MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia fergusonii ATCC 35469

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5873373 5873374 EFER_4502 EFER_0001 thrL thrA FALSE 0.187 82.000 0.043 1.000   NA
 5873374 5873375 EFER_0001 EFER_0002 thrA thrB TRUE 0.993 2.000 0.133 1.000 Y NA
 5873375 5873376 EFER_0002 EFER_0003 thrB thrC TRUE 0.996 4.000 0.233 1.000 Y NA
 5873376 5873377 EFER_0003 EFER_0004 thrC yaaX FALSE 0.012 213.000 0.003 NA   NA
 5873378 5873379 EFER_0005 EFER_0006 yaaA yaaJ FALSE 0.150 70.000 0.028 NA   NA
 5873380 5873381 EFER_0007 EFER_0008 talB mogA FALSE 0.120 115.000 0.042 1.000 N NA
 5873383 5873384 EFER_0010 EFER_misc_RNA_1 dnaK tpke11 TRUE 0.895 1.000 0.000 NA   NA
 5873384 5873385 EFER_misc_RNA_1 EFER_0011 tpke11 dnaJ TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5873387 5873388 EFER_misc_RNA_2 EFER_0013 sokC nhaA FALSE 0.003 438.000 0.000 NA   NA
 5873388 5873389 EFER_0013 EFER_0014 nhaA nhaR TRUE 0.812 38.000 0.292 1.000 N NA
 5873391 5873392 EFER_0016 EFER_0017 yaaY ribF TRUE 0.877 8.000 0.019 NA   NA
 5873392 5873393 EFER_0017 EFER_0018 ribF ileS TRUE 0.743 43.000 0.254 1.000 N NA
 5873393 5873394 EFER_0018 EFER_0020 ileS lspA TRUE 0.907 0.000 0.045 1.000 N NA
 5873394 5873395 EFER_0020 EFER_0021 lspA fkpB FALSE 0.334 108.000 0.154 1.000 N NA
 5873395 5873396 EFER_0021 EFER_0022 fkpB ispH TRUE 0.995 2.000 0.626 1.000 N NA
 5873396 5873397 EFER_0022 EFER_0023 ispH rihC FALSE 0.134 66.000 0.028 NA N NA
 5873397 5873398 EFER_0023 EFER_0024 rihC   TRUE 0.908 18.000 0.167 NA   NA
 5873399 5873400 EFER_0026 EFER_0027 citB citA TRUE 0.997 -7.000 1.000 1.000 Y NA
 5873400 5873401 EFER_0027 EFER_0028 citA oadB FALSE 0.112 143.000 0.068 1.000 N NA
 5873401 5873402 EFER_0028 EFER_0029 oadB oadA TRUE 0.999 13.000 0.886 0.002 Y NA
 5873402 5873403 EFER_0029 EFER_0030 oadA oadG TRUE 0.998 16.000 0.720 0.002 Y NA
 5873403 5873404 EFER_0030 EFER_0031 oadG citP FALSE 0.365 151.000 0.060 1.000 Y NA
 5873405 5873406 EFER_0032 EFER_0033 citC citD TRUE 0.973 30.000 0.426 1.000 Y NA
 5873406 5873407 EFER_0033 EFER_0034 citD citE TRUE 0.951 -78.000 0.537 0.001 N NA
 5873407 5873408 EFER_0034 EFER_0035 citE citF TRUE 0.991 13.000 0.373 0.001 N NA
 5873408 5873409 EFER_0035 EFER_0036 citF citX TRUE 0.980 0.000 0.231 1.000 N NA
 5873409 5873410 EFER_0036 EFER_0037 citX citG TRUE 0.979 -22.000 0.400 1.000 Y NA
 5873410 5873411 EFER_0037 EFER_0038 citG dapB FALSE 0.031 159.000 0.002 1.000 N NA
 5873413 5873414 EFER_0040 EFER_0041 carA carB TRUE 0.994 18.000 0.345 0.001 Y NA
 5873414 5873415 EFER_0041 EFER_0042 carB caiF FALSE 0.009 261.000 0.000 NA   NA
 5873416 5873417 EFER_0043 EFER_0044 caiE caiD TRUE 0.913 6.000 0.000 1.000   NA
 5873417 5873418 EFER_0044 EFER_0045 caiD caiC TRUE 0.793 53.000 0.000 0.023 Y NA
 5873418 5873419 EFER_0045 EFER_0046 caiC caiB TRUE 0.657 58.000 0.154 0.023 N NA
 5873419 5873420 EFER_0046 EFER_0047 caiB caiA TRUE 0.757 71.000 0.529 1.000 N NA
 5873420 5873421 EFER_0047 EFER_0048 caiA caiT TRUE 0.703 31.000 0.118 1.000 N NA
 5873422 5873423 EFER_0049 EFER_0050 fixA fixB TRUE 0.993 15.000 0.231 0.012 Y NA
 5873423 5873424 EFER_0050 EFER_0051 fixB fixC TRUE 0.793 51.000 0.000 0.054 Y NA
 5873424 5873425 EFER_0051 EFER_0052 fixC fixX TRUE 0.993 -3.000 0.167 0.054 Y NA
 5873425 5873426 EFER_0052 EFER_0053 fixX yaaU FALSE 0.181 59.000 0.000 1.000 N NA
 5873426 5873427 EFER_0053 EFER_0054 yaaU kefF FALSE 0.127 108.000 0.000 1.000   NA
 5873427 5873428 EFER_0054 EFER_0055 kefF kefC TRUE 0.981 -7.000 0.560 1.000   NA
 5873428 5873429 EFER_0055 EFER_0056 kefC folA FALSE 0.020 193.000 0.012 1.000 N NA
 5873429 5873430 EFER_0056 EFER_0057 folA   TRUE 0.614 21.000 0.000 NA   NA
 5873431 5873432 EFER_0058 EFER_0059     FALSE 0.370 36.000 0.000 NA   NA
 5873432 5873433 EFER_0059 EFER_0060   apaH TRUE 0.524 25.000 0.000 NA   NA
 5873433 5873434 EFER_0060 EFER_0061 apaH apaG TRUE 0.984 7.000 0.267 NA N NA
 5873434 5873435 EFER_0061 EFER_0062 apaG ksgA TRUE 0.945 3.000 0.078 NA N NA
 5873435 5873436 EFER_0062 EFER_0063 ksgA pdxA TRUE 0.964 -3.000 0.197 1.000 N NA
 5873436 5873437 EFER_0063 EFER_0064 pdxA surA TRUE 0.993 0.000 0.561 1.000 N NA
 5873437 5873438 EFER_0064 EFER_0065 surA imp TRUE 0.561 54.000 0.182 1.000 N NA
 5873440 5873441 EFER_0067 EFER_0068 rluA hepA TRUE 0.979 12.000 0.294 1.000 N NA
 5873441 5873442 EFER_0068 EFER_0069 hepA polB TRUE 0.487 164.000 0.098 0.069 Y NA
 5873442 5873443 EFER_0069 EFER_0070 polB araD FALSE 0.118 75.000 0.018 1.000 N NA
 5873443 5873444 EFER_0070 EFER_0071 araD araA TRUE 0.477 103.000 0.017 1.000 Y NA
 5873444 5873445 EFER_0071 EFER_0072 araA araB TRUE 0.960 11.000 0.138 1.000 N NA
 5873446 5873447 EFER_0073 EFER_0074 araC   FALSE 0.040 222.000 0.000 0.054 N NA
 5873447 5873448 EFER_0074 EFER_0075     TRUE 0.862 26.000 0.222 1.000 N NA
 5873448 5873449 EFER_0075 EFER_0076     FALSE 0.231 55.000 0.000 1.000   NA
 5873449 5873450 EFER_0076 EFER_0077     TRUE 0.991 13.000 0.667 NA   NA
 5873450 5873451 EFER_0077 EFER_0078     TRUE 0.994 10.000 0.600 NA   NA
 5873451 5873452 EFER_0078 EFER_0079   yabI FALSE 0.031 184.000 0.000 NA   NA
 5873453 5873454 EFER_0080 EFER_0081 thiQ thiP TRUE 0.976 -16.000 0.522 0.020 N NA
 5873454 5873455 EFER_0081 EFER_0082 thiP tbpA TRUE 0.976 -24.000 0.697 0.075 N NA
 5873455 5873456 EFER_0082 EFER_0083 tbpA sgrR FALSE 0.103 164.000 0.010 0.075   NA
 5873457 5873458 EFER_misc_RNA_3 EFER_0085 sgrS setA TRUE 0.467 28.000 0.000 NA   NA
 5873459 5873460 EFER_0086 EFER_0087     TRUE 0.902 4.000 0.000 NA   NA
 5873462 5873463 EFER_0089 EFER_0090 aroD   TRUE 0.691 18.000 0.019 1.000   NA
 5873463 5873464 EFER_0090 EFER_0091     TRUE 0.565 -70.000 0.082 1.000   NA
 5873464 5873465 EFER_0091 EFER_0092     TRUE 0.763 19.000 0.061 1.000 N NA
 5873465 5873466 EFER_0092 EFER_0093   leuD FALSE 0.009 266.000 0.000 1.000 N NA
 5873466 5873467 EFER_0093 EFER_0094 leuD leuC TRUE 0.998 11.000 0.309 0.001 Y NA
 5873467 5873468 EFER_0094 EFER_0095 leuC leuB TRUE 0.998 3.000 0.275 0.002 Y NA
 5873468 5873469 EFER_0095 EFER_0096 leuB leuA TRUE 0.996 0.000 0.126 0.002 Y NA
 5873469 5873470 EFER_0096 EFER_4503 leuA leuL FALSE 0.364 90.000 0.010 0.002   NA
 5873471 5873472 EFER_0097 EFER_0099 leuO ilvI FALSE 0.005 317.000 0.000 1.000 N NA
 5873472 5873473 EFER_0099 EFER_0100 ilvI ilvH TRUE 0.999 3.000 0.371 0.002 Y NA
 5873473 5873474 EFER_0100 EFER_0102 ilvH fruR FALSE 0.056 181.000 0.063 1.000 N NA
 5873474 5873475 EFER_0102 EFER_0103 fruR mraZ FALSE 0.002 594.000 0.000 NA   NA
 5873475 5873476 EFER_0103 EFER_0104 mraZ mraW TRUE 0.995 2.000 0.635 NA   NA
 5873476 5873477 EFER_0104 EFER_0105 mraW ftsL TRUE 0.970 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5873477 5873478 EFER_0105 EFER_0106 ftsL ftsI TRUE 0.902 16.000 0.124 1.000 N NA
 5873478 5873479 EFER_0106 EFER_0107 ftsI murE TRUE 0.935 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 5873479 5873480 EFER_0107 EFER_0108 murE murF TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 5873480 5873481 EFER_0108 EFER_0109 murF mraY TRUE 0.994 -6.000 0.309 0.005 Y NA
 5873481 5873482 EFER_0109 EFER_0110 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.005 Y NA
 5873482 5873483 EFER_0110 EFER_0111 murD ftsW TRUE 0.993 0.000 0.297 0.003 N NA
 5873483 5873484 EFER_0111 EFER_0112 ftsW murG TRUE 0.992 -3.000 0.647 1.000 N NA
 5873484 5873485 EFER_0112 EFER_0113 murG murC TRUE 0.884 54.000 0.283 1.000 Y NA
 5873485 5873486 EFER_0113 EFER_0114 murC ddlB TRUE 0.987 -7.000 0.153 0.005 Y NA
 5873486 5873487 EFER_0114 EFER_0115 ddlB ftsQ TRUE 0.997 2.000 0.372 NA Y NA
 5873487 5873488 EFER_0115 EFER_0116 ftsQ ftsA TRUE 0.983 -3.000 0.389 NA N NA
 5873488 5873489 EFER_0116 EFER_0117 ftsA ftsZ TRUE 0.914 62.000 0.460 1.000 Y NA
 5873489 5873490 EFER_0117 EFER_0118 ftsZ lpxC FALSE 0.316 101.000 0.134 1.000 N NA
 5873490 5873491 EFER_0118 EFER_0119 lpxC secM FALSE 0.039 181.000 0.000 1.000   NA
 5873491 5873492 EFER_0119 EFER_0120 secM secA FALSE 0.301 62.000 0.065 1.000   NA
 5873492 5873493 EFER_0120 EFER_0121 secA mutT TRUE 0.483 63.000 0.168 1.000 N NA
 5873494 5873495 EFER_0122 EFER_0123 yacG yacF TRUE 0.988 10.000 0.356 NA   NA
 5873495 5873496 EFER_0123 EFER_0124 yacF coaE TRUE 0.959 0.000 0.110 NA   NA
 5873498 5873499 EFER_0126 EFER_0127 hofC hofB TRUE 0.977 -43.000 0.571 1.000 Y NA
 5873499 5873500 EFER_0127 EFER_0128 hofB ppdD TRUE 0.998 10.000 0.556 1.000 Y NA
 5873500 5873501 EFER_0128 EFER_0129 ppdD nadC FALSE 0.013 214.000 0.015 1.000 N NA
 5873502 5873503 EFER_0130 EFER_0131 ampD ampE TRUE 0.992 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 5873506 5873507 EFER_misc_RNA_4 EFER_0134 tp2   TRUE 0.752 -4.000 0.000 NA   NA
 5873508 5873509 EFER_0135 EFER_0136 aceE aceF TRUE 0.987 15.000 0.220 1.000 Y NA
 5873509 5873510 EFER_0136 EFER_0137 aceF lpd TRUE 0.495 208.000 0.463 1.000 Y NA
 5873512 5873513 EFER_0139 EFER_0140 acnB yacL FALSE 0.044 197.000 0.068 NA   NA
 5873514 5873515 EFER_0141 EFER_0142 speD speE TRUE 0.980 16.000 0.162 1.000 Y NA
 5873515 5873516 EFER_0142 EFER_0143 speE yacC TRUE 0.581 106.000 0.354 NA   NA
 5873521 5873522 EFER_0148 EFER_0149 yadG yadH TRUE 0.998 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 5873522 5873523 EFER_0149 EFER_0150 yadH yadI FALSE 0.122 105.000 0.037 1.000 N NA
 5873523 5873524 EFER_0150 EFER_0151 yadI yadE TRUE 0.850 57.000 0.222 1.000 Y NA
 5873527 5873528 EFER_0155 EFER_0156 panC panB TRUE 0.998 12.000 0.395 0.001 Y NA
 5873528 5873529 EFER_0156 EFER_0157 panB yadC FALSE 0.101 112.000 0.000 1.000 N NA
 5873529 5873530 EFER_0157 EFER_0158 yadC   TRUE 0.944 25.000 0.000 0.008 Y NA
 5873530 5873531 EFER_0158 EFER_0159   yadL TRUE 0.976 26.000 0.571 0.008   NA
 5873531 5873532 EFER_0159 EFER_0160 yadL yadM TRUE 0.997 6.000 0.571 0.008   NA
 5873532 5873533 EFER_0160 EFER_0161 yadM htrE TRUE 0.984 16.000 0.571 1.000   NA
 5873533 5873534 EFER_0161 EFER_0163 htrE ecpD TRUE 0.987 36.000 1.000 1.000 Y NA
 5873534 5873535 EFER_0163 EFER_0164 ecpD yadN TRUE 0.878 97.000 0.500 1.000 Y NA
 5873535 5873536 EFER_0164 EFER_0165 yadN folK FALSE 0.004 355.000 0.000 1.000 N NA
 5873536 5873537 EFER_0165 EFER_0166 folK pcnB TRUE 0.972 -3.000 0.234 1.000 N NA
 5873537 5873538 EFER_0166 EFER_0167 pcnB yadB TRUE 0.883 39.000 0.131 1.000 Y NA
 5873538 5873539 EFER_0167 EFER_0168 yadB dksA TRUE 0.632 54.000 0.231 1.000 N NA
 5873539 5873540 EFER_0168 EFER_0169 dksA sfsA FALSE 0.128 179.000 0.151 NA   NA
 5873540 5873541 EFER_0169 EFER_0170 sfsA ligT TRUE 0.808 15.000 0.045 NA   NA
 5873542 5873543 EFER_0171 EFER_0172 hrpB mrcB FALSE 0.363 94.000 0.158 1.000 N NA
 5873543 5873544 EFER_0172 EFER_0173 mrcB fhuA FALSE 0.015 220.000 0.000 1.000 N NA
 5873544 5873545 EFER_0173 EFER_0174 fhuA fhuC TRUE 0.838 51.000 0.156 1.000 Y NA
 5873545 5873546 EFER_0174 EFER_0175 fhuC fhuD TRUE 0.984 0.000 0.031 1.000 Y NA
 5873546 5873547 EFER_0175 EFER_0176 fhuD fhuB TRUE 0.975 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5873549 5873550 EFER_0178 EFER_0179 clcA yadR FALSE 0.141 82.000 0.031 NA   NA
 5873551 5873552 EFER_0180 EFER_0181   btuF TRUE 0.774 36.000 0.213 NA   NA
 5873552 5873553 EFER_0181 EFER_0182 btuF pfs TRUE 0.601 -34.000 0.073 1.000 N NA
 5873554 5873555 EFER_0183 EFER_0184 dgt degP FALSE 0.188 130.000 0.101 1.000 N NA
 5873555 5873556 EFER_0184 EFER_0185 degP cdaR FALSE 0.090 158.000 0.080 NA N NA
 5873557 5873558 EFER_0186 EFER_0187 yaeH yaeI FALSE 0.049 158.000 0.000 NA   NA
 5873558 5873559 EFER_0187 EFER_0188 yaeI dapD FALSE 0.260 51.000 0.000 1.000   NA
 5873559 5873560 EFER_0188 EFER_0189 dapD glnD TRUE 0.668 31.000 0.097 1.000 N NA
 5873560 5873561 EFER_0189 EFER_0190 glnD map TRUE 0.591 62.000 0.243 1.000 N NA
 5873562 5873563 EFER_misc_RNA_5 EFER_0191 t44 rpsB TRUE 0.487 27.000 0.000 NA   NA
 5873563 5873564 EFER_0191 EFER_0192 rpsB tsf TRUE 0.876 135.000 0.748 1.000 Y NA
 5873564 5873565 EFER_0192 EFER_0193 tsf pyrH FALSE 0.464 147.000 0.416 1.000 N NA
 5873565 5873566 EFER_0193 EFER_0194 pyrH frr TRUE 0.581 150.000 0.626 1.000 N NA
 5873566 5873567 EFER_0194 EFER_0195 frr dxr FALSE 0.122 93.000 0.032 1.000 N NA
 5873567 5873568 EFER_0195 EFER_0196 dxr ispU FALSE 0.187 186.000 0.025 1.000 Y NA
 5873568 5873569 EFER_0196 EFER_0197 ispU cdsA TRUE 0.995 13.000 0.400 1.000 Y NA
 5873569 5873570 EFER_0197 EFER_0198 cdsA yaeL TRUE 0.921 12.000 0.080 1.000 N NA
 5873570 5873571 EFER_0198 EFER_0199 yaeL yaeT TRUE 0.937 32.000 0.204 1.000 Y NA
 5873571 5873572 EFER_0199 EFER_0201 yaeT hlpA TRUE 0.780 124.000 0.354 1.000 Y NA
 5873572 5873573 EFER_0201 EFER_0202 hlpA lpxD TRUE 0.999 4.000 0.814 1.000 Y NA
 5873573 5873574 EFER_0202 EFER_0203 lpxD fabZ TRUE 0.798 105.000 0.796 1.000 N NA
 5873574 5873575 EFER_0203 EFER_0204 fabZ lpxA TRUE 0.997 4.000 0.850 1.000 N NA
 5873575 5873576 EFER_0204 EFER_0205 lpxA lpxB TRUE 0.996 0.000 0.289 1.000 Y NA
 5873576 5873577 EFER_0205 EFER_0206 lpxB rnhB TRUE 0.963 -3.000 0.186 1.000 N NA
 5873577 5873578 EFER_0206 EFER_0207 rnhB dnaE TRUE 0.879 37.000 0.104 1.000 Y NA
 5873578 5873579 EFER_0207 EFER_0208 dnaE accA TRUE 0.935 13.000 0.122 1.000 N NA
 5873579 5873580 EFER_0208 EFER_0209 accA ldcC FALSE 0.085 98.000 0.010 1.000 N NA
 5873580 5873581 EFER_0209 EFER_0210 ldcC yaeR TRUE 0.652 57.000 0.039 NA Y NA
 5873581 5873582 EFER_0210 EFER_0211 yaeR tilS FALSE 0.108 65.000 0.015 NA N NA
 5873583 5873584 EFER_0212 EFER_0213 rof yaeP TRUE 0.922 -7.000 0.179 NA   NA
 5873585 5873586 EFER_0214 EFER_0215 yaeQ yaeJ TRUE 0.868 -3.000 0.034 1.000   NA
 5873586 5873587 EFER_0215 EFER_0216 yaeJ nlpE TRUE 0.783 14.000 0.027 NA   NA
 5873588 5873589 EFER_0217 EFER_0218 yaeF proS FALSE 0.158 53.000 0.002 NA   NA
 5873589 5873590 EFER_0218 EFER_0219 proS yaeB FALSE 0.140 111.000 0.048 NA   NA
 5873590 5873591 EFER_0219 EFER_0220 yaeB rcsF TRUE 0.973 -3.000 0.247 NA   NA
 5873591 5873592 EFER_0220 EFER_0221 rcsF metQ TRUE 0.638 118.000 0.500 NA   NA
 5873592 5873593 EFER_0221 EFER_0222 metQ metI TRUE 0.969 40.000 0.411 0.058 Y NA
 5873593 5873594 EFER_0222 EFER_0223 metI metN TRUE 0.994 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 5873595 5873596 EFER_0224 EFER_16S_5 gmhB   FALSE 0.004 367.000 0.000 NA   NA
 5873596 5873597 EFER_16S_5 EFER_tRNA1     FALSE 0.152 69.000 0.000 NA   NA
 5873597 5873598 EFER_tRNA1 EFER_tRNA2     FALSE 0.284 43.000 0.000 NA   NA
 5873598 5873599 EFER_tRNA2 EFER_23S_5     FALSE 0.031 184.000 0.000 NA   NA
 5873599 5873600 EFER_23S_5 EFER_5S_6     FALSE 0.115 99.000 0.000 NA   NA
 5873600 5873601 EFER_5S_6 EFER_tRNA3     FALSE 0.215 53.000 0.000 NA   NA
 5873601 5873602 EFER_tRNA3 EFER_0236   dkgB FALSE 0.045 163.000 0.000 NA   NA
 5873604 5873605 EFER_0238 EFER_0239 yafD yafE FALSE 0.227 78.000 0.066 NA   NA
 5873606 5873607 EFER_0240 EFER_0241 mltD gloB TRUE 0.551 72.000 0.233 1.000   NA
 5873610 5873611 EFER_0244 EFER_tRNA4 dnaQ   FALSE 0.074 133.000 0.000 NA   NA
 5873615 5873616 EFER_0248 EFER_0249 lpcA yafJ FALSE 0.125 205.000 0.229 1.000   NA
 5873621 5873622 EFER_tRNA87 EFER_tRNA86     FALSE 0.392 34.000 0.000 NA   NA
 5873622 5873623 EFER_tRNA86 EFER_tRNA85     FALSE 0.392 34.000 0.000 NA   NA
 5873624 5873625 EFER_0254 EFER_0255 mltA ygdL FALSE 0.103 77.000 0.009 1.000 N NA
 5873626 5873627 EFER_0256 EFER_0257 ygdK csdA TRUE 0.987 0.000 0.122 0.001   NA
 5873630 5873631 EFER_0259 EFER_0260 gcvA ygdD TRUE 0.816 19.000 0.081 NA   NA
 5873631 5873632 EFER_0260 EFER_0261 ygdD ygdE TRUE 0.905 -7.000 0.144 NA   NA
 5873633 5873634 EFER_0262 EFER_0263 exo sdaB TRUE 0.579 22.000 0.000 1.000 N NA
 5873634 5873635 EFER_0263 EFER_0264 sdaB sdaC TRUE 0.644 58.000 0.000 1.000 Y NA
 5873635 5873636 EFER_0264 EFER_0265 sdaC ygdH FALSE 0.002 552.000 0.000 NA   NA
 5873636 5873637 EFER_0265 EFER_0266 ygdH queF FALSE 0.192 116.000 0.079 NA   NA
 5873638 5873639 EFER_0267 EFER_misc_RNA_7 syd csrB FALSE 0.016 218.000 0.000 NA   NA
 5873639 5873640 EFER_misc_RNA_7 EFER_0269 csrB   FALSE 0.252 -145.000 0.000 NA   NA
 5873640 5873641 EFER_0269 EFER_0270   truC TRUE 0.993 0.000 0.518 NA   NA
 5873641 5873642 EFER_0270 EFER_0271 truC yqcA TRUE 0.678 18.000 0.000 1.000 N NA
 5873643 5873644 EFER_0272 EFER_0273     TRUE 0.984 1.000 0.250 NA   NA
 5873644 5873645 EFER_0273 EFER_0274     TRUE 0.524 25.000 0.000 NA   NA
 5873646 5873647 EFER_0275 EFER_0276 gudX gudD TRUE 0.968 21.000 0.037 0.001 Y NA
 5873647 5873648 EFER_0276 EFER_0277 gudD   FALSE 0.140 89.000 0.037 1.000 N NA
 5873650 5873651 EFER_0279 EFER_0280 rumA relA FALSE 0.401 51.000 0.082 1.000 N NA
 5873651 5873652 EFER_0280 EFER_0281 relA chpR TRUE 0.535 78.000 0.000 NA Y NA
 5873652 5873653 EFER_0281 EFER_0282 chpR chpA TRUE 0.998 0.000 0.531 NA Y NA
 5873653 5873654 EFER_0282 EFER_0283 chpA mazG FALSE 0.170 71.000 0.000 1.000   NA
 5873654 5873655 EFER_0283 EFER_0284 mazG pyrG FALSE 0.016 228.000 0.025 1.000   NA
 5873655 5873656 EFER_0284 EFER_0285 pyrG eno FALSE 0.215 88.000 0.068 1.000 N NA
 5873657 5873658 EFER_0286 EFER_0287 insG   FALSE 0.156 68.000 0.000 NA   NA
 5873658 5873659 EFER_0287 EFER_0288     FALSE 0.232 -190.000 0.000 NA   NA
 5873659 5873660 EFER_0288 EFER_0290     TRUE 0.744 -6.000 0.000 NA   NA
 5873660 5873661 EFER_0290 EFER_0291   ygcG TRUE 0.763 15.000 0.000 NA   NA
 5873661 5873662 EFER_0291 EFER_0292 ygcG   TRUE 0.642 -10.000 0.000 NA   NA
 5873663 5873664 EFER_0293 EFER_0294 ygcF   FALSE 0.002 550.000 0.000 NA   NA
 11539307 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 339.000 0.000 NA   NA
 11681670 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 339.000 0.000 NA   NA
 11824062 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 339.000 0.000 NA   NA
 11539308 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 368.000 0.000 NA   NA
 11681671 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 368.000 0.000 NA   NA
 11824063 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 368.000 0.000 NA   NA
 11539309 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 400.000 0.000 NA   NA
 11681672 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 400.000 0.000 NA   NA
 11824064 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 400.000 0.000 NA   NA
 11539310 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 429.000 0.000 NA   NA
 11681673 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 429.000 0.000 NA   NA
 11824065 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 429.000 0.000 NA   NA
 11539311 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 461.000 0.000 NA   NA
 11681674 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 461.000 0.000 NA   NA
 11824066 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 461.000 0.000 NA   NA
 11539312 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 490.000 0.000 NA   NA
 11681675 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 490.000 0.000 NA   NA
 11824067 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 490.000 0.000 NA   NA
 11539313 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 522.000 0.000 NA   NA
 11681676 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 522.000 0.000 NA   NA
 11824068 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 522.000 0.000 NA   NA
 5873664 5873665 EFER_0294 EFER_0295     FALSE 0.002 715.000 0.000 NA   NA
 11539314 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 551.000 0.000 NA   NA
 11681677 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 551.000 0.000 NA   NA
 11824069 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 551.000 0.000 NA   NA
 11539315 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11681678 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11824070 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11539316 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 612.000 0.000 NA   NA
 11681679 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 612.000 0.000 NA   NA
 11824071 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 612.000 0.000 NA   NA
 11539317 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 644.000 0.000 NA   NA
 11681680 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 644.000 0.000 NA   NA
 11824072 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 644.000 0.000 NA   NA
 11539318 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 673.000 0.000 NA   NA
 11681681 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 673.000 0.000 NA   NA
 11824073 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 673.000 0.000 NA   NA
 11539319 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 705.000 0.000 NA   NA
 11681682 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 705.000 0.000 NA   NA
 11824074 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 705.000 0.000 NA   NA
 11539320 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 734.000 0.000 NA   NA
 11681683 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 734.000 0.000 NA   NA
 11824075 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 734.000 0.000 NA   NA
 11539321 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 766.000 0.000 NA   NA
 11681684 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 766.000 0.000 NA   NA
 11824076 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 766.000 0.000 NA   NA
 11539322 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 795.000 0.000 NA   NA
 11681685 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 795.000 0.000 NA   NA
 11824077 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 795.000 0.000 NA   NA
 11539323 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 827.000 0.000 NA   NA
 11681686 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 827.000 0.000 NA   NA
 11824078 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 827.000 0.000 NA   NA
 11539324 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 856.000 0.000 NA   NA
 11681687 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 856.000 0.000 NA   NA
 11824079 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 856.000 0.000 NA   NA
 11539325 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11681688 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11824080 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11539326 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 917.000 0.000 NA   NA
 11681689 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 917.000 0.000 NA   NA
 11824081 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 917.000 0.000 NA   NA
 11539327 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 949.000 0.000 NA   NA
 11681690 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 949.000 0.000 NA   NA
 11824082 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 949.000 0.000 NA   NA
 11539328 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 978.000 0.000 NA   NA
 11681691 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 978.000 0.000 NA   NA
 11824083 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 978.000 0.000 NA   NA
 11539329 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1010.000 0.000 NA   NA
 11681692 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1010.000 0.000 NA   NA
 11824084 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1010.000 0.000 NA   NA
 11539330 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1039.000 0.000 NA   NA
 11681693 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1039.000 0.000 NA   NA
 11824085 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1039.000 0.000 NA   NA
 11539331 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1071.000 0.000 NA   NA
 11681694 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1071.000 0.000 NA   NA
 11824086 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1071.000 0.000 NA   NA
 11539332 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1100.000 0.000 NA   NA
 11681695 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1100.000 0.000 NA   NA
 11824087 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1100.000 0.000 NA   NA
 11539333 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1132.000 0.000 NA   NA
 11681696 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1132.000 0.000 NA   NA
 11824088 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1132.000 0.000 NA   NA
 11539334 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1161.000 0.000 NA   NA
 11681697 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1161.000 0.000 NA   NA
 11824089 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1161.000 0.000 NA   NA
 11539335 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1193.000 0.000 NA   NA
 11681698 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1193.000 0.000 NA   NA
 11824090 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1193.000 0.000 NA   NA
 11539336 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1222.000 0.000 NA   NA
 11681699 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1222.000 0.000 NA   NA
 11824091 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1222.000 0.000 NA   NA
 11539337 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1254.000 0.000 NA   NA
 11681700 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1254.000 0.000 NA   NA
 11824092 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1254.000 0.000 NA   NA
 11539338 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1283.000 0.000 NA   NA
 11681701 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1283.000 0.000 NA   NA
 11824093 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1283.000 0.000 NA   NA
 11539339 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1315.000 0.000 NA   NA
 11681702 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1315.000 0.000 NA   NA
 11824094 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1315.000 0.000 NA   NA
 5873667 5873668 EFER_0298 EFER_0299 cysJ cysI TRUE 0.999 0.000 0.791 0.001 Y NA
 5873668 5873669 EFER_0299 EFER_0300 cysI cysH FALSE 0.390 64.000 0.116 1.000 N NA
 5873669 5873670 EFER_0300 EFER_0302 cysH ygcB FALSE 0.003 358.000 0.003 1.000   NA
 5873670 5873671 EFER_0302 EFER_0303 ygcB ygcL FALSE 0.021 415.000 0.263 NA   NA
 5873671 5873672 EFER_0303 EFER_0304 ygcL ygcK TRUE 0.962 -7.000 0.336 NA   NA
 5873672 5873673 EFER_0304 EFER_0305 ygcK ygcJ TRUE 0.943 13.000 0.138 NA   NA
 5873673 5873674 EFER_0305 EFER_0306 ygcJ ygcI TRUE 0.977 3.000 0.171 NA   NA
 5873674 5873675 EFER_0306 EFER_0307 ygcI ygcH TRUE 0.924 -13.000 0.282 NA   NA
 5873675 5873676 EFER_0307 EFER_0308 ygcH ygbT TRUE 0.983 16.000 0.589 NA   NA
 5873676 5873677 EFER_0308 EFER_0309 ygbT ygbF TRUE 0.994 2.000 0.509 NA   NA
 11539340 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4167.000 0.000 NA   NA
 11681703 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4167.000 0.000 NA   NA
 11824095 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4167.000 0.000 NA   NA
 11539341 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4196.000 0.000 NA   NA
 11681704 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4196.000 0.000 NA   NA
 11824096 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4196.000 0.000 NA   NA
 11539342 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4228.000 0.000 NA   NA
 11681705 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4228.000 0.000 NA   NA
 11824097 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4228.000 0.000 NA   NA
 11539343 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4257.000 0.000 NA   NA
 11681706 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4257.000 0.000 NA   NA
 11824098 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4257.000 0.000 NA   NA
 11539344 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4289.000 0.000 NA   NA
 11681707 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4289.000 0.000 NA   NA
 11824099 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4289.000 0.000 NA   NA
 11539345 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4318.000 0.000 NA   NA
 11681708 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4318.000 0.000 NA   NA
 11824100 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4318.000 0.000 NA   NA
 11539346 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4350.000 0.000 NA   NA
 11681709 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4350.000 0.000 NA   NA
 11824101 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4350.000 0.000 NA   NA
 11539347 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4379.000 0.000 NA   NA
 11681710 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4379.000 0.000 NA   NA
 11824102 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4379.000 0.000 NA   NA
 11539348 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4411.000 0.000 NA   NA
 11681711 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4411.000 0.000 NA   NA
 11824103 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4411.000 0.000 NA   NA
 11539349 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4440.000 0.000 NA   NA
 11681712 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4440.000 0.000 NA   NA
 11824104 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4440.000 0.000 NA   NA
 11539350 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4472.000 0.000 NA   NA
 11681713 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4472.000 0.000 NA   NA
 11824105 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4472.000 0.000 NA   NA
 11539351 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4501.000 0.000 NA   NA
 11681714 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4501.000 0.000 NA   NA
 11824106 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4501.000 0.000 NA   NA
 11539352 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4533.000 0.000 NA   NA
 11681715 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4533.000 0.000 NA   NA
 11824107 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4533.000 0.000 NA   NA
 11539353 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4562.000 0.000 NA   NA
 11681716 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4562.000 0.000 NA   NA
 11824108 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4562.000 0.000 NA   NA
 5873678 5873679 EFER_0310 EFER_0311     TRUE 0.543 -19.000 0.000 NA   NA
 11539354 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4594.000 0.000 NA   NA
 11681717 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4594.000 0.000 NA   NA
 11824109 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4594.000 0.000 NA   NA
 11539355 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4623.000 0.000 NA   NA
 11681718 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4623.000 0.000 NA   NA
 11824110 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4623.000 0.000 NA   NA
 11539356 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4655.000 0.000 NA   NA
 11681719 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4655.000 0.000 NA   NA
 11824111 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4655.000 0.000 NA   NA
 11539357 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4684.000 0.000 NA   NA
 11681720 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4684.000 0.000 NA   NA
 11824112 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4684.000 0.000 NA   NA
 5873679 5873680 EFER_0311 EFER_0312     FALSE 0.179 61.000 0.000 NA   NA
 11539358 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4716.000 0.000 NA   NA
 11681721 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4716.000 0.000 NA   NA
 11824113 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4716.000 0.000 NA   NA
 11539359 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4745.000 0.000 NA   NA
 11681722 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4745.000 0.000 NA   NA
 11824114 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4745.000 0.000 NA   NA
 11539360 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4777.000 0.000 NA   NA
 11681723 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4777.000 0.000 NA   NA
 11824115 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4777.000 0.000 NA   NA
 11539361 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4806.000 0.000 NA   NA
 11681724 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4806.000 0.000 NA   NA
 11824116 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4806.000 0.000 NA   NA
 11539362 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4838.000 0.000 NA   NA
 11681725 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4838.000 0.000 NA   NA
 11824117 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4838.000 0.000 NA   NA
 11539363 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4867.000 0.000 NA   NA
 11681726 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4867.000 0.000 NA   NA
 11824118 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4867.000 0.000 NA   NA
 5873680 5873681 EFER_0312 EFER_0313   iap FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 11539364 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4900.000 0.000 NA   NA
 11681727 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4900.000 0.000 NA   NA
 11824119 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4900.000 0.000 NA   NA
 11539365 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4929.000 0.000 NA   NA
 11681728 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4929.000 0.000 NA   NA
 11824120 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4929.000 0.000 NA   NA
 11539366 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4961.000 0.000 NA   NA
 11681729 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4961.000 0.000 NA   NA
 11824121 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4961.000 0.000 NA   NA
 11539367 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4990.000 0.000 NA   NA
 11681730 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4990.000 0.000 NA   NA
 11824122 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4990.000 0.000 NA   NA
 11539368 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5022.000 0.000 NA   NA
 11681731 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5022.000 0.000 NA   NA
 11824123 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5022.000 0.000 NA   NA
 11539369 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5051.000 0.000 NA   NA
 11681732 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5051.000 0.000 NA   NA
 11824124 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5051.000 0.000 NA   NA
 11539370 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5083.000 0.000 NA   NA
 11681733 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5083.000 0.000 NA   NA
 11824125 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5083.000 0.000 NA   NA
 11539371 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5112.000 0.000 NA   NA
 11681734 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5112.000 0.000 NA   NA
 11824126 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5112.000 0.000 NA   NA
 11539372 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5144.000 0.000 NA   NA
 11681735 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5144.000 0.000 NA   NA
 11824127 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5144.000 0.000 NA   NA
 11539373 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5173.000 0.000 NA   NA
 11681736 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5173.000 0.000 NA   NA
 11824128 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5173.000 0.000 NA   NA
 11539374 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5205.000 0.000 NA   NA
 11681737 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5205.000 0.000 NA   NA
 11824129 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5205.000 0.000 NA   NA
 11539375 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5234.000 0.000 NA   NA
 11681738 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5234.000 0.000 NA   NA
 11824130 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5234.000 0.000 NA   NA
 11539376 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5266.000 0.000 NA   NA
 11681739 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5266.000 0.000 NA   NA
 11824131 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5266.000 0.000 NA   NA
 11539377 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5295.000 0.000 NA   NA
 11681740 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5295.000 0.000 NA   NA
 11824132 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5295.000 0.000 NA   NA
 11539378 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5327.000 0.000 NA   NA
 11681741 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5327.000 0.000 NA   NA
 11824133 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5327.000 0.000 NA   NA
 5873682 5873683 EFER_0315 EFER_0316 cysD cysN TRUE 0.997 2.000 0.574 0.001 N NA
 5873683 5873684 EFER_0316 EFER_0317 cysN cysC TRUE 0.996 0.000 0.340 1.000 Y NA
 5873684 5873685 EFER_0317 EFER_0318 cysC ygbE TRUE 0.952 14.000 0.198 NA   NA
 5873685 5873686 EFER_0318 EFER_0320 ygbE ftsB FALSE 0.036 175.000 0.028 NA   NA
 5873686 5873687 EFER_0320 EFER_0321 ftsB ispD TRUE 0.906 19.000 0.185 1.000 N NA
 5873687 5873688 EFER_0321 EFER_0322 ispD ispF TRUE 0.997 0.000 0.419 1.000 Y NA
 5873688 5873689 EFER_0322 EFER_0323 ispF truD TRUE 0.963 -3.000 0.173 1.000   NA
 5873689 5873690 EFER_0323 EFER_0324 truD surE TRUE 0.896 -19.000 0.235 1.000   NA
 5873690 5873691 EFER_0324 EFER_0325 surE pcm TRUE 0.972 -6.000 0.353 1.000   NA
 5873693 5873694 EFER_0327 EFER_0328 nlpD rpoS FALSE 0.117 180.000 0.142 1.000 N NA
 5873696 5873697 EFER_0330 EFER_0331     TRUE 0.982 0.000 0.000 NA Y NA
 5873697 5873698 EFER_0331 EFER_0332     TRUE 0.866 11.000 0.000 NA   NA
 5873699 5873700 EFER_0333 EFER_0334 pphB mutS FALSE 0.129 106.000 0.000 1.000   NA
 5873700 5873701 EFER_0334 EFER_0335 mutS eryD FALSE 0.012 239.000 0.000 1.000 N NA
 5873701 5873702 EFER_0335 EFER_0336 eryD eryC TRUE 0.906 27.000 0.333 NA   NA
 5873702 5873703 EFER_0336 EFER_0337 eryC eryB TRUE 0.795 -169.000 0.389 NA   NA
 5873703 5873704 EFER_0337 EFER_0338 eryB eryA TRUE 0.994 9.000 0.350 0.003 N NA
 5873705 5873706 EFER_0339 EFER_0340     TRUE 0.994 -3.000 0.786 NA   NA
 5873706 5873707 EFER_0340 EFER_0341     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 5873707 5873708 EFER_0341 EFER_0342     TRUE 0.927 87.000 0.727 NA Y NA
 5873708 5873709 EFER_0342 EFER_0343     TRUE 0.997 5.000 0.333 NA Y NA
 5873709 5873710 EFER_0343 EFER_0344   ygbA FALSE 0.063 146.000 0.000 NA   NA
 5873711 5873712 EFER_0345 EFER_0346   fhlA TRUE 0.881 32.000 0.231 0.094 N NA
 5873712 5873713 EFER_0346 EFER_0347 fhlA hypE FALSE 0.049 148.000 0.019 1.000 N NA
 5873713 5873714 EFER_0347 EFER_0348 hypE hypD TRUE 0.948 39.000 0.353 1.000 Y NA
 5873714 5873715 EFER_0348 EFER_0349 hypD hypC TRUE 0.981 0.000 0.021 NA Y NA
 5873715 5873716 EFER_0349 EFER_0350 hypC hypB TRUE 0.968 -9.000 0.139 NA Y NA
 5873716 5873717 EFER_0350 EFER_0351 hypB hypA TRUE 0.995 4.000 0.306 0.002   NA
 5873718 5873719 EFER_0352 EFER_0353 hycA hycB FALSE 0.064 143.000 0.000 NA   NA
 5873719 5873720 EFER_0353 EFER_0354 hycB hycC TRUE 0.989 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 5873720 5873721 EFER_0354 EFER_0355 hycC hycD TRUE 0.997 3.000 0.382 1.000 Y NA
 5873721 5873722 EFER_0355 EFER_0356 hycD hycE TRUE 0.982 18.000 0.235 1.000 Y NA
 5873722 5873723 EFER_0356 EFER_0357 hycE hycF TRUE 0.997 10.000 0.200 0.002 Y NA
 5873723 5873724 EFER_0357 EFER_0358 hycF hycG TRUE 0.996 0.000 0.111 0.002 Y NA
 5873724 5873725 EFER_0358 EFER_0359 hycG hycH TRUE 0.956 -3.000 0.156 NA   NA
 5873725 5873726 EFER_0359 EFER_0360 hycH hycI TRUE 0.965 -7.000 0.360 NA   NA
 5873727 5873728 EFER_0361 EFER_0362 ascB ascF TRUE 0.998 9.000 0.485 1.000 Y NA
 5873729 5873730 EFER_0363 EFER_0365 ascG hydN FALSE 0.367 149.000 0.316 1.000 N NA
 5873730 5873731 EFER_0365 EFER_0366 hydN hypF FALSE 0.043 153.000 0.018 1.000 N NA
 5873732 5873733 EFER_misc_RNA_8 EFER_0367 C0664 norW TRUE 0.881 10.000 0.000 NA   NA
 5873733 5873734 EFER_0367 EFER_0368 norW norV TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5873739 5873740 EFER_0374 EFER_0375 ygaD recA FALSE 0.267 80.000 0.082 NA   NA
 5873740 5873741 EFER_0375 EFER_0376 recA recX TRUE 0.631 68.000 0.296 1.000   NA
 5873741 5873742 EFER_0376 EFER_0377 recX alaS FALSE 0.187 128.000 0.085 1.000   NA
 5873742 5873743 EFER_0377 EFER_0378 alaS csrA FALSE 0.011 235.000 0.020 1.000 N NA
 5873743 5873744 EFER_0378 EFER_tRNA5 csrA   FALSE 0.006 315.000 0.000 NA   NA
 5873744 5873745 EFER_tRNA5 EFER_tRNA6     TRUE 0.902 4.000 0.000 NA   NA
 5873745 5873746 EFER_tRNA6 EFER_tRNA7     FALSE 0.022 200.000 0.000 NA   NA
 5873746 5873747 EFER_tRNA7 EFER_tRNA8     FALSE 0.173 63.000 0.000 NA   NA
 5873747 5873748 EFER_tRNA8 EFER_tRNA9     FALSE 0.022 199.000 0.000 NA   NA
 5873748 5873749 EFER_tRNA9 EFER_0379   yqaB FALSE 0.007 280.000 0.000 NA   NA
 5873749 5873750 EFER_0379 EFER_0380 yqaB yqaA TRUE 0.905 -3.000 0.067 NA   NA
 5873750 5873751 EFER_0380 EFER_0381 yqaA gshA FALSE 0.251 73.000 0.071 NA   NA
 5873754 5873755 EFER_0383 EFER_0384     TRUE 0.982 -3.000 0.344 NA   NA
 5873755 5873756 EFER_0384 EFER_0385   emrB FALSE 0.010 258.000 0.000 NA   NA
 5873756 5873757 EFER_0385 EFER_0386 emrB emrA TRUE 0.989 17.000 0.875 1.000 N NA
 5873757 5873758 EFER_0386 EFER_0387 emrA mprA FALSE 0.207 127.000 0.107 1.000 N NA
 5873758 5873759 EFER_0387 EFER_0388 mprA ygaH FALSE 0.204 91.000 0.065 NA   NA
 5873759 5873760 EFER_0388 EFER_0389 ygaH ygaZ TRUE 0.986 -10.000 0.915 NA   NA
 5873760 5873761 EFER_0389 EFER_0390 ygaZ   FALSE 0.117 125.000 0.060 NA N NA
 5873761 5873762 EFER_0390 EFER_0391   proX FALSE 0.106 192.000 0.174 NA N NA
 5873762 5873763 EFER_0391 EFER_0392 proX proW TRUE 0.969 58.000 0.695 0.053 Y NA
 5873763 5873764 EFER_0392 EFER_0393 proW proV TRUE 0.995 -7.000 0.630 1.000 Y NA
 5873764 5873765 EFER_0393 EFER_0394 proV nrdF FALSE 0.004 356.000 0.000 1.000 N NA
 5873765 5873766 EFER_0394 EFER_0395 nrdF nrdE TRUE 0.993 10.000 0.000 0.001 Y NA
 5873766 5873767 EFER_0395 EFER_0396 nrdE nrdI TRUE 0.868 -27.000 0.000 NA Y NA
 5873767 5873768 EFER_0396 EFER_0397 nrdI nrdH TRUE 0.986 -3.000 0.440 NA N NA
 5873768 5873769 EFER_0397 EFER_0398 nrdH   FALSE 0.019 209.000 0.000 NA   NA
 5873775 5873776 EFER_0404 EFER_0405 ygaP ygaV TRUE 0.938 10.000 0.083 NA N NA
 5873777 5873778 EFER_0406 EFER_0407 yqaE ygaU FALSE 0.150 84.000 0.027 1.000   NA
 5873779 5873780 EFER_0408 EFER_0409 csiR gabP TRUE 0.973 21.000 0.625 1.000 N NA
 5873780 5873781 EFER_0409 EFER_0410 gabP gabT FALSE 0.158 237.000 0.121 1.000 Y NA
 5873781 5873782 EFER_0410 EFER_0411 gabT gabD TRUE 0.970 14.000 0.303 1.000 N NA
 5873782 5873783 EFER_0411 EFER_0412 gabD ygaF TRUE 0.606 23.000 0.000 1.000   NA
 5873783 5873784 EFER_0412 EFER_0413 ygaF ygaT TRUE 0.637 20.000 0.000 NA   NA
 5873786 5873787 EFER_0415 EFER_0416 yahB yahC FALSE 0.122 92.000 0.000 NA   NA
 5873788 5873789 EFER_0417 EFER_0418 yahD yahE TRUE 0.921 40.000 0.667 NA   NA
 5873789 5873790 EFER_0418 EFER_0419 yahE yahF TRUE 0.962 -10.000 0.429 NA   NA
 5873790 5873791 EFER_0419 EFER_0420 yahF yahG TRUE 0.995 0.000 0.714 NA   NA
 5873791 5873792 EFER_0420 EFER_0421 yahG yahI FALSE 0.313 96.000 0.125 NA   NA
 5873792 5873793 EFER_0421 EFER_0422 yahI yahJ TRUE 0.983 10.000 0.278 1.000 N NA
 5873794 5873795 EFER_0423 EFER_0424 yjhP yjhX TRUE 0.940 10.000 0.077 NA   NA
 5873796 5873797 EFER_0425 EFER_0426 yahK yahK FALSE 0.244 -160.000 0.000 NA   NA
 5873798 5873799 EFER_0427 EFER_0428     TRUE 0.934 28.000 0.000 0.003 Y NA
 5873800 5873801 EFER_0429 EFER_0430     TRUE 0.995 2.000 0.200 1.000 Y NA
 5873801 5873802 EFER_0430 EFER_0431     TRUE 0.945 -9.000 0.042 1.000 Y NA
 5873802 5873803 EFER_0431 EFER_0432     TRUE 0.983 -3.000 0.083 NA Y NA
 5873803 5873804 EFER_0432 EFER_0433     TRUE 0.765 -43.000 0.182 NA   NA
 5873804 5873805 EFER_0433 EFER_0434     FALSE 0.135 85.000 0.029 NA   NA
 5873805 5873806 EFER_0434 EFER_0435     FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 5873806 5873807 EFER_0435 EFER_0436     FALSE 0.378 -48.000 0.000 NA   NA
 5873808 5873809 EFER_0437 EFER_0438     FALSE 0.002 507.000 0.000 NA   NA
 5873809 5873810 EFER_0438 EFER_0439     FALSE 0.015 225.000 0.000 NA   NA
 5873810 5873811 EFER_0439 EFER_0440     FALSE 0.020 206.000 0.000 NA   NA
 5873811 5873812 EFER_0440 EFER_0441     TRUE 0.763 15.000 0.000 NA   NA
 5873812 5873813 EFER_0441 EFER_0442     FALSE 0.070 136.000 0.000 NA   NA
 5873813 5873814 EFER_0442 EFER_0443     TRUE 0.990 -7.000 1.000 NA   NA
 5873814 5873815 EFER_0443 EFER_0444   cI TRUE 0.709 -7.000 0.000 NA   NA
 5873815 5873816 EFER_0444 EFER_0445 cI   FALSE 0.032 183.000 0.000 NA   NA
 5873817 5873818 EFER_0446 EFER_0447     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5873818 5873819 EFER_0447 EFER_0448     FALSE 0.143 74.000 0.000 NA   NA
 5873820 5873821 EFER_0449 EFER_0450   int TRUE 0.548 24.000 0.000 NA   NA
 5873821 5873822 EFER_0450 EFER_misc_RNA_10 int ssrA FALSE 0.093 119.000 0.000 NA   NA
 5873822 5873823 EFER_misc_RNA_10 EFER_0452 ssrA   FALSE 0.225 -229.000 0.000 NA   NA
 5873823 5873824 EFER_0452 EFER_0453   smpB FALSE 0.003 416.000 0.000 NA   NA
 5873825 5873826 EFER_0454 EFER_0455 yfjG yfjF TRUE 0.859 -10.000 0.124 NA   NA
 5873827 5873828 EFER_0456 EFER_0457 smpA recN FALSE 0.079 149.000 0.049 1.000 N NA
 5873828 5873829 EFER_0457 EFER_0458 recN ppnK FALSE 0.409 86.000 0.170 1.000 N NA
 5873831 5873832 EFER_0460 EFER_0461 yfjD ypjD TRUE 0.563 111.000 0.349 NA   NA
 5873833 5873834 EFER_0462 EFER_0463 ffh rpsP FALSE 0.455 137.000 0.361 1.000 N NA
 5873834 5873835 EFER_0463 EFER_0464 rpsP rimM TRUE 0.992 19.000 0.342 0.012 Y NA
 5873835 5873836 EFER_0464 EFER_0465 rimM trmD TRUE 0.984 31.000 0.672 1.000 Y NA
 5873836 5873837 EFER_0465 EFER_0466 trmD rplS TRUE 0.965 42.000 0.567 1.000 Y NA
 5873839 5873840 EFER_0468 EFER_0469 aroF tyrA TRUE 0.980 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5873841 5873842 EFER_0470 EFER_4504 pheA pheL FALSE 0.114 100.000 0.000 NA   NA
 5873842 5873843 EFER_4504 EFER_0471 pheL yfiA FALSE 0.112 104.000 0.000 NA   NA
 5873843 5873844 EFER_0471 EFER_0472 yfiA yfiO FALSE 0.006 268.000 0.004 NA   NA
 5873845 5873846 EFER_0473 EFER_0474 rluD yfiH TRUE 0.959 -3.000 0.168 NA   NA
 5873846 5873847 EFER_0474 EFER_misc_RNA_11 yfiH ryfD TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5873847 5873848 EFER_misc_RNA_11 EFER_0475 ryfD clpB TRUE 0.520 -22.000 0.000 NA   NA
 5873848 5873849 EFER_0475 EFER_16S_6 clpB   FALSE 0.003 443.000 0.000 NA   NA
 5873849 5873850 EFER_16S_6 EFER_tRNA11     FALSE 0.132 86.000 0.000 NA   NA
 5873850 5873851 EFER_tRNA11 EFER_23S_6     FALSE 0.026 194.000 0.000 NA   NA
 5873851 5873852 EFER_23S_6 EFER_5S_7     FALSE 0.120 94.000 0.000 NA   NA
 5873852 5873853 EFER_5S_7 EFER_0486   kgtP FALSE 0.005 330.000 0.000 NA   NA
 5873854 5873855 EFER_0487 EFER_0488 yfiM pssA FALSE 0.251 97.000 0.089 NA   NA
 5873855 5873856 EFER_0488 EFER_0489 pssA yfiQ FALSE 0.409 114.000 0.121 0.061 N NA
 5873856 5873857 EFER_0489 EFER_0490 yfiQ yfiP TRUE 0.814 32.000 0.222 NA   NA
 5873857 5873858 EFER_0490 EFER_0491 yfiP trxC FALSE 0.300 69.000 0.084 NA   NA
 5873859 5873860 EFER_0492 EFER_0493   yfiF TRUE 0.642 -10.000 0.000 NA   NA
 5873862 5873863 EFER_0495 EFER_0496 yfiD yfiE FALSE 0.007 288.000 0.000 NA   NA
 5873867 5873868 EFER_0501 EFER_0502 rpoE rseA TRUE 0.945 33.000 0.705 NA N NA
 5873868 5873869 EFER_0502 EFER_0503 rseA rseB TRUE 0.999 0.000 0.856 NA Y NA
 5873869 5873870 EFER_0503 EFER_0504 rseB rseC TRUE 0.997 -3.000 0.609 NA Y NA
 5873870 5873871 EFER_0504 EFER_0505 rseC lepA FALSE 0.025 198.000 0.045 NA N NA
 5873871 5873872 EFER_0505 EFER_0506 lepA lepB TRUE 0.938 16.000 0.187 1.000   NA
 5873872 5873873 EFER_0506 EFER_0507 lepB rnc FALSE 0.028 273.000 0.117 1.000   NA
 5873873 5873874 EFER_0507 EFER_0508 rnc era TRUE 0.974 -3.000 0.127 0.048   NA
 5873874 5873875 EFER_0508 EFER_0509 era recO TRUE 0.948 12.000 0.109 1.000   NA
 5873875 5873876 EFER_0509 EFER_0510 recO pdxJ TRUE 0.960 12.000 0.166 1.000 N NA
 5873876 5873877 EFER_0510 EFER_0511 pdxJ acpS TRUE 0.987 0.000 0.326 1.000 N NA
 5873879 5873880 EFER_misc_RNA_13 EFER_0512 ryfB   FALSE 0.235 -183.000 0.000 NA   NA
 5873881 5873882 EFER_0513 EFER_0514 yfhL yfhH FALSE 0.279 56.000 0.056 NA   NA
 5873883 5873884 EFER_0515 EFER_0516 yfhB tadA TRUE 0.619 25.000 0.062 NA N NA
 5873886 5873887 EFER_0518 EFER_misc_RNA_14 purL tke1 FALSE 0.005 333.000 0.000 NA   NA
 5873887 5873888 EFER_misc_RNA_14 EFER_0519 tke1 yfhK FALSE 0.120 94.000 0.000 NA   NA
 5873888 5873889 EFER_0519 EFER_0520 yfhK yfhG FALSE 0.044 165.000 0.029 NA   NA
 5873889 5873890 EFER_0520 EFER_0521 yfhG yfhA TRUE 0.646 -10.000 0.029 NA   NA
 5873890 5873891 EFER_0521 EFER_0522 yfhA glnB FALSE 0.460 61.000 0.146 1.000 N NA
 5873891 5873892 EFER_0522 EFER_0523 glnB adk FALSE 0.010 251.000 0.000 1.000 N NA
 5873892 5873893 EFER_0523 EFER_0525 adk hemH FALSE 0.057 132.000 0.013 1.000 N NA
 5873895 5873896 EFER_0527 EFER_0528 gsk   FALSE 0.050 156.000 0.000 NA   NA
 5873896 5873897 EFER_0528 EFER_0529     FALSE 0.148 71.000 0.000 NA   NA
 5873898 5873899 EFER_0530 EFER_0531 ybaL fsr FALSE 0.010 234.000 0.000 NA N NA
 5873901 5873902 EFER_misc_RNA_15 EFER_0533 rybC   FALSE 0.132 86.000 0.000 NA   NA
 5873902 5873903 EFER_0533 EFER_0534     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5873903 5873904 EFER_0534 EFER_0535   ybaK TRUE 0.548 24.000 0.000 NA   NA
 5873907 5873908 EFER_0537 EFER_0538   ybaQ TRUE 0.830 36.000 0.286 NA   NA
 5873910 5873911 EFER_0540 EFER_0541 ybaT siiCA FALSE 0.004 347.000 0.000 1.000 N NA
 5873911 5873912 EFER_0541 EFER_0542 siiCA siiEA FALSE 0.108 109.000 0.000 NA   NA
 5873912 5873913 EFER_0542 EFER_0543 siiEA siiBA TRUE 0.980 4.000 0.200 NA   NA
 5873913 5873914 EFER_0543 EFER_0544 siiBA siiDA TRUE 0.928 -3.000 0.000 0.082 N NA
 5873914 5873915 EFER_0544 EFER_0545 siiDA cueR TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5873916 5873917 EFER_0546 EFER_0547 ybbJ ybbK TRUE 0.994 -3.000 0.313 NA Y NA
 5873918 5873919 EFER_0548 EFER_0549 ybbL ybbM TRUE 0.538 -13.000 0.012 NA   NA
 5873920 5873921 EFER_0550 EFER_0551 ybbN ybbO FALSE 0.437 61.000 0.118 1.000   NA
 5873921 5873922 EFER_0551 EFER_0552 ybbO tesA TRUE 0.802 -10.000 0.072 1.000   NA
 5873923 5873924 EFER_0553 EFER_0554 ybbA ybbP TRUE 0.997 -3.000 0.535 1.000 Y NA
 5873924 5873925 EFER_0554 EFER_0555 ybbP   FALSE 0.013 237.000 0.000 NA   NA
 5873925 5873926 EFER_0555 EFER_0556     FALSE 0.116 98.000 0.000 NA   NA
 5873926 5873927 EFER_0556 EFER_0557     FALSE 0.002 469.000 0.000 NA   NA
 5873927 5873928 EFER_0557 EFER_0558     FALSE 0.003 427.000 0.000 NA   NA
 5873930 5873931 EFER_0560 EFER_0561 ylbF ybcF TRUE 0.984 -3.000 0.375 NA   NA
 5873932 5873933 EFER_0562 EFER_0563 purK purK FALSE 0.427 31.000 0.000 NA   NA
 5873933 5873934 EFER_0563 EFER_0564 purK purE TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5873934 5873935 EFER_0564 EFER_0565 purE   FALSE 0.082 96.000 0.002 NA   NA
 5873935 5873936 EFER_0565 EFER_0566   lpxH FALSE 0.076 111.000 0.005 NA   NA
 5873936 5873937 EFER_0566 EFER_0567 lpxH ppiB TRUE 0.985 3.000 0.237 1.000   NA
 5873939 5873940 EFER_0569 EFER_0570 ybcI ybcJ FALSE 0.085 108.000 0.011 NA   NA
 5873940 5873941 EFER_0570 EFER_0571 ybcJ folD TRUE 0.939 2.000 0.055 1.000   NA
 5873943 5873944 EFER_0572 EFER_0573 intD yfdT FALSE 0.014 227.000 0.000 NA   NA
 5873944 5873945 EFER_0573 EFER_0574 yfdT yfdS TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5873945 5873946 EFER_0574 EFER_0575 yfdS yfdR TRUE 0.672 -9.000 0.000 NA   NA
 5873946 5873947 EFER_0575 EFER_0576 yfdR yfdQ FALSE 0.094 128.000 0.039 NA   NA
 5873947 5873948 EFER_0576 EFER_0577 yfdQ   TRUE 0.566 66.000 0.233 NA   NA
 5873949 5873950 EFER_0578 EFER_0579     FALSE 0.038 172.000 0.000 NA   NA
 5873954 5873955 EFER_0583 EFER_0584   ymfL FALSE 0.319 -82.000 0.000 NA   NA
 5873955 5873956 EFER_0584 EFER_0585 ymfL ymfM TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5873956 5873957 EFER_0585 EFER_0587 ymfM   TRUE 0.881 10.000 0.000 NA   NA
 5873957 5873958 EFER_0587 EFER_0588   yfdN TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5873958 5873959 EFER_0588 EFER_0589 yfdN   FALSE 0.437 -33.000 0.000 NA   NA
 5873959 5873960 EFER_0589 EFER_0590     TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 5873960 5873961 EFER_0590 EFER_0591   rusA TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 5873961 5873962 EFER_0591 EFER_0592 rusA   TRUE 0.986 20.000 1.000 NA   NA
 5873962 5873963 EFER_0592 EFER_0593     TRUE 0.996 2.000 0.667 NA   NA
 5873963 5873964 EFER_0593 EFER_0594     TRUE 0.901 3.000 0.000 NA   NA
 5873966 5873967 EFER_0596 EFER_0597 S r TRUE 0.902 4.000 0.000 NA   NA
 5873967 5873968 EFER_0597 EFER_0598 r   TRUE 0.905 -16.000 0.250 NA   NA
 5873968 5873969 EFER_0598 EFER_0599     FALSE 0.002 514.000 0.000 NA   NA
 5873969 5873970 EFER_0599 EFER_0600     FALSE 0.203 128.000 0.105 NA   NA
 5873970 5873971 EFER_0600 EFER_0601     FALSE 0.240 117.000 0.105 NA   NA
 5873971 5873972 EFER_0601 EFER_0602     TRUE 0.966 -3.000 0.200 NA   NA
 5873972 5873973 EFER_0602 EFER_0603   ymfR TRUE 0.948 12.000 0.120 NA   NA
 5873973 5873974 EFER_0603 EFER_0604 ymfR   TRUE 0.994 0.000 0.600 NA   NA
 5873974 5873975 EFER_0604 EFER_0605     TRUE 0.775 -58.000 0.222 NA   NA
 5873975 5873976 EFER_0605 EFER_0606     TRUE 0.938 15.000 0.174 NA   NA
 5873976 5873977 EFER_0606 EFER_0607     FALSE 0.430 50.000 0.087 NA   NA
 5873977 5873978 EFER_0607 EFER_0608     TRUE 0.989 3.000 0.333 NA   NA
 5873978 5873979 EFER_0608 EFER_0609     TRUE 0.894 -3.000 0.058 NA   NA
 5873979 5873980 EFER_0609 EFER_0610     TRUE 0.564 -25.000 0.047 NA   NA
 5873980 5873981 EFER_0610 EFER_0611     TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 5873981 5873982 EFER_0611 EFER_0612     TRUE 0.991 9.000 0.417 NA   NA
 5873982 5873983 EFER_0612 EFER_0613     TRUE 0.977 -16.000 0.800 NA   NA
 5873983 5873984 EFER_0613 EFER_0614     TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 5873984 5873985 EFER_0614 EFER_0615     TRUE 0.997 0.000 0.900 NA   NA
 5873985 5873986 EFER_0615 EFER_0616     FALSE 0.274 142.000 0.200 NA   NA
 5873986 5873987 EFER_0616 EFER_0617     FALSE 0.135 82.000 0.000 NA   NA
 5873987 5873988 EFER_0617 EFER_0618     FALSE 0.124 91.000 0.000 NA   NA
 5873988 5873989 EFER_0618 EFER_0619     TRUE 0.974 -3.000 0.250 NA   NA
 5873989 5873990 EFER_0619 EFER_0620     TRUE 0.930 0.000 0.062 NA   NA
 5873990 5873991 EFER_0620 EFER_0621     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 5873991 5873992 EFER_0621 EFER_0622     TRUE 0.779 -13.000 0.083 NA   NA
 5873992 5873993 EFER_0622 EFER_0623   ymfQ TRUE 0.828 -9.000 0.083 NA   NA
 5873993 5873994 EFER_0623 EFER_0624 ymfQ   TRUE 0.902 4.000 0.000 NA   NA
 5873994 5873995 EFER_0624 EFER_0625     TRUE 0.503 -24.000 0.000 NA   NA
 5873998 5873999 EFER_0628 EFER_0629 yfdH yfdG TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5873999 5874000 EFER_0629 EFER_0632 yfdG hmp FALSE 0.004 372.000 0.000 1.000   NA
 5874004 5874005 EFER_0637 EFER_0638 csiE yfhR FALSE 0.028 196.000 0.000 1.000   NA
 5874005 5874006 EFER_0638 EFER_0639 yfhR suhB FALSE 0.063 134.000 0.003 1.000   NA
 5874007 5874008 EFER_0640 EFER_0641 yfhQ iscR FALSE 0.028 270.000 0.126 1.000 N NA
 5874008 5874009 EFER_0641 EFER_0642 iscR iscS FALSE 0.146 241.000 0.424 1.000 N NA
 5874009 5874010 EFER_0642 EFER_0643 iscS iscU TRUE 0.928 28.000 0.448 1.000 N NA
 5874010 5874011 EFER_0643 EFER_0644 iscU iscA TRUE 0.984 17.000 0.359 0.002   NA
 5874011 5874012 EFER_0644 EFER_0645 iscA hscB TRUE 0.702 96.000 0.500 1.000   NA
 5874012 5874013 EFER_0645 EFER_0646 hscB hscA TRUE 0.995 17.000 0.634 1.000 Y NA
 5874013 5874014 EFER_0646 EFER_0647 hscA fdx TRUE 0.996 2.000 0.794 1.000 N NA
 5874014 5874015 EFER_0647 EFER_0648 fdx yfhJ TRUE 0.993 12.000 0.625 1.000   NA
 5874015 5874016 EFER_0648 EFER_0649 yfhJ pepB FALSE 0.155 178.000 0.171 1.000   NA
 5874016 5874017 EFER_0649 EFER_0650 pepB sseB FALSE 0.430 119.000 0.253 NA   NA
 5874020 5874021 EFER_misc_RNA_19 EFER_0651 IS128 sseA FALSE 0.046 161.000 0.000 NA   NA
 5874022 5874023 EFER_0652 EFER_0653 yfhM pbpC TRUE 0.996 1.000 0.711 1.000   NA
 5874023 5874024 EFER_0653 EFER_0654 pbpC ndk FALSE 0.042 148.000 0.008 1.000 N NA
 5874024 5874025 EFER_0654 EFER_0655 ndk yfgB FALSE 0.217 150.000 0.156 1.000   NA
 5874025 5874026 EFER_0655 EFER_0656 yfgB yfgA FALSE 0.007 291.000 0.020 1.000   NA
 5874026 5874027 EFER_0656 EFER_0657 yfgA ispG TRUE 0.871 27.000 0.233 1.000   NA
 5874027 5874028 EFER_0657 EFER_0658 ispG hisS FALSE 0.396 111.000 0.207 1.000 N NA
 5874028 5874029 EFER_0658 EFER_0659 hisS yfgM TRUE 0.946 18.000 0.259 1.000   NA
 5874029 5874030 EFER_0659 EFER_0660 yfgM yfgL TRUE 0.991 11.000 0.492 1.000   NA
 5874030 5874031 EFER_0660 EFER_0661 yfgL der FALSE 0.379 119.000 0.203 1.000   NA
 5874031 5874032 EFER_0661 EFER_0662 der   FALSE 0.133 63.000 0.009 NA   NA
 5874032 5874033 EFER_0662 EFER_0663     FALSE 0.027 192.000 0.000 NA   NA
 5874033 5874034 EFER_0663 EFER_0664     TRUE 0.838 50.000 0.500 NA   NA
 5874034 5874035 EFER_0664 EFER_0665     FALSE 0.462 110.000 0.250 NA   NA
 5874037 5874038 EFER_0667 EFER_0668 guaB guaA TRUE 0.888 69.000 0.190 0.001 Y NA
 5874039 5874040 EFER_0669 EFER_0670   yfgI FALSE 0.111 106.000 0.000 NA   NA
 5874040 5874041 EFER_0670 EFER_0671 yfgI yfgH TRUE 0.956 16.000 0.273 NA   NA
 5874042 5874043 EFER_0672 EFER_0673     FALSE 0.004 370.000 0.000 NA   NA
 5874044 5874045 EFER_0674 EFER_0675 ppx ppk TRUE 0.961 -82.000 0.486 1.000 Y NA
 5874045 5874046 EFER_0675 EFER_0676 ppk purN FALSE 0.017 201.000 0.017 1.000 N NA
 5874046 5874047 EFER_0676 EFER_0677 purN purM TRUE 0.996 -3.000 0.230 0.001 Y NA
 5874048 5874049 EFER_0678 EFER_0679 upp uraA TRUE 0.667 86.000 0.101 1.000 Y NA
 5874049 5874050 EFER_0679 EFER_0680 uraA hda FALSE 0.164 72.000 0.048 NA N NA
 5874051 5874052 EFER_0681 EFER_0682 yfgD yfgC TRUE 0.927 21.000 0.259 1.000   NA
 5874054 5874055 EFER_0684 EFER_0685     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5874055 5874056 EFER_0685 EFER_0686   hyfI TRUE 0.946 -7.000 0.250 NA   NA
 5874056 5874057 EFER_0686 EFER_0687 hyfI   TRUE 0.940 -42.000 0.222 1.000 Y NA
 5874057 5874058 EFER_0687 EFER_0688   hyfG TRUE 0.984 10.000 0.044 1.000 Y NA
 5874058 5874059 EFER_0688 EFER_0689 hyfG hyfF TRUE 0.963 -10.000 0.016 0.007 Y NA
 5874059 5874060 EFER_0689 EFER_0690 hyfF hyfE TRUE 0.999 5.000 0.864 0.007 Y NA
 5874060 5874061 EFER_0690 EFER_0691 hyfE hyfD TRUE 0.992 12.000 0.093 0.007 Y NA
 5874061 5874062 EFER_0691 EFER_0692 hyfD hyfC TRUE 0.997 7.000 0.412 1.000 Y NA
 5874062 5874063 EFER_0692 EFER_0693 hyfC   TRUE 0.984 11.000 0.059 1.000 Y NA
 5874063 5874064 EFER_0693 EFER_0694     TRUE 0.816 -54.000 0.000 1.000 Y NA
 5874064 5874065 EFER_0694 EFER_0695   bcp FALSE 0.011 246.000 0.000 1.000 N NA
 5874065 5874066 EFER_0695 EFER_0696 bcp gcvR TRUE 0.955 0.000 0.102 1.000 N NA
 5874067 5874068 EFER_0697 EFER_0698 dapA nlpB TRUE 0.985 17.000 0.267 NA Y NA
 5874068 5874069 EFER_0698 EFER_0700 nlpB purC FALSE 0.012 212.000 0.019 NA N NA
 5874069 5874070 EFER_0700 EFER_0702 purC ypfJ FALSE 0.029 168.000 0.006 NA   NA
 5874070 5874071 EFER_0702 EFER_0703 ypfJ ypfI TRUE 0.764 15.000 0.029 NA   NA
 5874071 5874072 EFER_0703 EFER_0704 ypfI ypfH FALSE 0.143 74.000 0.000 NA   NA
 5874073 5874074 EFER_0705 EFER_0706 ypfN dapE FALSE 0.450 28.000 0.025 NA   NA
 5874074 5874075 EFER_0706 EFER_0707 dapE yffB TRUE 0.987 4.000 0.292 1.000 N NA
 5874075 5874076 EFER_0707 EFER_0708 yffB acrD FALSE 0.002 550.000 0.000 1.000 N NA
 5874076 5874077 EFER_0708 EFER_0709 acrD narQ FALSE 0.395 119.000 0.133 0.080 N NA
 5874078 5874079 EFER_0711 EFER_0712 aegA yffH FALSE 0.448 68.000 0.167 1.000 N NA
 5874079 5874080 EFER_0712 EFER_0713 yffH ypfG TRUE 0.568 99.000 0.333 NA   NA
 5874081 5874082 EFER_0714 EFER_0715 tktB talA TRUE 0.992 23.000 0.739 1.000 Y NA
 5874083 5874084 EFER_0716 EFER_0717 maeB ypfE FALSE 0.012 295.000 0.070 1.000 N NA
 5874084 5874085 EFER_0717 EFER_0718 ypfE eutP TRUE 0.969 13.000 0.017 1.000 Y NA
 5874085 5874086 EFER_0718 EFER_0719 eutP eutQ TRUE 0.864 -25.000 0.017 NA Y NA
 5874086 5874087 EFER_0719 EFER_0720 eutQ eutT TRUE 0.991 -3.000 0.214 NA Y NA
 5874087 5874088 EFER_0720 EFER_0721 eutT eutI TRUE 0.932 -3.000 0.095 1.000 N NA
 5874088 5874089 EFER_0721 EFER_0722 eutI cchA TRUE 0.958 39.000 0.455 NA Y NA
 5874089 5874090 EFER_0722 EFER_0723 cchA cchB TRUE 0.695 107.000 0.182 NA Y NA
 5874090 5874091 EFER_0723 EFER_0724 cchB eutE TRUE 0.998 12.000 0.667 NA Y NA
 5874091 5874092 EFER_0724 EFER_0725 eutE eutJ TRUE 0.987 11.000 0.375 1.000 N NA
 5874092 5874093 EFER_0725 EFER_0726 eutJ eutG TRUE 0.972 -10.000 0.556 1.000 N NA
 5874093 5874094 EFER_0726 EFER_0727 eutG eutH FALSE 0.396 117.000 0.222 1.000 N NA
 5874094 5874095 EFER_0727 EFER_0728 eutH eutA TRUE 0.995 -3.000 0.400 NA Y NA
 5874095 5874096 EFER_0728 EFER_0729 eutA eutB TRUE 0.975 12.000 0.000 NA Y NA
 5874096 5874097 EFER_0729 EFER_0730 eutB eutC TRUE 0.967 21.000 0.000 0.001 Y NA
 5874097 5874098 EFER_0730 EFER_0731 eutC eutL TRUE 0.983 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5874098 5874099 EFER_0731 EFER_0732 eutL yffI TRUE 0.921 13.000 0.106 NA N NA
 5874099 5874100 EFER_0732 EFER_0733 yffI yfeG TRUE 0.699 46.000 0.250 NA N NA
 5874101 5874102 EFER_0734 EFER_0735     TRUE 0.727 -36.000 0.133 NA   NA
 5874102 5874103 EFER_0735 EFER_0736   hemF FALSE 0.069 138.000 0.000 NA   NA
 5874103 5874104 EFER_0736 EFER_0737 hemF amiA TRUE 0.892 4.000 0.025 1.000 N NA
 5874105 5874106 EFER_0738 EFER_0739 ypeA yfeZ TRUE 0.714 -13.000 0.059 NA   NA
 5874106 5874107 EFER_0739 EFER_0740 yfeZ yfeY TRUE 0.547 61.000 0.204 NA   NA
 5874107 5874108 EFER_0740 EFER_0741 yfeY yfeX TRUE 0.573 96.000 0.333 NA   NA
 5874109 5874110 EFER_0742 EFER_0743 murQ murP TRUE 0.976 3.000 0.167 1.000 N NA
 5874110 5874111 EFER_0743 EFER_0744 murP yfeU TRUE 0.977 4.000 0.158 1.000   NA
 5874112 5874113 EFER_0745 EFER_0746 yfeT ucpA FALSE 0.075 129.000 0.000 1.000 N NA
 5874113 5874114 EFER_0746 EFER_0748 ucpA cysP FALSE 0.008 304.000 0.043 1.000 N NA
 5874114 5874115 EFER_0748 EFER_0749 cysP cysU TRUE 0.996 0.000 0.479 0.002 N NA
 5874115 5874116 EFER_0749 EFER_0750 cysU cysW TRUE 0.997 0.000 0.583 0.001 N NA
 5874116 5874117 EFER_0750 EFER_0751 cysW cysA TRUE 0.972 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 5874117 5874118 EFER_0751 EFER_0752 cysA cysM FALSE 0.094 135.000 0.049 1.000 N NA
 5874121 5874122 EFER_0755 EFER_0756 crr ptsI TRUE 0.863 41.000 0.000 0.014 Y NA
 5874122 5874123 EFER_0756 EFER_0757 ptsI ptsH TRUE 0.828 47.000 0.000 0.014 Y NA
 5874123 5874124 EFER_0757 EFER_0759 ptsH cysK FALSE 0.003 382.000 0.019 1.000 N NA
 5874124 5874125 EFER_0759 EFER_0761 cysK cysZ FALSE 0.406 164.000 0.122 1.000 Y NA
 5874126 5874127 EFER_0762 EFER_0763 zipA ligA FALSE 0.101 71.000 0.002 1.000 N NA
 5874127 5874128 EFER_0763 EFER_0764 ligA   FALSE 0.269 -91.000 0.017 NA   NA
 5874129 5874130 EFER_0765 EFER_0766 yfeH yfeN FALSE 0.008 277.000 0.000 NA   NA
 5874131 5874132 EFER_0767 EFER_0768 xapA xapB FALSE 0.443 58.000 0.111 1.000   NA
 5874132 5874133 EFER_0768 EFER_0769 xapB xapR FALSE 0.014 370.000 0.130 1.000   NA
 5874134 5874135 EFER_tRNA84 EFER_tRNA83     TRUE 0.900 5.000 0.000 NA   NA
 5874135 5874136 EFER_tRNA83 EFER_tRNA82     FALSE 0.253 47.000 0.000 NA   NA
 5874136 5874137 EFER_tRNA82 EFER_tRNA81     FALSE 0.268 45.000 0.000 NA   NA
 5874139 5874140 EFER_0771 EFER_0772 yfeD yfeC TRUE 0.993 2.000 0.250 0.006   NA
 5874141 5874142 EFER_tRNA13 EFER_tRNA14     FALSE 0.317 40.000 0.000 NA   NA
 5874142 5874143 EFER_tRNA14 EFER_0775     FALSE 0.071 135.000 0.000 NA   NA
 5874146 5874147 EFER_0778 EFER_0779 ypeC yfeO FALSE 0.100 115.000 0.000 NA   NA
 5874148 5874149 EFER_0780 EFER_0781 glk ypdH FALSE 0.167 219.000 0.091 1.000 Y NA
 5874149 5874150 EFER_0781 EFER_0782 ypdH ypdG TRUE 0.996 22.000 0.875 0.013 Y NA
 5874150 5874151 EFER_0782 EFER_0783 ypdG ypdF TRUE 0.700 15.000 0.011 1.000 N NA
 5874151 5874152 EFER_0783 EFER_0784 ypdF ypdE TRUE 0.953 0.000 0.009 0.020 N NA
 5874152 5874153 EFER_0784 EFER_0785 ypdE ypdD TRUE 0.986 25.000 0.571 1.000 Y NA
 5874154 5874155 EFER_0786 EFER_0787 ypdC ypdB TRUE 0.987 12.000 0.051 0.077 Y NA
 5874155 5874156 EFER_0787 EFER_0788 ypdB ypdA TRUE 0.998 15.000 0.744 0.015 Y NA
 5874157 5874159 EFER_0789 EFER_misc_RNA_20 yfdZ tpke70 FALSE 0.002 488.000 0.000 NA   NA
 5874162 5874163 EFER_0793 EFER_0794     FALSE 0.005 323.000 0.000 1.000 N NA
 5874163 5874164 EFER_0794 EFER_0795     FALSE 0.409 73.000 0.154 1.000 N NA
 5874164 5874165 EFER_0795 EFER_0796     TRUE 0.960 21.000 0.458 NA   NA
 5874165 5874166 EFER_0796 EFER_0797     TRUE 0.987 11.000 0.379 NA   NA
 5874166 5874167 EFER_0797 EFER_0798     TRUE 0.969 12.000 0.207 NA   NA
 5874167 5874168 EFER_0798 EFER_0799     TRUE 0.982 -30.000 0.840 0.005 N NA
 5874168 5874169 EFER_0799 EFER_0800     TRUE 0.980 -31.000 0.542 1.000 Y NA
 5874169 5874170 EFER_0800 EFER_0801     TRUE 0.989 10.000 0.375 1.000 N NA
 5874170 5874171 EFER_0801 EFER_0802     TRUE 0.988 11.000 0.231 0.046   NA
 5874171 5874172 EFER_0802 EFER_0803     TRUE 0.652 21.000 0.000 1.000   NA
 5874172 5874173 EFER_0803 EFER_0804     FALSE 0.002 685.000 0.000 NA   NA
 5874174 5874175 EFER_0805 EFER_0806     TRUE 0.992 -3.000 0.667 NA   NA
 5874175 5874176 EFER_0806 EFER_0807     TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 5874176 5874177 EFER_0807 EFER_0808     FALSE 0.003 401.000 0.000 NA   NA
 5874177 5874178 EFER_0808 EFER_0809     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5874178 5874179 EFER_0809 EFER_0810     TRUE 0.993 -3.000 0.750 NA   NA
 5874179 5874180 EFER_0810 EFER_0811     TRUE 0.967 32.000 1.000 NA   NA
 5874180 5874181 EFER_0811 EFER_0812     TRUE 0.923 -37.000 0.500 NA   NA
 5874183 5874184 EFER_0814 EFER_0815     FALSE 0.113 103.000 0.000 NA   NA
 5874184 5874185 EFER_0815 EFER_0816   int FALSE 0.427 31.000 0.000 NA   NA
 5874185 5874186 EFER_0816 EFER_tRNA80 int   FALSE 0.080 128.000 0.000 NA   NA
 5874186 5874187 EFER_tRNA80 EFER_0817   yfdC FALSE 0.141 76.000 0.000 NA   NA
 5874190 5874191 EFER_0821 EFER_0822 yfcZ yfcY FALSE 0.008 339.000 0.061 NA   NA
 5874191 5874192 EFER_0822 EFER_0823 yfcY yfcX TRUE 0.997 0.000 0.430 1.000 Y NA
 5874192 5874193 EFER_0823 EFER_0824 yfcX sixA FALSE 0.019 206.000 0.000 1.000 N NA
 5874193 5874194 EFER_0824 EFER_0825 sixA yfcV FALSE 0.002 569.000 0.000 1.000 N NA
 5874194 5874195 EFER_0825 EFER_0826 yfcV   TRUE 0.955 75.000 1.000 1.000 Y NA
 5874195 5874196 EFER_0826 EFER_0827   yfcS TRUE 0.996 20.000 1.000 1.000 Y NA
 5874196 5874197 EFER_0827 EFER_0828 yfcS yfcR TRUE 0.990 16.000 0.333 1.000 Y NA
 5874197 5874198 EFER_0828 EFER_0829 yfcR yfcQ TRUE 0.998 -3.000 0.571 0.007 Y NA
 5874198 5874199 EFER_0829 EFER_0830 yfcQ yfcP TRUE 0.996 -3.000 0.286 0.007 Y NA
 5874199 5874200 EFER_0830 EFER_0831 yfcP yfcO TRUE 0.600 -13.000 0.000 NA   NA
 5874202 5874203 EFER_0833 EFER_0834 prmB aroC TRUE 0.575 35.000 0.081 1.000 N NA
 5874203 5874204 EFER_0834 EFER_0835 aroC mepA TRUE 0.890 3.000 0.025 1.000 N NA
 5874204 5874205 EFER_0835 EFER_0836 mepA yfcA TRUE 0.973 0.000 0.160 1.000   NA
 5874205 5874206 EFER_0836 EFER_0837 yfcA yfcM TRUE 0.969 0.000 0.153 NA   NA
 5874206 5874207 EFER_0837 EFER_0838 yfcM yfcL TRUE 0.899 34.000 0.425 NA   NA
 5874209 5874210 EFER_0840 EFER_0841 fabB yfcJ FALSE 0.010 233.000 0.000 NA N NA
 5874212 5874213 EFER_0843 EFER_0844 pdxB usg TRUE 0.825 66.000 0.097 0.009 Y NA
 5874213 5874214 EFER_0844 EFER_0845 usg truA TRUE 0.900 0.000 0.040 1.000 N NA
 5874214 5874215 EFER_0845 EFER_0846 truA dedA FALSE 0.154 83.000 0.038 NA   NA
 5874215 5874216 EFER_0846 EFER_0847 dedA accD FALSE 0.044 156.000 0.020 NA   NA
 5874216 5874217 EFER_0847 EFER_0848 accD folC TRUE 0.680 70.000 0.383 1.000 N NA
 5874217 5874218 EFER_0848 EFER_0849 folC dedD TRUE 0.839 -28.000 0.216 NA   NA
 5874218 5874219 EFER_0849 EFER_0850 dedD cvpA FALSE 0.030 259.000 0.116 NA   NA
 5874219 5874220 EFER_0850 EFER_0851 cvpA purF TRUE 0.816 37.000 0.262 1.000   NA
 5874220 5874221 EFER_0851 EFER_0852 purF ubiX FALSE 0.169 95.000 0.056 1.000 N NA
 5874221 5874222 EFER_0852 EFER_0853 ubiX argT FALSE 0.009 265.000 0.000 1.000 N NA
 5874222 5874223 EFER_0853 EFER_0854 argT hisJ FALSE 0.179 223.000 0.000 0.015 Y NA
 5874223 5874224 EFER_0854 EFER_0855 hisJ hisQ TRUE 0.960 90.000 0.833 0.050 Y NA
 5874224 5874225 EFER_0855 EFER_0856 hisQ hisM TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.017 Y NA
 5874225 5874226 EFER_0856 EFER_0857 hisM hisP TRUE 0.998 8.000 0.643 1.000 Y NA
 5874226 5874227 EFER_0857 EFER_0858 hisP yfcI FALSE 0.023 197.000 0.000 NA   NA
 5874228 5874229 EFER_0859 EFER_0860 yfcH folX TRUE 0.854 21.000 0.122 1.000   NA
 5874229 5874230 EFER_0860 EFER_0861 folX yfcG FALSE 0.152 57.000 0.012 1.000 N NA
 5874231 5874232 EFER_0862 EFER_0863 yfcF yfcE FALSE 0.419 53.000 0.092 NA   NA
 5874232 5874233 EFER_0863 EFER_0864 yfcE yfcD TRUE 0.861 -40.000 0.143 0.011   NA
 5874235 5874236 EFER_0866 EFER_0867     TRUE 0.824 68.000 0.117 0.013 Y NA
 5874236 5874237 EFER_0867 EFER_0868     TRUE 0.894 17.000 0.000 0.017   NA
 5874237 5874238 EFER_0868 EFER_0869     TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 5874238 5874239 EFER_0869 EFER_0870     TRUE 0.998 -7.000 0.742 0.002 Y NA
 5874240 5874241 EFER_0871 EFER_0872 pta ackA TRUE 0.803 77.000 0.634 1.000   NA
 5874241 5874242 EFER_0872 EFER_0873 ackA   FALSE 0.038 172.000 0.000 NA   NA
 5874243 5874244 EFER_0874 EFER_0875 yfbV yfbU TRUE 0.555 64.000 0.221 NA   NA
 5874244 5874245 EFER_0875 EFER_0876 yfbU yfbT TRUE 0.987 11.000 0.375 NA   NA
 5874245 5874246 EFER_0876 EFER_0877 yfbT yfbS TRUE 0.593 87.000 0.308 1.000   NA
 5874247 5874248 EFER_0878 EFER_0879 yfbR yfbQ TRUE 0.706 -34.000 0.104 1.000   NA
 5874249 5874250 EFER_0881 EFER_0882 lrhA nuoA FALSE 0.002 617.000 0.000 1.000 N NA
 5874250 5874251 EFER_0882 EFER_0883 nuoA nuoB TRUE 0.995 16.000 0.377 0.004 Y NA
 5874251 5874252 EFER_0883 EFER_0884 nuoB nuoC TRUE 0.955 94.000 0.691 0.004 Y NA
 5874252 5874253 EFER_0884 EFER_0885 nuoC nuoE TRUE 0.999 3.000 0.407 0.007 Y NA
 5874253 5874254 EFER_0885 EFER_0886 nuoE nuoF TRUE 0.995 -3.000 0.186 0.007 Y NA
 5874254 5874255 EFER_0886 EFER_0887 nuoF nuoG TRUE 0.924 47.000 0.180 0.007 Y NA
 5874255 5874256 EFER_0887 EFER_0888 nuoG nuoH TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.007 Y NA
 5874256 5874257 EFER_0888 EFER_0889 nuoH nuoI TRUE 0.996 15.000 0.423 0.007 Y NA
 5874257 5874258 EFER_0889 EFER_0890 nuoI nuoJ TRUE 0.998 12.000 0.428 0.007 Y NA
 5874258 5874259 EFER_0890 EFER_0891 nuoJ nuoK TRUE 0.996 -3.000 0.269 0.004 Y NA
 5874259 5874260 EFER_0891 EFER_0892 nuoK nuoL TRUE 0.995 -3.000 0.211 0.007 Y NA
 5874260 5874261 EFER_0892 EFER_0893 nuoL nuoM TRUE 0.887 164.000 0.713 0.002 Y NA
 5874261 5874262 EFER_0893 EFER_0894 nuoM nuoN TRUE 0.737 187.000 0.437 0.002 Y NA
 5874262 5874263 EFER_0894 EFER_0895 nuoN   FALSE 0.064 143.000 0.000 NA   NA
 5874264 5874265 EFER_0896 EFER_0897   yfbM FALSE 0.054 152.000 0.000 NA   NA
 5874267 5874268 EFER_0899 EFER_0900   elaC TRUE 0.940 12.000 0.091 1.000   NA
 5874269 5874270 EFER_0901 EFER_0902 elaA elaB FALSE 0.352 55.000 0.077 NA   NA
 5874270 5874271 EFER_0902 EFER_0903 elaB menF FALSE 0.148 94.000 0.043 NA   NA
 5874271 5874272 EFER_0903 EFER_0904 menF menD TRUE 0.809 89.000 0.281 1.000 Y NA
 5874272 5874273 EFER_0904 EFER_0905 menD yfbB TRUE 0.983 -3.000 0.355 NA   NA
 5874273 5874274 EFER_0905 EFER_0906 yfbB menB TRUE 0.963 15.000 0.280 NA   NA
 5874274 5874275 EFER_0906 EFER_0907 menB menC TRUE 0.997 0.000 0.171 0.001 Y NA
 5874275 5874276 EFER_0907 EFER_0908 menC menE TRUE 0.990 -3.000 0.283 0.001 N NA
 5874276 5874277 EFER_0908 EFER_0909 menE pmrD FALSE 0.075 113.000 0.005 NA   NA
 5874278 5874279 EFER_0910 EFER_0911   yfbW TRUE 0.862 -282.000 0.613 NA   NA
 5874279 5874280 EFER_0911 EFER_0912 yfbW arnT TRUE 0.936 -3.000 0.091 1.000   NA
 5874280 5874281 EFER_0912 EFER_0913 arnT yfbH FALSE 0.458 -30.000 0.031 1.000 N NA
 5874281 5874282 EFER_0913 EFER_0914 yfbH yfbG TRUE 0.996 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 5874282 5874283 EFER_0914 EFER_0915 yfbG yfbF TRUE 0.994 0.000 0.220 NA Y NA
 5874283 5874284 EFER_0915 EFER_0916 yfbF yfbE TRUE 0.997 4.000 0.378 NA Y NA
 5874287 5874288 EFER_0919 EFER_0920 yfaZ yfaY FALSE 0.099 100.000 0.004 1.000   NA
 5874288 5874289 EFER_0920 EFER_0921 yfaY   FALSE 0.019 219.000 0.000 1.000   NA
 5874290 5874291 EFER_0922 EFER_0923 yfaD glpC FALSE 0.026 194.000 0.000 NA   NA
 5874291 5874292 EFER_0923 EFER_0924 glpC glpB TRUE 0.995 -3.000 0.547 0.001 N NA
 5874292 5874293 EFER_0924 EFER_0925 glpB glpA TRUE 0.989 -10.000 0.650 0.001 N NA
 5874294 5874295 EFER_0926 EFER_0927 glpT glpQ TRUE 0.878 -52.000 0.396 1.000 N NA
 5874295 5874296 EFER_0927 EFER_0928 glpQ inaA FALSE 0.064 152.000 0.000 1.000   NA
 5874297 5874298 EFER_0929 EFER_0930 yfaE nrdB TRUE 0.891 0.000 0.034 1.000 N NA
 5874298 5874299 EFER_0930 EFER_0931 nrdB nrdA TRUE 0.792 63.000 0.000 0.001 Y NA
 5874303 5874304 EFER_0935 EFER_0936 atoB atoE TRUE 0.950 26.000 0.174 1.000 Y NA
 5874304 5874305 EFER_0936 EFER_0937 atoE atoA TRUE 0.990 -3.000 0.174 1.000 Y NA
 5874305 5874306 EFER_0937 EFER_0938 atoA atoD TRUE 0.999 0.000 0.800 0.001 Y NA
 5874306 5874307 EFER_0938 EFER_0939 atoD atoC FALSE 0.023 197.000 0.000 NA   NA
 5874307 5874308 EFER_0939 EFER_0940 atoC atoC TRUE 0.744 -6.000 0.000 NA   NA
 5874308 5874309 EFER_0940 EFER_0941 atoC atoS TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5874311 5874312 EFER_0943 EFER_0944 rcsB rcsD TRUE 0.994 17.000 0.558 1.000 Y NA
 5874312 5874313 EFER_0944 EFER_misc_RNA_21 rcsD micF FALSE 0.110 107.000 0.000 NA   NA
 5874314 5874315 EFER_0945 EFER_0946 ompC yojL FALSE 0.144 123.000 0.066 1.000 N NA
 5874315 5874316 EFER_0946 EFER_0947 yojL ada FALSE 0.120 74.000 0.019 1.000 N NA
 5874316 5874317 EFER_0947 EFER_0948 ada alkB TRUE 0.957 0.000 0.015 0.012 N NA
 5874317 5874318 EFER_0948 EFER_0949 alkB yojI FALSE 0.252 76.000 0.076 1.000 N NA
 5874318 5874319 EFER_0949 EFER_0950 yojI mqo FALSE 0.020 215.000 0.000 1.000   NA
 5874320 5874321 EFER_0951 EFER_0952 glnQ glnP TRUE 0.977 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 5874321 5874322 EFER_0952 EFER_0953 glnP glnH TRUE 0.666 94.000 0.051 0.064 Y NA
 5874322 5874323 EFER_0953 EFER_0954 glnH dps FALSE 0.003 407.000 0.000 1.000 N NA
 5874323 5874324 EFER_0954 EFER_0955 dps rhtA FALSE 0.010 289.000 0.044 1.000   NA
 5874326 5874327 EFER_0957 EFER_0959 ybiP   FALSE 0.012 244.000 0.000 NA   NA
 5874327 5874328 EFER_0959 EFER_misc_RNA_22   rybA FALSE 0.391 -45.000 0.000 NA   NA
 5874329 5874330 EFER_0960 EFER_0961 mntR ybiR TRUE 0.797 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5874333 5874334 EFER_0964 EFER_0965 ybiV ybiW FALSE 0.073 146.000 0.000 1.000   NA
 5874334 5874335 EFER_0965 EFER_0966 ybiW ybiY TRUE 0.994 6.000 0.316 0.003 N NA
 5874337 5874338 EFER_0968 EFER_0969 moeB moeA TRUE 0.998 0.000 0.323 0.003 Y NA
 5874339 5874340 EFER_0970 EFER_0971 yliA yliB TRUE 0.712 27.000 0.083 1.000   NA
 5874340 5874341 EFER_0971 EFER_0972 yliB yliC TRUE 0.996 20.000 0.803 0.050 Y NA
 5874341 5874342 EFER_0972 EFER_0973 yliC yliD TRUE 0.999 3.000 0.689 0.050 Y NA
 5874342 5874343 EFER_0973 EFER_0974 yliD   FALSE 0.061 131.000 0.000 NA N NA
 5874343 5874344 EFER_0974 EFER_0975   yliF TRUE 0.981 10.000 0.000 NA Y NA
 5874346 5874347 EFER_0977 EFER_0978 bssR yliI FALSE 0.148 102.000 0.047 NA   NA
 5874350 5874351 EFER_0981 EFER_0982 deoR ybjG TRUE 0.831 33.000 0.235 1.000   NA
 5874353 5874354 EFER_0984 EFER_0985 ybjH ybjI FALSE 0.112 104.000 0.000 NA   NA
 5874354 5874355 EFER_0985 EFER_0986 ybjI ybjJ TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5874356 5874357 EFER_0987 EFER_0988 ybjK   FALSE 0.114 100.000 0.000 NA   NA
 5874358 5874359 EFER_0989 EFER_misc_RNA_23   rybB FALSE 0.191 58.000 0.000 NA   NA
 5874359 5874360 EFER_misc_RNA_23 EFER_0990 rybB ybjL FALSE 0.140 77.000 0.000 NA   NA
 5874361 5874362 EFER_0991 EFER_0993 ybjM nfsA FALSE 0.043 165.000 0.000 NA   NA
 5874362 5874363 EFER_0993 EFER_0994 nfsA rimK FALSE 0.229 50.000 0.000 1.000 N NA
 5874363 5874364 EFER_0994 EFER_0995 rimK ybjN FALSE 0.208 89.000 0.065 NA   NA
 5874364 5874365 EFER_0995 EFER_0997 ybjN potF FALSE 0.004 352.000 0.000 NA   NA
 5874365 5874366 EFER_0997 EFER_0998 potF potG TRUE 0.917 95.000 0.679 1.000 Y NA
 5874366 5874367 EFER_0998 EFER_0999 potG potH TRUE 0.999 10.000 0.857 1.000 Y NA
 5874367 5874368 EFER_0999 EFER_1000 potH potI TRUE 0.998 -3.000 0.528 0.050 Y NA
 5874368 5874369 EFER_1000 EFER_1001 potI ybjO TRUE 0.631 60.000 0.264 NA   NA
 5874369 5874370 EFER_1001 EFER_1002 ybjO rumB TRUE 0.739 41.000 0.226 NA   NA
 5874371 5874372 EFER_1003 EFER_1004 artJ artM FALSE 0.273 227.000 0.143 0.063 Y NA
 5874372 5874373 EFER_1004 EFER_1005 artM artQ TRUE 0.999 0.000 0.714 0.017 Y NA
 5874373 5874374 EFER_1005 EFER_1006 artQ artI TRUE 0.997 7.000 0.260 0.050 Y NA
 5874374 5874375 EFER_1006 EFER_1007 artI artP TRUE 0.987 18.000 0.323 1.000 Y NA
 5874375 5874376 EFER_1007 EFER_1008 artP ybjP FALSE 0.036 218.000 0.081 NA   NA
 5874377 5874378 EFER_1009 EFER_1010 ybjQ ybjR TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5874379 5874380 EFER_1011 EFER_1012 ybjS ybjT TRUE 0.656 99.000 0.022 0.008 Y NA
 5874380 5874381 EFER_1012 EFER_1013 ybjT ltaE TRUE 0.929 11.000 0.074 1.000 N NA
 5874381 5874382 EFER_1013 EFER_1014 ltaE poxB TRUE 0.821 37.000 0.041 1.000 Y NA
 5874384 5874385 EFER_1017 EFER_1018 hcr hcp TRUE 0.987 12.000 0.000 0.013 Y NA
 5874385 5874386 EFER_1018 EFER_1019 hcp ybjE FALSE 0.064 144.000 0.000 NA   NA
 5874387 5874388 EFER_1020 EFER_1021     FALSE 0.011 251.000 0.000 NA   NA
 5874391 5874392 EFER_1024 EFER_1025     FALSE 0.366 -54.000 0.000 NA   NA
 5874393 5874394 EFER_1026 EFER_1027 macA macB TRUE 0.996 -3.000 0.789 0.095 N NA
 5874396 5874397 EFER_1029 EFER_1030 clpS clpA TRUE 0.983 16.000 0.596 NA   NA
 5874398 5874399 EFER_1031 EFER_tRNA79     FALSE 0.134 83.000 0.000 NA   NA
 11539379 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7775.000 0.000 NA   NA
 11681742 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7775.000 0.000 NA   NA
 11824134 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7775.000 0.000 NA   NA
 11539380 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7795.000 0.000 NA   NA
 11681743 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7795.000 0.000 NA   NA
 11824135 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7795.000 0.000 NA   NA
 11539381 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7835.000 0.000 NA   NA
 11681744 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7835.000 0.000 NA   NA
 11824136 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7835.000 0.000 NA   NA
 11539382 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7855.000 0.000 NA   NA
 11681745 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7855.000 0.000 NA   NA
 11824137 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7855.000 0.000 NA   NA
 5874399 5874400 EFER_tRNA79 EFER_1032   infA FALSE 0.010 254.000 0.000 NA   NA
 5874400 5874401 EFER_1032 EFER_1033 infA aat FALSE 0.006 285.000 0.020 1.000 N NA
 5874401 5874402 EFER_1033 EFER_1034 aat cydC TRUE 0.790 42.000 0.049 1.000 Y NA
 5874402 5874403 EFER_1034 EFER_1035 cydC cydD TRUE 0.999 1.000 0.631 0.005 Y NA
 5874403 5874404 EFER_1035 EFER_1036 cydD trxB FALSE 0.457 123.000 0.049 1.000 Y NA
 5874405 5874406 EFER_1038 EFER_1039 lrp ftsK FALSE 0.449 135.000 0.345 1.000 N NA
 5874406 5874407 EFER_1039 EFER_1040 ftsK lolA FALSE 0.319 156.000 0.305 1.000 N NA
 5874407 5874408 EFER_1040 EFER_1041 lolA ycaJ TRUE 0.967 11.000 0.167 1.000 N NA
 5874408 5874409 EFER_1041 EFER_1042 ycaJ serS FALSE 0.371 91.000 0.078 0.087 N NA
 5874411 5874412 EFER_1045 EFER_1046 ycaD ycaM FALSE 0.015 208.000 0.000 NA N NA
 5874413 5874414 EFER_1047 EFER_1048 pflA pflB FALSE 0.065 193.000 0.092 1.000 N NA
 5874414 5874415 EFER_1048 EFER_1049 pflB focA TRUE 0.724 56.000 0.345 1.000 N NA
 5874415 5874416 EFER_1049 EFER_1050 focA ycaO FALSE 0.003 405.000 0.000 NA   NA
 5874417 5874418 EFER_1051 EFER_1052 ycaP serC FALSE 0.022 190.000 0.014 NA   NA
 5874418 5874419 EFER_1052 EFER_1053 serC aroA TRUE 0.758 43.000 0.033 1.000 Y NA
 5874419 5874420 EFER_1053 EFER_1054 aroA cmk FALSE 0.143 187.000 0.209 1.000 N NA
 5874420 5874421 EFER_1054 EFER_1055 cmk rpsA TRUE 0.484 111.000 0.281 1.000 N NA
 5874421 5874422 EFER_1055 EFER_1056 rpsA ihfB FALSE 0.292 160.000 0.292 1.000 N NA
 5874422 5874423 EFER_1056 EFER_1057 ihfB   FALSE 0.018 203.000 0.003 1.000   NA
 5874423 5874424 EFER_1057 EFER_1058   msbA TRUE 0.712 37.000 0.075 0.078   NA
 5874424 5874425 EFER_1058 EFER_1059 msbA lpxK TRUE 0.966 -3.000 0.205 1.000 N NA
 5874425 5874426 EFER_1059 EFER_1060 lpxK ycaQ FALSE 0.310 37.000 0.017 NA   NA
 5874426 5874427 EFER_1060 EFER_1061 ycaQ ycaR FALSE 0.183 53.000 0.016 NA   NA
 5874427 5874428 EFER_1061 EFER_1062 ycaR kdsB TRUE 0.975 -3.000 0.265 NA   NA
 5874428 5874429 EFER_1062 EFER_1063 kdsB ycbJ FALSE 0.048 153.000 0.023 NA   NA
 5874431 5874432 EFER_1065 EFER_1066 smtA mukF TRUE 0.979 -3.000 0.325 NA N NA
 5874432 5874433 EFER_1066 EFER_1067 mukF mukE TRUE 0.984 8.000 0.036 NA Y NA
 5874433 5874434 EFER_1067 EFER_1068 mukE mukB TRUE 0.993 0.000 0.000 0.001 Y NA
 5874434 5874435 EFER_1068 EFER_1069 mukB ycbB FALSE 0.014 243.000 0.000 1.000   NA
 5874435 5874436 EFER_1069 EFER_1070 ycbB ycbK FALSE 0.312 172.000 0.372 NA   NA
 5874436 5874437 EFER_1070 EFER_1071 ycbK ycbL TRUE 0.707 27.000 0.089 NA   NA
 5874438 5874439 EFER_1072 EFER_1073 aspC ompF FALSE 0.033 184.000 0.036 1.000 N NA
 5874439 5874440 EFER_1073 EFER_1074 ompF asnS FALSE 0.002 610.000 0.000 1.000 N NA
 5874440 5874441 EFER_1074 EFER_1075 asnS pncB FALSE 0.044 166.000 0.034 1.000 N NA
 5874443 5874444 EFER_1077 EFER_1078 ssuB ssuC TRUE 0.996 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 5874444 5874445 EFER_1078 EFER_1079 ssuC ssuD TRUE 0.972 12.000 0.226 1.000 N NA
 5874445 5874446 EFER_1079 EFER_1080 ssuD ssuA TRUE 0.982 -3.000 0.341 1.000 N NA
 5874446 5874447 EFER_1080 EFER_1081 ssuA ssuE TRUE 0.924 -7.000 0.169 1.000   NA
 5874448 5874449 EFER_1082 EFER_1083 pyrD ycbW FALSE 0.080 174.000 0.081 NA   NA
 5874451 5874452 EFER_1085 EFER_1086 ycbY uup TRUE 0.914 12.000 0.061 1.000   NA
 5874452 5874453 EFER_1086 EFER_1087 uup pqiA FALSE 0.112 130.000 0.054 NA   NA
 5874453 5874454 EFER_1087 EFER_1088 pqiA pqiB TRUE 0.997 5.000 0.819 NA   NA
 5874454 5874455 EFER_1088 EFER_1089 pqiB ymbA TRUE 0.990 12.000 0.531 NA   NA
 5874455 5874456 EFER_1089 EFER_1090 ymbA rmf FALSE 0.010 256.000 0.000 NA   NA
 5874457 5874458 EFER_1091 EFER_1092 fabA ycbZ TRUE 0.599 69.000 0.290 1.000 N NA
 5874464 5874465 EFER_1097 EFER_1098 yccS yccF TRUE 0.641 -40.000 0.090 NA   NA
 5874467 5874468 EFER_1100 EFER_1101 mgsA yccT FALSE 0.169 96.000 0.055 NA   NA
 5874470 5874471 EFER_1103 EFER_1104 yccV yccW FALSE 0.387 58.000 0.094 NA   NA
 5874473 5874474 EFER_1106 EFER_1107 tusE yccA FALSE 0.350 91.000 0.140 NA   NA
 5874475 5874476 EFER_tRNA15 EFER_1108     FALSE 0.035 178.000 0.000 NA   NA
 5874478 5874479 EFER_1110 EFER_1111 hyaA hyaB TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 5874479 5874480 EFER_1111 EFER_1112 hyaB hyaC TRUE 0.992 19.000 0.355 0.045 Y NA
 5874480 5874481 EFER_1112 EFER_1113 hyaC hyaD TRUE 0.990 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 5874481 5874482 EFER_1113 EFER_1114 hyaD hyaE TRUE 0.934 -3.000 0.096 NA   NA
 5874482 5874483 EFER_1114 EFER_1115 hyaE hyaF TRUE 0.941 -63.000 0.769 NA   NA
 5874483 5874484 EFER_1115 EFER_1116 hyaF yecA FALSE 0.120 94.000 0.000 NA   NA
 5874487 5874488 EFER_1119 EFER_1120 ftn   FALSE 0.077 130.000 0.000 NA   NA
 5874488 5874489 EFER_1120 EFER_1121   yecI FALSE 0.063 146.000 0.000 NA   NA
 5874490 5874491 EFER_1123 EFER_1124 araF araG TRUE 0.938 95.000 0.917 NA Y NA
 5874491 5874492 EFER_1124 EFER_1125 araG araH TRUE 0.994 15.000 0.451 1.000 Y NA
 5874492 5874493 EFER_1125 EFER_1126 araH otsB FALSE 0.308 154.000 0.037 1.000 Y NA
 5874493 5874494 EFER_1126 EFER_1127 otsB otsA TRUE 0.958 -25.000 0.068 0.001 Y NA
 5874496 5874497 EFER_1129 EFER_1130 flhD flhC TRUE 0.978 3.000 0.000 0.001   NA
 5874497 5874498 EFER_1130 EFER_1131 flhC motA TRUE 0.568 124.000 0.408 1.000   NA
 5874498 5874499 EFER_1131 EFER_1132 motA motB TRUE 0.996 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 5874499 5874500 EFER_1132 EFER_1133 motB cheA TRUE 0.985 -55.000 0.913 1.000 Y NA
 5874500 5874501 EFER_1133 EFER_1134 cheA cheW TRUE 0.996 17.000 0.447 0.003 Y NA
 5874501 5874502 EFER_1134 EFER_1135 cheW   FALSE 0.019 219.000 0.000 1.000   NA
 5874502 5874503 EFER_1135 EFER_1136     TRUE 0.933 13.000 0.115 NA   NA
 5874503 5874504 EFER_1136 EFER_1137     TRUE 0.958 13.000 0.188 NA   NA
 5874504 5874505 EFER_1137 EFER_1138     TRUE 0.991 -24.000 0.879 NA Y NA
 5874507 5874508 EFER_1140 EFER_1141   tar FALSE 0.463 60.000 0.129 1.000   NA
 5874508 5874509 EFER_1141 EFER_1142 tar cheR TRUE 0.935 20.000 0.037 1.000 Y NA
 5874509 5874510 EFER_1142 EFER_1143 cheR cheB TRUE 0.984 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 5874510 5874511 EFER_1143 EFER_1144 cheB cheY TRUE 0.996 15.000 0.467 0.011 Y NA
 5874511 5874512 EFER_1144 EFER_1145 cheY cheZ TRUE 0.985 8.000 0.000 1.000 Y NA
 5874513 5874514 EFER_1146 EFER_1147 cbpM cbpA TRUE 0.961 -15.000 0.512 NA   NA
 5874514 5874515 EFER_1147 EFER_1148 cbpA   FALSE 0.017 203.000 0.000 NA N NA
 5874515 5874516 EFER_1148 EFER_1149   dadA TRUE 0.846 -18.000 0.179 NA N NA
 5874516 5874517 EFER_1149 EFER_1150 dadA   TRUE 0.700 51.000 0.278 1.000 N NA
 5874521 5874522 EFER_1154 EFER_1155 yccJ wrbA TRUE 0.931 21.000 0.290 NA   NA
 5874523 5874524 EFER_1156 EFER_1157     FALSE 0.427 31.000 0.000 NA   NA
 5874524 5874525 EFER_1157 EFER_1158   rutR FALSE 0.019 208.000 0.000 NA   NA
 5874525 5874526 EFER_1158 EFER_1159 rutR yliE FALSE 0.001 1086.000 0.000 NA N NA
 5874526 5874527 EFER_1159 EFER_1160 yliE yliF TRUE 0.695 -166.000 0.000 NA Y NA
 5874527 5874528 EFER_1160 EFER_1161 yliF bcsA FALSE 0.147 69.000 0.000 1.000 N NA
 5874528 5874529 EFER_1161 EFER_1162 bcsA bcsB TRUE 0.507 65.000 0.045 0.002   NA
 5874530 5874531 EFER_1163 EFER_1164 yedF yedE TRUE 0.995 -3.000 0.844 NA   NA
 5874533 5874534 EFER_1166 EFER_1167 amyA fliT FALSE 0.403 66.000 0.115 1.000   NA
 5874534 5874535 EFER_1167 EFER_1168 fliT fliS TRUE 0.982 -3.000 0.324 1.000   NA
 5874535 5874536 EFER_1168 EFER_1169 fliS fliD TRUE 0.991 19.000 0.284 0.002 Y NA
 5874537 5874538 EFER_1170 EFER_1171 fliC fliA FALSE 0.040 166.000 0.000 1.000 N NA
 5874538 5874539 EFER_1171 EFER_1173 fliA fliZ FALSE 0.431 59.000 0.108 1.000   NA
 5874539 5874540 EFER_1173 EFER_1174 fliZ fliY TRUE 0.560 88.000 0.280 1.000   NA
 5874540 5874541 EFER_1174 EFER_1175 fliY yedO TRUE 0.863 107.000 0.469 1.000 Y NA
 5874541 5874542 EFER_1175 EFER_1176 yedO yecS TRUE 0.961 16.000 0.050 1.000 Y NA
 5874542 5874543 EFER_1176 EFER_1177 yecS yecC TRUE 0.989 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 5874543 5874544 EFER_1177 EFER_1178 yecC sdiA FALSE 0.047 195.000 0.071 1.000 N NA
 5874546 5874547 EFER_1180 EFER_1181 uvrY uvrC TRUE 0.965 -3.000 0.086 0.018 N NA
 5874547 5874548 EFER_1181 EFER_1182 uvrC pgsA TRUE 0.605 57.000 0.227 1.000 N NA
 5874548 5874549 EFER_1182 EFER_tRNA16 pgsA   FALSE 0.054 152.000 0.000 NA   NA
 5874549 5874550 EFER_tRNA16 EFER_tRNA17     FALSE 0.203 55.000 0.000 NA   NA
 5874550 5874551 EFER_tRNA17 EFER_tRNA18     TRUE 0.815 13.000 0.000 NA   NA
 5874553 5874554 EFER_1185 EFER_1186 appC appB TRUE 0.994 12.000 0.158 0.044 Y NA
 5874555 5874556 EFER_1187 EFER_1188   torS FALSE 0.095 118.000 0.000 NA   NA
 5874559 5874560 EFER_1191 EFER_1192 torC torA TRUE 0.990 0.000 0.000 0.044 Y NA
 5874560 5874561 EFER_1192 EFER_1193 torA torD TRUE 0.787 -36.000 0.077 0.044   NA
 5874561 5874562 EFER_1193 EFER_1194 torD flhB FALSE 0.069 149.000 0.000 1.000   NA
 5874562 5874563 EFER_1194 EFER_1195 flhB flhA TRUE 0.993 -7.000 0.287 0.007 Y NA
 5874563 5874564 EFER_1195 EFER_1196 flhA flhE TRUE 0.988 0.000 0.158 0.002   NA
 5874566 5874567 EFER_1199 EFER_1200 yecM cutC TRUE 0.934 6.000 0.057 NA   NA
 5874568 5874569 EFER_1201 EFER_1202 yecP yecO TRUE 0.980 -3.000 0.315 NA   NA
 5874569 5874570 EFER_1202 EFER_1203 yecO yecN TRUE 0.528 41.000 0.089 NA   NA
 5874570 5874571 EFER_1203 EFER_1204 yecN yecE TRUE 0.487 53.000 0.126 NA   NA
 5874571 5874572 EFER_1204 EFER_1205 yecE yecD TRUE 0.929 -3.000 0.089 NA   NA
 5874573 5874574 EFER_1206 EFER_1207 aspS nudB TRUE 0.924 2.000 0.050 1.000 N NA
 5874574 5874575 EFER_1207 EFER_1208 nudB yebC TRUE 0.477 29.000 0.035 NA   NA
 5874575 5874576 EFER_1208 EFER_1209 yebC ruvC TRUE 0.836 34.000 0.277 NA   NA
 5874578 5874579 EFER_1211 EFER_1212 ruvA ruvB TRUE 0.999 9.000 0.549 0.001 Y NA
 5874580 5874581 EFER_1213 EFER_1214 znuB znuC TRUE 0.997 -7.000 0.755 0.086 Y NA
 5874582 5874583 EFER_1215 EFER_1216 znuA yebA TRUE 0.907 16.000 0.131 1.000 N NA
 5874583 5874584 EFER_1216 EFER_1217 yebA lpxM TRUE 0.754 121.000 0.299 1.000 Y NA
 5874585 5874586 EFER_1218 EFER_1219 pykA yebK FALSE 0.158 122.000 0.071 1.000 N NA
 5874587 5874588 EFER_1221 EFER_1222 zwf edd FALSE 0.115 223.000 0.041 1.000 Y NA
 5874588 5874589 EFER_1222 EFER_1223 edd eda TRUE 0.970 37.000 0.523 1.000 Y NA
 5874591 5874592 EFER_1225 EFER_1226 yebG yebF FALSE 0.196 55.000 0.027 NA   NA
 5874592 5874593 EFER_1226 EFER_1227 yebF yebE FALSE 0.018 211.000 0.028 NA   NA
 5874593 5874594 EFER_1227 EFER_1228 yebE ptrB FALSE 0.278 89.000 0.092 NA   NA
 5874595 5874596 EFER_1229 EFER_1230 exoX   TRUE 0.956 24.000 0.500 1.000   NA
 5874596 5874597 EFER_1230 EFER_1231     TRUE 0.525 75.000 0.222 1.000   NA
 5874598 5874599 EFER_1232 EFER_1233   yebZ TRUE 0.995 3.000 0.613 1.000   NA
 5874599 5874600 EFER_1233 EFER_1234 yebZ yebY TRUE 0.993 12.000 0.704 NA   NA
 5874600 5874601 EFER_1234 EFER_1235 yebY   TRUE 0.687 18.000 0.000 NA   NA
 5874603 5874604 EFER_misc_RNA_26 EFER_1236 ryeB pphA FALSE 0.025 195.000 0.000 NA   NA
 5874605 5874606 EFER_1237 EFER_1238 yebW yebV TRUE 0.946 21.000 0.353 NA   NA
 5874606 5874607 EFER_1238 EFER_1239 yebV yebU FALSE 0.254 119.000 0.121 NA   NA
 5874607 5874608 EFER_1239 EFER_1240 yebU yebT TRUE 0.683 80.000 0.420 NA   NA
 5874608 5874609 EFER_1240 EFER_1241 yebT yebS TRUE 0.966 -31.000 0.840 NA   NA
 5874610 5874611 EFER_1242 EFER_1243 yebR proQ TRUE 0.585 97.000 0.081 NA Y NA
 5874611 5874612 EFER_1243 EFER_1244 proQ prc TRUE 0.935 20.000 0.304 NA N NA
 5874612 5874613 EFER_1244 EFER_1245 prc htpX FALSE 0.107 181.000 0.042 0.020 N NA
 5874617 5874618 EFER_1249 EFER_1250 yobG   TRUE 0.738 74.000 0.500 NA   NA
 5874618 5874619 EFER_1250 EFER_1251   yobF FALSE 0.002 826.000 0.000 NA   NA
 5874619 5874620 EFER_1251 EFER_1252 yobF cspC TRUE 0.963 13.000 0.214 NA   NA
 5874620 5874621 EFER_1252 EFER_1253 cspC rrmA FALSE 0.065 157.000 0.038 1.000   NA
 5874622 5874623 EFER_1254 EFER_1255 yebN   TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5874623 5874624 EFER_1255 EFER_1256   yobD FALSE 0.029 187.000 0.000 NA   NA
 5874624 5874625 EFER_1256 EFER_1257 yobD manZ TRUE 0.884 55.000 0.755 NA   NA
 5874625 5874626 EFER_1257 EFER_1258 manZ manY TRUE 0.999 4.000 0.939 0.017 Y NA
 5874626 5874627 EFER_1258 EFER_1259 manY manX TRUE 0.750 62.000 0.000 0.017 Y NA
 5874629 5874630 EFER_1261 EFER_1262 adrB sdaA TRUE 0.528 122.000 0.389 NA N NA
 5874630 5874631 EFER_1262 EFER_1263 sdaA yeaB FALSE 0.310 184.000 0.409 1.000   NA
 5874631 5874632 EFER_1263 EFER_1264 yeaB pabB TRUE 0.970 3.000 0.116 1.000   NA
 5874633 5874634 EFER_1265 EFER_1266 yoaH   FALSE 0.038 171.000 0.000 NA   NA
 5874634 5874635 EFER_1266 EFER_1267     FALSE 0.135 82.000 0.000 NA   NA
 5874636 5874637 EFER_1268 EFER_1269 yoaC yoaB FALSE 0.038 172.000 0.000 NA   NA
 5874637 5874638 EFER_1269 EFER_1270 yoaB   FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 5874638 5874639 EFER_1270 EFER_1271     TRUE 0.962 -3.000 0.182 NA   NA
 5874640 5874641 EFER_1272 EFER_1273 yoaA yeaZ FALSE 0.347 58.000 0.082 1.000 N NA
 5874641 5874642 EFER_1273 EFER_1274 yeaZ yeaY FALSE 0.301 39.000 0.024 1.000 N NA
 5874642 5874643 EFER_1274 EFER_1275 yeaY fadD FALSE 0.085 205.000 0.169 1.000 N NA
 5874643 5874644 EFER_1275 EFER_1276 fadD rnd FALSE 0.364 68.000 0.115 1.000 N NA
 5874645 5874646 EFER_1277 EFER_1278 ycfS mfd FALSE 0.058 141.000 0.006 1.000   NA
 5874646 5874647 EFER_1278 EFER_1279 mfd ycfT FALSE 0.069 128.000 0.003 1.000   NA
 5874648 5874649 EFER_1280 EFER_1281 lolC lolD TRUE 0.953 -7.000 0.175 0.061 N NA
 5874649 5874650 EFER_1281 EFER_1282 lolD lolE TRUE 0.980 0.000 0.125 0.061 N NA
 5874650 5874651 EFER_1282 EFER_1283 lolE ycfX TRUE 0.837 29.000 0.225 1.000 N NA
 5874651 5874652 EFER_1283 EFER_1284 ycfX cobB TRUE 0.975 16.000 0.119 1.000 Y NA
 5874653 5874654 EFER_1285 EFER_1286 ycfZ ymfA TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5874654 5874655 EFER_1286 EFER_1287 ymfA potD FALSE 0.191 58.000 0.000 NA   NA
 5874655 5874656 EFER_1287 EFER_1288 potD potC TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.048 Y NA
 5874656 5874657 EFER_1288 EFER_1289 potC potB TRUE 0.996 -3.000 0.286 0.048 Y NA
 5874657 5874658 EFER_1289 EFER_1290 potB potA TRUE 0.997 14.000 0.789 1.000 Y NA
 5874660 5874661 EFER_1292 EFER_1293 yeaD gapA TRUE 0.982 15.000 0.154 1.000 Y NA
 5874662 5874663 EFER_1294 EFER_1295 msrB yeaC TRUE 0.968 -3.000 0.216 NA   NA
 5874664 5874665 EFER_1296 EFER_1297 pncA ansA TRUE 0.526 -25.000 0.040 1.000 N NA
 5874665 5874666 EFER_1297 EFER_1298 ansA   FALSE 0.099 116.000 0.000 NA   NA
 5874666 5874667 EFER_1298 EFER_1299   sppA FALSE 0.070 136.000 0.000 NA   NA
 5874668 5874669 EFER_1300 EFER_1301 ydjA selD FALSE 0.100 117.000 0.033 1.000 N NA
 5874669 5874670 EFER_1301 EFER_1302 selD topB TRUE 0.565 -22.000 0.041 1.000 N NA
 5874670 5874671 EFER_1302 EFER_1303 topB ynjI FALSE 0.080 128.000 0.000 NA   NA
 5874674 5874675 EFER_1306 EFER_1307 nudG   FALSE 0.104 112.000 0.000 NA   NA
 5874677 5874678 EFER_1309 EFER_1310 ynjE ynjD FALSE 0.390 67.000 0.111 1.000   NA
 5874678 5874679 EFER_1310 EFER_1311 ynjD ynjC TRUE 0.994 0.000 0.602 1.000   NA
 5874679 5874680 EFER_1311 EFER_1312 ynjC ynjB TRUE 0.988 18.000 0.627 0.048   NA
 5874680 5874681 EFER_1312 EFER_1313 ynjB ynjA TRUE 0.886 10.000 0.032 NA   NA
 5874681 5874682 EFER_1313 EFER_1314 ynjA ydjZ TRUE 0.949 0.000 0.087 NA   NA
 5874682 5874683 EFER_1314 EFER_1315 ydjZ ydjX TRUE 0.969 4.000 0.125 NA   NA
 5874683 5874684 EFER_1315 EFER_1316 ydjX xthA FALSE 0.040 157.000 0.016 NA   NA
 5874685 5874686 EFER_1317 EFER_1318 astC astA TRUE 0.997 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 5874686 5874687 EFER_1318 EFER_1319 astA astD TRUE 0.961 -3.000 0.179 1.000 N NA
 5874687 5874688 EFER_1319 EFER_1320 astD astB TRUE 0.979 -3.000 0.306 1.000 N NA
 5874688 5874689 EFER_1320 EFER_1321 astB astE TRUE 0.973 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 5874689 5874690 EFER_1321 EFER_1323 astE spy FALSE 0.004 330.000 0.000 NA N NA
 5874690 5874691 EFER_1323 EFER_1325 spy ydjR FALSE 0.026 193.000 0.028 NA   NA
 5874692 5874693 EFER_1326 EFER_1327 ydjQ nadE FALSE 0.006 267.000 0.010 1.000 N NA
 5874694 5874695 EFER_1328 EFER_1329 osmE chbB FALSE 0.008 297.000 0.000 1.000   NA
 5874695 5874696 EFER_1329 EFER_1330 chbB chbC TRUE 0.831 85.000 0.167 0.012 Y NA
 5874696 5874697 EFER_1330 EFER_1331 chbC chbA TRUE 0.981 53.000 0.833 0.012 Y NA
 5874697 5874698 EFER_1331 EFER_1332 chbA chbR TRUE 0.996 8.000 0.727 1.000 N NA
 5874698 5874699 EFER_1332 EFER_1333 chbR chbF TRUE 0.692 121.000 0.625 1.000 N NA
 5874699 5874700 EFER_1333 EFER_1334 chbF chbG TRUE 0.991 13.000 0.429 0.018   NA
 5874702 5874703 EFER_1336 EFER_1337   cedA FALSE 0.349 -61.000 0.000 NA   NA
 5874704 5874705 EFER_1338 EFER_1339 ydjN ydjM FALSE 0.188 132.000 0.102 NA   NA
 5874705 5874706 EFER_1339 EFER_1340 ydjM yniC FALSE 0.087 159.000 0.068 NA   NA
 5874708 5874709 EFER_1342 EFER_1343 yniA   FALSE 0.107 110.000 0.000 NA   NA
 5874709 5874710 EFER_1343 EFER_1345   pfkB FALSE 0.159 67.000 0.000 NA   NA
 5874711 5874712 EFER_1346 EFER_1347 ydiY thrS FALSE 0.002 492.000 0.000 NA N NA
 5874712 5874713 EFER_1347 EFER_1348 thrS infC FALSE 0.104 112.000 0.000 NA   NA
 5874713 5874714 EFER_1348 EFER_1349 infC rpmI FALSE 0.116 97.000 0.000 NA   NA
 5874714 5874715 EFER_1349 EFER_1350 rpmI rplT TRUE 0.983 53.000 0.928 0.011 Y NA
 5874715 5874716 EFER_1350 EFER_4505 rplT pheM FALSE 0.087 123.000 0.000 NA   NA
 5874716 5874717 EFER_4505 EFER_1351 pheM pheS FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 5874717 5874718 EFER_1351 EFER_1352 pheS pheT TRUE 0.998 15.000 0.574 0.001 Y NA
 5874718 5874719 EFER_1352 EFER_1353 pheT ihfA TRUE 0.981 5.000 0.208 1.000 N NA
 5874719 5874720 EFER_1353 EFER_1354 ihfA btuC FALSE 0.101 101.000 0.023 1.000 N NA
 5874720 5874721 EFER_1354 EFER_1355 btuC btuD TRUE 0.997 4.000 0.356 1.000 Y NA
 5874721 5874722 EFER_1355 EFER_1356 btuD nlpC FALSE 0.395 78.000 0.167 NA N NA
 5874722 5874723 EFER_1356 EFER_1357 nlpC   FALSE 0.017 201.000 0.000 NA N NA
 5874723 5874724 EFER_1357 EFER_1358   ydiU FALSE 0.168 66.000 0.031 NA   NA
 5874725 5874726 EFER_1359 EFER_1360   aroH FALSE 0.102 127.000 0.054 NA N NA
 5874726 5874727 EFER_1360 EFER_1361 aroH ydiA FALSE 0.033 283.000 0.165 1.000   NA
 5874729 5874730 EFER_1363 EFER_misc_RNA_27   rprA TRUE 0.503 -24.000 0.000 NA   NA
 5874730 5874731 EFER_misc_RNA_27 EFER_1364 rprA ydiK FALSE 0.041 167.000 0.000 NA   NA
 5874732 5874733 EFER_1365 EFER_1366 ydiJ ydiI TRUE 0.943 -3.000 0.129 NA N NA
 5874733 5874734 EFER_1366 EFER_1367 ydiI ydiH FALSE 0.148 71.000 0.000 NA   NA
 5874734 5874735 EFER_1367 EFER_1368 ydiH sufA FALSE 0.004 352.000 0.000 NA   NA
 5874735 5874736 EFER_1368 EFER_1369 sufA sufB TRUE 0.909 9.000 0.041 NA   NA
 5874736 5874737 EFER_1369 EFER_1370 sufB sufC TRUE 0.997 10.000 0.466 1.000 Y NA
 5874737 5874738 EFER_1370 EFER_1371 sufC sufD TRUE 0.980 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 5874738 5874739 EFER_1371 EFER_1372 sufD sufS TRUE 0.964 -3.000 0.193 1.000 N NA
 5874739 5874740 EFER_1372 EFER_1373 sufS sufE TRUE 0.957 13.000 0.183 NA   NA
 5874740 5874741 EFER_1373 EFER_1374 sufE ynhG FALSE 0.107 149.000 0.069 NA   NA
 5874742 5874743 EFER_1375 EFER_1376 lpp pykF FALSE 0.006 309.000 0.000 1.000 N NA
 5874745 5874746 EFER_1378 EFER_1379 ydhS ydhR FALSE 0.046 161.000 0.000 NA   NA
 5874746 5874747 EFER_1379 EFER_tRNA78 ydhR   FALSE 0.108 109.000 0.000 NA   NA
 5874747 5874748 EFER_tRNA78 EFER_tRNA77     TRUE 0.900 5.000 0.000 NA   NA
 5874748 5874749 EFER_tRNA77 EFER_1381   mdtK FALSE 0.054 152.000 0.000 NA   NA
 5874751 5874752 EFER_1383 EFER_1384 cfa ydhC FALSE 0.006 290.000 0.000 1.000 N NA
 5874756 5874757 EFER_1388 EFER_1389 sodB   FALSE 0.012 206.000 0.015 NA N NA
 5874759 5874760 EFER_1391 EFER_1392 lhr rnt FALSE 0.354 88.000 0.000 0.011   NA
 5874760 5874761 EFER_1392 EFER_1393 rnt gloA FALSE 0.316 103.000 0.136 1.000 N NA
 5874761 5874762 EFER_1393 EFER_1394 gloA nemA FALSE 0.196 81.000 0.057 1.000 N NA
 5874762 5874763 EFER_1394 EFER_1395 nemA ydhM TRUE 0.860 37.000 0.362 1.000 N NA
 5874764 5874765 EFER_1396 EFER_1397 ydhF sodC FALSE 0.165 81.000 0.033 1.000   NA
 5874766 5874767 EFER_1398 EFER_1399 ydhK ydhJ TRUE 0.895 1.000 0.000 NA   NA
 5874767 5874768 EFER_1399 EFER_1400 ydhJ ydhI TRUE 0.975 -6.000 0.412 NA   NA
 5874771 5874772 EFER_1403 EFER_1404 anmK ydhA FALSE 0.360 38.000 0.034 NA   NA
 5874772 5874773 EFER_1404 EFER_1405 ydhA pdxH FALSE 0.204 58.000 0.034 NA   NA
 5874773 5874774 EFER_1405 EFER_1406 pdxH tyrS FALSE 0.116 127.000 0.054 1.000 N NA
 5874774 5874775 EFER_1406 EFER_1407 tyrS pdxY FALSE 0.227 57.000 0.041 1.000 N NA
 5874776 5874777 EFER_1408 EFER_1409 gst ydgR TRUE 0.566 107.000 0.344 1.000 N NA
 5874777 5874778 EFER_1409 EFER_1410 ydgR nth FALSE 0.002 601.000 0.000 1.000 N NA
 5874778 5874779 EFER_1410 EFER_1411 nth rsxE TRUE 0.958 0.000 0.109 1.000 N NA
 5874779 5874780 EFER_1411 EFER_1412 rsxE rsxG TRUE 0.999 3.000 0.908 0.043 Y NA
 5874780 5874781 EFER_1412 EFER_1413 rsxG rsxD TRUE 0.999 4.000 0.924 0.043 Y NA
 5874781 5874782 EFER_1413 EFER_1414 rsxD rsxC TRUE 0.999 1.000 0.814 0.043 Y NA
 5874782 5874783 EFER_1414 EFER_1415 rsxC rsxB TRUE 0.996 -7.000 0.537 0.043 Y NA
 5874783 5874784 EFER_1415 EFER_1416 rsxB rsxA TRUE 0.999 0.000 0.564 0.043 Y NA
 5874784 5874785 EFER_1416 EFER_1417 rsxA   FALSE 0.396 77.000 0.148 NA   NA
 5874785 5874786 EFER_1417 EFER_1418   ydgT FALSE 0.315 92.000 0.120 NA   NA
 5874788 5874789 EFER_1420 EFER_1421 add malY TRUE 0.970 4.000 0.132 1.000 N NA
 5874789 5874790 EFER_1421 EFER_1422 malY   TRUE 0.897 10.000 0.000 1.000   NA
 5874790 5874791 EFER_1422 EFER_1423   ydgA FALSE 0.114 101.000 0.000 NA   NA
 5874791 5874792 EFER_1423 EFER_1424 ydgA manA TRUE 0.967 27.000 0.778 NA   NA
 5874793 5874794 EFER_1425 EFER_1426 fumA fumC TRUE 0.500 154.000 0.000 0.001 Y NA
 5874795 5874796 EFER_1427 EFER_1428 tus rstB FALSE 0.251 152.000 0.200 1.000   NA
 5874796 5874797 EFER_1428 EFER_1429 rstB rstA TRUE 0.988 13.000 0.181 1.000 Y NA
 5874799 5874800 EFER_1431 EFER_1432 folM ydgI TRUE 0.695 35.000 0.140 1.000 N NA
 5874800 5874801 EFER_1432 EFER_1433 ydgI ydgH FALSE 0.101 188.000 0.143 NA   NA
 5874802 5874803 EFER_1434 EFER_1435 pntA pntB TRUE 0.999 11.000 0.745 0.001 Y NA
 5874803 5874804 EFER_1435 EFER_1436 pntB   FALSE 0.048 157.000 0.000 1.000 N NA
 5874805 5874806 EFER_1437 EFER_1438 ydgD asr FALSE 0.009 270.000 0.000 NA   NA
 5874806 5874807 EFER_1438 EFER_1439 asr ynfM FALSE 0.002 520.000 0.000 NA   NA
 5874808 5874809 EFER_1440 EFER_1441 ynfL   TRUE 0.825 16.000 0.061 NA   NA
 5874809 5874810 EFER_1441 EFER_1442   dgsA TRUE 0.487 -72.000 0.068 NA   NA
 5874810 5874811 EFER_1442 EFER_1443 dgsA ynfK TRUE 0.564 125.000 0.455 NA N NA
 5874812 5874813 EFER_1444 EFER_1445 clcB   FALSE 0.352 99.000 0.079 0.091 N NA
 5874813 5874814 EFER_1445 EFER_1446     TRUE 0.988 -78.000 0.903 0.091 Y NA
 5874814 5874815 EFER_1446 EFER_1447     TRUE 0.991 10.000 0.313 0.047 N NA
 5874815 5874816 EFER_1447 EFER_1448     TRUE 0.959 25.000 0.403 0.047 N NA
 5874818 5874819 EFER_1450 EFER_1451 ydcZ yncA TRUE 0.938 0.000 0.070 NA   NA
 5874820 5874821 EFER_1452 EFER_1453 yncB yncC FALSE 0.026 199.000 0.000 1.000   NA
 5874825 5874826 EFER_1457 EFER_1458 yncG   FALSE 0.005 338.000 0.000 NA   NA
 5874826 5874827 EFER_1458 EFER_1459     TRUE 0.589 22.000 0.000 NA   NA
 5874827 5874828 EFER_1459 EFER_1460     FALSE 0.268 45.000 0.000 NA   NA
 5874828 5874829 EFER_1460 EFER_1461     FALSE 0.070 136.000 0.000 NA   NA
 5874829 5874830 EFER_1461 EFER_1462   yhhI FALSE 0.020 205.000 0.000 NA   NA
 5874830 5874831 EFER_1462 EFER_1463 yhhI   FALSE 0.008 277.000 0.000 NA   NA
 5874831 5874832 EFER_1463 EFER_1464     FALSE 0.006 301.000 0.000 NA   NA
 5874832 5874833 EFER_1464 EFER_1465     FALSE 0.111 106.000 0.000 NA   NA
 5874833 5874834 EFER_1465 EFER_1466   yhhI FALSE 0.082 127.000 0.000 NA   NA
 5874834 5874835 EFER_1466 EFER_1467 yhhI yhhI FALSE 0.006 298.000 0.000 NA   NA
 5874835 5874836 EFER_1467 EFER_1468 yhhI   FALSE 0.156 68.000 0.000 NA   NA
 5874839 5874840 EFER_1471 EFER_1473 yddE   FALSE 0.006 320.000 0.000 1.000   NA
 5874841 5874842 EFER_1474 EFER_1475   ydcE TRUE 0.905 9.000 0.000 1.000   NA
 5874846 5874847 EFER_1479 EFER_1480 catB catC TRUE 0.877 -10.000 0.150 1.000 N NA
 5874847 5874848 EFER_1480 EFER_1481 catC catA TRUE 0.879 65.000 0.343 1.000 Y NA
 5874848 5874849 EFER_1481 EFER_1482 catA benA FALSE 0.445 80.000 0.188 1.000 N NA
 5874849 5874850 EFER_1482 EFER_1483 benA benB TRUE 0.998 0.000 0.953 0.001 N NA
 5874850 5874851 EFER_1483 EFER_1484 benB benC TRUE 0.991 7.000 0.250 0.043 N NA
 5874851 5874852 EFER_1484 EFER_1485 benC benD TRUE 0.991 10.000 0.438 1.000 N NA
 5874852 5874853 EFER_1485 EFER_1486 benD   FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 5874854 5874855 EFER_1487 EFER_1488   yddG FALSE 0.013 339.000 0.000 0.090   NA
 5874856 5874857 EFER_1489 EFER_1491 fdnG fdnH TRUE 0.998 13.000 0.429 0.002 Y NA
 5874857 5874858 EFER_1491 EFER_1492 fdnH fdnI TRUE 0.994 -7.000 0.333 0.002 Y NA
 5874859 5874860 EFER_1493 EFER_1494 yddM   TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5874860 5874861 EFER_1494 EFER_1495   adhP FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 5874861 5874862 EFER_1495 EFER_1496 adhP sfcA FALSE 0.085 134.000 0.000 1.000   NA
 5874866 5874867 EFER_1500 EFER_1501 ydcI pcaG FALSE 0.026 190.000 0.000 1.000 N NA
 5874867 5874868 EFER_1501 EFER_1502 pcaG pcaH TRUE 0.999 -3.000 0.782 0.001 Y NA
 5874869 5874870 EFER_1503 EFER_1504 ydcJ mdoD FALSE 0.005 318.000 0.000 NA   NA
 5874870 5874871 EFER_1504 EFER_1505 mdoD ydcH FALSE 0.061 143.000 0.026 NA   NA
 5874871 5874872 EFER_1505 EFER_1506 ydcH rimL FALSE 0.199 54.000 0.026 NA   NA
 5874874 5874875 EFER_1508 EFER_1509 tehB ydcL FALSE 0.147 143.000 0.088 NA   NA
 5874875 5874876 EFER_1509 EFER_1510 ydcL ydcP FALSE 0.082 127.000 0.000 NA   NA
 5874876 5874877 EFER_1510 EFER_1511 ydcP   FALSE 0.002 616.000 0.000 1.000 N NA
 5874879 5874880 EFER_1513 EFER_1514 ydcR ydcS FALSE 0.082 245.000 0.000 1.000 Y NA
 5874880 5874881 EFER_1514 EFER_1515 ydcS ydcT TRUE 0.996 18.000 0.609 0.047 Y NA
 5874881 5874882 EFER_1515 EFER_1516 ydcT ydcU TRUE 0.999 1.000 0.643 0.047 Y NA
 5874882 5874883 EFER_1516 EFER_1517 ydcU ydcV TRUE 0.997 -10.000 0.821 0.047 Y NA
 5874883 5874884 EFER_1517 EFER_1518 ydcV ydcW TRUE 0.893 22.000 0.216 1.000 N NA
 5874884 5874885 EFER_1518 EFER_1519 ydcW ydcX FALSE 0.003 422.000 0.000 NA   NA
 5874888 5874889 EFER_1522 EFER_1523 speG ynfB TRUE 0.535 31.000 0.055 NA   NA
 5874890 5874891 EFER_1524 EFER_1525 ynfA rspA FALSE 0.112 109.000 0.020 1.000   NA
 5874891 5874892 EFER_1525 EFER_1526 rspA rspB TRUE 0.683 -12.000 0.049 1.000 N NA
 5874892 5874893 EFER_1526 EFER_1527 rspB   FALSE 0.430 44.000 0.073 1.000 N NA
 5874893 5874894 EFER_1527 EFER_1528     TRUE 0.987 31.000 0.818 NA Y NA
 5874894 5874895 EFER_1528 EFER_1529     TRUE 0.983 25.000 0.500 NA Y NA
 5874895 5874896 EFER_1529 EFER_1530   dctP TRUE 0.632 60.000 0.000 1.000 Y NA
 5874896 5874897 EFER_1530 EFER_1531 dctP   TRUE 0.975 49.000 1.000 NA Y NA
 5874897 5874898 EFER_1531 EFER_1532     TRUE 0.949 -87.000 0.400 NA Y NA
 5874898 5874899 EFER_1532 EFER_1533   ydfI TRUE 0.611 64.000 0.000 1.000 Y NA
 5874900 5874901 EFER_1534 EFER_1535 ydfZ ydfH FALSE 0.393 154.000 0.375 NA   NA
 5874901 5874902 EFER_1535 EFER_1536 ydfH ydfG FALSE 0.190 87.000 0.047 1.000   NA
 5874905 5874906 EFER_1539 EFER_1540 ydeI ydeH FALSE 0.068 139.000 0.000 NA   NA
 5874909 5874910 EFER_1543 EFER_1544 marB marA TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5874910 5874911 EFER_1544 EFER_1545 marA marR TRUE 0.991 -27.000 0.667 0.044 Y NA
 5874913 5874914 EFER_1547 EFER_1548 ydeA yneJ FALSE 0.096 92.000 0.027 NA N NA
 5874915 5874916 EFER_1549 EFER_1550 yneI yneH FALSE 0.114 76.000 0.016 1.000 N NA
 5874916 5874917 EFER_1550 EFER_1551 yneH yneG TRUE 0.898 0.000 0.037 NA   NA
 5874917 5874918 EFER_1551 EFER_1552 yneG yneF FALSE 0.250 110.000 0.098 NA   NA
 5874918 5874919 EFER_1552 EFER_1553 yneF uxaB FALSE 0.057 149.000 0.000 1.000 N NA
 5874919 5874920 EFER_1553 EFER_1554 uxaB yneE FALSE 0.087 196.000 0.143 NA   NA
 5874921 5874922 EFER_1555 EFER_1556 tam ydcM FALSE 0.128 89.000 0.000 NA   NA
 5874922 5874923 EFER_1556 EFER_1557 ydcM   TRUE 0.520 -22.000 0.000 NA   NA
 5874925 5874926 EFER_1559 EFER_1560 lsrG lsrF TRUE 0.588 24.000 0.000 1.000   NA
 5874926 5874927 EFER_1560 EFER_1561 lsrF lsrB TRUE 0.872 27.000 0.000 NA Y NA
 5874927 5874928 EFER_1561 EFER_1562 lsrB lsrD TRUE 0.998 12.000 0.844 NA Y NA
 5874928 5874929 EFER_1562 EFER_1563 lsrD lsrC TRUE 0.999 0.000 0.788 0.047 Y NA
 5874929 5874930 EFER_1563 EFER_1564 lsrC ego TRUE 0.997 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 5874931 5874932 EFER_1565 EFER_1566 lsrR lsrK FALSE 0.133 79.000 0.000 1.000 N NA
 5874935 5874936 EFER_1570 EFER_1571     TRUE 0.549 123.000 0.400 NA   NA
 5874937 5874938 EFER_1572 EFER_1573 yddA yddB TRUE 0.619 37.000 0.000 0.060   NA
 5874938 5874939 EFER_1573 EFER_1574 yddB pqqL TRUE 0.600 50.000 0.167 1.000   NA
 5874939 5874940 EFER_1574 EFER_1575 pqqL gadB FALSE 0.006 327.000 0.000 1.000   NA
 5874940 5874941 EFER_1575 EFER_1577 gadB gadC FALSE 0.291 185.000 0.103 1.000 Y NA
 5874941 5874942 EFER_1577 EFER_1578 gadC yddW FALSE 0.392 37.000 0.000 1.000   NA
 5874942 5874943 EFER_1578 EFER_1579 yddW yddV FALSE 0.026 199.000 0.000 1.000   NA
 5874943 5874944 EFER_1579 EFER_1580 yddV dos TRUE 0.970 25.000 0.130 0.005 Y NA
 5874945 5874946 EFER_1582 EFER_1583 frmA yohL TRUE 0.978 17.000 0.531 NA   NA
 5874950 5874951 EFER_1586 EFER_1587 ydcF   FALSE 0.003 415.000 0.000 NA   NA
 5874951 5874952 EFER_1587 EFER_1588   hrpA FALSE 0.018 213.000 0.000 NA   NA
 5874954 5874955 EFER_1590 EFER_1591 ynbD ynbC TRUE 0.990 14.000 0.285 NA Y NA
 5874955 5874956 EFER_1591 EFER_1592 ynbC ynbB TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 5874956 5874957 EFER_1592 EFER_1593 ynbB ynbA TRUE 0.989 0.000 0.179 0.002   NA
 5874957 5874958 EFER_1593 EFER_1594 ynbA ydbD FALSE 0.038 171.000 0.000 NA   NA
 5874958 5874959 EFER_1594 EFER_1595 ydbD ydbC FALSE 0.170 64.000 0.000 NA   NA
 5874959 5874960 EFER_1595 EFER_1596 ydbC paaY FALSE 0.014 243.000 0.000 1.000   NA
 5874960 5874961 EFER_1596 EFER_1597 paaY paaX TRUE 0.802 -18.000 0.118 NA   NA
 5874961 5874962 EFER_1597 EFER_1598 paaX paaK FALSE 0.295 100.000 0.132 NA N NA
 5874962 5874963 EFER_1598 EFER_1599 paaK paaE TRUE 0.889 27.000 0.293 1.000 N NA
 5874963 5874964 EFER_1599 EFER_1600 paaE paaI TRUE 0.913 0.000 0.058 NA N NA
 5874964 5874965 EFER_1600 EFER_1601 paaI paaH TRUE 0.516 -10.000 0.013 NA N NA
 5874965 5874966 EFER_1601 EFER_1602 paaH paaG TRUE 0.987 2.000 0.051 1.000 Y NA
 5874966 5874967 EFER_1602 EFER_1603 paaG paaF TRUE 0.997 0.000 0.215 0.001 Y NA
 5874967 5874968 EFER_1603 EFER_1604 paaF paaJ TRUE 0.931 -3.000 0.093 1.000 N NA
 5874968 5874969 EFER_1604 EFER_1605 paaJ paaD TRUE 0.994 8.000 0.571 NA   NA
 5874969 5874970 EFER_1605 EFER_1606 paaD paaC TRUE 0.992 15.000 0.919 NA   NA
 5874970 5874971 EFER_1606 EFER_1607 paaC paaB TRUE 0.997 9.000 0.943 NA   NA
 5874971 5874972 EFER_1607 EFER_1608 paaB paaA TRUE 0.995 12.000 0.920 NA   NA
 5874973 5874974 EFER_1609 EFER_1610 maoC   FALSE 0.209 54.000 0.000 NA   NA
 5874974 5874975 EFER_1610 EFER_1611   tynA FALSE 0.441 30.000 0.000 NA   NA
 5874978 5874979 EFER_1614 EFER_1615   ydbL FALSE 0.196 57.000 0.000 NA   NA
 5874979 5874980 EFER_1615 EFER_1616 ydbL ynbE TRUE 0.996 5.000 0.726 NA   NA
 5874980 5874981 EFER_1616 EFER_1617 ynbE ydbH TRUE 0.907 -3.000 0.068 NA   NA
 5874982 5874983 EFER_1618 EFER_1619 ldhA hslJ FALSE 0.069 102.000 0.012 NA N NA
 5874985 5874986 EFER_1621 EFER_1622   ydbK FALSE 0.004 349.000 0.000 NA   NA
 5874988 5874989 EFER_1623 EFER_1624 ompN uspF FALSE 0.065 140.000 0.000 1.000 N NA
 5874989 5874990 EFER_1624 EFER_1625 uspF ydaO FALSE 0.007 270.000 0.000 NA N NA
 5874991 5874992 EFER_1626 EFER_1627 dbpA   FALSE 0.452 29.000 0.000 NA   NA
 5874992 5874993 EFER_1627 EFER_misc_RNA_30   C0343 FALSE 0.281 -115.000 0.000 NA   NA
 5874993 5874994 EFER_misc_RNA_30 EFER_1628 C0343   FALSE 0.014 231.000 0.000 NA   NA
 5874994 5874995 EFER_1628 EFER_1629   ydaN FALSE 0.396 -43.000 0.000 NA   NA
 5874997 5874998 EFER_1631 EFER_1632 pcaC pcaD TRUE 0.621 -31.000 0.065 1.000   NA
 5874998 5874999 EFER_1632 EFER_1633 pcaD pcaB FALSE 0.387 -61.000 0.028 1.000   NA
 5874999 5875000 EFER_1633 EFER_1634 pcaB paaJ TRUE 0.975 7.000 0.028 0.001 N NA
 5875000 5875001 EFER_1634 EFER_1635 paaJ pcaJ TRUE 0.999 10.000 1.000 1.000 Y NA
 5875001 5875002 EFER_1635 EFER_1636 pcaJ pcaI TRUE 0.999 11.000 1.000 0.001 Y NA
 5875004 5875005 EFER_1638 EFER_misc_RNA_31 ydaL isrA FALSE 0.199 56.000 0.000 NA   NA
 5875006 5875007 EFER_1639 EFER_1640 ogt fnr FALSE 0.044 195.000 0.067 1.000 N NA
 5875009 5875010 EFER_1642 EFER_1643   bla TRUE 0.512 183.000 0.800 1.000 N NA
 5875010 5875011 EFER_1643 EFER_1644 bla uspE FALSE 0.016 216.000 0.000 1.000 N NA
 5875018 5875019 EFER_1651 EFER_1652 tyrR ycjF FALSE 0.193 148.000 0.137 NA   NA
 5875019 5875020 EFER_1652 EFER_1653 ycjF ycjX TRUE 0.994 -3.000 0.791 NA   NA
 5875020 5875021 EFER_1653 EFER_1654 ycjX pspE FALSE 0.068 125.000 0.013 NA   NA
 5875021 5875022 EFER_1654 EFER_1655 pspE pspD TRUE 0.591 43.000 0.133 NA   NA
 5875022 5875023 EFER_1655 EFER_1656 pspD pspC TRUE 0.973 9.000 0.167 NA   NA
 5875023 5875024 EFER_1656 EFER_1657 pspC pspB TRUE 0.997 0.000 0.913 NA   NA
 5875024 5875025 EFER_1657 EFER_1658 pspB pspA TRUE 0.880 55.000 0.739 NA   NA
 5875026 5875027 EFER_1659 EFER_1660 pspF sapA TRUE 0.590 115.000 0.402 1.000 N NA
 5875027 5875028 EFER_1660 EFER_1661 sapA sapB TRUE 0.985 -3.000 0.264 0.046 N NA
 5875028 5875029 EFER_1661 EFER_1662 sapB sapC TRUE 0.986 -13.000 0.284 0.046 Y NA
 5875029 5875030 EFER_1662 EFER_1663 sapC sapD TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000 Y NA
 5875030 5875031 EFER_1663 EFER_1664 sapD sapF TRUE 0.999 2.000 0.684 0.015 Y NA
 5875031 5875032 EFER_1664 EFER_1665 sapF fabI FALSE 0.170 122.000 0.078 1.000 N NA
 5875032 5875033 EFER_1665 EFER_1666 fabI yciW FALSE 0.024 222.000 0.057 NA   NA
 5875033 5875034 EFER_1666 EFER_1667 yciW rnb FALSE 0.351 68.000 0.105 NA   NA
 5875034 5875035 EFER_1667 EFER_1668 rnb gmr FALSE 0.014 224.000 0.000 1.000 N NA
 5875035 5875036 EFER_1668 EFER_1669 gmr   FALSE 0.112 155.000 0.083 NA   NA
 5875036 5875037 EFER_1669 EFER_1670   yciT TRUE 0.763 -31.000 0.146 NA   NA
 5875037 5875038 EFER_1670 EFER_1671 yciT osmB FALSE 0.008 275.000 0.000 NA   NA
 5875039 5875040 EFER_1672 EFER_1673 yciH pyrF TRUE 0.868 -3.000 0.045 1.000 N NA
 5875040 5875041 EFER_1673 EFER_1674 pyrF yciM FALSE 0.086 191.000 0.125 1.000 N NA
 5875041 5875042 EFER_1674 EFER_1675 yciM yciS TRUE 0.995 7.000 0.576 NA   NA
 5875042 5875043 EFER_1675 EFER_1676 yciS pgpB FALSE 0.187 151.000 0.143 NA   NA
 5875047 5875048 EFER_1680 EFER_1681   yciX TRUE 0.994 1.000 0.556 NA   NA
 5875048 5875049 EFER_1681 EFER_1682 yciX cysB FALSE 0.009 264.000 0.000 NA   NA
 5875049 5875050 EFER_1682 EFER_1683 cysB topA FALSE 0.013 209.000 0.008 1.000 N NA
 5875053 5875054 EFER_1686 EFER_1687 yciK btuR TRUE 0.877 -3.000 0.050 1.000 N NA
 5875055 5875056 EFER_1688 EFER_1689 rluB yciQ FALSE 0.018 213.000 0.000 NA   NA
 5875056 5875057 EFER_1689 EFER_1690 yciQ yciO TRUE 0.467 28.000 0.000 NA   NA
 5875057 5875058 EFER_1690 EFER_1691 yciO yciV TRUE 0.977 -3.000 0.281 NA   NA
 5875059 5875060 EFER_4506 EFER_1692 trpL trpE FALSE 0.113 92.000 0.023 NA   NA
 5875060 5875061 EFER_1692 EFER_1693 trpE trpD TRUE 0.992 0.000 0.010 0.001 Y NA
 5875061 5875062 EFER_1693 EFER_1694 trpD trpC TRUE 0.996 4.000 0.293 1.000 Y NA
 5875062 5875063 EFER_1694 EFER_1695 trpC trpB TRUE 0.996 12.000 0.221 0.001 Y NA
 5875063 5875064 EFER_1695 EFER_1696 trpB trpA TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 5875066 5875067 EFER_1698 EFER_1699 ykgJ yciC TRUE 0.814 27.000 0.169 NA   NA
 5875067 5875068 EFER_1699 EFER_1700 yciC yciB TRUE 0.560 31.000 0.061 NA   NA
 5875068 5875069 EFER_1700 EFER_1701 yciB yciA FALSE 0.333 108.000 0.167 NA N NA
 5875073 5875074 EFER_1705 EFER_1706 cls yciU TRUE 0.809 34.000 0.231 NA   NA
 5875075 5875076 EFER_1707 EFER_1708 cikL oppF FALSE 0.385 -96.000 0.042 1.000   NA
 5875076 5875077 EFER_1708 EFER_1709 oppF oppD TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 5875077 5875078 EFER_1709 EFER_1710 oppD oppC TRUE 0.997 12.000 0.554 1.000 Y NA
 5875078 5875079 EFER_1710 EFER_1711 oppC oppB TRUE 0.998 15.000 0.870 0.046 Y NA
 5875079 5875080 EFER_1711 EFER_1712 oppB oppA TRUE 0.809 85.000 0.151 0.046 Y NA
 5875080 5875081 EFER_1712 EFER_1713 oppA ychE FALSE 0.001 860.000 0.000 NA N NA
 5875083 5875084 EFER_1715 EFER_1716 insG   FALSE 0.346 -63.000 0.000 NA   NA
 5875084 5875085 EFER_1716 EFER_1717   tdk FALSE 0.015 224.000 0.000 NA   NA
 5875087 5875088 EFER_1719 EFER_1720 galU rssB FALSE 0.124 203.000 0.235 1.000 N NA
 5875088 5875089 EFER_1720 EFER_1721 rssB rssA FALSE 0.373 44.000 0.048 1.000   NA
 5875090 5875091 EFER_1722 EFER_1723 ychJ purU TRUE 0.598 53.000 0.200 NA   NA
 5875091 5875092 EFER_1723 EFER_tRNA19 purU   FALSE 0.046 161.000 0.000 NA   NA
 5875092 5875093 EFER_tRNA19 EFER_tRNA20     FALSE 0.380 35.000 0.000 NA   NA
 5875093 5875094 EFER_tRNA20 EFER_misc_RNA_32   rtt TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5875095 5875096 EFER_1726 EFER_1727     TRUE 0.811 -13.000 0.103 NA   NA
 5875096 5875097 EFER_1727 EFER_1728     TRUE 0.922 -7.000 0.179 NA   NA
 5875097 5875098 EFER_1728 EFER_1729     TRUE 0.860 -15.000 0.162 NA   NA
 5875098 5875099 EFER_1729 EFER_1730     TRUE 0.920 -51.000 0.550 NA   NA
 5875099 5875100 EFER_1730 EFER_1731     TRUE 0.811 -22.000 0.133 1.000   NA
 5875100 5875101 EFER_1731 EFER_1732     TRUE 0.965 -3.000 0.200 1.000 N NA
 5875101 5875102 EFER_1732 EFER_1733   narI FALSE 0.101 112.000 0.000 1.000 N NA
 5875102 5875103 EFER_1733 EFER_1734 narI narJ TRUE 0.999 0.000 0.500 0.002 Y NA
 5875103 5875104 EFER_1734 EFER_1735 narJ narH TRUE 0.999 -3.000 0.588 0.002 Y NA
 5875104 5875105 EFER_1735 EFER_1736 narH narG TRUE 0.998 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 5875105 5875106 EFER_1736 EFER_1737 narG narK FALSE 0.003 393.000 0.000 1.000 N NA
 5875107 5875108 EFER_1738 EFER_1739 narX narL TRUE 0.996 -7.000 0.521 0.013 Y NA
 5875111 5875112 EFER_1742 EFER_1743 chaC chaB FALSE 0.161 158.000 0.140 NA   NA
 5875114 5875115 EFER_1745 EFER_1746   kdsA FALSE 0.014 229.000 0.000 NA   NA
 5875115 5875116 EFER_1746 EFER_1747 kdsA ychA TRUE 0.622 36.000 0.089 1.000   NA
 5875116 5875117 EFER_1747 EFER_1748 ychA   FALSE 0.139 78.000 0.000 NA   NA
 5875117 5875118 EFER_1748 EFER_1749   prmC FALSE 0.223 52.000 0.000 NA   NA
 5875118 5875119 EFER_1749 EFER_1750 prmC prfA TRUE 0.997 0.000 0.229 0.041 Y NA
 5875119 5875120 EFER_1750 EFER_1751 prfA hemA TRUE 0.786 42.000 0.171 0.041 N NA
 5875121 5875122 EFER_1752 EFER_1753 lolB ispE TRUE 0.970 0.000 0.157 1.000 N NA
 5875122 5875123 EFER_1753 EFER_1754 ispE prsA FALSE 0.079 151.000 0.053 1.000 N NA
 5875123 5875124 EFER_1754 EFER_1755 prsA ychM FALSE 0.079 125.000 0.027 1.000 N NA
 5875126 5875127 EFER_1757 EFER_1758 pth ychF TRUE 0.679 117.000 0.184 1.000 Y NA
 5875127 5875128 EFER_1758 EFER_1759 ychF treA FALSE 0.050 154.000 0.000 1.000 N NA
 5875132 5875133 EFER_1763 EFER_1764 ldcA cvrA FALSE 0.252 97.000 0.103 NA N NA
 5875134 5875135 EFER_1765 EFER_1766 dadX dadA TRUE 0.961 12.000 0.168 1.000 N NA
 5875138 5875139 EFER_1769 EFER_1770 nhaB dsbB TRUE 0.659 142.000 0.723 1.000 N NA
 5875140 5875141 EFER_1771 EFER_1772 eaeH   FALSE 0.017 215.000 0.000 NA   NA
 5875141 5875142 EFER_1772 EFER_1773   ycgN FALSE 0.159 67.000 0.000 NA   NA
 5875142 5875143 EFER_1773 EFER_1774 ycgN ycgM FALSE 0.241 103.000 0.088 NA   NA
 5875143 5875144 EFER_1774 EFER_1775 ycgM ycgL FALSE 0.319 51.000 0.056 NA   NA
 5875145 5875146 EFER_1776 EFER_1777 minC minD TRUE 0.984 24.000 0.466 1.000 Y NA
 5875146 5875147 EFER_1777 EFER_1778 minD minE TRUE 0.998 4.000 0.618 NA Y NA
 5875148 5875149 EFER_tRNA76 EFER_1779     FALSE 0.047 160.000 0.000 NA   NA
 5875149 5875150 EFER_1779 EFER_1780     TRUE 0.923 -7.000 0.000 0.001   NA
 5875150 5875151 EFER_1780 EFER_1781     TRUE 0.991 -6.000 0.500 0.001   NA
 5875151 5875152 EFER_1781 EFER_1782     TRUE 0.994 -28.000 0.750 0.001 Y NA
 5875152 5875153 EFER_1782 EFER_1783     TRUE 0.994 -15.000 0.500 0.001 Y NA
 5875153 5875154 EFER_1783 EFER_1784   ymgF FALSE 0.073 134.000 0.000 NA   NA
 5875154 5875155 EFER_1784 EFER_1785 ymgF   FALSE 0.038 171.000 0.000 NA   NA
 5875155 5875156 EFER_1785 EFER_1786     FALSE 0.004 388.000 0.000 1.000   NA
 5875159 5875160 EFER_1789 EFER_1790     FALSE 0.003 398.000 0.000 NA   NA
 5875160 5875161 EFER_1790 EFER_1791     FALSE 0.005 353.000 0.000 1.000   NA
 5875165 5875166 EFER_1795 EFER_1796 ymfC ymfB TRUE 0.973 10.000 0.182 1.000 N NA
 5875166 5875167 EFER_1796 EFER_1797 ymfB trmU TRUE 0.528 54.000 0.158 1.000 N NA
 5875167 5875168 EFER_1797 EFER_1798 trmU hflD TRUE 0.742 36.000 0.180 NA   NA
 5875168 5875169 EFER_1798 EFER_1799 hflD purB TRUE 0.961 4.000 0.093 NA   NA
 5875169 5875170 EFER_1799 EFER_1800 purB phoP FALSE 0.031 166.000 0.011 1.000 N NA
 5875170 5875171 EFER_1800 EFER_1801 phoP phoQ TRUE 0.999 0.000 0.940 1.000 Y NA
 5875171 5875172 EFER_1801 EFER_1802 phoQ ycfD TRUE 0.657 90.000 0.408 NA   NA
 5875173 5875174 EFER_1803 EFER_1804 yeaE mipA FALSE 0.268 45.000 0.000 NA   NA
 5875175 5875176 EFER_1805 EFER_1806 yeaG yeaH TRUE 0.752 113.000 0.683 NA   NA
 5875176 5875177 EFER_1806 EFER_1807 yeaH yeaI FALSE 0.008 279.000 0.000 NA   NA
 5875177 5875178 EFER_1807 EFER_1808 yeaI yeaJ FALSE 0.385 171.000 0.000 0.005 Y NA
 5875178 5875179 EFER_1808 EFER_1809 yeaJ yeaK TRUE 0.483 43.000 0.083 NA   NA
 5875181 5875182 EFER_1811 EFER_1812 yeaL yeaN FALSE 0.109 108.000 0.000 NA   NA
 5875182 5875183 EFER_1812 EFER_1813 yeaN yeaO FALSE 0.154 55.000 0.007 NA   NA
 5875186 5875187 EFER_1816 EFER_1817 yeaQ yeaS FALSE 0.049 166.000 0.000 1.000   NA
 5875187 5875188 EFER_1817 EFER_1818 yeaS ycfJ FALSE 0.069 149.000 0.000 1.000   NA
 5875188 5875189 EFER_1818 EFER_1819 ycfJ ndh FALSE 0.084 170.000 0.071 1.000   NA
 5875189 5875190 EFER_1819 EFER_1820 ndh ycfP FALSE 0.020 241.000 0.057 NA   NA
 5875190 5875191 EFER_1820 EFER_1821 ycfP nagZ TRUE 0.757 24.000 0.091 NA   NA
 5875191 5875192 EFER_1821 EFER_1822 nagZ thiK TRUE 0.728 22.000 0.069 1.000 N NA
 5875192 5875193 EFER_1822 EFER_1823 thiK ycfM TRUE 0.916 -19.000 0.310 NA   NA
 5875193 5875194 EFER_1823 EFER_1824 ycfM ycfL TRUE 0.985 14.000 0.516 NA   NA
 5875194 5875195 EFER_1824 EFER_1825 ycfL hinT TRUE 0.930 3.000 0.051 NA   NA
 5875195 5875196 EFER_1825 EFER_1826 hinT ptsG FALSE 0.032 336.000 0.005 1.000 Y NA
 5875196 5875197 EFER_1826 EFER_1827 ptsG ycfH FALSE 0.003 294.000 0.004 NA N NA
 5875197 5875198 EFER_1827 EFER_1828 ycfH holB TRUE 0.988 11.000 0.110 NA Y NA
 5875198 5875199 EFER_1828 EFER_1829 holB tmk TRUE 0.967 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5875199 5875200 EFER_1829 EFER_1830 tmk yceG TRUE 0.911 -10.000 0.209 NA   NA
 5875200 5875201 EFER_1830 EFER_1831 yceG pabC TRUE 0.966 -3.000 0.204 NA   NA
 5875201 5875202 EFER_1831 EFER_1832 pabC fabF FALSE 0.346 118.000 0.187 1.000 N NA
 5875202 5875203 EFER_1832 EFER_1833 fabF acpP TRUE 0.844 89.000 0.346 1.000 Y NA
 5875203 5875204 EFER_1833 EFER_1834 acpP fabG FALSE 0.332 276.000 0.321 0.004 Y NA
 5875204 5875205 EFER_1834 EFER_1835 fabG fabD TRUE 0.998 12.000 0.432 0.004 Y NA
 5875205 5875206 EFER_1835 EFER_1836 fabD fabH TRUE 0.990 16.000 0.182 0.004 Y NA
 5875206 5875207 EFER_1836 EFER_1837 fabH plsX TRUE 0.926 76.000 0.380 0.004 Y NA
 5875207 5875208 EFER_1837 EFER_1839 plsX rpmF TRUE 0.677 81.000 0.418 1.000 N NA
 5875208 5875209 EFER_1839 EFER_1840 rpmF yceD TRUE 0.860 52.000 0.599 NA   NA
 5875209 5875210 EFER_1840 EFER_misc_RNA_33 yceD sraB FALSE 0.353 37.000 0.000 NA   NA
 5875214 5875215 EFER_1845 EFER_1846 flgL flgK TRUE 0.990 16.000 0.142 0.001 Y NA
 5875215 5875216 EFER_1846 EFER_1847 flgK flgJ TRUE 0.970 66.000 0.705 0.002 Y NA
 5875216 5875217 EFER_1847 EFER_1848 flgJ flgI TRUE 0.992 0.000 0.036 0.006 Y NA
 5875217 5875218 EFER_1848 EFER_1849 flgI flgH TRUE 0.991 12.000 0.073 0.006 Y NA
 5875218 5875219 EFER_1849 EFER_1850 flgH flgG TRUE 0.934 53.000 0.268 0.005 Y NA
 5875219 5875220 EFER_1850 EFER_1852 flgG flgF TRUE 0.846 152.000 0.420 0.001 Y NA
 5875220 5875221 EFER_1852 EFER_1853 flgF flgE TRUE 0.994 20.000 0.476 0.003 Y NA
 5875221 5875222 EFER_1853 EFER_1854 flgE flgD TRUE 0.937 25.000 0.116 NA Y NA
 5875222 5875223 EFER_1854 EFER_1855 flgD flgC TRUE 0.990 12.000 0.186 NA Y NA
 5875223 5875224 EFER_1855 EFER_1856 flgC flgB TRUE 0.999 4.000 0.824 0.003 Y NA
 5875225 5875226 EFER_1857 EFER_1858 flgA flgM TRUE 0.820 91.000 0.330 NA Y NA
 5875226 5875227 EFER_1858 EFER_1859 flgM flgN TRUE 0.999 5.000 0.361 0.002 Y NA
 5875228 5875229 EFER_1860 EFER_1861 mviN mviM FALSE 0.158 71.000 0.022 1.000   NA
 5875229 5875230 EFER_1861 EFER_1862 mviM yceH TRUE 0.962 2.000 0.103 NA   NA
 5875230 5875231 EFER_1862 EFER_1863 yceH rimJ TRUE 0.800 -18.000 0.116 NA   NA
 5875232 5875233 EFER_1864 EFER_1866 mdtH yceB FALSE 0.263 145.000 0.196 NA   NA
 5875233 5875234 EFER_1866 EFER_1867 yceB pyrC FALSE 0.101 105.000 0.022 NA   NA
 5875234 5875235 EFER_1867 EFER_1868 pyrC dinI FALSE 0.149 73.000 0.031 NA   NA
 5875235 5875236 EFER_1868 EFER_1869 dinI bssS FALSE 0.007 289.000 0.000 NA   NA
 5875236 5875237 EFER_1869 EFER_1870 bssS solA TRUE 0.596 117.000 0.423 NA   NA
 5875237 5875238 EFER_1870 EFER_1871 solA yceJ FALSE 0.011 374.000 0.000 0.024 N NA
 5875238 5875239 EFER_1871 EFER_1872 yceJ yceI TRUE 0.993 -3.000 0.676 NA   NA
 5875241 5875242 EFER_1874 EFER_1875 lpxL mdtG TRUE 0.639 183.000 0.857 0.072 N NA
 5875242 5875243 EFER_1875 EFER_1876 mdtG msyB TRUE 0.611 83.000 0.333 NA   NA
 5875244 5875245 EFER_1877 EFER_1878 yceK mdoH FALSE 0.171 153.000 0.135 NA   NA
 5875245 5875246 EFER_1878 EFER_1879 mdoH mdoG TRUE 0.972 -7.000 0.469 NA N NA
 5875247 5875248 EFER_1880 EFER_1882   mdoC FALSE 0.207 72.000 0.054 NA   NA
 5875249 5875250 EFER_1883 EFER_1884 ymdC ymdB FALSE 0.409 -67.000 0.046 NA   NA
 5875250 5875251 EFER_1884 EFER_1885 ymdB ymdA FALSE 0.135 80.000 0.028 NA   NA
 5875251 5875252 EFER_1885 EFER_1886 ymdA csgC TRUE 0.491 116.000 0.300 NA   NA
 5875252 5875253 EFER_1886 EFER_1887 csgC csgA TRUE 0.850 60.000 0.667 NA   NA
 5875253 5875254 EFER_1887 EFER_1888 csgA csgB TRUE 0.903 41.000 0.333 0.006   NA
 5875255 5875256 EFER_1889 EFER_1890 csgD csgE TRUE 0.636 -130.000 0.176 NA   NA
 5875256 5875257 EFER_1890 EFER_1891 csgE csgF TRUE 0.971 24.000 0.723 NA   NA
 5875257 5875258 EFER_1891 EFER_1893 csgF csgG TRUE 0.545 27.000 0.043 NA   NA
 5875259 5875260 EFER_1894 EFER_1895 ycdZ ycdY FALSE 0.356 92.000 0.145 NA   NA
 5875260 5875261 EFER_1895 EFER_1896 ycdY ycdX TRUE 0.945 24.000 0.417 1.000   NA
 5875261 5875262 EFER_1896 EFER_1897 ycdX ycdW TRUE 0.734 87.000 0.169 1.000 Y NA
 5875264 5875265 EFER_1898 EFER_1899 lysU yjdL FALSE 0.008 269.000 0.000 1.000 N NA
 5875265 5875266 EFER_1899 EFER_1900 yjdL cadA TRUE 0.638 59.000 0.000 1.000 Y NA
 5875266 5875267 EFER_1900 EFER_1901 cadA cadB TRUE 0.549 80.000 0.000 1.000 Y NA
 5875267 5875268 EFER_1901 EFER_1902 cadB cadC FALSE 0.004 364.000 0.000 1.000 N NA
 5875268 5875269 EFER_1902 EFER_1903 cadC ycdT FALSE 0.004 340.000 0.000 1.000 N NA
 5875270 5875271 EFER_1904 EFER_1905 pgaA pgaB TRUE 0.996 9.000 0.696 1.000   NA
 5875271 5875272 EFER_1905 EFER_1906 pgaB pgaC TRUE 0.972 -7.000 0.435 1.000 N NA
 5875272 5875273 EFER_1906 EFER_1907 pgaC ycdP TRUE 0.993 2.000 0.462 NA   NA
 5875274 5875275 EFER_1908 EFER_1909 phoH efeB FALSE 0.002 473.000 0.000 NA N NA
 5875275 5875276 EFER_1909 EFER_1910 efeB efeO TRUE 0.997 6.000 0.378 NA Y NA
 5875276 5875277 EFER_1910 EFER_1911 efeO efeU TRUE 0.895 58.000 0.356 NA Y NA
 5875277 5875278 EFER_1911 EFER_1912 efeU putP FALSE 0.017 211.000 0.000 1.000 N NA
 5875280 5875281 EFER_1914 EFER_1915 msbB virK FALSE 0.140 77.000 0.000 NA   NA
 5875281 5875282 EFER_1915 EFER_1916 virK   FALSE 0.261 46.000 0.000 NA   NA
 5875282 5875283 EFER_1916 EFER_1917     FALSE 0.215 53.000 0.000 NA   NA
 5875283 5875284 EFER_1917 EFER_1918   shf FALSE 0.452 29.000 0.000 NA   NA
 5875284 5875285 EFER_1918 EFER_1919 shf umuC FALSE 0.032 181.000 0.000 1.000 N NA
 5875285 5875286 EFER_1919 EFER_1920 umuC umuD TRUE 0.881 0.000 0.000 1.000 N NA
 5875286 5875287 EFER_1920 EFER_1921 umuD fliE FALSE 0.009 258.000 0.000 1.000 N NA
 5875287 5875288 EFER_1921 EFER_1922 fliE   FALSE 0.403 45.000 0.067 NA   NA
 5875289 5875290 EFER_1923 EFER_1924 fliF fliG TRUE 0.991 -7.000 0.220 0.005 Y NA
 5875290 5875291 EFER_1924 EFER_1925 fliG fliH TRUE 0.975 -7.000 0.000 0.003 Y NA
 5875291 5875292 EFER_1925 EFER_1926 fliH fliI TRUE 0.975 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5875292 5875293 EFER_1926 EFER_1927 fliI fliJ TRUE 0.907 22.000 0.006 1.000 Y NA
 5875293 5875294 EFER_1927 EFER_1928 fliJ fliK TRUE 0.997 -3.000 0.317 0.005 Y NA
 5875294 5875295 EFER_1928 EFER_1929 fliK fliL TRUE 0.646 105.000 0.119 1.000 Y NA
 5875295 5875296 EFER_1929 EFER_1930 fliL fliM TRUE 1.000 5.000 0.957 0.001 Y NA
 5875296 5875297 EFER_1930 EFER_1931 fliM fliN TRUE 0.994 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 5875297 5875298 EFER_1931 EFER_1932 fliN fliO TRUE 0.998 2.000 0.443 1.000 Y NA
 5875298 5875299 EFER_1932 EFER_1933 fliO fliP TRUE 0.994 0.000 0.203 1.000 Y NA
 5875299 5875300 EFER_1933 EFER_1934 fliP fliQ TRUE 0.999 9.000 0.827 0.007 Y NA
 5875300 5875301 EFER_1934 EFER_1935 fliQ fliR TRUE 0.976 -7.000 0.000 0.002 Y NA
 5875301 5875302 EFER_1935 EFER_1936 fliR rcsA FALSE 0.007 277.000 0.000 1.000 N NA
 5875303 5875304 EFER_1937 EFER_misc_RNA_34 dsrB dsrB FALSE 0.236 -179.000 0.000 NA   NA
 5875308 5875309 EFER_1940 EFER_1941     FALSE 0.363 120.000 0.208 NA   NA
 5875309 5875310 EFER_1941 EFER_1942   yedI TRUE 0.673 18.000 0.025 NA   NA
 5875312 5875313 EFER_1944 EFER_1945 vsr   TRUE 0.696 19.000 0.000 1.000   NA
 5875313 5875314 EFER_1945 EFER_1947     FALSE 0.322 53.000 0.062 NA   NA
 5875315 5875316 EFER_1948 EFER_1949   nmpC FALSE 0.026 571.000 0.000 0.045 Y NA
 5875316 5875317 EFER_1949 EFER_1950 nmpC trkG FALSE 0.003 440.000 0.000 1.000 N NA
 5875317 5875318 EFER_1950 EFER_1951 trkG hchA FALSE 0.108 109.000 0.000 NA   NA
 5875320 5875321 EFER_1953 EFER_tRNA22 yeeI   FALSE 0.114 101.000 0.000 NA   NA
 5875322 5875323 EFER_1954 EFER_1955 cbl nac TRUE 0.825 102.000 0.222 0.049 Y NA
 5875324 5875325 EFER_tRNA23 EFER_1956     FALSE 0.102 114.000 0.000 NA   NA
 5875326 5875327 EFER_1957 EFER_1958     FALSE 0.035 178.000 0.000 NA   NA
 5875327 5875328 EFER_1958 EFER_1959     TRUE 0.996 12.000 1.000 NA   NA
 5875328 5875329 EFER_1959 EFER_1960     FALSE 0.002 784.000 0.000 NA   NA
 5875329 5875330 EFER_1960 EFER_1961     TRUE 0.966 0.000 0.136 NA   NA
 5875330 5875331 EFER_1961 EFER_1962     FALSE 0.186 200.000 0.333 NA   NA
 5875331 5875332 EFER_1962 EFER_1963     TRUE 0.916 18.000 0.182 NA   NA
 5875332 5875333 EFER_1963 EFER_1964     TRUE 0.766 -136.000 0.312 NA   NA
 5875333 5875334 EFER_1964 EFER_1965     TRUE 0.983 19.000 0.750 NA   NA
 5875334 5875335 EFER_1965 EFER_1966     TRUE 0.996 3.000 0.711 NA   NA
 5875335 5875336 EFER_1966 EFER_1967     TRUE 0.860 -3.000 0.039 NA   NA
 5875336 5875337 EFER_1967 EFER_1968     TRUE 0.992 9.000 0.471 NA   NA
 5875337 5875338 EFER_1968 EFER_1969     TRUE 0.985 -7.000 0.673 NA   NA
 5875338 5875339 EFER_1969 EFER_1970     TRUE 0.926 -99.000 0.765 NA   NA
 5875339 5875340 EFER_1970 EFER_1971     TRUE 0.995 -3.000 0.862 NA   NA
 5875340 5875341 EFER_1971 EFER_1972     TRUE 0.955 24.000 0.510 NA   NA
 5875341 5875342 EFER_1972 EFER_1973     TRUE 0.963 -36.000 0.863 NA   NA
 5875342 5875343 EFER_1973 EFER_1974     TRUE 0.994 6.000 0.552 NA   NA
 5875343 5875344 EFER_1974 EFER_1975     TRUE 0.995 3.000 0.627 NA   NA
 5875344 5875345 EFER_1975 EFER_1976     TRUE 0.991 15.000 0.821 NA   NA
 5875346 5875347 EFER_1977 EFER_1978     FALSE 0.018 210.000 0.000 NA   NA
 5875347 5875348 EFER_1978 EFER_1979     TRUE 0.589 22.000 0.000 NA   NA
 5875348 5875349 EFER_1979 EFER_1980     TRUE 0.487 27.000 0.000 NA   NA
 5875349 5875350 EFER_1980 EFER_1981     TRUE 0.897 7.000 0.000 NA   NA
 5875350 5875351 EFER_1981 EFER_1982   ydcC FALSE 0.011 251.000 0.000 NA   NA
 5875352 5875353 EFER_1983 EFER_1984 amn shiA FALSE 0.068 128.000 0.021 1.000 N NA
 5875353 5875354 EFER_1984 EFER_tRNA74 shiA   FALSE 0.004 358.000 0.000 NA   NA
 5875354 5875355 EFER_tRNA74 EFER_1985   yeeO FALSE 0.095 118.000 0.000 NA   NA
 5875356 5875357 EFER_tRNA24 EFER_1986     FALSE 0.006 313.000 0.000 NA   NA
 5875357 5875358 EFER_1986 EFER_1987     TRUE 0.953 23.000 0.308 0.068   NA
 5875358 5875359 EFER_1987 EFER_1988     TRUE 0.994 0.000 0.625 NA   NA
 5875359 5875360 EFER_1988 EFER_1989     FALSE 0.002 469.000 0.000 NA   NA
 5875360 5875361 EFER_1989 EFER_1990     TRUE 0.982 18.000 0.667 NA   NA
 5875361 5875362 EFER_1990 EFER_1991     TRUE 0.993 15.000 1.000 NA   NA
 5875362 5875363 EFER_1991 EFER_1992   adhE FALSE 0.328 39.000 0.000 NA   NA
 5875363 5875364 EFER_1992 EFER_1993 adhE   TRUE 0.487 27.000 0.000 NA   NA
 5875364 5875365 EFER_1993 EFER_1994   adhE TRUE 0.902 4.000 0.000 NA   NA
 5875365 5875366 EFER_1994 EFER_1995 adhE   TRUE 0.672 -9.000 0.000 NA   NA
 5875366 5875367 EFER_1995 EFER_1996     TRUE 0.948 52.000 0.815 0.003 N NA
 5875367 5875368 EFER_1996 EFER_1997     TRUE 0.973 12.000 0.250 NA N NA
 5875368 5875369 EFER_1997 EFER_1998     TRUE 0.995 -3.000 0.375 NA Y NA
 5875369 5875370 EFER_1998 EFER_1999     TRUE 0.985 12.000 0.375 NA   NA
 5875370 5875371 EFER_1999 EFER_2000     TRUE 0.952 33.000 0.750 NA   NA
 5875371 5875372 EFER_2000 EFER_2001     TRUE 0.999 10.000 1.000 0.071 Y NA
 5875373 5875374 EFER_2002 EFER_2003 erfK   FALSE 0.017 215.000 0.000 NA   NA
 5875374 5875375 EFER_2003 EFER_2006   pocR FALSE 0.002 500.000 0.000 NA   NA
 5875375 5875376 EFER_2006 EFER_2007 pocR pduF FALSE 0.141 195.000 0.231 1.000 N NA
 5875377 5875378 EFER_2008 EFER_2009     TRUE 0.924 -3.000 0.083 NA   NA
 5875378 5875379 EFER_2009 EFER_2010   pduC TRUE 0.843 19.000 0.100 1.000 N NA
 5875379 5875380 EFER_2010 EFER_2011 pduC PduD TRUE 0.992 11.000 0.273 0.001   NA
 5875380 5875381 EFER_2011 EFER_2012 PduD pduE TRUE 0.995 15.000 0.759 0.001   NA
 5875381 5875382 EFER_2012 EFER_2013 pduE   TRUE 0.991 11.000 0.500 NA   NA
 5875382 5875383 EFER_2013 EFER_2014     TRUE 0.713 -238.000 0.295 NA   NA
 5875383 5875384 EFER_2014 EFER_2015     TRUE 0.637 20.000 0.000 NA   NA
 5875384 5875385 EFER_2015 EFER_2016     TRUE 0.504 26.000 0.000 NA   NA
 5875385 5875386 EFER_2016 EFER_2017     TRUE 0.995 0.000 0.242 NA Y NA
 5875386 5875387 EFER_2017 EFER_2018     TRUE 0.863 -27.000 0.242 NA   NA
 5875387 5875388 EFER_2018 EFER_2019     TRUE 0.988 4.000 0.296 NA   NA
 5875388 5875389 EFER_2019 EFER_2020     TRUE 0.980 11.000 0.268 NA   NA
 5875389 5875390 EFER_2020 EFER_2021     TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 5875390 5875391 EFER_2021 EFER_2022     TRUE 0.989 11.000 0.000 0.023 Y NA
 5875391 5875392 EFER_2022 EFER_2023     TRUE 0.993 -3.000 0.259 1.000 Y NA
 5875392 5875393 EFER_2023 EFER_2024     TRUE 0.999 3.000 0.714 NA Y NA
 5875393 5875394 EFER_2024 EFER_2025     FALSE 0.446 -24.000 0.000 NA N NA
 5875394 5875395 EFER_2025 EFER_2026     TRUE 0.985 2.000 0.000 1.000 Y NA
 5875395 5875396 EFER_2026 EFER_2027     TRUE 0.938 -10.000 0.292 1.000 N NA
 5875397 5875398 EFER_2028 EFER_2029 yeeX yeeA FALSE 0.171 168.000 0.180 NA   NA
 5875398 5875399 EFER_2029 EFER_2030 yeeA sbmC FALSE 0.263 98.000 0.096 NA   NA
 5875400 5875401 EFER_2031 EFER_2032     FALSE 0.360 -57.000 0.000 NA   NA
 5875402 5875403 EFER_2033 EFER_2034     FALSE 0.074 133.000 0.000 NA   NA
 5875403 5875404 EFER_2034 EFER_2035     TRUE 0.959 -3.000 0.167 NA   NA
 5875404 5875405 EFER_2035 EFER_2036     TRUE 0.978 13.000 0.333 NA   NA
 5875405 5875406 EFER_2036 EFER_2037     TRUE 0.924 -25.000 0.400 NA   NA
 5875406 5875407 EFER_2037 EFER_2038   GP TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 5875407 5875408 EFER_2038 EFER_2039 GP   TRUE 0.984 0.000 0.286 NA   NA
 5875408 5875409 EFER_2039 EFER_2040   GP TRUE 0.993 1.000 0.500 NA   NA
 5875409 5875410 EFER_2040 EFER_2041 GP   FALSE 0.263 -133.000 0.000 NA   NA
 5875410 5875411 EFER_2041 EFER_2042   GP TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5875411 5875412 EFER_2042 EFER_2043 GP GP TRUE 0.971 0.000 0.161 NA   NA
 5875412 5875413 EFER_2043 EFER_2044 GP GP TRUE 0.968 14.000 0.286 NA   NA
 5875413 5875414 EFER_2044 EFER_2045 GP GP TRUE 0.971 1.000 0.143 NA   NA
 5875414 5875415 EFER_2045 EFER_2046 GP GP TRUE 0.900 -22.000 0.286 NA   NA
 5875415 5875416 EFER_2046 EFER_2047 GP   TRUE 0.948 18.000 0.286 NA   NA
 5875416 5875417 EFER_2047 EFER_2048     TRUE 0.991 2.000 0.400 NA   NA
 5875417 5875418 EFER_2048 EFER_2049     FALSE 0.004 353.000 0.000 NA   NA
 5875418 5875419 EFER_2049 EFER_2050     FALSE 0.411 -40.000 0.000 NA   NA
 5875419 5875420 EFER_2050 EFER_2051   Rz TRUE 0.614 -12.000 0.000 NA   NA
 5875420 5875421 EFER_2051 EFER_2052 Rz ybcS TRUE 0.624 -15.000 0.000 1.000   NA
 5875421 5875422 EFER_2052 EFER_2053 ybcS   TRUE 0.520 -22.000 0.000 NA   NA
 5875422 5875423 EFER_2053 EFER_2054     FALSE 0.002 671.000 0.000 NA   NA
 5875423 5875424 EFER_2054 EFER_2055   pph TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 5875424 5875425 EFER_2055 EFER_2056 pph   FALSE 0.333 -97.000 0.000 1.000   NA
 5875425 5875426 EFER_2056 EFER_2057   ninG TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5875426 5875427 EFER_2057 EFER_2059 ninG   TRUE 0.709 -7.000 0.000 NA   NA
 5875427 5875428 EFER_2059 EFER_2060   ninF TRUE 0.642 -10.000 0.000 NA   NA
 5875428 5875429 EFER_2060 EFER_2061 ninF   TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5875429 5875430 EFER_2061 EFER_2062     FALSE 0.073 134.000 0.000 NA   NA
 5875430 5875431 EFER_2062 EFER_2063     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5875431 5875432 EFER_2063 EFER_2064     TRUE 0.520 -22.000 0.000 NA   NA
 5875434 5875435 EFER_2067 EFER_2068     TRUE 0.953 -3.000 0.000 0.007   NA
 5875435 5875436 EFER_2068 EFER_2069     TRUE 0.901 3.000 0.000 NA   NA
 5875438 5875439 EFER_2070 EFER_2071   cro FALSE 0.274 107.000 0.000 0.052   NA
 5875440 5875441 EFER_2072 EFER_2073 cI   FALSE 0.110 107.000 0.000 NA   NA
 5875441 5875442 EFER_2073 EFER_2074     TRUE 0.975 -25.000 1.000 NA   NA
 5875442 5875443 EFER_2074 EFER_2075     FALSE 0.004 377.000 0.000 NA   NA
 5875445 5875446 EFER_2077 EFER_2078     FALSE 0.089 122.000 0.000 NA   NA
 5875446 5875447 EFER_2078 EFER_2079   kil FALSE 0.067 140.000 0.000 NA   NA
 5875447 5875448 EFER_2079 EFER_2080 kil   TRUE 0.555 -18.000 0.000 NA   NA
 5875448 5875449 EFER_2080 EFER_2081     FALSE 0.307 -91.000 0.000 NA   NA
 5875449 5875450 EFER_2081 EFER_2082   erf TRUE 0.564 -19.000 0.034 NA   NA
 5875450 5875451 EFER_2082 EFER_2083 erf   FALSE 0.328 -90.000 0.034 NA   NA
 5875451 5875452 EFER_2083 EFER_2084   abc TRUE 0.994 3.000 0.500 NA   NA
 5875452 5875453 EFER_2084 EFER_2085 abc   FALSE 0.256 -142.000 0.000 NA   NA
 5875453 5875454 EFER_2085 EFER_2086     FALSE 0.067 140.000 0.000 NA   NA
 5875454 5875455 EFER_2086 EFER_2087     TRUE 0.600 -13.000 0.000 NA   NA
 5875455 5875456 EFER_2087 EFER_2088     FALSE 0.385 -46.000 0.000 NA   NA
 5875456 5875457 EFER_2088 EFER_2089     FALSE 0.378 -48.000 0.000 NA   NA
 5875457 5875458 EFER_2089 EFER_2090     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5875458 5875459 EFER_2090 EFER_2091     TRUE 0.709 -7.000 0.000 NA   NA
 5875459 5875460 EFER_2091 EFER_2092     FALSE 0.118 95.000 0.000 NA   NA
 5875463 5875464 EFER_2095 EFER_2096 yeeD yeeE TRUE 0.980 14.000 0.419 NA   NA
 5875464 5875465 EFER_2096 EFER_2097 yeeE yeeF FALSE 0.035 178.000 0.000 NA   NA
 5875465 5875466 EFER_2097 EFER_2098 yeeF yeeY FALSE 0.009 266.000 0.000 1.000 N NA
 5875466 5875467 EFER_2098 EFER_2099 yeeY yeeZ FALSE 0.213 46.000 0.015 1.000 N NA
 5875467 5875468 EFER_2099 EFER_2100 yeeZ yoeB FALSE 0.134 83.000 0.000 NA   NA
 5875468 5875469 EFER_2100 EFER_2101 yoeB yefM TRUE 0.983 -3.000 0.366 NA   NA
 5875470 5875471 EFER_4507 EFER_2102 hisL hisG FALSE 0.194 146.000 0.003 0.003   NA
 5875471 5875472 EFER_2102 EFER_2103 hisG hisD TRUE 0.997 6.000 0.171 0.003 Y NA
 5875472 5875473 EFER_2103 EFER_2104 hisD hisC TRUE 0.997 -3.000 0.294 0.003 Y NA
 5875473 5875474 EFER_2104 EFER_2105 hisC hisB TRUE 0.998 0.000 0.341 0.003 Y NA
 5875474 5875475 EFER_2105 EFER_2106 hisB hisH TRUE 0.996 0.000 0.128 0.003 Y NA
 5875475 5875476 EFER_2106 EFER_2107 hisH hisA TRUE 0.997 0.000 0.210 0.003 Y NA
 5875476 5875477 EFER_2107 EFER_2108 hisA hisF TRUE 0.991 -18.000 0.433 0.003 Y NA
 5875477 5875478 EFER_2108 EFER_2109 hisF hisI TRUE 0.996 -6.000 0.430 0.003 Y NA
 5875479 5875480 EFER_2110 EFER_2111   ugd FALSE 0.261 232.000 0.250 1.000 Y NA
 5875480 5875481 EFER_2111 EFER_2112 ugd gnd FALSE 0.015 223.000 0.000 1.000 N NA
 5875481 5875482 EFER_2112 EFER_2113 gnd   FALSE 0.002 1435.000 0.000 NA   NA
 5875482 5875483 EFER_2113 EFER_2114   cpsG FALSE 0.452 29.000 0.000 NA   NA
 5875483 5875484 EFER_2114 EFER_2115 cpsG   TRUE 0.899 4.000 0.000 1.000 N NA
 5875484 5875485 EFER_2115 EFER_2116   nudD TRUE 0.561 -16.000 0.000 1.000 N NA
 5875485 5875486 EFER_2116 EFER_2117 nudD fcl TRUE 0.991 0.000 0.217 0.001 N NA
 5875486 5875487 EFER_2117 EFER_2118 fcl gmd TRUE 0.993 3.000 0.000 0.007 Y NA
 5875487 5875488 EFER_2118 EFER_2119 gmd   TRUE 0.628 22.000 0.000 1.000   NA
 5875488 5875489 EFER_2119 EFER_2120     FALSE 0.002 787.000 0.000 NA   NA
 5875489 5875490 EFER_2120 EFER_2121     TRUE 0.588 -10.000 0.000 NA N NA
 5875490 5875491 EFER_2121 EFER_2122     FALSE 0.402 -73.000 0.047 NA   NA
 5875491 5875492 EFER_2122 EFER_2123     TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5875492 5875493 EFER_2123 EFER_2124     TRUE 0.570 -16.000 0.000 NA   NA
 5875493 5875494 EFER_2124 EFER_2125     TRUE 0.895 1.000 0.000 NA   NA
 5875494 5875495 EFER_2125 EFER_2126   galF FALSE 0.004 382.000 0.000 1.000   NA
 5875495 5875496 EFER_2126 EFER_2127 galF wcaM FALSE 0.238 168.000 0.259 NA   NA
 5875496 5875497 EFER_2127 EFER_2128 wcaM wcaL TRUE 0.982 11.000 0.292 NA   NA
 5875497 5875498 EFER_2128 EFER_2129 wcaL wcaK TRUE 0.933 -3.000 0.095 NA   NA
 5875498 5875499 EFER_2129 EFER_2130 wcaK wzxC FALSE 0.313 73.000 0.095 NA   NA
 5875499 5875500 EFER_2130 EFER_2131 wzxC wcaJ TRUE 0.987 2.000 0.304 NA   NA
 5875500 5875501 EFER_2131 EFER_2132 wcaJ cpsG TRUE 0.817 55.000 0.538 NA N NA
 5875501 5875502 EFER_2132 EFER_2133 cpsG cpsB FALSE 0.232 281.000 1.000 1.000 N NA
 5875502 5875503 EFER_2133 EFER_2134 cpsB wcaI TRUE 0.993 3.000 0.123 1.000 Y NA
 5875503 5875504 EFER_2134 EFER_2135 wcaI nudD TRUE 0.939 -3.000 0.108 1.000 N NA
 5875504 5875505 EFER_2135 EFER_2136 nudD fcl TRUE 0.993 3.000 0.217 0.001 N NA
 5875505 5875506 EFER_2136 EFER_2137 fcl gmd TRUE 0.993 3.000 0.000 0.007 Y NA
 5875506 5875507 EFER_2137 EFER_2138 gmd wcaF TRUE 0.504 27.000 0.022 1.000   NA
 5875507 5875508 EFER_2138 EFER_2139 wcaF wcaE TRUE 0.854 16.000 0.077 NA   NA
 5875508 5875509 EFER_2139 EFER_2140 wcaE wcaD TRUE 0.479 126.000 0.333 NA   NA
 5875509 5875510 EFER_2140 EFER_2141 wcaD wcaC TRUE 0.844 -97.000 0.400 NA   NA
 5875510 5875511 EFER_2141 EFER_2142 wcaC wcaB TRUE 0.974 -3.000 0.259 1.000 N NA
 5875511 5875512 EFER_2142 EFER_2143 wcaB wcaA TRUE 0.984 3.000 0.259 NA N NA
 5875512 5875513 EFER_2143 EFER_2144 wcaA wzc FALSE 0.378 129.000 0.000 NA Y NA
 5875513 5875514 EFER_2144 EFER_2145 wzc wzb TRUE 0.898 3.000 0.000 1.000 N NA
 5875514 5875515 EFER_2145 EFER_2146 wzb wza TRUE 0.986 6.000 0.286 1.000 N NA
 5875519 5875520 EFER_2150 EFER_2151 asmA dcd TRUE 0.663 22.000 0.057 NA N NA
 5875520 5875521 EFER_2151 EFER_2152 dcd udk TRUE 0.644 92.000 0.098 1.000 Y NA
 5875527 5875528 EFER_2159 EFER_2160 yegK yegL TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5875529 5875530 EFER_misc_RNA_38 EFER_misc_RNA_37 ryeC rygD FALSE 0.258 -141.000 0.000 NA   NA
 5875530 5875531 EFER_misc_RNA_37 EFER_misc_RNA_39 rygD ryeD FALSE 0.029 187.000 0.000 NA   NA
 5875531 5875532 EFER_misc_RNA_39 EFER_2161 ryeD mdtA FALSE 0.002 591.000 0.000 NA   NA
 5875532 5875533 EFER_2161 EFER_2162 mdtA mdtB TRUE 0.859 0.000 0.000 NA N NA
 5875533 5875534 EFER_2162 EFER_2163 mdtB mdtC TRUE 0.988 1.000 0.062 NA Y NA
 5875534 5875535 EFER_2163 EFER_2164 mdtC mdtD TRUE 0.992 1.000 0.438 1.000 N NA
 5875535 5875536 EFER_2164 EFER_2165 mdtD baeS TRUE 0.950 -3.000 0.139 1.000 N NA
 5875536 5875537 EFER_2165 EFER_2166 baeS baeR TRUE 0.997 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 5875537 5875538 EFER_2166 EFER_2167 baeR yegP FALSE 0.058 180.000 0.062 NA   NA
 5875538 5875539 EFER_2167 EFER_2169 yegP   FALSE 0.012 244.000 0.000 NA   NA
 5875539 5875540 EFER_2169 EFER_2170     TRUE 0.898 2.000 0.000 NA   NA
 5875540 5875541 EFER_2170 EFER_2171   yegQ FALSE 0.113 103.000 0.000 NA   NA
 5875541 5875542 EFER_2171 EFER_misc_RNA_40 yegQ ryeE FALSE 0.134 84.000 0.000 NA   NA
 5875542 5875543 EFER_misc_RNA_40 EFER_2172 ryeE yegS FALSE 0.129 88.000 0.000 NA   NA
 5875544 5875545 EFER_2173 EFER_2174     TRUE 0.997 0.000 1.000 1.000   NA
 5875545 5875546 EFER_2174 EFER_2175     TRUE 0.917 27.000 0.375 1.000 N NA
 5875546 5875547 EFER_2175 EFER_2176     TRUE 0.987 14.000 0.200 1.000 Y NA
 5875550 5875551 EFER_2179 EFER_2180     TRUE 0.935 -13.000 0.306 1.000   NA
 5875551 5875552 EFER_2180 EFER_2181     FALSE 0.110 102.000 0.000 1.000 N NA
 5875555 5875556 EFER_2184 EFER_2185     TRUE 0.895 1.000 0.000 NA   NA
 5875556 5875557 EFER_2185 EFER_2186     TRUE 0.524 25.000 0.000 NA   NA
 5875557 5875558 EFER_2186 EFER_2187     TRUE 0.614 -12.000 0.000 NA   NA
 5875558 5875559 EFER_2187 EFER_2188   yegX FALSE 0.132 86.000 0.000 NA   NA
 5875559 5875560 EFER_2188 EFER_2189 yegX thiD FALSE 0.422 -34.000 0.000 1.000 N NA
 5875560 5875561 EFER_2189 EFER_2190 thiD   TRUE 0.988 -3.000 0.037 0.004 Y NA
 5875562 5875563 EFER_2191 EFER_2192   yohN FALSE 0.013 234.000 0.000 NA   NA
 5875564 5875565 EFER_2193 EFER_2194     TRUE 0.986 4.000 0.250 1.000   NA
 5875565 5875566 EFER_2194 EFER_2195     TRUE 0.997 13.000 0.667 1.000 Y NA
 5875566 5875567 EFER_2195 EFER_2196     TRUE 0.997 6.000 0.333 1.000 Y NA
 5875567 5875568 EFER_2196 EFER_2197     FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 5875568 5875569 EFER_2197 EFER_2198   mrp FALSE 0.017 217.000 0.000 NA   NA
 5875570 5875571 EFER_2199 EFER_2200 metG   FALSE 0.065 142.000 0.000 NA   NA
 5875571 5875572 EFER_2200 EFER_2201     TRUE 0.815 13.000 0.000 NA   NA
 5875572 5875573 EFER_2201 EFER_2202   yehI TRUE 0.881 10.000 0.000 NA   NA
 5875573 5875574 EFER_2202 EFER_2203 yehI yehK FALSE 0.183 60.000 0.000 NA   NA
 5875574 5875575 EFER_2203 EFER_2205 yehK yehL FALSE 0.002 1311.000 0.000 NA   NA
 5875575 5875576 EFER_2205 EFER_2206 yehL yehM TRUE 0.866 11.000 0.000 NA   NA
 5875576 5875577 EFER_2206 EFER_2207 yehM yehP TRUE 0.709 -7.000 0.000 NA   NA
 5875577 5875578 EFER_2207 EFER_2208 yehP yehQ TRUE 0.632 -108.000 0.160 NA   NA
 5875578 5875579 EFER_2208 EFER_2209 yehQ   FALSE 0.070 136.000 0.000 NA   NA
 5875580 5875581 EFER_2210 EFER_2211 yehS yehT FALSE 0.329 47.000 0.051 NA   NA
 5875581 5875582 EFER_2211 EFER_2212 yehT yehU TRUE 0.999 -3.000 0.877 0.013 Y NA
 5875583 5875584 EFER_2213 EFER_2214 mlrA yohO FALSE 0.183 60.000 0.000 NA   NA
 5875585 5875586 EFER_2215 EFER_2216 yehW yehX TRUE 0.998 5.000 0.542 1.000 Y NA
 5875586 5875587 EFER_2216 EFER_2217 yehX yehY TRUE 0.992 -7.000 0.489 1.000 Y NA
 5875587 5875588 EFER_2217 EFER_2218 yehY yehZ TRUE 0.996 7.000 0.521 0.044 N NA
 5875588 5875589 EFER_2218 EFER_2219 yehZ bglX FALSE 0.147 149.000 0.099 1.000 N NA
 5875591 5875592 EFER_2221 EFER_2222 pbpG yohC FALSE 0.131 174.000 0.145 NA   NA
 5875594 5875595 EFER_2224 EFER_2225 yohF dusC FALSE 0.026 268.000 0.000 0.023 N NA
 5875596 5875597 EFER_2226 EFER_2227 yohJ yohK TRUE 0.983 -3.000 0.340 1.000   NA
 5875597 5875598 EFER_2227 EFER_2228 yohK cdd FALSE 0.303 130.000 0.198 1.000 N NA
 5875598 5875599 EFER_2228 EFER_2229 cdd sanA FALSE 0.079 147.000 0.045 NA   NA
 5875599 5875600 EFER_2229 EFER_2230 sanA yeiS TRUE 0.886 3.000 0.019 NA   NA
 5875600 5875601 EFER_2230 EFER_2231 yeiS yeiT FALSE 0.006 319.000 0.036 NA   NA
 5875601 5875602 EFER_2231 EFER_2232 yeiT yeiA TRUE 0.831 -6.000 0.062 1.000 N NA
 5875603 5875604 EFER_2233 EFER_2234 mglC mglA TRUE 0.997 16.000 0.905 1.000 Y NA
 5875604 5875605 EFER_2234 EFER_2235 mglA mglB TRUE 0.843 61.000 0.250 NA Y NA
 5875605 5875606 EFER_2235 EFER_2236 mglB galS FALSE 0.005 299.000 0.000 NA N NA
 5875606 5875607 EFER_2236 EFER_2237 galS yeiB TRUE 0.673 108.000 0.500 NA   NA
 5875607 5875608 EFER_2237 EFER_2238 yeiB folE TRUE 0.986 17.000 0.719 NA   NA
 5875610 5875611 EFER_2240 EFER_2241 cirA lysP FALSE 0.007 283.000 0.000 1.000 N NA
 5875611 5875612 EFER_2241 EFER_2242 lysP yeiE FALSE 0.038 169.000 0.000 1.000 N NA
 5875613 5875614 EFER_2243 EFER_2244 yeiH nfo FALSE 0.170 74.000 0.040 NA   NA
 5875614 5875615 EFER_2244 EFER_2245 nfo yeiI TRUE 0.824 4.000 0.004 NA N NA
 5875616 5875617 EFER_2246 EFER_2247 yeiJ   TRUE 0.788 14.000 0.000 NA   NA
 5875617 5875618 EFER_2247 EFER_2248   rihB FALSE 0.459 -30.000 0.000 NA   NA
 5875620 5875621 EFER_2250 EFER_2251 yeiM yeiN FALSE 0.097 94.000 0.000 NA N NA
 5875621 5875622 EFER_2251 EFER_2252 yeiN yeiC FALSE 0.456 -12.000 0.008 NA N NA
 5875622 5875623 EFER_2252 EFER_2254 yeiC fruA FALSE 0.037 319.000 0.000 NA Y NA
 5875623 5875624 EFER_2254 EFER_2255 fruA fruK TRUE 0.984 -25.000 0.562 1.000 Y NA
 5875624 5875625 EFER_2255 EFER_2256 fruK fruB TRUE 0.991 0.000 0.112 1.000 Y NA
 5875630 5875631 EFER_2261 EFER_2262 yeiQ yeiR FALSE 0.342 112.000 0.167 NA   NA
 5875631 5875632 EFER_2262 EFER_2263 yeiR yeiU TRUE 0.811 37.000 0.275 NA   NA
 5875632 5875633 EFER_2263 EFER_2265 yeiU spr FALSE 0.003 414.000 0.000 NA   NA
 5875633 5875634 EFER_2265 EFER_2266 spr   FALSE 0.155 183.000 0.219 NA N NA
 5875634 5875635 EFER_2266 EFER_2267   yejA TRUE 0.863 37.000 0.394 NA N NA
 5875635 5875636 EFER_2267 EFER_2268 yejA yejB TRUE 0.998 1.000 0.848 0.043   NA
 5875636 5875637 EFER_2268 EFER_2269 yejB yejE TRUE 0.998 0.000 0.833 0.043   NA
 5875637 5875638 EFER_2269 EFER_2270 yejE yejF TRUE 0.952 -46.000 0.758 1.000   NA
 5875639 5875640 EFER_2271 EFER_2272 yejG bcr FALSE 0.006 311.000 0.000 NA   NA
 5875640 5875641 EFER_2272 EFER_2273 bcr rsuA TRUE 0.490 28.000 0.036 1.000 N NA
 5875642 5875643 EFER_2274 EFER_2275 yejH rplY FALSE 0.216 125.000 0.024 0.015 N NA
 5875644 5875645 EFER_2276 EFER_2278   yejK FALSE 0.005 321.000 0.000 NA   NA
 5875646 5875647 EFER_2279 EFER_2280 yejL yejM TRUE 0.474 31.000 0.040 NA   NA
 5875647 5875648 EFER_2280 EFER_tRNA25 yejM   FALSE 0.142 75.000 0.000 NA   NA
 5875648 5875649 EFER_tRNA25 EFER_2281     FALSE 0.002 473.000 0.000 NA   NA
 5875649 5875650 EFER_2281 EFER_2282   ymgD TRUE 0.902 4.000 0.000 NA   NA
 5875650 5875651 EFER_2282 EFER_2283 ymgD narP FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 5875652 5875653 EFER_2284 EFER_2285 ccmH ccmG TRUE 0.997 -3.000 0.578 1.000 Y NA
 5875653 5875654 EFER_2285 EFER_2286 ccmG ccmF TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 5875654 5875655 EFER_2286 EFER_2287 ccmF ccmE TRUE 0.996 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 5875655 5875656 EFER_2287 EFER_2288 ccmE ccmD TRUE 0.982 -3.000 0.344 1.000 N NA
 5875656 5875657 EFER_2288 EFER_2289 ccmD ccmC TRUE 0.989 -3.000 0.501 1.000 N NA
 5875657 5875658 EFER_2289 EFER_2290 ccmC ccmB TRUE 0.980 42.000 0.501 0.001 Y NA
 5875658 5875659 EFER_2290 EFER_2291 ccmB ccmA TRUE 0.998 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 5875659 5875660 EFER_2291 EFER_2292 ccmA napC TRUE 0.797 15.000 0.043 1.000 N NA
 5875660 5875661 EFER_2292 EFER_2293 napC napB TRUE 0.999 10.000 0.490 0.003 Y NA
 5875661 5875662 EFER_2293 EFER_2294 napB napH TRUE 0.997 -3.000 0.316 0.007 Y NA
 5875662 5875663 EFER_2294 EFER_2295 napH napG TRUE 0.988 -13.000 0.795 0.040   NA
 5875663 5875664 EFER_2295 EFER_2296 napG napA TRUE 0.991 7.000 0.243 0.040   NA
 5875664 5875665 EFER_2296 EFER_2297 napA napD TRUE 0.994 -3.000 0.875 NA N NA
 5875665 5875666 EFER_2297 EFER_2298 napD napF TRUE 0.911 -10.000 0.209 NA   NA
 5875667 5875668 EFER_2299 EFER_2300 eco ybiO FALSE 0.033 181.000 0.000 NA   NA
 5875670 5875671 EFER_2302 EFER_2303 ybiM fiu FALSE 0.009 265.000 0.000 NA   NA
 5875671 5875672 EFER_2303 EFER_2304 fiu ybiX TRUE 0.680 42.000 0.171 1.000   NA
 5875672 5875673 EFER_2304 EFER_2305 ybiX ybiI FALSE 0.165 74.000 0.000 1.000   NA
 5875673 5875674 EFER_2305 EFER_2306 ybiI ybiJ FALSE 0.009 265.000 0.027 NA   NA
 5875675 5875676 EFER_2307 EFER_2308 ybiC ybiB FALSE 0.161 141.000 0.000 0.051 N NA
 5875676 5875677 EFER_2308 EFER_2309 ybiB dinG TRUE 0.511 28.000 0.041 1.000 N NA
 5875680 5875681 EFER_2312 EFER_2313 ybiH ybhG TRUE 0.981 0.000 0.236 1.000 N NA
 5875681 5875682 EFER_2313 EFER_2314 ybhG ybhF TRUE 0.980 -7.000 0.545 1.000   NA
 5875682 5875683 EFER_2314 EFER_2315 ybhF ybhS TRUE 0.987 -7.000 0.547 0.077   NA
 5875683 5875684 EFER_2315 EFER_2316 ybhS ybhR TRUE 0.999 11.000 0.609 0.005 Y NA
 5875686 5875687 EFER_2318 EFER_2319 ybhP ybhO TRUE 0.981 -3.000 0.333 NA   NA
 5875687 5875688 EFER_2319 EFER_2320 ybhO ybhN TRUE 0.939 0.000 0.071 NA   NA
 5875689 5875690 EFER_2321 EFER_2322     TRUE 0.468 -28.000 0.000 NA   NA
 5875690 5875691 EFER_2322 EFER_2323   ybhM FALSE 0.253 47.000 0.000 NA   NA
 5875691 5875692 EFER_2323 EFER_2324 ybhM   FALSE 0.124 91.000 0.000 NA   NA
 5875692 5875693 EFER_2324 EFER_2325   ybhL FALSE 0.004 363.000 0.000 NA   NA
 5875693 5875694 EFER_2325 EFER_2326 ybhL moaE FALSE 0.241 47.000 0.025 NA   NA
 5875694 5875695 EFER_2326 EFER_2327 moaE moaD TRUE 0.999 2.000 0.501 0.003 Y NA
 5875695 5875696 EFER_2327 EFER_2328 moaD moaC TRUE 0.989 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 5875696 5875697 EFER_2328 EFER_2329 moaC moaB TRUE 0.996 3.000 0.109 0.003 Y NA
 5875697 5875698 EFER_2329 EFER_2330 moaB moaA TRUE 0.975 22.000 0.108 0.003 Y NA
 5875700 5875701 EFER_2332 EFER_2334 uvrB bioD FALSE 0.005 573.000 0.000 0.076 N NA
 5875701 5875702 EFER_2334 EFER_2335 bioD bioC TRUE 0.968 -13.000 0.054 0.002 Y NA
 5875704 5875705 EFER_2337 EFER_2338 bioF bioB TRUE 0.995 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 5875706 5875707 EFER_2339 EFER_2340 bioA ybhB FALSE 0.136 59.000 0.003 NA   NA
 5875707 5875708 EFER_2340 EFER_2341 ybhB ybhC FALSE 0.054 152.000 0.000 NA   NA
 5875711 5875712 EFER_2344 EFER_2345 modC modB TRUE 0.999 3.000 0.537 0.001 Y NA
 5875712 5875713 EFER_2345 EFER_2346 modB modA TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 5875713 5875714 EFER_2346 EFER_2347 modA   FALSE 0.120 145.000 0.072 NA   NA
 5875715 5875716 EFER_2348 EFER_2349 modE modF FALSE 0.311 68.000 0.009 0.076   NA
 5875716 5875717 EFER_2349 EFER_2350 modF galE FALSE 0.010 261.000 0.023 1.000   NA
 5875717 5875718 EFER_2350 EFER_2351 galE galT TRUE 0.976 10.000 0.053 0.001 N NA
 5875718 5875719 EFER_2351 EFER_2352 galT galK TRUE 0.996 4.000 0.370 0.001 N NA
 5875719 5875720 EFER_2352 EFER_2353 galK galM TRUE 0.987 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 5875720 5875721 EFER_2353 EFER_2354 galM gpmA FALSE 0.128 203.000 0.009 1.000 Y NA
 5875722 5875723 EFER_2355 EFER_2356   aroG FALSE 0.156 68.000 0.000 NA   NA
 5875724 5875725 EFER_2357 EFER_2358 ybgS zitB FALSE 0.156 114.000 0.057 NA   NA
 5875726 5875727 EFER_2359 EFER_2360 pnuC nadA TRUE 0.791 38.000 0.023 1.000 Y NA
 5875727 5875728 EFER_2360 EFER_tRNA73 nadA   FALSE 0.008 278.000 0.000 NA   NA
 5875728 5875729 EFER_tRNA73 EFER_tRNA72     FALSE 0.392 34.000 0.000 NA   NA
 5875729 5875730 EFER_tRNA72 EFER_tRNA71     FALSE 0.062 147.000 0.000 NA   NA
 5875730 5875731 EFER_tRNA71 EFER_tRNA70     TRUE 0.902 4.000 0.000 NA   NA
 5875731 5875732 EFER_tRNA70 EFER_tRNA69     FALSE 0.215 53.000 0.000 NA   NA
 5875732 5875733 EFER_tRNA69 EFER_tRNA68     TRUE 0.901 3.000 0.000 NA   NA
 5875733 5875734 EFER_tRNA68 EFER_tRNA67     FALSE 0.370 36.000 0.000 NA   NA
 5875734 5875735 EFER_tRNA67 EFER_2362   ybgF FALSE 0.043 165.000 0.000 NA   NA
 5875735 5875736 EFER_2362 EFER_2363 ybgF pal TRUE 0.954 10.000 0.088 1.000   NA
 5875736 5875737 EFER_2363 EFER_2364 pal tolB TRUE 0.928 35.000 0.592 1.000 N NA
 5875737 5875738 EFER_2364 EFER_2365 tolB   FALSE 0.089 133.000 0.051 NA N NA
 5875738 5875739 EFER_2365 EFER_2366   tolR FALSE 0.369 63.000 0.114 NA N NA
 5875739 5875740 EFER_2366 EFER_2367 tolR tolQ TRUE 0.999 4.000 0.556 0.055 Y NA
 5875740 5875741 EFER_2367 EFER_2368 tolQ ybgC TRUE 0.992 -3.000 0.593 1.000   NA
 5875741 5875742 EFER_2368 EFER_2369 ybgC ybgE FALSE 0.140 150.000 0.095 NA   NA
 5875742 5875743 EFER_2369 EFER_2370 ybgE cydB FALSE 0.197 128.000 0.100 NA   NA
 5875743 5875744 EFER_2370 EFER_2371 cydB cydA TRUE 0.974 16.000 0.000 0.039 Y NA
 5875744 5875745 EFER_2371 EFER_2372 cydA mngB FALSE 0.002 851.000 0.000 1.000 N NA
 5875745 5875746 EFER_2372 EFER_2373 mngB mngA TRUE 0.934 20.000 0.036 1.000 Y NA
 5875747 5875748 EFER_2374 EFER_2375 mngR   FALSE 0.003 375.000 0.000 1.000 N NA
 5875748 5875749 EFER_2375 EFER_2376     TRUE 0.989 0.000 0.367 NA   NA
 5875749 5875750 EFER_2376 EFER_2377     TRUE 0.965 19.000 0.429 NA   NA
 5875750 5875751 EFER_2377 EFER_2378     TRUE 0.998 1.000 0.651 1.000 Y NA
 5875751 5875752 EFER_2378 EFER_2379     TRUE 0.989 4.000 0.333 NA   NA
 5875752 5875753 EFER_2379 EFER_2380     TRUE 0.993 -3.000 0.689 NA   NA
 5875753 5875754 EFER_2380 EFER_2381     FALSE 0.426 60.000 0.121 NA   NA
 5875754 5875755 EFER_2381 EFER_2382     TRUE 0.907 63.000 0.429 1.000 Y NA
 5875756 5875757 EFER_2383 EFER_misc_RNA_41   rybD FALSE 0.014 231.000 0.000 NA   NA
 5875757 5875758 EFER_misc_RNA_41 EFER_2384 rybD sucD TRUE 0.895 1.000 0.000 NA   NA
 5875758 5875759 EFER_2384 EFER_2385 sucD sucC TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 5875759 5875760 EFER_2385 EFER_2386 sucC sucB TRUE 0.682 94.000 0.136 1.000 Y NA
 5875760 5875761 EFER_2386 EFER_2387 sucB sucA TRUE 0.996 15.000 0.667 1.000 Y NA
 5875761 5875762 EFER_2387 EFER_2388 sucA sdhB FALSE 0.094 256.000 0.067 1.000 Y NA
 5875762 5875763 EFER_2388 EFER_2389 sdhB sdhA TRUE 0.997 16.000 0.604 0.002 Y NA
 5875763 5875764 EFER_2389 EFER_2390 sdhA sdhD TRUE 0.999 0.000 0.705 0.002 Y NA
 5875764 5875765 EFER_2390 EFER_2391 sdhD sdhC TRUE 0.997 -6.000 0.453 0.000 Y NA
 5875766 5875767 EFER_2392 EFER_2393     FALSE 0.159 67.000 0.000 NA   NA
 5875767 5875768 EFER_2393 EFER_2394   gltA FALSE 0.021 202.000 0.000 NA   NA
 5875770 5875771 EFER_2396 EFER_2397   ybgQ TRUE 0.871 -28.000 0.000 1.000 Y NA
 5875771 5875772 EFER_2397 EFER_2398 ybgQ   TRUE 0.940 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 5875772 5875773 EFER_2398 EFER_2399   ybgO TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 5875773 5875774 EFER_2399 EFER_2400 ybgO abrB FALSE 0.143 74.000 0.000 NA   NA
 5875775 5875776 EFER_2401 EFER_2402     TRUE 0.985 10.000 0.300 NA   NA
 5875776 5875777 EFER_2402 EFER_2403     TRUE 0.995 -3.000 0.939 NA   NA
 5875777 5875778 EFER_2403 EFER_2404   ybgL TRUE 0.974 9.000 0.173 NA   NA
 5875778 5875779 EFER_2404 EFER_2405 ybgL ybgK TRUE 0.912 -10.000 0.211 NA   NA
 5875779 5875780 EFER_2405 EFER_2406 ybgK ybgJ TRUE 0.991 -6.000 0.379 NA Y NA
 5875780 5875781 EFER_2406 EFER_2407 ybgJ ybgI TRUE 0.651 23.000 0.050 NA   NA
 5875783 5875784 EFER_2409 EFER_2410 phr ybgA TRUE 0.816 -3.000 0.019 NA   NA
 5875784 5875785 EFER_2410 EFER_2411 ybgA ybfA FALSE 0.457 102.000 0.231 NA   NA
 5875786 5875787 EFER_2412 EFER_2413 kdpA kdpB TRUE 0.984 23.000 0.201 0.001 Y NA
 5875787 5875788 EFER_2413 EFER_2414 kdpB kdpC TRUE 0.999 9.000 0.877 0.001 Y NA
 5875788 5875789 EFER_2414 EFER_2415 kdpC kdpD TRUE 0.926 -7.000 0.100 0.082 N NA
 5875789 5875790 EFER_2415 EFER_2416 kdpD kdpE TRUE 0.995 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 5875792 5875793 EFER_2418 EFER_2419 speF potE TRUE 0.984 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 5875794 5875795 EFER_2420 EFER_2421 pgm seqA TRUE 0.804 26.000 0.151 1.000 N NA
 5875796 5875797 EFER_2422 EFER_2423 ybfF ybfE FALSE 0.363 140.000 0.276 NA   NA
 5875797 5875798 EFER_2423 EFER_2424 ybfE fldA TRUE 0.545 140.000 0.473 1.000   NA
 5875801 5875802 EFER_2427 EFER_2428 ybfN ybfM FALSE 0.236 50.000 0.000 NA   NA
 5875802 5875803 EFER_2428 EFER_2429 ybfM glnS FALSE 0.003 450.000 0.000 1.000   NA
 5875803 5875804 EFER_2429 EFER_2430 glnS nagE FALSE 0.014 203.000 0.006 1.000 N NA
 5875805 5875806 EFER_2431 EFER_2432 nagB nagA TRUE 0.967 61.000 0.557 0.001 Y NA
 5875806 5875807 EFER_2432 EFER_2433 nagA nagC TRUE 0.998 9.000 0.571 1.000 Y NA
 5875807 5875808 EFER_2433 EFER_2434 nagC nagD TRUE 0.774 48.000 0.070 1.000 Y NA
 5875808 5875809 EFER_2434 EFER_2435 nagD asnB FALSE 0.009 257.000 0.000 1.000 N NA
 5875811 5875812 EFER_tRNA26 EFER_tRNA27     TRUE 0.890 9.000 0.000 NA   NA
 5875812 5875813 EFER_tRNA27 EFER_tRNA28     FALSE 0.112 105.000 0.000 NA   NA
 5875813 5875814 EFER_tRNA28 EFER_tRNA29     FALSE 0.380 35.000 0.000 NA   NA
 5875814 5875815 EFER_tRNA29 EFER_tRNA30     TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 5875815 5875816 EFER_tRNA30 EFER_tRNA31     FALSE 0.241 49.000 0.000 NA   NA
 5875816 5875817 EFER_tRNA31 EFER_tRNA32     FALSE 0.339 38.000 0.000 NA   NA
 5875817 5875818 EFER_tRNA32 EFER_2439     FALSE 0.089 122.000 0.000 NA   NA
 5875820 5875821 EFER_2441 EFER_2442 miaB ybeZ FALSE 0.404 114.000 0.220 1.000 N NA
 5875821 5875822 EFER_2442 EFER_2443 ybeZ ybeY TRUE 0.987 -3.000 0.457 NA   NA
 5875822 5875823 EFER_2443 EFER_2444 ybeY ybeX FALSE 0.369 90.000 0.150 NA   NA
 5875823 5875824 EFER_2444 EFER_2445 ybeX lnt TRUE 0.956 25.000 0.557 1.000 N NA
 5875825 5875826 EFER_2446 EFER_2447     FALSE 0.343 -64.000 0.000 NA   NA
 5875827 5875828 EFER_2448 EFER_2449 gltI gltJ FALSE 0.356 170.000 0.000 0.043 Y NA
 5875828 5875829 EFER_2449 EFER_2450 gltJ gltK TRUE 0.999 0.000 0.933 0.014 Y NA
 5875829 5875830 EFER_2450 EFER_2451 gltK gltL TRUE 0.997 0.000 0.379 1.000 Y NA
 5875830 5875831 EFER_2451 EFER_2452 gltL rihA FALSE 0.335 118.000 0.195 NA N NA
 5875831 5875832 EFER_2452 EFER_2453 rihA hscC FALSE 0.109 84.000 0.000 NA N NA
 5875833 5875834 EFER_2454 EFER_2455 djlC ybeU TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5875836 5875837 EFER_2457 EFER_2458 djlB insF FALSE 0.246 48.000 0.000 NA   NA
 5875837 5875838 EFER_2458 EFER_2459 insF insE TRUE 0.940 -3.000 0.000 0.050   NA
 5875838 5875839 EFER_2459 EFER_2460 insE djlB FALSE 0.339 38.000 0.000 NA   NA
 5875839 5875840 EFER_2460 EFER_2461 djlB ybeR TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5875843 5875844 EFER_2464 EFER_2465 leuS rlpB TRUE 0.936 15.000 0.182 NA N NA
 5875844 5875845 EFER_2465 EFER_2466 rlpB holA TRUE 0.974 0.000 0.199 NA N NA
 5875845 5875846 EFER_2466 EFER_2467 holA nadD TRUE 0.921 4.000 0.045 1.000 N NA
 5875846 5875847 EFER_2467 EFER_2468 nadD ybeB FALSE 0.010 259.000 0.032 NA   NA
 5875847 5875848 EFER_2468 EFER_2469 ybeB ybeA TRUE 0.988 4.000 0.307 NA   NA
 5875848 5875849 EFER_2469 EFER_2470 ybeA mrdA FALSE 0.436 31.000 0.031 NA   NA
 5875849 5875850 EFER_2470 EFER_2471 mrdA mrdB TRUE 0.922 3.000 0.046 1.000 N NA
 5875850 5875851 EFER_2471 EFER_2472 mrdB rlpA FALSE 0.350 -49.000 0.035 NA N NA
 5875851 5875852 EFER_2472 EFER_2473 rlpA dacA TRUE 0.776 141.000 0.475 NA Y NA
 5875852 5875853 EFER_2473 EFER_2474 dacA ybeD FALSE 0.221 106.000 0.081 NA   NA
 5875853 5875854 EFER_2474 EFER_2475 ybeD lipB FALSE 0.437 101.000 0.219 NA   NA
 5875854 5875855 EFER_2475 EFER_2476 lipB lipA TRUE 0.727 179.000 0.319 0.000 Y NA
 5875856 5875857 EFER_2477 EFER_2478 tatE   FALSE 0.393 114.000 0.196 1.000   NA
 5875859 5875860 EFER_2480 EFER_2481 cspE   FALSE 0.249 186.000 0.333 1.000   NA
 5875861 5875862 EFER_2482 EFER_2483 dcuC rna FALSE 0.012 229.000 0.024 1.000 N NA
 5875862 5875863 EFER_2483 EFER_2484 rna rnk FALSE 0.018 199.000 0.018 1.000 N NA
 5875863 5875864 EFER_2484 EFER_2485 rnk uspG FALSE 0.004 359.000 0.000 1.000 N NA
 5875865 5875866 EFER_2486 EFER_2487 ahpF ahpC TRUE 0.839 171.000 0.551 0.001 Y NA
 5875867 5875868 EFER_2489 EFER_2490 dsbG   FALSE 0.071 167.000 0.067 1.000 N NA
 5875868 5875869 EFER_2490 EFER_2491   ibrA TRUE 0.660 69.000 0.333 1.000   NA
 5875869 5875870 EFER_2491 EFER_2492 ibrA ibrB TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 5875873 5875874 EFER_2495 EFER_2496 ybdD cstA TRUE 0.468 128.000 0.333 NA   NA
 5875874 5875875 EFER_2496 EFER_2497 cstA ybdB FALSE 0.163 181.000 0.222 NA N NA
 5875875 5875876 EFER_2497 EFER_2498 ybdB entA TRUE 0.988 3.000 0.065 NA Y NA
 5875876 5875877 EFER_2498 EFER_2499 entA entB TRUE 0.983 0.000 0.024 1.000 Y NA
 5875877 5875878 EFER_2499 EFER_2500 entB entE TRUE 0.997 14.000 0.667 1.000 Y NA
 5875878 5875879 EFER_2500 EFER_2501 entE entC TRUE 0.998 10.000 0.667 1.000 Y NA
 5875882 5875883 EFER_2504 EFER_2505 fepD fepG TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.043 Y NA
 5875883 5875884 EFER_2505 EFER_2506 fepG fepC TRUE 0.692 -321.000 0.038 1.000 Y NA
 5875885 5875886 EFER_2507 EFER_2508   entF FALSE 0.018 210.000 0.000 1.000 N NA
 5875886 5875887 EFER_2508 EFER_2509 entF ybdZ TRUE 0.919 -3.000 0.080 NA   NA
 5875887 5875888 EFER_2509 EFER_2510 ybdZ fes TRUE 0.980 -3.000 0.320 NA   NA
 5875889 5875890 EFER_2512 EFER_misc_RNA_42 fepA C0362 TRUE 0.890 9.000 0.000 NA   NA
 5875890 5875891 EFER_misc_RNA_42 EFER_2513 C0362   FALSE 0.259 -140.000 0.000 NA   NA
 5875892 5875893 EFER_2514 EFER_2515     TRUE 0.989 -118.000 0.860 0.001 Y NA
 5875894 5875895 EFER_2516 EFER_2517     FALSE 0.023 351.000 0.200 1.000 N NA
 5875895 5875896 EFER_2517 EFER_2518     FALSE 0.129 104.000 0.040 1.000 N NA
 5875896 5875897 EFER_2518 EFER_2519     TRUE 0.983 11.000 0.300 NA   NA
 5875897 5875898 EFER_2519 EFER_2520     TRUE 0.990 2.000 0.350 NA   NA
 5875898 5875899 EFER_2520 EFER_2521     TRUE 0.982 18.000 0.241 1.000 Y NA
 5875899 5875900 EFER_2521 EFER_2522     TRUE 0.777 27.000 0.138 1.000 N NA
 5875900 5875901 EFER_2522 EFER_2523     TRUE 0.998 0.000 0.240 0.001 Y NA
 5875902 5875903 EFER_2524 EFER_2525     FALSE 0.020 206.000 0.000 NA   NA
 5875903 5875904 EFER_2525 EFER_2526     FALSE 0.234 -187.000 0.000 NA   NA
 5875905 5875906 EFER_2528 EFER_2529 ybdK ybdJ FALSE 0.163 66.000 0.000 NA   NA
 5875906 5875907 EFER_2529 EFER_2530 ybdJ ybdF FALSE 0.167 65.000 0.000 NA   NA
 5875907 5875908 EFER_2530 EFER_2531 ybdF nfnB TRUE 0.692 95.000 0.500 NA   NA
 5875908 5875909 EFER_2531 EFER_2532 nfnB ybdG FALSE 0.082 108.000 0.012 1.000 N NA
 5875910 5875911 EFER_2533 EFER_2534 pheP cusA FALSE 0.249 102.000 0.000 0.067 N NA
 5875911 5875912 EFER_2534 EFER_2535 cusA   FALSE 0.297 -97.000 0.000 NA   NA
 5875912 5875913 EFER_2535 EFER_2536   cusB FALSE 0.385 -46.000 0.000 NA   NA
 5875913 5875914 EFER_2536 EFER_2537 cusB cusF TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 5875914 5875915 EFER_2537 EFER_2538 cusF cusC TRUE 0.956 23.000 0.500 NA   NA
 5875916 5875917 EFER_2540 EFER_2541 cusR cusS TRUE 0.994 -22.000 0.600 0.000 Y NA
 5875917 5875918 EFER_2541 EFER_2542 cusS   FALSE 0.017 216.000 0.000 NA   NA
 5875918 5875919 EFER_2542 EFER_2543     FALSE 0.026 194.000 0.000 NA   NA
 5875920 5875921 EFER_2544 EFER_2545 htpG recR FALSE 0.103 110.000 0.028 1.000 N NA
 5875921 5875922 EFER_2545 EFER_2546 recR ybaB TRUE 0.994 0.000 0.604 NA   NA
 5875922 5875923 EFER_2546 EFER_2547 ybaB dnaX TRUE 0.785 53.000 0.411 NA   NA
 5875923 5875924 EFER_2547 EFER_2548 dnaX apt FALSE 0.171 129.000 0.088 1.000 N NA
 5875924 5875925 EFER_2548 EFER_2549 apt ybaN FALSE 0.057 162.000 0.043 NA   NA
 5875926 5875927 EFER_2550 EFER_2551 priC ybaM TRUE 0.983 14.000 0.474 NA   NA
 5875928 5875929 EFER_2552 EFER_2553 kefA acrR FALSE 0.080 126.000 0.000 1.000 N NA
 5875930 5875931 EFER_2554 EFER_2555 acrA acrB TRUE 0.951 23.000 0.458 1.000 N NA
 5875931 5875932 EFER_2555 EFER_2556 acrB ybaJ FALSE 0.002 503.000 0.000 NA   NA
 5875932 5875933 EFER_2556 EFER_2557 ybaJ hha TRUE 0.677 27.000 0.080 NA   NA
 5875933 5875934 EFER_2557 EFER_2558 hha ylaC FALSE 0.002 473.000 0.000 NA   NA
 5875934 5875935 EFER_2558 EFER_2559 ylaC   FALSE 0.068 139.000 0.000 NA   NA
 5875936 5875937 EFER_2560 EFER_misc_RNA_43 ybaA ffs FALSE 0.107 110.000 0.000 NA   NA
 5875937 5875938 EFER_misc_RNA_43 EFER_2561 ffs   FALSE 0.293 -99.000 0.000 NA   NA
 5875939 5875940 EFER_2562 EFER_2563 ybaZ insG TRUE 0.497 101.000 0.000 1.000 Y NA
 5875943 5875944 EFER_2566 EFER_2567 amtB glnK TRUE 0.767 30.000 0.156 1.000 N NA
 5875944 5875945 EFER_2567 EFER_2568 glnK mdlB FALSE 0.031 181.000 0.028 1.000 N NA
 5875945 5875946 EFER_2568 EFER_2569 mdlB mdlA TRUE 0.998 -7.000 0.911 0.004 Y NA
 5875946 5875947 EFER_2569 EFER_2570 mdlA ybaO TRUE 0.790 30.000 0.179 1.000 N NA
 5875947 5875948 EFER_2570 EFER_2571 ybaO cof FALSE 0.055 153.000 0.020 1.000   NA
 5875949 5875950 EFER_2572 EFER_2573 ybaE queC FALSE 0.171 65.000 0.019 1.000   NA
 5875951 5875952 EFER_2574 EFER_2575 ybaW ybaV FALSE 0.126 106.000 0.027 1.000   NA
 5875952 5875953 EFER_2575 EFER_2576 ybaV ppiD FALSE 0.140 81.000 0.033 1.000 N NA
 5875953 5875954 EFER_2576 EFER_2577 ppiD hupB FALSE 0.059 147.000 0.000 1.000 N NA
 5875954 5875955 EFER_2577 EFER_2578 hupB lon FALSE 0.018 210.000 0.000 1.000 N NA
 5875957 5875958 EFER_2579 EFER_2580 clpX clpP TRUE 0.773 126.000 0.352 1.000 Y NA
 5875958 5875959 EFER_2580 EFER_2581 clpP tig FALSE 0.302 245.000 0.351 1.000 Y NA
 5875959 5875960 EFER_2581 EFER_2582 tig bolA FALSE 0.004 341.000 0.000 NA N NA
 5875961 5875962 EFER_2583 EFER_2584 yajG ampG TRUE 0.719 44.000 0.256 NA N NA
 5875962 5875963 EFER_2584 EFER_2585 ampG cyoA FALSE 0.001 643.000 0.000 NA N NA
 5875963 5875964 EFER_2585 EFER_2586 cyoA cyoB TRUE 0.962 22.000 0.041 0.003 Y NA
 5875964 5875965 EFER_2586 EFER_2587 cyoB cyoC TRUE 0.996 -10.000 0.697 0.039 Y NA
 5875965 5875966 EFER_2587 EFER_2588 cyoC cyoD TRUE 0.998 0.000 0.485 0.039 Y NA
 5875966 5875967 EFER_2588 EFER_2589 cyoD cyoE TRUE 0.970 12.000 0.118 0.067 N NA
 5875968 5875969 EFER_2590 EFER_2591     FALSE 0.213 59.000 0.000 1.000   NA
 5875970 5875971 EFER_2592 EFER_2593     TRUE 0.761 -99.000 0.273 1.000 N NA
 5875971 5875972 EFER_2593 EFER_2594     TRUE 0.801 -46.000 0.227 NA   NA
 5875972 5875973 EFER_2594 EFER_2595     TRUE 0.983 11.000 0.308 NA   NA
 5875973 5875974 EFER_2595 EFER_2596     FALSE 0.392 68.000 0.143 NA N NA
 5875974 5875975 EFER_2596 EFER_2597     TRUE 0.819 -100.000 0.086 NA Y NA
 5875975 5875976 EFER_2597 EFER_2598   yajR FALSE 0.263 153.000 0.007 NA Y NA
 5875978 5875979 EFER_2600 EFER_2601 panE yajL TRUE 0.751 -37.000 0.155 NA   NA
 5875981 5875982 EFER_2603 EFER_2604 xseB ispA TRUE 0.891 0.000 0.035 1.000 N NA
 5875982 5875983 EFER_2604 EFER_2605 ispA dxs TRUE 0.914 25.000 0.060 1.000 Y NA
 5875983 5875984 EFER_2605 EFER_2606 dxs yajO FALSE 0.024 180.000 0.009 1.000 N NA
 5875985 5875986 EFER_2607 EFER_2608 pgpA thiL TRUE 0.857 -22.000 0.206 1.000 N NA
 5875986 5875987 EFER_2608 EFER_2609 thiL nusB TRUE 0.500 78.000 0.225 1.000 N NA
 5875987 5875988 EFER_2609 EFER_2610 nusB ribE TRUE 0.949 20.000 0.347 1.000 N NA
 5875988 5875989 EFER_2610 EFER_2611 ribE ribD TRUE 0.737 88.000 0.034 0.001 Y NA
 5875989 5875990 EFER_2611 EFER_2612 ribD nrdR TRUE 0.985 4.000 0.277 NA N NA
 5875991 5875992 EFER_2613 EFER_2614 yajI tsx FALSE 0.006 298.000 0.000 NA   NA
 5875993 5875994 EFER_2615 EFER_2616 yajD secF FALSE 0.076 129.000 0.015 1.000   NA
 5875994 5875995 EFER_2616 EFER_2617 secF secD TRUE 0.997 11.000 0.206 0.000 Y NA
 5875995 5875996 EFER_2617 EFER_2618 secD yajC TRUE 0.876 28.000 0.045 NA Y NA
 5875996 5875997 EFER_2618 EFER_2619 yajC tgt TRUE 0.921 23.000 0.325 NA N NA
 5875997 5875998 EFER_2619 EFER_2620 tgt queA TRUE 0.956 55.000 0.360 0.000 Y NA
 5876000 5876001 EFER_2622 EFER_2623 malZ proY FALSE 0.152 155.000 0.123 1.000 N NA
 5876001 5876002 EFER_2623 EFER_2624 proY brnQ TRUE 0.902 77.000 0.348 0.067 Y NA
 5876004 5876005 EFER_2626 EFER_2627 phoR phoB TRUE 0.951 59.000 0.453 0.012 Y NA
 5876006 5876007 EFER_2628 EFER_2629 sbcD   TRUE 0.989 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 5876010 5876011 EFER_2632 EFER_2633 yaiE   FALSE 0.195 71.000 0.049 NA   NA
 5876011 5876012 EFER_2633 EFER_2634   yaiA FALSE 0.011 247.000 0.000 NA   NA
 5876012 5876013 EFER_2634 EFER_2635 yaiA aroL TRUE 0.533 28.000 0.044 NA   NA
 5876013 5876014 EFER_2635 EFER_2636 aroL yaiI FALSE 0.026 176.000 0.007 NA   NA
 5876016 5876017 EFER_2638 EFER_2639 yaiC psiF TRUE 0.919 21.000 0.250 NA   NA
 5876017 5876018 EFER_2639 EFER_2640 psiF phoA FALSE 0.071 140.000 0.032 NA   NA
 5876018 5876019 EFER_2640 EFER_2641 phoA yaiB FALSE 0.120 99.000 0.032 NA   NA
 5876023 5876024 EFER_2645 EFER_2646 yaiW sbmA TRUE 0.866 12.000 0.000 1.000   NA
 5876026 5876027 EFER_2648 EFER_2649 yaiV   TRUE 0.943 43.000 1.000 NA   NA
 5876029 5876030 EFER_2651 EFER_2652 tauD tauC TRUE 0.967 -3.000 0.214 1.000 N NA
 5876030 5876031 EFER_2652 EFER_2653 tauC tauB TRUE 0.998 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 5876031 5876032 EFER_2653 EFER_2654 tauB tauA TRUE 0.985 0.000 0.047 1.000 Y NA
 5876033 5876034 EFER_2655 EFER_2656 yaiS   FALSE 0.010 260.000 0.000 NA   NA
 5876035 5876036 EFER_2657 EFER_2658 prpE prpD TRUE 0.710 40.000 0.038 0.001   NA
 5876036 5876037 EFER_2658 EFER_2659 prpD prpC TRUE 0.804 34.000 0.216 1.000   NA
 5876037 5876038 EFER_2659 EFER_2660 prpC prpB TRUE 0.863 45.000 0.502 1.000 N NA
 5876041 5876042 EFER_2663 EFER_2664 yahN   FALSE 0.107 107.000 0.000 1.000 N NA
 5876042 5876043 EFER_2664 EFER_2665     FALSE 0.114 95.000 0.000 1.000 N NA
 5876044 5876045 EFER_2666 EFER_2667     TRUE 0.898 -28.000 0.333 1.000 N NA
 5876045 5876046 EFER_2667 EFER_2668     FALSE 0.005 300.000 0.000 NA N NA
 5876046 5876047 EFER_2668 EFER_2669     FALSE 0.004 361.000 0.000 NA   NA
 5876047 5876048 EFER_2669 EFER_2670   yahA FALSE 0.017 214.000 0.000 NA   NA
 5876049 5876050 EFER_2671 EFER_2672 yedL   FALSE 0.009 281.000 0.000 1.000   NA
 5876050 5876051 EFER_2672 EFER_2673     TRUE 0.936 27.000 0.438 1.000   NA
 5876054 5876055 EFER_2676 EFER_2677 tfaQ   TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5876055 5876056 EFER_2677 EFER_2678   I FALSE 0.289 -100.000 0.000 NA   NA
 5876056 5876057 EFER_2678 EFER_2679 I GpJ TRUE 0.808 -10.000 0.083 NA   NA
 5876057 5876058 EFER_2679 EFER_2680 GpJ W TRUE 0.982 -16.000 1.000 NA   NA
 5876058 5876059 EFER_2680 EFER_2681 W   TRUE 0.918 41.000 0.667 NA   NA
 5876059 5876060 EFER_2681 EFER_2682   X TRUE 0.954 -31.000 0.667 NA   NA
 5876060 5876061 EFER_2682 EFER_2683 X   TRUE 0.804 -25.000 0.158 NA   NA
 5876061 5876062 EFER_2683 EFER_2684     TRUE 0.938 -3.000 0.105 NA   NA
 5876062 5876063 EFER_2684 EFER_2685     TRUE 0.763 103.000 0.667 NA   NA
 5876063 5876064 EFER_2685 EFER_2686     FALSE 0.419 47.000 0.077 NA   NA
 5876064 5876065 EFER_2686 EFER_2687     TRUE 0.917 -3.000 0.077 NA   NA
 5876065 5876066 EFER_2687 EFER_2688   V TRUE 0.855 -37.000 0.286 NA   NA
 5876066 5876067 EFER_2688 EFER_2689 V   TRUE 0.795 -46.000 0.222 NA   NA
 5876067 5876068 EFER_2689 EFER_2690     TRUE 0.976 11.000 0.222 NA   NA
 5876068 5876069 EFER_2690 EFER_2691     TRUE 0.632 -91.000 0.143 NA   NA
 5876069 5876070 EFER_2691 EFER_2692     TRUE 0.495 -54.000 0.061 NA   NA
 5876070 5876071 EFER_2692 EFER_2693     TRUE 0.761 72.000 0.537 NA   NA
 5876071 5876072 EFER_2693 EFER_2694     TRUE 0.466 -238.000 0.098 1.000   NA
 5876072 5876073 EFER_2694 EFER_2695     TRUE 0.996 9.000 0.750 NA   NA
 5876073 5876074 EFER_2695 EFER_2696     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5876074 5876075 EFER_2696 EFER_2697     TRUE 0.995 4.000 0.571 NA   NA
 5876075 5876076 EFER_2697 EFER_2698     FALSE 0.080 128.000 0.000 NA   NA
 5876078 5876079 EFER_2700 EFER_2701 rzpD ybcS TRUE 0.624 -15.000 0.000 1.000   NA
 5876079 5876080 EFER_2701 EFER_2702 ybcS essD TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5876080 5876081 EFER_2702 EFER_2703 essD   FALSE 0.028 189.000 0.000 NA   NA
 5876081 5876082 EFER_2703 EFER_2704     FALSE 0.005 341.000 0.000 NA   NA
 5876084 5876085 EFER_2706 EFER_2707 ybcQ rusA FALSE 0.022 208.000 0.000 1.000   NA
 5876085 5876086 EFER_2707 EFER_2708 rusA ybcO TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5876086 5876087 EFER_2708 EFER_2709 ybcO   TRUE 0.709 -7.000 0.000 NA   NA
 5876087 5876088 EFER_2709 EFER_2710   ybcN TRUE 0.665 -81.000 0.154 NA   NA
 5876088 5876089 EFER_2710 EFER_2711 ybcN   FALSE 0.028 188.000 0.000 NA   NA
 5876089 5876090 EFER_2711 EFER_2712     FALSE 0.236 50.000 0.000 NA   NA
 5876090 5876091 EFER_2712 EFER_2713     FALSE 0.090 121.000 0.000 NA   NA
 5876091 5876092 EFER_2713 EFER_2714     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5876092 5876093 EFER_2714 EFER_2715     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5876093 5876094 EFER_2715 EFER_2716     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5876094 5876095 EFER_2716 EFER_2717     FALSE 0.352 -60.000 0.000 NA   NA
 5876095 5876096 EFER_2717 EFER_2718     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5876096 5876097 EFER_2718 EFER_2719     TRUE 0.982 -3.000 0.333 1.000   NA
 5876097 5876098 EFER_2719 EFER_2720     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5876098 5876099 EFER_2720 EFER_2721   cro FALSE 0.138 79.000 0.000 NA   NA
 5876100 5876101 EFER_2722 EFER_2723     FALSE 0.062 130.000 0.000 NA N NA
 5876101 5876102 EFER_2723 EFER_2724     TRUE 0.993 -3.000 0.726 NA   NA
 5876102 5876103 EFER_2724 EFER_2725     FALSE 0.008 275.000 0.000 NA   NA
 5876103 5876104 EFER_2725 EFER_2726     FALSE 0.141 76.000 0.000 NA   NA
 5876104 5876105 EFER_2726 EFER_2727     TRUE 0.915 6.000 0.040 NA   NA
 5876105 5876106 EFER_2727 EFER_2728     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5876106 5876107 EFER_2728 EFER_2729     FALSE 0.154 151.000 0.000 0.049   NA
 5876107 5876108 EFER_2729 EFER_2730     TRUE 0.520 -22.000 0.000 NA   NA
 5876108 5876109 EFER_2730 EFER_2731     FALSE 0.446 99.000 0.222 NA   NA
 5876109 5876110 EFER_2731 EFER_2732     TRUE 0.670 48.000 0.222 NA   NA
 5876110 5876111 EFER_2732 EFER_2733   xis TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5876111 5876112 EFER_2733 EFER_2734 xis int TRUE 0.537 -123.000 0.000 0.049   NA
 5876113 5876114 EFER_tRNA66 EFER_2735   proA FALSE 0.100 115.000 0.000 NA   NA
 5876114 5876115 EFER_2735 EFER_2736 proA proB TRUE 0.990 12.000 0.026 0.001 Y NA
 5876117 5876118 EFER_2738 EFER_2739 crl frsA FALSE 0.245 58.000 0.048 NA   NA
 5876118 5876119 EFER_2739 EFER_2740 frsA gpt FALSE 0.143 93.000 0.040 NA   NA
 5876120 5876121 EFER_2741 EFER_2742 pepD   TRUE 0.487 27.000 0.000 NA   NA
 5876122 5876123 EFER_2743 EFER_2744   prfH TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5876123 5876124 EFER_2744 EFER_2745 prfH   TRUE 0.512 111.000 0.303 NA   NA
 5876124 5876125 EFER_2745 EFER_2746   yafP FALSE 0.005 318.000 0.000 NA   NA
 5876125 5876126 EFER_2746 EFER_2747 yafP yafO TRUE 0.881 10.000 0.000 NA   NA
 5876126 5876127 EFER_2747 EFER_2748 yafO yafN TRUE 0.994 3.000 0.500 NA   NA
 5876127 5876128 EFER_2748 EFER_2749 yafN dinB FALSE 0.185 52.000 0.000 NA N NA
 5876128 5876129 EFER_2749 EFER_2750 dinB mbhA FALSE 0.143 71.000 0.000 1.000 N NA
 5876131 5876132 EFER_2752 EFER_2753 recD recB TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 5876132 5876133 EFER_2753 EFER_2754 recB ptr TRUE 0.773 -16.000 0.092 1.000 N NA
 5876133 5876134 EFER_2754 EFER_2755 ptr recC FALSE 0.086 177.000 0.092 1.000 N NA
 5876134 5876135 EFER_2755 EFER_2756 recC   TRUE 0.834 16.000 0.076 NA N NA
 5876135 5876136 EFER_2756 EFER_2757     TRUE 0.964 -15.000 0.538 NA   NA
 5876136 5876137 EFER_2757 EFER_2758   ppdB TRUE 0.984 -3.000 0.373 NA   NA
 5876137 5876138 EFER_2758 EFER_2759 ppdB ppdA TRUE 0.912 -249.000 0.368 NA Y NA
 5876138 5876139 EFER_2759 EFER_2760 ppdA thyA FALSE 0.023 175.000 0.016 NA N NA
 5876139 5876140 EFER_2760 EFER_2761 thyA lgt TRUE 0.974 7.000 0.164 1.000 N NA
 5876140 5876141 EFER_2761 EFER_2762 lgt ptsP FALSE 0.043 164.000 0.000 1.000 N NA
 5876141 5876142 EFER_2762 EFER_2763 ptsP nudH TRUE 0.751 13.000 0.008 1.000 N NA
 5876143 5876144 EFER_2764 EFER_2765 mutH ygdQ FALSE 0.226 64.000 0.052 1.000 N NA
 5876144 5876145 EFER_2765 EFER_2766 ygdQ ygdR TRUE 0.530 133.000 0.429 NA   NA
 5876145 5876146 EFER_2766 EFER_2767 ygdR tas FALSE 0.135 108.000 0.043 NA   NA
 5876146 5876147 EFER_2767 EFER_2768 tas   FALSE 0.064 143.000 0.000 NA   NA
 5876148 5876149 EFER_2769 EFER_2770 ygeD aas TRUE 0.893 -7.000 0.124 NA   NA
 5876149 5876150 EFER_2770 EFER_misc_RNA_45 aas omrA FALSE 0.120 94.000 0.000 NA   NA
 5876150 5876151 EFER_misc_RNA_45 EFER_2771 omrA   FALSE 0.113 102.000 0.000 NA   NA
 5876151 5876152 EFER_2771 EFER_misc_RNA_46   omrB FALSE 0.302 -96.000 0.000 NA   NA
 5876157 5876158 EFER_2776 EFER_2777 yqeG yqeH FALSE 0.003 443.000 0.000 NA   NA
 5876158 5876159 EFER_2777 EFER_2778 yqeH   FALSE 0.035 242.000 0.000 0.063   NA
 5876159 5876160 EFER_2778 EFER_2779     TRUE 0.709 -7.000 0.000 NA   NA
 5876160 5876161 EFER_2779 EFER_2780   nfrB FALSE 0.008 279.000 0.000 NA   NA
 5876161 5876162 EFER_2780 EFER_2781 nfrB nfrA TRUE 0.775 -31.000 0.159 1.000 N NA
 5876162 5876163 EFER_2781 EFER_2782 nfrA ybcH TRUE 0.992 0.000 0.500 NA   NA
 5876163 5876164 EFER_2782 EFER_2784 ybcH codB FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 5876164 5876165 EFER_2784 EFER_2785 codB codA TRUE 0.979 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 5876168 5876169 EFER_2788 EFER_2789     FALSE 0.100 115.000 0.000 NA   NA
 5876169 5876170 EFER_2789 EFER_2790     FALSE 0.100 115.000 0.000 NA   NA
 5876171 5876172 EFER_2791 EFER_2792 insE insF TRUE 0.941 -3.000 0.000 0.049   NA
 5876172 5876173 EFER_2792 EFER_2793 insF   FALSE 0.122 92.000 0.000 NA   NA
 5876173 5876174 EFER_2793 EFER_2794     FALSE 0.130 87.000 0.000 NA   NA
 5876174 5876175 EFER_2794 EFER_2795     FALSE 0.135 82.000 0.000 NA   NA
 5876175 5876176 EFER_2795 EFER_2796     FALSE 0.008 279.000 0.000 NA   NA
 5876176 5876177 EFER_2796 EFER_2797     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5876178 5876179 EFER_2798 EFER_2799     FALSE 0.356 -82.000 0.000 1.000   NA
 5876179 5876180 EFER_2799 EFER_2800     TRUE 0.487 27.000 0.000 NA   NA
 5876182 5876183 EFER_2802 EFER_2803 arsD   FALSE 0.246 48.000 0.000 NA   NA
 5876184 5876185 EFER_2804 EFER_2805     TRUE 0.946 -21.000 0.129 1.000 Y NA
 5876186 5876187 EFER_2806 EFER_tRNA65 int   FALSE 0.043 165.000 0.000 NA   NA
 5876187 5876188 EFER_tRNA65 EFER_2807   ygeR FALSE 0.138 79.000 0.000 NA   NA
 5876188 5876189 EFER_2807 EFER_2808 ygeR   FALSE 0.129 84.000 0.000 1.000 N NA
 5876189 5876190 EFER_2808 EFER_2809     TRUE 0.980 5.000 0.200 1.000 N NA
 5876190 5876191 EFER_2809 EFER_2810     TRUE 0.857 24.000 0.200 NA N NA
 5876191 5876192 EFER_2810 EFER_2811     TRUE 0.826 24.000 0.160 NA N NA
 5876193 5876194 EFER_2812 EFER_2813     FALSE 0.262 55.000 0.050 1.000 N NA
 5876194 5876195 EFER_2813 EFER_2814     TRUE 0.976 15.000 0.425 NA N NA
 5876195 5876196 EFER_2814 EFER_2815     TRUE 0.986 -3.000 0.419 NA   NA
 5876196 5876197 EFER_2815 EFER_2816     FALSE 0.379 -169.000 0.070 NA   NA
 5876197 5876198 EFER_2816 EFER_2817   gadA FALSE 0.163 195.000 0.000 1.000 Y NA
 5876198 5876199 EFER_2817 EFER_2818 gadA ybaS FALSE 0.152 198.000 0.028 1.000 Y NA
 5876199 5876200 EFER_2818 EFER_2819 ybaS yagT FALSE 0.082 125.000 0.000 1.000 N NA
 5876200 5876201 EFER_2819 EFER_2820 yagT yagS TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.038 Y NA
 5876201 5876202 EFER_2820 EFER_2821 yagS yagR TRUE 0.999 -3.000 0.917 0.000 Y NA
 5876202 5876203 EFER_2821 EFER_2822 yagR yagQ TRUE 0.953 10.000 0.111 NA N NA
 5876203 5876204 EFER_2822 EFER_2823 yagQ   TRUE 0.851 -3.000 0.034 NA   NA
 5876204 5876205 EFER_2823 EFER_2824   idi FALSE 0.203 55.000 0.000 NA   NA
 5876206 5876207 EFER_2825 EFER_2826 lysS prfB TRUE 0.996 10.000 0.162 0.037 Y NA
 5876207 5876208 EFER_2826 EFER_2827 prfB recJ FALSE 0.119 91.000 0.028 1.000 N NA
 5876208 5876209 EFER_2827 EFER_2828 recJ dsbC TRUE 0.952 6.000 0.082 1.000 N NA
 5876209 5876210 EFER_2828 EFER_2829 dsbC xerD TRUE 0.702 25.000 0.079 1.000 N NA
 5876212 5876213 EFER_2831 EFER_2832 ygfX ygfY TRUE 0.671 -19.000 0.061 NA   NA
 5876213 5876214 EFER_2832 EFER_2833 ygfY   TRUE 0.642 -10.000 0.000 NA   NA
 5876216 5876217 EFER_2835 EFER_2836 yqfA yqfB FALSE 0.127 164.000 0.113 NA   NA
 5876219 5876220 EFER_2838 EFER_2839   gcvP FALSE 0.003 411.000 0.000 NA   NA
 5876220 5876221 EFER_2839 EFER_2840 gcvP gcvH TRUE 0.724 119.000 0.249 1.000 Y NA
 5876221 5876222 EFER_2840 EFER_2841 gcvH gcvT TRUE 0.989 23.000 0.317 0.001 Y NA
 5876222 5876223 EFER_2841 EFER_2843 gcvT visC FALSE 0.002 448.000 0.004 1.000 N NA
 5876223 5876224 EFER_2843 EFER_2844 visC ubiH TRUE 0.993 23.000 0.474 0.001 Y NA
 5876224 5876225 EFER_2844 EFER_2845 ubiH pepP TRUE 0.825 -3.000 0.026 1.000 N NA
 5876225 5876226 EFER_2845 EFER_2846 pepP ygfB TRUE 0.537 26.000 0.036 NA   NA
 5876229 5876230 EFER_misc_RNA_47 EFER_2849 ssrS ygfA FALSE 0.150 70.000 0.000 NA   NA
 5876230 5876231 EFER_2849 EFER_misc_RNA_49 ygfA rygC TRUE 0.504 26.000 0.000 NA   NA
 5876231 5876232 EFER_misc_RNA_49 EFER_misc_RNA_48 rygC rygD FALSE 0.249 -147.000 0.000 NA   NA
 5876233 5876234 EFER_2850 EFER_2851 serA rpiA FALSE 0.012 243.000 0.029 1.000 N NA
 5876236 5876237 EFER_2854 EFER_2855 yggE argO FALSE 0.015 281.000 0.075 NA   NA
 5876237 5876238 EFER_2855 EFER_2856 argO mscS FALSE 0.106 139.000 0.049 1.000   NA
 5876238 5876239 EFER_2856 EFER_2857 mscS fbaA FALSE 0.005 358.000 0.038 1.000 N NA
 5876239 5876240 EFER_2857 EFER_2858 fbaA pgk TRUE 0.731 90.000 0.056 0.005 Y NA
 5876240 5876241 EFER_2858 EFER_2859 pgk epd TRUE 0.865 50.000 0.070 0.005 Y NA
 5876241 5876242 EFER_2859 EFER_2860 epd yggC FALSE 0.007 285.000 0.000 1.000 N NA
 5876242 5876243 EFER_2860 EFER_2861 yggC yggD TRUE 0.990 -3.000 0.588 NA N NA
 5876243 5876244 EFER_2861 EFER_2862 yggD yggF TRUE 0.962 22.000 0.545 NA N NA
 5876244 5876245 EFER_2862 EFER_2863 yggF yggP TRUE 0.988 -3.000 0.500 1.000 N NA
 5876245 5876246 EFER_2863 EFER_2864 yggP cmtA TRUE 0.980 15.000 0.458 1.000 N NA
 5876246 5876247 EFER_2864 EFER_2865 cmtA cmtB TRUE 0.976 28.000 0.250 0.010 Y NA
 5876250 5876251 EFER_2868 EFER_2869   yggG FALSE 0.388 71.000 0.133 NA   NA
 5876252 5876253 EFER_2870 EFER_2871   speB FALSE 0.057 150.000 0.000 NA   NA
 5876253 5876254 EFER_2871 EFER_2872 speB   FALSE 0.026 191.000 0.000 1.000 N NA
 5876254 5876255 EFER_2872 EFER_2873   insB FALSE 0.104 112.000 0.000 NA   NA
 5876255 5876256 EFER_2873 EFER_2874 insB insB TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 5876256 5876257 EFER_2874 EFER_2875 insB   FALSE 0.037 173.000 0.000 NA   NA
 5876258 5876259 EFER_2876 EFER_2877     FALSE 0.013 232.000 0.000 NA   NA
 5876263 5876264 EFER_2881 EFER_2882 metK galP FALSE 0.003 436.000 0.000 1.000 N NA
 5876264 5876265 EFER_2882 EFER_2883 galP sprT FALSE 0.170 77.000 0.042 NA   NA
 5876265 5876266 EFER_2883 EFER_2884 sprT endA FALSE 0.433 95.000 0.210 NA   NA
 5876266 5876267 EFER_2884 EFER_2885 endA yggJ TRUE 0.466 80.000 0.201 NA   NA
 5876267 5876268 EFER_2885 EFER_2886 yggJ gshB TRUE 0.954 13.000 0.173 NA   NA
 5876268 5876269 EFER_2886 EFER_2887 gshB yqgE FALSE 0.263 109.000 0.120 NA N NA
 5876269 5876270 EFER_2887 EFER_2888 yqgE yqgF TRUE 0.982 0.000 0.263 NA N NA
 5876272 5876273 EFER_2890 EFER_2891 yggS yggT TRUE 0.919 18.000 0.189 NA   NA
 5876273 5876274 EFER_2891 EFER_2892 yggT yggU TRUE 0.922 -3.000 0.081 NA   NA
 5876274 5876275 EFER_2892 EFER_2893 yggU yggV TRUE 0.871 8.000 0.016 NA   NA
 5876275 5876276 EFER_2893 EFER_2894 yggV yggW TRUE 0.935 -7.000 0.218 1.000 N NA
 5876276 5876277 EFER_2894 EFER_2895 yggW   FALSE 0.005 314.000 0.000 1.000 N NA
 5876277 5876278 EFER_2895 EFER_2896     TRUE 0.942 36.000 0.286 NA Y NA
 5876278 5876279 EFER_2896 EFER_2897   ygiK TRUE 0.995 0.000 0.286 NA Y NA
 5876280 5876281 EFER_2898 EFER_2899   ansB FALSE 0.082 117.000 0.018 NA   NA
 5876281 5876282 EFER_2899 EFER_2900 ansB yggN FALSE 0.029 186.000 0.027 NA   NA
 5876282 5876283 EFER_2900 EFER_2901 yggN yggL TRUE 0.536 53.000 0.155 NA   NA
 5876283 5876284 EFER_2901 EFER_2902 yggL yggH TRUE 0.952 0.000 0.092 NA   NA
 5876285 5876286 EFER_2903 EFER_2904 mutY yggX TRUE 0.763 28.000 0.150 NA N NA
 5876286 5876287 EFER_2904 EFER_2905 yggX mltC FALSE 0.386 65.000 0.128 NA N NA
 5876291 5876292 EFER_2909 EFER_2910 yqgA   FALSE 0.120 94.000 0.000 NA   NA
 5876292 5876293 EFER_2910 EFER_tRNA33     FALSE 0.314 -87.000 0.000 NA   NA
 5876293 5876294 EFER_tRNA33 EFER_2911   yghJ FALSE 0.002 1063.000 0.000 NA   NA
 5876294 5876295 EFER_2911 EFER_2912 yghJ pppA FALSE 0.050 156.000 0.000 NA   NA
 5876295 5876296 EFER_2912 EFER_2913 pppA yghG FALSE 0.163 66.000 0.000 NA   NA
 5876296 5876297 EFER_2913 EFER_2914 yghG yghF TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 5876297 5876298 EFER_2914 EFER_2915 yghF epsD TRUE 0.990 30.000 0.575 0.003 Y NA
 5876298 5876299 EFER_2915 EFER_2916 epsD epsE TRUE 0.999 0.000 0.776 0.003 Y NA
 5876299 5876300 EFER_2916 EFER_2917 epsE epsF TRUE 0.999 0.000 0.653 0.003 Y NA
 5876300 5876301 EFER_2917 EFER_2918 epsF   TRUE 0.996 -10.000 0.599 0.003 Y NA
 5876301 5876302 EFER_2918 EFER_2919     TRUE 0.996 4.000 0.425 0.003   NA
 5876302 5876303 EFER_2919 EFER_2920     TRUE 0.996 -3.000 0.605 0.003   NA
 5876303 5876304 EFER_2920 EFER_2921     TRUE 0.995 -3.000 0.569 0.003   NA
 5876304 5876305 EFER_2921 EFER_2922     TRUE 0.996 -3.000 0.461 1.000 Y NA
 5876305 5876306 EFER_2922 EFER_2923   yghE TRUE 0.998 -3.000 0.537 0.065 Y NA
 5876306 5876307 EFER_2923 EFER_2924 yghE yghD TRUE 0.999 2.000 0.811 1.000 Y NA
 5876307 5876308 EFER_2924 EFER_2925 yghD yafT FALSE 0.003 391.000 0.000 NA   NA
 5876309 5876310 EFER_2926 EFER_2927     FALSE 0.020 205.000 0.000 NA   NA
 5876310 5876311 EFER_2927 EFER_2928     FALSE 0.002 646.000 0.000 NA   NA
 5876311 5876312 EFER_2928 EFER_2929     FALSE 0.015 226.000 0.000 NA   NA
 5876312 5876313 EFER_2929 EFER_2930   gss FALSE 0.002 613.000 0.000 NA   NA
 5876314 5876315 EFER_2931 EFER_2932 envY yghU FALSE 0.145 70.000 0.000 1.000 N NA
 5876316 5876317 EFER_2933 EFER_2934 hybG hybF TRUE 0.815 13.000 0.000 NA   NA
 5876317 5876318 EFER_2934 EFER_2935 hybF hybE TRUE 0.789 -7.000 0.055 NA   NA
 5876318 5876319 EFER_2935 EFER_2936 hybE hybD TRUE 0.954 -7.000 0.291 NA   NA
 5876319 5876320 EFER_2936 EFER_2937 hybD hybC TRUE 0.999 0.000 0.828 1.000 Y NA
 5876320 5876321 EFER_2937 EFER_2938 hybC hybB TRUE 0.974 -3.000 0.000 NA Y NA
 5876321 5876322 EFER_2938 EFER_2939 hybB hybA TRUE 0.928 -10.000 0.000 NA Y NA
 5876322 5876323 EFER_2939 EFER_2940 hybA hybO TRUE 0.998 3.000 0.615 NA Y NA
 5876323 5876324 EFER_2940 EFER_2941 hybO yghW FALSE 0.057 189.000 0.077 NA   NA
 5876324 5876325 EFER_2941 EFER_2942 yghW   TRUE 0.809 -3.000 0.017 NA   NA
 5876329 5876330 EFER_2946 EFER_2947 exbD exbB TRUE 0.999 7.000 0.810 0.052 Y NA
 5876331 5876332 EFER_2948 EFER_2949 metC yghB FALSE 0.294 140.000 0.212 NA   NA
 5876334 5876335 EFER_2951 EFER_2952 yqhD dkgA FALSE 0.425 104.000 0.200 1.000   NA
 5876335 5876336 EFER_2952 EFER_2953 dkgA   FALSE 0.043 184.000 0.040 1.000   NA
 5876336 5876337 EFER_2953 EFER_2954   yqhH FALSE 0.079 117.000 0.000 NA N NA
 5876339 5876340 EFER_2956 EFER_2957     FALSE 0.005 325.000 0.000 1.000 N NA
 5876340 5876341 EFER_2957 EFER_2958     TRUE 0.939 -3.000 0.027 0.021 N NA
 5876341 5876342 EFER_2958 EFER_2959     TRUE 0.856 11.000 0.027 1.000 N NA
 5876342 5876343 EFER_2959 EFER_2960     FALSE 0.140 73.000 0.000 1.000 N NA
 5876343 5876344 EFER_2960 EFER_2961     TRUE 0.981 42.000 1.000 NA Y NA
 5876344 5876345 EFER_2961 EFER_2962   ygiK TRUE 0.990 -31.000 1.000 NA Y NA
 5876346 5876347 EFER_2963 EFER_2964 sufI plsC FALSE 0.423 69.000 0.154 1.000 N NA
 5876347 5876348 EFER_2964 EFER_2965 plsC parC FALSE 0.013 252.000 0.043 1.000 N NA
 5876348 5876349 EFER_2965 EFER_2966 parC ygiW FALSE 0.068 120.000 0.009 NA   NA
 5876350 5876351 EFER_2967 EFER_2968 qseB qseC TRUE 0.997 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 5876351 5876352 EFER_2968 EFER_2969 qseC mdaB FALSE 0.142 103.000 0.035 1.000   NA
 5876352 5876353 EFER_2969 EFER_2970 mdaB ygiN TRUE 0.710 31.000 0.025 0.021   NA
 5876354 5876355 EFER_2971 EFER_2972 parE yqiA TRUE 0.832 29.000 0.217 NA   NA
 5876355 5876356 EFER_2972 EFER_2973 yqiA cpdA TRUE 0.991 0.000 0.427 NA   NA
 5876356 5876357 EFER_2973 EFER_2974 cpdA yqiB TRUE 0.941 25.000 0.433 NA   NA
 5876357 5876358 EFER_2974 EFER_2975 yqiB nudF TRUE 0.991 0.000 0.443 NA   NA
 5876359 5876360 EFER_2976 EFER_2977 tolC ygiA TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5876360 5876361 EFER_2977 EFER_2978 ygiA ygiB TRUE 0.746 -16.000 0.080 NA   NA
 5876361 5876362 EFER_2978 EFER_2979 ygiB ygiC TRUE 0.995 6.000 0.632 NA   NA
 5876362 5876363 EFER_2979 EFER_2980 ygiC assT FALSE 0.002 523.000 0.000 NA   NA
 5876363 5876364 EFER_2980 EFER_2981 assT dsbA TRUE 0.980 16.000 0.500 1.000   NA
 5876364 5876365 EFER_2981 EFER_2982 dsbA   TRUE 0.988 15.000 0.375 0.003   NA
 5876369 5876370 EFER_2986 EFER_2987 ygiL yqiG TRUE 0.923 87.000 0.667 1.000 Y NA
 5876370 5876371 EFER_2987 EFER_2988 yqiG yqiH TRUE 0.999 7.000 0.667 1.000 Y NA
 5876371 5876372 EFER_2988 EFER_2989 yqiH   TRUE 0.985 -3.000 0.400 NA   NA
 5876376 5876377 EFER_2993 EFER_2994 yqiJ yqiK TRUE 0.947 31.000 0.641 NA   NA
 5876380 5876381 EFER_misc_RNA_51 EFER_2996 rygC rfaE FALSE 0.003 421.000 0.000 NA   NA
 5876381 5876382 EFER_2996 EFER_2997 rfaE glnE FALSE 0.424 48.000 0.083 1.000 N NA
 5876382 5876383 EFER_2997 EFER_2998 glnE ygiF TRUE 0.689 23.000 0.053 1.000   NA
 5876383 5876384 EFER_2998 EFER_2999 ygiF   TRUE 0.711 17.000 0.000 NA   NA
 5876385 5876386 EFER_3000 EFER_3001 htrG cca FALSE 0.350 64.000 0.106 NA N NA
 5876387 5876388 EFER_3002 EFER_3003 bacA folB FALSE 0.329 91.000 0.128 1.000 N NA
 5876391 5876392 EFER_3006 EFER_3007 rpsU dnaG FALSE 0.174 112.000 0.067 1.000 N NA
 5876392 5876393 EFER_3007 EFER_3008 dnaG rpoD FALSE 0.180 195.000 0.299 1.000 N NA
 5876393 5876394 EFER_3008 EFER_3009 rpoD   FALSE 0.183 60.000 0.000 NA   NA
 5876397 5876398 EFER_3011 EFER_3012     FALSE 0.385 -46.000 0.000 NA   NA
 5876398 5876399 EFER_3012 EFER_3013     FALSE 0.261 46.000 0.000 NA   NA
 5876399 5876400 EFER_3013 EFER_3014     TRUE 0.964 28.000 0.400 0.001   NA
 5876400 5876401 EFER_3014 EFER_3015     TRUE 0.988 14.000 0.600 1.000   NA
 5876401 5876402 EFER_3015 EFER_3016     TRUE 0.884 11.000 0.000 1.000   NA
 5876402 5876403 EFER_3016 EFER_3017     TRUE 0.892 -142.000 0.622 1.000   NA
 5876403 5876404 EFER_3017 EFER_3018     TRUE 0.733 21.000 0.054 1.000   NA
 5876404 5876405 EFER_3018 EFER_3019     TRUE 0.931 16.000 0.000 0.001   NA
 5876405 5876406 EFER_3019 EFER_3020     TRUE 0.528 27.000 0.000 1.000   NA
 5876406 5876407 EFER_3020 EFER_3021     TRUE 0.975 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5876407 5876408 EFER_3021 EFER_3022   yqjH FALSE 0.001 827.000 0.000 NA N NA
 5876411 5876412 EFER_3025 EFER_3026 ygjG   FALSE 0.043 165.000 0.000 NA   NA
 5876413 5876414 EFER_3027 EFER_3028   uxuR FALSE 0.009 261.000 0.000 NA   NA
 5876414 5876415 EFER_3028 EFER_3029 uxuR uxuB FALSE 0.011 245.000 0.000 1.000 N NA
 5876415 5876416 EFER_3029 EFER_3030 uxuB uxuA TRUE 0.623 81.000 0.070 1.000 Y NA
 5876417 5876418 EFER_3031 EFER_3032 slp dctR FALSE 0.004 359.000 0.000 1.000 N NA
 5876419 5876420 EFER_3033 EFER_3034 yhiD hdeB FALSE 0.105 111.000 0.000 NA   NA
 5876420 5876421 EFER_3034 EFER_3035 hdeB hdeA TRUE 0.687 18.000 0.000 NA   NA
 5876422 5876423 EFER_3036 EFER_3037 hdeD gadE FALSE 0.002 768.000 0.000 NA   NA
 5876423 5876424 EFER_3037 EFER_3038 gadE mdtE FALSE 0.106 120.000 0.000 1.000   NA
 5876424 5876425 EFER_3038 EFER_3039 mdtE mdtF TRUE 0.495 26.000 0.000 1.000 N NA
 5876426 5876427 EFER_3040 EFER_3041   gadW TRUE 0.637 20.000 0.000 NA   NA
 5876428 5876429 EFER_misc_RNA_52 EFER_3042 gadY   FALSE 0.006 313.000 0.000 NA   NA
 5876429 5876430 EFER_3042 EFER_3043     FALSE 0.444 33.000 0.000 1.000   NA
 5876430 5876431 EFER_3043 EFER_3044     FALSE 0.090 121.000 0.000 NA   NA
 5876431 5876432 EFER_3044 EFER_3045     FALSE 0.021 203.000 0.000 NA   NA
 5876432 5876433 EFER_3045 EFER_3046     FALSE 0.034 180.000 0.000 NA   NA
 5876433 5876434 EFER_3046 EFER_3047     FALSE 0.003 387.000 0.000 NA   NA
 5876435 5876436 EFER_3048 EFER_3049 yhaM tdcC FALSE 0.017 215.000 0.000 NA   NA
 5876436 5876437 EFER_3049 EFER_3050 tdcC tdcB TRUE 0.917 22.000 0.029 1.000 Y NA
 5876438 5876439 EFER_3051 EFER_3052 yjiM hgdC TRUE 0.946 4.000 0.078 NA N NA
 5876439 5876440 EFER_3052 EFER_3053 hgdC   FALSE 0.445 -126.000 0.078 NA   NA
 5876440 5876441 EFER_3053 EFER_3054   fadH FALSE 0.060 148.000 0.000 NA   NA
 5876444 5876445 EFER_3057 EFER_3058     FALSE 0.234 103.000 0.095 NA N NA
 5876445 5876446 EFER_3058 EFER_3059     TRUE 0.995 4.000 0.654 NA N NA
 5876449 5876450 EFER_3062 EFER_3063 hpaG hpaE TRUE 0.993 -3.000 0.510 0.047 N NA
 5876450 5876451 EFER_3063 EFER_3064 hpaE hpaD TRUE 0.991 2.000 0.378 1.000   NA
 5876451 5876452 EFER_3064 EFER_3065 hpaD hpaF TRUE 0.987 10.000 0.330 1.000   NA
 5876452 5876453 EFER_3065 EFER_3066 hpaF hpaH TRUE 0.711 50.000 0.282 1.000 N NA
 5876453 5876454 EFER_3066 EFER_3067 hpaH hpaI TRUE 0.839 -130.000 0.439 1.000 N NA
 5876454 5876455 EFER_3067 EFER_3068 hpaI   TRUE 0.641 124.000 0.175 1.000 Y NA
 5876455 5876456 EFER_3068 EFER_3069   hpaA TRUE 0.980 10.000 0.233 1.000 N NA
 5876456 5876457 EFER_3069 EFER_3070 hpaA hpaB FALSE 0.029 251.000 0.100 1.000 N NA
 5876457 5876458 EFER_3070 EFER_3071 hpaB hpaC TRUE 0.974 18.000 0.226 0.000   NA
 5876458 5876459 EFER_3071 EFER_3072 hpaC   FALSE 0.138 79.000 0.000 NA   NA
 5876459 5876460 EFER_3072 EFER_3073   yjiY FALSE 0.268 45.000 0.000 NA   NA
 5876460 5876461 EFER_3073 EFER_3074 yjiY yjiX TRUE 0.851 50.000 0.531 NA   NA
 5876461 5876462 EFER_3074 EFER_3075 yjiX yjiA TRUE 0.974 11.000 0.212 NA   NA
 5876463 5876464 EFER_3076 EFER_3077     TRUE 0.889 -154.000 0.654 NA   NA
 5876464 5876465 EFER_3077 EFER_3078     FALSE 0.078 129.000 0.000 NA   NA
 5876466 5876467 EFER_3079 EFER_3080 hsdR hsdM TRUE 0.943 77.000 0.567 0.048 Y NA
 5876467 5876468 EFER_3080 EFER_3081 hsdM   TRUE 0.992 -3.000 0.133 0.048 Y NA
 5876470 5876471 EFER_3082 EFER_3083 yjiW mcrB FALSE 0.046 162.000 0.000 NA   NA
 5876471 5876472 EFER_3083 EFER_3084 mcrB mcrC TRUE 0.999 0.000 0.490 0.000 Y NA
 5876473 5876474 EFER_3085 EFER_3086   yjgt TRUE 0.980 13.000 0.360 NA   NA
 5876474 5876475 EFER_3086 EFER_3087 yjgt yjiS FALSE 0.002 451.000 0.000 NA   NA
 5876478 5876479 EFER_3090 EFER_3091 yjiO yjiN FALSE 0.278 41.000 0.020 NA   NA
 5876479 5876480 EFER_3091 EFER_3092 yjiN   FALSE 0.003 390.000 0.000 NA   NA
 5876480 5876481 EFER_3092 EFER_3093     TRUE 0.815 13.000 0.000 NA   NA
 5876482 5876483 EFER_3094 EFER_3095     TRUE 0.941 -3.000 0.111 NA   NA
 5876483 5876484 EFER_3095 EFER_3096     TRUE 0.946 -49.000 0.750 NA   NA
 5876484 5876485 EFER_3096 EFER_3097     TRUE 0.985 -10.000 0.875 NA   NA
 5876485 5876486 EFER_3097 EFER_3098     TRUE 0.996 3.000 0.714 NA   NA
 5876486 5876487 EFER_3098 EFER_3099     TRUE 0.971 -16.000 0.667 NA   NA
 5876487 5876488 EFER_3099 EFER_3100     TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 5876488 5876489 EFER_3100 EFER_3101     TRUE 0.959 3.000 0.091 NA   NA
 5876489 5876490 EFER_3101 EFER_3102     TRUE 0.980 -3.000 0.182 0.047   NA
 5876490 5876491 EFER_3102 EFER_3103     TRUE 0.617 51.000 0.200 NA   NA
 5876491 5876492 EFER_3103 EFER_3104     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5876492 5876493 EFER_3104 EFER_3105     TRUE 0.987 -7.000 0.759 NA   NA
 5876493 5876494 EFER_3105 EFER_3106     FALSE 0.039 170.000 0.000 NA   NA
 5876496 5876497 EFER_3108 EFER_3109 intB intB FALSE 0.108 109.000 0.000 NA   NA
 5876500 5876501 EFER_3111 EFER_3112 yjgB   TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5876501 5876502 EFER_3112 EFER_3113   yjgR FALSE 0.341 -67.000 0.000 NA   NA
 5876503 5876504 EFER_3114 EFER_3115 yraQ yraR FALSE 0.184 73.000 0.045 NA   NA
 5876508 5876509 EFER_3119 EFER_3120 yhbS yhbT TRUE 0.964 -6.000 0.295 1.000   NA
 5876510 5876511 EFER_3121 EFER_3122 yhbU yhbV TRUE 0.999 9.000 0.948 0.003 Y NA
 5876511 5876512 EFER_3122 EFER_3123 yhbV yhbW FALSE 0.138 81.000 0.041 NA N NA
 5876514 5876515 EFER_3125 EFER_3126     FALSE 0.057 150.000 0.000 NA   NA
 5876515 5876516 EFER_3126 EFER_3127     FALSE 0.330 160.000 0.333 1.000 N NA
 5876516 5876517 EFER_3127 EFER_3128     TRUE 0.949 13.000 0.000 0.003   NA
 5876517 5876518 EFER_3128 EFER_3129     TRUE 0.995 12.000 0.833 NA   NA
 5876518 5876519 EFER_3129 EFER_3130     FALSE 0.370 -145.000 0.062 NA   NA
 5876519 5876520 EFER_3130 EFER_3131     TRUE 0.978 0.000 0.050 0.001   NA
 5876520 5876521 EFER_3131 EFER_3132     TRUE 0.988 16.000 0.750 NA   NA
 5876521 5876522 EFER_3132 EFER_3133     TRUE 0.910 -3.000 0.070 NA   NA
 5876522 5876523 EFER_3133 EFER_3134     TRUE 0.652 21.000 0.000 1.000   NA
 5876523 5876524 EFER_3134 EFER_3135     FALSE 0.006 305.000 0.000 NA   NA
 5876524 5876525 EFER_3135 EFER_3136     TRUE 0.990 17.000 0.945 NA   NA
 5876525 5876526 EFER_3136 EFER_3137     FALSE 0.274 44.000 0.000 NA   NA
 5876527 5876528 EFER_3138 EFER_3139   mtr FALSE 0.111 100.000 0.000 1.000 N NA
 5876530 5876531 EFER_3141 EFER_3142 deaD nlpI FALSE 0.056 180.000 0.053 1.000   NA
 5876531 5876532 EFER_3142 EFER_3143 nlpI pnp FALSE 0.212 109.000 0.071 1.000   NA
 5876534 5876535 EFER_3144 EFER_3145 rpsO truB TRUE 0.578 149.000 0.211 1.000 Y NA
 5876535 5876536 EFER_3145 EFER_3146 truB rbfA TRUE 0.996 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5876536 5876537 EFER_3146 EFER_3147 rbfA infB TRUE 0.737 163.000 0.530 1.000 Y NA
 5876537 5876538 EFER_3147 EFER_3148 infB nusA TRUE 0.920 25.000 0.342 1.000 N NA
 5876538 5876539 EFER_3148 EFER_3149 nusA yhbC TRUE 0.964 28.000 0.759 NA   NA
 5876539 5876540 EFER_3149 EFER_tRNA63 yhbC   FALSE 0.019 207.000 0.000 NA   NA
 5876542 5876543 EFER_3151 EFER_tRNA62 yhbX   FALSE 0.009 268.000 0.000 NA   NA
 5876543 5876544 EFER_tRNA62 EFER_3152   secG TRUE 0.763 15.000 0.000 NA   NA
 5876544 5876545 EFER_3152 EFER_3153 secG glmM FALSE 0.011 228.000 0.016 1.000 N NA
 5876545 5876546 EFER_3153 EFER_3154 glmM folP TRUE 0.947 -7.000 0.260 1.000 N NA
 5876546 5876547 EFER_3154 EFER_3155 folP ftsH TRUE 0.581 90.000 0.325 1.000 N NA
 5876547 5876548 EFER_3155 EFER_3156 ftsH rrmJ FALSE 0.342 100.000 0.152 1.000 N NA
 5876552 5876553 EFER_3160 EFER_3161 obgE yhbE TRUE 0.727 16.000 0.015 1.000   NA
 5876553 5876554 EFER_3161 EFER_3162 yhbE rpmA FALSE 0.084 127.000 0.019 1.000   NA
 5876554 5876555 EFER_3162 EFER_3163 rpmA rplU TRUE 0.996 21.000 0.667 0.009 Y NA
 5876556 5876557 EFER_3164 EFER_3165 ispB sfsB FALSE 0.021 201.000 0.000 1.000 N NA
 5876558 5876559 EFER_3166 EFER_3167 murA yrbA TRUE 0.642 54.000 0.258 NA N NA
 5876559 5876560 EFER_3167 EFER_3168 yrbA yrbB TRUE 0.576 126.000 0.453 NA   NA
 5876560 5876561 EFER_3168 EFER_3169 yrbB yrbC TRUE 0.986 0.000 0.308 NA   NA
 5876561 5876562 EFER_3169 EFER_3170 yrbC yrbD TRUE 0.909 19.000 0.188 NA   NA
 5876562 5876563 EFER_3170 EFER_3171 yrbD yrbE TRUE 0.973 -10.000 0.562 NA   NA
 5876563 5876564 EFER_3171 EFER_3172 yrbE yrbF TRUE 0.998 8.000 0.530 NA Y NA
 5876565 5876566 EFER_3173 EFER_3174 yrbG kdsD TRUE 0.959 14.000 0.226 1.000 N NA
 5876566 5876567 EFER_3174 EFER_3175 kdsD kdsC TRUE 0.980 18.000 0.598 1.000   NA
 5876567 5876568 EFER_3175 EFER_3176 kdsC yrbK TRUE 0.992 -3.000 0.617 NA   NA
 5876568 5876569 EFER_3176 EFER_3177 yrbK lptA TRUE 0.925 -31.000 0.459 NA   NA
 5876569 5876570 EFER_3177 EFER_3178 lptA lptB TRUE 0.994 7.000 0.543 NA   NA
 5876570 5876571 EFER_3178 EFER_3179 lptB rpoN TRUE 0.608 48.000 0.163 1.000   NA
 5876571 5876572 EFER_3179 EFER_3180 rpoN yhbH TRUE 0.976 23.000 0.820 NA N NA
 5876572 5876573 EFER_3180 EFER_3181 yhbH ptsN TRUE 0.727 120.000 0.728 NA N NA
 5876573 5876574 EFER_3181 EFER_3182 ptsN yhbJ TRUE 0.642 46.000 0.186 NA   NA
 5876574 5876575 EFER_3182 EFER_3183 yhbJ npr TRUE 0.963 -3.000 0.182 NA   NA
 5876575 5876576 EFER_3183 EFER_3184 npr yrbL FALSE 0.017 197.000 0.007 NA   NA
 5876577 5876578 EFER_3185 EFER_3186 mtgA elbB TRUE 0.904 -3.000 0.066 NA   NA
 5876580 5876581 EFER_3187 EFER_3188 arcB yhcC FALSE 0.313 95.000 0.113 1.000   NA
 5876582 5876583 EFER_3189 EFER_3190 gltB gltD TRUE 0.993 13.000 0.096 0.000 Y NA
 5876583 5876584 EFER_3190 EFER_3191 gltD yhcG FALSE 0.031 184.000 0.000 NA   NA
 5876585 5876586 EFER_3192 EFER_3193 yhcH nanK TRUE 0.974 -3.000 0.000 NA Y NA
 5876586 5876587 EFER_3193 EFER_3194 nanK nanE TRUE 0.975 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5876587 5876588 EFER_3194 EFER_3195 nanE nanT TRUE 0.722 47.000 0.000 1.000 Y NA
 5876588 5876589 EFER_3195 EFER_3196 nanT nanA TRUE 0.531 109.000 0.318 1.000 N NA
 5876589 5876590 EFER_3196 EFER_3197 nanA nanR FALSE 0.197 122.000 0.091 1.000 N NA
 5876590 5876591 EFER_3197 EFER_3198 nanR sspB FALSE 0.072 118.000 0.009 NA   NA
 5876591 5876592 EFER_3198 EFER_3199 sspB sspA TRUE 0.997 6.000 0.831 NA   NA
 5876594 5876595 EFER_3201 EFER_3202 rpsI rplM TRUE 0.997 16.000 0.601 0.009 Y NA
 5876595 5876596 EFER_3202 EFER_3203 rplM yhcM FALSE 0.011 219.000 0.003 NA   NA
 5876597 5876598 EFER_3204 EFER_3205 yhcB degQ FALSE 0.183 155.000 0.154 NA   NA
 5876598 5876599 EFER_3205 EFER_3206 degQ degS TRUE 0.888 90.000 0.262 0.002 Y NA
 5876600 5876601 EFER_3207 EFER_3208     FALSE 0.011 246.000 0.000 NA   NA
 5876601 5876602 EFER_3208 EFER_3209   ttdA TRUE 0.999 0.000 0.667 0.001 Y NA
 5876602 5876603 EFER_3209 EFER_3210 ttdA   TRUE 0.524 32.000 0.057 1.000 N NA
 5876603 5876604 EFER_3210 EFER_3211     FALSE 0.290 170.000 0.333 1.000 N NA
 5876604 5876605 EFER_3211 EFER_3212     TRUE 0.993 -13.000 0.429 0.003 Y NA
 5876605 5876606 EFER_3212 EFER_3213   mdh TRUE 0.477 -22.000 0.020 1.000 N NA
 5876606 5876607 EFER_3213 EFER_3214 mdh   FALSE 0.110 107.000 0.000 NA   NA
 5876608 5876609 EFER_3215 EFER_3216 argR yhcN FALSE 0.004 354.000 0.000 NA   NA
 5876610 5876611 EFER_3217 EFER_3218   aaeB TRUE 0.899 3.000 0.027 NA   NA
 5876611 5876612 EFER_3218 EFER_3219 aaeB aaeA TRUE 0.989 6.000 0.333 NA   NA
 5876612 5876613 EFER_3219 EFER_3220 aaeA aaeX TRUE 0.991 8.000 0.400 NA   NA
 5876615 5876616 EFER_3222 EFER_3223 tldD yhdP FALSE 0.072 155.000 0.050 NA   NA
 5876616 5876617 EFER_3223 EFER_3224 yhdP rng TRUE 0.684 56.000 0.296 NA   NA
 5876617 5876618 EFER_3224 EFER_3225 rng yhdE TRUE 0.957 -10.000 0.417 NA N NA
 5876618 5876619 EFER_3225 EFER_3226 yhdE mreD TRUE 0.918 18.000 0.206 NA N NA
 5876619 5876620 EFER_3226 EFER_3227 mreD mreC TRUE 0.999 0.000 0.550 0.002 Y NA
 5876620 5876621 EFER_3227 EFER_3228 mreC mreB TRUE 0.837 66.000 0.689 1.000 N NA
 5876621 5876622 EFER_3228 EFER_3230 mreB csrD FALSE 0.006 307.000 0.000 1.000 N NA
 5876623 5876624 EFER_3231 EFER_3232 yhdH yedY FALSE 0.369 98.000 0.059 0.036   NA
 5876624 5876625 EFER_3232 EFER_3233 yedY yedZ TRUE 0.998 1.000 0.790 0.036   NA
 5876625 5876626 EFER_3233 EFER_3234 yedZ accB FALSE 0.004 388.000 0.000 1.000   NA
 5876626 5876627 EFER_3234 EFER_3235 accB accC TRUE 0.997 11.000 0.275 0.001 Y NA
 5876627 5876628 EFER_3235 EFER_3236 accC yhdT FALSE 0.259 109.000 0.103 NA   NA
 5876628 5876629 EFER_3236 EFER_3237 yhdT panF TRUE 0.979 -10.000 0.682 NA   NA
 5876629 5876630 EFER_3237 EFER_3238 panF prmA TRUE 0.868 12.000 0.041 1.000 N NA
 5876630 5876631 EFER_3238 EFER_3239 prmA dusB FALSE 0.040 329.000 0.042 1.000 Y NA
 5876631 5876632 EFER_3239 EFER_3240 dusB fis TRUE 0.813 26.000 0.161 1.000 N NA
 5876632 5876633 EFER_3240 EFER_3241 fis yhdJ TRUE 0.588 65.000 0.016 1.000 Y NA
 5876633 5876634 EFER_3241 EFER_3242 yhdJ   FALSE 0.366 88.000 0.143 NA   NA
 5876636 5876637 EFER_3244 EFER_3245 acrE acrF TRUE 0.995 12.000 0.889 1.000 N NA
 5876637 5876638 EFER_3245 EFER_3246 acrF yhdV FALSE 0.014 231.000 0.000 NA   NA
 5876638 5876639 EFER_3246 EFER_3247 yhdV aapJ FALSE 0.002 451.000 0.000 NA   NA
 5876639 5876640 EFER_3247 EFER_3248 aapJ aapQ TRUE 0.949 68.000 0.548 0.040 Y NA
 5876640 5876641 EFER_3248 EFER_3249 aapQ aapM TRUE 0.999 10.000 0.815 0.013 Y NA
 5876641 5876642 EFER_3249 EFER_3250 aapM aapP TRUE 0.999 8.000 0.734 1.000 Y NA
 5876643 5876644 EFER_5S_5 EFER_tRNA61     FALSE 0.307 41.000 0.000 NA   NA
 5876644 5876645 EFER_tRNA61 EFER_5S_4     TRUE 0.815 13.000 0.000 NA   NA
 5876645 5876646 EFER_5S_4 EFER_23S_4     FALSE 0.120 94.000 0.000 NA   NA
 5876646 5876647 EFER_23S_4 EFER_tRNA60     FALSE 0.031 184.000 0.000 NA   NA
 5876647 5876648 EFER_tRNA60 EFER_tRNA59     FALSE 0.284 43.000 0.000 NA   NA
 5876648 5876649 EFER_tRNA59 EFER_16S_4     FALSE 0.152 69.000 0.000 NA   NA
 5876651 5876652 EFER_3265 EFER_3266 aroE yrdC TRUE 0.951 5.000 0.087 NA N NA
 5876652 5876653 EFER_3266 EFER_3267 yrdC yrdD TRUE 0.968 5.000 0.137 NA N NA
 5876653 5876654 EFER_3267 EFER_3268 yrdD smg TRUE 0.890 29.000 0.331 NA   NA
 5876654 5876655 EFER_3268 EFER_3269 smg smf TRUE 0.750 -28.000 0.124 NA   NA
 5876656 5876657 EFER_3270 EFER_3271 def fmt TRUE 0.982 15.000 0.058 0.014 Y NA
 5876657 5876658 EFER_3271 EFER_3272 fmt rsmB TRUE 0.917 46.000 0.305 1.000 Y NA
 5876658 5876659 EFER_3272 EFER_3273 rsmB trkA TRUE 0.824 22.000 0.122 1.000 N NA
 5876659 5876660 EFER_3273 EFER_3274 trkA mscL FALSE 0.082 130.000 0.035 1.000 N NA
 5876661 5876662 EFER_3275 EFER_3276 yhdL zntR TRUE 0.600 56.000 0.219 NA   NA
 5876662 5876663 EFER_3276 EFER_3277 zntR yhdN TRUE 0.946 11.000 0.095 NA   NA
 5876663 5876664 EFER_3277 EFER_3278 yhdN rplQ FALSE 0.088 107.000 0.012 NA   NA
 5876664 5876665 EFER_3278 EFER_3279 rplQ rpoA TRUE 0.941 41.000 0.873 1.000 N NA
 5876665 5876666 EFER_3279 EFER_3280 rpoA rpsD TRUE 0.951 26.000 0.549 1.000 N NA
 5876666 5876667 EFER_3280 EFER_3281 rpsD rpsK TRUE 0.984 34.000 0.509 0.012 Y NA
 5876667 5876668 EFER_3281 EFER_3282 rpsK rpsM TRUE 0.998 17.000 0.810 0.009 Y NA
 5876668 5876669 EFER_3282 EFER_3283 rpsM secY FALSE 0.005 295.000 0.011 1.000 N NA
 5876669 5876670 EFER_3283 EFER_3284 secY rplO TRUE 0.996 8.000 0.730 1.000 N NA
 5876670 5876671 EFER_3284 EFER_3285 rplO rpmD TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 5876671 5876672 EFER_3285 EFER_3286 rpmD rpsE TRUE 0.999 4.000 0.789 0.012 Y NA
 5876672 5876673 EFER_3286 EFER_3287 rpsE rplR TRUE 0.998 15.000 0.814 0.012 Y NA
 5876673 5876674 EFER_3287 EFER_3288 rplR rplF TRUE 0.999 10.000 0.815 0.009 Y NA
 5876674 5876675 EFER_3288 EFER_3289 rplF rpsH TRUE 0.999 13.000 0.808 0.009 Y NA
 5876675 5876676 EFER_3289 EFER_3290 rpsH rpsN TRUE 0.983 34.000 0.473 0.009 Y NA
 5876676 5876677 EFER_3290 EFER_3291 rpsN rplE TRUE 0.997 15.000 0.496 0.009 Y NA
 5876677 5876678 EFER_3291 EFER_3292 rplE rplX TRUE 0.998 15.000 0.758 0.009 Y NA
 5876678 5876679 EFER_3292 EFER_3293 rplX rplN TRUE 0.999 11.000 0.810 0.012 Y NA
 5876679 5876680 EFER_3293 EFER_3294 rplN rpsQ TRUE 0.884 165.000 0.791 0.012 Y NA
 5876680 5876681 EFER_3294 EFER_3295 rpsQ rpmC TRUE 0.999 0.000 0.828 0.009 Y NA
 5876681 5876682 EFER_3295 EFER_3296 rpmC rplP TRUE 0.999 0.000 0.802 0.009 Y NA
 5876682 5876683 EFER_3296 EFER_3297 rplP rpsC TRUE 0.999 13.000 0.828 0.012 Y NA
 5876683 5876684 EFER_3297 EFER_3298 rpsC rplV TRUE 0.997 18.000 0.719 0.012 Y NA
 5876684 5876685 EFER_3298 EFER_3299 rplV rpsS TRUE 0.998 15.000 0.769 0.012 Y NA
 5876685 5876686 EFER_3299 EFER_3300 rpsS rplB TRUE 0.998 17.000 0.820 0.012 Y NA
 5876686 5876687 EFER_3300 EFER_3301 rplB rplW TRUE 0.998 18.000 0.849 0.012 Y NA
 5876687 5876688 EFER_3301 EFER_3302 rplW rplD TRUE 0.998 -3.000 0.513 0.009 Y NA
 5876688 5876689 EFER_3302 EFER_3303 rplD rplC TRUE 0.998 11.000 0.486 0.009 Y NA
 5876689 5876690 EFER_3303 EFER_3304 rplC rpsJ TRUE 0.974 33.000 0.307 0.012 Y NA
 5876692 5876693 EFER_3307 EFER_3308 bfr bfd TRUE 0.556 73.000 0.033 NA Y NA
 5876693 5876694 EFER_3308 EFER_3309 bfd tufA FALSE 0.017 183.000 0.007 NA N NA
 5876694 5876695 EFER_3309 EFER_3310 tufA fusA TRUE 0.941 71.000 0.400 0.001 Y NA
 5876695 5876696 EFER_3310 EFER_3311 fusA rpsG TRUE 0.899 97.000 0.579 1.000 Y NA
 5876696 5876697 EFER_3311 EFER_3312 rpsG rpsL TRUE 0.949 97.000 0.620 0.002 Y NA
 5876697 5876698 EFER_3312 EFER_3313 rpsL tusB FALSE 0.112 126.000 0.058 NA N NA
 5876698 5876699 EFER_3313 EFER_3314 tusB tusC TRUE 0.999 8.000 0.804 NA Y NA
 5876699 5876700 EFER_3314 EFER_3315 tusC tusD TRUE 0.999 0.000 0.790 NA Y NA
 5876700 5876701 EFER_3315 EFER_3316 tusD yheO TRUE 0.979 0.000 0.220 NA   NA
 5876701 5876702 EFER_3316 EFER_3317 yheO fkpA FALSE 0.282 167.000 0.310 NA   NA
 5876704 5876705 EFER_3319 EFER_3320 slyD yheV FALSE 0.184 95.000 0.060 NA   NA
 5876705 5876706 EFER_3320 EFER_3321 yheV kefB TRUE 0.989 10.000 0.400 NA   NA
 5876706 5876707 EFER_3321 EFER_3322 kefB kefG TRUE 0.997 0.000 0.927 1.000   NA
 5876708 5876709 EFER_3324 EFER_3325 yheS yheT TRUE 0.861 0.000 0.016 NA   NA
 5876709 5876710 EFER_3325 EFER_3326 yheT yheU TRUE 0.948 -6.000 0.222 NA   NA
 5876713 5876714 EFER_3329 EFER_misc_RNA_56 yhfA crpTic TRUE 0.763 15.000 0.000 NA   NA
 5876715 5876716 EFER_3330 EFER_3331 crp yhfK TRUE 0.601 39.000 0.111 NA   NA
 5876717 5876718 EFER_3332 EFER_3333 argD pabA TRUE 0.648 86.000 0.088 1.000 Y NA
 5876718 5876719 EFER_3333 EFER_3334 pabA fic FALSE 0.327 32.000 0.008 1.000 N NA
 5876719 5876720 EFER_3334 EFER_3335 fic yhfG TRUE 0.642 -10.000 0.000 NA   NA
 5876720 5876721 EFER_3335 EFER_3336 yhfG ppiA TRUE 0.590 105.000 0.364 NA   NA
 5876722 5876723 EFER_3337 EFER_3338 nirB nirD TRUE 0.997 -3.000 0.829 0.000 N NA
 5876723 5876724 EFER_3338 EFER_3339 nirD nirC TRUE 0.720 127.000 0.283 1.000 Y NA
 5876724 5876725 EFER_3339 EFER_3340 nirC cysG TRUE 0.651 19.000 0.000 1.000 N NA
 5876725 5876726 EFER_3340 EFER_3341 cysG yhfL FALSE 0.011 250.000 0.000 NA   NA
 5876727 5876728 EFER_3342 EFER_3343 yhfS yhfT TRUE 0.965 12.000 0.185 NA   NA
 5876728 5876729 EFER_3343 EFER_3344 yhfT yhfU TRUE 0.995 12.000 0.828 NA   NA
 5876729 5876730 EFER_3344 EFER_3345 yhfU php TRUE 0.985 11.000 0.312 1.000   NA
 5876730 5876731 EFER_3345 EFER_3346 php yhfW TRUE 0.938 -3.000 0.094 1.000   NA
 5876731 5876732 EFER_3346 EFER_3347 yhfW yhfX TRUE 0.994 0.000 0.625 NA N NA
 5876732 5876733 EFER_3347 EFER_3348 yhfX yhfY TRUE 0.508 84.000 0.233 NA   NA
 5876733 5876734 EFER_3348 EFER_3349 yhfY yhfZ TRUE 0.980 17.000 0.562 NA   NA
 5876734 5876735 EFER_3349 EFER_3350 yhfZ trpS FALSE 0.032 161.000 0.004 NA   NA
 5876735 5876736 EFER_3350 EFER_3351 trpS gph TRUE 0.896 -7.000 0.118 1.000   NA
 5876736 5876737 EFER_3351 EFER_3352 gph rpe TRUE 0.897 -7.000 0.120 1.000   NA
 5876737 5876738 EFER_3352 EFER_3353 rpe dam TRUE 0.718 18.000 0.040 1.000 N NA
 5876738 5876739 EFER_3353 EFER_3354 dam damX FALSE 0.419 117.000 0.234 NA   NA
 5876739 5876740 EFER_3354 EFER_3355 damX aroB FALSE 0.111 92.000 0.022 NA   NA
 5876740 5876741 EFER_3355 EFER_3356 aroB aroK TRUE 0.836 58.000 0.208 1.000 Y NA
 5876741 5876742 EFER_3356 EFER_3357 aroK hofQ FALSE 0.022 468.000 0.319 1.000 N NA
 5876742 5876743 EFER_3357 EFER_3358 hofQ   FALSE 0.425 -130.000 0.072 NA   NA
 5876743 5876744 EFER_3358 EFER_3359     TRUE 0.964 -10.000 0.444 NA   NA
 5876744 5876745 EFER_3359 EFER_3360     TRUE 0.776 -166.000 0.348 NA   NA
 5876745 5876746 EFER_3360 EFER_3361   yrfD TRUE 0.996 0.000 0.870 NA   NA
 5876749 5876750 EFER_3364 EFER_3365 igaA yrfG FALSE 0.425 65.000 0.122 1.000   NA
 5876750 5876751 EFER_3365 EFER_3366 yrfG hslR TRUE 0.921 11.000 0.056 1.000   NA
 5876751 5876752 EFER_3366 EFER_3367 hslR hslO TRUE 0.803 25.000 0.140 1.000 N NA
 5876754 5876755 EFER_3369 EFER_3370 pck   FALSE 0.099 116.000 0.000 NA   NA
 5876755 5876756 EFER_3370 EFER_3371     TRUE 0.629 58.000 0.250 NA   NA
 5876757 5876758 EFER_3372 EFER_3373 envZ ompR TRUE 0.997 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 5876759 5876760 EFER_3374 EFER_3375 greB yhgF TRUE 0.661 97.000 0.123 1.000 Y NA
 5876760 5876761 EFER_3375 EFER_3376 yhgF feoA FALSE 0.003 437.000 0.000 1.000 N NA
 5876761 5876762 EFER_3376 EFER_3377 feoA feoB TRUE 0.979 17.000 0.177 1.000 Y NA
 5876762 5876763 EFER_3377 EFER_3378 feoB yhgG TRUE 0.991 0.000 0.455 NA   NA
 5876763 5876764 EFER_3378 EFER_3379 yhgG yhgA FALSE 0.021 202.000 0.000 NA   NA
 5876766 5876767 EFER_3382 EFER_3383 gntX gntY FALSE 0.314 60.000 0.066 1.000   NA
 5876767 5876768 EFER_3383 EFER_3384 gntY gntT FALSE 0.006 317.000 0.000 1.000   NA
 5876769 5876770 EFER_3385 EFER_3386 malQ malP TRUE 0.995 10.000 0.137 0.015 Y NA
 5876772 5876773 EFER_3388 EFER_3389 rtcA rtcB TRUE 0.954 4.000 0.081 NA   NA
 5876775 5876776 EFER_3391 EFER_3392 glpR glpG TRUE 0.932 17.000 0.190 1.000   NA
 5876776 5876777 EFER_3392 EFER_3393 glpG glpE TRUE 0.836 45.000 0.405 1.000   NA
 5876779 5876780 EFER_3395 EFER_3396     TRUE 0.815 13.000 0.000 NA   NA
 5876780 5876781 EFER_3396 EFER_3397     FALSE 0.137 80.000 0.000 NA   NA
 5876781 5876782 EFER_3397 EFER_3398     FALSE 0.059 134.000 0.000 NA N NA
 5876782 5876783 EFER_3398 EFER_3399     TRUE 0.949 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5876783 5876784 EFER_3399 EFER_3400     TRUE 0.968 -58.000 0.500 1.000 Y NA
 5876784 5876785 EFER_3400 EFER_3401     TRUE 0.999 8.000 0.667 0.005 Y NA
 5876785 5876786 EFER_3401 EFER_3402     TRUE 0.940 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 5876786 5876787 EFER_3402 EFER_3403     TRUE 0.773 41.000 0.000 1.000 Y NA
 5876787 5876788 EFER_3403 EFER_3404   aufA FALSE 0.436 120.000 0.000 1.000 Y NA
 5876788 5876789 EFER_3404 EFER_3405 aufA glgP FALSE 0.002 490.000 0.000 1.000 N NA
 5876789 5876790 EFER_3405 EFER_3406 glgP glgA TRUE 0.977 20.000 0.228 1.000 Y NA
 5876790 5876791 EFER_3406 EFER_3407 glgA glgC TRUE 0.996 0.000 0.307 1.000 Y NA
 5876791 5876792 EFER_3407 EFER_3408 glgC glgX TRUE 0.985 16.000 0.228 1.000 Y NA
 5876792 5876793 EFER_3408 EFER_3409 glgX glgB TRUE 0.988 -3.000 0.020 0.002 Y NA
 5876793 5876794 EFER_3409 EFER_3410 glgB asd FALSE 0.008 271.000 0.000 1.000 N NA
 5876796 5876797 EFER_3412 EFER_3413 gntU gntK TRUE 0.986 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5876797 5876798 EFER_3413 EFER_3414 gntK gntR FALSE 0.066 139.000 0.000 1.000 N NA
 5876798 5876799 EFER_3414 EFER_3415 gntR yhhW FALSE 0.121 93.000 0.000 NA   NA
 5876799 5876800 EFER_3415 EFER_3416 yhhW yhhX TRUE 0.549 123.000 0.400 NA   NA
 5876800 5876801 EFER_3416 EFER_misc_RNA_57 yhhX ryhB FALSE 0.087 123.000 0.000 NA   NA
 5876802 5876803 EFER_3417 EFER_3418 yhhY yrhB FALSE 0.107 110.000 0.000 NA   NA
 5876806 5876807 EFER_3421 EFER_3422 ugpQ ugpC TRUE 0.918 -3.000 0.080 1.000 N NA
 5876807 5876808 EFER_3422 EFER_3423 ugpC ugpE TRUE 0.998 2.000 0.272 0.039 Y NA
 5876808 5876809 EFER_3423 EFER_3424 ugpE ugpA TRUE 0.996 -3.000 0.306 0.039 Y NA
 5876809 5876810 EFER_3424 EFER_3425 ugpA ugpB TRUE 0.954 98.000 0.793 0.039 Y NA
 5876810 5876811 EFER_3425 EFER_3426 ugpB   FALSE 0.015 233.000 0.000 1.000   NA
 5876811 5876812 EFER_3426 EFER_3427   livF FALSE 0.108 119.000 0.000 1.000   NA
 5876812 5876813 EFER_3427 EFER_3428 livF livG TRUE 0.999 2.000 0.967 0.013 Y NA
 5876813 5876814 EFER_3428 EFER_3429 livG livM TRUE 0.997 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 5876814 5876815 EFER_3429 EFER_3430 livM livH TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.039 Y NA
 5876815 5876816 EFER_3430 EFER_3431 livH livK TRUE 0.880 48.000 0.217 1.000 Y NA
 5876818 5876819 EFER_3433 EFER_3434 livJ rpoH FALSE 0.008 272.000 0.000 1.000 N NA
 5876819 5876820 EFER_3434 EFER_3435 rpoH ftsX FALSE 0.016 245.000 0.051 1.000 N NA
 5876820 5876821 EFER_3435 EFER_3436 ftsX ftsE TRUE 0.973 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 5876821 5876822 EFER_3436 EFER_3437 ftsE ftsY TRUE 0.982 3.000 0.117 0.070 N NA
 5876823 5876824 EFER_3438 EFER_3439 yhhF   FALSE 0.387 -133.000 0.063 NA   NA
 5876826 5876827 EFER_3441 EFER_3442 yhhN zntA TRUE 0.737 74.000 0.325 0.062   NA
 5876827 5876828 EFER_3442 EFER_3443 zntA   FALSE 0.353 37.000 0.000 NA   NA
 5876830 5876831 EFER_3445 EFER_3446 yhhQ dcrB TRUE 0.779 19.000 0.066 NA   NA
 5876833 5876834 EFER_3448 EFER_3449 yhhT   FALSE 0.003 392.000 0.000 NA   NA
 5876834 5876835 EFER_3449 EFER_3450     TRUE 0.575 61.000 0.222 NA   NA
 5876835 5876836 EFER_3450 EFER_3451     TRUE 0.552 40.000 0.093 NA   NA
 5876836 5876837 EFER_3451 EFER_3452     TRUE 0.965 -21.000 0.636 NA   NA
 5876837 5876838 EFER_3452 EFER_3453     TRUE 0.845 -211.000 0.170 1.000 Y NA
 5876838 5876839 EFER_3453 EFER_3454     TRUE 0.994 12.000 0.117 0.002 Y NA
 5876839 5876840 EFER_3454 EFER_3455     TRUE 0.992 5.000 0.422 NA   NA
 5876840 5876841 EFER_3455 EFER_3456     TRUE 0.953 -42.000 0.758 NA   NA
 5876841 5876842 EFER_3456 EFER_3457     TRUE 0.960 -43.000 0.368 NA Y NA
 5876842 5876843 EFER_3457 EFER_3458     TRUE 0.947 -9.000 0.297 NA   NA
 5876843 5876844 EFER_3458 EFER_3459     TRUE 0.976 4.000 0.167 NA   NA
 5876844 5876845 EFER_3459 EFER_3460     TRUE 0.945 -3.000 0.110 1.000   NA
 5876845 5876846 EFER_3460 EFER_3461     TRUE 0.779 -31.000 0.146 1.000   NA
 5876846 5876847 EFER_3461 EFER_3462     TRUE 0.979 -3.000 0.305 NA   NA
 5876847 5876848 EFER_3462 EFER_3463     TRUE 0.971 -7.000 0.422 NA   NA
 5876848 5876849 EFER_3463 EFER_3464     TRUE 0.996 -3.000 0.514 NA Y NA
 5876849 5876850 EFER_3464 EFER_3465     TRUE 0.992 15.000 0.397 NA Y NA
 5876850 5876851 EFER_3465 EFER_3466     TRUE 0.996 -3.000 0.486 1.000 Y NA
 5876851 5876852 EFER_3466 EFER_3467   acpT TRUE 0.946 2.000 0.073 1.000 N NA
 5876852 5876853 EFER_3467 EFER_3468 acpT nikR FALSE 0.249 40.000 0.010 1.000 N NA
 5876853 5876854 EFER_3468 EFER_3469 nikR   FALSE 0.109 104.000 0.000 1.000 N NA
 5876854 5876855 EFER_3469 EFER_3470     FALSE 0.004 340.000 0.000 1.000 N NA
 5876855 5876856 EFER_3470 EFER_3471     TRUE 0.815 25.000 0.150 1.000 N NA
 5876856 5876857 EFER_3471 EFER_3472     TRUE 0.996 -3.000 0.231 0.010 Y NA
 5876857 5876858 EFER_3472 EFER_3473     TRUE 0.965 47.000 0.444 0.014 Y NA
 5876858 5876859 EFER_3473 EFER_3474     TRUE 0.986 -7.000 0.273 1.000 Y NA
 5876859 5876860 EFER_3474 EFER_3475     TRUE 0.932 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 5876860 5876861 EFER_3475 EFER_3476     TRUE 0.972 31.000 0.429 1.000 Y NA
 5876862 5876863 EFER_3477 EFER_3478 yhhJ rbbA TRUE 0.996 0.000 0.500 0.004   NA
 5876863 5876864 EFER_3478 EFER_3479 rbbA yhiI TRUE 0.947 -3.000 0.049 0.075   NA
 5876865 5876866 EFER_3480 EFER_3481 yhiM siiEB FALSE 0.002 871.000 0.000 NA   NA
 5876866 5876867 EFER_3481 EFER_3482 siiEB siiCB TRUE 0.556 77.000 0.250 1.000   NA
 5876867 5876868 EFER_3482 EFER_3483 siiCB siiBB TRUE 0.988 -3.000 0.500 1.000 N NA
 5876868 5876869 EFER_3483 EFER_3484 siiBB siiDB TRUE 0.988 -19.000 0.417 0.062 Y NA
 5876873 5876874 EFER_3488 EFER_3489 uspA yhiP FALSE 0.011 244.000 0.000 1.000 N NA
 5876875 5876876 EFER_3490 EFER_3491 yhiQ prlC TRUE 0.959 8.000 0.098 NA   NA
 5876877 5876878 EFER_3492 EFER_3493 yhiR gor FALSE 0.348 72.000 0.100 1.000   NA
 5876878 5876879 EFER_3493 EFER_3494 gor   FALSE 0.048 159.000 0.000 NA   NA
 5876879 5876880 EFER_3494 EFER_3495     FALSE 0.276 -121.000 0.000 NA   NA
 5876880 5876881 EFER_3495 EFER_3496     TRUE 0.524 25.000 0.000 NA   NA
 5876881 5876882 EFER_3496 EFER_3497   arsR FALSE 0.011 246.000 0.000 NA   NA
 5876882 5876883 EFER_3497 EFER_3498 arsR arsB FALSE 0.197 55.000 0.000 1.000 N NA
 5876883 5876884 EFER_3498 EFER_3499 arsB arsC TRUE 0.971 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5876886 5876887 EFER_3501 EFER_3502   treF FALSE 0.012 243.000 0.000 NA   NA
 5876889 5876890 EFER_3504 EFER_3505   yhjD FALSE 0.396 -43.000 0.000 NA   NA
 5876890 5876891 EFER_3505 EFER_3506 yhjD yhjE FALSE 0.010 274.000 0.000 1.000   NA
 5876892 5876893 EFER_3507 EFER_3508 yhjG yhjH FALSE 0.131 67.000 0.000 NA N NA
 5876894 5876895 EFER_3509 EFER_3510 kdgK   FALSE 0.146 90.000 0.000 1.000   NA
 5876895 5876896 EFER_3510 EFER_3511     FALSE 0.252 -238.000 0.000 1.000   NA
 5876897 5876898 EFER_3512 EFER_3513 yhjJ dctA FALSE 0.041 222.000 0.088 1.000   NA
 5876898 5876899 EFER_3513 EFER_3514 dctA yhjK FALSE 0.304 169.000 0.229 0.075 N NA
 5876899 5876900 EFER_3514 EFER_3515 yhjK bcsC FALSE 0.213 115.000 0.088 1.000 N NA
 5876900 5876901 EFER_3515 EFER_3516 bcsC bcsZ TRUE 0.903 -18.000 0.263 1.000 N NA
 5876901 5876902 EFER_3516 EFER_3517 bcsZ bcsB TRUE 0.911 7.000 0.000 1.000   NA
 5876902 5876903 EFER_3517 EFER_3518 bcsB bcsA TRUE 0.969 11.000 0.000 0.001   NA
 5876903 5876904 EFER_3518 EFER_3519 bcsA yhjQ TRUE 0.989 -3.000 0.545 NA N NA
 5876904 5876905 EFER_3519 EFER_3520 yhjQ yhjR TRUE 0.988 12.000 0.464 NA   NA
 5876906 5876907 EFER_3521 EFER_3522 bcsE bcsF TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5876907 5876908 EFER_3522 EFER_3524 bcsF bcsG TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5876914 5876915 EFER_misc_RNA_58 EFER_3533 rdlD   FALSE 0.006 309.000 0.000 NA   NA
 5876918 5876919 EFER_3536 EFER_3537   dppF TRUE 0.490 43.000 0.022 0.069 N NA
 5876919 5876920 EFER_3537 EFER_3538 dppF dppD TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.001 Y NA
 5876920 5876921 EFER_3538 EFER_3539 dppD dppC TRUE 0.998 11.000 0.560 1.000 Y NA
 5876921 5876922 EFER_3539 EFER_3540 dppC dppB TRUE 0.999 10.000 0.779 0.039 Y NA
 5876922 5876923 EFER_3540 EFER_3541 dppB dppA TRUE 0.551 151.000 0.087 0.039 Y NA
 5876923 5876924 EFER_3541 EFER_misc_RNA_59 dppA rtt FALSE 0.002 701.000 0.000 NA   NA
 5876924 5876925 EFER_misc_RNA_59 EFER_tRNA58 rtt   FALSE 0.223 52.000 0.000 NA   NA
 5876925 5876926 EFER_tRNA58 EFER_3543   yhjW FALSE 0.122 92.000 0.000 NA   NA
 5876926 5876927 EFER_3543 EFER_3544 yhjW yhjX FALSE 0.086 184.000 0.000 0.062   NA
 5876927 5876928 EFER_3544 EFER_3545 yhjX yhjY FALSE 0.139 74.000 0.000 1.000 N NA
 5876929 5876930 EFER_3546 EFER_3547 tag yiaC FALSE 0.316 -115.000 0.028 1.000   NA
 5876932 5876933 EFER_3549 EFER_3550 yiaD   FALSE 0.257 46.000 0.029 1.000 N NA
 5876933 5876934 EFER_3550 EFER_3551     TRUE 0.495 100.000 0.263 NA   NA
 5876934 5876935 EFER_3551 EFER_3552     TRUE 0.951 -25.000 0.571 NA   NA
 5876935 5876936 EFER_3552 EFER_3553     TRUE 0.717 95.000 0.175 1.000 Y NA
 5876936 5876937 EFER_3553 EFER_3554   tiaE TRUE 0.863 22.000 0.167 1.000 N NA
 5876939 5876940 EFER_3556 EFER_3557   yiaG FALSE 0.010 250.000 0.000 1.000 N NA
 5876940 5876941 EFER_3557 EFER_3558 yiaG cspA FALSE 0.053 282.000 0.000 1.000 Y NA
 5876942 5876943 EFER_3559 EFER_3560   glyS FALSE 0.002 634.000 0.000 NA   NA
 5876943 5876944 EFER_3560 EFER_3561 glyS glyQ TRUE 0.999 10.000 0.651 0.000 Y NA
 5876944 5876945 EFER_3561 EFER_3562 glyQ ysaB FALSE 0.090 96.000 0.010 NA   NA
 5876947 5876948 EFER_3564 EFER_3565 yiaB xylB FALSE 0.241 131.000 0.143 NA   NA
 5876948 5876949 EFER_3565 EFER_3566 xylB xylA TRUE 0.619 64.000 0.034 1.000 Y NA
 5876952 5876953 EFER_3569 EFER_3570 malS avtA FALSE 0.080 176.000 0.085 1.000 N NA
 5876954 5876955 EFER_3571 EFER_3572 yiaI yiaJ TRUE 0.985 -3.000 0.400 1.000 N NA
 5876956 5876957 EFER_3573 EFER_3574 yiaK yiaL TRUE 0.813 12.000 0.000 NA N NA
 5876957 5876958 EFER_3574 EFER_3575 yiaL yiaM FALSE 0.430 118.000 0.000 NA Y NA
 5876958 5876959 EFER_3575 EFER_3576 yiaM yiaN TRUE 0.999 3.000 0.864 NA Y NA
 5876959 5876960 EFER_3576 EFER_3577 yiaN yiaO TRUE 0.971 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5876960 5876961 EFER_3577 EFER_3578 yiaO lyxK TRUE 0.986 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5876961 5876962 EFER_3578 EFER_3579 lyxK sgbH TRUE 0.998 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 5876962 5876963 EFER_3579 EFER_3580 sgbH sgbU TRUE 0.989 -7.000 0.360 1.000 Y NA
 5876963 5876964 EFER_3580 EFER_3581 sgbU sgbE TRUE 0.984 -6.000 0.200 1.000 Y NA
 5876965 5876966 EFER_3582 EFER_3583 aldB yiaY FALSE 0.231 201.000 0.032 0.046 Y NA
 5876966 5876967 EFER_3583 EFER_3584 yiaY selB FALSE 0.021 190.000 0.015 1.000 N NA
 5876967 5876968 EFER_3584 EFER_3585 selB selA TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.001 N NA
 5876968 5876969 EFER_3585 EFER_3586 selA yibF FALSE 0.114 98.000 0.040 NA N NA
 5876969 5876970 EFER_3586 EFER_3587 yibF yibH FALSE 0.263 69.000 0.081 NA N NA
 5876970 5876971 EFER_3587 EFER_3588 yibH yibI TRUE 0.994 3.000 0.556 NA   NA
 5876972 5876973 EFER_3589 EFER_3590   mtlA FALSE 0.196 57.000 0.000 NA   NA
 5876973 5876974 EFER_3590 EFER_3591 mtlA mtlD TRUE 0.802 95.000 0.292 1.000 Y NA
 5876974 5876975 EFER_3591 EFER_3592 mtlD mtlR TRUE 0.703 43.000 0.230 NA N NA
 5876977 5876978 EFER_3594 EFER_3595 yibL   FALSE 0.002 532.000 0.000 NA   NA
 5876978 5876979 EFER_3595 EFER_3596     FALSE 0.441 30.000 0.000 NA   NA
 5876979 5876980 EFER_3596 EFER_3597   lldP FALSE 0.003 428.000 0.000 1.000 N NA
 5876980 5876981 EFER_3597 EFER_3598 lldP lldR TRUE 0.995 0.000 0.652 1.000 N NA
 5876981 5876982 EFER_3598 EFER_3599 lldR lldD TRUE 0.979 -3.000 0.309 1.000 N NA
 5876982 5876983 EFER_3599 EFER_3600 lldD yibK FALSE 0.215 48.000 0.020 1.000 N NA
 5876984 5876985 EFER_3601 EFER_3602 cysE gpsA TRUE 0.688 80.000 0.429 1.000 N NA
 5876985 5876986 EFER_3602 EFER_3603 gpsA secB TRUE 0.977 0.000 0.206 1.000 N NA
 5876986 5876987 EFER_3603 EFER_3604 secB grxC FALSE 0.195 62.000 0.038 1.000 N NA
 5876987 5876988 EFER_3604 EFER_3605 grxC yibN TRUE 0.487 29.000 0.048 NA N NA
 5876989 5876990 EFER_3606 EFER_3607 gpmI envC TRUE 0.746 34.000 0.170 1.000 N NA
 5876990 5876991 EFER_3607 EFER_3608 envC yibQ TRUE 0.962 4.000 0.088 1.000   NA
 5876992 5876993 EFER_3609 EFER_3610 yibD hemN FALSE 0.004 325.000 0.000 NA N NA
 5876993 5876994 EFER_3610 EFER_3611 hemN yihI FALSE 0.079 189.000 0.107 NA   NA
 5876994 5876995 EFER_3611 EFER_misc_RNA_60 yihI csrC TRUE 0.902 4.000 0.000 NA   NA
 5876997 5876998 EFER_misc_RNA_61 EFER_3613 spf polA FALSE 0.060 148.000 0.000 NA   NA
 5877000 5877001 EFER_3615 EFER_3616   dsbA FALSE 0.043 165.000 0.000 NA   NA
 5877001 5877002 EFER_3616 EFER_3617 dsbA yihE TRUE 0.882 17.000 0.111 NA   NA
 5877002 5877003 EFER_3617 EFER_3618 yihE yihD FALSE 0.325 77.000 0.106 NA   NA
 5877004 5877005 EFER_3619 EFER_3620 mobA mobB TRUE 0.991 -3.000 0.064 0.002 Y NA
 5877006 5877007 EFER_5S_3 EFER_23S_3     FALSE 0.115 99.000 0.000 NA   NA
 5877007 5877008 EFER_23S_3 EFER_tRNA57     FALSE 0.031 184.000 0.000 NA   NA
 5877008 5877009 EFER_tRNA57 EFER_tRNA56     FALSE 0.284 43.000 0.000 NA   NA
 5877009 5877010 EFER_tRNA56 EFER_16S_3     FALSE 0.152 69.000 0.000 NA   NA
 5877010 5877011 EFER_16S_3 EFER_3631   hemG FALSE 0.004 377.000 0.000 NA   NA
 5877011 5877012 EFER_3631 EFER_3632 hemG trkH TRUE 0.988 12.000 0.455 1.000 N NA
 5877012 5877013 EFER_3632 EFER_3633 trkH yigZ TRUE 0.744 39.000 0.202 1.000   NA
 5877013 5877014 EFER_3633 EFER_3634 yigZ pepQ TRUE 0.967 0.000 0.127 1.000   NA
 5877015 5877016 EFER_3635 EFER_3636 fadB fadA TRUE 0.998 10.000 0.607 1.000 Y NA
 5877017 5877018 EFER_3637 EFER_3638   fre FALSE 0.009 270.000 0.000 NA   NA
 5877018 5877019 EFER_3638 EFER_3639 fre ubiD TRUE 0.803 46.000 0.090 NA Y NA
 5877021 5877022 EFER_3641 EFER_3642 tatD tatC TRUE 0.557 42.000 0.121 NA N NA
 5877022 5877023 EFER_3642 EFER_3643 tatC tatB TRUE 0.997 3.000 0.333 NA Y NA
 5877023 5877024 EFER_3643 EFER_3644 tatB tatA TRUE 0.995 4.000 0.188 1.000 Y NA
 5877024 5877025 EFER_3644 EFER_3645 tatA ubiB FALSE 0.166 79.000 0.032 1.000   NA
 5877025 5877026 EFER_3645 EFER_3646 ubiB yigP TRUE 0.987 -3.000 0.432 1.000   NA
 5877026 5877027 EFER_3646 EFER_3647 yigP ubiE TRUE 0.941 14.000 0.145 1.000   NA
 5877027 5877028 EFER_3647 EFER_3648 ubiE rmuC FALSE 0.155 95.000 0.047 NA   NA
 5877029 5877030 EFER_3649 EFER_3650     TRUE 0.538 24.000 0.000 1.000 N NA
 5877030 5877031 EFER_3650 EFER_3651     TRUE 0.780 -85.000 0.000 1.000 Y NA
 5877031 5877032 EFER_3651 EFER_3652     TRUE 0.565 25.000 0.000 1.000   NA
 5877032 5877033 EFER_3652 EFER_3653     TRUE 0.711 17.000 0.000 NA   NA
 5877033 5877034 EFER_3653 EFER_3654     TRUE 0.815 13.000 0.000 NA   NA
 5877038 5877039 EFER_3658 EFER_3659     FALSE 0.037 173.000 0.000 NA   NA
 5877039 5877040 EFER_3659 EFER_3660     TRUE 0.478 -27.000 0.000 NA   NA
 5877041 5877042 EFER_3661 EFER_3662     TRUE 0.898 3.000 0.000 1.000 N NA
 5877043 5877044 EFER_3663 EFER_3664     TRUE 0.846 12.000 0.000 NA   NA
 5877044 5877045 EFER_3664 EFER_3665     TRUE 0.565 25.000 0.000 1.000   NA
 5877045 5877046 EFER_3665 EFER_3666     FALSE 0.268 45.000 0.000 NA   NA
 5877046 5877047 EFER_3666 EFER_3667     TRUE 0.726 39.000 0.200 NA   NA
 5877047 5877048 EFER_3667 EFER_3668     TRUE 0.977 15.000 0.000 0.045 Y NA
 5877048 5877049 EFER_3668 EFER_3669     TRUE 0.625 57.000 0.008 1.000 Y NA
 5877049 5877050 EFER_3669 EFER_3670     FALSE 0.012 238.000 0.000 1.000 N NA
 5877053 5877054 EFER_3673 EFER_3674 yigM yigL FALSE 0.254 76.000 0.067 1.000   NA
 5877054 5877055 EFER_3674 EFER_3675 yigL pldB TRUE 0.994 8.000 0.524 1.000   NA
 5877056 5877057 EFER_3676 EFER_3677 rhtB   FALSE 0.080 159.000 0.062 NA   NA
 5877058 5877059 EFER_3678 EFER_3679 rhtC recQ FALSE 0.202 64.000 0.043 1.000 N NA
 5877059 5877060 EFER_3679 EFER_3680 recQ   FALSE 0.150 70.000 0.000 NA   NA
 5877060 5877061 EFER_3680 EFER_3681   pldA FALSE 0.241 49.000 0.000 NA   NA
 5877062 5877063 EFER_3682 EFER_3683 yigI rarD FALSE 0.446 52.000 0.099 NA   NA
 5877067 5877068 EFER_3687 EFER_3688 yigE   FALSE 0.134 83.000 0.000 NA   NA
 5877069 5877070 EFER_3689 EFER_3690 uvrD yigB FALSE 0.372 84.000 0.128 1.000   NA
 5877070 5877071 EFER_3690 EFER_3691 yigB xerC TRUE 0.989 0.000 0.367 1.000   NA
 5877071 5877072 EFER_3691 EFER_3692 xerC yigA TRUE 0.993 -3.000 0.714 NA   NA
 5877072 5877073 EFER_3692 EFER_3693 yigA dapF TRUE 0.961 -3.000 0.175 NA   NA
 5877073 5877074 EFER_3693 EFER_3694 dapF yifL FALSE 0.273 37.000 0.021 NA N NA
 5877075 5877076 EFER_3695 EFER_3696     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5877076 5877077 EFER_3696 EFER_3697   cyaY FALSE 0.173 63.000 0.000 NA   NA
 5877079 5877080 EFER_3700 EFER_3701 hemC hemD TRUE 0.996 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 5877080 5877081 EFER_3701 EFER_3702 hemD hemX TRUE 0.990 22.000 0.600 1.000 Y NA
 5877081 5877082 EFER_3702 EFER_3703 hemX hemY TRUE 0.993 3.000 0.144 1.000 Y NA
 5877082 5877083 EFER_3703 EFER_3704 hemY   FALSE 0.229 -207.000 0.000 NA   NA
 5877086 5877087 EFER_3706 EFER_tRNA55 aslB   FALSE 0.062 147.000 0.000 NA   NA
 5877087 5877088 EFER_tRNA55 EFER_tRNA54     FALSE 0.284 43.000 0.000 NA   NA
 5877088 5877089 EFER_tRNA54 EFER_tRNA53     TRUE 0.614 21.000 0.000 NA   NA
 5877089 5877090 EFER_tRNA53 EFER_tRNA52     FALSE 0.186 59.000 0.000 NA   NA
 5877090 5877091 EFER_tRNA52 EFER_3708   yifK FALSE 0.113 103.000 0.000 NA   NA
 5877091 5877092 EFER_3708 EFER_3709 yifK rffM FALSE 0.026 191.000 0.000 1.000 N NA
 5877092 5877093 EFER_3709 EFER_3710 rffM wzyE TRUE 0.972 3.000 0.126 1.000   NA
 5877093 5877094 EFER_3710 EFER_3711 wzyE rffT TRUE 0.993 -3.000 0.684 1.000   NA
 5877094 5877095 EFER_3711 EFER_3712 rffT wzxE TRUE 0.992 -3.000 0.605 1.000   NA
 5877095 5877096 EFER_3712 EFER_3713 wzxE rffA TRUE 0.983 2.000 0.218 1.000   NA
 5877096 5877097 EFER_3713 EFER_3714 rffA rffC TRUE 0.985 5.000 0.248 1.000   NA
 5877097 5877098 EFER_3714 EFER_3715 rffC rffH TRUE 0.823 -22.000 0.145 1.000   NA
 5877098 5877099 EFER_3715 EFER_3716 rffH rffG TRUE 0.997 19.000 0.739 0.002 Y NA
 5877099 5877100 EFER_3716 EFER_3717 rffG rffD TRUE 0.995 0.000 0.273 1.000 Y NA
 5877100 5877101 EFER_3717 EFER_3718 rffD rffE TRUE 0.995 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 5877101 5877102 EFER_3718 EFER_3719 rffE wzzE TRUE 0.974 56.000 0.677 0.004 Y NA
 5877102 5877103 EFER_3719 EFER_3720 wzzE rfe TRUE 0.999 12.000 0.735 0.004 Y NA
 5877103 5877104 EFER_3720 EFER_3721 rfe rho FALSE 0.014 228.000 0.000 1.000 N NA
 5877104 5877105 EFER_3721 EFER_3723 rho trxA FALSE 0.012 325.000 0.087 1.000 N NA
 5877106 5877107 EFER_3724 EFER_3725 rhlB gpp TRUE 0.494 136.000 0.406 1.000 N NA
 5877112 5877113 EFER_3730 EFER_3731 ilvA ilvD TRUE 0.992 3.000 0.106 1.000 Y NA
 5877113 5877114 EFER_3731 EFER_3732 ilvD ilvE TRUE 0.686 65.000 0.075 1.000 Y NA
 5877114 5877115 EFER_3732 EFER_3733 ilvE ilvM TRUE 0.913 20.000 0.205 1.000   NA
 5877115 5877116 EFER_3733 EFER_3734 ilvM ilvG TRUE 0.998 -3.000 0.943 0.001   NA
 5877116 5877117 EFER_3734 EFER_3735 ilvG ilvL FALSE 0.352 141.000 0.091 0.002   NA
 5877121 5877122 EFER_tRNA51 EFER_tRNA50     TRUE 0.890 9.000 0.000 NA   NA
 5877122 5877123 EFER_tRNA50 EFER_5S_2     FALSE 0.215 53.000 0.000 NA   NA
 5877123 5877124 EFER_5S_2 EFER_23S_2     FALSE 0.115 99.000 0.000 NA   NA
 5877124 5877125 EFER_23S_2 EFER_tRNA49     FALSE 0.025 195.000 0.000 NA   NA
 5877125 5877126 EFER_tRNA49 EFER_16S_2     FALSE 0.132 86.000 0.000 NA   NA
 5877127 5877128 EFER_3748 EFER_3749 purH purD TRUE 0.993 12.000 0.238 1.000 Y NA
 5877129 5877130 EFER_3750 EFER_3751 zraR zraS TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.068 Y NA
 5877132 5877133 EFER_3753 EFER_3754 yjaH hupA TRUE 0.981 13.000 0.375 NA   NA
 5877133 5877134 EFER_3754 EFER_3755 hupA yjaG FALSE 0.249 187.000 0.355 NA   NA
 5877134 5877135 EFER_3755 EFER_3756 yjaG nfi TRUE 0.490 43.000 0.086 NA   NA
 5877135 5877136 EFER_3756 EFER_3757 nfi hemE TRUE 0.876 10.000 0.028 1.000 N NA
 5877136 5877137 EFER_3757 EFER_3758 hemE nudC FALSE 0.354 40.000 0.040 1.000 N NA
 5877138 5877139 EFER_3759 EFER_3760 rsd thiC FALSE 0.013 233.000 0.000 1.000 N NA
 5877139 5877140 EFER_3760 EFER_3761 thiC thiE TRUE 0.994 0.000 0.063 0.004 Y NA
 5877140 5877141 EFER_3761 EFER_3762 thiE thiF TRUE 0.984 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 5877141 5877142 EFER_3762 EFER_3763 thiF thiS TRUE 0.988 -16.000 0.548 1.000 Y NA
 5877142 5877143 EFER_3763 EFER_3764 thiS thiG TRUE 0.991 2.000 0.087 1.000 Y NA
 5877143 5877144 EFER_3764 EFER_3765 thiG thiH TRUE 0.996 -3.000 0.277 0.004 Y NA
 5877145 5877146 EFER_3766 EFER_3767 rpoC rpoB TRUE 0.931 77.000 0.851 0.000   NA
 5877146 5877147 EFER_3767 EFER_3768 rpoB rplL FALSE 0.035 320.000 0.223 1.000   NA
 5877147 5877148 EFER_3768 EFER_3769 rplL rplJ TRUE 0.975 67.000 0.884 0.009 Y NA
 5877148 5877149 EFER_3769 EFER_3770 rplJ rplA FALSE 0.138 413.000 0.302 0.012 Y NA
 5877149 5877150 EFER_3770 EFER_3771 rplA rplK TRUE 0.999 4.000 0.838 0.012 Y NA
 5877150 5877151 EFER_3771 EFER_3772 rplK nusG TRUE 0.566 159.000 0.681 1.000 N NA
 5877151 5877152 EFER_3772 EFER_3773 nusG secE TRUE 0.997 2.000 0.843 1.000 N NA
 5877152 5877153 EFER_3773 EFER_3774 secE tufB FALSE 0.010 230.000 0.009 1.000 N NA
 5877153 5877154 EFER_3774 EFER_tRNA48 tufB   FALSE 0.100 115.000 0.000 NA   NA
 5877154 5877155 EFER_tRNA48 EFER_tRNA47     TRUE 0.897 7.000 0.000 NA   NA
 5877155 5877156 EFER_tRNA47 EFER_tRNA46     FALSE 0.097 117.000 0.000 NA   NA
 5877156 5877157 EFER_tRNA46 EFER_tRNA45     TRUE 0.890 9.000 0.000 NA   NA
 5877159 5877160 EFER_3778 EFER_3779 birA murB TRUE 0.967 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5877160 5877161 EFER_3779 EFER_5S_1 murB   FALSE 0.071 135.000 0.000 NA   NA
 5877161 5877162 EFER_5S_1 EFER_23S_1     FALSE 0.115 99.000 0.000 NA   NA
 5877162 5877163 EFER_23S_1 EFER_tRNA44     FALSE 0.025 195.000 0.000 NA   NA
 5877163 5877164 EFER_tRNA44 EFER_16S_1     FALSE 0.132 86.000 0.000 NA   NA
 5877164 5877165 EFER_16S_1 EFER_3792   murI FALSE 0.004 373.000 0.000 NA   NA
 5877165 5877166 EFER_3792 EFER_3793 murI btuB FALSE 0.336 -55.000 0.025 1.000 N NA
 5877168 5877169 EFER_3796 EFER_3797 yijD fabR TRUE 0.976 0.000 0.194 NA   NA
 5877169 5877170 EFER_3797 EFER_3798 fabR   FALSE 0.109 104.000 0.000 1.000 N NA
 5877170 5877171 EFER_3798 EFER_3799     FALSE 0.308 44.000 0.000 1.000   NA
 5877175 5877176 EFER_3803 EFER_3804 argH argB TRUE 0.609 61.000 0.017 1.000 Y NA
 5877176 5877177 EFER_3804 EFER_3805 argB argC TRUE 0.994 11.000 0.097 0.002 Y NA
 5877178 5877179 EFER_3806 EFER_3807 argE ppc FALSE 0.007 346.000 0.053 1.000 N NA
 5877179 5877180 EFER_3807 EFER_3808 ppc yijP FALSE 0.028 197.000 0.000 1.000   NA
 5877180 5877181 EFER_3808 EFER_3809 yijP yijO FALSE 0.051 230.000 0.130 1.000   NA
 5877182 5877183 EFER_3810 EFER_3811 frwD pflC TRUE 0.973 2.000 0.156 1.000 N NA
 5877183 5877184 EFER_3811 EFER_3812 pflC pflD TRUE 0.935 -34.000 0.312 0.003 N NA
 5877184 5877185 EFER_3812 EFER_3813 pflD frwB TRUE 0.702 51.000 0.280 1.000 N NA
 5877185 5877186 EFER_3813 EFER_3814 frwB frwC TRUE 0.998 11.000 0.400 0.010 Y NA
 5877187 5877188 EFER_3815 EFER_3816 ptsA fsaB TRUE 0.977 12.000 0.000 1.000 Y NA
 5877188 5877189 EFER_3816 EFER_3817 fsaB gldA TRUE 0.993 11.000 0.600 1.000 N NA
 5877189 5877190 EFER_3817 EFER_3818 gldA yijF FALSE 0.093 119.000 0.000 NA   NA
 5877191 5877192 EFER_3819 EFER_3820 yijE katG FALSE 0.113 94.000 0.012 1.000   NA
 5877192 5877193 EFER_3820 EFER_3821 katG metF FALSE 0.004 328.000 0.010 1.000 N NA
 5877194 5877195 EFER_3822 EFER_3823     FALSE 0.223 52.000 0.000 NA   NA
 5877196 5877197 EFER_3824 EFER_3825   glyAB FALSE 0.306 -60.000 0.019 1.000 N NA
 5877197 5877198 EFER_3825 EFER_3826 glyAB   FALSE 0.370 36.000 0.000 NA   NA
 5877198 5877199 EFER_3826 EFER_3827     FALSE 0.252 -145.000 0.000 NA   NA
 5877203 5877204 EFER_3831 EFER_3832 metL metB TRUE 0.998 3.000 0.428 1.000 Y NA
 5877205 5877206 EFER_3833 EFER_3834 metJ yiiX FALSE 0.183 60.000 0.000 NA   NA
 5877206 5877207 EFER_3834 EFER_3835 yiiX   TRUE 0.902 4.000 0.000 NA   NA
 5877209 5877210 EFER_3837 EFER_3838 priA cytR FALSE 0.038 156.000 0.013 1.000 N NA
 5877210 5877211 EFER_3838 EFER_3839 cytR ftsN FALSE 0.463 94.000 0.245 NA N NA
 5877211 5877212 EFER_3839 EFER_3840 ftsN hslV FALSE 0.292 93.000 0.122 NA N NA
 5877212 5877213 EFER_3840 EFER_3841 hslV hslU TRUE 0.999 10.000 0.752 1.000 Y NA
 5877213 5877214 EFER_3841 EFER_3842 hslU menA FALSE 0.211 67.000 0.051 1.000 N NA
 5877214 5877215 EFER_3842 EFER_3843 menA rraA TRUE 0.693 93.000 0.158 NA Y NA
 5877216 5877217 EFER_3844 EFER_3845 yiiU   FALSE 0.117 90.000 0.023 NA   NA
 5877218 5877219 EFER_3846 EFER_3847 glpF glpK FALSE 0.463 23.000 0.004 1.000 N NA
 5877219 5877220 EFER_3847 EFER_3848 glpK glpX FALSE 0.093 113.000 0.025 1.000 N NA
 5877220 5877221 EFER_3848 EFER_3849 glpX fpr FALSE 0.293 97.000 0.117 1.000 N NA
 5877222 5877223 EFER_3850 EFER_3851 yiiT   TRUE 0.467 28.000 0.000 NA   NA
 5877223 5877224 EFER_3851 EFER_3852   yiiR FALSE 0.073 134.000 0.000 NA   NA
 5877225 5877226 EFER_3853 EFER_3854 yiiQ tpiA FALSE 0.167 108.000 0.058 NA   NA
 5877227 5877228 EFER_3855 EFER_3856 cdh sbp FALSE 0.398 62.000 0.115 1.000 N NA
 5877228 5877229 EFER_3856 EFER_3857 sbp pfkA FALSE 0.066 157.000 0.049 1.000 N NA
 5877229 5877230 EFER_3857 EFER_3858 pfkA fieF FALSE 0.038 181.000 0.040 1.000 N NA
 5877230 5877231 EFER_3858 EFER_3859 fieF cpxP FALSE 0.306 150.000 0.031 NA Y NA
 5877232 5877233 EFER_3860 EFER_3861 cpxR cpxA TRUE 0.998 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 5877234 5877235 EFER_3862 EFER_3863 yiiM sodA FALSE 0.404 70.000 0.129 1.000   NA
 5877237 5877238 EFER_3865 EFER_3866 rhaR rhaS TRUE 0.991 33.000 0.800 0.014 Y NA
 5877239 5877240 EFER_3867 EFER_3868 rhaB rhaA TRUE 0.995 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 5877240 5877241 EFER_3868 EFER_3869 rhaA rhaD TRUE 0.798 83.000 0.247 1.000 Y NA
 5877241 5877242 EFER_3869 EFER_3870 rhaD   TRUE 0.828 24.000 0.041 0.006 N NA
 5877242 5877243 EFER_3870 EFER_3871   yiiL TRUE 0.901 -3.000 0.063 NA   NA
 5877243 5877244 EFER_3871 EFER_3872 yiiL frvA FALSE 0.006 302.000 0.000 NA   NA
 5877244 5877245 EFER_3872 EFER_3873 frvA frvB TRUE 0.999 11.000 0.667 0.010 Y NA
 5877245 5877246 EFER_3873 EFER_3874 frvB frvX TRUE 0.993 -10.000 0.667 NA Y NA
 5877246 5877247 EFER_3874 EFER_3875 frvX frvR TRUE 0.989 0.000 0.400 NA N NA
 5877247 5877248 EFER_3875 EFER_3876 frvR   FALSE 0.114 116.000 0.000 1.000   NA
 5877249 5877250 EFER_3877 EFER_3878 yiiG yiiG FALSE 0.022 199.000 0.000 NA   NA
 5877250 5877251 EFER_3878 EFER_3879 yiiG   FALSE 0.024 196.000 0.000 NA   NA
 5877251 5877252 EFER_3879 EFER_3880   htpG TRUE 0.996 2.000 0.727 1.000   NA
 5877252 5877253 EFER_3880 EFER_3881 htpG fdhD FALSE 0.006 311.000 0.000 1.000 N NA
 5877254 5877255 EFER_3882 EFER_3884 fdoG fdoH TRUE 0.999 13.000 0.833 0.001 Y NA
 5877255 5877256 EFER_3884 EFER_3885 fdoH fdoI TRUE 0.999 -3.000 0.944 0.001 Y NA
 5877256 5877257 EFER_3885 EFER_3886 fdoI fdhE TRUE 0.959 -3.000 0.182 NA N NA
 5877258 5877259 EFER_3887 EFER_3888 yiiE   FALSE 0.003 388.000 0.000 NA   NA
 5877259 5877260 EFER_3888 EFER_3890     FALSE 0.004 359.000 0.000 NA   NA
 5877260 5877261 EFER_3890 EFER_3891   yiiD TRUE 0.815 13.000 0.000 NA   NA
 5877261 5877262 EFER_3891 EFER_3892 yiiD dtd TRUE 0.912 -3.000 0.065 1.000   NA
 5877262 5877263 EFER_3892 EFER_3893 dtd rbn TRUE 0.917 -3.000 0.069 1.000   NA
 5877263 5877264 EFER_3893 EFER_3894 rbn yihX TRUE 0.774 -6.000 0.000 1.000   NA
 5877265 5877266 EFER_3895 EFER_3896     TRUE 0.973 1.000 0.158 NA   NA
 5877266 5877267 EFER_3896 EFER_3897     TRUE 0.742 -7.000 0.000 1.000   NA
 5877267 5877268 EFER_3897 EFER_3898     TRUE 0.584 -19.000 0.000 1.000   NA
 5877268 5877269 EFER_3898 EFER_3899     TRUE 0.992 -3.000 0.633 NA   NA
 5877269 5877270 EFER_3899 EFER_3900     TRUE 0.927 -3.000 0.087 NA   NA
 5877272 5877273 EFER_3902 EFER_3903   glnA FALSE 0.080 128.000 0.000 NA   NA
 5877273 5877274 EFER_3903 EFER_3904 glnA glnL FALSE 0.052 174.000 0.053 1.000 N NA
 5877274 5877275 EFER_3904 EFER_3905 glnL glnG TRUE 0.998 12.000 0.587 0.058 Y NA
 5877276 5877277 EFER_3906 EFER_3907 tdh kbl TRUE 0.993 10.000 0.547 1.000 N NA
 5877278 5877279 EFER_3908 EFER_3909 waaD waaF TRUE 0.992 10.000 0.146 1.000 Y NA
 5877279 5877280 EFER_3909 EFER_3910 waaF waaC TRUE 0.998 4.000 0.205 0.001 Y NA
 5877280 5877281 EFER_3910 EFER_3911 waaC rfaL TRUE 0.786 39.000 0.036 NA Y NA
 5877282 5877283 EFER_3912 EFER_3913 rfaK waaZ TRUE 0.617 53.000 0.214 NA   NA
 5877283 5877284 EFER_3913 EFER_3914 waaZ waaY TRUE 0.502 72.000 0.214 NA   NA
 5877284 5877285 EFER_3914 EFER_3915 waaY waaJ TRUE 0.965 18.000 0.375 1.000   NA
 5877285 5877286 EFER_3915 EFER_3916 waaJ waaI TRUE 0.990 40.000 0.833 0.001 Y NA
 5877286 5877287 EFER_3916 EFER_3917 waaI waaB TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5877289 5877290 EFER_3919 EFER_3920 waaB   FALSE 0.093 119.000 0.000 NA   NA
 5877290 5877291 EFER_3920 EFER_3921   waaP TRUE 0.947 13.000 0.000 0.004   NA
 5877291 5877292 EFER_3921 EFER_3922 waaP waaG TRUE 0.742 -7.000 0.000 1.000   NA
 5877292 5877293 EFER_3922 EFER_3923 waaG waaQ TRUE 0.983 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 5877294 5877295 EFER_3924 EFER_3925 kdtA coaD TRUE 0.876 8.000 0.020 1.000 N NA
 5877296 5877297 EFER_3926 EFER_3927 mutM rpmG FALSE 0.122 98.000 0.034 1.000 N NA
 5877297 5877298 EFER_3927 EFER_3928 rpmG rpmB TRUE 0.990 21.000 0.332 0.009 Y NA
 5877298 5877299 EFER_3928 EFER_3929 rpmB yicR FALSE 0.011 217.000 0.002 1.000 N NA
 5877300 5877301 EFER_3930 EFER_3931 dfp dut TRUE 0.866 -19.000 0.201 1.000 N NA
 5877301 5877302 EFER_3931 EFER_3932 dut ttk FALSE 0.170 107.000 0.060 1.000 N NA
 5877303 5877304 EFER_3933 EFER_3934   pyrE FALSE 0.008 286.000 0.000 1.000   NA
 5877304 5877305 EFER_3934 EFER_3935 pyrE rph FALSE 0.143 66.000 0.022 1.000 N NA
 5877306 5877307 EFER_3936 EFER_3937 yicC yicG FALSE 0.011 251.000 0.000 NA   NA
 5877308 5877309 EFER_3938 EFER_3939 ligB ligB FALSE 0.284 43.000 0.000 NA   NA
 5877310 5877311 EFER_3940 EFER_3941 gmk rpoZ TRUE 0.797 55.000 0.471 1.000 N NA
 5877311 5877312 EFER_3941 EFER_3942 rpoZ spoT TRUE 0.983 19.000 0.291 1.000 Y NA
 5877312 5877313 EFER_3942 EFER_3943 spoT trmH TRUE 0.959 7.000 0.095 1.000 N NA
 5877313 5877314 EFER_3943 EFER_3944 trmH recG TRUE 0.948 6.000 0.076 1.000 N NA
 5877315 5877316 EFER_3945 EFER_3946   gltS TRUE 0.941 3.000 0.062 NA   NA
 5877317 5877318 EFER_3947 EFER_3948 yicE yicH FALSE 0.419 122.000 0.257 NA   NA
 5877319 5877320 EFER_3949 EFER_3950 yicI yicJ TRUE 0.983 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5877321 5877322 EFER_tRNA35 EFER_3951     FALSE 0.335 -72.000 0.000 NA   NA
 5877322 5877323 EFER_3951 EFER_3952     FALSE 0.026 193.000 0.000 NA   NA
 5877323 5877324 EFER_3952 EFER_3953   yicL FALSE 0.086 124.000 0.000 NA   NA
 5877324 5877325 EFER_3953 EFER_3954 yicL yicS FALSE 0.146 114.000 0.054 NA   NA
 5877327 5877328 EFER_3956 EFER_3957     TRUE 0.999 13.000 0.889 0.010 Y NA
 5877328 5877329 EFER_3957 EFER_3958     TRUE 0.994 0.000 0.222 1.000 Y NA
 5877329 5877330 EFER_3958 EFER_3959     TRUE 0.963 -18.000 0.200 1.000 Y NA
 5877330 5877331 EFER_3959 EFER_3960     TRUE 0.703 187.000 0.421 0.010 Y NA
 5877334 5877335 EFER_3963 EFER_3964 uhpT uhpC TRUE 0.506 138.000 0.000 0.038 Y NA
 5877335 5877336 EFER_3964 EFER_3965 uhpC uhpB TRUE 0.951 10.000 0.000 0.060 N NA
 5877336 5877337 EFER_3965 EFER_3966 uhpB uhpA TRUE 0.991 0.000 0.000 0.011 Y NA
 5877337 5877338 EFER_3966 EFER_3967 uhpA ilvN FALSE 0.375 73.000 0.118 1.000   NA
 5877338 5877339 EFER_3967 EFER_3968 ilvN ilvB TRUE 0.998 4.000 0.649 0.001   NA
 5877339 5877340 EFER_3968 EFER_4508 ilvB ivbL FALSE 0.426 106.000 0.216 NA   NA
 5877340 5877341 EFER_4508 EFER_misc_RNA_64 ivbL istR FALSE 0.077 130.000 0.000 NA   NA
 5877344 5877345 EFER_3972 EFER_3973 dsdX dsdA TRUE 0.962 18.000 0.083 1.000 Y NA
 5877346 5877347 EFER_3974 EFER_3975   yidG TRUE 0.984 13.000 0.429 NA   NA
 5877347 5877348 EFER_3975 EFER_3976 yidG yidH TRUE 0.939 -34.000 0.571 NA   NA
 5877348 5877349 EFER_3976 EFER_3977 yidH   FALSE 0.005 320.000 0.000 NA   NA
 5877349 5877350 EFER_3977 EFER_3978     TRUE 0.996 0.000 0.309 1.000 Y NA
 5877352 5877353 EFER_3980 EFER_3981 yidE ibpB TRUE 0.788 14.000 0.000 NA   NA
 5877353 5877354 EFER_3981 EFER_3982 ibpB ibpA TRUE 0.676 73.000 0.099 NA Y NA
 5877358 5877359 EFER_3986 EFER_3987 dgoT dgoD FALSE 0.342 120.000 0.192 1.000 N NA
 5877359 5877360 EFER_3987 EFER_3988 dgoD dgoA TRUE 0.991 -3.000 0.385 0.045 N NA
 5877360 5877361 EFER_3988 EFER_3989 dgoA dgoK TRUE 0.994 -16.000 0.909 1.000 Y NA
 5877361 5877362 EFER_3989 EFER_3990 dgoK dgoR TRUE 0.993 -3.000 0.733 1.000 N NA
 5877364 5877365 EFER_3992 EFER_3993 yidA yidB FALSE 0.100 115.000 0.000 NA   NA
 5877365 5877366 EFER_3993 EFER_3994 yidB gyrB FALSE 0.042 166.000 0.000 NA   NA
 5877366 5877367 EFER_3994 EFER_3995 gyrB recF TRUE 0.977 29.000 0.249 0.002 Y NA
 5877367 5877368 EFER_3995 EFER_3996 recF dnaN TRUE 0.996 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5877368 5877369 EFER_3996 EFER_3997 dnaN dnaA TRUE 0.997 5.000 0.328 1.000 Y NA
 5877370 5877371 EFER_3999 EFER_4000 rpmH rnpA TRUE 0.988 17.000 0.787 1.000   NA
 5877371 5877372 EFER_4000 EFER_4001 rnpA yidD TRUE 0.932 -36.000 0.540 NA   NA
 5877372 5877373 EFER_4001 EFER_4002 yidD yidC TRUE 0.993 3.000 0.461 NA   NA
 5877373 5877374 EFER_4002 EFER_4003 yidC trmE FALSE 0.451 106.000 0.221 1.000   NA
 5877374 5877375 EFER_4003 EFER_4509 trmE tnaC FALSE 0.012 243.000 0.000 NA   NA
 5877375 5877376 EFER_4509 EFER_4004 tnaC tnaA FALSE 0.033 221.000 0.077 NA   NA
 5877376 5877377 EFER_4004 EFER_4005 tnaA tnaB TRUE 0.704 92.000 0.154 1.000 Y NA
 5877377 5877378 EFER_4005 EFER_4006 tnaB mdtL FALSE 0.060 133.000 0.000 NA N NA
 5877378 5877379 EFER_4006 EFER_4007 mdtL yidZ TRUE 0.927 -34.000 0.526 NA N NA
 5877379 5877380 EFER_4007 EFER_4008 yidZ   FALSE 0.152 148.000 0.114 NA N NA
 5877380 5877381 EFER_4008 EFER_4009   yieF TRUE 0.930 11.000 0.074 NA   NA
 5877382 5877383 EFER_4010 EFER_4011     TRUE 0.902 4.000 0.000 NA   NA
 5877383 5877384 EFER_4011 EFER_4012   yieG TRUE 0.476 46.000 0.091 NA   NA
 5877385 5877386 EFER_4013 EFER_4014 yieH yieI FALSE 0.159 67.000 0.000 NA   NA
 5877386 5877387 EFER_4014 EFER_4015 yieI   FALSE 0.241 49.000 0.000 NA   NA
 5877388 5877389 EFER_4016 EFER_4017 yieK yieL TRUE 0.874 15.000 0.080 1.000 N NA
 5877389 5877390 EFER_4017 EFER_4018 yieL bglH TRUE 0.983 0.000 0.267 1.000 N NA
 5877390 5877391 EFER_4018 EFER_4019 bglH bglB TRUE 0.856 85.000 0.364 1.000 Y NA
 5877391 5877392 EFER_4019 EFER_4020 bglB bglF TRUE 0.992 19.000 0.562 1.000 Y NA
 5877392 5877393 EFER_4020 EFER_4021 bglF bglG TRUE 0.694 59.000 0.312 1.000   NA
 5877393 5877394 EFER_4021 EFER_4022 bglG phoU FALSE 0.007 286.000 0.000 NA   NA
 5877394 5877395 EFER_4022 EFER_4023 phoU pstB TRUE 0.990 15.000 0.317 NA Y NA
 5877395 5877396 EFER_4023 EFER_4024 pstB pstA TRUE 0.945 92.000 0.526 0.001 Y NA
 5877396 5877397 EFER_4024 EFER_4025 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.537 0.001 Y NA
 5877397 5877398 EFER_4025 EFER_4026 pstC pstS TRUE 0.846 86.000 0.145 0.001 Y NA
 5877398 5877399 EFER_4026 EFER_4027 pstS glmS FALSE 0.008 271.000 0.000 1.000 N NA
 5877399 5877400 EFER_4027 EFER_4028 glmS glmU FALSE 0.308 162.000 0.055 1.000 Y NA
 5877400 5877401 EFER_4028 EFER_4029 glmU   FALSE 0.008 276.000 0.000 NA   NA
 5877401 5877402 EFER_4029 EFER_4030   atpC FALSE 0.023 197.000 0.000 NA   NA
 5877402 5877403 EFER_4030 EFER_4031 atpC atpD TRUE 0.997 21.000 0.837 0.002 Y NA
 5877403 5877404 EFER_4031 EFER_4032 atpD atpG TRUE 0.994 27.000 0.724 0.002 Y NA
 5877404 5877405 EFER_4032 EFER_4033 atpG atpA TRUE 0.985 51.000 0.846 0.002 Y NA
 5877405 5877406 EFER_4033 EFER_4034 atpA atpH TRUE 0.999 13.000 0.864 0.002 Y NA
 5877406 5877407 EFER_4034 EFER_4035 atpH atpF TRUE 0.994 15.000 0.242 0.002 Y NA
 5877407 5877408 EFER_4035 EFER_4036 atpF atpE TRUE 0.970 62.000 0.666 0.002 Y NA
 5877408 5877409 EFER_4036 EFER_4037 atpE atpB TRUE 0.977 47.000 0.557 0.002 Y NA
 5877409 5877410 EFER_4037 EFER_4038 atpB atpI TRUE 0.998 9.000 0.291 0.002 Y NA
 5877410 5877411 EFER_4038 EFER_4039 atpI gidB FALSE 0.001 615.000 0.005 1.000 N NA
 5877411 5877412 EFER_4039 EFER_4040 gidB gidA TRUE 0.757 64.000 0.466 1.000 N NA
 5877412 5877413 EFER_4040 EFER_4041 gidA mioC FALSE 0.003 379.000 0.000 1.000 N NA
 5877413 5877414 EFER_4041 EFER_4042 mioC asnC FALSE 0.386 90.000 0.165 1.000 N NA
 5877416 5877417 EFER_4044 EFER_4045 yieM ravA TRUE 0.977 -6.000 0.443 NA   NA
 5877418 5877419 EFER_4046 EFER_4047 trkD rbsD FALSE 0.039 167.000 0.000 1.000 N NA
 5877419 5877420 EFER_4047 EFER_4048 rbsD rbsA TRUE 0.997 8.000 0.337 1.000 Y NA
 5877420 5877421 EFER_4048 EFER_4049 rbsA rbsC TRUE 0.998 5.000 0.504 1.000 Y NA
 5877421 5877422 EFER_4049 EFER_4050 rbsC rbsB TRUE 0.991 25.000 0.847 NA Y NA
 5877422 5877423 EFER_4050 EFER_4051 rbsB rbsK TRUE 0.761 126.000 0.347 NA Y NA
 5877423 5877424 EFER_4051 EFER_4052 rbsK rbsR TRUE 0.994 4.000 0.500 1.000 N NA
 5877426 5877427 EFER_16S_7 EFER_tRNA36     FALSE 0.132 86.000 0.000 NA   NA
 5877427 5877428 EFER_tRNA36 EFER_23S_7     FALSE 0.025 195.000 0.000 NA   NA
 5877428 5877429 EFER_23S_7 EFER_5S_8     FALSE 0.115 99.000 0.000 NA   NA
 5877431 5877432 EFER_4066 EFER_4067 metA aceB FALSE 0.008 269.000 0.000 1.000 N NA
 5877432 5877433 EFER_4067 EFER_4068 aceB aceA TRUE 0.940 30.000 0.043 0.001 Y NA
 5877433 5877434 EFER_4068 EFER_4069 aceA aceK FALSE 0.234 49.000 0.000 1.000 N NA
 5877434 5877435 EFER_4069 EFER_4070 aceK   TRUE 0.515 25.000 0.000 1.000 N NA
 5877437 5877438 EFER_4072 EFER_4073 metH   FALSE 0.209 54.000 0.000 NA   NA
 5877438 5877439 EFER_4073 EFER_4074     FALSE 0.284 43.000 0.000 NA   NA
 5877439 5877440 EFER_4074 EFER_4075   yjbB FALSE 0.038 171.000 0.000 NA   NA
 5877440 5877441 EFER_4075 EFER_4076 yjbB yaiL FALSE 0.246 48.000 0.000 NA   NA
 5877442 5877443 EFER_4077 EFER_4078     TRUE 0.683 54.000 0.286 1.000 N NA
 5877443 5877444 EFER_4078 EFER_4079     TRUE 0.986 -19.000 0.333 0.013 Y NA
 5877444 5877445 EFER_4079 EFER_4080     TRUE 0.931 68.000 0.400 0.013 Y NA
 5877445 5877446 EFER_4080 EFER_4081     TRUE 0.996 0.000 0.167 0.010 Y NA
 5877446 5877447 EFER_4081 EFER_4082     TRUE 0.944 10.000 0.083 1.000 N NA
 5877447 5877448 EFER_4082 EFER_4083     TRUE 0.917 13.000 0.091 1.000 N NA
 5877450 5877451 EFER_4085 EFER_4086 yjbD   FALSE 0.229 51.000 0.000 NA   NA
 5877454 5877455 EFER_4089 EFER_4090     TRUE 0.902 4.000 0.000 NA   NA
 5877455 5877456 EFER_4090 EFER_4091     TRUE 0.830 -3.000 0.026 NA   NA
 5877457 5877458 EFER_4092 EFER_4093     FALSE 0.017 214.000 0.000 NA   NA
 5877458 5877459 EFER_4093 EFER_4094     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5877459 5877460 EFER_4094 EFER_4095     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5877460 5877461 EFER_4095 EFER_4096     TRUE 0.940 -123.000 1.000 NA   NA
 5877461 5877462 EFER_4096 EFER_4097     TRUE 0.978 -22.000 1.000 NA   NA
 5877462 5877463 EFER_4097 EFER_4098     TRUE 0.902 -9.000 0.167 NA   NA
 5877463 5877464 EFER_4098 EFER_4099     FALSE 0.286 99.000 0.111 NA   NA
 5877464 5877465 EFER_4099 EFER_4100     TRUE 0.997 10.000 1.000 NA   NA
 5877465 5877466 EFER_4100 EFER_4101     TRUE 0.614 -12.000 0.000 NA   NA
 5877466 5877467 EFER_4101 EFER_4102     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5877467 5877468 EFER_4102 EFER_4103     TRUE 0.994 0.000 0.600 NA   NA
 5877468 5877469 EFER_4103 EFER_4104     TRUE 0.621 101.000 0.400 NA   NA
 5877469 5877470 EFER_4104 EFER_4105     TRUE 0.954 -40.000 0.750 NA   NA
 5877470 5877471 EFER_4105 EFER_4106     TRUE 0.520 51.000 0.133 NA   NA
 5877471 5877472 EFER_4106 EFER_4107     TRUE 0.965 0.000 0.133 NA   NA
 5877472 5877473 EFER_4107 EFER_4108     TRUE 0.975 -16.000 0.750 NA   NA
 5877473 5877474 EFER_4108 EFER_4109     TRUE 0.991 -3.000 0.600 NA   NA
 5877474 5877475 EFER_4109 EFER_4110     TRUE 0.573 118.000 0.400 NA   NA
 5877475 5877476 EFER_4110 EFER_4111     TRUE 0.990 13.000 0.600 NA   NA
 5877476 5877477 EFER_4111 EFER_4112     TRUE 0.904 -96.000 0.600 NA   NA
 5877479 5877480 EFER_4114 EFER_4115   lysC FALSE 0.080 139.000 0.000 1.000   NA
 5877483 5877484 EFER_4119 EFER_4120 yjbF yjbG TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 5877484 5877485 EFER_4120 EFER_4121 yjbG yjbH TRUE 0.967 0.000 0.140 NA   NA
 5877485 5877486 EFER_4121 EFER_4122 yjbH yjbA FALSE 0.090 121.000 0.000 NA   NA
 5877487 5877488 EFER_4123 EFER_4124 xylE malG FALSE 0.004 389.000 0.000 1.000   NA
 5877488 5877489 EFER_4124 EFER_4125 malG malF TRUE 0.999 13.000 0.814 0.037 Y NA
 5877489 5877490 EFER_4125 EFER_4126 malF malE FALSE 0.297 154.000 0.000 1.000 Y NA
 5877491 5877492 EFER_4127 EFER_4128 malK lamB TRUE 0.790 75.000 0.111 0.048 Y NA
 5877492 5877493 EFER_4128 EFER_4129 lamB malM FALSE 0.355 98.000 0.143 1.000   NA
 5877493 5877494 EFER_4129 EFER_4130 malM ubiC TRUE 0.806 13.000 0.025 NA   NA
 5877494 5877495 EFER_4130 EFER_4131 ubiC ubiA TRUE 0.991 13.000 0.248 NA Y NA
 5877497 5877498 EFER_4133 EFER_4134 dgkA lexA FALSE 0.309 110.000 0.141 1.000 N NA
 5877498 5877499 EFER_4134 EFER_4135 lexA dinF FALSE 0.150 73.000 0.033 1.000 N NA
 5877499 5877500 EFER_4135 EFER_4136 dinF yjbJ FALSE 0.067 132.000 0.021 NA   NA
 5877502 5877503 EFER_4138 EFER_4139 yjbN yjbO FALSE 0.132 135.000 0.070 NA   NA
 5877507 5877508 EFER_4143 EFER_4144 alr   TRUE 0.557 23.000 0.000 1.000 N NA
 5877508 5877509 EFER_4144 EFER_4145     TRUE 0.939 -24.000 0.143 NA Y NA
 5877509 5877510 EFER_4145 EFER_4146   tyrB FALSE 0.116 76.000 0.000 NA N NA
 5877510 5877511 EFER_4146 EFER_4147 tyrB sucA FALSE 0.107 110.000 0.000 NA   NA
 5877511 5877512 EFER_4147 EFER_4148 sucA sucA FALSE 0.244 -160.000 0.000 NA   NA
 5877512 5877513 EFER_4148 EFER_4149 sucA sucB FALSE 0.403 33.000 0.000 NA   NA
 5877513 5877514 EFER_4149 EFER_4150 sucB   TRUE 0.993 12.000 0.253 1.000 Y NA
 5877514 5877515 EFER_4150 EFER_4151   sucC TRUE 0.937 22.000 0.069 1.000 Y NA
 5877515 5877516 EFER_4151 EFER_4152 sucC sucD TRUE 0.999 13.000 0.806 0.001 Y NA
 5877516 5877517 EFER_4152 EFER_4153 sucD   FALSE 0.019 206.000 0.000 1.000 N NA
 5877517 5877518 EFER_4153 EFER_4154     TRUE 0.606 -126.000 0.156 1.000 N NA
 5877519 5877520 EFER_4155 EFER_4156 dctD   TRUE 0.984 -10.000 0.214 0.066 Y NA
 5877521 5877522 EFER_4157 EFER_4158 aphA yjbQ FALSE 0.080 111.000 0.009 NA   NA
 5877522 5877523 EFER_4158 EFER_4159 yjbQ yjbR TRUE 0.886 4.000 0.018 NA   NA
 5877526 5877527 EFER_4162 EFER_4163 yjcB soxS FALSE 0.026 193.000 0.000 NA   NA
 5877530 5877531 EFER_4165 EFER_4166 yjcD yjcE FALSE 0.167 157.000 0.130 1.000   NA
 5877533 5877534 EFER_4168 EFER_4169     TRUE 0.985 -10.000 0.857 NA   NA
 5877534 5877535 EFER_4169 EFER_4170   proP FALSE 0.007 281.000 0.000 NA   NA
 5877536 5877537 EFER_4171 EFER_4172 basS basR TRUE 0.988 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 5877537 5877538 EFER_4172 EFER_4173 basR eptA TRUE 0.773 -21.000 0.095 1.000   NA
 5877538 5877539 EFER_4173 EFER_4174 eptA adiY FALSE 0.129 105.000 0.000 1.000   NA
 5877539 5877540 EFER_4174 EFER_4175 adiY yjdF FALSE 0.003 406.000 0.000 NA   NA
 5877540 5877541 EFER_4175 EFER_4176 yjdF fumB FALSE 0.087 123.000 0.000 NA   NA
 5877541 5877542 EFER_4176 EFER_4177 fumB dcuB FALSE 0.159 78.000 0.000 1.000   NA
 5877542 5877543 EFER_4177 EFER_4178 dcuB dcuR FALSE 0.002 562.000 0.000 1.000   NA
 5877543 5877544 EFER_4178 EFER_4179 dcuR dcuS TRUE 0.990 -3.000 0.086 0.057 Y NA
 5877544 5877545 EFER_4179 EFER_4180 dcuS   FALSE 0.380 35.000 0.000 NA   NA
 5877546 5877547 EFER_4181 EFER_4182 dmsA   TRUE 0.995 14.000 0.500 NA Y NA
 5877547 5877548 EFER_4182 EFER_4183     TRUE 0.987 -7.000 0.800 NA   NA
 5877548 5877549 EFER_4183 EFER_4184     TRUE 0.993 4.000 0.444 1.000   NA
 5877549 5877550 EFER_4184 EFER_4185     FALSE 0.249 -147.000 0.000 NA   NA
 5877551 5877552 EFER_tRNA43 EFER_4187   yjdC FALSE 0.002 462.000 0.000 NA   NA
 5877552 5877553 EFER_4187 EFER_4188 yjdC dipZ TRUE 0.778 37.000 0.217 1.000   NA
 5877553 5877554 EFER_4188 EFER_4189 dipZ cutA TRUE 0.720 -24.000 0.092 1.000 N NA
 5877554 5877555 EFER_4189 EFER_4190 cutA dcuA FALSE 0.094 110.000 0.005 1.000   NA
 5877555 5877556 EFER_4190 EFER_4191 dcuA aspA FALSE 0.099 114.000 0.015 1.000   NA
 5877559 5877560 EFER_4194 EFER_4195 groS groL TRUE 0.977 44.000 0.631 0.066 Y NA
 5877560 5877561 EFER_4195 EFER_4196 groL yjeI FALSE 0.117 135.000 0.062 NA   NA
 5877562 5877563 EFER_4197 EFER_4198   yjeK FALSE 0.004 375.000 0.000 NA   NA
 5877564 5877565 EFER_4199 EFER_4200 efp ecnA FALSE 0.200 52.000 0.007 1.000   NA
 5877565 5877566 EFER_4200 EFER_4201 ecnA ecnB TRUE 0.654 111.000 0.212 0.000   NA
 5877566 5877567 EFER_4201 EFER_4202 ecnB sugE TRUE 0.701 26.000 0.074 1.000   NA
 5877568 5877569 EFER_4203 EFER_4204 blc ampC FALSE 0.113 89.000 0.022 1.000 N NA
 5877569 5877570 EFER_4204 EFER_4205 ampC frdD FALSE 0.154 63.000 0.022 1.000 N NA
 5877570 5877571 EFER_4205 EFER_4206 frdD frdC TRUE 0.999 11.000 0.787 0.002 Y NA
 5877571 5877572 EFER_4206 EFER_4207 frdC frdB TRUE 0.998 11.000 0.454 0.002 Y NA
 5877572 5877573 EFER_4207 EFER_4208 frdB frdA TRUE 0.996 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 5877574 5877575 EFER_4209 EFER_4210 poxA yjeM FALSE 0.011 218.000 0.009 1.000 N NA
 5877575 5877576 EFER_4210 EFER_4211 yjeM   FALSE 0.286 -102.000 0.000 NA   NA
 5877576 5877577 EFER_4211 EFER_4212   yjeO TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5877578 5877579 EFER_4213 EFER_4214 yjeP psd TRUE 0.850 22.000 0.148 1.000 N NA
 5877579 5877580 EFER_4214 EFER_4215 psd rsgA FALSE 0.280 97.000 0.095 1.000   NA
 5877583 5877584 EFER_tRNA37 EFER_tRNA38     FALSE 0.353 37.000 0.000 NA   NA
 5877584 5877585 EFER_tRNA38 EFER_tRNA39     FALSE 0.353 37.000 0.000 NA   NA
 5877587 5877588 EFER_4220 EFER_4221 yjeF yjeE TRUE 0.741 -28.000 0.118 NA   NA
 5877588 5877589 EFER_4221 EFER_4222 yjeE amiB TRUE 0.855 19.000 0.109 NA   NA
 5877589 5877590 EFER_4222 EFER_4223 amiB mutL TRUE 0.950 10.000 0.092 1.000 N NA
 5877590 5877591 EFER_4223 EFER_4224 mutL miaA TRUE 0.955 -7.000 0.188 0.066 N NA
 5877591 5877592 EFER_4224 EFER_4225 miaA hfq TRUE 0.746 86.000 0.531 1.000   NA
 5877592 5877593 EFER_4225 EFER_4226 hfq hflX FALSE 0.404 76.000 0.141 1.000   NA
 5877593 5877594 EFER_4226 EFER_4227 hflX hflK TRUE 0.587 86.000 0.184 0.059   NA
 5877594 5877595 EFER_4227 EFER_4228 hflK hflC TRUE 0.999 3.000 0.947 0.008 Y NA
 5877595 5877596 EFER_4228 EFER_4229 hflC yjeT TRUE 0.629 82.000 0.348 NA   NA
 5877596 5877597 EFER_4229 EFER_4230 yjeT purA FALSE 0.155 104.000 0.051 NA   NA
 5877597 5877598 EFER_4230 EFER_4231 purA nsrR FALSE 0.011 205.000 0.010 NA N NA
 5877598 5877599 EFER_4231 EFER_4232 nsrR rnr TRUE 0.789 39.000 0.038 NA Y NA
 5877599 5877600 EFER_4232 EFER_4233 rnr rlmB TRUE 0.537 91.000 0.147 0.013 N NA
 5877600 5877601 EFER_4233 EFER_4234 rlmB yjfI FALSE 0.057 127.000 0.002 NA   NA
 5877601 5877602 EFER_4234 EFER_4235 yjfI yjfJ TRUE 0.987 19.000 0.911 NA   NA
 5877602 5877603 EFER_4235 EFER_4236 yjfJ yjfK FALSE 0.080 166.000 0.071 NA   NA
 5877603 5877604 EFER_4236 EFER_4237 yjfK yjfL TRUE 0.963 18.000 0.379 NA   NA
 5877604 5877605 EFER_4237 EFER_4238 yjfL   TRUE 0.993 4.000 0.470 NA   NA
 5877605 5877606 EFER_4238 EFER_4239   yjfC TRUE 0.927 3.000 0.049 NA   NA
 5877606 5877607 EFER_4239 EFER_4240 yjfC aidB FALSE 0.389 66.000 0.133 NA N NA
 5877608 5877609 EFER_4241 EFER_4242 yjfN yjfO FALSE 0.220 184.000 0.300 NA   NA
 5877611 5877612 EFER_4244 EFER_4245 ulaR ulaG FALSE 0.215 108.000 0.071 1.000   NA
 5877613 5877614 EFER_4246 EFER_4247 ulaA ulaB TRUE 0.928 16.000 0.059 0.013   NA
 5877614 5877615 EFER_4247 EFER_4248 ulaB ulaC TRUE 0.995 10.000 0.115 0.009 Y NA
 5877615 5877616 EFER_4248 EFER_4249 ulaC ulaD TRUE 0.992 14.000 0.328 1.000 Y NA
 5877616 5877617 EFER_4249 EFER_4250 ulaD ulaE TRUE 0.995 10.000 0.250 1.000 Y NA
 5877617 5877618 EFER_4250 EFER_4251 ulaE ulaF TRUE 0.994 0.000 0.200 1.000 Y NA
 5877620 5877621 EFER_4253 EFER_4254 rpsF priB TRUE 0.966 7.000 0.122 1.000 N NA
 5877621 5877622 EFER_4254 EFER_4255 priB rpsR TRUE 0.969 5.000 0.128 1.000 N NA
 5877622 5877623 EFER_4255 EFER_4256 rpsR rplI TRUE 0.976 42.000 0.499 0.008 Y NA
 5877624 5877625 EFER_4257 EFER_4258     TRUE 0.678 53.000 0.000 1.000 Y NA
 5877625 5877626 EFER_4258 EFER_4259     TRUE 0.740 43.000 0.000 NA Y NA
 5877626 5877627 EFER_4259 EFER_4260     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA N NA
 5877627 5877628 EFER_4260 EFER_4261     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5877628 5877629 EFER_4261 EFER_4262     TRUE 0.996 10.000 0.200 0.044 Y NA
 5877629 5877630 EFER_4262 EFER_4263     TRUE 0.854 10.000 0.000 NA N NA
 5877630 5877631 EFER_4263 EFER_4264     TRUE 0.854 10.000 0.000 NA N NA
 5877634 5877635 EFER_4267 EFER_4268 fklB cycA FALSE 0.006 308.000 0.000 1.000 N NA
 5877636 5877637 EFER_4269 EFER_4270 ytfE ytfF FALSE 0.311 108.000 0.150 NA N NA
 5877637 5877638 EFER_4270 EFER_4271 ytfF ytfG TRUE 0.486 100.000 0.021 1.000 Y NA
 5877646 5877647 EFER_4279 EFER_4280   rpiB FALSE 0.388 68.000 0.125 NA   NA
 5877648 5877649 EFER_4281 EFER_4282 rpiR alsB TRUE 0.616 57.000 0.250 NA N NA
 5877649 5877650 EFER_4282 EFER_4283 alsB alsA TRUE 0.787 61.000 0.167 NA Y NA
 5877650 5877651 EFER_4283 EFER_4284 alsA alsC TRUE 0.837 -21.000 0.154 1.000   NA
 5877651 5877652 EFER_4284 EFER_4285 alsC alsE TRUE 0.988 11.000 0.385 1.000   NA
 5877652 5877653 EFER_4285 EFER_4286 alsE alsK TRUE 0.902 -31.000 0.081 1.000 Y NA
 5877653 5877654 EFER_4286 EFER_4287 alsK yjcS FALSE 0.014 228.000 0.000 1.000 N NA
 5877654 5877655 EFER_4287 EFER_4288 yjcS   FALSE 0.043 165.000 0.000 NA   NA
 5877655 5877656 EFER_4288 EFER_4289   yjcR TRUE 0.973 21.000 0.625 NA   NA
 5877656 5877657 EFER_4289 EFER_4290 yjcR   TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 5877657 5877658 EFER_4290 EFER_4291   yjcP TRUE 0.992 -3.000 0.625 NA   NA
 5877658 5877659 EFER_4291 EFER_4292 yjcP fdhF FALSE 0.027 198.000 0.000 1.000   NA
 5877659 5877660 EFER_4292 EFER_4294 fdhF yjcO FALSE 0.314 91.000 0.105 1.000   NA
 5877662 5877663 EFER_4296 EFER_4297 acs   TRUE 0.466 61.000 0.147 NA   NA
 5877663 5877664 EFER_4297 EFER_4298   actP TRUE 0.993 -3.000 0.733 NA   NA
 5877666 5877667 EFER_4300 EFER_4301 ytfM ytfN TRUE 0.991 -3.000 0.575 NA   NA
 5877667 5877668 EFER_4301 EFER_4302 ytfN ytfP TRUE 0.976 3.000 0.167 NA   NA
 5877668 5877669 EFER_4302 EFER_4303 ytfP   FALSE 0.057 150.000 0.000 NA   NA
 5877670 5877671 EFER_4304 EFER_4305 insG ppa FALSE 0.002 450.000 0.000 1.000 N NA
 5877672 5877673 EFER_4306 EFER_4307 ytfQ ytfR TRUE 0.885 133.000 0.804 NA Y NA
 5877673 5877674 EFER_4307 EFER_4308 ytfR ytfT TRUE 0.995 14.000 0.506 1.000 Y NA
 5877674 5877675 EFER_4308 EFER_4309 ytfT yjfF TRUE 0.996 -13.000 0.865 0.037 Y NA
 5877679 5877680 EFER_4313 EFER_4314 pmbA cybC FALSE 0.215 53.000 0.028 NA   NA
 5877682 5877683 EFER_4316 EFER_4317     TRUE 0.939 -88.000 0.875 NA N NA
 5877686 5877687 EFER_4320 EFER_4321 nrdD treC FALSE 0.003 394.000 0.000 1.000 N NA
 5877687 5877688 EFER_4321 EFER_4322 treC treB TRUE 0.958 51.000 0.650 1.000 Y NA
 5877688 5877689 EFER_4322 EFER_4323 treB treR FALSE 0.316 119.000 0.168 1.000 N NA
 5877689 5877690 EFER_4323 EFER_4324 treR   FALSE 0.101 123.000 0.000 1.000   NA
 5877690 5877691 EFER_4324 EFER_4325   yjgF FALSE 0.265 60.000 0.057 NA   NA
 5877691 5877692 EFER_4325 EFER_4326 yjgF pyrI FALSE 0.265 72.000 0.084 NA N NA
 5877692 5877693 EFER_4326 EFER_4327 pyrI pyrB TRUE 0.995 13.000 0.197 0.001 Y NA
 5877693 5877694 EFER_4327 EFER_4328 pyrB   FALSE 0.014 227.000 0.000 1.000 N NA
 5877694 5877695 EFER_4328 EFER_4329     FALSE 0.142 75.000 0.000 NA   NA
 5877695 5877696 EFER_4329 EFER_4330   arcB TRUE 0.548 24.000 0.000 NA   NA
 5877696 5877697 EFER_4330 EFER_4331 arcB arcC TRUE 0.996 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 5877697 5877698 EFER_4331 EFER_4332 arcC   TRUE 0.993 -13.000 0.750 1.000 Y NA
 5877704 5877705 EFER_4339 EFER_4340 valS holC TRUE 0.950 0.000 0.089 1.000 N NA
 5877705 5877706 EFER_4340 EFER_4341 holC   FALSE 0.163 66.000 0.000 NA   NA
 5877706 5877707 EFER_4341 EFER_4342   pepA TRUE 0.614 21.000 0.000 NA   NA
 5877708 5877709 EFER_4343 EFER_4344 yjgP yjgQ TRUE 0.997 0.000 0.631 0.058   NA
 5877710 5877711 EFER_4345 EFER_4346 ecfH yraO TRUE 0.994 10.000 0.613 NA   NA
 5877711 5877712 EFER_4346 EFER_4347 yraO yraN TRUE 0.898 20.000 0.187 1.000 N NA
 5877712 5877713 EFER_4347 EFER_4348 yraN yraM TRUE 0.775 -42.000 0.172 1.000   NA
 5877715 5877716 EFER_4350 EFER_4351 agaI agaD TRUE 0.990 1.000 0.080 1.000 Y NA
 5877716 5877717 EFER_4351 EFER_4352 agaD agaC TRUE 0.994 -10.000 0.444 0.009 Y NA
 5877717 5877718 EFER_4352 EFER_4353 agaC agaB TRUE 0.968 39.000 0.333 0.009 Y NA
 5877718 5877719 EFER_4353 EFER_4354 agaB kbaY FALSE 0.343 166.000 0.087 1.000 Y NA
 5877719 5877720 EFER_4354 EFER_4355 kbaY agaS TRUE 0.982 13.000 0.391 1.000 N NA
 5877720 5877721 EFER_4355 EFER_4356 agaS agaA FALSE 0.004 351.000 0.000 1.000 N NA
 5877721 5877722 EFER_4356 EFER_4357 agaA   TRUE 0.931 -24.000 0.104 1.000 Y NA
 5877722 5877723 EFER_4357 EFER_4358     TRUE 0.997 18.000 0.692 0.013 Y NA
 5877723 5877724 EFER_4358 EFER_4359     TRUE 0.994 -16.000 0.619 0.013 Y NA
 5877724 5877725 EFER_4359 EFER_4360   agaV TRUE 0.999 11.000 0.905 0.013 Y NA
 5877725 5877726 EFER_4360 EFER_4361 agaV kbaZ TRUE 0.974 23.000 0.280 1.000 Y NA
 5877728 5877729 EFER_4363 EFER_4364 yhaV sohA TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5877729 5877730 EFER_4364 EFER_4365 sohA garD FALSE 0.047 149.000 0.000 NA N NA
 5877731 5877732 EFER_4366 EFER_4367 garL garR TRUE 0.938 25.000 0.424 1.000 N NA
 5877737 5877738 EFER_4371 EFER_4372 yhaH yqjG FALSE 0.113 103.000 0.000 NA   NA
 5877738 5877739 EFER_4372 EFER_4373 yqjG yqjF FALSE 0.150 70.000 0.000 NA   NA
 5877739 5877740 EFER_4373 EFER_4374 yqjF yqjK FALSE 0.115 187.000 0.161 NA   NA
 5877740 5877741 EFER_4374 EFER_4375 yqjK yqjE TRUE 0.901 -10.000 0.185 NA   NA
 5877741 5877742 EFER_4375 EFER_4376 yqjE yqjD TRUE 0.979 3.000 0.185 NA   NA
 5877742 5877743 EFER_4376 EFER_4377 yqjD   TRUE 0.920 38.000 0.609 NA   NA
 5877743 5877744 EFER_4377 EFER_4378     TRUE 0.952 31.000 0.684 NA   NA
 5877744 5877745 EFER_4378 EFER_4379   yqjA TRUE 0.994 4.000 0.529 NA   NA
 5877745 5877746 EFER_4379 EFER_4380 yqjA   FALSE 0.374 -49.000 0.000 NA   NA
 5877746 5877747 EFER_4380 EFER_4381   exuR FALSE 0.011 249.000 0.000 NA   NA
 5877747 5877748 EFER_4381 EFER_4382 exuR exuT TRUE 0.568 125.000 0.433 1.000 N NA
 5877749 5877750 EFER_4383 EFER_4384 uxaC uxaA TRUE 0.976 15.000 0.092 1.000 Y NA
 5877750 5877751 EFER_4384 EFER_4386 uxaA ygjV FALSE 0.361 77.000 0.126 NA   NA
 5877752 5877753 EFER_4387 EFER_4389 sstT alx FALSE 0.018 208.000 0.000 1.000 N NA
 5877753 5877754 EFER_4389 EFER_misc_RNA_67 alx sraF TRUE 0.659 19.000 0.000 NA   NA
 5877754 5877755 EFER_misc_RNA_67 EFER_4390 sraF ygjR FALSE 0.140 77.000 0.000 NA   NA
 5877755 5877756 EFER_4390 EFER_4391 ygjR ygjQ FALSE 0.156 68.000 0.000 NA   NA
 5877756 5877757 EFER_4391 EFER_4392 ygjQ ygjQ TRUE 0.589 22.000 0.000 NA   NA
 5877757 5877758 EFER_4392 EFER_4393 ygjQ ygjP FALSE 0.140 77.000 0.000 NA   NA
 5877759 5877760 EFER_4394 EFER_4395 ygjO   FALSE 0.074 133.000 0.000 NA   NA
 5877761 5877762 EFER_4396 EFER_4397 mdoB yjjA FALSE 0.010 254.000 0.000 NA   NA
 5877762 5877763 EFER_4397 EFER_4398 yjjA dnaC TRUE 0.775 51.000 0.368 NA   NA
 5877763 5877764 EFER_4398 EFER_4399 dnaC dnaT TRUE 0.996 3.000 0.778 NA   NA
 5877764 5877765 EFER_4399 EFER_4400 dnaT   FALSE 0.151 96.000 0.046 NA   NA
 5877765 5877766 EFER_4400 EFER_4401   yjjP TRUE 0.982 -9.000 0.704 NA   NA
 5877767 5877768 EFER_4403 EFER_4404     FALSE 0.352 -43.000 0.020 1.000 N NA
 5877768 5877769 EFER_4404 EFER_4405     FALSE 0.193 218.000 0.000 0.013 Y NA
 5877769 5877770 EFER_4405 EFER_4406     TRUE 0.993 -42.000 0.889 0.013 Y NA
 5877773 5877774 EFER_tRNA42 EFER_tRNA41     FALSE 0.392 34.000 0.000 NA   NA
 5877774 5877775 EFER_tRNA41 EFER_tRNA40     FALSE 0.452 29.000 0.000 NA   NA
 5877775 5877776 EFER_tRNA40 EFER_4411     FALSE 0.003 435.000 0.000 NA   NA
 5877776 5877777 EFER_4411 EFER_4412   rsmC FALSE 0.003 414.000 0.000 NA   NA
 5877778 5877779 EFER_4413 EFER_4414 holD rimI TRUE 0.746 -31.000 0.121 1.000   NA
 5877779 5877780 EFER_4414 EFER_4415 rimI yjjG TRUE 0.765 15.000 0.018 1.000   NA
 5877780 5877781 EFER_4415 EFER_4416 yjjG   FALSE 0.004 386.000 0.000 1.000   NA
 5877782 5877783 EFER_4417 EFER_4418 flxA yfdR FALSE 0.002 713.000 0.000 NA   NA
 5877783 5877784 EFER_4418 EFER_4419 yfdR yfdQ FALSE 0.092 129.000 0.039 NA   NA
 5877784 5877785 EFER_4419 EFER_4420 yfdQ   TRUE 0.566 66.000 0.233 NA   NA
 5877785 5877786 EFER_4420 EFER_4421     FALSE 0.227 -220.000 0.000 NA   NA
 5877789 5877790 EFER_4424 EFER_4425   ymfL FALSE 0.330 -76.000 0.000 NA   NA
 5877790 5877791 EFER_4425 EFER_4426 ymfL ymfM TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5877791 5877792 EFER_4426 EFER_4428 ymfM   TRUE 0.881 10.000 0.000 NA   NA
 5877792 5877793 EFER_4428 EFER_4429   yfdN TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5877793 5877794 EFER_4429 EFER_4430 yfdN   FALSE 0.437 -33.000 0.000 NA   NA
 5877794 5877795 EFER_4430 EFER_4431   rusA TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 5877795 5877796 EFER_4431 EFER_4432 rusA   TRUE 0.986 20.000 1.000 NA   NA
 5877796 5877797 EFER_4432 EFER_4433     TRUE 0.996 2.000 0.667 NA   NA
 5877797 5877798 EFER_4433 EFER_4434   ydfT TRUE 0.715 14.000 0.002 NA   NA
 5877800 5877801 EFER_4436 EFER_4437 cspB essQ FALSE 0.002 753.000 0.000 NA   NA
 5877801 5877802 EFER_4437 EFER_4438 essQ   TRUE 0.570 -16.000 0.000 NA   NA
 5877804 5877805 EFER_4440 EFER_4441 ydfQ ydfP TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5877805 5877806 EFER_4441 EFER_4442 ydfP cspI FALSE 0.004 364.000 0.000 NA   NA
 5877806 5877807 EFER_4442 EFER_4443 cspI ynfN FALSE 0.004 346.000 0.000 NA   NA
 5877807 5877808 EFER_4443 EFER_4444 ynfN   FALSE 0.137 80.000 0.000 NA   NA
 5877808 5877809 EFER_4444 EFER_4445     FALSE 0.006 296.000 0.000 NA   NA
 5877809 5877810 EFER_4445 EFER_4446     FALSE 0.002 553.000 0.000 NA   NA
 5877810 5877811 EFER_4446 EFER_4447     TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5877811 5877812 EFER_4447 EFER_4448     TRUE 0.981 -9.000 0.667 NA   NA
 5877812 5877813 EFER_4448 EFER_4449     TRUE 0.927 -72.000 0.667 NA   NA
 5877813 5877814 EFER_4449 EFER_4450     FALSE 0.311 -247.000 0.049 1.000   NA
 5877814 5877815 EFER_4450 EFER_4451     TRUE 0.887 42.000 0.537 NA   NA
 5877815 5877816 EFER_4451 EFER_4452     TRUE 0.909 -7.000 0.152 NA   NA
 5877816 5877817 EFER_4452 EFER_4453     TRUE 0.846 12.000 0.000 NA   NA
 5877817 5877818 EFER_4453 EFER_4454     TRUE 0.983 -15.000 1.000 NA   NA
 5877818 5877819 EFER_4454 EFER_4455     TRUE 0.997 6.000 1.000 NA   NA
 5877819 5877820 EFER_4455 EFER_4456     TRUE 0.659 19.000 0.000 NA   NA
 5877820 5877821 EFER_4456 EFER_4457     TRUE 0.890 9.000 0.000 NA   NA
 5877821 5877822 EFER_4457 EFER_4458     TRUE 0.876 -58.000 0.400 NA   NA
 5877822 5877823 EFER_4458 EFER_4459     TRUE 0.990 0.000 0.400 NA   NA
 5877823 5877824 EFER_4459 EFER_4460     TRUE 0.881 10.000 0.000 NA   NA
 5877824 5877825 EFER_4460 EFER_4461     TRUE 0.899 6.000 0.000 NA   NA
 5877825 5877826 EFER_4461 EFER_4462     TRUE 0.943 -102.000 1.000 NA   NA
 5877826 5877827 EFER_4462 EFER_4463     TRUE 0.785 61.000 0.500 NA   NA
 5877827 5877828 EFER_4463 EFER_4464     FALSE 0.156 68.000 0.000 NA   NA
 5877828 5877829 EFER_4464 EFER_4465     TRUE 0.638 59.000 0.000 1.000 Y NA
 5877832 5877833 EFER_4468 EFER_4469 pinR ydfK FALSE 0.003 380.000 0.000 NA   NA
 5877833 5877834 EFER_4469 EFER_4470 ydfK   FALSE 0.002 576.000 0.000 NA   NA
 5877835 5877836 EFER_4471 EFER_4472 prfC osmY FALSE 0.003 393.000 0.000 NA   NA
 5877836 5877837 EFER_4472 EFER_4473 osmY ytjA FALSE 0.108 109.000 0.000 NA   NA
 5877837 5877838 EFER_4473 EFER_4474 ytjA yjjU FALSE 0.358 122.000 0.211 NA   NA
 5877838 5877839 EFER_4474 EFER_4475 yjjU yjjV TRUE 0.892 -3.000 0.057 NA   NA
 5877840 5877841 EFER_4476 EFER_4477 yjjW yjjI TRUE 0.967 -28.000 0.810 NA   NA
 5877842 5877843 EFER_4478 EFER_4479 deoC deoA TRUE 0.825 78.000 0.286 1.000 Y NA
 5877843 5877844 EFER_4479 EFER_4480 deoA deoB TRUE 0.779 52.000 0.398 1.000 N NA
 5877844 5877845 EFER_4480 EFER_4481 deoB deoD TRUE 0.762 57.000 0.414 1.000 N NA
 5877846 5877847 EFER_4482 EFER_4483   lplA FALSE 0.453 32.000 0.000 1.000   NA
 5877847 5877848 EFER_4483 EFER_4484 lplA ytjB TRUE 0.614 28.000 0.066 NA   NA
 5877849 5877850 EFER_4485 EFER_4486 serB radA FALSE 0.219 49.000 0.024 1.000 N NA
 5877850 5877851 EFER_4486 EFER_4487 radA nadR TRUE 0.573 21.000 0.021 1.000 N NA
 5877851 5877852 EFER_4487 EFER_4488 nadR   TRUE 0.788 14.000 0.000 NA   NA
 5877852 5877853 EFER_4488 EFER_4489     TRUE 0.921 -10.000 0.229 NA   NA
 5877855 5877856 EFER_4491 EFER_4492 slt trpR FALSE 0.393 90.000 0.167 1.000 N NA
 5877860 5877861 EFER_4496 EFER_4497 creA creB TRUE 0.837 13.000 0.038 NA   NA
 5877861 5877862 EFER_4497 EFER_4498 creB creC TRUE 0.999 0.000 0.776 1.000 Y NA
 5877862 5877863 EFER_4498 EFER_4499 creC creD TRUE 0.668 58.000 0.311 NA N NA
 5877865 5873373 EFER_4501 EFER_4502 yjtD thrL FALSE 0.021 214.000 0.000 1.000   NA
 5410747 5410748 pEFER_0003 pEFER_0004   parA FALSE 0.012 242.000 0.000 NA   NA
 5410748 5410749 pEFER_0004 pEFER_0005 parA parB TRUE 0.992 -3.000 0.667 1.000 N NA
 5410750 5410751 pEFER_0006 pEFER_0007 samB   TRUE 0.996 0.000 0.750 1.000 N NA
 5410752 5410753 pEFER_0008 pEFER_0009     TRUE 0.637 20.000 0.000 NA   NA
 5410753 5410756 pEFER_0009 pEFER_0012     FALSE 0.064 152.000 0.000 1.000   NA
 5410756 5410757 pEFER_0012 pEFER_0013     TRUE 0.974 -81.000 0.400 0.004 Y NA
 5410757 5410758 pEFER_0013 pEFER_0014     FALSE 0.002 850.000 0.000 NA   NA
 5410758 5410759 pEFER_0014 pEFER_0015     FALSE 0.006 313.000 0.000 NA   NA
 5410759 5410760 pEFER_0015 pEFER_0016     FALSE 0.026 193.000 0.000 NA   NA
 5410760 5410761 pEFER_0016 pEFER_0017     FALSE 0.003 391.000 0.000 NA   NA
 5410763 5410764 pEFER_0019 pEFER_0020     FALSE 0.327 69.000 0.095 NA   NA
 5410764 5410765 pEFER_0020 pEFER_0021     TRUE 0.905 10.000 0.043 NA   NA
 5410765 5410766 pEFER_0021 pEFER_0022     TRUE 0.979 -12.000 0.740 NA   NA
 5410766 5410767 pEFER_0022 pEFER_0023     TRUE 0.983 19.000 0.779 NA   NA
 5410767 5410768 pEFER_0023 pEFER_0024     TRUE 0.718 17.000 0.031 NA   NA
 5410768 5410769 pEFER_0024 pEFER_0025     TRUE 0.741 16.000 0.031 NA   NA
 5410769 5410770 pEFER_0025 pEFER_0026     TRUE 0.986 0.000 0.310 NA   NA
 5410770 5410771 pEFER_0026 pEFER_0027     TRUE 0.980 17.000 0.564 NA   NA
 5410772 5410773 pEFER_0028 pEFER_0029     FALSE 0.245 -294.000 0.000 1.000   NA
 5410773 5410774 pEFER_0029 pEFER_0030   tnpA FALSE 0.002 570.000 0.000 1.000   NA
 5410775 5410776 pEFER_0031 pEFER_0032     TRUE 0.960 10.000 0.000 0.043   NA
 5410776 5410777 pEFER_0032 pEFER_0033   insF TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5410779 5410780 pEFER_0035 pEFER_0036   bla TRUE 0.512 183.000 0.800 1.000 N NA
 5410780 5410781 pEFER_0036 pEFER_0037 bla   FALSE 0.114 116.000 0.000 1.000   NA
 5410786 5410787 pEFER_0042 pEFER_0043     TRUE 0.969 8.000 0.136 NA   NA
 5410787 5410788 pEFER_0043 pEFER_0044     FALSE 0.435 -118.000 0.071 NA   NA
 5410791 5410792 pEFER_misc_rna47570D pEFER_0048 RNAout   FALSE 0.015 226.000 0.000 NA   NA
 5410792 5410793 pEFER_0048 pEFER_0047     FALSE 0.231 -204.000 0.000 NA   NA
 5410793 5410794 pEFER_0047 pEFER_0049     FALSE 0.002 590.000 0.000 NA   NA
 5410795 5410796 pEFER_0050 pEFER_0051     FALSE 0.327 -78.000 0.000 NA   NA
 5410796 5410797 pEFER_0051 pEFER_0052     FALSE 0.203 55.000 0.000 NA   NA
 5410797 5410798 pEFER_0052 pEFER_0053     FALSE 0.002 536.000 0.000 NA   NA
 5410798 5410799 pEFER_0053 pEFER_0054     TRUE 0.952 -3.000 0.143 NA   NA
 5410800 5410801 pEFER_0055 pEFER_0056     FALSE 0.229 51.000 0.000 NA   NA
 5410801 5410802 pEFER_0056 pEFER_0057   resD TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA