5879651 5879652 EC55989_1647 EC55989_1648 lsrC lsrD TRUE 0.999 0.000 0.788 0.050 Y NA
 5879652 5879653 EC55989_1648 EC55989_1649 lsrD lsrB TRUE 0.998 12.000 0.844 NA Y NA
 5879653 5879654 EC55989_1649 EC55989_1650 lsrB lsrF TRUE 0.942 27.000 0.000 NA Y NA
 5879654 5879655 EC55989_1650 EC55989_1651 lsrF lsrG TRUE 0.799 24.000 0.000 1.000   NA
 5879655 5879656 EC55989_1651 EC55989_1652 lsrG tam FALSE 0.409 57.000 0.000 1.000   NA
 5879657 5879658 EC55989_1653 EC55989_1654 yneE uxaB FALSE 0.064 207.000 0.143 NA   NA
 5879658 5879659 EC55989_1654 EC55989_1655 uxaB yneF FALSE 0.016 227.000 0.000 1.000 N NA
 5879659 5879660 EC55989_1655 EC55989_1656 yneF yneG FALSE 0.152 139.000 0.098 NA   NA
 5879660 5879661 EC55989_1656 EC55989_1657 yneG yneH TRUE 0.904 0.000 0.037 NA   NA
 5879661 5879662 EC55989_1657 EC55989_1658 yneH yneI FALSE 0.250 64.000 0.000 1.000 N NA
 5879663 5879664 EC55989_1659 EC55989_1660 yneJ yneK FALSE 0.263 78.000 0.000 NA   NA
 5879664 5879665 EC55989_1660 EC55989_1661 yneK yneK TRUE 0.533 -51.000 0.000 NA   NA
 5879665 5879666 EC55989_1661 EC55989_1662 yneK yneK TRUE 0.601 -27.000 0.000 NA   NA
 5879666 5879667 EC55989_1662 EC55989_1663 yneK ydeA FALSE 0.081 150.000 0.000 NA   NA
 5879669 5879670 EC55989_1665 EC55989_1666 marR marA TRUE 0.997 20.000 0.667 0.045 Y NA
 5879670 5879671 EC55989_1666 EC55989_1667 marA marB TRUE 0.647 32.000 0.000 NA   NA
 5879672 5879673 EC55989_1668 EC55989_1669     TRUE 0.969 19.000 0.000 1.000 Y NA
 5879673 5879674 EC55989_1669 EC55989_1670     TRUE 0.942 56.000 0.250 0.013 Y NA
 5879674 5879675 EC55989_1670 EC55989_1671     TRUE 0.979 25.000 0.105 0.012 Y NA
 5879675 5879676 EC55989_1671 EC55989_1672     TRUE 0.973 76.000 0.789 0.012 Y NA
 5879680 5879681 EC55989_1676 EC55989_1677 ydeH ydeI FALSE 0.018 255.000 0.000 NA   NA
 5879684 5879685 EC55989_1680 EC55989_1681 ydfG ydfH FALSE 0.268 89.000 0.000 1.000   NA
 5879685 5879686 EC55989_1681 EC55989_1682 ydfH ydfZ FALSE 0.052 178.000 0.000 NA   NA
 5879687 5879688 EC55989_1683 EC55989_1684 ydfI ydfJ TRUE 0.676 89.000 0.000 1.000 Y NA
 5879689 5879690 EC55989_1686 EC55989_1687 yciG yciF FALSE 0.287 73.000 0.000 NA   NA
 5879690 5879691 EC55989_1687 EC55989_1688 yciF yciE TRUE 0.831 37.000 0.000 0.003   NA
 5879691 5879692 EC55989_1688 EC55989_1689 yciE   TRUE 0.955 19.000 0.115 0.003   NA
 5879693 5879694 EC55989_1690 EC55989_1691 tfaQ   TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879694 5879695 EC55989_1691 EC55989_1692     FALSE 0.365 65.000 0.000 1.000   NA
 5879695 5879696 EC55989_1692 EC55989_1693     FALSE 0.300 70.000 0.000 NA   NA
 5879696 5879697 EC55989_1693 EC55989_1694     TRUE 0.819 61.000 0.500 NA   NA
 5879697 5879698 EC55989_1694 EC55989_1695     TRUE 0.927 -102.000 1.000 NA   NA
 5879698 5879699 EC55989_1695 EC55989_1696     TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5879699 5879700 EC55989_1696 EC55989_1697     TRUE 0.890 10.000 0.000 NA   NA
 5879700 5879701 EC55989_1697 EC55989_1698     TRUE 0.988 0.000 0.400 NA   NA
 5879701 5879702 EC55989_1698 EC55989_1699     TRUE 0.879 -58.000 0.400 NA   NA
 5879702 5879703 EC55989_1699 EC55989_1700     TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 5879703 5879704 EC55989_1700 EC55989_1701     TRUE 0.822 19.000 0.000 NA   NA
 5879704 5879705 EC55989_1701 EC55989_1702     TRUE 0.956 -64.000 1.000 NA   NA
 5879705 5879706 EC55989_1702 EC55989_1703     TRUE 0.982 -15.000 1.000 NA   NA
 5879706 5879707 EC55989_1703 EC55989_1704     TRUE 0.876 12.000 0.000 NA   NA
 5879707 5879708 EC55989_1704 EC55989_1705     TRUE 0.908 -7.000 0.152 NA   NA
 5879708 5879709 EC55989_1705 EC55989_1706     TRUE 0.919 42.000 0.537 NA   NA
 5879709 5879710 EC55989_1706 EC55989_1707     FALSE 0.310 -247.000 0.049 1.000   NA
 5879710 5879711 EC55989_1707 EC55989_1708     TRUE 0.924 -72.000 0.667 NA   NA
 5879711 5879712 EC55989_1708 EC55989_1709     TRUE 0.980 -9.000 0.667 NA   NA
 5879712 5879713 EC55989_1709 EC55989_1710     TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879713 5879714 EC55989_1710 EC55989_1711     FALSE 0.005 553.000 0.000 NA   NA
 5879716 5879717 EC55989_1713 EC55989_1714 rzpD   TRUE 0.920 2.000 0.000 NA   NA
 5879717 5879718 EC55989_1714 EC55989_1715   ydfQ FALSE 0.143 124.000 0.000 NA   NA
 5879718 5879719 EC55989_1715 EC55989_1716 ydfQ   FALSE 0.372 56.000 0.000 NA   NA
 5879719 5879720 EC55989_1716 EC55989_1717   essD TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5879720 5879721 EC55989_1717 EC55989_1718 essD   FALSE 0.019 252.000 0.000 NA   NA
 5879721 5879722 EC55989_1718 EC55989_1719   tolA FALSE 0.080 151.000 0.000 NA   NA
 5879722 5879723 EC55989_1719 EC55989_1720 tolA   FALSE 0.008 367.000 0.000 NA   NA
 5879723 5879724 EC55989_1720 EC55989_1721     FALSE 0.253 81.000 0.000 NA   NA
 5879724 5879725 EC55989_1721 EC55989_tRNA82     FALSE 0.172 111.000 0.000 NA   NA
 5879727 5879728 EC55989_tRNA81 EC55989_1723     FALSE 0.095 144.000 0.000 NA   NA
 5879728 5879729 EC55989_1723 EC55989_1724     TRUE 0.922 -3.000 0.000 1.000   NA
 5879729 5879730 EC55989_1724 EC55989_1725     FALSE 0.304 -196.000 0.000 NA   NA
 5879730 5879731 EC55989_1725 EC55989_1726   ydfU TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5879731 5879732 EC55989_1726 EC55989_1727 ydfU rem FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 5879732 5879733 EC55989_1727 EC55989_1728 rem   FALSE 0.005 588.000 0.000 NA   NA
 5879733 5879734 EC55989_1728 EC55989_1729     FALSE 0.442 49.000 0.000 NA   NA
 5879734 5879735 EC55989_1729 EC55989_1730     FALSE 0.028 216.000 0.000 NA   NA
 5879735 5879736 EC55989_1730 EC55989_1731     TRUE 0.555 41.000 0.000 NA   NA
 5879736 5879737 EC55989_1731 EC55989_1732     TRUE 0.468 -73.000 0.000 NA   NA
 5879737 5879738 EC55989_1732 EC55989_1733   dicC TRUE 0.698 -16.000 0.000 NA   NA
 5879739 5879740 EC55989_1734 EC55989_1735 dicA ydfA FALSE 0.060 169.000 0.000 NA   NA
 5879740 5879741 EC55989_1735 EC55989_1736 ydfA   TRUE 0.551 -40.000 0.000 NA   NA
 5879741 5879742 EC55989_1736 EC55989_misc_RNA_35   dicF FALSE 0.017 260.000 0.000 NA   NA
 5879742 5879743 EC55989_misc_RNA_35 EC55989_1737 dicF   FALSE 0.300 70.000 0.000 NA   NA
 5879743 5879744 EC55989_1737 EC55989_1738   ydfD TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5879744 5879745 EC55989_1738 EC55989_1739 ydfD   FALSE 0.218 94.000 0.000 NA   NA
 5879745 5879746 EC55989_1739 EC55989_1740   xis FALSE 0.287 73.000 0.000 NA   NA
 5879746 5879747 EC55989_1740 EC55989_1741 xis intQ TRUE 0.814 20.000 0.000 NA   NA
 5879748 5879749 EC55989_1742 EC55989_1743 ynfP rspB FALSE 0.360 58.000 0.000 NA   NA
 5879749 5879750 EC55989_1743 EC55989_misc_RNA_36 rspB RNAout FALSE 0.211 96.000 0.000 NA   NA
 5879752 5879753 EC55989_1745 EC55989_1746 rspB rspA TRUE 0.742 -12.000 0.000 NA   NA
 5879753 5879754 EC55989_1746 EC55989_1747 rspA ynfA FALSE 0.026 206.000 0.020 1.000   NA
 5879755 5879756 EC55989_1748 EC55989_1749 ynfB speG TRUE 0.613 35.000 0.055 NA   NA
 5879758 5879759 EC55989_1751 EC55989_1752 ynfD ynfE FALSE 0.151 199.000 0.304 NA   NA
 5879759 5879760 EC55989_1752 EC55989_1753 ynfE ynfF TRUE 0.942 61.000 0.231 0.001 Y NA
 5879760 5879761 EC55989_1753 EC55989_1754 ynfF ynfG TRUE 0.998 11.000 0.667 0.044 Y NA
 5879761 5879762 EC55989_1754 EC55989_1755 ynfG ynfH TRUE 0.985 2.000 0.333 1.000   NA
 5879762 5879763 EC55989_1755 EC55989_1756 ynfH dmsD TRUE 0.696 43.000 0.125 1.000   NA
 5879763 5879764 EC55989_1756 EC55989_1757 dmsD clcB FALSE 0.057 195.000 0.079 1.000   NA
 5879765 5879766 EC55989_1758 EC55989_1759 ynfK dgsA TRUE 0.494 125.000 0.455 NA N NA
 5879766 5879767 EC55989_1759 EC55989_1760 dgsA ynfL TRUE 0.759 135.000 0.408 NA Y NA
 5879768 5879769 EC55989_1761 EC55989_1762 ynfM asr FALSE 0.006 424.000 0.000 NA   NA
 5879769 5879770 EC55989_1762 EC55989_1763 asr ydgD FALSE 0.014 276.000 0.000 NA   NA
 5879771 5879772 EC55989_1764 EC55989_1765 mdtI mdtJ TRUE 0.996 -13.000 0.869 0.077 Y NA
 5879774 5879775 EC55989_1767 EC55989_1768 pntB pntA TRUE 0.999 11.000 0.745 0.001 Y NA
 5879776 5879777 EC55989_1769 EC55989_1770 ydgH ydgI FALSE 0.087 186.000 0.143 NA   NA
 5879777 5879778 EC55989_1770 EC55989_1771 ydgI folM TRUE 0.700 37.000 0.140 1.000 N NA
 5879780 5879781 EC55989_1774 EC55989_1775 rstA rstB TRUE 0.992 4.000 0.181 1.000 Y NA
 5879781 5879782 EC55989_1775 EC55989_1776 rstB tus TRUE 0.546 76.000 0.200 1.000   NA
 5879783 5879784 EC55989_1777 EC55989_1778 fumC fumA TRUE 0.614 143.000 0.000 0.001 Y NA
 5879785 5879786 EC55989_1779 EC55989_1780 manA ydgA TRUE 0.796 101.000 0.778 NA   NA
 5879787 5879788 EC55989_1781 EC55989_1782 uidC uidB TRUE 0.903 39.000 0.375 1.000   NA
 5879788 5879789 EC55989_1782 EC55989_1783 uidB uidA TRUE 0.994 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 5879789 5879790 EC55989_1783 EC55989_1784 uidA uidR FALSE 0.005 389.000 0.000 1.000 N NA
 5879790 5879791 EC55989_1784 EC55989_1786 uidR hdhA FALSE 0.016 229.000 0.000 1.000 N NA
 5879791 5879792 EC55989_1786 EC55989_1787 hdhA malI FALSE 0.121 112.000 0.000 1.000 N NA
 5879793 5879794 EC55989_1788 EC55989_1789 malX malY TRUE 0.985 10.000 0.531 1.000 N NA
 5879794 5879795 EC55989_1789 EC55989_1790 malY add FALSE 0.257 104.000 0.132 1.000 N NA
 5879797 5879798 EC55989_1792 EC55989_1793 blr ydgT FALSE 0.015 273.000 0.000 NA   NA
 5879798 5879799 EC55989_1793 EC55989_1794 ydgT ydgK FALSE 0.359 86.000 0.120 NA   NA
 5879799 5879800 EC55989_1794 EC55989_1795 ydgK rsxA FALSE 0.437 77.000 0.148 NA   NA
 5879800 5879801 EC55989_1795 EC55989_1796 rsxA rsxB TRUE 0.999 0.000 0.564 0.044 Y NA
 5879801 5879802 EC55989_1796 EC55989_1797 rsxB rsxC TRUE 0.996 -7.000 0.537 0.044 Y NA
 5879802 5879803 EC55989_1797 EC55989_1798 rsxC rsxD TRUE 0.999 1.000 0.814 0.044 Y NA
 5879803 5879804 EC55989_1798 EC55989_1799 rsxD rsxG TRUE 0.999 4.000 0.924 0.044 Y NA
 5879804 5879805 EC55989_1799 EC55989_1800 rsxG rsxE TRUE 0.999 4.000 0.908 0.044 Y NA
 5879805 5879806 EC55989_1800 EC55989_1801 rsxE nth TRUE 0.937 0.000 0.109 1.000 N NA
 5879806 5879807 EC55989_1801 EC55989_1802 nth ydgR FALSE 0.003 611.000 0.000 1.000 N NA
 5879807 5879808 EC55989_1802 EC55989_1803 ydgR gst TRUE 0.514 106.000 0.344 1.000 N NA
 5879809 5879810 EC55989_1804 EC55989_1805 pdxY tyrS FALSE 0.223 59.000 0.041 1.000 N NA
 5879810 5879811 EC55989_1805 EC55989_1806 tyrS pdxH FALSE 0.087 129.000 0.054 1.000 N NA
 5879811 5879812 EC55989_1806 EC55989_1807 pdxH ydhA FALSE 0.286 59.000 0.034 NA   NA
 5879812 5879813 EC55989_1807 EC55989_1808 ydhA anmK FALSE 0.160 98.000 0.034 NA   NA
 5879816 5879817 EC55989_1811 EC55989_1812 ydhI ydhJ TRUE 0.987 3.000 0.412 NA   NA
 5879817 5879818 EC55989_1812 EC55989_1813 ydhJ ydhK TRUE 0.924 0.000 0.000 NA   NA
 5879819 5879820 EC55989_1814 EC55989_1815 sodC ydhF FALSE 0.235 81.000 0.033 1.000   NA
 5879820 5879821 EC55989_1815 EC55989_1816 ydhF ydhL FALSE 0.407 49.000 0.045 NA   NA
 5879822 5879823 EC55989_1817 EC55989_1818 ydhM nemA TRUE 0.883 37.000 0.362 1.000 N NA
 5879823 5879824 EC55989_1818 EC55989_1819 nemA gloA FALSE 0.187 81.000 0.057 1.000 N NA
 5879824 5879825 EC55989_1819 EC55989_1820 gloA rnt FALSE 0.264 103.000 0.136 1.000 N NA
 5879825 5879826 EC55989_1820 EC55989_1821 rnt lhr FALSE 0.255 93.000 0.000 1.000   NA
 5879828 5879829 EC55989_1823 EC55989_1824 ydhO sodB FALSE 0.047 128.000 0.015 1.000 N NA
 5879833 5879834 EC55989_1828 EC55989_1829 ydhC cfa FALSE 0.009 291.000 0.000 1.000 N NA
 5879838 5879839 EC55989_tRNA20 EC55989_tRNA21     TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5879839 5879840 EC55989_tRNA21 EC55989_1834   ydhR FALSE 0.179 108.000 0.000 NA   NA
 5879840 5879841 EC55989_1834 EC55989_1835 ydhR ydhS FALSE 0.140 126.000 0.000 NA   NA
 5879842 5879843 EC55989_1836 EC55989_1837 ydhT ydhU TRUE 0.971 4.000 0.222 NA   NA
 5879843 5879844 EC55989_1837 EC55989_1838 ydhU ydhX TRUE 0.996 -3.000 0.444 NA Y NA
 5879844 5879845 EC55989_1838 EC55989_1839 ydhX ydhW TRUE 0.637 64.000 0.235 NA   NA
 5879845 5879846 EC55989_1839 EC55989_1840 ydhW ydhV TRUE 0.987 4.000 0.458 NA   NA
 5879846 5879847 EC55989_1840 EC55989_1841 ydhV ydhY TRUE 0.997 21.000 0.600 0.014 Y NA
 5879847 5879848 EC55989_1841 EC55989_1842 ydhY ydhZ FALSE 0.006 456.000 0.000 NA   NA
 5879849 5879850 EC55989_1843 EC55989_1844 pykF lpp FALSE 0.008 311.000 0.000 1.000 N NA
 5879851 5879852 EC55989_1845 EC55989_1846 ynhG sufE FALSE 0.095 149.000 0.069 NA   NA
 5879852 5879853 EC55989_1846 EC55989_1847 sufE sufS TRUE 0.946 13.000 0.183 NA   NA
 5879853 5879854 EC55989_1847 EC55989_1848 sufS sufD TRUE 0.957 -3.000 0.193 1.000 N NA
 5879854 5879855 EC55989_1848 EC55989_1849 sufD sufC TRUE 0.981 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 5879855 5879856 EC55989_1849 EC55989_1850 sufC sufB TRUE 0.996 10.000 0.466 1.000 Y NA
 5879856 5879857 EC55989_1850 EC55989_1851 sufB sufA TRUE 0.872 9.000 0.041 NA   NA
 5879859 5879860 EC55989_1852 EC55989_1853 ydiH ydiI TRUE 0.770 19.000 0.032 NA   NA
 5879860 5879861 EC55989_1853 EC55989_1854 ydiI ydiJ TRUE 0.924 -3.000 0.129 NA N NA
 5879862 5879863 EC55989_1855 EC55989_misc_RNA_38 ydiK rprA FALSE 0.044 186.000 0.000 NA   NA
 5879863 5879864 EC55989_misc_RNA_38 EC55989_1856 rprA ydiL FALSE 0.097 143.000 0.000 NA   NA
 5879864 5879865 EC55989_1856 EC55989_1857 ydiL ydiM FALSE 0.299 100.000 0.095 1.000   NA
 5879865 5879866 EC55989_1857 EC55989_1858 ydiM ydiN FALSE 0.132 227.000 0.000 NA Y NA
 5879866 5879867 EC55989_1858 EC55989_1859 ydiN ydiB TRUE 0.844 12.000 0.082 NA N NA
 5879867 5879868 EC55989_1859 EC55989_1860 ydiB aroD TRUE 0.947 31.000 0.113 1.000 Y NA
 5879868 5879869 EC55989_1860 EC55989_1861 aroD ydiF FALSE 0.035 144.000 0.019 1.000 N NA
 5879869 5879870 EC55989_1861 EC55989_1862 ydiF ydiO TRUE 0.995 14.000 0.500 1.000 Y NA
 5879871 5879872 EC55989_1863 EC55989_1864 ydiP   FALSE 0.192 103.000 0.000 NA   NA
 5879873 5879874 EC55989_1865 EC55989_1866 ydiQ ydiR TRUE 0.998 20.000 1.000 0.012 Y NA
 5879874 5879875 EC55989_1866 EC55989_1867 ydiR ydiS TRUE 0.986 56.000 1.000 0.044 Y NA
 5879875 5879876 EC55989_1867 EC55989_1868 ydiS ydiT TRUE 0.998 -3.000 0.400 0.044 Y NA
 5879876 5879877 EC55989_1868 EC55989_1869 ydiT ydiD TRUE 0.909 3.000 0.080 1.000 N NA
 5879879 5879880 EC55989_1871 EC55989_1872 ydiA aroH FALSE 0.170 157.000 0.165 1.000   NA
 5879880 5879881 EC55989_1872 EC55989_1873 aroH ydiE FALSE 0.064 132.000 0.054 NA N NA
 5879882 5879883 EC55989_1874 EC55989_1875 ydiU ydiV FALSE 0.264 63.000 0.031 NA   NA
 5879883 5879884 EC55989_1875 EC55989_1876 ydiV nlpC FALSE 0.010 247.000 0.000 NA N NA
 5879884 5879885 EC55989_1876 EC55989_1877 nlpC btuD FALSE 0.157 78.000 0.000 NA N NA
 5879885 5879886 EC55989_1877 EC55989_1878 btuD btuE TRUE 0.892 0.000 0.000 1.000 N NA
 5879886 5879887 EC55989_1878 EC55989_1879 btuE btuC FALSE 0.329 63.000 0.084 1.000 N NA
 5879887 5879888 EC55989_1879 EC55989_1880 btuC ihfA FALSE 0.084 101.000 0.023 1.000 N NA
 5879888 5879889 EC55989_1880 EC55989_1881 ihfA pheT TRUE 0.957 5.000 0.208 1.000 N NA
 5879889 5879890 EC55989_1881 EC55989_1882 pheT pheS TRUE 0.998 15.000 0.574 0.001 Y NA
 5879890 5879891 EC55989_1882 EC55989_5069 pheS pheM FALSE 0.014 283.000 0.000 NA   NA
 5879891 5879892 EC55989_5069 EC55989_1883 pheM rplT FALSE 0.146 123.000 0.000 NA   NA
 5879892 5879893 EC55989_1883 EC55989_1884 rplT rpmI TRUE 0.988 53.000 0.928 0.010 Y NA
 5879893 5879894 EC55989_1884 EC55989_1885 rpmI infC FALSE 0.207 97.000 0.000 NA   NA
 5879894 5879895 EC55989_1885 EC55989_1886 infC thrS FALSE 0.169 112.000 0.000 NA   NA
 5879896 5879897 EC55989_1887 EC55989_1888     TRUE 0.792 22.000 0.000 NA   NA
 5879899 5879900 EC55989_1890 EC55989_1891 pfkB ydiZ FALSE 0.196 101.000 0.000 NA   NA
 5879900 5879901 EC55989_1891 EC55989_1892 ydiZ yniA FALSE 0.184 106.000 0.000 NA   NA
 5879903 5879904 EC55989_1894 EC55989_1895 yniC ydjM FALSE 0.075 163.000 0.068 NA   NA
 5879904 5879905 EC55989_1895 EC55989_1896 ydjM ydjN FALSE 0.174 133.000 0.102 NA   NA
 5879906 5879907 EC55989_1897 EC55989_1898 ydjO ydjO TRUE 0.890 10.000 0.000 NA   NA
 5879907 5879908 EC55989_1898 EC55989_1899 ydjO cedA FALSE 0.014 277.000 0.000 NA   NA
 5879910 5879911 EC55989_1901 EC55989_1902 chbG chbF TRUE 0.989 13.000 0.429 0.018   NA
 5879911 5879912 EC55989_1902 EC55989_1903 chbF chbR TRUE 0.703 105.000 0.625 1.000 N NA
 5879912 5879913 EC55989_1903 EC55989_1904 chbR chbA TRUE 0.991 8.000 0.727 1.000 N NA
 5879913 5879914 EC55989_1904 EC55989_1905 chbA chbC TRUE 0.987 51.000 0.833 0.012 Y NA
 5879914 5879915 EC55989_1905 EC55989_1906 chbC chbB TRUE 0.947 85.000 0.500 0.012 Y NA
 5879915 5879916 EC55989_1906 EC55989_1907 chbB osmE FALSE 0.015 299.000 0.000 1.000   NA
 5879917 5879918 EC55989_1908 EC55989_1909 nadE ydjQ FALSE 0.007 230.000 0.010 1.000 N NA
 5879919 5879920 EC55989_1910 EC55989_1911 ydjR spy FALSE 0.024 203.000 0.028 NA   NA
 5879920 5879921 EC55989_1911 EC55989_1912 spy astE FALSE 0.005 330.000 0.000 NA N NA
 5879921 5879922 EC55989_1912 EC55989_1913 astE astB TRUE 0.978 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 5879922 5879923 EC55989_1913 EC55989_1914 astB astD TRUE 0.975 -3.000 0.306 1.000 N NA
 5879923 5879924 EC55989_1914 EC55989_1915 astD astA TRUE 0.953 -3.000 0.179 1.000 N NA
 5879924 5879925 EC55989_1915 EC55989_1916 astA astC TRUE 0.998 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 5879926 5879927 EC55989_1917 EC55989_1918 xthA ydjX FALSE 0.038 167.000 0.016 NA   NA
 5879927 5879928 EC55989_1918 EC55989_1919 ydjX ydjY TRUE 0.925 5.000 0.083 NA   NA
 5879928 5879929 EC55989_1919 EC55989_1920 ydjY ydjZ TRUE 0.939 14.000 0.174 NA   NA
 5879929 5879930 EC55989_1920 EC55989_1921 ydjZ ynjA TRUE 0.943 0.000 0.087 NA   NA
 5879930 5879931 EC55989_1921 EC55989_1922 ynjA ynjB TRUE 0.853 10.000 0.032 NA   NA
 5879931 5879932 EC55989_1922 EC55989_1923 ynjB ynjC TRUE 0.990 18.000 0.627 0.049   NA
 5879932 5879933 EC55989_1923 EC55989_1924 ynjC ynjD TRUE 0.993 0.000 0.602 1.000   NA
 5879933 5879934 EC55989_1924 EC55989_1925 ynjD ynjE TRUE 0.467 67.000 0.111 1.000   NA
 5879936 5879937 EC55989_1927 EC55989_1928 nudG gdhA FALSE 0.004 474.000 0.000 1.000 N NA
 5879938 5879939 EC55989_1929 EC55989_1930 ynjI topB FALSE 0.133 128.000 0.000 NA   NA
 5879939 5879940 EC55989_1930 EC55989_1931 topB selD TRUE 0.829 5.000 0.041 1.000 N NA
 5879940 5879941 EC55989_1931 EC55989_1932 selD   TRUE 0.522 -58.000 0.000 NA   NA
 5879941 5879942 EC55989_1932 EC55989_1933   ydjA TRUE 0.736 26.000 0.000 NA   NA
 5879943 5879944 EC55989_1934 EC55989_1935   sppA TRUE 0.529 -57.000 0.000 NA   NA
 5879944 5879945 EC55989_1935 EC55989_1936 sppA ansA FALSE 0.078 167.000 0.113 1.000 N NA
 5879945 5879946 EC55989_1936 EC55989_1937 ansA pncA TRUE 0.795 11.000 0.040 1.000 N NA
 5879947 5879948 EC55989_1938 EC55989_1939 ydjE ydjF TRUE 0.645 117.000 0.125 1.000 Y NA
 5879948 5879949 EC55989_1939 EC55989_1940 ydjF ydjG FALSE 0.294 137.000 0.269 1.000 N NA
 5879949 5879950 EC55989_1940 EC55989_1941 ydjG ydjH TRUE 0.964 10.000 0.269 1.000 N NA
 5879950 5879951 EC55989_1941 EC55989_1942 ydjH ydjI TRUE 0.996 5.000 0.368 1.000 Y NA
 5879951 5879952 EC55989_1942 EC55989_1943 ydjI ydjJ TRUE 0.949 21.000 0.194 0.014 N NA
 5879952 5879953 EC55989_1943 EC55989_1944 ydjJ ydjK FALSE 0.385 82.000 0.167 1.000 N NA
 5879953 5879954 EC55989_1944 EC55989_1945 ydjK ydjL TRUE 0.889 27.000 0.250 1.000 N NA
 5879954 5879955 EC55989_1945 EC55989_1946 ydjL yeaC FALSE 0.008 370.000 0.000 NA   NA
 5879955 5879956 EC55989_1946 EC55989_1947 yeaC msrB TRUE 0.787 42.000 0.216 NA   NA
 5879957 5879958 EC55989_1948 EC55989_1949 gapA yeaD TRUE 0.782 84.000 0.154 1.000 Y NA
 5879959 5879960 EC55989_1950 EC55989_1951 yeaE mipA FALSE 0.252 90.000 0.067 NA   NA
 5879961 5879962 EC55989_1952 EC55989_1953 yeaG yeaH TRUE 0.739 113.000 0.683 NA   NA
 5879962 5879963 EC55989_1953 EC55989_1954 yeaH yeaI FALSE 0.089 147.000 0.000 NA   NA
 5879963 5879964 EC55989_1954 EC55989_1955 yeaI yeaJ FALSE 0.406 181.000 0.000 0.004 Y NA
 5879964 5879965 EC55989_1955 EC55989_1956 yeaJ yeaK TRUE 0.592 43.000 0.083 NA   NA
 5879969 5879970 EC55989_1961 EC55989_1962 yeaN yeaO FALSE 0.252 55.000 0.007 NA   NA
 5879973 5879974 EC55989_1965 EC55989_1966 yeaQ   TRUE 0.876 12.000 0.000 NA   NA
 5879974 5879975 EC55989_1966 EC55989_1967   ydcM TRUE 0.677 30.000 0.000 NA   NA
 5879975 5879976 EC55989_1967 EC55989_1968 ydcM   TRUE 0.641 -22.000 0.000 NA   NA
 5879976 5879977 EC55989_1968 EC55989_1969     FALSE 0.010 331.000 0.000 NA   NA
 5879977 5879978 EC55989_1969 EC55989_1970   yeaR TRUE 0.909 4.000 0.000 NA   NA
 5879978 5879979 EC55989_1970 EC55989_1971 yeaR yeaS FALSE 0.030 173.000 0.000 NA N NA
 5879979 5879980 EC55989_1971 EC55989_1972 yeaS yeaT FALSE 0.097 127.000 0.000 1.000 N NA
 5879981 5879982 EC55989_1973 EC55989_1974 yeaU yeaV FALSE 0.028 416.000 0.333 1.000 N NA
 5879982 5879983 EC55989_1974 EC55989_1975 yeaV yeaW TRUE 0.555 32.000 0.000 1.000 N NA
 5879983 5879984 EC55989_1975 EC55989_1976 yeaW yeaX TRUE 0.488 56.000 0.043 0.044 N NA
 5879985 5879986 EC55989_1977 EC55989_1978 rnd fadD FALSE 0.355 70.000 0.115 1.000 N NA
 5879986 5879987 EC55989_1978 EC55989_1979 fadD yeaY FALSE 0.063 205.000 0.169 1.000 N NA
 5879987 5879988 EC55989_1979 EC55989_1980 yeaY yeaZ FALSE 0.332 40.000 0.024 1.000 N NA
 5879988 5879989 EC55989_1980 EC55989_1981 yeaZ yoaA FALSE 0.348 58.000 0.082 1.000 N NA
 5879990 5879991 EC55989_1982 EC55989_1983 yoaB yoaC FALSE 0.008 363.000 0.000 NA   NA
 5879993 5879994 EC55989_1985 EC55989_1986 pabB yeaB TRUE 0.952 4.000 0.116 1.000   NA
 5879994 5879995 EC55989_1986 EC55989_1987 yeaB sdaA FALSE 0.268 184.000 0.409 1.000   NA
 5879995 5879996 EC55989_1987 EC55989_1988 sdaA adrB FALSE 0.410 131.000 0.389 NA N NA
 5879998 5879999 EC55989_1990 EC55989_1991 manX manY TRUE 0.857 63.000 0.000 0.015 Y NA
 5879999 5880000 EC55989_1991 EC55989_1992 manY manZ TRUE 0.999 4.000 0.939 0.015 Y NA
 5880000 5880001 EC55989_1992 EC55989_1993 manZ yobD TRUE 0.906 55.000 0.755 NA   NA
 5880001 5880002 EC55989_1993 EC55989_1994 yobD   FALSE 0.043 187.000 0.000 NA   NA
 5880002 5880003 EC55989_1994 EC55989_1995   yebN TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5880004 5880005 EC55989_1996 EC55989_1997 rrmA cspC FALSE 0.062 166.000 0.038 1.000   NA
 5880005 5880006 EC55989_1997 EC55989_1998 cspC yobF TRUE 0.953 13.000 0.214 NA   NA
 5880006 5880007 EC55989_1998 EC55989_1999 yobF yebO FALSE 0.005 670.000 0.000 NA   NA
 5880007 5880008 EC55989_1999 EC55989_2000 yebO yobG TRUE 0.769 75.000 0.500 NA   NA
 5880009 5880010 EC55989_2001 EC55989_2002 yobH insA FALSE 0.012 297.000 0.000 NA   NA
 5880010 5880011 EC55989_2002 EC55989_2003 insA insB TRUE 0.898 -81.000 0.000 0.025 Y NA
 5880014 5880015 EC55989_2006 EC55989_2007 htpX prc FALSE 0.069 192.000 0.042 0.020 N NA
 5880015 5880016 EC55989_2007 EC55989_2008 prc proQ TRUE 0.938 20.000 0.304 NA N NA
 5880016 5880017 EC55989_2008 EC55989_2009 proQ yebR TRUE 0.649 97.000 0.081 NA Y NA
 5880018 5880019 EC55989_2010 EC55989_2011 yebS yebT TRUE 0.962 -31.000 0.840 NA   NA
 5880019 5880020 EC55989_2011 EC55989_2012 yebT yebU TRUE 0.707 80.000 0.420 NA   NA
 5880020 5880021 EC55989_2012 EC55989_2013 yebU yebV FALSE 0.246 118.000 0.121 NA   NA
 5880021 5880022 EC55989_2013 EC55989_2014 yebV yebW TRUE 0.960 21.000 0.353 NA   NA
 5880025 5880026 EC55989_misc_RNA_40 EC55989_2016 ryeB   FALSE 0.396 -90.000 0.000 NA   NA
 5880026 5880027 EC55989_2016 EC55989_2017   yebY FALSE 0.244 85.000 0.000 NA   NA
 5880027 5880028 EC55989_2017 EC55989_2018 yebY yebZ TRUE 0.990 13.000 0.704 NA   NA
 5880028 5880029 EC55989_2018 EC55989_2019 yebZ yobA TRUE 0.992 4.000 0.613 1.000   NA
 5880030 5880031 EC55989_2020 EC55989_2021 holE yobB TRUE 0.471 102.000 0.222 1.000   NA
 5880031 5880032 EC55989_2021 EC55989_2022 yobB exoX TRUE 0.969 24.000 0.500 1.000   NA
 5880033 5880034 EC55989_2023 EC55989_2024 ptrB yebE FALSE 0.044 209.000 0.092 NA   NA
 5880034 5880035 EC55989_2024 EC55989_2025 yebE yebF FALSE 0.007 327.000 0.028 NA   NA
 5880035 5880036 EC55989_2025 EC55989_2026 yebF yebG FALSE 0.294 55.000 0.027 NA   NA
 5880038 5880039 EC55989_2028 EC55989_2029 eda edd TRUE 0.981 37.000 0.523 1.000 Y NA
 5880039 5880040 EC55989_2029 EC55989_2030 edd zwf FALSE 0.123 235.000 0.041 1.000 Y NA
 5880041 5880042 EC55989_2032 EC55989_2033 yebK pykA FALSE 0.112 128.000 0.071 1.000 N NA
 5880043 5880044 EC55989_2034 EC55989_2035 lpxM yebA TRUE 0.772 120.000 0.299 1.000 Y NA
 5880044 5880045 EC55989_2035 EC55989_2036 yebA znuA TRUE 0.888 16.000 0.131 1.000 N NA
 5880046 5880047 EC55989_2037 EC55989_2038 znuC znuB TRUE 0.999 -3.000 0.755 0.080 Y NA
 5880048 5880049 EC55989_2039 EC55989_2040 ruvB ruvA TRUE 0.998 9.000 0.549 0.001 Y NA
 5880051 5880052 EC55989_2042 EC55989_2043 ruvC yebC TRUE 0.872 35.000 0.277 NA   NA
 5880052 5880053 EC55989_2043 EC55989_2044 yebC nudB TRUE 0.626 29.000 0.035 NA   NA
 5880053 5880054 EC55989_2044 EC55989_2045 nudB aspS TRUE 0.875 2.000 0.050 1.000 N NA
 5880055 5880056 EC55989_2046 EC55989_2047 yecD yecE TRUE 0.933 -3.000 0.089 NA   NA
 5880056 5880057 EC55989_2047 EC55989_2048 yecE yecN TRUE 0.549 53.000 0.126 NA   NA
 5880057 5880058 EC55989_2048 EC55989_2049 yecN yecO TRUE 0.636 41.000 0.089 NA   NA
 5880058 5880059 EC55989_2049 EC55989_2050 yecO yecP TRUE 0.980 -3.000 0.315 NA   NA
 5880060 5880061 EC55989_2051 EC55989_2052 torZ torY TRUE 0.993 25.000 0.481 0.043 Y NA
 5880061 5880062 EC55989_2052 EC55989_2053 torY cutC FALSE 0.005 388.000 0.000 1.000 N NA
 5880062 5880063 EC55989_2053 EC55989_2054 cutC yecM TRUE 0.859 14.000 0.057 NA   NA
 5880064 5880065 EC55989_2055 EC55989_2056 argS yecT FALSE 0.053 177.000 0.000 NA   NA
 5880066 5880067 EC55989_2057 EC55989_2058 flhE flhA TRUE 0.986 0.000 0.158 0.002   NA
 5880067 5880068 EC55989_2058 EC55989_2059 flhA flhB TRUE 0.993 -7.000 0.287 0.007 Y NA
 5880068 5880069 EC55989_2059 EC55989_2060 flhB cheZ FALSE 0.198 202.000 0.000 1.000 Y NA
 5880069 5880070 EC55989_2060 EC55989_2061 cheZ cheY TRUE 0.981 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5880070 5880071 EC55989_2061 EC55989_2062 cheY cheB TRUE 0.986 15.000 0.000 0.010 Y NA
 5880071 5880072 EC55989_2062 EC55989_2063 cheB cheR TRUE 0.984 3.000 0.025 1.000 Y NA
 5880072 5880073 EC55989_2063 EC55989_2064 cheR tap TRUE 0.983 19.000 0.188 1.000 Y NA
 5880073 5880074 EC55989_2064 EC55989_2065 tap tar TRUE 0.967 46.000 0.235 0.001 Y NA
 5880076 5880077 EC55989_2066 EC55989_2067 cheW cheA TRUE 0.995 21.000 0.447 0.003 Y NA
 5880077 5880078 EC55989_2067 EC55989_2068 cheA motB TRUE 0.998 5.000 0.913 1.000 Y NA
 5880078 5880079 EC55989_2068 EC55989_2069 motB motA TRUE 0.996 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 5880079 5880080 EC55989_2069 EC55989_2070 motA flhC TRUE 0.543 127.000 0.408 1.000   NA
 5880080 5880081 EC55989_2070 EC55989_2071 flhC flhD TRUE 0.976 3.000 0.000 0.001   NA
 5880083 5880084 EC55989_2073 EC55989_2074 otsA otsB TRUE 0.963 -25.000 0.068 0.000 Y NA
 5880084 5880085 EC55989_2074 EC55989_2075 otsB araH FALSE 0.287 167.000 0.037 1.000 Y NA
 5880085 5880086 EC55989_2075 EC55989_2076 araH araG TRUE 0.995 12.000 0.451 1.000 Y NA
 5880086 5880087 EC55989_2076 EC55989_2077 araG araF TRUE 0.966 70.000 0.917 NA Y NA
 5880089 5880090 EC55989_2079 EC55989_misc_RNA_42 yecJ isrB FALSE 0.253 81.000 0.000 NA   NA
 5880091 5880092 EC55989_2080 EC55989_2081   yecR FALSE 0.033 206.000 0.000 NA   NA
 5880092 5880093 EC55989_2081 EC55989_2082 yecR ftn FALSE 0.058 172.000 0.000 NA   NA
 5880096 5880097 EC55989_2085 EC55989_2086 yecA int FALSE 0.008 357.000 0.000 NA   NA
 5880097 5880098 EC55989_2086 EC55989_2087 int   TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5880098 5880099 EC55989_2087 EC55989_2088     TRUE 0.677 30.000 0.000 NA   NA
 5880099 5880100 EC55989_2088 EC55989_2089     TRUE 0.867 16.000 0.074 NA   NA
 5880101 5880102 EC55989_2090 EC55989_2091     TRUE 0.836 17.000 0.000 NA   NA
 5880102 5880103 EC55989_2091 EC55989_2092     FALSE 0.029 212.000 0.000 NA   NA
 5880103 5880104 EC55989_2092 EC55989_2093     TRUE 0.536 -49.000 0.000 NA   NA
 5880104 5880105 EC55989_2093 EC55989_2094     TRUE 0.893 9.000 0.000 NA   NA
 5880105 5880106 EC55989_2094 EC55989_2095     FALSE 0.091 146.000 0.000 NA   NA
 5880106 5880107 EC55989_2095 EC55989_2096     TRUE 0.514 -60.000 0.000 NA   NA
 5880107 5880108 EC55989_2096 EC55989_2097     FALSE 0.099 142.000 0.000 NA   NA
 5880108 5880109 EC55989_2097 EC55989_2098     TRUE 0.896 7.000 0.000 NA   NA
 5880109 5880110 EC55989_2098 EC55989_2099   parM TRUE 0.887 77.000 1.000 NA   NA
 5880110 5880111 EC55989_2099 EC55989_2100 parM   TRUE 0.902 5.000 0.000 NA   NA
 5880111 5880112 EC55989_2100 EC55989_2101     TRUE 0.814 20.000 0.000 NA   NA
 5880112 5880113 EC55989_2101 EC55989_2102     TRUE 0.665 -19.000 0.000 NA   NA
 5880114 5880115 EC55989_2103 EC55989_2104   Q FALSE 0.245 103.000 0.087 NA   NA
 5880115 5880116 EC55989_2104 EC55989_2105 Q P TRUE 0.958 0.000 0.130 NA   NA
 5880117 5880118 EC55989_2106 EC55989_2107 O N