MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudomonas syringae pv. tomato T1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6215864 6215865 PSPTOT1_0305 PSPTOT1_0306     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 6215865 6215866 PSPTOT1_0306 PSPTOT1_0307     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6215866 6215867 PSPTOT1_0307 PSPTOT1_0308     TRUE 0.621 9.000 0.000 NA   NA
 6215868 6215869 PSPTOT1_0309 PSPTOT1_0310     FALSE 0.145 123.000 0.021 NA   NA
 6215870 6215871 PSPTOT1_0311 PSPTOT1_0312 panE-2   TRUE 0.582 45.000 0.049 1.000 N NA
 6215871 6215872 PSPTOT1_0312 PSPTOT1_0313     TRUE 0.750 16.000 0.030 1.000   NA
 6215873 6215874 PSPTOT1_0314 PSPTOT1_0315     TRUE 0.936 3.000 0.042 1.000 N NA
 6215874 6215875 PSPTOT1_0315 PSPTOT1_0316   argJ FALSE 0.331 58.000 0.011 1.000 N NA
 6215875 6215876 PSPTOT1_0316 PSPTOT1_0317 argJ secA FALSE 0.389 112.000 0.102 1.000 N NA
 6215878 6215879 PSPTOT1_0319 PSPTOT1_0320 lpxC ftsZ FALSE 0.435 113.000 0.134 1.000 N NA
 6215879 6215880 PSPTOT1_0320 PSPTOT1_0321 ftsZ ftsA TRUE 0.912 88.000 0.460 1.000 Y NA
 6215880 6215881 PSPTOT1_0321 PSPTOT1_0322 ftsA   TRUE 0.963 15.000 0.389 NA N NA
 6215881 6215882 PSPTOT1_0322 PSPTOT1_0323     TRUE 0.994 4.000 0.372 NA Y NA
 6215882 6215883 PSPTOT1_0323 PSPTOT1_0324   murC TRUE 0.995 -3.000 0.153 0.004 Y NA
 6215883 6215884 PSPTOT1_0324 PSPTOT1_0325 murC murG TRUE 0.988 -7.000 0.283 1.000 Y NA
 6215884 6215885 PSPTOT1_0325 PSPTOT1_0326 murG ftsW TRUE 0.988 -10.000 0.647 1.000 N NA
 6215885 6215886 PSPTOT1_0326 PSPTOT1_0327 ftsW murD TRUE 0.994 -3.000 0.297 0.003 N NA
 6215886 6215887 PSPTOT1_0327 PSPTOT1_0328 murD mraY TRUE 0.998 6.000 0.647 0.004 Y NA
 6215887 6215888 PSPTOT1_0328 PSPTOT1_0329 mraY murF TRUE 0.998 0.000 0.309 0.004 Y NA
 6215888 6215889 PSPTOT1_0329 PSPTOT1_0330 murF murE TRUE 0.997 -7.000 0.569 0.002 Y NA
 6215889 6215890 PSPTOT1_0330 PSPTOT1_0331 murE   TRUE 0.988 0.000 0.073 1.000 Y NA
 6215890 6215891 PSPTOT1_0331 PSPTOT1_0332     TRUE 0.979 0.000 0.153 1.000 N NA
 6215891 6215892 PSPTOT1_0332 PSPTOT1_0333     TRUE 0.985 -3.000 0.227 1.000 N NA
 6215892 6215893 PSPTOT1_0333 PSPTOT1_0334     TRUE 0.995 3.000 0.635 NA   NA
 6215893 6215894 PSPTOT1_0334 PSPTOT1_6006     FALSE 0.004 323.000 0.000 NA   NA
 6215894 6215895 PSPTOT1_6006 PSPTOT1_0335     FALSE 0.049 136.000 0.000 NA   NA
 6215896 6215897 PSPTOT1_0336 PSPTOT1_0337     TRUE 0.977 -3.000 0.172 NA   NA
 6215897 6215898 PSPTOT1_0337 PSPTOT1_0338   gmhA FALSE 0.328 176.000 0.187 1.000 N NA
 6215898 6215899 PSPTOT1_0338 PSPTOT1_0339 gmhA   TRUE 0.995 -3.000 0.613 NA   NA
 6215900 6215901 PSPTOT1_0340 PSPTOT1_0341 sspB sspA TRUE 0.986 18.000 0.831 NA   NA
 6215901 6215902 PSPTOT1_0341 PSPTOT1_0342 sspA rpsI FALSE 0.014 281.000 0.014 NA N NA
 6215902 6215903 PSPTOT1_0342 PSPTOT1_0343 rpsI rplM TRUE 0.995 15.000 0.601 0.012 Y NA
 6215905 6215906 PSPTOT1_0345 PSPTOT1_0346   trpS FALSE 0.484 63.000 0.061 NA   NA
 6215906 6215907 PSPTOT1_0346 PSPTOT1_0347 trpS   TRUE 0.608 40.000 0.048 1.000   NA
 6215909 6215910 PSPTOT1_0349 PSPTOT1_0350 cysN/C   TRUE 0.966 11.000 0.096 0.001 N NA
 6215910 6215911 PSPTOT1_0350 PSPTOT1_0351     FALSE 0.127 154.000 0.030 NA   NA
 6215913 6215914 PSPTOT1_0353 PSPTOT1_0354   hisC FALSE 0.001 755.000 0.000 NA   NA
 6215914 6215915 PSPTOT1_0354 PSPTOT1_0355 hisC hisD TRUE 0.994 0.000 0.087 0.003 Y NA
 6215915 6215916 PSPTOT1_0355 PSPTOT1_0356 hisD hisG TRUE 0.854 125.000 0.254 0.003 Y NA
 6215916 6215917 PSPTOT1_0356 PSPTOT1_0357 hisG murA FALSE 0.324 155.000 0.123 1.000 N NA
 6215917 6215918 PSPTOT1_0357 PSPTOT1_0358 murA   TRUE 0.910 23.000 0.258 NA N NA
 6215918 6215919 PSPTOT1_0358 PSPTOT1_0359     FALSE 0.280 115.000 0.067 NA N NA
 6215919 6215920 PSPTOT1_0359 PSPTOT1_0360     TRUE 0.990 -3.000 0.353 NA N NA
 6215920 6215921 PSPTOT1_0360 PSPTOT1_0361     FALSE 0.472 81.000 0.091 NA   NA
 6215921 6215922 PSPTOT1_0361 PSPTOT1_0362     TRUE 0.995 0.000 0.562 NA   NA
 6215922 6215923 PSPTOT1_0362 PSPTOT1_0363     TRUE 0.998 0.000 0.530 NA Y NA
 6215924 6215925 PSPTOT1_0364 PSPTOT1_0365     TRUE 0.602 13.000 0.000 1.000   NA
 6215925 6215926 PSPTOT1_0365 PSPTOT1_0366     TRUE 0.996 0.000 0.598 1.000   NA
 6215926 6215927 PSPTOT1_0366 PSPTOT1_0367     TRUE 0.991 9.000 0.617 NA   NA
 6215927 6215928 PSPTOT1_0367 PSPTOT1_0368     TRUE 0.974 -13.000 0.459 NA   NA
 6215928 6215929 PSPTOT1_0368 PSPTOT1_0369     TRUE 0.994 1.000 0.543 NA   NA
 6215929 6215930 PSPTOT1_0369 PSPTOT1_0370     FALSE 0.410 141.000 0.163 1.000   NA
 6215930 6215931 PSPTOT1_0370 PSPTOT1_0371   yfiA TRUE 0.932 75.000 0.820 NA N NA
 6215931 6215932 PSPTOT1_0371 PSPTOT1_0372 yfiA ptsN TRUE 0.990 12.000 0.728 NA N NA
 6215932 6215933 PSPTOT1_0372 PSPTOT1_0373 ptsN   TRUE 0.975 3.000 0.186 NA   NA
 6215933 6215934 PSPTOT1_0373 PSPTOT1_0374   ptsH TRUE 0.901 17.000 0.182 NA   NA
 6215935 6215936 PSPTOT1_0375 PSPTOT1_0376 sodA   TRUE 0.980 1.000 0.179 1.000   NA
 6215936 6215937 PSPTOT1_0376 PSPTOT1_0377   fumC-2 TRUE 0.553 33.000 0.024 1.000   NA
 6215937 6215938 PSPTOT1_0377 PSPTOT1_0378 fumC-2   TRUE 0.887 -7.000 0.058 NA   NA
 6215938 6215939 PSPTOT1_0378 PSPTOT1_0379   pmbA FALSE 0.010 305.000 0.010 NA   NA
 6215941 6215942 PSPTOT1_0381 PSPTOT1_0382 tldD   TRUE 0.983 3.000 0.259 NA   NA
 6215942 6215943 PSPTOT1_0382 PSPTOT1_0383     TRUE 0.868 49.000 0.358 NA   NA
 6215943 6215944 PSPTOT1_0383 PSPTOT1_0384   cafA FALSE 0.395 182.000 0.296 NA   NA
 6215944 6215945 PSPTOT1_0384 PSPTOT1_0385 cafA maf-2 TRUE 0.992 -3.000 0.417 NA N NA
 6215945 6215946 PSPTOT1_0385 PSPTOT1_0386 maf-2   TRUE 0.692 68.000 0.206 NA N NA
 6215946 6215947 PSPTOT1_0386 PSPTOT1_0387   mreC TRUE 0.997 -7.000 0.550 0.002 Y NA
 6215947 6215948 PSPTOT1_0387 PSPTOT1_0388 mreC mreB FALSE 0.432 258.000 0.689 1.000 N NA
 6215949 6215950 PSPTOT1_0389 PSPTOT1_0390 gatC gatA TRUE 0.996 15.000 0.643 0.002 Y NA
 6215950 6215951 PSPTOT1_0390 PSPTOT1_0391 gatA gatB TRUE 0.996 11.000 0.492 0.002 Y NA
 6215951 6215952 PSPTOT1_0391 PSPTOT1_0392 gatB   FALSE 0.136 99.000 0.010 NA   NA
 6215952 6215953 PSPTOT1_0392 PSPTOT1_0393     TRUE 0.842 67.000 0.417 NA   NA
 6215953 6215954 PSPTOT1_0393 PSPTOT1_0394   pcaC-2 TRUE 0.797 32.000 0.122 1.000   NA
 6215955 6215956 PSPTOT1_0395 PSPTOT1_0396     FALSE 0.100 105.000 0.000 1.000   NA
 6215957 6215958 PSPTOT1_0397 PSPTOT1_0398     TRUE 0.514 80.000 0.114 NA   NA
 6215958 6215959 PSPTOT1_0398 PSPTOT1_0399     FALSE 0.382 -40.000 0.000 NA   NA
 6215960 6215961 PSPTOT1_0400 PSPTOT1_0401   pnp FALSE 0.002 382.000 0.000 NA   NA
 6215961 6215962 PSPTOT1_0401 PSPTOT1_0402 pnp rpsO TRUE 0.691 176.000 0.335 1.000 Y NA
 6215962 6215963 PSPTOT1_0402 PSPTOT1_0403 rpsO truB TRUE 0.650 159.000 0.211 1.000 Y NA
 6215963 6215964 PSPTOT1_0403 PSPTOT1_0404 truB rbfA TRUE 0.994 4.000 0.318 1.000 Y NA
 6215964 6215965 PSPTOT1_0404 PSPTOT1_0405 rbfA infB TRUE 0.837 160.000 0.530 1.000 Y NA
 6215965 6215966 PSPTOT1_0405 PSPTOT1_0406 infB nusA TRUE 0.930 28.000 0.342 1.000 N NA
 6215966 6215967 PSPTOT1_0406 PSPTOT1_0407 nusA   TRUE 0.944 60.000 0.759 NA   NA
 6215967 6215968 PSPTOT1_0407 PSPTOT1_6008     FALSE 0.059 113.000 0.000 NA   NA
 6215968 6215969 PSPTOT1_6008 PSPTOT1_6007     FALSE 0.075 96.000 0.000 NA   NA
 6215969 6215970 PSPTOT1_6007 PSPTOT1_0408   secG FALSE 0.182 47.000 0.000 NA   NA
 6215970 6215971 PSPTOT1_0408 PSPTOT1_0409 secG tpiA TRUE 0.971 5.000 0.184 1.000 N NA
 6215971 6215972 PSPTOT1_0409 PSPTOT1_0410 tpiA glmM TRUE 0.779 67.000 0.082 1.000 Y NA
 6215972 6215973 PSPTOT1_0410 PSPTOT1_0411 glmM folP TRUE 0.938 17.000 0.260 1.000 N NA
 6215973 6215974 PSPTOT1_0411 PSPTOT1_0412 folP ftsH TRUE 0.980 9.000 0.325 1.000 N NA
 6215974 6215975 PSPTOT1_0412 PSPTOT1_0413 ftsH   FALSE 0.118 194.000 0.066 NA N NA
 6215977 6215978 PSPTOT1_0415 PSPTOT1_0416 greA carB TRUE 0.986 -3.000 0.241 1.000 N NA
 6215978 6215979 PSPTOT1_0416 PSPTOT1_0417 carB carA TRUE 0.883 136.000 0.345 0.001 Y NA
 6215979 6215980 PSPTOT1_0417 PSPTOT1_0418 carA dapB FALSE 0.196 217.000 0.034 1.000 Y NA
 6215980 6215981 PSPTOT1_0418 PSPTOT1_0419 dapB dnaJ TRUE 0.719 23.000 0.041 1.000 N NA
 6215981 6215982 PSPTOT1_0419 PSPTOT1_0420 dnaJ dnaK FALSE 0.260 326.000 0.236 0.003 Y NA
 6215982 6215983 PSPTOT1_0420 PSPTOT1_0421 dnaK grpE TRUE 0.683 111.000 0.049 0.008 Y NA
 6215983 6215984 PSPTOT1_0421 PSPTOT1_0422 grpE   TRUE 0.582 -7.000 0.000 NA   NA
 6215988 6215989 PSPTOT1_0426 PSPTOT1_0427     TRUE 0.915 -7.000 0.086 NA   NA
 6215989 6215990 PSPTOT1_0427 PSPTOT1_0428     TRUE 0.837 8.000 0.024 NA   NA
 6215991 6215992 PSPTOT1_0429 PSPTOT1_0430 smpB   FALSE 0.005 295.000 0.000 NA   NA
 6215992 6215993 PSPTOT1_0430 PSPTOT1_6009     FALSE 0.060 111.000 0.000 NA   NA
 6215993 6215994 PSPTOT1_6009 PSPTOT1_0431     FALSE 0.005 305.000 0.000 NA   NA
 6215994 6215995 PSPTOT1_0431 PSPTOT1_0432     FALSE 0.002 413.000 0.000 NA   NA
 6215995 6215996 PSPTOT1_0432 PSPTOT1_0433     FALSE 0.201 63.000 0.000 1.000 N NA
 6215996 6215997 PSPTOT1_0433 PSPTOT1_0434     TRUE 0.557 109.000 0.000 0.003 Y NA
 6215997 6215998 PSPTOT1_0434 PSPTOT1_0435     TRUE 0.728 37.000 0.000 1.000 Y NA
 6215998 6215999 PSPTOT1_0435 PSPTOT1_0436     FALSE 0.255 32.000 0.000 NA   NA
 6215999 6216000 PSPTOT1_0436 PSPTOT1_0437     FALSE 0.044 147.000 0.000 NA   NA
 6216000 6216001 PSPTOT1_0437 PSPTOT1_0438     FALSE 0.003 337.000 0.000 NA   NA
 6216001 6216002 PSPTOT1_0438 PSPTOT1_0439     FALSE 0.165 74.000 0.000 1.000 N NA
 6216002 6216003 PSPTOT1_0439 PSPTOT1_0440     FALSE 0.009 250.000 0.000 NA   NA
 6216004 6216005 PSPTOT1_0441 PSPTOT1_0442     FALSE 0.183 46.000 0.000 NA N NA
 6216005 6216006 PSPTOT1_0442 PSPTOT1_0443     TRUE 0.892 69.000 0.583 NA N NA
 6216010 6216011 PSPTOT1_0447 PSPTOT1_0448     FALSE 0.077 95.000 0.000 NA   NA
 6216011 6216012 PSPTOT1_0448 PSPTOT1_0449   nhaA-1 FALSE 0.175 49.000 0.000 NA   NA
 6216012 6216013 PSPTOT1_0449 PSPTOT1_0450 nhaA-1   FALSE 0.059 159.000 0.000 1.000 N NA
 6216013 6216014 PSPTOT1_0450 PSPTOT1_0451     TRUE 0.944 50.000 0.357 1.000 Y NA
 6216014 6216015 PSPTOT1_0451 PSPTOT1_0452     TRUE 0.994 -3.000 0.097 0.003 Y NA
 6216015 6216016 PSPTOT1_0452 PSPTOT1_0453     TRUE 0.986 -3.000 0.065 1.000 Y NA
 6216016 6216017 PSPTOT1_0453 PSPTOT1_0454     TRUE 0.837 75.000 0.105 0.076 Y NA
 6216018 6216019 PSPTOT1_0455 PSPTOT1_0456     TRUE 0.826 95.000 0.520 1.000 N NA
 6216019 6216020 PSPTOT1_0456 PSPTOT1_0457     FALSE 0.013 257.000 0.000 1.000 N NA
 6216020 6216021 PSPTOT1_0457 PSPTOT1_0458     FALSE 0.010 244.000 0.000 NA   NA
 6216021 6216022 PSPTOT1_0458 PSPTOT1_0459     FALSE 0.003 365.000 0.000 NA   NA
 6216022 6216023 PSPTOT1_0459 PSPTOT1_0460     FALSE 0.064 152.000 0.000 1.000   NA
 6216023 6216024 PSPTOT1_0460 PSPTOT1_0461     FALSE 0.013 225.000 0.000 NA   NA
 6216024 6216025 PSPTOT1_0461 PSPTOT1_0462     FALSE 0.039 158.000 0.000 NA   NA
 6216026 6216027 PSPTOT1_0463 PSPTOT1_0464   garD FALSE 0.034 167.000 0.000 NA   NA
 6216027 6216028 PSPTOT1_0464 PSPTOT1_0465 garD   TRUE 0.976 11.000 0.130 1.000 Y NA
 6216028 6216029 PSPTOT1_0465 PSPTOT1_0466     FALSE 0.208 166.000 0.065 1.000 N NA
 6216029 6216030 PSPTOT1_0466 PSPTOT1_0467     FALSE 0.009 291.000 0.000 1.000 N NA
 6216030 6216031 PSPTOT1_0467 PSPTOT1_0468     FALSE 0.311 98.000 0.048 1.000   NA
 6216031 6216032 PSPTOT1_0468 PSPTOT1_0469     FALSE 0.283 90.000 0.030 1.000   NA
 6216032 6216033 PSPTOT1_0469 PSPTOT1_0470     TRUE 0.998 -3.000 0.682 1.000 Y NA
 6216034 6216035 PSPTOT1_0471 PSPTOT1_0472     FALSE 0.092 85.000 0.000 NA   NA
 6216035 6216036 PSPTOT1_0472 PSPTOT1_0473     FALSE 0.074 97.000 0.000 NA   NA
 6216036 6216037 PSPTOT1_0473 PSPTOT1_0474     FALSE 0.112 258.000 0.000 0.076 Y NA
 6216037 6216038 PSPTOT1_0474 PSPTOT1_0475     FALSE 0.052 330.000 0.000 0.076 Y NA
 6216038 6216039 PSPTOT1_0475 PSPTOT1_0476     TRUE 0.847 156.000 0.714 0.095   NA
 6216039 6216040 PSPTOT1_0476 PSPTOT1_0477   dppA TRUE 0.990 15.000 0.714 0.095   NA
 6216040 6216041 PSPTOT1_0477 PSPTOT1_0478 dppA   TRUE 0.756 75.000 0.036 0.076 Y NA
 6216041 6216042 PSPTOT1_0478 PSPTOT1_0479   dppC TRUE 0.998 11.000 0.779 0.076 Y NA
 6216042 6216043 PSPTOT1_0479 PSPTOT1_0480 dppC   TRUE 0.995 11.000 0.560 1.000 Y NA
 6216043 6216044 PSPTOT1_0480 PSPTOT1_0481   dppF TRUE 0.998 0.000 0.377 0.003 Y NA
 6216045 6216046 PSPTOT1_0482 PSPTOT1_0483     FALSE 0.019 202.000 0.000 NA   NA
 6216046 6216047 PSPTOT1_0483 PSPTOT1_0484     FALSE 0.230 36.000 0.000 NA   NA
 6216047 6216048 PSPTOT1_0484 PSPTOT1_0485     FALSE 0.006 281.000 0.000 NA   NA
 6216048 6216049 PSPTOT1_0485 PSPTOT1_0486     FALSE 0.002 484.000 0.000 NA   NA
 6216049 6216050 PSPTOT1_0486 PSPTOT1_0487     FALSE 0.043 148.000 0.000 NA   NA
 6216050 6216051 PSPTOT1_0487 PSPTOT1_0488     FALSE 0.068 102.000 0.000 NA   NA
 6216053 6216054 PSPTOT1_0490 PSPTOT1_0491 opuCA   TRUE 0.999 -3.000 0.903 1.000 Y NA
 6216054 6216055 PSPTOT1_0491 PSPTOT1_0492     TRUE 0.973 14.000 0.313 0.076 N NA
 6216055 6216056 PSPTOT1_0492 PSPTOT1_0493     TRUE 0.978 15.000 0.403 0.076 N NA
 6216057 6216058 PSPTOT1_0494 PSPTOT1_0495 prfC   FALSE 0.003 350.000 0.000 NA   NA
 6216059 6216060 PSPTOT1_0496 PSPTOT1_0497     FALSE 0.073 98.000 0.000 NA   NA
 6216060 6216061 PSPTOT1_0497 PSPTOT1_0498     FALSE 0.059 112.000 0.000 NA   NA
 6216061 6216062 PSPTOT1_0498 PSPTOT1_0499     FALSE 0.304 126.000 0.082 NA   NA
 6216062 6216063 PSPTOT1_0499 PSPTOT1_0500     FALSE 0.243 175.000 0.132 NA   NA
 6216064 6216065 PSPTOT1_0501 PSPTOT1_0502     TRUE 0.647 63.000 0.149 NA   NA
 6216066 6216067 PSPTOT1_0503 PSPTOT1_0504   shcS2 FALSE 0.434 15.000 0.000 NA   NA
 6216067 6216068 PSPTOT1_0504 PSPTOT1_0505 shcS2 hopT2 FALSE 0.033 169.000 0.000 NA   NA
 6216068 6216069 PSPTOT1_0505 PSPTOT1_0506 hopT2   FALSE 0.336 22.000 0.000 NA   NA
 6216069 6216070 PSPTOT1_0506 PSPTOT1_0507     FALSE 0.003 347.000 0.000 NA   NA
 6216070 6216071 PSPTOT1_0507 PSPTOT1_0508     TRUE 0.656 6.000 0.000 NA   NA
 6216071 6216072 PSPTOT1_0508 PSPTOT1_0509     TRUE 0.870 13.000 0.000 0.001   NA
 6216072 6216073 PSPTOT1_0509 PSPTOT1_0510     FALSE 0.070 100.000 0.000 NA   NA
 6216073 6216074 PSPTOT1_0510 PSPTOT1_0511   shcS1 FALSE 0.486 13.000 0.000 NA   NA
 6216075 6216076 PSPTOT1_0512 PSPTOT1_0513   greB-2 FALSE 0.276 77.000 0.027 NA   NA
 6216080 6216081 PSPTOT1_0517 PSPTOT1_0518 glyA-2   FALSE 0.016 214.000 0.000 NA   NA
 6216082 6216083 PSPTOT1_0519 PSPTOT1_0520     FALSE 0.329 96.000 0.062 NA   NA
 6216083 6216084 PSPTOT1_0520 PSPTOT1_0521   cstA TRUE 0.832 28.000 0.156 NA   NA
 6216089 6216090 PSPTOT1_0526 PSPTOT1_0527     FALSE 0.082 130.000 0.000 1.000 N NA
 6216091 6216092 PSPTOT1_0528 PSPTOT1_0529 cioB cioA TRUE 0.974 4.000 0.000 0.045 Y NA
 6216092 6216093 PSPTOT1_0529 PSPTOT1_0530 cioA   FALSE 0.043 363.000 0.000 0.045 Y NA
 6216093 6216094 PSPTOT1_0530 PSPTOT1_0531     TRUE 0.999 -3.000 0.943 0.002 Y NA
 6216094 6216095 PSPTOT1_0531 PSPTOT1_0532     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.045 Y NA
 6216096 6216097 PSPTOT1_0533 PSPTOT1_0534   trmA TRUE 0.958 -3.000 0.062 1.000   NA
 6216097 6216098 PSPTOT1_0534 PSPTOT1_0535 trmA   FALSE 0.010 247.000 0.000 NA   NA
 6216098 6216099 PSPTOT1_0535 PSPTOT1_0536     FALSE 0.049 137.000 0.000 NA   NA
 6216099 6216100 PSPTOT1_0536 PSPTOT1_0537     TRUE 0.906 5.000 0.046 NA   NA
 6216101 6216102 PSPTOT1_0538 PSPTOT1_0539   tesB TRUE 0.672 33.000 0.052 1.000   NA
 6216102 6216103 PSPTOT1_0539 PSPTOT1_0540 tesB   FALSE 0.212 138.000 0.042 1.000 N NA
 6216104 6216105 PSPTOT1_0541 PSPTOT1_0542     FALSE 0.292 90.000 0.043 NA   NA
 6216106 6216107 PSPTOT1_0543 PSPTOT1_0544     FALSE 0.411 115.000 0.007 1.000 Y NA
 6216107 6216108 PSPTOT1_0544 PSPTOT1_0545     TRUE 0.542 19.000 0.010 NA   NA
 6216108 6216109 PSPTOT1_0545 PSPTOT1_0546     FALSE 0.070 100.000 0.000 NA   NA
 6216109 6216110 PSPTOT1_0546 PSPTOT1_0547     FALSE 0.190 45.000 0.000 NA   NA
 6216111 6216112 PSPTOT1_0548 PSPTOT1_0549     FALSE 0.318 87.000 0.048 NA   NA
 6216113 6216114 PSPTOT1_0550 PSPTOT1_0551     FALSE 0.047 140.000 0.000 NA   NA
 6216114 6216115 PSPTOT1_0551 PSPTOT1_0552     FALSE 0.016 215.000 0.000 NA   NA
 6216115 6216116 PSPTOT1_0552 PSPTOT1_0553     FALSE 0.002 390.000 0.000 NA   NA
 6216116 6216117 PSPTOT1_0553 PSPTOT1_0554     FALSE 0.080 92.000 0.000 NA   NA
 6216117 6216118 PSPTOT1_0554 PSPTOT1_0555     FALSE 0.007 266.000 0.000 NA   NA
 6216118 6216119 PSPTOT1_0555 PSPTOT1_0556     FALSE 0.002 439.000 0.000 NA   NA
 6216120 6216121 PSPTOT1_0557 PSPTOT1_0558     FALSE 0.114 72.000 0.000 NA   NA
 6216122 6216123 PSPTOT1_0559 PSPTOT1_0560     FALSE 0.028 177.000 0.000 NA   NA
 6216124 6216125 PSPTOT1_0561 PSPTOT1_0562     FALSE 0.011 236.000 0.000 NA   NA
 6216125 6216126 PSPTOT1_0562 PSPTOT1_0563     FALSE 0.057 121.000 0.000 NA   NA
 6216126 6216127 PSPTOT1_0563 PSPTOT1_0564     FALSE 0.001 774.000 0.000 NA   NA
 6216127 6216128 PSPTOT1_0564 PSPTOT1_0565     FALSE 0.002 420.000 0.000 NA   NA
 6216129 6216130 PSPTOT1_0566 PSPTOT1_0567     FALSE 0.173 50.000 0.000 NA   NA
 6216132 6216133 PSPTOT1_0569 PSPTOT1_0570     FALSE 0.004 380.000 0.000 1.000   NA
 6216133 6216134 PSPTOT1_0570 PSPTOT1_0571     FALSE 0.170 50.000 0.000 NA N NA
 6216135 6216136 PSPTOT1_0572 PSPTOT1_0573     FALSE 0.058 120.000 0.000 NA   NA
 6216137 6216138 PSPTOT1_0574 PSPTOT1_0575   gal FALSE 0.345 33.000 0.000 1.000   NA
 6216138 6216139 PSPTOT1_0575 PSPTOT1_0576 gal   FALSE 0.069 101.000 0.000 NA   NA
 6216140 6216141 PSPTOT1_0577 PSPTOT1_0578     FALSE 0.187 185.000 0.000 1.000 Y NA
 6216141 6216142 PSPTOT1_0578 PSPTOT1_0579     TRUE 0.880 27.000 0.000 0.023 Y NA
 6216142 6216143 PSPTOT1_0579 PSPTOT1_0580   kptA FALSE 0.089 115.000 0.000 1.000 N NA
 6216143 6216144 PSPTOT1_0580 PSPTOT1_0581 kptA   FALSE 0.002 470.000 0.000 NA   NA
 6216144 6216145 PSPTOT1_0581 PSPTOT1_0582     TRUE 0.712 16.000 0.031 NA   NA
 6216146 6216147 PSPTOT1_0583 PSPTOT1_6010     FALSE 0.069 101.000 0.000 NA   NA
 6216149 6216150 PSPTOT1_0585 PSPTOT1_0586     FALSE 0.278 80.000 0.019 1.000 N NA
 6216150 6216151 PSPTOT1_0586 PSPTOT1_0587     FALSE 0.059 159.000 0.000 1.000 N NA
 6216152 6216153 PSPTOT1_0588 PSPTOT1_0589   thiE TRUE 0.814 24.000 0.000 1.000 Y NA
 6216153 6216154 PSPTOT1_0589 PSPTOT1_0590 thiE hemL FALSE 0.143 206.000 0.000 1.000 Y NA
 6216154 6216155 PSPTOT1_0590 PSPTOT1_0591 hemL   FALSE 0.014 296.000 0.008 1.000   NA
 6216157 6216158 PSPTOT1_0593 PSPTOT1_0594 miaB   FALSE 0.357 178.000 0.220 1.000 N NA
 6216158 6216159 PSPTOT1_0594 PSPTOT1_0595     TRUE 0.983 -7.000 0.457 NA   NA
 6216159 6216160 PSPTOT1_0595 PSPTOT1_0596     TRUE 0.957 6.000 0.150 NA   NA
 6216160 6216161 PSPTOT1_0596 PSPTOT1_0597   cutE TRUE 0.940 42.000 0.557 1.000 N NA
 6216162 6216163 PSPTOT1_0598 PSPTOT1_0599     TRUE 0.839 71.000 0.435 NA   NA
 6216164 6216165 PSPTOT1_0600 PSPTOT1_0601 leuS   TRUE 0.563 90.000 0.182 NA N NA
 6216165 6216166 PSPTOT1_0601 PSPTOT1_0602   holA TRUE 0.793 42.000 0.199 NA N NA
 6216166 6216167 PSPTOT1_0602 PSPTOT1_0603 holA   TRUE 0.673 5.000 0.000 NA   NA
 6216167 6216168 PSPTOT1_0603 PSPTOT1_0604     FALSE 0.056 124.000 0.000 NA   NA
 6216168 6216169 PSPTOT1_0604 PSPTOT1_0605     TRUE 0.513 84.000 0.123 NA   NA
 6216173 6216174 PSPTOT1_2230 PSPTOT1_2231   vdh TRUE 0.613 106.000 0.172 0.076 N NA
 6216174 6216175 PSPTOT1_2231 PSPTOT1_2232 vdh fcs FALSE 0.415 273.000 0.600 0.076 N NA
 6216175 6216176 PSPTOT1_2232 PSPTOT1_2233 fcs   TRUE 0.994 -3.000 0.231 1.000 Y NA
 6216176 6216177 PSPTOT1_2233 PSPTOT1_2234     FALSE 0.058 117.000 0.000 NA   NA
 6216179 6216180 PSPTOT1_2236 PSPTOT1_2237     FALSE 0.296 89.000 0.032 1.000   NA
 6216180 6216181 PSPTOT1_2237 PSPTOT1_2238     TRUE 0.999 -3.000 0.886 0.005 Y NA
 6216183 6216184 PSPTOT1_2240 PSPTOT1_2241     FALSE 0.011 241.000 0.000 NA N NA
 6216184 6216185 PSPTOT1_2241 PSPTOT1_2242     FALSE 0.300 27.000 0.000 NA   NA
 6216186 6216187 PSPTOT1_2243 PSPTOT1_2244     TRUE 0.990 -10.000 0.750 NA   NA
 6216187 6216188 PSPTOT1_2244 PSPTOT1_2245   oprE FALSE 0.052 169.000 0.000 1.000   NA
 6216188 6216189 PSPTOT1_2245 PSPTOT1_2246 oprE   FALSE 0.488 73.000 0.083 NA   NA
 6216189 6216190 PSPTOT1_2246 PSPTOT1_2247   aspB TRUE 0.906 11.000 0.083 NA N NA
 6216191 6216192 PSPTOT1_2248 PSPTOT1_2249     FALSE 0.088 120.000 0.000 1.000 N NA
 6216192 6216193 PSPTOT1_2249 PSPTOT1_2250   accC-1 TRUE 0.916 41.000 0.066 0.002 Y NA
 6216193 6216194 PSPTOT1_2250 PSPTOT1_2251 accC-1   TRUE 0.936 -3.000 0.033 1.000 N NA
 6216194 6216195 PSPTOT1_2251 PSPTOT1_2252     TRUE 0.999 -3.000 0.750 NA Y NA
 6216195 6216196 PSPTOT1_2252 PSPTOT1_2253     TRUE 0.980 0.000 0.179 NA N NA
 6216196 6216197 PSPTOT1_2253 PSPTOT1_2254     TRUE 0.977 5.000 0.250 NA   NA
 6216197 6216198 PSPTOT1_2254 PSPTOT1_2255     FALSE 0.437 131.000 0.160 1.000   NA
 6216198 6216199 PSPTOT1_2255 PSPTOT1_2256     TRUE 0.825 122.000 0.640 1.000   NA
 6216199 6216200 PSPTOT1_2256 PSPTOT1_2257     TRUE 0.999 7.000 0.810 0.014 Y NA
 6216200 6216201 PSPTOT1_2257 PSPTOT1_2258     TRUE 0.996 11.000 0.714 1.000 Y NA
 6216201 6216202 PSPTOT1_2258 PSPTOT1_2259     TRUE 0.963 64.000 0.632 1.000 Y NA
 6216204 6216205 PSPTOT1_2261 PSPTOT1_2262     FALSE 0.001 906.000 0.000 NA   NA
 6216205 6216206 PSPTOT1_2262 PSPTOT1_2263     FALSE 0.047 140.000 0.000 NA   NA
 6216206 6216207 PSPTOT1_2263 PSPTOT1_2264     FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 6216207 6216208 PSPTOT1_2264 PSPTOT1_2265     FALSE 0.178 48.000 0.000 NA   NA
 6216208 6216209 PSPTOT1_2265 PSPTOT1_2266   vanR FALSE 0.160 76.000 0.000 1.000 N NA
 6216210 6216211 PSPTOT1_2267 PSPTOT1_2268 vanB vanA TRUE 0.777 70.000 0.128 0.001 N NA
 6216211 6216212 PSPTOT1_2268 PSPTOT1_2269 vanA   FALSE 0.066 148.000 0.000 1.000 N NA
 6216213 6216214 PSPTOT1_2270 PSPTOT1_2271     FALSE 0.091 113.000 0.000 1.000   NA
 6216216 6216217 PSPTOT1_2273 PSPTOT1_2274   glf TRUE 0.875 -12.000 0.065 1.000   NA
 6216217 6216218 PSPTOT1_2274 PSPTOT1_2275 glf   TRUE 0.930 3.000 0.036 1.000   NA
 6216218 6216219 PSPTOT1_2275 PSPTOT1_2276     FALSE 0.072 142.000 0.000 1.000   NA
 6216222 6216223 PSPTOT1_2279 PSPTOT1_2280     FALSE 0.009 253.000 0.000 NA   NA
 6216225 6216226 PSPTOT1_2282 PSPTOT1_2283     TRUE 0.899 -22.000 0.161 NA   NA
 6216227 6216228 PSPTOT1_2284 PSPTOT1_2285     FALSE 0.002 417.000 0.000 NA   NA
 6216230 6216231 PSPTOT1_2287 PSPTOT1_2288 yagT   TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.045 Y NA
 6216231 6216232 PSPTOT1_2288 PSPTOT1_2289     TRUE 0.543 427.000 0.917 0.002 Y NA
 6216232 6216233 PSPTOT1_2289 PSPTOT1_2290     FALSE 0.296 40.000 0.000 1.000 N NA
 6216234 6216235 PSPTOT1_2291 PSPTOT1_2292     TRUE 0.976 -3.000 0.167 NA   NA
 6216238 6216239 PSPTOT1_2295 PSPTOT1_2296     TRUE 0.520 12.000 0.000 NA   NA
 6216239 6216240 PSPTOT1_2296 PSPTOT1_2297     TRUE 0.967 -3.000 0.111 NA   NA
 6216240 6216241 PSPTOT1_2297 PSPTOT1_2298     TRUE 0.955 4.000 0.111 NA   NA
 6216241 6216242 PSPTOT1_2298 PSPTOT1_2299     TRUE 0.884 27.000 0.222 NA   NA
 6216242 6216243 PSPTOT1_2299 PSPTOT1_2300     TRUE 0.995 2.000 0.560 1.000   NA
 6216243 6216244 PSPTOT1_2300 PSPTOT1_2301     FALSE 0.001 993.000 0.000 NA   NA
 6216244 6216245 PSPTOT1_2301 PSPTOT1_2302     TRUE 0.948 33.000 0.556 NA   NA
 6216245 6216246 PSPTOT1_2302 PSPTOT1_2303     TRUE 0.993 8.000 0.714 NA   NA
 6216246 6216247 PSPTOT1_2303 PSPTOT1_2304     TRUE 0.876 56.000 0.429 NA   NA
 6216248 6216249 PSPTOT1_2305 PSPTOT1_2306     FALSE 0.039 311.000 0.000 1.000 Y NA
 6216249 6216250 PSPTOT1_2306 PSPTOT1_2307     FALSE 0.005 296.000 0.000 NA N NA
 6216250 6216251 PSPTOT1_2307 PSPTOT1_2308     TRUE 0.983 -3.000 0.222 NA   NA
 6216251 6216252 PSPTOT1_2308 PSPTOT1_2309   cbrD TRUE 0.987 -3.000 0.278 NA   NA
 6216252 6216253 PSPTOT1_2309 PSPTOT1_2310 cbrD cbrC TRUE 0.971 11.000 0.091 1.000 Y NA
 6216253 6216254 PSPTOT1_2310 PSPTOT1_2311 cbrC cbrB TRUE 0.988 -7.000 0.182 0.074 Y NA
 6216254 6216255 PSPTOT1_2311 PSPTOT1_2312 cbrB cbrA TRUE 0.999 -3.000 0.722 1.000 Y NA
 6216255 6216256 PSPTOT1_2312 PSPTOT1_2313 cbrA   TRUE 0.896 -10.000 0.073 1.000 N NA
 6216256 6216257 PSPTOT1_2313 PSPTOT1_2314     TRUE 0.953 5.000 0.098 1.000 N NA
 6216257 6216258 PSPTOT1_2314 PSPTOT1_2315     TRUE 0.992 0.000 0.355 1.000 N NA
 6216258 6216259 PSPTOT1_2315 PSPTOT1_2316     TRUE 0.917 22.000 0.241 1.000   NA
 6216259 6216260 PSPTOT1_2316 PSPTOT1_2317     TRUE 0.963 -3.000 0.074 1.000   NA
 6216260 6216261 PSPTOT1_2317 PSPTOT1_2318     TRUE 0.930 -7.000 0.093 1.000 N NA
 6216261 6216262 PSPTOT1_2318 PSPTOT1_2319     FALSE 0.125 191.000 0.054 1.000 N NA
 6216262 6216263 PSPTOT1_2319 PSPTOT1_2320     FALSE 0.006 326.000 0.000 1.000 N NA
 6216263 6216264 PSPTOT1_2320 PSPTOT1_2321     TRUE 0.937 70.000 0.500 NA Y NA
 6216264 6216265 PSPTOT1_2321 PSPTOT1_2322     TRUE 0.997 -3.000 0.800 NA N NA
 6216265 6216266 PSPTOT1_2322 PSPTOT1_2323     FALSE 0.019 232.000 0.000 1.000 N NA
 6216266 6216267 PSPTOT1_2323 PSPTOT1_2324     TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.026 Y NA
 6216267 6216268 PSPTOT1_2324 PSPTOT1_2325     TRUE 0.990 -7.000 0.324 1.000 Y NA
 6216268 6216269 PSPTOT1_2325 PSPTOT1_2326   dppB TRUE 0.998 -3.000 0.441 0.074 Y NA
 6216269 6216270 PSPTOT1_2326 PSPTOT1_2327 dppB   TRUE 0.697 21.000 0.000 0.074   NA
 6216270 6216271 PSPTOT1_2327 PSPTOT1_2328     FALSE 0.042 150.000 0.000 NA   NA
 6216271 6216272 PSPTOT1_2328 PSPTOT1_2329     TRUE 0.871 -15.000 0.091 NA   NA
 6216272 6216273 PSPTOT1_2329 PSPTOT1_2330     FALSE 0.211 129.000 0.045 NA   NA
 6216274 6216275 PSPTOT1_2331 PSPTOT1_2332     FALSE 0.314 25.000 0.000 NA   NA
 6216276 6216277 PSPTOT1_2333 PSPTOT1_2334     TRUE 0.938 -6.000 0.111 NA   NA
 6216279 6216280 PSPTOT1_2336 PSPTOT1_2337     FALSE 0.345 21.000 0.000 NA   NA
 6216280 6216281 PSPTOT1_2337 PSPTOT1_2338     TRUE 0.990 0.000 0.333 NA   NA
 6216281 6216282 PSPTOT1_2338 PSPTOT1_2339     FALSE 0.114 72.000 0.000 NA   NA
 6216282 6216283 PSPTOT1_2339 PSPTOT1_2340     TRUE 0.964 80.000 0.750 1.000 Y NA
 6216283 6216284 PSPTOT1_2340 PSPTOT1_2341     TRUE 0.998 -10.000 0.750 0.003 Y NA
 6216284 6216285 PSPTOT1_2341 PSPTOT1_2342     TRUE 0.998 -3.000 0.636 1.000 Y NA
 6216285 6216286 PSPTOT1_2342 PSPTOT1_2343     TRUE 0.999 -3.000 0.818 0.074 Y NA
 6216286 6216287 PSPTOT1_2343 PSPTOT1_2344     TRUE 0.991 -3.000 0.176 NA Y NA
 6216287 6216288 PSPTOT1_2344 PSPTOT1_2345     FALSE 0.108 363.000 0.471 NA N NA
 6216288 6216289 PSPTOT1_2345 PSPTOT1_2346     FALSE 0.094 108.000 0.000 1.000 N NA
 6216292 6216293 PSPTOT1_2349 PSPTOT1_2350     TRUE 0.875 25.000 0.000 0.074 Y NA
 6216293 6216294 PSPTOT1_2350 PSPTOT1_2351   proP FALSE 0.046 175.000 0.000 1.000 N NA
 6216294 6216295 PSPTOT1_2351 PSPTOT1_2352 proP   TRUE 0.835 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6216296 6216297 PSPTOT1_2353 PSPTOT1_2354     FALSE 0.286 42.000 0.000 1.000   NA
 6216298 6216299 PSPTOT1_2355 PSPTOT1_2356     TRUE 0.876 5.000 0.020 1.000 N NA
 6216300 6216301 PSPTOT1_2357 PSPTOT1_2358     FALSE 0.116 71.000 0.000 NA   NA
 6216301 6216302 PSPTOT1_2358 PSPTOT1_2359     TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 6216302 6216303 PSPTOT1_2359 PSPTOT1_2360     TRUE 0.992 8.000 0.667 NA   NA
 6216303 6216304 PSPTOT1_2360 PSPTOT1_2361   lexA-1 TRUE 0.992 0.000 0.381 NA   NA
 6216305 6216306 PSPTOT1_2362 PSPTOT1_2363     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6216308 6216309 PSPTOT1_2365 PSPTOT1_2366     TRUE 0.999 -3.000 0.795 0.074 Y NA
 6216309 6216310 PSPTOT1_2366 PSPTOT1_2367     TRUE 0.972 19.000 0.273 1.000 Y NA
 6216312 6216313 PSPTOT1_2369 PSPTOT1_2370     TRUE 0.520 12.000 0.000 NA   NA
 6216313 6216314 PSPTOT1_2370 PSPTOT1_2371     FALSE 0.365 19.000 0.000 NA   NA
 6216315 6216316 PSPTOT1_2372 PSPTOT1_2373   kdgK FALSE 0.083 130.000 0.000 1.000   NA
 6216316 6216317 PSPTOT1_2373 PSPTOT1_2374 kdgK   TRUE 0.646 29.000 0.047 NA N NA
 6216317 6216318 PSPTOT1_2374 PSPTOT1_2375     TRUE 0.738 18.000 0.047 NA N NA
 6216318 6216319 PSPTOT1_2375 PSPTOT1_2376     FALSE 0.475 98.000 0.150 NA N NA
 6216319 6216320 PSPTOT1_2376 PSPTOT1_2377     TRUE 0.854 37.000 0.250 NA N NA
 6216320 6216321 PSPTOT1_2377 PSPTOT1_2378     TRUE 0.990 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 6216321 6216322 PSPTOT1_2378 PSPTOT1_2379     TRUE 0.988 10.000 0.148 0.014 Y NA
 6216322 6216323 PSPTOT1_2379 PSPTOT1_2380     TRUE 0.979 64.000 0.706 0.074 Y NA
 6216323 6216324 PSPTOT1_2380 PSPTOT1_2381     FALSE 0.004 327.000 0.000 NA   NA
 6216324 6216325 PSPTOT1_2381 PSPTOT1_2382     FALSE 0.486 13.000 0.000 NA   NA
 6216325 6216326 PSPTOT1_2382 PSPTOT1_2383     FALSE 0.058 116.000 0.000 NA   NA
 6216326 6216327 PSPTOT1_2383 PSPTOT1_2384     FALSE 0.091 113.000 0.000 1.000   NA
 6216327 6216328 PSPTOT1_2384 PSPTOT1_2385     FALSE 0.087 88.000 0.000 NA   NA
 6216329 6216330 PSPTOT1_2386 PSPTOT1_2387     FALSE 0.002 395.000 0.000 NA   NA
 6216332 6216333 PSPTOT1_2389 PSPTOT1_2390     FALSE 0.033 168.000 0.000 NA N NA
 6216334 6216335 PSPTOT1_2391 PSPTOT1_2392 glgB   TRUE 0.994 -3.000 0.115 0.005 Y NA
 6216335 6216336 PSPTOT1_2392 PSPTOT1_2393     TRUE 0.983 20.000 0.544 0.005   NA
 6216338 6216339 PSPTOT1_2395 PSPTOT1_2396     TRUE 0.587 113.000 0.250 1.000 N NA
 6216339 6216340 PSPTOT1_2396 PSPTOT1_2397     FALSE 0.459 168.000 0.267 1.000 N NA
 6216340 6216341 PSPTOT1_2397 PSPTOT1_2398     TRUE 0.994 -3.000 0.556 NA N NA
 6216341 6216342 PSPTOT1_2398 PSPTOT1_2399   mdtB TRUE 0.998 -3.000 0.741 NA Y NA
 6216342 6216343 PSPTOT1_2399 PSPTOT1_2400 mdtB   TRUE 0.995 -3.000 0.619 NA N NA
 6216343 6216344 PSPTOT1_2400 PSPTOT1_2401   tpx FALSE 0.099 152.000 0.007 1.000 N NA
 6216344 6216345 PSPTOT1_2401 PSPTOT1_2402 tpx   FALSE 0.123 91.000 0.000 1.000 N NA
 6216345 6216346 PSPTOT1_2402 PSPTOT1_2403     FALSE 0.063 106.000 0.000 NA   NA
 6216346 6216347 PSPTOT1_2403 PSPTOT1_2404     TRUE 0.991 6.000 0.575 NA   NA
 6216347 6216348 PSPTOT1_2404 PSPTOT1_2405     FALSE 0.436 60.000 0.033 1.000   NA
 6216349 6216350 PSPTOT1_2406 PSPTOT1_2407 xthA   FALSE 0.266 131.000 0.056 1.000 N NA
 6216352 6216353 PSPTOT1_2409 PSPTOT1_2410     FALSE 0.460 168.000 0.033 0.073 Y NA
 6216353 6216354 PSPTOT1_2410 PSPTOT1_2411   mvaB TRUE 0.630 31.000 0.035 1.000 N NA
 6216356 6216357 PSPTOT1_2413 PSPTOT1_2414     TRUE 0.983 14.000 0.316 1.000 Y NA
 6216357 6216358 PSPTOT1_2414 PSPTOT1_2415     TRUE 0.970 15.000 0.189 1.000 Y NA
 6216358 6216359 PSPTOT1_2415 PSPTOT1_2416     TRUE 0.995 -3.000 0.205 0.075 Y NA
 6216360 6216361 PSPTOT1_2417 PSPTOT1_2418     FALSE 0.314 71.000 0.020 1.000   NA
 6216361 6216362 PSPTOT1_2418 PSPTOT1_2419   cti FALSE 0.168 176.000 0.059 1.000   NA
 6216365 6216366 PSPTOT1_2422 PSPTOT1_2423   cysI FALSE 0.457 14.000 0.000 NA   NA
 6216366 6216367 PSPTOT1_2423 PSPTOT1_2424 cysI   TRUE 0.910 -16.000 0.165 NA   NA
 6216369 6216370 PSPTOT1_2426 PSPTOT1_2427     TRUE 0.843 56.000 0.344 NA N NA
 6216370 6216371 PSPTOT1_2427 PSPTOT1_2428     FALSE 0.019 203.000 0.000 NA   NA
 6216371 6216372 PSPTOT1_2428 PSPTOT1_2429     TRUE 0.794 28.000 0.115 NA   NA
 6216372 6216373 PSPTOT1_2429 PSPTOT1_2430     FALSE 0.272 101.000 0.000 0.039   NA
 6216373 6216374 PSPTOT1_2430 PSPTOT1_2431     FALSE 0.098 106.000 0.000 1.000   NA
 6216375 6216376 PSPTOT1_2432 PSPTOT1_2433     FALSE 0.428 53.000 0.025 1.000 N NA
 6216377 6216378 PSPTOT1_2434 PSPTOT1_2435     TRUE 0.992 -3.000 0.174 1.000 Y NA
 6216379 6216380 PSPTOT1_2436 PSPTOT1_2437     TRUE 0.938 92.000 0.462 0.026 Y NA
 6216380 6216381 PSPTOT1_2437 PSPTOT1_2438     TRUE 0.982 -6.000 0.353 1.000   NA
 6216381 6216382 PSPTOT1_2438 PSPTOT1_2439     TRUE 0.992 -3.000 0.416 1.000   NA
 6216382 6216383 PSPTOT1_2439 PSPTOT1_2440     TRUE 0.934 35.000 0.208 1.000 Y NA
 6216384 6216385 PSPTOT1_2441 PSPTOT1_2442     FALSE 0.157 107.000 0.022 NA N NA
 6216387 6216388 PSPTOT1_2444 PSPTOT1_2445 mltR   FALSE 0.017 241.000 0.000 1.000 N NA
 6216388 6216389 PSPTOT1_2445 PSPTOT1_2446     TRUE 0.743 88.000 0.056 0.074 Y NA
 6216389 6216390 PSPTOT1_2446 PSPTOT1_2447     TRUE 0.997 14.000 0.918 0.074 Y NA
 6216390 6216391 PSPTOT1_2447 PSPTOT1_2448     TRUE 0.951 32.000 0.173 0.074 Y NA
 6216391 6216392 PSPTOT1_2448 PSPTOT1_2449   uxuB TRUE 0.987 19.000 0.524 1.000 Y NA
 6216392 6216393 PSPTOT1_2449 PSPTOT1_2450 uxuB xylB TRUE 0.975 11.000 0.118 1.000 Y NA
 6216393 6216394 PSPTOT1_2450 PSPTOT1_2451 xylB   TRUE 0.932 25.000 0.118 1.000 Y NA
 6216396 6216397 PSPTOT1_1771 PSPTOT1_1772     TRUE 0.643 7.000 0.000 NA   NA
 6216398 6216399 PSPTOT1_1773 PSPTOT1_1774     FALSE 0.398 65.000 0.041 NA N NA
 6216399 6216400 PSPTOT1_1774 PSPTOT1_1775     TRUE 0.813 -7.000 0.026 NA   NA
 6216400 6216401 PSPTOT1_1775 PSPTOT1_1776     FALSE 0.374 74.000 0.048 NA   NA
 6216403 6216404 PSPTOT1_1778 PSPTOT1_1779     TRUE 0.997 11.000 0.734 1.000 Y NA
 6216404 6216405 PSPTOT1_1779 PSPTOT1_1780     TRUE 0.998 11.000 0.815 0.014 Y NA
 6216405 6216406 PSPTOT1_1780 PSPTOT1_1781     TRUE 0.963 71.000 0.548 0.074 Y NA
 6216407 6216408 PSPTOT1_1782 PSPTOT1_1783 estA   FALSE 0.181 116.000 0.031 NA   NA
 6216409 6216410 PSPTOT1_1784 PSPTOT1_1785     TRUE 0.997 -3.000 0.740 NA   NA
 6216410 6216411 PSPTOT1_1785 PSPTOT1_1786     TRUE 0.965 28.000 0.625 NA   NA
 6216411 6216412 PSPTOT1_1786 PSPTOT1_1787   moaE FALSE 0.019 230.000 0.000 1.000 N NA
 6216412 6216413 PSPTOT1_1787 PSPTOT1_1788 moaE moaD TRUE 0.998 3.000 0.501 0.002 Y NA
 6216413 6216414 PSPTOT1_1788 PSPTOT1_1789 moaD moaC TRUE 0.996 -3.000 0.175 0.002 Y NA
 6216414 6216415 PSPTOT1_1789 PSPTOT1_1790 moaC   FALSE 0.146 128.000 0.013 1.000 N NA
 6216415 6216416 PSPTOT1_1790 PSPTOT1_1791     FALSE 0.009 295.000 0.000 1.000 N NA
 6216417 6216418 PSPTOT1_1792 PSPTOT1_1793     FALSE 0.041 153.000 0.000 NA   NA
 6216420 6216421 PSPTOT1_1795 PSPTOT1_1796 algD   TRUE 0.829 103.000 0.625 NA   NA
 6216421 6216422 PSPTOT1_1796 PSPTOT1_1797     TRUE 0.926 41.000 0.500 NA   NA
 6216422 6216423 PSPTOT1_1797 PSPTOT1_1798   algK TRUE 0.968 3.000 0.143 NA   NA
 6216423 6216424 PSPTOT1_1798 PSPTOT1_1799 algK algE TRUE 0.973 -3.000 0.143 NA   NA
 6216424 6216425 PSPTOT1_1799 PSPTOT1_1800 algE algG TRUE 0.967 27.000 0.625 NA   NA
 6216425 6216426 PSPTOT1_1800 PSPTOT1_1801 algG algX TRUE 0.869 69.000 0.500 NA   NA
 6216426 6216427 PSPTOT1_1801 PSPTOT1_1802 algX algL TRUE 0.990 9.000 0.562 NA   NA
 6216427 6216428 PSPTOT1_1802 PSPTOT1_1803 algL algI FALSE 0.490 187.000 0.438 NA   NA
 6216428 6216429 PSPTOT1_1803 PSPTOT1_1804 algI algJ TRUE 0.994 11.000 0.889 NA   NA
 6216429 6216430 PSPTOT1_1804 PSPTOT1_1805 algJ algF TRUE 0.992 13.000 0.889 NA   NA
 6216430 6216431 PSPTOT1_1805 PSPTOT1_1806 algF algA TRUE 0.669 128.000 0.400 NA   NA
 6216432 6216433 PSPTOT1_1807 PSPTOT1_1809     FALSE 0.037 304.000 0.000 NA Y NA
 6216434 6216435 PSPTOT1_1810 PSPTOT1_1811     TRUE 0.978 17.000 0.636 NA   NA
 6216437 6216438 PSPTOT1_1813 PSPTOT1_1814     FALSE 0.017 209.000 0.000 NA   NA
 6216439 6216440 PSPTOT1_1815 PSPTOT1_1816     FALSE 0.042 151.000 0.000 NA   NA
 6216442 6216443 PSPTOT1_1818 PSPTOT1_1819     TRUE 0.921 26.000 0.318 NA   NA
 6216443 6216444 PSPTOT1_1819 PSPTOT1_1820     TRUE 0.938 -10.000 0.182 NA   NA
 6216444 6216445 PSPTOT1_1820 PSPTOT1_1821     TRUE 0.996 -3.000 0.714 NA   NA
 6216446 6216447 PSPTOT1_1822 PSPTOT1_1823     TRUE 0.804 88.000 0.429 1.000 N NA
 6216450 6216451 PSPTOT1_1826 PSPTOT1_1827     TRUE 0.988 0.000 0.278 NA   NA
 6216451 6216452 PSPTOT1_1827 PSPTOT1_1828     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6216453 6216454 PSPTOT1_1829 PSPTOT1_1830     TRUE 0.996 -3.000 0.714 NA N NA
 6216454 6216455 PSPTOT1_1830 PSPTOT1_1831     FALSE 0.111 528.000 0.400 NA Y NA
 6216458 6216459 PSPTOT1_1834 PSPTOT1_1835     TRUE 0.991 -3.000 0.375 NA N NA
 6216460 6216461 PSPTOT1_1836 PSPTOT1_1837     FALSE 0.010 245.000 0.000 NA   NA
 6216463 6216464 PSPTOT1_1839 PSPTOT1_1840     FALSE 0.001 705.000 0.000 NA   NA
 6216464 6216465 PSPTOT1_1840 PSPTOT1_1841     FALSE 0.301 240.000 0.429 NA   NA
 6216465 6216466 PSPTOT1_1841 PSPTOT1_1842   nfrB TRUE 0.920 13.000 0.159 NA   NA
 6216466 6216467 PSPTOT1_1842 PSPTOT1_1843 nfrB   TRUE 0.985 -3.000 0.227 1.000 N NA
 6216467 6216468 PSPTOT1_1843 PSPTOT1_1844     TRUE 0.561 92.000 0.188 NA   NA
 6216468 6216469 PSPTOT1_1844 PSPTOT1_1845     FALSE 0.097 83.000 0.000 NA   NA
 6216470 6216471 PSPTOT1_1846 PSPTOT1_1847     FALSE 0.017 208.000 0.000 NA   NA
 6216471 6216472 PSPTOT1_1847 PSPTOT1_1848     FALSE 0.238 113.000 0.000 0.038 N NA
 6216473 6216474 PSPTOT1_1849 PSPTOT1_1850     FALSE 0.191 152.000 0.056 NA   NA
 6216474 6216475 PSPTOT1_1850 PSPTOT1_1851     FALSE 0.102 235.000 0.120 NA   NA
 6216475 6216476 PSPTOT1_1851 PSPTOT1_1852   folE-1 TRUE 0.834 22.000 0.100 1.000 N NA
 6216476 6216477 PSPTOT1_1852 PSPTOT1_1853 folE-1 folB-2 TRUE 0.982 0.000 0.030 1.000 Y NA
 6216477 6216478 PSPTOT1_1853 PSPTOT1_1854 folB-2   FALSE 0.013 228.000 0.000 NA   NA
 6216480 6216481 PSPTOT1_1856 PSPTOT1_1857 cysZ   FALSE 0.024 186.000 0.000 NA   NA
 6216483 6216484 PSPTOT1_1859 PSPTOT1_1860     FALSE 0.102 80.000 0.000 NA   NA
 6216485 6216486 PSPTOT1_1861 PSPTOT1_1862     FALSE 0.089 183.000 0.024 1.000 N NA
 6216486 6216487 PSPTOT1_1862 PSPTOT1_1863     FALSE 0.482 130.000 0.036 1.000 Y NA
 6216488 6216489 PSPTOT1_1864 PSPTOT1_1865   pta TRUE 0.492 78.000 0.094 NA   NA
 6216489 6216490 PSPTOT1_1865 PSPTOT1_1866 pta   TRUE 0.779 65.000 0.170 0.074   NA
 6216491 6216492 PSPTOT1_1867 PSPTOT1_1868     FALSE 0.091 114.000 0.000 1.000   NA
 6216492 6216493 PSPTOT1_1868 PSPTOT1_1869     TRUE 0.997 0.000 0.600 0.073   NA
 6216493 6216494 PSPTOT1_1869 PSPTOT1_1870     TRUE 0.987 -7.000 0.500 1.000   NA
 6216494 6216495 PSPTOT1_1870 PSPTOT1_1871     TRUE 0.994 -3.000 0.500 1.000   NA
 6216495 6216496 PSPTOT1_1871 PSPTOT1_1872     FALSE 0.018 234.000 0.000 1.000   NA
 6216497 6216498 PSPTOT1_1873 PSPTOT1_1874     TRUE 0.996 0.000 0.621 NA N NA
 6216498 6216499 PSPTOT1_1874 PSPTOT1_1875     TRUE 0.981 11.000 0.442 NA N NA
 6216499 6216500 PSPTOT1_1875 PSPTOT1_1876     TRUE 0.848 58.000 0.365 NA   NA
 6216500 6216501 PSPTOT1_1876 PSPTOT1_1877     TRUE 0.871 13.000 0.077 NA   NA
 6216501 6216502 PSPTOT1_1877 PSPTOT1_1878     FALSE 0.008 300.000 0.000 1.000   NA
 6216503 6216504 PSPTOT1_1879 PSPTOT1_1880     FALSE 0.232 252.000 0.375 NA   NA
 6216504 6216505 PSPTOT1_1880 PSPTOT1_1881     TRUE 0.996 5.000 0.889 NA   NA
 6216505 6216506 PSPTOT1_1881 PSPTOT1_1882   alkK FALSE 0.004 310.000 0.000 NA   NA
 6216506 6216507 PSPTOT1_1882 PSPTOT1_1883 alkK   FALSE 0.195 191.000 0.114 1.000 N NA
 6216508 6216509 PSPTOT1_1884 PSPTOT1_1885 rsmC   FALSE 0.010 247.000 0.000 NA   NA
 6216510 6216511 PSPTOT1_1886 PSPTOT1_1887     FALSE 0.059 184.000 0.017 NA   NA
 6216511 6216512 PSPTOT1_1887 PSPTOT1_1888     TRUE 0.913 29.000 0.320 NA   NA
 6216512 6216513 PSPTOT1_1888 PSPTOT1_1889     TRUE 0.991 0.000 0.364 NA   NA
 6216514 6216515 PSPTOT1_1890 PSPTOT1_1891     FALSE 0.008 262.000 0.000 NA   NA
 6216519 6216520 PSPTOT1_1895 PSPTOT1_1896     TRUE 0.998 -3.000 0.394 0.073 Y NA
 6216521 6216522 PSPTOT1_1897 PSPTOT1_1898     TRUE 0.753 67.000 0.261 NA   NA
 6216522 6216523 PSPTOT1_1898 PSPTOT1_1899   hpt FALSE 0.271 67.000 0.018 NA   NA
 6216524 6216525 PSPTOT1_1900 PSPTOT1_1901 upp uraA TRUE 0.983 5.000 0.101 1.000 Y NA
 6216526 6216527 PSPTOT1_1902 PSPTOT1_1903 hemH   TRUE 0.622 24.000 0.020 1.000   NA
 6216528 6216529 PSPTOT1_1904 PSPTOT1_1905     TRUE 0.949 -3.000 0.060 NA   NA
 6216529 6216530 PSPTOT1_1905 PSPTOT1_1906     FALSE 0.029 295.000 0.055 NA   NA
 6216530 6216531 PSPTOT1_1906 PSPTOT1_1907     TRUE 0.934 6.000 0.083 NA   NA
 6216531 6216532 PSPTOT1_1907 PSPTOT1_1908   phrB TRUE 0.830 10.000 0.017 1.000 N NA
 6216532 6216533 PSPTOT1_1908 PSPTOT1_1909 phrB   TRUE 0.872 -7.000 0.048 NA   NA
 6216533 6216534 PSPTOT1_1909 PSPTOT1_1910     TRUE 0.994 -3.000 0.533 NA   NA
 6216534 6216535 PSPTOT1_1910 PSPTOT1_1911     TRUE 0.990 -3.000 0.217 0.038   NA
 6216535 6216536 PSPTOT1_1911 PSPTOT1_1912     TRUE 0.847 114.000 0.722 NA   NA
 6216536 6216537 PSPTOT1_1912 PSPTOT1_1913   cfa TRUE 0.958 -13.000 0.311 NA   NA
 6216537 6216538 PSPTOT1_1913 PSPTOT1_1914 cfa   TRUE 0.988 -7.000 0.588 NA   NA
 6216538 6216539 PSPTOT1_1914 PSPTOT1_1915     FALSE 0.062 108.000 0.000 NA   NA
 6216540 6216541 PSPTOT1_1916 PSPTOT1_1917   murI FALSE 0.131 120.000 0.005 1.000   NA
 6216541 6216542 PSPTOT1_1917 PSPTOT1_1918 murI moeB TRUE 0.805 -7.000 0.013 1.000 N NA
 6216542 6216543 PSPTOT1_1918 PSPTOT1_1919 moeB hemK TRUE 0.863 -15.000 0.068 1.000 N NA
 6216543 6216544 PSPTOT1_1919 PSPTOT1_1920 hemK prfA TRUE 0.994 1.000 0.229 1.000 Y NA
 6216544 6216545 PSPTOT1_1920 PSPTOT1_1921 prfA hemA TRUE 0.988 -3.000 0.171 0.037 N NA
 6216546 6216547 PSPTOT1_1922 PSPTOT1_1923   lolB TRUE 0.942 5.000 0.072 1.000 N NA
 6216547 6216548 PSPTOT1_1923 PSPTOT1_1924 lolB ispE TRUE 0.955 3.000 0.072 1.000 N NA
 6216548 6216549 PSPTOT1_1924 PSPTOT1_6027 ispE   FALSE 0.215 39.000 0.000 NA   NA
 6216549 6216550 PSPTOT1_6027 PSPTOT1_1925     FALSE 0.150 58.000 0.000 NA   NA
 6216550 6216551 PSPTOT1_1925 PSPTOT1_1926     FALSE 0.366 138.000 0.122 1.000 N NA
 6216551 6216552 PSPTOT1_1926 PSPTOT1_1927   pth TRUE 0.872 165.000 0.496 0.018 Y NA
 6216552 6216553 PSPTOT1_1927 PSPTOT1_1928 pth ychF TRUE 0.954 22.000 0.184 1.000 Y NA
 6216553 6216554 PSPTOT1_1928 PSPTOT1_1929 ychF rfbB-1 FALSE 0.020 227.000 0.000 1.000 N NA
 6216554 6216555 PSPTOT1_1929 PSPTOT1_1930 rfbB-1 rfbD TRUE 0.994 0.000 0.084 0.002 Y NA
 6216555 6216556 PSPTOT1_1930 PSPTOT1_1931 rfbD rfbA TRUE 0.993 -3.000 0.074 0.002 Y NA
 6216556 6216557 PSPTOT1_1931 PSPTOT1_1932 rfbA   TRUE 0.885 42.000 0.150 NA Y NA
 6216559 6216560 PSPTOT1_1934 PSPTOT1_1935 rfbC-1   TRUE 0.981 0.000 0.028 1.000 Y NA
 6216560 6216561 PSPTOT1_1935 PSPTOT1_1936     TRUE 0.974 -10.000 0.155 1.000 Y NA
 6216561 6216562 PSPTOT1_1936 PSPTOT1_1937     TRUE 0.691 -7.000 0.000 1.000   NA
 6216562 6216563 PSPTOT1_1937 PSPTOT1_1938     FALSE 0.134 64.000 0.000 NA   NA
 6216563 6216564 PSPTOT1_1938 PSPTOT1_1939     TRUE 0.730 3.000 0.000 NA   NA
 6216564 6216565 PSPTOT1_1939 PSPTOT1_1940     TRUE 0.975 3.000 0.035 NA Y NA
 6216565 6216566 PSPTOT1_1940 PSPTOT1_1941     FALSE 0.473 -13.000 0.000 NA   NA
 6216566 6216567 PSPTOT1_1941 PSPTOT1_1942     TRUE 0.673 11.000 0.000 1.000   NA
 6216568 6216569 PSPTOT1_1943 PSPTOT1_1944     FALSE 0.001 775.000 0.000 NA   NA
 6216569 6216570 PSPTOT1_1944 PSPTOT1_1945     FALSE 0.065 105.000 0.000 NA   NA
 6216570 6216571 PSPTOT1_1945 PSPTOT1_1946     FALSE 0.035 165.000 0.000 NA   NA
 6216572 6216573 PSPTOT1_1947 PSPTOT1_6028     FALSE 0.058 118.000 0.000 NA   NA
 6216573 6216574 PSPTOT1_6028 PSPTOT1_1948     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 6216574 6216575 PSPTOT1_1948 PSPTOT1_1949     FALSE 0.006 284.000 0.000 NA   NA
 6216575 6216576 PSPTOT1_1949 PSPTOT1_1950     FALSE 0.032 171.000 0.000 NA   NA
 6216576 6216577 PSPTOT1_1950 PSPTOT1_1951     FALSE 0.030 173.000 0.000 NA   NA
 6216577 6216578 PSPTOT1_1951 PSPTOT1_1952     TRUE 0.814 -13.000 0.048 NA   NA
 6216579 6216580 PSPTOT1_1953 PSPTOT1_1954     TRUE 0.600 10.000 0.000 NA   NA
 6216580 6216581 PSPTOT1_1954 PSPTOT1_1955     FALSE 0.390 17.000 0.000 NA   NA
 6216582 6216583 PSPTOT1_1956 PSPTOT1_1957     FALSE 0.057 121.000 0.000 NA   NA
 6216585 6216586 PSPTOT1_1959 PSPTOT1_1960     FALSE 0.036 164.000 0.000 NA   NA
 6216586 6216587 PSPTOT1_1960 PSPTOT1_1961     TRUE 0.996 0.000 0.615 NA   NA
 6216588 6216589 PSPTOT1_1962 PSPTOT1_1963     FALSE 0.009 254.000 0.000 NA   NA
 6216590 6216591 PSPTOT1_1964 PSPTOT1_1965     FALSE 0.330 179.000 0.200 1.000   NA
 6216591 6216592 PSPTOT1_1965 PSPTOT1_1966     TRUE 0.944 57.000 0.450 NA Y NA
 6216592 6216593 PSPTOT1_1966 PSPTOT1_1967   dctP TRUE 0.927 57.000 0.350 NA Y NA
 6216593 6216594 PSPTOT1_1967 PSPTOT1_1968 dctP   TRUE 0.979 64.000 0.947 NA Y NA
 6216594 6216595 PSPTOT1_1968 PSPTOT1_1969   dctM TRUE 0.999 1.000 0.905 NA Y NA
 6216595 6216596 PSPTOT1_1969 PSPTOT1_1970 dctM   TRUE 0.527 84.000 0.133 NA   NA
 6216596 6216597 PSPTOT1_1970 PSPTOT1_1971     TRUE 0.814 -25.000 0.067 NA   NA
 6216597 6216598 PSPTOT1_1971 PSPTOT1_1972     FALSE 0.059 114.000 0.000 NA   NA
 6216598 6216599 PSPTOT1_1972 PSPTOT1_1973     TRUE 0.997 0.000 0.727 NA   NA
 6216599 6216600 PSPTOT1_1973 PSPTOT1_1974     FALSE 0.002 395.000 0.000 NA   NA
 6216600 6216601 PSPTOT1_1974 PSPTOT1_1975     FALSE 0.059 112.000 0.000 NA   NA
 6216601 6216602 PSPTOT1_1975 PSPTOT1_1976     FALSE 0.062 108.000 0.000 NA   NA
 6216602 6216603 PSPTOT1_1976 PSPTOT1_1977     TRUE 0.998 0.000 0.898 NA N NA
 6216604 6216605 PSPTOT1_1978 PSPTOT1_1979 aroA   FALSE 0.075 96.000 0.000 NA   NA
 6216605 6216606 PSPTOT1_1979 PSPTOT1_1980     TRUE 0.997 4.000 0.902 NA   NA
 6216607 6216608 PSPTOT1_1981 PSPTOT1_1982     TRUE 0.992 -3.000 0.412 NA   NA
 6216608 6216609 PSPTOT1_1982 PSPTOT1_1983     FALSE 0.001 1103.000 0.000 NA   NA
 6216609 6216610 PSPTOT1_1983 PSPTOT1_1984     TRUE 0.751 2.000 0.000 NA   NA
 6216611 6216612 PSPTOT1_1985 PSPTOT1_1986 wssI wssH TRUE 0.990 12.000 0.714 NA   NA
 6216612 6216613 PSPTOT1_1986 PSPTOT1_1987 wssH wssG TRUE 0.980 19.000 0.714 NA   NA
 6216613 6216614 PSPTOT1_1987 PSPTOT1_1988 wssG wssF TRUE 0.992 -3.000 0.429 NA   NA
 6216614 6216615 PSPTOT1_1988 PSPTOT1_1989 wssF wssE TRUE 0.856 16.000 0.080 1.000   NA
 6216615 6216616 PSPTOT1_1989 PSPTOT1_1990 wssE wssD FALSE 0.325 180.000 0.200 1.000 N NA
 6216616 6216617 PSPTOT1_1990 PSPTOT1_1991 wssD   TRUE 0.988 4.000 0.375 1.000   NA
 6216617 6216618 PSPTOT1_1991 PSPTOT1_1992   wssB TRUE 0.962 15.000 0.182 0.001   NA
 6216618 6216619 PSPTOT1_1992 PSPTOT1_1993 wssB wssA TRUE 0.991 -3.000 0.375 NA N NA
 6216619 6216620 PSPTOT1_1993 PSPTOT1_1994 wssA   FALSE 0.006 283.000 0.000 NA N NA
 6216620 6216621 PSPTOT1_1994 PSPTOT1_1995     FALSE 0.144 83.000 0.000 1.000 N NA
 6216621 6216622 PSPTOT1_1995 PSPTOT1_1996     FALSE 0.459 64.000 0.044 1.000 N NA
 6216622 6216623 PSPTOT1_1996 PSPTOT1_1997     TRUE 0.951 27.000 0.333 0.089 N NA
 6216623 6216624 PSPTOT1_1997 PSPTOT1_1998     TRUE 0.978 21.000 0.667 1.000 N NA
 6216624 6216625 PSPTOT1_1998 PSPTOT1_1999     TRUE 0.804 99.000 0.500 1.000 N NA
 6216626 6216627 PSPTOT1_2000 PSPTOT1_2001   phoD TRUE 0.835 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6216627 6216628 PSPTOT1_2001 PSPTOT1_2002 phoD   FALSE 0.062 155.000 0.000 1.000 N NA
 6216632 6216633 PSPTOT1_2006 PSPTOT1_2007     FALSE 0.162 76.000 0.000 1.000   NA
 6216635 6216636 PSPTOT1_2009 PSPTOT1_2010     FALSE 0.089 87.000 0.000 NA   NA
 6216637 6216638 PSPTOT1_2011 PSPTOT1_2012     FALSE 0.005 298.000 0.000 NA N NA
 6216639 6216640 PSPTOT1_2013 PSPTOT1_2014     FALSE 0.162 76.000 0.000 1.000   NA
 6216640 6216641 PSPTOT1_2014 PSPTOT1_2015     FALSE 0.062 156.000 0.000 1.000   NA
 6216644 6216645 PSPTOT1_2018 PSPTOT1_2019 rimI   TRUE 0.816 -7.000 0.027 NA   NA
 6216646 6216647 PSPTOT1_2020 PSPTOT1_2021     TRUE 0.993 -10.000 0.947 NA   NA
 6216647 6216648 PSPTOT1_2021 PSPTOT1_2022     TRUE 0.998 -3.000 0.950 NA   NA
 6216650 6216651 PSPTOT1_3672 PSPTOT1_3673     FALSE 0.029 175.000 0.000 NA   NA
 6216652 6216653 PSPTOT1_3674 PSPTOT1_3675 cheW   TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 6216653 6216654 PSPTOT1_3675 PSPTOT1_3676     FALSE 0.001 790.000 0.000 NA   NA
 6216654 6216655 PSPTOT1_3676 PSPTOT1_3677     FALSE 0.011 237.000 0.000 NA   NA
 6216655 6216656 PSPTOT1_3677 PSPTOT1_3678     FALSE 0.061 109.000 0.000 NA   NA
 6216656 6216657 PSPTOT1_3678 PSPTOT1_3679     FALSE 0.099 82.000 0.000 NA   NA
 6216657 6216658 PSPTOT1_3679 PSPTOT1_3680     FALSE 0.242 34.000 0.000 NA   NA
 6216658 6216659 PSPTOT1_3680 PSPTOT1_3681     FALSE 0.059 110.000 0.000 NA N NA
 6216660 6216661 PSPTOT1_3682 PSPTOT1_3683   tal FALSE 0.248 33.000 0.000 NA   NA
 6216662 6216663 PSPTOT1_3684 PSPTOT1_3685     TRUE 0.996 -3.000 0.408 NA Y NA
 6216666 6216667 PSPTOT1_3688 PSPTOT1_3689     FALSE 0.179 102.000 0.024 NA   NA
 6216668 6216669 PSPTOT1_3690 PSPTOT1_3691   lolE FALSE 0.093 110.000 0.000 1.000   NA
 6216669 6216670 PSPTOT1_3691 PSPTOT1_3692 lolE lolD TRUE 0.927 75.000 0.620 0.089 N NA
 6216670 6216671 PSPTOT1_3692 PSPTOT1_3693 lolD lolC TRUE 0.926 8.000 0.025 0.089 N NA
 6216672 6216673 PSPTOT1_3694 PSPTOT1_3695     TRUE 0.721 59.000 0.192 NA   NA
 6216674 6216675 PSPTOT1_3696 PSPTOT1_3697     FALSE 0.201 104.000 0.021 1.000 N NA
 6216677 6216678 PSPTOT1_3699 PSPTOT1_3700   gap2 FALSE 0.237 160.000 0.000 NA Y NA
 6216679 6216680 PSPTOT1_3701 PSPTOT1_3702 mfd   TRUE 0.879 12.000 0.071 NA   NA
 6216680 6216681 PSPTOT1_3702 PSPTOT1_3703     TRUE 0.498 75.000 0.091 NA   NA
 6216683 6216684 PSPTOT1_3705 PSPTOT1_6046     FALSE 0.028 177.000 0.000 NA   NA
 6216684 6216685 PSPTOT1_6046 PSPTOT1_3706     FALSE 0.015 219.000 0.000 NA   NA
 6216686 6216687 PSPTOT1_3707 PSPTOT1_3708     TRUE 0.780 0.000 0.000 NA   NA
 6216687 6216688 PSPTOT1_3708 PSPTOT1_3709     FALSE 0.248 33.000 0.000 NA   NA
 6216688 6216689 PSPTOT1_3709 PSPTOT1_3710     FALSE 0.131 65.000 0.000 NA   NA
 6216689 6216690 PSPTOT1_3710 PSPTOT1_3711     FALSE 0.290 28.000 0.000 NA   NA
 6216690 6216691 PSPTOT1_3711 PSPTOT1_3712     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6216691 6216692 PSPTOT1_3712 PSPTOT1_3713     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6216692 6216693 PSPTOT1_3713 PSPTOT1_3714     TRUE 0.992 0.000 0.417 NA   NA
 6216693 6216694 PSPTOT1_3714 PSPTOT1_3715     TRUE 0.982 3.000 0.250 NA   NA
 6216694 6216695 PSPTOT1_3715 PSPTOT1_3716     TRUE 0.992 0.000 0.400 NA   NA
 6216695 6216696 PSPTOT1_3716 PSPTOT1_3717     TRUE 0.886 18.000 0.167 NA   NA
 6216697 6216698 PSPTOT1_3718 PSPTOT1_3719     FALSE 0.004 335.000 0.000 NA   NA
 6216698 6216699 PSPTOT1_3719 PSPTOT1_3720     TRUE 0.643 7.000 0.000 NA   NA
 6216700 6216701 PSPTOT1_3721 PSPTOT1_3722     FALSE 0.001 813.000 0.000 NA   NA
 6216701 6216702 PSPTOT1_3722 PSPTOT1_3723     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6216703 6216704 PSPTOT1_3724 PSPTOT1_3725     FALSE 0.087 88.000 0.000 NA   NA
 6216705 6216706 PSPTOT1_3726 PSPTOT1_3727     TRUE 0.959 18.000 0.429 NA   NA
 6216706 6216707 PSPTOT1_3727 PSPTOT1_3728     FALSE 0.114 72.000 0.000 NA   NA
 6216707 6216708 PSPTOT1_3728 PSPTOT1_3729     FALSE 0.126 67.000 0.000 NA   NA
 6216708 6216709 PSPTOT1_3729 PSPTOT1_3730     TRUE 0.621 9.000 0.000 NA   NA
 6216709 6216710 PSPTOT1_3730 PSPTOT1_3731     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6216710 6216711 PSPTOT1_3731 PSPTOT1_3732     TRUE 0.989 0.000 0.294 NA   NA
 6216711 6216712 PSPTOT1_3732 PSPTOT1_3733     TRUE 0.982 9.000 0.375 NA   NA
 6216712 6216713 PSPTOT1_3733 PSPTOT1_3734     TRUE 0.963 11.000 0.250 NA   NA
 6216713 6216714 PSPTOT1_3734 PSPTOT1_3735     TRUE 0.850 52.000 0.333 NA   NA
 6216714 6216715 PSPTOT1_3735 PSPTOT1_3736     TRUE 0.985 4.000 0.333 NA   NA
 6216715 6216716 PSPTOT1_3736 PSPTOT1_3737     FALSE 0.057 121.000 0.000 NA   NA
 6216716 6216717 PSPTOT1_3737 PSPTOT1_3738     TRUE 0.912 -10.000 0.118 NA   NA
 6216717 6216718 PSPTOT1_3738 PSPTOT1_3739     TRUE 0.996 0.000 0.667 NA   NA
 6216718 6216719 PSPTOT1_3739 PSPTOT1_3740   recN TRUE 0.751 2.000 0.000 NA   NA
 6216721 6216722 PSPTOT1_3742 PSPTOT1_3743     TRUE 0.621 9.000 0.000 NA   NA
 6216722 6216723 PSPTOT1_3743 PSPTOT1_3744     FALSE 0.036 164.000 0.000 NA   NA
 6216723 6216724 PSPTOT1_3744 PSPTOT1_3745     FALSE 0.154 56.000 0.000 NA   NA
 6216724 6216725 PSPTOT1_3745 PSPTOT1_3746     TRUE 0.780 0.000 0.000 NA   NA
 6216727 6216728 PSPTOT1_3748 PSPTOT1_3749     TRUE 0.993 0.000 0.429 NA   NA
 6216728 6216729 PSPTOT1_3749 PSPTOT1_3750     TRUE 0.541 -9.000 0.000 NA   NA
 6216729 6216730 PSPTOT1_3750 PSPTOT1_3751     FALSE 0.002 460.000 0.000 NA   NA
 6216730 6216731 PSPTOT1_3751 PSPTOT1_3752     FALSE 0.068 102.000 0.000 NA   NA
 6216731 6216732 PSPTOT1_3752 PSPTOT1_3753     FALSE 0.026 182.000 0.000 NA   NA
 6216732 6216733 PSPTOT1_3753 PSPTOT1_3754     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6216733 6216734 PSPTOT1_3754 PSPTOT1_3755     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6216734 6216735 PSPTOT1_3755 PSPTOT1_3756     FALSE 0.020 228.000 0.000 1.000   NA
 6216735 6216736 PSPTOT1_3756 PSPTOT1_3757     TRUE 0.730 3.000 0.000 NA   NA
 6216736 6216737 PSPTOT1_3757 PSPTOT1_3758     TRUE 0.730 3.000 0.000 NA   NA
 6216737 6216738 PSPTOT1_3758 PSPTOT1_3759     FALSE 0.035 166.000 0.000 NA   NA
 6216738 6216739 PSPTOT1_3759 PSPTOT1_3760     FALSE 0.345 21.000 0.000 NA   NA
 6216739 6216740 PSPTOT1_3760 PSPTOT1_3761   cro FALSE 0.271 30.000 0.000 NA   NA
 6216743 6216744 PSPTOT1_3764 PSPTOT1_3765     FALSE 0.001 929.000 0.000 NA   NA
 6216744 6216745 PSPTOT1_3765 PSPTOT1_3766     FALSE 0.014 224.000 0.000 NA   NA
 6216745 6216746 PSPTOT1_3766 PSPTOT1_3767     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6216746 6216747 PSPTOT1_3767 PSPTOT1_3768     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6216747 6216748 PSPTOT1_3768 PSPTOT1_3769     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6216748 6216749 PSPTOT1_3769 PSPTOT1_3770     FALSE 0.041 152.000 0.000 NA   NA
 6216749 6216750 PSPTOT1_3770 PSPTOT1_3771     FALSE 0.054 130.000 0.000 NA   NA
 6216750 6216751 PSPTOT1_3771 PSPTOT1_3772     TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000   NA
 6216751 6216752 PSPTOT1_3772 PSPTOT1_3773     FALSE 0.007 271.000 0.000 NA   NA
 6216752 6216753 PSPTOT1_3773 PSPTOT1_3774     FALSE 0.054 130.000 0.000 NA   NA
 6216753 6216754 PSPTOT1_3774 PSPTOT1_3775     TRUE 0.989 -9.000 0.667 NA   NA
 6216754 6216755 PSPTOT1_3775 PSPTOT1_3776     FALSE 0.200 42.000 0.000 NA   NA
 6216755 6216756 PSPTOT1_3776 PSPTOT1_3777     FALSE 0.355 20.000 0.000 NA   NA
 6216756 6216757 PSPTOT1_3777 PSPTOT1_3778     FALSE 0.042 151.000 0.000 NA   NA
 6216757 6216758 PSPTOT1_3778 PSPTOT1_3779     FALSE 0.001 909.000 0.000 NA   NA
 6216758 6216759 PSPTOT1_3779 PSPTOT1_3780     TRUE 0.589 46.000 0.000 0.003   NA
 6216759 6216760 PSPTOT1_3780 PSPTOT1_3781     FALSE 0.410 16.000 0.000 NA   NA
 6216760 6216761 PSPTOT1_3781 PSPTOT1_3782     FALSE 0.055 126.000 0.000 NA   NA
 6216761 6216762 PSPTOT1_3782 PSPTOT1_3783     FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 6216762 6216763 PSPTOT1_3783 PSPTOT1_3784     FALSE 0.191 66.000 0.000 1.000   NA
 6216763 6216764 PSPTOT1_3784 PSPTOT1_3785     FALSE 0.119 70.000 0.000 NA   NA
 6216764 6216765 PSPTOT1_3785 PSPTOT1_3786     FALSE 0.001 642.000 0.000 NA   NA
 6216767 6216768 PSPTOT1_3788 PSPTOT1_3789     FALSE 0.215 39.000 0.000 NA   NA
 6216768 6216769 PSPTOT1_3789 PSPTOT1_3790     FALSE 0.018 205.000 0.000 NA   NA
 6216770 6216771 PSPTOT1_3791 PSPTOT1_3792     FALSE 0.005 297.000 0.000 NA   NA
 6216772 6216773 PSPTOT1_3793 PSPTOT1_3794     FALSE 0.014 220.000 0.000 NA   NA
 6216773 6216774 PSPTOT1_3794 PSPTOT1_3795     FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 6216778 6216779 PSPTOT1_3799 PSPTOT1_3800     FALSE 0.055 126.000 0.000 NA   NA
 6216779 6216780 PSPTOT1_3800 PSPTOT1_3801     FALSE 0.213 126.000 0.033 1.000 N NA
 6216783 6216784 PSPTOT1_3804 PSPTOT1_3805     TRUE 0.990 -3.000 0.365 NA   NA
 6216784 6216785 PSPTOT1_3805 PSPTOT1_3806     TRUE 0.990 13.000 0.805 NA   NA
 6216785 6216786 PSPTOT1_3806 PSPTOT1_3807     FALSE 0.004 321.000 0.000 NA   NA
 6216786 6216787 PSPTOT1_3807 PSPTOT1_3808     TRUE 0.780 0.000 0.000 NA   NA
 6216787 6216788 PSPTOT1_3808 PSPTOT1_3809     FALSE 0.010 247.000 0.000 NA   NA
 6216788 6216789 PSPTOT1_3809 PSPTOT1_3810     FALSE 0.259 191.000 0.200 NA   NA
 6216789 6216790 PSPTOT1_3810 PSPTOT1_3811   speE FALSE 0.012 265.000 0.000 1.000 N NA
 6216790 6216791 PSPTOT1_3811 PSPTOT1_3812 speE   FALSE 0.020 199.000 0.000 NA   NA
 6216793 6216794 PSPTOT1_3814 PSPTOT1_3815     TRUE 0.562 99.000 0.211 NA   NA
 6216794 6216795 PSPTOT1_3815 PSPTOT1_3816     TRUE 0.699 4.000 0.000 NA   NA
 6216797 6216798 PSPTOT1_3818 PSPTOT1_3819     FALSE 0.011 275.000 0.000 1.000 N NA
 6216798 6216799 PSPTOT1_3819 PSPTOT1_3820     TRUE 0.930 17.000 0.231 1.000   NA
 6216799 6216800 PSPTOT1_3820 PSPTOT1_3821     TRUE 0.609 77.000 0.148 1.000   NA
 6216800 6216801 PSPTOT1_3821 PSPTOT1_3822     TRUE 0.914 -3.000 0.018 1.000   NA
 6216801 6216802 PSPTOT1_3822 PSPTOT1_3823   aroC TRUE 0.803 -37.000 0.055 1.000   NA
 6216803 6216804 PSPTOT1_3824 PSPTOT1_3825     TRUE 0.580 97.000 0.219 NA   NA
 6216806 6216807 PSPTOT1_3827 PSPTOT1_3828     FALSE 0.044 147.000 0.000 NA   NA
 6216807 6216808 PSPTOT1_3828 PSPTOT1_3829     FALSE 0.182 47.000 0.000 NA   NA
 6216808 6216809 PSPTOT1_3829 PSPTOT1_3830   folE FALSE 0.103 420.000 0.545 NA   NA
 6216809 6216810 PSPTOT1_3830 PSPTOT1_3831 folE   TRUE 0.532 75.000 0.090 1.000 N NA
 6216811 6216812 PSPTOT1_3832 PSPTOT1_3833     FALSE 0.255 32.000 0.000 NA   NA
 6216819 6216820 PSPTOT1_3840 PSPTOT1_3841     FALSE 0.234 114.000 0.049 NA   NA
 6216823 6216824 PSPTOT1_3844 PSPTOT1_3845 pdxB   FALSE 0.200 89.000 0.009 1.000 N NA
 6216824 6216825 PSPTOT1_3845 PSPTOT1_3846     FALSE 0.406 67.000 0.047 NA   NA
 6216826 6216827 PSPTOT1_3847 PSPTOT1_3848 acnA   FALSE 0.101 121.000 0.006 NA   NA
 6216827 6216828 PSPTOT1_3848 PSPTOT1_3849   aer-2 FALSE 0.277 97.000 0.048 NA   NA
 6216828 6216829 PSPTOT1_3849 PSPTOT1_3850 aer-2   FALSE 0.004 317.000 0.000 NA   NA
 6216829 6216830 PSPTOT1_3850 PSPTOT1_3851     FALSE 0.002 439.000 0.000 NA   NA
 6216831 6216832 PSPTOT1_3852 PSPTOT1_3853     FALSE 0.111 74.000 0.000 NA   NA
 6216833 6216834 PSPTOT1_3854 PSPTOT1_3855     FALSE 0.170 51.000 0.000 NA   NA
 6216834 6216835 PSPTOT1_3855 PSPTOT1_3856     FALSE 0.106 77.000 0.000 NA   NA
 6216837 6216838 PSPTOT1_3858 PSPTOT1_3859 ccoN ccoO TRUE 0.999 0.000 0.833 0.001 N NA
 6216838 6216839 PSPTOT1_3859 PSPTOT1_3860 ccoO ccoQ TRUE 0.965 6.000 0.045 0.001 N NA
 6216839 6216840 PSPTOT1_3860 PSPTOT1_3861 ccoQ ccoP TRUE 0.975 -3.000 0.030 0.001 N NA
 6216840 6216841 PSPTOT1_3861 PSPTOT1_3862 ccoP   FALSE 0.048 138.000 0.000 NA   NA
 6216841 6216842 PSPTOT1_3862 PSPTOT1_3863     TRUE 0.990 0.000 0.323 NA   NA
 6216842 6216843 PSPTOT1_3863 PSPTOT1_3864     FALSE 0.131 65.000 0.000 NA   NA
 6216843 6216844 PSPTOT1_3864 PSPTOT1_3865     TRUE 0.922 11.000 0.111 NA   NA
 6216844 6216845 PSPTOT1_3865 PSPTOT1_3866     TRUE 0.976 3.000 0.197 NA   NA
 6216845 6216846 PSPTOT1_3866 PSPTOT1_3867   ccoS TRUE 0.941 55.000 0.713 NA   NA
 6216846 6216847 PSPTOT1_3867 PSPTOT1_3868 ccoS   TRUE 0.709 80.000 0.266 NA   NA
 6216847 6216848 PSPTOT1_3868 PSPTOT1_3869   hemN FALSE 0.333 96.000 0.051 1.000   NA
 6216850 6216851 PSPTOT1_3871 PSPTOT1_3872 anr apt FALSE 0.337 62.000 0.016 1.000 N NA
 6216852 6216853 PSPTOT1_3873 PSPTOT1_3874   cheW2 TRUE 0.997 1.000 0.743 NA   NA
 6216853 6216854 PSPTOT1_3874 PSPTOT1_3875 cheW2   TRUE 0.975 58.000 0.886 0.016   NA
 6216854 6216855 PSPTOT1_3875 PSPTOT1_3876     TRUE 0.848 76.000 0.454 1.000   NA
 6216855 6216856 PSPTOT1_3876 PSPTOT1_3877     TRUE 0.798 46.000 0.199 1.000 N NA
 6216856 6216857 PSPTOT1_3877 PSPTOT1_3878   motA-1 TRUE 0.990 7.000 0.248 1.000 Y NA
 6216857 6216858 PSPTOT1_3878 PSPTOT1_3879 motA-1 cheB-2 TRUE 0.992 0.000 0.153 1.000 Y NA
 6216858 6216859 PSPTOT1_3879 PSPTOT1_3880 cheB-2 cheA-2 FALSE 0.397 288.000 0.327 0.016 Y NA
 6216859 6216860 PSPTOT1_3880 PSPTOT1_3881 cheA-2   TRUE 0.961 34.000 0.341 1.000 Y NA
 6216860 6216861 PSPTOT1_3881 PSPTOT1_3882   cheY-2 TRUE 0.986 20.000 0.516 1.000 Y NA
 6216861 6216862 PSPTOT1_3882 PSPTOT1_3883 cheY-2 fliA FALSE 0.186 254.000 0.283 1.000 N NA
 6216862 6216863 PSPTOT1_3883 PSPTOT1_3884 fliA   TRUE 0.994 -3.000 0.482 1.000 N NA
 6216863 6216864 PSPTOT1_3884 PSPTOT1_3885   flhF TRUE 0.571 116.000 0.241 1.000 N NA
 6216864 6216865 PSPTOT1_3885 PSPTOT1_3886 flhF flhA TRUE 0.977 12.000 0.178 1.000 Y NA
 6216865 6216866 PSPTOT1_3886 PSPTOT1_3887 flhA flhB FALSE 0.154 385.000 0.205 0.010 Y NA
 6216866 6216867 PSPTOT1_3887 PSPTOT1_3888 flhB fliR TRUE 0.990 2.000 0.129 1.000 Y NA
 6216867 6216868 PSPTOT1_3888 PSPTOT1_3889 fliR fliQ TRUE 0.998 16.000 1.000 0.002 Y NA
 6216868 6216869 PSPTOT1_3889 PSPTOT1_3890 fliQ fliP TRUE 0.996 26.000 1.000 0.010 Y NA
 6216869 6216870 PSPTOT1_3890 PSPTOT1_3891 fliP fliO TRUE 0.987 0.000 0.061 1.000 Y NA
 6216870 6216871 PSPTOT1_3891 PSPTOT1_3892 fliO fliN TRUE 0.997 1.000 0.443 1.000 Y NA
 6216871 6216872 PSPTOT1_3892 PSPTOT1_3893 fliN fliM TRUE 0.985 62.000 0.741 0.001 Y NA
 6216872 6216873 PSPTOT1_3893 PSPTOT1_3894 fliM   TRUE 0.991 10.000 0.171 0.001 Y NA
 6216875 6216876 PSPTOT1_3896 PSPTOT1_3897 fliK   FALSE 0.333 99.000 0.069 NA N NA
 6216876 6216877 PSPTOT1_3897 PSPTOT1_3898     TRUE 0.961 34.000 0.381 NA Y NA
 6216877 6216878 PSPTOT1_3898 PSPTOT1_3899     TRUE 0.992 5.000 0.308 NA Y NA
 6216878 6216879 PSPTOT1_3899 PSPTOT1_3900   fliJ FALSE 0.234 83.000 0.022 NA N NA
 6216879 6216880 PSPTOT1_3900 PSPTOT1_3901 fliJ fliI TRUE 0.976 7.000 0.070 1.000 Y NA
 6216880 6216881 PSPTOT1_3901 PSPTOT1_3902 fliI   TRUE 0.966 -10.000 0.115 NA Y NA
 6216881 6216882 PSPTOT1_3902 PSPTOT1_3903   fliG TRUE 0.978 16.000 0.320 NA Y NA
 6216882 6216883 PSPTOT1_3903 PSPTOT1_3904 fliG fliF TRUE 0.992 8.000 0.189 0.005 Y NA
 6216883 6216884 PSPTOT1_3904 PSPTOT1_3905 fliF fliE TRUE 0.997 16.000 0.910 0.005 Y NA
 6216884 6216885 PSPTOT1_3905 PSPTOT1_3906 fliE fleR FALSE 0.327 242.000 0.446 1.000 N NA
 6216885 6216886 PSPTOT1_3906 PSPTOT1_3907 fleR   TRUE 0.999 0.000 0.679 1.000 Y NA
 6216886 6216887 PSPTOT1_3907 PSPTOT1_3908   fleQ TRUE 0.837 123.000 0.377 1.000 Y NA
 6216887 6216888 PSPTOT1_3908 PSPTOT1_3909 fleQ fliT FALSE 0.137 177.000 0.056 NA   NA
 6216888 6216889 PSPTOT1_3909 PSPTOT1_3910 fliT fliS TRUE 0.952 26.000 0.478 NA   NA
 6216889 6216890 PSPTOT1_3910 PSPTOT1_3911 fliS fliD TRUE 0.822 126.000 0.194 0.002 Y NA
 6216890 6216891 PSPTOT1_3911 PSPTOT1_3912 fliD   TRUE 0.733 84.000 0.117 NA Y NA
 6216891 6216892 PSPTOT1_3912 PSPTOT1_3913   fliC TRUE 0.609 73.000 0.025 NA Y NA
 6216892 6216893 PSPTOT1_3913 PSPTOT1_3914 fliC   FALSE 0.004 330.000 0.000 NA N NA
 6216893 6216894 PSPTOT1_3914 PSPTOT1_3915     FALSE 0.006 286.000 0.000 NA   NA
 6216894 6216895 PSPTOT1_3915 PSPTOT1_3916     FALSE 0.052 132.000 0.000 NA   NA
 6216895 6216896 PSPTOT1_3916 PSPTOT1_3917   flgL FALSE 0.084 89.000 0.000 NA N NA
 6216896 6216897 PSPTOT1_3917 PSPTOT1_3918 flgL flgK TRUE 0.972 14.000 0.057 0.001 Y NA
 6216897 6216898 PSPTOT1_3918 PSPTOT1_3919 flgK flgJ TRUE 0.997 12.000 0.705 0.002 Y NA
 6216898 6216899 PSPTOT1_3919 PSPTOT1_3920 flgJ flgI TRUE 0.995 11.000 0.405 0.006 Y NA
 6216899 6216900 PSPTOT1_3920 PSPTOT1_3921 flgI flgH TRUE 0.979 14.000 0.128 0.006 Y NA
 6216900 6216901 PSPTOT1_3921 PSPTOT1_3922 flgH flgG TRUE 0.967 85.000 0.632 0.005 Y NA
 6216901 6216902 PSPTOT1_3922 PSPTOT1_3923 flgG flgF TRUE 0.951 47.000 0.207 0.001 Y NA
 6216902 6216903 PSPTOT1_3923 PSPTOT1_3924 flgF flgE-2 FALSE 0.312 476.000 0.594 0.003 Y NA
 6216903 6216904 PSPTOT1_3924 PSPTOT1_3925 flgE-2 flgE-1 FALSE 0.327 190.000 0.000 0.001 Y NA
 6216904 6216905 PSPTOT1_3925 PSPTOT1_3926 flgE-1 flgD TRUE 0.992 26.000 0.875 NA Y NA
 6216905 6216906 PSPTOT1_3926 PSPTOT1_3927 flgD flgC TRUE 0.966 16.000 0.207 NA Y NA
 6216906 6216907 PSPTOT1_3927 PSPTOT1_3928 flgC flgB TRUE 0.999 4.000 0.800 0.003 Y NA
 6216907 6216908 PSPTOT1_3928 PSPTOT1_3929 flgB   FALSE 0.007 275.000 0.000 NA   NA
 6216908 6216909 PSPTOT1_3929 PSPTOT1_3930   cynS TRUE 0.732 11.000 0.011 NA   NA
 6216911 6216912 PSPTOT1_3932 PSPTOT1_3933 cheR-2   TRUE 0.988 37.000 0.838 1.000 Y NA
 6216913 6216914 PSPTOT1_3934 PSPTOT1_3935     TRUE 0.742 161.000 0.371 NA Y NA
 6216914 6216915 PSPTOT1_3935 PSPTOT1_3936     TRUE 0.968 50.000 0.361 0.002 Y NA
 6216915 6216916 PSPTOT1_3936 PSPTOT1_3937     TRUE 0.548 83.000 0.121 1.000 N NA
 6216917 6216918 PSPTOT1_3938 PSPTOT1_3939     TRUE 0.890 55.000 0.462 NA   NA
 6216919 6216920 PSPTOT1_3940 PSPTOT1_3941     TRUE 0.850 0.000 0.000 1.000   NA
 6216920 6216921 PSPTOT1_3941 PSPTOT1_3942     FALSE 0.109 75.000 0.000 NA   NA
 6216921 6216922 PSPTOT1_3942 PSPTOT1_3943     FALSE 0.410 16.000 0.000 NA   NA
 6216922 6216923 PSPTOT1_3943 PSPTOT1_3944     FALSE 0.131 65.000 0.000 NA   NA
 6216924 6216925 PSPTOT1_3945 PSPTOT1_3946     TRUE 0.884 6.000 0.027 1.000   NA
 6216925 6216926 PSPTOT1_3946 PSPTOT1_3947     TRUE 0.928 -3.000 0.027 1.000   NA
 6216926 6216927 PSPTOT1_3947 PSPTOT1_3948     FALSE 0.078 94.000 0.000 NA   NA
 6216927 6216928 PSPTOT1_3948 PSPTOT1_3949     FALSE 0.052 132.000 0.000 NA   NA
 6216928 6216929 PSPTOT1_3949 PSPTOT1_3950     TRUE 0.967 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 6216929 6216930 PSPTOT1_3950 PSPTOT1_3951     FALSE 0.018 399.000 0.000 NA Y NA
 6216930 6216931 PSPTOT1_3951 PSPTOT1_3952     FALSE 0.434 15.000 0.000 NA   NA
 6216934 6216935 PSPTOT1_3955 PSPTOT1_3956 pobA   FALSE 0.004 327.000 0.000 NA N NA
 6216937 6216938 PSPTOT1_1533 PSPTOT1_1534     FALSE 0.059 112.000 0.000 NA   NA
 6216938 6216939 PSPTOT1_1534 PSPTOT1_1535     TRUE 0.853 28.000 0.184 NA N NA
 6216940 6216941 PSPTOT1_1536 PSPTOT1_1537   argC FALSE 0.074 191.000 0.031 NA   NA
 6216942 6216943 PSPTOT1_1538 PSPTOT1_1539     FALSE 0.071 99.000 0.000 NA   NA
 6216943 6216944 PSPTOT1_1539 PSPTOT1_1540     FALSE 0.236 54.000 0.000 1.000   NA
 6216944 6216945 PSPTOT1_1540 PSPTOT1_1541     FALSE 0.155 105.000 0.008 1.000   NA
 6216945 6216946 PSPTOT1_1541 PSPTOT1_1542     FALSE 0.166 122.000 0.018 1.000 N NA
 6216947 6216948 PSPTOT1_1543 PSPTOT1_1544 speD   FALSE 0.038 243.000 0.025 1.000 N NA
 6216948 6216949 PSPTOT1_1544 PSPTOT1_1545     FALSE 0.262 31.000 0.000 NA   NA
 6216951 6216952 PSPTOT1_1547 PSPTOT1_1548   trpC FALSE 0.410 35.000 0.013 NA   NA
 6216952 6216953 PSPTOT1_1548 PSPTOT1_1549 trpC trpD TRUE 0.995 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 6216953 6216954 PSPTOT1_1549 PSPTOT1_1550 trpD trpG TRUE 0.934 22.000 0.105 1.000 Y NA
 6216954 6216955 PSPTOT1_1550 PSPTOT1_1551 trpG   FALSE 0.003 412.000 0.000 1.000   NA
 6216955 6216956 PSPTOT1_1551 PSPTOT1_1552     TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000   NA
 6216956 6216957 PSPTOT1_1552 PSPTOT1_1553     FALSE 0.062 108.000 0.000 NA   NA
 6216957 6216958 PSPTOT1_1553 PSPTOT1_1554     FALSE 0.001 794.000 0.000 NA   NA
 6216958 6216959 PSPTOT1_1554 PSPTOT1_1555     TRUE 0.992 8.000 0.667 NA   NA
 6216959 6216960 PSPTOT1_1555 PSPTOT1_1556     FALSE 0.043 149.000 0.000 NA   NA
 6216960 6216961 PSPTOT1_1556 PSPTOT1_1557     TRUE 0.940 -12.000 0.208 NA   NA
 6216961 6216962 PSPTOT1_1557 PSPTOT1_1558     TRUE 0.932 -10.000 0.167 NA   NA
 6216962 6216963 PSPTOT1_1558 PSPTOT1_1559     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 6216963 6216964 PSPTOT1_1559 PSPTOT1_1560     TRUE 0.970 -3.000 0.125 NA   NA
 6216964 6216965 PSPTOT1_1560 PSPTOT1_1561     TRUE 0.979 4.000 0.250 NA   NA
 6216965 6216966 PSPTOT1_1561 PSPTOT1_1562     TRUE 0.994 -3.000 0.556 NA   NA
 6216966 6216967 PSPTOT1_1562 PSPTOT1_1563     TRUE 0.728 131.000 0.500 NA   NA
 6216967 6216968 PSPTOT1_1563 PSPTOT1_1564     TRUE 0.998 -3.000 0.900 NA   NA
 6216968 6216969 PSPTOT1_1564 PSPTOT1_1565     TRUE 0.962 61.000 1.000 NA   NA
 6216969 6216970 PSPTOT1_1565 PSPTOT1_1566     TRUE 0.984 19.000 0.800 NA   NA
 6216970 6216971 PSPTOT1_1566 PSPTOT1_1567     TRUE 0.992 -3.000 0.417 NA   NA
 6216971 6216972 PSPTOT1_1567 PSPTOT1_1568     FALSE 0.186 46.000 0.000 NA   NA
 6216972 6216973 PSPTOT1_1568 PSPTOT1_1569     TRUE 0.986 -19.000 0.750 NA   NA
 6216973 6216974 PSPTOT1_1569 PSPTOT1_1570     FALSE 0.043 148.000 0.000 NA   NA
 6216975 6216976 PSPTOT1_1571 PSPTOT1_1572     FALSE 0.041 153.000 0.000 NA   NA
 6216976 6216977 PSPTOT1_1572 PSPTOT1_1573     FALSE 0.073 98.000 0.000 NA   NA
 6216977 6216978 PSPTOT1_1573 PSPTOT1_1574     FALSE 0.068 102.000 0.000 NA   NA
 6216979 6216980 PSPTOT1_1575 PSPTOT1_1576 trpE gph TRUE 0.739 70.000 0.233 1.000   NA
 6216980 6216981 PSPTOT1_1576 PSPTOT1_1577 gph rpe TRUE 0.973 -3.000 0.120 1.000   NA
 6216981 6216982 PSPTOT1_1577 PSPTOT1_1578 rpe   FALSE 0.079 170.000 0.007 1.000 N NA
 6216982 6216983 PSPTOT1_1578 PSPTOT1_1579     TRUE 0.982 12.000 0.145 0.068 Y NA
 6216983 6216984 PSPTOT1_1579 PSPTOT1_1580     TRUE 0.834 78.000 0.108 0.068 Y NA
 6216984 6216985 PSPTOT1_1580 PSPTOT1_1581     TRUE 0.937 83.000 0.556 1.000 Y NA
 6216987 6216988 PSPTOT1_1583 PSPTOT1_1584     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.031 Y NA
 6216990 6216991 PSPTOT1_1586 PSPTOT1_1587     TRUE 0.967 1.000 0.091 1.000 N NA
 6216991 6216992 PSPTOT1_1587 PSPTOT1_1588     TRUE 0.887 81.000 0.642 NA   NA
 6216993 6216994 PSPTOT1_1589 PSPTOT1_1590   surA TRUE 0.831 17.000 0.070 1.000 N NA
 6216994 6216995 PSPTOT1_1590 PSPTOT1_1591 surA pdxA TRUE 0.995 -3.000 0.561 1.000 N NA
 6216995 6216996 PSPTOT1_1591 PSPTOT1_1592 pdxA ksgA TRUE 0.982 -3.000 0.197 1.000 N NA
 6216996 6216997 PSPTOT1_1592 PSPTOT1_1593 ksgA apaG FALSE 0.309 114.000 0.078 NA N NA
 6216997 6216998 PSPTOT1_1593 PSPTOT1_1594 apaG apaH TRUE 0.987 0.000 0.267 NA   NA
 6216998 6216999 PSPTOT1_1594 PSPTOT1_1595 apaH   TRUE 0.947 -3.000 0.045 1.000   NA
 6216999 6217000 PSPTOT1_1595 PSPTOT1_1596     FALSE 0.006 286.000 0.000 NA N NA
 6217000 6217001 PSPTOT1_1596 PSPTOT1_1597     TRUE 0.831 122.000 0.683 NA   NA
 6217001 6217002 PSPTOT1_1597 PSPTOT1_1598     TRUE 0.997 -3.000 0.761 NA   NA
 6217002 6217003 PSPTOT1_1598 PSPTOT1_1599   cca FALSE 0.221 98.000 0.032 NA   NA
 6217004 6217005 PSPTOT1_1600 PSPTOT1_1601 folK-1 folB-1 TRUE 0.993 -9.000 0.500 1.000 Y NA
 6217010 6217011 PSPTOT1_1606 PSPTOT1_1607 dnaG rpoD TRUE 0.795 68.000 0.299 1.000 N NA
 6217011 6217012 PSPTOT1_1607 PSPTOT1_1608 rpoD   FALSE 0.025 257.000 0.013 1.000 N NA
 6217012 6217013 PSPTOT1_1608 PSPTOT1_6025     FALSE 0.410 16.000 0.000 NA   NA
 6217014 6217015 PSPTOT1_1609 PSPTOT1_1610     FALSE 0.041 152.000 0.000 NA   NA
 6217015 6217016 PSPTOT1_1610 PSPTOT1_1611     FALSE 0.175 49.000 0.000 NA   NA
 6217016 6217017 PSPTOT1_1611 PSPTOT1_1612     TRUE 0.621 9.000 0.000 NA   NA
 6217018 6217019 PSPTOT1_1613 PSPTOT1_1614     FALSE 0.007 270.000 0.000 NA   NA
 6217019 6217020 PSPTOT1_1614 PSPTOT1_1615   czcC FALSE 0.007 278.000 0.000 NA   NA
 6217020 6217021 PSPTOT1_1615 PSPTOT1_1616 czcC   FALSE 0.009 252.000 0.000 NA   NA
 6217021 6217022 PSPTOT1_1616 PSPTOT1_1617     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217022 6217023 PSPTOT1_1617 PSPTOT1_1618     TRUE 0.995 5.000 0.750 NA   NA
 6217026 6217027 PSPTOT1_1621 PSPTOT1_1622     TRUE 0.743 58.000 0.208 NA   NA
 6217027 6217028 PSPTOT1_1622 PSPTOT1_1623     FALSE 0.036 164.000 0.000 NA   NA
 6217028 6217029 PSPTOT1_1623 PSPTOT1_1624     TRUE 0.961 0.000 0.074 NA   NA
 6217029 6217030 PSPTOT1_1624 PSPTOT1_1625     FALSE 0.026 181.000 0.000 NA   NA
 6217030 6217031 PSPTOT1_1625 PSPTOT1_1626     TRUE 0.992 -3.000 0.419 NA   NA
 6217032 6217033 PSPTOT1_1627 PSPTOT1_1628     FALSE 0.186 46.000 0.000 NA   NA
 6217036 6217037 PSPTOT1_1631 PSPTOT1_1632     TRUE 0.780 0.000 0.000 NA   NA
 6217038 6217039 PSPTOT1_1633 PSPTOT1_1634     TRUE 0.656 6.000 0.000 NA   NA
 6217039 6217040 PSPTOT1_1634 PSPTOT1_1635     FALSE 0.377 152.000 0.161 1.000 N NA
 6217040 6217041 PSPTOT1_1635 PSPTOT1_1636     TRUE 0.934 18.000 0.258 1.000   NA
 6217041 6217042 PSPTOT1_1636 PSPTOT1_1637   pqqF FALSE 0.154 228.000 0.161 1.000   NA
 6217042 6217043 PSPTOT1_1637 PSPTOT1_1638 pqqF pqqB FALSE 0.031 308.000 0.000 0.001   NA
 6217043 6217044 PSPTOT1_1638 PSPTOT1_1639 pqqB pqqC TRUE 0.997 9.000 0.825 0.001   NA
 6217044 6217045 PSPTOT1_1639 PSPTOT1_1640 pqqC pqqD TRUE 0.993 -3.000 0.246 0.001   NA
 6217045 6217046 PSPTOT1_1640 PSPTOT1_1641 pqqD pqqE TRUE 0.982 -7.000 0.211 0.001   NA
 6217046 6217047 PSPTOT1_1641 PSPTOT1_1642 pqqE   TRUE 0.854 -37.000 0.088 1.000   NA
 6217048 6217049 PSPTOT1_6026 PSPTOT1_1643     FALSE 0.085 89.000 0.000 NA   NA
 6217049 6217050 PSPTOT1_1643 PSPTOT1_1644     FALSE 0.435 170.000 0.250 1.000 N NA
 6217052 6217053 PSPTOT1_1646 PSPTOT1_1647     FALSE 0.003 349.000 0.000 NA   NA
 6217053 6217054 PSPTOT1_1647 PSPTOT1_1648   bioD FALSE 0.448 155.000 0.244 NA   NA
 6217054 6217055 PSPTOT1_1648 PSPTOT1_1649 bioD bioC TRUE 0.854 32.000 0.063 0.001 N NA
 6217055 6217056 PSPTOT1_1649 PSPTOT1_1650 bioC bioH TRUE 0.946 -7.000 0.163 NA   NA
 6217056 6217057 PSPTOT1_1650 PSPTOT1_1651 bioH bioF TRUE 0.919 -7.000 0.092 NA   NA
 6217057 6217058 PSPTOT1_1651 PSPTOT1_1652 bioF bioB TRUE 0.919 64.000 0.168 0.001 Y NA
 6217059 6217060 PSPTOT1_1653 PSPTOT1_1654     FALSE 0.057 192.000 0.009 1.000   NA
 6217060 6217061 PSPTOT1_1654 PSPTOT1_1655     FALSE 0.486 82.000 0.100 NA   NA
 6217062 6217063 PSPTOT1_1656 PSPTOT1_1657     TRUE 0.945 25.000 0.382 1.000   NA
 6217063 6217064 PSPTOT1_1657 PSPTOT1_1658     TRUE 0.999 -3.000 0.632 0.068 Y NA
 6217064 6217065 PSPTOT1_1658 PSPTOT1_1659     TRUE 0.997 -3.000 0.660 0.068 N NA
 6217065 6217066 PSPTOT1_1659 PSPTOT1_1660     TRUE 0.999 0.000 0.870 0.068 N NA
 6217066 6217067 PSPTOT1_1660 PSPTOT1_1661     TRUE 0.989 -16.000 0.761 1.000 N NA
 6217068 6217069 PSPTOT1_1662 PSPTOT1_1663   rarD-1 FALSE 0.137 126.000 0.020 NA   NA
 6217069 6217070 PSPTOT1_1663 PSPTOT1_1664 rarD-1   FALSE 0.004 312.000 0.000 NA   NA
 6217072 6217073 PSPTOT1_1666 PSPTOT1_1667 glcB-1   FALSE 0.003 359.000 0.000 NA   NA
 6217073 6217074 PSPTOT1_1667 PSPTOT1_1668     TRUE 0.643 7.000 0.000 NA   NA
 6217074 6217075 PSPTOT1_1668 PSPTOT1_1669     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217075 6217076 PSPTOT1_1669 PSPTOT1_1670     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217076 6217077 PSPTOT1_1670 PSPTOT1_1671     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217077 6217078 PSPTOT1_1671 PSPTOT1_1672     FALSE 0.003 350.000 0.000 NA   NA
 6217080 6217081 PSPTOT1_1674 PSPTOT1_1675     TRUE 0.992 -3.000 0.392 1.000 N NA
 6217082 6217083 PSPTOT1_1676 PSPTOT1_1677     TRUE 0.853 -3.000 0.005 NA   NA
 6217085 6217086 PSPTOT1_1679 PSPTOT1_1680     FALSE 0.236 35.000 0.000 NA   NA
 6217087 6217088 PSPTOT1_1681 PSPTOT1_1682     TRUE 0.936 68.000 0.328 0.068 Y NA
 6217088 6217089 PSPTOT1_1682 PSPTOT1_1683     TRUE 0.999 -3.000 0.844 1.000 Y NA
 6217089 6217090 PSPTOT1_1683 PSPTOT1_1684   glyA-1 FALSE 0.073 257.000 0.000 1.000 Y NA
 6217090 6217091 PSPTOT1_1684 PSPTOT1_1685 glyA-1 soxB-1 TRUE 0.980 18.000 0.357 1.000 Y NA
 6217091 6217092 PSPTOT1_1685 PSPTOT1_1686 soxB-1 soxD-1 TRUE 0.997 16.000 0.824 0.001 Y NA
 6217092 6217093 PSPTOT1_1686 PSPTOT1_1687 soxD-1 soxA-1 TRUE 0.999 -3.000 0.824 0.001   NA
 6217093 6217094 PSPTOT1_1687 PSPTOT1_1688 soxA-1 soxG-1 TRUE 0.983 37.000 0.778 0.002   NA
 6217094 6217095 PSPTOT1_1688 PSPTOT1_1689 soxG-1 purU3 FALSE 0.480 171.000 0.303 1.000 N NA
 6217095 6217096 PSPTOT1_1689 PSPTOT1_1690 purU3 fdhA-1 FALSE 0.426 102.000 0.103 1.000 N NA
 6217097 6217098 PSPTOT1_1691 PSPTOT1_1692     FALSE 0.002 424.000 0.000 NA   NA
 6217102 6217103 PSPTOT1_1696 PSPTOT1_1697     FALSE 0.092 85.000 0.000 NA   NA
 6217103 6217104 PSPTOT1_1697 PSPTOT1_1698     TRUE 0.976 -3.000 0.167 NA   NA
 6217104 6217105 PSPTOT1_1698 PSPTOT1_1699     FALSE 0.057 121.000 0.000 NA   NA
 6217105 6217106 PSPTOT1_1699 PSPTOT1_1700     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA N NA
 6217106 6217107 PSPTOT1_1700 PSPTOT1_1701   betA FALSE 0.055 164.000 0.000 1.000 N NA
 6217107 6217108 PSPTOT1_1701 PSPTOT1_1702 betA betB TRUE 0.787 141.000 0.634 1.000 N NA
 6217108 6217109 PSPTOT1_1702 PSPTOT1_1703 betB betI TRUE 0.762 106.000 0.459 1.000 N NA
 6217109 6217110 PSPTOT1_1703 PSPTOT1_1704 betI   FALSE 0.006 336.000 0.000 1.000   NA
 6217110 6217111 PSPTOT1_1704 PSPTOT1_1705     TRUE 0.995 -7.000 0.904 NA   NA
 6217112 6217113 PSPTOT1_1706 PSPTOT1_1707 folA   FALSE 0.022 191.000 0.000 NA   NA
 6217114 6217115 PSPTOT1_1708 PSPTOT1_1709   thiG TRUE 0.898 11.000 0.060 1.000   NA
 6217115 6217116 PSPTOT1_1709 PSPTOT1_1710 thiG thiS TRUE 0.864 52.000 0.130 1.000 Y NA
 6217116 6217117 PSPTOT1_1710 PSPTOT1_1711 thiS   FALSE 0.269 109.000 0.058 NA   NA
 6217119 6217120 PSPTOT1_1713 PSPTOT1_1714 rpoH ftsX FALSE 0.245 119.000 0.054 NA N NA
 6217120 6217121 PSPTOT1_1714 PSPTOT1_1715 ftsX ftsE TRUE 0.979 -3.000 0.035 NA Y NA
 6217121 6217122 PSPTOT1_1715 PSPTOT1_1716 ftsE ftsY TRUE 0.972 -3.000 0.117 1.000 N NA
 6217123 6217124 PSPTOT1_1717 PSPTOT1_1718     TRUE 0.997 -3.000 0.598 0.005   NA
 6217124 6217125 PSPTOT1_1718 PSPTOT1_1719     TRUE 0.965 0.000 0.070 1.000   NA
 6217125 6217126 PSPTOT1_1719 PSPTOT1_1720     FALSE 0.008 264.000 0.000 NA   NA
 6217126 6217127 PSPTOT1_1720 PSPTOT1_1721     TRUE 0.957 13.000 0.286 NA   NA
 6217127 6217128 PSPTOT1_1721 PSPTOT1_1722     FALSE 0.050 135.000 0.000 NA   NA
 6217129 6217130 PSPTOT1_1723 PSPTOT1_1724     FALSE 0.338 54.000 0.008 1.000 N NA
 6217131 6217132 PSPTOT1_1725 PSPTOT1_1726     FALSE 0.079 168.000 0.005 1.000 N NA
 6217132 6217133 PSPTOT1_1726 PSPTOT1_1727     FALSE 0.413 91.000 0.088 NA   NA
 6217134 6217135 PSPTOT1_1728 PSPTOT1_1729   mutM FALSE 0.166 90.000 0.012 NA   NA
 6217135 6217136 PSPTOT1_1729 PSPTOT1_1730 mutM   FALSE 0.349 46.000 0.015 NA N NA
 6217139 6217140 PSPTOT1_1733 PSPTOT1_1734     FALSE 0.056 124.000 0.000 NA   NA
 6217140 6217141 PSPTOT1_1734 PSPTOT1_1735     TRUE 0.985 0.000 0.233 NA   NA
 6217141 6217142 PSPTOT1_1735 PSPTOT1_1736     TRUE 0.858 34.000 0.235 NA   NA
 6217142 6217143 PSPTOT1_1736 PSPTOT1_1737     FALSE 0.015 249.000 0.000 1.000   NA
 6217143 6217144 PSPTOT1_1737 PSPTOT1_1738   msrA FALSE 0.163 151.000 0.032 1.000 N NA
 6217146 6217147 PSPTOT1_1740 PSPTOT1_1741     FALSE 0.054 129.000 0.000 NA   NA
 6217149 6217150 PSPTOT1_1743 PSPTOT1_1744     FALSE 0.029 203.000 0.000 1.000 N NA
 6217151 6217152 PSPTOT1_1745 PSPTOT1_1746 etfB-1   TRUE 0.996 -10.000 0.776 NA Y NA
 6217152 6217153 PSPTOT1_1746 PSPTOT1_1747     TRUE 0.998 0.000 0.667 NA Y NA
 6217153 6217154 PSPTOT1_1747 PSPTOT1_1748     TRUE 0.928 130.000 0.574 0.036 Y NA
 6217154 6217155 PSPTOT1_1748 PSPTOT1_1749     TRUE 0.990 16.000 0.912 1.000   NA
 6217155 6217156 PSPTOT1_1749 PSPTOT1_1750     TRUE 0.934 84.000 0.868 1.000   NA
 6217157 6217158 PSPTOT1_1751 PSPTOT1_1752     FALSE 0.473 56.000 0.049 NA   NA
 6217159 6217160 PSPTOT1_1753 PSPTOT1_1754 fba   FALSE 0.322 114.000 0.084 NA   NA
 6217160 6217161 PSPTOT1_1754 PSPTOT1_1755     TRUE 0.804 87.000 0.455 NA   NA
 6217161 6217162 PSPTOT1_1755 PSPTOT1_1756   pgk FALSE 0.419 28.000 0.004 NA   NA
 6217162 6217163 PSPTOT1_1756 PSPTOT1_1757 pgk epd TRUE 0.953 23.000 0.070 0.003 Y NA
 6217163 6217164 PSPTOT1_1757 PSPTOT1_1758 epd tkt TRUE 0.745 144.000 0.285 1.000 Y NA
 6217165 6217166 PSPTOT1_1759 PSPTOT1_1760   metK TRUE 0.721 21.000 0.036 1.000 N NA
 6217166 6217167 PSPTOT1_1760 PSPTOT1_1761 metK   FALSE 0.033 223.000 0.004 1.000 N NA
 6217167 6217168 PSPTOT1_1761 PSPTOT1_1762     TRUE 0.652 41.000 0.079 NA   NA
 6217169 6217170 PSPTOT1_1763 PSPTOT1_1764     FALSE 0.058 115.000 0.000 NA   NA
 6217170 6217171 PSPTOT1_1764 PSPTOT1_1765     TRUE 0.984 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 6217172 6217173 PSPTOT1_1766 PSPTOT1_1767     TRUE 0.921 68.000 0.368 1.000 Y NA
 6217173 6217174 PSPTOT1_1767 PSPTOT1_1768     TRUE 0.950 25.000 0.421 1.000 N NA
 6217174 6217175 PSPTOT1_1768 PSPTOT1_1769     FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 6217179 6217180 PSPTOT1_4456 PSPTOT1_4457     TRUE 0.585 33.000 0.040 NA   NA
 6217180 6217181 PSPTOT1_4457 PSPTOT1_4458     TRUE 0.932 -3.000 0.040 NA   NA
 6217184 6217185 PSPTOT1_4461 PSPTOT1_4462     FALSE 0.094 136.000 0.009 NA   NA
 6217185 6217186 PSPTOT1_4462 PSPTOT1_4463     FALSE 0.140 129.000 0.011 1.000   NA
 6217186 6217187 PSPTOT1_4463 PSPTOT1_4464     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217187 6217188 PSPTOT1_4464 PSPTOT1_4465   aceF FALSE 0.078 94.000 0.000 NA   NA
 6217188 6217189 PSPTOT1_4465 PSPTOT1_4466 aceF aceE-2 TRUE 0.643 143.000 0.167 1.000 Y NA
 6217190 6217191 PSPTOT1_4467 PSPTOT1_4468 glnE rfaF FALSE 0.146 130.000 0.014 1.000 N NA
 6217191 6217192 PSPTOT1_4468 PSPTOT1_4469 rfaF waaC TRUE 0.996 3.000 0.205 0.001 Y NA
 6217192 6217193 PSPTOT1_4469 PSPTOT1_4470 waaC waaG TRUE 0.994 0.000 0.217 1.000 Y NA
 6217193 6217194 PSPTOT1_4470 PSPTOT1_4471 waaG waaP TRUE 0.987 0.000 0.241 1.000   NA
 6217194 6217195 PSPTOT1_4471 PSPTOT1_4472 waaP   TRUE 0.989 0.000 0.133 0.002   NA
 6217195 6217196 PSPTOT1_4472 PSPTOT1_4473     TRUE 0.988 -3.000 0.133 0.002   NA
 6217196 6217197 PSPTOT1_4473 PSPTOT1_4474     TRUE 0.881 31.000 0.095 0.002   NA
 6217199 6217200 PSPTOT1_4476 PSPTOT1_4477     TRUE 0.981 -16.000 0.409 0.016 N NA
 6217200 6217201 PSPTOT1_4477 PSPTOT1_4478     TRUE 0.989 0.000 0.312 NA   NA
 6217201 6217202 PSPTOT1_4478 PSPTOT1_4479     TRUE 0.978 -30.000 0.625 NA   NA
 6217202 6217203 PSPTOT1_4479 PSPTOT1_4480     TRUE 0.809 31.000 0.154 NA   NA
 6217203 6217204 PSPTOT1_4480 PSPTOT1_4481     FALSE 0.236 35.000 0.000 NA   NA
 6217204 6217205 PSPTOT1_4481 PSPTOT1_4482     TRUE 0.517 -10.000 0.000 NA   NA
 6217207 6217208 PSPTOT1_4484 PSPTOT1_4485 msbA   FALSE 0.179 125.000 0.023 1.000 N NA
 6217209 6217210 PSPTOT1_4486 PSPTOT1_4487     TRUE 0.897 37.000 0.324 1.000   NA
 6217210 6217211 PSPTOT1_4487 PSPTOT1_4488     TRUE 0.997 -3.000 0.441 1.000 Y NA
 6217211 6217212 PSPTOT1_4488 PSPTOT1_4489     TRUE 0.892 49.000 0.400 1.000 N NA
 6217215 6217216 PSPTOT1_4492 PSPTOT1_4493 thiC   FALSE 0.131 127.000 0.007 1.000 N NA
 6217218 6217219 PSPTOT1_4495 PSPTOT1_4496     TRUE 0.979 -9.000 0.443 NA   NA
 6217219 6217220 PSPTOT1_4496 PSPTOT1_4497     FALSE 0.011 241.000 0.000 NA   NA
 6217220 6217221 PSPTOT1_4497 PSPTOT1_4498     TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA   NA
 6217221 6217222 PSPTOT1_4498 PSPTOT1_4499     FALSE 0.022 192.000 0.000 NA   NA
 6217222 6217223 PSPTOT1_4499 PSPTOT1_4500     FALSE 0.056 124.000 0.000 NA   NA
 6217223 6217224 PSPTOT1_4500 PSPTOT1_4501     FALSE 0.087 88.000 0.000 NA   NA
 6217224 6217225 PSPTOT1_4501 PSPTOT1_4502   parE FALSE 0.084 90.000 0.000 NA   NA
 6217225 6217226 PSPTOT1_4502 PSPTOT1_4503 parE   TRUE 0.780 0.000 0.000 NA   NA
 6217226 6217227 PSPTOT1_4503 PSPTOT1_4504     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217227 6217228 PSPTOT1_4504 PSPTOT1_4505   parC TRUE 0.802 11.000 0.016 1.000   NA
 6217228 6217229 PSPTOT1_4505 PSPTOT1_4506 parC   FALSE 0.053 184.000 0.012 NA   NA
 6217232 6217233 PSPTOT1_4509 PSPTOT1_4510     FALSE 0.009 252.000 0.000 NA   NA
 6217233 6217234 PSPTOT1_4510 PSPTOT1_4511     TRUE 0.734 46.000 0.156 NA   NA
 6217235 6217236 PSPTOT1_4512 PSPTOT1_4513 motA-2 motB TRUE 0.998 4.000 0.722 1.000 Y NA
 6217238 6217239 PSPTOT1_4515 PSPTOT1_4516 orn   FALSE 0.153 97.000 0.013 NA   NA
 6217241 6217242 PSPTOT1_4518 PSPTOT1_4519     TRUE 0.784 30.000 0.118 NA   NA
 6217242 6217243 PSPTOT1_4519 PSPTOT1_4520     FALSE 0.402 57.000 0.033 NA   NA
 6217243 6217244 PSPTOT1_4520 PSPTOT1_4521   mutL TRUE 0.938 0.000 0.030 1.000 N NA
 6217244 6217245 PSPTOT1_4521 PSPTOT1_4522 mutL miaA TRUE 0.981 1.000 0.188 1.000 N NA
 6217245 6217246 PSPTOT1_4522 PSPTOT1_4523 miaA hfq TRUE 0.835 93.000 0.531 1.000   NA
 6217246 6217247 PSPTOT1_4523 PSPTOT1_4524 hfq hflX TRUE 0.923 13.000 0.141 1.000   NA
 6217247 6217248 PSPTOT1_4524 PSPTOT1_4525 hflX hflK TRUE 0.563 97.000 0.184 1.000   NA
 6217248 6217249 PSPTOT1_4525 PSPTOT1_4526 hflK hflC TRUE 0.999 0.000 0.947 0.008 Y NA
 6217249 6217250 PSPTOT1_4526 PSPTOT1_4527 hflC   FALSE 0.038 269.000 0.045 1.000 N NA
 6217250 6217251 PSPTOT1_4527 PSPTOT1_4528   purA TRUE 0.723 55.000 0.161 1.000 N NA
 6217251 6217252 PSPTOT1_4528 PSPTOT1_4529 purA   FALSE 0.073 173.000 0.007 1.000 N NA
 6217253 6217254 PSPTOT1_6058 PSPTOT1_6057     FALSE 0.037 161.000 0.000 NA   NA
 6217255 6217256 PSPTOT1_4530 PSPTOT1_4531 vacB   TRUE 0.987 -3.000 0.147 0.012 N NA
 6217256 6217257 PSPTOT1_4531 PSPTOT1_4532     FALSE 0.167 216.000 0.017 1.000 Y NA
 6217257 6217258 PSPTOT1_4532 PSPTOT1_4533   rpsR TRUE 0.978 29.000 0.319 0.010 Y NA
 6217258 6217259 PSPTOT1_4533 PSPTOT1_4534 rpsR   TRUE 0.505 40.000 0.034 NA   NA
 6217259 6217260 PSPTOT1_4534 PSPTOT1_4535   rplI TRUE 0.676 20.000 0.034 NA   NA
 6217260 6217261 PSPTOT1_4535 PSPTOT1_4536 rplI dnaB FALSE 0.329 124.000 0.074 1.000 N NA
 6217261 6217262 PSPTOT1_4536 PSPTOT1_4537 dnaB   FALSE 0.142 121.000 0.009 1.000 N NA
 6217264 6217265 PSPTOT1_4539 PSPTOT1_4540     TRUE 0.879 88.000 0.667 NA   NA
 6217265 6217266 PSPTOT1_4540 PSPTOT1_4541     TRUE 0.997 0.000 0.734 NA   NA
 6217266 6217267 PSPTOT1_4541 PSPTOT1_4542   azu FALSE 0.080 157.000 0.012 NA N NA
 6217268 6217269 PSPTOT1_4543 PSPTOT1_4544 nadE pncB TRUE 0.872 27.000 0.033 1.000 Y NA
 6217269 6217270 PSPTOT1_4544 PSPTOT1_4545 pncB   FALSE 0.162 100.000 0.007 1.000 N NA
 6217271 6217272 PSPTOT1_4546 PSPTOT1_4547   braD TRUE 0.595 163.000 0.175 1.000 Y NA
 6217272 6217273 PSPTOT1_4547 PSPTOT1_4548 braD braE TRUE 0.996 3.000 0.263 0.067 Y NA
 6217273 6217274 PSPTOT1_4548 PSPTOT1_4549 braE   TRUE 0.995 -3.000 0.268 1.000 Y NA
 6217274 6217275 PSPTOT1_4549 PSPTOT1_4550     TRUE 0.999 -3.000 0.881 0.023 Y NA
 6217275 6217276 PSPTOT1_4550 PSPTOT1_4551     FALSE 0.003 356.000 0.000 NA   NA
 6217276 6217277 PSPTOT1_4551 PSPTOT1_4552     FALSE 0.112 73.000 0.000 NA   NA
 6217278 6217279 PSPTOT1_4553 PSPTOT1_4554     FALSE 0.152 204.000 0.118 NA N NA
 6217279 6217280 PSPTOT1_4554 PSPTOT1_4555   ureG-2 TRUE 0.900 25.000 0.068 NA Y NA
 6217280 6217281 PSPTOT1_4555 PSPTOT1_4556 ureG-2 ureF-2 TRUE 0.992 21.000 0.550 0.003 Y NA
 6217281 6217282 PSPTOT1_4556 PSPTOT1_4557 ureF-2 ureE TRUE 0.999 -3.000 0.560 0.003 Y NA
 6217282 6217283 PSPTOT1_4557 PSPTOT1_4558 ureE   FALSE 0.066 185.000 0.010 1.000   NA
 6217285 6217286 PSPTOT1_4560 PSPTOT1_4561     TRUE 0.699 4.000 0.000 NA   NA
 6217286 6217287 PSPTOT1_4561 PSPTOT1_4562     FALSE 0.152 57.000 0.000 NA   NA
 6217290 6217291 PSPTOT1_4565 PSPTOT1_4566     FALSE 0.077 189.000 0.031 NA   NA
 6217294 6217295 PSPTOT1_4569 PSPTOT1_4570   ureC FALSE 0.056 193.000 0.010 1.000 N NA
 6217295 6217296 PSPTOT1_4570 PSPTOT1_4571 ureC ureB TRUE 0.741 226.000 0.486 0.001 Y NA
 6217296 6217297 PSPTOT1_4571 PSPTOT1_4572 ureB ttr TRUE 0.916 -3.000 0.019 1.000   NA
 6217297 6217298 PSPTOT1_4572 PSPTOT1_4573 ttr   TRUE 0.938 11.000 0.041 0.010   NA
 6217298 6217299 PSPTOT1_4573 PSPTOT1_4574   ureA TRUE 0.844 11.000 0.029 1.000 N NA
 6217299 6217300 PSPTOT1_4574 PSPTOT1_4575 ureA ureD-2 TRUE 0.933 86.000 0.664 0.003 N NA
 6217300 6217301 PSPTOT1_4575 PSPTOT1_4576 ureD-2   TRUE 0.807 49.000 0.221 1.000 N NA
 6217301 6217302 PSPTOT1_4576 PSPTOT1_4577     TRUE 0.935 90.000 0.731 0.023   NA
 6217302 6217303 PSPTOT1_4577 PSPTOT1_4578     TRUE 0.998 -3.000 0.823 1.000   NA
 6217303 6217304 PSPTOT1_4578 PSPTOT1_4579     TRUE 0.999 0.000 0.758 0.067 Y NA
 6217304 6217305 PSPTOT1_4579 PSPTOT1_4580     TRUE 0.719 221.000 0.654 1.000 Y NA
 6217305 6217306 PSPTOT1_4580 PSPTOT1_4581     FALSE 0.009 255.000 0.000 NA   NA
 6217306 6217307 PSPTOT1_4581 PSPTOT1_4582     FALSE 0.009 252.000 0.000 NA   NA
 6217307 6217308 PSPTOT1_4582 PSPTOT1_4583     FALSE 0.094 84.000 0.000 NA   NA
 6217308 6217309 PSPTOT1_4583 PSPTOT1_4584     TRUE 0.941 14.000 0.238 NA   NA
 6217309 6217310 PSPTOT1_4584 PSPTOT1_4585     FALSE 0.003 338.000 0.000 NA   NA
 6217310 6217311 PSPTOT1_4585 PSPTOT1_4586   cbiD TRUE 0.994 -3.000 0.123 0.008 Y NA
 6217311 6217312 PSPTOT1_4586 PSPTOT1_4587 cbiD cobL TRUE 0.991 0.000 0.043 0.008 Y NA
 6217313 6217314 PSPTOT1_4588 PSPTOT1_4589   cobH TRUE 0.977 -3.000 0.149 1.000 N NA
 6217314 6217315 PSPTOT1_4589 PSPTOT1_4590 cobH cobI TRUE 0.996 0.000 0.191 0.008 Y NA
 6217315 6217316 PSPTOT1_4590 PSPTOT1_4591 cobI   TRUE 0.994 0.000 0.097 0.008 Y NA
 6217316 6217317 PSPTOT1_4591 PSPTOT1_4592     FALSE 0.041 152.000 0.000 NA   NA
 6217317 6217318 PSPTOT1_4592 PSPTOT1_4593     FALSE 0.328 23.000 0.000 NA   NA
 6217318 6217319 PSPTOT1_4593 PSPTOT1_4594     FALSE 0.147 59.000 0.000 NA   NA
 6217319 6217320 PSPTOT1_4594 PSPTOT1_4595     TRUE 0.582 -7.000 0.000 NA   NA
 6217320 6217321 PSPTOT1_4595 PSPTOT1_4596     FALSE 0.224 37.000 0.000 NA   NA
 6217322 6217323 PSPTOT1_4597 PSPTOT1_4598     FALSE 0.264 70.000 0.020 NA N NA
 6217323 6217324 PSPTOT1_4598 PSPTOT1_4599   purD FALSE 0.209 88.000 0.010 1.000 N NA
 6217324 6217325 PSPTOT1_4599 PSPTOT1_4600 purD purH TRUE 0.517 199.000 0.238 1.000 Y NA
 6217325 6217326 PSPTOT1_4600 PSPTOT1_4601 purH fis TRUE 0.518 83.000 0.101 1.000 N NA
 6217326 6217327 PSPTOT1_4601 PSPTOT1_4602 fis   TRUE 0.978 -3.000 0.161 1.000 N NA
 6217327 6217328 PSPTOT1_4602 PSPTOT1_4603     FALSE 0.008 317.000 0.005 NA   NA
 6217328 6217329 PSPTOT1_4603 PSPTOT1_4604   prmA FALSE 0.479 25.000 0.009 NA   NA
 6217329 6217330 PSPTOT1_4604 PSPTOT1_4605 prmA accC-2 FALSE 0.409 136.000 0.152 1.000 N NA
 6217330 6217331 PSPTOT1_4605 PSPTOT1_4606 accC-2 accB2 TRUE 0.985 18.000 0.275 0.002 Y NA
 6217331 6217332 PSPTOT1_4606 PSPTOT1_4607 accB2 aroQ TRUE 0.733 77.000 0.254 1.000 N NA
 6217332 6217333 PSPTOT1_4607 PSPTOT1_4608 aroQ dsbD FALSE 0.134 130.000 0.010 1.000 N NA
 6217333 6217334 PSPTOT1_4608 PSPTOT1_4609 dsbD   FALSE 0.100 81.000 0.000 NA   NA
 6217334 6217335 PSPTOT1_4609 PSPTOT1_4610     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 6217335 6217336 PSPTOT1_4610 PSPTOT1_4611     TRUE 0.974 42.000 0.620 NA Y NA
 6217336 6217337 PSPTOT1_4611 PSPTOT1_4612     TRUE 0.999 2.000 0.844 NA Y NA
 6217337 6217338 PSPTOT1_4612 PSPTOT1_4613     TRUE 0.993 19.000 0.822 NA Y NA
 6217338 6217339 PSPTOT1_4613 PSPTOT1_4614     TRUE 0.999 0.000 0.732 NA Y NA
 6217339 6217340 PSPTOT1_4614 PSPTOT1_4615     TRUE 0.998 -3.000 0.696 NA Y NA
 6217340 6217341 PSPTOT1_4615 PSPTOT1_4616     TRUE 0.961 21.000 0.234 NA Y NA
 6217342 6217343 PSPTOT1_4617 PSPTOT1_4618     TRUE 0.952 41.000 0.667 NA N NA
 6217348 6217349 PSPTOT1_4623 PSPTOT1_4625   speA FALSE 0.007 275.000 0.000 NA   NA
 6217349 6217350 PSPTOT1_4625 PSPTOT1_4626 speA   FALSE 0.257 89.000 0.023 1.000 N NA
 6217350 6217351 PSPTOT1_4626 PSPTOT1_4627     FALSE 0.115 159.000 0.017 1.000 N NA
 6217351 6217352 PSPTOT1_4627 PSPTOT1_4628     TRUE 0.969 0.000 0.101 NA   NA
 6217354 6217355 PSPTOT1_4630 PSPTOT1_4631     FALSE 0.304 146.000 0.091 1.000   NA
 6217356 6217357 PSPTOT1_4632 PSPTOT1_4633     FALSE 0.147 59.000 0.000 NA   NA
 6217358 6217359 PSPTOT1_4634 PSPTOT1_4635     FALSE 0.043 148.000 0.000 NA   NA
 6217359 6217360 PSPTOT1_4635 PSPTOT1_4636     TRUE 0.887 4.000 0.019 1.000   NA
 6217361 6217362 PSPTOT1_4637 PSPTOT1_4638 proA nadD TRUE 0.926 14.000 0.170 1.000 N NA
 6217362 6217363 PSPTOT1_4638 PSPTOT1_4639 nadD   TRUE 0.678 76.000 0.221 NA   NA
 6217363 6217364 PSPTOT1_4639 PSPTOT1_4640     TRUE 0.974 10.000 0.307 NA   NA
 6217364 6217365 PSPTOT1_4640 PSPTOT1_4641     FALSE 0.411 30.000 0.007 NA   NA
 6217365 6217366 PSPTOT1_4641 PSPTOT1_4642   rodA FALSE 0.473 32.000 0.008 1.000 N NA
 6217366 6217367 PSPTOT1_4642 PSPTOT1_4643 rodA mltB TRUE 0.835 18.000 0.096 NA N NA
 6217367 6217368 PSPTOT1_4643 PSPTOT1_4644 mltB   TRUE 0.995 0.000 0.298 NA Y NA
 6217368 6217369 PSPTOT1_4644 PSPTOT1_4645     FALSE 0.337 242.000 0.241 NA Y NA
 6217369 6217370 PSPTOT1_4645 PSPTOT1_4646     FALSE 0.385 91.000 0.074 NA   NA
 6217370 6217371 PSPTOT1_4646 PSPTOT1_4647   lipB TRUE 0.984 0.000 0.219 NA   NA
 6217371 6217372 PSPTOT1_4647 PSPTOT1_4648 lipB lipA TRUE 0.995 -7.000 0.319 0.000 Y NA
 6217373 6217374 PSPTOT1_4935 PSPTOT1_4936     FALSE 0.019 323.000 0.000 0.048   NA
 6217374 6217375 PSPTOT1_4936 PSPTOT1_4937     FALSE 0.131 65.000 0.000 NA   NA
 6217375 6217376 PSPTOT1_4937 PSPTOT1_4938     FALSE 0.058 118.000 0.000 NA   NA
 6217376 6217377 PSPTOT1_4938 PSPTOT1_4939     TRUE 0.780 0.000 0.000 NA   NA
 6217377 6217378 PSPTOT1_4939 PSPTOT1_4940     FALSE 0.085 89.000 0.000 NA   NA
 6217378 6217379 PSPTOT1_4940 PSPTOT1_4941     FALSE 0.300 27.000 0.000 NA   NA
 6217383 6217384 PSPTOT1_4945 PSPTOT1_4946     FALSE 0.410 16.000 0.000 NA   NA
 6217384 6217385 PSPTOT1_4946 PSPTOT1_4947     FALSE 0.004 318.000 0.000 NA   NA
 6217385 6217386 PSPTOT1_4947 PSPTOT1_4948     FALSE 0.262 31.000 0.000 NA   NA
 6217386 6217387 PSPTOT1_4948 PSPTOT1_4949     FALSE 0.055 128.000 0.000 NA   NA
 6217387 6217388 PSPTOT1_4949 PSPTOT1_4950     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217390 6217391 PSPTOT1_4952 PSPTOT1_4953     FALSE 0.224 37.000 0.000 NA   NA
 6217391 6217392 PSPTOT1_4953 PSPTOT1_4954     TRUE 0.944 -19.000 0.130 0.011   NA
 6217392 6217393 PSPTOT1_4954 PSPTOT1_4955     FALSE 0.119 94.000 0.000 1.000   NA
 6217396 6217397 PSPTOT1_4958 PSPTOT1_4959     FALSE 0.113 147.000 0.010 1.000 N NA
 6217400 6217401 PSPTOT1_4962 PSPTOT1_4963     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217401 6217402 PSPTOT1_4963 PSPTOT1_4964   nasT TRUE 0.929 15.000 0.218 NA N NA
 6217404 6217405 PSPTOT1_4966 PSPTOT1_4967     FALSE 0.002 498.000 0.000 NA   NA
 6217405 6217406 PSPTOT1_4967 PSPTOT1_4968     TRUE 0.785 80.000 0.337 1.000 N NA
 6217406 6217407 PSPTOT1_4968 PSPTOT1_6060     TRUE 0.730 3.000 0.000 NA   NA
 6217407 6217408 PSPTOT1_6060 PSPTOT1_4969     FALSE 0.157 55.000 0.000 NA   NA
 6217408 6217409 PSPTOT1_4969 PSPTOT1_4970     TRUE 0.961 -3.000 0.069 1.000   NA
 6217409 6217410 PSPTOT1_4970 PSPTOT1_4971   cobA TRUE 0.881 11.000 0.048 1.000 N NA
 6217411 6217412 PSPTOT1_4972 PSPTOT1_4973 oprF   TRUE 0.630 107.000 0.280 1.000 N NA
 6217412 6217413 PSPTOT1_4973 PSPTOT1_4974     TRUE 0.710 83.000 0.279 NA   NA
 6217413 6217414 PSPTOT1_4974 PSPTOT1_4975   crfX TRUE 0.983 3.000 0.256 NA   NA
 6217414 6217415 PSPTOT1_4975 PSPTOT1_4976 crfX cmaX FALSE 0.450 86.000 0.093 NA   NA
 6217415 6217416 PSPTOT1_4976 PSPTOT1_4977 cmaX   TRUE 0.899 12.000 0.093 NA N NA
 6217416 6217417 PSPTOT1_4977 PSPTOT1_4978     FALSE 0.464 89.000 0.113 NA N NA
 6217417 6217418 PSPTOT1_4978 PSPTOT1_4979   ppsA FALSE 0.068 194.000 0.029 NA N NA
 6217420 6217421 PSPTOT1_4981 PSPTOT1_4982     TRUE 0.848 121.000 0.733 NA   NA
 6217421 6217422 PSPTOT1_4982 PSPTOT1_4983   prpC TRUE 0.887 75.000 0.289 1.000 Y NA
 6217424 6217425 PSPTOT1_4985 PSPTOT1_4986 prpB   TRUE 0.964 -3.000 0.080 1.000 N NA
 6217426 6217427 PSPTOT1_4987 PSPTOT1_4988     TRUE 0.958 5.000 0.141 NA   NA
 6217427 6217428 PSPTOT1_4988 PSPTOT1_4989     TRUE 0.998 -3.000 0.923 NA   NA
 6217428 6217429 PSPTOT1_4989 PSPTOT1_4990   pabB TRUE 0.615 90.000 0.042 1.000 Y NA
 6217432 6217433 PSPTOT1_4993 PSPTOT1_4994 cysB   FALSE 0.243 166.000 0.085 1.000 N NA
 6217433 6217434 PSPTOT1_4994 PSPTOT1_4995     FALSE 0.445 79.000 0.061 1.000   NA
 6217434 6217435 PSPTOT1_4995 PSPTOT1_4996   panE-1 TRUE 0.942 4.000 0.061 1.000   NA
 6217439 6217440 PSPTOT1_5000 PSPTOT1_5001     TRUE 0.833 109.000 0.667 NA   NA
 6217440 6217441 PSPTOT1_5001 PSPTOT1_5002     FALSE 0.390 57.000 0.031 NA   NA
 6217442 6217443 PSPTOT1_5003 PSPTOT1_5004     FALSE 0.053 1167.000 0.535 NA   NA
 6217444 6217445 PSPTOT1_5005 PSPTOT1_5006 greB-1   FALSE 0.182 47.000 0.000 NA   NA
 6217445 6217446 PSPTOT1_5006 PSPTOT1_5007     FALSE 0.097 83.000 0.000 NA   NA
 6217446 6217447 PSPTOT1_5007 PSPTOT1_5008     FALSE 0.328 23.000 0.000 NA   NA
 6217449 6217450 PSPTOT1_5010 PSPTOT1_5011     TRUE 0.976 -3.000 0.167 NA   NA
 6217450 6217451 PSPTOT1_5011 PSPTOT1_5012     TRUE 0.814 22.000 0.100 NA   NA
 6217451 6217452 PSPTOT1_5012 PSPTOT1_5013     FALSE 0.005 305.000 0.000 NA   NA
 6217452 6217453 PSPTOT1_5013 PSPTOT1_5014     FALSE 0.008 259.000 0.000 NA   NA
 6217453 6217454 PSPTOT1_5014 PSPTOT1_5015     TRUE 0.730 107.000 0.444 NA   NA
 6217455 6217456 PSPTOT1_5016 PSPTOT1_5017     FALSE 0.446 85.000 0.089 NA N NA
 6217456 6217457 PSPTOT1_5017 PSPTOT1_5018     FALSE 0.058 120.000 0.000 NA   NA
 6217458 6217459 PSPTOT1_5019 PSPTOT1_5020     FALSE 0.277 158.000 0.116 NA   NA
 6217459 6217460 PSPTOT1_5020 PSPTOT1_5021     TRUE 0.581 25.000 0.025 NA   NA
 6217460 6217461 PSPTOT1_5021 PSPTOT1_5022     TRUE 0.997 -3.000 0.727 NA   NA
 6217461 6217462 PSPTOT1_5022 PSPTOT1_5023     TRUE 0.984 -30.000 0.739 NA   NA
 6217462 6217463 PSPTOT1_5023 PSPTOT1_5024     FALSE 0.021 197.000 0.000 NA   NA
 6217463 6217464 PSPTOT1_5024 PSPTOT1_5025   kdpE FALSE 0.062 107.000 0.000 NA   NA
 6217464 6217465 PSPTOT1_5025 PSPTOT1_5026 kdpE kdpD TRUE 0.998 -3.000 0.621 1.000 Y NA
 6217465 6217466 PSPTOT1_5026 PSPTOT1_5027 kdpD   FALSE 0.392 55.000 0.020 1.000 N NA
 6217466 6217467 PSPTOT1_5027 PSPTOT1_5028   kdpB TRUE 0.998 13.000 0.877 0.001 Y NA
 6217467 6217468 PSPTOT1_5028 PSPTOT1_5029 kdpB kdpA TRUE 0.982 11.000 0.059 0.001 Y NA
 6217470 6217471 PSPTOT1_5031 PSPTOT1_5032     FALSE 0.082 91.000 0.000 NA   NA
 6217471 6217472 PSPTOT1_5032 PSPTOT1_5033     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217472 6217473 PSPTOT1_5033 PSPTOT1_5034     FALSE 0.215 39.000 0.000 NA   NA
 6217473 6217474 PSPTOT1_5034 PSPTOT1_5035     FALSE 0.157 55.000 0.000 NA   NA
 6217474 6217475 PSPTOT1_5035 PSPTOT1_5036     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217475 6217476 PSPTOT1_5036 PSPTOT1_5037     FALSE 0.058 120.000 0.000 NA   NA
 6217477 6217478 PSPTOT1_5038 PSPTOT1_5039   fimA FALSE 0.003 369.000 0.000 NA   NA
 6217478 6217479 PSPTOT1_5039 PSPTOT1_5040 fimA papD TRUE 0.960 108.000 1.000 1.000 Y NA
 6217479 6217480 PSPTOT1_5040 PSPTOT1_5041 papD fimD TRUE 0.990 40.000 1.000 1.000 Y NA
 6217480 6217481 PSPTOT1_5041 PSPTOT1_5042 fimD   TRUE 0.865 47.000 0.111 1.000 Y NA
 6217482 6217483 PSPTOT1_5043 PSPTOT1_5044     FALSE 0.049 136.000 0.000 NA   NA
 6217483 6217484 PSPTOT1_5044 PSPTOT1_5045     FALSE 0.005 297.000 0.000 NA   NA
 6217485 6217486 PSPTOT1_5046 PSPTOT1_5047     TRUE 0.998 -3.000 0.533 1.000 Y NA
 6217487 6217488 PSPTOT1_5048 PSPTOT1_5049     TRUE 0.797 92.000 0.478 NA   NA
 6217488 6217489 PSPTOT1_5049 PSPTOT1_5050     FALSE 0.084 251.000 0.118 NA   NA
 6217489 6217490 PSPTOT1_5050 PSPTOT1_5051     TRUE 0.964 -3.000 0.096 NA   NA
 6217490 6217491 PSPTOT1_5051 PSPTOT1_5052     FALSE 0.348 120.000 0.101 NA   NA
 6217491 6217492 PSPTOT1_5052 PSPTOT1_5053   sixA FALSE 0.393 68.000 0.045 NA N NA
 6217492 6217493 PSPTOT1_5053 PSPTOT1_5054 sixA   TRUE 0.968 -3.000 0.114 NA   NA
 6217493 6217494 PSPTOT1_5054 PSPTOT1_5055   gpsA TRUE 0.855 40.000 0.273 NA   NA
 6217497 6217498 PSPTOT1_5058 PSPTOT1_5059 fabA fabB TRUE 0.993 11.000 0.451 1.000 Y NA
 6217499 6217500 PSPTOT1_5060 PSPTOT1_5061   htpG FALSE 0.192 91.000 0.008 1.000 N NA
 6217502 6217503 PSPTOT1_5063 PSPTOT1_5064 brnQ   FALSE 0.210 40.000 0.000 NA   NA
 6217505 6217506 PSPTOT1_5066 PSPTOT1_5067 sucD sucC TRUE 0.999 0.000 0.806 0.000 Y NA
 6217506 6217507 PSPTOT1_5067 PSPTOT1_5068 sucC lpdA FALSE 0.274 209.000 0.069 1.000 Y NA
 6217507 6217508 PSPTOT1_5068 PSPTOT1_5069 lpdA sucB TRUE 0.636 173.000 0.253 1.000 Y NA
 6217508 6217509 PSPTOT1_5069 PSPTOT1_5070 sucB sucA TRUE 0.979 42.000 0.667 1.000 Y NA
 6217509 6217510 PSPTOT1_5070 PSPTOT1_5071 sucA sdhB FALSE 0.151 260.000 0.067 1.000 Y NA
 6217510 6217511 PSPTOT1_5071 PSPTOT1_5072 sdhB sdhA TRUE 0.996 13.000 0.604 0.001 Y NA
 6217511 6217512 PSPTOT1_5072 PSPTOT1_5073 sdhA sdhD TRUE 0.999 4.000 0.705 0.001 Y NA
 6217512 6217513 PSPTOT1_5073 PSPTOT1_5074 sdhD sdhC TRUE 0.997 -6.000 0.453 0.000 Y NA
 6217515 6217516 PSPTOT1_5076 PSPTOT1_5077     FALSE 0.421 58.000 0.037 NA   NA
 6217516 6217517 PSPTOT1_5077 PSPTOT1_5078     FALSE 0.202 95.000 0.025 NA   NA
 6217517 6217518 PSPTOT1_5078 PSPTOT1_5079     TRUE 0.897 35.000 0.333 NA   NA
 6217518 6217519 PSPTOT1_5079 PSPTOT1_5080     FALSE 0.298 218.000 0.308 1.000 N NA
 6217519 6217520 PSPTOT1_5080 PSPTOT1_5081     TRUE 0.983 -3.000 0.231 NA   NA
 6217520 6217521 PSPTOT1_5081 PSPTOT1_5082     TRUE 0.966 11.000 0.273 NA   NA
 6217521 6217522 PSPTOT1_5082 PSPTOT1_5083   etfA-2 TRUE 0.491 121.000 0.182 1.000 N NA
 6217522 6217523 PSPTOT1_5083 PSPTOT1_5084 etfA-2 etfB TRUE 0.993 1.000 0.100 0.009 Y NA
 6217527 6217528 PSPTOT1_5088 PSPTOT1_5089     FALSE 0.454 82.000 0.069 1.000 N NA
 6217528 6217529 PSPTOT1_5089 PSPTOT1_5090     FALSE 0.454 96.000 0.103 1.000 N NA
 6217529 6217530 PSPTOT1_5090 PSPTOT1_5091   eda-2 TRUE 0.712 61.000 0.084 0.066 N NA
 6217530 6217531 PSPTOT1_5091 PSPTOT1_5092 eda-2 dgoK TRUE 0.984 2.000 0.060 1.000 Y NA
 6217531 6217532 PSPTOT1_5092 PSPTOT1_5093 dgoK asd-1 FALSE 0.054 166.000 0.000 1.000 N NA
 6217532 6217533 PSPTOT1_5093 PSPTOT1_5094 asd-1 leuB TRUE 0.900 71.000 0.196 0.033 Y NA
 6217533 6217534 PSPTOT1_5094 PSPTOT1_5095 leuB leuD TRUE 0.762 147.000 0.159 0.001 Y NA
 6217534 6217535 PSPTOT1_5095 PSPTOT1_5096 leuD leuC TRUE 0.999 -3.000 0.463 0.000 Y NA
 6217536 6217537 PSPTOT1_5097 PSPTOT1_5098     TRUE 0.747 69.000 0.163 0.098 N NA
 6217538 6217539 PSPTOT1_5099 PSPTOT1_5100     FALSE 0.132 131.000 0.021 NA N NA
 6217539 6217540 PSPTOT1_5100 PSPTOT1_5101     TRUE 0.621 29.000 0.029 1.000   NA
 6217541 6217542 PSPTOT1_0606 PSPTOT1_0607     TRUE 0.997 -3.000 0.750 NA   NA
 6217542 6217543 PSPTOT1_0607 PSPTOT1_0608     TRUE 0.996 4.000 0.750 NA   NA
 6217543 6217544 PSPTOT1_0608 PSPTOT1_0609     TRUE 0.959 43.000 0.750 NA   NA
 6217544 6217545 PSPTOT1_0609 PSPTOT1_0610     TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 6217545 6217546 PSPTOT1_0610 PSPTOT1_0611     TRUE 0.985 -7.000 0.500 NA   NA
 6217546 6217547 PSPTOT1_0611 PSPTOT1_0612     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 6217547 6217548 PSPTOT1_0612 PSPTOT1_0613     TRUE 0.967 3.000 0.136 NA   NA
 6217548 6217549 PSPTOT1_0613 PSPTOT1_0614     TRUE 0.844 86.000 0.545 NA   NA
 6217549 6217550 PSPTOT1_0614 PSPTOT1_0615   clpP-1 TRUE 0.995 -3.000 0.588 NA   NA
 6217550 6217551 PSPTOT1_0615 PSPTOT1_0616 clpP-1   TRUE 0.997 -3.000 0.706 1.000   NA
 6217551 6217552 PSPTOT1_0616 PSPTOT1_0617     TRUE 0.984 -3.000 0.235 NA   NA
 6217552 6217553 PSPTOT1_0617 PSPTOT1_0618     TRUE 0.985 2.000 0.273 NA   NA
 6217553 6217554 PSPTOT1_0618 PSPTOT1_0619     TRUE 0.989 5.000 0.455 NA   NA
 6217554 6217555 PSPTOT1_0619 PSPTOT1_0620     FALSE 0.003 375.000 0.000 NA   NA
 6217555 6217556 PSPTOT1_0620 PSPTOT1_0621     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217556 6217557 PSPTOT1_0621 PSPTOT1_0622     FALSE 0.002 527.000 0.000 NA   NA
 6217557 6217558 PSPTOT1_0622 PSPTOT1_0623     TRUE 0.991 -7.000 0.667 NA   NA
 6217558 6217559 PSPTOT1_0623 PSPTOT1_0624     TRUE 0.517 -10.000 0.000 NA   NA
 6217559 6217560 PSPTOT1_0624 PSPTOT1_0625     TRUE 0.582 -7.000 0.000 NA   NA
 6217560 6217561 PSPTOT1_0625 PSPTOT1_0626     FALSE 0.004 311.000 0.000 NA   NA
 6217562 6217563 PSPTOT1_0627 PSPTOT1_0628     FALSE 0.009 250.000 0.000 NA   NA
 6217563 6217564 PSPTOT1_0628 PSPTOT1_0629     TRUE 0.994 9.000 0.750 NA   NA
 6217564 6217565 PSPTOT1_0629 PSPTOT1_0630     FALSE 0.225 230.000 0.286 NA   NA
 6217565 6217566 PSPTOT1_0630 PSPTOT1_0631     TRUE 0.829 51.000 0.286 NA   NA
 6217566 6217567 PSPTOT1_0631 PSPTOT1_0632     FALSE 0.001 695.000 0.000 NA   NA
 6217567 6217568 PSPTOT1_0632 PSPTOT1_0633     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217568 6217569 PSPTOT1_0633 PSPTOT1_0634     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217570 6217571 PSPTOT1_0635 PSPTOT1_0636     FALSE 0.190 45.000 0.000 NA   NA
 6217572 6217573 PSPTOT1_0637 PSPTOT1_0638   shcF FALSE 0.002 466.000 0.000 NA   NA
 6217573 6217574 PSPTOT1_0638 PSPTOT1_0639 shcF   FALSE 0.036 163.000 0.000 NA   NA
 6217575 6217576 PSPTOT1_0640 PSPTOT1_0641     FALSE 0.001 864.000 0.000 NA   NA
 6217576 6217577 PSPTOT1_0641 PSPTOT1_0642     FALSE 0.114 72.000 0.000 NA   NA
 6217577 6217578 PSPTOT1_0642 PSPTOT1_0643     FALSE 0.019 202.000 0.000 NA   NA
 6217578 6217579 PSPTOT1_0643 PSPTOT1_0644     FALSE 0.105 78.000 0.000 NA   NA
 6217579 6217580 PSPTOT1_0644 PSPTOT1_0645   hrpL FALSE 0.089 87.000 0.000 NA   NA
 6217581 6217582 PSPTOT1_0646 PSPTOT1_0647 hrpJ hrcV TRUE 0.981 0.000 0.167 1.000   NA
 6217582 6217583 PSPTOT1_0647 PSPTOT1_0648 hrcV hrpQ TRUE 0.687 34.000 0.073 NA   NA
 6217583 6217584 PSPTOT1_0648 PSPTOT1_0649 hrpQ hrcN TRUE 0.957 -3.000 0.073 NA   NA
 6217584 6217585 PSPTOT1_0649 PSPTOT1_0650 hrcN hrpO TRUE 0.982 3.000 0.250 NA   NA
 6217585 6217586 PSPTOT1_0650 PSPTOT1_0651 hrpO hrpP TRUE 0.996 7.000 1.000 NA   NA
 6217586 6217587 PSPTOT1_0651 PSPTOT1_0652 hrpP hrcQa TRUE 0.991 -3.000 0.400 NA   NA
 6217587 6217588 PSPTOT1_0652 PSPTOT1_0653 hrcQa hrcQb TRUE 0.927 -10.000 0.154 NA   NA
 6217588 6217589 PSPTOT1_0653 PSPTOT1_0654 hrcQb   TRUE 0.916 48.000 0.231 1.000 Y NA
 6217589 6217590 PSPTOT1_0654 PSPTOT1_0655   hrcS TRUE 0.995 8.000 0.318 0.009 Y NA
 6217590 6217591 PSPTOT1_0655 PSPTOT1_0656 hrcS hrcT TRUE 0.997 1.000 0.273 0.055 Y NA
 6217591 6217592 PSPTOT1_0656 PSPTOT1_0657 hrcT hrcU TRUE 0.999 -3.000 0.875 0.055 Y NA
 6217593 6217594 PSPTOT1_0658 PSPTOT1_0659 hrpV hrpT TRUE 0.998 3.000 1.000 NA   NA
 6217594 6217595 PSPTOT1_0659 PSPTOT1_0660 hrpT   TRUE 0.991 -3.000 0.375 NA   NA
 6217595 6217596 PSPTOT1_0660 PSPTOT1_0661   hrpG TRUE 0.984 2.000 0.250 NA   NA
 6217596 6217597 PSPTOT1_0661 PSPTOT1_0662 hrpG hrpF TRUE 0.962 -13.000 0.333 NA   NA
 6217597 6217598 PSPTOT1_0662 PSPTOT1_0663 hrpF hrpE TRUE 0.737 95.000 0.385 NA   NA
 6217598 6217599 PSPTOT1_0663 PSPTOT1_0664 hrpE hrpD TRUE 0.928 36.000 0.462 NA   NA
 6217599 6217600 PSPTOT1_0664 PSPTOT1_0665 hrpD hrcJ TRUE 0.995 -3.000 0.600 NA   NA
 6217600 6217601 PSPTOT1_0665 PSPTOT1_0666 hrcJ hrpB TRUE 0.983 9.000 0.222 0.009   NA
 6217601 6217602 PSPTOT1_0666 PSPTOT1_0667 hrpB   TRUE 0.740 28.000 0.074 NA   NA
 6217602 6217603 PSPTOT1_0667 PSPTOT1_0668     TRUE 0.864 56.000 0.400 NA   NA
 6217603 6217604 PSPTOT1_0668 PSPTOT1_0669   hrpS FALSE 0.078 94.000 0.000 NA   NA
 6217604 6217605 PSPTOT1_0669 PSPTOT1_0670 hrpS hrpR TRUE 0.810 46.000 0.000 0.006 Y NA
 6217605 6217606 PSPTOT1_0670 PSPTOT1_0671 hrpR hrpH FALSE 0.001 1078.000 0.000 NA   NA
 6217608 6217609 PSPTOT1_0673 PSPTOT1_0674 shcE   FALSE 0.114 72.000 0.000 NA   NA
 6217609 6217610 PSPTOT1_0674 PSPTOT1_0675   shcM TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217613 6217614 PSPTOT1_0678 PSPTOT1_0679     FALSE 0.126 67.000 0.000 NA   NA
 6217617 6217618 PSPTOT1_0682 PSPTOT1_0683 gstA   FALSE 0.211 112.000 0.039 NA   NA
 6217618 6217619 PSPTOT1_0683 PSPTOT1_0684     FALSE 0.084 90.000 0.000 NA   NA
 6217620 6217621 PSPTOT1_0685 PSPTOT1_0686     FALSE 0.200 42.000 0.000 NA   NA
 6217621 6217622 PSPTOT1_0686 PSPTOT1_0687     FALSE 0.013 225.000 0.000 NA   NA
 6217622 6217623 PSPTOT1_0687 PSPTOT1_0688     TRUE 0.889 15.000 0.107 1.000   NA
 6217623 6217624 PSPTOT1_0688 PSPTOT1_0689     TRUE 0.996 10.000 0.929 1.000   NA
 6217624 6217625 PSPTOT1_0689 PSPTOT1_0690     TRUE 0.997 -7.000 0.966 0.064   NA
 6217625 6217626 PSPTOT1_0690 PSPTOT1_0691   amiE TRUE 0.885 25.000 0.189 1.000   NA
 6217626 6217627 PSPTOT1_0691 PSPTOT1_0692 amiE   TRUE 0.969 6.000 0.184 1.000   NA
 6217627 6217628 PSPTOT1_0692 PSPTOT1_0693     TRUE 0.995 3.000 0.632 1.000   NA
 6217628 6217629 PSPTOT1_0693 PSPTOT1_0694     TRUE 0.993 -3.000 0.429 1.000   NA
 6217629 6217630 PSPTOT1_0694 PSPTOT1_0695     TRUE 0.967 0.000 0.095 NA   NA
 6217630 6217631 PSPTOT1_0695 PSPTOT1_0696     TRUE 0.974 -3.000 0.150 NA   NA
 6217631 6217632 PSPTOT1_0696 PSPTOT1_0697     FALSE 0.008 262.000 0.000 NA   NA
 6217632 6217633 PSPTOT1_0697 PSPTOT1_0698     FALSE 0.307 26.000 0.000 NA   NA
 6217633 6217634 PSPTOT1_0698 PSPTOT1_0699     TRUE 0.896 -12.000 0.085 1.000   NA
 6217634 6217635 PSPTOT1_0699 PSPTOT1_0700     FALSE 0.023 220.000 0.000 1.000   NA
 6217637 6217638 PSPTOT1_0702 PSPTOT1_0703     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217639 6217640 PSPTOT1_0704 PSPTOT1_0705 gnl   TRUE 0.644 18.000 0.025 NA   NA
 6217640 6217641 PSPTOT1_0705 PSPTOT1_0706     FALSE 0.063 106.000 0.000 NA   NA
 6217642 6217643 PSPTOT1_0707 PSPTOT1_0708     FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 6217643 6217644 PSPTOT1_0708 PSPTOT1_0709     FALSE 0.008 259.000 0.000 NA   NA
 6217644 6217645 PSPTOT1_0709 PSPTOT1_0710     FALSE 0.020 198.000 0.000 NA   NA
 6217646 6217647 PSPTOT1_0711 PSPTOT1_0712 sodC   FALSE 0.017 242.000 0.000 1.000 N NA
 6217647 6217648 PSPTOT1_0712 PSPTOT1_0713     FALSE 0.490 57.000 0.042 1.000 N NA
 6217649 6217650 PSPTOT1_0714 PSPTOT1_0715     FALSE 0.361 120.000 0.000 1.000 Y NA
 6217650 6217651 PSPTOT1_0715 PSPTOT1_0716     FALSE 0.042 150.000 0.000 NA   NA
 6217652 6217653 PSPTOT1_0717 PSPTOT1_0718 ilvE   FALSE 0.073 140.000 0.000 1.000   NA
 6217653 6217654 PSPTOT1_0718 PSPTOT1_0719     FALSE 0.375 98.000 0.085 NA   NA
 6217654 6217655 PSPTOT1_0719 PSPTOT1_0720   cyoE FALSE 0.008 258.000 0.000 NA   NA
 6217655 6217656 PSPTOT1_0720 PSPTOT1_0721 cyoE cyoD TRUE 0.944 11.000 0.064 0.054 N NA
 6217656 6217657 PSPTOT1_0721 PSPTOT1_0722 cyoD cyoC TRUE 0.997 0.000 0.273 0.038 Y NA
 6217657 6217658 PSPTOT1_0722 PSPTOT1_0723 cyoC cyoB TRUE 0.995 4.000 0.258 0.038 Y NA
 6217658 6217659 PSPTOT1_0723 PSPTOT1_0724 cyoB cyoA TRUE 0.994 4.000 0.200 0.005 Y NA
 6217659 6217660 PSPTOT1_0724 PSPTOT1_0725 cyoA dsbB FALSE 0.009 466.000 0.000 0.038 N NA
 6217661 6217662 PSPTOT1_0726 PSPTOT1_0727     TRUE 0.895 63.000 0.500 1.000   NA
 6217662 6217663 PSPTOT1_0727 PSPTOT1_0728     TRUE 0.636 115.000 0.333 NA   NA
 6217664 6217665 PSPTOT1_0729 PSPTOT1_0730     FALSE 0.178 48.000 0.000 NA   NA
 6217665 6217666 PSPTOT1_0730 PSPTOT1_0731     TRUE 0.969 2.000 0.105 1.000   NA
 6217666 6217667 PSPTOT1_0731 PSPTOT1_0732     TRUE 0.962 3.000 0.000 1.000 Y NA
 6217667 6217668 PSPTOT1_0732 PSPTOT1_0733     TRUE 0.943 132.000 0.875 1.000 Y NA
 6217668 6217669 PSPTOT1_0733 PSPTOT1_0734     TRUE 0.983 64.000 1.000 1.000 Y NA
 6217669 6217670 PSPTOT1_0734 PSPTOT1_0735     FALSE 0.004 313.000 0.000 NA   NA
 6217671 6217672 PSPTOT1_0736 PSPTOT1_0737     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.012 N NA
 6217672 6217673 PSPTOT1_0737 PSPTOT1_0738     TRUE 0.965 11.000 0.240 1.000 N NA
 6217673 6217674 PSPTOT1_0738 PSPTOT1_0739     TRUE 0.998 -10.000 0.793 0.002 Y NA
 6217674 6217675 PSPTOT1_0739 PSPTOT1_0740     FALSE 0.147 204.000 0.000 1.000 Y NA
 6217678 6217679 PSPTOT1_0743 PSPTOT1_0744 eda-1 pgl TRUE 0.901 27.000 0.064 1.000 Y NA
 6217679 6217680 PSPTOT1_0744 PSPTOT1_0745 pgl zwf-1 TRUE 0.970 -13.000 0.163 1.000 Y NA
 6217682 6217683 PSPTOT1_0747 PSPTOT1_0748   oprB FALSE 0.180 114.000 0.021 1.000 N NA
 6217683 6217684 PSPTOT1_0748 PSPTOT1_0749 oprB gltK TRUE 0.517 134.000 0.135 0.064 N NA
 6217684 6217685 PSPTOT1_0749 PSPTOT1_0750 gltK   TRUE 0.999 3.000 0.723 0.064 Y NA
 6217685 6217686 PSPTOT1_0750 PSPTOT1_0751     TRUE 0.998 -7.000 0.816 0.064 Y NA
 6217686 6217687 PSPTOT1_0751 PSPTOT1_0752     TRUE 0.893 105.000 0.367 0.064 Y NA
 6217687 6217688 PSPTOT1_0752 PSPTOT1_0753     TRUE 0.532 172.000 0.367 1.000 N NA
 6217688 6217689 PSPTOT1_0753 PSPTOT1_0754     TRUE 0.966 92.000 0.909 1.000 Y NA
 6217689 6217690 PSPTOT1_0754 PSPTOT1_0755   glk TRUE 0.878 51.000 0.364 1.000 N NA
 6217690 6217691 PSPTOT1_0755 PSPTOT1_0756 glk edd TRUE 0.981 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 6217691 6217692 PSPTOT1_0756 PSPTOT1_0757 edd   FALSE 0.410 16.000 0.000 NA   NA
 6217693 6217694 PSPTOT1_0758 PSPTOT1_0759 gap-1   FALSE 0.344 79.000 0.033 1.000 N NA
 6217694 6217695 PSPTOT1_0759 PSPTOT1_0760     TRUE 0.898 128.000 1.000 NA N NA
 6217695 6217696 PSPTOT1_0760 PSPTOT1_0761     TRUE 0.626 121.000 0.122 NA Y NA
 6217696 6217697 PSPTOT1_0761 PSPTOT1_0762     TRUE 0.940 -19.000 0.074 NA Y NA
 6217697 6217698 PSPTOT1_0762 PSPTOT1_0763     TRUE 0.972 -3.000 0.132 NA   NA
 6217698 6217699 PSPTOT1_0763 PSPTOT1_0764     FALSE 0.065 105.000 0.000 NA   NA
 6217699 6217700 PSPTOT1_0764 PSPTOT1_0765     FALSE 0.080 290.000 0.200 NA   NA
 6217700 6217701 PSPTOT1_0765 PSPTOT1_0766     FALSE 0.116 172.000 0.000 0.096 N NA
 6217701 6217702 PSPTOT1_0766 PSPTOT1_0767     TRUE 0.996 -15.000 0.667 0.029 Y NA
 6217702 6217703 PSPTOT1_0767 PSPTOT1_0768     TRUE 0.998 10.000 0.667 0.022 Y NA
 6217703 6217704 PSPTOT1_0768 PSPTOT1_0769   gcvH-2 FALSE 0.007 305.000 0.000 1.000 N NA
 6217704 6217705 PSPTOT1_0769 PSPTOT1_0770 gcvH-2 gcvP TRUE 0.986 11.000 0.249 1.000 Y NA
 6217705 6217706 PSPTOT1_0770 PSPTOT1_0771 gcvP gcvT-2 TRUE 0.954 -37.000 0.032 0.001 Y NA
 6217706 6217707 PSPTOT1_0771 PSPTOT1_0772 gcvT-2   FALSE 0.003 404.000 0.000 1.000 N NA
 6217708 6217709 PSPTOT1_0773 PSPTOT1_0774     TRUE 0.990 -13.000 0.631 0.054   NA
 6217710 6217711 PSPTOT1_0775 PSPTOT1_0776 pepA holC TRUE 0.898 59.000 0.494 1.000 N NA
 6217711 6217712 PSPTOT1_0776 PSPTOT1_0777 holC   TRUE 0.869 8.000 0.034 NA   NA
 6217714 6217715 PSPTOT1_0779 PSPTOT1_0780 valS   FALSE 0.272 64.000 0.003 1.000   NA
 6217717 6217718 PSPTOT1_2917 PSPTOT1_2918   prlC TRUE 0.977 -3.000 0.173 NA   NA
 6217721 6217722 PSPTOT1_2921 PSPTOT1_2922     FALSE 0.028 177.000 0.000 NA   NA
 6217722 6217723 PSPTOT1_2922 PSPTOT1_2923     FALSE 0.004 314.000 0.000 NA   NA
 6217723 6217724 PSPTOT1_2923 PSPTOT1_2924     FALSE 0.365 19.000 0.000 NA   NA
 6217725 6217726 PSPTOT1_2925 PSPTOT1_2926   osmC FALSE 0.162 118.000 0.026 NA   NA
 6217728 6217729 PSPTOT1_2928 PSPTOT1_2929     FALSE 0.366 78.000 0.049 NA   NA
 6217732 6217733 PSPTOT1_2932 PSPTOT1_2933 trpB trpA TRUE 0.998 -3.000 0.344 0.000 Y NA
 6217733 6217734 PSPTOT1_2933 PSPTOT1_2934 trpA   FALSE 0.055 127.000 0.000 NA   NA
 6217735 6217736 PSPTOT1_2935 PSPTOT1_2936     FALSE 0.016 213.000 0.000 NA   NA
 6217736 6217737 PSPTOT1_2936 PSPTOT1_2937     FALSE 0.164 53.000 0.000 NA   NA
 6217740 6217741 PSPTOT1_2940 PSPTOT1_2941     TRUE 0.848 37.000 0.218 1.000 N NA
 6217741 6217742 PSPTOT1_2941 PSPTOT1_2942     FALSE 0.139 62.000 0.000 NA   NA
 6217742 6217743 PSPTOT1_2942 PSPTOT1_2943     FALSE 0.114 72.000 0.000 NA   NA
 6217744 6217745 PSPTOT1_2944 PSPTOT1_2945 aroE hemF TRUE 0.971 0.000 0.093 1.000 N NA
 6217747 6217748 PSPTOT1_2947 PSPTOT1_2948   smf FALSE 0.442 39.000 0.023 NA N NA
 6217748 6217749 PSPTOT1_2948 PSPTOT1_2949 smf   FALSE 0.214 124.000 0.033 1.000   NA
 6217750 6217751 PSPTOT1_2950 PSPTOT1_2951 def-1 fmt TRUE 0.887 61.000 0.105 0.016 Y NA
 6217751 6217752 PSPTOT1_2951 PSPTOT1_2952 fmt sun TRUE 0.995 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 6217752 6217753 PSPTOT1_2952 PSPTOT1_2953 sun trkA TRUE 0.973 -3.000 0.122 1.000 N NA
 6217753 6217754 PSPTOT1_2953 PSPTOT1_2954 trkA   FALSE 0.070 143.000 0.000 1.000 N NA
 6217755 6217756 PSPTOT1_2955 PSPTOT1_2956   tag FALSE 0.475 38.000 0.017 1.000 N NA
 6217757 6217758 PSPTOT1_2957 PSPTOT1_2958 glyQ glyS TRUE 0.999 -3.000 0.651 0.000 Y NA
 6217758 6217759 PSPTOT1_2958 PSPTOT1_2959 glyS   TRUE 0.907 14.000 0.123 1.000 N NA
 6217759 6217760 PSPTOT1_2959 PSPTOT1_2960     TRUE 0.834 58.000 0.310 1.000 N NA
 6217763 6217764 PSPTOT1_2963 PSPTOT1_2964 gyrB recF TRUE 0.995 5.000 0.249 0.004 Y NA
 6217764 6217765 PSPTOT1_2964 PSPTOT1_2965 recF dnaN TRUE 0.972 23.000 0.318 1.000 Y NA
 6217765 6217766 PSPTOT1_2965 PSPTOT1_2966 dnaN dnaA TRUE 0.951 39.000 0.328 1.000 Y NA
 6217767 6217768 PSPTOT1_2967 PSPTOT1_2968 rpmH rnpA TRUE 0.986 17.000 0.787 1.000   NA
 6217768 6217769 PSPTOT1_2968 PSPTOT1_2969 rnpA   TRUE 0.987 -7.000 0.540 NA   NA
 6217769 6217770 PSPTOT1_2969 PSPTOT1_2970     TRUE 0.991 3.000 0.461 NA   NA
 6217770 6217771 PSPTOT1_2970 PSPTOT1_2971   trmE TRUE 0.783 79.000 0.221 0.054   NA
 6217773 6217774 PSPTOT1_2973 PSPTOT1_2974 gidA gidB TRUE 0.989 6.000 0.466 1.000 N NA
 6217774 6217775 PSPTOT1_2974 PSPTOT1_2975 gidB   TRUE 0.949 19.000 0.339 1.000 N NA
 6217775 6217776 PSPTOT1_2975 PSPTOT1_2976     TRUE 0.995 10.000 0.827 1.000 N NA
 6217776 6217777 PSPTOT1_2976 PSPTOT1_2977   atpI FALSE 0.230 147.000 0.056 1.000 N NA
 6217777 6217778 PSPTOT1_2977 PSPTOT1_2978 atpI atpB TRUE 0.976 17.000 0.291 1.000 Y NA
 6217778 6217779 PSPTOT1_2978 PSPTOT1_2979 atpB atpE TRUE 0.849 139.000 0.557 0.002   NA
 6217779 6217780 PSPTOT1_2979 PSPTOT1_2980 atpE atpF TRUE 0.962 58.000 0.666 0.002   NA
 6217780 6217781 PSPTOT1_2980 PSPTOT1_2981 atpF atpH TRUE 0.989 13.000 0.242 0.002 Y NA
 6217781 6217782 PSPTOT1_2981 PSPTOT1_2982 atpH atpA TRUE 0.996 22.000 0.864 0.002 Y NA
 6217782 6217783 PSPTOT1_2982 PSPTOT1_2983 atpA atpG TRUE 0.991 51.000 0.846 0.002 Y NA
 6217783 6217784 PSPTOT1_2983 PSPTOT1_2984 atpG atpD TRUE 0.994 28.000 0.724 0.002 Y NA
 6217784 6217785 PSPTOT1_2984 PSPTOT1_2985 atpD atpC TRUE 0.992 45.000 0.837 0.002 Y NA
 6217785 6217786 PSPTOT1_2985 PSPTOT1_2986 atpC glmU FALSE 0.305 126.000 0.067 1.000 N NA
 6217786 6217787 PSPTOT1_2986 PSPTOT1_2987 glmU   FALSE 0.009 337.000 0.010 1.000 N NA
 6217787 6217788 PSPTOT1_2987 PSPTOT1_2988   glmS TRUE 0.984 10.000 0.412 1.000 N NA
 6217791 6217792 PSPTOT1_2991 PSPTOT1_2992     FALSE 0.038 159.000 0.000 NA   NA
 6217792 6217793 PSPTOT1_2992 PSPTOT1_2993     FALSE 0.034 167.000 0.000 NA N NA
 6217793 6217794 PSPTOT1_2993 PSPTOT1_2994     TRUE 0.985 -3.000 0.250 NA   NA
 6217796 6217797 PSPTOT1_2996 PSPTOT1_2997     FALSE 0.087 88.000 0.000 NA   NA
 6217798 6217799 PSPTOT1_2998 PSPTOT1_2999     FALSE 0.002 429.000 0.000 NA   NA
 6217799 6217800 PSPTOT1_2999 PSPTOT1_3000     FALSE 0.337 177.000 0.000 0.015 Y NA
 6217800 6217801 PSPTOT1_3000 PSPTOT1_3001     FALSE 0.050 135.000 0.000 NA   NA
 6217801 6217802 PSPTOT1_3001 PSPTOT1_3002     FALSE 0.018 205.000 0.000 NA   NA
 6217802 6217803 PSPTOT1_3002 PSPTOT1_3003     TRUE 0.985 32.000 0.667 1.000 Y NA
 6217803 6217804 PSPTOT1_3003 PSPTOT1_3004     TRUE 0.669 50.000 0.095 1.000 N NA
 6217804 6217805 PSPTOT1_3004 PSPTOT1_3005     TRUE 0.999 0.000 0.800 1.000 Y NA
 6217806 6217807 PSPTOT1_3006 PSPTOT1_3007     FALSE 0.214 60.000 0.000 1.000   NA
 6217807 6217808 PSPTOT1_3007 PSPTOT1_3008     TRUE 0.978 2.000 0.188 NA   NA
 6217808 6217809 PSPTOT1_3008 PSPTOT1_3009     FALSE 0.001 598.000 0.000 NA   NA
 6217809 6217810 PSPTOT1_3009 PSPTOT1_3010   cdsA-2 FALSE 0.004 402.000 0.000 1.000   NA
 6217810 6217811 PSPTOT1_3010 PSPTOT1_3011 cdsA-2   TRUE 0.996 0.000 0.595 1.000   NA
 6217811 6217812 PSPTOT1_3011 PSPTOT1_3012     TRUE 0.948 9.000 0.140 NA   NA
 6217812 6217813 PSPTOT1_3012 PSPTOT1_3013     TRUE 0.792 24.000 0.090 NA   NA
 6217813 6217814 PSPTOT1_3013 PSPTOT1_3014     TRUE 0.934 -42.000 0.285 NA   NA
 6217814 6217815 PSPTOT1_3014 PSPTOT1_3015     TRUE 0.933 33.000 0.215 NA Y NA
 6217816 6217817 PSPTOT1_3016 PSPTOT1_3017     TRUE 0.926 12.000 0.019 NA Y NA
 6217817 6217818 PSPTOT1_3017 PSPTOT1_3018     TRUE 0.974 -3.000 0.022 NA Y NA
 6217818 6217819 PSPTOT1_3018 PSPTOT1_3019   cadA-2 TRUE 0.996 -3.000 0.700 NA N NA
 6217820 6217821 PSPTOT1_3020 PSPTOT1_3021   cls FALSE 0.112 73.000 0.000 NA   NA
 6217822 6217823 PSPTOT1_3022 PSPTOT1_3023     FALSE 0.020 199.000 0.000 NA   NA
 6217825 6217826 PSPTOT1_3025 PSPTOT1_3026     TRUE 0.990 0.000 0.333 NA   NA
 6217833 6217834 PSPTOT1_3033 PSPTOT1_3034     FALSE 0.125 131.000 0.018 NA   NA
 6217834 6217835 PSPTOT1_3034 PSPTOT1_3035   uvrD FALSE 0.021 225.000 0.000 1.000   NA
 6217836 6217837 PSPTOT1_3036 PSPTOT1_3037     TRUE 0.633 108.000 0.316 NA   NA
 6217839 6217840 PSPTOT1_3039 PSPTOT1_3040   oadA TRUE 0.788 103.000 0.354 0.064 N NA
 6217841 6217842 PSPTOT1_3041 PSPTOT1_3042     TRUE 0.986 16.000 0.556 0.009   NA
 6217842 6217843 PSPTOT1_3042 PSPTOT1_3043     TRUE 0.948 -3.000 0.047 1.000   NA
 6217844 6217845 PSPTOT1_3044 PSPTOT1_3045     FALSE 0.455 55.000 0.042 NA   NA
 6217845 6217846 PSPTOT1_3045 PSPTOT1_3046     FALSE 0.051 133.000 0.000 NA   NA
 6217847 6217848 PSPTOT1_3047 PSPTOT1_3048 ansA   TRUE 0.908 30.000 0.095 1.000 Y NA
 6217848 6217849 PSPTOT1_3048 PSPTOT1_3049   aspA FALSE 0.055 283.000 0.000 1.000 Y NA
 6217851 6217852 PSPTOT1_3051 PSPTOT1_3052     FALSE 0.009 256.000 0.000 NA   NA
 6217853 6217854 PSPTOT1_3054 PSPTOT1_3055 purE purK TRUE 0.990 10.000 0.136 0.000 Y NA
 6217854 6217855 PSPTOT1_3055 PSPTOT1_3056 purK   FALSE 0.033 288.000 0.050 1.000   NA
 6217855 6217856 PSPTOT1_3056 PSPTOT1_3057     TRUE 0.673 102.000 0.333 NA   NA
 6217857 6217858 PSPTOT1_3058 PSPTOT1_3059     FALSE 0.212 91.000 0.025 NA N NA
 6217859 6217860 PSPTOT1_3060 PSPTOT1_3061     FALSE 0.188 170.000 0.020 0.078 N NA
 6217860 6217861 PSPTOT1_3061 PSPTOT1_3062     TRUE 0.548 153.000 0.211 0.078   NA
 6217861 6217862 PSPTOT1_3062 PSPTOT1_3063     TRUE 0.875 69.000 0.489 1.000   NA
 6217862 6217863 PSPTOT1_3063 PSPTOT1_3064   pstB-2 TRUE 0.971 67.000 0.511 0.002 Y NA
 6217863 6217864 PSPTOT1_3064 PSPTOT1_3065 pstB-2 phoU TRUE 0.895 71.000 0.330 NA Y NA
 6217864 6217865 PSPTOT1_3065 PSPTOT1_3066 phoU   FALSE 0.057 203.000 0.027 NA N NA
 6217865 6217866 PSPTOT1_3066 PSPTOT1_3067     FALSE 0.014 224.000 0.000 NA   NA
 6217866 6217867 PSPTOT1_3067 PSPTOT1_3068     FALSE 0.224 37.000 0.000 NA   NA
 6217867 6217868 PSPTOT1_3068 PSPTOT1_3069     FALSE 0.037 161.000 0.000 NA   NA
 6217869 6217870 PSPTOT1_3070 PSPTOT1_3071   phoR FALSE 0.237 100.000 0.037 NA   NA
 6217870 6217871 PSPTOT1_3071 PSPTOT1_3072 phoR phoB TRUE 0.961 61.000 0.453 0.095 Y NA
 6217871 6217872 PSPTOT1_3072 PSPTOT1_3073 phoB ubiA FALSE 0.157 169.000 0.043 1.000 N NA
 6217872 6217873 PSPTOT1_3073 PSPTOT1_3074 ubiA   TRUE 0.994 0.000 0.248 NA Y NA
 6217874 6217875 PSPTOT1_3075 PSPTOT1_3076 rubA rubB TRUE 0.797 49.000 0.208 1.000   NA
 6217875 6217876 PSPTOT1_3076 PSPTOT1_3077 rubB   FALSE 0.325 189.000 0.229 1.000   NA
 6217876 6217877 PSPTOT1_3077 PSPTOT1_3078     FALSE 0.007 265.000 0.000 NA   NA
 6217877 6217878 PSPTOT1_3078 PSPTOT1_3079     TRUE 0.563 11.000 0.000 NA   NA
 6217879 6217880 PSPTOT1_3080 PSPTOT1_3081     TRUE 0.996 -3.000 0.647 NA   NA
 6217880 6217881 PSPTOT1_3081 PSPTOT1_3082     TRUE 0.961 39.000 0.727 NA   NA
 6217881 6217882 PSPTOT1_3082 PSPTOT1_3083     TRUE 0.910 88.000 0.800 NA   NA
 6217882 6217883 PSPTOT1_3083 PSPTOT1_3084     FALSE 0.004 316.000 0.000 NA   NA
 6217883 6217884 PSPTOT1_3084 PSPTOT1_3085     FALSE 0.004 321.000 0.000 NA   NA
 6217884 6217885 PSPTOT1_3085 PSPTOT1_3086   pntB FALSE 0.397 180.000 0.077 1.000 Y NA
 6217885 6217886 PSPTOT1_3086 PSPTOT1_3087 pntB pntAB TRUE 0.989 -3.000 0.144 0.001   NA
 6217886 6217887 PSPTOT1_3087 PSPTOT1_3088 pntAB pntAA TRUE 0.997 11.000 0.829 0.001   NA
 6217887 6217888 PSPTOT1_3088 PSPTOT1_3089 pntAA   FALSE 0.003 425.000 0.000 1.000 N NA
 6217889 6217890 PSPTOT1_3090 PSPTOT1_3091     TRUE 0.924 13.000 0.143 1.000 N NA
 6217891 6217892 PSPTOT1_0874 PSPTOT1_0875     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217893 6217894 PSPTOT1_0876 PSPTOT1_0877 bphP bphO TRUE 0.988 -3.000 0.300 NA N NA
 6217894 6217895 PSPTOT1_0877 PSPTOT1_0878 bphO   FALSE 0.003 357.000 0.000 NA N NA
 6217895 6217896 PSPTOT1_0878 PSPTOT1_0879     TRUE 0.963 11.000 0.250 NA   NA
 6217896 6217897 PSPTOT1_0879 PSPTOT1_0880     TRUE 0.988 -3.000 0.297 NA   NA
 6217897 6217898 PSPTOT1_0880 PSPTOT1_0881     TRUE 0.621 39.000 0.062 NA N NA
 6217898 6217899 PSPTOT1_0881 PSPTOT1_0882     TRUE 0.995 0.000 0.562 NA   NA
 6217900 6217901 PSPTOT1_0883 PSPTOT1_0884     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 6217902 6217903 PSPTOT1_0885 PSPTOT1_0886   pcD TRUE 0.787 43.000 0.173 1.000 N NA
 6217904 6217905 PSPTOT1_0887 PSPTOT1_0888 gabT-3   TRUE 0.906 24.000 0.250 NA   NA
 6217905 6217906 PSPTOT1_0888 PSPTOT1_0889     FALSE 0.215 39.000 0.000 NA   NA
 6217906 6217907 PSPTOT1_0889 PSPTOT1_0890     FALSE 0.038 159.000 0.000 NA   NA
 6217910 6217911 PSPTOT1_0893 PSPTOT1_0894     TRUE 0.921 7.000 0.069 NA   NA
 6217913 6217914 PSPTOT1_0896 PSPTOT1_0897     FALSE 0.116 71.000 0.000 NA   NA
 6217914 6217915 PSPTOT1_0897 PSPTOT1_0898     TRUE 0.767 5.000 0.000 1.000   NA
 6217915 6217916 PSPTOT1_0898 PSPTOT1_0899     TRUE 0.996 4.000 0.750 1.000 N NA
 6217917 6217918 PSPTOT1_0900 PSPTOT1_0901   fdH FALSE 0.098 105.000 0.000 1.000 N NA
 6217919 6217920 PSPTOT1_0902 PSPTOT1_0903 hyuE   FALSE 0.001 664.000 0.000 NA   NA
 6217921 6217922 PSPTOT1_0904 PSPTOT1_0905     FALSE 0.005 348.000 0.000 1.000 N NA
 6217922 6217923 PSPTOT1_0905 PSPTOT1_0906     FALSE 0.236 35.000 0.000 NA   NA
 6217923 6217924 PSPTOT1_0906 PSPTOT1_0907   hss FALSE 0.003 364.000 0.000 NA   NA
 6217926 6217927 PSPTOT1_0909 PSPTOT1_0910     FALSE 0.012 264.000 0.000 1.000 N NA
 6217927 6217928 PSPTOT1_0910 PSPTOT1_0911     TRUE 0.937 42.000 0.378 0.033   NA
 6217928 6217929 PSPTOT1_0911 PSPTOT1_0912     TRUE 0.880 17.000 0.148 NA   NA
 6217929 6217930 PSPTOT1_0912 PSPTOT1_0913     TRUE 0.560 80.000 0.143 NA   NA
 6217930 6217931 PSPTOT1_0913 PSPTOT1_0914     FALSE 0.373 78.000 0.000 0.033   NA
 6217931 6217932 PSPTOT1_0914 PSPTOT1_0915     FALSE 0.111 74.000 0.000 NA   NA
 6217935 6217936 PSPTOT1_0918 PSPTOT1_0919     TRUE 0.908 110.000 1.000 NA   NA
 6217937 6217938 PSPTOT1_0920 PSPTOT1_0921     FALSE 0.186 46.000 0.000 NA   NA
 6217939 6217940 PSPTOT1_0922 PSPTOT1_6012     FALSE 0.007 279.000 0.000 NA   NA
 6217941 6217942 PSPTOT1_0923 PSPTOT1_0924     TRUE 0.490 -12.000 0.000 NA   NA
 6217942 6217943 PSPTOT1_0924 PSPTOT1_0925     FALSE 0.002 430.000 0.000 NA   NA
 6217946 6217947 PSPTOT1_6013 PSPTOT1_6014     FALSE 0.087 88.000 0.000 NA   NA
 6217947 6217948 PSPTOT1_6014 PSPTOT1_6015     FALSE 0.060 110.000 0.000 NA   NA
 6217948 6217949 PSPTOT1_6015 PSPTOT1_0929   csrA FALSE 0.137 63.000 0.000 NA   NA
 6217949 6217950 PSPTOT1_0929 PSPTOT1_0930 csrA   FALSE 0.213 172.000 0.079 1.000 N NA
 6217950 6217951 PSPTOT1_0930 PSPTOT1_0931   alaS FALSE 0.393 91.000 0.065 1.000 N NA
 6217951 6217952 PSPTOT1_0931 PSPTOT1_0932 alaS   FALSE 0.113 145.000 0.009 1.000 N NA
 6217954 6217955 PSPTOT1_0934 PSPTOT1_0935 astE   TRUE 0.993 12.000 0.909 NA   NA
 6217955 6217956 PSPTOT1_0935 PSPTOT1_0936   astB TRUE 0.525 62.000 0.072 NA   NA
 6217956 6217957 PSPTOT1_0936 PSPTOT1_0937 astB astD TRUE 0.680 100.000 0.306 1.000 N NA
 6217957 6217958 PSPTOT1_0937 PSPTOT1_0938 astD aruG TRUE 0.985 0.000 0.205 1.000 N NA
 6217958 6217959 PSPTOT1_0938 PSPTOT1_0939 aruG aruF TRUE 0.991 64.000 1.000 0.000 Y NA
 6217959 6217960 PSPTOT1_0939 PSPTOT1_0940 aruF argD-1 TRUE 0.876 134.000 0.533 1.000 Y NA
 6217960 6217961 PSPTOT1_0940 PSPTOT1_0941 argD-1 argR FALSE 0.018 237.000 0.000 1.000 N NA
 6217961 6217962 PSPTOT1_0941 PSPTOT1_0942 argR hisP TRUE 0.871 73.000 0.500 1.000 N NA
 6217962 6217963 PSPTOT1_0942 PSPTOT1_0943 hisP   TRUE 0.970 23.000 0.571 1.000   NA
 6217963 6217964 PSPTOT1_0943 PSPTOT1_0944     TRUE 0.994 2.000 0.500 1.000   NA
 6217964 6217965 PSPTOT1_0944 PSPTOT1_0945     TRUE 0.999 -3.000 0.875 0.011 Y NA
 6217965 6217966 PSPTOT1_0945 PSPTOT1_0946     TRUE 0.969 85.000 0.714 0.063 Y NA
 6217966 6217967 PSPTOT1_0946 PSPTOT1_0947   acs FALSE 0.002 534.000 0.000 1.000 N NA
 6217970 6217971 PSPTOT1_0950 PSPTOT1_0951 phhA phhB TRUE 0.846 35.000 0.203 1.000 N NA
 6217971 6217972 PSPTOT1_0951 PSPTOT1_0952 phhB   FALSE 0.057 121.000 0.000 NA   NA
 6217972 6217973 PSPTOT1_0952 PSPTOT1_0953     FALSE 0.089 87.000 0.000 NA   NA
 6217973 6217974 PSPTOT1_0953 PSPTOT1_0954     TRUE 0.701 174.000 0.667 NA   NA
 6217974 6217975 PSPTOT1_0954 PSPTOT1_0955   cytX FALSE 0.046 143.000 0.000 NA   NA
 6217976 6217977 PSPTOT1_0956 PSPTOT1_0957     TRUE 0.659 -19.000 0.007 1.000   NA
 6217977 6217978 PSPTOT1_0957 PSPTOT1_0958     TRUE 0.762 -3.000 0.000 NA   NA
 6217978 6217979 PSPTOT1_0958 PSPTOT1_0959   rluB FALSE 0.137 63.000 0.000 NA   NA
 6217979 6217980 PSPTOT1_0959 PSPTOT1_0960 rluB   FALSE 0.072 185.000 0.026 NA   NA
 6217980 6217981 PSPTOT1_0960 PSPTOT1_0961     TRUE 0.843 -25.000 0.087 NA   NA
 6217981 6217982 PSPTOT1_0961 PSPTOT1_0962     TRUE 0.838 16.000 0.083 NA   NA
 6217982 6217983 PSPTOT1_0962 PSPTOT1_0963     TRUE 0.938 0.000 0.040 NA   NA
 6217983 6217984 PSPTOT1_0963 PSPTOT1_0964     TRUE 0.941 -25.000 0.281 NA   NA
 6217985 6217986 PSPTOT1_0965 PSPTOT1_0966     TRUE 0.982 2.000 0.224 NA   NA
 6217986 6217987 PSPTOT1_0966 PSPTOT1_0967     FALSE 0.109 181.000 0.043 NA   NA
 6217987 6217988 PSPTOT1_0967 PSPTOT1_0968     TRUE 0.984 8.000 0.409 NA   NA
 6217988 6217989 PSPTOT1_0968 PSPTOT1_0969     TRUE 0.578 193.000 0.318 NA Y NA
 6217989 6217990 PSPTOT1_0969 PSPTOT1_0970     TRUE 0.847 87.000 0.286 NA Y NA
 6217992 6217993 PSPTOT1_0972 PSPTOT1_0973 trkH   FALSE 0.001 629.000 0.000 NA   NA
 6217994 6217995 PSPTOT1_0974 PSPTOT1_0975     FALSE 0.146 93.000 0.008 NA   NA
 6217995 6217996 PSPTOT1_0975 PSPTOT1_0976     FALSE 0.241 52.000 0.000 1.000 N NA
 6217996 6217997 PSPTOT1_0976 PSPTOT1_0977     TRUE 0.996 3.000 0.429 1.000 Y NA
 6218000 6218001 PSPTOT1_0980 PSPTOT1_0981     TRUE 0.994 -3.000 0.511 NA   NA
 6218001 6218002 PSPTOT1_0981 PSPTOT1_0982     FALSE 0.305 189.000 0.062