MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia fergusonii ATCC 35469

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5873373 5873374 EFER_4502 EFER_0001 thrL thrA FALSE 0.187 82.000 0.043 1.000   NA
 5873374 5873375 EFER_0001 EFER_0002 thrA thrB TRUE 0.993 2.000 0.133 1.000 Y NA
 5873375 5873376 EFER_0002 EFER_0003 thrB thrC TRUE 0.996 4.000 0.233 1.000 Y NA
 5873376 5873377 EFER_0003 EFER_0004 thrC yaaX FALSE 0.012 213.000 0.003 NA   NA
 5873378 5873379 EFER_0005 EFER_0006 yaaA yaaJ FALSE 0.150 70.000 0.028 NA   NA
 5873380 5873381 EFER_0007 EFER_0008 talB mogA FALSE 0.120 115.000 0.042 1.000 N NA
 5873383 5873384 EFER_0010 EFER_misc_RNA_1 dnaK tpke11 TRUE 0.895 1.000 0.000 NA   NA
 5873384 5873385 EFER_misc_RNA_1 EFER_0011 tpke11 dnaJ TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5873387 5873388 EFER_misc_RNA_2 EFER_0013 sokC nhaA FALSE 0.003 438.000 0.000 NA   NA
 5873388 5873389 EFER_0013 EFER_0014 nhaA nhaR TRUE 0.812 38.000 0.292 1.000 N NA
 5873391 5873392 EFER_0016 EFER_0017 yaaY ribF TRUE 0.877 8.000 0.019 NA   NA
 5873392 5873393 EFER_0017 EFER_0018 ribF ileS TRUE 0.743 43.000 0.254 1.000 N NA
 5873393 5873394 EFER_0018 EFER_0020 ileS lspA TRUE 0.907 0.000 0.045 1.000 N NA
 5873394 5873395 EFER_0020 EFER_0021 lspA fkpB FALSE 0.334 108.000 0.154 1.000 N NA
 5873395 5873396 EFER_0021 EFER_0022 fkpB ispH TRUE 0.995 2.000 0.626 1.000 N NA
 5873396 5873397 EFER_0022 EFER_0023 ispH rihC FALSE 0.134 66.000 0.028 NA N NA
 5873397 5873398 EFER_0023 EFER_0024 rihC   TRUE 0.908 18.000 0.167 NA   NA
 5873399 5873400 EFER_0026 EFER_0027 citB citA TRUE 0.997 -7.000 1.000 1.000 Y NA
 5873400 5873401 EFER_0027 EFER_0028 citA oadB FALSE 0.112 143.000 0.068 1.000 N NA
 5873401 5873402 EFER_0028 EFER_0029 oadB oadA TRUE 0.999 13.000 0.886 0.002 Y NA
 5873402 5873403 EFER_0029 EFER_0030 oadA oadG TRUE 0.998 16.000 0.720 0.002 Y NA
 5873403 5873404 EFER_0030 EFER_0031 oadG citP FALSE 0.365 151.000 0.060 1.000 Y NA
 5873405 5873406 EFER_0032 EFER_0033 citC citD TRUE 0.973 30.000 0.426 1.000 Y NA
 5873406 5873407 EFER_0033 EFER_0034 citD citE TRUE 0.951 -78.000 0.537 0.001 N NA
 5873407 5873408 EFER_0034 EFER_0035 citE citF TRUE 0.991 13.000 0.373 0.001 N NA
 5873408 5873409 EFER_0035 EFER_0036 citF citX TRUE 0.980 0.000 0.231 1.000 N NA
 5873409 5873410 EFER_0036 EFER_0037 citX citG TRUE 0.979 -22.000 0.400 1.000 Y NA
 5873410 5873411 EFER_0037 EFER_0038 citG dapB FALSE 0.031 159.000 0.002 1.000 N NA
 5873413 5873414 EFER_0040 EFER_0041 carA carB TRUE 0.994 18.000 0.345 0.001 Y NA
 5873414 5873415 EFER_0041 EFER_0042 carB caiF FALSE 0.009 261.000 0.000 NA   NA
 5873416 5873417 EFER_0043 EFER_0044 caiE caiD TRUE 0.913 6.000 0.000 1.000   NA
 5873417 5873418 EFER_0044 EFER_0045 caiD caiC TRUE 0.793 53.000 0.000 0.023 Y NA
 5873418 5873419 EFER_0045 EFER_0046 caiC caiB TRUE 0.657 58.000 0.154 0.023 N NA
 5873419 5873420 EFER_0046 EFER_0047 caiB caiA TRUE 0.757 71.000 0.529 1.000 N NA
 5873420 5873421 EFER_0047 EFER_0048 caiA caiT TRUE 0.703 31.000 0.118 1.000 N NA
 5873422 5873423 EFER_0049 EFER_0050 fixA fixB TRUE 0.993 15.000 0.231 0.012 Y NA
 5873423 5873424 EFER_0050 EFER_0051 fixB fixC TRUE 0.793 51.000 0.000 0.054 Y NA
 5873424 5873425 EFER_0051 EFER_0052 fixC fixX TRUE 0.993 -3.000 0.167 0.054 Y NA
 5873425 5873426 EFER_0052 EFER_0053 fixX yaaU FALSE 0.181 59.000 0.000 1.000 N NA
 5873426 5873427 EFER_0053 EFER_0054 yaaU kefF FALSE 0.127 108.000 0.000 1.000   NA
 5873427 5873428 EFER_0054 EFER_0055 kefF kefC TRUE 0.981 -7.000 0.560 1.000   NA
 5873428 5873429 EFER_0055 EFER_0056 kefC folA FALSE 0.020 193.000 0.012 1.000 N NA
 5873429 5873430 EFER_0056 EFER_0057 folA   TRUE 0.614 21.000 0.000 NA   NA
 5873431 5873432 EFER_0058 EFER_0059     FALSE 0.370 36.000 0.000 NA   NA
 5873432 5873433 EFER_0059 EFER_0060   apaH TRUE 0.524 25.000 0.000 NA   NA
 5873433 5873434 EFER_0060 EFER_0061 apaH apaG TRUE 0.984 7.000 0.267 NA N NA
 5873434 5873435 EFER_0061 EFER_0062 apaG ksgA TRUE 0.945 3.000 0.078 NA N NA
 5873435 5873436 EFER_0062 EFER_0063 ksgA pdxA TRUE 0.964 -3.000 0.197 1.000 N NA
 5873436 5873437 EFER_0063 EFER_0064 pdxA surA TRUE 0.993 0.000 0.561 1.000 N NA
 5873437 5873438 EFER_0064 EFER_0065 surA imp TRUE 0.561 54.000 0.182 1.000 N NA
 5873440 5873441 EFER_0067 EFER_0068 rluA hepA TRUE 0.979 12.000 0.294 1.000 N NA
 5873441 5873442 EFER_0068 EFER_0069 hepA polB TRUE 0.487 164.000 0.098 0.069 Y NA
 5873442 5873443 EFER_0069 EFER_0070 polB araD FALSE 0.118 75.000 0.018 1.000 N NA
 5873443 5873444 EFER_0070 EFER_0071 araD araA TRUE 0.477 103.000 0.017 1.000 Y NA
 5873444 5873445 EFER_0071 EFER_0072 araA araB TRUE 0.960 11.000 0.138 1.000 N NA
 5873446 5873447 EFER_0073 EFER_0074 araC   FALSE 0.040 222.000 0.000 0.054 N NA
 5873447 5873448 EFER_0074 EFER_0075     TRUE 0.862 26.000 0.222 1.000 N NA
 5873448 5873449 EFER_0075 EFER_0076     FALSE 0.231 55.000 0.000 1.000   NA
 5873449 5873450 EFER_0076 EFER_0077     TRUE 0.991 13.000 0.667 NA   NA
 5873450 5873451 EFER_0077 EFER_0078     TRUE 0.994 10.000 0.600 NA   NA
 5873451 5873452 EFER_0078 EFER_0079   yabI FALSE 0.031 184.000 0.000 NA   NA
 5873453 5873454 EFER_0080 EFER_0081 thiQ thiP TRUE 0.976 -16.000 0.522 0.020 N NA
 5873454 5873455 EFER_0081 EFER_0082 thiP tbpA TRUE 0.976 -24.000 0.697 0.075 N NA
 5873455 5873456 EFER_0082 EFER_0083 tbpA sgrR FALSE 0.103 164.000 0.010 0.075   NA
 5873457 5873458 EFER_misc_RNA_3 EFER_0085 sgrS setA TRUE 0.467 28.000 0.000 NA   NA
 5873459 5873460 EFER_0086 EFER_0087     TRUE 0.902 4.000 0.000 NA   NA
 5873462 5873463 EFER_0089 EFER_0090 aroD   TRUE 0.691 18.000 0.019 1.000   NA
 5873463 5873464 EFER_0090 EFER_0091     TRUE 0.565 -70.000 0.082 1.000   NA
 5873464 5873465 EFER_0091 EFER_0092     TRUE 0.763 19.000 0.061 1.000 N NA
 5873465 5873466 EFER_0092 EFER_0093   leuD FALSE 0.009 266.000 0.000 1.000 N NA
 5873466 5873467 EFER_0093 EFER_0094 leuD leuC TRUE 0.998 11.000 0.309 0.001 Y NA
 5873467 5873468 EFER_0094 EFER_0095 leuC leuB TRUE 0.998 3.000 0.275 0.002 Y NA
 5873468 5873469 EFER_0095 EFER_0096 leuB leuA TRUE 0.996 0.000 0.126 0.002 Y NA
 5873469 5873470 EFER_0096 EFER_4503 leuA leuL FALSE 0.364 90.000 0.010 0.002   NA
 5873471 5873472 EFER_0097 EFER_0099 leuO ilvI FALSE 0.005 317.000 0.000 1.000 N NA
 5873472 5873473 EFER_0099 EFER_0100 ilvI ilvH TRUE 0.999 3.000 0.371 0.002 Y NA
 5873473 5873474 EFER_0100 EFER_0102 ilvH fruR FALSE 0.056 181.000 0.063 1.000 N NA
 5873474 5873475 EFER_0102 EFER_0103 fruR mraZ FALSE 0.002 594.000 0.000 NA   NA
 5873475 5873476 EFER_0103 EFER_0104 mraZ mraW TRUE 0.995 2.000 0.635 NA   NA
 5873476 5873477 EFER_0104 EFER_0105 mraW ftsL TRUE 0.970 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5873477 5873478 EFER_0105 EFER_0106 ftsL ftsI TRUE 0.902 16.000 0.124 1.000 N NA
 5873478 5873479 EFER_0106 EFER_0107 ftsI murE TRUE 0.935 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 5873479 5873480 EFER_0107 EFER_0108 murE murF TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 5873480 5873481 EFER_0108 EFER_0109 murF mraY TRUE 0.994 -6.000 0.309 0.005 Y NA
 5873481 5873482 EFER_0109 EFER_0110 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.005 Y NA
 5873482 5873483 EFER_0110 EFER_0111 murD ftsW TRUE 0.993 0.000 0.297 0.003 N NA
 5873483 5873484 EFER_0111 EFER_0112 ftsW murG TRUE 0.992 -3.000 0.647 1.000 N NA
 5873484 5873485 EFER_0112 EFER_0113 murG murC TRUE 0.884 54.000 0.283 1.000 Y NA
 5873485 5873486 EFER_0113 EFER_0114 murC ddlB TRUE 0.987 -7.000 0.153 0.005 Y NA
 5873486 5873487 EFER_0114 EFER_0115 ddlB ftsQ TRUE 0.997 2.000 0.372 NA Y NA
 5873487 5873488 EFER_0115 EFER_0116 ftsQ ftsA TRUE 0.983 -3.000 0.389 NA N NA
 5873488 5873489 EFER_0116 EFER_0117 ftsA ftsZ TRUE 0.914 62.000 0.460 1.000 Y NA
 5873489 5873490 EFER_0117 EFER_0118 ftsZ lpxC FALSE 0.316 101.000 0.134 1.000 N NA
 5873490 5873491 EFER_0118 EFER_0119 lpxC secM FALSE 0.039 181.000 0.000 1.000   NA
 5873491 5873492 EFER_0119 EFER_0120 secM secA FALSE 0.301 62.000 0.065 1.000   NA
 5873492 5873493 EFER_0120 EFER_0121 secA mutT TRUE 0.483 63.000 0.168 1.000 N NA
 5873494 5873495 EFER_0122 EFER_0123 yacG yacF TRUE 0.988 10.000 0.356 NA   NA
 5873495 5873496 EFER_0123 EFER_0124 yacF coaE TRUE 0.959 0.000 0.110 NA   NA
 5873498 5873499 EFER_0126 EFER_0127 hofC hofB TRUE 0.977 -43.000 0.571 1.000 Y NA
 5873499 5873500 EFER_0127 EFER_0128 hofB ppdD TRUE 0.998 10.000 0.556 1.000 Y NA
 5873500 5873501 EFER_0128 EFER_0129 ppdD nadC FALSE 0.013 214.000 0.015 1.000 N NA
 5873502 5873503 EFER_0130 EFER_0131 ampD ampE TRUE 0.992 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 5873506 5873507 EFER_misc_RNA_4 EFER_0134 tp2   TRUE 0.752 -4.000 0.000 NA   NA
 5873508 5873509 EFER_0135 EFER_0136 aceE aceF TRUE 0.987 15.000 0.220 1.000 Y NA
 5873509 5873510 EFER_0136 EFER_0137 aceF lpd TRUE 0.495 208.000 0.463 1.000 Y NA
 5873512 5873513 EFER_0139 EFER_0140 acnB yacL FALSE 0.044 197.000 0.068 NA   NA
 5873514 5873515 EFER_0141 EFER_0142 speD speE TRUE 0.980 16.000 0.162 1.000 Y NA
 5873515 5873516 EFER_0142 EFER_0143 speE yacC TRUE 0.581 106.000 0.354 NA   NA
 5873521 5873522 EFER_0148 EFER_0149 yadG yadH TRUE 0.998 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 5873522 5873523 EFER_0149 EFER_0150 yadH yadI FALSE 0.122 105.000 0.037 1.000 N NA
 5873523 5873524 EFER_0150 EFER_0151 yadI yadE TRUE 0.850 57.000 0.222 1.000 Y NA
 5873527 5873528 EFER_0155 EFER_0156 panC panB TRUE 0.998 12.000 0.395 0.001 Y NA
 5873528 5873529 EFER_0156 EFER_0157 panB yadC FALSE 0.101 112.000 0.000 1.000 N NA
 5873529 5873530 EFER_0157 EFER_0158 yadC   TRUE 0.944 25.000 0.000 0.008 Y NA
 5873530 5873531 EFER_0158 EFER_0159   yadL TRUE 0.976 26.000 0.571 0.008   NA
 5873531 5873532 EFER_0159 EFER_0160 yadL yadM TRUE 0.997 6.000 0.571 0.008   NA
 5873532 5873533 EFER_0160 EFER_0161 yadM htrE TRUE 0.984 16.000 0.571 1.000   NA
 5873533 5873534 EFER_0161 EFER_0163 htrE ecpD TRUE 0.987 36.000 1.000 1.000 Y NA
 5873534 5873535 EFER_0163 EFER_0164 ecpD yadN TRUE 0.878 97.000 0.500 1.000 Y NA
 5873535 5873536 EFER_0164 EFER_0165 yadN folK FALSE 0.004 355.000 0.000 1.000 N NA
 5873536 5873537 EFER_0165 EFER_0166 folK pcnB TRUE 0.972 -3.000 0.234 1.000 N NA
 5873537 5873538 EFER_0166 EFER_0167 pcnB yadB TRUE 0.883 39.000 0.131 1.000 Y NA
 5873538 5873539 EFER_0167 EFER_0168 yadB dksA TRUE 0.632 54.000 0.231 1.000 N NA
 5873539 5873540 EFER_0168 EFER_0169 dksA sfsA FALSE 0.128 179.000 0.151 NA   NA
 5873540 5873541 EFER_0169 EFER_0170 sfsA ligT TRUE 0.808 15.000 0.045 NA   NA
 5873542 5873543 EFER_0171 EFER_0172 hrpB mrcB FALSE 0.363 94.000 0.158 1.000 N NA
 5873543 5873544 EFER_0172 EFER_0173 mrcB fhuA FALSE 0.015 220.000 0.000 1.000 N NA
 5873544 5873545 EFER_0173 EFER_0174 fhuA fhuC TRUE 0.838 51.000 0.156 1.000 Y NA
 5873545 5873546 EFER_0174 EFER_0175 fhuC fhuD TRUE 0.984 0.000 0.031 1.000 Y NA
 5873546 5873547 EFER_0175 EFER_0176 fhuD fhuB TRUE 0.975 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5873549 5873550 EFER_0178 EFER_0179 clcA yadR FALSE 0.141 82.000 0.031 NA   NA
 5873551 5873552 EFER_0180 EFER_0181   btuF TRUE 0.774 36.000 0.213 NA   NA
 5873552 5873553 EFER_0181 EFER_0182 btuF pfs TRUE 0.601 -34.000 0.073 1.000 N NA
 5873554 5873555 EFER_0183 EFER_0184 dgt degP FALSE 0.188 130.000 0.101 1.000 N NA
 5873555 5873556 EFER_0184 EFER_0185 degP cdaR FALSE 0.090 158.000 0.080 NA N NA
 5873557 5873558 EFER_0186 EFER_0187 yaeH yaeI FALSE 0.049 158.000 0.000 NA   NA
 5873558 5873559 EFER_0187 EFER_0188 yaeI dapD FALSE 0.260 51.000 0.000 1.000   NA
 5873559 5873560 EFER_0188 EFER_0189 dapD glnD TRUE 0.668 31.000 0.097 1.000 N NA
 5873560 5873561 EFER_0189 EFER_0190 glnD map TRUE 0.591 62.000 0.243 1.000 N NA
 5873562 5873563 EFER_misc_RNA_5 EFER_0191 t44 rpsB TRUE 0.487 27.000 0.000 NA   NA
 5873563 5873564 EFER_0191 EFER_0192 rpsB tsf TRUE 0.876 135.000 0.748 1.000 Y NA
 5873564 5873565 EFER_0192 EFER_0193 tsf pyrH FALSE 0.464 147.000 0.416 1.000 N NA
 5873565 5873566 EFER_0193 EFER_0194 pyrH frr TRUE 0.581 150.000 0.626 1.000 N NA
 5873566 5873567 EFER_0194 EFER_0195 frr dxr FALSE 0.122 93.000 0.032 1.000 N NA
 5873567 5873568 EFER_0195 EFER_0196 dxr ispU FALSE 0.187 186.000 0.025 1.000 Y NA
 5873568 5873569 EFER_0196 EFER_0197 ispU cdsA TRUE 0.995 13.000 0.400 1.000 Y NA
 5873569 5873570 EFER_0197 EFER_0198 cdsA yaeL TRUE 0.921 12.000 0.080 1.000 N NA
 5873570 5873571 EFER_0198 EFER_0199 yaeL yaeT TRUE 0.937 32.000 0.204 1.000 Y NA
 5873571 5873572 EFER_0199 EFER_0201 yaeT hlpA TRUE 0.780 124.000 0.354 1.000 Y NA
 5873572 5873573 EFER_0201 EFER_0202 hlpA lpxD TRUE 0.999 4.000 0.814 1.000 Y NA
 5873573 5873574 EFER_0202 EFER_0203 lpxD fabZ TRUE 0.798 105.000 0.796 1.000 N NA
 5873574 5873575 EFER_0203 EFER_0204 fabZ lpxA TRUE 0.997 4.000 0.850 1.000 N NA
 5873575 5873576 EFER_0204 EFER_0205 lpxA lpxB TRUE 0.996 0.000 0.289 1.000 Y NA
 5873576 5873577 EFER_0205 EFER_0206 lpxB rnhB TRUE 0.963 -3.000 0.186 1.000 N NA
 5873577 5873578 EFER_0206 EFER_0207 rnhB dnaE TRUE 0.879 37.000 0.104 1.000 Y NA
 5873578 5873579 EFER_0207 EFER_0208 dnaE accA TRUE 0.935 13.000 0.122 1.000 N NA
 5873579 5873580 EFER_0208 EFER_0209 accA ldcC FALSE 0.085 98.000 0.010 1.000 N NA
 5873580 5873581 EFER_0209 EFER_0210 ldcC yaeR TRUE 0.652 57.000 0.039 NA Y NA
 5873581 5873582 EFER_0210 EFER_0211 yaeR tilS FALSE 0.108 65.000 0.015 NA N NA
 5873583 5873584 EFER_0212 EFER_0213 rof yaeP TRUE 0.922 -7.000 0.179 NA   NA
 5873585 5873586 EFER_0214 EFER_0215 yaeQ yaeJ TRUE 0.868 -3.000 0.034 1.000   NA
 5873586 5873587 EFER_0215 EFER_0216 yaeJ nlpE TRUE 0.783 14.000 0.027 NA   NA
 5873588 5873589 EFER_0217 EFER_0218 yaeF proS FALSE 0.158 53.000 0.002 NA   NA
 5873589 5873590 EFER_0218 EFER_0219 proS yaeB FALSE 0.140 111.000 0.048 NA   NA
 5873590 5873591 EFER_0219 EFER_0220 yaeB rcsF TRUE 0.973 -3.000 0.247 NA   NA
 5873591 5873592 EFER_0220 EFER_0221 rcsF metQ TRUE 0.638 118.000 0.500 NA   NA
 5873592 5873593 EFER_0221 EFER_0222 metQ metI TRUE 0.969 40.000 0.411 0.058 Y NA
 5873593 5873594 EFER_0222 EFER_0223 metI metN TRUE 0.994 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 5873595 5873596 EFER_0224 EFER_16S_5 gmhB   FALSE 0.004 367.000 0.000 NA   NA
 5873596 5873597 EFER_16S_5 EFER_tRNA1     FALSE 0.152 69.000 0.000 NA   NA
 5873597 5873598 EFER_tRNA1 EFER_tRNA2     FALSE 0.284 43.000 0.000 NA   NA
 5873598 5873599 EFER_tRNA2 EFER_23S_5     FALSE 0.031 184.000 0.000 NA   NA
 5873599 5873600 EFER_23S_5 EFER_5S_6     FALSE 0.115 99.000 0.000 NA   NA
 5873600 5873601 EFER_5S_6 EFER_tRNA3     FALSE 0.215 53.000 0.000 NA   NA
 5873601 5873602 EFER_tRNA3 EFER_0236   dkgB FALSE 0.045 163.000 0.000 NA   NA
 5873604 5873605 EFER_0238 EFER_0239 yafD yafE FALSE 0.227 78.000 0.066 NA   NA
 5873606 5873607 EFER_0240 EFER_0241 mltD gloB TRUE 0.551 72.000 0.233 1.000   NA
 5873610 5873611 EFER_0244 EFER_tRNA4 dnaQ   FALSE 0.074 133.000 0.000 NA   NA
 5873615 5873616 EFER_0248 EFER_0249 lpcA yafJ FALSE 0.125 205.000 0.229 1.000   NA
 5873621 5873622 EFER_tRNA87 EFER_tRNA86     FALSE 0.392 34.000 0.000 NA   NA
 5873622 5873623 EFER_tRNA86 EFER_tRNA85     FALSE 0.392 34.000 0.000 NA   NA
 5873624 5873625 EFER_0254 EFER_0255 mltA ygdL FALSE 0.103 77.000 0.009 1.000 N NA
 5873626 5873627 EFER_0256 EFER_0257 ygdK csdA TRUE 0.987 0.000 0.122 0.001   NA
 5873630 5873631 EFER_0259 EFER_0260 gcvA ygdD TRUE 0.816 19.000 0.081 NA   NA
 5873631 5873632 EFER_0260 EFER_0261 ygdD ygdE TRUE 0.905 -7.000 0.144 NA   NA
 5873633 5873634 EFER_0262 EFER_0263 exo sdaB TRUE 0.579 22.000 0.000 1.000 N NA
 5873634 5873635 EFER_0263 EFER_0264 sdaB sdaC TRUE 0.644 58.000 0.000 1.000 Y NA
 5873635 5873636 EFER_0264 EFER_0265 sdaC ygdH FALSE 0.002 552.000 0.000 NA   NA
 5873636 5873637 EFER_0265 EFER_0266 ygdH queF FALSE 0.192 116.000 0.079 NA   NA
 5873638 5873639 EFER_0267 EFER_misc_RNA_7 syd csrB FALSE 0.016 218.000 0.000 NA   NA
 5873639 5873640 EFER_misc_RNA_7 EFER_0269 csrB   FALSE 0.252 -145.000 0.000 NA   NA
 5873640 5873641 EFER_0269 EFER_0270   truC TRUE 0.993 0.000 0.518 NA   NA
 5873641 5873642 EFER_0270 EFER_0271 truC yqcA TRUE 0.678 18.000 0.000 1.000 N NA
 5873643 5873644 EFER_0272 EFER_0273     TRUE 0.984 1.000 0.250 NA   NA
 5873644 5873645 EFER_0273 EFER_0274     TRUE 0.524 25.000 0.000 NA   NA
 5873646 5873647 EFER_0275 EFER_0276 gudX gudD TRUE 0.968 21.000 0.037 0.001 Y NA
 5873647 5873648 EFER_0276 EFER_0277 gudD   FALSE 0.140 89.000 0.037 1.000 N NA
 5873650 5873651 EFER_0279 EFER_0280 rumA relA FALSE 0.401 51.000 0.082 1.000 N NA
 5873651 5873652 EFER_0280 EFER_0281 relA chpR TRUE 0.535 78.000 0.000 NA Y NA
 5873652 5873653 EFER_0281 EFER_0282 chpR chpA TRUE 0.998 0.000 0.531 NA Y NA
 5873653 5873654 EFER_0282 EFER_0283 chpA mazG FALSE 0.170 71.000 0.000 1.000   NA
 5873654 5873655 EFER_0283 EFER_0284 mazG pyrG FALSE 0.016 228.000 0.025 1.000   NA
 5873655 5873656 EFER_0284 EFER_0285 pyrG eno FALSE 0.215 88.000 0.068 1.000 N NA
 5873657 5873658 EFER_0286 EFER_0287 insG   FALSE 0.156 68.000 0.000 NA   NA
 5873658 5873659 EFER_0287 EFER_0288     FALSE 0.232 -190.000 0.000 NA   NA
 5873659 5873660 EFER_0288 EFER_0290     TRUE 0.744 -6.000 0.000 NA   NA
 5873660 5873661 EFER_0290 EFER_0291   ygcG TRUE 0.763 15.000 0.000 NA   NA
 5873661 5873662 EFER_0291 EFER_0292 ygcG   TRUE 0.642 -10.000 0.000 NA   NA
 5873663 5873664 EFER_0293 EFER_0294 ygcF   FALSE 0.002 550.000 0.000 NA   NA
 11539307 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 339.000 0.000 NA   NA
 11681670 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 339.000 0.000 NA   NA
 11824062 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 339.000 0.000 NA   NA
 11539308 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 368.000 0.000 NA   NA
 11681671 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 368.000 0.000 NA   NA
 11824063 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 368.000 0.000 NA   NA
 11539309 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 400.000 0.000 NA   NA
 11681672 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 400.000 0.000 NA   NA
 11824064 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 400.000 0.000 NA   NA
 11539310 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 429.000 0.000 NA   NA
 11681673 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 429.000 0.000 NA   NA
 11824065 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 429.000 0.000 NA   NA
 11539311 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 461.000 0.000 NA   NA
 11681674 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 461.000 0.000 NA   NA
 11824066 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 461.000 0.000 NA   NA
 11539312 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 490.000 0.000 NA   NA
 11681675 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 490.000 0.000 NA   NA
 11824067 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 490.000 0.000 NA   NA
 11539313 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 522.000 0.000 NA   NA
 11681676 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 522.000 0.000 NA   NA
 11824068 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 522.000 0.000 NA   NA
 5873664 5873665 EFER_0294 EFER_0295     FALSE 0.002 715.000 0.000 NA   NA
 11539314 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 551.000 0.000 NA   NA
 11681677 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 551.000 0.000 NA   NA
 11824069 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 551.000 0.000 NA   NA
 11539315 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11681678 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11824070 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 583.000 0.000 NA   NA
 11539316 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 612.000 0.000 NA   NA
 11681679 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 612.000 0.000 NA   NA
 11824071 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 612.000 0.000 NA   NA
 11539317 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 644.000 0.000 NA   NA
 11681680 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 644.000 0.000 NA   NA
 11824072 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 644.000 0.000 NA   NA
 11539318 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 673.000 0.000 NA   NA
 11681681 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 673.000 0.000 NA   NA
 11824073 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 673.000 0.000 NA   NA
 11539319 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 705.000 0.000 NA   NA
 11681682 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 705.000 0.000 NA   NA
 11824074 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 705.000 0.000 NA   NA
 11539320 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 734.000 0.000 NA   NA
 11681683 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 734.000 0.000 NA   NA
 11824075 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 734.000 0.000 NA   NA
 11539321 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 766.000 0.000 NA   NA
 11681684 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 766.000 0.000 NA   NA
 11824076 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 766.000 0.000 NA   NA
 11539322 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 795.000 0.000 NA   NA
 11681685 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 795.000 0.000 NA   NA
 11824077 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 795.000 0.000 NA   NA
 11539323 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 827.000 0.000 NA   NA
 11681686 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 827.000 0.000 NA   NA
 11824078 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 827.000 0.000 NA   NA
 11539324 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 856.000 0.000 NA   NA
 11681687 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 856.000 0.000 NA   NA
 11824079 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 856.000 0.000 NA   NA
 11539325 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11681688 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11824080 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 888.000 0.000 NA   NA
 11539326 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 917.000 0.000 NA   NA
 11681689 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 917.000 0.000 NA   NA
 11824081 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 917.000 0.000 NA   NA
 11539327 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 949.000 0.000 NA   NA
 11681690 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 949.000 0.000 NA   NA
 11824082 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 949.000 0.000 NA   NA
 11539328 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 978.000 0.000 NA   NA
 11681691 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 978.000 0.000 NA   NA
 11824083 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 978.000 0.000 NA   NA
 11539329 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1010.000 0.000 NA   NA
 11681692 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1010.000 0.000 NA   NA
 11824084 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1010.000 0.000 NA   NA
 11539330 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1039.000 0.000 NA   NA
 11681693 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1039.000 0.000 NA   NA
 11824085 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1039.000 0.000 NA   NA
 11539331 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1071.000 0.000 NA   NA
 11681694 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1071.000 0.000 NA   NA
 11824086 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1071.000 0.000 NA   NA
 11539332 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1100.000 0.000 NA   NA
 11681695 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1100.000 0.000 NA   NA
 11824087 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1100.000 0.000 NA   NA
 11539333 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1132.000 0.000 NA   NA
 11681696 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1132.000 0.000 NA   NA
 11824088 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1132.000 0.000 NA   NA
 11539334 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1161.000 0.000 NA   NA
 11681697 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1161.000 0.000 NA   NA
 11824089 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1161.000 0.000 NA   NA
 11539335 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1193.000 0.000 NA   NA
 11681698 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1193.000 0.000 NA   NA
 11824090 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1193.000 0.000 NA   NA
 11539336 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1222.000 0.000 NA   NA
 11681699 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1222.000 0.000 NA   NA
 11824091 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1222.000 0.000 NA   NA
 11539337 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1254.000 0.000 NA   NA
 11681700 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1254.000 0.000 NA   NA
 11824092 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1254.000 0.000 NA   NA
 11539338 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1283.000 0.000 NA   NA
 11681701 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1283.000 0.000 NA   NA
 11824093 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1283.000 0.000 NA   NA
 11539339 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1315.000 0.000 NA   NA
 11681702 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1315.000 0.000 NA   NA
 11824094 5873663   EFER_0293   ygcF FALSE NA 1315.000 0.000 NA   NA
 5873667 5873668 EFER_0298 EFER_0299 cysJ cysI TRUE 0.999 0.000 0.791 0.001 Y NA
 5873668 5873669 EFER_0299 EFER_0300 cysI cysH FALSE 0.390 64.000 0.116 1.000 N NA
 5873669 5873670 EFER_0300 EFER_0302 cysH ygcB FALSE 0.003 358.000 0.003 1.000   NA
 5873670 5873671 EFER_0302 EFER_0303 ygcB ygcL FALSE 0.021 415.000 0.263 NA   NA
 5873671 5873672 EFER_0303 EFER_0304 ygcL ygcK TRUE 0.962 -7.000 0.336 NA   NA
 5873672 5873673 EFER_0304 EFER_0305 ygcK ygcJ TRUE 0.943 13.000 0.138 NA   NA
 5873673 5873674 EFER_0305 EFER_0306 ygcJ ygcI TRUE 0.977 3.000 0.171 NA   NA
 5873674 5873675 EFER_0306 EFER_0307 ygcI ygcH TRUE 0.924 -13.000 0.282 NA   NA
 5873675 5873676 EFER_0307 EFER_0308 ygcH ygbT TRUE 0.983 16.000 0.589 NA   NA
 5873676 5873677 EFER_0308 EFER_0309 ygbT ygbF TRUE 0.994 2.000 0.509 NA   NA
 11539340 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4167.000 0.000 NA   NA
 11681703 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4167.000 0.000 NA   NA
 11824095 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4167.000 0.000 NA   NA
 11539341 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4196.000 0.000 NA   NA
 11681704 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4196.000 0.000 NA   NA
 11824096 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4196.000 0.000 NA   NA
 11539342 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4228.000 0.000 NA   NA
 11681705 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4228.000 0.000 NA   NA
 11824097 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4228.000 0.000 NA   NA
 11539343 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4257.000 0.000 NA   NA
 11681706 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4257.000 0.000 NA   NA
 11824098 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4257.000 0.000 NA   NA
 11539344 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4289.000 0.000 NA   NA
 11681707 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4289.000 0.000 NA   NA
 11824099 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4289.000 0.000 NA   NA
 11539345 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4318.000 0.000 NA   NA
 11681708 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4318.000 0.000 NA   NA
 11824100 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4318.000 0.000 NA   NA
 11539346 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4350.000 0.000 NA   NA
 11681709 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4350.000 0.000 NA   NA
 11824101 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4350.000 0.000 NA   NA
 11539347 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4379.000 0.000 NA   NA
 11681710 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4379.000 0.000 NA   NA
 11824102 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4379.000 0.000 NA   NA
 11539348 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4411.000 0.000 NA   NA
 11681711 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4411.000 0.000 NA   NA
 11824103 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4411.000 0.000 NA   NA
 11539349 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4440.000 0.000 NA   NA
 11681712 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4440.000 0.000 NA   NA
 11824104 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4440.000 0.000 NA   NA
 11539350 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4472.000 0.000 NA   NA
 11681713 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4472.000 0.000 NA   NA
 11824105 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4472.000 0.000 NA   NA
 11539351 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4501.000 0.000 NA   NA
 11681714 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4501.000 0.000 NA   NA
 11824106 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4501.000 0.000 NA   NA
 11539352 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4533.000 0.000 NA   NA
 11681715 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4533.000 0.000 NA   NA
 11824107 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4533.000 0.000 NA   NA
 11539353 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4562.000 0.000 NA   NA
 11681716 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4562.000 0.000 NA   NA
 11824108 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4562.000 0.000 NA   NA
 5873678 5873679 EFER_0310 EFER_0311     TRUE 0.543 -19.000 0.000 NA   NA
 11539354 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4594.000 0.000 NA   NA
 11681717 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4594.000 0.000 NA   NA
 11824109 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4594.000 0.000 NA   NA
 11539355 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4623.000 0.000 NA   NA
 11681718 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4623.000 0.000 NA   NA
 11824110 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4623.000 0.000 NA   NA
 11539356 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4655.000 0.000 NA   NA
 11681719 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4655.000 0.000 NA   NA
 11824111 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4655.000 0.000 NA   NA
 11539357 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4684.000 0.000 NA   NA
 11681720 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4684.000 0.000 NA   NA
 11824112 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4684.000 0.000 NA   NA
 5873679 5873680 EFER_0311 EFER_0312     FALSE 0.179 61.000 0.000 NA   NA
 11539358 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4716.000 0.000 NA   NA
 11681721 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4716.000 0.000 NA   NA
 11824113 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4716.000 0.000 NA   NA
 11539359 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4745.000 0.000 NA   NA
 11681722 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4745.000 0.000 NA   NA
 11824114 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4745.000 0.000 NA   NA
 11539360 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4777.000 0.000 NA   NA
 11681723 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4777.000 0.000 NA   NA
 11824115 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4777.000 0.000 NA   NA
 11539361 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4806.000 0.000 NA   NA
 11681724 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4806.000 0.000 NA   NA
 11824116 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4806.000 0.000 NA   NA
 11539362 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4838.000 0.000 NA   NA
 11681725 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4838.000 0.000 NA   NA
 11824117 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4838.000 0.000 NA   NA
 11539363 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4867.000 0.000 NA   NA
 11681726 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4867.000 0.000 NA   NA
 11824118 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4867.000 0.000 NA   NA
 5873680 5873681 EFER_0312 EFER_0313   iap FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 11539364 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4900.000 0.000 NA   NA
 11681727 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4900.000 0.000 NA   NA
 11824119 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4900.000 0.000 NA   NA
 11539365 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4929.000 0.000 NA   NA
 11681728 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4929.000 0.000 NA   NA
 11824120 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4929.000 0.000 NA   NA
 11539366 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4961.000 0.000 NA   NA
 11681729 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4961.000 0.000 NA   NA
 11824121 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4961.000 0.000 NA   NA
 11539367 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4990.000 0.000 NA   NA
 11681730 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4990.000 0.000 NA   NA
 11824122 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 4990.000 0.000 NA   NA
 11539368 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5022.000 0.000 NA   NA
 11681731 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5022.000 0.000 NA   NA
 11824123 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5022.000 0.000 NA   NA
 11539369 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5051.000 0.000 NA   NA
 11681732 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5051.000 0.000 NA   NA
 11824124 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5051.000 0.000 NA   NA
 11539370 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5083.000 0.000 NA   NA
 11681733 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5083.000 0.000 NA   NA
 11824125 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5083.000 0.000 NA   NA
 11539371 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5112.000 0.000 NA   NA
 11681734 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5112.000 0.000 NA   NA
 11824126 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5112.000 0.000 NA   NA
 11539372 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5144.000 0.000 NA   NA
 11681735 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5144.000 0.000 NA   NA
 11824127 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5144.000 0.000 NA   NA
 11539373 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5173.000 0.000 NA   NA
 11681736 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5173.000 0.000 NA   NA
 11824128 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5173.000 0.000 NA   NA
 11539374 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5205.000 0.000 NA   NA
 11681737 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5205.000 0.000 NA   NA
 11824129 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5205.000 0.000 NA   NA
 11539375 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5234.000 0.000 NA   NA
 11681738 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5234.000 0.000 NA   NA
 11824130 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5234.000 0.000 NA   NA
 11539376 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5266.000 0.000 NA   NA
 11681739 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5266.000 0.000 NA   NA
 11824131 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5266.000 0.000 NA   NA
 11539377 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5295.000 0.000 NA   NA
 11681740 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5295.000 0.000 NA   NA
 11824132 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5295.000 0.000 NA   NA
 11539378 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5327.000 0.000 NA   NA
 11681741 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5327.000 0.000 NA   NA
 11824133 5873671   EFER_0303   ygcL FALSE NA 5327.000 0.000 NA   NA
 5873682 5873683 EFER_0315 EFER_0316 cysD cysN TRUE 0.997 2.000 0.574 0.001 N NA
 5873683 5873684 EFER_0316 EFER_0317 cysN cysC TRUE 0.996 0.000 0.340 1.000 Y NA
 5873684 5873685 EFER_0317 EFER_0318 cysC ygbE TRUE 0.952 14.000 0.198 NA   NA
 5873685 5873686 EFER_0318 EFER_0320 ygbE ftsB FALSE 0.036 175.000 0.028 NA   NA
 5873686 5873687 EFER_0320 EFER_0321 ftsB ispD TRUE 0.906 19.000 0.185 1.000 N NA
 5873687 5873688 EFER_0321 EFER_0322 ispD ispF TRUE 0.997 0.000 0.419 1.000 Y NA
 5873688 5873689 EFER_0322 EFER_0323 ispF truD TRUE 0.963 -3.000 0.173 1.000   NA
 5873689 5873690 EFER_0323 EFER_0324 truD surE TRUE 0.896 -19.000 0.235 1.000   NA
 5873690 5873691 EFER_0324 EFER_0325 surE pcm TRUE 0.972 -6.000 0.353 1.000   NA
 5873693 5873694 EFER_0327 EFER_0328 nlpD rpoS FALSE 0.117 180.000 0.142 1.000 N NA
 5873696 5873697 EFER_0330 EFER_0331     TRUE 0.982 0.000 0.000 NA Y NA
 5873697 5873698 EFER_0331 EFER_0332     TRUE 0.866 11.000 0.000 NA   NA
 5873699 5873700 EFER_0333 EFER_0334 pphB mutS FALSE 0.129 106.000 0.000 1.000   NA
 5873700 5873701 EFER_0334 EFER_0335 mutS eryD FALSE 0.012 239.000 0.000 1.000 N NA
 5873701 5873702 EFER_0335 EFER_0336 eryD eryC TRUE 0.906 27.000 0.333 NA   NA
 5873702 5873703 EFER_0336 EFER_0337 eryC eryB TRUE 0.795 -169.000 0.389 NA   NA
 5873703 5873704 EFER_0337 EFER_0338 eryB eryA TRUE 0.994 9.000 0.350 0.003 N NA
 5873705 5873706 EFER_0339 EFER_0340     TRUE 0.994 -3.000 0.786 NA   NA
 5873706 5873707 EFER_0340 EFER_0341     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 5873707 5873708 EFER_0341 EFER_0342     TRUE 0.927 87.000 0.727 NA Y NA
 5873708 5873709 EFER_0342 EFER_0343     TRUE 0.997 5.000 0.333 NA Y NA
 5873709 5873710 EFER_0343 EFER_0344   ygbA FALSE 0.063 146.000 0.000 NA   NA
 5873711 5873712 EFER_0345 EFER_0346   fhlA TRUE 0.881 32.000 0.231 0.094 N NA
 5873712 5873713 EFER_0346 EFER_0347 fhlA hypE FALSE 0.049 148.000 0.019 1.000 N NA
 5873713 5873714 EFER_0347 EFER_0348 hypE hypD TRUE 0.948 39.000 0.353 1.000 Y NA
 5873714 5873715 EFER_0348 EFER_0349 hypD hypC TRUE 0.981 0.000 0.021 NA Y NA
 5873715 5873716 EFER_0349 EFER_0350 hypC hypB TRUE 0.968 -9.000 0.139 NA Y NA
 5873716 5873717 EFER_0350 EFER_0351 hypB hypA TRUE 0.995 4.000 0.306 0.002   NA
 5873718 5873719 EFER_0352 EFER_0353 hycA hycB FALSE 0.064 143.000 0.000 NA   NA
 5873719 5873720 EFER_0353 EFER_0354 hycB hycC TRUE 0.989 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 5873720 5873721 EFER_0354 EFER_0355 hycC hycD TRUE 0.997 3.000 0.382 1.000 Y NA
 5873721 5873722 EFER_0355 EFER_0356 hycD hycE TRUE 0.982 18.000 0.235 1.000 Y NA
 5873722 5873723 EFER_0356 EFER_0357 hycE hycF TRUE 0.997 10.000 0.200 0.002 Y NA
 5873723 5873724 EFER_0357 EFER_0358 hycF hycG TRUE 0.996 0.000 0.111 0.002 Y NA
 5873724 5873725 EFER_0358 EFER_0359 hycG hycH TRUE 0.956 -3.000 0.156 NA   NA
 5873725 5873726 EFER_0359 EFER_0360 hycH hycI TRUE 0.965 -7.000 0.360 NA   NA
 5873727 5873728 EFER_0361 EFER_0362 ascB ascF TRUE 0.998 9.000 0.485 1.000 Y NA
 5873729 5873730 EFER_0363 EFER_0365 ascG hydN FALSE 0.367 149.000 0.316 1.000 N NA
 5873730 5873731 EFER_0365 EFER_0366 hydN hypF FALSE 0.043 153.000 0.018 1.000 N NA
 5873732 5873733 EFER_misc_RNA_8 EFER_0367 C0664 norW TRUE 0.881 10.000 0.000 NA   NA
 5873733 5873734 EFER_0367 EFER_0368 norW norV TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5873739 5873740 EFER_0374 EFER_0375 ygaD recA FALSE 0.267 80.000 0.082 NA   NA
 5873740 5873741 EFER_0375 EFER_0376 recA recX TRUE 0.631 68.000 0.296 1.000   NA
 5873741 5873742 EFER_0376 EFER_0377 recX alaS FALSE 0.187 128.000 0.085 1.000   NA
 5873742 5873743 EFER_0377 EFER_0378 alaS csrA FALSE 0.011 235.000 0.020 1.000 N NA
 5873743 5873744 EFER_0378 EFER_tRNA5 csrA   FALSE 0.006 315.000 0.000 NA   NA
 5873744 5873745 EFER_tRNA5 EFER_tRNA6     TRUE 0.902 4.000 0.000 NA   NA
 5873745 5873746 EFER_tRNA6 EFER_tRNA7     FALSE 0.022 200.000 0.000 NA   NA
 5873746 5873747 EFER_tRNA7 EFER_tRNA8     FALSE 0.173 63.000 0.000 NA   NA
 5873747 5873748 EFER_tRNA8 EFER_tRNA9     FALSE 0.022 199.000 0.000 NA   NA
 5873748 5873749 EFER_tRNA9 EFER_0379   yqaB FALSE 0.007 280.000 0.000 NA   NA
 5873749 5873750 EFER_0379 EFER_0380 yqaB yqaA TRUE 0.905 -3.000 0.067 NA   NA
 5873750 5873751 EFER_0380 EFER_0381 yqaA gshA FALSE 0.251 73.000 0.071 NA   NA
 5873754 5873755 EFER_0383 EFER_0384     TRUE 0.982 -3.000 0.344 NA   NA
 5873755 5873756 EFER_0384 EFER_0385   emrB FALSE 0.010 258.000 0.000 NA   NA
 5873756 5873757 EFER_0385 EFER_0386 emrB emrA TRUE 0.989 17.000 0.875 1.000 N NA
 5873757 5873758 EFER_0386 EFER_0387 emrA mprA FALSE 0.207 127.000 0.107 1.000 N NA
 5873758 5873759 EFER_0387 EFER_0388 mprA ygaH FALSE 0.204 91.000 0.065 NA   NA
 5873759 5873760 EFER_0388 EFER_0389 ygaH ygaZ TRUE 0.986 -10.000 0.915 NA   NA
 5873760 5873761 EFER_0389 EFER_0390 ygaZ   FALSE 0.117 125.000 0.060 NA N NA
 5873761 5873762 EFER_0390 EFER_0391   proX FALSE 0.106 192.000 0.174 NA N NA
 5873762 5873763 EFER_0391 EFER_0392 proX proW TRUE 0.969 58.000 0.695 0.053 Y NA
 5873763 5873764 EFER_0392 EFER_0393 proW proV TRUE 0.995 -7.000 0.630 1.000 Y NA
 5873764 5873765 EFER_0393 EFER_0394 proV nrdF FALSE 0.004 356.000 0.000 1.000 N NA
 5873765 5873766 EFER_0394 EFER_0395 nrdF nrdE TRUE 0.993 10.000 0.000 0.001 Y NA
 5873766 5873767 EFER_0395 EFER_0396 nrdE nrdI TRUE 0.868 -27.000 0.000 NA Y NA
 5873767 5873768 EFER_0396 EFER_0397 nrdI nrdH TRUE 0.986 -3.000 0.440 NA N NA
 5873768 5873769 EFER_0397 EFER_0398 nrdH   FALSE 0.019 209.000 0.000 NA   NA
 5873775 5873776 EFER_0404 EFER_0405 ygaP ygaV TRUE 0.938 10.000 0.083 NA N NA
 5873777 5873778 EFER_0406 EFER_0407 yqaE ygaU FALSE 0.150 84.000 0.027 1.000   NA
 5873779 5873780 EFER_0408 EFER_0409 csiR gabP TRUE 0.973 21.000 0.625 1.000 N NA
 5873780 5873781 EFER_0409 EFER_0410 gabP gabT FALSE 0.158 237.000 0.121 1.000 Y NA
 5873781 5873782 EFER_0410 EFER_0411 gabT gabD TRUE 0.970 14.000 0.303 1.000 N NA
 5873782 5873783 EFER_0411 EFER_0412 gabD ygaF TRUE 0.606 23.000 0.000 1.000   NA
 5873783 5873784 EFER_0412 EFER_0413 ygaF ygaT TRUE 0.637 20.000 0.000 NA   NA
 5873786 5873787 EFER_0415 EFER_0416 yahB yahC FALSE 0.122 92.000 0.000 NA   NA
 5873788 5873789 EFER_0417 EFER_0418 yahD yahE TRUE 0.921 40.000 0.667 NA   NA
 5873789 5873790 EFER_0418 EFER_0419 yahE yahF TRUE 0.962 -10.000 0.429 NA   NA
 5873790 5873791 EFER_0419 EFER_0420 yahF yahG TRUE 0.995 0.000 0.714 NA   NA
 5873791 5873792 EFER_0420 EFER_0421 yahG yahI FALSE 0.313 96.000 0.125 NA   NA
 5873792 5873793 EFER_0421 EFER_0422 yahI yahJ TRUE 0.983 10.000 0.278 1.000 N NA
 5873794 5873795 EFER_0423 EFER_0424 yjhP yjhX TRUE 0.940 10.000 0.077 NA   NA
 5873796 5873797 EFER_0425 EFER_0426 yahK yahK FALSE 0.244 -160.000 0.000 NA   NA
 5873798 5873799 EFER_0427 EFER_0428     TRUE 0.934 28.000 0.000 0.003 Y NA
 5873800 5873801 EFER_0429 EFER_0430     TRUE 0.995 2.000 0.200 1.000 Y NA
 5873801 5873802 EFER_0430 EFER_0431     TRUE 0.945 -9.000 0.042 1.000 Y NA
 5873802 5873803 EFER_0431 EFER_0432     TRUE 0.983 -3.000 0.083 NA Y NA
 5873803 5873804 EFER_0432 EFER_0433     TRUE 0.765 -43.000 0.182 NA   NA
 5873804 5873805 EFER_0433 EFER_0434     FALSE 0.135 85.000 0.029 NA   NA
 5873805 5873806 EFER_0434 EFER_0435     FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 5873806 5873807 EFER_0435 EFER_0436     FALSE 0.378 -48.000 0.000 NA   NA
 5873808 5873809 EFER_0437 EFER_0438     FALSE 0.002 507.000 0.000 NA   NA
 5873809 5873810 EFER_0438 EFER_0439     FALSE 0.015 225.000 0.000 NA   NA
 5873810 5873811 EFER_0439 EFER_0440     FALSE 0.020 206.000 0.000 NA   NA
 5873811 5873812 EFER_0440 EFER_0441     TRUE 0.763 15.000 0.000 NA   NA
 5873812 5873813 EFER_0441 EFER_0442     FALSE 0.070 136.000 0.000 NA   NA
 5873813 5873814 EFER_0442 EFER_0443     TRUE 0.990 -7.000 1.000 NA   NA
 5873814 5873815 EFER_0443 EFER_0444   cI TRUE 0.709 -7.000 0.000 NA   NA
 5873815 5873816 EFER_0444 EFER_0445 cI   FALSE 0.032 183.000 0.000 NA   NA
 5873817 5873818 EFER_0446 EFER_0447     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5873818 5873819 EFER_0447 EFER_0448     FALSE 0.143 74.000 0.000 NA   NA
 5873820 5873821 EFER_0449 EFER_0450   int TRUE 0.548 24.000 0.000 NA   NA
 5873821 5873822 EFER_0450 EFER_misc_RNA_10 int ssrA FALSE 0.093 119.000 0.000 NA   NA
 5873822 5873823 EFER_misc_RNA_10 EFER_0452 ssrA   FALSE 0.225 -229.000 0.000 NA   NA
 5873823 5873824 EFER_0452 EFER_0453   smpB FALSE 0.003 416.000 0.000 NA   NA
 5873825 5873826 EFER_0454 EFER_0455 yfjG yfjF TRUE 0.859 -10.000 0.124 NA   NA
 5873827 5873828 EFER_0456 EFER_0457 smpA recN FALSE 0.079 149.000 0.049 1.000 N NA
 5873828 5873829 EFER_0457 EFER_0458 recN ppnK FALSE 0.409 86.000 0.170 1.000 N NA
 5873831 5873832 EFER_0460 EFER_0461 yfjD ypjD TRUE 0.563 111.000 0.349 NA   NA
 5873833 5873834 EFER_0462 EFER_0463 ffh rpsP FALSE 0.455 137.000 0.361 1.000 N NA
 5873834 5873835 EFER_0463 EFER_0464 rpsP rimM TRUE 0.992 19.000 0.342 0.012 Y NA
 5873835 5873836 EFER_0464 EFER_0465 rimM trmD TRUE 0.984 31.000 0.672 1.000 Y NA
 5873836 5873837 EFER_0465 EFER_0466 trmD rplS TRUE 0.965 42.000 0.567 1.000 Y NA
 5873839 5873840 EFER_0468 EFER_0469 aroF tyrA TRUE 0.980 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5873841 5873842 EFER_0470 EFER_4504 pheA pheL FALSE 0.114 100.000 0.000 NA   NA
 5873842 5873843 EFER_4504 EFER_0471 pheL yfiA FALSE 0.112 104.000 0.000 NA   NA
 5873843 5873844 EFER_0471 EFER_0472 yfiA yfiO FALSE 0.006 268.000 0.004 NA   NA
 5873845 5873846 EFER_0473 EFER_0474 rluD yfiH TRUE 0.959 -3.000 0.168 NA   NA
 5873846 5873847 EFER_0474 EFER_misc_RNA_11 yfiH ryfD TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5873847 5873848 EFER_misc_RNA_11 EFER_0475 ryfD clpB TRUE 0.520 -22.000 0.000 NA   NA
 5873848 5873849 EFER_0475 EFER_16S_6 clpB   FALSE 0.003 443.000 0.000 NA   NA
 5873849 5873850 EFER_16S_6 EFER_tRNA11     FALSE 0.132 86.000 0.000 NA   NA
 5873850 5873851 EFER_tRNA11 EFER_23S_6     FALSE 0.026 194.000 0.000 NA   NA
 5873851 5873852 EFER_23S_6 EFER_5S_7     FALSE 0.120 94.000 0.000 NA   NA
 5873852 5873853 EFER_5S_7 EFER_0486   kgtP FALSE 0.005 330.000 0.000 NA   NA
 5873854 5873855 EFER_0487 EFER_0488 yfiM pssA FALSE 0.251 97.000 0.089 NA   NA
 5873855 5873856 EFER_0488 EFER_0489 pssA yfiQ FALSE 0.409 114.000 0.121 0.061 N NA
 5873856 5873857 EFER_0489 EFER_0490 yfiQ yfiP TRUE 0.814 32.000 0.222 NA   NA
 5873857 5873858 EFER_0490 EFER_0491 yfiP trxC FALSE 0.300 69.000 0.084 NA   NA
 5873859 5873860 EFER_0492 EFER_0493   yfiF TRUE 0.642 -10.000 0.000 NA   NA
 5873862 5873863 EFER_0495 EFER_0496 yfiD yfiE FALSE 0.007 288.000 0.000 NA   NA
 5873867 5873868 EFER_0501 EFER_0502 rpoE rseA TRUE 0.945 33.000 0.705 NA N NA
 5873868 5873869 EFER_0502 EFER_0503 rseA rseB TRUE 0.999 0.000 0.856 NA Y NA
 5873869 5873870 EFER_0503 EFER_0504 rseB rseC TRUE 0.997 -3.000 0.609 NA Y NA
 5873870 5873871 EFER_0504 EFER_0505 rseC lepA FALSE 0.025 198.000 0.045 NA N NA
 5873871 5873872 EFER_0505 EFER_0506 lepA lepB TRUE 0.938 16.000 0.187 1.000   NA
 5873872 5873873 EFER_0506 EFER_0507 lepB rnc FALSE 0.028 273.000 0.117 1.000   NA
 5873873 5873874 EFER_0507 EFER_0508 rnc era TRUE 0.974 -3.000 0.127 0.048   NA
 5873874 5873875 EFER_0508 EFER_0509 era recO TRUE 0.948 12.000 0.109 1.000   NA
 5873875 5873876 EFER_0509 EFER_0510 recO pdxJ TRUE 0.960 12.000 0.166 1.000 N NA
 5873876 5873877 EFER_0510 EFER_0511 pdxJ acpS TRUE 0.987 0.000 0.326 1.000 N NA
 5873879 5873880 EFER_misc_RNA_13 EFER_0512 ryfB   FALSE 0.235 -183.000 0.000 NA   NA
 5873881 5873882 EFER_0513 EFER_0514 yfhL yfhH FALSE 0.279 56.000 0.056 NA   NA
 5873883 5873884 EFER_0515 EFER_0516 yfhB tadA TRUE 0.619 25.000 0.062 NA N NA
 5873886 5873887 EFER_0518 EFER_misc_RNA_14 purL tke1 FALSE 0.005 333.000 0.000 NA   NA
 5873887 5873888 EFER_misc_RNA_14 EFER_0519 tke1 yfhK FALSE 0.120 94.000 0.000 NA   NA
 5873888 5873889 EFER_0519 EFER_0520 yfhK yfhG FALSE 0.044 165.000 0.029 NA   NA
 5873889 5873890 EFER_0520 EFER_0521 yfhG yfhA TRUE 0.646 -10.000 0.029 NA   NA
 5873890 5873891 EFER_0521 EFER_0522 yfhA glnB FALSE 0.460 61.000 0.146 1.000 N NA
 5873891 5873892 EFER_0522 EFER_0523 glnB adk FALSE 0.010 251.000 0.000 1.000 N NA
 5873892 5873893 EFER_0523 EFER_0525 adk hemH FALSE 0.057 132.000 0.013 1.000 N NA
 5873895 5873896 EFER_0527 EFER_0528 gsk   FALSE 0.050 156.000 0.000 NA   NA
 5873896 5873897 EFER_0528 EFER_0529     FALSE 0.148 71.000 0.000 NA   NA
 5873898 5873899 EFER_0530 EFER_0531 ybaL fsr FALSE 0.010 234.000 0.000 NA N NA
 5873901 5873902 EFER_misc_RNA_15 EFER_0533 rybC   FALSE 0.132 86.000 0.000 NA   NA
 5873902 5873903 EFER_0533 EFER_0534     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5873903 5873904 EFER_0534 EFER_0535   ybaK TRUE 0.548 24.000 0.000 NA   NA
 5873907 5873908 EFER_0537 EFER_0538   ybaQ TRUE 0.830 36.000 0.286 NA   NA
 5873910 5873911 EFER_0540 EFER_0541 ybaT siiCA FALSE 0.004 347.000 0.000 1.000 N NA
 5873911 5873912 EFER_0541 EFER_0542 siiCA siiEA FALSE 0.108 109.000 0.000 NA   NA
 5873912 5873913 EFER_0542 EFER_0543 siiEA siiBA TRUE 0.980 4.000 0.200 NA   NA
 5873913 5873914 EFER_0543 EFER_0544 siiBA siiDA TRUE 0.928 -3.000 0.000 0.082 N NA
 5873914 5873915 EFER_0544 EFER_0545 siiDA cueR TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5873916 5873917 EFER_0546 EFER_0547 ybbJ ybbK TRUE 0.994 -3.000 0.313 NA Y NA
 5873918 5873919 EFER_0548 EFER_0549 ybbL ybbM TRUE 0.538 -13.000 0.012 NA   NA
 5873920 5873921 EFER_0550 EFER_0551 ybbN ybbO FALSE 0.437 61.000 0.118 1.000   NA
 5873921 5873922 EFER_0551 EFER_0552 ybbO tesA TRUE 0.802 -10.000 0.072 1.000   NA
 5873923 5873924 EFER_0553 EFER_0554 ybbA ybbP TRUE 0.997 -3.000 0.535 1.000 Y NA
 5873924 5873925 EFER_0554 EFER_0555 ybbP   FALSE 0.013 237.000 0.000 NA   NA
 5873925 5873926 EFER_0555 EFER_0556     FALSE 0.116 98.000 0.000 NA   NA
 5873926 5873927 EFER_0556 EFER_0557     FALSE 0.002 469.000 0.000 NA   NA
 5873927 5873928 EFER_0557 EFER_0558     FALSE 0.003 427.000 0.000 NA   NA
 5873930 5873931 EFER_0560 EFER_0561 ylbF ybcF TRUE 0.984 -3.000 0.375 NA   NA
 5873932 5873933 EFER_0562 EFER_0563 purK purK FALSE 0.427 31.000 0.000 NA   NA
 5873933 5873934 EFER_0563 EFER_0564 purK purE TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5873934 5873935 EFER_0564 EFER_0565 purE   FALSE 0.082 96.000 0.002 NA   NA
 5873935 5873936 EFER_0565 EFER_0566   lpxH FALSE 0.076 111.000 0.005 NA   NA
 5873936 5873937 EFER_0566 EFER_0567 lpxH ppiB TRUE 0.985 3.000 0.237 1.000   NA
 5873939 5873940 EFER_0569 EFER_0570 ybcI ybcJ FALSE 0.085 108.000 0.011 NA   NA
 5873940 5873941 EFER_0570 EFER_0571 ybcJ folD TRUE 0.939 2.000 0.055 1.000   NA
 5873943 5873944 EFER_0572 EFER_0573 intD yfdT FALSE 0.014 227.000 0.000 NA   NA
 5873944 5873945 EFER_0573 EFER_0574 yfdT yfdS TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5873945 5873946 EFER_0574 EFER_0575 yfdS yfdR TRUE 0.672 -9.000 0.000 NA   NA
 5873946 5873947 EFER_0575 EFER_0576 yfdR yfdQ FALSE 0.094 128.000 0.039 NA   NA
 5873947 5873948 EFER_0576 EFER_0577 yfdQ   TRUE 0.566 66.000 0.233 NA   NA
 5873949 5873950 EFER_0578 EFER_0579     FALSE 0.038 172.000 0.000 NA   NA
 5873954 5873955 EFER_0583 EFER_0584   ymfL FALSE 0.319 -82.000 0.000 NA   NA
 5873955 5873956 EFER_0584 EFER_0585 ymfL ymfM TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5873956 5873957 EFER_0585 EFER_0587 ymfM   TRUE 0.881 10.000 0.000 NA   NA
 5873957 5873958 EFER_0587 EFER_0588   yfdN TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5873958 5873959 EFER_0588 EFER_0589 yfdN   FALSE 0.437 -33.000 0.000 NA   NA
 5873959 5873960 EFER_0589 EFER_0590     TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 5873960 5873961 EFER_0590 EFER_0591   rusA TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 5873961 5873962 EFER_0591 EFER_0592 rusA   TRUE 0.986 20.000 1.000 NA   NA
 5873962 5873963 EFER_0592 EFER_0593     TRUE 0.996 2.000 0.667 NA   NA
 5873963 5873964 EFER_0593 EFER_0594     TRUE 0.901 3.000 0.000 NA   NA
 5873966 5873967 EFER_0596 EFER_0597 S r TRUE 0.902 4.000 0.000 NA   NA
 5873967 5873968 EFER_0597 EFER_0598 r   TRUE 0.905 -16.000 0.250 NA   NA
 5873968 5873969 EFER_0598 EFER_0599     FALSE 0.002 514.000 0.000 NA   NA
 5873969 5873970 EFER_0599 EFER_0600     FALSE 0.203 128.000 0.105 NA   NA
 5873970 5873971 EFER_0600 EFER_0601     FALSE 0.240 117.000 0.105 NA   NA
 5873971 5873972 EFER_0601 EFER_0602     TRUE 0.966 -3.000 0.200 NA   NA
 5873972 5873973 EFER_0602 EFER_0603   ymfR TRUE 0.948 12.000 0.120 NA   NA
 5873973 5873974 EFER_0603 EFER_0604 ymfR   TRUE 0.994 0.000 0.600 NA   NA
 5873974 5873975 EFER_0604 EFER_0605     TRUE 0.775 -58.000 0.222 NA   NA
 5873975 5873976 EFER_0605 EFER_0606     TRUE 0.938 15.000 0.174 NA   NA
 5873976 5873977 EFER_0606 EFER_0607     FALSE 0.430 50.000 0.087 NA   NA
 5873977 5873978 EFER_0607 EFER_0608     TRUE 0.989 3.000 0.333 NA   NA
 5873978 5873979 EFER_0608 EFER_0609     TRUE 0.894 -3.000 0.058 NA   NA
 5873979 5873980 EFER_0609 EFER_0610     TRUE 0.564 -25.000 0.047 NA   NA
 5873980 5873981 EFER_0610 EFER_0611     TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 5873981 5873982 EFER_0611 EFER_0612     TRUE 0.991 9.000 0.417 NA   NA
 5873982 5873983 EFER_0612 EFER_0613     TRUE 0.977 -16.000 0.800 NA   NA
 5873983 5873984 EFER_0613 EFER_0614     TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 5873984 5873985 EFER_0614 EFER_0615     TRUE 0.997 0.000 0.900 NA   NA
 5873985 5873986 EFER_0615 EFER_0616     FALSE 0.274 142.000 0.200 NA   NA
 5873986 5873987 EFER_0616 EFER_0617     FALSE 0.135 82.000 0.000 NA   NA
 5873987 5873988 EFER_0617 EFER_0618     FALSE 0.124 91.000 0.000 NA   NA
 5873988 5873989 EFER_0618 EFER_0619     TRUE 0.974 -3.000 0.250 NA   NA
 5873989 5873990 EFER_0619 EFER_0620     TRUE 0.930 0.000 0.062 NA   NA
 5873990 5873991 EFER_0620 EFER_0621     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 5873991 5873992 EFER_0621 EFER_0622     TRUE 0.779 -13.000 0.083 NA   NA
 5873992 5873993 EFER_0622 EFER_0623   ymfQ TRUE 0.828 -9.000 0.083 NA   NA
 5873993 5873994 EFER_0623 EFER_0624 ymfQ   TRUE 0.902 4.000 0.000 NA   NA
 5873994 5873995 EFER_0624 EFER_0625     TRUE 0.503 -24.000 0.000 NA   NA
 5873998 5873999 EFER_0628 EFER_0629 yfdH yfdG TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5873999 5874000 EFER_0629 EFER_0632 yfdG hmp FALSE 0.004 372.000 0.000 1.000   NA
 5874004 5874005 EFER_0637 EFER_0638 csiE yfhR FALSE 0.028 196.000 0.000 1.000   NA
 5874005 5874006 EFER_0638 EFER_0639 yfhR suhB FALSE 0.063 134.000 0.003 1.000   NA
 5874007 5874008 EFER_0640 EFER_0641 yfhQ iscR FALSE 0.028 270.000 0.126 1.000 N NA
 5874008 5874009 EFER_0641 EFER_0642 iscR iscS FALSE 0.146 241.000 0.424 1.000 N NA
 5874009 5874010 EFER_0642 EFER_0643 iscS iscU TRUE 0.928 28.000 0.448 1.000 N NA
 5874010 5874011 EFER_0643 EFER_0644 iscU iscA TRUE 0.984 17.000 0.359 0.002   NA
 5874011 5874012 EFER_0644 EFER_0645 iscA hscB TRUE 0.702 96.000 0.500 1.000   NA
 5874012 5874013 EFER_0645 EFER_0646 hscB hscA TRUE 0.995 17.000 0.634 1.000 Y NA
 5874013 5874014 EFER_0646 EFER_0647 hscA fdx TRUE 0.996 2.000 0.794 1.000 N NA
 5874014 5874015 EFER_0647 EFER_0648 fdx yfhJ TRUE 0.993 12.000 0.625 1.000   NA
 5874015 5874016 EFER_0648 EFER_0649 yfhJ pepB FALSE 0.155 178.000 0.171 1.000   NA
 5874016 5874017 EFER_0649 EFER_0650 pepB sseB FALSE 0.430 119.000 0.253 NA   NA
 5874020 5874021 EFER_misc_RNA_19 EFER_0651 IS128 sseA FALSE 0.046 161.000 0.000 NA   NA
 5874022 5874023 EFER_0652 EFER_0653 yfhM pbpC TRUE 0.996 1.000 0.711 1.000   NA
 5874023 5874024 EFER_0653 EFER_0654 pbpC ndk FALSE 0.042 148.000 0.008 1.000 N NA
 5874024 5874025 EFER_0654 EFER_0655 ndk yfgB FALSE 0.217 150.000 0.156 1.000   NA
 5874025 5874026 EFER_0655 EFER_0656 yfgB yfgA FALSE 0.007 291.000 0.020 1.000   NA
 5874026 5874027 EFER_0656 EFER_0657 yfgA ispG TRUE 0.871 27.000 0.233 1.000   NA
 5874027 5874028 EFER_0657 EFER_0658 ispG hisS FALSE 0.396 111.000 0.207 1.000 N NA
 5874028 5874029 EFER_0658 EFER_0659 hisS yfgM TRUE 0.946 18.000 0.259 1.000   NA
 5874029 5874030 EFER_0659 EFER_0660 yfgM yfgL TRUE 0.991 11.000 0.492 1.000   NA
 5874030 5874031 EFER_0660 EFER_0661 yfgL der FALSE 0.379 119.000 0.203 1.000   NA
 5874031 5874032 EFER_0661 EFER_0662 der   FALSE 0.133 63.000 0.009 NA   NA
 5874032 5874033 EFER_0662 EFER_0663     FALSE 0.027 192.000 0.000 NA   NA
 5874033 5874034 EFER_0663 EFER_0664     TRUE 0.838 50.000 0.500 NA   NA
 5874034 5874035 EFER_0664 EFER_0665     FALSE 0.462 110.000 0.250 NA   NA
 5874037 5874038 EFER_0667 EFER_0668 guaB guaA TRUE 0.888 69.000 0.190 0.001 Y NA
 5874039 5874040 EFER_0669 EFER_0670   yfgI FALSE 0.111 106.000 0.000 NA   NA
 5874040 5874041 EFER_0670 EFER_0671 yfgI yfgH TRUE 0.956 16.000 0.273 NA   NA
 5874042 5874043 EFER_0672 EFER_0673     FALSE 0.004 370.000 0.000 NA   NA
 5874044 5874045 EFER_0674 EFER_0675 ppx ppk TRUE 0.961 -82.000 0.486 1.000 Y NA
 5874045 5874046 EFER_0675 EFER_0676 ppk purN FALSE 0.017 201.000 0.017 1.000 N NA
 5874046 5874047 EFER_0676 EFER_0677 purN purM TRUE 0.996 -3.000 0.230 0.001 Y NA
 5874048 5874049 EFER_0678 EFER_0679 upp uraA TRUE 0.667 86.000 0.101 1.000 Y NA
 5874049 5874050 EFER_0679 EFER_0680 uraA hda FALSE 0.164 72.000 0.048 NA N NA
 5874051 5874052 EFER_0681 EFER_0682 yfgD yfgC TRUE 0.927 21.000 0.259 1.000   NA
 5874054 5874055 EFER_0684 EFER_0685     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5874055 5874056 EFER_0685 EFER_0686   hyfI TRUE 0.946 -7.000 0.250 NA   NA
 5874056 5874057 EFER_0686 EFER_0687 hyfI   TRUE 0.940 -42.000 0.222 1.000 Y NA
 5874057 5874058 EFER_0687 EFER_0688   hyfG TRUE 0.984 10.000 0.044 1.000 Y NA
 5874058 5874059 EFER_0688 EFER_0689 hyfG hyfF TRUE 0.963 -10.000 0.016 0.007 Y NA
 5874059 5874060 EFER_0689 EFER_0690 hyfF hyfE TRUE 0.999 5.000 0.864 0.007 Y NA
 5874060 5874061 EFER_0690 EFER_0691 hyfE hyfD TRUE 0.992 12.000 0.093 0.007 Y NA
 5874061 5874062 EFER_0691 EFER_0692 hyfD hyfC TRUE 0.997 7.000 0.412 1.000 Y NA
 5874062 5874063 EFER_0692 EFER_0693 hyfC   TRUE 0.984 11.000 0.059 1.000 Y NA
 5874063 5874064 EFER_0693 EFER_0694     TRUE 0.816 -54.000 0.000 1.000 Y NA
 5874064 5874065 EFER_0694 EFER_0695   bcp FALSE 0.011 246.000 0.000 1.000 N NA
 5874065 5874066 EFER_0695 EFER_0696 bcp gcvR TRUE 0.955 0.000 0.102 1.000 N NA
 5874067 5874068 EFER_0697 EFER_0698 dapA nlpB TRUE 0.985 17.000 0.267 NA Y NA
 5874068 5874069 EFER_0698 EFER_0700 nlpB purC FALSE 0.012 212.000 0.019 NA N NA
 5874069 5874070 EFER_0700 EFER_0702 purC ypfJ FALSE 0.029 168.000 0.006 NA   NA
 5874070 5874071 EFER_0702 EFER_0703 ypfJ ypfI TRUE 0.764 15.000 0.029 NA   NA
 5874071 5874072 EFER_0703 EFER_0704 ypfI ypfH FALSE 0.143 74.000 0.000 NA   NA
 5874073 5874074 EFER_0705 EFER_0706 ypfN dapE FALSE 0.450 28.000 0.025 NA   NA
 5874074 5874075 EFER_0706 EFER_0707 dapE yffB TRUE 0.987 4.000 0.292 1.000 N NA
 5874075 5874076 EFER_0707 EFER_0708 yffB acrD FALSE 0.002 550.000 0.000 1.000 N NA
 5874076 5874077 EFER_0708 EFER_0709 acrD narQ FALSE 0.395 119.000 0.133 0.080 N NA
 5874078 5874079 EFER_0711 EFER_0712 aegA yffH FALSE 0.448 68.000 0.167 1.000 N NA
 5874079 5874080 EFER_0712 EFER_0713 yffH ypfG TRUE 0.568 99.000 0.333 NA   NA
 5874081 5874082 EFER_0714 EFER_0715 tktB talA TRUE 0.992 23.000 0.739 1.000 Y NA
 5874083 5874084 EFER_0716 EFER_0717 maeB ypfE FALSE 0.012 295.000 0.070 1.000 N NA
 5874084 5874085 EFER_0717 EFER_0718 ypfE eutP TRUE 0.969 13.000 0.017 1.000 Y NA
 5874085 5874086 EFER_0718 EFER_0719 eutP eutQ TRUE 0.864 -25.000 0.017 NA Y NA
 5874086 5874087 EFER_0719 EFER_0720 eutQ eutT TRUE 0.991 -3.000 0.214 NA Y NA
 5874087 5874088 EFER_0720 EFER_0721 eutT eutI TRUE 0.932 -3.000 0.095 1.000 N NA
 5874088 5874089 EFER_0721 EFER_0722 eutI cchA TRUE 0.958 39.000 0.455 NA Y NA
 5874089 5874090 EFER_0722 EFER_0723 cchA cchB TRUE 0.695 107.000 0.182 NA Y NA
 5874090 5874091 EFER_0723 EFER_0724 cchB eutE TRUE 0.998 12.000 0.667 NA Y NA
 5874091 5874092 EFER_0724 EFER_0725 eutE eutJ TRUE 0.987 11.000 0.375 1.000 N NA
 5874092 5874093 EFER_0725 EFER_0726 eutJ eutG TRUE 0.972 -10.000 0.556 1.000 N NA
 5874093 5874094 EFER_0726 EFER_0727 eutG eutH FALSE 0.396 117.000 0.222 1.000 N NA
 5874094 5874095 EFER_0727 EFER_0728 eutH eutA TRUE 0.995 -3.000 0.400 NA Y NA
 5874095 5874096 EFER_0728 EFER_0729 eutA eutB TRUE 0.975 12.000 0.000 NA Y NA
 5874096 5874097 EFER_0729 EFER_0730 eutB eutC TRUE 0.967 21.000 0.000 0.001 Y NA
 5874097 5874098 EFER_0730 EFER_0731 eutC eutL TRUE 0.983 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5874098 5874099 EFER_0731 EFER_0732 eutL yffI TRUE 0.921 13.000 0.106 NA N NA
 5874099 5874100 EFER_0732 EFER_0733 yffI yfeG TRUE 0.699 46.000 0.250 NA N NA
 5874101 5874102 EFER_0734 EFER_0735     TRUE 0.727 -36.000 0.133 NA   NA
 5874102 5874103 EFER_0735 EFER_0736   hemF FALSE 0.069 138.000 0.000 NA   NA
 5874103 5874104 EFER_0736 EFER_0737 hemF amiA TRUE 0.892 4.000 0.025 1.000 N NA
 5874105 5874106 EFER_0738 EFER_0739 ypeA yfeZ TRUE 0.714 -13.000 0.059 NA   NA
 5874106 5874107 EFER_0739 EFER_0740 yfeZ yfeY TRUE 0.547 61.000 0.204 NA   NA
 5874107 5874108 EFER_0740 EFER_0741 yfeY yfeX TRUE 0.573 96.000 0.333 NA   NA
 5874109 5874110 EFER_0742 EFER_0743 murQ murP TRUE 0.976 3.000 0.167 1.000 N NA
 5874110 5874111 EFER_0743 EFER_0744 murP yfeU TRUE 0.977 4.000 0.158 1.000   NA
 5874112 5874113 EFER_0745 EFER_0746 yfeT ucpA FALSE 0.075 129.000 0.000 1.000 N NA
 5874113 5874114 EFER_0746 EFER_0748 ucpA cysP FALSE 0.008 304.000 0.043 1.000 N NA
 5874114 5874115 EFER_0748 EFER_0749 cysP cysU TRUE 0.996 0.000 0.479 0.002 N NA
 5874115 5874116 EFER_0749 EFER_0750 cysU cysW TRUE 0.997 0.000 0.583 0.001 N NA
 5874116 5874117 EFER_0750 EFER_0751 cysW cysA TRUE 0.972 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 5874117 5874118 EFER_0751 EFER_0752 cysA cysM FALSE 0.094 135.000 0.049 1.000 N NA
 5874121 5874122 EFER_0755 EFER_0756 crr ptsI TRUE 0.863 41.000 0.000 0.014 Y NA
 5874122 5874123 EFER_0756 EFER_0757 ptsI ptsH TRUE 0.828 47.000 0.000 0.014 Y NA
 5874123 5874124 EFER_0757 EFER_0759 ptsH cysK FALSE 0.003 382.000 0.019 1.000 N NA
 5874124 5874125 EFER_0759 EFER_0761 cysK cysZ FALSE 0.406 164.000 0.122 1.000 Y NA
 5874126 5874127 EFER_0762 EFER_0763 zipA ligA FALSE 0.101 71.000 0.002 1.000 N NA
 5874127 5874128 EFER_0763 EFER_0764 ligA   FALSE 0.269 -91.000 0.017 NA   NA
 5874129 5874130 EFER_0765 EFER_0766 yfeH yfeN FALSE 0.008 277.000 0.000 NA   NA
 5874131 5874132 EFER_0767 EFER_0768 xapA xapB FALSE 0.443 58.000 0.111 1.000   NA
 5874132 5874133 EFER_0768 EFER_0769 xapB xapR FALSE 0.014 370.000 0.130 1.000   NA
 5874134 5874135 EFER_tRNA84 EFER_tRNA83     TRUE 0.900 5.000 0.000 NA   NA
 5874135 5874136 EFER_tRNA83 EFER_tRNA82     FALSE 0.253 47.000 0.000 NA   NA
 5874136 5874137 EFER_tRNA82 EFER_tRNA81     FALSE 0.268 45.000 0.000 NA   NA
 5874139 5874140 EFER_0771 EFER_0772 yfeD yfeC TRUE 0.993 2.000 0.250 0.006   NA
 5874141 5874142 EFER_tRNA13 EFER_tRNA14     FALSE 0.317 40.000 0.000 NA   NA
 5874142 5874143 EFER_tRNA14 EFER_0775     FALSE 0.071 135.000 0.000 NA   NA
 5874146 5874147 EFER_0778 EFER_0779 ypeC yfeO FALSE 0.100 115.000 0.000 NA   NA
 5874148 5874149 EFER_0780 EFER_0781 glk ypdH FALSE 0.167 219.000 0.091 1.000 Y NA
 5874149 5874150 EFER_0781 EFER_0782 ypdH ypdG TRUE 0.996 22.000 0.875 0.013 Y NA
 5874150 5874151 EFER_0782 EFER_0783 ypdG ypdF TRUE 0.700 15.000 0.011 1.000 N NA
 5874151 5874152 EFER_0783 EFER_0784 ypdF ypdE TRUE 0.953 0.000 0.009 0.020 N NA
 5874152 5874153 EFER_0784 EFER_0785 ypdE ypdD TRUE 0.986 25.000 0.571 1.000 Y NA
 5874154 5874155 EFER_0786 EFER_0787 ypdC ypdB TRUE 0.987 12.000 0.051 0.077 Y NA
 5874155 5874156 EFER_0787 EFER_0788 ypdB ypdA TRUE 0.998 15.000 0.744 0.015 Y NA
 5874157 5874159 EFER_0789 EFER_misc_RNA_20 yfdZ tpke70 FALSE 0.002 488.000 0.000 NA   NA
 5874162 5874163 EFER_0793 EFER_0794     FALSE 0.005 323.000 0.000 1.000 N NA
 5874163 5874164 EFER_0794 EFER_0795     FALSE 0.409 73.000 0.154 1.000 N NA
 5874164 5874165 EFER_0795 EFER_0796     TRUE 0.960 21.000 0.458 NA   NA
 5874165 5874166 EFER_0796 EFER_0797     TRUE 0.987 11.000 0.379 NA   NA
 5874166 5874167 EFER_0797 EFER_0798     TRUE 0.969 12.000 0.207 NA   NA
 5874167 5874168 EFER_0798 EFER_0799     TRUE 0.982 -30.000 0.840 0.005 N NA
 5874168 5874169 EFER_0799 EFER_0800     TRUE 0.980 -31.000 0.542 1.000 Y NA
 5874169 5874170 EFER_0800 EFER_0801     TRUE 0.989 10.000 0.375 1.000 N NA
 5874170 5874171 EFER_0801 EFER_0802     TRUE 0.988 11.000 0.231 0.046   NA
 5874171 5874172 EFER_0802 EFER_0803     TRUE 0.652 21.000 0.000 1.000   NA
 5874172 5874173 EFER_0803 EFER_0804     FALSE 0.002 685.000 0.000 NA   NA
 5874174 5874175 EFER_0805 EFER_0806     TRUE 0.992 -3.000 0.667 NA   NA
 5874175 5874176 EFER_0806 EFER_0807     TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 5874176 5874177 EFER_0807 EFER_0808     FALSE 0.003 401.000 0.000 NA   NA
 5874177 5874178 EFER_0808 EFER_0809     TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5874178 5874179 EFER_0809 EFER_0810     TRUE 0.993 -3.000 0.750 NA   NA
 5874179 5874180 EFER_0810 EFER_0811     TRUE 0.967 32.000 1.000 NA   NA
 5874180 5874181 EFER_0811 EFER_0812     TRUE 0.923 -37.000 0.500 NA   NA
 5874183 5874184 EFER_0814 EFER_0815     FALSE 0.113 103.000 0.000 NA   NA
 5874184 5874185 EFER_0815 EFER_0816   int FALSE 0.427 31.000 0.000 NA   NA
 5874185 5874186 EFER_0816 EFER_tRNA80 int   FALSE 0.080 128.000 0.000 NA   NA
 5874186 5874187 EFER_tRNA80 EFER_0817   yfdC FALSE 0.141 76.000 0.000 NA   NA
 5874190 5874191 EFER_0821 EFER_0822 yfcZ yfcY FALSE 0.008 339.000 0.061 NA   NA
 5874191 5874192 EFER_0822 EFER_0823 yfcY yfcX TRUE 0.997 0.000 0.430 1.000 Y NA
 5874192 5874193 EFER_0823 EFER_0824 yfcX sixA FALSE 0.019 206.000 0.000 1.000 N NA
 5874193 5874194 EFER_0824 EFER_0825 sixA yfcV FALSE 0.002 569.000 0.000 1.000 N NA
 5874194 5874195 EFER_0825 EFER_0826 yfcV   TRUE 0.955 75.000 1.000 1.000 Y NA
 5874195 5874196 EFER_0826 EFER_0827   yfcS TRUE 0.996 20.000 1.000 1.000 Y NA
 5874196 5874197 EFER_0827 EFER_0828 yfcS yfcR TRUE 0.990 16.000 0.333 1.000 Y NA
 5874197 5874198 EFER_0828 EFER_0829 yfcR yfcQ TRUE 0.998 -3.000 0.571 0.007 Y NA
 5874198 5874199 EFER_0829 EFER_0830 yfcQ yfcP TRUE 0.996 -3.000 0.286 0.007 Y NA
 5874199 5874200 EFER_0830 EFER_0831 yfcP yfcO TRUE 0.600 -13.000 0.000 NA   NA
 5874202 5874203 EFER_0833 EFER_0834 prmB aroC TRUE 0.575 35.000 0.081 1.000 N NA
 5874203 5874204 EFER_0834 EFER_0835 aroC mepA TRUE 0.890 3.000 0.025 1.000 N NA
 5874204 5874205 EFER_0835 EFER_0836 mepA yfcA TRUE 0.973 0.000 0.160 1.000   NA
 5874205 5874206 EFER_0836 EFER_0837 yfcA yfcM TRUE 0.969 0.000 0.153 NA   NA
 5874206 5874207 EFER_0837 EFER_0838 yfcM yfcL TRUE 0.899 34.000 0.425 NA   NA
 5874209 5874210 EFER_0840 EFER_0841 fabB yfcJ FALSE 0.010 233.000 0.000 NA N NA
 5874212 5874213 EFER_0843 EFER_0844 pdxB usg TRUE 0.825 66.000 0.097 0.009 Y NA
 5874213 5874214 EFER_0844 EFER_0845 usg truA TRUE 0.900 0.000 0.040 1.000 N NA
 5874214 5874215 EFER_0845 EFER_0846 truA dedA FALSE 0.154 83.000 0.038 NA   NA
 5874215 5874216 EFER_0846 EFER_0847 dedA accD FALSE 0.044 156.000 0.020 NA   NA
 5874216 5874217 EFER_0847 EFER_0848 accD folC TRUE 0.680 70.000 0.383 1.000 N NA
 5874217 5874218 EFER_0848 EFER_0849 folC dedD TRUE 0.839 -28.000 0.216 NA   NA
 5874218 5874219 EFER_0849 EFER_0850 dedD cvpA FALSE 0.030 259.000 0.116 NA   NA
 5874219 5874220 EFER_0850 EFER_0851 cvpA purF TRUE 0.816 37.000 0.262 1.000   NA
 5874220 5874221 EFER_0851 EFER_0852 purF ubiX FALSE 0.169 95.000 0.056 1.000 N NA
 5874221 5874222 EFER_0852 EFER_0853 ubiX argT FALSE 0.009 265.000 0.000 1.000 N NA
 5874222 5874223 EFER_0853 EFER_0854 argT hisJ FALSE 0.179 223.000 0.000 0.015 Y NA
 5874223 5874224 EFER_0854 EFER_0855 hisJ hisQ TRUE 0.960 90.000 0.833 0.050 Y NA
 5874224 5874225 EFER_0855 EFER_0856 hisQ hisM TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.017 Y NA
 5874225 5874226 EFER_0856 EFER_0857 hisM hisP TRUE 0.998 8.000 0.643 1.000 Y NA
 5874226 5874227 EFER_0857 EFER_0858 hisP yfcI FALSE 0.023 197.000 0.000 NA   NA
 5874228 5874229 EFER_0859 EFER_0860 yfcH folX TRUE 0.854 21.000 0.122 1.000   NA
 5874229 5874230 EFER_0860 EFER_0861 folX yfcG FALSE 0.152 57.000 0.012 1.000 N NA
 5874231 5874232 EFER_0862 EFER_0863 yfcF yfcE FALSE 0.419 53.000 0.092 NA   NA
 5874232 5874233 EFER_0863 EFER_0864 yfcE yfcD TRUE 0.861 -40.000 0.143 0.011   NA
 5874235 5874236 EFER_0866 EFER_0867     TRUE 0.824 68.000 0.117 0.013 Y NA
 5874236 5874237 EFER_0867 EFER_0868     TRUE 0.894 17.000 0.000 0.017   NA
 5874237 5874238 EFER_0868 EFER_0869     TRUE 0.859 -3.000 0.000 1.000   NA
 5874238 5874239 EFER_0869 EFER_0870     TRUE 0.998 -7.000 0.742 0.002 Y NA
 5874240 5874241 EFER_0871 EFER_0872 pta ackA TRUE 0.803 77.000 0.634 1.000   NA
 5874241 5874242 EFER_0872 EFER_0873 ackA   FALSE 0.038 172.000 0.000 NA   NA
 5874243 5874244 EFER_0874 EFER_0875 yfbV yfbU TRUE 0.555 64.000 0.221 NA   NA
 5874244 5874245 EFER_0875 EFER_0876 yfbU yfbT TRUE 0.987 11.000 0.375 NA   NA
 5874245 5874246 EFER_0876 EFER_0877 yfbT yfbS TRUE 0.593 87.000 0.308 1.000   NA
 5874247 5874248 EFER_0878 EFER_0879 yfbR yfbQ TRUE 0.706 -34.000 0.104 1.000   NA
 5874249 5874250 EFER_0881 EFER_0882 lrhA nuoA FALSE 0.002 617.000 0.000 1.000 N NA
 5874250 5874251 EFER_0882 EFER_0883 nuoA nuoB TRUE 0.995 16.000 0.377 0.004 Y NA
 5874251 5874252 EFER_0883 EFER_0884 nuoB nuoC TRUE 0.955 94.000 0.691 0.004 Y NA
 5874252 5874253 EFER_0884 EFER_0885 nuoC nuoE TRUE 0.999 3.000 0.407 0.007 Y NA
 5874253 5874254 EFER_0885 EFER_0886 nuoE nuoF TRUE 0.995 -3.000 0.186 0.007 Y NA
 5874254 5874255 EFER_0886 EFER_0887 nuoF nuoG TRUE 0.924 47.000 0.180 0.007 Y NA
 5874255 5874256 EFER_0887 EFER_0888 nuoG nuoH TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.007 Y NA
 5874256 5874257 EFER_0888 EFER_0889 nuoH nuoI TRUE 0.996 15.000 0.423 0.007 Y NA
 5874257 5874258 EFER_0889 EFER_0890 nuoI nuoJ TRUE 0.998 12.000 0.428 0.007 Y NA
 5874258 5874259 EFER_0890 EFER_0891 nuoJ nuoK TRUE 0.996 -3.000 0.269 0.004 Y NA
 5874259 5874260 EFER_0891 EFER_0892 nuoK nuoL TRUE 0.995 -3.000 0.211 0.007 Y NA
 5874260 5874261 EFER_0892 EFER_0893 nuoL nuoM TRUE 0.887 164.000 0.713 0.002 Y NA
 5874261 5874262 EFER_0893 EFER_0894 nuoM nuoN TRUE 0.737 187.000 0.437 0.002 Y NA
 5874262 5874263 EFER_0894 EFER_0895 nuoN   FALSE 0.064 143.000 0.000 NA   NA
 5874264 5874265 EFER_0896 EFER_0897   yfbM FALSE 0.054 152.000 0.000 NA   NA
 5874267 5874268 EFER_0899 EFER_0900   elaC TRUE 0.940 12.000 0.091 1.000   NA
 5874269 5874270 EFER_0901 EFER_0902 elaA elaB FALSE 0.352 55.000 0.077 NA   NA
 5874270 5874271 EFER_0902 EFER_0903 elaB menF FALSE 0.148 94.000 0.043 NA   NA
 5874271 5874272 EFER_0903 EFER_0904 menF menD TRUE 0.809 89.000 0.281 1.000 Y NA
 5874272 5874273 EFER_0904 EFER_0905 menD yfbB TRUE 0.983 -3.000 0.355 NA   NA
 5874273 5874274 EFER_0905 EFER_0906 yfbB menB TRUE 0.963 15.000 0.280 NA   NA
 5874274 5874275 EFER_0906 EFER_0907 menB menC TRUE 0.997 0.000 0.171 0.001 Y NA
 5874275 5874276 EFER_0907 EFER_0908 menC menE TRUE 0.990 -3.000 0.283 0.001 N NA
 5874276 5874277 EFER_0908 EFER_0909 menE pmrD FALSE 0.075 113.000 0.005 NA   NA
 5874278 5874279 EFER_0910 EFER_0911   yfbW TRUE 0.862 -282.000 0.613 NA   NA
 5874279 5874280 EFER_0911 EFER_0912 yfbW arnT TRUE 0.936 -3.000 0.091 1.000   NA
 5874280 5874281 EFER_0912 EFER_0913 arnT yfbH FALSE 0.458 -30.000 0.031 1.000 N NA
 5874281 5874282 EFER_0913 EFER_0914 yfbH yfbG TRUE 0.996 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 5874282 5874283 EFER_0914 EFER_0915 yfbG yfbF TRUE 0.994 0.000 0.220 NA Y NA
 5874283 5874284 EFER_0915 EFER_0916 yfbF yfbE TRUE 0.997 4.000 0.378 NA Y NA
 5874287 5874288 EFER_0919 EFER_0920 yfaZ yfaY FALSE 0.099 100.000 0.004 1.000   NA
 5874288 5874289 EFER_0920 EFER_0921 yfaY   FALSE 0.019 219.000 0.000 1.000   NA
 5874290 5874291 EFER_0922 EFER_0923 yfaD glpC FALSE 0.026 194.000 0.000 NA   NA
 5874291 5874292 EFER_0923 EFER_0924 glpC glpB TRUE 0.995 -3.000 0.547 0.001 N NA
 5874292 5874293 EFER_0924 EFER_0925 glpB glpA TRUE 0.989 -10.000 0.650 0.001 N NA
 5874294 5874295 EFER_0926 EFER_0927 glpT glpQ TRUE 0.878 -52.000 0.396 1.000 N NA
 5874295 5874296 EFER_0927 EFER_0928 glpQ inaA FALSE 0.064 152.000 0.000 1.000   NA
 5874297 5874298 EFER_0929 EFER_0930 yfaE nrdB TRUE 0.891 0.000 0.034 1.000 N NA
 5874298 5874299 EFER_0930 EFER_0931 nrdB nrdA TRUE 0.792 63.000 0.000 0.001 Y NA
 5874303 5874304 EFER_0935 EFER_0936 atoB atoE TRUE 0.950 26.000 0.174 1.000 Y NA
 5874304 5874305 EFER_0936 EFER_0937 atoE atoA TRUE 0.990 -3.000 0.174 1.000 Y NA
 5874305 5874306 EFER_0937 EFER_0938 atoA atoD TRUE 0.999 0.000 0.800 0.001 Y NA
 5874306 5874307 EFER_0938 EFER_0939 atoD atoC FALSE 0.023 197.000 0.000 NA   NA
 5874307 5874308 EFER_0939 EFER_0940 atoC atoC TRUE 0.744 -6.000 0.000 NA   NA
 5874308 5874309 EFER_0940 EFER_0941 atoC atoS TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5874311 5874312 EFER_0943 EFER_0944 rcsB rcsD TRUE 0.994 17.000 0.558 1.000 Y NA
 5874312 5874313 EFER_0944 EFER_misc_RNA_21 rcsD micF FALSE 0.110 107.000 0.000 NA   NA
 5874314 5874315 EFER_0945 EFER_0946 ompC yojL FALSE 0.144 123.000 0.066 1.000 N NA
 5874315 5874316 EFER_0946 EFER_0947 yojL ada FALSE 0.120 74.000 0.019 1.000 N NA
 5874316 5874317 EFER_0947 EFER_0948 ada alkB TRUE 0.957 0.000 0.015 0.012 N NA
 5874317 5874318 EFER_0948 EFER_0949 alkB yojI FALSE 0.252 76.000 0.076 1.000 N NA
 5874318 5874319 EFER_0949 EFER_0950 yojI mqo FALSE 0.020 215.000 0.000 1.000   NA
 5874320 5874321 EFER_0951 EFER_0952 glnQ glnP TRUE 0.977 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 5874321 5874322 EFER_0952 EFER_0953 glnP glnH TRUE 0.666 94.000 0.051 0.064 Y NA
 5874322 5874323 EFER_0953 EFER_0954 glnH dps FALSE 0.003 407.000 0.000 1.000 N NA
 5874323 5874324 EFER_0954 EFER_0955 dps rhtA FALSE 0.010 289.000 0.044 1.000   NA
 5874326 5874327 EFER_0957 EFER_0959 ybiP   FALSE 0.012 244.000 0.000 NA   NA
 5874327 5874328 EFER_0959 EFER_misc_RNA_22   rybA FALSE 0.391 -45.000 0.000 NA   NA
 5874329 5874330 EFER_0960 EFER_0961 mntR ybiR TRUE 0.797 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5874333 5874334 EFER_0964 EFER_0965 ybiV ybiW FALSE 0.073 146.000 0.000 1.000   NA
 5874334 5874335 EFER_0965 EFER_0966 ybiW ybiY TRUE 0.994 6.000 0.316 0.003 N NA
 5874337 5874338 EFER_0968 EFER_0969 moeB moeA TRUE 0.998 0.000 0.323 0.003 Y NA
 5874339 5874340 EFER_0970 EFER_0971 yliA yliB TRUE 0.712 27.000 0.083 1.000   NA
 5874340 5874341 EFER_0971 EFER_0972 yliB yliC TRUE 0.996 20.000 0.803 0.050 Y NA
 5874341 5874342 EFER_0972 EFER_0973 yliC yliD TRUE 0.999 3.000 0.689 0.050 Y NA
 5874342 5874343 EFER_0973 EFER_0974 yliD   FALSE 0.061 131.000 0.000 NA N NA
 5874343 5874344 EFER_0974 EFER_0975   yliF TRUE 0.981 10.000 0.000 NA Y NA
 5874346 5874347 EFER_0977 EFER_0978 bssR yliI FALSE 0.148 102.000 0.047 NA   NA
 5874350 5874351 EFER_0981 EFER_0982 deoR ybjG TRUE 0.831 33.000 0.235 1.000   NA
 5874353 5874354 EFER_0984 EFER_0985 ybjH ybjI FALSE 0.112 104.000 0.000 NA   NA
 5874354 5874355 EFER_0985 EFER_0986 ybjI ybjJ TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5874356 5874357 EFER_0987 EFER_0988 ybjK   FALSE 0.114 100.000 0.000 NA   NA
 5874358 5874359 EFER_0989 EFER_misc_RNA_23   rybB FALSE 0.191 58.000 0.000 NA   NA
 5874359 5874360 EFER_misc_RNA_23 EFER_0990 rybB ybjL FALSE 0.140 77.000 0.000 NA   NA
 5874361 5874362 EFER_0991 EFER_0993 ybjM nfsA FALSE 0.043 165.000 0.000 NA   NA
 5874362 5874363 EFER_0993 EFER_0994 nfsA rimK FALSE 0.229 50.000 0.000 1.000 N NA
 5874363 5874364 EFER_0994 EFER_0995 rimK ybjN FALSE 0.208 89.000 0.065 NA   NA
 5874364 5874365 EFER_0995 EFER_0997 ybjN potF FALSE 0.004 352.000 0.000 NA   NA
 5874365 5874366 EFER_0997 EFER_0998 potF potG TRUE 0.917 95.000 0.679 1.000 Y NA
 5874366 5874367 EFER_0998 EFER_0999 potG potH TRUE 0.999 10.000 0.857 1.000 Y NA
 5874367 5874368 EFER_0999 EFER_1000 potH potI TRUE 0.998 -3.000 0.528 0.050 Y NA
 5874368 5874369 EFER_1000 EFER_1001 potI ybjO TRUE 0.631 60.000 0.264 NA   NA
 5874369 5874370 EFER_1001 EFER_1002 ybjO rumB TRUE 0.739 41.000 0.226 NA   NA
 5874371 5874372 EFER_1003 EFER_1004 artJ artM FALSE 0.273 227.000 0.143 0.063 Y NA
 5874372 5874373 EFER_1004 EFER_1005 artM artQ TRUE 0.999 0.000 0.714 0.017 Y NA
 5874373 5874374 EFER_1005 EFER_1006 artQ artI TRUE 0.997 7.000 0.260 0.050 Y NA
 5874374 5874375 EFER_1006 EFER_1007 artI artP TRUE 0.987 18.000 0.323 1.000 Y NA
 5874375 5874376 EFER_1007 EFER_1008 artP ybjP FALSE 0.036 218.000 0.081 NA   NA
 5874377 5874378 EFER_1009 EFER_1010 ybjQ ybjR TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5874379 5874380 EFER_1011 EFER_1012 ybjS ybjT TRUE 0.656 99.000 0.022 0.008 Y NA
 5874380 5874381 EFER_1012 EFER_1013 ybjT ltaE TRUE 0.929 11.000 0.074 1.000 N NA
 5874381 5874382 EFER_1013 EFER_1014 ltaE poxB TRUE 0.821 37.000 0.041 1.000 Y NA
 5874384 5874385 EFER_1017 EFER_1018 hcr hcp TRUE 0.987 12.000 0.000 0.013 Y NA
 5874385 5874386 EFER_1018 EFER_1019 hcp ybjE FALSE 0.064 144.000 0.000 NA   NA
 5874387 5874388 EFER_1020 EFER_1021     FALSE 0.011 251.000 0.000 NA   NA
 5874391 5874392 EFER_1024 EFER_1025     FALSE 0.366 -54.000 0.000 NA   NA
 5874393 5874394 EFER_1026 EFER_1027 macA macB TRUE 0.996 -3.000 0.789 0.095 N NA
 5874396 5874397 EFER_1029 EFER_1030 clpS clpA TRUE 0.983 16.000 0.596 NA   NA
 5874398 5874399 EFER_1031 EFER_tRNA79     FALSE 0.134 83.000 0.000 NA   NA
 11539379 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7775.000 0.000 NA   NA
 11681742 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7775.000 0.000 NA   NA
 11824134 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7775.000 0.000 NA   NA
 11539380 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7795.000 0.000 NA   NA
 11681743 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7795.000 0.000 NA   NA
 11824135 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7795.000 0.000 NA   NA
 11539381 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7835.000 0.000 NA   NA
 11681744 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7835.000 0.000 NA   NA
 11824136 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7835.000 0.000 NA   NA
 11539382 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7855.000 0.000 NA   NA
 11681745 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7855.000 0.000 NA   NA
 11824137 5874390   EFER_1023   ybjD FALSE NA 7855.000 0.000 NA   NA
 5874399 5874400 EFER_tRNA79 EFER_1032   infA FALSE 0.010 254.000 0.000 NA   NA
 5874400 5874401 EFER_1032 EFER_1033 infA aat FALSE 0.006 285.000 0.020 1.000 N NA
 5874401 5874402 EFER_1033 EFER_1034 aat cydC TRUE 0.790 42.000 0.049 1.000 Y NA
 5874402 5874403 EFER_1034 EFER_1035 cydC cydD TRUE 0.999 1.000 0.631 0.005 Y NA
 5874403 5874404 EFER_1035 EFER_1036 cydD trxB FALSE 0.457 123.000 0.049 1.000 Y NA
 5874405 5874406 EFER_1038 EFER_1039 lrp ftsK FALSE 0.449 135.000 0.345 1.000 N NA
 5874406 5874407 EFER_1039 EFER_1040 ftsK lolA FALSE 0.319 156.000 0.305 1.000 N NA
 5874407 5874408 EFER_1040 EFER_1041 lolA ycaJ TRUE 0.967 11.000 0.167 1.000 N NA
 5874408 5874409 EFER_1041 EFER_1042 ycaJ serS FALSE 0.371 91.000 0.078 0.087 N NA
 5874411 5874412 EFER_1045 EFER_1046 ycaD ycaM FALSE 0.015 208.000 0.000 NA N NA
 5874413 5874414 EFER_1047 EFER_1048 pflA pflB FALSE 0.065 193.000 0.092 1.000 N NA
 5874414 5874415 EFER_1048 EFER_1049 pflB focA TRUE 0.724 56.000 0.345 1.000 N NA
 5874415 5874416 EFER_1049 EFER_1050 focA ycaO FALSE 0.003 405.000 0.000 NA   NA
 5874417 5874418 EFER_1051 EFER_1052 ycaP serC FALSE 0.022 190.000 0.014 NA   NA
 5874418 5874419 EFER_1052 EFER_1053 serC aroA TRUE 0.758 43.000 0.033 1.000 Y NA
 5874419 5874420 EFER_1053 EFER_1054 aroA cmk FALSE 0.143 187.000 0.209 1.000 N NA
 5874420 5874421 EFER_1054 EFER_1055 cmk rpsA TRUE 0.484 111.000 0.281 1.000 N NA
 5874421 5874422 EFER_1055 EFER_1056 rpsA ihfB FALSE 0.292 160.000 0.292 1.000 N NA
 5874422 5874423 EFER_1056 EFER_1057 ihfB   FALSE 0.018 203.000 0.003 1.000   NA
 5874423 5874424 EFER_1057 EFER_1058   msbA TRUE 0.712 37.000 0.075 0.078   NA
 5874424 5874425 EFER_1058 EFER_1059 msbA lpxK TRUE 0.966 -3.000 0.205 1.000 N NA
 5874425 5874426 EFER_1059 EFER_1060 lpxK ycaQ FALSE 0.310 37.000 0.017 NA   NA
 5874426 5874427 EFER_1060 EFER_1061 ycaQ ycaR FALSE 0.183 53.000 0.016 NA   NA
 5874427 5874428 EFER_1061 EFER_1062 ycaR kdsB TRUE 0.975 -3.000 0.265 NA   NA
 5874428 5874429 EFER_1062 EFER_1063 kdsB ycbJ FALSE 0.048 153.000 0.023 NA   NA
 5874431 5874432 EFER_1065 EFER_1066 smtA mukF TRUE 0.979 -3.000 0.325 NA N NA
 5874432 5874433 EFER_1066 EFER_1067 mukF mukE TRUE 0.984 8.000 0.036 NA Y NA
 5874433 5874434 EFER_1067 EFER_1068 mukE mukB TRUE 0.993 0.000 0.000 0.001 Y NA
 5874434 5874435 EFER_1068 EFER_1069 mukB ycbB FALSE 0.014 243.000 0.000 1.000   NA
 5874435 5874436 EFER_1069 EFER_1070 ycbB ycbK FALSE 0.312 172.000 0.372 NA   NA
 5874436 5874437 EFER_1070 EFER_1071 ycbK ycbL TRUE 0.707 27.000 0.089 NA   NA
 5874438 5874439 EFER_1072 EFER_1073 aspC ompF FALSE 0.033 184.000 0.036 1.000 N NA
 5874439 5874440 EFER_1073 EFER_1074 ompF asnS FALSE 0.002 610.000 0.000 1.000 N NA
 5874440 5874441 EFER_1074 EFER_1075 asnS pncB FALSE 0.044 166.000 0.034 1.000 N NA
 5874443 5874444 EFER_1077 EFER_1078 ssuB ssuC TRUE 0.996 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 5874444 5874445 EFER_1078 EFER_1079 ssuC ssuD TRUE 0.972 12.000 0.226 1.000 N NA
 5874445 5874446 EFER_1079 EFER_1080 ssuD ssuA TRUE 0.982 -3.000 0.341 1.000 N NA
 5874446 5874447 EFER_1080 EFER_1081 ssuA ssuE TRUE 0.924 -7.000 0.169 1.000   NA
 5874448 5874449 EFER_1082 EFER_1083 pyrD ycbW FALSE 0.080 174.000 0.081 NA   NA
 5874451 5874452 EFER_1085 EFER_1086 ycbY uup TRUE 0.914 12.000 0.061 1.000   NA
 5874452 5874453 EFER_1086 EFER_1087 uup pqiA FALSE 0.112 130.000 0.054 NA   NA
 5874453 5874454 EFER_1087 EFER_1088 pqiA pqiB TRUE 0.997 5.000 0.819 NA   NA
 5874454 5874455 EFER_1088 EFER_1089 pqiB ymbA TRUE 0.990 12.000 0.531 NA   NA
 5874455 5874456 EFER_1089 EFER_1090 ymbA rmf FALSE 0.010 256.000 0.000 NA   NA
 5874457 5874458 EFER_1091 EFER_1092 fabA ycbZ TRUE 0.599 69.000 0.290 1.000 N NA
 5874464 5874465 EFER_1097 EFER_1098 yccS yccF TRUE 0.641 -40.000 0.090 NA   NA
 5874467 5874468 EFER_1100 EFER_1101 mgsA yccT FALSE 0.169 96.000 0.055 NA   NA
 5874470 5874471 EFER_1103 EFER_1104 yccV yccW FALSE 0.387 58.000 0.094 NA   NA
 5874473 5874474 EFER_1106 EFER_1107 tusE yccA FALSE 0.350 91.000 0.140 NA   NA
 5874475 5874476 EFER_tRNA15 EFER_1108     FALSE 0.035 178.000 0.000 NA   NA
 5874478 5874479 EFER_1110 EFER_1111 hyaA hyaB TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 5874479 5874480 EFER_1111 EFER_1112 hyaB hyaC TRUE 0.992 19.000 0.355 0.045 Y NA
 5874480 5874481 EFER_1112 EFER_1113 hyaC hyaD TRUE 0.990 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 5874481 5874482 EFER_1113 EFER_1114 hyaD hyaE TRUE 0.934 -3.000 0.096 NA   NA
 5874482 5874483 EFER_1114 EFER_1115 hyaE hyaF TRUE 0.941 -63.000 0.769 NA   NA
 5874483 5874484 EFER_1115 EFER_1116 hyaF yecA FALSE 0.120 94.000 0.000 NA   NA
 5874487 5874488 EFER_1119 EFER_1120 ftn   FALSE 0.077 130.000 0.000 NA   NA
 5874488 5874489 EFER_1120 EFER_1121   yecI FALSE 0.063 146.000 0.000 NA   NA
 5874490 5874491 EFER_1123 EFER_1124 araF araG TRUE 0.938 95.000 0.917 NA Y NA
 5874491 5874492 EFER_1124 EFER_1125 araG araH TRUE 0.994 15.000 0.451 1.000 Y NA
 5874492 5874493 EFER_1125 EFER_1126 araH otsB FALSE 0.308 154.000 0.037 1.000 Y NA
 5874493 5874494 EFER_1126 EFER_1127 otsB otsA TRUE 0.958 -25.000 0.068 0.001 Y NA
 5874496 5874497 EFER_1129 EFER_1130 flhD flhC TRUE 0.978 3.000 0.000 0.001   NA
 5874497 5874498 EFER_1130 EFER_1131 flhC motA TRUE 0.568 124.000 0.408 1.000   NA
 5874498 5874499 EFER_1131 EFER_1132 motA motB TRUE 0.996 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 5874499 5874500 EFER_1132 EFER_1133 motB cheA TRUE 0.985 -55.000 0.913 1.000 Y NA
 5874500 5874501 EFER_1133 EFER_1134 cheA cheW TRUE 0.996 17.000 0.447 0.003 Y NA
 5874501 5874502 EFER_1134 EFER_1135 cheW   FALSE 0.019 219.000 0.000 1.000   NA
 5874502 5874503 EFER_1135 EFER_1136     TRUE 0.933 13.000 0.115 NA   NA
 5874503 5874504 EFER_1136 EFER_1137     TRUE 0.958 13.000 0.188 NA   NA
 5874504 5874505 EFER_1137 EFER_1138     TRUE 0.991 -24.000 0.879 NA Y NA
 5874507 5874508 EFER_1140 EFER_1141   tar FALSE 0.463 60.000 0.129 1.000   NA
 5874508 5874509 EFER_1141 EFER_1142 tar cheR TRUE 0.935 20.000 0.037 1.000 Y NA
 5874509 5874510 EFER_1142 EFER_1143 cheR cheB TRUE 0.984 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 5874510 5874511 EFER_1143 EFER_1144 cheB cheY TRUE 0.996 15.000 0.467 0.011 Y NA
 5874511 5874512 EFER_1144 EFER_1145 cheY cheZ TRUE 0.985 8.000 0.000 1.000 Y NA
 5874513 5874514 EFER_1146 EFER_1147 cbpM cbpA TRUE 0.961 -15.000 0.512 NA   NA
 5874514 5874515 EFER_1147 EFER_1148 cbpA   FALSE 0.017 203.000 0.000 NA N NA
 5874515 5874516 EFER_1148 EFER_1149   dadA TRUE 0.846 -18.000 0.179 NA N NA
 5874516 5874517 EFER_1149 EFER_1150 dadA   TRUE 0.700 51.000 0.278 1.000 N NA
 5874521 5874522 EFER_1154 EFER_1155 yccJ wrbA TRUE 0.931 21.000 0.290 NA   NA
 5874523 5874524 EFER_1156 EFER_1157     FALSE 0.427 31.000 0.000 NA   NA
 5874524 5874525 EFER_1157 EFER_1158   rutR FALSE 0.019 208.000 0.000 NA   NA
 5874525 5874526 EFER_1158 EFER_1159 rutR yliE FALSE 0.001 1086.000 0.000 NA N NA
 5874526 5874527 EFER_1159 EFER_1160 yliE yliF TRUE 0.695 -166.000 0.000 NA Y NA
 5874527 5874528 EFER_1160 EFER_1161 yliF bcsA FALSE 0.147 69.000 0.000 1.000 N NA
 5874528 5874529 EFER_1161 EFER_1162 bcsA bcsB TRUE 0.507 65.000 0.045 0.002   NA
 5874530 5874531 EFER_1163 EFER_1164 yedF yedE TRUE 0.995 -3.000 0.844 NA   NA
 5874533 5874534 EFER_1166 EFER_1167 amyA fliT FALSE 0.403 66.000 0.115 1.000   NA
 5874534 5874535 EFER_1167 EFER_1168 fliT fliS TRUE 0.982 -3.000 0.324 1.000   NA
 5874535 5874536 EFER_1168 EFER_1169 fliS fliD TRUE 0.991 19.000 0.284 0.002 Y NA
 5874537 5874538 EFER_1170 EFER_1171 fliC fliA FALSE 0.040 166.000 0.000 1.000 N NA
 5874538 5874539 EFER_1171 EFER_1173 fliA fliZ FALSE 0.431 59.000 0.108 1.000   NA
 5874539 5874540 EFER_1173 EFER_1174 fliZ fliY TRUE 0.560 88.000 0.280 1.000   NA
 5874540 5874541 EFER_1174 EFER_1175 fliY yedO TRUE 0.863 107.000 0.469 1.000 Y NA
 5874541 5874542 EFER_1175 EFER_1176 yedO yecS TRUE 0.961 16.000 0.050 1.000 Y NA
 5874542 5874543 EFER_1176 EFER_1177 yecS yecC TRUE 0.989 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 5874543 5874544 EFER_1177 EFER_1178 yecC sdiA FALSE 0.047 195.000 0.071 1.000 N NA
 5874546 5874547 EFER_1180 EFER_1181 uvrY uvrC TRUE 0.965 -3.000 0.086 0.018 N NA
 5874547 5874548 EFER_1181 EFER_1182 uvrC pgsA TRUE 0.605 57.000 0.227 1.000 N NA
 5874548 5874549 EFER_1182 EFER_tRNA16 pgsA   FALSE 0.054 152.000 0.000 NA   NA
 5874549 5874550 EFER_tRNA16 EFER_tRNA17     FALSE 0.203 55.000 0.000 NA   NA
 5874550 5874551 EFER_tRNA17 EFER_tRNA18     TRUE 0.815 13.000 0.000 NA   NA
 5874553 5874554 EFER_1185 EFER_1186 appC appB TRUE 0.994 12.000 0.158 0.044 Y NA
 5874555 5874556 EFER_1187 EFER_1188   torS FALSE 0.095 118.000 0.000 NA   NA
 5874559 5874560 EFER_1191 EFER_1192 torC torA TRUE 0.990 0.000 0.000 0.044 Y NA
 5874560 5874561 EFER_1192 EFER_1193 torA torD TRUE 0.787 -36.000 0.077 0.044   NA
 5874561 5874562 EFER_1193 EFER_1194 torD flhB FALSE 0.069 149.000 0.000 1.000   NA
 5874562 5874563 EFER_1194 EFER_1195 flhB flhA TRUE 0.993 -7.000 0.287 0.007 Y NA
 5874563 5874564 EFER_1195 EFER_1196 flhA flhE TRUE 0.988 0.000 0.158 0.002   NA
 5874566 5874567 EFER_1199 EFER_1200 yecM cutC TRUE 0.934 6.000 0.057 NA   NA
 5874568 5874569 EFER_1201 EFER_1202 yecP yecO TRUE 0.980 -3.000 0.315 NA   NA
 5874569 5874570 EFER_1202 EFER_1203 yecO yecN TRUE 0.528 41.000 0.089 NA   NA
 5874570 5874571 EFER_1203 EFER_1204 yecN yecE TRUE 0.487 53.000 0.126 NA   NA
 5874571 5874572 EFER_1204 EFER_1205 yecE yecD TRUE 0.929 -3.000 0.089 NA   NA
 5874573 5874574 EFER_1206 EFER_1207 aspS nudB TRUE 0.924 2.000 0.050 1.000 N NA
 5874574 5874575 EFER_1207 EFER_1208 nudB yebC TRUE 0.477 29.000 0.035 NA   NA
 5874575 5874576 EFER_1208 EFER_1209 yebC ruvC TRUE 0.836 34.000 0.277 NA   NA
 5874578 5874579 EFER_1211 EFER_1212 ruvA ruvB TRUE 0.999 9.000 0.549 0.001 Y NA
 5874580 5874581 EFER_1213 EFER_1214 znuB znuC TRUE 0.997 -7.000 0.755 0.086 Y NA
 5874582 5874583 EFER_1215 EFER_1216 znuA yebA TRUE 0.907 16.000 0.131 1.000 N NA
 5874583 5874584 EFER_1216 EFER_1217 yebA lpxM TRUE 0.754 121.000 0.299 1.000 Y NA
 5874585 5874586 EFER_1218 EFER_1219 pykA yebK FALSE 0.158 122.000 0.071 1.000 N NA
 5874587 5874588 EFER_1221 EFER_1222 zwf edd FALSE 0.115 223.000 0.041 1.000 Y NA
 5874588 5874589 EFER_1222 EFER_1223 edd eda TRUE 0.970 37.000 0.523 1.000 Y NA
 5874591 5874592 EFER_1225 EFER_1226 yebG yebF FALSE 0.196 55.000 0.027 NA   NA
 5874592 5874593 EFER_1226 EFER_1227 yebF yebE FALSE 0.018 211.000 0.028 NA   NA
 5874593 5874594 EFER_1227 EFER_1228 yebE ptrB FALSE 0.278 89.000 0.092 NA   NA
 5874595 5874596 EFER_1229 EFER_1230 exoX   TRUE 0.956 24.000 0.500 1.000   NA
 5874596 5874597 EFER_1230 EFER_1231     TRUE 0.525 75.000 0.222 1.000   NA
 5874598 5874599 EFER_1232 EFER_1233   yebZ TRUE 0.995 3.000 0.613 1.000   NA
 5874599 5874600 EFER_1233 EFER_1234 yebZ yebY TRUE 0.993 12.000 0.704 NA   NA
 5874600 5874601 EFER_1234 EFER_1235 yebY   TRUE 0.687 18.000 0.000 NA   NA
 5874603 5874604 EFER_misc_RNA_26 EFER_1236 ryeB pphA FALSE 0.025 195.000 0.000 NA   NA
 5874605 5874606 EFER_1237 EFER_1238 yebW yebV TRUE 0.946 21.000 0.353 NA   NA
 5874606 5874607 EFER_1238 EFER_1239 yebV yebU FALSE 0.254 119.000 0.121 NA   NA
 5874607 5874608 EFER_1239 EFER_1240 yebU yebT TRUE 0.683 80.000 0.420 NA   NA
 5874608 5874609 EFER_1240 EFER_1241 yebT yebS TRUE 0.966 -31.000 0.840 NA   NA
 5874610 5874611 EFER_1242 EFER_1243 yebR proQ TRUE 0.585 97.000 0.081 NA Y NA
 5874611 5874612 EFER_1243 EFER_1244 proQ prc TRUE 0.935 20.000 0.304 NA N NA
 5874612 5874613 EFER_1244 EFER_1245 prc htpX FALSE 0.107 181.000 0.042 0.020 N NA
 5874617 5874618 EFER_1249 EFER_1250 yobG   TRUE 0.738 74.000 0.500 NA   NA
 5874618 5874619 EFER_1250 EFER_1251   yobF FALSE 0.002 826.000 0.000 NA   NA
 5874619 5874620 EFER_1251 EFER_1252 yobF cspC TRUE 0.963 13.000 0.214 NA   NA
 5874620 5874621 EFER_1252 EFER_1253 cspC rrmA FALSE 0.065 157.000 0.038 1.000   NA
 5874622 5874623 EFER_1254 EFER_1255 yebN   TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5874623 5874624 EFER_1255 EFER_1256   yobD FALSE 0.029 187.000 0.000 NA   NA
 5874624 5874625 EFER_1256 EFER_1257 yobD manZ TRUE 0.884 55.000 0.755 NA   NA
 5874625 5874626 EFER_1257 EFER_1258 manZ manY TRUE 0.999 4.000 0.939 0.017 Y NA
 5874626 5874627 EFER_1258 EFER_1259 manY manX TRUE 0.750 62.000 0.000 0.017 Y NA
 5874629 5874630 EFER_1261 EFER_1262 adrB sdaA TRUE 0.528 122.000 0.389 NA N NA
 5874630 5874631 EFER_1262 EFER_1263 sdaA yeaB FALSE 0.310 184.000 0.409 1.000   NA
 5874631 5874632 EFER_1263 EFER_1264 yeaB pabB TRUE 0.970 3.000 0.116 1.000   NA
 5874633 5874634 EFER_1265 EFER_1266 yoaH   FALSE 0.038 171.000 0.000 NA   NA
 5874634 5874635 EFER_1266 EFER_1267     FALSE 0.135 82.000 0.000 NA   NA
 5874636 5874637 EFER_1268 EFER_1269 yoaC yoaB FALSE 0.038 172.000 0.000 NA   NA
 5874637 5874638 EFER_1269 EFER_1270 yoaB   FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 5874638 5874639 EFER_1270 EFER_1271     TRUE 0.962 -3.000 0.182 NA   NA
 5874640 5874641 EFER_1272 EFER_1273 yoaA yeaZ FALSE 0.347 58.000 0.082 1.000 N NA
 5874641 5874642 EFER_1273 EFER_1274 yeaZ yeaY FALSE 0.301 39.000 0.024 1.000 N NA
 5874642 5874643 EFER_1274 EFER_1275 yeaY fadD FALSE 0.085 205.000 0.169 1.000 N NA
 5874643 5874644 EFER_1275 EFER_1276 fadD rnd FALSE 0.364 68.000 0.115 1.000 N NA
 5874645 5874646 EFER_1277 EFER_1278 ycfS mfd FALSE 0.058 141.000 0.006 1.000   NA
 5874646 5874647 EFER_1278 EFER_1279 mfd ycfT FALSE 0.069 128.000 0.003 1.000   NA
 5874648 5874649 EFER_1280 EFER_1281 lolC lolD TRUE 0.953 -7.000 0.175 0.061 N NA
 5874649 5874650 EFER_1281 EFER_1282 lolD lolE TRUE 0.980 0.000 0.125 0.061 N NA
 5874650 5874651 EFER_1282 EFER_1283 lolE ycfX TRUE 0.837 29.000 0.225 1.000 N NA
 5874651 5874652 EFER_1283 EFER_1284 ycfX cobB TRUE 0.975 16.000 0.119 1.000 Y NA
 5874653 5874654 EFER_1285 EFER_1286 ycfZ ymfA TRUE 0.838 -3.000 0.000 NA   NA
 5874654 5874655 EFER_1286 EFER_1287 ymfA potD FALSE 0.191 58.000 0.000 NA   NA
 5874655 5874656 EFER_1287 EFER_1288 potD potC TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.048 Y NA
 5874656 5874657 EFER_1288 EFER_1289 potC potB TRUE 0.996 -3.000 0.286 0.048 Y NA
 5874657 5874658 EFER_1289 EFER_1290 potB potA TRUE 0.997 14.000 0.789 1.000 Y NA
 5874660 5874661 EFER_1292 EFER_1293 yeaD gapA TRUE 0.982 15.000 0.154 1.000 Y NA
 5874662 5874663 EFER_1294 EFER_1295 msrB yeaC TRUE 0.968 -3.000 0.216 NA   NA
 5874664 5874665 EFER_1296 EFER_1297 pncA ansA TRUE 0.526 -25.000 0.040 1.000 N NA
 5874665 5874666 EFER_1297 EFER_1298 ansA   FALSE 0.099 116.000 0.000 NA   NA
 5874666 5874667 EFER_1298 EFER_1299   sppA FALSE 0.070 136.000 0.000 NA   NA
 5874668 5874669 EFER_1300 EFER_1301 ydjA selD FALSE 0.100 117.000 0.033 1.000 N NA
 5874669 5874670 EFER_1301 EFER_1302 selD topB TRUE 0.565 -22.000 0.041 1.000 N NA
 5874670 5874671 EFER_1302 EFER_1303 topB ynjI FALSE 0.080 128.000 0.000 NA   NA
 5874674 5874675 EFER_1306 EFER_1307 nudG   FALSE 0.104 112.000 0.000 NA   NA
 5874677 5874678 EFER_1309 EFER_1310 ynjE ynjD FALSE 0.390 67.000 0.111 1.000   NA
 5874678 5874679 EFER_1310 EFER_1311 ynjD ynjC TRUE 0.994 0.000 0.602 1.000   NA
 5874679 5874680 EFER_1311 EFER_1312 ynjC ynjB TRUE 0.988 18.000 0.627 0.048   NA
 5874680 5874681 EFER_1312 EFER_1313 ynjB ynjA TRUE 0.886 10.000 0.032 NA   NA
 5874681 5874682 EFER_1313 EFER_1314 ynjA ydjZ TRUE 0.949 0.000 0.087 NA   NA
 5874682 5874683 EFER_1314 EFER_1315 ydjZ ydjX TRUE 0.969 4.000 0.125 NA   NA
 5874683 5874684 EFER_1315 EFER_1316 ydjX xthA FALSE 0.040 157.000 0.016 NA   NA
 5874685 5874686 EFER_1317 EFER_1318 astC astA TRUE 0.997 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 5874686 5874687 EFER_1318 EFER_1319 astA astD TRUE 0.961 -3.000 0.179 1.000 N NA
 5874687 5874688 EFER_1319 EFER_1320 astD astB TRUE 0.979 -3.000 0.306 1.000 N NA
 5874688 5874689 EFER_1320 EFER_1321 astB astE TRUE 0.973 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 5874689 5874690 EFER_1321 EFER_1323 astE spy FALSE 0.004 330.000 0.000 NA N NA
 5874690 5874691 EFER_1323 EFER_1325 spy ydjR FALSE 0.026 193.000 0.028 NA   NA
 5874692 5874693 EFER_1326 EFER_1327 ydjQ nadE FALSE 0.006 267.000 0.010 1.000 N NA
 5874694 5874695 EFER_1328 EFER_1329 osmE chbB FALSE 0.008 297.000 0.000 1.000   NA
 5874695 5874696 EFER_1329 EFER_1330 chbB chbC TRUE 0.831 85.000 0.167 0.012 Y NA
 5874696 5874697 EFER_1330 EFER_1331 chbC chbA TRUE 0.981 53.000 0.833 0.012 Y NA
 5874697 5874698 EFER_1331 EFER_1332 chbA chbR TRUE 0.996 8.000 0.727 1.000 N NA
 5874698 5874699 EFER_1332 EFER_1333 chbR chbF TRUE 0.692 121.000 0.625 1.000 N NA
 5874699 5874700 EFER_1333 EFER_1334 chbF chbG TRUE 0.991 13.000 0.429 0.018   NA
 5874702 5874703 EFER_1336 EFER_1337   cedA FALSE 0.349 -61.000 0.000 NA   NA
 5874704 5874705 EFER_1338 EFER_1339 ydjN ydjM FALSE 0.188 132.000 0.102 NA   NA
 5874705 5874706 EFER_1339 EFER_1340 ydjM yniC FALSE 0.087 159.000 0.068 NA   NA
 5874708 5874709 EFER_1342 EFER_1343 yniA   FALSE 0.107 110.000 0.000 NA   NA
 5874709 5874710 EFER_1343 EFER_1345   pfkB FALSE 0.159 67.000 0.000 NA   NA
 5874711 5874712 EFER_1346 EFER_1347 ydiY thrS FALSE 0.002 492.000 0.000 NA N NA
 5874712 5874713 EFER_1347 EFER_1348 thrS infC FALSE 0.104 112.000 0.000 NA   NA
 5874713 5874714 EFER_1348 EFER_1349 infC rpmI FALSE 0.116 97.000 0.000 NA   NA
 5874714 5874715 EFER_1349 EFER_1350 rpmI rplT TRUE 0.983 53.000 0.928 0.011 Y NA
 5874715 5874716 EFER_1350 EFER_4505 rplT pheM FALSE 0.087 123.000 0.000 NA   NA
 5874716 5874717 EFER_4505 EFER_1351 pheM pheS FALSE 0.007 284.000 0.000 NA   NA
 5874717 5874718 EFER_1351 EFER_1352 pheS pheT TRUE 0.998 15.000 0.574 0.001 Y NA
 5874718 5874719 EFER_1352 EFER_1353 pheT ihfA TRUE 0.981 5.000 0.208 1.000 N NA
 5874719 5874720 EFER_1353 EFER_1354 ihfA btuC FALSE 0.101 101.000 0.023 1.000 N NA
 5874720 5874721 EFER_1354 EFER_1355 btuC btuD TRUE 0.997 4.000 0.356 1.000 Y NA
 5874721 5874722 EFER_1355 EFER_1356 btuD nlpC FALSE 0.395 78.000 0.167 NA N NA
 5874722 5874723 EFER_1356 EFER_1357 nlpC   FALSE 0.017 201.000 0.000 NA N NA
 5874723 5874724 EFER_1357 EFER_1358   ydiU FALSE 0.168 66.000 0.031 NA   NA
 5874725 5874726 EFER_1359 EFER_1360   aroH FALSE 0.102 127.000 0.054 NA N NA
 5874726 5874727 EFER_1360 EFER_1361 aroH ydiA FALSE 0.033 283.000 0.165 1.000   NA
 5874729 5874730 EFER_1363 EFER_misc_RNA_27   rprA TRUE 0.503 -24.000 0.000 NA   NA
 5874730 5874731 EFER_misc_RNA_27 EFER_1364 rprA ydiK FALSE 0.041 167.000 0.000 NA   NA
 5874732 5874733 EFER_1365 EFER_1366 ydiJ ydiI TRUE 0.943 -3.000 0.129 NA N NA
 5874733 5874734 EFER_1366 EFER_1367 ydiI ydiH FALSE 0.148 71.000 0.000 NA   NA
 5874734 5874735 EFER_1367 EFER_1368 ydiH sufA FALSE 0.004 352.000 0.000 NA   NA
 5874735 5874736 EFER_1368 EFER_1369 sufA sufB TRUE 0.909 9.000 0.041 NA   NA
 5874736 5874737 EFER_1369 EFER_1370 sufB sufC TRUE 0.997 10.000 0.466 1.000 Y NA
 5874737 5874738 EFER_1370 EFER_1371 sufC sufD TRUE 0.980 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 5874738 5874739 EFER_1371 EFER_1372 sufD sufS TRUE 0.964 -3.000 0.193 1.000 N NA
 5874739 5874740 EFER_1372 EFER_1373 sufS sufE TRUE 0.957 13.000 0.183 NA   NA
 5874740 5874741 EFER_1373 EFER_1374 sufE ynhG FALSE 0.107 149.000 0.069 NA   NA
 5874742 5874743 EFER_1375 EFER_1376 lpp pykF FALSE 0.006 309.000 0.000 1.000 N NA
 5874745 5874746 EFER_1378 EFER_1379 ydhS ydhR FALSE 0.046 161.000 0.000 NA   NA
 5874746 5874747 EFER_1379 EFER_tRNA78 ydhR   FALSE 0.108 109.000 0.000 NA   NA
 5874747 5874748 EFER_tRNA78 EFER_tRNA77     TRUE 0.900 5.000 0.000 NA   NA
 5874748 5874749 EFER_tRNA77 EFER_1381   mdtK FALSE 0.054 152.000 0.000 NA   NA
 5874751 5874752 EFER_1383 EFER_1384 cfa ydhC FALSE 0.006 290.000 0.000 1.000 N NA
 5874756 5874757 EFER_1388 EFER_1389 sodB   FALSE 0.012 206.000 0.015 NA N NA
 5874759 5874760 EFER_1391 EFER_1392 lhr rnt FALSE 0.354 88.000 0.000 0.011   NA
 5874760 5874761 EFER_1392 EFER_1393 rnt gloA FALSE 0.316 103.000 0.136 1.000 N NA
 5874761 5874762 EFER_1393 EFER_1394 gloA nemA FALSE 0.196 81.000 0.057 1.000 N NA
 5874762 5874763 EFER_1394 EFER_1395 nemA ydhM TRUE 0.860 37.000 0.362 1.000 N NA
 5874764 5874765 EFER_1396 EFER_1397 ydhF sodC FALSE 0.165 81.000 0.033 1.000   NA
 5874766 5874767 EFER_1398 EFER_1399 ydhK ydhJ TRUE 0.895 1.000 0.000 NA   NA
 5874767 5874768 EFER_1399 EFER_1400 ydhJ ydhI TRUE 0.975 -6.000 0.412 NA   NA
 5874771 5874772 EFER_1403 EFER_1404 anmK ydhA FALSE 0.360 38.000 0.034 NA   NA
 5874772 5874773 EFER_1404 EFER_1405 ydhA pdxH FALSE 0.204 58.000 0.034 NA   NA
 5874773 5874774 EFER_1405 EFER_1406 pdxH tyrS FALSE 0.116 127.000 0.054 1.000 N NA
 5874774 5874775 EFER_1406 EFER_1407 tyrS pdxY FALSE 0.227 57.000 0.041 1.000 N NA
 5874776 5874777 EFER_1408 EFER_1409 gst ydgR TRUE 0.566 107.000 0.344 1.000 N NA
 5874777 5874778 EFER_1409 EFER_1410 ydgR nth FALSE 0.002 601.000 0.000 1.000 N NA
 5874778 5874779 EFER_1410 EFER_1411 nth rsxE TRUE 0.958 0.000 0.109 1.000 N NA
 5874779 5874780 EFER_1411 EFER_1412 rsxE rsxG TRUE 0.999 3.000 0.908 0.043 Y NA
 5874780 5874781 EFER_1412 EFER_1413 rsxG rsxD TRUE 0.999 4.000 0.924 0.043 Y NA
 5874781 5874782 EFER_1413 EFER_1414 rsxD rsxC TRUE 0.999 1.000 0.814 0.043 Y NA
 5874782 5874783 EFER_1414 EFER_1415 rsxC rsxB TRUE 0.996 -7.000 0.537 0.043 Y NA
 5874783 5874784 EFER_1415 EFER_1416 rsxB rsxA TRUE 0.999 0.000 0.564 0.043 Y NA
 5874784 5874785 EFER_1416 EFER_1417 rsxA   FALSE 0.396 77.000 0.148 NA   NA
 5874785 5874786 EFER_1417 EFER_1418   ydgT FALSE 0.315 92.000 0.120 NA   NA
 5874788 5874789 EFER_1420 EFER_1421 add malY TRUE 0.970 4.000 0.132 1.000 N NA
 5874789 5874790 EFER_1421 EFER_1422 malY   TRUE 0.897 10.000 0.000 1.000   NA
 5874790 5874791 EFER_1422 EFER_1423   ydgA FALSE 0.114 101.000 0.000 NA   NA
 5874791 5874792 EFER_1423 EFER_1424 ydgA manA TRUE 0.967 27.000 0.778 NA   NA
 5874793 5874794 EFER_1425 EFER_1426 fumA fumC TRUE 0.500 154.000 0.000 0.001 Y NA
 5874795 5874796 EFER_1427 EFER_1428 tus rstB FALSE 0.251 152.000 0.200 1.000   NA
 5874796 5874797 EFER_1428 EFER_1429 rstB rstA TRUE 0.988 13.000 0.181 1.000 Y NA
 5874799 5874800 EFER_1431 EFER_1432 folM ydgI TRUE 0.695 35.000 0.140 1.000 N NA
 5874800 5874801 EFER_1432 EFER_1433 ydgI ydgH FALSE 0.101 188.000 0.143 NA   NA
 5874802 5874803 EFER_1434 EFER_1435 pntA pntB TRUE 0.999 11.000 0.745 0.001 Y NA
 5874803 5874804 EFER_1435 EFER_1436 pntB   FALSE 0.048 157.000 0.000 1.000 N NA
 5874805 5874806 EFER_1437 EFER_1438 ydgD asr FALSE 0.009 270.000 0.000 NA   NA
 5874806 5874807 EFER_1438 EFER_1439 asr ynfM FALSE 0.002 520.000 0.000 NA   NA
 5874808 5874809 EFER_1440 EFER_1441 ynfL   TRUE 0.825 16.000 0.061 NA   NA
 5874809 5874810 EFER_1441 EFER_1442   dgsA TRUE 0.487 -72.000 0.068 NA   NA
 5874810 5874811 EFER_1442 EFER_1443 dgsA ynfK TRUE 0.564 125.000 0.455 NA N NA
 5874812 5874813 EFER_1444 EFER_1445 clcB   FALSE 0.352 99.000 0.079 0.091 N NA
 5874813 5874814 EFER_1445 EFER_1446     TRUE 0.988 -78.000 0.903 0.091 Y NA
 5874814 5874815 EFER_1446 EFER_1447     TRUE 0.991 10.000 0.313 0.047 N NA
 5874815 5874816 EFER_1447 EFER_1448     TRUE 0.959 25.000 0.403 0.047 N NA
 5874818 5874819 EFER_1450 EFER_1451 ydcZ yncA TRUE 0.938 0.000 0.070 NA   NA
 5874820 5874821 EFER_1452 EFER_1453 yncB yncC FALSE 0.026 199.000 0.000 1.000   NA
 5874825 5874826 EFER_1457 EFER_1458 yncG   FALSE 0.005 338.000 0.000 NA   NA
 5874826 5874827 EFER_1458 EFER_1459     TRUE 0.589 22.000 0.000 NA   NA
 5874827 5874828 EFER_1459 EFER_1460     FALSE 0.268 45.000 0.000 NA   NA
 5874828 5874829 EFER_1460 EFER_1461     FALSE 0.070 136.000 0.000 NA   NA
 5874829 5874830 EFER_1461 EFER_1462   yhhI FALSE 0.020 205.000 0.000 NA   NA
 5874830 5874831 EFER_1462 EFER_1463 yhhI   FALSE 0.008 277.000 0.000 NA   NA
 5874831 5874832 EFER_1463 EFER_1464     FALSE 0.006 301.000 0.000 NA   NA
 5874832 5874833 EFER_1464 EFER_1465     FALSE 0.111 106.000 0.000 NA   NA
 5874833 5874834 EFER_1465 EFER_1466   yhhI FALSE 0.082 127.000 0.000 NA   NA
 5874834 5874835 EFER_1466 EFER_1467 yhhI yhhI FALSE 0.006 298.000 0.000 NA   NA
 5874835 5874836 EFER_1467 EFER_1468 yhhI   FALSE 0.156 68.000 0.000 NA   NA
 5874839 5874840 EFER_1471 EFER_1473 yddE   FALSE 0.006 320.000 0.000 1.000   NA
 5874841 5874842 EFER_1474 EFER_1475   ydcE TRUE 0.905 9.000 0.000 1.000   NA
 5874846 5874847 EFER_1479 EFER_1480 catB catC TRUE 0.877 -10.000 0.150 1.000 N NA
 5874847 5874848 EFER_1480 EFER_1481 catC catA TRUE 0.879 65.000 0.343 1.000 Y NA
 5874848 5874849 EFER_1481 EFER_1482 catA benA FALSE 0.445 80.000 0.188 1.000 N NA
 5874849 5874850 EFER_1482 EFER_1483 benA benB TRUE 0.998 0.000 0.953 0.001 N NA
 5874850 5874851 EFER_1483 EFER_1484 benB benC TRUE 0.991 7.000 0.250 0.043 N NA
 5874851 5874852 EFER_1484 EFER_1485 benC benD TRUE 0.991 10.000 0.438 1.000 N NA
 5874852 5874853 EFER_1485 EFER_1486 benD   FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 5874854 5874855 EFER_1487 EFER_1488   yddG FALSE 0.013 339.000 0.000 0.090   NA
 5874856 5874857 EFER_1489 EFER_1491 fdnG fdnH TRUE 0.998 13.000 0.429 0.002 Y NA
 5874857 5874858 EFER_1491 EFER_1492 fdnH fdnI TRUE 0.994 -7.000 0.333 0.002 Y NA
 5874859 5874860 EFER_1493 EFER_1494 yddM   TRUE 0.884 0.000 0.000 NA   NA
 5874860 5874861 EFER_1494 EFER_1495   adhP FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 5874861 5874862 EFER_1495 EFER_1496 adhP sfcA FALSE 0.085 134.000 0.000 1.000   NA
 5874866 5874867 EFER_1500 EFER_1501 ydcI pcaG FALSE 0.026 190.000 0.000 1.000 N NA
 5874867 5874868 EFER_1501 EFER_1502 pcaG pcaH TRUE 0.999 -3.000 0.782 0.001 Y NA
 5874869 5874870 EFER_1503 EFER_1504 ydcJ mdoD FALSE 0.005 318.000 0.000 NA   NA
 5874870 5874871 EFER_1504 EFER_1505 mdoD ydcH FALSE 0.061 143.000 0.026 NA   NA
 5874871 5874872 EFER_1505 EFER_1506 ydcH rimL FALSE 0.199 54.000 0.026 NA   NA
 5874874 5874875 EFER_1508 EFER_1509 tehB ydcL FALSE 0.147 143.000 0.088 NA   NA
 5874875 5874876 EFER_1509 EFER_1510 ydcL ydcP FALSE 0.082 127.000 0.000 NA   NA
 5874876 5874877 EFER_1510 EFER_1511 ydcP   FALSE 0.002 616.000 0.000 1.000 N NA
 5874879 5874880 EFER_1513 EFER_1514 ydcR ydcS FALSE 0.082 245.000 0.000 1.000 Y NA
 5874880 5874881 EFER_1514 EFER_1515 ydcS ydcT TRUE 0.996 18.000 0.609 0.047 Y NA
 5874881 5874882 EFER_1515 EFER_1516 ydcT ydcU TRUE 0.999 1.000 0.643 0.047 Y NA
 5874882 5874883 EFER_1516 EFER_1517 ydcU ydcV TRUE 0.997 -10.000 0.821 0.047 Y NA
 5874883 5874884 EFER_1517 EFER_1518 ydcV ydcW TRUE 0.893 22.000 0.216 1.000 N NA
 5874884 5874885 EFER_1518 EFER_1519 ydcW ydcX FALSE 0.003 422.000 0.000 NA   NA
 5874888 5874889 EFER_1522 EFER_1523 speG ynfB TRUE 0.535 31.000 0.055 NA   NA
 5874890 5874891 EFER_1524 EFER_1525 ynfA rspA FALSE 0.112 109.000 0.020 1.000   NA
 5874891 5874892 EFER_1525 EFER_1526 rspA rspB TRUE 0.683 -12.000 0.049 1.000 N NA
 5874892 5874893 EFER_1526 EFER_1527 rspB   FALSE 0.430 44.000 0.073 1.000 N NA
 5874893 5874894 EFER_1527 EFER_1528     TRUE 0.987 31.000 0.818 NA Y NA
 5874894 5874895 EFER_1528 EFER_1529     TRUE 0.983 25.000 0.500 NA Y NA
 5874895 5874896 EFER_1529 EFER_1530   dctP TRUE 0.632 60.000 0.000 1.000 Y NA
 5874896 5874897 EFER_1530 EFER_1531 dctP   TRUE 0.975 49.000 1.000 NA Y NA
 5874897 5874898 EFER_1531 EFER_1532     TRUE 0.949 -87.000 0.400 NA Y NA
 5874898 5874899 EFER_1532 EFER_1533   ydfI TRUE 0.611 64.000 0.000 1.000 Y NA
 5874900 5874901 EFER_1534 EFER_1535 ydfZ ydfH FALSE 0.393 154.000 0.375 NA   NA
 5874901 5874902 EFER_1535 EFER_1536 ydfH ydfG FALSE 0.190 87.000 0.047 1.000   NA
 5874905 5874906 EFER_1539 EFER_1540 ydeI ydeH FALSE 0.068 139.000 0.000 NA   NA
 5874909 5874910 EFER_1543 EFER_1544 marB marA TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5874910 5874911 EFER_1544 EFER_1545 marA marR TRUE 0.991 -27.000 0.667 0.044 Y NA
 5874913 5874914 EFER_1547 EFER_1548 ydeA yneJ FALSE 0.096 92.000 0.027 NA N NA
 5874915 5874916 EFER_1549 EFER_1550 yneI yneH FALSE 0.114 76.000 0.016 1.000 N NA
 5874916 5874917 EFER_1550 EFER_1551 yneH yneG TRUE 0.898 0.000 0.037 NA   NA
 5874917 5874918 EFER_1551 EFER_1552 yneG yneF FALSE 0.250 110.000 0.098 NA   NA
 5874918 5874919 EFER_1552 EFER_1553 yneF uxaB FALSE 0.057 149.000 0.000 1.000 N NA
 5874919 5874920 EFER_1553 EFER_1554 uxaB yneE FALSE 0.087 196.000 0.143 NA   NA
 5874921 5874922 EFER_1555 EFER_1556 tam ydcM FALSE 0.128 89.000 0.000 NA   NA
 5874922 5874923 EFER_1556 EFER_1557 ydcM   TRUE 0.520 -22.000 0.000 NA   NA
 5874925 5874926 EFER_1559 EFER_1560 lsrG lsrF TRUE 0.588 24.000 0.000 1.000   NA
 5874926 5874927 EFER_1560 EFER_1561 lsrF lsrB TRUE 0.872 27.000 0.000 NA Y NA
 5874927 5874928 EFER_1561 EFER_1562 lsrB lsrD TRUE 0.998 12.000 0.844 NA Y NA
 5874928 5874929 EFER_1562 EFER_1563 lsrD lsrC TRUE 0.999 0.000 0.788 0.047 Y NA
 5874929 5874930 EFER_1563 EFER_1564 lsrC ego TRUE 0.997 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 5874931 5874932 EFER_1565 EFER_1566 lsrR lsrK FALSE 0.133 79.000 0.000 1.000 N NA
 5874935 5874936 EFER_1570 EFER_1571     TRUE 0.549 123.000 0.400 NA   NA
 5874937 5874938 EFER_1572 EFER_1573 yddA yddB TRUE 0.619 37.000 0.000 0.060   NA
 5874938 5874939 EFER_1573 EFER_1574 yddB pqqL TRUE 0.600 50.000 0.167 1.000   NA
 5874939 5874940 EFER_1574 EFER_1575 pqqL gadB FALSE 0.006 327.000 0.000 1.000   NA
 5874940 5874941 EFER_1575 EFER_1577 gadB gadC FALSE 0.291 185.000 0.103 1.000 Y NA
 5874941 5874942 EFER_1577 EFER_1578 gadC yddW FALSE 0.392 37.000 0.000 1.000   NA
 5874942 5874943 EFER_1578 EFER_1579 yddW yddV FALSE 0.026 199.000 0.000 1.000   NA
 5874943 5874944 EFER_1579 EFER_1580 yddV dos TRUE 0.970 25.000 0.130 0.005 Y NA
 5874945 5874946 EFER_1582 EFER_1583 frmA yohL TRUE 0.978 17.000 0.531 NA   NA
 5874950 5874951 EFER_1586 EFER_1587 ydcF   FALSE 0.003 415.000 0.000 NA   NA
 5874951 5874952 EFER_1587 EFER_1588   hrpA FALSE 0.018 213.000 0.000 NA   NA
 5874954 5874955 EFER_1590 EFER_1591 ynbD ynbC TRUE 0.990 14.000 0.285 NA Y NA
 5874955 5874956 EFER_1591 EFER_1592 ynbC ynbB TRUE 0.734 16.000 0.000 NA   NA
 5874956 5874957 EFER_1592 EFER_1593 ynbB ynbA TRUE 0.989 0.000 0.179 0.002   NA
 5874957 5874958 EFER_1593 EFER_1594 ynbA ydbD FALSE 0.038 171.000 0.000 NA   NA
 5874958 5874959 EFER_1594 EFER_1595 ydbD ydbC FALSE 0.170 64.000 0.000 NA   NA
 5874959 5874960 EFER_1595 EFER_1596 ydbC paaY FALSE 0.014 243.000 0.000 1.000   NA
 5874960 5874961 EFER_1596 EFER_1597 paaY paaX TRUE 0.802 -18.000 0.118 NA   NA
 5874961 5874962 EFER_1597 EFER_1598 paaX paaK FALSE 0.295 100.000 0.132 NA N NA
 5874962 5874963 EFER_1598 EFER_1599 paaK paaE TRUE 0.889 27.000 0.293 1.000 N NA
 5874963 5874964 EFER_1599 EFER_1600 paaE paaI TRUE 0.913 0.000 0.058 NA N NA
 5874964 5874965 EFER_1600 EFER_1601 paaI paaH TRUE 0.516 -10.000 0.013 NA N NA
 5874965 5874966 EFER_1601 EFER_1602 paaH paaG TRUE 0.987 2.000 0.051 1.000 Y NA
 5874966 5874967 EFER_1602 EFER_1603 paaG paaF TRUE 0.997 0.000 0.215 0.001 Y NA
 5874967 5874968 EFER_1603 EFER_1604 paaF paaJ TRUE 0.931 -3.000 0.093 1.000 N NA
 5874968 5874969 EFER_1604 EFER_1605 paaJ paaD TRUE 0.994 8.000 0.571 NA   NA
 5874969 5874970 EFER_1605 EFER_1606 paaD paaC TRUE 0.992 15.000 0.919 NA   NA
 5874970 5874971 EFER_1606 EFER_1607 paaC paaB TRUE 0.997 9.000 0.943 NA   NA
 5874971 5874972 EFER_1607 EFER_1608 paaB paaA TRUE 0.995 12.000 0.920 NA   NA
 5874973 5874974 EFER_1609 EFER_1610 maoC   FALSE 0.209 54.000 0.000 NA   NA
 5874974 5874975 EFER_1610 EFER_1611   tynA FALSE 0.441 30.000 0.000 NA   NA
 5874978 5874979 EFER_1614 EFER_1615   ydbL FALSE 0.196 57.000 0.000 NA   NA
 5874979 5874980 EFER_1615 EFER_1616 ydbL ynbE TRUE 0.996 5.000 0.726 NA   NA
 5874980 5874981 EFER_1616 EFER_1617 ynbE ydbH TRUE 0.907 -3.000 0.068 NA   NA
 5874982 5874983 EFER_1618 EFER_1619 ldhA hslJ FALSE 0.069 102.000 0.012 NA N NA
 5874985 5874986 EFER_1621 EFER_1622   ydbK FALSE 0.004 349.000 0.000 NA   NA
 5874988 5874989 EFER_1623 EFER_1624 ompN uspF FALSE 0.065 140.000 0.000 1.000 N NA
 5874989 5874990 EFER_1624 EFER_1625 uspF ydaO FALSE 0.007 270.000 0.000 NA N NA
 5874991 5874992 EFER_1626 EFER_1627 dbpA   FALSE 0.452 29.000 0.000 NA   NA
 5874992 5874993 EFER_1627 EFER_misc_RNA_30   C0343 FALSE 0.281 -115.000 0.000 NA   NA
 5874993 5874994 EFER_misc_RNA_30 EFER_1628 C0343   FALSE 0.014 231.000 0.000 NA   NA
 5874994 5874995 EFER_1628 EFER_1629   ydaN FALSE 0.396 -43.000 0.000 NA   NA
 5874997 5874998 EFER_1631 EFER_1632 pcaC pcaD TRUE 0.621 -31.000 0.065 1.000   NA
 5874998 5874999 EFER_1632 EFER_1633 pcaD pcaB FALSE 0.387 -61.000 0.028 1.000   NA
 5874999 5875000 EFER_1633 EFER_1634 pcaB paaJ TRUE 0.975 7.000 0.028 0.001 N NA
 5875000 5875001 EFER_1634 EFER_1635 paaJ pcaJ TRUE 0.999 10.000 1.000 1.000 Y NA
 5875001 5875002 EFER_1635 EFER_1636 pcaJ pcaI TRUE 0.999 11.000 1.000 0.001 Y NA
 5875004 5875005 EFER_1638 EFER_misc_RNA_31 ydaL isrA FALSE 0.199 56.000 0.000 NA   NA
 5875006 5875007 EFER_1639 EFER_1640 ogt fnr FALSE 0.044 195.000 0.067 1.000 N NA
 5875009 5875010 EFER_1642 EFER_1643   bla TRUE 0.512 183.000 0.800 1.000 N NA
 5875010 5875011 EFER_1643 EFER_1644 bla uspE FALSE 0.016 216.000 0.000 1.000 N NA
 5875018 5875019 EFER_1651 EFER_1652 tyrR ycjF FALSE 0.193 148.000 0.137 NA   NA
 5875019 5875020 EFER_1652 EFER_1653 ycjF ycjX TRUE 0.994 -3.000 0.791 NA   NA
 5875020 5875021 EFER_1653 EFER_1654 ycjX pspE FALSE 0.068 125.000 0.013 NA   NA
 5875021 5875022 EFER_1654 EFER_1655 pspE pspD TRUE 0.591 43.000 0.133 NA   NA
 5875022 5875023 EFER_1655 EFER_1656 pspD pspC TRUE 0.973 9.000 0.167 NA   NA
 5875023 5875024 EFER_1656 EFER_1657 pspC pspB TRUE 0.997 0.000 0.913 NA   NA
 5875024 5875025 EFER_1657 EFER_1658 pspB pspA TRUE 0.880 55.000 0.739 NA   NA
 5875026 5875027 EFER_1659 EFER_1660 pspF sapA TRUE 0.590 115.000 0.402 1.000 N NA
 5875027 5875028 EFER_1660 EFER_1661 sapA sapB TRUE 0.985 -3.000 0.264 0.046 N NA
 5875028 5875029 EFER_1661 EFER_1662 sapB sapC TRUE 0.986 -13.000 0.284 0.046 Y NA
 5875029 5875030 EFER_1662 EFER_1663 sapC sapD TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000 Y NA
 5875030 5875031 EFER_1663 EFER_1664 sapD sapF TRUE 0.999 2.000 0.684 0.015 Y NA
 5875031 5875032 EFER_1664 EFER_1665 sapF fabI FALSE 0.170 122.000 0.078 1.000 N NA
 5875032 5875033 EFER_1665 EFER_1666 fabI yciW FALSE 0.024 222.000 0.057 NA   NA
 5875033 5875034 EFER_1666 EFER_1667 yciW rnb FALSE 0.351 68.000 0.105 NA   NA
 5875034 5875035 EFER_1667 EFER_1668 rnb gmr FALSE 0.014 224.000 0.000 1.000 N NA
 5875035 5875036 EFER_1668 EFER_1669 gmr   FALSE 0.112 155.000 0.083 NA   NA
 5875036 5875037 EFER_1669 EFER_1670   yciT TRUE 0.763 -31.000 0.146 NA   NA
 5875037 5875038 EFER_1670 EFER_1671 yciT osmB FALSE 0.008 275.000 0.000 NA   NA
 5875039 5875040 EFER_1672 EFER_1673 yciH pyrF TRUE 0.868 -3.000 0.045 1.000 N NA
 5875040 5875041 EFER_1673 EFER_1674 pyrF yciM FALSE 0.086 191.000 0.125 1.000 N NA
 5875041 5875042 EFER_1674 EFER_1675 yciM yciS TRUE 0.995 7.000 0.576 NA   NA
 5875042 5875043 EFER_1675 EFER_1676 yciS pgpB FALSE 0.187 151.000 0.143 NA   NA
 5875047 5875048 EFER_1680 EFER_1681   yciX TRUE 0.994 1.000 0.556 NA   NA
 5875048 5875049 EFER_1681 EFER_1682 yciX cysB FALSE 0.009 264.000 0.000 NA   NA
 5875049 5875050 EFER_1682 EFER_1683 cysB topA FALSE 0.013 209.000 0.008 1.000 N NA
 5875053 5875054 EFER_1686 EFER_1687 yciK btuR TRUE 0.877 -3.000 0.050 1.000 N NA
 5875055 5875056 EFER_1688 EFER_1689 rluB yciQ FALSE 0.018 213.000 0.000 NA   NA
 5875056 5875057 EFER_1689 EFER_1690 yciQ yciO TRUE 0.467 28.000 0.000 NA   NA
 5875057 5875058 EFER_1690 EFER_1691 yciO yciV TRUE 0.977 -3.000 0.281 NA   NA
 5875059 5875060 EFER_4506 EFER_1692 trpL trpE FALSE 0.113 92.000 0.023 NA   NA
 5875060 5875061 EFER_1692 EFER_1693 trpE trpD TRUE 0.992 0.000 0.010 0.001 Y NA
 5875061 5875062 EFER_1693 EFER_1694 trpD trpC TRUE 0.996 4.000 0.293 1.000 Y NA
 5875062 5875063 EFER_1694 EFER_1695 trpC trpB TRUE 0.996 12.000 0.221 0.001 Y NA
 5875063 5875064 EFER_1695 EFER_1696 trpB trpA TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 5875066 5875067 EFER_1698 EFER_1699 ykgJ yciC TRUE 0.814 27.000 0.169 NA   NA
 5875067 5875068 EFER_1699 EFER_1700 yciC yciB TRUE 0.560 31.000 0.061 NA   NA
 5875068 5875069 EFER_1700 EFER_1701 yciB yciA FALSE 0.333 108.000 0.167 NA N NA
 5875073 5875074 EFER_1705 EFER_1706 cls yciU TRUE 0.809 34.000 0.231 NA   NA
 5875075 5875076 EFER_1707 EFER_1708 cikL oppF FALSE 0.385 -96.000 0.042 1.000   NA
 5875076 5875077 EFER_1708 EFER_1709 oppF oppD TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 5875077 5875078 EFER_1709 EFER_1710 oppD oppC TRUE 0.997 12.000 0.554 1.000 Y NA
 5875078 5875079 EFER_1710 EFER_1711 oppC oppB TRUE 0.998 15.000 0.870 0.046 Y NA
 5875079 5875080 EFER_1711 EFER_1712 oppB oppA TRUE 0.809 85.000 0.151 0.046 Y NA
 5875080 5875081 EFER_1712 EFER_1713 oppA ychE FALSE 0.001 860.000 0.000 NA N NA
 5875083 5875084 EFER_1715 EFER_1716 insG   FALSE 0.346 -63.000 0.000 NA   NA
 5875084 5875085 EFER_1716 EFER_1717   tdk FALSE 0.015 224.000 0.000 NA   NA
 5875087 5875088 EFER_1719 EFER_1720 galU rssB FALSE 0.124 203.000 0.235 1.000 N NA
 5875088 5875089 EFER_1720 EFER_1721 rssB rssA FALSE 0.373 44.000 0.048 1.000   NA
 5875090 5875091 EFER_1722 EFER_1723 ychJ purU TRUE 0.598 53.000 0.200 NA   NA
 5875091 5875092 EFER_1723 EFER_tRNA19 purU   FALSE 0.046 161.000 0.000 NA   NA
 5875092 5875093 EFER_tRNA19 EFER_tRNA20     FALSE 0.380 35.000 0.000 NA   NA
 5875093 5875094 EFER_tRNA20 EFER_misc_RNA_32   rtt TRUE 0.894 8.000 0.000 NA   NA
 5875095 5875096 EFER_1726 EFER_1727     TRUE 0.811 -13.000 0.103 NA   NA
 5875096 5875097 EFER_1727 EFER_1728     TRUE 0.922 -7.000 0.179 NA   NA
 5875097 5875098 EFER_1728 EFER_1729     TRUE 0.860 -15.000 0.162 NA   NA
 5875098 5875099 EFER_1729 EFER_1730     TRUE 0.920 -51.000 0.550 NA   NA
 5875099 5875100 EFER_1730 EFER_1731     TRUE 0.811 -22.000 0.133 1.000   NA
 5875100 5875101 EFER_1731 EFER_1732     TRUE 0.965 -3.000 0.200 1.000 N NA
 5875101 5875102 EFER_1732 EFER_1733   narI FALSE 0.101 112.000 0.000 1.000 N NA
 5875102 5875103 EFER_1733 EFER_1734 narI narJ TRUE 0.999 0.000 0.500 0.002 Y NA
 5875103 5875104 EFER_1734 EFER_1735 narJ narH TRUE 0.999 -3.000 0.588 0.002 Y NA
 5875104 5875105 EFER_1735 EFER_1736 narH narG TRUE 0.998 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 5875105 5875106 EFER_1736 EFER_1737 narG narK FALSE 0.003 393.000 0.000 1.000 N NA
 5875107 5875108 EFER_1738 EFER_1739 narX narL TRUE 0.996 -7.000 0.521 0.013 Y NA
 5875111 5875112 EFER_1742 EFER_1743 chaC chaB FALSE 0.161 158.000 0.140 NA   NA
 5875114 5875115 EFER_1745 EFER_1746   kdsA FALSE 0.014 229.000 0.000 NA   NA
 5875115 5875116 EFER_1746 EFER_1747 kdsA ychA TRUE 0.622 36.000 0.089 1.000   NA
 5875116 5875117 EFER_1747 EFER_1748 ychA   FALSE 0.139 78.000 0.000 NA   NA
 5875117 5875118 EFER_1748 EFER_1749   prmC FALSE 0.223 52.000 0.000 NA   NA
 5875118 5875119 EFER_1749 EFER_1750 prmC prfA TRUE 0.997 0.000 0.229 0.041 Y NA
 5875119 5875120 EFER_1750 EFER_1751 prfA hemA TRUE 0.786 42.000 0.171 0.041 N NA
 5875121 5875122 EFER_1752 EFER_1753 lolB ispE TRUE 0.970 0.000 0.157 1.000 N NA
 5875122 5875123 EFER_1753 EFER_1754 ispE prsA FALSE 0.079 151.000 0.053 1.000 N NA
 5875123 5875124 EFER_1754 EFER_1755 prsA ychM FALSE 0.079 125.000 0.027 1.000 N NA
 5875126 5875127 EFER_1757 EFER_1758 pth ychF TRUE 0.679 117.000 0.184 1.000 Y NA
 5875127 5875128 EFER_1758 EFER_1759 ychF treA FALSE 0.050 154.000 0.000 1.000 N NA
 5875132 5875133 EFER_1763 EFER_1764 ldcA cvrA FALSE 0.252 97.000 0.103 NA N NA
 5875134 5875135 EFER_1765 EFER_1766 dadX dadA TRUE 0.961 12.000 0.168 1.000 N NA
 5875138 5875139 EFER_1769 EFER_1770 nhaB dsbB TRUE 0.659 142.000 0.723 1.000 N NA
 5875140 5875141 EFER_1771 EFER_1772 eaeH   FALSE 0.017 215.000 0.000 NA   NA
 5875141 5875142 EFER_1772 EFER_1773   ycgN FALSE 0.159 67.000 0.000 NA   NA
 5875142 5875143 EFER_1773 EFER_1774 ycgN ycgM FALSE 0.241 103.000 0.088 NA   NA
 5875143 5875144 EFER_1774 EFER_1775 ycgM ycgL FALSE 0.319 51.000 0.056 NA   NA
 5875145 5875146 EFER_1776 EFER_1777 minC minD TRUE 0.984 24.000 0.466 1.000 Y NA
 5875146 5875147 EFER_1777 EFER_1778 minD minE TRUE 0.998 4.000 0.618 NA Y NA
 5875148 5875149 EFER_tRNA76 EFER_1779     FALSE 0.047 160.000 0.000 NA   NA
 5875149 5875150 EFER_1779 EFER_1780     TRUE 0.923 -7.000 0.000 0.001   NA
 5875150 5875151 EFER_1780 EFER_1781     TRUE 0.991 -6.000 0.500 0.001   NA
 5875151 5875152 EFER_1781 EFER_1782     TRUE 0.994 -28.000 0.750 0.001 Y NA
 5875152 5875153 EFER_1782 EFER_1783     TRUE 0.994 -15.000 0.500 0.001 Y NA
 5875153 5875154 EFER_1783 EFER_1784   ymgF FALSE 0.073 134.000 0.000 NA   NA
 5875154 5875155 EFER_1784 EFER_1785 ymgF   FALSE 0.038 171.000 0.000 NA   NA
 5875155 5875156 EFER_1785 EFER_1786     FALSE 0.004 388.000 0.000 1.000   NA
 5875159 5875160 EFER_1789 EFER_1790     FALSE 0.003 398.000 0.000 NA   NA
 5875160 5875161 EFER_1790 EFER_1791     FALSE 0.005 353.000 0.000 1.000   NA
 5875165 5875166 EFER_1795 EFER_1796 ymfC ymfB TRUE 0.973 10.000 0.182 1.000 N NA
 5875166 5875167 EFER_1796 EFER_1797 ymfB trmU TRUE 0.528 54.000 0.158 1.000 N NA
 5875167 5875168 EFER_1797 EFER_1798 trmU hflD TRUE 0.742 36.000 0.180 NA   NA
 5875168 5875169 EFER_1798 EFER_1799 hflD purB TRUE 0.961 4.000 0.093 NA   NA
 5875169 5875170 EFER_1799 EFER_1800 purB phoP FALSE 0.031 166.000 0.011 1.000 N NA
 5875170 5875171 EFER_1800 EFER_1801 phoP phoQ TRUE 0.999 0.000 0.940 1.000 Y NA
 5875171 5875172 EFER_1801 EFER_1802 phoQ ycfD TRUE 0.657 90.000 0.408 NA   NA
 5875173 5875174 EFER_1803 EFER_1804 yeaE mipA FALSE 0.268 45.000 0.000 NA   NA
 5875175 5875176 EFER_1805 EFER_1806 yeaG yeaH TRUE 0.752 113.000 0.683 NA   NA
 5875176 5875177 EFER_1806 EFER_1807 yeaH yeaI FALSE 0.008 279.000 0.000 NA   NA
 5875177 5875178 EFER_1807 EFER_1808 yeaI yeaJ FALSE 0.385 171.000 0.000 0.005 Y NA
 5875178 5875179 EFER_1808 EFER_1809 yeaJ yeaK TRUE 0.483 43.000 0.083 NA   NA
 5875181 5875182 EFER_1811 EFER_1812 yeaL yeaN FALSE 0.109 108.000 0.000 NA   NA
 5875182 5875183 EFER_1812 EFER_1813 yeaN yeaO FALSE 0.154 55.000 0.007 NA   NA
 5875186 5875187 EFER_1816 EFER_1817 yeaQ yeaS FALSE 0.049 166.000 0.000 1.000   NA
 5875187 5875188 EFER_1817 EFER_1818 yeaS ycfJ FALSE 0.069 149.000 0.000 1.000   NA
 5875188 5875189 EFER_1818 EFER_1819 ycfJ ndh FALSE 0.084 170.000 0.071 1.000   NA
 5875189 5875190 EFER_1819 EFER_1820 ndh ycfP FALSE 0.020 241.000 0.057 NA   NA
 5875190 5875191 EFER_1820 EFER_1821 ycfP nagZ TRUE 0.757 24.000 0.091 NA   NA
 5875191 5875192 EFER_1821 EFER_1822 nagZ thiK TRUE 0.728 22.000 0.069 1.000 N NA
 5875192 5875193 EFER_1822 EFER_1823 thiK ycfM TRUE 0.916 -19.000 0.310 NA   NA
 5875193 5875194 EFER_1823 EFER_1824 ycfM ycfL TRUE 0.985 14.000 0.516 NA   NA
 5875194 5875195 EFER_1824 EFER_1825 ycfL hinT TRUE 0.930 3.000 0.051 NA   NA
 5875195 5875196 EFER_1825 EFER_1826 hinT ptsG FALSE 0.032 336.000 0.005 1.000 Y NA
 5875196 5875197 EFER_1826 EFER_1827 ptsG ycfH FALSE 0.003 294.000 0.004 NA N NA
 5875197 5875198 EFER_1827 EFER_1828 ycfH holB TRUE 0.988 11.000 0.110 NA Y NA
 5875198 5875199 EFER_1828 EFER_1829 holB tmk TRUE 0.967 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5875199 5875200 EFER_1829 EFER_1830 tmk yceG TRUE 0.911 -10.000 0.209 NA   NA
 5875200 5875201 EFER_1830 EFER_1831 yceG pabC TRUE 0.966 -3.000 0.204 NA   NA
 5875201 5875202 EFER_1831 EFER_1832 pabC fabF FALSE 0.346 118.000 0.187 1.000 N NA
 5875202 5875203 EFER_1832 EFER_1833 fabF acpP TRUE 0.844 89.000 0.346 1.000 Y NA
 5875203 5875204 EFER_1833 EFER_1834 acpP fabG FALSE 0.332 276.000 0.321 0.004 Y NA
 5875204 5875205 EFER_1834 EFER_1835 fabG fabD TRUE 0.998 12.000 0.432 0.004 Y NA
 5875205 5875206 EFER_1835 EFER_1836 fabD fabH TRUE 0.990 16.000 0.182 0.004 Y NA
 5875206 5875207 EFER_1836 EFER_1837 fabH plsX TRUE 0.926 76.000 0.380 0.004 Y NA
 5875207 5875208 EFER_1837 EFER_1839 plsX rpmF TRUE 0.677 81.000 0.418 1.000 N NA
 5875208 5875209 EFER_1839 EFER_1840 rpmF yceD TRUE 0.860 52.000 0.599 NA   NA
 5875209 5875210 EFER_1840 EFER_misc_RNA_33 yceD sraB FALSE 0.353 37.000 0.000 NA   NA
 5875214 5875215 EFER_1845 EFER_1846 flgL flgK TRUE 0.990 16.000 0.142 0.001 Y NA
 5875215 5875216 EFER_1846 EFER_1847 flgK flgJ TRUE 0.970 66.000 0.705 0.002 Y NA
 5875216 5875217 EFER_1847 EFER_1848 flgJ flgI TRUE 0.992 0.000 0.036 0.006 Y NA
 5875217 5875218 EFER_1848 EFER_1849 flgI flgH TRUE 0.991 12.000 0.073 0.006 Y NA
 5875218 5875219 EFER_1849 EFER_1850 flgH flgG TRUE 0.934 53.000 0.268 0.005 Y NA
 5875219 5875220 EFER_1850 EFER_1852 flgG flgF TRUE 0.846 152.000 0.420 0.001 Y NA
 5875220 5875221 EFER_1852 EFER_1853 flgF flgE TRUE 0.994 20.000 0.476 0.003 Y NA
 5875221 5875222 EFER_1853 EFER_1854 flgE flgD TRUE 0.937 25.000 0.116 NA Y NA
 5875222 5875223 EFER_1854 EFER_1855 flgD flgC TRUE 0.990 12.000 0.186 NA Y NA
 5875223 5875224 EFER_1855 EFER_1856 flgC flgB TRUE 0.999 4.000 0.824 0.003 Y NA
 5875225 5875226 EFER_1857 EFER_1858 flgA flgM TRUE 0.820 91.000 0.330 NA Y NA
 5875226 5875227 EFER_1858 EFER_1859 flgM flgN TRUE 0.999 5.000 0.361 0.002 Y NA
 5875228 5875229 EFER_1860 EFER_1861 mviN mviM FALSE 0.158 71.000 0.022 1.000   NA
 5875229 5875230 EFER_1861 EFER_1862 mviM yceH TRUE 0.962 2.000 0.103 NA   NA
 5875230 5875231 EFER_1862 EFER_1863 yceH rimJ TRUE 0.800 -18.000 0.116 NA   NA
 5875232 5875233 EFER_1864 EFER_1866 mdtH yceB FALSE 0.263 145.000 0.196 NA   NA
 5875233 5875234 EFER_1866 EFER_1867 yceB pyrC FALSE 0.101 105.000 0.022 NA   NA
 5875234 5875235 EFER_1867 EFER_1868 pyrC dinI FALSE 0.149 73.000 0.031 NA   NA
 5875235 5875236 EFER_1868 EFER_1869 dinI bssS FALSE 0.007 289.000 0.000 NA   NA
 5875236 5875237 EFER_1869 EFER_1870 bssS solA TRUE 0.596 117.000 0.423 NA   NA
 5875237 5875238 EFER_1870 EFER_1871 solA yceJ FALSE 0.011 374.000 0.000 0.024 N NA
 5875238 5875239 EFER_1871 EFER_1872 yceJ yceI TRUE 0.993 -3.000 0.676 NA   NA
 5875241 5875242 EFER_1874 EFER_1875 lpxL mdtG TRUE 0.639 183.000 0.857 0.072 N NA
 5875242 5875243 EFER_1875 EFER_1876 mdtG msyB TRUE 0.611 83.000 0.333 NA   NA
 5875244 5875245 EFER_1877 EFER_1878 yceK mdoH FALSE 0.171 153.000 0.135 NA   NA
 5875245 5875246 EFER_1878 EFER_1879 mdoH mdoG TRUE 0.972 -7.000 0.469 NA N NA
 5875247 5875248 EFER_1880 EFER_1882   mdoC FALSE 0.207 72.000 0.054 NA   NA
 5875249 5875250 EFER_1883 EFER_1884 ymdC ymdB FALSE 0.409 -67.000 0.046 NA   NA
 5875250 5875251 EFER_1884 EFER_1885 ymdB ymdA FALSE 0.135 80.000 0.028 NA   NA
 5875251 5875252 EFER_1885 EFER_1886 ymdA csgC TRUE 0.491 116.000 0.300 NA   NA
 5875252 5875253 EFER_1886 EFER_1887 csgC csgA TRUE 0.850 60.000 0.667 NA   NA
 5875253 5875254 EFER_1887 EFER_1888 csgA csgB TRUE 0.903 41.000 0.333 0.006   NA
 5875255 5875256 EFER_1889 EFER_1890 csgD csgE TRUE 0.636 -130.000 0.176 NA   NA
 5875256 5875257 EFER_1890 EFER_1891 csgE csgF TRUE 0.971 24.000 0.723 NA   NA
 5875257 5875258 EFER_1891 EFER_1893 csgF csgG TRUE 0.545 27.000 0.043 NA   NA
 5875259 5875260 EFER_1894 EFER_1895 ycdZ ycdY FALSE 0.356 92.000 0.145 NA   NA
 5875260 5875261 EFER_1895 EFER_1896 ycdY ycdX TRUE 0.945 24.000 0.417 1.000   NA
 5875261 5875262 EFER_1896 EFER_1897 ycdX ycdW TRUE 0.734 87.000 0.169 1.000 Y NA
 5875264 5875265 EFER_1898 EFER_1899 lysU yjdL FALSE 0.008 269.000 0.000 1.000 N NA
 5875265 5875266 EFER_1899 EFER_1900 yjdL cadA TRUE 0.638 59.000 0.000 1.000 Y NA
 5875266 5875267 EFER_1900 EFER_1901 cadA cadB TRUE 0.549 80.000 0.000 1.000 Y NA
 5875267 5875268 EFER_1901 EFER_1902 cadB cadC FALSE 0.004 364.000 0.000 1.000 N NA
 5875268 5875269 EFER_1902 EFER_1903 cadC ycdT FALSE 0.004 340.000 0.000 1.000 N NA
 5875270 5875271 EFER_1904 EFER_1905 pgaA pgaB TRUE 0.996 9.000 0.696 1.000   NA
 5875271 5875272 EFER_1905 EFER_1906 pgaB pgaC TRUE 0.972 -7.000 0.435 1.000 N NA
 5875272 5875273 EFER_1906 EFER_1907 pgaC ycdP TRUE 0.993 2.000 0.462 NA   NA
 5875274 5875275 EFER_1908 EFER_1909 phoH efeB FALSE 0.002 473.000 0.000 NA N NA
 5875275 5875276 EFER_1909 EFER_1910 efeB efeO TRUE 0.997 6.000 0.378 NA Y NA