MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudomonas aeruginosa LESB58

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5816892 5816893 PLES_00001 PLES_00011 dnaA dnaN TRUE 0.974 29.000 0.328 1.000 Y NA
 5816893 5816894 PLES_00011 PLES_00021 dnaN recF TRUE 0.991 10.000 0.318 1.000 Y NA
 5816894 5816895 PLES_00021 PLES_00031 recF gyrB TRUE 0.999 -3.000 0.249 0.003 Y NA
 5816896 5816897 PLES_00041 PLES_00051 lptA   TRUE 0.959 12.000 0.310 1.000 N NA
 5816899 5816900 PLES_00071 PLES_00081 glyS glyQ TRUE 0.999 0.000 0.651 0.001 Y NA
 5816901 5816902 PLES_00091 PLES_00101 tag   FALSE 0.138 144.000 0.017 1.000 N NA
 5816902 5816903 PLES_00101 PLES_00111     FALSE 0.420 85.000 0.053 NA   NA
 5816903 5816904 PLES_00111 PLES_00121     FALSE 0.078 147.000 0.000 NA   NA
 5816905 5816906 PLES_00131 PLES_00141     FALSE 0.014 292.000 0.000 NA   NA
 5816906 5816907 PLES_00141 PLES_00151   trkA FALSE 0.137 149.000 0.008 1.000   NA
 5816907 5816908 PLES_00151 PLES_00161 trkA   TRUE 0.825 28.000 0.122 1.000 N NA
 5816908 5816909 PLES_00161 PLES_00171   fmt TRUE 0.998 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 5816909 5816910 PLES_00171 PLES_00181 fmt def TRUE 0.939 55.000 0.105 0.016 Y NA
 5816911 5816912 PLES_00191 PLES_00201     FALSE 0.242 135.000 0.043 1.000   NA
 5816912 5816913 PLES_00201 PLES_00211     TRUE 0.517 41.000 0.023 NA N NA
 5816915 5816916 PLES_00231 PLES_00241 hemF aroE TRUE 0.612 58.000 0.093 1.000 N NA
 5816916 5816917 PLES_00241 PLES_00251 aroE plcB FALSE 0.128 111.000 0.000 1.000   NA
 5816917 5816918 PLES_00251 PLES_00261 plcB   TRUE 0.909 -19.000 0.000 1.000   NA
 5816918 5816919 PLES_00261 PLES_00271     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5816920 5816921 PLES_00281 PLES_00291     TRUE 0.985 5.000 0.259 0.063 N NA
 5816921 5816922 PLES_00291 PLES_00301   betC TRUE 0.922 17.000 0.218 1.000 N NA
 5816924 5816925 PLES_00321 PLES_00331     TRUE 0.957 8.000 0.000 NA Y NA
 5816925 5816926 PLES_00331 PLES_00341   trpA FALSE 0.040 186.000 0.000 1.000 N NA
 5816926 5816927 PLES_00341 PLES_00351 trpA trpB TRUE 0.999 -3.000 0.344 0.001 Y NA
 5816928 5816929 PLES_00361 PLES_00371 trpI   FALSE 0.129 101.000 0.000 NA   NA
 5816929 5816930 PLES_00371 PLES_00381     FALSE 0.140 184.000 0.049 NA   NA
 5816930 5816931 PLES_00381 PLES_00391     FALSE 0.014 297.000 0.000 NA   NA
 5816931 5816932 PLES_00391 PLES_00401     FALSE 0.110 113.000 0.000 NA   NA
 5816932 5816933 PLES_00401 PLES_00411     FALSE 0.005 778.000 0.000 1.000   NA
 5816933 5816934 PLES_00411 PLES_00421     FALSE 0.015 289.000 0.000 NA   NA
 5816934 5816935 PLES_00421 PLES_00431     FALSE 0.005 619.000 0.000 NA   NA
 5816937 5816938 PLES_00451 PLES_00461 exoT   FALSE 0.005 496.000 0.000 1.000 N NA
 5816938 5816939 PLES_00461 PLES_00471     TRUE 0.951 31.000 0.625 NA   NA
 5816939 5816940 PLES_00471 PLES_00481     TRUE 0.697 153.000 0.740 NA   NA
 5816941 5816942 PLES_00491 PLES_00501     FALSE 0.015 282.000 0.000 NA   NA
 5816944 5816945 PLES_00531 PLES_00541     FALSE 0.033 209.000 0.000 NA   NA
 5816945 5816946 PLES_00541 PLES_00551     FALSE 0.202 73.000 0.000 NA   NA
 5816946 5816947 PLES_00551 PLES_00561     FALSE 0.379 39.000 0.000 NA   NA
 5816947 5816948 PLES_00561 PLES_00571     FALSE 0.228 66.000 0.000 NA   NA
 5816949 5816950 PLES_00581 PLES_00591     TRUE 0.693 63.000 0.157 1.000   NA
 5816950 5816951 PLES_00591 PLES_00601   osmC TRUE 0.635 84.000 0.000 1.000 Y NA
 5816951 5816952 PLES_00601 PLES_00611 osmC   FALSE 0.231 111.000 0.026 NA   NA
 5816953 5816954 PLES_00621 PLES_00631     FALSE 0.259 57.000 0.000 NA   NA
 5816956 5816957 PLES_00651 PLES_00661     TRUE 0.562 33.000 0.009 NA   NA
 5816957 5816958 PLES_00661 PLES_00671     TRUE 0.955 -7.000 0.016 1.000   NA
 5816959 5816960 PLES_00681 PLES_00691 prlC   TRUE 0.986 -3.000 0.173 NA   NA
 5816960 5816961 PLES_00691 PLES_00701     FALSE 0.244 89.000 0.006 NA   NA
 5816962 5816963 PLES_00711 PLES_00721     TRUE 0.902 62.000 0.714 NA   NA
 5816963 5816964 PLES_00721 PLES_00731     TRUE 0.985 -7.000 0.161 NA   NA
 5816964 5816965 PLES_00731 PLES_00741     TRUE 0.994 0.000 0.710 NA N NA
 5816965 5816966 PLES_00741 PLES_00751   ppkA TRUE 0.984 -3.000 0.160 1.000 N NA
 5816966 5816967 PLES_00751 PLES_00761 ppkA   TRUE 0.997 8.000 1.000 1.000 Y NA
 5816967 5816968 PLES_00761 PLES_00771     TRUE 0.936 10.000 0.128 NA   NA
 5816968 5816969 PLES_00771 PLES_00781     TRUE 0.983 -3.000 0.128 NA   NA
 5816969 5816970 PLES_00781 PLES_00791     FALSE 0.455 222.000 0.714 NA   NA
 5816970 5816971 PLES_00791 PLES_00801     TRUE 0.989 7.000 0.714 NA   NA
 5816971 5816972 PLES_00801 PLES_00811     TRUE 0.980 16.000 0.833 NA   NA
 5816972 5816973 PLES_00811 PLES_00821     TRUE 0.944 45.000 0.833 NA   NA
 5816974 5816975 PLES_00831 PLES_00841     TRUE 0.624 89.000 0.209 NA   NA
 5816975 5816976 PLES_00841 PLES_00851     TRUE 0.976 13.000 0.588 NA   NA
 5816976 5816977 PLES_00851 PLES_00861     TRUE 0.742 76.000 0.294 NA   NA
 5816977 5816978 PLES_00861 PLES_00871     FALSE 0.262 168.000 0.125 NA   NA
 5816978 5816979 PLES_00871 PLES_00881     TRUE 0.983 2.000 0.311 NA   NA
 5816979 5816980 PLES_00881 PLES_00891     TRUE 0.981 -3.000 0.111 NA   NA
 5816980 5816981 PLES_00891 PLES_00901     TRUE 0.994 -36.000 0.500 NA   NA
 5816981 5816982 PLES_00901 PLES_00911     TRUE 0.992 -7.000 0.333 NA   NA
 5816982 5816983 PLES_00911 PLES_00921     TRUE 0.746 47.000 0.143 NA   NA
 5816984 5816985 PLES_00931 PLES_00941     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5816985 5816986 PLES_00941 PLES_00951     TRUE 0.594 16.000 0.000 NA   NA
 5816987 5816988 PLES_00961 PLES_00971     TRUE 0.858 28.000 0.160 NA   NA
 5816988 5816989 PLES_00971 PLES_00981     TRUE 0.983 -70.000 0.160 NA   NA
 5816989 5816990 PLES_00981 PLES_00991     TRUE 0.988 -3.000 0.200 NA   NA
 5816990 5816991 PLES_00991 PLES_01001     TRUE 0.977 1.000 0.200 NA   NA
 5816991 5816992 PLES_01001 PLES_01011     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5816992 5816993 PLES_01011 PLES_01021     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 5816993 5816994 PLES_01021 PLES_01031     FALSE 0.010 376.000 0.000 1.000   NA
 5816994 5816995 PLES_01031 PLES_01041     TRUE 0.533 211.000 0.241 1.000 Y NA
 5816995 5816996 PLES_01041 PLES_01051     FALSE 0.272 137.000 0.069 NA   NA
 5816996 5816997 PLES_01051 PLES_01061   coxB FALSE 0.018 264.000 0.000 NA   NA
 5816997 5816998 PLES_01061 PLES_01071 coxB coxA TRUE 0.998 10.000 0.741 0.003 Y NA
 5816998 5816999 PLES_01071 PLES_01081 coxA   TRUE 0.958 11.000 0.268 1.000 N NA
 5816999 5817000 PLES_01081 PLES_01091   coIII TRUE 0.978 11.000 0.536 1.000 N NA
 5817002 5817003 PLES_01111 PLES_01121     TRUE 0.996 -25.000 0.722 NA   NA
 5817003 5817004 PLES_01121 PLES_01131     TRUE 0.758 65.000 0.255 NA   NA
 5817004 5817005 PLES_01131 PLES_01141     TRUE 0.977 26.000 0.321 1.000 Y NA
 5817005 5817006 PLES_01141 PLES_01151     TRUE 0.838 26.000 0.099 1.000   NA
 5817008 5817009 PLES_01171 PLES_01181     FALSE 0.104 257.000 0.128 NA   NA
 5817009 5817010 PLES_01181 PLES_01191     TRUE 0.945 25.000 0.429 1.000   NA
 5817010 5817011 PLES_01191 PLES_01201     FALSE 0.022 230.000 0.000 1.000 N NA
 5817011 5817012 PLES_01201 PLES_01211     TRUE 0.684 49.000 0.102 1.000 N NA
 5817012 5817013 PLES_01211 PLES_01221     TRUE 0.750 101.000 0.000 0.003 Y NA
 5817013 5817014 PLES_01221 PLES_01231     FALSE 0.056 180.000 0.000 1.000   NA
 5817015 5817016 PLES_01241 PLES_01251     FALSE 0.013 300.000 0.000 NA   NA
 5817016 5817017 PLES_01251 PLES_01261     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817017 5817018 PLES_01261 PLES_01271     FALSE 0.052 176.000 0.000 NA   NA
 5817019 5817020 PLES_01281 PLES_01291     FALSE 0.227 73.000 0.000 1.000   NA
 5817021 5817022 PLES_01301 PLES_01311 gabP   FALSE 0.050 169.000 0.000 1.000 N NA
 5817022 5817023 PLES_01311 PLES_01321     FALSE 0.440 84.000 0.059 NA   NA
 5817023 5817024 PLES_01321 PLES_01331     TRUE 0.958 0.000 0.059 NA   NA
 5817027 5817028 PLES_01361 PLES_01371     FALSE 0.005 581.000 0.000 NA   NA
 5817028 5817029 PLES_01371 PLES_01381     TRUE 0.993 0.000 0.590 1.000   NA
 5817029 5817030 PLES_01381 PLES_01391     TRUE 0.940 22.000 0.154 0.062   NA
 5817030 5817031 PLES_01391 PLES_01401   ahpC FALSE 0.070 165.000 0.000 1.000   NA
 5817031 5817032 PLES_01401 PLES_01411 ahpC ahpF TRUE 0.856 145.000 0.551 1.000 Y NA
 5817034 5817035 PLES_01431 PLES_01441   nuh TRUE 0.518 108.000 0.000 1.000 Y NA
 5817036 5817037 PLES_01451 PLES_01461     TRUE 0.463 122.000 0.000 NA Y NA
 5817038 5817039 PLES_01471 PLES_01481     TRUE 0.585 73.000 0.106 1.000   NA
 5817039 5817040 PLES_01481 PLES_01491     FALSE 0.259 105.000 0.025 1.000   NA
 5817040 5817041 PLES_01491 PLES_01501     FALSE 0.035 197.000 0.000 1.000 N NA
 5817041 5817042 PLES_01501 PLES_01511     TRUE 0.995 -3.000 0.588 NA N NA
 5817042 5817043 PLES_01511 PLES_01521     TRUE 0.602 148.000 0.085 NA Y NA
 5817043 5817044 PLES_01521 PLES_01531   pcaQ FALSE 0.008 376.000 0.000 1.000 N NA
 5817044 5817045 PLES_01531 PLES_01541 pcaQ pcaH TRUE 0.631 135.000 0.153 0.001 N NA
 5817045 5817046 PLES_01541 PLES_01551 pcaH pcaG TRUE 0.998 11.000 0.782 0.001 Y NA
 5817046 5817047 PLES_01551 PLES_01561 pcaG pcaR FALSE 0.030 207.000 0.000 1.000 N NA
 5817047 5817048 PLES_01561 PLES_01571 pcaR   FALSE 0.063 153.000 0.000 1.000 N NA
 5817048 5817049 PLES_01571 PLES_01581     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.014 Y NA
 5817049 5817050 PLES_01581 PLES_01591     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA N NA
 5817050 5817051 PLES_01591 PLES_01601     FALSE 0.028 199.000 0.000 NA N NA
 5817051 5817052 PLES_01601 PLES_01611     FALSE 0.107 116.000 0.000 NA   NA
 5817052 5817053 PLES_01611 PLES_01621     FALSE 0.016 281.000 0.000 NA   NA
 5817053 5817054 PLES_01621 PLES_01631   opdC FALSE 0.068 156.000 0.000 NA   NA
 5817056 5817057 PLES_01651 PLES_01661     FALSE 0.003 672.000 0.000 NA N NA
 5817057 5817058 PLES_01661 PLES_01671     FALSE 0.017 242.000 0.000 NA N NA
 5817058 5817059 PLES_01671 PLES_01681     TRUE 0.617 93.000 0.240 1.000 N NA
 5817059 5817060 PLES_01681 PLES_01691     TRUE 0.879 6.000 0.019 1.000   NA
 5817061 5817062 PLES_01701 PLES_01711     FALSE 0.309 127.000 0.073 NA   NA
 5817062 5817063 PLES_01711 PLES_01721     TRUE 0.972 27.000 0.911 NA   NA
 5817063 5817064 PLES_01721 PLES_01731     TRUE 0.942 9.000 0.133 NA   NA
 5817064 5817065 PLES_01731 PLES_01741     FALSE 0.132 263.000 0.000 1.000 Y NA
 5817065 5817066 PLES_01741 PLES_01751     TRUE 0.956 20.000 0.078 1.000 Y NA
 5817066 5817067 PLES_01751 PLES_01761     TRUE 0.982 6.000 0.067 1.000 Y NA
 5817067 5817068 PLES_01761 PLES_01771   aer2 TRUE 0.938 70.000 0.444 1.000 Y NA
 5817068 5817069 PLES_01771 PLES_01781 aer2   TRUE 0.926 36.000 0.000 0.011 Y NA
 5817069 5817070 PLES_01781 PLES_01791     TRUE 0.997 -13.000 0.105 0.011 Y NA
 5817070 5817071 PLES_01791 PLES_01801     TRUE 0.981 28.000 0.444 1.000 Y NA
 5817071 5817072 PLES_01801 PLES_01811     FALSE 0.433 198.000 0.082 1.000 Y NA
 5817072 5817073 PLES_01811 PLES_01821     FALSE 0.036 193.000 0.000 1.000 N NA
 5817075 5817076 PLES_01841 PLES_01851 atsA   TRUE 0.935 87.000 0.571 1.000 Y NA
 5817076 5817077 PLES_01851 PLES_01861     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5817078 5817079 PLES_01871 PLES_01881     FALSE 0.007 418.000 0.000 1.000 N NA
 5817079 5817080 PLES_01881 PLES_01891     TRUE 0.979 -3.000 0.082 1.000   NA
 5817084 5817085 PLES_01931 PLES_01941     FALSE 0.335 41.000 0.000 1.000 N NA
 5817085 5817086 PLES_01941 PLES_01951     TRUE 0.810 68.000 0.000 0.073 Y NA
 5817086 5817087 PLES_01951 PLES_01961   pntAA FALSE 0.014 647.000 0.000 0.073 N NA
 5817087 5817088 PLES_01961 PLES_01971 pntAA pntB FALSE 0.160 384.000 0.000 0.001 Y NA
 5817088 5817089 PLES_01971 PLES_01981 pntB tonB2 FALSE 0.009 343.000 0.000 1.000 N NA
 5817089 5817090 PLES_01981 PLES_01991 tonB2 exbB1 TRUE 0.980 29.000 0.778 0.017 N NA
 5817090 5817091 PLES_01991 PLES_02001 exbB1 exbD1 TRUE 0.999 2.000 0.778 0.080 Y NA
 5817093 5817094 PLES_02021 PLES_02031   mdcA FALSE 0.113 111.000 0.000 NA   NA
 5817094 5817095 PLES_02031 PLES_02041 mdcA   TRUE 0.992 0.000 0.508 1.000   NA
 5817095 5817096 PLES_02041 PLES_02051   mdcC TRUE 0.989 2.000 0.475 NA   NA
 5817096 5817097 PLES_02051 PLES_02061 mdcC mdcD TRUE 0.993 -7.000 0.400 NA   NA
 5817097 5817098 PLES_02061 PLES_02071 mdcD mdcE TRUE 0.996 -3.000 0.700 NA   NA
 5817098 5817099 PLES_02071 PLES_02081 mdcE   TRUE 0.952 16.000 0.339 NA   NA
 5817099 5817100 PLES_02081 PLES_02091     TRUE 0.996 -3.000 0.651 1.000   NA
 5817100 5817101 PLES_02091 PLES_02101     TRUE 0.742 57.000 0.200 NA   NA
 5817101 5817102 PLES_02101 PLES_02111     TRUE 0.992 6.000 0.945 NA   NA
 5817103 5817104 PLES_02121 PLES_02131     FALSE 0.044 188.000 0.000 NA   NA
 5817104 5817105 PLES_02131 PLES_02141     FALSE 0.042 192.000 0.000 NA   NA
 5817105 5817106 PLES_02141 PLES_02151     TRUE 0.534 21.000 0.000 NA   NA
 5817107 5817108 PLES_02161 PLES_02171     TRUE 0.643 58.000 0.118 1.000 N NA
 5817108 5817109 PLES_02171 PLES_02181     TRUE 0.859 31.000 0.200 1.000 N NA
 5817109 5817110 PLES_02181 PLES_02191     FALSE 0.055 164.000 0.000 1.000 N NA
 5817111 5817112 PLES_02201 PLES_02211     TRUE 0.808 60.000 0.333 1.000 N NA
 5817113 5817114 PLES_02221 PLES_02231     FALSE 0.065 151.000 0.000 1.000 N NA
 5817114 5817115 PLES_02231 PLES_02241     TRUE 1.000 -3.000 0.739 0.000 Y NA
 5817115 5817116 PLES_02241 PLES_02251   pcaF TRUE 0.998 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 5817116 5817117 PLES_02251 PLES_02261 pcaF pcaT FALSE 0.206 150.000 0.051 1.000 N NA
 5817117 5817118 PLES_02261 PLES_02271 pcaT pcaB TRUE 0.754 23.000 0.042 1.000 N NA
 5817118 5817119 PLES_02271 PLES_02281 pcaB pcaD TRUE 0.864 15.000 0.063 1.000   NA
 5817119 5817120 PLES_02281 PLES_02291 pcaD pcaC TRUE 0.945 11.000 0.174 1.000   NA
 5817120 5817121 PLES_02291 PLES_02301 pcaC   FALSE 0.060 175.000 0.000 1.000   NA
 5817121 5817122 PLES_02301 PLES_02311     FALSE 0.238 191.000 0.167 NA   NA
 5817124 5817125 PLES_02331 PLES_02341     FALSE 0.180 244.000 0.222 1.000   NA
 5817125 5817126 PLES_02341 PLES_02351     TRUE 0.870 23.000 0.143 NA   NA
 5817126 5817127 PLES_02351 PLES_02361     FALSE 0.228 150.000 0.057 NA   NA
 5817128 5817129 PLES_02371 PLES_02381     FALSE 0.228 66.000 0.000 NA   NA
 5817130 5817131 PLES_02391 PLES_02401     TRUE 0.484 93.000 0.122 1.000 N NA
 5817132 5817133 PLES_02411 PLES_02421   aroQ2 TRUE 0.999 -3.000 0.583 1.000 Y NA
 5817133 5817134 PLES_02421 PLES_02431 aroQ2   FALSE 0.094 117.000 0.000 1.000 N NA
 5817134 5817135 PLES_02431 PLES_02441   pobA FALSE 0.115 175.000 0.029 1.000 N NA
 5817137 5817138 PLES_02461 PLES_02471     FALSE 0.449 78.000 0.000 0.085   NA
 5817138 5817139 PLES_02471 PLES_02481     FALSE 0.061 165.000 0.000 NA   NA
 5817139 5817140 PLES_02481 PLES_02491     FALSE 0.017 268.000 0.000 NA   NA
 5817140 5817141 PLES_02491 PLES_02501     FALSE 0.152 92.000 0.000 NA   NA
 5817141 5817142 PLES_02501 PLES_02511     FALSE 0.295 41.000 0.000 NA N NA
 5817142 5817143 PLES_02511 PLES_02521     FALSE 0.088 134.000 0.000 NA   NA
 5817143 5817144 PLES_02521 PLES_02531     FALSE 0.062 164.000 0.000 NA   NA
 5817144 5817145 PLES_02531 PLES_02541     FALSE 0.004 1082.000 0.000 NA   NA
 5817145 5817146 PLES_02541 PLES_02551     FALSE 0.049 180.000 0.000 NA   NA
 5817146 5817147 PLES_02551 PLES_02561     FALSE 0.075 150.000 0.000 NA   NA
 5817147 5817148 PLES_02561 PLES_02571     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817148 5817149 PLES_02571 PLES_02581     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5817149 5817150 PLES_02581 PLES_02591   hcpC FALSE 0.048 182.000 0.000 NA   NA
 5817150 5817151 PLES_02591 PLES_02592 hcpC   FALSE 0.004 1255.000 0.000 NA   NA
 5817151 5817152 PLES_02592 PLES_02601     FALSE 0.044 189.000 0.000 NA   NA
 5817153 5817154 PLES_02611 PLES_02621 gabD gabT FALSE 0.206 245.000 0.303 1.000 N NA
 5817154 5817155 PLES_02621 PLES_02631 gabT   FALSE 0.078 326.000 0.182 1.000 N NA
 5817157 5817158 PLES_02651 PLES_02661     TRUE 0.662 12.000 0.000 NA   NA
 5817158 5817159 PLES_02661 PLES_02671     FALSE 0.413 34.000 0.000 NA   NA
 5817160 5817161 PLES_02681 PLES_02691     TRUE 0.871 50.000 0.444 NA N NA
 5817161 5817162 PLES_02691 PLES_02701     FALSE 0.063 163.000 0.000 NA   NA
 5817162 5817163 PLES_02701 PLES_02711     FALSE 0.115 109.000 0.000 NA   NA
 5817165 5817166 PLES_02731 PLES_02741     FALSE 0.062 172.000 0.000 1.000   NA
 5817168 5817169 PLES_02761 PLES_02771 cysA cysW TRUE 0.996 4.000 0.587 1.000 Y NA
 5817169 5817170 PLES_02771 PLES_02781 cysW cysT TRUE 0.995 11.000 0.935 0.000 N NA
 5817170 5817171 PLES_02781 PLES_02791 cysT sbp FALSE 0.436 162.000 0.066 0.002 N NA
 5817171 5817172 PLES_02791 PLES_02801 sbp   FALSE 0.297 177.000 0.188 NA   NA
 5817172 5817173 PLES_02801 PLES_02811     FALSE 0.202 164.000 0.062 NA   NA
 5817174 5817175 PLES_02821 PLES_02831 desA gpuP FALSE 0.022 231.000 0.000 1.000 N NA
 5817175 5817176 PLES_02831 PLES_02841 gpuP gpuA TRUE 0.873 56.000 0.087 1.000 Y NA
 5817176 5817177 PLES_02841 PLES_02851 gpuA gpuR FALSE 0.254 53.000 0.000 1.000 N NA
 5817177 5817178 PLES_02851 PLES_02861 gpuR   FALSE 0.098 113.000 0.000 1.000 N NA
 5817178 5817179 PLES_02861 PLES_02871   oprE FALSE 0.006 613.000 0.000 1.000   NA
 5817180 5817181 PLES_02881 PLES_02891 aguA aguB TRUE 0.498 86.000 0.084 1.000   NA
 5817181 5817182 PLES_02891 PLES_02901 aguB aguR FALSE 0.161 163.000 0.032 1.000   NA
 5817182 5817183 PLES_02901 PLES_02911 aguR   TRUE 0.607 63.000 0.105 1.000 N NA
 5817183 5817184 PLES_02911 PLES_02921     FALSE 0.142 256.000 0.000 1.000 Y NA
 5817185 5817186 PLES_02931 PLES_02941 spuA spuB TRUE 0.822 41.000 0.182 1.000   NA
 5817186 5817187 PLES_02941 PLES_02951 spuB spuC TRUE 0.731 66.000 0.239 1.000 N NA
 5817187 5817188 PLES_02951 PLES_02961 spuC spuD FALSE 0.095 116.000 0.000 1.000 N NA
 5817188 5817189 PLES_02961 PLES_02971 spuD spuE FALSE 0.116 419.000 0.000 0.022 Y NA
 5817189 5817190 PLES_02971 PLES_02981 spuE spuF TRUE 0.751 55.000 0.000 1.000 Y NA
 5817190 5817191 PLES_02981 PLES_02991 spuF spuG TRUE 0.883 27.000 0.000 1.000 Y NA
 5817191 5817192 PLES_02991 PLES_03001 spuG spuH TRUE 0.777 83.000 0.000 0.061 Y NA
 5817201 5817202 PLES_03091 PLES_03101     TRUE 0.972 72.000 0.625 0.080 Y NA
 5817205 5817206 PLES_03131 PLES_03141     FALSE 0.412 92.000 0.071 1.000 N NA
 5817206 5817207 PLES_03141 PLES_03151     FALSE 0.317 99.000 0.041 NA   NA
 5817207 5817208 PLES_03151 PLES_03161     TRUE 0.600 84.000 0.167 NA   NA
 5817209 5817210 PLES_03171 PLES_03181     TRUE 0.516 16.000 0.000 NA N NA
 5817210 5817211 PLES_03181 PLES_03191     FALSE 0.056 421.000 0.000 1.000 Y NA
 5817211 5817212 PLES_03191 PLES_03201     TRUE 0.990 48.000 1.000 0.061 Y NA
 5817212 5817213 PLES_03201 PLES_03211     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.061 Y NA
 5817213 5817214 PLES_03211 PLES_03221     TRUE 0.999 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 5817218 5817219 PLES_03261 PLES_03271   rpiA FALSE 0.099 123.000 0.000 NA   NA
 5817220 5817221 PLES_03281 PLES_03291 ilvA1   FALSE 0.239 120.000 0.034 NA   NA
 5817221 5817222 PLES_03291 PLES_03301     TRUE 0.703 51.000 0.125 NA   NA
 5817223 5817224 PLES_03311 PLES_03321     FALSE 0.306 92.000 0.032 1.000 N NA
 5817225 5817226 PLES_03331 PLES_03341 ygdP ptsP TRUE 0.834 23.000 0.097 1.000 N NA
 5817226 5817227 PLES_03341 PLES_03351 ptsP   TRUE 0.887 26.000 0.000 1.000 Y NA
 5817229 5817230 PLES_03371 PLES_03381   lgt TRUE 0.874 10.000 0.030 1.000   NA
 5817230 5817231 PLES_03381 PLES_03391 lgt thyA FALSE 0.192 206.000 0.164 1.000 N NA
 5817232 5817233 PLES_03401 PLES_03411     FALSE 0.407 35.000 0.000 NA   NA
 5817233 5817234 PLES_03411 PLES_03421     TRUE 0.997 -7.000 0.904 NA   NA
 5817237 5817238 PLES_03451 PLES_03461     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817238 5817239 PLES_03461 PLES_03471   folA FALSE 0.207 71.000 0.000 NA   NA
 5817240 5817241 PLES_03481 PLES_03491     FALSE 0.083 139.000 0.000 NA   NA
 5817241 5817242 PLES_03491 PLES_03501   ilvD FALSE 0.022 230.000 0.000 1.000 N NA
 5817242 5817243 PLES_03501 PLES_03511 ilvD   FALSE 0.013 328.000 0.000 1.000   NA
 5817243 5817244 PLES_03511 PLES_03521   pfpI FALSE 0.416 73.000 0.031 1.000   NA
 5817245 5817246 PLES_03531 PLES_03541   mutM FALSE 0.349 59.000 0.015 NA N NA
 5817246 5817247 PLES_03541 PLES_03551 mutM   FALSE 0.258 77.000 0.003 1.000 N NA
 5817247 5817248 PLES_03551 PLES_03561     FALSE 0.178 83.000 0.000 NA   NA
 5817248 5817249 PLES_03561 PLES_03571     FALSE 0.017 270.000 0.000 NA   NA
 5817250 5817251 PLES_03581 PLES_03591   fdx1 FALSE 0.312 128.000 0.076 NA   NA
 5817251 5817252 PLES_03591 PLES_03601 fdx1 coaD FALSE 0.348 121.000 0.088 NA   NA
 5817252 5817253 PLES_03601 PLES_03611 coaD   FALSE 0.114 152.000 0.011 1.000 N NA
 5817253 5817254 PLES_03611 PLES_03621     TRUE 0.929 56.000 0.886 NA   NA
 5817254 5817255 PLES_03621 PLES_03631     TRUE 0.819 55.000 0.308 NA   NA
 5817257 5817258 PLES_03651 PLES_03661     FALSE 0.393 37.000 0.000 NA   NA
 5817258 5817259 PLES_03661 PLES_03671     FALSE 0.016 279.000 0.000 NA   NA
 5817259 5817260 PLES_03671 PLES_03681     TRUE 0.965 0.000 0.070 1.000   NA
 5817260 5817261 PLES_03681 PLES_03691     TRUE 0.998 -7.000 0.598 0.005   NA
 5817262 5817263 PLES_03701 PLES_03711 ftsY ftsE TRUE 0.990 -3.000 0.117 0.098 N NA
 5817263 5817264 PLES_03711 PLES_03721 ftsE ftsX TRUE 0.988 0.000 0.035 NA Y NA
 5817264 5817265 PLES_03721 PLES_03731 ftsX rpoH FALSE 0.273 114.000 0.054 NA N NA
 5817265 5817266 PLES_03731 PLES_03741 rpoH   FALSE 0.334 65.000 0.005 NA   NA
 5817268 5817269 PLES_03761 PLES_03771     FALSE 0.343 103.000 0.058 NA   NA
 5817269 5817270 PLES_03771 PLES_03781   thiG TRUE 0.886 59.000 0.130 1.000 Y NA
 5817270 5817271 PLES_03781 PLES_03791 thiG micA FALSE 0.232 154.000 0.060 1.000   NA
 5817271 5817272 PLES_03791 PLES_03801 micA   FALSE 0.098 163.000 0.004 NA   NA
 5817273 5817274 PLES_03811 PLES_03821     FALSE 0.242 62.000 0.000 NA   NA
 5817274 5817275 PLES_03821 PLES_03831     FALSE 0.289 81.000 0.011 NA   NA
 5817275 5817276 PLES_03831 PLES_03841     TRUE 0.493 121.000 0.218 1.000 N NA
 5817276 5817277 PLES_03841 PLES_03851     TRUE 0.971 -3.000 0.050 NA   NA
 5817277 5817278 PLES_03851 PLES_03861     FALSE 0.335 132.000 0.100 NA   NA
 5817278 5817279 PLES_03861 PLES_03871   metX TRUE 0.983 8.000 0.509 NA   NA
 5817279 5817280 PLES_03871 PLES_03881 metX   FALSE 0.335 89.000 0.027 1.000   NA
 5817280 5817281 PLES_03881 PLES_03891     FALSE 0.188 108.000 0.010 NA   NA
 5817281 5817282 PLES_03891 PLES_03901     TRUE 0.499 123.000 0.220 NA   NA
 5817282 5817283 PLES_03901 PLES_03911   proC TRUE 0.936 11.000 0.152 NA   NA
 5817283 5817284 PLES_03911 PLES_03921 proC   TRUE 0.930 12.000 0.158 NA   NA
 5817285 5817286 PLES_03931 PLES_03941 pilT pilU TRUE 0.853 178.000 0.436 0.018 Y NA
 5817288 5817289 PLES_03961 PLES_03971     FALSE 0.022 243.000 0.000 NA   NA
 5817289 5817290 PLES_03971 PLES_03981     TRUE 0.998 -3.000 0.133 0.019 Y NA
 5817291 5817292 PLES_03991 PLES_04001   pyrB TRUE 0.998 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 5817292 5817293 PLES_04001 PLES_04011 pyrB pyrR TRUE 0.973 24.000 0.247 1.000 Y NA
 5817293 5817294 PLES_04011 PLES_04021 pyrR yqgF FALSE 0.386 112.000 0.109 1.000 N NA
 5817294 5817295 PLES_04021 PLES_04031 yqgF   TRUE 0.984 0.000 0.263 NA N NA
 5817295 5817296 PLES_04031 PLES_04041     TRUE 0.602 49.000 0.064 NA N NA
 5817296 5817297 PLES_04041 PLES_04051   gshB TRUE 0.501 81.000 0.089 1.000 N NA
 5817298 5817299 PLES_04061 PLES_04071 pilG pilH TRUE 0.974 47.000 0.296 0.022 Y NA
 5817299 5817300 PLES_04071 PLES_04081 pilH pilI TRUE 0.939 51.000 0.266 1.000 Y NA
 5817300 5817301 PLES_04081 PLES_04091 pilI pilJ TRUE 0.977 85.000 0.795 0.011 Y NA
 5817301 5817302 PLES_04091 PLES_04101 pilJ pilK TRUE 0.918 61.000 0.241 1.000 Y NA
 5817302 5817303 PLES_04101 PLES_04111 pilK chpA TRUE 0.984 12.000 0.217 1.000 Y NA
 5817303 5817304 PLES_04111 PLES_04121 chpA chpB TRUE 0.998 -7.000 0.217 0.011 Y NA
 5817304 5817305 PLES_04121 PLES_04131 chpB chpC TRUE 0.998 -3.000 0.517 0.011   NA
 5817305 5817306 PLES_04131 PLES_04141 chpC chpD TRUE 0.918 8.000 0.000 0.060   NA
 5817306 5817307 PLES_04141 PLES_04151 chpD chpE TRUE 0.477 76.000 0.067 1.000 N NA
 5817308 5817309 PLES_04161 PLES_04171     FALSE 0.407 35.000 0.000 NA   NA
 5817309 5817310 PLES_04171 PLES_04181   bioA FALSE 0.346 93.000 0.041 NA   NA
 5817311 5817312 PLES_04191 PLES_04201     FALSE 0.227 181.000 0.032 0.072 N NA
 5817312 5817313 PLES_04201 PLES_04211   pasP TRUE 0.982 12.000 0.676 NA   NA
 5817315 5817316 PLES_04231 PLES_04241 mexA mexB TRUE 0.969 16.000 0.565 1.000 N NA
 5817316 5817317 PLES_04241 PLES_04251 mexB oprM TRUE 0.994 2.000 0.538 0.061 N NA
 5817318 5817319 PLES_04261 PLES_04271     FALSE 0.021 251.000 0.000 NA   NA
 5817319 5817320 PLES_04271 PLES_04281   metF FALSE 0.321 70.000 0.010 NA   NA
 5817320 5817321 PLES_04281 PLES_04291 metF   FALSE 0.347 43.000 0.000 NA   NA
 5817321 5817322 PLES_04291 PLES_04301   sahH FALSE 0.365 41.000 0.000 NA   NA
 5817323 5817324 PLES_04311 PLES_04321     FALSE 0.097 126.000 0.000 NA   NA
 5817324 5817325 PLES_04321 PLES_04331     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5817325 5817326 PLES_04331 PLES_04341     FALSE 0.172 85.000 0.000 NA   NA
 5817327 5817328 PLES_04351 PLES_04361 codA codB TRUE 0.997 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 5817328 5817329 PLES_04361 PLES_04371 codB   FALSE 0.291 182.000 0.000 1.000 Y NA
 5817329 5817330 PLES_04371 PLES_04381     TRUE 0.991 -3.000 0.301 1.000 N NA
 5817330 5817331 PLES_04381 PLES_04391   dht FALSE 0.327 95.000 0.043 1.000 N NA
 5817332 5817333 PLES_04401 PLES_04411     TRUE 0.563 59.000 0.069 1.000 N NA
 5817334 5817335 PLES_04421 PLES_04431   gcdH FALSE 0.406 120.000 0.143 1.000 N NA
 5817336 5817337 PLES_04441 PLES_04451     FALSE 0.054 152.000 0.000 NA N NA
 5817339 5817340 PLES_04471 PLES_04481     TRUE 0.998 -3.000 0.330 NA Y NA
 5817341 5817342 PLES_04491 PLES_04501     FALSE 0.158 90.000 0.000 NA   NA
 5817342 5817343 PLES_04501 PLES_04511   dbpA FALSE 0.032 262.000 0.010 NA   NA
 5817344 5817345 PLES_04521 PLES_04531     FALSE 0.065 151.000 0.000 1.000 N NA
 5817347 5817348 PLES_04551 PLES_04561     FALSE 0.126 102.000 0.000 NA   NA
 5817350 5817351 PLES_04581 PLES_04591   creB TRUE 0.474 85.000 0.085 1.000 N NA
 5817351 5817352 PLES_04591 PLES_04601 creB creC TRUE 0.998 0.000 0.776 1.000 Y NA
 5817352 5817353 PLES_04601 PLES_04611 creC creD TRUE 0.615 103.000 0.311 NA N NA
 5817353 5817354 PLES_04611 PLES_04621 creD   TRUE 0.517 50.000 0.029 NA   NA
 5817355 5817356 PLES_04631 PLES_04641     TRUE 0.474 19.000 0.000 NA N NA
 5817358 5817359 PLES_04661 PLES_04671 fiuA   TRUE 0.911 104.000 0.600 NA Y NA
 5817359 5817360 PLES_04671 PLES_04681     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA N NA
 5817361 5817362 PLES_04691 PLES_04701     FALSE 0.061 140.000 0.000 NA N NA
 5817362 5817363 PLES_04701 PLES_04711     FALSE 0.300 50.000 0.000 NA   NA
 5817364 5817365 PLES_04721 PLES_04731     FALSE 0.009 348.000 0.000 1.000 N NA
 5817368 5817369 PLES_04761 PLES_04771     FALSE 0.347 43.000 0.000 NA   NA
 5817371 5817372 PLES_04791 PLES_04801     TRUE 0.849 32.000 0.048 0.083   NA
 5817373 5817374 PLES_04811 PLES_04821     FALSE 0.073 203.000 0.020 NA   NA
 5817374 5817375 PLES_04821 PLES_04831     FALSE 0.402 62.000 0.019 NA   NA
 5817375 5817376 PLES_04831 PLES_04841     FALSE 0.218 68.000 0.000 NA   NA
 5817376 5817377 PLES_04841 PLES_04851     FALSE 0.355 42.000 0.000 NA   NA
 5817377 5817378 PLES_04851 PLES_04861     FALSE 0.126 139.000 0.003 NA   NA
 5817378 5817379 PLES_04861 PLES_04871     FALSE 0.274 54.000 0.000 NA   NA
 5817380 5817381 PLES_04881 PLES_04891     TRUE 0.713 77.000 0.242 1.000   NA
 5817381 5817382 PLES_04891 PLES_04901     TRUE 0.940 11.000 0.154 1.000   NA
 5817382 5817383 PLES_04901 PLES_04911     TRUE 0.989 2.000 0.514 1.000 N NA
 5817383 5817384 PLES_04911 PLES_04921     TRUE 1.000 -10.000 0.886 0.005 Y NA
 5817385 5817386 PLES_04931 PLES_04941     TRUE 0.569 78.000 0.000 0.002   NA
 5817386 5817387 PLES_04941 PLES_04951     TRUE 0.629 16.000 0.000 1.000   NA
 5817388 5817389 PLES_04961 PLES_04971 bioB bioF TRUE 0.898 106.000 0.168 0.001 Y NA
 5817389 5817390 PLES_04971 PLES_04981 bioF   TRUE 0.979 -7.000 0.092 NA   NA
 5817390 5817391 PLES_04981 PLES_04991     TRUE 0.985 -7.000 0.163 NA   NA
 5817391 5817392 PLES_04991 PLES_05001   bioD TRUE 0.978 4.000 0.063 0.001 N NA
 5817392 5817393 PLES_05001 PLES_05011 bioD   TRUE 0.560 109.000 0.244 NA   NA
 5817395 5817396 PLES_05031 PLES_05041     FALSE 0.380 213.000 0.000 0.009 Y NA
 5817396 5817397 PLES_05041 PLES_05051     TRUE 0.467 273.000 0.150 0.009 Y NA
 5817398 5817399 PLES_05061 PLES_05071 nirN   TRUE 0.981 -9.000 0.125 1.000 N NA
 5817399 5817400 PLES_05071 PLES_05081   nirJ TRUE 0.954 11.000 0.217 1.000   NA
 5817400 5817401 PLES_05081 PLES_05091 nirJ nirH TRUE 0.993 -6.000 0.391 NA   NA
 5817401 5817402 PLES_05091 PLES_05101 nirH   TRUE 0.998 -25.000 0.483 NA Y NA
 5817402 5817403 PLES_05101 PLES_05111   nirL TRUE 0.997 -7.000 0.241 NA Y NA
 5817403 5817404 PLES_05111 PLES_05121 nirL   TRUE 0.998 -3.000 0.333 NA Y NA
 5817404 5817405 PLES_05121 PLES_05131   nirF TRUE 0.916 9.000 0.070 NA   NA
 5817405 5817406 PLES_05131 PLES_05141 nirF nirC TRUE 0.994 -3.000 0.186 0.014   NA
 5817406 5817407 PLES_05141 PLES_05151 nirC nirM TRUE 0.997 -3.000 0.062 0.014 Y NA
 5817407 5817408 PLES_05151 PLES_05161 nirM nirS TRUE 0.944 51.000 0.094 0.014 Y NA
 5817409 5817410 PLES_05171 PLES_05181 nirQ   TRUE 0.904 35.000 0.071 0.001   NA
 5817410 5817411 PLES_05181 PLES_05191     TRUE 0.989 8.000 0.750 NA   NA
 5817411 5817412 PLES_05191 PLES_05201   norC FALSE 0.158 90.000 0.000 NA   NA
 5817412 5817413 PLES_05201 PLES_05211 norC norB TRUE 0.998 0.000 0.794 0.001   NA
 5817413 5817414 PLES_05211 PLES_05221 norB   TRUE 0.996 2.000 0.118 0.001 Y NA
 5817415 5817416 PLES_05231 PLES_05241   dnr FALSE 0.175 84.000 0.000 NA   NA
 5817419 5817420 PLES_05261 PLES_05271     FALSE 0.110 226.000 0.000 0.019   NA
 5817420 5817421 PLES_05271 PLES_05281     TRUE 0.936 0.000 0.029 1.000 N NA
 5817423 5817424 PLES_05301 PLES_05311     FALSE 0.421 33.000 0.000 NA   NA
 5817424 5817425 PLES_05311 PLES_05321     FALSE 0.259 57.000 0.000 NA   NA
 5817425 5817426 PLES_05321 PLES_05331     TRUE 0.920 18.000 0.226 1.000 N NA
 5817427 5817428 PLES_05341 PLES_05351     TRUE 0.875 4.000 0.013 NA   NA
 5817428 5817429 PLES_05351 PLES_05361   dsbB FALSE 0.164 88.000 0.000 NA   NA
 5817430 5817431 PLES_05371 PLES_05381     TRUE 0.739 70.000 0.267 NA   NA
 5817431 5817432 PLES_05381 PLES_05391     FALSE 0.356 113.000 0.080 NA   NA
 5817437 5817438 PLES_05441 PLES_05451 metK   TRUE 0.952 16.000 0.036 1.000 Y NA
 5817439 5817440 PLES_05461 PLES_05471 tktA   TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5817442 5817443 PLES_05491 PLES_05501 epd pgk TRUE 0.992 6.000 0.070 0.003 Y NA
 5817443 5817444 PLES_05501 PLES_05511 pgk   FALSE 0.287 73.000 0.003 NA   NA
 5817444 5817445 PLES_05511 PLES_05521     FALSE 0.434 160.000 0.273 NA   NA
 5817445 5817446 PLES_05521 PLES_05531   fda FALSE 0.345 120.000 0.084 NA   NA
 5817446 5817447 PLES_05531 PLES_05541 fda   FALSE 0.228 66.000 0.000 NA   NA
 5817452 5817453 PLES_05591 PLES_05601     FALSE 0.107 129.000 0.000 1.000   NA
 5817453 5817454 PLES_05601 PLES_05611     FALSE 0.058 178.000 0.000 1.000   NA
 5817458 5817459 PLES_05651 PLES_05661     TRUE 0.594 16.000 0.000 NA   NA
 5817459 5817460 PLES_05661 PLES_05671     TRUE 0.621 14.000 0.000 NA   NA
 5817460 5817461 PLES_05671 PLES_05681     TRUE 0.901 -10.000 0.000 NA   NA
 5817461 5817462 PLES_05681 PLES_05691     FALSE 0.042 191.000 0.000 NA   NA
 5817462 5817463 PLES_05691 PLES_05701     FALSE 0.005 534.000 0.000 NA   NA
 5817463 5817464 PLES_05701 PLES_05711     FALSE 0.149 93.000 0.000 NA   NA
 5817464 5817465 PLES_05711 PLES_05712     FALSE 0.005 550.000 0.000 NA   NA
 5817465 5817466 PLES_05712 PLES_05721     TRUE 0.579 17.000 0.000 NA   NA
 5817466 5817467 PLES_05721 PLES_05731   rpoD FALSE 0.186 107.000 0.013 1.000 N NA
 5817467 5817468 PLES_05731 PLES_05741 rpoD dnaG TRUE 0.722 80.000 0.299 1.000 N NA
 5817468 5817469 PLES_05741 PLES_05751 dnaG   TRUE 0.586 83.000 0.137 1.000   NA
 5817469 5817470 PLES_05751 PLES_05761   rpsU TRUE 0.820 70.000 0.173 0.016   NA
 5817473 5817474 PLES_05791 PLES_05801 folB   TRUE 0.998 -9.000 0.500 1.000 Y NA
 5817475 5817476 PLES_05811 PLES_05821 cca   TRUE 0.468 44.000 0.008 NA   NA
 5817476 5817477 PLES_05821 PLES_05831     FALSE 0.221 95.000 0.007 NA   NA
 5817477 5817478 PLES_05831 PLES_05841     TRUE 0.997 -3.000 0.761 NA   NA
 5817478 5817479 PLES_05841 PLES_05851     TRUE 0.805 101.000 0.683 NA   NA
 5817479 5817480 PLES_05851 PLES_05861     FALSE 0.012 279.000 0.000 NA N NA
 5817480 5817481 PLES_05861 PLES_05871   apaH TRUE 0.636 44.000 0.045 1.000   NA
 5817481 5817482 PLES_05871 PLES_05881 apaH   TRUE 0.985 0.000 0.267 NA   NA
 5817482 5817483 PLES_05881 PLES_05891   ksgA TRUE 0.715 37.000 0.078 NA N NA
 5817483 5817484 PLES_05891 PLES_05901 ksgA pdxA TRUE 0.482 116.000 0.197 1.000 N NA
 5817484 5817485 PLES_05901 PLES_05911 pdxA surA TRUE 0.995 -3.000 0.561 1.000 N NA
 5817485 5817486 PLES_05911 PLES_05921 surA ostA TRUE 0.971 -19.000 0.070 1.000 N NA
 5817487 5817488 PLES_05931 PLES_05941     TRUE 0.996 -3.000 0.642 NA   NA
 5817488 5817489 PLES_05941 PLES_05951     TRUE 0.956 2.000 0.091 1.000 N NA
 5817491 5817492 PLES_05971 PLES_05981     TRUE 0.987 46.000 0.667 0.028 Y NA
 5817492 5817493 PLES_05981 PLES_05991     FALSE 0.083 129.000 0.000 1.000 N NA
 5817493 5817494 PLES_05991 PLES_06001     FALSE 0.169 233.000 0.000 1.000 Y NA
 5817494 5817495 PLES_06001 PLES_06011     TRUE 0.962 56.000 0.556 1.000 Y NA
 5817495 5817496 PLES_06011 PLES_06021     TRUE 0.824 115.000 0.108 0.060 Y NA
 5817496 5817497 PLES_06021 PLES_06031     TRUE 0.856 106.000 0.145 0.060 Y NA
 5817497 5817498 PLES_06031 PLES_06041   rpe FALSE 0.144 124.000 0.007 1.000 N NA
 5817498 5817499 PLES_06041 PLES_06051 rpe   TRUE 0.974 0.000 0.120 1.000   NA
 5817499 5817500 PLES_06051 PLES_06061   trpE TRUE 0.717 73.000 0.233 1.000   NA
 5817501 5817502 PLES_06071 PLES_06081 prtN prtR FALSE 0.131 100.000 0.000 NA   NA
 5817503 5817504 PLES_06091 PLES_06101 ptrB   FALSE 0.314 48.000 0.000 NA   NA
 5817504 5817505 PLES_06101 PLES_06111     FALSE 0.009 363.000 0.000 NA   NA
 5817505 5817506 PLES_06111 PLES_06121     TRUE 0.526 22.000 0.000 NA   NA
 5817506 5817507 PLES_06121 PLES_06131     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5817507 5817508 PLES_06131 PLES_06141     TRUE 0.596 153.000 0.500 NA   NA
 5817508 5817509 PLES_06141 PLES_06151     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817509 5817510 PLES_06151 PLES_06161     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5817510 5817511 PLES_06161 PLES_06171     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5817511 5817512 PLES_06171 PLES_06181     FALSE 0.006 491.000 0.000 NA   NA
 5817512 5817513 PLES_06181 PLES_06191     TRUE 0.967 13.000 0.423 NA   NA
 5817513 5817514 PLES_06191 PLES_06201     TRUE 0.925 15.000 0.192 NA   NA
 5817514 5817515 PLES_06201 PLES_06211     FALSE 0.373 170.000 0.250 NA   NA
 5817515 5817516 PLES_06211 PLES_06221     TRUE 0.944 10.000 0.158 NA   NA
 5817516 5817517 PLES_06221 PLES_06231     TRUE 0.987 -25.000 0.211 NA   NA
 5817517 5817518 PLES_06231 PLES_06241     FALSE 0.255 58.000 0.000 NA   NA
 5817518 5817519 PLES_06241 PLES_06251     FALSE 0.421 33.000 0.000 NA   NA
 5817519 5817520 PLES_06251 PLES_06261     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817520 5817521 PLES_06261 PLES_06271     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817521 5817522 PLES_06271 PLES_06281   trpG FALSE 0.010 348.000 0.000 NA   NA
 5817522 5817523 PLES_06281 PLES_06291 trpG trpD TRUE 0.990 2.000 0.105 1.000 Y NA
 5817523 5817524 PLES_06291 PLES_06301 trpD trpC TRUE 0.997 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 5817526 5817527 PLES_06321 PLES_06331   speD FALSE 0.025 320.000 0.025 1.000 N NA
 5817528 5817529 PLES_06341 PLES_06351     FALSE 0.221 100.000 0.018 1.000 N NA
 5817531 5817532 PLES_06371 PLES_06381     TRUE 0.562 61.000 0.057 1.000   NA
 5817532 5817533 PLES_06381 PLES_06391     FALSE 0.441 122.000 0.154 1.000   NA
 5817533 5817534 PLES_06391 PLES_06401     TRUE 0.758 17.000 0.024 NA   NA
 5817535 5817536 PLES_06411 PLES_06421 argC   TRUE 0.915 0.000 0.008 NA   NA
 5817536 5817537 PLES_06421 PLES_06431     TRUE 0.964 1.000 0.103 NA   NA
 5817537 5817538 PLES_06431 PLES_06441     TRUE 0.510 78.000 0.079 NA   NA
 5817539 5817540 PLES_06451 PLES_06461     TRUE 0.966 3.000 0.184 NA N NA
 5817541 5817542 PLES_06471 PLES_06472 tyrZ   FALSE 0.005 540.000 0.000 NA   NA
 5817542 5817543 PLES_06472 PLES_06473     FALSE 0.233 65.000 0.000 NA   NA
 5817543 5817544 PLES_06473 PLES_06474     FALSE 0.456 29.000 0.000 NA   NA
 5817544 5817545 PLES_06474 PLES_06475     FALSE 0.026 227.000 0.000 NA   NA
 5817545 5817546 PLES_06475 PLES_06476     FALSE 0.081 142.000 0.000 NA   NA
 5817546 5817547 PLES_06476 PLES_06481   birA FALSE 0.066 160.000 0.000 NA   NA
 5817547 5817548 PLES_06481 PLES_06491 birA   TRUE 0.983 -3.000 0.147 1.000 N NA
 5817548 5817549 PLES_06491 PLES_06501     TRUE 0.834 9.000 0.012 NA   NA
 5817549 5817550 PLES_06501 PLES_06502     FALSE 0.077 148.000 0.000 NA   NA
 5817550 5817551 PLES_06502 PLES_06503     TRUE 0.479 27.000 0.000 NA   NA
 5817551 5817552 PLES_06503 PLES_06504     TRUE 0.543 20.000 0.000 NA   NA
 5817552 5817553 PLES_06504 PLES_06511   tufB FALSE 0.172 85.000 0.000 NA   NA
 5817553 5817554 PLES_06511 PLES_06512 tufB   FALSE 0.264 56.000 0.000 NA   NA
 5817554 5817555 PLES_06512 PLES_06521   secE FALSE 0.326 46.000 0.000 NA   NA
 5817555 5817556 PLES_06521 PLES_06531 secE nusG TRUE 0.988 10.000 0.843 1.000 N NA
 5817556 5817557 PLES_06531 PLES_06541 nusG rplK TRUE 0.760 117.000 0.681 1.000 N NA
 5817557 5817558 PLES_06541 PLES_06551 rplK rplA TRUE 0.999 0.000 0.838 0.013 Y NA
 5817560 5817561 PLES_06561 PLES_06571 rplJ rplL TRUE 0.982 79.000 0.884 0.009 Y NA
 5817561 5817562 PLES_06571 PLES_06572 rplL   TRUE 0.758 6.000 0.000 NA   NA
 5817562 5817563 PLES_06572 PLES_06581   rpoB FALSE 0.073 151.000 0.000 NA   NA
 5817563 5817564 PLES_06581 PLES_06591 rpoB rpoC TRUE 0.988 66.000 0.851 0.000 Y NA
 5817564 5817565 PLES_06591 PLES_06601 rpoC rpsL FALSE 0.294 152.000 0.122 1.000 N NA
 5817565 5817566 PLES_06601 PLES_06611 rpsL rpsG TRUE 0.964 100.000 0.620 0.002 Y NA
 5817566 5817567 PLES_06611 PLES_06621 rpsG fusA1 TRUE 0.983 31.000 0.579 1.000 Y NA
 5817567 5817568 PLES_06621 PLES_06631 fusA1 tufA TRUE 0.990 31.000 0.400 0.001 Y NA
 5817568 5817569 PLES_06631 PLES_06641 tufA rpsJ TRUE 0.759 157.000 0.318 1.000 Y NA
 5817569 5817570 PLES_06641 PLES_06651 rpsJ rplC TRUE 0.948 83.000 0.307 0.013 Y NA
 5817570 5817571 PLES_06651 PLES_06661 rplC rplD TRUE 0.995 14.000 0.486 0.009 Y NA
 5817571 5817572 PLES_06661 PLES_06671 rplD rplW TRUE 0.998 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 5817572 5817573 PLES_06671 PLES_06681 rplW rplB TRUE 0.995 12.000 0.849 1.000 Y NA
 5817573 5817574 PLES_06681 PLES_06691 rplB rpsS TRUE 0.997 17.000 0.820 0.013 Y NA
 5817574 5817575 PLES_06691 PLES_06701 rpsS rplV TRUE 0.997 13.000 0.769 0.013 Y NA
 5817575 5817576 PLES_06701 PLES_06711 rplV rpsC TRUE 0.997 13.000 0.719 0.013 Y NA
 5817576 5817577 PLES_06711 PLES_06721 rpsC rplP TRUE 0.998 12.000 0.828 0.013 Y NA
 5817577 5817578 PLES_06721 PLES_06731 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.009 Y NA
 5817578 5817579 PLES_06731 PLES_06741 rpmC rpsQ TRUE 0.999 3.000 0.828 0.009 Y NA
 5817579 5817580 PLES_06741 PLES_06751 rpsQ rplN TRUE 0.995 24.000 0.791 0.013 Y NA
 5817580 5817581 PLES_06751 PLES_06761 rplN rplX TRUE 0.997 13.000 0.810 0.013 Y NA
 5817581 5817582 PLES_06761 PLES_06771 rplX rplE TRUE 0.996 20.000 0.758 0.009 Y NA
 5817582 5817583 PLES_06771 PLES_06781 rplE rpsN TRUE 0.993 14.000 0.309 0.009 Y NA
 5817583 5817584 PLES_06781 PLES_06791 rpsN rpsH TRUE 0.792 190.000 0.295 0.009 Y NA
 5817584 5817585 PLES_06791 PLES_06801 rpsH rplF TRUE 0.998 12.000 0.808 0.009 Y NA
 5817585 5817586 PLES_06801 PLES_06811 rplF rplR TRUE 0.998 11.000 0.815 0.009 Y NA
 5817586 5817587 PLES_06811 PLES_06821 rplR rpsE TRUE 0.999 4.000 0.814 0.013 Y NA
 5817587 5817588 PLES_06821 PLES_06831 rpsE rpmD TRUE 0.999 3.000 0.789 0.013 Y NA
 5817588 5817589 PLES_06831 PLES_06841 rpmD rplO TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 5817589 5817590 PLES_06841 PLES_06851 rplO secY TRUE 0.993 1.000 0.730 1.000 N NA
 5817590 5817591 PLES_06851 PLES_06861 secY rpsM FALSE 0.027 276.000 0.011 1.000 N NA
 5817591 5817592 PLES_06861 PLES_06871 rpsM rpsK TRUE 0.996 19.000 0.810 0.009 Y NA
 5817592 5817593 PLES_06871 PLES_06881 rpsK rpsD TRUE 0.994 17.000 0.509 0.013 Y NA
 5817593 5817594 PLES_06881 PLES_06891 rpsD rpoA TRUE 0.956 23.000 0.549 1.000 N NA
 5817594 5817595 PLES_06891 PLES_06901 rpoA rplQ TRUE 0.946 44.000 0.873 1.000 N NA
 5817595 5817596 PLES_06901 PLES_06911 rplQ katA FALSE 0.013 282.000 0.000 1.000 N NA
 5817596 5817597 PLES_06911 PLES_06921 katA bfrA FALSE 0.453 131.000 0.000 1.000 Y NA
 5817599 5817600 PLES_06941 PLES_06951   ssb TRUE 0.838 17.000 0.075 NA N NA
 5817601 5817602 PLES_06961 PLES_06971 pchA pchB TRUE 0.956 -3.000 0.027 1.000 N NA
 5817602 5817603 PLES_06971 PLES_06981 pchB pchC TRUE 0.975 0.000 0.149 1.000 N NA
 5817603 5817604 PLES_06981 PLES_06991 pchC pchD TRUE 0.988 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5817605 5817606 PLES_07001 PLES_07011 pchR pchE FALSE 0.213 194.000 0.154 1.000 N NA
 5817606 5817607 PLES_07011 PLES_07021 pchE pchF TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 5817607 5817608 PLES_07021 PLES_07031 pchF pchG TRUE 0.994 -3.000 0.074 1.000 Y NA
 5817608 5817609 PLES_07031 PLES_07041 pchG   TRUE 0.895 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5817609 5817610 PLES_07041 PLES_07051     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.005 Y NA
 5817610 5817611 PLES_07051 PLES_07061   fptA TRUE 0.823 92.000 0.667 1.000 N NA
 5817611 5817612 PLES_07061 PLES_07071 fptA   TRUE 0.994 0.000 0.667 NA   NA
 5817612 5817613 PLES_07071 PLES_07081     FALSE 0.012 323.000 0.000 NA   NA
 5817613 5817614 PLES_07081 PLES_07091     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5817615 5817616 PLES_07101 PLES_07111 phzS phzG1 FALSE 0.162 238.000 0.000 1.000 Y NA
 5817616 5817617 PLES_07111 PLES_07121 phzG1 phzF1 TRUE 0.907 26.000 0.235 1.000   NA
 5817617 5817618 PLES_07121 PLES_07131 phzF1 phzE1 TRUE 0.911 14.000 0.016 0.023   NA
 5817618 5817619 PLES_07131 PLES_07141 phzE1 phzD1 TRUE 0.988 -3.000 0.055 0.023 N NA
 5817619 5817620 PLES_07141 PLES_07151 phzD1 phzC1 TRUE 0.895 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5817620 5817621 PLES_07151 PLES_07161 phzC1 phzB1 FALSE 0.437 36.000 0.000 1.000   NA
 5817621 5817622 PLES_07161 PLES_07171 phzB1 phzA1 TRUE 0.806 30.000 0.000 0.004   NA
 5817624 5817625 PLES_07191 PLES_07201 opmD mexI TRUE 0.974 -3.000 0.080 NA N NA
 5817625 5817626 PLES_07201 PLES_07211 mexI mexH TRUE 0.965 13.000 0.435 NA N NA
 5817626 5817627 PLES_07211 PLES_07221 mexH mexG TRUE 0.955 8.000 0.174 NA   NA
 5817627 5817628 PLES_07221 PLES_07231 mexG   FALSE 0.005 650.000 0.000 NA   NA
 5817628 5817629 PLES_07231 PLES_07241     FALSE 0.142 80.000 0.000 NA N NA
 5817630 5817631 PLES_07251 PLES_07261   ddlA FALSE 0.158 96.000 0.000 1.000   NA
 5817632 5817633 PLES_07271 PLES_07281     FALSE 0.038 208.000 0.000 1.000   NA
 5817633 5817634 PLES_07281 PLES_07291     TRUE 0.900 118.000 0.600 1.000 Y NA
 5817635 5817636 PLES_07301 PLES_07311     TRUE 0.997 3.000 0.280 0.027 Y NA
 5817636 5817637 PLES_07311 PLES_07321     FALSE 0.375 156.000 0.000 1.000 Y NA
 5817637 5817638 PLES_07321 PLES_07331     TRUE 0.973 85.000 0.778 0.059 Y NA
 5817638 5817639 PLES_07331 PLES_07341     TRUE 1.000 -3.000 0.857 0.013 Y NA
 5817639 5817640 PLES_07341 PLES_07351     TRUE 0.999 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 5817640 5817641 PLES_07351 PLES_07361     TRUE 0.945 9.000 0.133 1.000   NA
 5817642 5817643 PLES_07371 PLES_07381 pqsL   FALSE 0.335 168.000 0.000 1.000 Y NA
 5817643 5817644 PLES_07381 PLES_07391     TRUE 0.998 -7.000 0.690 0.081 N NA
 5817644 5817645 PLES_07391 PLES_07401     TRUE 0.713 65.000 0.208 1.000 N NA
 5817645 5817646 PLES_07401 PLES_07411     TRUE 0.723 136.000 0.714 1.000 N NA
 5817646 5817647 PLES_07411 PLES_07421     TRUE 0.668 93.000 0.300 1.000 N NA
 5817648 5817649 PLES_07431 PLES_07441     TRUE 0.490 26.000 0.000 NA   NA
 5817650 5817651 PLES_07451 PLES_07461     TRUE 0.468 28.000 0.000 NA   NA
 5817653 5817654 PLES_07481 PLES_07491     FALSE 0.027 237.000 0.000 1.000   NA
 5817654 5817655 PLES_07491 PLES_07501     FALSE 0.349 100.000 0.000 0.081   NA
 5817657 5817658 PLES_07521 PLES_07531 piv   FALSE 0.006 535.000 0.000 1.000   NA
 5817660 5817661 PLES_07551 PLES_07561     TRUE 0.552 23.000 0.000 1.000   NA
 5817661 5817662 PLES_07561 PLES_07571     FALSE 0.098 136.000 0.000 1.000   NA
 5817668 5817669 PLES_07631 PLES_07641     FALSE 0.242 62.000 0.000 NA   NA
 5817671 5817672 PLES_07661 PLES_07671 fepG fepD TRUE 0.997 -3.000 0.079 0.059 Y NA
 5817672 5817673 PLES_07671 PLES_07681 fepD fepB TRUE 0.947 31.000 0.130 1.000 Y NA
 5817676 5817677 PLES_07711 PLES_07721     TRUE 0.762 68.000 0.318 NA N NA
 5817677 5817678 PLES_07721 PLES_07731     FALSE 0.005 437.000 0.000 NA N NA
 5817679 5817680 PLES_07741 PLES_07751     TRUE 0.871 14.000 0.062 1.000   NA
 5817680 5817681 PLES_07751 PLES_07761   acoB TRUE 0.993 -3.000 0.375 1.000   NA
 5817681 5817682 PLES_07761 PLES_07771 acoB   TRUE 0.994 33.000 0.804 0.001 Y NA
 5817682 5817683 PLES_07771 PLES_07781     TRUE 0.930 23.000 0.141 0.081   NA
 5817683 5817684 PLES_07781 PLES_07791     TRUE 0.987 -3.000 0.054 0.081   NA
 5817686 5817687 PLES_07811 PLES_07821     FALSE 0.044 188.000 0.000 NA   NA
 5817687 5817688 PLES_07821 PLES_07831     FALSE 0.124 96.000 0.000 1.000 N NA
 5817688 5817689 PLES_07831 PLES_07841     TRUE 0.951 0.000 0.000 0.077 N NA
 5817689 5817690 PLES_07841 PLES_07851     TRUE 0.953 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5817690 5817691 PLES_07851 PLES_07861     FALSE 0.137 97.000 0.000 NA   NA
 5817691 5817692 PLES_07861 PLES_07871     FALSE 0.013 309.000 0.000 NA   NA
 5817692 5817693 PLES_07871 PLES_07881     FALSE 0.346 132.000 0.111 NA   NA
 5817693 5817694 PLES_07881 PLES_07891     FALSE 0.004 797.000 0.000 NA   NA
 5817694 5817695 PLES_07891 PLES_07901     FALSE 0.027 226.000 0.000 NA   NA
 5817695 5817696 PLES_07901 PLES_07911     TRUE 0.770 5.000 0.000 NA   NA
 5817696 5817697 PLES_07911 PLES_07921     FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 5817697 5817698 PLES_07921 PLES_07931     FALSE 0.110 113.000 0.000 NA   NA
 5817698 5817699 PLES_07931 PLES_07941     FALSE 0.006 511.000 0.000 NA   NA
 5817699 5817700 PLES_07941 PLES_07951     FALSE 0.006 471.000 0.000 NA   NA
 5817700 5817701 PLES_07951 PLES_07961     FALSE 0.042 352.000 0.000 0.032   NA
 5817702 5817703 PLES_07971 PLES_07981 endY   FALSE 0.004 835.000 0.000 NA   NA
 5817703 5817704 PLES_07981 PLES_07991     FALSE 0.110 113.000 0.000 NA   NA
 5817704 5817705 PLES_07991 PLES_08001     FALSE 0.012 319.000 0.000 NA   NA
 5817705 5817706 PLES_08001 PLES_08011     FALSE 0.008 418.000 0.000 NA   NA
 5817706 5817707 PLES_08011 PLES_08021     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817707 5817708 PLES_08021 PLES_08031     TRUE 0.994 33.000 1.000 0.017 Y NA
 5817708 5817709 PLES_08031 PLES_08041     FALSE 0.011 365.000 0.000 1.000   NA
 5817709 5817710 PLES_08041 PLES_08051     TRUE 0.607 15.000 0.000 NA   NA
 5817710 5817711 PLES_08051 PLES_08061     TRUE 0.706 141.000 0.667 NA   NA
 5817713 5817714 PLES_08072 PLES_08081     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 5817714 5817715 PLES_08081 PLES_08091     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817715 5817716 PLES_08091 PLES_08101     FALSE 0.027 236.000 0.000 1.000   NA
 5817716 5817717 PLES_08101 PLES_08111     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817717 5817718 PLES_08111 PLES_08121     FALSE 0.008 395.000 0.000 NA   NA
 5817718 5817719 PLES_08121 PLES_08131     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5817719 5817720 PLES_08131 PLES_08141     FALSE 0.032 212.000 0.000 NA   NA
 5817720 5817721 PLES_08141 PLES_08151     FALSE 0.013 329.000 0.000 1.000   NA
 5817721 5817722 PLES_08151 PLES_08161     TRUE 0.856 67.000 0.537 NA   NA
 5817722 5817723 PLES_08161 PLES_08171     FALSE 0.042 191.000 0.000 NA   NA
 5817723 5817724 PLES_08171 PLES_08181     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5817724 5817725 PLES_08181 PLES_08191     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5817725 5817726 PLES_08191 PLES_08201     FALSE 0.181 82.000 0.000 NA   NA
 5817726 5817727 PLES_08201 PLES_08211     FALSE 0.006 465.000 0.000 NA   NA
 5817727 5817728 PLES_08211 PLES_08221     FALSE 0.004 963.000 0.000 NA   NA
 5817728 5817729 PLES_08221 PLES_08231     TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 5817729 5817730 PLES_08231 PLES_08241     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5817730 5817731 PLES_08241 PLES_08251     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5817731 5817732 PLES_08251 PLES_08261     TRUE 0.899 -13.000 0.000 NA   NA
 5817732 5817733 PLES_08261 PLES_08271     FALSE 0.188 79.000 0.000 NA   NA
 5817733 5817734 PLES_08271 PLES_08281     FALSE 0.044 189.000 0.000 NA   NA
 5817734 5817735 PLES_08281 PLES_08291     TRUE 0.840 1.000 0.000 NA   NA
 5817735 5817736 PLES_08291 PLES_08301     FALSE 0.005 547.000 0.000 NA   NA
 5817736 5817737 PLES_08301 PLES_08311     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817737 5817738 PLES_08311 PLES_08321     FALSE 0.202 73.000 0.000 NA   NA
 5817738 5817739 PLES_08321 PLES_08331   tyrS FALSE 0.004 1797.000 0.000 NA   NA
 5817741 5817742 PLES_08351 PLES_08361     FALSE 0.151 86.000 0.000 1.000 N NA
 5817743 5817744 PLES_08371 PLES_08381     TRUE 0.873 84.000 0.800 NA   NA
 5817744 5817745 PLES_08381 PLES_08391     FALSE 0.016 264.000 0.000 1.000 N NA
 5817745 5817746 PLES_08391 PLES_08401     TRUE 0.692 98.000 0.385 1.000 N NA
 5817747 5817748 PLES_08411 PLES_08421     TRUE 0.991 -3.000 0.273 NA   NA
 5817749 5817750 PLES_08431 PLES_08441   hpcG TRUE 0.879 13.000 0.075 1.000 N NA
 5817750 5817751 PLES_08441 PLES_08451 hpcG   TRUE 0.831 18.000 0.075 NA N NA
 5817751 5817752 PLES_08451 PLES_08461   hpcD FALSE 0.305 93.000 0.039 NA N NA
 5817752 5817753 PLES_08461 PLES_08471 hpcD hpcB TRUE 0.968 11.000 0.330 1.000   NA
 5817753 5817754 PLES_08471 PLES_08481 hpcB hpcC TRUE 0.609 132.000 0.378 1.000   NA
 5817754 5817755 PLES_08481 PLES_08491 hpcC   TRUE 0.997 -3.000 0.510 0.081 N NA
 5817755 5817756 PLES_08491 PLES_08501     TRUE 0.998 11.000 0.618 0.000 Y NA
 5817757 5817758 PLES_08511 PLES_08521   aph FALSE 0.259 52.000 0.000 1.000 N NA
 5817759 5817760 PLES_08531 PLES_08541     FALSE 0.191 78.000 0.000 NA   NA
 5817760 5817761 PLES_08541 PLES_08551     TRUE 0.653 28.000 0.029 NA N NA
 5817761 5817762 PLES_08551 PLES_08561     FALSE 0.105 118.000 0.000 NA   NA
 5817763 5817764 PLES_08571 PLES_08581     FALSE 0.070 154.000 0.000 NA   NA
 5817764 5817765 PLES_08581 PLES_08591     FALSE 0.071 128.000 0.000 NA N NA
 5817766 5817767 PLES_08601 PLES_08611   ampC FALSE 0.233 65.000 0.000 NA   NA
 5817769 5817770 PLES_08631 PLES_08641     FALSE 0.012 321.000 0.000 NA   NA
 5817771 5817772 PLES_08651 PLES_08661     FALSE 0.379 75.000 0.029 NA   NA
 5817772 5817773 PLES_08661 PLES_08671     TRUE 0.997 -7.000 0.914 NA   NA
 5817774 5817775 PLES_08681 PLES_08691     TRUE 0.661 32.000 0.031 NA   NA
 5817775 5817776 PLES_08691 PLES_08701     FALSE 0.306 130.000 0.069 1.000   NA
 5817776 5817777 PLES_08701 PLES_08711     TRUE 0.999 -3.000 0.897 1.000 Y NA
 5817779 5817780 PLES_08731 PLES_08741     FALSE 0.280 155.000 0.118 1.000 N NA
 5817780 5817781 PLES_08741 PLES_08751     FALSE 0.154 85.000 0.000 1.000 N NA
 5817781 5817782 PLES_08751 PLES_08761     TRUE 0.982 15.000 0.500 0.046 N NA
 5817782 5817783 PLES_08761 PLES_08771     TRUE 0.993 -3.000 0.417 1.000 N NA
 5817783 5817784 PLES_08771 PLES_08781     TRUE 0.785 71.000 0.333 1.000   NA
 5817785 5817786 PLES_08791 PLES_08801     FALSE 0.250 48.000 0.000 NA N NA
 5817787 5817788 PLES_08811 PLES_08821     TRUE 0.492 29.000 0.000 1.000   NA
 5817790 5817791 PLES_08841 PLES_08851 hpaC hpaA TRUE 0.929 29.000 0.097 0.001   NA
 5817791 5817792 PLES_08851 PLES_08861 hpaA   FALSE 0.060 166.000 0.000 NA   NA
 5817792 5817793 PLES_08861 PLES_08871     FALSE 0.032 212.000 0.000 NA   NA
 5817793 5817794 PLES_08871 PLES_08881     TRUE 0.960 -3.000 0.033 1.000 N NA
 5817794 5817795 PLES_08881 PLES_08891     TRUE 0.878 9.000 0.033 NA   NA
 5817796 5817797 PLES_08901 PLES_08911 cupB1 cupB2 TRUE 0.988 31.000 0.800 1.000 Y NA
 5817797 5817798 PLES_08911 PLES_08921 cupB2 cupB3 FALSE 0.388 316.000 0.400 1.000 Y NA
 5817798 5817799 PLES_08921 PLES_08931 cupB3 cupB4 TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 5817799 5817800 PLES_08931 PLES_08941 cupB4 cupB5 TRUE 0.616 88.000 0.000 1.000 Y NA
 5817800 5817801 PLES_08941 PLES_08951 cupB5 cupB6 TRUE 0.553 100.000 0.000 1.000 Y NA
 5817801 5817802 PLES_08951 PLES_08961 cupB6   FALSE 0.004 645.000 0.000 1.000 N NA
 5817803 5817804 PLES_08971 PLES_08981     FALSE 0.224 74.000 0.000 1.000   NA
 5817804 5817805 PLES_08981 PLES_08991     FALSE 0.028 210.000 0.000 1.000 N NA
 5817805 5817806 PLES_08991 PLES_09001     TRUE 0.993 -3.000 0.357 NA   NA
 5817809 5817810 PLES_09031 PLES_09041     FALSE 0.051 168.000 0.000 1.000 N NA
 5817810 5817811 PLES_09041 PLES_09051     TRUE 0.997 -25.000 0.864 NA   NA
 5817811 5817812 PLES_09051 PLES_09061     FALSE 0.065 161.000 0.000 NA   NA
 5817812 5817813 PLES_09061 PLES_09071     FALSE 0.015 269.000 0.000 1.000 N NA
 5817813 5817814 PLES_09071 PLES_09081     TRUE 0.987 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5817815 5817816 PLES_09091 PLES_09101   oprG FALSE 0.175 84.000 0.000 NA   NA
 5817816 5817817 PLES_09101 PLES_09111 oprG   FALSE 0.237 148.000 0.060 NA   NA
 5817817 5817818 PLES_09111 PLES_09121     TRUE 0.875 18.000 0.114 NA   NA
 5817818 5817819 PLES_09121 PLES_09131     TRUE 0.997 3.000 0.605 NA Y NA
 5817819 5817820 PLES_09131 PLES_09141     TRUE 0.723 89.000 0.336 NA   NA
 5817822 5817823 PLES_09161 PLES_09171     FALSE 0.384 72.000 0.022 1.000   NA
 5817823 5817824 PLES_09171 PLES_09181     TRUE 0.688 114.000 0.462 NA   NA
 5817825 5817826 PLES_09191 PLES_09201   ribD TRUE 0.990 -3.000 0.277 NA N NA
 5817826 5817827 PLES_09201 PLES_09211 ribD ribC FALSE 0.290 428.000 0.456 1.000 Y NA
 5817827 5817828 PLES_09211 PLES_09221 ribC ribB TRUE 0.940 27.000 0.065 1.000 Y NA
 5817828 5817829 PLES_09221 PLES_09231 ribB ribE TRUE 0.819 118.000 0.049 0.001 Y NA
 5817829 5817830 PLES_09231 PLES_09241 ribE nusB TRUE 0.992 -3.000 0.347 1.000 N NA
 5817830 5817831 PLES_09241 PLES_09251 nusB thiL TRUE 0.916 19.000 0.225 1.000 N NA
 5817831 5817832 PLES_09251 PLES_09261 thiL pgpA TRUE 0.987 -7.000 0.206 1.000 N NA
 5817832 5817833 PLES_09261 PLES_09271 pgpA   TRUE 0.836 9.000 0.018 1.000 N NA
 5817833 5817834 PLES_09271 PLES_09281     TRUE 0.950 3.000 0.075 1.000   NA
 5817834 5817835 PLES_09281 PLES_09291   ribA FALSE 0.233 131.000 0.035 1.000   NA
 5817835 5817836 PLES_09291 PLES_09301 ribA   TRUE 0.970 -3.000 0.050 NA   NA
 5817836 5817837 PLES_09301 PLES_09311     TRUE 0.961 0.000 0.066 NA   NA
 5817838 5817839 PLES_09321 PLES_09331 dxs ispA TRUE 0.819 109.000 0.246 1.000 Y NA
 5817839 5817840 PLES_09331 PLES_09341 ispA xseB TRUE 0.986 -3.000 0.177 1.000 N NA
 5817842 5817843 PLES_09361 PLES_09371     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5817843 5817844 PLES_09371 PLES_09381     TRUE 0.977 10.000 0.435 NA   NA
 5817844 5817845 PLES_09381 PLES_09391     TRUE 0.994 -3.000 0.426 1.000   NA
 5817845 5817846 PLES_09391 PLES_09401     FALSE 0.023 405.000 0.000 0.094 N NA
 5817846 5817847 PLES_09401 PLES_09411     TRUE 0.945 19.000 0.345 NA   NA
 5817847 5817848 PLES_09411 PLES_09421   aqpZ FALSE 0.060 166.000 0.000 NA   NA
 5817848 5817849 PLES_09421 PLES_09431 aqpZ   FALSE 0.010 347.000 0.000 NA   NA
 5817851 5817852 PLES_09451 PLES_09461 ppa   FALSE 0.334 80.000 0.022 NA   NA
 5817852 5817853 PLES_09461 PLES_09471     TRUE 0.914 3.000 0.030 NA   NA
 5817853 5817854 PLES_09471 PLES_09481     FALSE 0.004 974.000 0.000 NA   NA
 5817854 5817855 PLES_09481 PLES_09491     FALSE 0.006 475.000 0.000 NA   NA
 5817855 5817856 PLES_09491 PLES_09501     FALSE 0.332 50.000 0.000 1.000   NA
 5817856 5817857 PLES_09501 PLES_09511     FALSE 0.192 163.000 0.047 1.000   NA
 5817857 5817858 PLES_09511 PLES_09521   eutB TRUE 0.998 11.000 0.859 0.000 Y NA
 5817858 5817859 PLES_09521 PLES_09531 eutB   TRUE 0.947 59.000 0.407 1.000 Y NA
 5817859 5817860 PLES_09531 PLES_09541     FALSE 0.028 210.000 0.000 1.000 N NA
 5817861 5817862 PLES_09551 PLES_09561   mpl FALSE 0.252 158.000 0.020 0.093 N NA
 5817862 5817863 PLES_09561 PLES_09571 mpl   TRUE 0.961 9.000 0.235 1.000 N NA
 5817863 5817864 PLES_09571 PLES_09581     TRUE 0.951 2.000 0.070 NA   NA
 5817865 5817866 PLES_09591 PLES_09601     TRUE 0.628 47.000 0.056 NA   NA
 5817866 5817867 PLES_09601 PLES_09611     FALSE 0.315 191.000 0.243 1.000   NA
 5817868 5817869 PLES_09621 PLES_09631     TRUE 0.995 0.000 0.818 NA   NA
 5817869 5817870 PLES_09631 PLES_09641     TRUE 0.740 20.000 0.027 NA   NA
 5817871 5817872 PLES_09651 PLES_09661     TRUE 0.957 -3.000 0.019 1.000   NA
 5817875 5817876 PLES_09691 PLES_09701 proA nadD TRUE 0.977 0.000 0.170 1.000 N NA
 5817876 5817877 PLES_09701 PLES_09711 nadD   TRUE 0.906 23.000 0.221 NA   NA
 5817877 5817878 PLES_09711 PLES_09721     TRUE 0.972 8.000 0.307 NA   NA
 5817878 5817879 PLES_09721 PLES_09731   pbpA TRUE 0.640 13.000 0.000 NA   NA
 5817879 5817880 PLES_09731 PLES_09741 pbpA rodA FALSE 0.398 32.000 0.000 1.000 N NA
 5817880 5817881 PLES_09741 PLES_09751 rodA sltB1 TRUE 0.922 9.000 0.096 NA N NA
 5817881 5817882 PLES_09751 PLES_09761 sltB1   TRUE 0.997 -3.000 0.298 NA Y NA
 5817882 5817883 PLES_09761 PLES_09771   dacC TRUE 0.907 66.000 0.241 NA Y NA
 5817883 5817884 PLES_09771 PLES_09781 dacC   TRUE 0.527 71.000 0.074 NA   NA
 5817884 5817885 PLES_09781 PLES_09791   lipB TRUE 0.982 0.000 0.219 NA   NA
 5817885 5817886 PLES_09791 PLES_09801 lipB lis TRUE 0.999 -3.000 0.319 0.000 Y NA
 5817891 5817892 PLES_09851 PLES_09861   holA FALSE 0.234 92.000 0.007 NA   NA
 5817892 5817893 PLES_09861 PLES_09871 holA   TRUE 0.821 38.000 0.199 NA N NA
 5817893 5817894 PLES_09871 PLES_09881   leuS TRUE 0.664 67.000 0.182 NA N NA
 5817895 5817896 PLES_09891 PLES_09901     TRUE 0.811 73.000 0.435 NA   NA
 5817897 5817898 PLES_09911 PLES_09921 lnt   TRUE 0.486 186.000 0.557 NA N NA
 5817898 5817899 PLES_09921 PLES_09931     TRUE 0.984 -3.000 0.150 NA   NA
 5817899 5817900 PLES_09931 PLES_09941     TRUE 0.994 -10.000 0.457 NA   NA
 5817900 5817901 PLES_09941 PLES_09951     FALSE 0.341 169.000 0.220 1.000 N NA
 5817903 5817904 PLES_09971 PLES_09981   hemL FALSE 0.061 209.000 0.008 1.000   NA
 5817904 5817905 PLES_09981 PLES_09991 hemL thiE TRUE 0.944 38.000 0.173 1.000 Y NA
 5817905 5817906 PLES_09991 PLES_10001 thiE thiD TRUE 0.986 11.000 0.209 1.000 Y NA
 5817907 5817908 PLES_10011 PLES_10021 ladS   FALSE 0.262 106.000 0.036 1.000 N NA
 5817908 5817909 PLES_10021 PLES_10031     TRUE 0.982 -3.000 0.127 1.000 N NA
 5817909 5817910 PLES_10031 PLES_10041     TRUE 0.588 12.000 0.000 NA N NA
 5817910 5817911 PLES_10041 PLES_10051   amn FALSE 0.212 55.000 0.000 NA N NA
 5817914 5817915 PLES_10081 PLES_10091     FALSE 0.336 101.000 0.051 NA   NA
 5817915 5817916 PLES_10091 PLES_10101     FALSE 0.142 202.000 0.077 NA   NA
 5817916 5817917 PLES_10101 PLES_10111     FALSE 0.009 382.000 0.000 NA   NA
 5817917 5817918 PLES_10111 PLES_10121     TRUE 0.893 -43.000 0.000 NA   NA
 5817918 5817919 PLES_10121 PLES_10131     FALSE 0.334 89.000 0.031 NA   NA
 5817921 5817922 PLES_10151 PLES_10161     TRUE 0.504 24.000 0.000 NA   NA
 5817922 5817923 PLES_10161 PLES_10171     FALSE 0.297 90.000 0.024 NA   NA
 5817925 5817926 PLES_10191 PLES_10201     TRUE 0.643 67.000 0.143 NA   NA
 5817926 5817927 PLES_10201 PLES_10211     FALSE 0.175 84.000 0.000 NA   NA
 5817927 5817928 PLES_10211 PLES_10221     FALSE 0.059 158.000 0.000 1.000 N NA
 5817929 5817930 PLES_10231 PLES_10241     TRUE 0.480 66.000 0.043 NA   NA
 5817930 5817931 PLES_10241 PLES_10251     FALSE 0.191 78.000 0.000 NA   NA
 5817932 5817933 PLES_10261 PLES_10271   rocA1 FALSE 0.009 360.000 0.000 NA   NA
 5817933 5817934 PLES_10271 PLES_10281 rocA1   FALSE 0.213 69.000 0.000 NA   NA
 5817935 5817936 PLES_10291 PLES_10301 rocR two-compo TRUE 0.719 102.000 0.000 0.021 Y NA
 5817936 5817937 PLES_10301 PLES_10311 two-compo   FALSE 0.027 215.000 0.000 1.000 N NA
 5817937 5817938 PLES_10311 PLES_10321     TRUE 0.958 27.000 0.014 0.008 Y NA
 5817938 5817939 PLES_10321 PLES_10331     TRUE 0.829 3.000 0.000 1.000   NA
 5817939 5817940 PLES_10331 PLES_10341   tesB FALSE 0.449 34.000 0.000 1.000   NA
 5817940 5817941 PLES_10341 PLES_10351 tesB   TRUE 0.973 -3.000 0.052 1.000   NA
 5817943 5817944 PLES_10371 PLES_10381     FALSE 0.040 205.000 0.000 1.000   NA
 5817944 5817945 PLES_10381 PLES_10391     TRUE 0.858 65.000 0.093 1.000 Y NA
 5817945 5817946 PLES_10391 PLES_10401     TRUE 0.999 -10.000 0.728 1.000 Y NA
 5817946 5817947 PLES_10401 PLES_10411   tauD TRUE 0.526 107.000 0.214 1.000 N NA
 5817947 5817948 PLES_10411 PLES_10421 tauD   FALSE 0.063 163.000 0.000 NA   NA
 5817949 5817950 PLES_10431 PLES_10441     FALSE 0.038 190.000 0.000 1.000 N NA
 5817950 5817951 PLES_10441 PLES_10451     FALSE 0.372 175.000 0.294 NA N NA
 5817951 5817952 PLES_10451 PLES_10461     FALSE 0.035 204.000 0.000 NA   NA
 5817953 5817954 PLES_10471 PLES_10481 cioA cioB TRUE 0.983 4.000 0.000 0.069 Y NA
 5817954 5817955 PLES_10481 PLES_10491 cioB   TRUE 0.621 14.000 0.000 NA   NA
 5817959 5817960 PLES_10531 PLES_10541     FALSE 0.032 212.000 0.000 NA   NA
 5817960 5817961 PLES_10541 PLES_10551     TRUE 0.923 61.000 0.889 NA   NA
 5817961 5817962 PLES_10551 PLES_10561     FALSE 0.142 333.000 0.375 NA   NA
 5817964 5817965 PLES_10581 PLES_10591   moaC FALSE 0.036 249.000 0.013 1.000 N NA
 5817965 5817966 PLES_10591 PLES_10601 moaC moaD TRUE 0.998 -3.000 0.175 0.002 Y NA
 5817966 5817967 PLES_10601 PLES_10611 moaD moaE TRUE 0.998 5.000 0.501 0.002 Y NA
 5817967 5817968 PLES_10611 PLES_10621 moaE moaB1 TRUE 0.802 102.000 0.018 0.002 Y NA
 5817968 5817969 PLES_10621 PLES_10631 moaB1 moeA1 TRUE 0.998 -3.000 0.073 0.002 Y NA
 5817969 5817970 PLES_10631 PLES_10641 moeA1   FALSE 0.096 115.000 0.000 1.000 N NA
 5817970 5817971 PLES_10641 PLES_10651     TRUE 0.998 12.000 0.948 0.003 Y NA
 5817971 5817972 PLES_10651 PLES_10661     TRUE 0.989 -6.000 0.235 1.000 N NA
 5817972 5817973 PLES_10661 PLES_10671     FALSE 0.018 252.000 0.000 1.000 N NA
 5817973 5817974 PLES_10671 PLES_10681     FALSE 0.393 37.000 0.000 NA   NA
 5817975 5817976 PLES_10691 PLES_10701     TRUE 0.995 -3.000 0.571 NA   NA
 5817976 5817977 PLES_10701 PLES_10711     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817977 5817978 PLES_10711 PLES_10721     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5817978 5817979 PLES_10721 PLES_10731     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817979 5817980 PLES_10731 PLES_10741   prfC FALSE 0.008 385.000 0.000 NA   NA
 5817982 5817983 PLES_10761 PLES_10771 fecA   TRUE 0.891 95.000 0.400 NA Y NA
 5817983 5817984 PLES_10771 PLES_10781     TRUE 0.990 -3.000 0.286 NA N NA
 5817984 5817985 PLES_10781 PLES_10791     TRUE 0.720 101.000 0.000 0.031 Y NA
 5817987 5817988 PLES_10811 PLES_10821     FALSE 0.127 95.000 0.000 1.000 N NA
 5817989 5817990 PLES_10831 PLES_10841     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5817990 5817991 PLES_10841 PLES_10851     FALSE 0.026 227.000 0.000 NA   NA
 5817992 5817993 PLES_10861 PLES_10871     TRUE 0.995 13.000 0.903 1.000 Y NA
 5817993 5817994 PLES_10871 PLES_10881     TRUE 0.993 0.000 0.313 0.058 N NA
 5817994 5817995 PLES_10881 PLES_10891     TRUE 0.994 0.000 0.403 0.058 N NA
 5817997 5817998 PLES_10911 PLES_10921     FALSE 0.445 30.000 0.000 NA   NA
 5817998 5817999 PLES_10921 PLES_10931     FALSE 0.107 105.000 0.000 1.000 N NA
 5817999 5818000 PLES_10931 PLES_10941     FALSE 0.142 95.000 0.000 NA   NA
 5818000 5818001 PLES_10941 PLES_10951     TRUE 0.534 21.000 0.000 NA   NA
 5818001 5818002 PLES_10951 PLES_10961     FALSE 0.415 87.000 0.000 0.079   NA
 5818002 5818003 PLES_10961 PLES_10971     TRUE 0.594 16.000 0.000 NA   NA
 5818003 5818004 PLES_10971 PLES_10981     FALSE 0.054 172.000 0.000 NA   NA
 5818004 5818005 PLES_10981 PLES_10991   narL FALSE 0.172 85.000 0.000 NA   NA
 5818005 5818006 PLES_10991 PLES_11001 narL narX TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.027 Y NA
 5818007 5818008 PLES_11011 PLES_11021 narK1 narK2 TRUE 0.938 12.000 0.000 NA Y NA
 5818008 5818009 PLES_11021 PLES_11031 narK2 narG FALSE 0.175 76.000 0.000 1.000 N NA
 5818009 5818010 PLES_11031 PLES_11041 narG narH TRUE 0.998 12.000 0.727 0.000 Y NA
 5818010 5818011 PLES_11041 PLES_11051 narH narJ TRUE 0.999 6.000 0.818 0.001 Y NA
 5818011 5818012 PLES_11051 PLES_11061 narJ narI TRUE 0.999 3.000 0.818 0.001 Y NA
 5818012 5818013 PLES_11061 PLES_11071 narI   TRUE 0.626 55.000 0.091 1.000 N NA
 5818013 5818014 PLES_11071 PLES_11081   moaA1 TRUE 0.511 57.000 0.045 1.000 N NA
 5818014 5818015 PLES_11081 PLES_11091 moaA1   FALSE 0.004 638.000 0.000 1.000 N NA
 5818016 5818017 PLES_11101 PLES_11111     TRUE 0.814 63.000 0.333 1.000   NA
 5818017 5818018 PLES_11111 PLES_11121     TRUE 0.977 23.000 0.286 1.000 Y NA
 5818018 5818019 PLES_11121 PLES_11131   rhl FALSE 0.118 161.000 0.019 1.000 N NA
 5818022 5818023 PLES_11161 PLES_11171   pcs FALSE 0.099 112.000 0.000 1.000 N NA
 5818023 5818024 PLES_11171 PLES_11181 pcs   FALSE 0.359 71.000 0.020 NA   NA
 5818024 5818025 PLES_11181 PLES_11191     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 5818025 5818026 PLES_11191 PLES_11201     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA N NA
 5818026 5818027 PLES_11201 PLES_11211     TRUE 0.492 29.000 0.000 1.000   NA
 5818027 5818028 PLES_11211 PLES_11221     FALSE 0.116 121.000 0.000 1.000   NA
 5818028 5818029 PLES_11221 PLES_11231     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5818029 5818030 PLES_11231 PLES_11241     FALSE 0.161 89.000 0.000 NA   NA
 5818031 5818032 PLES_11251 PLES_11261     FALSE 0.149 93.000 0.000 NA   NA
 5818032 5818033 PLES_11261 PLES_11271     FALSE 0.199 74.000 0.000 NA   NA
 5818037 5818038 PLES_11311 PLES_11321     TRUE 0.504 24.000 0.000 NA   NA
 5818040 5818041 PLES_11341 PLES_11351     FALSE 0.261 92.000 0.010 1.000   NA
 5818041 5818042 PLES_11351 PLES_11361     FALSE 0.118 119.000 0.000 1.000   NA
 5818042 5818043 PLES_11361 PLES_11371     TRUE 0.993 3.000 0.771 1.000   NA
 5818043 5818044 PLES_11371 PLES_11381     TRUE 0.823 84.000 0.562 NA   NA
 5818046 5818047 PLES_11401 PLES_11411 valS   FALSE 0.167 121.000 0.009 NA   NA
 5818047 5818048 PLES_11411 PLES_11421   holC TRUE 0.844 12.000 0.034 NA   NA
 5818048 5818049 PLES_11421 PLES_11431 holC pepA TRUE 0.994 -3.000 0.494 1.000 N NA
 5818050 5818051 PLES_11441 PLES_11451     FALSE 0.198 84.000 0.000 1.000   NA
 5818051 5818052 PLES_11451 PLES_11461     FALSE 0.048 192.000 0.000 1.000   NA
 5818052 5818053 PLES_11461 PLES_11471     TRUE 0.998 -7.000 0.631 0.071   NA
 5818057 5818058 PLES_11501 PLES_11511 queA tgt TRUE 0.995 13.000 0.360 0.000 Y NA
 5818058 5818059 PLES_11511 PLES_11521 tgt   TRUE 0.857 44.000 0.325 NA N NA
 5818059 5818060 PLES_11521 PLES_11531   secD TRUE 0.803 60.000 0.031 NA Y NA
 5818060 5818061 PLES_11531 PLES_11541 secD secF TRUE 0.993 11.000 0.171 0.001 Y NA
 5818061 5818062 PLES_11541 PLES_11551 secF   FALSE 0.151 184.000 0.050 1.000   NA
 5818064 5818065 PLES_11571 PLES_11581   cysE TRUE 0.981 0.000 0.208 1.000 N NA
 5818065 5818066 PLES_11581 PLES_11591 cysE   TRUE 0.470 145.000 0.271 1.000 N NA
 5818066 5818067 PLES_11591 PLES_11601   iscS TRUE 0.926 30.000 0.424 1.000 N NA
 5818067 5818068 PLES_11601 PLES_11611 iscS iscU FALSE 0.369 36.000 0.000 1.000 N NA
 5818068 5818069 PLES_11611 PLES_11621 iscU iscA TRUE 0.843 28.000 0.000 0.001   NA
 5818069 5818070 PLES_11621 PLES_11631 iscA hscB TRUE 0.983 8.000 0.500 1.000   NA
 5818070 5818071 PLES_11631 PLES_11641 hscB hscA TRUE 0.978 43.000 0.634 1.000 Y NA
 5818071 5818072 PLES_11641 PLES_11651 hscA fdx2 TRUE 0.989 7.000 0.794 1.000 N NA
 5818072 5818073 PLES_11651 PLES_11661 fdx2   TRUE 0.960 27.000 0.625 1.000   NA
 5818073 5818074 PLES_11661 PLES_11671   ndk FALSE 0.048 244.000 0.017 1.000   NA
 5818074 5818075 PLES_11671 PLES_11681 ndk   TRUE 0.877 25.000 0.156 1.000   NA
 5818075 5818076 PLES_11681 PLES_11691   pilF TRUE 0.865 18.000 0.086 1.000   NA
 5818076 5818077 PLES_11691 PLES_11701 pilF   TRUE 0.988 -3.000 0.204 1.000   NA
 5818077 5818078 PLES_11701 PLES_11711   gcpE TRUE 0.990 -3.000 0.233 1.000   NA
 5818078 5818079 PLES_11711 PLES_11721 gcpE hisS TRUE 0.910 19.000 0.207 1.000 N NA
 5818079 5818080 PLES_11721 PLES_11731 hisS   TRUE 0.910 27.000 0.259 1.000   NA
 5818080 5818081 PLES_11731 PLES_11741     TRUE 0.989 2.000 0.492 1.000   NA
 5818081 5818082 PLES_11741 PLES_11751     TRUE 0.676 78.000 0.203 1.000   NA
 5818082 5818083 PLES_11751 PLES_11761     FALSE 0.025 297.000 0.006 1.000   NA
 5818083 5818084 PLES_11761 PLES_11771     TRUE 0.980 -12.000 0.099 1.000   NA
 5818084 5818085 PLES_11771 PLES_11781     FALSE 0.088 134.000 0.000 NA   NA
 5818087 5818088 PLES_11801 PLES_11811     FALSE 0.274 54.000 0.000 NA   NA
 5818090 5818091 PLES_11831 PLES_11841   oprC FALSE 0.102 121.000 0.000 NA   NA
 5818091 5818092 PLES_11841 PLES_11851 oprC   FALSE 0.451 65.000 0.029 1.000   NA
 5818093 5818094 PLES_11861 PLES_11871     FALSE 0.168 86.000 0.000 NA   NA
 5818095 5818096 PLES_11881 PLES_11891     FALSE 0.092 130.000 0.000 NA   NA
 5818096 5818097 PLES_11891 PLES_11901     FALSE 0.259 57.000 0.000 NA   NA
 5818100 5818101 PLES_11931 PLES_11941     TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA Y NA
 5818101 5818102 PLES_11941 PLES_11951     TRUE 0.938 78.000 0.533 NA Y NA
 5818102 5818103 PLES_11951 PLES_11961     TRUE 0.483 152.000 0.333 NA N NA
 5818103 5818104 PLES_11961 PLES_11971   xseA TRUE 0.724 7.000 0.000 1.000 N NA
 5818104 5818105 PLES_11971 PLES_11981 xseA   TRUE 0.497 37.000 0.006 1.000 N NA
 5818107 5818108 PLES_12001 PLES_12011     TRUE 0.861 30.000 0.208 NA N NA
 5818108 5818109 PLES_12011 PLES_12021     TRUE 0.934 13.000 0.214 NA N NA
 5818109 5818110 PLES_12021 PLES_12031     FALSE 0.321 135.000 0.120 NA N NA
 5818111 5818112 PLES_12041 PLES_12051 guaB guaA TRUE 0.944 80.000 0.190 0.000 Y NA
 5818112 5818113 PLES_12051 PLES_12061 guaA   FALSE 0.051 188.000 0.000 1.000   NA
 5818113 5818114 PLES_12061 PLES_12071     FALSE 0.005 739.000 0.000 1.000   NA
 5818114 5818115 PLES_12071 PLES_12081     FALSE 0.072 152.000 0.000 NA   NA
 5818117 5818118 PLES_12101 PLES_12111     FALSE 0.222 163.000 0.000 0.045   NA
 5818118 5818119 PLES_12111 PLES_12121     TRUE 0.965 -9.000 0.045 1.000 N NA
 5818119 5818120 PLES_12121 PLES_12131     FALSE 0.006 389.000 0.000 NA N NA
 5818120 5818121 PLES_12131 PLES_12141     FALSE 0.097 126.000 0.000 NA   NA
 5818123 5818124 PLES_12161 PLES_12171 purL   TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 5818124 5818125 PLES_12171 PLES_12181     FALSE 0.049 180.000 0.000 NA   NA
 5818126 5818127 PLES_12191 PLES_12201     TRUE 0.988 25.000 0.258 0.002 Y NA
 5818127 5818128 PLES_12201 PLES_12211     TRUE 0.915 17.000 0.200 1.000 N NA
 5818128 5818129 PLES_12211 PLES_12221     TRUE 0.983 -3.000 0.146 1.000 N NA
 5818129 5818130 PLES_12221 PLES_12231     TRUE 0.893 17.000 0.146 1.000 N NA
 5818130 5818131 PLES_12231 PLES_12241     FALSE 0.022 243.000 0.000 NA   NA
 5818131 5818132 PLES_12241 PLES_12251     TRUE 0.550 63.000 0.065 NA   NA
 5818133 5818134 PLES_12261 PLES_12271     TRUE 0.746 38.000 0.078 1.000   NA
 5818134 5818135 PLES_12271 PLES_12281     TRUE 0.974 -3.000 0.062 NA   NA
 5818135 5818136 PLES_12281 PLES_12291   purT TRUE 0.806 38.000 0.154 NA   NA
 5818136 5818137 PLES_12291 PLES_12301 purT   TRUE 0.923 2.000 0.033 1.000 N NA
 5818138 5818139 PLES_12311 PLES_12321     FALSE 0.018 304.000 0.008 NA N NA
 5818139 5818140 PLES_12321 PLES_12331     TRUE 0.961 13.000 0.349 NA   NA
 5818141 5818142 PLES_12341 PLES_12351 ffh rpsP FALSE 0.314 210.000 0.361 1.000 N NA
 5818142 5818143 PLES_12351 PLES_12361 rpsP rimM TRUE 0.993 16.000 0.342 0.009 Y NA
 5818143 5818144 PLES_12361 PLES_12371 rimM trmD TRUE 0.996 7.000 0.672 1.000 Y NA
 5818144 5818145 PLES_12371 PLES_12381 trmD rplS TRUE 0.975 42.000 0.567 1.000 Y NA
 5818145 5818146 PLES_12381 PLES_12391 rplS   FALSE 0.091 152.000 0.004 NA N NA
 5818147 5818148 PLES_12401 PLES_12411     FALSE 0.110 113.000 0.000 NA   NA
 5818149 5818150 PLES_12421 PLES_12431 xerD dsbC FALSE 0.189 127.000 0.026 1.000 N NA
 5818150 5818151 PLES_12431 PLES_12441 dsbC hom FALSE 0.070 214.000 0.029 1.000 N NA
 5818151 5818152 PLES_12441 PLES_12451 hom thrC TRUE 0.897 53.000 0.125 1.000 Y NA
 5818155 5818156 PLES_12481 PLES_12491     TRUE 0.504 24.000 0.000 NA   NA
 5818157 5818158 PLES_12501 PLES_12511     TRUE 0.983 15.000 0.911 NA   NA
 5818158 5818159 PLES_12511 PLES_12521     TRUE 0.653 56.000 0.107 NA   NA
 5818159 5818160 PLES_12521 PLES_12531     TRUE 0.945 36.000 0.644 NA   NA
 5818160 5818161 PLES_12531 PLES_12541     TRUE 0.698 150.000 0.711 NA   NA
 5818161 5818162 PLES_12541 PLES_12551     TRUE 0.848 19.000 0.073 1.000   NA
 5818162 5818163 PLES_12551 PLES_12561     FALSE 0.133 107.000 0.000 1.000   NA
 5818163 5818164 PLES_12561 PLES_12571   recJ TRUE 0.507 44.000 0.011 1.000   NA
 5818164 5818165 PLES_12571 PLES_12581 recJ lasB FALSE 0.013 287.000 0.000 1.000 N NA
 5818165 5818166 PLES_12581 PLES_12591 lasB   FALSE 0.050 169.000 0.000 1.000 N NA
 5818166 5818167 PLES_12591 PLES_12601     FALSE 0.044 189.000 0.000 NA   NA
 5818169 5818170 PLES_12621 PLES_12631     TRUE 0.741 8.000 0.000 NA   NA
 5818170 5818171 PLES_12631 PLES_12641     FALSE 0.077 148.000 0.000 NA   NA
 5818174 5818175 PLES_12671 PLES_12681     FALSE 0.102 121.000 0.000 NA   NA
 5818175 5818176 PLES_12681 PLES_12691   spdH FALSE 0.014 324.000 0.000 1.000   NA
 5818179 5818180 PLES_12721 PLES_12731     FALSE 0.375 109.000 0.094 1.000 N NA
 5818180 5818181 PLES_12731 PLES_12741   wspA FALSE 0.016 267.000 0.000 1.000 N NA
 5818181 5818182 PLES_12741 PLES_12751 wspA wspB TRUE 0.998 5.000 0.600 0.010 Y NA
 5818182 5818183 PLES_12751 PLES_12761 wspB wspC TRUE 0.999 -3.000 0.635 1.000 Y NA
 5818183 5818184 PLES_12761 PLES_12771 wspC wspD TRUE 0.999 -7.000 0.558 1.000 Y NA
 5818184 5818185 PLES_12771 PLES_12781 wspD wspE FALSE 0.004 761.000 0.000 NA   NA
 5818185 5818186 PLES_12781 PLES_12791 wspE wspF TRUE 0.479 27.000 0.000 NA   NA
 5818186 5818187 PLES_12791 PLES_12801 wspF wspF TRUE 0.498 25.000 0.000 NA   NA
 5818187 5818188 PLES_12801 PLES_12811 wspF wspR FALSE 0.116 108.000 0.000 NA   NA
 5818188 5818189 PLES_12811 PLES_12821 wspR   FALSE 0.019 307.000 0.002 1.000 N NA
 5818191 5818192 PLES_12841 PLES_12851 lysS   FALSE 0.063 212.000 0.012 1.000   NA
 5818192 5818193 PLES_12851 PLES_12861     TRUE 0.658 97.000 0.304 NA   NA
 5818193 5818194 PLES_12861 PLES_12871     TRUE 0.933 9.000 0.104 NA   NA
 5818194 5818195 PLES_12871 PLES_12881     FALSE 0.344 69.000 0.015 NA   NA
 5818195 5818196 PLES_12881 PLES_12891     TRUE 0.949 -3.000 0.015 NA   NA
 5818196 5818197 PLES_12891 PLES_12901     TRUE 0.986 -3.000 0.174 NA   NA
 5818197 5818198 PLES_12901 PLES_12911     TRUE 0.954 -3.000 0.020 NA   NA
 5818199 5818200 PLES_12921 PLES_12931     TRUE 0.855 49.000 0.333 NA   NA
 5818200 5818201 PLES_12931 PLES_12941     FALSE 0.009 380.000 0.000 NA   NA
 5818204 5818205 PLES_12971 PLES_12981 ppc adk FALSE 0.057 161.000 0.000 1.000 N NA
 5818205 5818206 PLES_12981 PLES_12991 adk   FALSE 0.212 104.000 0.019 1.000 N NA
 5818206 5818207 PLES_12991 PLES_13001     FALSE 0.301 74.000 0.008 NA   NA
 5818207 5818208 PLES_13001 PLES_13011     TRUE 0.840 19.000 0.074 NA   NA
 5818208 5818209 PLES_13011 PLES_13021     FALSE 0.419 73.000 0.037 NA   NA
 5818209 5818210 PLES_13021 PLES_13031     TRUE 0.941 5.000 0.090 NA   NA
 5818210 5818211 PLES_13031 PLES_13041     FALSE 0.418 56.000 0.017 NA   NA
 5818211 5818212 PLES_13041 PLES_13051     FALSE 0.456 29.000 0.000 NA   NA
 5818214 5818215 PLES_13071 PLES_13081     TRUE 0.977 5.000 0.354 NA N NA
 5818216 5818217 PLES_13091 PLES_13101     FALSE 0.220 137.000 0.042 NA   NA
 5818217 5818218 PLES_13101 PLES_13111   plsB FALSE 0.229 144.000 0.052 NA   NA
 5818219 5818220 PLES_13121 PLES_13131     TRUE 0.994 -3.000 0.426 NA   NA
 5818220 5818221 PLES_13131 PLES_13141     TRUE 0.974 11.000 0.435 NA   NA
 5818221 5818222 PLES_13141 PLES_13151     TRUE 0.907 4.000 0.032 NA   NA
 5818223 5818224 PLES_13161 PLES_13171     TRUE 0.981 -3.000 0.116 NA   NA
 5818224 5818225 PLES_13171 PLES_13181   dapD TRUE 0.853 95.000 0.244 1.000 Y NA
 5818225 5818226 PLES_13181 PLES_13191 dapD   TRUE 0.868 30.000 0.000 1.000 Y NA
 5818226 5818227 PLES_13191 PLES_13201     TRUE 0.609 13.000 0.000 1.000 N NA
 5818227 5818228 PLES_13201 PLES_13211     FALSE 0.347 67.000 0.006 1.000   NA
 5818228 5818229 PLES_13211 PLES_13221     TRUE 0.993 -19.000 0.130 0.006   NA
 5818229 5818230 PLES_13221 PLES_13231     FALSE 0.030 216.000 0.000 NA   NA
 5818230 5818231 PLES_13231 PLES_13241     FALSE 0.006 455.000 0.000 NA   NA
 5818231 5818232 PLES_13241 PLES_13251     FALSE 0.199 74.000 0.000 NA   NA
 5818232 5818233 PLES_13251 PLES_13261     FALSE 0.133 99.000 0.000 NA   NA
 5818233 5818234 PLES_13261 PLES_13271     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818234 5818235 PLES_13271 PLES_13281     TRUE 0.893 -36.000 0.000 NA   NA
 5818235 5818236 PLES_13281 PLES_13291     FALSE 0.178 83.000 0.000 NA   NA
 5818236 5818237 PLES_13291 PLES_13301     FALSE 0.152 92.000 0.000 NA   NA
 5818237 5818238 PLES_13301 PLES_13311     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818238 5818239 PLES_13311 PLES_13321     FALSE 0.233 65.000 0.000 NA   NA
 5818239 5818240 PLES_13321 PLES_13322     FALSE 0.033 208.000 0.000 NA   NA
 5818240 5818241 PLES_13322 PLES_13331     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5818241 5818242 PLES_13331 PLES_13341     FALSE 0.095 310.000 0.000 1.000 Y NA
 5818242 5818243 PLES_13341 PLES_13351     FALSE 0.026 227.000 0.000 NA   NA
 5818245 5818246 PLES_13371 PLES_13381     FALSE 0.008 404.000 0.000 NA   NA
 5818247 5818248 PLES_13391 PLES_13401     FALSE 0.261 65.000 0.000 1.000   NA
 5818248 5818249 PLES_13401 PLES_13411     TRUE 0.899 -13.000 0.000 NA   NA
 5818249 5818250 PLES_13411 PLES_13421     FALSE 0.037 200.000 0.000 NA   NA
 5818250 5818251 PLES_13421 PLES_13431     FALSE 0.014 295.000 0.000 NA   NA
 5818252 5818253 PLES_13441 PLES_13451     TRUE 0.904 47.000 0.517 NA   NA
 5818254 5818255 PLES_13461 PLES_13471     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5818257 5818258 PLES_13491 PLES_13501     FALSE 0.183 81.000 0.000 NA   NA
 5818258 5818259 PLES_13501 PLES_13511     TRUE 0.894 -28.000 0.000 NA   NA
 5818259 5818260 PLES_13511 PLES_13521     FALSE 0.095 128.000 0.000 NA   NA
 5818260 5818261 PLES_13521 PLES_13531     TRUE 0.974 -28.000 0.073 1.000   NA
 5818261 5818262 PLES_13531 PLES_13541     TRUE 0.489 67.000 0.049 NA   NA
 5818262 5818263 PLES_13541 PLES_13551     FALSE 0.042 191.000 0.000 NA   NA
 5818263 5818264 PLES_13551 PLES_13561     FALSE 0.037 200.000 0.000 NA   NA
 5818264 5818265 PLES_13561 PLES_13571     FALSE 0.181 82.000 0.000 NA   NA
 5818265 5818266 PLES_13571 PLES_13581     FALSE 0.006 465.000 0.000 NA   NA
 5818266 5818267 PLES_13581 PLES_13591     TRUE 0.944 28.000 0.500 NA   NA
 5818267 5818268 PLES_13591 PLES_13601     TRUE 0.996 0.000 1.000 NA   NA
 5818268 5818269 PLES_13601 PLES_13611     TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 5818269 5818270 PLES_13611 PLES_13621     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5818270 5818271 PLES_13621 PLES_13631     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5818271 5818272 PLES_13631 PLES_13641     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818272 5818273 PLES_13641 PLES_13651     FALSE 0.445 30.000 0.000 NA   NA
 5818273 5818274 PLES_13651 PLES_13661     FALSE 0.044 189.000 0.000 NA   NA
 5818274 5818275 PLES_13661 PLES_13671     FALSE 0.016 275.000 0.000 NA   NA
 5818275 5818276 PLES_13671 PLES_13681     TRUE 0.983 0.000 0.222 NA   NA
 5818276 5818277 PLES_13681 PLES_13691     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818278 5818279 PLES_13701 PLES_13711     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5818281 5818282 PLES_13731 PLES_13741     FALSE 0.012 322.000 0.000 NA   NA
 5818284 5818285 PLES_13761 PLES_13771   glnD TRUE 0.928 18.000 0.257 1.000 N NA
 5818285 5818286 PLES_13771 PLES_13781 glnD map TRUE 0.611 167.000 0.651 1.000 N NA
 5818287 5818288 PLES_13791 PLES_13801 rpsB tsf TRUE 0.907 131.000 0.748 1.000 Y NA
 5818288 5818289 PLES_13801 PLES_13811 tsf pyrH FALSE 0.069 199.000 0.017 1.000 N NA
 5818289 5818290 PLES_13811 PLES_13821 pyrH frr TRUE 0.908 3.000 0.030 1.000 N NA
 5818290 5818291 PLES_13821 PLES_13831 frr uppS TRUE 0.957 16.000 0.409 1.000 N NA
 5818291 5818292 PLES_13831 PLES_13841 uppS cdsA TRUE 0.998 -6.000 0.400 1.000 Y NA
 5818292 5818293 PLES_13841 PLES_13851 cdsA dxr TRUE 0.998 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 5818293 5818294 PLES_13851 PLES_13861 dxr   TRUE 0.953 26.000 0.568 1.000 N NA
 5818294 5818295 PLES_13861 PLES_13871     TRUE 0.741 71.000 0.014 1.000 Y NA
 5818295 5818296 PLES_13871 PLES_13881     TRUE 0.863 51.000 0.050 1.000 Y NA
 5818296 5818297 PLES_13881 PLES_13891   lpxD TRUE 0.998 0.000 0.814 1.000 Y NA
 5818297 5818298 PLES_13891 PLES_13901 lpxD fabZ TRUE 0.937 46.000 0.796 1.000 N NA
 5818298 5818299 PLES_13901 PLES_13911 fabZ lpxA TRUE 0.997 -3.000 0.850 1.000 N NA
 5818299 5818300 PLES_13911 PLES_13921 lpxA lpxB TRUE 0.993 4.000 0.289 1.000 Y NA
 5818300 5818301 PLES_13921 PLES_13931 lpxB rnhB TRUE 0.979 0.000 0.186 1.000 N NA
 5818301 5818302 PLES_13931 PLES_13941 rnhB   FALSE 0.026 217.000 0.000 1.000 N NA
 5818302 5818303 PLES_13941 PLES_13951   dnaE FALSE 0.082 130.000 0.000 1.000 N NA
 5818303 5818304 PLES_13951 PLES_13961 dnaE accA FALSE 0.304 150.000 0.122 1.000 N NA
 5818304 5818305 PLES_13961 PLES_13971 accA   TRUE 0.590 70.000 0.123 1.000 N NA
 5818305 5818306 PLES_13971 PLES_13981   pyrG FALSE 0.095 171.000 0.016 1.000 N NA
 5818306 5818307 PLES_13981 PLES_13991 pyrG kdsA TRUE 0.961 3.000 0.138 1.000 N NA
 5818307 5818308 PLES_13991 PLES_14001 kdsA eno TRUE 0.727 46.000 0.125 1.000 N NA
 5818308 5818309 PLES_14001 PLES_14011 eno   TRUE 0.738 65.000 0.241 1.000 N NA
 5818309 5818310 PLES_14011 PLES_14021   ygbP TRUE 0.897 20.000 0.185 1.000 N NA
 5818311 5818312 PLES_14031 PLES_14041     TRUE 0.997 -34.000 0.844 NA   NA
 5818312 5818313 PLES_14041 PLES_14051     FALSE 0.195 76.000 0.000 NA   NA
 5818314 5818315 PLES_14061 PLES_14071 adhC   TRUE 0.897 54.000 0.567 1.000   NA
 5818315 5818316 PLES_14071 PLES_14081   ygbB FALSE 0.350 71.000 0.012 1.000   NA
 5818316 5818317 PLES_14081 PLES_14091 ygbB   TRUE 0.987 -3.000 0.173 1.000   NA
 5818317 5818318 PLES_14091 PLES_14101   surE TRUE 0.989 -12.000 0.235 1.000   NA
 5818318 5818319 PLES_14101 PLES_14111 surE pcm TRUE 0.915 33.000 0.353 1.000   NA
 5818319 5818320 PLES_14111 PLES_14121 pcm   FALSE 0.428 46.000 0.007 1.000 N NA
 5818320 5818321 PLES_14121 PLES_14131   rpoS FALSE 0.368 105.000 0.081 1.000 N NA
 5818321 5818322 PLES_14131 PLES_14132 rpoS rsmZ FALSE 0.021 251.000 0.000 NA   NA
 5818323 5818324 PLES_14141 PLES_14151 fdxA mutS FALSE 0.360 67.000 0.020 1.000 N NA
 5818324 5818325 PLES_14151 PLES_14161 mutS   FALSE 0.073 126.000 0.000 NA N NA
 5818326 5818327 PLES_14171 PLES_14181   recA FALSE 0.304 134.000 0.082 NA   NA
 5818327 5818328 PLES_14181 PLES_14191 recA   TRUE 0.975 6.000 0.296 1.000   NA
 5818329 5818330 PLES_14201 PLES_14211     TRUE 0.507 83.000 0.089 NA   NA
 5818332 5818333 PLES_14231 PLES_14241     TRUE 0.553 19.000 0.000 NA   NA
 5818333 5818334 PLES_14241 PLES_14251   potD FALSE 0.052 176.000 0.000 NA   NA
 5818334 5818335 PLES_14251 PLES_14261 potD potC TRUE 0.759 89.000 0.000 0.056 Y NA
 5818335 5818336 PLES_14261 PLES_14271 potC potB TRUE 0.996 -7.000 0.040 0.056 Y NA
 5818336 5818337 PLES_14271 PLES_14281 potB potA TRUE 0.995 5.000 0.440 1.000 Y NA
 5818340 5818341 PLES_14311 PLES_14321   dgkA FALSE 0.184 72.000 0.000 1.000 N NA
 5818343 5818344 PLES_14341 PLES_14351     TRUE 0.987 0.000 0.083 0.009   NA
 5818346 5818347 PLES_14371 PLES_14381     TRUE 0.554 200.000 0.750 1.000   NA
 5818348 5818349 PLES_14391 PLES_14401     FALSE 0.218 68.000 0.000 NA   NA
 5818350 5818351 PLES_14411 PLES_14421     TRUE 0.737 39.000 0.094 1.000 N NA
 5818351 5818352 PLES_14421 PLES_14431     TRUE 0.508 60.000 0.000 0.077 N NA
 5818352 5818353 PLES_14431 PLES_14441     TRUE 0.998 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 5818353 5818354 PLES_14441 PLES_14451     TRUE 0.980 23.000 0.333 1.000 Y NA
 5818354 5818355 PLES_14451 PLES_14461     FALSE 0.311 53.000 0.000 1.000   NA
 5818358 5818359 PLES_14491 PLES_14501 glpM glpD FALSE 0.089 133.000 0.000 NA   NA
 5818359 5818360 PLES_14501 PLES_14511 glpD glpR FALSE 0.014 279.000 0.000 1.000 N NA
 5818360 5818361 PLES_14511 PLES_14521 glpR glpK FALSE 0.108 206.000 0.055 1.000 N NA
 5818361 5818362 PLES_14521 PLES_14531 glpK glpF TRUE 0.551 40.000 0.023 1.000 N NA
 5818363 5818364 PLES_14541 PLES_14551     FALSE 0.333 64.000 0.004 NA   NA
 5818364 5818365 PLES_14551 PLES_14561     FALSE 0.070 196.000 0.004 1.000   NA
 5818366 5818367 PLES_14571 PLES_14581     FALSE 0.133 99.000 0.000 NA   NA
 5818367 5818368 PLES_14581 PLES_14591     FALSE 0.008 359.000 0.000 1.000 N NA
 5818370 5818371 PLES_14611 PLES_14621   mmsR FALSE 0.096 127.000 0.000 NA   NA
 5818372 5818373 PLES_14631 PLES_14641 mmsA mmsB TRUE 0.879 16.000 0.000 0.002 N NA
 5818373 5818374 PLES_14641 PLES_14651 mmsB   TRUE 0.602 102.000 0.009 1.000 Y NA
 5818375 5818376 PLES_14661 PLES_14671     TRUE 0.972 22.000 0.400 0.043   NA
 5818378 5818379 PLES_14691 PLES_14701   fruR FALSE 0.170 113.000 0.017 NA N NA
 5818380 5818381 PLES_14711 PLES_14721   fruK TRUE 0.992 0.000 0.101 1.000 Y NA
 5818381 5818382 PLES_14721 PLES_14731 fruK fruA TRUE 0.997 2.000 0.562 1.000 Y NA
 5818383 5818384 PLES_14741 PLES_14751     TRUE 0.986 -3.000 0.161 1.000   NA
 5818384 5818385 PLES_14751 PLES_14761     TRUE 0.998 -3.000 0.613 0.068   NA
 5818385 5818386 PLES_14761 PLES_14771   arnT TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5818386 5818387 PLES_14771 PLES_14781 arnT   TRUE 0.951 -3.000 0.020 1.000 N NA
 5818387 5818388 PLES_14781 PLES_14791     TRUE 0.998 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 5818388 5818389 PLES_14791 PLES_14801     TRUE 0.997 -3.000 0.220 NA Y NA
 5818389 5818390 PLES_14801 PLES_14811     TRUE 0.998 -3.000 0.378 NA Y NA
 5818390 5818391 PLES_14811 PLES_14821   algA FALSE 0.064 388.000 0.000 1.000 Y NA
 5818391 5818392 PLES_14821 PLES_14831 algA algF FALSE 0.387 197.000 0.400 NA   NA
 5818392 5818393 PLES_14831 PLES_14841 algF algJ TRUE 0.904 73.000 0.889 NA   NA
 5818393 5818394 PLES_14841 PLES_14851 algJ algI TRUE 0.983 15.000 0.889 NA   NA
 5818394 5818395 PLES_14851 PLES_14861 algI algL FALSE 0.306 230.000 0.438 NA   NA
 5818395 5818396 PLES_14861 PLES_14871 algL algX TRUE 0.988 4.000 0.562 NA   NA
 5818396 5818397 PLES_14871 PLES_14881 algX algG TRUE 0.972 13.000 0.500 NA   NA
 5818397 5818398 PLES_14881 PLES_14891 algG algE TRUE 0.966 21.000 0.625 NA   NA
 5818398 5818399 PLES_14891 PLES_14901 algE algK TRUE 0.994 -3.000 0.417 NA   NA
 5818399 5818400 PLES_14901 PLES_14911 algK alg44 TRUE 0.967 14.000 0.455 NA   NA
 5818400 5818401 PLES_14911 PLES_14921 alg44 alg8 TRUE 0.807 83.000 0.500 NA   NA
 5818401 5818402 PLES_14921 PLES_14931 alg8 algD TRUE 0.691 140.000 0.625 NA   NA
 5818402 5818403 PLES_14931 PLES_14941 algD   FALSE 0.004 902.000 0.000 NA   NA
 5818403 5818404 PLES_14941 PLES_14951     FALSE 0.117 107.000 0.000 NA   NA
 5818404 5818405 PLES_14951 PLES_14961   argF TRUE 0.976 5.000 0.025 1.000 Y NA
 5818408 5818409 PLES_14991 PLES_15001     FALSE 0.254 113.000 0.039 1.000 N NA
 5818409 5818410 PLES_15001 PLES_15011     FALSE 0.137 83.000 0.000 NA N NA
 5818411 5818412 PLES_15021 PLES_15031 bfrB   TRUE 0.563 209.000 0.286 NA Y NA
 5818414 5818415 PLES_15051 PLES_15061 rnt pyrC TRUE 0.973 -3.000 0.068 1.000 N NA
 5818416 5818417 PLES_15071 PLES_15081   argG FALSE 0.169 118.000 0.013 1.000 N NA
 5818419 5818420 PLES_15101 PLES_15111     TRUE 0.895 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5818420 5818421 PLES_15111 PLES_15121     TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.055 N NA
 5818421 5818422 PLES_15121 PLES_15131     FALSE 0.004 598.000 0.000 1.000 N NA
 5818422 5818423 PLES_15131 PLES_15141     FALSE 0.009 401.000 0.000 1.000   NA
 5818423 5818424 PLES_15141 PLES_15151     TRUE 0.803 33.000 0.000 0.002   NA
 5818424 5818425 PLES_15151 PLES_15161     TRUE 0.474 31.000 0.000 1.000   NA
 5818425 5818426 PLES_15161 PLES_15171     TRUE 0.993 0.000 0.000 0.001 Y NA
 5818426 5818427 PLES_15171 PLES_15181     FALSE 0.273 50.000 0.000 1.000 N NA
 5818428 5818429 PLES_15191 PLES_15201   nth FALSE 0.192 109.000 0.012 NA   NA
 5818429 5818430 PLES_15201 PLES_15211 nth   TRUE 0.980 -3.000 0.109 1.000 N NA
 5818430 5818431 PLES_15211 PLES_15221     TRUE 0.999 -7.000 0.908 0.065 Y NA
 5818431 5818432 PLES_15221 PLES_15231     TRUE 0.999 0.000 0.924 0.065 Y NA
 5818432 5818433 PLES_15231 PLES_15241     TRUE 0.999 3.000 0.814 0.065 Y NA
 5818433 5818434 PLES_15241 PLES_15251     TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.065 Y NA
 5818434 5818435 PLES_15251 PLES_15261     TRUE 0.999 -3.000 0.564 0.065 Y NA
 5818435 5818436 PLES_15261 PLES_15271     FALSE 0.084 137.000 0.000 NA   NA
 5818436 5818437 PLES_15271 PLES_15281     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818437 5818438 PLES_15281 PLES_15291     FALSE 0.166 87.000 0.000 NA   NA
 5818438 5818439 PLES_15291 PLES_15301   metG TRUE 0.590 34.000 0.018 NA   NA
 5818440 5818441 PLES_15311 PLES_15321     FALSE 0.429 101.000 0.112 1.000 N NA
 5818441 5818442 PLES_15321 PLES_15331   rhlA FALSE 0.007 424.000 0.000 NA   NA
 5818442 5818443 PLES_15331 PLES_15341 rhlA rhlB FALSE 0.228 66.000 0.000 NA   NA
 5818443 5818444 PLES_15341 PLES_15351 rhlB rhlR FALSE 0.087 125.000 0.000 1.000 N NA
 5818444 5818445 PLES_15351 PLES_15361 rhlR rhlI FALSE 0.271 180.000 0.182 1.000 N NA
 5818445 5818446 PLES_15361 PLES_15371 rhlI pheC FALSE 0.378 155.000 0.000 1.000 Y NA
 5818446 5818447 PLES_15371 PLES_15381 pheC   TRUE 0.582 94.000 0.000 1.000 Y NA
 5818447 5818448 PLES_15381 PLES_15391     TRUE 0.953 -3.000 0.019 NA   NA
 5818451 5818452 PLES_15421 PLES_15431     TRUE 0.895 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5818452 5818453 PLES_15431 PLES_15441     TRUE 0.464 20.000 0.000 NA N NA
 5818453 5818454 PLES_15441 PLES_15451     FALSE 0.043 168.000 0.000 NA N NA
 5818459 5818460 PLES_15501 PLES_15511 orf2   TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 5818460 5818461 PLES_15511 PLES_15521     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5818461 5818462 PLES_15521 PLES_15531   orf6 TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5818462 5818463 PLES_15531 PLES_15541 orf6 orf7 TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5818463 5818464 PLES_15541 PLES_15551 orf7 orf8 TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818464 5818465 PLES_15551 PLES_15561 orf8   FALSE 0.129 101.000 0.000 NA   NA
 5818465 5818466 PLES_15561 PLES_15571     TRUE 0.901 -10.000 0.000 NA   NA
 5818466 5818467 PLES_15571 PLES_15581     TRUE 0.579 17.000 0.000 NA   NA
 5818467 5818468 PLES_15581 PLES_15591     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5818468 5818469 PLES_15591 PLES_15601     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5818469 5818470 PLES_15601 PLES_15611     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5818470 5818471 PLES_15611 PLES_15621     TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 5818471 5818472 PLES_15621 PLES_15631     FALSE 0.013 305.000 0.000 NA   NA
 5818472 5818473 PLES_15631 PLES_15641     TRUE 0.984 -13.000 0.160 NA   NA
 5818473 5818474 PLES_15641 PLES_15651   orf20 FALSE 0.007 443.000 0.000 NA   NA
 5818474 5818475 PLES_15651 PLES_15661 orf20 orf21 TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5818475 5818476 PLES_15661 PLES_15671 orf21 orf21a TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5818476 5818477 PLES_15671 PLES_15681 orf21a orf22 TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818477 5818478 PLES_15681 PLES_15691 orf22 orf23 FALSE 0.113 111.000 0.000 NA   NA
 5818478 5818479 PLES_15691 PLES_15701 orf23   TRUE 0.729 9.000 0.000 NA   NA
 5818479 5818480 PLES_15701 PLES_15711     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818480 5818481 PLES_15711 PLES_15721     TRUE 0.770 5.000 0.000 NA   NA
 5818481 5818482 PLES_15721 PLES_15731     TRUE 0.881 12.000 0.061 NA   NA
 5818482 5818483 PLES_15731 PLES_15741     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5818483 5818484 PLES_15741 PLES_15751     FALSE 0.005 580.000 0.000 NA   NA
 5818484 5818485 PLES_15751 PLES_15761   orf29b TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818485 5818486 PLES_15761 PLES_15771 orf29b   FALSE 0.183 81.000 0.000 NA   NA
 5818486 5818487 PLES_15771 PLES_15781     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818487 5818488 PLES_15781 PLES_15791     FALSE 0.029 220.000 0.000 NA   NA
 5818488 5818489 PLES_15791 PLES_15801     TRUE 0.974 10.000 0.386 NA   NA
 5818489 5818490 PLES_15801 PLES_15811     TRUE 0.787 28.000 0.073 NA   NA
 5818490 5818491 PLES_15811 PLES_15821     TRUE 0.892 12.000 0.073 NA   NA
 5818491 5818492 PLES_15821 PLES_15831     FALSE 0.239 63.000 0.000 NA   NA
 5818492 5818493 PLES_15831 PLES_15841     FALSE 0.008 410.000 0.000 NA   NA
 5818493 5818494 PLES_15841 PLES_15851     FALSE 0.037 200.000 0.000 NA   NA
 5818494 5818495 PLES_15851 PLES_15861     TRUE 0.980 4.000 0.333 NA   NA
 5818495 5818496 PLES_15861 PLES_15871     FALSE 0.013 311.000 0.000 NA   NA
 5818496 5818497 PLES_15871 PLES_15881   orf46e TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 5818497 5818498 PLES_15881 PLES_15891 orf46e orf48 TRUE 0.994 2.000 0.857 NA   NA
 5818498 5818499 PLES_15891 PLES_15901 orf48 orf49 TRUE 0.928 36.000 0.500 NA   NA
 5818499 5818500 PLES_15901 PLES_15911 orf49   TRUE 0.921 35.000 0.435 NA   NA
 5818500 5818501 PLES_15911 PLES_15921     TRUE 0.926 9.000 0.087 NA   NA
 5818501 5818502 PLES_15921 PLES_15931     FALSE 0.035 205.000 0.000 NA   NA
 5818502 5818503 PLES_15931 PLES_15941     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818503 5818504 PLES_15941 PLES_15951     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818504 5818505 PLES_15951 PLES_15961     FALSE 0.188 79.000 0.000 NA   NA
 5818506 5818507 PLES_15971 PLES_15981     FALSE 0.285 52.000 0.000 NA   NA
 5818507 5818508 PLES_15981 PLES_15991     FALSE 0.321 137.000 0.125 NA N NA
 5818508 5818509 PLES_15991 PLES_16001     TRUE 0.994 -3.000 0.471 NA N NA
 5818509 5818510 PLES_16001 PLES_16011     TRUE 0.917 41.000 0.514 1.000 N NA
 5818512 5818513 PLES_16031 PLES_16041     FALSE 0.147 101.000 0.000 1.000   NA
 5818514 5818515 PLES_16051 PLES_16061     FALSE 0.161 153.000 0.029 NA   NA
 5818515 5818516 PLES_16061 PLES_16071     FALSE 0.094 129.000 0.000 NA   NA
 5818517 5818518 PLES_16081 PLES_16091 mqoA   FALSE 0.036 203.000 0.000 NA   NA
 5818519 5818520 PLES_16101 PLES_16111     FALSE 0.018 251.000 0.000 1.000 N NA
 5818520 5818521 PLES_16111 PLES_16121     TRUE 0.999 4.000 0.795 0.054 Y NA
 5818521 5818522 PLES_16121 PLES_16131     TRUE 0.961 37.000 0.273 1.000 Y NA
 5818522 5818523 PLES_16131 PLES_16141     FALSE 0.080 154.000 0.000 1.000   NA
 5818523 5818524 PLES_16141 PLES_16151     TRUE 0.496 119.000 0.193 1.000   NA
 5818524 5818525 PLES_16151 PLES_16161   ssuD TRUE 0.625 78.000 0.176 1.000 N NA
 5818525 5818526 PLES_16161 PLES_16171 ssuD   TRUE 0.910 21.000 0.226 1.000 N NA
 5818526 5818527 PLES_16171 PLES_16181     TRUE 0.998 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 5818527 5818528 PLES_16181 PLES_16191     TRUE 0.875 41.000 0.161 0.087 N NA
 5818529 5818530 PLES_16201 PLES_16211     TRUE 0.665 52.000 0.097 NA   NA
 5818530 5818531 PLES_16211 PLES_16221   folX FALSE 0.281 129.000 0.061 NA   NA
 5818531 5818532 PLES_16221 PLES_16231 folX folE1 TRUE 0.984 2.000 0.030 1.000 Y NA
 5818532 5818533 PLES_16231 PLES_16241 folE1   TRUE 0.862 18.000 0.100 1.000 N NA
 5818533 5818534 PLES_16241 PLES_16251     FALSE 0.416 111.000 0.120 NA   NA
 5818537 5818538 PLES_16281 PLES_16291     TRUE 0.997 -13.000 0.840 NA   NA
 5818538 5818539 PLES_16291 PLES_16301     FALSE 0.193 129.000 0.034 NA N NA
 5818539 5818540 PLES_16301 PLES_16311     TRUE 0.983 -3.000 0.125 1.000   NA
 5818540 5818541 PLES_16311 PLES_16321     FALSE 0.133 99.000 0.000 NA   NA
 5818541 5818542 PLES_16321 PLES_16331     FALSE 0.107 116.000 0.000 NA   NA
 5818542 5818543 PLES_16331 PLES_16341     TRUE 0.715 117.000 0.021 0.074 Y NA
 5818544 5818545 PLES_16351 PLES_16361     TRUE 0.942 35.000 0.600 NA   NA
 5818545 5818546 PLES_16361 PLES_16371     TRUE 0.730 91.000 0.400 1.000 N NA
 5818547 5818548 PLES_16381 PLES_16391     FALSE 0.259 57.000 0.000 NA   NA
 5818548 5818549 PLES_16391 PLES_16401     TRUE 0.518 150.000 0.333 NA   NA
 5818551 5818552 PLES_16421 PLES_16431 ldh   FALSE 0.247 142.000 0.065 1.000 N NA
 5818552 5818553 PLES_16431 PLES_16441     TRUE 0.999 -7.000 0.458 0.001 Y NA
 5818553 5818554 PLES_16441 PLES_16451     TRUE 0.994 18.000 0.556 0.074 Y NA
 5818555 5818556 PLES_16461 PLES_16471     FALSE 0.145 94.000 0.000 NA   NA
 5818556 5818557 PLES_16471 PLES_16481     FALSE 0.401 36.000 0.000 NA   NA
 5818558 5818559 PLES_16491 PLES_16501     FALSE 0.103 120.000 0.000 NA   NA
 5818559 5818560 PLES_16501 PLES_16511     FALSE 0.194 77.000 0.000 NA   NA
 5818560 5818561 PLES_16511 PLES_16521     TRUE 0.909 65.000 0.875 NA N NA
 5818561 5818562 PLES_16521 PLES_16531   hasR TRUE 0.489 210.000 0.200 NA Y NA
 5818562 5818563 PLES_16531 PLES_16541 hasR hasAp TRUE 0.757 86.000 0.400 NA   NA
 5818563 5818564 PLES_16541 PLES_16551 hasAp hasD FALSE 0.029 218.000 0.000 NA   NA
 5818564 5818565 PLES_16551 PLES_16561 hasD hasE TRUE 0.996 -3.000 0.286 0.007   NA
 5818565 5818566 PLES_16561 PLES_16571 hasE   TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.007   NA
 5818566 5818567 PLES_16571 PLES_16581     FALSE 0.007 455.000 0.000 1.000   NA
 5818567 5818568 PLES_16581 PLES_16591     FALSE 0.126 113.000 0.000 1.000   NA
 5818568 5818569 PLES_16591 PLES_16601     TRUE 0.996 4.000 0.538 NA Y NA
 5818569 5818570 PLES_16601 PLES_16611     TRUE 0.994 -3.000 0.086 NA Y NA
 5818570 5818571 PLES_16611 PLES_16621     FALSE 0.274 54.000 0.000 NA   NA
 5818574 5818575 PLES_16651 PLES_16661 nosL nosY TRUE 0.893 17.000 0.135 NA   NA
 5818575 5818576 PLES_16661 PLES_16671 nosY nosD FALSE 0.004 902.000 0.000 NA   NA
 5818576 5818577 PLES_16671 PLES_16681 nosD nosZ TRUE 0.988 -3.000 0.035 0.003 N NA
 5818577 5818578 PLES_16681 PLES_16691 nosZ nosR TRUE 0.703 43.000 0.088 1.000 N NA
 5818578 5818579 PLES_16691 PLES_16701 nosR   FALSE 0.021 221.000 0.000 NA N NA
 5818581 5818582 PLES_16721 PLES_16731   rhlG TRUE 0.475 53.000 0.025 NA   NA
 5818582 5818583 PLES_16731 PLES_16741 rhlG   FALSE 0.135 98.000 0.000 NA   NA
 5818583 5818584 PLES_16741 PLES_16751   amrZ FALSE 0.070 154.000 0.000 NA   NA
 5818585 5818586 PLES_16761 PLES_16771 phnC   TRUE 0.976 53.000 0.337 0.002 Y NA
 5818586 5818587 PLES_16771 PLES_16781   phnE TRUE 0.967 68.000 0.330 0.001 Y NA
 5818587 5818588 PLES_16781 PLES_16791 phnE   TRUE 0.881 21.000 0.158 1.000 N NA
 5818588 5818589 PLES_16791 PLES_16801   phnG TRUE 0.985 10.000 0.691 1.000 N NA
 5818589 5818590 PLES_16801 PLES_16811 phnG phnH TRUE 0.999 0.000 0.967 0.002 Y NA
 5818590 5818591 PLES_16811 PLES_16821 phnH phnI TRUE 0.999 0.000 0.960 0.002 Y NA
 5818591 5818592 PLES_16821 PLES_16831 phnI phnJ TRUE 0.999 -3.000 0.880 1.000 Y NA
 5818592 5818593 PLES_16831 PLES_16841 phnJ   TRUE 0.999 -3.000 0.883 1.000 Y NA
 5818593 5818594 PLES_16841 PLES_16851     TRUE 0.989 50.000 0.859 0.015 Y NA
 5818594 5818595 PLES_16851 PLES_16861   phnM TRUE 0.998 -10.000 0.320 1.000 Y NA
 5818595 5818596 PLES_16861 PLES_16871 phnM phnN TRUE 0.995 0.000 0.235 NA Y NA
 5818596 5818597 PLES_16871 PLES_16881 phnN phnP TRUE 0.988 -9.000 0.214 NA   NA
 5818598 5818599 PLES_16891 PLES_16901     FALSE 0.285 52.000 0.000 NA   NA
 5818599 5818600 PLES_16901 PLES_16911     FALSE 0.158 90.000 0.000 NA   NA
 5818600 5818601 PLES_16911 PLES_16921     FALSE 0.041 193.000 0.000 NA   NA
 5818602 5818603 PLES_16922 PLES_16931     FALSE 0.004 1289.000 0.000 NA   NA
 5818603 5818604 PLES_16931 PLES_16941     TRUE 0.903 15.000 0.133 NA   NA
 5818604 5818605 PLES_16941 PLES_16951     FALSE 0.004 1029.000 0.000 NA   NA
 5818605 5818606 PLES_16951 PLES_16961     FALSE 0.458 33.000 0.000 1.000   NA
 5818606 5818607 PLES_16961 PLES_16971     FALSE 0.004 1130.000 0.000 NA   NA
 5818607 5818608 PLES_16971 PLES_16981   amiE FALSE 0.004 674.000 0.000 NA   NA
 5818608 5818609 PLES_16981 PLES_16991 amiE   TRUE 0.678 83.000 0.222 1.000   NA
 5818609 5818610 PLES_16991 PLES_17001   amiC TRUE 0.824 26.000 0.083 1.000   NA
 5818610 5818611 PLES_17001 PLES_17011 amiC amiR TRUE 0.975 -3.000 0.083 NA N NA
 5818611 5818612 PLES_17011 PLES_17021 amiR   TRUE 0.612 43.000 0.040 NA   NA
 5818614 5818615 PLES_17041 PLES_17051     TRUE 0.973 23.000 0.818 NA   NA
 5818616 5818617 PLES_17061 PLES_17071   dsdA FALSE 0.259 57.000 0.000 NA   NA
 5818618 5818619 PLES_17081 PLES_17091     TRUE 0.463 185.000 0.462 NA   NA
 5818619 5818620 PLES_17091 PLES_17101     FALSE 0.355 42.000 0.000 NA   NA
 5818621 5818622 PLES_17111 PLES_17121   flgN TRUE 0.818 29.000 0.121 1.000 N NA
 5818622 5818623 PLES_17121 PLES_17131 flgN flgM TRUE 0.977 55.000 0.361 0.001 Y NA
 5818623 5818624 PLES_17131 PLES_17141 flgM flgA TRUE 0.801 145.000 0.371 NA Y NA
 5818625 5818626 PLES_17151 PLES_17161     TRUE 0.963 77.000 0.838 1.000 Y NA
 5818626 5818627 PLES_17161 PLES_17171     FALSE 0.087 315.000 0.000 NA Y NA
 5818627 5818628 PLES_17171 PLES_17181     TRUE 0.996 2.000 0.429 NA Y NA
 5818628 5818629 PLES_17181 PLES_17191     TRUE 0.910 66.000 0.250 NA Y NA
 5818629 5818630 PLES_17191 PLES_17201   recQ FALSE 0.134 84.000 0.000 NA N NA
 5818630 5818631 PLES_17201 PLES_17211 recQ   FALSE 0.224 89.000 0.005 1.000 N NA
 5818631 5818632 PLES_17211 PLES_17221     FALSE 0.073 151.000 0.000 NA   NA
 5818632 5818633 PLES_17221 PLES_17231     FALSE 0.105 118.000 0.000 NA   NA
 5818633 5818634 PLES_17231 PLES_17241     FALSE 0.064 277.000 0.080 1.000 N NA
 5818636 5818637 PLES_17261 PLES_17271   rfaD FALSE 0.141 90.000 0.000 1.000 N NA
 5818638 5818639 PLES_17281 PLES_17291     FALSE 0.152 92.000 0.000 NA   NA
 5818639 5818640 PLES_17291 PLES_17301     FALSE 0.105 118.000 0.000 NA   NA
 5818640 5818641 PLES_17301 PLES_17311   fabH2 TRUE 0.656 14.000 0.000 1.000   NA
 5818641 5818642 PLES_17311 PLES_17321 fabH2   TRUE 0.810 4.000 0.000 1.000   NA
 5818642 5818643 PLES_17321 PLES_17331     TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5818643 5818644 PLES_17331 PLES_17341     TRUE 0.918 -7.000 0.000 1.000   NA
 5818644 5818645 PLES_17341 PLES_17351     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5818645 5818646 PLES_17351 PLES_17361     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5818646 5818647 PLES_17361 PLES_17371     TRUE 0.971 -3.000 0.059 1.000 N NA
 5818649 5818650 PLES_17391 PLES_17401     TRUE 0.714 10.000 0.000 NA   NA
 5818650 5818651 PLES_17401 PLES_17411     TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5818657 5818658 PLES_17471 PLES_17481     FALSE 0.228 66.000 0.000 NA   NA
 5818658 5818659 PLES_17481 PLES_17491     FALSE 0.117 107.000 0.000 NA   NA
 5818659 5818660 PLES_17491 PLES_17501     TRUE 0.997 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 5818660 5818661 PLES_17501 PLES_17511     TRUE 0.999 -6.000 0.696 1.000 Y NA
 5818661 5818662 PLES_17511 PLES_17521     TRUE 0.999 -3.000 0.690 0.002 Y NA
 5818666 5818667 PLES_17561 PLES_17571     FALSE 0.300 50.000 0.000 NA   NA
 5818667 5818668 PLES_17571 PLES_17581   hepA FALSE 0.421 33.000 0.000 NA   NA
 5818669 5818670 PLES_17591 PLES_17601   alkB TRUE 0.719 54.000 0.156 NA   NA
 5818670 5818671 PLES_17601 PLES_17602 alkB   FALSE 0.017 268.000 0.000 NA   NA
 5818671 5818672 PLES_17602 PLES_17611     FALSE 0.070 154.000 0.000 NA   NA
 5818672 5818673 PLES_17611 PLES_17612     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5818673 5818674 PLES_17612 PLES_17621     FALSE 0.205 72.000 0.000 NA   NA
 5818675 5818676 PLES_17631 PLES_17641   phaJ1 FALSE 0.055 151.000 0.000 NA N NA
 5818676 5818677 PLES_17641 PLES_17651 phaJ1   TRUE 0.993 -3.000 0.046 1.000 Y NA
 5818678 5818679 PLES_17661 PLES_17671 fadD2 fadD1 FALSE 0.366 235.000 0.000 0.000 Y NA
 5818679 5818680 PLES_17671 PLES_17681 fadD1   FALSE 0.445 30.000 0.000 NA   NA
 5818680 5818681 PLES_17681 PLES_17691     TRUE 0.895 -25.000 0.000 NA   NA
 5818683 5818684 PLES_17711 PLES_17721     FALSE 0.026 229.000 0.000 NA   NA
 5818684 5818685 PLES_17721 PLES_17731     TRUE 0.714 10.000 0.000 NA   NA
 5818685 5818686 PLES_17731 PLES_17741     FALSE 0.049 1040.000 0.333 NA   NA
 5818686 5818687 PLES_17741 PLES_17751     TRUE 0.984 15.000 1.000 NA   NA
 5818691 5818692 PLES_17791 PLES_17801     TRUE 0.912 3.000 0.038 NA N NA
 5818692 5818693 PLES_17801 PLES_17811     FALSE 0.009 381.000 0.000 NA   NA
 5818693 5818694 PLES_17811 PLES_17821     FALSE 0.105 118.000 0.000 NA   NA
 5818694 5818695 PLES_17821 PLES_17831     TRUE 0.951 19.000 0.406 NA   NA
 5818695 5818696 PLES_17831 PLES_17841     TRUE 0.997 -3.000 0.914 NA   NA
 5818696 5818697 PLES_17841 PLES_17851     TRUE 0.978 3.000 0.271 NA   NA
 5818697 5818698 PLES_17851 PLES_17861   oprO FALSE 0.022 247.000 0.000 NA   NA
 5818700 5818701 PLES_17881 PLES_17891 oprP   FALSE 0.057 169.000 0.000 NA   NA
 5818701 5818702 PLES_17891 PLES_17901     FALSE 0.097 126.000 0.000 NA   NA
 5818702 5818703 PLES_17901 PLES_17911     FALSE 0.024 233.000 0.000 NA   NA
 5818703 5818704 PLES_17911 PLES_17921     TRUE 0.983 -3.000 0.133 NA   NA
 5818706 5818707 PLES_17941 PLES_17951     FALSE 0.213 69.000 0.000 NA   NA
 5818709 5818710 PLES_17971 PLES_17981     TRUE 0.659 67.000 0.167 1.000 N NA
 5818710 5818711 PLES_17981 PLES_17991     FALSE 0.122 97.000 0.000 1.000 N NA
 5818711 5818712 PLES_17991 PLES_18001     FALSE 0.046 175.000 0.000 1.000 N NA
 5818713 5818714 PLES_18011 PLES_18021 capB   FALSE 0.027 215.000 0.000 1.000 N NA
 5818714 5818715 PLES_18021 PLES_18031     FALSE 0.290 140.000 0.074 1.000   NA
 5818715 5818716 PLES_18031 PLES_18041   rdgC TRUE 0.475 87.000 0.074 1.000   NA
 5818717 5818718 PLES_18042 PLES_18043     TRUE 0.579 17.000 0.000 NA   NA
 5818718 5818719 PLES_18043 PLES_18051     FALSE 0.020 257.000 0.000 NA   NA
 5818721 5818722 PLES_18071 PLES_18081     FALSE 0.011 358.000 0.000 1.000   NA
 5818723 5818724 PLES_18091 PLES_18101   prc TRUE 0.586 39.000 0.029 1.000 N NA
 5818726 5818727 PLES_18121 PLES_18131     TRUE 0.894 72.000 0.222 1.000 Y NA
 5818727 5818728 PLES_18131 PLES_18141     TRUE 0.997 3.000 0.360 0.053 Y NA
 5818728 5818729 PLES_18141 PLES_18151     TRUE 0.998 -13.000 0.774 0.053   NA
 5818729 5818730 PLES_18151 PLES_18161     TRUE 0.992 -3.000 0.290 1.000   NA
 5818730 5818731 PLES_18161 PLES_18171     TRUE 0.882 55.000 0.500 1.000   NA
 5818732 5818733 PLES_18181 PLES_18191     FALSE 0.206 66.000 0.000 1.000 N NA
 5818734 5818735 PLES_18201 PLES_18211   rluA FALSE 0.109 169.000 0.022 1.000 N NA
 5818735 5818736 PLES_18211 PLES_18221 rluA minE FALSE 0.191 104.000 0.018 NA N NA
 5818736 5818737 PLES_18221 PLES_18231 minE minD TRUE 0.999 -3.000 0.618 NA Y NA
 5818737 5818738 PLES_18231 PLES_18241 minD minC TRUE 0.950 62.000 0.466 1.000 Y NA
 5818739 5818740 PLES_18251 PLES_18261     TRUE 0.547 68.000 0.069 1.000   NA
 5818741 5818742 PLES_18271 PLES_18281   vacJ FALSE 0.145 141.000 0.014 NA   NA
 5818742 5818743 PLES_18281 PLES_18291 vacJ   TRUE 0.969 4.000 0.204 NA   NA
 5818743 5818744 PLES_18291 PLES_18301     FALSE 0.201 143.000 0.038 NA   NA
 5818745 5818746 PLES_18311 PLES_18321     FALSE 0.029 218.000 0.000 NA   NA
 5818746 5818747 PLES_18321 PLES_18331     TRUE 0.997 -3.000 0.733 NA   NA
 5818747 5818748 PLES_18331 PLES_18341     FALSE 0.178 90.000 0.000 1.000   NA
 5818748 5818749 PLES_18341 PLES_18351     TRUE 0.995 -3.000 0.588 1.000 N NA
 5818749 5818750 PLES_18351 PLES_18361     FALSE 0.115 109.000 0.000 NA   NA
 5818750 5818751 PLES_18361 PLES_18371     FALSE 0.019 260.000 0.000 NA   NA
 5818752 5818753 PLES_18381 PLES_18391     FALSE 0.015 282.000 0.000 NA   NA
 5818753 5818754 PLES_18391 PLES_18401   ppiA TRUE 0.684 63.000 0.171 1.000 N NA
 5818754 5818755 PLES_18401 PLES_18411 ppiA   TRUE 0.990 -18.000 0.286 NA   NA
 5818755 5818756 PLES_18411 PLES_18421     TRUE 0.943 7.000 0.118 NA   NA
 5818757 5818758 PLES_18431 PLES_18441   acpD TRUE 0.666 147.000 0.600 NA   NA
 5818759 5818760 PLES_18451 PLES_18461   csaA TRUE 0.814 10.000 0.009 NA   NA
 5818760 5818761 PLES_18461 PLES_18471 csaA   FALSE 0.372 65.000 0.009 1.000   NA
 5818763 5818764 PLES_18491 PLES_18501   cyaB FALSE 0.005 542.000 0.000 NA   NA
 5818764 5818765 PLES_18501 PLES_18511 cyaB   FALSE 0.082 217.000 0.038 NA   NA
 5818767 5818768 PLES_18531 PLES_18541     TRUE 0.988 -3.000 0.201 NA   NA
 5818768 5818769 PLES_18541 PLES_18551     TRUE 0.997 2.000 0.650 NA Y NA
 5818769 5818770 PLES_18551 PLES_18561     TRUE 0.998 -3.000 0.491 NA Y NA
 5818770 5818771 PLES_18561 PLES_18571   trkH FALSE 0.173 67.000 0.000 NA N NA
 5818772 5818773 PLES_18581 PLES_18591     FALSE 0.368 65.000 0.014 NA   NA
 5818774 5818775 PLES_18601 PLES_18611     FALSE 0.373 40.000 0.000 NA   NA
 5818775 5818776 PLES_18611 PLES_18621     TRUE 0.822 115.000 0.286 NA Y NA
 5818776 5818777 PLES_18621 PLES_18631     TRUE 0.810 129.000 0.318 NA Y NA
 5818777 5818778 PLES_18631 PLES_18641     TRUE 0.972 11.000 0.409 NA   NA
 5818778 5818779 PLES_18641 PLES_18651   yciI FALSE 0.145 176.000 0.043 NA   NA
 5818779 5818780 PLES_18651 PLES_18661 yciI yciB TRUE 0.978 2.000 0.224 NA   NA
 5818781 5818782 PLES_18671 PLES_18681     TRUE 0.991 -3.000 0.281 NA   NA
 5818782 5818783 PLES_18681 PLES_18691     TRUE 0.672 35.000 0.040 NA   NA
 5818783 5818784 PLES_18691 PLES_18701     FALSE 0.280 145.000 0.083 NA   NA
 5818784 5818785 PLES_18701 PLES_18711     FALSE 0.181 82.000 0.000 NA   NA
 5818785 5818786 PLES_18711 PLES_18721     FALSE 0.108 115.000 0.000 NA   NA
 5818788 5818789 PLES_18741 PLES_18751 edd glk TRUE 0.538 103.000 0.000 1.000 Y NA
 5818789 5818790 PLES_18751 PLES_18761 glk gltR FALSE 0.375 35.000 0.000 1.000 N NA
 5818790 5818791 PLES_18761 PLES_18771 gltR   TRUE 0.992 24.000 0.909 1.000 Y NA
 5818791 5818792 PLES_18771 PLES_18781     FALSE 0.072 525.000 0.367 1.000 N NA
 5818792 5818793 PLES_18781 PLES_18791     TRUE 0.930 101.000 0.367 0.053 Y NA
 5818793 5818794 PLES_18791 PLES_18801     TRUE 0.999 -7.000 0.816 0.053 Y NA
 5818794 5818795 PLES_18801 PLES_18811     TRUE 0.992 33.000 0.723 0.053 Y NA
 5818795 5818796 PLES_18811 PLES_18821   oprB TRUE 0.647 44.000 0.000 0.053 N NA
 5818796 5818797 PLES_18821 PLES_18831 oprB   FALSE 0.027 215.000 0.000 1.000 N NA
 5818799 5818800 PLES_18851 PLES_18861 zwf pgl TRUE 0.996 -13.000 0.163 1.000 Y NA
 5818800 5818801 PLES_18861 PLES_18871 pgl   TRUE 0.956 18.000 0.064 1.000 Y NA
 5818803 5818804 PLES_18891 PLES_18901     FALSE 0.102 121.000 0.000 NA   NA
 5818805 5818806 PLES_18911 PLES_18921   gltS FALSE 0.023 229.000 0.000 1.000 N NA
 5818806 5818807 PLES_18921 PLES_18931 gltS   TRUE 0.871 39.000 0.016 1.000 Y NA
 5818807 5818808 PLES_18931 PLES_18941     TRUE 0.801 16.000 0.039 1.000 N NA
 5818808 5818809 PLES_18941 PLES_18951     FALSE 0.059 159.000 0.000 1.000 N NA
 5818809 5818810 PLES_18951 PLES_18961     TRUE 0.763 65.000 0.098 0.072   NA
 5818810 5818811 PLES_18961 PLES_18971   ubiG TRUE 0.991 -3.000 0.259 1.000   NA
 5818811 5818812 PLES_18971 PLES_18981 ubiG   FALSE 0.278 151.000 0.104 1.000 N NA
 5818813 5818814 PLES_18991 PLES_19001   gyrA FALSE 0.035 237.000 0.007 1.000 N NA
 5818814 5818815 PLES_19001 PLES_19011 gyrA serC FALSE 0.422 88.000 0.067 1.000 N NA
 5818815 5818816 PLES_19011 PLES_19021 serC pheA TRUE 0.993 0.000 0.121 1.000 Y NA
 5818816 5818817 PLES_19021 PLES_19031 pheA hisC2 TRUE 0.846 69.000 0.098 1.000 Y NA
 5818817 5818818 PLES_19031 PLES_19041 hisC2   TRUE 0.992 -7.000 0.029 1.000 Y NA
 5818818 5818819 PLES_19041 PLES_19051   cmk TRUE 0.981 0.000 0.209 1.000 N NA
 5818819 5818820 PLES_19051 PLES_19061 cmk rpsA FALSE 0.160 268.000 0.281 1.000 N NA
 5818820 5818821 PLES_19061 PLES_19071 rpsA himD TRUE 0.509 137.000 0.292 1.000 N NA
 5818821 5818822 PLES_19071 PLES_19081 himD wzz FALSE 0.004 728.000 0.000 1.000 N NA
 5818822 5818823 PLES_19081 PLES_19091 wzz   TRUE 0.513 110.000 0.000 1.000 Y NA
 5818823 5818824 PLES_19091 PLES_19101     TRUE 0.948 41.000 0.212 1.000 Y NA
 5818824 5818825 PLES_19101 PLES_19111     FALSE 0.043 200.000 0.000 1.000   NA
 5818825 5818826 PLES_19111 PLES_19121   wbpR FALSE 0.115 122.000 0.000 1.000   NA
 5818826 5818827 PLES_19121 PLES_19131 wbpR   TRUE 0.936 5.000 0.085 1.000 N NA
 5818827 5818828 PLES_19131 PLES_19141     TRUE 0.980 -3.000 0.113 1.000 N NA
 5818828 5818829 PLES_19141 PLES_19151     TRUE 0.952 44.000 0.089 0.020 Y NA
 5818829 5818830 PLES_19151 PLES_19161     FALSE 0.322 231.000 0.080 1.000 Y NA
 5818830 5818831 PLES_19161 PLES_19171   orfN TRUE 0.997 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 5818831 5818832 PLES_19171 PLES_19181 orfN wbpM FALSE 0.367 198.000 0.041 1.000 Y NA
 5818832 5818833 PLES_19181 PLES_19191 wbpM   FALSE 0.069 191.000 0.012 1.000 N NA
 5818834 5818835 PLES_19192 PLES_19201     FALSE 0.213 69.000 0.000 NA   NA
 5818837 5818838 PLES_19221 PLES_19231     TRUE 0.820 50.000 0.250 1.000   NA
 5818839 5818840 PLES_19241 PLES_19251   gltX TRUE 0.480 38.000 0.004 1.000 N NA
 5818840 5818841 PLES_19251 PLES_19252 gltX   FALSE 0.037 202.000 0.000 NA   NA
 5818841 5818842 PLES_19252 PLES_19253     FALSE 0.308 49.000 0.000 NA   NA
 5818842 5818843 PLES_19253 PLES_19254     FALSE 0.145 94.000 0.000 NA   NA
 5818843 5818844 PLES_19254 PLES_19255     FALSE 0.319 47.000 0.000 NA   NA
 5818844 5818845 PLES_19255 PLES_19261     FALSE 0.066 159.000 0.000 NA   NA
 5818845 5818846 PLES_19261 PLES_19271     TRUE 0.845 12.000 0.035 NA   NA
 5818846 5818847 PLES_19271 PLES_19281     FALSE 0.112 112.000 0.000 NA   NA
 5818847 5818848 PLES_19281 PLES_19291     TRUE 0.923 0.000 0.008 1.000   NA
 5818848 5818849 PLES_19291 PLES_19301     FALSE 0.323 93.000 0.029 1.000   NA
 5818850 5818851 PLES_19311 PLES_19321     TRUE 0.833 17.000 0.000 0.072   NA
 5818854 5818855 PLES_19351 PLES_19361     FALSE 0.142 80.000 0.000 NA N NA
 5818857 5818858 PLES_19381 PLES_19391 leuC leuD TRUE 0.997 12.000 0.463 0.000 Y NA
 5818858 5818859 PLES_19391 PLES_19401 leuD   FALSE 0.065 270.000 0.060 1.000   NA
 5818859 5818860 PLES_19401 PLES_19411   leuB TRUE 0.464 59.000 0.026 1.000   NA
 5818860 5818861 PLES_19411 PLES_19421 leuB asd TRUE 0.938 70.000 0.196 0.031 Y NA
 5818861 5818862 PLES_19421 PLES_19431 asd   TRUE 0.828 102.000 0.025 0.000 Y NA
 5818862 5818863 PLES_19431 PLES_19441   fimV FALSE 0.099 169.000 0.017 1.000 N NA
 5818863 5818864 PLES_19441 PLES_19451 fimV truA TRUE 0.741 22.000 0.035 1.000 N NA
 5818864 5818865 PLES_19451 PLES_19461 truA trpF TRUE 0.523 90.000 0.139 1.000 N NA
 5818865 5818866 PLES_19461 PLES_19471 trpF   TRUE 0.892 -91.000 0.000 NA   NA
 5818866 5818867 PLES_19471 PLES_19481   accD FALSE 0.077 148.000 0.000 NA   NA
 5818867 5818868 PLES_19481 PLES_19491 accD folC TRUE 0.993 -3.000 0.383 1.000 N NA
 5818868 5818869 PLES_19491 PLES_19501 folC   TRUE 0.970 4.000 0.216 NA   NA
 5818869 5818870 PLES_19501 PLES_19511   cvpA TRUE 0.576 74.000 0.116 NA   NA
 5818870 5818871 PLES_19511 PLES_19521 cvpA purF FALSE 0.242 222.000 0.262 1.000   NA
 5818871 5818872 PLES_19521 PLES_19531 purF metZ TRUE 0.896 17.000 0.153 1.000 N NA
 5818872 5818873 PLES_19531 PLES_19541 metZ   TRUE 0.960 -3.000 0.033 1.000 N NA
 5818874 5818875 PLES_19551 PLES_19561 xcpQ xcpP TRUE 0.862 5.000 0.013 NA   NA
 5818876 5818877 PLES_19571 PLES_19581 xcpR xcpS TRUE 0.999 0.000 0.653 0.004 Y NA
 5818877 5818878 PLES_19581 PLES_19591 xcpS xcpT TRUE 0.998 5.000 0.599 0.004 Y NA
 5818878 5818879 PLES_19591 PLES_19601 xcpT xcpU TRUE 0.997 7.000 0.425 0.004 Y NA
 5818879 5818880 PLES_19601 PLES_19611 xcpU xcpV TRUE 0.999 -3.000 0.605 0.004 Y NA
 5818880 5818881 PLES_19611 PLES_19621 xcpV xcpW TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.004 Y NA
 5818881 5818882 PLES_19621 PLES_19631 xcpW xcpX TRUE 0.991 -3.000 0.024 1.000 Y NA
 5818882 5818883 PLES_19631 PLES_19641 xcpX xcpY TRUE 0.995 -3.000 0.020 0.065 Y NA
 5818883 5818884 PLES_19641 PLES_19651 xcpY xcpZ TRUE 0.998 2.000 0.811 1.000 Y NA
 5818884 5818885 PLES_19651 PLES_19652 xcpZ   FALSE 0.083 139.000 0.000 NA   NA
 5818885 5818886 PLES_19652 PLES_19653     TRUE 0.579 17.000 0.000 NA   NA
 5818886 5818887 PLES_19653 PLES_19654     FALSE 0.108 115.000 0.000 NA   NA
 5818888 5818889 PLES_19661 PLES_19671     TRUE 0.996 -3.000 0.615 1.000   NA
 5818890 5818891 PLES_19681 PLES_19691 fadH1   FALSE 0.024 337.000 0.024 NA   NA
 5818891 5818892 PLES_19691 PLES_19701     TRUE 0.759 38.000 0.099 NA   NA
 5818894 5818895 PLES_19721 PLES_19731     TRUE 0.955 0.000 0.045 1.000   NA
 5818895 5818896 PLES_19731 PLES_19741     TRUE 0.984 -3.000 0.131 1.000   NA
 5818896 5818897 PLES_19741 PLES_19751     TRUE 0.549 84.000 0.124 NA   NA
 5818897 5818898 PLES_19751 PLES_19761     TRUE 0.839 33.000 0.168 NA   NA
 5818898 5818899 PLES_19761 PLES_19771   pepN TRUE 0.821 19.000 0.059 NA   NA
 5818899 5818900 PLES_19771 PLES_19781 pepN gbt FALSE 0.007 447.000 0.000 NA   NA
 5818900 5818901 PLES_19781 PLES_19791 gbt   TRUE 0.889 59.000 0.600 NA   NA
 5818901 5818902 PLES_19791 PLES_19801     FALSE 0.198 180.000 0.091 NA   NA
 5818902 5818903 PLES_19801 PLES_19811     TRUE 0.982 13.000 0.409 0.065   NA
 5818904 5818905 PLES_19821 PLES_19831     TRUE 0.997 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 5818905 5818906 PLES_19831 PLES_19841     FALSE 0.270 62.000 0.000 1.000   NA
 5818906 5818907 PLES_19841 PLES_19851     FALSE 0.274 54.000 0.000 NA   NA
 5818907 5818908 PLES_19851 PLES_19861     TRUE 0.990 -3.000 0.258 NA   NA
 5818908 5818909 PLES_19861 PLES_19871     TRUE 0.986 -3.000 0.171 NA   NA
 5818909 5818910 PLES_19871 PLES_19881     TRUE 0.992 -7.000 0.314 NA   NA
 5818910 5818911 PLES_19881 PLES_19891     TRUE 0.994 -3.000 0.484 NA   NA
 5818911 5818912 PLES_19891 PLES_19901     TRUE 0.943 11.000 0.179 NA   NA
 5818913 5818914 PLES_19911 PLES_19921   gdhB FALSE 0.017 273.000 0.000 NA   NA
 5818914 5818915 PLES_19921 PLES_19931 gdhB   FALSE 0.088 148.000 0.000 1.000   NA
 5818915 5818916 PLES_19931 PLES_19941     TRUE 0.903 43.000 0.429 1.000   NA
 5818916 5818917 PLES_19941 PLES_19951     TRUE 0.640 13.000 0.000 NA   NA
 5818917 5818918 PLES_19951 PLES_19961   pelA FALSE 0.006 482.000 0.000 NA   NA
 5818918 5818919 PLES_19961 PLES_19971 pelA pelB TRUE 0.909 -22.000 0.000 1.000   NA
 5818919 5818920 PLES_19971 PLES_19981 pelB pelC FALSE 0.373 40.000 0.000 NA   NA
 5818920 5818921 PLES_19981 PLES_19991 pelC pelD TRUE 0.980 6.000 0.400 NA   NA
 5818921 5818922 PLES_19991 PLES_20001 pelD pelE TRUE 0.991 -22.000 0.333 NA   NA
 5818922 5818923 PLES_20001 PLES_20011 pelE pelF TRUE 0.996 -3.000 0.600 1.000   NA
 5818923 5818924 PLES_20011 PLES_20021 pelF pelG TRUE 0.994 2.000 0.889 NA   NA
 5818926 5818927 PLES_20041 PLES_20051     FALSE 0.420 38.000 0.000 1.000   NA
 5818928 5818929 PLES_20061 PLES_20071     FALSE 0.067 168.000 0.000 1.000   NA
 5818930 5818931 PLES_20081 PLES_20091   pyrD FALSE 0.421 57.000 0.019 NA   NA
 5818932 5818933 PLES_20101 PLES_20111 rmf   FALSE 0.052 176.000 0.000 NA   NA
 5818936 5818937 PLES_20141 PLES_20151     FALSE 0.007 426.000 0.000 NA   NA
 5818937 5818938 PLES_20151 PLES_20161     TRUE 0.967 14.000 0.000 0.019 Y NA
 5818939 5818940 PLES_20171 PLES_20181     FALSE 0.211 117.000 0.024 NA   NA
 5818940 5818941 PLES_20181 PLES_20191     TRUE 0.865 14.000 0.065 NA   NA
 5818941 5818942 PLES_20191 PLES_20201     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5818944 5818945 PLES_20221 PLES_20231     FALSE 0.065 169.000 0.000 1.000   NA
 5818945 5818946 PLES_20231 PLES_20241     TRUE 0.878 0.000 0.000 1.000   NA
 5818946 5818947 PLES_20241 PLES_20251     TRUE 0.615 17.000 0.000 1.000   NA
 5818948 5818949 PLES_20261 PLES_20271     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 5818949 5818950 PLES_20271 PLES_20281   snr1 FALSE 0.009 368.000 0.000 NA   NA
 5818951 5818952 PLES_20282 PLES_20291     FALSE 0.070 154.000 0.000 NA   NA
 5818952 5818953 PLES_20291 PLES_20301   mobA FALSE 0.090 132.000 0.000 NA   NA
 5818954 5818955 PLES_20311 PLES_20321 moaB2 moeA2 TRUE 0.998 -3.000 0.073 0.002 Y NA
 5818957 5818958 PLES_20341 PLES_20351     TRUE 0.993 6.000 0.352 1.000 Y NA
 5818958 5818959 PLES_20351 PLES_20361     TRUE 0.976 21.000 0.365 0.001 N NA
 5818959 5818960 PLES_20361 PLES_20371     FALSE 0.177 75.000 0.000 1.000 N NA
 5818960 5818961 PLES_20371 PLES_20381     FALSE 0.141 103.000 0.000 1.000   NA
 5818962 5818963 PLES_20401 PLES_20411     FALSE 0.259 57.000 0.000 NA   NA
 5818963 5818964 PLES_20411 PLES_20421     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5818965 5818966 PLES_20431 PLES_20441     FALSE 0.145 150.000 0.019 NA   NA
 5818970 5818971 PLES_20481 PLES_20491 faoA foaB TRUE 0.984 31.000 0.607 1.000 Y NA
 5818971 5818972 PLES_20491 PLES_20501 foaB   TRUE 0.472 83.000 0.070 NA   NA
 5818972 5818973 PLES_20501 PLES_20511   topA FALSE 0.236 91.000 0.007 NA   NA
 5818973 5818974 PLES_20511 PLES_20521 topA   FALSE 0.195 107.000 0.011 NA   NA
 5818974 5818975 PLES_20521 PLES_20531     FALSE 0.332 206.000 0.348 NA   NA
 5818976 5818977 PLES_20541 PLES_20551   lexA TRUE 0.913 12.000 0.122 1.000 N NA
 5818978 5818979 PLES_20561 PLES_20571 psrA nagZ FALSE 0.070 210.000 0.028 1.000 N NA
 5818979 5818980 PLES_20571 PLES_20581 nagZ   TRUE 0.787 12.000 0.018 1.000 N NA
 5818981 5818982 PLES_20591 PLES_20601   mfd TRUE 0.902 11.000 0.071 NA   NA
 5818983 5818984 PLES_20611 PLES_20621   aroP1 FALSE 0.113 102.000 0.000 1.000 N NA
 5818984 5818985 PLES_20621 PLES_20631 aroP1 nqrA FALSE 0.017 259.000 0.000 1.000 N NA
 5818985 5818986 PLES_20631 PLES_20641 nqrA nqrB TRUE 0.999 4.000 0.618 0.001 Y NA
 5818986 5818987 PLES_20641 PLES_20651 nqrB nqrC TRUE 0.999 -7.000 0.538 0.001 Y NA
 5818987 5818988 PLES_20651 PLES_20661 nqrC nqrD TRUE 0.999 -3.000 0.188 0.001 Y NA
 5818988 5818989 PLES_20661 PLES_20671 nqrD nqrE TRUE 0.998 0.000 0.240 0.001 Y NA
 5818989 5818990 PLES_20671 PLES_20681 nqrE nqrF TRUE 0.998 11.000 0.700 0.001 Y NA
 5818990 5818991 PLES_20681 PLES_20691 nqrF   TRUE 0.986 -7.000 0.189 1.000 N NA
 5818991 5818992 PLES_20691 PLES_20701     TRUE 0.983 -3.000 0.137 NA   NA
 5818992 5818993 PLES_20701 PLES_20711   sth FALSE 0.227 179.000 0.121 NA   NA
 5818994 5818995 PLES_20721 PLES_20731     FALSE 0.090 315.000 0.192 NA   NA
 5818996 5818997 PLES_20741 PLES_20751     TRUE 0.981 -7.000 0.025 0.068 N NA
 5818997 5818998 PLES_20751 PLES_20761     TRUE 0.987 13.000 0.620 0.068 N NA
 5819000 5819001 PLES_20781 PLES_20791     TRUE 0.466 73.000 0.045 1.000   NA
 5819001 5819002 PLES_20791 PLES_20801     TRUE 0.999 -3.000 0.746 0.068 Y NA
 5819002 5819003 PLES_20801 PLES_20811   lpxK TRUE 0.967 0.000 0.096 1.000 N NA
 5819003 5819004 PLES_20811 PLES_20821 lpxK   TRUE 0.868 38.000 0.263 NA   NA
 5819004 5819005 PLES_20821 PLES_20831   kdsB TRUE 0.985 0.000 0.265 NA   NA
 5819005 5819006 PLES_20831 PLES_20841 kdsB ptpA TRUE 0.952 0.000 0.050 1.000 N NA
 5819006 5819007 PLES_20841 PLES_20851 ptpA murB TRUE 0.969 -3.000 0.050 1.000 N NA
 5819009 5819010 PLES_20871 PLES_20881   rluC FALSE 0.011 343.000 0.000 NA   NA
 5819010 5819011 PLES_20881 PLES_20891 rluC   TRUE 0.994 -7.000 0.389 1.000   NA
 5819011 5819012 PLES_20891 PLES_20901     TRUE 0.984 -7.000 0.134 1.000   NA
 5819014 5819015 PLES_20921 PLES_20931   rpmF TRUE 0.975 14.000 0.599 NA   NA
 5819015 5819016 PLES_20931 PLES_20941 rpmF plsX TRUE 0.916 34.000 0.418 1.000 N NA
 5819016 5819017 PLES_20941 PLES_20951 plsX fabD TRUE 0.864 106.000 0.106 0.003 Y NA
 5819017 5819018 PLES_20951 PLES_20961 fabD fabG TRUE 0.992 23.000 0.432 0.003 Y NA
 5819018 5819019 PLES_20961 PLES_20971 fabG acpP TRUE 0.799 196.000 0.321 0.003 Y NA
 5819019 5819020 PLES_20971 PLES_20981 acpP fabF1 TRUE 0.829 129.000 0.346 1.000 Y NA
 5819020 5819021 PLES_20981 PLES_20991 fabF1 pabC TRUE 0.979 0.000 0.187 1.000 N NA
 5819021 5819022 PLES_20991 PLES_21001 pabC   TRUE 0.964 6.000 0.204 NA   NA
 5819022 5819023 PLES_21001 PLES_21011   tmk TRUE 0.878 29.000 0.209 NA   NA
 5819023 5819024 PLES_21011 PLES_21021 tmk holB TRUE 0.993 -7.000 0.211 0.084 N NA
 5819024 5819025 PLES_21021 PLES_21031 holB pilZ TRUE 0.905 34.000 0.382 NA N NA
 5819025 5819026 PLES_21031 PLES_21041 pilZ   TRUE 0.866 15.000 0.089 NA N NA
 5819027 5819028 PLES_21042 PLES_21051     TRUE 0.758 6.000 0.000 NA   NA
 5819029 5819030 PLES_21061 PLES_21071     FALSE 0.219 150.000 0.058 1.000 N NA
 5819030 5819031 PLES_21071 PLES_21081     TRUE 0.570 65.000 0.077 NA   NA
 5819031 5819032 PLES_21081 PLES_21091     TRUE 0.973 -7.000 0.062 NA   NA
 5819034 5819035 PLES_21111 PLES_21121 etfB etfA TRUE 0.991 0.000 0.000 0.018 Y NA
 5819035 5819036 PLES_21121 PLES_21131 etfA   FALSE 0.046 185.000 0.000 NA   NA
 5819037 5819038 PLES_21141 PLES_21151   cobM FALSE 0.107 129.000 0.000 1.000   NA
 5819038 5819039 PLES_21151 PLES_21161 cobM   TRUE 0.987 -3.000 0.025 0.006   NA
 5819039 5819040 PLES_21161 PLES_21171     TRUE 0.601 73.000 0.132 NA   NA
 5819041 5819042 PLES_21181 PLES_21191   cobN TRUE 0.738 76.000 0.274 1.000   NA
 5819043 5819044 PLES_21201 PLES_21202     FALSE 0.028 223.000 0.000 NA   NA
 5819045 5819046 PLES_21211 PLES_21221     TRUE 0.987 21.000 0.568 NA Y NA
 5819046 5819047 PLES_21221 PLES_21231     FALSE 0.075 122.000 0.000 NA N NA
 5819050 5819051 PLES_21261 PLES_21271     FALSE 0.139 96.000 0.000 NA   NA
 5819053 5819054 PLES_21291 PLES_21301     TRUE 0.526 22.000 0.000 NA   NA
 5819054 5819055 PLES_21301 PLES_21311   morB FALSE 0.177 66.000 0.000 NA N NA
 5819058 5819059 PLES_21341 PLES_21371     FALSE 0.004 3148.000 0.000 NA   NA
 5819060 5819061 PLES_21381 PLES_21391 hisP hisM TRUE 0.904 21.000 0.000 1.000 Y NA
 5819061 5819062 PLES_21391 PLES_21401 hisM hisQ TRUE 0.999 -3.000 0.800 0.011 Y NA
 5819062 5819063 PLES_21401 PLES_21411 hisQ hisJ TRUE 0.848 56.000 0.000 0.068 Y NA
 5819063 5819064 PLES_21411 PLES_21421 hisJ   FALSE 0.277 60.000 0.000 1.000   NA
 5819065 5819066 PLES_21431 PLES_21441     FALSE 0.154 85.000 0.000 1.000 N NA
 5819067 5819068 PLES_21451 PLES_21461     TRUE 0.568 51.000 0.045 NA   NA
 5819069 5819070 PLES_21471 PLES_21481     TRUE 0.873 51.000 0.448 1.000 N NA
 5819070 5819071 PLES_21481 PLES_21491     FALSE 0.117 120.000 0.000 1.000   NA
 5819072 5819073 PLES_21501 PLES_21511     TRUE 0.999 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 5819073 5819074 PLES_21511 PLES_21521     TRUE 0.998 -3.000 0.368 1.000 Y NA
 5819074 5819075 PLES_21521 PLES_21531     TRUE 0.890 53.000 0.105 1.000 Y NA
 5819077 5819078 PLES_21551 PLES_21561 cobK cbiD TRUE 0.998 -3.000 0.123 0.006 Y NA
 5819078 5819079 PLES_21561 PLES_21571 cbiD cobL TRUE 0.997 -7.000 0.043 0.006 Y NA
 5819080 5819081 PLES_21581 PLES_21591   cobH TRUE 0.984 -3.000 0.149 1.000 N NA
 5819081 5819082 PLES_21591 PLES_21601 cobH cobI TRUE 0.998 -3.000 0.191 0.006 Y NA
 5819082 5819083 PLES_21601 PLES_21611 cobI cobJ TRUE 0.998 -7.000 0.097 0.006 Y NA
 5819083 5819084 PLES_21611 PLES_21621 cobJ   FALSE 0.188 70.000 0.000 1.000 N NA
 5819084 5819085 PLES_21621 PLES_21631     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819085 5819086 PLES_21631 PLES_21641     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5819086 5819087 PLES_21641 PLES_21651     FALSE 0.036 194.000 0.000 1.000 N NA
 5819087 5819088 PLES_21651 PLES_21661     FALSE 0.168 86.000 0.000 NA   NA
 5819088 5819089 PLES_21661 PLES_21671     FALSE 0.028 222.000 0.000 NA   NA
 5819089 5819090 PLES_21671 PLES_21681     FALSE 0.147 329.000 0.000 0.083 Y NA
 5819090 5819091 PLES_21681 PLES_21691     TRUE 0.963 -3.000 0.034 NA   NA
 5819091 5819092 PLES_21691 PLES_21701     FALSE 0.010 346.000 0.000 NA   NA
 5819093 5819094 PLES_21711 PLES_21721 atuH atuG TRUE 0.808 162.000 0.250 0.071 Y NA
 5819094 5819095 PLES_21721 PLES_21731 atuG atuF TRUE 0.958 52.000 0.227 0.071 Y NA
 5819095 5819096 PLES_21731 PLES_21741 atuF atuE TRUE 0.984 46.000 0.600 0.071 Y NA
 5819096 5819097 PLES_21741 PLES_21751 atuE atuD TRUE 0.980 21.000 0.316 1.000 Y NA
 5819097 5819098 PLES_21751 PLES_21761 atuD atuC TRUE 0.890 117.000 0.544 1.000 Y NA
 5819098 5819099 PLES_21761 PLES_21771 atuC atuB TRUE 0.997 2.000 0.510 1.000 Y NA
 5819099 5819100 PLES_21771 PLES_21781 atuB atuA TRUE 0.718 70.000 0.239 NA   NA
 5819102 5819103 PLES_21801 PLES_21811     FALSE 0.024 233.000 0.000 NA   NA
 5819104 5819105 PLES_21821 PLES_21831     TRUE 0.848 2.000 0.000 1.000   NA
 5819109 5819110 PLES_21871 PLES_21881   pyrF FALSE 0.122 97.000 0.000 1.000 N NA
 5819110 5819111 PLES_21881 PLES_21891 pyrF   FALSE 0.029 230.000 0.000 1.000   NA
 5819111 5819112 PLES_21891 PLES_21901     TRUE 0.995 0.000 0.739 NA   NA
 5819112 5819113 PLES_21901 PLES_21911     TRUE 0.996 -3.000 0.727 NA   NA
 5819113 5819114 PLES_21911 PLES_21921     TRUE 0.957 -3.000 0.025 NA   NA
 5819114 5819115 PLES_21921 PLES_21931     TRUE 0.550 81.000 0.116 NA   NA
 5819116 5819117 PLES_21941 PLES_21951     TRUE 0.743 10.000 0.000 1.000   NA
 5819117 5819118 PLES_21951 PLES_21961     FALSE 0.166 87.000 0.000 NA   NA
 5819118 5819119 PLES_21961 PLES_21971     TRUE 0.571 126.000 0.312 NA   NA
 5819119 5819120 PLES_21971 PLES_21981   mttC FALSE 0.275 139.000 0.089 NA N NA
 5819121 5819122 PLES_21991 PLES_22001     TRUE 0.727 99.000 0.444 NA   NA
 5819123 5819124 PLES_22011 PLES_22021 lipH lipA FALSE 0.168 206.000 0.109 1.000   NA
 5819124 5819125 PLES_22021 PLES_22031 lipA ligT FALSE 0.071 196.000 0.005 1.000   NA
 5819127 5819128 PLES_22051 PLES_22061 greB   TRUE 0.546 52.000 0.053 NA N NA
 5819128 5819129 PLES_22061 PLES_22071     TRUE 0.994 9.000 0.535 NA Y NA
 5819130 5819131 PLES_22081 PLES_22091 tesA   TRUE 0.483 56.000 0.031 NA   NA
 5819131 5819132 PLES_22091 PLES_22101     TRUE 0.864 78.000 0.667 NA   NA
 5819133 5819134 PLES_22111 PLES_22112 oprI   FALSE 0.008 417.000 0.000 NA   NA
 5819135 5819136 PLES_22121 PLES_22131   efp TRUE 0.694 43.000 0.074 NA   NA
 5819137 5819138 PLES_22141 PLES_22151 ohr   TRUE 0.506 145.000 0.314 1.000 N NA
 5819138 5819139 PLES_22151 PLES_22161     TRUE 0.870 86.000 0.086 0.082 Y NA
 5819142 5819143 PLES_22191 PLES_22201     FALSE 0.295 83.000 0.015 NA   NA
 5819146 5819147 PLES_22231 PLES_22241     FALSE 0.084 137.000 0.000 NA   NA
 5819149 5819150 PLES_22261 PLES_22271     FALSE 0.175 91.000 0.000 1.000   NA
 5819150 5819151 PLES_22271 PLES_22281     FALSE 0.362 37.000 0.000 1.000 N NA
 5819151 5819152 PLES_22281 PLES_22291     TRUE 0.993 -3.000 0.423 1.000 N NA
 5819152 5819153 PLES_22291 PLES_22301     TRUE 0.967 12.000 0.385 NA   NA
 5819153 5819154 PLES_22301 PLES_22311     TRUE 0.585 138.000 0.400 NA   NA
 5819155 5819156 PLES_22321 PLES_22331   tpm FALSE 0.294 56.000 0.000 1.000   NA
 5819157 5819158 PLES_22341 PLES_22351   htpX FALSE 0.258 141.000 0.000 0.021 N NA
 5819158 5819159 PLES_22351 PLES_22361 htpX   FALSE 0.192 134.000 0.029 NA   NA
 5819159 5819160 PLES_22361 PLES_22371     TRUE 0.526 52.000 0.036 NA   NA
 5819161 5819162 PLES_22381 PLES_22391     TRUE 0.631 112.000 0.036 1.000 Y NA
 5819162 5819163 PLES_22391 PLES_22401     TRUE 0.965 -3.000 0.041 1.000 N NA
 5819165 5819166 PLES_22421 PLES_22431     TRUE 0.952 -3.000 0.019 NA   NA
 5819167 5819168 PLES_22441 PLES_22451     TRUE 0.773 62.000 0.267 NA   NA
 5819169 5819170 PLES_22452 PLES_22453     TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 5819170 5819171 PLES_22453 PLES_22454     FALSE 0.172 85.000 0.000 NA   NA
 5819172 5819173 PLES_22461 PLES_22471     TRUE 0.910 63.000 0.800 NA   NA
 5819173 5819174 PLES_22471 PLES_22481     TRUE 0.549 151.000 0.400 NA   NA
 5819174 5819175 PLES_22481 PLES_22491     FALSE 0.274 54.000 0.000 NA   NA
 5819175 5819176 PLES_22491 PLES_22501     FALSE 0.026 229.000 0.000 NA   NA
 5819176 5819177 PLES_22501 PLES_22511     FALSE 0.291 51.000 0.000 NA   NA
 5819177 5819178 PLES_22511 PLES_22521     TRUE 0.931 31.000 0.444 NA   NA
 5819178 5819179 PLES_22521 PLES_22531     TRUE 0.824 69.000 0.444 NA   NA
 5819179 5819180 PLES_22531 PLES_22541     TRUE 0.593 66.000 0.105 1.000 N NA
 5819180 5819181 PLES_22541 PLES_22551     FALSE 0.018 265.000 0.000 NA   NA
 5819181 5819182 PLES_22551 PLES_22561     FALSE 0.252 59.000 0.000 NA   NA
 5819182 5819183 PLES_22561 PLES_22571     FALSE 0.094 129.000 0.000 NA   NA
 5819184 5819185 PLES_22581 PLES_22591     FALSE 0.304 115.000 0.056 NA   NA
 5819185 5819186 PLES_22591 PLES_22601     FALSE 0.401 76.000 0.039 1.000 N NA
 5819186 5819187 PLES_22601 PLES_22611     TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.083 Y NA
 5819188 5819189 PLES_22621 PLES_22631 copS copR TRUE 1.000 -3.000 0.857 0.002 Y NA
 5819190 5819191 PLES_22641 PLES_22651 ptrA   FALSE 0.054 172.000 0.000 NA   NA
 5819191 5819192 PLES_22651 PLES_22661     FALSE 0.235 118.000 0.027 1.000   NA
 5819193 5819194 PLES_22671 PLES_22681     FALSE 0.199 74.000 0.000 NA   NA
 5819194 5819195 PLES_22681 PLES_22691     TRUE 0.965 -3.000 0.036 NA   NA
 5819200 5819201 PLES_22741 PLES_22751     TRUE 0.998 -3.000 0.408 NA Y NA
 5819202 5819203 PLES_22761 PLES_22771 tal   FALSE 0.386 80.000 0.039 1.000 N NA
 5819203 5819204 PLES_22771 PLES_22781     FALSE 0.006 593.000 0.000 1.000   NA
 5819204 5819205 PLES_22781 PLES_22791     FALSE 0.085 298.000 0.147 1.000   NA
 5819206 5819207 PLES_22801 PLES_22811     FALSE 0.183 81.000 0.000 NA   NA
 5819207 5819208 PLES_22811 PLES_22821     FALSE 0.145 94.000 0.000 NA   NA
 5819208 5819209 PLES_22821 PLES_22831     FALSE 0.011 329.000 0.000 NA   NA
 5819210 5819211 PLES_22841 PLES_22851     FALSE 0.007 435.000 0.000 NA   NA
 5819213 5819214 PLES_22871 PLES_22881 cpg2   FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 5819214 5819215 PLES_22881 PLES_22891     FALSE 0.108 115.000 0.000 NA   NA
 5819215 5819216 PLES_22891 PLES_22901     TRUE 0.980 9.000 0.491 NA   NA
 5819216 5819217 PLES_22901 PLES_22911     FALSE 0.055 171.000 0.000 NA   NA
 5819217 5819218 PLES_22911 PLES_22921     TRUE 0.820 78.000 0.500 NA   NA
 5819218 5819219 PLES_22921 PLES_22931     FALSE 0.006 479.000 0.000 NA   NA
 5819219 5819220 PLES_22931 PLES_22941     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819221 5819222 PLES_22951 PLES_22961     TRUE 0.924 33.000 0.429 NA   NA
 5819222 5819223 PLES_22961 PLES_22971     FALSE 0.204 82.000 0.000 1.000   NA
 5819225 5819226 PLES_22982 PLES_22991     FALSE 0.042 192.000 0.000 NA   NA
 5819226 5819227 PLES_22991 PLES_23001     TRUE 0.960 5.000 0.167 NA   NA
 5819227 5819228 PLES_23001 PLES_23011     FALSE 0.038 199.000 0.000 NA   NA
 5819232 5819233 PLES_23051 PLES_23061     FALSE 0.166 87.000 0.000 NA   NA
 5819233 5819234 PLES_23061 PLES_23071     TRUE 0.562 22.000 0.000 1.000   NA
 5819235 5819236 PLES_23081 PLES_23091     TRUE 0.758 6.000 0.000 NA   NA
 5819237 5819238 PLES_23101 PLES_23111     FALSE 0.011 342.000 0.000 NA   NA
 5819242 5819243 PLES_23151 PLES_23161     FALSE 0.112 112.000 0.000 NA   NA
 5819244 5819245 PLES_23171 PLES_23181     FALSE 0.112 112.000 0.000 NA   NA
 5819248 5819249 PLES_23211 PLES_23221     FALSE 0.083 139.000 0.000 NA   NA
 5819250 5819251 PLES_23231 PLES_23241 eco   FALSE 0.010 349.000 0.000 NA   NA
 5819253 5819254 PLES_23261 PLES_23271     FALSE 0.113 111.000 0.000 NA   NA
 5819258 5819259 PLES_23311 PLES_23321   endA TRUE 0.589 19.000 0.000 1.000   NA
 5819260 5819261 PLES_23331 PLES_23341     FALSE 0.274 54.000 0.000 NA   NA
 5819261 5819262 PLES_23341 PLES_23351     FALSE 0.038 199.000 0.000 NA   NA
 5819263 5819264 PLES_23361 PLES_23371     FALSE 0.172 85.000 0.000 NA   NA
 5819265 5819266 PLES_23381 PLES_23391   thrS FALSE 0.021 250.000 0.000 NA   NA
 5819266 5819267 PLES_23391 PLES_23401 thrS infC TRUE 0.974 18.000 0.186 1.000 Y NA
 5819267 5819268 PLES_23401 PLES_23411 infC rpmI TRUE 0.964 62.000 0.652 1.000 Y NA
 5819268 5819269 PLES_23411 PLES_23421 rpmI rplT TRUE 0.996 24.000 0.928 0.008 Y NA
 5819269 5819270 PLES_23421 PLES_23431 rplT pheS TRUE 0.826 98.000 0.202 1.000 Y NA
 5819270 5819271 PLES_23431 PLES_23441 pheS pheT TRUE 0.992 35.000 0.574 0.000 Y NA
 5819271 5819272 PLES_23441 PLES_23451 pheT himA TRUE 0.968 4.000 0.208 1.000 N NA
 5819272 5819273 PLES_23451 PLES_23461 himA   TRUE 0.818 80.000 0.535 1.000 N NA
 5819273 5819274 PLES_23461 PLES_23462     FALSE 0.158 90.000 0.000 NA   NA
 5819276 5819277 PLES_23481 PLES_23491     TRUE 0.756 33.000 0.000 0.042   NA
 5819277 5819278 PLES_23491 PLES_23501     FALSE 0.009 409.000 0.000 1.000   NA
 5819278 5819279 PLES_23501 PLES_23511     TRUE 0.991 3.000 0.684 NA   NA
 5819280 5819281 PLES_23521 PLES_23531     FALSE 0.006 483.000 0.000 NA   NA
 5819281 5819282 PLES_23531 PLES_23541     TRUE 0.822 77.000 0.500 NA   NA
 5819282 5819283 PLES_23541 PLES_23551     TRUE 0.820 78.000 0.500 NA   NA
 5819283 5819284 PLES_23551 PLES_23561     FALSE 0.005 557.000 0.000 NA   NA
 5819284 5819285 PLES_23561 PLES_23571     TRUE 0.968 -19.000 0.000 0.082   NA
 5819286 5819287 PLES_23581 PLES_23591     FALSE 0.007 420.000 0.000 NA   NA
 5819287 5819288 PLES_23591 PLES_23601     TRUE 0.878 0.000 0.000 1.000   NA
 5819288 5819289 PLES_23601 PLES_23611     FALSE 0.004 1307.000 0.000 NA   NA
 5819289 5819290 PLES_23611 PLES_23621     FALSE 0.004 828.000 0.000 NA   NA
 5819290 5819291 PLES_23621 PLES_23631     TRUE 0.997 -3.000 0.875 NA   NA
 5819291 5819292 PLES_23631 PLES_23641     FALSE 0.004 811.000 0.000 NA   NA
 5819293 5819294 PLES_23651 PLES_23661     FALSE 0.035 442.000 0.000 0.003   NA
 5819294 5819295 PLES_23661 PLES_23671     FALSE 0.015 289.000 0.000 NA   NA
 5819295 5819296 PLES_23671 PLES_23681     FALSE 0.060 166.000 0.000 NA   NA
 5819297 5819298 PLES_23691 PLES_23701     TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 5819299 5819300 PLES_23711 PLES_23721     TRUE 0.756 33.000 0.000 0.042   NA
 5819301 5819302 PLES_23731 PLES_23741     FALSE 0.005 644.000 0.000 NA   NA
 5819302 5819303 PLES_23741 PLES_23751     FALSE 0.004 741.000 0.000 NA   NA
 5819303 5819304 PLES_23751 PLES_23761     FALSE 0.149 93.000 0.000 NA   NA
 5819305 5819306 PLES_23771 PLES_23781     TRUE 0.948 15.000 0.308 1.000 N NA
 5819306 5819307 PLES_23781 PLES_23791     TRUE 0.997 2.000 0.550 1.000 Y NA
 5819307 5819308 PLES_23791 PLES_23801     FALSE 0.194 77.000 0.000 NA   NA
 5819308 5819309 PLES_23801 PLES_23811     FALSE 0.197 75.000 0.000 NA   NA
 5819309 5819310 PLES_23811 PLES_23821     FALSE 0.445 30.000 0.000 NA   NA
 5819310 5819311 PLES_23821 PLES_23831     FALSE 0.430 32.000 0.000 NA   NA
 5819313 5819314 PLES_23851 PLES_23861     FALSE 0.131 100.000 0.000 NA   NA
 5819315 5819316 PLES_23871 PLES_23881 cpo   FALSE 0.110 127.000 0.000 1.000   NA
 5819317 5819318 PLES_23891 PLES_23901     TRUE 0.957 17.000 0.000 0.060 Y NA
 5819320 5819321 PLES_23921 PLES_23931     FALSE 0.007 420.000 0.000 NA   NA
 5819321 5819322 PLES_23931 PLES_23941     FALSE 0.247 199.000 0.000 1.000 Y NA
 5819322 5819323 PLES_23941 PLES_23951   cysK TRUE 0.734 59.000 0.000 1.000 Y NA
 5819324 5819325 PLES_23961 PLES_23971     FALSE 0.169 163.000 0.041 NA   NA
 5819325 5819326 PLES_23971 PLES_23981     FALSE 0.418 65.000 0.020 1.000   NA
 5819326 5819327 PLES_23981 PLES_23991     TRUE 0.491 49.000 0.021 NA   NA
 5819327 5819328 PLES_23991 PLES_24001     FALSE 0.109 114.000 0.000 NA   NA
 5819329 5819330 PLES_24011 PLES_24021     TRUE 0.714 10.000 0.000 NA   NA
 5819330 5819331 PLES_24021 PLES_24031     FALSE 0.078 147.000 0.000 NA   NA
 5819331 5819332 PLES_24031 PLES_24041   opdB TRUE 0.955 3.000 0.100 NA   NA
 5819332 5819333 PLES_24041 PLES_24051 opdB   FALSE 0.341 49.000 0.000 1.000   NA
 5819334 5819335 PLES_24061 PLES_24071     FALSE 0.259 57.000 0.000 NA   NA
 5819335 5819336 PLES_24071 PLES_24081     FALSE 0.056 170.000 0.000 NA   NA
 5819336 5819337 PLES_24081 PLES_24091     FALSE 0.109 114.000 0.000 NA   NA
 5819337 5819338 PLES_24091 PLES_24101     FALSE 0.183 81.000 0.000 NA   NA
 5819339 5819340 PLES_24111 PLES_24121     FALSE 0.041 171.000 0.000 NA N NA
 5819342 5819343 PLES_24141 PLES_24151     FALSE 0.011 341.000 0.000 NA   NA
 5819343 5819344 PLES_24151 PLES_24161   pfeA TRUE 0.822 20.000 0.065 NA   NA
 5819344 5819345 PLES_24161 PLES_24171 pfeA pfeS TRUE 0.694 99.000 0.400 1.000 N NA
 5819345 5819346 PLES_24171 PLES_24181 pfeS pfeR TRUE 0.998 0.000 0.600 1.000 Y NA
 5819347 5819348 PLES_24191 PLES_24201     FALSE 0.300 50.000 0.000 NA   NA
 5819348 5819349 PLES_24201 PLES_24211     FALSE 0.007 351.000 0.000 NA N NA
 5819350 5819351 PLES_24221 PLES_24231     FALSE 0.041 183.000 0.000 1.000 N NA
 5819351 5819352 PLES_24231 PLES_24241     TRUE 0.935 23.000 0.357 1.000 N NA
 5819353 5819354 PLES_24251 PLES_24261     FALSE 0.004 590.000 0.000 1.000 N NA
 5819354 5819355 PLES_24261 PLES_24271     TRUE 0.981 -10.000 0.028 0.066 N NA
 5819355 5819356 PLES_24271 PLES_24281     TRUE 0.992 5.000 0.250 1.000 Y NA
 5819356 5819357 PLES_24281 PLES_24291     TRUE 0.975 54.000 0.364 0.004 Y NA
 5819357 5819358 PLES_24291 PLES_24301     TRUE 0.989 -31.000 0.273 NA   NA
 5819358 5819359 PLES_24301 PLES_24311     TRUE 0.990 0.000 0.400 NA   NA
 5819359 5819360 PLES_24311 PLES_24321     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819360 5819361 PLES_24321 PLES_24331     TRUE 0.901 -10.000 0.000 NA   NA
 5819361 5819362 PLES_24331 PLES_24341     FALSE 0.338 44.000 0.000 NA   NA
 5819362 5819363 PLES_24341 PLES_24351     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5819364 5819365 PLES_24371 PLES_24381     FALSE 0.015 308.000 0.000 1.000   NA
 5819365 5819366 PLES_24381 PLES_24391     FALSE 0.115 101.000 0.000 1.000 N NA
 5819367 5819368 PLES_24401 PLES_24411 fhp   FALSE 0.446 55.000 0.021 NA   NA
 5819368 5819369 PLES_24411 PLES_24421     TRUE 0.899 -13.000 0.000 NA   NA
 5819370 5819371 PLES_24431 PLES_24441     TRUE 0.724 27.000 0.037 NA   NA
 5819372 5819373 PLES_24451 PLES_24461     TRUE 0.997 0.000 0.619 0.002   NA
 5819373 5819374 PLES_24461 PLES_24471     TRUE 0.995 0.000 0.762 1.000   NA
 5819374 5819375 PLES_24471 PLES_24481     TRUE 0.999 -3.000 0.882 1.000 Y NA
 5819375 5819376 PLES_24481 PLES_24491     FALSE 0.155 91.000 0.000 NA   NA
 5819378 5819379 PLES_24511 PLES_24521     FALSE 0.267 114.000 0.034 1.000   NA
 5819379 5819380 PLES_24521 PLES_24531     FALSE 0.127 160.000 0.019 NA   NA
 5819381 5819382 PLES_24541 PLES_24551     FALSE 0.103 120.000 0.000 NA   NA
 5819382 5819383 PLES_24551 PLES_24561   nuoN FALSE 0.096 115.000 0.000 1.000 N NA
 5819383 5819384 PLES_24561 PLES_24571 nuoN nuoM TRUE 0.997 8.000 0.437 0.001 Y NA
 5819384 5819385 PLES_24571 PLES_24581 nuoM nuoL TRUE 0.995 28.000 0.713 0.001 Y NA
 5819385 5819386 PLES_24581 PLES_24591 nuoL nuoK TRUE 0.999 -3.000 0.211 0.003 Y NA
 5819386 5819387 PLES_24591 PLES_24601 nuoK nuoJ TRUE 0.976 46.000 0.269 0.002 Y NA
 5819387 5819388 PLES_24601 PLES_24611 nuoJ nuoI TRUE 0.996 12.000 0.428 0.003 Y NA
 5819388 5819389 PLES_24611 PLES_24621 nuoI nuoH TRUE 0.996 12.000 0.423 0.003 Y NA
 5819389 5819390 PLES_24621 PLES_24631 nuoH nuoG TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.003 Y NA
 5819390 5819391 PLES_24631 PLES_24641 nuoG nuoF TRUE 0.860 132.000 0.180 0.003 Y NA
 5819391 5819392 PLES_24641 PLES_24651 nuoF nuoE TRUE 0.998 -3.000 0.186 0.003 Y NA
 5819392 5819393 PLES_24651 PLES_24661 nuoE nuoD TRUE 0.998 2.000 0.407 0.003 Y NA
 5819393 5819394 PLES_24661 PLES_24671 nuoD nuoB TRUE 0.978 81.000 0.691 0.002 Y NA
 5819394 5819395 PLES_24671 PLES_24681 nuoB nuoA TRUE 0.996 11.000 0.377 0.002 Y NA
 5819395 5819396 PLES_24681 PLES_24691 nuoA   FALSE 0.008 410.000 0.000 NA   NA
 5819396 5819397 PLES_24691 PLES_24701     FALSE 0.188 79.000 0.000 NA   NA
 5819397 5819398 PLES_24701 PLES_24711   aceA FALSE 0.141 179.000 0.044 NA   NA
 5819398 5819399 PLES_24711 PLES_24721 aceA   FALSE 0.006 595.000 0.000 1.000   NA
 5819399 5819400 PLES_24721 PLES_24731     TRUE 0.991 -3.000 0.280 NA   NA
 5819400 5819401 PLES_24731 PLES_24741     TRUE 0.960 7.000 0.191 NA   NA
 5819401 5819402 PLES_24741 PLES_24751     TRUE 0.986 -7.000 0.167 NA   NA
 5819402 5819403 PLES_24751 PLES_24761   purB FALSE 0.448 60.000 0.029 NA   NA
 5819403 5819404 PLES_24761 PLES_24771 purB   FALSE 0.277 76.000 0.002 NA   NA
 5819404 5819405 PLES_24771 PLES_24781     TRUE 0.889 3.000 0.014 NA   NA
 5819405 5819406 PLES_24781 PLES_24791   trmU TRUE 0.986 -3.000 0.180 NA   NA
 5819406 5819407 PLES_24791 PLES_24801 trmU   TRUE 0.769 44.000 0.158 1.000 N NA
 5819407 5819408 PLES_24801 PLES_24811   idh FALSE 0.328 87.000 0.032 1.000 N NA
 5819411 5819412 PLES_24841 PLES_24851   clpA TRUE 0.953 28.000 0.596 NA   NA
 5819413 5819414 PLES_24861 PLES_24871 infA   FALSE 0.363 105.000 0.078 1.000 N NA
 5819414 5819415 PLES_24871 PLES_24881   aat TRUE 0.935 55.000 0.285 1.000 Y NA
 5819415 5819416 PLES_24881 PLES_24891 aat trxB1 TRUE 0.903 38.000 0.046 1.000 Y NA
 5819417 5819418 PLES_24901 PLES_24911 ftsK lolA TRUE 0.918 26.000 0.305 1.000 N NA
 5819418 5819419 PLES_24911 PLES_24921 lolA   TRUE 0.944 10.000 0.167 1.000 N NA
 5819419 5819420 PLES_24921 PLES_24931   serS TRUE 0.486 122.000 0.078 0.081 N NA
 5819420 5819421 PLES_24931 PLES_24941 serS cysG TRUE 0.921 2.000 0.031 1.000 N NA
 5819422 5819423 PLES_24951 PLES_24961     FALSE 0.367 88.000 0.051 NA N NA
 5819423 5819424 PLES_24961 PLES_24971     FALSE 0.297 119.000 0.072 NA N NA
 5819424 5819425 PLES_24971 PLES_24981     TRUE 0.997 -3.000 0.317 NA Y NA
 5819425 5819426 PLES_24981 PLES_24991     TRUE 0.998 0.000 0.804 NA Y NA
 5819426 5819427 PLES_24991 PLES_25001     TRUE 0.999 -3.000 0.790 NA Y NA
 5819427 5819428 PLES_25001 PLES_25011     TRUE 0.476 111.000 0.167 NA   NA
 5819430 5819431 PLES_25021 PLES_25031     FALSE 0.338 44.000 0.000 NA   NA
 5819431 5819432 PLES_25031 PLES_25041     FALSE 0.188 79.000 0.000 NA   NA
 5819432 5819433 PLES_25041 PLES_25051     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819433 5819434 PLES_25051 PLES_25061     TRUE 0.893 -36.000 0.000 NA   NA
 5819434 5819435 PLES_25061 PLES_25071     FALSE 0.178 83.000 0.000 NA   NA
 5819435 5819436 PLES_25071 PLES_25081     TRUE 0.515 23.000 0.000 NA   NA
 5819436 5819437 PLES_25081 PLES_25091     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819437 5819438 PLES_25091 PLES_25101     FALSE 0.104 119.000 0.000 NA   NA
 5819438 5819439 PLES_25101 PLES_25111     FALSE 0.033 208.000 0.000 NA   NA
 5819439 5819440 PLES_25111 PLES_25121     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5819440 5819441 PLES_25121 PLES_25131     FALSE 0.095 310.000 0.000 1.000 Y NA
 5819441 5819442 PLES_25131 PLES_25141     FALSE 0.026 227.000 0.000 NA   NA
 5819442 5819443 PLES_25141 PLES_25151     FALSE 0.010 351.000 0.000 NA   NA
 5819443 5819444 PLES_25151 PLES_25161     FALSE 0.013 307.000 0.000 NA   NA
 5819444 5819445 PLES_25161 PLES_25171   cI FALSE 0.005 566.000 0.000 NA   NA
 5819446 5819447 PLES_25181 PLES_25191     FALSE 0.421 33.000 0.000 NA   NA
 5819447 5819448 PLES_25191 PLES_25201     FALSE 0.011 337.000 0.000 NA   NA
 5819448 5819449 PLES_25201 PLES_25211     FALSE 0.009 382.000 0.000 NA   NA
 5819449 5819450 PLES_25211 PLES_25221     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819450 5819451 PLES_25221 PLES_25231     TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5819451 5819452 PLES_25231 PLES_25241     FALSE 0.107 116.000 0.000 NA   NA
 5819452 5819453 PLES_25241 PLES_25251     FALSE 0.040 195.000 0.000 NA   NA
 5819453 5819454 PLES_25251 PLES_25261     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5819454 5819455 PLES_25261 PLES_25271     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819455 5819456 PLES_25271 PLES_25281     FALSE 0.009 359.000 0.000 NA   NA
 5819456 5819457 PLES_25281 PLES_25291     TRUE 0.991 -3.000 0.286 NA   NA
 5819457 5819458 PLES_25291 PLES_25292     FALSE 0.005 590.000 0.000 NA   NA
 5819458 5819459 PLES_25292 PLES_25293     TRUE 0.594 16.000 0.000 NA   NA
 5819459 5819460 PLES_25293 PLES_25294     TRUE 0.741 8.000 0.000 NA   NA
 5819460 5819461 PLES_25294 PLES_25311     FALSE 0.285 52.000 0.000 NA   NA
 5819461 5819462 PLES_25311 PLES_25321     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5819462 5819463 PLES_25321 PLES_25331   orf91 TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5819463 5819464 PLES_25331 PLES_25341 orf91 orf93 FALSE 0.105 118.000 0.000 NA   NA
 5819464 5819465 PLES_25341 PLES_25351 orf93 orf94 TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5819465 5819466 PLES_25351 PLES_25361 orf94   FALSE 0.158 90.000 0.000 NA   NA
 5819466 5819467 PLES_25361 PLES_25371     FALSE 0.031 213.000 0.000 NA   NA
 5819467 5819468 PLES_25371 PLES_25381     TRUE 0.955 2.000 0.080 NA   NA
 5819468 5819469 PLES_25381 PLES_25391     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819469 5819470 PLES_25391 PLES_25401     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5819470 5819471 PLES_25401 PLES_25411     FALSE 0.090 132.000 0.000 NA   NA
 5819471 5819472 PLES_25411 PLES_25421     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819472 5819473 PLES_25421 PLES_25431     FALSE 0.059 167.000 0.000 NA   NA
 5819473 5819474 PLES_25431 PLES_25441     TRUE 0.897 -19.000 0.000 NA   NA
 5819474 5819475 PLES_25441 PLES_25451     TRUE 0.840 1.000 0.000 NA   NA
 5819475 5819476 PLES_25451 PLES_25461     FALSE 0.004 787.000 0.000 NA   NA
 5819476 5819477 PLES_25461 PLES_25471     TRUE 0.553 19.000 0.000 NA   NA
 5819477 5819478 PLES_25471 PLES_25481     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5819478 5819479 PLES_25481 PLES_25491     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5819479 5819480 PLES_25491 PLES_25501     TRUE 0.991 3.000 0.635 NA   NA
 5819482 5819483 PLES_25521 PLES_25531     TRUE 0.987 10.000 0.778 NA   NA
 5819483 5819484 PLES_25531 PLES_25541     TRUE 0.984 6.000 0.500 NA   NA
 5819484 5819485 PLES_25541 PLES_25551     FALSE 0.300 50.000 0.000 NA   NA
 5819485 5819486 PLES_25551 PLES_25561     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819486 5819487 PLES_25561 PLES_25571     TRUE 0.991 -16.000 0.333 NA   NA
 5819487 5819488 PLES_25571 PLES_25581     TRUE 0.770 5.000 0.000 NA   NA
 5819488 5819489 PLES_25581 PLES_25591     TRUE 0.894 -28.000 0.000 NA   NA
 5819489 5819490 PLES_25591 PLES_25601     FALSE 0.248 60.000 0.000 NA   NA
 5819490 5819491 PLES_25601 PLES_25611     TRUE 0.640 13.000 0.000 NA   NA
 5819491 5819492 PLES_25611 PLES_25621     FALSE 0.365 45.000 0.000 1.000   NA
 5819492 5819493 PLES_25621 PLES_25631     FALSE 0.197 75.000 0.000 NA   NA
 5819493 5819494 PLES_25631 PLES_25641   orf32 TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819494 5819495 PLES_25641 PLES_25651 orf32 orf34 FALSE 0.009 362.000 0.000 NA   NA
 5819496 5819497 PLES_25661 PLES_25671     FALSE 0.007 424.000 0.000 NA   NA
 5819497 5819498 PLES_25671 PLES_25681     TRUE 0.976 -3.000 0.064 1.000   NA
 5819499 5819500 PLES_25691 PLES_25701     FALSE 0.010 340.000 0.000 1.000 N NA
 5819500 5819501 PLES_25701 PLES_25711     TRUE 0.985 10.000 0.667 1.000 N NA
 5819501 5819502 PLES_25711 PLES_25721     TRUE 0.686 10.000 0.000 1.000 N NA
 5819502 5819503 PLES_25721 PLES_25731     TRUE 0.937 5.000 0.087 1.000 N NA
 5819503 5819504 PLES_25731 PLES_25741     FALSE 0.103 108.000 0.000 1.000 N NA
 5819504 5819505 PLES_25741 PLES_25751     TRUE 0.976 12.000 0.000 0.002 Y NA
 5819505 5819506 PLES_25751 PLES_25761     TRUE 0.802 136.000 0.077 0.002 Y NA
 5819506 5819507 PLES_25761 PLES_25771     FALSE 0.048 172.000 0.000 1.000 N NA
 5819508 5819509 PLES_25781 PLES_25791   pltR FALSE 0.228 59.000 0.000 1.000 N NA
 5819510 5819511 PLES_25801 PLES_25811 pltL pltA TRUE 0.943 17.000 0.286 1.000   NA
 5819511 5819512 PLES_25811 PLES_25821 pltA pltB FALSE 0.430 32.000 0.000 NA   NA
 5819512 5819513 PLES_25821 PLES_25841 pltB pltC FALSE 0.004 1371.000 0.000 NA   NA
 5819513 5819514 PLES_25841 PLES_25851 pltC pltD FALSE 0.264 56.000 0.000 NA   NA
 5819514 5819515 PLES_25851 PLES_25861 pltD pltE TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5819515 5819516 PLES_25861 PLES_25871 pltE pltF TRUE 0.996 -3.000 0.185 1.000 Y NA
 5819516 5819517 PLES_25871 PLES_25881 pltF pltG TRUE 0.944 19.000 0.037 1.000 Y NA
 5819519 5819520 PLES_25901 PLES_25911 pltH pltI TRUE 0.993 0.000 0.545 1.000   NA
 5819520 5819521 PLES_25911 PLES_25921 pltI pltJ TRUE 0.986 13.000 0.547 0.080   NA
 5819521 5819522 PLES_25921 PLES_25922 pltJ PltK TRUE 0.958 5.000 0.019 0.004 N NA
 5819522 5819523 PLES_25922 PLES_25931 PltK pltN TRUE 0.954 0.000 0.000 0.065 N NA
 5819523 5819524 PLES_25931 PLES_25941 pltN pltO TRUE 0.578 68.000 0.105 1.000 N NA
 5819525 5819526 PLES_25951 PLES_25961     FALSE 0.034 207.000 0.000 NA   NA
 5819527 5819528 PLES_25971 PLES_25981     FALSE 0.091 120.000 0.000 1.000 N NA
 5819528 5819529 PLES_25981 PLES_25991     TRUE 0.618 11.000 0.000 NA N NA
 5819531 5819532 PLES_26011 PLES_26021 pqsH gacA FALSE 0.009 342.000 0.000 1.000 N NA
 5819532 5819533 PLES_26021 PLES_26031 gacA uvrC TRUE 0.982 1.000 0.086 0.027 N NA
 5819533 5819534 PLES_26031 PLES_26041 uvrC pgsA TRUE 0.862 34.000 0.227 1.000 N NA
 5819534 5819535 PLES_26041 PLES_26042 pgsA   FALSE 0.213 69.000 0.000 NA   NA
 5819535 5819536 PLES_26042 PLES_26051     FALSE 0.026 227.000 0.000 NA   NA
 5819537 5819538 PLES_26061 PLES_26071     FALSE 0.007 425.000 0.000 NA   NA
 5819538 5819539 PLES_26071 PLES_26081     FALSE 0.012 321.000 0.000 NA   NA
 5819540 5819541 PLES_26091 PLES_26101     FALSE 0.129 101.000 0.000 NA   NA
 5819542 5819543 PLES_26111 PLES_26121     FALSE 0.023 237.000 0.000 NA   NA
 5819543 5819544 PLES_26121 PLES_26131   fdx FALSE 0.101 224.000 0.000 0.017 N NA
 5819544 5819545 PLES_26131 PLES_26141 fdx   TRUE 0.724 16.000 0.016 1.000 N NA
 5819545 5819546 PLES_26141 PLES_26151     TRUE 0.976 16.000 0.304 0.003 N NA
 5819548 5819549 PLES_26171 PLES_26181     FALSE 0.004 828.000 0.000 1.000 N NA
 5819549 5819550 PLES_26181 PLES_26191     TRUE 0.908 14.000 0.133 NA   NA
 5819550 5819551 PLES_26191 PLES_26201     FALSE 0.004 799.000 0.000 NA   NA
 5819552 5819553 PLES_26211 PLES_26221     TRUE 0.975 10.000 0.407 NA   NA
 5819553 5819554 PLES_26221 PLES_26231   efflux FALSE 0.076 194.000 0.025 NA N NA
 5819554 5819555 PLES_26231 PLES_26241 efflux   TRUE 0.616 44.000 0.049 1.000 N NA
 5819555 5819556 PLES_26241 PLES_26251     FALSE 0.006 533.000 0.000 NA   NA
 5819556 5819557 PLES_26251 PLES_26261     FALSE 0.059 167.000 0.000 NA   NA
 5819557 5819558 PLES_26261 PLES_26271     FALSE 0.359 112.000 0.071 1.000   NA
 5819558 5819559 PLES_26271 PLES_26281     FALSE 0.034 719.000 0.179 1.000   NA
 5819559 5819560 PLES_26281 PLES_26291     TRUE 0.976 21.000 0.500 0.050 N NA
 5819560 5819561 PLES_26291 PLES_26301     FALSE 0.004 516.000 0.000 NA N NA
 5819561 5819562 PLES_26301 PLES_26311     FALSE 0.007 452.000 0.000 NA   NA
 5819562 5819563 PLES_26311 PLES_26321     FALSE 0.018 267.000 0.000 NA   NA
 5819563 5819564 PLES_26321 PLES_26331     FALSE 0.007 447.000 0.000 NA   NA
 5819565 5819566 PLES_26341 PLES_26351     FALSE 0.133 182.000 0.042 NA   NA
 5819569 5819570 PLES_26381 PLES_26391     TRUE 0.720 11.000 0.000 1.000   NA
 5819570 5819571 PLES_26391 PLES_26401     FALSE 0.046 175.000 0.000 1.000 N NA
 5819573 5819574 PLES_26431 PLES_26441     TRUE 0.982 13.000 0.769 NA   NA
 5819574 5819575 PLES_26441 PLES_26451     TRUE 0.580 85.000 0.154 NA   NA
 5819576 5819577 PLES_26461 PLES_26471     TRUE 0.975 16.000 0.667 NA   NA
 5819577 5819578 PLES_26471 PLES_26481     TRUE 0.997 -3.000 0.857 NA   NA
 5819578 5819579 PLES_26481 PLES_26491     TRUE 0.982 10.000 0.571 NA   NA
 5819579 5819580 PLES_26491 PLES_26501     TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 5819580 5819581 PLES_26501 PLES_26511     FALSE 0.292 217.000 0.333 NA   NA
 5819581 5819582 PLES_26511 PLES_26521     FALSE 0.386 183.000 0.333 1.000 N NA
 5819582 5819583 PLES_26521 PLES_26531     TRUE 0.984 14.000 0.857 1.000   NA
 5819583 5819584 PLES_26531 PLES_26541     FALSE 0.007 421.000 0.000 NA   NA
 5819584 5819585 PLES_26541 PLES_26551     FALSE 0.004 898.000 0.000 NA   NA
 5819585 5819586 PLES_26551 PLES_26561     TRUE 0.997 -3.000 0.955 NA   NA
 5819586 5819587 PLES_26561 PLES_26571     TRUE 0.582 91.000 0.182 NA   NA
 5819587 5819588 PLES_26571 PLES_26581     TRUE 0.958 17.000 0.429 NA   NA
 5819588 5819589 PLES_26581 PLES_26591     TRUE 0.995 -3.000 0.571 NA   NA
 5819590 5819591 PLES_26601 PLES_26611     TRUE 0.994 -3.000 0.419 NA   NA
 5819591 5819592 PLES_26611 PLES_26621     TRUE 0.862 18.000 0.091 NA   NA
 5819592 5819593 PLES_26621 PLES_26631     FALSE 0.007 464.000 0.000 1.000   NA
 5819593 5819594 PLES_26631 PLES_26641     TRUE 0.993 0.000 0.571 1.000   NA
 5819594 5819595 PLES_26641 PLES_26651     TRUE 0.831 39.000 0.194 NA   NA
 5819595 5819596 PLES_26651 PLES_26661     TRUE 0.701 52.000 0.129 NA   NA
 5819597 5819598 PLES_26671 PLES_26681     TRUE 0.993 5.000 1.000 NA   NA
 5819598 5819599 PLES_26681 PLES_26691     TRUE 0.837 42.000 0.227 NA   NA
 5819599 5819600 PLES_26691 PLES_26701     TRUE 0.990 3.000 0.600 NA   NA
 5819600 5819601 PLES_26701 PLES_26711     TRUE 0.972 13.000 0.500 NA   NA
 5819601 5819602 PLES_26711 PLES_26721     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 5819602 5819603 PLES_26721 PLES_26731     FALSE 0.016 277.000 0.000 NA   NA
 5819603 5819604 PLES_26731 PLES_26741     TRUE 0.640 137.000 0.500 NA   NA
 5819604 5819605 PLES_26741 PLES_26751     TRUE 0.783 90.000 0.500 NA   NA
 5819605 5819606 PLES_26751 PLES_26761     TRUE 0.845 51.000 0.333 NA   NA
 5819606 5819607 PLES_26761 PLES_26771     TRUE 0.736 65.000 0.222 NA   NA
 5819607 5819608 PLES_26771 PLES_26781     TRUE 0.687 77.000 0.222 NA   NA
 5819608 5819609 PLES_26781 PLES_26791     TRUE 0.982 17.000 1.000 NA   NA
 5819609 5819610 PLES_26791 PLES_26801     TRUE 0.787 105.000 0.667 NA   NA
 5819610 5819611 PLES_26801 PLES_26811     TRUE 0.558 95.000 0.182 NA   NA
 5819611 5819612 PLES_26811 PLES_26821     TRUE 0.704 95.000 0.364 NA   NA
 5819612 5819613 PLES_26821 PLES_26831     TRUE 0.567 146.000 0.400 NA   NA
 5819613 5819614 PLES_26831 PLES_26841     FALSE 0.029 218.000 0.000 NA   NA
 5819614 5819615 PLES_26841 PLES_26851     FALSE 0.013 308.000 0.000 NA   NA
 5819615 5819616 PLES_26851 PLES_26861     FALSE 0.005 552.000 0.000 NA   NA
 5819616 5819617 PLES_26861 PLES_26871   merA TRUE 0.553 19.000 0.000 NA   NA
 5819617 5819618 PLES_26871 PLES_26881 merA merP TRUE 0.988 11.000 0.400 0.001 N NA
 5819618 5819619 PLES_26881 PLES_26891 merP merT TRUE 0.994 13.000 0.833 0.000   NA
 5819621 5819622 PLES_26911 PLES_26921     FALSE 0.015 289.000 0.000 NA   NA
 5819622 5819623 PLES_26921 PLES_26931     TRUE 0.834 98.000 0.800 NA   NA
 5819623 5819624 PLES_26931 PLES_26941     TRUE 0.895 84.000 1.000 NA   NA
 5819624 5819625 PLES_26941 PLES_26951     FALSE 0.432 183.000 0.400 NA   NA
 5819625 5819626 PLES_26951 PLES_26961     TRUE 0.973 22.000 0.800 NA   NA
 5819626 5819627 PLES_26961 PLES_26971     TRUE 0.483 137.000 0.250 NA   NA
 5819627 5819628 PLES_26971 PLES_26981     FALSE 0.011 337.000 0.000 NA   NA
 5819628 5819629 PLES_26981 PLES_26991     TRUE 0.930 4.000 0.062 1.000 N NA
 5819630 5819631 PLES_27001 PLES_27002 metR   FALSE 0.003 1076.000 0.000 1.000 N NA
 5819632 5819633 PLES_27011 PLES_27021     FALSE 0.111 284.000 0.000 1.000 Y NA
 5819633 5819634 PLES_27021 PLES_27031     TRUE 0.909 74.000 1.000 NA   NA
 5819634 5819635 PLES_27031 PLES_27041     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 5819635 5819636 PLES_27041 PLES_27051     FALSE 0.007 430.000 0.000 NA   NA
 5819636 5819637 PLES_27051 PLES_27061     TRUE 0.991 4.000 0.714 NA   NA
 5819637 5819638 PLES_27061 PLES_27071     TRUE 0.984 15.000 1.000 NA   NA
 5819638 5819639 PLES_27071 PLES_27081     FALSE 0.025 246.000 0.000 1.000   NA
 5819639 5819640 PLES_27081 PLES_27091     TRUE 0.711 43.000 0.106 NA N NA
 5819640 5819641 PLES_27091 PLES_27101     FALSE 0.428 119.000 0.149 NA   NA
 5819642 5819643 PLES_27102 PLES_27111     FALSE 0.004 1153.000 0.000 NA   NA
 5819643 5819644 PLES_27111 PLES_27121     TRUE 0.586 91.000 0.000 NA Y NA
 5819644 5819645 PLES_27121 PLES_27122     FALSE 0.014 290.000 0.000 NA   NA
 5819647 5819648 PLES_27141 PLES_27151     FALSE 0.013 325.000 0.000 1.000   NA
 5819649 5819650 PLES_27161 PLES_27171     TRUE 0.575 15.000 0.000 1.000 N NA
 5819653 5819654 PLES_27201 PLES_27211 alkB1   FALSE 0.127 112.000 0.000 1.000   NA
 5819656 5819657 PLES_27231 PLES_27232     FALSE 0.109 114.000 0.000 NA   NA
 5819657 5819658 PLES_27232 PLES_27241   lecA FALSE 0.008 416.000 0.000 NA   NA
 5819658 5819659 PLES_27241 PLES_27251 lecA   FALSE 0.017 273.000 0.000 NA   NA
 5819659 5819660 PLES_27251 PLES_27261     FALSE 0.104 119.000 0.000 NA   NA
 5819669 5819670 PLES_27351 PLES_27361     FALSE 0.084 137.000 0.000 NA   NA
 5819671 5819672 PLES_27371 PLES_27381     FALSE 0.191 69.000 0.000 1.000 N NA
 5819672 5819673 PLES_27381 PLES_27391     FALSE 0.339 178.000 0.250 1.000 N NA
 5819673 5819674 PLES_27391 PLES_27401     TRUE 0.977 20.000 0.100 0.067 Y NA
 5819674 5819675 PLES_27401 PLES_27411     TRUE 0.990 18.000 0.575 1.000 Y NA
 5819675 5819676 PLES_27411 PLES_27421     TRUE 0.982 29.000 0.529 1.000 Y NA
 5819679 5819680 PLES_27451 PLES_27461     TRUE 0.509 150.000 0.029 1.000 Y NA
 5819680 5819681 PLES_27461 PLES_27471     FALSE 0.225 60.000 0.000 1.000 N NA
 5819684 5819685 PLES_27501 PLES_27511     FALSE 0.219 134.000 0.033 1.000   NA
 5819685 5819686 PLES_27511 PLES_27521     TRUE 0.995 -3.000 0.575 NA   NA
 5819686 5819687 PLES_27521 PLES_27531     FALSE 0.087 135.000 0.000 NA   NA
 5819687 5819688 PLES_27531 PLES_27541     TRUE 0.851 90.000 0.215 NA Y NA
 5819688 5819689 PLES_27541 PLES_27551     TRUE 0.872 36.000 0.285 NA N NA
 5819689 5819690 PLES_27551 PLES_27561     TRUE 0.979 -7.000 0.090 NA   NA
 5819690 5819691 PLES_27561 PLES_27571     TRUE 0.924 12.000 0.140 NA   NA
 5819691 5819692 PLES_27571 PLES_27581     TRUE 0.992 2.000 0.595 1.000   NA
 5819694 5819695 PLES_27601 PLES_27611     FALSE 0.060 156.000 0.000 1.000 N NA
 5819695 5819696 PLES_27611 PLES_27621   tpx FALSE 0.128 135.000 0.007 1.000 N NA
 5819697 5819698 PLES_27631 PLES_27641     FALSE 0.039 197.000 0.000 NA   NA
 5819698 5819699 PLES_27641 PLES_27651     TRUE 0.983 0.000 0.233 NA   NA
 5819700 5819701 PLES_27661 PLES_27671     TRUE 0.995 -3.000 0.619 NA N NA
 5819701 5819702 PLES_27671 PLES_27681     TRUE 0.999 -3.000 0.741 NA Y NA
 5819702 5819703 PLES_27681 PLES_27691     TRUE 0.995 -3.000 0.556 NA N NA
 5819703 5819704 PLES_27691 PLES_27701     FALSE 0.088 134.000 0.000 NA   NA
 5819705 5819706 PLES_27711 PLES_27721     TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.002 Y NA
 5819707 5819708 PLES_27731 PLES_27741 czcC czcB TRUE 0.950 53.000 0.368 1.000 Y NA
 5819708 5819709 PLES_27741 PLES_27751 czcB czcA TRUE 0.943 23.000 0.421 1.000 N NA
 5819709 5819710 PLES_27751 PLES_27761 czcA xylS FALSE 0.030 207.000 0.000 1.000 N NA
 5819710 5819711 PLES_27761 PLES_27771 xylS xylX FALSE 0.094 117.000 0.000 1.000 N NA
 5819711 5819712 PLES_27771 PLES_27781 xylX xylY TRUE 0.999 -3.000 0.953 0.000 N NA
 5819712 5819713 PLES_27781 PLES_27791 xylY xylZ TRUE 0.971 34.000 0.672 0.058 N NA
 5819713 5819714 PLES_27791 PLES_27801 xylZ xylL TRUE 0.954 26.000 0.574 1.000 N NA
 5819715 5819716 PLES_27811 PLES_27821 antC antB TRUE 0.974 19.000 0.429 0.058 N NA
 5819716 5819717 PLES_27821 PLES_27831 antB antA TRUE 0.998 -3.000 0.429 0.000 N NA
 5819720 5819721 PLES_27861 PLES_27871 catB catC FALSE 0.398 32.000 0.000 1.000 N NA
 5819721 5819722 PLES_27871 PLES_27881 catC catA TRUE 0.803 45.000 0.000 1.000 Y NA
 5819724 5819725 PLES_27901 PLES_27911 opdT   FALSE 0.020 252.000 0.000 NA   NA
 5819727 5819728 PLES_27931 PLES_27941     FALSE 0.123 104.000 0.000 NA   NA
 5819729 5819730 PLES_27951 PLES_27961     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA N NA
 5819730 5819731 PLES_27961 PLES_27971     TRUE 0.884 18.000 0.128 NA   NA
 5819732 5819733 PLES_27981 PLES_27991     FALSE 0.252 59.000 0.000 NA   NA
 5819734 5819735 PLES_28001 PLES_28011 oprN mexF TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819735 5819736 PLES_28011 PLES_28021 mexF mexF FALSE 0.038 199.000 0.000 NA   NA
 5819736 5819737 PLES_28021 PLES_28031 mexF mexE TRUE 0.526 22.000 0.000 NA   NA
 5819737 5819738 PLES_28031 PLES_28041 mexE mexT FALSE 0.086 136.000 0.000 NA   NA
 5819740 5819741 PLES_28061 PLES_28071     TRUE 0.509 81.000 0.094 1.000 N NA
 5819741 5819742 PLES_28071 PLES_28081     TRUE 0.941 27.000 0.000 0.040 Y NA
 5819744 5819745 PLES_28101 PLES_28111     TRUE 0.579 17.000 0.000 NA   NA
 5819746 5819747 PLES_28121 PLES_28131     FALSE 0.073 151.000 0.000 NA   NA
 5819747 5819748 PLES_28131 PLES_28141     TRUE 0.485 115.000 0.000 NA Y NA
 5819748 5819749 PLES_28141 PLES_28151     TRUE 0.999 -3.000 0.371 0.011 Y NA
 5819750 5819751 PLES_28161 PLES_28171     TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 5819752 5819753 PLES_28181 PLES_28191     TRUE 0.992 0.000 0.000 0.002 Y NA
 5819753 5819754 PLES_28191 PLES_28201   dsbG TRUE 0.987 -3.000 0.000 NA Y NA
 5819754 5819755 PLES_28201 PLES_28211 dsbG   FALSE 0.156 73.000 0.000 NA N NA
 5819756 5819757 PLES_28221 PLES_28231     FALSE 0.326 42.000 0.000 1.000 N NA
 5819757 5819758 PLES_28231 PLES_28241     TRUE 0.609 13.000 0.000 1.000 N NA
 5819758 5819759 PLES_28241 PLES_28251     FALSE 0.171 78.000 0.000 1.000 N NA
 5819759 5819760 PLES_28251 PLES_28261   gtdA TRUE 0.979 13.000 0.167 1.000 Y NA
 5819761 5819762 PLES_28271 PLES_28281   foxI TRUE 0.744 89.000 0.000 0.078 Y NA
 5819762 5819763 PLES_28281 PLES_28291 foxI foxR TRUE 0.977 9.000 0.444 NA N NA
 5819763 5819764 PLES_28291 PLES_28301 foxR foxA TRUE 0.681 144.000 0.160 NA Y NA
 5819764 5819765 PLES_28301 PLES_28311 foxA   FALSE 0.428 118.000 0.147 NA   NA
 5819765 5819766 PLES_28311 PLES_28321     FALSE 0.319 47.000 0.000 NA   NA
 5819766 5819767 PLES_28321 PLES_28331     FALSE 0.012 313.000 0.000 NA   NA
 5819767 5819768 PLES_28331 PLES_28341     TRUE 0.490 113.000 0.000 NA Y NA
 5819768 5819769 PLES_28341 PLES_28351     FALSE 0.004 754.000 0.000 NA   NA
 5819770 5819771 PLES_28361 PLES_28371     FALSE 0.078 147.000 0.000 NA   NA
 5819771 5819772 PLES_28371 PLES_28381     TRUE 0.903 15.000 0.133 NA   NA
 5819772 5819773 PLES_28381 PLES_28391     FALSE 0.073 823.000 0.500 NA   NA
 5819773 5819774 PLES_28391 PLES_28401     FALSE 0.005 614.000 0.000 NA   NA
 5819774 5819775 PLES_28401 PLES_28411     TRUE 0.984 -3.000 0.029 0.067   NA
 5819775 5819776 PLES_28411 PLES_28421     FALSE 0.274 54.000 0.000 NA   NA
 5819777 5819778 PLES_28431 PLES_28441     FALSE 0.036 203.000 0.000 NA   NA
 5819778 5819779 PLES_28441 PLES_28451     FALSE 0.181 82.000 0.000 NA   NA
 5819781 5819782 PLES_28471 PLES_28481   gcvH2 FALSE 0.017 259.000 0.000 1.000 N NA
 5819782 5819783 PLES_28481 PLES_28491 gcvH2 gcvP2 TRUE 0.987 11.000 0.249 1.000 Y NA
 5819783 5819784 PLES_28491 PLES_28501 gcvP2 glyA2 TRUE 0.662 143.000 0.000 0.001 Y NA
 5819784 5819785 PLES_28501 PLES_28511 glyA2 sdaA TRUE 0.790 48.000 0.000 1.000 Y NA
 5819785 5819786 PLES_28511 PLES_28521 sdaA gcvT2 TRUE 0.650 94.000 0.013 1.000 Y NA
 5819787 5819788 PLES_28531 PLES_28541     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819789 5819790 PLES_28551 PLES_28561     TRUE 0.975 12.000 0.019 0.098 Y NA
 5819790 5819791 PLES_28561 PLES_28571     TRUE 0.995 -3.000 0.022 0.098 Y NA
 5819791 5819792 PLES_28571 PLES_28581     FALSE 0.070 154.000 0.000 NA   NA
 5819792 5819793 PLES_28581 PLES_28591     FALSE 0.456 29.000 0.000 NA   NA
 5819793 5819794 PLES_28591 PLES_28601     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819795 5819796 PLES_28611 PLES_28621     FALSE 0.108 115.000 0.000 NA   NA
 5819796 5819797 PLES_28621 PLES_28631     FALSE 0.072 152.000 0.000 NA   NA
 5819798 5819799 PLES_28641 PLES_28651     FALSE 0.323 196.000 0.286 NA   NA
 5819801 5819802 PLES_28671 PLES_28681     FALSE 0.166 87.000 0.000 NA   NA
 5819804 5819805 PLES_28701 PLES_28711 pvdG pvdL TRUE 0.920 73.000 0.333 1.000 Y NA
 5819806 5819807 PLES_28721 PLES_28731     FALSE 0.005 537.000 0.000 NA   NA
 5819807 5819808 PLES_28731 PLES_28741     FALSE 0.013 299.000 0.000 NA   NA
 5819808 5819809 PLES_28741 PLES_28751     FALSE 0.005 590.000 0.000 NA   NA
 5819809 5819810 PLES_28751 PLES_28761     FALSE 0.421 33.000 0.000 NA   NA
 5819810 5819811 PLES_28761 PLES_28771     FALSE 0.204 82.000 0.000 1.000   NA
 5819811 5819812 PLES_28771 PLES_28781     FALSE 0.137 97.000 0.000 NA   NA
 5819815 5819816 PLES_28811 PLES_28821     TRUE 0.994 -7.000 0.488 NA   NA
 5819816 5819817 PLES_28821 PLES_28831   pvdH FALSE 0.044 179.000 0.000 1.000 N NA
 5819817 5819818 PLES_28831 PLES_28841 pvdH   TRUE 0.645 78.000 0.184 NA   NA
 5819818 5819819 PLES_28841 PLES_28851     TRUE 0.983 1.000 0.273 NA   NA
 5819820 5819821 PLES_28861 PLES_28871     TRUE 0.998 -3.000 0.512 1.000 Y NA
 5819821 5819822 PLES_28871 PLES_28881     TRUE 0.999 -3.000 0.814 0.078 Y NA
 5819822 5819823 PLES_28881 PLES_28891     TRUE 0.998 -3.000 0.484 1.000 Y NA
 5819823 5819824 PLES_28891 PLES_28901     TRUE 0.916 33.000 0.387 NA   NA
 5819824 5819825 PLES_28901 PLES_28911     TRUE 0.993 -3.000 0.360 NA   NA
 5819825 5819826 PLES_28911 PLES_28921     TRUE 0.990 -3.000 0.250 NA   NA
 5819829 5819830 PLES_28951 PLES_28961 pvdI pvdJ TRUE 0.990 2.000 0.000 0.002 Y NA
 5819830 5819831 PLES_28961 PLES_28971 pvdJ pvdD TRUE 0.974 13.000 0.000 0.002 Y NA
 5819831 5819832 PLES_28971 PLES_28981 pvdD fpvA FALSE 0.054 165.000 0.000 1.000 N NA
 5819834 5819835 PLES_29001 PLES_29011 pvdF fpvA2 FALSE 0.102 121.000 0.000 NA   NA
 5819837 5819838 PLES_29031 PLES_29041 pvdF fpvA3 FALSE 0.102 121.000 0.000 NA   NA
 5819841 5819842 PLES_29071 PLES_29081 pvdO pvdN TRUE 0.933 29.000 0.429 NA   NA
 5819842 5819843 PLES_29081 PLES_29091 pvdN   TRUE 0.983 12.000 0.188 1.000 Y NA
 5819845 5819846 PLES_29111 PLES_29121 opmQ   TRUE 0.985 6.000 0.314 0.098 N NA
 5819846 5819847 PLES_29121 PLES_29131     TRUE 0.997 0.000 0.943 0.098 N NA
 5819847 5819848 PLES_29131 PLES_29141     FALSE 0.097 101.000 0.000 NA N NA
 5819849 5819850 PLES_29151 PLES_29161   pvdA TRUE 0.633 133.000 0.500 NA N NA
 5819850 5819851 PLES_29161 PLES_29171 pvdA pvdQ FALSE 0.099 123.000 0.000 NA   NA
 5819851 5819852 PLES_29171 PLES_29181 pvdQ   FALSE 0.048 181.000 0.000 NA   NA
 5819852 5819853 PLES_29181 PLES_29191     FALSE 0.355 42.000 0.000 NA   NA
 5819853 5819854 PLES_29191 PLES_29201   lldA FALSE 0.365 97.000 0.064 1.000 N NA
 5819856 5819857 PLES_29221 PLES_29231     FALSE 0.018 266.000 0.000 NA   NA
 5819857 5819858 PLES_29231 PLES_29241     TRUE 0.999 -3.000 0.200 0.001 Y NA
 5819859 5819860 PLES_29251 PLES_29261     FALSE 0.068 132.000 0.000 NA N NA
 5819862 5819863 PLES_29281 PLES_29291     TRUE 0.967 11.000 0.333 NA   NA
 5819863 5819864 PLES_29291 PLES_29301     FALSE 0.393 37.000 0.000 NA   NA
 5819864 5819865 PLES_29301 PLES_29311     FALSE 0.116 108.000 0.000 NA   NA
 5819865 5819866 PLES_29311 PLES_29321     FALSE 0.199 74.000 0.000 NA   NA
 5819866 5819867 PLES_29321 PLES_29331     TRUE 0.978 2.000 0.233 NA   NA
 5819867 5819868 PLES_29331 PLES_29341     TRUE 0.992 -36.000 0.400 NA   NA
 5819868 5819869 PLES_29341 PLES_29351     TRUE 0.991 -16.000 0.300 NA   NA
 5819869 5819870 PLES_29351 PLES_29361     TRUE 0.959 13.000 0.333 NA   NA
 5819870 5819871 PLES_29361 PLES_29371     TRUE 0.488 74.000 0.062 NA   NA
 5819871 5819872 PLES_29371 PLES_29381     TRUE 0.976 23.000 0.920 NA   NA
 5819873 5819874 PLES_29391 PLES_29401     TRUE 0.774 60.000 0.256 NA   NA
 5819874 5819875 PLES_29401 PLES_29411     TRUE 0.975 18.000 0.744 NA   NA
 5819875 5819876 PLES_29411 PLES_29421     TRUE 0.991 -3.000 0.300 NA   NA
 5819876 5819877 PLES_29421 PLES_29431     TRUE 0.986 -3.000 0.176 NA   NA
 5819877 5819878 PLES_29431 PLES_29441     FALSE 0.114 110.000 0.000 NA   NA
 5819878 5819879 PLES_29441 PLES_29451     FALSE 0.110 113.000 0.000 NA   NA
 5819879 5819880 PLES_29451 PLES_29461   msuE FALSE 0.066 160.000 0.000 NA   NA
 5819880 5819881 PLES_29461 PLES_29471 msuE msuD TRUE 0.940 10.000 0.129 1.000   NA
 5819881 5819882 PLES_29471 PLES_29481 msuD   TRUE 0.818 30.000 0.129 1.000 N NA
 5819882 5819883 PLES_29481 PLES_29491     TRUE 0.994 -3.000 0.467 1.000 N NA
 5819883 5819884 PLES_29491 PLES_29501     FALSE 0.054 172.000 0.000 NA   NA
 5819885 5819886 PLES_29511 PLES_29521     FALSE 0.044 178.000 0.000 1.000 N NA
 5819886 5819887 PLES_29521 PLES_29531     TRUE 0.993 -16.000 0.056 1.000 Y NA
 5819887 5819888 PLES_29531 PLES_29541     TRUE 0.996 -3.000 0.200 NA Y NA
 5819888 5819889 PLES_29541 PLES_29551     TRUE 0.905 32.000 0.346 NA N NA
 5819889 5819890 PLES_29551 PLES_29561     TRUE 0.954 18.000 0.452 NA N NA
 5819890 5819891 PLES_29561 PLES_29571     TRUE 0.997 11.000 0.500 0.007 Y NA
 5819893 5819894 PLES_29591 PLES_29601 mtlZ mtlY TRUE 0.926 41.000 0.118 1.000 Y NA
 5819894 5819895 PLES_29601 PLES_29611 mtlY mtlD TRUE 0.995 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 5819895 5819896 PLES_29611 PLES_29621 mtlD   TRUE 0.986 23.000 0.524 1.000 Y NA
 5819896 5819897 PLES_29621 PLES_29631     TRUE 0.968 40.000 0.173 0.048 Y NA
 5819897 5819898 PLES_29631 PLES_29641     TRUE 0.998 11.000 0.918 0.048 Y NA
 5819898 5819899 PLES_29641 PLES_29651     TRUE 0.856 76.000 0.028 0.048 Y NA
 5819899 5819900 PLES_29651 PLES_29661   mtlR FALSE 0.343 158.000 0.182 1.000 N NA
 5819900 5819901 PLES_29661 PLES_29671 mtlR   FALSE 0.072 152.000 0.000 NA   NA
 5819901 5819902 PLES_29671 PLES_29681     TRUE 0.815 23.000 0.071 NA   NA
 5819903 5819904 PLES_29691 PLES_29701     TRUE 0.495 97.000 0.150 1.000 N NA
 5819906 5819907 PLES_29721 PLES_29731     TRUE 0.779 50.000 0.200 NA   NA
 5819907 5819908 PLES_29731 PLES_29741     TRUE 0.980 -3.000 0.113 1.000 N NA
 5819908 5819909 PLES_29741 PLES_29751     TRUE 0.996 -34.000 0.189 1.000 Y NA
 5819909 5819910 PLES_29751 PLES_29761     TRUE 0.999 -3.000 0.973 1.000 Y NA
 5819910 5819911 PLES_29761 PLES_29771     FALSE 0.107 116.000 0.000 NA   NA
 5819911 5819912 PLES_29771 PLES_29781     FALSE 0.009 380.000 0.000 NA   NA
 5819913 5819914 PLES_29791 PLES_29801     TRUE 0.979 31.000 0.176 0.007 Y NA
 5819914 5819915 PLES_29801 PLES_29811     FALSE 0.026 218.000 0.000 1.000 N NA
 5819915 5819916 PLES_29811 PLES_29821     FALSE 0.062 164.000 0.000 NA   NA
 5819916 5819917 PLES_29821 PLES_29831     TRUE 0.490 26.000 0.000 NA   NA
 5819917 5819918 PLES_29831 PLES_29841     TRUE 0.885 97.000 0.364 1.000 Y NA
 5819920 5819921 PLES_29861 PLES_29871     TRUE 0.906 33.000 0.333 NA   NA
 5819921 5819922 PLES_29871 PLES_29881     FALSE 0.109 104.000 0.000 1.000 N NA
 5819923 5819924 PLES_29891 PLES_29901     TRUE 0.820 0.000 0.000 NA N NA
 5819925 5819926 PLES_29911 PLES_29921     FALSE 0.459 83.000 0.065 NA   NA
 5819926 5819927 PLES_29921 PLES_29931     FALSE 0.269 55.000 0.000 NA   NA
 5819928 5819929 PLES_29941 PLES_29951     TRUE 0.931 41.000 0.647 NA N NA
 5819929 5819930 PLES_29951 PLES_29961     TRUE 0.995 8.000 0.553 NA Y NA
 5819930 5819931 PLES_29961 PLES_29971     TRUE 0.993 17.000 0.795 1.000 Y NA
 5819931 5819932 PLES_29971 PLES_29981     FALSE 0.272 110.000 0.000 0.097 N NA
 5819932 5819933 PLES_29981 PLES_29991     FALSE 0.124 96.000 0.000 1.000 N NA
 5819933 5819934 PLES_29991 PLES_30001     TRUE 0.868 30.000 0.000 1.000 Y NA
 5819934 5819935 PLES_30001 PLES_30011     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.038 Y NA
 5819935 5819936 PLES_30011 PLES_30021     TRUE 0.907 20.000 0.000 1.000 Y NA
 5819936 5819937 PLES_30021 PLES_30031     FALSE 0.218 68.000 0.000 NA   NA
 5819937 5819938 PLES_30031 PLES_30041   chiC FALSE 0.029 220.000 0.000 NA   NA
 5819938 5819939 PLES_30041 PLES_30051 chiC   FALSE 0.045 176.000 0.000 1.000 N NA
 5819939 5819940 PLES_30051 PLES_30061     TRUE 0.991 -3.000 0.310 1.000 N NA
 5819940 5819941 PLES_30061 PLES_30071     TRUE 0.937 85.000 0.595 NA Y NA
 5819941 5819942 PLES_30071 PLES_30081     TRUE 0.597 135.000 0.439 NA N NA
 5819942 5819943 PLES_30081 PLES_30091     TRUE 0.994 25.000 0.732 0.048 Y NA
 5819943 5819944 PLES_30091 PLES_30101     TRUE 0.998 -3.000 0.424 1.000 Y NA
 5819944 5819945 PLES_30101 PLES_30111     TRUE 0.991 -3.000 0.316 1.000 N NA
 5819945 5819946 PLES_30111 PLES_30121     TRUE 0.991 -3.000 0.273 NA   NA
 5819946 5819947 PLES_30121 PLES_30131     FALSE 0.011 342.000 0.000 NA   NA
 5819947 5819948 PLES_30131 PLES_30141   gcd FALSE 0.062 154.000 0.000 1.000 N NA
 5819948 5819949 PLES_30141 PLES_30151 gcd   FALSE 0.080 132.000 0.000 1.000 N NA
 5819949 5819950 PLES_30151 PLES_30161     FALSE 0.102 121.000 0.000 NA   NA
 5819951 5819952 PLES_30171 PLES_30181     TRUE 0.899 -13.000 0.000 NA   NA
 5819952 5819953 PLES_30181 PLES_30191     TRUE 0.840 1.000 0.000 NA   NA
 5819953 5819954 PLES_30191 PLES_30201     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819954 5819955 PLES_30201 PLES_30211     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5819955 5819956 PLES_30211 PLES_30221     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 5819958 5819959 PLES_30241 PLES_30251   arsC TRUE 0.920 12.000 0.128 NA   NA
 5819959 5819960 PLES_30251 PLES_30261 arsC arsB TRUE 0.786 32.000 0.103 1.000 N NA
 5819960 5819961 PLES_30261 PLES_30271 arsB arsR TRUE 0.950 14.000 0.300 1.000 N NA
 5819961 5819962 PLES_30271 PLES_30281 arsR   TRUE 0.796 79.000 0.000 0.047 Y NA
 5819966 5819967 PLES_30321 PLES_30331 pbpC   FALSE 0.115 122.000 0.000 1.000   NA
 5819967 5819968 PLES_30331 PLES_30341     TRUE 0.768 8.000 0.000 1.000   NA
 5819972 5819973 PLES_30381 PLES_30391     TRUE 0.987 12.000 0.579 0.057 N NA
 5819973 5819974 PLES_30391 PLES_30401     TRUE 0.998 3.000 0.895 0.000   NA
 5819974 5819975 PLES_30401 PLES_30411     FALSE 0.067 168.000 0.000 1.000   NA
 5819975 5819976 PLES_30411 PLES_30421     TRUE 0.980 19.000 1.000 1.000 N NA
 5819976 5819977 PLES_30421 PLES_30431     TRUE 0.863 63.000 0.095 1.000 Y NA
 5819977 5819978 PLES_30431 PLES_30441     TRUE 0.995 -7.000 0.571 NA   NA
 5819978 5819979 PLES_30441 PLES_30451   ptxS TRUE 0.732 72.000 0.263 NA   NA
 5819981 5819982 PLES_30471 PLES_30481 pvcD pvcC TRUE 0.971 -7.000 0.000 0.057 N NA
 5819982 5819983 PLES_30481 PLES_30491 pvcC pvcB TRUE 0.965 52.000 0.280 0.057 Y NA
 5819983 5819984 PLES_30491 PLES_30501 pvcB pvcA TRUE 0.990 18.000 0.630 NA Y NA
 5819984 5819985 PLES_30501 PLES_30511 pvcA ansA FALSE 0.023 215.000 0.000 NA N NA
 5819985 5819986 PLES_30511 PLES_30521 ansA   TRUE 0.752 100.000 0.095 1.000 Y NA
 5819988 5819989 PLES_30541 PLES_30551 lpdV bkdB TRUE 0.989 4.000 0.143 1.000 Y NA
 5819989 5819990 PLES_30551 PLES_30561 bkdB bkdA2 TRUE 0.992 1.000 0.036 0.066 Y NA
 5819990 5819991 PLES_30561 PLES_30571 bkdA2 bkdA1 TRUE 0.999 -3.000 0.558 0.000 Y NA
 5819993 5819994 PLES_30591 PLES_30601 pslO pslN TRUE 0.468 28.000 0.000 NA   NA
 5819994 5819995 PLES_30601 PLES_30611 pslN pslM FALSE 0.239 56.000 0.000 1.000 N NA
 5819995 5819996 PLES_30611 PLES_30621 pslM pslL FALSE 0.040 187.000 0.000 1.000 N NA
 5819996 5819997 PLES_30621 PLES_30631 pslL pslK TRUE 0.582 83.000 0.133 1.000   NA
 5819997 5819998 PLES_30631 PLES_30641 pslK pslJ TRUE 0.967 2.000 0.133 NA   NA
 5819998 5819999 PLES_30641 PLES_30651 pslJ pslI TRUE 0.990 3.000 0.625 NA   NA
 5819999 5820000 PLES_30651 PLES_30661 pslI pslH TRUE 0.999 -9.000 0.714 0.018 Y NA
 5820000 5820001 PLES_30661 PLES_30671 pslH pslG TRUE 0.987 9.000 0.714 1.000 N NA
 5820001 5820002 PLES_30671 PLES_30681 pslG pslF TRUE 0.968 -10.000 0.054 1.000 N NA
 5820002 5820003 PLES_30681 PLES_30691 pslF pslE TRUE 0.990 0.000 0.054 1.000 Y NA
 5820003 5820004 PLES_30691 PLES_30701 pslE pslD TRUE 0.984 15.000 0.152 0.097 Y NA
 5820004 5820005 PLES_30701 PLES_30711 pslD pslC TRUE 0.861 30.000 0.000 NA Y NA
 5820005 5820006 PLES_30711 PLES_30721 pslC pslB TRUE 0.980 0.000 0.000 NA Y NA
 5820006 5820007 PLES_30721 PLES_30731 pslB pslA TRUE 0.988 0.000 0.034 NA Y NA
 5820007 5820008 PLES_30731 PLES_30741 pslA   FALSE 0.006 533.000 0.000 NA   NA
 5820008 5820009 PLES_30741 PLES_30751     FALSE 0.347 43.000 0.000 NA   NA
 5820009 5820010 PLES_30751 PLES_30761     FALSE 0.016 293.000 0.000 1.000   NA
 5820010 5820011 PLES_30761 PLES_30771     FALSE 0.300 50.000 0.000 NA   NA
 5820012 5820013 PLES_30781 PLES_30791     FALSE 0.004 673.000 0.000 NA   NA
 5820016 5820017 PLES_30821 PLES_30831     TRUE 0.967 11.000 0.333 NA   NA
 5820017 5820018 PLES_30831 PLES_30841     TRUE 0.638 93.000 0.250 NA   NA
 5820018 5820019 PLES_30841 PLES_30851     TRUE 0.851 84.000 0.667 NA   NA
 5820019 5820020 PLES_30851 PLES_30861     FALSE 0.005 555.000 0.000 NA   NA
 5820020 5820021 PLES_30861 PLES_30871     TRUE 0.794 111.000 0.750 NA   NA
 5820021 5820022 PLES_30871 PLES_30881     TRUE 0.794 62.000 0.333 NA N NA
 5820023 5820024 PLES_30891 PLES_30901     FALSE 0.005 525.000 0.000 1.000 N NA
 5820024 5820025 PLES_30901 PLES_30911     TRUE 0.987 -3.000 0.182 NA   NA
 5820025 5820026 PLES_30911 PLES_30921     FALSE 0.025 231.000 0.000 NA   NA
 5820026 5820027 PLES_30921 PLES_30931     TRUE 0.923 13.000 0.167 1.000 N NA
 5820027 5820028 PLES_30931 PLES_30941     TRUE 0.608 79.000 0.167 1.000 N NA
 5820028 5820029 PLES_30941 PLES_30951     FALSE 0.297 46.000 0.000 1.000 N NA
 5820029 5820030 PLES_30951 PLES_30961     FALSE 0.144 89.000 0.000 1.000 N NA
 5820031 5820032 PLES_30971 PLES_30981     TRUE 0.995 -3.000 0.524 NA   NA
 5820032 5820033 PLES_30981 PLES_30991     TRUE 0.711 57.000 0.167 NA   NA
 5820033 5820034 PLES_30991 PLES_31001     TRUE 0.660 225.000 0.286 0.066 Y NA
 5820034 5820035 PLES_31001 PLES_31011     TRUE 0.996 0.000 0.286 1.000 Y NA
 5820035 5820036 PLES_31011 PLES_31021     TRUE 0.888 51.000 0.500 NA   NA
 5820036 5820037 PLES_31021 PLES_31031     TRUE 0.967 -3.000 0.041 NA   NA
 5820039 5820040 PLES_31051 PLES_31061     FALSE 0.252 59.000 0.000 NA   NA
 5820040 5820041 PLES_31061 PLES_31071     TRUE 0.994 2.000 0.840 NA   NA
 5820041 5820042 PLES_31071 PLES_31081     FALSE 0.005 649.000 0.000 NA   NA
 5820042 5820043 PLES_31081 PLES_31091     TRUE 0.473 129.000 0.061 0.066   NA
 5820043 5820044 PLES_31091 PLES_31101     TRUE 0.896 28.000 0.061 0.027   NA
 5820044 5820045 PLES_31101 PLES_31111     TRUE 0.730 31.000 0.067 NA N NA
 5820045 5820046 PLES_31111 PLES_31121     FALSE 0.045 186.000 0.000 NA   NA
 5820046 5820047 PLES_31121 PLES_31131     FALSE 0.062 173.000 0.000 1.000   NA
 5820047 5820048 PLES_31131 PLES_31141     TRUE 0.981 -3.000 0.097 1.000   NA
 5820049 5820050 PLES_31151 PLES_31161     FALSE 0.139 96.000 0.000 NA   NA
 5820050 5820051 PLES_31161 PLES_31171     TRUE 0.910 28.000 0.286 NA   NA
 5820051 5820052 PLES_31171 PLES_31181     TRUE 0.990 -3.000 0.250 NA   NA
 5820052 5820053 PLES_31181 PLES_31191     TRUE 0.804 68.000 0.375 NA   NA
 5820053 5820054 PLES_31191 PLES_31201     FALSE 0.181 82.000 0.000 NA   NA
 5820054 5820055 PLES_31201 PLES_31211     FALSE 0.013 299.000 0.000 NA   NA
 5820055 5820056 PLES_31211 PLES_31221     TRUE 0.952 81.000 0.395 0.062 Y NA
 5820056 5820057 PLES_31221 PLES_31231     TRUE 0.999 2.000 0.692 0.010 Y NA
 5820058 5820059 PLES_31241 PLES_31251     FALSE 0.098 125.000 0.000 NA   NA
 5820059 5820060 PLES_31251 PLES_31261     FALSE 0.125 88.000 0.000 NA N NA
 5820060 5820061 PLES_31261 PLES_31271     TRUE 0.785 6.000 0.000 1.000   NA
 5820061 5820062 PLES_31271 PLES_31281     TRUE 0.977 -3.000 0.000 0.037   NA
 5820062 5820063 PLES_31281 PLES_31291     FALSE 0.369 131.000 0.115 1.000   NA
 5820063 5820064 PLES_31291 PLES_31301   hcnC FALSE 0.062 154.000 0.000 1.000 N NA
 5820064 5820065 PLES_31301 PLES_31311 hcnC hcnB TRUE 0.987 3.000 0.136 0.001   NA
 5820065 5820066 PLES_31311 PLES_31321 hcnB hcnA TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.001   NA
 5820066 5820067 PLES_31321 PLES_31331 hcnA   FALSE 0.008 424.000 0.000 1.000   NA
 5820069 5820070 PLES_31351 PLES_31361     FALSE 0.052 176.000 0.000 NA   NA
 5820072 5820073 PLES_31381 PLES_31391     FALSE 0.120 105.000 0.000 NA   NA
 5820073 5820074 PLES_31391 PLES_31401   katN FALSE 0.175 84.000 0.000 NA   NA
 5820075 5820076 PLES_31411 PLES_31421     TRUE 0.985 -3.000 0.154 NA   NA
 5820076 5820077 PLES_31421 PLES_31431     FALSE 0.014 294.000 0.000 NA   NA
 5820079 5820080 PLES_31451 PLES_31461     TRUE 0.989 -16.000 0.250 NA   NA
 5820080 5820081 PLES_31461 PLES_31471     FALSE 0.009 375.000 0.000 NA   NA
 5820083 5820084 PLES_31491 PLES_31501     TRUE 0.640 13.000 0.000 NA   NA
 5820084 5820085 PLES_31501 PLES_31511     FALSE 0.015 284.000 0.000 NA   NA
 5820086 5820087 PLES_31521 PLES_31531     FALSE 0.264 56.000 0.000 NA   NA
 5820087 5820088 PLES_31531 PLES_31541     TRUE 0.479 27.000 0.000 NA   NA
 5820088 5820089 PLES_31541 PLES_31551     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5820089 5820090 PLES_31551 PLES_31561     FALSE 0.197 75.000 0.000 NA   NA
 5820090 5820091 PLES_31561 PLES_31571     TRUE 0.479 27.000 0.000 NA   NA
 5820091 5820092 PLES_31571 PLES_31581     FALSE 0.111 126.000 0.000 1.000   NA
 5820092 5820093 PLES_31581 PLES_31591     TRUE 0.989 -3.000 0.221 NA   NA
 5820093 5820094 PLES_31591 PLES_31601     FALSE 0.011 329.000 0.000 NA   NA
 5820095 5820096 PLES_31611 PLES_31621     TRUE 0.999 0.000 0.917 1.000 Y NA
 5820096 5820097 PLES_31621 PLES_31631     TRUE 0.999 -7.000 0.204 0.002 Y NA
 5820097 5820098 PLES_31631 PLES_31641     TRUE 0.998 -7.000 0.141 0.002 Y NA
 5820098 5820099 PLES_31641 PLES_31651     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5820099 5820100 PLES_31651 PLES_31661     TRUE 0.640 13.000 0.000 NA   NA
 5820100 5820101 PLES_31661 PLES_31671     FALSE 0.149 100.000 0.000 1.000   NA
 5820101 5820102 PLES_31671 PLES_31681     TRUE 0.608 67.000 0.100 1.000   NA
 5820102 5820103 PLES_31681 PLES_31691     TRUE 0.960 4.000 0.150 NA   NA
 5820103 5820104 PLES_31691 PLES_31701     TRUE 0.994 -3.000 0.417 NA   NA
 5820104 5820105 PLES_31701 PLES_31711     TRUE 0.996 -3.000 0.636 NA   NA
 5820105 5820106 PLES_31711 PLES_31721     TRUE 0.993 -3.000 0.357 NA   NA
 5820107 5820108 PLES_31731 PLES_31741 glgB   TRUE 0.998 -3.000 0.115 0.002 Y NA
 5820108 5820109 PLES_31741 PLES_31751     TRUE 0.991 11.000 0.544 0.002   NA
 5820109 5820110 PLES_31751 PLES_31761     FALSE 0.091 144.000 0.000 1.000   NA
 5820110 5820111 PLES_31761 PLES_31771     TRUE 0.723 23.000 0.029 NA   NA
 5820111 5820112 PLES_31771 PLES_31781     TRUE 0.890 14.000 0.095 NA   NA
 5820112 5820113 PLES_31781 PLES_31791   katE FALSE 0.030 228.000 0.000 1.000   NA
 5820113 5820114 PLES_31791 PLES_31801 katE   FALSE 0.183 81.000 0.000 NA   NA
 5820116 5820117 PLES_31821 PLES_31831 glgP   FALSE 0.432 53.000 0.016 NA   NA
 5820119 5820120 PLES_31851 PLES_31861     TRUE 0.490 26.000 0.000 NA   NA
 5820120 5820121 PLES_31861 PLES_31871     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5820121 5820122 PLES_31871 PLES_31881     TRUE 0.543 20.000 0.000 NA   NA
 5820122 5820123 PLES_31881 PLES_31891     FALSE 0.195 76.000 0.000 NA   NA
 5820123 5820124 PLES_31891 PLES_31901     TRUE 0.601 18.000 0.000 1.000   NA
 5820126 5820127 PLES_31921 PLES_31931     FALSE 0.456 29.000 0.000 NA   NA
 5820127 5820128 PLES_31931 PLES_31941     FALSE 0.149 93.000 0.000 NA   NA
 5820128 5820129 PLES_31941 PLES_31951   cupA5 TRUE 0.876 -3.000 0.000 NA N NA
 5820129 5820130 PLES_31951 PLES_31961 cupA5 cupA4 TRUE 0.993 -10.000 0.400 1.000   NA
 5820130 5820131 PLES_31961 PLES_31971 cupA4 cupA3 TRUE 0.995 -3.000 0.500 1.000   NA
 5820131 5820132 PLES_31971 PLES_31981 cupA3 cupA2 TRUE 0.986 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 5820132 5820133 PLES_31981 PLES_31991 cupA2 cupA1 TRUE 0.868 88.000 0.231 1.000 Y NA
 5820134 5820135 PLES_32001 PLES_32011     FALSE 0.008 427.000 0.000 1.000   NA
 5820136 5820137 PLES_32021 PLES_32031     TRUE 0.886 22.000 0.174 1.000 N NA
 5820137 5820138 PLES_32031 PLES_32041     TRUE 0.818 105.000 0.833 1.000 N NA
 5820138 5820139 PLES_32041 PLES_32051     FALSE 0.393 37.000 0.000 NA   NA
 5820140 5820141 PLES_32061 PLES_32071     FALSE 0.077 148.000 0.000 NA   NA
 5820141 5820142 PLES_32071 PLES_32081     FALSE 0.011 332.000 0.000 NA   NA
 5820142 5820143 PLES_32081 PLES_32091     FALSE 0.097 126.000 0.000 NA   NA
 5820146 5820147 PLES_32121 PLES_32131     FALSE 0.236 107.000 0.025 NA   NA
 5820148 5820149 PLES_32141 PLES_32151   opdO TRUE 0.796 25.000 0.000 0.059   NA
 5820149 5820150 PLES_32151 PLES_32161 opdO   FALSE 0.458 33.000 0.000 1.000   NA
 5820150 5820151 PLES_32161 PLES_32171     TRUE 0.997 -3.000 0.909 1.000   NA
 5820151 5820152 PLES_32171 PLES_32181     TRUE 0.999 -3.000 0.909 NA Y NA
 5820152 5820153 PLES_32181 PLES_32191     FALSE 0.218 68.000 0.000 NA   NA
 5820156 5820157 PLES_32221 PLES_32231     TRUE 0.969 -15.000 0.047 1.000   NA
 5820157 5820158 PLES_32231 PLES_32241     TRUE 0.899 11.000 0.074 1.000 N NA
 5820159 5820160 PLES_32251 PLES_32261     FALSE 0.076 149.000 0.000 NA   NA
 5820161 5820162 PLES_32271 PLES_32281     TRUE 0.876 -3.000 0.000 NA N NA
 5820162 5820163 PLES_32281 PLES_32291     FALSE 0.094 103.000 0.000 NA N NA
 5820163 5820164 PLES_32291 PLES_32301     TRUE 0.986 -13.000 0.000 NA Y NA
 5820164 5820165 PLES_32301 PLES_32311     TRUE 0.876 -3.000 0.000 NA N NA
 5820165 5820166 PLES_32311 PLES_32321     TRUE 0.565 13.000 0.000 NA N NA
 5820166 5820167 PLES_32321 PLES_32331     FALSE 0.172 92.000 0.000 1.000   NA
 5820167 5820168 PLES_32331 PLES_32341     TRUE 0.898 -16.000 0.000 NA   NA
 5820168 5820169 PLES_32341 PLES_32351     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5820169 5820170 PLES_32351 PLES_32361     TRUE 0.907 11.000 0.000 0.027   NA
 5820170 5820171 PLES_32361 PLES_32371     FALSE 0.435 28.000 0.000 1.000 N NA
 5820171 5820172 PLES_32371 PLES_32381     FALSE 0.146 88.000 0.000 1.000 N NA
 5820172 5820173 PLES_32381 PLES_32391     FALSE 0.032 202.000 0.000 1.000 N NA
 5820174 5820175 PLES_32401 PLES_32411 kynB   TRUE 0.907 4.000 0.028 1.000   NA
 5820175 5820176 PLES_32411 PLES_32421     TRUE 0.477 156.000 0.028 1.000 Y NA
 5820176 5820177 PLES_32421 PLES_32431     FALSE 0.017 286.000 0.000 1.000   NA
 5820177 5820178 PLES_32431 PLES_32441     TRUE 0.739 40.000 0.000 0.011   NA
 5820180 5820181 PLES_32461 PLES_32471     FALSE 0.051 177.000 0.000 NA   NA
 5820182 5820183 PLES_32481 PLES_32491     TRUE 0.962 0.000 0.062 1.000   NA
 5820183 5820184 PLES_32491 PLES_32501     FALSE 0.026 218.000 0.000 1.000 N NA
 5820184 5820185 PLES_32501 PLES_32511   fusA2 FALSE 0.048 172.000 0.000 1.000 N NA
 5820186 5820187 PLES_32521 PLES_32531     FALSE 0.043 180.000 0.000 1.000 N NA
 5820187 5820188 PLES_32531 PLES_32541     FALSE 0.372 44.000 0.000 1.000   NA
 5820188 5820189 PLES_32541 PLES_32551     TRUE 0.848 2.000 0.000 1.000   NA
 5820189 5820190 PLES_32551 PLES_32561     TRUE 0.954 -3.000 0.020 NA   NA
 5820190 5820191 PLES_32561 PLES_32571   pcoA FALSE 0.076 149.000 0.000 NA   NA
 5820192 5820193 PLES_32581 PLES_32591     FALSE 0.037 202.000 0.000 NA   NA
 5820193 5820194 PLES_32591 PLES_32601     FALSE 0.090 146.000 0.000 1.000   NA
 5820194 5820195 PLES_32601 PLES_32611     TRUE 0.848 2.000 0.000 1.000   NA
 5820195 5820196 PLES_32611 PLES_32621     TRUE 0.952 2.000 0.000 0.047   NA
 5820196 5820197 PLES_32621 PLES_32631     TRUE 0.952 2.000 0.000 0.047   NA
 5820197 5820198 PLES_32631 PLES_32641     TRUE 0.931 4.000 0.000 0.047 N NA
 5820198 5820199 PLES_32641 PLES_32651     FALSE 0.004 680.000 0.000 1.000 N NA
 5820202 5820203 PLES_32681 PLES_32691 cynT cynS TRUE 0.863 40.000 0.011 1.000 Y NA
 5820204 5820205 PLES_32701 PLES_32711     TRUE 0.876 -3.000 0.000 NA N NA
 5820207 5820208 PLES_32731 PLES_32741     TRUE 0.594 16.000 0.000 NA   NA
 5820209 5820210 PLES_32751 PLES_32761     FALSE 0.004 1036.000 0.000 NA   NA
 5820210 5820211 PLES_32761 PLES_32771     FALSE 0.252 59.000 0.000 NA   NA
 5820211 5820212 PLES_32771 PLES_32781     FALSE 0.052 175.000 0.000 NA   NA
 5820213 5820214 PLES_32791 PLES_32801     FALSE 0.199 121.000 0.026 1.000 N NA
 5820214 5820215 PLES_32801 PLES_32811     FALSE 0.080 488.000 0.000 0.095 Y NA
 5820215 5820216 PLES_32811 PLES_32821     FALSE 0.373 157.000 0.000 1.000 Y NA
 5820217 5820218 PLES_32831 PLES_32841     TRUE 0.996 -15.000 0.651 NA   NA
 5820219 5820220 PLES_32851 PLES_32861     FALSE 0.082 141.000 0.000 NA   NA
 5820222 5820223 PLES_32881 PLES_32891     TRUE 0.820 0.000 0.000 NA N NA
 5820223 5820224 PLES_32891 PLES_32901     FALSE 0.065 135.000 0.000 NA N NA
 5820225 5820226 PLES_32911 PLES_32921     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5820227 5820228 PLES_32931 PLES_32941     TRUE 0.504 24.000 0.000 NA   NA
 5820229 5820230 PLES_32951 PLES_32961     FALSE 0.070 154.000 0.000 NA   NA
 5820231 5820232 PLES_32971 PLES_32981 gor gor TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5820234 5820235 PLES_33001 PLES_33011 galU   TRUE 0.946 48.000 0.273 1.000 Y NA
 5820238 5820239 PLES_33041 PLES_33051     TRUE 0.561 16.000 0.000 1.000 N NA
 5820241 5820242 PLES_33071 PLES_33081 liuR liuA FALSE 0.440 49.000 0.014 1.000 N NA
 5820242 5820243 PLES_33081 PLES_33091 liuA liuB TRUE 0.826 123.000 0.316 1.000 Y NA
 5820243 5820244 PLES_33091 PLES_33101 liuB liuC TRUE 0.979 14.000 0.189 1.000 Y NA
 5820244 5820245 PLES_33101 PLES_33111 liuC liuD TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.065 Y NA
 5820245 5820246 PLES_33111 PLES_33121 liuD liuE TRUE 0.951 21.000 0.229 0.065 N NA
 5820248 5820249 PLES_33141 PLES_33151 hmgA fahA TRUE 0.990 5.000 0.188 1.000 Y NA
 5820249 5820250 PLES_33151 PLES_33161 fahA maiA TRUE 0.992 -3.000 0.077 0.001 N NA
 5820250 5820251 PLES_33161 PLES_33171 maiA   TRUE 0.679 85.000 0.267 1.000 N NA
 5820251 5820252 PLES_33171 PLES_33181     FALSE 0.191 69.000 0.000 1.000 N NA
 5820252 5820253 PLES_33181 PLES_33191     FALSE 0.016 262.000 0.000 1.000 N NA
 5820253 5820254 PLES_33191 PLES_33201   bdhA TRUE 0.887 34.000 0.288 1.000 N NA
 5820255 5820256 PLES_33211 PLES_33221   atoB FALSE 0.210 213.000 0.000 1.000 Y NA
 5820256 5820257 PLES_33221 PLES_33231 atoB   FALSE 0.399 150.000 0.000 1.000 Y NA
 5820257 5820258 PLES_33231 PLES_33241     TRUE 0.988 35.000 0.352 0.000 Y NA
 5820259 5820260 PLES_33251 PLES_33261     FALSE 0.196 68.000 0.000 1.000 N NA
 5820260 5820261 PLES_33261 PLES_33271   ppiC1 FALSE 0.456 58.000 0.023 1.000   NA
 5820261 5820262 PLES_33271 PLES_33281 ppiC1   TRUE 0.553 19.000 0.000 NA   NA
 5820262 5820263 PLES_33281 PLES_33291     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5820263 5820264 PLES_33291 PLES_33301     FALSE 0.098 125.000 0.000 NA   NA
 5820265 5820266 PLES_33311 PLES_33321     TRUE 0.885 -16.000 0.000 1.000 N NA
 5820266 5820267 PLES_33321 PLES_33331     FALSE 0.364 86.000 0.041 1.000 N NA
 5820267 5820268 PLES_33331 PLES_33341   pqqE TRUE 0.944 5.000 0.088 1.000   NA
 5820268 5820269 PLES_33341 PLES_33351 pqqE pqqD TRUE 0.995 -28.000 0.211 0.001   NA
 5820269 5820270 PLES_33351 PLES_33361 pqqD pqqC TRUE 0.996 -3.000 0.246 0.001   NA
 5820270 5820271 PLES_33361 PLES_33371 pqqC pqqB TRUE 0.995 10.000 0.825 0.001   NA
 5820271 5820272 PLES_33371 PLES_33381 pqqB   FALSE 0.007 482.000 0.000 1.000   NA
 5820272 5820273 PLES_33381 PLES_33391   exaB TRUE 0.619 87.000 0.000 1.000 Y NA
 5820274 5820275 PLES_33401 PLES_33411 exaA   TRUE 0.904 54.000 0.625 NA   NA
 5820276 5820277 PLES_33421 PLES_33431     TRUE 0.987 13.000 0.545 0.022   NA
 5820277 5820278 PLES_33431 PLES_33441     TRUE 0.729 9.000 0.000 NA   NA
 5820279 5820280 PLES_33451 PLES_33461     TRUE 0.743 10.000 0.000 1.000   NA
 5820281 5820282 PLES_33471 PLES_33481     TRUE 0.995 -70.000 0.562 NA   NA
 5820282 5820283 PLES_33481 PLES_33491     TRUE 0.520 103.000 0.182 NA   NA
 5820283 5820284 PLES_33491 PLES_33501   pqqF FALSE 0.020 267.000 0.000 1.000   NA
 5820284 5820285 PLES_33501 PLES_33511 pqqF   FALSE 0.218 77.000 0.000 1.000   NA
 5820286 5820287 PLES_33521 PLES_33531 braZ   FALSE 0.023 236.000 0.000 NA   NA
 5820288 5820289 PLES_33541 PLES_33551     FALSE 0.319 47.000 0.000 NA   NA
 5820291 5820292 PLES_33571 PLES_33581     FALSE 0.015 283.000 0.000 NA   NA
 5820294 5820295 PLES_33601 PLES_33611     FALSE 0.117 107.000 0.000 NA   NA
 5820297 5820298 PLES_33631 PLES_33641   bacA FALSE 0.411 72.000 0.029 1.000   NA
 5820299 5820300 PLES_33651 PLES_33661     TRUE 0.997 -3.000 0.242 NA Y NA
 5820300 5820301 PLES_33661 PLES_33671     FALSE 0.013 303.000 0.000 NA   NA
 5820301 5820302 PLES_33671 PLES_33681     TRUE 0.994 -3.000 0.455 NA   NA
 5820302 5820303 PLES_33681 PLES_33691     TRUE 0.897 57.000 0.625 NA   NA
 5820303 5820304 PLES_33691 PLES_33701     TRUE 0.920 62.000 0.875 NA   NA
 5820304 5820305 PLES_33701 PLES_33711     TRUE 0.978 14.000 0.667 NA   NA
 5820305 5820306 PLES_33711 PLES_33721     TRUE 0.793 61.000 0.292 NA   NA
 5820307 5820308 PLES_33731 PLES_33741 rbsK rbsR TRUE 0.870 54.000 0.484 1.000 N NA
 5820308 5820309 PLES_33741 PLES_33751 rbsR rbsC TRUE 0.970 4.000 0.226 1.000 N NA
 5820309 5820310 PLES_33751 PLES_33761 rbsC rbsA TRUE 0.990 24.000 0.778 1.000 Y NA
 5820310 5820311 PLES_33761 PLES_33771 rbsA rbsB TRUE 0.961 22.000 0.132 NA Y NA
 5820311 5820312 PLES_33771 PLES_33781 rbsB   FALSE 0.021 219.000 0.000 NA N NA
 5820312 5820313 PLES_33781 PLES_33791     FALSE 0.227 136.000 0.000 0.075 N NA
 5820314 5820315 PLES_33801 PLES_33811     FALSE 0.242 62.000 0.000 NA   NA
 5820315 5820316 PLES_33811 PLES_33821     FALSE 0.012 312.000 0.000 NA   NA
 5820316 5820317 PLES_33821 PLES_33831     TRUE 0.730 179.000 0.667 0.056   NA
 5820318 5820319 PLES_33841 PLES_33851     FALSE 0.007 428.000 0.000 NA   NA
 5820319 5820320 PLES_33851 PLES_33861     FALSE 0.004 1261.000 0.000 NA   NA
 5820320 5820321 PLES_33861 PLES_33871     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5820321 5820322 PLES_33871 PLES_33881     FALSE 0.015 283.000 0.000 NA   NA
 5820322 5820323 PLES_33881 PLES_33891     FALSE 0.005 569.000 0.000 NA   NA
 5820323 5820324 PLES_33891 PLES_33901     FALSE 0.007 494.000 0.000 1.000   NA
 5820324 5820325 PLES_33901 PLES_33911     TRUE 1.000 -3.000 0.943 0.001 Y NA
 5820325 5820326 PLES_33911 PLES_33921     TRUE 0.998 6.000 0.833 0.056 Y NA
 5820326 5820327 PLES_33921 PLES_33931     FALSE 0.049 170.000 0.000 1.000 N NA
 5820328 5820329 PLES_33941 PLES_33951   rimJ FALSE 0.319 47.000 0.000 NA   NA
 5820330 5820331 PLES_33961 PLES_33971 metE   FALSE 0.089 133.000 0.000 NA   NA
 5820331 5820332 PLES_33971 PLES_33981     FALSE 0.006 501.000 0.000 NA   NA
 5820332 5820333 PLES_33981 PLES_33991     TRUE 0.995 0.000 0.778 NA   NA
 5820333 5820334 PLES_33991 PLES_34001     TRUE 0.989 -3.000 0.263 NA N NA
 5820334 5820335 PLES_34001 PLES_34011     TRUE 0.976 0.000 0.158 1.000 N NA
 5820336 5820337 PLES_34021 PLES_34031     FALSE 0.077 158.000 0.000 1.000   NA
 5820337 5820338 PLES_34031 PLES_34041     FALSE 0.203 187.000 0.122 1.000 N NA
 5820338 5820339 PLES_34041 PLES_34051     FALSE 0.036 194.000 0.000 1.000 N NA
 5820339 5820340 PLES_34051 PLES_34061     TRUE 0.947 13.000 0.250 NA   NA
 5820340 5820341 PLES_34061 PLES_34071     FALSE 0.332 45.000 0.000 NA   NA
 5820341 5820342 PLES_34071 PLES_34081     FALSE 0.184 64.000 0.000 NA N NA
 5820344 5820345 PLES_34101 PLES_34111     FALSE 0.117 107.000 0.000 NA   NA
 5820345 5820346 PLES_34111 PLES_34121     FALSE 0.152 92.000 0.000 NA   NA
 5820346 5820347 PLES_34121 PLES_34131     TRUE 0.990 -3.000 0.286 NA N NA
 5820347 5820348 PLES_34131 PLES_34141     FALSE 0.208 209.000 0.000 NA Y NA
 5820348 5820349 PLES_34141 PLES_34151     FALSE 0.365 41.000 0.000 NA   NA
 5820349 5820350 PLES_34151 PLES_34161     FALSE 0.045 187.000 0.000 NA   NA
 5820350 5820351 PLES_34161 PLES_34171     TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5820351 5820352 PLES_34171 PLES_34181     FALSE 0.390 42.000 0.000 1.000   NA
 5820353 5820354 PLES_34191 PLES_34201 phzG2 phzF2 TRUE 0.907 26.000 0.235 1.000   NA
 5820354 5820355 PLES_34201 PLES_34211 phzF2 phzE2 TRUE 0.913 14.000 0.016 0.018   NA
 5820355 5820356 PLES_34211 PLES_34221 phzE2 phzD2 TRUE 0.988 -3.000 0.055 0.018 N NA
 5820356 5820357 PLES_34221 PLES_34231 phzD2 phzC2 TRUE 0.895 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5820357 5820358 PLES_34231 PLES_34241 phzC2 phzG FALSE 0.437 36.000 0.000 1.000   NA
 5820358 5820359 PLES_34241 PLES_34251 phzG phzA2 TRUE 0.810 30.000 0.000 0.003   NA
 5820359 5820360 PLES_34251 PLES_34261 phzA2 qscR FALSE 0.007 482.000 0.000 1.000   NA
 5820361 5820362 PLES_34271 PLES_34281     TRUE 0.758 6.000 0.000 NA   NA
 5820362 5820363 PLES_34281 PLES_34291     TRUE 0.553 19.000 0.000 NA   NA
 5820363 5820364 PLES_34291 PLES_34301     TRUE 0.892 -52.000 0.000 NA   NA
 5820364 5820365 PLES_34301 PLES_34311     TRUE 0.490 26.000 0.000 NA   NA
 5820365 5820366 PLES_34311 PLES_34321     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5820366 5820367 PLES_34321 PLES_34331     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5820367 5820368 PLES_34331 PLES_34341     FALSE 0.161 89.000 0.000 NA   NA
 5820371 5820372 PLES_34371 PLES_34381 polB   FALSE 0.238 69.000 0.000 1.000   NA
 5820374 5820375 PLES_34401 PLES_34411     TRUE 0.609 13.000 0.000 1.000 N NA
 5820376 5820377 PLES_34421 PLES_34431     TRUE 0.996 5.000 0.214 0.001 Y NA
 5820377 5820378 PLES_34431 PLES_34441     FALSE 0.077 158.000 0.000 1.000   NA
 5820378 5820379 PLES_34441 PLES_34451     TRUE 0.567 89.000 0.148 1.000   NA
 5820380 5820381 PLES_34461 PLES_34471     TRUE 0.996 -10.000 0.364 0.058 N NA
 5820381 5820382 PLES_34471 PLES_34481     TRUE 0.993 -10.000 0.200 0.061 N NA
 5820382 5820383 PLES_34481 PLES_34491     TRUE 0.958 0.000 0.057 NA   NA
 5820384 5820385 PLES_34501 PLES_34511     FALSE 0.245 61.000 0.000 NA   NA
 5820386 5820387 PLES_34521 PLES_34531 lasA   FALSE 0.015 282.000 0.000 NA   NA
 5820387 5820388 PLES_34531 PLES_34541     FALSE 0.015 283.000 0.000 NA   NA
 5820388 5820389 PLES_34541 PLES_34551   xqhA FALSE 0.051 168.000 0.000 1.000 N NA
 5820389 5820390 PLES_34551 PLES_34561 xqhA xphA TRUE 0.899 -13.000 0.000 NA   NA
 5820390 5820391 PLES_34561 PLES_34571 xphA   FALSE 0.081 142.000 0.000 NA   NA
 5820391 5820392 PLES_34571 PLES_34581     FALSE 0.158 90.000 0.000 NA   NA
 5820392 5820393 PLES_34581 PLES_34591     TRUE 0.990 -7.000 0.254 NA   NA
 5820394 5820395 PLES_34601 PLES_34611   modA FALSE 0.095 116.000 0.000 1.000 N NA
 5820395 5820396 PLES_34611 PLES_34621 modA modB TRUE 0.997 13.000 0.660 0.001 Y NA
 5820396 5820397 PLES_34621 PLES_34631 modB modC TRUE 0.998 2.000 0.308 0.001 Y NA
 5820399 5820400 PLES_34651 PLES_34661   str TRUE 0.702 9.000 0.000 1.000 N NA
 5820400 5820401 PLES_34661 PLES_34671 str   FALSE 0.107 116.000 0.000 NA   NA
 5820401 5820402 PLES_34671 PLES_34681     FALSE 0.010 347.000 0.000 NA   NA
 5820402 5820403 PLES_34681 PLES_34691     TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 5820403 5820404 PLES_34691 PLES_34701     FALSE 0.152 92.000 0.000 NA   NA
 5820407 5820408 PLES_34731 PLES_34741     FALSE 0.166 87.000 0.000 NA   NA
 5820409 5820410 PLES_34751 PLES_34761     TRUE 0.704 23.000 0.023 NA   NA
 5820410 5820411 PLES_34761 PLES_34771     TRUE 0.770 5.000 0.000 NA   NA
 5820412 5820413 PLES_34781 PLES_34791   cti FALSE 0.455 123.000 0.030 0.018   NA
 5820414 5820415 PLES_34801 PLES_34811     FALSE 0.355 42.000 0.000 NA   NA
 5820415 5820416 PLES_34811 PLES_34821   metH FALSE 0.016 274.000 0.000 NA   NA
 5820416 5820417 PLES_34821 PLES_34831 metH   TRUE 0.777 15.000 0.024 NA   NA
 5820418 5820419 PLES_34841 PLES_34851     TRUE 0.621 14.000 0.000 NA   NA
 5820420 5820421 PLES_34861 PLES_34871     FALSE 0.233 65.000 0.000 NA   NA
 5820423 5820424 PLES_34891 PLES_34901 cysI   TRUE 0.984 -16.000 0.165 NA   NA
 5820427 5820428 PLES_34931 PLES_34941     FALSE 0.185 80.000 0.000 NA   NA
 5820428 5820429 PLES_34941 PLES_34951     TRUE 0.468 59.000 0.036 1.000 N NA
 5820430 5820431 PLES_34961 PLES_34971     TRUE 0.803 61.000 0.344 NA N NA
 5820431 5820432 PLES_34971 PLES_34981     FALSE 0.019 258.000 0.000 NA   NA
 5820432 5820433 PLES_34981 PLES_34991     TRUE 0.843 25.000 0.115 NA   NA
 5820438 5820439 PLES_35041 PLES_35051     TRUE 0.952 0.000 0.045 NA   NA
 5820439 5820440 PLES_35051 PLES_35061     TRUE 0.857 40.000 0.250 NA   NA
 5820442 5820443 PLES_35081 PLES_35091     TRUE 0.893 24.000 0.000 1.000 Y NA
 5820445 5820446 PLES_35111 PLES_35121 dnaQ rnhA TRUE 0.914 65.000 0.248 1.000 Y NA
 5820446 5820447 PLES_35121 PLES_35131 rnhA   TRUE 0.891 3.000 0.009 1.000   NA
 5820448 5820449 PLES_35141 PLES_35151   mltD FALSE 0.357 78.000 0.020 1.000   NA
 5820449 5820450 PLES_35151 PLES_35161 mltD   FALSE 0.037 191.000 0.000 1.000 N NA
 5820450 5820451 PLES_35161 PLES_35171     TRUE 0.998 -3.000 0.159 0.046 Y NA
 5820451 5820452 PLES_35171 PLES_35181     TRUE 0.996 7.000 1.000 0.046   NA
 5820452 5820453 PLES_35181 PLES_35191     TRUE 0.996 5.000 1.000 0.046   NA
 5820453 5820454 PLES_35191 PLES_35201     TRUE 0.995 2.000 1.000 1.000   NA
 5820454 5820455 PLES_35201 PLES_35211   fabI TRUE 0.812 22.000 0.057 1.000   NA
 5820456 5820457 PLES_35221 PLES_35222 ppiD   FALSE 0.123 104.000 0.000 NA   NA
 5820457 5820458 PLES_35222 PLES_35231   hupB FALSE 0.285 52.000 0.000 NA   NA
 5820458 5820459 PLES_35231 PLES_35241 hupB lon FALSE 0.208 136.000 0.040 1.000 N NA
 5820459 5820460 PLES_35241 PLES_35251 lon clpX TRUE 0.837 132.000 0.201 0.074 Y NA
 5820460 5820461 PLES_35251 PLES_35261 clpX clpP TRUE 0.867 105.000 0.352 1.000 Y NA
 5820461 5820462 PLES_35261 PLES_35271 clpP tig TRUE 0.889 94.000 0.351 1.000 Y NA
 5820463 5820464 PLES_35281 PLES_35291     TRUE 0.750 7.000 0.000 NA   NA
 5820464 5820465 PLES_35291 PLES_35301     TRUE 0.977 1.000 0.000 1.000 Y NA
 5820465 5820466 PLES_35301 PLES_35311     FALSE 0.107 105.000 0.000 1.000 N NA
 5820467 5820468 PLES_35321 PLES_35322     FALSE 0.043 190.000 0.000 NA   NA
 5820468 5820469 PLES_35322 PLES_35323     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 5820469 5820470 PLES_35323 PLES_35324     FALSE 0.269 55.000 0.000 NA   NA
 5820470 5820471 PLES_35324 PLES_35325     FALSE 0.285 52.000 0.000 NA   NA
 5820473 5820474 PLES_35341 PLES_35351 cysS glnS TRUE 0.985 10.000 0.032 0.028 Y NA
 5820475 5820476 PLES_35361 PLES_35371 ppiB   TRUE 0.971 5.000 0.237 1.000   NA
 5820476 5820477 PLES_35371 PLES_35381     FALSE 0.088 134.000 0.000 NA   NA
 5820481 5820482 PLES_35421 PLES_35431 acnB nasS FALSE 0.067 178.000 0.007 NA N NA
 5820482 5820483 PLES_35431 PLES_35441 nasS nasT TRUE 0.917 17.000 0.218 NA N NA
 5820483 5820484 PLES_35441 PLES_35451 nasT   FALSE 0.025 230.000 0.000 NA   NA
 5820484 5820485 PLES_35451 PLES_35461   nasA FALSE 0.010 354.000 0.000 NA   NA
 5820485 5820486 PLES_35461 PLES_35471 nasA   TRUE 0.762 75.000 0.337 1.000 N NA
 5820486 5820487 PLES_35471 PLES_35472     TRUE 0.741 8.000 0.000 NA   NA
 5820487 5820488 PLES_35472 PLES_35481   nirB FALSE 0.373 40.000 0.000 NA   NA
 5820488 5820489 PLES_35481 PLES_35491 nirB nirD TRUE 0.953 53.000 0.539 0.000 N NA
 5820489 5820490 PLES_35491 PLES_35501 nirD   TRUE 0.913 27.000 0.294 1.000 N NA
 5820490 5820491 PLES_35501 PLES_35511   cobA TRUE 0.858 12.000 0.048 1.000 N NA
 5820492 5820493 PLES_35521 PLES_35531 oprF sigX TRUE 0.581 109.000 0.280 1.000 N NA
 5820493 5820494 PLES_35531 PLES_35541 sigX cmpX FALSE 0.432 165.000 0.279 1.000   NA
 5820494 5820495 PLES_35541 PLES_35551 cmpX cfrX TRUE 0.977 3.000 0.256 NA   NA
 5820495 5820496 PLES_35551 PLES_35561 cfrX cmaX TRUE 0.684 49.000 0.093 NA   NA
 5820496 5820497 PLES_35561 PLES_35571 cmaX panE2 FALSE 0.166 188.000 0.093 NA N NA
 5820497 5820498 PLES_35571 PLES_35581 panE2 estX FALSE 0.387 107.000 0.113 NA N NA
 5820498 5820499 PLES_35581 PLES_35591 estX ppsA FALSE 0.362 70.000 0.029 NA N NA
 5820500 5820501 PLES_35601 PLES_35611     FALSE 0.014 291.000 0.000 NA   NA
 5820501 5820502 PLES_35611 PLES_35621     TRUE 0.951 6.000 0.141 NA   NA
 5820502 5820503 PLES_35621 PLES_35631     TRUE 0.993 4.000 0.923 NA   NA
 5820504 5820505 PLES_35641 PLES_35651     TRUE 0.921 14.000 0.154 1.000   NA
 5820505 5820506 PLES_35651 PLES_35661     TRUE 0.964 20.000 0.571 NA   NA
 5820506 5820507 PLES_35661 PLES_35671     TRUE 0.890 41.000 0.357 NA   NA
 5820507 5820508 PLES_35671 PLES_35681     FALSE 0.188 79.000 0.000 NA   NA
 5820508 5820509 PLES_35681 PLES_35691     FALSE 0.024 232.000 0.000 NA   NA
 5820509 5820510 PLES_35691 PLES_35701     TRUE 0.998 3.000 0.400 0.025 Y NA
 5820513 5820514 PLES_35731 PLES_35741 cysH   FALSE 0.332 65.000 0.005 NA   NA
 5820515 5820516 PLES_35751 PLES_35761 cysB   FALSE 0.302 132.000 0.085 1.000 N NA
 5820516 5820517 PLES_35761 PLES_35771     FALSE 0.191 163.000 0.059 1.000 N NA
 5820517 5820518 PLES_35771 PLES_35781     TRUE 0.953 0.000 0.047 NA   NA
 5820521 5820522 PLES_35811 PLES_35821     FALSE 0.075 150.000 0.000 NA   NA
 5820524 5820525 PLES_35841 PLES_35851     FALSE 0.069 155.000 0.000 NA   NA
 5820525 5820526 PLES_35851 PLES_35861     TRUE 0.468 28.000 0.000 NA   NA
 5820529 5820530 PLES_35891 PLES_35901     FALSE 0.436 23.000 0.000 NA N NA
 5820532 5820533 PLES_35921 PLES_35931     TRUE 0.992 14.000 0.600 1.000 Y NA
 5820533 5820534 PLES_35931 PLES_35941     FALSE 0.006 572.000 0.000 1.000   NA
 5820536 5820537 PLES_35961 PLES_35971     TRUE 0.751 82.000 0.383 NA N NA
 5820537 5820538 PLES_35971 PLES_35981     TRUE 0.993 -3.000 0.365 NA   NA
 5820538 5820539 PLES_35981 PLES_35991     TRUE 0.993 3.000 0.805 NA   NA
 5820539 5820540 PLES_35991 PLES_36001     FALSE 0.010 350.000 0.000 NA   NA
 5820540 5820541 PLES_36001 PLES_36011     FALSE 0.135 98.000 0.000 NA   NA
 5820542 5820543 PLES_36021 PLES_36031   bglX FALSE 0.049 171.000 0.000 1.000 N NA
 5820544 5820545 PLES_36041 PLES_36051 pscL pscK TRUE 0.996 -21.000 0.727 1.000   NA
 5820545 5820546 PLES_36051 PLES_36061 pscK pscJ TRUE 0.989 9.000 0.800 1.000   NA
 5820546 5820547 PLES_36061 PLES_36071 pscJ pscI TRUE 0.997 -3.000 0.333 0.010   NA
 5820547 5820548 PLES_36071 PLES_36081 pscI pscH TRUE 0.995 0.000 0.333 0.003   NA
 5820548 5820549 PLES_36081 PLES_36091 pscH pscG TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.003   NA
 5820549 5820550 PLES_36091 PLES_36101 pscG pscF TRUE 0.995 3.000 0.556 0.003   NA
 5820550 5820551 PLES_36101 PLES_36111 pscF pscE TRUE 0.994 3.000 0.417 0.003   NA
 5820551 5820552 PLES_36111 PLES_36121 pscE pscD TRUE 0.989 -37.000 0.268 NA   NA
 5820552 5820553 PLES_36121 PLES_36131 pscD pscC TRUE 0.977 2.000 0.220 NA   NA
 5820553 5820554 PLES_36131 PLES_36141 pscC pscB TRUE 0.995 0.000 0.750 1.000   NA
 5820554 5820555 PLES_36141 PLES_36151 pscB exsD TRUE 0.941 34.000 0.583 NA   NA
 5820555 5820556 PLES_36151 PLES_36161 exsD exsA TRUE 0.792 98.000 0.615 NA   NA
 5820556 5820557 PLES_36161 PLES_36171 exsA exsB FALSE 0.084 298.000 0.154 NA   NA
 5820557 5820558 PLES_36171 PLES_36181 exsB exsC FALSE 0.018 264.000 0.000 NA   NA
 5820558 5820559 PLES_36181 PLES_36191 exsC popD FALSE 0.450 126.000 0.182 NA   NA
 5820559 5820560 PLES_36191 PLES_36201 popD popB TRUE 0.976 12.000 0.526 NA   NA
 5820560 5820561 PLES_36201 PLES_36211 popB pcrV FALSE 0.030 496.000 0.000 0.003   NA
 5820561 5820562 PLES_36211 PLES_36221 pcrV pcrG TRUE 0.982 10.000 0.556 NA   NA
 5820562 5820563 PLES_36221 PLES_36231 pcrG pcrR TRUE 0.973 28.000 1.000 NA   NA
 5820563 5820564 PLES_36231 PLES_36241 pcrR pcrD TRUE 0.991 -3.000 0.281 NA   NA
 5820564 5820565 PLES_36241 PLES_36251 pcrD   TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5820565 5820566 PLES_36251 PLES_36261     TRUE 0.770 5.000 0.000 NA   NA
 5820566 5820567 PLES_36261 PLES_36271     TRUE 0.988 -3.000 0.214 NA   NA
 5820567 5820568 PLES_36271 PLES_36281     TRUE 0.899 -13.000 0.000 NA   NA
 5820568 5820569 PLES_36281 PLES_36291   popN TRUE 0.897 -19.000 0.000 NA   NA
 5820570 5820571 PLES_36301 PLES_36311   pscO TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5820571 5820572 PLES_36311 PLES_36321 pscO pscQ FALSE 0.004 1064.000 0.000 NA   NA
 5820572 5820573 PLES_36321 PLES_36331 pscQ pscR TRUE 0.998 -3.000 0.529 1.000 Y NA
 5820573 5820574 PLES_36331 PLES_36341 pscR   TRUE 0.997 3.000 0.300 0.010 Y NA
 5820574 5820575 PLES_36341 PLES_36351   pscT TRUE 0.997 -3.000 0.097 0.057 Y NA
 5820575 5820576 PLES_36351 PLES_36361 pscT pscU TRUE 0.999 -3.000 0.548 0.057 Y NA
 5820577 5820578 PLES_36371 PLES_36381     TRUE 0.973 3.000 0.200 1.000   NA
 5820578 5820579 PLES_36381 PLES_36391   speE FALSE 0.074 161.000 0.000 1.000   NA
 5820581 5820582 PLES_36411 PLES_36421   masA FALSE 0.308 49.000 0.000 NA   NA
 5820582 5820583 PLES_36421 PLES_36431 masA   TRUE 0.720 72.000 0.231 1.000   NA
 5820583 5820584 PLES_36431 PLES_36441     TRUE 0.985 -3.000 0.148 1.000   NA
 5820584 5820585 PLES_36441 PLES_36451     TRUE 0.956 -3.000 0.018 1.000   NA
 5820585 5820586 PLES_36451 PLES_36461   aroC TRUE 0.662 44.000 0.055 1.000   NA
 5820587 5820588 PLES_36471 PLES_36481     TRUE 0.679 78.000 0.219 NA   NA
 5820590 5820591 PLES_36501 PLES_36511     FALSE 0.400 173.000 0.292 NA   NA
 5820591 5820592 PLES_36511 PLES_36521     TRUE 0.858 57.000 0.444 NA   NA
 5820592 5820593 PLES_36521 PLES_36531   folE2 TRUE 0.832 78.000 0.545 NA   NA
 5820596 5820597 PLES_36561 PLES_36571 stk1 stp1 TRUE 0.999 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 5820597 5820598 PLES_36571 PLES_36581 stp1   TRUE 0.980 0.000 0.188 NA   NA
 5820598 5820599 PLES_36581 PLES_36591     TRUE 0.972 16.000 0.600 NA   NA
 5820599 5820600 PLES_36591 PLES_36601     TRUE 0.993 3.000 0.833 NA   NA
 5820600 5820601 PLES_36601 PLES_36611     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5820601 5820602 PLES_36611 PLES_36621     TRUE 0.977 6.000 0.333 NA   NA
 5820602 5820603 PLES_36621 PLES_36631     TRUE 0.935 18.000 0.278 NA   NA
 5820603 5820604 PLES_36631 PLES_36641     TRUE 0.838 89.000 0.667 NA   NA
 5820604 5820605 PLES_36641 PLES_36651     TRUE 0.965 11.000 0.118 0.014 N NA
 5820605 5820606 PLES_36651 PLES_36661     TRUE 0.960 7.000 0.196 NA   NA
 5820606 5820607 PLES_36661 PLES_36671     TRUE 0.997 -36.000 0.863 NA   NA
 5820607 5820608 PLES_36671 PLES_36681     FALSE 0.102 545.000 0.552 NA   NA
 5820608 5820609 PLES_36681 PLES_36691     TRUE 0.978 13.000 0.627 NA   NA
 5820609 5820610 PLES_36691 PLES_36701     TRUE 0.757 29.000 0.060 NA   NA
 5820610 5820611 PLES_36701 PLES_36711     TRUE 0.749 36.000 0.080 NA   NA
 5820611 5820612 PLES_36711 PLES_36721     FALSE 0.004 1172.000 0.000 NA   NA
 5820612 5820613 PLES_36721 PLES_36731     TRUE 0.669 56.000 0.131 1.000 N NA
 5820617 5820618 PLES_36771 PLES_36781     FALSE 0.164 159.000 0.029 1.000   NA
 5820619 5820620 PLES_36791 PLES_36801     FALSE 0.092 143.000 0.000 1.000   NA
 5820623 5820624 PLES_36831 PLES_36841     FALSE 0.006 464.000 0.000 NA   NA
 5820624 5820625 PLES_36841 PLES_36851   selD TRUE 0.982 0.000 0.214 NA   NA
 5820625 5820626 PLES_36851 PLES_36861 selD   FALSE 0.175 84.000 0.000 NA   NA
 5820628 5820629 PLES_36881 PLES_36891     FALSE 0.113 111.000 0.000 NA   NA
 5820629 5820630 PLES_36891 PLES_36901   kdpE FALSE 0.090 121.000 0.000 1.000 N NA
 5820630 5820631 PLES_36901 PLES_36911 kdpE kdpD TRUE 0.922 101.000 0.621 1.000 Y NA
 5820631 5820632 PLES_36911 PLES_36921 kdpD kdpC FALSE 0.381 108.000 0.020 0.093 N NA
 5820632 5820633 PLES_36921 PLES_36931 kdpC kdpB TRUE 0.990 54.000 0.877 0.001 Y NA
 5820633 5820634 PLES_36931 PLES_36941 kdpB kdpA TRUE 0.988 12.000 0.059 0.001 Y NA
 5820634 5820635 PLES_36941 PLES_36951 kdpA   FALSE 0.013 288.000 0.000 1.000 N NA
 5820635 5820636 PLES_36951 PLES_36961     TRUE 0.662 55.000 0.120 1.000 N NA
 5820637 5820638 PLES_36971 PLES_36981     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5820638 5820639 PLES_36981 PLES_36991     FALSE 0.081 142.000 0.000 NA   NA
 5820639 5820640 PLES_36991 PLES_37001     FALSE 0.084 138.000 0.000 NA   NA
 5820640 5820641 PLES_37001 PLES_37011     TRUE 0.934 16.000 0.250 1.000 N NA
 5820642 5820643 PLES_37021 PLES_37031     TRUE 0.537 166.000 0.478 NA   NA
 5820643 5820644 PLES_37031 PLES_37041     TRUE 0.908 9.000 0.057 NA   NA
 5820644 5820645 PLES_37041 PLES_37051     FALSE 0.265 80.000 0.015 NA N NA
 5820645 5820646 PLES_37051 PLES_37061     TRUE 0.980 -3.000 0.096 NA   NA
 5820646 5820647 PLES_37061 PLES_37071     FALSE 0.265 102.000 0.029 NA   NA
 5820647 5820648 PLES_37071 PLES_37081     TRUE 0.921 41.000 0.545 1.000 N NA
 5820648 5820649 PLES_37081 PLES_37091     TRUE 0.522 58.000 0.057 NA N NA
 5820649 5820650 PLES_37091 PLES_37101     TRUE 0.706 50.000 0.143 NA N NA
 5820650 5820651 PLES_37101 PLES_37111     FALSE 0.241 127.000 0.045 1.000 N NA
 5820651 5820652 PLES_37111 PLES_37121     TRUE 0.981 -3.000 0.114 NA   NA
 5820652 5820653 PLES_37121 PLES_37131   gpsA TRUE 0.947 14.000 0.273 NA   NA
 5820654 5820655 PLES_37141 PLES_37151     TRUE 0.498 172.000 0.444 NA   NA
 5820655 5820656 PLES_37151 PLES_37161     TRUE 0.994 -3.000 0.444 NA   NA
 5820656 5820657 PLES_37161 PLES_37171   fabA FALSE 0.038 189.000 0.000 1.000 N NA
 5820657 5820658 PLES_37171 PLES_37181 fabA fabB TRUE 0.991 12.000 0.451 1.000 Y NA
 5820658 5820659 PLES_37181 PLES_37191 fabB   FALSE 0.061 155.000 0.000 1.000 N NA
 5820659 5820660 PLES_37191 PLES_37201     FALSE 0.089 106.000 0.000 NA N NA
 5820661 5820662 PLES_37211 PLES_37221     TRUE 0.792 69.000 0.357 NA   NA
 5820663 5820664 PLES_37231 PLES_37241     FALSE 0.348 39.000 0.000 1.000 N NA
 5820664 5820665 PLES_37241 PLES_37251     FALSE 0.030 207.000 0.000 1.000 N NA
 5820665 5820666 PLES_37251 PLES_37261     TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.054 Y NA
 5820666 5820667 PLES_37261 PLES_37271     TRUE 0.984 50.000 0.625 0.054 Y NA
 5820670 5820671 PLES_37301 PLES_37311   htpG FALSE 0.307 68.000 0.008 1.000 N NA
 5820671 5820672 PLES_37311 PLES_37321 htpG   FALSE 0.182 118.000 0.007 1.000   NA
 5820672 5820673 PLES_37321 PLES_37331     TRUE 0.695 37.000 0.054 NA   NA
 5820673 5820674 PLES_37331 PLES_37341     TRUE 0.999 -3.000 0.845 NA Y NA
 5820676 5820677 PLES_37361 PLES_37371   braB FALSE 0.218 146.000 0.048 NA   NA
 5820677 5820678 PLES_37371 PLES_37381 braB sucD FALSE 0.011 311.000 0.000 1.000 N NA
 5820678 5820679 PLES_37381 PLES_37391 sucD sucC TRUE 0.999 0.000 0.806 0.000 Y NA
 5820679 5820680 PLES_37391 PLES_37401 sucC lpdG FALSE 0.167 329.000 0.069 1.000 Y NA
 5820680 5820681 PLES_37401 PLES_37411 lpdG sucB TRUE 0.907 69.000 0.253 1.000 Y NA
 5820681 5820682 PLES_37411 PLES_37421 sucB sucA TRUE 0.979 43.000 0.667 1.000 Y NA
 5820682 5820683 PLES_37421 PLES_37431 sucA sdhB FALSE 0.255 257.000 0.067 1.000 Y NA
 5820683 5820684 PLES_37431 PLES_37441 sdhB sdhA TRUE 0.997 12.000 0.604 0.001 Y NA
 5820684 5820685 PLES_37441 PLES_37451 sdhA sdhD TRUE 0.999 4.000 0.705 0.001 Y NA
 5820685 5820686 PLES_37451 PLES_37461 sdhD sdhC TRUE 0.999 -6.000 0.453 0.000 Y NA
 5820688 5820689 PLES_37481 PLES_37491     FALSE 0.088 134.000 0.000 NA   NA
 5820689 5820690 PLES_37491 PLES_37501     FALSE 0.123 104.000 0.000 NA   NA
 5820693 5820694 PLES_37531 PLES_37541     FALSE 0.355 95.000 0.049 NA   NA
 5820695 5820696 PLES_37551 PLES_37561     TRUE 0.827 11.000 0.020 NA   NA
 5820699 5820700 PLES_37591 PLES_37601     FALSE 0.207 56.000 0.000 NA N NA
 5820700 5820701 PLES_37601 PLES_37611     TRUE 0.618 11.000 0.000 NA N NA
 5820703 5820704 PLES_37631 PLES_37641     TRUE 0.959 69.000 0.667 1.000 Y NA
 5820705 5820706 PLES_37651 PLES_37661     FALSE 0.403 85.000 0.047 NA   NA
 5820707 5820708 PLES_37671 PLES_37681 acnA aer FALSE 0.013 373.000 0.004 1.000 N NA
 5820709 5820710 PLES_37691 PLES_37701     FALSE 0.182 89.000 0.000 1.000   NA
 5820711 5820712 PLES_37711 PLES_37721     TRUE 0.917 11.000 0.000 0.002 N NA
 5820712 5820713 PLES_37721 PLES_37731     TRUE 0.494 188.000 0.000 0.002 Y NA
 5820713 5820714 PLES_37731 PLES_37741     FALSE 0.044 365.000 0.000 0.002 N NA
 5820714 5820715 PLES_37741 PLES_37751     TRUE 0.885 15.000 0.000 0.002 N NA
 5820715 5820716 PLES_37751 PLES_37761     TRUE 0.494 188.000 0.000 0.002 Y NA
 5820716 5820717 PLES_37761 PLES_37771     FALSE 0.199 218.000 0.000 1.000 Y NA
 5820717 5820718 PLES_37771 PLES_37781     TRUE 0.912 12.000 0.111 NA   NA
 5820718 5820719 PLES_37781 PLES_37791     TRUE 0.987 -3.000 0.197 NA   NA
 5820719 5820720 PLES_37791 PLES_37801     TRUE 0.999 -21.000 0.713 NA Y NA
 5820720 5820721 PLES_37801 PLES_37811     TRUE 0.990 -7.000 0.266 NA   NA
 5820721 5820722 PLES_37811 PLES_37821   hemN FALSE 0.278 128.000 0.051 1.000   NA
 5820724 5820725 PLES_37841 PLES_37851 anr apt FALSE 0.268 86.000 0.016 1.000 N NA
 5820725 5820726 PLES_37851 PLES_37861 apt   FALSE 0.023 240.000 0.000 NA   NA
 5820726 5820727 PLES_37861 PLES_37871     FALSE 0.008 409.000 0.000 NA   NA
 5820727 5820728 PLES_37871 PLES_37881     TRUE 0.999 -6.000 0.869 0.056 Y NA
 5820730 5820731 PLES_37901 PLES_37911     TRUE 0.972 -3.000 0.050 1.000   NA
 5820731 5820732 PLES_37911 PLES_37921     FALSE 0.199 74.000 0.000 NA   NA
 5820733 5820734 PLES_37931 PLES_37941   recR FALSE 0.140 123.000 0.004 1.000 N NA
 5820734 5820735 PLES_37941 PLES_37951 recR   TRUE 0.847 79.000 0.604 NA   NA
 5820735 5820736 PLES_37951 PLES_37961   dnaX TRUE 0.885 46.000 0.411 NA   NA
 5820736 5820737 PLES_37961 PLES_37972 dnaX ffs FALSE 0.094 129.000 0.000 NA   NA
 5820737 5820738 PLES_37972 PLES_37991 ffs lig FALSE 0.009 372.000 0.000 NA   NA
 5820738 5820739 PLES_37991 PLES_38001 lig zipA TRUE 0.476 91.000 0.106 1.000 N NA
 5820739 5820740 PLES_38001 PLES_38011 zipA   TRUE 0.750 165.000 0.115 0.007 Y NA
 5820740 5820741 PLES_38011 PLES_38021     TRUE 0.613 26.000 0.010 1.000 N NA
 5820742 5820743 PLES_38031 PLES_38041 alkB2 xdhA FALSE 0.033 221.000 0.000 1.000   NA
 5820743 5820744 PLES_38041 PLES_38051 xdhA xdhB TRUE 0.999 -7.000 0.269 0.000 Y NA
 5820744 5820745 PLES_38051 PLES_38061 xdhB   FALSE 0.401 27.000 0.000 NA N NA
 5820745 5820746 PLES_38061 PLES_38071     FALSE 0.290 70.000 0.013 NA N NA
 5820749 5820750 PLES_38101 PLES_38111 pdxB   FALSE 0.023 215.000 0.000 NA N NA
 5820751 5820752 PLES_38121 PLES_38131 fabF2   FALSE 0.004 1150.000 0.000 NA   NA
 5820752 5820753 PLES_38131 PLES_38141     FALSE 0.015 289.000 0.000 NA   NA
 5820753 5820754 PLES_38141 PLES_38151     FALSE 0.008 423.000 0.000 1.000   NA
 5820755 5820756 PLES_38161 PLES_38171     TRUE 0.645 78.000 0.000 NA Y NA
 5820756 5820757 PLES_38171 PLES_38181     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA N NA
 5820757 5820758 PLES_38181 PLES_38191     TRUE 0.640 13.000 0.000 NA   NA
 5820761 5820762 PLES_38221 PLES_38231     FALSE 0.385 38.000 0.000 NA   NA
 5820763 5820764 PLES_38241 PLES_38251     FALSE 0.213 69.000 0.000 NA   NA
 5820764 5820765 PLES_38251 PLES_38261     TRUE 0.876 21.000 0.139 NA   NA
 5820766 5820767 PLES_38271 PLES_38281     TRUE 0.787 37.000 0.123 NA   NA
 5820767 5820768 PLES_38281 PLES_38291     FALSE 0.056 170.000 0.000 NA   NA
 5820769 5820770 PLES_38301 PLES_38311     TRUE 0.565 18.000 0.000 NA   NA
 5820770 5820771 PLES_38311 PLES_38321     FALSE 0.052 175.000 0.000 NA   NA
 5820771 5820772 PLES_38321 PLES_38331     FALSE 0.047 183.000 0.000 NA   NA
 5820773 5820774 PLES_38341 PLES_38351     FALSE 0.157 84.000 0.000 1.000 N NA
 5820775 5820776 PLES_38361 PLES_38371     FALSE 0.041 184.000 0.000 1.000 N NA
 5820776 5820777 PLES_38371 PLES_38381     FALSE 0.139 96.000 0.000 NA   NA
 5820778 5820779 PLES_38391 PLES_38401     FALSE 0.387 203.000 0.000 0.046 Y NA
 5820779 5820780 PLES_38401 PLES_38411     TRUE 1.000 -3.000 0.933 0.010 Y NA
 5820780 5820781 PLES_38411 PLES_38421     TRUE 0.996 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 5820781 5820782 PLES_38421 PLES_38431   ggt TRUE 0.800 78.000 0.065 1.000 Y NA
 5820782 5820783 PLES_38431 PLES_38441 ggt ansB TRUE 0.624 86.000 0.000 1.000 Y NA
 5820783 5820784 PLES_38441 PLES_38451 ansB   FALSE 0.124 96.000 0.000 1.000 N NA
 5820784 5820785 PLES_38451 PLES_38461     TRUE 0.985 45.000 0.613 0.073 Y NA
 5820785 5820786 PLES_38461 PLES_38471     FALSE 0.013 284.000 0.000 1.000 N NA
 5820786 5820787 PLES_38471 PLES_38481     FALSE 0.040 195.000 0.000 NA   NA
 5820787 5820788 PLES_38481 PLES_38491     FALSE 0.087 135.000 0.000 NA   NA
 5820788 5820789 PLES_38491 PLES_38501     FALSE 0.017 269.000 0.000 NA   NA
 5820790 5820791 PLES_38511 PLES_38521     TRUE 0.905 6.000 0.041 NA   NA
 5820793 5820794 PLES_38541 PLES_38551   ilvA2 FALSE 0.136 92.000 0.000 1.000 N NA
 5820794 5820795 PLES_38551 PLES_38561 ilvA2   TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5820795 5820796 PLES_38561 PLES_38562     FALSE 0.332 45.000 0.000 NA   NA
 5820796 5820797 PLES_38562 PLES_38571     FALSE 0.145 94.000 0.000 NA   NA
 5820797 5820798 PLES_38571 PLES_38581     FALSE 0.248 60.000 0.000 NA   NA
 5820798 5820799 PLES_38581 PLES_38591     FALSE 0.094 129.000 0.000 NA   NA
 5820799 5820800 PLES_38591 PLES_38601   cyoE FALSE 0.020 239.000 0.000 1.000 N NA
 5820800 5820801 PLES_38601 PLES_38611 cyoE cyoD TRUE 0.949 11.000 0.064 0.056 N NA
 5820801 5820802 PLES_38611 PLES_38621 cyoD cyoC TRUE 0.998 0.000 0.273 0.054 Y NA
 5820802 5820803 PLES_38621 PLES_38631 cyoC cyoB TRUE 0.996 4.000 0.258 0.054 Y NA
 5820803 5820804 PLES_38631 PLES_38641 cyoB cyoA TRUE 0.982 7.000 0.000 0.011 Y NA
 5820808 5820809 PLES_38681 PLES_38691     TRUE 0.621 14.000 0.000 NA   NA
 5820811 5820812 PLES_38711 PLES_38721 phnX phnW TRUE 0.651 36.000 0.030 1.000   NA
 5820814 5820815 PLES_38741 PLES_38751     TRUE 0.763 27.000 0.053 NA   NA
 5820815 5820816 PLES_38751 PLES_38761     TRUE 0.880 4.000 0.011 1.000   NA
 5820816 5820817 PLES_38761 PLES_38771     TRUE 0.598 64.000 0.091 NA   NA
 5820818 5820819 PLES_38781 PLES_38791     TRUE 0.485 77.000 0.000 0.019 N NA
 5820820 5820821 PLES_38801 PLES_38811     TRUE 0.708 129.000 0.148 NA Y NA
 5820821 5820822 PLES_38811 PLES_38821     TRUE 0.995 -3.000 0.615 NA N NA
 5820822 5820823 PLES_38821 PLES_38831     FALSE 0.076 149.000 0.000 NA   NA
 5820823 5820824 PLES_38831 PLES_38841     FALSE 0.194 77.000 0.000 NA   NA
 5820826 5820827 PLES_38861 PLES_38871     FALSE 0.068 255.000 0.056 NA   NA
 5820827 5820828 PLES_38871 PLES_38881   rnd TRUE 0.976 -3.000 0.073 NA   NA
 5820833 5820834 PLES_38931 PLES_38941     TRUE 0.980 -3.000 0.097 NA   NA
 5820834 5820835 PLES_38941 PLES_38951   alc TRUE 0.971 18.000 0.647 NA   NA
 5820835 5820836 PLES_38951 PLES_38961 alc   TRUE 0.968 55.000 0.647 1.000 Y NA
 5820836 5820837 PLES_38961 PLES_38971     TRUE 0.907 49.000 0.538 1.000   NA
 5820837 5820838 PLES_38971 PLES_38981   hcpA FALSE 0.005 619.000 0.000 NA   NA
 5820838 5820839 PLES_38981 PLES_38991 hcpA   FALSE 0.048 182.000 0.000 NA   NA
 5820839 5820840 PLES_38991 PLES_39001     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5820840 5820841 PLES_39001 PLES_39011     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5820841 5820842 PLES_39011 PLES_39021     TRUE 0.640 13.000 0.000 NA   NA
 5820845 5820846 PLES_39051 PLES_39061   moaA2 FALSE 0.046 185.000 0.000 NA   NA
 5820847 5820848 PLES_39071 PLES_39081     FALSE 0.094 129.000 0.000 NA   NA
 5820850 5820851 PLES_39101 PLES_39111 gcl   TRUE 0.761 96.000 0.495 1.000   NA
 5820851 5820852 PLES_39111 PLES_39121     TRUE 0.815 75.000 0.492 1.000 N NA
 5820852 5820853 PLES_39121 PLES_39131     FALSE 0.081 297.000 0.154 1.000 N NA
 5820853 5820854 PLES_39131 PLES_39141   pykF TRUE 0.975 2.000 0.000 1.000 Y NA
 5820854 5820855 PLES_39141 PLES_39151 pykF   FALSE 0.008 367.000 0.000 1.000 N NA
 5820855 5820856 PLES_39151 PLES_39161     FALSE 0.412 66.000 0.030 1.000 N NA
 5820856 5820857 PLES_39161 PLES_39171     TRUE 0.899 -13.000 0.000 NA   NA
 5820857 5820858 PLES_39171 PLES_39181     FALSE 0.099 124.000 0.000 NA   NA
 5820858 5820859 PLES_39181 PLES_39191   cysP FALSE 0.094 129.000 0.000 NA   NA
 5820860 5820861 PLES_39201 PLES_39211     TRUE 0.826 60.000 0.364 NA   NA
 5820862 5820863 PLES_39221 PLES_39231     FALSE 0.028 404.000 0.048 1.000   NA
 5820863 5820864 PLES_39231 PLES_39241     TRUE 0.996 -13.000 0.381 0.035   NA
 5820864 5820865 PLES_39241 PLES_39251     TRUE 0.921 21.000 0.238 1.000   NA
 5820866 5820867 PLES_39261 PLES_39271     TRUE 0.975 14.000 0.148 NA Y NA
 5820869 5820870 PLES_39291 PLES_39301   cycH TRUE 0.961 27.000 0.667 NA   NA
 5820870 5820871 PLES_39301 PLES_39311 cycH ccmH TRUE 0.998 -3.000 0.522 NA Y NA
 5820871 5820872 PLES_39311 PLES_39321 ccmH ccmG TRUE 0.996 -3.000 0.196 NA Y NA
 5820872 5820873 PLES_39321 PLES_39331 ccmG ccmF TRUE 0.999 4.000 0.804 0.002 Y NA
 5820873 5820874 PLES_39331 PLES_39341 ccmF ccmE TRUE 0.997 1.000 0.211 0.002 Y NA
 5820874 5820875 PLES_39341 PLES_39351 ccmE   TRUE 0.992 -3.000 0.344 1.000 N NA
 5820875 5820876 PLES_39351 PLES_39361   ccmC TRUE 0.995 -3.000 0.501 1.000 N NA
 5820876 5820877 PLES_39361 PLES_39371 ccmC ccmB TRUE 0.813 123.000 0.051 0.001 Y NA
 5820877 5820878 PLES_39371 PLES_39381 ccmB ccmA TRUE 0.998 -3.000 0.074 0.002 Y NA
 5820879 5820880 PLES_39391 PLES_39401     TRUE 0.992 -3.000 0.286 1.000   NA
 5820880 5820881 PLES_39401 PLES_39411     FALSE 0.144 102.000 0.000 1.000   NA
 5820881 5820882 PLES_39411 PLES_39421     FALSE 0.116 108.000 0.000 NA   NA
 5820883 5820884 PLES_39431 PLES_39441     FALSE 0.088 134.000 0.000 NA   NA
 5820884 5820885 PLES_39441 PLES_39451     FALSE 0.255 58.000 0.000 NA   NA
 5820885 5820886 PLES_39451 PLES_39461     FALSE 0.155 91.000 0.000 NA   NA
 5820888 5820889 PLES_39481 PLES_39491     TRUE 0.959 31.000 0.743 NA   NA
 5820889 5820890 PLES_39491 PLES_39501     TRUE 0.975 46.000 0.886 0.008   NA
 5820890 5820891 PLES_39501 PLES_39511     TRUE 0.768 92.000 0.454 1.000   NA
 5820891 5820892 PLES_39511 PLES_39521   motD TRUE 0.563 95.000 0.199 1.000 N NA
 5820892 5820893 PLES_39521 PLES_39531 motD motC TRUE 0.984 13.000 0.248 1.000 Y NA
 5820893 5820894 PLES_39531 PLES_39541 motC   TRUE 0.828 89.000 0.153 1.000 Y NA
 5820894 5820895 PLES_39541 PLES_39551     TRUE 0.972 54.000 0.327 0.008 Y NA
 5820895 5820896 PLES_39551 PLES_39561   cheZ TRUE 0.641 201.000 0.341 1.000 Y NA
 5820896 5820897 PLES_39561 PLES_39571 cheZ cheY TRUE 0.979 20.000 0.284 1.000 Y NA
 5820897 5820898 PLES_39571 PLES_39581 cheY fliA TRUE 0.617 102.000 0.145 0.094 N NA
 5820898 5820899 PLES_39581 PLES_39591 fliA fleN TRUE 0.994 -3.000 0.482 1.000 N NA
 5820899 5820900 PLES_39591 PLES_39601 fleN flhF TRUE 0.649 139.000 0.241 0.013 N NA
 5820900 5820901 PLES_39601 PLES_39611 flhF flhA TRUE 0.855 84.000 0.178 1.000 Y NA
 5820901 5820902 PLES_39611 PLES_39621 flhA   FALSE 0.083 139.000 0.000 NA   NA
 5820902 5820903 PLES_39621 PLES_39631     FALSE 0.421 33.000 0.000 NA   NA
 5820903 5820904 PLES_39631 PLES_39641   flhB FALSE 0.202 73.000 0.000 NA   NA
 5820904 5820905 PLES_39641 PLES_39651 flhB fliR TRUE 0.990 3.000 0.129 1.000 Y NA
 5820905 5820906 PLES_39651 PLES_39661 fliR fliQ TRUE 0.999 0.000 1.000 0.001 Y NA
 5820906 5820907 PLES_39661 PLES_39671 fliQ fliP TRUE 0.992 45.000 1.000 0.010 Y NA
 5820907 5820908 PLES_39671 PLES_39681 fliP fliO TRUE 0.994 -3.000 0.061 1.000 Y NA
 5820908 5820909 PLES_39681 PLES_39691 fliO fliN TRUE 0.996 2.000 0.443 1.000 Y NA
 5820909 5820910 PLES_39691 PLES_39701 fliN fliM TRUE 0.995 28.000 0.741 0.001 Y NA
 5820910 5820911 PLES_39701 PLES_39711 fliM   TRUE 0.995 8.000 0.171 0.001 Y NA
 5820911 5820912 PLES_39711 PLES_39721     FALSE 0.291 244.000 0.075 1.000 Y NA
 5820913 5820914 PLES_39731 PLES_39741     TRUE 0.741 8.000 0.000 NA   NA
 5820914 5820915 PLES_39741 PLES_39751     TRUE 0.895 12.000 0.077 NA   NA
 5820916 5820917 PLES_39761 PLES_39771     TRUE 0.999 -22.000 0.793 0.002 Y NA
 5820917 5820918 PLES_39771 PLES_39781     TRUE 0.549 104.000 0.240 NA N NA
 5820918 5820919 PLES_39781 PLES_39791     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA N NA
 5820920 5820921 PLES_39801 PLES_39811     TRUE 0.983 1.000 0.273 NA   NA
 5820924 5820925 PLES_39841 PLES_39851 lasR   FALSE 0.006 451.000 0.000 1.000 N NA
 5820925 5820926 PLES_39851 PLES_39861     FALSE 0.196 166.000 0.000 0.062   NA
 5820926 5820927 PLES_39861 PLES_39871     FALSE 0.004 1418.000 0.000 NA   NA
 5820927 5820928 PLES_39871 PLES_39881     FALSE 0.365 41.000 0.000 NA   NA
 5820928 5820929 PLES_39881 PLES_39891     FALSE 0.006 490.000 0.000 NA   NA
 5820932 5820933 PLES_39921 PLES_39931 gbuA   TRUE 0.607 15.000 0.000 NA   NA
 5820933 5820934 PLES_39931 PLES_39941     TRUE 0.862 19.000 0.100 NA   NA
 5820934 5820935 PLES_39941 PLES_39951     TRUE 0.662 94.000 0.150 0.091 N NA
 5820935 5820936 PLES_39951 PLES_39961     TRUE 0.665 76.000 0.000 1.000 Y NA
 5820936 5820937 PLES_39961 PLES_39971     TRUE 0.590 14.000 0.000 1.000 N NA
 5820937 5820938 PLES_39971 PLES_39981     FALSE 0.365 45.000 0.000 1.000   NA
 5820939 5820940 PLES_39991 PLES_40001     TRUE 0.847 56.000 0.400 NA   NA
 5820942 5820943 PLES_40021 PLES_40031     FALSE 0.043 201.000 0.000 1.000   NA
 5820943 5820944 PLES_40031 PLES_40041   aphA TRUE 0.618 11.000 0.000 NA N NA
 5820945 5820946 PLES_40051 PLES_40061     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 5820946 5820947 PLES_40061 PLES_40071     FALSE 0.401 36.000 0.000 NA   NA
 5820951 5820952 PLES_40111 PLES_40121     FALSE 0.191 78.000 0.000 NA   NA
 5820955 5820956 PLES_40151 PLES_40161     FALSE 0.183 81.000 0.000 NA   NA
 5820958 5820959 PLES_40181 PLES_40191     TRUE 0.594 16.000 0.000 NA   NA
 5820962 5820963 PLES_40221 PLES_40231     FALSE 0.028 222.000 0.000 NA   NA
 5820963 5820964 PLES_40231 PLES_40241     FALSE 0.035 206.000 0.000 NA   NA
 5820965 5820966 PLES_40251 PLES_40261     FALSE 0.146 165.000 0.042 NA N NA
 5820966 5820967 PLES_40261 PLES_40271     TRUE 0.669 74.000 0.220 NA N NA
 5820971 5820972 PLES_40311 PLES_40321 cobV   TRUE 0.884 3.000 0.021 NA N NA
 5820972 5820973 PLES_40321 PLES_40331   cobU TRUE 0.976 -3.000 0.090 NA N NA
 5820973 5820974 PLES_40331 PLES_40341 cobU cobP TRUE 0.996 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 5820974 5820975 PLES_40341 PLES_40351 cobP cobQ TRUE 0.994 -7.000 0.079 1.000 Y NA
 5820975 5820976 PLES_40351 PLES_40361 cobQ cobC TRUE 0.987 -7.000 0.033 0.005 N NA
 5820976 5820977 PLES_40361 PLES_40371 cobC cobD TRUE 0.997 -7.000 0.463 0.005 N NA
 5820977 5820978 PLES_40371 PLES_40381 cobD   TRUE 0.970 -3.000 0.053 1.000 N NA
 5820978 5820979 PLES_40381 PLES_40391   cobB TRUE 0.949 2.000 0.071 1.000 N NA
 5820979 5820980 PLES_40391 PLES_40401 cobB cobO TRUE 0.964 32.000 0.054 0.005 Y NA
 5820980 5820981 PLES_40401 PLES_40411 cobO   TRUE 0.717 64.000 0.000 1.000 Y NA
 5820981 5820982 PLES_40411 PLES_40421     FALSE 0.010 352.000 0.000 NA   NA
 5820983 5820984 PLES_40431 PLES_40441     FALSE 0.264 117.000 0.046 1.000 N NA
 5820984 5820985 PLES_40441 PLES_40451     TRUE 0.993 -3.000 0.046 1.000 Y NA
 5820985 5820986 PLES_40451 PLES_40461     FALSE 0.121 230.000 0.000 0.003   NA
 5820990 5820991 PLES_40501 PLES_40511     FALSE 0.061 165.000 0.000 NA   NA
 5820991 5820992 PLES_40511 PLES_40521     FALSE 0.017 258.000 0.000 1.000 N NA
 5820992 5820993 PLES_40521 PLES_40531     FALSE 0.281 59.000 0.000 1.000   NA
 5820993 5820994 PLES_40531 PLES_40541     TRUE 0.878 0.000 0.000 1.000   NA
 5820994 5820995 PLES_40541 PLES_40551     TRUE 0.998 11.000 0.846 0.010 Y NA
 5820995 5820996 PLES_40551 PLES_40561     TRUE 0.999 -3.000 0.650 1.000 Y NA
 5820996 5820997 PLES_40561 PLES_40571     TRUE 0.881 26.000 0.000 NA Y NA
 5820997 5820998 PLES_40571 PLES_40581     FALSE 0.379 151.000 0.000 NA Y NA
 5820998 5820999 PLES_40581 PLES_40591     FALSE 0.370 93.000 0.000 0.062 N NA
 5821002 5821003 PLES_40621 PLES_40631 aprI aprA FALSE 0.104 247.000 0.095 1.000   NA
 5821003 5821004 PLES_40631 PLES_40641 aprA aprF FALSE 0.008 359.000 0.000 1.000 N NA
 5821004 5821005 PLES_40641 PLES_40651 aprF aprE TRUE 0.992 4.000 0.375 0.006 N NA
 5821005 5821006 PLES_40651 PLES_40661 aprE aprD TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.006   NA
 5821006 5821007 PLES_40661 PLES_40671 aprD   FALSE 0.166 87.000 0.000 NA   NA
 5821008 5821009 PLES_40681 PLES_40691     FALSE 0.024 235.000 0.000 NA   NA
 5821011 5821012 PLES_40711 PLES_40721     TRUE 0.997 -3.000 0.600 0.091 N NA
 5821012 5821013 PLES_40721 PLES_40731     TRUE 0.994 -10.000 0.429 1.000   NA
 5821016 5821017 PLES_40761 PLES_40771     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5821017 5821018 PLES_40771 PLES_40781     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5821018 5821019 PLES_40781 PLES_40791     TRUE 0.936 13.000 0.200 NA   NA
 5821020 5821021 PLES_40801 PLES_40811     FALSE 0.114 110.000 0.000 NA   NA
 5821022 5821023 PLES_40821 PLES_40831     FALSE 0.379 39.000 0.000 NA   NA
 5821026 5821027 PLES_40861 PLES_40871     FALSE 0.124 96.000 0.000 1.000 N NA
 5821027 5821028 PLES_40871 PLES_40881     FALSE 0.004 684.000 0.000 1.000 N NA
 5821028 5821029 PLES_40881 PLES_40891     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5821029 5821030 PLES_40891 PLES_40901     TRUE 0.908 -6.000 0.000 NA   NA
 5821030 5821031 PLES_40901 PLES_40911     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5821031 5821032 PLES_40911 PLES_40921     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5821032 5821033 PLES_40921 PLES_40931     TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5821033 5821034 PLES_40931 PLES_40941     FALSE 0.042 202.000 0.000 1.000   NA
 5821034 5821035 PLES_40941 PLES_40951     TRUE 0.845 0.000 0.000 1.000 N NA
 5821035 5821036 PLES_40951 PLES_40961     TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5821036 5821037 PLES_40961 PLES_40971     TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5821037 5821038 PLES_40971 PLES_40981     TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5821038 5821039 PLES_40981 PLES_40991     FALSE 0.104 119.000 0.000 NA   NA
 5821039 5821040 PLES_40991 PLES_41001     FALSE 0.056 170.000 0.000 NA   NA
 5821041 5821042 PLES_41011 PLES_41021   kefB FALSE 0.339 167.000 0.000 1.000 Y NA
 5821042 5821043 PLES_41021 PLES_41031 kefB   TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 5821043 5821044 PLES_41031 PLES_41041     FALSE 0.066 160.000 0.000 NA   NA
 5821044 5821045 PLES_41041 PLES_41051     TRUE 0.479 27.000 0.000 NA   NA
 5821045 5821046 PLES_41051 PLES_41061     TRUE 0.468 28.000 0.000 NA   NA
 5821046 5821047 PLES_41061 PLES_41071     FALSE 0.070 144.000 0.000 1.000 N NA
 5821049 5821050 PLES_41091 PLES_41101     TRUE 0.921 23.000 0.273 NA   NA
 5821050 5821051 PLES_41101 PLES_41111     TRUE 0.961 83.000 0.909 NA Y NA
 5821051 5821052 PLES_41111 PLES_41121     TRUE 0.741 66.000 0.267 NA N NA
 5821052 5821053 PLES_41121 PLES_41131     TRUE 0.936 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5821054 5821055 PLES_41141 PLES_41151     TRUE 0.699 105.000 0.065 1.000 Y NA
 5821056 5821057 PLES_41161 PLES_41171     FALSE 0.427 47.000 0.015 NA N NA
 5821057 5821058 PLES_41171 PLES_41181     FALSE 0.089 106.000 0.000 NA N NA
 5821058 5821059 PLES_41181 PLES_41191     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5821059 5821060 PLES_41191 PLES_41201     FALSE 0.019 258.000 0.000 NA   NA
 5821060 5821061 PLES_41201 PLES_41211     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5821061 5821062 PLES_41211 PLES_41221     TRUE 0.714 10.000 0.000 NA   NA
 5821062 5821063 PLES_41221 PLES_41231     FALSE 0.082 140.000 0.000 NA   NA
 5821063 5821064 PLES_41231 PLES_41241     TRUE 0.621 14.000 0.000 NA   NA
 5821064 5821065 PLES_41241 PLES_41242     TRUE 0.662 12.000 0.000 NA   NA
 5821065 5821066 PLES_41242 PLES_41251     TRUE 0.579 17.000 0.000 NA   NA
 5821066 5821067 PLES_41251 PLES_41261     FALSE 0.036 203.000 0.000 NA   NA
 5821067 5821068 PLES_41261 PLES_41271     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5821068 5821069 PLES_41271 PLES_41281     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5821070 5821071 PLES_41291 PLES_41301     FALSE 0.006 529.000 0.000 NA   NA
 5821071 5821072 PLES_41301 PLES_41311     FALSE 0.219 159.000 0.066 NA   NA
 5821072 5821073 PLES_41311 PLES_41321     FALSE 0.130 168.000 0.028 NA   NA
 5821074 5821075 PLES_41331 PLES_41341     FALSE 0.144 89.000 0.000 1.000 N NA
 5821075 5821076 PLES_41341 PLES_41351     FALSE 0.126 102.000 0.000 NA   NA
 5821076 5821077 PLES_41351 PLES_41361     TRUE 0.990 -3.000 0.250 NA   NA
 5821081 5821082 PLES_41401 PLES_41411   phoQ TRUE 0.728 102.000 0.000 0.012 Y NA
 5821082 5821083 PLES_41411 PLES_41421 phoQ phoP TRUE 0.999 -3.000 0.940 1.000 Y NA
 5821083 5821084 PLES_41421 PLES_41431 phoP oprH TRUE 0.645 80.000 0.180 1.000   NA
 5821085 5821086 PLES_41441 PLES_41451 napE napF TRUE 0.908 9.000 0.058 NA   NA
 5821086 5821087 PLES_41451 PLES_41461 napF napD TRUE 0.956 -7.000 0.023 NA   NA
 5821087 5821088 PLES_41461 PLES_41471 napD napA TRUE 0.976 -19.000 0.106 NA N NA
 5821088 5821089 PLES_41471 PLES_41481 napA napB TRUE 0.994 11.000 0.643 NA Y NA
 5821089 5821090 PLES_41481 PLES_41491 napB napC TRUE 0.981 11.000 0.143 NA Y NA
 5821093 5821094 PLES_41521 PLES_41531     FALSE 0.191 78.000 0.000 NA   NA
 5821094 5821095 PLES_41531 PLES_41541     FALSE 0.006 500.000 0.000 NA   NA
 5821096 5821097 PLES_41551 PLES_41561   pcpS FALSE 0.317 228.000 0.069 1.000 Y NA
 5821099 5821100 PLES_41581 PLES_41591   dapE FALSE 0.185 115.000 0.018 1.000 N NA
 5821100 5821101 PLES_41591 PLES_41601 dapE rrmA TRUE 0.947 0.000 0.033 1.000   NA
 5821101 5821102 PLES_41601 PLES_41611 rrmA   TRUE 0.856 18.000 0.083 NA   NA
 5821103 5821104 PLES_41621 PLES_41631     FALSE 0.010 320.000 0.000 1.000 N NA
 5821104 5821105 PLES_41631 PLES_41641     FALSE 0.265 342.000 0.229 1.000 Y NA
 5821106 5821107 PLES_41651 PLES_41661 nrdA nrdB TRUE 0.766 264.000 0.564 0.000 Y NA
 5821107 5821108 PLES_41661 PLES_41671 nrdB   FALSE 0.009 355.000 0.000 1.000 N NA
 5821108 5821109 PLES_41671 PLES_41681     FALSE 0.003 620.000 0.000 NA N NA
 5821111 5821112 PLES_41701 PLES_41711   toxA FALSE 0.021 250.000 0.000 NA   NA
 5821112 5821113 PLES_41711 PLES_41721 toxA   FALSE 0.019 260.000 0.000 NA   NA
 5821113 5821114 PLES_41721 PLES_41731     FALSE 0.254 102.000 0.029 1.000 N NA
 5821116 5821117 PLES_41751 PLES_41761     FALSE 0.169 68.000 0.000 NA N NA
 5821117 5821118 PLES_41761 PLES_41771     FALSE 0.162 82.000 0.000 1.000 N NA
 5821118 5821119 PLES_41771 PLES_41781     TRUE 0.494 166.000 0.000 0.071 Y NA
 5821119 5821120 PLES_41781 PLES_41791     FALSE 0.149 137.000 0.013 NA   NA
 5821121 5821122 PLES_41801 PLES_41811     FALSE 0.155 91.000 0.000 NA   NA
 5821125 5821126 PLES_41841 PLES_41851     FALSE 0.020 256.000 0.000 NA   NA
 5821126 5821127 PLES_41851 PLES_41861     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 5821129 5821130 PLES_41881 PLES_41891   rhlC TRUE 0.900 -12.000 0.000 NA   NA
 5821131 5821132 PLES_41901 PLES_41911     FALSE 0.328 36.000 0.000 NA N NA
 5821133 5821134 PLES_41921 PLES_41931     FALSE 0.145 94.000 0.000 NA   NA
 5821135 5821136 PLES_41941 PLES_41951   dgt TRUE 0.590 14.000 0.000 1.000 N NA
 5821139 5821140 PLES_41981 PLES_41991     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5821140 5821141 PLES_41991 PLES_42001     TRUE 0.990 -28.000 0.290 1.000 N NA
 5821141 5821142 PLES_42001 PLES_42011     FALSE 0.078 146.000 0.000 NA   NA
 5821142 5821143 PLES_42011 PLES_42021     FALSE 0.117 107.000 0.000 NA   NA
 5821145 5821146 PLES_42041 PLES_42051     FALSE 0.123 104.000 0.000 NA   NA
 5821148 5821149 PLES_42071 PLES_42081     FALSE 0.129 101.000 0.000 NA   NA
 5821150 5821151 PLES_42091 PLES_42101     FALSE 0.149 93.000 0.000 NA   NA
 5821154 5821155 PLES_42131 PLES_42141     FALSE 0.094 117.000 0.000 1.000 N NA
 5821155 5821156 PLES_42141 PLES_42151     FALSE 0.038 199.000 0.000 NA   NA
 5821157 5821158 PLES_42161 PLES_42171 fliJ fliI TRUE 0.966 14.000 0.070 1.000 Y NA
 5821158 5821159 PLES_42171 PLES_42181 fliI   TRUE 0.995 -10.000 0.115 NA Y NA
 5821159 5821160 PLES_42181 PLES_42191   fliG TRUE 0.995 2.000 0.320 NA Y NA
 5821160 5821161 PLES_42191 PLES_42201 fliG fliF TRUE 0.995 6.000 0.189 0.003 Y NA
 5821161 5821162 PLES_42201 PLES_42211 fliF fliE TRUE 0.996 23.000 0.910 0.003 Y NA
 5821162 5821163 PLES_42211 PLES_42221 fliE fleR FALSE 0.270 247.000 0.446 1.000 N NA
 5821163 5821164 PLES_42221 PLES_42231 fleR fleS TRUE 0.998 5.000 0.679 0.071 Y NA
 5821164 5821165 PLES_42231 PLES_42241 fleS fleQ TRUE 0.914 113.000 0.377 0.071 Y NA
 5821165 5821166 PLES_42241 PLES_42251 fleQ   FALSE 0.053 282.000 0.056 NA   NA
 5821166 5821167 PLES_42251 PLES_42261     TRUE 0.951 23.000 0.478 NA   NA
 5821167 5821168 PLES_42261 PLES_42271   fliD TRUE 0.889 122.000 0.194 0.001 Y NA
 5821168 5821169 PLES_42271 PLES_42281 fliD   TRUE 0.807 86.000 0.117 NA Y NA
 5821169 5821170 PLES_42281 PLES_42291   fliC TRUE 0.726 79.000 0.025 NA Y NA
 5821170 5821171 PLES_42291 PLES_42301 fliC fgtA FALSE 0.008 361.000 0.000 1.000 N NA
 5821171 5821172 PLES_42301 PLES_42311 fgtA   TRUE 0.994 -7.000 0.069 1.000 Y NA
 5821172 5821173 PLES_42311 PLES_42321     TRUE 0.940 -24.000 0.017 1.000 N NA
 5821173 5821174 PLES_42321 PLES_42331     TRUE 0.944 5.000 0.017 0.061 N NA
 5821174 5821175 PLES_42331 PLES_42341   flgL TRUE 0.659 55.000 0.118 1.000 N NA
 5821175 5821176 PLES_42341 PLES_42351 flgL flgK TRUE 0.975 26.000 0.057 0.001 Y NA
 5821176 5821177 PLES_42351 PLES_42361 flgK flgJ TRUE 0.996 19.000 0.705 0.001 Y NA
 5821177 5821178 PLES_42361 PLES_42371 flgJ flgI TRUE 0.996 11.000 0.405 0.004 Y NA
 5821178 5821179 PLES_42371 PLES_42381 flgI flgH TRUE 0.990 12.000 0.128 0.004 Y NA
 5821179 5821180 PLES_42381 PLES_42391 flgH flgG TRUE 0.988 46.000 0.632 0.003 Y NA
 5821180 5821181 PLES_42391 PLES_42401 flgG flgF TRUE 0.972 47.000 0.207 0.001 Y NA
 5821181 5821182 PLES_42401 PLES_42411 flgF flgE TRUE 0.836 218.000 0.594 0.002 Y NA
 5821182 5821183 PLES_42411 PLES_42421 flgE flgD TRUE 0.990 28.000 0.875 NA Y NA
 5821183 5821184 PLES_42421 PLES_42431 flgD flgC TRUE 0.981 13.000 0.207 NA Y NA
 5821184 5821185 PLES_42431 PLES_42441 flgC flgB TRUE 0.999 6.000 0.800 0.002 Y NA
 5821185 5821186 PLES_42441 PLES_42451 flgB   FALSE 0.020 253.000 0.000 NA   NA
 5821186 5821187 PLES_42451 PLES_42461     TRUE 0.466 67.000 0.041 NA   NA
 5821188 5821189 PLES_42471 PLES_42481   braC TRUE 0.490 26.000 0.000 NA   NA
 5821189 5821190 PLES_42481 PLES_42491 braC braD FALSE 0.201 261.000 0.033 1.000 Y NA
 5821190 5821191 PLES_42491 PLES_42501 braD braE TRUE 0.999 -3.000 0.574 0.044 Y NA
 5821191 5821192 PLES_42501 PLES_42511 braE braF TRUE 0.999 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 5821192 5821193 PLES_42511 PLES_42521 braF braG TRUE 0.999 3.000 0.967 0.012 Y NA
 5821194 5821195 PLES_42531 PLES_42541     TRUE 0.952 37.000 0.727 1.000   NA
 5821195 5821196 PLES_42541 PLES_42551     FALSE 0.119 99.000 0.000 1.000 N NA
 5821200 5821201 PLES_42591 PLES_42601     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5821201 5821202 PLES_42601 PLES_42611     TRUE 0.883 11.000 0.000 0.061 N NA
 5821202 5821203 PLES_42611 PLES_42621     TRUE 0.948 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5821203 5821204 PLES_42621 PLES_42631     FALSE 0.182 114.000 0.016 1.000 N NA
 5821204 5821205 PLES_42631 PLES_42641     TRUE 0.999 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 5821205 5821206 PLES_42641 PLES_42651     TRUE 0.999 -15.000 0.937 0.055 Y NA
 5821206 5821207 PLES_42651 PLES_42661     TRUE 0.999 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 5821207 5821208 PLES_42661 PLES_42671     TRUE 1.000 -3.000 0.976 0.003 Y NA
 5821208 5821209 PLES_42671 PLES_42681     TRUE 0.999 0.000 0.881 0.003 Y NA
 5821211 5821212 PLES_42701 PLES_42711     FALSE 0.028 409.000 0.065 1.000 N NA
 5821212 5821213 PLES_42711 PLES_42721     TRUE 0.892 42.000 0.047 1.000 Y NA
 5821213 5821214 PLES_42721 PLES_42731     FALSE 0.275 159.000 0.120 1.000 N NA
 5821214 5821215 PLES_42731 PLES_42741   pdxH TRUE 0.814 8.000 0.006 1.000 N NA
 5821215 5821216 PLES_42741 PLES_42751 pdxH   FALSE 0.241 99.000 0.023 1.000 N NA
 5821216 5821217 PLES_42751 PLES_42761     TRUE 0.481 206.000 0.667 1.000 N NA
 5821217 5821218 PLES_42761 PLES_42771     TRUE 0.820 77.000 0.467 1.000   NA
 5821218 5821219 PLES_42771 PLES_42781     FALSE 0.382 79.000 0.029 1.000   NA
 5821221 5821222 PLES_42801 PLES_42811     TRUE 0.980 -7.000 0.106 NA   NA
 5821222 5821223 PLES_42811 PLES_42821     FALSE 0.107 116.000 0.000 NA   NA
 5821224 5821225 PLES_42831 PLES_42841     TRUE 0.985 3.000 0.407 NA   NA
 5821225 5821226 PLES_42841 PLES_42851     TRUE 0.862 0.000 0.000 NA   NA
 5821226 5821227 PLES_42851 PLES_42861     FALSE 0.178 83.000 0.000 NA   NA
 5821229 5821230 PLES_42881 PLES_42891     TRUE 0.952 8.000 0.163 NA   NA
 5821230 5821231 PLES_42891 PLES_42901     FALSE 0.059 167.000 0.000 NA   NA
 5821231 5821232 PLES_42901 PLES_42911   quiP FALSE 0.353 123.000 0.086 1.000   NA
 5821233 5821234 PLES_42921 PLES_42922     FALSE 0.005 549.000 0.000 NA   NA
 5821234 5821235 PLES_42922 PLES_42931     FALSE 0.081 142.000 0.000 NA   NA
 5821235 5821236 PLES_42931 PLES_42941     FALSE 0.087 135.000 0.000 NA   NA
 5821236 5821237 PLES_42941 PLES_42951     FALSE 0.227 73.000 0.000 1.000   NA
 5821237 5821238 PLES_42951 PLES_42961     TRUE 0.714 56.000 0.173 1.000 N NA
 5821240 5821241 PLES_42981 PLES_42991     FALSE 0.029 219.000 0.000 NA   NA
 5821241 5821242 PLES_42991 PLES_43001     FALSE 0.211 79.000 0.000 1.000   NA
 5821242 5821243 PLES_43001 PLES_43011     TRUE 0.863 16.000 0.000 0.035   NA
 5821243 5821244 PLES_43011 PLES_43021     TRUE 0.825 41.000 0.000 1.000 Y NA
 5821244 5821245 PLES_43021 PLES_43031     TRUE 0.975 2.000 0.000 1.000 Y NA
 5821245 5821246 PLES_43031 PLES_43041     TRUE 0.981 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5821246 5821247 PLES_43041 PLES_43051     FALSE 0.113 93.000 0.000 NA N NA
 5821247 5821248 PLES_43051 PLES_43061   mucK FALSE 0.426 24.000 0.000 NA N NA
 5821248 5821249 PLES_43061 PLES_43071 mucK   FALSE 0.162 82.000 0.000 1.000 N NA
 5821249 5821250 PLES_43071 PLES_43081   pauA TRUE 0.988 -16.000 0.250 1.000 N NA
 5821250 5821251 PLES_43081 PLES_43091 pauA   TRUE 0.540 110.000 0.250 NA N NA
 5821253 5821254 PLES_43111 PLES_43112     FALSE 0.010 351.000 0.000 NA   NA
 5821254 5821255 PLES_43112 PLES_43121   purC FALSE 0.145 94.000 0.000 NA   NA
 5821255 5821256 PLES_43121 PLES_43131 purC   TRUE 0.666 29.000 0.021 1.000   NA
 5821256 5821257 PLES_43131 PLES_43141     TRUE 0.948 -61.000 0.022 NA   NA
 5821257 5821258 PLES_43141 PLES_43151   dapA TRUE 0.960 18.000 0.088 NA Y NA
 5821259 5821260 PLES_43161 PLES_43171   bcp TRUE 0.899 12.000 0.102 NA N NA
 5821261 5821262 PLES_43181 PLES_43191     TRUE 0.798 34.000 0.121 NA   NA
 5821266 5821267 PLES_43231 PLES_43241 phnB phnA TRUE 0.999 -22.000 0.703 0.001 Y NA
 5821267 5821268 PLES_43241 PLES_43251 phnA pqsE FALSE 0.121 117.000 0.000 1.000   NA
 5821268 5821269 PLES_43251 PLES_43261 pqsE pqsD TRUE 0.994 -6.000 0.438 NA   NA
 5821269 5821270 PLES_43261 PLES_43271 pqsD pqsC TRUE 0.804 43.000 0.000 NA Y NA
 5821270 5821271 PLES_43271 PLES_43281 pqsC pqsB TRUE 0.987 -7.000 0.000 NA Y NA
 5821271 5821272 PLES_43281 PLES_43291 pqsB pqsA TRUE 0.987 -6.000 0.000 NA Y NA
 5821274 5821275 PLES_43311 PLES_43321 cupC3 cupC2 TRUE 0.944 101.000 0.875 1.000 Y NA
 5821275 5821276 PLES_43321 PLES_43331 cupC2 cupC1 TRUE 0.978 58.000 1.000 1.000 Y NA
 5821276 5821277 PLES_43331 PLES_43341 cupC1   FALSE 0.005 455.000 0.000 NA N NA
 5821278 5821279 PLES_43351 PLES_43361     FALSE 0.008 385.000 0.000 NA   NA
 5821280 5821281 PLES_43371 PLES_43372     FALSE 0.008 391.000 0.000 NA   NA
 5821281 5821282 PLES_43372 PLES_43381     FALSE 0.248 60.000 0.000 NA   NA
 5821282 5821283 PLES_43381 PLES_43391     TRUE 0.943 16.000 0.270 1.000   NA
 5821283 5821284 PLES_43391 PLES_43401     TRUE 0.503 73.000 0.059 1.000   NA
 5821284 5821285 PLES_43401 PLES_43411   oprL TRUE 0.967 10.000 0.278 1.000   NA
 5821285 5821286 PLES_43411 PLES_43421 oprL tolB TRUE 0.896 53.000 0.592 1.000 N NA
 5821286 5821287 PLES_43421 PLES_43431 tolB tolA TRUE 0.995 -3.000 0.215 0.006   NA
 5821287 5821288 PLES_43431 PLES_43441 tolA tolR TRUE 0.993 3.000 0.460 0.089   NA
 5821288 5821289 PLES_43441 PLES_43451 tolR tolQ TRUE 0.993 23.000 0.556 0.057 Y NA
 5821289 5821290 PLES_43451 PLES_43461 tolQ   TRUE 0.991 2.000 0.593 1.000   NA
 5821290 5821291 PLES_43461 PLES_43471   ruvB TRUE 0.653 53.000 0.082 1.000   NA
 5821291 5821292 PLES_43471 PLES_43481 ruvB ruvA TRUE 0.984 11.000 0.011 0.001 Y NA
 5821292 5821293 PLES_43481 PLES_43491 ruvA ruvC TRUE 0.971 17.000 0.011 0.005 Y NA
 5821293 5821294 PLES_43491 PLES_43501 ruvC   TRUE 0.702 84.000 0.277 NA   NA
 5821294 5821295 PLES_43501 PLES_43511   aspS FALSE 0.458 67.000 0.039 NA   NA
 5821296 5821297 PLES_43521 PLES_43531     FALSE 0.004 639.000 0.000 1.000 N NA
 5821298 5821299 PLES_43541 PLES_43551     TRUE 0.936 1.000 0.035 NA   NA
 5821302 5821303 PLES_43581 PLES_43591 proS   TRUE 0.836 9.000 0.013 NA   NA
 5821304 5821305 PLES_43601 PLES_43611     TRUE 0.878 0.000 0.000 1.000   NA
 5821307 5821308 PLES_43631 PLES_43641     FALSE 0.115 159.000 0.011 NA   NA
 5821309 5821310 PLES_43651 PLES_43661   wrbA TRUE 0.992 -3.000 0.112 0.052   NA
 5821310 5821311 PLES_43661 PLES_43671 wrbA   TRUE 0.992 2.000 0.657 NA   NA
 5821312 5821313 PLES_43681 PLES_43691     FALSE 0.219 202.000 0.174 NA   NA
 5821314 5821315 PLES_43701 PLES_43711 purM purN TRUE 0.998 0.000 0.230 0.001 Y NA
 5821315 5821316 PLES_43711 PLES_43721 purN   TRUE 0.974 -7.000 0.065 NA   NA
 5821318 5821319 PLES_43741 PLES_43751     TRUE 0.662 12.000 0.000 NA   NA
 5821319 5821320 PLES_43751 PLES_43761     TRUE 0.876 6.000 0.024 NA   NA
 5821320 5821321 PLES_43761 PLES_43771     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 5821322 5821323 PLES_43781 PLES_43791     FALSE 0.044 188.000 0.000 NA   NA
 5821325 5821326 PLES_43811 PLES_43821   relA FALSE 0.291 105.000 0.035 1.000   NA
 5821326 5821327 PLES_43821 PLES_43831 relA ygcA FALSE 0.387 85.000 0.047 1.000 N NA
 5821327 5821328 PLES_43831 PLES_43841 ygcA cysM TRUE 0.881 9.000 0.039 1.000 N NA
 5821328 5821329 PLES_43841 PLES_43851 cysM pirA FALSE 0.018 250.000 0.000 1.000 N NA
 5821329 5821330 PLES_43851 PLES_43861 pirA   FALSE 0.067 236.000 0.000 0.089 N NA
 5821330 5821331 PLES_43861 PLES_43871     TRUE 0.995 0.000 0.222 1.000 Y NA
 5821332 5821333 PLES_43881 PLES_43891 gacS ldhA TRUE 0.892 3.000 0.020 1.000 N NA
 5821333 5821334 PLES_43891 PLES_43901 ldhA   TRUE 0.590 36.000 0.020 NA   NA
 5821334 5821335 PLES_43901 PLES_43911     TRUE 0.629 68.000 0.135 NA   NA
 5821335 5821336 PLES_43911 PLES_43921     FALSE 0.110 113.000 0.000 NA   NA
 5821338 5821339 PLES_43932 PLES_43941     FALSE 0.050 179.000 0.000 NA   NA
 5821341 5821342 PLES_43961 PLES_43971     TRUE 0.973 2.000 0.176 NA   NA
 5821342 5821343 PLES_43971 PLES_43981     FALSE 0.048 161.000 0.000 NA N NA
 5821345 5821346 PLES_44001 PLES_44011     FALSE 0.245 61.000 0.000 NA   NA
 5821346 5821347 PLES_44011 PLES_44021     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5821350 5821351 PLES_44051 PLES_44061     FALSE 0.280 53.000 0.000 NA   NA
 5821351 5821352 PLES_44061 PLES_44071     FALSE 0.152 92.000 0.000 NA   NA
 5821352 5821353 PLES_44071 PLES_44081     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5821353 5821354 PLES_44081 PLES_44091     FALSE 0.061 165.000 0.000 NA   NA
 5821356 5821357 PLES_44102 PLES_44103     FALSE 0.112 112.000 0.000 NA   NA
 5821357 5821358 PLES_44103 PLES_44104     FALSE 0.102 121.000 0.000 NA   NA
 5821358 5821359 PLES_44104 PLES_44111   rsmA FALSE 0.242 62.000 0.000 NA   NA
 5821359 5821360 PLES_44111 PLES_44121 rsmA lysC FALSE 0.167 185.000 0.079 1.000 N NA
 5821360 5821361 PLES_44121 PLES_44131 lysC alaS FALSE 0.235 148.000 0.065 1.000 N NA
 5821361 5821362 PLES_44131 PLES_44141 alaS   FALSE 0.152 122.000 0.009 1.000 N NA
 5821362 5821363 PLES_44141 PLES_44151   aruE TRUE 0.527 145.000 0.031 1.000 Y NA
 5821363 5821364 PLES_44151 PLES_44161 aruE   TRUE 0.984 14.000 0.909 NA   NA
 5821364 5821365 PLES_44161 PLES_44171   aruB TRUE 0.873 14.000 0.072 NA   NA
 5821365 5821366 PLES_44171 PLES_44181 aruB aruD TRUE 0.991 -3.000 0.306 1.000 N NA
 5821366 5821367 PLES_44181 PLES_44191 aruD aruG TRUE 0.811 43.000 0.205 1.000 N NA
 5821367 5821368 PLES_44191 PLES_44201 aruG aruF TRUE 0.998 12.000 1.000 0.000 Y NA
 5821368 5821369 PLES_44201 PLES_44211 aruF aruC TRUE 0.728 199.000 0.533 1.000 Y NA
 5821371 5821372 PLES_44231 PLES_44241 argR aotP TRUE 0.931 33.000 0.500 1.000 N NA
 5821372 5821373 PLES_44241 PLES_44251 aotP   TRUE 0.589 19.000 0.000 1.000   NA
 5821373 5821374 PLES_44251 PLES_44261   aotM TRUE 0.656 14.000 0.000 1.000   NA
 5821374 5821375 PLES_44261 PLES_44271 aotM aotQ TRUE 0.997 17.000 0.875 0.009 Y NA
 5821375 5821376 PLES_44271 PLES_44281 aotQ aotJ TRUE 0.663 119.000 0.000 0.044 Y NA
 5821376 5821377 PLES_44281 PLES_44282 aotJ   FALSE 0.041 194.000 0.000 NA   NA
 5821377 5821378 PLES_44282 PLES_44291   acsA FALSE 0.024 233.000 0.000 NA   NA
 5821378 5821379 PLES_44291 PLES_44301 acsA   FALSE 0.042 182.000 0.000 1.000 N NA
 5821379 5821380 PLES_44301 PLES_44311     TRUE 0.999 -3.000 0.882 NA Y NA
 5821380 5821381 PLES_44311 PLES_44321     TRUE 0.850 49.000 0.034 NA Y NA
 5821381 5821382 PLES_44321 PLES_44331     TRUE 0.814 114.000 0.250 1.000 Y NA
 5821382 5821383 PLES_44331 PLES_44341     TRUE 0.976 11.000 0.500 1.000 N NA
 5821383 5821384 PLES_44341 PLES_44351     TRUE 0.829 56.000 0.324 1.000   NA
 5821384 5821385 PLES_44351 PLES_44361     TRUE 0.570 39.000 0.021 NA   NA
 5821385 5821386 PLES_44361 PLES_44371     TRUE 0.736 15.000 0.021 NA N NA
 5821386 5821387 PLES_44371 PLES_44381     TRUE 0.811 46.000 0.216 NA   NA
 5821390 5821391 PLES_44411 PLES_44421     FALSE 0.017 269.000 0.000 NA   NA
 5821393 5821394 PLES_44441 PLES_44451 phhA phhB TRUE 0.523 105.000 0.203 1.000 N NA
 5821394 5821395 PLES_44451 PLES_44461 phhB phhC TRUE 0.963 -3.000 0.037 1.000 N NA
 5821395 5821396 PLES_44461 PLES_44471 phhC pbpG FALSE 0.011 314.000 0.000 1.000 N NA
 5821397 5821398 PLES_44481 PLES_44491     FALSE 0.102 121.000 0.000 NA   NA
 5821398 5821399 PLES_44491 PLES_44501   aroP2 FALSE 0.071 153.000 0.000 NA   NA
 5821399 5821400 PLES_44501 PLES_44511 aroP2 hpd FALSE 0.101 298.000 0.000 1.000 Y NA
 5821401 5821402 PLES_44521 PLES_44531     FALSE 0.099 124.000 0.000 NA   NA
 5821402 5821403 PLES_44531 PLES_44541     TRUE 0.804 84.000 0.500 NA   NA
 5821403 5821404 PLES_44541 PLES_44551     TRUE 0.853 26.000 0.133 NA   NA
 5821405 5821406 PLES_44561 PLES_44571     TRUE 0.670 75.000 0.222 NA N NA
 5821406 5821407 PLES_44571 PLES_44581     FALSE 0.084 295.000 0.158 1.000 N NA
 5821407 5821408 PLES_44581 PLES_44591     TRUE 0.993 -7.000 0.407 1.000 N NA
 5821408 5821409 PLES_44591 PLES_44601     TRUE 0.650 40.000 0.038 1.000   NA
 5821409 5821410 PLES_44601 PLES_44611   bolA FALSE 0.178 165.000 0.049 NA   NA
 5821410 5821411 PLES_44611 PLES_44621 bolA   TRUE 0.855 14.000 0.056 NA   NA
 5821412 5821413 PLES_44631 PLES_44641   fumC2 FALSE 0.145 129.000 0.005 NA   NA
 5821413 5821414 PLES_44641 PLES_44651 fumC2   TRUE 0.948 -7.000 0.007 1.000   NA
 5821414 5821415 PLES_44651 PLES_44661   cbpD FALSE 0.018 280.000 0.000 1.000   NA
 5821415 5821416 PLES_44661 PLES_44671 cbpD   FALSE 0.059 177.000 0.000 1.000   NA
 5821417 5821418 PLES_44681 PLES_44691   trxB2 FALSE 0.020 254.000 0.000 NA   NA
 5821418 5821419 PLES_44691 PLES_44701 trxB2   TRUE 0.536 134.000 0.024 1.000 Y NA
 5821420 5821421 PLES_44711 PLES_44721     FALSE 0.245 85.000 0.007 1.000 N NA
 5821421 5821422 PLES_44721 PLES_44731     FALSE 0.009 378.000 0.000 NA   NA
 5821422 5821423 PLES_44731 PLES_44741   plcH FALSE 0.011 342.000 0.000 NA   NA
 5821423 5821424 PLES_44741 PLES_44751 plcH plcR TRUE 0.945 18.000 0.333 NA   NA
 5821424 5821425 PLES_44751 PLES_44761 plcR   FALSE 0.164 88.000 0.000 NA   NA
 5821426 5821427 PLES_44771 PLES_44781     FALSE 0.042 191.000 0.000 NA   NA
 5821427 5821428 PLES_44781 PLES_44791     TRUE 0.690 41.000 0.070 1.000 N NA
 5821428 5821429 PLES_44791 PLES_44801     FALSE 0.130 151.000 0.018 1.000 N NA
 5821429 5821430 PLES_44801 PLES_44811   slyD FALSE 0.301 206.000 0.024 1.000 Y NA
 5821430 5821431 PLES_44811 PLES_44812 slyD   FALSE 0.027 225.000 0.000 NA   NA
 5821432 5821433 PLES_44821 PLES_44831 ackA pta TRUE 0.591 63.000 0.075 1.000   NA
 5821433 5821434 PLES_44831 PLES_44841 pta   FALSE 0.448 127.000 0.170 1.000   NA
 5821435 5821436 PLES_44851 PLES_44861     FALSE 0.244 106.000 0.021 1.000   NA
 5821438 5821439 PLES_44881 PLES_44891     FALSE 0.004 708.000 0.000 NA   NA
 5821439 5821440 PLES_44891 PLES_44901     FALSE 0.113 111.000 0.000 NA   NA
 5821440 5821441 PLES_44901 PLES_44911     FALSE 0.099 123.000 0.000 NA   NA
 5821441 5821442 PLES_44911 PLES_44921     FALSE 0.259 57.000 0.000 NA   NA
 5821444 5821445 PLES_44941 PLES_44951     FALSE 0.161 89.000 0.000 NA   NA
 5821445 5821446 PLES_44951 PLES_44961     FALSE 0.164 88.000 0.000 NA   NA
 5821446 5821447 PLES_44961 PLES_44971     FALSE 0.009 382.000 0.000 NA   NA
 5821447 5821448 PLES_44971 PLES_44981     FALSE 0.018 262.000 0.000 NA   NA
 5821448 5821449 PLES_44981 PLES_44991     TRUE 0.758 33.000 0.000 0.036   NA
 5821449 5821450 PLES_44991 PLES_45001     FALSE 0.116 108.000 0.000 NA   NA
 5821450 5821451 PLES_45001 PLES_45011   ORF159 FALSE 0.149 93.000 0.000 NA   NA
 5821451 5821452 PLES_45011 PLES_45021 ORF159   FALSE 0.041 193.000 0.000 NA   NA
 5821454 5821455 PLES_45041 PLES_45051     TRUE 0.906 -7.000 0.000 NA   NA
 5821455 5821456 PLES_45051 PLES_45061     FALSE 0.058 168.000 0.000 NA   NA
 5821456 5821457 PLES_45061 PLES_45071     FALSE 0.029 218.000 0.000 NA   NA
 5821457 5821458 PLES_45071 PLES_45081     TRUE 0.607 15.000 0.000 NA   NA
 5821458 5821459 PLES_45081 PLES_45091     TRUE 0.894 -34.000 0.000 NA   NA
 5821461 5821462 PLES_45111 PLES_45121 repA oruR FALSE 0.004 918.000 0.000 NA   NA
 5821464 5821465 PLES_45141 PLES_45151     FALSE 0.267 109.000 0.031 1.000   NA
 5821466 5821467 PLES_45161 PLES_45162   ssrA FALSE 0.242 62.000 0.000 NA   NA
 5821467 5821468 PLES_45162 PLES_45171 ssrA   FALSE 0.006 473.000 0.000 NA   NA
 5821468 5821469 PLES_45171 PLES_45181     FALSE 0.022 243.000 0.000 NA   NA
 5821469 5821470 PLES_45181 PLES_45191     FALSE 0.053 174.000 0.000 NA   NA
 5821470 5821471 PLES_45191 PLES_45201     FALSE 0.020 252.000 0.000 NA   NA
 5821471 5821472 PLES_45201 PLES_45211     TRUE 0.579 17.000 0.000 NA   NA
 5821478 5821479 PLES_45281 PLES_45291     TRUE 0.876 -3.000 0.000 NA N NA
 5821479 5821480 PLES_45291 PLES_45301     FALSE 0.054 289.000 0.000 0.060   NA
 5821480 5821481 PLES_45301 PLES_45311     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5821481 5821482 PLES_45311 PLES_45321     FALSE 0.437 31.000 0.000 NA   NA
 5821482 5821483 PLES_45321 PLES_45331     FALSE 0.133 107.000 0.000 1.000   NA
 5821484 5821485 PLES_45341 PLES_45351   ampDh3 FALSE 0.213 69.000 0.000 NA   NA
 5821485 5821486 PLES_45351 PLES_45361 ampDh3   FALSE 0.005 627.000 0.000 NA   NA
 5821488 5821489 PLES_45381 PLES_45391     TRUE 0.466 32.000 0.000 1.000   NA
 5821489 5821490 PLES_45391 PLES_45401     FALSE 0.168 86.000 0.000 NA   NA
 5821490 5821491 PLES_45401 PLES_45411     TRUE 0.971 0.000 0.111 NA   NA
 5821491 5821492 PLES_45411 PLES_45421     TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 5821495 5821496 PLES_45451 PLES_45461   prpB TRUE 0.903 11.000 0.080 1.000 N NA
 5821496 5821497 PLES_45461 PLES_45471 prpB prpC TRUE 0.769 93.000 0.502 1.000 N NA
 5821497 5821498 PLES_45471 PLES_45481 prpC   TRUE 0.802 131.000 0.289 1.000 Y NA
 5821498 5821499 PLES_45481 PLES_45491     TRUE 0.775 119.000 0.733 NA   NA
 5821499 5821500 PLES_45491 PLES_45501   prpD FALSE 0.248 135.000 0.053 NA   NA
 5821503 5821504 PLES_45531 PLES_45541     FALSE 0.007 431.000 0.000 NA   NA
 5821506 5821507 PLES_45561 PLES_45571     FALSE 0.264 56.000 0.000 NA   NA
 5821507 5821508 PLES_45571 PLES_45581     TRUE 0.911 10.000 0.077 1.000 N NA
 5821510 5821511 PLES_45601 PLES_45611 putP putA FALSE 0.024 312.000 0.020 1.000 N NA
 5821514 5821515 PLES_45641 PLES_45651   icp FALSE 0.278 111.000 0.041 NA   NA
 5821515 5821516 PLES_45651 PLES_45661 icp   FALSE 0.133 99.000 0.000 NA   NA
 5821516 5821517 PLES_45661 PLES_45671     FALSE 0.090 132.000 0.000 NA   NA
 5821517 5821518 PLES_45671 PLES_45681     FALSE 0.192 105.000 0.008 NA   NA
 5821518 5821519 PLES_45681 PLES_45691     TRUE 0.992 -3.000 0.315 NA   NA
 5821520 5821521 PLES_45701 PLES_45711 pdxJ recO TRUE 0.985 -7.000 0.166 1.000 N NA
 5821521 5821522 PLES_45711 PLES_45721 recO era TRUE 0.646 61.000 0.109 1.000   NA
 5821522 5821523 PLES_45721 PLES_45731 era rnc TRUE 0.992 -7.000 0.127 0.043   NA
 5821523 5821524 PLES_45731 PLES_45741 rnc   TRUE 0.963 -3.000 0.033 NA   NA
 5821524 5821525 PLES_45741 PLES_45751   lepB FALSE 0.264 169.000 0.133 NA   NA
 5821525 5821526 PLES_45751 PLES_45761 lepB lepA TRUE 0.959 6.000 0.187 1.000 N NA
 5821526 5821527 PLES_45761 PLES_45771 lepA mucD FALSE 0.137 150.000 0.020 1.000 N NA
 5821527 5821528 PLES_45771 PLES_45781 mucD mucC TRUE 0.820 40.000 0.206 NA N NA
 5821528 5821529 PLES_45781 PLES_45791 mucC mucB TRUE 0.999 -3.000 0.609 NA Y NA
 5821529 5821530 PLES_45791 PLES_45801 mucB mucA TRUE 0.997 9.000 0.856 NA Y NA
 5821530 5821531 PLES_45801 PLES_45811 mucA algU TRUE 0.952 32.000 0.705 NA N NA
 5821534 5821535 PLES_45841 PLES_45851     FALSE 0.287 101.000 0.034 NA   NA
 5821536 5821537 PLES_45861 PLES_45871     TRUE 0.996 -7.000 0.163 1.000 Y NA
 5821538 5821539 PLES_45881 PLES_45891 opdH   TRUE 0.482 30.000 0.000 1.000   NA
 5821539 5821540 PLES_45891 PLES_45901     TRUE 0.831 49.000 0.277 NA   NA
 5821540 5821541 PLES_45901 PLES_45911     TRUE 0.987 11.000 0.857 NA   NA
 5821541 5821542 PLES_45911 PLES_45921     TRUE 0.994 -7.000 0.429 NA   NA
 5821543 5821544 PLES_45931 PLES_45941 ung   FALSE 0.099 100.000 0.000 NA N NA
 5821544 5821545 PLES_45941 PLES_45951     FALSE 0.347 43.000 0.000 NA   NA
 5821546 5821547 PLES_45961 PLES_45971     TRUE 0.771 12.000 0.013 1.000 N NA
 5821547 5821548 PLES_45971 PLES_45981     TRUE 0.911 66.000 0.242 1.000 Y NA
 5821548 5821549 PLES_45981 PLES_45991     TRUE 0.983 59.000 0.627 0.003 Y NA
 5821549 5821550 PLES_45991 PLES_46001     TRUE 0.918 112.000 0.687 1.000 Y NA
 5821550 5821551 PLES_46001 PLES_46011     FALSE 0.008 393.000 0.000 NA   NA
 5821551 5821552 PLES_46011 PLES_46021     FALSE 0.107 116.000 0.000 NA   NA
 5821555 5821556 PLES_46051 PLES_46061     FALSE 0.099 123.000 0.000 NA   NA
 5821556 5821557 PLES_46061 PLES_46071     FALSE 0.106 117.000 0.000 NA   NA
 5821557 5821558 PLES_46071 PLES_46081     FALSE 0.139 96.000 0.000 NA   NA
 5821559 5821560 PLES_46091 PLES_46101     TRUE 0.995 -3.000 0.556 NA   NA
 5821560 5821561 PLES_46101 PLES_46111     TRUE 0.534 21.000 0.000 NA   NA
 5821561 5821562 PLES_46111 PLES_46121     TRUE 0.980 0.000 0.189 NA   NA
 5821562 5821563 PLES_46121 PLES_46131     FALSE 0.086 136.000 0.000 NA   NA
 5821563 5821564 PLES_46131 PLES_46141     FALSE 0.185 80.000 0.000 NA   NA
 5821564 5821565 PLES_46141 PLES_46151     FALSE 0.007 452.000 0.000 NA   NA
 5821565 5821566 PLES_46151 PLES_46152     FALSE 0.092 131.000 0.000 NA   NA
 5821567 5821568 PLES_46161 PLES_46171     FALSE 0.024 232.000 0.000 NA   NA
 5821569 5821570 PLES_46181 PLES_46191     TRUE 0.596 60.000 0.080 NA   NA
 5821571 5821572 PLES_46201 PLES_46211 gloA2   FALSE 0.365 45.000 0.000 1.000   NA
 5821573 5821574 PLES_46221 PLES_46231   toxR FALSE 0.015 286.000 0.000 NA   NA
 5821574 5821575 PLES_46231 PLES_46241 toxR cat FALSE 0.149 93.000 0.000 NA   NA
 5821575 5821576 PLES_46241 PLES_46251 cat   FALSE 0.020 255.000 0.000 NA   NA
 5821576 5821577 PLES_46251 PLES_46261     FALSE 0.071 128.000 0.000 NA N NA
 5821577 5821578 PLES_46261 PLES_46271     TRUE 0.599 71.000 0.133 1.000 N NA
 5821578 5821579 PLES_46271 PLES_46281     FALSE 0.144 79.000 0.000 NA N NA
 5821580 5821581 PLES_46291 PLES_46301     TRUE 0.714 10.000 0.000 NA   NA
 5821581 5821582 PLES_46301 PLES_46311     TRUE 0.969 0.000 0.100 NA   NA
 5821582 5821583 PLES_46311 PLES_46321     TRUE 0.985 5.000 0.500 NA   NA
 5821583 5821584 PLES_46321 PLES_46331     TRUE 0.933 29.000 0.429 NA   NA
 5821584 5821585 PLES_46331 PLES_46341     TRUE 0.926 35.000 0.480 NA   NA
 5821585 5821586 PLES_46341 PLES_46351     TRUE 0.806 68.000 0.360 1.000   NA
 5821586 5821587 PLES_46351 PLES_46361   exbD2 TRUE 0.974 9.000 0.190 0.087 N NA
 5821587 5821588 PLES_46361 PLES_46371 exbD2 exbB2 TRUE 0.991 11.000 0.655 0.056   NA
 5821588 5821589 PLES_46371 PLES_46381 exbB2   TRUE 0.951 24.000 0.472 1.000   NA
 5821589 5821590 PLES_46381 PLES_46391     FALSE 0.290 164.000 0.139 NA   NA
 5821590 5821591 PLES_46391 PLES_46401     FALSE 0.008 391.000 0.000 NA   NA
 5821591 5821592 PLES_46401 PLES_46411     FALSE 0.047 183.000 0.000 NA   NA
 5821592 5821593 PLES_46411 PLES_46421     TRUE 0.925 86.000 0.500 NA Y NA
 5821593 5821594 PLES_46421 PLES_46431     FALSE 0.004 514.000 0.000 NA N NA
 5821594 5821595 PLES_46431 PLES_46441     TRUE 0.999 0.000 0.653 0.003 Y NA
 5821595 5821596 PLES_46441 PLES_46451     TRUE 1.000 -3.000 0.776 0.003 Y NA
 5821596 5821597 PLES_46451 PLES_46461     TRUE 0.993 -3.000 0.044 1.000 Y NA
 5821597 5821598 PLES_46461 PLES_46471     FALSE 0.030 1195.000 0.000 1.000 Y NA
 5821598 5821599 PLES_46471 PLES_46481     TRUE 0.973 8.000 0.029 1.000 Y NA
 5821602 5821603 PLES_46511 PLES_46521     TRUE 0.985 -16.000 0.000 NA Y NA
 5821604 5821605 PLES_46531 PLES_46541     TRUE 0.887 70.000 0.800 NA N NA
 5821605 5821606 PLES_46541 PLES_46551     TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5821609 5821610 PLES_46581 PLES_46591     TRUE 0.987 8.000 0.667 NA   NA
 5821610 5821611 PLES_46591 PLES_46601     TRUE 0.998 -24.000 0.500 1.000 Y NA
 5821612 5821613 PLES_46602 PLES_46603     FALSE 0.081 142.000 0.000 NA   NA
 5821613 5821614 PLES_46603 PLES_46604     FALSE 0.026 227.000 0.000 NA   NA
 5821614 5821615 PLES_46604 PLES_46605     FALSE 0.456 29.000 0.000 NA   NA
 5821615 5821616 PLES_46605 PLES_46606     FALSE 0.233 65.000 0.000 NA   NA
 5821617 5821618 PLES_46611 PLES_46621 sbcD   TRUE 0.986 9.000 0.669 1.000 N NA
 5821619 5821620 PLES_46631 PLES_46641 recD recB TRUE 1.000 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 5821620 5821621 PLES_46641 PLES_46651 recB recC TRUE 0.999 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 5821621 5821622 PLES_46651 PLES_46661 recC   FALSE 0.335 41.000 0.000 1.000 N NA
 5821622 5821623 PLES_46661 PLES_46671     FALSE 0.126 113.000 0.000 1.000   NA
 5821624 5821625 PLES_46681 PLES_46691     FALSE 0.244 55.000 0.000 1.000 N NA
 5821627 5821628 PLES_46711 PLES_46721     FALSE 0.080 144.000 0.000 NA   NA
 5821629 5821630 PLES_46731 PLES_46741 pprA   TRUE 0.963 10.000 0.286 NA N NA
 5821631 5821632 PLES_46751 PLES_46761 fppA pprB TRUE 0.720 121.000 0.600 1.000 N NA
 5821633 5821634 PLES_46771 PLES_46781 tadG   TRUE 0.841 25.000 0.111 NA   NA
 5821634 5821635 PLES_46781 PLES_46791   tadD TRUE 0.953 23.000 0.500 NA   NA
 5821635 5821636 PLES_46791 PLES_46801 tadD tadC TRUE 0.999 -3.000 0.620 NA Y NA
 5821636 5821637 PLES_46801 PLES_46811 tadC tadB TRUE 0.996 10.000 0.844 NA Y NA
 5821637 5821638 PLES_46811 PLES_46821 tadB tadA TRUE 0.999 -3.000 0.822 NA Y NA
 5821638 5821639 PLES_46821 PLES_46831 tadA tadZ TRUE 0.999 -3.000 0.732 NA Y NA
 5821639 5821640 PLES_46831 PLES_46841 tadZ rcpA TRUE 0.995 10.000 0.696 NA Y NA
 5821640 5821641 PLES_46841 PLES_46851 rcpA rcpC TRUE 0.981 14.000 0.234 NA Y NA
 5821642 5821643 PLES_46861 PLES_46871   flp FALSE 0.037 200.000 0.000 NA   NA
 5821643 5821644 PLES_46871 PLES_46881 flp pctC FALSE 0.033 188.000 0.000 NA N NA
 5821644 5821645 PLES_46881 PLES_46891 pctC   FALSE 0.011 318.000 0.000 1.000 N NA
 5821645 5821646 PLES_46891 PLES_46901     TRUE 0.987 -7.000 0.182 1.000   NA
 5821646 5821647 PLES_46901 PLES_46911     TRUE 0.976 -3.000 0.071 NA   NA
 5821651 5821652 PLES_46951 PLES_46961     TRUE 0.538 38.000 0.012 NA   NA
 5821652 5821653 PLES_46961 PLES_46971     TRUE 0.996 -3.000 0.708 NA   NA
 5821653 5821654 PLES_46971 PLES_46981     TRUE 0.981 -13.000 0.129 NA   NA
 5821654 5821655 PLES_46981 PLES_46991     TRUE 0.997 -3.000 0.955 NA   NA
 5821655 5821656 PLES_46991 PLES_47001     TRUE 0.995 -3.000 0.583 NA   NA
 5821656 5821657 PLES_47001 PLES_47011     TRUE 0.987 -3.000 0.182 NA   NA
 5821658 5821659 PLES_47021 PLES_47031     FALSE 0.245 61.000 0.000 NA   NA
 5821659 5821660 PLES_47031 PLES_47041     FALSE 0.124 103.000 0.000 NA   NA
 5821661 5821662 PLES_47051 PLES_47061     FALSE 0.324 85.000 0.019 1.000   NA
 5821662 5821663 PLES_47061 PLES_47071   pykA FALSE 0.371 83.000 0.038 1.000 N NA
 5821664 5821665 PLES_47081 PLES_47091     TRUE 0.849 65.000 0.500 1.000 N NA
 5821665 5821666 PLES_47091 PLES_47101     TRUE 0.991 -7.000 0.286 1.000 N NA
 5821668 5821669 PLES_47121 PLES_47131     FALSE 0.098 136.000 0.000 1.000   NA
 5821669 5821670 PLES_47131 PLES_47141     TRUE 0.906 21.000 0.188 1.000   NA
 5821670 5821671 PLES_47141 PLES_47151     FALSE 0.201 104.000 0.010 NA   NA
 5821671 5821672 PLES_47151 PLES_47161     FALSE 0.145 94.000 0.000 NA   NA
 5821672 5821673 PLES_47161 PLES_47171     TRUE 0.553 100.000 0.000 1.000 Y NA
 5821673 5821674 PLES_47171 PLES_47181     TRUE 0.797 75.000 0.412 NA   NA
 5821674 5821675 PLES_47181 PLES_47191     TRUE 0.506 65.000 0.050 NA   NA
 5821675 5821676 PLES_47191 PLES_47201     FALSE 0.420 100.000 0.100 1.000 N NA
 5821676 5821677 PLES_47201 PLES_47211     TRUE 0.822 1.000 0.000 1.000 N NA
 5821677 5821678 PLES_47211 PLES_47221     FALSE 0.420 38.000 0.000 1.000   NA
 5821678 5821679 PLES_47221 PLES_47231     FALSE 0.061 165.000 0.000 NA   NA
 5821679 5821680 PLES_47231 PLES_47241     FALSE 0.245 61.000 0.000 NA   NA
 5821680 5821681 PLES_47241 PLES_47251     TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 5821681 5821682 PLES_47251 PLES_47261     TRUE 0.708 29.000 0.043 1.000 N NA
 5821682 5821683 PLES_47261 PLES_47271     FALSE 0.194 85.000 0.000 1.000   NA
 5821684 5821685 PLES_47281 PLES_47291     TRUE 0.986 0.000 0.286 NA   NA
 5821686 5821687 PLES_47301 PLES_47311     FALSE 0.075 150.000 0.000 NA   NA
 5821688 5821689 PLES_47321 PLES_47331     FALSE 0.245 49.000 0.000 NA N NA
 5821689 5821690 PLES_47331 PLES_47341   xenB TRUE 0.719 37.000 0.080 NA N NA
 5821691 5821692 PLES_47351 PLES_47361     TRUE 0.991 0.000 0.455 NA   NA
 5821692 5821693 PLES_47361 PLES_47371     TRUE 0.973 18.000 0.177 1.000 Y NA
 5821693 5821694 PLES_47371 PLES_47381     FALSE 0.030 217.000 0.000 NA   NA
 5821699 5821700 PLES_47431 PLES_47441     TRUE 0.909 2.000 0.019 NA   NA
 5821700 5821701 PLES_47441 PLES_47451   sodB FALSE 0.020 347.000 0.009 1.000   NA
 5821701 5821702 PLES_47451 PLES_47461 sodB   FALSE 0.070 181.000 0.004 1.000 N NA
 5821703 5821704 PLES_47471 PLES_47481     TRUE 0.993 2.000 0.722 NA   NA
 5821705 5821706 PLES_47491 PLES_47501 icmP   TRUE 0.511 163.000 0.436 NA N NA
 5821706 5821707 PLES_47501 PLES_47511     TRUE 0.986 10.000 0.713 NA   NA
 5821707 5821708 PLES_47511 PLES_47521     TRUE 0.982 11.000 0.620 NA   NA
 5821708 5821709 PLES_47521 PLES_47531     FALSE 0.056 170.000 0.000 NA   NA
 5821709 5821710 PLES_47531 PLES_47541     TRUE 0.918 51.000 0.429 0.086 N NA
 5821710 5821711 PLES_47541 PLES_47551   pncB2 FALSE 0.074 138.000 0.000 1.000 N NA
 5821712 5821713 PLES_47561 PLES_47571   inaA TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5821713 5821714 PLES_47571 PLES_47581 inaA   TRUE 0.829 3.000 0.000 1.000   NA
 5821714 5821715 PLES_47581 PLES_47591     FALSE 0.209 80.000 0.000 1.000   NA
 5821715 5821716 PLES_47591 PLES_47601     TRUE 0.995 -10.000 0.133 1.000 Y NA
 5821720 5821721 PLES_47641 PLES_47651 groEL groES TRUE 0.952 51.000 0.177 0.069 Y NA
 5821721 5821722 PLES_47651 PLES_47661 groES   FALSE 0.100 196.000 0.028 1.000   NA
 5821722 5821723 PLES_47661 PLES_47671     FALSE 0.408 69.000 0.026 1.000   NA
 5821725 5821726 PLES_47691 PLES_47701     FALSE 0.447 115.000 0.154 NA   NA
 5821727 5821728 PLES_47711 PLES_47721     TRUE 0.749 43.000 0.120 NA   NA
 5821729 5821730 PLES_47731 PLES_47741     FALSE 0.052 233.000 0.021 NA   NA
 5821731 5821732 PLES_47751 PLES_47761   panE TRUE 0.588 37.000 0.027 1.000 N NA
 5821732 5821733 PLES_47761 PLES_47771 panE   TRUE 0.564 51.000 0.049 1.000 N NA
 5821733 5821734 PLES_47771 PLES_47781     TRUE 0.956 5.000 0.030 0.069   NA
 5821735 5821736 PLES_47791 PLES_47801     TRUE 0.522 54.000 0.042 1.000 N NA
 5821736 5821737 PLES_47801 PLES_47811   argJ FALSE 0.158 121.000 0.011 1.000 N NA
 5821737 5821738 PLES_47811 PLES_47821 argJ secA FALSE 0.290 147.000 0.102 1.000 N NA
 5821738 5821739 PLES_47821 PLES_47831 secA   FALSE 0.327 134.000 0.111 1.000 N NA
 5821741 5821742 PLES_47851 PLES_47861 lpxC ftsZ FALSE 0.417 113.000 0.134 1.000 N NA
 5821742 5821743 PLES_47861 PLES_47871 ftsZ ftsA TRUE 0.960 51.000 0.460 1.000 Y NA
 5821743 5821744 PLES_47871 PLES_47881 ftsA ftsQ TRUE 0.938 22.000 0.389 NA N NA
 5821744 5821745 PLES_47881 PLES_47891 ftsQ ddlB TRUE 0.994 4.000 0.372 NA Y NA
 5821745 5821746 PLES_47891 PLES_47901 ddlB murC TRUE 0.998 -3.000 0.153 0.002 Y NA
 5821746 5821747 PLES_47901 PLES_47911 murC murG TRUE 0.997 -7.000 0.283 1.000 Y NA
 5821747 5821748 PLES_47911 PLES_47921 murG ftsW TRUE 0.996 -10.000 0.647 1.000 N NA
 5821748 5821749 PLES_47921 PLES_47931 ftsW murD TRUE 0.994 0.000 0.297 0.002 N NA
 5821749 5821750 PLES_47931 PLES_47941 murD mraY TRUE 0.997 14.000 0.647 0.002 Y NA
 5821750 5821751 PLES_47941 PLES_47951 mraY murF TRUE 0.998 0.000 0.309 0.002 Y NA
 5821751 5821752 PLES_47951 PLES_47961 murF murE TRUE 0.999 -7.000 0.569 0.001 Y NA
 5821752 5821753 PLES_47961 PLES_47971 murE ftsI TRUE 0.991 0.000 0.073 1.000 Y NA
 5821753 5821754 PLES_47971 PLES_47981 ftsI ftsL TRUE 0.984 -3.000 0.153 1.000 N NA
 5821754 5821755 PLES_47981 PLES_47991 ftsL   TRUE 0.989 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5821755 5821756 PLES_47991 PLES_48001     TRUE 0.991 3.000 0.635 NA   NA
 5821759 5821760 PLES_48021 PLES_48031     TRUE 0.986 -3.000 0.172 NA   NA
 5821760 5821761 PLES_48031 PLES_48041     TRUE 0.862 29.000 0.187 1.000 N NA
 5821761 5821762 PLES_48041 PLES_48051     TRUE 0.996 -3.000 0.613 NA   NA
 5821763 5821764 PLES_48061 PLES_48071 sspB sspA TRUE 0.985 12.000 0.831 NA   NA
 5821764 5821765 PLES_48071 PLES_48081 sspA   TRUE 0.729 86.000 0.370 NA N NA
 5821765 5821766 PLES_48081 PLES_48091     TRUE 0.999 0.000 0.630 0.001 Y NA
 5821766 5821767 PLES_48091 PLES_48101     TRUE 0.998 0.000 0.233 0.001 Y NA
 5821767 5821768 PLES_48101 PLES_48111   rpsI FALSE 0.032 250.000 0.006 1.000 N NA
 5821768 5821769 PLES_48111 PLES_48121 rpsI rplM TRUE 0.996 15.000 0.601 0.007 Y NA
 5821772 5821773 PLES_48151 PLES_48161     FALSE 0.241 159.000 0.080 NA   NA
 5821774 5821775 PLES_48171 PLES_48181   trpS FALSE 0.385 95.000 0.061 NA   NA
 5821775 5821776 PLES_48181 PLES_48191 trpS   TRUE 0.498 68.000 0.048 1.000   NA
 5821778 5821779 PLES_48211 PLES_48221 cysN cysD TRUE 0.967 12.000 0.096 0.000 N NA
 5821783 5821784 PLES_48261 PLES_48271 hisC1 hisD TRUE 0.995 3.000 0.087 0.002 Y NA
 5821784 5821785 PLES_48271 PLES_48281 hisD hisG TRUE 0.899 126.000 0.254 0.002 Y NA
 5821785 5821786 PLES_48281 PLES_48291 hisG murA TRUE 0.875 18.000 0.123 1.000 N NA
 5821786 5821787 PLES_48291 PLES_48301 murA   TRUE 0.915 21.000 0.258 NA N NA
 5821787 5821788 PLES_48301 PLES_48302     FALSE 0.285 52.000 0.000 NA   NA
 5821788 5821789 PLES_48302 PLES_48311     TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5821789 5821790 PLES_48311 PLES_48321     TRUE 0.993 -3.000 0.353 NA   NA
 5821790 5821791 PLES_48321 PLES_48331     TRUE 0.903 12.000 0.091 NA   NA
 5821791 5821792 PLES_48331 PLES_48341     TRUE 0.991 1.000 0.562 NA   NA
 5821792 5821793 PLES_48341 PLES_48351     TRUE 0.997 0.000 0.530 NA Y NA
 5821794 5821795 PLES_48361 PLES_48371     TRUE 0.993 0.000 0.598 1.000   NA
 5821795 5821796 PLES_48371 PLES_48381     TRUE 0.985 9.000 0.617 NA   NA
 5821796 5821797 PLES_48381 PLES_48391     TRUE 0.994 -13.000 0.459 NA   NA
 5821797 5821798 PLES_48391 PLES_48401     TRUE 0.992 0.000 0.543 NA   NA
 5821798 5821799 PLES_48401 PLES_48411   rpoN FALSE 0.170 226.000 0.163 1.000   NA
 5821799 5821800 PLES_48411 PLES_48421 rpoN   TRUE 0.878 78.000 0.820 NA N NA
 5821800 5821801 PLES_48421 PLES_48431   ptsN TRUE 0.978 14.000 0.728 NA N NA
 5821801 5821802 PLES_48431 PLES_48441 ptsN   TRUE 0.974 2.000 0.186 NA   NA
 5821802 5821803 PLES_48441 PLES_48451     TRUE 0.860 30.000 0.182 NA   NA
 5821804 5821805 PLES_48461 PLES_48471   sodM TRUE 0.987 19.000 0.464 1.000 Y NA
 5821805 5821806 PLES_48471 PLES_48481 sodM   TRUE 0.909 13.000 0.107 1.000   NA
 5821806 5821807 PLES_48481 PLES_48491   fumC1 TRUE 0.634 28.000 0.010 1.000   NA
 5821807 5821808 PLES_48491 PLES_48501 fumC1   TRUE 0.973 -7.000 0.058 NA   NA
 5821808 5821809 PLES_48501 PLES_48511   pmbA FALSE 0.130 148.000 0.010 NA   NA
 5821811 5821812 PLES_48531 PLES_48541     TRUE 0.978 3.000 0.259 NA   NA
 5821812 5821813 PLES_48541 PLES_48551     TRUE 0.858 50.000 0.358 NA   NA
 5821813 5821814 PLES_48551 PLES_48561   cafA TRUE 0.948 15.000 0.296 NA   NA
 5821814 5821815 PLES_48561 PLES_48571 cafA   TRUE 0.912 34.000 0.417 NA N NA
 5821815 5821816 PLES_48571 PLES_48581   mreD TRUE 0.588 90.000 0.206 NA N NA
 5821816 5821817 PLES_48581 PLES_48591 mreD mreC TRUE 0.999 0.000 0.550 0.001 Y NA
 5821817 5821818 PLES_48591 PLES_48601 mreC mreB TRUE 0.859 80.000 0.689 1.000 N NA
 5821818 5821819 PLES_48601 PLES_48611 mreB   FALSE 0.126 102.000 0.000 NA   NA
 5821820 5821821 PLES_48621 PLES_48631 gatC gatA TRUE 0.996 16.000 0.643 0.001 Y NA
 5821821 5821822 PLES_48631 PLES_48641 gatA gatB TRUE 0.951 107.000 0.492 0.001 Y NA
 5821822 5821823 PLES_48641 PLES_48651 gatB   FALSE 0.369 60.000 0.010 NA   NA
 5821823 5821824 PLES_48651 PLES_48661     FALSE 0.430 32.000 0.000 NA   NA
 5821825 5821826 PLES_48671 PLES_48681     TRUE 0.973 5.000 0.273 NA   NA
 5821826 5821827 PLES_48681 PLES_48691     TRUE 0.991 -3.000 0.273 NA   NA
 5821827 5821828 PLES_48691 PLES_48701     TRUE 0.855 27.000 0.148 NA   NA
 5821828 5821829 PLES_48701 PLES_48711     TRUE 0.984 -3.000 0.148 NA   NA
 5821829 5821830 PLES_48711 PLES_48721     TRUE 0.875 39.000 0.286 NA   NA
 5821830 5821831 PLES_48721 PLES_48731     FALSE 0.064 162.000 0.000 NA   NA
 5821831 5821832 PLES_48731 PLES_48741     TRUE 0.988 26.000 0.682 1.000 Y NA
 5821833 5821834 PLES_48751 PLES_48761     FALSE 0.020 253.000 0.000 NA   NA
 5821834 5821835 PLES_48761 PLES_48771     TRUE 0.744 94.000 0.000 0.043 Y NA
 5821837 5821838 PLES_48791 PLES_48801     FALSE 0.070 266.000 0.077 1.000 N NA
 5821838 5821839 PLES_48801 PLES_48811   opdD FALSE 0.102 225.000 0.000 0.055   NA
 5821839 5821840 PLES_48811 PLES_48821 opdD   TRUE 0.633 50.000 0.000 0.055   NA
 5821840 5821841 PLES_48821 PLES_48831     TRUE 0.883 68.000 0.036 0.043 Y NA
 5821841 5821842 PLES_48831 PLES_48841     TRUE 0.997 12.000 0.779 0.043 Y NA
 5821842 5821843 PLES_48841 PLES_48851     TRUE 0.965 53.000 0.560 1.000 Y NA
 5821843 5821844 PLES_48851 PLES_48861     TRUE 0.999 0.000 0.377 0.001 Y NA
 5821847 5821848 PLES_48891 PLES_48901     TRUE 0.999 -3.000 0.909 NA Y NA
 5821848 5821849 PLES_48901 PLES_48911     TRUE 0.997 -3.000 0.909 1.000   NA
 5821851 5821852 PLES_48931 PLES_48941     TRUE 0.526 216.000 0.068 0.016 Y NA
 5821853 5821854 PLES_48951 PLES_48961     TRUE 0.978 3.000 0.250 1.000   NA
 5821854 5821855 PLES_48961 PLES_48971     FALSE 0.113 123.000 0.000 1.000   NA
 5821856 5821857 PLES_48981 PLES_48991   speC FALSE 0.107 116.000 0.000 NA   NA
 5821859 5821860 PLES_49011 PLES_49021     FALSE 0.114 190.000 0.042 1.000 N NA
 5821860 5821861 PLES_49021 PLES_49031   ampD TRUE 0.997 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 5821861 5821862 PLES_49031 PLES_49041 ampD   FALSE 0.207 151.000 0.048 NA   NA
 5821864 5821865 PLES_49052 PLES_49061     FALSE 0.280 53.000 0.000 NA   NA
 5821865 5821866 PLES_49061 PLES_49071   pilA TRUE 0.491 76.000 0.067 NA   NA
 5821866 5821867 PLES_49071 PLES_49081 pilA   FALSE 0.213 69.000 0.000 NA   NA
 5821868 5821869 PLES_49091 PLES_49101 pilB pilC TRUE 0.997 4.000 0.362 0.012 Y NA
 5821869 5821870 PLES_49101 PLES_49111 pilC pilD TRUE 0.997 1.000 0.454 1.000 Y NA
 5821870 5821871 PLES_49111 PLES_49121 pilD coaE TRUE 0.981 -3.000 0.122 1.000 N NA
 5821871 5821872 PLES_49121 PLES_49131 coaE   TRUE 0.966 -3.000 0.033 1.000   NA
 5821873 5821874 PLES_49141 PLES_49151     FALSE 0.323 106.000 0.054 NA   NA
 5821874 5821875 PLES_49151 PLES_49161     TRUE 0.968 -3.000 0.043 NA   NA
 5821875 5821876 PLES_49161 PLES_49171     TRUE 0.948 -3.000 0.013 NA   NA
 5821877 5821878 PLES_49181 PLES_49191     TRUE 0.968 -3.000 0.039 1.000   NA
 5821878 5821879 PLES_49191 PLES_49201     TRUE 0.738 26.000 0.039 NA   NA
 5821879 5821880 PLES_49201 PLES_49211   ndh TRUE 0.893 64.000 0.667 NA   NA
 5821882 5821883 PLES_49231 PLES_49241     TRUE 0.931 49.000 0.750 NA   NA
 5821884 5821885 PLES_49242 PLES_49243     TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5821885 5821886 PLES_49243 PLES_49254     TRUE 0.714 10.000 0.000 NA   NA
 5821886 5821887 PLES_49254 PLES_49251   clpB FALSE 0.024 235.000 0.000 NA   NA
 5821887 5821888 PLES_49251 PLES_49261 clpB   FALSE 0.278 156.000 0.108 NA   NA
 5821888 5821889 PLES_49261 PLES_49271   rluD TRUE 0.986 -3.000 0.168 NA   NA
 5821890 5821891 PLES_49281 PLES_49291 comL pilS FALSE 0.008 392.000 0.000 NA   NA
 5821891 5821892 PLES_49291 PLES_49301 pilS pilR TRUE 0.995 15.000 0.556 0.068 Y NA
 5821894 5821895 PLES_49321 PLES_49331 fimT fimU TRUE 0.918 106.000 0.667 NA Y NA
 5821895 5821896 PLES_49331 PLES_49341 fimU pilV TRUE 0.998 -9.000 0.500 NA Y NA
 5821896 5821897 PLES_49341 PLES_49351 pilV pilW TRUE 0.998 -3.000 0.500 NA Y NA
 5821897 5821898 PLES_49351 PLES_49361 pilW pilX TRUE 0.999 -3.000 0.667 NA Y NA
 5821898 5821899 PLES_49361 PLES_49371 pilX pilY1 TRUE 0.972 12.000 0.077 NA Y NA
 5821899 5821900 PLES_49371 PLES_49381 pilY1 pilY2 TRUE 0.933 2.000 0.038 NA   NA
 5821900 5821901 PLES_49381 PLES_49391 pilY2 pilE TRUE 0.995 -3.000 0.500 NA   NA
 5821902 5821903 PLES_49401 PLES_49411 lytB   TRUE 0.831 86.000 0.626 1.000 N NA
 5821903 5821904 PLES_49411 PLES_49421   lspA TRUE 0.993 -7.000 0.417 1.000 N NA
 5821904 5821905 PLES_49421 PLES_49431 lspA ileS TRUE 0.983 -7.000 0.147 1.000 N NA
 5821905 5821906 PLES_49431 PLES_49441 ileS ribF TRUE 0.909 24.000 0.254 1.000 N NA
 5821906 5821907 PLES_49441 PLES_49451 ribF   TRUE 0.547 97.000 0.169 1.000   NA
 5821909 5821910 PLES_49471 PLES_49481   proB TRUE 0.796 12.000 0.017 NA   NA
 5821910 5821911 PLES_49481 PLES_49491 proB obg TRUE 0.701 71.000 0.206 1.000   NA
 5821911 5821912 PLES_49491 PLES_49501 obg rpmA TRUE 0.557 142.000 0.335 1.000   NA
 5821912 5821913 PLES_49501 PLES_49511 rpmA rplU TRUE 0.995 24.000 0.667 0.007 Y NA
 5821914 5821915 PLES_49521 PLES_49531 ispB   FALSE 0.134 138.000 0.007 NA   NA
 5821915 5821916 PLES_49531 PLES_49541     FALSE 0.011 343.000 0.000 NA   NA
 5821917 5821918 PLES_49551 PLES_49561 fklB   FALSE 0.393 85.000 0.043 NA   NA
 5821918 5821919 PLES_49561 PLES_49571     FALSE 0.057 257.000 0.041 NA   NA
 5821919 5821920 PLES_49571 PLES_49581     FALSE 0.202 174.000 0.082 NA   NA
 5821920 5821921 PLES_49581 PLES_49591     FALSE 0.320 151.000 0.132 NA   NA
 5821921 5821922 PLES_49591 PLES_49601     FALSE 0.266 99.000 0.029 1.000 N NA
 5821923 5821924 PLES_49611 PLES_49621     TRUE 0.686 59.000 0.149 NA   NA
 5821925 5821926 PLES_49631 PLES_49641   rtcR FALSE 0.264 56.000 0.000 NA   NA
 5821927 5821928 PLES_49642 PLES_49651     FALSE 0.017 272.000 0.000 NA   NA
 5821928 5821929 PLES_49651 PLES_49661     TRUE 0.707 56.000 0.155 NA   NA
 5821929 5821930 PLES_49661 PLES_49671     TRUE 0.812 37.000 0.154 NA   NA
 5821930 5821931 PLES_49671 PLES_49681   rtcA TRUE 0.971 -3.000 0.052 NA   NA
 5821931 5821932 PLES_49681 PLES_49691 rtcA   FALSE 0.126 102.000 0.000 NA   NA
 5821932 5821933 PLES_49691 PLES_49701   ccpR FALSE 0.099 124.000 0.000 NA   NA
 5821934 5821935 PLES_49711 PLES_49721 gdhA   FALSE 0.314 48.000 0.000 NA   NA
 5821935 5821936 PLES_49721 PLES_49731     FALSE 0.126 102.000 0.000 NA   NA
 5821936 5821937 PLES_49731 PLES_49741   pra FALSE 0.047 260.000 0.031 NA   NA
 5821937 5821938 PLES_49741 PLES_49751 pra   FALSE 0.005 597.000 0.000 NA   NA
 5821938 5821939 PLES_49751 PLES_49761     TRUE 0.998 -10.000 0.333 1.000 Y NA
 5821939 5821940 PLES_49761 PLES_49771     TRUE 0.992 -7.000 0.333 1.000 N NA
 5821940 5821941 PLES_49771 PLES_49781     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 5821941 5821942 PLES_49781 PLES_49791     FALSE 0.026 507.000 0.000 0.012   NA
 5821943 5821944 PLES_49801 PLES_49811     FALSE 0.039 197.000 0.000 NA   NA
 5821945 5821946 PLES_49821 PLES_49831 oprJ mexD TRUE 0.992 6.000 0.529 0.042 N NA
 5821946 5821947 PLES_49831 PLES_49841 mexD mexC TRUE 0.960 28.000 0.706 1.000 N NA
 5821948 5821949 PLES_49851 PLES_49861 nfxB morA FALSE 0.072 244.000 0.000 0.088   NA
 5821949 5821950 PLES_49861 PLES_49871 morA glyA3 TRUE 0.584 123.000 0.333 1.000 N NA
 5821951 5821952 PLES_49881 PLES_49891     TRUE 0.515 23.000 0.000 NA   NA
 5821952 5821953 PLES_49891 PLES_49901     FALSE 0.433 60.000 0.025 NA   NA
 5821953 5821954 PLES_49901 PLES_49911     TRUE 0.685 49.000 0.094 NA   NA
 5821954 5821955 PLES_49911 PLES_49921     FALSE 0.011 338.000 0.000 NA   NA
 5821959 5821960 PLES_49961 PLES_49971     FALSE 0.197 75.000 0.000 NA   NA
 5821960 5821961 PLES_49971 PLES_49981   katB FALSE 0.274 54.000 0.000 NA   NA
 5821963 5821964 PLES_50001 PLES_50011     FALSE 0.104 107.000 0.000 1.000 N NA
 5821966 5821967 PLES_50031 PLES_50041     TRUE 0.942 4.000 0.097 NA N NA
 5821967 5821968 PLES_50041 PLES_50051     TRUE 0.998 3.000 0.452 0.014 Y NA
 5821968 5821969 PLES_50051 PLES_50061     TRUE 0.998 -7.000 0.167 0.050 Y NA
 5821971 5821972 PLES_50081 PLES_50091     FALSE 0.013 303.000 0.000 NA   NA
 5821972 5821973 PLES_50091 PLES_50101     FALSE 0.239 63.000 0.000 NA   NA
 5821974 5821975 PLES_50111 PLES_50121 hprA   FALSE 0.270 110.000 0.042 1.000 N NA
 5821975 5821976 PLES_50121 PLES_50131   lysP FALSE 0.251 95.000 0.021 1.000 N NA
 5821976 5821977 PLES_50131 PLES_50141 lysP   FALSE 0.011 353.000 0.000 1.000   NA
 5821977 5821978 PLES_50141 PLES_50151     FALSE 0.171 117.000 0.008 NA   NA
 5821979 5821980 PLES_50161 PLES_50171     FALSE 0.070 144.000 0.000 1.000 N NA
 5821984 5821985 PLES_50211 PLES_50221     TRUE 0.989 0.000 0.364 NA   NA
 5821987 5821988 PLES_50241 PLES_50251     TRUE 0.468 28.000 0.000 NA   NA
 5821990 5821991 PLES_50271 PLES_50281     FALSE 0.017 270.000 0.000 NA   NA
 5821991 5821992 PLES_50281 PLES_50291     TRUE 0.695 83.000 0.261 NA   NA
 5821992 5821993 PLES_50291 PLES_50301     TRUE 0.659 63.000 0.138 NA   NA
 5821993 5821994 PLES_50301 PLES_50311     TRUE 0.931 2.000 0.036 NA   NA
 5821995 5821996 PLES_50321 PLES_50331 upp uraA TRUE 0.988 3.000 0.101 1.000 Y NA
 5821996 5821997 PLES_50331 PLES_50341 uraA   FALSE 0.011 334.000 0.000 NA   NA
 5821997 5821998 PLES_50341 PLES_50351     TRUE 0.862 31.000 0.192 NA   NA
 5821998 5821999 PLES_50351 PLES_50361     TRUE 0.994 0.000 0.714 NA   NA
 5821999 5822000 PLES_50361 PLES_50371     TRUE 0.917 19.000 0.219 NA   NA
 5822000 5822001 PLES_50371 PLES_50381     TRUE 0.993 17.000 0.879 NA Y NA
 5822001 5822002 PLES_50381 PLES_50391     TRUE 0.997 -3.000 0.848 NA   NA
 5822003 5822004 PLES_50401 PLES_50411   hemH FALSE 0.011 280.000 0.000 NA N NA
 5822004 5822005 PLES_50411 PLES_50421 hemH   TRUE 0.958 -3.000 0.020 1.000   NA
 5822006 5822007 PLES_50431 PLES_50441     FALSE 0.134 153.000 0.017 NA   NA
 5822007 5822008 PLES_50441 PLES_50451     TRUE 0.919 10.000 0.083 NA   NA
 5822008 5822009 PLES_50451 PLES_50461   phr TRUE 0.947 -3.000 0.017 1.000 N NA
 5822010 5822011 PLES_50471 PLES_50481 pagL murI FALSE 0.101 134.000 0.000 1.000   NA
 5822011 5822012 PLES_50481 PLES_50491 murI moeB TRUE 0.941 -10.000 0.013 1.000 N NA
 5822012 5822013 PLES_50491 PLES_50501 moeB hemK TRUE 0.974 -6.000 0.068 1.000 N NA
 5822013 5822014 PLES_50501 PLES_50511 hemK prfA TRUE 0.994 2.000 0.229 1.000 Y NA
 5822014 5822015 PLES_50511 PLES_50521 prfA hemA TRUE 0.952 18.000 0.171 0.025 N NA
 5822016 5822017 PLES_50531 PLES_50541     TRUE 0.795 5.000 0.000 1.000   NA
 5822017 5822018 PLES_50541 PLES_50551   ipk TRUE 0.950 2.000 0.072 1.000 N NA
 5822018 5822019 PLES_50551 PLES_50552 ipk   FALSE 0.393 37.000 0.000 NA   NA
 5822019 5822020 PLES_50552 PLES_50561   prs FALSE 0.264 56.000 0.000 NA   NA
 5822020 5822021 PLES_50561 PLES_50571 prs   FALSE 0.390 117.000 0.122 1.000 N NA
 5822021 5822022 PLES_50571 PLES_50581     TRUE 0.986 42.000 0.496 0.011 Y NA
 5822022 5822023 PLES_50581 PLES_50591     TRUE 0.942 41.000 0.184 1.000 Y NA
 5822023 5822024 PLES_50591 PLES_50592     FALSE 0.049 180.000 0.000 NA   NA
 5822027 5822028 PLES_50621 PLES_50631     FALSE 0.218 62.000 0.000 1.000 N NA
 5822028 5822029 PLES_50631 PLES_50641   rimI FALSE 0.044 199.000 0.000 1.000   NA
 5822029 5822030 PLES_50641 PLES_50651 rimI   TRUE 0.959 -3.000 0.027 NA   NA
 5822030 5822031 PLES_50651 PLES_50661     FALSE 0.019 260.000 0.000 NA   NA
 5822031 5822032 PLES_50661 PLES_50671     TRUE 0.969 31.000 1.000 NA   NA
 5822032 5822033 PLES_50671 PLES_50681     TRUE 0.994 2.000 0.800 NA   NA
 5822033 5822034 PLES_50681 PLES_50691     FALSE 0.359 205.000 0.400 NA   NA
 5822035 5822036 PLES_50701 PLES_50711     TRUE 0.997 -10.000 0.947 NA   NA
 5822036 5822037 PLES_50711 PLES_50721     TRUE 0.997 -3.000 0.950 NA   NA
 5822037 5822038 PLES_50721 PLES_50731   hitA FALSE 0.112 112.000 0.000 NA   NA
 5822039 5822040 PLES_50741 PLES_50751     FALSE 0.143 600.000 0.840 NA   NA
 5822040 5822041 PLES_50751 PLES_50752     FALSE 0.040 196.000 0.000 NA   NA
 5822041 5822042 PLES_50752 PLES_50753     FALSE 0.081 142.000 0.000 NA   NA
 5822042 5822043 PLES_50753 PLES_50754     FALSE 0.026 227.000 0.000 NA   NA
 5822043 5822044 PLES_50754 PLES_50755     FALSE 0.456 29.000 0.000 NA   NA
 5822044 5822045 PLES_50755 PLES_50756     FALSE 0.233 65.000 0.000 NA   NA
 5822045 5822046 PLES_50756 PLES_50761     FALSE 0.005 543.000 0.000 NA   NA
 5822046 5822047 PLES_50761 PLES_50771     TRUE 0.997 0.000 0.790 0.050   NA
 5822047 5822048 PLES_50771 PLES_50781   pssA TRUE 0.468 61.000 0.029 1.000   NA
 5822048 5822049 PLES_50781 PLES_50791 pssA ilvC FALSE 0.174 155.000 0.041 1.000 N NA
 5822049 5822050 PLES_50791 PLES_50801 ilvC ilvH TRUE 0.963 43.000 0.092 0.001 Y NA
 5822050 5822051 PLES_50801 PLES_50811 ilvH ilvI TRUE 0.998 3.000 0.371 0.001 Y NA
 5822053 5822054 PLES_50831 PLES_50841     TRUE 0.957 0.000 0.055 NA   NA
 5822054 5822055 PLES_50841 PLES_50851   mrcB TRUE 0.805 17.000 0.035 1.000   NA
 5822056 5822057 PLES_50861 PLES_50871     FALSE 0.269 92.000 0.018 NA   NA
 5822057 5822058 PLES_50871 PLES_50881     FALSE 0.299 226.000 0.400 NA   NA
 5822058 5822059 PLES_50881 PLES_50891     TRUE 0.581 105.000 0.250 NA   NA
 5822059 5822060 PLES_50891 PLES_50892   PrrF1 FALSE 0.274 54.000 0.000 NA   NA
 5822060 5822061 PLES_50892 PLES_50893 PrrF1 PrrF2 FALSE 0.213 69.000 0.000 NA   NA
 5822062 5822063 PLES_50901 PLES_50911     TRUE 0.841 11.000 0.027 NA   NA
 5822063 5822064 PLES_50911 PLES_50921     TRUE 0.990 0.000 0.053 1.000 Y NA
 5822064 5822065 PLES_50921 PLES_50931   phuT TRUE 0.979 51.000 0.852 1.000 Y NA
 5822065 5822066 PLES_50931 PLES_50941 phuT   TRUE 0.992 10.000 0.384 1.000 Y NA
 5822067 5822068 PLES_50951 PLES_50961 phuR   TRUE 0.524 103.000 0.000 NA Y NA
 5822068 5822069 PLES_50961 PLES_50971     FALSE 0.183 81.000 0.000 NA   NA
 5822073 5822074 PLES_51011 PLES_51021     FALSE 0.218 68.000 0.000 NA   NA
 5822076 5822077 PLES_51041 PLES_51051   trmA TRUE 0.975 -3.000 0.062 1.000   NA
 5822078 5822079 PLES_51061 PLES_51071     TRUE 0.947 0.000 0.038 NA   NA
 5822080 5822081 PLES_51081 PLES_51091 dksA   TRUE 0.714 68.000 0.231 1.000 N NA
 5822081 5822082 PLES_51091 PLES_51101   cbrA FALSE 0.101 230.000 0.006 0.067 N NA
 5822082 5822083 PLES_51101 PLES_51111 cbrA cbrB TRUE 0.965 27.000 0.453 0.067 N NA
 5822083 5822084 PLES_51111 PLES_51112 cbrB   TRUE 0.741 8.000 0.000 NA   NA
 5822086 5822087 PLES_51121 PLES_51131 pcnB folK TRUE 0.989 -3.000 0.234 1.000 N NA
 5822087 5822088 PLES_51131 PLES_51141 folK panB FALSE 0.321 249.000 0.117 1.000 Y NA
 5822088 5822089 PLES_51141 PLES_51151 panB panC TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 5822089 5822090 PLES_51151 PLES_51161 panC panD TRUE 0.888 94.000 0.342 1.000 Y NA
 5822090 5822091 PLES_51161 PLES_51171 panD pgi FALSE 0.214 90.000 0.004 1.000 N NA
 5822091 5822092 PLES_51171 PLES_51181 pgi acsB FALSE 0.205 194.000 0.146 1.000 N NA
 5822092 5822093 PLES_51181 PLES_51191 acsB   FALSE 0.428 97.000 0.088 NA   NA
 5822093 5822094 PLES_51191 PLES_51201     FALSE 0.098 125.000 0.000 NA   NA
 5822094 5822095 PLES_51201 PLES_51211     TRUE 0.915 5.000 0.046 NA   NA
 5822095 5822096 PLES_51211 PLES_51221     TRUE 0.824 96.000 0.714 NA   NA
 5822097 5822098 PLES_51231 PLES_51241     TRUE 0.742 50.000 0.156 NA   NA
 5822098 5822099 PLES_51241 PLES_51251   pnp FALSE 0.017 273.000 0.000 NA   NA
 5822099 5822100 PLES_51251 PLES_51261 pnp rpsO TRUE 0.721 174.000 0.335 1.000 Y NA
 5822100 5822101 PLES_51261 PLES_51271 rpsO truB TRUE 0.836 96.000 0.211 1.000 Y NA
 5822101 5822102 PLES_51271 PLES_51281 truB rbfA TRUE 0.994 3.000 0.318 1.000 Y NA
 5822102 5822103 PLES_51281 PLES_51291 rbfA infB TRUE 0.905 103.000 0.530 1.000 Y NA
 5822103 5822104 PLES_51291 PLES_51301 infB nusA TRUE 0.920 28.000 0.342 1.000 N NA
 5822104 5822105 PLES_51301 PLES_51311 nusA   TRUE 0.938 45.000 0.759 NA   NA
 5822105 5822106 PLES_51311 PLES_51312     FALSE 0.096 127.000 0.000 NA   NA
 5822106 5822107 PLES_51312 PLES_51313     FALSE 0.155 91.000 0.000 NA   NA
 5822107 5822108 PLES_51313 PLES_51321   secG TRUE 0.621 14.000 0.000 NA   NA
 5822108 5822109 PLES_51321 PLES_51331 secG tpiA TRUE 0.968 3.000 0.184 1.000 N NA
 5822109 5822110 PLES_51331 PLES_51341 tpiA glmM TRUE 0.848 66.000 0.082 1.000 Y NA
 5822110 5822111 PLES_51341 PLES_51351 glmM folP TRUE 0.932 17.000 0.260 1.000 N NA
 5822111 5822112 PLES_51351 PLES_51361 folP ftsH TRUE 0.968 10.000 0.325 1.000 N NA
 5822112 5822113 PLES_51361 PLES_51371 ftsH ftsJ FALSE 0.121 199.000 0.066 NA N NA
 5822115 5822116 PLES_51391 PLES_51401   greA TRUE 0.690 11.000 0.000 NA   NA
 5822116 5822117 PLES_51401 PLES_51411 greA carB TRUE 0.895 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5822117 5822118 PLES_51411 PLES_51421 carB   TRUE 0.939 20.000 0.030 1.000 Y NA
 5822118 5822119 PLES_51421 PLES_51431   carA TRUE 0.960 12.000 0.026 1.000 Y NA
 5822119 5822120 PLES_51431 PLES_51432 carA   FALSE 0.319 47.000 0.000 NA   NA
 5822120 5822121 PLES_51432 PLES_51441   dapB TRUE 0.490 26.000 0.000 NA   NA
 5822121 5822122 PLES_51441 PLES_51451 dapB dnaJ TRUE 0.494 57.000 0.041 1.000 N NA
 5822122 5822123 PLES_51451 PLES_51461 dnaJ dnaK TRUE 0.903 116.000 0.236 0.002 Y NA
 5822123 5822124 PLES_51461 PLES_51471 dnaK grpE TRUE 0.865 90.000 0.049 0.005 Y NA
 5822128 5822129 PLES_51511 PLES_51521     TRUE 0.978 -7.000 0.086 NA   NA
 5822132 5822133 PLES_51551 PLES_51561 lldP lldD TRUE 0.541 155.000 0.055 1.000 Y NA
 5822133 5822134 PLES_51561 PLES_51571 lldD   TRUE 0.875 67.000 0.145 1.000 Y NA
 5822134 5822135 PLES_51571 PLES_51581     FALSE 0.006 430.000 0.000 1.000 N NA
 5822135 5822136 PLES_51581 PLES_51591     TRUE 0.659 78.000 0.000 1.000 Y NA
 5822136 5822137 PLES_51591 PLES_51601     TRUE 0.806 3.000 0.000 NA   NA
 5822137 5822138 PLES_51601 PLES_51611   pmrA TRUE 0.640 13.000 0.000 NA   NA
 5822138 5822139 PLES_51611 PLES_51621 pmrA pmrB TRUE 0.961 24.000 0.143 1.000 Y NA
 5822139 5822140 PLES_51621 PLES_51631 pmrB   FALSE 0.214 64.000 0.000 1.000 N NA
 5822141 5822142 PLES_51641 PLES_51651     FALSE 0.178 90.000 0.000 1.000   NA
 5822142 5822143 PLES_51651 PLES_51661     TRUE 0.472 124.000 0.000 1.000 Y NA
 5822143 5822144 PLES_51661 PLES_51671     FALSE 0.116 108.000 0.000 NA   NA
 5822144 5822145 PLES_51671 PLES_51681     FALSE 0.413 34.000 0.000 NA   NA
 5822150 5822151 PLES_51731 PLES_51741 phaJ3   FALSE 0.385 82.000 0.036 NA   NA
 5822151 5822152 PLES_51741 PLES_51751     TRUE 0.978 -3.000 0.088 NA   NA
 5822152 5822153 PLES_51751 PLES_51761     TRUE 0.580 66.000 0.087 NA   NA
 5822155 5822156 PLES_51781 PLES_51791     TRUE 0.952 2.000 0.071 NA   NA
 5822156 5822157 PLES_51791 PLES_51801     TRUE 0.901 -10.000 0.000 NA   NA
 5822157 5822158 PLES_51801 PLES_51811     TRUE 0.988 -3.000 0.214 NA   NA
 5822158 5822159 PLES_51811 PLES_51821     FALSE 0.106 117.000 0.000 NA   NA
 5822160 5822161 PLES_51831 PLES_51841     TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5822161 5822162 PLES_51841 PLES_51851     FALSE 0.014 296.000 0.000 NA   NA
 5822164 5822165 PLES_51862 PLES_51871     FALSE 0.090 132.000 0.000 NA   NA
 5822165 5822166 PLES_51871 PLES_51881     FALSE 0.161 95.000 0.000 1.000   NA
 5822166 5822167 PLES_51881 PLES_51891     FALSE 0.281 49.000 0.000 1.000 N NA
 5822169 5822170 PLES_51911 PLES_51921 selB selA TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.000 N NA
 5822170 5822171 PLES_51921 PLES_51931 selA fdhE TRUE 0.480 79.000 0.083 NA N NA
 5822171 5822172 PLES_51931 PLES_51941 fdhE fdnI FALSE 0.294 133.000 0.091 NA N NA
 5822172 5822173 PLES_51941 PLES_51951 fdnI fdnH TRUE 0.976 72.000 0.538 0.001 Y NA
 5822173 5822174 PLES_51951 PLES_51961 fdnH fdnG TRUE 0.980 9.000 0.128 0.001   NA
 5822174 5822175 PLES_51961 PLES_51971 fdnG   TRUE 0.731 49.000 0.000 0.001   NA
 5822175 5822176 PLES_51971 PLES_51981   lipC FALSE 0.013 308.000 0.000 NA   NA
 5822177 5822178 PLES_51991 PLES_52001 fadH2   FALSE 0.033 208.000 0.000 NA   NA
 5822178 5822179 PLES_52001 PLES_52011     FALSE 0.068 157.000 0.000 NA   NA
 5822179 5822180 PLES_52011 PLES_52021     TRUE 0.895 -24.000 0.000 NA   NA
 5822181 5822182 PLES_52031 PLES_52041     TRUE 0.997 -3.000 0.222 NA Y NA
 5822182 5822183 PLES_52041 PLES_52051     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5822185 5822186 PLES_52071 PLES_52081     FALSE 0.347 43.000 0.000 NA   NA
 5822186 5822187 PLES_52081 PLES_52091     FALSE 0.291 51.000 0.000 NA   NA
 5822187 5822188 PLES_52091 PLES_52101   mgtA FALSE 0.135 98.000 0.000 NA   NA
 5822188 5822189 PLES_52101 PLES_52111 mgtA   FALSE 0.026 227.000 0.000 NA   NA
 5822189 5822190 PLES_52111 PLES_52121     FALSE 0.011 330.000 0.000 NA   NA
 5822193 5822194 PLES_52151 PLES_52161     TRUE 0.574 68.000 0.115 NA N NA
 5822197 5822198 PLES_52191 PLES_52201     TRUE 0.897 -18.000 0.000 NA   NA
 5822198 5822199 PLES_52201 PLES_52211     TRUE 0.992 -3.000 0.312 NA   NA
 5822199 5822200 PLES_52211 PLES_52221     TRUE 0.482 30.000 0.000 1.000   NA
 5822202 5822203 PLES_52241 PLES_52251 speA   FALSE 0.042 251.000 0.023 1.000 N NA
 5822203 5822204 PLES_52251 PLES_52261     FALSE 0.064 204.000 0.017 1.000 N NA
 5822204 5822205 PLES_52261 PLES_52271     TRUE 0.949 4.000 0.101 NA   NA
 5822206 5822207 PLES_52281 PLES_52291     TRUE 0.917 78.000 0.350 1.000 Y NA
 5822207 5822208 PLES_52291 PLES_52301   dipZ FALSE 0.175 160.000 0.000 0.084 N NA
 5822208 5822209 PLES_52301 PLES_52311 dipZ aroQ1 FALSE 0.113 144.000 0.004 1.000 N NA
 5822209 5822210 PLES_52311 PLES_52321 aroQ1 accB TRUE 0.909 24.000 0.254 1.000 N NA
 5822210 5822211 PLES_52321 PLES_52331 accB accC TRUE 0.992 18.000 0.275 0.001 Y NA
 5822211 5822212 PLES_52331 PLES_52341 accC   FALSE 0.128 111.000 0.000 1.000   NA
 5822212 5822213 PLES_52341 PLES_52351   prmA FALSE 0.206 81.000 0.000 1.000   NA
 5822213 5822214 PLES_52351 PLES_52361 prmA   FALSE 0.212 96.000 0.006 NA   NA
 5822214 5822215 PLES_52361 PLES_52371     FALSE 0.055 204.000 0.003 NA   NA
 5822215 5822216 PLES_52371 PLES_52381   fis TRUE 0.985 -3.000 0.161 1.000 N NA
 5822216 5822217 PLES_52381 PLES_52391 fis purH TRUE 0.523 80.000 0.101 1.000 N NA
 5822217 5822218 PLES_52391 PLES_52401 purH purD TRUE 0.827 104.000 0.238 1.000 Y NA
 5822218 5822219 PLES_52401 PLES_52411 purD retS FALSE 0.388 104.000 0.010 0.067 N NA
 5822219 5822220 PLES_52411 PLES_52421 retS   FALSE 0.038 244.000 0.020 NA N NA
 5822222 5822223 PLES_52441 PLES_52451     FALSE 0.263 783.000 0.654 1.000 Y NA
 5822223 5822224 PLES_52451 PLES_52461     TRUE 0.999 -3.000 0.758 0.041 Y NA
 5822224 5822225 PLES_52461 PLES_52471     TRUE 0.997 -3.000 0.823 1.000   NA
 5822225 5822226 PLES_52471 PLES_52481     TRUE 0.855 137.000 0.731 0.011   NA
 5822226 5822227 PLES_52481 PLES_52491     FALSE 0.198 84.000 0.000 1.000   NA
 5822227 5822228 PLES_52491 PLES_52501   ureD TRUE 0.757 9.000 0.000 1.000   NA
 5822228 5822229 PLES_52501 PLES_52511 ureD ureA TRUE 0.997 2.000 0.664 0.001 N NA
 5822229 5822230 PLES_52511 PLES_52521 ureA   TRUE 0.702 9.000 0.000 1.000 N NA
 5822230 5822231 PLES_52521 PLES_52531   ureB TRUE 0.547 17.000 0.000 1.000 N NA
 5822231 5822232 PLES_52531 PLES_52541 ureB ureC TRUE 0.978 63.000 0.486 0.001 Y NA
 5822232 5822233 PLES_52541 PLES_52551 ureC   FALSE 0.017 269.000 0.000 NA   NA
 5822239 5822240 PLES_52611 PLES_52621   osmE FALSE 0.182 89.000 0.000 1.000   NA
 5822244 5822245 PLES_52661 PLES_52671     FALSE 0.016 276.000 0.000 NA   NA
 5822246 5822247 PLES_52681 PLES_52691     TRUE 0.997 -3.000 0.429 0.049   NA
 5822247 5822248 PLES_52691 PLES_52701     TRUE 0.896 54.000 0.583 NA   NA
 5822249 5822250 PLES_52711 PLES_52721 irlR   TRUE 1.000 -21.000 0.889 0.002 Y NA
 5822251 5822252 PLES_52731 PLES_52741   desB FALSE 0.025 220.000 0.000 1.000 N NA
 5822252 5822253 PLES_52741 PLES_52751 desB   TRUE 0.984 -3.000 0.154 1.000 N NA
 5822254 5822255 PLES_52761 PLES_52771 desT ureE FALSE 0.022 230.000 0.000 1.000 N NA
 5822255 5822256 PLES_52771 PLES_52781 ureE ureF TRUE 0.999 -3.000 0.560 0.001 Y NA
 5822256 5822257 PLES_52781 PLES_52791 ureF ureG TRUE 0.997 11.000 0.550 0.001 Y NA
 5822257 5822258 PLES_52791 PLES_52801 ureG ureJ TRUE 0.930 30.000 0.068 NA Y NA
 5822259 5822260 PLES_52811 PLES_52821     TRUE 0.989 -7.000 0.250 NA N NA
 5822262 5822263 PLES_52841 PLES_52851 opdK   TRUE 0.583 108.000 0.250 1.000   NA
 5822263 5822264 PLES_52851 PLES_52861     TRUE 0.911 23.000 0.250 1.000 N NA
 5822264 5822265 PLES_52861 PLES_52871   mdlC TRUE 0.622 87.000 0.211 1.000 N NA
 5822268 5822269 PLES_52901 PLES_52911 vanA vanB TRUE 0.962 15.000 0.128 0.001 N NA
 5822270 5822271 PLES_52921 PLES_52931     FALSE 0.264 64.000 0.000 1.000   NA
 5822271 5822272 PLES_52931 PLES_52941     FALSE 0.011 357.000 0.000 1.000   NA
 5822272 5822273 PLES_52941 PLES_52951     TRUE 0.681 71.000 0.000 1.000 Y NA
 5822273 5822274 PLES_52951 PLES_52961     TRUE 1.000 -3.000 0.881 0.011 Y NA
 5822274 5822275 PLES_52961 PLES_52971     TRUE 0.997 -3.000 0.268 1.000 Y NA
 5822275 5822276 PLES_52971 PLES_52981     TRUE 0.994 11.000 0.263 0.041 Y NA
 5822276 5822277 PLES_52981 PLES_52991     FALSE 0.402 235.000 0.175 1.000 Y NA
 5822278 5822279 PLES_53001 PLES_53011     FALSE 0.234 57.000 0.000 1.000 N NA
 5822280 5822281 PLES_53021 PLES_53031     TRUE 0.575 15.000 0.000 1.000 N NA
 5822282 5822283 PLES_53041 PLES_53051 pncA pncB1 TRUE 0.931 3.000 0.053 1.000 N NA
 5822283 5822284 PLES_53051 PLES_53061 pncB1 nadE TRUE 0.918 29.000 0.033 1.000 Y NA
 5822284 5822285 PLES_53061 PLES_53071 nadE   FALSE 0.078 134.000 0.000 1.000 N NA
 5822288 5822289 PLES_53101 PLES_53111     FALSE 0.279 187.000 0.000 1.000 Y NA
 5822289 5822290 PLES_53111 PLES_53121     FALSE 0.015 251.000 0.000 NA N NA
 5822290 5822291 PLES_53121 PLES_53131     TRUE 0.995 0.000 0.734 NA   NA
 5822291 5822292 PLES_53131 PLES_53141     FALSE 0.018 262.000 0.000 NA   NA
 5822292 5822293 PLES_53141 PLES_53151     FALSE 0.020 253.000 0.000 NA   NA
 5822293 5822294 PLES_53151 PLES_53161   alr FALSE 0.017 272.000 0.000 NA   NA
 5822294 5822295 PLES_53161 PLES_53171 alr dnaB FALSE 0.348 69.000 0.020 1.000 N NA
 5822295 5822296 PLES_53171 PLES_53181 dnaB rplI FALSE 0.295 129.000 0.074 1.000 N NA
 5822296 5822297 PLES_53181 PLES_53191 rplI   TRUE 0.750 22.000 0.034 NA   NA
 5822297 5822298 PLES_53191 PLES_53201   rpsR TRUE 0.639 37.000 0.034 NA   NA
 5822298 5822299 PLES_53201 PLES_53211 rpsR rpsF TRUE 0.987 30.000 0.319 0.007 Y NA
 5822299 5822300 PLES_53211 PLES_53221 rpsF   FALSE 0.264 215.000 0.017 1.000 Y NA
 5822300 5822301 PLES_53221 PLES_53231   rnr TRUE 0.993 -3.000 0.147 0.008 N NA
 5822302 5822303 PLES_53232 PLES_53233     FALSE 0.092 130.000 0.000 NA   NA
 5822304 5822305 PLES_53241 PLES_53251 purA   TRUE 0.723 52.000 0.161 1.000 N NA
 5822305 5822306 PLES_53251 PLES_53261     TRUE 0.791 35.000 0.117 NA   NA
 5822306 5822307 PLES_53261 PLES_53271   hflC TRUE 0.692 96.000 0.348 NA   NA
 5822307 5822308 PLES_53271 PLES_53281 hflC hflK TRUE 0.999 0.000 0.947 0.006 Y NA
 5822308 5822309 PLES_53281 PLES_53291 hflK   TRUE 0.734 95.000 0.184 0.051   NA
 5822309 5822310 PLES_53291 PLES_53301   hfq TRUE 0.921 13.000 0.141 1.000   NA
 5822310 5822311 PLES_53301 PLES_53311 hfq miaA TRUE 0.743 106.000 0.531 1.000   NA
 5822311 5822312 PLES_53311 PLES_53321 miaA mutL TRUE 0.833 58.000 0.188 0.066 N NA
 5822312 5822313 PLES_53321 PLES_53331 mutL amiB TRUE 0.937 0.000 0.030 1.000 N NA
 5822313 5822314 PLES_53331 PLES_53341 amiB   TRUE 0.878 9.000 0.033 NA   NA
 5822314 5822315 PLES_53341 PLES_53351     TRUE 0.980 -12.000 0.118 NA   NA
 5822319 5822320 PLES_53391 PLES_53401 motB motA TRUE 0.991 20.000 0.722 1.000 Y NA
 5822321 5822322 PLES_53411 PLES_53421   rhdA TRUE 0.624 75.000 0.156 NA   NA
 5822322 5822323 PLES_53421 PLES_53431 rhdA psd TRUE 0.953 4.000 0.125 1.000 N NA
 5822323 5822324 PLES_53431 PLES_53441 psd   FALSE 0.010 678.000 0.023 NA   NA
 5822324 5822325 PLES_53441 PLES_53451   fimX TRUE 0.824 65.000 0.400 NA   NA
 5822327 5822328 PLES_53471 PLES_53481     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5822329 5822330 PLES_53491 PLES_53501   parC FALSE 0.026 293.000 0.012 NA   NA
 5822330 5822331 PLES_53501 PLES_53511 parC   TRUE 0.861 8.000 0.016 1.000   NA
 5822331 5822332 PLES_53511 PLES_53521     TRUE 0.978 -3.000 0.086 NA   NA
 5822332 5822333 PLES_53521 PLES_53531   parE TRUE 0.928 0.000 0.019 NA   NA
 5822333 5822334 PLES_53531 PLES_53541 parE   TRUE 0.946 12.000 0.217 NA   NA
 5822334 5822335 PLES_53541 PLES_53551     TRUE 0.620 132.000 0.427 NA   NA
 5822335 5822336 PLES_53551 PLES_53561     TRUE 0.559 154.000 0.433 NA   NA
 5822336 5822337 PLES_53561 PLES_53571   aspP TRUE 0.994 -9.000 0.443 NA   NA
 5822343 5822344 PLES_53631 PLES_53641   aruH TRUE 0.722 51.000 0.130 1.000   NA
 5822344 5822345 PLES_53641 PLES_53651 aruH aruI TRUE 0.964 23.000 0.154 1.000 Y NA
 5822345 5822346 PLES_53651 PLES_53661 aruI   TRUE 0.832 42.000 0.231 1.000 N NA
 5822346 5822347 PLES_53661 PLES_53671     TRUE 0.889 67.000 0.714 1.000 N NA
 5822347 5822348 PLES_53671 PLES_53681     TRUE 0.984 21.000 0.429 1.000 Y NA
 5822348 5822349 PLES_53681 PLES_53691     FALSE 0.017 259.000 0.000 1.000 N NA
 5822349 5822350 PLES_53691 PLES_53701     FALSE 0.320 184.000 0.250 1.000 N NA
 5822350 5822351 PLES_53701 PLES_53711     TRUE 0.929 33.000 0.000 0.015 Y NA
 5822351 5822352 PLES_53711 PLES_53721     TRUE 0.817 118.000 0.125 0.086 Y NA
 5822352 5822353 PLES_53721 PLES_53731     FALSE 0.174 77.000 0.000 1.000 N NA
 5822354 5822355 PLES_53741 PLES_53751     TRUE 0.792 78.000 0.400 1.000   NA
 5822356 5822357 PLES_53761 PLES_53771 waaA   TRUE 0.601 36.000 0.028 1.000 N NA
 5822358 5822359 PLES_53781 PLES_53791     TRUE 0.828 61.000 0.400 1.000 N NA
 5822359 5822360 PLES_53791 PLES_53801     TRUE 0.999 -3.000 0.441 0.032 Y NA
 5822360 5822361 PLES_53801 PLES_53811     FALSE 0.448 169.000 0.324 1.000   NA
 5822362 5822363 PLES_53821 PLES_53831     TRUE 0.986 49.000 0.604 0.006 Y NA
 5822365 5822366 PLES_53851 PLES_53861 rfaE msbA TRUE 0.543 41.000 0.023 1.000 N NA
 5822367 5822368 PLES_53871 PLES_53881   waaL TRUE 0.741 8.000 0.000 NA   NA
 5822369 5822370 PLES_53891 PLES_53901     FALSE 0.065 161.000 0.000 NA   NA
 5822370 5822371 PLES_53901 PLES_53911     TRUE 0.771 73.000 0.333 NA   NA
 5822371 5822372 PLES_53911 PLES_53921     TRUE 0.967 4.000 0.188 NA   NA
 5822372 5822373 PLES_53921 PLES_53931     TRUE 0.992 -6.000 0.312 NA   NA
 5822373 5822374 PLES_53931 PLES_53941     TRUE 0.996 -16.000 0.409 0.016 N NA
 5822374 5822375 PLES_53941 PLES_53951     FALSE 0.374 104.000 0.067 1.000   NA
 5822375 5822376 PLES_53951 PLES_53961     TRUE 0.993 -3.000 0.095 0.001   NA
 5822376 5822377 PLES_53961 PLES_53971     TRUE 0.994 -3.000 0.133 0.003   NA
 5822377 5822378 PLES_53971 PLES_53981   waaP TRUE 0.990 0.000 0.133 0.003   NA
 5822378 5822379 PLES_53981 PLES_53991 waaP waaG TRUE 0.990 -3.000 0.241 1.000   NA
 5822379 5822380 PLES_53991 PLES_54001 waaG waaC TRUE 0.997 -3.000 0.217 1.000 Y NA
 5822380 5822381 PLES_54001 PLES_54011 waaC waaF TRUE 0.999 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 5822381 5822382 PLES_54011 PLES_54021 waaF ilvE FALSE 0.459 60.000 0.034 1.000 N NA
 5822382 5822383 PLES_54021 PLES_54031 ilvE glnE TRUE 0.599 56.000 0.078 1.000 N NA
 5822384 5822385 PLES_54041 PLES_54051 aceE aceF TRUE 0.695 145.000 0.167 1.000 Y NA
 5822385 5822386 PLES_54051 PLES_54061 aceF   FALSE 0.332 45.000 0.000 NA   NA
 5822386 5822387 PLES_54061 PLES_54071     FALSE 0.199 74.000 0.000 NA   NA
 5822387 5822388 PLES_54071 PLES_54081   msrA FALSE 0.294 94.000 0.032 1.000 N NA
 5822390 5822391 PLES_54101 PLES_54111     FALSE 0.022 419.000 0.046 1.000 N NA
 5822391 5822392 PLES_54111 PLES_54121     TRUE 0.719 92.000 0.379 1.000 N NA
 5822392 5822393 PLES_54121 PLES_54131     FALSE 0.410 67.000 0.028 NA   NA
 5822393 5822394 PLES_54131 PLES_54141     FALSE 0.008 406.000 0.000 NA   NA
 5822394 5822395 PLES_54141 PLES_54151   metY FALSE 0.116 121.000 0.000 1.000   NA
 5822395 5822396 PLES_54151 PLES_54161 metY   FALSE 0.118 91.000 0.000 NA N NA
 5822396 5822397 PLES_54161 PLES_54171     FALSE 0.440 113.000 0.167 NA N NA
 5822398 5822399 PLES_54181 PLES_54191     FALSE 0.376 91.000 0.054 1.000 N NA
 5822402 5822403 PLES_54221 PLES_54231     FALSE 0.199 74.000 0.000 NA   NA
 5822404 5822405 PLES_54241 PLES_54251 hemE gltD FALSE 0.102 177.000 0.024 1.000 N NA
 5822405 5822406 PLES_54251 PLES_54261 gltD gltB TRUE 0.982 34.000 0.214 0.001 Y NA
 5822406 5822407 PLES_54261 PLES_54271 gltB   FALSE 0.075 225.000 0.037 NA   NA
 5822407 5822408 PLES_54271 PLES_54281   aroB TRUE 0.864 7.000 0.020 NA   NA
 5822408 5822409 PLES_54281 PLES_54291 aroB aroK TRUE 0.930 50.000 0.208 1.000 Y NA
 5822409 5822410 PLES_54291 PLES_54301 aroK pilQ TRUE 0.960 12.000 0.319 1.000 N NA
 5822410 5822411 PLES_54301 PLES_54311 pilQ pilP TRUE 0.970 54.000 0.668 NA Y NA
 5822411 5822412 PLES_54311 PLES_54321 pilP pilO TRUE 0.999 -3.000 0.680 NA Y NA
 5822412 5822413 PLES_54321 PLES_54331 pilO pilN TRUE 0.999 -3.000 0.770 NA Y NA
 5822413 5822414 PLES_54331 PLES_54341 pilN pilM TRUE 0.998 0.000 0.616 NA Y NA
 5822416 5822417 PLES_54361 PLES_54371     FALSE 0.335 103.000 0.048 1.000   NA
 5822417 5822418 PLES_54371 PLES_54381     TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5822418 5822419 PLES_54381 PLES_54391   rpmE FALSE 0.405 60.000 0.023 1.000 N NA
 5822420 5822421 PLES_54401 PLES_54411 priA argS FALSE 0.119 250.000 0.036 0.066 N NA
 5822421 5822422 PLES_54411 PLES_54421 argS   TRUE 0.673 35.000 0.052 NA N NA
 5822422 5822423 PLES_54421 PLES_54431   hslV FALSE 0.078 119.000 0.000 NA N NA
 5822423 5822424 PLES_54431 PLES_54441 hslV hslU TRUE 0.873 29.000 0.000 1.000 Y NA
 5822424 5822425 PLES_54441 PLES_54451 hslU   FALSE 0.406 95.000 0.070 NA   NA
 5822425 5822426 PLES_54451 PLES_54461   phaC1 FALSE 0.007 419.000 0.000 NA   NA
 5822426 5822427 PLES_54461 PLES_54471 phaC1 phaD FALSE 0.379 153.000 0.190 NA   NA
 5822427 5822428 PLES_54471 PLES_54481 phaD phaC2 FALSE 0.069 304.000 0.119 NA   NA
 5822428 5822429 PLES_54481 PLES_54491 phaC2   TRUE 0.660 56.000 0.123 1.000 N NA
 5822430 5822431 PLES_54501 PLES_54511 phaF   TRUE 0.984 11.000 0.667 NA   NA
 5822431 5822432 PLES_54511 PLES_54521     FALSE 0.381 143.000 0.167 NA   NA
 5822433 5822434 PLES_54531 PLES_54541 ubiE   TRUE 0.912 15.000 0.145 1.000   NA
 5822434 5822435 PLES_54541 PLES_54551   ubiB TRUE 0.994 -3.000 0.432 1.000   NA
 5822435 5822436 PLES_54551 PLES_54561 ubiB hisI FALSE 0.214 116.000 0.018 1.000   NA
 5822436 5822437 PLES_54561 PLES_54571 hisI hisE TRUE 0.998 -7.000 0.152 0.002 Y NA
 5822437 5822438 PLES_54571 PLES_54581 hisE tatA TRUE 0.660 26.000 0.021 1.000 N NA
 5822438 5822439 PLES_54581 PLES_54591 tatA tatB TRUE 0.989 14.000 0.157 0.006 Y NA
 5822439 5822440 PLES_54591 PLES_54601 tatB tatC TRUE 0.997 -3.000 0.314 NA Y NA
 5822440 5822441 PLES_54601 PLES_54611 tatC   TRUE 0.977 -3.000 0.076 NA   NA
 5822441 5822442 PLES_54611 PLES_54621     FALSE 0.032 212.000 0.000 NA   NA
 5822442 5822443 PLES_54621 PLES_54631     FALSE 0.114 110.000 0.000 NA   NA
 5822444 5822445 PLES_54641 PLES_54651     TRUE 0.998 -7.000 0.536 1.000 Y NA
 5822445 5822446 PLES_54651 PLES_54661     TRUE 0.939 66.000 0.179 0.053 Y NA
 5822446 5822447 PLES_54661 PLES_54671   mdoH FALSE 0.017 238.000 0.000 NA N NA
 5822447 5822448 PLES_54671 PLES_54681 mdoH   TRUE 0.994 -7.000 0.469 NA N NA
 5822448 5822449 PLES_54681 PLES_54691     FALSE 0.006 457.000 0.000 1.000 N NA
 5822449 5822450 PLES_54691 PLES_54701     TRUE 0.986 -3.000 0.026 0.024   NA
 5822452 5822453 PLES_54721 PLES_54731     TRUE 0.865 43.000 0.333 NA N NA
 5822453 5822454 PLES_54731 PLES_54741     TRUE 0.843 26.000 0.143 NA N NA
 5822456 5822457 PLES_54761 PLES_54771     FALSE 0.103 237.000 0.000 0.010   NA
 5822457 5822458 PLES_54771 PLES_54781     TRUE 0.627 57.000 0.000 0.010   NA
 5822458 5822459 PLES_54781 PLES_54791     TRUE 0.810 4.000 0.000 1.000   NA
 5822459 5822460 PLES_54791 PLES_54801     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5822460 5822461 PLES_54801 PLES_54811   hutG FALSE 0.017 270.000 0.000 NA   NA
 5822461 5822462 PLES_54811 PLES_54821 hutG hutI TRUE 0.959 -7.000 0.031 1.000 N NA
 5822462 5822463 PLES_54821 PLES_54831 hutI   TRUE 0.895 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5822463 5822464 PLES_54831 PLES_54841     TRUE 0.997 -3.000 0.212 1.000 Y NA
 5822464 5822465 PLES_54841 PLES_54851     TRUE 0.999 -3.000 0.485 0.083 Y NA
 5822465 5822466 PLES_54851 PLES_54861     TRUE 0.945 25.000 0.000 0.041 Y NA
 5822466 5822467 PLES_54861 PLES_54871     TRUE 0.490 118.000 0.000 1.000 Y NA
 5822467 5822468 PLES_54871 PLES_54881   hutH TRUE 0.788 63.000 0.022 1.000 Y NA
 5822468 5822469 PLES_54881 PLES_54891 hutH   FALSE 0.122 97.000 0.000 1.000 N NA
 5822469 5822470 PLES_54891 PLES_54901   hutU FALSE 0.217 108.000 0.024 1.000 N NA
 5822470 5822471 PLES_54901 PLES_54911 hutU   FALSE 0.008 326.000 0.000 NA N NA
 5822471 5822472 PLES_54911 PLES_54921     TRUE 0.937 19.000 0.333 NA N NA
 5822472 5822473 PLES_54921 PLES_54931     TRUE 0.561 16.000 0.000 1.000 N NA
 5822473 5822474 PLES_54931 PLES_54941     FALSE 0.081 142.000 0.000 NA   NA
 5822474 5822475 PLES_54941 PLES_54951   hutC TRUE 0.987 -3.000 0.189 NA   NA
 5822477 5822478 PLES_54971 PLES_54981 blc   TRUE 0.990 -3.000 0.250 1.000   NA
 5822478 5822479 PLES_54981 PLES_54991     TRUE 0.601 73.000 0.119 1.000   NA
 5822479 5822480 PLES_54991 PLES_55001   fbp TRUE 0.948 5.000 0.103 1.000   NA
 5822480 5822481 PLES_55001 PLES_55011 fbp gloA3 FALSE 0.284 140.000 0.000 0.007 N NA
 5822481 5822482 PLES_55011 PLES_55021 gloA3 estA FALSE 0.060 157.000 0.000 1.000 N NA
 5822482 5822483 PLES_55021 PLES_55031 estA   FALSE 0.115 109.000 0.000 NA   NA
 5822483 5822484 PLES_55031 PLES_55041     TRUE 0.991 -3.000 0.283 NA   NA
 5822484 5822485 PLES_55041 PLES_55051     FALSE 0.083 139.000 0.000 NA   NA
 5822487 5822488 PLES_55071 PLES_55081 typA thiI FALSE 0.049 217.000 0.011 1.000 N NA
 5822489 5822490 PLES_55091 PLES_55101 glnA   FALSE 0.077 148.000 0.000 NA   NA
 5822492 5822493 PLES_55121 PLES_55131     TRUE 0.997 -3.000 0.889 NA   NA
 5822493 5822494 PLES_55131 PLES_55141   ntrB FALSE 0.032 271.000 0.014 NA   NA
 5822494 5822495 PLES_55141 PLES_55151 ntrB ntrC TRUE 0.998 3.000 0.587 0.066 Y NA
 5822498 5822499 PLES_55181 PLES_55191 secB grx TRUE 0.849 37.000 0.221 1.000 N NA
 5822499 5822500 PLES_55191 PLES_55201 grx   TRUE 0.778 2.000 0.000 NA N NA
 5822501 5822502 PLES_55211 PLES_55221 pgm   FALSE 0.012 314.000 0.000 NA   NA
 5822502 5822503 PLES_55221 PLES_55231     FALSE 0.075 150.000 0.000 NA   NA
 5822503 5822504 PLES_55231 PLES_55241     TRUE 0.963 29.000 0.408 0.017 N NA
 5822504 5822505 PLES_55241 PLES_55251     TRUE 0.983 0.000 0.210 1.000   NA
 5822505 5822506 PLES_55251 PLES_55261     FALSE 0.213 69.000 0.000 NA   NA
 5822507 5822508 PLES_55271 PLES_55281     TRUE 0.878 150.000 0.333 0.015 Y NA
 5822508 5822509 PLES_55281 PLES_55291     TRUE 0.923 91.000 0.222 0.015 Y NA
 5822509 5822510 PLES_55291 PLES_55301   hisF1 FALSE 0.320 172.000 0.000 1.000 Y NA
 5822510 5822511 PLES_55301 PLES_55311 hisF1 hisA TRUE 0.996 11.000 0.433 0.002 Y NA
 5822511 5822512 PLES_55311 PLES_55321 hisA   TRUE 0.466 49.000 0.016 NA   NA
 5822512 5822513 PLES_55321 PLES_55331   hisH1 TRUE 0.937 4.000 0.069 NA   NA
 5822513 5822514 PLES_55331 PLES_55341 hisH1 hisB TRUE 0.998 -3.000 0.111 0.002 Y NA
 5822515 5822516 PLES_55351 PLES_55361     FALSE 0.020 270.000 0.000 1.000   NA
 5822516 5822517 PLES_55361 PLES_55371     FALSE 0.238 94.000 0.012 NA   NA
 5822517 5822518 PLES_55371 PLES_55381   mutY TRUE 0.957 -3.000 0.033 NA N NA
 5822518 5822519 PLES_55381 PLES_55391 mutY   TRUE 0.749 44.000 0.150 NA N NA
 5822519 5822520 PLES_55391 PLES_55401     TRUE 0.468 28.000 0.000 NA   NA
 5822520 5822521 PLES_55401 PLES_55402     FALSE 0.109 114.000 0.000 NA   NA
 5822523 5822524 PLES_55421 PLES_55431     FALSE 0.021 249.000 0.000 NA   NA
 5822524 5822525 PLES_55431 PLES_55441     TRUE 0.994 15.000 0.824 1.000 Y NA
 5822525 5822526 PLES_55441 PLES_55451     TRUE 0.941 62.000 0.169 0.053 Y NA
 5822526 5822527 PLES_55451 PLES_55461     TRUE 0.998 -3.000 0.195 0.009 Y NA
 5822527 5822528 PLES_55461 PLES_55471     FALSE 0.010 354.000 0.000 NA   NA
 5822528 5822529 PLES_55471 PLES_55481     FALSE 0.008 404.000 0.000 NA   NA
 5822529 5822530 PLES_55481 PLES_55491     TRUE 0.764 4.000 0.000 1.000 N NA
 5822530 5822531 PLES_55491 PLES_55501     TRUE 0.824 15.000 0.000 0.083 N NA
 5822531 5822532 PLES_55501 PLES_55511     TRUE 0.989 11.000 0.900 1.000   NA
 5822532 5822533 PLES_55511 PLES_55512     FALSE 0.199 74.000 0.000 NA   NA
 5822533 5822534 PLES_55512 PLES_55531   rmlB FALSE 0.024 235.000 0.000 NA   NA
 5822534 5822535 PLES_55531 PLES_55541 rmlB rmlD TRUE 0.999 -3.000 0.318 0.001 Y NA
 5822535 5822536 PLES_55541 PLES_55551 rmlD rmlA TRUE 0.998 -3.000 0.168 0.001 Y NA
 5822536 5822537 PLES_55551 PLES_55561 rmlA rmlC TRUE 0.981 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5822537 5822538 PLES_55561 PLES_55571 rmlC   FALSE 0.225 60.000 0.000 1.000 N NA
 5822538 5822539 PLES_55571 PLES_55581     TRUE 0.999 -3.000 0.375 0.066 Y NA
 5822539 5822540 PLES_55581 PLES_55591     FALSE 0.020 241.000 0.000 1.000 N NA
 5822540 5822541 PLES_55591 PLES_55601     TRUE 0.940 19.000 0.034 NA Y NA
 5822541 5822542 PLES_55601 PLES_55611     TRUE 0.999 -3.000 0.882 NA Y NA
 5822542 5822543 PLES_55611 PLES_55621   arcD FALSE 0.015 796.000 0.000 0.051 N NA
 5822543 5822544 PLES_55621 PLES_55631 arcD arcA TRUE 0.982 22.000 0.375 1.000 Y NA
 5822544 5822545 PLES_55631 PLES_55641 arcA arcB TRUE 0.823 80.000 0.100 1.000 Y NA
 5822545 5822546 PLES_55641 PLES_55651 arcB arcC TRUE 0.952 61.000 0.483 1.000 Y NA
 5822546 5822547 PLES_55651 PLES_55661 arcC   FALSE 0.007 416.000 0.000 1.000 N NA
 5822548 5822549 PLES_55671 PLES_55681   cysQ FALSE 0.004 1233.000 0.000 NA   NA
 5822549 5822550 PLES_55681 PLES_55691 cysQ   TRUE 0.993 -3.000 0.373 1.000 N NA
 5822553 5822554 PLES_55721 PLES_55731     FALSE 0.122 97.000 0.000 1.000 N NA
 5822554 5822555 PLES_55731 PLES_55741     TRUE 0.996 8.000 0.286 0.001 Y NA
 5822557 5822558 PLES_55751 PLES_55761     FALSE 0.133 99.000 0.000 NA   NA
 5822561 5822562 PLES_55791 PLES_55801     TRUE 0.892 23.000 0.185 NA   NA
 5822562 5822563 PLES_55801 PLES_55811     TRUE 0.810 27.000 0.094 1.000 N NA
 5822563 5822564 PLES_55811 PLES_55821     TRUE 0.997 2.000 0.500 1.000 Y NA
 5822568 5822569 PLES_55861 PLES_55871 pckA yrfI FALSE 0.271 116.000 0.048 1.000 N NA
 5822572 5822573 PLES_55901 PLES_55911   rimK FALSE 0.324 132.000 0.102 1.000 N NA
 5822573 5822574 PLES_55911 PLES_55921 rimK   FALSE 0.260 191.000 0.214 NA N NA
 5822575 5822576 PLES_55931 PLES_55941 envZ ompR TRUE 0.959 95.000 0.584 0.019 Y NA
 5822577 5822578 PLES_55951 PLES_55961     TRUE 0.826 12.000 0.036 NA N NA
 5822578 5822579 PLES_55961 PLES_55971   gshA FALSE 0.078 207.000 0.036 NA N NA
 5822582 5822583 PLES_56001 PLES_56011 argE   FALSE 0.318 100.000 0.048 1.000 N NA
 5822583 5822584 PLES_56011 PLES_56021     TRUE 0.982 47.000 0.937 NA Y NA
 5822585 5822586 PLES_56031 PLES_56041     TRUE 0.730 38.000 0.068 1.000   NA
 5822586 5822587 PLES_56041 PLES_56051     FALSE 0.182 222.000 0.000 NA Y NA
 5822587 5822588 PLES_56051 PLES_56061     FALSE 0.151 132.000 0.010 NA   NA
 5822589 5822590 PLES_56071 PLES_56081 gcvP1 gcvH1 TRUE 0.663 174.000 0.249 1.000 Y NA
 5822590 5822591 PLES_56081 PLES_56091 gcvH1 gcvT1 TRUE 0.980 47.000 0.317 0.001 Y NA
 5822591 5822592 PLES_56091 PLES_56101 gcvT1   FALSE 0.128 151.000 0.017 1.000 N NA
 5822592 5822593 PLES_56101 PLES_56111     TRUE 0.983 68.000 0.844 0.041 Y NA
 5822593 5822594 PLES_56111 PLES_56121     FALSE 0.196 68.000 0.000 1.000 N NA
 5822595 5822596 PLES_56131 PLES_56141     TRUE 0.767 39.000 0.114 NA   NA
 5822597 5822598 PLES_56151 PLES_56161     TRUE 0.788 29.000 0.079 NA   NA
 5822598 5822599 PLES_56161 PLES_56171   ubiH TRUE 0.911 5.000 0.042 NA   NA
 5822599 5822600 PLES_56171 PLES_56181 ubiH pepP TRUE 0.977 8.000 0.396 1.000 N NA
 5822600 5822601 PLES_56181 PLES_56191 pepP   TRUE 0.970 10.000 0.329 NA   NA
 5822602 5822603 PLES_56201 PLES_56211     TRUE 0.971 -3.000 0.053 NA   NA
 5822603 5822604 PLES_56211 PLES_56221     FALSE 0.073 222.000 0.034 NA   NA
 5822604 5822605 PLES_56221 PLES_56231     FALSE 0.016 367.000 0.011 NA   NA
 5822606 5822607 PLES_56241 PLES_56251     TRUE 0.950 4.000 0.000 0.004   NA
 5822607 5822608 PLES_56251 PLES_56261     TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.082   NA
 5822608 5822609 PLES_56261 PLES_56271     FALSE 0.030 207.000 0.000 1.000 N NA
 5822610 5822611 PLES_56281 PLES_56291   glpT FALSE 0.018 250.000 0.000 1.000 N NA
 5822612 5822613 PLES_56301 PLES_56311     TRUE 0.988 0.000 0.039 NA Y NA
 5822613 5822614 PLES_56311 PLES_56321     FALSE 0.247 79.000 0.009 NA N NA
 5822614 5822615 PLES_56321 PLES_56331   rho FALSE 0.276 71.000 0.003 1.000 N NA
 5822615 5822616 PLES_56331 PLES_56341 rho trxA FALSE 0.100 245.000 0.087 1.000   NA
 5822618 5822619 PLES_56361 PLES_56371 ppk hemB TRUE 0.766 18.000 0.033 1.000 N NA
 5822620 5822621 PLES_56381 PLES_56391     FALSE 0.124 165.000 0.021 NA   NA
 5822621 5822622 PLES_56391 PLES_56401     TRUE 0.644 96.000 0.021 NA Y NA
 5822623 5822624 PLES_56411 PLES_56421     FALSE 0.348 67.000 0.012 NA   NA
 5822624 5822625 PLES_56421 PLES_56431     FALSE 0.409 105.000 0.024 0.082 N NA
 5822625 5822626 PLES_56431 PLES_56441     FALSE 0.022 230.000 0.000 1.000 N NA
 5822626 5822627 PLES_56441 PLES_56451     TRUE 0.879 7.000 0.022 1.000   NA
 5822627 5822628 PLES_56451 PLES_56461     TRUE 0.972 0.000 0.108 1.000   NA
 5822628 5822629 PLES_56461 PLES_56471   algP FALSE 0.006 522.000 0.000 NA   NA
 5822631 5822632 PLES_56491 PLES_56501 algQ dsbH FALSE 0.083 280.000 0.133 1.000 N NA
 5822632 5822633 PLES_56501 PLES_56511 dsbH   FALSE 0.131 179.000 0.042 1.000 N NA
 5822633 5822634 PLES_56511 PLES_56521     TRUE 0.999 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 5822634 5822635 PLES_56521 PLES_56531   hemD TRUE 0.986 27.000 0.600 1.000 Y NA
 5822635 5822636 PLES_56531 PLES_56541 hemD hemC TRUE 0.999 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 5822636 5822637 PLES_56541 PLES_56551 hemC algR FALSE 0.242 109.000 0.032 1.000 N NA
 5822637 5822638 PLES_56551 PLES_56561 algR algZ TRUE 0.998 5.000 0.775 0.019 Y NA
 5822640 5822641 PLES_56581 PLES_56591     FALSE 0.025 231.000 0.000 NA   NA
 5822641 5822642 PLES_56591 PLES_56601     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5822642 5822643 PLES_56601 PLES_56611   hcpB FALSE 0.037 200.000 0.000 NA   NA
 5822643 5822644 PLES_56611 PLES_56621 hcpB corA FALSE 0.014 293.000 0.000 NA   NA
 5822645 5822646 PLES_56631 PLES_56641     TRUE 0.821 19.000 0.059 NA   NA
 5822646 5822647 PLES_56641 PLES_56651     TRUE 0.644 43.000 0.044 1.000   NA
 5822647 5822648 PLES_56651 PLES_56661   cyaA FALSE 0.379 149.000 0.164 1.000   NA
 5822648 5822649 PLES_56661 PLES_56671 cyaA   FALSE 0.365 41.000 0.000 NA   NA
 5822650 5822651 PLES_56681 PLES_56691 rnk   FALSE 0.248 136.000 0.054 NA   NA
 5822651 5822652 PLES_56691 PLES_56701     TRUE 0.763 17.000 0.025 NA   NA
 5822653 5822654 PLES_56711 PLES_56721 lppL lysA TRUE 0.749 11.000 0.006 NA N NA
 5822654 5822655 PLES_56721 PLES_56731 lysA dapF TRUE 0.991 11.000 0.104 0.001 Y NA
 5822655 5822656 PLES_56731 PLES_56741 dapF   TRUE 0.851 31.000 0.175 NA   NA
 5822656 5822657 PLES_56741 PLES_56751   sss TRUE 0.972 20.000 0.714 NA   NA
 5822657 5822658 PLES_56751 PLES_56761 sss   TRUE 0.993 -3.000 0.367 1.000   NA
 5822661 5822662 PLES_56791 PLES_56801     FALSE 0.008 415.000 0.000 NA   NA
 5822662 5822663 PLES_56801 PLES_56811     FALSE 0.327 78.000 0.018 NA   NA
 5822663 5822664 PLES_56811 PLES_56821   amtB FALSE 0.019 261.000 0.000 NA   NA
 5822664 5822665 PLES_56821 PLES_56831 amtB glnK TRUE 0.775 40.000 0.135 1.000 N NA
 5822666 5822667 PLES_56841 PLES_56851     TRUE 0.708 41.000 0.074 NA   NA
 5822667 5822668 PLES_56851 PLES_56861     FALSE 0.140 125.000 0.005 1.000 N NA
 5822669 5822670 PLES_56871 PLES_56881 pchP   FALSE 0.073 151.000 0.000 NA   NA
 5822673 5822674 PLES_56911 PLES_56921 rep poxB FALSE 0.078 134.000 0.000 1.000 N NA
 5822674 5822675 PLES_56921 PLES_56931 poxB   FALSE 0.055 164.000 0.000 1.000 N NA
 5822676 5822677 PLES_56941 PLES_56951   cycB FALSE 0.428 210.000 0.123 1.000 Y NA
 5822677 5822678 PLES_56951 PLES_56961 cycB   FALSE 0.090 222.000 0.057 1.000 N NA
 5822678 5822679 PLES_56961 PLES_56971   dadX FALSE 0.192 151.000 0.046 1.000 N NA
 5822679 5822680 PLES_56971 PLES_56981 dadX   FALSE 0.397 91.000 0.070 NA N NA
 5822680 5822681 PLES_56981 PLES_56991   dadA TRUE 0.972 -25.000 0.088 NA N NA
 5822681 5822682 PLES_56991 PLES_57001 dadA   FALSE 0.010 357.000 0.000 NA   NA
 5822682 5822683 PLES_57001 PLES_57011     TRUE 0.981 13.000 0.726 NA   NA
 5822683 5822684 PLES_57011 PLES_57021     TRUE 0.846 21.000 0.091 NA   NA
 5822685 5822686 PLES_57031 PLES_57041 lrp   FALSE 0.081 179.000 0.012 1.000 N NA
 5822686 5822687 PLES_57041 PLES_57051     FALSE 0.151 86.000 0.000 1.000 N NA
 5822688 5822689 PLES_57061 PLES_57071     TRUE 0.474 147.000 0.292 NA N NA
 5822690 5822691 PLES_57081 PLES_57091     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 5822692 5822693 PLES_57101 PLES_57111 rpmG rpmB TRUE 0.995 12.000 0.332 0.006 Y NA
 5822694 5822695 PLES_57121 PLES_57131     TRUE 0.490 26.000 0.000 NA   NA
 5822697 5822698 PLES_57151 PLES_57161 coaC dut TRUE 0.958 8.000 0.201 1.000 N NA
 5822698 5822699 PLES_57161 PLES_57171 dut algC FALSE 0.010 1243.000 0.039 1.000 N NA
 5822699 5822700 PLES_57171 PLES_57181 algC argB TRUE 0.802 17.000 0.044 1.000 N NA
 5822703 5822704 PLES_57211 PLES_57221     TRUE 0.816 83.000 0.571 NA N NA
 5822704 5822705 PLES_57221 PLES_57231     TRUE 0.857 78.000 0.155 1.000 Y NA
 5822707 5822708 PLES_57251 PLES_57261   pyrE TRUE 0.758 21.000 0.034 NA   NA
 5822710 5822711 PLES_57281 PLES_57291   rph TRUE 0.489 47.000 0.018 NA   NA
 5822712 5822713 PLES_57301 PLES_57311   gmk TRUE 0.789 59.000 0.276 NA   NA
 5822713 5822714 PLES_57311 PLES_57321 gmk rpoZ TRUE 0.770 89.000 0.471 1.000 N NA
 5822714 5822715 PLES_57321 PLES_57331 rpoZ spoT TRUE 0.923 66.000 0.291 1.000 Y NA
 5822715 5822716 PLES_57331 PLES_57341 spoT   TRUE 0.718 62.000 0.215 NA N NA
 5822716 5822717 PLES_57341 PLES_57351     TRUE 0.571 55.000 0.056 NA   NA
 5822718 5822719 PLES_57361 PLES_57371     TRUE 0.529 67.000 0.071 1.000 N NA
 5822719 5822720 PLES_57371 PLES_57381     TRUE 0.902 0.000 0.004 1.000 N NA
 5822721 5822722 PLES_57391 PLES_57401   recG TRUE 0.995 -3.000 0.117 1.000 Y NA
 5822722 5822723 PLES_57401 PLES_57411 recG sadB FALSE 0.318 90.000 0.038 NA N NA
 5822724 5822725 PLES_57421 PLES_57431     TRUE 0.535 136.000 0.290 1.000   NA
 5822725 5822726 PLES_57431 PLES_57441     FALSE 0.262 202.000 0.229 NA   NA
 5822726 5822727 PLES_57441 PLES_57451   rubA2 TRUE 0.550 52.000 0.042 NA   NA
 5822727 5822728 PLES_57451 PLES_57461 rubA2 rubA1 TRUE 0.487 184.000 0.000 0.006 Y NA
 5822728 5822729 PLES_57461 PLES_57471 rubA1   FALSE 0.088 134.000 0.000 NA   NA
 5822729 5822730 PLES_57471 PLES_57481   glcF TRUE 0.924 5.000 0.057 NA   NA
 5822730 5822731 PLES_57481 PLES_57491 glcF glcE TRUE 0.989 10.000 0.074 0.032 Y NA
 5822731 5822732 PLES_57491 PLES_57501 glcE glcD TRUE 0.996 0.000 0.070 0.013 Y NA
 5822733 5822734 PLES_57511 PLES_57521 glcC ubiC FALSE 0.247 80.000 0.010 NA N NA
 5822734 5822735 PLES_57521 PLES_57531 ubiC ubiA TRUE 0.969 27.000 0.248 NA Y NA
 5822737 5822738 PLES_57551 PLES_57561 phoB phoR TRUE 0.966 73.000 0.453 0.019 Y NA
 5822738 5822739 PLES_57561 PLES_57571 phoR   FALSE 0.289 103.000 0.037 NA   NA
 5822740 5822741 PLES_57581 PLES_57591     FALSE 0.107 116.000 0.000 NA   NA
 5822741 5822742 PLES_57591 PLES_57601   phoU FALSE 0.142 119.000 0.009 NA N NA
 5822742 5822743 PLES_57601 PLES_57611 phoU pstB TRUE 0.872 96.000 0.330 NA Y NA
 5822743 5822744 PLES_57611 PLES_57621 pstB pstA TRUE 0.996 16.000 0.511 0.001 Y NA
 5822744 5822745 PLES_57621 PLES_57631 pstA pstC TRUE 0.975 20.000 0.489 0.082   NA
 5822745 5822746 PLES_57631 PLES_57641 pstC pstS FALSE 0.117 423.000 0.211 0.053   NA
 5822746 5822747 PLES_57641 PLES_57642 pstS   FALSE 0.008 402.000 0.000 NA   NA
 5822747 5822748 PLES_57642 PLES_57643     FALSE 0.081 142.000 0.000 NA   NA
 5822748 5822749 PLES_57643 PLES_57644     FALSE 0.026 227.000 0.000 NA   NA
 5822749 5822750 PLES_57644 PLES_57645     FALSE 0.456 29.000 0.000 NA   NA
 5822750 5822751 PLES_57645 PLES_57646     FALSE 0.233 65.000 0.000 NA   NA
 5822751 5822752 PLES_57646 PLES_57651     FALSE 0.005 566.000 0.000 NA   NA
 5822754 5822755 PLES_57671 PLES_57681 betA betB TRUE 0.696 136.000 0.634 1.000 N NA
 5822755 5822756 PLES_57681 PLES_57691 betB betI TRUE 0.848 61.000 0.459 1.000 N NA
 5822758 5822759 PLES_57711 PLES_57721     TRUE 0.999 4.000 0.844 0.082 Y NA
 5822759 5822760 PLES_57721 PLES_57731     TRUE 0.979 42.000 0.328 0.041 Y NA
 5822760 5822761 PLES_57731 PLES_57741     FALSE 0.020 257.000 0.000 NA   NA
 5822762 5822763 PLES_57751 PLES_57761 sdaB   FALSE 0.006 420.000 0.000 1.000 N NA
 5822764 5822765 PLES_57771 PLES_57781     FALSE 0.082 140.000 0.000 NA   NA
 5822767 5822768 PLES_57801 PLES_57811     TRUE 0.972 6.000 0.281 NA   NA
 5822768 5822769 PLES_57811 PLES_57821     TRUE 0.869 51.000 0.419 NA   NA
 5822769 5822770 PLES_57821 PLES_57831     TRUE 0.912 51.000 0.608 1.000   NA
 5822770 5822771 PLES_57831 PLES_57841     FALSE 0.227 73.000 0.000 1.000   NA
 5822773 5822774 PLES_57861 PLES_57871     TRUE 0.795 57.000 0.279 NA   NA
 5822774 5822775 PLES_57871 PLES_57881     TRUE 0.964 14.000 0.419 NA   NA
 5822775 5822776 PLES_57881 PLES_57891     TRUE 0.989 0.000 0.425 NA N NA
 5822776 5822777 PLES_57891 PLES_57901   cls FALSE 0.012 294.000 0.000 1.000 N NA
 5822778 5822779 PLES_57911 PLES_57921     FALSE 0.028 222.000 0.000 NA   NA
 5822779 5822780 PLES_57921 PLES_57931     TRUE 0.799 127.000 0.868 1.000   NA
 5822780 5822781 PLES_57931 PLES_57941     TRUE 0.983 16.000 0.912 1.000   NA
 5822781 5822782 PLES_57941 PLES_57951     TRUE 0.950 104.000 0.574 0.032 Y NA
 5822782 5822783 PLES_57951 PLES_57961     FALSE 0.445 365.000 0.667 1.000 Y NA
 5822783 5822784 PLES_57961 PLES_57971     TRUE 0.992 36.000 0.776 0.014 Y NA
 5822784 5822785 PLES_57971 PLES_57981     FALSE 0.098 125.000 0.000 NA   NA
 5822785 5822786 PLES_57981 PLES_57991     TRUE 0.923 8.000 0.073 NA   NA
 5822786 5822787 PLES_57991 PLES_58001     FALSE 0.430 32.000 0.000 NA   NA
 5822787 5822788 PLES_58001 PLES_58011     TRUE 0.621 14.000 0.000 NA   NA
 5822788 5822789 PLES_58011 PLES_58021     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5822789 5822790 PLES_58021 PLES_58031     TRUE 0.951 -3.000 0.017 NA   NA
 5822791 5822792 PLES_58041 PLES_58051     TRUE 0.770 5.000 0.000 NA   NA
 5822792 5822793 PLES_58051 PLES_58061     FALSE 0.016 275.000 0.000 NA   NA
 5822795 5822796 PLES_58081 PLES_58091 ltaA   FALSE 0.183 81.000 0.000 NA   NA
 5822797 5822798 PLES_58101 PLES_58111 glyA1 soxB TRUE 0.624 86.000 0.000 1.000 Y NA
 5822798 5822799 PLES_58111 PLES_58121 soxB soxD TRUE 0.978 94.000 0.824 0.000 Y NA
 5822799 5822800 PLES_58121 PLES_58131 soxD soxA TRUE 0.999 -3.000 0.824 0.000   NA
 5822800 5822801 PLES_58131 PLES_58141 soxA soxG TRUE 0.931 94.000 0.778 0.001   NA
 5822801 5822802 PLES_58141 PLES_58151 soxG purU2 TRUE 0.832 50.000 0.303 1.000 N NA
 5822802 5822803 PLES_58151 PLES_58161 purU2 fdhA FALSE 0.145 207.000 0.103 1.000 N NA
 5822803 5822804 PLES_58161 PLES_58171 fdhA   FALSE 0.157 84.000 0.000 1.000 N NA
 5822805 5822806 PLES_58181 PLES_58191     TRUE 0.809 62.000 0.333 NA   NA
 5822806 5822807 PLES_58191 PLES_58201   purK FALSE 0.307 115.000 0.050 1.000   NA
 5822807 5822808 PLES_58201 PLES_58211 purK purE TRUE 0.979 31.000 0.136 0.000 Y NA
 5822812 5822813 PLES_58251 PLES_58261     TRUE 0.666 37.000 0.042 NA   NA
 5822814 5822815 PLES_58271 PLES_58281     TRUE 0.932 9.000 0.000 0.006   NA
 5822816 5822817 PLES_58291 PLES_58301 mtr   FALSE 0.042 181.000 0.000 1.000 N NA
 5822817 5822818 PLES_58301 PLES_58311     TRUE 0.974 16.000 0.354 0.055 N NA
 5822821 5822822 PLES_58341 PLES_58351     FALSE 0.164 81.000 0.000 1.000 N NA
 5822823 5822824 PLES_58361 PLES_58371     FALSE 0.252 59.000 0.000 NA   NA
 5822825 5822826 PLES_58381 PLES_58391 uvrD   FALSE 0.420 38.000 0.000 1.000   NA
 5822826 5822827 PLES_58391 PLES_58401     FALSE 0.153 98.000 0.000 1.000   NA
 5822827 5822828 PLES_58401 PLES_58411     FALSE 0.009 378.000 0.000 NA   NA
 5822829 5822830 PLES_58421 PLES_58431 wbpZ wbpY TRUE 0.997 1.000 0.256 0.016 Y NA
 5822830 5822831 PLES_58431 PLES_58441 wbpY wbpX TRUE 0.996 -16.000 0.047 0.016 Y NA
 5822831 5822832 PLES_58441 PLES_58451 wbpX wzt TRUE 0.918 -3.000 0.000 1.000   NA
 5822832 5822833 PLES_58451 PLES_58461 wzt wzm TRUE 0.959 0.000 0.000 0.065   NA
 5822833 5822834 PLES_58461 PLES_58471 wzm wbpW TRUE 0.990 0.000 0.061 1.000 Y NA
 5822834 5822835 PLES_58471 PLES_58481 wbpW gmd TRUE 0.787 4.000 0.000 NA   NA
 5822835 5822836 PLES_58481 PLES_58491 gmd rmd FALSE 0.007 450.000 0.000 NA   NA
 5822837 5822838 PLES_58501 PLES_58511     TRUE 0.999 -6.000 1.000 0.016   NA
 5822838 5822839 PLES_58511 PLES_58521     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000   NA
 5822839 5822840 PLES_58521 PLES_58531     TRUE 0.997 -3.000 1.000 1.000 N NA
 5822840 5822841 PLES_58531 PLES_58541     TRUE 0.997 -6.000 1.000 1.000 N NA
 5822841 5822842 PLES_58541 PLES_58551     FALSE 0.063 163.000 0.000 NA   NA
 5822842 5822843 PLES_58551 PLES_58561     TRUE 0.571 96.000 0.200 NA   NA
 5822843 5822844 PLES_58561 PLES_58571     TRUE 0.778 125.000 0.800 NA   NA
 5822844 5822845 PLES_58571 PLES_58581     TRUE 0.961 29.000 0.727 NA   NA
 5822845 5822846 PLES_58581 PLES_58591     TRUE 0.996 -3.000 0.647 NA   NA
 5822848 5822849 PLES_58611 PLES_58621     TRUE 0.906 -3.000 0.000 NA   NA
 5822849 5822850 PLES_58621 PLES_58631     FALSE 0.016 280.000 0.000 NA   NA
 5822850 5822851 PLES_58631 PLES_58641     TRUE 0.919 21.000 0.085 0.050 N NA
 5822852 5822853 PLES_58651 PLES_58661     TRUE 0.992 -3.000 0.303 NA   NA
 5822853 5822854 PLES_58661 PLES_58671     FALSE 0.009 368.000 0.000 NA   NA
 5822854 5822855 PLES_58671 PLES_58681     FALSE 0.421 33.000 0.000 NA   NA
 5822856 5822857 PLES_58691 PLES_58701     FALSE 0.238 69.000 0.000 1.000   NA
 5822858 5822859 PLES_58711 PLES_58721   citA FALSE 0.092 143.000 0.000 1.000   NA
 5822861 5822862 PLES_58741 PLES_58751   gltP FALSE 0.326 105.000 0.047 1.000   NA
 5822864 5822865 PLES_58771 PLES_58781     TRUE 0.873 22.000 0.140 NA   NA
 5822866 5822867 PLES_58791 PLES_58801 algB   TRUE 0.999 -3.000 0.455 0.065 Y NA
 5822868 5822869 PLES_58811 PLES_58821 ampDh2   TRUE 0.633 28.000 0.025 NA N NA
 5822869 5822870 PLES_58821 PLES_58831     FALSE 0.079 118.000 0.000 NA N NA
 5822870 5822871 PLES_58831 PLES_58841     TRUE 0.984 -3.000 0.147 NA   NA
 5822871 5822872 PLES_58841 PLES_58851   dsbA TRUE 0.910 16.000 0.162 NA   NA
 5822872 5822873 PLES_58851 PLES_58861 dsbA cc4 FALSE 0.215 168.000 0.088 1.000 N NA
 5822873 5822874 PLES_58861 PLES_58871 cc4   TRUE 0.937 46.000 0.039 0.009 Y NA
 5822877 5822878 PLES_58901 PLES_58911   thrB TRUE 0.855 34.000 0.204 NA   NA
 5822879 5822880 PLES_58921 PLES_58931 nrdJb nrdJa TRUE 0.716 17.000 0.012 NA   NA
 5822880 5822881 PLES_58931 PLES_58941 nrdJa   FALSE 0.101 110.000 0.000 1.000 N NA
 5822882 5822883 PLES_58951 PLES_58961 np20 znuC TRUE 0.996 0.000 0.309 1.000 Y NA
 5822883 5822884 PLES_58961 PLES_58971 znuC znuB TRUE 0.999 -7.000 0.755 0.065 Y NA
 5822884 5822885 PLES_58971 PLES_58981 znuB   TRUE 0.612 42.000 0.037 NA   NA
 5822885 5822886 PLES_58981 PLES_58991     FALSE 0.146 207.000 0.094 NA   NA
 5822886 5822887 PLES_58991 PLES_59001     TRUE 0.997 0.000 0.469 1.000 Y NA
 5822887 5822888 PLES_59001 PLES_59011     TRUE 0.963 77.000 0.867 NA Y NA
 5822888 5822889 PLES_59011 PLES_59021     FALSE 0.026 203.000 0.000 NA N NA
 5822889 5822890 PLES_59021 PLES_59031     TRUE 0.934 5.000 0.080 1.000 N NA
 5822890 5822891 PLES_59031 PLES_59041     TRUE 0.972 -3.000 0.060 1.000 N NA
 5822891 5822892 PLES_59041 PLES_59051     TRUE 0.839 68.000 0.081 1.000 Y NA
 5822892 5822893 PLES_59051 PLES_59061     TRUE 0.696 102.000 0.054 1.000 Y NA
 5822894 5822895 PLES_59071 PLES_59081     TRUE 0.999 -3.000 0.419 0.065 Y NA
 5822896 5822897 PLES_59091 PLES_59101     FALSE 0.160 71.000 0.000 NA N NA
 5822900 5822901 PLES_59131 PLES_59141     TRUE 0.827 2.000 0.000 NA   NA
 5822901 5822902 PLES_59141 PLES_59151     FALSE 0.006 379.000 0.000 NA N NA
 5822904 5822905 PLES_59171 PLES_59181     FALSE 0.127 95.000 0.000 1.000 N NA
 5822905 5822906 PLES_59181 PLES_59191     TRUE 0.947 2.000 0.066 1.000 N NA
 5822907 5822908 PLES_59201 PLES_59211     FALSE 0.210 65.000 0.000 1.000 N NA
 5822909 5822910 PLES_59221 PLES_59231     FALSE 0.029 218.000 0.000 NA   NA
 5822910 5822911 PLES_59231 PLES_59241     FALSE 0.077 197.000 0.018 NA   NA
 5822912 5822913 PLES_59251 PLES_59261     FALSE 0.171 316.000 0.000 0.050 Y NA
 5822914 5822915 PLES_59271 PLES_59281 tonB   FALSE 0.149 93.000 0.000 NA   NA
 5822917 5822918 PLES_59301 PLES_59311     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 5822918 5822919 PLES_59311 PLES_59321     TRUE 0.853 15.000 0.061 NA   NA
 5822922 5822923 PLES_59351 PLES_59361     TRUE 0.962 -3.000 0.026 1.000   NA
 5822923 5822924 PLES_59361 PLES_59371   pyrQ TRUE 0.919 3.000 0.029 1.000   NA
 5822925 5822926 PLES_59381 PLES_59391     FALSE 0.166 87.000 0.000 NA   NA
 5822926 5822927 PLES_59391 PLES_59401     TRUE 0.994 -3.000 0.433 NA   NA
 5822927 5822928 PLES_59401 PLES_59411     TRUE 0.850 75.000 0.588 NA   NA
 5822928 5822929 PLES_59411 PLES_59421     FALSE 0.071 164.000 0.000 1.000   NA
 5822930 5822931 PLES_59431 PLES_59441     FALSE 0.008 358.000 0.000 1.000 N NA
 5822932 5822933 PLES_59451 PLES_59461 glmS glmR TRUE 0.957 16.000 0.412 1.000 N NA
 5822933 5822934 PLES_59461 PLES_59471 glmR   FALSE 0.218 68.000 0.000 NA   NA
 5822934 5822935 PLES_59471 PLES_59481   glmU TRUE 0.621 14.000 0.000 NA   NA
 5822935 5822936 PLES_59481 PLES_59491 glmU atpC FALSE 0.299 121.000 0.067 1.000 N NA
 5822936 5822937 PLES_59491 PLES_59501 atpC atpD TRUE 0.993 42.000 0.837 0.002 Y NA
 5822937 5822938 PLES_59501 PLES_59511 atpD atpG TRUE 0.994 31.000 0.724 0.002 Y NA
 5822938 5822939 PLES_59511 PLES_59521 atpG atpA TRUE 0.990 51.000 0.846 0.002 Y NA
 5822939 5822940 PLES_59521 PLES_59531 atpA atpH TRUE 0.997 19.000 0.864 0.002 Y NA
 5822940 5822941 PLES_59531 PLES_59541 atpH atpF TRUE 0.994 12.000 0.242 0.002 Y NA
 5822941 5822942 PLES_59541 PLES_59551 atpF atpE TRUE 0.956 58.000 0.666 0.002   NA
 5822942 5822943 PLES_59551 PLES_59561 atpE atpB TRUE 0.958 50.000 0.557 0.002   NA
 5822943 5822944 PLES_59561 PLES_59571 atpB atpI TRUE 0.982 17.000 0.291 1.000 Y NA
 5822944 5822945 PLES_59571 PLES_59581 atpI spoOJ FALSE 0.183 164.000 0.056 1.000 N NA
 5822945 5822946 PLES_59581 PLES_59591 spoOJ soj TRUE 0.988 10.000 0.827 1.000 N NA
 5822946 5822947 PLES_59591 PLES_59601 soj gidB TRUE 0.942 19.000 0.339 1.000 N NA
 5822947 5822948 PLES_59601 PLES_59611 gidB gidA TRUE 0.991 0.000 0.466 1.000 N NA
 5822948 5822949 PLES_59611 PLES_59621 gidA   FALSE 0.006 474.000 0.000 NA   NA
 5822949 5822950 PLES_59621 PLES_59631     FALSE 0.006 482.000 0.000 NA   NA
 5822950 5822951 PLES_59631 PLES_59641     TRUE 0.832 72.000 0.221 0.050   NA
 5822951 5822952 PLES_59641 PLES_59651   rnpA FALSE 0.102 241.000 0.105 1.000 N NA