MicrobesOnline Operon Predictions for Caulobacter crescentus NA1000

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5847217 5847218 CCNA_00001 CCNA_00002     TRUE 0.928 -3.000 0.135 NA   NA
 5847218 5847219 CCNA_00002 CCNA_00003     TRUE 0.946 -3.000 0.169 NA N NA
 5847219 5847220 CCNA_00003 CCNA_00004     TRUE 0.916 2.000 0.078 1.000 N NA
 5847220 5847221 CCNA_00004 CCNA_00005   dnaQ TRUE 0.660 32.000 0.092 1.000 N NA
 5847221 5847222 CCNA_00005 CCNA_00006 dnaQ   FALSE 0.172 119.000 0.000 1.000 N NA
 5847222 5847223 CCNA_00006 CCNA_00007     FALSE 0.237 135.000 0.016 1.000 N NA
 5847223 5847224 CCNA_00007 CCNA_00008   dnaA FALSE 0.003 401.000 0.000 1.000 N NA
 5847226 5847227 CCNA_00010 CCNA_00011 dnaK dnaJ TRUE 0.798 163.000 0.236 0.003 Y NA
 5847227 5847228 CCNA_00011 CCNA_00012 dnaJ mutS FALSE 0.171 87.000 0.003 1.000 N NA
 5847228 5847229 CCNA_00012 CCNA_00013 mutS   TRUE 0.564 21.000 0.021 1.000 N NA
 5847230 5847231 CCNA_00014 CCNA_00015 moaC moaB TRUE 0.989 -3.000 0.109 0.003 Y NA
 5847231 5847232 CCNA_00015 CCNA_00016 moaB moaE TRUE 0.977 1.000 0.018 0.003 Y NA
 5847232 5847233 CCNA_00016 CCNA_00017 moaE moaD TRUE 0.995 -3.000 0.501 0.003 Y NA
 5847233 5847234 CCNA_00017 CCNA_00018 moaD moaA TRUE 0.970 4.000 0.010 0.003 Y NA
 5847236 5847237 CCNA_00020 CCNA_00021     FALSE 0.199 172.000 0.100 NA   NA
 5847237 5847238 CCNA_00021 CCNA_00022     TRUE 0.990 -3.000 0.150 0.002 Y NA
 5847239 5847240 CCNA_00023 CCNA_00024     FALSE 0.232 17.000 0.000 NA   NA
 5847241 5847242 CCNA_00025 CCNA_00026     TRUE 0.706 58.000 0.400 1.000 N NA
 5847242 5847243 CCNA_00026 CCNA_00027     FALSE 0.433 99.000 0.073 1.000   NA
 5847243 5847244 CCNA_00027 CCNA_00028     FALSE 0.454 146.000 0.163 1.000   NA
 5847245 5847246 CCNA_00029 CCNA_00030     FALSE 0.302 49.000 0.018 1.000 N NA
 5847247 5847248 CCNA_00031 CCNA_00032 vapC vapB TRUE 0.977 1.000 0.750 NA   NA
 5847248 5847249 CCNA_00032 CCNA_00033 vapB   FALSE 0.001 883.000 0.000 NA   NA
 5847249 5847250 CCNA_00033 CCNA_00034     FALSE 0.330 249.000 0.335 1.000 Y NA
 5847250 5847251 CCNA_00034 CCNA_00035     TRUE 0.967 15.000 0.211 1.000 Y NA
 5847251 5847252 CCNA_00035 CCNA_00036     TRUE 0.989 3.000 0.318 1.000 Y NA
 5847252 5847253 CCNA_00036 CCNA_00037     FALSE 0.207 101.000 0.004 1.000 N NA
 5847253 5847254 CCNA_00037 CCNA_00038     FALSE 0.433 60.000 0.105 NA   NA
 5847254 5847255 CCNA_00038 CCNA_00039     TRUE 0.978 0.000 0.750 NA   NA
 5847255 5847256 CCNA_00039 CCNA_00040     FALSE 0.101 39.000 0.000 NA   NA
 5847256 5847257 CCNA_00040 CCNA_00041     FALSE 0.067 56.000 0.000 NA   NA
 5847257 5847258 CCNA_00041 CCNA_00042     FALSE 0.211 195.000 0.223 NA N NA
 5847258 5847259 CCNA_00042 CCNA_00043     TRUE 0.756 79.000 0.075 NA Y NA
 5847259 5847260 CCNA_00043 CCNA_00044     TRUE 0.975 3.000 0.759 NA   NA
 5847262 5847263 CCNA_00046 CCNA_00047     FALSE 0.074 101.000 0.000 NA   NA
 5847263 5847264 CCNA_00047 CCNA_00048   metK FALSE 0.487 90.000 0.112 1.000   NA
 5847264 5847265 CCNA_00048 CCNA_00049 metK hipB FALSE 0.335 120.000 0.028 1.000 N NA
 5847265 5847266 CCNA_00049 CCNA_00050 hipB   TRUE 0.552 28.000 0.037 1.000 N NA
 5847266 5847267 CCNA_00050 CCNA_00051   corC TRUE 0.946 -3.000 0.213 NA   NA
 5847267 5847268 CCNA_00051 CCNA_00052 corC   TRUE 0.918 9.000 0.222 NA   NA
 5847268 5847269 CCNA_00052 CCNA_00053   phoH TRUE 0.880 20.000 0.457 NA   NA
 5847269 5847270 CCNA_00053 CCNA_00054 phoH   TRUE 0.958 -3.000 0.220 1.000 N NA
 5847270 5847271 CCNA_00054 CCNA_00055     FALSE 0.054 190.000 0.010 1.000 N NA
 5847271 5847272 CCNA_00055 CCNA_00056     FALSE 0.437 46.000 0.061 1.000   NA
 5847272 5847273 CCNA_00056 CCNA_00057     TRUE 0.922 9.000 0.209 1.000   NA
 5847273 5847274 CCNA_00057 CCNA_00058     TRUE 0.514 4.000 0.003 NA   NA
 5847274 5847275 CCNA_00058 CCNA_00059     FALSE 0.323 148.000 0.091 NA   NA
 5847275 5847276 CCNA_00059 CCNA_00060     FALSE 0.217 70.000 0.011 1.000 N NA
 5847278 5847279 CCNA_00062 CCNA_00063 trpS mviN FALSE 0.216 168.000 0.078 1.000   NA
 5847279 5847280 CCNA_00063 CCNA_00064 mviN   FALSE 0.009 240.000 0.000 1.000   NA
 5847280 5847281 CCNA_00064 CCNA_00065     FALSE 0.031 162.000 0.000 NA   NA
 5847281 5847282 CCNA_00065 CCNA_00066     FALSE 0.065 58.000 0.000 NA   NA
 5847282 5847283 CCNA_00066 CCNA_00067     TRUE 0.819 5.000 0.049 NA   NA
 5847283 5847284 CCNA_00067 CCNA_00068   gpsA TRUE 0.880 20.000 0.456 NA   NA
 5847284 5847285 CCNA_00068 CCNA_00069 gpsA   TRUE 0.918 -3.000 0.070 1.000 N NA
 5847286 5847287 CCNA_00070 CCNA_00071     TRUE 0.980 5.000 0.056 0.002 Y NA
 5847287 5847288 CCNA_00071 CCNA_00072     TRUE 0.796 26.000 0.263 NA   NA
 5847288 5847289 CCNA_00072 CCNA_00073     TRUE 0.965 -3.000 0.408 NA   NA
 5847289 5847290 CCNA_00073 CCNA_R0001     FALSE 0.094 42.000 0.000 NA   NA
 5847291 5847292 CCNA_00074 CCNA_00075     TRUE 0.967 25.000 0.562 1.000 Y NA
 5847292 5847293 CCNA_00075 CCNA_00076     FALSE 0.191 67.000 0.022 NA   NA
 5847293 5847294 CCNA_00076 CCNA_00077     TRUE 0.924 -3.000 0.118 NA   NA
 5847294 5847295 CCNA_00077 CCNA_00078     TRUE 0.986 3.000 0.103 0.008 Y NA
 5847295 5847296 CCNA_00078 CCNA_00079     FALSE 0.372 88.000 0.046 1.000 N NA
 5847298 5847299 CCNA_00081 CCNA_00082   lysS FALSE 0.004 250.000 0.000 NA   NA
 5847299 5847300 CCNA_00082 CCNA_00083 lysS   FALSE 0.096 163.000 0.005 1.000 N NA
 5847301 5847302 CCNA_00084 CCNA_00085 purH   TRUE 0.592 13.000 0.004 1.000 N NA
 5847307 5847308 CCNA_00089 CCNA_00090     FALSE 0.147 65.000 0.000 1.000 N NA
 5847308 5847309 CCNA_00090 CCNA_00091     FALSE 0.017 206.000 0.000 NA N NA
 5847309 5847310 CCNA_00091 CCNA_00092     TRUE 0.912 -3.000 0.077 NA N NA
 5847310 5847311 CCNA_00092 CCNA_00093     FALSE 0.072 99.000 0.000 NA   NA
 5847311 5847312 CCNA_00093 CCNA_00094     FALSE 0.060 73.000 0.000 NA   NA
 5847312 5847313 CCNA_00094 CCNA_00095     FALSE 0.308 104.000 0.019 1.000 N NA
 5847314 5847315 CCNA_00096 CCNA_00097     FALSE 0.069 54.000 0.000 NA   NA
 5847316 5847317 CCNA_00098 CCNA_00099     TRUE 0.695 6.000 0.020 NA   NA
 5847317 5847318 CCNA_00099 CCNA_00100     TRUE 0.754 10.000 0.042 NA   NA
 5847318 5847319 CCNA_00100 CCNA_00101   rsmB FALSE 0.264 86.000 0.018 1.000 N NA
 5847320 5847321 CCNA_00102 CCNA_00103     FALSE 0.065 88.000 0.000 NA   NA
 5847323 5847324 CCNA_00105 CCNA_00106     FALSE 0.205 48.000 0.008 NA N NA
 5847325 5847326 CCNA_00107 CCNA_00108     TRUE 0.889 10.000 0.148 NA   NA
 5847326 5847327 CCNA_00108 CCNA_00109     TRUE 0.868 16.000 0.222 1.000   NA
 5847327 5847328 CCNA_00109 CCNA_00110     TRUE 0.618 110.000 0.245 NA   NA
 5847329 5847330 CCNA_00111 CCNA_00112     FALSE 0.420 5.000 0.000 NA   NA
 5847330 5847331 CCNA_00112 CCNA_00113     FALSE 0.062 80.000 0.000 NA   NA
 5847331 5847332 CCNA_00113 CCNA_00114     TRUE 0.949 3.000 0.286 NA   NA
 5847332 5847333 CCNA_00114 CCNA_00115     FALSE 0.096 69.000 0.000 1.000   NA
 5847335 5847336 CCNA_00117 CCNA_00118     TRUE 0.577 11.000 0.000 1.000 N NA
 5847336 5847337 CCNA_00118 CCNA_00119     FALSE 0.299 -12.000 0.000 NA   NA
 5847337 5847338 CCNA_00119 CCNA_00120     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5847339 5847340 CCNA_00121 CCNA_00122     TRUE 0.760 9.000 0.040 NA   NA
 5847342 5847343 CCNA_00124 CCNA_00125     TRUE 0.702 27.000 0.138 NA   NA
 5847343 5847344 CCNA_00125 CCNA_00126     TRUE 0.793 7.000 0.037 1.000   NA
 5847346 5847347 CCNA_00128 CCNA_00129     FALSE 0.093 83.000 0.004 NA   NA
 5847347 5847348 CCNA_00129 CCNA_00130     FALSE 0.440 4.000 0.000 NA   NA
 5847349 5847350 CCNA_00131 CCNA_00132   hetN FALSE 0.066 92.000 0.000 NA   NA
 5847350 5847351 CCNA_00132 CCNA_00133 hetN   FALSE 0.008 247.000 0.000 1.000   NA
 5847351 5847352 CCNA_00133 CCNA_00134     FALSE 0.132 95.000 0.003 1.000   NA
 5847352 5847353 CCNA_00134 CCNA_00135     TRUE 0.901 26.000 0.750 1.000   NA
 5847354 5847355 CCNA_00136 CCNA_00137   shkA TRUE 0.852 34.000 0.750 NA   NA
 5847357 5847358 CCNA_00139 CCNA_00140 chlI   FALSE 0.276 109.000 0.013 1.000 N NA
 5847358 5847359 CCNA_00140 CCNA_00141     FALSE 0.220 56.000 0.018 1.000   NA
 5847359 5847360 CCNA_00141 CCNA_00142     TRUE 0.693 2.000 0.006 1.000   NA
 5847360 5847361 CCNA_00142 CCNA_00143     TRUE 0.945 0.000 0.165 1.000   NA
 5847361 5847362 CCNA_00143 CCNA_00144     FALSE 0.235 35.000 0.006 1.000   NA
 5847362 5847363 CCNA_00144 CCNA_00145     TRUE 0.919 -7.000 0.218 1.000 N NA
 5847364 5847365 CCNA_00146 CCNA_00147     FALSE 0.403 144.000 0.133 NA   NA
 5847365 5847366 CCNA_00147 CCNA_00148     FALSE 0.483 76.000 0.154 NA   NA
 5847366 5847367 CCNA_00148 CCNA_00149     TRUE 0.920 17.000 0.615 NA   NA
 5847368 5847369 CCNA_00150 CCNA_00151     FALSE 0.079 167.000 0.003 1.000 N NA
 5847370 5847371 CCNA_00152 CCNA_00153 hrcA grpE TRUE 0.878 13.000 0.120 1.000 N NA
 5847373 5847374 CCNA_00155 CCNA_00156     FALSE 0.160 55.000 0.000 1.000 N NA
 5847374 5847375 CCNA_00156 CCNA_00157     FALSE 0.109 71.000 0.000 NA N NA
 5847375 5847376 CCNA_00157 CCNA_00158   recF FALSE 0.012 228.000 0.000 NA N NA
 5847376 5847377 CCNA_00158 CCNA_00159 recF gyrB TRUE 0.992 -3.000 0.249 0.004 Y NA
 5847377 5847378 CCNA_00159 CCNA_00160 gyrB   FALSE 0.083 141.000 0.000 1.000   NA
 5847378 5847379 CCNA_00160 CCNA_00161     FALSE 0.001 425.000 0.000 NA   NA
 5847379 5847380 CCNA_00161 CCNA_00162     TRUE 0.581 72.000 0.286 NA   NA
 5847380 5847381 CCNA_00162 CCNA_00163     TRUE 0.686 47.000 0.300 1.000   NA
 5847381 5847382 CCNA_00163 CCNA_00164     TRUE 0.960 -10.000 0.100 NA Y NA
 5847383 5847384 CCNA_00165 CCNA_00166 pssY   FALSE 0.001 357.000 0.000 NA   NA
 5847385 5847386 CCNA_00167 CCNA_00168     TRUE 0.586 70.000 0.250 1.000   NA
 5847386 5847387 CCNA_00168 CCNA_00169     FALSE 0.001 578.000 0.000 NA   NA
 5847387 5847388 CCNA_00169 CCNA_00170     TRUE 0.636 80.000 0.373 NA   NA
 5847388 5847389 CCNA_00170 CCNA_00171     FALSE 0.013 190.000 0.000 NA   NA
 5847389 5847390 CCNA_00171 CCNA_00172   pulD FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5847390 5847391 CCNA_00172 CCNA_00173 pulD pulE TRUE 0.996 -3.000 0.776 0.004 Y NA
 5847391 5847392 CCNA_00173 CCNA_00174 pulE pulF TRUE 0.990 -13.000 0.653 0.004 Y NA
 5847392 5847393 CCNA_00174 CCNA_00175 pulF   TRUE 0.990 12.000 0.599 0.004 Y NA
 5847393 5847394 CCNA_00175 CCNA_00176     TRUE 0.973 -85.000 0.425 0.004 Y NA
 5847394 5847395 CCNA_00176 CCNA_00177     TRUE 0.985 -31.000 0.605 0.004 Y NA
 5847395 5847396 CCNA_00177 CCNA_00178     TRUE 0.995 -3.000 0.569 0.004 Y NA
 5847396 5847397 CCNA_00178 CCNA_00179     TRUE 0.992 -3.000 0.461 1.000 Y NA
 5847397 5847398 CCNA_00179 CCNA_00180     TRUE 0.986 -18.000 0.537 0.050 Y NA
 5847398 5847399 CCNA_00180 CCNA_00181     TRUE 0.995 -3.000 0.811 1.000 Y NA
 5847399 5847400 CCNA_00181 CCNA_00182     TRUE 0.977 -3.000 0.649 1.000   NA
 5847401 5847402 CCNA_00183 CCNA_00184 pulO   FALSE 0.064 59.000 0.000 NA   NA
 5847402 5847403 CCNA_00184 CCNA_00185     FALSE 0.221 18.000 0.000 NA   NA
 5847403 5847404 CCNA_00185 CCNA_R0003     FALSE 0.002 315.000 0.000 NA   NA
 5847404 5847405 CCNA_R0003 CCNA_00186     FALSE 0.064 85.000 0.000 NA   NA
 5847405 5847406 CCNA_00186 CCNA_00187     TRUE 0.925 -3.000 0.125 NA   NA
 5847406 5847407 CCNA_00187 CCNA_00188     FALSE 0.325 40.000 0.019 NA N NA
 5847408 5847409 CCNA_00189 CCNA_00190     TRUE 0.859 2.000 0.055 NA   NA
 5847409 5847410 CCNA_00190 CCNA_00191     FALSE 0.108 126.000 0.000 1.000   NA
 5847411 5847412 CCNA_00192 CCNA_00193   leuB FALSE 0.044 196.000 0.007 1.000 N NA
 5847412 5847413 CCNA_00193 CCNA_00194 leuB   TRUE 0.858 2.000 0.015 0.040   NA
 5847413 5847414 CCNA_00194 CCNA_00195   leuD TRUE 0.531 142.000 0.231 1.000   NA
 5847414 5847415 CCNA_00195 CCNA_00196 leuD leuC TRUE 0.985 -3.000 0.054 0.001 Y NA
 5847417 5847418 CCNA_00197 CCNA_00198 rplS trmD TRUE 0.993 -3.000 0.567 1.000 Y NA
 5847421 5847422 CCNA_00201 CCNA_00202     FALSE 0.230 117.000 0.007 1.000 N NA
 5847422 5847423 CCNA_00202 CCNA_00203     TRUE 0.844 19.000 0.000 NA Y NA
 5847424 5847425 CCNA_00204 CCNA_00205 kefB   TRUE 0.975 4.000 0.750 1.000   NA
 5847426 5847427 CCNA_00206 CCNA_00207     TRUE 0.996 0.000 0.800 0.002 Y NA
 5847428 5847429 CCNA_00208 CCNA_00209     FALSE 0.063 81.000 0.000 NA   NA
 5847430 5847431 CCNA_00210 CCNA_00211     FALSE 0.415 55.000 0.057 1.000 N NA
 5847431 5847432 CCNA_00211 CCNA_00212     TRUE 0.944 0.000 0.158 1.000   NA
 5847432 5847433 CCNA_00212 CCNA_00213     TRUE 0.776 -3.000 0.014 1.000   NA
 5847433 5847434 CCNA_00213 CCNA_00214     FALSE 0.157 128.000 0.000 1.000 N NA
 5847434 5847435 CCNA_00214 CCNA_00215     FALSE 0.009 307.000 0.034 NA   NA
 5847439 5847440 CCNA_00219 CCNA_00220     FALSE 0.137 29.000 0.000 NA   NA
 5847442 5847443 CCNA_00222 CCNA_00223     FALSE 0.377 9.000 0.000 NA   NA
 5847445 5847446 CCNA_00225 CCNA_00226     FALSE 0.074 101.000 0.000 NA   NA
 5847447 5847448 CCNA_00227 CCNA_00228     TRUE 0.603 0.000 0.004 NA   NA
 5847453 5847454 CCNA_00233 CCNA_00234     TRUE 0.978 -3.000 0.678 1.000   NA
 5847455 5847456 CCNA_00235 CCNA_00236     FALSE 0.062 63.000 0.000 NA   NA
 5847457 5847458 CCNA_00237 CCNA_00238 chvI chvG TRUE 0.984 -25.000 0.829 1.000 Y NA
 5847458 5847459 CCNA_00238 CCNA_00239 chvG   TRUE 0.972 -3.000 0.304 0.021   NA
 5847459 5847460 CCNA_00239 CCNA_00240     FALSE 0.501 76.000 0.145 1.000   NA
 5847460 5847461 CCNA_00240 CCNA_00241     TRUE 0.994 -3.000 0.420 0.003 Y NA
 5847462 5847463 CCNA_00242 CCNA_00243     FALSE 0.079 48.000 0.000 NA   NA
 5847464 5847465 CCNA_00244 CCNA_00245     FALSE 0.372 29.000 0.016 1.000   NA
 5847465 5847466 CCNA_00245 CCNA_00246     FALSE 0.289 45.000 0.012 1.000 N NA
 5847467 5847468 CCNA_00247 CCNA_00248     TRUE 0.907 78.000 0.560 1.000 Y NA
 5847469 5847470 CCNA_00249 CCNA_00250     TRUE 0.572 60.000 0.250 NA   NA
 5847470 5847471 CCNA_00250 CCNA_00251     FALSE 0.167 49.000 0.011 NA   NA
 5847473 5847474 CCNA_00253 CCNA_00254     FALSE 0.123 137.000 0.011 NA   NA
 5847475 5847476 CCNA_00255 CCNA_00256     TRUE 0.842 19.000 0.179 1.000 N NA
 5847476 5847477 CCNA_00256 CCNA_00257     TRUE 0.663 119.000 0.004 1.000 Y NA
 5847479 5847480 CCNA_00259 CCNA_00260     FALSE 0.004 252.000 0.000 NA   NA
 5847481 5847482 CCNA_00261 CCNA_00262     FALSE 0.080 183.000 0.022 1.000 N NA
 5847483 5847484 CCNA_00263 CCNA_00264     FALSE 0.343 147.000 0.100 NA   NA
 5847486 5847487 CCNA_00266 CCNA_00267     FALSE 0.160 94.000 0.000 1.000 N NA
 5847488 5847489 CCNA_R0005 CCNA_00268     FALSE 0.096 41.000 0.000 NA   NA
 5847489 5847490 CCNA_00268 CCNA_00269     TRUE 0.586 146.000 0.411 NA   NA
 5847490 5847491 CCNA_00269 CCNA_00270   recR TRUE 0.732 127.000 0.604 NA   NA
 5847491 5847492 CCNA_00270 CCNA_00271 recR   FALSE 0.092 110.000 0.002 NA   NA
 5847492 5847493 CCNA_00271 CCNA_00272     FALSE 0.104 54.000 0.004 NA   NA
 5847493 5847494 CCNA_00272 CCNA_00273     TRUE 0.838 9.000 0.074 NA   NA
 5847494 5847495 CCNA_00273 CCNA_00274     FALSE 0.002 341.000 0.000 NA   NA
 5847496 5847497 CCNA_00275 CCNA_00276     FALSE 0.066 90.000 0.000 NA   NA
 5847498 5847499 CCNA_00277 CCNA_00278     TRUE 0.879 18.000 0.005 1.000 Y NA
 5847499 5847500 CCNA_00278 CCNA_00279     FALSE 0.223 52.000 0.016 1.000   NA
 5847501 5847502 CCNA_00280 CCNA_00281     TRUE 0.981 0.000 0.069 1.000 Y NA
 5847504 5847505 CCNA_00283 CCNA_00284     TRUE 0.904 -3.000 0.071 1.000   NA
 5847505 5847506 CCNA_00284 CCNA_00285     TRUE 0.901 -3.000 0.069 1.000   NA
 5847506 5847507 CCNA_00285 CCNA_00286   lovR FALSE 0.032 193.000 0.000 1.000 N NA
 5847507 5847508 CCNA_00286 CCNA_00287 lovR lovK TRUE 0.894 19.000 0.000 0.033 Y NA
 5847508 5847509 CCNA_00287 CCNA_00288 lovK   FALSE 0.069 167.000 0.000 1.000 N NA
 5847509 5847510 CCNA_00288 CCNA_00289     FALSE 0.258 15.000 0.000 NA   NA
 5847510 5847511 CCNA_00289 CCNA_00290     FALSE 0.010 203.000 0.000 NA   NA
 5847512 5847513 CCNA_00291 CCNA_00292 phoR pstC FALSE 0.182 145.000 0.012 1.000 N NA
 5847513 5847514 CCNA_00292 CCNA_00293 pstC pstA TRUE 0.990 -7.000 0.485 0.001 Y NA
 5847514 5847515 CCNA_00293 CCNA_00294 pstA pstB TRUE 0.991 9.000 0.402 0.001 Y NA
 5847515 5847516 CCNA_00294 CCNA_00295 pstB phoU TRUE 0.935 26.000 0.203 NA Y NA
 5847516 5847517 CCNA_00295 CCNA_00296 phoU phoB TRUE 0.766 22.000 0.128 NA N NA
 5847518 5847519 CCNA_00297 CCNA_00298     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5847522 5847523 CCNA_00301 CCNA_00302     TRUE 0.869 5.000 0.080 NA   NA
 5847524 5847525 CCNA_00303 CCNA_00304     TRUE 0.968 -3.000 0.017 1.000 Y NA
 5847525 5847526 CCNA_00304 CCNA_00305   czcD TRUE 0.903 -30.000 0.333 1.000 N NA
 5847526 5847527 CCNA_00305 CCNA_00306 czcD   TRUE 0.528 32.000 0.066 NA   NA
 5847527 5847528 CCNA_00306 CCNA_00307     TRUE 0.751 -3.000 0.017 NA   NA
 5847530 5847531 CCNA_00309 CCNA_00310     TRUE 0.888 21.000 0.515 NA   NA
 5847531 5847532 CCNA_00310 CCNA_00311   pmbA TRUE 0.940 -3.000 0.182 NA   NA
 5847532 5847533 CCNA_00311 CCNA_00312 pmbA   FALSE 0.185 56.000 0.018 NA   NA
 5847533 5847534 CCNA_00312 CCNA_00313     FALSE 0.168 85.000 0.016 NA   NA
 5847534 5847535 CCNA_00313 CCNA_00314     FALSE 0.289 43.000 0.027 NA   NA
 5847535 5847536 CCNA_00314 CCNA_00315     FALSE 0.247 26.000 0.006 NA   NA
 5847536 5847537 CCNA_00315 CCNA_00316     FALSE 0.360 24.000 0.006 NA N NA
 5847537 5847538 CCNA_00316 CCNA_00317   cgtA TRUE 0.916 -3.000 0.087 1.000   NA
 5847540 5847541 CCNA_00319 CCNA_00320     FALSE 0.297 183.000 0.011 1.000 Y NA
 5847541 5847542 CCNA_00320 CCNA_00321     TRUE 0.972 31.000 0.667 0.016 Y NA
 5847543 5847544 CCNA_00322 CCNA_00323     TRUE 0.768 43.000 0.500 NA   NA
 5847545 5847546 CCNA_00324 CCNA_00325     FALSE 0.262 -19.000 0.000 NA   NA
 5847549 5847550 CCNA_00328 CCNA_00329     TRUE 0.523 13.000 0.006 1.000   NA
 5847552 5847553 CCNA_00331 CCNA_00332     TRUE 0.995 3.000 0.660 0.001 Y NA
 5847555 5847556 CCNA_00334 CCNA_00335     FALSE 0.395 38.000 0.043 NA   NA
 5847556 5847557 CCNA_00335 CCNA_00336     TRUE 0.893 11.000 0.182 NA   NA
 5847557 5847558 CCNA_00336 CCNA_00337     TRUE 0.778 15.000 0.091 NA   NA
 5847558 5847559 CCNA_00337 CCNA_00338     TRUE 0.741 -60.000 0.103 1.000   NA
 5847559 5847560 CCNA_00338 CCNA_00339     TRUE 0.612 69.000 0.276 NA N NA
 5847560 5847561 CCNA_00339 CCNA_00340     FALSE 0.003 330.000 0.000 NA N NA
 5847561 5847562 CCNA_00340 CCNA_00341   sucD TRUE 0.992 1.000 0.256 0.001 Y NA
 5847562 5847563 CCNA_00341 CCNA_00342 sucD odhA FALSE 0.488 179.000 0.092 1.000 Y NA
 5847563 5847564 CCNA_00342 CCNA_00343 odhA odhB TRUE 0.920 60.000 0.667 1.000 Y NA
 5847564 5847565 CCNA_00343 CCNA_00344 odhB   FALSE 0.060 72.000 0.000 NA   NA
 5847567 5847568 CCNA_00346 CCNA_00347     FALSE 0.066 90.000 0.000 NA   NA
 5847569 5847570 CCNA_00348 CCNA_00349     FALSE 0.066 174.000 0.005 1.000 N NA
 5847570 5847571 CCNA_00349 CCNA_00350     TRUE 0.909 -3.000 0.093 NA   NA
 5847574 5847575 CCNA_00353 CCNA_00354     TRUE 0.560 71.000 0.250 NA   NA
 5847575 5847576 CCNA_00354 CCNA_00355     FALSE 0.024 171.000 0.000 NA   NA
 5847576 5847577 CCNA_00355 CCNA_00356     FALSE 0.060 71.000 0.000 NA   NA
 5847577 5847578 CCNA_00356 CCNA_00357     TRUE 0.674 109.000 0.333 NA   NA
 5847580 5847581 CCNA_00359 CCNA_00360     FALSE 0.018 200.000 0.000 1.000   NA
 5847582 5847583 CCNA_00361 CCNA_00362     FALSE 0.253 52.000 0.032 NA   NA
 5847583 5847584 CCNA_00362 CCNA_00363     FALSE 0.426 31.000 0.016 1.000 N NA
 5847584 5847585 CCNA_00363 CCNA_00364     FALSE 0.239 79.000 0.015 1.000 N NA
 5847585 5847586 CCNA_00364 CCNA_00365     FALSE 0.491 123.000 0.081 1.000 N NA
 5847587 5847588 CCNA_00366 CCNA_00367     TRUE 0.985 -3.000 0.059 0.001 Y NA
 5847588 5847589 CCNA_00367 CCNA_00368     TRUE 0.975 6.000 0.038 0.001 Y NA
 5847589 5847590 CCNA_00368 CCNA_00369     FALSE 0.042 150.000 0.000 NA   NA
 5847591 5847592 CCNA_00370 CCNA_00371     TRUE 0.993 11.000 0.863 0.004 Y NA
 5847592 5847593 CCNA_00371 CCNA_00372     TRUE 0.717 127.000 0.278 0.004   NA
 5847593 5847594 CCNA_00372 CCNA_00373     TRUE 0.830 50.000 0.628 0.004   NA
 5847594 5847595 CCNA_00373 CCNA_00374     TRUE 0.918 6.000 0.195 NA   NA
 5847596 5847597 CCNA_00375 CCNA_00376     FALSE 0.206 44.000 0.014 NA   NA
 5847598 5847599 CCNA_00377 CCNA_00378     FALSE 0.362 22.000 0.004 NA N NA
 5847599 5847600 CCNA_00378 CCNA_00379     TRUE 0.994 0.000 0.750 NA Y NA
 5847600 5847601 CCNA_00379 CCNA_00380     FALSE 0.021 239.000 0.025 NA   NA
 5847603 5847604 CCNA_00382 CCNA_00383 ccrM   TRUE 0.706 139.000 0.048 1.000 Y NA
 5847605 5847606 CCNA_00384 CCNA_00385     FALSE 0.079 48.000 0.000 NA   NA
 5847609 5847610 CCNA_00388 CCNA_00389     FALSE 0.071 98.000 0.000 NA   NA
 5847611 5847612 CCNA_00390 CCNA_00391     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5847612 5847613 CCNA_00391 CCNA_00392     FALSE 0.063 81.000 0.000 NA   NA
 5847614 5847615 CCNA_00393 CCNA_00394     TRUE 0.937 -3.000 0.167 NA   NA
 5847620 5847621 CCNA_00399 CCNA_00400     FALSE 0.363 45.000 0.039 1.000   NA
 5847621 5847622 CCNA_00400 CCNA_00401     TRUE 0.952 -3.000 0.172 1.000 N NA
 5847622 5847623 CCNA_00401 CCNA_00402     TRUE 0.935 4.000 0.222 NA   NA
 5847623 5847624 CCNA_00402 CCNA_00403     TRUE 0.686 37.000 0.222 NA   NA
 5847624 5847625 CCNA_00403 CCNA_00404     TRUE 0.957 0.000 0.286 NA   NA
 5847625 5847626 CCNA_00404 CCNA_00405     TRUE 0.881 -3.000 0.062 NA   NA
 5847630 5847631 CCNA_00409 CCNA_00410     FALSE 0.062 63.000 0.000 NA   NA
 5847631 5847632 CCNA_00410 CCNA_00411     TRUE 0.554 33.000 0.080 NA   NA
 5847632 5847633 CCNA_00411 CCNA_00412     TRUE 0.961 -3.000 0.346 NA   NA
 5847633 5847634 CCNA_00412 CCNA_00413     TRUE 0.582 93.000 0.163 1.000 N NA
 5847634 5847635 CCNA_00413 CCNA_00414     FALSE 0.476 21.000 0.009 1.000 N NA
 5847636 5847637 CCNA_00415 CCNA_00416     FALSE 0.210 102.000 0.019 NA   NA
 5847637 5847638 CCNA_00416 CCNA_00417     TRUE 0.764 4.000 0.028 NA   NA
 5847639 5847640 CCNA_00418 CCNA_00419     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5847641 5847642 CCNA_00420 CCNA_00421     TRUE 0.759 -3.000 0.018 NA   NA
 5847642 5847643 CCNA_00421 CCNA_00422     FALSE 0.436 50.000 0.055 1.000 N NA
 5847644 5847645 CCNA_00423 CCNA_00424     FALSE 0.012 247.000 0.000 1.000 N NA
 5847647 5847648 CCNA_00426 CCNA_00427     FALSE 0.061 69.000 0.000 NA   NA
 5847648 5847649 CCNA_00427 CCNA_00428     TRUE 0.966 0.000 0.400 NA   NA
 5847649 5847650 CCNA_00428 CCNA_00429     FALSE 0.068 55.000 0.000 NA   NA
 5847654 5847655 CCNA_00433 CCNA_00434     TRUE 0.686 63.000 0.500 NA   NA
 5847655 5847656 CCNA_00434 CCNA_00435     FALSE 0.459 102.000 0.095 NA   NA
 5847656 5847657 CCNA_00435 CCNA_00436     TRUE 0.538 110.000 0.095 1.000 N NA
 5847657 5847658 CCNA_00436 CCNA_00437     FALSE 0.029 199.000 0.000 1.000 N NA
 5847660 5847661 CCNA_00439 CCNA_00440     TRUE 0.890 -15.000 0.000 NA Y NA
 5847661 5847662 CCNA_00440 CCNA_00441   cheYI TRUE 0.987 -3.000 0.200 NA Y NA
 5847662 5847663 CCNA_00441 CCNA_00442 cheYI cheAI TRUE 0.920 70.000 0.711 1.000 Y NA
 5847663 5847664 CCNA_00442 CCNA_00443 cheAI   TRUE 0.988 4.000 0.156 0.012 Y NA
 5847664 5847665 CCNA_00443 CCNA_00444     TRUE 0.985 0.000 0.109 1.000 Y NA
 5847665 5847666 CCNA_00444 CCNA_00445     TRUE 0.992 0.000 0.439 1.000 Y NA
 5847666 5847667 CCNA_00445 CCNA_00446     TRUE 0.990 4.000 0.258 0.028 Y NA
 5847667 5847668 CCNA_00446 CCNA_00447   cheD TRUE 0.991 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 5847668 5847669 CCNA_00447 CCNA_00448 cheD cheU TRUE 0.852 4.000 0.060 NA   NA
 5847669 5847670 CCNA_00448 CCNA_00449 cheU cheYIII TRUE 0.970 8.000 1.000 NA   NA
 5847670 5847671 CCNA_00449 CCNA_00450 cheYIII cheE TRUE 0.981 -3.000 1.000 NA   NA
 5847671 5847672 CCNA_00450 CCNA_00451 cheE   FALSE 0.003 270.000 0.000 NA   NA
 5847673 5847674 CCNA_00452 CCNA_00453     TRUE 0.728 0.000 0.000 1.000 N NA
 5847674 5847675 CCNA_00453 CCNA_00454     FALSE 0.295 29.000 0.000 1.000 N NA
 5847676 5847677 CCNA_00455 CCNA_R0006 nagA   FALSE 0.067 93.000 0.000 NA   NA
 5847677 5847678 CCNA_R0006 CCNA_00456     FALSE 0.244 -24.000 0.000 NA   NA
 5847678 5847679 CCNA_00456 CCNA_00457     TRUE 0.958 14.000 0.100 1.000 Y NA
 5847679 5847680 CCNA_00457 CCNA_00458     TRUE 0.993 -3.000 0.258 0.002 Y NA
 5847680 5847681 CCNA_00458 CCNA_00459   nhaA FALSE 0.281 127.000 0.000 0.048 N NA
 5847681 5847682 CCNA_00459 CCNA_00460 nhaA   FALSE 0.001 462.000 0.000 NA   NA
 5847682 5847683 CCNA_00460 CCNA_00461     FALSE 0.001 854.000 0.000 NA   NA
 5847683 10784558 CCNA_00461 CCNA_04006     FALSE 0.151 27.000 0.000 NA   NA
 5847685 5847686 CCNA_00464 CCNA_00465     FALSE 0.005 243.000 0.000 NA   NA
 5847686 5847687 CCNA_00465 CCNA_00466     FALSE 0.457 158.000 0.000 1.000 Y NA
 5847687 5847688 CCNA_00466 CCNA_00467     TRUE 0.564 4.000 0.000 1.000   NA
 5847689 5847690 CCNA_00468 CCNA_00469     FALSE 0.002 298.000 0.000 NA   NA
 5847691 5847692 CCNA_00470 CCNA_00471     FALSE 0.151 27.000 0.000 NA   NA
 5847692 5847693 CCNA_00471 CCNA_00472     TRUE 0.942 -34.000 0.050 0.009 Y NA
 5847693 5847694 CCNA_00472 CCNA_00473     FALSE 0.077 105.000 0.000 NA   NA
 5847694 5847695 CCNA_00473 CCNA_00474   trwC TRUE 0.504 0.000 0.000 NA   NA
 5847695 5847696 CCNA_00474 CCNA_00475 trwC trwB TRUE 0.820 -66.000 0.214 NA N NA
 5847696 5847697 CCNA_00475 CCNA_00476 trwB   FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5847697 5847698 CCNA_00476 CCNA_00477     FALSE 0.001 381.000 0.000 NA   NA
 5847698 5847699 CCNA_00477 CCNA_00478     FALSE 0.071 122.000 0.000 NA   NA
 5847702 5847703 CCNA_00481 CCNA_00482     TRUE 0.894 -13.000 0.261 NA   NA
 5847704 5847705 CCNA_R0007 CCNA_00483     FALSE 0.010 205.000 0.000 NA   NA
 5847705 5847706 CCNA_00483 CCNA_00484     TRUE 0.722 90.000 0.600 NA   NA
 5847706 5847707 CCNA_00484 CCNA_00485     FALSE 0.084 57.000 0.003 NA   NA
 5847708 5847709 CCNA_00486 CCNA_00487     FALSE 0.349 187.000 0.035 1.000 Y NA
 5847710 5847711 CCNA_00488 CCNA_00489     TRUE 0.909 -13.000 0.003 1.000 Y NA
 5847714 5847715 CCNA_00492 CCNA_00493     TRUE 0.558 3.000 0.004 NA   NA
 5847715 5847716 CCNA_00493 CCNA_00494     TRUE 0.539 7.000 0.006 NA   NA
 5847716 5847717 CCNA_00494 CCNA_00495     FALSE 0.284 53.000 0.041 NA   NA
 5847717 5847718 CCNA_00495 CCNA_00496     TRUE 0.777 -3.000 0.021 NA   NA
 5847718 5847719 CCNA_00496 CCNA_00497     TRUE 0.734 0.000 0.014 NA   NA
 5847720 5847721 CCNA_00498 CCNA_00499     FALSE 0.060 76.000 0.000 NA   NA
 5847721 5847722 CCNA_00499 CCNA_00500     TRUE 0.886 -3.000 0.067 NA   NA
 5847722 5847723 CCNA_00500 CCNA_00501     TRUE 0.955 -3.000 0.200 1.000 N NA
 5847724 5847725 CCNA_00502 CCNA_00503     TRUE 0.531 57.000 0.184 NA   NA
 5847727 5847728 CCNA_00505 CCNA_00506     TRUE 0.979 6.000 0.058 0.001 Y NA
 5847728 5847729 CCNA_00506 CCNA_00507     TRUE 0.994 6.000 0.630 0.001 Y NA
 5847730 5847731 CCNA_00508 CCNA_00509     FALSE 0.061 66.000 0.000 NA   NA
 5847731 5847732 CCNA_00509 CCNA_00510     TRUE 0.651 -3.000 0.000 NA N NA
 5847732 5847733 CCNA_00510 CCNA_00511     TRUE 0.996 0.000 0.600 0.002 Y NA
 5847733 5847734 CCNA_00511 CCNA_00512     FALSE 0.187 50.000 0.002 1.000 N NA
 5847734 5847735 CCNA_00512 CCNA_00513     FALSE 0.069 125.000 0.000 NA   NA
 5847736 5847737 CCNA_00514 CCNA_00515     FALSE 0.001 416.000 0.000 NA   NA
 5847738 5847739 CCNA_00516 CCNA_00517     TRUE 0.628 3.000 0.003 1.000   NA
 5847739 5847740 CCNA_00517 CCNA_00518     TRUE 0.927 88.000 0.496 0.024 Y NA
 5847740 5847741 CCNA_00518 CCNA_00519     FALSE 0.050 158.000 0.004 NA   NA
 5847741 5847742 CCNA_00519 CCNA_00520     FALSE 0.019 231.000 0.018 NA   NA
 5847742 5847743 CCNA_00520 CCNA_00521     FALSE 0.083 141.000 0.000 1.000   NA
 5847743 5847744 CCNA_00521 CCNA_00522     TRUE 0.925 -19.000 0.533 NA   NA
 5847744 5847745 CCNA_00522 CCNA_00523     FALSE 0.079 48.000 0.000 NA   NA
 5847745 5847746 CCNA_00523 CCNA_00524     TRUE 0.918 -3.000 0.107 NA   NA
 5847746 5847747 CCNA_00524 CCNA_00525     TRUE 0.863 -13.000 0.170 NA   NA
 5847748 5847749 CCNA_00526 CCNA_00527     FALSE 0.378 131.000 0.080 NA   NA
 5847749 5847750 CCNA_00527 CCNA_00528     FALSE 0.268 181.000 0.308 NA   NA
 5847750 5847751 CCNA_00528 CCNA_00529     FALSE 0.362 69.000 0.062 1.000   NA
 5847751 5847752 CCNA_00529 CCNA_00530     FALSE 0.002 350.000 0.000 1.000   NA
 5847752 5847753 CCNA_00530 CCNA_00531     TRUE 0.961 46.000 0.884 0.015 Y NA
 5847753 5847754 CCNA_00531 CCNA_00532     FALSE 0.001 424.000 0.000 NA   NA
 5847756 5847757 CCNA_00534 CCNA_00535     FALSE 0.091 43.000 0.000 NA   NA
 5847757 5847758 CCNA_00535 CCNA_00536     FALSE 0.002 294.000 0.000 NA   NA
 5847758 5847759 CCNA_00536 CCNA_00537     TRUE 0.868 114.000 0.851 0.001   NA
 5847759 5847760 CCNA_00537 CCNA_00538     FALSE 0.019 219.000 0.000 1.000 N NA
 5847761 5847762 CCNA_00539 CCNA_00540     FALSE 0.020 195.000 0.000 1.000   NA
 5847764 5847765 CCNA_00542 CCNA_00543     FALSE 0.246 49.000 0.026 NA   NA
 5847766 5847767 CCNA_00544 CCNA_00545     TRUE 0.723 71.000 0.044 1.000 Y NA
 5847767 5847768 CCNA_00545 CCNA_00546     FALSE 0.361 124.000 0.062 NA   NA
 5847768 5847769 CCNA_00546 CCNA_00547     FALSE 0.017 178.000 0.000 NA   NA
 5847769 5847770 CCNA_00547 CCNA_00548     FALSE 0.244 25.000 0.000 1.000   NA
 5847770 5847771 CCNA_00548 CCNA_00549     TRUE 0.887 -6.000 0.077 0.053   NA
 5847771 5847772 CCNA_00549 CCNA_00550     FALSE 0.349 -84.000 0.000 1.000 N NA
 5847773 5847774 CCNA_00551 CCNA_00552     FALSE 0.004 256.000 0.000 NA   NA
 5847774 5847775 CCNA_00552 CCNA_00553     TRUE 0.891 -3.000 0.071 NA   NA
 5847776 5847777 CCNA_00554 CCNA_00555     FALSE 0.268 73.000 0.036 1.000   NA
 5847777 5847778 CCNA_00555 CCNA_00556     TRUE 0.679 85.000 0.333 1.000 N NA
 5847779 5847780 CCNA_00557 CCNA_00558     TRUE 0.724 -3.000 0.014 NA   NA
 5847780 5847781 CCNA_00558 CCNA_00559     TRUE 0.709 128.000 0.509 NA   NA
 5847782 5847783 CCNA_00560 CCNA_00561 sixA   TRUE 0.795 -3.000 0.026 NA   NA
 5847783 5847784 CCNA_00561 CCNA_00562     TRUE 0.920 -3.000 0.108 NA   NA
 5847784 5847785 CCNA_00562 CCNA_00563     TRUE 0.616 -3.000 0.005 NA   NA
 5847785 5847786 CCNA_00563 CCNA_00564   cenK TRUE 0.843 10.000 0.082 NA   NA
 5847789 5847790 CCNA_00566 CCNA_00567 rspA   FALSE 0.302 123.000 0.000 0.028 N NA
 5847790 5847791 CCNA_00567 CCNA_00568     TRUE 0.985 -28.000 1.000 1.000 Y NA
 5847791 5847792 CCNA_00568 CCNA_00569     TRUE 0.985 0.000 1.000 1.000 N NA
 5847792 5847793 CCNA_00569 CCNA_00570     TRUE 0.881 38.000 1.000 1.000 N NA
 5847794 5847795 CCNA_00571 CCNA_00572     TRUE 0.993 -3.000 0.258 0.002 Y NA
 5847795 5847796 CCNA_00572 CCNA_00573     FALSE 0.008 247.000 0.000 1.000   NA
 5847796 5847797 CCNA_00573 CCNA_00574     FALSE 0.489 140.000 0.167 1.000   NA
 5847797 5847798 CCNA_00574 CCNA_00575     TRUE 0.960 -3.000 0.333 NA   NA
 5847798 5847799 CCNA_00575 CCNA_00576   oppA TRUE 0.843 9.000 0.077 NA   NA
 5847802 5847803 CCNA_00579 CCNA_00580     FALSE 0.377 9.000 0.000 NA   NA
 5847807 5847808 CCNA_00584 CCNA_00585     FALSE 0.065 88.000 0.000 NA   NA
 5847810 5847811 CCNA_00587 CCNA_00588     FALSE 0.020 174.000 0.000 NA   NA
 5847812 5847813 CCNA_00589 CCNA_00590     FALSE 0.079 48.000 0.000 NA   NA
 5847813 5847814 CCNA_00590 CCNA_00591     TRUE 0.955 4.000 0.333 1.000   NA
 5847814 5847815 CCNA_00591 CCNA_00592     TRUE 0.902 13.000 0.267 NA   NA
 5847815 5847816 CCNA_00592 CCNA_00593     FALSE 0.062 63.000 0.000 NA   NA
 5847816 5847817 CCNA_00593 CCNA_00594     TRUE 0.967 5.000 0.667 NA   NA
 5847817 5847818 CCNA_00594 CCNA_00595     FALSE 0.001 557.000 0.000 NA   NA
 5847818 5847819 CCNA_00595 CCNA_00596     FALSE 0.321 -42.000 0.000 NA N NA
 5847821 5847822 CCNA_00598 CCNA_00599     FALSE 0.073 51.000 0.000 NA   NA
 5847823 5847824 CCNA_00600 CCNA_00601     TRUE 0.818 -13.000 0.101 NA   NA
 5847824 5847825 CCNA_00601 CCNA_00602     TRUE 0.975 -3.000 0.648 NA   NA
 5847825 5847826 CCNA_00602 CCNA_00603     TRUE 0.946 -3.000 0.216 NA   NA
 5847826 5847827 CCNA_00603 CCNA_00604     TRUE 0.935 -22.000 0.708 NA   NA
 5847828 5847829 CCNA_00605 CCNA_00606     FALSE 0.066 90.000 0.000 NA   NA
 5847830 5847831 CCNA_00607 CCNA_00608     FALSE 0.147 132.000 0.000 1.000 N NA
 5847831 5847832 CCNA_00608 CCNA_00609     FALSE 0.152 84.000 0.000 1.000 N NA
 5847832 5847833 CCNA_00609 CCNA_00610     TRUE 0.536 13.000 0.000 1.000 N NA
 5847833 5847834 CCNA_00610 CCNA_00611     FALSE 0.007 288.000 0.000 1.000 N NA
 5847835 5847836 CCNA_00612 CCNA_00613     TRUE 0.720 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5847836 5847837 CCNA_00613 CCNA_00614     FALSE 0.156 -123.000 0.000 NA   NA
 5847837 5847838 CCNA_00614 CCNA_00615     TRUE 0.936 17.000 0.833 NA   NA
 5847838 5847839 CCNA_00615 CCNA_00616     FALSE 0.004 294.000 0.000 1.000   NA
 5847840 5847841 CCNA_00617 CCNA_00618     TRUE 0.518 -13.000 0.000 1.000 N NA
 5847841 5847842 CCNA_00618 CCNA_00619     TRUE 0.720 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5847842 5847843 CCNA_00619 CCNA_00620     TRUE 0.953 10.000 0.000 0.001 Y NA
 5847845 5847846 CCNA_00622 CCNA_00623     FALSE 0.055 138.000 0.000 NA   NA
 5847849 5847850 CCNA_00626 CCNA_00627     FALSE 0.062 79.000 0.000 NA   NA
 5847850 5847851 CCNA_00627 CCNA_00628   cheY FALSE 0.405 6.000 0.000 NA   NA
 5847852 5847853 CCNA_00629 CCNA_00630   cheAII TRUE 0.799 37.000 0.000 0.012 Y NA
 5847853 5847854 CCNA_00630 CCNA_00631 cheAII cheW TRUE 0.976 -3.000 0.014 0.012 Y NA
 5847854 5847855 CCNA_00631 CCNA_00632 cheW   TRUE 0.957 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5847855 5847856 CCNA_00632 CCNA_00633   cheBII TRUE 0.970 -3.000 0.000 0.027 Y NA
 5847856 5847857 CCNA_00633 CCNA_00634 cheBII   TRUE 0.975 -3.000 0.042 1.000 Y NA
 5847857 5847858 CCNA_00634 CCNA_00635     FALSE 0.001 537.000 0.000 NA   NA
 5847858 5847859 CCNA_00635 CCNA_00636     FALSE 0.405 6.000 0.000 NA   NA
 5847860 5847861 CCNA_00637 CCNA_00638     FALSE 0.218 -33.000 0.000 NA   NA
 5847861 5847862 CCNA_00638 CCNA_00639     TRUE 0.617 -3.000 0.000 1.000   NA
 5847862 5847863 CCNA_00639 CCNA_00640     FALSE 0.047 146.000 0.000 NA   NA
 5847863 5847864 CCNA_00640 CCNA_00641     FALSE 0.010 204.000 0.000 NA   NA
 5847864 5847865 CCNA_00641 CCNA_00642     FALSE 0.232 -30.000 0.000 NA   NA
 5847866 5847867 CCNA_00643 CCNA_00644     FALSE 0.001 490.000 0.000 NA   NA
 5847867 5847868 CCNA_00644 CCNA_00645   nrtA TRUE 0.772 13.000 0.064 NA   NA
 5847868 5847869 CCNA_00645 CCNA_00646 nrtA nrtB TRUE 0.989 12.000 0.915 NA Y NA
 5847869 5847870 CCNA_00646 CCNA_00647 nrtB nrtD TRUE 0.986 13.000 0.323 0.001 Y NA
 5847870 5847871 CCNA_00647 CCNA_00648 nrtD nasT TRUE 0.777 5.000 0.015 1.000 N NA
 5847871 5847872 CCNA_00648 CCNA_00649 nasT   TRUE 0.773 44.000 0.466 NA N NA
 5847872 5847873 CCNA_00649 CCNA_00650     TRUE 0.938 13.000 0.036 NA Y NA
 5847873 5847874 CCNA_00650 CCNA_00651     TRUE 0.624 29.000 0.074 NA N NA
 5847874 5847875 CCNA_00651 CCNA_00652   nasE TRUE 0.984 -3.000 0.539 0.001 N NA
 5847875 5847876 CCNA_00652 CCNA_00653 nasE nasC TRUE 0.964 1.000 0.294 1.000 N NA
 5847876 5847877 CCNA_00653 CCNA_00654 nasC   TRUE 0.718 -10.000 0.022 1.000 N NA
 5847877 5847878 CCNA_00654 CCNA_R0009     FALSE 0.016 179.000 0.000 NA   NA
 5847880 5847881 CCNA_00656 CCNA_00657     TRUE 0.978 -3.000 0.025 0.052 Y NA
 5847881 5847882 CCNA_00657 CCNA_00658     TRUE 0.800 -3.000 0.000 0.052   NA
 5847882 5847883 CCNA_00658 CCNA_00659     TRUE 0.681 11.000 0.000 0.052   NA
 5847884 5847885 CCNA_00660 CCNA_00661     TRUE 0.800 -3.000 0.000 0.052   NA
 5847885 5847886 CCNA_00661 CCNA_00662     FALSE 0.272 -16.000 0.000 NA   NA
 5847886 5847887 CCNA_00662 CCNA_00663     FALSE 0.232 17.000 0.000 NA   NA
 5847887 5847888 CCNA_00663 CCNA_R0010     FALSE 0.001 422.000 0.000 NA   NA
 5847889 5847890 CCNA_00664 CCNA_00665     FALSE 0.357 168.000 0.182 1.000 N NA
 5847890 5847891 CCNA_00665 CCNA_00666     TRUE 0.995 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 5847892 5847893 CCNA_00667 CCNA_00668     TRUE 0.977 11.000 0.222 NA Y NA
 5847893 5847894 CCNA_00668 CCNA_00669     TRUE 0.929 -3.000 0.105 NA N NA
 5847894 5847895 CCNA_00669 CCNA_00670     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5847895 5847896 CCNA_00670 CCNA_00671   tagG TRUE 0.984 10.000 0.375 NA Y NA
 5847896 5847897 CCNA_00671 CCNA_00672 tagG   FALSE 0.060 134.000 0.000 NA   NA
 5847899 5847900 CCNA_00674 CCNA_00675     FALSE 0.396 -34.000 0.011 NA   NA
 5847900 5847901 CCNA_00675 CCNA_00676     TRUE 0.949 0.000 0.222 NA   NA
 5847901 5847902 CCNA_00676 CCNA_00677     FALSE 0.052 148.000 0.002 NA   NA
 5847902 5847903 CCNA_00677 CCNA_00678     TRUE 0.995 5.000 0.838 0.020 Y NA
 5847904 5847905 CCNA_R0011 CCNA_00679     FALSE 0.279 14.000 0.000 NA   NA
 5847906 5847907 CCNA_00680 CCNA_00681     TRUE 0.943 -3.000 0.160 1.000   NA
 5847909 5847910 CCNA_00683 CCNA_00684     FALSE 0.306 13.000 0.000 NA   NA
 5847910 5847911 CCNA_00684 CCNA_00685     TRUE 0.982 -3.000 0.898 NA N NA
 5847913 5847914 CCNA_00687 CCNA_00688     FALSE 0.262 -19.000 0.000 NA   NA
 5847916 5847917 CCNA_00690 CCNA_00691     FALSE 0.006 299.000 0.000 1.000 N NA
 5847919 5847920 CCNA_00693 CCNA_00694     TRUE 0.984 -3.000 0.116 1.000 Y NA
 5847920 5847921 CCNA_00694 CCNA_00695     FALSE 0.036 172.000 0.000 1.000   NA
 5847923 5847924 CCNA_00697 CCNA_00698     FALSE 0.181 22.000 0.000 NA   NA
 5847925 5847926 CCNA_00699 CCNA_R0012     FALSE 0.003 283.000 0.000 NA   NA
 5847930 5847931 CCNA_00703 CCNA_00704     FALSE 0.091 43.000 0.000 NA   NA
 5847932 5847933 CCNA_00705 CCNA_00706     FALSE 0.044 149.000 0.000 NA   NA
 5847933 5847934 CCNA_00706 CCNA_00707     FALSE 0.073 100.000 0.000 NA   NA
 5847934 5847935 CCNA_00707 CCNA_00708     TRUE 0.953 -3.000 0.260 NA   NA
 5847946 5847947 CCNA_00719 CCNA_00720 hylD   FALSE 0.298 -39.000 0.000 1.000   NA
 5847948 5847949 CCNA_00721 CCNA_00722     TRUE 0.782 58.000 0.043 0.090 Y NA
 5847950 5847951 CCNA_00723 CCNA_00724     FALSE 0.207 19.000 0.000 NA   NA
 5847952 5847953 CCNA_00725 CCNA_00726     FALSE 0.476 51.000 0.071 1.000 N NA
 5847954 5847955 CCNA_00727 CCNA_00728     FALSE 0.480 73.000 0.154 NA   NA
 5847955 5847956 CCNA_00728 CCNA_00729     TRUE 0.896 23.000 0.667 NA   NA
 5847956 5847957 CCNA_00729 CCNA_00730   skgA TRUE 0.641 76.000 0.400 NA   NA
 5847959 5847960 CCNA_00732 CCNA_00733     TRUE 0.733 60.000 0.667 NA   NA
 5847960 5847961 CCNA_00733 CCNA_00734     FALSE 0.069 54.000 0.000 NA   NA
 5847962 5847963 CCNA_00735 CCNA_00736     TRUE 0.749 113.000 0.588 NA   NA
 5847963 5847964 CCNA_00736 CCNA_00737     FALSE 0.069 210.000 0.045 1.000 N NA
 5847964 5847965 CCNA_00737 CCNA_00738     FALSE 0.005 314.000 0.000 1.000 N NA
 5847965 5847966 CCNA_00738 CCNA_00739     FALSE 0.050 143.000 0.000 NA   NA
 5847966 5847967 CCNA_00739 CCNA_00740     FALSE 0.065 129.000 0.000 NA   NA
 5847967 5847968 CCNA_00740 CCNA_00741     TRUE 0.894 0.000 0.044 1.000 N NA
 5847968 5847969 CCNA_00741 CCNA_00742     TRUE 0.857 25.000 0.216 0.080 N NA
 5847970 5847971 CCNA_00743 CCNA_00744     FALSE 0.006 236.000 0.000 NA   NA
 5847972 5847973 CCNA_00745 CCNA_00746     TRUE 0.775 -3.000 0.021 NA   NA
 5847973 5847974 CCNA_00746 CCNA_00747   tipF FALSE 0.130 99.000 0.000 NA N NA
 5847975 5847976 CCNA_00748 CCNA_00749     TRUE 0.983 5.000 0.178 1.000 Y NA
 5847977 5847978 CCNA_00750 CCNA_00751     FALSE 0.064 59.000 0.000 NA   NA
 5847978 5847979 CCNA_00751 CCNA_00752     FALSE 0.060 76.000 0.000 NA   NA
 5847979 5847980 CCNA_00752 CCNA_00753     FALSE 0.180 138.000 0.007 1.000 N NA
 5847980 5847981 CCNA_00753 CCNA_00754     FALSE 0.073 119.000 0.000 NA   NA
 5847981 5847982 CCNA_00754 CCNA_00755   terB FALSE 0.190 124.000 0.018 NA   NA
 5847982 5847983 CCNA_00755 CCNA_00756 terB   TRUE 0.928 -42.000 1.000 NA   NA
 5847983 5847984 CCNA_00756 CCNA_00757     FALSE 0.058 136.000 0.000 NA   NA
 5847986 5847987 CCNA_00759 CCNA_00760     FALSE 0.142 135.000 0.000 1.000 N NA
 5847987 5847988 CCNA_00760 CCNA_00761     FALSE 0.049 145.000 0.000 NA   NA
 5847988 5847989 CCNA_00761 CCNA_00762     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5847989 5847990 CCNA_00762 CCNA_00763     FALSE 0.420 5.000 0.000 NA   NA
 5847990 5847991 CCNA_00763 CCNA_00764     TRUE 0.994 0.000 0.417 0.012 Y NA
 5847993 5847994 CCNA_00766 CCNA_00767     TRUE 0.631 38.000 0.156 NA   NA
 5847995 5847996 CCNA_00768 CCNA_00769     TRUE 0.966 -3.000 0.429 NA   NA
 5847996 5847997 CCNA_00769 CCNA_00770     TRUE 0.934 84.000 0.571 0.012 Y NA
 5847997 5847998 CCNA_00770 CCNA_00771     FALSE 0.170 24.000 0.000 NA   NA
 5847998 5847999 CCNA_00771 CCNA_R0013     FALSE 0.001 357.000 0.000 NA   NA
 5848001 5848002 CCNA_00773 CCNA_00774     FALSE 0.009 381.000 0.045 NA N NA
 5848003 5848004 CCNA_00775 CCNA_00776     FALSE 0.105 93.000 0.000 1.000   NA
 5848004 5848005 CCNA_00776 CCNA_00777     FALSE 0.119 114.000 0.000 1.000   NA
 5848005 5848006 CCNA_00777 CCNA_00778     TRUE 0.625 55.000 0.000 1.000 Y NA
 5848007 5848008 CCNA_R0014 CCNA_00779     FALSE 0.060 74.000 0.000 NA   NA
 5848010 5848011 CCNA_00781 CCNA_R0015 cpdR   FALSE 0.077 110.000 0.000 NA   NA
 10784561 5848018 CCNA_04003 CCNA_00787   motA FALSE 0.332 112.000 0.047 NA   NA
 5848022 5848023 CCNA_00791 CCNA_00792     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5848024 5848025 CCNA_00793 CCNA_00794     FALSE 0.121 110.000 0.000 1.000   NA
 5848026 5848027 CCNA_00795 CCNA_00796 fixJ fixL TRUE 0.987 -7.000 0.375 0.031 Y NA
 5848027 5848028 CCNA_00796 CCNA_00797 fixL   FALSE 0.420 5.000 0.000 NA   NA
 5848028 5848029 CCNA_00797 CCNA_00798   cydC FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5848029 5848030 CCNA_00798 CCNA_00799 cydC cydD TRUE 0.832 173.000 0.631 0.004 Y NA
 5848031 5848032 CCNA_00800 CCNA_00801 cydA cydB TRUE 0.989 15.000 0.953 0.052 Y NA
 5848032 5848033 CCNA_00801 CCNA_00802 cydB   TRUE 0.842 19.000 0.256 NA   NA
 5848033 5848034 CCNA_00802 CCNA_00803     FALSE 0.458 96.000 0.105 NA   NA
 5848035 5848036 CCNA_00804 CCNA_00805   engB FALSE 0.006 230.000 0.000 NA   NA
 5848036 5848037 CCNA_00805 CCNA_00806 engB yidC TRUE 0.941 0.000 0.082 0.046   NA
 5848037 5848038 CCNA_00806 CCNA_00807 yidC   TRUE 0.904 8.000 0.105 1.000 N NA
 5848038 5848039 CCNA_00807 CCNA_00808     TRUE 0.785 94.000 0.787 1.000   NA
 5848039 5848040 CCNA_00808 CCNA_00809     FALSE 0.005 280.000 0.000 1.000   NA
 5848040 5848041 CCNA_00809 CCNA_00810     FALSE 0.321 159.000 0.089 1.000 N NA
 5848041 5848042 CCNA_00810 CCNA_00811     TRUE 0.853 32.000 0.500 1.000 N NA
 5848042 5848043 CCNA_00811 CCNA_00812     FALSE 0.063 60.000 0.000 NA   NA
 5848043 5848044 CCNA_00812 CCNA_00813     TRUE 0.686 6.000 0.018 NA   NA
 5848044 5848045 CCNA_00813 CCNA_00814     FALSE 0.026 226.000 0.027 NA   NA
 5848045 5848046 CCNA_00814 CCNA_00815     FALSE 0.121 193.000 0.100 NA   NA
 5848046 5848047 CCNA_00815 CCNA_00816     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5848047 5848048 CCNA_00816 CCNA_00817     FALSE 0.088 44.000 0.000 NA   NA
 5848048 5848049 CCNA_00817 CCNA_00818     FALSE 0.082 161.000 0.000 1.000 N NA
 5848049 5848050 CCNA_00818 CCNA_00819     FALSE 0.163 -93.000 0.000 NA   NA
 5848050 5848051 CCNA_00819 CCNA_00820     FALSE 0.094 42.000 0.000 NA   NA
 5848051 5848052 CCNA_00820 CCNA_00821     FALSE 0.500 45.000 0.100 NA   NA
 5848052 5848053 CCNA_00821 CCNA_00822     TRUE 0.677 72.000 0.500 NA   NA
 5848053 5848054 CCNA_00822 CCNA_00823     TRUE 0.696 88.000 0.500 NA   NA
 5848054 5848055 CCNA_00823 CCNA_00824     TRUE 0.804 34.000 0.000 0.044 Y NA
 5848055 5848056 CCNA_00824 CCNA_00825     FALSE 0.075 163.000 0.000 1.000 N NA
 5848056 5848057 CCNA_00825 CCNA_00826     TRUE 0.993 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5848058 5848059 CCNA_00827 CCNA_00828     TRUE 0.747 127.000 0.667 NA   NA
 5848061 5848062 CCNA_00830 CCNA_00831     TRUE 0.960 -99.000 0.250 0.017 Y NA
 5848064 5848065 CCNA_00833 CCNA_00834     FALSE 0.002 443.000 0.000 1.000   NA
 5848065 5848066 CCNA_00834 CCNA_R0017     FALSE 0.063 131.000 0.000 NA   NA
 5848066 5848067 CCNA_R0017 CCNA_00835     FALSE 0.002 330.000 0.000 NA   NA
 5848067 5848068 CCNA_00835 CCNA_00836     FALSE 0.054 336.000 0.000 0.003 Y NA
 5848069 5848070 CCNA_00837 CCNA_00838     FALSE 0.053 161.000 0.000 1.000   NA
 5848071 5848072 CCNA_00839 CCNA_00840     FALSE 0.004 293.000 0.000 1.000   NA
 5848073 5848074 CCNA_00841 CCNA_00842     FALSE 0.066 90.000 0.000 NA   NA
 5848074 5848075 CCNA_00842 CCNA_00843     FALSE 0.064 84.000 0.000 NA   NA
 5848075 5848076 CCNA_00843 CCNA_00844   relE-1 FALSE 0.060 76.000 0.000 NA   NA
 5848076 5848077 CCNA_00844 CCNA_00845 relE-1 relB-1 FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5848077 5848078 CCNA_00845 CCNA_00846 relB-1   FALSE 0.155 39.000 0.000 1.000   NA
 5848079 5848080 CCNA_R0018 CCNA_R0019     FALSE 0.167 -86.000 0.000 NA   NA
 5848080 5848081 CCNA_R0019 CCNA_00847     FALSE 0.064 84.000 0.000 NA   NA
 5848082 5848083 CCNA_00848 CCNA_00849     FALSE 0.066 57.000 0.000 NA   NA
 5848083 5848084 CCNA_00849 CCNA_00850   acrB2 TRUE 0.971 2.000 0.286 0.036 N NA
 5848084 5848085 CCNA_00850 CCNA_00851 acrB2   TRUE 0.957 13.000 0.667 1.000 N NA
 5848089 5848090 CCNA_00855 CCNA_00856     TRUE 0.603 141.000 0.286 1.000 N NA
 5848090 5848091 CCNA_00856 CCNA_00857     FALSE 0.036 172.000 0.000 1.000   NA
 5848093 5848094 CCNA_00859 CCNA_00860     FALSE 0.124 32.000 0.000 NA   NA
 5848094 5848095 CCNA_00860 CCNA_00861     FALSE 0.070 124.000 0.000 NA   NA
 5848095 5848096 CCNA_00861 CCNA_00862   xylD FALSE 0.075 115.000 0.000 NA   NA
 5848096 5848097 CCNA_00862 CCNA_00863 xylD xylC TRUE 0.967 -7.000 0.116 NA Y NA
 5848097 5848098 CCNA_00863 CCNA_00864 xylC xylB TRUE 0.709 125.000 0.417 NA N NA
 5848098 5848099 CCNA_00864 CCNA_00865 xylB xylA TRUE 0.931 6.000 0.091 0.037 N NA
 5848099 5848100 CCNA_00865 CCNA_00866 xylA xylX TRUE 0.667 17.000 0.017 0.079   NA
 5848103 5848104 CCNA_00869 CCNA_00870     FALSE 0.061 66.000 0.000 NA   NA
 5848104 5848105 CCNA_00870 CCNA_00871     TRUE 0.718 20.000 0.097 NA   NA
 5848105 5848106 CCNA_00871 CCNA_00872     TRUE 0.847 -3.000 0.035 1.000   NA
 5848106 5848107 CCNA_00872 CCNA_00873     FALSE 0.436 29.000 0.027 1.000   NA
 5848109 5848110 CCNA_00875 CCNA_00876     FALSE 0.397 -21.000 0.000 NA N NA
 5848110 5848111 CCNA_00876 CCNA_00877     FALSE 0.124 32.000 0.000 NA   NA
 5848112 5848113 CCNA_00878 CCNA_00879     FALSE 0.090 157.000 0.000 1.000 N NA
 5848114 5848115 CCNA_00880 CCNA_00881     TRUE 0.961 -3.000 0.346 NA   NA
 5848115 5848116 CCNA_00881 CCNA_00882     FALSE 0.037 156.000 0.000 NA   NA
 5848116 5848117 CCNA_00882 CCNA_00883     FALSE 0.013 192.000 0.000 NA   NA
 5848117 5848118 CCNA_00883 CCNA_00884     FALSE 0.460 3.000 0.000 NA   NA
 5848118 5848119 CCNA_00884 CCNA_00885     FALSE 0.308 -10.000 0.000 NA   NA
 5848120 5848121 CCNA_00886 CCNA_00887     FALSE 0.015 183.000 0.000 NA   NA
 5848121 5848122 CCNA_00887 CCNA_00888     FALSE 0.069 125.000 0.000 NA   NA
 5848123 5848124 CCNA_00889 CCNA_00890     FALSE 0.065 58.000 0.000 NA   NA
 5848125 5848126 CCNA_00891 CCNA_R0020     FALSE 0.006 228.000 0.000 NA   NA
 5848126 5848127 CCNA_R0020 CCNA_00892     FALSE 0.029 164.000 0.000 NA   NA
 5848127 5848128 CCNA_00892 CCNA_00893     FALSE 0.228 160.000 0.060 1.000   NA
 5848128 5848129 CCNA_00893 CCNA_00894     FALSE 0.246 182.000 0.233 1.000   NA
 5848129 5848130 CCNA_00894 CCNA_00895     FALSE 0.342 11.000 0.000 NA   NA
 5848133 5848134 CCNA_00898 CCNA_00899   prfA TRUE 0.949 4.000 0.002 1.000 Y NA
 5848137 5848138 CCNA_00902 CCNA_00903 ibpA iatA TRUE 0.815 23.000 0.000 NA Y NA
 5848138 5848139 CCNA_00903 CCNA_00904 iatA iatP TRUE 0.992 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 5848140 5848141 CCNA_00905 CCNA_00906     FALSE 0.098 40.000 0.000 NA   NA
 5848141 5848142 CCNA_00906 CCNA_00907     TRUE 0.976 -3.000 0.667 NA   NA
 5848142 5848143 CCNA_00907 CCNA_00908     TRUE 0.883 -63.000 0.250 0.002   NA
 5848143 5848144 CCNA_00908 CCNA_00909     FALSE 0.164 25.000 0.000 NA   NA
 5848144 5848145 CCNA_00909 CCNA_00910     FALSE 0.243 16.000 0.000 NA   NA
 5848145 5848146 CCNA_00910 CCNA_00911     FALSE 0.098 63.000 0.000 1.000   NA
 5848146 5848147 CCNA_00911 CCNA_00912     TRUE 0.617 -3.000 0.000 1.000   NA
 5848147 5848148 CCNA_00912 CCNA_00913     FALSE 0.075 50.000 0.000 NA   NA
 5848148 5848149 CCNA_00913 CCNA_00914     FALSE 0.062 79.000 0.000 NA   NA
 5848151 5848152 CCNA_00916 CCNA_00917 parE-1 parD-1 TRUE 0.964 -3.000 0.385 NA   NA
 5848153 5848154 CCNA_00918 CCNA_00919     FALSE 0.103 38.000 0.000 NA   NA
 5848154 5848155 CCNA_00919 CCNA_00920     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5848155 5848156 CCNA_00920 CCNA_00921     FALSE 0.026 168.000 0.000 NA   NA
 5848156 5848157 CCNA_00921 CCNA_00922   clpB TRUE 0.652 99.000 0.003 1.000 Y NA
 5848157 5848158 CCNA_00922 CCNA_00923 clpB   FALSE 0.007 220.000 0.000 NA   NA
 5848159 5848160 CCNA_00924 CCNA_00925     FALSE 0.483 1.000 0.000 NA   NA
 5848160 5848161 CCNA_00925 CCNA_00926     FALSE 0.077 105.000 0.000 NA   NA
 5848161 5848162 CCNA_00926 CCNA_00927     FALSE 0.026 168.000 0.000 NA   NA
 5848162 5848163 CCNA_00927 CCNA_00928     FALSE 0.362 10.000 0.000 NA   NA
 5848164 5848165 CCNA_00929 CCNA_00930     TRUE 0.986 11.000 0.456 1.000 Y NA
 5848165 5848166 CCNA_00930 CCNA_00931     TRUE 0.897 -24.000 0.009 1.000 Y NA
 5848166 5848167 CCNA_00931 CCNA_00932   ribH TRUE 0.929 16.000 0.008 0.002 Y NA
 5848167 5848168 CCNA_00932 CCNA_00933 ribH   FALSE 0.095 73.000 0.000 1.000   NA
 5848168 5848169 CCNA_00933 CCNA_00934     FALSE 0.073 51.000 0.000 NA   NA
 5848172 5848173 CCNA_00937 CCNA_00938     FALSE 0.031 162.000 0.000 NA   NA
 5848174 5848175 CCNA_00939 CCNA_00940     FALSE 0.120 93.000 0.000 NA N NA
 5848176 5848177 CCNA_00941 CCNA_00942   flgL FALSE 0.261 45.000 0.008 1.000 N NA
 5848177 5848178 CCNA_00942 CCNA_00943 flgL flaN TRUE 0.995 4.000 0.800 0.005 Y NA
 5848179 5848180 CCNA_00944 CCNA_00945     FALSE 0.150 -147.000 0.000 NA   NA
 5848180 5848181 CCNA_00945 CCNA_00946   flgD TRUE 0.893 12.000 0.207 NA   NA
 5848181 5848182 CCNA_00946 CCNA_00947 flgD flgE TRUE 0.814 147.000 0.276 NA Y NA
 5848182 5848183 CCNA_00947 CCNA_00948 flgE sciP FALSE 0.202 169.000 0.072 1.000   NA
 5848183 5848184 CCNA_00948 CCNA_00949 sciP   FALSE 0.187 21.000 0.000 NA   NA
 5848184 5848185 CCNA_00949 CCNA_00950   fliF FALSE 0.207 19.000 0.000 NA   NA
 5848185 5848186 CCNA_00950 CCNA_00951 fliF fliG TRUE 0.996 0.000 0.762 0.005 Y NA
 5848186 5848187 CCNA_00951 CCNA_00952 fliG flbE TRUE 0.844 11.000 0.095 NA   NA
 5848187 5848188 CCNA_00952 CCNA_00953 flbE fliN TRUE 0.811 16.000 0.139 NA   NA
 5848188 5848189 CCNA_00953 CCNA_00954 fliN flbD TRUE 0.835 34.000 0.484 1.000 N NA
 5848191 5848192 CCNA_00956 CCNA_00957 flhA   FALSE 0.172 40.000 0.000 NA N NA
 5848194 5848195 CCNA_00959 CCNA_00960     FALSE 0.405 6.000 0.000 NA   NA
 5848195 5848196 CCNA_00960 CCNA_00961     FALSE 0.179 -69.000 0.000 NA   NA
 5848197 5848198 CCNA_00962 CCNA_00963     TRUE 0.827 11.000 0.052 1.000 N NA
 5848198 5848199 CCNA_00963 CCNA_00964     FALSE 0.002 295.000 0.000 NA   NA
 5848199 5848200 CCNA_00964 CCNA_00965     FALSE 0.019 175.000 0.000 NA   NA
 5848210 5848211 CCNA_00975 CCNA_00976   sppA FALSE 0.065 58.000 0.000 NA   NA
 5848211 5848212 CCNA_00976 CCNA_R0021 sppA   FALSE 0.020 174.000 0.000 NA   NA
 5848213 5848214 CCNA_R0022 CCNA_00977     FALSE 0.069 95.000 0.000 NA   NA
 5848214 5848215 CCNA_00977 CCNA_00978     TRUE 0.878 15.000 0.000 NA Y NA
 5848215 5848216 CCNA_00978 CCNA_00979     FALSE 0.101 152.000 0.000 1.000 N NA
 5848216 5848217 CCNA_00979 CCNA_00980   lolE TRUE 0.979 5.000 0.070 0.099 Y NA
 5848217 5848218 CCNA_00980 CCNA_00981 lolE lolD TRUE 0.979 -3.000 0.647 1.000 N NA
 5848218 5848219 CCNA_00981 CCNA_00982 lolD   FALSE 0.005 321.000 0.000 1.000 N NA
 5848220 5848221 CCNA_00983 CCNA_00984     TRUE 0.722 74.000 0.500 1.000 N NA
 5848221 5848222 CCNA_00984 CCNA_00985     TRUE 0.867 -3.000 0.030 1.000 N NA
 5848223 5848224 CCNA_00986 CCNA_00987     TRUE 0.641 61.000 0.375 NA   NA
 5848227 5848228 CCNA_00990 CCNA_00991     FALSE 0.149 62.000 0.000 1.000 N NA
 5848228 5848229 CCNA_00991 CCNA_00992     FALSE 0.061 65.000 0.000 NA   NA
 5848229 5848230 CCNA_00992 CCNA_00993     FALSE 0.060 72.000 0.000 NA   NA
 5848230 5848231 CCNA_00993 CCNA_00994     FALSE 0.378 161.000 0.143 1.000 N NA
 5848232 5848233 CCNA_00995 CCNA_00996     FALSE 0.015 231.000 0.000 1.000 N NA
 5848233 5848234 CCNA_00996 CCNA_00997     FALSE 0.007 224.000 0.000 NA   NA
 5848234 5848235 CCNA_00997 CCNA_00998     FALSE 0.006 229.000 0.000 NA   NA
 5848235 5848236 CCNA_00998 CCNA_00999     FALSE 0.229 162.000 0.080 NA   NA
 5848236 5848237 CCNA_00999 CCNA_01000     FALSE 0.067 56.000 0.000 NA   NA
 5848238 5848239 CCNA_01001 CCNA_01002   fliP TRUE 0.773 21.000 0.103 1.000 N NA
 5848239 5848240 CCNA_01002 CCNA_01003 fliP fliO TRUE 0.822 0.000 0.023 1.000   NA
 5848241 5848242 CCNA_01004 CCNA_01005 flgB flgC TRUE 0.987 13.000 0.804 NA Y NA
 5848242 5848243 CCNA_01005 CCNA_01006 flgC fliE TRUE 0.967 11.000 0.037 0.002 Y NA
 5848244 5848245 CCNA_01007 CCNA_01008     FALSE 0.111 35.000 0.000 NA   NA
 5848245 5848246 CCNA_01008 CCNA_01009     TRUE 0.777 125.000 0.061 1.000 Y NA
 5848246 5848247 CCNA_01009 CCNA_01010     TRUE 0.752 119.000 0.039 1.000 Y NA
 5848247 5848248 CCNA_01010 CCNA_01011     TRUE 0.920 -15.000 0.192 0.035 N NA
 5848249 5848250 CCNA_01012 CCNA_01013     TRUE 0.817 -3.000 0.013 1.000 N NA
 5848251 5848252 CCNA_R0023 CCNA_01014     FALSE 0.004 264.000 0.000 NA   NA
 5848253 5848254 CCNA_01015 CCNA_01016     TRUE 0.865 -3.000 0.000 0.002 N NA
 5848254 5848255 CCNA_01016 CCNA_01017     FALSE 0.008 276.000 0.000 1.000 N NA
 5848256 5848257 CCNA_01018 CCNA_01019     FALSE 0.038 171.000 0.000 1.000   NA
 5848257 5848258 CCNA_01019 CCNA_01020     TRUE 0.706 64.000 0.429 1.000 N NA
 5848259 5848260 CCNA_01021 CCNA_01022     FALSE 0.195 227.000 0.600 NA   NA
 5848260 5848261 CCNA_01022 CCNA_01023     TRUE 0.955 10.000 0.600 NA   NA
 5848262 5848263 CCNA_01024 CCNA_01025     FALSE 0.306 13.000 0.000 NA   NA
 5848263 5848264 CCNA_01025 CCNA_01026     FALSE 0.272 -16.000 0.000 NA   NA
 5848264 5848265 CCNA_01026 CCNA_01027     FALSE 0.012 198.000 0.000 NA   NA
 5848267 5848268 CCNA_01029 CCNA_01030     FALSE 0.096 68.000 0.000 1.000   NA
 5848269 5848270 CCNA_01031 CCNA_01032     FALSE 0.143 75.000 0.000 1.000 N NA
 5848270 5848271 CCNA_01032 CCNA_01033     TRUE 0.924 -36.000 0.667 NA N NA
 5848271 5848272 CCNA_01033 CCNA_01034     TRUE 0.796 78.000 0.118 NA Y NA
 5848272 5848273 CCNA_01034 CCNA_01035     TRUE 0.711 1.000 0.000 1.000 N NA
 5848274 5848275 CCNA_01036 CCNA_01037     FALSE 0.099 82.000 0.000 1.000   NA
 5848275 5848276 CCNA_01037 CCNA_01038     FALSE 0.063 83.000 0.000 NA   NA
 5848277 5848278 CCNA_01039 CCNA_01040     TRUE 0.986 -3.000 0.171 NA Y NA
 5848279 5848280 CCNA_01041 CCNA_01042     FALSE 0.001 563.000 0.000 NA   NA
 5848280 5848281 CCNA_01042 CCNA_01043     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5848283 5848284 CCNA_01045 CCNA_01046     TRUE 0.695 0.000 0.010 NA   NA
 5848285 5848286 CCNA_R0024 CCNA_01047     FALSE 0.005 247.000 0.000 NA   NA
 5848286 5848287 CCNA_01047 CCNA_01048     FALSE 0.035 158.000 0.000 NA   NA
 5848287 5848288 CCNA_01048 CCNA_01049     FALSE 0.002 303.000 0.000 NA   NA
 5848288 5848289 CCNA_01049 CCNA_01050     FALSE 0.065 129.000 0.000 NA   NA
 5848289 5848290 CCNA_01050 CCNA_01051     FALSE 0.002 446.000 0.000 1.000   NA
 5848290 5848291 CCNA_01051 CCNA_01052     TRUE 0.681 90.000 0.455 NA   NA
 5848291 5848292 CCNA_01052 CCNA_01053     TRUE 0.893 -75.000 0.647 NA   NA
 5848292 5848293 CCNA_01053 CCNA_01054     TRUE 0.889 24.000 0.647 NA   NA
 5848294 5848295 CCNA_01055 CCNA_01056     TRUE 0.849 11.000 0.100 NA   NA
 5848295 5848296 CCNA_01056 CCNA_01057     FALSE 0.130 31.000 0.000 NA   NA
 5848296 5848297 CCNA_01057 CCNA_01058     TRUE 0.637 83.000 0.364 NA   NA
 5848298 5848299 CCNA_01059 CCNA_01060 rsaA rsaD FALSE 0.008 243.000 0.000 1.000   NA
 5848299 5848300 CCNA_01060 CCNA_01061 rsaD rsaE TRUE 0.807 68.000 0.688 0.008   NA
 5848300 5848301 CCNA_01061 CCNA_01062 rsaE   FALSE 0.129 140.000 0.000 1.000 N NA
 5848301 5848302 CCNA_01062 CCNA_01063     TRUE 0.626 0.000 0.000 1.000   NA
 5848302 5848303 CCNA_01063 CCNA_01064     TRUE 0.878 -3.000 0.050 1.000   NA
 5848303 5848304 CCNA_01064 CCNA_01065     TRUE 0.977 4.000 0.080 1.000 Y NA
 5848304 5848305 CCNA_01065 CCNA_01066     TRUE 0.992 11.000 0.714 0.014 Y NA
 5848305 5848306 CCNA_01066 CCNA_01067   rsaFa TRUE 0.875 57.000 0.286 1.000 Y NA
 5848308 5848309 CCNA_01069 CCNA_R0025     FALSE 0.044 149.000 0.000 NA   NA
 5848310 5848311 CCNA_01070 CCNA_01071     TRUE 0.757 42.000 0.444 NA   NA
 5848311 5848312 CCNA_01071 CCNA_01072     FALSE 0.256 174.000 0.200 NA   NA
 5848312 5848313 CCNA_01072 CCNA_01073     TRUE 0.582 104.000 0.200 NA   NA
 5848313 5848314 CCNA_01073 CCNA_01074     FALSE 0.063 60.000 0.000 NA   NA
 5848314 5848315 CCNA_01074 CCNA_01075     TRUE 0.672 95.000 0.400 NA   NA
 5848315 5848316 CCNA_01075 CCNA_01076     FALSE 0.342 11.000 0.000 NA   NA
 5848316 5848317 CCNA_01076 CCNA_01077     FALSE 0.065 86.000 0.000 NA   NA
 5848320 5848321 CCNA_01080 CCNA_01081     FALSE 0.482 46.000 0.095 NA   NA
 5848323 5848324 CCNA_01083 CCNA_01084     TRUE 0.965 -3.000 0.400 NA   NA
 5848325 5848326 CCNA_01085 CCNA_01086   lepA FALSE 0.032 193.000 0.000 1.000 N NA
 5848328 5848329 CCNA_01088 CCNA_01089     FALSE 0.077 49.000 0.000 NA   NA
 5848329 5848330 CCNA_01089 CCNA_01090     TRUE 0.866 -6.000 0.116 NA   NA
 5848330 5848331 CCNA_01090 CCNA_01091     FALSE 0.060 76.000 0.000 NA   NA
 5848331 5848332 CCNA_01091 CCNA_01092     FALSE 0.290 54.000 0.043 NA   NA
 5848332 5848333 CCNA_01092 CCNA_01093     TRUE 0.945 -15.000 0.750 NA   NA
 5848333 5848334 CCNA_01093 CCNA_01094     TRUE 0.747 127.000 0.667 NA   NA
 5848334 5848335 CCNA_01094 CCNA_01095     FALSE 0.062 79.000 0.000 NA   NA
 5848335 5848336 CCNA_01095 CCNA_01096     TRUE 0.890 158.000 0.574 0.001 Y NA
 5848336 5848337 CCNA_01096 CCNA_01097     FALSE 0.266 249.000 0.202 1.000 Y NA
 5848337 5848338 CCNA_01097 CCNA_01098     TRUE 0.989 16.000 0.928 0.014 Y NA
 5848338 5848339 CCNA_01098 CCNA_01099     FALSE 0.181 122.000 0.002 1.000 N NA
 5848339 5848340 CCNA_01099 CCNA_01100     TRUE 0.749 67.000 0.600 1.000 N NA
 5848340 5848341 CCNA_01100 CCNA_01101     FALSE 0.156 133.000 0.002 1.000 N NA
 5848343 5848344 CCNA_01103 CCNA_01104     TRUE 0.985 -3.000 0.141 1.000 Y NA
 5848345 5848346 CCNA_01105 CCNA_01106   parD-2 FALSE 0.152 59.000 0.000 1.000 N NA
 5848346 5848347 CCNA_01106 CCNA_01107 parD-2 parE-2 FALSE 0.440 4.000 0.000 NA   NA
 5848349 5848350 CCNA_R0026 CCNA_R0027     FALSE 0.073 51.000 0.000 NA   NA
 5848350 5848351 CCNA_R0027 CCNA_01109     FALSE 0.072 99.000 0.000 NA   NA
 5848351 5848352 CCNA_01109 CCNA_01110     FALSE 0.460 3.000 0.000 NA   NA
 5848352 5848353 CCNA_01110 CCNA_01111     FALSE 0.003 328.000 0.000 1.000   NA
 5848353 5848354 CCNA_01111 CCNA_01112     TRUE 0.820 0.000 0.032 NA   NA
 5848355 5848356 CCNA_01113 CCNA_01114     FALSE 0.329 -7.000 0.000 NA   NA
 5848356 5848357 CCNA_01114 CCNA_01115     FALSE 0.228 43.000 0.016 NA   NA
 5848360 5848361 CCNA_01118 CCNA_01119     FALSE 0.308 129.000 0.051 NA   NA
 5848363 5848364 CCNA_01121 CCNA_01122     FALSE 0.228 134.000 0.000 0.013   NA
 5848364 5848365 CCNA_01122 CCNA_01123     FALSE 0.461 11.000 0.000 1.000   NA
 5848366 5848367 CCNA_01124 CCNA_01125     FALSE 0.002 365.000 0.000 1.000   NA
 5848367 5848368 CCNA_01125 CCNA_01126     FALSE 0.111 35.000 0.000 NA   NA
 5848368 5848369 CCNA_01126 CCNA_01127     FALSE 0.119 33.000 0.000 NA   NA
 5848370 5848371 CCNA_01128 CCNA_01129   fliQ FALSE 0.045 148.000 0.000 NA   NA
 5848371 5848372 CCNA_01129 CCNA_01130 fliQ fliR TRUE 0.990 15.000 0.929 0.002 Y NA
 5848372 5848373 CCNA_01130 CCNA_01131 fliR flhB TRUE 0.991 10.000 0.788 1.000 Y NA
 5848373 5848374 CCNA_01131 CCNA_01132 flhB cckA TRUE 0.703 103.000 0.200 0.097 N NA
 5848375 5848376 CCNA_01133 CCNA_01134     TRUE 0.639 122.000 0.308 NA   NA
 5848376 5848377 CCNA_01134 CCNA_01135     TRUE 0.757 39.000 0.400 NA   NA
 5848377 5848378 CCNA_01135 CCNA_01136     FALSE 0.085 45.000 0.000 NA   NA
 5848378 5848379 CCNA_01136 CCNA_01137     FALSE 0.066 57.000 0.000 NA   NA
 5848380 5848381 CCNA_01138 CCNA_01139     TRUE 0.622 104.000 0.250 NA   NA
 5848383 5848384 CCNA_01141 CCNA_01142 recA   FALSE 0.001 687.000 0.000 NA   NA
 5848385 5848386 CCNA_01143 CCNA_01144     TRUE 0.616 30.000 0.075 NA N NA
 5848386 5848387 CCNA_01144 CCNA_01145     TRUE 0.859 23.000 0.188 0.049 N NA
 5848388 5848389 CCNA_01146 CCNA_01147     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5848389 5848390 CCNA_01147 CCNA_01148     FALSE 0.066 90.000 0.000 NA   NA
 5848392 5848393 CCNA_01150 CCNA_01151     FALSE 0.377 9.000 0.000 NA   NA
 5848393 5848394 CCNA_01151 CCNA_01152     FALSE 0.492 11.000 0.007 NA   NA
 5848394 5848395 CCNA_01152 CCNA_01153     TRUE 0.674 2.000 0.010 NA   NA
 5848395 5848396 CCNA_01153 CCNA_01154     FALSE 0.357 40.000 0.029 1.000   NA
 5848396 5848397 CCNA_01154 CCNA_01155     FALSE 0.014 214.000 0.000 1.000   NA
 5848397 5848398 CCNA_01155 CCNA_01156     FALSE 0.483 76.000 0.154 NA   NA
 5848398 5848399 CCNA_01156 CCNA_01157     FALSE 0.024 171.000 0.000 NA   NA
 5848399 5848400 CCNA_01157 CCNA_01158     TRUE 0.692 -106.000 0.111 NA   NA
 5848400 5848401 CCNA_01158 CCNA_01159     FALSE 0.004 249.000 0.000 NA   NA
 5848403 5848404 CCNA_01161 CCNA_01162     FALSE 0.299 72.000 0.031 1.000 N NA
 5848404 5848405 CCNA_01162 CCNA_01163     FALSE 0.002 348.000 0.000 NA   NA
 5848405 5848406 CCNA_01163 CCNA_01164     FALSE 0.038 155.000 0.000 NA   NA
 5848406 5848407 CCNA_01164 CCNA_01165     FALSE 0.256 -21.000 0.000 NA   NA
 5848408 5848409 CCNA_01166 CCNA_01167     TRUE 0.504 0.000 0.000 NA   NA
 5848409 5848410 CCNA_01167 CCNA_01168     TRUE 0.959 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5848410 5848411 CCNA_01168 CCNA_01169     FALSE 0.070 96.000 0.000 NA   NA
 5848411 5848412 CCNA_01169 CCNA_01170     FALSE 0.207 19.000 0.000 NA   NA
 5848412 5848413 CCNA_01170 CCNA_R0028     FALSE 0.005 238.000 0.000 NA   NA
 5848414 5848415 CCNA_01171 CCNA_01172 shpA   FALSE 0.159 111.000 0.010 NA   NA
 5848416 5848417 CCNA_01173 CCNA_01174     TRUE 0.674 24.000 0.060 1.000 N NA
 5848418 5848419 CCNA_01175 CCNA_01176     TRUE 0.948 -3.000 0.224 NA   NA
 5848419 5848420 CCNA_01176 CCNA_01177     TRUE 0.970 7.000 0.919 NA   NA
 5848420 5848421 CCNA_01177 CCNA_01178     TRUE 0.897 -16.000 0.309 NA   NA
 5848421 5848422 CCNA_01178 CCNA_01179     TRUE 0.931 0.000 0.139 NA   NA
 5848423 5848424 CCNA_01180 CCNA_01181     FALSE 0.105 93.000 0.000 1.000   NA
 5848425 5848426 CCNA_01182 CCNA_01183     TRUE 0.587 19.000 0.033 1.000   NA
 5848426 5848427 CCNA_01183 CCNA_01184     TRUE 0.753 8.000 0.026 1.000   NA
 5848429 5848430 CCNA_01186 CCNA_01187     FALSE 0.008 218.000 0.000 NA   NA
 5848430 5848431 CCNA_01187 CCNA_01188     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA N NA
 5848431 5848432 CCNA_01188 CCNA_01189     TRUE 0.893 76.000 0.500 NA Y NA
 5848432 5848433 CCNA_01189 CCNA_01190     FALSE 0.469 106.000 0.097 NA   NA
 5848434 5848435 CCNA_01191 CCNA_01192     TRUE 0.957 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5848435 5848436 CCNA_01192 CCNA_01193     TRUE 0.894 -18.000 0.000 1.000 Y NA
 5848436 5848437 CCNA_01193 CCNA_01194     FALSE 0.375 67.000 0.052 1.000 N NA
 5848437 5848438 CCNA_01194 CCNA_01195     FALSE 0.103 151.000 0.000 1.000 N NA
 5848441 5848442 CCNA_01198 CCNA_01199     TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 5848443 5848444 CCNA_01200 CCNA_01201     TRUE 0.544 68.000 0.222 NA   NA
 5848444 5848445 CCNA_01201 CCNA_01202     TRUE 0.937 -3.000 0.167 NA   NA
 5848445 5848446 CCNA_01202 CCNA_01203     FALSE 0.155 88.000 0.000 1.000 N NA
 5848446 5848447 CCNA_01203 CCNA_01204     FALSE 0.501 75.000 0.111 1.000 N NA
 5848448 5848449 CCNA_01205 CCNA_01206     TRUE 0.988 2.000 0.286 NA Y NA
 5848449 5848450 CCNA_01206 CCNA_01207   yocF TRUE 0.931 -3.000 0.107 NA N NA
 5848450 5848451 CCNA_01207 CCNA_01208 yocF yocG TRUE 0.992 -3.000 0.270 0.029 Y NA
 5848451 5848452 CCNA_01208 CCNA_01209 yocG   TRUE 0.599 10.000 0.000 1.000 N NA
 5848452 5848453 CCNA_01209 CCNA_01210     FALSE 0.017 226.000 0.000 1.000 N NA
 5848454 5848455 CCNA_01211 CCNA_01212     TRUE 0.612 -96.000 0.069 NA   NA
 5848455 5848456 CCNA_01212 CCNA_01213     TRUE 0.635 0.000 0.005 NA   NA
 5848456 5848457 CCNA_01213 CCNA_01214     TRUE 0.982 -3.000 0.631 0.043   NA
 5848457 5848458 CCNA_01214 CCNA_01215     TRUE 0.718 -3.000 0.007 1.000   NA
 5848458 5848459 CCNA_01215 CCNA_01216     FALSE 0.290 106.000 0.027 1.000   NA
 5848460 5848461 CCNA_01217 CCNA_01218     TRUE 0.951 -81.000 0.250 1.000 Y NA
 5848461 5848462 CCNA_01218 CCNA_01219     TRUE 0.976 -3.000 0.694 NA   NA
 5848463 5848464 CCNA_01220 CCNA_01221     TRUE 0.943 4.000 0.191 1.000 N NA
 5848464 5848465 CCNA_01221 CCNA_01222     FALSE 0.331 68.000 0.038 1.000 N NA
 5848465 5848466 CCNA_01222 CCNA_01223     TRUE 0.862 -10.000 0.096 1.000 N NA
 5848466 5848467 CCNA_01223 CCNA_01224     TRUE 0.912 5.000 0.129 1.000   NA
 5848467 5848468 CCNA_01224 CCNA_01225     TRUE 0.970 -3.000 0.500 NA   NA
 5848468 5848469 CCNA_01225 CCNA_01226     TRUE 0.813 2.000 0.036 NA   NA
 5848470 5848471 CCNA_01227 CCNA_01228     TRUE 0.965 -3.000 0.333 NA N NA
 5848473 5848474 CCNA_01230 CCNA_01231     TRUE 0.857 -12.000 0.148 NA   NA
 5848475 5848476 CCNA_01232 CCNA_01233     FALSE 0.258 15.000 0.000 NA   NA
 5848477 5848478 CCNA_01234 CCNA_01235     FALSE 0.446 64.000 0.100 1.000   NA
 5848479 5848480 CCNA_01236 CCNA_01237     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5848480 5848481 CCNA_01237 CCNA_01238     FALSE 0.071 98.000 0.000 NA   NA
 5848481 5848482 CCNA_01238 CCNA_01239     TRUE 0.896 23.000 0.600 1.000   NA
 5848482 5848483 CCNA_01239 CCNA_01240     TRUE 0.990 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 5848483 5848484 CCNA_01240 CCNA_01241     FALSE 0.164 91.000 0.008 1.000   NA
 5848484 5848485 CCNA_01241 CCNA_01242     FALSE 0.202 30.000 0.000 1.000   NA
 5848487 5848488 CCNA_01244 CCNA_01245     FALSE 0.002 310.000 0.000 NA   NA
 5848488 5848489 CCNA_01245 CCNA_01246     TRUE 0.924 6.000 0.213 NA   NA
 5848489 5848490 CCNA_01246 CCNA_01247     FALSE 0.494 18.000 0.021 NA   NA
 5848491 5848492 CCNA_01248 CCNA_01249     TRUE 0.973 5.000 0.667 1.000 N NA
 5848492 5848493 CCNA_01249 CCNA_01250     TRUE 0.979 -57.000 0.833 1.000 Y NA
 5848493 5848494 CCNA_01250 CCNA_01251     TRUE 0.995 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 5848496 5848497 CCNA_01253 CCNA_01254 dapA smpB TRUE 0.910 0.000 0.058 1.000 N NA
 5848498 5848499 CCNA_01255 CCNA_01256     FALSE 0.001 438.000 0.000 NA   NA
 5848499 5848500 CCNA_01256 CCNA_01257     TRUE 0.944 -3.000 0.202 NA   NA
 5848500 5848501 CCNA_01257 CCNA_01258     TRUE 0.980 -3.000 0.939 NA   NA
 5848502 5848503 CCNA_01259 CCNA_01260     TRUE 0.714 39.000 0.294 NA   NA
 5848503 5848504 CCNA_01260 CCNA_01261     FALSE 0.419 119.000 0.080 NA   NA
 5848504 5848505 CCNA_01261 CCNA_01262   acrB3 TRUE 0.960 0.000 0.260 NA N NA
 5848505 5848506 CCNA_01262 CCNA_01263 acrB3   TRUE 0.845 16.000 0.154 NA N NA
 5848507 5848508 CCNA_01264 CCNA_01265     FALSE 0.075 115.000 0.000 NA   NA
 5848508 5848509 CCNA_01265 CCNA_01266     FALSE 0.072 99.000 0.000 NA   NA
 5848509 5848510 CCNA_01266 CCNA_01267     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5848510 5848511 CCNA_01267 CCNA_01268     FALSE 0.097 78.000 0.000 1.000   NA
 5848512 5848513 CCNA_01269 CCNA_01270     TRUE 0.651 57.000 0.375 NA   NA
 5848513 5848514 CCNA_01270 CCNA_01271     TRUE 0.650 149.000 0.667 NA   NA
 5848515 5848516 CCNA_01272 CCNA_01273     TRUE 0.572 5.000 0.007 NA   NA
 5848516 5848517 CCNA_01273 CCNA_R0029     FALSE 0.158 26.000 0.000 NA   NA
 5848517 5848518 CCNA_R0029 CCNA_01274     FALSE 0.061 77.000 0.000 NA   NA
 5848519 5848520 CCNA_01275 CCNA_01276     TRUE 0.906 0.000 0.054 1.000 N NA
 5848520 5848521 CCNA_01276 CCNA_01277     TRUE 0.957 17.000 0.155 1.000 Y NA
 5848522 5848523 CCNA_01278 CCNA_01279     FALSE 0.488 28.000 0.044 NA   NA
 5848523 5848524 CCNA_01279 CCNA_01280     FALSE 0.410 32.000 0.036 NA   NA
 5848525 5848526 CCNA_01281 CCNA_01282     FALSE 0.170 71.000 0.004 1.000 N NA
 5848526 5848527 CCNA_01282 CCNA_01283     TRUE 0.673 -93.000 0.081 1.000   NA
 5848527 5848528 CCNA_01283 CCNA_01284     TRUE 0.813 -114.000 0.273 1.000   NA
 5848534 5848535 CCNA_01290 CCNA_01291     TRUE 0.968 -3.000 0.455 NA   NA
 5848535 5848536 CCNA_01291 CCNA_01292     TRUE 0.976 -3.000 0.667 NA   NA
 5848539 5848540 CCNA_01295 CCNA_01296     FALSE 0.358 124.000 0.061 NA   NA
 5848540 5848541 CCNA_01296 CCNA_01297     FALSE 0.127 36.000 0.002 NA   NA
 5848542 5848543 CCNA_R0030 CCNA_R0031     FALSE 0.077 111.000 0.000 NA   NA
 5848543 5848544 CCNA_R0031 CCNA_01298     FALSE 0.068 55.000 0.000 NA   NA
 5848544 5848545 CCNA_01298 CCNA_01299     FALSE 0.067 93.000 0.000 NA   NA
 5848545 5848546 CCNA_01299 CCNA_01300   fdhD FALSE 0.031 162.000 0.000 NA   NA
 5848546 5848547 CCNA_01300 CCNA_01301 fdhD   TRUE 0.985 0.000 0.047 0.001 Y NA
 5848547 5848548 CCNA_01301 CCNA_01302     TRUE 0.565 6.000 0.000 NA N NA
 5848548 5848549 CCNA_01302 CCNA_01303     FALSE 0.076 113.000 0.000 NA   NA
 5848549 5848550 CCNA_01303 CCNA_01304     FALSE 0.070 97.000 0.000 NA   NA
 5848550 5848551 CCNA_01304 CCNA_01305   rpsJ FALSE 0.279 14.000 0.000 NA   NA
 5848551 5848552 CCNA_01305 CCNA_01306 rpsJ rplC TRUE 0.979 -22.000 0.307 0.018 Y NA
 5848552 5848553 CCNA_01306 CCNA_01307 rplC rplD TRUE 0.995 0.000 0.486 0.013 Y NA
 5848553 5848554 CCNA_01307 CCNA_01308 rplD rplW TRUE 0.995 0.000 0.513 0.013 Y NA
 5848554 5848555 CCNA_01308 CCNA_01309 rplW rplB TRUE 0.995 4.000 0.849 0.014 Y NA
 5848555 5848556 CCNA_01309 CCNA_01310 rplB rpsS TRUE 0.995 4.000 0.820 0.018 Y NA
 5848556 5848557 CCNA_01310 CCNA_01311 rpsS rplV TRUE 0.987 3.000 0.119 0.018 Y NA
 5848557 5848558 CCNA_01311 CCNA_01312 rplV rpsC TRUE 0.989 0.000 0.109 0.018 Y NA
 5848558 5848559 CCNA_01312 CCNA_01313 rpsC rplP TRUE 0.990 14.000 0.828 0.018 Y NA
 5848559 5848560 CCNA_01313 CCNA_01314 rplP rpmC TRUE 0.994 6.000 0.802 0.013 Y NA
 5848560 5848561 CCNA_01314 CCNA_01315 rpmC rpsQ TRUE 0.993 11.000 0.828 0.013 Y NA
 5848561 5848562 CCNA_01315 CCNA_01316 rpsQ rplN TRUE 0.986 18.000 0.791 0.018 Y NA
 5848562 5848563 CCNA_01316 CCNA_01317 rplN rplX TRUE 0.996 0.000 0.810 0.018 Y NA
 5848563 5848564 CCNA_01317 CCNA_01318 rplX rplE TRUE 0.992 -7.000 0.758 0.013 Y NA
 5848564 5848565 CCNA_01318 CCNA_01319 rplE rpsN TRUE 0.969 22.000 0.309 0.013 Y NA
 5848565 5848566 CCNA_01319 CCNA_01320 rpsN rpsH TRUE 0.969 -64.000 0.295 0.013 Y NA
 5848566 5848567 CCNA_01320 CCNA_01321 rpsH rplF TRUE 0.986 19.000 0.808 0.013 Y NA
 5848567 5848568 CCNA_01321 CCNA_01322 rplF rplR TRUE 0.995 4.000 0.815 0.013 Y NA
 5848568 5848569 CCNA_01322 CCNA_01323 rplR rpsE TRUE 0.993 11.000 0.814 0.018 Y NA
 5848569 5848570 CCNA_01323 CCNA_01324 rpsE rpmD TRUE 0.995 4.000 0.789 0.018 Y NA
 5848570 5848571 CCNA_01324 CCNA_01325 rpmD rplO TRUE 0.838 173.000 0.653 0.002 Y NA
 5848571 5848572 CCNA_01325 CCNA_01326 rplO secY FALSE 0.281 220.000 0.730 1.000 N NA
 5848572 5848573 CCNA_01326 CCNA_01327 secY adk FALSE 0.200 135.000 0.009 1.000 N NA
 5848573 5848574 CCNA_01327 CCNA_01328 adk rpsM FALSE 0.016 247.000 0.006 1.000 N NA
 5848574 5848575 CCNA_01328 CCNA_01329 rpsM rpsK TRUE 0.990 14.000 0.810 0.013 Y NA
 5848575 5848576 CCNA_01329 CCNA_01330 rpsK rpoA TRUE 0.654 78.000 0.308 1.000 N NA
 5848579 5848580 CCNA_01333 CCNA_01334     FALSE 0.027 167.000 0.000 NA   NA
 5848580 5848581 CCNA_01334 CCNA_01335     TRUE 0.978 0.000 0.750 NA   NA
 5848582 5848583 CCNA_01336 CCNA_01337     FALSE 0.096 70.000 0.000 1.000   NA
 5848583 5848584 CCNA_01337 CCNA_01338     FALSE 0.060 71.000 0.000 NA   NA
 5848584 5848585 CCNA_01338 CCNA_01339     TRUE 0.946 -3.000 0.217 NA   NA
 5848585 5848586 CCNA_01339 CCNA_01340     FALSE 0.355 -22.000 0.000 1.000   NA
 5848586 5848587 CCNA_01340 CCNA_01341     FALSE 0.345 93.000 0.037 1.000 N NA
 5848587 5848588 CCNA_01341 CCNA_01342     FALSE 0.419 119.000 0.051 1.000 N NA
 5848588 5848589 CCNA_01342 CCNA_01343     TRUE 0.742 -3.000 0.002 1.000 N NA
 5848589 5848590 CCNA_01343 CCNA_01344     TRUE 0.852 -13.000 0.148 NA   NA
 5848590 5848591 CCNA_01344 CCNA_01345     FALSE 0.033 161.000 0.000 NA   NA
 5848591 5848592 CCNA_01345 CCNA_01346     FALSE 0.037 187.000 0.000 1.000 N NA
 5848592 5848593 CCNA_01346 CCNA_01347     FALSE 0.209 -36.000 0.000 NA   NA
 5848593 5848594 CCNA_01347 CCNA_01348     FALSE 0.006 229.000 0.000 NA   NA
 5848594 5848595 CCNA_01348 CCNA_01349     FALSE 0.003 273.000 0.000 NA   NA
 5848595 5848596 CCNA_01349 CCNA_01350     TRUE 0.878 15.000 0.000 NA Y NA
 5848597 5848598 CCNA_01351 CCNA_01352     TRUE 0.992 1.000 0.464 1.000 Y NA
 5848598 5848599 CCNA_01352 CCNA_01353     FALSE 0.181 109.000 0.000 1.000 N NA
 5848599 5848600 CCNA_01353 CCNA_01354   idhA FALSE 0.003 311.000 0.000 1.000   NA
 5848601 5848602 CCNA_01355 CCNA_01356 iolR iolC FALSE 0.311 129.000 0.029 1.000 N NA
 5848602 5848603 CCNA_01356 CCNA_01357 iolC iolD TRUE 0.837 2.000 0.021 1.000 N NA
 5848603 5848604 CCNA_01357 CCNA_01358 iolD iolE TRUE 0.973 4.000 0.600 1.000 N NA
 5848604 5848605 CCNA_01358 CCNA_01359 iolE iolB TRUE 0.969 -3.000 0.019 1.000 Y NA
 5848605 5848606 CCNA_01359 CCNA_01360 iolB iolA FALSE 0.281 31.000 0.000 1.000 N NA
 5848606 5848607 CCNA_01360 CCNA_01361 iolA   FALSE 0.112 122.000 0.000 1.000   NA
 5848607 5848608 CCNA_01361 CCNA_01362   phoP TRUE 0.965 -3.000 0.344 1.000   NA
 5848608 5848609 CCNA_01362 CCNA_01363 phoP phoQ TRUE 0.995 -3.000 0.963 1.000 Y NA
 5848609 5848610 CCNA_01363 CCNA_01364 phoQ   FALSE 0.015 231.000 0.000 1.000 N NA
 5848611 5848612 CCNA_01365 CCNA_01366 perP   FALSE 0.007 306.000 0.021 NA   NA
 5848613 5848614 CCNA_01367 CCNA_01368     FALSE 0.203 152.000 0.024 1.000 N NA
 5848614 5848615 CCNA_01368 CCNA_01369     TRUE 0.908 61.000 0.323 0.007 Y NA
 5848615 5848616 CCNA_01369 CCNA_01370     FALSE 0.151 27.000 0.000 NA   NA
 5848617 5848618 CCNA_01371 CCNA_01372     FALSE 0.279 102.000 0.035 NA   NA
 5848619 5848620 CCNA_01373 CCNA_01374     TRUE 0.810 -72.000 0.250 NA   NA
 5848620 5848621 CCNA_01374 CCNA_01375     TRUE 0.800 4.000 0.017 1.000 N NA
 5848621 5848622 CCNA_01375 CCNA_01376     FALSE 0.253 34.000 0.000 1.000 N NA
 5848622 5848623 CCNA_01376 CCNA_R0032     FALSE 0.065 89.000 0.000 NA   NA
 5848623 5848624 CCNA_R0032 CCNA_R0033     FALSE 0.060 73.000 0.000 NA   NA
 5848624 5848625 CCNA_R0033 CCNA_R0034     FALSE 0.058 136.000 0.000 NA   NA
 5848627 5848628 CCNA_01378 CCNA_01379   rsaFb FALSE 0.310 110.000 0.019 1.000 N NA
 5848628 5848629 CCNA_01379 CCNA_01380 rsaFb popZ FALSE 0.300 129.000 0.049 NA   NA
 5848629 5848630 CCNA_01380 CCNA_01381 popZ   FALSE 0.250 127.000 0.033 NA   NA
 5848630 5848631 CCNA_01381 CCNA_01382     FALSE 0.006 295.000 0.000 1.000 N NA
 5848631 5848632 CCNA_01382 CCNA_01383     FALSE 0.420 5.000 0.000 NA   NA
 5848636 5848637 CCNA_01387 CCNA_01388     TRUE 0.655 7.000 0.007 NA N NA
 5848637 5848638 CCNA_01388 CCNA_01389     FALSE 0.179 49.000 0.000 1.000 N NA
 5848638 5848639 CCNA_01389 CCNA_01390     FALSE 0.144 76.000 0.000 1.000 N NA
 5848639 5848640 CCNA_01390 CCNA_01391     FALSE 0.246 35.000 0.000 1.000 N NA
 5848640 5848641 CCNA_01391 CCNA_01392     FALSE 0.037 156.000 0.000 NA   NA
 5848642 5848643 CCNA_01393 CCNA_01394     TRUE 0.518 37.000 0.051 1.000 N NA
 5848644 5848645 CCNA_01395 CCNA_01396     FALSE 0.421 75.000 0.091 1.000   NA
 5848645 5848646 CCNA_01396 CCNA_01397     TRUE 0.575 42.000 0.107 1.000   NA
 5848646 5848647 CCNA_01397 CCNA_01398     TRUE 0.653 8.000 0.003 1.000 N NA
 5848648 5848649 CCNA_01399 CCNA_01400     FALSE 0.496 27.000 0.020 1.000 N NA
 5848649 5848650 CCNA_01400 CCNA_01401     FALSE 0.064 130.000 0.000 NA   NA
 5848650 5848651 CCNA_01401 CCNA_01402     FALSE 0.177 -72.000 0.000 NA   NA
 5848652 5848653 CCNA_01403 CCNA_01404 glyQ glyS TRUE 0.994 7.000 0.651 0.001 Y NA
 5848654 5848655 CCNA_01405 CCNA_01406     FALSE 0.008 218.000 0.000 NA   NA
 5848657 5848658 CCNA_01408 CCNA_01409     TRUE 0.784 -3.000 0.007 1.000 N NA
 5848658 5848659 CCNA_01409 CCNA_01410     FALSE 0.188 59.000 0.005 1.000 N NA
 5848661 5848662 CCNA_01412 CCNA_01413     TRUE 0.741 8.000 0.013 1.000 N NA
 5848662 5848663 CCNA_01413 CCNA_01414     TRUE 0.877 9.000 0.041 0.073 N NA
 5848663 5848664 CCNA_01414 CCNA_01415     FALSE 0.337 59.000 0.061 NA   NA
 5848664 5848665 CCNA_01415 CCNA_01416     FALSE 0.466 72.000 0.143 NA   NA
 5848665 5848666 CCNA_01416 CCNA_01417     FALSE 0.208 176.000 0.096 1.000 N NA
 5848668 5848669 CCNA_01419 CCNA_01420     TRUE 0.521 33.000 0.052 NA N NA
 5848669 5848670 CCNA_01420 CCNA_01421     FALSE 0.129 66.000 0.003 NA N NA
 5848670 5848671 CCNA_01421 CCNA_01422   nusB TRUE 0.969 -3.000 0.347 1.000 N NA
 5848671 5848672 CCNA_01422 CCNA_01423 nusB   TRUE 0.859 -40.000 0.225 1.000 N NA
 5848672 5848673 CCNA_01423 CCNA_01424     FALSE 0.086 142.000 0.006 NA   NA
 5848673 5848674 CCNA_01424 CCNA_01425     FALSE 0.005 243.000 0.000 NA   NA
 5848675 5848676 CCNA_01426 CCNA_01427     FALSE 0.009 266.000 0.000 1.000 N NA
 5848677 5848678 CCNA_01428 CCNA_01429     FALSE 0.061 67.000 0.000 NA   NA
 5848678 5848679 CCNA_01429 CCNA_01430     TRUE 0.765 -15.000 0.071 NA   NA
 5848679 5848680 CCNA_01430 CCNA_01431     FALSE 0.097 176.000 0.044 NA   NA
 5848680 5848681 CCNA_01431 CCNA_01432     TRUE 0.994 -3.000 0.380 0.004 Y NA
 5848681 5848682 CCNA_01432 CCNA_01433     FALSE 0.155 215.000 0.207 1.000 N NA
 5848682 5848683 CCNA_01433 CCNA_01434     TRUE 0.950 13.000 0.535 1.000 N NA
 5848683 5848684 CCNA_01434 CCNA_R0035     FALSE 0.062 64.000 0.000 NA   NA
 5848690 5848691 CCNA_01440 CCNA_01441     TRUE 0.990 4.000 0.231 0.013 Y NA
 5848691 5848692 CCNA_01441 CCNA_01442     FALSE 0.383 92.000 0.049 1.000 N NA
 5848693 5848694 CCNA_01443 CCNA_01444     FALSE 0.065 88.000 0.000 NA   NA
 5848695 5848696 CCNA_01445 CCNA_01446     FALSE 0.210 109.000 0.018 NA   NA
 5848696 5848697 CCNA_01446 CCNA_01447     TRUE 0.908 37.000 0.202 1.000 Y NA
 5848697 5848698 CCNA_01447 CCNA_01448   glpX FALSE 0.502 75.000 0.112 1.000 N NA
 5848698 5848699 CCNA_01448 CCNA_01449 glpX   TRUE 0.882 28.000 0.013 0.001 Y NA
 5848699 5848700 CCNA_01449 CCNA_01450   recJ FALSE 0.161 68.000 0.002 1.000 N NA
 5848700 5848701 CCNA_01450 CCNA_R0036 recJ   FALSE 0.064 130.000 0.000 NA   NA
 5848701 5848702 CCNA_R0036 CCNA_R0037     FALSE 0.082 46.000 0.000 NA   NA
 5848702 5848703 CCNA_R0037 CCNA_01451   cspD FALSE 0.021 173.000 0.000 NA   NA
 5848703 5848704 CCNA_01451 CCNA_01452 cspD   TRUE 0.845 -31.000 0.226 NA   NA
 5848704 5848705 CCNA_01452 CCNA_R0038     FALSE 0.061 65.000 0.000 NA   NA
 5848705 5848706 CCNA_R0038 CCNA_01453     FALSE 0.151 27.000 0.000 NA   NA
 5848706 5848707 CCNA_01453 CCNA_R0039     FALSE 0.137 29.000 0.000 NA   NA
 5848708 5848709 CCNA_01454 CCNA_01455     FALSE 0.209 -36.000 0.000 NA   NA
 5848709 5848710 CCNA_01455 CCNA_01456     FALSE 0.011 200.000 0.000 NA   NA
 5848711 5848712 CCNA_01457 CCNA_01458     TRUE 0.978 3.000 1.000 NA   NA
 5848712 5848713 CCNA_01458 CCNA_01459     FALSE 0.483 1.000 0.000 NA   NA
 5848713 5848714 CCNA_01459 CCNA_01460     FALSE 0.060 73.000 0.000 NA   NA
 5848714 5848715 CCNA_01460 CCNA_01461     FALSE 0.074 118.000 0.000 NA   NA
 5848716 5848717 CCNA_01462 CCNA_01463     FALSE 0.030 198.000 0.000 1.000 N NA
 5848717 5848718 CCNA_01463 CCNA_01464     FALSE 0.002 290.000 0.000 NA   NA
 5848721 5848722 CCNA_01467 CCNA_01468 ccoN ccoO TRUE 0.941 9.000 0.135 0.004 N NA
 5848722 5848723 CCNA_01468 CCNA_01469 ccoO ccoQ TRUE 0.964 -3.000 0.143 0.004 N NA
 5848723 5848724 CCNA_01469 CCNA_01470 ccoQ ccoP TRUE 0.972 0.000 0.217 0.004 N NA
 5848724 5848725 CCNA_01470 CCNA_01471 ccoP fixG TRUE 0.978 6.000 0.116 1.000 Y NA
 5848725 5848726 CCNA_01471 CCNA_01472 fixG fixH TRUE 0.922 -3.000 0.092 NA N NA
 5848726 5848727 CCNA_01472 CCNA_01473 fixH fixI TRUE 0.987 -3.000 0.206 NA Y NA
 5848727 5848728 CCNA_01473 CCNA_01474 fixI ccoS TRUE 0.994 -3.000 0.713 NA Y NA
 5848728 5848729 CCNA_01474 CCNA_01475 ccoS ompW FALSE 0.159 131.000 0.007 NA N NA
 5848729 5848730 CCNA_01475 CCNA_01476 ompW ftrB FALSE 0.039 182.000 0.000 1.000 N NA
 5848730 5848731 CCNA_01476 CCNA_01477 ftrB hemN FALSE 0.195 45.000 0.000 1.000 N NA
 5848733 5848734 CCNA_01479 CCNA_01480     TRUE 0.981 -3.000 1.000 NA   NA
 5848734 5848735 CCNA_01480 CCNA_01481     TRUE 0.967 10.000 1.000 NA   NA
 5848737 5848738 CCNA_01483 CCNA_01484     FALSE 0.170 24.000 0.000 NA   NA
 5848739 5848740 CCNA_01485 CCNA_01486     FALSE 0.149 41.000 0.000 1.000   NA
 5848741 5848742 CCNA_01487 CCNA_01488     FALSE 0.062 170.000 0.000 1.000 N NA
 5848742 5848743 CCNA_01488 CCNA_01489     TRUE 0.731 95.000 0.035 1.000 Y NA
 5848743 5848744 CCNA_01489 CCNA_01490     FALSE 0.060 71.000 0.000 NA   NA
 5848745 5848746 CCNA_01491 CCNA_01492     TRUE 0.666 25.000 0.060 1.000 N NA
 5848746 5848747 CCNA_01492 CCNA_01493     FALSE 0.285 74.000 0.027 1.000 N NA
 5848747 5848748 CCNA_01493 CCNA_01494     FALSE 0.125 177.000 0.041 1.000 N NA
 5848748 5848749 CCNA_01494 CCNA_01495     FALSE 0.430 44.000 0.041 1.000 N NA
 5848750 5848751 CCNA_01496 CCNA_01497     TRUE 0.955 3.000 0.004 1.000 Y NA
 5848751 5848752 CCNA_01497 CCNA_01498     FALSE 0.184 102.000 0.006 NA N NA
 5848752 5848753 CCNA_01498 CCNA_01499     TRUE 0.958 11.000 0.065 NA Y NA
 5848753 5848754 CCNA_01499 CCNA_01500     TRUE 0.704 32.000 0.200 NA   NA
 5848755 5848756 CCNA_01501 CCNA_01503     TRUE 0.962 -3.000 0.367 NA   NA
 5848758 5848759 CCNA_01504 CCNA_01505 recG   FALSE 0.156 43.000 0.007 NA   NA
 5848759 5848760 CCNA_01505 CCNA_01506     FALSE 0.431 66.000 0.107 NA   NA
 5848760 5848761 CCNA_01506 CCNA_01507     TRUE 0.986 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 5848761 5848762 CCNA_01507 CCNA_01508     TRUE 0.983 5.000 0.100 0.041 Y NA
 5848762 5848763 CCNA_01508 CCNA_01509     FALSE 0.248 84.000 0.015 1.000 N NA
 5848764 5848765 CCNA_01510 CCNA_01511     TRUE 0.880 0.000 0.060 NA   NA
 5848765 5848766 CCNA_01511 CCNA_01512     FALSE 0.113 131.000 0.000 NA N NA
 5848766 5848767 CCNA_01512 CCNA_01513     FALSE 0.007 279.000 0.000 1.000 N NA
 5848767 5848768 CCNA_01513 CCNA_01514     TRUE 0.994 -3.000 0.756 NA Y NA
 5848768 5848769 CCNA_01514 CCNA_01515     TRUE 0.905 -9.000 0.000 NA Y NA
 5848770 5848771 CCNA_01516 CCNA_01517     FALSE 0.092 136.000 0.000 1.000   NA
 5848771 10784564 CCNA_01517 CCNA_04008     TRUE 0.713 -37.000 0.070 1.000   NA
 10784564 5848772 CCNA_04008 CCNA_01518     FALSE 0.146 -505.000 0.000 NA   NA
 5848773 5848774 CCNA_01519 CCNA_01520     TRUE 0.674 32.000 0.154 NA   NA
 5848775 5848776 CCNA_01521 CCNA_01522     FALSE 0.211 99.000 0.020 NA   NA
 5848776 5848777 CCNA_01522 CCNA_01523   flmH FALSE 0.203 109.000 0.010 1.000   NA
 5848777 5848778 CCNA_01523 CCNA_01524 flmH flbA FALSE 0.306 152.000 0.061 1.000 N NA
 5848779 5848780 CCNA_01525 CCNA_01526 flbT flaF TRUE 0.971 -40.000 0.500 NA Y NA
 5848780 5848781 CCNA_01526 CCNA_01527 flaF fljL FALSE 0.086 248.000 0.000 NA Y NA
 5848781 5848782 CCNA_01527 CCNA_01528 fljL fljK FALSE 0.095 277.000 0.000 0.003 Y NA
 5848782 5848783 CCNA_01528 CCNA_01529 fljK   FALSE 0.076 113.000 0.000 NA   NA
 5848783 5848784 CCNA_01529 CCNA_01530     FALSE 0.042 180.000 0.014 NA   NA
 5848784 5848785 CCNA_01530 CCNA_01531     TRUE 0.657 66.000 0.375 1.000   NA
 5848785 5848786 CCNA_01531 CCNA_01532   flaY TRUE 0.639 80.000 0.375 NA   NA
 5848786 5848787 CCNA_01532 CCNA_01533 flaY   TRUE 0.718 62.000 0.625 NA   NA
 5848787 5848788 CCNA_01533 CCNA_01534     TRUE 0.932 18.000 0.833 NA   NA
 5848788 5848789 CCNA_01534 CCNA_01535     FALSE 0.105 257.000 0.429 NA   NA
 5848789 5848790 CCNA_01535 CCNA_01536     TRUE 0.630 51.000 0.286 NA   NA
 5848790 5848791 CCNA_01536 CCNA_R0040     FALSE 0.065 129.000 0.000 NA   NA
 5848795 5848796 CCNA_01540 CCNA_01541     FALSE 0.061 66.000 0.000 NA   NA
 5848797 5848798 CCNA_01542 CCNA_01543     FALSE 0.066 90.000 0.000 NA   NA
 5848799 5848800 CCNA_01544 CCNA_01545     FALSE 0.244 -24.000 0.000 NA   NA
 5848802 5848803 CCNA_01547 CCNA_01548     TRUE 0.710 2.000 0.008 1.000   NA
 5848804 5848805 CCNA_01549 CCNA_01550     TRUE 0.981 0.000 0.390 0.001 N NA
 5848806 5848807 CCNA_01551 CCNA_01552   tipN FALSE 0.302 173.000 0.250 NA   NA
 5848807 5848808 CCNA_01552 CCNA_01553 tipN   FALSE 0.499 15.000 0.015 NA   NA
 5848809 5848810 CCNA_01554 CCNA_01555     TRUE 0.759 87.000 0.057 1.000 Y NA
 5848811 5848812 CCNA_01556 CCNA_01557     FALSE 0.478 108.000 0.066 1.000 N NA
 5848812 5848813 CCNA_01557 CCNA_01558     TRUE 0.892 25.000 0.049 1.000 Y NA
 5848813 5848814 CCNA_01558 CCNA_01559     TRUE 0.655 157.000 0.667 1.000 N NA
 5848814 5848815 CCNA_01559 CCNA_01560     FALSE 0.037 187.000 0.000 1.000 N NA
 5848815 5848816 CCNA_01560 CCNA_01561     FALSE 0.038 155.000 0.000 NA   NA
 5848816 5848817 CCNA_01561 CCNA_01562     FALSE 0.344 -6.000 0.000 NA   NA
 5848817 5848818 CCNA_01562 CCNA_01563     TRUE 0.965 7.000 0.051 1.000 Y NA
 5848819 5848820 CCNA_01564 CCNA_01565     FALSE 0.174 -78.000 0.000 NA   NA
 5848820 5848821 CCNA_01565 CCNA_01566     FALSE 0.002 319.000 0.000 NA   NA
 5848822 5848823 CCNA_01567 CCNA_01568     FALSE 0.095 74.000 0.000 1.000   NA
 5848823 5848824 CCNA_01568 CCNA_01569     FALSE 0.179 112.000 0.000 1.000 N NA
 5848824 5848825 CCNA_01569 CCNA_01570     FALSE 0.145 77.000 0.000 1.000 N NA
 5848826 5848827 CCNA_01571 CCNA_01572     TRUE 0.903 -3.000 0.055 1.000 N NA
 5848827 5848828 CCNA_01572 CCNA_01573     TRUE 0.720 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5848830 5848831 CCNA_01575 CCNA_01576     TRUE 0.628 115.000 0.000 NA Y NA
 5848831 5848832 CCNA_01576 CCNA_01577     TRUE 0.792 28.000 0.250 NA N NA
 5848833 5848834 CCNA_01578 CCNA_01579     FALSE 0.006 262.000 0.000 1.000   NA
 5848834 5848835 CCNA_01579 CCNA_01580     FALSE 0.012 267.000 0.022 NA   NA
 5848835 5848836 CCNA_01580 CCNA_01581     FALSE 0.189 109.000 0.015 NA   NA
 5848836 5848837 CCNA_01581 CCNA_01582     FALSE 0.075 115.000 0.000 NA   NA
 5848838 5848839 CCNA_01583 CCNA_01584     FALSE 0.124 125.000 0.000 NA N NA
 5848839 5848840 CCNA_01584 CCNA_01585     FALSE 0.007 286.000 0.000 1.000 N NA
 5848841 5848842 CCNA_01586 CCNA_01587     TRUE 0.951 -3.000 0.250 NA   NA
 5848842 5848843 CCNA_01587 CCNA_01588     TRUE 0.967 -3.000 0.444 NA   NA
 5848845 5848846 CCNA_01590 CCNA_01591 ligA   TRUE 0.920 -24.000 0.006 0.040 Y NA
 5848846 5848847 CCNA_01591 CCNA_01592     FALSE 0.409 116.000 0.074 NA   NA
 5848848 5848849 CCNA_01593 CCNA_01594     FALSE 0.058 204.000 0.027 1.000 N NA
 5848849 5848850 CCNA_01594 CCNA_01595     FALSE 0.125 40.000 0.003 NA   NA
 5848850 5848851 CCNA_01595 CCNA_01596   uvrD FALSE 0.091 43.000 0.000 NA   NA
 5848851 5848852 CCNA_01596 CCNA_01597 uvrD   FALSE 0.061 70.000 0.000 NA   NA
 5848854 5848855 CCNA_01599 CCNA_01600     FALSE 0.405 6.000 0.000 NA   NA
 5848856 5848857 CCNA_01601 CCNA_01602     FALSE 0.390 127.000 0.077 NA   NA
 5848860 5848861 CCNA_01605 CCNA_01606     TRUE 0.609 11.000 0.017 NA   NA
 5848864 5848865 CCNA_01609 CCNA_01610     FALSE 0.013 242.000 0.000 1.000 N NA
 5848865 5848866 CCNA_01610 CCNA_01611     FALSE 0.129 127.000 0.003 1.000   NA
 5848866 5848867 CCNA_01611 CCNA_01612   mreB FALSE 0.002 354.000 0.000 1.000   NA
 5848867 5848868 CCNA_01612 CCNA_01613 mreB mreC TRUE 0.808 50.000 0.689 1.000 N NA
 5848868 5848869 CCNA_01613 CCNA_01614 mreC   TRUE 0.737 -3.000 0.015 NA   NA
 5848869 5848870 CCNA_01614 CCNA_01615     TRUE 0.915 5.000 0.156 NA   NA
 5848870 5848871 CCNA_01615 CCNA_01616   rodA TRUE 0.931 -3.000 0.094 1.000 N NA
 5848871 5848872 CCNA_01616 CCNA_01617 rodA   TRUE 0.728 0.000 0.000 1.000 N NA
 5848873 5848874 CCNA_01618 CCNA_01619     TRUE 0.936 3.000 0.204 NA   NA
 5848875 5848876 CCNA_01620 CCNA_01621     FALSE 0.379 129.000 0.049 1.000 N NA
 5848876 5848877 CCNA_01621 CCNA_01622   spoT TRUE 0.892 102.000 0.291 1.000 Y NA
 5848881 5848882 CCNA_01626 CCNA_01627   acpS TRUE 0.967 -3.000 0.326 1.000 N NA
 5848882 5848883 CCNA_01627 CCNA_01628 acpS   FALSE 0.325 12.000 0.000 NA   NA
 5848883 5848884 CCNA_01628 CCNA_01629     FALSE 0.070 124.000 0.000 NA   NA
 5848884 5848885 CCNA_01629 CCNA_01630     FALSE 0.433 22.000 0.005 1.000 N NA
 5848886 5848887 CCNA_01631 CCNA_01632     FALSE 0.081 47.000 0.000 NA   NA
 5848888 5848889 CCNA_01633 CCNA_01634 era   TRUE 0.631 -7.000 0.014 1.000   NA
 5848889 5848890 CCNA_01634 CCNA_01635     TRUE 0.725 3.000 0.003 1.000 N NA
 5848890 5848891 CCNA_01635 CCNA_01636     FALSE 0.177 54.000 0.002 1.000 N NA
 5848891 5848892 CCNA_01636 CCNA_01637     FALSE 0.149 62.000 0.000 1.000 N NA
 5848892 5848893 CCNA_01637 CCNA_01638     TRUE 0.754 -3.000 0.003 1.000 N NA
 5848893 5848894 CCNA_01638 CCNA_01639     TRUE 0.740 112.000 0.000 0.004 Y NA
 5848894 5848895 CCNA_01639 CCNA_01640     TRUE 0.736 38.000 0.231 1.000 N NA
 5848895 5848896 CCNA_01640 CCNA_01641     TRUE 0.861 9.000 0.039 0.034   NA
 5848896 5848897 CCNA_01641 CCNA_01642     TRUE 0.818 13.000 0.039 0.034   NA
 5848898 5848899 CCNA_01643 CCNA_01644     FALSE 0.270 101.000 0.014 1.000 N NA
 5848901 5848902 CCNA_01646 CCNA_01647     TRUE 0.981 -3.000 0.029 0.001 Y NA
 5848903 5848904 CCNA_01648 CCNA_01649     TRUE 0.692 -3.000 0.005 1.000   NA
 5848906 5848907 CCNA_01651 CCNA_01652     FALSE 0.437 27.000 0.012 1.000 N NA
 5848907 5848908 CCNA_01652 CCNA_01653     FALSE 0.150 158.000 0.015 1.000 N NA
 5848908 5848909 CCNA_01653 CCNA_01654     TRUE 0.996 -3.000 0.750 0.004 Y NA
 5848909 5848910 CCNA_01654 CCNA_01655     TRUE 0.878 92.000 0.150 0.004 Y NA
 5848911 5848912 CCNA_01656 CCNA_01657     FALSE 0.094 42.000 0.000 NA   NA
 5848913 5848914 CCNA_01658 CCNA_01659     TRUE 0.994 0.000 0.360 0.001 Y NA
 5848918 5848919 CCNA_01662 CCNA_01663     FALSE 0.227 102.000 0.022 NA   NA
 5848919 5848920 CCNA_01663 CCNA_01664     TRUE 0.983 12.000 0.201 0.001 Y NA
 5848920 5848921 CCNA_01664 CCNA_01665     TRUE 0.980 28.000 0.877 0.001 Y NA
 5848921 5848922 CCNA_01665 CCNA_01666     TRUE 0.955 0.000 0.106 0.091 N NA
 5848922 5848923 CCNA_01666 CCNA_01667     TRUE 0.991 8.000 0.695 1.000 Y NA
 5848923 5848924 CCNA_01667 CCNA_01668     FALSE 0.009 264.000 0.000 1.000 N NA
 5848924 5848925 CCNA_01668 CCNA_01669     TRUE 0.989 0.000 0.935 0.001 N NA
 5848925 5848926 CCNA_01669 CCNA_01670     TRUE 0.928 17.000 0.050 1.000 Y NA
 5848926 5848927 CCNA_01670 CCNA_01671     TRUE 0.583 105.000 0.200 NA   NA
 5848928 5848929 CCNA_01672 CCNA_01673     TRUE 0.823 12.000 0.085 NA   NA
 5848929 5848930 CCNA_01673 CCNA_01674     TRUE 0.979 -3.000 0.805 NA   NA
 5848931 5848932 CCNA_01675 CCNA_01676     TRUE 0.781 -3.000 0.023 NA   NA
 5848932 5848933 CCNA_01676 CCNA_01677     FALSE 0.075 102.000 0.000 NA   NA
 5848933 5848934 CCNA_01677 CCNA_01678     TRUE 0.982 1.000 0.097 1.000 Y NA
 5848934 5848935 CCNA_01678 CCNA_01679     TRUE 0.981 -3.000 0.727 1.000 N NA
 5848935 5848936 CCNA_01679 CCNA_01680     TRUE 0.891 -3.000 0.045 1.000 N NA
 5848936 5848937 CCNA_01680 CCNA_01681     TRUE 0.859 -3.000 0.027 1.000 N NA
 5848940 5848941 CCNA_01684 CCNA_01685     FALSE 0.090 165.000 0.020 NA   NA
 5848942 5848943 CCNA_01686 CCNA_01687     TRUE 0.963 -3.000 0.316 NA N NA
 5848943 5848944 CCNA_01687 CCNA_01688     TRUE 0.651 -3.000 0.000 NA N NA
 5848944 5848945 CCNA_01688 CCNA_01689     FALSE 0.158 93.000 0.000 1.000 N NA
 5848945 5848946 CCNA_01689 CCNA_01690     TRUE 0.551 4.000 0.004 NA   NA
 5848946 5848947 CCNA_01690 CCNA_01691     TRUE 0.752 0.000 0.016 NA   NA
 5848947 5848948 CCNA_01691 CCNA_01692     FALSE 0.330 33.000 0.013 NA N NA
 5848949 5848950 CCNA_01693 CCNA_01694     TRUE 0.863 14.000 0.154 1.000   NA
 5848950 5848951 CCNA_01694 CCNA_01695     TRUE 0.809 19.000 0.154 1.000   NA
 5848951 5848952 CCNA_01695 CCNA_01696     FALSE 0.010 205.000 0.000 NA   NA
 5848953 5848954 CCNA_01697 CCNA_01698     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5848956 5848957 CCNA_01700 CCNA_01701     TRUE 0.969 1.000 0.500 NA   NA
 5848957 5848958 CCNA_01701 CCNA_01702     TRUE 0.891 0.000 0.068 NA   NA
 5848958 5848959 CCNA_01702 CCNA_01703     TRUE 0.963 0.000 0.347 NA   NA
 5848959 5848960 CCNA_01703 CCNA_01704     TRUE 0.526 28.000 0.040 NA N NA
 5848962 5848963 CCNA_01706 CCNA_01707     TRUE 0.979 0.000 0.800 NA   NA
 5848963 5848964 CCNA_01707 CCNA_01708     FALSE 0.077 105.000 0.000 NA   NA
 5848965 5848966 CCNA_01709 CCNA_01710     TRUE 0.908 3.000 0.107 NA   NA
 5848966 5848967 CCNA_01710 CCNA_01711     FALSE 0.220 174.000 0.107 NA N NA
 5848967 5848968 CCNA_01711 CCNA_01712     TRUE 0.989 -10.000 1.000 NA Y NA
 5848969 5848970 CCNA_01713 CCNA_01714     FALSE 0.225 48.000 0.005 1.000 N NA
 5848970 5848971 CCNA_01714 CCNA_01715     FALSE 0.102 154.000 0.008 1.000   NA
 5848971 5848972 CCNA_01715 CCNA_01716     FALSE 0.253 37.000 0.015 NA   NA
 5848972 5848973 CCNA_01716 CCNA_01717     TRUE 0.925 13.000 0.400 NA   NA
 5848973 5848974 CCNA_01717 CCNA_01718     TRUE 0.975 0.000 0.625 NA   NA
 5848974 5848975 CCNA_01718 CCNA_01719     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 10784565 5848977 CCNA_04016 CCNA_01721     TRUE 0.890 23.000 0.625 NA   NA
 5848977 5848978 CCNA_01721 CCNA_01722     TRUE 0.905 -31.000 0.500 NA   NA
 5848978 5848979 CCNA_01722 CCNA_01723     FALSE 0.091 93.000 0.003 NA   NA
 5848979 5848980 CCNA_01723 CCNA_01724     FALSE 0.166 153.000 0.026 1.000   NA
 5848980 5848981 CCNA_01724 CCNA_01725     TRUE 0.935 -3.000 0.154 NA   NA
 5848981 5848982 CCNA_01725 CCNA_01726     TRUE 0.558 126.000 0.203 NA   NA
 5848983 5848984 CCNA_01727 CCNA_01728     FALSE 0.073 147.000 0.000 1.000   NA
 5848984 5848985 CCNA_01728 CCNA_01729     FALSE 0.217 49.000 0.013 1.000   NA
 5848985 5848986 CCNA_01729 CCNA_01730     FALSE 0.378 20.000 0.007 1.000   NA
 5848986 5848987 CCNA_01730 CCNA_01731     TRUE 0.924 -3.000 0.101 1.000   NA
 5848987 5848988 CCNA_01731 CCNA_01732     TRUE 0.919 -3.000 0.094 1.000   NA
 5848988 5848989 CCNA_01732 CCNA_01733     FALSE 0.163 74.000 0.003 1.000 N NA
 5848989 5848990 CCNA_01733 CCNA_01734     TRUE 0.506 40.000 0.065 NA N NA
 5848990 5848991 CCNA_01734 CCNA_01735     FALSE 0.116 58.000 0.000 NA N NA
 5848993 5848994 CCNA_01737 CCNA_01738     FALSE 0.023 210.000 0.000 1.000 N NA
 5848994 5848995 CCNA_01738 CCNA_01739     FALSE 0.027 205.000 0.002 1.000 N NA
 5848995 5848996 CCNA_01739 CCNA_01740     TRUE 0.986 14.000 0.499 0.013 Y NA
 5848996 5848997 CCNA_01740 CCNA_01741     TRUE 0.981 15.000 0.319 0.013 Y NA
 5848999 5849000 CCNA_01743 CCNA_01744     TRUE 0.684 74.000 0.444 NA N NA
 5849000 5849001 CCNA_01744 CCNA_01745     FALSE 0.257 72.000 0.019 1.000 N NA
 5849002 5849003 CCNA_01746 CCNA_01747     TRUE 0.979 19.000 0.432 0.004 Y NA
 5849003 5849004 CCNA_01747 CCNA_01748     FALSE 0.266 22.000 0.000 1.000   NA
 5849004 5849005 CCNA_01748 CCNA_01749     FALSE 0.046 165.000 0.000 1.000   NA
 5849005 5849006 CCNA_01749 CCNA_01750     TRUE 0.636 167.000 0.106 1.000 Y NA
 5849006 5849007 CCNA_01750 CCNA_01751     TRUE 0.928 -3.000 0.134 NA   NA
 5849007 5849008 CCNA_01751 CCNA_01752     TRUE 0.852 4.000 0.060 NA   NA
 5849008 5849009 CCNA_01752 CCNA_01753     TRUE 0.913 -7.000 0.276 NA   NA
 5849010 5849011 CCNA_01754 CCNA_01755     FALSE 0.120 113.000 0.000 1.000   NA
 5849011 5849012 CCNA_01755 CCNA_01756     FALSE 0.063 83.000 0.000 NA   NA
 5849012 5849013 CCNA_01756 CCNA_01757     FALSE 0.062 64.000 0.000 NA   NA
 5849013 5849014 CCNA_01757 CCNA_01758     TRUE 0.766 30.000 0.197 1.000 N NA
 5849014 5849015 CCNA_01758 CCNA_01759     TRUE 0.977 -3.000 0.561 1.000 N NA
 5849015 5849016 CCNA_01759 CCNA_01760     FALSE 0.309 167.000 0.112 1.000 N NA
 5849016 5849017 CCNA_01760 CCNA_01761     TRUE 0.887 -7.000 0.153 1.000   NA
 5849017 5849018 CCNA_01761 CCNA_01762     TRUE 0.982 -3.000 0.631 0.041   NA
 5849019 5849020 CCNA_01763 CCNA_01764     TRUE 0.650 121.000 0.230 1.000 N NA
 5849020 5849021 CCNA_01764 CCNA_01765     TRUE 0.712 -3.000 0.012 NA   NA
 5849024 5849025 CCNA_01768 CCNA_01769     FALSE 0.195 54.000 0.019 NA   NA
 5849029 5849030 CCNA_01773 CCNA_01774     FALSE 0.062 79.000 0.000 NA   NA
 5849030 5849031 CCNA_01774 CCNA_01775     TRUE 0.814 161.000 0.230 0.002 Y NA
 5849032 5849033 CCNA_01776 CCNA_01777     FALSE 0.027 202.000 0.000 1.000 N NA
 5849033 5849034 CCNA_01777 CCNA_01778     FALSE 0.180 105.000 0.000 1.000 N NA
 5849035 5849036 CCNA_01779 CCNA_01780     FALSE 0.156 72.000 0.015 NA   NA
 5849036 5849037 CCNA_01780 CCNA_01781     FALSE 0.169 91.000 0.015 NA   NA
 5849037 5849038 CCNA_01781 CCNA_01782     TRUE 0.588 -3.000 0.004 NA   NA
 5849038 5849039 CCNA_01782 CCNA_01783     FALSE 0.137 206.000 0.134 1.000 N NA
 5849039 5849040 CCNA_01783 CCNA_01784     FALSE 0.018 177.000 0.000 NA   NA
 5849040 5849041 CCNA_01784 CCNA_01785     FALSE 0.152 -133.000 0.000 NA   NA
 5849045 5849046 CCNA_01788 CCNA_01789     FALSE 0.016 179.000 0.000 NA   NA
 5849047 5849048 CCNA_01790 CCNA_01791     TRUE 0.509 116.000 0.083 1.000 N NA
 5849048 5849049 CCNA_01791 CCNA_01792     FALSE 0.213 115.000 0.004 1.000 N NA
 5849049 5849050 CCNA_01792 CCNA_01793     FALSE 0.131 124.000 0.003 1.000   NA
 5849052 5849053 CCNA_01795 CCNA_01796     FALSE 0.012 194.000 0.000 NA   NA
 5849053 5849054 CCNA_01796 CCNA_01797     FALSE 0.070 53.000 0.000 NA   NA
 5849056 5849057 CCNA_01799 CCNA_01800     TRUE 0.995 -3.000 0.456 0.001 Y NA
 5849057 5849058 CCNA_01800 CCNA_01801     FALSE 0.405 6.000 0.000 NA   NA
 5849058 5849059 CCNA_01801 CCNA_01802     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5849059 5849060 CCNA_01802 CCNA_01803     FALSE 0.306 13.000 0.000 NA   NA
 5849060 5849061 CCNA_01803 CCNA_01804     TRUE 0.542 19.000 0.013 1.000 N NA
 5849061 5849062 CCNA_01804 CCNA_01805     FALSE 0.241 83.000 0.014 1.000 N NA
 5849062 5849063 CCNA_01805 CCNA_01806     FALSE 0.310 20.000 0.007 NA   NA
 5849064 5849065 CCNA_01807 CCNA_01808     TRUE 0.663 89.000 0.011 1.000 Y NA
 5849066 5849067 CCNA_01809 CCNA_01810     TRUE 0.898 4.000 0.081 NA N NA
 5849068 5849069 CCNA_01811 CCNA_01812     FALSE 0.456 39.000 0.061 NA   NA
 5849070 5849071 CCNA_01813 CCNA_01814     TRUE 0.931 -3.000 0.094 1.000 N NA
 5849071 5849072 CCNA_01814 CCNA_01815     TRUE 0.992 -3.000 0.297 0.079 Y NA
 5849072 5849073 CCNA_01815 CCNA_01816     TRUE 0.875 65.000 0.205 0.079 Y NA
 5849073 5849074 CCNA_01816 CCNA_01817     TRUE 0.995 -3.000 0.533 0.079 Y NA
 5849074 5849075 CCNA_01817 CCNA_01818     TRUE 0.924 1.000 0.085 1.000 N NA
 5849075 5849076 CCNA_01818 CCNA_01819     FALSE 0.438 158.000 0.243 1.000   NA
 5849076 5849077 CCNA_01819 CCNA_01820     TRUE 0.858 13.000 0.115 1.000   NA
 5849078 5849079 CCNA_01821 CCNA_01822 mazG   FALSE 0.286 -37.000 0.004 NA   NA
 5849079 5849080 CCNA_01822 CCNA_01823     FALSE 0.003 278.000 0.000 NA   NA
 5849080 5849081 CCNA_01823 CCNA_01824     FALSE 0.060 76.000 0.000 NA   NA
 5849081 5849082 CCNA_01824 CCNA_01825     FALSE 0.004 264.000 0.000 NA   NA
 5849083 5849084 CCNA_01826 CCNA_01827     TRUE 0.616 66.000 0.003 1.000 Y NA
 5849086 5849087 CCNA_01829 CCNA_01830     TRUE 0.614 135.000 0.250 1.000 N NA
 5849087 5849088 CCNA_01830 CCNA_01831     TRUE 0.684 115.000 0.375 NA   NA
 5849088 5849089 CCNA_01831 CCNA_01832     FALSE 0.015 186.000 0.000 NA   NA
 5849089 5849090 CCNA_01832 CCNA_01833     TRUE 0.856 0.000 0.000 0.015 N NA
 5849091 5849092 CCNA_01834 CCNA_01835     TRUE 0.994 -3.000 0.626 1.000 Y NA
 5849094 5849095 CCNA_01837 CCNA_01838     FALSE 0.001 430.000 0.000 NA   NA
 5849098 5849099 CCNA_01841 CCNA_01842     FALSE 0.114 34.000 0.000 NA   NA
 5849099 5849100 CCNA_01842 CCNA_01843     FALSE 0.063 81.000 0.000 NA   NA
 5849101 5849102 CCNA_01844 CCNA_01845     FALSE 0.004 283.000 0.000 1.000   NA
 5849102 5849103 CCNA_01845 CCNA_01846     TRUE 0.988 -7.000 0.682 1.000 Y NA
 5849103 5849104 CCNA_01846 CCNA_01847     TRUE 0.941 -3.000 0.188 NA   NA
 5849104 5849105 CCNA_01847 CCNA_01848   qoxD TRUE 0.980 -3.000 0.849 NA   NA
 5849105 5849106 CCNA_01848 CCNA_01849 qoxD qoxC TRUE 0.996 -3.000 0.906 0.045 Y NA
 5849106 5849107 CCNA_01849 CCNA_01850 qoxC qoxB TRUE 0.996 3.000 0.847 0.003 Y NA
 5849107 5849108 CCNA_01850 CCNA_01851 qoxB qoxA TRUE 0.987 19.000 0.915 0.003 Y NA
 5849109 5849110 CCNA_01852 CCNA_01853     FALSE 0.067 93.000 0.000 NA   NA
 5849110 5849111 CCNA_01853 CCNA_01854     FALSE 0.049 145.000 0.000 NA   NA
 5849111 5849112 CCNA_01854 CCNA_01855     FALSE 0.152 130.000 0.000 1.000 N NA
 5849112 5849113 CCNA_01855 CCNA_01856     TRUE 0.843 -57.000 0.000 1.000 Y NA
 5849113 5849114 CCNA_01856 CCNA_01857     FALSE 0.253 27.000 0.000 NA N NA
 5849114 5849115 CCNA_01857 CCNA_01858     FALSE 0.199 -42.000 0.000 NA   NA
 5849115 5849116 CCNA_01858 CCNA_01859     FALSE 0.063 83.000 0.000 NA   NA
 5849116 5849117 CCNA_01859 CCNA_01860     TRUE 0.969 3.000 0.500 1.000   NA
 5849117 5849118 CCNA_01860 CCNA_01861     FALSE 0.004 258.000 0.000 NA   NA
 5849119 5849120 CCNA_01862 CCNA_01863     FALSE 0.362 10.000 0.000 NA   NA
 5849121 5849122 CCNA_01864 CCNA_01865     TRUE 0.741 89.000 0.500 1.000 N NA
 5849122 5849123 CCNA_01865 CCNA_01866   acrB4 TRUE 0.982 -3.000 0.857 NA N NA
 5849123 5849124 CCNA_01866 CCNA_01867 acrB4   FALSE 0.193 20.000 0.000 NA   NA
 5849125 5849126 CCNA_01868 CCNA_01869     TRUE 0.972 3.000 0.600 1.000   NA
 5849126 5849127 CCNA_01869 CCNA_01870     TRUE 0.832 109.000 1.000 NA N NA
 5849127 5849128 CCNA_01870 CCNA_01871     FALSE 0.325 12.000 0.000 NA   NA
 5849129 5849130 CCNA_01872 CCNA_01873     FALSE 0.420 5.000 0.000 NA   NA
 5849136 5849137 CCNA_01879 CCNA_01880     FALSE 0.252 77.000 0.000 0.069 N NA
 5849137 5849138 CCNA_01880 CCNA_01881     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5849138 5849139 CCNA_01881 CCNA_01882     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5849139 5849140 CCNA_01882 CCNA_01883     TRUE 0.923 14.000 0.333 1.000 N NA
 5849140 5849141 CCNA_01883 CCNA_01884     TRUE 0.990 8.000 0.333 0.006 Y NA
 5849142 5849143 CCNA_01885 CCNA_01886     FALSE 0.051 174.000 0.000 1.000 N NA
 5849144 5849145 CCNA_01887 CCNA_01888     FALSE 0.064 59.000 0.000 NA   NA
 5849149 5849150 CCNA_01892 CCNA_01893     FALSE 0.258 15.000 0.000 NA   NA
 5849153 5849154 CCNA_01896 CCNA_01897     FALSE 0.003 271.000 0.000 NA   NA
 5849154 5849155 CCNA_01897 CCNA_01898     TRUE 0.929 -3.000 0.139 NA   NA
 5849155 5849156 CCNA_01898 CCNA_01899     TRUE 0.974 -3.000 0.046 NA Y NA
 5849156 5849157 CCNA_01899 CCNA_01900     TRUE 0.971 -3.000 0.254 0.078 N NA
 5849157 5849158 CCNA_01900 CCNA_01901     FALSE 0.166 108.000 0.003 NA N NA
 5849159 5849160 CCNA_R0043 CCNA_01902     FALSE 0.001 369.000 0.000 NA   NA
 5849160 5849161 CCNA_01902 CCNA_01903     TRUE 0.853 -3.000 0.046 NA   NA
 5849161 5849162 CCNA_01903 CCNA_01904     TRUE 0.963 11.000 0.931 NA   NA
 5849162 5849163 CCNA_01904 CCNA_01905     TRUE 0.962 11.000 0.835 NA   NA
 5849163 5849164 CCNA_01905 CCNA_01906     TRUE 0.973 -3.000 0.437 1.000 N NA
 5849165 5849166 CCNA_01907 CCNA_01908     TRUE 0.995 0.000 0.797 1.000 Y NA
 5849166 5849167 CCNA_01908 CCNA_01909     TRUE 0.922 56.000 0.719 NA Y NA
 5849167 5849168 CCNA_01909 CCNA_01910     FALSE 0.007 222.000 0.000 NA   NA
 5849168 5849169 CCNA_01910 CCNA_01911     FALSE 0.058 136.000 0.000 NA   NA
 5849169 5849170 CCNA_01911 CCNA_01912     FALSE 0.012 196.000 0.000 NA   NA
 5849171 5849172 CCNA_01913 CCNA_01914     FALSE 0.123 95.000 0.000 NA N NA
 5849172 5849173 CCNA_01914 CCNA_01915     TRUE 0.982 -3.000 0.088 1.000 Y NA
 5849173 10784566 CCNA_01915 CCNA_04000     TRUE 0.690 -7.000 0.013 1.000 N NA
 5849177 5849178 CCNA_01918 CCNA_01919     FALSE 0.307 82.000 0.029 1.000 N NA
 5849179 5849180 CCNA_01920 CCNA_01921     TRUE 0.867 5.000 0.078 NA   NA
 5849180 5849181 CCNA_01921 CCNA_01922     FALSE 0.170 24.000 0.000 NA   NA
 5849183 5849184 CCNA_01924 CCNA_01925     TRUE 0.791 33.000 0.333 NA N NA
 5849185 5849186 CCNA_01926 CCNA_01927     TRUE 0.602 137.000 0.250 1.000 N NA
 5849187 5849188 CCNA_01928 CCNA_01929     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5849188 5849189 CCNA_01929 CCNA_01930     TRUE 0.969 1.000 0.500 NA   NA
 5849190 5849191 CCNA_01931 CCNA_01932     TRUE 0.970 -3.000 0.375 1.000 N NA
 5849192 5849193 CCNA_01933 CCNA_01934     TRUE 0.775 0.000 0.020 NA   NA
 5849193 5849194 CCNA_01934 CCNA_01935     TRUE 0.929 6.000 0.240 NA   NA
 5849194 5849195 CCNA_01935 CCNA_01936     TRUE 0.936 8.000 0.309 NA   NA
 5849195 5849196 CCNA_01936 CCNA_01937     TRUE 0.956 0.000 0.193 1.000 N NA
 5849196 5849197 CCNA_01937 CCNA_01938     TRUE 0.993 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 5849197 5849198 CCNA_01938 CCNA_01939     FALSE 0.329 -7.000 0.000 NA   NA
 5849198 5849199 CCNA_01939 CCNA_01940     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5849199 5849200 CCNA_01940 CCNA_01941     TRUE 0.941 0.000 0.109 1.000 N NA
 5849200 5849201 CCNA_01941 CCNA_01942     TRUE 0.946 -3.000 0.168 NA N NA
 5849203 5849204 CCNA_01944 CCNA_01945     FALSE 0.167 98.000 0.000 1.000 N NA
 5849205 5849206 CCNA_01946 CCNA_01947     FALSE 0.217 128.000 0.008 1.000 N NA
 5849206 5849207 CCNA_01947 CCNA_01948     FALSE 0.018 234.000 0.004 1.000 N NA
 5849207 5849208 CCNA_01948 CCNA_01949     TRUE 0.935 -19.000 0.053 NA Y NA
 5849209 5849210 CCNA_01950 CCNA_01951     FALSE 0.342 79.000 0.041 1.000 N NA
 5849210 5849211 CCNA_01951 CCNA_01952     TRUE 0.806 161.000 0.396 1.000 Y NA
 5849211 5849212 CCNA_01952 CCNA_01953     FALSE 0.001 366.000 0.000 NA   NA
 5849213 5849214 CCNA_01954 CCNA_01955     FALSE 0.246 143.000 0.039 1.000   NA
 5849214 5849215 CCNA_01955 CCNA_01956     TRUE 0.669 25.000 0.079 1.000   NA
 5849216 5849217 CCNA_01957 CCNA_01958 thiG thiS TRUE 0.774 145.000 0.130 1.000 Y NA
 5849218 5849219 CCNA_01959 CCNA_01960     FALSE 0.349 61.000 0.042 1.000 N NA
 5849219 5849220 CCNA_01960 CCNA_01961     TRUE 0.986 6.000 0.153 0.002 Y NA
 5849220 5849221 CCNA_01961 CCNA_01962     TRUE 0.558 100.000 0.114 1.000 N NA
 5849222 5849223 CCNA_01963 CCNA_01964     TRUE 0.584 59.000 0.260 NA   NA
 5849223 5849224 CCNA_01964 CCNA_01965     TRUE 0.504 0.000 0.000 NA   NA
 5849225 5849226 CCNA_01966 CCNA_01967     FALSE 0.212 72.000 0.029 NA   NA
 5849226 5849227 CCNA_01967 CCNA_01968     FALSE 0.069 95.000 0.000 NA   NA
 5849228 5849229 CCNA_01969 CCNA_01970     FALSE 0.179 122.000 0.002 1.000 N NA
 5849230 5849231 CCNA_01971 CCNA_01972     TRUE 0.929 0.000 0.106 1.000   NA
 5849233 5849234 CCNA_01974 CCNA_01975     TRUE 0.950 9.000 0.019 1.000 Y NA
 5849234 5849235 CCNA_01975 CCNA_01976     TRUE 0.990 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 5849235 5849236 CCNA_01976 CCNA_01977     FALSE 0.164 96.000 0.000 1.000 N NA
 5849236 5849237 CCNA_01977 CCNA_01978     FALSE 0.237 51.000 0.000 0.069   NA
 5849237 5849238 CCNA_01978 CCNA_01979     FALSE 0.155 138.000 0.011 1.000   NA
 5849239 5849240 CCNA_01980 CCNA_01981     FALSE 0.169 28.000 0.002 NA   NA
 5849241 5849242 CCNA_01982 CCNA_01983     TRUE 0.518 68.000 0.127 1.000 N NA
 5849243 5849244 CCNA_01984 CCNA_01985     TRUE 0.894 -3.000 0.061 1.000   NA
 5849244 5849245 CCNA_01985 CCNA_01986     FALSE 0.125 86.000 0.003 1.000   NA
 5849245 5849246 CCNA_01986 CCNA_01987     TRUE 0.939 -3.000 0.173 NA   NA
 5849246 5849247 CCNA_01987 CCNA_01988     TRUE 0.952 10.000 0.552 NA   NA
 5849247 5849248 CCNA_01988 CCNA_01989     TRUE 0.963 -3.000 0.264 1.000 N NA
 5849248 5849249 CCNA_01989 CCNA_01990     TRUE 0.951 3.000 0.212 1.000 N NA
 5849249 5849250 CCNA_01990 CCNA_01991     TRUE 0.773 54.000 0.060 1.000 Y NA
 5849250 5849251 CCNA_01991 CCNA_01992     TRUE 0.982 3.000 0.123 1.000 Y NA
 5849251 5849252 CCNA_01992 CCNA_01993   mmpA TRUE 0.959 18.000 0.204 1.000 Y NA
 5849252 5849253 CCNA_01993 CCNA_01994 mmpA   TRUE 0.910 -58.000 0.568 1.000 N NA
 5849253 5849254 CCNA_01994 CCNA_01995     TRUE 0.980 -12.000 0.372 1.000 Y NA
 5849254 5849255 CCNA_01995 CCNA_01996     TRUE 0.969 -40.000 0.400 1.000 Y NA
 5849255 5849256 CCNA_01996 CCNA_01997     TRUE 0.732 52.000 0.409 1.000 N NA
 5849256 5849257 CCNA_01997 CCNA_01998     TRUE 0.894 27.000 0.626 1.000 N NA
 5849257 5849258 CCNA_01998 CCNA_01999     FALSE 0.386 178.000 0.416 1.000 N NA
 5849258 5849259 CCNA_01999 CCNA_02000     TRUE 0.911 140.000 0.748 1.000 Y NA
 5849261 5849262 CCNA_02002 CCNA_02003     FALSE 0.049 168.000 0.002 1.000   NA
 5849262 5849263 CCNA_02003 CCNA_02004     FALSE 0.108 36.000 0.000 NA   NA
 5849265 5849266 CCNA_02006 CCNA_02007     TRUE 0.958 -7.000 0.620 1.000 N NA
 5849266 5849267 CCNA_02007 CCNA_02008     TRUE 0.924 0.000 0.076 1.000 N NA
 5849267 5849268 CCNA_02008 CCNA_02009     TRUE 0.504 0.000 0.000 NA   NA
 5849268 5849269 CCNA_02009 CCNA_02010     FALSE 0.207 19.000 0.000 NA   NA
 5849269 5849270 CCNA_02010 CCNA_02011     TRUE 0.941 0.000 0.172 NA   NA
 5849270 5849271 CCNA_02011 CCNA_02012     TRUE 0.518 109.000 0.105 1.000   NA
 5849271 5849272 CCNA_02012 CCNA_02013     TRUE 0.913 0.000 0.080 1.000   NA
 5849272 5849273 CCNA_02013 CCNA_02014     TRUE 0.919 -3.000 0.071 1.000 N NA
 5849273 5849274 CCNA_02014 CCNA_02015   nuoN TRUE 0.967 2.000 0.372 1.000 N NA
 5849274 5849275 CCNA_02015 CCNA_02016 nuoN nuoM TRUE 0.989 -7.000 0.453 0.005 Y NA
 5849275 5849276 CCNA_02016 CCNA_02017 nuoM nuoL TRUE 0.992 -3.000 0.251 0.005 Y NA
 5849276 5849277 CCNA_02017 CCNA_02018 nuoL nuoK TRUE 0.991 9.000 0.451 0.005 Y NA
 5849277 5849278 CCNA_02018 CCNA_02019 nuoK nuoJ TRUE 0.995 -3.000 0.484 0.002 Y NA
 5849278 5849279 CCNA_02019 CCNA_02020 nuoJ nuoI TRUE 0.940 47.000 0.442 0.005 Y NA
 5849279 5849280 CCNA_02020 CCNA_02021 nuoI   FALSE 0.079 142.000 0.004 NA   NA
 5849280 5849281 CCNA_02021 CCNA_02022   nuoH TRUE 0.666 0.000 0.008 NA   NA
 5849281 5849282 CCNA_02022 CCNA_02023 nuoH nuoG TRUE 0.993 5.000 0.515 0.005 Y NA
 5849282 5849283 CCNA_02023 CCNA_02024 nuoG nuoF TRUE 0.991 6.000 0.395 0.005 Y NA
 5849283 5849284 CCNA_02024 CCNA_02025 nuoF   TRUE 0.578 4.000 0.006 NA   NA
 5849284 5849285 CCNA_02025 CCNA_02026     TRUE 0.981 -3.000 1.000 NA   NA
 5849285 5849286 CCNA_02026 CCNA_02027   nuoE TRUE 0.599 2.000 0.005 NA   NA
 5849286 5849287 CCNA_02027 CCNA_02028 nuoE   TRUE 0.710 -3.000 0.012 NA   NA
 5849287 5849288 CCNA_02028 CCNA_02029   nuoD TRUE 0.776 -3.000 0.021 NA   NA
 5849288 5849289 CCNA_02029 CCNA_02030 nuoD   FALSE 0.460 3.000 0.000 NA   NA
 5849289 5849290 CCNA_02030 CCNA_02031   nuoC FALSE 0.181 22.000 0.000 NA   NA
 5849290 5849291 CCNA_02031 CCNA_02032 nuoC nuoB TRUE 0.993 -3.000 0.262 0.002 Y NA
 5849291 5849292 CCNA_02032 CCNA_02033 nuoB nuoA TRUE 0.981 -30.000 0.396 0.002 Y NA
 5849293 5849294 CCNA_R0045 CCNA_R0046     FALSE 0.061 65.000 0.000 NA   NA
 5849294 5849295 CCNA_R0046 CCNA_02034     FALSE 0.064 59.000 0.000 NA   NA
 5849296 5849297 CCNA_02035 CCNA_R0047     FALSE 0.002 303.000 0.000 NA   NA
 5849297 5849298 CCNA_R0047 CCNA_02036     FALSE 0.078 107.000 0.000 NA   NA
 5849298 5849299 CCNA_02036 CCNA_02037     FALSE 0.177 144.000 0.010 1.000 N NA
 5849303 5849304 CCNA_02041 CCNA_02042 clpP   TRUE 0.748 169.000 0.351 1.000 Y NA
 5849304 5849305 CCNA_02042 CCNA_R0048     FALSE 0.016 179.000 0.000 NA   NA
 5849305 5849306 CCNA_R0048 CCNA_02043     FALSE 0.085 45.000 0.000 NA   NA
 5849306 5849307 CCNA_02043 CCNA_02044     TRUE 0.932 10.000 0.008 NA Y NA
 5849307 5849308 CCNA_02044 CCNA_02045     TRUE 0.809 6.000 0.027 1.000 N NA
 5849309 5849310 CCNA_02046 CCNA_02047     TRUE 0.873 44.000 0.145 1.000 Y NA
 5849310 5849311 CCNA_02047 CCNA_02048     FALSE 0.152 130.000 0.000 1.000 N NA
 5849313 5849314 CCNA_02050 CCNA_02051     TRUE 0.997 0.000 0.874 0.001 Y NA
 5849314 5849315 CCNA_02051 CCNA_02052     FALSE 0.039 199.000 0.006 1.000 N NA
 5849315 5849316 CCNA_02052 CCNA_02053     FALSE 0.003 278.000 0.000 NA   NA
 5849317 5849318 CCNA_02054 CCNA_02055     FALSE 0.105 128.000 0.000 1.000   NA
 5849318 5849319 CCNA_02055 CCNA_02056     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5849320 5849321 CCNA_02057 CCNA_02058     TRUE 0.964 -3.000 0.378 NA   NA
 5849322 5849323 CCNA_02059 CCNA_02060     TRUE 0.926 -3.000 0.083 1.000 N NA
 5849325 5849326 CCNA_02062 CCNA_02063     FALSE 0.484 83.000 0.117 1.000   NA
 5849326 5849327 CCNA_02063 CCNA_02064     FALSE 0.417 101.000 0.064 1.000   NA
 5849329 5849330 CCNA_02066 CCNA_02067     FALSE 0.234 72.000 0.035 NA   NA
 5849330 5849331 CCNA_02067 CCNA_02068     FALSE 0.202 96.000 0.020 NA   NA
 5849331 5849332 CCNA_02068 CCNA_02069     TRUE 0.752 0.000 0.016 NA   NA
 5849332 5849333 CCNA_02069 CCNA_02070     TRUE 0.983 1.000 0.044 0.001 Y NA
 5849333 5849334 CCNA_02070 CCNA_02071     TRUE 0.664 158.000 0.099 NA Y NA
 5849335 5849336 CCNA_02072 CCNA_02073     FALSE 0.060 75.000 0.000 NA   NA
 5849336 5849337 CCNA_02073 CCNA_02074     TRUE 0.528 6.000 0.000 1.000   NA
 5849338 5849339 CCNA_02075 CCNA_02076     FALSE 0.487 93.000 0.089 1.000 N NA
 5849339 5849340 CCNA_02076 CCNA_02077     TRUE 0.939 -3.000 0.147 1.000   NA
 5849340 5849341 CCNA_02077 CCNA_02078   serS TRUE 0.889 -3.000 0.058 1.000   NA
 5849341 5849342 CCNA_02078 CCNA_02079 serS   FALSE 0.098 40.000 0.000 NA   NA
 5849342 5849343 CCNA_02079 CCNA_02080     FALSE 0.009 211.000 0.000 NA   NA
 5849343 5849344 CCNA_02080 CCNA_02081     TRUE 0.963 -3.000 0.014 NA Y NA
 5849344 5849345 CCNA_02081 CCNA_02082     TRUE 0.749 85.000 0.016 0.007 Y NA
 5849345 5849346 CCNA_02082 CCNA_02083   scpB FALSE 0.362 134.000 0.060 NA N NA
 5849346 5849347 CCNA_02083 CCNA_02084 scpB   TRUE 0.972 -3.000 0.570 NA   NA
 5849347 5849348 CCNA_02084 CCNA_02085     TRUE 0.916 -3.000 0.103 NA   NA
 5849348 5849349 CCNA_02085 CCNA_02086     TRUE 0.740 -3.000 0.016 NA   NA
 5849349 5849350 CCNA_02086 CCNA_02087     FALSE 0.072 170.000 0.018 NA   NA
 5849353 5849354 CCNA_02090 CCNA_02091     FALSE 0.390 40.000 0.046 NA   NA
 5849360 5849361 CCNA_02097 CCNA_02098     FALSE 0.308 89.000 0.051 NA   NA
 5849362 5849363 CCNA_02099 CCNA_02100     FALSE 0.073 119.000 0.000 NA   NA
 5849364 5849365 CCNA_02101 CCNA_02102     TRUE 0.739 8.000 0.033 NA   NA
 5849366 5849367 CCNA_02103 CCNA_02104     TRUE 0.929 0.000 0.130 NA   NA
 5849367 5849368 CCNA_02104 CCNA_02105     FALSE 0.248 62.000 0.037 NA   NA
 5849368 5849369 CCNA_02105 CCNA_02106     FALSE 0.003 275.000 0.000 NA   NA
 5849369 5849370 CCNA_02106 CCNA_02107     FALSE 0.074 117.000 0.000 NA   NA
 5849370 5849371 CCNA_02107 CCNA_02108     FALSE 0.070 53.000 0.000 NA   NA
 5849371 5849372 CCNA_02108 CCNA_02109   thiC FALSE 0.200 49.000 0.003 1.000 N NA
 5849372 5849373 CCNA_02109 CCNA_02110 thiC   FALSE 0.006 232.000 0.000 NA   NA
 5849373 5849374 CCNA_02110 CCNA_02111     TRUE 0.862 12.000 0.133 NA   NA
 5849375 5849376 CCNA_02112 CCNA_02113     TRUE 0.784 12.000 0.038 1.000 N NA
 5849379 5849380 CCNA_02116 CCNA_02117     FALSE 0.075 115.000 0.000 NA   NA
 5849380 5849381 CCNA_02117 CCNA_02118     FALSE 0.063 83.000 0.000 NA   NA
 5849381 5849382 CCNA_02118 CCNA_02119     FALSE 0.420 5.000 0.000 NA   NA
 5849382 5849383 CCNA_02119 CCNA_02120     FALSE 0.251 -22.000 0.000 NA   NA
 5849384 5849385 CCNA_02121 CCNA_02122     TRUE 0.968 -3.000 0.460 NA   NA
 5849385 5849386 CCNA_02122 CCNA_02123     FALSE 0.002 336.000 0.000 NA   NA
 5849387 5849388 CCNA_02124 CCNA_02125   podJ FALSE 0.005 244.000 0.000 NA   NA
 5849391 5849392 CCNA_02128 CCNA_02129     TRUE 0.682 73.000 0.000 0.006 Y NA
 5849393 5849394 CCNA_02130 CCNA_02131   celD TRUE 0.847 20.000 0.000 1.000 Y NA
 5849394 5849395 CCNA_02131 CCNA_02132 celD   FALSE 0.006 298.000 0.000 1.000 N NA
 5849395 5849396 CCNA_02132 CCNA_02133   glk FALSE 0.153 86.000 0.000 1.000 N NA
 5849396 5849397 CCNA_02133 CCNA_02134 glk edd TRUE 0.941 15.000 0.058 1.000 Y NA
 5849397 5849398 CCNA_02134 CCNA_02135 edd pgl TRUE 0.982 7.000 0.202 1.000 Y NA
 5849398 5849399 CCNA_02135 CCNA_02136 pgl zwf TRUE 0.985 3.000 0.163 1.000 Y NA
 5849399 5849400 CCNA_02136 CCNA_02137 zwf   FALSE 0.004 282.000 0.000 1.000   NA
 5849400 5849401 CCNA_02137 CCNA_02138     TRUE 0.952 10.000 0.556 NA   NA
 5849401 5849402 CCNA_02138 CCNA_02139   pflI TRUE 0.977 -3.000 0.714 NA   NA
 5849402 5849403 CCNA_02139 CCNA_02140 pflI fliM TRUE 0.786 -3.000 0.024 NA   NA
 5849403 5849404 CCNA_02140 CCNA_02141 fliM fliL TRUE 0.963 28.000 0.323 0.001 Y NA
 5849405 5849406 CCNA_02142 CCNA_02143 flgF flgG TRUE 0.981 14.000 0.235 0.001 Y NA
 5849406 5849407 CCNA_02143 CCNA_02144 flgG flgA TRUE 0.964 5.000 0.043 NA Y NA
 5849407 5849408 CCNA_02144 CCNA_02145 flgA flgH TRUE 0.937 13.000 0.035 NA Y NA
 5849408 5849409 CCNA_02145 CCNA_02146 flgH   FALSE 0.066 57.000 0.000 NA   NA
 5849409 5849410 CCNA_02146 CCNA_02147     FALSE 0.072 99.000 0.000 NA   NA
 5849410 5849411 CCNA_02147 CCNA_02148     FALSE 0.060 75.000 0.000 NA   NA
 5849412 5849413 CCNA_02149 CCNA_02150 dxs   TRUE 0.941 18.000 0.088 1.000 Y NA
 5849413 5849414 CCNA_02150 CCNA_02151     TRUE 0.549 38.000 0.062 1.000 N NA
 5849414 5849415 CCNA_02151 CCNA_02152     FALSE 0.071 98.000 0.000 NA   NA
 5849415 5849416 CCNA_02152 CCNA_02153     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5849417 5849418 CCNA_02154 CCNA_02155     FALSE 0.070 169.000 0.015 NA   NA
 5849419 5849420 CCNA_02156 CCNA_02157     TRUE 0.941 12.000 0.500 NA   NA
 5849421 5849422 CCNA_02158 CCNA_02159     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5849427 5849428 CCNA_02164 CCNA_02165     FALSE 0.322 63.000 0.044 NA N NA
 5849428 5849429 CCNA_02165 CCNA_02166     TRUE 0.796 -3.000 0.015 NA N NA
 5849429 5849430 CCNA_02166 CCNA_02167     FALSE 0.156 44.000 0.000 NA N NA
 5849433 5849434 CCNA_02170 CCNA_02171     FALSE 0.268 63.000 0.020 1.000 N NA
 5849435 5849436 CCNA_02172 CCNA_02173     TRUE 0.989 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 5849436 5849437 CCNA_02173 CCNA_02174     TRUE 0.970 21.000 0.500 1.000 Y NA
 5849439 5849440 CCNA_02176 CCNA_02177     FALSE 0.062 79.000 0.000 NA   NA
 5849440 5849441 CCNA_02177 CCNA_02178     FALSE 0.062 64.000 0.000 NA   NA
 5849441 5849442 CCNA_02178 CCNA_02179     FALSE 0.120 231.000 0.000 1.000 Y NA
 5849443 5849444 CCNA_02180 CCNA_02181     FALSE 0.103 88.000 0.000 1.000   NA
 5849444 5849445 CCNA_02181 CCNA_02182     TRUE 0.714 -3.000 0.007 1.000   NA
 5849446 5849447 CCNA_02183 CCNA_02184     TRUE 0.729 -3.000 0.014 NA   NA
 5849447 5849448 CCNA_02184 CCNA_02185     FALSE 0.001 407.000 0.000 NA   NA
 5849448 5849449 CCNA_02185 CCNA_02186     TRUE 0.914 43.000 0.146 0.001 Y NA
 5849449 5849451 CCNA_02186 CCNA_R0049     FALSE 0.024 171.000 0.000 NA   NA
 5849450 5849452 CCNA_R0049 CCNA_02187     FALSE 0.001 406.000 0.000 NA   NA
 5849451 5849450 CCNA_R0049 CCNA_R0049     FALSE 0.171 -82.000 0.000 NA   NA
 5849452 5849453 CCNA_02187 CCNA_02188     TRUE 0.869 -3.000 0.055 NA   NA
 5849453 5849454 CCNA_02188 CCNA_02189     TRUE 0.881 8.000 0.108 NA   NA
 5849454 5849455 CCNA_02189 CCNA_02190     FALSE 0.465 79.000 0.108 1.000   NA
 5849455 5849456 CCNA_02190 CCNA_02191     TRUE 0.621 81.000 0.333 NA   NA
 5849457 5849458 CCNA_02192 CCNA_02193     FALSE 0.446 -42.000 0.018 NA   NA
 5849459 5849460 CCNA_02194 CCNA_02195     TRUE 0.569 8.000 0.003 1.000   NA
 5849461 5849462 CCNA_02196 CCNA_02197     FALSE 0.065 89.000 0.000 NA   NA
 5849462 5849463 CCNA_02197 CCNA_02198     TRUE 0.571 1.000 0.004 NA   NA
 5849465 5849466 CCNA_02200 CCNA_02201     FALSE 0.112 63.000 0.000 NA N NA
 5849468 5849469 CCNA_02203 CCNA_02204     FALSE 0.054 139.000 0.000 NA   NA
 5849469 5849470 CCNA_02204 CCNA_02205     FALSE 0.003 281.000 0.000 NA   NA
 5849471 5849472 CCNA_02206 CCNA_02207     FALSE 0.163 77.000 0.017 NA   NA
 5849472 5849473 CCNA_02207 CCNA_02208     FALSE 0.151 119.000 0.003 NA N NA
 5849475 5849476 CCNA_02210 CCNA_02211     FALSE 0.066 92.000 0.000 NA   NA
 5849476 5849477 CCNA_02211 CCNA_02212     FALSE 0.063 83.000 0.000 NA   NA
 5849480 5849481 CCNA_02215 CCNA_02216     TRUE 0.954 7.000 0.429 1.000   NA
 5849481 5849482 CCNA_02216 CCNA_02217     TRUE 0.512 122.000 0.143 NA   NA
 5849482 5849483 CCNA_02217 CCNA_02218     FALSE 0.177 99.000 0.015 NA   NA
 5849485 5849486 CCNA_02220 CCNA_02221     FALSE 0.018 223.000 0.000 1.000 N NA
 5849486 5849487 CCNA_02221 CCNA_02222     FALSE 0.419 178.000 0.008 0.001 Y NA
 5849487 5849488 CCNA_02222 CCNA_02223     TRUE 0.975 -3.000 0.571 1.000   NA
 5849488 5849489 CCNA_02223 CCNA_02224     TRUE 0.771 -3.000 0.014 1.000   NA
 5849489 5849490 CCNA_02224 CCNA_02225     TRUE 0.950 -3.000 0.160 1.000 N NA
 5849490 5849491 CCNA_02225 CCNA_02226     FALSE 0.165 44.000 0.008 NA   NA
 5849491 5849492 CCNA_02226 CCNA_02227     FALSE 0.124 32.000 0.000 NA   NA
 5849493 5849494 CCNA_02228 CCNA_02229     FALSE 0.071 122.000 0.000 NA   NA
 5849495 5849496 CCNA_02230 CCNA_02231     FALSE 0.082 142.000 0.000 1.000   NA
 5849497 5849498 CCNA_02232 CCNA_02233     TRUE 0.526 159.000 0.222 0.085 N NA
 5849500 5849501 CCNA_02235 CCNA_02236     TRUE 0.937 4.000 0.154 1.000 N NA
 5849501 5849502 CCNA_02236 CCNA_02237     FALSE 0.261 68.000 0.020 1.000 N NA
 5849502 5849503 CCNA_02237 CCNA_02238     FALSE 0.164 138.000 0.020 NA   NA
 5849504 5849505 CCNA_02239 CCNA_02240     TRUE 0.954 -3.000 0.280 NA   NA
 5849505 5849506 CCNA_02240 CCNA_02241     TRUE 0.980 0.000 0.696 NA N NA
 5849506 5849507 CCNA_02241 CCNA_02242     FALSE 0.086 175.000 0.036 NA   NA
 5849509 5849510 CCNA_02244 CCNA_02245     FALSE 0.116 101.000 0.000 1.000   NA
 5849510 5849511 CCNA_02245 CCNA_02246     FALSE 0.239 74.000 0.027 1.000   NA
 5849513 5849514 CCNA_02248 CCNA_02249     FALSE 0.325 12.000 0.000 NA   NA
 5849516 5849517 CCNA_02250 CCNA_02251     TRUE 0.676 61.000 0.000 0.066 Y NA
 5849517 5849518 CCNA_02251 CCNA_02252     TRUE 0.858 22.000 0.009 1.000 Y NA
 5849519 5849520 CCNA_02253 CCNA_R0051     FALSE 0.094 42.000 0.000 NA   NA
 5849521 5849522 CCNA_02254 CCNA_02255   spmX FALSE 0.032 202.000 0.011 1.000   NA
 5849522 5849523 CCNA_02255 CCNA_02256 spmX   FALSE 0.305 106.000 0.029 1.000   NA
 5849523 5849524 CCNA_02256 CCNA_R0052     FALSE 0.044 149.000 0.000 NA   NA
 5849524 5849525 CCNA_R0052 CCNA_02257     FALSE 0.065 86.000 0.000 NA   NA
 5849526 5849527 CCNA_02258 CCNA_02259     FALSE 0.108 36.000 0.000 NA   NA
 5849528 5849529 CCNA_02260 CCNA_02261     FALSE 0.258 84.000 0.028 1.000   NA
 5849530 5849531 CCNA_02262 CCNA_02263     TRUE 0.951 -3.000 0.250 NA   NA
 5849533 5849534 CCNA_02265 CCNA_02266     TRUE 0.593 57.000 0.000 NA Y NA
 5849534 5849535 CCNA_02266 CCNA_02267     FALSE 0.077 111.000 0.000 NA   NA
 5849536 5849537 CCNA_02268 CCNA_R0053     FALSE 0.008 215.000 0.000 NA   NA
 5849539 5849540 CCNA_02270 CCNA_02271     FALSE 0.006 228.000 0.000 NA   NA
 5849540 5849541 CCNA_02271 CCNA_02272     TRUE 0.753 45.000 0.500 NA   NA
 5849541 5849542 CCNA_02272 CCNA_02273     FALSE 0.291 35.000 0.019 NA   NA
 5849542 5849543 CCNA_02273 CCNA_02274     FALSE 0.108 126.000 0.000 1.000   NA
 5849543 5849544 CCNA_02274 CCNA_02275     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5849545 5849546 CCNA_02276 CCNA_02277     FALSE 0.064 85.000 0.000 NA   NA
 5849546 5849547 CCNA_02277 CCNA_02278     FALSE 0.190 107.000 0.015 NA   NA
 5849547 5849548 CCNA_02278 CCNA_02279     TRUE 0.964 -3.000 0.385 NA   NA
 5849548 5849549 CCNA_02279 CCNA_02280     TRUE 0.947 -3.000 0.145 1.000 N NA
 5849549 5849550 CCNA_02280 CCNA_02281     FALSE 0.239 92.000 0.012 1.000 N NA
 5849550 5849551 CCNA_02281 CCNA_02282     TRUE 0.655 108.000 0.300 NA   NA
 5849552 5849553 CCNA_02283 CCNA_02284     FALSE 0.217 163.000 0.050 1.000 N NA
 5849553 5849554 CCNA_02284 CCNA_02285     FALSE 0.214 52.000 0.006 1.000 N NA
 5849554 5849555 CCNA_02285 CCNA_02286     FALSE 0.017 178.000 0.000 NA   NA
 5849556 5849557 CCNA_02287 CCNA_02288     TRUE 0.756 -3.000 0.011 1.000   NA
 5849558 5849559 CCNA_02289 CCNA_02290     TRUE 0.967 9.000 0.833 NA   NA
 5849559 5849560 CCNA_02290 CCNA_02291     TRUE 0.960 -3.000 0.333 NA   NA
 5849560 5849561 CCNA_02291 CCNA_02292     FALSE 0.017 202.000 0.000 1.000   NA
 5849561 5849562 CCNA_02292 CCNA_02293     TRUE 0.617 -3.000 0.000 1.000   NA
 5849563 5849564 CCNA_02294 CCNA_02295     FALSE 0.317 -21.000 0.003 NA   NA
 5849564 5849565 CCNA_02295 CCNA_02296     FALSE 0.445 10.000 0.003 NA   NA
 5849566 5849567 CCNA_02297 CCNA_02298     TRUE 0.636 -58.000 0.062 NA   NA
 5849568 5849569 CCNA_02299 CCNA_02300     TRUE 0.985 -3.000 0.139 1.000 Y NA
 5849569 5849570 CCNA_02300 CCNA_02301     TRUE 0.966 -3.000 0.417 NA   NA
 5849570 5849571 CCNA_02301 CCNA_02302     TRUE 0.951 -3.000 0.250 NA   NA
 5849573 5849574 CCNA_02304 CCNA_02305     FALSE 0.257 58.000 0.037 NA   NA
 5849574 5849575 CCNA_02305 CCNA_02306     TRUE 0.738 46.000 0.019 1.000 Y NA
 5849575 5849576 CCNA_02306 CCNA_02307     TRUE 0.981 7.000 0.198 1.000 Y NA
 5849578 5849579 CCNA_02309 CCNA_02310     FALSE 0.063 154.000 0.000 1.000   NA
 5849579 5849580 CCNA_02310 CCNA_R0054     FALSE 0.061 67.000 0.000 NA   NA
 5849580 10784568 CCNA_R0054 CCNA_04009     FALSE 0.061 67.000 0.000 NA   NA
 5849581 5849582 CCNA_02312 CCNA_02313     TRUE 0.705 94.000 0.500 NA   NA
 5849582 5849583 CCNA_02313 CCNA_02314     TRUE 0.661 118.000 0.333 NA   NA
 5849583 5849584 CCNA_02314 CCNA_02315     TRUE 0.654 28.000 0.105 NA   NA
 5849584 5849585 CCNA_02315 CCNA_02316     TRUE 0.917 -3.000 0.105 NA   NA
 5849585 5849586 CCNA_02316 CCNA_02317     TRUE 0.729 -90.000 0.143 NA   NA
 5849586 5849587 CCNA_02317 CCNA_02318     TRUE 0.867 29.000 0.667 NA   NA
 5849587 5849588 CCNA_02318 CCNA_02319     TRUE 0.727 78.000 0.667 NA   NA
 5849588 5849589 CCNA_02319 CCNA_02320     FALSE 0.116 119.000 0.005 NA   NA
 5849590 5849591 CCNA_02321 CCNA_02322     TRUE 0.774 -19.000 0.066 NA N NA
 5849592 5849593 CCNA_02323 CCNA_02324   hsp33 FALSE 0.065 88.000 0.000 NA   NA
 5849593 5849594 CCNA_02324 CCNA_02325 hsp33   FALSE 0.066 218.000 0.052 1.000 N NA
 5849594 5849595 CCNA_02325 CCNA_02326     TRUE 0.753 118.000 0.038 1.000 Y NA
 5849595 5849596 CCNA_02326 CCNA_02327     FALSE 0.258 155.000 0.048 1.000 N NA
 5849597 5849598 CCNA_02328 CCNA_02329     FALSE 0.004 276.000 0.002 NA   NA
 5849598 5849599 CCNA_02329 CCNA_02330     FALSE 0.284 28.000 0.011 NA   NA
 5849599 5849600 CCNA_02330 CCNA_02331     TRUE 0.645 -15.000 0.034 NA   NA
 5849600 5849601 CCNA_02331 CCNA_02332     FALSE 0.193 136.000 0.015 NA N NA
 5849603 5849604 CCNA_02334 CCNA_02335 staR   TRUE 0.651 63.000 0.294 1.000 N NA
 5849605 5849606 CCNA_02336 CCNA_02337     TRUE 0.966 4.000 0.033 1.000 Y NA
 5849606 5849607 CCNA_02337 CCNA_02338     TRUE 0.581 89.000 0.250 NA   NA
 5849607 5849608 CCNA_02338 CCNA_02339     TRUE 0.973 -3.000 0.600 NA   NA
 5849608 5849609 CCNA_02339 CCNA_02340     TRUE 0.791 45.000 0.667 NA   NA
 5849611 5849612 CCNA_02342 CCNA_02343     FALSE 0.076 103.000 0.000 NA   NA
 5849612 5849613 CCNA_02343 CCNA_02344     FALSE 0.294 93.000 0.045 NA   NA
 5849614 5849615 CCNA_02345 CCNA_02346     TRUE 0.806 -3.000 0.029 NA   NA
 5849615 5849616 CCNA_02346 CCNA_02347     FALSE 0.401 100.000 0.013 0.014 N NA
 5849616 5849617 CCNA_02347 CCNA_02348     FALSE 0.144 80.000 0.007 1.000   NA
 5849617 5849618 CCNA_02348 CCNA_02349     FALSE 0.095 134.000 0.000 1.000   NA
 5849618 5849619 CCNA_02349 CCNA_02350     FALSE 0.094 42.000 0.000 NA   NA
 5849620 5849621 CCNA_02351 CCNA_02352     FALSE 0.183 52.000 0.002 1.000 N NA
 5849621 5849622 CCNA_02352 CCNA_02353     TRUE 0.995 3.000 0.625 0.001 Y NA
 5849623 5849624 CCNA_02354 CCNA_02355     TRUE 0.708 82.000 0.500 1.000   NA
 5849625 5849626 CCNA_02356 CCNA_02357     FALSE 0.268 139.000 0.028 1.000 N NA
 5849626 5849627 CCNA_02357 CCNA_02358     FALSE 0.245 76.000 0.028 1.000   NA
 5849627 5849628 CCNA_02358 CCNA_02359     FALSE 0.098 40.000 0.000 NA   NA
 5849628 5849629 CCNA_02359 CCNA_02360     TRUE 0.698 -114.000 0.120 NA   NA
 5849629 5849630 CCNA_02360 CCNA_02361     TRUE 0.903 0.000 0.080 NA   NA
 5849630 5849631 CCNA_02361 CCNA_02362     FALSE 0.161 95.000 0.005 NA N NA
 5849633 5849634 CCNA_02364 CCNA_02365     FALSE 0.448 124.000 0.065 1.000 N NA
 5849634 5849635 CCNA_02365 CCNA_02366   malY TRUE 0.740 34.000 0.290 NA   NA
 5849637 5849638 CCNA_02368 CCNA_02369     TRUE 0.968 -24.000 0.127 0.004 Y NA
 5849639 5849640 CCNA_02370 CCNA_02371 malA   FALSE 0.327 172.000 0.273 NA   NA
 5849641 5849642 CCNA_02372 CCNA_02373     FALSE 0.236 -28.000 0.000 NA   NA
 5849642 5849643 CCNA_02373 CCNA_02374     TRUE 0.888 -6.000 0.077 0.042   NA
 5849643 5849644 CCNA_02374 CCNA_02375     FALSE 0.064 59.000 0.000 NA   NA
 5849646 5849647 CCNA_02377 CCNA_R0055     FALSE 0.011 199.000 0.000 NA   NA
 5849649 5849650 CCNA_02379 CCNA_02380     TRUE 0.573 4.000 0.005 NA   NA
 5849651 5849652 CCNA_02381 CCNA_02382     TRUE 0.973 2.000 0.667 NA   NA
 5849653 5849654 CCNA_02383 CCNA_02384     TRUE 0.609 83.000 0.000 1.000 Y NA
 5849654 5849655 CCNA_02384 CCNA_02385     FALSE 0.031 196.000 0.000 1.000 N NA
 5849655 5849656 CCNA_02385 CCNA_02386     FALSE 0.264 114.000 0.018 NA N NA
 5849656 5849657 CCNA_02386 CCNA_02387     TRUE 0.855 -3.000 0.035 NA N NA
 5849657 5849658 CCNA_02387 CCNA_02388     FALSE 0.381 43.000 0.026 1.000 N NA
 5849658 5849659 CCNA_02388 CCNA_02389     TRUE 0.790 -3.000 0.008 1.000 N NA
 5849660 5849661 CCNA_02390 CCNA_R0056     FALSE 0.079 48.000 0.000 NA   NA
 5849661 5849662 CCNA_R0056 CCNA_02391     FALSE 0.013 191.000 0.000 NA   NA
 5849662 5849663 CCNA_02391 CCNA_02392     FALSE 0.362 10.000 0.000 NA   NA
 5849665 5849666 CCNA_02394 CCNA_02395     FALSE 0.078 108.000 0.000 NA   NA
 5849666 5849667 CCNA_02395 CCNA_02396     FALSE 0.023 172.000 0.000 NA   NA
 5849669 5849670 CCNA_02398 CCNA_02399     FALSE 0.224 62.000 0.012 1.000 N NA
 5849670 5849671 CCNA_02399 CCNA_02400     FALSE 0.428 27.000 0.017 NA N NA
 5849674 5849675 CCNA_02403 CCNA_02404     TRUE 0.992 -3.000 0.491 NA Y NA
 5849675 5849676 CCNA_02404 CCNA_02405     TRUE 0.994 0.000 0.650 NA Y NA
 5849676 5849677 CCNA_02405 CCNA_02406     TRUE 0.943 -3.000 0.201 NA   NA
 5849678 5849679 CCNA_02407 CCNA_02408     FALSE 0.434 71.000 0.111 NA   NA
 5849680 5849681 CCNA_02409 CCNA_02410     TRUE 0.505 146.000 0.182 1.000 N NA
 5849684 5849685 CCNA_02413 CCNA_02414     TRUE 0.536 29.000 0.036 1.000 N NA
 5849686 5849687 CCNA_02415 CCNA_02416     FALSE 0.005 307.000 0.000 1.000 N NA
 5849687 5849688 CCNA_02416 CCNA_02417     FALSE 0.112 122.000 0.000 1.000   NA
 5849688 5849689 CCNA_02417 CCNA_02418     TRUE 0.980 0.000 0.748 1.000   NA
 5849690 5849691 CCNA_R0057 CCNA_02419   tonB1 FALSE 0.065 129.000 0.000 NA   NA
 5849691 5849692 CCNA_02419 CCNA_02420 tonB1 exbD TRUE 0.968 11.000 0.667 0.083   NA
 5849692 5849693 CCNA_02420 CCNA_02421 exbD exbB TRUE 0.993 6.000 0.667 0.037 Y NA
 5849693 5849694 CCNA_02421 CCNA_02422 exbB   FALSE 0.001 914.000 0.000 1.000   NA
 5849694 5849695 CCNA_02422 CCNA_02423     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5849697 5849698 CCNA_R0058 CCNA_02425     FALSE 0.073 100.000 0.000 NA   NA
 5849698 5849699 CCNA_02425 CCNA_02426     TRUE 0.935 -3.000 0.154 NA   NA
 5849699 5849700 CCNA_02426 CCNA_02427     TRUE 0.937 -3.000 0.133 NA N NA
 5849700 5849701 CCNA_02427 CCNA_02428     TRUE 0.927 8.000 0.207 NA N NA
 5849701 5849702 CCNA_02428 CCNA_02429     TRUE 0.659 85.000 0.293 1.000 N NA
 5849702 5849703 CCNA_02429 CCNA_02430     TRUE 0.975 3.000 0.768 NA   NA
 5849703 5849704 CCNA_02430 CCNA_02431     TRUE 0.766 22.000 0.157 NA   NA
 5849704 5849705 CCNA_02431 CCNA_02432     FALSE 0.230 46.000 0.004 1.000 N NA
 5849705 5849706 CCNA_02432 CCNA_02433     FALSE 0.072 121.000 0.000 NA   NA
 5849706 5849707 CCNA_02433 CCNA_02434     FALSE 0.014 188.000 0.000 NA   NA
 5849707 5849708 CCNA_02434 CCNA_02435     TRUE 0.760 -51.000 0.138 NA   NA
 5849708 5849709 CCNA_02435 CCNA_02436     FALSE 0.107 98.000 0.004 NA   NA
 5849713 5849714 CCNA_02439 CCNA_02440     TRUE 0.946 10.000 0.333 1.000 N NA
 5849716 5849717 CCNA_02442 CCNA_02443     FALSE 0.079 162.000 0.000 1.000 N NA
 5849717 5849718 CCNA_02443 CCNA_02444     FALSE 0.269 66.000 0.021 1.000 N NA
 5849720 5849721 CCNA_02446 CCNA_02447     TRUE 0.862 0.000 0.036 NA N NA
 5849721 5849722 CCNA_02447 CCNA_02448     TRUE 0.911 24.000 0.911 NA   NA
 5849723 5849724 CCNA_02449 CCNA_02450     FALSE 0.443 165.000 0.379 NA   NA
 5849724 5849725 CCNA_02450 CCNA_02451     TRUE 0.942 11.000 0.470 NA   NA
 5849725 5849726 CCNA_02451 CCNA_02452     FALSE 0.233 146.000 0.049 NA   NA
 5849727 5849728 CCNA_02453 CCNA_02454     TRUE 0.543 -15.000 0.003 1.000 N NA
 5849728 5849729 CCNA_02454 CCNA_02455     FALSE 0.200 53.000 0.013 1.000   NA
 5849729 5849730 CCNA_02455 CCNA_02456     FALSE 0.003 288.000 0.000 NA   NA
 5849730 5849731 CCNA_02456 CCNA_02457     FALSE 0.276 94.000 0.040 NA   NA
 5849732 5849733 CCNA_02458 CCNA_02459     TRUE 0.989 5.000 0.220 0.001 Y NA
 5849734 5849735 CCNA_02460 CCNA_02461     TRUE 0.768 37.000 0.400 NA   NA
 5849737 5849738 CCNA_02463 CCNA_02464     TRUE 0.986 3.000 0.192 1.000 Y NA
 5849740 5849741 CCNA_02465 CCNA_02466     TRUE 0.637 52.000 0.000 1.000 Y NA
 5849741 5849742 CCNA_02466 CCNA_02467   pssZ TRUE 0.684 42.000 0.000 NA Y NA
 5849742 5849743 CCNA_02467 CCNA_02468 pssZ   FALSE 0.088 44.000 0.000 NA   NA
 5849746 5849747 CCNA_02471 CCNA_02472     TRUE 0.989 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 5849747 5849748 CCNA_02472 CCNA_02473     TRUE 0.880 -31.000 0.250 1.000 N NA
 5849749 5849750 CCNA_02474 CCNA_02475   vanR TRUE 0.855 88.000 0.111 0.036 Y NA
 5849751 5849752 CCNA_02476 CCNA_02477 vanA vanB TRUE 0.963 -3.000 0.128 0.001 N NA
 5849753 5849754 CCNA_02478 CCNA_02479     FALSE 0.235 26.000 0.000 1.000   NA
 5849754 5849755 CCNA_02479 CCNA_02480     TRUE 0.970 13.000 0.086 0.030 Y NA
 5849755 5849756 CCNA_02480 CCNA_02481     FALSE 0.175 50.000 0.000 1.000 N NA
 5849756 5849757 CCNA_02481 CCNA_02482     FALSE 0.163 125.000 0.000 1.000 N NA
 5849757 5849758 CCNA_02482 CCNA_02483     FALSE 0.175 50.000 0.000 1.000 N NA
 5849758 5849759 CCNA_02483 CCNA_02484     TRUE 0.820 44.000 0.031 0.064 Y NA
 5849759 5849760 CCNA_02484 CCNA_02485     TRUE 0.705 53.000 0.222 0.064 N NA
 5849760 5849761 CCNA_02485 CCNA_02486     TRUE 0.656 115.000 0.222 1.000 N NA
 5849762 5849763 CCNA_02487 CCNA_02488     TRUE 0.780 7.000 0.020 1.000 N NA
 5849763 5849764 CCNA_02488 CCNA_02489     TRUE 0.994 0.000 0.333 0.001 Y NA
 5849764 5849765 CCNA_02489 CCNA_02490     TRUE 0.982 -3.000 0.086 1.000 Y NA
 5849765 5849766 CCNA_02490 CCNA_02491     TRUE 0.914 10.000 0.066 0.001 N NA
 5849766 5849767 CCNA_02491 CCNA_02492     TRUE 0.993 -7.000 0.782 0.001 Y NA
 5849767 5849768 CCNA_02492 CCNA_02493     TRUE 0.876 20.000 0.314 1.000 N NA
 5849768 5849769 CCNA_02493 CCNA_02494     TRUE 0.838 0.000 0.028 1.000   NA
 5849769 5849770 CCNA_02494 CCNA_02495     FALSE 0.100 60.000 0.000 1.000   NA
 5849771 5849772 CCNA_02496 CCNA_02497     FALSE 0.325 12.000 0.000 NA   NA
 5849773 5849774 CCNA_02498 CCNA_02499     FALSE 0.306 13.000 0.000 NA   NA
 5849774 5849775 CCNA_02499 CCNA_02500     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5849775 5849776 CCNA_02500 CCNA_02501     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5849776 5849777 CCNA_02501 CCNA_02502     TRUE 0.959 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5849777 5849778 CCNA_02502 CCNA_02503     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5849778 5849779 CCNA_02503 CCNA_02504     TRUE 0.889 14.000 0.000 NA Y NA
 5849779 5849780 CCNA_02504 CCNA_02505     TRUE 0.976 -3.000 0.048 1.000 Y NA
 5849781 5849782 CCNA_02506 CCNA_R0062     FALSE 0.010 204.000 0.000 NA   NA
 5849783 5849784 CCNA_02507 CCNA_02508 hfsE hfsF FALSE 0.086 188.000 0.054 NA   NA
 5849784 5849785 CCNA_02508 CCNA_02509 hfsF hfsG TRUE 0.893 -3.000 0.072 NA   NA
 5849785 5849786 CCNA_02509 CCNA_02510 hfsG hfsH TRUE 0.922 0.000 0.087 NA N NA
 5849787 5849788 CCNA_02511 CCNA_02512 hfsC hfsB TRUE 0.981 -3.000 1.000 NA   NA
 5849788 5849789 CCNA_02512 CCNA_02513 hfsB hfsA FALSE 0.426 43.000 0.061 NA   NA
 5849791 5849792 CCNA_02515 CCNA_02516     FALSE 0.170 173.000 0.069 1.000   NA
 5849794 5849795 CCNA_02518 CCNA_02519 gatB   TRUE 0.989 -9.000 0.492 0.001 Y NA
 5849795 5849796 CCNA_02519 CCNA_02520     TRUE 0.996 0.000 0.643 0.001 Y NA
 5849797 5849798 CCNA_02521 CCNA_02522     FALSE 0.077 49.000 0.000 NA   NA
 5849798 5849799 CCNA_02522 CCNA_02523     FALSE 0.006 235.000 0.000 NA   NA
 5849799 5849800 CCNA_02523 CCNA_02524     FALSE 0.063 61.000 0.000 NA   NA
 5849801 5849802 CCNA_02525 CCNA_02526     TRUE 0.894 134.000 0.452 1.000 Y NA
 5849802 5849803 CCNA_02526 CCNA_02527     FALSE 0.225 -31.000 0.000 NA   NA
 5849803 5849804 CCNA_02527 CCNA_02528     FALSE 0.124 32.000 0.000 NA   NA
 5849804 5849805 CCNA_02528 CCNA_02529     TRUE 0.903 -3.000 0.070 1.000   NA
 5849805 5849806 CCNA_02529 CCNA_02530     FALSE 0.111 64.000 0.002 1.000   NA
 5849807 5849808 CCNA_02531 CCNA_02532     FALSE 0.068 55.000 0.000 NA   NA
 10784571 5849813 CCNA_04018 CCNA_02537     FALSE 0.009 207.000 0.000 NA   NA
 5849817 5849818 CCNA_02541 CCNA_02542     FALSE 0.417 28.000 0.029 NA   NA
 5849818 5849819 CCNA_02542 CCNA_02543     FALSE 0.077 82.000 0.002 NA   NA
 5849820 5849821 CCNA_02544 CCNA_02545     FALSE 0.468 57.000 0.125 NA   NA
 5849821 5849822 CCNA_02545 CCNA_02546   pleD FALSE 0.126 47.000 0.000 1.000   NA
 5849822 5849823 CCNA_02546 CCNA_02547 pleD divK TRUE 0.994 -3.000 0.461 0.021 Y NA
 5849824 5849825 CCNA_02548 CCNA_02549     TRUE 0.847 -3.000 0.043 NA   NA
 5849825 5849826 CCNA_02549 CCNA_02550     TRUE 0.878 9.000 0.076 1.000 N NA
 5849826 5849827 CCNA_02550 CCNA_02551     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5849827 5849828 CCNA_02551 CCNA_02552   clpS FALSE 0.151 27.000 0.000 NA   NA
 5849828 5849829 CCNA_02552 CCNA_02553 clpS clpA TRUE 0.933 14.000 0.596 NA   NA
 5849829 5849830 CCNA_02553 CCNA_02554 clpA   FALSE 0.112 109.000 0.004 NA   NA
 5849832 5849833 CCNA_02556 CCNA_02557     FALSE 0.072 121.000 0.000 NA   NA
 5849833 5849834 CCNA_02557 CCNA_02558     TRUE 0.757 13.000 0.043 NA N NA
 5849835 5849836 CCNA_02559 CCNA_02560     FALSE 0.070 124.000 0.000 NA   NA
 5849836 5849837 CCNA_02560 CCNA_02561     TRUE 0.981 -3.000 1.000 NA   NA
 5849837 5849838 CCNA_02561 CCNA_02562     FALSE 0.483 1.000 0.000 NA   NA
 5849838 5849839 CCNA_02562 CCNA_02563     FALSE 0.006 263.000 0.000 1.000   NA
 5849839 5849840 CCNA_02563 CCNA_02564     TRUE 0.991 14.000 0.833 0.006 Y NA
 5849841 5849842 CCNA_02565 CCNA_02566     FALSE 0.133 87.000 0.009 NA   NA
 5849842 5849843 CCNA_02566 CCNA_02567   pleC FALSE 0.140 168.000 0.025 1.000 N NA
 5849843 5849844 CCNA_02567 CCNA_02568 pleC   FALSE 0.146 68.000 0.000 1.000 N NA
 5849846 5849847 CCNA_02570 CCNA_02571     FALSE 0.478 150.000 0.000 NA Y NA
 5849847 5849848 CCNA_02571 CCNA_02572     FALSE 0.038 189.000 0.002 1.000 N NA
 5849848 5849849 CCNA_02572 CCNA_02573     TRUE 0.706 3.000 0.002 1.000 N NA
 5849849 5849850 CCNA_02573 CCNA_02574     TRUE 0.531 -13.000 0.006 NA N NA
 5849852 5849853 CCNA_02576 CCNA_02577     TRUE 0.913 51.000 0.460 1.000 Y NA
 5849855 5849856 CCNA_02579 CCNA_02580     TRUE 0.962 11.000 0.429 0.041 N NA
 5849856 5849857 CCNA_02580 CCNA_02581     FALSE 0.010 311.000 0.040 NA   NA
 5849857 5849858 CCNA_02581 CCNA_02582     FALSE 0.290 -13.000 0.000 NA   NA
 5849858 5849859 CCNA_02582 CCNA_02583     FALSE 0.061 67.000 0.000 NA   NA
 5849860 10784572 CCNA_02584 CCNA_04012     FALSE 0.148 -280.000 0.000 NA   NA
 10784572 5849861 CCNA_04012 CCNA_02585     FALSE 0.003 278.000 0.000 NA   NA
 5849863 5849864 CCNA_02587 CCNA_02588     FALSE 0.252 24.000 0.000 1.000   NA
 5849865 5849866 CCNA_02589 CCNA_02590     TRUE 0.570 14.000 0.011 NA N NA
 5849866 5849867 CCNA_02590 CCNA_02591     FALSE 0.372 50.000 0.037 1.000 N NA
 5849867 5849868 CCNA_02591 CCNA_02592     TRUE 0.639 17.000 0.037 1.000   NA
 5849869 5849870 CCNA_02593 CCNA_02594     FALSE 0.061 68.000 0.000 NA   NA
 5849870 5849871 CCNA_02594 CCNA_02595     TRUE 0.567 10.000 0.010 NA   NA
 5849871 5849872 CCNA_02595 CCNA_02596     FALSE 0.003 265.000 0.000 NA   NA
 5849872 5849873 CCNA_02596 CCNA_02597     FALSE 0.023 172.000 0.000 NA   NA
 5849873 5849874 CCNA_02597 CCNA_02598     FALSE 0.062 80.000 0.000 NA   NA
 5849874 5849875 CCNA_02598 CCNA_02599     FALSE 0.196 -48.000 0.000 NA   NA
 5849875 5849876 CCNA_02599 CCNA_02600     FALSE 0.170 24.000 0.000 NA   NA
 5849876 5849877 CCNA_02600 CCNA_02601     FALSE 0.159 149.000 0.019 1.000   NA
 5849879 5849880 CCNA_02603 CCNA_02604     TRUE 0.662 82.000 0.429 NA   NA
 5849880 5849881 CCNA_02604 CCNA_02605     FALSE 0.173 93.000 0.007 NA N NA
 5849881 5849882 CCNA_02605 CCNA_02606     FALSE 0.209 43.000 0.000 1.000 N NA
 5849883 5849884 CCNA_02607 CCNA_02608     FALSE 0.086 156.000 0.012 NA   NA
 5849884 5849885 CCNA_02608 CCNA_02609     TRUE 0.945 11.000 0.500 NA   NA
 5849885 5849886 CCNA_02609 CCNA_02610     FALSE 0.119 33.000 0.000 NA   NA
 5849887 5849888 CCNA_02611 CCNA_02612     FALSE 0.005 317.000 0.000 1.000 N NA
 5849888 5849889 CCNA_02612 CCNA_02613     FALSE 0.027 187.000 0.000 NA N NA
 5849889 5849890 CCNA_02613 CCNA_02614     TRUE 0.850 -3.000 0.033 NA N NA
 5849890 5849891 CCNA_02614 CCNA_02615     TRUE 0.746 116.000 0.034 1.000 Y NA
 5849891 5849892 CCNA_02615 CCNA_02616     FALSE 0.181 171.000 0.051 1.000 N NA
 5849892 5849893 CCNA_02616 CCNA_02617     TRUE 0.952 21.000 0.214 1.000 Y NA
 5849893 5849894 CCNA_02617 CCNA_02618     FALSE 0.170 120.000 0.000 1.000 N NA
 5849895 5849896 CCNA_02619 CCNA_02620     FALSE 0.062 79.000 0.000 NA   NA
 5849896 5849897 CCNA_02620 CCNA_02621     FALSE 0.068 126.000 0.000 NA   NA
 5849898 5849899 CCNA_02622 CCNA_02623   ftsZ FALSE 0.111 123.000 0.000 1.000   NA
 5849899 5849900 CCNA_02623 CCNA_02624 ftsZ ftsA FALSE 0.078 372.000 0.114 1.000 Y NA
 5849900 5849901 CCNA_02624 CCNA_02625 ftsA ftsQ TRUE 0.697 31.000 0.137 NA N NA
 5849901 5849902 CCNA_02625 CCNA_02626 ftsQ   TRUE 0.969 -31.000 0.372 NA Y NA
 5849902 5849903 CCNA_02626 CCNA_02627     FALSE 0.014 223.000 0.004 1.000   NA
 5849903 5849904 CCNA_02627 CCNA_02628     FALSE 0.012 219.000 0.000 1.000   NA
 5849904 5849905 CCNA_02628 CCNA_02629     TRUE 0.792 152.000 0.108 0.004 Y NA
 5849909 5849910 CCNA_02633 CCNA_02634     FALSE 0.102 86.000 0.000 1.000   NA
 5849910 5849911 CCNA_02634 CCNA_02635     TRUE 0.980 0.000 0.647 1.000 N NA
 5849912 5849913 CCNA_02636 CCNA_02637     FALSE 0.118 102.000 0.000 1.000   NA
 5849914 5849915 CCNA_02638 CCNA_02639   murD TRUE 0.694 4.000 0.002 1.000 N NA
 5849915 5849916 CCNA_02639 CCNA_02640 murD   TRUE 0.988 15.000 0.647 0.004 Y NA
 5849916 5849917 CCNA_02640 CCNA_02641     TRUE 0.993 0.000 0.309 0.004 Y NA
 5849917 5849918 CCNA_02641 CCNA_02642     TRUE 0.991 -7.000 0.569 0.002 Y NA
 5849918 5849919 CCNA_02642 CCNA_02643   ftsI TRUE 0.982 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 5849919 5849920 CCNA_02643 CCNA_02644 ftsI   TRUE 0.902 -3.000 0.082 NA   NA
 5849920 5849921 CCNA_02644 CCNA_02645     TRUE 0.648 -3.000 0.007 NA   NA
 5849921 5849922 CCNA_02645 CCNA_02646     TRUE 0.974 -3.000 0.635 NA   NA
 5849926 5849927 CCNA_02649 CCNA_02650     TRUE 0.862 0.000 0.026 1.000 N NA
 5849927 5849928 CCNA_02650 CCNA_02651     TRUE 0.910 -3.000 0.078 1.000   NA
 5849929 5849930 CCNA_02652 CCNA_02653     FALSE 0.250 75.000 0.029 1.000   NA
 5849930 5849931 CCNA_02653 CCNA_02654     FALSE 0.062 132.000 0.000 NA   NA
 5849932 5849933 CCNA_02655 CCNA_02656     FALSE 0.061 68.000 0.000 NA   NA
 5849933 5849934 CCNA_02656 CCNA_02657     FALSE 0.306 13.000 0.000 NA   NA
 5849934 5849935 CCNA_02657 CCNA_02658     TRUE 0.941 3.000 0.231 NA   NA
 5849936 5849937 CCNA_02659 CCNA_02660     FALSE 0.336 51.000 0.042 1.000   NA
 5849937 5849938 CCNA_02660 CCNA_02661     FALSE 0.095 72.000 0.000 1.000   NA
 5849939 5849940 CCNA_02662 CCNA_02663   dksA FALSE 0.181 33.000 0.000 1.000   NA
 5849940 5849941 CCNA_02663 CCNA_02664 dksA fliX FALSE 0.076 212.000 0.086 NA   NA
 5849942 5849943 CCNA_02665 CCNA_02666 flgI   TRUE 0.875 0.000 0.056 NA   NA
 5849943 5849944 CCNA_02666 CCNA_02667   flbY TRUE 0.930 5.000 0.222 NA   NA
 5849945 5849946 CCNA_02668 CCNA_02669     TRUE 0.828 17.000 0.182 NA   NA
 5849946 5849947 CCNA_02669 CCNA_02670     FALSE 0.321 41.000 0.032 NA   NA
 5849947 5849948 CCNA_02670 CCNA_02671     FALSE 0.216 136.000 0.032 NA   NA
 5849948 5849949 CCNA_02671 CCNA_02672     FALSE 0.072 121.000 0.000 NA   NA
 5849950 5849951 CCNA_02673 CCNA_02674     FALSE 0.187 200.000 0.000 NA Y NA
 5849951 5849952 CCNA_02674 CCNA_02675     TRUE 0.918 -135.000 0.136 NA Y NA
 5849955 5849956 CCNA_02678 CCNA_02679     TRUE 0.955 10.000 0.600 NA   NA
 5849956 5849957 CCNA_02679 CCNA_02680     FALSE 0.041 152.000 0.000 NA   NA
 5849959 5849960 CCNA_02682 CCNA_02683     TRUE 0.979 -3.000 0.722 1.000   NA
 5849961 5849962 CCNA_02684 CCNA_02685     TRUE 0.805 -3.000 0.029 NA   NA
 5849962 5849963 CCNA_02685 CCNA_02686     FALSE 0.020 174.000 0.000 NA   NA
 5849963 5849964 CCNA_02686 CCNA_02687     TRUE 0.853 35.000 0.060 1.000 Y NA
 5849964 5849965 CCNA_02687 CCNA_02688     FALSE 0.328 131.000 0.036 1.000 N NA
 5849965 5849966 CCNA_02688 CCNA_02689     FALSE 0.257 149.000 0.052 1.000   NA
 5849966 5849967 CCNA_02689 CCNA_02690     TRUE 0.928 0.000 0.103 1.000   NA
 5849967 5849968 CCNA_02690 CCNA_02691     TRUE 0.972 -3.000 0.500 1.000   NA
 5849969 5849970 CCNA_02692 CCNA_02693     FALSE 0.066 128.000 0.000 NA   NA
 5849970 5849971 CCNA_02693 CCNA_02694     FALSE 0.009 237.000 0.000 1.000   NA
 5849972 5849973 CCNA_02695 CCNA_02696     TRUE 0.839 -3.000 0.041 NA   NA
 5849973 5849974 CCNA_02696 CCNA_02697     TRUE 0.944 -3.000 0.203 NA   NA
 5849974 5849975 CCNA_02697 CCNA_02698     TRUE 0.808 10.000 0.061 NA   NA
 5849976 5849977 CCNA_02699 CCNA_02700     TRUE 0.773 -13.000 0.055 NA N NA
 5849977 5849978 CCNA_02700 CCNA_02701     FALSE 0.474 118.000 0.082 NA N NA
 5849978 5849979 CCNA_02701 CCNA_02702     TRUE 0.980 -7.000 0.128 0.001 Y NA
 5849979 5849980 CCNA_02702 CCNA_02703     TRUE 0.900 0.000 0.064 1.000   NA
 5849982 5849983 CCNA_02705 CCNA_R0064     FALSE 0.005 247.000 0.000 NA   NA
 5849983 5849984 CCNA_R0064 CCNA_R0065     FALSE 0.062 64.000 0.000 NA   NA
 5849984 5849985 CCNA_R0065 CCNA_R0066     FALSE 0.072 99.000 0.000 NA   NA
 5849985 5849986 CCNA_R0066 CCNA_R0067     FALSE 0.002 296.000 0.000 NA   NA
 5849986 5849987 CCNA_R0067 CCNA_R0068     FALSE 0.061 68.000 0.000 NA   NA
 5849987 5849988 CCNA_R0068 CCNA_R0069     FALSE 0.018 176.000 0.000 NA   NA
 5849992 5849993 CCNA_02709 CCNA_02710     TRUE 0.555 73.000 0.211 1.000   NA
 5849994 5849995 CCNA_02711 CCNA_02712 hfaA hfaB TRUE 0.974 -3.000 0.625 NA   NA
 5849995 5849996 CCNA_02712 CCNA_02713 hfaB hfaD TRUE 0.902 -82.000 0.750 NA   NA
 5849996 5849997 CCNA_02713 CCNA_02714 hfaD   FALSE 0.074 118.000 0.000 NA   NA
 5849997 5849998 CCNA_02714 CCNA_02715     FALSE 0.031 215.000 0.000 0.071   NA
 5849998 5849999 CCNA_02715 CCNA_02716     FALSE 0.332 93.000 0.043 NA N NA
 5849999 5850000 CCNA_02716 CCNA_02717   malK TRUE 0.994 -3.000 0.702 NA Y NA
 5850000 5850001 CCNA_02717 CCNA_02718 malK tauC TRUE 0.981 -3.000 0.077 1.000 Y NA
 5850001 5850002 CCNA_02718 CCNA_02719 tauC   FALSE 0.062 62.000 0.000 NA   NA
 5850002 5850003 CCNA_02719 CCNA_02720     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850003 5850004 CCNA_02720 CCNA_02721     TRUE 0.566 46.000 0.154 NA   NA
 5850007 5850008 CCNA_02724 CCNA_02725     TRUE 0.577 11.000 0.000 1.000 N NA
 5850011 5850012 CCNA_02727 CCNA_02728     FALSE 0.023 176.000 0.002 NA   NA
 5850012 5850013 CCNA_02728 CCNA_02729     FALSE 0.237 95.000 0.029 NA   NA
 5850013 5850014 CCNA_02729 CCNA_02730     FALSE 0.395 7.000 0.000 NA   NA
 5850015 5850016 CCNA_02731 CCNA_02732     FALSE 0.067 56.000 0.000 NA   NA
 5850016 5850017 CCNA_02732 CCNA_02733     FALSE 0.004 261.000 0.000 NA   NA
 5850017 5850018 CCNA_02733 CCNA_02734     TRUE 0.822 1.000 0.016 1.000 N NA
 5850018 5850019 CCNA_02734 CCNA_02735     TRUE 0.525 44.000 0.091 1.000   NA
 5850023 5850024 CCNA_02739 CCNA_02740     TRUE 0.805 -3.000 0.000 0.040   NA
 5850026 5850027 CCNA_02742 CCNA_02743     TRUE 0.900 149.000 1.000 NA Y NA
 5850027 5850028 CCNA_02743 CCNA_02744     FALSE 0.249 172.000 0.100 1.000 N NA
 5850028 5850029 CCNA_02744 CCNA_02745     FALSE 0.036 207.000 0.000 0.043   NA
 5850033 5850034 CCNA_02749 CCNA_02750     TRUE 0.558 45.000 0.143 NA   NA
 5850034 5850035 CCNA_02750 CCNA_02751     TRUE 0.990 -3.000 0.312 1.000 Y NA
 5850035 5850036 CCNA_02751 CCNA_02752     FALSE 0.274 94.000 0.000 0.070 N NA
 5850036 5850037 CCNA_02752 CCNA_02753     FALSE 0.064 169.000 0.000 1.000 N NA
 5850037 5850038 CCNA_02753 CCNA_02754     FALSE 0.002 494.000 0.000 1.000 N NA
 5850039 5850040 CCNA_R0071 CCNA_02755     FALSE 0.077 106.000 0.000 NA   NA
 5850042 5850043 CCNA_02757 CCNA_02758     FALSE 0.104 58.000 0.005 NA   NA
 5850043 5850044 CCNA_02758 CCNA_02759     FALSE 0.110 153.000 0.016 NA   NA
 5850044 5850045 CCNA_02759 CCNA_02760     FALSE 0.063 61.000 0.000 NA   NA
 5850045 5850046 CCNA_02760 CCNA_02761     FALSE 0.009 211.000 0.000 NA   NA
 5850046 5850047 CCNA_02761 CCNA_02762     FALSE 0.009 206.000 0.000 NA   NA
 5850047 5850048 CCNA_02762 CCNA_02763     TRUE 0.599 96.000 0.217 1.000   NA
 5850049 5850050 CCNA_02764 CCNA_02765     FALSE 0.440 4.000 0.000 NA   NA
 5850050 5850051 CCNA_02765 CCNA_02766     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850051 5850052 CCNA_02766 CCNA_02767     FALSE 0.325 12.000 0.000 NA   NA
 5850052 5850053 CCNA_02767 CCNA_02768     TRUE 0.994 -3.000 0.833 NA Y NA
 5850053 5850054 CCNA_02768 CCNA_02769     TRUE 0.994 -3.000 0.714 NA Y NA
 5850054 5850055 CCNA_02769 CCNA_02770     TRUE 0.989 4.000 0.429 NA Y NA
 5850056 5850057 CCNA_02771 CCNA_02772     TRUE 0.888 -6.000 0.077 0.040   NA
 5850057 5850058 CCNA_02772 CCNA_02773     FALSE 0.300 19.000 0.000 1.000   NA
 5850058 5850059 CCNA_02773 CCNA_02774     FALSE 0.325 12.000 0.000 NA   NA
 5850060 5850061 CCNA_02775 CCNA_02776     FALSE 0.072 99.000 0.000 NA   NA
 5850061 5850062 CCNA_02776 CCNA_02777     FALSE 0.025 181.000 0.000 1.000   NA
 5850063 5850064 CCNA_02778 CCNA_02779     FALSE 0.103 38.000 0.000 NA   NA
 5850064 5850065 CCNA_02779 CCNA_02780     FALSE 0.001 420.000 0.000 NA   NA
 5850065 5850066 CCNA_02780 CCNA_02781     TRUE 0.967 10.000 1.000 NA   NA
 5850068 5850069 CCNA_02783 CCNA_02784     TRUE 0.909 -34.000 0.600 NA   NA
 5850069 5850070 CCNA_02784 CCNA_02785     TRUE 0.893 11.000 0.182 NA   NA
 5850070 5850071 CCNA_02785 CCNA_02786     TRUE 0.987 1.000 0.182 1.000 Y NA
 5850071 5850072 CCNA_02786 CCNA_02787     FALSE 0.306 13.000 0.000 NA   NA
 5850073 5850074 CCNA_02788 CCNA_02789     TRUE 0.835 78.000 1.000 0.016   NA
 5850075 5850076 CCNA_02790 CCNA_02791     TRUE 0.963 13.000 1.000 NA N NA
 5850076 5850077 CCNA_02791 CCNA_02792     TRUE 0.613 123.000 0.000 NA Y NA
 5850077 5850078 CCNA_02792 CCNA_02793     TRUE 0.763 51.000 0.500 1.000 N NA
 5850079 5850080 CCNA_02794 CCNA_02795     TRUE 0.976 -3.000 0.667 NA   NA
 5850080 5850081 CCNA_02795 CCNA_02796     FALSE 0.061 65.000 0.000 NA   NA
 5850081 5850082 CCNA_02796 CCNA_02797     FALSE 0.181 22.000 0.000 NA   NA
 5850082 5850083 CCNA_02797 CCNA_02798     FALSE 0.061 68.000 0.000 NA   NA
 5850084 5850085 CCNA_02799 CCNA_02800     FALSE 0.073 51.000 0.000 NA   NA
 5850089 5850090 CCNA_02804 CCNA_02805     FALSE 0.081 47.000 0.000 NA   NA
 5850090 5850091 CCNA_02805 CCNA_02806     TRUE 0.604 57.000 0.286 NA   NA
 5850091 5850092 CCNA_02806 CCNA_02807     TRUE 0.994 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 5850092 5850093 CCNA_02807 CCNA_02808     TRUE 0.877 -31.000 0.333 NA   NA
 5850093 5850094 CCNA_02808 CCNA_02809     TRUE 0.960 -3.000 0.333 NA   NA
 5850094 5850095 CCNA_02809 CCNA_02810     TRUE 0.957 2.000 0.333 NA   NA
 5850095 5850096 CCNA_02810 CCNA_02811     FALSE 0.062 63.000 0.000 NA   NA
 5850096 5850097 CCNA_02811 CCNA_02812     FALSE 0.079 162.000 0.000 1.000 N NA
 5850097 5850098 CCNA_02812 CCNA_02813     TRUE 0.617 -3.000 0.000 1.000   NA
 5850098 5850099 CCNA_02813 CCNA_02814     TRUE 0.805 -3.000 0.000 0.040   NA
 5850100 5850101 CCNA_02815 CCNA_02816     FALSE 0.405 6.000 0.000 NA   NA
 5850101 5850102 CCNA_02816 CCNA_02817     FALSE 0.060 71.000 0.000 NA   NA
 5850106 5850107 CCNA_02821 CCNA_02822     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850107 5850108 CCNA_02822 CCNA_02823     FALSE 0.004 249.000 0.000 NA   NA
 5850109 5850110 CCNA_02824 CCNA_02825     FALSE 0.342 11.000 0.000 NA   NA
 5850110 5850111 CCNA_02825 CCNA_R0070     FALSE 0.101 39.000 0.000 NA   NA
 5850111 5850112 CCNA_R0070 CCNA_02826     FALSE 0.460 3.000 0.000 NA   NA
 5850112 5850113 CCNA_02826 CCNA_02827     FALSE 0.260 125.000 0.000 0.007   NA
 5850113 5850114 CCNA_02827 CCNA_02828     TRUE 0.888 -6.000 0.077 0.040   NA
 5850114 5850115 CCNA_02828 CCNA_02829     FALSE 0.337 -28.000 0.000 1.000   NA
 5850115 5850116 CCNA_02829 CCNA_02830     FALSE 0.002 369.000 0.000 1.000   NA
 5850116 5850117 CCNA_02830 CCNA_02831     FALSE 0.062 79.000 0.000 NA   NA
 5850117 5850118 CCNA_02831 CCNA_02832     FALSE 0.067 93.000 0.000 NA   NA
 5850119 5850120 CCNA_02833 CCNA_02834     TRUE 0.909 31.000 0.790 0.040   NA
 5850120 5850121 CCNA_02834 CCNA_02835     FALSE 0.148 49.000 0.008 NA   NA
 5850121 5850122 CCNA_02835 CCNA_02836     TRUE 0.905 -3.000 0.087 NA   NA
 5850122 5850123 CCNA_02836 CCNA_02837     TRUE 0.696 17.000 0.062 NA   NA
 5850123 5850124 CCNA_02837 CCNA_02838     FALSE 0.226 27.000 0.000 1.000   NA
 5850124 5850125 CCNA_02838 CCNA_02839     FALSE 0.005 278.000 0.000 1.000   NA
 5850126 5850127 CCNA_02840 CCNA_02841     FALSE 0.065 88.000 0.000 NA   NA
 5850128 5850129 CCNA_02842 CCNA_02843   parE-3 TRUE 0.728 5.000 0.023 NA   NA
 5850129 5850130 CCNA_02843 CCNA_02844 parE-3 parD-3 FALSE 0.306 13.000 0.000 NA   NA
 5850130 5850131 CCNA_02844 CCNA_02845 parD-3   FALSE 0.119 33.000 0.000 NA   NA
 5850131 5850132 CCNA_02845 CCNA_02846     FALSE 0.006 443.000 0.025 1.000 N NA
 5850132 5850133 CCNA_02846 CCNA_02847     TRUE 0.733 180.000 0.750 NA Y NA
 5850133 5850134 CCNA_02847 CCNA_02848     TRUE 0.991 -3.000 0.400 NA Y NA
 5850134 5850135 CCNA_02848 CCNA_02849     TRUE 0.657 155.000 0.021 0.002 Y NA
 5850135 5850136 CCNA_02849 CCNA_02850     TRUE 0.967 -3.000 0.016 1.000 Y NA
 5850138 5850139 CCNA_02852 CCNA_02853     FALSE 0.168 161.000 0.046 NA   NA
 5850139 5850140 CCNA_02853 CCNA_02854     TRUE 0.923 131.000 0.713 1.000 Y NA
 5850140 5850141 CCNA_02854 CCNA_02855     TRUE 0.851 19.000 0.287 NA   NA
 5850141 5850142 CCNA_02855 CCNA_02856     FALSE 0.065 129.000 0.000 NA   NA
 5850142 5850143 CCNA_02856 CCNA_02857     FALSE 0.299 -12.000 0.000 NA   NA
 5850143 5850144 CCNA_02857 CCNA_02858     FALSE 0.124 32.000 0.000 NA   NA
 5850144 5850145 CCNA_02858 CCNA_02859     TRUE 0.933 -3.000 0.149 NA   NA
 5850145 5850146 CCNA_02859 CCNA_02860     FALSE 0.048 163.000 0.000 1.000   NA
 5850146 5850147 CCNA_02860 CCNA_02861     TRUE 0.581 89.000 0.250 NA   NA
 5850147 5850148 CCNA_02861 CCNA_02862     FALSE 0.148 -364.000 0.000 NA   NA
 5850148 5850149 CCNA_02862 CCNA_02863     TRUE 0.646 125.000 0.333 NA   NA
 5850149 5850150 CCNA_02863 CCNA_02864     TRUE 0.939 -3.000 0.179 NA   NA
 5850150 5850151 CCNA_02864 CCNA_02865     TRUE 0.965 0.000 0.390 NA   NA
 5850153 5850154 CCNA_02867 CCNA_02868     TRUE 0.914 -3.000 0.100 NA   NA
 5850154 5850155 CCNA_02868 CCNA_02869     TRUE 0.961 -3.000 0.344 NA   NA
 5850155 5850156 CCNA_02869 CCNA_02870     TRUE 0.581 156.000 0.577 NA   NA
 5850156 5850157 CCNA_02870 CCNA_02871     TRUE 0.527 16.000 0.021 NA   NA
 5850157 5850158 CCNA_02871 CCNA_02872     FALSE 0.077 112.000 0.000 NA   NA
 5850160 5850161 CCNA_02874 CCNA_02875     TRUE 0.869 -10.000 0.156 NA   NA
 5850161 5850162 CCNA_02875 CCNA_02877     TRUE 0.813 13.000 0.088 NA   NA
 5850164 5850165 CCNA_02878 CCNA_02879     FALSE 0.060 75.000 0.000 NA   NA
 5850165 5850166 CCNA_02879 CCNA_02880     FALSE 0.063 131.000 0.000 NA   NA
 5850168 5850169 CCNA_02882 CCNA_02883     TRUE 0.959 15.000 0.667 0.040 N NA
 5850169 5850170 CCNA_02883 CCNA_02884     FALSE 0.110 148.000 0.000 1.000 N NA
 5850171 5850172 CCNA_02885 CCNA_02886     TRUE 0.606 149.000 0.442 NA N NA
 5850172 5850173 CCNA_02886 CCNA_02887     FALSE 0.137 230.000 0.365 NA   NA
 5850173 5850174 CCNA_02887 CCNA_02888     FALSE 0.280 160.000 0.103 NA   NA
 5850176 5850177 CCNA_02890 CCNA_02891     FALSE 0.062 64.000 0.000 NA   NA
 5850177 5850178 CCNA_02891 CCNA_02892     FALSE 0.061 70.000 0.000 NA   NA
 5850179 5850180 CCNA_02893 CCNA_02894     TRUE 0.655 170.000 0.083 0.013 Y NA
 5850180 5850181 CCNA_02894 CCNA_02895     FALSE 0.330 145.000 0.056 1.000 N NA
 5850182 5850183 CCNA_02896 CCNA_02897     TRUE 0.970 -3.000 0.500 NA   NA
 5850183 5850184 CCNA_02897 CCNA_02898     FALSE 0.025 169.000 0.000 NA   NA
 5850184 5850185 CCNA_02898 CCNA_02899     TRUE 0.960 -3.000 0.333 NA   NA
 5850186 5850187 CCNA_02900 CCNA_02901     TRUE 0.564 4.000 0.000 1.000   NA
 5850187 5850188 CCNA_02901 CCNA_02902     FALSE 0.003 411.000 0.000 1.000 N NA
 5850189 5850190 CCNA_02903 CCNA_02904     TRUE 0.806 127.000 0.800 1.000 N NA
 5850190 5850191 CCNA_02904 CCNA_02905     FALSE 0.105 93.000 0.000 1.000   NA
 5850191 5850192 CCNA_02905 CCNA_02906     FALSE 0.107 94.000 0.000 1.000   NA
 5850192 5850193 CCNA_02906 CCNA_R0072     FALSE 0.050 143.000 0.000 NA   NA
 5850193 5850194 CCNA_R0072 CCNA_02907     FALSE 0.279 14.000 0.000 NA   NA
 5850197 5850198 CCNA_02910 CCNA_02911     FALSE 0.003 279.000 0.000 NA   NA
 5850199 5850200 CCNA_02912 CCNA_02913     TRUE 0.870 0.000 0.053 NA   NA
 5850200 5850201 CCNA_02913 CCNA_02914     FALSE 0.001 429.000 0.000 NA   NA
 5850201 5850202 CCNA_02914 CCNA_02915     FALSE 0.181 22.000 0.000 NA   NA
 5850202 5850203 CCNA_02915 CCNA_02916     TRUE 0.961 10.000 0.720 NA   NA
 5850203 5850204 CCNA_02916 CCNA_02917     TRUE 0.801 19.000 0.168 NA   NA
 5850204 5850205 CCNA_02917 CCNA_02918     TRUE 0.909 9.000 0.193 NA   NA
 5850205 5850206 CCNA_02918 CCNA_02919     TRUE 0.936 -3.000 0.161 NA   NA
 5850206 5850207 CCNA_02919 CCNA_02920     TRUE 0.938 -3.000 0.172 NA   NA
 5850207 5850208 CCNA_02920 CCNA_02921     TRUE 0.977 -3.000 0.724 NA   NA
 5850209 5850210 CCNA_02922 CCNA_02923     FALSE 0.013 192.000 0.000 NA   NA
 5850210 5850211 CCNA_02923 CCNA_02924     FALSE 0.001 372.000 0.000 NA   NA
 5850212 5850213 CCNA_02925 CCNA_02926     FALSE 0.003 280.000 0.000 NA   NA
 5850213 5850214 CCNA_02926 CCNA_02927     FALSE 0.044 149.000 0.000 NA   NA
 5850214 5850215 CCNA_02927 CCNA_02928     FALSE 0.306 13.000 0.000 NA   NA
 5850215 5850216 CCNA_02928 CCNA_02929     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850217 5850218 CCNA_02930 CCNA_02931     FALSE 0.051 162.000 0.000 1.000   NA
 5850219 5850220 CCNA_02932 CCNA_02933     FALSE 0.013 192.000 0.000 NA   NA
 5850220 5850221 CCNA_02933 CCNA_02934     FALSE 0.329 148.000 0.095 NA   NA
 5850223 5850224 CCNA_02936 CCNA_02937     FALSE 0.076 103.000 0.000 NA   NA
 5850224 5850225 CCNA_02937 CCNA_02938     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850225 5850226 CCNA_02938 CCNA_02939     FALSE 0.066 91.000 0.000 NA   NA
 5850226 5850227 CCNA_02939 CCNA_02940     TRUE 0.970 -3.000 0.500 NA   NA
 5850227 5850228 CCNA_02940 CCNA_02941   greA FALSE 0.111 155.000 0.004 1.000 N NA
 5850228 5850229 CCNA_02941 CCNA_02942 greA   FALSE 0.229 114.000 0.012 NA N NA
 5850233 5850234 CCNA_02946 CCNA_02947   flmD TRUE 0.957 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5850234 5850235 CCNA_02947 CCNA_02948 flmD   FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850235 5850236 CCNA_02948 CCNA_02949   flmE FALSE 0.002 337.000 0.000 NA   NA
 5850236 5850237 CCNA_02949 CCNA_02950 flmE flmF FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850237 5850238 CCNA_02950 CCNA_02951 flmF   FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850238 5850239 CCNA_02951 CCNA_02952     FALSE 0.004 257.000 0.000 NA   NA
 5850239 5850240 CCNA_02952 CCNA_02953     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850240 5850241 CCNA_02953 CCNA_02954     FALSE 0.003 344.000 0.000 1.000   NA
 5850242 5850243 CCNA_02955 CCNA_02956     TRUE 0.798 5.000 0.042 NA   NA
 5850243 5850244 CCNA_02956 CCNA_02957     TRUE 0.593 -34.000 0.028 NA N NA
 5850245 5850246 CCNA_02958 CCNA_02959     FALSE 0.182 -64.000 0.000 NA   NA
 5850246 5850247 CCNA_02959 CCNA_02960     FALSE 0.096 68.000 0.000 1.000   NA
 5850252 5850253 CCNA_02965 CCNA_02966     TRUE 0.761 10.000 0.021 1.000 N NA
 5850254 5850255 CCNA_02967 CCNA_02968     FALSE 0.067 56.000 0.000 NA   NA
 5850255 5850256 CCNA_02968 CCNA_02969     FALSE 0.158 26.000 0.000 NA   NA
 5850256 5850257 CCNA_02969 CCNA_02970     FALSE 0.091 43.000 0.000 NA   NA
 5850258 5850259 CCNA_02971 CCNA_02972     FALSE 0.060 76.000 0.000 NA   NA
 5850260 5850261 CCNA_02973 CCNA_02974 relB-3 relE-3 FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850261 5850262 CCNA_02974 CCNA_02975 relE-3   FALSE 0.133 30.000 0.000 NA   NA
 5850264 5850265 CCNA_02977 CCNA_02978 sigU   FALSE 0.012 247.000 0.000 1.000 N NA
 5850266 5850267 CCNA_02979 CCNA_02980     TRUE 0.916 -24.000 0.025 1.000 Y NA
 5850268 5850269 CCNA_02981 CCNA_02982     FALSE 0.044 178.000 0.000 1.000 N NA
 5850269 5850270 CCNA_02982 CCNA_02983     TRUE 0.690 44.000 0.000 1.000 Y NA
 5850270 5850271 CCNA_02983 CCNA_02984     TRUE 0.845 -3.000 0.034 1.000   NA
 5850271 5850272 CCNA_02984 CCNA_02985     TRUE 0.626 0.000 0.000 1.000   NA
 5850274 5850275 CCNA_02987 CCNA_02988     FALSE 0.061 67.000 0.000 NA   NA
 5850275 5850276 CCNA_02988 CCNA_02989     FALSE 0.060 76.000 0.000 NA   NA
 5850279 5850280 CCNA_02992 CCNA_02993     TRUE 0.504 0.000 0.000 NA   NA
 5850280 5850281 CCNA_02993 CCNA_02994     FALSE 0.044 178.000 0.000 1.000 N NA
 5850283 5850284 CCNA_02996 CCNA_02997     FALSE 0.096 133.000 0.000 1.000   NA
 5850284 5850285 CCNA_02997 CCNA_02998     FALSE 0.014 187.000 0.000 NA   NA
 5850285 5850286 CCNA_02998 CCNA_02999     FALSE 0.020 174.000 0.000 NA   NA
 5850286 5850287 CCNA_02999 CCNA_03000     TRUE 0.954 -3.000 0.271 NA   NA
 5850287 5850288 CCNA_03000 CCNA_03001     TRUE 0.689 75.000 0.542 NA   NA
 5850288 5850289 CCNA_03001 CCNA_03002     FALSE 0.029 165.000 0.000 NA   NA
 5850290 5850291 CCNA_03003 CCNA_03004     TRUE 0.924 0.000 0.056 0.068   NA
 5850291 5850292 CCNA_03004 CCNA_03005     TRUE 0.781 11.000 0.056 NA   NA
 5850292 5850293 CCNA_03005 CCNA_03006     FALSE 0.055 138.000 0.000 NA   NA
 5850293 5850294 CCNA_03006 CCNA_03007     TRUE 0.868 121.000 0.210 1.000 Y NA
 5850294 5850295 CCNA_03007 CCNA_03008     FALSE 0.274 30.000 0.006 1.000   NA
 5850295 5850296 CCNA_03008 CCNA_03009     TRUE 0.655 -3.000 0.002 1.000   NA
 5850297 5850298 CCNA_03010 CCNA_03011     FALSE 0.066 91.000 0.000 NA   NA
 5850299 5850300 CCNA_03012 CCNA_03013     TRUE 0.890 142.000 0.551 1.000 Y NA
 5850301 5850302 CCNA_03014 CCNA_03015     FALSE 0.225 -31.000 0.000 NA   NA
 5850302 5850303 CCNA_03015 CCNA_03016     FALSE 0.325 12.000 0.000 NA   NA
 5850303 5850304 CCNA_03016 CCNA_03017     TRUE 0.835 4.000 0.042 1.000   NA
 5850305 5850306 CCNA_R0073 CCNA_03018     FALSE 0.279 14.000 0.000 NA   NA
 5850309 5850310 CCNA_03021 CCNA_03022     TRUE 0.822 -30.000 0.167 NA   NA
 5850310 5850311 CCNA_03022 CCNA_03023     TRUE 0.681 -90.000 0.100 NA   NA
 5850311 5850312 CCNA_03023 CCNA_03024     FALSE 0.018 221.000 0.000 1.000 N NA
 5850313 5850314 CCNA_03025 CCNA_03026     TRUE 0.993 -3.000 0.392 0.067 Y NA
 5850314 5850315 CCNA_03026 CCNA_03027     TRUE 0.826 163.000 0.592 1.000 Y NA
 5850316 5850317 CCNA_03028 CCNA_03029     TRUE 0.926 -3.000 0.083 1.000 N NA
 5850319 5850320 CCNA_03031 CCNA_03032     TRUE 0.969 -3.000 0.408 NA N NA
 5850322 5850323 CCNA_03034 CCNA_03035     FALSE 0.060 76.000 0.000 NA   NA
 5850323 5850324 CCNA_03035 CCNA_03036     TRUE 0.927 81.000 0.889 NA Y NA
 5850324 5850325 CCNA_03036 CCNA_03037   cpaF TRUE 0.986 4.000 0.265 NA Y NA
 5850325 5850326 CCNA_03037 CCNA_03038 cpaF cpaE TRUE 0.990 1.000 0.294 1.000 Y NA
 5850326 5850327 CCNA_03038 CCNA_03039 cpaE cpaD TRUE 0.963 0.000 0.300 NA N NA
 5850327 5850328 CCNA_03039 CCNA_03040 cpaD cpaC TRUE 0.936 10.000 0.300 NA N NA
 5850328 5850329 CCNA_03040 CCNA_03041 cpaC cpaB TRUE 0.993 -3.000 0.600 NA Y NA
 5850329 5850330 CCNA_03041 CCNA_03042 cpaB cpaA TRUE 0.617 190.000 0.429 NA Y NA
 5850330 5850331 CCNA_03042 CCNA_03043 cpaA pilA TRUE 0.680 175.000 0.375 NA Y NA
 5850332 5850333 CCNA_03044 CCNA_03045     FALSE 0.329 93.000 0.056 NA   NA
 5850333 5850334 CCNA_03045 CCNA_03046     TRUE 0.986 -3.000 0.194 NA Y NA
 5850335 5850336 CCNA_03047 CCNA_03048     TRUE 0.987 -3.000 0.180 1.000 Y NA
 5850336 5850337 CCNA_03048 CCNA_03049     FALSE 0.136 54.000 0.009 NA   NA
 5850337 5850338 CCNA_03049 CCNA_03050     FALSE 0.117 136.000 0.009 NA   NA
 5850338 5850339 CCNA_03050 CCNA_03051     FALSE 0.016 179.000 0.000 NA   NA
 5850339 5850340 CCNA_03051 CCNA_03052     FALSE 0.010 204.000 0.000 NA   NA
 5850344 5850345 CCNA_03056 CCNA_03057     FALSE 0.072 99.000 0.000 NA   NA
 5850345 5850346 CCNA_03057 CCNA_03058     FALSE 0.460 3.000 0.000 NA   NA
 5850346 5850347 CCNA_03058 CCNA_03059     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850348 5850349 CCNA_03060 CCNA_03061     FALSE 0.299 93.000 0.047 NA   NA
 5850350 5850351 CCNA_03062 CCNA_03063     FALSE 0.001 418.000 0.000 NA   NA
 5850351 5850352 CCNA_03063 CCNA_03064     TRUE 0.933 -19.000 0.643 NA   NA
 5850354 5850355 CCNA_03066 CCNA_03067     FALSE 0.119 92.000 0.000 NA N NA
 5850356 5850357 CCNA_03068 CCNA_03069     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850357 5850358 CCNA_03069 CCNA_03070     FALSE 0.440 4.000 0.000 NA   NA
 5850358 5850359 CCNA_03070 CCNA_03071     FALSE 0.013 217.000 0.000 1.000   NA
 5850359 5850360 CCNA_03071 CCNA_03072     FALSE 0.099 81.000 0.000 1.000   NA
 5850360 5850361 CCNA_03072 CCNA_03073     FALSE 0.061 78.000 0.000 NA   NA
 5850361 5850362 CCNA_03073 CCNA_03074     TRUE 0.971 0.000 0.500 NA   NA
 5850362 5850363 CCNA_03074 CCNA_03075     TRUE 0.617 -3.000 0.000 1.000   NA
 5850363 5850364 CCNA_03075 CCNA_03076     FALSE 0.107 94.000 0.000 1.000   NA
 5850364 5850365 CCNA_03076 CCNA_03077     FALSE 0.088 44.000 0.000 NA   NA
 5850365 5850366 CCNA_03077 CCNA_03078     FALSE 0.473 2.000 0.000 NA   NA
 5850367 5850368 CCNA_03079 CCNA_03080 parE-4 parD_4 TRUE 0.900 -52.000 0.607 NA   NA
 5850368 5850369 CCNA_03080 CCNA_03081 parD_4   FALSE 0.012 197.000 0.000 NA   NA
 5850369 5850370 CCNA_03081 CCNA_03082     FALSE 0.003 266.000 0.000 NA   NA
 5850370 5850371 CCNA_03082 CCNA_03083     FALSE 0.001 716.000 0.000 NA   NA
 5850371 5850372 CCNA_03083 CCNA_03084     FALSE 0.076 103.000 0.000 NA   NA
 5850372 5850373 CCNA_03084 CCNA_03085     FALSE 0.077 105.000 0.000 NA   NA
 5850373 5850374 CCNA_03085 CCNA_03086     FALSE 0.391 64.000 0.087 NA   NA
 5850375 5850376 CCNA_03087 CCNA_03088     FALSE 0.446 -7.000 0.000 1.000   NA
 5850377 5850378 CCNA_03089 CCNA_03090     FALSE 0.207 19.000 0.000 NA   NA
 5850379 5850380 CCNA_03091 CCNA_03092     FALSE 0.465 101.000 0.100 NA   NA
 5850380 5850381 CCNA_03092 CCNA_03093     TRUE 0.729 9.000 0.012 1.000 N NA
 5850382 5850383 CCNA_03094 CCNA_03095     TRUE 0.512 40.000 0.071 1.000   NA
 5850383 5850384 CCNA_03095 CCNA_03096     FALSE 0.108 163.000 0.000 0.076   NA
 5850384 5850385 CCNA_03096 CCNA_03097     FALSE 0.002 517.000 0.000 1.000 N NA
 5850387 5850388 CCNA_03099 CCNA_03100     FALSE 0.073 51.000 0.000 NA   NA
 5850388 5850389 CCNA_03100 CCNA_03101     FALSE 0.200 98.000 0.004 1.000 N NA
 5850389 5850390 CCNA_03101 CCNA_03102     TRUE 0.627 -3.000 0.006 NA   NA
 5850391 5850392 CCNA_03103 CCNA_03104     TRUE 0.976 10.000 0.147 1.000 Y NA
 5850394 5850395 CCNA_03106 CCNA_03107     FALSE 0.171 137.000 0.011 NA N NA
 5850398 5850399 CCNA_03110 CCNA_03111     FALSE 0.440 4.000 0.000 NA   NA
 5850399 5850400 CCNA_03111 CCNA_03112     FALSE 0.074 117.000 0.000 NA   NA
 5850400 5850401 CCNA_03112 CCNA_03113     FALSE 0.002 538.000 0.000 NA N NA
 5850402 5850403 CCNA_03114 CCNA_03115     FALSE 0.119 33.000 0.000 NA   NA
 5850403 5850404 CCNA_03115 CCNA_03116     FALSE 0.076 114.000 0.000 NA   NA
 5850404 5850405 CCNA_03116 CCNA_03117     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850406 5850407 CCNA_03118 CCNA_03119     FALSE 0.011 202.000 0.000 NA   NA
 5850409 5850410 CCNA_03121 CCNA_03122     FALSE 0.279 -15.000 0.000 NA   NA
 5850410 5850411 CCNA_03122 CCNA_03123     TRUE 0.669 -7.000 0.028 NA   NA
 5850412 5850413 CCNA_03124 CCNA_03125     TRUE 0.565 6.000 0.000 NA N NA
 5850413 5850414 CCNA_03125 CCNA_03126     FALSE 0.111 66.000 0.000 NA N NA
 5850414 5850415 CCNA_03126 CCNA_03127     FALSE 0.008 271.000 0.000 1.000 N NA
 5850416 5850417 CCNA_03128 CCNA_03129     FALSE 0.024 206.000 0.000 1.000 N NA
 5850417 5850418 CCNA_03129 CCNA_03130   ctrA FALSE 0.010 260.000 0.000 1.000 N NA
 5850418 5850419 CCNA_03130 CCNA_03131 ctrA   FALSE 0.023 415.000 0.000 NA Y NA
 5850419 5850420 CCNA_03131 CCNA_03132   higA TRUE 0.677 43.000 0.000 NA Y NA
 5850420 5850421 CCNA_03132 CCNA_03133 higA higB FALSE 0.344 -6.000 0.000 NA   NA
 5850422 5850423 CCNA_03134 CCNA_03135   fliI FALSE 0.413 59.000 0.079 1.000   NA
 5850423 5850424 CCNA_03135 CCNA_03136 fliI fliJ TRUE 0.927 3.000 0.158 NA   NA
 5850424 5850425 CCNA_03136 CCNA_03137 fliJ   TRUE 0.963 2.000 0.429 NA   NA
 5850425 5850426 CCNA_03137 CCNA_03138   katG FALSE 0.003 375.000 0.000 1.000 N NA
 5850428 5850429 CCNA_03140 CCNA_03141     FALSE 0.171 51.000 0.000 1.000 N NA
 5850430 5850431 CCNA_03142 CCNA_03143     FALSE 0.006 391.000 0.000 0.066 N NA
 5850431 5850432 CCNA_03143 CCNA_03144   dnaG FALSE 0.183 122.000 0.002 1.000 N NA
 5850433 5850434 CCNA_03145 CCNA_03146     FALSE 0.279 -15.000 0.000 NA   NA
 5850434 5850435 CCNA_03146 CCNA_03147     FALSE 0.065 89.000 0.000 NA   NA
 5850435 5850436 CCNA_03147 CCNA_03148     FALSE 0.076 103.000 0.000 NA   NA
 5850436 5850437 CCNA_03148 CCNA_03149     FALSE 0.002 295.000 0.000 NA   NA
 5850439 5850440 CCNA_03151 CCNA_03152     FALSE 0.003 302.000 0.000 1.000   NA
 5850440 5850441 CCNA_03152 CCNA_03153     TRUE 0.769 -3.000 0.020 NA   NA
 5850441 5850442 CCNA_03153 CCNA_03154     FALSE 0.315 33.000 0.020 NA   NA
 5850442 5850443 CCNA_03154 CCNA_03155     FALSE 0.042 150.000 0.000 NA   NA
 5850443 5850444 CCNA_03155 CCNA_03156     TRUE 0.962 11.000 0.848 NA   NA
 5850444 5850445 CCNA_03156 CCNA_03157     TRUE 0.979 -3.000 0.808 NA   NA
 5850445 5850446 CCNA_03157 CCNA_03158     TRUE 0.716 102.000 0.462 NA   NA
 5850446 5850447 CCNA_03158 CCNA_03159     TRUE 0.977 0.000 0.500 1.000 N NA
 5850450 5850451 CCNA_03162 CCNA_03163     TRUE 0.553 16.000 0.008 1.000 N NA
 5850455 5850456 CCNA_03167 CCNA_03168     FALSE 0.005 241.000 0.000 NA   NA
 5850458 5850459 CCNA_03170 CCNA_03171     FALSE 0.077 49.000 0.000 NA   NA
 5850459 5850460 CCNA_03171 CCNA_03172     FALSE 0.420 79.000 0.067 1.000 N NA
 5850461 5850462 CCNA_03173 CCNA_03174     FALSE 0.094 42.000 0.000 NA   NA
 5850463 5850464 CCNA_03175 CCNA_03176     FALSE 0.191 -55.000 0.000 NA   NA
 5850464 5850465 CCNA_03176 CCNA_03177     FALSE 0.215 28.000 0.000 1.000   NA
 5850465 5850466 CCNA_03177 CCNA_03178     FALSE 0.011 249.000 0.000 1.000 N NA
 5850470 5850471 CCNA_03182 CCNA_03183     FALSE 0.066 57.000 0.000 NA   NA
 5850471 5850472 CCNA_03183 CCNA_03184     FALSE 0.373 103.000 0.036 1.000 N NA
 5850475 5850476 CCNA_03187 CCNA_03188     FALSE 0.031 215.000 0.000 0.076   NA
 5850476 5850477 CCNA_03188 CCNA_03189     FALSE 0.244 25.000 0.000 1.000   NA
 5850477 5850478 CCNA_03189 CCNA_03190     TRUE 0.617 -3.000 0.000 1.000   NA
 5850479 5850480 CCNA_03191 CCNA_03192     FALSE 0.038 155.000 0.000 NA   NA
 5850480 5850481 CCNA_03192 CCNA_03193     TRUE 0.933 0.000 0.143 NA   NA
 5850481 5850482 CCNA_03193 CCNA_03194     FALSE 0.279 14.000 0.000 NA   NA
 5850486 5850487 CCNA_03198 CCNA_03199     TRUE 0.611 76.000 0.333 NA   NA
 5850487 5850488 CCNA_03199 CCNA_03200     TRUE 0.671 104.000 0.333 NA   NA
 5850488 5850489 CCNA_03200 CCNA_03201     FALSE 0.181 98.000 0.002 1.000 N NA
 5850489 5850490 CCNA_03201 CCNA_03202     FALSE 0.138 121.000 0.003 1.000   NA
 5850491 5850492 CCNA_03203 CCNA_03204     TRUE 0.690 133.000 0.027 1.000 Y NA
 5850492 5850493 CCNA_03204 CCNA_03205     FALSE 0.016 205.000 0.000 1.000   NA
 5850493 5850494 CCNA_03205 CCNA_03206     FALSE 0.131 203.000 0.133 1.000   NA
 5850494 5850495 CCNA_03206 CCNA_03207     FALSE 0.273 103.000 0.033 NA   NA
 5850496 5850497 CCNA_03208 CCNA_03209     TRUE 0.523 30.000 0.048 1.000   NA
 5850499 5850500 CCNA_03211 CCNA_03212     TRUE 0.846 31.000 0.600 NA   NA
 5850504 5850505 CCNA_03216 CCNA_03217     TRUE 0.693 130.000 0.500 NA   NA
 5850506 5850507 CCNA_03218 CCNA_03219   acrB5 TRUE 0.980 4.000 0.579 0.008 N NA
 5850507 5850508 CCNA_03219 CCNA_03220 acrB5   FALSE 0.151 27.000 0.000 NA   NA
 5850508 5850509 CCNA_03220 CCNA_03221     FALSE 0.114 34.000 0.000 NA   NA
 5850509 5850510 CCNA_03221 CCNA_03222     TRUE 0.526 62.000 0.129 1.000 N NA
 5850510 5850511 CCNA_03222 CCNA_03223     TRUE 0.542 137.000 0.167 1.000 N NA
 5850512 5850513 CCNA_03224 CCNA_03225     FALSE 0.065 89.000 0.000 NA   NA
 5850513 5850514 CCNA_03225 CCNA_03226     TRUE 0.892 -3.000 0.045 1.000 N NA
 5850514 5850515 CCNA_03226 CCNA_03227     TRUE 0.626 52.000 0.114 0.075 N NA
 5850515 5850516 CCNA_03227 CCNA_03228     TRUE 0.720 131.000 0.545 1.000   NA
 5850516 5850517 CCNA_03228 CCNA_03229     FALSE 0.261 83.000 0.029 1.000   NA
 5850517 5850518 CCNA_03229 CCNA_03230     TRUE 0.919 76.000 0.706 1.000 Y NA
 5850519 5850520 CCNA_03231 CCNA_03232 relB-4 relE-4 FALSE 0.299 -12.000 0.000 NA   NA
 5850521 5850522 CCNA_03233 CCNA_03234     TRUE 0.911 18.000 0.500 1.000   NA
 5850522 5850523 CCNA_03234 CCNA_03235     TRUE 0.955 5.000 0.375 1.000   NA
 5850523 5850524 CCNA_03235 CCNA_03236     TRUE 0.612 146.000 0.020 1.000 Y NA
 5850524 5850525 CCNA_03236 CCNA_03237     FALSE 0.268 -18.000 0.000 NA   NA
 5850525 5850526 CCNA_03237 CCNA_03238     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850526 5850527 CCNA_03238 CCNA_03239     TRUE 0.919 116.000 0.312 0.027 Y NA
 5850527 5850528 CCNA_03239 CCNA_03240     TRUE 0.858 78.000 0.250 1.000 Y NA
 5850528 5850529 CCNA_03240 CCNA_03241     TRUE 0.926 -3.000 0.082 1.000 N NA
 5850529 5850530 CCNA_03241 CCNA_03242     FALSE 0.436 128.000 0.066 1.000 N NA
 5850530 5850531 CCNA_03242 CCNA_03243     TRUE 0.994 -3.000 0.444 0.059 Y NA
 5850531 5850532 CCNA_03243 CCNA_03244     TRUE 0.627 56.000 0.222 1.000 N NA
 5850535 5850536 CCNA_03247 CCNA_03248     FALSE 0.017 267.000 0.000 0.075 N NA
 5850536 5850537 CCNA_03248 CCNA_03249     FALSE 0.045 359.000 0.000 0.019 Y NA
 5850537 5850538 CCNA_03249 CCNA_03250     FALSE 0.125 96.000 0.000 NA N NA
 10784573 5850539 CCNA_04004 CCNA_03251     FALSE 0.147 -411.000 0.000 NA   NA
 5850540 5850541 CCNA_03252 CCNA_03253     TRUE 0.980 -3.000 0.087 NA Y NA
 5850541 5850542 CCNA_03253 CCNA_03254     FALSE 0.122 94.000 0.000 NA N NA
 5850544 5850545 CCNA_03256 CCNA_03257     FALSE 0.055 174.000 0.002 1.000 N NA
 5850545 5850546 CCNA_03257 CCNA_03258     FALSE 0.077 49.000 0.000 NA   NA
 5850547 5850548 CCNA_03259 CCNA_03260     TRUE 0.504 14.000 0.000 1.000 N NA
 5850548 5850549 CCNA_03260 CCNA_03261     FALSE 0.500 73.000 0.111 1.000 N NA
 5850549 5850550 CCNA_03261 CCNA_03262     TRUE 0.958 -3.000 0.270 1.000   NA
 5850559 5850560 CCNA_03270 CCNA_03272     TRUE 0.553 63.000 0.087 0.065 N NA
 5850561 5850562 CCNA_03274 CCNA_03275     FALSE 0.195 -49.000 0.000 NA   NA
 5850564 5850565 CCNA_R0075 CCNA_03277     FALSE 0.085 45.000 0.000 NA   NA
 5850565 5850566 CCNA_03277 CCNA_03278     FALSE 0.214 106.000 0.012 1.000   NA
 5850566 5850567 CCNA_03278 CCNA_03279     FALSE 0.075 146.000 0.000 1.000   NA
 5850567 5850568 CCNA_03279 CCNA_03280     FALSE 0.007 256.000 0.000 1.000   NA
 5850569 5850570 CCNA_03281 CCNA_03282     FALSE 0.007 219.000 0.000 NA   NA
 5850572 5850573 CCNA_03284 CCNA_03285     TRUE 0.702 11.000 0.013 1.000 N NA
 5850574 5850575 CCNA_03286 CCNA_03287     FALSE 0.153 -132.000 0.000 NA   NA
 5850576 5850577 CCNA_03288 CCNA_03289     TRUE 0.927 5.000 0.208 NA   NA
 5850578 5850579 CCNA_03290 CCNA_03291     FALSE 0.156 58.000 0.014 NA   NA
 5850579 5850580 CCNA_03291 CCNA_03292     FALSE 0.406 128.000 0.021 0.020 N NA
 5850580 5850581 CCNA_03292 CCNA_03293     TRUE 0.812 72.000 0.133 1.000 Y NA
 5850581 5850582 CCNA_03293 CCNA_03294     FALSE 0.014 410.000 0.078 1.000 N NA
 5850583 5850584 CCNA_03295 CCNA_03296     FALSE 0.324 175.000 0.143 0.065 N NA
 5850584 5850585 CCNA_03296 CCNA_03297     TRUE 0.523 101.000 0.143 NA   NA
 5850587 5850588 CCNA_03299 CCNA_03300     TRUE 0.980 -42.000 0.600 0.075 Y NA
 5850588 5850589 CCNA_03300 CCNA_03301   acrB TRUE 0.986 0.000 0.750 0.075 N NA
 5850590 5850591 CCNA_03302 CCNA_03303 narX   FALSE 0.018 223.000 0.000 1.000 N NA
 5850591 5850592 CCNA_03303 CCNA_03304     TRUE 0.875 120.000 0.102 0.001 Y NA
 5850592 5850593 CCNA_03304 CCNA_03305     TRUE 0.839 115.000 0.114 1.000 Y NA
 5850593 5850594 CCNA_03305 CCNA_03306     TRUE 0.989 14.000 0.620 0.002 Y NA
 5850595 5850596 CCNA_03307 CCNA_03308     FALSE 0.085 45.000 0.000 NA   NA
 5850596 5850597 CCNA_03308 CCNA_03309     FALSE 0.296 49.000 0.038 NA   NA
 5850598 5850599 CCNA_03310 CCNA_03311     TRUE 0.969 11.000 0.843 1.000 N NA
 5850599 5850600 CCNA_03311 CCNA_R0076     FALSE 0.072 99.000 0.000 NA   NA
 5850603 5850604 CCNA_03314 CCNA_03315     FALSE 0.330 111.000 0.024 1.000 N NA
 5850604 5850605 CCNA_03315 CCNA_03316     FALSE 0.292 89.000 0.024 1.000 N NA
 5850606 5850607 CCNA_03317 CCNA_03318     TRUE 0.895 126.000 0.366 1.000 Y NA
 5850611 5850612 CCNA_03321 CCNA_03322     FALSE 0.069 54.000 0.000 NA   NA
 5850612 5850613 CCNA_03322 CCNA_03323     TRUE 0.747 152.000 0.140 1.000 Y NA
 5850613 5850614 CCNA_03323 CCNA_03324     FALSE 0.179 136.000 0.021 NA   NA
 5850614 5850615 CCNA_03324 CCNA_03325     FALSE 0.060 71.000 0.000 NA   NA
 5850616 5850617 CCNA_03326 CCNA_03327     FALSE 0.055 138.000 0.000 NA   NA
 5850618 5850619 CCNA_03328 CCNA_03329     FALSE 0.108 36.000 0.000 NA   NA
 5850619 5850620 CCNA_03329 CCNA_03330     FALSE 0.185 -60.000 0.000 NA   NA
 5850620 5850621 CCNA_03330 CCNA_03331     TRUE 0.875 -3.000 0.059 NA   NA
 5850621 5850622 CCNA_03331 CCNA_03332     TRUE 0.646 53.000 0.003 1.000 Y NA
 5850622 5850623 CCNA_03332 CCNA_03333     TRUE 0.577 11.000 0.000 1.000 N NA
 5850623 5850624 CCNA_03333 CCNA_03334   ftsH FALSE 0.480 -148.000 0.000 0.066 N NA
 5850624 5850625 CCNA_03334 CCNA_03335 ftsH   TRUE 0.653 97.000 0.145 0.066 N NA
 5850625 5850626 CCNA_03335 CCNA_03336   ybgF TRUE 0.834 -9.000 0.085 1.000   NA
 5850626 5850627 CCNA_03336 CCNA_03337 ybgF pal TRUE 0.546 78.000 0.199 1.000   NA
 5850627 5850628 CCNA_03337 CCNA_03338 pal tolB FALSE 0.347 197.000 0.592 1.000 N NA
 5850628 5850629 CCNA_03338 CCNA_03339 tolB tolA TRUE 0.763 -3.000 0.010 NA N NA
 5850629 5850630 CCNA_03339 CCNA_03340 tolA tolR TRUE 0.798 8.000 0.037 NA N NA
 5850630 5850631 CCNA_03340 CCNA_03341 tolR tolQ TRUE 0.988 5.000 0.220 0.033 Y NA
 5850631 5850632 CCNA_03341 CCNA_03342 tolQ   TRUE 0.763 115.000 0.593 1.000   NA
 5850632 5850633 CCNA_03342 CCNA_03343     TRUE 0.665 -3.000 0.003 1.000   NA
 5850633 5850634 CCNA_03343 CCNA_03344   ruvB TRUE 0.561 -10.000 0.002 1.000 N NA
 5850634 5850635 CCNA_03344 CCNA_03345 ruvB ruvA TRUE 0.995 -3.000 0.549 0.001 Y NA
 5850635 5850636 CCNA_03345 CCNA_03346 ruvA ruvC TRUE 0.994 -3.000 0.451 0.006 Y NA
 5850637 5850638 CCNA_03347 CCNA_03348     FALSE 0.072 120.000 0.000 NA   NA
 5850641 5850642 CCNA_03351 CCNA_03352     FALSE 0.061 68.000 0.000 NA   NA
 5850642 5850643 CCNA_03352 CCNA_03353     FALSE 0.245 95.000 0.031 NA   NA
 5850643 5850644 CCNA_03353 CCNA_03354     TRUE 0.659 22.000 0.077 NA   NA
 5850646 5850647 CCNA_03355 CCNA_03356     FALSE 0.082 70.000 0.003 NA   NA
 5850647 5850648 CCNA_03356 CCNA_03357     TRUE 0.617 4.000 0.008 NA   NA
 5850649 5850650 CCNA_03358 CCNA_03359     FALSE 0.391 179.000 0.006 0.003 Y NA
 5850650 5850651 CCNA_03359 CCNA_03360     FALSE 0.500 167.000 0.002 0.003 Y NA
 5850651 5850652 CCNA_03360 CCNA_03361     FALSE 0.279 14.000 0.000 NA   NA
 5850653 5850654 CCNA_03273 CCNA_03362     TRUE 0.951 -13.000 0.812 NA   NA
 5850655 5850656 CCNA_03363 CCNA_03364     FALSE 0.372 77.000 0.080 NA   NA
 5850656 5850657 CCNA_03364 CCNA_03365     TRUE 0.937 -7.000 0.450 NA   NA
 5850657 5850658 CCNA_03365 CCNA_03366     TRUE 0.962 -3.000 0.367 NA   NA
 5850658 5850659 CCNA_03366 CCNA_03367     FALSE 0.070 124.000 0.000 NA   NA
 5850659 5850660 CCNA_03367 CCNA_03368     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850663 5850664 CCNA_03371 CCNA_03372     TRUE 0.803 153.000 0.316 NA Y NA
 5850665 5850666 CCNA_03373 CCNA_03374     FALSE 0.142 89.000 0.011 NA   NA
 5850667 5850668 CCNA_03375 CCNA_03376     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850668 5850669 CCNA_03376 CCNA_03377     TRUE 0.805 -3.000 0.029 NA   NA
 5850671 5850672 CCNA_03379 CCNA_03380     TRUE 0.504 0.000 0.000 NA   NA
 5850673 5850674 CCNA_03381 CCNA_03382     FALSE 0.432 25.000 0.025 NA   NA
 5850679 5850680 CCNA_03387 CCNA_03388     TRUE 0.678 2.000 0.011 NA   NA
 5850680 5850681 CCNA_03388 CCNA_03389     TRUE 0.933 0.000 0.143 NA   NA
 5850682 5850683 CCNA_03390 CCNA_03391     TRUE 0.974 0.000 0.600 NA   NA
 5850684 5850685 CCNA_03392 CCNA_03393     TRUE 0.988 6.000 0.201 0.001 Y NA
 5850686 5850687 CCNA_03394 CCNA_03395     TRUE 0.635 143.000 0.023 1.000 Y NA
 5850687 5850688 CCNA_03395 CCNA_03396     FALSE 0.061 68.000 0.000 NA   NA
 5850689 5850690 CCNA_03397 CCNA_03398     FALSE 0.154 -130.000 0.000 NA   NA
 5850690 5850691 CCNA_03398 CCNA_03399     TRUE 0.747 -73.000 0.144 NA   NA
 5850693 5850694 CCNA_03401 CCNA_03402     FALSE 0.349 141.000 0.087 NA   NA
 5850695 5850696 CCNA_03403 CCNA_03404   rcdA FALSE 0.172 182.000 0.141 NA   NA
 5850699 5850700 CCNA_03407 CCNA_03408     TRUE 0.929 -3.000 0.141 NA   NA
 5850700 5850701 CCNA_03408 CCNA_03409     FALSE 0.103 38.000 0.000 NA   NA
 5850701 5850702 CCNA_03409 CCNA_03410     TRUE 0.739 52.000 0.600 NA   NA
 5850702 5850703 CCNA_03410 CCNA_03411     FALSE 0.005 242.000 0.000 NA   NA
 5850704 5850705 CCNA_03412 CCNA_03413     TRUE 0.750 29.000 0.087 0.001   NA
 5850705 5850706 CCNA_03413 CCNA_03414     TRUE 0.936 26.000 0.829 0.001   NA
 5850706 5850707 CCNA_03414 CCNA_03415     FALSE 0.230 119.000 0.024 NA   NA
 5850707 5850708 CCNA_03415 CCNA_03416     FALSE 0.144 64.000 0.013 NA   NA
 5850708 5850709 CCNA_03416 CCNA_03417     FALSE 0.140 72.000 0.013 NA   NA
 5850709 5850710 CCNA_03417 CCNA_03418     TRUE 0.937 4.000 0.235 NA   NA
 5850711 5850712 CCNA_03419 CCNA_03420     TRUE 0.948 -10.000 0.667 NA   NA
 5850713 5850714 CCNA_03421 CCNA_03422     TRUE 0.805 7.000 0.050 NA   NA
 5850714 5850715 CCNA_03422 CCNA_03423     FALSE 0.186 42.000 0.009 NA   NA
 5850716 5850717 CCNA_03424 CCNA_03425     TRUE 0.504 0.000 0.000 NA   NA
 5850720 5850721 CCNA_03428 CCNA_03429     FALSE 0.242 102.000 0.026 NA   NA
 5850721 5850722 CCNA_03429 CCNA_03430     TRUE 0.898 0.000 0.062 1.000   NA
 5850725 5850726 CCNA_03433 CCNA_03434     FALSE 0.035 158.000 0.000 NA   NA
 5850726 5850727 CCNA_03434 CCNA_03435     TRUE 0.694 -33.000 0.069 NA   NA
 5850727 5850728 CCNA_03435 CCNA_03436     TRUE 0.961 -3.000 0.345 NA   NA
 5850729 5850730 CCNA_03437 CCNA_03438     FALSE 0.081 47.000 0.000 NA   NA
 5850730 5850731 CCNA_03438 CCNA_03439     FALSE 0.075 102.000 0.000 NA   NA
 5850731 5850732 CCNA_03439 CCNA_03440     FALSE 0.127 92.000 0.008 NA   NA
 5850732 5850733 CCNA_03440 CCNA_03441     FALSE 0.483 1.000 0.000 NA   NA
 5850733 5850734 CCNA_03441 CCNA_03442     TRUE 0.878 15.000 0.000 NA Y NA
 5850734 5850735 CCNA_03442 CCNA_03443     FALSE 0.175 23.000 0.000 NA   NA
 5850736 5850737 CCNA_03444 CCNA_03445     TRUE 0.684 137.000 0.500 1.000   NA
 5850738 5850739 CCNA_03446 CCNA_03447     TRUE 0.604 91.000 0.286 NA   NA
 5850739 5850740 CCNA_03447 CCNA_03448     FALSE 0.103 38.000 0.000 NA   NA
 5850740 5850741 CCNA_03448 CCNA_03449     FALSE 0.098 40.000 0.000 NA   NA
 5850742 5850743 CCNA_03450 CCNA_03451     FALSE 0.004 260.000 0.000 NA   NA
 5850744 5850745 CCNA_03452 CCNA_03453     FALSE 0.207 19.000 0.000 NA   NA
 5850746 5850747 CCNA_03454 CCNA_03455     TRUE 0.771 0.000 0.013 1.000   NA
 5850747 5850748 CCNA_03455 CCNA_03456     FALSE 0.145 77.000 0.000 1.000 N NA
 5850749 5850750 CCNA_03457 CCNA_03458     TRUE 0.862 -102.000 0.500 NA   NA
 5850752 5850753 CCNA_03460 CCNA_03461     TRUE 0.978 -3.000 0.750 NA   NA
 5850753 5850754 CCNA_03461 CCNA_03462     FALSE 0.099 132.000 0.005 NA   NA
 5850754 5850755 CCNA_03462 CCNA_03463     TRUE 0.993 -3.000 0.316 0.001 Y NA
 5850755 5850756 CCNA_03463 CCNA_03464     TRUE 0.840 119.000 0.130 1.000 Y NA
 5850756 5850757 CCNA_03464 CCNA_03465     TRUE 0.967 20.000 0.202 0.001 Y NA
 5850761 10784575 CCNA_03469 CCNA_04011     TRUE 0.679 -3.000 0.009 NA   NA
 5850762 5850763 CCNA_03470 CCNA_03471     FALSE 0.065 58.000 0.000 NA   NA
 5850763 5850764 CCNA_03471 CCNA_03472     FALSE 0.060 75.000 0.000 NA   NA
 5850765 5850766 CCNA_03473 CCNA_03474 doc phd TRUE 0.894 -3.000 0.074 NA   NA
 5850767 5850768 CCNA_03475 CCNA_03476     TRUE 0.925 -3.000 0.104 1.000   NA
 5850772 5850773 CCNA_03480 CCNA_03481     FALSE 0.443 32.000 0.021 1.000 N NA
 5850774 5850775 CCNA_03482 CCNA_03483     TRUE 0.992 -3.000 0.303 0.065 Y NA
 5850775 5850776 CCNA_03483 CCNA_03484     FALSE 0.172 104.000 0.004 NA N NA
 5850776 5850777 CCNA_03484 CCNA_03485     TRUE 0.989 2.000 0.313 NA Y NA
 5850777 5850778 CCNA_03485 CCNA_03486     FALSE 0.276 35.000 0.017 NA   NA
 5850780 5850781 CCNA_03488 CCNA_03489     FALSE 0.076 113.000 0.000 NA   NA
 5850781 5850782 CCNA_03489 CCNA_03490     TRUE 0.613 69.000 0.333 NA   NA
 5850782 5850783 CCNA_03490 CCNA_03491     FALSE 0.434 53.000 0.094 NA   NA
 5850783 5850784 CCNA_03491 CCNA_03492     FALSE 0.129 65.000 0.004 1.000   NA
 5850784 5850785 CCNA_03492 CCNA_03493     FALSE 0.121 111.000 0.000 1.000   NA
 5850785 5850786 CCNA_03493 CCNA_03494     TRUE 0.712 10.000 0.021 1.000   NA
 5850786 5850787 CCNA_03494 CCNA_03495     TRUE 0.652 72.000 0.375 1.000   NA
 5850787 5850788 CCNA_03495 CCNA_03496     FALSE 0.152 98.000 0.011 NA   NA
 5850789 5850790 CCNA_03497 CCNA_03498     TRUE 0.960 -3.000 0.333 NA   NA
 5850790 5850791 CCNA_03498 CCNA_03499     TRUE 0.640 44.000 0.222 NA   NA
 5850792 5850793 CCNA_03500 CCNA_03501     FALSE 0.465 24.000 0.018 NA N NA
 5850793 5850794 CCNA_03501 CCNA_03502     TRUE 0.518 -69.000 0.023 NA N NA
 5850794 5850795 CCNA_03502 CCNA_03503     TRUE 0.600 34.000 0.107 NA   NA
 5850799 5850800 CCNA_03507 CCNA_03508     TRUE 0.777 35.000 0.293 1.000 N NA
 5850800 5850801 CCNA_03508 CCNA_03509     TRUE 0.928 18.000 0.674 1.000   NA
 5850801 5850802 CCNA_03509 CCNA_03510     TRUE 0.557 47.000 0.129 1.000   NA
 5850802 5850803 CCNA_03510 CCNA_03511   surF1 TRUE 0.668 0.000 0.008 NA   NA
 5850803 5850804 CCNA_03511 CCNA_03512 surF1   TRUE 0.841 -7.000 0.100 NA   NA
 5850804 5850805 CCNA_03512 CCNA_03513   coxC FALSE 0.224 174.000 0.122 1.000   NA
 5850805 5850806 CCNA_03513 CCNA_03514 coxC ctaG TRUE 0.735 70.000 0.536 1.000 N NA
 5850806 5850807 CCNA_03514 CCNA_03515 ctaG   FALSE 0.430 -22.000 0.010 NA   NA
 5850807 5850808 CCNA_03515 CCNA_03516   coxE TRUE 0.649 -3.000 0.007 NA   NA
 5850808 5850809 CCNA_03516 CCNA_03517 coxE coxA TRUE 0.691 108.000 0.153 0.033 N NA
 5850809 5850810 CCNA_03517 CCNA_03518 coxA coxB TRUE 0.978 27.000 0.741 0.003 Y NA
 5850811 5850812 CCNA_03519 CCNA_03520     TRUE 0.968 -3.000 0.478 NA   NA
 5850812 5850813 CCNA_03520 CCNA_03521     TRUE 0.968 -3.000 0.474 NA   NA
 5850813 5850814 CCNA_03521 CCNA_03522     FALSE 0.050 162.000 0.005 NA   NA
 5850817 5850818 CCNA_03524 CCNA_03525     FALSE 0.362 10.000 0.000 NA   NA
 5850820 5850821 CCNA_03527 CCNA_03528     FALSE 0.342 143.000 0.087 NA   NA
 5850823 5850824 CCNA_03530 CCNA_03531     FALSE 0.210 65.000 0.027 NA   NA
 5850827 5850828 CCNA_03534 CCNA_03535     FALSE 0.077 170.000 0.004 1.000 N NA
 5850828 5850829 CCNA_03535 CCNA_03536     TRUE 0.691 25.000 0.091 1.000   NA
 5850829 5850830 CCNA_03536 CCNA_03537     TRUE 0.774 45.000 0.600 NA   NA
 5850832 5850833 CCNA_03539 CCNA_03540     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5850833 5850834 CCNA_03540 CCNA_03541     TRUE 0.642 21.000 0.054 1.000   NA
 5850834 5850835 CCNA_03541 CCNA_03542     FALSE 0.262 -19.000 0.000 NA   NA
 5850835 5850836 CCNA_03542 CCNA_03543     FALSE 0.001 598.000 0.000 NA   NA
 5850836 5850837 CCNA_03543 CCNA_03544     TRUE 0.844 -34.000 0.170 1.000 N NA
 5850837 5850838 CCNA_03544 CCNA_03545     TRUE 0.922 7.000 0.221 NA   NA
 5850838 5850839 CCNA_03545 CCNA_03546     TRUE 0.662 48.000 0.307 NA   NA
 5850839 5850840 CCNA_03546 CCNA_03547     TRUE 0.707 17.000 0.067 NA   NA
 5850840 5850841 CCNA_03547 CCNA_03548     TRUE 0.801 114.000 0.408 0.026 N NA
 5850842 5850843 CCNA_03549 CCNA_03550     FALSE 0.001 370.000 0.000 NA   NA
 5850844 5850845 CCNA_03551 CCNA_03552     FALSE 0.101 39.000 0.000 NA   NA
 5850845 5850846 CCNA_03552 CCNA_03553     TRUE 0.739 23.000 0.109 1.000   NA
 5850846 5850847 CCNA_03553 CCNA_03554     TRUE 0.770 1.000 0.012 NA N NA
 5850847 5850848 CCNA_03554 CCNA_03555     TRUE 0.926 38.000 0.375 NA Y NA
 5850849 5850850 CCNA_03556 CCNA_03557     FALSE 0.336 98.000 0.053 NA   NA
 5850850 5850851 CCNA_03557 CCNA_03558     FALSE 0.023 178.000 0.003 NA   NA
 5850851 5850852 CCNA_03558 CCNA_03559     TRUE 0.576 0.000 0.003 NA   NA
 5850852 5850853 CCNA_03559 CCNA_03560     TRUE 0.574 0.000 0.003 NA   NA
 5850853 5850854 CCNA_03560 CCNA_03561     TRUE 0.956 48.000 0.724 0.003 Y NA
 5850854 5850855 CCNA_03561 CCNA_03562     TRUE 0.972 35.000 0.846 0.003 Y NA
 5850855 5850856 CCNA_03562 CCNA_03563     TRUE 0.955 53.000 0.864 0.003 Y NA
 5850856 5850857 CCNA_03563 CCNA_03564     FALSE 0.051 154.000 0.003 NA   NA
 5850857 5850858 CCNA_03564 CCNA_03565     FALSE 0.426 145.000 0.154 NA   NA
 5850859 5850860 CCNA_03566 CCNA_03567     FALSE 0.065 87.000 0.000 NA   NA
 5850860 5850861 CCNA_03567 CCNA_03568     FALSE 0.379 -22.000 0.007 NA   NA
 5850861 5850862 CCNA_03568 CCNA_03569     TRUE 0.950 1.000 0.257 NA   NA
 5850862 5850863 CCNA_03569 CCNA_03570     TRUE 0.907 14.000 0.338 NA   NA
 5850863 5850864 CCNA_03570 CCNA_03571     TRUE 0.669 2.000 0.010 NA   NA
 5850864 5850865 CCNA_03571 CCNA_03572     FALSE 0.164 25.000 0.000 NA   NA
 5850866 5850867 CCNA_03573 CCNA_03574     FALSE 0.173 118.000 0.000 1.000 N NA
 5850869 5850870 CCNA_03576 CCNA_03577     FALSE 0.062 64.000 0.000 NA   NA
 5850871 5850872 CCNA_03578 CCNA_03579     FALSE 0.158 45.000 0.008 NA   NA
 5850875 5850876 CCNA_03582 CCNA_03583     TRUE 0.855 -3.000 0.048 NA   NA
 5850877 5850878 CCNA_03584 CCNA_03585 chpT   FALSE 0.279 80.000 0.045 NA   NA
 5850878 5850879 CCNA_03585 CCNA_03586     TRUE 0.988 -3.000 0.208 1.000 Y NA
 5850880 5850881 CCNA_03587 CCNA_03588     TRUE 0.634 90.000 0.188 0.072   NA
 5850881 5850882 CCNA_03588 CCNA_03589   sigT TRUE 0.966 -3.000 0.312 1.000 N NA
 5850882 5850883 CCNA_03589 CCNA_03590 sigT   FALSE 0.460 3.000 0.000 NA   NA
 5850885 5850886 CCNA_03592 CCNA_03593     TRUE 0.611 65.000 0.286 1.000   NA
 5850888 5850889 CCNA_03595 CCNA_03596 ubiE   FALSE 0.142 43.000 0.000 1.000   NA
 5850889 5850890 CCNA_03596 CCNA_03597     TRUE 0.832 -3.000 0.028 1.000   NA
 5850891 5850892 CCNA_03598 CCNA_03599     FALSE 0.005 304.000 0.000 1.000 N NA
 5850892 5850893 CCNA_03599 CCNA_03600     FALSE 0.046 165.000 0.000 1.000   NA
 5850893 5850894 CCNA_03600 CCNA_03601     FALSE 0.395 119.000 0.024 0.033   NA
 5850894 5850895 CCNA_03601 CCNA_03602     TRUE 0.843 17.000 0.182 1.000   NA
 5850895 5850896 CCNA_03602 CCNA_03603     FALSE 0.098 64.000 0.000 1.000   NA
 5850897 5850898 CCNA_03604 CCNA_03605     TRUE 0.875 23.000 0.500 NA   NA
 5850898 5850899 CCNA_03605 CCNA_03606     FALSE 0.158 26.000 0.000 NA   NA
 5850899 5850900 CCNA_03606 CCNA_03607     FALSE 0.243 16.000 0.000 NA   NA
 5850900 5850901 CCNA_03607 CCNA_03608     FALSE 0.075 115.000 0.000 NA   NA
 5850901 5850902 CCNA_03608 CCNA_03609     FALSE 0.193 20.000 0.000 NA   NA
 5850902 5850903 CCNA_03609 CCNA_03610     FALSE 0.006 258.000 0.000 1.000   NA
 5850903 5850904 CCNA_03610 CCNA_03611     TRUE 0.617 -3.000 0.000 1.000   NA
 5850904 5850905 CCNA_03611 CCNA_03612     TRUE 0.570 20.000 0.033 1.000   NA
 5850906 5850907 CCNA_03613 CCNA_03614     FALSE 0.063 60.000 0.000 NA   NA
 5850907 5850908 CCNA_03614 CCNA_03615     TRUE 0.697 23.000 0.100 NA   NA
 5850908 5850909 CCNA_03615 CCNA_03616     TRUE 0.507 70.000 0.150 1.000   NA
 5850909 5850910 CCNA_03616 CCNA_03617     FALSE 0.460 3.000 0.000 NA   NA
 5850910 5850911 CCNA_03617 CCNA_03618     TRUE 0.504 0.000 0.000 NA   NA
 5850911 5850912 CCNA_03618 CCNA_03619     FALSE 0.018 201.000 0.000 1.000   NA
 5850913 5850914 CCNA_03620 CCNA_03621     FALSE 0.064 59.000 0.000 NA   NA
 5850915 5850916 CCNA_03622 CCNA_03623     TRUE 0.957 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5850918 5850919 CCNA_03625 CCNA_R0079     FALSE 0.037 156.000 0.000 NA   NA
 5850920 5850921 CCNA_03626 CCNA_03627     TRUE 0.989 0.000 0.239 1.000 Y NA
 5850921 5850922 CCNA_03627 CCNA_03628     TRUE 0.878 -28.000 0.097 0.001 N NA
 5850924 5850925 CCNA_03629 CCNA_03630     TRUE 0.854 -22.000 0.208 NA   NA
 5850926 5850927 CCNA_03631 CCNA_03632     FALSE 0.079 48.000 0.000 NA   NA
 5850927 5850928 CCNA_03632 CCNA_03633     FALSE 0.002 343.000 0.000 NA   NA
 5850929 5850930 CCNA_03634 CCNA_03635     FALSE 0.077 110.000 0.000 NA   NA
 5850930 5850931 CCNA_03635 CCNA_03636     FALSE 0.008 212.000 0.000 NA   NA
 5850933 5850934 CCNA_R0082 CCNA_R0083     FALSE 0.062 64.000 0.000 NA   NA
 5850934 5850935 CCNA_R0083 CCNA_R0084     FALSE 0.072 99.000 0.000 NA   NA
 5850935 5850936 CCNA_R0084 CCNA_R0085     FALSE 0.002 296.000 0.000 NA   NA
 5850936 5850937 CCNA_R0085 CCNA_R0086     FALSE 0.061 68.000 0.000 NA   NA
 5850937 5850938 CCNA_R0086 CCNA_R0087     FALSE 0.018 176.000 0.000 NA   NA
 5850938 5850939 CCNA_R0087 CCNA_03638     FALSE 0.001 463.000 0.000 NA   NA
 5850939 5850940 CCNA_03638 CCNA_03639     FALSE 0.021 173.000 0.000 NA   NA
 5850940 5850941 CCNA_03639 CCNA_03640     TRUE 0.758 44.000 0.273 0.037   NA
 5850941 5850942 CCNA_03640 CCNA_03641     FALSE 0.261 90.000 0.004 0.037   NA
 5850942 5850943 CCNA_03641 CCNA_03642     TRUE 0.993 8.000 0.604 0.001 Y NA
 5850943 5850944 CCNA_03642 CCNA_03643     TRUE 0.996 -3.000 0.705 0.001 Y NA
 5850944 5850945 CCNA_03643 CCNA_03644   sdhC TRUE 0.976 -33.000 0.291 0.001 Y NA
 5850945 5850946 CCNA_03644 CCNA_03645 sdhC   FALSE 0.036 172.000 0.000 1.000   NA
 5850946 5850947 CCNA_03645 CCNA_03646     TRUE 0.717 10.000 0.032 NA   NA
 5850948 5850949 CCNA_03647 CCNA_03648     TRUE 0.893 -3.000 0.061 1.000   NA
 5850949 5850950 CCNA_03648 CCNA_03649     FALSE 0.444 -16.000 0.009 NA   NA
 5850950 5850951 CCNA_03649 CCNA_03650     TRUE 0.974 -3.000 0.642 NA   NA
 5850951 5850952 CCNA_03650 CCNA_03651     TRUE 0.949 -3.000 0.196 NA N NA
 5850952 5850953 CCNA_03651 CCNA_03652     TRUE 0.926 131.000 0.863 NA Y NA
 5850953 5850954 CCNA_03652 CCNA_03653     TRUE 0.562 73.000 0.173 1.000 N NA
 5850954 5850955 CCNA_03653 CCNA_03654     FALSE 0.207 19.000 0.000 NA   NA
 5850956 5850957 CCNA_03655 CCNA_03656     TRUE 0.951 10.000 0.383 1.000 N NA
 5850957 5850958 CCNA_03656 CCNA_03657     TRUE 0.914 13.000 0.232 1.000 N NA
 5850958 5850959 CCNA_03657 CCNA_03658     TRUE 0.986 13.000 0.344 0.001 Y NA
 5850959 5850960 CCNA_03658 CCNA_03659     TRUE 0.989 11.000 0.375 0.001 Y NA
 5850960 5850961 CCNA_03659 CCNA_03660     TRUE 0.638 50.000 0.003 NA Y NA
 5850961 5850962 CCNA_03660 CCNA_03661     FALSE 0.071 98.000 0.000 NA   NA
 5850962 5850963 CCNA_03661 CCNA_03662     FALSE 0.002 298.000 0.000 NA   NA
 5850963 5850964 CCNA_03662 CCNA_03663     FALSE 0.063 61.000 0.000 NA   NA
 5850965 5850966 CCNA_03664 CCNA_03665     FALSE 0.087 51.000 0.002 NA   NA
 5850966 5850967 CCNA_03665 CCNA_03666     TRUE 0.946 -3.000 0.214 NA   NA
 5850967 5850968 CCNA_03666 CCNA_03667     TRUE 0.801 16.000 0.123 NA   NA
 5850972 5850973 CCNA_03670 CCNA_03671     TRUE 0.884 -3.000 0.054 1.000   NA
 5850974 5850975 CCNA_03672 CCNA_03673     FALSE 0.007 222.000 0.000 NA   NA
 5850975 5850976 CCNA_03673 CCNA_03674     TRUE 0.978 -3.000 0.750 NA   NA
 5850977 5850978 CCNA_03675 CCNA_03676     TRUE 0.980 -3.000 0.667 1.000 N NA
 5850981 5850982 CCNA_03679 CCNA_03680     TRUE 0.825 -3.000 0.022 NA N NA
 5850982 5850983 CCNA_03680 CCNA_03681     TRUE 0.917 14.000 0.300 1.000 N NA
 5850984 5850985 CCNA_03682 CCNA_03683     TRUE 0.742 40.000 0.267 1.000 N NA
 5850985 5850986 CCNA_03683 CCNA_03684     TRUE 0.843 1.000 0.022 1.000 N NA
 5850987 5850988 CCNA_03685 CCNA_03686     TRUE 0.865 26.000 0.473 1.000   NA
 5850988 5850989 CCNA_03686 CCNA_03687     FALSE 0.095 74.000 0.000 1.000   NA
 5850989 5850990 CCNA_03687 CCNA_03688     TRUE 0.835 19.000 0.158 1.000 N NA
 5850992 5850993 CCNA_03690 CCNA_03691     FALSE 0.289 167.000 0.100 1.000 N NA
 5850996 5850997 CCNA_03694 CCNA_03695     TRUE 0.598 114.000 0.190 1.000   NA
 5850997 5850998 CCNA_03695 CCNA_03696     TRUE 0.709 113.000 0.200 0.056 N NA
 5850998 5850999 CCNA_03696 CCNA_03697     TRUE 0.810 34.000 0.500 NA   NA
 5850999 5851000 CCNA_03697 CCNA_03698     TRUE 0.515 -15.000 0.014 NA   NA
 5851000 5851001 CCNA_03698 CCNA_03699     FALSE 0.065 88.000 0.000 NA   NA
 5851002 5851003 CCNA_03700 CCNA_03701     FALSE 0.227 82.000 0.012 1.000 N NA
 5851003 5851004 CCNA_03701 CCNA_03702     FALSE 0.224 203.000 0.292 1.000 N NA
 5851004 5851005 CCNA_03702 CCNA_03703     TRUE 0.553 149.000 0.281 1.000 N NA
 5851005 5851006 CCNA_03703 CCNA_03704     TRUE 0.647 115.000 0.209 1.000 N NA
 5851007 5851008 CCNA_03705 CCNA_R0089     FALSE 0.008 216.000 0.000 NA   NA
 5851008 5851009 CCNA_R0089 CCNA_03706     FALSE 0.024 170.000 0.000 NA   NA
 5851009 5851010 CCNA_03706 CCNA_03707     TRUE 0.779 86.000 0.955 NA   NA
 5851011 5851012 CCNA_03708 CCNA_03709     TRUE 0.878 15.000 0.000 NA Y NA
 5851012 5851013 CCNA_03709 CCNA_03710     FALSE 0.053 165.000 0.000 NA N NA
 5851013 5851014 CCNA_03710 CCNA_03711     TRUE 0.949 8.000 0.353 NA N NA
 5851014 5851015 CCNA_03711 CCNA_03712     FALSE 0.182 64.000 0.020 NA   NA
 5851015 5851016 CCNA_03712 CCNA_03713     TRUE 0.677 50.000 0.364 NA   NA
 5851016 5851017 CCNA_03713 CCNA_03714     FALSE 0.144 139.000 0.009 1.000   NA
 5851017 5851018 CCNA_03714 CCNA_03715     TRUE 0.955 9.000 0.543 NA   NA
 5851018 5851019 CCNA_03715 CCNA_03716     FALSE 0.486 59.000 0.144 NA   NA
 5851019 5851020 CCNA_03716 CCNA_03717     TRUE 0.799 -33.000 0.151 NA   NA
 5851020 5851021 CCNA_03717 CCNA_R0090     FALSE 0.037 156.000 0.000 NA   NA
 5851024 5851025 CCNA_03720 CCNA_03721     FALSE 0.066 90.000 0.000 NA   NA
 5851025 5851026 CCNA_03721 CCNA_03722     TRUE 0.894 127.000 0.188 0.001 Y NA
 5851028 5851029 CCNA_03724 CCNA_03725     FALSE 0.065 86.000 0.000 NA   NA
 5851032 5851033 CCNA_03728 CCNA_03729     FALSE 0.223 90.000 0.028 NA   NA
 5851033 5851034 CCNA_03729 CCNA_03730     FALSE 0.252 73.000 0.018 1.000 N NA
 5851034 5851035 CCNA_03730 CCNA_03731     TRUE 0.798 -3.000 0.009 1.000 N NA
 5851037 5851038 CCNA_03733 CCNA_03734     FALSE 0.255 95.000 0.014 1.000 N NA
 5851041 5851042 CCNA_03736 CCNA_03737     TRUE 0.748 -7.000 0.048 NA   NA
 5851042 5851043 CCNA_03737 CCNA_03738     FALSE 0.034 176.000 0.007 NA   NA
 5851044 5851045 CCNA_03739 CCNA_03740     TRUE 0.708 19.000 0.053 1.000 N NA
 5851045 5851046 CCNA_03740 CCNA_03741     FALSE 0.377 68.000 0.053 1.000 N NA
 5851048 5851049 CCNA_03743 CCNA_03744     FALSE 0.349 -84.000 0.000 1.000 N NA
 5851049 5851050 CCNA_03744 CCNA_03745     FALSE 0.307 74.000 0.034 1.000 N NA
 5851053 5851054 CCNA_03748 CCNA_03749     FALSE 0.299 122.000 0.029 NA N NA
 5851054 5851055 CCNA_03749 CCNA_03750     FALSE 0.349 25.000 0.006 NA N NA
 5851058 5851059 CCNA_03753 CCNA_03754     TRUE 0.890 -19.000 0.213 1.000 N NA
 5851059 5851060 CCNA_03754 CCNA_03755     FALSE 0.228 108.000 0.006 1.000 N NA
 5851060 5851061 CCNA_03755 CCNA_03756     TRUE 0.771 3.000 0.009 1.000 N NA
 5851061 5851062 CCNA_03756 CCNA_03757     FALSE 0.358 32.000 0.009 1.000 N NA
 5851065 5851066 CCNA_03760 CCNA_03761     TRUE 0.995 -3.000 0.845 NA Y NA
 5851066 5851067 CCNA_03761 CCNA_03762     FALSE 0.008 216.000 0.000 NA   NA
 5851070 5851071 CCNA_03765 CCNA_03766     FALSE 0.372 24.000 0.002 1.000 N NA
 5851071 5851072 CCNA_03766 CCNA_03767     TRUE 0.916 57.000 0.342 0.010 Y NA
 5851072 5851073 CCNA_03767 CCNA_03768   srp TRUE 0.852 27.000 0.361 1.000 N NA
 5851073 5851074 CCNA_03768 CCNA_03769 srp   FALSE 0.002 342.000 0.000 NA   NA
 5851074 5851075 CCNA_03769 CCNA_03770     FALSE 0.066 57.000 0.000 NA   NA
 5851076 5851077 CCNA_03771 CCNA_03772     TRUE 0.673 -7.000 0.010 1.000 N NA
 5851078 5851079 CCNA_03773 CCNA_03774     FALSE 0.366 -130.000 0.018 NA   NA
 5851081 5851082 CCNA_03776 CCNA_03777     TRUE 0.629 14.000 0.012 1.000 N NA
 5851085 5851086 CCNA_R0088 CCNA_R0092     FALSE 0.075 115.000 0.000 NA   NA
 5851087 5851088 CCNA_03780 CCNA_03781     FALSE 0.141 162.000 0.038 NA   NA
 5851089 5851090 CCNA_03782 CCNA_03783     TRUE 0.995 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 5851091 5851092 CCNA_03784 CCNA_03785     FALSE 0.060 75.000 0.000 NA   NA
 10784576 5851093 CCNA_04010 CCNA_03786     FALSE 0.155 101.000 0.010 NA   NA
 5851093 5851094 CCNA_03786 CCNA_03787     TRUE 0.973 -3.000 0.501 1.000   NA
 5851094 5851095 CCNA_03787 CCNA_03788     TRUE 0.777 -3.000 0.015 1.000   NA
 5851098 5851099 CCNA_03791 CCNA_03792     FALSE 0.323 101.000 0.024 1.000 N NA
 5851099 5851100 CCNA_03792 CCNA_03793     TRUE 0.875 4.000 0.050 1.000 N NA
 5851101 5851102 CCNA_03794 CCNA_03795     FALSE 0.013 191.000 0.000 NA   NA
 5851102 5851103 CCNA_03795 CCNA_03796     FALSE 0.049 289.000 0.000 NA Y NA
 5851104 5851105 CCNA_03797 CCNA_03798     TRUE 0.824 -3.000 0.004 0.055   NA
 5851105 5851106 CCNA_03798 CCNA_03799     TRUE 0.824 -3.000 0.004 0.055   NA
 5851106 5851107 CCNA_03799 CCNA_03800     FALSE 0.276 -87.000 0.002 1.000   NA
 5851108 5851109 CCNA_03801 CCNA_03802     TRUE 0.981 1.000 0.034 0.001 Y NA
 5851109 5851110 CCNA_03802 CCNA_03803     FALSE 0.113 131.000 0.000 NA N NA
 5851111 5851112 CCNA_03804 CCNA_03805     TRUE 0.552 -31.000 0.029 NA   NA
 5851113 5851114 CCNA_03806 CCNA_03807     TRUE 0.822 -3.000 0.021 NA N NA
 5851114 5851115 CCNA_03807 CCNA_03808     FALSE 0.256 31.000 0.010 NA   NA
 5851115 5851116 CCNA_03808 CCNA_03809     TRUE 0.970 2.000 0.562 NA   NA
 5851116 5851117 CCNA_03809 CCNA_03810     TRUE 0.986 -3.000 0.178 NA Y NA
 5851119 5851120 CCNA_03812 CCNA_03813   creS FALSE 0.040 153.000 0.000 NA   NA
 5851121 5851122 CCNA_03814 CCNA_03815     FALSE 0.063 60.000 0.000 NA   NA
 5851122 5851123 CCNA_03815 CCNA_03816     FALSE 0.061 66.000 0.000 NA   NA
 5851126 5851127 CCNA_03819 CCNA_03820 ftsK   FALSE 0.208 124.000 0.005 1.000 N NA
 5851127 5851128 CCNA_03820 CCNA_03821     FALSE 0.055 241.000 0.068 1.000 N NA
 5851130 5851131 CCNA_03823 CCNA_03824   ubiB TRUE 0.909 5.000 0.115 1.000   NA
 5851132 5851133 CCNA_03825 CCNA_03826     FALSE 0.495 -3.000 0.000 NA   NA
 5851134 5851135 CCNA_03827 CCNA_03828     TRUE 0.595 60.000 0.201 1.000 N NA
 5851137 5851138 CCNA_03830 CCNA_03831     TRUE 0.724 15.000 0.052 1.000   NA
 5851138 5851139 CCNA_03831 CCNA_03832     TRUE 0.906 17.000 0.429 1.000   NA
 5851140 5851141 CCNA_03833 CCNA_03834     FALSE 0.195 45.000 0.000 1.000 N NA
 5851141 5851142 CCNA_03834 CCNA_03835     TRUE 0.536 13.000 0.000 1.000 N NA
 5851142 5851143 CCNA_03835 CCNA_03836     TRUE 0.894 71.000 0.451 1.000 Y NA
 5851143 5851144 CCNA_03836 CCNA_03837     FALSE 0.265 71.000 0.043 NA   NA
 5851145 5851146 CCNA_03838 CCNA_03839     FALSE 0.164 96.000 0.000 1.000 N NA
 5851147 5851148 CCNA_03840 CCNA_03841     FALSE 0.071 52.000 0.000 NA   NA
 5851148 5851149 CCNA_03841 CCNA_03842     FALSE 0.171 55.000 0.015 NA   NA
 5851150 5851151 CCNA_03843 CCNA_03844     TRUE 0.995 0.000 0.752 1.000 Y NA
 5851152 5851153 CCNA_03845 CCNA_03846     TRUE 0.542 47.000 0.142 NA   NA
 5851156 5851157 CCNA_03849 CCNA_03850     TRUE 0.675 8.000 0.004 1.000 N NA
 5851157 5851158 CCNA_03850 CCNA_03851     TRUE 0.964 13.000 0.049 0.003 Y NA
 5851158 5851159 CCNA_03851 CCNA_03852     TRUE 0.969 -12.000 0.070 0.003 Y NA
 5851159 5851160 CCNA_03852 CCNA_03853     TRUE 0.995 0.000 0.433 0.003 Y NA
 5851160 5851161 CCNA_03853 CCNA_03854     TRUE 0.988 -3.000 0.105 0.003 Y NA
 5851162 5851163 CCNA_03855 CCNA_03856     TRUE 0.956 2.000 0.332 NA   NA
 5851163 5851164 CCNA_03856 CCNA_03857     TRUE 0.964 0.000 0.324 1.000   NA
 5851171 5851172 CCNA_03864 CCNA_03865     FALSE 0.265 140.000 0.051 NA   NA
 5851172 5851173 CCNA_03865 CCNA_03866     TRUE 0.827 12.000 0.090 NA   NA
 5851173 5851174 CCNA_03866 CCNA_03867     TRUE 0.878 6.000 0.097 NA   NA
 5851175 5851176 CCNA_03868 CCNA_03869 parB parA TRUE 0.868 39.000 0.827 1.000 N NA
 5851176 5851177 CCNA_03869 CCNA_03870 parA gidB TRUE 0.934 -10.000 0.339 1.000 N NA
 5851177 5851178 CCNA_03870 CCNA_03871 gidB gidA TRUE 0.945 -10.000 0.466 1.000 N NA
 5851178 5851179 CCNA_03871 CCNA_03872 gidA trmE TRUE 0.659 105.000 0.266 1.000   NA
 5851179 5851180 CCNA_03872 CCNA_03873 trmE   TRUE 0.545 -25.000 0.024 NA   NA
 5851181 5851182 CCNA_03874 CCNA_03875   qor TRUE 0.971 0.000 0.364 1.000 N NA
 5851183 5851184 CCNA_03876 CCNA_03877 rho   FALSE 0.015 259.000 0.024 NA   NA
 5851184 5851185 CCNA_03877 CCNA_03878   hemH TRUE 0.575 -51.000 0.043 NA   NA
 5851185 5851186 CCNA_03878 CCNA_03879 hemH hemE TRUE 0.985 -3.000 0.131 1.000 Y NA