MicrobesOnline Operon Predictions for Bacillus cereus 03BB102

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7631032 7631033 BCA_0001 BCA_0002 dnaA dnaN1 TRUE 0.711 179.000 0.328 1.000 Y NA
 7631033 7631034 BCA_0002 BCA_0003 dnaN1   FALSE 0.440 128.000 0.103 1.000   NA
 7631034 7631035 BCA_0003 BCA_0004   recF TRUE 0.728 13.000 0.209 1.000   NA
 7631035 7631036 BCA_0004 BCA_0005 recF gyrB TRUE 0.951 39.000 0.249 0.004 Y NA
 7631036 7631037 BCA_0005 BCA_0006 gyrB gyrA TRUE 0.927 89.000 0.306 0.002 Y NA
 7631037 7631038 BCA_0006 BCA_0007 gyrA rrs_1 FALSE 0.005 267.000 0.000 NA   NA
 7631038 7631039 BCA_0007 BCA_0008 rrs_1   FALSE 0.050 150.000 0.000 NA   NA
 7631039 7631040 BCA_0008 BCA_0009     FALSE 0.226 7.000 0.000 NA   NA
 7631040 7631041 BCA_0009 BCA_0011   rrl_1 FALSE 0.072 94.000 0.000 NA   NA
 7631041 7631042 BCA_0011 BCA_0012 rrl_1 rrf_1 FALSE 0.088 50.000 0.000 NA   NA
 7631044 7631045 BCA_0014 BCA_0015 guaB dacA TRUE 0.715 105.000 0.304 1.000 N NA
 7631045 7631046 BCA_0015 BCA_0016 dacA   FALSE 0.436 161.000 0.017 1.000 N NA
 7631046 7631047 BCA_0016 BCA_0017     TRUE 0.956 19.000 0.488 NA Y NA
 7631047 7631048 BCA_0017 BCA_0018   serS FALSE 0.038 328.000 0.010 NA N NA
 7631048 7631049 BCA_0018 BCA_0019 serS   FALSE 0.040 157.000 0.000 NA   NA
 7631049 7631050 BCA_0019 BCA_0020     FALSE 0.031 167.000 0.000 NA   NA
 7631051 7631052 BCA_0021 BCA_0022     TRUE 0.982 3.000 0.255 0.001 Y NA
 7631052 7631053 BCA_0022 BCA_0023     TRUE 0.666 126.000 0.058 1.000 N NA
 7631054 7631055 BCA_0024 BCA_0025   srpB FALSE 0.017 193.000 0.000 NA   NA
 7631055 7631056 BCA_0025 BCA_0026 srpB dnaX FALSE 0.022 182.000 0.000 NA   NA
 7631056 7631057 BCA_0026 BCA_0027 dnaX   FALSE 0.471 23.000 0.071 NA   NA
 7631057 7631058 BCA_0027 BCA_0028   recR TRUE 0.774 15.000 0.604 NA   NA
 7631058 7631059 BCA_0028 BCA_0029 recR   FALSE 0.504 15.000 0.071 NA   NA
 7631059 7631060 BCA_0029 BCA_0030   bofA FALSE 0.099 215.000 0.417 NA   NA
 7631060 7631061 BCA_0030 BCA_0031 bofA rrs_2 FALSE 0.007 244.000 0.000 NA   NA
 7631061 7631062 BCA_0031 BCA_0032 rrs_2   FALSE 0.050 150.000 0.000 NA   NA
 7631062 7631063 BCA_0032 BCA_0033     FALSE 0.226 7.000 0.000 NA   NA
 7631063 7631064 BCA_0033 BCA_0035   rrl_2 FALSE 0.072 94.000 0.000 NA   NA
 7631064 7631065 BCA_0035 BCA_0036 rrl_2 rrf_2 FALSE 0.088 50.000 0.000 NA   NA
 7631065 7631066 BCA_0036 BCA_0037 rrf_2   FALSE 0.018 191.000 0.000 NA   NA
 7631066 7631067 BCA_0037 BCA_0038     FALSE 0.411 73.000 0.400 NA   NA
 7631067 7631068 BCA_0038 BCA_0039   tmk TRUE 0.875 2.000 0.009 1.000 N NA
 7631068 7631069 BCA_0039 BCA_0040 tmk holB TRUE 0.740 36.000 0.009 1.000 N NA
 7631069 7631070 BCA_0040 BCA_0041 holB   TRUE 0.725 6.000 0.372 NA   NA
 7631070 7631071 BCA_0041 BCA_0042     TRUE 0.565 15.000 0.183 NA   NA
 7631071 7631072 BCA_0042 BCA_0043     FALSE 0.484 121.000 0.193 1.000   NA
 7631072 7631073 BCA_0043 BCA_0044     FALSE 0.075 131.000 0.000 NA   NA
 7631073 7631074 BCA_0044 BCA_0045     FALSE 0.349 -31.000 0.000 NA   NA
 7631076 7631077 BCA_0047 BCA_0048 metS   FALSE 0.385 166.000 0.221 NA N NA
 7631077 7631078 BCA_0048 BCA_0049     FALSE 0.401 215.000 0.058 NA Y NA
 7631078 7631079 BCA_0049 BCA_0050   ksgA TRUE 0.908 -3.000 0.093 1.000 N NA
 7631079 7631080 BCA_0050 BCA_0051 ksgA   FALSE 0.227 111.000 0.022 NA   NA
 7631080 7631081 BCA_0051 BCA_0052     FALSE 0.037 239.000 0.116 NA   NA
 7631081 7631082 BCA_0052 BCA_0053   sspF FALSE 0.286 92.000 0.163 NA   NA
 7631082 7631083 BCA_0053 BCA_0054 sspF ispE FALSE 0.108 197.000 0.024 1.000   NA
 7631083 7631084 BCA_0054 BCA_0055 ispE purR TRUE 0.673 55.000 0.062 1.000 N NA
 7631084 7631085 BCA_0055 BCA_0056 purR   FALSE 0.331 -13.000 0.000 NA   NA
 7631085 7631086 BCA_0056 BCA_0057     FALSE 0.194 17.000 0.000 NA   NA
 7631086 7631087 BCA_0057 BCA_0058   spoVG FALSE 0.536 153.000 0.377 NA N NA
 7631087 7631088 BCA_0058 BCA_0059 spoVG glmU FALSE 0.176 326.000 0.014 1.000 Y NA
 7631088 7631089 BCA_0059 BCA_0060 glmU prsA TRUE 0.849 19.000 0.069 1.000 N NA
 7631089 7631090 BCA_0060 BCA_0061 prsA spoVC TRUE 0.852 10.000 0.010 1.000 N NA
 7631090 7631091 BCA_0061 BCA_0062 spoVC   FALSE 0.205 71.000 0.033 NA   NA
 7631091 7631092 BCA_0062 BCA_0063   mfd FALSE 0.227 106.000 0.035 NA   NA
 7631092 7631093 BCA_0063 BCA_0064 mfd spoVT TRUE 0.810 136.000 0.026 NA Y NA
 7631093 7631094 BCA_0064 BCA_0065 spoVT   FALSE 0.042 231.000 0.147 NA   NA
 7631094 7631095 BCA_0065 BCA_0066     TRUE 0.680 13.000 0.058 1.000   NA
 7631095 7631096 BCA_0066 BCA_0067     TRUE 0.661 15.000 0.054 1.000   NA
 7631096 7631097 BCA_0067 BCA_0068   yabP FALSE 0.287 59.000 0.108 NA   NA
 7631097 7631098 BCA_0068 BCA_0069 yabP yabQ TRUE 0.883 -3.000 0.774 NA   NA
 7631098 7631099 BCA_0069 BCA_0070 yabQ divIC1 TRUE 0.640 -3.000 0.074 NA   NA
 7631099 7631100 BCA_0070 BCA_0071 divIC1   TRUE 0.650 88.000 0.134 1.000 N NA
 7631100 7631101 BCA_0071 BCA_0072     FALSE 0.037 160.000 0.000 NA   NA
 7631101 7631102 BCA_0072 BCA_0073     FALSE 0.218 10.000 0.000 NA   NA
 7631102 7631103 BCA_0073 BCA_0074   spoIIE FALSE 0.006 257.000 0.000 NA   NA
 7631103 7631104 BCA_0074 BCA_0075 spoIIE tilS FALSE 0.160 234.000 0.041 1.000 N NA
 7631104 7631105 BCA_0075 BCA_0076 tilS hpt TRUE 0.942 -3.000 0.067 0.047 N NA
 7631105 7631106 BCA_0076 BCA_0077 hpt ftsH TRUE 0.658 86.000 0.192 1.000 N NA
 7631106 7631107 BCA_0077 BCA_0078 ftsH coaX FALSE 0.174 225.000 0.029 1.000 N NA
 7631107 7631108 BCA_0078 BCA_0079 coaX hslO TRUE 0.871 7.000 0.060 1.000 N NA
 7631108 7631109 BCA_0079 BCA_0080 hslO cysK1 TRUE 0.653 105.000 0.053 1.000 N NA
 7631109 7631110 BCA_0080 BCA_0081 cysK1 pabB FALSE 0.456 221.000 0.107 1.000 Y NA
 7631110 7631111 BCA_0081 BCA_0082 pabB pabA TRUE 0.981 6.000 0.452 0.017 Y NA
 7631111 7631112 BCA_0082 BCA_0083 pabA pabC TRUE 0.982 -6.000 0.532 1.000 Y NA
 7631112 7631113 BCA_0083 BCA_0084 pabC folP TRUE 0.976 2.000 0.519 1.000 Y NA
 7631113 7631114 BCA_0084 BCA_0085 folP folB TRUE 0.968 1.000 0.176 1.000 Y NA
 7631114 7631115 BCA_0085 BCA_0086 folB folK TRUE 0.971 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 7631115 7631116 BCA_0086 BCA_0087 folK   TRUE 0.922 -48.000 0.027 1.000 N NA
 7631116 7631117 BCA_0087 BCA_0088     TRUE 0.805 24.000 0.016 1.000 N NA
 7631117 7631118 BCA_0088 BCA_0089   lysS_1 TRUE 0.738 160.000 0.021 1.000 Y NA
 7631118 7631119 BCA_0089 BCA_0090 lysS_1 rrs_3 FALSE 0.002 398.000 0.000 NA   NA
 7631119 7631120 BCA_0090 BCA_0092 rrs_3 rrl_3 FALSE 0.024 179.000 0.000 NA   NA
 7631120 7631121 BCA_0092 BCA_0093 rrl_3 rrf_3 FALSE 0.074 102.000 0.000 NA   NA
 7631121 7631122 BCA_0093 BCA_0094 rrf_3   FALSE 0.231 6.000 0.000 NA   NA
 7631122 7631123 BCA_0094 BCA_0095     FALSE 0.236 5.000 0.000 NA   NA
 7631123 7631124 BCA_0095 BCA_0096     FALSE 0.194 14.000 0.000 NA   NA
 7631124 7631125 BCA_0096 BCA_0097     FALSE 0.191 15.000 0.000 NA   NA
 7631125 7631126 BCA_0097 BCA_0098     FALSE 0.153 26.000 0.000 NA   NA
 7631126 7631127 BCA_0098 BCA_0099     FALSE 0.192 16.000 0.000 NA   NA
 7631127 7631128 BCA_0099 BCA_0100     FALSE 0.253 2.000 0.000 NA   NA
 7631128 7631129 BCA_0100 BCA_0101     FALSE 0.242 4.000 0.000 NA   NA
 7631129 7631130 BCA_0101 BCA_0102     FALSE 0.236 5.000 0.000 NA   NA
 7631130 7631131 BCA_0102 BCA_0103   rrs_4 FALSE 0.074 102.000 0.000 NA   NA
 7631131 7631132 BCA_0103 BCA_0105 rrs_4 rrl_4 FALSE 0.024 179.000 0.000 NA   NA
 7631132 7631133 BCA_0105 BCA_0106 rrl_4 rrf_4 FALSE 0.090 49.000 0.000 NA   NA
 7631133 7631134 BCA_0106 BCA_0107 rrf_4 ctsR FALSE 0.013 207.000 0.000 NA   NA
 7631134 7631135 BCA_0107 BCA_0108 ctsR   FALSE 0.315 174.000 0.681 NA   NA
 7631135 7631136 BCA_0108 BCA_0109     TRUE 0.899 5.000 0.848 1.000   NA
 7631136 7631137 BCA_0109 BCA_0110     TRUE 0.879 23.000 0.425 1.000 N NA
 7631137 7631138 BCA_0110 BCA_0111   radA TRUE 0.910 97.000 0.062 0.010 Y NA
 7631138 7631139 BCA_0111 BCA_0112 radA   TRUE 0.608 4.000 0.126 NA   NA
 7631139 7631140 BCA_0112 BCA_0113     FALSE 0.149 160.000 0.088 NA   NA
 7631140 7631141 BCA_0113 BCA_0114   ispD FALSE 0.534 17.000 0.108 NA   NA
 7631141 7631142 BCA_0114 BCA_0115 ispD ispF TRUE 0.911 115.000 0.419 1.000 Y NA
 7631142 7631143 BCA_0115 BCA_0116 ispF gltX TRUE 0.640 72.000 0.076 1.000 N NA
 7631143 7631144 BCA_0116 BCA_0117 gltX cysE FALSE 0.032 432.000 0.008 1.000 N NA
 7631144 7631145 BCA_0117 BCA_0118 cysE cysS TRUE 0.952 -19.000 0.039 0.047 N NA
 7631145 7631146 BCA_0118 BCA_0119 cysS   TRUE 0.757 3.000 0.129 1.000   NA
 7631146 7631147 BCA_0119 BCA_0120     TRUE 0.909 -3.000 0.150 0.003   NA
 7631147 7631148 BCA_0120 BCA_0121     TRUE 0.603 4.000 0.109 NA   NA
 7631148 7631149 BCA_0121 BCA_0122   sigH FALSE 0.399 68.000 0.361 NA   NA
 7631149 7631150 BCA_0122 BCA_0123 sigH secE FALSE 0.053 311.000 0.000 1.000 N NA
 7631150 7631151 BCA_0123 BCA_0124 secE nusG TRUE 0.835 121.000 0.843 1.000 N NA
 7631151 7631152 BCA_0124 BCA_0125 nusG rplK TRUE 0.602 168.000 0.681 1.000 N NA
 7631152 7631153 BCA_0125 BCA_0126 rplK rplA TRUE 0.868 178.000 0.838 0.017 Y NA
 7631153 7631154 BCA_0126 BCA_0128 rplA rplJ TRUE 0.569 233.000 0.302 0.017 Y NA
 7631154 7631155 BCA_0128 BCA_0129 rplJ rplL TRUE 0.953 68.000 0.884 0.013 Y NA
 7631155 7631156 BCA_0129 BCA_0130 rplL   TRUE 0.847 77.000 0.050 1.000 Y NA
 7631156 7631157 BCA_0130 BCA_0131   rpoB FALSE 0.075 294.000 0.008 1.000 N NA
 7631157 7631158 BCA_0131 BCA_0132 rpoB rpoC TRUE 0.973 38.000 0.851 0.002 Y NA
 7631158 7631159 BCA_0132 BCA_0133 rpoC   TRUE 0.604 114.000 0.065 NA N NA
 7631159 7631160 BCA_0133 BCA_0134   rpsL TRUE 0.868 115.000 0.239 NA Y NA
 7631160 7631161 BCA_0134 BCA_0135 rpsL rpsG TRUE 0.962 30.000 0.224 0.002 Y NA
 7631161 7631162 BCA_0135 BCA_0136 rpsG fusA TRUE 0.614 208.000 0.579 1.000 Y NA
 7631162 7631163 BCA_0136 BCA_0137 fusA tuf TRUE 0.947 118.000 0.400 0.001 Y NA
 7631163 7631164 BCA_0137 BCA_0138 tuf rpsJ FALSE 0.145 399.000 0.318 1.000 Y NA
 7631164 7631165 BCA_0138 BCA_0139 rpsJ rplC TRUE 0.962 35.000 0.467 0.017 Y NA
 7631165 7631166 BCA_0139 BCA_0140 rplC rplD TRUE 0.973 26.000 0.544 0.013 Y NA
 7631166 7631167 BCA_0140 BCA_0141 rplD rplW TRUE 0.983 0.000 0.307 0.013 Y NA
 7631167 7631168 BCA_0141 BCA_0142 rplW rplB TRUE 0.976 29.000 0.849 0.017 Y NA
 7631168 7631169 BCA_0142 BCA_0143 rplB rpsS TRUE 0.953 61.000 0.820 0.017 Y NA
 7631169 7631170 BCA_0143 BCA_0144 rpsS rplV TRUE 0.983 18.000 0.769 0.017 Y NA
 7631170 7631171 BCA_0144 BCA_0145 rplV rpsC TRUE 0.986 4.000 0.719 0.017 Y NA
 7631171 7631172 BCA_0145 BCA_0146 rpsC rplP TRUE 0.988 2.000 0.828 0.017 Y NA
 7631172 7631173 BCA_0146 BCA_0147 rplP rpmC TRUE 0.992 -10.000 0.802 0.013 Y NA
 7631173 7631174 BCA_0147 BCA_0148 rpmC rpsQ TRUE 0.983 21.000 0.828 0.013 Y NA
 7631174 7631175 BCA_0148 BCA_0149 rpsQ rplN TRUE 0.965 44.000 0.791 0.017 Y NA
 7631175 7631176 BCA_0149 BCA_0150 rplN rplX TRUE 0.942 39.000 0.071 0.017 Y NA
 7631176 7631177 BCA_0150 BCA_0151 rplX rplE TRUE 0.957 27.000 0.057 0.013 Y NA
 7631177 7631178 BCA_0151 BCA_0152 rplE rpsN TRUE 0.965 34.000 0.496 0.013 Y NA
 7631178 7631179 BCA_0152 BCA_0153 rpsN rpsH TRUE 0.967 30.000 0.473 0.013 Y NA
 7631179 7631180 BCA_0153 BCA_0154 rpsH rplF TRUE 0.974 33.000 0.808 0.013 Y NA
 7631180 7631181 BCA_0154 BCA_0155 rplF rplR TRUE 0.975 32.000 0.815 0.013 Y NA
 7631181 7631182 BCA_0155 BCA_0156 rplR rpsE TRUE 0.982 22.000 0.814 0.017 Y NA
 7631182 7631183 BCA_0156 BCA_0157 rpsE rpmD TRUE 0.983 14.000 0.789 0.017 Y NA
 7631183 7631184 BCA_0157 BCA_0158 rpmD rplO TRUE 0.972 34.000 0.653 0.002 Y NA
 7631184 7631185 BCA_0158 BCA_0159 rplO secY1 TRUE 0.949 0.000 0.730 1.000 N NA
 7631185 7631186 BCA_0159 BCA_0160 secY1 adk TRUE 0.703 57.000 0.241 1.000 N NA
 7631186 7631187 BCA_0160 BCA_0161 adk maP1 TRUE 0.915 0.000 0.290 1.000 N NA
 7631187 7631188 BCA_0161 BCA_0162 maP1 infA TRUE 0.866 69.000 0.160 1.000 Y NA
 7631188 7631189 BCA_0162 BCA_0163 infA rpmJ TRUE 0.614 36.000 0.257 1.000   NA
 7631189 7631190 BCA_0163 BCA_0164 rpmJ rpsM TRUE 0.836 22.000 0.194 0.013   NA
 7631190 7631191 BCA_0164 BCA_0165 rpsM rpsK TRUE 0.979 25.000 0.810 0.013 Y NA
 7631191 7631192 BCA_0165 BCA_0166 rpsK rpoA FALSE 0.419 181.000 0.308 1.000 N NA
 7631192 7631193 BCA_0166 BCA_0167 rpoA rplQ TRUE 0.888 36.000 0.873 1.000 N NA
 7631193 7631194 BCA_0167 BCA_0168 rplQ   TRUE 0.659 104.000 0.074 1.000 N NA
 7631194 7631195 BCA_0168 BCA_0169     TRUE 0.991 -24.000 0.713 0.031 Y NA
 7631195 7631196 BCA_0169 BCA_0170     TRUE 0.976 -12.000 0.139 1.000 Y NA
 7631196 7631197 BCA_0170 BCA_0171   truA1 TRUE 0.904 0.000 0.170 1.000 N NA
 7631197 7631198 BCA_0171 BCA_0173 truA1 rplM TRUE 0.788 153.000 0.052 1.000 Y NA
 7631198 7631199 BCA_0173 BCA_0174 rplM rpsI TRUE 0.978 22.000 0.601 0.013 Y NA
 7631199 7631200 BCA_0174 BCA_0175 rpsI   FALSE 0.099 163.000 0.021 NA   NA
 7631200 7631201 BCA_0175 BCA_0176   cwlD FALSE 0.313 67.000 0.211 NA   NA
 7631201 7631202 BCA_0176 BCA_0177 cwlD   TRUE 0.624 145.000 0.211 1.000 N NA
 7631206 7631207 BCA_0181 BCA_0182   rrs_5 FALSE 0.007 249.000 0.000 NA   NA
 7631207 7631208 BCA_0182 BCA_0184 rrs_5 rrl_5 FALSE 0.024 179.000 0.000 NA   NA
 7631208 7631209 BCA_0184 BCA_0185 rrl_5 rrf_5 FALSE 0.069 87.000 0.000 NA   NA
 7631209 7631210 BCA_0185 BCA_0186 rrf_5   FALSE 0.221 9.000 0.000 NA   NA
 7631210 7631211 BCA_0186 BCA_0187     FALSE 0.242 4.000 0.000 NA   NA
 7631211 7631212 BCA_0187 BCA_0188     FALSE 0.185 21.000 0.000 NA   NA
 7631212 7631213 BCA_0188 BCA_0189     FALSE 0.242 4.000 0.000 NA   NA
 7631213 7631214 BCA_0189 BCA_0190     FALSE 0.194 17.000 0.000 NA   NA
 7631214 7631215 BCA_0190 BCA_0191     FALSE 0.073 66.000 0.000 NA   NA
 7631215 7631216 BCA_0191 BCA_0192     FALSE 0.231 6.000 0.000 NA   NA
 7631216 7631217 BCA_0192 BCA_0193     FALSE 0.231 6.000 0.000 NA   NA
 7631217 7631218 BCA_0193 BCA_0194     FALSE 0.223 8.000 0.000 NA   NA
 7631218 7631219 BCA_0194 BCA_0195     FALSE 0.086 113.000 0.000 NA   NA
 7631219 7631220 BCA_0195 BCA_0196   rocF FALSE 0.171 210.000 0.000 1.000 N NA
 7631220 7631221 BCA_0196 BCA_0197 rocF   FALSE 0.007 249.000 0.000 NA   NA
 7631221 7631222 BCA_0197 BCA_0198     TRUE 0.849 -7.000 0.502 NA   NA
 7631222 7631223 BCA_0198 BCA_0199   glmM TRUE 0.698 -7.000 0.150 NA   NA
 7631223 7631224 BCA_0199 BCA_0200 glmM   FALSE 0.067 139.000 0.000 NA   NA
 7631224 7631225 BCA_0200 BCA_0201   glmS FALSE 0.017 192.000 0.000 NA   NA
 7631225 7631226 BCA_0201 BCA_0202 glmS tnsA FALSE 0.357 104.000 0.006 1.000   NA
 7631226 7631227 BCA_0202 BCA_0203 tnsA   FALSE 0.007 252.000 0.000 NA   NA
 7631227 7631228 BCA_0203 BCA_0204   gntR FALSE 0.006 254.000 0.000 NA   NA
 7631228 7631229 BCA_0204 BCA_0205 gntR   TRUE 0.956 -7.000 0.680 1.000 N NA
 7631229 7631230 BCA_0205 BCA_0206   gntP1 TRUE 0.930 117.000 0.696 1.000 Y NA
 7631230 7631231 BCA_0206 BCA_0207 gntP1 yqjI FALSE 0.257 265.000 0.000 1.000 Y NA
 7631231 7631232 BCA_0207 BCA_0208 yqjI   FALSE 0.054 343.000 0.047 1.000 N NA
 7631232 7631233 BCA_0208 BCA_0209     FALSE 0.301 119.000 0.100 NA   NA
 7631234 7631235 BCA_0210 BCA_0211     FALSE 0.008 241.000 0.000 NA   NA
 7631235 7631236 BCA_0211 BCA_0212     TRUE 0.868 0.000 0.750 NA   NA
 7631236 7631237 BCA_0212 BCA_0213     FALSE 0.462 138.000 0.500 NA   NA
 7631239 7631240 BCA_0215 BCA_0216     TRUE 0.988 -25.000 0.846 1.000 Y NA
 7631240 7631241 BCA_0216 BCA_0217     TRUE 0.971 13.000 0.880 NA Y NA
 7631241 7631242 BCA_0217 BCA_0219     FALSE 0.047 281.000 0.000 NA N NA
 7631243 7631244 BCA_0220 BCA_0221     FALSE 0.315 112.000 0.137 NA   NA
 7631244 7631245 BCA_0221 BCA_0222     TRUE 0.769 -3.000 0.052 1.000   NA
 7631245 7631246 BCA_0222 BCA_0223     FALSE 0.190 79.000 0.026 NA   NA
 7631246 7631247 BCA_0223 BCA_0225     FALSE 0.303 119.000 0.104 NA   NA
 7631251 7631252 BCA_0229 BCA_0230     TRUE 0.984 17.000 0.909 0.037 Y NA
 7631252 7631253 BCA_0230 BCA_0231     TRUE 0.980 -43.000 0.233 1.000 Y NA
 7631253 7631254 BCA_0231 BCA_0232     TRUE 0.984 -3.000 0.233 0.003 Y NA
 7631254 7631255 BCA_0232 BCA_0233     TRUE 0.958 14.000 0.292 1.000 Y NA
 7631257 7631258 BCA_0235 BCA_0236     FALSE 0.532 19.000 0.105 NA   NA
 7631258 7631259 BCA_0236 BCA_0237     FALSE 0.393 66.000 0.333 NA   NA
 7631259 7631260 BCA_0237 BCA_0238     FALSE 0.409 59.000 0.333 NA   NA
 7631261 7631262 BCA_0239 BCA_0240     FALSE 0.155 388.000 0.000 0.037 Y NA
 7631262 7631263 BCA_0240 BCA_0242     FALSE 0.008 393.000 0.000 1.000   NA
 7631263 7631264 BCA_0242 BCA_0243     TRUE 0.853 2.000 0.471 1.000   NA
 7631266 7631267 BCA_0245 BCA_0246     FALSE 0.093 307.000 0.000 0.069 N NA
 7631272 7631273 BCA_0251 BCA_0252     TRUE 0.739 22.000 0.556 NA   NA
 7631273 7631274 BCA_0252 BCA_0253     FALSE 0.001 493.000 0.000 NA   NA
 7631274 7631275 BCA_0253 BCA_0254     FALSE 0.022 475.000 0.000 1.000 N NA
 7631275 7631276 BCA_0254 BCA_0255     FALSE 0.505 149.000 0.778 NA   NA
 7631276 7631277 BCA_0255 BCA_0256     TRUE 0.634 119.000 0.778 NA   NA
 7631277 7631278 BCA_0256 BCA_0257     FALSE 0.534 138.000 0.667 NA   NA
 7631278 7631279 BCA_0257 BCA_0258     FALSE 0.001 571.000 0.000 NA   NA
 7631279 7631280 BCA_0258 BCA_0259     FALSE 0.291 59.000 0.125 NA   NA
 7631280 7631281 BCA_0259 BCA_0260     FALSE 0.076 130.000 0.000 NA   NA
 7631284 7631285 BCA_0263 BCA_0264     FALSE 0.263 135.000 0.097 NA   NA
 7631286 7631287 BCA_0265 BCA_0266     FALSE 0.302 125.000 0.140 NA   NA
 7631289 7631290 BCA_0268 BCA_0269     FALSE 0.008 239.000 0.000 NA   NA
 7631290 7631291 BCA_0269 BCA_0270     TRUE 0.936 56.000 0.444 0.037 Y NA
 7631291 7631292 BCA_0270 BCA_0271     TRUE 0.985 12.000 0.850 0.037 Y NA
 7631292 7631293 BCA_0271 BCA_0272     TRUE 0.976 11.000 0.750 1.000 Y NA
 7631293 7631294 BCA_0272 BCA_0273     TRUE 0.988 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 7631296 7631297 BCA_0275 BCA_0276     FALSE 0.001 602.000 0.000 NA   NA
 7631297 7631298 BCA_0276 BCA_0277     FALSE 0.128 34.000 0.000 NA   NA
 7631298 7631299 BCA_0277 BCA_0278   hppD FALSE 0.003 311.000 0.000 NA   NA
 7631299 7631300 BCA_0278 BCA_0279 hppD   TRUE 0.665 64.000 0.118 1.000 N NA
 7631300 7631301 BCA_0279 BCA_0280     TRUE 0.978 -34.000 0.101 1.000 Y NA
 7631301 7631302 BCA_0280 BCA_0281     FALSE 0.126 234.000 0.000 1.000 N NA
 7631302 7631303 BCA_0281 BCA_0282     FALSE 0.032 383.000 0.000 1.000 N NA
 7631303 7631304 BCA_0282 BCA_0283   murF TRUE 0.914 61.000 0.044 0.005 Y NA
 7631304 7631305 BCA_0283 BCA_0284 murF   FALSE 0.067 306.000 0.004 1.000 N NA
 7631305 7631306 BCA_0284 BCA_0286   uvdE_1 TRUE 0.850 97.000 0.013 1.000 Y NA
 7631308 7631309 BCA_0287 BCA_0288 acpS   FALSE 0.539 94.000 0.038 NA N NA
 7631309 7631310 BCA_0288 BCA_0289   dal1 TRUE 0.860 119.000 0.194 NA Y NA
 7631310 7631311 BCA_0289 BCA_0290 dal1   FALSE 0.055 310.000 0.108 NA N NA
 7631311 7631312 BCA_0290 BCA_0291     TRUE 0.861 5.000 0.260 NA N NA
 7631312 7631313 BCA_0291 BCA_0292     TRUE 0.634 68.000 0.045 1.000 N NA
 7631313 7631314 BCA_0292 BCA_0293     FALSE 0.012 370.000 0.215 NA   NA
 7631314 7631315 BCA_0293 BCA_0294     FALSE 0.087 114.000 0.000 NA   NA
 7631315 7631316 BCA_0294 BCA_0295     FALSE 0.253 2.000 0.000 NA   NA
 7631316 7631317 BCA_0295 BCA_0296     FALSE 0.226 7.000 0.000 NA   NA
 7631317 7631318 BCA_0296 BCA_0297     FALSE 0.242 4.000 0.000 NA   NA
 7631318 7631319 BCA_0297 BCA_0298     FALSE 0.096 46.000 0.000 NA   NA
 7631319 7631320 BCA_0298 BCA_0299     FALSE 0.069 87.000 0.000 NA   NA
 7631320 7631321 BCA_0299 BCA_0300     FALSE 0.231 6.000 0.000 NA   NA
 7631321 7631322 BCA_0300 BCA_0301     FALSE 0.194 14.000 0.000 NA   NA
 7631322 7631323 BCA_0301 BCA_0302     FALSE 0.072 95.000 0.000 NA   NA
 7631323 7631324 BCA_0302 BCA_0303     FALSE 0.236 5.000 0.000 NA   NA
 7631324 7631325 BCA_0303 BCA_0304     FALSE 0.253 2.000 0.000 NA   NA
 7631325 7631326 BCA_0304 BCA_0305   rrs_6 FALSE 0.073 99.000 0.000 NA   NA
 7631326 7631327 BCA_0305 BCA_0307 rrs_6 rrl_6 FALSE 0.024 180.000 0.000 NA   NA
 7631327 7631328 BCA_0307 BCA_0308 rrl_6 rrf_6 FALSE 0.090 49.000 0.000 NA   NA
 7631328 7631329 BCA_0308 BCA_0309 rrf_6   FALSE 0.210 12.000 0.000 NA   NA
 7631329 7631330 BCA_0309 BCA_0310     FALSE 0.253 2.000 0.000 NA   NA
 7631330 7631331 BCA_0310 BCA_0311     FALSE 0.027 174.000 0.000 NA   NA
 7631331 7631332 BCA_0311 BCA_0312     TRUE 0.752 -19.000 0.217 NA   NA
 7631332 7631333 BCA_0312 BCA_0313   rimI TRUE 0.695 14.000 0.127 1.000   NA
 7631333 7631334 BCA_0313 BCA_0314 rimI   TRUE 0.769 0.000 0.090 1.000   NA
 7631337 7631338 BCA_0317 BCA_0318     TRUE 0.820 -3.000 0.480 NA   NA
 7631339 7631340 BCA_0319 BCA_0320 groES groL TRUE 0.947 39.000 0.674 1.000 Y NA
 7631340 7631341 BCA_0320 BCA_0321 groL   FALSE 0.003 332.000 0.000 NA   NA
 7631341 7631342 BCA_0321 BCA_0322     FALSE 0.164 24.000 0.000 NA   NA
 7631342 7631343 BCA_0322 BCA_0324   guaA FALSE 0.001 660.000 0.000 NA   NA
 7631343 7631344 BCA_0324 BCA_0326 guaA   FALSE 0.009 385.000 0.000 1.000   NA
 7631344 7631345 BCA_0326 BCA_0327     FALSE 0.374 145.000 0.146 1.000   NA
 7631345 7631346 BCA_0327 BCA_0328     TRUE 0.974 32.000 0.800 0.023 Y NA
 7631346 7631347 BCA_0328 BCA_0329   rrs_7 FALSE 0.003 321.000 0.000 NA   NA
 7631347 7631348 BCA_0329 BCA_0331 rrs_7 rrl_7 FALSE 0.024 179.000 0.000 NA   NA
 7631348 7631349 BCA_0331 BCA_0332 rrl_7 rrf_7 FALSE 0.090 49.000 0.000 NA   NA
 7631349 7631350 BCA_0332 BCA_0333 rrf_7   FALSE 0.005 278.000 0.000 NA   NA
 7631350 7631351 BCA_0333 BCA_0334     FALSE 0.461 166.000 0.171 1.000 N NA
 7631351 7631352 BCA_0334 BCA_0335   rrs_8 FALSE 0.002 352.000 0.000 NA   NA
 7631352 7631353 BCA_0335 BCA_0337 rrs_8 rrl_8 FALSE 0.024 179.000 0.000 NA   NA
 7631353 7631354 BCA_0337 BCA_0338 rrl_8 rrf_8 FALSE 0.088 50.000 0.000 NA   NA
 7631354 7631355 BCA_0338 BCA_0339 rrf_8   FALSE 0.001 525.000 0.000 NA   NA
 7631355 7631356 BCA_0339 BCA_0340     FALSE 0.002 447.000 0.000 NA   NA
 7631356 7631357 BCA_0340 BCA_0341   rrs_9 FALSE 0.001 1132.000 0.000 NA   NA
 7631357 7631358 BCA_0341 BCA_0343 rrs_9 rrl_9 FALSE 0.024 179.000 0.000 NA   NA
 7631358 7631359 BCA_0343 BCA_0344 rrl_9 rrf_9 FALSE 0.088 50.000 0.000 NA   NA
 7631360 7631361 BCA_0345 BCA_0346 uppP   TRUE 0.600 18.000 0.240 NA   NA
 7631361 7631362 BCA_0346 BCA_0347     TRUE 0.812 -7.000 0.400 NA   NA
 7631362 7631363 BCA_0347 BCA_0348     TRUE 0.762 69.000 0.556 1.000 N NA
 7631363 7631364 BCA_0348 BCA_0349     TRUE 0.983 -10.000 0.538 1.000 Y NA
 7631365 7631366 BCA_0350 BCA_0352 rrs_10 rrl_10 FALSE 0.026 178.000 0.000 NA   NA
 7631366 7631367 BCA_0352 BCA_0353 rrl_10 rrf_10 FALSE 0.090 49.000 0.000 NA   NA
 7631367 7631368 BCA_0353 BCA_0354 rrf_10   FALSE 0.005 281.000 0.000 NA   NA
 7631370 7631371 BCA_0356 BCA_0357   rrs_11 FALSE 0.007 243.000 0.000 NA   NA
 7631371 7631372 BCA_0357 BCA_0359 rrs_11 rrl_11 FALSE 0.024 179.000 0.000 NA   NA
 7631372 7631373 BCA_0359 BCA_0360 rrl_11 rrf_11 FALSE 0.090 49.000 0.000 NA   NA
 7631373 7631374 BCA_0360 BCA_0362 rrf_11 purE FALSE 0.001 700.000 0.000 NA   NA
 7631374 7631375 BCA_0362 BCA_0363 purE purK TRUE 0.983 -3.000 0.038 0.001 Y NA
 7631375 7631376 BCA_0363 BCA_0364 purK purB TRUE 0.968 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 7631376 7631377 BCA_0364 BCA_0365 purB purC TRUE 0.857 89.000 0.072 1.000 Y NA
 7631377 7631378 BCA_0365 BCA_0366 purC purS TRUE 0.981 -7.000 0.460 1.000 Y NA
 7631378 7631379 BCA_0366 BCA_0367 purS purQ TRUE 0.990 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 7631379 7631380 BCA_0367 BCA_0368 purQ purL TRUE 0.989 -16.000 0.346 0.001 Y NA
 7631380 7631381 BCA_0368 BCA_0369 purL purF TRUE 0.978 -15.000 0.223 1.000 Y NA
 7631381 7631382 BCA_0369 BCA_0370 purF purM TRUE 0.885 107.000 0.248 1.000 Y NA
 7631382 7631383 BCA_0370 BCA_0371 purM purN TRUE 0.985 -3.000 0.238 0.002 Y NA
 7631383 7631384 BCA_0371 BCA_0372 purN purH TRUE 0.943 25.000 0.225 1.000 Y NA
 7631384 7631385 BCA_0372 BCA_0373 purH purD TRUE 0.889 121.000 0.238 1.000 Y NA
 7631386 7631387 BCA_0374 BCA_0375     TRUE 0.757 17.000 0.549 NA   NA
 7631387 7631388 BCA_0375 BCA_0376     FALSE 0.012 210.000 0.000 NA   NA
 7631389 7631390 BCA_0377 BCA_0378   pcrA TRUE 0.571 1.000 0.049 NA   NA
 7631390 7631391 BCA_0378 BCA_0379 pcrA ligA TRUE 0.969 16.000 0.103 0.011 Y NA
 7631391 7631392 BCA_0379 BCA_0380 ligA   FALSE 0.403 17.000 0.009 NA   NA
 7631392 7631393 BCA_0380 BCA_0381     TRUE 0.604 96.000 0.800 NA   NA
 7631393 7631394 BCA_0381 BCA_0382     FALSE 0.332 154.000 0.205 1.000   NA
 7631394 7631395 BCA_0382 BCA_0383     FALSE 0.073 186.000 0.051 NA   NA
 7631397 7631398 BCA_0386 BCA_0387     TRUE 0.977 -10.000 0.233 1.000 Y NA
 7631398 7631399 BCA_0387 BCA_0388     TRUE 0.937 22.000 0.233 NA Y NA
 7631400 7631401 BCA_0389 BCA_0390     TRUE 0.873 -7.000 0.636 NA   NA
 7631401 7631402 BCA_0390 BCA_0391     TRUE 0.771 78.000 0.667 1.000 N NA
 7631403 7631404 BCA_0392 BCA_0393   gatC FALSE 0.159 142.000 0.009 NA   NA
 7631404 7631405 BCA_0393 BCA_0394 gatC gatA TRUE 0.983 16.000 0.643 0.001 Y NA
 7631405 7631406 BCA_0394 BCA_0395 gatA gatB TRUE 0.980 15.000 0.492 0.001 Y NA
 7631406 7631407 BCA_0395 BCA_0396 gatB   FALSE 0.033 438.000 0.034 1.000 N NA
 7631407 7631408 BCA_0396 BCA_0397     FALSE 0.345 140.000 0.028 1.000   NA
 7631408 7631409 BCA_0397 BCA_0398   gabT FALSE 0.368 83.000 0.045 1.000   NA
 7631409 7631410 BCA_0398 BCA_0399 gabT   TRUE 0.765 113.000 0.409 1.000 N NA
 7631410 7631411 BCA_0399 BCA_0400   gabD TRUE 0.951 -7.000 0.583 1.000 N NA
 7631411 7631412 BCA_0400 BCA_0401 gabD   TRUE 0.719 48.000 0.157 1.000 N NA
 7631413 7631414 BCA_0402 BCA_0403 ampS   TRUE 0.726 117.000 0.258 1.000 N NA
 7631414 7631415 BCA_0403 BCA_0404     TRUE 0.887 152.000 0.300 0.006 Y NA
 7631415 7631416 BCA_0404 BCA_0405     FALSE 0.076 274.000 0.000 1.000 N NA
 7631417 7631418 BCA_0407 BCA_0408     TRUE 0.849 97.000 0.008 1.000 Y NA
 7631418 7631419 BCA_0408 BCA_0409     FALSE 0.050 317.000 0.000 1.000 N NA
 7631419 7631420 BCA_0409 BCA_0410     FALSE 0.176 78.000 0.014 NA   NA
 7631420 7631421 BCA_0410 BCA_0411     FALSE 0.072 95.000 0.000 NA   NA
 7631422 7631423 BCA_0412 BCA_0413     TRUE 0.824 15.000 0.189 0.087   NA
 7631426 7631427 BCA_0416 BCA_0417 amhX   FALSE 0.249 152.000 0.263 NA   NA
 7631428 7631429 BCA_0418 BCA_0419 ahpF ahpC TRUE 0.967 15.000 0.551 1.000 Y NA
 7631430 7631431 BCA_0420 BCA_0421   mtnA_1 TRUE 0.689 10.000 0.042 1.000   NA
 7631431 7631432 BCA_0421 BCA_0422 mtnA_1   TRUE 0.651 55.000 0.017 1.000 N NA
 7631433 7631434 BCA_0423 BCA_0424     TRUE 0.985 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 7631434 7631435 BCA_0424 BCA_0425     TRUE 0.919 49.000 0.487 1.000 Y NA
 7631438 7631439 BCA_0428 BCA_0429     FALSE 0.008 236.000 0.000 NA   NA
 7631439 7631440 BCA_0429 BCA_0430     FALSE 0.185 21.000 0.000 NA   NA
 7631440 7631441 BCA_0430 BCA_0431     FALSE 0.034 163.000 0.000 NA   NA
 7631441 7631442 BCA_0431 BCA_0432     FALSE 0.008 238.000 0.000 NA   NA
 7631442 7631443 BCA_0432 BCA_0433     FALSE 0.082 122.000 0.000 NA   NA
 7631443 7631444 BCA_0433 BCA_0434     FALSE 0.028 172.000 0.000 NA   NA
 7631444 7631445 BCA_0434 BCA_0435     FALSE 0.003 335.000 0.000 NA   NA
 7631447 7631448 BCA_0438 BCA_0439     FALSE 0.275 122.000 0.068 NA   NA
 7631449 7631450 BCA_0440 BCA_0441     TRUE 0.594 144.000 0.053 1.000 N NA
 7631452 7631453 BCA_0443 BCA_0444     TRUE 0.889 144.000 0.130 0.048 Y NA
 7631453 7631454 BCA_0444 BCA_0445     TRUE 0.900 122.000 0.348 1.000 Y NA
 7631455 7631456 BCA_0446 BCA_0447     FALSE 0.122 237.000 0.000 1.000 N NA
 7631456 7631457 BCA_0447 BCA_0448     FALSE 0.523 206.000 0.167 1.000 Y NA
 7631457 7631458 BCA_0448 BCA_0449     TRUE 0.818 5.000 0.610 NA   NA
 7631458 7631459 BCA_0449 BCA_0450     FALSE 0.193 19.000 0.000 NA   NA
 7631459 7631460 BCA_0450 BCA_0451     FALSE 0.073 133.000 0.000 NA   NA
 7631462 7631463 BCA_0454 BCA_0455 thiM thiE TRUE 0.970 17.000 0.061 0.004 Y NA
 7631465 7631466 BCA_0457 BCA_0459     FALSE 0.006 264.000 0.000 NA   NA
 7631466 7631467 BCA_0459 BCA_0460     TRUE 0.823 -28.000 0.364 NA   NA
 7631467 7631468 BCA_0460 BCA_0461     TRUE 0.976 -3.000 0.584 NA Y NA
 7631468 7631469 BCA_0461 BCA_0462     TRUE 0.975 -3.000 0.554 NA Y NA
 7631469 7631470 BCA_0462 BCA_0463     FALSE 0.209 68.000 0.032 NA   NA
 7631470 7631471 BCA_0463 BCA_0464     FALSE 0.004 305.000 0.000 NA   NA
 7631473 7631474 BCA_0466 BCA_0467     FALSE 0.534 11.000 0.065 NA   NA
 7631474 7631475 BCA_0467 BCA_0468     FALSE 0.460 14.000 0.037 NA   NA
 7631475 7631476 BCA_0468 BCA_0469     FALSE 0.339 127.000 0.222 NA   NA
 7631476 7631477 BCA_0469 BCA_0470     FALSE 0.460 81.000 0.500 NA   NA
 7631477 7631478 BCA_0470 BCA_0471     TRUE 0.574 67.000 0.714 NA   NA
 7631478 7631479 BCA_0471 BCA_0472     FALSE 0.436 114.000 0.333 NA   NA
 7631479 7631480 BCA_0472 BCA_0473     TRUE 0.558 13.000 0.143 NA   NA
 7631481 7631482 BCA_0474 BCA_0475     FALSE 0.274 109.000 0.068 NA   NA
 7631483 7631484 BCA_0476 BCA_0477   proS1 FALSE 0.002 348.000 0.000 NA   NA
 7631486 7631487 BCA_0479 BCA_0480     TRUE 0.676 129.000 0.145 1.000 N NA
 7631487 7631488 BCA_0480 BCA_0481     TRUE 0.972 24.000 0.364 0.003 Y NA
 7631488 7631489 BCA_0481 BCA_0482     TRUE 0.939 80.000 0.571 0.003 Y NA
 7631489 7631490 BCA_0482 BCA_0483     TRUE 0.692 73.000 0.308 1.000 N NA
 7631490 7631491 BCA_0483 BCA_0484     FALSE 0.364 108.000 0.256 NA   NA
 7631491 7631492 BCA_0484 BCA_0485     TRUE 0.807 19.000 0.727 NA   NA
 7631493 7631494 BCA_0486 BCA_0487     FALSE 0.088 187.000 0.125 NA   NA
 7631495 7631496 BCA_0488 BCA_0489     FALSE 0.218 54.000 0.019 NA   NA
 7631496 7631497 BCA_0489 BCA_0490   yihY TRUE 0.667 7.000 0.273 NA   NA
 7631499 7631500 BCA_0492 BCA_0493     FALSE 0.241 123.000 0.039 NA   NA
 7631500 7631501 BCA_0493 BCA_0494   sipS1 FALSE 0.033 246.000 0.000 1.000   NA
 7631504 7631505 BCA_0497 BCA_0498     FALSE 0.169 157.000 0.129 NA   NA
 7631505 7631506 BCA_0498 BCA_0499     FALSE 0.180 155.000 0.111 NA   NA
 7631507 7631508 BCA_0500 BCA_0501 cax   FALSE 0.296 82.000 0.212 NA   NA
 7631510 7631511 BCA_0503 BCA_0504   fumA FALSE 0.057 206.000 0.093 NA   NA
 7631511 7631512 BCA_0504 BCA_0505 fumA pdaA TRUE 0.691 127.000 0.185 1.000 N NA
 7631512 7631513 BCA_0505 BCA_0506 pdaA   TRUE 0.680 60.000 0.160 1.000 N NA
 7631513 7631514 BCA_0506 BCA_0507   rumA TRUE 0.875 11.000 0.164 1.000 N NA
 7631514 7631515 BCA_0507 BCA_0508 rumA truA2 TRUE 0.910 57.000 0.016 0.018 Y NA
 7631516 7631517 BCA_0509 BCA_0510   rocR1 FALSE 0.356 84.000 0.304 NA   NA
 7631518 7631519 BCA_0511 BCA_0512     FALSE 0.231 6.000 0.000 NA   NA
 7631519 7631520 BCA_0512 BCA_0513     FALSE 0.331 -13.000 0.000 NA   NA
 7631520 7631521 BCA_0513 BCA_0514     TRUE 0.877 96.000 0.259 1.000 Y NA
 7631523 7631524 BCA_0516 BCA_0517     FALSE 0.508 115.000 0.462 NA   NA
 7631525 7631526 BCA_0518 BCA_0519   glsA1 FALSE 0.174 177.000 0.320 NA   NA
 7631527 7631528 BCA_0520 BCA_0521     FALSE 0.097 254.000 0.000 1.000 N NA
 7631528 7631529 BCA_0521 BCA_0522     FALSE 0.069 238.000 0.385 NA   NA
 7631529 7631530 BCA_0522 BCA_0523     TRUE 0.799 17.000 0.692 NA   NA
 7631530 7631531 BCA_0523 BCA_0524     TRUE 0.891 -19.000 0.667 NA   NA
 7631531 7631532 BCA_0524 BCA_0525     TRUE 0.978 -10.000 0.533 NA Y NA
 7631532 7631533 BCA_0525 BCA_0526     TRUE 0.970 -3.000 0.064 1.000 Y NA
 7631533 7631534 BCA_0526 BCA_0527     TRUE 0.635 -7.000 0.050 NA   NA
 7631534 7631535 BCA_0527 BCA_0528   pfl FALSE 0.003 340.000 0.000 NA   NA
 7631535 7631536 BCA_0528 BCA_0529 pfl pflA TRUE 0.654 70.000 0.135 1.000 N NA
 7631536 7631537 BCA_0529 BCA_0530 pflA   FALSE 0.027 413.000 0.000 1.000 N NA
 7631538 7631539 BCA_0531 BCA_0532     FALSE 0.522 111.000 0.500 NA   NA
 7631539 7631540 BCA_0532 BCA_0533     FALSE 0.076 242.000 0.000 NA N NA
 7631540 7631541 BCA_0533 BCA_0534     FALSE 0.417 141.000 0.200 1.000   NA
 7631542 7631543 BCA_0535 BCA_0536     FALSE 0.510 10.000 0.045 NA   NA
 7631544 7631545 BCA_0537 BCA_0538   sspK TRUE 0.595 38.000 0.480 NA   NA
 7631550 7631551 BCA_0543 BCA_0544     TRUE 0.688 0.000 0.227 NA   NA
 7631551 7631552 BCA_0544 BCA_0545     FALSE 0.346 61.000 0.250 NA   NA
 7631552 7631553 BCA_0545 BCA_0546     FALSE 0.029 243.000 0.058 NA   NA
 7631553 7631554 BCA_0546 BCA_0547     TRUE 0.594 55.000 0.077 NA N NA
 7631555 7631556 BCA_0548 BCA_0549     FALSE 0.024 261.000 0.066 NA   NA
 7631556 7631557 BCA_0549 BCA_0550   hemL1 FALSE 0.256 199.000 0.036 1.000 N NA
 7631558 7631559 BCA_0551 BCA_0552     TRUE 0.838 -7.000 0.488 NA   NA
 7631559 7631560 BCA_0552 BCA_0553     TRUE 0.785 5.000 0.500 NA   NA
 7631560 7631561 BCA_0553 BCA_0554     FALSE 0.291 73.000 0.188 NA   NA
 7631561 7631562 BCA_0554 BCA_0555   bcP FALSE 0.247 45.000 0.015 NA   NA
 7631562 7631563 BCA_0555 BCA_0556 bcP   FALSE 0.071 299.000 0.005 1.000 N NA
 7631565 7631566 BCA_0558 BCA_0560 rrs_12 rrl_12 FALSE 0.024 179.000 0.000 NA   NA
 7631566 7631567 BCA_0560 BCA_0561 rrl_12 rrf_12 FALSE 0.074 102.000 0.000 NA   NA
 7631567 7631568 BCA_0561 BCA_0562 rrf_12   FALSE 0.223 8.000 0.000 NA   NA
 7631568 7631569 BCA_0562 BCA_0563     FALSE 0.259 1.000 0.000 NA   NA
 7631569 7631570 BCA_0563 BCA_0564     FALSE 0.192 16.000 0.000 NA   NA
 7631570 7631571 BCA_0564 BCA_0565     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 7631571 7631572 BCA_0565 BCA_0566     FALSE 0.171 23.000 0.000 NA   NA
 7631572 7631573 BCA_0566 BCA_0567     FALSE 0.253 2.000 0.000 NA   NA
 7631573 7631574 BCA_0567 BCA_0568     FALSE 0.221 9.000 0.000 NA   NA
 7631574 7631575 BCA_0568 BCA_0569     FALSE 0.193 19.000 0.000 NA   NA
 7631575 7631576 BCA_0569 BCA_0570     FALSE 0.215 11.000 0.000 NA   NA
 7631576 7631577 BCA_0570 BCA_0571     FALSE 0.226 7.000 0.000 NA   NA
 7631577 7631578 BCA_0571 BCA_0572     FALSE 0.195 18.000 0.000 NA   NA
 7631578 7631579 BCA_0572 BCA_0573     FALSE 0.075 63.000 0.000 NA   NA
 7631579 7631580 BCA_0573 BCA_0574     FALSE 0.236 5.000 0.000 NA   NA
 7631580 7631581 BCA_0574 BCA_0575     FALSE 0.191 15.000 0.000 NA   NA
 7631581 7631582 BCA_0575 BCA_0576     FALSE 0.226 7.000 0.000 NA   NA
 7631584 7631585 BCA_0578 BCA_0579     FALSE 0.134 148.000 0.008 NA   NA
 7631585 7631586 BCA_0579 BCA_0580     FALSE 0.006 487.000 0.000 1.000   NA
 7631586 7631587 BCA_0580 BCA_0581     FALSE 0.152 189.000 0.123 1.000   NA
 7631587 7631588 BCA_0581 BCA_0582     FALSE 0.087 115.000 0.000 NA   NA
 7631588 7631589 BCA_0582 BCA_0583     FALSE 0.015 199.000 0.000 NA   NA
 7631589 7631590 BCA_0583 BCA_0584     FALSE 0.370 45.000 0.174 NA   NA
 7631590 7631591 BCA_0584 BCA_0585     FALSE 0.284 59.000 0.097 NA   NA
 7631591 7631592 BCA_0585 BCA_0586     TRUE 0.641 128.000 0.016 1.000 N NA
 7631592 7631593 BCA_0586 BCA_0587     FALSE 0.080 392.000 0.000 NA Y NA
 7631593 7631594 BCA_0587 BCA_0588     FALSE 0.024 446.000 0.683 NA   NA
 7631594 7631595 BCA_0588 BCA_0589     FALSE 0.202 130.000 0.018 NA   NA
 7631597 7631598 BCA_0591 BCA_0592     FALSE 0.007 246.000 0.000 NA   NA
 7631598 7631599 BCA_0592 BCA_0593     TRUE 0.735 13.000 0.464 NA   NA
 7631599 7631600 BCA_0593 BCA_0594     FALSE 0.008 237.000 0.000 NA   NA
 7631600 7631601 BCA_0594 BCA_0595     TRUE 0.895 157.000 0.600 0.016 Y NA
 7631601 7631602 BCA_0595 BCA_0596     TRUE 0.988 0.000 0.818 0.088 Y NA
 7631604 7631605 BCA_0598 BCA_0599     FALSE 0.270 135.000 0.125 NA   NA
 7631605 7631606 BCA_0599 BCA_0600     FALSE 0.004 290.000 0.000 NA   NA
 7631606 7631607 BCA_0600 BCA_0601     FALSE 0.001 635.000 0.000 NA   NA
 7631607 7631608 BCA_0601 BCA_0602     FALSE 0.323 150.000 0.091 1.000   NA
 7631608 7631609 BCA_0602 BCA_0603     TRUE 0.982 -3.000 0.606 1.000 Y NA
 7631609 7631610 BCA_0603 BCA_0604     FALSE 0.013 206.000 0.000 NA   NA
 7631610 7631611 BCA_0604 BCA_0605     TRUE 0.615 44.000 0.600 NA   NA
 7631611 7631612 BCA_0605 BCA_0606     FALSE 0.008 240.000 0.000 NA   NA
 7631612 7631613 BCA_0606 BCA_0607     TRUE 0.910 79.000 0.229 0.016 Y NA
 7631613 7631614 BCA_0607 BCA_0608     TRUE 0.981 -3.000 0.229 0.088 Y NA
 7631614 7631615 BCA_0608 BCA_0609     TRUE 0.710 123.000 0.243 1.000 N NA
 7631615 7631616 BCA_0609 BCA_0610     TRUE 0.902 60.000 0.432 1.000 Y NA
 7631617 7631618 BCA_0611 BCA_0612     FALSE 0.051 268.000 0.429 NA   NA
 7631620 7631621 BCA_0614 BCA_0615     FALSE 0.082 292.000 0.636 1.000   NA
 7631621 7631622 BCA_0615 BCA_0616     TRUE 0.920 66.000 0.727 1.000 Y NA
 7631624 7631625 BCA_0618 BCA_0619     FALSE 0.135 178.000 0.222 NA   NA
 7631625 7631626 BCA_0619 BCA_0620   fdhD1 FALSE 0.132 230.000 0.000 1.000 N NA
 7631627 7631628 BCA_0621 BCA_0622     TRUE 0.750 13.000 0.500 NA   NA
 7631628 7631629 BCA_0622 BCA_0623     TRUE 0.692 6.000 0.300 NA   NA
 7631629 7631630 BCA_0623 BCA_0624     TRUE 0.669 -13.000 0.061 NA   NA
 7631630 7631631 BCA_0624 BCA_0625   ald1 FALSE 0.035 369.000 0.000 1.000 N NA
 7631631 7631632 BCA_0625 BCA_0626 ald1   TRUE 0.931 104.000 0.889 1.000 Y NA
 7631632 7631633 BCA_0626 BCA_0627     FALSE 0.095 255.000 0.000 1.000 N NA
 7631633 7631634 BCA_0627 BCA_0628     TRUE 0.828 26.000 0.203 1.000 N NA
 7631636 7631637 BCA_0630 BCA_0631     TRUE 0.590 15.000 0.231 NA   NA
 7631637 7631638 BCA_0631 BCA_0632     FALSE 0.180 167.000 0.273 NA   NA
 7631640 7631641 BCA_0634 BCA_0635     TRUE 0.806 16.000 0.727 NA   NA
 7631642 7631643 BCA_0636 BCA_0637     FALSE 0.084 235.000 0.000 NA N NA
 7631643 7631644 BCA_0637 BCA_0638     FALSE 0.117 261.000 0.333 NA N NA
 7631645 7631646 BCA_0639 BCA_0640     FALSE 0.200 108.000 0.010 NA   NA
 7631646 7631647 BCA_0640 BCA_0641   aspA1 FALSE 0.172 163.000 0.222 NA   NA
 7631648 7631649 BCA_0642 BCA_0643 lldP1   FALSE 0.081 124.000 0.000 NA   NA
 7631651 7631652 BCA_0645 BCA_0646     TRUE 0.919 135.000 0.333 0.049 Y NA
 7631654 7631655 BCA_0648 BCA_0649     FALSE 0.032 382.000 0.000 1.000 N NA
 7631656 7631657 BCA_0650 BCA_0651     TRUE 0.983 -3.000 0.273 0.035 Y NA
 7631657 7631658 BCA_0651 BCA_0652     TRUE 0.959 13.000 0.273 1.000 Y NA
 7631660 7631661 BCA_0654 BCA_0655     TRUE 0.735 45.000 0.165 1.000 N NA
 7631661 7631662 BCA_0655 BCA_0656   pyrE_1 TRUE 0.660 113.000 0.009 1.000 N NA
 7631662 7631663 BCA_0656 BCA_0657 pyrE_1   TRUE 0.911 -13.000 0.012 1.000 N NA
 7631664 7631665 BCA_0658 BCA_0659     TRUE 0.864 4.000 0.822 NA   NA
 7631665 7631666 BCA_0659 BCA_0660   cls1 FALSE 0.453 128.000 0.156 1.000   NA
 7631667 7631668 BCA_0661 BCA_0662     FALSE 0.002 367.000 0.000 NA   NA
 7631670 7631671 BCA_0664 BCA_0665 treR treB TRUE 0.632 140.000 0.115 1.000 N NA
 7631671 7631672 BCA_0665 BCA_0666 treB treC TRUE 0.970 14.000 0.650 1.000 Y NA
 7631673 7631674 BCA_0667 BCA_0668 gerKC gerKB TRUE 0.964 -19.000 0.833 0.008   NA
 7631674 7631675 BCA_0668 BCA_0669 gerKB gerKA TRUE 0.943 -19.000 0.412 0.008   NA
 7631676 7631677 BCA_0670 BCA_0671     TRUE 0.977 2.000 0.049 0.022 Y NA
 7631677 7631678 BCA_0671 BCA_0672     FALSE 0.008 402.000 0.000 1.000   NA
 7631678 7631679 BCA_0672 BCA_0673     FALSE 0.006 262.000 0.000 NA   NA
 7631679 7631680 BCA_0673 BCA_0674     FALSE 0.017 193.000 0.000 NA   NA
 7631680 7631681 BCA_0674 BCA_0675     TRUE 0.641 24.000 0.385 NA   NA
 7631681 7631682 BCA_0675 BCA_0676     FALSE 0.307 158.000 0.462 NA   NA
 7631682 7631683 BCA_0676 BCA_0677     TRUE 0.850 140.000 0.093 1.000 Y NA
 7631683 7631684 BCA_0677 BCA_0678     TRUE 0.963 13.000 0.389 1.000 Y NA
 7631684 7631685 BCA_0678 BCA_0679     TRUE 0.913 71.000 0.280 0.047 Y NA
 7631685 7631686 BCA_0679 BCA_0680     TRUE 0.990 1.000 0.947 0.007 Y NA
 7631686 7631687 BCA_0680 BCA_0681     TRUE 0.557 205.000 0.000 0.065 Y NA
 7631687 7631688 BCA_0681 BCA_0682     TRUE 0.936 -25.000 0.242 1.000 N NA
 7631688 7631689 BCA_0682 BCA_0683     TRUE 0.673 60.000 0.111 1.000 N NA
 7631689 7631690 BCA_0683 BCA_0684     FALSE 0.478 160.000 0.079 1.000 N NA
 7631690 7631691 BCA_0684 BCA_0685     FALSE 0.351 -34.000 0.000 NA   NA
 7631694 7631695 BCA_0688 BCA_0689     TRUE 0.970 12.000 0.538 1.000 Y NA
 7631696 7631697 BCA_0690 BCA_0691     FALSE 0.434 158.000 0.778 NA   NA
 7631697 7631698 BCA_0691 BCA_0692     TRUE 0.780 66.000 0.615 1.000 N NA
 7631698 7631699 BCA_0692 BCA_0693     FALSE 0.010 218.000 0.000 NA   NA
 7631700 7631701 BCA_0694 BCA_0695     TRUE 0.969 15.000 0.195 0.035 Y NA
 7631701 7631702 BCA_0695 BCA_0696     TRUE 0.981 19.000 0.727 0.035 Y NA
 7631702 7631703 BCA_0696 BCA_0697     TRUE 0.856 15.000 0.727 1.000   NA
 7631703 7631704 BCA_0697 BCA_0698     TRUE 0.948 -13.000 0.477 0.003   NA
 7631704 7631705 BCA_0698 BCA_0699   glpT FALSE 0.069 285.000 0.000 1.000 N NA
 7631706 7631707 BCA_0700 BCA_0701     TRUE 0.883 20.000 0.351 1.000 N NA
 7631707 7631708 BCA_0701 BCA_0702   rbsR TRUE 0.696 138.000 0.333 1.000 N NA
 7631708 7631709 BCA_0702 BCA_0703 rbsR rbsK TRUE 0.856 14.000 0.109 1.000 N NA
 7631709 7631710 BCA_0703 BCA_0704 rbsK rbsD TRUE 0.972 -3.000 0.183 1.000 Y NA
 7631710 7631711 BCA_0704 BCA_0705 rbsD rbsA TRUE 0.958 13.000 0.243 1.000 Y NA
 7631711 7631712 BCA_0705 BCA_0706 rbsA rbsC TRUE 0.984 3.000 0.358 0.001 Y NA
 7631712 7631713 BCA_0706 BCA_0707 rbsC rbsB TRUE 0.968 15.000 0.847 NA Y NA
 7631713 7631714 BCA_0707 BCA_0708 rbsB   TRUE 0.889 36.000 0.032 NA Y NA
 7631714 7631715 BCA_0708 BCA_0709   inhA FALSE 0.014 317.000 0.000 1.000   NA
 7631717 7631718 BCA_0711 BCA_0712     FALSE 0.270 119.000 0.059 NA   NA
 7631718 7631719 BCA_0712 BCA_0713   plC FALSE 0.006 254.000 0.000 NA   NA
 7631719 7631720 BCA_0713 BCA_0714 plC sph FALSE 0.255 74.000 0.000 1.000   NA
 7631720 7631721 BCA_0714 BCA_0715 sph   FALSE 0.081 108.000 0.000 NA   NA
 7631721 7631722 BCA_0715 BCA_0716     TRUE 0.939 -12.000 0.571 NA N NA
 7631725 7631726 BCA_0719 BCA_0720     TRUE 0.657 133.000 0.085 1.000 N NA
 7631727 7631728 BCA_0721 BCA_0722     TRUE 0.721 113.000 0.233 1.000 N NA
 7631728 7631729 BCA_0722 BCA_0723     TRUE 0.844 -7.000 0.500 NA   NA
 7631729 7631730 BCA_0723 BCA_0724     FALSE 0.495 117.000 0.438 NA   NA
 7631732 7631733 BCA_0726 BCA_0727   brnQ1 TRUE 0.712 -37.000 0.083 NA   NA
 7631733 7631734 BCA_0727 BCA_0728 brnQ1   FALSE 0.265 136.000 0.121 NA   NA
 7631735 7631736 BCA_0729 BCA_0730     FALSE 0.109 182.000 0.171 NA   NA
 7631737 7631738 BCA_0731 BCA_0732     FALSE 0.097 290.000 0.750 1.000   NA
 7631738 7631739 BCA_0732 BCA_0733     TRUE 0.733 5.000 0.375 NA   NA
 7631740 7631741 BCA_0734 BCA_0735     FALSE 0.534 15.000 0.125 NA   NA
 7631741 7631742 BCA_0735 BCA_0736     FALSE 0.237 90.000 0.062 NA   NA
 7631742 7631743 BCA_0736 BCA_0737     FALSE 0.067 80.000 0.000 NA   NA
 7631743 7631744 BCA_0737 BCA_0738   qoxD FALSE 0.342 -21.000 0.000 NA   NA
 7631744 7631745 BCA_0738 BCA_0739 qoxD qoxC TRUE 0.983 1.000 0.959 1.000 Y NA
 7631745 7631746 BCA_0739 BCA_0740 qoxC qoxB TRUE 0.984 14.000 0.957 0.037 Y NA
 7631746 7631747 BCA_0740 BCA_0741 qoxB qoxA TRUE 0.956 34.000 0.234 0.006 Y NA
 7631748 7631749 BCA_0742 BCA_0743     TRUE 0.581 133.000 0.727 NA   NA
 7631749 7631750 BCA_0743 BCA_0744     TRUE 0.708 2.000 0.286 NA   NA
 7631750 7631751 BCA_0744 BCA_0745     TRUE 0.828 -3.000 0.500 NA   NA
 7631751 7631752 BCA_0745 BCA_0746   gerLA TRUE 0.563 111.000 0.353 1.000   NA
 7631752 7631753 BCA_0746 BCA_0747 gerLA gerLB TRUE 0.942 1.000 0.706 0.008   NA
 7631753 7631754 BCA_0747 BCA_0748 gerLB gerLC TRUE 0.927 -16.000 0.235 0.008   NA
 7631754 7631755 BCA_0748 BCA_0749 gerLC   TRUE 0.759 12.000 0.500 NA   NA
 7631756 7631757 BCA_0750 BCA_0751     TRUE 0.955 -22.000 0.556 0.003   NA
 7631757 7631758 BCA_0751 BCA_0752     TRUE 0.822 -3.000 0.250 1.000   NA
 7631759 7631760 BCA_0753 BCA_0754     TRUE 0.867 71.000 0.206 1.000 Y NA
 7631760 7631761 BCA_0754 BCA_0755     TRUE 0.990 3.000 0.907 0.002 Y NA
 7631761 7631762 BCA_0755 BCA_0756     FALSE 0.143 186.000 0.048 1.000   NA
 7631764 7631765 BCA_0758 BCA_0760 rrs_13 rrl_13 FALSE 0.024 179.000 0.000 NA   NA
 7631765 7631766 BCA_0760 BCA_0761 rrl_13 rrf_13 FALSE 0.074 103.000 0.000 NA   NA
 7631766 7631767 BCA_0761 BCA_0762 rrf_13   FALSE 0.236 5.000 0.000 NA   NA
 7631767 7631768 BCA_0762 BCA_0763     FALSE 0.223 8.000 0.000 NA   NA
 7631768 7631769 BCA_0763 BCA_0764     FALSE 0.210 12.000 0.000 NA   NA
 7631769 7631770 BCA_0764 BCA_0765     FALSE 0.236 5.000 0.000 NA   NA
 7631770 7631771 BCA_0765 BCA_0766     FALSE 0.194 14.000 0.000 NA   NA
 7631771 7631772 BCA_0766 BCA_0767     FALSE 0.153 26.000 0.000 NA   NA
 7631772 7631773 BCA_0767 BCA_0768     FALSE 0.192 16.000 0.000 NA   NA
 7631773 7631774 BCA_0768 BCA_0769     FALSE 0.253 2.000 0.000 NA   NA
 7631774 7631775 BCA_0769 BCA_0770     FALSE 0.226 7.000 0.000 NA   NA
 7631775 7631776 BCA_0770 BCA_0771     FALSE 0.202 13.000 0.000 NA   NA
 7631776 7631777 BCA_0771 BCA_0772     FALSE 0.194 17.000 0.000 NA   NA
 7631777 7631778 BCA_0772 BCA_0773     FALSE 0.080 56.000 0.000 NA   NA
 7631778 7631779 BCA_0773 BCA_0774     FALSE 0.149 27.000 0.000 NA   NA
 7631779 7631780 BCA_0774 BCA_0775     FALSE 0.253 2.000 0.000 NA   NA
 7631780 7631781 BCA_0775 BCA_0776     FALSE 0.226 7.000 0.000 NA   NA
 7631781 7631782 BCA_0776 BCA_0777     FALSE 0.223 8.000 0.000 NA   NA
 7631782 7631783 BCA_0777 BCA_0778     FALSE 0.253 2.000 0.000 NA   NA
 7631783 7631784 BCA_0778 BCA_0779     FALSE 0.231 6.000 0.000 NA   NA
 7631784 7631785 BCA_0779 BCA_0780     FALSE 0.221 9.000 0.000 NA   NA
 7631785 7631786 BCA_0780 BCA_0781     FALSE 0.080 126.000 0.000 NA   NA
 7631786 7631787 BCA_0781 BCA_0782     FALSE 0.004 295.000 0.000 NA   NA
 7631788 7631789 BCA_0783 BCA_0784     TRUE 0.736 15.000 0.500 NA   NA
 7631789 7631790 BCA_0784 BCA_0785     TRUE 0.844 6.000 0.750 NA   NA
 7631791 7631792 BCA_0788 BCA_0789     TRUE 0.931 -31.000 0.145 1.000 N NA
 7631792 7631793 BCA_0789 BCA_0790     TRUE 0.983 0.000 0.826 1.000 Y NA
 7631793 7631794 BCA_0790 BCA_0791     TRUE 0.981 -3.000 0.135 0.034 Y NA
 7631794 7631795 BCA_0791 BCA_0792   tenI TRUE 0.876 5.000 0.054 1.000 N NA
 7631795 7631796 BCA_0792 BCA_0793 tenI thiO TRUE 0.923 -7.000 0.194 1.000 N NA
 7631796 7631797 BCA_0793 BCA_0794 thiO thiS TRUE 0.867 16.000 0.239 1.000 N NA
 7631797 7631798 BCA_0794 BCA_0795 thiS thiG TRUE 0.962 3.000 0.054 1.000 Y NA
 7631798 7631799 BCA_0795 BCA_0796 thiG   TRUE 0.981 -7.000 0.012 0.030 Y NA
 7631799 7631800 BCA_0796 BCA_0797   thiD1 TRUE 0.953 16.000 0.195 1.000 Y NA
 7631800 7631801 BCA_0797 BCA_0799 thiD1   FALSE 0.003 327.000 0.000 NA   NA
 7631801 7631802 BCA_0799 BCA_0800     TRUE 0.764 17.000 0.571 NA   NA
 7631802 7631803 BCA_0800 BCA_0801     FALSE 0.540 29.000 0.286 NA   NA
 7631803 7631804 BCA_0801 BCA_0803   kdpA FALSE 0.001 546.000 0.000 NA   NA
 7631804 7631805 BCA_0803 BCA_0804 kdpA kdpB TRUE 0.975 11.000 0.035 0.001 Y NA
 7631805 7631806 BCA_0804 BCA_0805 kdpB kdpC TRUE 0.986 17.000 0.877 0.001 Y NA
 7631806 7631807 BCA_0805 BCA_0806 kdpC kdpD FALSE 0.412 63.000 0.066 1.000   NA
 7631809 7631810 BCA_0808 BCA_0809     TRUE 0.602 129.000 0.500 1.000   NA
 7631810 7631811 BCA_0809 BCA_0810     FALSE 0.101 199.000 0.286 NA   NA
 7631811 7631812 BCA_0810 BCA_0811     TRUE 0.593 88.000 0.800 NA   NA
 7631812 7631813 BCA_0811 BCA_0812     TRUE 0.799 10.000 0.600 NA   NA
 7631813 7631814 BCA_0812 BCA_0813     TRUE 0.872 1.000 0.800 NA   NA
 7631814 7631815 BCA_0813 BCA_0814     TRUE 0.581 47.000 0.571 NA   NA
 7631817 7631818 BCA_0816 BCA_0817     FALSE 0.452 66.000 0.438 NA   NA
 7631818 7631819 BCA_0817 BCA_0818     TRUE 0.592 105.000 0.727 NA   NA
 7631820 7631821 BCA_0819 BCA_0820 scrK scrB TRUE 0.971 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 7631821 7631822 BCA_0820 BCA_0821 scrB scrA TRUE 0.952 18.000 0.100 1.000 Y NA
 7631822 7631823 BCA_0821 BCA_0822 scrA scrR TRUE 0.672 129.000 0.113 1.000 N NA
 7631823 7631824 BCA_0822 BCA_0823 scrR   FALSE 0.269 118.000 0.056 NA   NA
 7631824 7631825 BCA_0823 BCA_0824     FALSE 0.271 73.000 0.148 NA   NA
 7631825 7631826 BCA_0824 BCA_0825     TRUE 0.849 13.000 0.073 0.005   NA
 7631826 7631827 BCA_0825 BCA_0826     FALSE 0.139 166.000 0.127 NA   NA
 7631827 7631828 BCA_0826 BCA_0827     FALSE 0.449 117.000 0.364 NA   NA
 7631828 7631829 BCA_0827 BCA_0828     FALSE 0.528 46.000 0.444 NA   NA
 7631829 7631830 BCA_0828 BCA_0829     TRUE 0.907 17.000 0.600 0.008   NA
 7631830 7631831 BCA_0829 BCA_0830     TRUE 0.956 -3.000 0.867 0.008   NA
 7631831 7631832 BCA_0830 BCA_0831     TRUE 0.595 126.000 0.462 1.000   NA
 7631833 7631834 BCA_0832 BCA_0833   spoVR FALSE 0.227 116.000 0.019 NA   NA
 7631834 7631835 BCA_0833 BCA_0834 spoVR   TRUE 0.598 -34.000 0.007 NA   NA
 7631835 7631836 BCA_0834 BCA_0835     FALSE 0.074 102.000 0.000 NA   NA
 7631836 7631837 BCA_0835 BCA_0836     TRUE 0.890 -24.000 0.000 0.006   NA
 7631837 7631838 BCA_0836 BCA_0837     FALSE 0.020 186.000 0.000 NA   NA
 7631838 7631839 BCA_0837 BCA_0838     FALSE 0.268 89.000 0.127 NA   NA
 7631839 7631840 BCA_0838 BCA_0839     TRUE 0.611 39.000 0.286 1.000   NA
 7631840 7631841 BCA_0839 BCA_0840     TRUE 0.621 32.000 0.207 1.000   NA
 7631841 7631842 BCA_0840 BCA_0841     TRUE 0.736 31.000 0.154 NA N NA
 7631842 7631843 BCA_0841 BCA_0842     TRUE 0.951 15.000 0.410 NA Y NA
 7631843 7631844 BCA_0842 BCA_0843     FALSE 0.324 61.000 0.211 NA   NA
 7631844 7631845 BCA_0843 BCA_0844     FALSE 0.448 34.000 0.184 NA   NA
 7631846 7631847 BCA_0845 BCA_0846     FALSE 0.461 149.000 0.667 NA   NA
 7631849 7631850 BCA_0848 BCA_0849     FALSE 0.030 331.000 0.000 NA N NA
 7631851 7631852 BCA_0850 BCA_0851     FALSE 0.417 73.000 0.149 1.000   NA
 7631852 7631853 BCA_0851 BCA_0852   celC1 TRUE 0.816 112.000 0.149 0.006 N NA
 7631853 7631854 BCA_0852 BCA_0853 celC1 celA1 TRUE 0.988 2.000 0.778 0.006 Y NA
 7631854 7631855 BCA_0853 BCA_0854 celA1 celB1 TRUE 0.938 83.000 0.583 0.006 Y NA
 7631855 7631856 BCA_0854 BCA_0855 celB1   TRUE 0.879 -24.000 0.583 NA   NA
 7631856 7631857 BCA_0855 BCA_0856     TRUE 0.889 -10.000 0.700 NA   NA
 7631858 7631859 BCA_0857 BCA_0858     FALSE 0.012 639.000 0.000 NA N NA
 7631859 7631860 BCA_0858 BCA_0859     TRUE 0.985 -12.000 0.889 NA Y NA
 7631860 7631861 BCA_0859 BCA_0860     TRUE 0.960 -3.000 0.889 1.000 N NA
 7631862 7631863 BCA_0861 BCA_0862     FALSE 0.226 162.000 0.333 NA   NA
 7631863 7631864 BCA_0862 BCA_0863     TRUE 0.988 2.000 0.875 0.034 Y NA
 7631864 7631865 BCA_0863 BCA_0864     FALSE 0.384 140.000 0.375 NA   NA
 7631866 7631867 BCA_0865 BCA_0866 brnQ2 cotJC FALSE 0.151 218.000 0.000 1.000 N NA
 7631867 7631868 BCA_0866 BCA_0867 cotJC cotJB TRUE 0.725 13.000 0.438 NA   NA
 7631868 7631869 BCA_0867 BCA_0868 cotJB cotJA TRUE 0.778 9.000 0.516 NA   NA
 7631870 7631871 BCA_0869 BCA_0870     TRUE 0.609 15.000 0.259 NA   NA
 7631873 7631874 BCA_0873 BCA_0874     TRUE 0.706 11.000 0.368 NA   NA
 7631874 7631875 BCA_0874 BCA_0875     FALSE 0.495 105.000 0.500 NA   NA
 7631875 7631876 BCA_0875 BCA_0876     TRUE 0.782 21.000 0.667 NA   NA
 7631878 7631879 BCA_0878 BCA_0879     FALSE 0.403 80.000 0.400 NA   NA
 7631879 7631880 BCA_0879 BCA_0880     TRUE 0.769 13.000 0.556 NA   NA
 7631882 7631883 BCA_0882 BCA_0883     TRUE 0.620 126.000 0.778 NA   NA
 7631883 7631884 BCA_0883 BCA_0884     FALSE 0.516 30.000 0.259 NA   NA
 7631884 7631885 BCA_0884 BCA_0885     FALSE 0.544 156.000 0.156 0.001   NA
 7631885 7631886 BCA_0885 BCA_0886     TRUE 0.731 24.000 0.344 1.000   NA
 7631886 7631887 BCA_0886 BCA_0887     FALSE 0.546 132.000 0.036 NA N NA
 7631887 7631888 BCA_0887 BCA_0888     FALSE 0.205 75.000 0.038 NA   NA
 7631888 7631889 BCA_0888 BCA_0889     FALSE 0.150 161.000 0.113 NA   NA
 7631889 7631890 BCA_0889 BCA_0890     FALSE 0.307 156.000 0.429 NA   NA
 7631890 7631891 BCA_0890 BCA_0891     FALSE 0.463 75.000 0.500 NA   NA
 7631893 7631894 BCA_0893 BCA_0894     TRUE 0.643 129.000 0.027 1.000 N NA
 7631894 7631895 BCA_0894 BCA_0895     FALSE 0.037 358.000 0.000 1.000 N NA
 7631895 7631896 BCA_0895 BCA_0896     TRUE 0.987 3.000 0.846 0.064 Y NA
 7631896 7631897 BCA_0896 BCA_0897     TRUE 0.763 133.000 0.538 1.000 N NA
 7631897 7631898 BCA_0897 BCA_0898   blT FALSE 0.196 202.000 0.000 1.000 N NA
 7631901 7631902 BCA_0901 BCA_0902     FALSE 0.008 238.000 0.000 NA   NA
 7631902 7631903 BCA_0902 BCA_0903     TRUE 0.666 24.000 0.176 1.000   NA
 7631903 7631904 BCA_0903 BCA_0904     FALSE 0.240 192.000 0.160 NA N NA
 7631904 7631905 BCA_0904 BCA_0905     TRUE 0.647 61.000 0.320 NA N NA
 7631906 7631907 BCA_0907 BCA_0908     FALSE 0.204 113.000 0.005 NA   NA
 7631909 7631910 BCA_0910 BCA_0911     TRUE 0.991 -3.000 0.844 0.004 Y NA
 7631910 7631911 BCA_0911 BCA_0912     FALSE 0.131 273.000 0.000 0.046 N NA
 7631911 7631912 BCA_0912 BCA_0913     TRUE 0.990 -19.000 0.594 0.034 Y NA
 7631912 7631913 BCA_0913 BCA_0914     TRUE 0.950 29.000 0.481 1.000 Y NA
 7631916 7631917 BCA_0917 BCA_0918     TRUE 0.757 21.000 0.583 NA   NA
 7631918 7631919 BCA_0919 BCA_0920     FALSE 0.346 142.000 0.321 NA   NA
 7631920 7631921 BCA_0921 BCA_0922     TRUE 0.735 22.000 0.545 NA   NA
 7631922 7631923 BCA_0923 BCA_0924 alsS alsD TRUE 0.882 17.000 0.323 1.000 N NA
 7631927 7631928 BCA_0928 BCA_0929     FALSE 0.085 315.000 0.000 0.082 N NA
 7631930 7631931 BCA_0931 BCA_0932     TRUE 0.732 -10.000 0.200 NA   NA
 7631931 7631932 BCA_0932 BCA_0933     TRUE 0.625 25.000 0.375 NA   NA
 7631932 7631933 BCA_0933 BCA_0934     FALSE 0.002 360.000 0.000 NA   NA
 7631934 7631935 BCA_0935 BCA_0936   secA1 TRUE 0.746 15.000 0.519 NA   NA
 7631936 7631937 BCA_0937 BCA_0938   csaB FALSE 0.195 142.000 0.040 NA   NA
 7631937 7631938 BCA_0938 BCA_0939 csaB   FALSE 0.001 678.000 0.000 NA   NA
 7631938 7631939 BCA_0939 BCA_0940   eag FALSE 0.001 727.000 0.000 NA   NA
 7631940 7631941 BCA_0941 BCA_0942     TRUE 0.639 25.000 0.400 NA   NA
 7631941 7631942 BCA_0942 BCA_0943     FALSE 0.006 260.000 0.000 NA   NA
 7631943 7631944 BCA_0944 BCA_0945     FALSE 0.367 102.000 0.292 NA   NA
 7631944 7631945 BCA_0945 BCA_0946     TRUE 0.749 15.000 0.538 NA   NA
 7631947 7631948 BCA_0948 BCA_0949     FALSE 0.117 240.000 0.000 1.000 N NA
 7631948 7631949 BCA_0949 BCA_0950     TRUE 0.636 133.000 0.318 NA N NA
 7631951 7631952 BCA_0952 BCA_0953     TRUE 0.950 20.000 0.109 1.000 Y NA
 7631954 7631955 BCA_0955 BCA_0956     TRUE 0.947 60.000 0.688 0.034 Y NA
 7631955 7631956 BCA_0956 BCA_0957     TRUE 0.985 7.000 0.786 0.034 Y NA
 7631956 7631957 BCA_0957 BCA_0958     TRUE 0.943 27.000 0.286 1.000 Y NA
 7631957 7631958 BCA_0958 BCA_0959     TRUE 0.989 -7.000 0.436 0.002 Y NA
 7631958 7631959 BCA_0959 BCA_0960     FALSE 0.033 315.000 0.000 NA N NA
 7631959 7631960 BCA_0960 BCA_0961     FALSE 0.070 89.000 0.000 NA   NA
 7631960 7631961 BCA_0961 BCA_0962     FALSE 0.226 7.000 0.000 NA   NA
 7631961 7631962 BCA_0962 BCA_0963     FALSE 0.313 -7.000 0.000 NA   NA
 7631962 7631963 BCA_0963 BCA_0964     FALSE 0.003 331.000 0.000 NA   NA
 7631965 7631966 BCA_0966 BCA_0967     TRUE 0.974 20.000 0.833 1.000 Y NA
 7631966 7631967 BCA_0967 BCA_0968     TRUE 0.897 -3.000 0.611 1.000   NA
 7631967 7631968 BCA_0968 BCA_0969     FALSE 0.015 199.000 0.000 NA   NA
 7631968 7631969 BCA_0969 BCA_0970     FALSE 0.001 588.000 0.000 NA   NA
 7631969 7631970 BCA_0970 BCA_0971     TRUE 0.717 24.000 0.000 0.048   NA
 7631970 7631971 BCA_0971 BCA_0972     TRUE 0.982 -7.000 0.000 0.001 Y NA
 7631972 7631973 BCA_0973 BCA_0974     TRUE 0.919 135.000 0.333 0.048 Y NA
 7631974 7631975 BCA_0975 BCA_0976     TRUE 0.630 -10.000 0.038 NA   NA
 7631975 7631976 BCA_0976 BCA_0977     FALSE 0.018 191.000 0.000 NA   NA
 7631976 7631977 BCA_0977 BCA_0978     FALSE 0.158 25.000 0.000 NA   NA
 7631977 7631978 BCA_0978 BCA_0979     TRUE 0.754 15.000 0.552 NA   NA
 7631978 7631979 BCA_0979 BCA_0980     FALSE 0.001 1870.000 0.000 NA   NA
 7631979 7631980 BCA_0980 BCA_0981     TRUE 0.597 -3.000 0.041 NA   NA
 7631980 7631981 BCA_0981 BCA_0982     FALSE 0.098 45.000 0.000 NA   NA
 7631986 7631987 BCA_0987 BCA_0988     TRUE 0.577 -3.000 0.030 NA   NA
 7631987 7631988 BCA_0988 BCA_0989     TRUE 0.594 -7.000 0.023 NA   NA
 7631988 7631989 BCA_0989 BCA_0990     FALSE 0.015 201.000 0.000 NA   NA
 7631992 7631993 BCA_0993 BCA_0994     FALSE 0.309 117.000 0.109 NA   NA
 7631994 7631995 BCA_0995 BCA_0996     TRUE 0.700 59.000 0.244 1.000 N NA
 7631995 7631996 BCA_0996 BCA_0997     FALSE 0.002 419.000 0.000 NA   NA
 7631997 7631998 BCA_0998 BCA_0999   pssA TRUE 0.699 44.000 0.011 1.000 N NA
 7631998 7631999 BCA_0999 BCA_1000 pssA   FALSE 0.355 98.000 0.013 1.000   NA
 7632001 7632002 BCA_1002 BCA_1003     FALSE 0.076 130.000 0.000 NA   NA
 7632002 7632003 BCA_1003 BCA_1004     FALSE 0.008 234.000 0.000 NA   NA
 7632004 7632005 BCA_1005 BCA_1006 dhaK   TRUE 0.914 20.000 0.625 1.000 N NA
 7632008 7632009 BCA_1009 BCA_1010     FALSE 0.013 204.000 0.000 NA   NA
 7632009 7632010 BCA_1010 BCA_1011     FALSE 0.044 223.000 0.000 1.000   NA
 7632010 7632011 BCA_1011 BCA_1012     FALSE 0.008 416.000 0.000 1.000   NA
 7632011 7632012 BCA_1012 BCA_1013     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 7632012 7632013 BCA_1013 BCA_1014     FALSE 0.001 666.000 0.000 NA   NA
 7632017 7632018 BCA_1018 BCA_1019     FALSE 0.003 307.000 0.000 NA   NA
 7632018 7632019 BCA_1019 BCA_1020     FALSE 0.246 141.000 0.114 NA   NA
 7632019 7632020 BCA_1020 BCA_1021     TRUE 0.732 14.000 0.486 NA   NA
 7632022 7632023 BCA_1023 BCA_1024     TRUE 0.664 51.000 0.875 NA   NA
 7632023 7632024 BCA_1024 BCA_1025     FALSE 0.461 76.000 0.500 NA   NA
 7632026 7632027 BCA_1027 BCA_1028 rsbV rsbW TRUE 0.977 7.000 0.714 1.000 Y NA
 7632027 7632028 BCA_1028 BCA_1029 rsbW sigB TRUE 0.968 -34.000 0.838 1.000 N NA
 7632028 7632029 BCA_1029 BCA_1030 sigB   TRUE 0.628 69.000 0.038 1.000 N NA
 7632029 7632030 BCA_1030 BCA_1031     FALSE 0.353 179.000 0.032 1.000 N NA
 7632031 7632032 BCA_1032 BCA_1033     TRUE 0.953 17.000 0.169 1.000 Y NA
 7632032 7632033 BCA_1033 BCA_1034     FALSE 0.013 206.000 0.000 NA   NA
 7632034 7632035 BCA_1035 BCA_1036     TRUE 0.639 40.000 0.600 NA   NA
 7632035 7632036 BCA_1036 BCA_1037     FALSE 0.407 153.000 0.600 NA   NA
 7632036 7632037 BCA_1037 BCA_1038     FALSE 0.062 143.000 0.000 NA   NA
 7632038 7632039 BCA_1039 BCA_1040     FALSE 0.282 118.000 0.068 NA   NA
 7632040 7632041 BCA_1041 BCA_1042     FALSE 0.009 228.000 0.000 NA   NA
 7632045 7632046 BCA_1046 BCA_1047     TRUE 0.764 -3.000 0.330 NA   NA
 7632046 7632047 BCA_1047 BCA_1048     FALSE 0.465 42.000 0.291 NA   NA
 7632047 7632048 BCA_1048 BCA_1049     FALSE 0.001 559.000 0.000 NA   NA
 7632048 7632049 BCA_1049 BCA_1050     FALSE 0.171 23.000 0.000 NA   NA
 7632049 7632050 BCA_1050 BCA_1051     FALSE 0.048 151.000 0.000 NA   NA
 7632050 7632051 BCA_1051 BCA_1052     FALSE 0.072 95.000 0.000 NA   NA
 7632051 7632052 BCA_1052 BCA_1053     FALSE 0.001 533.000 0.000 NA   NA
 7632052 7632053 BCA_1053 BCA_1054     FALSE 0.318 98.000 0.222 NA   NA
 7632053 7632054 BCA_1054 BCA_1055     FALSE 0.487 45.000 0.368 NA   NA
 7632054 7632055 BCA_1055 BCA_1056     FALSE 0.006 258.000 0.000 NA   NA
 7632055 7632056 BCA_1056 BCA_1057     FALSE 0.267 0.000 0.000 NA   NA
 7632056 7632057 BCA_1057 BCA_1058     FALSE 0.008 237.000 0.000 NA   NA
 7632057 7632058 BCA_1058 BCA_1059     FALSE 0.344 81.000 0.292 NA   NA
 7632058 7632059 BCA_1059 BCA_1060     FALSE 0.132 173.000 0.167 NA   NA
 7632059 7632060 BCA_1060 BCA_1061     FALSE 0.002 360.000 0.000 NA   NA
 7632060 7632061 BCA_1061 BCA_1062   glpP TRUE 0.863 97.000 0.083 1.000 Y NA
 7632061 7632062 BCA_1062 BCA_1063 glpP glpF FALSE 0.180 229.000 0.083 1.000 N NA
 7632062 7632063 BCA_1063 BCA_1064 glpF glpK TRUE 0.847 14.000 0.057 1.000 N NA
 7632063 7632064 BCA_1064 BCA_1065 glpK glpD TRUE 0.913 134.000 0.013 0.001 Y NA
 7632068 7632069 BCA_1069 BCA_1070     TRUE 0.967 5.000 0.533 NA Y NA
 7632069 7632070 BCA_1070 BCA_1071     TRUE 0.875 8.000 0.389 NA N NA
 7632072 7632073 BCA_1073 BCA_1074     FALSE 0.226 162.000 0.333 NA   NA
 7632073 7632074 BCA_1074 BCA_1075     TRUE 0.860 23.000 0.333 0.005   NA
 7632075 7632076 BCA_1076 BCA_1077     FALSE 0.469 88.000 0.500 NA   NA
 7632076 7632077 BCA_1077 BCA_1078   prsA1 FALSE 0.007 461.000 0.000 1.000   NA
 7632078 7632079 BCA_1079 BCA_1080     FALSE 0.003 345.000 0.000 NA   NA
 7632080 7632081 BCA_1081 BCA_1082 hpr   FALSE 0.015 299.000 0.063 NA   NA
 7632081 7632082 BCA_1082 BCA_1083     FALSE 0.092 186.000 0.137 NA   NA
 7632083 7632084 BCA_1084 BCA_1085 ecsA ecsB TRUE 0.903 -7.000 0.271 NA N NA
 7632084 7632085 BCA_1085 BCA_1086 ecsB ecsC TRUE 0.638 14.000 0.292 NA   NA
 7632086 7632087 BCA_1087 BCA_1088     FALSE 0.069 136.000 0.000 NA   NA
 7632087 7632088 BCA_1088 BCA_1089     FALSE 0.202 13.000 0.000 NA   NA
 7632088 7632089 BCA_1089 BCA_1090     FALSE 0.331 -13.000 0.000 NA   NA
 7632089 7632090 BCA_1090 BCA_1091     FALSE 0.074 65.000 0.000 NA   NA
 7632090 7632091 BCA_1091 BCA_1092     FALSE 0.004 295.000 0.000 NA   NA
 7632093 7632094 BCA_1094 BCA_1095     FALSE 0.007 244.000 0.000 NA   NA
 7632096 7632097 BCA_1097 BCA_1098     FALSE 0.022 183.000 0.000 NA   NA
 7632098 7632099 BCA_1099 BCA_1100     TRUE 0.810 15.000 0.750 NA   NA
 7632099 7632100 BCA_1100 BCA_1101     FALSE 0.015 201.000 0.000 NA   NA
 7632100 7632101 BCA_1101 BCA_1102     TRUE 0.861 3.000 0.778 NA   NA
 7632101 7632102 BCA_1102 BCA_1103     TRUE 0.575 80.000 0.778 NA   NA
 7632102 7632103 BCA_1103 BCA_1104     TRUE 0.857 -16.000 0.500 NA   NA
 7632103 7632104 BCA_1104 BCA_1105     FALSE 0.068 86.000 0.000 NA   NA
 7632104 7632105 BCA_1105 BCA_1106     TRUE 0.672 -3.000 0.150 NA   NA
 7632107 7632108 BCA_1108 BCA_1109     FALSE 0.001 746.000 0.000 NA   NA
 7632108 7632109 BCA_1109 BCA_1110     FALSE 0.001 693.000 0.000 NA   NA
 7632111 7632112 BCA_1112 BCA_1113     FALSE 0.016 198.000 0.000 NA   NA
 7632112 7632113 BCA_1113 BCA_1114     FALSE 0.371 76.000 0.333 NA   NA
 7632113 7632114 BCA_1114 BCA_1115     TRUE 0.896 -7.000 0.778 NA   NA
 7632116 7632117 BCA_1117 BCA_1118 pbpF hemE FALSE 0.481 156.000 0.020 1.000 N NA
 7632117 7632118 BCA_1118 BCA_1119 hemE hemH1 TRUE 0.951 15.000 0.131 1.000 Y NA
 7632118 7632119 BCA_1119 BCA_1120 hemH1 hemY1 TRUE 0.949 20.000 0.069 1.000 Y NA
 7632121 7632122 BCA_1122 BCA_1123     FALSE 0.287 112.000 0.071 NA   NA
 7632122 7632123 BCA_1123 BCA_1124     FALSE 0.075 131.000 0.000 NA   NA
 7632125 7632126 BCA_1126 BCA_1127 blaI   TRUE 0.976 3.000 0.833 NA Y NA
 7632126 7632127 BCA_1127 BCA_1128     FALSE 0.189 274.000 0.000 NA Y NA
 7632127 7632128 BCA_1128 BCA_1129     FALSE 0.012 212.000 0.000 NA   NA
 7632129 7632130 BCA_1130 BCA_1131     FALSE 0.047 152.000 0.000 NA   NA
 7632131 7632132 BCA_1132 BCA_1133     TRUE 0.711 38.000 0.778 NA   NA
 7632133 7632134 BCA_1134 BCA_1135     FALSE 0.293 65.000 0.160 NA   NA
 7632134 7632135 BCA_1135 BCA_1136     FALSE 0.001 720.000 0.000 NA   NA
 7632135 7632136 BCA_1136 BCA_1137     FALSE 0.346 93.000 0.273 NA   NA
 7632139 7632140 BCA_1140 BCA_1141     TRUE 0.745 10.000 0.200 1.000   NA
 7632140 7632141 BCA_1141 BCA_1142     FALSE 0.122 171.000 0.098 NA   NA
 7632141 7632142 BCA_1142 BCA_1143     FALSE 0.402 162.000 0.778 NA   NA
 7632142 7632143 BCA_1143 BCA_1144     FALSE 0.360 113.000 0.222 NA   NA
 7632143 7632144 BCA_1144 BCA_1145     FALSE 0.007 251.000 0.000 NA   NA
 7632144 7632145 BCA_1145 BCA_1146     FALSE 0.084 52.000 0.000 NA   NA
 7632145 7632146 BCA_1146 BCA_1147     FALSE 0.006 254.000 0.000 NA   NA
 7632146 7632147 BCA_1147 BCA_1148     FALSE 0.003 316.000 0.000 NA   NA
 7632147 7632148 BCA_1148 BCA_1149     FALSE 0.006 261.000 0.000 NA   NA
 7632148 7632149 BCA_1149 BCA_1150     FALSE 0.074 65.000 0.000 NA   NA
 7632149 7632150 BCA_1150 BCA_1151     FALSE 0.003 324.000 0.000 NA   NA
 7632150 7632151 BCA_1151 BCA_1152     FALSE 0.164 24.000 0.000 NA   NA
 7632153 7632154 BCA_1154 BCA_1155     FALSE 0.351 147.000 0.121 1.000   NA
 7632157 7632158 BCA_1158 BCA_1159     TRUE 0.710 6.000 0.333 NA   NA
 7632160 7632161 BCA_1161 BCA_1162     TRUE 0.971 10.000 0.533 1.000 Y NA
 7632162 7632163 BCA_1163 BCA_1164     FALSE 0.057 146.000 0.000 NA   NA
 7632163 7632164 BCA_1164 BCA_1165     TRUE 0.715 12.000 0.400 NA   NA
 7632164 7632165 BCA_1165 BCA_1166     FALSE 0.177 135.000 0.009 NA   NA
 7632165 7632166 BCA_1166 BCA_1167     FALSE 0.176 96.000 0.006 NA   NA
 7632166 7632167 BCA_1167 BCA_1168     FALSE 0.459 78.000 0.500 NA   NA
 7632169 7632170 BCA_1170 BCA_1171     FALSE 0.001 461.000 0.000 NA   NA
 7632170 7632171 BCA_1171 BCA_1172   aceB FALSE 0.073 185.000 0.044 NA   NA
 7632171 7632172 BCA_1172 BCA_1173 aceB aceA TRUE 0.941 24.000 0.084 1.000 Y NA
 7632175 7632176 BCA_1176 BCA_1177     FALSE 0.002 401.000 0.000 NA   NA
 7632177 7632178 BCA_1178 BCA_1179     FALSE 0.016 274.000 0.033 NA   NA
 7632178 7632179 BCA_1179 BCA_1180   sipT FALSE 0.351 57.000 0.246 NA   NA
 7632179 7632180 BCA_1180 BCA_1181 sipT addB TRUE 0.695 117.000 0.086 1.000 N NA
 7632180 7632181 BCA_1181 BCA_1182 addB addA TRUE 0.987 -3.000 0.408 0.003 Y NA
 7632181 7632182 BCA_1182 BCA_1183 addA   TRUE 0.815 13.000 0.035 0.046   NA
 7632183 7632184 BCA_1184 BCA_1185 gerPF1 gerPE FALSE 0.409 43.000 0.222 NA   NA
 7632184 7632185 BCA_1185 BCA_1186 gerPE gerPD TRUE 0.638 16.000 0.296 NA   NA
 7632185 7632186 BCA_1186 BCA_1187 gerPD gerPC FALSE 0.439 7.000 0.003 NA   NA
 7632186 7632187 BCA_1187 BCA_1188 gerPC gerPB FALSE 0.172 68.000 0.003 NA   NA
 7632187 7632188 BCA_1188 BCA_1189 gerPB gerPA TRUE 0.836 15.000 0.889 NA   NA
 7632188 7632189 BCA_1189 BCA_1190 gerPA   FALSE 0.367 97.000 0.296 NA   NA
 7632191 7632192 BCA_1192 BCA_1193   rocD FALSE 0.213 106.000 0.023 NA   NA
 7632195 7632196 BCA_1196 BCA_1197 asnO1 hemH2 FALSE 0.283 189.000 0.011 1.000 N NA
 7632196 7632197 BCA_1197 BCA_1198 hemH2 katB TRUE 0.635 60.000 0.013 1.000 N NA
 7632199 7632200 BCA_1200 BCA_1201     FALSE 0.026 262.000 0.000 1.000   NA
 7632202 7632203 BCA_1203 BCA_1204     FALSE 0.021 184.000 0.000 NA   NA
 7632204 7632205 BCA_1205 BCA_1206 prsA2   FALSE 0.478 129.000 0.467 NA   NA
 7632207 7632208 BCA_1208 BCA_1209     TRUE 0.875 1.000 0.826 NA   NA
 7632208 7632209 BCA_1209 BCA_1210     FALSE 0.461 106.000 0.429 NA   NA
 7632210 7632211 BCA_1211 BCA_1212   clpB FALSE 0.032 212.000 0.009 NA   NA
 7632213 7632214 BCA_1214 BCA_1215     FALSE 0.296 48.000 0.065 NA   NA
 7632214 7632215 BCA_1215 BCA_1216     FALSE 0.272 54.000 0.065 NA   NA
 7632215 7632216 BCA_1216 BCA_1217   fabH FALSE 0.002 390.000 0.000 NA   NA
 7632216 7632217 BCA_1217 BCA_1218 fabH fabF TRUE 0.958 32.000 0.076 0.001 Y NA
 7632217 7632218 BCA_1218 BCA_1219 fabF   TRUE 0.565 107.000 0.039 NA N NA
 7632218 7632219 BCA_1219 BCA_1220     FALSE 0.337 144.000 0.321 NA   NA
 7632220 7632221 BCA_1221 BCA_1222 trpS   FALSE 0.002 398.000 0.000 NA   NA
 7632222 7632223 BCA_1223 BCA_1224     TRUE 0.908 128.000 0.031 0.032 Y NA
 7632223 7632224 BCA_1224 BCA_1225     TRUE 0.981 -3.000 0.165 0.032 Y NA
 7632224 7632225 BCA_1225 BCA_1226     TRUE 0.972 19.000 0.706 1.000 Y NA
 7632225 7632226 BCA_1226 BCA_1227     TRUE 0.937 -7.000 0.375 0.003   NA
 7632230 7632231 BCA_1231 BCA_1232     FALSE 0.001 500.000 0.000 NA   NA
 7632233 7632234 BCA_1234 BCA_1235 mecA cls2 TRUE 0.618 73.000 0.314 NA N NA
 7632234 7632235 BCA_1235 BCA_1236 cls2   FALSE 0.287 82.000 0.189 NA   NA
 7632235 7632236 BCA_1236 BCA_1237   pepF1 FALSE 0.466 51.000 0.398 NA   NA
 7632236 7632237 BCA_1237 BCA_1238 pepF1   FALSE 0.028 172.000 0.000 NA   NA
 7632238 7632239 BCA_1239 BCA_1240     TRUE 0.643 0.000 0.138 NA   NA
 7632239 7632240 BCA_1240 BCA_1241     FALSE 0.168 181.000 0.063 1.000   NA
 7632241 7632242 BCA_1242 BCA_1243     FALSE 0.527 31.000 0.283 NA   NA
 7632242 7632243 BCA_1243 BCA_1244     TRUE 0.857 19.000 0.725 1.000   NA
 7632243 7632244 BCA_1244 BCA_1245     TRUE 0.900 16.000 0.480 1.000 N NA
 7632245 7632246 BCA_1246 BCA_1247     FALSE 0.329 141.000 0.017 1.000   NA
 7632246 7632247 BCA_1247 BCA_1248     FALSE 0.354 75.000 0.028 1.000   NA
 7632247 7632248 BCA_1248 BCA_1249     FALSE 0.362 119.000 0.238 NA   NA
 7632248 7632249 BCA_1249 BCA_1250     TRUE 0.601 14.000 0.242 NA   NA
 7632249 7632250 BCA_1250 BCA_1251     FALSE 0.106 215.000 0.212 1.000   NA
 7632250 7632251 BCA_1251 BCA_1252     FALSE 0.464 123.000 0.154 1.000   NA
 7632252 7632253 BCA_1253 BCA_1254     FALSE 0.052 212.000 0.000 1.000   NA
 7632253 7632254 BCA_1254 BCA_1255     FALSE 0.499 117.000 0.444 NA   NA
 7632254 7632255 BCA_1255 BCA_1256     TRUE 0.723 15.000 0.471 NA   NA
 7632255 7632256 BCA_1256 BCA_1257     TRUE 0.723 15.000 0.471 NA   NA
 7632256 7632257 BCA_1257 BCA_1258   rfbC TRUE 0.958 9.000 0.096 1.000 Y NA
 7632257 7632258 BCA_1258 BCA_1259 rfbC rfbB TRUE 0.954 17.000 0.183 1.000 Y NA
 7632258 7632259 BCA_1259 BCA_1260 rfbB rfbD TRUE 0.975 12.000 0.088 0.002 Y NA
 7632259 7632260 BCA_1260 BCA_1261 rfbD fabI TRUE 0.683 109.000 0.082 1.000 N NA
 7632260 7632261 BCA_1261 BCA_1262 fabI   FALSE 0.145 163.000 0.129 NA   NA
 7632263 7632264 BCA_1264 BCA_1265     FALSE 0.084 111.000 0.000 NA   NA
 7632265 7632266 BCA_1266 BCA_1267   cotZ2 FALSE 0.030 168.000 0.000 NA   NA
 7632266 7632267 BCA_1267 BCA_1268 cotZ2   FALSE 0.524 143.000 0.700 NA   NA
 7632267 7632268 BCA_1268 BCA_1269     FALSE 0.459 100.000 0.222 1.000   NA
 7632268 7632269 BCA_1269 BCA_1270     TRUE 0.783 2.000 0.213 1.000   NA
 7632269 7632270 BCA_1270 BCA_1271     TRUE 0.619 93.000 0.287 NA N NA
 7632271 7632272 BCA_1272 BCA_1273     FALSE 0.388 117.000 0.267 NA   NA
 7632273 7632274 BCA_1274 BCA_1275     FALSE 0.024 271.000 0.130 NA   NA
 7632275 7632276 BCA_1276 BCA_1277   trpE FALSE 0.002 370.000 0.000 NA   NA
 7632276 7632277 BCA_1277 BCA_1278 trpE   TRUE 0.986 -3.000 0.293 0.001 Y NA
 7632277 7632278 BCA_1278 BCA_1279   trpD TRUE 0.969 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 7632278 7632279 BCA_1279 BCA_1280 trpD   TRUE 0.967 2.000 0.216 1.000 Y NA
 7632279 7632280 BCA_1280 BCA_1281   trpF TRUE 0.986 -3.000 0.264 0.001 Y NA
 7632280 7632281 BCA_1281 BCA_1282 trpF trpB TRUE 0.987 -3.000 0.375 0.001 Y NA
 7632281 7632282 BCA_1282 BCA_1283 trpB trpA TRUE 0.981 4.000 0.248 0.001 Y NA
 7632282 7632283 BCA_1283 BCA_1284 trpA   FALSE 0.116 156.000 0.015 NA   NA
 7632283 7632284 BCA_1284 BCA_1285     FALSE 0.314 115.000 0.119 NA   NA
 7632284 7632285 BCA_1285 BCA_1286     FALSE 0.290 93.000 0.167 NA   NA
 7632289 7632290 BCA_1290 BCA_1291     FALSE 0.393 36.000 0.098 NA   NA
 7632290 7632291 BCA_1291 BCA_1292     FALSE 0.264 145.000 0.208 NA   NA
 7632292 7632293 BCA_1293 BCA_1294     TRUE 0.822 17.000 0.786 NA   NA
 7632293 7632294 BCA_1294 BCA_1295     TRUE 0.878 -3.000 0.733 NA   NA
 7632294 7632295 BCA_1295 BCA_1296   odhB FALSE 0.206 125.000 0.014 NA   NA
 7632295 7632296 BCA_1296 BCA_1297 odhB odhA TRUE 0.915 134.000 0.667 1.000 Y NA
 7632297 7632298 BCA_1298 BCA_1299     TRUE 0.874 3.000 0.875 NA   NA
 7632298 7632299 BCA_1299 BCA_1300     TRUE 0.723 29.000 0.667 NA   NA
 7632299 7632300 BCA_1300 BCA_1301     FALSE 0.547 135.000 0.667 NA   NA
 7632300 7632301 BCA_1301 BCA_1302     FALSE 0.002 370.000 0.000 NA   NA
 7632301 7632302 BCA_1302 BCA_1303     FALSE 0.286 158.000 0.417 NA   NA
 7632304 7632305 BCA_1305 BCA_1306     FALSE 0.031 167.000 0.000 NA   NA
 7632305 7632306 BCA_1306 BCA_1307     FALSE 0.092 48.000 0.000 NA   NA
 7632306 7632307 BCA_1307 BCA_1308     FALSE 0.094 47.000 0.000 NA   NA
 7632307 7632308 BCA_1308 BCA_1309     FALSE 0.084 52.000 0.000 NA   NA
 7632308 7632309 BCA_1309 BCA_1310     FALSE 0.104 43.000 0.000 NA   NA
 7632309 7632310 BCA_1310 BCA_1311     FALSE 0.012 210.000 0.000 NA   NA
 7632310 7632311 BCA_1311 BCA_1312     FALSE 0.004 288.000 0.000 NA   NA
 7632311 7632312 BCA_1312 BCA_1313     FALSE 0.087 114.000 0.000 NA   NA
 7632312 7632313 BCA_1313 BCA_1314     FALSE 0.231 6.000 0.000 NA   NA
 7632313 7632314 BCA_1314 BCA_1315     FALSE 0.075 132.000 0.000 NA   NA
 7632314 7632315 BCA_1315 BCA_1316     FALSE 0.084 52.000 0.000 NA   NA
 7632315 7632316 BCA_1316 BCA_1317     FALSE 0.067 79.000 0.000 NA   NA
 7632316 7632317 BCA_1317 BCA_1318     TRUE 0.911 -7.000 1.000 NA   NA
 7632317 7632318 BCA_1318 BCA_1319     FALSE 0.324 -10.000 0.000 NA   NA
 7632318 7632319 BCA_1319 BCA_1320     TRUE 0.654 -3.000 0.000 1.000   NA
 7632319 7632320 BCA_1320 BCA_1321     TRUE 0.654 -3.000 0.000 1.000   NA
 7632320 7632321 BCA_1321 BCA_1322     FALSE 0.414 33.000 0.000 1.000   NA
 7632321 7632322 BCA_1322 BCA_1323     TRUE 0.805 -7.000 0.382 NA   NA
 7632323 7632324 BCA_1324 BCA_1325     FALSE 0.019 189.000 0.000 NA   NA
 7632324 7632325 BCA_1325 BCA_1326     FALSE 0.023 273.000 0.103 NA   NA
 7632326 7632327 BCA_1327 BCA_1328     FALSE 0.423 156.000 0.700 NA   NA
 7632327 7632328 BCA_1328 BCA_1329   sipW FALSE 0.306 195.000 0.320 0.034   NA
 7632328 7632329 BCA_1329 BCA_1330 sipW   FALSE 0.394 61.000 0.320 NA   NA
 7632329 7632330 BCA_1330 BCA_1331     FALSE 0.452 156.000 0.778 NA   NA
 7632330 7632331 BCA_1331 BCA_1332   calY FALSE 0.002 425.000 0.000 NA   NA
 7632332 7632333 BCA_1333 BCA_1334 sinR   TRUE 0.698 80.000 0.389 0.004   NA
 7632334 7632335 BCA_1335 BCA_1336     FALSE 0.203 172.000 0.069 1.000   NA
 7632335 7632336 BCA_1336 BCA_1337   potA FALSE 0.118 239.000 0.000 1.000 N NA
 7632336 7632337 BCA_1337 BCA_1338 potA potB TRUE 0.990 -3.000 0.789 0.032 Y NA
 7632337 7632338 BCA_1338 BCA_1339 potB potC TRUE 0.977 7.000 0.286 0.032 Y NA
 7632338 7632339 BCA_1339 BCA_1340 potC potD TRUE 0.940 39.000 0.067 0.032 Y NA
 7632339 7632340 BCA_1340 BCA_1341 potD   TRUE 0.705 60.000 0.267 1.000 N NA
 7632340 7632341 BCA_1341 BCA_1342     TRUE 0.555 111.000 0.333 1.000   NA
 7632341 7632342 BCA_1342 BCA_1343     FALSE 0.392 101.000 0.333 NA   NA
 7632342 7632343 BCA_1343 BCA_1344     FALSE 0.265 99.000 0.089 NA   NA
 7632343 7632344 BCA_1344 BCA_1345     FALSE 0.261 92.000 0.089 NA   NA
 7632345 7632346 BCA_1346 BCA_1347     FALSE 0.001 466.000 0.000 NA   NA
 7632346 7632347 BCA_1347 BCA_1348   glcD TRUE 0.976 -3.000 0.342 1.000 Y NA
 7632347 7632348 BCA_1348 BCA_1349 glcD   TRUE 0.719 118.000 0.247 1.000 N NA
 7632349 7632350 BCA_1350 BCA_1351     TRUE 0.853 -7.000 0.543 NA   NA
 7632350 7632351 BCA_1351 BCA_1352     TRUE 0.977 4.000 0.621 1.000 Y NA
 7632351 7632352 BCA_1352 BCA_1353     FALSE 0.090 261.000 0.000 1.000 N NA
 7632352 7632353 BCA_1353 BCA_1354     FALSE 0.430 169.000 0.395 NA N NA
 7632353 7632354 BCA_1354 BCA_1355     TRUE 0.970 17.000 0.947 NA Y NA
 7632354 7632355 BCA_1355 BCA_1356     TRUE 0.938 0.000 0.500 0.001   NA
 7632355 7632356 BCA_1356 BCA_1357   comC FALSE 0.410 113.000 0.022 1.000   NA
 7632356 7632357 BCA_1357 BCA_1358 comC   FALSE 0.391 15.000 0.005 NA   NA
 7632358 7632359 BCA_1359 BCA_1360     FALSE 0.462 204.000 0.000 1.000 Y NA
 7632359 7632360 BCA_1360 BCA_1362     FALSE 0.271 295.000 0.000 0.060 Y NA
 7632360 7632361 BCA_1362 BCA_1363     TRUE 0.614 115.000 0.455 1.000   NA
 7632361 7632362 BCA_1363 BCA_1364     FALSE 0.546 148.000 0.615 1.000   NA
 7632362 7632363 BCA_1364 BCA_1365     FALSE 0.538 102.000 0.615 NA   NA
 7632363 7632364 BCA_1365 BCA_1366     FALSE 0.443 43.000 0.273 NA   NA
 7632365 7632366 BCA_1367 BCA_1368   phbB FALSE 0.347 152.000 0.450 NA   NA
 7632366 7632367 BCA_1368 BCA_1369 phbB phaC TRUE 0.918 83.000 0.161 0.001 Y NA
 7632367 7632368 BCA_1369 BCA_1370 phaC   TRUE 0.658 96.000 0.113 1.000 N NA
 7632368 7632369 BCA_1370 BCA_1371     TRUE 0.827 24.000 0.096 1.000 N NA
 7632371 7632372 BCA_1373 BCA_1374     FALSE 0.353 -43.000 0.000 NA   NA
 7632372 7632373 BCA_1374 BCA_1375     FALSE 0.009 229.000 0.000 NA   NA
 7632373 7632374 BCA_1375 BCA_1376     TRUE 0.906 21.000 0.111 0.032 N NA
 7632374 7632375 BCA_1376 BCA_1377     TRUE 0.938 1.000 0.125 0.032 N NA
 7632375 7632376 BCA_1377 BCA_1378   phnX TRUE 0.694 13.000 0.079 1.000   NA
 7632376 7632377 BCA_1378 BCA_1379 phnX   TRUE 0.850 16.000 0.315 0.077   NA
 7632377 7632378 BCA_1379 BCA_1380     TRUE 0.959 -3.000 0.029 NA Y NA
 7632378 7632379 BCA_1380 BCA_1381     TRUE 0.641 41.000 0.029 NA N NA
 7632379 7632380 BCA_1381 BCA_1382     FALSE 0.297 162.000 0.500 NA   NA
 7632380 7632381 BCA_1382 BCA_1383     FALSE 0.401 151.000 0.556 NA   NA
 7632381 7632382 BCA_1383 BCA_1384     FALSE 0.031 249.000 0.000 1.000   NA
 7632382 7632383 BCA_1384 BCA_1385     FALSE 0.369 126.000 0.267 NA   NA
 7632387 7632388 BCA_1389 BCA_1390     FALSE 0.388 161.000 0.129 NA N NA
 7632388 7632389 BCA_1390 BCA_1391     FALSE 0.255 139.000 0.114 NA   NA
 7632389 7632390 BCA_1391 BCA_1392     FALSE 0.441 103.000 0.417 NA   NA
 7632392 7632393 BCA_1395 BCA_1396     TRUE 0.756 0.000 0.062 1.000   NA
 7632393 7632394 BCA_1396 BCA_1397   queE TRUE 0.930 -7.000 0.280 1.000 N NA
 7632394 7632395 BCA_1397 BCA_1398 queE   TRUE 0.690 19.000 0.101 1.000   NA
 7632397 7632398 BCA_1400 BCA_1401     FALSE 0.271 89.000 0.140 NA   NA
 7632400 7632401 BCA_1403 BCA_1404     FALSE 0.516 27.000 0.229 NA   NA
 7632401 7632402 BCA_1404 BCA_1405   nrdI FALSE 0.001 477.000 0.000 NA   NA
 7632402 7632403 BCA_1405 BCA_1406 nrdI   TRUE 0.941 23.000 0.333 NA Y NA
 7632403 7632404 BCA_1406 BCA_1407     FALSE 0.043 226.000 0.000 1.000   NA
 7632404 7632405 BCA_1407 BCA_1408     FALSE 0.270 133.000 0.000 1.000   NA
 7632405 7632406 BCA_1408 BCA_1409   nrdF TRUE 0.788 94.000 0.625 0.001   NA
 7632406 7632407 BCA_1409 BCA_1410 nrdF   FALSE 0.154 217.000 0.000 1.000 N NA
 7632407 7632408 BCA_1410 BCA_1411     TRUE 0.922 -3.000 0.280 1.000 N NA
 7632408 7632409 BCA_1411 BCA_1412     TRUE 0.884 -3.000 0.778 NA   NA
 7632409 7632410 BCA_1412 BCA_1413     TRUE 0.805 15.000 0.727 NA   NA
 7632410 7632411 BCA_1413 BCA_1414     TRUE 0.802 0.000 0.471 NA   NA
 7632411 7632412 BCA_1414 BCA_1415     FALSE 0.048 203.000 0.040 NA   NA
 7632413 7632414 BCA_1416 BCA_1417     FALSE 0.341 101.000 0.258 NA   NA
 7632415 7632416 BCA_1418 BCA_1419     TRUE 0.720 -7.000 0.194 NA   NA
 7632416 7632417 BCA_1419 BCA_1420     FALSE 0.265 87.000 0.127 NA   NA
 7632420 7632421 BCA_1423 BCA_1424 dltD dltC TRUE 0.776 -3.000 0.064 1.000   NA
 7632421 7632422 BCA_1424 BCA_1425 dltC dltB FALSE 0.410 70.000 0.387 NA   NA
 7632422 7632423 BCA_1425 BCA_1426 dltB dltA TRUE 0.914 -3.000 0.435 NA N NA
 7632423 7632424 BCA_1426 BCA_1427 dltA   TRUE 0.766 13.000 0.549 NA   NA
 7632425 7632426 BCA_1428 BCA_1429 amaA   FALSE 0.009 227.000 0.000 NA   NA
 7632426 7632427 BCA_1429 BCA_1430     TRUE 0.780 -7.000 0.316 NA   NA
 7632427 7632428 BCA_1430 BCA_1431     TRUE 0.651 25.000 0.421 NA   NA
 7632428 7632429 BCA_1431 BCA_1432     FALSE 0.401 99.000 0.357 NA   NA
 7632432 7632433 BCA_1435 BCA_1436     TRUE 0.791 19.000 0.667 NA   NA
 7632433 7632434 BCA_1436 BCA_1437     FALSE 0.184 74.000 0.018 NA   NA
 7632436 7632437 BCA_1439 BCA_1440     FALSE 0.200 67.000 0.022 NA   NA
 7632438 7632439 BCA_1441 BCA_1442     TRUE 0.581 137.000 0.778 NA   NA
 7632443 7632444 BCA_1446 BCA_1447     TRUE 0.569 85.000 0.750 NA   NA
 7632445 7632446 BCA_1448 BCA_1449     FALSE 0.326 127.000 0.195 NA   NA
 7632447 7632448 BCA_1450 BCA_1451   ilvE1 FALSE 0.253 142.000 0.150 NA   NA
 7632448 7632449 BCA_1451 BCA_1452 ilvE1 ilvB FALSE 0.178 308.000 0.000 1.000 Y NA
 7632449 7632450 BCA_1452 BCA_1453 ilvB ilvN TRUE 0.985 -3.000 0.249 0.001 Y NA
 7632450 7632451 BCA_1453 BCA_1454 ilvN ilvC1 TRUE 0.962 27.000 0.130 0.002 Y NA
 7632451 7632452 BCA_1454 BCA_1455 ilvC1 leuA TRUE 0.965 2.000 0.103 1.000 Y NA
 7632452 7632453 BCA_1455 BCA_1456 leuA leuB TRUE 0.910 78.000 0.041 0.001 Y NA
 7632453 7632454 BCA_1456 BCA_1457 leuB leuC TRUE 0.982 0.000 0.080 0.001 Y NA
 7632454 7632455 BCA_1457 BCA_1458 leuC leuD TRUE 0.991 -22.000 0.477 0.001 Y NA
 7632455 7632456 BCA_1458 BCA_1459 leuD hisZ FALSE 0.173 311.000 0.000 1.000 Y NA
 7632456 7632457 BCA_1459 BCA_1460 hisZ hisG TRUE 0.988 -24.000 0.239 0.004 Y NA
 7632457 7632458 BCA_1460 BCA_1461 hisG hisD TRUE 0.976 12.000 0.254 0.004 Y NA
 7632458 7632459 BCA_1461 BCA_1462 hisD hisB TRUE 0.981 0.000 0.096 0.004 Y NA
 7632459 7632460 BCA_1462 BCA_1463 hisB hisH TRUE 0.980 1.000 0.125 0.004 Y NA
 7632460 7632461 BCA_1463 BCA_1464 hisH hisA TRUE 0.987 -27.000 0.124 0.004 Y NA
 7632461 7632462 BCA_1464 BCA_1465 hisA hisF TRUE 0.988 -6.000 0.433 0.004 Y NA
 7632462 7632463 BCA_1465 BCA_1466 hisF hisE TRUE 0.987 -3.000 0.430 0.004 Y NA
 7632463 7632464 BCA_1466 BCA_1467 hisE hisI TRUE 0.975 11.000 0.152 0.004 Y NA
 7632464 7632465 BCA_1467 BCA_1468 hisI   TRUE 0.971 12.000 0.016 0.004 Y NA
 7632465 7632466 BCA_1468 BCA_1469     TRUE 0.583 68.000 0.750 NA   NA
 7632466 7632467 BCA_1469 BCA_1470     FALSE 0.267 99.000 0.096 NA   NA
 7632468 7632469 BCA_1471 BCA_1472     FALSE 0.322 182.000 0.011 1.000 N NA
 7632470 7632471 BCA_1473 BCA_1475   lysA FALSE 0.001 452.000 0.000 NA   NA
 7632471 7632472 BCA_1475 BCA_1477 lysA   FALSE 0.004 298.000 0.000 NA   NA
 7632472 7632473 BCA_1477 BCA_1478   cysH FALSE 0.176 87.000 0.011 NA   NA
 7632473 7632474 BCA_1478 BCA_1479 cysH sat TRUE 0.749 39.000 0.065 1.000 N NA
 7632474 7632475 BCA_1479 BCA_1480 sat cysC TRUE 0.974 13.000 0.101 0.001 Y NA
 7632475 7632476 BCA_1480 BCA_1481 cysC   TRUE 0.955 12.000 0.067 1.000 Y NA
 7632476 7632477 BCA_1481 BCA_1482     TRUE 0.807 11.000 0.647 NA   NA
 7632477 7632478 BCA_1482 BCA_1483   cysG FALSE 0.342 87.000 0.281 NA   NA
 7632478 7632479 BCA_1483 BCA_1484 cysG   TRUE 0.804 2.000 0.281 1.000   NA
 7632479 7632480 BCA_1484 BCA_1485     TRUE 0.885 -25.000 0.375 1.000   NA
 7632480 7632481 BCA_1485 BCA_1486     FALSE 0.008 419.000 0.000 1.000   NA
 7632482 7632483 BCA_1487 BCA_1488     TRUE 0.919 135.000 0.333 0.044 Y NA
 7632483 7632484 BCA_1488 BCA_1489     FALSE 0.044 335.000 0.000 1.000 N NA
 7632485 7632486 BCA_1490 BCA_1491     FALSE 0.504 68.000 0.556 NA   NA
 7632486 7632487 BCA_1491 BCA_1493     FALSE 0.003 322.000 0.000 NA   NA
 7632487 7632488 BCA_1493 BCA_1494     FALSE 0.034 228.000 0.046 NA   NA
 7632488 7632489 BCA_1494 BCA_1495     FALSE 0.538 51.000 0.514 NA   NA
 7632489 7632490 BCA_1495 BCA_1496     FALSE 0.298 107.000 0.135 NA   NA
 7632490 7632491 BCA_1496 BCA_1497     TRUE 0.621 0.000 0.080 NA   NA
 7632491 7632492 BCA_1497 BCA_1498     TRUE 0.990 -3.000 0.853 0.020 Y NA
 7632492 7632493 BCA_1498 BCA_1499     FALSE 0.258 133.000 0.075 NA   NA
 7632494 7632495 BCA_1500 BCA_1501 brnQ3   FALSE 0.017 837.000 0.000 1.000 N NA
 7632498 7632499 BCA_1504 BCA_1505     FALSE 0.306 115.000 0.092 NA   NA
 7632499 7632500 BCA_1505 BCA_1506   hmp FALSE 0.126 160.000 0.049 NA   NA
 7632503 7632504 BCA_1509 BCA_1510     FALSE 0.469 118.000 0.136 1.000   NA
 7632504 7632505 BCA_1510 BCA_1511     TRUE 0.944 12.000 0.100 NA Y NA
 7632507 7632508 BCA_1513 BCA_1514     FALSE 0.011 397.000 0.250 NA   NA
 7632508 7632509 BCA_1514 BCA_1515     FALSE 0.058 205.000 0.000 1.000   NA
 7632511 7632512 BCA_1517 BCA_1518     FALSE 0.518 120.000 0.500 NA   NA
 7632512 7632513 BCA_1518 BCA_1519     TRUE 0.566 108.000 0.389 1.000   NA
 7632513 7632514 BCA_1519 BCA_1520   deoD FALSE 0.480 157.000 0.040 1.000 N NA
 7632515 7632516 BCA_1521 BCA_1522     FALSE 0.002 378.000 0.000 NA   NA
 7632518 7632519 BCA_1524 BCA_1525     TRUE 0.690 22.000 0.435 NA   NA
 7632519 7632520 BCA_1525 BCA_1526     FALSE 0.285 106.000 0.101 NA   NA
 7632520 7632521 BCA_1526 BCA_1527     TRUE 0.695 112.000 0.101 1.000 N NA
 7632521 7632522 BCA_1527 BCA_1528   spmA TRUE 0.840 -7.000 0.252 1.000   NA
 7632522 7632523 BCA_1528 BCA_1529 spmA   TRUE 0.862 -3.000 0.655 NA   NA
 7632523 7632524 BCA_1529 BCA_1530   rluB FALSE 0.017 290.000 0.063 NA   NA
 7632524 7632525 BCA_1530 BCA_1531 rluB resA TRUE 0.647 95.000 0.069 1.000 N NA
 7632525 7632526 BCA_1531 BCA_1532 resA resB TRUE 0.870 122.000 0.306 NA Y NA
 7632526 7632527 BCA_1532 BCA_1533 resB resC TRUE 0.944 15.000 0.278 NA Y NA
 7632527 7632528 BCA_1533 BCA_1534 resC resD FALSE 0.086 303.000 0.178 1.000 N NA
 7632528 7632529 BCA_1534 BCA_1535 resD resE TRUE 0.968 0.000 0.111 1.000 Y NA
 7632529 7632530 BCA_1535 BCA_1536 resE   FALSE 0.403 138.000 0.108 1.000   NA
 7632530 7632531 BCA_1536 BCA_1537     FALSE 0.405 85.000 0.108 1.000   NA
 7632533 7632534 BCA_1540 BCA_1541     FALSE 0.079 58.000 0.000 NA   NA
 7632536 7632537 BCA_1543 BCA_1544   recQ1 TRUE 0.693 -10.000 0.103 NA   NA
 7632537 7632538 BCA_1544 BCA_1545 recQ1   FALSE 0.294 72.000 0.192 NA   NA
 7632538 7632539 BCA_1545 BCA_1546     TRUE 0.619 23.000 0.320 NA   NA
 7632539 7632540 BCA_1546 BCA_1547     FALSE 0.485 58.000 0.233 1.000   NA
 7632540 7632541 BCA_1547 BCA_1548     TRUE 0.855 0.000 0.433 1.000   NA
 7632541 7632542 BCA_1548 BCA_1549     TRUE 0.645 78.000 0.417 NA N NA
 7632542 7632543 BCA_1549 BCA_1550   gudB FALSE 0.091 268.000 0.222 NA N NA
 7632543 7632544 BCA_1550 BCA_1551 gudB   FALSE 0.269 146.000 0.233 NA   NA
 7632544 7632545 BCA_1551 BCA_1552     TRUE 0.564 93.000 0.700 NA   NA
 7632545 7632546 BCA_1552 BCA_1553     TRUE 0.556 80.000 0.727 NA   NA
 7632546 7632547 BCA_1553 BCA_1554     FALSE 0.422 110.000 0.044 1.000   NA
 7632549 7632550 BCA_1556 BCA_1557 cmk rpsA FALSE 0.058 334.000 0.047 1.000 N NA
 7632550 7632551 BCA_1557 BCA_1558 rpsA   TRUE 0.854 13.000 0.061 1.000 N NA
 7632553 7632554 BCA_1560 BCA_1561     TRUE 0.858 -7.000 0.567 NA   NA
 7632554 7632555 BCA_1561 BCA_1562     TRUE 0.858 -3.000 0.633 NA   NA
 7632555 7632556 BCA_1562 BCA_1563   engA FALSE 0.206 125.000 0.014 NA   NA
 7632556 7632557 BCA_1563 BCA_1564 engA gpsA TRUE 0.675 19.000 0.068 1.000   NA
 7632557 7632558 BCA_1564 BCA_1565 gpsA   FALSE 0.251 117.000 0.039 NA   NA
 7632558 7632559 BCA_1565 BCA_1566     FALSE 0.005 267.000 0.000 NA   NA
 7632559 7632560 BCA_1566 BCA_1567     TRUE 0.596 65.000 0.771 NA   NA
 7632560 7632561 BCA_1567 BCA_1568   spoIVA FALSE 0.033 243.000 0.081 NA   NA
 7632561 7632562 BCA_1568 BCA_1569 spoIVA hup1 FALSE 0.004 299.000 0.000 NA   NA
 7632562 7632563 BCA_1569 BCA_1570 hup1 folE TRUE 0.695 121.000 0.154 1.000 N NA
 7632563 7632564 BCA_1570 BCA_1571 folE   FALSE 0.053 259.000 0.114 1.000   NA
 7632564 7632565 BCA_1571 BCA_1572   menG TRUE 0.799 30.000 0.708 1.000   NA
 7632565 7632566 BCA_1572 BCA_1573 menG hepT TRUE 0.947 32.000 0.476 1.000 Y NA
 7632566 7632567 BCA_1573 BCA_1574 hepT   TRUE 0.666 125.000 0.054 1.000 N NA
 7632567 7632568 BCA_1574 BCA_1575   aroC1 FALSE 0.093 271.000 0.002 1.000 N NA
 7632568 7632569 BCA_1575 BCA_1576 aroC1 aroB TRUE 0.982 0.000 0.110 0.001 Y NA
 7632569 7632570 BCA_1576 BCA_1577 aroB hisC1 TRUE 0.853 132.000 0.009 1.000 Y NA
 7632570 7632571 BCA_1577 BCA_1578 hisC1   FALSE 0.015 313.000 0.000 1.000   NA
 7632571 7632572 BCA_1578 BCA_1579     FALSE 0.395 74.000 0.375 NA   NA
 7632572 7632573 BCA_1579 BCA_1580     FALSE 0.388 155.000 0.583 NA   NA
 7632573 7632574 BCA_1580 BCA_1581   qcrA FALSE 0.449 144.000 0.540 NA   NA
 7632574 7632575 BCA_1581 BCA_1582 qcrA qcrB TRUE 0.916 1.000 0.447 0.033   NA
 7632575 7632576 BCA_1582 BCA_1583 qcrB qcrC TRUE 0.693 44.000 0.095 0.033   NA
 7632576 7632577 BCA_1583 BCA_1584 qcrC   FALSE 0.282 111.000 0.069 NA   NA
 7632577 7632578 BCA_1584 BCA_1585     FALSE 0.462 26.000 0.104 NA   NA
 7632578 7632579 BCA_1585 BCA_1586     FALSE 0.293 108.000 0.104 NA   NA
 7632579 7632580 BCA_1586 BCA_1587     TRUE 0.666 -22.000 0.050 NA   NA
 7632580 7632581 BCA_1587 BCA_1588     FALSE 0.198 102.000 0.020 NA   NA
 7632583 7632584 BCA_1590 BCA_1591   dapB TRUE 0.574 0.000 0.044 NA   NA
 7632584 7632585 BCA_1591 BCA_1592 dapB mgsA TRUE 0.901 15.000 0.044 0.039 N NA
 7632585 7632586 BCA_1592 BCA_1593 mgsA   FALSE 0.546 12.000 0.081 NA   NA
 7632586 7632587 BCA_1593 BCA_1594     TRUE 0.702 -3.000 0.210 NA   NA
 7632587 7632588 BCA_1594 BCA_1595     TRUE 0.924 -13.000 0.126 1.000 N NA
 7632588 7632589 BCA_1595 BCA_1596   birA TRUE 0.926 -15.000 0.134 1.000 N NA
 7632591 7632592 BCA_1598 BCA_1599 panB panC TRUE 0.987 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 7632592 7632593 BCA_1599 BCA_1600 panC panD TRUE 0.962 13.000 0.342 1.000 Y NA
 7632593 7632594 BCA_1600 BCA_1601 panD   TRUE 0.655 129.000 0.053 1.000 N NA
 7632594 7632595 BCA_1601 BCA_1602     FALSE 0.026 251.000 0.056 NA   NA
 7632595 7632596 BCA_1602 BCA_1603     TRUE 0.674 8.000 0.289 NA   NA
 7632596 7632597 BCA_1603 BCA_1604   aspB TRUE 0.676 19.000 0.367 NA   NA
 7632597 7632598 BCA_1604 BCA_1605 aspB dnaD TRUE 0.594 122.000 0.072 NA N NA
 7632598 7632599 BCA_1605 BCA_1606 dnaD nth TRUE 0.936 16.000 0.075 NA Y NA
 7632599 7632600 BCA_1606 BCA_1607 nth   FALSE 0.525 4.000 0.034 NA   NA
 7632601 7632602 BCA_1608 BCA_1609   recU FALSE 0.397 66.000 0.056 1.000   NA
 7632603 7632604 BCA_1610 BCA_1611     FALSE 0.007 250.000 0.000 NA   NA
 7632604 7632605 BCA_1611 BCA_1612     FALSE 0.083 121.000 0.000 NA   NA
 7632605 7632606 BCA_1612 BCA_1613     FALSE 0.544 16.000 0.148 NA   NA
 7632608 7632609 BCA_1615 BCA_1616     FALSE 0.265 155.000 0.318 NA   NA
 7632609 7632610 BCA_1616 BCA_1617     FALSE 0.274 57.000 0.074 NA   NA
 7632610 7632611 BCA_1617 BCA_1618     FALSE 0.516 98.000 0.579 NA   NA
 7632611 7632612 BCA_1618 BCA_1619     FALSE 0.068 86.000 0.000 NA   NA
 7632612 7632613 BCA_1619 BCA_1620     FALSE 0.026 178.000 0.000 NA   NA
 7632613 7632614 BCA_1620 BCA_1621     FALSE 0.196 62.000 0.014 NA   NA
 7632614 7632615 BCA_1621 BCA_1622     FALSE 0.317 138.000 0.250 NA   NA
 7632615 7632616 BCA_1622 BCA_1623     TRUE 0.675 106.000 0.118 1.000 N NA
 7632616 7632617 BCA_1623 BCA_1624     FALSE 0.443 45.000 0.021 1.000   NA
 7632619 7632620 BCA_1626 BCA_1628 maP2 xpt FALSE 0.047 326.000 0.000 1.000 N NA
 7632620 7632621 BCA_1628 BCA_1629 xpt pbuX TRUE 0.961 4.000 0.056 1.000 Y NA
 7632623 7632624 BCA_1631 BCA_1632     FALSE 0.073 195.000 0.089 NA   NA
 7632626 7632627 BCA_1634 BCA_1635     FALSE 0.480 22.000 0.069 NA   NA
 7632627 7632628 BCA_1635 BCA_1636     FALSE 0.552 3.000 0.046 NA   NA
 7632628 7632629 BCA_1636 BCA_1637     FALSE 0.086 117.000 0.000 NA   NA
 7632629 7632630 BCA_1637 BCA_1638     FALSE 0.178 22.000 0.000 NA   NA
 7632630 7632631 BCA_1638 BCA_1639     FALSE 0.001 527.000 0.000 NA   NA
 7632633 7632634 BCA_1641 BCA_1642     TRUE 0.855 4.000 0.765 NA   NA
 7632634 7632635 BCA_1642 BCA_1643     TRUE 0.850 -3.000 0.588 NA   NA
 7632635 7632636 BCA_1643 BCA_1645     FALSE 0.001 693.000 0.000 NA   NA
 7632636 7632637 BCA_1645 BCA_1646     FALSE 0.443 131.000 0.157 1.000   NA
 7632637 7632638 BCA_1646 BCA_1647     FALSE 0.070 185.000 0.039 NA   NA
 7632643 7632644 BCA_1652 BCA_1653   rnhA TRUE 0.731 8.000 0.133 1.000   NA
 7632644 7632645 BCA_1653 BCA_1654 rnhA   TRUE 0.644 70.000 0.076 1.000 N NA
 7632646 7632647 BCA_1656 BCA_1657     FALSE 0.215 153.000 0.200 NA   NA
 7632647 7632648 BCA_1657 BCA_1658     TRUE 0.805 13.000 0.680 NA   NA
 7632649 7632650 BCA_1659 BCA_1660   cspB1 TRUE 0.573 120.000 0.619 NA   NA
 7632651 7632652 BCA_1661 BCA_1662     FALSE 0.368 70.000 0.308 NA   NA
 7632652 7632653 BCA_1662 BCA_1663     TRUE 0.735 20.000 0.500 NA   NA
 7632653 7632654 BCA_1663 BCA_1664     FALSE 0.335 91.000 0.259 NA   NA
 7632654 7632655 BCA_1664 BCA_1665     FALSE 0.010 224.000 0.000 NA   NA
 7632655 7632656 BCA_1665 BCA_1666     TRUE 0.780 3.000 0.455 NA   NA
 7632656 7632657 BCA_1666 BCA_1667     FALSE 0.220 187.000 0.364 1.000   NA
 7632657 7632658 BCA_1667 BCA_1668     FALSE 0.434 83.000 0.444 NA   NA
 7632660 7632661 BCA_1670 BCA_1671     FALSE 0.446 96.000 0.188 1.000   NA
 7632661 7632662 BCA_1671 BCA_1672     TRUE 0.666 139.000 0.250 1.000 N NA
 7632664 7632665 BCA_1674 BCA_1675     TRUE 0.719 -37.000 0.100 NA   NA
 7632665 7632666 BCA_1675 BCA_1676     FALSE 0.281 150.000 0.300 NA   NA
 7632666 7632667 BCA_1676 BCA_1677     FALSE 0.033 249.000 0.143 NA   NA
 7632667 7632668 BCA_1677 BCA_1678     FALSE 0.344 51.000 0.190 NA   NA
 7632669 7632670 BCA_1679 BCA_1680     FALSE 0.351 125.000 0.235 NA   NA
 7632670 7632671 BCA_1680 BCA_1681     TRUE 0.657 20.000 0.333 NA   NA
 7632671 7632672 BCA_1681 BCA_1682     FALSE 0.286 129.000 0.118 NA   NA
 7632672 7632673 BCA_1682 BCA_1683     TRUE 0.590 8.000 0.147 NA   NA
 7632673 7632674 BCA_1683 BCA_1684     FALSE 0.254 167.000 0.444 NA   NA
 7632675 7632676 BCA_1685 BCA_1686   hfq1 TRUE 0.625 55.000 0.778 NA   NA
 7632678 7632679 BCA_1688 BCA_1689     TRUE 0.947 23.000 0.192 1.000 Y NA
 7632679 7632680 BCA_1689 BCA_1690     TRUE 0.566 150.000 0.143 1.000 N NA
 7632680 7632681 BCA_1690 BCA_1691     TRUE 0.916 130.000 0.154 0.019 Y NA
 7632681 7632682 BCA_1691 BCA_1692     TRUE 0.781 174.000 0.036 0.006 Y NA
 7632682 7632683 BCA_1692 BCA_1693     FALSE 0.371 30.000 0.042 NA   NA
 7632683 7632684 BCA_1693 BCA_1694     TRUE 0.785 28.000 0.889 NA   NA
 7632685 7632686 BCA_1695 BCA_1696 cheR   FALSE 0.326 40.000 0.053 NA   NA
 7632687 7632688 BCA_1697 BCA_1698     FALSE 0.487 17.000 0.056 NA   NA
 7632688 7632689 BCA_1698 BCA_1699     FALSE 0.474 18.000 0.045 NA   NA
 7632689 7632690 BCA_1699 BCA_1700     TRUE 0.643 206.000 0.028 0.001 Y NA
 7632690 7632691 BCA_1700 BCA_1701     TRUE 0.956 21.000 0.292 1.000 Y NA
 7632691 7632692 BCA_1701 BCA_1702     TRUE 0.980 23.000 0.608 0.001 Y NA
 7632692 7632693 BCA_1702 BCA_1703     TRUE 0.693 -10.000 0.101 NA   NA
 7632693 7632694 BCA_1703 BCA_1704   flgB FALSE 0.002 367.000 0.000 NA   NA
 7632694 7632695 BCA_1704 BCA_1705 flgB flgC TRUE 0.984 21.000 0.804 0.002 Y NA
 7632695 7632696 BCA_1705 BCA_1706 flgC   TRUE 0.971 17.000 0.068 0.002 Y NA
 7632696 7632697 BCA_1706 BCA_1707     TRUE 0.966 23.000 0.076 0.004 Y NA
 7632697 7632698 BCA_1707 BCA_1708   fliG TRUE 0.970 14.000 0.056 0.004 Y NA
 7632698 7632699 BCA_1708 BCA_1709 fliG   TRUE 0.846 -13.000 0.471 NA   NA
 7632699 7632700 BCA_1709 BCA_1710     TRUE 0.664 -3.000 0.129 NA   NA
 7632700 7632701 BCA_1710 BCA_1711     FALSE 0.276 117.000 0.061 NA   NA
 7632701 7632702 BCA_1711 BCA_1712     TRUE 0.855 11.000 0.889 NA   NA
 7632702 7632703 BCA_1712 BCA_1713     FALSE 0.545 4.000 0.047 NA   NA
 7632703 7632704 BCA_1713 BCA_1714     FALSE 0.509 22.000 0.117 NA   NA
 7632704 7632705 BCA_1714 BCA_1715     FALSE 0.351 50.000 0.195 NA   NA
 7632705 7632706 BCA_1715 BCA_1716     FALSE 0.004 295.000 0.000 NA   NA
 7632706 7632707 BCA_1716 BCA_1717     FALSE 0.223 129.000 0.033 NA   NA
 7632707 7632708 BCA_1717 BCA_1718     FALSE 0.001 801.000 0.000 NA   NA
 7632709 7632710 BCA_1719 BCA_1720     FALSE 0.127 239.000 0.000 0.001   NA
 7632711 7632712 BCA_1721 BCA_1722     FALSE 0.270 63.000 0.083 NA   NA
 7632712 7632713 BCA_1722 BCA_1723     TRUE 0.859 15.000 0.079 0.001   NA
 7632713 7632714 BCA_1723 BCA_1724     TRUE 0.974 11.000 0.032 0.001 Y NA
 7632714 7632715 BCA_1724 BCA_1725     TRUE 0.705 13.000 0.400 NA   NA
 7632715 7632716 BCA_1725 BCA_1726     TRUE 0.639 -3.000 0.073 NA   NA
 7632716 7632717 BCA_1726 BCA_1727     TRUE 0.955 34.000 0.162 0.003 Y NA
 7632717 7632718 BCA_1727 BCA_1728   fliR TRUE 0.967 16.000 0.181 0.095 Y NA
 7632718 7632719 BCA_1728 BCA_1729 fliR   TRUE 0.973 11.000 0.259 0.095 Y NA
 7632719 7632720 BCA_1729 BCA_1730   flhA TRUE 0.967 24.000 0.207 0.003 Y NA
 7632720 7632721 BCA_1730 BCA_1731 flhA   TRUE 0.974 15.000 0.440 0.095 Y NA
 7632721 7632722 BCA_1731 BCA_1732     TRUE 0.899 43.000 0.045 1.000 Y NA
 7632722 7632723 BCA_1732 BCA_1733     FALSE 0.346 118.000 0.200 NA   NA
 7632723 7632724 BCA_1733 BCA_1734     TRUE 0.775 18.000 0.600 NA   NA
 7632724 7632725 BCA_1734 BCA_1735     TRUE 0.887 -7.000 0.133 NA N NA
 7632725 7632726 BCA_1735 BCA_1736     TRUE 0.798 -9.000 0.338 NA   NA
 7632726 7632727 BCA_1736 BCA_1737     FALSE 0.231 63.000 0.044 NA   NA
 7632727 7632728 BCA_1737 BCA_1738     FALSE 0.359 88.000 0.300 NA   NA
 7632728 7632729 BCA_1738 BCA_1739     TRUE 0.844 -7.000 0.500 NA   NA
 7632730 7632731 BCA_1740 BCA_1741     TRUE 0.626 1.000 0.114 NA   NA
 7632731 7632732 BCA_1741 BCA_1742     TRUE 0.729 3.000 0.051 1.000   NA
 7632732 7632733 BCA_1742 BCA_1743     FALSE 0.131 188.000 0.034 1.000   NA
 7632733 7632734 BCA_1743 BCA_1744     FALSE 0.462 67.000 0.231 1.000   NA
 7632735 7632736 BCA_1745 BCA_1746     FALSE 0.531 106.000 0.571 NA   NA
 7632738 7632739 BCA_1748 BCA_1749     TRUE 0.968 -22.000 0.419 0.031 N NA
 7632739 7632740 BCA_1749 BCA_1750     TRUE 0.983 13.000 0.750 0.031 Y NA
 7632740 7632741 BCA_1750 BCA_1751     TRUE 0.913 0.000 0.278 1.000 N NA
 7632741 7632742 BCA_1751 BCA_1752     TRUE 0.585 21.000 0.241 NA   NA
 7632744 7632745 BCA_1754 BCA_1755     FALSE 0.241 162.000 0.375 NA   NA
 7632745 7632746 BCA_1755 BCA_1756     TRUE 0.588 101.000 0.500 1.000   NA
 7632746 7632747 BCA_1756 BCA_1757     FALSE 0.319 51.000 0.143 NA   NA
 7632747 7632748 BCA_1757 BCA_1758     FALSE 0.038 159.000 0.000 NA   NA
 7632748 7632749 BCA_1758 BCA_1759     FALSE 0.183 90.000 0.014 NA   NA
 7632750 7632751 BCA_1760 BCA_1761     FALSE 0.385 37.000 0.096 NA   NA
 7632751 7632752 BCA_1761 BCA_1762     TRUE 0.760 -16.000 0.247 NA   NA
 7632755 7632756 BCA_1765 BCA_1766     TRUE 0.861 -3.000 0.643 NA   NA
 7632758 7632759 BCA_1768 BCA_1769     FALSE 0.062 194.000 0.049 NA   NA
 7632760 7632761 BCA_1770 BCA_1771     TRUE 0.863 17.000 0.194 1.000 N NA
 7632761 7632762 BCA_1771 BCA_1772     FALSE 0.094 183.000 0.097 NA   NA
 7632763 7632764 BCA_1773 BCA_1774     FALSE 0.185 21.000 0.000 NA   NA
 7632764 7632765 BCA_1774 BCA_1775     TRUE 0.813 14.000 0.750 NA   NA
 7632765 7632766 BCA_1775 BCA_1776     FALSE 0.421 113.000 0.312 NA   NA
 7632766 7632767 BCA_1776 BCA_1777   nhaC2 FALSE 0.003 333.000 0.000 NA   NA
 7632767 7632768 BCA_1777 BCA_1778 nhaC2 fumC FALSE 0.312 254.000 0.003 1.000 Y NA
 7632772 7632773 BCA_1782 BCA_1783     FALSE 0.272 99.000 0.111 NA   NA
 7632775 7632776 BCA_1785 BCA_1786     FALSE 0.299 108.000 0.125 NA   NA
 7632776 7632777 BCA_1786 BCA_1787     TRUE 0.859 5.000 0.250 NA N NA
 7632777 7632778 BCA_1787 BCA_1788   ccdA1 TRUE 0.853 55.000 0.171 NA Y NA
 7632778 7632779 BCA_1788 BCA_1789 ccdA1   TRUE 0.955 19.000 0.241 1.000 Y NA
 7632779 7632780 BCA_1789 BCA_1790     TRUE 0.628 18.000 0.011 1.000   NA
 7632782 7632783 BCA_1792 BCA_1793   dsdA FALSE 0.007 248.000 0.000 NA   NA
 7632783 7632784 BCA_1793 BCA_1794 dsdA   FALSE 0.200 146.000 0.065 NA   NA
 7632785 7632786 BCA_1795 BCA_1796     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 7632786 7632787 BCA_1796 BCA_1797     TRUE 0.809 -7.000 0.393 NA   NA
 7632787 7632788 BCA_1797 BCA_1798     TRUE 0.814 -3.000 0.455 NA   NA
 7632789 7632790 BCA_1799 BCA_1800     TRUE 0.987 5.000 0.857 0.019 Y NA
 7632790 7632791 BCA_1800 BCA_1801     TRUE 0.867 118.000 0.667 0.098 N NA
 7632791 7632792 BCA_1801 BCA_1802     TRUE 0.721 38.000 0.250 NA N NA
 7632792 7632793 BCA_1802 BCA_1803     TRUE 0.959 2.000 0.227 NA Y NA
 7632793 7632794 BCA_1803 BCA_1804     TRUE 0.703 112.000 0.160 1.000 N NA
 7632796 7632797 BCA_1806 BCA_1807   aspA2 TRUE 0.902 25.000 0.700 1.000 N NA
 7632797 7632798 BCA_1807 BCA_1808 aspA2 malS TRUE 0.758 75.000 0.583 1.000 N NA
 7632798 7632799 BCA_1808 BCA_1809 malS   TRUE 0.739 75.000 0.500 1.000 N NA
 7632799 7632800 BCA_1809 BCA_1810     TRUE 0.977 3.000 0.600 1.000 Y NA
 7632800 7632801 BCA_1810 BCA_1811     TRUE 0.716 5.000 0.333 NA   NA
 7632801 7632802 BCA_1811 BCA_1812     TRUE 0.618 -3.000 0.057 NA   NA
 7632804 7632805 BCA_1814 BCA_1815 asnA   FALSE 0.008 242.000 0.000 NA   NA
 7632805 7632806 BCA_1815 BCA_1816     FALSE 0.007 247.000 0.000 NA   NA
 7632807 7632808 BCA_1817 BCA_1818     FALSE 0.198 148.000 0.077 NA   NA
 7632808 7632809 BCA_1818 BCA_1819   dapG1 FALSE 0.002 350.000 0.000 NA   NA
 7632810 7632811 BCA_1821 BCA_1822     TRUE 0.758 4.000 0.417 NA   NA
 7632811 7632812 BCA_1822 BCA_1823     TRUE 0.739 6.000 0.400 NA   NA
 7632814 7632815 BCA_1825 BCA_1826     FALSE 0.098 321.000 0.000 0.004 N NA
 7632815 7632816 BCA_1826 BCA_1827     TRUE 0.822 146.000 0.333 NA Y NA
 7632816 7632817 BCA_1827 BCA_1828     FALSE 0.496 29.000 0.222 NA   NA
 7632819 7632820 BCA_1830 BCA_1831     FALSE 0.182 88.000 0.015 NA   NA
 7632820 7632821 BCA_1831 BCA_1832     FALSE 0.090 177.000 0.044 NA   NA
 7632821 7632822 BCA_1832 BCA_1833     FALSE 0.437 36.000 0.194 NA   NA
 7632822 7632823 BCA_1833 BCA_1834     FALSE 0.148 204.000 0.000 0.057   NA
 7632827 7632828 BCA_1838 BCA_1839 fsR cysK2 TRUE 0.813 11.000 0.059 NA N NA
 7632828 7632829 BCA_1839 BCA_1840 cysK2   FALSE 0.408 80.000 0.143 1.000   NA
 7632829 7632830 BCA_1840 BCA_1841     TRUE 0.576 81.000 0.778 NA   NA
 7632834 7632835 BCA_1845 BCA_1846     FALSE 0.178 183.000 0.412 NA   NA
 7632835 7632836 BCA_1846 BCA_1847     FALSE 0.451 111.000 0.375 NA   NA
 7632836 7632837 BCA_1847 BCA_1848     FALSE 0.001 462.000 0.000 NA   NA
 7632839 7632840 BCA_1850 BCA_1851     FALSE 0.158 25.000 0.000 NA   NA
 7632840 7632841 BCA_1851 BCA_1852     FALSE 0.019 188.000 0.000 NA   NA
 7632842 7632843 BCA_1853 BCA_1854 msrA1   TRUE 0.668 91.000 0.194 1.000 N NA
 7632844 7632845 BCA_1855 BCA_1856 ilvE2 ilvB2 TRUE 0.938 23.000 0.017 1.000 Y NA
 7632845 7632846 BCA_1856 BCA_1857 ilvB2   TRUE 0.923 -3.000 0.249 0.001   NA
 7632846 7632847 BCA_1857 BCA_1858   ilvC2 TRUE 0.856 15.000 0.130 0.002   NA
 7632847 7632848 BCA_1858 BCA_1859 ilvC2 ilvD TRUE 0.931 47.000 0.022 0.002 Y NA
 7632848 7632849 BCA_1859 BCA_1860 ilvD ilvA TRUE 0.918 32.000 0.012 1.000 Y NA
 7632851 7632852 BCA_1862 BCA_1863     FALSE 0.447 16.000 0.032 NA   NA
 7632852 7632853 BCA_1863 BCA_1864     FALSE 0.215 169.000 0.075 1.000   NA
 7632855 7632856 BCA_1866 BCA_1867     FALSE 0.080 56.000 0.000 NA   NA
 7632858 7632859 BCA_1869 BCA_1870     FALSE 0.541 128.000 0.588 NA   NA
 7632859 7632860 BCA_1870 BCA_1871     FALSE 0.053 211.000 0.000 1.000   NA
 7632860 7632861 BCA_1871 BCA_1872     FALSE 0.494 28.000 0.207 NA   NA
 7632861 7632862 BCA_1872 BCA_1873     FALSE 0.241 72.000 0.069 NA   NA
 7632862 7632863 BCA_1873 BCA_1874     FALSE 0.002 347.000 0.000 NA   NA
 7632863 7632864 BCA_1874 BCA_1875     FALSE 0.351 -34.000 0.000 NA   NA
 7632864 7632865 BCA_1875 BCA_1876     FALSE 0.202 13.000 0.000 NA   NA
 7632866 7632867 BCA_1877 BCA_1878     FALSE 0.007 248.000 0.000 NA   NA
 7632870 7632871 BCA_1881 BCA_1882     TRUE 0.797 27.000 1.000 NA   NA
 7632871 7632872 BCA_1882 BCA_1883     FALSE 0.069 72.000 0.000 NA   NA
 7632874 7632875 BCA_1885 BCA_1886     FALSE 0.353 -40.000 0.000 NA   NA
 7632875 7632876 BCA_1886 BCA_1887     FALSE 0.109 41.000 0.000 NA   NA
 7632876 7632877 BCA_1887 BCA_1888     FALSE 0.267 0.000 0.000 NA   NA
 7632877 7632878 BCA_1888 BCA_1889     FALSE 0.139 30.000 0.000 NA   NA
 7632878 7632879 BCA_1889 BCA_1890     FALSE 0.231 6.000 0.000 NA   NA
 7632879 7632880 BCA_1890 BCA_1891     FALSE 0.101 44.000 0.000 NA   NA
 7632880 7632881 BCA_1891 BCA_1892     FALSE 0.125 35.000 0.000 NA   NA
 7632881 7632882 BCA_1892 BCA_1893     FALSE 0.158 25.000 0.000 NA   NA
 7632882 7632883 BCA_1893 BCA_1894     FALSE 0.191 15.000 0.000 NA   NA
 7632883 7632884 BCA_1894 BCA_1895     FALSE 0.202 13.000 0.000 NA   NA
 7632884 7632885 BCA_1895 BCA_1896     FALSE 0.192 16.000 0.000 NA   NA
 7632885 7632886 BCA_1896 BCA_1897     FALSE 0.111 40.000 0.000 NA   NA
 7632886 7632887 BCA_1897 BCA_1898     FALSE 0.101 44.000 0.000 NA   NA
 7632887 7632888 BCA_1898 BCA_1899     FALSE 0.142 29.000 0.000 NA   NA
 7632888 7632889 BCA_1899 BCA_1900     FALSE 0.158 25.000 0.000 NA   NA
 7632889 7632890 BCA_1900 BCA_1901     FALSE 0.107 42.000 0.000 NA   NA
 7632890 7632891 BCA_1901 BCA_1902     FALSE 0.118 37.000 0.000 NA   NA
 7632891 7632892 BCA_1902 BCA_1903     TRUE 0.630 0.000 0.000 1.000   NA
 7632892 7632893 BCA_1903 BCA_1904     FALSE 0.005 275.000 0.000 NA   NA
 7632893 7632894 BCA_1904 BCA_1905     FALSE 0.010 219.000 0.000 NA   NA
 7632894 7632895 BCA_1905 BCA_1906     FALSE 0.185 21.000 0.000 NA   NA
 7632895 7632896 BCA_1906 BCA_1907     FALSE 0.085 112.000 0.000 NA   NA
 7632896 7632897 BCA_1907 BCA_1908     FALSE 0.145 28.000 0.000 NA   NA
 7632897 7632898 BCA_1908 BCA_1909     TRUE 0.868 0.000 0.750 NA   NA
 7632898 7632899 BCA_1909 BCA_1910     FALSE 0.004 286.000 0.000 NA   NA
 7632899 7632900 BCA_1910 BCA_1911     FALSE 0.178 22.000 0.000 NA   NA
 7632900 7632901 BCA_1911 BCA_1912     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 7632901 7632902 BCA_1912 BCA_1913     FALSE 0.001 465.000 0.000 NA   NA
 7632902 7632903 BCA_1913 BCA_1914     FALSE 0.101 44.000 0.000 NA   NA
 7632903 7632904 BCA_1914 BCA_1915     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 7632904 7632905 BCA_1915 BCA_1916     FALSE 0.002 446.000 0.000 NA   NA
 7632905 7632906 BCA_1916 BCA_1917     TRUE 0.787 -3.000 0.385 NA   NA
 7632906 7632907 BCA_1917 BCA_1918     TRUE 0.715 12.000 0.400 NA   NA
 7632907 7632908 BCA_1918 BCA_1919     TRUE 0.700 0.000 0.250 NA   NA
 7632908 7632909 BCA_1919 BCA_1920     TRUE 0.671 4.000 0.250 NA   NA
 7632909 7632910 BCA_1920 BCA_1921     TRUE 0.826 6.000 0.667 NA   NA
 7632910 7632911 BCA_1921 BCA_1922     FALSE 0.253 2.000 0.000 NA   NA
 7632911 7632912 BCA_1922 BCA_1923     TRUE 0.801 2.000 0.500 NA   NA
 7632912 7632913 BCA_1923 BCA_1924     TRUE 0.891 0.000 1.000 NA   NA
 7632913 7632914 BCA_1924 BCA_1925     TRUE 0.605 1.000 0.074 NA   NA
 7632914 7632915 BCA_1925 BCA_1926     TRUE 0.561 7.000 0.074 NA   NA
 7632915 7632916 BCA_1926 BCA_1927     FALSE 0.009 231.000 0.000 NA   NA
 7632916 7632917 BCA_1927 BCA_1928     FALSE 0.107 42.000 0.000 NA   NA
 7632917 7632918 BCA_1928 BCA_1929     FALSE 0.289 -3.000 0.000 NA   NA
 7632918 7632919 BCA_1929 BCA_1930     FALSE 0.078 106.000 0.000 NA   NA
 7632919 7632920 BCA_1930 BCA_1931     TRUE 0.564 15.000 0.182 NA   NA
 7632920 7632921 BCA_1931 BCA_1932     FALSE 0.248 3.000 0.000 NA   NA
 7632921 7632922 BCA_1932 BCA_1933     FALSE 0.267 0.000 0.000 NA   NA
 7632923 7632924 BCA_1934 BCA_1935     FALSE 0.007 247.000 0.000 NA   NA
 7632925 7632926 BCA_1936 BCA_1937     FALSE 0.001 514.000 0.000 NA   NA
 7632926 7632927 BCA_1937 BCA_1938     FALSE 0.002 362.000 0.000 NA   NA
 7632927 7632928 BCA_1938 BCA_1939     FALSE 0.389 134.000 0.333 NA   NA
 7632928 7632929 BCA_1939 BCA_1940     FALSE 0.267 67.000 0.095 NA   NA
 7632929 7632930 BCA_1940 BCA_1941     FALSE 0.054 277.000 0.000 0.072   NA
 7632932 7632933 BCA_1943 BCA_1944     TRUE 0.972 -10.000 0.007 1.000 Y NA
 7632933 7632934 BCA_1944 BCA_1945     FALSE 0.252 83.000 0.000 1.000   NA
 7632934 7632935 BCA_1945 BCA_1946     FALSE 0.541 13.000 0.000 1.000   NA
 7632941 7632942 BCA_1952 BCA_1954     FALSE 0.009 233.000 0.000 NA   NA
 7632942 7632943 BCA_1954 BCA_1955     FALSE 0.014 594.000 0.000 0.093   NA
 7632943 7632944 BCA_1955 BCA_1956     TRUE 0.837 37.000 0.500 0.003   NA
 7632944 7632945 BCA_1956 BCA_1957     FALSE 0.293 228.000 0.625 0.003   NA
 7632945 7632946 BCA_1957 BCA_1958     FALSE 0.146 236.000 0.222 0.093   NA
 7632946 7632947 BCA_1958 BCA_1959     FALSE 0.037 358.000 0.000 1.000 N NA
 7632947 7632948 BCA_1959 BCA_1960   deoC FALSE 0.077 307.000 0.077 1.000 N NA
 7632948 7632949 BCA_1960 BCA_1961 deoC   TRUE 0.856 103.000 0.026 1.000 Y NA
 7632949 7632950 BCA_1961 BCA_1962   pyn1 TRUE 0.909 37.000 0.031 1.000 Y NA
 7632950 7632951 BCA_1962 BCA_1963 pyn1 cdd1 TRUE 0.917 34.000 0.031 1.000 Y NA
 7632951 7632952 BCA_1963 BCA_1964 cdd1   FALSE 0.481 27.000 0.167 NA   NA
 7632953 7632954 BCA_1965 BCA_1966     FALSE 0.003 307.000 0.000 NA   NA
 7632954 7632955 BCA_1966 BCA_1967     TRUE 0.704 52.000 0.750 1.000   NA
 7632956 7632957 BCA_1968 BCA_1969     TRUE 0.667 118.000 0.027 1.000 N NA
 7632957 7632958 BCA_1969 BCA_1970     FALSE 0.019 606.000 0.000 1.000 N NA
 7632960 7632961 BCA_1972 BCA_1973 topB2   FALSE 0.021 270.000 0.065 NA   NA
 7632963 7632964 BCA_1975 BCA_1976     FALSE 0.117 240.000 0.000 1.000 N NA
 7632964 7632965 BCA_1976 BCA_1977     FALSE 0.336 84.000 0.010 1.000   NA
 7632965 7632966 BCA_1977 BCA_1978     FALSE 0.012 336.000 0.000 1.000   NA
 7632966 7632967 BCA_1978 BCA_1979     FALSE 0.527 100.000 0.600 NA   NA
 7632968 7632969 BCA_1980 BCA_1981     FALSE 0.316 122.000 0.158 NA   NA
 7632970 7632971 BCA_1982 BCA_1983     TRUE 0.880 121.000 0.389 NA Y NA
 7632971 7632972 BCA_1983 BCA_1984     TRUE 0.568 72.000 0.158 NA N NA
 7632972 7632973 BCA_1984 BCA_1985     TRUE 0.636 58.000 0.123 0.032   NA
 7632973 7632974 BCA_1985 BCA_1986     FALSE 0.412 127.000 0.333 NA   NA
 7632974 7632975 BCA_1986 BCA_1987     FALSE 0.313 112.000 0.128 NA   NA
 7632975 7632976 BCA_1987 BCA_1988     FALSE 0.109 179.000 0.128 NA   NA
 7632978 7632979 BCA_1990 BCA_1991     TRUE 0.819 -10.000 0.400 NA   NA
 7632979 7632980 BCA_1991 BCA_1992     TRUE 0.658 1.000 0.182 NA   NA
 7632982 7632983 BCA_1994 BCA_1995     TRUE 0.846 14.000 0.052 1.000 N NA
 7632983 7632984 BCA_1995 BCA_1996     TRUE 0.978 5.000 0.333 0.071 Y NA
 7632984 7632985 BCA_1996 BCA_1997     TRUE 0.959 0.000 0.121 NA Y NA
 7632985 7632986 BCA_1997 BCA_1998     FALSE 0.264 182.000 0.054 NA N NA
 7632986 7632987 BCA_1998 BCA_1999     TRUE 0.899 90.000 0.750 NA Y NA
 7632987 7632988 BCA_1999 BCA_2000     TRUE 0.991 -22.000 0.708 0.025 Y NA
 7632988 7632989 BCA_2000 BCA_2001     TRUE 0.969 22.000 0.746 1.000 Y NA
 7632989 7632990 BCA_2001 BCA_2002     TRUE 0.986 2.000 0.687 0.030 Y NA
 7632992 7632993 BCA_2004 BCA_2005     FALSE 0.391 37.000 0.111 NA   NA
 7632993 7632994 BCA_2005 BCA_2006     TRUE 0.883 2.000 0.647 1.000   NA
 7632994 7632995 BCA_2006 BCA_2007     FALSE 0.366 154.000 0.286 1.000   NA
 7632995 7632996 BCA_2007 BCA_2008     TRUE 0.651 118.000 0.259 NA N NA
 7632996 7632997 BCA_2008 BCA_2009   cydA1 FALSE 0.052 618.000 0.000 NA Y NA
 7632997 7632998 BCA_2009 BCA_2010 cydA1 cydB1 TRUE 0.983 -13.000 0.051 0.032 Y NA
 7632998 7632999 BCA_2010 BCA_2011 cydB1   TRUE 0.968 0.000 0.151 1.000 Y NA
 7632999 7633000 BCA_2011 BCA_2012     TRUE 0.979 3.000 0.168 0.004 Y NA
 7633000 7633001 BCA_2012 BCA_2013     FALSE 0.004 289.000 0.000 NA   NA
 7633001 7633002 BCA_2013 BCA_2014     FALSE 0.394 91.000 0.353 NA   NA
 7633004 7633005 BCA_2016 BCA_2017     FALSE 0.033 245.000 0.000 1.000   NA
 7633005 7633006 BCA_2017 BCA_2018     FALSE 0.001 918.000 0.000 NA   NA
 7633008 7633009 BCA_2020 BCA_2021     TRUE 0.912 2.000 0.306 1.000 N NA
 7633009 7633010 BCA_2021 BCA_2022     TRUE 0.980 -3.000 0.538 1.000 Y NA
 7633010 7633011 BCA_2022 BCA_2023     FALSE 0.163 180.000 0.047 1.000   NA
 7633011 7633012 BCA_2023 BCA_2024     FALSE 0.299 150.000 0.050 1.000   NA
 7633012 7633013 BCA_2024 BCA_2025     FALSE 0.216 135.000 0.040 NA   NA
 7633013 7633014 BCA_2025 BCA_2026     FALSE 0.314 118.000 0.136 NA   NA
 7633014 7633015 BCA_2026 BCA_2027     FALSE 0.069 72.000 0.000 NA   NA
 7633017 7633018 BCA_2029 BCA_2030   hom1 FALSE 0.005 966.000 0.000 1.000   NA
 7633018 7633019 BCA_2030 BCA_2031 hom1 thrC TRUE 0.971 -7.000 0.021 1.000 Y NA
 7633019 7633020 BCA_2031 BCA_2032 thrC thrB TRUE 0.973 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 7633020 7633021 BCA_2032 BCA_2033 thrB   FALSE 0.215 115.000 0.011 NA   NA
 7633021 7633022 BCA_2033 BCA_2034     FALSE 0.011 214.000 0.000 NA   NA
 7633022 7633023 BCA_2034 BCA_2035     FALSE 0.013 204.000 0.000 NA   NA
 7633023 7633024 BCA_2035 BCA_2036     FALSE 0.185 160.000 0.222 NA   NA
 7633024 7633025 BCA_2036 BCA_2037     FALSE 0.460 14.000 0.038 NA   NA
 7633025 7633026 BCA_2037 BCA_2038     TRUE 0.983 -21.000 0.472 1.000 Y NA
 7633026 7633027 BCA_2038 BCA_2039     TRUE 0.661 101.000 0.129 1.000 N NA
 7633027 7633028 BCA_2039 BCA_2040     FALSE 0.530 15.000 0.111 NA   NA
 7633028 7633029 BCA_2040 BCA_2041     FALSE 0.154 160.000 0.111 NA   NA
 7633029 7633030 BCA_2041 BCA_2042     FALSE 0.388 95.000 0.049 1.000   NA
 7633030 7633031 BCA_2042 BCA_2043   asbA FALSE 0.017 299.000 0.000 1.000   NA
 7633031 7633032 BCA_2043 BCA_2044 asbA asbB TRUE 0.928 64.000 0.163 0.000 Y NA
 7633032 7633033 BCA_2044 BCA_2045 asbB asbC TRUE 0.980 -13.000 0.310 1.000 Y NA
 7633033 7633034 BCA_2045 BCA_2046 asbC asbD TRUE 0.835 -3.000 0.526 NA   NA
 7633034 7633035 BCA_2046 BCA_2047 asbD asbE TRUE 0.730 24.000 0.583 NA   NA
 7633035 7633036 BCA_2047 BCA_2048 asbE asbF TRUE 0.559 38.000 0.412 NA   NA
 7633036 7633037 BCA_2048 BCA_2049 asbF   FALSE 0.299 126.000 0.137 NA   NA
 7633037 7633038 BCA_2049 BCA_2050     FALSE 0.243 167.000 0.167 1.000   NA
 7633040 7633041 BCA_2052 BCA_2053     TRUE 0.719 13.000 0.429 NA   NA
 7633042 7633043 BCA_2054 BCA_2055     TRUE 0.562 88.000 0.714 NA   NA
 7633044 7633045 BCA_2056 BCA_2057     FALSE 0.339 147.000 0.375 NA   NA
 7633045 7633046 BCA_2057 BCA_2058     TRUE 0.631 104.000 0.875 NA   NA
 7633046 7633047 BCA_2058 BCA_2059     TRUE 0.619 57.000 0.778 NA   NA
 7633048 7633049 BCA_2060 BCA_2061 nadE   FALSE 0.013 204.000 0.000 NA   NA
 7633049 7633050 BCA_2061 BCA_2062     FALSE 0.111 40.000 0.000 NA   NA
 7633051 7633052 BCA_2063 BCA_2064     FALSE 0.077 60.000 0.000 NA   NA
 7633052 7633053 BCA_2064 BCA_2065     FALSE 0.044 155.000 0.000 NA   NA
 7633053 7633054 BCA_2065 BCA_2066     FALSE 0.001 664.000 0.000 NA   NA
 7633054 7633055 BCA_2066 BCA_2067     FALSE 0.071 69.000 0.000 NA   NA
 7633055 7633056 BCA_2067 BCA_2068     FALSE 0.054 147.000 0.000 NA   NA
 7633056 7633057 BCA_2068 BCA_2069     FALSE 0.495 156.000 1.000 NA   NA
 7633057 7633058 BCA_2069 BCA_2070     TRUE 0.694 48.000 1.000 NA   NA
 7633058 7633059 BCA_2070 BCA_2071     FALSE 0.002 372.000 0.000 NA   NA
 7633059 7633060 BCA_2071 BCA_2072     FALSE 0.071 135.000 0.000 NA   NA
 7633060 7633061 BCA_2072 BCA_2073     FALSE 0.081 55.000 0.000 NA   NA
 7633061 7633062 BCA_2073 BCA_2074     FALSE 0.192 16.000 0.000 NA   NA
 7633062 7633063 BCA_2074 BCA_2075     FALSE 0.429 35.000 0.167 NA   NA
 7633065 7633066 BCA_2077 BCA_2078     FALSE 0.551 94.000 0.667 NA   NA
 7633068 7633069 BCA_2080 BCA_2081     FALSE 0.087 116.000 0.000 NA   NA
 7633069 7633070 BCA_2081 BCA_2082     FALSE 0.049 275.000 0.000 NA N NA
 7633072 7633073 BCA_2084 BCA_2085     TRUE 0.778 49.000 0.429 1.000 N NA
 7633074 7633075 BCA_2086 BCA_2087     TRUE 0.612 85.000 0.889 NA   NA
 7633076 7633077 BCA_2088 BCA_2089   rsgA_1 FALSE 0.100 180.000 0.091 NA   NA
 7633077 7633078 BCA_2089 BCA_2090 rsgA_1   FALSE 0.058 205.000 0.000 1.000   NA
 7633078 7633079 BCA_2090 BCA_2091     FALSE 0.194 200.000 0.667 NA   NA
 7633079 7633080 BCA_2091 BCA_2092     FALSE 0.005 270.000 0.000 NA   NA
 7633082 7633083 BCA_2094 BCA_2095 dps1   FALSE 0.292 107.000 0.111 NA   NA
 7633083 7633084 BCA_2095 BCA_2096     FALSE 0.010 225.000 0.000 NA   NA
 7633085 7633086 BCA_2097 BCA_2098     FALSE 0.481 106.000 0.467 NA   NA
 7633087 7633088 BCA_2099 BCA_2100     TRUE 0.769 85.000 0.636 1.000 N NA
 7633091 7633092 BCA_2103 BCA_2104     FALSE 0.001 455.000 0.000 NA   NA
 7633092 7633093 BCA_2104 BCA_2105     FALSE 0.069 88.000 0.000 NA   NA
 7633093 7633094 BCA_2105 BCA_2106     FALSE 0.194 17.000 0.000 NA   NA
 7633094 7633095 BCA_2106 BCA_2107     FALSE 0.004 305.000 0.000 NA   NA
 7633096 7633097 BCA_2108 BCA_2109     TRUE 0.562 116.000 0.333 1.000   NA
 7633099 7633100 BCA_2111 BCA_2112 ogt1   FALSE 0.529 8.000 0.054 NA   NA
 7633100 7633101 BCA_2112 BCA_2113     FALSE 0.348 77.000 0.296 NA   NA
 7633101 7633102 BCA_2113 BCA_2114   fosB1 TRUE 0.843 59.000 0.129 NA Y NA
 7633102 7633103 BCA_2114 BCA_2115 fosB1   FALSE 0.464 13.000 0.032 NA   NA
 7633103 7633104 BCA_2115 BCA_2116     TRUE 0.678 13.000 0.056 1.000   NA
 7633106 7633107 BCA_2118 BCA_2119 cotH   TRUE 0.574 106.000 0.062 NA N NA
 7633107 7633108 BCA_2119 BCA_2120     FALSE 0.254 105.000 0.062 NA   NA
 7633108 7633109 BCA_2120 BCA_2121     FALSE 0.480 98.000 0.500 NA   NA
 7633109 7633110 BCA_2121 BCA_2122     FALSE 0.140 185.000 0.033 1.000   NA
 7633110 7633111 BCA_2122 BCA_2123     FALSE 0.057 199.000 0.053 NA   NA
 7633111 7633112 BCA_2123 BCA_2124     TRUE 0.866 4.000 0.841 NA   NA
 7633112 7633113 BCA_2124 BCA_2125     FALSE 0.086 196.000 0.195 NA   NA
 7633113 7633114 BCA_2125 BCA_2126     FALSE 0.092 425.000 0.000 1.000 Y NA
 7633114 7633115 BCA_2126 BCA_2127     TRUE 0.756 31.000 0.800 NA   NA
 7633115 7633116 BCA_2127 BCA_2128     FALSE 0.140 187.000 0.333 NA   NA
 7633116 7633117 BCA_2128 BCA_2129     FALSE 0.327 103.000 0.227 NA   NA
 7633118 7633119 BCA_2130 BCA_2131     FALSE 0.540 2.000 0.034 NA   NA
 7633119 7633120 BCA_2131 BCA_2132     FALSE 0.012 209.000 0.000 NA   NA
 7633121 7633122 BCA_2133 BCA_2134   brnQ4 FALSE 0.002 424.000 0.000 NA   NA
 7633122 7633123 BCA_2134 BCA_2135 brnQ4 csaA FALSE 0.374 67.000 0.032 1.000   NA
 7633123 7633124 BCA_2135 BCA_2136 csaA   FALSE 0.451 18.000 0.032 NA   NA
 7633126 7633127 BCA_2138 BCA_2139 spoIIP   FALSE 0.054 224.000 0.214 NA   NA
 7633127 7633128 BCA_2139 BCA_2140     TRUE 0.918 12.000 0.571 1.000 N NA
 7633128 7633129 BCA_2140 BCA_2141     TRUE 0.765 24.000 0.444 1.000   NA
 7633129 7633130 BCA_2141 BCA_2142     FALSE 0.206 185.000 0.286 1.000   NA
 7633132 7633133 BCA_2144 BCA_2145     TRUE 0.959 3.000 0.259 NA Y NA
 7633133 7633134 BCA_2145 BCA_2146     FALSE 0.118 239.000 0.000 1.000 N NA
 7633134 7633135 BCA_2146 BCA_2147     TRUE 0.599 151.000 0.286 1.000 N NA
 7633135 7633136 BCA_2147 BCA_2148