MicrobesOnline Operon Predictions for Deinococcus deserti VCD115

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7574164 7574165 Deide_00010 Deide_00020 dnaA dnaN FALSE 0.197 392.000 0.328 1.000 Y NA
 7574165 7574166 Deide_00020 Deide_00030 dnaN   FALSE 0.114 208.000 0.008 1.000 N NA
 7574166 7574167 Deide_00030 Deide_00040   pyk TRUE 0.924 91.000 0.017 0.005 Y NA
 7574169 7574170 Deide_00060 Deide_00070     TRUE 0.984 -3.000 0.008 NA   NA
 7574171 7574172 Deide_00080 Deide_00100   rplI FALSE 0.021 250.000 0.000 1.000   NA
 7574172 7574173 Deide_00100 Deide_00110 rplI rpsR TRUE 0.991 12.000 0.499 0.018 Y NA
 7574173 7574174 Deide_00110 Deide_00120 rpsR ssb TRUE 0.736 21.000 0.006 1.000 N NA
 7574174 7574175 Deide_00120 Deide_00130 ssb rpsF FALSE 0.317 138.000 0.006 1.000 N NA
 7574176 7574177 Deide_00133 Deide_00132     TRUE 0.947 -159.000 0.000 NA   NA
 7574178 7574179 Deide_00131 Deide_00140     FALSE 0.011 328.000 0.000 1.000 N NA
 7574181 7574182 Deide_00143 Deide_00160     FALSE 0.025 234.000 0.000 1.000 N NA
 7574182 7574183 Deide_00160 Deide_00170     TRUE 0.967 11.000 0.042 1.000 Y NA
 7574183 7574184 Deide_00170 Deide_00180     TRUE 0.997 -3.000 0.032 1.000 Y NA
 7574184 7574185 Deide_00180 Deide_00190     TRUE 0.964 17.000 0.521 0.060 N NA
 7574185 7574186 Deide_00190 Deide_00200     FALSE 0.191 198.000 0.042 1.000 N NA
 7574186 7574187 Deide_00200 Deide_00210     FALSE 0.257 192.000 0.111 1.000 N NA
 7574188 7574189 Deide_00220 Deide_00230     TRUE 0.994 -3.000 0.211 NA   NA
 7574189 7574190 Deide_00230 Deide_00240     FALSE 0.381 31.000 0.000 1.000   NA
 7574190 7574191 Deide_00240 Deide_00250     TRUE 0.987 -3.000 0.010 1.000 N NA
 7574191 7574192 Deide_00250 Deide_00260     TRUE 0.997 -21.000 0.012 1.000 Y NA
 7574194 7574195 Deide_00280 Deide_00290     FALSE 0.434 25.000 0.000 1.000   NA
 7574195 7574196 Deide_00290 Deide_00300     TRUE 0.959 7.000 0.385 NA   NA
 7574196 7574197 Deide_00300 Deide_00305   trnD FALSE 0.245 87.000 0.000 NA   NA
 7574197 7574198 Deide_00305 Deide_00306 trnD trnF FALSE 0.421 20.000 0.000 NA   NA
 7574198 7574199 Deide_00306 Deide_00310 trnF   FALSE 0.024 218.000 0.000 NA   NA
 7574199 7574200 Deide_00310 Deide_00320     TRUE 0.988 -22.000 0.008 1.000   NA
 7574200 7574201 Deide_00320 Deide_00330     TRUE 0.989 -3.000 0.019 1.000 N NA
 7574201 7574202 Deide_00330 Deide_00340     TRUE 0.971 3.000 0.270 1.000   NA
 7574203 7574204 Deide_00350 Deide_00360     FALSE 0.286 90.000 0.000 1.000   NA
 7574204 7574205 Deide_00360 Deide_00370     FALSE 0.067 176.000 0.000 1.000   NA
 7574206 7574207 Deide_00380 Deide_00390     TRUE 0.987 -3.000 0.012 1.000 N NA
 7574207 7574208 Deide_00390 Deide_00400     FALSE 0.174 187.000 0.020 NA   NA
 7574208 7574209 Deide_00400 Deide_00410     TRUE 0.995 -3.000 0.328 NA   NA
 7574210 7574211 Deide_00420 Deide_00430     FALSE 0.251 85.000 0.000 NA   NA
 7574211 7574212 Deide_00430 Deide_00440     TRUE 0.659 49.000 0.013 NA   NA
 7574212 7574213 Deide_00440 Deide_00450     TRUE 0.755 69.000 0.083 NA   NA
 7574215 7574216 Deide_00470 Deide_00480     FALSE 0.359 47.000 0.000 1.000   NA
 7574218 7574219 Deide_00500 Deide_00510     TRUE 0.836 44.000 0.250 NA   NA
 7574219 7574220 Deide_00510 Deide_00530     TRUE 0.998 -3.000 0.917 NA   NA
 7574221 7574222 Deide_00535 Deide_00540 trnR   FALSE 0.010 304.000 0.000 NA   NA
 7574223 7574224 Deide_00550 Deide_00560     TRUE 0.630 176.000 0.150 1.000 Y NA
 7574224 7574225 Deide_00560 Deide_00570     TRUE 0.990 17.000 0.952 0.060 Y NA
 7574225 7574226 Deide_00570 Deide_00580     TRUE 0.955 70.000 0.190 0.060 Y NA
 7574226 7574227 Deide_00580 Deide_00590     TRUE 0.882 66.000 0.500 1.000 N NA
 7574227 7574228 Deide_00590 Deide_00600     FALSE 0.004 563.000 0.000 1.000 N NA
 7574230 7574231 Deide_00620 Deide_00630     TRUE 0.997 -12.000 0.500 NA   NA
 7574231 7574232 Deide_00630 Deide_00640     TRUE 0.822 19.000 0.037 NA   NA
 7574232 7574233 Deide_00640 Deide_00650     TRUE 0.756 43.000 0.056 NA   NA
 7574233 7574234 Deide_00650 Deide_00660     TRUE 0.997 -3.000 0.750 NA   NA
 7574234 7574235 Deide_00660 Deide_00670     TRUE 0.856 18.000 0.075 NA   NA
 7574237 7574238 Deide_00690 Deide_00693     FALSE 0.099 140.000 0.000 NA   NA
 7574239 7574240 Deide_00691 Deide_00692     FALSE 0.180 110.000 0.000 NA   NA
 7574242 7574243 Deide_00710 Deide_00720     FALSE 0.009 330.000 0.000 NA   NA
 7574243 7574244 Deide_00720 Deide_00730     TRUE 0.899 2.000 0.002 NA   NA
 7574244 7574245 Deide_00730 Deide_00740     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574245 7574246 Deide_00740 Deide_00750     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.016   NA
 7574246 7574247 Deide_00750 Deide_00760     TRUE 0.588 53.000 0.003 1.000   NA
 7574247 7574248 Deide_00760 Deide_00770     FALSE 0.408 112.000 0.002 1.000   NA
 7574248 7574249 Deide_00770 Deide_00780     TRUE 0.900 109.000 0.600 0.016   NA
 7574249 7574250 Deide_00780 Deide_00790     TRUE 0.810 44.000 0.014 0.086   NA
 7574250 7574251 Deide_00790 Deide_00800     FALSE 0.218 96.000 0.000 NA   NA
 7574251 7574252 Deide_00800 Deide_00810     FALSE 0.295 57.000 0.000 NA   NA
 7574252 7574253 Deide_00810 Deide_00820     FALSE 0.004 473.000 0.000 NA   NA
 7574253 7574254 Deide_00820 Deide_00830   ung FALSE 0.031 203.000 0.000 NA   NA
 7574254 7574255 Deide_00830 Deide_00840 ung   TRUE 0.876 70.000 0.012 1.000 Y NA
 7574255 7574256 Deide_00840 Deide_00850     FALSE 0.003 796.000 0.000 NA   NA
 7574256 7574257 Deide_00850 Deide_00860     TRUE 0.948 -70.000 0.000 NA   NA
 7574257 7574258 Deide_00860 Deide_00870     FALSE 0.025 215.000 0.000 NA   NA
 7574258 7574259 Deide_00870 Deide_00880     TRUE 0.869 5.000 0.005 NA   NA
 7574259 7574260 Deide_00880 Deide_00890     FALSE 0.531 81.000 0.002 1.000 N NA
 7574260 7574261 Deide_00890 Deide_00900     TRUE 0.687 68.000 0.023 NA   NA
 7574261 7574262 Deide_00900 Deide_00910     FALSE 0.016 252.000 0.000 NA   NA
 7574262 7574263 Deide_00910 Deide_00920     TRUE 0.844 28.000 0.167 1.000 N NA
 7574263 7574264 Deide_00920 Deide_00930     FALSE 0.012 280.000 0.000 NA   NA
 7574264 7574265 Deide_00930 Deide_00940   atpI TRUE 0.989 -3.000 0.029 NA   NA
 7574265 7574266 Deide_00940 Deide_00950 atpI atpP TRUE 0.977 19.000 0.848 0.004   NA
 7574266 7574267 Deide_00950 Deide_00960 atpP atpE TRUE 0.986 6.000 0.489 0.004   NA
 7574267 7574268 Deide_00960 Deide_00970 atpE atpC TRUE 0.989 12.000 0.258 0.004 Y NA
 7574268 7574269 Deide_00970 Deide_00980 atpC atpF TRUE 0.999 -3.000 0.172 0.004 Y NA
 7574269 7574270 Deide_00980 Deide_00990 atpF atpA TRUE 0.862 144.000 0.118 0.004 Y NA
 7574270 7574271 Deide_00990 Deide_01000 atpA atpB TRUE 0.999 -3.000 0.129 0.004 Y NA
 7574271 7574272 Deide_01000 Deide_01010 atpB atpD TRUE 0.951 74.000 0.052 0.004 Y NA
 7574273 7574274 Deide_01020 Deide_01030     FALSE 0.516 14.000 0.000 NA   NA
 7574274 7574275 Deide_01030 Deide_01040     TRUE 0.849 76.000 0.400 NA   NA
 7574275 7574276 Deide_01040 Deide_01050     TRUE 0.997 -3.000 0.600 NA   NA
 7574278 7574279 Deide_01070 Deide_01080     FALSE 0.005 480.000 0.000 1.000 N NA
 7574280 7574281 Deide_01090 Deide_01100     FALSE 0.019 237.000 0.000 NA   NA
 7574281 7574282 Deide_01100 Deide_01110     FALSE 0.313 34.000 0.000 NA   NA
 7574284 7574285 Deide_01130 Deide_01140     FALSE 0.026 231.000 0.000 1.000 N NA
 7574286 7574287 Deide_01150 Deide_01160 glnS ddrD FALSE 0.233 91.000 0.000 NA   NA
 7574287 7574288 Deide_01160 Deide_01170 ddrD   TRUE 0.859 54.000 0.400 NA   NA
 7574288 7574289 Deide_01170 Deide_01171     FALSE 0.285 70.000 0.000 NA   NA
 7574290 7574291 Deide_01180 Deide_01190     FALSE 0.317 32.000 0.000 NA   NA
 7574300 7574301 Deide_01241 Deide_01242     FALSE 0.059 170.000 0.000 NA   NA
 7574301 7574302 Deide_01242 Deide_01250     FALSE 0.296 63.000 0.000 NA   NA
 7574302 7574303 Deide_01250 Deide_01260     FALSE 0.002 1146.000 0.000 NA   NA
 7574303 7574304 Deide_01260 Deide_01270     TRUE 0.998 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 7574305 7574306 Deide_01280 Deide_01281   rpmB FALSE 0.036 209.000 0.000 1.000   NA
 7574308 7574309 Deide_01300 Deide_01303 luxS rrlA FALSE 0.012 279.000 0.000 NA   NA
 7574309 7574310 Deide_01303 Deide_01304 rrlA rrfA FALSE 0.199 103.000 0.000 NA   NA
 7574310 7574311 Deide_01304 Deide_01305 rrfA trnG TRUE 0.603 8.000 0.000 NA   NA
 7574314 7574315 Deide_01320 Deide_01330     FALSE 0.072 172.000 0.000 1.000   NA
 7574318 7574319 Deide_01360 Deide_01370   galE TRUE 0.870 62.000 0.400 1.000 N NA
 7574319 7574320 Deide_01370 Deide_01380 galE   FALSE 0.209 113.000 0.000 1.000 N NA
 7574321 7574322 Deide_01390 Deide_01400     FALSE 0.005 442.000 0.000 NA   NA
 7574322 7574323 Deide_01400 Deide_01410     TRUE 0.753 87.000 0.111 1.000   NA
 7574324 7574325 Deide_01420 Deide_01430     FALSE 0.313 32.000 0.000 NA N NA
 7574325 7574326 Deide_01430 Deide_01429   rrsA FALSE 0.005 448.000 0.000 NA   NA
 7574326 7574327 Deide_01429 Deide_01433 rrsA   FALSE 0.070 162.000 0.000 NA   NA
 7574327 7574328 Deide_01433 Deide_01434     FALSE 0.005 443.000 0.000 NA   NA
 7574329 7574330 Deide_01447 Deide_01446 trnR trnG FALSE 0.172 113.000 0.000 NA   NA
 7574330 7574331 Deide_01446 Deide_01445 trnG trnP FALSE 0.321 31.000 0.000 NA   NA
 7574332 7574333 Deide_01440 Deide_01441     TRUE 0.990 -18.000 0.024 NA   NA
 7574333 7574334 Deide_01441 Deide_01450     TRUE 0.958 8.000 0.417 NA   NA
 7574334 7574335 Deide_01450 Deide_01461     TRUE 0.812 77.000 0.250 NA   NA
 7574335 7574336 Deide_01461 Deide_01470     TRUE 0.921 91.000 0.286 1.000 Y NA
 7574336 7574337 Deide_01470 Deide_01480     TRUE 0.919 104.000 0.423 1.000 Y NA
 7574338 7574339 Deide_01490 Deide_01500 argR coaBC TRUE 0.671 32.000 0.009 1.000 N NA
 7574340 7574341 Deide_01510 Deide_01520 hemC   FALSE 0.314 33.000 0.000 NA   NA
 7574341 7574342 Deide_01520 Deide_01530     FALSE 0.338 28.000 0.000 NA   NA
 7574342 7574343 Deide_01530 Deide_01540     FALSE 0.223 109.000 0.000 1.000 N NA
 7574343 7574344 Deide_01540 Deide_01550     TRUE 0.995 -3.000 0.235 1.000 N NA
 7574344 7574345 Deide_01550 Deide_01560   phbA FALSE 0.011 336.000 0.000 1.000 N NA
 7574345 7574346 Deide_01560 Deide_01570 phbA   TRUE 0.697 85.000 0.056 NA   NA
 7574346 7574347 Deide_01570 Deide_01580     TRUE 0.641 6.000 0.000 NA   NA
 7574347 7574348 Deide_01580 Deide_01590     FALSE 0.135 125.000 0.000 NA   NA
 7574348 7574349 Deide_01590 Deide_01600     FALSE 0.177 111.000 0.000 NA   NA
 7574349 7574350 Deide_01600 Deide_01610   dnaX FALSE 0.038 189.000 0.000 NA   NA
 7574350 7574351 Deide_01610 Deide_01620 dnaX   FALSE 0.539 73.000 0.003 NA   NA
 7574351 7574352 Deide_01620 Deide_01630     TRUE 0.820 39.000 0.182 NA   NA
 7574352 7574353 Deide_01630 Deide_01640     TRUE 0.921 15.000 0.273 NA   NA
 7574353 7574354 Deide_01640 Deide_01650     FALSE 0.291 65.000 0.000 NA   NA
 7574355 7574356 Deide_01660 Deide_01670     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574356 7574357 Deide_01670 Deide_01680     TRUE 0.821 89.000 0.029 0.013   NA
 7574357 7574358 Deide_01680 Deide_01690   ptpA TRUE 0.698 6.000 0.000 1.000   NA
 7574358 7574359 Deide_01690 Deide_01700 ptpA accA TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7574359 7574360 Deide_01700 Deide_01710 accA   TRUE 0.999 -3.000 0.234 0.001 Y NA
 7574360 7574361 Deide_01710 Deide_01720     FALSE 0.315 133.000 0.006 NA   NA
 7574362 7574363 Deide_01730 Deide_01740 cutA   FALSE 0.003 805.000 0.000 1.000   NA
 7574363 7574364 Deide_01740 Deide_01750     TRUE 0.685 68.000 0.000 0.010   NA
 7574364 7574365 Deide_01750 Deide_01760     FALSE 0.016 682.000 0.000 0.010   NA
 7574365 7574366 Deide_01760 Deide_01770     TRUE 0.897 7.000 0.000 0.010   NA
 7574367 7574368 Deide_01785 Deide_01780 trnW   FALSE 0.261 82.000 0.000 NA   NA
 7574369 7574370 Deide_01790 Deide_01800     TRUE 0.985 -3.000 0.010 NA   NA
 7574370 7574371 Deide_01800 Deide_01810     FALSE 0.525 128.000 0.077 NA   NA
 7574371 7574372 Deide_01810 Deide_01820     FALSE 0.358 26.000 0.000 NA   NA
 7574374 7574375 Deide_01840 Deide_01850 pdxY   FALSE 0.516 14.000 0.000 NA   NA
 7574376 7574377 Deide_01860 Deide_01870     TRUE 0.998 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 7574378 7574379 Deide_01880 Deide_01890     TRUE 0.956 24.000 0.039 0.084 Y NA
 7574380 7574381 Deide_01900 Deide_01910     FALSE 0.145 122.000 0.000 NA   NA
 7574383 7574384 Deide_01930 Deide_01940     TRUE 0.995 -3.000 0.364 NA   NA
 7574385 7574386 Deide_01960 Deide_01970   mutY FALSE 0.534 71.000 0.002 NA   NA
 7574386 7574387 Deide_01970 Deide_01980 mutY uppS TRUE 0.582 69.000 0.003 1.000 N NA
 7574387 7574388 Deide_01980 Deide_01990 uppS   FALSE 0.008 334.000 0.000 NA   NA
 7574388 7574389 Deide_01990 Deide_02000     TRUE 0.854 70.000 0.400 NA   NA
 7574389 7574390 Deide_02000 Deide_02010     FALSE 0.408 139.000 0.000 0.002   NA
 7574390 7574391 Deide_02010 Deide_02020     TRUE 0.692 4.000 0.000 NA   NA
 7574391 7574392 Deide_02020 Deide_02030     FALSE 0.016 248.000 0.000 NA   NA
 7574392 7574393 Deide_02030 Deide_02040     FALSE 0.144 133.000 0.000 1.000   NA
 7574393 7574394 Deide_02040 Deide_02045   trnQ FALSE 0.226 94.000 0.000 NA   NA
 7574394 7574395 Deide_02045 Deide_02050 trnQ   FALSE 0.012 284.000 0.000 NA   NA
 7574396 7574397 Deide_02060 Deide_02070     FALSE 0.121 130.000 0.000 NA   NA
 7574397 7574398 Deide_02070 Deide_02080     FALSE 0.004 491.000 0.000 NA   NA
 7574399 7574400 Deide_02090 Deide_02100     TRUE 0.700 58.000 0.018 1.000 N NA
 7574402 7574403 Deide_02120 Deide_02130     TRUE 0.629 62.000 0.006 1.000   NA
 7574403 7574404 Deide_02130 Deide_02140     FALSE 0.013 318.000 0.000 1.000 N NA
 7574404 7574405 Deide_02140 Deide_02150     TRUE 0.978 5.000 0.041 1.000 Y NA
 7574405 7574406 Deide_02150 Deide_02160     TRUE 0.998 -7.000 0.112 1.000 Y NA
 7574406 7574407 Deide_02160 Deide_02170     TRUE 0.826 44.000 0.167 1.000 N NA
 7574409 7574410 Deide_02190 Deide_02200     FALSE 0.140 124.000 0.000 NA   NA
 7574411 7574412 Deide_02210 Deide_02220   mscL TRUE 0.606 37.000 0.005 NA   NA
 7574412 7574413 Deide_02220 Deide_02230 mscL   TRUE 0.626 76.000 0.008 1.000 N NA
 7574413 7574414 Deide_02230 Deide_02240     FALSE 0.202 158.000 0.002 1.000 N NA
 7574414 7574415 Deide_02240 Deide_02250   ribAB TRUE 0.936 52.000 0.007 0.002 Y NA
 7574415 7574416 Deide_02250 Deide_02260 ribAB   TRUE 0.996 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 7574416 7574417 Deide_02260 Deide_02270   ribD TRUE 0.995 0.000 0.456 1.000 Y NA
 7574419 7574420 Deide_02280 Deide_02290     FALSE 0.013 268.000 0.000 NA   NA
 7574420 7574421 Deide_02290 Deide_02300     FALSE 0.416 26.000 0.000 1.000 N NA
 7574421 7574422 Deide_02300 Deide_02310     FALSE 0.457 22.000 0.000 1.000 N NA
 7574422 7574423 Deide_02310 Deide_02320     FALSE 0.124 140.000 0.000 1.000 N NA
 7574423 7574424 Deide_02320 Deide_02330     TRUE 0.777 56.000 0.000 1.000 Y NA
 7574424 7574425 Deide_02330 Deide_02340     FALSE 0.299 86.000 0.000 1.000   NA
 7574426 7574427 Deide_02350 Deide_02360     TRUE 0.656 121.000 0.231 NA   NA
 7574428 7574429 Deide_02370 Deide_02380     TRUE 0.888 58.000 0.600 NA   NA
 7574429 7574430 Deide_02380 Deide_02390     TRUE 0.992 -3.000 0.093 NA   NA
 7574431 7574432 Deide_02400 Deide_02401     TRUE 0.835 7.000 0.004 NA   NA
 7574434 7574435 Deide_02421 Deide_02430     FALSE 0.348 27.000 0.000 NA   NA
 7574437 7574438 Deide_02445 Deide_02450 trnT   FALSE 0.108 136.000 0.000 NA   NA
 7574441 7574442 Deide_02490 Deide_02500     FALSE 0.006 383.000 0.000 NA   NA
 7574442 7574443 Deide_02500 Deide_02510     FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 7574443 7574444 Deide_02510 Deide_02520     TRUE 0.894 59.000 0.095 0.007   NA
 7574444 7574445 Deide_02520 Deide_02530     TRUE 0.983 3.000 0.667 1.000   NA
 7574445 7574446 Deide_02530 Deide_02540     TRUE 0.999 -3.000 0.308 0.057 Y NA
 7574446 7574447 Deide_02540 Deide_02550     TRUE 0.908 125.000 0.308 0.057 Y NA
 7574448 7574449 Deide_02560 Deide_02570 cadA   TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7574449 7574450 Deide_02570 Deide_02580     TRUE 0.728 88.000 0.000 1.000 Y NA
 7574451 7574452 Deide_02590 Deide_02600     TRUE 0.612 116.000 0.073 1.000 N NA
 7574452 7574453 Deide_02600 Deide_02610     FALSE 0.025 232.000 0.000 1.000 N NA
 7574453 7574454 Deide_02610 Deide_02620   ispF TRUE 0.657 44.000 0.008 1.000 N NA
 7574454 7574455 Deide_02620 Deide_02630 ispF   FALSE 0.295 48.000 0.000 NA N NA
 7574455 7574456 Deide_02630 Deide_02640     FALSE 0.312 40.000 0.000 NA   NA
 7574456 7574457 Deide_02640 Deide_02650     TRUE 0.745 25.000 0.012 1.000   NA
 7574457 7574458 Deide_02650 Deide_02660     FALSE 0.299 48.000 0.000 NA   NA
 7574459 7574460 Deide_02670 Deide_02680     FALSE 0.580 10.000 0.000 NA   NA
 7574460 7574461 Deide_02680 Deide_02690     FALSE 0.006 408.000 0.000 NA   NA
 7574461 7574462 Deide_02690 Deide_02700     FALSE 0.427 117.000 0.006 1.000 N NA
 7574466 7574467 Deide_02740 Deide_02750     FALSE 0.337 149.000 0.000 0.012   NA
 7574467 7574468 Deide_02750 Deide_02770     FALSE 0.002 2646.000 0.000 NA   NA
 7574468 7574469 Deide_02770 Deide_02775     TRUE 0.692 4.000 0.000 NA   NA
 7574469 7574470 Deide_02775 Deide_02771     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574471 7574472 Deide_02785 Deide_02773 trnS   FALSE 0.383 24.000 0.000 NA   NA
 7574472 7574473 Deide_02773 Deide_02774     FALSE 0.048 178.000 0.000 NA   NA
 7574473 7574474 Deide_02774 Deide_02780     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574474 7574475 Deide_02780 Deide_02790     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574475 7574476 Deide_02790 Deide_02800     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574476 7574477 Deide_02800 Deide_02801     FALSE 0.010 310.000 0.000 NA   NA
 7574477 7574478 Deide_02801 Deide_02810     TRUE 0.854 72.000 0.000 0.056 Y NA
 7574478 7574479 Deide_02810 Deide_02820     FALSE 0.551 12.000 0.000 NA   NA
 7574479 7574480 Deide_02820 Deide_02830     FALSE 0.258 83.000 0.000 NA   NA
 7574481 7574482 Deide_02840 Deide_02841     TRUE 0.790 102.000 0.000 0.056 Y NA
 7574483 7574484 Deide_02842 Deide_02843     FALSE 0.265 96.000 0.000 1.000   NA
 7574485 7574486 Deide_02851 Deide_02852     FALSE 0.261 82.000 0.000 NA   NA
 7574486 7574487 Deide_02852 Deide_02853     FALSE 0.195 104.000 0.000 NA   NA
 7574488 7574489 Deide_02865 Deide_02860 trnK   FALSE 0.312 38.000 0.000 NA   NA
 7574489 7574490 Deide_02860 Deide_02870     TRUE 0.989 -3.000 0.028 NA   NA
 7574491 7574492 Deide_02880 Deide_02890 purE   TRUE 0.999 -3.000 0.201 0.001 Y NA
 7574492 7574493 Deide_02890 Deide_02900     FALSE 0.568 86.000 0.009 NA N NA
 7574493 7574494 Deide_02900 Deide_02910     TRUE 0.851 73.000 0.400 NA N NA
 7574495 7574496 Deide_02920 Deide_02930 argB   TRUE 0.722 73.000 0.034 1.000   NA
 7574497 7574498 Deide_02940 Deide_02950     TRUE 0.980 -3.000 0.004 NA   NA
 7574500 7574501 Deide_02970 Deide_02971     FALSE 0.003 685.000 0.000 NA   NA
 7574501 7574502 Deide_02971 Deide_02980     FALSE 0.167 115.000 0.000 NA   NA
 7574503 7574504 Deide_02990 Deide_03000 ddrB   FALSE 0.239 89.000 0.000 NA   NA
 7574504 7574505 Deide_03000 Deide_03010     TRUE 0.994 -3.000 0.227 NA   NA
 7574506 7574507 Deide_03013 Deide_03020 rrsA   FALSE 0.112 134.000 0.000 NA   NA
 7574507 7574508 Deide_03020 Deide_03030     FALSE 0.049 329.000 0.031 NA N NA
 7574508 7574509 Deide_03030 Deide_03040   folP TRUE 0.663 30.000 0.009 NA N NA
 7574509 7574510 Deide_03040 Deide_03050 folP   TRUE 0.997 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 7574510 7574511 Deide_03050 Deide_03051     TRUE 0.854 99.000 0.037 1.000 Y NA
 7574511 7574512 Deide_03051 Deide_03060     TRUE 0.692 22.000 0.005 NA   NA
 7574513 7574514 Deide_03070 Deide_03080     FALSE 0.296 58.000 0.000 NA   NA
 7574514 7574515 Deide_03080 Deide_03090     TRUE 0.618 37.000 0.004 1.000   NA
 7574515 7574516 Deide_03090 Deide_03100     TRUE 0.983 -3.000 0.004 1.000   NA
 7574518 7574519 Deide_03120 Deide_03130 uvrB   FALSE 0.032 214.000 0.000 1.000 N NA
 7574519 7574520 Deide_03130 Deide_03140     TRUE 0.986 0.000 0.000 0.044 Y NA
 7574521 7574522 Deide_03150 Deide_03160   aceE FALSE 0.274 94.000 0.000 1.000   NA
 7574522 7574523 Deide_03160 Deide_03170 aceE aceF TRUE 0.841 101.000 0.026 1.000 Y NA
 7574524 7574525 Deide_03180 Deide_03190     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574527 7574528 Deide_03200 Deide_03210     TRUE 0.892 68.000 0.667 NA   NA
 7574529 7574530 Deide_03220 Deide_03230     TRUE 0.712 94.000 0.107 NA   NA
 7574531 7574532 Deide_03240 Deide_03250 rnr   FALSE 0.003 1264.000 0.000 1.000 N NA
 7574533 7574534 Deide_03260 Deide_03270     FALSE 0.030 206.000 0.000 NA   NA
 7574535 7574536 Deide_03271 Deide_03280   accC TRUE 0.606 62.000 0.000 0.082   NA
 7574536 7574537 Deide_03280 Deide_03290 accC accB TRUE 0.929 91.000 0.015 0.001 Y NA
 7574537 7574538 Deide_03290 Deide_03300 accB efp FALSE 0.382 169.000 0.120 1.000 N NA
 7574539 7574540 Deide_03310 Deide_03320 rplY   FALSE 0.017 247.000 0.000 NA   NA
 7574541 7574542 Deide_03330 Deide_03340     TRUE 0.972 58.000 0.266 0.001 Y NA
 7574542 7574543 Deide_03340 Deide_03350   sufC TRUE 0.906 116.000 0.466 1.000 Y NA
 7574544 7574545 Deide_03360 Deide_03370     TRUE 0.999 -3.000 0.132 0.065 Y NA
 7574545 7574546 Deide_03370 Deide_03380     TRUE 0.995 -3.000 0.333 NA   NA
 7574546 7574547 Deide_03380 Deide_03390     TRUE 0.930 27.000 0.857 NA   NA
 7574547 7574548 Deide_03390 Deide_03400     FALSE 0.572 40.000 0.003 NA   NA
 7574549 7574550 Deide_03410 Deide_03420     TRUE 0.944 17.000 0.030 NA Y NA
 7574550 7574551 Deide_03420 Deide_03430     FALSE 0.125 128.000 0.000 NA N NA
 7574551 7574552 Deide_03430 Deide_03440     FALSE 0.057 180.000 0.000 1.000   NA
 7574552 7574553 Deide_03440 Deide_03450     TRUE 0.990 -3.000 0.028 1.000   NA
 7574553 7574554 Deide_03450 Deide_03460     TRUE 0.999 -3.000 0.050 0.004 Y NA
 7574555 7574556 Deide_03470 Deide_03475   trnS FALSE 0.286 69.000 0.000 NA   NA
 7574556 7574557 Deide_03475 Deide_03476 trnS trnS FALSE 0.480 16.000 0.000 NA   NA
 7574557 7574558 Deide_03476 Deide_03477 trnS trnR FALSE 0.516 14.000 0.000 NA   NA
 7574559 7574560 Deide_03480 Deide_03490     FALSE 0.167 115.000 0.000 NA   NA
 7574561 7574562 Deide_03500 Deide_03510     FALSE 0.003 701.000 0.000 NA   NA
 7574562 7574563 Deide_03510 Deide_03520     FALSE 0.183 109.000 0.000 NA   NA
 7574565 7574566 Deide_03540 Deide_03550   adh FALSE 0.012 328.000 0.000 1.000   NA
 7574567 7574568 Deide_03560 Deide_03570     FALSE 0.091 146.000 0.000 NA   NA
 7574568 7574569 Deide_03570 Deide_03580     FALSE 0.003 757.000 0.000 NA   NA
 7574569 7574570 Deide_03580 Deide_03590     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574570 7574571 Deide_03590 Deide_03600     TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7574573 7574574 Deide_03620 Deide_03630     FALSE 0.060 178.000 0.000 1.000 N NA
 7574576 7574577 Deide_03650 Deide_03660     FALSE 0.028 209.000 0.000 NA   NA
 7574577 7574578 Deide_03660 Deide_03670     FALSE 0.008 347.000 0.000 NA   NA
 7574578 7574579 Deide_03670 Deide_03680     FALSE 0.009 327.000 0.000 NA   NA
 7574579 7574580 Deide_03680 Deide_03690   xylB FALSE 0.058 179.000 0.000 1.000 N NA
 7574580 7574581 Deide_03690 Deide_03700 xylB   FALSE 0.005 487.000 0.000 1.000 N NA
 7574581 7574582 Deide_03700 Deide_03710     FALSE 0.003 779.000 0.000 NA   NA
 7574584 7574585 Deide_03730 Deide_03740   hisD TRUE 0.970 1.000 0.091 1.000   NA
 7574585 7574586 Deide_03740 Deide_03750 hisD   TRUE 0.764 92.000 0.227 NA   NA
 7574586 7574587 Deide_03750 Deide_03760   deoB TRUE 0.728 39.000 0.031 NA   NA
 7574588 7574589 Deide_03770 Deide_03780     FALSE 0.516 14.000 0.000 NA   NA
 7574589 7574590 Deide_03780 Deide_03790     FALSE 0.020 231.000 0.000 NA   NA
 7574590 7574591 Deide_03790 Deide_03800     FALSE 0.007 423.000 0.000 1.000   NA
 7574591 7574592 Deide_03800 Deide_03810     FALSE 0.381 31.000 0.000 1.000   NA
 7574593 7574594 Deide_03820 Deide_03830     TRUE 0.758 125.000 0.000 0.003 Y NA
 7574594 7574595 Deide_03830 Deide_03831     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574596 7574597 Deide_03840 Deide_03850     FALSE 0.098 141.000 0.000 NA   NA
 7574598 7574599 Deide_03860 Deide_03861     TRUE 0.978 0.000 0.130 1.000   NA
 7574600 7574601 Deide_03870 Deide_03871 rpmH rnpA TRUE 0.939 23.000 0.787 1.000   NA
 7574601 7574602 Deide_03871 Deide_03875 rnpA   TRUE 0.996 -3.000 0.540 NA   NA
 7574602 7574603 Deide_03875 Deide_03880     TRUE 0.996 -3.000 0.461 NA   NA
 7574604 7574605 Deide_03890 Deide_03900   pdhB FALSE 0.339 72.000 0.000 1.000   NA
 7574605 7574606 Deide_03900 Deide_03910 pdhB   TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 7574606 7574607 Deide_03910 Deide_03920     FALSE 0.008 349.000 0.000 NA   NA
 7574608 7574609 Deide_03930 Deide_03940     TRUE 0.864 24.000 0.150 1.000   NA
 7574610 7574611 Deide_03950 Deide_03960   sigW FALSE 0.135 125.000 0.000 NA   NA
 7574614 7574615 Deide_03990 Deide_04000     TRUE 0.747 50.000 0.060 NA   NA
 7574615 7574616 Deide_04000 Deide_04010     TRUE 0.996 -3.000 0.444 NA   NA
 7574616 7574617 Deide_04010 Deide_04020     FALSE 0.397 22.000 0.000 NA   NA
 7574617 7574618 Deide_04020 Deide_04030   xpt FALSE 0.144 186.000 0.009 NA   NA
 7574618 7574619 Deide_04030 Deide_04040 xpt   FALSE 0.564 95.000 0.009 1.000 N NA
 7574619 7574620 Deide_04040 Deide_04050   msrB FALSE 0.307 83.000 0.000 1.000 N NA
 7574621 7574622 Deide_04060 Deide_04070     FALSE 0.106 137.000 0.000 NA   NA
 7574622 7574623 Deide_04070 Deide_04080     FALSE 0.284 71.000 0.000 NA   NA
 7574623 7574624 Deide_04080 Deide_04090     FALSE 0.015 257.000 0.000 NA   NA
 7574625 7574626 Deide_04091 Deide_04110     FALSE 0.178 123.000 0.000 1.000   NA
 7574627 7574628 Deide_04120 Deide_04130     FALSE 0.072 159.000 0.000 NA   NA
 7574629 7574630 Deide_04140 Deide_04150 gatB   TRUE 0.591 56.000 0.005 NA   NA
 7574630 7574631 Deide_04150 Deide_04160     TRUE 0.730 116.000 0.364 NA   NA
 7574631 7574632 Deide_04160 Deide_04170     TRUE 0.994 -3.000 0.167 NA   NA
 7574632 7574633 Deide_04170 Deide_04171     TRUE 0.763 75.000 0.100 NA   NA
 7574634 7574635 Deide_04180 Deide_04190   ade TRUE 0.636 73.000 0.009 1.000 N NA
 7574635 7574636 Deide_04190 Deide_04200 ade   FALSE 0.174 177.000 0.009 NA   NA
 7574636 7574637 Deide_04200 Deide_04210     FALSE 0.264 81.000 0.000 NA   NA
 7574637 7574638 Deide_04210 Deide_04220     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574638 7574639 Deide_04220 Deide_04230     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574639 7574640 Deide_04230 Deide_04240     TRUE 0.997 -3.000 0.667 NA   NA
 7574640 7574641 Deide_04240 Deide_04250     FALSE 0.279 75.000 0.000 NA   NA
 7574643 7574644 Deide_04260 Deide_04270     TRUE 0.702 73.000 0.036 NA N NA
 7574644 7574645 Deide_04270 Deide_04280     FALSE 0.213 160.000 0.004 1.000 N NA
 7574646 7574647 Deide_04290 Deide_04291     FALSE 0.098 141.000 0.000 NA   NA
 7574647 7574648 Deide_04291 Deide_04300     FALSE 0.010 316.000 0.000 NA   NA
 7574648 7574649 Deide_04300 Deide_04310     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574649 7574650 Deide_04310 Deide_04320     FALSE 0.264 81.000 0.000 NA   NA
 7574651 7574652 Deide_04330 Deide_04340 ilvA   FALSE 0.280 74.000 0.000 NA   NA
 7574652 7574653 Deide_04340 Deide_04350     FALSE 0.117 132.000 0.000 NA   NA
 7574654 7574655 Deide_04360 Deide_04370     TRUE 0.995 -3.000 0.261 NA   NA
 7574655 7574656 Deide_04370 Deide_04380     TRUE 0.908 35.000 0.750 NA   NA
 7574657 7574658 Deide_04390 Deide_04400     FALSE 0.561 11.000 0.000 NA N NA
 7574659 7574660 Deide_04405 Deide_04410 trnD speA FALSE 0.035 195.000 0.000 NA   NA
 7574660 7574661 Deide_04410 Deide_04420 speA   FALSE 0.022 228.000 0.000 NA   NA
 7574661 7574662 Deide_04420 Deide_04430     FALSE 0.006 376.000 0.000 NA   NA
 7574662 7574663 Deide_04430 Deide_04431     FALSE 0.324 130.000 0.005 NA   NA
 7574664 7574665 Deide_04440 Deide_04450     TRUE 0.678 72.000 0.014 1.000   NA
 7574666 7574667 Deide_04460 Deide_04470     FALSE 0.101 154.000 0.000 1.000   NA
 7574668 7574669 Deide_04480 Deide_04490     FALSE 0.024 220.000 0.000 NA   NA
 7574670 7574671 Deide_04510 Deide_04520 thiC thiE TRUE 0.998 -3.000 0.007 0.004 Y NA
 7574671 7574672 Deide_04520 Deide_04525 thiE   TRUE 0.998 -9.000 0.120 1.000 Y NA
 7574672 7574673 Deide_04525 Deide_04530   thiG TRUE 0.989 2.000 0.095 1.000 Y NA
 7574673 7574674 Deide_04530 Deide_04540 thiG   TRUE 0.988 -3.000 0.014 1.000 N NA
 7574674 7574675 Deide_04540 Deide_04550   thiD TRUE 0.992 -3.000 0.059 1.000 N NA
 7574675 7574676 Deide_04550 Deide_04560 thiD paaA FALSE 0.456 122.000 0.012 1.000   NA
 7574676 7574677 Deide_04560 Deide_04570 paaA paaB TRUE 0.991 0.000 0.920 NA   NA
 7574677 7574678 Deide_04570 Deide_04580 paaB paaC TRUE 0.998 -3.000 0.943 NA   NA
 7574678 7574679 Deide_04580 Deide_04590 paaC paaD TRUE 0.981 5.000 0.919 NA   NA
 7574679 7574680 Deide_04590 Deide_04600 paaD paaZ TRUE 0.677 64.000 0.018 NA   NA
 7574680 7574681 Deide_04600 Deide_04602 paaZ   FALSE 0.012 287.000 0.000 NA   NA
 7574683 7574684 Deide_04616 Deide_04617 rrlA rrfA FALSE 0.199 103.000 0.000 NA   NA
 7574684 7574685 Deide_04617 Deide_04615 rrfA trnG TRUE 0.603 8.000 0.000 NA   NA
 7574685 7574686 Deide_04615 Deide_04613 trnG   FALSE 0.180 110.000 0.000 NA   NA
 7574687 7574688 Deide_04625 Deide_04620 trnL   FALSE 0.003 605.000 0.000 NA   NA
 7574688 7574689 Deide_04620 Deide_04630     TRUE 0.719 105.000 0.172 1.000   NA
 7574689 7574690 Deide_04630 Deide_04640     FALSE 0.135 125.000 0.000 NA   NA
 7574691 7574692 Deide_04650 Deide_04651     FALSE 0.032 201.000 0.000 NA   NA
 7574692 7574693 Deide_04651 Deide_04652     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574694 7574695 Deide_04660 Deide_04670   gpsA FALSE 0.022 243.000 0.000 1.000 N NA
 7574695 7574696 Deide_04670 Deide_04680 gpsA   TRUE 0.989 -3.000 0.021 1.000   NA
 7574699 7574700 Deide_04710 Deide_04720 dnaB   TRUE 0.971 0.000 0.056 1.000 N NA
 7574700 7574701 Deide_04720 Deide_04721     TRUE 0.856 63.000 0.375 NA   NA
 7574701 7574702 Deide_04721 Deide_04730     TRUE 0.828 42.000 0.214 NA   NA
 7574702 7574703 Deide_04730 Deide_04740   nrdR TRUE 0.987 -3.000 0.015 NA N NA
 7574704 7574705 Deide_04750 Deide_04760     TRUE 0.999 -3.000 0.444 0.055 Y NA
 7574705 7574706 Deide_04760 Deide_04770     TRUE 0.963 76.000 0.889 NA Y NA
 7574706 7574707 Deide_04770 Deide_04780     TRUE 0.969 33.000 0.889 NA Y NA
 7574707 7574708 Deide_04780 Deide_04790     TRUE 0.996 2.000 0.444 0.025 Y NA
 7574708 7574709 Deide_04790 Deide_04800     FALSE 0.471 121.000 0.013 1.000 N NA
 7574709 7574710 Deide_04800 Deide_04810     FALSE 0.003 854.000 0.000 NA   NA
 7574711 7574712 Deide_04820 Deide_04830     TRUE 0.902 76.000 0.833 NA   NA
 7574713 7574714 Deide_04840 Deide_04850     TRUE 0.984 -3.000 0.005 1.000 N NA
 7574714 7574715 Deide_04850 Deide_04860     FALSE 0.279 91.000 0.000 1.000 N NA
 7574716 7574717 Deide_04880 Deide_04890     TRUE 0.895 7.000 0.021 NA   NA
 7574719 7574720 Deide_04910 Deide_04920     FALSE 0.312 35.000 0.000 NA   NA
 7574723 7574724 Deide_04940 Deide_04950 gcvP gcvH TRUE 0.890 109.000 0.249 1.000 Y NA
 7574724 7574725 Deide_04950 Deide_04960 gcvH gcvT TRUE 0.967 85.000 0.317 0.001 Y NA
 7574725 7574726 Deide_04960 Deide_04970 gcvT   FALSE 0.297 59.000 0.000 NA   NA
 7574729 7574730 Deide_05000 Deide_05001     TRUE 0.669 25.000 0.005 NA   NA
 7574730 7574731 Deide_05001 Deide_05010     TRUE 0.910 27.000 0.600 NA   NA
 7574731 7574732 Deide_05010 Deide_05020     FALSE 0.544 143.000 0.250 NA N NA
 7574732 7574733 Deide_05020 Deide_05030   lysS TRUE 0.606 172.000 0.833 1.000 N NA
 7574733 7574734 Deide_05030 Deide_05040 lysS   FALSE 0.037 189.000 0.000 NA N NA
 7574734 7574735 Deide_05040 Deide_05050     TRUE 0.997 -3.000 0.089 NA Y NA
 7574735 7574736 Deide_05050 Deide_05060     TRUE 0.895 109.000 0.044 0.055 Y NA
 7574736 7574737 Deide_05060 Deide_05070     TRUE 0.994 0.000 0.061 0.055 Y NA
 7574737 7574738 Deide_05070 Deide_05080     TRUE 0.875 31.000 0.091 0.085 N NA
 7574738 7574739 Deide_05080 Deide_05090     FALSE 0.008 395.000 0.000 1.000 N NA
 7574739 7574740 Deide_05090 Deide_05100     TRUE 0.639 248.000 0.498 0.002 Y NA
 7574740 7574741 Deide_05100 Deide_05110     TRUE 0.999 -12.000 0.125 0.002 Y NA
 7574741 7574742 Deide_05110 Deide_05120     TRUE 0.999 -3.000 0.026 0.006 Y NA
 7574742 7574743 Deide_05120 Deide_05130     TRUE 0.987 12.000 0.161 0.006 Y NA
 7574743 7574744 Deide_05130 Deide_05140     TRUE 0.999 -3.000 0.163 0.006 Y NA
 7574744 7574745 Deide_05140 Deide_05150     TRUE 1.000 -3.000 0.753 0.006 Y NA
 7574745 7574746 Deide_05150 Deide_05160     TRUE 0.996 0.000 0.151 0.006 Y NA
 7574746 7574747 Deide_05160 Deide_05170     TRUE 0.969 37.000 0.221 0.006 Y NA
 7574747 7574748 Deide_05170 Deide_05180     TRUE 0.999 -3.000 0.210 0.006 Y NA
 7574748 7574749 Deide_05180 Deide_05190     TRUE 0.997 0.000 0.306 0.002 Y NA
 7574749 7574750 Deide_05190 Deide_05200     TRUE 0.993 13.000 0.790 0.006 Y NA
 7574750 7574751 Deide_05200 Deide_05210     TRUE 0.874 134.000 0.071 0.002 Y NA
 7574751 7574752 Deide_05210 Deide_05220     TRUE 0.995 1.000 0.044 0.002 Y NA
 7574754 7574755 Deide_05240 Deide_05250     FALSE 0.045 180.000 0.000 NA   NA
 7574755 7574756 Deide_05250 Deide_05260     FALSE 0.178 212.000 0.091 NA   NA
 7574757 7574758 Deide_05270 Deide_05280   hemY FALSE 0.222 94.000 0.000 NA N NA
 7574758 7574759 Deide_05280 Deide_05290 hemY hemH TRUE 0.997 -3.000 0.014 1.000 Y NA
 7574759 7574760 Deide_05290 Deide_05300 hemH hemE TRUE 0.963 17.000 0.131 1.000 Y NA
 7574760 7574761 Deide_05300 Deide_05301 hemE   FALSE 0.068 163.000 0.000 NA   NA
 7574762 7574763 Deide_05310 Deide_05311     TRUE 0.956 14.000 0.667 NA   NA
 7574763 7574764 Deide_05311 Deide_05320     FALSE 0.037 190.000 0.000 NA   NA
 7574764 7574765 Deide_05320 Deide_05330     FALSE 0.005 467.000 0.000 NA   NA
 7574765 7574766 Deide_05330 Deide_05340   serS TRUE 0.987 0.000 0.010 1.000 Y NA
 7574766 7574767 Deide_05340 Deide_05350 serS   FALSE 0.038 189.000 0.000 NA   NA
 7574767 7574768 Deide_05350 Deide_05360     TRUE 0.993 -3.000 0.143 NA   NA
 7574768 7574769 Deide_05360 Deide_05371     FALSE 0.005 469.000 0.000 NA   NA
 7574770 7574771 Deide_05380 Deide_05390     TRUE 0.987 -3.000 0.016 NA   NA
 7574771 7574772 Deide_05390 Deide_05400     FALSE 0.555 88.000 0.005 1.000   NA
 7574772 7574773 Deide_05400 Deide_05410     TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 7574773 7574774 Deide_05410 Deide_05420     TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 7574779 7574780 Deide_05470 Deide_05471     TRUE 0.715 70.000 0.041 NA   NA
 7574782 7574783 Deide_05490 Deide_05500     TRUE 0.653 44.000 0.010 NA   NA
 7574783 7574784 Deide_05500 Deide_05510   murD FALSE 0.105 201.000 0.004 1.000 N NA
 7574784 7574785 Deide_05510 Deide_05520 murD   TRUE 0.995 -3.000 0.297 1.000 N NA
 7574786 7574787 Deide_05530 Deide_05540 engD   FALSE 0.030 221.000 0.000 1.000 N NA
 7574788 7574789 Deide_05550 Deide_05570     FALSE 0.003 588.000 0.000 NA   NA
 7574790 7574791 Deide_05580 Deide_05590 guaA   FALSE 0.475 100.000 0.005 NA   NA
 7574792 7574793 Deide_05610 Deide_05620     TRUE 0.990 -3.000 0.032 1.000 N NA
 7574793 7574794 Deide_05620 Deide_05630     TRUE 0.994 -3.000 0.015 0.041 N NA
 7574795 7574796 Deide_05640 Deide_05641 aroA   FALSE 0.537 112.000 0.016 1.000   NA
 7574796 7574797 Deide_05641 Deide_05650     FALSE 0.050 177.000 0.000 NA   NA
 7574797 7574798 Deide_05650 Deide_05665   trnN FALSE 0.002 1037.000 0.000 NA   NA
 7574798 7574799 Deide_05665 Deide_05660 trnN   FALSE 0.251 85.000 0.000 NA   NA
 7574799 7574800 Deide_05660 Deide_05670   lon TRUE 0.638 61.000 0.010 NA N NA
 7574800 7574801 Deide_05670 Deide_05680 lon   FALSE 0.023 240.000 0.000 1.000 N NA
 7574802 7574803 Deide_05685 Deide_05686 trnH trnL FALSE 0.311 43.000 0.000 NA   NA
 7574803 7574804 Deide_05686 Deide_05690 trnL tig FALSE 0.014 264.000 0.000 NA   NA
 7574804 7574805 Deide_05690 Deide_05700 tig fabH FALSE 0.125 184.000 0.003 1.000 N NA
 7574805 7574806 Deide_05700 Deide_05710 fabH fabD TRUE 0.998 -3.000 0.008 0.005 Y NA
 7574806 7574807 Deide_05710 Deide_05711 fabD   TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574807 7574808 Deide_05711 Deide_05730   fabG TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574808 7574809 Deide_05730 Deide_05740 fabG acpP TRUE 0.587 198.000 0.021 0.005 Y NA
 7574809 7574810 Deide_05740 Deide_05750 acpP fabF TRUE 0.925 94.000 0.346 1.000 Y NA
 7574810 7574811 Deide_05750 Deide_05760 fabF   FALSE 0.077 155.000 0.000 NA   NA
 7574811 7574812 Deide_05760 Deide_05770     TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 7574812 7574813 Deide_05770 Deide_05771     FALSE 0.565 11.000 0.000 NA   NA
 7574813 7574814 Deide_05771 Deide_05780   ppk FALSE 0.014 262.000 0.000 NA   NA
 7574816 7574817 Deide_05795 Deide_05800 trnQ trxB FALSE 0.154 119.000 0.000 NA   NA
 7574817 7574818 Deide_05800 Deide_05810 trxB   TRUE 0.723 77.000 0.040 1.000   NA
 7574819 7574820 Deide_05820 Deide_05821     FALSE 0.011 303.000 0.000 NA   NA
 7574822 7574823 Deide_05840 Deide_05850     TRUE 0.630 100.000 0.033 1.000 N NA
 7574826 7574827 Deide_05870 Deide_05875   trnA FALSE 0.296 58.000 0.000 NA   NA
 7574827 7574828 Deide_05875 Deide_05876 trnA trnM FALSE 0.312 36.000 0.000 NA   NA
 7574830 7574831 Deide_05890 Deide_05900     FALSE 0.293 88.000 0.000 1.000   NA
 7574831 7574832 Deide_05900 Deide_05910   rpmI FALSE 0.121 183.000 0.002 1.000 N NA
 7574832 7574833 Deide_05910 Deide_05920 rpmI rplT TRUE 0.996 6.000 0.928 0.016 Y NA
 7574834 7574835 Deide_05930 Deide_05940   moaA FALSE 0.279 212.000 0.333 1.000 N NA
 7574836 7574837 Deide_05950 Deide_05960     TRUE 0.996 -3.000 0.444 NA   NA
 7574837 7574838 Deide_05960 Deide_05961     FALSE 0.297 61.000 0.000 NA   NA
 7574839 7574840 Deide_05970 Deide_05980     TRUE 0.802 2.000 0.000 1.000 N NA
 7574844 7574845 Deide_06020 Deide_06030 rpoC rpoB TRUE 0.980 89.000 0.851 0.001 Y NA
 7574846 7574847 Deide_06040 Deide_06041     FALSE 0.020 232.000 0.000 NA   NA
 7574848 7574849 Deide_06050 Deide_06060 rplL rplJ TRUE 0.982 67.000 0.884 0.016 Y NA
 7574849 7574850 Deide_06060 Deide_06070 rplJ rplA TRUE 0.706 199.000 0.302 0.022 Y NA
 7574850 7574851 Deide_06070 Deide_06080 rplA rplK TRUE 1.000 -7.000 0.838 0.022 Y NA
 7574851 7574852 Deide_06080 Deide_06090 rplK nusG TRUE 0.584 170.000 0.681 1.000 N NA
 7574852 7574853 Deide_06090 Deide_06100 nusG secE TRUE 0.998 -3.000 0.843 1.000 N NA
 7574853 7574854 Deide_06100 Deide_06110 secE rpmG TRUE 0.757 83.000 0.100 1.000 N NA
 7574854 7574855 Deide_06110 Deide_06111 rpmG   FALSE 0.023 222.000 0.000 NA   NA
 7574855 7574856 Deide_06111 Deide_06120   tufA FALSE 0.050 177.000 0.000 NA   NA
 7574856 7574857 Deide_06120 Deide_06138 tufA trnT FALSE 0.093 144.000 0.000 NA   NA
 7574857 7574858 Deide_06138 Deide_06137 trnT trnG FALSE 0.580 10.000 0.000 NA   NA
 7574858 7574859 Deide_06137 Deide_06136 trnG trnY TRUE 0.592 9.000 0.000 NA   NA
 7574859 7574860 Deide_06136 Deide_06135 trnY trnT FALSE 0.312 39.000 0.000 NA   NA
 7574861 7574862 Deide_06130 Deide_06140     TRUE 0.999 -3.000 0.118 0.004 Y NA
 7574865 7574866 Deide_06160 Deide_06170     TRUE 0.862 36.000 0.357 NA   NA
 7574866 7574867 Deide_06170 Deide_06180     FALSE 0.175 112.000 0.000 NA   NA
 7574868 7574869 Deide_06190 Deide_06200     FALSE 0.015 292.000 0.000 1.000   NA
 7574871 7574872 Deide_06210 Deide_06220     TRUE 0.596 68.000 0.004 1.000   NA
 7574873 7574874 Deide_06230 Deide_06240     TRUE 0.805 32.000 0.094 1.000   NA
 7574874 7574875 Deide_06240 Deide_06250     TRUE 0.851 15.000 0.021 1.000 N NA
 7574875 7574876 Deide_06250 Deide_06260   hslO FALSE 0.111 257.000 0.000 1.000 Y NA
 7574877 7574878 Deide_06270 Deide_06280     FALSE 0.554 122.000 0.049 1.000 N NA
 7574878 7574879 Deide_06280 Deide_06290     FALSE 0.141 547.000 0.062 0.031 Y NA
 7574883 7574884 Deide_06330 Deide_06331     TRUE 0.956 44.000 0.500 NA Y NA
 7574885 7574886 Deide_06340 Deide_06350 recR   TRUE 0.905 29.000 0.604 NA   NA
 7574886 7574887 Deide_06350 Deide_06360     FALSE 0.290 66.000 0.000 NA   NA
 7574887 7574888 Deide_06360 Deide_06370     FALSE 0.232 105.000 0.000 1.000 N NA
 7574889 7574890 Deide_06380 Deide_06390 infC nrdH FALSE 0.157 128.000 0.000 1.000 N NA
 7574894 7574895 Deide_06430 Deide_06435   trnC FALSE 0.007 355.000 0.000 NA   NA
 7574895 7574896 Deide_06435 Deide_06436 trnC trnV FALSE 0.495 15.000 0.000 NA   NA
 7574897 7574898 Deide_06440 Deide_06450     FALSE 0.251 85.000 0.000 NA   NA
 7574898 7574899 Deide_06450 Deide_06460     FALSE 0.048 178.000 0.000 NA   NA
 7574899 7574900 Deide_06460 Deide_06470     FALSE 0.003 612.000 0.000 NA   NA
 7574901 7574902 Deide_06471 Deide_06472     FALSE 0.154 119.000 0.000 NA   NA
 7574903 7574904 Deide_06480 Deide_06490     TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 7574904 7574905 Deide_06490 Deide_06491     TRUE 0.867 17.000 0.000 NA Y NA
 7574905 7574906 Deide_06491 Deide_06492     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574906 7574907 Deide_06492 Deide_06500     TRUE 0.917 26.000 0.636 NA   NA
 7574908 7574909 Deide_06510 Deide_06511     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574911 7574912 Deide_06521 Deide_06540     FALSE 0.112 134.000 0.000 NA   NA
 7574912 7574913 Deide_06540 Deide_06550     FALSE 0.002 1114.000 0.000 NA   NA
 7574913 7574914 Deide_06550 Deide_06551     FALSE 0.015 254.000 0.000 NA   NA
 7574914 7574915 Deide_06551 Deide_06561     FALSE 0.218 96.000 0.000 NA   NA
 7574915 7574916 Deide_06561 Deide_06570     FALSE 0.008 336.000 0.000 NA   NA
 7574917 7574918 Deide_06571 Deide_06580     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574918 7574919 Deide_06580 Deide_06581     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7574919 7574920 Deide_06581 Deide_06590     TRUE 0.997 -3.000 0.667 NA   NA
 7574920 7574921 Deide_06590 Deide_06600     FALSE 0.002 1392.000 0.000 NA   NA
 7574923 7574924 Deide_06610 Deide_06620     FALSE 0.166 125.000 0.000 1.000 N NA
 7574925 7574926 Deide_06630 Deide_06640 ppgK   TRUE 0.683 50.000 0.019 NA   NA
 7574926 7574927 Deide_06640 Deide_06650     TRUE 0.697 53.000 0.025 NA   NA
 7574930 7574931 Deide_06670 Deide_06680 rpmE   FALSE 0.219 95.000 0.000 NA N NA
 7574932 7574933 Deide_06690 Deide_06700     FALSE 0.056 172.000 0.000 NA   NA
 7574933 7574934 Deide_06700 Deide_06710     FALSE 0.003 610.000 0.000 NA   NA
 7574934 7574935 Deide_06710 Deide_06720   valS TRUE 0.991 -3.000 0.041 1.000 N NA
 7574936 7574937 Deide_06730 Deide_06740   iscS FALSE 0.004 592.000 0.000 1.000   NA
 7574937 7574938 Deide_06740 Deide_06750 iscS   TRUE 0.862 35.000 0.312 1.000   NA
 7574938 7574939 Deide_06750 Deide_06760     TRUE 0.820 64.000 0.231 NA   NA
 7574939 7574940 Deide_06760 Deide_06770     TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 7574941 7574942 Deide_06780 Deide_06781     FALSE 0.121 130.000 0.000 NA   NA
 7574943 7574944 Deide_06790 Deide_06800     FALSE 0.003 692.000 0.000 NA   NA
 7574944 7574945 Deide_06800 Deide_06801     FALSE 0.314 33.000 0.000 NA   NA
 7574945 7574946 Deide_06801 Deide_06810     TRUE 0.890 48.000 0.600 NA   NA
 7574946 7574947 Deide_06810 Deide_06811     FALSE 0.043 181.000 0.000 NA   NA
 7574947 7574948 Deide_06811 Deide_06820     TRUE 0.959 12.000 0.600 NA   NA
 7574948 7574949 Deide_06820 Deide_06830     TRUE 0.910 45.000 0.800 NA   NA
 7574950 7574951 Deide_06840 Deide_06850     FALSE 0.293 54.000 0.000 NA   NA
 7574951 7574952 Deide_06850 Deide_06860     TRUE 0.917 60.000 1.000 NA   NA
 7574952 7574953 Deide_06860 Deide_06870     TRUE 0.981 0.000 0.267 NA   NA
 7574953 7574954 Deide_06870 Deide_06880     TRUE 0.993 -3.000 0.133 NA   NA
 7574954 7574955 Deide_06880 Deide_06890     TRUE 0.882 28.000 0.400 NA   NA
 7574955 7574956 Deide_06890 Deide_06900     TRUE 0.963 6.000 0.400 NA   NA
 7574956 7574957 Deide_06900 Deide_06910     FALSE 0.127 128.000 0.000 NA   NA
 7574957 7574958 Deide_06910 Deide_06920   mfd FALSE 0.318 81.000 0.000 1.000   NA
 7574959 7574960 Deide_06930 Deide_06940     FALSE 0.003 614.000 0.000 NA   NA
 7574960 7574961 Deide_06940 Deide_06950   coaE FALSE 0.312 36.000 0.000 NA   NA
 7574963 7574964 Deide_06980 Deide_06990     TRUE 0.996 2.000 0.417 0.024 Y NA
 7574964 7574965 Deide_06990 Deide_07000     TRUE 0.998 -3.000 0.255 1.000 Y NA
 7574965 7574966 Deide_07000 Deide_07010     TRUE 0.975 49.000 0.617 0.053 Y NA
 7574966 7574967 Deide_07010 Deide_07020     TRUE 0.938 96.000 0.558 1.000 Y NA
 7574967 7574968 Deide_07020 Deide_07030     FALSE 0.118 143.000 0.000 1.000 N NA
 7574968 7574969 Deide_07030 Deide_07040     TRUE 0.997 -7.000 0.044 0.002 N NA
 7574969 7574970 Deide_07040 Deide_07050     TRUE 0.628 11.000 0.000 1.000   NA
 7574971 7574972 Deide_07060 Deide_07070 argF   TRUE 0.768 30.000 0.039 1.000 N NA
 7574972 7574973 Deide_07070 Deide_07080     TRUE 0.989 -3.000 0.019 1.000 N NA
 7574974 7574975 Deide_07090 Deide_07100   trpS TRUE 0.949 0.000 0.010 NA   NA
 7574975 7574976 Deide_07100 Deide_07110 trpS   TRUE 0.828 78.000 0.273 1.000 N NA
 7574977 7574978 Deide_07115 Deide_07120 trnR   FALSE 0.026 212.000 0.000 NA   NA
 7574979 7574980 Deide_07130 Deide_07131     TRUE 0.884 3.000 0.002 NA   NA
 7574980 7574981 Deide_07131 Deide_07150     TRUE 0.766 78.000 0.120 NA   NA
 7574982 7574983 Deide_07160 Deide_07170     TRUE 0.994 -7.000 0.102 NA   NA
 7574983 7574984 Deide_07170 Deide_07180   greA FALSE 0.004 476.000 0.000 NA   NA
 7574985 7574986 Deide_07190 Deide_07200     TRUE 0.990 3.000 0.286 1.000 Y NA
 7574986 7574987 Deide_07200 Deide_07210   lipA FALSE 0.026 230.000 0.000 1.000 N NA
 7574987 7574988 Deide_07210 Deide_07220 lipA lipB TRUE 0.995 4.000 0.319 0.001 Y NA
 7574991 7574992 Deide_07240 Deide_07250 rplS   FALSE 0.029 325.000 0.002 1.000   NA
 7574994 7574995 Deide_07270 Deide_07280     TRUE 0.693 34.000 0.017 NA N NA
 7574995 7574996 Deide_07280 Deide_07290     TRUE 0.982 9.000 0.313 NA Y NA
 7574997 7574998 Deide_07300 Deide_07310   rpsI FALSE 0.095 156.000 0.000 1.000   NA
 7574998 7574999 Deide_07310 Deide_07320 rpsI rplM TRUE 0.998 0.000 0.601 0.016 Y NA
 7574999 7575000 Deide_07320 Deide_07330 rplM   FALSE 0.052 183.000 0.000 1.000 N NA
 7575000 7575001 Deide_07330 Deide_07340   rpmB TRUE 0.984 -3.000 0.005 1.000   NA
 7575004 7575005 Deide_07380 Deide_07390     FALSE 0.047 190.000 0.000 1.000   NA
 7575007 7575008 Deide_07410 Deide_07420 topA   TRUE 0.922 1.000 0.004 NA   NA
 7575009 7575010 Deide_07430 Deide_07440     TRUE 0.731 73.000 0.057 NA   NA
 7575010 7575011 Deide_07440 Deide_07450     TRUE 0.710 86.000 0.074 NA   NA
 7575012 7575013 Deide_07460 Deide_07470 rnhA   FALSE 0.124 129.000 0.000 NA   NA
 7575013 7575014 Deide_07470 Deide_07480     FALSE 0.004 501.000 0.000 NA   NA
 7575015 7575016 Deide_07490 Deide_07500   glmU TRUE 0.741 4.000 0.000 1.000 N NA
 7575016 7575017 Deide_07500 Deide_07510 glmU lgt FALSE 0.553 165.000 0.011 1.000 Y NA
 7575017 7575018 Deide_07510 Deide_07520 lgt   FALSE 0.577 77.000 0.006 NA N NA
 7575018 7575019 Deide_07520 Deide_07530     TRUE 0.800 20.000 0.023 NA   NA
 7575020 7575021 Deide_07535 Deide_07532     TRUE 0.908 63.000 0.750 1.000   NA
 7575021 7575022 Deide_07532 Deide_07533     TRUE 0.948 18.000 0.800 NA   NA
 7575028 7575029 Deide_07570 Deide_07580 tdh trpS FALSE 0.018 263.000 0.000 1.000 N NA
 7575029 7575030 Deide_07580 Deide_07590 trpS   TRUE 0.588 103.000 0.020 1.000 N NA
 7575031 7575032 Deide_07600 Deide_07610     FALSE 0.008 331.000 0.000 NA N NA
 7575033 7575034 Deide_07620 Deide_07630 prs   FALSE 0.005 416.000 0.000 NA   NA
 7575034 7575035 Deide_07630 Deide_07640   panC TRUE 0.623 44.000 0.007 NA   NA
 7575035 7575036 Deide_07640 Deide_07650 panC pilT TRUE 0.987 -3.000 0.011 1.000 N NA
 7575038 7575039 Deide_07670 Deide_07680     FALSE 0.152 257.000 0.030 0.052 N NA
 7575039 7575040 Deide_07680 Deide_07690     TRUE 0.624 197.000 0.121 0.052 Y NA
 7575041 7575042 Deide_07700 Deide_07710     FALSE 0.026 212.000 0.000 NA   NA
 7575042 7575043 Deide_07710 Deide_07720     TRUE 0.699 85.000 0.057 NA   NA
 7575045 7575046 Deide_07740 Deide_07750     FALSE 0.230 92.000 0.000 NA   NA
 7575046 7575047 Deide_07750 Deide_07751     FALSE 0.020 232.000 0.000 NA   NA
 7575049 7575050 Deide_07770 Deide_07771     FALSE 0.003 646.000 0.000 NA   NA
 7575052 7575053 Deide_07790 Deide_07800     TRUE 0.718 105.000 0.222 NA   NA
 7575053 7575054 Deide_07800 Deide_07810     TRUE 0.665 31.000 0.007 1.000   NA
 7575054 7575055 Deide_07810 Deide_07820     TRUE 0.998 -3.000 0.720 0.052   NA
 7575056 7575057 Deide_07830 Deide_07840 ndk   FALSE 0.015 288.000 0.000 1.000 N NA
 7575059 7575060 Deide_07860 Deide_07870     FALSE 0.090 217.000 0.009 NA   NA
 7575060 7575061 Deide_07870 Deide_07880     TRUE 0.877 111.000 0.018 0.042 Y NA
 7575061 7575062 Deide_07880 Deide_07890     TRUE 0.704 83.000 0.039 1.000 N NA
 7575063 7575064 Deide_07900 Deide_07910     FALSE 0.004 520.000 0.000 NA   NA
 7575065 7575066 Deide_07920 Deide_07930 acn   FALSE 0.127 188.000 0.004 1.000   NA
 7575067 7575068 Deide_07940 Deide_07950     TRUE 0.777 68.000 0.115 NA   NA
 7575068 7575069 Deide_07950 Deide_07960     TRUE 0.995 -3.000 0.308 NA   NA
 7575070 7575071 Deide_07970 Deide_07980   cysK FALSE 0.057 171.000 0.000 NA   NA
 7575071 7575072 Deide_07980 Deide_07981 cysK   FALSE 0.013 274.000 0.000 NA   NA
 7575072 7575073 Deide_07981 Deide_07990     FALSE 0.007 371.000 0.000 NA   NA
 7575075 7575076 Deide_08010 Deide_08020     TRUE 0.998 -7.000 0.886 NA   NA
 7575076 7575077 Deide_08020 Deide_08030     TRUE 0.899 29.000 0.545 NA   NA
 7575077 7575078 Deide_08030 Deide_08040     FALSE 0.007 353.000 0.000 NA   NA
 7575078 7575079 Deide_08040 Deide_08050     TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 7575079 7575080 Deide_08050 Deide_08060     FALSE 0.246 101.000 0.000 1.000 N NA
 7575080 7575081 Deide_08060 Deide_08070     FALSE 0.038 441.000 0.062 1.000 N NA
 7575081 7575082 Deide_08070 Deide_08071     TRUE 0.991 0.000 0.062 1.000 Y NA
 7575082 7575083 Deide_08071 Deide_08080     FALSE 0.318 81.000 0.000 1.000   NA
 7575084 7575085 Deide_08090 Deide_08091     TRUE 0.876 7.000 0.011 NA   NA
 7575085 7575086 Deide_08091 Deide_08100     TRUE 0.988 -19.000 0.010 NA   NA
 7575087 7575088 Deide_08110 Deide_08120 rpe   TRUE 0.987 -3.000 0.010 1.000 N NA
 7575088 7575089 Deide_08120 Deide_08130     FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 7575089 7575090 Deide_08130 Deide_08140     FALSE 0.005 418.000 0.000 NA   NA
 7575092 7575093 Deide_08155 Deide_08161     TRUE 0.865 50.000 0.429 NA   NA
 7575094 7575095 Deide_08170 Deide_08180     FALSE 0.308 39.000 0.000 NA N NA
 7575095 7575096 Deide_08180 Deide_08190     TRUE 0.986 -3.000 0.011 NA   NA
 7575097 7575098 Deide_08200 Deide_08210     FALSE 0.107 196.000 0.005 NA N NA
 7575098 7575099 Deide_08210 Deide_08220     TRUE 0.645 66.000 0.012 NA N NA
 7575099 7575100 Deide_08220 Deide_08230     FALSE 0.159 128.000 0.000 1.000   NA
 7575101 7575102 Deide_08240 Deide_08250     FALSE 0.370 41.000 0.000 1.000   NA
 7575102 7575103 Deide_08250 Deide_08260     TRUE 0.903 15.000 0.154 NA   NA
 7575103 7575104 Deide_08260 Deide_08270     TRUE 0.996 -3.000 0.385 NA   NA
 7575104 7575105 Deide_08270 Deide_08280     TRUE 0.998 -3.000 0.385 NA Y NA
 7575105 7575106 Deide_08280 Deide_08290     TRUE 0.999 -3.000 0.857 NA Y NA
 7575106 7575107 Deide_08290 Deide_08300   ccmF TRUE 0.927 54.000 0.146 1.000 Y NA
 7575107 7575108 Deide_08300 Deide_08310 ccmF ccmE TRUE 0.970 26.000 0.086 0.002 Y NA
 7575108 7575109 Deide_08310 Deide_08320 ccmE ccmC TRUE 0.899 124.000 0.067 0.002 Y NA
 7575109 7575110 Deide_08320 Deide_08330 ccmC ccmB TRUE 0.968 99.000 0.501 0.001 Y NA
 7575110 7575111 Deide_08330 Deide_08340 ccmB ccmA TRUE 0.994 -3.000 0.196 1.000 N NA
 7575111 7575112 Deide_08340 Deide_08350 ccmA   TRUE 0.992 -3.000 0.075 1.000 N NA
 7575112 7575113 Deide_08350 Deide_08360     TRUE 0.763 72.000 0.095 NA   NA
 7575113 7575114 Deide_08360 Deide_08370     TRUE 0.782 112.000 0.500 NA   NA
 7575114 7575115 Deide_08370 Deide_08380     TRUE 0.875 53.000 0.444 1.000 N NA
 7575115 7575116 Deide_08380 Deide_08390     TRUE 0.604 142.000 0.333 1.000 N NA
 7575117 7575118 Deide_08400 Deide_08410     TRUE 0.799 72.000 0.182 NA   NA
 7575118 7575119 Deide_08410 Deide_08415     FALSE 0.317 32.000 0.000 NA   NA
 7575119 7575120 Deide_08415 Deide_08420     TRUE 0.723 3.000 0.000 NA   NA
 7575123 7575124 Deide_08450 Deide_08460     FALSE 0.016 249.000 0.000 NA N NA
 7575124 7575125 Deide_08460 Deide_08465     FALSE 0.295 57.000 0.000 NA   NA
 7575125 7575126 Deide_08465 Deide_08461     FALSE 0.338 28.000 0.000 NA   NA
 7575126 7575127 Deide_08461 Deide_08470     TRUE 0.980 2.000 0.038 0.014   NA
 7575129 7575130 Deide_08481 Deide_08490     FALSE 0.004 711.000 0.000 1.000   NA
 7575130 7575131 Deide_08490 Deide_08500     TRUE 0.988 -3.000 0.022 NA   NA
 7575131 7575132 Deide_08500 Deide_08510     TRUE 0.668 99.000 0.077 NA   NA
 7575132 7575133 Deide_08510 Deide_08520     TRUE 0.752 134.000 0.833 NA   NA
 7575134 7575135 Deide_08530 Deide_08531     TRUE 0.777 94.000 0.273 NA   NA
 7575138 7575139 Deide_08560 Deide_08570     TRUE 0.651 76.000 0.011 1.000   NA
 7575142 7575143 Deide_08591 Deide_08600   scpB TRUE 0.983 -3.000 0.006 NA N NA
 7575143 7575144 Deide_08600 Deide_08610 scpB   FALSE 0.503 90.000 0.005 NA   NA
 7575144 7575145 Deide_08610 Deide_08620     FALSE 0.475 88.000 0.002 NA   NA
 7575147 7575148 Deide_08640 Deide_08650     TRUE 0.987 -3.000 0.015 NA   NA
 7575150 7575151 Deide_08661 Deide_08670     TRUE 0.972 6.000 0.635 NA   NA
 7575151 7575152 Deide_08670 Deide_08680     TRUE 0.983 -3.000 0.006 NA   NA
 7575152 7575153 Deide_08680 Deide_08690     TRUE 0.998 -9.000 0.833 NA   NA
 7575153 7575154 Deide_08690 Deide_08700     FALSE 0.005 425.000 0.000 NA   NA
 7575154 7575155 Deide_08700 Deide_08710     FALSE 0.327 216.000 0.615 NA   NA
 7575155 7575156 Deide_08710 Deide_08720     FALSE 0.011 329.000 0.000 1.000   NA
 7575157 7575158 Deide_08730 Deide_08740     TRUE 0.990 -13.000 0.013 1.000   NA
 7575159 7575160 Deide_08750 Deide_08760     TRUE 0.637 109.000 0.086 NA   NA
 7575160 7575161 Deide_08760 Deide_08770     FALSE 0.401 113.000 0.002 1.000   NA
 7575161 7575162 Deide_08770 Deide_08780     TRUE 0.821 15.000 0.010 1.000 N NA
 7575162 7575163 Deide_08780 Deide_08790     TRUE 0.993 -3.000 0.122 NA   NA
 7575163 7575164 Deide_08790 Deide_08800   smc FALSE 0.296 152.000 0.013 NA   NA
 7575165 7575166 Deide_08801 Deide_08810     TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.043   NA
 7575166 7575167 Deide_08810 Deide_08820     TRUE 0.626 62.000 0.006 1.000 N NA
 7575167 7575168 Deide_08820 Deide_08830     TRUE 0.704 68.000 0.021 1.000   NA
 7575169 7575170 Deide_08840 Deide_08850     FALSE 0.521 111.000 0.013 1.000 N NA
 7575170 7575171 Deide_08850 Deide_08860     TRUE 0.679 65.000 0.019 NA   NA
 7575171 7575172 Deide_08860 Deide_08870     FALSE 0.055 173.000 0.000 NA   NA
 7575172 7575173 Deide_08870 Deide_08880     FALSE 0.297 61.000 0.000 NA   NA
 7575173 7575174 Deide_08880 Deide_08890     TRUE 0.993 -3.000 0.154 NA   NA
 7575175 7575176 Deide_08900 Deide_08910     TRUE 0.723 3.000 0.000 NA   NA
 7575177 7575178 Deide_08920 Deide_08930     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7575178 7575179 Deide_08930 Deide_08940     FALSE 0.305 46.000 0.000 NA   NA
 7575179 7575180 Deide_08940 Deide_08950     FALSE 0.421 20.000 0.000 NA   NA
 7575180 7575181 Deide_08950 Deide_08960     FALSE 0.228 93.000 0.000 NA   NA
 7575181 7575182 Deide_08960 Deide_08970     FALSE 0.286 69.000 0.000 NA   NA
 7575182 7575183 Deide_08970 Deide_08980     FALSE 0.104 152.000 0.000 1.000 N NA
 7575183 7575184 Deide_08980 Deide_08990     FALSE 0.009 364.000 0.000 1.000 N NA
 7575184 7575185 Deide_08990 Deide_09000     TRUE 0.933 74.000 0.006 0.001 Y NA
 7575185 7575186 Deide_09000 Deide_09010     TRUE 0.996 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 7575188 7575189 Deide_09030 Deide_09040     TRUE 0.900 70.000 0.041 1.000 Y NA
 7575189 7575190 Deide_09040 Deide_09050     FALSE 0.124 129.000 0.000 NA   NA
 7575194 7575195 Deide_09070 Deide_09080     FALSE 0.010 346.000 0.000 1.000   NA
 7575195 7575196 Deide_09080 Deide_09090     TRUE 0.996 -3.000 0.078 0.041   NA
 7575196 7575197 Deide_09090 Deide_09100     TRUE 0.993 -3.000 0.120 1.000   NA
 7575197 7575198 Deide_09100 Deide_09110     FALSE 0.154 181.000 0.006 1.000   NA
 7575198 7575199 Deide_09110 Deide_09120     FALSE 0.143 123.000 0.000 NA   NA
 7575200 7575201 Deide_09130 Deide_09150   ddrA FALSE 0.035 211.000 0.000 1.000   NA
 7575201 7575202 Deide_09150 Deide_09160 ddrA   TRUE 0.625 138.000 0.333 1.000   NA
 7575202 7575203 Deide_09160 Deide_09170     TRUE 0.858 74.000 0.000 0.044 Y NA
 7575204 7575205 Deide_09180 Deide_09190     TRUE 0.999 -3.000 0.046 0.004 Y NA
 7575205 7575206 Deide_09190 Deide_09200     TRUE 0.889 57.000 0.017 1.000 Y NA
 7575206 7575207 Deide_09200 Deide_09210     FALSE 0.018 263.000 0.000 1.000 N NA
 7575207 7575208 Deide_09210 Deide_09220     TRUE 0.986 -3.000 0.013 NA   NA
 7575208 7575209 Deide_09220 Deide_09230     FALSE 0.307 45.000 0.000 NA   NA
 7575210 7575211 Deide_09240 Deide_09250     TRUE 0.879 63.000 0.011 1.000 Y NA
 7575211 7575212 Deide_09250 Deide_09260     TRUE 0.991 -27.000 0.033 NA   NA
 7575213 7575214 Deide_09270 Deide_09280     TRUE 0.996 -3.000 0.455 NA   NA
 7575214 7575215 Deide_09280 Deide_09290     FALSE 0.286 69.000 0.000 NA   NA
 7575215 7575216 Deide_09290 Deide_09300     TRUE 0.908 10.000 0.064 NA   NA
 7575216 7575217 Deide_09300 Deide_09310     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7575217 7575218 Deide_09310 Deide_09320     FALSE 0.297 62.000 0.000 NA   NA
 7575219 7575220 Deide_09330 Deide_09345   trnM FALSE 0.272 78.000 0.000 NA   NA
 7575222 7575223 Deide_09350 Deide_09360   ruvA TRUE 0.586 32.000 0.003 NA   NA
 7575226 7575227 Deide_09380 Deide_09390     FALSE 0.528 79.000 0.003 NA   NA
 7575227 7575228 Deide_09390 Deide_09400     TRUE 0.988 -3.000 0.020 NA   NA
 7575228 7575229 Deide_09400 Deide_09410     FALSE 0.005 419.000 0.000 NA   NA
 7575230 7575231 Deide_09420 Deide_09430     FALSE 0.003 925.000 0.000 1.000   NA
 7575231 7575232 Deide_09430 Deide_09440     TRUE 0.988 -3.000 0.020 NA   NA
 7575232 7575233 Deide_09440 Deide_09450     TRUE 0.598 155.000 0.538 NA   NA
 7575233 7575234 Deide_09450 Deide_09460     FALSE 0.514 157.000 0.333 NA   NA
 7575236 7575237 Deide_09480 Deide_09490     TRUE 0.999 -3.000 0.136 0.051 Y NA
 7575237 7575238 Deide_09490 Deide_09500     TRUE 0.792 149.000 0.318 1.000 Y NA
 7575239 7575240 Deide_09510 Deide_09520     TRUE 0.874 69.000 0.455 1.000 N NA
 7575241 7575242 Deide_09530 Deide_09540     FALSE 0.397 22.000 0.000 NA   NA
 7575242 7575243 Deide_09540 Deide_09550     FALSE 0.245 87.000 0.000 NA   NA
 7575243 7575244 Deide_09550 Deide_09560     TRUE 0.691 77.000 0.021 1.000   NA
 7575245 7575246 Deide_09570 Deide_09580     FALSE 0.082 152.000 0.000 NA N NA
 7575250 7575251 Deide_09620 Deide_09630     FALSE 0.307 45.000 0.000 NA   NA
 7575253 7575254 Deide_09650 Deide_09660     FALSE 0.347 64.000 0.000 1.000 N NA
 7575254 7575255 Deide_09660 Deide_09670     TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7575256 7575257 Deide_09671 Deide_09680     FALSE 0.186 108.000 0.000 NA   NA
 7575257 7575258 Deide_09680 Deide_09690     FALSE 0.009 321.000 0.000 NA   NA
 7575258 7575259 Deide_09690 Deide_09700     TRUE 0.843 17.000 0.041 NA   NA
 7575259 7575260 Deide_09700 Deide_09710     FALSE 0.186 193.000 0.027 1.000   NA
 7575261 7575262 Deide_09711 Deide_09720     TRUE 0.829 73.000 0.294 NA   NA
 7575264 7575265 Deide_09740 Deide_09750     FALSE 0.330 29.000 0.000 NA   NA
 7575265 7575266 Deide_09750 Deide_09760     TRUE 0.923 2.000 0.008 NA   NA
 7575266 7575267 Deide_09760 Deide_09770     TRUE 0.618 41.000 0.004 1.000   NA
 7575267 7575268 Deide_09770 Deide_09780     FALSE 0.030 353.000 0.010 NA   NA
 7575268 7575269 Deide_09780 Deide_09790     TRUE 0.866 6.000 0.006 NA N NA
 7575269 7575270 Deide_09790 Deide_09800     FALSE 0.237 104.000 0.000 1.000 N NA
 7575272 7575273 Deide_09810 Deide_09820     TRUE 0.666 5.000 0.000 NA   NA
 7575277 7575278 Deide_09860 Deide_09870     TRUE 0.970 80.000 0.400 0.010 Y NA
 7575279 7575280 Deide_09880 Deide_09890     TRUE 0.637 100.000 0.037 1.000   NA
 7575282 7575283 Deide_09910 Deide_09920     TRUE 0.993 -3.000 0.088 1.000   NA
 7575283 7575284 Deide_09920 Deide_09930     FALSE 0.149 131.000 0.000 1.000   NA
 7575285 7575286 Deide_09940 Deide_09950     TRUE 0.991 -3.000 0.062 NA   NA
 7575287 7575288 Deide_09960 Deide_09970 recG   FALSE 0.019 455.000 0.009 NA   NA
 7575288 7575289 Deide_09970 Deide_09980     FALSE 0.048 178.000 0.000 NA   NA
 7575291 7575292 Deide_10000 Deide_10010     TRUE 0.993 -3.000 0.087 1.000 N NA
 7575293 7575294 Deide_10020 Deide_10030     FALSE 0.221 110.000 0.000 1.000   NA
 7575295 7575296 Deide_10040 Deide_10050     FALSE 0.348 65.000 0.000 1.000   NA
 7575296 7575297 Deide_10050 Deide_10060     TRUE 0.996 0.000 0.061 0.001 Y NA
 7575298 7575299 Deide_10070 Deide_10080     TRUE 0.997 -3.000 0.648 NA   NA
 7575299 7575300 Deide_10080 Deide_10090     TRUE 0.994 -3.000 0.239 NA   NA
 7575300 7575301 Deide_10090 Deide_10100     TRUE 0.966 0.000 0.043 NA   NA
 7575305 7575306 Deide_10140 Deide_10150     FALSE 0.304 84.000 0.000 1.000 N NA
 7575307 7575308 Deide_10160 Deide_10170     FALSE 0.199 116.000 0.000 1.000 N NA
 7575308 7575309 Deide_10170 Deide_10180     TRUE 0.892 26.000 0.005 1.000 Y NA
 7575309 7575310 Deide_10180 Deide_10190     TRUE 0.805 39.000 0.133 NA   NA
 7575310 7575311 Deide_10190 Deide_10191     FALSE 0.054 175.000 0.000 NA   NA
 7575312 7575313 Deide_10200 Deide_10201     FALSE 0.108 186.000 0.003 NA   NA
 7575313 7575314 Deide_10201 Deide_10210     FALSE 0.278 76.000 0.000 NA   NA
 7575314 7575315 Deide_10210 Deide_10220     FALSE 0.005 468.000 0.000 NA   NA
 7575316 7575317 Deide_10230 Deide_10240     TRUE 0.995 5.000 0.779 0.050 Y NA
 7575317 7575318 Deide_10240 Deide_10250     TRUE 0.735 155.000 0.021 0.050 Y NA
 7575318 7575319 Deide_10250 Deide_10260     FALSE 0.178 123.000 0.000 1.000   NA
 7575319 7575320 Deide_10260 Deide_10270     FALSE 0.472 130.000 0.031 1.000   NA
 7575322 7575323 Deide_10290 Deide_10300     TRUE 0.997 -3.000 0.625 NA   NA
 7575323 7575324 Deide_10300 Deide_10310     TRUE 0.846 55.000 0.333 NA   NA
 7575324 7575325 Deide_10310 Deide_10320     TRUE 0.894 18.000 0.222 NA   NA
 7575325 7575326 Deide_10320 Deide_10322     TRUE 0.679 39.000 0.014 NA   NA
 7575327 7575328 Deide_10321 Deide_10330     TRUE 0.986 -3.000 0.011 NA   NA
 7575330 7575331 Deide_10332 Deide_10333     FALSE 0.305 46.000 0.000 NA   NA
 7575331 7575332 Deide_10333 Deide_10340     FALSE 0.346 66.000 0.000 1.000   NA
 7575333 7575334 Deide_10350 Deide_10360   secDF FALSE 0.145 132.000 0.000 1.000 N NA
 7575334 7575335 Deide_10360 Deide_10362 secDF   TRUE 0.721 55.000 0.039 NA   NA
 7575335 7575336 Deide_10362 Deide_10370     FALSE 0.003 574.000 0.000 NA   NA
 7575336 7575337 Deide_10370 Deide_10375     TRUE 0.798 68.000 0.171 NA N NA
 7575337 7575338 Deide_10375 Deide_10380     TRUE 0.984 7.000 0.323 NA Y NA
 7575338 7575339 Deide_10380 Deide_10390     TRUE 0.910 38.000 0.759 NA   NA
 7575339 7575340 Deide_10390 Deide_10400     FALSE 0.031 202.000 0.000 NA   NA
 7575341 7575342 Deide_10410 Deide_10420     FALSE 0.153 129.000 0.000 1.000 N NA
 7575343 7575344 Deide_10421 Deide_10430     FALSE 0.535 85.000 0.005 NA   NA
 7575344 7575345 Deide_10430 Deide_10431     FALSE 0.409 21.000 0.000 NA   NA
 7575345 7575346 Deide_10431 Deide_10440     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7575346 7575347 Deide_10440 Deide_10450     FALSE 0.037 208.000 0.000 1.000   NA
 7575347 7575348 Deide_10450 Deide_10460     FALSE 0.172 113.000 0.000 NA   NA
 7575348 7575349 Deide_10460 Deide_10470     FALSE 0.371 25.000 0.000 NA   NA
 7575349 7575350 Deide_10470 Deide_10480     FALSE 0.462 17.000 0.000 NA   NA
 7575351 7575352 Deide_10490 Deide_10500     FALSE 0.208 169.000 0.006 1.000 N NA
 7575353 7575354 Deide_10510 Deide_10520     TRUE 0.862 24.000 0.143 1.000 N NA
 7575354 7575355 Deide_10520 Deide_10540     TRUE 0.996 -3.000 0.429 1.000 N NA
 7575355 7575356 Deide_10540 Deide_10550     TRUE 0.972 6.000 0.538 1.000   NA
 7575356 7575357 Deide_10550 Deide_10560     TRUE 0.592 98.000 0.015 1.000   NA
 7575357 7575358 Deide_10560 Deide_10570   mreB TRUE 0.720 76.000 0.037 1.000 N NA
 7575358 7575359 Deide_10570 Deide_10571 mreB   FALSE 0.261 82.000 0.000 NA   NA
 7575361 7575362 Deide_10590 Deide_10600     FALSE 0.204 115.000 0.000 1.000 N NA
 7575363 7575364 Deide_10610 Deide_10620     FALSE 0.023 224.000 0.000 NA   NA
 7575365 7575366 Deide_10630 Deide_10640     TRUE 0.990 7.000 0.672 1.000 Y NA
 7575366 7575367 Deide_10640 Deide_10650     TRUE 0.995 -3.000 0.324 1.000   NA
 7575367 7575368 Deide_10650 Deide_10660     TRUE 0.784 106.000 0.385 1.000   NA
 7575368 7575369 Deide_10660 Deide_10670     FALSE 0.106 136.000 0.000 NA N NA
 7575369 7575370 Deide_10670 Deide_10680   ftsX TRUE 0.992 -3.000 0.000 NA Y NA
 7575370 7575371 Deide_10680 Deide_10690 ftsX ftsE TRUE 0.995 0.000 0.431 1.000 Y NA
 7575373 7575374 Deide_10710 Deide_10720     TRUE 0.997 -3.000 0.600 NA   NA
 7575375 7575376 Deide_10725 Deide_10721     TRUE 0.763 62.000 0.000 NA Y NA
 7575377 7575378 Deide_10730 Deide_10740     TRUE 0.946 5.000 0.123 NA   NA
 7575378 7575379 Deide_10740 Deide_10750     TRUE 0.866 69.000 0.457 NA   NA
 7575380 7575381 Deide_10760 Deide_10770 aroE   TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7575381 7575382 Deide_10770 Deide_10780     TRUE 0.997 -7.000 0.000 0.015 Y NA
 7575382 7575383 Deide_10780 Deide_10790     TRUE 0.672 37.000 0.009 1.000 N NA
 7575385 7575386 Deide_10792 Deide_10800     FALSE 0.021 455.000 0.000 0.039   NA
 7575386 7575387 Deide_10800 Deide_10810     TRUE 0.961 -15.000 0.000 1.000 N NA
 7575387 7575388 Deide_10810 Deide_10820     FALSE 0.003 613.000 0.000 NA N NA
 7575388 7575389 Deide_10820 Deide_10830     FALSE 0.005 445.000 0.000 NA N NA
 7575389 7575390 Deide_10830 Deide_10840     FALSE 0.077 169.000 0.000 1.000 N NA
 7575391 7575392 Deide_10850 Deide_10860   mreD TRUE 0.997 -3.000 0.556 NA   NA
 7575392 7575393 Deide_10860 Deide_10870 mreD mreC TRUE 0.983 -3.000 0.006 NA   NA
 7575393 7575394 Deide_10870 Deide_10880 mreC   TRUE 0.983 -3.000 0.008 NA N NA
 7575394 7575395 Deide_10880 Deide_10890     TRUE 0.949 0.000 0.011 NA N NA
 7575396 7575397 Deide_10900 Deide_10910     TRUE 0.987 -3.000 0.012 1.000 N NA
 7575400 7575401 Deide_10940 Deide_10950     TRUE 0.847 57.000 0.333 NA   NA
 7575401 7575402 Deide_10950 Deide_10960     TRUE 0.706 39.000 0.014 1.000 N NA
 7575403 7575404 Deide_10970 Deide_10980   msrA TRUE 0.829 31.000 0.150 1.000   NA
 7575406 7575407 Deide_11000 Deide_11010     FALSE 0.284 71.000 0.000 NA   NA
 7575407 7575408 Deide_11010 Deide_11020     TRUE 0.994 -3.000 0.200 NA   NA
 7575408 7575409 Deide_11020 Deide_11030     FALSE 0.294 51.000 0.000 NA   NA
 7575409 7575410 Deide_11030 Deide_11040     TRUE 0.990 -3.000 0.042 NA   NA
 7575410 7575411 Deide_11040 Deide_11050     TRUE 0.943 0.000 0.005 1.000   NA
 7575411 7575412 Deide_11050 Deide_11055   trnL FALSE 0.294 51.000 0.000 NA   NA
 7575412 7575413 Deide_11055 Deide_11051 trnL   FALSE 0.016 251.000 0.000 NA   NA
 7575413 7575414 Deide_11051 Deide_11052     FALSE 0.261 82.000 0.000 NA   NA
 7575414 7575415 Deide_11052 Deide_11060     FALSE 0.049 270.000 0.005 1.000   NA
 7575415 7575416 Deide_11060 Deide_11070     TRUE 0.935 97.000 0.175 0.050 Y NA
 7575416 7575417 Deide_11070 Deide_11080     TRUE 0.981 11.000 0.750 0.050   NA
 7575417 7575418 Deide_11080 Deide_11090     TRUE 0.800 77.000 0.164 1.000   NA
 7575418 7575419 Deide_11090 Deide_11100     TRUE 0.999 -3.000 0.436 0.001 Y NA
 7575419 7575420 Deide_11100 Deide_11101     TRUE 0.684 105.000 0.133 NA   NA
 7575421 7575422 Deide_11110 Deide_11120     TRUE 0.996 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 7575423 7575424 Deide_11130 Deide_11140     FALSE 0.059 170.000 0.000 NA   NA
 7575426 7575427 Deide_11160 Deide_11165   trnV FALSE 0.307 45.000 0.000 NA   NA
 7575428 7575429 Deide_11170 Deide_11171     FALSE 0.020 231.000 0.000 NA   NA
 7575429 7575430 Deide_11171 Deide_11180     TRUE 0.947 -207.000 0.000 NA   NA
 7575435 7575436 Deide_11211 Deide_11212     TRUE 0.950 -16.000 0.000 NA   NA
 7575436 7575437 Deide_11212 Deide_11213     FALSE 0.199 103.000 0.000 NA   NA
 7575437 7575438 Deide_11213 Deide_11220     TRUE 0.679 76.000 0.023 NA   NA
 7575439 7575440 Deide_11230 Deide_11240     TRUE 0.941 13.000 0.364 NA   NA
 7575441 7575442 Deide_11250 Deide_11260     FALSE 0.302 47.000 0.000 NA   NA
 7575443 7575444 Deide_11270 Deide_11280     FALSE 0.230 92.000 0.000 NA   NA
 7575444 7575445 Deide_11280 Deide_11290     FALSE 0.003 633.000 0.000 NA N NA
 7575446 7575447 Deide_11300 Deide_11310     FALSE 0.247 163.000 0.009 1.000 N NA
 7575448 7575449 Deide_11320 Deide_11330 recQ   FALSE 0.406 27.000 0.000 1.000 N NA
 7575449 7575450 Deide_11330 Deide_11331     FALSE 0.293 54.000 0.000 NA   NA
 7575450 7575451 Deide_11331 Deide_11340     FALSE 0.003 656.000 0.000 NA   NA
 7575453 7575454 Deide_11360 Deide_11370     TRUE 0.905 53.000 0.727 1.000   NA
 7575454 7575455 Deide_11370 Deide_11380     FALSE 0.224 175.000 0.013 1.000   NA
 7575455 7575456 Deide_11380 Deide_11390     FALSE 0.020 458.000 0.009 1.000 N NA
 7575456 7575457 Deide_11390 Deide_11400     TRUE 0.784 1.000 0.000 NA   NA
 7575457 7575458 Deide_11400 Deide_11410     TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 7575458 7575459 Deide_11410 Deide_11420     TRUE 0.751 155.000 0.010 0.004 Y NA
 7575461 7575462 Deide_11440 Deide_11450   uvrC FALSE 0.007 403.000 0.000 1.000 N NA
 7575462 7575463 Deide_11450 Deide_11460 uvrC   FALSE 0.044 312.000 0.000 0.036 N NA
 7575463 7575464 Deide_11460 Deide_11470     TRUE 0.999 -3.000 0.161 0.036 Y NA
 7575464 7575465 Deide_11470 Deide_11471     FALSE 0.373 115.000 0.003 NA   NA
 7575466 7575467 Deide_11490 Deide_11500     FALSE 0.209 181.000 0.021 1.000 N NA
 7575471 7575472 Deide_11540 Deide_11550     TRUE 0.996 -3.000 0.400 1.000   NA
 7575472 7575473 Deide_11550 Deide_11560     TRUE 0.701 55.000 0.027 NA   NA
 7575473 7575474 Deide_11560 Deide_11570     TRUE 0.991 -12.000 0.027 NA   NA
 7575474 7575475 Deide_11570 Deide_11580     TRUE 0.950 2.000 0.022 1.000   NA
 7575476 7575477 Deide_11581 Deide_11590     TRUE 0.994 -3.000 0.152 1.000   NA
 7575477 7575478 Deide_11590 Deide_11600     TRUE 0.663 66.000 0.011 1.000   NA
 7575478 7575479 Deide_11600 Deide_11610     TRUE 0.999 -10.000 0.488 1.000 Y NA
 7575479 7575480 Deide_11610 Deide_11620     TRUE 0.599 70.000 0.005 1.000 N NA
 7575480 7575481 Deide_11620 Deide_11630     TRUE 0.989 -3.000 0.019 1.000 N NA
 7575481 7575482 Deide_11630 Deide_11640     TRUE 0.773 18.000 0.008 1.000 N NA
 7575482 7575483 Deide_11640 Deide_11650     TRUE 0.989 -3.000 0.016 1.000 N NA
 7575487 7575488 Deide_11690 Deide_11700     TRUE 0.716 113.000 0.286 NA   NA
 7575488 7575489 Deide_11700 Deide_11710     TRUE 0.999 0.000 0.857 0.001 Y NA
 7575490 7575491 Deide_11720 Deide_11721     TRUE 0.987 -3.000 0.011 1.000   NA
 7575491 7575492 Deide_11721 Deide_11730     TRUE 0.703 116.000 0.286 NA   NA
 7575493 7575494 Deide_11740 Deide_11750     FALSE 0.535 130.000 0.000 1.000 Y NA
 7575494 7575495 Deide_11750 Deide_11760     TRUE 0.999 -3.000 0.452 0.001 Y NA
 7575495 7575496 Deide_11760 Deide_11761     TRUE 0.643 52.000 0.008 1.000 N NA
 7575496 7575497 Deide_11761 Deide_11770     FALSE 0.438 115.000 0.008 NA   NA
 7575497 7575498 Deide_11770 Deide_11780     TRUE 0.997 -3.000 0.750 NA   NA
 7575499 7575500 Deide_11790 Deide_11800     FALSE 0.434 178.000 0.429 NA   NA
 7575501 7575502 Deide_11801 Deide_11810     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7575502 7575503 Deide_11810 Deide_11820     TRUE 0.891 38.000 0.545 NA   NA
 7575503 7575504 Deide_11820 Deide_11830     FALSE 0.421 20.000 0.000 NA   NA
 7575506 7575507 Deide_11850 Deide_11860     TRUE 0.845 38.000 0.240 1.000 N NA
 7575507 7575508 Deide_11860 Deide_11870     TRUE 0.980 5.000 0.059 1.000 Y NA
 7575508 7575509 Deide_11870 Deide_11880     FALSE 0.331 153.000 0.018 1.000 N NA
 7575509 7575510 Deide_11880 Deide_11890     TRUE 0.661 34.000 0.011 NA   NA
 7575510 7575511 Deide_11890 Deide_11900     TRUE 0.868 44.000 0.400 NA   NA
 7575516 7575517 Deide_11960 Deide_11961     TRUE 0.997 -7.000 0.357 1.000   NA
 7575518 7575519 Deide_11970 Deide_11971     TRUE 0.886 38.000 0.000 0.029 Y NA
 7575519 7575520 Deide_11971 Deide_11980     FALSE 0.003 782.000 0.000 1.000 N NA
 7575520 7575521 Deide_11980 Deide_11990     TRUE 0.911 76.000 0.084 1.000 Y NA
 7575521 7575522 Deide_11990 Deide_12000     FALSE 0.080 168.000 0.000 1.000   NA
 7575522 7575523 Deide_12000 Deide_12010     TRUE 0.853 65.000 0.375 NA   NA
 7575525 7575526 Deide_12030 Deide_12040     TRUE 0.985 2.000 0.667 NA   NA
 7575526 7575527 Deide_12040 Deide_12050     TRUE 0.735 91.000 0.133 NA   NA
 7575528 7575529 Deide_12060 Deide_12070     TRUE 0.937 4.000 0.047 NA   NA
 7575529 7575530 Deide_12070 Deide_12080     FALSE 0.297 61.000 0.000 NA   NA
 7575530 7575531 Deide_12080 Deide_12090     FALSE 0.350 54.000 0.000 1.000   NA
 7575534 7575535 Deide_12102 Deide_12110     FALSE 0.013 269.000 0.000 NA   NA
 7575536 7575537 Deide_12120 Deide_12121     TRUE 0.913 15.000 0.222 NA   NA
 7575538 7575539 Deide_12130 Deide_12140     FALSE 0.065 166.000 0.000 NA   NA
 7575539 7575540 Deide_12140 Deide_12150   ispG TRUE 0.980 -3.000 0.004 NA   NA
 7575540 7575541 Deide_12150 Deide_12160 ispG   FALSE 0.369 33.000 0.000 1.000 N NA
 7575543 7575544 Deide_12180 Deide_12190     TRUE 0.999 -7.000 0.286 0.022 Y NA
 7575544 7575545 Deide_12190 Deide_12200     TRUE 0.998 -3.000 0.182 1.000 Y NA
 7575545 7575546 Deide_12200 Deide_12210     TRUE 0.999 -3.000 0.917 0.049 Y NA
 7575546 7575547 Deide_12210 Deide_12220     FALSE 0.201 207.000 0.000 1.000 Y NA
 7575547 7575548 Deide_12220 Deide_12230     TRUE 0.996 -7.000 0.250 1.000 N NA
 7575549 7575550 Deide_12240 Deide_12250     FALSE 0.008 342.000 0.000 NA   NA
 7575551 7575552 Deide_12251 Deide_12260     FALSE 0.004 493.000 0.000 NA   NA
 7575552 7575553 Deide_12260 Deide_12261     TRUE 0.992 -3.000 0.052 1.000   NA
 7575553 7575554 Deide_12261 Deide_12270   nusB TRUE 0.943 2.000 0.014 1.000 N NA
 7575554 7575555 Deide_12270 Deide_12280 nusB   TRUE 0.989 -3.000 0.032 NA   NA
 7575555 7575556 Deide_12280 Deide_12290     FALSE 0.571 52.000 0.004 NA   NA
 7575558 7575559 Deide_12301 Deide_12310   recN TRUE 0.711 83.000 0.061 NA   NA
 7575560 7575561 Deide_12320 Deide_12330   pckA FALSE 0.018 243.000 0.000 NA   NA
 7575562 7575563 Deide_12340 Deide_12355   trnP FALSE 0.297 62.000 0.000 NA   NA
 7575563 7575564 Deide_12355 Deide_12350 trnP   FALSE 0.201 102.000 0.000 NA   NA
 7575566 7575567 Deide_12361 Deide_12370     TRUE 0.876 64.000 0.500 NA   NA
 7575567 7575568 Deide_12370 Deide_12380     TRUE 0.997 -27.000 0.667 NA   NA
 7575568 7575569 Deide_12380 Deide_12390   leuB FALSE 0.157 118.000 0.000 NA   NA
 7575569 7575570 Deide_12390 Deide_12400 leuB   TRUE 0.999 -7.000 0.038 0.002 Y NA
 7575570 7575571 Deide_12400 Deide_12410     TRUE 0.803 18.000 0.019 NA   NA
 7575571 7575572 Deide_12410 Deide_12420     TRUE 0.857 37.000 0.333 NA   NA
 7575575 7575576 Deide_12430 Deide_12440     TRUE 0.997 0.000 0.157 0.001 Y NA
 7575576 7575577 Deide_12440 Deide_12450     TRUE 0.985 31.000 0.705 0.001 Y NA
 7575577 7575578 Deide_12450 Deide_12460     TRUE 0.983 43.000 0.604 0.001 Y NA
 7575579 7575580 Deide_12461 Deide_12480     TRUE 0.985 -3.000 0.009 NA   NA
 7575580 7575581 Deide_12480 Deide_12490     FALSE 0.297 62.000 0.000 NA   NA
 7575581 7575582 Deide_12490 Deide_12500     TRUE 0.996 -3.000 0.545 NA   NA
 7575582 7575583 Deide_12500 Deide_12510     TRUE 0.995 -3.000 0.310 NA   NA
 7575584 7575585 Deide_12520 Deide_12530 gyrA   FALSE 0.014 295.000 0.000 1.000 N NA
 7575585 7575586 Deide_12530 Deide_12540     TRUE 0.701 125.000 0.364 1.000 N NA
 7575586 7575587 Deide_12540 Deide_12541     TRUE 0.636 168.000 0.333 0.039 N NA
 7575588 7575589 Deide_12550 Deide_12570     TRUE 0.717 98.000 0.113 1.000   NA
 7575590 7575591 Deide_12580 Deide_12590     FALSE 0.098 273.000 0.000 1.000 Y NA
 7575591 7575592 Deide_12590 Deide_12600     FALSE 0.065 337.000 0.000 1.000 Y NA
 7575592 7575593 Deide_12600 Deide_12610     TRUE 0.999 -3.000 0.508 0.049 Y NA
 7575593 7575594 Deide_12610 Deide_12620     TRUE 0.999 -3.000 0.581 1.000 Y NA
 7575594 7575595 Deide_12620 Deide_12630     TRUE 1.000 -7.000 0.773 0.022 Y NA
 7575595 7575596 Deide_12630 Deide_12640   clpB FALSE 0.250 178.000 0.003 0.100 N NA
 7575597 7575598 Deide_12650 Deide_12660   radA FALSE 0.007 439.000 0.000 1.000 N NA
 7575598 7575599 Deide_12660 Deide_12670 radA   TRUE 0.983 -7.000 0.002 NA   NA
 7575599 7575600 Deide_12670 Deide_12680     FALSE 0.209 99.000 0.000 NA   NA
 7575603 7575604 Deide_12700 Deide_12710     TRUE 0.975 46.000 0.407 0.007 Y NA
 7575604 7575605 Deide_12710 Deide_12720     FALSE 0.145 132.000 0.000 1.000 N NA
 7575606 7575607 Deide_12730 Deide_12740     TRUE 0.994 2.000 0.092 0.004 Y NA
 7575607 7575608 Deide_12740 Deide_12750     TRUE 0.993 -22.000 0.077 NA   NA
 7575608 7575609 Deide_12750 Deide_12760   uvrA TRUE 0.584 51.000 0.005 NA   NA
 7575609 7575610 Deide_12760 Deide_12770 uvrA   FALSE 0.012 320.000 0.000 1.000   NA
 7575611 7575612 Deide_12771 Deide_12780     FALSE 0.209 99.000 0.000 NA   NA
 7575613 7575614 Deide_12790 Deide_12800     FALSE 0.071 173.000 0.000 1.000   NA
 7575614 7575615 Deide_12800 Deide_12810     FALSE 0.118 143.000 0.000 1.000 N NA
 7575619 7575620 Deide_12850 Deide_12860     TRUE 0.962 4.000 0.196 1.000 N NA
 7575620 7575621 Deide_12860 Deide_12870     TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7575621 7575622 Deide_12870 Deide_12880     TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7575622 7575623 Deide_12880 Deide_12890     FALSE 0.514 143.000 0.182 NA   NA
 7575624 7575625 Deide_12900 Deide_12910 hisZ hisG TRUE 0.999 -3.000 0.239 0.004 Y NA
 7575627 7575628 Deide_12930 Deide_12940     TRUE 0.993 -3.000 0.078 1.000   NA
 7575628 7575629 Deide_12940 Deide_12950     TRUE 0.997 -3.000 0.667 1.000   NA
 7575629 7575630 Deide_12950 Deide_12960     FALSE 0.350 59.000 0.000 1.000 N NA
 7575632 7575633 Deide_12980 Deide_12990     TRUE 0.702 64.000 0.000 0.005   NA
 7575633 7575634 Deide_12990 Deide_13000     TRUE 0.751 20.000 0.006 1.000   NA
 7575635 7575636 Deide_13010 Deide_13020     FALSE 0.257 82.000 0.000 NA N NA
 7575636 7575637 Deide_13020 Deide_13021     FALSE 0.312 35.000 0.000 NA   NA
 7575638 7575639 Deide_13030 Deide_13040   ffh FALSE 0.535 63.000 0.002 NA   NA
 7575639 7575640 Deide_13040 Deide_13045 ffh trnK FALSE 0.291 65.000 0.000 NA   NA
 7575641 7575642 Deide_13041 Deide_13050     FALSE 0.045 180.000 0.000 NA   NA
 7575642 7575643 Deide_13050 Deide_13051     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7575643 7575644 Deide_13051 Deide_13052     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7575645 7575646 Deide_13060 Deide_13061     FALSE 0.010 318.000 0.000 NA   NA
 7575646 7575647 Deide_13061 Deide_13062     FALSE 0.371 25.000 0.000 NA   NA
 7575647 7575648 Deide_13062 Deide_13063     FALSE 0.022 227.000 0.000 NA   NA
 7575648 7575649 Deide_13063 Deide_13068     FALSE 0.311 42.000 0.000 NA   NA
 7575649 7575650 Deide_13068 Deide_13064     FALSE 0.004 541.000 0.000 NA   NA
 7575653 7575654 Deide_13067 Deide_13070     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7575656 7575657 Deide_13080 Deide_13081     FALSE 0.003 781.000 0.000 NA   NA
 7575657 7575658 Deide_13081 Deide_13090     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7575658 7575659 Deide_13090 Deide_13100     FALSE 0.188 107.000 0.000 NA   NA
 7575659 7575660 Deide_13100 Deide_13101     FALSE 0.135 125.000 0.000 NA   NA
 7575661 7575662 Deide_13110 Deide_13120     FALSE 0.003 931.000 0.000 1.000   NA
 7575662 7575663 Deide_13120 Deide_13130     FALSE 0.061 178.000 0.000 1.000   NA
 7575664 7575665 Deide_13140 Deide_13141     TRUE 0.996 -3.000 0.444 NA   NA
 7575665 7575666 Deide_13141 Deide_13150     TRUE 0.995 -3.000 0.333 NA   NA
 7575666 7575667 Deide_13150 Deide_13160   uppP FALSE 0.305 46.000 0.000 NA   NA
 7575668 7575669 Deide_13170 Deide_13180   rpsB FALSE 0.045 192.000 0.000 1.000 N NA
 7575669 7575670 Deide_13180 Deide_13190 rpsB tsf TRUE 0.883 137.000 0.748 1.000 Y NA
 7575670 7575671 Deide_13190 Deide_13200 tsf   TRUE 0.793 105.000 0.416 1.000 N NA
 7575671 7575672 Deide_13200 Deide_13210   frr TRUE 0.885 80.000 0.626 1.000 N NA
 7575672 7575673 Deide_13210 Deide_13220 frr   TRUE 0.693 74.000 0.020 1.000 N NA
 7575673 7575674 Deide_13220 Deide_13230   dxr TRUE 0.921 98.000 0.372 1.000 Y NA
 7575674 7575675 Deide_13230 Deide_13240 dxr   TRUE 0.988 -3.000 0.013 1.000 N NA
 7575677 7575678 Deide_13260 Deide_13261     TRUE 0.884 68.000 0.600 NA   NA
 7575679 7575680 Deide_13270 Deide_13280     TRUE 0.995 0.000 0.455 1.000 Y NA
 7575682 7575683 Deide_13300 Deide_13310     TRUE 0.990 -3.000 0.029 1.000   NA
 7575683 7575684 Deide_13310 Deide_13320   proB TRUE 0.772 3.000 0.000 1.000   NA
 7575684 7575685 Deide_13320 Deide_13330 proB   FALSE 0.166 125.000 0.000 1.000 N NA
 7575689 7575690 Deide_13361 Deide_13370     FALSE 0.013 273.000 0.000 NA   NA
 7575691 7575692 Deide_13371 Deide_13380     FALSE 0.003 658.000 0.000 NA   NA
 7575692 7575693 Deide_13380 Deide_13390     FALSE 0.311 42.000 0.000 NA   NA
 7575694 7575695 Deide_13410 Deide_13420     TRUE 0.997 -3.000 0.750 1.000 N NA
 7575695 7575696 Deide_13420 Deide_13430     FALSE 0.018 260.000 0.000 1.000 N NA
 7575696 7575697 Deide_13430 Deide_13440     TRUE 0.815 84.000 0.269 1.000   NA
 7575697 7575698 Deide_13440 Deide_13450     TRUE 0.708 57.000 0.029 NA   NA
 7575698 7575699 Deide_13450 Deide_13460     TRUE 0.741 29.000 0.029 NA   NA
 7575699 7575700 Deide_13460 Deide_13470     TRUE 0.998 0.000 0.417 0.001 Y NA
 7575701 7575702 Deide_13480 Deide_13490     TRUE 0.966 77.000 1.000 1.000 Y NA
 7575702 7575703 Deide_13490 Deide_13500     FALSE 0.013 318.000 0.000 1.000   NA
 7575704 7575705 Deide_13510 Deide_13511     TRUE 0.992 -3.000 0.067 1.000 N NA
 7575705 7575706 Deide_13511 Deide_13520     FALSE 0.005 516.000 0.000 1.000 N NA
 7575706 7575707 Deide_13520 Deide_13530     TRUE 0.663 124.000 0.038 0.070   NA
 7575707 7575708 Deide_13530 Deide_13540     TRUE 0.993 -3.000 0.103 NA   NA
 7575709 7575710 Deide_13550 Deide_13560   nadC TRUE 0.942 32.000 0.223 1.000 Y NA
 7575710 7575711 Deide_13560 Deide_13570 nadC   TRUE 0.999 -3.000 0.198 0.002 Y NA
 7575713 7575714 Deide_13590 Deide_13600     TRUE 0.729 64.000 0.044 NA   NA
 7575714 7575715 Deide_13600 Deide_13610     TRUE 0.999 -7.000 0.200 0.048 Y NA
 7575715 7575716 Deide_13610 Deide_13620     TRUE 0.852 0.000 0.000 1.000   NA
 7575716 7575717 Deide_13620 Deide_13630     TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7575717 7575718 Deide_13630 Deide_13640     TRUE 0.954 -3.000 0.000 1.000   NA
 7575718 7575719 Deide_13640 Deide_13650     TRUE 0.666 5.000 0.000 NA   NA
 7575719 7575720 Deide_13650 Deide_13660     TRUE 0.941 11.000 0.286 NA   NA
 7575720 7575721 Deide_13660 Deide_13670     TRUE 0.763 122.000 0.600 NA N NA
 7575721 7575722 Deide_13670 Deide_13680     TRUE 0.815 100.000 0.500 NA   NA
 7575722 7575723 Deide_13680 Deide_13690     TRUE 0.996 -6.000 0.333 NA   NA
 7575723 7575724 Deide_13690 Deide_13700     FALSE 0.048 178.000 0.000 NA   NA
 7575726 7575727 Deide_13720 Deide_13730     FALSE 0.427 148.000 0.077 NA   NA
 7575728 7575729 Deide_13740 Deide_13741 ftsY   TRUE 0.584 37.000 0.004 NA   NA
 7575729 7575730 Deide_13741 Deide_13750     TRUE 0.663 33.000 0.011 NA   NA
 7575731 7575732 Deide_13760 Deide_13770     FALSE 0.284 71.000 0.000 NA   NA
 7575734 7575735 Deide_13790 Deide_13800     TRUE 0.988 -3.000 0.021 NA   NA
 7575737 7575738 Deide_13820 Deide_13821     FALSE 0.036 191.000 0.000 NA   NA
 7575738 7575739 Deide_13821 Deide_13830     FALSE 0.018 240.000 0.000 NA   NA
 7575739 7575740 Deide_13830 Deide_13840     TRUE 0.997 -3.000 0.625 1.000 N NA
 7575740 7575741 Deide_13840 Deide_13850     TRUE 0.811 55.000 0.154 1.000 N NA
 7575742 7575743 Deide_13851 Deide_13860     TRUE 0.957 3.000 0.087 1.000 N NA
 7575743 7575744 Deide_13860 Deide_13870     FALSE 0.350 59.000 0.000 1.000 N NA
 7575744 7575745 Deide_13870 Deide_13880     TRUE 0.917 149.000 0.538 0.001 Y NA
 7575746 7575747 Deide_13890 Deide_13900     TRUE 0.754 31.000 0.045 NA   NA
 7575747 7575748 Deide_13900 Deide_13910     TRUE 0.997 -3.000 0.065 1.000 Y NA
 7575748 7575749 Deide_13910 Deide_13920     TRUE 0.990 -3.000 0.022 1.000 N NA
 7575749 7575750 Deide_13920 Deide_13930     TRUE 0.726 85.000 0.065 1.000 N NA
 7575750 7575751 Deide_13930 Deide_13940     TRUE 0.839 93.000 0.012 1.000 Y NA
 7575751 7575752 Deide_13940 Deide_13950     TRUE 0.988 5.000 0.071 0.048 Y NA
 7575752 7575753 Deide_13950 Deide_13960     TRUE 0.992 -3.000 0.054 1.000 N NA
 7575755 7575756 Deide_13980 Deide_13990     FALSE 0.070 360.000 0.167 1.000   NA
 7575756 7575757 Deide_13990 Deide_14000     TRUE 0.990 -3.000 0.027 1.000   NA
 7575757 7575758 Deide_14000 Deide_14010     FALSE 0.307 84.000 0.000 1.000   NA
 7575758 7575759 Deide_14010 Deide_14020     FALSE 0.509 89.000 0.002 1.000   NA
 7575759 7575760 Deide_14020 Deide_14021     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7575760 7575761 Deide_14021 Deide_14030   rex TRUE 0.760 2.000 0.000 NA   NA
 7575761 7575762 Deide_14030 Deide_14031 rex   TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7575763 7575764 Deide_14040 Deide_14041 cpdB   FALSE 0.020 254.000 0.000 1.000   NA
 7575764 7575765 Deide_14041 Deide_14050     TRUE 0.998 -13.000 0.294 0.010   NA
 7575765 7575766 Deide_14050 Deide_14060     TRUE 0.998 -3.000 0.022 0.039 Y NA
 7575766 7575767 Deide_14060 Deide_14070     FALSE 0.007 406.000 0.000 1.000 N NA
 7575769 7575770 Deide_14080 Deide_14090     TRUE 0.991 -3.000 0.044 1.000   NA
 7575770 7575771 Deide_14090 Deide_14100     TRUE 0.762 100.000 0.250 1.000 N NA
 7575771 7575772 Deide_14100 Deide_14110   purM TRUE 0.987 -3.000 0.010 1.000 N NA
 7575772 7575773 Deide_14110 Deide_14120 purM   FALSE 0.524 79.000 0.003 NA   NA
 7575773 7575774 Deide_14120 Deide_14130     FALSE 0.283 72.000 0.000 NA   NA
 7575774 7575775 Deide_14130 Deide_14140     TRUE 0.987 -3.000 0.010 1.000   NA
 7575776 7575777 Deide_14150 Deide_14160     TRUE 0.723 3.000 0.000 NA   NA
 7575777 7575778 Deide_14160 Deide_14170   leuS FALSE 0.073 158.000 0.000 NA   NA
 7575780 7575781 Deide_14190 Deide_14200     FALSE 0.565 11.000 0.000 NA   NA
 7575781 7575782 Deide_14200 Deide_14210     FALSE 0.020 232.000 0.000 NA   NA
 7575783 7575784 Deide_14220 Deide_14221     FALSE 0.005 430.000 0.000 NA   NA
 7575787 7575788 Deide_14250 Deide_14260 recF   TRUE 0.992 -3.000 0.099 NA   NA
 7575788 7575789 Deide_14260 Deide_14270     FALSE 0.003 729.000 0.000 NA   NA
 7575789 7575790 Deide_14270 Deide_14280     TRUE 0.909 5.000 0.018 NA   NA
 7575790 7575791 Deide_14280 Deide_14290   truD TRUE 0.627 47.000 0.008 NA   NA
 7575791 7575792 Deide_14290 Deide_14300 truD   TRUE 0.987 -3.000 0.014 NA   NA
 7575792 7575793 Deide_14300 Deide_14301     TRUE 0.734 42.000 0.036 NA   NA
 7575793 7575794 Deide_14301 Deide_14310     FALSE 0.154 119.000 0.000 NA   NA
 7575794 7575795 Deide_14310 Deide_14320     FALSE 0.107 135.000 0.000 NA N NA
 7575795 7575796 Deide_14320 Deide_14330     FALSE 0.227 236.000 0.000 0.048 Y NA
 7575796 7575797 Deide_14330 Deide_14340     TRUE 0.991 14.000 0.723 0.048 Y NA
 7575798 7575799 Deide_14341 Deide_14350     FALSE 0.016 250.000 0.000 NA   NA
 7575799 7575800 Deide_14350 Deide_14360     FALSE 0.297 62.000 0.000 NA   NA
 7575800 7575801 Deide_14360 Deide_14370     TRUE 0.962 4.000 0.241 NA   NA
 7575801 7575802 Deide_14370 Deide_14371     TRUE 0.997 -3.000 0.625 NA   NA
 7575802 7575803 Deide_14371 Deide_14380     TRUE 0.610 137.000 0.333 NA   NA
 7575803 7575804 Deide_14380 Deide_14390     FALSE 0.154 185.000 0.008 1.000 N NA
 7575804 7575805 Deide_14390 Deide_14400     FALSE 0.038 206.000 0.000 1.000 N NA
 7575805 7575806 Deide_14400 Deide_14410     TRUE 0.736 63.000 0.036 1.000 N NA
 7575806 7575807 Deide_14410 Deide_14420     TRUE 0.959 72.000 0.732 NA Y NA
 7575807 7575808 Deide_14420 Deide_14430     TRUE 0.801 116.000 0.038 NA Y NA
 7575808 7575809 Deide_14430 Deide_14440     TRUE 0.966 31.000 0.250 0.048 Y NA
 7575809 7575810 Deide_14440 Deide_14450     TRUE 0.801 59.000 0.121 1.000 N NA
 7575810 7575811 Deide_14450 Deide_14460     TRUE 0.993 -3.000 0.103 1.000 N NA
 7575812 7575813 Deide_14470 Deide_14480     FALSE 0.368 34.000 0.000 1.000 N NA
 7575813 7575814 Deide_14480 Deide_14490     FALSE 0.367 35.000 0.000 1.000 N NA
 7575814 7575815 Deide_14490 Deide_14500     FALSE 0.010 342.000 0.000 1.000 N NA
 7575815 7575816 Deide_14500 Deide_14510     FALSE 0.298 134.000 0.003 1.000 N NA
 7575816 7575817 Deide_14510 Deide_14520     TRUE 0.998 -3.000 0.226 1.000 Y NA
 7575817 7575818 Deide_14520 Deide_14521     FALSE 0.019 1154.000 0.000 1.000 Y NA
 7575818 7575819 Deide_14521 Deide_14530     FALSE 0.042 197.000 0.000 1.000 N NA
 7575819 7575820 Deide_14530 Deide_14540     FALSE 0.006 400.000 0.000 NA   NA
 7575820 7575821 Deide_14540 Deide_14550   murG FALSE 0.507 95.000 0.006 NA   NA
 7575821 7575822 Deide_14550 Deide_14560 murG murC TRUE 0.939 53.000 0.270 1.000 Y NA
 7575822 7575823 Deide_14560 Deide_14570 murC murB TRUE 0.999 -3.000 0.136 0.004 Y NA
 7575823 7575824 Deide_14570 Deide_14571 murB   TRUE 0.915 34.000 0.070 NA Y NA
 7575824 7575825 Deide_14571 Deide_14580   ftsA TRUE 0.996 -3.000 0.389 NA N NA
 7575825 7575826 Deide_14580 Deide_14590 ftsA ftsZ TRUE 0.784 163.000 0.460 1.000 Y NA
 7575826 7575827 Deide_14590 Deide_14600 ftsZ   FALSE 0.011 289.000 0.000 NA N NA
 7575828 7575829 Deide_14610 Deide_14620 pfkA   TRUE 0.662 69.000 0.011 1.000   NA
 7575829 7575830 Deide_14620 Deide_14630     FALSE 0.399 116.000 0.005 NA   NA
 7575830 7575831 Deide_14630 Deide_14640     TRUE 0.997 -3.000 0.833 NA   NA
 7575832 7575833 Deide_14650 Deide_14660     FALSE 0.226 94.000 0.000 NA   NA
 7575833 7575834 Deide_14660 Deide_14670     TRUE 0.834 45.000 0.250 NA   NA
 7575834 7575835 Deide_14670 Deide_14680   mraY FALSE 0.014 265.000 0.000 NA   NA
 7575835 7575836 Deide_14680 Deide_14690 mraY   FALSE 0.415 108.000 0.004 NA   NA
 7575836 7575837 Deide_14690 Deide_14700     TRUE 0.669 75.000 0.020 NA   NA
 7575837 7575838 Deide_14700 Deide_14710     FALSE 0.287 166.000 0.030 NA   NA
 7575838 7575839 Deide_14710 Deide_14720     TRUE 0.977 2.000 0.333 NA   NA
 7575839 7575840 Deide_14720 Deide_14730     TRUE 0.824 65.000 0.250 NA   NA
 7575841 7575842 Deide_14740 Deide_14741     TRUE 0.820 106.000 0.625 NA   NA
 7575842 7575843 Deide_14741 Deide_14750     FALSE 0.050 187.000 0.000 1.000   NA
 7575843 7575844 Deide_14750 Deide_14760     FALSE 0.311 83.000 0.000 1.000   NA
 7575844 7575845 Deide_14760 Deide_14770     FALSE 0.010 349.000 0.000 1.000 N NA
 7575845 7575846 Deide_14770 Deide_14780     TRUE 0.960 116.000 0.800 0.021 Y NA
 7575846 7575847 Deide_14780 Deide_14790     TRUE 0.999 -3.000 0.643 1.000 Y NA
 7575847 7575848 Deide_14790 Deide_14800     TRUE 0.999 -3.000 0.643 0.047 Y NA
 7575848 7575849 Deide_14800 Deide_14810     TRUE 0.922 114.000 0.700 NA Y NA
 7575850 7575851 Deide_14820 Deide_14830     TRUE 0.993 -7.000 0.048 NA   NA
 7575851 7575852 Deide_14830 Deide_14840     TRUE 0.989 -3.000 0.028 NA   NA
 7575852 7575853 Deide_14840 Deide_14850     TRUE 0.961 121.000 0.789 0.001 Y NA
 7575853 7575854 Deide_14850 Deide_14851     FALSE 0.008 393.000 0.000 1.000   NA
 7575856 7575857 Deide_14870 Deide_14880     FALSE 0.037 190.000 0.000 NA   NA
 7575857 7575858 Deide_14880 Deide_14890     TRUE 0.900 49.000 0.031 1.000 Y NA
 7575858 7575859 Deide_14890 Deide_14900     FALSE 0.189 119.000 0.000 1.000 N NA
 7575859 7575860 Deide_14900 Deide_14910     FALSE 0.335 72.000 0.000 1.000 N NA
 7575861 7575862 Deide_14920 Deide_14930   opdA FALSE 0.236 90.000 0.000 NA   NA
 7575864 7575865 Deide_14950 Deide_14960     TRUE 0.989 -10.000 0.013 NA   NA
 7575866 7575867 Deide_14970 Deide_14980     TRUE 0.895 50.000 0.023 1.000 Y NA
 7575868 7575869 Deide_14981 Deide_14990     TRUE 0.907 12.000 0.091 NA   NA
 7575869 7575870 Deide_14990 Deide_15000     TRUE 0.892 67.000 0.667 NA   NA
 7575875 7575876 Deide_15050 Deide_15070     FALSE 0.291 177.000 0.061 1.000 N NA
 7575877 7575878 Deide_15071 Deide_15080     FALSE 0.022 226.000 0.000 NA   NA
 7575878 7575879 Deide_15080 Deide_15090     TRUE 0.998 -10.000 0.115 NA Y NA
 7575883 7575884 Deide_15130 Deide_15140 polA glmM FALSE 0.548 88.000 0.005 1.000 N NA
 7575889 7575890 Deide_15190 Deide_15200     TRUE 0.982 -3.000 0.003 1.000   NA
 7575890 7575891 Deide_15200 Deide_15201     FALSE 0.350 64.000 0.000 1.000   NA
 7575891 7575892 Deide_15201 Deide_15202     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7575892 7575893 Deide_15202 Deide_15203     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7575894 7575895 Deide_15210 Deide_15220   hutH FALSE 0.236 192.000 0.000 1.000 Y NA
 7575895 7575896 Deide_15220 Deide_15230 hutH hutI TRUE 0.906 44.000 0.192 0.034 N NA
 7575896 7575897 Deide_15230 Deide_15240 hutI   TRUE 0.991 -7.000 0.015 1.000 N NA
 7575897 7575898 Deide_15240 Deide_15250   hutU TRUE 0.996 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 7575900 7575901 Deide_15252 Deide_15270     FALSE 0.297 62.000 0.000 NA   NA
 7575902 7575903 Deide_15280 Deide_15290     FALSE 0.295 57.000 0.000 NA   NA
 7575903 7575904 Deide_15290 Deide_15291     TRUE 0.986 0.000 0.455 NA   NA
 7575907 7575908 Deide_15311 Deide_15320     FALSE 0.286 69.000 0.000 NA   NA
 7575908 7575909 Deide_15320 Deide_15330     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 7575910 7575911 Deide_15340 Deide_15350     TRUE 0.819 80.000 0.300 NA   NA
 7575911 7575912 Deide_15350 Deide_15360     TRUE 0.982 1.000 0.400 NA   NA
 7575913 7575914 Deide_15370 Deide_15380     TRUE 0.997 -3.000 0.857 NA   NA
 7575914 7575915 Deide_15380 Deide_15390     TRUE 0.997 -3.000 0.571 NA   NA
 7575915 7575916 Deide_15390 Deide_15391     FALSE 0.311 83.000 0.000 1.000   NA
 7575916 7575917 Deide_15391 Deide_15400     TRUE 0.898 10.000 0.000 0.001   NA
 7575917 7575918 Deide_15400 Deide_15410     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   NA
 7575918 7575919 Deide_15410 Deide_15420     TRUE 0.998 -6.000 1.000 NA   NA
 7575919 7575920 Deide_15420 Deide_15430     FALSE 0.016 251.000 0.000 NA N NA
 7575920 7575921 Deide_15430 Deide_15440     TRUE 0.995 -3.000 0.029 0.027   NA
 7575921 7575922 Deide_15440 Deide_15450   rbfA TRUE 0.986 -3.000 0.009 1.000   NA
 7575922 7575923 Deide_15450 Deide_15460 rbfA   FALSE 0.351 62.000 0.000 1.000 N NA
 7575923 7575924 Deide_15460 Deide_15470     TRUE 0.823 82.000 0.333 NA   NA
 7575924 7575925 Deide_15470 Deide_15480     TRUE 0.952 15.000 0.667 NA   NA
 7575926 7575927 Deide_15490 Deide_15500 gyrB   FALSE 0.007 441.000 0.000 1.000   NA
 7575927 7575928 Deide_15500 Deide_15510     FALSE 0.005 569.000 0.000 1.000   NA
 7575928 7575929 Deide_15510 Deide_15511     TRUE 0.926 18.000 0.024 0.002   NA
 7575929 7575930 Deide_15511 Deide_15520     FALSE 0.011 293.000 0.000 NA   NA
 7575931 7575932 Deide_15530 Deide_15531     TRUE 0.988 -3.000 0.012 1.000   NA
 7575933 7575934 Deide_15540 Deide_15550 mutS   FALSE 0.003 869.000 0.000 NA   NA
 7575936 7575937 Deide_15570 Deide_15571     FALSE 0.085 151.000 0.000 NA   NA
 7575937 7575938 Deide_15571 Deide_15590     FALSE 0.119 131.000 0.000 NA   NA
 7575938 7575939 Deide_15590 Deide_15600   mutL FALSE 0.324 79.000 0.000 1.000   NA
 7575939 7575940 Deide_15600 Deide_15610 mutL   FALSE 0.302 47.000 0.000 NA   NA
 7575940 7575941 Deide_15610 Deide_15620     FALSE 0.032 199.000 0.000 NA   NA
 7575941 7575942 Deide_15620 Deide_15630     FALSE 0.233 91.000 0.000 NA   NA
 7575942 7575943 Deide_15630 Deide_15640   gltX FALSE 0.353 58.000 0.000 1.000   NA
 7575943 7575944 Deide_15640 Deide_15650 gltX   FALSE 0.337 70.000 0.000 1.000 N NA
 7575944 7575945 Deide_15650 Deide_15660     FALSE 0.291 50.000 0.000 NA N NA
 7575945 7575946 Deide_15660 Deide_15670     FALSE 0.006 401.000 0.000 NA   NA
 7575946 7575947 Deide_15670 Deide_15680     FALSE 0.117 132.000 0.000 NA   NA
 7575947 7575948 Deide_15680 Deide_15690     FALSE 0.003 757.000 0.000 NA   NA
 7575948 7575949 Deide_15690 Deide_15700     TRUE 0.948 14.000 0.000 0.031 Y NA
 7575951 7575952 Deide_15720 Deide_15730     FALSE 0.576 109.000 0.036 NA   NA
 7575952 7575953 Deide_15730 Deide_15740   asd FALSE 0.180 163.000 0.003 NA   NA
 7575953 7575954 Deide_15740 Deide_15750 asd   TRUE 0.596 72.000 0.005 1.000   NA
 7575955 7575956 Deide_15760 Deide_15770     FALSE 0.004 479.000 0.000 NA   NA
 7575956 7575957 Deide_15770 Deide_15780     TRUE 0.991 -3.000 0.059 NA   NA
 7575957 7575958 Deide_15780 Deide_15790     FALSE 0.032 213.000 0.000 1.000 N NA
 7575958 7575959 Deide_15790 Deide_15800     TRUE 0.997 -3.000 0.800 1.000 N NA
 7575959 7575960 Deide_15800 Deide_15810     TRUE 0.884 52.000 0.500 1.000 N NA
 7575960 7575961 Deide_15810 Deide_15820     TRUE 0.995 -3.000 0.333 NA N NA
 7575962 7575963 Deide_15830 Deide_15840     FALSE 0.172 124.000 0.000 1.000 N NA
 7575963 7575964 Deide_15840 Deide_15850     TRUE 0.953 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7575964 7575965 Deide_15850 Deide_15860     TRUE 0.969 0.000 0.045 1.000 N NA
 7575965 7575966 Deide_15860 Deide_15870     FALSE 0.264 81.000 0.000 NA   NA
 7575966 7575967 Deide_15870 Deide_15880     FALSE 0.311 43.000 0.000 NA   NA
 7575967 7575968 Deide_15880 Deide_15890     FALSE 0.313 32.000 0.000 NA N NA
 7575968 7575969 Deide_15890 Deide_15900     TRUE 0.588 47.000 0.005 NA   NA
 7575969 7575970 Deide_15900 Deide_15910   hemL FALSE 0.375 126.000 0.009 NA   NA
 7575970 7575971 Deide_15910 Deide_15920 hemL   TRUE 0.985 -3.000 0.010 NA   NA
 7575973 7575974 Deide_15940 Deide_15950 prfA   TRUE 0.989 -13.000 0.010 1.000 N NA
 7575976 7575977 Deide_15970 Deide_15980     FALSE 0.297 59.000 0.000 NA   NA
 7575977 7575978 Deide_15980 Deide_15990     TRUE 0.774 69.000 0.111 NA   NA
 7575978 7575979 Deide_15990 Deide_16000   purH FALSE 0.050 240.000 0.002 NA N NA
 7575979 7575980 Deide_16000 Deide_16010 purH folD TRUE 0.818 13.000 0.005 1.000 N NA
 7575980 7575981 Deide_16010 Deide_16020 folD   TRUE 0.822 22.000 0.043 1.000 N NA
 7575982 7575983 Deide_16030 Deide_16040 metX   TRUE 0.998 -3.000 0.188 1.000 Y NA
 7575983 7575984 Deide_16040 Deide_16041     FALSE 0.012 323.000 0.000 1.000 N NA
 7575984 7575985 Deide_16041 Deide_16050     TRUE 0.763 81.000 0.129 NA   NA
 7575985 7575986 Deide_16050 Deide_16060     TRUE 0.991 0.000 0.833 NA   NA
 7575990 7575991 Deide_16091 Deide_16093     FALSE 0.021 230.000 0.000 NA   NA
 7575993 7575994 Deide_16110 Deide_16120     FALSE 0.296 58.000 0.000 NA   NA
 7575994 7575995 Deide_16120 Deide_16130     FALSE 0.245 87.000 0.000 NA   NA
 7575995 7575996 Deide_16130 Deide_16140     FALSE 0.324 79.000 0.000 1.000   NA
 7575997 7575998 Deide_16150 Deide_16160     FALSE 0.495 15.000 0.000 NA   NA
 7575999 7576000 Deide_16161 Deide_16170     FALSE 0.280 74.000 0.000 NA   NA
 7576000 7576001 Deide_16170 Deide_16180     TRUE 1.000 -3.000 0.669 0.002 Y NA
 7576001 7576002 Deide_16180 Deide_16190     FALSE 0.188 120.000 0.000 1.000   NA
 7576002 7576003 Deide_16190 Deide_16200     FALSE 0.184 121.000 0.000 1.000   NA
 7576009 7576010 Deide_16251 Deide_16260     FALSE 0.383 24.000 0.000 NA   NA
 7576010 7576011 Deide_16260 Deide_16270     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   NA
 7576011 7576012 Deide_16270 Deide_16280     FALSE 0.338 28.000 0.000 NA   NA
 7576012 7576013 Deide_16280 Deide_16290     TRUE 0.935 3.000 0.025 NA   NA
 7576013 7576014 Deide_16290 Deide_16300     TRUE 0.848 12.000 0.013 NA   NA
 7576014 7576015 Deide_16300 Deide_16310     TRUE 0.988 -3.000 0.019 NA   NA
 7576015 7576016 Deide_16310 Deide_16320     FALSE 0.297 49.000 0.000 NA   NA
 7576016 7576017 Deide_16320 Deide_16330     TRUE 0.953 -7.000 0.000 NA   NA
 7576017 7576018 Deide_16330 Deide_16340     TRUE 0.948 -37.000 0.000 NA   NA
 7576018 7576019 Deide_16340 Deide_16350     FALSE 0.242 88.000 0.000 NA   NA
 7576019 7576020 Deide_16350 Deide_16360     FALSE 0.528 83.000 0.004 NA   NA
 7576020 7576021 Deide_16360 Deide_16370     TRUE 0.985 -3.000 0.007 1.000 N NA
 7576022 7576023 Deide_16380 Deide_16381     TRUE 0.974 1.000 0.154 1.000 N NA
 7576023 7576024 Deide_16381 Deide_16390     TRUE 0.997 -7.000 0.091 0.027   NA
 7576026 7576027 Deide_16400 Deide_16410 lrrA cysS FALSE 0.160 127.000 0.000 1.000 N NA
 7576027 7576028 Deide_16410 Deide_16420 cysS   FALSE 0.239 139.000 0.002 NA   NA
 7576028 7576029 Deide_16420 Deide_16430     FALSE 0.311 43.000 0.000 NA   NA
 7576031 7576032 Deide_16450 Deide_16460 gnd   TRUE 0.997 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 7576032 7576033 Deide_16460 Deide_16470     TRUE 0.982 14.000 0.583 NA Y NA
 7576035 7576036 Deide_16485 Deide_16490     FALSE 0.313 34.000 0.000 NA   NA
 7576036 7576037 Deide_16490 Deide_16500     FALSE 0.293 60.000 0.000 NA N NA
 7576038 7576039 Deide_16510 Deide_16520 tmk   TRUE 0.986 -3.000 0.012 NA   NA
 7576039 7576040 Deide_16520 Deide_16530     FALSE 0.189 106.000 0.000 NA   NA
 7576041 7576042 Deide_16540 Deide_16551     TRUE 0.851 96.000 0.667 NA   NA
 7576042 7576043 Deide_16551 Deide_16560   glgX FALSE 0.254 211.000 0.286 NA   NA
 7576043 7576044 Deide_16560 Deide_16570 glgX   FALSE 0.224 254.000 0.000 0.009 Y NA
 7576045 7576046 Deide_16580 Deide_16590     FALSE 0.296 58.000 0.000 NA   NA
 7576046 7576047 Deide_16590 Deide_16600     FALSE 0.032 215.000 0.000 1.000   NA
 7576049 7576050 Deide_16620 Deide_16630     FALSE 0.091 146.000 0.000 NA   NA
 7576051 7576052 Deide_16640 Deide_16650 dcd   FALSE 0.012 614.000 0.007 NA   NA
 7576052 7576053 Deide_16650 Deide_16670     FALSE 0.057 171.000 0.000 NA   NA
 7576053 7576054 Deide_16670 Deide_16680     TRUE 0.809 51.000 0.188 NA   NA
 7576054 7576055 Deide_16680 Deide_16690     TRUE 0.876 24.000 0.250 NA   NA
 7576056 7576057 Deide_16700 Deide_16710   purB FALSE 0.457 17.000 0.000 NA N NA
 7576058 7576059 Deide_16720 Deide_16730   suhB FALSE 0.195 104.000 0.000 NA   NA
 7576059 7576060 Deide_16730 Deide_16740 suhB   FALSE 0.014 262.000 0.000 NA   NA
 7576060 7576061 Deide_16740 Deide_16750     FALSE 0.421 20.000 0.000 NA   NA
 7576061 7576062 Deide_16750 Deide_16760     FALSE 0.314 33.000 0.000 NA   NA
 7576062 7576063 Deide_16760 Deide_16770     TRUE 0.995 -3.000 0.310 NA   NA
 7576063 7576064 Deide_16770 Deide_16780     TRUE 0.641 6.000 0.000 NA   NA
 7576064 7576065 Deide_16780 Deide_16790   rluD FALSE 0.348 27.000 0.000 NA   NA
 7576065 7576066 Deide_16790 Deide_16800 rluD   FALSE 0.090 412.000 0.000 0.017 Y NA
 7576066 7576067 Deide_16800 Deide_16810   ilvB FALSE 0.018 258.000 0.000 1.000 N NA
 7576067 7576068 Deide_16810 Deide_16820 ilvB ilvH TRUE 0.999 -3.000 0.054 0.001 Y NA
 7576068 7576069 Deide_16820 Deide_16830 ilvH ilvC TRUE 0.944 72.000 0.014 0.001 Y NA
 7576069 7576070 Deide_16830 Deide_16840 ilvC   FALSE 0.004 516.000 0.000 NA   NA
 7576070 7576071 Deide_16840 Deide_16850     FALSE 0.294 56.000 0.000 NA   NA
 7576071 7576072 Deide_16850 Deide_16851     TRUE 0.858 72.000 0.000 0.045 Y NA
 7576074 7576075 Deide_16870 Deide_16880 leuA   FALSE 0.010 736.000 0.003 1.000   NA
 7576075 7576076 Deide_16880 Deide_16890     FALSE 0.312 36.000 0.000 NA   NA
 7576077 7576078 Deide_16900 Deide_16910   argD FALSE 0.073 157.000 0.000 NA N NA
 7576079 7576080 Deide_16930 Deide_16940     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7576080 7576081 Deide_16940 Deide_16950     TRUE 0.987 0.000 0.500 NA   NA
 7576081 7576082 Deide_16950 Deide_16960     TRUE 0.993 -3.000 0.150 NA   NA
 7576083 7576084 Deide_16970 Deide_16980   malQ TRUE 0.637 78.000 0.010 1.000   NA
 7576084 7576085 Deide_16980 Deide_16990 malQ lytC FALSE 0.199 116.000 0.000 1.000 N NA
 7576087 7576088 Deide_17010 Deide_17020     TRUE 0.677 84.000 0.037 NA   NA
 7576089 7576090 Deide_17030 Deide_17040 pyrF   FALSE 0.206 99.000 0.000 NA N NA
 7576090 7576091 Deide_17040 Deide_17050     FALSE 0.024 219.000 0.000 NA   NA
 7576095 7576096 Deide_17090 Deide_17100     TRUE 0.999 -3.000 0.500 NA Y NA
 7576096 7576097 Deide_17100 Deide_17120     FALSE 0.004 488.000 0.000 NA   NA
 7576097 7576098 Deide_17120 Deide_17130     TRUE 0.956 4.000 0.162 NA   NA
 7576099 7576100 Deide_17140 Deide_17150     FALSE 0.004 658.000 0.000 1.000 N NA
 7576101 7576102 Deide_17160 Deide_17170   buk FALSE 0.429 154.000 0.120 NA N NA
 7576102 7576103 Deide_17170 Deide_17180 buk   TRUE 0.981 3.000 0.625 NA   NA
 7576105 7576106 Deide_17200 Deide_17210 gcp secA FALSE 0.578 84.000 0.006 1.000 N NA
 7576106 7576107 Deide_17210 Deide_17220 secA   FALSE 0.249 100.000 0.000 1.000 N NA
 7576108 7576109 Deide_17230 Deide_17240     FALSE 0.041 327.000 0.010 1.000   NA
 7576109 7576110 Deide_17240 Deide_17250     TRUE 0.997 -7.000 0.015 1.000 Y NA
 7576110 7576111 Deide_17250 Deide_17260     TRUE 0.962 9.000 0.012 1.000 Y NA
 7576112 7576113 Deide_17261 Deide_17270     TRUE 0.976 0.000 0.130 NA   NA
 7576113 7576114 Deide_17270 Deide_17280     TRUE 0.995 -3.000 0.261 NA   NA
 7576115 7576116 Deide_17290 Deide_17300     FALSE 0.007 362.000 0.000 NA   NA
 7576116 7576117 Deide_17300 Deide_17310     FALSE 0.102 139.000 0.000 NA   NA
 7576117 7576118 Deide_17310 Deide_17320     TRUE 0.995 -13.000 0.242 NA   NA
 7576120 7576121 Deide_17346 Deide_17345 trnV trnM TRUE 0.618 7.000 0.000 NA   NA
 7576123 7576124 Deide_17350 Deide_17360     FALSE 0.016 252.000 0.000 NA   NA
 7576124 7576125 Deide_17360 Deide_17370     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7576125 7576126 Deide_17370 Deide_17380     TRUE 0.695 68.000 0.018 1.000   NA
 7576126 7576127 Deide_17380 Deide_17390     TRUE 0.872 79.000 0.500 1.000   NA
 7576128 7576129 Deide_17400 Deide_17410     FALSE 0.312 36.000 0.000 NA   NA
 7576129 7576130 Deide_17410 Deide_17420     TRUE 0.627 70.000 0.007 1.000   NA
 7576130 7576131 Deide_17420 Deide_17430     FALSE 0.008 396.000 0.000 1.000   NA
 7576134 7576135 Deide_17460 Deide_17470 dusA   FALSE 0.016 252.000 0.000 NA   NA
 7576135 7576136 Deide_17470 Deide_17480     FALSE 0.409 21.000 0.000 NA   NA
 7576136 7576137 Deide_17480 Deide_17490   glgC FALSE 0.082 166.000 0.000 1.000   NA
 7576138 7576139 Deide_17500 Deide_17501 glyQS   FALSE 0.017 244.000 0.000 NA   NA
 7576140 7576141 Deide_17505 Deide_17510     FALSE 0.018 243.000 0.000 NA   NA
 7576141 7576142 Deide_17510 Deide_17520     FALSE 0.222 95.000 0.000 NA   NA
 7576142 7576143 Deide_17520 Deide_17530   mug FALSE 0.474 115.000 0.012 NA   NA
 7576143 7576144 Deide_17530 Deide_17540 mug   TRUE 0.990 -7.000 0.016 NA   NA
 7576147 7576148 Deide_17570 Deide_17580     TRUE 0.997 -7.000 0.567 NA   NA
 7576148 7576149 Deide_17580 Deide_17590   murF TRUE 0.614 79.000 0.008 1.000   NA
 7576149 7576150 Deide_17590 Deide_17591 murF   FALSE 0.072 248.000 0.013 NA   NA
 7576150 7576151 Deide_17591 Deide_17600     FALSE 0.006 377.000 0.000 NA   NA
 7576151 7576152 Deide_17600 Deide_17610     TRUE 0.993 -7.000 0.050 NA   NA
 7576152 7576153 Deide_17610 Deide_17620     TRUE 0.991 -10.000 0.023 NA   NA
 7576153 7576154 Deide_17620 Deide_17630     TRUE 0.988 -3.000 0.018 NA   NA
 7576154 7576155 Deide_17630 Deide_17640     TRUE 0.979 4.000 0.667 NA   NA
 7576155 7576156 Deide_17640 Deide_17650   aroC FALSE 0.496 96.000 0.004 1.000 N NA
 7576156 7576157 Deide_17650 Deide_17660 aroC aroK TRUE 0.936 17.000 0.010 1.000 Y NA
 7576157 7576158 Deide_17660 Deide_17670 aroK aroB TRUE 0.997 -19.000 0.013 1.000 Y NA
 7576158 7576159 Deide_17670 Deide_17680 aroB aroQ TRUE 0.986 10.000 0.052 0.002 Y NA
 7576160 7576161 Deide_17695 Deide_17690 trnI   FALSE 0.195 104.000 0.000 NA   NA
 7576162 7576163 Deide_17700 Deide_17710   ribF TRUE 0.989 -3.000 0.018 1.000 N NA
 7576163 7576164 Deide_17710 Deide_17720 ribF   FALSE 0.195 158.000 0.003 NA   NA
 7576164 7576165 Deide_17720 Deide_17730     TRUE 0.630 69.000 0.010 NA   NA
 7576165 7576166 Deide_17730 Deide_17740     TRUE 0.788 35.000 0.096 NA   NA
 7576167 7576168 Deide_17750 Deide_17760     TRUE 0.921 25.000 0.643 NA   NA
 7576169 7576170 Deide_17770 Deide_17780     FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 7576171 7576172 Deide_17781 Deide_17790     FALSE 0.006 407.000 0.000 NA   NA
 7576172 7576173 Deide_17790 Deide_17800   uvsE FALSE 0.049 391.000 0.000 1.000 Y NA
 7576173 7576174 Deide_17800 Deide_17805 uvsE   TRUE 0.989 -3.000 0.015 1.000   NA
 7576174 7576175 Deide_17805 Deide_17801     TRUE 0.948 -49.000 0.000 NA   NA
 7576179 7576180 Deide_17832 Deide_17822     FALSE 0.008 348.000 0.000 NA   NA
 7576181 7576182 Deide_17823 Deide_17825     FALSE 0.004 519.000 0.000 NA   NA
 7576185 7576186 Deide_17828 Deide_17829     FALSE 0.012 285.000 0.000 NA   NA
 7576186 7576187 Deide_17829 Deide_17830     FALSE 0.097 142.000 0.000 NA   NA
 7576187 7576188 Deide_17830 Deide_17840     TRUE 0.704 71.000 0.034 NA   NA
 7576189 7576190 Deide_17850 Deide_17860 hisF hisI TRUE 0.998 0.000 0.430 0.004 Y NA
 7576190 7576191 Deide_17860 Deide_17870 hisI   FALSE 0.030 204.000 0.000 NA   NA
 7576191 7576192 Deide_17870 Deide_17880     FALSE 0.002 1060.000 0.000 NA   NA
 7576192 7576193 Deide_17880 Deide_17890     TRUE 0.962 -12.000 0.000 1.000   NA
 7576193 7576194 Deide_17890 Deide_17900     FALSE 0.421 20.000 0.000 NA   NA
 7576194 7576195 Deide_17900 Deide_17910     FALSE 0.211 98.000 0.000 NA   NA
 7576195 7576196 Deide_17910 Deide_17920     TRUE 0.811 102.000 0.444 1.000   NA
 7576196 7576197 Deide_17920 Deide_17930     FALSE 0.153 129.000 0.000 1.000 N NA
 7576199 7576200 Deide_17950 Deide_17960   lysK TRUE 0.960 2.000 0.075 NA   NA
 7576200 7576201 Deide_17960 Deide_17970 lysK   TRUE 0.945 4.000 0.060 1.000 N NA
 7576202 7576203 Deide_17971 Deide_17980     FALSE 0.267 80.000 0.000 NA   NA
 7576208 7576209 Deide_18030 Deide_18040 lrp   TRUE 0.915 63.000 0.833 1.000 N NA
 7576209 7576210 Deide_18040 Deide_18050     FALSE 0.282 73.000 0.000 NA   NA
 7576210 7576211 Deide_18050 Deide_18060     FALSE 0.013 269.000 0.000 NA   NA
 7576215 7576216 Deide_18100 Deide_18110 pyrR pyrB TRUE 0.998 -3.000 0.247 1.000 Y NA
 7576216 7576217 Deide_18110 Deide_18120 pyrB pyrC TRUE 0.992 3.000 0.452 1.000 Y NA
 7576218 7576219 Deide_18130 Deide_18140     FALSE 0.201 102.000 0.000 NA   NA
 7576219 7576220 Deide_18140 Deide_18150   nasC TRUE 0.734 59.000 0.046 NA   NA
 7576221 7576222 Deide_18160 Deide_18170 nasB nirD TRUE 0.914 27.000 0.061 0.001 N NA
 7576222 7576223 Deide_18170 Deide_18180 nirD   TRUE 0.991 -21.000 0.024 1.000 N NA
 7576224 7576225 Deide_18190 Deide_18200     FALSE 0.157 128.000 0.000 1.000 N NA
 7576225 7576226 Deide_18200 Deide_18210     FALSE 0.009 321.000 0.000 NA N NA
 7576227 7576228 Deide_18220 Deide_18230     TRUE 0.998 -3.000 0.069 1.000 Y NA
 7576230 7576231 Deide_18250 Deide_18260   gdhA FALSE 0.073 333.000 0.103 1.000 N NA
 7576231 7576232 Deide_18260 Deide_18270 gdhA gdhA TRUE 0.921 122.000 0.147 0.001 Y NA
 7576233 7576234 Deide_18280 Deide_18290 panB   TRUE 0.585 69.000 0.006 NA   NA
 7576235 7576236 Deide_18300 Deide_18310   ctaB TRUE 0.986 6.000 0.321 1.000 Y NA
 7576236 7576237 Deide_18310 Deide_18320 ctaB ctaC FALSE 0.146 237.000 0.005 0.030 N NA
 7576237 7576238 Deide_18320 Deide_18330 ctaC   TRUE 0.999 -3.000 0.417 0.001 Y NA
 7576238 7576239 Deide_18330 Deide_18340     TRUE 0.851 117.000 0.417 0.036   NA
 7576239 7576240 Deide_18340 Deide_18350   ruvB FALSE 0.527 90.000 0.004 1.000   NA
 7576241 7576242 Deide_18360 Deide_18370     FALSE 0.580 10.000 0.000 NA   NA
 7576242 7576243 Deide_18370 Deide_18380     TRUE 0.998 -3.000 0.095 NA Y NA
 7576243 7576244 Deide_18380 Deide_18390     TRUE 0.994 -3.000 0.200 NA N NA
 7576245 7576246 Deide_18400 Deide_18401     TRUE 0.592 9.000 0.000 NA   NA
 7576247 7576248 Deide_18410 Deide_18420     FALSE 0.054 175.000 0.000 NA   NA
 7576248 7576249 Deide_18420 Deide_18430     TRUE 0.950 -16.000 0.000 NA   NA
 7576253 7576254 Deide_18470 Deide_18480     FALSE 0.007 375.000 0.000 NA   NA
 7576254 7576255 Deide_18480 Deide_18490     FALSE 0.183 109.000 0.000 NA   NA
 7576257 7576258 Deide_18510 Deide_18520     TRUE 0.959 3.000 0.130 NA   NA
 7576258 7576259 Deide_18520 Deide_18530     TRUE 0.987 -3.000 0.017 NA   NA
 7576259 7576260 Deide_18530 Deide_18540     TRUE 0.618 87.000 0.017 NA   NA
 7576262 7576263 Deide_18560 Deide_18570   plsX FALSE 0.517 105.000 0.009 1.000 N NA
 7576263 7576264 Deide_18570 Deide_18580 plsX   TRUE 0.987 -10.000 0.008 NA   NA
 7576264 7576265 Deide_18580 Deide_18590     TRUE 0.709 57.000 0.030 NA   NA
 7576267 7576268 Deide_18610 Deide_18620   rplQ FALSE 0.539 62.000 0.002 NA   NA
 7576268 7576269 Deide_18620 Deide_18630 rplQ rpoA TRUE 0.703 153.000 0.873 1.000 N NA
 7576269 7576270 Deide_18630 Deide_18640 rpoA rpsD TRUE 0.950 15.000 0.549 1.000 N NA
 7576270 7576271 Deide_18640 Deide_18650 rpsD rpsK TRUE 0.907 146.000 0.509 0.018 Y NA
 7576271 7576272 Deide_18650 Deide_18660 rpsK rpsM TRUE 0.997 4.000 0.810 0.013 Y NA
 7576272 7576273 Deide_18660 Deide_18670 rpsM rpmJ TRUE 0.984 3.000 0.194 0.013   NA
 7576273 7576274 Deide_18670 Deide_18680 rpmJ infA TRUE 0.743 108.000 0.257 1.000   NA
 7576274 7576275 Deide_18680 Deide_18690 infA   FALSE 0.034 196.000 0.000 NA N NA
 7576275 7576276 Deide_18690 Deide_18700     TRUE 0.921 6.000 0.046 NA   NA
 7576276 7576277 Deide_18700 Deide_18710     TRUE 0.902 10.000 0.050 NA   NA
 7576277 7576278 Deide_18710 Deide_18720     TRUE 0.991 -3.000 0.050 NA   NA
 7576278 7576279 Deide_18720 Deide_18730     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7576279 7576280 Deide_18730 Deide_18740   adk FALSE 0.085 164.000 0.000 1.000   NA
 7576280 7576281 Deide_18740 Deide_18750 adk secY FALSE 0.116 299.000 0.241 1.000 N NA
 7576281 7576282 Deide_18750 Deide_18760 secY rplO TRUE 0.990 0.000 0.730 1.000 N NA
 7576282 7576283 Deide_18760 Deide_18770 rplO rpmD TRUE 0.999 -3.000 0.653 0.002 Y NA
 7576283 7576284 Deide_18770 Deide_18780 rpmD rpsE TRUE 0.999 -3.000 0.789 0.018 Y NA
 7576284 7576285 Deide_18780 Deide_18790 rpsE rplR TRUE 1.000 -10.000 0.814 0.018 Y NA
 7576285 7576286 Deide_18790 Deide_18800 rplR rplF TRUE 0.998 0.000 0.815 0.013 Y NA
 7576286 7576287 Deide_18800 Deide_18810 rplF rpsH TRUE 0.980 78.000 0.808 0.013 Y NA
 7576287 7576288 Deide_18810 Deide_18820 rpsH rpsZ TRUE 0.610 249.000 0.473 0.013 Y NA
 7576288 7576289 Deide_18820 Deide_18830 rpsZ rplE TRUE 0.991 13.000 0.496 0.013 Y NA
 7576289 7576290 Deide_18830 Deide_18840 rplE rplX TRUE 0.988 21.000 0.758 0.013 Y NA
 7576290 7576291 Deide_18840 Deide_18850 rplX rplN TRUE 0.998 0.000 0.810 0.018 Y NA
 7576291 7576292 Deide_18850 Deide_18860 rplN rpsQ TRUE 0.999 -3.000 0.791 0.018 Y NA
 7576292 7576293 Deide_18860 Deide_18870 rpsQ rpmC TRUE 1.000 -3.000 0.828 0.013 Y NA
 7576293 7576294 Deide_18870 Deide_18880 rpmC rplP TRUE 1.000 -13.000 0.802 0.013 Y NA
 7576294 7576295 Deide_18880 Deide_18890 rplP rpsC TRUE 1.000 -3.000 0.828 0.018 Y NA
 7576295 7576296 Deide_18890 Deide_18900 rpsC rplV TRUE 0.998 0.000 0.719 0.018 Y NA
 7576296 7576297 Deide_18900 Deide_18910 rplV rpsS TRUE 0.999 -3.000 0.769 0.018 Y NA
 7576297 7576298 Deide_18910 Deide_18920 rpsS rplB TRUE 0.993 13.000 0.820 0.018 Y NA
 7576298 7576299 Deide_18920 Deide_18930 rplB rplW TRUE 0.993 14.000 0.849 0.016 Y NA
 7576299 7576300 Deide_18930 Deide_18940 rplW rplD TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.013 Y NA
 7576300 7576301 Deide_18940 Deide_18950 rplD rplC TRUE 0.995 4.000 0.361 0.013 Y NA
 7576301 7576302 Deide_18950 Deide_18960 rplC rpsJ TRUE 0.999 -3.000 0.467 0.018 Y NA
 7576302 7576303 Deide_18960 Deide_18970 rpsJ tufB TRUE 0.985 7.000 0.318 1.000 Y NA
 7576303 7576304 Deide_18970 Deide_18980 tufB   FALSE 0.014 263.000 0.000 NA   NA
 7576304 7576305 Deide_18980 Deide_18990   fusA FALSE 0.520 95.000 0.008 NA   NA
 7576305 7576306 Deide_18990 Deide_19000 fusA rpsG TRUE 0.887 129.000 0.579 1.000 Y NA
 7576306 7576307 Deide_19000 Deide_19010 rpsG rpsL TRUE 0.778 159.000 0.620 0.003   NA
 7576309 7576310 Deide_19012 Deide_19020     FALSE 0.286 69.000 0.000 NA   NA
 7576310 7576311 Deide_19020 Deide_19030     FALSE 0.075 156.000 0.000 NA   NA
 7576312 7576313 Deide_19040 Deide_19051 hflX   FALSE 0.052 176.000 0.000 NA   NA
 7576313 7576314 Deide_19051 Deide_19055     FALSE 0.186 108.000 0.000 NA   NA
 7576315 7576316 Deide_19052 Deide_19060     TRUE 0.597 77.000 0.009 NA   NA
 7576316 7576317 Deide_19060 Deide_19070     FALSE 0.043 181.000 0.000 NA   NA
 7576317 7576318 Deide_19070 Deide_19080     TRUE 0.996 -3.000 0.083 0.045 N NA
 7576318 7576319 Deide_19080 Deide_19090     TRUE 0.728 121.000 0.000 0.045 Y NA
 7576319 7576320 Deide_19090 Deide_19100     FALSE 0.318 80.000 0.000 1.000 N NA
 7576321 7576322 Deide_19110 Deide_19120     TRUE 0.915 110.000 0.125 0.045 Y NA
 7576322 7576323 Deide_19120 Deide_19130     TRUE 0.975 44.000 0.535 0.045 Y NA
 7576324 7576325 Deide_19131 Deide_19140     TRUE 0.845 9.000 0.007 NA   NA
 7576325 7576326 Deide_19140 Deide_19150   hemA FALSE 0.073 329.000 0.005 0.032   NA
 7576326 7576327 Deide_19150 Deide_19160 hemA   TRUE 0.997 -3.000 0.041 1.000 Y NA
 7576327 7576328 Deide_19160 Deide_19170     TRUE 0.681 88.000 0.036 1.000   NA
 7576328 7576329 Deide_19170 Deide_19180   hemD TRUE 0.812 97.000 0.400 1.000   NA
 7576331 7576332 Deide_19192 Deide_19191     TRUE 0.816 0.000 0.000 NA   NA
 7576332 7576333 Deide_19191 Deide_19201     FALSE 0.033 198.000 0.000 NA   NA
 7576333 7576334 Deide_19201 Deide_19210   phoP TRUE 0.657 76.000 0.018 NA N NA
 7576335 7576336 Deide_19220 Deide_19230     TRUE 0.774 71.000 0.088 1.000 N NA
 7576336 7576337 Deide_19230 Deide_19231     TRUE 0.782 112.000 0.500 NA   NA
 7576337 7576338 Deide_19231 Deide_19240     FALSE 0.163 116.000 0.000 NA   NA
 7576340 7576341 Deide_19260 Deide_19261     FALSE 0.151 120.000 0.000 NA   NA
 7576341 7576342 Deide_19261 Deide_19262     FALSE 0.218 96.000 0.000 NA   NA
 7576342 7576343 Deide_19262 Deide_19270   alaS FALSE 0.017 244.000 0.000 NA   NA
 7576344 7576345 Deide_19290 Deide_19300     FALSE 0.326 30.000 0.000 NA   NA
 7576347 7576348 Deide_19320 Deide_19330     FALSE 0.004 496.000 0.000 NA   NA
 7576348 7576349 Deide_19330 Deide_19340     FALSE 0.159 117.000 0.000 NA   NA
 7576351 7576352 Deide_19360 Deide_19370     FALSE 0.467 96.000 0.002 1.000 N NA
 7576352 7576353 Deide_19370 Deide_19380     FALSE 0.395 28.000 0.000 1.000 N NA
 7576353 7576354 Deide_19380 Deide_19390     FALSE 0.565 11.000 0.000 NA   NA
 7576354 7576355 Deide_19390 Deide_19400   rraA FALSE 0.471 119.000 0.015 NA   NA
 7576356 7576357 Deide_19410 Deide_19425     FALSE 0.023 225.000 0.000 NA   NA
 7576357 7576358 Deide_19425 Deide_19430   cinA FALSE 0.067 164.000 0.000 NA   NA
 7576358 7576359 Deide_19430 Deide_19440 cinA   TRUE 0.992 -3.000 0.051 1.000   NA
 7576359 7576360 Deide_19440 Deide_19450   recA TRUE 0.988 -3.000 0.014 1.000 N NA
 7576360 7576361 Deide_19450 Deide_19451 recA   FALSE 0.021 229.000 0.000 NA   NA
 7576361 7576362 Deide_19451 Deide_19452     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7576362 7576363 Deide_19452 Deide_19453     FALSE 0.312 35.000 0.000 NA   NA
 7576363 7576364 Deide_19453 Deide_19454     TRUE 0.995 -3.000 0.286 NA   NA
 7576365 7576366 Deide_19460 Deide_19470     TRUE 0.858 14.000 0.027 NA   NA
 7576367 7576368 Deide_19480 Deide_19481     TRUE 0.718 95.000 0.125 NA   NA
 7576368 7576369 Deide_19481 Deide_19490     FALSE 0.020 233.000 0.000 NA   NA
 7576369 7576370 Deide_19490 Deide_19500     FALSE 0.199 103.000 0.000 NA   NA
 7576370 7576371 Deide_19500 Deide_19510     FALSE 0.477 123.000 0.024 NA N NA
 7576371 7576372 Deide_19510 Deide_19520     FALSE 0.252 163.000 0.013 NA   NA
 7576372 7576373 Deide_19520 Deide_19530     FALSE 0.028 210.000 0.000 NA   NA
 7576374 7576375 Deide_19540 Deide_19550   mtrA FALSE 0.118 351.000 0.000 0.017 Y NA
 7576376 7576377 Deide_19560 Deide_19570   clpP FALSE 0.007 421.000 0.000 1.000   NA
 7576377 7576378 Deide_19570 Deide_19580 clpP clpX TRUE 0.997 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 7576378 7576379 Deide_19580 Deide_19590 clpX lon TRUE 0.767 134.000 0.009 0.090 Y NA
 7576380 7576381 Deide_19600 Deide_19610 pilT   TRUE 0.956 40.000 0.084 0.034 Y NA
 7576381 7576382 Deide_19610 Deide_19620     TRUE 0.812 75.000 0.189 1.000   NA
 7576382 7576383 Deide_19620 Deide_19630     TRUE 0.987 -3.000 0.014 NA   NA
 7576384 7576385 Deide_19640 Deide_19650 fabI   TRUE 0.758 119.000 0.143 0.064   NA
 7576385 7576386 Deide_19650 Deide_19660     FALSE 0.354 59.000 0.000 1.000   NA
 7576390 7576391 Deide_19700 Deide_19710     TRUE 0.719 21.000 0.007 NA   NA
 7576391 7576392 Deide_19710 Deide_19720     FALSE 0.312 145.000 0.012 NA   NA
 7576392 7576393 Deide_19720 Deide_19730     TRUE 0.990 -3.000 0.045 NA N NA
 7576393 7576394 Deide_19730 Deide_19740     TRUE 0.985 -3.000 0.010 NA   NA
 7576395 7576396 Deide_19741 Deide_19750     TRUE 0.980 5.000 0.833 NA   NA
 7576397 7576398 Deide_19760 Deide_19770     FALSE 0.371 25.000 0.000 NA   NA
 7576398 7576399 Deide_19770 Deide_19780   coaD TRUE 0.982 -3.000 0.004 1.000 N NA
 7576401 7576402 Deide_19800 Deide_19810     TRUE 0.999 -3.000 0.533 1.000 Y NA
 7576402 7576403 Deide_19810 Deide_19820   phoU TRUE 0.865 73.000 0.467 NA N NA
 7576403 7576404 Deide_19820 Deide_19830 phoU   FALSE 0.083 151.000 0.000 NA N NA
 7576404 7576405 Deide_19830 Deide_19840     TRUE 0.958 56.000 0.072 0.003 Y NA
 7576407 7576408 Deide_19860 Deide_19870     FALSE 0.274 94.000 0.000 1.000   NA
 7576408 7576409 Deide_19870 Deide_19880   sodC FALSE 0.009 372.000 0.000 1.000   NA
 7576410 7576411 Deide_19890 Deide_19900     TRUE 0.983 0.000 0.333 NA   NA
 7576411 7576412 Deide_19900 Deide_19910     TRUE 0.998 -3.000 0.286 0.012   NA
 7576412 7576413 Deide_19910 Deide_19920     TRUE 0.999 -3.000 0.714 0.012   NA
 7576416 7576417 Deide_19950 Deide_19951     TRUE 0.948 -105.000 0.000 NA   NA
 7576418 7576419 Deide_19960 Deide_19965     TRUE 0.776 96.000 0.300 NA   NA
 7576421 7576422 Deide_19975 Deide_19972     FALSE 0.151 120.000 0.000 NA   NA
 7576423 7576424 Deide_19990 Deide_20000     TRUE 0.723 32.000 0.028 NA N NA
 7576424 7576425 Deide_20000 Deide_20020     FALSE 0.577 97.000 0.018 NA N NA
 7576425 7576426 Deide_20020 Deide_20030     TRUE 0.904 32.000 0.036 NA Y NA
 7576426 7576427 Deide_20030 Deide_20040     TRUE 0.731 34.000 0.035 NA N NA
 7576429 7576430 Deide_20060 Deide_20070     FALSE 0.102 139.000 0.000 NA   NA
 7576430 7576431 Deide_20070 Deide_20080   mgsA TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7576431 7576432 Deide_20080 Deide_20090 mgsA prpC FALSE 0.038 206.000 0.000 1.000 N NA
 7576432 7576433 Deide_20090 Deide_20100 prpC   FALSE 0.510 155.000 0.304 NA N NA
 7576433 7576434 Deide_20100 Deide_20110     FALSE 0.406 118.000 0.007 NA   NA
 7576434 7576435 Deide_20110 Deide_20120     FALSE 0.293 54.000 0.000 NA   NA
 7576437 7576438 Deide_20140 Deide_20150     FALSE 0.108 136.000 0.000 NA   NA
 7576439 7576440 Deide_20160 Deide_20170     TRUE 0.585 101.000 0.024 NA   NA
 7576441 7576442 Deide_20171 Deide_20180     FALSE 0.307 45.000 0.000 NA   NA
 7576445 7576446 Deide_20215 Deide_20210 trnL   FALSE 0.003 673.000 0.000 NA   NA
 7576446 7576447 Deide_20210 Deide_20220     TRUE 0.776 52.000 0.000 1.000 Y NA
 7576447 7576448 Deide_20220 Deide_20230     FALSE 0.326 30.000 0.000 NA   NA
 7576448 7576449 Deide_20230 Deide_20240   mdh FALSE 0.282 73.000 0.000 NA   NA
 7576449 7576450 Deide_20240 Deide_20250 mdh   FALSE 0.521 104.000 0.009 1.000 N NA
 7576451 7576452 Deide_20251 Deide_20252     TRUE 0.941 -3.000 0.000 NA   NA
 7576453 7576454 Deide_20253 Deide_20260   capD TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7576454 7576455 Deide_20260 Deide_20271 capD capM TRUE 0.675 97.000