MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5855046 5855047 E2348C_0001 E2348C_0002 thrL thrA FALSE 0.262 81.000 0.043 1.000   NA
 5855047 5855048 E2348C_0002 E2348C_0003 thrA thrB TRUE 0.993 2.000 0.133 1.000 Y NA
 5855048 5855049 E2348C_0003 E2348C_0004 thrB thrC TRUE 0.996 1.000 0.233 1.000 Y NA
 5855049 5855050 E2348C_0004 E2348C_0005 thrC yaaX FALSE 0.025 214.000 0.003 NA   NA
 5855051 5855052 E2348C_0006 E2348C_0007 yaaA yaaJ FALSE 0.223 70.000 0.028 NA   NA
 5855053 5855054 E2348C_0008 E2348C_0009 talB mog FALSE 0.148 115.000 0.042 1.000 N NA
 5855054 5855055 E2348C_0009 E2348C_0010 mog   FALSE 0.084 184.000 0.000 1.000   NA
 5855056 5855057 E2348C_0011 E2348C_0012 yaaH yaaW FALSE 0.116 149.000 0.043 NA   NA
 5855057 5855058 E2348C_0012 E2348C_0013 yaaW yaaI TRUE 0.941 26.000 0.500 NA   NA
 5855059 5855060 E2348C_0014 E2348C_0015 dnaK dnaJ TRUE 0.899 89.000 0.236 0.004 Y NA
 5855061 5855062 E2348C_0016 E2348C_0017 mokC1 hokC1 TRUE 0.585 -152.000 0.000 NA   NA
 5855063 5855064 E2348C_ncR01 E2348C_0018 sokC   FALSE 0.005 512.000 0.000 NA   NA
 5855064 5855065 E2348C_0018 E2348C_0019     TRUE 0.964 21.000 0.571 NA   NA
 5855065 5855066 E2348C_0019 E2348C_0020     FALSE 0.158 129.000 0.000 NA   NA
 5855066 5855067 E2348C_0020 E2348C_0021   nhaA FALSE 0.029 235.000 0.000 NA   NA
 5855067 5855068 E2348C_0021 E2348C_0022 nhaA nhaR TRUE 0.674 60.000 0.292 1.000 N NA
 5855070 5855071 E2348C_0024 E2348C_0025 yaaY ribF TRUE 0.873 8.000 0.019 NA   NA
 5855071 5855072 E2348C_0025 E2348C_0026 ribF ileS TRUE 0.765 43.000 0.254 1.000 N NA
 5855072 5855073 E2348C_0026 E2348C_0027 ileS lspA TRUE 0.921 0.000 0.045 1.000 N NA
 5855073 5855074 E2348C_0027 E2348C_0028 lspA fkpB FALSE 0.354 108.000 0.154 1.000 N NA
 5855074 5855075 E2348C_0028 E2348C_0029 fkpB ispH TRUE 0.993 2.000 0.626 1.000 N NA
 5855075 5855076 E2348C_0029 E2348C_0030 ispH rihC FALSE 0.155 66.000 0.028 NA N NA
 5855076 5855077 E2348C_0030 E2348C_0031 rihC dapB FALSE 0.032 167.000 0.003 NA N NA
 5855077 5855078 E2348C_0031 E2348C_0032 dapB carA FALSE 0.032 456.000 0.034 1.000 Y NA
 5855078 5855079 E2348C_0032 E2348C_0033 carA carB TRUE 0.993 18.000 0.345 0.001 Y NA
 5855082 5855083 E2348C_0036 E2348C_0037 caiE caiD TRUE 0.926 6.000 0.000 1.000   NA
 5855083 5855084 E2348C_0037 E2348C_0038 caiD caiC TRUE 0.726 109.000 0.000 0.022 Y NA
 5855084 5855085 E2348C_0038 E2348C_0039 caiC caiB TRUE 0.602 73.000 0.154 0.022 N NA
 5855085 5855086 E2348C_0039 E2348C_0040 caiB caiA TRUE 0.661 118.000 0.529 1.000 N NA
 5855086 5855087 E2348C_0040 E2348C_0041 caiA caiT TRUE 0.700 31.000 0.118 1.000 N NA
 5855088 5855089 E2348C_0042 E2348C_0043 fixA fixB TRUE 0.992 15.000 0.231 0.013 Y NA
 5855089 5855090 E2348C_0043 E2348C_0044 fixB fixC TRUE 0.865 51.000 0.000 0.053 Y NA
 5855090 5855091 E2348C_0044 E2348C_0045 fixC fixX TRUE 0.995 -3.000 0.167 0.053 Y NA
 5855091 5855092 E2348C_0045 E2348C_0046 fixX yaaU FALSE 0.274 59.000 0.000 1.000 N NA
 5855092 5855093 E2348C_0046 E2348C_0047 yaaU kefF FALSE 0.224 108.000 0.000 1.000   NA
 5855093 5855094 E2348C_0047 E2348C_0048 kefF kefC TRUE 0.983 -7.000 0.560 1.000   NA
 5855094 5855095 E2348C_0048 E2348C_0049 kefC folA FALSE 0.032 192.000 0.012 1.000 N NA
 5855095 5855096 E2348C_0049 E2348C_0050 folA   FALSE 0.263 86.000 0.000 1.000   NA
 5855096 5855097 E2348C_0050 E2348C_0051     TRUE 0.939 3.000 0.000 1.000   NA
 5855098 5855099 E2348C_0052 E2348C_0053 apaH apaG TRUE 0.974 7.000 0.267 NA N NA
 5855099 5855100 E2348C_0053 E2348C_0054 apaG ksgA TRUE 0.929 3.000 0.078 NA N NA
 5855100 5855101 E2348C_0054 E2348C_0055 ksgA pdxA TRUE 0.970 -3.000 0.197 1.000 N NA
 5855101 5855102 E2348C_0055 E2348C_0056 pdxA surA TRUE 0.993 0.000 0.561 1.000 N NA
 5855102 5855103 E2348C_0056 E2348C_0057 surA imp TRUE 0.605 53.000 0.182 1.000 N NA
 5855105 5855106 E2348C_0059 E2348C_0060 rluA hepA TRUE 0.968 12.000 0.294 1.000 N NA
 5855106 5855107 E2348C_0060 E2348C_0061 hepA polB TRUE 0.593 165.000 0.098 0.083 Y NA
 5855107 5855108 E2348C_0061 E2348C_0062 polB araD FALSE 0.150 75.000 0.018 1.000 N NA
 5855108 5855109 E2348C_0062 E2348C_0063 araD araA TRUE 0.552 115.000 0.017 1.000 Y NA
 5855109 5855110 E2348C_0063 E2348C_0064 araA araB TRUE 0.940 11.000 0.138 1.000 N NA
 5855111 5855112 E2348C_0065 E2348C_0066 araC   FALSE 0.064 225.000 0.000 0.051 N NA
 5855112 5855113 E2348C_0066 E2348C_0067     TRUE 0.854 26.000 0.222 1.000 N NA
 5855113 5855114 E2348C_0067 E2348C_0068     FALSE 0.385 55.000 0.000 1.000   NA
 5855114 5855115 E2348C_0068 E2348C_0069     TRUE 0.899 49.000 0.667 NA   NA
 5855115 5855116 E2348C_0069 E2348C_0070     TRUE 0.990 10.000 0.600 NA   NA
 5855116 5855117 E2348C_0070 E2348C_0071   yabI FALSE 0.071 184.000 0.000 NA   NA
 5855118 5855119 E2348C_0072 E2348C_0073 thiQ thiP TRUE 0.974 -16.000 0.522 0.018 N NA
 5855119 5855120 E2348C_0073 E2348C_0074 thiP tbpA TRUE 0.976 -24.000 0.697 0.075 N NA
 5855120 5855121 E2348C_0074 E2348C_ncR02 tbpA   TRUE 0.571 31.000 0.000 NA   NA
 5855121 5855122 E2348C_ncR02 E2348C_0075   sgrR TRUE 0.540 34.000 0.000 NA   NA
 5855124 5855125 E2348C_0076 E2348C_0077 leuD leuC TRUE 0.997 11.000 0.309 0.001 Y NA
 5855125 5855126 E2348C_0077 E2348C_0078 leuC leuB TRUE 0.998 3.000 0.275 0.002 Y NA
 5855126 5855127 E2348C_0078 E2348C_0079 leuB leuA TRUE 0.997 0.000 0.126 0.002 Y NA
 5855127 5855128 E2348C_0079 E2348C_0080 leuA leuL FALSE 0.434 93.000 0.010 0.002   NA
 5855129 5855130 E2348C_0081 E2348C_0082 leuO ilvI FALSE 0.010 318.000 0.000 1.000 N NA
 5855130 5855131 E2348C_0082 E2348C_0083 ilvI ilvH TRUE 0.998 3.000 0.371 0.002 Y NA
 5855131 5855132 E2348C_0083 E2348C_0084 ilvH   TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5855132 5855133 E2348C_0084 E2348C_0085   fruR FALSE 0.234 82.000 0.000 NA   NA
 5855133 5855134 E2348C_0085 E2348C_0086 fruR mraZ FALSE 0.004 602.000 0.000 NA   NA
 5855134 5855135 E2348C_0086 E2348C_0087 mraZ mraW TRUE 0.994 2.000 0.635 NA   NA
 5855135 5855136 E2348C_0087 E2348C_0088 mraW ftsL TRUE 0.974 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5855136 5855137 E2348C_0088 E2348C_0089 ftsL ftsI TRUE 0.875 16.000 0.124 1.000 N NA
 5855137 5855138 E2348C_0089 E2348C_0090 ftsI murE TRUE 0.955 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 5855138 5855139 E2348C_0090 E2348C_0091 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 5855139 5855140 E2348C_0091 E2348C_0092 murF mraY TRUE 0.996 -6.000 0.309 0.005 Y NA
 5855140 5855141 E2348C_0092 E2348C_0093 mraY murD TRUE 0.999 3.000 0.647 0.005 Y NA
 5855141 5855142 E2348C_0093 E2348C_0094 murD ftsW TRUE 0.993 0.000 0.297 0.003 N NA
 5855142 5855143 E2348C_0094 E2348C_0095 ftsW murG TRUE 0.992 -3.000 0.647 1.000 N NA
 5855143 5855144 E2348C_0095 E2348C_0096 murG murC TRUE 0.911 54.000 0.283 1.000 Y NA
 5855144 5855145 E2348C_0096 E2348C_0097 murC ddlB TRUE 0.991 -7.000 0.153 0.005 Y NA
 5855145 5855146 E2348C_0097 E2348C_0098 ddlB ftsQ TRUE 0.997 2.000 0.372 NA Y NA
 5855146 5855147 E2348C_0098 E2348C_0099 ftsQ ftsA TRUE 0.985 -3.000 0.389 NA N NA
 5855147 5855148 E2348C_0099 E2348C_0100 ftsA ftsZ TRUE 0.931 61.000 0.460 1.000 Y NA
 5855148 5855149 E2348C_0100 E2348C_0101 ftsZ lpxC FALSE 0.335 101.000 0.134 1.000 N NA
 5855149 5855150 E2348C_0101 E2348C_0102 lpxC secM FALSE 0.036 230.000 0.000 1.000   NA
 5855150 5855151 E2348C_0102 E2348C_0103 secM secA FALSE 0.388 62.000 0.065 1.000   NA
 5855151 5855152 E2348C_0103 E2348C_0104 secA mutT TRUE 0.532 60.000 0.168 1.000 N NA
 5855153 5855154 E2348C_0105 E2348C_0106 yacG yacF TRUE 0.982 10.000 0.356 NA   NA
 5855154 5855155 E2348C_0106 E2348C_0107 yacF coaE TRUE 0.966 0.000 0.110 NA   NA
 5855157 5855158 E2348C_0109 E2348C_0110 hofC hofB TRUE 0.993 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 5855158 5855159 E2348C_0110 E2348C_0111 hofB ppdD TRUE 0.997 10.000 0.556 NA Y NA
 5855159 5855160 E2348C_0111 E2348C_0112 ppdD nadC FALSE 0.019 204.000 0.015 NA N NA
 5855161 5855162 E2348C_0113 E2348C_0114 ampD ampE TRUE 0.995 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 5855164 5855165 E2348C_0116 E2348C_0117 pdhR aceE FALSE 0.324 161.000 0.276 1.000 N NA
 5855165 5855166 E2348C_0117 E2348C_0118 aceE aceF TRUE 0.985 15.000 0.220 1.000 Y NA
 5855166 5855167 E2348C_0118 E2348C_0119 aceF lpd TRUE 0.586 208.000 0.463 1.000 Y NA
 5855169 5855170 E2348C_0121 E2348C_0122 acnB yacL FALSE 0.104 175.000 0.068 NA   NA
 5855171 5855172 E2348C_0123 E2348C_0124 speD speE TRUE 0.979 16.000 0.162 1.000 Y NA
 5855172 5855173 E2348C_0124 E2348C_0125 speE yacC TRUE 0.610 106.000 0.354 NA   NA
 5855178 5855179 E2348C_0130 E2348C_0131 yadG yadH TRUE 0.998 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 5855179 5855180 E2348C_0131 E2348C_0132 yadH yadI FALSE 0.148 105.000 0.037 1.000 N NA
 5855180 5855181 E2348C_0132 E2348C_0133 yadI yadE TRUE 0.865 64.000 0.222 1.000 Y NA
 5855184 5855185 E2348C_0136 E2348C_0137 panC panB TRUE 0.997 12.000 0.395 0.001 Y NA
 5855185 5855186 E2348C_0137 E2348C_0138 panB yadC FALSE 0.189 112.000 0.000 NA   NA
 5855186 5855187 E2348C_0138 E2348C_0139 yadC yadK FALSE 0.392 50.000 0.000 NA   NA
 5855187 5855188 E2348C_0139 E2348C_0140 yadK yadL TRUE 0.618 27.000 0.000 NA   NA
 5855188 5855189 E2348C_0140 E2348C_0141 yadL yadM TRUE 0.812 15.000 0.000 NA   NA
 5855189 5855190 E2348C_0141 E2348C_0142 yadM htrE TRUE 0.774 17.000 0.000 NA   NA
 5855190 5855191 E2348C_0142 E2348C_0143 htrE ecpD TRUE 0.529 35.000 0.000 NA   NA
 5855191 5855192 E2348C_0143 E2348C_0144 ecpD yadN FALSE 0.194 109.000 0.000 NA   NA
 5855192 5855193 E2348C_0144 E2348C_0145 yadN folK FALSE 0.007 359.000 0.000 1.000 N NA
 5855193 5855194 E2348C_0145 E2348C_0146 folK pcnB TRUE 0.975 -3.000 0.234 1.000 N NA
 5855194 5855195 E2348C_0146 E2348C_0147 pcnB yadB TRUE 0.744 93.000 0.131 1.000 Y NA
 5855195 5855196 E2348C_0147 E2348C_0148 yadB dksA TRUE 0.789 37.000 0.231 1.000 N NA
 5855196 5855197 E2348C_0148 E2348C_0149 dksA sfsA FALSE 0.178 178.000 0.151 NA   NA
 5855197 5855198 E2348C_0149 E2348C_0150 sfsA ligT TRUE 0.809 15.000 0.045 NA   NA
 5855199 5855200 E2348C_0151 E2348C_0152 hrpB mrcB FALSE 0.391 94.000 0.158 1.000 N NA
 5855200 5855201 E2348C_0152 E2348C_0153 mrcB   FALSE 0.009 327.000 0.000 1.000 N NA
 5855201 5855202 E2348C_0153 E2348C_0154     FALSE 0.430 46.000 0.000 NA   NA
 5855202 5855203 E2348C_0154 E2348C_0155     FALSE 0.454 43.000 0.000 NA   NA
 5855203 5855204 E2348C_0155 E2348C_0156     TRUE 0.981 22.000 0.333 1.000 Y NA
 5855204 5855205 E2348C_0156 E2348C_0157   fhuA FALSE 0.029 221.000 0.000 1.000 N NA
 5855205 5855206 E2348C_0157 E2348C_0158 fhuA fhuC TRUE 0.879 51.000 0.156 1.000 Y NA
 5855206 5855207 E2348C_0158 E2348C_0159 fhuC fhuD TRUE 0.988 0.000 0.031 1.000 Y NA
 5855207 5855208 E2348C_0159 E2348C_0160 fhuD fhuB TRUE 0.986 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5855210 5855211 E2348C_0162 E2348C_0163 clcA yadR FALSE 0.202 82.000 0.031 NA   NA
 5855212 5855213 E2348C_0164 E2348C_0165 yadS btuF TRUE 0.783 38.000 0.213 NA   NA
 5855213 5855214 E2348C_0165 E2348C_0166 btuF pfs TRUE 0.855 -7.000 0.073 1.000 N NA
 5855215 5855216 E2348C_0167 E2348C_0168 dgt degP FALSE 0.223 130.000 0.101 1.000 N NA
 5855216 5855217 E2348C_0168 E2348C_0169 degP cdaR FALSE 0.115 155.000 0.080 NA N NA
 5855218 5855219 E2348C_0170 E2348C_0171 yaeH dapD FALSE 0.012 310.000 0.035 NA   NA
 5855219 5855220 E2348C_0171 E2348C_0172 dapD glnD TRUE 0.668 31.000 0.097 1.000 N NA
 5855220 5855221 E2348C_0172 E2348C_0173 glnD map TRUE 0.614 62.000 0.243 1.000 N NA
 5855222 5855223 E2348C_ncR04 E2348C_0174 tff rpsB TRUE 0.618 27.000 0.000 NA   NA
 5855223 5855224 E2348C_0174 E2348C_0175 rpsB tsf TRUE 0.554 258.000 0.748 1.000 Y NA
 5855224 5855225 E2348C_0175 E2348C_0176 tsf pyrH TRUE 0.495 147.000 0.416 1.000 N NA
 5855225 5855226 E2348C_0176 E2348C_0177 pyrH frr FALSE 0.151 292.000 0.626 1.000 N NA
 5855226 5855227 E2348C_0177 E2348C_0178 frr dxr FALSE 0.156 92.000 0.032 1.000 N NA
 5855227 5855228 E2348C_0178 E2348C_0179 dxr ispU FALSE 0.289 186.000 0.025 1.000 Y NA
 5855228 5855229 E2348C_0179 E2348C_0180 ispU cdsA TRUE 0.957 43.000 0.400 1.000 Y NA
 5855229 5855230 E2348C_0180 E2348C_0181 cdsA yaeL TRUE 0.891 12.000 0.080 1.000 N NA
 5855230 5855231 E2348C_0181 E2348C_0182 yaeL yaeT TRUE 0.952 30.000 0.204 1.000 Y NA
 5855231 5855232 E2348C_0182 E2348C_0183 yaeT skp TRUE 0.834 122.000 0.354 1.000 Y NA
 5855232 5855233 E2348C_0183 E2348C_0184 skp lpxD TRUE 0.999 4.000 0.814 1.000 Y NA
 5855233 5855234 E2348C_0184 E2348C_0185 lpxD fabZ TRUE 0.785 105.000 0.796 1.000 N NA
 5855234 5855235 E2348C_0185 E2348C_0186 fabZ lpxA TRUE 0.995 4.000 0.850 1.000 N NA
 5855235 5855236 E2348C_0186 E2348C_0187 lpxA lpxB TRUE 0.996 0.000 0.289 1.000 Y NA
 5855236 5855237 E2348C_0187 E2348C_0188 lpxB rnhB TRUE 0.969 -3.000 0.186 1.000 N NA
 5855237 5855238 E2348C_0188 E2348C_0189 rnhB dnaE TRUE 0.921 32.000 0.104 1.000 Y NA
 5855238 5855239 E2348C_0189 E2348C_0190 dnaE accA TRUE 0.911 13.000 0.122 1.000 N NA
 5855239 5855240 E2348C_0190 E2348C_0191 accA ldcC FALSE 0.115 99.000 0.010 1.000 N NA
 5855240 5855241 E2348C_0191 E2348C_0192 ldcC yaeR TRUE 0.734 57.000 0.039 NA Y NA
 5855241 5855242 E2348C_0192 E2348C_0193 yaeR tilS FALSE 0.131 65.000 0.015 NA N NA
 5855243 5855244 E2348C_0194 E2348C_0195 rof yaeP TRUE 0.939 -7.000 0.179 NA   NA
 5855245 5855246 E2348C_0196 E2348C_0197 yaeQ yaeJ TRUE 0.919 -3.000 0.034 1.000   NA
 5855246 5855247 E2348C_0197 E2348C_0198 yaeJ nlpE TRUE 0.795 14.000 0.027 NA   NA
 5855248 5855249 E2348C_0199 E2348C_0200 yaeF proS FALSE 0.260 53.000 0.002 NA   NA
 5855249 5855250 E2348C_0200 E2348C_0201 proS yaeB FALSE 0.194 111.000 0.048 NA   NA
 5855250 5855251 E2348C_0201 E2348C_0202 yaeB rcsF TRUE 0.979 -3.000 0.247 NA   NA
 5855251 5855252 E2348C_0202 E2348C_0203 rcsF metQ TRUE 0.667 118.000 0.500 NA   NA
 5855252 5855253 E2348C_0203 E2348C_0204 metQ metI TRUE 0.976 40.000 0.411 0.059 Y NA
 5855253 5855254 E2348C_0204 E2348C_0205 metI metN TRUE 0.995 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 5855255 5855256 E2348C_0206 E2348C_rRNA1 gmhB rrsH FALSE 0.008 366.000 0.000 NA   NA
 5855256 5855257 E2348C_rRNA1 E2348C_tRNA01 rrsH ileV FALSE 0.268 69.000 0.000 NA   NA
 5855257 5855258 E2348C_tRNA01 E2348C_tRNA02 ileV alaV FALSE 0.454 43.000 0.000 NA   NA
 5855258 5855259 E2348C_tRNA02 E2348C_rRNA2 alaV rrlH FALSE 0.071 184.000 0.000 NA   NA
 5855259 5855260 E2348C_rRNA2 E2348C_rRNA3 rrlH rrfH FALSE 0.206 99.000 0.000 NA   NA
 5855260 5855261 E2348C_rRNA3 E2348C_tRNA03 rrfH aspU FALSE 0.360 53.000 0.000 NA   NA
 5855261 5855262 E2348C_tRNA03 E2348C_0207 aspU dkgB FALSE 0.101 162.000 0.000 NA   NA
 5855264 5855265 E2348C_0209 E2348C_0210 yafD yafE FALSE 0.287 78.000 0.066 NA   NA
 5855266 5855267 E2348C_0211 E2348C_0212 mltD gloB TRUE 0.607 72.000 0.233 1.000   NA
 5855270 5855271 E2348C_0215 E2348C_tRNA04 dnaQ aspV FALSE 0.150 133.000 0.000 NA   NA
 5855275 5855276 E2348C_0219 E2348C_0220 lpcA yafJ FALSE 0.176 205.000 0.229 1.000   NA
 5855279 5855280 E2348C_0223 E2348C_0224   fhiA FALSE 0.008 376.000 0.000 NA   NA
 5855281 5855282 E2348C_0225 E2348C_0226 mbhA dinB FALSE 0.222 71.000 0.000 1.000 N NA
 5855282 5855283 E2348C_0226 E2348C_0227 dinB yafP TRUE 0.902 -3.000 0.011 1.000   NA
 5855283 5855284 E2348C_0227 E2348C_0228 yafP   FALSE 0.063 191.000 0.000 NA   NA
 5855284 5855285 E2348C_0228 E2348C_0229   prfH TRUE 0.983 -3.000 0.303 NA   NA
 5855287 5855288 E2348C_0231 E2348C_0232 gpt frsA FALSE 0.207 92.000 0.040 NA   NA
 5855288 5855289 E2348C_0232 E2348C_0233 frsA crl FALSE 0.329 58.000 0.048 NA   NA
 5855291 5855292 E2348C_0235 E2348C_0236 proB proA TRUE 0.988 12.000 0.026 0.001 Y NA
 5855292 5855293 E2348C_0236 E2348C_tRNA05 proA thrW FALSE 0.185 115.000 0.000 NA   NA
 5855293 10800733 E2348C_tRNA05 E2348C_IE1a thrW   TRUE 0.615 -45.000 0.000 NA   NA
 5855295 5855296 E2348C_0238 E2348C_0239     TRUE 0.618 27.000 0.000 NA   NA
 5855296 5855297 E2348C_0239 E2348C_0240     FALSE 0.018 282.000 0.000 NA   NA
 5855297 5855298 E2348C_0240 E2348C_0241     TRUE 0.791 16.000 0.000 NA   NA
 5855298 10800734 E2348C_0241 E2348C_IE1b     FALSE 0.121 149.000 0.000 NA   NA
 5855301 5855302 E2348C_0244 E2348C_0245 ykgJ ecpE FALSE 0.013 313.000 0.000 NA   NA
 5855302 5855303 E2348C_0245 E2348C_0246 ecpE ecpD TRUE 0.949 -31.000 0.571 NA   NA
 5855303 5855304 E2348C_0246 E2348C_0247 ecpD ecpC TRUE 0.967 -10.000 0.429 NA   NA
 5855304 5855305 E2348C_0247 E2348C_0248 ecpC ecpB TRUE 0.903 26.000 0.308 NA   NA
 5855305 5855306 E2348C_0248 E2348C_0249 ecpB ecpA TRUE 0.776 57.000 0.385 NA   NA
 5855306 5855307 E2348C_0249 E2348C_0250 ecpA ecpR TRUE 0.705 74.000 0.400 NA   NA
 5855308 5855309 E2348C_0251 E2348C_0252   ykgL FALSE 0.301 62.000 0.000 NA   NA
 5855310 5855311 E2348C_0253 E2348C_0254 ykgO ykgM TRUE 0.970 0.000 0.004 0.013   NA
 5855311 5855312 E2348C_0254 E2348C_0255 ykgM   FALSE 0.003 939.000 0.000 1.000 N NA
 5855312 5855313 E2348C_0255 E2348C_0256     FALSE 0.101 172.000 0.000 1.000   NA
 5855314 5855315 E2348C_0257 E2348C_0258     FALSE 0.360 200.000 0.000 0.061 Y NA
 5855316 5855317 E2348C_0259 E2348C_0260     TRUE 0.934 27.000 0.438 1.000   NA
 5855321 5855322 E2348C_0264 E2348C_0265 ykgB ykgI TRUE 0.865 12.000 0.043 NA   NA
 5855322 5855323 E2348C_0265 E2348C_0266 ykgI ykgC TRUE 0.763 109.000 0.667 NA   NA
 5855324 5855325 E2348C_0267 E2348C_0268 ykgD ykgE FALSE 0.003 528.000 0.000 NA N NA
 5855325 5855326 E2348C_0268 E2348C_0269 ykgE ykgF TRUE 0.993 11.000 0.286 NA Y NA
 5855326 5855327 E2348C_0269 E2348C_0270 ykgF ykgG TRUE 0.984 -7.000 0.286 0.001   NA
 5855328 5855329 E2348C_0271 E2348C_0272   ykgH FALSE 0.244 76.000 0.000 NA   NA
 5855329 5855330 E2348C_0272 E2348C_0273 ykgH betA FALSE 0.041 213.000 0.000 NA   NA
 5855330 5855331 E2348C_0273 E2348C_0274 betA betB TRUE 0.982 14.000 0.634 1.000 N NA
 5855331 5855332 E2348C_0274 E2348C_0275 betB betI TRUE 0.974 14.000 0.459 1.000 N NA
 5855333 5855334 E2348C_0276 E2348C_0277 betT yahA FALSE 0.003 878.000 0.000 1.000 N NA
 5855335 5855336 E2348C_0278 E2348C_0279 yahB yahC FALSE 0.221 92.000 0.000 NA   NA
 5855337 5855338 E2348C_0280 E2348C_0281 yahD yahE TRUE 0.927 40.000 0.667 NA   NA
 5855338 5855339 E2348C_0281 E2348C_0282 yahE yahF TRUE 0.967 -10.000 0.429 NA   NA
 5855339 5855340 E2348C_0282 E2348C_0283 yahF yahG TRUE 0.995 0.000 0.714 NA   NA
 5855340 5855341 E2348C_0283 E2348C_0284 yahG yahH TRUE 0.635 26.000 0.000 NA   NA
 5855341 5855342 E2348C_0284 E2348C_0285 yahH yahI TRUE 0.558 32.000 0.000 NA   NA
 5855342 5855343 E2348C_0285 E2348C_0286 yahI yahJ TRUE 0.974 10.000 0.278 1.000 N NA
 5855343 5855344 E2348C_0286 E2348C_0287 yahJ yahK FALSE 0.008 377.000 0.000 NA   NA
 5855348 5855349 E2348C_0291 E2348C_0292 prpB prpC TRUE 0.458 169.000 0.502 1.000 N NA
 5855349 5855350 E2348C_0292 E2348C_0293 prpC prpD TRUE 0.826 34.000 0.216 1.000   NA
 5855350 5855351 E2348C_0293 E2348C_0294 prpD prpE TRUE 0.770 40.000 0.038 0.001   NA
 5855351 5855352 E2348C_0294 E2348C_0295 prpE codB FALSE 0.010 325.000 0.000 1.000 N NA
 5855352 5855353 E2348C_0295 E2348C_0296 codB codA TRUE 0.985 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 5855354 5855355 E2348C_0297 E2348C_0298 lacA lacY TRUE 0.619 66.000 0.222 1.000   NA
 5855355 5855356 E2348C_0298 E2348C_0299 lacY lacZ TRUE 0.744 52.000 0.261 1.000   NA
 5855356 5855357 E2348C_0299 E2348C_0300 lacZ lacI FALSE 0.350 123.000 0.174 1.000 N NA
 5855359 5855360 E2348C_0302 E2348C_0303 frmB frmA TRUE 0.636 93.000 0.327 1.000   NA
 5855360 5855361 E2348C_0303 E2348C_0304 frmA frmR TRUE 0.917 35.000 0.531 NA   NA
 5855362 5855363 E2348C_0305 E2348C_0306 tauA tauB TRUE 0.973 13.000 0.047 1.000 Y NA
 5855363 5855364 E2348C_0306 E2348C_0307 tauB tauC TRUE 0.998 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 5855364 5855365 E2348C_0307 E2348C_0308 tauC tauD TRUE 0.972 -3.000 0.214 1.000 N NA
 5855367 5855368 E2348C_0310 E2348C_0311 yaiT yaiV FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5855370 5855371 E2348C_0313 E2348C_0314 sbmA yaiW TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5855375 5855376 E2348C_0318 E2348C_0319 iraP phoA FALSE 0.174 101.000 0.032 NA   NA
 5855376 5855377 E2348C_0319 E2348C_0320 phoA psiF FALSE 0.152 119.000 0.032 NA   NA
 5855377 5855378 E2348C_0320 E2348C_0321 psiF adrA TRUE 0.519 102.000 0.250 NA   NA
 5855380 5855381 E2348C_0323 E2348C_0324 yaiI aroL FALSE 0.049 183.000 0.007 NA   NA
 5855381 5855382 E2348C_0324 E2348C_0325 aroL yaiA FALSE 0.387 50.000 0.044 NA   NA
 5855382 5855383 E2348C_0325 E2348C_0326 yaiA aroM FALSE 0.023 258.000 0.000 NA   NA
 5855383 5855384 E2348C_0326 E2348C_0327 aroM yaiE FALSE 0.263 72.000 0.049 NA   NA
 5855384 5855385 E2348C_0327 E2348C_0328 yaiE ykiA FALSE 0.044 208.000 0.000 NA   NA
 5855388 5855389 E2348C_0331 E2348C_0332 araJ sbcC FALSE 0.087 126.000 0.030 NA N NA
 5855389 5855390 E2348C_0332 E2348C_0333 sbcC sbcD TRUE 0.993 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 5855391 5855392 E2348C_0334 E2348C_0335 phoB phoR TRUE 0.960 58.000 0.453 0.015 Y NA
 5855392 5855393 E2348C_0335 E2348C_0336 phoR brnQ FALSE 0.005 407.000 0.000 1.000 N NA
 5855393 5855394 E2348C_0336 E2348C_0337 brnQ proY TRUE 0.919 76.000 0.348 0.090 Y NA
 5855394 5855395 E2348C_0337 E2348C_0338 proY malZ FALSE 0.183 156.000 0.123 1.000 N NA
 5855397 5855398 E2348C_0340 E2348C_0341 queA tgt TRUE 0.963 55.000 0.360 0.001 Y NA
 5855398 5855399 E2348C_0341 E2348C_0342 tgt yajC TRUE 0.908 23.000 0.325 NA N NA
 5855399 5855400 E2348C_0342 E2348C_0343 yajC secD TRUE 0.897 28.000 0.045 NA Y NA
 5855400 5855401 E2348C_0343 E2348C_0344 secD secF TRUE 0.996 11.000 0.206 0.001 Y NA
 5855401 5855402 E2348C_0344 E2348C_0345 secF yajD FALSE 0.139 129.000 0.015 1.000   NA
 5855403 5855404 E2348C_0346 E2348C_0347 tsx yajI FALSE 0.015 299.000 0.000 NA   NA
 5855405 5855406 E2348C_0348 E2348C_0349 nrdR ribD TRUE 0.978 4.000 0.277 NA N NA
 5855406 5855407 E2348C_0349 E2348C_0350 ribD ribE TRUE 0.782 89.000 0.034 0.002 Y NA
 5855407 5855408 E2348C_0350 E2348C_0351 ribE nusB TRUE 0.938 20.000 0.347 1.000 N NA
 5855408 5855409 E2348C_0351 E2348C_0352 nusB thiL TRUE 0.518 78.000 0.225 1.000 N NA
 5855409 5855410 E2348C_0352 E2348C_0353 thiL pgpA TRUE 0.867 -22.000 0.206 1.000 N NA
 5855411 5855412 E2348C_0354 E2348C_0355 yajO dxs FALSE 0.206 55.000 0.009 1.000 N NA
 5855412 5855413 E2348C_0355 E2348C_0356 dxs ispA TRUE 0.929 25.000 0.060 1.000 Y NA
 5855413 5855414 E2348C_0356 E2348C_0357 ispA xseB TRUE 0.909 0.000 0.035 1.000 N NA
 5855416 5855417 E2348C_0359 E2348C_0360 yajL panE TRUE 0.811 -37.000 0.155 NA   NA
 5855419 5855420 E2348C_0362 E2348C_0363 yajR cyoE FALSE 0.101 149.000 0.061 NA N NA
 5855420 5855421 E2348C_0363 E2348C_0364 cyoE cyoD TRUE 0.955 12.000 0.118 0.090 N NA
 5855421 5855422 E2348C_0364 E2348C_0365 cyoD cyoC TRUE 0.999 0.000 0.485 0.052 Y NA
 5855422 5855423 E2348C_0365 E2348C_0366 cyoC cyoB TRUE 0.997 -10.000 0.697 0.052 Y NA
 5855423 5855424 E2348C_0366 E2348C_0367 cyoB cyoA TRUE 0.965 22.000 0.041 0.004 Y NA
 5855424 5855425 E2348C_0367 E2348C_0368 cyoA ampG FALSE 0.006 460.000 0.000 NA   NA
 5855425 5855426 E2348C_0368 E2348C_0369 ampG yajG TRUE 0.779 44.000 0.256 NA   NA
 5855427 5855428 E2348C_0370 E2348C_0371 bolA tig FALSE 0.006 344.000 0.000 NA N NA
 5855428 5855429 E2348C_0371 E2348C_0372 tig clpP FALSE 0.386 246.000 0.351 1.000 Y NA
 5855429 5855430 E2348C_0372 E2348C_0373 clpP clpX TRUE 0.825 126.000 0.352 1.000 Y NA
 5855430 5855431 E2348C_0373 E2348C_0374 clpX lon TRUE 0.597 189.000 0.201 0.100 Y NA
 5855431 5855432 E2348C_0374 E2348C_0375 lon hupB FALSE 0.036 209.000 0.000 1.000 N NA
 5855432 5855433 E2348C_0375 E2348C_0376 hupB ppiD FALSE 0.050 192.000 0.000 1.000 N NA
 5855433 5855434 E2348C_0376 E2348C_0377 ppiD ybaV FALSE 0.080 151.000 0.033 1.000 N NA
 5855434 5855435 E2348C_0377 E2348C_0378 ybaV ybaW FALSE 0.191 106.000 0.027 1.000   NA
 5855436 5855437 E2348C_0379 E2348C_0380 queC ybaE FALSE 0.262 65.000 0.019 1.000   NA
 5855438 5855439 E2348C_0381 E2348C_0382 cof ybaO FALSE 0.103 153.000 0.020 1.000   NA
 5855439 5855440 E2348C_0382 E2348C_0383 ybaO mdlA TRUE 0.789 30.000 0.179 1.000 N NA
 5855440 5855441 E2348C_0383 E2348C_0384 mdlA mdlB TRUE 0.998 -7.000 0.911 0.005 Y NA
 5855441 5855442 E2348C_0384 E2348C_0385 mdlB glnK FALSE 0.048 181.000 0.028 1.000 N NA
 5855442 5855443 E2348C_0385 E2348C_0386 glnK amtB TRUE 0.764 30.000 0.156 1.000 N NA
 5855445 5855446 E2348C_0388 E2348C_0389 ybaY   FALSE 0.064 190.000 0.000 NA   NA
 5855448 5855449 E2348C_ncR05 E2348C_0391 ffs ybaA FALSE 0.191 111.000 0.000 NA   NA
 5855450 5855451 E2348C_0392 E2348C_0393 ylaB ylaC FALSE 0.098 164.000 0.000 NA   NA
 5855451 5855452 E2348C_0393 E2348C_0394 ylaC maa FALSE 0.184 116.000 0.000 NA   NA
 5855452 5855453 E2348C_0394 E2348C_0395 maa hha FALSE 0.083 174.000 0.000 NA   NA
 5855453 5855454 E2348C_0395 E2348C_0396 hha ybaJ TRUE 0.721 26.000 0.080 NA   NA
 5855454 5855455 E2348C_0396 E2348C_0397 ybaJ acrB FALSE 0.005 545.000 0.000 NA   NA
 5855455 5855456 E2348C_0397 E2348C_0398 acrB acrA TRUE 0.941 23.000 0.458 1.000 N NA
 5855457 5855458 E2348C_0399 E2348C_0400 acrR kefA FALSE 0.109 128.000 0.000 NA N NA
 5855459 5855460 E2348C_0401 E2348C_0402 ybaM priC TRUE 0.977 14.000 0.474 NA   NA
 5855461 5855462 E2348C_0403 E2348C_0404 ybaN apt FALSE 0.109 153.000 0.043 NA   NA
 5855462 5855463 E2348C_0404 E2348C_0405 apt dnaX FALSE 0.205 129.000 0.088 1.000 N NA
 5855463 5855464 E2348C_0405 E2348C_0406 dnaX ybaB TRUE 0.807 53.000 0.411 NA   NA
 5855464 5855465 E2348C_0406 E2348C_0407 ybaB recR TRUE 0.994 0.000 0.604 NA   NA
 5855465 5855466 E2348C_0407 E2348C_0408 recR htpG FALSE 0.129 110.000 0.028 1.000 N NA
 5855466 5855467 E2348C_0408 E2348C_0409 htpG adk FALSE 0.116 181.000 0.035 0.099 N NA
 5855467 5855468 E2348C_0409 E2348C_0410 adk hemH FALSE 0.084 132.000 0.013 1.000 N NA
 5855471 5855472 E2348C_0413 E2348C_0414 ybaL fsr FALSE 0.018 239.000 0.000 NA N NA
 5855479 5855480 E2348C_0420 E2348C_0421 ybaS ybaT TRUE 0.987 3.000 0.028 1.000 Y NA
 5855480 5855481 E2348C_0421 E2348C_0422 ybaT cueR FALSE 0.140 125.000 0.000 1.000 N NA
 5855482 5855483 E2348C_0423 E2348C_0424     FALSE 0.015 296.000 0.000 NA   NA
 5855483 5855484 E2348C_0424 E2348C_0425     FALSE 0.352 54.000 0.000 NA   NA
 5855486 5855487 E2348C_0427 E2348C_0428 ybbJ ybbK TRUE 0.996 0.000 0.313 NA Y NA
 5855488 5855489 E2348C_0429 E2348C_0430 ybbL ybbM TRUE 0.870 -13.000 0.127 NA   NA
 5855490 5855491 E2348C_0431 E2348C_0432 ybbN ybbO TRUE 0.508 61.000 0.118 1.000   NA
 5855491 5855492 E2348C_0432 E2348C_0433 ybbO tesA TRUE 0.858 -10.000 0.072 1.000   NA
 5855493 5855494 E2348C_0434 E2348C_0435 ybbA ybbP TRUE 0.997 -3.000 0.535 NA Y NA
 5855494 5855495 E2348C_0435 E2348C_0436 ybbP   FALSE 0.003 585.000 0.000 NA N NA
 5855496 5855497 E2348C_0437 E2348C_0438 ybbB allS FALSE 0.198 69.000 0.012 NA   NA
 5855498 5855499 E2348C_0439 E2348C_0440 allA allR TRUE 0.777 78.000 0.625 1.000 N NA
 5855499 5855500 E2348C_0440 E2348C_0441 allR gcl FALSE 0.274 90.000 0.054 1.000   NA
 5855500 5855501 E2348C_0441 E2348C_0442 gcl hyi TRUE 0.892 13.000 0.065 1.000   NA
 5855501 5855502 E2348C_0442 E2348C_0443 hyi glxR FALSE 0.367 100.000 0.154 1.000 N NA
 5855502 5855503 E2348C_0443 E2348C_0444 glxR ybbW FALSE 0.073 170.000 0.000 1.000 N NA
 5855503 5855504 E2348C_0444 E2348C_0445 ybbW allB TRUE 0.845 60.000 0.161 1.000 Y NA
 5855504 5855505 E2348C_0445 E2348C_0446 allB ybbY TRUE 0.859 56.000 0.161 1.000 Y NA
 5855505 5855506 E2348C_0446 E2348C_0447 ybbY glxK TRUE 0.820 22.000 0.133 1.000 N NA
 5855507 5855508 E2348C_0448 E2348C_0449 ylbA allC TRUE 0.901 11.000 0.059 NA   NA
 5855508 5855509 E2348C_0449 E2348C_0450 allC allD TRUE 0.858 22.000 0.174 1.000 N NA
 5855510 5855511 E2348C_0451 E2348C_0452 fdrA ylbE TRUE 0.985 10.000 0.412 NA   NA
 5855511 5855512 E2348C_0452 E2348C_0453 ylbE ylbF TRUE 0.972 11.000 0.265 NA   NA
 5855512 5855513 E2348C_0453 E2348C_0454 ylbF ybcF TRUE 0.987 -3.000 0.375 NA   NA
 5855514 5855515 E2348C_0455 E2348C_0456 purK purE TRUE 0.996 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 5855515 5855516 E2348C_0456 E2348C_0457 purE lpxH FALSE 0.160 118.000 0.016 1.000   NA
 5855516 5855517 E2348C_0457 E2348C_0458 lpxH ppiB TRUE 0.983 3.000 0.237 1.000   NA
 5855519 5855520 E2348C_0460 E2348C_0461 ybcI ybcJ FALSE 0.139 108.000 0.011 NA   NA
 5855520 5855521 E2348C_0461 E2348C_0462 ybcJ folD TRUE 0.947 2.000 0.055 1.000   NA
 5855522 10800735 E2348C_tRNA06 E2348C_PP1 argU   TRUE 0.613 -47.000 0.000 NA   NA
 5855525 5855526 E2348C_0465 E2348C_0466   ompT FALSE 0.031 244.000 0.000 1.000   NA
 5855526 5855527 E2348C_0466 E2348C_0467 ompT ybcH FALSE 0.004 658.000 0.000 NA   NA
 5855527 5855528 E2348C_0467 E2348C_0468 ybcH nfrA TRUE 0.992 1.000 0.500 NA   NA
 5855528 5855529 E2348C_0468 E2348C_0469 nfrA nfrB TRUE 0.902 -13.000 0.159 1.000   NA
 5855529 5855530 E2348C_0469 E2348C_0470 nfrB cusS FALSE 0.193 150.000 0.000 0.099 N NA
 5855530 5855531 E2348C_0470 E2348C_0471 cusS cusR TRUE 0.997 -10.000 0.600 0.001 Y NA
 5855532 5855533 E2348C_0472 E2348C_0473 cusC cusF TRUE 0.948 24.000 0.500 NA   NA
 5855533 5855534 E2348C_0473 E2348C_0474 cusF cusB TRUE 0.791 16.000 0.000 NA   NA
 5855534 5855535 E2348C_0474 E2348C_0475 cusB cusA TRUE 0.982 12.000 0.500 1.000 N NA
 5855535 5855536 E2348C_0475 E2348C_0476 cusA pheP FALSE 0.313 102.000 0.000 0.089 N NA
 5855537 5855538 E2348C_0477 E2348C_0478 ybdG nfsB FALSE 0.081 108.000 0.012 NA N NA
 5855538 5855539 E2348C_0478 E2348C_0479 nfsB ybdF TRUE 0.740 79.000 0.500 NA   NA
 5855539 5855540 E2348C_0479 E2348C_0480 ybdF ybdJ FALSE 0.285 65.000 0.000 NA   NA
 5855540 5855541 E2348C_0480 E2348C_0481 ybdJ ybdK FALSE 0.279 66.000 0.000 NA   NA
 5855542 5855543 E2348C_0482 E2348C_0483 mokC2 hokC2 TRUE 0.585 -152.000 0.000 NA   NA
 5855544 5855545 E2348C_0484 E2348C_0485 entD fepA TRUE 0.578 166.000 0.700 1.000 N NA
 5855546 5855547 E2348C_0486 E2348C_0487 fes ybdZ TRUE 0.986 3.000 0.320 NA   NA
 5855547 5855548 E2348C_0487 E2348C_0488 ybdZ entF TRUE 0.943 -3.000 0.080 NA   NA
 5855548 5855549 E2348C_0488 E2348C_0489 entF fepE FALSE 0.039 216.000 0.000 NA   NA
 5855550 5855551 E2348C_0490 E2348C_0491 fepC fepG TRUE 0.985 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 5855551 5855552 E2348C_0491 E2348C_0492 fepG fepD TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.057 Y NA
 5855555 5855556 E2348C_0495 E2348C_0496 entC entE TRUE 0.998 10.000 0.667 1.000 Y NA
 5855556 5855557 E2348C_0496 E2348C_0497 entE entB TRUE 0.996 14.000 0.667 1.000 Y NA
 5855557 5855558 E2348C_0497 E2348C_0498 entB entA TRUE 0.988 0.000 0.024 1.000 Y NA
 5855558 5855559 E2348C_0498 E2348C_0499 entA ybdB TRUE 0.988 3.000 0.065 NA Y NA
 5855559 5855560 E2348C_0499 E2348C_0500 ybdB cstA FALSE 0.197 181.000 0.222 NA N NA
 5855560 5855561 E2348C_0500 E2348C_0501 cstA ybdD TRUE 0.577 113.000 0.333 NA   NA
 5855564 5855565 E2348C_0504 E2348C_0505 ybdM ybdN TRUE 0.696 -27.000 0.000 1.000   NA
 5855565 5855566 E2348C_0505 E2348C_0506 ybdN ybdO TRUE 0.484 147.000 0.333 1.000   NA
 5855566 5855567 E2348C_0506 E2348C_0507 ybdO dsbG FALSE 0.042 205.000 0.067 NA N NA
 5855568 5855569 E2348C_0508 E2348C_0509 ahpC ahpF TRUE 0.780 171.000 0.551 1.000 Y NA
 5855570 5855571 E2348C_0510 E2348C_0511 uspG rnk FALSE 0.008 354.000 0.000 1.000 N NA
 5855571 5855572 E2348C_0511 E2348C_0512 rnk rna FALSE 0.017 230.000 0.018 1.000 N NA
 5855572 5855573 E2348C_0512 E2348C_0513 rna citT FALSE 0.118 114.000 0.024 1.000 N NA
 5855573 5855574 E2348C_0513 E2348C_0514 citT citG TRUE 0.642 51.000 0.194 1.000 N NA
 5855574 5855575 E2348C_0514 E2348C_0515 citG citX TRUE 0.982 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 5855575 5855576 E2348C_0515 E2348C_0516 citX citF TRUE 0.905 4.000 0.000 1.000 N NA
 5855576 5855577 E2348C_0516 E2348C_0517 citF citE TRUE 0.958 11.000 0.000 0.001 N NA
 5855577 5855578 E2348C_0517 E2348C_0518 citE citD TRUE 0.995 -3.000 0.537 0.001 N NA
 5855578 5855579 E2348C_0518 E2348C_0519 citD citC TRUE 0.992 15.000 0.426 1.000 Y NA
 5855580 5855581 E2348C_0520 E2348C_0521 citA citB TRUE 0.917 -31.000 0.000 1.000 Y NA
 5855583 5855584 E2348C_0523 E2348C_0524 pagP cspE FALSE 0.365 175.000 0.333 1.000   NA
 5855586 5855587 E2348C_0526 E2348C_0527 ybeM tatE FALSE 0.408 129.000 0.196 1.000   NA
 5855588 5855589 E2348C_0528 E2348C_0529 lipA ybeF FALSE 0.027 241.000 0.000 NA   NA
 5855589 5855590 E2348C_0529 E2348C_0530 ybeF lipB FALSE 0.022 260.000 0.000 NA   NA
 5855590 5855591 E2348C_0530 E2348C_0531 lipB ybeD TRUE 0.484 101.000 0.219 NA   NA
 5855591 5855592 E2348C_0531 E2348C_0532 ybeD dacA FALSE 0.265 110.000 0.081 NA   NA
 5855592 5855593 E2348C_0532 E2348C_0533 dacA rlpA TRUE 0.821 140.000 0.475 NA Y NA
 5855593 5855594 E2348C_0533 E2348C_0534 rlpA mrdB TRUE 0.802 11.000 0.035 NA N NA
 5855594 5855595 E2348C_0534 E2348C_0535 mrdB mrdA TRUE 0.912 3.000 0.046 1.000 N NA
 5855595 5855596 E2348C_0535 E2348C_0536 mrdA ybeA TRUE 0.522 31.000 0.031 NA   NA
 5855596 5855597 E2348C_0536 E2348C_0537 ybeA ybeB TRUE 0.984 4.000 0.307 NA   NA
 5855597 5855598 E2348C_0537 E2348C_0538 ybeB cobC FALSE 0.022 260.000 0.000 NA   NA
 5855598 5855599 E2348C_0538 E2348C_0539 cobC nadD TRUE 0.655 24.000 0.057 1.000 N NA
 5855599 5855600 E2348C_0539 E2348C_0540 nadD holA TRUE 0.915 2.000 0.045 1.000 N NA
 5855600 5855601 E2348C_0540 E2348C_0541 holA rlpB TRUE 0.975 0.000 0.199 NA N NA
 5855601 5855602 E2348C_0541 E2348C_0542 rlpB leuS TRUE 0.914 15.000 0.182 NA N NA
 5855604 5855605 E2348C_0544 E2348C_0545 rihA gltL FALSE 0.363 118.000 0.195 NA N NA
 5855605 5855606 E2348C_0545 E2348C_0546 gltL gltK TRUE 0.997 0.000 0.379 1.000 Y NA
 5855606 5855607 E2348C_0546 E2348C_0547 gltK gltJ TRUE 0.999 0.000 0.933 0.017 Y NA
 5855607 5855608 E2348C_0547 E2348C_ncR07 gltJ sroC TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5855608 5855609 E2348C_ncR07 E2348C_0548 sroC gltI TRUE 0.864 -4.000 0.000 NA   NA
 5855611 5855612 E2348C_0550 E2348C_0551 lnt ybeX TRUE 0.947 25.000 0.557 1.000 N NA
 5855612 5855613 E2348C_0551 E2348C_0552 ybeX ybeY FALSE 0.421 90.000 0.150 NA   NA
 5855613 5855614 E2348C_0552 E2348C_0553 ybeY ybeZ TRUE 0.989 -3.000 0.457 NA   NA
 5855614 5855615 E2348C_0553 E2348C_0554 ybeZ miaB FALSE 0.432 114.000 0.220 1.000 N NA
 5855617 5855618 E2348C_tRNA07 E2348C_tRNA08 glnV metU FALSE 0.401 49.000 0.000 NA   NA
 5855618 5855619 E2348C_tRNA08 E2348C_tRNA09 metU glnW TRUE 0.791 16.000 0.000 NA   NA
 5855619 5855620 E2348C_tRNA09 E2348C_tRNA10 glnW glnU TRUE 0.529 35.000 0.000 NA   NA
 5855620 5855621 E2348C_tRNA10 E2348C_tRNA11 glnU leuW TRUE 0.668 24.000 0.000 NA   NA
 5855621 5855622 E2348C_tRNA11 E2348C_tRNA12 leuW metT TRUE 0.885 11.000 0.000 NA   NA
 5855622 5855623 E2348C_tRNA12 E2348C_0556 metT asnB FALSE 0.008 381.000 0.000 NA   NA
 5855623 5855624 E2348C_0556 E2348C_0557 asnB nagD FALSE 0.019 257.000 0.000 1.000 N NA
 5855624 5855625 E2348C_0557 E2348C_0558 nagD nagC TRUE 0.839 48.000 0.070 1.000 Y NA
 5855625 5855626 E2348C_0558 E2348C_0559 nagC nagA TRUE 0.997 9.000 0.571 1.000 Y NA
 5855626 5855627 E2348C_0559 E2348C_0560 nagA nagB TRUE 0.972 60.000 0.557 0.001 Y NA
 5855629 5855630 E2348C_0562 E2348C_0563     TRUE 0.760 14.000 0.000 NA N NA
 5855630 5855631 E2348C_0563 E2348C_0564     TRUE 0.989 -3.000 0.092 NA Y NA
 5855631 5855632 E2348C_0564 E2348C_0565     FALSE 0.413 36.000 0.031 1.000 N NA
 5855632 5855633 E2348C_0565 E2348C_0566     TRUE 0.459 60.000 0.125 1.000 N NA
 5855633 5855634 E2348C_0566 E2348C_0567     TRUE 0.984 4.000 0.208 0.061 N NA
 5855635 5855636 E2348C_0568 E2348C_0569     TRUE 0.971 -7.000 0.361 NA   NA
 5855636 5855637 E2348C_0569 E2348C_0570     TRUE 0.992 2.000 0.533 1.000 N NA
 5855637 5855638 E2348C_0570 E2348C_0571   glnS FALSE 0.030 220.000 0.000 1.000 N NA
 5855638 5855639 E2348C_0571 E2348C_0572 glnS ybfM FALSE 0.007 442.000 0.000 1.000   NA
 5855639 5855640 E2348C_0572 E2348C_0573 ybfM ybfN FALSE 0.392 50.000 0.000 NA   NA
 5855641 5855642 E2348C_0574 E2348C_0575 fur uof TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5855642 5855643 E2348C_0575 E2348C_0576 uof fldA FALSE 0.043 210.000 0.000 NA   NA
 5855643 5855644 E2348C_0576 E2348C_0577 fldA ybfE TRUE 0.599 140.000 0.473 1.000   NA
 5855644 5855645 E2348C_0577 E2348C_0578 ybfE ybfF FALSE 0.429 140.000 0.276 NA   NA
 5855646 5855647 E2348C_0579 E2348C_0580 seqA pgm TRUE 0.795 26.000 0.151 1.000 N NA
 5855648 5855649 E2348C_0581 E2348C_0582 potE speF TRUE 0.989 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 5855649 5855650 E2348C_0582 E2348C_0583 speF kdpE FALSE 0.004 596.000 0.000 1.000 N NA
 5855650 5855651 E2348C_0583 E2348C_0584 kdpE kdpD TRUE 0.997 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 5855651 5855652 E2348C_0584 E2348C_0585 kdpD kdpC TRUE 0.888 -7.000 0.100 1.000 N NA
 5855652 5855653 E2348C_0585 E2348C_0586 kdpC kdpB TRUE 0.999 9.000 0.877 0.001 Y NA
 5855653 5855654 E2348C_0586 E2348C_0587 kdpB kdpA TRUE 0.984 23.000 0.201 0.001 Y NA
 5855654 5855655 E2348C_0587 E2348C_0588 kdpA kdpF TRUE 0.991 0.000 0.172 0.001   NA
 5855656 5855657 E2348C_0589 E2348C_0590 ybfA ybgA TRUE 0.501 101.000 0.231 NA   NA
 5855657 5855658 E2348C_0590 E2348C_0591 ybgA phr TRUE 0.888 -3.000 0.019 NA   NA
 5855660 5855661 E2348C_0593 E2348C_0594 ybgI ybgJ TRUE 0.692 23.000 0.050 NA   NA
 5855661 5855662 E2348C_0594 E2348C_0595 ybgJ ybgK TRUE 0.993 -6.000 0.379 NA Y NA
 5855662 5855663 E2348C_0595 E2348C_0596 ybgK ybgL TRUE 0.931 -10.000 0.211 NA   NA
 5855663 5855664 E2348C_0596 E2348C_0597 ybgL nei TRUE 0.539 36.000 0.037 1.000   NA
 5855665 5855666 E2348C_0598 E2348C_0599 abrB ybgO FALSE 0.110 155.000 0.000 NA   NA
 5855666 5855667 E2348C_0599 E2348C_0600 ybgO gltA FALSE 0.162 127.000 0.000 NA   NA
 5855668 5855669 E2348C_0601 E2348C_0602 sdhC sdhD TRUE 0.997 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 5855669 5855670 E2348C_0602 E2348C_0603 sdhD sdhA TRUE 0.999 0.000 0.705 0.002 Y NA
 5855670 5855671 E2348C_0603 E2348C_0604 sdhA sdhB TRUE 0.997 16.000 0.604 0.002 Y NA
 5855671 5855672 E2348C_0604 E2348C_0605 sdhB sucA FALSE 0.090 312.000 0.067 1.000 Y NA
 5855672 5855673 E2348C_0605 E2348C_0606 sucA sucB TRUE 0.995 15.000 0.667 1.000 Y NA
 5855673 5855674 E2348C_0606 E2348C_0607 sucB sucC TRUE 0.746 94.000 0.136 1.000 Y NA
 5855674 5855675 E2348C_0607 E2348C_0608 sucC sucD TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 5855677 5855678 E2348C_0610 E2348C_0611 mngA   FALSE 0.098 164.000 0.000 NA   NA
 5855679 5855680 E2348C_0612 E2348C_0613     FALSE 0.067 187.000 0.000 NA   NA
 5855680 5855681 E2348C_0613 E2348C_0614     FALSE 0.060 193.000 0.000 NA   NA
 5855681 5855682 E2348C_0614 E2348C_0615     FALSE 0.235 81.000 0.000 NA   NA
 5855683 5855684 E2348C_0616 E2348C_0617 cydA cydB TRUE 0.975 16.000 0.000 0.051 Y NA
 5855684 5855685 E2348C_0617 E2348C_0618 cydB ybgT TRUE 0.915 15.000 0.149 NA   NA
 5855685 5855686 E2348C_0618 E2348C_0619 ybgT ybgE TRUE 0.987 0.000 0.310 NA   NA
 5855686 5855687 E2348C_0619 E2348C_0620 ybgE ybgC FALSE 0.188 150.000 0.095 NA   NA
 5855687 5855688 E2348C_0620 E2348C_0621 ybgC tolQ TRUE 0.993 -3.000 0.593 1.000   NA
 5855688 5855689 E2348C_0621 E2348C_0622 tolQ tolR TRUE 0.998 4.000 0.556 0.072 Y NA
 5855689 5855690 E2348C_0622 E2348C_0623 tolR tolA FALSE 0.371 65.000 0.114 NA N NA
 5855690 5855691 E2348C_0623 E2348C_0624 tolA tolB FALSE 0.109 133.000 0.051 NA N NA
 5855691 5855692 E2348C_0624 E2348C_0625 tolB pal TRUE 0.919 35.000 0.592 1.000 N NA
 5855692 5855693 E2348C_0625 E2348C_0626 pal ybgF TRUE 0.942 10.000 0.088 1.000   NA
 5855693 5855694 E2348C_0626 E2348C_tRNA13 ybgF lysT FALSE 0.098 164.000 0.000 NA   NA
 5855694 5855695 E2348C_tRNA13 E2348C_tRNA14 lysT valT TRUE 0.522 36.000 0.000 NA   NA
 5855695 5855696 E2348C_tRNA14 E2348C_tRNA15 valT lysW TRUE 0.928 3.000 0.000 NA   NA
 5855696 5855697 E2348C_tRNA15 E2348C_tRNA16 lysW valZ FALSE 0.371 52.000 0.000 NA   NA
 5855697 5855698 E2348C_tRNA16 E2348C_tRNA17 valZ lysY TRUE 0.922 4.000 0.000 NA   NA
 5855698 5855699 E2348C_tRNA17 E2348C_tRNA18 lysY lysZ FALSE 0.401 49.000 0.000 NA   NA
 5855699 5855700 E2348C_tRNA18 E2348C_tRNA19 lysZ lysQ_1 TRUE 0.540 34.000 0.000 NA   NA
 5855700 5855701 E2348C_tRNA19 E2348C_tRNA20 lysQ_1 lysQ_2 TRUE 0.540 34.000 0.000 NA   NA
 5855701 5855702 E2348C_tRNA20 E2348C_0627 lysQ_2 nadA FALSE 0.006 434.000 0.000 NA   NA
 5855702 5855703 E2348C_0627 E2348C_0628 nadA pnuC TRUE 0.849 38.000 0.023 1.000 Y NA
 5855704 5855705 E2348C_0629 E2348C_0630 zitB ybgS FALSE 0.212 114.000 0.057 NA   NA
 5855707 5855708 E2348C_0632 E2348C_0633 gpmA galM FALSE 0.214 203.000 0.009 1.000 Y NA
 5855708 5855709 E2348C_0633 E2348C_0634 galM galK TRUE 0.990 -6.000 0.083 0.002 Y NA
 5855709 5855710 E2348C_0634 E2348C_0635 galK galT TRUE 0.993 4.000 0.370 0.002 N NA
 5855710 5855711 E2348C_0635 E2348C_0636 galT   TRUE 0.961 10.000 0.053 0.002 N NA
 5855711 5855712 E2348C_0636 E2348C_0637   modF FALSE 0.023 250.000 0.023 1.000   NA
 5855712 5855713 E2348C_0637 E2348C_0638 modF modE FALSE 0.403 68.000 0.009 0.097   NA
 5855714 5855715 E2348C_0639 E2348C_0640 ybhT modA FALSE 0.122 167.000 0.072 NA   NA
 5855715 5855716 E2348C_0640 E2348C_0641 modA modB TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 5855716 5855717 E2348C_0641 E2348C_0642 modB modC TRUE 0.999 3.000 0.537 0.001 Y NA
 5855721 5855722 E2348C_0646 E2348C_0647 ybhH ybhI FALSE 0.244 76.000 0.000 NA   NA
 5855722 5855723 E2348C_0647 E2348C_0648 ybhI ybhJ FALSE 0.096 260.000 0.300 1.000 N NA
 5855725 5855726 E2348C_0650 E2348C_0651     TRUE 0.929 -22.000 0.174 0.016   NA
 5855726 5855727 E2348C_0651 E2348C_0652     TRUE 0.486 40.000 0.000 NA   NA
 5855727 5855728 E2348C_0652 E2348C_0653     FALSE 0.254 73.000 0.000 NA   NA
 5855728 5855729 E2348C_0653 E2348C_0654     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5855729 5855730 E2348C_0654 E2348C_0655     TRUE 0.885 11.000 0.000 NA   NA
 5855730 5855731 E2348C_0655 E2348C_0656     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5855731 5855732 E2348C_0656 E2348C_0657     TRUE 0.743 19.000 0.000 NA   NA
 5855732 5855733 E2348C_0657 E2348C_0658     FALSE 0.430 46.000 0.000 NA   NA
 5855733 5855734 E2348C_0658 E2348C_0659     TRUE 0.754 -13.000 0.000 NA   NA
 5855734 5855735 E2348C_0659 E2348C_0660     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5855735 5855736 E2348C_0660 E2348C_0661     TRUE 0.990 11.000 0.667 NA   NA
 5855736 5855737 E2348C_0661 E2348C_0662     TRUE 0.831 14.000 0.000 NA   NA
 5855737 5855738 E2348C_0662 E2348C_0663     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5855738 5855739 E2348C_0663 E2348C_0664     TRUE 0.943 1.000 0.000 1.000   NA
 5855739 5855740 E2348C_0664 E2348C_0665     TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 5855740 5855741 E2348C_0665 E2348C_0666     FALSE 0.244 76.000 0.000 NA   NA
 5855741 5855742 E2348C_0666 E2348C_0667     TRUE 0.933 1.000 0.000 NA   NA
 5855742 5855743 E2348C_0667 E2348C_0668     FALSE 0.077 180.000 0.000 NA   NA
 5855743 5855744 E2348C_0668 E2348C_0669     FALSE 0.297 63.000 0.000 NA   NA
 5855744 5855745 E2348C_0669 E2348C_0670     TRUE 0.922 4.000 0.000 NA   NA
 5855745 5855746 E2348C_0670 E2348C_0671     FALSE 0.006 443.000 0.000 NA   NA
 5855746 5855747 E2348C_0671 E2348C_0672     FALSE 0.047 205.000 0.000 NA   NA
 5855748 5855749 E2348C_0673 E2348C_0674     FALSE 0.369 107.000 0.000 0.078   NA
 5855749 5855750 E2348C_0674 E2348C_0675     FALSE 0.100 163.000 0.000 NA   NA
 5855750 5855751 E2348C_0675 E2348C_0676     FALSE 0.195 108.000 0.000 NA   NA
 5855751 5855752 E2348C_0676 E2348C_0677     FALSE 0.240 78.000 0.000 NA   NA
 5855752 5855753 E2348C_0677 E2348C_0678     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5855753 5855754 E2348C_0678 E2348C_0679     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5855754 5855755 E2348C_0679 E2348C_0680     TRUE 0.477 41.000 0.000 NA   NA
 5855755 5855756 E2348C_0680 E2348C_0681     FALSE 0.352 54.000 0.000 NA   NA
 5855756 5855757 E2348C_0681 E2348C_0682     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5855758 5855759 E2348C_0683 E2348C_0684     FALSE 0.021 266.000 0.000 NA   NA
 5855760 5855761 E2348C_0685 E2348C_0686     FALSE 0.042 212.000 0.000 NA   NA
 5855761 5855762 E2348C_0686 E2348C_0687     FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5855762 5855763 E2348C_0687 E2348C_0688     FALSE 0.015 299.000 0.000 NA   NA
 5855763 5855764 E2348C_0688 E2348C_0689     FALSE 0.006 448.000 0.000 NA   NA
 5855764 5855765 E2348C_0689 E2348C_0690     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5855765 5855766 E2348C_0690 E2348C_0691     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5855766 5855767 E2348C_0691 E2348C_0692     TRUE 0.621 -238.000 0.000 1.000   NA
 5855767 5855768 E2348C_0692 E2348C_0693     FALSE 0.049 203.000 0.000 NA   NA
 5855770 5855771 E2348C_0695 E2348C_0696     TRUE 0.648 -28.000 0.000 NA   NA
 5855771 5855772 E2348C_0696 E2348C_0697     TRUE 0.719 -16.000 0.000 NA   NA
 5855772 5855773 E2348C_0697 E2348C_0698     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5855773 5855774 E2348C_0698 E2348C_0699     TRUE 0.915 -10.000 0.150 1.000   NA
 5855774 5855775 E2348C_0699 E2348C_0700     TRUE 0.557 37.000 0.000 1.000   NA
 5855775 5855776 E2348C_0700 E2348C_0701     FALSE 0.326 58.000 0.000 NA   NA
 5855776 5855777 E2348C_0701 E2348C_0702     FALSE 0.371 52.000 0.000 NA   NA
 5855777 5855778 E2348C_0702 E2348C_0703     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5855778 5855779 E2348C_0703 E2348C_0704     TRUE 0.812 15.000 0.000 NA   NA
 5855779 5855780 E2348C_0704 E2348C_0705     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5855780 5855781 E2348C_0705 E2348C_0706     TRUE 0.907 8.000 0.000 NA   NA
 5855781 5855782 E2348C_0706 E2348C_0707     TRUE 0.831 14.000 0.000 NA   NA
 5855782 5855783 E2348C_0707 E2348C_0708     TRUE 0.956 27.000 0.667 NA   NA
 5855783 5855784 E2348C_0708 E2348C_0709     TRUE 0.696 -19.000 0.000 NA   NA
 5855784 5855785 E2348C_0709 E2348C_0710     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5855785 5855786 E2348C_0710 E2348C_0711     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5855786 5855787 E2348C_0711 E2348C_0712     TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 5855787 5855788 E2348C_0712 E2348C_0713     TRUE 0.594 -102.000 0.000 NA   NA
 5855788 5855789 E2348C_0713 E2348C_0714     TRUE 0.801 61.000 0.500 NA   NA
 5855789 5855790 E2348C_0714 E2348C_0715     FALSE 0.264 70.000 0.000 NA   NA
 5855790 5855791 E2348C_0715 E2348C_0716     FALSE 0.323 65.000 0.000 1.000   NA
 5855791 5855792 E2348C_0716 E2348C_0717     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5855792 5855793 E2348C_0717 E2348C_0718     FALSE 0.197 106.000 0.000 NA   NA
 5855793 5855794 E2348C_0718 E2348C_0719     FALSE 0.034 224.000 0.000 NA   NA
 5855794 5855795 E2348C_0719 E2348C_0720     FALSE 0.226 89.000 0.000 NA   NA
 5855795 5855796 E2348C_0720 E2348C_0721     FALSE 0.015 293.000 0.000 NA   NA
 5855796 5855797 E2348C_0721 E2348C_0722     FALSE 0.232 84.000 0.000 NA   NA
 5855798 5855799 E2348C_0723 E2348C_0724   ybhB FALSE 0.005 504.000 0.000 NA   NA
 5855802 5855803 E2348C_0727 E2348C_0728 bioB bioF TRUE 0.996 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 5855803 5855804 E2348C_0728 E2348C_0729 bioF bioC TRUE 0.937 -13.000 0.133 0.002 N NA
 5855804 5855805 E2348C_0729 E2348C_0730 bioC bioD TRUE 0.936 -7.000 0.054 0.002 N NA
 5855805 5855806 E2348C_0730 E2348C_0731 bioD uvrB FALSE 0.008 579.000 0.000 0.096 N NA
 5855808 5855809 E2348C_0733 E2348C_0734 moaA moaB TRUE 0.977 22.000 0.108 0.003 Y NA
 5855809 5855810 E2348C_0734 E2348C_0735 moaB moaC TRUE 0.996 3.000 0.109 0.003 Y NA
 5855810 5855811 E2348C_0735 E2348C_0736 moaC moaD TRUE 0.992 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 5855811 5855812 E2348C_0736 E2348C_0737 moaD moaE TRUE 0.999 2.000 0.501 0.003 Y NA
 5855812 5855813 E2348C_0737 E2348C_0738 moaE ybhL FALSE 0.113 137.000 0.025 NA   NA
 5855813 5855814 E2348C_0738 E2348C_0739 ybhL ybhM FALSE 0.042 205.000 0.037 NA   NA
 5855815 5855816 E2348C_0740 E2348C_0741 ybhN ybhO TRUE 0.952 0.000 0.071 NA   NA
 5855816 5855817 E2348C_0741 E2348C_0742 ybhO ybhP TRUE 0.985 -3.000 0.333 NA   NA
 5855819 5855820 E2348C_0744 E2348C_0745 ybhR ybhS TRUE 0.998 11.000 0.609 0.005 Y NA
 5855820 5855821 E2348C_0745 E2348C_0746 ybhS ybhF TRUE 0.988 -7.000 0.547 0.095   NA
 5855821 5855822 E2348C_0746 E2348C_0747 ybhF ybhG TRUE 0.983 -7.000 0.545 1.000   NA
 5855822 5855823 E2348C_0747 E2348C_0748 ybhG ybiH TRUE 0.982 0.000 0.236 1.000 N NA
 5855826 5855827 E2348C_0751 E2348C_0752 dinG ybiB TRUE 0.531 28.000 0.041 1.000 N NA
 5855827 5855828 E2348C_0752 E2348C_0753 ybiB ybiC FALSE 0.230 141.000 0.000 0.059 N NA
 5855829 5855830 E2348C_0754 E2348C_0755 ybiJ ybiI FALSE 0.016 265.000 0.027 NA   NA
 5855830 5855831 E2348C_0755 E2348C_0756 ybiI ybiX FALSE 0.285 74.000 0.000 1.000   NA
 5855831 5855832 E2348C_0756 E2348C_0757 ybiX fiu TRUE 0.740 42.000 0.171 1.000   NA
 5855832 5855833 E2348C_0757 E2348C_0758 fiu ybiM FALSE 0.021 265.000 0.000 NA   NA
 5855835 5855836 E2348C_0760 E2348C_0761 ybiO glnQ FALSE 0.126 117.000 0.000 NA N NA
 5855836 5855837 E2348C_0761 E2348C_0762 glnQ glnP TRUE 0.985 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 5855837 5855838 E2348C_0762 E2348C_0763 glnP glnH TRUE 0.616 142.000 0.051 0.070 Y NA
 5855838 5855839 E2348C_0763 E2348C_0764 glnH dps FALSE 0.006 404.000 0.000 1.000 N NA
 5855839 5855840 E2348C_0764 E2348C_0765 dps rhtA FALSE 0.014 300.000 0.044 NA   NA
 5855841 5855842 E2348C_0766 E2348C_0767 ompX   FALSE 0.052 190.000 0.000 1.000 N NA
 5855843 5855844 E2348C_0768 E2348C_ncR08 ybiP rybA FALSE 0.009 355.000 0.000 NA   NA
 5855845 5855846 E2348C_0769 E2348C_0770 mntR ybiR TRUE 0.852 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5855849 5855850 E2348C_0773 E2348C_0774 ybiV ybiW FALSE 0.151 145.000 0.000 1.000   NA
 5855850 5855851 E2348C_0774 E2348C_0775 ybiW ybiY TRUE 0.990 6.000 0.316 0.003 N NA
 5855853 5855854 E2348C_0777 E2348C_0778 moeB moeA TRUE 0.998 0.000 0.323 0.003 Y NA
 5855855 5855856 E2348C_0779 E2348C_0780 iaaA gsiA TRUE 0.867 -13.000 0.104 1.000   NA
 5855856 5855857 E2348C_0780 E2348C_0781 gsiA gsiB TRUE 0.828 20.000 0.083 1.000   NA
 5855857 5855858 E2348C_0781 E2348C_0782 gsiB gsiC TRUE 0.996 18.000 0.803 0.055 Y NA
 5855858 5855859 E2348C_0782 E2348C_0783 gsiC gsiD TRUE 0.999 3.000 0.689 0.055 Y NA
 5855859 5855860 E2348C_0783 E2348C_0784 gsiD yliE FALSE 0.053 177.000 0.000 NA N NA
 5855860 5855861 E2348C_0784 E2348C_0785 yliE yliF TRUE 0.983 8.000 0.000 NA Y NA
 5855863 5855864 E2348C_0787 E2348C_0788 bssR yliI FALSE 0.192 111.000 0.047 NA   NA
 5855867 5855868 E2348C_0791 E2348C_0792 deoR ybjG TRUE 0.685 58.000 0.235 1.000   NA
 5855870 5855871 E2348C_0794 E2348C_0795 ybjH ybjI FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5855871 5855872 E2348C_0795 E2348C_0796 ybjI ybjJ TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5855873 10800737 E2348C_0797 E2348C_PP3 ybjK   TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5855874 5855875 E2348C_0798 E2348C_0799     FALSE 0.229 87.000 0.000 NA   NA
 5855875 5855876 E2348C_0799 E2348C_0800     TRUE 0.635 26.000 0.000 NA   NA
 5855876 5855877 E2348C_0800 E2348C_0801     TRUE 0.668 51.000 0.000 0.003   NA
 5855878 5855879 E2348C_0802 E2348C_0803     TRUE 0.549 33.000 0.000 NA   NA
 5855879 5855880 E2348C_0803 E2348C_0804     TRUE 0.907 8.000 0.000 NA   NA
 5855880 5855881 E2348C_0804 E2348C_0805     TRUE 0.964 -36.000 0.800 NA   NA
 5855881 5855882 E2348C_0805 E2348C_0806     TRUE 0.728 68.000 0.400 NA   NA
 5855882 5855883 E2348C_0806 E2348C_0807     TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 5855883 5855884 E2348C_0807 E2348C_0808     TRUE 0.995 -3.000 1.000 1.000 N NA
 5855884 5855885 E2348C_0808 E2348C_0809     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 5855885 5855886 E2348C_0809 E2348C_0810     TRUE 0.530 155.000 0.500 NA   NA
 5855886 5855887 E2348C_0810 E2348C_0811     TRUE 0.992 11.000 0.750 NA   NA
 5855889 5855890 E2348C_0813 E2348C_0814     TRUE 0.733 -15.000 0.000 NA   NA
 5855890 5855891 E2348C_0814 E2348C_0815     TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5855892 5855893 E2348C_0816 E2348C_0817     TRUE 0.995 0.000 0.667 NA   NA
 5855894 5855895 E2348C_0818 E2348C_0819     TRUE 0.804 17.000 0.000 1.000   NA
 5855895 5855896 E2348C_0819 E2348C_0820     TRUE 0.996 4.000 1.000 1.000   NA
 5855896 5855897 E2348C_0820 E2348C_0821     TRUE 0.919 96.000 1.000 0.002   NA
 5855897 5855898 E2348C_0821 E2348C_0822     TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 5855898 5855899 E2348C_0822 E2348C_0823     TRUE 0.996 4.000 1.000 NA   NA
 5855899 5855900 E2348C_0823 E2348C_0824     TRUE 0.968 -19.000 0.667 NA   NA
 5855900 5855901 E2348C_0824 E2348C_0825     TRUE 0.995 2.000 0.667 NA   NA
 5855901 5855902 E2348C_0825 E2348C_0826     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 5855902 5855903 E2348C_0826 E2348C_0827     TRUE 0.843 96.000 1.000 NA   NA
 5855903 5855904 E2348C_0827 E2348C_0828     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5855905 5855906 E2348C_0829 E2348C_0830     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 5855906 5855907 E2348C_0830 E2348C_0831     TRUE 0.990 -7.000 1.000 NA   NA
 5855907 5855908 E2348C_0831 E2348C_0832     TRUE 0.754 -13.000 0.000 NA   NA
 5855908 5855909 E2348C_0832 E2348C_0833     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5855910 5855911 E2348C_0834 E2348C_0835     FALSE 0.180 118.000 0.000 NA   NA
 5855911 5855912 E2348C_0835 E2348C_0836     FALSE 0.132 143.000 0.000 NA   NA
 5855912 5855913 E2348C_0836 E2348C_0837     TRUE 0.897 10.000 0.000 NA   NA
 5855913 5855914 E2348C_0837 E2348C_0838     FALSE 0.344 55.000 0.000 NA   NA
 5855914 5855915 E2348C_0838 E2348C_0839     TRUE 0.812 15.000 0.000 NA   NA
 5855915 5855916 E2348C_0839 E2348C_0840     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5855916 5855917 E2348C_0840 E2348C_0841     TRUE 0.985 -3.000 0.333 NA   NA
 5855917 5855918 E2348C_0841 E2348C_0842     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 5855918 5855919 E2348C_0842 E2348C_0843     FALSE 0.228 88.000 0.000 NA   NA
 5855920 5855921 E2348C_ncR09 E2348C_0844 rybB ybjL FALSE 0.237 80.000 0.000 NA   NA
 5855924 5855925 E2348C_0847 E2348C_0848 ybjC nfsA TRUE 0.873 -16.000 0.159 NA   NA
 5855925 5855926 E2348C_0848 E2348C_0849 nfsA rimK FALSE 0.263 61.000 0.000 1.000 N NA
 5855926 5855927 E2348C_0849 E2348C_0850 rimK ybjN FALSE 0.269 88.000 0.065 NA   NA
 5855927 5855928 E2348C_0850 E2348C_0851 ybjN potF FALSE 0.010 350.000 0.000 NA   NA
 5855928 5855929 E2348C_0851 E2348C_0852 potF potG TRUE 0.930 95.000 0.679 1.000 Y NA
 5855929 5855930 E2348C_0852 E2348C_0853 potG potH TRUE 0.998 10.000 0.857 1.000 Y NA
 5855930 5855931 E2348C_0853 E2348C_0854 potH potI TRUE 0.998 -3.000 0.528 0.055 Y NA
 5855931 5855932 E2348C_0854 E2348C_0855 potI ybjO TRUE 0.672 60.000 0.264 NA   NA
 5855932 5855933 E2348C_0855 E2348C_0856 ybjO rumB TRUE 0.779 41.000 0.226 NA   NA
 5855934 5855935 E2348C_0857 E2348C_0858 artJ artM FALSE 0.367 226.000 0.143 0.069 Y NA
 5855935 5855936 E2348C_0858 E2348C_0859 artM artQ TRUE 0.999 0.000 0.714 0.017 Y NA
 5855936 5855937 E2348C_0859 E2348C_0860 artQ artI TRUE 0.996 7.000 0.260 0.055 Y NA
 5855937 5855938 E2348C_0860 E2348C_0861 artI artP TRUE 0.985 18.000 0.323 1.000 Y NA
 5855938 5855939 E2348C_0861 E2348C_0862 artP ybjP FALSE 0.056 218.000 0.081 NA   NA
 5855940 5855941 E2348C_0863 E2348C_0864 ybjQ ybjR TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5855942 5855943 E2348C_0865 E2348C_0866 ybjS ybjT TRUE 0.727 99.000 0.022 0.010 Y NA
 5855943 5855944 E2348C_0866 E2348C_0867 ybjT ltaE TRUE 0.900 11.000 0.074 1.000 N NA
 5855944 5855945 E2348C_0867 E2348C_0868 ltaE poxB TRUE 0.867 37.000 0.041 1.000 Y NA
 5855945 5855946 E2348C_0868 E2348C_0869 poxB hcr FALSE 0.095 133.000 0.025 1.000 N NA
 5855946 5855947 E2348C_0869 E2348C_0870 hcr hcp TRUE 0.987 12.000 0.000 0.015 Y NA
 5855947 5855948 E2348C_0870 E2348C_0871 hcp ybjE FALSE 0.131 144.000 0.000 NA   NA
 5855948 5855949 E2348C_0871 E2348C_0872 ybjE aqpZ FALSE 0.004 484.000 0.025 NA   NA
 5855952 5855953 E2348C_0875 E2348C_0876 macA macB TRUE 0.994 -3.000 0.789 1.000 N NA
 5855955 5855956 E2348C_0878 E2348C_0879 clpS clpA TRUE 0.937 31.000 0.596 NA   NA
 5855957 5855958 E2348C_tRNA21 E2348C_0880 serW infA FALSE 0.024 254.000 0.000 NA   NA
 5855958 5855959 E2348C_0880 E2348C_0881 infA aat FALSE 0.010 285.000 0.020 1.000 N NA
 5855959 5855960 E2348C_0881 E2348C_0882 aat cydC TRUE 0.851 42.000 0.049 1.000 Y NA
 5855960 5855961 E2348C_0882 E2348C_0883 cydC cydD TRUE 0.999 1.000 0.631 0.005 Y NA
 5855961 5855962 E2348C_0883 E2348C_0884 cydD trxB TRUE 0.571 123.000 0.049 1.000 Y NA
 5855963 5855964 E2348C_0885 E2348C_0886 lrp ftsK TRUE 0.489 135.000 0.345 1.000 N NA
 5855964 5855965 E2348C_0886 E2348C_0887 ftsK lolA FALSE 0.365 156.000 0.305 1.000 N NA
 5855965 5855966 E2348C_0887 E2348C_0888 lolA rarA TRUE 0.950 11.000 0.167 1.000 N NA
 5855966 5855967 E2348C_0888 E2348C_0889 rarA serS FALSE 0.408 91.000 0.078 0.094 N NA
 5855967 5855968 E2348C_0889 E2348C_0890 serS dmsA FALSE 0.028 239.000 0.000 NA   NA
 5855968 5855969 E2348C_0890 E2348C_0891 dmsA dmsB TRUE 0.885 11.000 0.000 NA   NA
 5855969 5855970 E2348C_0891 E2348C_0892 dmsB dmsC TRUE 0.989 2.000 0.333 1.000   NA
 5855973 5855974 E2348C_0895 E2348C_0896 pflA pflB FALSE 0.087 192.000 0.092 1.000 N NA
 5855974 5855975 E2348C_0896 E2348C_0897 pflB focA TRUE 0.745 55.000 0.345 1.000 N NA
 5855975 5855976 E2348C_0897 E2348C_0898 focA ycaO FALSE 0.007 406.000 0.000 NA   NA
 5855977 5855978 E2348C_0899 E2348C_0900 ycaP serC FALSE 0.037 199.000 0.014 NA   NA
 5855978 5855979 E2348C_0900 E2348C_0901 serC aroA TRUE 0.673 71.000 0.033 1.000 Y NA
 5855979 5855980 E2348C_0901 E2348C_0902 aroA ycaL FALSE 0.043 170.000 0.003 1.000 N NA
 5855980 5855981 E2348C_0902 E2348C_0903 ycaL cmk FALSE 0.041 173.000 0.004 1.000 N NA
 5855981 5855982 E2348C_0903 E2348C_0904 cmk rpsA TRUE 0.504 111.000 0.281 1.000 N NA
 5855982 5855983 E2348C_0904 E2348C_0905 rpsA ihfB FALSE 0.341 160.000 0.292 1.000 N NA
 5855983 5855984 E2348C_0905 E2348C_0906 ihfB ycaI FALSE 0.037 206.000 0.003 1.000   NA
 5855984 5855985 E2348C_0906 E2348C_0907 ycaI msbA TRUE 0.761 37.000 0.075 0.084   NA
 5855985 5855986 E2348C_0907 E2348C_0908 msbA lpxK TRUE 0.971 -3.000 0.205 1.000 N NA
 5855986 5855987 E2348C_0908 E2348C_0909 lpxK ycaQ FALSE 0.424 37.000 0.017 NA   NA
 5855987 5855988 E2348C_0909 E2348C_0910 ycaQ ycaR FALSE 0.291 52.000 0.016 NA   NA
 5855988 5855989 E2348C_0910 E2348C_0911 ycaR kdsB TRUE 0.981 -3.000 0.265 NA   NA
 5855989 5855990 E2348C_0911 E2348C_0912 kdsB ycbJ FALSE 0.085 154.000 0.023 NA   NA
 5855992 5855993 E2348C_0914 E2348C_0915 smtA mukF TRUE 0.981 -3.000 0.325 NA N NA
 5855993 5855994 E2348C_0915 E2348C_0916 mukF mukE TRUE 0.925 -19.000 0.036 NA Y NA
 5855994 5855995 E2348C_0916 E2348C_0917 mukE mukB TRUE 0.995 0.000 0.000 0.001 Y NA
 5855995 5855996 E2348C_0917 E2348C_0918 mukB ycbB FALSE 0.026 261.000 0.000 1.000   NA
 5855996 5855997 E2348C_0918 E2348C_0919 ycbB ycbK FALSE 0.354 181.000 0.372 NA   NA
 5855997 5855998 E2348C_0919 E2348C_0920 ycbK ycbL TRUE 0.727 27.000 0.089 NA   NA
 5855999 5856000 E2348C_0921 E2348C_0922 aspC ompF FALSE 0.050 184.000 0.036 1.000 N NA
 5856000 5856001 E2348C_0922 E2348C_0923 ompF asnS FALSE 0.003 603.000 0.000 1.000 N NA
 5856001 5856002 E2348C_0923 E2348C_0924 asnS pncB FALSE 0.062 169.000 0.034 1.000 N NA
 5856004 5856005 E2348C_0926 E2348C_0927 ssuB ssuC TRUE 0.997 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 5856005 5856006 E2348C_0927 E2348C_0928 ssuC ssuD TRUE 0.958 12.000 0.226 1.000 N NA
 5856006 5856007 E2348C_0928 E2348C_0929 ssuD ssuA TRUE 0.984 -3.000 0.341 1.000 N NA
 5856007 5856008 E2348C_0929 E2348C_0930 ssuA ssuE TRUE 0.943 -7.000 0.169 1.000   NA
 5856009 5856010 E2348C_0931 E2348C_0932 pyrD ycbW FALSE 0.121 174.000 0.081 NA   NA
 5856012 5856013 E2348C_0934 E2348C_0935 rlmL uup TRUE 0.904 12.000 0.061 1.000   NA
 5856013 5856014 E2348C_0935 E2348C_0936 uup pqiA FALSE 0.169 130.000 0.054 NA   NA
 5856014 5856015 E2348C_0936 E2348C_0937 pqiA pqiB TRUE 0.995 5.000 0.819 NA   NA
 5856015 5856016 E2348C_0937 E2348C_0938 pqiB ymbA TRUE 0.991 -3.000 0.531 NA   NA
 5856016 5856017 E2348C_0938 E2348C_0939 ymbA rmf FALSE 0.024 256.000 0.000 NA   NA
 5856018 5856019 E2348C_0940 E2348C_0941 fabA ycbZ TRUE 0.622 69.000 0.290 1.000 N NA
 5856021 5856022 E2348C_0943 E2348C_0944 ompA sulA FALSE 0.007 356.000 0.000 1.000 N NA
 5856024 5856025 E2348C_0946 E2348C_0947 yccS yccF TRUE 0.828 19.000 0.090 NA   NA
 5856027 5856028 E2348C_0949 E2348C_0950 mgsA yccT FALSE 0.229 96.000 0.055 NA   NA
 5856030 5856031 E2348C_0952 E2348C_0953 hspQ yccW FALSE 0.454 58.000 0.094 NA   NA
 5856033 5856034 E2348C_0955 E2348C_0956 yccK yccA FALSE 0.400 92.000 0.140 NA   NA
 5856034 5856035 E2348C_0956 E2348C_tRNA22 yccA serT FALSE 0.045 207.000 0.000 NA   NA
 5856036 5856037 E2348C_0957 E2348C_0958 hyaA hyaB TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 5856037 5856038 E2348C_0958 E2348C_0959 hyaB hyaC TRUE 0.991 19.000 0.355 0.048 Y NA
 5856038 5856039 E2348C_0959 E2348C_0960 hyaC hyaD TRUE 0.993 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 5856039 5856040 E2348C_0960 E2348C_0961 hyaD hyaE TRUE 0.951 -3.000 0.096 NA   NA
 5856040 5856041 E2348C_0961 E2348C_0962 hyaE hyaF TRUE 0.994 -3.000 0.769 NA   NA
 5856041 5856042 E2348C_0962 E2348C_0963 hyaF appC FALSE 0.173 134.000 0.061 NA   NA
 5856042 5856043 E2348C_0963 E2348C_0964 appC appB TRUE 0.992 12.000 0.158 0.048 Y NA
 5856043 5856044 E2348C_0964 E2348C_0965 appB appA FALSE 0.081 185.000 0.000 1.000   NA
 5856045 5856046 E2348C_0966 E2348C_0967 etk etp TRUE 0.980 20.000 1.000 1.000 N NA
 5856046 5856047 E2348C_0967 E2348C_0968 etp gfcE TRUE 0.979 -12.000 0.750 1.000 N NA
 5856047 5856048 E2348C_0968 E2348C_0969 gfcE gfcD FALSE 0.430 46.000 0.000 NA   NA
 5856048 5856049 E2348C_0969 E2348C_0970 gfcD gfcC TRUE 0.946 0.000 0.060 NA   NA
 5856049 5856050 E2348C_0970 E2348C_0971 gfcC gfcB TRUE 0.992 -3.000 0.600 NA   NA
 5856050 5856051 E2348C_0971 E2348C_0972 gfcB gfcA FALSE 0.195 108.000 0.000 NA   NA
 5856051 5856052 E2348C_0972 E2348C_0973 gfcA cspH FALSE 0.006 442.000 0.000 NA   NA
 5856053 5856054 E2348C_0974 E2348C_0975 cspG ymcE FALSE 0.083 174.000 0.000 NA   NA
 5856054 5856055 E2348C_0975 E2348C_0976 ymcE gnsA TRUE 0.792 -10.000 0.000 NA   NA
 5856056 5856057 E2348C_0977 E2348C_0978 yccM torS FALSE 0.164 83.000 0.000 NA N NA
 5856058 5856059 E2348C_0979 E2348C_0980     TRUE 0.930 -22.000 0.174 0.015   NA
 5856059 5856060 E2348C_0980 E2348C_0981     TRUE 0.486 40.000 0.000 NA   NA
 5856060 5856061 E2348C_0981 E2348C_0982     FALSE 0.226 89.000 0.000 NA   NA
 5856061 5856062 E2348C_0982 E2348C_0983     FALSE 0.049 203.000 0.000 NA   NA
 5856062 5856063 E2348C_0983 E2348C_0984     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856063 5856064 E2348C_0984 E2348C_0985     FALSE 0.086 172.000 0.000 NA   NA
 5856064 5856065 E2348C_0985 E2348C_0986     TRUE 0.831 14.000 0.000 NA   NA
 5856065 5856066 E2348C_0986 E2348C_0987     TRUE 0.995 1.000 0.667 1.000   NA
 5856066 5856067 E2348C_0987 E2348C_0988     TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 5856067 5856068 E2348C_0988 E2348C_0989     TRUE 0.601 -79.000 0.000 NA   NA
 5856068 5856069 E2348C_0989 E2348C_0990     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856069 5856070 E2348C_0990 E2348C_0991     TRUE 0.733 -15.000 0.000 NA   NA
 5856070 5856071 E2348C_0991 E2348C_0992     FALSE 0.244 76.000 0.000 NA   NA
 5856071 5856072 E2348C_0992 E2348C_0993     FALSE 0.116 151.000 0.000 NA   NA
 5856072 5856073 E2348C_0993 E2348C_0994     FALSE 0.318 59.000 0.000 NA   NA
 5856073 5856074 E2348C_0994 E2348C_0995     FALSE 0.006 439.000 0.000 NA   NA
 5856074 5856075 E2348C_0995 E2348C_0996     FALSE 0.235 81.000 0.000 NA   NA
 5856076 5856077 E2348C_0997 E2348C_0998     FALSE 0.155 142.000 0.000 1.000   NA
 5856077 5856078 E2348C_0998 E2348C_0999     TRUE 0.593 33.000 0.000 1.000   NA
 5856078 5856079 E2348C_0999 E2348C_1000     TRUE 0.986 -3.000 0.333 1.000   NA
 5856079 5856080 E2348C_1000 E2348C_1001     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856080 5856081 E2348C_1001 E2348C_1002     FALSE 0.254 73.000 0.000 NA   NA
 5856081 5856082 E2348C_1002 E2348C_1003     TRUE 0.682 23.000 0.000 NA   NA
 5856082 5856083 E2348C_1003 E2348C_1004     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856083 5856084 E2348C_1004 E2348C_1005     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856084 5856085 E2348C_1005 E2348C_1006     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856085 5856086 E2348C_1006 E2348C_1007     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5856086 5856087 E2348C_1007 E2348C_1008     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856087 5856088 E2348C_1008 E2348C_1009     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 5856088 5856089 E2348C_1009 E2348C_1010     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856089 5856090 E2348C_1010 E2348C_1011     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856090 5856091 E2348C_1011 E2348C_1012     FALSE 0.019 280.000 0.000 NA   NA
 5856093 5856094 E2348C_1014 E2348C_1015     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856094 5856095 E2348C_1015 E2348C_1016     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5856095 5856096 E2348C_1016 E2348C_1017     TRUE 0.619 -247.000 0.000 1.000   NA
 5856096 5856097 E2348C_1017 E2348C_1018     FALSE 0.027 240.000 0.000 NA   NA
 5856097 5856098 E2348C_1018 E2348C_1019     FALSE 0.004 608.000 0.000 NA   NA
 5856098 5856099 E2348C_1019 E2348C_1020     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856099 5856100 E2348C_1020 E2348C_1021     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 5856100 5856101 E2348C_1021 E2348C_1022     TRUE 0.995 0.000 0.667 NA   NA
 5856101 5856102 E2348C_1022 E2348C_1023     TRUE 0.636 -118.000 0.049 1.000   NA
 5856102 5856103 E2348C_1023 E2348C_1024     TRUE 0.747 87.000 0.537 NA   NA
 5856103 5856104 E2348C_1024 E2348C_1025     TRUE 0.929 -7.000 0.152 NA   NA
 5856104 5856105 E2348C_1025 E2348C_1026     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856105 5856106 E2348C_1026 E2348C_1027     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 5856106 5856107 E2348C_1027 E2348C_1028     TRUE 0.994 11.000 1.000 NA   NA
 5856107 5856108 E2348C_1028 E2348C_1029     FALSE 0.306 61.000 0.000 NA   NA
 5856108 5856109 E2348C_1029 E2348C_1030     TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 5856109 5856110 E2348C_1030 E2348C_1031     TRUE 0.648 -28.000 0.000 NA   NA
 5856110 5856111 E2348C_1031 E2348C_1032     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856111 5856112 E2348C_1032 E2348C_1033     TRUE 0.897 10.000 0.000 NA   NA
 5856112 5856113 E2348C_1033 E2348C_1034     TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5856113 5856114 E2348C_1034 E2348C_1035     TRUE 0.594 -102.000 0.000 NA   NA
 5856114 5856115 E2348C_1035 E2348C_1036     FALSE 0.306 61.000 0.000 NA   NA
 5856115 5856116 E2348C_1036 E2348C_1037     FALSE 0.264 70.000 0.000 NA   NA
 5856116 5856117 E2348C_1037 E2348C_1038     FALSE 0.323 65.000 0.000 1.000   NA
 5856117 5856118 E2348C_1038 E2348C_1039     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856118 5856119 E2348C_1039 E2348C_1040     FALSE 0.185 115.000 0.000 NA   NA
 5856119 5856120 E2348C_1040 E2348C_1041     FALSE 0.009 362.000 0.000 NA   NA
 5856120 5856121 E2348C_1041 E2348C_1042     FALSE 0.306 61.000 0.000 NA   NA
 5856121 5856122 E2348C_1042 E2348C_1043     FALSE 0.285 65.000 0.000 NA   NA
 5856122 5856123 E2348C_1043 E2348C_1044     FALSE 0.030 231.000 0.000 NA   NA
 5856123 5856124 E2348C_1044 E2348C_1045   torT FALSE 0.005 475.000 0.000 NA   NA
 5856126 5856127 E2348C_1047 E2348C_1048 torC torA TRUE 0.994 0.000 0.000 0.048 Y NA
 5856127 5856128 E2348C_1048 E2348C_1049 torA torD TRUE 0.974 -3.000 0.077 0.048   NA
 5856129 5856130 E2348C_1050 E2348C_1051 cbpM cbpA TRUE 0.993 0.000 0.512 NA   NA
 5856131 5856132 E2348C_1052 E2348C_1053 agp   FALSE 0.077 189.000 0.000 1.000   NA
 5856133 5856134 E2348C_1054 E2348C_1055 yccJ wrbA TRUE 0.926 21.000 0.290 NA   NA
 5856136 5856137 E2348C_1057 E2348C_1058 rutG rutF TRUE 0.964 21.000 0.533 1.000   NA
 5856137 5856138 E2348C_1058 E2348C_1059 rutF rutE TRUE 0.994 11.000 0.625 0.027   NA
 5856138 5856139 E2348C_1059 E2348C_1060 rutE rutD TRUE 0.974 10.000 0.256 NA   NA
 5856139 5856140 E2348C_1060 E2348C_1061 rutD rutC TRUE 0.985 8.000 0.365 NA   NA
 5856140 5856141 E2348C_1061 E2348C_1062 rutC rutB TRUE 0.978 12.000 0.442 NA N NA
 5856141 5856142 E2348C_1062 E2348C_1063 rutB rutA TRUE 0.993 0.000 0.621 NA N NA
 5856145 5856146 E2348C_1066 E2348C_1067 putP efeU FALSE 0.030 220.000 0.000 1.000 N NA
 5856146 5856147 E2348C_1067 E2348C_1068 efeU ycdO TRUE 0.915 58.000 0.356 NA Y NA
 5856147 5856148 E2348C_1068 E2348C_1069 ycdO ycdB TRUE 0.996 6.000 0.378 NA Y NA
 5856148 5856149 E2348C_1069 E2348C_1070 ycdB phoH FALSE 0.006 351.000 0.000 NA N NA
 5856149 5856150 E2348C_1070 E2348C_1071 phoH   FALSE 0.005 563.000 0.000 NA   NA
 5856150 10800739 E2348C_1071 E2348C_IE2     FALSE 0.203 101.000 0.000 NA   NA
 10800739 5856151 E2348C_IE2 E2348C_1072     TRUE 0.563 -1382.000 0.000 NA   NA
 5856153 5856154 E2348C_1074 E2348C_1075     FALSE 0.003 1375.000 0.000 NA   NA
 5856157 5856158 E2348C_1078 E2348C_1079     FALSE 0.017 287.000 0.000 NA   NA
 5856158 5856159 E2348C_1079 E2348C_1080     FALSE 0.005 471.000 0.000 NA   NA
 5856159 5856160 E2348C_1080 E2348C_1081     FALSE 0.401 49.000 0.000 NA   NA
 5856160 5856161 E2348C_1081 E2348C_1082     FALSE 0.004 607.000 0.000 NA   NA
 5856161 5856162 E2348C_1082 E2348C_1083     FALSE 0.004 796.000 0.000 NA   NA
 5856163 5856164 E2348C_1084 E2348C_1085     TRUE 0.622 52.000 0.000 0.015   NA
 5856164 5856165 E2348C_1085 E2348C_1086     TRUE 0.964 -3.000 0.000 0.073   NA
 5856167 5856168 E2348C_1088 E2348C_1089     TRUE 0.989 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5856169 5856170 E2348C_1090 E2348C_1091     TRUE 0.991 0.000 0.411 NA   NA
 5856170 5856171 E2348C_1091 E2348C_1092     TRUE 0.709 19.000 0.033 NA   NA
 5856171 5856172 E2348C_1092 E2348C_1093     TRUE 0.857 36.000 0.317 NA   NA
 5856172 5856173 E2348C_1093 E2348C_1094     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856173 5856174 E2348C_1094 E2348C_1095     TRUE 0.985 12.000 0.045 0.073 Y NA
 5856174 5856175 E2348C_1095 E2348C_1096     TRUE 0.617 40.000 0.093 NA   NA
 5856175 5856176 E2348C_1096 E2348C_1097     FALSE 0.031 229.000 0.000 NA   NA
 5856177 5856178 E2348C_1098 E2348C_1099     FALSE 0.264 70.000 0.000 NA   NA
 5856179 5856180 E2348C_1100 E2348C_1101     FALSE 0.004 596.000 0.000 NA   NA
 5856180 5856181 E2348C_1101 E2348C_1102     TRUE 0.964 -3.000 0.000 0.073   NA
 5856182 5856183 E2348C_1103 E2348C_1104     FALSE 0.155 130.000 0.000 NA   NA
 5856184 5856185 E2348C_1105 E2348C_1106     TRUE 0.964 -3.000 0.000 0.073   NA
 5856185 5856186 E2348C_1106 E2348C_1107     FALSE 0.044 208.000 0.000 NA   NA
 5856187 5856188 E2348C_1108 E2348C_1109     FALSE 0.049 203.000 0.000 NA   NA
 5856188 5856189 E2348C_1109 E2348C_1110     TRUE 0.759 18.000 0.000 NA   NA
 5856189 5856190 E2348C_1110 E2348C_1111     TRUE 0.992 -3.000 0.600 NA   NA
 5856190 5856191 E2348C_1111 E2348C_1112     TRUE 0.994 -3.000 0.800 NA   NA
 5856193 5856194 E2348C_1114 E2348C_1115     FALSE 0.223 91.000 0.000 NA   NA
 5856194 5856195 E2348C_1115 E2348C_1116     TRUE 0.791 16.000 0.000 NA   NA
 5856195 5856196 E2348C_1116 E2348C_1117     FALSE 0.297 63.000 0.000 NA   NA
 5856196 5856197 E2348C_1117 E2348C_1118     FALSE 0.100 163.000 0.000 NA   NA
 5856197 5856198 E2348C_1118 E2348C_1119     FALSE 0.421 47.000 0.000 NA   NA
 5856198 5856199 E2348C_1119 E2348C_1120     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856199 5856200 E2348C_1120 E2348C_1121     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856200 5856201 E2348C_1121 E2348C_1122     FALSE 0.232 85.000 0.000 NA   NA
 5856203 5856204 E2348C_1123 E2348C_1124 ghrA ycdX TRUE 0.868 55.000 0.169 1.000 Y NA
 5856204 5856205 E2348C_1124 E2348C_1125 ycdX ycdY TRUE 0.943 24.000 0.417 1.000   NA
 5856205 5856206 E2348C_1125 E2348C_1126 ycdY ycdZ TRUE 0.460 72.000 0.145 NA   NA
 5856207 5856208 E2348C_1127 E2348C_1128 csgG csgF TRUE 0.607 27.000 0.043 NA   NA
 5856208 5856209 E2348C_1128 E2348C_1129 csgF csgE TRUE 0.965 25.000 0.723 NA   NA
 5856209 5856210 E2348C_1129 E2348C_1130 csgE csgD TRUE 0.970 5.000 0.176 NA   NA
 5856210 5856211 E2348C_1130 E2348C_1131 csgD   FALSE 0.007 412.000 0.000 NA   NA
 5856212 5856213 E2348C_1132 E2348C_1133 csgB csgA TRUE 0.917 41.000 0.333 0.008   NA
 5856213 5856214 E2348C_1133 E2348C_1134 csgA csgC TRUE 0.862 59.000 0.667 NA   NA
 5856214 5856215 E2348C_1134 E2348C_1135 csgC ymdA TRUE 0.623 121.000 0.429 NA   NA
 5856215 5856216 E2348C_1135 E2348C_1136 ymdA ymdB FALSE 0.177 95.000 0.028 NA   NA
 5856216 5856217 E2348C_1136 E2348C_1137 ymdB ymdC TRUE 0.931 2.000 0.046 NA   NA
 5856219 5856220 E2348C_1139 E2348C_1140 mdoG mdoH TRUE 0.973 -7.000 0.469 NA N NA
 5856220 5856221 E2348C_1140 E2348C_1141 mdoH yceK FALSE 0.174 173.000 0.135 NA   NA
 5856222 5856223 E2348C_1142 E2348C_1143 msyB mdtG TRUE 0.642 83.000 0.333 NA   NA
 5856223 5856224 E2348C_1143 E2348C_1144 mdtG lpxL TRUE 0.697 172.000 0.857 0.081 N NA
 5856226 5856227 E2348C_1146 E2348C_1147 yceI yceJ TRUE 0.994 4.000 0.676 NA   NA
 5856227 5856228 E2348C_1147 E2348C_1148 yceJ yceO FALSE 0.022 262.000 0.000 NA   NA
 5856228 5856229 E2348C_1148 E2348C_1149 yceO solA TRUE 0.763 48.000 0.269 NA   NA
 5856229 5856230 E2348C_1149 E2348C_1150 solA bssS TRUE 0.634 115.000 0.423 NA   NA
 5856230 5856231 E2348C_1150 E2348C_1151 bssS dinI FALSE 0.017 290.000 0.000 NA   NA
 5856231 5856232 E2348C_1151 E2348C_1152 dinI pyrC FALSE 0.214 74.000 0.031 NA   NA
 5856232 5856233 E2348C_1152 E2348C_1153 pyrC yceB FALSE 0.153 106.000 0.022 NA   NA
 5856233 5856234 E2348C_1153 E2348C_1154 yceB grxB FALSE 0.202 134.000 0.078 NA   NA
 5856234 5856235 E2348C_1154 E2348C_1155 grxB mdtH FALSE 0.358 64.000 0.103 NA N NA
 5856236 5856237 E2348C_1156 E2348C_1157 rimJ yceH TRUE 0.939 11.000 0.116 NA   NA
 5856237 5856238 E2348C_1157 E2348C_1158 yceH yceM TRUE 0.961 2.000 0.103 NA   NA
 5856238 5856239 E2348C_1158 E2348C_1159 yceM yceN FALSE 0.179 110.000 0.022 1.000   NA
 5856240 5856241 E2348C_1160 E2348C_1161 flgN flgM TRUE 0.998 5.000 0.361 0.002 Y NA
 5856241 5856242 E2348C_1161 E2348C_1162 flgM flgA TRUE 0.866 76.000 0.330 NA Y NA
 5856243 5856244 E2348C_1163 E2348C_1164 flgB flgC TRUE 0.999 4.000 0.824 0.003 Y NA
 5856244 5856245 E2348C_1164 E2348C_1165 flgC flgD TRUE 0.988 12.000 0.186 NA Y NA
 5856245 5856246 E2348C_1165 E2348C_1166 flgD flgE TRUE 0.943 25.000 0.116 NA Y NA
 5856246 5856247 E2348C_1166 E2348C_1167 flgE flgF TRUE 0.994 20.000 0.476 0.003 Y NA
 5856247 5856248 E2348C_1167 E2348C_1168 flgF flgG TRUE 0.842 172.000 0.420 0.001 Y NA
 5856248 5856249 E2348C_1168 E2348C_1169 flgG flgH TRUE 0.949 53.000 0.268 0.005 Y NA
 5856249 5856250 E2348C_1169 E2348C_1170 flgH flgI TRUE 0.990 12.000 0.073 0.006 Y NA
 5856250 5856251 E2348C_1170 E2348C_1171 flgI flgJ TRUE 0.994 0.000 0.036 0.006 Y NA
 5856251 5856252 E2348C_1171 E2348C_1172 flgJ flgK TRUE 0.974 66.000 0.705 0.002 Y NA
 5856252 5856253 E2348C_1172 E2348C_1173 flgK flgL TRUE 0.993 12.000 0.142 0.001 Y NA
 5856254 5856255 E2348C_1174 E2348C_1175     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5856255 5856256 E2348C_1175 E2348C_1176   rne FALSE 0.172 134.000 0.000 1.000   NA
 5856256 5856257 E2348C_1176 E2348C_ncR10 rne rne5 TRUE 0.653 25.000 0.000 NA   NA
 5856258 5856259 E2348C_1177 E2348C_1178 yceQ rluC FALSE 0.123 118.000 0.005 NA   NA
 5856261 5856262 E2348C_ncR11 E2348C_1180 psrD yceD TRUE 0.513 37.000 0.000 NA   NA
 5856262 5856263 E2348C_1180 E2348C_1181 yceD rpmF TRUE 0.869 52.000 0.599 NA   NA
 5856263 5856264 E2348C_1181 E2348C_1182 rpmF plsX TRUE 0.616 111.000 0.418 1.000 N NA
 5856264 5856265 E2348C_1182 E2348C_1183 plsX fabH TRUE 0.946 68.000 0.380 0.004 Y NA
 5856265 5856266 E2348C_1183 E2348C_1184 fabH fabD TRUE 0.989 16.000 0.182 0.004 Y NA
 5856266 5856267 E2348C_1184 E2348C_1185 fabD fabG TRUE 0.997 13.000 0.432 0.004 Y NA
 5856267 5856268 E2348C_1185 E2348C_1186 fabG acpP TRUE 0.634 211.000 0.321 0.004 Y NA
 5856268 5856269 E2348C_1186 E2348C_1187 acpP fabF TRUE 0.874 88.000 0.346 1.000 Y NA
 5856269 5856270 E2348C_1187 E2348C_1188 fabF pabC FALSE 0.377 120.000 0.187 1.000 N NA
 5856270 5856271 E2348C_1188 E2348C_1189 pabC yceG TRUE 0.978 3.000 0.204 NA   NA
 5856271 5856272 E2348C_1189 E2348C_1190 yceG tmk TRUE 0.930 -10.000 0.209 NA   NA
 5856272 5856273 E2348C_1190 E2348C_1191 tmk holB TRUE 0.972 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5856273 5856274 E2348C_1191 E2348C_1192 holB ycfH TRUE 0.985 11.000 0.110 NA Y NA
 5856274 5856275 E2348C_1192 E2348C_1193 ycfH ptsG FALSE 0.005 294.000 0.004 NA N NA
 5856277 5856278 E2348C_1195 E2348C_1196 hinT ycfL TRUE 0.932 3.000 0.051 NA   NA
 5856278 5856279 E2348C_1196 E2348C_1197 ycfL ycfM TRUE 0.979 14.000 0.516 NA   NA
 5856279 5856280 E2348C_1197 E2348C_1198 ycfM thiK TRUE 0.925 -19.000 0.310 NA   NA
 5856280 5856281 E2348C_1198 E2348C_1199 thiK nagZ TRUE 0.894 11.000 0.069 1.000 N NA
 5856281 5856282 E2348C_1199 E2348C_1200 nagZ ycfP TRUE 0.782 23.000 0.091 NA   NA
 5856282 5856283 E2348C_1200 E2348C_1201 ycfP ndh FALSE 0.008 399.000 0.057 NA   NA
 5856283 5856284 E2348C_1201 E2348C_1202 ndh ycfJ FALSE 0.051 227.000 0.071 1.000   NA
 5856287 5856288 E2348C_1205 E2348C_1206 ycfS mfd FALSE 0.109 143.000 0.006 1.000   NA
 5856288 5856289 E2348C_1206 E2348C_1207 mfd ycfT FALSE 0.131 128.000 0.003 1.000   NA
 5856290 5856291 E2348C_1208 E2348C_1209 lolC lolD TRUE 0.959 -7.000 0.175 0.066 N NA
 5856291 5856292 E2348C_1209 E2348C_1210 lolD lolE TRUE 0.981 0.000 0.125 0.066 N NA
 5856292 5856293 E2348C_1210 E2348C_1211 lolE nagK TRUE 0.832 29.000 0.225 1.000 N NA
 5856293 5856294 E2348C_1211 E2348C_1212 nagK cobB TRUE 0.974 16.000 0.119 1.000 Y NA
 5856295 5856296 E2348C_1213 E2348C_1214 ycfZ ymfA TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856296 5856297 E2348C_1214 E2348C_1215 ymfA potD FALSE 0.326 58.000 0.000 NA   NA
 5856297 5856298 E2348C_1215 E2348C_1216 potD potC TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.052 Y NA
 5856299 5856300 E2348C_1217 E2348C_1218     TRUE 0.968 -31.000 0.500 0.014   NA
 5856300 5856301 E2348C_1218 E2348C_1219     FALSE 0.339 62.000 0.000 1.000   NA
 5856301 5856302 E2348C_1219 E2348C_1220     FALSE 0.218 93.000 0.000 NA   NA
 5856302 5856303 E2348C_1220 E2348C_1221     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856303 5856304 E2348C_1221 E2348C_ncR12   dicF_1 FALSE 0.081 175.000 0.000 NA   NA
 5856306 5856307 E2348C_1223 E2348C_1224     TRUE 0.583 30.000 0.000 NA   NA
 5856307 5856308 E2348C_1224 E2348C_1225     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856308 5856309 E2348C_1225 E2348C_1226     FALSE 0.206 99.000 0.000 NA   NA
 5856310 5856311 E2348C_1227 E2348C_1228     TRUE 0.719 -16.000 0.000 NA   NA
 5856311 5856312 E2348C_1228 E2348C_1229     TRUE 0.648 -28.000 0.000 NA   NA
 5856312 5856313 E2348C_1229 E2348C_1230     TRUE 0.581 -211.000 0.000 NA   NA
 5856313 5856314 E2348C_1230 E2348C_1231     FALSE 0.196 107.000 0.000 NA   NA
 5856314 5856315 E2348C_1231 E2348C_1232     FALSE 0.006 440.000 0.000 NA   NA
 5856315 5856316 E2348C_1232 E2348C_1233     FALSE 0.197 106.000 0.000 NA   NA
 5856316 5856317 E2348C_1233 E2348C_1234     FALSE 0.007 413.000 0.000 NA   NA
 5856317 5856318 E2348C_1234 E2348C_1235     TRUE 0.961 -13.000 0.444 NA   NA
 5856320 5856321 E2348C_1237 E2348C_1238     FALSE 0.037 220.000 0.000 NA   NA
 5856321 5856322 E2348C_1238 E2348C_1239     FALSE 0.275 67.000 0.000 NA   NA
 5856322 5856323 E2348C_1239 E2348C_1240     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856323 5856324 E2348C_1240 E2348C_1241     TRUE 0.933 1.000 0.000 NA   NA
 5856324 5856325 E2348C_1241 E2348C_1242     TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 5856325 5856326 E2348C_1242 E2348C_1243     FALSE 0.019 278.000 0.000 NA   NA
 5856326 5856327 E2348C_1243 E2348C_1244     FALSE 0.116 151.000 0.000 NA   NA
 5856327 5856328 E2348C_1244 E2348C_tRNA24   tRNA_24 FALSE 0.392 50.000 0.000 NA   NA
 5856328 5856329 E2348C_tRNA24 E2348C_tRNA25 tRNA_24 tRNA_25 TRUE 0.907 8.000 0.000 NA   NA
 5856329 5856330 E2348C_tRNA25 E2348C_tRNA26 tRNA_25 tRNA_26 TRUE 0.831 14.000 0.000 NA   NA
 5856332 5856333 E2348C_1246 E2348C_1247     FALSE 0.006 435.000 0.000 NA   NA
 5856333 5856334 E2348C_1247 E2348C_1248     FALSE 0.315 138.000 0.000 0.015   NA
 5856334 5856335 E2348C_1248 E2348C_1249     FALSE 0.103 160.000 0.000 NA   NA
 5856335 5856336 E2348C_1249 E2348C_1250     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856336 5856337 E2348C_1250 E2348C_1251     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5856337 5856338 E2348C_1251 E2348C_1252     TRUE 0.621 -238.000 0.000 1.000   NA
 5856338 5856339 E2348C_1252 E2348C_1253     FALSE 0.004 1076.000 0.000 1.000   NA
 5856339 5856340 E2348C_1253 E2348C_1254     FALSE 0.005 692.000 0.000 1.000   NA
 5856340 5856341 E2348C_1254 E2348C_1255     TRUE 0.648 -28.000 0.000 NA   NA
 5856341 5856342 E2348C_1255 E2348C_1256     TRUE 0.719 -16.000 0.000 NA   NA
 5856342 5856343 E2348C_1256 E2348C_1257     TRUE 0.930 -3.000 0.000 1.000   NA
 5856343 5856344 E2348C_1257 E2348C_1258     TRUE 0.792 -10.000 0.000 NA   NA
 5856344 5856345 E2348C_1258 E2348C_1259     TRUE 0.635 26.000 0.000 NA   NA
 5856345 5856346 E2348C_1259 E2348C_1260     TRUE 0.801 61.000 0.500 NA   NA
 5856346 5856347 E2348C_1260 E2348C_1261     FALSE 0.264 70.000 0.000 NA   NA
 5856347 5856348 E2348C_1261 E2348C_1262     FALSE 0.323 65.000 0.000 1.000   NA
 5856348 5856349 E2348C_1262 E2348C_1263     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856352 5856353 E2348C_1266 E2348C_1267 potB potA TRUE 0.993 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 5856355 5856356 E2348C_1269 E2348C_1270 ycfD phoQ TRUE 0.705 76.000 0.408 NA   NA
 5856356 5856357 E2348C_1270 E2348C_1271 phoQ phoP TRUE 0.999 0.000 0.940 1.000 Y NA
 5856357 5856358 E2348C_1271 E2348C_1272 phoP purB FALSE 0.047 170.000 0.011 1.000 N NA
 5856358 5856359 E2348C_1272 E2348C_1273 purB hflD TRUE 0.953 4.000 0.093 NA   NA
 5856359 5856360 E2348C_1273 E2348C_1274 hflD mnmA TRUE 0.769 36.000 0.180 NA   NA
 5856360 5856361 E2348C_1274 E2348C_1275 mnmA nudJ TRUE 0.560 54.000 0.158 1.000 N NA
 5856361 5856362 E2348C_1275 E2348C_1276 nudJ rluE TRUE 0.960 10.000 0.182 1.000 N NA
 5856364 5856365 E2348C_1278 E2348C_1279 ycgX ycgE FALSE 0.036 221.000 0.000 NA   NA
 5856365 5856366 E2348C_1279 E2348C_1280 ycgE ycgF FALSE 0.208 205.000 0.333 1.000 N NA
 5856367 5856368 E2348C_1281 E2348C_1282 ycgZ ymgA TRUE 0.857 43.000 0.400 NA   NA
 5856368 5856369 E2348C_1282 E2348C_1283 ymgA ymgB TRUE 0.592 29.000 0.000 NA   NA
 5856369 5856370 E2348C_1283 E2348C_1284 ymgB ymgC FALSE 0.188 113.000 0.000 NA   NA
 5856370 5856371 E2348C_1284 E2348C_1285 ymgC ycgG FALSE 0.015 298.000 0.000 NA   NA
 5856371 5856372 E2348C_1285 E2348C_1286 ycgG ymgF FALSE 0.168 125.000 0.000 NA   NA
 5856372 5856373 E2348C_1286 E2348C_1287 ymgF ycgH FALSE 0.007 399.000 0.000 NA   NA
 5856374 5856375 E2348C_1288 E2348C_1289 ymgD ymgG TRUE 0.897 10.000 0.000 NA   NA
 5856375 5856376 E2348C_1289 E2348C_1290 ymgG ymgI TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856377 5856378 E2348C_1291 E2348C_1292 ymgJ ycgI FALSE 0.152 132.000 0.000 NA   NA
 5856379 5856380 E2348C_1293 E2348C_1294 minE minD TRUE 0.998 4.000 0.618 NA Y NA
 5856380 5856381 E2348C_1294 E2348C_1295 minD minC TRUE 0.984 24.000 0.466 1.000 Y NA
 5856384 5856385 E2348C_1298 E2348C_1299 ycgL ycgM FALSE 0.284 72.000 0.056 NA   NA
 5856385 5856386 E2348C_1299 E2348C_1300 ycgM ycgN FALSE 0.315 92.000 0.088 NA   NA
 5856388 5856389 E2348C_ncR13 E2348C_1302   umuD FALSE 0.313 60.000 0.000 NA   NA
 5856389 5856390 E2348C_1302 E2348C_1303 umuD umuC TRUE 0.922 0.000 0.000 1.000 N NA
 5856391 5856392 E2348C_1304 E2348C_1305 dsbB nhaB TRUE 0.664 146.000 0.723 1.000 N NA
 5856395 5856396 E2348C_1308 E2348C_1309 dadA dadX TRUE 0.956 10.000 0.168 1.000 N NA
 5856397 5856398 E2348C_1310 E2348C_1311 cvrA ldcA FALSE 0.270 95.000 0.103 NA N NA
 5856402 5856403 E2348C_1315 E2348C_1316     TRUE 0.539 26.000 0.034 1.000 N NA
 5856403 5856404 E2348C_1316 E2348C_1317     TRUE 0.904 -3.000 0.034 NA   NA
 5856404 5856405 E2348C_1317 E2348C_1318     TRUE 0.949 10.000 0.123 NA   NA
 5856405 5856406 E2348C_1318 E2348C_1319     TRUE 0.999 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 5856406 5856407 E2348C_1319 E2348C_1320     TRUE 0.998 0.000 0.422 1.000 Y NA
 5856407 5856408 E2348C_1320 E2348C_1321   treA FALSE 0.009 337.000 0.000 1.000 N NA
 5856408 5856409 E2348C_1321 E2348C_1322 treA dhaM FALSE 0.015 320.000 0.000 1.000   NA
 5856409 5856410 E2348C_1322 E2348C_1323 dhaM dhaL TRUE 0.947 11.000 0.118 1.000   NA
 5856410 5856411 E2348C_1323 E2348C_1324 dhaL dhaK TRUE 0.996 11.000 0.226 0.001 Y NA
 5856413 5856414 E2348C_1326 E2348C_1327 ychF pth TRUE 0.750 117.000 0.184 1.000 Y NA
 5856416 5856417 E2348C_1329 E2348C_1330 ychM prs FALSE 0.109 125.000 0.027 1.000 N NA
 5856417 5856418 E2348C_1330 E2348C_1331 prs ispE FALSE 0.104 151.000 0.053 1.000 N NA
 5856418 5856419 E2348C_1331 E2348C_1332 ispE lolB TRUE 0.971 0.000 0.157 1.000 N NA
 5856420 5856421 E2348C_1333 E2348C_1334 hemA prfA TRUE 0.807 42.000 0.171 0.043 N NA
 5856421 5856422 E2348C_1334 E2348C_1335 prfA prmC TRUE 0.997 0.000 0.229 0.043 Y NA
 5856422 5856423 E2348C_1335 E2348C_1336 prmC ychQ TRUE 0.955 -3.000 0.109 NA   NA
 5856423 5856424 E2348C_1336 E2348C_1337 ychQ ychA TRUE 0.975 4.000 0.195 NA   NA
 5856424 5856425 E2348C_1337 E2348C_1338 ychA kdsA TRUE 0.674 36.000 0.089 1.000   NA
 5856429 5856430 E2348C_1341 E2348C_1342 chaB chaC FALSE 0.216 158.000 0.140 NA   NA
 5856433 5856434 E2348C_1345 E2348C_1346 narL narX TRUE 0.997 -7.000 0.521 0.013 Y NA
 5856435 5856436 E2348C_1347 E2348C_1348 narK narG FALSE 0.006 393.000 0.000 1.000 N NA
 5856436 5856437 E2348C_1348 E2348C_1349 narG narH TRUE 0.999 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 5856437 5856438 E2348C_1349 E2348C_1350 narH narJ TRUE 0.999 -3.000 0.588 0.003 Y NA
 5856438 5856439 E2348C_1350 E2348C_1351 narJ narI TRUE 0.999 0.000 0.500 0.003 Y NA
 5856439 5856440 E2348C_1351 E2348C_1352 narI   FALSE 0.131 112.000 0.000 NA N NA
 5856440 5856441 E2348C_1352 E2348C_1353     TRUE 0.967 -3.000 0.200 NA N NA
 5856441 5856442 E2348C_1353 E2348C_1354     TRUE 0.845 -22.000 0.133 1.000   NA
 5856442 5856443 E2348C_1354 E2348C_1355     TRUE 0.991 -3.000 0.550 NA   NA
 5856443 5856444 E2348C_1355 E2348C_1356     TRUE 0.968 -3.000 0.162 NA   NA
 5856444 5856445 E2348C_1356 E2348C_1357     TRUE 0.940 -7.000 0.179 NA   NA
 5856445 5856446 E2348C_1357 E2348C_1358     TRUE 0.849 -13.000 0.103 NA   NA
 5856447 5856448 E2348C_tRNA27 E2348C_1359 tyrT purU FALSE 0.103 160.000 0.000 NA   NA
 5856448 5856449 E2348C_1359 E2348C_1360 purU ychJ TRUE 0.684 50.000 0.200 NA   NA
 5856450 5856451 E2348C_1361 E2348C_1362 rssA rssB FALSE 0.256 92.000 0.048 1.000   NA
 5856451 5856452 E2348C_1362 E2348C_1363 rssB galU FALSE 0.162 202.000 0.235 1.000 N NA
 5856455 5856456 E2348C_1366 E2348C_1367   adhE FALSE 0.165 126.000 0.000 NA   NA
 5856457 5856458 E2348C_1368 E2348C_1369 ychE oppA FALSE 0.002 738.000 0.000 NA N NA
 5856458 5856459 E2348C_1369 E2348C_1370 oppA oppB TRUE 0.844 86.000 0.151 0.051 Y NA
 5856459 5856460 E2348C_1370 E2348C_1371 oppB oppC TRUE 0.998 15.000 0.870 0.051 Y NA
 5856460 5856461 E2348C_1371 E2348C_1372 oppC oppD TRUE 0.996 12.000 0.554 1.000 Y NA
 5856461 5856462 E2348C_1372 E2348C_1373 oppD oppF TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 5856463 5856464 E2348C_1374 E2348C_1375 yciU cls TRUE 0.817 35.000 0.231 NA   NA
 5856466 5856467 E2348C_1377 E2348C_1378 kch yciI FALSE 0.015 300.000 0.000 NA   NA
 5856469 5856470 E2348C_1380 E2348C_1381 yciA yciB FALSE 0.349 105.000 0.167 NA N NA
 5856470 5856471 E2348C_1381 E2348C_1382 yciB yciC TRUE 0.628 30.000 0.061 NA   NA
 5856472 10800741 E2348C_1383 E2348C_PP6 ompW   TRUE 0.589 -114.000 0.000 NA   NA
 5856473 5856474 E2348C_1384 E2348C_1385     TRUE 0.857 -22.000 0.000 0.014   NA
 5856474 5856475 E2348C_1385 E2348C_1386     FALSE 0.323 65.000 0.000 1.000   NA
 5856475 5856476 E2348C_1386 E2348C_1387     FALSE 0.218 93.000 0.000 NA   NA
 5856476 5856477 E2348C_1387 E2348C_1388     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856477 5856478 E2348C_1388 E2348C_ncR15   dicF_2 FALSE 0.081 175.000 0.000 NA   NA
 5856480 5856481 E2348C_1390 E2348C_1391     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856481 5856482 E2348C_1391 E2348C_1392     FALSE 0.069 185.000 0.000 NA   NA
 5856483 5856484 E2348C_1393 E2348C_1394     TRUE 0.719 -16.000 0.000 NA   NA
 5856484 5856485 E2348C_1394 E2348C_1395     TRUE 0.682 23.000 0.000 NA   NA
 5856485 5856486 E2348C_1395 E2348C_1396     TRUE 0.477 41.000 0.000 NA   NA
 5856486 5856487 E2348C_1396 E2348C_1397     FALSE 0.026 244.000 0.000 NA   NA
 5856487 5856488 E2348C_1397 E2348C_1398     FALSE 0.014 301.000 0.000 NA   NA
 5856489 5856490 E2348C_1399 E2348C_1400     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5856490 5856491 E2348C_1400 E2348C_1401     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856492 5856493 E2348C_1402 E2348C_1403     TRUE 0.767 -155.000 0.000 0.095   NA
 5856493 5856494 E2348C_1403 E2348C_1404     FALSE 0.092 167.000 0.000 NA   NA
 5856494 5856495 E2348C_1404 E2348C_1405     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856495 5856496 E2348C_1405 E2348C_1406     TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5856496 5856497 E2348C_1406 E2348C_1407     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856497 5856498 E2348C_1407 E2348C_tRNA28   tRNA_28 FALSE 0.055 196.000 0.000 NA   NA
 5856498 5856499 E2348C_tRNA28 E2348C_tRNA29 tRNA_28 tRNA_29 TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856499 5856500 E2348C_tRNA29 E2348C_tRNA30 tRNA_29 tRNA_30 TRUE 0.831 14.000 0.000 NA   NA
 5856502 5856503 E2348C_1409 E2348C_1410     FALSE 0.116 151.000 0.000 NA   NA
 5856503 5856504 E2348C_1410 E2348C_1411     TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5856504 5856505 E2348C_1411 E2348C_1412     FALSE 0.292 64.000 0.000 NA   NA
 5856505 5856506 E2348C_1412 E2348C_1413     FALSE 0.108 156.000 0.000 NA   NA
 5856506 5856507 E2348C_1413 E2348C_1414     TRUE 0.503 38.000 0.000 NA   NA
 5856507 5856508 E2348C_1414 E2348C_1415     FALSE 0.204 100.000 0.000 NA   NA
 5856508 5856509 E2348C_1415 E2348C_1416     TRUE 0.617 -274.000 0.000 1.000   NA
 5856509 5856510 E2348C_1416 E2348C_1417     FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5856512 5856513 E2348C_1419 E2348C_1420     FALSE 0.010 291.000 0.026 1.000 N NA
 5856513 5856514 E2348C_1420 E2348C_1421     TRUE 0.932 -3.000 0.064 NA   NA
 5856514 5856515 E2348C_1421 E2348C_1422     FALSE 0.380 64.000 0.080 NA   NA
 5856515 5856516 E2348C_1422 E2348C_1423     FALSE 0.420 45.000 0.040 NA   NA
 5856516 5856517 E2348C_1423 E2348C_1424     TRUE 0.612 -54.000 0.000 NA   NA
 5856517 5856518 E2348C_1424 E2348C_1425     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856518 5856519 E2348C_1425 E2348C_1426     TRUE 0.981 10.000 0.333 NA   NA
 5856519 5856520 E2348C_1426 E2348C_1427     TRUE 0.945 -3.000 0.083 NA   NA
 5856520 5856521 E2348C_1427 E2348C_1428     TRUE 0.993 -3.000 0.635 NA   NA
 5856521 5856522 E2348C_1428 E2348C_1429     TRUE 0.631 65.000 0.250 NA   NA
 5856522 5856523 E2348C_1429 E2348C_1430     TRUE 0.982 15.000 0.643 NA   NA
 5856523 5856524 E2348C_1430 E2348C_1431     TRUE 0.971 24.000 0.818 NA   NA
 5856524 5856525 E2348C_1431 E2348C_1432     FALSE 0.410 48.000 0.000 NA   NA
 5856525 5856526 E2348C_1432 E2348C_1433     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5856526 5856527 E2348C_1433 E2348C_1434     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856527 5856528 E2348C_1434 E2348C_1435     TRUE 0.912 6.000 0.000 NA   NA
 5856528 5856529 E2348C_1435 E2348C_1436     TRUE 0.594 -102.000 0.000 NA   NA
 5856529 5856530 E2348C_1436 E2348C_1437     FALSE 0.027 241.000 0.000 NA   NA
 5856530 5856531 E2348C_1437 E2348C_1438     FALSE 0.272 68.000 0.000 NA   NA
 5856531 5856532 E2348C_1438 E2348C_1439     FALSE 0.134 152.000 0.000 1.000   NA
 5856532 5856533 E2348C_1439 E2348C_1440     TRUE 0.931 2.000 0.000 NA   NA
 5856533 5856534 E2348C_1440 E2348C_1441     FALSE 0.036 221.000 0.000 NA   NA
 5856535 5856536 E2348C_1442 E2348C_1443     FALSE 0.004 655.000 0.000 NA   NA
 5856537 5856538 E2348C_1444 E2348C_1445     FALSE 0.279 66.000 0.000 NA   NA
 5856539 5856540 E2348C_1446 E2348C_1447     FALSE 0.005 487.000 0.000 NA   NA
 5856540 5856541 E2348C_1447 E2348C_1448     FALSE 0.003 1173.000 0.000 NA   NA
 5856543 5856544 E2348C_1450 E2348C_1451 trpA trpB TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 5856544 5856545 E2348C_1451 E2348C_1452 trpB trpC TRUE 0.995 12.000 0.221 0.001 Y NA
 5856545 5856546 E2348C_1452 E2348C_1453 trpC trpD TRUE 0.996 4.000 0.293 1.000 Y NA
 5856546 5856547 E2348C_1453 E2348C_1454 trpD trpE TRUE 0.994 0.000 0.010 0.001 Y NA
 5856547 5856548 E2348C_1454 E2348C_1455 trpE trpL FALSE 0.176 92.000 0.023 NA   NA
 5856549 5856550 E2348C_1456 E2348C_1457 trpH yciO TRUE 0.982 -3.000 0.281 NA   NA
 5856550 5856551 E2348C_1457 E2348C_1458 yciO yciQ TRUE 0.602 28.000 0.000 NA   NA
 5856551 5856552 E2348C_1458 E2348C_1459 yciQ rluB FALSE 0.041 213.000 0.000 NA   NA
 5856553 5856554 E2348C_1460 E2348C_1461 btuR yciK TRUE 0.904 -3.000 0.050 1.000 N NA
 5856557 5856558 E2348C_1464 E2348C_1465 topA cysB FALSE 0.021 210.000 0.008 1.000 N NA
 5856558 5856559 E2348C_1465 E2348C_1466 cysB ymiA FALSE 0.011 331.000 0.000 NA   NA
 5856559 5856560 E2348C_1466 E2348C_1467 ymiA yciX TRUE 0.993 3.000 0.556 NA   NA
 5856560 5856561 E2348C_1467 E2348C_1468 yciX acnA FALSE 0.008 372.000 0.000 NA   NA
 5856563 5856564 E2348C_1470 E2348C_1471 pgpB yciS FALSE 0.248 149.000 0.143 NA   NA
 5856564 5856565 E2348C_1471 E2348C_1472 yciS yciM TRUE 0.991 7.000 0.576 NA   NA
 5856565 5856566 E2348C_1472 E2348C_1473 yciM pyrF FALSE 0.109 192.000 0.125 1.000 N NA
 5856566 5856567 E2348C_1473 E2348C_1474 pyrF yciH TRUE 0.921 0.000 0.045 1.000 N NA
 5856568 5856569 E2348C_1475 E2348C_1476 osmB yciT FALSE 0.020 269.000 0.000 NA   NA
 5856569 5856570 E2348C_1476 E2348C_1477 yciT yciZ FALSE 0.416 90.000 0.146 NA   NA
 5856570 5856571 E2348C_1477 E2348C_1478 yciZ gmr FALSE 0.180 148.000 0.083 NA   NA
 5856571 5856572 E2348C_1478 E2348C_1479 gmr   FALSE 0.009 330.000 0.000 1.000 N NA
 5856572 5856573 E2348C_1479 E2348C_1480   rnb FALSE 0.057 185.000 0.000 1.000 N NA
 5856573 5856574 E2348C_1480 E2348C_1481 rnb yciW TRUE 0.640 40.000 0.105 NA   NA
 5856574 5856575 E2348C_1481 E2348C_1482 yciW fabI FALSE 0.146 145.000 0.057 NA   NA
 5856576 5856577 E2348C_1483 E2348C_1484     FALSE 0.377 149.000 0.286 1.000 N NA
 5856577 5856578 E2348C_1484 E2348C_1485     TRUE 0.973 0.000 0.167 1.000 N NA
 5856578 5856579 E2348C_1485 E2348C_1486     TRUE 0.992 4.000 0.367 0.050 N NA
 5856579 5856580 E2348C_1486 E2348C_1487     TRUE 0.974 9.000 0.143 0.050 N NA
 5856581 5856582 E2348C_1488 E2348C_1489   sapF FALSE 0.058 203.000 0.000 1.000   NA
 5856582 5856583 E2348C_1489 E2348C_1490 sapF sapD TRUE 0.999 2.000 0.684 0.015 Y NA
 5856583 5856584 E2348C_1490 E2348C_1491 sapD sapC TRUE 0.999 0.000 0.667 1.000 Y NA
 5856584 5856585 E2348C_1491 E2348C_1492 sapC sapB TRUE 0.989 -13.000 0.284 0.050 Y NA
 5856585 5856586 E2348C_1492 E2348C_1493 sapB sapA TRUE 0.987 -3.000 0.264 0.050 N NA
 5856586 5856587 E2348C_1493 E2348C_1494 sapA ymjA FALSE 0.013 313.000 0.000 NA   NA
 5856587 5856588 E2348C_1494 E2348C_1495 ymjA pspF FALSE 0.006 425.000 0.000 NA   NA
 5856589 5856590 E2348C_1496 E2348C_1497 pspA pspB TRUE 0.892 54.000 0.739 NA   NA
 5856590 5856591 E2348C_1497 E2348C_1498 pspB pspC TRUE 0.996 0.000 0.913 NA   NA
 5856591 5856592 E2348C_1498 E2348C_1499 pspC pspD TRUE 0.963 9.000 0.167 NA   NA
 5856592 5856593 E2348C_1499 E2348C_1500 pspD pspE FALSE 0.426 75.000 0.133 NA   NA
 5856593 5856594 E2348C_1500 E2348C_1501 pspE ycjM FALSE 0.032 214.000 0.000 1.000 N NA
 5856594 5856595 E2348C_1501 E2348C_1502 ycjM ycjN TRUE 0.992 14.000 0.360 1.000 Y NA
 5856595 5856596 E2348C_1502 E2348C_1503 ycjN ycjO TRUE 0.994 21.000 0.620 0.050 Y NA
 5856596 5856597 E2348C_1503 E2348C_1504 ycjO ycjP TRUE 0.996 -13.000 0.805 0.050 Y NA
 5856597 5856598 E2348C_1504 E2348C_1505 ycjP ycjQ TRUE 0.802 31.000 0.205 1.000 N NA
 5856598 5856599 E2348C_1505 E2348C_1506 ycjQ ycjR TRUE 0.912 19.000 0.261 NA N NA
 5856599 5856600 E2348C_1506 E2348C_1507 ycjR ycjS TRUE 0.982 10.000 0.347 NA   NA
 5856600 5856601 E2348C_1507 E2348C_1508 ycjS ycjT TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856601 5856602 E2348C_1508 E2348C_1509 ycjT   FALSE 0.094 166.000 0.000 NA   NA
 5856602 5856603 E2348C_1509 E2348C_1510   ycjU FALSE 0.064 197.000 0.000 1.000   NA
 5856603 5856604 E2348C_1510 E2348C_1511 ycjU ycjV TRUE 0.912 14.000 0.103 1.000   NA
 5856604 5856605 E2348C_1511 E2348C_1512 ycjV ompG TRUE 0.850 45.000 0.222 0.050   NA
 5856607 5856608 E2348C_1514 E2348C_1515 ycjX ycjF TRUE 0.994 -3.000 0.791 NA   NA
 5856608 5856609 E2348C_1515 E2348C_1516 ycjF tyrR FALSE 0.247 148.000 0.137 NA   NA
 5856612 5856613 E2348C_1519 E2348C_1520 mpaA ymjC FALSE 0.013 291.000 0.000 1.000 N NA
 5856613 5856614 E2348C_1520 E2348C_1521 ymjC ycjY FALSE 0.296 71.000 0.000 1.000   NA
 5856615 5856616 E2348C_1522 E2348C_1523 ycjZ mppA FALSE 0.009 337.000 0.000 1.000 N NA
 5856619 5856620 E2348C_1526 E2348C_1527 uspE fnr TRUE 0.845 152.000 0.619 1.000 Y NA
 5856620 5856621 E2348C_1527 E2348C_1528 fnr ogt FALSE 0.047 195.000 0.000 1.000 N NA
 5856624 5856625 E2348C_1530 E2348C_1531     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856625 5856626 E2348C_1531 E2348C_1532   ydaL FALSE 0.057 195.000 0.000 NA   NA
 5856628 5856629 E2348C_1534 E2348C_ncR17 ydaN   FALSE 0.011 330.000 0.000 NA   NA
 5856629 5856630 E2348C_ncR17 E2348C_1535   dbpA FALSE 0.250 74.000 0.000 NA   NA
 5856632 5856633 E2348C_1537 E2348C_1538 uspF ompN FALSE 0.112 141.000 0.000 1.000 N NA
 5856637 5856638 E2348C_1541 E2348C_1542 hslJ ldhA FALSE 0.132 111.000 0.000 NA N NA
 5856639 5856640 E2348C_1543 E2348C_1544 ydbH ynbE TRUE 0.935 -3.000 0.068 NA   NA
 5856640 5856641 E2348C_1544 E2348C_1545 ynbE ydbL TRUE 0.993 8.000 0.726 NA   NA
 5856643 5856644 E2348C_1547 E2348C_1548 paaY ydbC FALSE 0.051 201.000 0.000 NA   NA
 5856645 5856646 E2348C_1549 E2348C_1550   azoR FALSE 0.072 192.000 0.000 1.000   NA
 5856647 5856648 E2348C_1551 E2348C_1552 hrpA ydcF FALSE 0.019 274.000 0.000 NA   NA
 5856648 5856649 E2348C_1552 E2348C_1553 ydcF aldA FALSE 0.050 197.000 0.040 NA   NA
 5856654 5856655 E2348C_1557 E2348C_1558     TRUE 0.774 17.000 0.000 NA   NA
 5856655 5856656 E2348C_1558 E2348C_1559     FALSE 0.018 281.000 0.000 NA   NA
 5856656 5856657 E2348C_1559 E2348C_1560     TRUE 0.618 27.000 0.000 NA   NA
 5856657 5856658 E2348C_1560 E2348C_1561     FALSE 0.010 348.000 0.000 NA   NA
 5856658 5856659 E2348C_1561 E2348C_1562     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856659 5856660 E2348C_1562 E2348C_1563     FALSE 0.094 166.000 0.000 NA   NA
 5856660 5856661 E2348C_1563 E2348C_1564     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856664 5856665 E2348C_1567 E2348C_1568 ydcJ mdoD FALSE 0.034 225.000 0.000 NA   NA
 5856665 5856666 E2348C_1568 E2348C_1569 mdoD ydcH FALSE 0.109 140.000 0.026 NA   NA
 5856666 5856667 E2348C_1569 E2348C_1570 ydcH rimL FALSE 0.245 63.000 0.026 NA   NA
 5856669 5856670 E2348C_1572 E2348C_1573 tehA tehB TRUE 0.974 -3.000 0.175 1.000   NA
 5856670 5856671 E2348C_1573 E2348C_1574 tehB ydcL FALSE 0.023 303.000 0.088 NA   NA
 5856673 5856674 E2348C_1576 E2348C_1577 ydcN ydcP FALSE 0.216 73.000 0.000 1.000 N NA
 5856676 5856677 E2348C_1579 E2348C_1580 ydcR ydcS FALSE 0.146 245.000 0.000 1.000 Y NA
 5856677 5856678 E2348C_1580 E2348C_1581 ydcS ydcT TRUE 0.995 18.000 0.609 0.050 Y NA
 5856678 5856679 E2348C_1581 E2348C_1582 ydcT ydcU TRUE 0.999 1.000 0.643 0.050 Y NA
 5856679 5856680 E2348C_1582 E2348C_1583 ydcU ydcV TRUE 0.997 -10.000 0.821 0.050 Y NA
 5856680 5856681 E2348C_1583 E2348C_1584 ydcV ydcW TRUE 0.882 22.000 0.216 1.000 N NA
 5856683 5856684 E2348C_1586 E2348C_1587 ydcX ydcY FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5856685 5856686 E2348C_1588 E2348C_1589 ydcZ yncA TRUE 0.937 -3.000 0.070 NA   NA
 5856691 5856692 E2348C_1594 E2348C_1595     TRUE 0.831 14.000 0.000 NA   NA
 5856692 5856693 E2348C_1595 E2348C_1596     FALSE 0.035 222.000 0.000 NA   NA
 5856693 5856694 E2348C_1596 E2348C_1597     FALSE 0.214 95.000 0.000 NA   NA
 5856694 5856695 E2348C_1597 E2348C_1598   pptA FALSE 0.003 1451.000 0.000 NA   NA
 5856698 5856699 E2348C_1601 E2348C_1602 yddE narV FALSE 0.270 80.000 0.000 1.000   NA
 5856699 5856700 E2348C_1602 E2348C_1603 narV narW TRUE 0.999 -3.000 0.714 0.003 Y NA
 5856700 5856701 E2348C_1603 E2348C_1604 narW narY TRUE 0.999 0.000 0.714 0.003 Y NA
 5856701 5856702 E2348C_1604 E2348C_1605 narY narZ TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 5856702 5856703 E2348C_1605 E2348C_1606 narZ narU TRUE 0.720 95.000 0.556 1.000 N NA
 5856703 5856704 E2348C_1606 E2348C_1607 narU yddG FALSE 0.022 279.000 0.000 1.000   NA
 5856705 5856706 E2348C_1608 E2348C_1609 fdnG fdnH TRUE 0.997 13.000 0.429 0.002 Y NA
 5856706 5856707 E2348C_1609 E2348C_1610 fdnH fdnI TRUE 0.995 -7.000 0.333 0.002 Y NA
 5856708 5856709 E2348C_1611 E2348C_1612 yddM adhP FALSE 0.007 464.000 0.000 1.000   NA
 5856709 5856710 E2348C_1612 E2348C_1613 adhP maeA FALSE 0.172 134.000 0.000 1.000   NA
 5856710 5856711 E2348C_1613 E2348C_1614 maeA sra TRUE 0.669 156.000 0.750 1.000   NA
 5856711 5856712 E2348C_1614 E2348C_1615 sra bdm TRUE 0.731 102.000 0.571 NA   NA
 5856714 5856715 E2348C_1617 E2348C_1618 dos yddW FALSE 0.006 567.000 0.000 1.000   NA
 5856715 5856716 E2348C_1618 E2348C_1619 yddW gadC FALSE 0.178 131.000 0.000 1.000   NA
 5856716 5856717 E2348C_1619 E2348C_1620 gadC gadB TRUE 0.524 156.000 0.103 1.000 Y NA
 5856717 5856718 E2348C_1620 E2348C_1621 gadB pqqL FALSE 0.011 362.000 0.000 1.000   NA
 5856718 5856719 E2348C_1621 E2348C_1622 pqqL yddB TRUE 0.609 57.000 0.167 1.000   NA
 5856719 5856720 E2348C_1622 E2348C_1623 yddB yddA TRUE 0.714 38.000 0.000 0.063   NA
 5856720 5856721 E2348C_1623 E2348C_1624 yddA ydeM FALSE 0.019 291.000 0.000 1.000   NA
 5856721 5856722 E2348C_1624 E2348C_1625 ydeM ydeN TRUE 0.921 52.000 0.600 0.053   NA
 5856722 5856723 E2348C_1625 E2348C_1626 ydeN ydeO FALSE 0.006 402.000 0.000 1.000 N NA
 5856723 5856724 E2348C_1626 E2348C_1627 ydeO   FALSE 0.247 75.000 0.000 NA   NA
 5856724 5856725 E2348C_1627 E2348C_1628   ydeP FALSE 0.026 248.000 0.000 NA   NA
 5856725 5856726 E2348C_1628 E2348C_1629 ydeP ydeQ FALSE 0.012 339.000 0.000 1.000   NA
 5856726 5856727 E2348C_1629 E2348C_1630 ydeQ ydeR TRUE 0.590 59.000 0.000 0.007   NA
 5856727 5856728 E2348C_1630 E2348C_1631 ydeR ydeS TRUE 0.986 13.000 0.000 0.007 Y NA
 5856728 5856729 E2348C_1631 E2348C_1632 ydeS   TRUE 0.969 14.000 0.000 1.000 Y NA
 5856729 5856730 E2348C_1632 E2348C_1633     TRUE 0.848 42.000 0.000 1.000 Y NA
 5856730 5856731 E2348C_1633 E2348C_1634     FALSE 0.054 362.000 0.000 1.000 Y NA
 5856732 5856733 E2348C_1635 E2348C_1636     FALSE 0.005 478.000 0.000 NA   NA
 5856733 5856734 E2348C_1636 E2348C_ncR20     FALSE 0.004 866.000 0.000 NA   NA
 5856734 5856735 E2348C_ncR20 E2348C_1637     FALSE 0.275 67.000 0.000 NA   NA
 5856736 5856737 E2348C_1638 E2348C_1639 hipA hipB TRUE 0.995 0.000 0.675 NA   NA
 5856739 5856740 E2348C_1641 E2348C_1642 yneE uxaB FALSE 0.120 197.000 0.143 NA   NA
 5856740 5856741 E2348C_1642 E2348C_1643 uxaB yneF FALSE 0.026 227.000 0.000 1.000 N NA
 5856741 5856742 E2348C_1643 E2348C_1644 yneF yneG FALSE 0.224 139.000 0.098 NA   NA
 5856742 5856743 E2348C_1644 E2348C_1645 yneG yneH TRUE 0.929 0.000 0.037 NA   NA
 5856743 5856744 E2348C_1645 E2348C_1646 yneH yneI FALSE 0.250 64.000 0.000 1.000 N NA
 5856745 5856746 E2348C_1647 E2348C_1648 yneJ ydeA FALSE 0.005 339.000 0.027 NA N NA
 5856748 5856749 E2348C_1650 E2348C_1651 marR marA TRUE 0.995 21.000 0.667 0.042 Y NA
 5856749 5856750 E2348C_1651 E2348C_1652 marA marB TRUE 0.558 32.000 0.000 NA   NA
 5856752 5856753 E2348C_1654 E2348C_1655 ydeE yneM FALSE 0.218 127.000 0.077 NA   NA
 5856754 5856755 E2348C_1656 E2348C_1657 ydeH ydeI FALSE 0.024 254.000 0.000 NA   NA
 5856755 5856756 E2348C_1657 E2348C_1658 ydeI dcp FALSE 0.096 165.000 0.000 NA   NA
 5856757 5856758 E2348C_1659 E2348C_1660 ydfG ydfH FALSE 0.259 89.000 0.000 1.000   NA
 5856758 5856759 E2348C_1660 E2348C_1661 ydfH ydfZ FALSE 0.080 177.000 0.000 NA   NA
 5856760 5856761 E2348C_1662 E2348C_1663 ydfI ydfJ FALSE 0.191 89.000 0.000 1.000 N NA
 5856761 5856762 E2348C_1663 E2348C_1664 ydfJ rspB FALSE 0.281 58.000 0.000 1.000 N NA
 5856762 5856763 E2348C_1664 E2348C_1665 rspB rspA TRUE 0.847 12.000 0.049 1.000 N NA
 5856763 5856764 E2348C_1665 E2348C_1666 rspA ynfA FALSE 0.041 206.000 0.020 1.000   NA
 5856765 5856766 E2348C_1667 E2348C_1668 ynfB speG TRUE 0.556 35.000 0.055 NA   NA
 5856768 5856769 E2348C_1670 E2348C_1671 ynfD ynfE FALSE 0.226 199.000 0.304 NA   NA
 5856769 5856770 E2348C_1671 E2348C_1672 ynfE ynfF TRUE 0.908 88.000 0.231 0.001 Y NA
 5856770 5856771 E2348C_1672 E2348C_1673 ynfF ynfG TRUE 0.998 11.000 0.667 0.044 Y NA
 5856771 5856772 E2348C_1673 E2348C_1674 ynfG ynfH TRUE 0.989 2.000 0.333 1.000   NA
 5856772 5856773 E2348C_1674 E2348C_1675 ynfH dmsD TRUE 0.670 43.000 0.125 1.000   NA
 5856773 5856774 E2348C_1675 E2348C_1676 dmsD clcB FALSE 0.090 196.000 0.079 1.000   NA
 5856775 5856776 E2348C_1677 E2348C_1678 ynfK dgsA TRUE 0.577 125.000 0.455 NA N NA
 5856776 5856777 E2348C_1678 E2348C_1679 dgsA ynfL TRUE 0.811 135.000 0.408 NA Y NA
 5856778 5856779 E2348C_1680 E2348C_1681 ynfM asr FALSE 0.006 425.000 0.000 NA   NA
 5856779 5856780 E2348C_1681 E2348C_1682 asr ydgU FALSE 0.218 93.000 0.000 NA   NA
 5856780 5856781 E2348C_1682 E2348C_1683 ydgU ydgD FALSE 0.204 100.000 0.000 NA   NA
 5856782 5856783 E2348C_1684 E2348C_1685 mdtI mdtJ TRUE 0.996 -13.000 0.869 0.076 Y NA
 5856785 5856786 E2348C_1687 E2348C_1688 pntB pntA TRUE 0.999 11.000 0.745 0.001 Y NA
 5856787 5856788 E2348C_1689 E2348C_1690 ydgH ydgI FALSE 0.148 186.000 0.143 NA   NA
 5856788 5856789 E2348C_1690 E2348C_1691 ydgI folM TRUE 0.683 37.000 0.140 1.000 N NA
 5856791 5856792 E2348C_1693 E2348C_1694 rstA rstB TRUE 0.994 4.000 0.181 1.000 Y NA
 5856792 5856793 E2348C_1694 E2348C_1695 rstB tus TRUE 0.548 76.000 0.200 1.000   NA
 5856794 5856795 E2348C_1696 E2348C_1697 fumC fumA TRUE 0.681 143.000 0.000 0.001 Y NA
 5856796 5856797 E2348C_1698 E2348C_1699 manA ydgA TRUE 0.800 101.000 0.778 NA   NA
 5856798 5856799 E2348C_1700 E2348C_1701 uidC uidB TRUE 0.496 39.000 0.000 NA   NA
 5856799 5856800 E2348C_1701 E2348C_1702 uidB uidA TRUE 0.995 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 5856800 5856801 E2348C_1702 E2348C_1703 uidA uidR FALSE 0.006 390.000 0.000 1.000 N NA
 5856801 5856802 E2348C_1703 E2348C_1704 uidR hdhA FALSE 0.025 229.000 0.000 1.000 N NA
 5856802 5856803 E2348C_1704 E2348C_1705 hdhA malI FALSE 0.159 112.000 0.000 1.000 N NA
 5856804 5856805 E2348C_1706 E2348C_1707 malX malY TRUE 0.987 10.000 0.531 1.000 N NA
 5856805 5856806 E2348C_1707 E2348C_1708 malY add FALSE 0.327 104.000 0.132 1.000 N NA
 5856807 5856808 E2348C_1709 E2348C_1710   ydgJ FALSE 0.092 178.000 0.000 1.000   NA
 5856809 5856810 E2348C_1711 E2348C_1712 blr cnu FALSE 0.020 273.000 0.000 NA   NA
 5856810 5856811 E2348C_1712 E2348C_1713 cnu ydgK FALSE 0.382 86.000 0.120 NA   NA
 5856811 5856812 E2348C_1713 E2348C_1714 ydgK rsxA FALSE 0.444 77.000 0.148 NA   NA
 5856812 5856813 E2348C_1714 E2348C_1715 rsxA rsxB TRUE 0.999 0.000 0.564 0.044 Y NA
 5856813 5856814 E2348C_1715 E2348C_1716 rsxB rsxC TRUE 0.997 -7.000 0.537 0.044 Y NA
 5856814 5856815 E2348C_1716 E2348C_1717 rsxC rsxD TRUE 0.999 1.000 0.814 0.044 Y NA
 5856815 5856816 E2348C_1717 E2348C_1718 rsxD rsxG TRUE 0.999 4.000 0.924 0.044 Y NA
 5856816 5856817 E2348C_1718 E2348C_1719 rsxG rsxE TRUE 0.999 4.000 0.908 0.044 Y NA
 5856817 5856818 E2348C_1719 E2348C_1720 rsxE nth TRUE 0.960 0.000 0.109 1.000 N NA
 5856818 5856819 E2348C_1720 E2348C_1721 nth tppB FALSE 0.003 611.000 0.000 1.000 N NA
 5856819 5856820 E2348C_1721 E2348C_1722 tppB gst TRUE 0.577 106.000 0.344 1.000 N NA
 5856821 5856822 E2348C_1723 E2348C_1724 pdxY tyrS FALSE 0.246 62.000 0.041 1.000 N NA
 5856822 5856823 E2348C_1724 E2348C_1725 tyrS pdxH FALSE 0.144 129.000 0.054 1.000 N NA
 5856823 5856824 E2348C_1725 E2348C_1726 pdxH ydhA FALSE 0.283 59.000 0.034 NA   NA
 5856824 5856825 E2348C_1726 E2348C_1727 ydhA anmK FALSE 0.176 104.000 0.034 NA   NA
 5856828 5856829 E2348C_1730 E2348C_1731 ydhI ydhJ TRUE 0.990 3.000 0.412 NA   NA
 5856829 5856830 E2348C_1731 E2348C_1732 ydhJ ydhK TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856831 5856832 E2348C_1733 E2348C_1734 sodC ydhF FALSE 0.239 81.000 0.033 1.000   NA
 5856832 5856833 E2348C_1734 E2348C_1735 ydhF ydhL FALSE 0.398 49.000 0.045 NA   NA
 5856834 5856835 E2348C_1736 E2348C_1737 ydhM nemA TRUE 0.861 37.000 0.362 1.000 N NA
 5856835 5856836 E2348C_1737 E2348C_1738 nemA gloA FALSE 0.225 81.000 0.057 1.000 N NA
 5856836 5856837 E2348C_1738 E2348C_1739 gloA rnt FALSE 0.334 103.000 0.136 1.000 N NA
 5856839 5856840 E2348C_1741 E2348C_1742 ydhO sodB FALSE 0.091 128.000 0.015 1.000 N NA
 5856841 5856842 E2348C_1743 E2348C_1744 ydhP ynhF FALSE 0.094 166.000 0.000 NA   NA
 5856845 5856846 E2348C_1747 E2348C_1748 ydhC cfa FALSE 0.014 285.000 0.000 1.000 N NA
 5856850 5856851 E2348C_tRNA31 E2348C_tRNA32 valV valW TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5856851 5856852 E2348C_tRNA32 E2348C_1752 valW ydhR FALSE 0.189 112.000 0.000 NA   NA
 5856852 5856853 E2348C_1752 E2348C_1753 ydhR ydhS FALSE 0.165 126.000 0.000 NA   NA
 5856854 5856855 E2348C_1754 E2348C_1755 ydhT ydhU TRUE 0.690 52.000 0.222 NA   NA
 5856855 5856856 E2348C_1755 E2348C_1756 ydhU ydhX TRUE 0.997 -3.000 0.444 NA Y NA
 5856856 5856857 E2348C_1756 E2348C_1757 ydhX ydhW TRUE 0.958 13.000 0.235 NA   NA
 5856857 5856858 E2348C_1757 E2348C_1758 ydhW ydhV TRUE 0.979 13.000 0.458 NA   NA
 5856858 5856859 E2348C_1758 E2348C_1759 ydhV ydhY TRUE 0.994 21.000 0.600 0.013 Y NA
 5856859 5856860 E2348C_1759 E2348C_1760 ydhY ydhZ FALSE 0.006 456.000 0.000 NA   NA
 5856861 5856862 E2348C_1761 E2348C_1762 pykF lpp FALSE 0.011 311.000 0.000 1.000 N NA
 5856863 5856864 E2348C_1763 E2348C_1764 ynhG sufE FALSE 0.153 149.000 0.069 NA   NA
 5856864 5856865 E2348C_1764 E2348C_1765 sufE sufS TRUE 0.946 13.000 0.183 NA   NA
 5856865 5856866 E2348C_1765 E2348C_1766 sufS sufD TRUE 0.970 -3.000 0.193 1.000 N NA
 5856866 5856867 E2348C_1766 E2348C_1767 sufD sufC TRUE 0.984 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 5856867 5856868 E2348C_1767 E2348C_1768 sufC sufB TRUE 0.996 10.000 0.466 1.000 Y NA
 5856868 5856869 E2348C_1768 E2348C_1769 sufB sufA TRUE 0.898 9.000 0.041 NA   NA
 5856869 5856870 E2348C_1769 E2348C_ncR21 sufA rydB FALSE 0.012 326.000 0.000 NA   NA
 5856870 5856871 E2348C_ncR21 E2348C_1770 rydB ydiH FALSE 0.110 155.000 0.000 NA   NA
 5856871 5856872 E2348C_1770 E2348C_1771 ydiH ydiI FALSE 0.176 100.000 0.032 NA   NA
 5856872 5856873 E2348C_1771 E2348C_1772 ydiI ydiJ TRUE 0.949 -3.000 0.129 NA N NA
 5856874 5856875 E2348C_1773 E2348C_ncR22 ydiK rprA FALSE 0.068 186.000 0.000 NA   NA
 5856875 5856876 E2348C_ncR22 E2348C_1774 rprA ydiL FALSE 0.141 138.000 0.000 NA   NA
 5856876 5856877 E2348C_1774 E2348C_1775 ydiL ydiM FALSE 0.339 100.000 0.095 1.000   NA
 5856877 5856878 E2348C_1775 E2348C_1776 ydiM ydiN FALSE 0.032 227.000 0.000 NA   NA
 5856878 5856879 E2348C_1776 E2348C_1777 ydiN ydiB TRUE 0.878 12.000 0.082 NA N NA
 5856879 5856880 E2348C_1777 E2348C_1778 ydiB aroD TRUE 0.927 31.000 0.113 1.000 Y NA
 5856880 5856881 E2348C_1778 E2348C_1779 aroD ydiF FALSE 0.075 145.000 0.019 1.000 N NA
 5856881 5856882 E2348C_1779 E2348C_1780 ydiF ydiO TRUE 0.994 14.000 0.500 1.000 Y NA
 5856884 5856885 E2348C_1782 E2348C_1783 ydiQ ydiR TRUE 0.997 20.000 1.000 0.011 Y NA
 5856885 5856886 E2348C_1783 E2348C_1784 ydiR ydiS TRUE 0.983 55.000 1.000 0.044 Y NA
 5856886 5856887 E2348C_1784 E2348C_1785 ydiS ydiT TRUE 0.998 -3.000 0.400 0.044 Y NA
 5856887 5856888 E2348C_1785 E2348C_1786 ydiT fadK FALSE 0.384 57.000 0.080 1.000 N NA
 5856890 5856891 E2348C_1788 E2348C_1789 ydiA aroH FALSE 0.268 157.000 0.165 1.000   NA
 5856891 5856892 E2348C_1789 E2348C_1790 aroH ydiE FALSE 0.115 132.000 0.054 NA N NA
 5856893 5856894 E2348C_1791 E2348C_1792 ydiU ydiV FALSE 0.257 63.000 0.031 NA   NA
 5856894 5856895 E2348C_1792 E2348C_1793 ydiV nlpC FALSE 0.017 247.000 0.000 NA N NA
 5856895 5856896 E2348C_1793 E2348C_1794 nlpC btuD FALSE 0.169 78.000 0.000 NA N NA
 5856896 5856897 E2348C_1794 E2348C_1795 btuD btuE TRUE 0.922 0.000 0.000 1.000 N NA
 5856897 5856898 E2348C_1795 E2348C_1796 btuE btuC FALSE 0.366 62.000 0.084 1.000 N NA
 5856899 5856900 E2348C_1797 E2348C_1798     FALSE 0.435 50.000 0.000 1.000   NA
 5856901 5856902 E2348C_1799 E2348C_1800     TRUE 0.812 15.000 0.000 NA   NA
 5856902 5856903 E2348C_1800 E2348C_1801     TRUE 0.885 11.000 0.000 NA   NA
 5856903 5856904 E2348C_1801 E2348C_1802     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856904 5856905 E2348C_1802 E2348C_1803     FALSE 0.054 197.000 0.000 NA   NA
 5856905 5856906 E2348C_1803 E2348C_1804     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856906 5856907 E2348C_1804 E2348C_1805     FALSE 0.133 142.000 0.000 NA   NA
 5856907 5856908 E2348C_1805 E2348C_1806     FALSE 0.130 145.000 0.000 NA   NA
 5856908 5856909 E2348C_1806 E2348C_1807     TRUE 0.811 77.000 0.667 NA   NA
 5856909 5856910 E2348C_1807 E2348C_1808     TRUE 0.916 5.000 0.000 NA   NA
 5856910 5856911 E2348C_1808 E2348C_1809     FALSE 0.008 379.000 0.000 NA   NA
 5856911 5856912 E2348C_1809 E2348C_1810     TRUE 0.993 -3.000 0.600 1.000   NA
 5856913 5856914 E2348C_1811 E2348C_1812     TRUE 0.970 0.000 0.130 NA   NA
 5856915 5856916 E2348C_1813 E2348C_1814     TRUE 0.706 24.000 0.000 1.000   NA
 5856916 5856917 E2348C_1814 E2348C_1815     TRUE 0.474 46.000 0.000 1.000   NA
 5856917 5856918 E2348C_1815 E2348C_1816     TRUE 0.878 102.000 0.667 0.002   NA
 5856918 5856919 E2348C_1816 E2348C_1817     TRUE 0.988 0.000 0.333 NA   NA
 5856919 5856920 E2348C_1817 E2348C_1818     TRUE 0.928 3.000 0.000 NA   NA
 5856920 5856921 E2348C_1818 E2348C_1819     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856921 5856922 E2348C_1819 E2348C_1820     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 5856922 5856923 E2348C_1820 E2348C_1821     TRUE 0.688 138.000 0.667 NA   NA
 5856923 5856924 E2348C_1821 E2348C_1822     TRUE 0.719 -16.000 0.000 NA   NA
 5856924 5856925 E2348C_1822 E2348C_1823     TRUE 0.869 12.000 0.000 NA   NA
 5856925 5856926 E2348C_1823 E2348C_1824     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856926 5856927 E2348C_1824 E2348C_1825     TRUE 0.994 4.000 0.667 NA   NA
 5856927 5856928 E2348C_1825 E2348C_1826     TRUE 0.836 -7.000 0.000 NA   NA
 5856928 5856929 E2348C_1826 E2348C_1827     TRUE 0.917 -3.000 0.000 NA   NA
 5856929 5856930 E2348C_1827 E2348C_1828     TRUE 0.885 11.000 0.000 NA   NA
 5856931 5856932 E2348C_1829 E2348C_1830     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856934 5856935 E2348C_1832 E2348C_1833     TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5856935 5856936 E2348C_1833 E2348C_1834     TRUE 0.754 -13.000 0.000 NA   NA
 5856936 5856937 E2348C_1834 E2348C_1835     TRUE 0.602 -72.000 0.000 NA   NA
 5856937 5856938 E2348C_1835 E2348C_1836     FALSE 0.337 56.000 0.000 NA   NA
 5856938 5856939 E2348C_1836 E2348C_1837     TRUE 0.936 0.000 0.000 NA   NA
 5856940 5856941 E2348C_1838 E2348C_1839     FALSE 0.057 195.000 0.000 NA   NA
 5856941 5856942 E2348C_1839 E2348C_1840     FALSE 0.118 150.000 0.000 NA   NA
 5856943 5856944 E2348C_1841 E2348C_1842 ihfA pheT TRUE 0.971 5.000 0.208 1.000 N NA
 5856944 5856945 E2348C_1842 E2348C_1843 pheT pheS TRUE 0.997 15.000 0.574 0.001 Y NA
 5856945 5856946 E2348C_1843 E2348C_1844 pheS pheM FALSE 0.018 284.000 0.000 NA   NA
 5856946 5856947 E2348C_1844 E2348C_1845 pheM rplT FALSE 0.171 123.000 0.000 NA   NA
 5856947 5856948 E2348C_1845 E2348C_1846 rplT rpmI TRUE 0.984 53.000 0.928 0.011 Y NA
 5856948 5856949 E2348C_1846 E2348C_1847 rpmI infC TRUE 0.923 97.000 0.652 1.000 Y NA
 5856949 5856950 E2348C_1847 E2348C_1848 infC thrS TRUE 0.994 4.000 0.186 1.000 Y NA
 5856951 5856952 E2348C_1849 E2348C_1850   yniD FALSE 0.083 174.000 0.000 NA   NA
 5856954 5856955 E2348C_1852 E2348C_1853 pfkB ydiZ FALSE 0.203 101.000 0.000 NA   NA
 5856955 5856956 E2348C_1853 E2348C_1854 ydiZ yniA FALSE 0.197 106.000 0.000 NA   NA
 5856958 5856959 E2348C_1856 E2348C_1857 yniC ydjM FALSE 0.127 163.000 0.068 NA   NA
 5856959 5856960 E2348C_1857 E2348C_1858 ydjM ydjN FALSE 0.244 133.000 0.102 NA   NA
 5856963 5856964 E2348C_1861 E2348C_1862 chbG chbF TRUE 0.988 13.000 0.429 0.018   NA
 5856964 5856965 E2348C_1862 E2348C_1863 chbF chbR TRUE 0.733 104.000 0.625 1.000 N NA
 5856965 5856966 E2348C_1863 E2348C_1864 chbR chbA TRUE 0.992 8.000 0.727 1.000 N NA
 5856966 5856967 E2348C_1864 E2348C_1865 chbA chbC TRUE 0.985 51.000 0.833 0.009 Y NA
 5856967 5856968 E2348C_1865 E2348C_1866 chbC chbB TRUE 0.945 85.000 0.500 0.009 Y NA
 5856968 5856969 E2348C_1866 E2348C_1867 chbB osmE FALSE 0.017 300.000 0.000 1.000   NA
 5856970 5856971 E2348C_1868 E2348C_1869 nadE cho FALSE 0.015 230.000 0.010 1.000 N NA
 5856972 5856973 E2348C_1870 E2348C_1871 vse spy FALSE 0.040 203.000 0.028 NA   NA
 5856973 5856974 E2348C_1871 E2348C_1872 spy astE FALSE 0.007 330.000 0.000 NA N NA
 5856974 5856975 E2348C_1872 E2348C_1873 astE astB TRUE 0.981 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 5856975 5856976 E2348C_1873 E2348C_1874 astB astD TRUE 0.981 -3.000 0.306 1.000 N NA
 5856976 5856977 E2348C_1874 E2348C_1875 astD astA TRUE 0.968 -3.000 0.179 1.000 N NA
 5856977 5856978 E2348C_1875 E2348C_1876 astA astC TRUE 0.998 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 5856979 5856980 E2348C_1877 E2348C_1878 xthA ydjX FALSE 0.066 167.000 0.016 NA   NA
 5856980 5856981 E2348C_1878 E2348C_1879 ydjX ydjY TRUE 0.944 5.000 0.083 NA   NA
 5856981 5856982 E2348C_1879 E2348C_1880 ydjY ydjZ TRUE 0.910 17.000 0.174 NA   NA
 5856982 5856983 E2348C_1880 E2348C_1881 ydjZ ynjA TRUE 0.959 0.000 0.087 NA   NA
 5856983 5856984 E2348C_1881 E2348C_1882 ynjA ynjB TRUE 0.878 10.000 0.032 NA   NA
 5856984 5856985 E2348C_1882 E2348C_1883 ynjB ynjC TRUE 0.976 -27.000 0.627 0.048   NA
 5856985 5856986 E2348C_1883 E2348C_1884 ynjC ynjD TRUE 0.995 0.000 0.602 1.000   NA
 5856986 5856987 E2348C_1884 E2348C_1885 ynjD ynjE TRUE 0.458 67.000 0.111 1.000   NA
 5856992 5856993 E2348C_1890 E2348C_1891 topB selD TRUE 0.891 5.000 0.041 1.000 N NA
 5856993 5856994 E2348C_1891 E2348C_1892 selD ydjA FALSE 0.129 117.000 0.033 1.000 N NA
 5856995 5856996 E2348C_1893 E2348C_1894 sppA ansA FALSE 0.153 165.000 0.113 1.000 N NA
 5856996 5856997 E2348C_1894 E2348C_1895 ansA pncA TRUE 0.849 11.000 0.040 1.000 N NA
 5856998 5856999 E2348C_1896 E2348C_1897 ydjE ydjF TRUE 0.691 118.000 0.125 1.000 Y NA
 5856999 5857000 E2348C_1897 E2348C_1898 ydjF ydjG FALSE 0.409 137.000 0.269 1.000 N NA
 5857000 5857001 E2348C_1898 E2348C_1899 ydjG ydjH TRUE 0.973 10.000 0.269 1.000 N NA
 5857001 5857002 E2348C_1899 E2348C_1900 ydjH ydjI TRUE 0.996 5.000 0.368 1.000 Y NA
 5857002 5857003 E2348C_1900 E2348C_1901 ydjI ydjJ TRUE 0.933 21.000 0.194 0.015 N NA
 5857003 5857004 E2348C_1901 E2348C_1902 ydjJ ydjK TRUE 0.894 17.000 0.167 1.000 N NA
 5857004 5857005 E2348C_1902 E2348C_1903 ydjK ydjL TRUE 0.861 27.000 0.250 1.000 N NA
 5857005 5857006 E2348C_1903 E2348C_1904 ydjL yeaC FALSE 0.008 370.000 0.000 NA   NA
 5857006 5857007 E2348C_1904 E2348C_1905 yeaC msrB TRUE 0.760 42.000 0.216 NA   NA
 5857008 5857009 E2348C_1906 E2348C_1907 gapA yeaD TRUE 0.779 84.000 0.154 1.000 Y NA
 5857010 5857011 E2348C_1908 E2348C_1909 yeaE mipA FALSE 0.273 90.000 0.067 NA   NA
 5857012 5857013 E2348C_1910 E2348C_1911 yeaG yeaH TRUE 0.766 113.000 0.683 NA   NA
 5857013 5857014 E2348C_1911 E2348C_1912 yeaH yeaI FALSE 0.019 279.000 0.000 NA   NA
 5857014 5857015 E2348C_1912 E2348C_1913 yeaI yeaJ TRUE 0.508 181.000 0.000 0.003 Y NA
 5857015 5857016 E2348C_1913 E2348C_1914 yeaJ yeaK TRUE 0.564 43.000 0.083 NA   NA
 5857020 5857021 E2348C_1918 E2348C_1919 yeaN yeaO FALSE 0.252 55.000 0.007 NA   NA
 5857024 5857025 E2348C_1922 E2348C_1923 yeaQ yoaG FALSE 0.124 148.000 0.000 NA   NA
 5857025 5857026 E2348C_1923 E2348C_1924 yoaG yeaR TRUE 0.922 4.000 0.000 NA   NA
 5857026 5857027 E2348C_1924 E2348C_1925 yeaR leuE FALSE 0.057 172.000 0.000 NA N NA
 5857027 5857028 E2348C_1925 E2348C_1926 leuE yeaT FALSE 0.162 127.000 0.000 NA   NA
 5857028 5857029 E2348C_1926 E2348C_1927 yeaT rnd FALSE 0.025 249.000 0.000 NA   NA
 5857029 5857030 E2348C_1927 E2348C_ncR23 rnd sroD TRUE 0.635 26.000 0.000 NA   NA
 5857030 5857031 E2348C_ncR23 E2348C_1928 sroD fadD TRUE 0.619 -41.000 0.000 NA   NA
 5857031 5857032 E2348C_1928 E2348C_1929 fadD yeaY FALSE 0.111 205.000 0.169 1.000 N NA
 5857032 5857033 E2348C_1929 E2348C_1930 yeaY yeaZ FALSE 0.355 40.000 0.024 1.000 N NA
 5857033 5857034 E2348C_1930 E2348C_1931 yeaZ yoaA FALSE 0.385 58.000 0.082 1.000 N NA
 5857035 5857036 E2348C_1932 E2348C_1933 yoaB yoaC FALSE 0.006 422.000 0.000 NA   NA
 5857038 5857039 E2348C_1935 E2348C_1936 pabB nudL TRUE 0.964 4.000 0.116 1.000   NA
 5857039 5857040 E2348C_1936 E2348C_1937 nudL sdaA FALSE 0.384 184.000 0.409 1.000   NA
 5857040 5857041 E2348C_1937 E2348C_1938 sdaA yoaD TRUE 0.511 131.000 0.389 NA N NA
 5857042 5857043 E2348C_1939 E2348C_1940 yoaE   TRUE 0.742 -12.000 0.034 NA   NA
 5857044 5857045 E2348C_1941 E2348C_1942 manX manY TRUE 0.826 63.000 0.000 0.015 Y NA
 5857045 5857046 E2348C_1942 E2348C_1943 manY manZ TRUE 0.999 4.000 0.939 0.015 Y NA
 5857046 5857047 E2348C_1943 E2348C_1944 manZ yobD TRUE 0.890 55.000 0.755 NA   NA
 5857047 5857048 E2348C_1944 E2348C_ncR24 yobD   FALSE 0.053 198.000 0.000 NA   NA
 5857048 5857049 E2348C_ncR24 E2348C_1945   yebN FALSE 0.194 109.000 0.000 NA   NA
 5857050 5857051 E2348C_1946 E2348C_1947 rrmA cspC FALSE 0.101 166.000 0.038 1.000   NA
 5857051 5857052 E2348C_1947 E2348C_1948 cspC yobF TRUE 0.953 13.000 0.214 NA   NA
 5857052 5857053 E2348C_1948 E2348C_1949 yobF yebO FALSE 0.004 671.000 0.000 NA   NA
 5857053 5857054 E2348C_1949 E2348C_1950 yebO mgrB TRUE 0.749 75.000 0.500 NA   NA
 5857058 5857059 E2348C_1954 E2348C_1955 htpX prc FALSE 0.119 192.000 0.042 0.018 N NA
 5857059 5857060 E2348C_1955 E2348C_1956 prc proQ TRUE 0.919 20.000 0.304 NA N NA
 5857060 5857061 E2348C_1956 E2348C_1957 proQ yebR TRUE 0.660 97.000 0.081 NA Y NA
 5857062 5857063 E2348C_1958 E2348C_1959 yebS yebT TRUE 0.968 -31.000 0.840 NA   NA
 5857063 5857064 E2348C_1959 E2348C_1960 yebT rsmF TRUE 0.701 80.000 0.420 NA   NA
 5857064 5857065 E2348C_1960 E2348C_1961 rsmF yebV FALSE 0.314 118.000 0.121 NA   NA
 5857065 5857066 E2348C_1961 E2348C_1962 yebV yebW TRUE 0.941 21.000 0.353 NA   NA
 5857069 5857070 E2348C_ncR26 E2348C_1964 ryeB yebY FALSE 0.237 80.000 0.000 NA   NA
 5857070 5857071 E2348C_1964 E2348C_1965 yebY yebZ TRUE 0.988 13.000 0.704 NA   NA
 5857071 5857072 E2348C_1965 E2348C_1966 yebZ yobA TRUE 0.993 4.000 0.613 1.000   NA
 5857073 5857074 E2348C_1967 E2348C_1968 holE yobB TRUE 0.514 102.000 0.222 1.000   NA
 5857074 5857075 E2348C_1968 E2348C_1969 yobB exoX TRUE 0.952 24.000 0.500 1.000   NA
 5857076 5857077 E2348C_1970 E2348C_1971 ptrB yebE FALSE 0.074 207.000 0.092 NA   NA
 5857077 5857078 E2348C_1971 E2348C_1972 yebE yebF FALSE 0.009 327.000 0.028 NA   NA
 5857078 5857079 E2348C_1972 E2348C_1973 yebF yebG FALSE 0.228 67.000 0.027 NA   NA
 5857081 5857082 E2348C_1975 E2348C_1976 eda edd TRUE 0.973 37.000 0.523 1.000 Y NA
 5857082 5857083 E2348C_1976 E2348C_1977 edd zwf FALSE 0.156 235.000 0.041 1.000 Y NA
 5857084 5857085 E2348C_1978 E2348C_1979 yebK pykA FALSE 0.177 128.000 0.071 1.000 N NA
 5857086 5857087 E2348C_1980 E2348C_1981 lpxM yebA TRUE 0.811 119.000 0.299 1.000 Y NA
 5857087 5857088 E2348C_1981 E2348C_1982 yebA znuA TRUE 0.880 16.000 0.131 1.000 N NA
 5857089 5857090 E2348C_1983 E2348C_1984 znuC znuB TRUE 0.999 -3.000 0.755 0.082 Y NA
 5857091 5857092 E2348C_1985 E2348C_1986 ruvB ruvA TRUE 0.999 9.000 0.549 0.001 Y NA
 5857094 5857095 E2348C_1988 E2348C_1989 ruvC yebC TRUE 0.842 35.000 0.277 NA   NA
 5857095 5857096 E2348C_1989 E2348C_1990 yebC nudB TRUE 0.555 29.000 0.035 NA   NA
 5857096 5857097 E2348C_1990 E2348C_1991 nudB aspS TRUE 0.921 2.000 0.050 1.000 N NA
 5857098 5857099 E2348C_1992 E2348C_1993 yecD yecE TRUE 0.948 -3.000 0.089 NA   NA
 5857099 5857100 E2348C_1993 E2348C_1994 yecE yecN TRUE 0.549 53.000 0.126 NA   NA
 5857100 5857101 E2348C_1994 E2348C_1995 yecN cmoA TRUE 0.599 41.000 0.089 NA   NA
 5857101 5857102 E2348C_1995 E2348C_1996 cmoA cmoB TRUE 0.984 -3.000 0.315 NA   NA
 5857103 5857104 E2348C_1997 E2348C_1998 torZ torY TRUE 0.989 25.000 0.481 0.043 Y NA
 5857104 5857105 E2348C_1998 E2348C_1999 torY cutC FALSE 0.006 388.000 0.000 1.000 N NA
 5857105 5857106 E2348C_1999 E2348C_2000 cutC yecM TRUE 0.850 14.000 0.057 NA   NA
 5857108 5857109 E2348C_2002 E2348C_2003 flhE flhA TRUE 0.990 0.000 0.158 0.002   NA
 5857109 5857110 E2348C_2003 E2348C_2004 flhA flhB TRUE 0.994 -7.000 0.287 0.009 Y NA
 5857110 5857111 E2348C_2004 E2348C_2005 flhB cheZ FALSE 0.309 189.000 0.000 1.000 Y NA
 5857111 5857112 E2348C_2005 E2348C_2006 cheZ cheY TRUE 0.980 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5857112 5857113 E2348C_2006 E2348C_2007 cheY cheB TRUE 0.981 15.000 0.000 0.010 Y NA
 5857113 5857114 E2348C_2007 E2348C_2008 cheB cheR TRUE 0.988 3.000 0.000 1.000 Y NA
 5857114 5857115 E2348C_2008 E2348C_2009 cheR tar FALSE 0.091 291.000 0.037 1.000 Y NA
 5857117 5857118 E2348C_2010 E2348C_2011 cheW cheA TRUE 0.993 21.000 0.447 0.003 Y NA
 5857118 5857119 E2348C_2011 E2348C_2012 cheA motB TRUE 0.999 5.000 0.913 1.000 Y NA
 5857119 5857120 E2348C_2012 E2348C_2013 motB motA TRUE 0.997 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 5857120 5857121 E2348C_2013 E2348C_2014 motA flhC TRUE 0.611 127.000 0.408 1.000   NA
 5857121 5857122 E2348C_2014 E2348C_2015 flhC flhD TRUE 0.980 3.000 0.000 0.001   NA
 5857124 5857125 E2348C_2017 E2348C_2018 otsA otsB TRUE 0.970 -25.000 0.068 0.001 Y NA
 5857125 5857126 E2348C_2018 E2348C_2019 otsB araH FALSE 0.092 167.000 0.000 NA   NA
 5857126 5857127 E2348C_2019 E2348C_2020 araH   TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5857127 5857128 E2348C_2020 E2348C_2021   araG FALSE 0.004 791.000 0.000 1.000   NA
 5857128 5857129 E2348C_2021 E2348C_2022 araG araF TRUE 0.955 70.000 0.917 NA Y NA
 5857131 5857132 E2348C_2024 E2348C_ncR28 yecJ isrB FALSE 0.235 81.000 0.000 NA   NA
 5857133 5857134 E2348C_2025 E2348C_2026 yecR ftnA FALSE 0.086 172.000 0.000 NA   NA
 5857137 5857138 E2348C_2029 E2348C_tRNA33 yecA leuZ FALSE 0.055 196.000 0.000 NA   NA
 5857138 5857139 E2348C_tRNA33 E2348C_tRNA34 leuZ cysT TRUE 0.849 13.000 0.000 NA   NA
 5857139 5857140 E2348C_tRNA34 E2348C_tRNA35 cysT glyW FALSE 0.352 54.000 0.000 NA   NA
 5857140 5857141 E2348C_tRNA35 E2348C_2030 glyW pgsA FALSE 0.114 152.000 0.000 NA   NA
 5857141 5857142 E2348C_2030 E2348C_2031 pgsA uvrC TRUE 0.632 57.000 0.227 1.000 N NA
 5857142 5857143 E2348C_2031 E2348C_2032 uvrC uvrY TRUE 0.971 -3.000 0.086 0.022 N NA
 5857145 5857146 E2348C_2034 E2348C_2035 sdiA yecC FALSE 0.035 230.000 0.071 1.000 N NA
 5857146 5857147 E2348C_2035 E2348C_2036 yecC yecS TRUE 0.992 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 5857147 5857148 E2348C_2036 E2348C_2037 yecS dcyD TRUE 0.966 15.000 0.050 1.000 Y NA
 5857148 5857149 E2348C_2037 E2348C_2038 dcyD fliY TRUE 0.884 105.000 0.469 1.000 Y NA
 5857149 5857150 E2348C_2038 E2348C_2039 fliY fliZ TRUE 0.609 88.000 0.280 1.000   NA
 5857150 5857151 E2348C_2039 E2348C_2040 fliZ fliA TRUE 0.623 46.000 0.108 1.000   NA
 5857151 5857152 E2348C_2040 E2348C_2041 fliA fliC FALSE 0.006 321.000 0.012 1.000 N NA
 5857153 5857154 E2348C_2042 E2348C_2043 fliD fliS TRUE 0.986 25.000 0.284 0.002 Y NA
 5857154 5857155 E2348C_2043 E2348C_2044 fliS fliT TRUE 0.989 0.000 0.324 1.000   NA
 5857155 5857156 E2348C_2044 E2348C_2045 fliT amyA FALSE 0.418 78.000 0.115 1.000   NA
 5857158 5857159 E2348C_2047 E2348C_2048 yedE yedF TRUE 0.995 -3.000 0.844 NA   NA
 5857159 5857160 E2348C_2048 E2348C_2049 yedF yedK FALSE 0.194 109.000 0.000 NA   NA
 5857160 5857161 E2348C_2049 E2348C_2050 yedK yedL FALSE 0.191 111.000 0.000 NA   NA
 5857163 5857164 E2348C_2052 E2348C_2053 fliF fliG TRUE 0.993 -7.000 0.220 0.005 Y NA
 5857164 5857165 E2348C_2053 E2348C_2054 fliG fliH TRUE 0.985 -7.000 0.000 0.003 Y NA
 5857165 5857166 E2348C_2054 E2348C_2055 fliH fliI TRUE 0.989 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5857166 5857167 E2348C_2055 E2348C_2056 fliI fliJ TRUE 0.938 19.000 0.006 1.000 Y NA
 5857167 5857168 E2348C_2056 E2348C_2057 fliJ fliK TRUE 0.998 -3.000 0.317 0.005 Y NA
 5857168 5857169 E2348C_2057 E2348C_2058 fliK fliL TRUE 0.709 105.000 0.119 1.000 Y NA
 5857169 5857170 E2348C_2058 E2348C_2059 fliL fliM TRUE 0.999 5.000 0.957 0.001 Y NA
 5857170 5857171 E2348C_2059 E2348C_2060 fliM fliN TRUE 0.996 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 5857171 5857172 E2348C_2060 E2348C_2061 fliN fliO TRUE 0.997 3.000 0.443 1.000 Y NA
 5857172 5857173 E2348C_2061 E2348C_2062 fliO fliP TRUE 0.995 0.000 0.203 1.000 Y NA
 5857173 5857174 E2348C_2062 E2348C_2063 fliP fliQ TRUE 0.999 10.000 0.827 0.009 Y NA
 5857174 5857175 E2348C_2063 E2348C_2064 fliQ fliR TRUE 0.992 9.000 0.000 0.002 Y NA
 5857175 5857176 E2348C_2064 E2348C_2065 fliR rcsA FALSE 0.013 290.000 0.000 1.000 N NA
 5857181 5857182 E2348C_2069 E2348C_2070 yedQ yodC FALSE 0.088 171.000 0.000 NA   NA
 5857182 5857183 E2348C_2070 E2348C_2071 yodC yedI FALSE 0.192 79.000 0.025 NA   NA
 5857185 5857186 E2348C_2073 E2348C_2074 vsr dcm TRUE 0.959 -19.000 0.000 0.065 Y NA
 5857186 5857187 E2348C_2074 E2348C_2075 dcm yedJ FALSE 0.312 67.000 0.000 1.000   NA
 5857187 5857188 E2348C_2075 E2348C_2076 yedJ yedR TRUE 0.535 40.000 0.062 NA   NA
 5857189 5857190 E2348C_ncR30 E2348C_2077 rseX ysdS FALSE 0.014 310.000 0.000 NA   NA
 5857190 5857191 E2348C_2077 E2348C_2078 ysdS hchA FALSE 0.004 594.000 0.000 NA   NA
 5857192 5857193 E2348C_2079 E2348C_2080 yedV yedW TRUE 0.999 0.000 0.857 0.001 Y NA
 5857194 5857195 E2348C_2081 E2348C_2082 yedX yedY FALSE 0.223 109.000 0.000 1.000   NA
 5857195 5857196 E2348C_2082 E2348C_2083 yedY yedZ TRUE 0.997 1.000 0.790 0.042   NA
 5857196 5857197 E2348C_2083 E2348C_2084 yedZ yodA FALSE 0.028 257.000 0.000 1.000   NA
 5857199 5857200 E2348C_2085 E2348C_tRNA37 mtfA asnT FALSE 0.203 101.000 0.000 NA   NA
 5857200 5857201 E2348C_tRNA37 E2348C_2086 asnT yeeJ FALSE 0.017 285.000 0.000 NA   NA
 5857203 5857204 E2348C_2088 E2348C_2089 shiA amn FALSE 0.124 102.000 0.021 1.000 N NA
 5857204 5857205 E2348C_2089 E2348C_2090 amn yeeN FALSE 0.010 343.000 0.000 NA   NA
 5857205 10800744 E2348C_2090 E2348C_IE3 yeeN   FALSE 0.006 451.000 0.000 NA