MicrobesOnline Operon Predictions for Listeria monocytogenes HCC23

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5805491 5805492 LMHCC_T056 LMHCC_0002     FALSE 0.069 153.000 0.000 NA   NA
 5805492 5805493 LMHCC_0002 LMHCC_0003     FALSE 0.327 101.000 0.524 1.000 N NA
 5805495 5805496 LMHCC_0005 LMHCC_0006     TRUE 0.947 0.000 0.333 NA   NA
 5805496 5805497 LMHCC_0006 LMHCC_0007   fdhD TRUE 0.595 62.000 0.923 NA   NA
 5805497 5805498 LMHCC_0007 LMHCC_0008 fdhD   TRUE 0.563 47.000 0.278 1.000 N NA
 5805498 5805499 LMHCC_0008 LMHCC_0009     TRUE 0.994 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 5805499 5805500 LMHCC_0009 LMHCC_0010     TRUE 0.576 79.000 0.367 0.093 N NA
 5805500 5805501 LMHCC_0010 LMHCC_0011     TRUE 0.993 0.000 0.852 1.000 Y NA
 5805501 5805502 LMHCC_0011 LMHCC_0013     FALSE 0.016 352.000 0.000 1.000   NA
 5805505 5805506 LMHCC_0015 LMHCC_0016     TRUE 0.921 13.000 0.917 NA   NA
 5805507 5805508 LMHCC_0017 LMHCC_0018     FALSE 0.091 168.000 0.025 1.000   NA
 5805508 5805509 LMHCC_0018 LMHCC_0019     TRUE 0.485 49.000 0.090 NA   NA
 5805509 5805510 LMHCC_0019 LMHCC_0020     FALSE 0.259 97.000 0.175 NA   NA
 5805510 5805511 LMHCC_0020 LMHCC_0021     TRUE 0.922 3.000 0.175 1.000 N NA
 5805511 5805512 LMHCC_0021 LMHCC_0022     TRUE 0.906 1.000 0.018 1.000 N NA
 5805512 5805513 LMHCC_0022 LMHCC_0023     TRUE 0.651 24.000 0.018 NA   NA
 5805513 5805514 LMHCC_0023 LMHCC_0024     TRUE 0.518 46.000 0.133 NA   NA
 5805514 5805515 LMHCC_0024 LMHCC_0025     TRUE 0.922 -27.000 0.000 NA   NA
 5805515 5805516 LMHCC_0025 LMHCC_0028     FALSE 0.156 154.000 0.500 NA   NA
 5805516 5805517 LMHCC_0028 LMHCC_0029     TRUE 0.843 23.000 1.000 NA   NA
 5805517 5805518 LMHCC_0029 LMHCC_0030     FALSE 0.014 319.000 0.000 NA   NA
 5805518 5805519 LMHCC_0030 LMHCC_0031     TRUE 0.940 15.000 0.082 0.028   NA
 5805521 5805522 LMHCC_0033 LMHCC_0034     FALSE 0.272 78.000 0.026 NA   NA
 5805522 5805523 LMHCC_0034 LMHCC_0035   argS TRUE 0.938 -3.000 0.079 NA   NA
 5805523 5805524 LMHCC_0035 LMHCC_0036 argS rpoE FALSE 0.014 366.000 0.010 1.000 N NA
 5805524 5805525 LMHCC_0036 LMHCC_0037 rpoE pyrG FALSE 0.015 368.000 0.029 1.000 N NA
 5805526 5805527 LMHCC_0039 LMHCC_0040     TRUE 0.394 45.000 0.000 NA   NA
 5805528 5805529 LMHCC_0041 LMHCC_0042   fba FALSE 0.099 168.000 0.189 1.000 N NA
 5805529 5805530 LMHCC_0042 LMHCC_0043 fba   FALSE 0.014 322.000 0.000 1.000 N NA
 5805530 5805531 LMHCC_0043 LMHCC_0044     TRUE 0.994 8.000 0.413 0.011 Y NA
 5805531 5805532 LMHCC_0044 LMHCC_0045     TRUE 0.922 6.000 0.336 NA   NA
 5805532 5805533 LMHCC_0045 LMHCC_0046   murA FALSE 0.346 69.000 0.072 NA   NA
 5805533 5805534 LMHCC_0046 LMHCC_0047 murA rho FALSE 0.185 105.000 0.022 1.000 N NA
 5805534 5805535 LMHCC_0047 LMHCC_0048 rho   FALSE 0.198 111.000 0.005 1.000   NA
 5805535 5805536 LMHCC_0048 LMHCC_0049   rpmE FALSE 0.236 102.000 0.020 1.000   NA
 5805536 5805537 LMHCC_0049 LMHCC_0050 rpmE   FALSE 0.029 222.000 0.000 1.000 N NA
 5805537 5805538 LMHCC_0050 LMHCC_0051   thrC TRUE 0.985 3.000 0.034 1.000 Y NA
 5805538 5805539 LMHCC_0051 LMHCC_0052 thrC thrB TRUE 0.990 0.000 0.221 1.000 Y NA
 5805539 5805540 LMHCC_0052 LMHCC_0053 thrB tdk FALSE 0.166 112.000 0.019 1.000 N NA
 5805540 5805541 LMHCC_0053 LMHCC_0054 tdk prfA TRUE 0.704 23.000 0.062 1.000 N NA
 5805541 5805542 LMHCC_0054 LMHCC_0055 prfA hemK TRUE 0.996 -13.000 0.084 0.057 Y NA
 5805542 5805543 LMHCC_0055 LMHCC_0056 hemK   FALSE 0.141 301.000 0.204 NA Y NA
 5805543 5805544 LMHCC_0056 LMHCC_0057     TRUE 0.933 -3.000 0.176 NA N NA
 5805544 5805545 LMHCC_0057 LMHCC_0058   glyA FALSE 0.125 136.000 0.037 1.000 N NA
 5805545 5805546 LMHCC_0058 LMHCC_0059 glyA upp FALSE 0.124 138.000 0.051 1.000 N NA
 5805546 5805547 LMHCC_0059 LMHCC_0060 upp   FALSE 0.149 119.000 0.011 1.000 N NA
 5805549 5805550 LMHCC_0062 LMHCC_0063     FALSE 0.030 235.000 0.009 NA   NA
 5805550 5805551 LMHCC_0063 LMHCC_0064   atpE TRUE 0.702 72.000 0.189 0.008   NA
 5805551 5805552 LMHCC_0064 LMHCC_0065 atpE atpF TRUE 0.648 88.000 0.402 0.008   NA
 5805552 5805553 LMHCC_0065 LMHCC_0066 atpF atpH TRUE 0.997 -3.000 0.222 0.008 Y NA
 5805553 5805554 LMHCC_0066 LMHCC_0067 atpH atpA TRUE 0.981 27.000 0.864 0.008 Y NA
 5805554 5805555 LMHCC_0067 LMHCC_0068 atpA atpG TRUE 0.970 38.000 0.846 0.008 Y NA
 5805555 5805556 LMHCC_0068 LMHCC_0069 atpG atpD TRUE 0.949 61.000 0.724 0.008 Y NA
 5805556 5805557 LMHCC_0069 LMHCC_0070 atpD atpC TRUE 0.987 22.000 0.837 0.008 Y NA
 5805557 5805558 LMHCC_0070 LMHCC_0071 atpC   FALSE 0.154 122.000 0.039 NA   NA
 5805558 5805559 LMHCC_0071 LMHCC_0072   murA FALSE 0.092 182.000 0.279 NA   NA
 5805559 5805560 LMHCC_0072 LMHCC_0073 murA   FALSE 0.097 163.000 0.126 1.000 N NA
 5805560 5805561 LMHCC_0073 LMHCC_0074   fabZ TRUE 0.711 22.000 0.037 1.000 N NA
 5805561 5805562 LMHCC_0074 LMHCC_0075 fabZ   FALSE 0.023 252.000 0.000 1.000 N NA
 5805562 5805563 LMHCC_0075 LMHCC_0076     FALSE 0.010 390.000 0.000 1.000 N NA
 5805563 5805564 LMHCC_0076 LMHCC_0077     FALSE 0.109 127.000 0.000 NA   NA
 5805564 5805565 LMHCC_0077 LMHCC_0078     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5805565 5805566 LMHCC_0078 LMHCC_0079   menC TRUE 0.987 1.000 0.015 1.000 Y NA
 5805566 5805567 LMHCC_0079 LMHCC_0080 menC   TRUE 0.943 26.000 0.273 1.000 Y NA
 5805568 5805569 LMHCC_0081 LMHCC_0082     FALSE 0.109 176.000 0.688 NA N NA
 5805569 5805570 LMHCC_0082 LMHCC_0083     TRUE 0.924 2.000 0.030 1.000   NA
 5805571 5805572 LMHCC_0084 LMHCC_0085     TRUE 0.785 21.000 0.210 NA   NA
 5805572 5805573 LMHCC_0085 LMHCC_0086     FALSE 0.070 196.000 0.214 NA   NA
 5805573 5805574 LMHCC_0086 LMHCC_0087     TRUE 0.960 -7.000 0.130 1.000   NA
 5805574 5805575 LMHCC_0087 LMHCC_0088     FALSE 0.059 194.000 0.080 NA   NA
 5805575 5805576 LMHCC_0088 LMHCC_0089   secA FALSE 0.028 230.000 0.041 NA N NA
 5805576 5805577 LMHCC_0089 LMHCC_0090 secA prfB FALSE 0.077 169.000 0.052 1.000 N NA
 5805577 5805578 LMHCC_0090 LMHCC_0091 prfB   FALSE 0.178 107.000 0.024 NA   NA
 5805578 5805579 LMHCC_0091 LMHCC_0092   ftsE FALSE 0.008 505.000 0.000 NA   NA
 5805579 5805580 LMHCC_0092 LMHCC_0093 ftsE   TRUE 0.994 -10.000 0.431 1.000 Y NA
 5805580 5805581 LMHCC_0093 LMHCC_0094     FALSE 0.275 76.000 0.021 NA   NA
 5805581 5805582 LMHCC_0094 LMHCC_0095     FALSE 0.231 120.000 0.333 NA   NA
 5805582 5805583 LMHCC_0095 LMHCC_0097   cls FALSE 0.270 124.000 0.692 1.000 N NA
 5805583 5805584 LMHCC_0097 LMHCC_0098 cls   FALSE 0.062 211.000 0.094 1.000   NA
 5805584 5805585 LMHCC_0098 LMHCC_0099     FALSE 0.151 151.000 0.188 1.000   NA
 5805585 5805586 LMHCC_0099 LMHCC_0100     TRUE 0.996 0.000 0.384 0.012 Y NA
 5805586 5805587 LMHCC_0100 LMHCC_0101     FALSE 0.022 256.000 0.000 1.000 N NA
 5805587 5805588 LMHCC_0101 LMHCC_0102   pstC TRUE 0.810 67.000 0.093 1.000 Y NA
 5805588 5805589 LMHCC_0102 LMHCC_0103 pstC pstA TRUE 0.998 -3.000 0.907 0.003 Y NA
 5805589 5805590 LMHCC_0103 LMHCC_0104 pstA pstB TRUE 0.978 28.000 0.490 0.003 Y NA
 5805590 5805591 LMHCC_0104 LMHCC_0105 pstB pstB TRUE 0.990 15.000 0.086 0.001 Y NA
 5805591 5805592 LMHCC_0105 LMHCC_0106 pstB phoU TRUE 0.974 13.000 0.182 NA Y NA
 5805592 5805593 LMHCC_0106 LMHCC_0107 phoU   FALSE 0.019 268.000 0.027 NA N NA
 5805593 5805594 LMHCC_0107 LMHCC_0108     FALSE 0.271 106.000 0.333 NA   NA
 5805594 5805595 LMHCC_0108 LMHCC_0109     TRUE 0.721 22.000 0.059 NA   NA
 5805595 5805596 LMHCC_0109 LMHCC_0110     TRUE 0.752 21.000 0.093 NA   NA
 5805596 5805597 LMHCC_0110 LMHCC_0111   uvrB FALSE 0.027 252.000 0.007 NA   NA
 5805597 5805598 LMHCC_0111 LMHCC_0112 uvrB uvrA TRUE 0.994 8.000 0.154 0.002 Y NA
 5805598 5805599 LMHCC_0112 LMHCC_0113 uvrA   FALSE 0.032 209.000 0.000 NA   NA
 5805599 5805600 LMHCC_0113 LMHCC_0114     TRUE 0.518 67.000 0.667 NA   NA
 5805600 5805601 LMHCC_0114 LMHCC_0115     TRUE 0.774 23.000 0.316 NA   NA
 5805601 5805602 LMHCC_0115 LMHCC_0116     TRUE 0.905 9.000 0.241 NA   NA
 5805602 5805603 LMHCC_0116 LMHCC_0117   hprK FALSE 0.080 187.000 0.215 NA   NA
 5805603 5805604 LMHCC_0117 LMHCC_0118 hprK lgt FALSE 0.349 89.000 0.494 1.000 N NA
 5805604 5805605 LMHCC_0118 LMHCC_0119 lgt   TRUE 0.606 43.000 0.169 1.000   NA
 5805605 5805606 LMHCC_0119 LMHCC_0120     FALSE 0.230 136.000 0.417 1.000   NA
 5805606 5805607 LMHCC_0120 LMHCC_0121     FALSE 0.232 86.000 0.000 1.000   NA
 5805607 5805608 LMHCC_0121 LMHCC_0122   trxB FALSE 0.272 79.000 0.000 1.000   NA
 5805608 5805609 LMHCC_0122 LMHCC_0123 trxB galE FALSE 0.189 118.000 0.100 1.000 N NA
 5805609 5805610 LMHCC_0123 LMHCC_0124 galE   TRUE 0.822 16.000 0.120 1.000 N NA
 5805610 5805611 LMHCC_0124 LMHCC_0125     TRUE 0.963 28.000 0.122 0.032 Y NA
 5805611 5805612 LMHCC_0125 LMHCC_0126     FALSE 0.217 108.000 0.131 NA   NA
 5805612 5805613 LMHCC_0126 LMHCC_0127     TRUE 0.931 2.000 0.214 NA   NA
 5805613 5805614 LMHCC_0127 LMHCC_0128     TRUE 0.924 8.000 0.470 NA   NA
 5805614 5805615 LMHCC_0128 LMHCC_0129     TRUE 0.626 26.000 0.028 NA   NA
 5805615 5805616 LMHCC_0129 LMHCC_0130     FALSE 0.047 182.000 0.000 1.000 N NA
 5805618 5805619 LMHCC_0132 LMHCC_T005     FALSE 0.121 120.000 0.000 NA   NA
 5805619 5805620 LMHCC_T005 LMHCC_0133     FALSE 0.037 197.000 0.000 NA   NA
 5805622 5805623 LMHCC_0135 LMHCC_0136     TRUE 0.864 14.000 0.263 NA   NA
 5805623 5805624 LMHCC_0136 LMHCC_0137     TRUE 0.404 79.000 0.237 1.000   NA
 5805624 5805625 LMHCC_0137 LMHCC_0138     FALSE 0.367 79.000 0.113 1.000   NA
 5805625 5805626 LMHCC_0138 LMHCC_0139   rpoN FALSE 0.100 158.000 0.103 1.000 N NA
 5805626 5805627 LMHCC_0139 LMHCC_0140 rpoN   FALSE 0.085 442.000 0.050 1.000 Y NA
 5805627 5805628 LMHCC_0140 LMHCC_0141   gap TRUE 0.590 33.000 0.084 1.000 N NA
 5805628 5805629 LMHCC_0141 LMHCC_0142 gap pgk TRUE 0.719 135.000 0.008 0.007 Y NA
 5805629 5805630 LMHCC_0142 LMHCC_0143 pgk tpiA TRUE 0.881 46.000 0.141 1.000 Y NA
 5805630 5805631 LMHCC_0143 LMHCC_0144 tpiA gpmI TRUE 0.988 2.000 0.138 1.000 Y NA
 5805631 5805632 LMHCC_0144 LMHCC_0145 gpmI eno TRUE 0.551 135.000 0.136 1.000 Y NA
 5805632 5805633 LMHCC_0145 LMHCC_0146 eno   FALSE 0.171 109.000 0.020 NA   NA
 5805633 5805634 LMHCC_0146 LMHCC_0147     FALSE 0.187 133.000 0.286 NA   NA
 5805634 5805635 LMHCC_0147 LMHCC_0148     FALSE 0.086 183.000 0.238 NA   NA
 5805635 5805636 LMHCC_0148 LMHCC_0149   secG FALSE 0.252 90.000 0.012 1.000   NA
 5805636 5805637 LMHCC_0149 LMHCC_0150 secG   FALSE 0.039 252.000 0.032 1.000   NA
 5805637 5805638 LMHCC_0150 LMHCC_0151   rnr TRUE 0.624 34.000 0.060 1.000   NA
 5805638 5805639 LMHCC_0151 LMHCC_0152 rnr smpB TRUE 0.930 16.000 0.143 0.027 N NA
 5805641 5805642 LMHCC_0154 LMHCC_0155     TRUE 0.609 61.000 0.636 1.000   NA
 5805642 5805643 LMHCC_0155 LMHCC_0156     TRUE 0.900 12.000 0.159 1.000   NA
 5805643 5805644 LMHCC_0156 LMHCC_0157     TRUE 0.502 51.000 0.159 NA   NA
 5805644 5805645 LMHCC_0157 LMHCC_0158     FALSE 0.007 955.000 0.000 NA   NA
 5805645 5805646 LMHCC_0158 LMHCC_0159     TRUE 0.866 3.000 0.000 NA   NA
 5805646 5805647 LMHCC_0159 LMHCC_0160     FALSE 0.035 201.000 0.000 NA   NA
 5805647 5805648 LMHCC_0160 LMHCC_0161     TRUE 0.794 19.000 0.153 NA   NA
 5805648 5805649 LMHCC_0161 LMHCC_0162     TRUE 0.451 56.000 0.103 NA   NA
 5805656 5805657 LMHCC_0169 LMHCC_0170     FALSE 0.206 133.000 0.407 NA   NA
 5805658 5805659 LMHCC_0171 LMHCC_0172     TRUE 0.993 0.000 0.889 1.000 Y NA
 5805659 5805660 LMHCC_0172 LMHCC_0173     TRUE 0.993 -3.000 0.520 1.000 Y NA
 5805660 5805661 LMHCC_0173 LMHCC_0174   mrdB FALSE 0.184 142.000 0.455 1.000 N NA
 5805661 5805662 LMHCC_0174 LMHCC_0175 mrdB mrdB TRUE 0.879 77.000 0.008 0.005 Y NA
 5805662 5805663 LMHCC_0175 LMHCC_0176 mrdB   FALSE 0.079 156.000 0.008 1.000 N NA
 5805663 5805664 LMHCC_0176 LMHCC_0177   gcvH TRUE 0.498 41.000 0.038 1.000 N NA
 5805664 5805665 LMHCC_0177 LMHCC_0178 gcvH   FALSE 0.284 86.000 0.038 1.000   NA
 5805665 5805666 LMHCC_0178 LMHCC_0179     FALSE 0.070 192.000 0.034 1.000   NA
 5805666 5805667 LMHCC_0179 LMHCC_0180     FALSE 0.295 75.000 0.034 1.000 N NA
 5805667 5805668 LMHCC_0180 LMHCC_0181     TRUE 0.995 -10.000 0.932 1.000 Y NA
 5805668 5805669 LMHCC_0181 LMHCC_0182     FALSE 0.327 79.000 0.161 NA   NA
 5805669 5805670 LMHCC_0182 LMHCC_0183     FALSE 0.014 317.000 0.000 NA   NA
 5805670 5805671 LMHCC_0183 LMHCC_0184     TRUE 0.994 -3.000 0.642 1.000 Y NA
 5805671 5805672 LMHCC_0184 LMHCC_0185     TRUE 0.813 65.000 0.181 NA Y NA
 5805674 5805675 LMHCC_0187 LMHCC_0188 sufC sufD TRUE 0.963 19.000 0.139 1.000 Y NA
 5805675 5805676 LMHCC_0188 LMHCC_0189 sufD   TRUE 0.954 1.000 0.606 1.000 N NA
 5805676 5805677 LMHCC_0189 LMHCC_0190     TRUE 0.954 -3.000 0.292 1.000 N NA
 5805677 5805678 LMHCC_0190 LMHCC_0191   sufB TRUE 0.920 23.000 0.152 0.002 N NA
 5805678 5805679 LMHCC_0191 LMHCC_0192 sufB   FALSE 0.013 376.000 0.004 NA   NA
 5805680 5805681 LMHCC_0193 LMHCC_0194     TRUE 0.961 1.000 0.903 NA   NA
 5805682 5805683 LMHCC_0195 LMHCC_0196     TRUE 0.956 -3.000 0.347 NA   NA
 5805683 5805684 LMHCC_0196 LMHCC_0197     TRUE 0.871 14.000 0.320 NA   NA
 5805684 5805685 LMHCC_0197 LMHCC_0198     TRUE 0.743 49.000 0.113 0.064   NA
 5805685 5805686 LMHCC_0198 LMHCC_0199     TRUE 0.576 36.000 0.125 NA   NA
 5805687 5805688 LMHCC_0200 LMHCC_0201 pgpA   FALSE 0.184 112.000 0.056 1.000 N NA
 5805688 5805689 LMHCC_0201 LMHCC_0202     FALSE 0.087 174.000 0.028 1.000   NA
 5805690 5805691 LMHCC_0203 LMHCC_0204     TRUE 0.766 22.000 0.190 NA   NA
 5805692 5805693 LMHCC_0205 LMHCC_0206     FALSE 0.271 88.000 0.141 1.000 N NA
 5805694 5805695 LMHCC_0207 LMHCC_0208     FALSE 0.285 84.000 0.148 NA   NA
 5805695 5805696 LMHCC_0208 LMHCC_0209     TRUE 0.531 35.000 0.033 NA   NA
 5805697 5805698 LMHCC_0210 LMHCC_0212     TRUE 0.556 75.000 0.040 0.090   NA
 5805700 5805701 LMHCC_0214 LMHCC_0215     TRUE 0.993 -10.000 0.293 1.000 Y NA
 5805701 5805702 LMHCC_0215 LMHCC_0216     TRUE 0.997 -3.000 0.829 0.081 Y NA
 5805702 5805703 LMHCC_0216 LMHCC_0217     TRUE 0.989 7.000 0.842 1.000 Y NA
 5805703 5805704 LMHCC_0217 LMHCC_0218     TRUE 0.998 -19.000 0.289 0.001 Y NA
 5805704 5805705 LMHCC_0218 LMHCC_0219     TRUE 0.990 0.000 0.317 NA Y NA
 5805705 5805706 LMHCC_0219 LMHCC_0220     TRUE 0.992 -13.000 0.268 NA Y NA
 5805706 5805707 LMHCC_0220 LMHCC_0221     FALSE 0.013 345.000 0.000 1.000 N NA
 5805708 5805709 LMHCC_0222 LMHCC_0223     FALSE 0.011 483.000 0.000 1.000   NA
 5805709 5805710 LMHCC_0223 LMHCC_0224     FALSE 0.196 114.000 0.107 NA   NA
 5805713 5805714 LMHCC_0227 LMHCC_0228     TRUE 0.957 0.000 0.591 1.000 N NA
 5805714 5805715 LMHCC_0228 LMHCC_0229     FALSE 0.136 139.000 0.110 1.000 N NA
 5805716 5805717 LMHCC_0230 LMHCC_0231     FALSE 0.074 150.000 0.000 1.000 N NA
 5805717 5805718 LMHCC_0231 LMHCC_0232   pgi FALSE 0.158 102.000 0.000 1.000 N NA
 5805718 5805719 LMHCC_0232 LMHCC_0233 pgi   TRUE 0.634 105.000 0.021 1.000 Y NA
 5805719 5805720 LMHCC_0233 LMHCC_R001   rrsA FALSE 0.011 358.000 0.000 NA   NA
 5805720 5805721 LMHCC_R001 LMHCC_T030 rrsA   FALSE 0.092 136.000 0.000 NA   NA
 5805721 5805722 LMHCC_T030 LMHCC_T001     FALSE 0.380 47.000 0.000 NA   NA
 5805722 5805723 LMHCC_T001 LMHCC_R002   rrlA FALSE 0.051 175.000 0.000 NA   NA
 5805723 5805724 LMHCC_R002 LMHCC_R003 rrlA rrfA FALSE 0.207 80.000 0.000 NA   NA
 5805724 5805725 LMHCC_R003 LMHCC_T010 rrfA   TRUE 0.822 10.000 0.000 NA   NA
 5805725 5805726 LMHCC_T010 LMHCC_T051     TRUE 0.836 7.000 0.000 NA   NA
 5805726 5805727 LMHCC_T051 LMHCC_T063     TRUE 0.467 34.000 0.000 NA   NA
 5805727 5805728 LMHCC_T063 LMHCC_T064     FALSE 0.327 58.000 0.000 NA   NA
 5805728 5805729 LMHCC_T064 LMHCC_T043     TRUE 0.639 22.000 0.000 NA   NA
 5805729 5805730 LMHCC_T043 LMHCC_T014     TRUE 0.836 7.000 0.000 NA   NA
 5805730 5805731 LMHCC_T014 LMHCC_T047     TRUE 0.848 5.000 0.000 NA   NA
 5805731 5805732 LMHCC_T047 LMHCC_T061     TRUE 0.657 21.000 0.000 NA   NA
 5805732 5805733 LMHCC_T061 LMHCC_T060     TRUE 0.831 8.000 0.000 NA   NA
 5805733 5805734 LMHCC_T060 LMHCC_T028     TRUE 0.731 16.000 0.000 NA   NA
 5805734 5805735 LMHCC_T028 LMHCC_T018     TRUE 0.504 30.000 0.000 NA   NA
 5805735 5805736 LMHCC_T018 LMHCC_T023     TRUE 0.843 6.000 0.000 NA   NA
 5805736 5805737 LMHCC_T023 LMHCC_T017     TRUE 0.671 20.000 0.000 NA   NA
 5805737 5805738 LMHCC_T017 LMHCC_T033     FALSE 0.387 46.000 0.000 NA   NA
 5805738 5805739 LMHCC_T033 LMHCC_0235     FALSE 0.007 720.000 0.000 NA   NA
 5805739 5805740 LMHCC_0235 LMHCC_0236     TRUE 0.639 22.000 0.000 NA   NA
 5805740 5805741 LMHCC_0236 LMHCC_0237     FALSE 0.033 205.000 0.000 NA   NA
 5805741 5805742 LMHCC_0237 LMHCC_0238     TRUE 0.848 5.000 0.000 NA   NA
 5805742 5805743 LMHCC_0238 LMHCC_0239     FALSE 0.170 91.000 0.000 NA   NA
 5805744 5805745 LMHCC_0240 LMHCC_0241     TRUE 0.983 13.000 0.700 1.000 Y NA
 5805746 5805747 LMHCC_0242 LMHCC_0243     TRUE 0.394 45.000 0.000 NA   NA
 5805747 5805748 LMHCC_0243 LMHCC_0244     FALSE 0.015 296.000 0.000 NA   NA
 5805748 5805749 LMHCC_0244 LMHCC_0245     TRUE 0.639 34.000 0.257 NA   NA
 5805749 5805750 LMHCC_0245 LMHCC_0246     FALSE 0.274 120.000 0.615 NA   NA
 5805750 5805751 LMHCC_0246 LMHCC_0247     TRUE 0.709 44.000 0.769 1.000   NA
 5805751 5805752 LMHCC_0247 LMHCC_0248     TRUE 0.896 16.000 0.846 NA   NA
 5805752 5805753 LMHCC_0248 LMHCC_0249     FALSE 0.122 190.000 0.833 NA   NA
 5805753 5805754 LMHCC_0249 LMHCC_0250     TRUE 0.527 60.000 0.417 NA   NA
 5805754 5805755 LMHCC_0250 LMHCC_0251     TRUE 0.902 4.000 0.083 NA   NA
 5805755 5805756 LMHCC_0251 LMHCC_0252     TRUE 0.925 3.000 0.208 NA   NA
 5805756 5805757 LMHCC_0252 LMHCC_0253     FALSE 0.188 124.000 0.042 1.000   NA
 5805759 5805760 LMHCC_0255 LMHCC_0256 ssuE   TRUE 0.851 16.000 0.108 1.000   NA
 5805760 5805761 LMHCC_0256 LMHCC_0257     TRUE 0.878 17.000 0.391 1.000   NA
 5805761 5805762 LMHCC_0257 LMHCC_0258     TRUE 0.980 22.000 0.458 0.039 Y NA
 5805762 5805763 LMHCC_0258 LMHCC_0259     TRUE 0.993 11.000 0.476 0.011 Y NA
 5805763 5805764 LMHCC_0259 LMHCC_0260     TRUE 0.993 -3.000 0.405 1.000 Y NA
 5805764 5805765 LMHCC_0260 LMHCC_0261     TRUE 0.946 -3.000 0.353 NA N NA
 5805765 5805766 LMHCC_0261 LMHCC_0262     TRUE 0.957 -7.000 0.474 NA N NA
 5805766 5805767 LMHCC_0262 LMHCC_0263     TRUE 0.947 -3.000 0.368 NA N NA
 5805767 5805768 LMHCC_0263 LMHCC_0264     FALSE 0.267 73.000 0.071 NA N NA
 5805768 5805769 LMHCC_0264 LMHCC_0265     FALSE 0.153 133.000 0.102 1.000 N NA
 5805769 5805770 LMHCC_0265 LMHCC_0266     TRUE 0.921 -3.000 0.085 NA N NA
 5805770 5805771 LMHCC_0266 LMHCC_0268     FALSE 0.259 81.000 0.042 NA   NA
 5805773 5805774 LMHCC_0269 LMHCC_0270   pfkB TRUE 0.994 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 5805774 5805775 LMHCC_0270 LMHCC_0271 pfkB   TRUE 0.992 2.000 0.816 1.000 Y NA
 5805775 5805776 LMHCC_0271 LMHCC_0272     FALSE 0.207 106.000 0.075 1.000 N NA
 5805778 5805779 LMHCC_0274 LMHCC_0275   addB FALSE 0.107 150.000 0.076 NA   NA
 5805779 5805780 LMHCC_0275 LMHCC_0276 addB addA TRUE 0.996 2.000 0.408 0.003 Y NA
 5805780 5805781 LMHCC_0276 LMHCC_0277 addA   TRUE 0.920 1.000 0.075 1.000 N NA
 5805781 5805782 LMHCC_0277 LMHCC_0278     TRUE 0.785 20.000 0.169 NA   NA
 5805782 5805783 LMHCC_0278 LMHCC_0279     FALSE 0.319 84.000 0.263 NA   NA
 5805785 5805786 LMHCC_0281 LMHCC_0282     TRUE 0.468 65.000 0.303 NA   NA
 5805786 5805787 LMHCC_0282 LMHCC_0284     FALSE 0.333 80.000 0.214 NA   NA
 5805789 5805790 LMHCC_0285 LMHCC_0286     FALSE 0.008 503.000 0.000 NA   NA
 5805791 5805792 LMHCC_0287 LMHCC_0288     FALSE 0.220 110.000 0.167 NA   NA
 5805794 5805795 LMHCC_0290 LMHCC_0291     TRUE 0.780 73.000 0.088 1.000 Y NA
 5805795 5805796 LMHCC_0291 LMHCC_0292     TRUE 0.992 -7.000 0.154 1.000 Y NA
 5805796 5805797 LMHCC_0292 LMHCC_0293     FALSE 0.080 192.000 0.256 1.000 N NA
 5805797 5805798 LMHCC_0293 LMHCC_0294     TRUE 0.968 14.000 0.100 NA Y NA
 5805799 5805800 LMHCC_0295 LMHCC_0296     TRUE 0.942 -3.000 0.119 NA   NA
 5805800 5805801 LMHCC_0296 LMHCC_0297     TRUE 0.900 2.000 0.119 NA N NA
 5805802 5805803 LMHCC_0298 LMHCC_0299     TRUE 0.742 22.000 0.100 1.000 N NA
 5805804 5805805 LMHCC_0300 LMHCC_0301     FALSE 0.259 92.000 0.135 1.000 N NA
 5805805 5805806 LMHCC_0301 LMHCC_0302     TRUE 0.953 -10.000 0.149 1.000 N NA
 5805806 5805807 LMHCC_0302 LMHCC_0303     TRUE 0.953 3.000 0.833 NA   NA
 5805808 5805809 LMHCC_0304 LMHCC_0305     FALSE 0.279 160.000 0.250 0.038   NA
 5805809 5805810 LMHCC_0305 LMHCC_0306     TRUE 0.749 33.000 0.571 1.000   NA
 5805810 5805811 LMHCC_0306 LMHCC_0307     TRUE 0.502 59.000 0.286 1.000 N NA
 5805811 5805812 LMHCC_0307 LMHCC_0308     FALSE 0.376 69.000 0.320 NA N NA
 5805814 5805815 LMHCC_0310 LMHCC_0311     FALSE 0.029 256.000 0.000 1.000   NA
 5805815 5805816 LMHCC_0311 LMHCC_0312     TRUE 0.503 65.000 0.750 NA N NA
 5805817 5805818 LMHCC_0313 LMHCC_0314     FALSE 0.216 109.000 0.141 NA   NA
 5805818 5805819 LMHCC_0314 LMHCC_0315     TRUE 0.932 0.000 0.118 NA   NA
 5805819 5805820 LMHCC_0315 LMHCC_0316     TRUE 0.953 -3.000 0.275 NA   NA
 5805820 5805821 LMHCC_0316 LMHCC_0317   fumC FALSE 0.301 70.000 0.017 NA   NA
 5805821 5805822 LMHCC_0317 LMHCC_0318 fumC   FALSE 0.181 104.000 0.014 NA   NA
 5805822 5805823 LMHCC_0318 LMHCC_0319     FALSE 0.343 82.000 0.321 NA   NA
 5805823 5805824 LMHCC_0319 LMHCC_0320     FALSE 0.123 144.000 0.093 NA   NA
 5805824 5805825 LMHCC_0320 LMHCC_0321     TRUE 0.955 -3.000 0.330 NA   NA
 5805825 5805826 LMHCC_0321 LMHCC_0322     TRUE 0.945 0.000 0.291 NA   NA
 5805827 5805828 LMHCC_0323 LMHCC_0324     FALSE 0.204 117.000 0.167 NA   NA
 5805828 5805829 LMHCC_0324 LMHCC_0325     FALSE 0.081 183.000 0.190 NA   NA
 5805829 5805830 LMHCC_0325 LMHCC_0326     TRUE 0.634 30.000 0.137 NA   NA
 5805831 5805832 LMHCC_0327 LMHCC_0328     TRUE 0.949 -10.000 0.271 NA N NA
 5805834 5805835 LMHCC_0330 LMHCC_0331 hemE hemH TRUE 0.983 7.000 0.131 1.000 Y NA
 5805835 5805836 LMHCC_0331 LMHCC_0332 hemH   FALSE 0.109 154.000 0.020 1.000   NA
 5805836 5805837 LMHCC_0332 LMHCC_0333     FALSE 0.253 121.000 0.256 1.000   NA
 5805837 5805838 LMHCC_0333 LMHCC_0334     TRUE 0.704 64.000 0.256 0.062   NA
 5805838 5805839 LMHCC_0334 LMHCC_0335     FALSE 0.256 111.000 0.344 NA   NA
 5805839 5805840 LMHCC_0335 LMHCC_0336   clpB FALSE 0.091 148.000 0.011 NA   NA
 5805840 5805841 LMHCC_0336 LMHCC_0337 clpB   FALSE 0.205 91.000 0.013 1.000 N NA
 5805843 5805844 LMHCC_0339 LMHCC_0340     FALSE 0.177 120.000 0.081 1.000 N NA
 5805844 5805845 LMHCC_0340 LMHCC_0341   fabF TRUE 0.546 203.000 0.076 0.001 Y NA
 5805845 5805846 LMHCC_0341 LMHCC_0342 fabF   FALSE 0.123 120.000 0.000 1.000 N NA
 5805846 5805847 LMHCC_0342 LMHCC_0343     TRUE 0.922 -16.000 0.000 1.000 N NA
 5805848 5805849 LMHCC_0344 LMHCC_0345 trpS   FALSE 0.013 335.000 0.000 NA   NA
 5805850 5805851 LMHCC_0346 LMHCC_0347     FALSE 0.240 279.000 0.000 0.038 Y NA
 5805851 5805852 LMHCC_0347 LMHCC_0348     TRUE 0.995 0.000 0.299 0.038 Y NA
 5805852 5805853 LMHCC_0348 LMHCC_0349     TRUE 0.974 18.000 0.595 1.000 Y NA
 5805853 5805854 LMHCC_0349 LMHCC_0350     TRUE 0.997 -3.000 0.238 0.001 Y NA
 5805854 5805855 LMHCC_0350 LMHCC_0351     FALSE 0.014 320.000 0.000 1.000 N NA
 5805855 5805856 LMHCC_0351 LMHCC_0352     FALSE 0.030 226.000 0.063 NA N NA
 5805856 5805857 LMHCC_0352 LMHCC_0353     FALSE 0.077 184.000 0.167 NA   NA
 5805857 5805858 LMHCC_0353 LMHCC_0354   pepF TRUE 0.425 73.000 0.398 NA   NA
 5805858 5805859 LMHCC_0354 LMHCC_0355 pepF   FALSE 0.015 299.000 0.000 NA   NA
 5805859 5805860 LMHCC_0355 LMHCC_0356     FALSE 0.031 211.000 0.000 NA   NA
 5805860 5805861 LMHCC_0356 LMHCC_0357     TRUE 0.901 13.000 0.515 NA   NA
 5805861 5805862 LMHCC_0357 LMHCC_0358     TRUE 0.429 38.000 0.000 NA   NA
 5805862 5805863 LMHCC_0358 LMHCC_0359     TRUE 0.511 29.000 0.000 NA   NA
 5805863 5805864 LMHCC_0359 LMHCC_0360     TRUE 0.995 -10.000 0.877 1.000 Y NA
 5805864 5805865 LMHCC_0360 LMHCC_0361     TRUE 0.995 -19.000 0.657 1.000 Y NA
 5805865 5805866 LMHCC_0361 LMHCC_0362   srtB TRUE 0.931 4.000 0.373 NA   NA
 5805866 5805867 LMHCC_0362 LMHCC_0363 srtB   FALSE 0.387 61.000 0.038 NA   NA
 5805867 5805868 LMHCC_0363 LMHCC_0364     FALSE 0.039 194.000 0.000 NA   NA
 5805868 5805869 LMHCC_0364 LMHCC_0365     FALSE 0.309 181.000 0.556 0.012   NA
 5805869 5805870 LMHCC_0365 LMHCC_0366     TRUE 0.402 235.000 0.000 0.002 Y NA
 5805871 5805872 LMHCC_0367 LMHCC_0368     FALSE 0.313 106.000 0.579 NA   NA
 5805873 5805874 LMHCC_0369 LMHCC_0370     FALSE 0.100 151.000 0.050 1.000 N NA
 5805874 5805875 LMHCC_0370 LMHCC_0371     TRUE 0.635 106.000 0.033 1.000 Y NA
 5805875 5805876 LMHCC_0371 LMHCC_0372     FALSE 0.027 230.000 0.000 1.000 N NA
 5805876 5805877 LMHCC_0372 LMHCC_0373     TRUE 0.959 -3.000 0.700 NA N NA
 5805877 5805878 LMHCC_0373 LMHCC_0375     TRUE 0.838 22.000 0.714 NA   NA
 5805879 5805880 LMHCC_0376 LMHCC_0377     TRUE 0.655 26.000 0.068 NA   NA
 5805881 5805882 LMHCC_0378 LMHCC_0379     FALSE 0.341 66.000 0.025 NA   NA
 5805882 5805883 LMHCC_0379 LMHCC_0380     FALSE 0.145 253.000 0.000 NA Y NA
 5805883 5805884 LMHCC_0380 LMHCC_0381     TRUE 0.422 70.000 0.562 NA N NA
 5805884 5805885 LMHCC_0381 LMHCC_0382     TRUE 0.506 75.000 0.625 1.000   NA
 5805885 5805886 LMHCC_0382 LMHCC_0383     TRUE 0.874 16.000 0.500 NA   NA
 5805886 5805887 LMHCC_0383 LMHCC_0384     TRUE 0.989 2.000 0.480 NA Y NA
 5805887 5805888 LMHCC_0384 LMHCC_0385     TRUE 0.986 3.000 0.244 NA Y NA
 5805888 5805889 LMHCC_0385 LMHCC_0386     TRUE 0.760 23.000 0.244 NA   NA
 5805889 5805890 LMHCC_0386 LMHCC_0387     FALSE 0.299 94.000 0.308 NA   NA
 5805892 5805893 LMHCC_0389 LMHCC_0390     TRUE 0.947 56.000 0.101 0.001 Y NA
 5805893 5805894 LMHCC_0390 LMHCC_0391     TRUE 0.648 42.000 0.550 1.000 N NA
 5805894 5805895 LMHCC_0391 LMHCC_0392     TRUE 0.968 -3.000 0.484 1.000   NA
 5805895 5805896 LMHCC_0392 LMHCC_0393     FALSE 0.346 79.000 0.220 NA   NA
 5805899 5805900 LMHCC_0396 LMHCC_0397     TRUE 0.443 56.000 0.086 NA   NA
 5805901 5805902 LMHCC_0398 LMHCC_0399     FALSE 0.345 69.000 0.071 NA   NA
 5805902 5805903 LMHCC_0399 LMHCC_0400     FALSE 0.184 115.000 0.077 NA   NA
 5805906 5805907 LMHCC_0403 LMHCC_0404     TRUE 0.775 17.000 0.162 NA N NA
 5805907 5805908 LMHCC_0404 LMHCC_0406     TRUE 0.888 8.000 0.103 NA   NA
 5805909 5805910 LMHCC_0407 LMHCC_0408     TRUE 0.960 12.000 0.429 0.032 N NA
 5805910 5805911 LMHCC_0408 LMHCC_0409     TRUE 0.991 13.000 0.464 0.030 Y NA
 5805911 5805912 LMHCC_0409 LMHCC_0410     TRUE 0.989 14.000 0.393 0.030 Y NA
 5805912 5805913 LMHCC_0410 LMHCC_0411     TRUE 0.971 18.000 0.364 1.000 Y NA
 5805913 5805914 LMHCC_0411 LMHCC_0412     TRUE 0.990 17.000 0.278 0.002 Y NA
 5805917 5805918 LMHCC_T039 LMHCC_T019     TRUE 0.836 7.000 0.000 NA   NA
 5805918 5805919 LMHCC_T019 LMHCC_T062     TRUE 0.801 12.000 0.000 NA   NA
 5805919 5805920 LMHCC_T062 LMHCC_T057     TRUE 0.822 10.000 0.000 NA   NA
 5805920 5805921 LMHCC_T057 LMHCC_T020     FALSE 0.063 158.000 0.000 NA   NA
 5805922 5805923 LMHCC_0416 LMHCC_0417     FALSE 0.007 666.000 0.000 NA   NA
 5805923 5805924 LMHCC_0417 LMHCC_0418     FALSE 0.177 139.000 0.370 NA   NA
 5805926 5805927 LMHCC_0420 LMHCC_0421     FALSE 0.254 213.000 0.065 1.000 Y NA
 5805927 5805928 LMHCC_0421 LMHCC_0422     TRUE 0.869 88.000 0.621 0.037 Y NA
 5805928 5805929 LMHCC_0422 LMHCC_0423     TRUE 0.996 1.000 0.714 0.037 Y NA
 5805929 5805930 LMHCC_0423 LMHCC_0424     TRUE 0.619 28.000 0.057 NA   NA
 5805930 5805931 LMHCC_0424 LMHCC_0425     TRUE 0.731 16.000 0.000 NA   NA
 5805931 5805932 LMHCC_0425 LMHCC_0426     FALSE 0.061 175.000 0.009 NA   NA
 5805932 5805933 LMHCC_0426 LMHCC_0427     TRUE 0.962 -3.000 0.502 NA   NA
 5805933 5805934 LMHCC_0427 LMHCC_0428   glmM FALSE 0.040 249.000 0.150 NA   NA
 5805937 5805938 LMHCC_0431 LMHCC_0432     TRUE 0.977 -13.000 0.750 1.000   NA
 5805938 5805939 LMHCC_0432 LMHCC_0433     FALSE 0.052 196.000 0.045 NA   NA
 5805939 5805940 LMHCC_0433 LMHCC_0434     FALSE 0.250 84.000 0.054 NA   NA
 5805941 5805942 LMHCC_0435 LMHCC_0436   manA FALSE 0.210 80.000 0.000 1.000 N NA
 5805943 5805944 LMHCC_0437 LMHCC_0438   nagA TRUE 0.656 42.000 0.615 NA   NA
 5805944 5805945 LMHCC_0438 LMHCC_0439 nagA   TRUE 0.985 6.000 0.220 1.000 Y NA
 5805947 5805948 LMHCC_0441 LMHCC_0442   feoB TRUE 0.778 25.000 0.517 NA   NA
 5805948 5805949 LMHCC_0442 LMHCC_0443 feoB   TRUE 0.992 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 5805950 5805951 LMHCC_0444 LMHCC_0445 pta   FALSE 0.012 349.000 0.000 NA   NA
 5805951 5805952 LMHCC_0445 LMHCC_0446     TRUE 0.959 0.000 0.667 NA   NA
 5805953 5805954 LMHCC_0447 LMHCC_0448     TRUE 0.989 2.000 0.488 NA Y NA
 5805955 5805956 LMHCC_0449 LMHCC_0450     TRUE 0.560 181.000 0.375 0.080 Y NA
 5805956 5805957 LMHCC_0450 LMHCC_0451     TRUE 0.964 8.000 0.308 0.032 N NA
 5805957 5805958 LMHCC_0451 LMHCC_0452     TRUE 0.995 6.000 0.846 0.029 Y NA
 5805958 5805959 LMHCC_0452 LMHCC_0453     TRUE 0.968 28.000 0.400 0.044 Y NA
 5805959 5805960 LMHCC_0453 LMHCC_0454   pfkB TRUE 0.973 18.000 0.526 1.000 Y NA
 5805960 5805961 LMHCC_0454 LMHCC_0455 pfkB   TRUE 0.991 2.000 0.526 1.000 Y NA
 5805961 5805962 LMHCC_0455 LMHCC_0456     TRUE 0.951 4.000 0.909 NA   NA
 5805963 5805964 LMHCC_0457 LMHCC_0458   argH FALSE 0.067 168.000 0.006 1.000 N NA
 5805964 5805965 LMHCC_0458 LMHCC_0459 argH argG TRUE 0.987 4.000 0.278 1.000 Y NA
 5805966 5805967 LMHCC_0460 LMHCC_0461     FALSE 0.255 111.000 0.323 1.000 N NA
 5805967 5805968 LMHCC_0461 LMHCC_0462     TRUE 0.910 10.000 0.323 1.000 N NA
 5805968 5805969 LMHCC_0462 LMHCC_0463     FALSE 0.009 411.000 0.000 NA   NA
 5805969 5805970 LMHCC_0463 LMHCC_0464     FALSE 0.200 81.000 0.000 NA   NA
 5805970 5805971 LMHCC_0464 LMHCC_0465     FALSE 0.376 97.000 0.500 1.000   NA
 5805973 5805974 LMHCC_0467 LMHCC_0468     FALSE 0.008 553.000 0.000 NA   NA
 5805974 5805975 LMHCC_0468 LMHCC_0469     FALSE 0.008 487.000 0.000 NA   NA
 5805975 5805976 LMHCC_0469 LMHCC_0470     FALSE 0.055 168.000 0.000 NA   NA
 5805976 5805977 LMHCC_0470 LMHCC_0471     TRUE 0.985 1.000 0.000 1.000 Y NA
 5805978 5805979 LMHCC_0472 LMHCC_T034     FALSE 0.083 142.000 0.000 NA   NA
 5805980 5805981 LMHCC_0473 LMHCC_0474     TRUE 0.951 -3.000 0.231 NA   NA
 5805981 5805982 LMHCC_0474 LMHCC_0475   crcB FALSE 0.165 122.000 0.069 NA   NA
 5805982 5805983 LMHCC_0475 LMHCC_0476 crcB crcB TRUE 0.996 -10.000 0.229 0.085 Y NA
 5805983 5805984 LMHCC_0476 LMHCC_0477 crcB   FALSE 0.285 96.000 0.262 NA   NA
 5805984 5805985 LMHCC_0477 LMHCC_0478     FALSE 0.262 134.000 0.917 NA   NA
 5805985 5805986 LMHCC_0478 LMHCC_0479     FALSE 0.179 105.000 0.015 NA   NA
 5805986 5805987 LMHCC_0479 LMHCC_0480     TRUE 0.950 -3.000 0.217 NA   NA
 5805987 5805988 LMHCC_0480 LMHCC_0481   rimI TRUE 0.962 -27.000 0.127 1.000   NA
 5805988 5805989 LMHCC_0481 LMHCC_0482 rimI   TRUE 0.952 -3.000 0.090 1.000   NA
 5805990 5805991 LMHCC_0483 LMHCC_0484     FALSE 0.043 188.000 0.000 NA   NA
 5805991 5805992 LMHCC_0484 LMHCC_0485     TRUE 0.690 25.000 0.105 NA   NA
 5805994 5805995 LMHCC_0487 LMHCC_0488     TRUE 0.953 2.000 0.714 NA   NA
 5805996 5805997 LMHCC_0489 LMHCC_0490 groS groL TRUE 0.932 35.000 0.674 1.000 Y NA
 5805997 5805998 LMHCC_0490 LMHCC_0491 groL   FALSE 0.022 256.000 0.000 1.000 N NA
 5805998 5805999 LMHCC_0491 LMHCC_0492     FALSE 0.145 152.000 0.364 NA   NA
 5805999 5806000 LMHCC_0492 LMHCC_0493     TRUE 0.682 45.000 0.917 NA   NA
 5806000 5806001 LMHCC_0493 LMHCC_0494     FALSE 0.011 372.000 0.000 NA   NA
 5806001 5806002 LMHCC_0494 LMHCC_0495     TRUE 0.731 16.000 0.000 NA   NA
 5806003 5806004 LMHCC_0496 LMHCC_0497 mscL   FALSE 0.364 62.000 0.020 NA   NA
 5806005 5806006 LMHCC_0498 LMHCC_0499     TRUE 0.906 13.000 0.600 NA   NA
 5806006 5806007 LMHCC_0499 LMHCC_0500     TRUE 0.805 19.000 0.200 NA   NA
 5806008 5806009 LMHCC_0501 LMHCC_0502     TRUE 0.394 109.000 0.028 0.085   NA
 5806010 5806011 LMHCC_0503 LMHCC_0504 cyoE   FALSE 0.103 147.000 0.037 NA   NA
 5806011 5806012 LMHCC_0504 LMHCC_0505     TRUE 0.558 49.000 0.301 NA   NA
 5806012 5806013 LMHCC_0505 LMHCC_0506     TRUE 0.714 31.000 0.500 NA   NA
 5806013 5806014 LMHCC_0506 LMHCC_0507   rsmD FALSE 0.215 97.000 0.048 NA   NA
 5806014 5806015 LMHCC_0507 LMHCC_0508 rsmD coaD TRUE 0.937 3.000 0.367 1.000 N NA
 5806015 5806016 LMHCC_0508 LMHCC_0509 coaD   TRUE 0.763 19.000 0.052 1.000 N NA
 5806017 5806018 LMHCC_0510 LMHCC_0511     FALSE 0.242 82.000 0.027 NA   NA
 5806019 5806020 LMHCC_0512 LMHCC_0513     FALSE 0.019 267.000 0.000 NA   NA
 5806020 5806021 LMHCC_0513 LMHCC_0514   panE TRUE 0.905 1.000 0.019 NA   NA
 5806021 5806022 LMHCC_0514 LMHCC_0516 panE   TRUE 0.946 -7.000 0.091 NA   NA
 5806024 5806025 LMHCC_0517 LMHCC_0518   mraZ FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 5806025 5806026 LMHCC_0518 LMHCC_0519 mraZ mraW TRUE 0.907 13.000 0.635 NA   NA
 5806026 5806027 LMHCC_0519 LMHCC_0520 mraW   TRUE 0.795 17.000 0.077 1.000 N NA
 5806027 5806028 LMHCC_0520 LMHCC_0521     TRUE 0.433 69.000 0.316 1.000 N NA
 5806028 5806029 LMHCC_0521 LMHCC_0522     FALSE 0.111 175.000 0.190 1.000   NA
 5806029 5806030 LMHCC_0522 LMHCC_0523     TRUE 0.977 3.000 0.000 0.001   NA
 5806030 5806031 LMHCC_0523 LMHCC_0524   mraY FALSE 0.245 176.000 0.025 0.005   NA
 5806031 5806032 LMHCC_0524 LMHCC_0525 mraY   TRUE 0.856 4.000 0.000 NA   NA
 5806032 5806033 LMHCC_0525 LMHCC_0526   murD TRUE 0.595 24.000 0.000 NA   NA
 5806033 5806034 LMHCC_0526 LMHCC_0527 murD murG TRUE 0.991 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 5806034 5806035 LMHCC_0527 LMHCC_0528 murG   TRUE 0.937 23.000 0.072 NA Y NA
 5806035 5806036 LMHCC_0528 LMHCC_0529   ftsA FALSE 0.021 364.000 0.389 NA N NA
 5806036 5806037 LMHCC_0529 LMHCC_0530 ftsA ftsZ TRUE 0.849 67.000 0.460 1.000 Y NA
 5806037 5806038 LMHCC_0530 LMHCC_0531 ftsZ   FALSE 0.155 120.000 0.030 NA   NA
 5806038 5806039 LMHCC_0531 LMHCC_0532     TRUE 0.917 4.000 0.194 NA   NA
 5806039 5806040 LMHCC_0532 LMHCC_0533     TRUE 0.784 23.000 0.370 NA   NA
 5806040 5806041 LMHCC_0533 LMHCC_0534     FALSE 0.256 122.000 0.287 1.000   NA
 5806042 5806043 LMHCC_0535 LMHCC_0536 nadA nadC TRUE 0.997 -3.000 0.198 0.003 Y NA
 5806043 5806044 LMHCC_0536 LMHCC_0537 nadC nadB TRUE 0.997 -3.000 0.223 0.003 Y NA
 5806045 5806046 LMHCC_0538 LMHCC_0539     TRUE 0.933 5.000 0.243 1.000   NA
 5806046 5806047 LMHCC_0539 LMHCC_0540     FALSE 0.228 94.000 0.064 NA   NA
 5806047 5806048 LMHCC_0540 LMHCC_0541   ileS FALSE 0.015 283.000 0.012 NA N NA
 5806048 5806049 LMHCC_0541 LMHCC_0542 ileS dapF FALSE 0.160 112.000 0.010 1.000 N NA
 5806049 5806050 LMHCC_0542 LMHCC_0543 dapF   TRUE 0.796 14.000 0.011 1.000 N NA
 5806050 5806051 LMHCC_0543 LMHCC_0544     FALSE 0.017 289.000 0.000 1.000 N NA
 5806053 5806054 LMHCC_0546 LMHCC_0547     TRUE 0.946 4.000 0.421 1.000   NA
 5806054 5806055 LMHCC_0547 LMHCC_0548     TRUE 0.552 61.000 0.579 NA   NA
 5806055 5806056 LMHCC_0548 LMHCC_0549     TRUE 0.559 63.000 0.714 NA   NA
 5806056 5806057 LMHCC_0549 LMHCC_0550     TRUE 0.996 0.000 0.226 0.011 Y NA
 5806057 5806058 LMHCC_0550 LMHCC_0551     FALSE 0.186 113.000 0.065 1.000 N NA
 5806058 5806059 LMHCC_0551 LMHCC_0552     TRUE 0.981 19.000 0.154 0.037 Y NA
 5806059 5806060 LMHCC_0552 LMHCC_0553     TRUE 0.986 20.000 1.000 0.037 Y NA
 5806060 5806061 LMHCC_0553 LMHCC_0554   alsS FALSE 0.060 198.000 0.111 1.000 N NA
 5806061 5806062 LMHCC_0554 LMHCC_0555 alsS   FALSE 0.194 117.000 0.111 1.000 N NA
 5806062 5806063 LMHCC_0555 LMHCC_0556     FALSE 0.089 172.000 0.148 1.000 N NA
 5806063 5806064 LMHCC_0556 LMHCC_0557     TRUE 0.995 2.000 0.500 0.051 Y NA
 5806064 5806065 LMHCC_0557 LMHCC_0558     TRUE 0.807 20.000 0.257 1.000 N NA
 5806065 5806066 LMHCC_0558 LMHCC_0559     TRUE 0.981 23.000 0.800 0.043 Y NA
 5806066 5806067 LMHCC_0559 LMHCC_0560     TRUE 0.997 -19.000 0.448 0.043 Y NA
 5806067 5806068 LMHCC_0560 LMHCC_0561     TRUE 0.925 13.000 0.692 1.000   NA
 5806068 5806069 LMHCC_0561 LMHCC_0562     TRUE 0.929 23.000 0.300 0.006   NA
 5806069 5806070 LMHCC_0562 LMHCC_0563     TRUE 0.848 17.000 0.333 1.000 N NA
 5806070 5806071 LMHCC_0563 LMHCC_0564     FALSE 0.269 97.000 0.200 1.000 N NA
 5806071 5806072 LMHCC_0564 LMHCC_0565   deoC TRUE 0.402 63.000 0.077 1.000 N NA
 5806072 5806073 LMHCC_0565 LMHCC_0566 deoC   FALSE 0.268 80.000 0.038 1.000 N NA
 5806073 5806074 LMHCC_0566 LMHCC_0567     FALSE 0.140 131.000 0.044 1.000 N NA
 5806075 5806076 LMHCC_0568 LMHCC_0569 budA ilvA FALSE 0.058 193.000 0.056 1.000 N NA
 5806076 5806077 LMHCC_0569 LMHCC_0570 ilvA leuD TRUE 0.969 16.000 0.100 1.000 Y NA
 5806077 5806078 LMHCC_0570 LMHCC_0571 leuD leuC TRUE 0.998 -13.000 0.477 0.001 Y NA
 5806078 5806079 LMHCC_0571 LMHCC_0572 leuC leuB TRUE 0.996 2.000 0.080 0.002 Y NA
 5806079 5806080 LMHCC_0572 LMHCC_0573 leuB leuA TRUE 0.995 2.000 0.041 0.002 Y NA
 5806080 5806081 LMHCC_0573 LMHCC_0574 leuA ilvC TRUE 0.430 159.000 0.103 1.000 Y NA
 5806081 5806082 LMHCC_0574 LMHCC_0575 ilvC ilvN TRUE 0.863 99.000 0.130 0.002 Y NA
 5806082 5806083 LMHCC_0575 LMHCC_0576 ilvN ilvB TRUE 0.997 1.000 0.249 0.001 Y NA
 5806083 5806084 LMHCC_0576 LMHCC_0577 ilvB ilvD TRUE 0.987 18.000 0.089 0.002 Y NA
 5806085 5806086 LMHCC_0578 LMHCC_0579     TRUE 0.639 22.000 0.000 NA   NA
 5806086 5806087 LMHCC_0579 LMHCC_0581     TRUE 0.962 -27.000 0.312 NA   NA
 5806088 5806089 LMHCC_0580 LMHCC_0582     TRUE 0.606 32.000 0.106 NA   NA
 5806089 5806090 LMHCC_0582 LMHCC_0583   zwf FALSE 0.189 119.000 0.116 NA   NA
 5806091 5806092 LMHCC_0584 LMHCC_0585 rnz   TRUE 0.916 5.000 0.074 1.000   NA
 5806092 5806093 LMHCC_0585 LMHCC_0586     FALSE 0.224 109.000 0.040 1.000   NA
 5806094 5806095 LMHCC_0588 LMHCC_0589     TRUE 0.964 -22.000 0.373 NA   NA
 5806096 5806097 LMHCC_0590 LMHCC_0591     FALSE 0.007 664.000 0.000 NA   NA
 5806097 5806098 LMHCC_0591 LMHCC_0592     FALSE 0.007 651.000 0.000 NA   NA
 5806098 5806099 LMHCC_0592 LMHCC_0593     TRUE 0.939 -3.000 0.086 NA   NA
 5806099 5806100 LMHCC_0593 LMHCC_0594     TRUE 0.927 0.000 0.080 NA   NA
 5806101 5806102 LMHCC_0595 LMHCC_0596     TRUE 0.962 -10.000 0.333 1.000 N NA
 5806103 5806104 LMHCC_0597 LMHCC_0598     TRUE 0.757 102.000 0.750 1.000 Y NA
 5806104 5806105 LMHCC_0598 LMHCC_0599     TRUE 0.996 0.000 0.643 0.037 Y NA
 5806105 5806106 LMHCC_0599 LMHCC_0600     FALSE 0.180 242.000 0.000 1.000 Y NA
 5806106 5806107 LMHCC_0600 LMHCC_0601   xerD FALSE 0.088 155.000 0.029 1.000 N NA
 5806107 5806108 LMHCC_0601 LMHCC_0602 xerD deoB TRUE 0.581 29.000 0.024 1.000 N NA
 5806108 5806109 LMHCC_0602 LMHCC_0603 deoB   TRUE 0.859 19.000 0.609 1.000 N NA
 5806109 5806110 LMHCC_0603 LMHCC_0604   lysA FALSE 0.060 181.000 0.014 1.000 N NA
 5806110 5806111 LMHCC_0604 LMHCC_0605 lysA   TRUE 0.772 16.000 0.013 NA   NA
 5806111 5806112 LMHCC_0605 LMHCC_0606   scpB TRUE 0.963 -3.000 0.570 NA   NA
 5806112 5806113 LMHCC_0606 LMHCC_0607 scpB rluB TRUE 0.909 3.000 0.224 NA N NA
 5806113 5806114 LMHCC_0607 LMHCC_0608 rluB   FALSE 0.080 166.000 0.046 1.000 N NA
 5806114 5806115 LMHCC_0608 LMHCC_0609     TRUE 0.739 101.000 0.511 1.000 Y NA
 5806115 5806116 LMHCC_0609 LMHCC_0610     TRUE 0.788 16.000 0.157 NA N NA
 5806116 5806117 LMHCC_0610 LMHCC_0611     FALSE 0.009 440.000 0.000 NA   NA
 5806119 5806120 LMHCC_0613 LMHCC_0614     TRUE 0.944 -3.000 0.143 NA   NA
 5806120 5806121 LMHCC_0614 LMHCC_0615     FALSE 0.019 319.000 0.000 1.000   NA
 5806121 5806122 LMHCC_0615 LMHCC_0616     FALSE 0.292 81.000 0.014 1.000   NA
 5806122 5806123 LMHCC_0616 LMHCC_0617   cmk TRUE 0.781 16.000 0.021 1.000 N NA
 5806123 5806124 LMHCC_0617 LMHCC_0618 cmk   FALSE 0.016 358.000 0.047 1.000 N NA
 5806124 5806125 LMHCC_0618 LMHCC_0619     FALSE 0.134 144.000 0.032 1.000   NA
 5806125 5806126 LMHCC_0619 LMHCC_0620     TRUE 0.755 23.000 0.068 1.000   NA
 5806126 5806127 LMHCC_0620 LMHCC_0621     FALSE 0.204 103.000 0.042 1.000 N NA
 5806127 5806128 LMHCC_0621 LMHCC_0622     FALSE 0.010 413.000 0.000 1.000 N NA
 5806128 5806129 LMHCC_0622 LMHCC_0623   folE FALSE 0.044 235.000 0.154 1.000 N NA
 5806129 5806130 LMHCC_0623 LMHCC_0624 folE   TRUE 0.503 59.000 0.114 1.000   NA
 5806130 5806131 LMHCC_0624 LMHCC_0625   menG TRUE 0.850 23.000 0.708 1.000   NA
 5806131 5806132 LMHCC_0625 LMHCC_0626 menG hepT TRUE 0.985 11.000 0.476 1.000 Y NA
 5806132 5806133 LMHCC_0626 LMHCC_0627 hepT   TRUE 0.763 19.000 0.054 1.000 N NA
 5806133 5806134 LMHCC_0627 LMHCC_0628   aroC FALSE 0.040 204.000 0.002 1.000 N NA
 5806134 5806135 LMHCC_0628 LMHCC_0629 aroC aroB TRUE 0.995 3.000 0.110 0.002 Y NA
 5806135 5806136 LMHCC_0629 LMHCC_0630 aroB aroH TRUE 0.990 -3.000 0.041 1.000 Y NA
 5806136 5806137 LMHCC_0630 LMHCC_0631 aroH hisC TRUE 0.989 0.000 0.078 1.000 Y NA
 5806137 5806138 LMHCC_0631 LMHCC_0632 hisC   TRUE 0.952 22.000 0.098 1.000 Y NA
 5806138 5806139 LMHCC_0632 LMHCC_0633   aroA TRUE 0.971 14.000 0.069 1.000 Y NA
 5806139 5806140 LMHCC_0633 LMHCC_0634 aroA   TRUE 0.712 20.000 0.006 1.000 N NA
 5806140 5806141 LMHCC_0634 LMHCC_0635     TRUE 0.590 36.000 0.167 NA   NA
 5806141 5806142 LMHCC_0635 LMHCC_0636     FALSE 0.290 87.000 0.200 NA   NA
 5806142 5806143 LMHCC_0636 LMHCC_0637     FALSE 0.252 87.000 0.083 NA   NA
 5806143 5806144 LMHCC_0637 LMHCC_0638     FALSE 0.168 111.000 0.023 NA   NA
 5806145 5806146 LMHCC_0639 LMHCC_0640 pflB   FALSE 0.026 235.000 0.000 1.000 N NA
 5806146 5806147 LMHCC_0640 LMHCC_0641     TRUE 0.926 3.000 0.209 1.000 N NA
 5806147 5806148 LMHCC_0641 LMHCC_0643     FALSE 0.159 111.000 0.093 NA N NA
 5806148 5806149 LMHCC_0643 LMHCC_0644     TRUE 0.780 19.000 0.100 NA   NA
 5806149 5806150 LMHCC_0644 LMHCC_0645     TRUE 0.960 -3.000 0.225 1.000   NA
 5806150 5806151 LMHCC_0645 LMHCC_0646     TRUE 0.983 26.000 0.667 0.002 Y NA
 5806154 5806155 LMHCC_0649 LMHCC_0650   dapB TRUE 0.932 -3.000 0.044 NA   NA
 5806155 5806156 LMHCC_0650 LMHCC_0651 dapB mgsA TRUE 0.911 16.000 0.044 0.051 N NA
 5806156 5806157 LMHCC_0651 LMHCC_0652 mgsA   TRUE 0.798 15.000 0.029 1.000 N NA
 5806157 5806158 LMHCC_0652 LMHCC_0653     TRUE 0.952 -10.000 0.134 1.000 N NA
 5806158 5806159 LMHCC_0653 LMHCC_0654     FALSE 0.128 148.000 0.039 1.000   NA
 5806159 5806160 LMHCC_0654 LMHCC_0655   panB FALSE 0.089 167.000 0.012 1.000   NA
 5806160 5806161 LMHCC_0655 LMHCC_0656 panB panC TRUE 0.996 4.000 0.395 0.001 Y NA
 5806161 5806162 LMHCC_0656 LMHCC_0657 panC panD TRUE 0.988 4.000 0.342 1.000 Y NA
 5806162 5806163 LMHCC_0657 LMHCC_0658 panD   FALSE 0.220 97.000 0.053 1.000 N NA
 5806163 5806164 LMHCC_0658 LMHCC_0659     TRUE 0.631 45.000 0.296 1.000   NA
 5806164 5806165 LMHCC_0659 LMHCC_0660     TRUE 0.818 23.000 0.367 1.000   NA
 5806165 5806166 LMHCC_0660 LMHCC_0661   asnS TRUE 0.834 14.000 0.094 1.000 N NA
 5806166 5806167 LMHCC_0661 LMHCC_0662 asnS   FALSE 0.117 146.000 0.234 NA N NA
 5806167 5806168 LMHCC_0662 LMHCC_0663   nth TRUE 0.976 11.000 0.075 NA Y NA
 5806168 5806169 LMHCC_0663 LMHCC_0664 nth   TRUE 0.938 -7.000 0.034 NA   NA
 5806170 5806171 LMHCC_0665 LMHCC_0666   recU TRUE 0.642 32.000 0.062 1.000   NA
 5806172 5806173 LMHCC_0667 LMHCC_0668     TRUE 0.946 -3.000 0.165 NA   NA
 5806173 5806174 LMHCC_0668 LMHCC_0669     FALSE 0.232 132.000 0.579 NA   NA
 5806174 5806175 LMHCC_0669 LMHCC_0670     FALSE 0.008 581.000 0.000 NA   NA
 5806175 5806176 LMHCC_0670 LMHCC_0671     TRUE 0.727 20.000 0.020 1.000 N NA
 5806176 5806177 LMHCC_0671 LMHCC_0672   xpt FALSE 0.133 126.000 0.009 1.000 N NA
 5806177 5806178 LMHCC_0672 LMHCC_0673 xpt   TRUE 0.982 7.000 0.051 1.000 Y NA
 5806178 5806179 LMHCC_0673 LMHCC_0674     FALSE 0.081 192.000 0.270 1.000 N NA
 5806179 5806180 LMHCC_0674 LMHCC_0675     FALSE 0.145 123.000 0.020 1.000 N NA
 5806180 5806181 LMHCC_0675 LMHCC_0676     FALSE 0.270 78.000 0.020 1.000 N NA
 5806182 5806183 LMHCC_0677 LMHCC_0678 rnhA   FALSE 0.190 123.000 0.167 1.000 N NA
 5806184 5806185 LMHCC_0679 LMHCC_0680   fhs FALSE 0.098 157.000 0.083 1.000 N NA
 5806185 5806186 LMHCC_0680 LMHCC_0681 fhs   FALSE 0.189 120.000 0.022 1.000   NA
 5806186 5806187 LMHCC_0681 LMHCC_0682   thyA TRUE 0.863 13.000 0.036 1.000   NA
 5806187 5806188 LMHCC_0682 LMHCC_0683 thyA folA TRUE 0.853 16.000 0.295 1.000 N NA
 5806188 5806189 LMHCC_0683 LMHCC_0684 folA   TRUE 0.488 53.000 0.027 1.000   NA
 5806189 5806190 LMHCC_0684 LMHCC_0685     TRUE 0.410 69.000 0.082 1.000   NA
 5806190 5806191 LMHCC_0685 LMHCC_0686     FALSE 0.131 138.000 0.083 NA   NA
 5806191 5806192 LMHCC_0686 LMHCC_0687     FALSE 0.244 94.000 0.102 NA   NA
 5806192 5806193 LMHCC_0687 LMHCC_0688     TRUE 0.906 4.000 0.102 NA   NA
 5806194 5806195 LMHCC_0689 LMHCC_0690 ppdK   TRUE 0.766 19.000 0.065 NA   NA
 5806195 5806196 LMHCC_0690 LMHCC_0691     TRUE 0.865 13.000 0.179 NA   NA
 5806196 5806197 LMHCC_0691 LMHCC_0692     FALSE 0.198 123.000 0.064 1.000   NA
 5806198 5806199 LMHCC_0693 LMHCC_0694     TRUE 0.836 15.000 0.153 NA   NA
 5806199 5806200 LMHCC_0694 LMHCC_0695     TRUE 0.894 16.000 0.828 NA   NA
 5806200 5806201 LMHCC_0695 LMHCC_0696   msrA TRUE 0.593 36.000 0.172 NA   NA
 5806201 5806202 LMHCC_0696 LMHCC_0697 msrA msrB TRUE 0.995 7.000 0.262 0.001 Y NA
 5806202 5806203 LMHCC_0697 LMHCC_0698 msrB   FALSE 0.326 83.000 0.098 1.000   NA
 5806203 5806204 LMHCC_0698 LMHCC_0699     TRUE 0.410 63.000 0.098 NA   NA
 5806204 5806205 LMHCC_0699 LMHCC_0700   deoD TRUE 0.877 12.000 0.159 NA   NA
 5806205 5806206 LMHCC_0700 LMHCC_0701 deoD   TRUE 0.494 59.000 0.253 1.000 N NA
 5806206 5806207 LMHCC_0701 LMHCC_0702     FALSE 0.234 126.000 0.458 NA   NA
 5806207 5806208 LMHCC_0702 LMHCC_0703     TRUE 0.865 15.000 0.333 NA   NA
 5806208 5806209 LMHCC_0703 LMHCC_0704     TRUE 0.975 13.000 0.088 1.000 Y NA
 5806209 5806210 LMHCC_0704 LMHCC_0705     FALSE 0.118 154.000 0.175 1.000 N NA
 5806210 5806211 LMHCC_0705 LMHCC_0706     TRUE 0.610 37.000 0.240 1.000 N NA
 5806211 5806212 LMHCC_0706 LMHCC_0707     FALSE 0.109 159.000 0.174 1.000 N NA
 5806212 5806213 LMHCC_0707 LMHCC_0708     TRUE 0.986 4.000 0.174 1.000 Y NA
 5806213 5806214 LMHCC_0708 LMHCC_0709     TRUE 0.992 -3.000 0.173 1.000 Y NA
 5806214 5806215 LMHCC_0709 LMHCC_0710     FALSE 0.013 337.000 0.000 NA   NA
 5806217 5806218 LMHCC_0712 LMHCC_0713   lspA TRUE 0.524 82.000 0.087 0.083   NA
 5806218 5806219 LMHCC_0713 LMHCC_0714 lspA rluD TRUE 0.910 0.000 0.011 1.000 N NA
 5806221 5806222 LMHCC_0716 LMHCC_0717     TRUE 0.580 129.000 0.140 1.000 Y NA
 5806222 5806223 LMHCC_0717 LMHCC_0718   pyrB TRUE 0.709 85.000 0.064 1.000 Y NA
 5806223 5806224 LMHCC_0718 LMHCC_0719 pyrB   TRUE 0.994 -12.000 0.452 1.000 Y NA
 5806224 5806225 LMHCC_0719 LMHCC_0720   carA TRUE 0.992 -3.000 0.155 1.000 Y NA
 5806225 5806226 LMHCC_0720 LMHCC_0721 carA carB TRUE 0.997 -7.000 0.117 0.001 Y NA
 5806226 5806227 LMHCC_0721 LMHCC_0722 carB   TRUE 0.736 23.000 0.147 1.000 N NA
 5806227 5806228 LMHCC_0722 LMHCC_0723     TRUE 0.964 -3.000 0.592 1.000 N NA
 5806228 5806229 LMHCC_0723 LMHCC_0724   pyrF TRUE 0.997 -3.000 0.154 0.001 Y NA
 5806229 5806230 LMHCC_0724 LMHCC_0725 pyrF pyrE TRUE 0.991 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 5806231 5806232 LMHCC_0726 LMHCC_0727     FALSE 0.220 87.000 0.023 NA   NA
 5806233 5806234 LMHCC_0728 LMHCC_0729   gmk TRUE 0.849 16.000 0.276 NA   NA
 5806234 5806235 LMHCC_0729 LMHCC_0730 gmk rpoZ TRUE 0.953 0.000 0.471 1.000 N NA
 5806235 5806236 LMHCC_0730 LMHCC_0731 rpoZ coaBC FALSE 0.120 154.000 0.192 1.000 N NA
 5806236 5806237 LMHCC_0731 LMHCC_0733 coaBC   TRUE 0.901 5.000 0.099 1.000 N NA
 5806237 5806238 LMHCC_0733 LMHCC_0734   fmt TRUE 0.820 14.000 0.052 1.000 N NA
 5806238 5806239 LMHCC_0734 LMHCC_0735 fmt sun TRUE 0.990 1.000 0.305 1.000 Y NA
 5806239 5806240 LMHCC_0735 LMHCC_0736 sun   TRUE 0.731 22.000 0.074 1.000 N NA
 5806240 5806241 LMHCC_0736 LMHCC_0737     TRUE 0.994 -3.000 0.704 1.000 Y NA
 5806241 5806242 LMHCC_0737 LMHCC_0738   rsgA TRUE 0.838 19.000 0.196 1.000   NA
 5806242 5806243 LMHCC_0738 LMHCC_0739 rsgA rpe TRUE 0.940 3.000 0.213 1.000   NA
 5806243 5806244 LMHCC_0739 LMHCC_0740 rpe   TRUE 0.433 64.000 0.166 1.000 N NA
 5806246 5806247 LMHCC_0742 LMHCC_0743     TRUE 0.886 15.000 0.567 NA   NA
 5806247 5806248 LMHCC_0743 LMHCC_0744   sdaAB TRUE 0.631 31.000 0.029 1.000   NA
 5806248 5806249 LMHCC_0744 LMHCC_0745 sdaAB sdaAA TRUE 0.754 147.000 0.147 0.001 Y NA
 5806249 5806250 LMHCC_0745 LMHCC_0746 sdaAA recG TRUE 0.958 -7.000 0.265 1.000 N NA
 5806250 5806251 LMHCC_0746 LMHCC_0747 recG   FALSE 0.071 181.000 0.225 NA N NA
 5806251 5806252 LMHCC_0747 LMHCC_0748   plsX TRUE 0.661 21.000 0.035 NA N NA
 5806252 5806253 LMHCC_0748 LMHCC_0749 plsX fabD TRUE 0.997 -7.000 0.106 0.005 Y NA
 5806253 5806254 LMHCC_0749 LMHCC_0750 fabD fabG TRUE 0.994 4.000 0.149 0.005 Y NA
 5806254 5806255 LMHCC_0750 LMHCC_0751 fabG acpP TRUE 0.829 107.000 0.100 0.005 Y NA
 5806255 5806256 LMHCC_0751 LMHCC_0752 acpP   TRUE 0.527 33.000 0.011 NA   NA
 5806256 5806257 LMHCC_0752 LMHCC_0753   rnc TRUE 0.740 18.000 0.009 NA   NA
 5806257 5806258 LMHCC_0753 LMHCC_0754 rnc smc TRUE 0.730 23.000 0.120 1.000 N NA
 5806258 5806259 LMHCC_0754 LMHCC_0755 smc ftsY TRUE 0.945 15.000 0.165 0.011 N NA
 5806259 5806260 LMHCC_0755 LMHCC_0756 ftsY   FALSE 0.176 134.000 0.081 1.000   NA
 5806260 5806261 LMHCC_0756 LMHCC_0757   ffh TRUE 0.886 13.000 0.151 1.000   NA
 5806261 5806262 LMHCC_0757 LMHCC_0758 ffh   FALSE 0.100 142.000 0.006 1.000 N NA
 5806262 5806263 LMHCC_0758 LMHCC_0759     FALSE 0.012 426.000 0.000 1.000   NA
 5806263 5806264 LMHCC_0759 LMHCC_0760     TRUE 0.454 74.000 0.316 1.000   NA
 5806264 5806265 LMHCC_0760 LMHCC_0761   rpsP FALSE 0.224 103.000 0.009 1.000   NA
 5806265 5806266 LMHCC_0761 LMHCC_0762 rpsP   TRUE 0.878 17.000 0.385 1.000   NA
 5806266 5806267 LMHCC_0762 LMHCC_0763     FALSE 0.198 111.000 0.005 1.000   NA
 5806267 5806268 LMHCC_0763 LMHCC_0764     TRUE 0.592 28.000 0.024 NA   NA
 5806268 5806269 LMHCC_0764 LMHCC_0765   rimM TRUE 0.865 10.000 0.041 NA   NA
 5806269 5806270 LMHCC_0765 LMHCC_0766 rimM trmD TRUE 0.993 0.000 0.672 1.000 Y NA
 5806270 5806271 LMHCC_0766 LMHCC_0767 trmD   TRUE 0.716 20.000 0.012 NA   NA
 5806272 5806273 LMHCC_0768 LMHCC_0769     TRUE 0.951 -3.000 0.080 1.000   NA
 5806273 5806274 LMHCC_0769 LMHCC_0770     TRUE 0.944 0.000 0.102 1.000   NA
 5806275 5806276 LMHCC_0771 LMHCC_0772 rplS   FALSE 0.011 516.000 0.000 1.000   NA
 5806276 5806277 LMHCC_0772 LMHCC_0773     TRUE 0.731 16.000 0.000 NA   NA
 5806278 5806279 LMHCC_0774 LMHCC_0775     TRUE 0.831 8.000 0.000 NA   NA
 5806279 5806280 LMHCC_0775 LMHCC_0776     TRUE 0.595 24.000 0.000 NA   NA
 5806281 5806282 LMHCC_0777 LMHCC_0778 infC rpmI TRUE 0.966 22.000 0.652 1.000 Y NA
 5806282 5806283 LMHCC_0778 LMHCC_0779 rpmI rplT TRUE 0.966 40.000 0.928 0.019 Y NA
 5806285 5806286 LMHCC_0781 LMHCC_0782   pepT TRUE 0.477 58.000 0.200 NA   NA
 5806287 5806288 LMHCC_0783 LMHCC_0784     TRUE 0.570 50.000 0.367 NA   NA
 5806289 5806290 LMHCC_0785 LMHCC_R004   rrsB FALSE 0.012 345.000 0.000 NA   NA
 5806290 5806291 LMHCC_R004 LMHCC_R005 rrsB rrlB FALSE 0.022 254.000 0.000 NA   NA
 5806291 5806292 LMHCC_R005 LMHCC_R006 rrlB rrfB FALSE 0.207 80.000 0.000 NA   NA
 5806292 5806293 LMHCC_R006 LMHCC_0787 rrfB   FALSE 0.107 128.000 0.000 NA   NA
 5806293 5806294 LMHCC_0787 LMHCC_0789   purE FALSE 0.032 206.000 0.000 NA   NA
 5806294 5806295 LMHCC_0789 LMHCC_0790 purE purK TRUE 0.997 -7.000 0.011 0.001 Y NA
 5806295 5806296 LMHCC_0790 LMHCC_0791 purK purB TRUE 0.955 19.000 0.010 1.000 Y NA
 5806296 5806297 LMHCC_0791 LMHCC_0792 purB purC TRUE 0.731 81.000 0.072 1.000 Y NA
 5806297 5806298 LMHCC_0792 LMHCC_0793 purC purS TRUE 0.983 12.000 0.460 1.000 Y NA
 5806298 5806299 LMHCC_0793 LMHCC_0794 purS purQ TRUE 0.997 4.000 0.656 0.001 Y NA
 5806299 5806300 LMHCC_0794 LMHCC_0795 purQ purL TRUE 0.998 -7.000 0.346 0.001 Y NA
 5806300 5806301 LMHCC_0795 LMHCC_0796 purL purF TRUE 0.993 -15.000 0.223 1.000 Y NA
 5806301 5806302 LMHCC_0796 LMHCC_0797 purF purM TRUE 0.966 19.000 0.248 1.000 Y NA
 5806302 5806303 LMHCC_0797 LMHCC_0798 purM purN TRUE 0.997 -3.000 0.238 0.003 Y NA
 5806303 5806304 LMHCC_0798 LMHCC_0799 purN purH TRUE 0.986 6.000 0.225 1.000 Y NA
 5806304 5806305 LMHCC_0799 LMHCC_0800 purH purD TRUE 0.946 25.000 0.238 1.000 Y NA
 5806305 5806306 LMHCC_0800 LMHCC_0801 purD   FALSE 0.133 139.000 0.011 1.000   NA
 5806306 5806307 LMHCC_0801 LMHCC_0802     TRUE 0.824 14.000 0.068 NA   NA
 5806309 5806310 LMHCC_0804 LMHCC_0805   pcrA FALSE 0.344 65.000 0.017 NA   NA
 5806310 5806311 LMHCC_0805 LMHCC_0806 pcrA ligA TRUE 0.971 26.000 0.103 0.015 Y NA
 5806311 5806312 LMHCC_0806 LMHCC_0807 ligA   TRUE 0.923 -3.000 0.010 NA   NA
 5806312 5806313 LMHCC_0807 LMHCC_0808   gatC FALSE 0.136 124.000 0.013 NA   NA
 5806313 5806314 LMHCC_0808 LMHCC_0809 gatC   TRUE 0.986 24.000 0.643 0.001 Y NA
 5806314 5806315 LMHCC_0809 LMHCC_0810     TRUE 0.995 12.000 0.492 0.001 Y NA
 5806315 5806316 LMHCC_0810 LMHCC_0811     FALSE 0.106 146.000 0.034 1.000 N NA
 5806316 5806317 LMHCC_0811 LMHCC_0812     FALSE 0.122 148.000 0.132 NA   NA
 5806317 5806318 LMHCC_0812 LMHCC_0813   rumA TRUE 0.704 24.000 0.103 NA   NA
 5806318 5806319 LMHCC_0813 LMHCC_0814 rumA   FALSE 0.349 54.000 0.000 NA   NA
 5806319 5806320 LMHCC_0814 LMHCC_0815     FALSE 0.062 159.000 0.000 NA   NA
 5806322 5806323 LMHCC_0817 LMHCC_0818     FALSE 0.103 130.000 0.000 NA   NA
 5806323 5806324 LMHCC_0818 LMHCC_0819     TRUE 0.975 -10.000 0.667 1.000   NA
 5806324 5806325 LMHCC_0819 LMHCC_0820     TRUE 0.548 62.000 0.333 1.000   NA
 5806325 5806326 LMHCC_0820 LMHCC_0821     FALSE 0.365 69.000 0.104 1.000 N NA
 5806326 5806327 LMHCC_0821 LMHCC_0822     TRUE 0.757 21.000 0.104 NA   NA
 5806327 5806328 LMHCC_0822 LMHCC_0823   ade TRUE 0.779 17.000 0.045 NA   NA
 5806328 5806329 LMHCC_0823 LMHCC_0824 ade   TRUE 0.714 22.000 0.040 1.000 N NA
 5806329 5806330 LMHCC_0824 LMHCC_0825     FALSE 0.010 403.000 0.000 1.000 N NA
 5806330 5806331 LMHCC_0825 LMHCC_0826     TRUE 0.981 11.000 0.136 1.000 Y NA
 5806331 5806332 LMHCC_0826 LMHCC_0827     TRUE 0.988 2.000 0.131 1.000 Y NA
 5806332 5806333 LMHCC_0827 LMHCC_0828     FALSE 0.222 95.000 0.046 1.000 N NA
 5806333 5806334 LMHCC_0828 LMHCC_0830     TRUE 0.970 3.000 0.118 0.058   NA
 5806336 5806337 LMHCC_0831 LMHCC_0832     TRUE 0.991 15.000 0.222 0.001 Y NA
 5806338 5806339 LMHCC_0833 LMHCC_0834     TRUE 0.981 17.000 0.040 0.036 Y NA
 5806339 5806340 LMHCC_0834 LMHCC_0835     TRUE 0.937 60.000 0.660 0.036 Y NA
 5806341 5806342 LMHCC_0836 LMHCC_0837     TRUE 0.992 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 5806342 5806343 LMHCC_0837 LMHCC_0838     TRUE 0.563 48.000 0.293 1.000 N NA
 5806343 5806344 LMHCC_0838 LMHCC_0839     TRUE 0.528 60.000 0.205 1.000   NA
 5806344 5806345 LMHCC_0839 LMHCC_0840     FALSE 0.208 133.000 0.200 1.000   NA
 5806345 5806346 LMHCC_0840 LMHCC_0841     TRUE 0.526 135.000 0.052 1.000 Y NA
 5806346 5806347 LMHCC_0841 LMHCC_0842     FALSE 0.290 157.000 0.500 0.042 N NA
 5806347 5806348 LMHCC_0842 LMHCC_0843     TRUE 0.927 70.000 1.000 0.028 Y NA
 5806348 5806349 LMHCC_0843 LMHCC_0844     TRUE 0.868 22.000 0.800 1.000   NA
 5806349 5806350 LMHCC_0844 LMHCC_0845     FALSE 0.033 237.000 0.000 1.000   NA
 5806352 5806353 LMHCC_0847 LMHCC_0848     FALSE 0.285 81.000 0.096 NA   NA
 5806354 5806355 LMHCC_T006 LMHCC_0849     FALSE 0.105 129.000 0.000 NA   NA
 5806355 5806356 LMHCC_0849 LMHCC_0850     FALSE 0.030 218.000 0.000 1.000 N NA
 5806356 5806357 LMHCC_0850 LMHCC_0851     TRUE 0.706 104.000 0.323 1.000 Y NA
 5806357 5806358 LMHCC_0851 LMHCC_0852     FALSE 0.180 138.000 0.355 1.000 N NA
 5806359 5806360 LMHCC_0853 LMHCC_0854 map   FALSE 0.190 122.000 0.156 1.000 N NA
 5806364 5806365 LMHCC_0858 LMHCC_0860   rumA TRUE 0.398 65.000 0.090 1.000 N NA
 5806365 5806366 LMHCC_0860 LMHCC_0861 rumA   FALSE 0.118 121.000 0.000 NA   NA
 5806366 5806367 LMHCC_0861 LMHCC_0862     FALSE 0.020 266.000 0.000 NA   NA
 5806367 5806368 LMHCC_0862 LMHCC_0863     TRUE 0.738 29.000 0.579 NA   NA
 5806369 5806370 LMHCC_0864 LMHCC_0865     TRUE 0.723 28.000 0.400 NA   NA
 5806373 5806374 LMHCC_0868 LMHCC_0869     TRUE 0.637 27.000 0.059 NA   NA
 5806376 5806377 LMHCC_0871 LMHCC_0872     TRUE 0.898 2.000 0.015 NA   NA
 5806377 5806378 LMHCC_0872 LMHCC_0873     TRUE 0.834 12.000 0.013 NA   NA
 5806380 5806381 LMHCC_0875 LMHCC_0876 mutY   TRUE 0.881 4.000 0.010 1.000 N NA
 5806381 5806382 LMHCC_0876 LMHCC_0877     FALSE 0.079 155.000 0.088 NA N NA
 5806383 5806384 LMHCC_0878 LMHCC_0879     FALSE 0.215 106.000 0.102 NA   NA
 5806385 5806386 LMHCC_0880 LMHCC_0881     FALSE 0.269 89.000 0.146 1.000 N NA
 5806386 5806387 LMHCC_0881 LMHCC_R007   rrsC FALSE 0.008 463.000 0.000 NA   NA
 5806387 5806388 LMHCC_R007 LMHCC_R008 rrsC rrlC FALSE 0.022 254.000 0.000 NA   NA
 5806388 5806389 LMHCC_R008 LMHCC_R009 rrlC rrfC FALSE 0.207 80.000 0.000 NA   NA
 5806389 5806390 LMHCC_R009 LMHCC_T065 rrfC   TRUE 0.828 9.000 0.000 NA   NA
 5806390 5806391 LMHCC_T065 LMHCC_T058     TRUE 0.828 9.000 0.000 NA   NA
 5806391 5806392 LMHCC_T058 LMHCC_T040     TRUE 0.429 38.000 0.000 NA   NA
 5806392 5806393 LMHCC_T040 LMHCC_T035     TRUE 0.843 6.000 0.000 NA   NA
 5806393 5806394 LMHCC_T035 LMHCC_T024     TRUE 0.731 16.000 0.000 NA   NA
 5806394 5806395 LMHCC_T024 LMHCC_T036     TRUE 0.745 15.000 0.000 NA   NA
 5806395 5806396 LMHCC_T036 LMHCC_T007     TRUE 0.822 10.000 0.000 NA   NA
 5806396 5806397 LMHCC_T007 LMHCC_T049     TRUE 0.813 11.000 0.000 NA   NA
 5806397 5806398 LMHCC_T049 LMHCC_T002     TRUE 0.639 22.000 0.000 NA   NA
 5806398 5806399 LMHCC_T002 LMHCC_T044     FALSE 0.360 52.000 0.000 NA   NA
 5806399 5806400 LMHCC_T044 LMHCC_T045     TRUE 0.801 12.000 0.000 NA   NA
 5806400 5806401 LMHCC_T045 LMHCC_T052     TRUE 0.614 23.000 0.000 NA   NA
 5806401 5806402 LMHCC_T052 LMHCC_T046     TRUE 0.394 45.000 0.000 NA   NA
 5806402 5806403 LMHCC_T046 LMHCC_T015     TRUE 0.848 5.000 0.000 NA   NA
 5806403 5806404 LMHCC_T015 LMHCC_T048     TRUE 0.848 5.000 0.000 NA   NA
 5806404 5806405 LMHCC_T048 LMHCC_T029     TRUE 0.511 29.000 0.000 NA   NA
 5806405 5806406 LMHCC_T029 LMHCC_T025     TRUE 0.577 25.000 0.000 NA   NA
 5806406 5806407 LMHCC_T025 LMHCC_T031     TRUE 0.545 27.000 0.000 NA   NA
 5806407 5806408 LMHCC_T031 LMHCC_T011     TRUE 0.836 7.000 0.000 NA   NA
 5806408 5806409 LMHCC_T011 LMHCC_T053     TRUE 0.456 35.000 0.000 NA   NA
 5806409 5806410 LMHCC_T053 LMHCC_T021     TRUE 0.843 6.000 0.000 NA   NA
 5806410 5806411 LMHCC_T021 LMHCC_0884     FALSE 0.293 65.000 0.000 NA   NA
 5806411 5806412 LMHCC_0884 LMHCC_0885   metE FALSE 0.015 257.000 0.000 NA N NA
 5806412 5806413 LMHCC_0885 LMHCC_0886 metE   TRUE 0.946 22.000 0.017 1.000 Y NA
 5806413 5806414 LMHCC_0886 LMHCC_0887     TRUE 0.998 -7.000 0.600 0.001 Y NA
 5806414 5806415 LMHCC_0887 LMHCC_0888     TRUE 0.992 -3.000 0.162 1.000 Y NA
 5806417 5806418 LMHCC_0890 LMHCC_0891   menD TRUE 0.991 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 5806418 5806419 LMHCC_0891 LMHCC_0892 menD   TRUE 0.951 2.000 0.355 1.000   NA
 5806419 5806420 LMHCC_0892 LMHCC_0893   menB TRUE 0.962 -3.000 0.280 1.000   NA
 5806420 5806421 LMHCC_0893 LMHCC_0894 menB menE TRUE 0.953 16.000 0.193 0.002 N NA
 5806422 5806423 LMHCC_0895 LMHCC_0896     FALSE 0.086 150.000 0.007 NA   NA
 5806424 5806425 LMHCC_0897 LMHCC_0898 ytkD   TRUE 0.534 51.000 0.250 NA   NA
 5806425 5806426 LMHCC_0898 LMHCC_0899     TRUE 0.715 17.000 0.000 NA   NA
 5806428 5806429 LMHCC_0901 LMHCC_0902 metK asnB FALSE 0.142 137.000 0.108 1.000 N NA
 5806430 5806431 LMHCC_0903 LMHCC_0904     TRUE 0.966 -3.000 0.408 1.000   NA
 5806432 5806433 LMHCC_0905 LMHCC_0906 leuS   FALSE 0.170 105.000 0.002 NA   NA
 5806433 5806434 LMHCC_0906 LMHCC_0907   rpsB FALSE 0.034 202.000 0.000 NA   NA
 5806434 5806435 LMHCC_0907 LMHCC_0908 rpsB tsf TRUE 0.815 80.000 0.748 1.000 Y NA
 5806435 5806436 LMHCC_0908 LMHCC_0909 tsf   FALSE 0.168 92.000 0.000 NA   NA
 5806436 5806437 LMHCC_0909 LMHCC_0910     FALSE 0.008 532.000 0.000 NA   NA
 5806437 5806438 LMHCC_0910 LMHCC_0911     TRUE 0.885 16.000 0.667 NA   NA
 5806438 5806439 LMHCC_0911 LMHCC_0912     FALSE 0.010 406.000 0.000 NA   NA
 5806439 5806440 LMHCC_0912 LMHCC_0913     TRUE 0.998 -16.000 0.911 0.010 Y NA
 5806440 5806441 LMHCC_0913 LMHCC_0914     FALSE 0.228 81.000 0.083 NA N NA
 5806441 5806442 LMHCC_0914 LMHCC_0915     FALSE 0.130 174.000 0.600 NA   NA
 5806444 5806445 LMHCC_0917 LMHCC_0918     TRUE 0.993 -3.000 0.669 NA Y NA
 5806445 5806446 LMHCC_0918 LMHCC_0919     TRUE 0.664 84.000 0.023 NA Y NA
 5806446 5806447 LMHCC_0919 LMHCC_0920     TRUE 0.929 0.000 0.094 NA   NA
 5806447 5806448 LMHCC_0920 LMHCC_0921     TRUE 0.821 24.000 0.833 NA   NA
 5806448 5806449 LMHCC_0921 LMHCC_0922   acnA FALSE 0.058 156.000 0.008 NA N NA
 5806449 5806450 LMHCC_0922 LMHCC_0923 acnA   FALSE 0.012 346.000 0.000 1.000 N NA
 5806450 5806451 LMHCC_0923 LMHCC_0924     TRUE 0.903 -3.000 0.019 NA N NA
 5806452 5806453 LMHCC_0925 LMHCC_0926     TRUE 0.964 -3.000 0.579 NA   NA
 5806453 5806454 LMHCC_0926 LMHCC_0927     TRUE 0.401 82.000 0.625 NA   NA
 5806454 5806455 LMHCC_0927 LMHCC_0928     FALSE 0.279 123.000 0.750 NA   NA
 5806456 5806457 LMHCC_0929 LMHCC_0930 trpE pabA TRUE 0.998 -3.000 0.321 0.001 Y NA
 5806457 5806458 LMHCC_0930 LMHCC_0931 pabA trpD TRUE 0.992 -28.000 0.018 1.000 Y NA
 5806458 5806459 LMHCC_0931 LMHCC_0932 trpD trpC TRUE 0.992 -3.000 0.216 1.000 Y NA
 5806459 5806460 LMHCC_0932 LMHCC_0933 trpC trpF TRUE 0.997 -3.000 0.264 0.002 Y NA
 5806460 5806461 LMHCC_0933 LMHCC_0934 trpF trpB TRUE 0.996 3.000 0.375 0.002 Y NA
 5806461 5806462 LMHCC_0934 LMHCC_0935 trpB trpA TRUE 0.998 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 5806462 5806463 LMHCC_0935 LMHCC_0936 trpA   FALSE 0.300 71.000 0.024 NA   NA
 5806463 5806464 LMHCC_0936 LMHCC_0937     TRUE 0.402 85.000 0.750 NA   NA
 5806464 5806465 LMHCC_0937 LMHCC_0939     TRUE 0.690 110.000 0.900 0.001   NA
 5806465 5806466 LMHCC_0939 LMHCC_0940     TRUE 0.946 10.000 0.833 1.000   NA
 5806468 5806469 LMHCC_0942 LMHCC_0943     FALSE 0.374 75.000 0.224 1.000 N NA
 5806469 5806470 LMHCC_0943 LMHCC_0944   dat TRUE 0.677 113.000 0.347 1.000 Y NA
 5806470 5806471 LMHCC_0944 LMHCC_0945 dat   FALSE 0.029 223.000 0.000 1.000 N NA
 5806471 5806472 LMHCC_0945 LMHCC_0946     TRUE 0.933 3.000 0.297 1.000 N NA
 5806472 5806473 LMHCC_0946 LMHCC_0947     FALSE 0.022 212.000 0.000 NA N NA
 5806473 5806474 LMHCC_0947 LMHCC_0948   trmB TRUE 0.899 7.000 0.154 NA   NA
 5806474 5806475 LMHCC_0948 LMHCC_0949 trmB   TRUE 0.493 61.000 0.117 1.000   NA
 5806475 5806476 LMHCC_0949 LMHCC_0950     FALSE 0.141 134.000 0.074 NA   NA
 5806478 5806479 LMHCC_0952 LMHCC_0953     TRUE 0.580 41.000 0.224 NA   NA
 5806479 5806480 LMHCC_0953 LMHCC_0954     FALSE 0.204 114.000 0.140 NA   NA
 5806480 5806481 LMHCC_0954 LMHCC_0955     TRUE 0.680 35.000 0.500 NA   NA
 5806481 5806482 LMHCC_0955 LMHCC_0956     TRUE 0.932 6.000 0.511 NA   NA
 5806482 5806483 LMHCC_0956 LMHCC_0957     FALSE 0.031 310.000 0.143 1.000   NA
 5806483 5806484 LMHCC_0957 LMHCC_0958   murC FALSE 0.075 295.000 0.017 0.005 N NA
 5806484 5806485 LMHCC_0958 LMHCC_0959 murC   FALSE 0.097 145.000 0.010 1.000 N NA
 5806487 5806488 LMHCC_0961 LMHCC_0962     TRUE 0.762 22.000 0.175 NA   NA
 5806488 5806489 LMHCC_0962 LMHCC_0963   aroF FALSE 0.029 220.000 0.000 NA   NA
 5806489 5806490 LMHCC_0963 LMHCC_0964 aroF ccpA FALSE 0.032 235.000 0.017 1.000 N NA
 5806490 5806491 LMHCC_0964 LMHCC_0965 ccpA tyrS FALSE 0.013 324.000 0.000 1.000 N NA
 5806492 5806493 LMHCC_0966 LMHCC_0967 rpsD   FALSE 0.027 212.000 0.005 NA N NA
 5806494 5806495 LMHCC_0968 LMHCC_0969 ezrA   FALSE 0.195 124.000 0.201 1.000 N NA
 5806495 5806496 LMHCC_0969 LMHCC_0970   thiI TRUE 0.940 2.000 0.349 1.000 N NA
 5806496 5806497 LMHCC_0970 LMHCC_0971 thiI argC FALSE 0.161 173.000 0.013 0.049 N NA
 5806497 5806498 LMHCC_0971 LMHCC_0972 argC argJ TRUE 0.991 16.000 0.303 0.002 Y NA
 5806498 5806499 LMHCC_0972 LMHCC_0973 argJ argB TRUE 0.991 13.000 0.067 0.002 Y NA
 5806499 5806500 LMHCC_0973 LMHCC_0974 argB   TRUE 0.993 -3.000 0.322 1.000 Y NA
 5806500 5806501 LMHCC_0974 LMHCC_0975   argF TRUE 0.990 -3.000 0.037 1.000 Y NA
 5806503 5806504 LMHCC_0977 LMHCC_0978     TRUE 0.762 20.000 0.087 NA   NA
 5806504 5806505 LMHCC_0978 LMHCC_0979     FALSE 0.388 61.000 0.040 NA   NA
 5806506 5806507 LMHCC_0980 LMHCC_0981     FALSE 0.257 133.000 0.500 1.000   NA
 5806507 5806508 LMHCC_0981 LMHCC_0982     TRUE 0.715 17.000 0.000 NA   NA
 5806509 5806510 LMHCC_0983 LMHCC_0984     TRUE 0.960 -3.000 0.231 1.000   NA
 5806510 5806511 LMHCC_0984 LMHCC_0985     TRUE 0.805 18.000 0.154 NA   NA
 5806511 5806512 LMHCC_0985 LMHCC_0986     FALSE 0.007 1212.000 0.000 NA   NA
 5806512 5806513 LMHCC_0986 LMHCC_0987   ackA TRUE 0.941 0.000 0.217 1.000 N NA
 5806517 5806518 LMHCC_0991 LMHCC_0992     TRUE 0.633 26.000 0.000 1.000   NA
 5806518 5806519 LMHCC_0992 LMHCC_0993     TRUE 0.723 21.000 0.000 1.000   NA
 5806519 5806520 LMHCC_0993 LMHCC_0994     FALSE 0.239 119.000 0.159 1.000   NA
 5806520 5806521 LMHCC_0994 LMHCC_0995   accD FALSE 0.093 218.000 0.003 0.047 N NA
 5806521 5806522 LMHCC_0995 LMHCC_0996 accD accA TRUE 0.998 -10.000 0.234 0.001 Y NA
 5806524 5806525 LMHCC_0998 LMHCC_0999 pfkA pyk FALSE 0.360 283.000 0.261 0.006 Y NA
 5806525 5806526 LMHCC_0999 LMHCC_1000 pyk   FALSE 0.215 120.000 0.082 1.000   NA
 5806526 5806527 LMHCC_1000 LMHCC_1001     FALSE 0.088 157.000 0.043 NA   NA
 5806527 5806528 LMHCC_1001 LMHCC_1002     TRUE 0.519 37.000 0.039 NA   NA
 5806528 5806529 LMHCC_1002 LMHCC_1003   icd TRUE 0.960 20.000 0.140 1.000 Y NA
 5806529 5806530 LMHCC_1003 LMHCC_1004 icd polA FALSE 0.070 165.000 0.008 1.000 N NA
 5806530 5806531 LMHCC_1004 LMHCC_1005 polA mutM TRUE 0.943 24.000 0.101 1.000 Y NA
 5806531 5806532 LMHCC_1005 LMHCC_1006 mutM coaE TRUE 0.791 17.000 0.066 1.000 N NA
 5806532 5806533 LMHCC_1006 LMHCC_1007 coaE nrdR FALSE 0.210 79.000 0.024 NA N NA
 5806533 5806534 LMHCC_1007 LMHCC_1008 nrdR   TRUE 0.871 6.000 0.109 NA N NA
 5806534 5806535 LMHCC_1008 LMHCC_1009     TRUE 0.986 10.000 0.817 NA Y NA
 5806535 5806536 LMHCC_1009 LMHCC_1010   thrS FALSE 0.012 351.000 0.000 1.000 N NA
 5806536 5806537 LMHCC_1010 LMHCC_1011 thrS   FALSE 0.208 108.000 0.010 1.000   NA
 5806537 5806538 LMHCC_1011 LMHCC_1012   hemA FALSE 0.168 128.000 0.020 1.000   NA
 5806538 5806539 LMHCC_1012 LMHCC_1013 hemA hemC TRUE 0.994 4.000 0.016 0.003 Y NA
 5806539 5806540 LMHCC_1013 LMHCC_1014 hemC hemD TRUE 0.996 -3.000 0.020 0.003 Y NA
 5806540 5806541 LMHCC_1014 LMHCC_1015 hemD hemB TRUE 0.996 -3.000 0.042 0.003 Y NA
 5806541 5806542 LMHCC_1015 LMHCC_1016 hemB hemL TRUE 0.991 13.000 0.126 0.003 Y NA
 5806542 5806543 LMHCC_1016 LMHCC_1017 hemL valS FALSE 0.014 320.000 0.000 1.000 N NA
 5806543 5806544 LMHCC_1017 LMHCC_1018 valS   FALSE 0.380 63.000 0.041 1.000 N NA
 5806544 5806545 LMHCC_1018 LMHCC_1019     FALSE 0.040 210.000 0.016 1.000 N NA
 5806545 5806546 LMHCC_1019 LMHCC_1020     TRUE 0.839 12.000 0.019 1.000 N NA
 5806546 5806547 LMHCC_1020 LMHCC_1021     FALSE 0.009 451.000 0.000 1.000 N NA
 5806547 5806548 LMHCC_1021 LMHCC_1022   mreC TRUE 0.391 86.000 0.689 1.000 N NA
 5806548 5806549 LMHCC_1022 LMHCC_1023 mreC mreD TRUE 0.996 3.000 0.550 0.004 Y NA
 5806549 5806550 LMHCC_1023 LMHCC_1024 mreD minC FALSE 0.078 179.000 0.106 1.000 N NA
 5806550 5806551 LMHCC_1024 LMHCC_1025 minC minD TRUE 0.989 3.000 0.368 1.000 Y NA
 5806551 5806552 LMHCC_1025 LMHCC_1026 minD   TRUE 0.451 53.000 0.060 1.000 N NA
 5806552 5806553 LMHCC_1026 LMHCC_1027   rplU TRUE 0.593 157.000 0.011 0.023 Y NA
 5806553 5806554 LMHCC_1027 LMHCC_1028 rplU   TRUE 0.959 19.000 0.208 NA Y NA
 5806554 5806555 LMHCC_1028 LMHCC_1029   rpmA TRUE 0.971 14.000 0.203 NA Y NA
 5806555 5806556 LMHCC_1029 LMHCC_1030 rpmA   FALSE 0.011 364.000 0.000 1.000 N NA
 5806556 5806557 LMHCC_1030 LMHCC_1031   glpK FALSE 0.342 75.000 0.131 1.000 N NA
 5806557 5806558 LMHCC_1031 LMHCC_1032 glpK   FALSE 0.097 159.000 0.010 1.000   NA
 5806558 5806559 LMHCC_1032 LMHCC_1033     FALSE 0.382 67.000 0.012 1.000   NA
 5806559 5806560 LMHCC_1033 LMHCC_1034     FALSE 0.166 110.000 0.016 NA   NA
 5806560 5806561 LMHCC_1034 LMHCC_1035     FALSE 0.301 69.000 0.012 NA   NA
 5806561 5806562 LMHCC_1035 LMHCC_1036   ruvA FALSE 0.136 124.000 0.010 1.000 N NA
 5806562 5806563 LMHCC_1036 LMHCC_1037 ruvA ruvB TRUE 0.992 16.000 0.549 0.002 Y NA
 5806563 5806564 LMHCC_1037 LMHCC_1038 ruvB queA TRUE 0.901 4.000 0.069 1.000 N NA
 5806564 5806565 LMHCC_1038 LMHCC_1039 queA tgt TRUE 0.903 87.000 0.360 0.001 Y NA
 5806565 5806566 LMHCC_1039 LMHCC_1040 tgt yajC TRUE 0.602 34.000 0.325 NA N NA
 5806566 5806567 LMHCC_1040 LMHCC_1041 yajC   FALSE 0.100 143.000 0.013 NA   NA
 5806567 5806568 LMHCC_1041 LMHCC_1042     FALSE 0.254 101.000 0.185 NA   NA
 5806568 5806569 LMHCC_1042 LMHCC_1043     FALSE 0.218 96.000 0.048 NA   NA
 5806569 5806570 LMHCC_1043 LMHCC_1044     FALSE 0.185 105.000 0.026 NA   NA
 5806570 5806571 LMHCC_1044 LMHCC_1045   apt TRUE 0.951 -10.000 0.128 1.000 N NA
 5806571 5806572 LMHCC_1045 LMHCC_1046 apt   FALSE 0.049 206.000 0.068 1.000 N NA
 5806572 5806573 LMHCC_1046 LMHCC_1047   dtd TRUE 0.834 16.000 0.177 1.000 N NA
 5806575 5806576 LMHCC_1049 LMHCC_1050 hisS aspS TRUE 0.993 3.000 0.161 0.049 Y NA
 5806577 5806578 LMHCC_1051 LMHCC_1052     FALSE 0.156 150.000 0.407 NA   NA
 5806578 5806579 LMHCC_1052 LMHCC_1053   amt TRUE 0.865 14.000 0.259 1.000 N NA
 5806579 5806580 LMHCC_1053 LMHCC_1054 amt   FALSE 0.017 245.000 0.000 NA N NA
 5806581 5806582 LMHCC_1055 LMHCC_1056     FALSE 0.011 382.000 0.000 1.000 N NA
 5806582 5806583 LMHCC_1056 LMHCC_1057   trmU TRUE 0.772 19.000 0.072 1.000 N NA
 5806583 5806584 LMHCC_1057 LMHCC_1058 trmU   FALSE 0.125 118.000 0.000 NA   NA
 5806584 5806585 LMHCC_1058 LMHCC_1059     TRUE 0.813 11.000 0.000 NA   NA
 5806585 5806586 LMHCC_1059 LMHCC_1060     TRUE 0.672 28.000 0.174 1.000 N NA
 5806587 5806588 LMHCC_1061 LMHCC_1062     TRUE 0.988 6.000 0.586 1.000 Y NA
 5806589 5806590 LMHCC_1063 LMHCC_1064     TRUE 0.987 9.000 0.565 1.000 Y NA
 5806590 5806591 LMHCC_1064 LMHCC_1065   alaS FALSE 0.015 307.000 0.000 1.000 N NA
 5806591 5806592 LMHCC_1065 LMHCC_1066 alaS   FALSE 0.250 92.000 0.110 NA   NA
 5806592 5806593 LMHCC_1066 LMHCC_1067     TRUE 0.933 6.000 0.537 NA   NA
 5806593 5806594 LMHCC_1067 LMHCC_1068     TRUE 0.884 16.000 0.651 NA   NA
 5806596 5806597 LMHCC_1070 LMHCC_1071     FALSE 0.339 76.000 0.154 NA   NA
 5806597 5806598 LMHCC_1071 LMHCC_1073   udk TRUE 0.947 -3.000 0.039 1.000   NA
 5806600 5806601 LMHCC_1074 LMHCC_1075     TRUE 0.460 51.000 0.065 NA   NA
 5806601 5806602 LMHCC_1075 LMHCC_1076   mtnN TRUE 0.449 50.000 0.041 NA   NA
 5806604 5806605 LMHCC_1078 LMHCC_1079 yqeG   TRUE 0.969 -3.000 0.555 1.000   NA
 5806605 5806606 LMHCC_1079 LMHCC_1080   aroE TRUE 0.848 20.000 0.336 1.000   NA
 5806606 5806607 LMHCC_1080 LMHCC_1081 aroE   TRUE 0.908 0.000 0.089 NA N NA
 5806607 5806608 LMHCC_1081 LMHCC_1082   nadD TRUE 0.761 18.000 0.150 NA N NA
 5806608 5806609 LMHCC_1082 LMHCC_1083 nadD   TRUE 0.993 -13.000 0.199 1.000 Y NA
 5806609 5806610 LMHCC_1083 LMHCC_1084     TRUE 0.907 5.000 0.149 NA   NA
 5806610 5806611 LMHCC_1084 LMHCC_1085     TRUE 0.451 55.000 0.085 NA   NA
 5806611 5806612 LMHCC_1085 LMHCC_1086     FALSE 0.237 104.000 0.033 1.000   NA
 5806612 5806613 LMHCC_1086 LMHCC_1087     FALSE 0.113 150.000 0.095 1.000 N NA
 5806613 5806614 LMHCC_1087 LMHCC_1088     FALSE 0.262 98.000 0.055 1.000   NA
 5806614 5806615 LMHCC_1088 LMHCC_1089   holA TRUE 0.451 68.000 0.163 1.000   NA
 5806619 5806620 LMHCC_1093 LMHCC_1094     FALSE 0.240 89.000 0.063 1.000 N NA
 5806620 5806621 LMHCC_1094 LMHCC_1095   hrcA FALSE 0.117 147.000 0.082 1.000 N NA
 5806621 5806622 LMHCC_1095 LMHCC_1096 hrcA grpE TRUE 0.593 42.000 0.286 1.000 N NA
 5806622 5806623 LMHCC_1096 LMHCC_1097 grpE dnaK TRUE 0.965 34.000 0.224 0.006 Y NA
 5806623 5806624 LMHCC_1097 LMHCC_1098 dnaK dnaJ TRUE 0.751 143.000 0.196 0.003 Y NA
 5806624 5806625 LMHCC_1098 LMHCC_1099 dnaJ prmA FALSE 0.353 73.000 0.133 1.000 N NA
 5806625 5806626 LMHCC_1099 LMHCC_1100 prmA   TRUE 0.936 1.000 0.227 NA   NA
 5806626 5806627 LMHCC_1100 LMHCC_1101   rpsU FALSE 0.046 198.000 0.019 NA   NA
 5806627 5806628 LMHCC_1101 LMHCC_1102 rpsU   TRUE 0.921 20.000 0.150 0.028   NA
 5806628 5806629 LMHCC_1102 LMHCC_1103     FALSE 0.072 188.000 0.027 1.000   NA
 5806629 5806630 LMHCC_1103 LMHCC_1104     TRUE 0.861 16.000 0.172 1.000   NA
 5806630 5806631 LMHCC_1104 LMHCC_1105     TRUE 0.821 17.000 0.182 NA   NA
 5806631 5806632 LMHCC_1105 LMHCC_1106     TRUE 0.951 -16.000 0.123 NA   NA
 5806632 5806633 LMHCC_1106 LMHCC_1107   cdd TRUE 0.686 25.000 0.090 1.000 N NA
 5806633 5806634 LMHCC_1107 LMHCC_1108 cdd era TRUE 0.943 -3.000 0.019 1.000   NA
 5806636 5806637 LMHCC_1110 LMHCC_1111 recO glyQ FALSE 0.024 281.000 0.036 1.000 N NA
 5806637 5806638 LMHCC_1111 LMHCC_1112 glyQ glyS TRUE 0.998 -7.000 0.651 0.001 Y NA
 5806638 5806639 LMHCC_1112 LMHCC_1113 glyS   TRUE 0.510 35.000 0.013 NA   NA
 5806639 5806640 LMHCC_1113 LMHCC_1114     FALSE 0.055 191.000 0.029 NA   NA
 5806640 5806641 LMHCC_1114 LMHCC_1115     TRUE 0.734 20.000 0.033 NA   NA
 5806641 5806642 LMHCC_1115 LMHCC_1116     FALSE 0.276 95.000 0.209 1.000 N NA
 5806642 5806643 LMHCC_1116 LMHCC_1117     TRUE 0.420 68.000 0.239 NA   NA
 5806643 5806644 LMHCC_1117 LMHCC_1118     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5806644 5806645 LMHCC_1118 LMHCC_1119     FALSE 0.049 178.000 0.000 NA   NA
 5806645 5806646 LMHCC_1119 LMHCC_1120     TRUE 0.885 43.000 0.104 1.000 Y NA
 5806646 5806647 LMHCC_1120 LMHCC_1121     TRUE 0.765 17.000 0.019 1.000 N NA
 5806647 5806648 LMHCC_1121 LMHCC_1122     FALSE 0.102 143.000 0.013 1.000 N NA
 5806648 5806649 LMHCC_1122 LMHCC_1123     TRUE 0.993 -25.000 0.130 1.000 Y NA
 5806649 5806650 LMHCC_1123 LMHCC_1124     TRUE 0.994 -19.000 0.480 1.000 Y NA
 5806650 5806651 LMHCC_1124 LMHCC_1125     FALSE 0.137 138.000 0.102 1.000 N NA
 5806652 5806653 LMHCC_1126 LMHCC_1127     TRUE 0.962 -9.000 0.338 NA   NA
 5806653 5806654 LMHCC_1127 LMHCC_1128     FALSE 0.021 298.000 0.033 NA   NA
 5806655 5806656 LMHCC_1129 LMHCC_1130     FALSE 0.173 130.000 0.169 1.000 N NA
 5806656 5806657 LMHCC_1130 LMHCC_1131   asd FALSE 0.061 198.000 0.136 1.000 N NA
 5806657 5806658 LMHCC_1131 LMHCC_1132 asd   TRUE 0.978 12.000 0.091 1.000 Y NA
 5806658 5806659 LMHCC_1132 LMHCC_1133   dapA TRUE 0.963 15.000 0.000 1.000 Y NA
 5806659 5806660 LMHCC_1133 LMHCC_1134 dapA   TRUE 0.735 20.000 0.000 1.000   NA
 5806660 5806661 LMHCC_1134 LMHCC_1135     FALSE 0.322 89.000 0.167 1.000   NA
 5806661 5806662 LMHCC_1135 LMHCC_1136     TRUE 0.626 53.000 0.786 NA   NA
 5806664 5806665 LMHCC_1138 LMHCC_1139     FALSE 0.024 248.000 0.000 NA   NA
 5806665 5806666 LMHCC_1139 LMHCC_1140     FALSE 0.016 293.000 0.000 NA   NA
 5806666 5806667 LMHCC_1140 LMHCC_1141     TRUE 0.994 4.000 0.727 0.078 Y NA
 5806667 5806668 LMHCC_1141 LMHCC_1142     TRUE 0.981 2.000 0.909 0.034 N NA
 5806668 5806669 LMHCC_1142 LMHCC_1143     TRUE 0.957 15.000 0.909 0.034 N NA
 5806669 5806670 LMHCC_1143 LMHCC_1144     TRUE 0.501 113.000 0.636 0.034 N NA
 5806670 5806671 LMHCC_1144 LMHCC_1145     FALSE 0.219 138.000 0.700 NA   NA
 5806672 5806673 LMHCC_1146 LMHCC_1147     TRUE 0.978 -3.000 0.218 0.078 N NA
 5806674 5806675 LMHCC_1148 LMHCC_1149 murB   TRUE 0.764 17.000 0.021 NA   NA
 5806675 5806676 LMHCC_1149 LMHCC_1150     TRUE 0.408 66.000 0.152 NA   NA
 5806676 5806677 LMHCC_1150 LMHCC_1151     TRUE 0.767 19.000 0.068 NA   NA
 5806677 5806678 LMHCC_1151 LMHCC_1152     FALSE 0.311 70.000 0.029 NA   NA
 5806680 5806681 LMHCC_1154 LMHCC_1155     FALSE 0.091 186.000 0.140 1.000   NA
 5806681 5806682 LMHCC_1155 LMHCC_1156     FALSE 0.021 258.000 0.000 NA   NA
 5806683 5806684 LMHCC_1157 LMHCC_1158     TRUE 0.585 40.000 0.214 1.000 N NA
 5806684 5806685 LMHCC_1158 LMHCC_1159     TRUE 0.816 16.000 0.107 NA   NA
 5806685 5806686 LMHCC_1159 LMHCC_1160     FALSE 0.117 136.000 0.024 NA   NA
 5806688 5806689 LMHCC_1162 LMHCC_1163 pflA pflB FALSE 0.332 77.000 0.135 1.000 N NA
 5806689 5806690 LMHCC_1163 LMHCC_1164 pflB   FALSE 0.009 422.000 0.000 1.000 N NA
 5806690 5806691 LMHCC_1164 LMHCC_1165     TRUE 0.765 17.000 0.020 1.000 N NA
 5806691 5806692 LMHCC_1165 LMHCC_1166   mutS TRUE 0.984 23.000 0.220 0.001 Y NA
 5806692 5806693 LMHCC_1166 LMHCC_1167 mutS   FALSE 0.175 110.000 0.031 NA   NA
 5806693 5806694 LMHCC_1167 LMHCC_1168     TRUE 0.771 17.000 0.031 NA   NA
 5806694 5806695 LMHCC_1168 LMHCC_1169     TRUE 0.880 5.000 0.026 NA   NA
 5806695 5806696 LMHCC_1169 LMHCC_1170     FALSE 0.199 114.000 0.016 1.000   NA
 5806696 5806697 LMHCC_1170 LMHCC_1171   recA FALSE 0.025 301.000 0.018 1.000   NA
 5806697 5806698 LMHCC_1171 LMHCC_1172 recA   FALSE 0.036 273.000 0.083 1.000   NA
 5806698 5806699 LMHCC_1172 LMHCC_1173   pgsA FALSE 0.015 784.000 0.151 1.000   NA
 5806699 5806700 LMHCC_1173 LMHCC_1174 pgsA   FALSE 0.288 91.000 0.077 1.000   NA
 5806700 5806701 LMHCC_1174 LMHCC_1175     TRUE 0.579 51.000 0.213 1.000   NA
 5806701 5806702 LMHCC_1175 LMHCC_1176     FALSE 0.368 92.000 0.397 1.000   NA
 5806702 5806703 LMHCC_1176 LMHCC_1177     TRUE 0.992 -19.000 0.872 0.006   NA
 5806703 5806704 LMHCC_1177 LMHCC_1178     FALSE 0.220 118.000 0.077 1.000   NA
 5806704 5806705 LMHCC_1178 LMHCC_1179     TRUE 0.988 -3.000 0.720 0.034   NA
 5806705 5806706 LMHCC_1179 LMHCC_1180     TRUE 0.971 -7.000 0.438 1.000   NA
 5806706 5806707 LMHCC_1180 LMHCC_1181     FALSE 0.019 386.000 0.048 1.000   NA
 5806709 5806710 LMHCC_1183 LMHCC_1184     FALSE 0.097 151.000 0.042 NA   NA
 5806712 5806713 LMHCC_1186 LMHCC_1188     TRUE 0.579 29.000 0.026 NA   NA
 5806714 5806715 LMHCC_1189 LMHCC_1190     FALSE 0.268 86.000 0.115 NA   NA
 5806715 5806716 LMHCC_1190 LMHCC_1191     TRUE 0.709 37.000 0.833 NA   NA
 5806717 5806718 LMHCC_1192 LMHCC_1193     TRUE 0.993 -3.000 0.438 1.000 Y NA
 5806718 5806719 LMHCC_1193 LMHCC_1194   gnd FALSE 0.055 191.000 0.025 1.000 N NA
 5806719 5806720 LMHCC_1194 LMHCC_1195 gnd   FALSE 0.107 145.000 0.035 1.000 N NA
 5806722 5806723 LMHCC_1197 LMHCC_1198     TRUE 0.970 31.000 0.882 0.055 Y NA
 5806723 5806724 LMHCC_1198 LMHCC_1199     TRUE 0.993 17.000 0.897 0.001 Y NA
 5806724 5806725 LMHCC_1199 LMHCC_1200   lpdA TRUE 0.952 25.000 0.414 1.000 Y NA
 5806725 5806726 LMHCC_1200 LMHCC_1201 lpdA buk TRUE 0.984 15.000 0.078 0.048 Y NA
 5806726 5806727 LMHCC_1201 LMHCC_1202 buk   TRUE 0.609 137.000 0.562 1.000 Y NA
 5806727 5806728 LMHCC_1202 LMHCC_1203   recN FALSE 0.128 130.000 0.013 1.000 N NA
 5806728 5806729 LMHCC_1203 LMHCC_1204 recN argR TRUE 0.701 23.000 0.056 1.000 N NA
 5806729 5806730 LMHCC_1204 LMHCC_1205 argR   FALSE 0.061 191.000 0.064 1.000 N NA
 5806730 5806731 LMHCC_1205 LMHCC_1206   dxs TRUE 0.948 -3.000 0.189 1.000 N NA
 5806731 5806732 LMHCC_1206 LMHCC_1207 dxs   FALSE 0.038 215.000 0.015 1.000 N NA
 5806732 5806733 LMHCC_1207 LMHCC_1208     FALSE 0.058 199.000 0.108 1.000 N NA
 5806733 5806734 LMHCC_1208 LMHCC_1209   xseB TRUE 0.913 3.000 0.100 1.000 N NA
 5806734 5806735 LMHCC_1209 LMHCC_1210 xseB xseA TRUE 0.998 -10.000 0.412 0.001 Y NA
 5806735 5806736 LMHCC_1210 LMHCC_1211 xseA   TRUE 0.801 16.000 0.058 1.000 N NA
 5806736 5806737 LMHCC_1211 LMHCC_1212   nusB FALSE 0.221 97.000 0.056 1.000 N NA
 5806737 5806738 LMHCC_1212 LMHCC_1213 nusB   TRUE 0.561 31.000 0.023 NA   NA
 5806738 5806739 LMHCC_1213 LMHCC_1214   accC TRUE 0.931 4.000 0.373 NA   NA
 5806739 5806740 LMHCC_1214 LMHCC_1215 accC accB TRUE 0.990 14.000 0.086 0.002 Y NA
 5806740 5806741 LMHCC_1215 LMHCC_1216 accB efp FALSE 0.101 159.000 0.120 1.000 N NA
 5806741 5806742 LMHCC_1216 LMHCC_1217 efp   FALSE 0.244 103.000 0.160 1.000 N NA
 5806743 5806744 LMHCC_1218 LMHCC_1219     TRUE 0.858 13.000 0.140 NA   NA
 5806744 5806745 LMHCC_1219 LMHCC_1220     FALSE 0.371 62.000 0.029 NA   NA
 5806746 5806747 LMHCC_1221 LMHCC_1222     TRUE 0.998 -3.000 0.316 0.001 Y NA
 5806747 5806748 LMHCC_1222 LMHCC_1223   gcvT TRUE 0.990 16.000 0.092 0.001 Y NA
 5806749 5806750 LMHCC_1224 LMHCC_1225     TRUE 0.995 -22.000 0.639 1.000 Y NA
 5806750 5806751 LMHCC_1225 LMHCC_1226     TRUE 0.994 14.000 0.861 0.001 Y NA
 5806751 5806752 LMHCC_1226 LMHCC_1227     TRUE 0.955 -3.000 0.320 NA   NA
 5806752 5806753 LMHCC_1227 LMHCC_1228     FALSE 0.244 83.000 0.036 NA   NA
 5806753 5806754 LMHCC_1228 LMHCC_1229     TRUE 0.942 -37.000 0.036 NA   NA
 5806754 5806755 LMHCC_1229 LMHCC_1230     TRUE 0.950 -3.000 0.214 NA   NA
 5806756 5806757 LMHCC_1231 LMHCC_1232     FALSE 0.136 134.000 0.058 NA   NA
 5806757 5806758 LMHCC_1232 LMHCC_1233     TRUE 0.775 25.000 0.496 NA   NA
 5806758 5806759 LMHCC_1233 LMHCC_1234     TRUE 0.887 13.000 0.347 NA   NA
 5806759 5806760 LMHCC_1234 LMHCC_1235     FALSE 0.309 81.000 0.037 1.000   NA
 5806761 5806762 LMHCC_1236 LMHCC_1237     TRUE 0.600 28.000 0.031 NA   NA
 5806762 5806763 LMHCC_1237 LMHCC_1238   rsgA FALSE 0.076 160.000 0.014 NA   NA
 5806764 5806765 LMHCC_1239 LMHCC_1240   rpsO FALSE 0.253 246.000 0.335 1.000 Y NA
 5806765 5806766 LMHCC_1240 LMHCC_1241 rpsO ribF FALSE 0.144 137.000 0.119 1.000 N NA
 5806766 5806767 LMHCC_1241 LMHCC_1242 ribF truB TRUE 0.423 70.000 0.308 1.000 N NA
 5806767 5806768 LMHCC_1242 LMHCC_1243 truB rbfA TRUE 0.692 96.000 0.111 1.000 Y NA
 5806768 5806769 LMHCC_1243 LMHCC_1244 rbfA   TRUE 0.818 16.000 0.113 NA   NA
 5806769 5806770 LMHCC_1244 LMHCC_1245   infB TRUE 0.941 -3.000 0.102 NA   NA
 5806770 5806771 LMHCC_1245 LMHCC_1246 infB   TRUE 0.953 23.000 0.223 1.000 Y NA
 5806771 5806772 LMHCC_1246 LMHCC_1247     TRUE 0.955 -7.000 0.408 NA N NA
 5806772 5806773 LMHCC_1247 LMHCC_1248   nusA TRUE 0.972 15.000 0.323 NA Y NA
 5806773 5806774 LMHCC_1248 LMHCC_1249 nusA   TRUE 0.753 30.000 0.759 NA   NA
 5806774 5806775 LMHCC_1249 LMHCC_1250   polC FALSE 0.067 182.000 0.059 NA   NA
 5806775 5806776 LMHCC_1250 LMHCC_1251 polC proS TRUE 0.402 106.000 0.070 0.047 N NA
 5806776 5806777 LMHCC_1251 LMHCC_1252 proS rseP TRUE 0.543 39.000 0.095 1.000 N NA
 5806777 5806778 LMHCC_1252 LMHCC_1253 rseP dxr TRUE 0.894 14.000 0.568 1.000 N NA
 5806778 5806779 LMHCC_1253 LMHCC_1254 dxr cdsA TRUE 0.970 15.000 0.071 1.000 Y NA
 5806779 5806780 LMHCC_1254 LMHCC_1255 cdsA uppS TRUE 0.973 14.000 0.113 1.000 Y NA
 5806780 5806781 LMHCC_1255 LMHCC_1256 uppS frr FALSE 0.062 228.000 0.409 1.000 N NA
 5806781 5806782 LMHCC_1256 LMHCC_1257 frr pyrH TRUE 0.958 0.000 0.626 1.000 N NA
 5806783 5806784 LMHCC_1258 LMHCC_1259     TRUE 0.952 -16.000 0.137 NA   NA
 5806784 5806785 LMHCC_1259 LMHCC_1260     TRUE 0.961 -10.000 0.123 1.000   NA
 5806785 5806786 LMHCC_1260 LMHCC_1261     TRUE 0.942 10.000 0.692 1.000   NA
 5806786 5806787 LMHCC_1261 LMHCC_1262     TRUE 0.717 23.000 0.087 1.000 N NA
 5806787 5806788 LMHCC_1262 LMHCC_1263     TRUE 0.743 19.000 0.026 NA   NA
 5806789 5806790 LMHCC_1264 LMHCC_1265   tkt FALSE 0.039 221.000 0.000 1.000   NA
 5806790 5806791 LMHCC_1265 LMHCC_1266 tkt   FALSE 0.169 147.000 0.440 NA   NA
 5806791 5806792 LMHCC_1266 LMHCC_1267     FALSE 0.333 94.000 0.480 NA   NA
 5806793 5806794 LMHCC_1268 LMHCC_1269 lexA   TRUE 0.509 31.000 0.043 NA N NA
 5806795 5806796 LMHCC_1270 LMHCC_1271   glnA FALSE 0.146 144.000 0.212 1.000 N NA
 5806796 5806797 LMHCC_1271 LMHCC_1272 glnA   FALSE 0.382 71.000 0.192 1.000 N NA
 5806797 5806798 LMHCC_1272 LMHCC_1273     FALSE 0.153 103.000 0.000 NA   NA
 5806798 5806799 LMHCC_1273 LMHCC_1274     TRUE 0.922 -49.000 0.000 NA   NA
 5806799 5806800 LMHCC_1274 LMHCC_1276   hflX TRUE 0.955 -7.000 0.065 1.000   NA
 5806800 5806801 LMHCC_1276 LMHCC_1277 hflX hfq FALSE 0.204 111.000 0.014 1.000   NA
 5806801 5806802 LMHCC_1277 LMHCC_1278 hfq miaA FALSE 0.232 123.000 0.192 1.000   NA
 5806802 5806803 LMHCC_1278 LMHCC_1279 miaA   FALSE 0.110 127.000 0.000 1.000 N NA
 5806803 5806804 LMHCC_1279 LMHCC_1280     FALSE 0.190 233.000 0.000 1.000 Y NA
 5806806 5806807 LMHCC_1282 LMHCC_1283     FALSE 0.195 82.000 0.000 NA   NA
 5806807 5806808 LMHCC_1283 LMHCC_1284     FALSE 0.380 47.000 0.000 NA   NA
 5806808 5806809 LMHCC_1284 LMHCC_1285     FALSE 0.007 595.000 0.000 NA   NA
 5806809 5806810 LMHCC_1285 LMHCC_1286     FALSE 0.045 404.000 0.000 0.011   NA
 5806810 5806811 LMHCC_1286 LMHCC_1287   luxS FALSE 0.014 376.000 0.000 1.000   NA
 5806811 5806812 LMHCC_1287 LMHCC_1288 luxS parC FALSE 0.239 83.000 0.026 1.000 N NA
 5806812 5806813 LMHCC_1288 LMHCC_1289 parC parE TRUE 0.998 -3.000 0.552 0.002 Y NA
 5806813 5806814 LMHCC_1289 LMHCC_1290 parE   FALSE 0.061 182.000 0.030 NA   NA
 5806816 5806817 LMHCC_1292 LMHCC_1293     TRUE 0.913 3.000 0.105 NA   NA
 5806817 5806818 LMHCC_1293 LMHCC_1294     TRUE 0.718 23.000 0.096 NA   NA
 5806818 5806819 LMHCC_1294 LMHCC_1295   codY FALSE 0.258 104.000 0.076 1.000   NA
 5806819 5806820 LMHCC_1295 LMHCC_1296 codY hslU TRUE 0.767 21.000 0.131 1.000 N NA
 5806820 5806821 LMHCC_1296 LMHCC_1298 hslU hslV TRUE 0.982 14.000 0.752 1.000 Y NA
 5806821 5806822 LMHCC_1298 LMHCC_1299 hslV xerC TRUE 0.762 21.000 0.113 1.000 N NA
 5806822 5806823 LMHCC_1299 LMHCC_1300 xerC trmFO FALSE 0.027 284.000 0.105 1.000 N NA
 5806823 5806824 LMHCC_1300 LMHCC_1301 trmFO topA TRUE 0.429 63.000 0.137 1.000 N NA
 5806824 5806825 LMHCC_1301 LMHCC_1302 topA dprA FALSE 0.197 272.000 0.238 1.000 Y NA
 5806825 5806826 LMHCC_1302 LMHCC_1303 dprA   TRUE 0.527 134.000 0.037 1.000 Y NA
 5806826 5806827 LMHCC_1303 LMHCC_1304     TRUE 0.956 -3.000 0.148 1.000   NA
 5806827 5806828 LMHCC_1304 LMHCC_1305   lepB TRUE 0.887 10.000 0.023 1.000   NA
 5806828 5806829 LMHCC_1305 LMHCC_1306 lepB lepB TRUE 0.904 103.000 0.769 0.001 Y NA
 5806829 5806830 LMHCC_1306 LMHCC_1307 lepB lepB TRUE 0.976 35.000 0.643 0.001 Y NA
 5806830 5806831 LMHCC_1307 LMHCC_1308 lepB clpX FALSE 0.147 119.000 0.009 1.000 N NA
 5806831 5806832 LMHCC_1308 LMHCC_1309 clpX tig TRUE 0.569 185.000 0.033 0.003 Y NA
 5806832 5806833 LMHCC_1309 LMHCC_1310 tig   FALSE 0.194 116.000 0.014 1.000   NA
 5806834 5806835 LMHCC_1311 LMHCC_1312     FALSE 0.340 82.000 0.306 NA   NA
 5806835 5806836 LMHCC_1312 LMHCC_1313   proB FALSE 0.093 148.000 0.015 NA   NA
 5806836 5806837 LMHCC_1313 LMHCC_1314 proB proA TRUE 0.998 -16.000 0.281 0.003 Y NA
 5806841 5806842 LMHCC_1318 LMHCC_1319 treP treC TRUE 0.973 19.000 0.650 1.000 Y NA
 5806844 5806845 LMHCC_1321 LMHCC_1322     FALSE 0.013 331.000 0.000 NA   NA
 5806845 5806846 LMHCC_1322 LMHCC_1323     TRUE 0.522 67.000 0.692 NA   NA
 5806848 5806849 LMHCC_1325 LMHCC_1326     TRUE 0.951 -3.000 0.239 NA   NA
 5806850 5806851 LMHCC_1327 LMHCC_1328     FALSE 0.090 166.000 0.106 NA   NA
 5806851 5806852 LMHCC_1328 LMHCC_1329     TRUE 0.682 25.000 0.086 NA   NA
 5806855 5806856 LMHCC_1332 LMHCC_1333     FALSE 0.183 137.000 0.364 NA   NA
 5806857 5806858 LMHCC_1334 LMHCC_1335     FALSE 0.177 123.000 0.115 NA   NA
 5806858 5806859 LMHCC_1335 LMHCC_1336     FALSE 0.007 668.000 0.000 NA   NA
 5806859 5806860 LMHCC_1336 LMHCC_1337     FALSE 0.030 215.000 0.000 NA   NA
 5806860 5806861 LMHCC_1337 LMHCC_1338     FALSE 0.044 186.000 0.000 NA   NA
 5806861 5806862 LMHCC_1338 LMHCC_1339     FALSE 0.008 507.000 0.000 NA   NA
 5806862 5806863 LMHCC_1339 LMHCC_1340     TRUE 0.866 3.000 0.000 NA   NA
 5806863 5806864 LMHCC_1340 LMHCC_1341     FALSE 0.019 313.000 0.000 1.000   NA
 5806864 5806865 LMHCC_1341 LMHCC_1342     FALSE 0.170 91.000 0.000 NA   NA
 5806866 5806867 LMHCC_1343 LMHCC_1344     FALSE 0.008 531.000 0.000 NA   NA
 5806867 5806868 LMHCC_1344 LMHCC_1345     FALSE 0.032 206.000 0.000 NA   NA
 5806868 5806869 LMHCC_1345 LMHCC_1346     FALSE 0.145 106.000 0.000 NA   NA
 5806869 5806870 LMHCC_1346 LMHCC_1347     TRUE 0.760 32.000 1.000 NA   NA
 5806870 5806871 LMHCC_1347 LMHCC_1348     TRUE 0.934 5.000 0.500 NA   NA
 5806872 5806873 LMHCC_1349 LMHCC_1350     TRUE 0.917 -7.000 0.000 NA   NA
 5806873 5806874 LMHCC_1350 LMHCC_1351     FALSE 0.048 179.000 0.000 NA   NA
 5806874 5806875 LMHCC_1351 LMHCC_1352     FALSE 0.011 380.000 0.000 NA   NA
 5806875 5806876 LMHCC_1352 LMHCC_1353     TRUE 0.891 0.000 0.000 NA   NA
 5806876 5806877 LMHCC_1353 LMHCC_1354     TRUE 0.779 13.000 0.000 NA   NA
 5806877 5806878 LMHCC_1354 LMHCC_1355     TRUE 0.922 -33.000 0.000 NA   NA
 5806878 5806879 LMHCC_1355 LMHCC_1356     TRUE 0.558 26.000 0.000 NA   NA
 5806879 5806880 LMHCC_1356 LMHCC_1357     TRUE 0.882 1.000 0.000 NA   NA
 5806880 5806881 LMHCC_1357 LMHCC_1358     TRUE 0.715 17.000 0.000 NA   NA
 5806881 5806882 LMHCC_1358 LMHCC_1359     TRUE 0.801 12.000 0.000 NA   NA
 5806882 5806883 LMHCC_1359 LMHCC_1360     TRUE 0.891 0.000 0.000 NA   NA
 5806883 5806884 LMHCC_1360 LMHCC_1361     TRUE 0.891 0.000 0.000 NA   NA
 5806884 5806885 LMHCC_1361 LMHCC_1362     TRUE 0.939 10.000 1.000 NA   NA
 5806885 5806886 LMHCC_1362 LMHCC_1363     TRUE 0.891 0.000 0.000 NA   NA
 5806886 5806887 LMHCC_1363 LMHCC_1364     TRUE 0.958 -34.000 0.222 NA   NA
 5806887 5806888 LMHCC_1364 LMHCC_1365     TRUE 0.841 16.000 0.222 NA   NA
 5806888 5806889 LMHCC_1365 LMHCC_1366     TRUE 0.609 51.000 0.600 NA   NA
 5806889 5806890 LMHCC_1366 LMHCC_1367     TRUE 0.392 71.000 0.231 NA   NA
 5806890 5806891 LMHCC_1367 LMHCC_1368     TRUE 0.829 22.000 0.615 NA   NA
 5806891 5806892 LMHCC_1368 LMHCC_1369     TRUE 0.956 -3.000 0.333 NA   NA
 5806892 5806893 LMHCC_1369 LMHCC_1370     TRUE 0.957 -3.000 0.375 NA   NA
 5806893 5806894 LMHCC_1370 LMHCC_1371     TRUE 0.967 -16.000 0.500 NA   NA
 5806894 5806895 LMHCC_1371 LMHCC_1372     TRUE 0.926 10.000 0.600 NA   NA
 5806895 5806896 LMHCC_1372 LMHCC_1373     TRUE 0.913 7.000 0.273 NA   NA
 5806896 5806897 LMHCC_1373 LMHCC_1374     TRUE 0.744 27.000 0.444 NA   NA
 5806897 5806898 LMHCC_1374 LMHCC_1375     TRUE 0.956 -3.000 0.333 NA   NA
 5806898 5806899 LMHCC_1375 LMHCC_1376     TRUE 0.890 12.000 0.250 NA   NA
 5806899 5806900 LMHCC_1376 LMHCC_1377     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5806900 5806901 LMHCC_1377 LMHCC_1378     FALSE 0.267 106.000 0.312 NA   NA
 5806901 5806902 LMHCC_1378 LMHCC_1379     FALSE 0.011 475.000 0.000 1.000   NA
 5806902 5806903 LMHCC_1379 LMHCC_1380     FALSE 0.298 98.000 0.160 1.000   NA
 5806903 5806904 LMHCC_1380 LMHCC_1381     TRUE 0.882 1.000 0.000 NA   NA
 5806904 5806905 LMHCC_1381 LMHCC_1382     FALSE 0.007 590.000 0.000 NA   NA
 5806905 5806906 LMHCC_1382 LMHCC_1383     TRUE 0.915 2.000 0.080 NA   NA
 5806906 5806907 LMHCC_1383 LMHCC_1384     FALSE 0.013 334.000 0.000 NA   NA
 5806907 5806908 LMHCC_1384 LMHCC_1385     TRUE 0.777 23.000 0.333 NA   NA
 5806908 5806909 LMHCC_1385 LMHCC_1386     TRUE 0.813 23.000 0.600 NA   NA
 5806909 5806910 LMHCC_1386 LMHCC_1387     FALSE 0.222 127.000 0.400 NA   NA
 5806910 5806911 LMHCC_1387 LMHCC_1388     TRUE 0.847 20.000 0.600 NA   NA
 5806911 5806912 LMHCC_1388 LMHCC_1389     TRUE 0.950 2.000 0.600 NA   NA
 5806912 5806913 LMHCC_1389 LMHCC_1390     TRUE 0.969 -3.000 0.833 NA   NA
 5806913 5806914 LMHCC_1390 LMHCC_1391     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5806914 5806915 LMHCC_1391 LMHCC_1392     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5806915 5806916 LMHCC_1392 LMHCC_1393     TRUE 0.964 -3.000 0.600 NA   NA
 5806916 5806917 LMHCC_1393 LMHCC_1394     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5806917 5806918 LMHCC_1394 LMHCC_1395     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5806918 5806919 LMHCC_1395 LMHCC_1396     TRUE 0.891 0.000 0.000 NA   NA
 5806919 5806920 LMHCC_1396 LMHCC_1397     TRUE 0.882 1.000 0.000 NA   NA
 5806920 5806921 LMHCC_1397 LMHCC_1398     TRUE 0.715 17.000 0.000 NA   NA
 5806921 5806922 LMHCC_1398 LMHCC_1399     TRUE 0.908 -3.000 0.000 NA   NA
 5806922 5806923 LMHCC_1399 LMHCC_1400     FALSE 0.153 103.000 0.000 NA   NA
 5806923 5806924 LMHCC_1400 LMHCC_1401     TRUE 0.882 1.000 0.000 NA   NA
 5806924 5806925 LMHCC_1401 LMHCC_1402     FALSE 0.021 256.000 0.000 NA   NA
 5806925 5806926 LMHCC_1402 LMHCC_1403     FALSE 0.014 307.000 0.000 NA   NA
 5806926 5806927 LMHCC_1403 LMHCC_1404     FALSE 0.088 138.000 0.000 NA   NA
 5806927 5806928 LMHCC_1404 LMHCC_1405     FALSE 0.025 235.000 0.000 NA   NA
 5806928 5806929 LMHCC_1405 LMHCC_1406     TRUE 0.939 3.000 0.429 NA   NA
 5806929 5806930 LMHCC_1406 LMHCC_1407     TRUE 0.750 22.000 0.132 NA   NA
 5806931 5806932 LMHCC_1408 LMHCC_1409     FALSE 0.010 399.000 0.000 NA   NA
 5806932 5806933 LMHCC_1409 LMHCC_1410     TRUE 0.889 17.000 0.857 NA   NA
 5806933 5806934 LMHCC_1410 LMHCC_1411     TRUE 0.534 51.000 0.250 NA   NA
 5806934 5806935 LMHCC_1411 LMHCC_1412     FALSE 0.167 132.000 0.167 NA   NA
 5806936 5806937 LMHCC_T008 LMHCC_1413     FALSE 0.135 111.000 0.000 NA   NA
 5806937 5806938 LMHCC_1413 LMHCC_1414   rdgB TRUE 0.549 37.000 0.085 NA   NA
 5806938 5806939 LMHCC_1414 LMHCC_1415 rdgB rph TRUE 0.925 4.000 0.262 1.000 N NA
 5806939 5806940 LMHCC_1415 LMHCC_1416 rph murI TRUE 0.836 13.000 0.048 1.000 N NA
 5806942 5806943 LMHCC_1418 LMHCC_1419   uvrC FALSE 0.048 194.000 0.009 1.000 N NA
 5806943 5806944 LMHCC_1419 LMHCC_1420 uvrC trx FALSE 0.265 76.000 0.008 1.000 N NA
 5806944 5806945 LMHCC_1420 LMHCC_1421 trx   FALSE 0.248 82.000 0.031 1.000 N NA
 5806945 5806946 LMHCC_1421 LMHCC_1422     TRUE 0.948 23.000 0.114 1.000 Y NA
 5806946 5806947 LMHCC_1422 LMHCC_1423   cvpA FALSE 0.279 93.000 0.066 1.000   NA
 5806947 5806948 LMHCC_1423 LMHCC_1424 cvpA   TRUE 0.928 0.000 0.091 NA   NA
 5806950 5806951 LMHCC_1426 LMHCC_1427 ung   FALSE 0.194 104.000 0.000 1.000   NA
 5806951 5806952 LMHCC_1427 LMHCC_1428     TRUE 0.788 16.000 0.000 1.000   NA
 5806952 5806953 LMHCC_1428 LMHCC_1429     FALSE 0.261 98.000 0.182 1.000 N NA
 5806953 5806954 LMHCC_1429 LMHCC_1430     TRUE 0.884 14.000 0.438 1.000 N NA
 5806954 5806955 LMHCC_1430 LMHCC_1431   pheT FALSE 0.118 134.000 0.009 1.000 N NA
 5806955 5806956 LMHCC_1431 LMHCC_1432 pheT pheS TRUE 0.997 0.000 0.574 0.001 Y NA
 5806956 5806957 LMHCC_1432 LMHCC_1433 pheS   FALSE 0.008 368.000 0.000 NA N NA
 5806959 5806960 LMHCC_1435 LMHCC_1436     TRUE 0.625 26.000 0.022 1.000 N NA
 5806960 5806961 LMHCC_1436 LMHCC_1437     FALSE 0.235 112.000 0.237 1.000 N NA
 5806961 5806962 LMHCC_1437 LMHCC_1438     FALSE 0.323 270.000 0.000 0.003 Y NA
 5806962 5806963 LMHCC_1438 LMHCC_1439     FALSE 0.011 373.000 0.000 1.000 N NA
 5806964 5806965 LMHCC_1440 LMHCC_1441     TRUE 0.885 15.000 0.545 NA   NA
 5806966 5806967 LMHCC_1442 LMHCC_1443   cbiP TRUE 0.985 -36.000 0.021 0.010   NA
 5806967 5806968 LMHCC_1443 LMHCC_1444 cbiP cbiO TRUE 0.918 0.000 0.033 1.000 N NA
 5806968 5806969 LMHCC_1444 LMHCC_1445 cbiO cbiQ TRUE 0.992 13.000 0.152 0.002 Y NA
 5806969 5806970 LMHCC_1445 LMHCC_1446 cbiQ cbiN TRUE 0.998 -37.000 0.804 0.002 Y NA
 5806970 5806971 LMHCC_1446 LMHCC_1447 cbiN cbiM TRUE 0.998 -3.000 0.861 0.010 Y NA
 5806971 5806972 LMHCC_1447 LMHCC_1448 cbiM cbiL TRUE 0.981 -3.000 0.058 0.010 N NA
 5806972 5806973 LMHCC_1448 LMHCC_1449 cbiL cbiK TRUE 0.992 -7.000 0.048 1.000 Y NA
 5806973 5806974 LMHCC_1449 LMHCC_1450 cbiK   TRUE 0.991 -3.000 0.084 1.000 Y NA
 5806974 5806975 LMHCC_1450 LMHCC_1451   cbiJ TRUE 0.988 0.000 0.042 1.000 Y NA
 5806975 5806976 LMHCC_1451 LMHCC_1452 cbiJ cbiH TRUE 0.997 -3.000 0.423 0.010 Y NA
 5806976 5806977 LMHCC_1452 LMHCC_1453 cbiH cbiG TRUE 0.997 -3.000 0.352 0.010 Y NA
 5806977 5806978 LMHCC_1453 LMHCC_1454 cbiG cbiF TRUE 0.997 -13.000 0.397 0.010 Y NA
 5806978 5806979 LMHCC_1454 LMHCC_1455 cbiF cbiT TRUE 0.993 6.000 0.056 0.010 Y NA
 5806979 5806980 LMHCC_1455 LMHCC_1456 cbiT cbiE TRUE 0.998 -10.000 0.300 0.001 Y NA
 5806980 5806981 LMHCC_1456 LMHCC_1457 cbiE cbiD TRUE 0.996 -3.000 0.126 0.010 Y NA
 5806981 5806982 LMHCC_1457 LMHCC_1458 cbiD cbiC TRUE 0.988 16.000 0.168 0.010 Y NA
 5806982 5806983 LMHCC_1458 LMHCC_1459 cbiC cbiB TRUE 0.990 13.000 0.107 0.010 Y NA
 5806983 5806984 LMHCC_1459 LMHCC_1460 cbiB cbiA TRUE 0.996 -3.000 0.124 0.010 Y NA
 5806984 5806985 LMHCC_1460 LMHCC_1461 cbiA   FALSE 0.013 333.000 0.000 NA   NA
 5806987 5806988 LMHCC_1463 LMHCC_1464     TRUE 0.994 -7.000 0.759 NA Y NA
 5806988 5806989 LMHCC_1464 LMHCC_1465     TRUE 0.853 16.000 0.552 NA N NA
 5806989 5806990 LMHCC_1465 LMHCC_1466     TRUE 0.877 50.000 0.385 NA Y NA
 5806990 5806991 LMHCC_1466 LMHCC_1467     TRUE 0.880 15.000 0.487 NA   NA
 5806991 5806992 LMHCC_1467 LMHCC_1468     TRUE 0.941 3.000 0.459 NA   NA
 5806992 5806993 LMHCC_1468 LMHCC_1469     TRUE 0.874 13.000 0.452 NA N NA
 5806993 5806994 LMHCC_1469 LMHCC_1470     FALSE 0.098 166.000 0.357 NA N NA
 5806994 5806995 LMHCC_1470 LMHCC_1471     TRUE 0.918 32.000 0.349 NA Y NA
 5806995 5806996 LMHCC_1471 LMHCC_1472     TRUE 0.990 0.000 0.442 NA Y NA
 5806996 5806997 LMHCC_1472 LMHCC_1473     TRUE 0.854 15.000 0.468 NA N NA
 5806997 5806998 LMHCC_1473 LMHCC_1474   eutC TRUE 0.962 23.000 0.617 1.000 Y NA
 5806998 5806999 LMHCC_1474 LMHCC_1475 eutC eutB TRUE 0.987 20.000 0.190 0.001 Y NA
 5806999 5807000 LMHCC_1475 LMHCC_1476 eutB   TRUE 0.906 42.000 0.636 NA Y NA
 5807000 5807001 LMHCC_1476 LMHCC_1477     FALSE 0.222 90.000 0.163 NA N NA
 5807001 5807002 LMHCC_1477 LMHCC_1478     TRUE 0.994 -7.000 0.388 1.000 Y NA
 5807002 5807003 LMHCC_1478 LMHCC_1479     FALSE 0.028 224.000 0.000 1.000 N NA
 5807003 5807004 LMHCC_1479 LMHCC_1480     FALSE 0.008 591.000 0.000 1.000 N NA
 5807004 5807005 LMHCC_1480 LMHCC_1481   cobD TRUE 0.961 -10.000 0.300 1.000 N NA
 5807005 5807006 LMHCC_1481 LMHCC_1482 cobD ackA TRUE 0.876 14.000 0.346 1.000 N NA
 5807006 5807007 LMHCC_1482 LMHCC_1483 ackA   TRUE 0.478 66.000 0.375 1.000 N NA
 5807007 5807008 LMHCC_1483 LMHCC_1485     TRUE 0.727 28.000 0.407 1.000 N NA
 5807008 5807009 LMHCC_1485 LMHCC_1486     TRUE 0.986 16.000 0.222 0.029 Y NA
 5807009 5807010 LMHCC_1486 LMHCC_1487     TRUE 0.909 7.000 0.073 1.000   NA
 5807010 5807011 LMHCC_1487 LMHCC_1488     TRUE 0.857 15.000 0.268 NA   NA
 5807011 5807012 LMHCC_1488 LMHCC_1489     TRUE 0.929 5.000 0.407 NA   NA
 5807012 5807013 LMHCC_1489 LMHCC_1490     TRUE 0.960 -3.000 0.440 NA   NA
 5807013 5807014 LMHCC_1490 LMHCC_1491     TRUE 0.775 21.000 0.364 NA N NA
 5807014 5807015 LMHCC_1491 LMHCC_1492     TRUE 0.986 4.000 0.364 NA Y NA
 5807015 5807016 LMHCC_1492 LMHCC_1493     TRUE 0.950 25.000 0.645 NA Y NA
 5807016 5807017 LMHCC_1493 LMHCC_1494     TRUE 0.891 13.000 0.387 NA   NA
 5807017 5807018 LMHCC_1494 LMHCC_1495     TRUE 0.954 -3.000 0.295 NA   NA
 5807018 5807019 LMHCC_1495 LMHCC_1496     TRUE 0.616 46.000 0.500 NA   NA
 5807019 5807020 LMHCC_1496 LMHCC_1497     TRUE 0.971 17.000 0.759 0.001   NA
 5807020 5807021 LMHCC_1497 LMHCC_1498     TRUE 0.896 38.000 0.455 0.001   NA
 5807021 5807022 LMHCC_1498 LMHCC_1499     TRUE 0.795 19.000 0.150 1.000 N NA
 5807022 5807023 LMHCC_1499 LMHCC_1500     TRUE 0.942 -7.000 0.200 NA N NA
 5807025 5807026 LMHCC_1502 LMHCC_1503 cobC cobS TRUE 0.908 1.000 0.023 1.000 N NA
 5807026 5807027 LMHCC_1503 LMHCC_1504 cobS   TRUE 0.987 2.000 0.046 1.000 Y NA
 5807027 5807028 LMHCC_1504 LMHCC_1505     TRUE 0.938 -3.000 0.077 NA   NA
 5807028 5807029 LMHCC_1505 LMHCC_1506   eutP TRUE 0.668 25.000 0.062 NA   NA
 5807029 5807030 LMHCC_1506 LMHCC_1507 eutP   TRUE 0.988 6.000 0.467 1.000 Y NA
 5807030 5807031 LMHCC_1507 LMHCC_1508     FALSE 0.123 148.000 0.316 NA N NA
 5807031 5807032 LMHCC_1508 LMHCC_1509     TRUE 0.989 -3.000 0.053 NA Y NA
 5807032 5807033 LMHCC_1509 LMHCC_1510     FALSE 0.142 128.000 0.036 1.000 N NA
 5807034 5807035 LMHCC_1511 LMHCC_1512     FALSE 0.186 107.000 0.037 NA   NA
 5807035 5807036 LMHCC_1512 LMHCC_1513   clpP FALSE 0.097 147.000 0.020 NA   NA
 5807036 5807037 LMHCC_1513 LMHCC_1514 clpP   FALSE 0.375 68.000 0.111 NA   NA
 5807038 5807039 LMHCC_1515 LMHCC_1516     FALSE 0.018 281.000 0.000 NA   NA
 5807039 5807040 LMHCC_1516 LMHCC_1517     TRUE 0.964 -7.000 0.444 NA   NA
 5807042 5807043 LMHCC_1519 LMHCC_1520     TRUE 0.771 25.000 0.462 NA   NA
 5807045 5807046 LMHCC_1522 LMHCC_1523     TRUE 0.996 2.000 0.576 0.009 Y NA
 5807047 5807048 LMHCC_1524 LMHCC_1525     TRUE 0.949 -3.000 0.057 1.000   NA
 5807048 5807049 LMHCC_1525 LMHCC_1526     TRUE 0.951 -3.000 0.082 1.000   NA
 5807050 5807051 LMHCC_1527 LMHCC_1528     TRUE 0.668 26.000 0.094 NA   NA
 5807051 5807052 LMHCC_1528 LMHCC_1529     FALSE 0.087 183.000 0.250 NA   NA
 5807052 5807053 LMHCC_1529 LMHCC_1530     FALSE 0.244 115.000 0.333 NA   NA
 5807053 5807054 LMHCC_1530 LMHCC_1531     TRUE 0.601 38.000 0.250 NA   NA
 5807054 5807055 LMHCC_1531 LMHCC_1532     TRUE 0.928 5.000 0.375 NA   NA
 5807055 5807056 LMHCC_1532 LMHCC_1533     FALSE 0.130 114.000 0.000 NA   NA
 5807056 5807057 LMHCC_1533 LMHCC_1534     FALSE 0.320 60.000 0.000 NA   NA
 5807057 5807058 LMHCC_1534 LMHCC_1535     FALSE 0.140 108.000 0.000 NA   NA
 5807058 5807059 LMHCC_1535 LMHCC_1536     FALSE 0.008 549.000 0.000 NA   NA
 5807059 5807060 LMHCC_1536 LMHCC_1537     FALSE 0.007 995.000 0.000 NA   NA
 5807060 5807061 LMHCC_1537 LMHCC_1538     FALSE 0.100 141.000 0.004 1.000 N NA
 5807061 5807062 LMHCC_1538 LMHCC_1539     TRUE 0.471 62.000 0.083 1.000   NA
 5807062 5807063 LMHCC_1539 LMHCC_1540   nadE TRUE 0.863 13.000 0.037 1.000   NA
 5807063 5807064 LMHCC_1540 LMHCC_1541 nadE pncB TRUE 0.993 12.000 0.194 0.003 Y NA
 5807064 5807065 LMHCC_1541 LMHCC_1542 pncB tagD FALSE 0.176 118.000 0.064 1.000 N NA
 5807065 5807066 LMHCC_1542 LMHCC_1543 tagD   TRUE 0.939 65.000 0.244 0.002 Y NA
 5807066 5807067 LMHCC_1543 LMHCC_1544     TRUE 0.990 13.000 0.000 0.001 Y NA
 5807067 5807068 LMHCC_1544 LMHCC_1545     TRUE 0.984 0.000 0.000 NA Y NA
 5807068 5807069 LMHCC_1545 LMHCC_1546     FALSE 0.120 143.000 0.222 NA N NA
 5807069 5807070 LMHCC_1546 LMHCC_1547     TRUE 0.962 -7.000 0.367 1.000 N NA
 5807070 5807071 LMHCC_1547 LMHCC_1548     FALSE 0.363 65.000 0.033 1.000 N NA
 5807073 5807074 LMHCC_1550 LMHCC_1551     FALSE 0.349 54.000 0.000 NA   NA
 5807074 5807075 LMHCC_1551 LMHCC_1552     FALSE 0.019 269.000 0.000 NA   NA
 5807075 5807076 LMHCC_1552 LMHCC_1553     FALSE 0.141 134.000 0.222 NA N NA
 5807078 5807079 LMHCC_1555 LMHCC_1556     TRUE 0.984 13.000 0.808 1.000 Y NA
 5807079 5807080 LMHCC_1556 LMHCC_1557     FALSE 0.018 282.000 0.000 1.000 N NA
 5807080 5807081 LMHCC_1557 LMHCC_1558   pyc FALSE 0.086 156.000 0.028 1.000 N NA
 5807081 5807082 LMHCC_1558 LMHCC_1559 pyc   FALSE 0.026 278.000 0.046 1.000 N NA
 5807082 5807083 LMHCC_1559 LMHCC_1560     TRUE 0.631 28.000 0.077 NA   NA
 5807083 5807084 LMHCC_1560 LMHCC_1561     TRUE 0.789 17.000 0.067 NA   NA
 5807086 5807087 LMHCC_1563 LMHCC_1564   typA FALSE 0.080 175.000 0.010 1.000   NA
 5807087 5807088 LMHCC_1564 LMHCC_1565 typA   FALSE 0.053 192.000 0.024 1.000 N NA
 5807089 5807090 LMHCC_1566 LMHCC_1567     FALSE 0.035 201.000 0.000 NA   NA
 5807091 5807092 LMHCC_1568 LMHCC_1569     TRUE 0.753 22.000 0.145 NA   NA
 5807092 5807093 LMHCC_1569 LMHCC_1570     TRUE 0.921 0.000 0.048 NA   NA
 5807093 5807094 LMHCC_1570 LMHCC_1571     FALSE 0.105 129.000 0.000 NA   NA
 5807094 5807095 LMHCC_1571 LMHCC_1572   lpdA FALSE 0.056 187.000 0.026 NA   NA
 5807095 5807096 LMHCC_1572 LMHCC_1573 lpdA   TRUE 0.990 5.000 0.948 1.000 Y NA
 5807096 5807097 LMHCC_1573 LMHCC_1574     TRUE 0.838 111.000 0.883 0.052 Y NA
 5807097 5807098 LMHCC_1574 LMHCC_1575     TRUE 0.997 3.000 0.484 0.001 Y NA
 5807101 5807102 LMHCC_1579 LMHCC_1580     TRUE 0.977 12.000 0.044 1.000 Y NA
 5807103 5807104 LMHCC_1581 LMHCC_1582 moaA moaC TRUE 0.808 119.000 0.071 0.003 Y NA
 5807104 5807105 LMHCC_1582 LMHCC_1583 moaC moaD TRUE 0.992 13.000 0.175 0.003 Y NA
 5807105 5807106 LMHCC_1583 LMHCC_1584 moaD moaE TRUE 0.998 -16.000 0.501 0.003 Y NA
 5807106 5807107 LMHCC_1584 LMHCC_1585 moaE mobB TRUE 0.996 -3.000 0.012 0.003 Y NA
 5807107 5807108 LMHCC_1585 LMHCC_1586 mobB   TRUE 0.997 -21.000 0.003 0.003 Y NA
 5807108 5807109 LMHCC_1586 LMHCC_1587   modA FALSE 0.216 95.000 0.036 1.000 N NA
 5807110 5807111 LMHCC_1588 LMHCC_1589     TRUE 0.931 3.000 0.103 1.000   NA
 5807111 5807112 LMHCC_1589 LMHCC_1590     FALSE 0.165 113.000 0.024 NA   NA
 5807112 5807113 LMHCC_1590 LMHCC_1591     FALSE 0.324 68.000 0.026 NA   NA
 5807115 5807116 LMHCC_1593 LMHCC_1594     TRUE 0.932 7.000 0.576 NA   NA
 5807116 5807117 LMHCC_1594 LMHCC_1595     FALSE 0.194 110.000 0.076 NA   NA
 5807118 5807119 LMHCC_1596 LMHCC_1597     TRUE 0.970 -3.000 0.900 NA   NA
 5807119 5807120 LMHCC_1597 LMHCC_1598     FALSE 0.116 155.000 0.184 NA   NA
 5807120 5807121 LMHCC_1598 LMHCC_1599     TRUE 0.806 19.000 0.194 1.000 N NA
 5807121 5807122 LMHCC_1599 LMHCC_1600     TRUE 0.998 -3.000 0.853 0.010 Y NA
 5807122 5807123 LMHCC_1600 LMHCC_1601     TRUE 0.966 -3.000 0.679 NA   NA
 5807123 5807124 LMHCC_1601 LMHCC_1602     FALSE 0.126 135.000 0.038 NA   NA
 5807124 5807125 LMHCC_1602 LMHCC_1603     FALSE 0.284 81.000 0.006 1.000   NA
 5807125 5807126 LMHCC_1603 LMHCC_1604     FALSE 0.174 114.000 0.038 1.000 N NA
 5807126 5807127 LMHCC_1604 LMHCC_1605     FALSE 0.217 115.000 0.192 1.000 N NA
 5807127 5807128 LMHCC_1605 LMHCC_1606     TRUE 0.987 14.000 0.179 0.032 Y NA
 5807128 5807129 LMHCC_1606 LMHCC_1607     TRUE 0.995 -7.000 0.042 0.073 Y NA
 5807131 5807132 LMHCC_1609 LMHCC_1610   dapD TRUE 0.546 64.000 0.372 1.000   NA
 5807132 5807133 LMHCC_1610 LMHCC_1611 dapD   TRUE 0.506 48.000 0.121 1.000 N NA
 5807133 5807134 LMHCC_1611 LMHCC_1612     TRUE 0.991 -3.000 0.214 NA Y NA
 5807134 5807135 LMHCC_1612 LMHCC_1613     FALSE 0.043 202.000 0.017 NA   NA
 5807135 5807136 LMHCC_1613 LMHCC_1614     FALSE 0.015 305.000 0.000 NA   NA
 5807138 5807139 LMHCC_1616 LMHCC_1617     TRUE 0.837 13.000 0.058 NA   NA
 5807139 5807140 LMHCC_1617 LMHCC_1619   ptsP FALSE 0.203 113.000 0.121 NA   NA
 5807140 5807141 LMHCC_1619 LMHCC_1620 ptsP   TRUE 0.995 0.000 0.140 0.027 Y NA
 5807142 5807143 LMHCC_1621 LMHCC_1622     FALSE 0.227 112.000 0.214 NA   NA
 5807145 5807146 LMHCC_1624 LMHCC_1625     FALSE 0.092 165.000 0.115 NA   NA
 5807148 5807149 LMHCC_1627 LMHCC_1628     TRUE 0.683 30.000 0.303 NA   NA
 5807150 5807151 LMHCC_1629 LMHCC_1630     TRUE 0.993 -37.000 0.151 1.000 Y NA
 5807151 5807152 LMHCC_1630 LMHCC_1631     TRUE 0.824 103.000 0.381 0.065 Y NA
 5807152 5807153 LMHCC_1631 LMHCC_1632     FALSE 0.018 282.000 0.000 1.000 N NA
 5807153 5807154 LMHCC_1632 LMHCC_1633     TRUE 0.606 53.000 0.625 1.000 N NA
 5807154 5807155 LMHCC_1633 LMHCC_1634   prfC FALSE 0.174 108.000 0.017 1.000 N NA
 5807155 5807156 LMHCC_1634 LMHCC_1635 prfC   FALSE 0.285 82.000 0.014 1.000   NA
 5807156 5807157 LMHCC_1635 LMHCC_1636     TRUE 0.977 -7.000 0.849 1.000   NA
 5807157 5807158 LMHCC_1636 LMHCC_1637     TRUE 0.948 -3.000 0.189 NA   NA
 5807158 5807159 LMHCC_1637 LMHCC_1638     TRUE 0.951 -3.000 0.235 NA   NA
 5807159 5807160 LMHCC_1638 LMHCC_1639     FALSE 0.168 135.000 0.216 NA   NA
 5807160 5807161 LMHCC_1639 LMHCC_1640     TRUE 0.854 13.000 0.106 1.000 N NA
 5807163 5807164 LMHCC_1642 LMHCC_1643     TRUE 0.970 -3.000 0.860 1.000 N NA
 5807164 5807165 LMHCC_1643 LMHCC_1644   ilvE FALSE 0.059 196.000 0.086 1.000 N NA
 5807166 5807167 LMHCC_1645 LMHCC_1646     TRUE 0.806 18.000 0.159 NA   NA
 5807169 5807170 LMHCC_1648 LMHCC_1649   dltA TRUE 0.671 37.000 0.549 NA   NA
 5807170 5807171 LMHCC_1649 LMHCC_1650 dltA   TRUE 0.950 -3.000 0.435 NA N NA
 5807171 5807172 LMHCC_1650 LMHCC_1651   dltC TRUE 0.745 26.000 0.387 NA   NA
 5807172 5807173 LMHCC_1651 LMHCC_1652 dltC   FALSE 0.247 132.000 0.409 1.000   NA
 5807174 5807175 LMHCC_1653 LMHCC_1654     FALSE 0.331 78.000 0.141 1.000 N NA
 5807175 5807176 LMHCC_1654 LMHCC_1655     TRUE 0.848 19.000 0.480 1.000 N NA
 5807176 5807177 LMHCC_1655 LMHCC_1656     TRUE 0.772 32.000 0.725 1.000   NA
 5807178 5807179 LMHCC_1657 LMHCC_1658     TRUE 0.837 17.000 0.096 1.000   NA
 5807180 5807181 LMHCC_1659 LMHCC_1660     TRUE 0.755 23.000 0.222 NA   NA
 5807181 5807182 LMHCC_1660 LMHCC_1661     FALSE 0.229 84.000 0.020 NA   NA
 5807182 5807183 LMHCC_1661 LMHCC_1662     TRUE 0.991 14.000 0.156 0.002 Y NA
 5807183 5807184 LMHCC_1662 LMHCC_1663     FALSE 0.206 115.000 0.149 1.000 N NA
 5807184 5807185 LMHCC_1663 LMHCC_1664     FALSE 0.213 121.000 0.245 1.000 N NA
 5807185 5807186 LMHCC_1664 LMHCC_1665   nagB TRUE 0.808 16.000 0.075 1.000 N NA
 5807186 5807187 LMHCC_1665 LMHCC_1666 nagB nagA TRUE 0.990 16.000 0.194 0.002 Y NA
 5807187 5807188 LMHCC_1666 LMHCC_1667 nagA   FALSE 0.051 188.000 0.083 NA N NA
 5807188 5807189 LMHCC_1667 LMHCC_1668     TRUE 0.848 16.000 0.270 NA   NA
 5807189 5807190 LMHCC_1668 LMHCC_1669     FALSE 0.047 229.000 0.167 NA   NA
 5807190 5807191 LMHCC_1669 LMHCC_1670     FALSE 0.364 97.000 0.733 NA   NA
 5807192 5807193 LMHCC_1671 LMHCC_1672     TRUE 0.788 21.000 0.222 NA   NA
 5807195 5807196 LMHCC_1674 LMHCC_1675     TRUE 0.931 -3.000 0.162 NA N NA
 5807197 5807198 LMHCC_1676 LMHCC_1677     FALSE 0.341 90.000 0.481 NA   NA
 5807198 5807199 LMHCC_1677 LMHCC_1678     FALSE 0.264 113.000 0.409 NA   NA
 5807199 5807200 LMHCC_1678 LMHCC_1679     FALSE 0.026 234.000 0.000 NA   NA
 5807201 5807202 LMHCC_1680 LMHCC_1681     TRUE 0.867 9.000 0.000 1.000   NA
 5807202 5807203 LMHCC_1681 LMHCC_1682     TRUE 0.859 27.000 0.000 0.008   NA
 5807203 5807204 LMHCC_1682 LMHCC_1683     FALSE 0.332 96.000 0.500 NA   NA
 5807204 5807205 LMHCC_1683 LMHCC_1684     TRUE 0.817 13.000 0.016 NA   NA
 5807205 5807206 LMHCC_1684 LMHCC_1685     FALSE 0.213 88.000 0.018 NA   NA
 5807207 5807208 LMHCC_1686 LMHCC_1687     TRUE 0.831 13.000 0.036 1.000 N NA
 5807208 5807209 LMHCC_1687 LMHCC_1688     TRUE 0.748 21.000 0.077 1.000 N NA
 5807209 5807210 LMHCC_1688 LMHCC_T026     FALSE 0.158 99.000 0.000 NA   NA
 5807211 5807212 LMHCC_1689 LMHCC_1690     FALSE 0.154 127.000 0.066 NA   NA
 5807213 5807214 LMHCC_1691 LMHCC_1692     TRUE 0.756 24.000 0.113 1.000   NA
 5807214 5807215 LMHCC_1692 LMHCC_1693     FALSE 0.190 116.000 0.100 NA   NA
 5807215 5807216 LMHCC_1693 LMHCC_1694     FALSE 0.136 109.000 0.027 NA N NA
 5807218 5807219 LMHCC_1696 LMHCC_1697     TRUE 0.726 23.000 0.110 1.000 N NA
 5807219 5807220 LMHCC_1697 LMHCC_1698     TRUE 0.960 0.000 0.713 1.000 N NA
 5807220 5807221 LMHCC_1698 LMHCC_1699   coaA FALSE 0.167 117.000 0.036 1.000 N NA
 5807221 5807222 LMHCC_1699 LMHCC_1700 coaA   FALSE 0.217 89.000 0.026 NA   NA
 5807222 5807223 LMHCC_1700 LMHCC_1701     TRUE 0.874 19.000 0.841 NA   NA
 5807223 5807224 LMHCC_1701 LMHCC_1702     FALSE 0.184 122.000 0.139 NA   NA
 5807224 5807225 LMHCC_1702 LMHCC_1703     FALSE 0.022 292.000 0.000 1.000   NA
 5807225 5807226 LMHCC_1703 LMHCC_1704     FALSE 0.336 74.000 0.100 1.000 N NA
 5807226 5807227 LMHCC_1704 LMHCC_1706     TRUE 0.973 12.000 0.000 1.000 Y NA
 5807227 5807228 LMHCC_1706 LMHCC_1707     TRUE 0.990 15.000 0.783 0.027 Y NA
 5807228 5807229 LMHCC_1707 LMHCC_1708     TRUE 0.994 5.000 0.522 0.027 Y NA
 5807229 5807230 LMHCC_1708 LMHCC_1709     FALSE 0.191 143.000 0.533 1.000 N NA
 5807230 5807231 LMHCC_1709 LMHCC_1710     FALSE 0.028 225.000 0.000 1.000 N NA
 5807231 5807232 LMHCC_1710 LMHCC_1711     FALSE 0.243 114.000 0.310 NA   NA
 5807232 5807233 LMHCC_1711 LMHCC_1712     FALSE 0.349 83.000 0.368 NA   NA
 5807233 5807234 LMHCC_1712 LMHCC_1713     TRUE 0.941 3.000 0.474 NA   NA
 5807236 5807237 LMHCC_1715 LMHCC_1716   gor TRUE 0.505 29.000 0.026 NA N NA
 5807237 5807238 LMHCC_1716 LMHCC_1717 gor   TRUE 0.566 36.000 0.010 1.000   NA
 5807238 5807239 LMHCC_1717 LMHCC_1718     FALSE 0.199 131.000 0.333 NA   NA
 5807239 5807240 LMHCC_1718 LMHCC_1719     TRUE 0.922 -39.000 0.000 NA   NA
 5807240 5807241 LMHCC_1719 LMHCC_1720     FALSE 0.129 115.000 0.000 NA   NA
 5807241 5807242 LMHCC_1720 LMHCC_T016     FALSE 0.107 128.000 0.000 NA   NA
 5807242 5807243 LMHCC_T016 LMHCC_T022     TRUE 0.545 27.000 0.000 NA   NA
 5807243 5807244 LMHCC_T022 LMHCC_1721     FALSE 0.037 198.000 0.000 NA   NA
 5807244 5807245 LMHCC_1721 LMHCC_1722   celB FALSE 0.345 81.000 0.286 1.000 N NA
 5807245 5807246 LMHCC_1722 LMHCC_1723 celB   FALSE 0.126 146.000 0.123 NA   NA
 5807246 5807247 LMHCC_1723 LMHCC_1724     FALSE 0.168 92.000 0.000 NA   NA
 5807247 5807248 LMHCC_1724 LMHCC_1725     TRUE 0.476 33.000 0.000 NA   NA
 5807248 5807249 LMHCC_1725 LMHCC_1726     TRUE 0.856 16.000 0.333 NA   NA
 5807249 5807250 LMHCC_1726 LMHCC_T054     FALSE 0.069 153.000 0.000 NA   NA
 5807250 5807251 LMHCC_T054 LMHCC_T012     TRUE 0.856 4.000 0.000 NA   NA
 5807251 5807252 LMHCC_T012 LMHCC_1727     FALSE 0.355 53.000 0.000 NA   NA
 5807252 5807253 LMHCC_1727 LMHCC_1728     TRUE 0.940 0.000 0.215 NA   NA
 5807253 5807254 LMHCC_1728 LMHCC_1729     FALSE 0.306 71.000 0.027 1.000 N NA
 5807254 5807255 LMHCC_1729 LMHCC_1730     FALSE 0.044 206.000 0.000 1.000   NA
 5807255 5807256 LMHCC_1730 LMHCC_1731   sigB TRUE 0.949 1.000 0.243 1.000   NA
 5807256 5807257 LMHCC_1731 LMHCC_1732 sigB rsbW TRUE 0.974 -22.000 0.838 1.000 N NA
 5807257 5807258 LMHCC_1732 LMHCC_1733 rsbW   TRUE 0.995 -16.000 0.714 1.000 Y NA
 5807258 5807259 LMHCC_1733 LMHCC_1734     TRUE 0.536 150.000 0.440 1.000 Y NA
 5807259 5807260 LMHCC_1734 LMHCC_1735     TRUE 0.976 17.000 0.617 1.000 Y NA
 5807260 5807261 LMHCC_1735 LMHCC_1736     TRUE 0.987 3.000 0.320 NA Y NA
 5807261 5807262 LMHCC_1736 LMHCC_1737     TRUE 0.984 6.000 0.258 NA Y NA
 5807262 5807263 LMHCC_1737 LMHCC_1738     FALSE 0.172 250.000 0.032 NA Y NA
 5807263 5807264 LMHCC_1738 LMHCC_1739     TRUE 0.962 7.000 0.260 0.042 N NA
 5807264 5807265 LMHCC_1739 LMHCC_1740   alr FALSE 0.053 206.000 0.108 1.000 N NA
 5807265 5807266 LMHCC_1740 LMHCC_1741 alr acpS TRUE 0.780 19.000 0.093 1.000 N NA
 5807266 5807267 LMHCC_1741 LMHCC_1742 acpS hemG TRUE 0.900 2.000 0.017 1.000 N NA
 5807267 5807268 LMHCC_1742 LMHCC_1743 hemG   FALSE 0.124 150.000 0.170 NA   NA
 5807268 5807269 LMHCC_1743 LMHCC_1744     TRUE 0.955 -7.000 0.216 NA   NA
 5807271 5807272 LMHCC_1746 LMHCC_1747     FALSE 0.153 118.000 0.111 NA N NA
 5807272 5807273 LMHCC_1747 LMHCC_1748     TRUE 0.833 18.000 0.542 NA N NA
 5807273 5807274 LMHCC_1748 LMHCC_1749     TRUE 0.954 0.000 0.480 1.000 N NA
 5807274 5807275 LMHCC_1749 LMHCC_1750     TRUE 0.966 21.000 0.440 1.000 Y NA
 5807275 5807276 LMHCC_1750 LMHCC_1751     TRUE 0.987 20.000 0.786 0.024 Y NA
 5807276 5807277 LMHCC_1751 LMHCC_1752     TRUE 0.996 1.000 0.733 0.024 Y NA
 5807277 5807278 LMHCC_1752 LMHCC_1753     TRUE 0.953 15.000 0.600 0.026 N NA
 5807278 5807279 LMHCC_1753 LMHCC_1754     FALSE 0.032 208.000 0.000 1.000 N NA
 5807281 5807282 LMHCC_1756 LMHCC_1757     TRUE 0.813 11.000 0.000 NA   NA
 5807282 5807283 LMHCC_1757 LMHCC_1758     TRUE 0.856 4.000 0.000 NA   NA
 5807283 5807284 LMHCC_1758 LMHCC_1759     TRUE 0.856 4.000 0.000 NA   NA
 5807284 5807285 LMHCC_1759 LMHCC_1760     TRUE 0.866 3.000 0.000 NA   NA
 5807285 5807286 LMHCC_1760 LMHCC_1761     FALSE 0.017 283.000 0.000 NA   NA
 5807286 5807287 LMHCC_1761 LMHCC_1762     FALSE 0.010 444.000 0.004 NA   NA
 5807287 5807288 LMHCC_1762 LMHCC_1763     FALSE 0.009 462.000 0.000 1.000 N NA
 5807288 5807289 LMHCC_1763 LMHCC_1764     TRUE 0.992 -3.000 0.529 NA Y NA
 5807289 5807290 LMHCC_1764 LMHCC_1765     TRUE 0.821 22.000 0.529 NA   NA
 5807290 5807291 LMHCC_1765 LMHCC_1766     TRUE 0.942 2.000 0.400 NA   NA
 5807291 5807292 LMHCC_1766 LMHCC_1767     TRUE 0.971 16.000 0.200 1.000 Y NA
 5807292 5807293 LMHCC_1767 LMHCC_1768     TRUE 0.997 -13.000 0.711 0.031 Y NA
 5807293 5807294 LMHCC_1768 LMHCC_1769     TRUE 0.822 120.000 0.733 0.031 Y NA
 5807296 5807297 LMHCC_1771 LMHCC_1772     TRUE 0.478 67.000 0.216 1.000   NA
 5807297 5807298 LMHCC_1772 LMHCC_1773     TRUE 0.974 25.000 0.046 0.004 Y NA
 5807298 5807299 LMHCC_1773 LMHCC_1774     FALSE 0.095 150.000 0.027 1.000 N NA
 5807299 5807300 LMHCC_1774 LMHCC_1775     TRUE 0.995 3.000 0.941 0.064 Y NA
 5807300 5807301 LMHCC_1775 LMHCC_1776     TRUE 0.880 17.000 0.706 1.000 N NA
 5807301 5807302 LMHCC_1776 LMHCC_1777     FALSE 0.355 80.000 0.297 NA   NA
 5807302 5807303 LMHCC_1777 LMHCC_1778     FALSE 0.028 222.000 0.000 NA   NA
 5807303 5807304 LMHCC_1778 LMHCC_1779     FALSE 0.244 72.000 0.000 NA   NA
 5807304 5807305 LMHCC_1779 LMHCC_1780     TRUE 0.414 41.000 0.000 NA   NA
 5807307 5807308 LMHCC_1782 LMHCC_1783     TRUE 0.994 -7.000 0.414 1.000 Y NA
 5807308 5807309 LMHCC_1783 LMHCC_1784     FALSE 0.065 170.000 0.009 1.000 N NA
 5807309 5807310 LMHCC_1784 LMHCC_1785     FALSE 0.175 105.000 0.008 1.000 N NA
 5807310 5807311 LMHCC_1785 LMHCC_1786     FALSE 0.020 220.000 0.000 NA N NA
 5807314 5807315 LMHCC_1789 LMHCC_1790     FALSE 0.223 130.000 0.462 1.000 N NA
 5807316 5807317 LMHCC_1791 LMHCC_1792     FALSE 0.047 294.000 0.000 0.046 N NA
 5807319 5807320 LMHCC_1794 LMHCC_1795     TRUE 0.614 23.000 0.000 NA   NA
 5807320 5807321 LMHCC_1795 LMHCC_1796     FALSE 0.084 141.000 0.000 NA   NA
 5807321 5807322 LMHCC_1796 LMHCC_1797     FALSE 0.191 83.000 0.000 NA   NA
 5807322 5807323 LMHCC_1797 LMHCC_1798     FALSE 0.135 191.000 0.727 1.000   NA
 5807324 5807325 LMHCC_1799 LMHCC_1800   fbp FALSE 0.275 111.000 0.222 1.000   NA
 5807326 5807327 LMHCC_1801 LMHCC_1802 nifJ   FALSE 0.089 155.000 0.032 1.000 N NA
 5807327 5807328 LMHCC_1802 LMHCC_1803     FALSE 0.046 198.000 0.013 1.000 N NA
 5807328 5807329 LMHCC_1803 LMHCC_1804     TRUE 0.513 41.000 0.065 NA   NA
 5807329 5807330 LMHCC_1804 LMHCC_1805     FALSE 0.359 79.000 0.265 NA   NA
 5807332 5807333 LMHCC_1807 LMHCC_1808     TRUE 0.833 17.000 0.244 NA   NA
 5807333 5807334 LMHCC_1808 LMHCC_1809     FALSE 0.229 112.000 0.220 NA   NA
 5807334 5807335 LMHCC_1809 LMHCC_1810     TRUE 0.857 15.000 0.265 NA   NA
 5807337 5807338 LMHCC_1812 LMHCC_1813     FALSE 0.014 315.000 0.000 NA   NA
 5807338 5807339 LMHCC_1813 LMHCC_1814     TRUE 0.459 85.000 0.818 1.000   NA
 5807339 5807340 LMHCC_1814 LMHCC_1815     FALSE 0.164 138.000 0.089 1.000   NA
 5807340 5807341 LMHCC_1815 LMHCC_1816     TRUE 0.416 68.000 0.073 1.000   NA
 5807342 5807343 LMHCC_1817 LMHCC_1818     FALSE 0.337 85.000 0.167 1.000   NA
 5807344 5807345 LMHCC_1819 LMHCC_1820     FALSE 0.060 162.000 0.000 NA   NA
 5807346 5807347 LMHCC_1821 LMHCC_1822     TRUE 0.843 34.000 0.000 0.002   NA
 5807348 5807349 LMHCC_1823 LMHCC_1824     FALSE 0.020 265.000 0.000 NA   NA
 5807349 5807350 LMHCC_1824 LMHCC_1825     TRUE 0.996 -3.000 0.253 0.031 Y NA
 5807350 5807351 LMHCC_1825 LMHCC_1826     TRUE 0.997 -3.000 0.492 0.031 Y NA
 5807351 5807352 LMHCC_1826 LMHCC_1827     TRUE 0.997 0.000 0.928 0.031 Y NA
 5807352 5807353 LMHCC_1827 LMHCC_1828     TRUE 0.910 10.000 0.326 1.000 N NA
 5807354 5807355 LMHCC_1829 LMHCC_1830     TRUE 0.784 28.000 0.889 NA   NA
 5807356 5807357 LMHCC_1831 LMHCC_1832     FALSE 0.198 129.000 0.113 1.000   NA
 5807357 5807358 LMHCC_1832 LMHCC_1833     FALSE 0.116 152.000 0.155 NA   NA
 5807359 5807360 LMHCC_1834 LMHCC_1835     FALSE 0.012 356.000 0.000 1.000 N NA
 5807362 5807363 LMHCC_1837 LMHCC_1838   rarD FALSE 0.178 108.000 0.028 NA   NA
 5807363 5807364 LMHCC_1838 LMHCC_1839 rarD   FALSE 0.284 84.000 0.026 1.000   NA
 5807364 5807365 LMHCC_1839 LMHCC_1840     FALSE 0.180 114.000 0.059 NA   NA
 5807366 5807367 LMHCC_1841 LMHCC_1842     FALSE 0.297 104.000 0.429 NA   NA
 5807368 5807369 LMHCC_1843 LMHCC_1844 ybaK   TRUE 0.667 27.000 0.018 1.000   NA
 5807370 5807371 LMHCC_1845 LMHCC_1846     FALSE 0.020 265.000 0.000 NA   NA
 5807371 5807372 LMHCC_1846 LMHCC_1847     FALSE 0.091 193.000 0.421 1.000 N NA
 5807375 5807376 LMHCC_1850 LMHCC_1851     TRUE 0.996 0.000 0.550 0.024 Y NA
 5807376 5807377 LMHCC_1851 LMHCC_1852     TRUE 0.575 175.000 0.234 0.036 Y NA
 5807377 5807378 LMHCC_1852 LMHCC_1853     TRUE 0.988 18.000 0.939 0.036 Y NA
 5807379 5807380 LMHCC_1854 LMHCC_1855     TRUE 0.438 37.000 0.000 NA   NA
 5807384 5807385 LMHCC_1859 LMHCC_1860     TRUE 0.634 40.000 0.423 NA   NA
 5807387 5807388 LMHCC_1862 LMHCC_1863     TRUE 0.738 35.000 1.000 NA   NA
 5807388 5807389 LMHCC_1863 LMHCC_1864     FALSE 0.186 133.000 0.273 NA   NA
 5807389 5807390 LMHCC_1864 LMHCC_1865     TRUE 0.932 6.000 0.265 1.000   NA
 5807390 5807391 LMHCC_1865 LMHCC_1866   hflX FALSE 0.390 66.000 0.010 1.000   NA
 5807391 5807392 LMHCC_1866 LMHCC_1867 hflX   FALSE 0.018 328.000 0.000 1.000   NA
 5807392 5807393 LMHCC_1867 LMHCC_1868     TRUE 0.885 10.000 0.123 NA   NA
 5807393 5807394 LMHCC_1868 LMHCC_1869     TRUE 0.905 7.000 0.200 NA   NA
 5807394 5807395 LMHCC_1869 LMHCC_1870     TRUE 0.962 -3.000 0.526 NA   NA
 5807395 5807396 LMHCC_1870 LMHCC_1871     FALSE 0.193 127.000 0.233 NA   NA
 5807396 5807397 LMHCC_1871 LMHCC_1872     TRUE 0.971 -7.000 0.791 NA   NA
 5807397 5807398 LMHCC_1872 LMHCC_1873     TRUE 0.974 -28.000 0.850 1.000 N NA
 5807398 5807399 LMHCC_1873 LMHCC_1874     FALSE 0.211 115.000 0.175 NA   NA
 5807399 5807400 LMHCC_1874 LMHCC_1875     FALSE 0.371 81.000 0.409 NA   NA
 5807400 5807401 LMHCC_1875 LMHCC_1876     FALSE 0.203 126.000 0.267 NA   NA
 5807401 5807402 LMHCC_1876 LMHCC_1877     FALSE 0.240 96.000 0.100 NA   NA
 5807402 5807403 LMHCC_1877 LMHCC_1878     TRUE 0.598 55.000 0.667 NA   NA
 5807403 5807404 LMHCC_1878 LMHCC_1879     TRUE 0.941 -7.000 0.051 NA   NA
 5807404 5807405 LMHCC_1879 LMHCC_1880     TRUE 0.934 -3.000 0.051 NA   NA
 5807405 5807406 LMHCC_1880 LMHCC_1881     FALSE 0.358 107.000 1.000 NA   NA
 5807408 5807409 LMHCC_1883 LMHCC_1884     TRUE 0.707 29.000 0.385 NA   NA
 5807409 5807410 LMHCC_1884 LMHCC_1885     TRUE 0.884 15.000 0.538 NA   NA
 5807410 5807411 LMHCC_1885 LMHCC_1886     TRUE 0.967 -3.000 0.750 NA   NA
 5807411 5807412 LMHCC_1886 LMHCC_1887     TRUE 0.972 -16.000 0.750 1.000 N NA
 5807414 5807415 LMHCC_1889 LMHCC_1890     FALSE 0.090 154.000 0.000 1.000   NA
 5807417 5807418 LMHCC_1892 LMHCC_1893     FALSE 0.075 148.000 0.000 NA   NA
 5807418 5807419 LMHCC_1893 LMHCC_1894     TRUE 0.861 14.000 0.241 NA   NA
 5807419 5807420 LMHCC_1894 LMHCC_1895     FALSE 0.240 86.000 0.049 NA   NA
 5807420 5807421 LMHCC_1895 LMHCC_1896   glmS FALSE 0.160 114.000 0.014 1.000 N NA
 5807421 5807422 LMHCC_1896 LMHCC_1897 glmS   FALSE 0.181 101.000 0.005 NA   NA
 5807424 5807425 LMHCC_1899 LMHCC_1900     TRUE 0.891 13.000 0.391 NA   NA
 5807425 5807426 LMHCC_1900 LMHCC_1901