MicrobesOnline Operon Predictions for Pectobacterium carotovorum WPP14

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5226482 5226483         FALSE 0.438 70.000 0.106 NA   NA
 5226483 5226484       dsbA TRUE 0.691 25.000 0.111 NA   NA
 5226484 5226485     dsbA polA FALSE 0.007 380.000 0.000 1.000   NA
 5226487 5226488       hemN FALSE 0.050 322.000 0.107 NA   NA
 5226489 5226490     glnG glnL TRUE 0.995 8.000 0.587 0.093 Y NA
 5226490 5226491     glnL glnA FALSE 0.014 292.000 0.053 1.000 N NA
 5226492 5226493     typA   FALSE 0.082 127.000 0.007 1.000   NA
 5226493 5226494       dtd TRUE 0.641 -3.000 0.010 1.000   NA
 5226494 5226495     dtd   FALSE 0.203 139.000 0.065 1.000   NA
 5226496 5226497         FALSE 0.523 140.000 0.257 NA   NA
 5226497 5226498       recG FALSE 0.006 166.000 0.009 1.000 N NA
 5226498 5226499     recG trmH TRUE 0.792 0.000 0.076 1.000 N NA
 5226499 5226500     trmH spoT TRUE 0.780 6.000 0.095 1.000 N NA
 5226500 5226501     spoT rpoZ TRUE 0.957 19.000 0.291 1.000 Y NA
 5226501 5226502     rpoZ gmk TRUE 0.809 54.000 0.471 1.000 N NA
 5226503 5226504         FALSE 0.017 256.000 0.000 1.000   NA
 5226504 5226505       tRNA-Pro FALSE 0.076 132.000 0.000 NA   NA
 5226505 5226506     tRNA-Pro   FALSE 0.006 391.000 0.000 NA   NA
 5226507 5226508         TRUE 0.863 -21.000 0.182 NA   NA
 5226508 5226509         FALSE 0.042 176.000 0.000 NA   NA
 5226509 5226510         FALSE 0.126 68.000 0.000 NA   NA
 5226510 5226511         FALSE 0.070 138.000 0.000 NA   NA
 5226514 5226515     uspA gdhA FALSE 0.001 293.000 0.000 1.000 N NA
 5226515 5226516     gdhA   FALSE 0.279 175.000 0.000 1.000 Y NA
 5226517 5226518         FALSE 0.038 185.000 0.009 NA   NA
 5226518 5226519       prlC TRUE 0.894 -3.000 0.098 NA   NA
 5226520 5226521         FALSE 0.005 182.000 0.000 1.000 N NA
 5226521 5226522         FALSE 0.155 -3.000 0.000 NA N NA
 5226522 5226523         FALSE 0.031 204.000 0.000 NA   NA
 5226526 5226527         TRUE 0.626 0.000 0.000 NA   NA
 5226528 5226529         FALSE 0.010 123.000 0.000 NA N NA
 5226529 5226530         FALSE 0.012 282.000 0.000 NA   NA
 5226530 5226531       gor FALSE 0.311 129.000 0.100 NA   NA
 5226532 5226533         TRUE 0.986 -3.000 0.286 NA Y NA
 5226537 5226538         FALSE 0.005 407.000 0.000 NA   NA
 5226538 5226539         TRUE 0.970 -3.000 0.333 NA   NA
 5226539 5226540         TRUE 0.986 2.000 0.667 NA   NA
 5226540 5226541         TRUE 0.992 -3.000 0.955 1.000   NA
 5226541 5226542         TRUE 0.998 -3.000 0.864 0.086 Y NA
 5226542 5226543         TRUE 0.990 28.000 0.792 0.086 Y NA
 5226543 5226544       tkrA FALSE 0.001 304.000 0.000 1.000 N NA
 5226546 5226547       tag FALSE 0.459 -30.000 0.028 1.000   NA
 5226548 5226549       glyQ FALSE 0.078 128.000 0.005 1.000   NA
 5226549 5226550     glyQ glyS TRUE 0.998 10.000 0.651 0.001 Y NA
 5226550 5226551     glyS   FALSE 0.089 114.000 0.000 NA   NA
 5226551 5226552         FALSE 0.223 -73.000 0.000 NA   NA
 5226552 5226553       mtlA FALSE 0.005 437.000 0.000 NA   NA
 5226553 5226554     mtlA mtlD TRUE 0.873 62.000 0.292 1.000 Y NA
 5226554 5226555     mtlD mtlR TRUE 0.795 25.000 0.230 NA N NA
 5226555 5226556     mtlR   FALSE 0.086 214.000 0.067 NA   NA
 5226557 5226558       sodA FALSE 0.001 300.000 0.000 1.000 N NA
 5226558 5226559     sodA fdhD FALSE 0.006 236.000 0.029 1.000 N NA
 5226560 5226561     aldB   FALSE 0.029 213.000 0.000 1.000   NA
 5226562 5226563     xylB xylA TRUE 0.589 63.000 0.020 1.000 Y NA
 5226564 5226565     xylF xylG TRUE 0.884 117.000 0.518 NA Y NA
 5226565 5226566     xylG xylH TRUE 0.977 -22.000 0.469 1.000 Y NA
 5226566 5226567     xylH xylR FALSE 0.298 137.000 0.146 1.000 N NA
 5226569 5226570     argG expI FALSE 0.002 270.000 0.000 1.000 N NA
 5226571 5226572         FALSE 0.152 53.000 0.000 NA   NA
 5226572 5226573       pmeB FALSE 0.007 350.000 0.000 NA   NA
 5226573 5226574     pmeB   FALSE 0.045 -37.000 0.000 1.000 N NA
 5226577 5226578         TRUE 0.929 -3.000 0.200 NA N NA
 5226578 5226579         TRUE 0.889 -7.000 0.133 1.000   NA
 5226579 5226580         TRUE 0.984 -3.000 0.550 NA   NA
 5226580 5226581         TRUE 0.935 -3.000 0.162 NA   NA
 5226581 5226582         TRUE 0.923 5.000 0.179 NA   NA
 5226582 5226583         TRUE 0.919 -13.000 0.077 NA Y NA
 5226583 5226584         TRUE 0.996 -3.000 0.375 0.033 Y NA
 5226584 5226585         FALSE 0.137 61.000 0.000 NA   NA
 5226585 5226586       aldA FALSE 0.011 290.000 0.000 NA   NA
 5226586 5226587     aldA lctD FALSE 0.222 200.000 0.000 1.000 Y NA
 5226587 5226588     lctD   FALSE 0.094 107.000 0.000 NA   NA
 5226588 5226589         FALSE 0.222 34.000 0.000 NA   NA
 5226590 5226591         FALSE 0.178 43.000 0.000 NA   NA
 5226593 5226594         FALSE 0.013 279.000 0.000 NA   NA
 5226594 5226595         FALSE 0.008 343.000 0.000 1.000   NA
 5226595 5226596         FALSE 0.014 267.000 0.000 NA   NA
 5226596 5226597         FALSE 0.532 6.000 0.000 NA   NA
 5226597 5226598         FALSE 0.018 243.000 0.000 NA   NA
 5226600 5226601         FALSE 0.087 99.000 0.003 NA   NA
 5226602 5226603         TRUE 0.678 61.000 0.062 NA Y NA
 5226603 5226604         FALSE 0.141 272.000 0.051 NA Y NA
 5226604 5226605         TRUE 0.922 9.000 0.051 NA Y NA
 5226605 5226606         TRUE 0.977 9.000 0.082 0.085 Y NA
 5226606 5226607         TRUE 0.994 19.000 0.803 0.085 Y NA
 5226607 5226608         FALSE 0.303 89.000 0.067 1.000   NA
 5226608 5226609         TRUE 0.794 57.000 0.364 1.000   NA
 5226610 5226611     rph pyrE FALSE 0.098 207.000 0.108 1.000 N NA
 5226612 5226613     ttK dut FALSE 0.114 129.000 0.060 1.000 N NA
 5226613 5226614     dut dfp TRUE 0.833 -22.000 0.201 1.000 N NA
 5226615 5226616       rpmB FALSE 0.004 470.000 0.002 NA   NA
 5226616 5226617     rpmB rpmG TRUE 0.993 12.000 0.332 0.013 Y NA
 5226617 5226618     rpmG mutM FALSE 0.011 232.000 0.034 1.000 N NA
 5226618 5226619     mutM   FALSE 0.016 67.000 0.000 1.000 N NA
 5226620 5226621     KdtB kdtA FALSE 0.029 36.000 0.020 1.000 N NA
 5226621 5226622     kdtA kdtX FALSE 0.504 146.000 0.083 NA Y NA
 5226622 5226623     kdtX   FALSE 0.541 70.000 0.011 NA Y NA
 5226623 5226624         TRUE 0.738 62.000 0.105 NA Y NA
 5226624 5226625       waaC TRUE 0.922 12.000 0.072 1.000 Y NA
 5226625 5226626     waaC waaF TRUE 0.996 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 5226626 5226627     waaF rfaD TRUE 0.904 24.000 0.146 1.000 Y NA
 5226628 5226629     kbl tdh TRUE 0.961 11.000 0.547 1.000 N NA
 5226630 5226631         TRUE 0.875 3.000 0.088 1.000   NA
 5226632 5226633       secB FALSE 0.129 220.000 0.158 NA N NA
 5226633 5226634     secB gpsA TRUE 0.936 0.000 0.206 1.000 N NA
 5226634 5226635     gpsA cysE TRUE 0.589 143.000 0.429 1.000 N NA
 5226635 5226636     cysE pagP FALSE 0.011 307.000 0.000 1.000   NA
 5226636 5226637     pagP   FALSE 0.005 442.000 0.000 NA   NA
 5226638 5226639         FALSE 0.003 568.000 0.000 NA   NA
 5226641 5226642     metE   FALSE 0.000 538.000 0.000 1.000 N NA
 5226642 5226643         FALSE 0.102 688.000 0.000 0.014 Y NA
 5226645 5226646     udp   FALSE 0.021 150.000 0.030 1.000 N NA
 5226647 5226648     ppc   FALSE 0.002 244.000 0.000 1.000 N NA
 5226650 5226651       argE FALSE 0.024 43.000 0.020 1.000 N NA
 5226652 5226653     argC argB TRUE 0.958 38.000 0.097 0.002 Y NA
 5226653 5226654     argB argH TRUE 0.581 63.000 0.017 1.000 Y NA
 5226654 5226655     argH rmuC FALSE 0.023 225.000 0.000 NA   NA
 5226655 5226656     rmuC ubiE FALSE 0.173 132.000 0.047 NA   NA
 5226656 5226657     ubiE   TRUE 0.862 13.000 0.145 1.000   NA
 5226657 5226658       ubiB TRUE 0.979 -3.000 0.432 1.000   NA
 5226658 5226659     ubiB tatA FALSE 0.190 83.000 0.032 1.000   NA
 5226659 5226660     tatA tatB TRUE 0.917 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5226660 5226661     tatB tatC TRUE 0.915 4.000 0.000 NA Y NA
 5226661 5226662     tatC tatD FALSE 0.346 79.000 0.121 NA N NA
 5226662 5226663     tatD hemB FALSE 0.145 18.000 0.031 NA N NA
 5226665 5226666     ubiD fre TRUE 0.747 53.000 0.090 NA Y NA
 5226667 5226668     fadA fadB TRUE 0.994 -3.000 0.607 1.000 Y NA
 5226669 5226670     pepQ   TRUE 0.923 0.000 0.127 1.000   NA
 5226670 5226671       trkH TRUE 0.722 43.000 0.202 1.000   NA
 5226671 5226672     trkH hemG TRUE 0.909 22.000 0.455 1.000 N NA
 5226673 5226674     murB birA TRUE 0.935 -3.000 0.211 1.000 N NA
 5226675 5226676     coaA   FALSE 0.030 212.000 0.000 1.000   NA
 5226677 5226678     tRNA-Thr tRNA-Tyr FALSE 0.384 16.000 0.000 NA   NA
 5226678 5226679     tRNA-Tyr tRNA-Gly FALSE 0.077 131.000 0.000 NA   NA
 5226680 5226681     secE nusG TRUE 0.988 2.000 0.843 1.000 N NA
 5226681 5226682     nusG   TRUE 0.673 163.000 0.681 1.000 N NA
 5226682 5226683       rplA TRUE 0.972 134.000 0.838 0.017 Y NA
 5226683 5226684     rplA rplJ TRUE 0.583 318.000 0.302 0.017 Y NA
 5226684 5226685     rplJ rpoB FALSE 0.003 757.000 0.000 1.000   NA
 5226685 5226686     rpoB rpoC TRUE 0.973 107.000 0.851 0.001   NA
 5226686 5226687     rpoC shiA FALSE 0.005 172.000 0.000 1.000 N NA
 5226690 5226691     thiH thiG TRUE 0.996 -3.000 0.277 0.004 Y NA
 5226691 5226692     thiG thiS TRUE 0.962 2.000 0.087 1.000 Y NA
 5226692 5226693     thiS thiF TRUE 0.982 -19.000 0.548 1.000 Y NA
 5226693 5226694     thiF thiE TRUE 0.960 -19.000 0.242 1.000 Y NA
 5226694 5226695     thiE thiC TRUE 0.991 -3.000 0.063 0.004 Y NA
 5226695 5226696     thiC rsd FALSE 0.001 391.000 0.000 1.000 N NA
 5226697 5226698     nudC hemE FALSE 0.077 100.000 0.040 1.000 N NA
 5226698 5226699     hemE   FALSE 0.153 16.000 0.028 1.000 N NA
 5226699 5226700         FALSE 0.373 78.000 0.086 NA   NA
 5226700 5226701       hupA FALSE 0.404 205.000 0.355 NA   NA
 5226701 5226702     hupA   TRUE 0.966 5.000 0.375 NA   NA
 5226703 5226704     purD purH TRUE 0.953 18.000 0.238 1.000 Y NA
 5226705 5226706     aapP aapM TRUE 0.992 9.000 0.734 1.000 Y NA
 5226706 5226707     aapM aapQ TRUE 0.997 10.000 0.815 0.024 Y NA
 5226707 5226708     aapQ aapJ TRUE 0.987 -42.000 0.548 0.084 Y NA
 5226708 5226709     aapJ   FALSE 0.151 366.000 0.000 0.084 Y NA
 5226709 5226710         TRUE 0.603 356.000 0.594 0.084 Y NA
 5226711 5226712         FALSE 0.129 66.000 0.000 NA   NA
 5226712 5226713         FALSE 0.003 583.000 0.000 NA   NA
 5226713 5226714         TRUE 0.976 -3.000 0.400 NA   NA
 5226714 5226715         FALSE 0.003 829.000 0.000 NA   NA
 5226716 5226717     fis   TRUE 0.712 24.000 0.161 1.000 N NA
 5226717 5226718       cah FALSE 0.001 358.000 0.000 1.000 N NA
 5226718 5226719     cah prmA FALSE 0.005 176.000 0.009 1.000 N NA
 5226719 5226720     prmA   FALSE 0.302 18.000 0.041 1.000 N NA
 5226720 5226721         TRUE 0.735 -10.000 0.059 1.000   NA
 5226721 5226722         TRUE 0.971 -16.000 0.682 NA   NA
 5226724 5226725     accC accB TRUE 0.995 12.000 0.275 0.001 Y NA
 5226725 5226726     accB aroQ TRUE 0.813 25.000 0.254 1.000 N NA
 5226726 5226727     aroQ   FALSE 0.016 255.000 0.006 1.000   NA
 5226727 5226728         FALSE 0.191 -178.000 0.000 NA   NA
 5226728 5226729         TRUE 0.880 79.000 0.790 NA   NA
 5226729 5226730         FALSE 0.019 380.000 0.059 1.000   NA
 5226731 5226732       mreB FALSE 0.001 317.000 0.000 1.000 N NA
 5226732 5226733     mreB mreC FALSE 0.452 234.000 0.689 1.000 N NA
 5226733 5226734     mreC mreD TRUE 0.998 -3.000 0.550 0.003 Y NA
 5226734 5226735     mreD   TRUE 0.894 9.000 0.206 NA N NA
 5226735 5226736       cafA TRUE 0.946 -10.000 0.417 NA N NA
 5226736 5226737     cafA   TRUE 0.800 42.000 0.296 NA   NA
 5226737 5226738       tldD FALSE 0.309 57.000 0.050 NA   NA
 5226739 5226740         TRUE 0.967 -7.000 0.429 NA   NA
 5226740 5226741         FALSE 0.054 159.000 0.000 NA   NA
 5226742 5226743         TRUE 0.897 8.000 0.150 NA   NA
 5226743 5226744         TRUE 0.987 9.000 1.000 NA   NA
 5226744 5226745         FALSE 0.066 140.000 0.000 NA   NA
 5226748 5226749     rnk ptsO FALSE 0.011 173.000 0.026 1.000 N NA
 5226749 5226750     ptsO   TRUE 0.756 32.000 0.182 NA   NA
 5226750 5226751       ptsN FALSE 0.369 161.000 0.186 NA   NA
 5226751 5226752     ptsN   TRUE 0.974 10.000 0.728 NA N NA
 5226752 5226753       rpoN TRUE 0.951 24.000 0.820 NA N NA
 5226753 5226754     rpoN   TRUE 0.637 50.000 0.163 1.000   NA
 5226754 5226755         TRUE 0.979 4.000 0.543 NA   NA
 5226755 5226756         TRUE 0.955 -15.000 0.459 NA   NA
 5226756 5226757         TRUE 0.986 -3.000 0.617 NA   NA
 5226757 5226758         TRUE 0.952 20.000 0.598 1.000   NA
 5226758 5226759         FALSE 0.212 216.000 0.226 1.000 N NA
 5226760 5226761         TRUE 0.988 8.000 0.530 NA Y NA
 5226761 5226762       vpsC TRUE 0.979 5.000 0.562 NA   NA
 5226762 5226763     vpsC   TRUE 0.870 16.000 0.188 NA   NA
 5226763 5226764         TRUE 0.930 14.000 0.308 NA   NA
 5226764 5226765         TRUE 0.697 135.000 0.453 NA   NA
 5226765 5226766       murA TRUE 0.581 85.000 0.258 NA N NA
 5226767 5226768     degS degQ TRUE 0.934 138.000 0.262 0.002 Y NA
 5226768 5226769     degQ   FALSE 0.292 170.000 0.154 NA   NA
 5226770 5226771       rplM FALSE 0.016 239.000 0.003 NA   NA
 5226772 5226773         FALSE 0.165 47.000 0.000 NA   NA
 5226773 5226774         FALSE 0.003 214.000 0.000 1.000 N NA
 5226774 5226775         FALSE 0.035 111.000 0.030 1.000 N NA
 5226776 5226777         FALSE 0.001 340.000 0.000 1.000 N NA
 5226777 5226778       sspA FALSE 0.001 419.000 0.000 NA N NA
 5226778 5226779     sspA sspB TRUE 0.986 6.000 0.831 NA   NA
 5226782 5226783     gltD   TRUE 0.990 10.000 0.096 0.001 Y NA
 5226783 5226784         TRUE 0.703 -159.000 0.027 1.000 Y NA
 5226785 5226786       arcB FALSE 0.364 120.000 0.113 1.000   NA
 5226786 5226787     arcB elbB FALSE 0.000 470.000 0.000 NA N NA
 5226787 5226788     elbB mtgA FALSE 0.344 64.000 0.066 NA   NA
 5226788 5226789     mtgA   FALSE 0.139 66.000 0.009 1.000   NA
 5226790 5226791         TRUE 0.972 12.000 0.613 NA   NA
 5226791 5226792         FALSE 0.226 189.000 0.187 1.000 N NA
 5226792 5226793         FALSE 0.494 111.000 0.172 NA   NA
 5226796 5226797         TRUE 0.974 11.000 0.632 NA   NA
 5226797 5226798       tolC FALSE 0.305 271.000 0.480 NA   NA
 5226799 5226800     nudF   TRUE 0.952 -16.000 0.443 NA   NA
 5226800 5226801       icc TRUE 0.743 108.000 0.433 NA   NA
 5226801 5226802     icc   TRUE 0.978 0.000 0.427 NA   NA
 5226802 5226803       parE TRUE 0.613 85.000 0.217 NA   NA
 5226803 5226804     parE   FALSE 0.026 41.000 0.022 1.000 N NA
 5226805 5226806     mdaB   FALSE 0.034 203.000 0.000 1.000   NA
 5226806 5226807         TRUE 0.987 -27.000 0.167 0.001 Y NA
 5226807 5226808         TRUE 0.987 12.000 0.600 1.000 Y NA
 5226808 5226809         TRUE 0.963 26.000 0.107 0.013 Y NA
 5226809 5226810         TRUE 0.989 14.000 0.214 0.011 Y NA
 5226810 5226811         TRUE 0.848 49.000 0.143 0.013 N NA
 5226811 5226812         FALSE 0.001 435.000 0.000 1.000 N NA
 5226812 5226813         TRUE 0.831 35.000 0.000 0.008   NA
 5226814 5226815         FALSE 0.231 32.000 0.000 NA   NA
 5226815 5226816         FALSE 0.207 36.000 0.000 NA   NA
 5226816 5226817       parC FALSE 0.037 188.000 0.000 NA   NA
 5226817 5226818     parC plsC FALSE 0.052 151.000 0.043 1.000 N NA
 5226818 5226819     plsC sufI FALSE 0.396 100.000 0.154 1.000 N NA
 5226819 5226820     sufI   FALSE 0.001 339.000 0.000 1.000 N NA
 5226821 5226822     dkgA   TRUE 0.751 -412.000 0.000 0.032   NA
 5226822 5226823         FALSE 0.081 369.000 0.000 0.032   NA
 5226823 5226824         TRUE 0.986 4.000 0.081 0.032 Y NA
 5226826 5226827       metC FALSE 0.052 465.000 0.212 NA   NA
 5226827 5226828     metC   FALSE 0.002 263.000 0.000 1.000 N NA
 5226828 5226829         TRUE 0.990 16.000 0.905 NA Y NA
 5226829 5226830         TRUE 0.939 116.000 0.947 NA Y NA
 5226831 5226832       exbB FALSE 0.341 -27.000 0.000 NA   NA
 5226832 5226833     exbB exbD TRUE 0.994 4.000 0.810 1.000 Y NA
 5226834 5226835     scrR scrB TRUE 0.858 31.000 0.400 1.000 N NA
 5226835 5226836     scrB   TRUE 0.992 0.000 0.475 1.000 Y NA
 5226836 5226837         TRUE 0.949 -30.000 0.000 0.013 Y NA
 5226837 5226838       scrY TRUE 0.956 62.000 0.275 0.015 Y NA
 5226838 5226839     scrY scrK FALSE 0.466 200.000 0.167 1.000 Y NA
 11528061 5226842         FALSE NA 1813.000 0.000 NA   NA
 11670424 5226842         FALSE NA 1813.000 0.000 NA   NA
 11812816 5226842         FALSE NA 1813.000 0.000 NA   NA
 11528062 5226842         FALSE NA 1781.000 0.000 NA   NA
 11670425 5226842         FALSE NA 1781.000 0.000 NA   NA
 11812817 5226842         FALSE NA 1781.000 0.000 NA   NA
 11528063 5226842         FALSE NA 1752.000 0.000 NA   NA
 11670426 5226842         FALSE NA 1752.000 0.000 NA   NA
 11812818 5226842         FALSE NA 1752.000 0.000 NA   NA
 11528064 5226842         FALSE NA 1720.000 0.000 NA   NA
 11670427 5226842         FALSE NA 1720.000 0.000 NA   NA
 11812819 5226842         FALSE NA 1720.000 0.000 NA   NA
 11528065 5226842         FALSE NA 1691.000 0.000 NA   NA
 11670428 5226842         FALSE NA 1691.000 0.000 NA   NA
 11812820 5226842         FALSE NA 1691.000 0.000 NA   NA
 11528066 5226842         FALSE NA 1659.000 0.000 NA   NA
 11670429 5226842         FALSE NA 1659.000 0.000 NA   NA
 11812821 5226842         FALSE NA 1659.000 0.000 NA   NA
 11528067 5226842         FALSE NA 1630.000 0.000 NA   NA
 11670430 5226842         FALSE NA 1630.000 0.000 NA   NA
 11812822 5226842         FALSE NA 1630.000 0.000 NA   NA
 11528068 5226842         FALSE NA 1598.000 0.000 NA   NA
 11670431 5226842         FALSE NA 1598.000 0.000 NA   NA
 11812823 5226842         FALSE NA 1598.000 0.000 NA   NA
 11528069 5226842         FALSE NA 1569.000 0.000 NA   NA
 11670432 5226842         FALSE NA 1569.000 0.000 NA   NA
 11812824 5226842         FALSE NA 1569.000 0.000 NA   NA
 11528070 5226842         FALSE NA 1537.000 0.000 NA   NA
 11670433 5226842         FALSE NA 1537.000 0.000 NA   NA
 11812825 5226842         FALSE NA 1537.000 0.000 NA   NA
 11528071 5226842         FALSE NA 1508.000 0.000 NA   NA
 11670434 5226842         FALSE NA 1508.000 0.000 NA   NA
 11812826 5226842         FALSE NA 1508.000 0.000 NA   NA
 11528072 5226842         FALSE NA 1476.000 0.000 NA   NA
 11670435 5226842         FALSE NA 1476.000 0.000 NA   NA
 11812827 5226842         FALSE NA 1476.000 0.000 NA   NA
 11528073 5226842         FALSE NA 1447.000 0.000 NA   NA
 11670436 5226842         FALSE NA 1447.000 0.000 NA   NA
 11812828 5226842         FALSE NA 1447.000 0.000 NA   NA
 11528074 5226842         FALSE NA 1415.000 0.000 NA   NA
 11670437 5226842         FALSE NA 1415.000 0.000 NA   NA
 11812829 5226842         FALSE NA 1415.000 0.000 NA   NA
 11528075 5226842         FALSE NA 1386.000 0.000 NA   NA
 11670438 5226842         FALSE NA 1386.000 0.000 NA   NA
 11812830 5226842         FALSE NA 1386.000 0.000 NA   NA
 11528076 5226842         FALSE NA 1354.000 0.000 NA   NA
 11670439 5226842         FALSE NA 1354.000 0.000 NA   NA
 11812831 5226842         FALSE NA 1354.000 0.000 NA   NA
 11528077 5226842         FALSE NA 1325.000 0.000 NA   NA
 11670440 5226842         FALSE NA 1325.000 0.000 NA   NA
 11812832 5226842         FALSE NA 1325.000 0.000 NA   NA
 11528078 5226842         FALSE NA 1293.000 0.000 NA   NA
 11670441 5226842         FALSE NA 1293.000 0.000 NA   NA
 11812833 5226842         FALSE NA 1293.000 0.000 NA   NA
 11528079 5226842         FALSE NA 1264.000 0.000 NA   NA
 11670442 5226842         FALSE NA 1264.000 0.000 NA   NA
 11812834 5226842         FALSE NA 1264.000 0.000 NA   NA
 11528080 5226842         FALSE NA 1232.000 0.000 NA   NA
 11670443 5226842         FALSE NA 1232.000 0.000 NA   NA
 11812835 5226842         FALSE NA 1232.000 0.000 NA   NA
 11528081 5226842         FALSE NA 1203.000 0.000 NA   NA
 11670444 5226842         FALSE NA 1203.000 0.000 NA   NA
 11812836 5226842         FALSE NA 1203.000 0.000 NA   NA
 11528082 5226842         FALSE NA 1171.000 0.000 NA   NA
 11670445 5226842         FALSE NA 1171.000 0.000 NA   NA
 11812837 5226842         FALSE NA 1171.000 0.000 NA   NA
 11528083 5226842         FALSE NA 1142.000 0.000 NA   NA
 11670446 5226842         FALSE NA 1142.000 0.000 NA   NA
 11812838 5226842         FALSE NA 1142.000 0.000 NA   NA
 11528084 5226842         FALSE NA 1110.000 0.000 NA   NA
 11670447 5226842         FALSE NA 1110.000 0.000 NA   NA
 11812839 5226842         FALSE NA 1110.000 0.000 NA   NA
 11528085 5226842         FALSE NA 1081.000 0.000 NA   NA
 11670448 5226842         FALSE NA 1081.000 0.000 NA   NA
 11812840 5226842         FALSE NA 1081.000 0.000 NA   NA
 11528086 5226842         FALSE NA 1049.000 0.000 NA   NA
 11670449 5226842         FALSE NA 1049.000 0.000 NA   NA
 11812841 5226842         FALSE NA 1049.000 0.000 NA   NA
 11528087 5226842         FALSE NA 1020.000 0.000 NA   NA
 11670450 5226842         FALSE NA 1020.000 0.000 NA   NA
 11812842 5226842         FALSE NA 1020.000 0.000 NA   NA
 11528088 5226842         FALSE NA 988.000 0.000 NA   NA
 11670451 5226842         FALSE NA 988.000 0.000 NA   NA
 11812843 5226842         FALSE NA 988.000 0.000 NA   NA
 11528089 5226842         FALSE NA 959.000 0.000 NA   NA
 11670452 5226842         FALSE NA 959.000 0.000 NA   NA
 11812844 5226842         FALSE NA 959.000 0.000 NA   NA
 5226844 5226845         FALSE 0.020 52.000 0.000 NA N NA
 5226846 5226847         FALSE 0.481 10.000 0.000 NA   NA
 5226847 5226848         FALSE 0.270 89.000 0.056 1.000   NA
 5226849 5226850     nrdG nrdD TRUE 0.747 81.000 0.464 1.000 N NA
 5226850 5226851     nrdD   FALSE 0.196 71.000 0.031 NA   NA
 5226851 5226852         FALSE 0.007 366.000 0.000 NA   NA
 5226852 5226853       pyrI FALSE 0.306 54.000 0.084 NA N NA
 5226853 5226854     pyrI pyrB TRUE 0.991 16.000 0.197 0.001 Y NA
 5226859 5226860         TRUE 0.976 10.000 0.637 NA   NA
 5226860 5226861         FALSE 0.001 349.000 0.000 1.000 N NA
 5226861 5226862         FALSE 0.003 213.000 0.000 1.000 N NA
 5226863 5226864         FALSE 0.128 72.000 0.000 1.000   NA
 5226864 5226865         TRUE 0.857 -286.000 0.003 0.001   NA
 5226865 5226866       holC TRUE 0.785 4.000 0.089 1.000 N NA
 5226866 5226867     holC pepA TRUE 0.727 105.000 0.494 1.000 N NA
 5226868 5226869         TRUE 0.995 0.000 0.631 0.081   NA
 5226869 5226870       tRNA-Leu FALSE 0.021 231.000 0.000 NA   NA
 5226870 5226871     tRNA-Leu   FALSE 0.024 221.000 0.000 NA   NA
 5226872 5226873         TRUE 0.960 -10.000 0.429 NA   NA
 5226873 5226874         FALSE 0.003 699.000 0.000 NA   NA
 5226875 5226876         FALSE 0.004 566.000 0.000 1.000   NA
 5226876 5226877         FALSE 0.100 100.000 0.000 NA   NA
 5226877 5226878         FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 5226879 5226880         TRUE 0.985 -6.000 0.743 NA   NA
 5226880 5226881         TRUE 0.988 -3.000 0.729 NA   NA
 5226881 5226882         TRUE 0.974 -3.000 0.464 NA N NA
 5226882 5226883       aspA1 FALSE 0.001 331.000 0.000 1.000 N NA
 5226884 5226885         FALSE 0.003 657.000 0.000 NA   NA
 5226886 5226887         TRUE 0.937 -94.000 0.759 NA   NA
 5226889 5226890         FALSE 0.384 16.000 0.000 NA   NA
 5226890 5226891         FALSE 0.121 80.000 0.000 1.000   NA
 5226891 5226892         TRUE 0.990 -3.000 0.800 NA   NA
 5226895 5226896         TRUE 0.996 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 5226896 5226897         FALSE 0.000 540.000 0.000 1.000 N NA
 5226897 5226898         FALSE 0.005 440.000 0.000 1.000   NA
 5226898 5226899         TRUE 0.948 -25.000 0.042 0.001   NA
 5226899 5226900         FALSE 0.001 455.000 0.000 1.000 N NA
 5226900 5226901         FALSE 0.004 462.000 0.000 NA   NA
 5226901 5226902       rhaD FALSE 0.378 110.000 0.112 NA   NA
 5226902 5226903     rhaD rhaA TRUE 0.979 5.000 0.247 1.000 Y NA
 5226903 5226904     rhaA rhaB TRUE 0.989 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 5226905 5226906     rhaS rhaR TRUE 0.998 4.000 0.800 0.022 Y NA
 5226906 5226907     rhaR   TRUE 0.843 59.000 0.000 0.051 Y NA
 5226907 5226908         TRUE 0.965 -12.000 0.514 NA   NA
 5226909 5226910         TRUE 0.980 -3.000 0.467 1.000   NA
 5226910 5226911         TRUE 0.992 -7.000 0.333 0.078 Y NA
 5226911 5226912         TRUE 0.992 -22.000 0.556 0.078 Y NA
 5226913 5226914         FALSE 0.162 85.000 0.026 NA   NA
 5226914 5226915         FALSE 0.005 409.000 0.000 NA   NA
 5226916 5226917         FALSE 0.032 200.000 0.000 NA   NA
 5226917 5226918         FALSE 0.058 152.000 0.000 NA   NA
 5226918 5226919         FALSE 0.152 53.000 0.000 NA   NA
 5226919 5226920         TRUE 0.617 -3.000 0.000 NA   NA
 5226920 5226921       rhaT FALSE 0.087 117.000 0.000 NA   NA
 5226922 5226923         FALSE 0.104 95.000 0.000 NA   NA
 5226923 5226924         TRUE 0.963 -3.000 0.019 0.015   NA
 5226925 5226926         FALSE 0.520 7.000 0.000 NA   NA
 5226926 5226927         FALSE 0.106 91.000 0.000 NA   NA
 5226927 5226928         FALSE 0.498 9.000 0.000 NA   NA
 5226928 5226929       visC FALSE 0.004 474.000 0.000 NA   NA
 5226929 5226930     visC visB TRUE 0.972 123.000 0.474 0.001 Y NA
 5226930 5226931     visB pepP FALSE 0.058 18.000 0.000 1.000 N NA
 5226931 5226932     pepP   FALSE 0.119 72.000 0.000 NA   NA
 5226933 5226934         FALSE 0.061 199.000 0.034 NA   NA
 5226935 5226936     nadR radA FALSE 0.011 118.000 0.021 1.000 N NA
 5226936 5226937     radA serB FALSE 0.086 18.000 0.024 1.000 N NA
 5226940 5226941     prfC osmY FALSE 0.004 502.000 0.000 NA   NA
 5226941 5226942     osmY   FALSE 0.333 146.000 0.140 NA   NA
 5226942 5226943         FALSE 0.214 139.000 0.070 NA   NA
 5226943 5226944         FALSE 0.113 82.000 0.010 NA   NA
 5226945 5226946       entD FALSE 0.007 150.000 0.000 1.000 N NA
 5226947 5226948         TRUE 0.929 16.000 0.429 NA N NA
 5226949 5226950         TRUE 0.875 -102.000 0.000 0.001   NA
 5226950 5226951       entE TRUE 0.965 -3.000 0.276 1.000   NA
 5226951 5226952     entE entB TRUE 0.897 -58.000 0.172 1.000 Y NA
 5226952 5226953     entB   TRUE 0.917 -39.000 0.429 NA   NA
 5226953 5226954       entF FALSE 0.211 -88.000 0.000 NA   NA
 5226954 5226955     entF entA TRUE 0.921 -6.000 0.024 1.000 Y NA
 5226955 5226956     entA   TRUE 0.809 23.000 0.032 1.000 Y NA
 5226956 5226957         TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 5226958 5226959         FALSE 0.116 75.000 0.000 NA   NA
 5226961 5226962         FALSE 0.029 209.000 0.000 NA   NA
 5226962 5226963         FALSE 0.006 394.000 0.000 NA   NA
 5226963 5226964         FALSE 0.065 141.000 0.000 NA   NA
 5226964 5226965         TRUE 0.982 -3.000 0.500 1.000   NA
 5226965 5226966         TRUE 0.992 -3.000 0.429 0.011 N NA
 5226966 5226967         FALSE 0.026 222.000 0.000 1.000   NA
 5226968 5226969         TRUE 0.923 -21.000 0.320 NA   NA
 5226969 5226970       phnN FALSE 0.416 14.000 0.000 NA   NA
 5226970 5226971     phnN   FALSE 0.140 65.000 0.000 1.000   NA
 5226973 5226974         FALSE 0.009 329.000 0.000 1.000   NA
 5226974 5226975         TRUE 0.969 -18.000 0.667 1.000   NA
 5226975 5226976         FALSE 0.003 1084.000 0.000 1.000   NA
 5226976 5226977         TRUE 0.974 3.000 0.410 1.000   NA
 5226978 5226979         TRUE 0.941 104.000 0.667 0.022   NA
 5226981 5226982       tRNA-Phe FALSE 0.050 164.000 0.000 NA   NA
 5226983 5226984         TRUE 0.855 36.000 0.448 1.000 N NA
 5226985 5226986       dsbD TRUE 0.782 35.000 0.217 1.000   NA
 5226986 5226987     dsbD cutA TRUE 0.624 -24.000 0.092 1.000 N NA
 5226987 5226988     cutA dcuA FALSE 0.120 129.000 0.024 1.000   NA
 5226990 5226991     fxsA groS FALSE 0.040 238.000 0.040 NA   NA
 5226991 5226992     groS groL TRUE 0.953 46.000 0.631 1.000 Y NA
 5226992 5226993     groL ubiC FALSE 0.007 157.000 0.000 NA N NA
 5226993 5226994     ubiC ubiA TRUE 0.911 35.000 0.248 NA Y NA
 5226996 5226997     dgkA lexA FALSE 0.345 111.000 0.141 1.000 N NA
 5226998 5226999     zur   FALSE 0.114 101.000 0.016 NA   NA
 5227001 5227002         FALSE 0.210 108.000 0.048 NA   NA
 5227002 5227003         FALSE 0.107 274.000 0.161 NA   NA
 5227003 5227004         TRUE 0.944 -3.000 0.185 NA   NA
 5227004 5227005         TRUE 0.882 14.000 0.185 NA   NA
 5227005 5227006         TRUE 0.651 176.000 0.609 NA   NA
 5227006 5227007         TRUE 0.988 -3.000 0.684 NA   NA
 5227007 5227008         TRUE 0.969 3.000 0.353 NA   NA
 5227008 5227009       exuR FALSE 0.004 502.000 0.000 NA   NA
 5227009 5227010     exuR exuT FALSE 0.389 210.000 0.433 1.000 N NA
 5227011 5227012     uxaC uxaB1 TRUE 0.745 114.000 0.190 1.000 Y NA
 5227012 5227013     uxaB1 uxaA TRUE 0.910 20.000 0.126 1.000 Y NA
 5227013 5227014     uxaA   FALSE 0.454 90.000 0.126 NA   NA
 5227015 5227016         FALSE 0.001 354.000 0.000 1.000 N NA
 5227016 5227017         FALSE 0.018 254.000 0.000 1.000   NA
 5227020 5227021         FALSE 0.018 244.000 0.000 NA   NA
 5227021 5227022         FALSE 0.196 210.000 0.000 NA Y NA
 5227022 5227023         FALSE 0.124 69.000 0.000 NA   NA
 5227023 5227024         FALSE 0.009 320.000 0.000 NA   NA
 5227025 5227026         FALSE 0.012 281.000 0.000 NA   NA
 5227027 5227028         FALSE 0.000 574.000 0.000 1.000 N NA
 5227029 5227030         TRUE 0.992 0.000 0.357 0.051   NA
 5227031 5227032         FALSE 0.237 31.000 0.000 NA   NA
 5227032 5227033         FALSE 0.481 10.000 0.000 NA   NA
 5227037 5227038     rpoD dnaG FALSE 0.448 155.000 0.299 1.000 N NA
 5227038 5227039     dnaG rpsU FALSE 0.098 155.000 0.067 1.000 N NA
 5227043 5227044         FALSE 0.269 241.000 0.000 0.004   NA
 5227046 5227047     rplU rpmA TRUE 0.994 20.000 0.667 0.012 Y NA
 5227047 5227048     rpmA   FALSE 0.136 90.000 0.019 NA   NA
 5227048 5227049         FALSE 0.017 260.000 0.015 NA   NA
 5227053 5227054     rrmJ hflB FALSE 0.532 48.000 0.152 1.000 N NA
 5227054 5227055     hflB dhpS TRUE 0.580 122.000 0.325 1.000 N NA
 5227055 5227056     dhpS mrsA TRUE 0.785 -61.000 0.260 1.000 N NA
 5227056 5227057     mrsA secG FALSE 0.002 250.000 0.016 1.000 N NA
 5227057 5227058     secG tRNA-Leu FALSE 0.276 25.000 0.000 NA   NA
 5227059 5227060         FALSE 0.231 32.000 0.000 NA   NA
 5227060 5227061         FALSE 0.130 65.000 0.000 NA   NA
 5227061 5227062         FALSE 0.211 -121.000 0.000 1.000   NA
 5227062 5227063         FALSE 0.123 78.000 0.000 1.000   NA
 5227063 5227064         FALSE 0.065 141.000 0.000 NA   NA
 5227065 5227066         FALSE 0.482 11.000 0.000 1.000   NA
 5227066 5227067         FALSE 0.088 116.000 0.000 NA   NA
 5227068 5227069         TRUE 0.585 113.000 0.000 0.021   NA
 5227070 5227071         FALSE 0.142 58.000 0.000 NA   NA
 5227071 5227072         FALSE 0.518 -7.000 0.000 NA   NA
 5227073 5227074       tRNA-Met FALSE 0.010 311.000 0.000 NA   NA
 5227074 5227075     tRNA-Met   FALSE 0.121 71.000 0.000 NA   NA
 5227075 5227076         FALSE 0.141 59.000 0.000 NA   NA
 5227076 5227077       nusA TRUE 0.960 22.000 0.759 NA   NA
 5227077 5227078     nusA infB TRUE 0.855 26.000 0.342 1.000 N NA
 5227078 5227079     infB rbfA TRUE 0.915 75.000 0.530 1.000 Y NA
 5227079 5227080     rbfA truB TRUE 0.988 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5227080 5227081     truB   TRUE 0.872 18.000 0.211 1.000   NA
 5227081 5227082       pnp FALSE 0.157 326.000 0.335 1.000   NA
 5227082 5227083     pnp nlpI FALSE 0.164 166.000 0.071 1.000   NA
 5227083 5227084     nlpI deaD FALSE 0.137 160.000 0.053 1.000   NA
 5227085 5227086         FALSE 0.061 132.000 0.041 1.000 N NA
 5227086 5227087         TRUE 0.996 12.000 0.948 0.003   NA
 5227087 5227088         TRUE 0.930 -21.000 0.015 0.003   NA
 5227089 5227090         TRUE 0.956 -6.000 0.295 1.000   NA
 5227092 5227093         FALSE 0.118 73.000 0.000 NA   NA
 5227093 5227094       deoC FALSE 0.004 567.000 0.000 1.000   NA
 5227094 5227095     deoC deoA TRUE 0.835 94.000 0.286 1.000 Y NA
 5227095 5227096     deoA deoB TRUE 0.697 90.000 0.398 1.000 N NA
 5227096 5227097     deoB deoD TRUE 0.797 48.000 0.414 1.000 N NA
 5227098 5227099         TRUE 0.914 49.000 0.750 1.000   NA
 5227099 5227100         FALSE 0.328 314.000 0.333 NA Y NA
 5227101 5227102         FALSE 0.020 239.000 0.000 1.000   NA
 5227102 5227103       rimI FALSE 0.030 212.000 0.000 1.000   NA
 5227103 5227104     rimI holD TRUE 0.696 -49.000 0.121 1.000   NA
 5227109 5227110       budR FALSE 0.283 157.000 0.125 NA   NA
 5227111 5227112     budA budB TRUE 0.867 22.000 0.323 1.000 N NA
 5227112 5227113     budB   FALSE 0.039 184.000 0.000 NA   NA
 5227113 5227114         TRUE 0.978 -3.000 0.429 NA   NA
 5227118 5227119     gcvT gcvH TRUE 0.976 60.000 0.317 0.001 Y NA
 5227119 5227120     gcvH gcvP TRUE 0.782 119.000 0.249 1.000 Y NA
 5227122 5227123         FALSE 0.001 356.000 0.000 1.000 N NA
 5227123 5227124         TRUE 0.997 -10.000 0.816 0.077 Y NA
 5227124 5227125         FALSE 0.135 247.000 0.158 1.000   NA
 5227125 5227126         TRUE 0.962 0.000 0.250 1.000   NA
 5227126 5227127         TRUE 0.988 -7.000 0.188 0.077 Y NA
 5227129 5227130     rafA rafR FALSE 0.404 224.000 0.538 1.000 N NA
 5227130 5227131     rafR   FALSE 0.146 55.000 0.000 NA   NA
 5227134 5227135         TRUE 0.674 -19.000 0.061 NA   NA
 5227135 5227136         FALSE 0.124 69.000 0.000 NA   NA
 5227137 5227138       fldB FALSE 0.248 29.000 0.000 NA   NA
 5227138 5227139     fldB   FALSE 0.008 339.000 0.000 NA   NA
 5227139 5227140         FALSE 0.029 208.000 0.000 NA   NA
 5227141 5227142     xerD dsbC FALSE 0.146 140.000 0.079 1.000 N NA
 5227142 5227143     dsbC recJ TRUE 0.732 7.000 0.082 1.000 N NA
 5227143 5227144     recJ prfB FALSE 0.015 159.000 0.028 1.000 N NA
 5227144 5227145     prfB lysS TRUE 0.988 9.000 0.162 0.041 Y NA
 5227145 5227146     lysS   FALSE 0.000 625.000 0.000 NA N NA
 5227146 5227147         FALSE 0.006 167.000 0.000 NA N NA
 5227147 5227148         TRUE 0.742 -3.000 0.067 1.000 N NA
 5227148 5227149       tRNA-Gly FALSE 0.110 83.000 0.000 NA   NA
 5227149 5227150     tRNA-Gly   TRUE 0.626 0.000 0.000 NA   NA
 5227150 5227151         FALSE 0.002 983.000 0.000 NA   NA
 5227151 5227152         FALSE 0.022 230.000 0.000 NA   NA
 5227152 5227153         FALSE 0.026 214.000 0.000 NA   NA
 5227153 5227154         TRUE 0.888 106.000 1.000 NA   NA
 5227161 5227162         TRUE 0.939 -3.000 0.220 1.000 N NA
 5227162 5227163         TRUE 0.782 15.000 0.143 1.000 N NA
 5227165 5227166         FALSE 0.004 479.000 0.000 1.000   NA
 5227166 5227167         FALSE 0.001 360.000 0.000 1.000 N NA
 5227167 5227168         TRUE 0.967 -22.000 0.333 1.000 Y NA
 5227170 5227171         TRUE 0.921 47.000 0.400 NA Y NA
 5227171 5227172         TRUE 0.816 80.000 0.225 NA Y NA
 5227172 5227173         TRUE 0.841 22.000 0.275 NA N NA
 5227173 5227174         TRUE 0.840 15.000 0.194 NA N NA
 5227174 5227175         FALSE 0.196 586.000 0.472 1.000 Y NA
 5227175 5227176         TRUE 0.906 18.000 0.103 NA Y NA
 5227176 5227177         TRUE 0.961 15.000 0.240 NA Y NA
 5227177 5227178         TRUE 0.795 121.000 0.607 NA   NA
 5227178 5227179         TRUE 0.864 0.000 0.071 NA   NA
 5227179 5227180         TRUE 0.988 -7.000 1.000 NA   NA
 5227180 5227181         FALSE 0.254 178.000 0.143 NA   NA
 5227181 5227182         FALSE 0.174 44.000 0.000 NA   NA
 5227182 5227183         TRUE 0.674 59.000 0.214 NA   NA
 5227183 5227184         TRUE 0.931 -3.000 0.000 NA Y NA
 5227184 5227185         FALSE 0.011 115.000 0.000 1.000 N NA
 5227185 5227186         TRUE 0.987 0.000 0.300 1.000 Y NA
 5227186 5227187         TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.010 Y NA
 5227187 5227188         TRUE 0.993 3.000 0.667 1.000 Y NA
 5227188 5227189       rhiE FALSE 0.010 323.000 0.000 1.000   NA
 5227190 5227191         TRUE 0.988 -3.000 0.733 NA   NA
 5227191 5227192         FALSE 0.344 126.000 0.111 NA   NA
 5227193 5227194     hexY   FALSE 0.003 807.000 0.000 NA   NA
 5227194 5227195         FALSE 0.005 172.000 0.000 1.000 N NA
 5227195 5227196         TRUE 0.976 -3.000 0.500 NA N NA
 5227196 5227197         FALSE 0.046 170.000 0.000 NA   NA
 5227202 5227203         FALSE 0.041 179.000 0.000 NA   NA
 5227203 5227204       cybB FALSE 0.320 22.000 0.000 1.000   NA
 5227204 5227205     cybB   FALSE 0.381 243.000 0.000 0.038 Y NA
 5227206 5227207         FALSE 0.038 187.000 0.000 NA   NA
 5227208 5227209         FALSE 0.121 256.000 0.000 1.000 Y NA
 5227209 5227210         FALSE 0.006 369.000 0.000 NA   NA
 5227211 5227212         FALSE 0.420 -15.000 0.000 NA   NA
 5227214 5227215         FALSE 0.462 11.000 0.000 NA   NA
 5227216 5227217       smpB FALSE 0.000 597.000 0.000 1.000 N NA
 5227218 5227219         TRUE 0.854 -10.000 0.124 NA   NA
 5227220 5227221     smpA recN FALSE 0.060 153.000 0.049 1.000 N NA
 5227221 5227222     recN ppnK FALSE 0.457 82.000 0.170 1.000 N NA
 5227223 5227224     grpE mntH FALSE 0.002 262.000 0.000 1.000 N NA
 5227225 5227226         TRUE 0.646 14.000 0.048 NA   NA
 5227227 5227228         FALSE 0.006 382.000 0.000 NA   NA
 5227228 5227229         TRUE 0.914 64.000 0.463 NA Y NA
 5227229 5227230         TRUE 0.998 2.000 0.926 0.076 Y NA
 5227230 5227231         TRUE 0.875 37.000 0.000 0.076 Y NA
 5227231 5227232         FALSE 0.213 204.000 0.000 1.000 Y NA
 5227233 5227234         FALSE 0.434 78.000 0.111 NA   NA
 5227234 5227235         FALSE 0.013 281.000 0.000 1.000   NA
 5227235 5227236         TRUE 0.982 21.000 0.750 1.000 Y NA
 5227236 5227237         TRUE 0.998 -3.000 0.750 0.076 Y NA
 5227237 5227238         FALSE 0.006 413.000 0.000 1.000   NA
 5227238 5227239         TRUE 0.655 146.000 0.444 1.000   NA
 5227239 5227240         TRUE 0.832 65.000 0.214 1.000 Y NA
 5227242 5227243         TRUE 0.979 2.000 0.200 NA Y NA
 5227243 5227244       tpiA TRUE 0.948 -3.000 0.042 1.000 Y NA
 5227244 5227245     tpiA   TRUE 0.825 -67.000 0.083 NA Y NA
 5227245 5227246         FALSE 0.315 175.000 0.182 NA   NA
 5227246 5227247         FALSE 0.052 202.000 0.029 NA   NA
 5227247 5227248       maeB FALSE 0.002 272.000 0.000 1.000 N NA
 5227248 5227249     maeB   FALSE 0.037 196.000 0.000 1.000   NA
 5227249 5227250         FALSE 0.370 -22.000 0.000 NA   NA
 5227251 5227252       hemF TRUE 0.604 4.000 0.016 NA   NA
 5227253 5227254         FALSE 0.022 235.000 0.000 1.000   NA
 5227254 5227255         FALSE 0.331 71.000 0.067 1.000   NA
 5227255 5227256         FALSE 0.499 106.000 0.167 1.000   NA
 5227256 5227257         TRUE 0.969 6.000 0.429 1.000   NA
 5227257 5227258         FALSE 0.110 188.000 0.061 NA   NA
 5227258 5227259         TRUE 0.580 143.000 0.333 NA   NA
 5227259 5227260       cysP FALSE 0.097 318.000 0.043 NA Y NA
 5227260 5227261     cysP cysT TRUE 0.995 0.000 0.479 0.003 N NA
 5227261 5227262     cysT cysW TRUE 0.997 0.000 0.583 0.001 N NA
 5227262 5227263     cysW cysM FALSE 0.005 173.000 0.000 1.000 N NA
 5227264 5227265     macB macA TRUE 0.973 4.000 0.439 NA   NA
 5227265 5227266     macA   FALSE 0.243 30.000 0.000 NA   NA
 5227267 5227268         TRUE 0.980 3.000 0.216 1.000 Y NA
 5227269 5227270     crr ptsI TRUE 0.821 149.000 0.114 0.013 Y NA
 5227270 5227271     ptsI cysK FALSE 0.000 737.000 0.000 1.000 N NA
 5227271 5227272     cysK cysZ FALSE 0.522 163.000 0.122 1.000 Y NA
 5227273 5227274     zipA asoB FALSE 0.009 130.000 0.022 1.000 N NA
 5227277 5227278     tehB   FALSE 0.284 107.000 0.071 NA   NA
 5227279 5227280       norV TRUE 0.906 -37.000 0.375 NA   NA
 5227282 5227283     fumA   FALSE 0.000 491.000 0.000 1.000 N NA
 5227285 5227286         FALSE 0.004 197.000 0.000 NA N NA
 5227287 5227288     ada alkB FALSE 0.363 30.000 0.068 NA N NA
 5227289 5227290         TRUE 0.861 42.000 0.429 1.000   NA
 5227290 5227291         TRUE 0.891 66.000 0.750 1.000   NA
 5227291 5227292         TRUE 0.782 1.000 0.075 1.000 N NA
 5227292 5227293         TRUE 0.696 -7.000 0.075 NA N NA
 5227293 5227294         FALSE 0.000 522.000 0.000 NA N NA
 5227295 5227296       rspA FALSE 0.002 272.000 0.000 1.000 N NA
 5227296 5227297     rspA rspB TRUE 0.582 30.000 0.122 1.000 N NA
 5227297 5227298     rspB   FALSE 0.296 164.000 0.195 1.000 N NA
 5227299 5227300         FALSE 0.004 205.000 0.000 1.000 N NA
 5227301 5227302         FALSE 0.222 34.000 0.000 NA   NA
 5227302 5227303         FALSE 0.499 -7.000 0.044 1.000 N NA
 5227304 5227305         TRUE 0.813 91.000 0.667 NA N NA
 5227305 5227306         TRUE 0.908 -40.000 0.500 NA N NA
 5227306 5227307         FALSE 0.001 309.000 0.000 NA N NA
 5227307 5227308         FALSE 0.484 -9.000 0.000 NA   NA
 5227308 5227309         FALSE 0.004 603.000 0.000 1.000   NA
 5227309 5227310         FALSE 0.013 288.000 0.000 1.000   NA
 5227310 5227311         TRUE 0.923 15.000 0.375 1.000 N NA
 5227312 5227313         FALSE 0.484 -9.000 0.000 NA   NA
 5227313 5227314         FALSE 0.081 133.000 0.000 1.000   NA
 5227314 5227315       fhuE FALSE 0.031 209.000 0.000 1.000   NA
 5227315 5227316     fhuE   TRUE 0.643 114.000 0.000 0.007   NA
 5227317 5227318         FALSE 0.109 -7.000 0.000 NA N NA
 5227320 5227321         TRUE 0.903 28.000 0.000 0.001   NA
 5227321 5227322         FALSE 0.370 18.000 0.000 1.000   NA
 5227322 5227323         TRUE 0.677 38.000 0.000 1.000 Y NA
 5227323 5227324         FALSE 0.379 140.000 0.000 1.000 Y NA
 5227325 5227326         FALSE 0.432 -13.000 0.000 NA   NA
 5227329 5227330         FALSE 0.026 214.000 0.000 NA   NA
 5227331 5227332         FALSE 0.098 1805.000 0.000 0.006 Y NA
 5227333 5227334         FALSE 0.014 273.000 0.000 1.000   NA
 5227334 5227335         FALSE 0.215 35.000 0.000 NA   NA
 5227339 5227340         FALSE 0.009 325.000 0.000 NA   NA
 5227342 5227343     wcaJ   TRUE 0.885 -10.000 0.158 NA   NA
 5227343 5227344         TRUE 0.942 2.000 0.184 NA   NA
 5227344 5227345         TRUE 0.977 3.000 0.194 1.000 Y NA
 5227345 5227346         TRUE 0.864 14.000 0.161 NA   NA
 5227346 5227347         TRUE 0.985 -3.000 0.600 NA   NA
 5227347 5227348         TRUE 0.968 -7.000 0.438 NA   NA
 5227348 5227349         TRUE 0.969 7.000 0.189 NA Y NA
 5227349 5227350         TRUE 0.997 2.000 0.459 0.015 Y NA
 5227350 5227351         TRUE 0.954 3.000 0.241 NA   NA
 5227352 5227353         FALSE 0.261 27.000 0.000 NA   NA
 5227353 5227354         FALSE 0.040 189.000 0.000 1.000   NA
 5227355 5227356     ccdA2   FALSE 0.007 348.000 0.000 NA   NA
 5227357 5227358         FALSE 0.009 335.000 0.000 1.000   NA
 5227358 5227359         FALSE 0.417 -18.000 0.000 1.000   NA
 5227359 5227360         FALSE 0.014 277.000 0.000 1.000   NA
 5227360 5227361         TRUE 0.950 -9.000 0.333 NA   NA
 5227361 5227362         FALSE 0.416 14.000 0.000 NA   NA
 5227363 5227364         FALSE 0.007 352.000 0.000 NA   NA
 5227364 5227365         FALSE 0.003 905.000 0.000 NA   NA
 5227365 5227366         FALSE 0.004 471.000 0.000 NA   NA
 5227366 5227367       tRNA-Phe FALSE 0.065 141.000 0.000 NA   NA
 5227369 5227370         TRUE 0.895 -34.000 0.000 0.004   NA
 5227370 5227371         FALSE 0.006 383.000 0.000 1.000   NA
 5227371 5227372         FALSE 0.145 62.000 0.000 1.000   NA
 5227373 5227374         TRUE 0.638 13.000 0.042 NA   NA
 5227374 5227375         TRUE 0.911 -18.000 0.021 0.020   NA
 5227375 5227376         FALSE 0.028 215.000 0.000 1.000   NA
 5227377 5227378       mltC FALSE 0.013 95.000 0.000 NA N NA
 5227378 5227379     mltC   FALSE 0.447 53.000 0.128 NA N NA
 5227379 5227380       mutY TRUE 0.903 -3.000 0.150 1.000 N NA
 5227381 5227382         TRUE 0.885 2.000 0.092 NA   NA
 5227382 5227383       yggN FALSE 0.456 115.000 0.155 NA   NA
 5227384 5227385     tas   FALSE 0.000 565.000 0.000 1.000 N NA
 5227385 5227386       mutH FALSE 0.006 294.000 0.034 1.000 N NA
 5227387 5227388     nudH ptsP FALSE 0.080 13.000 0.012 1.000 N NA
 5227388 5227389     ptsP lgt FALSE 0.003 224.000 0.003 1.000 N NA
 5227389 5227390     lgt thyA TRUE 0.615 37.000 0.164 1.000 N NA
 5227392 5227393     ppdA ppdB TRUE 0.907 53.000 0.368 NA Y NA
 5227393 5227394     ppdB   TRUE 0.974 -3.000 0.373 NA   NA
 5227395 5227396     ppdC   FALSE 0.407 57.000 0.076 NA   NA
 5227396 5227397       recC TRUE 0.979 -3.000 0.019 0.001   NA
 5227397 5227398     recC ptrA FALSE 0.292 70.000 0.092 1.000 N NA
 5227399 5227400         TRUE 0.880 -51.000 0.017 0.003   NA
 5227400 5227401         TRUE 0.998 -3.000 0.688 0.001   NA
 5227401 5227402         TRUE 0.625 -6.000 0.019 1.000   NA
 5227410 5227411         TRUE 0.792 44.000 0.375 1.000 N NA
 5227411 5227412         FALSE 0.117 85.000 0.000 1.000   NA
 5227413 5227414         TRUE 0.992 -3.000 1.000 1.000   NA
 5227414 5227415         TRUE 0.998 2.000 1.000 0.074 Y NA
 5227415 5227416         TRUE 0.956 50.000 0.300 0.074 Y NA
 5227417 5227418         FALSE 0.016 69.000 0.000 1.000 N NA
 5227419 5227420       csdA TRUE 0.986 4.000 0.122 0.001   NA
 5227421 5227422       gcvA FALSE 0.003 663.000 0.000 NA   NA
 5227422 5227423     gcvA   FALSE 0.320 103.000 0.081 NA   NA
 5227423 5227424         TRUE 0.896 -7.000 0.144 NA   NA
 5227425 5227426     ygdG   TRUE 0.575 72.000 0.178 NA   NA
 5227426 5227427         FALSE 0.038 318.000 0.079 NA   NA
 5227428 5227429     syd aepA FALSE 0.002 923.000 0.000 NA   NA
 5227429 5227430     aepA   FALSE 0.016 265.000 0.000 1.000   NA
 5227430 5227431         FALSE 0.106 92.000 0.000 NA   NA
 5227431 5227432         TRUE 0.941 -31.000 0.518 NA   NA
 5227432 5227433         TRUE 0.562 68.000 0.209 1.000 N NA
 5227434 5227435       dapD FALSE 0.106 156.000 0.035 NA   NA
 5227435 5227436     dapD glnD FALSE 0.512 29.000 0.097 1.000 N NA
 5227436 5227437     glnD map FALSE 0.517 114.000 0.243 1.000 N NA
 5227438 5227439     rpsB tsf TRUE 0.904 135.000 0.748 1.000 Y NA
 5227439 5227440     tsf pyrH FALSE 0.539 157.000 0.416 1.000 N NA
 5227440 5227441     pyrH frr TRUE 0.727 136.000 0.626 1.000 N NA
 5227441 5227442     frr   FALSE 0.032 246.000 0.032 1.000   NA
 5227442 5227443         FALSE 0.314 -30.000 0.007 NA   NA
 5227443 5227444       uppS FALSE 0.051 199.000 0.025 NA   NA
 5227444 5227445     uppS cdsA TRUE 0.982 10.000 0.400 1.000 Y NA
 5227445 5227446     cdsA ecfE FALSE 0.510 22.000 0.080 1.000 N NA
 5227446 5227447     ecfE ecfK TRUE 0.892 36.000 0.204 1.000 Y NA
 5227447 5227448     ecfK ompH TRUE 0.695 178.000 0.354 1.000 Y NA
 5227448 5227449     ompH lpxD TRUE 0.994 4.000 0.814 1.000 Y NA
 5227449 5227450     lpxD fabZ TRUE 0.837 102.000 0.796 1.000 N NA
 5227450 5227451     fabZ lpxA TRUE 0.968 -22.000 0.850 1.000 N NA
 5227451 5227452     lpxA lpxB TRUE 0.982 4.000 0.289 1.000 Y NA
 5227452 5227453     lpxB rnhB TRUE 0.776 21.000 0.186 1.000 N NA
 5227453 5227454     rnhB dnaE TRUE 0.688 86.000 0.104 1.000 Y NA
 5227454 5227455     dnaE accA TRUE 0.767 13.000 0.122 1.000 N NA
 5227455 5227456     accA   FALSE 0.010 127.000 0.008 1.000 N NA
 5227456 5227457       mesJ FALSE 0.090 -10.000 0.015 1.000 N NA
 5227459 5227460       cutF FALSE 0.140 71.000 0.017 NA   NA
 5227463 5227464         FALSE 0.518 -7.000 0.000 NA   NA
 5227464 5227465         FALSE 0.119 72.000 0.000 NA   NA
 5227465 5227466         FALSE 0.008 342.000 0.000 NA   NA
 5227467 5227468         FALSE 0.261 27.000 0.000 NA   NA
 5227468 5227469       phnA FALSE 0.084 121.000 0.000 NA   NA
 5227469 5227470     phnA mltB FALSE 0.008 139.000 0.004 NA N NA
 5227472 5227473         FALSE 0.014 79.000 0.000 1.000 N NA
 5227473 5227474         TRUE 0.931 -13.000 0.293 NA   NA
 5227474 5227475         TRUE 0.991 2.000 0.911 NA   NA
 5227475 5227476         TRUE 0.734 82.000 0.356 NA   NA
 5227476 5227477         FALSE 0.014 83.000 0.000 NA N NA
 5227478 5227479       uxuA FALSE 0.001 287.000 0.000 1.000 N NA
 5227482 5227483         TRUE 0.990 11.000 0.800 0.077 N NA
 5227483 5227484         TRUE 0.663 40.000 0.200 1.000 N NA
 5227484 5227485         FALSE 0.491 130.000 0.200 NA   NA
 5227485 5227486         TRUE 0.617 -3.000 0.000 NA   NA
 5227486 5227487         FALSE 0.193 -168.000 0.000 NA   NA
 5227488 5227489       ansB1 FALSE 0.023 216.000 0.043 1.000 N NA
 5227489 5227490     ansB1 aroL FALSE 0.096 282.000 0.000 1.000 Y NA
 5227490 5227491     aroL   FALSE 0.076 141.000 0.016 NA   NA
 5227491 5227492         FALSE 0.017 247.000 0.000 NA   NA
 5227492 5227493         TRUE 0.617 -3.000 0.000 NA   NA
 5227493 5227494         FALSE 0.155 -3.000 0.000 NA N NA
 5227499 5227500         TRUE 0.616 -3.000 0.009 NA   NA
 5227500 5227501       sbcD TRUE 0.987 -3.000 0.669 1.000   NA
 5227502 5227503     phoB phoR TRUE 0.983 28.000 0.453 0.080 Y NA
 5227503 5227504     phoR   TRUE 0.806 16.000 0.168 1.000 N NA
 5227504 5227505         FALSE 0.002 243.000 0.000 1.000 N NA
 5227505 5227506       brnQ FALSE 0.034 481.000 0.000 1.000 Y NA
 5227506 5227507     brnQ proY TRUE 0.873 142.000 0.261 0.077 Y NA
 5227508 5227509         FALSE 0.005 182.000 0.000 NA N NA
 5227509 5227510         FALSE 0.010 335.000 0.014 1.000   NA
 5227511 5227512     queA tgt TRUE 0.970 97.000 0.360 0.001 Y NA
 5227512 5227513     tgt   TRUE 0.564 127.000 0.325 NA N NA
 5227513 5227514       secD TRUE 0.796 28.000 0.045 NA Y NA
 5227514 5227515     secD secF TRUE 0.994 10.000 0.206 0.001 Y NA
 5227517 5227518       ribD TRUE 0.656 63.000 0.277 NA N NA
 5227518 5227519     ribD ribH TRUE 0.865 111.000 0.034 0.002 Y NA
 5227519 5227520     ribH nusB TRUE 0.862 25.000 0.347 1.000 N NA
 5227520 5227521     nusB thiL TRUE 0.587 69.000 0.225 1.000 N NA
 5227521 5227522     thiL pgpA TRUE 0.824 -25.000 0.206 1.000 N NA
 5227523 5227524     dxs ispA TRUE 0.868 19.000 0.060 1.000 Y NA
 5227524 5227525     ispA xseB FALSE 0.461 -3.000 0.035 1.000 N NA
 5227527 5227528     thiJ panE TRUE 0.781 -37.000 0.155 NA   NA
 5227530 5227531       cyoE FALSE 0.086 146.000 0.061 NA N NA
 5227531 5227532     cyoE cyoD TRUE 0.920 15.000 0.118 0.077 N NA
 5227532 5227533     cyoD cyoC TRUE 0.997 0.000 0.485 0.037 Y NA
 5227533 5227534     cyoC cyoB TRUE 0.996 -10.000 0.697 0.037 Y NA
 5227535 5227536     cyoA ampG FALSE 0.001 425.000 0.000 NA N NA
 5227536 5227537     ampG   TRUE 0.646 60.000 0.256 NA N NA
 5227538 5227539     bolA tig FALSE 0.001 316.000 0.000 NA N NA
 5227539 5227540     tig clpP FALSE 0.163 536.000 0.351 1.000 Y NA
 5227540 5227541     clpP clpX TRUE 0.733 164.000 0.352 1.000 Y NA
 5227541 5227542     clpX   FALSE 0.307 192.000 0.201 1.000   NA
 5227542 5227543       lon TRUE 0.942 -25.000 0.025 0.001   NA
 5227543 5227544     lon hupB FALSE 0.004 199.000 0.008 1.000 N NA
 5227544 5227545     hupB   FALSE 0.009 339.000 0.000 1.000   NA
 5227545 5227546         FALSE 0.398 -18.000 0.000 NA   NA
 5227546 5227547         FALSE 0.118 139.000 0.033 NA   NA
 5227547 5227548         FALSE 0.152 106.000 0.027 1.000   NA
 5227549 5227550         FALSE 0.122 100.000 0.016 1.000   NA
 5227551 5227552       mdlA FALSE 0.476 79.000 0.179 1.000 N NA
 5227552 5227553     mdlA mdlB TRUE 0.996 -37.000 0.911 0.008 Y NA
 5227553 5227554     mdlB glnK FALSE 0.002 376.000 0.028 1.000 N NA
 5227558 5227559       hha FALSE 0.003 744.000 0.000 NA   NA
 5227559 5227560     hha   TRUE 0.668 54.000 0.200 NA   NA
 5227560 5227561       rpmJ2 FALSE 0.003 600.000 0.000 NA   NA
 5227561 5227562     rpmJ2 rpmE2 TRUE 0.938 18.000 0.083 0.011   NA
 5227562 5227563     rpmE2 acrB FALSE 0.003 219.000 0.008 1.000 N NA
 5227563 5227564     acrB acrA TRUE 0.895 29.000 0.500 1.000 N NA
 5227566 5227567       priC TRUE 0.891 36.000 0.474 NA   NA
 5227568 5227569       apt FALSE 0.061 213.000 0.043 NA   NA
 5227569 5227570     apt dnaX FALSE 0.273 72.000 0.088 1.000 N NA
 5227570 5227571     dnaX   TRUE 0.856 41.000 0.411 NA   NA
 5227571 5227572         FALSE 0.238 346.000 0.604 NA   NA
 5227572 5227573       htpG FALSE 0.073 175.000 0.028 1.000   NA
 5227573 5227574     htpG adk FALSE 0.008 264.000 0.035 1.000 N NA
 5227574 5227575     adk hemH FALSE 0.003 222.000 0.008 1.000 N NA
 5227578 5227579         FALSE 0.012 293.000 0.000 1.000   NA
 5227579 5227580         TRUE 0.707 143.000 0.531 NA   NA
 5227580 5227581         TRUE 0.879 17.000 0.212 NA   NA
 5227581 5227582       pehN FALSE 0.014 267.000 0.000 NA   NA
 5227583 5227584         FALSE 0.160 71.000 0.022 NA   NA
 5227584 5227585       copA FALSE 0.055 174.000 0.018 NA   NA
 5227587 5227588         TRUE 0.987 0.000 0.313 NA Y NA
 5227588 5227589         FALSE 0.008 141.000 0.017 NA N NA
 5227589 5227590       nrdB FALSE 0.398 4.000 0.034 1.000 N NA
 5227590 5227591     nrdB nrdA TRUE 0.980 123.000 0.667 0.001 Y NA
 5227591 5227592     nrdA ubiG FALSE 0.001 351.000 0.000 1.000 N NA
 5227593 5227594     gyrA rcsC FALSE 0.011 116.000 0.013 1.000 N NA
 5227595 5227596     rcsB   TRUE 0.989 9.000 0.558 1.000 Y NA
 5227596 5227597         FALSE 0.300 96.000 0.070 NA   NA
 5227597 5227598         TRUE 0.781 14.000 0.093 NA   NA
 5227598 5227599         TRUE 0.626 0.000 0.000 NA   NA
 5227600 5227601     menF menD FALSE 0.430 246.000 0.281 1.000 Y NA
 5227601 5227602     menD   FALSE 0.424 200.000 0.355 NA   NA
 5227602 5227603       menB TRUE 0.950 6.000 0.280 NA   NA
 5227603 5227604     menB menC TRUE 0.991 0.000 0.008 0.001 Y NA
 5227604 5227605     menC menE TRUE 0.943 -12.000 0.005 0.001 N NA
 5227605 5227606     menE   FALSE 0.432 13.000 0.000 NA   NA
 5227606 5227607         FALSE 0.042 177.000 0.000 NA   NA
 5227610 5227611         FALSE 0.399 110.000 0.118 1.000   NA
 5227611 5227612       tesA TRUE 0.567 29.000 0.072 1.000   NA
 5227613 5227614         TRUE 0.992 -3.000 0.535 NA Y NA
 5227615 5227616     speG   FALSE 0.006 169.000 0.014 1.000 N NA
 5227616 5227617         TRUE 0.846 -100.000 0.128 1.000 Y NA
 5227617 5227618       purN FALSE 0.002 264.000 0.000 1.000 N NA
 5227618 5227619     purN purM TRUE 0.997 0.000 0.230 0.002 Y NA
 5227621 5227622     uraA   FALSE 0.102 90.000 0.048 NA N NA
 5227623 5227624         TRUE 0.590 9.000 0.021 1.000   NA
 5227624 5227625         FALSE 0.058 152.000 0.000 NA   NA
 5227625 5227626         TRUE 0.954 -39.000 0.714 NA   NA
 5227626 5227627       bcp FALSE 0.012 291.000 0.000 1.000   NA
 5227627 5227628     bcp gcvR FALSE 0.109 193.000 0.102 1.000 N NA
 5227629 5227630     dapA nlpB TRUE 0.834 17.000 0.014 NA Y NA
 5227630 5227631     nlpB purC FALSE 0.008 144.000 0.006 NA N NA
 5227631 5227632     purC   FALSE 0.024 220.000 0.000 NA   NA
 5227632 5227633         TRUE 0.780 15.000 0.100 NA   NA
 5227634 5227635         FALSE 0.036 190.000 0.000 NA   NA
 5227635 5227636         FALSE 0.010 128.000 0.000 1.000 N NA
 5227636 5227637         TRUE 0.995 15.000 0.750 0.089 Y NA
 5227637 5227638         TRUE 0.766 61.000 0.082 0.012 N NA
 5227638 5227639         FALSE 0.009 218.000 0.033 NA N NA
 5227639 5227640         TRUE 0.929 1.000 0.200 NA N NA
 5227641 5227642         TRUE 0.617 -3.000 0.000 NA   NA
 5227642 5227643         FALSE 0.242 -70.000 0.000 1.000   NA
 5227643 5227644         FALSE 0.136 314.000 0.071 0.089   NA
 5227644 5227645         FALSE 0.236 34.000 0.000 1.000   NA
 5227647 5227648         FALSE 0.050 164.000 0.000 NA   NA
 5227649 5227650         TRUE 0.942 -7.000 0.000 0.014   NA
 5227651 5227652       dapE TRUE 0.980 0.000 0.163 0.023 N NA
 5227652 5227653     dapE   TRUE 0.954 2.000 0.292 1.000 N NA
 5227653 5227654         FALSE 0.001 464.000 0.000 1.000 N NA
 5227658 5227659     lipA lipB TRUE 0.853 227.000 0.319 0.001 Y NA
 5227659 5227660     lipB   FALSE 0.398 166.000 0.219 NA   NA
 5227660 5227661       dacA FALSE 0.250 137.000 0.081 NA   NA
 5227661 5227662     dacA rlpA TRUE 0.782 167.000 0.475 NA Y NA
 5227662 5227663     rlpA mrdB FALSE 0.257 14.000 0.035 NA N NA
 5227663 5227664     mrdB mrdA FALSE 0.479 10.000 0.046 1.000 N NA
 5227664 5227665     mrdA   FALSE 0.335 34.000 0.031 NA   NA
 5227665 5227666         TRUE 0.967 2.000 0.307 NA   NA
 5227666 5227667       nadD FALSE 0.061 195.000 0.032 NA   NA
 5227667 5227668     nadD holA FALSE 0.296 -33.000 0.045 1.000 N NA
 5227668 5227669     holA rlpB TRUE 0.591 53.000 0.199 NA N NA
 5227669 5227670     rlpB leuS TRUE 0.827 15.000 0.182 NA N NA
 5227672 5227673     gltL gltK TRUE 0.954 26.000 0.379 1.000 Y NA
 5227673 5227674     gltK gltJ TRUE 0.998 4.000 0.933 0.020 Y NA
 5227674 5227675     gltJ gltI TRUE 0.622 219.000 0.150 0.073 Y NA
 5227675 5227676     gltI lnt FALSE 0.001 453.000 0.000 1.000 N NA
 5227676 5227677     lnt corC TRUE 0.969 8.000 0.557 1.000 N NA
 5227677 5227678     corC   FALSE 0.416 128.000 0.150 NA   NA
 5227678 5227679         TRUE 0.979 -3.000 0.457 NA   NA
 5227679 5227680         FALSE 0.075 331.000 0.220 1.000 N NA
 5227682 5227683       tRNA-Gln FALSE 0.108 87.000 0.000 NA   NA
 5227683 5227684     tRNA-Gln tRNA-Met FALSE 0.520 7.000 0.000 NA   NA
 5227684 5227685     tRNA-Met tRNA-Gln FALSE 0.149 54.000 0.000 NA   NA
 5227685 5227686     tRNA-Gln tRNA-Gln FALSE 0.207 36.000 0.000 NA   NA
 5227686 5227687     tRNA-Gln tRNA-Leu FALSE 0.143 57.000 0.000 NA   NA
 5227687 5227688     tRNA-Leu tRNA-Met FALSE 0.498 9.000 0.000 NA   NA
 5227688 5227689     tRNA-Met   FALSE 0.024 220.000 0.000 NA   NA
 5227689 5227690         FALSE 0.306 -31.000 0.008 NA   NA
 5227690 5227691         TRUE 0.936 -25.000 0.008 0.001   NA
 5227691 5227692       nagC FALSE 0.033 204.000 0.000 1.000   NA
 5227692 5227693     nagC nagA TRUE 0.912 96.000 0.571 1.000 Y NA
 5227693 5227694     nagA nagB TRUE 0.996 16.000 0.557 0.001 Y NA
 5227695 5227696     nagE glnS FALSE 0.005 176.000 0.018 1.000 N NA
 5227697 5227698     fur fldA FALSE 0.049 330.000 0.156 1.000 N NA
 5227700 5227701         FALSE 0.162 291.000 0.276 1.000   NA
 5227703 5227704         TRUE 0.978 -3.000 0.007 0.001   NA
 5227705 5227706       kdpE FALSE 0.467 83.000 0.129 NA   NA
 5227706 5227707     kdpE kdpD TRUE 0.985 6.000 0.385 1.000 Y NA
 5227708 5227709     kdpC kdpB TRUE 0.997 20.000 0.877 0.001 Y NA
 5227709 5227710     kdpB kdpA TRUE 0.991 16.000 0.201 0.001 Y NA
 5227712 5227713         TRUE 0.930 90.000 0.750 0.073 N NA
 5227713 5227714         TRUE 0.856 17.000 0.226 1.000 N NA
 5227715 5227716       phrB FALSE 0.364 22.000 0.019 NA   NA
 5227716 5227717     phrB   FALSE 0.329 -64.000 0.027 NA   NA
 5227717 5227718         FALSE 0.096 186.000 0.050 NA   NA
 5227718 5227719         TRUE 0.986 -6.000 0.379 NA Y NA
 5227719 5227720         TRUE 0.915 -10.000 0.211 NA   NA
 5227720 5227721       pcp FALSE 0.291 30.000 0.017 1.000   NA
 5227721 5227722     pcp nei FALSE 0.089 44.000 0.033 1.000 N NA
 5227722 5227723     nei   FALSE 0.066 16.000 0.000 NA N NA
 5227725 5227726     sdhC sdhD TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 5227726 5227727     sdhD sdhA TRUE 0.999 0.000 0.705 0.003 Y NA
 5227727 5227728     sdhA sdhB TRUE 0.996 17.000 0.604 0.003 Y NA
 5227728 5227729     sdhB sucA FALSE 0.154 277.000 0.067 1.000 Y NA
 5227729 5227730     sucA sucB TRUE 0.985 16.000 0.667 1.000 Y NA
 5227730 5227731     sucB sucC FALSE 0.441 198.000 0.136 1.000 Y NA
 5227731 5227732     sucC sucD TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 5227732 5227733     sucD   FALSE 0.024 228.000 0.000 1.000   NA
 5227733 5227734         FALSE 0.003 723.000 0.000 1.000   NA
 5227734 5227735         TRUE 0.853 -36.000 0.000 0.028   NA
 5227735 5227736       cydB1 TRUE 0.971 14.000 0.217 0.037   NA
 5227736 5227737     cydB1   TRUE 0.797 -120.000 0.261 NA   NA
 5227737 5227738         TRUE 0.925 -3.000 0.140 NA   NA
 5227738 5227739         FALSE 0.288 134.000 0.095 NA   NA
 5227739 5227740       tolQ TRUE 0.985 -3.000 0.593 1.000   NA
 5227740 5227741     tolQ tolR TRUE 0.994 13.000 0.556 0.088 Y NA
 5227741 5227742     tolR tolA FALSE 0.360 65.000 0.114 NA N NA
 5227742 5227743     tolA tolB FALSE 0.073 138.000 0.051 NA N NA
 5227743 5227744     tolB pal TRUE 0.880 41.000 0.592 1.000 N NA
 5227744 5227745     pal   TRUE 0.819 10.000 0.088 1.000   NA
 5227745 5227746       tRNA-Lys FALSE 0.042 176.000 0.000 NA   NA
 5227746 5227747     tRNA-Lys tRNA-Lys FALSE 0.155 52.000 0.000 NA   NA
 5227750 5227751     nadA pnuC FALSE 0.237 202.000 0.023 1.000 Y NA
 5227754 5227755     gpmA cusA FALSE 0.008 138.000 0.009 1.000 N NA
 5227755 5227756     cusA cusB TRUE 0.990 -3.000 1.000 1.000 N NA
 5227756 5227757     cusB   TRUE 0.981 -48.000 0.857 1.000 Y NA
 5227757 5227758         TRUE 0.954 13.000 0.429 NA   NA
 5227758 5227759         TRUE 0.881 42.000 0.500 NA   NA
 5227759 5227760       galM FALSE 0.236 139.000 0.079 NA   NA
 5227760 5227761     galM galE TRUE 0.659 120.000 0.000 0.001 N NA
 5227761 5227762     galE modF FALSE 0.051 199.000 0.023 1.000   NA
 5227762 5227763     modF modE FALSE 0.285 41.000 0.028 1.000   NA
 5227763 5227764     modE   FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 5227765 5227766     modA modB TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 5227766 5227767     modB modC TRUE 0.995 -34.000 0.537 0.001 Y NA
 5227767 5227768     modC   FALSE 0.002 238.000 0.000 NA N NA
 5227769 5227770         FALSE 0.333 126.000 0.104 1.000   NA
 5227770 5227771         TRUE 0.912 -3.000 0.120 NA   NA
 5227771 5227772         FALSE 0.303 137.000 0.107 NA   NA
 5227776 5227777         TRUE 0.869 15.000 0.177 NA   NA
 5227778 5227779     fdnI fdnH TRUE 0.994 -7.000 0.190 0.001 Y NA
 5227779 5227780     fdnH fdnG TRUE 0.992 13.000 0.190 0.001 Y NA
 5227780 5227781     fdnG metG FALSE 0.106 280.000 0.000 0.038 N NA
 5227782 5227783       udk FALSE 0.076 188.000 0.073 1.000 N NA
 5227783 5227784     udk dcd TRUE 0.644 108.000 0.098 1.000 Y NA
 5227784 5227785     dcd asmA FALSE 0.166 64.000 0.057 NA N NA
 5227785 5227786     asmA dcuC FALSE 0.002 264.000 0.000 NA N NA
 5227787 5227788         TRUE 0.986 -3.000 0.614 NA   NA
 5227788 5227789         FALSE 0.097 113.000 0.000 1.000   NA
 5227790 5227791       wza FALSE 0.279 175.000 0.000 1.000 Y NA
 5227791 5227792     wza wzb TRUE 0.951 9.000 0.400 1.000 N NA
 5227792 5227793     wzb wzc TRUE 0.956 17.000 0.667 1.000 N NA
 5227793 5227794     wzc rfbA TRUE 0.744 28.000 0.000 1.000 Y NA
 5227794 5227795     rfbA   FALSE 0.545 5.000 0.000 NA   NA
 5227795 5227796         TRUE 0.617 -3.000 0.000 NA   NA
 5227796 5227797         FALSE 0.002 233.000 0.000 1.000 N NA
 5227797 5227798         TRUE 0.902 -3.000 0.106 1.000   NA
 5227798 5227799         FALSE 0.254 28.000 0.000 NA   NA
 5227799 5227800         TRUE 0.609 2.000 0.000 NA   NA
 5227800 5227801         FALSE 0.128 67.000 0.000 NA   NA
 5227801 5227802         FALSE 0.006 383.000 0.000 1.000   NA
 5227802 5227803         TRUE 0.940 8.000 0.000 0.015   NA
 5227803 5227804         TRUE 0.962 0.000 0.000 0.015   NA
 5227804 5227805         TRUE 0.804 20.000 0.000 1.000 Y NA
 5227805 5227806         TRUE 0.988 3.000 0.000 0.002 Y NA
 5227806 5227807         TRUE 0.953 2.000 0.217 1.000   NA
 5227807 5227808         FALSE 0.123 206.000 0.084 1.000   NA
 5227808 5227809         TRUE 0.958 2.000 0.073 NA Y NA
 5227809 5227810         FALSE 0.512 7.000 0.049 NA N NA
 5227810 5227811       galF FALSE 0.001 290.000 0.000 1.000 N NA
 5227811 5227812     galF gnd FALSE 0.002 231.000 0.000 1.000 N NA
 5227812 5227813     gnd   FALSE 0.006 392.000 0.000 NA   NA
 5227813 5227814         FALSE 0.116 76.000 0.000 NA   NA
 5227814 5227815         TRUE 0.974 10.000 0.600 NA   NA
 5227815 5227816         TRUE 0.835 -3.000 0.060 NA   NA
 5227816 5227817         FALSE 0.006 392.000 0.000 NA   NA
 5227817 5227818         FALSE 0.353 19.000 0.000 1.000   NA
 5227818 5227819         FALSE 0.012 297.000 0.000 1.000   NA
 5227819 5227820         FALSE 0.098 111.000 0.000 1.000   NA
 5227820 5227821       adrA FALSE 0.026 222.000 0.000 1.000   NA
 5227822 5227823         FALSE 0.009 329.000 0.000 1.000   NA
 5227823 5227824         FALSE 0.175 48.000 0.000 1.000   NA
 5227825 5227826         TRUE 0.926 -31.000 0.000 0.001   NA
 5227827 5227828         TRUE 0.908 -31.000 0.023 0.004   NA
 5227829 5227830     idhA   TRUE 0.807 81.000 0.500 NA   NA
 5227830 5227831         TRUE 0.939 67.000 0.667 NA Y NA
 5227831 5227832         TRUE 0.881 101.000 0.444 1.000 Y NA
 5227832 5227833         TRUE 0.735 35.000 0.176 1.000   NA
 5227833 5227834         FALSE 0.417 45.000 0.064 1.000   NA
 5227835 5227836     mocC   TRUE 0.837 57.000 0.199 1.000 Y NA
 5227837 5227838         TRUE 0.985 0.000 0.591 NA   NA
 5227838 5227839         FALSE 0.015 78.000 0.000 1.000 N NA
 5227839 5227840         FALSE 0.199 22.000 0.035 1.000 N NA
 5227840 5227841         TRUE 0.961 -16.000 0.043 0.072 Y NA
 5227841 5227842         FALSE 0.022 235.000 0.000 1.000   NA
 5227842 5227843         TRUE 0.882 95.000 0.833 1.000   NA
 5227843 5227844         TRUE 0.935 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5227844 5227845         TRUE 0.967 -13.000 0.000 0.013 Y NA
 5227847 5227848         TRUE 0.961 11.000 0.444 NA   NA
 5227853 5227854         TRUE 0.962 -58.000 0.378 0.028   NA
 5227854 5227855         TRUE 0.827 95.000 0.185 0.028   NA
 5227855 5227856         TRUE 0.959 8.000 0.074 0.028   NA
 5227857 5227858     lacY lacZ TRUE 0.606 116.000 0.261 1.000   NA
 5227858 5227859     lacZ   TRUE 0.796 62.000 0.087 0.022   NA
 5227859 5227860       lacI FALSE 0.068 314.000 0.130 1.000   NA
 5227860 5227861     lacI afuC FALSE 0.003 226.000 0.000 1.000 N NA
 5227861 5227862     afuC afuB TRUE 0.983 6.000 0.381 0.072 N NA
 5227862 5227863     afuB afuA TRUE 0.896 202.000 0.667 0.072 Y NA
 5227863 5227864     afuA uhpC TRUE 0.827 38.000 0.407 NA N NA
 5227864 5227865     uhpC uhpB TRUE 0.798 90.000 0.611 NA N NA
 5227865 5227866     uhpB uhpA TRUE 0.998 4.000 0.900 0.014 Y NA
 5227867 5227868     nlpA pnl FALSE 0.003 225.000 0.000 NA N NA
 5227871 5227872     gltP   FALSE 0.000 662.000 0.000 1.000 N NA
 5227872 5227873       citM FALSE 0.001 276.000 0.000 1.000 N NA
 5227873 5227874     citM   FALSE 0.003 690.000 0.000 1.000   NA
 5227875 5227876         FALSE 0.000 505.000 0.000 NA N NA
 5227876 5227877         FALSE 0.275 246.000 0.133 NA Y NA
 5227877 5227878         TRUE 0.583 158.000 0.386 NA   NA
 5227878 5227879         TRUE 0.984 3.000 0.625 NA   NA
 5227879 5227880         TRUE 0.977 -76.000 0.878 NA Y NA
 5227880 5227881         TRUE 0.970 5.000 0.175 NA Y NA
 5227881 5227882         TRUE 0.641 -13.000 0.078 1.000 N NA
 5227883 5227884         TRUE 0.675 67.000 0.316 NA N NA
 5227885 5227886     cbl gltP FALSE 0.001 422.000 0.000 1.000 N NA
 5227887 5227888         FALSE 0.137 129.000 0.068 1.000 N NA
 5227888 5227889         TRUE 0.981 -40.000 0.795 1.000 Y NA
 5227889 5227890         TRUE 0.895 24.000 0.132 NA Y NA
 5227891 5227892       tauA FALSE 0.014 79.000 0.000 1.000 N NA
 5227892 5227893     tauA tauC TRUE 0.979 7.000 0.074 0.072 Y NA
 5227893 5227894     tauC tauB TRUE 0.979 -21.000 0.500 1.000 Y NA
 5227894 5227895     tauB   FALSE 0.047 22.000 0.000 1.000 N NA
 5227895 5227896         TRUE 0.962 -3.000 0.333 1.000 N NA
 5227897 5227898     dcuB hasF FALSE 0.003 718.000 0.000 1.000   NA
 5227898 5227899     hasF hasE TRUE 0.948 3.000 0.000 0.009 N NA
 5227899 5227900     hasE hasD TRUE 0.976 65.000 1.000 0.009   NA
 5227901 5227902     hasA hasR TRUE 0.705 118.000 0.400 NA   NA
 5227902 5227903     hasR   FALSE 0.319 261.000 0.200 NA Y NA
 5227903 5227904         TRUE 0.856 100.000 0.875 NA N NA
 5227905 5227906         FALSE 0.001 328.000 0.000 1.000 N NA
 5227906 5227907         FALSE 0.000 824.000 0.000 1.000 N NA
 5227909 5227910       proP FALSE 0.002 275.000 0.000 1.000 N NA
 5227910 5227911     proP   FALSE 0.110 83.000 0.000 NA   NA
 5227912 5227913     amn   FALSE 0.010 121.000 0.000 1.000 N NA
 5227913 5227914         TRUE 0.971 38.000 0.353 0.072 Y NA
 5227914 5227915         TRUE 0.811 11.000 0.137 NA N NA
 5227915 5227916         TRUE 0.676 85.000 0.095 NA Y NA
 5227916 5227917         TRUE 0.995 -3.000 0.250 0.026 Y NA
 5227917 5227918         FALSE 0.038 187.000 0.000 NA   NA
 5227918 5227919         FALSE 0.170 45.000 0.000 NA   NA
 5227919 5227920       astC TRUE 0.793 17.000 0.119 1.000   NA
 5227920 5227921     astC atsB TRUE 0.989 -3.000 0.357 1.000 Y NA
 5227924 5227925     cdh   FALSE 0.002 271.000 0.000 1.000 N NA
 5227925 5227926         FALSE 0.056 155.000 0.000 NA   NA
 5227926 5227927         FALSE 0.023 224.000 0.000 NA   NA
 5227928 5227929         TRUE 0.617 -3.000 0.000 NA   NA
 5227929 5227930         FALSE 0.334 -28.000 0.000 NA   NA
 5227931 5227932         FALSE 0.086 119.000 0.000 NA   NA
 5227934 5227935         TRUE 0.940 -3.000 0.174 NA   NA
 5227935 5227936         TRUE 0.973 -3.000 0.364 NA   NA
 5227936 5227937         TRUE 0.938 -10.000 0.286 NA   NA
 5227937 5227938         TRUE 0.635 21.000 0.071 NA   NA
 5227940 5227941         FALSE 0.049 165.000 0.000 NA   NA
 5227942 5227943         FALSE 0.008 354.000 0.000 1.000   NA
 5227947 5227948         FALSE 0.517 120.000 0.200 NA   NA
 5227949 5227950         FALSE 0.347 239.000 0.000 0.075 Y NA
 5227951 5227952         FALSE 0.003 213.000 0.000 1.000 N NA
 5227952 5227953         FALSE 0.056 162.000 0.000 1.000   NA
 5227953 5227954         FALSE 0.086 177.000 0.039 NA   NA
 5227954 5227955         FALSE 0.034 198.000 0.000 NA   NA
 5227955 5227956         TRUE 0.871 -3.000 0.120 1.000 N NA
 5227959 5227960     metE   TRUE 0.946 31.000 0.775 NA   NA
 5227960 5227961         FALSE 0.006 375.000 0.000 NA   NA
 5227962 5227963         FALSE 0.010 125.000 0.000 1.000 N NA
 5227964 5227965         FALSE 0.510 87.000 0.000 1.000 Y NA
 5227966 5227967         FALSE 0.466 -10.000 0.000 NA   NA
 5227968 5227969         FALSE 0.003 615.000 0.000 1.000   NA
 5227970 5227971         FALSE 0.410 -16.000 0.000 NA   NA
 5227971 5227972         TRUE 0.588 3.000 0.000 NA   NA
 5227973 5227974         FALSE 0.003 714.000 0.000 NA   NA
 5227975 5227976         FALSE 0.286 233.000 0.000 0.006   NA
 5227979 5227980         TRUE 0.855 12.000 0.133 NA   NA
 5227980 5227981         FALSE 0.413 48.000 0.067 1.000   NA
 5227983 5227984         TRUE 0.999 -7.000 0.793 0.001 Y NA
 5227986 5227987     nac   FALSE 0.006 384.000 0.000 NA   NA
 5227989 5227990     tRNA-Lys   FALSE 0.004 467.000 0.000 NA   NA
 5227992 5227993     expA uvrC TRUE 0.744 -7.000 0.086 1.000 N NA
 5227993 5227994     uvrC pgsA TRUE 0.627 59.000 0.227 1.000 N NA
 5227994 5227995     pgsA tRNA-Gly FALSE 0.066 140.000 0.000 NA   NA
 5227995 5227996     tRNA-Gly tRNA-Cys FALSE 0.155 52.000 0.000 NA   NA
 5227996 5227997     tRNA-Cys tRNA-Leu FALSE 0.498 9.000 0.000 NA   NA
 5227998 5227999         FALSE 0.462 11.000 0.000 NA   NA
 5228000 5228001         FALSE 0.191 40.000 0.000 NA   NA
 5228001 5228002         TRUE 0.985 2.000 0.625 NA   NA
 5228002 5228003         FALSE 0.102 98.000 0.000 NA   NA
 5228003 5228004         TRUE 0.588 3.000 0.000 NA   NA
 5228004 5228005         FALSE 0.004 536.000 0.000 NA   NA
 5228006 5228007         TRUE 0.905 -3.000 0.111 NA   NA
 5228007 5228008         TRUE 0.949 -49.000 0.750 NA   NA
 5228008 5228009         TRUE 0.983 -10.000 0.875 NA   NA
 5228009 5228010         TRUE 0.987 3.000 0.714 NA   NA
 5228010 5228011         TRUE 0.970 -16.000 0.667 NA   NA
 5228011 5228012         TRUE 0.927 25.000 0.500 NA   NA
 5228012 5228013         TRUE 0.874 3.000 0.091 NA   NA
 5228013 5228014         TRUE 0.980 4.000 0.182 0.047   NA
 5228014 5228015         TRUE 0.683 51.000 0.200 NA   NA
 5228015 5228016         FALSE 0.007 365.000 0.000 NA   NA
 5228016 5228017         FALSE 0.320 22.000 0.000 1.000   NA
 5228018 5228019         FALSE 0.155 52.000 0.000 NA   NA
 5228019 5228020         FALSE 0.020 234.000 0.000 NA   NA
 5228020 5228021         FALSE 0.217 -168.000 0.016 NA   NA
 5228022 5228023         FALSE 0.013 276.000 0.000 NA   NA
 5228026 5228027       flhD FALSE 0.003 811.000 0.000 NA   NA
 5228027 5228028     flhD flhC TRUE 0.992 4.000 0.250 0.001   NA
 5228028 5228029     flhC motA FALSE 0.192 323.000 0.408 1.000   NA
 5228029 5228030     motA motB TRUE 0.990 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 5228030 5228031     motB cheA TRUE 0.982 28.000 0.913 1.000 Y NA
 5228032 5228033       cheD TRUE 0.854 62.000 0.095 0.003   NA
 5228033 5228034     cheD cheR FALSE 0.032 514.000 0.000 1.000 Y NA
 5228034 5228035     cheR cheB TRUE 0.965 0.000 0.087 1.000 Y NA
 5228035 5228036     cheB cheY TRUE 0.943 39.000 0.091 0.010 Y NA
 5228036 5228037     cheY cheZ TRUE 0.929 10.000 0.068 1.000 Y NA
 5228037 5228038     cheZ flhB FALSE 0.133 245.000 0.000 1.000 Y NA
 5228038 5228039     flhB flhA TRUE 0.994 -7.000 0.287 0.010 Y NA
 5228039 5228040     flhA flhE TRUE 0.978 -3.000 0.035 0.002   NA
 5228041 5228042     flgN flgM TRUE 0.997 6.000 0.361 0.002 Y NA
 5228042 5228043     flgM flgA TRUE 0.768 142.000 0.330 NA Y NA
 5228044 5228045     flgB flgC TRUE 0.995 29.000 0.824 0.003 Y NA
 5228045 5228046     flgC flgD TRUE 0.947 16.000 0.186 NA Y NA
 5228046 5228047     flgD flgE TRUE 0.553 75.000 0.023 NA Y NA
 5228047 5228048     flgE flgF TRUE 0.974 22.000 0.095 0.003 Y NA
 5228048 5228049     flgF flgG TRUE 0.991 28.000 0.420 0.001 Y NA
 5228049 5228050     flgG flgH TRUE 0.881 175.000 0.268 0.005 Y NA
 5228050 5228051     flgH flgI TRUE 0.969 17.000 0.037 0.006 Y NA
 5228051 5228052     flgI flgJ TRUE 0.988 0.000 0.018 0.006 Y NA
 5228052 5228053     flgJ flgK TRUE 0.978 127.000 0.705 0.002 Y NA
 5228053 5228054     flgK flgL TRUE 0.976 32.000 0.142 0.001 Y NA
 5228055 5228056     fliR fliQ TRUE 0.989 3.000 0.028 0.002 Y NA
 5228056 5228057     fliQ fliP TRUE 0.995 21.000 0.827 0.010 Y NA
 5228057 5228058     fliP fliO TRUE 0.981 -3.000 0.203 1.000 Y NA
 5228058 5228059     fliO fliN TRUE 0.991 0.000 0.443 1.000 Y NA
 5228059 5228060     fliN fliM TRUE 0.993 -7.000 0.137 0.001 Y NA
 5228060 5228061     fliM fliL TRUE 0.999 6.000 0.957 0.001 Y NA
 5228061 5228062     fliL fliK TRUE 0.556 150.000 0.119 1.000 Y NA
 5228062 5228063     fliK fliJ TRUE 0.997 -3.000 0.317 0.005 Y NA
 5228063 5228064     fliJ fliI TRUE 0.936 9.000 0.073 1.000 Y NA
 5228064 5228065     fliI fliH TRUE 0.970 0.000 0.115 1.000 Y NA
 5228065 5228066     fliH   TRUE 0.982 -7.000 0.007 0.003 Y NA
 5228069 5228070     fliT fliS TRUE 0.971 0.000 0.324 1.000   NA
 5228070 5228071     fliS fliD TRUE 0.984 31.000 0.284 0.002 Y NA
 5228072 5228073     fliC   FALSE 0.003 226.000 0.000 1.000 N NA
 5228073 5228074       vioA FALSE 0.037 316.000 0.116 1.000 N NA
 5228074 5228075     vioA   FALSE 0.383 120.000 0.123 NA   NA
 5228075 5228076         TRUE 0.770 3.000 0.043 NA   NA
 5228076 5228077         FALSE 0.090 113.000 0.000 NA   NA
 5228077 5228078         FALSE 0.446 -12.000 0.000 NA   NA
 5228078 5228079         TRUE 0.678 -3.000 0.017 1.000   NA
 5228079 5228080         FALSE 0.124 69.000 0.000 NA   NA
 5228080 5228081         FALSE 0.215 35.000 0.000 NA   NA
 5228081 5228082       fliA FALSE 0.003 593.000 0.000 NA   NA
 5228082 5228083     fliA fliZ FALSE 0.155 205.000 0.108 1.000   NA
 5228083 5228084     fliZ phoH FALSE 0.004 532.000 0.000 1.000   NA
 5228085 5228086       betT FALSE 0.003 217.000 0.000 1.000 N NA
 5228088 5228089     betB betA TRUE 0.943 20.000 0.634 1.000 N NA
 5228089 5228090     betA   FALSE 0.053 160.000 0.000 NA   NA
 5228091 5228092     fabA   TRUE 0.609 92.000 0.290 1.000 N NA
 5228094 5228095     ompA sulA FALSE 0.001 333.000 0.000 1.000 N NA
 5228097 5228098         TRUE 0.689 21.000 0.090 NA   NA
 5228099 5228100         TRUE 0.743 71.000 0.000 0.003   NA
 5228101 5228102     mgsA   FALSE 0.177 138.000 0.055 NA   NA
 5228106 5228107         FALSE 0.443 110.000 0.140 1.000   NA
 5228108 5228109         FALSE 0.222 34.000 0.000 NA   NA
 5228110 5228111         FALSE 0.025 42.000 0.000 1.000 N NA
 5228111 5228112         TRUE 0.937 5.000 0.000 0.054   NA
 5228112 5228113         FALSE 0.053 165.000 0.000 1.000   NA
 5228114 5228115         FALSE 0.110 84.000 0.000 NA   NA
 5228116 5228117         FALSE 0.054 159.000 0.000 NA   NA
 5228117 5228118         FALSE 0.003 852.000 0.000 1.000   NA
 5228119 5228120         FALSE 0.213 85.000 0.040 NA   NA
 5228121 5228122     opgG opgH TRUE 0.962 -7.000 0.469 NA N NA
 5228123 5228124     htrB   FALSE 0.002 261.000 0.000 1.000 N NA
 5228126 5228127         FALSE 0.248 -118.000 0.019 NA   NA
 5228127 5228128         TRUE 0.945 27.000 0.676 NA   NA
 5228128 5228129         FALSE 0.002 948.000 0.000 NA   NA
 5228129 5228130       dinI FALSE 0.417 89.000 0.111 NA   NA
 5228130 5228131     dinI pyrC FALSE 0.155 107.000 0.031 NA   NA
 5228132 5228133         FALSE 0.108 89.000 0.000 NA   NA
 5228137 5228138       rpmF TRUE 0.960 17.000 0.599 NA   NA
 5228138 5228139     rpmF plsX TRUE 0.868 30.000 0.418 1.000 N NA
 5228139 5228140     plsX fabH TRUE 0.996 7.000 0.380 0.003 Y NA
 5228140 5228141     fabH fabD TRUE 0.986 18.000 0.182 0.003 Y NA
 5228141 5228142     fabD fabG TRUE 0.995 15.000 0.432 0.003 Y NA
 5228142 5228143     fabG acpP TRUE 0.925 155.000 0.321 0.003 Y NA
 5228143 5228144     acpP fabF TRUE 0.867 82.000 0.346 1.000 Y NA
 5228144 5228145     fabF pabC FALSE 0.396 128.000 0.187 1.000 N NA
 5228145 5228146     pabC   TRUE 0.890 15.000 0.204 1.000   NA
 5228146 5228147       tmk TRUE 0.986 -10.000 0.209 0.001   NA
 5228147 5228148     tmk holB TRUE 0.938 0.000 0.211 1.000 N NA
 5228148 5228149     holB   TRUE 0.899 20.000 0.110 NA Y NA
 5228149 5228150       ptsG FALSE 0.001 314.000 0.004 NA N NA
 5228152 5228153         FALSE 0.161 229.000 0.000 1.000 Y NA
 5228153 5228154         FALSE 0.232 100.000 0.051 NA   NA
 5228154 5228155         TRUE 0.982 -3.000 0.516 NA   NA
 5228155 5228156         TRUE 0.880 -40.000 0.310 NA   NA
 5228156 5228157       nagZ FALSE 0.203 73.000 0.069 1.000 N NA
 5228157 5228158     nagZ   FALSE 0.207 163.000 0.091 NA   NA
 5228158 5228159         FALSE 0.019 367.000 0.057 NA   NA
 5228159 5228160       ndh FALSE 0.395 -40.000 0.029 NA   NA
 5228160 5228161     ndh   FALSE 0.019 428.000 0.071 1.000   NA
 5228165 5228166         FALSE 0.064 149.000 0.000 1.000   NA
 5228167 5228168         FALSE 0.343 -40.000 0.018 1.000   NA
 5228169 5228170     lolC lolD TRUE 0.865 -76.000 0.175 0.085 N NA
 5228170 5228171     lolD lolE TRUE 0.966 -3.000 0.125 0.085 N NA
 5228171 5228172     lolE   TRUE 0.553 85.000 0.225 1.000 N NA
 5228172 5228173       cobB TRUE 0.942 12.000 0.119 1.000 Y NA
 5228175 5228176         FALSE 0.173 61.000 0.019 NA   NA
 5228176 5228177       btuC FALSE 0.009 133.000 0.000 1.000 N NA
 5228177 5228178     btuC btuE FALSE 0.324 52.000 0.084 1.000 N NA
 5228178 5228179     btuE   FALSE 0.492 1.000 0.036 1.000 N NA
 5228179 5228180       nlpC TRUE 0.733 -34.000 0.167 NA N NA
 5228180 5228181     nlpC   TRUE 0.586 19.000 0.091 NA N NA
 5228181 5228182         FALSE 0.009 136.000 0.000 NA N NA
 5228182 5228183         FALSE 0.034 188.000 0.006 NA   NA
 5228184 5228185     hmuV hmuU TRUE 0.974 -7.000 0.220 1.000 Y NA
 5228185 5228186     hmuU hmuT TRUE 0.996 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 5228186 5228187     hmuT hemS TRUE 0.989 -3.000 0.384 1.000 Y NA
 5228187 5228188     hemS aroH FALSE 0.003 217.000 0.000 1.000 N NA
 5228188 5228189     aroH   FALSE 0.223 204.000 0.165 NA   NA
 5228191 5228192     apbE   FALSE 0.004 519.000 0.000 NA   NA
 5228193 5228194         TRUE 0.884 0.000 0.129 NA N NA
 5228196 5228197     sufA sufB TRUE 0.619 14.000 0.041 NA   NA
 5228197 5228198     sufB sufC TRUE 0.899 83.000 0.466 1.000 Y NA
 5228198 5228199     sufC sufD TRUE 0.975 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 5228199 5228200     sufD sufS TRUE 0.930 0.000 0.193 1.000 N NA
 5228200 5228201     sufS sufE TRUE 0.747 34.000 0.183 NA   NA
 5228203 5228204     lpp pykF FALSE 0.001 314.000 0.000 1.000 N NA
 5228204 5228205     pykF   FALSE 0.012 286.000 0.000 NA   NA
 5228207 5228208     arbF arbB TRUE 0.958 36.000 0.562 1.000 Y NA
 5228208 5228209     arbB   FALSE 0.277 251.000 0.364 1.000   NA
 5228209 5228210         TRUE 0.943 8.000 0.000 0.012   NA
 5228210 5228211         FALSE 0.017 64.000 0.000 1.000 N NA
 5228211 5228212         FALSE 0.012 107.000 0.000 NA N NA
 5228212 5228213       nrfA FALSE 0.001 438.000 0.000 NA N NA
 5228213 5228214     nrfA nrfB TRUE 0.855 43.000 0.000 0.001   NA
 5228214 5228215     nrfB nrfC TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.001   NA
 5228215 5228216     nrfC nrfD TRUE 0.998 -3.000 0.927 0.001 N NA
 5228216 5228217     nrfD nrfE TRUE 0.907 19.000 0.400 1.000 N NA
 5228217 5228218     nrfE nrfF TRUE 0.972 -7.000 0.214 NA Y NA
 5228218 5228219     nrfF nrfG TRUE 0.961 27.000 0.464 NA Y NA
 5228219 5228220     nrfG   FALSE 0.027 615.000 0.000 1.000 Y NA
 5228220 5228221       ccmB TRUE 0.997 -12.000 0.503 0.002 Y NA
 5228221 5228222     ccmB ccmC TRUE 0.983 69.000 0.501 0.001 Y NA
 5228222 5228223     ccmC ccmD TRUE 0.977 -3.000 0.501 1.000 N NA
 5228223 5228224     ccmD ccmE TRUE 0.963 -3.000 0.344 1.000 N NA
 5228225 5228226     ccmF dsbE TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 5228226 5228227     dsbE ccmH1 TRUE 0.993 -3.000 0.578 NA Y NA
 5228227 5228228     ccmH1 ccmH2 TRUE 0.995 -3.000 0.727 NA Y NA
 5228229 5228230     napC napB TRUE 0.992 -3.000 0.490 1.000 Y NA
 5228230 5228231     napB napH TRUE 0.997 -3.000 0.316 0.003 Y NA
 5228231 5228232     napH napG TRUE 0.995 -13.000 0.795 0.003   NA
 5228232 5228233     napG   TRUE 0.940 6.000 0.000 0.027   NA
 5228233 5228234         TRUE 0.874 -28.000 0.000 0.027   NA
 5228234 5228235       napD TRUE 0.991 -3.000 0.875 1.000   NA
 5228235 5228236     napD   TRUE 0.935 -3.000 0.209 1.000 N NA
 5228237 5228238     narQ narP TRUE 0.823 88.000 0.000 0.014 Y NA
 5228239 5228240         TRUE 0.907 -9.000 0.000 0.073   NA
 5228242 5228243       tRNA-Val FALSE 0.020 236.000 0.000 NA   NA
 5228243 5228244     tRNA-Val   FALSE 0.017 246.000 0.000 NA   NA
 5228247 5228248       katB FALSE 0.005 444.000 0.000 1.000   NA
 5228250 5228251         FALSE 0.001 345.000 0.000 NA N NA
 5228251 5228252         TRUE 0.979 23.000 0.719 NA Y NA
 5228252 5228253         TRUE 0.995 -3.000 0.797 1.000 Y NA
 5228253 5228254         TRUE 0.931 14.000 0.314 NA   NA
 5228254 5228255         TRUE 0.690 0.000 0.020 NA   NA
 5228255 5228256         TRUE 0.985 -9.000 0.931 NA   NA
 5228256 5228257         FALSE 0.540 243.000 0.835 NA   NA
 5228258 5228259     tRNA-Val norM FALSE 0.052 161.000 0.000 NA   NA
 5228261 5228262     cfa purR FALSE 0.004 204.000 0.000 NA N NA
 5228262 5228263     purR   FALSE 0.509 -28.000 0.037 NA   NA
 5228266 5228267     rnt gloA FALSE 0.237 150.000 0.136 1.000 N NA
 5228268 5228269       hor FALSE 0.022 229.000 0.000 NA   NA
 5228271 5228272         FALSE 0.179 98.000 0.034 NA   NA
 5228272 5228273       pdxH FALSE 0.165 107.000 0.034 NA   NA
 5228273 5228274     pdxH tyrS FALSE 0.025 235.000 0.054 1.000 N NA
 5228274 5228275     tyrS pdxY FALSE 0.090 85.000 0.041 1.000 N NA
 5228277 5228278       acnA FALSE 0.094 285.000 0.000 1.000 Y NA
 5228278 5228279     acnA   FALSE 0.002 247.000 0.004 1.000 N NA
 5228281 5228282     pgpB   FALSE 0.002 262.000 0.000 NA N NA
 5228282 5228283         TRUE 0.777 45.000 0.280 NA   NA
 5228283 5228284         TRUE 0.967 0.000 0.292 NA   NA
 5228284 5228285         TRUE 0.989 -16.000 0.793 1.000 Y NA
 5228285 5228286         FALSE 0.447 163.000 0.075 1.000 Y NA
 5228286 5228287         TRUE 0.999 -7.000 0.860 0.001 Y NA
 5228287 5228288         TRUE 0.959 -15.000 0.596 1.000 N NA
 5228291 5228292         TRUE 0.980 -6.000 0.576 NA   NA
 5228292 5228293       pyrF FALSE 0.154 185.000 0.125 1.000 N NA
 5228293 5228294     pyrF   TRUE 0.580 3.000 0.045 1.000 N NA
 5228297 5228298         TRUE 0.870 38.000 0.000 0.001   NA
 5228298 5228299         FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 5228301 5228302       rnb FALSE 0.158 60.000 0.012 1.000   NA
 5228302 5228303     rnb   FALSE 0.023 237.000 0.053 1.000 N NA
 5228304 5228305         FALSE 0.028 212.000 0.000 NA   NA
 5228307 5228308         TRUE 0.933 35.000 0.341 1.000 Y NA
 5228309 5228310         TRUE 0.967 -3.000 0.000 0.007   NA
 5228310 5228311         TRUE 0.971 -3.000 0.071 0.035   NA
 5228311 5228312         TRUE 0.587 116.000 0.238 1.000   NA
 5228314 5228315     sapF sapD TRUE 0.998 -3.000 0.684 0.025 Y NA
 5228315 5228316     sapD sapC TRUE 0.984 17.000 0.667 1.000 Y NA
 5228316 5228317     sapC sapB TRUE 0.988 -13.000 0.284 0.070 Y NA
 5228317 5228318     sapB sapA TRUE 0.984 -3.000 0.264 0.070 N NA
 5228319 5228320         TRUE 0.617 -3.000 0.000 NA   NA
 5228320 5228321       ryhB2 FALSE 0.089 115.000 0.000 NA   NA
 5228321 5228322     ryhB2 celV FALSE 0.058 152.000 0.000 NA   NA
 5228324 5228325     pspA pspB TRUE 0.863 91.000 0.739 NA   NA
 5228325 5228326     pspB pspC TRUE 0.992 0.000 0.913 NA   NA
 5228327 5228328         FALSE 0.072 136.000 0.000 NA   NA
 5228328 5228329         FALSE 0.432 13.000 0.000 NA   NA
 5228329 5228330         FALSE 0.037 28.000 0.000 1.000 N NA
 5228330 5228331         TRUE 0.908 9.000 0.222 1.000 N NA
 5228332 5228333         TRUE 0.989 -3.000 0.791 NA   NA
 5228333 5228334         FALSE 0.053 160.000 0.000 NA   NA
 5228334 5228335       tyrR FALSE 0.334 198.000 0.070 1.000 Y NA
 5228336 5228337     tpx   FALSE 0.014 80.000 0.007 1.000 N NA
 5228338 5228339         TRUE 0.929 5.000 0.000 0.070   NA
 5228339 5228340       ydaN FALSE 0.109 125.000 0.019 1.000   NA
 5228340 5228341     ydaN   FALSE 0.105 122.000 0.019 NA   NA
 5228342 5228343         FALSE 0.006 377.000 0.000 NA   NA
 5228344 5228345         FALSE 0.017 249.000 0.000 NA   NA
 5228346 5228347     ldhA aer1 FALSE 0.011 112.000 0.000 1.000 N NA
 5228347 5228348     aer1 aer2 FALSE 0.208 370.000 0.000 0.011 Y NA
 5228348 5228349     aer2   FALSE 0.518 -7.000 0.000 NA   NA
 5228353 5228354         FALSE 0.165 47.000 0.000 NA   NA
 5228354 5228355         FALSE 0.000 472.000 0.000 1.000 N NA
 5228355 5228356         FALSE 0.030 205.000 0.000 NA   NA
 5228356 5228357       asr FALSE 0.005 405.000 0.000 NA   NA
 5228357 5228358     asr rstB FALSE 0.198 173.000 0.100 NA   NA
 5228358 5228359     rstB rstA TRUE 0.978 -3.000 0.181 1.000 Y NA
 5228360 5228361         FALSE 0.027 213.000 0.000 NA   NA
 5228362 5228363         TRUE 0.982 -3.000 0.500 NA   NA
 5228363 5228364         FALSE 0.014 79.000 0.000 1.000 N NA
 5228369 5228370         FALSE 0.011 294.000 0.000 NA   NA
 5228371 5228372     narL narX TRUE 0.997 -7.000 0.521 0.013 Y NA
 5228374 5228375     narG narH TRUE 0.998 0.000 0.412 0.001 Y NA
 5228375 5228376     narH narJ TRUE 0.990 -7.000 0.118 0.003 Y NA
 5228376 5228377     narJ narI TRUE 0.998 0.000 0.400 0.003 Y NA
 5228379 5228380         FALSE 0.014 81.000 0.000 1.000 N NA
 5228381 5228382         TRUE 0.982 -3.000 0.220 NA Y NA
 5228382 5228383         TRUE 0.880 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5228387 5228388         TRUE 0.920 -3.000 0.132 NA   NA
 5228388 5228389         FALSE 0.151 55.000 0.008 1.000   NA
 5228389 5228390         FALSE 0.399 -16.000 0.008 NA   NA
 5228390 5228391         TRUE 0.834 14.000 0.129 NA   NA
 5228391 5228392         FALSE 0.111 97.000 0.000 1.000   NA
 5228392 5228393         FALSE 0.001 386.000 0.000 1.000 N NA
 5228393 5228394         FALSE 0.239 194.000 0.000 1.000 Y NA
 5228395 5228396         TRUE 0.968 3.000 0.000 0.003   NA
 5228396 5228397       gabD TRUE 0.902 11.000 0.233 1.000 N NA
 5228397 5228398     gabD   FALSE 0.001 359.000 0.000 1.000 N NA
 5228398 5228399         TRUE 0.927 22.000 0.000 0.069 Y NA
 5228399 5228400         TRUE 0.940 27.000 0.072 0.069 Y NA
 5228400 5228401         FALSE 0.002 1140.000 0.000 NA   NA
 5228401 5228402         TRUE 0.915 -87.000 0.588 NA   NA
 5228403 5228404         FALSE 0.001 409.000 0.000 1.000 N NA
 5228404 5228405         FALSE 0.170 45.000 0.000 NA   NA
 5228406 5228407         TRUE 0.621 -49.000 0.087 1.000   NA
 5228407 5228408         TRUE 0.935 49.000 0.957 1.000   NA
 5228408 5228409         FALSE 0.025 42.000 0.000 1.000 N NA
 5228409 5228410         FALSE 0.001 288.000 0.000 NA N NA
 5228412 5228413         FALSE 0.194 39.000 0.000 NA   NA
 5228414 5228415     hrcU   TRUE 0.997 11.000 0.875 0.072 Y NA
 5228415 5228416       hrcS TRUE 0.991 7.000 0.273 0.072 Y NA
 5228416 5228417     hrcS hrcR TRUE 0.995 8.000 0.318 0.009 Y NA
 5228417 5228418     hrcR hrcQ TRUE 0.983 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 5228418 5228419     hrcQ hrpP TRUE 0.962 -25.000 0.667 NA   NA
 5228419 5228420     hrpP hrpO TRUE 0.987 -3.000 0.667 NA   NA
 5228420 5228421     hrpO   TRUE 0.929 -10.000 0.250 NA   NA
 5228421 5228422       hrcN FALSE 0.420 -15.000 0.000 NA   NA
 5228422 5228423     hrcN hrpQ TRUE 0.962 0.000 0.250 NA   NA
 5228423 5228424     hrpQ hrpI TRUE 0.937 9.000 0.250 NA   NA
 5228424 5228425     hrpI hrpJ TRUE 0.568 70.000 0.167 1.000   NA
 5228426 5228427     hrpL hrpX FALSE 0.231 182.000 0.000 0.074 N NA
 5228427 5228428     hrpX hrpY TRUE 0.907 37.000 0.000 0.013 Y NA
 5228428 5228429     hrpY hrpS FALSE 0.178 369.000 0.000 0.041 Y NA
 5228431 5228432     hrpA hrpB TRUE 0.702 24.000 0.111 NA   NA
 5228432 5228433     hrpB hrcJ TRUE 0.985 7.000 0.222 0.009   NA
 5228433 5228434     hrcJ hrpD TRUE 0.943 -39.000 0.600 NA   NA
 5228434 5228435     hrpD hrpE TRUE 0.895 34.000 0.462 NA   NA
 5228435 5228436     hrpE hrpF TRUE 0.609 147.000 0.385 NA   NA
 5228436 5228437     hrpF hrpG TRUE 0.966 11.000 0.500 NA   NA
 5228437 5228438     hrpG hrcC TRUE 0.962 -7.000 0.375 NA   NA
 5228438 5228439     hrcC hrpT TRUE 0.889 28.000 0.375 NA   NA
 5228439 5228440     hrpT hrpV FALSE 0.518 -7.000 0.000 NA   NA
 5228440 5228441     hrpV hrpN FALSE 0.062 145.000 0.000 NA   NA
 5228442 5228443         TRUE 0.617 -3.000 0.000 NA   NA
 5228443 5228444         TRUE 0.951 0.000 0.200 NA   NA
 5228444 5228445         TRUE 0.617 -3.000 0.000 NA   NA
 5228446 5228447         TRUE 0.908 2.000 0.118 NA   NA
 5228447 5228448         FALSE 0.097 104.000 0.000 NA   NA
 5228449 5228450     dspE dspF TRUE 0.925 36.000 0.667 NA   NA
 5228452 5228453       hecB FALSE 0.070 138.000 0.000 NA   NA
 5228453 5228454     hecB hecA1 FALSE 0.157 51.000 0.000 NA   NA
 5228455 5228456         FALSE 0.314 21.000 0.000 NA   NA
 5228456 5228457         FALSE 0.400 15.000 0.000 NA   NA
 5228457 5228458         FALSE 0.446 -12.000 0.000 NA   NA
 5228458 5228459         FALSE 0.066 140.000 0.000 NA   NA
 5228459 5228460         FALSE 0.155 52.000 0.000 NA   NA
 5228460 5228461         FALSE 0.005 443.000 0.000 NA   NA
 5228462 5228463         FALSE 0.098 112.000 0.000 1.000   NA
 5228468 5228469         FALSE 0.095 115.000 0.000 1.000   NA
 5228469 5228470         TRUE 0.815 -309.000 0.000 0.004   NA
 5228470 5228471         FALSE 0.027 218.000 0.000 1.000   NA
 5228471 5228472         TRUE 0.946 -7.000 0.343 1.000 N NA
 5228472 5228473         TRUE 0.848 -25.000 0.229 1.000 N NA
 5228473 5228474         TRUE 0.655 -3.000 0.052 1.000 N NA
 5228474 5228475         TRUE 0.933 72.000 0.654 1.000 Y NA
 5228475 5228476         TRUE 0.998 0.000 0.758 0.069 Y NA
 5228476 5228477         TRUE 0.715 -234.000 0.000 0.069   NA
 5228477 5228478         TRUE 0.985 -7.000 0.823 1.000   NA
 5228478 5228479         TRUE 0.990 -22.000 0.731 0.025   NA
 5228479 5228480         FALSE 0.105 94.000 0.000 NA   NA
 5228480 5228481         TRUE 0.992 -3.000 1.000 NA   NA
 5228481 5228482       arsR FALSE 0.082 124.000 0.000 NA   NA
 5228482 5228483     arsR   TRUE 0.827 35.000 0.364 1.000 N NA
 5228483 5228484       arsC TRUE 0.987 10.000 0.545 1.000 Y NA
 5228485 5228486         TRUE 0.954 25.000 0.366 1.000 Y NA
 5228486 5228487         TRUE 0.633 78.000 0.220 1.000   NA
 5228487 5228488         TRUE 0.737 87.000 0.364 1.000   NA
 5228488 5228489         TRUE 0.942 115.000 0.333 0.013 Y NA
 5228489 5228490         TRUE 0.832 23.000 0.273 NA N NA
 5228493 5228494         FALSE 0.113 80.000 0.000 NA   NA
 5228494 5228495         FALSE 0.003 816.000 0.000 NA   NA
 5228497 5228498     ascF   TRUE 0.881 41.000 0.485 1.000   NA
 5228498 5228499         TRUE 0.947 -19.000 0.061 0.004   NA
 5228499 5228500         FALSE 0.149 235.000 0.000 1.000 Y NA
 5228500 5228501         FALSE 0.021 50.000 0.000 1.000 N NA
 5228504 5228505         TRUE 0.937 6.000 0.219 NA   NA
 5228506 5228507         FALSE 0.018 244.000 0.000 NA   NA
 5228507 5228508         FALSE 0.484 -9.000 0.000 NA   NA
 5228512 5228513         TRUE 0.757 64.000 0.333 NA   NA
 5228515 5228516         FALSE 0.381 -21.000 0.000 NA   NA
 5228516 5228517         TRUE 0.588 3.000 0.000 NA   NA
 5228517 5228518         FALSE 0.002 1281.000 0.000 NA   NA
 5228518 5228519         FALSE 0.003 626.000 0.000 NA   NA
 5228519 5228520         FALSE 0.044 399.000 0.000 1.000 Y NA
 5228520 5228521         FALSE 0.003 215.000 0.000 1.000 N NA
 5228521 5228522       pth TRUE 0.705 130.000 0.184 1.000 Y NA
 5228524 5228525     prs ispE FALSE 0.008 138.000 0.000 1.000 N NA
 5228525 5228526     ispE lolB FALSE 0.128 4.000 0.000 1.000 N NA
 5228527 5228528     hemA prfA TRUE 0.893 34.000 0.171 0.036 N NA
 5228528 5228529     prfA hemK TRUE 0.995 0.000 0.229 0.036 Y NA
 5228529 5228530     hemK sirB2 TRUE 0.825 12.000 0.109 NA   NA
 5228530 5228531     sirB2 sirB1 TRUE 0.941 3.000 0.195 NA   NA
 5228531 5228532     sirB1 kdsA FALSE 0.392 76.000 0.089 1.000   NA
 5228534 5228535       pntA FALSE 0.046 170.000 0.000 NA   NA
 5228535 5228536     pntA pntB TRUE 0.998 11.000 0.745 0.001 Y NA
 5228537 5228538       fnr TRUE 0.734 212.000 0.619 1.000 Y NA
 5228538 5228539     fnr ogt FALSE 0.008 283.000 0.038 1.000 N NA
 5228540 5228541         FALSE 0.098 111.000 0.000 1.000   NA
 5228542 5228543         FALSE 0.019 55.000 0.000 1.000 N NA
 5228545 5228546         TRUE 0.976 6.000 0.533 NA   NA
 5228546 5228547       srfC FALSE 0.016 258.000 0.000 NA   NA
 5228547 5228548     srfC srfB TRUE 0.970 -3.000 0.333 NA   NA
 5228548 5228549     srfB srfA TRUE 0.930 3.000 0.167 NA   NA
 5228549 5228550     srfA   FALSE 0.012 289.000 0.000 NA   NA
 5228551 5228552     osmC cybC FALSE 0.001 328.000 0.000 1.000 N NA
 5228552 5228553     cybC   FALSE 0.020 241.000 0.000 1.000   NA
 5228553 5228554         FALSE 0.068 139.000 0.000 NA   NA
 5228554 5228555         FALSE 0.071 137.000 0.000 NA   NA
 5228555 5228556         FALSE 0.086 119.000 0.000 NA   NA
 5228556 5228557         FALSE 0.369 17.000 0.000 NA   NA
 5228557 5228558         FALSE 0.005 171.000 0.000 1.000 N NA
 5228562 5228563         TRUE 0.646 6.000 0.027 NA   NA
 5228564 5228565         FALSE 0.237 31.000 0.000 NA   NA
 5228566 5228567     dat ddc TRUE 0.997 1.000 0.459 0.016 Y NA
 5228569 5228570         FALSE 0.350 -25.000 0.000 NA   NA
 5228570 5228571         FALSE 0.008 334.000 0.000 NA   NA
 5228571 5228572         TRUE 0.933 13.000 0.302 NA   NA
 5228572 5228573         FALSE 0.004 518.000 0.000 NA   NA
 5228573 5228574         FALSE 0.032 205.000 0.000 1.000   NA
 5228574 5228575       ynfB FALSE 0.024 267.000 0.029 NA   NA
 5228575 5228576     ynfB   FALSE 0.058 151.000 0.000 NA   NA
 5228576 5228577       ynfD FALSE 0.097 104.000 0.000 NA   NA
 5228578 5228579         FALSE 0.188 -208.000 0.000 NA   NA
 5228579 5228580       ynfK FALSE 0.012 103.000 0.000 NA N NA
 5228580 5228581     ynfK dgsA TRUE 0.646 134.000 0.455 1.000 N NA
 5228581 5228582     dgsA   FALSE 0.393 301.000 0.408 1.000 Y NA
 5228583 5228584     ynfM tus FALSE 0.060 167.000 0.018 NA   NA
 5228586 5228587     manA   TRUE 0.872 89.000 0.778 NA   NA
 5228587 5228588         FALSE 0.101 99.000 0.000 NA   NA
 5228588 5228589       add FALSE 0.010 122.000 0.000 1.000 N NA
 5228590 5228591         FALSE 0.128 146.000 0.041 NA   NA
 5228591 5228592         FALSE 0.031 329.000 0.069 NA   NA
 5228592 5228593         FALSE 0.315 -36.000 0.000 1.000   NA
 5228593 5228594         TRUE 0.879 -16.000 0.000 0.073   NA
 5228594 5228595       araH TRUE 0.618 69.000 0.196 1.000   NA
 5228595 5228596     araH araG TRUE 0.994 19.000 0.451 0.002 Y NA
 5228596 5228597     araG araF TRUE 0.986 112.000 0.917 0.002 Y NA
 5228598 5228599     araB araA FALSE 0.195 38.000 0.046 1.000 N NA
 5228599 5228600     araA   FALSE 0.054 159.000 0.000 NA   NA
 5228600 5228601       rnfA FALSE 0.025 217.000 0.000 NA   NA
 5228601 5228602     rnfA rnfB TRUE 0.998 0.000 0.564 0.034 Y NA
 5228603 5228604     rnfD rnfG TRUE 0.997 11.000 0.924 0.034 Y NA
 5228604 5228605     rnfG rnfE TRUE 0.999 -3.000 0.908 0.034 Y NA
 5228605 5228606     rnfE nth TRUE 0.856 -3.000 0.109 1.000 N NA
 5228606 5228607     nth   FALSE 0.000 608.000 0.000 1.000 N NA
 5228608 5228609     cysB topA FALSE 0.001 380.000 0.008 1.000 N NA
 5228611 5228612     sohB   FALSE 0.106 91.000 0.000 NA   NA
 5228613 5228614       btuR FALSE 0.354 19.000 0.050 1.000 N NA
 5228615 5228616         FALSE 0.383 180.000 0.075 NA Y NA
 5228616 5228617       trpH FALSE 0.534 143.000 0.281 NA   NA
 5228618 5228619     trpE trpG TRUE 0.999 0.000 0.703 0.001 Y NA
 5228619 5228620     trpG trpD TR