MicrobesOnline Operon Predictions for Ureaplasma urealyticum serovar 4 str. ATCC 27816

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5966004 5966005 UUR4_0001 UUR4_0002 rplT rpmI TRUE 0.964 55.000 0.928 0.094 Y NA
 5966005 5966006 UUR4_0002 UUR4_0003 rpmI infC TRUE 0.991 15.000 0.652 1.000 Y NA
 5966006 5966007 UUR4_0003 UUR4_0004 infC   FALSE 0.153 198.000 0.002 1.000   NA
 5966007 5966008 UUR4_0004 UUR4_0005     TRUE 0.382 174.000 1.000 NA   NA
 5966008 5966009 UUR4_0005 UUR4_0006     TRUE 0.979 10.000 1.000 NA   NA
 5966009 5966010 UUR4_0006 UUR4_0007     TRUE 0.887 57.000 1.000 NA   NA
 5966010 5966011 UUR4_0007 UUR4_0008     TRUE 0.382 178.000 1.000 NA   NA
 5966011 5966012 UUR4_0008 UUR4_0009     FALSE 0.120 214.000 0.000 1.000   NA
 5966012 5966013 UUR4_0009 UUR4_0010   fhs TRUE 0.610 132.000 0.500 1.000 N NA
 5966013 5966014 UUR4_0010 UUR4_0011 fhs   TRUE 0.856 14.000 0.000 NA   NA
 5966014 5966015 UUR4_0011 UUR4_0012     FALSE 0.113 117.000 0.000 NA   NA
 5966015 5966016 UUR4_0012 UUR4_0013     TRUE 0.706 172.000 1.000 0.005 Y NA
 5966016 5966017 UUR4_0013 UUR4_0014   rsgA FALSE 0.180 198.000 0.003 1.000   NA
 5966017 5966018 UUR4_0014 UUR4_0015 rsgA   TRUE 0.961 3.000 0.024 1.000   NA
 5966018 5966019 UUR4_0015 UUR4_0016     TRUE 0.987 5.000 0.093 1.000 Y NA
 5966019 5966020 UUR4_0016 UUR4_0017     TRUE 0.907 4.000 0.003 NA   NA
 5966020 5966021 UUR4_0017 UUR4_0018   gmk TRUE 0.779 -16.000 0.003 NA   NA
 5966022 5966023 UUR4_0019 UUR4_0020 rplU   TRUE 0.984 6.000 0.208 NA Y NA
 5966023 5966024 UUR4_0020 UUR4_0021   rpmA TRUE 0.984 6.000 0.203 NA Y NA
 5966024 5966025 UUR4_0021 UUR4_0022 rpmA   FALSE 0.124 111.000 0.000 NA   NA
 5966027 5966028 UUR4_0024 UUR4_0025     TRUE 0.563 103.000 1.000 NA   NA
 5966028 5966029 UUR4_0025 UUR4_0026     TRUE 0.934 15.000 0.006 NA   NA
 5966029 5966030 UUR4_0026 UUR4_0027   plsX TRUE 0.966 5.000 0.021 1.000   NA
 5966030 5966031 UUR4_0027 UUR4_0028 plsX rnc TRUE 0.956 -10.000 0.020 1.000 N NA
 5966031 5966032 UUR4_0028 UUR4_0029 rnc rpsO TRUE 0.366 112.000 0.002 1.000 N NA
 5966032 5966033 UUR4_0029 UUR4_0030 rpsO   FALSE 0.077 290.000 0.000 NA   NA
 5966034 5966035 UUR4_0031 UUR4_0032     TRUE 0.982 4.000 0.006 0.005 Y NA
 5966035 5966036 UUR4_0032 UUR4_0033     TRUE 0.467 159.000 0.200 NA Y NA
 5966036 5966037 UUR4_0033 UUR4_0034   pstB TRUE 0.980 24.000 0.258 NA Y NA
 5966037 5966038 UUR4_0034 UUR4_0035 pstB   TRUE 0.991 5.000 0.226 0.005 Y NA
 5966038 5966039 UUR4_0035 UUR4_0036     TRUE 0.976 0.000 0.467 NA Y NA
 5966039 5966040 UUR4_0036 UUR4_0037   metG TRUE 0.518 88.000 0.005 NA N NA
 5966040 5966041 UUR4_0037 UUR4_0038 metG   TRUE 0.966 20.000 0.003 1.000 N NA
 5966041 5966042 UUR4_0038 UUR4_0039     TRUE 0.919 2.000 0.003 1.000   NA
 5966042 5966043 UUR4_0039 UUR4_0040     TRUE 0.942 4.000 0.004 1.000   NA
 5966043 5966044 UUR4_0040 UUR4_0041   prs TRUE 0.982 4.000 0.040 1.000 N NA
 5966044 5966045 UUR4_0041 UUR4_0042 prs   TRUE 0.964 25.000 0.080 1.000   NA
 5966047 5966048 UUR4_0044 UUR4_0045   rpoC FALSE 0.125 140.000 0.002 NA   NA
 5966048 5966049 UUR4_0045 UUR4_0046 rpoC rpoB TRUE 0.992 22.000 0.851 0.008 Y NA
 5966049 5966050 UUR4_0046 UUR4_0047 rpoB pyk TRUE 0.326 122.000 0.002 1.000 N NA
 5966050 5966051 UUR4_0047 UUR4_0048 pyk   TRUE 0.988 12.000 0.019 0.013 Y NA
 5966051 5966052 UUR4_0048 UUR4_0049   eno TRUE 0.972 -31.000 0.400 0.013 Y NA
 5966052 5966053 UUR4_0049 UUR4_0050 eno   TRUE 0.416 119.000 0.400 NA   NA
 5966053 5966054 UUR4_0050 UUR4_0051   gpmI TRUE 0.757 43.000 0.003 NA   NA
 5966054 5966055 UUR4_0051 UUR4_0052 gpmI tpiA TRUE 0.959 31.000 0.006 1.000 Y NA
 5966057 5966058 UUR4_0054 UUR4_0055     TRUE 0.496 95.000 0.087 NA   NA
 5966058 5966059 UUR4_0055 UUR4_0056     TRUE 0.989 8.000 0.261 1.000 Y NA
 5966059 5966060 UUR4_0056 UUR4_0057     TRUE 0.964 -13.000 0.222 1.000 N NA
 5966061 5966062 UUR4_0058 UUR4_0059 trpS   FALSE 0.190 203.000 0.004 1.000   NA
 5966062 5966063 UUR4_0059 UUR4_0060     FALSE 0.214 88.000 0.000 NA   NA
 5966064 5966065 UUR4_0061 UUR4_0062     FALSE 0.076 269.000 0.000 NA   NA
 5966065 5966066 UUR4_0062 UUR4_0063     FALSE 0.079 320.000 0.000 NA   NA
 5966068 5966069 UUR4_0696 UUR4_0697     TRUE 0.799 2.000 0.000 NA   NA
 5966071 5966072 UUR4_0068 UUR4_0069   ftsY TRUE 0.942 -10.000 0.081 1.000   NA
 5966072 5966073 UUR4_0069 UUR4_0070 ftsY   TRUE 0.986 3.000 0.165 0.028 N NA
 5966073 5966074 UUR4_0070 UUR4_0071     TRUE 0.512 69.000 0.003 NA   NA
 5966075 5966076 UUR4_0072 UUR4_0073   atpB TRUE 0.792 41.000 0.005 NA   NA
 5966076 5966077 UUR4_0073 UUR4_0074 atpB   TRUE 0.931 63.000 0.085 0.027 Y NA
 5966079 5966080 UUR4_0076 UUR4_0077   atpH TRUE 0.987 4.000 0.022 0.025 Y NA
 5966080 5966081 UUR4_0077 UUR4_0078 atpH   TRUE 0.960 10.000 0.004 0.025   NA
 5966081 5966082 UUR4_0078 UUR4_0079   atpA TRUE 0.983 3.000 0.864 0.025   NA
 5966082 5966083 UUR4_0079 UUR4_0080 atpA   TRUE 0.897 15.000 0.002 NA   NA
 5966083 5966084 UUR4_0080 UUR4_0081   atpG TRUE 0.854 2.000 0.002 NA   NA
 5966084 5966085 UUR4_0081 UUR4_0082 atpG atpD TRUE 0.991 24.000 0.724 0.025 Y NA
 5966085 5966086 UUR4_0082 UUR4_0083 atpD atpC TRUE 0.988 0.000 0.837 0.025 Y NA
 5966086 5966087 UUR4_0083 UUR4_0084 atpC   FALSE 0.107 224.000 0.002 NA   NA
 5966087 5966088 UUR4_0084 UUR4_0085     TRUE 0.458 128.000 1.000 NA   NA
 5966088 5966089 UUR4_0085 UUR4_0087     TRUE 0.857 12.000 0.000 NA   NA
 5966090 5966091 UUR4_0086 UUR4_0088   cysS TRUE 0.982 2.000 0.088 1.000 Y NA
 5966091 5966092 UUR4_0088 UUR4_0089 cysS   TRUE 0.889 17.000 0.002 NA   NA
 5966093 5966094 UUR4_0090 UUR4_0091     FALSE 0.224 87.000 0.000 NA   NA
 5966094 5966095 UUR4_0091 UUR4_0092     FALSE 0.085 437.000 0.000 NA   NA
 5966096 5966097 UUR4_0093 UUR4_0094 ligA uvrB TRUE 0.641 93.000 0.006 1.000 Y NA
 5966097 5966098 UUR4_0094 UUR4_0095 uvrB secA TRUE 0.961 3.000 0.004 1.000 N NA
 5966098 5966099 UUR4_0095 UUR4_0096 secA   TRUE 0.980 17.000 0.017 1.000 N NA
 5966100 5966101 UUR4_0097 UUR4_0698 tyrS srpB TRUE 0.828 22.000 0.000 NA   NA
 5966101 5966102 UUR4_0698 UUR4_0098 srpB upp FALSE 0.106 121.000 0.000 NA   NA
 5966103 5966104 UUR4_0699 UUR4_0100     TRUE 0.486 59.000 0.000 NA   NA
 5966104 5966105 UUR4_0100 UUR4_0101   folA TRUE 0.854 9.000 0.000 NA   NA
 5966105 5966106 UUR4_0101 UUR4_0700 folA rrf FALSE 0.082 146.000 0.000 NA   NA
 5966106 5966107 UUR4_0700 UUR4_0701 rrf rrl TRUE 0.373 69.000 0.000 NA   NA
 5966107 5966108 UUR4_0701 UUR4_0702 rrl rrs FALSE 0.077 295.000 0.000 NA   NA
 5966108 5966109 UUR4_0702 UUR4_0103 rrs   FALSE 0.075 247.000 0.000 NA   NA
 5966109 5966110 UUR4_0103 UUR4_0104     TRUE 0.965 22.000 0.005 1.000 N NA
 5966110 5966111 UUR4_0104 UUR4_0105     TRUE 0.670 65.000 0.011 NA   NA
 5966111 5966112 UUR4_0105 UUR4_0106     TRUE 0.311 119.000 0.022 NA   NA
 5966112 5966113 UUR4_0106 UUR4_0107     TRUE 0.980 4.000 0.253 0.089   NA
 5966113 5966114 UUR4_0107 UUR4_0108     TRUE 0.978 -13.000 0.492 0.041 Y NA
 5966114 5966115 UUR4_0108 UUR4_0109     TRUE 0.656 -16.000 0.000 NA   NA
 5966115 5966116 UUR4_0109 UUR4_0111     FALSE 0.075 244.000 0.000 NA   NA
 5966116 5966117 UUR4_0111 UUR4_0112     FALSE 0.284 77.000 0.000 NA   NA
 5966117 5966118 UUR4_0112 UUR4_0113   serS FALSE 0.074 239.000 0.000 NA   NA
 5966118 5966119 UUR4_0113 UUR4_0114 serS   TRUE 0.405 111.000 0.003 1.000 N NA
 5966119 5966120 UUR4_0114 UUR4_0115   hpt TRUE 0.986 5.000 0.192 1.000 N NA
 5966120 5966121 UUR4_0115 UUR4_0116 hpt   TRUE 0.705 66.000 0.021 NA   NA
 5966121 5966122 UUR4_0116 UUR4_0117   uvrA TRUE 0.888 5.000 0.002 NA   NA
 5966123 5966124 UUR4_0118 UUR4_0119     FALSE 0.091 138.000 0.000 NA   NA
 5966124 5966125 UUR4_0119 UUR4_0120     TRUE 0.614 -28.000 0.000 NA   NA
 5966126 5966127 UUR4_0121 UUR4_0123     FALSE 0.108 120.000 0.000 NA   NA
 5966127 5966128 UUR4_0123 UUR4_0124     TRUE 0.945 0.000 0.250 NA   NA
 5966128 5966129 UUR4_0124 UUR4_0125   ffh FALSE 0.074 227.000 0.000 NA   NA
 5966131 5966132 UUR4_0127 UUR4_0128     TRUE 0.974 10.000 0.604 NA   NA
 5966132 5966133 UUR4_0128 UUR4_0129     TRUE 0.964 8.000 0.100 NA   NA
 5966134 5966135 UUR4_0130 UUR4_0131     TRUE 0.920 -16.000 0.500 NA   NA
 5966135 5966136 UUR4_0131 UUR4_0132     FALSE 0.080 322.000 0.000 NA   NA
 5966136 5966137 UUR4_0132 UUR4_0133     FALSE 0.093 136.000 0.000 NA   NA
 5966137 5966138 UUR4_0133 UUR4_0134     FALSE 0.089 632.000 0.000 NA   NA
 5966138 5966139 UUR4_0134 UUR4_0135     FALSE 0.080 335.000 0.000 NA   NA
 5966139 5966140 UUR4_0135 UUR4_0136     FALSE 0.078 298.000 0.000 NA   NA
 5966141 5966142 UUR4_0137 UUR4_0138   recA TRUE 0.925 36.000 0.018 1.000   NA
 5966142 5966143 UUR4_0138 UUR4_0139 recA   TRUE 0.733 41.000 0.002 NA   NA
 5966143 5966144 UUR4_0139 UUR4_0140   gyrA FALSE 0.170 110.000 0.002 NA   NA
 5966144 5966145 UUR4_0140 UUR4_0141 gyrA gyrB TRUE 0.992 19.000 0.306 0.009 Y NA
 5966145 5966146 UUR4_0141 UUR4_0142 gyrB   TRUE 0.893 8.000 0.002 NA   NA
 5966146 5966147 UUR4_0142 UUR4_0143   dnaN FALSE 0.150 195.000 0.005 NA   NA
 5966148 5966149 UUR4_0144 UUR4_0145 pth tilS TRUE 0.938 -28.000 0.025 1.000 N NA
 5966149 5966150 UUR4_0145 UUR4_0146 tilS hprK TRUE 0.931 0.000 0.002 1.000 N NA
 5966150 5966151 UUR4_0146 UUR4_0147 hprK lgt TRUE 0.976 1.000 0.064 1.000 N NA
 5966151 5966152 UUR4_0147 UUR4_0148 lgt trxB TRUE 0.986 18.000 0.101 1.000 N NA
 5966152 5966153 UUR4_0148 UUR4_0149 trxB   TRUE 0.837 -34.000 0.018 NA   NA
 5966155 5966156 UUR4_0151 UUR4_0152     TRUE 0.857 12.000 0.000 NA   NA
 5966156 5966157 UUR4_0152 UUR4_0153     TRUE 0.958 5.000 0.000 1.000 Y NA
 5966157 5966158 UUR4_0153 UUR4_0154     TRUE 0.579 92.000 0.030 1.000   NA
 5966158 5966159 UUR4_0154 UUR4_0155     TRUE 0.952 38.000 0.667 1.000   NA
 5966161 5966162 UUR4_0157 UUR4_0158 pepF   TRUE 0.802 25.000 0.000 NA   NA
 5966163 5966164 UUR4_0159 UUR4_0160 lysS   TRUE 0.388 78.000 0.003 NA   NA
 5966164 5966165 UUR4_0160 UUR4_0161     TRUE 0.724 76.000 0.500 NA   NA
 5966165 5966166 UUR4_0161 UUR4_0162     TRUE 0.973 -25.000 0.400 0.007 Y NA
 5966166 5966167 UUR4_0162 UUR4_0163   smpB TRUE 0.960 20.000 0.002 1.000 N NA
 5966167 5966168 UUR4_0163 UUR4_0164 smpB   FALSE 0.099 128.000 0.000 NA   NA
 5966168 5966169 UUR4_0164 UUR4_0165   rnr TRUE 0.857 12.000 0.000 NA   NA
 5966169 5966170 UUR4_0165 UUR4_0166 rnr   TRUE 0.909 1.000 0.003 1.000   NA
 5966170 5966171 UUR4_0166 UUR4_0167     TRUE 0.718 88.000 0.667 1.000   NA
 5966171 5966172 UUR4_0167 UUR4_0168     FALSE 0.074 239.000 0.000 NA   NA
 5966172 5966173 UUR4_0168 UUR4_0169   atpD FALSE 0.077 157.000 0.000 NA   NA
 5966173 5966174 UUR4_0169 UUR4_0170 atpD   TRUE 0.989 0.000 1.000 0.023 Y NA
 5966174 5966175 UUR4_0170 UUR4_0171     TRUE 0.856 16.000 0.000 NA   NA
 5966175 5966176 UUR4_0171 UUR4_0172     TRUE 0.711 -10.000 0.000 NA   NA
 5966176 5966177 UUR4_0172 UUR4_0173     TRUE 0.950 -10.000 1.000 NA   NA
 5966177 5966178 UUR4_0173 UUR4_0174     TRUE 0.960 3.000 0.250 NA   NA
 5966178 5966179 UUR4_0174 UUR4_0175     TRUE 0.918 -13.000 0.250 NA   NA
 5966179 5966180 UUR4_0175 UUR4_0176     TRUE 0.945 30.000 0.250 NA   NA
 5966180 5966181 UUR4_0176 UUR4_0177     TRUE 0.979 15.000 1.000 NA   NA
 5966181 5966182 UUR4_0177 UUR4_0178     TRUE 0.696 37.000 0.000 NA   NA
 5966182 5966183 UUR4_0178 UUR4_0179     TRUE 0.751 31.000 0.000 NA   NA
 5966183 5966184 UUR4_0179 UUR4_0180     TRUE 0.965 23.000 0.500 NA   NA
 5966184 5966185 UUR4_0180 UUR4_0181     FALSE 0.241 173.000 0.033 NA   NA
 5966185 5966186 UUR4_0181 UUR4_0182     TRUE 0.727 66.000 0.033 NA   NA
 5966186 5966187 UUR4_0182 UUR4_0183   gidB TRUE 0.875 23.000 0.002 NA   NA
 5966187 5966188 UUR4_0183 UUR4_0184 gidB gidA TRUE 0.976 -7.000 0.466 1.000 N NA
 5966188 5966189 UUR4_0184 UUR4_0185 gidA   TRUE 0.667 76.000 0.002 1.000 N NA
 5966189 5966190 UUR4_0185 UUR4_0186     TRUE 0.757 97.000 0.667 1.000 N NA
 5966191 5966192 UUR4_0187 UUR4_0188     FALSE 0.185 142.000 0.000 0.022   NA
 5966192 5966193 UUR4_0188 UUR4_0189     FALSE 0.256 107.000 0.000 0.080   NA
 5966193 5966194 UUR4_0189 UUR4_0190     TRUE 0.964 4.000 0.000 0.080 Y NA
 5966194 5966195 UUR4_0190 UUR4_0191     TRUE 0.381 142.000 0.667 NA   NA
 5966196 5966197 UUR4_0192 UUR4_0193     FALSE 0.129 109.000 0.000 NA   NA
 5966198 5966199 UUR4_0194 UUR4_0195     TRUE 0.937 6.000 0.009 NA   NA
 5966199 5966200 UUR4_0195 UUR4_0196     TRUE 0.979 15.000 1.000 NA   NA
 5966200 5966201 UUR4_0196 UUR4_0197     FALSE 0.193 98.000 0.002 NA   NA
 5966201 5966202 UUR4_0197 UUR4_0198     FALSE 0.243 172.000 0.002 1.000 N NA
 5966202 5966203 UUR4_0198 UUR4_0199     TRUE 0.819 46.000 0.012 NA   NA
 5966203 5966204 UUR4_0199 UUR4_0200     TRUE 0.578 101.000 1.000 NA   NA
 5966204 5966205 UUR4_0200 UUR4_0201     TRUE 0.990 1.000 1.000 0.037 Y NA
 5966205 5966206 UUR4_0201 UUR4_0202     FALSE 0.214 105.000 0.000 1.000   NA
 5966206 5966207 UUR4_0202 UUR4_0203   tmk TRUE 0.766 -16.000 0.000 1.000   NA
 5966207 5966208 UUR4_0203 UUR4_0204 tmk   TRUE 0.962 0.000 0.254 1.000   NA
 5966208 5966209 UUR4_0204 UUR4_0205   trmE TRUE 0.945 3.000 0.008 1.000   NA
 5966209 5966210 UUR4_0205 UUR4_0206 trmE   TRUE 0.869 2.000 0.003 NA   NA
 5966210 5966211 UUR4_0206 UUR4_0207     TRUE 0.386 168.000 1.000 NA   NA
 5966211 5966212 UUR4_0207 UUR4_0208     TRUE 0.826 56.000 0.012 1.000   NA
 5966212 5966213 UUR4_0208 UUR4_0209     TRUE 0.974 3.000 0.438 1.000   NA
 5966213 5966214 UUR4_0209 UUR4_0210     TRUE 0.975 0.000 0.720 0.037   NA
 5966214 5966215 UUR4_0210 UUR4_0211     FALSE 0.134 393.000 0.000 1.000   NA
 5966216 5966217 UUR4_0212 UUR4_0213 rplL   TRUE 0.990 25.000 0.884 0.077 Y NA
 5966217 5966218 UUR4_0213 UUR4_0214   mgtE FALSE 0.262 157.000 0.002 1.000 N NA
 5966218 5966219 UUR4_0214 UUR4_0215 mgtE   TRUE 0.364 147.000 0.667 NA   NA
 5966219 5966220 UUR4_0215 UUR4_0216     TRUE 0.967 3.000 0.667 NA   NA
 5966220 5966221 UUR4_0216 UUR4_0217     FALSE 0.301 125.000 0.031 NA   NA
 5966221 5966222 UUR4_0217 UUR4_0218     TRUE 0.967 5.000 0.012 NA N NA
 5966222 5966223 UUR4_0218 UUR4_0219     TRUE 0.913 -13.000 0.005 NA Y NA
 5966223 5966224 UUR4_0219 UUR4_0220   prfA TRUE 0.978 0.000 0.081 1.000 Y NA
 5966224 5966225 UUR4_0220 UUR4_0221 prfA rpmE TRUE 0.575 142.000 0.110 1.000 Y NA
 5966225 5966226 UUR4_0221 UUR4_0222 rpmE   TRUE 0.311 138.000 0.002 1.000 N NA
 5966227 5966228 UUR4_0223 UUR4_0224 rpmH rnpA TRUE 0.982 6.000 0.787 1.000   NA
 5966228 5966229 UUR4_0224 UUR4_0225 rnpA   TRUE 0.980 20.000 0.021 1.000 N NA
 5966229 5966230 UUR4_0225 UUR4_0226   ksgA TRUE 0.960 2.000 0.005 1.000 N NA
 5966230 5966231 UUR4_0226 UUR4_0227 ksgA   TRUE 0.982 22.000 0.068 1.000 N NA
 5966231 5966232 UUR4_0227 UUR4_0228   gltX TRUE 0.931 -10.000 0.004 1.000 N NA
 5966232 5966233 UUR4_0228 UUR4_0229 gltX   TRUE 0.970 8.000 0.028 1.000   NA
 5966233 5966234 UUR4_0229 UUR4_0230   rpoE TRUE 0.838 51.000 0.007 1.000   NA
 5966234 5966235 UUR4_0230 UUR4_0231 rpoE fba TRUE 0.980 3.000 0.060 1.000 N NA
 5966235 5966236 UUR4_0231 UUR4_0232 fba ychF TRUE 0.973 17.000 0.006 1.000 N NA
 5966236 5966237 UUR4_0232 UUR4_0233 ychF tdk TRUE 0.974 7.000 0.007 1.000 N NA
 5966237 5966238 UUR4_0233 UUR4_0234 tdk   TRUE 0.806 38.000 0.004 NA   NA
 5966238 5966239 UUR4_0234 UUR4_0235   ylqF TRUE 0.926 12.000 0.005 NA   NA
 5966239 5966240 UUR4_0235 UUR4_0236 ylqF   TRUE 0.762 52.000 0.007 NA   NA
 5966240 5966241 UUR4_0236 UUR4_0237   topA TRUE 0.662 73.000 0.002 NA Y NA
 5966241 5966242 UUR4_0237 UUR4_0238 topA   TRUE 0.944 28.000 0.002 1.000 N NA
 5966242 5966243 UUR4_0238 UUR4_0703     FALSE 0.205 89.000 0.000 NA   NA
 5966243 5966244 UUR4_0703 UUR4_0240     FALSE 0.092 137.000 0.000 NA   NA
 5966244 5966245 UUR4_0240 UUR4_0241     TRUE 0.653 103.000 0.080 1.000 N NA
 5966245 5966246 UUR4_0241 UUR4_0242   tkt TRUE 0.960 43.000 0.080 1.000 Y NA
 5966246 5966247 UUR4_0242 UUR4_0243 tkt deoC TRUE 0.976 13.000 0.009 1.000 N NA
 5966247 5966248 UUR4_0243 UUR4_0244 deoC   TRUE 0.357 168.000 0.009 1.000 N NA
 5966248 5966249 UUR4_0244 UUR4_0245     TRUE 0.353 467.000 0.000 0.004 Y NA
 5966249 5966250 UUR4_0245 UUR4_0246     TRUE 0.955 -10.000 0.018 1.000 N NA
 5966251 5966252 UUR4_0247 UUR4_0248     TRUE 0.947 26.000 0.002 1.000 N NA
 5966252 5966253 UUR4_0248 UUR4_0249     TRUE 0.499 180.000 0.200 1.000 N NA
 5966254 5966255 UUR4_0250 UUR4_0704     FALSE 0.091 5919.000 0.000 NA   NA
 5966255 5966256 UUR4_0704 UUR4_0252     FALSE 0.092 7492.000 0.000 NA   NA
 5966258 5966259 UUR4_0254 UUR4_0255 rplM rpsI TRUE 0.992 20.000 0.601 0.075 Y NA
 5966259 5966260 UUR4_0255 UUR4_0256 rpsI   TRUE 0.494 71.000 0.003 NA   NA
 5966260 5966261 UUR4_0256 UUR4_0257     TRUE 0.945 6.000 0.013 NA   NA
 5966262 5966263 UUR4_0258 UUR4_0259     FALSE 0.231 86.000 0.000 NA   NA
 5966264 5966265 UUR4_0260 UUR4_0261     FALSE 0.082 376.000 0.000 NA   NA
 5966265 5966266 UUR4_0261 UUR4_0262     FALSE 0.074 194.000 0.000 NA   NA
 5966266 5966267 UUR4_0262 UUR4_0263     FALSE 0.074 229.000 0.000 NA   NA
 5966267 5966268 UUR4_0263 UUR4_0264     FALSE 0.084 403.000 0.000 NA   NA
 5966268 5966269 UUR4_0264 UUR4_0265     FALSE 0.076 160.000 0.000 NA   NA
 5966269 5966270 UUR4_0265 UUR4_0266     TRUE 0.943 34.000 0.015 0.013   NA
 5966270 5966271 UUR4_0266 UUR4_0267   rpsP TRUE 0.306 97.000 0.002 1.000   NA
 5966271 5966272 UUR4_0267 UUR4_0268 rpsP trmD TRUE 0.986 13.000 0.033 1.000 Y NA
 5966272 5966273 UUR4_0268 UUR4_0269 trmD rplS TRUE 0.991 11.000 0.567 1.000 Y NA
 5966273 5966274 UUR4_0269 UUR4_0270 rplS   FALSE 0.156 134.000 0.003 NA   NA
 5966274 5966275 UUR4_0270 UUR4_0271     FALSE 0.088 510.000 0.000 NA   NA
 5966275 5966276 UUR4_0271 UUR4_0272     TRUE 0.937 -16.000 1.000 NA   NA
 5966276 5966277 UUR4_0272 UUR4_0273     TRUE 0.967 16.000 0.182 NA   NA
 5966277 5966278 UUR4_0273 UUR4_0274     TRUE 0.994 5.000 1.000 0.036 Y NA
 5966278 5966279 UUR4_0274 UUR4_0275     TRUE 0.990 4.000 0.692 1.000 Y NA
 5966279 5966280 UUR4_0275 UUR4_0276     TRUE 0.994 18.000 0.769 0.004 Y NA
 5966280 5966281 UUR4_0276 UUR4_0277     TRUE 0.851 19.000 0.000 NA   NA
 5966281 5966282 UUR4_0277 UUR4_0278     TRUE 0.851 19.000 0.000 NA   NA
 5966282 5966283 UUR4_0278 UUR4_0279     TRUE 0.967 9.000 0.200 NA   NA
 5966283 5966284 UUR4_0279 UUR4_0280     FALSE 0.083 395.000 0.000 NA   NA
 5966284 5966285 UUR4_0280 UUR4_0281     TRUE 0.854 9.000 0.000 NA   NA
 5966285 5966286 UUR4_0281 UUR4_0282     FALSE 0.073 213.000 0.000 NA   NA
 5966286 5966287 UUR4_0282 UUR4_0705     FALSE 0.132 108.000 0.000 NA   NA
 5966289 5966290 UUR4_0285 UUR4_0286   ssb TRUE 0.865 46.000 0.002 1.000 N NA
 5966290 5966291 UUR4_0286 UUR4_0287 ssb rpsR TRUE 0.962 9.000 0.002 1.000 N NA
 5966291 5966292 UUR4_0287 UUR4_0288 rpsR rplI TRUE 0.869 85.000 0.499 0.073 Y NA
 5966292 5966293 UUR4_0288 UUR4_0289 rplI   TRUE 0.950 7.000 0.000 1.000 N NA
 5966293 5966294 UUR4_0289 UUR4_0290     TRUE 0.818 3.000 0.000 NA   NA
 5966294 5966295 UUR4_0290 UUR4_0291   ung TRUE 0.929 -21.000 1.000 NA   NA
 5966295 5966296 UUR4_0291 UUR4_0292 ung   TRUE 0.967 27.000 1.000 NA   NA
 5966296 5966297 UUR4_0292 UUR4_0293     TRUE 0.828 22.000 0.000 NA   NA
 5966297 5966298 UUR4_0293 UUR4_0294   gatA TRUE 0.940 -10.000 0.643 NA   NA
 5966298 5966299 UUR4_0294 UUR4_0295 gatA gatB TRUE 0.991 3.000 0.492 0.004 Y NA
 5966301 5966302 UUR4_0297 UUR4_0298 rplK rplA TRUE 0.991 3.000 0.838 0.099 Y NA
 5966302 5966303 UUR4_0298 UUR4_0299 rplA   FALSE 0.272 143.000 0.002 1.000 N NA
 5966303 5966304 UUR4_0299 UUR4_0300     TRUE 0.907 -12.000 0.000 0.021 N NA
 5966304 5966305 UUR4_0300 UUR4_0301     TRUE 0.865 1.000 0.000 1.000   NA
 5966305 5966306 UUR4_0301 UUR4_0303   truA TRUE 0.847 62.000 0.076 1.000   NA
 5966308 5966309 UUR4_0304 UUR4_0305 thrS rpmG TRUE 0.841 61.000 0.002 1.000 Y NA
 5966309 5966310 UUR4_0305 UUR4_0306 rpmG   TRUE 0.980 11.000 0.014 1.000 N NA
 5966310 5966311 UUR4_0306 UUR4_0706     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 5966311 5966312 UUR4_0706 UUR4_0308   cdd FALSE 0.096 132.000 0.000 NA   NA
 5966312 5966313 UUR4_0308 UUR4_0309 cdd   TRUE 0.967 31.000 0.032 1.000 N NA
 5966313 5966314 UUR4_0309 UUR4_0310     FALSE 0.073 217.000 0.000 NA   NA
 5966314 5966315 UUR4_0310 UUR4_0311     FALSE 0.103 123.000 0.000 NA   NA
 5966315 5966316 UUR4_0311 UUR4_0312     FALSE 0.086 440.000 0.000 NA   NA
 5966316 5966317 UUR4_0312 UUR4_0313     FALSE 0.076 267.000 0.000 NA   NA
 5966317 5966318 UUR4_0313 UUR4_0314     FALSE 0.077 286.000 0.000 NA   NA
 5966318 5966319 UUR4_0314 UUR4_0315   rpsL FALSE 0.235 184.000 0.008 1.000   NA
 5966319 5966320 UUR4_0315 UUR4_0316 rpsL rpsG TRUE 0.985 30.000 0.224 0.014 Y NA
 5966320 5966321 UUR4_0316 UUR4_0317 rpsG   TRUE 0.793 27.000 0.000 NA   NA
 5966321 5966322 UUR4_0317 UUR4_0318   fusA TRUE 0.668 -15.000 0.000 NA   NA
 5966322 5966323 UUR4_0318 UUR4_0319 fusA tuf FALSE 0.092 137.000 0.000 NA   NA
 5966323 5966324 UUR4_0319 UUR4_0320 tuf pepF TRUE 0.460 97.000 0.002 1.000 N NA
 5966324 5966325 UUR4_0320 UUR4_0321 pepF   TRUE 0.786 75.000 1.000 NA   NA
 5966325 5966326 UUR4_0321 UUR4_0322     TRUE 0.587 98.000 1.000 NA   NA
 5966326 5966327 UUR4_0322 UUR4_0323     FALSE 0.075 243.000 0.000 NA   NA
 5966327 5966328 UUR4_0323 UUR4_0324     FALSE 0.090 863.000 0.000 NA   NA
 5966329 5966330 UUR4_0325 UUR4_0326     FALSE 0.254 82.000 0.000 NA   NA
 5966330 5966331 UUR4_0326 UUR4_0327     TRUE 0.895 40.000 0.012 1.000   NA
 5966331 5966332 UUR4_0327 UUR4_0328     TRUE 0.979 2.000 0.012 0.034 Y NA
 5966333 5966334 UUR4_0707 UUR4_0708     TRUE 0.624 45.000 0.000 NA   NA
 5966334 5966335 UUR4_0708 UUR4_0709     TRUE 0.373 69.000 0.000 NA   NA
 5966335 5966336 UUR4_0709 UUR4_0710     TRUE 0.818 3.000 0.000 NA   NA
 5966336 5966337 UUR4_0710 UUR4_0333   tsf FALSE 0.083 144.000 0.000 NA   NA
 5966337 5966338 UUR4_0333 UUR4_0334 tsf pyrH TRUE 0.779 91.000 0.416 1.000 N NA
 5966338 5966339 UUR4_0334 UUR4_0335 pyrH frr TRUE 0.984 18.000 0.626 NA N NA
 5966339 5966340 UUR4_0335 UUR4_0337 frr cdsA TRUE 0.974 11.000 0.020 NA N NA
 5966341 5966342 UUR4_0336 UUR4_0338     TRUE 0.895 -16.000 0.077 NA   NA
 5966343 5966344 UUR4_0339 UUR4_0340     TRUE 0.957 20.000 0.039 NA   NA
 5966344 5966345 UUR4_0340 UUR4_0341     TRUE 0.707 97.000 0.182 1.000 N NA
 5966345 5966346 UUR4_0341 UUR4_0342     FALSE 0.087 498.000 0.000 NA   NA
 5966347 5966348 UUR4_0343 UUR4_0711     FALSE 0.089 512.000 0.000 NA   NA
 5966348 5966349 UUR4_0711 UUR4_0345     TRUE 0.343 72.000 0.000 NA   NA
 5966349 5966350 UUR4_0345 UUR4_0346     TRUE 0.948 16.000 0.013 NA   NA
 5966350 5966351 UUR4_0346 UUR4_0347     TRUE 0.972 23.000 1.000 NA   NA
 5966351 5966352 UUR4_0347 UUR4_0348     TRUE 0.950 -10.000 1.000 NA   NA
 5966353 5966354 UUR4_0712 UUR4_0713     FALSE 0.261 80.000 0.000 NA   NA
 5966354 5966355 UUR4_0713 UUR4_0351     FALSE 0.214 88.000 0.000 NA   NA
 5966355 5966356 UUR4_0351 UUR4_0352     TRUE 0.950 1.000 0.200 NA   NA
 5966356 5966357 UUR4_0352 UUR4_0353     TRUE 0.936 25.000 0.022 NA   NA
 5966357 5966358 UUR4_0353 UUR4_0354     TRUE 0.929 4.000 0.007 NA   NA
 5966358 5966359 UUR4_0354 UUR4_0714     FALSE 0.081 148.000 0.000 NA   NA
 5966359 5966360 UUR4_0714 UUR4_0715     TRUE 0.839 4.000 0.000 NA   NA
 5966360 5966361 UUR4_0715 UUR4_0716     TRUE 0.624 45.000 0.000 NA   NA
 5966361 5966362 UUR4_0716 UUR4_0717     TRUE 0.818 3.000 0.000 NA   NA
 5966362 5966363 UUR4_0717 UUR4_0718     TRUE 0.788 1.000 0.000 NA   NA
 5966363 5966364 UUR4_0718 UUR4_0719     TRUE 0.391 67.000 0.000 NA   NA
 5966364 5966365 UUR4_0719 UUR4_0720     TRUE 0.503 57.000 0.000 NA   NA
 5966365 5966366 UUR4_0720 UUR4_0721     TRUE 0.788 1.000 0.000 NA   NA
 5966369 5966370 UUR4_0365 UUR4_0366   glyS TRUE 0.880 -12.000 0.000 1.000 N NA
 5966370 5966371 UUR4_0366 UUR4_0367 glyS recO TRUE 0.962 36.000 0.034 1.000 N NA
 5966371 5966372 UUR4_0367 UUR4_0368 recO era TRUE 0.958 0.000 0.108 1.000   NA
 5966372 5966373 UUR4_0368 UUR4_0369 era   TRUE 0.913 -7.000 0.026 NA   NA
 5966373 5966374 UUR4_0369 UUR4_0370     TRUE 0.358 70.000 0.000 NA   NA
 5966375 5966376 UUR4_0371 UUR4_0372   apt TRUE 0.895 21.000 0.002 NA   NA
 5966376 5966377 UUR4_0372 UUR4_0374 apt   FALSE 0.073 203.000 0.000 NA   NA
 5966377 5966378 UUR4_0374 UUR4_0375     FALSE 0.081 368.000 0.000 NA   NA
 5966378 5966379 UUR4_0375 UUR4_0376     TRUE 0.736 32.000 0.000 NA   NA
 5966379 5966380 UUR4_0376 UUR4_0377     FALSE 0.084 423.000 0.000 NA   NA
 5966383 5966384 UUR4_0383 UUR4_0384     TRUE 0.689 -12.000 0.000 NA   NA
 5966385 5966386 UUR4_0385 UUR4_0387   apt TRUE 0.838 21.000 0.000 NA   NA
 5966386 5966387 UUR4_0387 UUR4_0388 apt   FALSE 0.074 223.000 0.000 NA   NA
 5966387 5966388 UUR4_0388 UUR4_0389     FALSE 0.082 146.000 0.000 NA   NA
 5966388 5966389 UUR4_0389 UUR4_0390     FALSE 0.074 185.000 0.000 NA   NA
 5966391 5966392 UUR4_0393 UUR4_0395     FALSE 0.074 230.000 0.000 NA   NA
 5966394 5966395 UUR4_0397 UUR4_0398     FALSE 0.079 154.000 0.000 NA   NA
 5966395 5966396 UUR4_0398 UUR4_0399     FALSE 0.079 155.000 0.000 NA   NA
 5966396 5966397 UUR4_0399 UUR4_0400     TRUE 0.850 6.000 0.000 NA   NA
 5966397 5966398 UUR4_0400 UUR4_0401     FALSE 0.078 156.000 0.000 NA   NA
 5966399 5966400 UUR4_0402 UUR4_0403   rplW TRUE 0.973 3.000 0.307 1.000   NA
 5966400 5966401 UUR4_0403 UUR4_0404 rplW rplB TRUE 0.960 54.000 0.849 1.000 Y NA
 5966401 5966402 UUR4_0404 UUR4_0405 rplB rpsS TRUE 0.992 21.000 0.820 0.088 Y NA
 5966402 5966403 UUR4_0405 UUR4_0406 rpsS   TRUE 0.983 22.000 0.769 0.088   NA
 5966403 5966404 UUR4_0406 UUR4_0407   rpsC TRUE 0.984 20.000 0.719 0.088   NA
 5966404 5966405 UUR4_0407 UUR4_0408 rpsC rplP TRUE 0.993 15.000 0.828 0.088 Y NA
 5966405 5966406 UUR4_0408 UUR4_0409 rplP rpmC TRUE 0.988 0.000 0.802 0.064 Y NA
 5966406 5966407 UUR4_0409 UUR4_0410 rpmC rpsQ TRUE 0.988 0.000 0.828 0.064 Y NA
 5966407 5966408 UUR4_0410 UUR4_0411 rpsQ rplN TRUE 0.992 20.000 0.791 0.088 Y NA
 5966408 5966409 UUR4_0411 UUR4_0412 rplN rplX TRUE 0.993 15.000 0.810 0.088 Y NA
 5966409 5966410 UUR4_0412 UUR4_0413 rplX   TRUE 0.993 17.000 0.758 0.064 Y NA
 5966410 5966411 UUR4_0413 UUR4_0414   rpsN TRUE 0.991 4.000 0.496 0.064 Y NA
 5966411 5966412 UUR4_0414 UUR4_0415 rpsN rpsH TRUE 0.992 11.000 0.473 0.064 Y NA
 5966412 5966413 UUR4_0415 UUR4_0416 rpsH   TRUE 0.993 9.000 0.808 0.064 Y NA
 5966413 5966414 UUR4_0416 UUR4_0417   rplR TRUE 0.993 19.000 0.815 0.064 Y NA
 5966414 5966415 UUR4_0417 UUR4_0418 rplR rpsE TRUE 0.993 18.000 0.814 0.088 Y NA
 5966415 5966416 UUR4_0418 UUR4_0419 rpsE rplO TRUE 0.990 17.000 0.148 0.088 Y NA
 5966416 5966417 UUR4_0419 UUR4_0420 rplO secY TRUE 0.953 53.000 0.730 1.000 N NA
 5966417 5966418 UUR4_0420 UUR4_0421 secY adk TRUE 0.987 10.000 0.241 1.000 N NA
 5966418 5966419 UUR4_0421 UUR4_0422 adk map TRUE 0.978 24.000 0.041 1.000 N NA
 5966419 5966420 UUR4_0422 UUR4_0423 map infA TRUE 0.979 28.000 0.051 1.000 Y NA
 5966420 5966421 UUR4_0423 UUR4_0424 infA rpmJ TRUE 0.967 24.000 0.104 1.000   NA
 5966421 5966422 UUR4_0424 UUR4_0425 rpmJ rpsM TRUE 0.967 30.000 0.194 0.064   NA
 5966422 5966423 UUR4_0425 UUR4_0426 rpsM rpsK TRUE 0.992 22.000 0.810 0.064 Y NA
 5966423 5966424 UUR4_0426 UUR4_0427 rpsK rpoA TRUE 0.969 37.000 0.308 1.000 N NA
 5966424 5966425 UUR4_0427 UUR4_0428 rpoA rplQ TRUE 0.984 28.000 0.873 1.000 N NA
 5966425 5966426 UUR4_0428 UUR4_0429 rplQ   FALSE 0.147 102.000 0.000 NA   NA
 5966426 5966427 UUR4_0429 UUR4_0430     FALSE 0.083 144.000 0.000 NA   NA
 5966427 5966428 UUR4_0430 UUR4_0431     TRUE 0.818 3.000 0.000 NA   NA
 5966428 5966429 UUR4_0431 UUR4_0432     TRUE 0.660 84.000 0.500 NA   NA
 5966429 5966430 UUR4_0432 UUR4_0433     TRUE 0.840 -10.000 0.005 NA   NA
 5966431 5966432 UUR4_0434 UUR4_0435     FALSE 0.073 206.000 0.000 NA   NA
 5966433 5966434 UUR4_0436 UUR4_0437   ysxC TRUE 0.932 5.000 0.007 NA   NA
 5966434 5966435 UUR4_0437 UUR4_0438 ysxC valS TRUE 0.888 -19.000 0.013 1.000   NA
 5966435 5966436 UUR4_0438 UUR4_0439 valS   TRUE 0.967 4.000 0.002 1.000 Y NA
 5966436 5966437 UUR4_0439 UUR4_0440   trmB TRUE 0.947 6.000 0.005 1.000   NA
 5966437 5966438 UUR4_0440 UUR4_0722 trmB   TRUE 0.696 37.000 0.000 NA   NA
 5966438 5966439 UUR4_0722 UUR4_0442     FALSE 0.078 156.000 0.000 NA   NA
 5966439 5966440 UUR4_0442 UUR4_0443     TRUE 0.595 47.000 0.000 NA   NA
 5966440 5966441 UUR4_0443 UUR4_0444     TRUE 0.766 0.000 0.000 NA   NA
 5966441 5966442 UUR4_0444 UUR4_0446     TRUE 0.944 14.000 0.011 NA   NA
 5966443 5966444 UUR4_0445 UUR4_0447     TRUE 0.954 13.000 0.021 NA   NA
 5966445 5966446 UUR4_0448 UUR4_0449     TRUE 0.941 4.000 0.013 NA   NA
 5966446 5966447 UUR4_0449 UUR4_0450   rpsU TRUE 0.667 76.000 0.013 1.000   NA
 5966447 5966448 UUR4_0450 UUR4_0451 rpsU argS FALSE 0.217 120.000 0.002 1.000   NA
 5966448 5966449 UUR4_0451 UUR4_0452 argS pgk TRUE 0.947 3.000 0.002 1.000 N NA
 5966449 5966450 UUR4_0452 UUR4_0453 pgk   TRUE 0.946 4.000 0.002 NA Y NA
 5966450 5966451 UUR4_0453 UUR4_0454   deoD TRUE 0.862 75.000 1.000 NA N NA
 5966451 5966452 UUR4_0454 UUR4_0455 deoD   TRUE 0.692 111.000 0.667 1.000 N NA
 5966452 5966453 UUR4_0455 UUR4_0456     TRUE 0.516 140.000 0.065 1.000 N NA
 5966453 5966454 UUR4_0456 UUR4_0457     TRUE 0.766 0.000 0.000 NA   NA
 5966454 5966455 UUR4_0457 UUR4_0458   hisS FALSE 0.080 357.000 0.000 NA   NA
 5966455 5966456 UUR4_0458 UUR4_0459 hisS aspS TRUE 0.990 4.000 0.161 0.059 Y NA
 5966456 5966457 UUR4_0459 UUR4_0460 aspS   TRUE 0.790 -7.000 0.002 NA   NA
 5966457 5966458 UUR4_0460 UUR4_0461   msrA TRUE 0.746 53.000 0.006 NA   NA
 5966459 5966460 UUR4_0462 UUR4_0463     TRUE 0.950 8.000 0.000 1.000 N NA
 5966461 5966462 UUR4_0464 UUR4_0465     FALSE 0.075 259.000 0.000 NA   NA
 5966462 5966463 UUR4_0465 UUR4_0466     TRUE 0.399 154.000 1.000 NA   NA
 5966463 5966464 UUR4_0466 UUR4_0467     TRUE 0.906 14.000 0.002 NA   NA
 5966464 5966465 UUR4_0467 UUR4_0469     TRUE 0.841 0.000 0.002 NA   NA
 5966467 5966468 UUR4_0470 UUR4_0471 efp   TRUE 0.858 3.000 0.002 NA   NA
 5966468 5966469 UUR4_0471 UUR4_0472   nusB TRUE 0.944 3.000 0.027 NA   NA
 5966469 5966470 UUR4_0472 UUR4_0473 nusB   TRUE 0.931 8.000 0.006 NA   NA
 5966470 5966471 UUR4_0473 UUR4_0474     TRUE 0.818 23.000 0.000 NA   NA
 5966471 5966472 UUR4_0474 UUR4_0723   rrs FALSE 0.075 258.000 0.000 NA   NA
 5966472 5966473 UUR4_0723 UUR4_0724 rrs rrl FALSE 0.078 296.000 0.000 NA   NA
 5966473 5966474 UUR4_0724 UUR4_0725 rrl rrf TRUE 0.373 69.000 0.000 NA   NA
 5966474 5966475 UUR4_0725 UUR4_0476 rrf greA FALSE 0.117 115.000 0.000 NA   NA
 5966475 5966476 UUR4_0476 UUR4_0726 greA   FALSE 0.261 80.000 0.000 NA   NA
 5966476 5966477 UUR4_0726 UUR4_0727     TRUE 0.839 4.000 0.000 NA   NA
 5966477 5966478 UUR4_0727 UUR4_0728     TRUE 0.416 65.000 0.000 NA   NA
 5966478 5966479 UUR4_0728 UUR4_0729     TRUE 0.459 62.000 0.000 NA   NA
 5966479 5966480 UUR4_0729 UUR4_0730     TRUE 0.847 5.000 0.000 NA   NA
 5966480 5966481 UUR4_0730 UUR4_0482     TRUE 0.437 63.000 0.000 NA   NA
 5966481 5966482 UUR4_0482 UUR4_0483     TRUE 0.922 2.000 0.004 1.000   NA
 5966483 5966484 UUR4_0484 UUR4_0485     TRUE 0.985 3.000 0.817 NA Y NA
 5966488 5966489 UUR4_0488 UUR4_0489     TRUE 0.925 -22.000 0.209 1.000   NA
 5966489 5966490 UUR4_0489 UUR4_0490     TRUE 0.945 -7.000 0.006 1.000 N NA
 5966490 5966491 UUR4_0490 UUR4_0491     TRUE 0.975 3.000 0.018 1.000 N NA
 5966491 5966492 UUR4_0491 UUR4_0492   ppa TRUE 0.965 0.000 0.015 1.000 N NA
 5966493 5966494 UUR4_0493 UUR4_0494     TRUE 0.784 28.000 0.000 NA   NA
 5966494 5966495 UUR4_0494 UUR4_0495     FALSE 0.250 83.000 0.000 NA   NA
 5966495 5966496 UUR4_0495 UUR4_0496   nusA FALSE 0.185 115.000 0.000 1.000   NA
 5966496 5966497 UUR4_0496 UUR4_0497 nusA   TRUE 0.986 12.000 0.323 NA Y NA
 5966497 5966498 UUR4_0497 UUR4_0498   infB TRUE 0.945 39.000 0.171 NA N NA
 5966498 5966499 UUR4_0498 UUR4_0499 infB rbfA TRUE 0.990 8.000 0.530 1.000 Y NA
 5966499 5966500 UUR4_0499 UUR4_0500 rbfA   TRUE 0.852 7.000 0.000 NA   NA
 5966501 5966502 UUR4_0501 UUR4_0502     FALSE 0.271 78.000 0.000 NA   NA
 5966502 5966503 UUR4_0502 UUR4_0503   lepA TRUE 0.888 13.000 0.002 NA   NA
 5966503 5966504 UUR4_0503 UUR4_0504 lepA   FALSE 0.177 119.000 0.003 NA   NA
 5966505 5966506 UUR4_0505 UUR4_0506     TRUE 0.919 4.000 0.005 NA   NA
 5966506 5966507 UUR4_0506 UUR4_0507     TRUE 0.964 11.000 0.002 1.000 N NA
 5966507 5966508 UUR4_0507 UUR4_0508     FALSE 0.111 158.000 0.002 NA   NA
 5966508 5966509 UUR4_0508 UUR4_0509     TRUE 0.788 1.000 0.000 NA   NA
 5966510 5966511 UUR4_0510 UUR4_0511   udk TRUE 0.880 29.000 0.005 NA   NA
 5966512 5966513 UUR4_0512 UUR4_0513 rpmF   TRUE 0.900 10.000 0.002 NA   NA
 5966513 5966514 UUR4_0513 UUR4_0514     TRUE 0.511 114.000 1.000 NA   NA
 5966514 5966515 UUR4_0514 UUR4_0515     TRUE 0.976 21.000 1.000 NA   NA
 5966515 5966516 UUR4_0515 UUR4_0516     TRUE 0.649 65.000 0.009 NA   NA
 5966516 5966517 UUR4_0516 UUR4_0517     TRUE 0.575 72.000 0.009 NA   NA
 5966517 5966518 UUR4_0517 UUR4_0518   dnaK FALSE 0.097 171.000 0.002 NA   NA
 5966518 5966519 UUR4_0518 UUR4_0519 dnaK   FALSE 0.146 116.000 0.002 NA   NA
 5966519 5966520 UUR4_0519 UUR4_0520     TRUE 0.917 50.000 1.000 NA   NA
 5966520 5966521 UUR4_0520 UUR4_0521   cmk TRUE 0.896 4.000 0.002 NA   NA
 5966521 5966522 UUR4_0521 UUR4_0522 cmk   TRUE 0.345 84.000 0.002 NA   NA
 5966522 5966523 UUR4_0522 UUR4_0523     TRUE 0.826 54.000 0.043 NA   NA
 5966523 5966524 UUR4_0523 UUR4_0524     FALSE 0.236 145.000 0.019 NA   NA
 5966524 5966525 UUR4_0524 UUR4_0525     TRUE 0.945 32.000 0.570 NA   NA
 5966525 5966526 UUR4_0525 UUR4_0526   tig TRUE 0.401 94.000 0.002 NA N NA
 5966526 5966527 UUR4_0526 UUR4_0527 tig lon TRUE 0.632 102.000 0.014 1.000 Y NA
 5966527 5966528 UUR4_0527 UUR4_0528 lon   TRUE 0.690 95.000 0.045 1.000 N NA
 5966528 5966529 UUR4_0528 UUR4_0529     TRUE 0.891 -16.000 0.053 NA   NA
 5966529 5966530 UUR4_0529 UUR4_0530     TRUE 0.905 -19.000 0.283 NA   NA
 5966531 5966532 UUR4_0531 UUR4_0532     FALSE 0.073 217.000 0.000 NA   NA
 5966533 5966534 UUR4_0533 UUR4_0534 truB   TRUE 0.952 -40.000 0.308 1.000 N NA
 5966534 5966535 UUR4_0534 UUR4_0535     FALSE 0.085 143.000 0.000 NA   NA
 5966535 5966536 UUR4_0535 UUR4_0536     TRUE 0.979 15.000 1.000 NA   NA
 5966536 5966537 UUR4_0536 UUR4_0537     TRUE 0.985 6.000 0.012 0.028 Y NA
 5966537 5966538 UUR4_0537 UUR4_0538     FALSE 0.204 149.000 0.012 NA   NA
 5966538 5966539 UUR4_0538 UUR4_0539     TRUE 0.643 93.000 1.000 NA   NA
 5966539 5966540 UUR4_0539 UUR4_0540     FALSE 0.077 157.000 0.000 NA   NA
 5966541 5966542 UUR4_0541 UUR4_0542 gapN asnA TRUE 0.954 32.000 0.011 1.000 N NA
 5966542 5966543 UUR4_0542 UUR4_0543 asnA pgsA TRUE 0.887 -22.000 0.002 1.000 N NA
 5966543 5966544 UUR4_0543 UUR4_0544 pgsA asnS TRUE 0.920 -19.000 0.007 1.000 N NA
 5966544 5966545 UUR4_0544 UUR4_0545 asnS   TRUE 0.311 94.000 0.005 NA   NA
 5966545 5966546 UUR4_0545 UUR4_0546     FALSE 0.089 140.000 0.000 NA   NA
 5966547 5966548 UUR4_0547 UUR4_0548   alaS TRUE 0.932 31.000 0.002 1.000 N NA
 5966548 5966549 UUR4_0548 UUR4_0549 alaS   TRUE 0.965 -7.000 0.032 1.000 N NA
 5966549 5966550 UUR4_0549 UUR4_0550   leuS TRUE 0.967 16.000 0.003 1.000 N NA
 5966550 5966551 UUR4_0550 UUR4_0551 leuS   FALSE 0.074 218.000 0.000 NA   NA
 5966551 5966552 UUR4_0551 UUR4_0552     TRUE 0.600 -37.000 0.000 NA   NA
 5966552 5966553 UUR4_0552 UUR4_0553     FALSE 0.086 446.000 0.000 NA   NA
 5966555 5966556 UUR4_0555 UUR4_0556     FALSE 0.081 359.000 0.000 NA   NA
 5966556 5966557 UUR4_0556 UUR4_0557     TRUE 0.941 -10.000 0.667 NA   NA
 5966557 5966558 UUR4_0557 UUR4_0558     TRUE 0.738 -7.000 0.000 NA   NA
 5966558 5966559 UUR4_0558 UUR4_0559     TRUE 0.857 11.000 0.000 NA   NA
 5966559 5966560 UUR4_0559 UUR4_0560     TRUE 0.972 3.000 1.000 NA   NA
 5966560 5966561 UUR4_0560 UUR4_0562     TRUE 0.979 16.000 1.000 NA   NA
 5966563 5966564 UUR4_0563 UUR4_0564     TRUE 0.766 0.000 0.000 NA   NA
 5966564 5966565 UUR4_0564 UUR4_0565     TRUE 0.847 5.000 0.000 NA   NA
 5966565 5966566 UUR4_0565 UUR4_0566     TRUE 0.587 98.000 1.000 NA   NA
 5966566 5966567 UUR4_0566 UUR4_0567     TRUE 0.389 269.000 1.000 NA   NA
 5966569 5966570 UUR4_0571 UUR4_0572     TRUE 0.934 41.000 1.000 NA   NA
 5966570 5966571 UUR4_0572 UUR4_0573     FALSE 0.082 377.000 0.000 NA   NA
 5966571 5966572 UUR4_0573 UUR4_0574   mtnN TRUE 0.353 108.000 0.006 1.000   NA
 5966572 5966573 UUR4_0574 UUR4_0575 mtnN   TRUE 0.977 10.000 0.010 1.000 N NA
 5966573 5966574 UUR4_0575 UUR4_0576   yqeH TRUE 0.938 28.000 0.010 1.000   NA
 5966574 5966575 UUR4_0576 UUR4_0577 yqeH parC TRUE 0.949 0.000 0.031 1.000   NA
 5966575 5966576 UUR4_0577 UUR4_0578 parC parE TRUE 0.993 6.000 0.552 0.006 Y NA
 5966576 5966577 UUR4_0578 UUR4_0579 parE def TRUE 0.978 7.000 0.012 1.000 N NA
 5966578 5966579 UUR4_0580 UUR4_0581   fmt TRUE 0.500 75.000 0.005 NA   NA
 5966579 5966580 UUR4_0581 UUR4_0582 fmt   TRUE 0.651 51.000 0.002 NA   NA
 5966580 5966581 UUR4_0582 UUR4_0583     TRUE 0.887 3.000 0.003 NA   NA
 5966581 5966582 UUR4_0583 UUR4_0584   nadE TRUE 0.929 8.000 0.002 1.000   NA
 5966582 5966583 UUR4_0584 UUR4_0585 nadE   TRUE 0.882 -7.000 0.009 NA   NA
 5966583 5966584 UUR4_0585 UUR4_0586   pheS TRUE 0.882 7.000 0.002 NA   NA
 5966584 5966585 UUR4_0586 UUR4_0587 pheS pheT TRUE 0.985 33.000 0.574 0.003 Y NA
 5966585 5966586 UUR4_0587 UUR4_0588 pheT   FALSE 0.141 141.000 0.000 1.000   NA
 5966586 5966587 UUR4_0588 UUR4_0589     TRUE 0.946 -7.000 0.051 1.000   NA
 5966587 5966588 UUR4_0589 UUR4_0590     FALSE 0.074 226.000 0.000 NA   NA
 5966588 5966589 UUR4_0590 UUR4_0591     TRUE 0.459 62.000 0.000 NA   NA
 5966589 5966590 UUR4_0591 UUR4_0592     TRUE 0.600 -37.000 0.000 NA   NA
 5966590 5966591 UUR4_0592 UUR4_0593     TRUE 0.607 -33.000 0.000 NA   NA
 5966591 5966592 UUR4_0593 UUR4_0594     TRUE 0.677 -13.000 0.000 NA   NA
 5966592 5966593 UUR4_0594 UUR4_0595     FALSE 0.231 86.000 0.000 NA   NA
 5966593 5966594 UUR4_0595 UUR4_0596     TRUE 0.669 39.000 0.000 NA   NA
 5966595 5966596 UUR4_0597 UUR4_0598     TRUE 0.766 0.000 0.000 NA   NA
 5966597 5966598 UUR4_0599 UUR4_0600     TRUE 0.958 -13.000 0.053 1.000 N NA
 5966598 5966599 UUR4_0600 UUR4_0601   proS TRUE 0.845 58.000 0.004 1.000 N NA
 5966599 5966600 UUR4_0601 UUR4_0602 proS   FALSE 0.243 105.000 0.004 NA   NA
 5966600 5966601 UUR4_0602 UUR4_0603     TRUE 0.478 104.000 0.333 NA   NA
 5966601 5966602 UUR4_0603 UUR4_0604     TRUE 0.798 36.000 0.002 NA   NA
 5966602 5966603 UUR4_0604 UUR4_0606   ruvB TRUE 0.983 -10.000 0.549 0.006 Y NA
 5966604 5966605 UUR4_0605 UUR4_0607   rrmJ TRUE 0.941 -10.000 0.006 1.000 N NA
 5966605 5966606 UUR4_0607 UUR4_0608 rrmJ   TRUE 0.358 130.000 0.003 1.000 N NA
 5966607 5966608 UUR4_0609 UUR4_0610   ureA TRUE 0.607 46.000 0.000 NA   NA
 5966608 5966609 UUR4_0610 UUR4_0611 ureA ureB TRUE 0.939 52.000 0.010 0.005 Y NA
 5966609 5966610 UUR4_0611 UUR4_0612 ureB ureC TRUE 0.970 39.000 0.029 0.005 Y NA
 5966610 5966611 UUR4_0612 UUR4_0613 ureC   TRUE 0.907 67.000 0.087 0.006 N NA
 5966611 5966612 UUR4_0613 UUR4_0614     TRUE 0.979 -13.000 0.460 0.012 Y NA
 5966612 5966613 UUR4_0614 UUR4_0615   ureG TRUE 0.899 77.000 0.439 0.012 Y NA
 5966613 5966614 UUR4_0615 UUR4_0616 ureG ureD TRUE 0.992 10.000 0.337 0.012 Y NA
 5966614 5966615 UUR4_0616 UUR4_0617 ureD   FALSE 0.103 123.000 0.000 NA   NA
 5966615 5966616 UUR4_0617 UUR4_0618     FALSE 0.078 304.000 0.000 NA   NA
 5966617 5966618 UUR4_0619 UUR4_0620     FALSE 0.076 160.000 0.000 NA   NA
 5966618 5966619 UUR4_0620 UUR4_0621     TRUE 0.910 -7.000 0.022 NA   NA
 5966619 5966620 UUR4_0621 UUR4_0622     TRUE 0.950 16.000 0.015 NA   NA
 5966620 5966621 UUR4_0622 UUR4_0623   hrcA TRUE 0.810 -10.000 0.003 NA   NA
 5966621 5966622 UUR4_0623 UUR4_0624 hrcA   TRUE 0.901 4.000 0.003 NA   NA
 5966623 5966624 UUR4_0625 UUR4_0626   thiI TRUE 0.875 -22.000 0.011 1.000   NA
 5966624 5966625 UUR4_0626 UUR4_0627 thiI   TRUE 0.965 11.000 0.014 1.000   NA
 5966625 5966626 UUR4_0627 UUR4_0628     TRUE 0.599 87.000 0.222 NA   NA
 5966626 5966627 UUR4_0628 UUR4_0629     TRUE 0.914 0.000 0.016 NA   NA
 5966627 5966628 UUR4_0629 UUR4_0630     TRUE 0.990 4.000 0.119 0.012 Y NA
 5966628 5966629 UUR4_0630 UUR4_0631   mutM TRUE 0.953 37.000 0.010 1.000 Y NA
 5966629 5966630 UUR4_0631 UUR4_0732 mutM   TRUE 0.459 62.000 0.000 NA   NA
 5966631 5966632 UUR4_0633 UUR4_0634 metK   TRUE 0.965 21.000 0.004 1.000 N NA
 5966632 5966633 UUR4_0634 UUR4_0635   ileS TRUE 0.961 14.000 0.002 1.000 N NA
 5966634 5966635 UUR4_0636 UUR4_0637     TRUE 0.907 -19.000 0.333 NA   NA
 5966635 5966636 UUR4_0637 UUR4_0638   dnaJ FALSE 0.165 133.000 0.004 NA   NA
 5966636 5966637 UUR4_0638 UUR4_0639 dnaJ grpE TRUE 0.970 0.000 0.005 0.009 Y NA
 5966639 5966640 UUR4_0641 UUR4_0642     TRUE 0.558 91.000 0.019 1.000   NA
 5966642 5966643 UUR4_0644 UUR4_0645 trmU   FALSE 0.244 123.000 0.003 1.000   NA
 5966643 5966644 UUR4_0645 UUR4_0646     TRUE 0.985 16.000 1.000 1.000   NA
 5966644 5966645 UUR4_0646 UUR4_0647     TRUE 0.994 10.000 1.000 0.026 Y NA
 5966647 5966648 UUR4_0649 UUR4_0650 rnhB   TRUE 0.766 54.000 0.011 NA   NA
 5966650 5966651 UUR4_0652 UUR4_0653     TRUE 0.822 45.000 0.011 NA   NA
 5966651 5966652 UUR4_0653 UUR4_0654   acpS TRUE 0.907 4.000 0.003 NA   NA
 5966653 5966654 UUR4_0655 UUR4_0656     FALSE 0.267 153.000 0.051 NA   NA
 5966654 5966655 UUR4_0656 UUR4_0657     TRUE 0.325 123.000 0.051 NA   NA
 5966655 5966656 UUR4_0657 UUR4_0658     TRUE 0.957 29.000 0.667 NA   NA
 5966656 5966657 UUR4_0658 UUR4_0659     TRUE 0.969 6.000 0.286 NA   NA
 5966657 5966658 UUR4_0659 UUR4_0660     FALSE 0.077 271.000 0.000 NA   NA
 5966658 5966659 UUR4_0660 UUR4_0661   mraW TRUE 0.854 18.000 0.000 NA   NA
 5966659 5966660 UUR4_0661 UUR4_0662 mraW mraZ TRUE 0.940 -10.000 0.635 NA   NA
 5966660 5966661 UUR4_0662 UUR4_0663 mraZ   TRUE 0.385 77.000 0.002 NA   NA
 5966662 5966663 UUR4_0664 UUR4_0665 engA   TRUE 0.975 10.000 0.068 1.000   NA
 5966663 5966664 UUR4_0665 UUR4_0666   uvrC TRUE 0.934 0.000 0.002 1.000 N NA
 5966664 5966665 UUR4_0666 UUR4_0667 uvrC   FALSE 0.175 144.000 0.002 1.000   NA
 5966665 5966666 UUR4_0667 UUR4_0668     TRUE 0.955 0.000 0.667 NA   NA
 5966667 5966668 UUR4_0669 UUR4_0670   polC FALSE 0.246 114.000 0.007 NA   NA
 5966668 5966669 UUR4_0670 UUR4_0671 polC   FALSE 0.076 268.000 0.000 NA   NA
 5966669 5966670 UUR4_0671 UUR4_0672     TRUE 0.459 62.000 0.000 NA   NA
 5966670 5966671 UUR4_0672 UUR4_0673     FALSE 0.073 211.000 0.000 NA   NA
 5966672 5966673 UUR4_0674 UUR4_0675     FALSE 0.171 96.000 0.000 NA   NA
 5966673 5966674 UUR4_0675 UUR4_0676     TRUE 0.428 64.000 0.000 NA   NA
 5966674 5966675 UUR4_0676 UUR4_0677     FALSE 0.079 318.000 0.000 NA   NA
 5966675 5966676 UUR4_0677 UUR4_0678     FALSE 0.303 76.000 0.000 NA   NA
 5966676 5966677 UUR4_0678 UUR4_0679     FALSE 0.074 173.000 0.000 NA   NA
 5966677 5966678 UUR4_0679 UUR4_0680     TRUE 0.644 -18.000 0.000 NA   NA
 5966678 5966679 UUR4_0680 UUR4_0681     FALSE 0.189 93.000 0.000 NA   NA
 5966679 5966680 UUR4_0681 UUR4_0682     FALSE 0.076 166.000 0.000 NA   NA
 5966680 5966681 UUR4_0682 UUR4_0683     TRUE 0.711 -10.000 0.000 NA   NA
 5966681 5966682 UUR4_0683 UUR4_0684     TRUE 0.937 -16.000 1.000 NA   NA
 5966682 5966683 UUR4_0684 UUR4_0685     TRUE 0.968 2.000 1.000 NA   NA
 5966683 5966684 UUR4_0685 UUR4_0686     TRUE 0.978 6.000 1.000 NA   NA
 5966684 5966685 UUR4_0686 UUR4_0687     TRUE 0.974 22.000 1.000 NA   NA
 5966685 5966686 UUR4_0687 UUR4_0688     TRUE 0.918 -43.000 1.000 NA   NA
 5966686 5966687 UUR4_0688 UUR4_0689     TRUE 0.956 -7.000 1.000 NA   NA
 5966687 5966688 UUR4_0689 UUR4_0690     TRUE 0.711 -10.000 0.000 NA   NA
 5966688 5966689 UUR4_0690 UUR4_0691   bet TRUE 0.766 0.000 0.000 NA   NA
 5966689 5966690 UUR4_0691 UUR4_0692 bet   TRUE 0.909 -10.000 0.040 NA   NA
 5966690 5966691 UUR4_0692 UUR4_0693     TRUE 0.979 11.000 1.000 NA   NA
 5966691 5966692 UUR4_0693 UUR4_0694     TRUE 0.933 -18.000 1.000 NA   NA