MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudomonas aeruginosa LESB58

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5816892 5816893 PLES_00001 PLES_00011 dnaA dnaN TRUE 0.974 29.000 0.328 1.000 Y NA
 5816893 5816894 PLES_00011 PLES_00021 dnaN recF TRUE 0.991 10.000 0.318 1.000 Y NA
 5816894 5816895 PLES_00021 PLES_00031 recF gyrB TRUE 0.999 -3.000 0.249 0.003 Y NA
 5816896 5816897 PLES_00041 PLES_00051 lptA   TRUE 0.959 12.000 0.310 1.000 N NA
 5816899 5816900 PLES_00071 PLES_00081 glyS glyQ TRUE 0.999 0.000 0.651 0.001 Y NA
 5816901 5816902 PLES_00091 PLES_00101 tag   FALSE 0.138 144.000 0.017 1.000 N NA
 5816902 5816903 PLES_00101 PLES_00111     FALSE 0.420 85.000 0.053 NA   NA
 5816903 5816904 PLES_00111 PLES_00121     FALSE 0.078 147.000 0.000 NA   NA
 5816905 5816906 PLES_00131 PLES_00141     FALSE 0.014 292.000 0.000 NA   NA
 5816906 5816907 PLES_00141 PLES_00151   trkA FALSE 0.137 149.000 0.008 1.000   NA
 5816907 5816908 PLES_00151 PLES_00161 trkA   TRUE 0.825 28.000 0.122 1.000 N NA
 5816908 5816909 PLES_00161 PLES_00171   fmt TRUE 0.998 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 5816909 5816910 PLES_00171 PLES_00181 fmt def TRUE 0.939 55.000 0.105 0.016 Y NA
 5816911 5816912 PLES_00191 PLES_00201     FALSE 0.242 135.000 0.043 1.000   NA
 5816912 5816913 PLES_00201 PLES_00211     TRUE 0.517 41.000 0.023 NA N NA
 5816915 5816916 PLES_00231 PLES_00241 hemF aroE TRUE 0.612 58.000 0.093 1.000 N NA
 5816916 5816917 PLES_00241 PLES_00251 aroE plcB FALSE 0.128 111.000 0.000 1.000   NA
 5816917 5816918 PLES_00251 PLES_00261 plcB   TRUE 0.909 -19.000 0.000 1.000   NA
 5816918 5816919 PLES_00261 PLES_00271     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5816920 5816921 PLES_00281 PLES_00291     TRUE 0.985 5.000 0.259 0.063 N NA
 5816921 5816922 PLES_00291 PLES_00301   betC TRUE 0.922 17.000 0.218 1.000 N NA
 5816924 5816925 PLES_00321 PLES_00331     TRUE 0.957 8.000 0.000 NA Y NA
 5816925 5816926 PLES_00331 PLES_00341   trpA FALSE 0.040 186.000 0.000 1.000 N NA
 5816926 5816927 PLES_00341 PLES_00351 trpA trpB TRUE 0.999 -3.000 0.344 0.001 Y NA
 5816928 5816929 PLES_00361 PLES_00371 trpI   FALSE 0.129 101.000 0.000 NA   NA
 5816929 5816930 PLES_00371 PLES_00381     FALSE 0.140 184.000 0.049 NA   NA
 5816930 5816931 PLES_00381 PLES_00391     FALSE 0.014 297.000 0.000 NA   NA
 5816931 5816932 PLES_00391 PLES_00401     FALSE 0.110 113.000 0.000 NA   NA
 5816932 5816933 PLES_00401 PLES_00411     FALSE 0.005 778.000 0.000 1.000   NA
 5816933 5816934 PLES_00411 PLES_00421     FALSE 0.015 289.000 0.000 NA   NA
 5816934 5816935 PLES_00421 PLES_00431     FALSE 0.005 619.000 0.000 NA   NA
 5816937 5816938 PLES_00451 PLES_00461 exoT   FALSE 0.005 496.000 0.000 1.000 N NA
 5816938 5816939 PLES_00461 PLES_00471     TRUE 0.951 31.000 0.625 NA   NA
 5816939 5816940 PLES_00471 PLES_00481     TRUE 0.697 153.000 0.740 NA   NA
 5816941 5816942 PLES_00491 PLES_00501     FALSE 0.015 282.000 0.000 NA   NA
 5816944 5816945 PLES_00531 PLES_00541     FALSE 0.033 209.000 0.000 NA   NA
 5816945 5816946 PLES_00541 PLES_00551     FALSE 0.202 73.000 0.000 NA   NA
 5816946 5816947 PLES_00551 PLES_00561     FALSE 0.379 39.000 0.000 NA   NA
 5816947 5816948 PLES_00561 PLES_00571     FALSE 0.228 66.000 0.000 NA   NA
 5816949 5816950 PLES_00581 PLES_00591     TRUE 0.693 63.000 0.157 1.000   NA
 5816950 5816951 PLES_00591 PLES_00601   osmC TRUE 0.635 84.000 0.000 1.000 Y NA
 5816951 5816952 PLES_00601 PLES_00611 osmC   FALSE 0.231 111.000 0.026 NA   NA
 5816953 5816954 PLES_00621 PLES_00631     FALSE 0.259 57.000 0.000 NA   NA
 5816956 5816957 PLES_00651 PLES_00661     TRUE 0.562 33.000 0.009 NA   NA
 5816957 5816958 PLES_00661 PLES_00671     TRUE 0.955 -7.000 0.016 1.000   NA
 5816959 5816960 PLES_00681 PLES_00691 prlC   TRUE 0.986 -3.000 0.173 NA   NA
 5816960 5816961 PLES_00691 PLES_00701     FALSE 0.244 89.000 0.006 NA   NA
 5816962 5816963 PLES_00711 PLES_00721     TRUE 0.902 62.000 0.714 NA   NA
 5816963 5816964 PLES_00721 PLES_00731     TRUE 0.985 -7.000 0.161 NA   NA
 5816964 5816965 PLES_00731 PLES_00741     TRUE 0.994 0.000 0.710 NA N NA
 5816965 5816966 PLES_00741 PLES_00751   ppkA TRUE 0.984 -3.000 0.160 1.000 N NA
 5816966 5816967 PLES_00751 PLES_00761 ppkA   TRUE 0.997 8.000 1.000 1.000 Y NA
 5816967 5816968 PLES_00761 PLES_00771     TRUE 0.936 10.000 0.128 NA   NA
 5816968 5816969 PLES_00771 PLES_00781     TRUE 0.983 -3.000 0.128 NA   NA
 5816969 5816970 PLES_00781 PLES_00791     FALSE 0.455 222.000 0.714 NA   NA
 5816970 5816971 PLES_00791 PLES_00801     TRUE 0.989 7.000 0.714 NA   NA
 5816971 5816972 PLES_00801 PLES_00811     TRUE 0.980 16.000 0.833 NA   NA
 5816972 5816973 PLES_00811 PLES_00821     TRUE 0.944 45.000 0.833 NA   NA
 5816974 5816975 PLES_00831 PLES_00841     TRUE 0.624 89.000 0.209 NA   NA
 5816975 5816976 PLES_00841 PLES_00851     TRUE 0.976 13.000 0.588 NA   NA
 5816976 5816977 PLES_00851 PLES_00861     TRUE 0.742 76.000 0.294 NA   NA
 5816977 5816978 PLES_00861 PLES_00871     FALSE 0.262 168.000 0.125 NA   NA
 5816978 5816979 PLES_00871 PLES_00881     TRUE 0.983 2.000 0.311 NA   NA
 5816979 5816980 PLES_00881 PLES_00891     TRUE 0.981 -3.000 0.111 NA   NA
 5816980 5816981 PLES_00891 PLES_00901     TRUE 0.994 -36.000 0.500 NA   NA
 5816981 5816982 PLES_00901 PLES_00911     TRUE 0.992 -7.000 0.333 NA   NA
 5816982 5816983 PLES_00911 PLES_00921     TRUE 0.746 47.000 0.143 NA   NA
 5816984 5816985 PLES_00931 PLES_00941     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5816985 5816986 PLES_00941 PLES_00951     TRUE 0.594 16.000 0.000 NA   NA
 5816987 5816988 PLES_00961 PLES_00971     TRUE 0.858 28.000 0.160 NA   NA
 5816988 5816989 PLES_00971 PLES_00981     TRUE 0.983 -70.000 0.160 NA   NA
 5816989 5816990 PLES_00981 PLES_00991     TRUE 0.988 -3.000 0.200 NA   NA
 5816990 5816991 PLES_00991 PLES_01001     TRUE 0.977 1.000 0.200 NA   NA
 5816991 5816992 PLES_01001 PLES_01011     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5816992 5816993 PLES_01011 PLES_01021     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 5816993 5816994 PLES_01021 PLES_01031     FALSE 0.010 376.000 0.000 1.000   NA
 5816994 5816995 PLES_01031 PLES_01041     TRUE 0.533 211.000 0.241 1.000 Y NA
 5816995 5816996 PLES_01041 PLES_01051     FALSE 0.272 137.000 0.069 NA   NA
 5816996 5816997 PLES_01051 PLES_01061   coxB FALSE 0.018 264.000 0.000 NA   NA
 5816997 5816998 PLES_01061 PLES_01071 coxB coxA TRUE 0.998 10.000 0.741 0.003 Y NA
 5816998 5816999 PLES_01071 PLES_01081 coxA   TRUE 0.958 11.000 0.268 1.000 N NA
 5816999 5817000 PLES_01081 PLES_01091   coIII TRUE 0.978 11.000 0.536 1.000 N NA
 5817002 5817003 PLES_01111 PLES_01121     TRUE 0.996 -25.000 0.722 NA   NA
 5817003 5817004 PLES_01121 PLES_01131     TRUE 0.758 65.000 0.255 NA   NA
 5817004 5817005 PLES_01131 PLES_01141     TRUE 0.977 26.000 0.321 1.000 Y NA
 5817005 5817006 PLES_01141 PLES_01151     TRUE 0.838 26.000 0.099 1.000   NA
 5817008 5817009 PLES_01171 PLES_01181     FALSE 0.104 257.000 0.128 NA   NA
 5817009 5817010 PLES_01181 PLES_01191     TRUE 0.945 25.000 0.429 1.000   NA
 5817010 5817011 PLES_01191 PLES_01201     FALSE 0.022 230.000 0.000 1.000 N NA
 5817011 5817012 PLES_01201 PLES_01211     TRUE 0.684 49.000 0.102 1.000 N NA
 5817012 5817013 PLES_01211 PLES_01221     TRUE 0.750 101.000 0.000 0.003 Y NA
 5817013 5817014 PLES_01221 PLES_01231     FALSE 0.056 180.000 0.000 1.000   NA
 5817015 5817016 PLES_01241 PLES_01251     FALSE 0.013 300.000 0.000 NA   NA
 5817016 5817017 PLES_01251 PLES_01261     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817017 5817018 PLES_01261 PLES_01271     FALSE 0.052 176.000 0.000 NA   NA
 5817019 5817020 PLES_01281 PLES_01291     FALSE 0.227 73.000 0.000 1.000   NA
 5817021 5817022 PLES_01301 PLES_01311 gabP   FALSE 0.050 169.000 0.000 1.000 N NA
 5817022 5817023 PLES_01311 PLES_01321     FALSE 0.440 84.000 0.059 NA   NA
 5817023 5817024 PLES_01321 PLES_01331     TRUE 0.958 0.000 0.059 NA   NA
 5817027 5817028 PLES_01361 PLES_01371     FALSE 0.005 581.000 0.000 NA   NA
 5817028 5817029 PLES_01371 PLES_01381     TRUE 0.993 0.000 0.590 1.000   NA
 5817029 5817030 PLES_01381 PLES_01391     TRUE 0.940 22.000 0.154 0.062   NA
 5817030 5817031 PLES_01391 PLES_01401   ahpC FALSE 0.070 165.000 0.000 1.000   NA
 5817031 5817032 PLES_01401 PLES_01411 ahpC ahpF TRUE 0.856 145.000 0.551 1.000 Y NA
 5817034 5817035 PLES_01431 PLES_01441   nuh TRUE 0.518 108.000 0.000 1.000 Y NA
 5817036 5817037 PLES_01451 PLES_01461     TRUE 0.463 122.000 0.000 NA Y NA
 5817038 5817039 PLES_01471 PLES_01481     TRUE 0.585 73.000 0.106 1.000   NA
 5817039 5817040 PLES_01481 PLES_01491     FALSE 0.259 105.000 0.025 1.000   NA
 5817040 5817041 PLES_01491 PLES_01501     FALSE 0.035 197.000 0.000 1.000 N NA
 5817041 5817042 PLES_01501 PLES_01511     TRUE 0.995 -3.000 0.588 NA N NA
 5817042 5817043 PLES_01511 PLES_01521     TRUE 0.602 148.000 0.085 NA Y NA
 5817043 5817044 PLES_01521 PLES_01531   pcaQ FALSE 0.008 376.000 0.000 1.000 N NA
 5817044 5817045 PLES_01531 PLES_01541 pcaQ pcaH TRUE 0.631 135.000 0.153 0.001 N NA
 5817045 5817046 PLES_01541 PLES_01551 pcaH pcaG TRUE 0.998 11.000 0.782 0.001 Y NA
 5817046 5817047 PLES_01551 PLES_01561 pcaG pcaR FALSE 0.030 207.000 0.000 1.000 N NA
 5817047 5817048 PLES_01561 PLES_01571 pcaR   FALSE 0.063 153.000 0.000 1.000 N NA
 5817048 5817049 PLES_01571 PLES_01581     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.014 Y NA
 5817049 5817050 PLES_01581 PLES_01591     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA N NA
 5817050 5817051 PLES_01591 PLES_01601     FALSE 0.028 199.000 0.000 NA N NA
 5817051 5817052 PLES_01601 PLES_01611     FALSE 0.107 116.000 0.000 NA   NA
 5817052 5817053 PLES_01611 PLES_01621     FALSE 0.016 281.000 0.000 NA   NA
 5817053 5817054 PLES_01621 PLES_01631   opdC FALSE 0.068 156.000 0.000 NA   NA
 5817056 5817057 PLES_01651 PLES_01661     FALSE 0.003 672.000 0.000 NA N NA
 5817057 5817058 PLES_01661 PLES_01671     FALSE 0.017 242.000 0.000 NA N NA
 5817058 5817059 PLES_01671 PLES_01681     TRUE 0.617 93.000 0.240 1.000 N NA
 5817059 5817060 PLES_01681 PLES_01691     TRUE 0.879 6.000 0.019 1.000   NA
 5817061 5817062 PLES_01701 PLES_01711     FALSE 0.309 127.000 0.073 NA   NA
 5817062 5817063 PLES_01711 PLES_01721     TRUE 0.972 27.000 0.911 NA   NA
 5817063 5817064 PLES_01721 PLES_01731     TRUE 0.942 9.000 0.133 NA   NA
 5817064 5817065 PLES_01731 PLES_01741     FALSE 0.132 263.000 0.000 1.000 Y NA
 5817065 5817066 PLES_01741 PLES_01751     TRUE 0.956 20.000 0.078 1.000 Y NA
 5817066 5817067 PLES_01751 PLES_01761     TRUE 0.982 6.000 0.067 1.000 Y NA
 5817067 5817068 PLES_01761 PLES_01771   aer2 TRUE 0.938 70.000 0.444 1.000 Y NA
 5817068 5817069 PLES_01771 PLES_01781 aer2   TRUE 0.926 36.000 0.000 0.011 Y NA
 5817069 5817070 PLES_01781 PLES_01791     TRUE 0.997 -13.000 0.105 0.011 Y NA
 5817070 5817071 PLES_01791 PLES_01801     TRUE 0.981 28.000 0.444 1.000 Y NA
 5817071 5817072 PLES_01801 PLES_01811     FALSE 0.433 198.000 0.082 1.000 Y NA
 5817072 5817073 PLES_01811 PLES_01821     FALSE 0.036 193.000 0.000 1.000 N NA
 5817075 5817076 PLES_01841 PLES_01851 atsA   TRUE 0.935 87.000 0.571 1.000 Y NA
 5817076 5817077 PLES_01851 PLES_01861     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5817078 5817079 PLES_01871 PLES_01881     FALSE 0.007 418.000 0.000 1.000 N NA
 5817079 5817080 PLES_01881 PLES_01891     TRUE 0.979 -3.000 0.082 1.000   NA
 5817084 5817085 PLES_01931 PLES_01941     FALSE 0.335 41.000 0.000 1.000 N NA
 5817085 5817086 PLES_01941 PLES_01951     TRUE 0.810 68.000 0.000 0.073 Y NA
 5817086 5817087 PLES_01951 PLES_01961   pntAA FALSE 0.014 647.000 0.000 0.073 N NA
 5817087 5817088 PLES_01961 PLES_01971 pntAA pntB FALSE 0.160 384.000 0.000 0.001 Y NA
 5817088 5817089 PLES_01971 PLES_01981 pntB tonB2 FALSE 0.009 343.000 0.000 1.000 N NA
 5817089 5817090 PLES_01981 PLES_01991 tonB2 exbB1 TRUE 0.980 29.000 0.778 0.017 N NA
 5817090 5817091 PLES_01991 PLES_02001 exbB1 exbD1 TRUE 0.999 2.000 0.778 0.080 Y NA
 5817093 5817094 PLES_02021 PLES_02031   mdcA FALSE 0.113 111.000 0.000 NA   NA
 5817094 5817095 PLES_02031 PLES_02041 mdcA   TRUE 0.992 0.000 0.508 1.000   NA
 5817095 5817096 PLES_02041 PLES_02051   mdcC TRUE 0.989 2.000 0.475 NA   NA
 5817096 5817097 PLES_02051 PLES_02061 mdcC mdcD TRUE 0.993 -7.000 0.400 NA   NA
 5817097 5817098 PLES_02061 PLES_02071 mdcD mdcE TRUE 0.996 -3.000 0.700 NA   NA
 5817098 5817099 PLES_02071 PLES_02081 mdcE   TRUE 0.952 16.000 0.339 NA   NA
 5817099 5817100 PLES_02081 PLES_02091     TRUE 0.996 -3.000 0.651 1.000   NA
 5817100 5817101 PLES_02091 PLES_02101     TRUE 0.742 57.000 0.200 NA   NA
 5817101 5817102 PLES_02101 PLES_02111     TRUE 0.992 6.000 0.945 NA   NA
 5817103 5817104 PLES_02121 PLES_02131     FALSE 0.044 188.000 0.000 NA   NA
 5817104 5817105 PLES_02131 PLES_02141     FALSE 0.042 192.000 0.000 NA   NA
 5817105 5817106 PLES_02141 PLES_02151     TRUE 0.534 21.000 0.000 NA   NA
 5817107 5817108 PLES_02161 PLES_02171     TRUE 0.643 58.000 0.118 1.000 N NA
 5817108 5817109 PLES_02171 PLES_02181     TRUE 0.859 31.000 0.200 1.000 N NA
 5817109 5817110 PLES_02181 PLES_02191     FALSE 0.055 164.000 0.000 1.000 N NA
 5817111 5817112 PLES_02201 PLES_02211     TRUE 0.808 60.000 0.333 1.000 N NA
 5817113 5817114 PLES_02221 PLES_02231     FALSE 0.065 151.000 0.000 1.000 N NA
 5817114 5817115 PLES_02231 PLES_02241     TRUE 1.000 -3.000 0.739 0.000 Y NA
 5817115 5817116 PLES_02241 PLES_02251   pcaF TRUE 0.998 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 5817116 5817117 PLES_02251 PLES_02261 pcaF pcaT FALSE 0.206 150.000 0.051 1.000 N NA
 5817117 5817118 PLES_02261 PLES_02271 pcaT pcaB TRUE 0.754 23.000 0.042 1.000 N NA
 5817118 5817119 PLES_02271 PLES_02281 pcaB pcaD TRUE 0.864 15.000 0.063 1.000   NA
 5817119 5817120 PLES_02281 PLES_02291 pcaD pcaC TRUE 0.945 11.000 0.174 1.000   NA
 5817120 5817121 PLES_02291 PLES_02301 pcaC   FALSE 0.060 175.000 0.000 1.000   NA
 5817121 5817122 PLES_02301 PLES_02311     FALSE 0.238 191.000 0.167 NA   NA
 5817124 5817125 PLES_02331 PLES_02341     FALSE 0.180 244.000 0.222 1.000   NA
 5817125 5817126 PLES_02341 PLES_02351     TRUE 0.870 23.000 0.143 NA   NA
 5817126 5817127 PLES_02351 PLES_02361     FALSE 0.228 150.000 0.057 NA   NA
 5817128 5817129 PLES_02371 PLES_02381     FALSE 0.228 66.000 0.000 NA   NA
 5817130 5817131 PLES_02391 PLES_02401     TRUE 0.484 93.000 0.122 1.000 N NA
 5817132 5817133 PLES_02411 PLES_02421   aroQ2 TRUE 0.999 -3.000 0.583 1.000 Y NA
 5817133 5817134 PLES_02421 PLES_02431 aroQ2   FALSE 0.094 117.000 0.000 1.000 N NA
 5817134 5817135 PLES_02431 PLES_02441   pobA FALSE 0.115 175.000 0.029 1.000 N NA
 5817137 5817138 PLES_02461 PLES_02471     FALSE 0.449 78.000 0.000 0.085   NA
 5817138 5817139 PLES_02471 PLES_02481     FALSE 0.061 165.000 0.000 NA   NA
 5817139 5817140 PLES_02481 PLES_02491     FALSE 0.017 268.000 0.000 NA   NA
 5817140 5817141 PLES_02491 PLES_02501     FALSE 0.152 92.000 0.000 NA   NA
 5817141 5817142 PLES_02501 PLES_02511     FALSE 0.295 41.000 0.000 NA N NA
 5817142 5817143 PLES_02511 PLES_02521     FALSE 0.088 134.000 0.000 NA   NA
 5817143 5817144 PLES_02521 PLES_02531     FALSE 0.062 164.000 0.000 NA   NA
 5817144 5817145 PLES_02531 PLES_02541     FALSE 0.004 1082.000 0.000 NA   NA
 5817145 5817146 PLES_02541 PLES_02551     FALSE 0.049 180.000 0.000 NA   NA
 5817146 5817147 PLES_02551 PLES_02561     FALSE 0.075 150.000 0.000 NA   NA
 5817147 5817148 PLES_02561 PLES_02571     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817148 5817149 PLES_02571 PLES_02581     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5817149 5817150 PLES_02581 PLES_02591   hcpC FALSE 0.048 182.000 0.000 NA   NA
 5817150 5817151 PLES_02591 PLES_02592 hcpC   FALSE 0.004 1255.000 0.000 NA   NA
 5817151 5817152 PLES_02592 PLES_02601     FALSE 0.044 189.000 0.000 NA   NA
 5817153 5817154 PLES_02611 PLES_02621 gabD gabT FALSE 0.206 245.000 0.303 1.000 N NA
 5817154 5817155 PLES_02621 PLES_02631 gabT   FALSE 0.078 326.000 0.182 1.000 N NA
 5817157 5817158 PLES_02651 PLES_02661     TRUE 0.662 12.000 0.000 NA   NA
 5817158 5817159 PLES_02661 PLES_02671     FALSE 0.413 34.000 0.000 NA   NA
 5817160 5817161 PLES_02681 PLES_02691     TRUE 0.871 50.000 0.444 NA N NA
 5817161 5817162 PLES_02691 PLES_02701     FALSE 0.063 163.000 0.000 NA   NA
 5817162 5817163 PLES_02701 PLES_02711     FALSE 0.115 109.000 0.000 NA   NA
 5817165 5817166 PLES_02731 PLES_02741     FALSE 0.062 172.000 0.000 1.000   NA
 5817168 5817169 PLES_02761 PLES_02771 cysA cysW TRUE 0.996 4.000 0.587 1.000 Y NA
 5817169 5817170 PLES_02771 PLES_02781 cysW cysT TRUE 0.995 11.000 0.935 0.000 N NA
 5817170 5817171 PLES_02781 PLES_02791 cysT sbp FALSE 0.436 162.000 0.066 0.002 N NA
 5817171 5817172 PLES_02791 PLES_02801 sbp   FALSE 0.297 177.000 0.188 NA   NA
 5817172 5817173 PLES_02801 PLES_02811     FALSE 0.202 164.000 0.062 NA   NA
 5817174 5817175 PLES_02821 PLES_02831 desA gpuP FALSE 0.022 231.000 0.000 1.000 N NA
 5817175 5817176 PLES_02831 PLES_02841 gpuP gpuA TRUE 0.873 56.000 0.087 1.000 Y NA
 5817176 5817177 PLES_02841 PLES_02851 gpuA gpuR FALSE 0.254 53.000 0.000 1.000 N NA
 5817177 5817178 PLES_02851 PLES_02861 gpuR   FALSE 0.098 113.000 0.000 1.000 N NA
 5817178 5817179 PLES_02861 PLES_02871   oprE FALSE 0.006 613.000 0.000 1.000   NA
 5817180 5817181 PLES_02881 PLES_02891 aguA aguB TRUE 0.498 86.000 0.084 1.000   NA
 5817181 5817182 PLES_02891 PLES_02901 aguB aguR FALSE 0.161 163.000 0.032 1.000   NA
 5817182 5817183 PLES_02901 PLES_02911 aguR   TRUE 0.607 63.000 0.105 1.000 N NA
 5817183 5817184 PLES_02911 PLES_02921     FALSE 0.142 256.000 0.000 1.000 Y NA
 5817185 5817186 PLES_02931 PLES_02941 spuA spuB TRUE 0.822 41.000 0.182 1.000   NA
 5817186 5817187 PLES_02941 PLES_02951 spuB spuC TRUE 0.731 66.000 0.239 1.000 N NA
 5817187 5817188 PLES_02951 PLES_02961 spuC spuD FALSE 0.095 116.000 0.000 1.000 N NA
 5817188 5817189 PLES_02961 PLES_02971 spuD spuE FALSE 0.116 419.000 0.000 0.022 Y NA
 5817189 5817190 PLES_02971 PLES_02981 spuE spuF TRUE 0.751 55.000 0.000 1.000 Y NA
 5817190 5817191 PLES_02981 PLES_02991 spuF spuG TRUE 0.883 27.000 0.000 1.000 Y NA
 5817191 5817192 PLES_02991 PLES_03001 spuG spuH TRUE 0.777 83.000 0.000 0.061 Y NA
 5817201 5817202 PLES_03091 PLES_03101     TRUE 0.972 72.000 0.625 0.080 Y NA
 5817205 5817206 PLES_03131 PLES_03141     FALSE 0.412 92.000 0.071 1.000 N NA
 5817206 5817207 PLES_03141 PLES_03151     FALSE 0.317 99.000 0.041 NA   NA
 5817207 5817208 PLES_03151 PLES_03161     TRUE 0.600 84.000 0.167 NA   NA
 5817209 5817210 PLES_03171 PLES_03181     TRUE 0.516 16.000 0.000 NA N NA
 5817210 5817211 PLES_03181 PLES_03191     FALSE 0.056 421.000 0.000 1.000 Y NA
 5817211 5817212 PLES_03191 PLES_03201     TRUE 0.990 48.000 1.000 0.061 Y NA
 5817212 5817213 PLES_03201 PLES_03211     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.061 Y NA
 5817213 5817214 PLES_03211 PLES_03221     TRUE 0.999 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 5817218 5817219 PLES_03261 PLES_03271   rpiA FALSE 0.099 123.000 0.000 NA   NA
 5817220 5817221 PLES_03281 PLES_03291 ilvA1   FALSE 0.239 120.000 0.034 NA   NA
 5817221 5817222 PLES_03291 PLES_03301     TRUE 0.703 51.000 0.125 NA   NA
 5817223 5817224 PLES_03311 PLES_03321     FALSE 0.306 92.000 0.032 1.000 N NA
 5817225 5817226 PLES_03331 PLES_03341 ygdP ptsP TRUE 0.834 23.000 0.097 1.000 N NA
 5817226 5817227 PLES_03341 PLES_03351 ptsP   TRUE 0.887 26.000 0.000 1.000 Y NA
 5817229 5817230 PLES_03371 PLES_03381   lgt TRUE 0.874 10.000 0.030 1.000   NA
 5817230 5817231 PLES_03381 PLES_03391 lgt thyA FALSE 0.192 206.000 0.164 1.000 N NA
 5817232 5817233 PLES_03401 PLES_03411     FALSE 0.407 35.000 0.000 NA   NA
 5817233 5817234 PLES_03411 PLES_03421     TRUE 0.997 -7.000 0.904 NA   NA
 5817237 5817238 PLES_03451 PLES_03461     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817238 5817239 PLES_03461 PLES_03471   folA FALSE 0.207 71.000 0.000 NA   NA
 5817240 5817241 PLES_03481 PLES_03491     FALSE 0.083 139.000 0.000 NA   NA
 5817241 5817242 PLES_03491 PLES_03501   ilvD FALSE 0.022 230.000 0.000 1.000 N NA
 5817242 5817243 PLES_03501 PLES_03511 ilvD   FALSE 0.013 328.000 0.000 1.000   NA
 5817243 5817244 PLES_03511 PLES_03521   pfpI FALSE 0.416 73.000 0.031 1.000   NA
 5817245 5817246 PLES_03531 PLES_03541   mutM FALSE 0.349 59.000 0.015 NA N NA
 5817246 5817247 PLES_03541 PLES_03551 mutM   FALSE 0.258 77.000 0.003 1.000 N NA
 5817247 5817248 PLES_03551 PLES_03561     FALSE 0.178 83.000 0.000 NA   NA
 5817248 5817249 PLES_03561 PLES_03571     FALSE 0.017 270.000 0.000 NA   NA
 5817250 5817251 PLES_03581 PLES_03591   fdx1 FALSE 0.312 128.000 0.076 NA   NA
 5817251 5817252 PLES_03591 PLES_03601 fdx1 coaD FALSE 0.348 121.000 0.088 NA   NA
 5817252 5817253 PLES_03601 PLES_03611 coaD   FALSE 0.114 152.000 0.011 1.000 N NA
 5817253 5817254 PLES_03611 PLES_03621     TRUE 0.929 56.000 0.886 NA   NA
 5817254 5817255 PLES_03621 PLES_03631     TRUE 0.819 55.000 0.308 NA   NA
 5817257 5817258 PLES_03651 PLES_03661     FALSE 0.393 37.000 0.000 NA   NA
 5817258 5817259 PLES_03661 PLES_03671     FALSE 0.016 279.000 0.000 NA   NA
 5817259 5817260 PLES_03671 PLES_03681     TRUE 0.965 0.000 0.070 1.000   NA
 5817260 5817261 PLES_03681 PLES_03691     TRUE 0.998 -7.000 0.598 0.005   NA
 5817262 5817263 PLES_03701 PLES_03711 ftsY ftsE TRUE 0.990 -3.000 0.117 0.098 N NA
 5817263 5817264 PLES_03711 PLES_03721 ftsE ftsX TRUE 0.988 0.000 0.035 NA Y NA
 5817264 5817265 PLES_03721 PLES_03731 ftsX rpoH FALSE 0.273 114.000 0.054 NA N NA
 5817265 5817266 PLES_03731 PLES_03741 rpoH   FALSE 0.334 65.000 0.005 NA   NA
 5817268 5817269 PLES_03761 PLES_03771     FALSE 0.343 103.000 0.058 NA   NA
 5817269 5817270 PLES_03771 PLES_03781   thiG TRUE 0.886 59.000 0.130 1.000 Y NA
 5817270 5817271 PLES_03781 PLES_03791 thiG micA FALSE 0.232 154.000 0.060 1.000   NA
 5817271 5817272 PLES_03791 PLES_03801 micA   FALSE 0.098 163.000 0.004 NA   NA
 5817273 5817274 PLES_03811 PLES_03821     FALSE 0.242 62.000 0.000 NA   NA
 5817274 5817275 PLES_03821 PLES_03831     FALSE 0.289 81.000 0.011 NA   NA
 5817275 5817276 PLES_03831 PLES_03841     TRUE 0.493 121.000 0.218 1.000 N NA
 5817276 5817277 PLES_03841 PLES_03851     TRUE 0.971 -3.000 0.050 NA   NA
 5817277 5817278 PLES_03851 PLES_03861     FALSE 0.335 132.000 0.100 NA   NA
 5817278 5817279 PLES_03861 PLES_03871   metX TRUE 0.983 8.000 0.509 NA   NA
 5817279 5817280 PLES_03871 PLES_03881 metX   FALSE 0.335 89.000 0.027 1.000   NA
 5817280 5817281 PLES_03881 PLES_03891     FALSE 0.188 108.000 0.010 NA   NA
 5817281 5817282 PLES_03891 PLES_03901     TRUE 0.499 123.000 0.220 NA   NA
 5817282 5817283 PLES_03901 PLES_03911   proC TRUE 0.936 11.000 0.152 NA   NA
 5817283 5817284 PLES_03911 PLES_03921 proC   TRUE 0.930 12.000 0.158 NA   NA
 5817285 5817286 PLES_03931 PLES_03941 pilT pilU TRUE 0.853 178.000 0.436 0.018 Y NA
 5817288 5817289 PLES_03961 PLES_03971     FALSE 0.022 243.000 0.000 NA   NA
 5817289 5817290 PLES_03971 PLES_03981     TRUE 0.998 -3.000 0.133 0.019 Y NA
 5817291 5817292 PLES_03991 PLES_04001   pyrB TRUE 0.998 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 5817292 5817293 PLES_04001 PLES_04011 pyrB pyrR TRUE 0.973 24.000 0.247 1.000 Y NA
 5817293 5817294 PLES_04011 PLES_04021 pyrR yqgF FALSE 0.386 112.000 0.109 1.000 N NA
 5817294 5817295 PLES_04021 PLES_04031 yqgF   TRUE 0.984 0.000 0.263 NA N NA
 5817295 5817296 PLES_04031 PLES_04041     TRUE 0.602 49.000 0.064 NA N NA
 5817296 5817297 PLES_04041 PLES_04051   gshB TRUE 0.501 81.000 0.089 1.000 N NA
 5817298 5817299 PLES_04061 PLES_04071 pilG pilH TRUE 0.974 47.000 0.296 0.022 Y NA
 5817299 5817300 PLES_04071 PLES_04081 pilH pilI TRUE 0.939 51.000 0.266 1.000 Y NA
 5817300 5817301 PLES_04081 PLES_04091 pilI pilJ TRUE 0.977 85.000 0.795 0.011 Y NA
 5817301 5817302 PLES_04091 PLES_04101 pilJ pilK TRUE 0.918 61.000 0.241 1.000 Y NA
 5817302 5817303 PLES_04101 PLES_04111 pilK chpA TRUE 0.984 12.000 0.217 1.000 Y NA
 5817303 5817304 PLES_04111 PLES_04121 chpA chpB TRUE 0.998 -7.000 0.217 0.011 Y NA
 5817304 5817305 PLES_04121 PLES_04131 chpB chpC TRUE 0.998 -3.000 0.517 0.011   NA
 5817305 5817306 PLES_04131 PLES_04141 chpC chpD TRUE 0.918 8.000 0.000 0.060   NA
 5817306 5817307 PLES_04141 PLES_04151 chpD chpE TRUE 0.477 76.000 0.067 1.000 N NA
 5817308 5817309 PLES_04161 PLES_04171     FALSE 0.407 35.000 0.000 NA   NA
 5817309 5817310 PLES_04171 PLES_04181   bioA FALSE 0.346 93.000 0.041 NA   NA
 5817311 5817312 PLES_04191 PLES_04201     FALSE 0.227 181.000 0.032 0.072 N NA
 5817312 5817313 PLES_04201 PLES_04211   pasP TRUE 0.982 12.000 0.676 NA   NA
 5817315 5817316 PLES_04231 PLES_04241 mexA mexB TRUE 0.969 16.000 0.565 1.000 N NA
 5817316 5817317 PLES_04241 PLES_04251 mexB oprM TRUE 0.994 2.000 0.538 0.061 N NA
 5817318 5817319 PLES_04261 PLES_04271     FALSE 0.021 251.000 0.000 NA   NA
 5817319 5817320 PLES_04271 PLES_04281   metF FALSE 0.321 70.000 0.010 NA   NA
 5817320 5817321 PLES_04281 PLES_04291 metF   FALSE 0.347 43.000 0.000 NA   NA
 5817321 5817322 PLES_04291 PLES_04301   sahH FALSE 0.365 41.000 0.000 NA   NA
 5817323 5817324 PLES_04311 PLES_04321     FALSE 0.097 126.000 0.000 NA   NA
 5817324 5817325 PLES_04321 PLES_04331     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5817325 5817326 PLES_04331 PLES_04341     FALSE 0.172 85.000 0.000 NA   NA
 5817327 5817328 PLES_04351 PLES_04361 codA codB TRUE 0.997 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 5817328 5817329 PLES_04361 PLES_04371 codB   FALSE 0.291 182.000 0.000 1.000 Y NA
 5817329 5817330 PLES_04371 PLES_04381     TRUE 0.991 -3.000 0.301 1.000 N NA
 5817330 5817331 PLES_04381 PLES_04391   dht FALSE 0.327 95.000 0.043 1.000 N NA
 5817332 5817333 PLES_04401 PLES_04411     TRUE 0.563 59.000 0.069 1.000 N NA
 5817334 5817335 PLES_04421 PLES_04431   gcdH FALSE 0.406 120.000 0.143 1.000 N NA
 5817336 5817337 PLES_04441 PLES_04451     FALSE 0.054 152.000 0.000 NA N NA
 5817339 5817340 PLES_04471 PLES_04481     TRUE 0.998 -3.000 0.330 NA Y NA
 5817341 5817342 PLES_04491 PLES_04501     FALSE 0.158 90.000 0.000 NA   NA
 5817342 5817343 PLES_04501 PLES_04511   dbpA FALSE 0.032 262.000 0.010 NA   NA
 5817344 5817345 PLES_04521 PLES_04531     FALSE 0.065 151.000 0.000 1.000 N NA
 5817347 5817348 PLES_04551 PLES_04561     FALSE 0.126 102.000 0.000 NA   NA
 5817350 5817351 PLES_04581 PLES_04591   creB TRUE 0.474 85.000 0.085 1.000 N NA
 5817351 5817352 PLES_04591 PLES_04601 creB creC TRUE 0.998 0.000 0.776 1.000 Y NA
 5817352 5817353 PLES_04601 PLES_04611 creC creD TRUE 0.615 103.000 0.311 NA N NA
 5817353 5817354 PLES_04611 PLES_04621 creD   TRUE 0.517 50.000 0.029 NA   NA
 5817355 5817356 PLES_04631 PLES_04641     TRUE 0.474 19.000 0.000 NA N NA
 5817358 5817359 PLES_04661 PLES_04671 fiuA   TRUE 0.911 104.000 0.600 NA Y NA
 5817359 5817360 PLES_04671 PLES_04681     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA N NA
 5817361 5817362 PLES_04691 PLES_04701     FALSE 0.061 140.000 0.000 NA N NA
 5817362 5817363 PLES_04701 PLES_04711     FALSE 0.300 50.000 0.000 NA   NA
 5817364 5817365 PLES_04721 PLES_04731     FALSE 0.009 348.000 0.000 1.000 N NA
 5817368 5817369 PLES_04761 PLES_04771     FALSE 0.347 43.000 0.000 NA   NA
 5817371 5817372 PLES_04791 PLES_04801     TRUE 0.849 32.000 0.048 0.083   NA
 5817373 5817374 PLES_04811 PLES_04821     FALSE 0.073 203.000 0.020 NA   NA
 5817374 5817375 PLES_04821 PLES_04831     FALSE 0.402 62.000 0.019 NA   NA
 5817375 5817376 PLES_04831 PLES_04841     FALSE 0.218 68.000 0.000 NA   NA
 5817376 5817377 PLES_04841 PLES_04851     FALSE 0.355 42.000 0.000 NA   NA
 5817377 5817378 PLES_04851 PLES_04861     FALSE 0.126 139.000 0.003 NA   NA
 5817378 5817379 PLES_04861 PLES_04871     FALSE 0.274 54.000 0.000 NA   NA
 5817380 5817381 PLES_04881 PLES_04891     TRUE 0.713 77.000 0.242 1.000   NA
 5817381 5817382 PLES_04891 PLES_04901     TRUE 0.940 11.000 0.154 1.000   NA
 5817382 5817383 PLES_04901 PLES_04911     TRUE 0.989 2.000 0.514 1.000 N NA
 5817383 5817384 PLES_04911 PLES_04921     TRUE 1.000 -10.000 0.886 0.005 Y NA
 5817385 5817386 PLES_04931 PLES_04941     TRUE 0.569 78.000 0.000 0.002   NA
 5817386 5817387 PLES_04941 PLES_04951     TRUE 0.629 16.000 0.000 1.000   NA
 5817388 5817389 PLES_04961 PLES_04971 bioB bioF TRUE 0.898 106.000 0.168 0.001 Y NA
 5817389 5817390 PLES_04971 PLES_04981 bioF   TRUE 0.979 -7.000 0.092 NA   NA
 5817390 5817391 PLES_04981 PLES_04991     TRUE 0.985 -7.000 0.163 NA   NA
 5817391 5817392 PLES_04991 PLES_05001   bioD TRUE 0.978 4.000 0.063 0.001 N NA
 5817392 5817393 PLES_05001 PLES_05011 bioD   TRUE 0.560 109.000 0.244 NA   NA
 5817395 5817396 PLES_05031 PLES_05041     FALSE 0.380 213.000 0.000 0.009 Y NA
 5817396 5817397 PLES_05041 PLES_05051     TRUE 0.467 273.000 0.150 0.009 Y NA
 5817398 5817399 PLES_05061 PLES_05071 nirN   TRUE 0.981 -9.000 0.125 1.000 N NA
 5817399 5817400 PLES_05071 PLES_05081   nirJ TRUE 0.954 11.000 0.217 1.000   NA
 5817400 5817401 PLES_05081 PLES_05091 nirJ nirH TRUE 0.993 -6.000 0.391 NA   NA
 5817401 5817402 PLES_05091 PLES_05101 nirH   TRUE 0.998 -25.000 0.483 NA Y NA
 5817402 5817403 PLES_05101 PLES_05111   nirL TRUE 0.997 -7.000 0.241 NA Y NA
 5817403 5817404 PLES_05111 PLES_05121 nirL   TRUE 0.998 -3.000 0.333 NA Y NA
 5817404 5817405 PLES_05121 PLES_05131   nirF TRUE 0.916 9.000 0.070 NA   NA
 5817405 5817406 PLES_05131 PLES_05141 nirF nirC TRUE 0.994 -3.000 0.186 0.014   NA
 5817406 5817407 PLES_05141 PLES_05151 nirC nirM TRUE 0.997 -3.000 0.062 0.014 Y NA
 5817407 5817408 PLES_05151 PLES_05161 nirM nirS TRUE 0.944 51.000 0.094 0.014 Y NA
 5817409 5817410 PLES_05171 PLES_05181 nirQ   TRUE 0.904 35.000 0.071 0.001   NA
 5817410 5817411 PLES_05181 PLES_05191     TRUE 0.989 8.000 0.750 NA   NA
 5817411 5817412 PLES_05191 PLES_05201   norC FALSE 0.158 90.000 0.000 NA   NA
 5817412 5817413 PLES_05201 PLES_05211 norC norB TRUE 0.998 0.000 0.794 0.001   NA
 5817413 5817414 PLES_05211 PLES_05221 norB   TRUE 0.996 2.000 0.118 0.001 Y NA
 5817415 5817416 PLES_05231 PLES_05241   dnr FALSE 0.175 84.000 0.000 NA   NA
 5817419 5817420 PLES_05261 PLES_05271     FALSE 0.110 226.000 0.000 0.019   NA
 5817420 5817421 PLES_05271 PLES_05281     TRUE 0.936 0.000 0.029 1.000 N NA
 5817423 5817424 PLES_05301 PLES_05311     FALSE 0.421 33.000 0.000 NA   NA
 5817424 5817425 PLES_05311 PLES_05321     FALSE 0.259 57.000 0.000 NA   NA
 5817425 5817426 PLES_05321 PLES_05331     TRUE 0.920 18.000 0.226 1.000 N NA
 5817427 5817428 PLES_05341 PLES_05351     TRUE 0.875 4.000 0.013 NA   NA
 5817428 5817429 PLES_05351 PLES_05361   dsbB FALSE 0.164 88.000 0.000 NA   NA
 5817430 5817431 PLES_05371 PLES_05381     TRUE 0.739 70.000 0.267 NA   NA
 5817431 5817432 PLES_05381 PLES_05391     FALSE 0.356 113.000 0.080 NA   NA
 5817437 5817438 PLES_05441 PLES_05451 metK   TRUE 0.952 16.000 0.036 1.000 Y NA
 5817439 5817440 PLES_05461 PLES_05471 tktA   TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5817442 5817443 PLES_05491 PLES_05501 epd pgk TRUE 0.992 6.000 0.070 0.003 Y NA
 5817443 5817444 PLES_05501 PLES_05511 pgk   FALSE 0.287 73.000 0.003 NA   NA
 5817444 5817445 PLES_05511 PLES_05521     FALSE 0.434 160.000 0.273 NA   NA
 5817445 5817446 PLES_05521 PLES_05531   fda FALSE 0.345 120.000 0.084 NA   NA
 5817446 5817447 PLES_05531 PLES_05541 fda   FALSE 0.228 66.000 0.000 NA   NA
 5817452 5817453 PLES_05591 PLES_05601     FALSE 0.107 129.000 0.000 1.000   NA
 5817453 5817454 PLES_05601 PLES_05611     FALSE 0.058 178.000 0.000 1.000   NA
 5817458 5817459 PLES_05651 PLES_05661     TRUE 0.594 16.000 0.000 NA   NA
 5817459 5817460 PLES_05661 PLES_05671     TRUE 0.621 14.000 0.000 NA   NA
 5817460 5817461 PLES_05671 PLES_05681     TRUE 0.901 -10.000 0.000 NA   NA
 5817461 5817462 PLES_05681 PLES_05691     FALSE 0.042 191.000 0.000 NA   NA
 5817462 5817463 PLES_05691 PLES_05701     FALSE 0.005 534.000 0.000 NA   NA
 5817463 5817464 PLES_05701 PLES_05711     FALSE 0.149 93.000 0.000 NA   NA
 5817464 5817465 PLES_05711 PLES_05712     FALSE 0.005 550.000 0.000 NA   NA
 5817465 5817466 PLES_05712 PLES_05721     TRUE 0.579 17.000 0.000 NA   NA
 5817466 5817467 PLES_05721 PLES_05731   rpoD FALSE 0.186 107.000 0.013 1.000 N NA
 5817467 5817468 PLES_05731 PLES_05741 rpoD dnaG TRUE 0.722 80.000 0.299 1.000 N NA
 5817468 5817469 PLES_05741 PLES_05751 dnaG   TRUE 0.586 83.000 0.137 1.000   NA
 5817469 5817470 PLES_05751 PLES_05761   rpsU TRUE 0.820 70.000 0.173 0.016   NA
 5817473 5817474 PLES_05791 PLES_05801 folB   TRUE 0.998 -9.000 0.500 1.000 Y NA
 5817475 5817476 PLES_05811 PLES_05821 cca   TRUE 0.468 44.000 0.008 NA   NA
 5817476 5817477 PLES_05821 PLES_05831     FALSE 0.221 95.000 0.007 NA   NA
 5817477 5817478 PLES_05831 PLES_05841     TRUE 0.997 -3.000 0.761 NA   NA
 5817478 5817479 PLES_05841 PLES_05851     TRUE 0.805 101.000 0.683 NA   NA
 5817479 5817480 PLES_05851 PLES_05861     FALSE 0.012 279.000 0.000 NA N NA
 5817480 5817481 PLES_05861 PLES_05871   apaH TRUE 0.636 44.000 0.045 1.000   NA
 5817481 5817482 PLES_05871 PLES_05881 apaH   TRUE 0.985 0.000 0.267 NA   NA
 5817482 5817483 PLES_05881 PLES_05891   ksgA TRUE 0.715 37.000 0.078 NA N NA
 5817483 5817484 PLES_05891 PLES_05901 ksgA pdxA TRUE 0.482 116.000 0.197 1.000 N NA
 5817484 5817485 PLES_05901 PLES_05911 pdxA surA TRUE 0.995 -3.000 0.561 1.000 N NA
 5817485 5817486 PLES_05911 PLES_05921 surA ostA TRUE 0.971 -19.000 0.070 1.000 N NA
 5817487 5817488 PLES_05931 PLES_05941     TRUE 0.996 -3.000 0.642 NA   NA
 5817488 5817489 PLES_05941 PLES_05951     TRUE 0.956 2.000 0.091 1.000 N NA
 5817491 5817492 PLES_05971 PLES_05981     TRUE 0.987 46.000 0.667 0.028 Y NA
 5817492 5817493 PLES_05981 PLES_05991     FALSE 0.083 129.000 0.000 1.000 N NA
 5817493 5817494 PLES_05991 PLES_06001     FALSE 0.169 233.000 0.000 1.000 Y NA
 5817494 5817495 PLES_06001 PLES_06011     TRUE 0.962 56.000 0.556 1.000 Y NA
 5817495 5817496 PLES_06011 PLES_06021     TRUE 0.824 115.000 0.108 0.060 Y NA
 5817496 5817497 PLES_06021 PLES_06031     TRUE 0.856 106.000 0.145 0.060 Y NA
 5817497 5817498 PLES_06031 PLES_06041   rpe FALSE 0.144 124.000 0.007 1.000 N NA
 5817498 5817499 PLES_06041 PLES_06051 rpe   TRUE 0.974 0.000 0.120 1.000   NA
 5817499 5817500 PLES_06051 PLES_06061   trpE TRUE 0.717 73.000 0.233 1.000   NA
 5817501 5817502 PLES_06071 PLES_06081 prtN prtR FALSE 0.131 100.000 0.000 NA   NA
 5817503 5817504 PLES_06091 PLES_06101 ptrB   FALSE 0.314 48.000 0.000 NA   NA
 5817504 5817505 PLES_06101 PLES_06111     FALSE 0.009 363.000 0.000 NA   NA
 5817505 5817506 PLES_06111 PLES_06121     TRUE 0.526 22.000 0.000 NA   NA
 5817506 5817507 PLES_06121 PLES_06131     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5817507 5817508 PLES_06131 PLES_06141     TRUE 0.596 153.000 0.500 NA   NA
 5817508 5817509 PLES_06141 PLES_06151     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817509 5817510 PLES_06151 PLES_06161     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5817510 5817511 PLES_06161 PLES_06171     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5817511 5817512 PLES_06171 PLES_06181     FALSE 0.006 491.000 0.000 NA   NA
 5817512 5817513 PLES_06181 PLES_06191     TRUE 0.967 13.000 0.423 NA   NA
 5817513 5817514 PLES_06191 PLES_06201     TRUE 0.925 15.000 0.192 NA   NA
 5817514 5817515 PLES_06201 PLES_06211     FALSE 0.373 170.000 0.250 NA   NA
 5817515 5817516 PLES_06211 PLES_06221     TRUE 0.944 10.000 0.158 NA   NA
 5817516 5817517 PLES_06221 PLES_06231     TRUE 0.987 -25.000 0.211 NA   NA
 5817517 5817518 PLES_06231 PLES_06241     FALSE 0.255 58.000 0.000 NA   NA
 5817518 5817519 PLES_06241 PLES_06251     FALSE 0.421 33.000 0.000 NA   NA
 5817519 5817520 PLES_06251 PLES_06261     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817520 5817521 PLES_06261 PLES_06271     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817521 5817522 PLES_06271 PLES_06281   trpG FALSE 0.010 348.000 0.000 NA   NA
 5817522 5817523 PLES_06281 PLES_06291 trpG trpD TRUE 0.990 2.000 0.105 1.000 Y NA
 5817523 5817524 PLES_06291 PLES_06301 trpD trpC TRUE 0.997 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 5817526 5817527 PLES_06321 PLES_06331   speD FALSE 0.025 320.000 0.025 1.000 N NA
 5817528 5817529 PLES_06341 PLES_06351     FALSE 0.221 100.000 0.018 1.000 N NA
 5817531 5817532 PLES_06371 PLES_06381     TRUE 0.562 61.000 0.057 1.000   NA
 5817532 5817533 PLES_06381 PLES_06391     FALSE 0.441 122.000 0.154 1.000   NA
 5817533 5817534 PLES_06391 PLES_06401     TRUE 0.758 17.000 0.024 NA   NA
 5817535 5817536 PLES_06411 PLES_06421 argC   TRUE 0.915 0.000 0.008 NA   NA
 5817536 5817537 PLES_06421 PLES_06431     TRUE 0.964 1.000 0.103 NA   NA
 5817537 5817538 PLES_06431 PLES_06441     TRUE 0.510 78.000 0.079 NA   NA
 5817539 5817540 PLES_06451 PLES_06461     TRUE 0.966 3.000 0.184 NA N NA
 5817541 5817542 PLES_06471 PLES_06472 tyrZ   FALSE 0.005 540.000 0.000 NA   NA
 5817542 5817543 PLES_06472 PLES_06473     FALSE 0.233 65.000 0.000 NA   NA
 5817543 5817544 PLES_06473 PLES_06474     FALSE 0.456 29.000 0.000 NA   NA
 5817544 5817545 PLES_06474 PLES_06475     FALSE 0.026 227.000 0.000 NA   NA
 5817545 5817546 PLES_06475 PLES_06476     FALSE 0.081 142.000 0.000 NA   NA
 5817546 5817547 PLES_06476 PLES_06481   birA FALSE 0.066 160.000 0.000 NA   NA
 5817547 5817548 PLES_06481 PLES_06491 birA   TRUE 0.983 -3.000 0.147 1.000 N NA
 5817548 5817549 PLES_06491 PLES_06501     TRUE 0.834 9.000 0.012 NA   NA
 5817549 5817550 PLES_06501 PLES_06502     FALSE 0.077 148.000 0.000 NA   NA
 5817550 5817551 PLES_06502 PLES_06503     TRUE 0.479 27.000 0.000 NA   NA
 5817551 5817552 PLES_06503 PLES_06504     TRUE 0.543 20.000 0.000 NA   NA
 5817552 5817553 PLES_06504 PLES_06511   tufB FALSE 0.172 85.000 0.000 NA   NA
 5817553 5817554 PLES_06511 PLES_06512 tufB   FALSE 0.264 56.000 0.000 NA   NA
 5817554 5817555 PLES_06512 PLES_06521   secE FALSE 0.326 46.000 0.000 NA   NA
 5817555 5817556 PLES_06521 PLES_06531 secE nusG TRUE 0.988 10.000 0.843 1.000 N NA
 5817556 5817557 PLES_06531 PLES_06541 nusG rplK TRUE 0.760 117.000 0.681 1.000 N NA
 5817557 5817558 PLES_06541 PLES_06551 rplK rplA TRUE 0.999 0.000 0.838 0.013 Y NA
 5817560 5817561 PLES_06561 PLES_06571 rplJ rplL TRUE 0.982 79.000 0.884 0.009 Y NA
 5817561 5817562 PLES_06571 PLES_06572 rplL   TRUE 0.758 6.000 0.000 NA   NA
 5817562 5817563 PLES_06572 PLES_06581   rpoB FALSE 0.073 151.000 0.000 NA   NA
 5817563 5817564 PLES_06581 PLES_06591 rpoB rpoC TRUE 0.988 66.000 0.851 0.000 Y NA
 5817564 5817565 PLES_06591 PLES_06601 rpoC rpsL FALSE 0.294 152.000 0.122 1.000 N NA
 5817565 5817566 PLES_06601 PLES_06611 rpsL rpsG TRUE 0.964 100.000 0.620 0.002 Y NA
 5817566 5817567 PLES_06611 PLES_06621 rpsG fusA1 TRUE 0.983 31.000 0.579 1.000 Y NA
 5817567 5817568 PLES_06621 PLES_06631 fusA1 tufA TRUE 0.990 31.000 0.400 0.001 Y NA
 5817568 5817569 PLES_06631 PLES_06641 tufA rpsJ TRUE 0.759 157.000 0.318 1.000 Y NA
 5817569 5817570 PLES_06641 PLES_06651 rpsJ rplC TRUE 0.948 83.000 0.307 0.013 Y NA
 5817570 5817571 PLES_06651 PLES_06661 rplC rplD TRUE 0.995 14.000 0.486 0.009 Y NA
 5817571 5817572 PLES_06661 PLES_06671 rplD rplW TRUE 0.998 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 5817572 5817573 PLES_06671 PLES_06681 rplW rplB TRUE 0.995 12.000 0.849 1.000 Y NA
 5817573 5817574 PLES_06681 PLES_06691 rplB rpsS TRUE 0.997 17.000 0.820 0.013 Y NA
 5817574 5817575 PLES_06691 PLES_06701 rpsS rplV TRUE 0.997 13.000 0.769 0.013 Y NA
 5817575 5817576 PLES_06701 PLES_06711 rplV rpsC TRUE 0.997 13.000 0.719 0.013 Y NA
 5817576 5817577 PLES_06711 PLES_06721 rpsC rplP TRUE 0.998 12.000 0.828 0.013 Y NA
 5817577 5817578 PLES_06721 PLES_06731 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.009 Y NA
 5817578 5817579 PLES_06731 PLES_06741 rpmC rpsQ TRUE 0.999 3.000 0.828 0.009 Y NA
 5817579 5817580 PLES_06741 PLES_06751 rpsQ rplN TRUE 0.995 24.000 0.791 0.013 Y NA
 5817580 5817581 PLES_06751 PLES_06761 rplN rplX TRUE 0.997 13.000 0.810 0.013 Y NA
 5817581 5817582 PLES_06761 PLES_06771 rplX rplE TRUE 0.996 20.000 0.758 0.009 Y NA
 5817582 5817583 PLES_06771 PLES_06781 rplE rpsN TRUE 0.993 14.000 0.309 0.009 Y NA
 5817583 5817584 PLES_06781 PLES_06791 rpsN rpsH TRUE 0.792 190.000 0.295 0.009 Y NA
 5817584 5817585 PLES_06791 PLES_06801 rpsH rplF TRUE 0.998 12.000 0.808 0.009 Y NA
 5817585 5817586 PLES_06801 PLES_06811 rplF rplR TRUE 0.998 11.000 0.815 0.009 Y NA
 5817586 5817587 PLES_06811 PLES_06821 rplR rpsE TRUE 0.999 4.000 0.814 0.013 Y NA
 5817587 5817588 PLES_06821 PLES_06831 rpsE rpmD TRUE 0.999 3.000 0.789 0.013 Y NA
 5817588 5817589 PLES_06831 PLES_06841 rpmD rplO TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 5817589 5817590 PLES_06841 PLES_06851 rplO secY TRUE 0.993 1.000 0.730 1.000 N NA
 5817590 5817591 PLES_06851 PLES_06861 secY rpsM FALSE 0.027 276.000 0.011 1.000 N NA
 5817591 5817592 PLES_06861 PLES_06871 rpsM rpsK TRUE 0.996 19.000 0.810 0.009 Y NA
 5817592 5817593 PLES_06871 PLES_06881 rpsK rpsD TRUE 0.994 17.000 0.509 0.013 Y NA
 5817593 5817594 PLES_06881 PLES_06891 rpsD rpoA TRUE 0.956 23.000 0.549 1.000 N NA
 5817594 5817595 PLES_06891 PLES_06901 rpoA rplQ TRUE 0.946 44.000 0.873 1.000 N NA
 5817595 5817596 PLES_06901 PLES_06911 rplQ katA FALSE 0.013 282.000 0.000 1.000 N NA
 5817596 5817597 PLES_06911 PLES_06921 katA bfrA FALSE 0.453 131.000 0.000 1.000 Y NA
 5817599 5817600 PLES_06941 PLES_06951   ssb TRUE 0.838 17.000 0.075 NA N NA
 5817601 5817602 PLES_06961 PLES_06971 pchA pchB TRUE 0.956 -3.000 0.027 1.000 N NA
 5817602 5817603 PLES_06971 PLES_06981 pchB pchC TRUE 0.975 0.000 0.149 1.000 N NA
 5817603 5817604 PLES_06981 PLES_06991 pchC pchD TRUE 0.988 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5817605 5817606 PLES_07001 PLES_07011 pchR pchE FALSE 0.213 194.000 0.154 1.000 N NA
 5817606 5817607 PLES_07011 PLES_07021 pchE pchF TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 5817607 5817608 PLES_07021 PLES_07031 pchF pchG TRUE 0.994 -3.000 0.074 1.000 Y NA
 5817608 5817609 PLES_07031 PLES_07041 pchG   TRUE 0.895 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5817609 5817610 PLES_07041 PLES_07051     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.005 Y NA
 5817610 5817611 PLES_07051 PLES_07061   fptA TRUE 0.823 92.000 0.667 1.000 N NA
 5817611 5817612 PLES_07061 PLES_07071 fptA   TRUE 0.994 0.000 0.667 NA   NA
 5817612 5817613 PLES_07071 PLES_07081     FALSE 0.012 323.000 0.000 NA   NA
 5817613 5817614 PLES_07081 PLES_07091     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5817615 5817616 PLES_07101 PLES_07111 phzS phzG1 FALSE 0.162 238.000 0.000 1.000 Y NA
 5817616 5817617 PLES_07111 PLES_07121 phzG1 phzF1 TRUE 0.907 26.000 0.235 1.000   NA
 5817617 5817618 PLES_07121 PLES_07131 phzF1 phzE1 TRUE 0.911 14.000 0.016 0.023   NA
 5817618 5817619 PLES_07131 PLES_07141 phzE1 phzD1 TRUE 0.988 -3.000 0.055 0.023 N NA
 5817619 5817620 PLES_07141 PLES_07151 phzD1 phzC1 TRUE 0.895 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5817620 5817621 PLES_07151 PLES_07161 phzC1 phzB1 FALSE 0.437 36.000 0.000 1.000   NA
 5817621 5817622 PLES_07161 PLES_07171 phzB1 phzA1 TRUE 0.806 30.000 0.000 0.004   NA
 5817624 5817625 PLES_07191 PLES_07201 opmD mexI TRUE 0.974 -3.000 0.080 NA N NA
 5817625 5817626 PLES_07201 PLES_07211 mexI mexH TRUE 0.965 13.000 0.435 NA N NA
 5817626 5817627 PLES_07211 PLES_07221 mexH mexG TRUE 0.955 8.000 0.174 NA   NA
 5817627 5817628 PLES_07221 PLES_07231 mexG   FALSE 0.005 650.000 0.000 NA   NA
 5817628 5817629 PLES_07231 PLES_07241     FALSE 0.142 80.000 0.000 NA N NA
 5817630 5817631 PLES_07251 PLES_07261   ddlA FALSE 0.158 96.000 0.000 1.000   NA
 5817632 5817633 PLES_07271 PLES_07281     FALSE 0.038 208.000 0.000 1.000   NA
 5817633 5817634 PLES_07281 PLES_07291     TRUE 0.900 118.000 0.600 1.000 Y NA
 5817635 5817636 PLES_07301 PLES_07311     TRUE 0.997 3.000 0.280 0.027 Y NA
 5817636 5817637 PLES_07311 PLES_07321     FALSE 0.375 156.000 0.000 1.000 Y NA
 5817637 5817638 PLES_07321 PLES_07331     TRUE 0.973 85.000 0.778 0.059 Y NA
 5817638 5817639 PLES_07331 PLES_07341     TRUE 1.000 -3.000 0.857 0.013 Y NA
 5817639 5817640 PLES_07341 PLES_07351     TRUE 0.999 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 5817640 5817641 PLES_07351 PLES_07361     TRUE 0.945 9.000 0.133 1.000   NA
 5817642 5817643 PLES_07371 PLES_07381 pqsL   FALSE 0.335 168.000 0.000 1.000 Y NA
 5817643 5817644 PLES_07381 PLES_07391     TRUE 0.998 -7.000 0.690 0.081 N NA
 5817644 5817645 PLES_07391 PLES_07401     TRUE 0.713 65.000 0.208 1.000 N NA
 5817645 5817646 PLES_07401 PLES_07411     TRUE 0.723 136.000 0.714 1.000 N NA
 5817646 5817647 PLES_07411 PLES_07421     TRUE 0.668 93.000 0.300 1.000 N NA
 5817648 5817649 PLES_07431 PLES_07441     TRUE 0.490 26.000 0.000 NA   NA
 5817650 5817651 PLES_07451 PLES_07461     TRUE 0.468 28.000 0.000 NA   NA
 5817653 5817654 PLES_07481 PLES_07491     FALSE 0.027 237.000 0.000 1.000   NA
 5817654 5817655 PLES_07491 PLES_07501     FALSE 0.349 100.000 0.000 0.081   NA
 5817657 5817658 PLES_07521 PLES_07531 piv   FALSE 0.006 535.000 0.000 1.000   NA
 5817660 5817661 PLES_07551 PLES_07561     TRUE 0.552 23.000 0.000 1.000   NA
 5817661 5817662 PLES_07561 PLES_07571     FALSE 0.098 136.000 0.000 1.000   NA
 5817668 5817669 PLES_07631 PLES_07641     FALSE 0.242 62.000 0.000 NA   NA
 5817671 5817672 PLES_07661 PLES_07671 fepG fepD TRUE 0.997 -3.000 0.079 0.059 Y NA
 5817672 5817673 PLES_07671 PLES_07681 fepD fepB TRUE 0.947 31.000 0.130 1.000 Y NA
 5817676 5817677 PLES_07711 PLES_07721     TRUE 0.762 68.000 0.318 NA N NA
 5817677 5817678 PLES_07721 PLES_07731     FALSE 0.005 437.000 0.000 NA N NA
 5817679 5817680 PLES_07741 PLES_07751     TRUE 0.871 14.000 0.062 1.000   NA
 5817680 5817681 PLES_07751 PLES_07761   acoB TRUE 0.993 -3.000 0.375 1.000   NA
 5817681 5817682 PLES_07761 PLES_07771 acoB   TRUE 0.994 33.000 0.804 0.001 Y NA
 5817682 5817683 PLES_07771 PLES_07781     TRUE 0.930 23.000 0.141 0.081   NA
 5817683 5817684 PLES_07781 PLES_07791     TRUE 0.987 -3.000 0.054 0.081   NA
 5817686 5817687 PLES_07811 PLES_07821     FALSE 0.044 188.000 0.000 NA   NA
 5817687 5817688 PLES_07821 PLES_07831     FALSE 0.124 96.000 0.000 1.000 N NA
 5817688 5817689 PLES_07831 PLES_07841     TRUE 0.951 0.000 0.000 0.077 N NA
 5817689 5817690 PLES_07841 PLES_07851     TRUE 0.953 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5817690 5817691 PLES_07851 PLES_07861     FALSE 0.137 97.000 0.000 NA   NA
 5817691 5817692 PLES_07861 PLES_07871     FALSE 0.013 309.000 0.000 NA   NA
 5817692 5817693 PLES_07871 PLES_07881     FALSE 0.346 132.000 0.111 NA   NA
 5817693 5817694 PLES_07881 PLES_07891     FALSE 0.004 797.000 0.000 NA   NA
 5817694 5817695 PLES_07891 PLES_07901     FALSE 0.027 226.000 0.000 NA   NA
 5817695 5817696 PLES_07901 PLES_07911     TRUE 0.770 5.000 0.000 NA   NA
 5817696 5817697 PLES_07911 PLES_07921     FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 5817697 5817698 PLES_07921 PLES_07931     FALSE 0.110 113.000 0.000 NA   NA
 5817698 5817699 PLES_07931 PLES_07941     FALSE 0.006 511.000 0.000 NA   NA
 5817699 5817700 PLES_07941 PLES_07951     FALSE 0.006 471.000 0.000 NA   NA
 5817700 5817701 PLES_07951 PLES_07961     FALSE 0.042 352.000 0.000 0.032   NA
 5817702 5817703 PLES_07971 PLES_07981 endY   FALSE 0.004 835.000 0.000 NA   NA
 5817703 5817704 PLES_07981 PLES_07991     FALSE 0.110 113.000 0.000 NA   NA
 5817704 5817705 PLES_07991 PLES_08001     FALSE 0.012 319.000 0.000 NA   NA
 5817705 5817706 PLES_08001 PLES_08011     FALSE 0.008 418.000 0.000 NA   NA
 5817706 5817707 PLES_08011 PLES_08021     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817707 5817708 PLES_08021 PLES_08031     TRUE 0.994 33.000 1.000 0.017 Y NA
 5817708 5817709 PLES_08031 PLES_08041     FALSE 0.011 365.000 0.000 1.000   NA
 5817709 5817710 PLES_08041 PLES_08051     TRUE 0.607 15.000 0.000 NA   NA
 5817710 5817711 PLES_08051 PLES_08061     TRUE 0.706 141.000 0.667 NA   NA
 5817713 5817714 PLES_08072 PLES_08081     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 5817714 5817715 PLES_08081 PLES_08091     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817715 5817716 PLES_08091 PLES_08101     FALSE 0.027 236.000 0.000 1.000   NA
 5817716 5817717 PLES_08101 PLES_08111     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817717 5817718 PLES_08111 PLES_08121     FALSE 0.008 395.000 0.000 NA   NA
 5817718 5817719 PLES_08121 PLES_08131     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5817719 5817720 PLES_08131 PLES_08141     FALSE 0.032 212.000 0.000 NA   NA
 5817720 5817721 PLES_08141 PLES_08151     FALSE 0.013 329.000 0.000 1.000   NA
 5817721 5817722 PLES_08151 PLES_08161     TRUE 0.856 67.000 0.537 NA   NA
 5817722 5817723 PLES_08161 PLES_08171     FALSE 0.042 191.000 0.000 NA   NA
 5817723 5817724 PLES_08171 PLES_08181     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5817724 5817725 PLES_08181 PLES_08191     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5817725 5817726 PLES_08191 PLES_08201     FALSE 0.181 82.000 0.000 NA   NA
 5817726 5817727 PLES_08201 PLES_08211     FALSE 0.006 465.000 0.000 NA   NA
 5817727 5817728 PLES_08211 PLES_08221     FALSE 0.004 963.000 0.000 NA   NA
 5817728 5817729 PLES_08221 PLES_08231     TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 5817729 5817730 PLES_08231 PLES_08241     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5817730 5817731 PLES_08241 PLES_08251     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5817731 5817732 PLES_08251 PLES_08261     TRUE 0.899 -13.000 0.000 NA   NA
 5817732 5817733 PLES_08261 PLES_08271     FALSE 0.188 79.000 0.000 NA   NA
 5817733 5817734 PLES_08271 PLES_08281     FALSE 0.044 189.000 0.000 NA   NA
 5817734 5817735 PLES_08281 PLES_08291     TRUE 0.840 1.000 0.000 NA   NA
 5817735 5817736 PLES_08291 PLES_08301     FALSE 0.005 547.000 0.000 NA   NA
 5817736 5817737 PLES_08301 PLES_08311     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817737 5817738 PLES_08311 PLES_08321     FALSE 0.202 73.000 0.000 NA   NA
 5817738 5817739 PLES_08321 PLES_08331   tyrS FALSE 0.004 1797.000 0.000 NA   NA
 5817741 5817742 PLES_08351 PLES_08361     FALSE 0.151 86.000 0.000 1.000 N NA
 5817743 5817744 PLES_08371 PLES_08381     TRUE 0.873 84.000 0.800 NA   NA
 5817744 5817745 PLES_08381 PLES_08391     FALSE 0.016 264.000 0.000 1.000 N NA
 5817745 5817746 PLES_08391 PLES_08401     TRUE 0.692 98.000 0.385 1.000 N NA
 5817747 5817748 PLES_08411 PLES_08421     TRUE 0.991 -3.000 0.273 NA   NA
 5817749 5817750 PLES_08431 PLES_08441   hpcG TRUE 0.879 13.000 0.075 1.000 N NA
 5817750 5817751 PLES_08441 PLES_08451 hpcG   TRUE 0.831 18.000 0.075 NA N NA
 5817751 5817752 PLES_08451 PLES_08461   hpcD FALSE 0.305 93.000 0.039 NA N NA
 5817752 5817753 PLES_08461 PLES_08471 hpcD hpcB TRUE 0.968 11.000 0.330 1.000   NA
 5817753 5817754 PLES_08471 PLES_08481 hpcB hpcC TRUE 0.609 132.000 0.378 1.000   NA
 5817754 5817755 PLES_08481 PLES_08491 hpcC   TRUE 0.997 -3.000 0.510 0.081 N NA
 5817755 5817756 PLES_08491 PLES_08501     TRUE 0.998 11.000 0.618 0.000 Y NA
 5817757 5817758 PLES_08511 PLES_08521   aph FALSE 0.259 52.000 0.000 1.000 N NA
 5817759 5817760 PLES_08531 PLES_08541     FALSE 0.191 78.000 0.000 NA   NA
 5817760 5817761 PLES_08541 PLES_08551     TRUE 0.653 28.000 0.029 NA N NA
 5817761 5817762 PLES_08551 PLES_08561     FALSE 0.105 118.000 0.000 NA   NA
 5817763 5817764 PLES_08571 PLES_08581     FALSE 0.070 154.000 0.000 NA   NA
 5817764 5817765 PLES_08581 PLES_08591     FALSE 0.071 128.000 0.000 NA N NA
 5817766 5817767 PLES_08601 PLES_08611   ampC FALSE 0.233 65.000 0.000 NA   NA
 5817769 5817770 PLES_08631 PLES_08641     FALSE 0.012 321.000 0.000 NA   NA
 5817771 5817772 PLES_08651 PLES_08661     FALSE 0.379 75.000 0.029 NA   NA
 5817772 5817773 PLES_08661 PLES_08671     TRUE 0.997 -7.000 0.914 NA   NA
 5817774 5817775 PLES_08681 PLES_08691     TRUE 0.661 32.000 0.031 NA   NA
 5817775 5817776 PLES_08691 PLES_08701     FALSE 0.306 130.000 0.069 1.000   NA
 5817776 5817777 PLES_08701 PLES_08711     TRUE 0.999 -3.000 0.897 1.000 Y NA
 5817779 5817780 PLES_08731 PLES_08741     FALSE 0.280 155.000 0.118 1.000 N NA
 5817780 5817781 PLES_08741 PLES_08751     FALSE 0.154 85.000 0.000 1.000 N NA
 5817781 5817782 PLES_08751 PLES_08761     TRUE 0.982 15.000 0.500 0.046 N NA
 5817782 5817783 PLES_08761 PLES_08771     TRUE 0.993 -3.000 0.417 1.000 N NA
 5817783 5817784 PLES_08771 PLES_08781     TRUE 0.785 71.000 0.333 1.000   NA
 5817785 5817786 PLES_08791 PLES_08801     FALSE 0.250 48.000 0.000 NA N NA
 5817787 5817788 PLES_08811 PLES_08821     TRUE 0.492 29.000 0.000 1.000   NA
 5817790 5817791 PLES_08841 PLES_08851 hpaC hpaA TRUE 0.929 29.000 0.097 0.001   NA
 5817791 5817792 PLES_08851 PLES_08861 hpaA   FALSE 0.060 166.000 0.000 NA   NA
 5817792 5817793 PLES_08861 PLES_08871     FALSE 0.032 212.000 0.000 NA   NA
 5817793 5817794 PLES_08871 PLES_08881     TRUE 0.960 -3.000 0.033 1.000 N NA
 5817794 5817795 PLES_08881 PLES_08891     TRUE 0.878 9.000 0.033 NA   NA
 5817796 5817797 PLES_08901 PLES_08911 cupB1 cupB2 TRUE 0.988 31.000 0.800 1.000 Y NA
 5817797 5817798 PLES_08911 PLES_08921 cupB2 cupB3 FALSE 0.388 316.000 0.400 1.000 Y NA
 5817798 5817799 PLES_08921 PLES_08931 cupB3 cupB4 TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 5817799 5817800 PLES_08931 PLES_08941 cupB4 cupB5 TRUE 0.616 88.000 0.000 1.000 Y NA
 5817800 5817801 PLES_08941 PLES_08951 cupB5 cupB6 TRUE 0.553 100.000 0.000 1.000 Y NA
 5817801 5817802 PLES_08951 PLES_08961 cupB6   FALSE 0.004 645.000 0.000 1.000 N NA
 5817803 5817804 PLES_08971 PLES_08981     FALSE 0.224 74.000 0.000 1.000   NA
 5817804 5817805 PLES_08981 PLES_08991     FALSE 0.028 210.000 0.000 1.000 N NA
 5817805 5817806 PLES_08991 PLES_09001     TRUE 0.993 -3.000 0.357 NA   NA
 5817809 5817810 PLES_09031 PLES_09041     FALSE 0.051 168.000 0.000 1.000 N NA
 5817810 5817811 PLES_09041 PLES_09051     TRUE 0.997 -25.000 0.864 NA   NA
 5817811 5817812 PLES_09051 PLES_09061     FALSE 0.065 161.000 0.000 NA   NA
 5817812 5817813 PLES_09061 PLES_09071     FALSE 0.015 269.000 0.000 1.000 N NA
 5817813 5817814 PLES_09071 PLES_09081     TRUE 0.987 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5817815 5817816 PLES_09091 PLES_09101   oprG FALSE 0.175 84.000 0.000 NA   NA
 5817816 5817817 PLES_09101 PLES_09111 oprG   FALSE 0.237 148.000 0.060 NA   NA
 5817817 5817818 PLES_09111 PLES_09121     TRUE 0.875 18.000 0.114 NA   NA
 5817818 5817819 PLES_09121 PLES_09131     TRUE 0.997 3.000 0.605 NA Y NA
 5817819 5817820 PLES_09131 PLES_09141     TRUE 0.723 89.000 0.336 NA   NA
 5817822 5817823 PLES_09161 PLES_09171     FALSE 0.384 72.000 0.022 1.000   NA
 5817823 5817824 PLES_09171 PLES_09181     TRUE 0.688 114.000 0.462 NA   NA
 5817825 5817826 PLES_09191 PLES_09201   ribD TRUE 0.990 -3.000 0.277 NA N NA
 5817826 5817827 PLES_09201 PLES_09211 ribD ribC FALSE 0.290 428.000 0.456 1.000 Y NA
 5817827 5817828 PLES_09211 PLES_09221 ribC ribB TRUE 0.940 27.000 0.065 1.000 Y NA
 5817828 5817829 PLES_09221 PLES_09231 ribB ribE TRUE 0.819 118.000 0.049 0.001 Y NA
 5817829 5817830 PLES_09231 PLES_09241 ribE nusB TRUE 0.992 -3.000 0.347 1.000 N NA
 5817830 5817831 PLES_09241 PLES_09251 nusB thiL TRUE 0.916 19.000 0.225 1.000 N NA
 5817831 5817832 PLES_09251 PLES_09261 thiL pgpA TRUE 0.987 -7.000 0.206 1.000 N NA
 5817832 5817833 PLES_09261 PLES_09271 pgpA   TRUE 0.836 9.000 0.018 1.000 N NA
 5817833 5817834 PLES_09271 PLES_09281     TRUE 0.950 3.000 0.075 1.000   NA
 5817834 5817835 PLES_09281 PLES_09291   ribA FALSE 0.233 131.000 0.035 1.000   NA
 5817835 5817836 PLES_09291 PLES_09301 ribA   TRUE 0.970 -3.000 0.050 NA   NA
 5817836 5817837 PLES_09301 PLES_09311     TRUE 0.961 0.000 0.066 NA   NA
 5817838 5817839 PLES_09321 PLES_09331 dxs ispA TRUE 0.819 109.000 0.246 1.000 Y NA
 5817839 5817840 PLES_09331 PLES_09341 ispA xseB TRUE 0.986 -3.000 0.177 1.000 N NA
 5817842 5817843 PLES_09361 PLES_09371     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5817843 5817844 PLES_09371 PLES_09381     TRUE 0.977 10.000 0.435 NA   NA
 5817844 5817845 PLES_09381 PLES_09391     TRUE 0.994 -3.000 0.426 1.000   NA
 5817845 5817846 PLES_09391 PLES_09401     FALSE 0.023 405.000 0.000 0.094 N NA
 5817846 5817847 PLES_09401 PLES_09411     TRUE 0.945 19.000 0.345 NA   NA
 5817847 5817848 PLES_09411 PLES_09421   aqpZ FALSE 0.060 166.000 0.000 NA   NA
 5817848 5817849 PLES_09421 PLES_09431 aqpZ   FALSE 0.010 347.000 0.000 NA   NA
 5817851 5817852 PLES_09451 PLES_09461 ppa   FALSE 0.334 80.000 0.022 NA   NA
 5817852 5817853 PLES_09461 PLES_09471     TRUE 0.914 3.000 0.030 NA   NA
 5817853 5817854 PLES_09471 PLES_09481     FALSE 0.004 974.000 0.000 NA   NA
 5817854 5817855 PLES_09481 PLES_09491     FALSE 0.006 475.000 0.000 NA   NA
 5817855 5817856 PLES_09491 PLES_09501     FALSE 0.332 50.000 0.000 1.000   NA
 5817856 5817857 PLES_09501 PLES_09511     FALSE 0.192 163.000 0.047 1.000   NA
 5817857 5817858 PLES_09511 PLES_09521   eutB TRUE 0.998 11.000 0.859 0.000 Y NA
 5817858 5817859 PLES_09521 PLES_09531 eutB   TRUE 0.947 59.000 0.407 1.000 Y NA
 5817859 5817860 PLES_09531 PLES_09541     FALSE 0.028 210.000 0.000 1.000 N NA
 5817861 5817862 PLES_09551 PLES_09561   mpl FALSE 0.252 158.000 0.020 0.093 N NA
 5817862 5817863 PLES_09561 PLES_09571 mpl   TRUE 0.961 9.000 0.235 1.000 N NA
 5817863 5817864 PLES_09571 PLES_09581     TRUE 0.951 2.000 0.070 NA   NA
 5817865 5817866 PLES_09591 PLES_09601     TRUE 0.628 47.000 0.056 NA   NA
 5817866 5817867 PLES_09601 PLES_09611     FALSE 0.315 191.000 0.243 1.000   NA
 5817868 5817869 PLES_09621 PLES_09631     TRUE 0.995 0.000 0.818 NA   NA
 5817869 5817870 PLES_09631 PLES_09641     TRUE 0.740 20.000 0.027 NA   NA
 5817871 5817872 PLES_09651 PLES_09661     TRUE 0.957 -3.000 0.019 1.000   NA
 5817875 5817876 PLES_09691 PLES_09701 proA nadD TRUE 0.977 0.000 0.170 1.000 N NA
 5817876 5817877 PLES_09701 PLES_09711 nadD   TRUE 0.906 23.000 0.221 NA   NA
 5817877 5817878 PLES_09711 PLES_09721     TRUE 0.972 8.000 0.307 NA   NA
 5817878 5817879 PLES_09721 PLES_09731   pbpA TRUE 0.640 13.000 0.000 NA   NA
 5817879 5817880 PLES_09731 PLES_09741 pbpA rodA FALSE 0.398 32.000 0.000 1.000 N NA
 5817880 5817881 PLES_09741 PLES_09751 rodA sltB1 TRUE 0.922 9.000 0.096 NA N NA
 5817881 5817882 PLES_09751 PLES_09761 sltB1   TRUE 0.997 -3.000 0.298 NA Y NA
 5817882 5817883 PLES_09761 PLES_09771   dacC TRUE 0.907 66.000 0.241 NA Y NA
 5817883 5817884 PLES_09771 PLES_09781 dacC   TRUE 0.527 71.000 0.074 NA   NA
 5817884 5817885 PLES_09781 PLES_09791   lipB TRUE 0.982 0.000 0.219 NA   NA
 5817885 5817886 PLES_09791 PLES_09801 lipB lis TRUE 0.999 -3.000 0.319 0.000 Y NA
 5817891 5817892 PLES_09851 PLES_09861   holA FALSE 0.234 92.000 0.007 NA   NA
 5817892 5817893 PLES_09861 PLES_09871 holA   TRUE 0.821 38.000 0.199 NA N NA
 5817893 5817894 PLES_09871 PLES_09881   leuS TRUE 0.664 67.000 0.182 NA N NA
 5817895 5817896 PLES_09891 PLES_09901     TRUE 0.811 73.000 0.435 NA   NA
 5817897 5817898 PLES_09911 PLES_09921 lnt   TRUE 0.486 186.000 0.557 NA N NA
 5817898 5817899 PLES_09921 PLES_09931     TRUE 0.984 -3.000 0.150 NA   NA
 5817899 5817900 PLES_09931 PLES_09941     TRUE 0.994 -10.000 0.457 NA   NA
 5817900 5817901 PLES_09941 PLES_09951     FALSE 0.341 169.000 0.220 1.000 N NA
 5817903 5817904 PLES_09971 PLES_09981   hemL FALSE 0.061 209.000 0.008 1.000   NA
 5817904 5817905 PLES_09981 PLES_09991 hemL thiE TRUE 0.944 38.000 0.173 1.000 Y NA
 5817905 5817906 PLES_09991 PLES_10001 thiE thiD TRUE 0.986 11.000 0.209 1.000 Y NA
 5817907 5817908 PLES_10011 PLES_10021 ladS   FALSE 0.262 106.000 0.036 1.000 N NA
 5817908 5817909 PLES_10021 PLES_10031     TRUE 0.982 -3.000 0.127 1.000 N NA
 5817909 5817910 PLES_10031 PLES_10041     TRUE 0.588 12.000 0.000 NA N NA
 5817910 5817911 PLES_10041 PLES_10051   amn FALSE 0.212 55.000 0.000 NA N NA
 5817914 5817915 PLES_10081 PLES_10091     FALSE 0.336 101.000 0.051 NA   NA
 5817915 5817916 PLES_10091 PLES_10101     FALSE 0.142 202.000 0.077 NA   NA
 5817916 5817917 PLES_10101 PLES_10111     FALSE 0.009 382.000 0.000 NA   NA
 5817917 5817918 PLES_10111 PLES_10121     TRUE 0.893 -43.000 0.000 NA   NA
 5817918 5817919 PLES_10121 PLES_10131     FALSE 0.334 89.000 0.031 NA   NA
 5817921 5817922 PLES_10151 PLES_10161     TRUE 0.504 24.000 0.000 NA   NA
 5817922 5817923 PLES_10161 PLES_10171     FALSE 0.297 90.000 0.024 NA   NA
 5817925 5817926 PLES_10191 PLES_10201     TRUE 0.643 67.000 0.143 NA   NA
 5817926 5817927 PLES_10201 PLES_10211     FALSE 0.175 84.000 0.000 NA   NA
 5817927 5817928 PLES_10211 PLES_10221     FALSE 0.059 158.000 0.000 1.000 N NA
 5817929 5817930 PLES_10231 PLES_10241     TRUE 0.480 66.000 0.043 NA   NA
 5817930 5817931 PLES_10241 PLES_10251     FALSE 0.191 78.000 0.000 NA   NA
 5817932 5817933 PLES_10261 PLES_10271   rocA1 FALSE 0.009 360.000 0.000 NA   NA
 5817933 5817934 PLES_10271 PLES_10281 rocA1   FALSE 0.213 69.000 0.000 NA   NA
 5817935 5817936 PLES_10291 PLES_10301 rocR two-compo TRUE 0.719 102.000 0.000 0.021 Y NA
 5817936 5817937 PLES_10301 PLES_10311 two-compo   FALSE 0.027 215.000 0.000 1.000 N NA
 5817937 5817938 PLES_10311 PLES_10321     TRUE 0.958 27.000 0.014 0.008 Y NA
 5817938 5817939 PLES_10321 PLES_10331     TRUE 0.829 3.000 0.000 1.000   NA
 5817939 5817940 PLES_10331 PLES_10341   tesB FALSE 0.449 34.000 0.000 1.000   NA
 5817940 5817941 PLES_10341 PLES_10351 tesB   TRUE 0.973 -3.000 0.052 1.000   NA
 5817943 5817944 PLES_10371 PLES_10381     FALSE 0.040 205.000 0.000 1.000   NA
 5817944 5817945 PLES_10381 PLES_10391     TRUE 0.858 65.000 0.093 1.000 Y NA
 5817945 5817946 PLES_10391 PLES_10401     TRUE 0.999 -10.000 0.728 1.000 Y NA
 5817946 5817947 PLES_10401 PLES_10411   tauD TRUE 0.526 107.000 0.214 1.000 N NA
 5817947 5817948 PLES_10411 PLES_10421 tauD   FALSE 0.063 163.000 0.000 NA   NA
 5817949 5817950 PLES_10431 PLES_10441     FALSE 0.038 190.000 0.000 1.000 N NA
 5817950 5817951 PLES_10441 PLES_10451     FALSE 0.372 175.000 0.294 NA N NA
 5817951 5817952 PLES_10451 PLES_10461     FALSE 0.035 204.000 0.000 NA   NA
 5817953 5817954 PLES_10471 PLES_10481 cioA cioB TRUE 0.983 4.000 0.000 0.069 Y NA
 5817954 5817955 PLES_10481 PLES_10491 cioB   TRUE 0.621 14.000 0.000 NA   NA
 5817959 5817960 PLES_10531 PLES_10541     FALSE 0.032 212.000 0.000 NA   NA
 5817960 5817961 PLES_10541 PLES_10551     TRUE 0.923 61.000 0.889 NA   NA
 5817961 5817962 PLES_10551 PLES_10561     FALSE 0.142 333.000 0.375 NA   NA
 5817964 5817965 PLES_10581 PLES_10591   moaC FALSE 0.036 249.000 0.013 1.000 N NA
 5817965 5817966 PLES_10591 PLES_10601 moaC moaD TRUE 0.998 -3.000 0.175 0.002 Y NA
 5817966 5817967 PLES_10601 PLES_10611 moaD moaE TRUE 0.998 5.000 0.501 0.002 Y NA
 5817967 5817968 PLES_10611 PLES_10621 moaE moaB1 TRUE 0.802 102.000 0.018 0.002 Y NA
 5817968 5817969 PLES_10621 PLES_10631 moaB1 moeA1 TRUE 0.998 -3.000 0.073 0.002 Y NA
 5817969 5817970 PLES_10631 PLES_10641 moeA1   FALSE 0.096 115.000 0.000 1.000 N NA
 5817970 5817971 PLES_10641 PLES_10651     TRUE 0.998 12.000 0.948 0.003 Y NA
 5817971 5817972 PLES_10651 PLES_10661     TRUE 0.989 -6.000 0.235 1.000 N NA
 5817972 5817973 PLES_10661 PLES_10671     FALSE 0.018 252.000 0.000 1.000 N NA
 5817973 5817974 PLES_10671 PLES_10681     FALSE 0.393 37.000 0.000 NA   NA
 5817975 5817976 PLES_10691 PLES_10701     TRUE 0.995 -3.000 0.571 NA   NA
 5817976 5817977 PLES_10701 PLES_10711     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817977 5817978 PLES_10711 PLES_10721     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5817978 5817979 PLES_10721 PLES_10731     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817979 5817980 PLES_10731 PLES_10741   prfC FALSE 0.008 385.000 0.000 NA   NA
 5817982 5817983 PLES_10761 PLES_10771 fecA   TRUE 0.891 95.000 0.400 NA Y NA
 5817983 5817984 PLES_10771 PLES_10781     TRUE 0.990 -3.000 0.286 NA N NA
 5817984 5817985 PLES_10781 PLES_10791     TRUE 0.720 101.000 0.000 0.031 Y NA
 5817987 5817988 PLES_10811 PLES_10821     FALSE 0.127 95.000 0.000 1.000 N NA
 5817989 5817990 PLES_10831 PLES_10841     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817990 5817991 PLES_10841 PLES_10851     FALSE 0.026 227.000 0.000 NA   NA
 5817992 5817993 PLES_10861 PLES_10871     TRUE 0.995 13.000 0.903 1.000 Y NA
 5817993 5817994 PLES_10871 PLES_10881     TRUE 0.993 0.000 0.313 0.058 N NA
 5817994 5817995 PLES_10881 PLES_10891     TRUE 0.994 0.000 0.403 0.058 N NA
 5817997 5817998 PLES_10911 PLES_10921     FALSE 0.445 30.000 0.000 NA   NA
 5817998 5817999 PLES_10921 PLES_10931     FALSE 0.107 105.000 0.000 1.000 N NA
 5817999 5818000 PLES_10931 PLES_10941     FALSE 0.142 95.000 0.000 NA   NA
 5818000 5818001 PLES_10941 PLES_10951     TRUE 0.534 21.000 0.000 NA   NA
 5818001 5818002 PLES_10951 PLES_10961     FALSE 0.415 87.000 0.000 0.079   NA
 5818002 5818003 PLES_10961 PLES_10971     TRUE 0.594 16.000 0.000 NA   NA
 5818003 5818004 PLES_10971 PLES_10981     FALSE 0.054 172.000 0.000 NA   NA
 5818004 5818005 PLES_10981 PLES_10991   narL FALSE 0.172 85.000 0.000 NA   NA
 5818005 5818006 PLES_10991 PLES_11001 narL narX TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.027 Y NA
 5818007 5818008 PLES_11011 PLES_11021 narK1 narK2 TRUE 0.938 12.000 0.000 NA Y NA
 5818008 5818009 PLES_11021 PLES_11031 narK2 narG FALSE 0.175 76.000 0.000 1.000 N NA
 5818009 5818010 PLES_11031 PLES_11041 narG narH TRUE 0.998 12.000 0.727 0.000 Y NA
 5818010 5818011 PLES_11041 PLES_11051 narH narJ TRUE 0.999 6.000 0.818 0.001 Y NA
 5818011 5818012 PLES_11051 PLES_11061 narJ narI TRUE 0.999 3.000 0.818 0.001 Y NA
 5818012 5818013 PLES_11061 PLES_11071 narI   TRUE 0.626 55.000 0.091 1.000 N NA
 5818013 5818014 PLES_11071 PLES_11081   moaA1 TRUE 0.511 57.000 0.045 1.000 N NA
 5818014 5818015 PLES_11081 PLES_11091 moaA1   FALSE 0.004 638.000 0.000 1.000 N NA
 5818016 5818017 PLES_11101 PLES_11111     TRUE 0.814 63.000 0.333 1.000   NA
 5818017 5818018 PLES_11111 PLES_11121     TRUE 0.977 23.000 0.286 1.000 Y NA
 5818018 5818019 PLES_11121 PLES_11131   rhl FALSE 0.118 161.000 0.019 1.000 N NA
 5818022 5818023 PLES_11161 PLES_11171   pcs FALSE 0.099 112.000 0.000 1.000 N NA
 5818023 5818024 PLES_11171 PLES_11181 pcs   FALSE 0.359 71.000 0.020 NA   NA
 5818024 5818025 PLES_11181 PLES_11191     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 5818025 5818026 PLES_11191 PLES_11201     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA N NA
 5818026 5818027 PLES_11201 PLES_11211     TRUE 0.492 29.000 0.000 1.000   NA
 5818027 5818028 PLES_11211 PLES_11221     FALSE 0.116 121.000 0.000 1.000   NA
 5818028 5818029 PLES_11221 PLES_11231     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5818029 5818030 PLES_11231 PLES_11241     FALSE 0.161 89.000 0.000 NA   NA
 5818031 5818032 PLES_11251 PLES_11261     FALSE 0.149 93.000 0.000 NA   NA
 5818032 5818033 PLES_11261 PLES_11271     FALSE 0.199 74.000 0.000 NA   NA
 5818037 5818038 PLES_11311 PLES_11321     TRUE 0.504 24.000 0.000 NA   NA
 5818040 5818041 PLES_11341 PLES_11351     FALSE 0.261 92.000 0.010 1.000   NA
 5818041 5818042 PLES_11351 PLES_11361     FALSE 0.118 119.000 0.000 1.000   NA
 5818042 5818043 PLES_11361 PLES_11371     TRUE 0.993 3.000 0.771 1.000   NA
 5818043 5818044 PLES_11371 PLES_11381     TRUE 0.823 84.000 0.562 NA   NA
 5818046 5818047 PLES_11401 PLES_11411 valS   FALSE 0.167 121.000 0.009 NA   NA
 5818047 5818048 PLES_11411 PLES_11421   holC TRUE 0.844 12.000 0.034 NA   NA
 5818048 5818049 PLES_11421 PLES_11431 holC pepA TRUE 0.994 -3.000 0.494 1.000 N NA
 5818050 5818051 PLES_11441 PLES_11451     FALSE 0.198 84.000 0.000 1.000   NA
 5818051 5818052 PLES_11451 PLES_11461     FALSE 0.048 192.000 0.000 1.000   NA
 5818052 5818053 PLES_11461 PLES_11471     TRUE 0.998 -7.000 0.631 0.071   NA
 5818057 5818058 PLES_11501 PLES_11511 queA tgt TRUE 0.995 13.000 0.360 0.000 Y NA
 5818058 5818059 PLES_11511 PLES_11521 tgt   TRUE 0.857 44.000 0.325 NA N NA
 5818059 5818060 PLES_11521 PLES_11531   secD TRUE 0.803 60.000 0.031 NA Y NA
 5818060 5818061 PLES_11531 PLES_11541 secD secF TRUE 0.993 11.000 0.171 0.001 Y NA
 5818061 5818062 PLES_11541 PLES_11551 secF   FALSE 0.151 184.000 0.050 1.000   NA
 5818064 5818065 PLES_11571 PLES_11581   cysE TRUE 0.981 0.000 0.208 1.000 N NA
 5818065 5818066 PLES_11581 PLES_11591 cysE   TRUE 0.470 145.000 0.271 1.000 N NA
 5818066 5818067 PLES_11591 PLES_11601   iscS TRUE 0.926 30.000 0.424 1.000 N NA
 5818067 5818068 PLES_11601 PLES_11611 iscS iscU FALSE 0.369 36.000 0.000 1.000 N NA
 5818068 5818069 PLES_11611 PLES_11621 iscU iscA TRUE 0.843 28.000 0.000 0.001   NA
 5818069 5818070 PLES_11621 PLES_11631 iscA hscB TRUE 0.983 8.000 0.500 1.000   NA
 5818070 5818071 PLES_11631 PLES_11641 hscB hscA TRUE 0.978 43.000 0.634 1.000 Y NA
 5818071 5818072 PLES_11641 PLES_11651 hscA fdx2 TRUE 0.989 7.000 0.794 1.000 N NA
 5818072 5818073 PLES_11651 PLES_11661 fdx2   TRUE 0.960 27.000 0.625 1.000   NA
 5818073 5818074 PLES_11661 PLES_11671   ndk FALSE 0.048 244.000 0.017 1.000   NA
 5818074 5818075 PLES_11671 PLES_11681 ndk   TRUE 0.877 25.000 0.156 1.000   NA
 5818075 5818076 PLES_11681 PLES_11691   pilF TRUE 0.865 18.000 0.086 1.000   NA
 5818076 5818077 PLES_11691 PLES_11701 pilF   TRUE 0.988 -3.000 0.204 1.000   NA
 5818077 5818078 PLES_11701 PLES_11711   gcpE TRUE 0.990 -3.000 0.233 1.000   NA
 5818078 5818079 PLES_11711 PLES_11721 gcpE hisS TRUE 0.910 19.000 0.207 1.000 N NA
 5818079 5818080 PLES_11721 PLES_11731 hisS   TRUE 0.910 27.000 0.259 1.000   NA
 5818080 5818081 PLES_11731 PLES_11741     TRUE 0.989 2.000 0.492 1.000   NA
 5818081 5818082 PLES_11741 PLES_11751     TRUE 0.676 78.000 0.203 1.000   NA
 5818082 5818083 PLES_11751 PLES_11761     FALSE 0.025 297.000 0.006 1.000   NA
 5818083 5818084 PLES_11761 PLES_11771     TRUE 0.980 -12.000 0.099 1.000   NA
 5818084 5818085 PLES_11771 PLES_11781     FALSE 0.088 134.000 0.000 NA   NA
 5818087 5818088 PLES_11801 PLES_11811     FALSE 0.274 54.000 0.000 NA   NA
 5818090 5818091 PLES_11831 PLES_11841   oprC FALSE 0.102 121.000 0.000 NA   NA
 5818091 5818092 PLES_11841 PLES_11851 oprC   FALSE 0.451 65.000 0.029 1.000   NA
 5818093 5818094 PLES_11861 PLES_11871     FALSE 0.168 86.000 0.000 NA   NA
 5818095 5818096 PLES_11881 PLES_11891     FALSE 0.092 130.000 0.000 NA   NA
 5818096 5818097 PLES_11891 PLES_11901     FALSE 0.259 57.000 0.000 NA   NA
 5818100 5818101 PLES_11931 PLES_11941     TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA Y NA
 5818101 5818102 PLES_11941 PLES_11951     TRUE 0.938 78.000 0.533 NA Y NA
 5818102 5818103 PLES_11951 PLES_11961     TRUE 0.483 152.000 0.333 NA N NA
 5818103 5818104 PLES_11961 PLES_11971   xseA TRUE 0.724 7.000 0.000 1.000 N NA
 5818104 5818105 PLES_11971 PLES_11981 xseA   TRUE 0.497 37.000 0.006 1.000 N NA
 5818107 5818108 PLES_12001 PLES_12011     TRUE 0.861 30.000 0.208 NA N NA
 5818108 5818109 PLES_12011 PLES_12021     TRUE 0.934 13.000 0.214 NA N NA
 5818109 5818110 PLES_12021 PLES_12031     FALSE 0.321 135.000 0.120 NA N NA
 5818111 5818112 PLES_12041 PLES_12051 guaB guaA TRUE 0.944 80.000 0.190 0.000 Y NA
 5818112 5818113 PLES_12051 PLES_12061 guaA   FALSE 0.051 188.000 0.000 1.000   NA
 5818113 5818114 PLES_12061 PLES_12071     FALSE 0.005 739.000 0.000 1.000   NA
 5818114 5818115 PLES_12071 PLES_12081     FALSE 0.072 152.000 0.000 NA   NA
 5818117 5818118 PLES_12101 PLES_12111     FALSE 0.222 163.000 0.000 0.045   NA
 5818118 5818119 PLES_12111 PLES_12121     TRUE 0.965 -9.000 0.045 1.000 N NA
 5818119 5818120 PLES_12121 PLES_12131     FALSE 0.006 389.000 0.000 NA N NA
 5818120 5818121 PLES_12131 PLES_12141     FALSE 0.097 126.000 0.000 NA   NA
 5818123 5818124 PLES_12161 PLES_12171 purL   TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 5818124 5818125 PLES_12171 PLES_12181     FALSE 0.049 180.000 0.000 NA   NA
 5818126 5818127 PLES_12191 PLES_12201     TRUE 0.988 25.000 0.258 0.002 Y NA
 5818127 5818128 PLES_12201 PLES_12211     TRUE 0.915 17.000 0.200 1.000 N NA
 5818128 5818129 PLES_12211 PLES_12221     TRUE 0.983 -3.000 0.146 1.000 N NA
 5818129 5818130 PLES_12221 PLES_12231     TRUE 0.893 17.000 0.146 1.000 N NA
 5818130 5818131 PLES_12231 PLES_12241     FALSE 0.022 243.000 0.000 NA   NA
 5818131 5818132 PLES_12241 PLES_12251     TRUE 0.550 63.000 0.065 NA   NA
 5818133 5818134 PLES_12261 PLES_12271     TRUE 0.746 38.000 0.078 1.000   NA
 5818134 5818135 PLES_12271 PLES_12281     TRUE 0.974 -3.000 0.062 NA   NA
 5818135 5818136 PLES_12281 PLES_12291   purT TRUE 0.806 38.000 0.154 NA   NA
 5818136 5818137 PLES_12291 PLES_12301 purT   TRUE 0.923 2.000 0.033 1.000 N NA
 5818138 5818139 PLES_12311 PLES_12321     FALSE 0.018 304.000 0.008 NA N NA
 5818139 5818140 PLES_12321 PLES_12331     TRUE 0.961 13.000 0.349 NA   NA
 5818141 5818142 PLES_12341 PLES_12351 ffh rpsP FALSE 0.314 210.000 0.361 1.000 N NA
 5818142 5818143 PLES_12351 PLES_12361 rpsP rimM TRUE 0.993 16.000 0.342 0.009 Y NA
 5818143 5818144 PLES_12361 PLES_12371 rimM trmD TRUE 0.996 7.000 0.672 1.000 Y NA
 5818144 5818145 PLES_12371 PLES_12381 trmD rplS TRUE 0.975 42.000 0.567 1.000 Y NA
 5818145 5818146 PLES_12381 PLES_12391 rplS   FALSE 0.091 152.000 0.004 NA N NA
 5818147 5818148 PLES_12401 PLES_12411     FALSE 0.110 113.000 0.000 NA   NA
 5818149 5818150 PLES_12421 PLES_12431 xerD dsbC FALSE 0.189 127.000 0.026 1.000 N NA
 5818150 5818151 PLES_12431 PLES_12441 dsbC hom FALSE 0.070 214.000 0.029 1.000 N NA
 5818151 5818152 PLES_12441 PLES_12451 hom thrC TRUE 0.897 53.000 0.125 1.000 Y NA
 5818155 5818156 PLES_12481 PLES_12491     TRUE 0.504 24.000 0.000 NA   NA
 5818157 5818158 PLES_12501 PLES_12511     TRUE 0.983 15.000 0.911 NA   NA
 5818158 5818159 PLES_12511 PLES_12521     TRUE 0.653 56.000 0.107 NA   NA
 5818159 5818160 PLES_12521 PLES_12531     TRUE 0.945 36.000 0.644 NA   NA
 5818160 5818161 PLES_12531 PLES_12541     TRUE 0.698 150.000 0.711 NA   NA
 5818161 5818162 PLES_12541 PLES_12551     TRUE 0.848 19.000 0.073 1.000   NA
 5818162 5818163 PLES_12551 PLES_12561     FALSE 0.133 107.000 0.000 1.000   NA
 5818163 5818164 PLES_12561 PLES_12571   recJ TRUE 0.507 44.000 0.011 1.000   NA
 5818164 5818165 PLES_12571 PLES_12581 recJ lasB FALSE 0.013 287.000 0.000 1.000 N NA
 5818165 5818166 PLES_12581 PLES_12591 lasB   FALSE 0.050 169.000 0.000 1.000 N NA
 5818166 5818167 PLES_12591 PLES_12601     FALSE 0.044 189.000 0.000 NA   NA
 5818169 5818170 PLES_12621 PLES_12631     TRUE 0.741 8.000 0.000 NA   NA
 5818170 5818171 PLES_12631 PLES_12641     FALSE 0.077 148.000 0.000 NA   NA
 5818174 5818175 PLES_12671 PLES_12681     FALSE 0.102 121.000 0.000 NA   NA
 5818175 5818176 PLES_12681 PLES_12691   spdH FALSE 0.014 324.000 0.000 1.000   NA
 5818179 5818180 PLES_12721 PLES_12731     FALSE 0.375 109.000 0.094 1.000 N NA
 5818180 5818181 PLES_12731 PLES_12741   wspA FALSE 0.016 267.000 0.000 1.000 N NA
 5818181 5818182 PLES_12741 PLES_12751 wspA wspB TRUE 0.998 5.000 0.600 0.010 Y NA
 5818182 5818183 PLES_12751 PLES_12761 wspB wspC TRUE 0.999 -3.000 0.635 1.000 Y NA
 5818183 5818184 PLES_12761 PLES_12771 wspC wspD TRUE 0.999 -7.000 0.558 1.000 Y NA
 5818184 5818185 PLES_12771 PLES_12781 wspD wspE FALSE 0.004 761.000 0.000 NA   NA
 5818185 5818186 PLES_12781 PLES_12791 wspE wspF TRUE 0.479 27.000 0.000 NA   NA
 5818186 5818187 PLES_12791 PLES_12801 wspF wspF TRUE 0.498 25.000 0.000 NA   NA
 5818187 5818188 PLES_12801 PLES_12811 wspF wspR FALSE 0.116 108.000 0.000 NA   NA
 5818188 5818189 PLES_12811 PLES_12821 wspR   FALSE 0.019 307.000 0.002 1.000 N NA
 5818191 5818192 PLES_12841 PLES_12851 lysS   FALSE 0.063 212.000 0.012 1.000   NA
 5818192 5818193 PLES_12851 PLES_12861     TRUE 0.658 97.000 0.304 NA   NA
 5818193 5818194 PLES_12861 PLES_12871     TRUE 0.933 9.000 0.104 NA   NA
 5818194 5818195 PLES_12871 PLES_12881     FALSE 0.344 69.000 0.015 NA   NA
 5818195 5818196 PLES_12881 PLES_12891     TRUE 0.949 -3.000 0.015 NA   NA
 5818196 5818197 PLES_12891 PLES_12901     TRUE 0.986 -3.000 0.174 NA   NA
 5818197 5818198 PLES_12901 PLES_12911     TRUE 0.954 -3.000 0.020 NA   NA
 5818199 5818200 PLES_12921 PLES_12931     TRUE 0.855 49.000 0.333 NA   NA
 5818200 5818201 PLES_12931 PLES_12941     FALSE 0.009 380.000 0.000 NA   NA
 5818204 5818205 PLES_12971 PLES_12981 ppc adk FALSE 0.057 161.000 0.000 1.000 N NA
 5818205 5818206 PLES_12981 PLES_12991 adk   FALSE 0.212 104.000 0.019 1.000 N NA
 5818206 5818207 PLES_12991 PLES_13001     FALSE 0.301 74.000 0.008 NA   NA
 5818207 5818208 PLES_13001 PLES_13011     TRUE 0.840 19.000 0.074 NA   NA
 5818208 5818209 PLES_13011 PLES_13021     FALSE 0.419 73.000 0.037 NA   NA
 5818209 5818210 PLES_13021 PLES_13031     TRUE 0.941 5.000 0.090 NA   NA
 5818210 5818211 PLES_13031 PLES_13041     FALSE 0.418 56.000 0.017 NA   NA
 5818211 5818212 PLES_13041 PLES_13051     FALSE 0.456 29.000 0.000 NA   NA
 5818214 5818215 PLES_13071 PLES_13081     TRUE 0.977 5.000 0.354 NA N NA
 5818216 5818217 PLES_13091 PLES_13101     FALSE 0.220 137.000 0.042 NA   NA
 5818217 5818218 PLES_13101 PLES_13111   plsB FALSE 0.229 144.000 0.052 NA   NA
 5818219 5818220 PLES_13121 PLES_13131     TRUE 0.994 -3.000 0.426 NA   NA
 5818220 5818221 PLES_13131 PLES_13141     TRUE 0.974 11.000 0.435 NA   NA
 5818221 5818222 PLES_13141 PLES_13151     TRUE 0.907 4.000 0.032 NA   NA
 5818223 5818224 PLES_13161 PLES_13171     TRUE 0.981 -3.000 0.116 NA   NA
 5818224 5818225 PLES_13171 PLES_13181   dapD TRUE 0.853 95.000 0.244 1.000 Y NA
 5818225 5818226 PLES_13181 PLES_13191 dapD   TRUE 0.868 30.000 0.000 1.000 Y NA
 5818226 5818227 PLES_13191 PLES_13201     TRUE 0.609 13.000 0.000 1.000 N NA
 5818227 5818228 PLES_13201 PLES_13211     FALSE 0.347 67.000 0.006 1.000   NA
 5818228 5818229 PLES_13211 PLES_13221     TRUE 0.993 -19.000 0.130 0.006   NA
 5818229 5818230 PLES_13221 PLES_13231     FALSE 0.030 216.000 0.000 NA   NA
 5818230 5818231 PLES_13231 PLES_13241     FALSE 0.006 455.000 0.000 NA   NA
 5818231 5818232 PLES_13241 PLES_13251     FALSE 0.199 74.000 0.000 NA   NA
 5818232 5818233 PLES_13251 PLES_13261     FALSE 0.133 99.000 0.000 NA   NA
 5818233 5818234 PLES_13261 PLES_13271     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818234 5818235 PLES_13271 PLES_13281     TRUE 0.893 -36.000 0.000 NA   NA
 5818235 5818236 PLES_13281 PLES_13291     FALSE 0.178 83.000 0.000 NA   NA
 5818236 5818237 PLES_13291 PLES_13301     FALSE 0.152 92.000 0.000 NA   NA
 5818237 5818238 PLES_13301 PLES_13311     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818238 5818239 PLES_13311 PLES_13321     FALSE 0.233 65.000 0.000 NA   NA
 5818239 5818240 PLES_13321 PLES_13322     FALSE 0.033 208.000 0.000 NA   NA
 5818240 5818241 PLES_13322 PLES_13331     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5818241 5818242 PLES_13331 PLES_13341     FALSE 0.095 310.000 0.000 1.000 Y NA
 5818242 5818243 PLES_13341 PLES_13351     FALSE 0.026 227.000 0.000 NA   NA
 5818245 5818246 PLES_13371 PLES_13381     FALSE 0.008 404.000 0.000 NA   NA
 5818247 5818248 PLES_13391 PLES_13401     FALSE 0.261 65.000 0.000 1.000   NA
 5818248 5818249 PLES_13401 PLES_13411     TRUE 0.899 -13.000 0.000 NA   NA
 5818249 5818250 PLES_13411 PLES_13421     FALSE 0.037 200.000 0.000 NA   NA
 5818250 5818251 PLES_13421 PLES_13431     FALSE 0.014 295.000 0.000 NA   NA
 5818252 5818253 PLES_13441 PLES_13451     TRUE 0.904 47.000 0.517 NA   NA
 5818254 5818255 PLES_13461 PLES_13471     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5818257 5818258 PLES_13491 PLES_13501     FALSE 0.183 81.000 0.000 NA   NA
 5818258 5818259 PLES_13501 PLES_13511     TRUE 0.894 -28.000 0.000 NA   NA
 5818259 5818260 PLES_13511 PLES_13521     FALSE 0.095 128.000 0.000 NA   NA
 5818260 5818261 PLES_13521 PLES_13531     TRUE 0.974 -28.000 0.073 1.000   NA
 5818261 5818262 PLES_13531 PLES_13541     TRUE 0.489 67.000 0.049 NA   NA
 5818262 5818263 PLES_13541 PLES_13551     FALSE 0.042 191.000 0.000 NA   NA
 5818263 5818264 PLES_13551 PLES_13561     FALSE 0.037 200.000 0.000 NA   NA
 5818264 5818265 PLES_13561 PLES_13571     FALSE 0.181 82.000 0.000 NA   NA
 5818265 5818266 PLES_13571 PLES_13581     FALSE 0.006 465.000 0.000 NA   NA
 5818266 5818267 PLES_13581 PLES_13591     TRUE 0.944 28.000 0.500 NA   NA
 5818267 5818268 PLES_13591 PLES_13601     TRUE 0.996 0.000 1.000 NA   NA
 5818268 5818269 PLES_13601 PLES_13611     TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 5818269 5818270 PLES_13611 PLES_13621     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5818270 5818271 PLES_13621 PLES_13631     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5818271 5818272 PLES_13631 PLES_13641     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818272 5818273 PLES_13641 PLES_13651     FALSE 0.445 30.000 0.000 NA   NA
 5818273 5818274 PLES_13651 PLES_13661     FALSE 0.044 189.000 0.000 NA   NA
 5818274 5818275 PLES_13661 PLES_13671     FALSE 0.016 275.000 0.000 NA   NA
 5818275 5818276 PLES_13671 PLES_13681     TRUE 0.983 0.000 0.222 NA   NA
 5818276 5818277 PLES_13681 PLES_13691     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818278 5818279 PLES_13701 PLES_13711     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5818281 5818282 PLES_13731 PLES_13741     FALSE 0.012 322.000 0.000 NA   NA
 5818284 5818285 PLES_13761 PLES_13771   glnD TRUE 0.928 18.000 0.257 1.000 N NA
 5818285 5818286 PLES_13771 PLES_13781 glnD map TRUE 0.611 167.000 0.651 1.000 N NA
 5818287 5818288 PLES_13791 PLES_13801 rpsB tsf TRUE 0.907 131.000 0.748 1.000 Y NA
 5818288 5818289 PLES_13801 PLES_13811 tsf pyrH FALSE 0.069 199.000 0.017 1.000 N NA
 5818289 5818290 PLES_13811 PLES_13821 pyrH frr TRUE 0.908 3.000 0.030 1.000 N NA
 5818290 5818291 PLES_13821 PLES_13831 frr uppS TRUE 0.957 16.000 0.409 1.000 N NA
 5818291 5818292 PLES_13831 PLES_13841 uppS cdsA TRUE 0.998 -6.000 0.400 1.000 Y NA
 5818292 5818293 PLES_13841 PLES_13851 cdsA dxr TRUE 0.998 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 5818293 5818294 PLES_13851 PLES_13861 dxr   TRUE 0.953 26.000 0.568 1.000 N NA
 5818294 5818295 PLES_13861 PLES_13871     TRUE 0.741 71.000 0.014 1.000 Y NA
 5818295 5818296 PLES_13871 PLES_13881     TRUE 0.863 51.000 0.050 1.000 Y NA
 5818296 5818297 PLES_13881 PLES_13891   lpxD TRUE 0.998 0.000 0.814 1.000 Y NA
 5818297 5818298 PLES_13891 PLES_13901 lpxD fabZ TRUE 0.937 46.000 0.796 1.000 N NA
 5818298 5818299 PLES_13901 PLES_13911 fabZ lpxA TRUE 0.997 -3.000 0.850 1.000 N NA
 5818299 5818300 PLES_13911 PLES_13921 lpxA lpxB TRUE 0.993 4.000 0.289 1.000 Y NA
 5818300 5818301 PLES_13921 PLES_13931 lpxB rnhB TRUE 0.979 0.000 0.186 1.000 N NA
 5818301 5818302 PLES_13931 PLES_13941 rnhB   FALSE 0.026 217.000 0.000 1.000 N NA
 5818302 5818303 PLES_13941 PLES_13951   dnaE FALSE 0.082 130.000 0.000 1.000 N NA
 5818303 5818304 PLES_13951 PLES_13961 dnaE accA FALSE 0.304 150.000 0.122 1.000 N NA
 5818304 5818305 PLES_13961 PLES_13971 accA   TRUE 0.590 70.000 0.123 1.000 N NA
 5818305 5818306 PLES_13971 PLES_13981   pyrG FALSE 0.095 171.000 0.016 1.000 N NA
 5818306 5818307 PLES_13981 PLES_13991 pyrG kdsA TRUE 0.961 3.000 0.138 1.000 N NA
 5818307 5818308 PLES_13991 PLES_14001 kdsA eno TRUE 0.727 46.000 0.125 1.000 N NA
 5818308 5818309 PLES_14001 PLES_14011 eno   TRUE 0.738 65.000 0.241 1.000 N NA
 5818309 5818310 PLES_14011 PLES_14021   ygbP TRUE 0.897 20.000 0.185 1.000 N NA
 5818311 5818312 PLES_14031 PLES_14041     TRUE 0.997 -34.000 0.844 NA   NA
 5818312 5818313 PLES_14041 PLES_14051     FALSE 0.195 76.000 0.000 NA   NA
 5818314 5818315 PLES_14061 PLES_14071 adhC   TRUE 0.897 54.000 0.567 1.000   NA
 5818315 5818316 PLES_14071 PLES_14081   ygbB FALSE 0.350 71.000 0.012 1.000   NA
 5818316 5818317 PLES_14081 PLES_14091 ygbB   TRUE 0.987 -3.000 0.173 1.000   NA
 5818317 5818318 PLES_14091 PLES_14101   surE TRUE 0.989 -12.000 0.235 1.000   NA
 5818318 5818319 PLES_14101 PLES_14111 surE pcm TRUE 0.915 33.000 0.353 1.000   NA
 5818319 5818320 PLES_14111 PLES_14121 pcm   FALSE 0.428 46.000 0.007 1.000 N NA
 5818320 5818321 PLES_14121 PLES_14131   rpoS FALSE 0.368 105.000 0.081 1.000 N NA
 5818321 5818322 PLES_14131 PLES_14132 rpoS rsmZ FALSE 0.021 251.000 0.000 NA   NA
 5818323 5818324 PLES_14141 PLES_14151 fdxA mutS FALSE 0.360 67.000 0.020 1.000 N NA
 5818324 5818325 PLES_14151 PLES_14161 mutS   FALSE 0.073 126.000 0.000 NA N NA
 5818326 5818327 PLES_14171 PLES_14181   recA FALSE 0.304 134.000 0.082 NA   NA
 5818327 5818328 PLES_14181 PLES_14191 recA   TRUE 0.975 6.000 0.296 1.000   NA
 5818329 5818330 PLES_14201 PLES_14211     TRUE 0.507 83.000 0.089 NA   NA
 5818332 5818333 PLES_14231 PLES_14241     TRUE 0.553 19.000 0.000 NA   NA
 5818333 5818334 PLES_14241 PLES_14251   potD FALSE 0.052 176.000 0.000 NA   NA
 5818334 5818335 PLES_14251 PLES_14261 potD potC TRUE 0.759 89.000 0.000 0.056 Y NA
 5818335 5818336 PLES_14261 PLES_14271 potC potB TRUE 0.996 -7.000 0.040 0.056 Y NA
 5818336 5818337 PLES_14271 PLES_14281 potB potA TRUE 0.995 5.000 0.440 1.000 Y NA
 5818340 5818341 PLES_14311 PLES_14321   dgkA FALSE 0.184 72.000 0.000 1.000 N NA
 5818343 5818344 PLES_14341 PLES_14351     TRUE 0.987 0.000 0.083 0.009   NA
 5818346 5818347 PLES_14371 PLES_14381     TRUE 0.554 200.000 0.750 1.000   NA
 5818348 5818349 PLES_14391 PLES_14401     FALSE 0.218 68.000 0.000 NA   NA
 5818350 5818351 PLES_14411 PLES_14421     TRUE 0.737 39.000 0.094 1.000 N NA
 5818351 5818352 PLES_14421 PLES_14431     TRUE 0.508 60.000 0.000 0.077 N NA
 5818352 5818353 PLES_14431 PLES_14441     TRUE 0.998 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 5818353 5818354 PLES_14441 PLES_14451     TRUE 0.980 23.000 0.333 1.000 Y NA
 5818354 5818355 PLES_14451 PLES_14461     FALSE 0.311 53.000 0.000 1.000   NA
 5818358 5818359 PLES_14491 PLES_14501 glpM glpD FALSE 0.089 133.000 0.000 NA   NA
 5818359 5818360 PLES_14501 PLES_14511 glpD glpR FALSE 0.014 279.000 0.000 1.000 N NA
 5818360 5818361 PLES_14511 PLES_14521 glpR glpK FALSE 0.108 206.000 0.055 1.000 N NA
 5818361 5818362 PLES_14521 PLES_14531 glpK glpF TRUE 0.551 40.000 0.023 1.000 N NA
 5818363 5818364 PLES_14541 PLES_14551     FALSE 0.333 64.000 0.004 NA   NA
 5818364 5818365 PLES_14551 PLES_14561     FALSE 0.070 196.000 0.004 1.000   NA
 5818366 5818367 PLES_14571 PLES_14581     FALSE 0.133 99.000 0.000 NA   NA
 5818367 5818368 PLES_14581 PLES_14591     FALSE 0.008 359.000 0.000 1.000 N NA
 5818370 5818371 PLES_14611 PLES_14621   mmsR FALSE 0.096 127.000 0.000 NA   NA
 5818372 5818373 PLES_14631 PLES_14641 mmsA mmsB TRUE 0.879 16.000 0.000 0.002 N NA
 5818373 5818374 PLES_14641 PLES_14651 mmsB   TRUE 0.602 102.000 0.009 1.000 Y NA
 5818375 5818376 PLES_14661 PLES_14671     TRUE 0.972 22.000 0.400 0.043   NA
 5818378 5818379 PLES_14691 PLES_14701   fruR FALSE 0.170 113.000 0.017 NA N NA
 5818380 5818381 PLES_14711 PLES_14721   fruK TRUE 0.992 0.000 0.101 1.000 Y NA
 5818381 5818382 PLES_14721 PLES_14731 fruK fruA TRUE 0.997 2.000 0.562 1.000 Y NA
 5818383 5818384 PLES_14741 PLES_14751     TRUE 0.986 -3.000 0.161 1.000   NA
 5818384 5818385 PLES_14751 PLES_14761     TRUE 0.998 -3.000 0.613 0.068   NA
 5818385 5818386 PLES_14761 PLES_14771   arnT TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5818386 5818387 PLES_14771 PLES_14781 arnT   TRUE 0.951 -3.000 0.020 1.000 N NA
 5818387 5818388 PLES_14781 PLES_14791     TRUE 0.998 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 5818388 5818389 PLES_14791 PLES_14801     TRUE 0.997 -3.000 0.220 NA Y NA
 5818389 5818390 PLES_14801 PLES_14811     TRUE 0.998 -3.000 0.378 NA Y NA
 5818390 5818391 PLES_14811 PLES_14821   algA FALSE 0.064 388.000 0.000 1.000 Y NA
 5818391 5818392 PLES_14821 PLES_14831 algA algF FALSE 0.387 197.000 0.400 NA   NA
 5818392 5818393 PLES_14831 PLES_14841 algF algJ TRUE 0.904 73.000 0.889 NA   NA
 5818393 5818394 PLES_14841 PLES_14851 algJ algI TRUE 0.983 15.000 0.889 NA   NA
 5818394 5818395 PLES_14851 PLES_14861 algI algL FALSE 0.306 230.000 0.438 NA   NA
 5818395 5818396 PLES_14861 PLES_14871 algL algX TRUE 0.988 4.000 0.562 NA   NA
 5818396 5818397 PLES_14871 PLES_14881 algX algG TRUE 0.972 13.000 0.500 NA   NA
 5818397 5818398 PLES_14881 PLES_14891 algG algE TRUE 0.966 21.000 0.625 NA   NA
 5818398 5818399 PLES_14891 PLES_14901 algE algK TRUE 0.994 -3.000 0.417 NA   NA
 5818399 5818400 PLES_14901 PLES_14911 algK alg44 TRUE 0.967 14.000 0.455 NA   NA
 5818400 5818401 PLES_14911 PLES_14921 alg44 alg8 TRUE 0.807 83.000 0.500 NA   NA
 5818401 5818402 PLES_14921 PLES_14931 alg8 algD TRUE 0.691 140.000 0.625 NA   NA
 5818402 5818403 PLES_14931 PLES_14941 algD   FALSE 0.004 902.000 0.000 NA   NA
 5818403 5818404 PLES_14941 PLES_14951     FALSE 0.117 107.000 0.000 NA   NA
 5818404 5818405 PLES_14951 PLES_14961   argF TRUE 0.976 5.000 0.025 1.000 Y NA
 5818408 5818409 PLES_14991 PLES_15001     FALSE 0.254 113.000 0.039 1.000 N NA
 5818409 5818410 PLES_15001 PLES_15011     FALSE 0.137 83.000 0.000 NA N NA
 5818411 5818412 PLES_15021 PLES_15031 bfrB   TRUE 0.563 209.000 0.286 NA Y NA
 5818414 5818415 PLES_15051 PLES_15061 rnt pyrC TRUE 0.973 -3.000 0.068 1.000 N NA
 5818416 5818417 PLES_15071 PLES_15081   argG FALSE 0.169 118.000 0.013 1.000 N NA
 5818419 5818420 PLES_15101 PLES_15111     TRUE 0.895 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5818420 5818421 PLES_15111 PLES_15121     TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.055 N NA
 5818421 5818422 PLES_15121 PLES_15131     FALSE 0.004 598.000 0.000 1.000 N NA
 5818422 5818423 PLES_15131 PLES_15141     FALSE 0.009 401.000 0.000 1.000   NA
 5818423 5818424 PLES_15141 PLES_15151     TRUE 0.803 33.000 0.000 0.002   NA
 5818424 5818425 PLES_15151 PLES_15161     TRUE 0.474 31.000 0.000 1.000   NA
 5818425 5818426 PLES_15161 PLES_15171     TRUE 0.993 0.000 0.000 0.001 Y NA
 5818426 5818427 PLES_15171 PLES_15181     FALSE 0.273 50.000 0.000 1.000 N NA
 5818428 5818429 PLES_15191 PLES_15201   nth FALSE 0.192 109.000 0.012 NA   NA
 5818429 5818430 PLES_15201 PLES_15211 nth   TRUE 0.980 -3.000 0.109 1.000 N NA
 5818430 5818431 PLES_15211 PLES_15221     TRUE 0.999 -7.000 0.908 0.065 Y NA
 5818431 5818432 PLES_15221 PLES_15231     TRUE 0.999 0.000 0.924 0.065 Y NA
 5818432 5818433 PLES_15231 PLES_15241     TRUE 0.999 3.000 0.814 0.065 Y NA
 5818433 5818434 PLES_15241 PLES_15251     TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.065 Y NA
 5818434 5818435 PLES_15251 PLES_15261     TRUE 0.999 -3.000 0.564 0.065 Y NA
 5818435 5818436 PLES_15261 PLES_15271     FALSE 0.084 137.000 0.000 NA   NA
 5818436 5818437 PLES_15271 PLES_15281     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818437 5818438 PLES_15281 PLES_15291     FALSE 0.166 87.000 0.000 NA   NA
 5818438 5818439 PLES_15291 PLES_15301   metG TRUE 0.590 34.000 0.018 NA   NA
 5818440 5818441 PLES_15311 PLES_15321     FALSE 0.429 101.000 0.112 1.000 N NA
 5818441 5818442 PLES_15321 PLES_15331   rhlA FALSE 0.007 424.000 0.000 NA   NA
 5818442 5818443 PLES_15331 PLES_15341 rhlA rhlB FALSE 0.228 66.000 0.000 NA   NA
 5818443 5818444 PLES_15341 PLES_15351 rhlB rhlR FALSE 0.087 125.000 0.000 1.000 N NA
 5818444 5818445 PLES_15351 PLES_15361 rhlR rhlI FALSE 0.271 180.000 0.182 1.000 N NA
 5818445 5818446 PLES_15361 PLES_15371 rhlI pheC FALSE 0.378 155.000 0.000 1.000 Y NA
 5818446 5818447 PLES_15371 PLES_15381 pheC   TRUE 0.582 94.000 0.000 1.000 Y NA
 5818447 5818448 PLES_15381 PLES_15391     TRUE 0.953 -3.000 0.019 NA   NA
 5818451 5818452 PLES_15421 PLES_15431     TRUE 0.895 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5818452 5818453 PLES_15431 PLES_15441     TRUE 0.464 20.000 0.000 NA N NA
 5818453 5818454 PLES_15441 PLES_15451     FALSE 0.043 168.000 0.000 NA N NA
 5818459 5818460 PLES_15501 PLES_15511 orf2   TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 5818460 5818461 PLES_15511 PLES_15521     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5818461 5818462 PLES_15521 PLES_15531   orf6 TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5818462 5818463 PLES_15531 PLES_15541 orf6 orf7 TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5818463 5818464 PLES_15541 PLES_15551 orf7 orf8 TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818464 5818465 PLES_15551 PLES_15561 orf8   FALSE 0.129 101.000 0.000 NA   NA
 5818465 5818466 PLES_15561 PLES_15571     TRUE 0.901 -10.000 0.000 NA   NA
 5818466 5818467 PLES_15571 PLES_15581     TRUE 0.579 17.000 0.000 NA   NA
 5818467 5818468 PLES_15581 PLES_15591     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5818468 5818469 PLES_15591 PLES_15601     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5818469 5818470 PLES_15601 PLES_15611     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5818470 5818471 PLES_15611 PLES_15621     TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 5818471 5818472 PLES_15621 PLES_15631     FALSE 0.013 305.000 0.000 NA   NA
 5818472 5818473 PLES_15631 PLES_15641     TRUE 0.984 -13.000 0.160 NA   NA
 5818473 5818474 PLES_15641 PLES_15651   orf20 FALSE 0.007 443.000 0.000 NA   NA
 5818474 5818475 PLES_15651 PLES_15661 orf20 orf21 TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5818475 5818476 PLES_15661 PLES_15671 orf21 orf21a TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5818476 5818477 PLES_15671 PLES_15681 orf21a orf22 TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818477 5818478 PLES_15681 PLES_15691 orf22 orf23 FALSE 0.113 111.000 0.000 NA   NA
 5818478 5818479 PLES_15691 PLES_15701 orf23   TRUE 0.729 9.000 0.000 NA   NA
 5818479 5818480 PLES_15701 PLES_15711     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818480 5818481 PLES_15711 PLES_15721     TRUE 0.770 5.000 0.000 NA   NA
 5818481 5818482 PLES_15721 PLES_15731     TRUE 0.881 12.000 0.061 NA   NA
 5818482 5818483 PLES_15731 PLES_15741     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5818483 5818484 PLES_15741 PLES_15751     FALSE 0.005 580.000 0.000 NA   NA
 5818484 5818485 PLES_15751 PLES_15761   orf29b TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818485 5818486 PLES_15761 PLES_15771 orf29b   FALSE 0.183 81.000 0.000 NA   NA
 5818486 5818487 PLES_15771 PLES_15781     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818487 5818488 PLES_15781 PLES_15791     FALSE 0.029 220.000 0.000 NA   NA
 5818488 5818489 PLES_15791 PLES_15801     TRUE 0.974 10.000 0.386 NA   NA
 5818489 5818490 PLES_15801 PLES_15811     TRUE 0.787 28.000 0.073 NA   NA
 5818490 5818491 PLES_15811 PLES_15821     TRUE 0.892 12.000 0.073 NA   NA
 5818491 5818492 PLES_15821 PLES_15831     FALSE 0.239 63.000 0.000 NA   NA
 5818492 5818493 PLES_15831 PLES_15841     FALSE 0.008 410.000 0.000 NA   NA
 5818493 5818494 PLES_15841 PLES_15851     FALSE 0.037 200.000 0.000 NA   NA
 5818494 5818495 PLES_15851 PLES_15861     TRUE 0.980 4.000 0.333 NA   NA
 5818495 5818496 PLES_15861 PLES_15871     FALSE 0.013 311.000 0.000 NA   NA
 5818496 5818497 PLES_15871 PLES_15881   orf46e TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 5818497 5818498 PLES_15881 PLES_15891 orf46e orf48 TRUE 0.994 2.000 0.857 NA   NA
 5818498 5818499 PLES_15891 PLES_15901 orf48 orf49 TRUE 0.928 36.000 0.500 NA   NA
 5818499 5818500 PLES_15901 PLES_15911 orf49   TRUE 0.921 35.000 0.435 NA   NA
 5818500 5818501 PLES_15911 PLES_15921     TRUE 0.926 9.000 0.087 NA   NA
 5818501 5818502 PLES_15921 PLES_15931     FALSE 0.035 205.000 0.000 NA   NA
 5818502 5818503 PLES_15931 PLES_15941     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818503 5818504 PLES_15941 PLES_15951     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818504 5818505 PLES_15951 PLES_15961     FALSE 0.188 79.000 0.000 NA   NA
 5818506 5818507 PLES_15971 PLES_15981     FALSE 0.285 52.000 0.000 NA   NA
 5818507 5818508 PLES_15981 PLES_15991     FALSE 0.321 137.000 0.125 NA N NA
 5818508 5818509 PLES_15991 PLES_16001     TRUE 0.994 -3.000 0.471 NA N NA
 5818509 5818510 PLES_16001 PLES_16011     TRUE 0.917 41.000 0.514 1.000 N NA
 5818512 5818513 PLES_16031 PLES_16041     FALSE 0.147 101.000 0.000 1.000   NA
 5818514 5818515 PLES_16051 PLES_16061     FALSE 0.161 153.000 0.029 NA   NA
 5818515 5818516 PLES_16061 PLES_16071     FALSE 0.094 129.000 0.000 NA   NA
 5818517 5818518 PLES_16081 PLES_16091 mqoA   FALSE 0.036 203.000 0.000 NA   NA
 5818519 5818520 PLES_16101 PLES_16111     FALSE 0.018 251.000 0.000 1.000 N NA
 5818520 5818521 PLES_16111 PLES_16121     TRUE 0.999 4.000 0.795 0.054 Y NA
 5818521 5818522 PLES_16121 PLES_16131     TRUE 0.961 37.000 0.273 1.000 Y NA
 5818522 5818523 PLES_16131 PLES_16141     FALSE 0.080 154.000 0.000 1.000   NA
 5818523 5818524 PLES_16141 PLES_16151     TRUE 0.496 119.000 0.193 1.000   NA
 5818524 5818525 PLES_16151 PLES_16161   ssuD TRUE 0.625 78.000 0.176 1.000 N NA
 5818525 5818526 PLES_16161 PLES_16171 ssuD   TRUE 0.910 21.000 0.226 1.000 N NA
 5818526 5818527 PLES_16171 PLES_16181     TRUE 0.998 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 5818527 5818528 PLES_16181 PLES_16191     TRUE 0.875 41.000 0.161 0.087 N NA
 5818529 5818530 PLES_16201 PLES_16211     TRUE 0.665 52.000 0.097 NA   NA
 5818530 5818531 PLES_16211 PLES_16221   folX FALSE 0.281 129.000 0.061 NA   NA
 5818531 5818532 PLES_16221 PLES_16231 folX folE1 TRUE 0.984 2.000 0.030 1.000 Y NA
 5818532 5818533 PLES_16231 PLES_16241 folE1   TRUE 0.862 18.000 0.100 1.000 N NA
 5818533 5818534 PLES_16241 PLES_16251     FALSE 0.416 111.000 0.120 NA   NA
 5818537 5818538 PLES_16281 PLES_16291     TRUE 0.997 -13.000 0.840 NA   NA
 5818538 5818539 PLES_16291 PLES_16301     FALSE 0.193 129.000 0.034 NA N NA
 5818539 5818540 PLES_16301 PLES_16311     TRUE 0.983 -3.000 0.125 1.000   NA
 5818540 5818541 PLES_16311 PLES_16321     FALSE 0.133 99.000 0.000 NA   NA
 5818541 5818542 PLES_16321 PLES_16331     FALSE 0.107 116.000 0.000 NA   NA
 5818542 5818543 PLES_16331 PLES_16341     TRUE 0.715 117.000 0.021 0.074 Y NA
 5818544 5818545 PLES_16351 PLES_16361     TRUE 0.942 35.000 0.600 NA   NA
 5818545 5818546 PLES_16361 PLES_16371     TRUE 0.730 91.000 0.400 1.000 N NA
 5818547 5818548 PLES_16381 PLES_16391     FALSE 0.259 57.000 0.000 NA   NA
 5818548 5818549 PLES_16391 PLES_16401     TRUE 0.518 150.000 0.333 NA   NA
 5818551 5818552 PLES_16421 PLES_16431 ldh   FALSE 0.247 142.000 0.065 1.000 N NA
 5818552 5818553 PLES_16431 PLES_16441     TRUE 0.999 -7.000 0.458 0.001 Y NA
 5818553 5818554 PLES_16441 PLES_16451     TRUE 0.994 18.000 0.556 0.074 Y NA
 5818555 5818556 PLES_16461 PLES_16471     FALSE 0.145 94.000 0.000 NA   NA
 5818556 5818557 PLES_16471 PLES_16481     FALSE 0.401 36.000 0.000 NA   NA
 5818558 5818559 PLES_16491 PLES_16501     FALSE 0.103 120.000 0.000 NA   NA
 5818559 5818560 PLES_16501 PLES_16511     FALSE 0.194 77.000 0.000 NA   NA
 5818560 5818561 PLES_16511 PLES_16521     TRUE 0.909 65.000 0.875 NA N NA
 5818561 5818562 PLES_16521 PLES_16531   hasR TRUE 0.489 210.000 0.200 NA Y NA
 5818562 5818563 PLES_16531 PLES_16541 hasR hasAp TRUE 0.757 86.000 0.400 NA   NA
 5818563 5818564 PLES_16541 PLES_16551 hasAp hasD FALSE 0.029 218.000 0.000 NA   NA
 5818564 5818565 PLES_16551 PLES_16561 hasD hasE TRUE 0.996 -3.000 0.286 0.007   NA
 5818565 5818566 PLES_16561 PLES_16571 hasE   TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.007   NA
 5818566 5818567 PLES_16571 PLES_16581     FALSE 0.007 455.000 0.000 1.000   NA
 5818567 5818568 PLES_16581 PLES_16591     FALSE 0.126 113.000 0.000 1.000   NA
 5818568 5818569 PLES_16591 PLES_16601     TRUE 0.996 4.000 0.538 NA Y NA
 5818569 5818570 PLES_16601 PLES_16611     TRUE 0.994 -3.000 0.086 NA Y NA
 5818570 5818571 PLES_16611 PLES_16621     FALSE 0.274 54.000 0.000 NA   NA
 5818574 5818575 PLES_16651 PLES_16661 nosL nosY TRUE 0.893 17.000 0.135 NA   NA
 5818575 5818576 PLES_16661 PLES_16671 nosY nosD FALSE 0.004 902.000 0.000 NA   NA
 5818576 5818577 PLES_16671 PLES_16681 nosD nosZ TRUE 0.988 -3.000 0.035 0.003 N NA
 5818577 5818578 PLES_16681 PLES_16691 nosZ nosR TRUE 0.703 43.000 0.088 1.000 N NA
 5818578 5818579 PLES_16691 PLES_16701 nosR   FALSE 0.021 221.000 0.000 NA N NA
 5818581 5818582 PLES_16721 PLES_16731   rhlG TRUE 0.475 53.000 0.025 NA   NA
 5818582 5818583 PLES_16731 PLES_16741 rhlG   FALSE 0.135 98.000 0.000 NA   NA
 5818583 5818584 PLES_16741 PLES_16751   amrZ FALSE 0.070 154.000 0.000 NA   NA
 5818585 5818586 PLES_16761 PLES_16771 phnC   TRUE 0.976 53.000 0.337 0.002 Y NA
 5818586 5818587 PLES_16771 PLES_16781   phnE TRUE 0.967 68.000 0.330 0.001 Y NA
 5818587 5818588 PLES_16781 PLES_16791 phnE   TRUE 0.881 21.000 0.158 1.000 N NA
 5818588 5818589 PLES_16791 PLES_16801   phnG TRUE 0.985 10.000 0.691 1.000 N NA
 5818589 5818590 PLES_16801 PLES_16811 phnG phnH TRUE 0.999 0.000 0.967 0.002 Y NA
 5818590 5818591 PLES_16811 PLES_16821 phnH phnI TRUE 0.999 0.000 0.960 0.002 Y NA
 5818591 5818592 PLES_16821 PLES_16831 phnI phnJ TRUE 0.999 -3.000 0.880 1.000 Y NA
 5818592 5818593 PLES_16831 PLES_16841 phnJ   TRUE 0.999 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 5818593 5818594 PLES_16841 PLES_16851     TRUE 0.989 50.000 0.859 0.015 Y NA
 5818594 5818595 PLES_16851 PLES_16861   phnM TRUE 0.998 -10.000 0.320 1.000 Y NA
 5818595 5818596 PLES_16861 PLES_16871 phnM phnN TRUE 0.995 0.000 0.235 NA Y NA
 5818596 5818597 PLES_16871 PLES_16881 phnN phnP TRUE 0.988 -9.000 0.214 NA   NA
 5818598 5818599 PLES_16891 PLES_16901     FALSE 0.285 52.000 0.000 NA   NA
 5818599 5818600 PLES_16901 PLES_16911     FALSE 0.158 90.000 0.000 NA   NA
 5818600 5818601 PLES_16911 PLES_16921     FALSE 0.041 193.000 0.000 NA   NA
 5818602 5818603 PLES_16922 PLES_16931     FALSE 0.004 1289.000 0.000 NA   NA
 5818603 5818604 PLES_16931 PLES_16941     TRUE 0.903 15.000 0.133 NA   NA
 5818604 5818605 PLES_16941 PLES_16951     FALSE 0.004 1029.000 0.000 NA   NA
 5818605 5818606 PLES_16951 PLES_16961     FALSE 0.458 33.000 0.000 1.000   NA
 5818606 5818607 PLES_16961 PLES_16971     FALSE 0.004 1130.000 0.000 NA   NA
 5818607 5818608 PLES_16971 PLES_16981   amiE FALSE 0.004 674.000 0.000 NA   NA
 5818608 5818609 PLES_16981 PLES_16991 amiE   TRUE 0.678 83.000 0.222 1.000   NA
 5818609 5818610 PLES_16991 PLES_17001   amiC TRUE 0.824 26.000 0.083 1.000   NA
 5818610 5818611 PLES_17001 PLES_17011 amiC amiR TRUE 0.975 -3.000 0.083 NA N NA
 5818611 5818612 PLES_17011 PLES_17021 amiR   TRUE 0.612 43.000 0.040 NA   NA
 5818614 5818615 PLES_17041 PLES_17051     TRUE 0.973 23.000 0.818 NA   NA
 5818616 5818617 PLES_17061 PLES_17071   dsdA FALSE 0.259 57.000 0.000 NA   NA
 5818618 5818619 PLES_17081 PLES_17091     TRUE 0.463 185.000 0.462 NA   NA
 5818619 5818620 PLES_17091 PLES_17101     FALSE 0.355 42.000 0.000 NA   NA
 5818621 5818622 PLES_17111 PLES_17121   flgN TRUE 0.818 29.000 0.121 1.000 N NA
 5818622 5818623 PLES_17121 PLES_17131 flgN flgM TRUE 0.977 55.000 0.361 0.001 Y NA
 5818623 5818624 PLES_17131 PLES_17141 flgM flgA TRUE 0.801 145.000 0.371 NA Y NA
 5818625 5818626 PLES_17151 PLES_17161     TRUE 0.963 77.000 0.838 1.000 Y NA
 5818626 5818627 PLES_17161 PLES_17171     FALSE 0.087 315.000 0.000 NA Y NA
 5818627 5818628 PLES_17171 PLES_17181     TRUE 0.996 2.000 0.429 NA Y NA
 5818628 5818629 PLES_17181 PLES_17191     TRUE 0.910 66.000 0.250 NA Y NA
 5818629 5818630 PLES_17191 PLES_17201   recQ FALSE 0.134 84.000 0.000 NA N NA
 5818630 5818631 PLES_17201 PLES_17211 recQ   FALSE 0.224 89.000 0.005 1.000 N NA
 5818631 5818632 PLES_17211 PLES_17221     FALSE 0.073 151.000 0.000 NA   NA
 5818632 5818633 PLES_17221 PLES_17231     FALSE 0.105 118.000 0.000 NA   NA
 5818633 5818634 PLES_17231 PLES_17241     FALSE 0.064 277.000 0.080 1.000 N NA
 5818636 5818637 PLES_17261 PLES_17271   rfaD FALSE 0.141 90.000 0.000 1.000 N NA
 5818638 5818639 PLES_17281 PLES_17291     FALSE 0.152 92.000 0.000 NA   NA
 5818639 5818640 PLES_17291 PLES_17301     FALSE 0.105 118.000 0.000 NA   NA
 5818640 5818641 PLES_17301 PLES_17311   fabH2 TRUE 0.656 14.000 0.000 1.000   NA
 5818641 5818642 PLES_17311 PLES_17321 fabH2   TRUE 0.810 4.000 0.000 1.000   NA
 5818642 5818643 PLES_17321 PLES_17331     TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5818643 5818644 PLES_17331 PLES_17341     TRUE 0.918 -7.000 0.000 1.000   NA
 5818644 5818645 PLES_17341 PLES_17351     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5818645 5818646 PLES_17351 PLES_17361     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818646 5818647 PLES_17361 PLES_17371     TRUE 0.971 -3.000 0.059 1.000 N NA
 5818649 5818650 PLES_17391 PLES_17401     TRUE 0.714 10.000 0.000 NA   NA
 5818650 5818651 PLES_17401 PLES_17411     TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5818657 5818658 PLES_17471 PLES_17481     FALSE 0.228 66.000 0.000 NA   NA
 5818658 5818659 PLES_17481 PLES_17491     FALSE 0.117 107.000 0.000 NA   NA
 5818659 5818660 PLES_17491 PLES_17501     TRUE 0.997 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 5818660 5818661 PLES_17501 PLES_17511     TRUE 0.999 -6.000 0.696 1.000 Y NA
 5818661 5818662 PLES_17511 PLES_17521     TRUE 0.999 -3.000 0.690 0.002 Y NA
 5818666 5818667 PLES_17561 PLES_17571     FALSE 0.300 50.000 0.000 NA   NA
 5818667 5818668 PLES_17571 PLES_17581   hepA FALSE 0.421 33.000 0.000 NA   NA
 5818669 5818670 PLES_17591 PLES_17601   alkB TRUE 0.719 54.000 0.156 NA   NA
 5818670 5818671 PLES_17601 PLES_17602 alkB   FALSE 0.017 268.000 0.000 NA   NA
 5818671 5818672 PLES_17602 PLES_17611     FALSE 0.070 154.000 0.000 NA   NA
 5818672 5818673 PLES_17611 PLES_17612     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5818673 5818674 PLES_17612 PLES_17621     FALSE 0.205 72.000 0.000 NA   NA
 5818675 5818676 PLES_17631 PLES_17641   phaJ1 FALSE 0.055 151.000 0.000 NA N NA
 5818676 5818677 PLES_17641 PLES_17651 phaJ1   TRUE 0.993 -3.000 0.046 1.000 Y NA
 5818678 5818679 PLES_17661 PLES_17671 fadD2 fadD1 FALSE 0.366 235.000 0.000 0.000 Y NA
 5818679 5818680 PLES_17671 PLES_17681 fadD1   FALSE 0.445 30.000 0.000 NA   NA
 5818680 5818681 PLES_17681 PLES_17691     TRUE 0.895 -25.000 0.000 NA   NA
 5818683 5818684 PLES_17711 PLES_17721     FALSE 0.026 229.000 0.000 NA   NA
 5818684 5818685 PLES_17721 PLES_17731     TRUE 0.714 10.000 0.000 NA   NA
 5818685 5818686 PLES_17731 PLES_17741     FALSE 0.049 1040.000 0.333 NA   NA
 5818686 5818687 PLES_17741 PLES_17751     TRUE 0.984 15.000 1.000 NA   NA
 5818691 5818692 PLES_17791 PLES_17801     TRUE 0.912 3.000 0.038 NA N NA
 5818692 5818693 PLES_17801 PLES_17811     FALSE 0.009 381.000 0.000 NA   NA
 5818693 5818694 PLES_17811 PLES_17821     FALSE 0.105 118.000 0.000 NA   NA
 5818694 5818695 PLES_17821 PLES_17831     TRUE 0.951 19.000 0.406 NA   NA
 5818695 5818696 PLES_17831 PLES_17841     TRUE 0.997 -3.000 0.914 NA   NA
 5818696 5818697 PLES_17841 PLES_17851     TRUE 0.978 3.000 0.271 NA   NA
 5818697 5818698 PLES_17851 PLES_17861   oprO FALSE 0.022 247.000 0.000 NA   NA
 5818700 5818701 PLES_17881 PLES_17891 oprP   FALSE 0.057 169.000 0.000 NA   NA
 5818701 5818702 PLES_17891 PLES_17901     FALSE 0.097 126.000 0.000 NA   NA
 5818702 5818703 PLES_17901 PLES_17911     FALSE 0.024 233.000 0.000 NA   NA
 5818703 5818704 PLES_17911 PLES_17921     TRUE 0.983 -3.000 0.133 NA   NA
 5818706 5818707 PLES_17941 PLES_17951     FALSE 0.213 69.000 0.000 NA   NA
 5818709 5818710 PLES_17971 PLES_17981     TRUE 0.659 67.000 0.167 1.000 N NA
 5818710 5818711 PLES_17981 PLES_17991     FALSE 0.122 97.000 0.000 1.000 N NA
 5818711 5818712 PLES_17991 PLES_18001     FALSE 0.046 175.000 0.000 1.000 N NA
 5818713 5818714 PLES_18011 PLES_18021 capB   FALSE 0.027 215.000 0.000 1.000 N NA
 5818714 5818715 PLES_18021 PLES_18031     FALSE 0.290 140.000 0.074 1.000   NA
 5818715 5818716 PLES_18031 PLES_18041   rdgC TRUE 0.475 87.000 0.074 1.000   NA
 5818717 5818718 PLES_18042 PLES_18043     TRUE 0.579 17.000 0.000 NA   NA
 5818718 5818719 PLES_18043 PLES_18051     FALSE 0.020 257.000 0.000 NA   NA
 5818721 5818722 PLES_18071 PLES_18081     FALSE 0.011 358.000 0.000 1.000   NA
 5818723 5818724 PLES_18091 PLES_18101   prc TRUE 0.586 39.000 0.029 1.000 N NA
 5818726 5818727 PLES_18121 PLES_18131     TRUE 0.894 72.000 0.222 1.000 Y NA
 5818727 5818728 PLES_18131 PLES_18141     TRUE 0.997 3.000 0.360 0.053 Y NA
 5818728 5818729 PLES_18141 PLES_18151     TRUE 0.998 -13.000 0.774 0.053   NA
 5818729 5818730 PLES_18151 PLES_18161     TRUE 0.992 -3.000 0.290 1.000   NA
 5818730 5818731 PLES_18161 PLES_18171     TRUE 0.882 55.000 0.500 1.000   NA
 5818732 5818733 PLES_18181 PLES_18191     FALSE 0.206 66.000 0.000 1.000 N NA
 5818734 5818735 PLES_18201 PLES_18211   rluA FALSE 0.109 169.000 0.022 1.000 N NA
 5818735 5818736 PLES_18211 PLES_18221 rluA minE FALSE 0.191 104.000 0.018 NA N NA
 5818736 5818737 PLES_18221 PLES_18231 minE minD TRUE 0.999 -3.000 0.618 NA Y NA
 5818737 5818738 PLES_18231 PLES_18241 minD minC TRUE 0.950 62.000 0.466 1.000 Y NA
 5818739 5818740 PLES_18251 PLES_18261     TRUE 0.547 68.000 0.069 1.000   NA
 5818741 5818742 PLES_18271 PLES_18281   vacJ FALSE 0.145 141.000 0.014 NA   NA
 5818742 5818743 PLES_18281 PLES_18291 vacJ   TRUE 0.969 4.000 0.204 NA   NA
 5818743 5818744 PLES_18291 PLES_18301     FALSE 0.201 143.000 0.038 NA   NA
 5818745 5818746 PLES_18311 PLES_18321     FALSE 0.029 218.000 0.000 NA   NA
 5818746 5818747 PLES_18321 PLES_18331     TRUE 0.997 -3.000 0.733 NA   NA
 5818747 5818748 PLES_18331 PLES_18341     FALSE 0.178 90.000 0.000 1.000   NA
 5818748 5818749 PLES_18341 PLES_18351     TRUE 0.995 -3.000 0.588 1.000 N NA
 5818749 5818750 PLES_18351 PLES_18361     FALSE 0.115 109.000 0.000 NA   NA
 5818750 5818751 PLES_18361 PLES_18371     FALSE 0.019 260.000 0.000 NA   NA
 5818752 5818753 PLES_18381 PLES_18391     FALSE 0.015 282.000 0.000 NA   NA
 5818753 5818754 PLES_18391 PLES_18401   ppiA TRUE 0.684 63.000 0.171 1.000 N NA
 5818754 5818755 PLES_18401 PLES_18411 ppiA   TRUE 0.990 -18.000 0.286 NA   NA
 5818755 5818756 PLES_18411 PLES_18421     TRUE 0.943 7.000 0.118 NA   NA
 5818757 5818758 PLES_18431 PLES_18441   acpD TRUE 0.666 147.000 0.600 NA   NA
 5818759 5818760 PLES_18451 PLES_18461   csaA TRUE 0.814 10.000 0.009 NA   NA
 5818760 5818761 PLES_18461 PLES_18471 csaA   FALSE 0.372 65.000 0.009 1.000   NA
 5818763 5818764 PLES_18491 PLES_18501   cyaB FALSE 0.005 542.000 0.000 NA   NA
 5818764 5818765 PLES_18501 PLES_18511 cyaB   FALSE 0.082 217.000 0.038 NA   NA
 5818767 5818768 PLES_18531 PLES_18541     TRUE 0.988 -3.000 0.201 NA   NA
 5818768 5818769 PLES_18541 PLES_18551     TRUE 0.997 2.000 0.650 NA Y NA
 5818769 5818770 PLES_18551 PLES_18561     TRUE 0.998 -3.000 0.491 NA Y NA
 5818770 5818771 PLES_18561 PLES_18571   trkH FALSE 0.173 67.000 0.000 NA N NA
 5818772 5818773 PLES_18581 PLES_18591     FALSE 0.368 65.000 0.014 NA   NA
 5818774 5818775 PLES_18601 PLES_18611     FALSE 0.373 40.000 0.000 NA   NA
 5818775 5818776 PLES_18611 PLES_18621     TRUE 0.822 115.000 0.286 NA Y NA
 5818776 5818777 PLES_18621 PLES_18631     TRUE 0.810 129.000 0.318 NA Y NA
 5818777 5818778 PLES_18631 PLES_18641     TRUE 0.972 11.000 0.409 NA   NA
 5818778 5818779 PLES_18641 PLES_18651   yciI FALSE 0.145 176.000 0.043 NA   NA
 5818779 5818780 PLES_18651 PLES_18661 yciI yciB TRUE 0.978 2.000 0.224 NA   NA
 5818781 5818782 PLES_18671 PLES_18681     TRUE 0.991 -3.000 0.281 NA   NA
 5818782 5818783 PLES_18681 PLES_18691     TRUE 0.672 35.000 0.040 NA   NA
 5818783 5818784 PLES_18691 PLES_18701     FALSE 0.280 145.000 0.083 NA   NA
 5818784 5818785 PLES_18701 PLES_18711     FALSE 0.181 82.000 0.000 NA   NA
 5818785 5818786 PLES_18711 PLES_18721     FALSE 0.108 115.000 0.000 NA   NA
 5818788 5818789 PLES_18741 PLES_18751 edd glk TRUE 0.538 103.000 0.000 1.000 Y NA
 5818789 5818790 PLES_18751 PLES_18761 glk gltR FALSE 0.375 35.000 0.000 1.000 N NA
 5818790 5818791 PLES_18761 PLES_18771 gltR   TRUE 0.992 24.000 0.909 1.000 Y NA
 5818791 5818792 PLES_18771 PLES_18781     FALSE 0.072 525.000 0.367 1.000 N NA
 5818792 5818793 PLES_18781 PLES_18791     TRUE 0.930 101.000 0.367 0.053 Y NA
 5818793 5818794 PLES_18791 PLES_18801     TRUE 0.999 -7.000 0.816 0.053 Y NA
 5818794 5818795 PLES_18801 PLES_18811     TRUE 0.992 33.000 0.723 0.053 Y NA
 5818795 5818796 PLES_18811 PLES_18821   oprB TRUE 0.647 44.000 0.000 0.053 N NA
 5818796 5818797 PLES_18821 PLES_18831 oprB   FALSE 0.027 215.000 0.000 1.000 N NA
 5818799 5818800 PLES_18851 PLES_18861 zwf pgl TRUE 0.996 -13.000 0.163 1.000 Y NA
 5818800 5818801 PLES_18861 PLES_18871 pgl   TRUE 0.956 18.000 0.064 1.000 Y NA
 5818803 5818804 PLES_18891 PLES_18901     FALSE 0.102 121.000 0.000 NA   NA
 5818805 5818806 PLES_18911 PLES_18921   gltS FALSE 0.023 229.000 0.000 1.000 N NA
 5818806 5818807 PLES_18921 PLES_18931 gltS   TRUE 0.871 39.000 0.016 1.000 Y NA
 5818807 5818808 PLES_18931 PLES_18941     TRUE 0.801 16.000 0.039 1.000 N NA
 5818808 5818809 PLES_18941 PLES_18951     FALSE 0.059 159.000 0.000 1.000 N NA
 5818809 5818810 PLES_18951 PLES_18961     TRUE 0.763 65.000 0.098 0.072   NA
 5818810 5818811 PLES_18961 PLES_18971   ubiG TRUE 0.991 -3.000 0.259 1.000   NA
 5818811 5818812 PLES_18971 PLES_18981 ubiG   FALSE 0.278 151.000 0.104 1.000 N NA
 5818813 5818814 PLES_18991 PLES_19001   gyrA FALSE 0.035 237.000 0.007 1.000 N NA
 5818814 5818815 PLES_19001 PLES_19011 gyrA serC FALSE 0.422 88.000 0.067 1.000 N NA
 5818815 5818816 PLES_19011 PLES_19021 serC pheA TRUE 0.993 0.000 0.121 1.000 Y NA
 5818816 5818817 PLES_19021 PLES_19031 pheA hisC2 TRUE 0.846 69.000 0.098 1.000 Y NA
 5818817 5818818 PLES_19031 PLES_19041 hisC2   TRUE 0.992 -7.000 0.029 1.000 Y NA
 5818818 5818819 PLES_19041 PLES_19051   cmk TRUE 0.981 0.000 0.209 1.000 N NA
 5818819 5818820 PLES_19051 PLES_19061 cmk rpsA FALSE 0.160 268.000 0.281 1.000 N NA
 5818820 5818821 PLES_19061 PLES_19071 rpsA himD TRUE 0.509 137.000 0.292 1.000 N NA
 5818821 5818822 PLES_19071 PLES_19081 himD wzz FALSE 0.004 728.000 0.000 1.000 N NA
 5818822 5818823 PLES_19081 PLES_19091 wzz   TRUE 0.513 110.000 0.000 1.000 Y NA
 5818823 5818824 PLES_19091 PLES_19101     TRUE 0.948 41.000 0.212 1.000 Y NA
 5818824 5818825 PLES_19101 PLES_19111     FALSE 0.043 200.000 0.000 1.000   NA
 5818825 5818826 PLES_19111 PLES_19121   wbpR FALSE 0.115 122.000 0.000 1.000   NA
 5818826 5818827 PLES_19121 PLES_19131 wbpR   TRUE 0.936 5.000 0.085 1.000 N NA
 5818827 5818828 PLES_19131 PLES_19141     TRUE 0.980 -3.000 0.113 1.000 N NA
 5818828 5818829 PLES_19141 PLES_19151     TRUE 0.952 44.000 0.089 0.020 Y NA
 5818829 5818830 PLES_19151 PLES_19161     FALSE 0.322 231.000 0.080 1.000 Y NA
 5818830 5818831 PLES_19161 PLES_19171   orfN TRUE 0.997 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 5818831 5818832 PLES_19171 PLES_19181 orfN wbpM FALSE 0.367 198.000 0.041 1.000 Y NA
 5818832 5818833 PLES_19181 PLES_19191 wbpM   FALSE 0.069 191.000 0.012 1.000 N NA
 5818834 5818835 PLES_19192 PLES_19201     FALSE 0.213 69.000 0.000 NA   NA
 5818837 5818838 PLES_19221 PLES_19231     TRUE 0.820 50.000 0.250 1.000   NA
 5818839 5818840 PLES_19241 PLES_19251   gltX TRUE 0.480 38.000 0.004 1.000 N NA
 5818840 5818841 PLES_19251 PLES_19252 gltX   FALSE 0.037 202.000 0.000 NA   NA
 5818841 5818842 PLES_19252 PLES_19253     FALSE 0.308 49.000 0.000 NA   NA
 5818842 5818843 PLES_19253 PLES_19254     FALSE 0.145 94.000 0.000 NA   NA
 5818843 5818844 PLES_19254 PLES_19255     FALSE 0.319 47.000 0.000 NA   NA
 5818844 5818845 PLES_19255 PLES_19261     FALSE 0.066 159.000 0.000 NA   NA
 5818845 5818846 PLES_19261 PLES_19271     TRUE 0.845 12.000 0.035 NA   NA
 5818846 5818847 PLES_19271 PLES_19281     FALSE 0.112 112.000 0.000 NA   NA
 5818847 5818848 PLES_19281 PLES_19291     TRUE 0.923 0.000 0.008 1.000   NA
 5818848 5818849 PLES_19291 PLES_19301     FALSE 0.323 93.000 0.029 1.000   NA
 5818850 5818851 PLES_19311 PLES_19321     TRUE 0.833 17.000 0.000 0.072   NA
 5818854 5818855 PLES_19351 PLES_19361     FALSE 0.142 80.000 0.000 NA N NA
 5818857 5818858 PLES_19381 PLES_19391 leuC leuD TRUE 0.997 12.000 0.463 0.000 Y NA
 5818858 5818859 PLES_19391 PLES_19401 leuD   FALSE 0.065 270.000 0.060 1.000   NA
 5818859 5818860 PLES_19401 PLES_19411   leuB TRUE 0.464 59.000 0.026 1.000   NA
 5818860 5818861 PLES_19411 PLES_19421 leuB asd TRUE 0.938 70.000 0.196 0.031 Y NA
 5818861 5818862 PLES_19421 PLES_19431 asd   TRUE 0.828 102.000 0.025 0.000 Y NA
 5818862 5818863 PLES_19431 PLES_19441   fimV FALSE 0.099 169.000 0.017 1.000 N NA
 5818863 5818864 PLES_19441 PLES_19451 fimV truA TRUE 0.741 22.000 0.035 1.000 N NA
 5818864 5818865 PLES_19451 PLES_19461 truA trpF TRUE 0.523 90.000 0.139 1.000 N NA
 5818865 5818866 PLES_19461 PLES_19471 trpF   TRUE 0.892 -91.000 0.000 NA   NA
 5818866 5818867 PLES_19471 PLES_19481   accD FALSE 0.077 148.000 0.000 NA   NA
 5818867 5818868 PLES_19481 PLES_19491 accD folC TRUE 0.993 -3.000 0.383 1.000 N NA
 5818868 5818869 PLES_19491 PLES_19501 folC   TRUE 0.970 4.000 0.216 NA   NA
 5818869 5818870 PLES_19501 PLES_19511   cvpA TRUE 0.576 74.000 0.116 NA   NA
 5818870 5818871 PLES_19511 PLES_19521 cvpA purF FALSE 0.242 222.000 0.262 1.000   NA
 5818871 5818872 PLES_19521 PLES_19531 purF metZ TRUE 0.896 17.000 0.153 1.000 N NA
 5818872 5818873 PLES_19531 PLES_19541 metZ   TRUE 0.960 -3.000 0.033 1.000 N NA
 5818874 5818875 PLES_19551 PLES_19561 xcpQ xcpP TRUE 0.862 5.000 0.013 NA   NA
 5818876 5818877 PLES_19571 PLES_19581 xcpR xcpS TRUE 0.999 0.000 0.653 0.004 Y NA
 5818877 5818878 PLES_19581 PLES_19591 xcpS xcpT TRUE 0.998 5.000 0.599 0.004 Y NA
 5818878 5818879 PLES_19591 PLES_19601 xcpT xcpU TRUE 0.997 7.000 0.425 0.004 Y NA
 5818879 5818880 PLES_19601 PLES_19611 xcpU xcpV TRUE 0.999 -3.000 0.605 0.004 Y NA
 5818880 5818881 PLES_19611 PLES_19621 xcpV xcpW TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.004 Y NA
 5818881 5818882 PLES_19621 PLES_19631 xcpW xcpX TRUE 0.991 -3.000 0.024 1.000 Y NA
 5818882 5818883 PLES_19631 PLES_19641 xcpX xcpY TRUE 0.995 -3.000 0.020 0.065 Y NA
 5818883 5818884 PLES_19641 PLES_19651 xcpY xcpZ TRUE 0.998 2.000 0.811 1.000 Y NA
 5818884 5818885 PLES_19651 PLES_19652 xcpZ   FALSE 0.083 139.000 0.000 NA   NA
 5818885 5818886 PLES_19652 PLES_19653     TRUE 0.579 17.000 0.000 NA   NA
 5818886 5818887 PLES_19653 PLES_19654     FALSE 0.108 115.000 0.000 NA   NA
 5818888 5818889 PLES_19661 PLES_19671     TRUE 0.996 -3.000 0.615 1.000   NA
 5818890 5818891 PLES_19681 PLES_19691 fadH1   FALSE 0.024 337.000 0.024 NA   NA
 5818891 5818892 PLES_19691 PLES_19701     TRUE 0.759 38.000 0.099 NA   NA
 5818894 5818895 PLES_19721 PLES_19731     TRUE 0.955 0.000 0.045 1.000   NA
 5818895 5818896 PLES_19731 PLES_19741     TRUE 0.984 -3.000 0.131 1.000   NA
 5818896 5818897 PLES_19741 PLES_19751     TRUE 0.549 84.000 0.124 NA   NA
 5818897 5818898 PLES_19751 PLES_19761     TRUE 0.839 33.000 0.168 NA   NA
 5818898 5818899 PLES_19761 PLES_19771   pepN TRUE 0.821 19.000 0.059 NA   NA
 5818899 5818900 PLES_19771 PLES_19781 pepN gbt FALSE 0.007 447.000 0.000 NA   NA
 5818900 5818901 PLES_19781 PLES_19791 gbt   TRUE 0.889 59.000 0.600 NA   NA
 5818901 5818902 PLES_19791 PLES_19801     FALSE 0.198 180.000 0.091 NA   NA
 5818902 5818903 PLES_19801 PLES_19811     TRUE 0.982 13.000 0.409 0.065   NA
 5818904 5818905 PLES_19821 PLES_19831     TRUE 0.997 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 5818905 5818906 PLES_19831 PLES_19841     FALSE 0.270 62.000 0.000 1.000   NA
 5818906 5818907 PLES_19841 PLES_19851     FALSE 0.274 54.000 0.000 NA   NA
 5818907 5818908 PLES_19851 PLES_19861     TRUE 0.990 -3.000 0.258 NA   NA
 5818908 5818909 PLES_19861 PLES_19871     TRUE 0.986 -3.000 0.171 NA   NA
 5818909 5818910 PLES_19871 PLES_19881     TRUE 0.992 -7.000 0.314 NA   NA
 5818910 5818911 PLES_19881 PLES_19891     TRUE 0.994 -3.000 0.484 NA   NA
 5818911 5818912 PLES_19891 PLES_19901     TRUE 0.943 11.000 0.179 NA   NA
 5818913 5818914 PLES_19911 PLES_19921   gdhB FALSE 0.017 273.000 0.000 NA   NA
 5818914 5818915 PLES_19921 PLES_19931 gdhB   FALSE 0.088 148.000 0.000 1.000   NA
 5818915 5818916 PLES_19931 PLES_19941     TRUE 0.903 43.000 0.429 1.000   NA
 5818916 5818917 PLES_19941 PLES_19951     TRUE 0.640 13.000 0.000 NA   NA
 5818917 5818918 PLES_19951 PLES_19961   pelA FALSE 0.006 482.000 0.000 NA   NA
 5818918 5818919 PLES_19961 PLES_19971 pelA pelB TRUE 0.909 -22.000 0.000 1.000   NA
 5818919 5818920 PLES_19971 PLES_19981 pelB pelC FALSE 0.373 40.000 0.000 NA   NA
 5818920 5818921 PLES_19981 PLES_19991 pelC pelD TRUE 0.980 6.000 0.400 NA   NA
 5818921 5818922 PLES_19991 PLES_20001 pelD pelE TRUE 0.991 -22.000 0.333 NA   NA
 5818922 5818923 PLES_20001 PLES_20011 pelE pelF TRUE 0.996 -3.000 0.600 1.000   NA
 5818923 5818924 PLES_20011 PLES_20021 pelF pelG TRUE 0.994 2.000 0.889 NA   NA
 5818926 5818927 PLES_20041 PLES_20051     FALSE 0.420 38.000 0.000 1.000   NA
 5818928 5818929 PLES_20061 PLES_20071     FALSE 0.067 168.000 0.000 1.000   NA
 5818930 5818931 PLES_20081 PLES_20091   pyrD FALSE 0.421 57.000 0.019 NA   NA
 5818932 5818933 PLES_20101 PLES_20111 rmf   FALSE 0.052 176.000 0.000 NA   NA
 5818936 5818937 PLES_20141 PLES_20151     FALSE 0.007 426.000 0.000 NA   NA
 5818937 5818938 PLES_20151 PLES_20161     TRUE 0.967 14.000 0.000 0.019 Y NA
 5818939 5818940 PLES_20171 PLES_20181     FALSE 0.211 117.000 0.024 NA   NA
 5818940 5818941 PLES_20181 PLES_20191     TRUE 0.865 14.000 0.065 NA   NA
 5818941 5818942 PLES_20191 PLES_20201     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5818944 5818945 PLES_20221 PLES_20231     FALSE 0.065 169.000 0.000 1.000   NA
 5818945 5818946 PLES_20231 PLES_20241     TRUE 0.878 0.000 0.000 1.000   NA
 5818946 5818947 PLES_20241 PLES_20251     TRUE 0.615 17.000 0.000 1.000   NA
 5818948 5818949 PLES_20261 PLES_20271     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 5818949 5818950 PLES_20271 PLES_20281   snr1 FALSE 0.009 368.000 0.000 NA   NA
 5818951 5818952 PLES_20282 PLES_20291     FALSE 0.070 154.000 0.000 NA   NA
 5818952 5818953 PLES_20291 PLES_20301   mobA FALSE 0.090 132.000 0.000 NA   NA
 5818954 5818955 PLES_20311 PLES_20321 moaB2 moeA2 TRUE 0.998 -3.000 0.073 0.002 Y NA
 5818957 5818958 PLES_20341 PLES_20351     TRUE 0.993 6.000 0.352 1.000 Y NA
 5818958 5818959 PLES_20351 PLES_20361     TRUE 0.976 21.000 0.365 0.001 N NA
 5818959 5818960 PLES_20361 PLES_20371     FALSE 0.177 75.000 0.000 1.000 N NA
 5818960 5818961 PLES_20371 PLES_20381     FALSE 0.141 103.000 0.000 1.000   NA
 5818962 5818963 PLES_20401 PLES_20411     FALSE 0.259 57.000 0.000 NA   NA
 5818963 5818964 PLES_20411 PLES_20421     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5818965 5818966 PLES_20431 PLES_20441     FALSE 0.145 150.000 0.019 NA   NA
 5818970 5818971 PLES_20481 PLES_20491 faoA foaB TRUE 0.984 31.000 0.607 1.000 Y NA
 5818971 5818972 PLES_20491 PLES_20501 foaB   TRUE 0.472 83.000 0.070 NA   NA
 5818972 5818973 PLES_20501 PLES_20511   topA FALSE 0.236 91.000 0.007 NA   NA
 5818973 5818974 PLES_20511 PLES_20521 topA   FALSE 0.195 107.000 0.011 NA   NA
 5818974 5818975 PLES_20521 PLES_20531     FALSE 0.332 206.000 0.348 NA   NA
 5818976 5818977 PLES_20541 PLES_20551   lexA TRUE 0.913 12.000 0.122 1.000 N NA
 5818978 5818979 PLES_20561 PLES_20571 psrA nagZ FALSE 0.070 210.000 0.028 1.000 N NA
 5818979 5818980 PLES_20571 PLES_20581 nagZ   TRUE 0.787 12.000 0.018 1.000 N NA
 5818981 5818982 PLES_20591 PLES_20601   mfd TRUE 0.902 11.000 0.071 NA   NA
 5818983 5818984 PLES_20611 PLES_20621   aroP1 FALSE 0.113 102.000 0.000 1.000 N NA
 5818984 5818985 PLES_20621 PLES_20631 aroP1 nqrA FALSE 0.017 259.000 0.000 1.000 N NA
 5818985 5818986 PLES_20631 PLES_20641 nqrA nqrB TRUE 0.999 4.000 0.618 0.001 Y NA
 5818986 5818987 PLES_20641 PLES_20651 nqrB nqrC TRUE 0.999 -7.000 0.538 0.001 Y NA
 5818987 5818988 PLES_20651 PLES_20661 nqrC nqrD TRUE 0.999 -3.000 0.188 0.001 Y NA
 5818988 5818989 PLES_20661 PLES_20671 nqrD nqrE TRUE 0.998 0.000 0.240 0.001 Y NA
 5818989 5818990 PLES_20671 PLES_20681 nqrE nqrF TRUE 0.998 11.000 0.700 0.001 Y NA
 5818990 5818991 PLES_20681 PLES_20691 nqrF   TRUE 0.986 -7.000 0.189 1.000 N NA
 5818991 5818992 PLES_20691 PLES_20701