MicrobesOnline Operon Predictions for Helicobacter cinaedi CCUG 18818

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6151931 6151932 HcinC1_010100000005 HcinC1_010100000010     FALSE 0.177 84.000 0.000 NA   NA
 6151932 6151933 HcinC1_010100000010 HcinC1_010100000015     TRUE 0.515 -16.000 0.000 NA   NA
 6151933 6151934 HcinC1_010100000015 HcinC1_010100000040     FALSE 0.018 2038.000 0.000 NA   NA
 6151934 6151935 HcinC1_010100000040 HcinC1_010100000045     TRUE 0.903 16.000 0.000 1.000   NA
 6151935 6151936 HcinC1_010100000045 HcinC1_010100000050     TRUE 0.815 23.000 0.000 1.000   NA
 6151936 6151937 HcinC1_010100000050 HcinC1_010100000055     TRUE 0.916 -12.000 0.075 NA   NA
 6151937 6151938 HcinC1_010100000055 HcinC1_010100000060     FALSE 0.237 72.000 0.000 NA   NA
 6151938 6151939 HcinC1_010100000060 HcinC1_010100000065     FALSE 0.369 -37.000 0.000 NA   NA
 6151939 6151940 HcinC1_010100000065 HcinC1_010100000075     FALSE 0.020 850.000 0.000 NA   NA
 6151940 6151941 HcinC1_010100000075 HcinC1_010100000085     FALSE 0.019 1339.000 0.000 NA   NA
 6151942 6151943 HcinC1_010100000090 HcinC1_010100000095     TRUE 0.902 13.000 0.000 NA   NA
 6151943 6151944 HcinC1_010100000095 HcinC1_010100000100     TRUE 0.713 -7.000 0.000 NA   NA
 6151944 6151945 HcinC1_010100000100 HcinC1_010100000105     FALSE 0.024 367.000 0.000 NA   NA
 6151945 6151946 HcinC1_010100000105 HcinC1_010100000110     TRUE 0.862 2.000 0.000 NA   NA
 6151946 6151947 HcinC1_010100000110 HcinC1_010100000115     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6151947 6151948 HcinC1_010100000115 HcinC1_010100000120     FALSE 0.029 265.000 0.000 NA   NA
 6151948 6151949 HcinC1_010100000120 HcinC1_010100000125     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6151949 6151950 HcinC1_010100000125 HcinC1_010100000130     FALSE 0.033 231.000 0.000 NA   NA
 6151950 6151951 HcinC1_010100000130 HcinC1_010100000135     FALSE 0.033 231.000 0.000 NA   NA
 6151951 6151952 HcinC1_010100000135 HcinC1_010100000140     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6151952 6151953 HcinC1_010100000140 HcinC1_010100000145     TRUE 0.844 20.000 0.000 NA   NA
 6151953 6151954 HcinC1_010100000145 HcinC1_010100000150     FALSE 0.120 100.000 0.000 NA   NA
 6151954 6151955 HcinC1_010100000150 HcinC1_010100000155     FALSE 0.068 136.000 0.000 NA   NA
 6151955 6151956 HcinC1_010100000155 HcinC1_010100000160     FALSE 0.334 60.000 0.000 NA   NA
 6151956 6151957 HcinC1_010100000160 HcinC1_010100000165     FALSE 0.031 253.000 0.000 NA   NA
 6151957 6151958 HcinC1_010100000165 HcinC1_010100000170     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6151959 6151960 HcinC1_010100000175 HcinC1_010100000180     TRUE 0.828 21.000 0.000 NA   NA
 6151960 6151961 HcinC1_010100000180 HcinC1_010100000185     TRUE 0.770 24.000 0.000 NA   NA
 6151961 6151962 HcinC1_010100000185 HcinC1_010100000190     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6151962 6151963 HcinC1_010100000190 HcinC1_010100000195     FALSE 0.106 106.000 0.000 NA   NA
 6151963 6151964 HcinC1_010100000195 HcinC1_010100000200     TRUE 0.577 34.000 0.000 NA   NA
 6151964 6151965 HcinC1_010100000200 HcinC1_010100000205     FALSE 0.132 97.000 0.000 NA   NA
 6151965 6151966 HcinC1_010100000205 HcinC1_010100000210     FALSE 0.138 95.000 0.000 NA   NA
 6151966 6151967 HcinC1_010100000210 HcinC1_010100000215     FALSE 0.112 103.000 0.000 NA   NA
 6151967 6151968 HcinC1_010100000215 HcinC1_010100000220     FALSE 0.080 124.000 0.000 NA   NA
 6151968 6151969 HcinC1_010100000220 HcinC1_010100000225     FALSE 0.107 105.000 0.000 NA   NA
 6151969 6151970 HcinC1_010100000225 HcinC1_010100000230     TRUE 0.515 -16.000 0.000 NA   NA
 6151970 6151971 HcinC1_010100000230 HcinC1_010100000235     FALSE 0.060 149.000 0.000 NA   NA
 6151971 6151972 HcinC1_010100000235 HcinC1_010100000240     FALSE 0.120 100.000 0.000 NA   NA
 6151974 6151975 HcinC1_010100000250 HcinC1_010100000255     TRUE 0.451 44.000 0.000 NA   NA
 6151975 6151976 HcinC1_010100000255 HcinC1_010100000260     FALSE 0.041 192.000 0.000 NA   NA
 6151976 6151977 HcinC1_010100000260 HcinC1_010100000265     TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 6151977 6151978 HcinC1_010100000265 HcinC1_010100000270     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6151978 6151979 HcinC1_010100000270 HcinC1_010100000275     TRUE 0.595 33.000 0.000 NA   NA
 6151979 6151980 HcinC1_010100000275 HcinC1_010100000280     FALSE 0.135 96.000 0.000 NA   NA
 6151980 6151981 HcinC1_010100000280 HcinC1_010100000285     TRUE 0.713 -7.000 0.000 NA   NA
 6151981 6151982 HcinC1_010100000285 HcinC1_010100000290     TRUE 0.828 21.000 0.000 NA   NA
 6151982 6151983 HcinC1_010100000290 HcinC1_010100000295     TRUE 0.533 -15.000 0.000 NA   NA
 6151983 6151984 HcinC1_010100000295 HcinC1_010100000300     TRUE 0.609 -12.000 0.000 NA   NA
 6151984 6151985 HcinC1_010100000300 HcinC1_010100000305     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6151985 6151986 HcinC1_010100000305 HcinC1_010100000310     FALSE 0.042 191.000 0.000 NA   NA
 6151986 6151987 HcinC1_010100000310 HcinC1_010100000315     TRUE 0.645 30.000 0.000 NA   NA
 6151987 6151988 HcinC1_010100000315 HcinC1_010100000320     TRUE 0.532 37.000 0.000 NA   NA
 6151988 6151989 HcinC1_010100000320 HcinC1_010100000325     TRUE 0.878 4.000 0.000 NA   NA
 6151989 6151990 HcinC1_010100000325 HcinC1_010100000330     TRUE 0.844 20.000 0.000 NA   NA
 6151990 6151991 HcinC1_010100000330 HcinC1_010100000335     FALSE 0.092 114.000 0.000 NA   NA
 6151991 6151992 HcinC1_010100000335 HcinC1_010100000340     TRUE 0.906 11.000 0.000 NA   NA
 6151992 6151993 HcinC1_010100000340 HcinC1_010100000345     FALSE 0.051 168.000 0.000 NA   NA
 6151993 6151994 HcinC1_010100000345 HcinC1_010100000350     FALSE 0.037 213.000 0.000 NA   NA
 6151994 6151995 HcinC1_010100000350 HcinC1_010100000355     TRUE 0.992 -3.000 0.400 NA   NA
 6151996 6151997 HcinC1_010100000360 HcinC1_010100000365     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6151997 6151998 HcinC1_010100000365 HcinC1_010100000370     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6151998 6151999 HcinC1_010100000370 HcinC1_010100000375     TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 6151999 6152000 HcinC1_010100000375 HcinC1_010100000380     FALSE 0.166 86.000 0.000 NA   NA
 6152000 6152001 HcinC1_010100000380 HcinC1_010100000385     TRUE 0.571 -13.000 0.000 NA   NA
 6152001 6152002 HcinC1_010100000385 HcinC1_010100000390     FALSE 0.101 109.000 0.000 NA   NA
 6152002 6152003 HcinC1_010100000390 HcinC1_010100000395     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152004 6152005 HcinC1_010100000400 HcinC1_010100000405     TRUE 0.684 28.000 0.000 NA   NA
 6152005 6152006 HcinC1_010100000405 HcinC1_010100000410     TRUE 0.748 -6.000 0.000 NA   NA
 6152006 6152007 HcinC1_010100000410 HcinC1_010100000415     FALSE 0.383 53.000 0.000 NA   NA
 6152010 6152011 HcinC1_010100000430 HcinC1_010100000435     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152011 6152012 HcinC1_010100000435 HcinC1_010100000440     FALSE 0.022 454.000 0.000 NA   NA
 6152012 6152013 HcinC1_010100000440 HcinC1_010100000445     FALSE 0.382 -34.000 0.000 NA   NA
 6152013 6152014 HcinC1_010100000445 HcinC1_010100000450     FALSE 0.208 77.000 0.000 NA   NA
 6152014 6152015 HcinC1_010100000450 HcinC1_010100000455     FALSE 0.071 131.000 0.000 NA   NA
 6152015 6152016 HcinC1_010100000455 HcinC1_010100000460     TRUE 0.533 -15.000 0.000 NA   NA
 6152017 6152018 HcinC1_010100000465 HcinC1_010100000470     TRUE 0.887 16.000 0.000 NA   NA
 6152018 6152019 HcinC1_010100000470 HcinC1_010100000475     FALSE 0.054 161.000 0.000 NA   NA
 6152021 6152022 HcinC1_010100000485 HcinC1_010100000490     FALSE 0.022 445.000 0.000 NA   NA
 6152023 6152024 HcinC1_010100000505 HcinC1_010100000510 flhA   TRUE 0.990 10.000 0.106 1.000   NA
 6152024 6152025 HcinC1_010100000510 HcinC1_010100000515     TRUE 0.965 28.000 0.154 NA   NA
 6152025 6152026 HcinC1_010100000515 HcinC1_010100000520     TRUE 0.932 6.000 0.007 NA   NA
 6152026 6152027 HcinC1_010100000520 HcinC1_010100000525     TRUE 0.889 -3.000 0.004 1.000 N NA
 6152027 6152028 HcinC1_010100000525 HcinC1_010100000530     TRUE 0.937 0.000 0.016 1.000   NA
 6152028 6152029 HcinC1_010100000530 HcinC1_010100000535     TRUE 0.986 7.000 0.080 1.000   NA
 6152029 6152030 HcinC1_010100000535 HcinC1_010100000540     TRUE 0.490 56.000 0.000 0.038 N NA
 6152030 6152031 HcinC1_010100000540 HcinC1_010100000545     TRUE 0.635 33.000 0.000 1.000   NA
 6152031 6152032 HcinC1_010100000545 HcinC1_010100000550     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6152035 6152036 HcinC1_010100000565 HcinC1_010100000570     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152036 6152037 HcinC1_010100000570 HcinC1_010100000575     TRUE 0.713 -7.000 0.000 NA   NA
 6152037 6152038 HcinC1_010100000575 HcinC1_010100000580     FALSE 0.368 112.000 0.036 0.053 N NA
 6152038 6152039 HcinC1_010100000580 HcinC1_010100000585     FALSE 0.085 272.000 0.013 0.053 N NA
 6152039 6152040 HcinC1_010100000585 HcinC1_010100000590     FALSE 0.414 79.000 0.022 1.000 N NA
 6152040 6152041 HcinC1_010100000590 HcinC1_010100000595     TRUE 0.778 -15.000 0.024 1.000   NA
 6152042 6152043 HcinC1_010100000600 HcinC1_010100000605     TRUE 0.451 44.000 0.000 NA   NA
 6152043 6152044 HcinC1_010100000605 HcinC1_010100000610     FALSE 0.101 109.000 0.000 NA   NA
 6152047 6152048 HcinC1_010100000620 HcinC1_010100000625     FALSE 0.398 78.000 0.023 NA   NA
 6152048 6152049 HcinC1_010100000625 HcinC1_010100000630   rplM FALSE 0.198 85.000 0.002 NA N NA
 6152049 6152050 HcinC1_010100000630 HcinC1_010100000635 rplM rpsI TRUE 0.996 10.000 0.231 0.028 Y NA
 6152050 6152051 HcinC1_010100000635 HcinC1_010100000640 rpsI   TRUE 0.948 8.000 0.008 1.000   NA
 6152051 6152052 HcinC1_010100000640 HcinC1_010100000645     TRUE 0.501 65.000 0.015 1.000   NA
 6152052 6152053 HcinC1_010100000645 HcinC1_010100000650   motB TRUE 0.991 10.000 0.119 1.000 Y NA
 6152054 6152055 HcinC1_010100000655 HcinC1_010100000660     FALSE 0.269 67.000 0.000 NA   NA
 6152055 6152056 HcinC1_010100000660 HcinC1_010100000665     TRUE 0.878 4.000 0.000 NA   NA
 6152057 6152058 HcinC1_010100000672 HcinC1_010100000677     TRUE 0.994 22.000 0.579 1.000 Y NA
 6152058 6152059 HcinC1_010100000677 HcinC1_010100000682   rpsL TRUE 0.998 14.000 0.620 0.006 Y NA
 6152059 6152060 HcinC1_010100000682 HcinC1_010100000687 rpsL   TRUE 0.677 91.000 0.122 1.000 N NA
 6152060 6152061 HcinC1_010100000687 HcinC1_010100000692   rplL FALSE 0.110 157.000 0.008 1.000 N NA
 6152061 6152062 HcinC1_010100000692 HcinC1_010100000697 rplL rplJ TRUE 0.999 12.000 0.884 0.028 Y NA
 6152062 6152063 HcinC1_010100000697 HcinC1_010100000702 rplJ rplA TRUE 0.806 98.000 0.302 0.038 Y NA
 6152063 6152064 HcinC1_010100000702 HcinC1_010100000707 rplA rplK TRUE 0.999 16.000 0.838 0.038 Y NA
 6152064 6152065 HcinC1_010100000707 HcinC1_010100000712 rplK nusG TRUE 0.992 27.000 0.681 1.000 N NA
 6152065 6152066 HcinC1_010100000712 HcinC1_010100000717 nusG   TRUE 0.996 23.000 0.843 1.000   NA
 6152066 6152067 HcinC1_010100000717 HcinC1_010100t00784     TRUE 0.464 43.000 0.000 NA   NA
 6152067 6152068 HcinC1_010100t00784 HcinC1_010100000722   rpmG TRUE 0.869 18.000 0.000 NA   NA
 6152068 6152069 HcinC1_010100000722 HcinC1_010100000727 rpmG   TRUE 0.988 14.000 0.099 1.000 Y NA
 6152069 6152070 HcinC1_010100000727 HcinC1_010100t00786     FALSE 0.341 59.000 0.000 NA   NA
 6152070 6152071 HcinC1_010100t00786 HcinC1_010100t00788     FALSE 0.223 74.000 0.000 NA   NA
 6152071 6152072 HcinC1_010100t00788 HcinC1_010100t00790     FALSE 0.198 79.000 0.000 NA   NA
 6152072 6152073 HcinC1_010100t00790 HcinC1_010100t00792     FALSE 0.345 58.000 0.000 NA   NA
 6152073 6152074 HcinC1_010100t00792 HcinC1_010100000732     FALSE 0.040 200.000 0.000 NA   NA
 6152076 6152077 HcinC1_010100t00794 HcinC1_010100t00796     TRUE 0.532 37.000 0.000 NA   NA
 6152077 6152078 HcinC1_010100t00796 HcinC1_010100t00798     FALSE 0.244 71.000 0.000 NA   NA
 6152078 6152079 HcinC1_010100t00798 HcinC1_010100t00800     FALSE 0.146 92.000 0.000 NA   NA
 6152080 6152081 HcinC1_010100000752 HcinC1_010100000757   murC TRUE 0.921 -3.000 0.016 1.000 N NA
 6152081 6152082 HcinC1_010100000757 HcinC1_010100000762 murC   TRUE 0.923 0.000 0.013 NA   NA
 6152082 6152083 HcinC1_010100000762 HcinC1_010100000767     TRUE 0.980 14.000 0.058 NA   NA
 6152083 6152084 HcinC1_010100000767 HcinC1_010100000772     FALSE 0.150 159.000 0.029 NA   NA
 6152084 6152085 HcinC1_010100000772 HcinC1_010100000777     TRUE 0.979 9.000 0.054 NA   NA
 6152086 6152087 HcinC1_010100000800 HcinC1_010100000805     FALSE 0.109 104.000 0.000 NA   NA
 6152087 6152088 HcinC1_010100000805 HcinC1_010100000810     TRUE 0.957 12.000 0.013 1.000   NA
 6152088 6152089 HcinC1_010100000810 HcinC1_010100000815     TRUE 0.562 59.000 0.015 1.000   NA
 6152089 6152090 HcinC1_010100000815 HcinC1_010100000820     TRUE 0.986 10.000 0.071 1.000 Y NA
 6152093 6152094 HcinC1_010100000835 HcinC1_010100000840     TRUE 0.991 35.000 1.000 NA   NA
 6152094 6152095 HcinC1_010100000840 HcinC1_010100000845   flgD TRUE 0.975 16.000 0.053 NA   NA
 6152095 6152096 HcinC1_010100000845 HcinC1_010100000850 flgD flgE TRUE 0.991 -3.000 0.368 NA   NA
 6152099 6152100 HcinC1_010100000865 HcinC1_010100000870     FALSE 0.089 116.000 0.000 NA   NA
 6152100 6152101 HcinC1_010100000870 HcinC1_010100000875     TRUE 0.967 -10.000 0.222 NA   NA
 6152101 6152102 HcinC1_010100000875 HcinC1_010100000880     TRUE 0.451 44.000 0.000 NA   NA
 6152102 6152103 HcinC1_010100000880 HcinC1_010100000885     TRUE 0.647 -10.000 0.000 NA   NA
 6152103 6152104 HcinC1_010100000885 HcinC1_010100000890     FALSE 0.269 67.000 0.000 NA   NA
 6152104 6152105 HcinC1_010100000890 HcinC1_010100000895     TRUE 0.906 11.000 0.000 NA   NA
 6152105 6152106 HcinC1_010100000895 HcinC1_010100000900     FALSE 0.041 196.000 0.000 NA   NA
 6152106 6152107 HcinC1_010100000900 HcinC1_010100000905     TRUE 0.878 4.000 0.000 NA   NA
 6152108 6152109 HcinC1_010100000910 HcinC1_010100000915     FALSE 0.080 183.000 0.000 0.012   NA
 6152110 6152111 HcinC1_010100000920 HcinC1_010100000925     TRUE 0.828 21.000 0.000 NA   NA
 6152112 6152113 HcinC1_010100000930 HcinC1_010100000935     TRUE 0.615 56.000 0.022 1.000   NA
 6152114 6152115 HcinC1_010100000940 HcinC1_010100000945 prpD   FALSE 0.028 282.000 0.000 NA   NA
 6152117 6152118 HcinC1_010100000955 HcinC1_010100000960   prpB TRUE 0.979 35.000 0.502 1.000 N NA
 6152118 6152119 HcinC1_010100000960 HcinC1_010100000965 prpB   TRUE 0.934 -3.000 0.013 0.068 N NA
 6152120 6152121 HcinC1_010100000970 HcinC1_010100000975     FALSE 0.367 55.000 0.000 NA   NA
 6152122 6152123 HcinC1_010100000980 HcinC1_010100000985     TRUE 0.999 10.000 0.945 1.000 N NA
 6152123 6152124 HcinC1_010100000985 HcinC1_010100000990     FALSE 0.042 219.000 0.000 1.000 N NA
 6152124 6152125 HcinC1_010100000990 HcinC1_010100000995     TRUE 0.548 57.000 0.016 NA   NA
 6152125 6152126 HcinC1_010100000995 HcinC1_010100001000     FALSE 0.308 82.000 0.012 NA   NA
 6152127 6152128 HcinC1_010100001005 HcinC1_010100001010     TRUE 0.870 -3.000 0.004 NA   NA
 6152128 6152129 HcinC1_010100001010 HcinC1_010100001015     TRUE 0.828 21.000 0.000 NA   NA
 6152130 6152131 HcinC1_010100001020 HcinC1_010100001025     TRUE 0.951 10.000 0.008 1.000 N NA
 6152131 6152132 HcinC1_010100001025 HcinC1_010100001030   ispDF TRUE 0.906 25.000 0.027 1.000 N NA
 6152133 6152134 HcinC1_010100001035 HcinC1_010100001040     TRUE 0.768 27.000 0.003 NA   NA
 6152135 6152136 HcinC1_010100001045 HcinC1_010100001050     TRUE 0.761 26.000 0.000 1.000   NA
 6152136 6152137 HcinC1_010100001050 HcinC1_010100001055     TRUE 0.984 32.000 0.531 1.000   NA
 6152137 6152138 HcinC1_010100001055 HcinC1_010100001060     TRUE 0.951 62.000 0.625 NA   NA
 6152138 6152139 HcinC1_010100001060 HcinC1_010100001065     FALSE 0.344 68.000 0.004 NA   NA
 6152139 6152140 HcinC1_010100001065 HcinC1_010100001070     TRUE 0.951 8.000 0.011 1.000 N NA
 6152140 6152141 HcinC1_010100001070 HcinC1_010100001075     TRUE 0.888 66.000 0.303 NA   NA
 6152142 6152143 HcinC1_010100001080 HcinC1_010100001085     FALSE 0.135 118.000 0.003 1.000   NA
 6152143 6152144 HcinC1_010100001085 HcinC1_010100001090     FALSE 0.298 64.000 0.000 NA   NA
 6152144 6152145 HcinC1_010100001090 HcinC1_010100001095   oorD FALSE 0.422 48.000 0.000 NA   NA
 6152145 6152146 HcinC1_010100001095 HcinC1_010100001100 oorD oorA TRUE 0.997 10.000 0.316 0.003 Y NA
 6152146 6152147 HcinC1_010100001100 HcinC1_010100001105 oorA oorB TRUE 0.998 2.000 0.771 0.003 Y NA
 6152147 6152148 HcinC1_010100001105 HcinC1_010100001110 oorB oorC TRUE 0.995 2.000 0.324 0.003 Y NA
 6152148 6152149 HcinC1_010100001110 HcinC1_010100001115 oorC   FALSE 0.028 280.000 0.000 NA   NA
 6152149 6152150 HcinC1_010100001115 HcinC1_010100001120     TRUE 0.997 11.000 0.596 NA   NA
 6152150 6152151 HcinC1_010100001120 HcinC1_010100001125     TRUE 0.889 -3.000 0.008 NA   NA
 6152151 6152152 HcinC1_010100001125 HcinC1_010100001130     FALSE 0.237 72.000 0.000 NA   NA
 6152152 6152153 HcinC1_010100001130 HcinC1_010100001135     TRUE 0.488 -37.000 0.006 NA   NA
 6152153 6152154 HcinC1_010100001135 HcinC1_010100001140     TRUE 0.883 -3.000 0.006 NA   NA
 6152154 6152155 HcinC1_010100001140 HcinC1_010100001145     FALSE 0.407 55.000 0.000 1.000   NA
 6152158 6152159 HcinC1_010100001160 HcinC1_010100001165 ruvB panB TRUE 0.968 9.000 0.027 1.000 N NA
 6152159 6152160 HcinC1_010100001165 HcinC1_010100001170 panB   TRUE 0.847 23.000 0.002 1.000 N NA
 6152160 6152161 HcinC1_010100001170 HcinC1_010100001175     TRUE 0.990 -16.000 0.869 0.058 Y NA
 6152161 6152162 HcinC1_010100001175 HcinC1_010100001180     TRUE 0.892 -3.000 0.005 1.000 N NA
 6152162 6152163 HcinC1_010100001180 HcinC1_010100001185     TRUE 0.901 0.000 0.005 NA   NA
 6152163 6152164 HcinC1_010100001185 HcinC1_010100001190     TRUE 0.755 142.000 0.667 NA   NA
 6152164 6152165 HcinC1_010100001190 HcinC1_010100001195     TRUE 0.995 9.000 0.286 NA   NA
 6152165 6152166 HcinC1_010100001195 HcinC1_010100001200   ruvA FALSE 0.253 74.000 0.000 1.000 N NA
 6152166 6152167 HcinC1_010100001200 HcinC1_010100001205 ruvA   TRUE 0.532 37.000 0.000 NA   NA
 6152168 6152169 HcinC1_010100001210 HcinC1_010100001215   cysS TRUE 0.937 -3.000 0.027 1.000   NA
 6152170 6152171 HcinC1_010100001220 HcinC1_010100001225     TRUE 0.683 -31.000 0.029 1.000 N NA
 6152171 6152172 HcinC1_010100001225 HcinC1_010100001230     TRUE 0.906 0.000 0.006 NA   NA
 6152173 6152174 HcinC1_010100001235 HcinC1_010100001240 pyrB   FALSE 0.026 448.000 0.000 1.000   NA
 6152174 6152175 HcinC1_010100001240 HcinC1_010100001245     FALSE 0.122 123.000 0.003 1.000   NA
 6152175 6152176 HcinC1_010100001245 HcinC1_010100001250     TRUE 0.996 13.000 0.372 1.000 Y NA
 6152176 6152177 HcinC1_010100001250 HcinC1_010100001255     TRUE 0.618 34.000 0.000 1.000   NA
 6152177 6152178 HcinC1_010100001255 HcinC1_010100001260     FALSE 0.231 73.000 0.000 NA   NA
 6152178 6152179 HcinC1_010100001260 HcinC1_010100001275     FALSE 0.018 2535.000 0.000 NA   NA
 6152179 6152180 HcinC1_010100001275 HcinC1_010100001280     FALSE 0.026 314.000 0.000 NA   NA
 6152180 6152181 HcinC1_010100001280 HcinC1_010100001285     TRUE 0.729 26.000 0.000 NA   NA
 6152181 6152182 HcinC1_010100001285 HcinC1_010100001290     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152182 6152183 HcinC1_010100001290 HcinC1_010100001295     TRUE 0.866 3.000 0.000 NA   NA
 6152183 6152184 HcinC1_010100001295 HcinC1_010100001300     TRUE 0.464 43.000 0.000 NA   NA
 6152184 6152185 HcinC1_010100001300 HcinC1_010100001305     FALSE 0.047 179.000 0.000 NA   NA
 6152185 6152186 HcinC1_010100001305 HcinC1_010100001310     FALSE 0.030 261.000 0.000 NA   NA
 6152188 6152189 HcinC1_010100001320 HcinC1_010100001325     TRUE 0.879 17.000 0.000 NA   NA
 6152189 6152190 HcinC1_010100001325 HcinC1_010100001330     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152190 6152191 HcinC1_010100001330 HcinC1_010100001335     FALSE 0.062 146.000 0.000 NA   NA
 6152191 6152192 HcinC1_010100001335 HcinC1_010100001340     TRUE 0.489 40.000 0.000 NA   NA
 6152196 6152197 HcinC1_010100001360 HcinC1_010100001365     FALSE 0.351 57.000 0.000 NA   NA
 6152199 6152200 HcinC1_010100001375 HcinC1_010100001380     TRUE 0.571 -13.000 0.000 NA   NA
 6152200 6152201 HcinC1_010100001380 HcinC1_010100001385     TRUE 0.900 8.000 0.000 NA   NA
 6152203 6152204 HcinC1_010100001395 HcinC1_010100001410     FALSE 0.018 2237.000 0.000 NA   NA
 6152204 6152205 HcinC1_010100001410 HcinC1_010100001415     FALSE 0.352 -49.000 0.000 NA   NA
 6152205 6152206 HcinC1_010100001415 HcinC1_010100001420     FALSE 0.223 74.000 0.000 NA   NA
 6152206 6152207 HcinC1_010100001420 HcinC1_010100001425     TRUE 0.906 10.000 0.000 NA   NA
 6152207 6152208 HcinC1_010100001425 HcinC1_010100001430     FALSE 0.338 -61.000 0.000 NA   NA
 6152208 6152209 HcinC1_010100001430 HcinC1_010100001435     TRUE 0.906 10.000 0.000 NA   NA
 6152209 6152210 HcinC1_010100001435 HcinC1_010100001440     FALSE 0.367 55.000 0.000 NA   NA
 6152210 6152211 HcinC1_010100001440 HcinC1_010100001445     FALSE 0.437 -22.000 0.000 NA   NA
 6152211 6152212 HcinC1_010100001445 HcinC1_010100001450     FALSE 0.437 -22.000 0.000 NA   NA
 6152212 6152213 HcinC1_010100001450 HcinC1_010100001455     FALSE 0.076 127.000 0.000 NA   NA
 6152213 6152214 HcinC1_010100001455 HcinC1_010100001460     FALSE 0.023 415.000 0.000 NA   NA
 6152214 6152215 HcinC1_010100001460 HcinC1_010100001465     TRUE 0.896 7.000 0.000 NA   NA
 6152215 6152216 HcinC1_010100001465 HcinC1_010100001470     FALSE 0.422 48.000 0.000 NA   NA
 6152216 6152217 HcinC1_010100001470 HcinC1_010100001475     TRUE 0.904 12.000 0.000 NA   NA
 6152217 6152218 HcinC1_010100001475 HcinC1_010100001480     FALSE 0.289 65.000 0.000 NA   NA
 6152218 6152219 HcinC1_010100001480 HcinC1_010100001485     FALSE 0.319 62.000 0.000 NA   NA
 6152219 6152220 HcinC1_010100001485 HcinC1_010100001490     TRUE 0.902 13.000 0.000 NA   NA
 6152222 6152223 HcinC1_010100001500 HcinC1_010100001505     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152225 6152226 HcinC1_010100001515 HcinC1_010100001520     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152226 6152227 HcinC1_010100001520 HcinC1_010100001525     TRUE 0.545 36.000 0.000 NA   NA
 6152228 6152229 HcinC1_010100001530 HcinC1_010100001535     FALSE 0.135 96.000 0.000 NA   NA
 6152229 6152230 HcinC1_010100001535 HcinC1_010100001540     FALSE 0.315 -103.000 0.000 NA   NA
 6152230 6152231 HcinC1_010100001540 HcinC1_010100001545     TRUE 0.451 -21.000 0.000 NA   NA
 6152234 6152235 HcinC1_010100001560 HcinC1_010100001565     TRUE 0.993 -7.000 0.569 0.001 N NA
 6152235 6152236 HcinC1_010100001565 HcinC1_010100001570     TRUE 0.941 3.000 0.015 1.000   NA
 6152236 6152237 HcinC1_010100001570 HcinC1_010100001575     TRUE 0.945 29.000 0.089 1.000   NA
 6152237 6152238 HcinC1_010100001575 HcinC1_010100001580     TRUE 0.845 32.000 0.029 1.000 N NA
 6152238 6152239 HcinC1_010100001580 HcinC1_010100001585     TRUE 0.718 38.000 0.019 NA   NA
 6152239 6152240 HcinC1_010100001585 HcinC1_010100001590     TRUE 0.862 2.000 0.000 NA   NA
 6152241 6152242 HcinC1_010100001595 HcinC1_010100001600     TRUE 0.900 8.000 0.000 NA   NA
 6152242 6152243 HcinC1_010100001600 HcinC1_010100001605     FALSE 0.041 222.000 0.000 1.000   NA
 6152243 6152244 HcinC1_010100001605 HcinC1_010100001610     TRUE 0.899 -3.000 0.000 0.006   NA
 6152244 6152245 HcinC1_010100001610 HcinC1_010100001615   rpsU FALSE 0.043 217.000 0.000 1.000   NA
 6152246 6152247 HcinC1_010100t01922 HcinC1_010100001620     FALSE 0.414 49.000 0.000 NA   NA
 6152247 6152248 HcinC1_010100001620 HcinC1_010100001625     FALSE 0.319 62.000 0.000 NA   NA
 6152249 6152250 HcinC1_010100001630 HcinC1_010100001635     TRUE 0.990 11.000 0.114 1.000 Y NA
 6152250 6152251 HcinC1_010100001635 HcinC1_010100001640     TRUE 0.982 24.000 0.184 1.000   NA
 6152251 6152252 HcinC1_010100001640 HcinC1_010100t01924     FALSE 0.027 305.000 0.000 NA   NA
 6152252 6152253 HcinC1_010100t01924 HcinC1_010100001645     FALSE 0.363 -38.000 0.000 NA   NA
 6152254 6152255 HcinC1_010100001650 HcinC1_010100001655     TRUE 0.615 -70.000 0.031 NA   NA
 6152255 6152256 HcinC1_010100001655 HcinC1_010100001660   trmB TRUE 0.960 22.000 0.060 NA   NA
 6152256 6152257 HcinC1_010100001660 HcinC1_010100001665 trmB   TRUE 0.973 4.000 0.044 1.000   NA
 6152257 6152258 HcinC1_010100001665 HcinC1_010100001670     TRUE 0.782 -13.000 0.024 NA   NA
 6152258 6152259 HcinC1_010100001670 HcinC1_010100001675     TRUE 0.970 0.000 0.057 NA   NA
 6152259 6152260 HcinC1_010100001675 HcinC1_010100001680     FALSE 0.297 64.000 0.000 NA N NA
 6152260 6152261 HcinC1_010100001680 HcinC1_010100001685   fliD FALSE 0.328 60.000 0.000 NA Y NA
 6152261 6152262 HcinC1_010100001685 HcinC1_010100001690 fliD fliS TRUE 0.998 18.000 0.608 0.003 Y NA
 6152262 6152263 HcinC1_010100001690 HcinC1_010100001695 fliS   TRUE 0.807 -16.000 0.038 NA   NA
 6152263 6152264 HcinC1_010100001695 HcinC1_010100001700     FALSE 0.314 149.000 0.077 NA   NA
 6152265 6152266 HcinC1_010100001705 HcinC1_010100001710 gpsA   TRUE 0.669 36.000 0.007 NA   NA
 6152267 6152268 HcinC1_010100001715 HcinC1_010100001720 gatB   TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152268 6152269 HcinC1_010100001720 HcinC1_010100001725     FALSE 0.323 -82.000 0.000 NA   NA
 6152269 6152270 HcinC1_010100001725 HcinC1_010100001740     FALSE 0.017 3751.000 0.000 NA   NA
 6152270 6152271 HcinC1_010100001740 HcinC1_010100001745     TRUE 0.902 13.000 0.000 NA   NA
 6152271 6152272 HcinC1_010100001745 HcinC1_010100001750     FALSE 0.024 370.000 0.000 NA   NA
 6152272 6152273 HcinC1_010100001750 HcinC1_010100001755     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6152273 6152274 HcinC1_010100001755 HcinC1_010100001760     FALSE 0.044 185.000 0.000 NA   NA
 6152275 6152276 HcinC1_010100001765 HcinC1_010100001770   ispG FALSE 0.171 103.000 0.003 1.000 N NA
 6152277 6152278 HcinC1_010100001775 HcinC1_010100001780 hypA   TRUE 0.906 22.000 0.018 NA   NA
 6152278 6152279 HcinC1_010100001780 HcinC1_010100001785   lpxB TRUE 0.931 10.000 0.003 NA   NA
 6152279 6152280 HcinC1_010100001785 HcinC1_010100001790 lpxB   FALSE 0.129 97.000 0.000 NA Y NA
 6152280 6152281 HcinC1_010100001790 HcinC1_010100001795     TRUE 0.577 34.000 0.000 NA   NA
 6152281 6152282 HcinC1_010100001795 HcinC1_010100001800     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6152282 6152283 HcinC1_010100001800 HcinC1_010100001805     TRUE 0.866 3.000 0.000 NA   NA
 6152283 6152284 HcinC1_010100001805 HcinC1_010100001810     TRUE 0.895 4.000 0.000 1.000   NA
 6152285 6152286 HcinC1_010100001815 HcinC1_010100001820     FALSE 0.101 109.000 0.000 NA   NA
 6152287 6152288 HcinC1_010100001825 HcinC1_010100001830     TRUE 0.489 40.000 0.000 NA   NA
 6152291 6152292 HcinC1_010100001845 HcinC1_010100001850     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152292 6152293 HcinC1_010100001850 HcinC1_010100001855     TRUE 0.895 15.000 0.000 NA   NA
 6152293 6152294 HcinC1_010100001855 HcinC1_010100001860     FALSE 0.044 215.000 0.000 1.000 N NA
 6152294 6152295 HcinC1_010100001860 HcinC1_010100001865     TRUE 0.506 39.000 0.000 NA   NA
 6152296 6152297 HcinC1_010100001870 HcinC1_010100001875     TRUE 0.571 -13.000 0.000 NA   NA
 6152297 6152298 HcinC1_010100001875 HcinC1_010100001880     FALSE 0.092 403.000 0.042 NA   NA
 6152299 6152300 HcinC1_010100001885 HcinC1_010100001890     FALSE 0.107 105.000 0.000 NA   NA
 6152300 6152301 HcinC1_010100001890 HcinC1_010100001895     FALSE 0.039 204.000 0.000 NA   NA
 6152301 6152302 HcinC1_010100001895 HcinC1_010100001900     TRUE 0.980 0.000 0.095 NA   NA
 6152302 6152303 HcinC1_010100001900 HcinC1_010100001915     FALSE 0.020 1020.000 0.000 NA   NA
 6152304 6152305 HcinC1_010100001924 HcinC1_010100001929 alaS   TRUE 0.930 13.000 0.002 1.000 N NA
 6152305 6152306 HcinC1_010100001929 HcinC1_010100001934   pdxA FALSE 0.372 60.000 0.000 1.000 N NA
 6152306 6152307 HcinC1_010100001934 HcinC1_010100001939 pdxA   TRUE 0.925 -12.000 0.048 0.001 Y NA
 6152307 6152308 HcinC1_010100001939 HcinC1_010100001944   ilvH TRUE 0.934 15.000 0.004 1.000 N NA
 6152308 6152309 HcinC1_010100001944 HcinC1_010100001949 ilvH   TRUE 0.996 11.000 0.249 0.001 Y NA
 6152310 6152311 HcinC1_010100001954 HcinC1_010100001959     FALSE 0.097 111.000 0.000 NA   NA
 6152311 6152312 HcinC1_010100001959 HcinC1_010100001964     FALSE 0.290 151.000 0.069 NA   NA
 6152312 6152313 HcinC1_010100001964 HcinC1_010100001969     TRUE 0.984 16.000 0.091 NA   NA
 6152313 6152314 HcinC1_010100001969 HcinC1_010100001974     TRUE 0.789 62.000 0.091 NA   NA
 6152314 6152315 HcinC1_010100001974 HcinC1_010100001979     TRUE 0.807 22.000 0.000 NA   NA
 6152315 6152316 HcinC1_010100001979 HcinC1_010100001984     FALSE 0.022 455.000 0.000 NA   NA
 6152317 6152318 HcinC1_010100001989 HcinC1_010100001994     TRUE 0.959 3.000 0.035 NA   NA
 6152318 6152319 HcinC1_010100001994 HcinC1_010100001999     TRUE 0.980 12.000 0.056 NA   NA
 6152319 6152320 HcinC1_010100001999 HcinC1_010100002004     TRUE 0.994 5.000 0.269 1.000   NA
 6152320 6152321 HcinC1_010100002004 HcinC1_010100002009     TRUE 0.475 -19.000 0.000 NA   NA
 6152322 6152323 HcinC1_010100002014 HcinC1_010100002019     TRUE 0.831 79.000 0.290 NA   NA
 6152323 6152324 HcinC1_010100002019 HcinC1_010100002024     TRUE 0.962 69.000 0.677 0.004   NA
 6152324 6152325 HcinC1_010100002024 HcinC1_010100002029   flgK TRUE 0.998 9.000 0.558 0.003   NA
 6152325 6152326 HcinC1_010100002029 HcinC1_010100002034 flgK   TRUE 0.945 19.000 0.023 1.000   NA
 6152327 6152328 HcinC1_010100002039 HcinC1_010100002044     TRUE 0.838 -16.000 0.051 NA   NA
 6152328 6152329 HcinC1_010100002044 HcinC1_010100002049     TRUE 0.904 -13.000 0.067 1.000 N NA
 6152329 6152330 HcinC1_010100002049 HcinC1_010100002054     TRUE 0.831 48.000 0.063 1.000 N NA
 6152330 6152331 HcinC1_010100002054 HcinC1_010100002059   aroB TRUE 0.956 -3.000 0.041 1.000 N NA
 6152331 6152332 HcinC1_010100002059 HcinC1_010100002064 aroB   TRUE 0.955 0.000 0.031 1.000   NA
 6152332 6152333 HcinC1_010100002064 HcinC1_010100002069     FALSE 0.284 84.000 0.010 NA   NA
 6152333 6152334 HcinC1_010100002069 HcinC1_010100002074     TRUE 0.942 11.000 0.007 NA   NA
 6152334 6152335 HcinC1_010100002074 HcinC1_010100002079     TRUE 0.966 18.000 0.043 NA   NA
 6152335 6152336 HcinC1_010100002079 HcinC1_010100002084     FALSE 0.025 484.000 0.000 1.000   NA
 6152336 6152337 HcinC1_010100002084 HcinC1_010100002089     TRUE 0.575 50.000 0.000 0.003   NA
 6152337 6152338 HcinC1_010100002089 HcinC1_010100002094     FALSE 0.406 50.000 0.000 NA   NA
 6152338 6152339 HcinC1_010100002094 HcinC1_010100002099     FALSE 0.383 53.000 0.000 NA   NA
 6152339 6152340 HcinC1_010100002099 HcinC1_010100002104     FALSE 0.068 136.000 0.000 NA   NA
 6152340 6152341 HcinC1_010100002104 HcinC1_010100002109     TRUE 0.975 -3.000 0.095 NA   NA
 6152341 6152342 HcinC1_010100002109 HcinC1_010100002114     FALSE 0.280 66.000 0.000 NA   NA
 6152343 6152344 HcinC1_010100002119 HcinC1_010100002124     FALSE 0.059 150.000 0.000 NA   NA
 6152344 6152345 HcinC1_010100002124 HcinC1_010100002129     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6152345 6152346 HcinC1_010100002129 HcinC1_010100002134     TRUE 0.902 13.000 0.000 NA   NA
 6152346 6152347 HcinC1_010100002134 HcinC1_010100002139     TRUE 0.985 16.000 0.097 NA   NA
 6152347 6152348 HcinC1_010100002139 HcinC1_010100002144     TRUE 0.475 -19.000 0.000 NA   NA
 6152348 6152349 HcinC1_010100002144 HcinC1_010100002149     TRUE 0.948 -7.000 0.080 NA   NA
 6152349 6152350 HcinC1_010100002149 HcinC1_010100002154     FALSE 0.030 264.000 0.000 NA   NA
 6152350 6152351 HcinC1_010100002154 HcinC1_010100002159   mpi TRUE 0.719 28.000 0.000 1.000 N NA
 6152354 6152355 HcinC1_010100002174 HcinC1_010100002179     TRUE 0.950 -3.000 0.041 NA   NA
 6152355 6152356 HcinC1_010100002179 HcinC1_010100002184     TRUE 0.500 64.000 0.019 NA   NA
 6152356 6152357 HcinC1_010100002184 HcinC1_010100002189     TRUE 0.786 34.000 0.019 1.000   NA
 6152358 6152359 HcinC1_010100002194 HcinC1_010100002199     FALSE 0.020 943.000 0.000 NA   NA
 6152360 6152361 HcinC1_010100002204 HcinC1_010100002209     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152361 6152362 HcinC1_010100002209 HcinC1_010100002214     TRUE 0.612 -13.000 0.000 1.000   NA
 6152362 6152363 HcinC1_010100002214 HcinC1_010100002219     TRUE 0.904 12.000 0.000 NA   NA
 6152363 6152364 HcinC1_010100002219 HcinC1_010100002224     FALSE 0.044 185.000 0.000 NA   NA
 6152364 6152365 HcinC1_010100002224 HcinC1_010100002229     FALSE 0.089 116.000 0.000 NA   NA
 6152365 6152366 HcinC1_010100002229 HcinC1_010100002234     FALSE 0.072 130.000 0.000 NA   NA
 6152366 6152367 HcinC1_010100002234 HcinC1_010100002239     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6152367 6152368 HcinC1_010100002239 HcinC1_010100002244     TRUE 0.887 16.000 0.000 NA   NA
 6152368 6152369 HcinC1_010100002244 HcinC1_010100002249     FALSE 0.123 99.000 0.000 NA   NA
 6152369 6152370 HcinC1_010100002249 HcinC1_010100002254     TRUE 0.895 15.000 0.000 NA   NA
 6152370 6152371 HcinC1_010100002254 HcinC1_010100002259     FALSE 0.069 135.000 0.000 NA   NA
 6152371 6152372 HcinC1_010100002259 HcinC1_010100002264     FALSE 0.083 122.000 0.000 NA   NA
 6152372 6152373 HcinC1_010100002264 HcinC1_010100002269     TRUE 0.788 23.000 0.000 NA   NA
 6152373 6152374 HcinC1_010100002269 HcinC1_010100002274     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6152374 6152375 HcinC1_010100002274 HcinC1_010100002279     FALSE 0.051 170.000 0.000 NA   NA
 6152375 6152376 HcinC1_010100002279 HcinC1_010100002284     FALSE 0.406 50.000 0.000 NA   NA
 6152376 6152377 HcinC1_010100002284 HcinC1_010100002289     TRUE 0.906 11.000 0.000 NA   NA
 6152377 6152378 HcinC1_010100002289 HcinC1_010100002294     TRUE 0.902 13.000 0.000 NA   NA
 6152378 6152379 HcinC1_010100002294 HcinC1_010100002299     TRUE 0.866 3.000 0.000 NA   NA
 6152379 6152380 HcinC1_010100002299 HcinC1_010100002304     FALSE 0.048 175.000 0.000 NA   NA
 6152380 6152381 HcinC1_010100002304 HcinC1_010100002309     TRUE 0.475 -19.000 0.000 NA   NA
 6152381 6152382 HcinC1_010100002309 HcinC1_010100002314     TRUE 0.571 -13.000 0.000 NA   NA
 6152382 6152383 HcinC1_010100002314 HcinC1_010100002319     FALSE 0.024 382.000 0.000 NA   NA
 6152383 6152384 HcinC1_010100002319 HcinC1_010100002324     TRUE 0.478 41.000 0.000 NA   NA
 6152384 6152385 HcinC1_010100002324 HcinC1_010100002329     FALSE 0.028 286.000 0.000 NA   NA
 6152385 6152386 HcinC1_010100002329 HcinC1_010100002334     TRUE 0.515 -16.000 0.000 NA   NA
 6152387 6152388 HcinC1_010100002339 HcinC1_010100002344     TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 6152388 6152389 HcinC1_010100002344 HcinC1_010100002349     FALSE 0.223 74.000 0.000 NA   NA
 6152389 6152390 HcinC1_010100002349 HcinC1_010100002354     TRUE 0.902 13.000 0.000 NA   NA
 6152390 6152391 HcinC1_010100002354 HcinC1_010100002359     TRUE 0.861 1.000 0.000 NA   NA
 6152391 6152392 HcinC1_010100002359 HcinC1_010100002364     TRUE 0.866 3.000 0.000 NA   NA
 6152392 6152393 HcinC1_010100002364 HcinC1_010100002369     TRUE 0.906 10.000 0.000 NA   NA
 6152393 6152394 HcinC1_010100002369 HcinC1_010100002374     TRUE 0.890 6.000 0.000 NA   NA
 6152394 6152395 HcinC1_010100002374 HcinC1_010100002379     TRUE 0.878 4.000 0.000 NA   NA
 6152395 6152396 HcinC1_010100002379 HcinC1_010100002384     TRUE 0.741 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 6152396 6152397 HcinC1_010100002384 HcinC1_010100002389     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152397 6152398 HcinC1_010100002389 HcinC1_010100002394     TRUE 0.906 10.000 0.000 NA   NA
 6152398 6152399 HcinC1_010100002394 HcinC1_010100002399     TRUE 0.887 16.000 0.000 NA   NA
 6152399 6152400 HcinC1_010100002399 HcinC1_010100002404     TRUE 0.788 23.000 0.000 NA   NA
 6152402 6152403 HcinC1_010100002409 HcinC1_010100002414     TRUE 0.991 7.000 0.158 NA   NA
 6152403 6152404 HcinC1_010100002414 HcinC1_010100002419     TRUE 0.927 19.000 0.014 NA   NA
 6152404 6152405 HcinC1_010100002419 HcinC1_010100002424     TRUE 0.920 11.000 0.000 1.000   NA
 6152405 6152406 HcinC1_010100002424 HcinC1_010100002429     FALSE 0.040 200.000 0.000 NA   NA
 6152407 6152408 HcinC1_010100002434 HcinC1_010100002439 flgH   TRUE 0.586 101.000 0.109 1.000 N NA
 6152411 6152412 HcinC1_010100002454 HcinC1_010100002459 miaA   TRUE 0.826 28.000 0.011 1.000 N NA
 6152412 6152413 HcinC1_010100002459 HcinC1_010100002464     TRUE 0.607 49.000 0.011 1.000 N NA
 6152413 6152414 HcinC1_010100002464 HcinC1_010100002469     TRUE 0.988 -3.000 0.236 1.000 Y NA
 6152414 6152415 HcinC1_010100002469 HcinC1_010100002474     FALSE 0.049 173.000 0.000 NA   NA
 6152415 6152416 HcinC1_010100002474 HcinC1_010100002479     TRUE 0.985 10.000 0.072 NA   NA
 6152418 6152419 HcinC1_010100002489 HcinC1_010100002494     FALSE 0.066 158.000 0.000 1.000   NA
 6152419 6152420 HcinC1_010100002494 HcinC1_010100002499     FALSE 0.035 222.000 0.000 NA   NA
 6152421 6152422 HcinC1_010100002504 HcinC1_010100002509     TRUE 0.866 3.000 0.000 NA   NA
 6152423 6152424 HcinC1_010100002514 HcinC1_010100002519     FALSE 0.033 235.000 0.000 NA   NA
 6152424 6152425 HcinC1_010100002519 HcinC1_010100002524     TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 6152426 6152427 HcinC1_010100002529 HcinC1_010100002534     TRUE 0.954 9.000 0.012 1.000 N NA
 6152427 6152428 HcinC1_010100002534 HcinC1_010100002539   argC TRUE 0.907 3.000 0.003 1.000 Y NA
 6152428 6152429 HcinC1_010100002539 HcinC1_010100002544 argC   TRUE 0.960 7.000 0.021 1.000   NA
 6152429 6152430 HcinC1_010100002544 HcinC1_010100002549     TRUE 0.970 -3.000 0.065 1.000   NA
 6152430 6152431 HcinC1_010100002549 HcinC1_010100002554     TRUE 0.940 44.000 0.147 0.008 Y NA
 6152431 6152432 HcinC1_010100002554 HcinC1_010100002559     TRUE 0.991 3.000 0.137 0.015 Y NA
 6152432 6152433 HcinC1_010100002559 HcinC1_010100002564     TRUE 0.729 26.000 0.000 NA   NA
 6152433 6152434 HcinC1_010100002564 HcinC1_010100002569     FALSE 0.050 171.000 0.000 NA   NA
 6152435 6152436 HcinC1_010100002574 HcinC1_010100002579     TRUE 0.747 -6.000 0.000 NA N NA
 6152437 6152438 HcinC1_010100002584 HcinC1_010100002589     TRUE 0.815 23.000 0.000 1.000 N NA
 6152438 6152439 HcinC1_010100002589 HcinC1_010100002594     TRUE 0.918 12.000 0.000 1.000 N NA
 6152439 6152440 HcinC1_010100002594 HcinC1_010100002599     FALSE 0.106 136.000 0.000 0.099 N NA
 6152440 6152441 HcinC1_010100002599 HcinC1_010100002604     TRUE 0.846 32.000 0.033 NA   NA
 6152441 6152442 HcinC1_010100002604 HcinC1_010100002609   rpmF TRUE 0.955 3.000 0.032 NA   NA
 6152442 6152443 HcinC1_010100002609 HcinC1_010100002614 rpmF   TRUE 0.991 23.000 0.418 1.000 N NA
 6152443 6152444 HcinC1_010100002614 HcinC1_010100002619     TRUE 0.954 27.000 0.058 0.006 Y NA
 6152444 6152445 HcinC1_010100002619 HcinC1_010100002624     TRUE 0.773 46.000 0.038 1.000 N NA
 6152446 6152447 HcinC1_010100002631 HcinC1_010100002636 tgt   FALSE 0.064 159.000 0.000 1.000   NA
 6152447 6152448 HcinC1_010100002636 HcinC1_010100002641     FALSE 0.280 66.000 0.000 NA   NA
 6152450 6152451 HcinC1_010100002651 HcinC1_010100002656     FALSE 0.044 211.000 0.000 1.000 N NA
 6152451 6152452 HcinC1_010100002656 HcinC1_010100002661     TRUE 0.991 1.000 0.128 0.002 Y NA
 6152452 6152453 HcinC1_010100002661 HcinC1_010100002666   frdB TRUE 0.992 0.000 0.153 0.002 Y NA
 6152453 6152454 HcinC1_010100002666 HcinC1_010100002671 frdB   TRUE 0.528 54.000 0.006 1.000 N NA
 6152455 6152456 HcinC1_010100002676 HcinC1_010100002681   argJ FALSE 0.183 113.000 0.015 NA   NA
 6152456 6152457 HcinC1_010100002681 HcinC1_010100002686 argJ   TRUE 0.868 -7.000 0.019 1.000 N NA
 6152457 6152458 HcinC1_010100002686 HcinC1_010100002691   rpmB TRUE 0.937 21.000 0.025 1.000 N NA
 6152458 6152459 HcinC1_010100002691 HcinC1_010100002696 rpmB   FALSE 0.358 66.000 0.002 1.000 N NA
 6152459 6152460 HcinC1_010100002696 HcinC1_010100002701     TRUE 0.997 10.000 0.464 1.000 N NA
 6152462 6152463 HcinC1_010100002711 HcinC1_010100002716     TRUE 0.571 -13.000 0.000 NA   NA
 6152463 6152464 HcinC1_010100002716 HcinC1_010100002721     TRUE 0.906 39.000 0.105 NA   NA
 6152464 6152465 HcinC1_010100002721 HcinC1_010100002726     TRUE 0.952 1.000 0.031 NA N NA
 6152465 6152466 HcinC1_010100002726 HcinC1_010100002731     TRUE 0.975 13.000 0.037 1.000 N NA
 6152467 6152468 HcinC1_010100002736 HcinC1_010100t02983     TRUE 0.571 -13.000 0.000 NA   NA
 6152469 6152470 HcinC1_010100002741 HcinC1_010100002746   mraW TRUE 0.937 -3.000 0.031 NA   NA
 6152470 6152471 HcinC1_010100002746 HcinC1_010100002751 mraW   TRUE 0.913 15.000 0.002 NA   NA
 6152471 6152472 HcinC1_010100002751 HcinC1_010100002756     TRUE 0.958 -7.000 0.103 NA   NA
 6152472 6152473 HcinC1_010100002756 HcinC1_010100002761     TRUE 0.998 4.000 1.000 NA   NA
 6152473 6152474 HcinC1_010100002761 HcinC1_010100002766     TRUE 0.567 190.000 0.462 NA   NA
 6152474 6152475 HcinC1_010100002766 HcinC1_010100002771     TRUE 0.950 1.000 0.029 NA   NA
 6152475 6152476 HcinC1_010100002771 HcinC1_010100002776     TRUE 0.836 33.000 0.033 NA   NA
 6152476 6152477 HcinC1_010100002776 HcinC1_010100002781     FALSE 0.059 151.000 0.000 NA   NA
 6152477 6152478 HcinC1_010100002781 HcinC1_010100002786     TRUE 0.998 11.000 0.667 NA Y NA
 6152478 6152479 HcinC1_010100002786 HcinC1_010100002791     FALSE 0.144 158.000 0.027 NA   NA
 6152479 6152480 HcinC1_010100002791 HcinC1_010100002796     TRUE 0.971 -3.000 0.080 NA   NA
 6152480 6152481 HcinC1_010100002796 HcinC1_010100002801     TRUE 0.931 6.000 0.007 NA   NA
 6152481 6152482 HcinC1_010100002801 HcinC1_010100002806   hisZ TRUE 0.950 35.000 0.161 1.000 N NA
 6152483 6152484 HcinC1_010100002811 HcinC1_010100002816 mnmA   FALSE 0.029 354.000 0.000 1.000 N NA
 6152486 6152487 HcinC1_010100002826 HcinC1_010100002831 aspA   FALSE 0.211 556.000 0.127 1.000   NA
 6152491 6152492 HcinC1_010100002851 HcinC1_010100002856   gmk TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152492 6152493 HcinC1_010100002856 HcinC1_010100002861 gmk   TRUE 0.470 47.000 0.000 1.000 N NA
 6152493 6152494 HcinC1_010100002861 HcinC1_010100002866   argS TRUE 0.958 15.000 0.020 1.000 N NA
 6152494 6152495 HcinC1_010100002866 HcinC1_010100002871 argS   TRUE 0.886 3.000 0.002 NA N NA
 6152495 6152496 HcinC1_010100002871 HcinC1_010100002876     TRUE 0.993 -10.000 0.915 NA Y NA
 6152498 6152499 HcinC1_010100002886 HcinC1_010100002891     TRUE 0.979 -3.000 0.100 1.000   NA
 6152500 6152501 HcinC1_010100002896 HcinC1_010100002901     TRUE 0.945 9.000 0.000 0.011   NA
 6152501 6152502 HcinC1_010100002901 HcinC1_010100002906     FALSE 0.066 139.000 0.000 NA   NA
 6152502 6152503 HcinC1_010100002906 HcinC1_010100002911     TRUE 0.881 82.000 0.500 NA Y NA
 6152503 6152504 HcinC1_010100002911 HcinC1_010100002916     TRUE 0.895 38.000 0.091 NA Y NA
 6152504 6152505 HcinC1_010100002916 HcinC1_010100002921     TRUE 0.992 2.000 0.274 1.000 Y NA
 6152505 6152506 HcinC1_010100002921 HcinC1_010100002926     FALSE 0.139 159.000 0.021 1.000 N NA
 6152506 6152507 HcinC1_010100002926 HcinC1_010100002931     TRUE 0.974 0.000 0.059 1.000   NA
 6152507 6152508 HcinC1_010100002931 HcinC1_010100002936     FALSE 0.269 371.000 0.164 1.000   NA
 6152508 6152509 HcinC1_010100002936 HcinC1_010100002941     FALSE 0.406 50.000 0.000 NA   NA
 6152509 6152510 HcinC1_010100002941 HcinC1_010100002946     TRUE 0.848 -22.000 0.077 NA   NA
 6152510 6152511 HcinC1_010100002946 HcinC1_010100002951     TRUE 0.996 4.000 0.462 1.000   NA
 6152513 6152514 HcinC1_010100t02985 HcinC1_010100002961     FALSE 0.040 201.000 0.000 NA   NA
 6152515 6152516 HcinC1_010100002966 HcinC1_010100002971     TRUE 0.836 27.000 0.014 NA   NA
 6152516 6152517 HcinC1_010100002971 HcinC1_010100002976     FALSE 0.116 101.000 0.000 NA   NA
 6152518 6152519 HcinC1_010100002985 HcinC1_010100002990     TRUE 0.963 4.000 0.035 NA   NA
 6152519 6152520 HcinC1_010100002990 HcinC1_010100002995     TRUE 0.773 61.000 0.066 1.000 N NA
 6152520 6152521 HcinC1_010100002995 HcinC1_010100003000     TRUE 0.506 39.000 0.000 NA   NA
 6152521 6152522 HcinC1_010100003000 HcinC1_010100003005     FALSE 0.075 128.000 0.000 NA   NA
 6152523 6152524 HcinC1_010100003010 HcinC1_010100003015     FALSE 0.307 63.000 0.000 NA   NA
 6152525 6152526 HcinC1_010100003020 HcinC1_010100003025     FALSE 0.100 166.000 0.008 1.000   NA
 6152526 6152527 HcinC1_010100003025 HcinC1_010100003030     TRUE 0.858 25.000 0.008 1.000 N NA
 6152527 6152528 HcinC1_010100003030 HcinC1_010100003035     TRUE 0.965 35.000 0.284 1.000 Y NA
 6152528 6152529 HcinC1_010100003035 HcinC1_010100003040     FALSE 0.194 192.000 0.053 1.000 N NA
 6152529 6152530 HcinC1_010100003040 HcinC1_010100003045     FALSE 0.136 119.000 0.004 1.000 N NA
 6152530 6152531 HcinC1_010100003045 HcinC1_010100003050     TRUE 0.666 36.000 0.000 0.059 N NA
 6152532 6152533 HcinC1_010100003055 HcinC1_010100003060     FALSE 0.383 53.000 0.000 NA   NA
 6152535 6152536 HcinC1_010100003070 HcinC1_010100003075     FALSE 0.027 410.000 0.000 1.000   NA
 6152536 6152537 HcinC1_010100003075 HcinC1_010100003080     TRUE 0.808 -7.000 0.000 0.050   NA
 6152537 6152538 HcinC1_010100003080 HcinC1_010100003085     FALSE 0.244 75.000 0.000 1.000   NA
 6152538 6152539 HcinC1_010100003085 HcinC1_010100003090     FALSE 0.099 120.000 0.000 1.000   NA
 6152539 6152540 HcinC1_010100003090 HcinC1_010100003095     TRUE 0.729 26.000 0.000 NA   NA
 6152540 6152541 HcinC1_010100003095 HcinC1_010100003100     TRUE 0.878 4.000 0.000 NA   NA
 6152541 6152542 HcinC1_010100003100 HcinC1_010100003105     TRUE 0.995 4.000 0.429 1.000   NA
 6152542 6152543 HcinC1_010100003105 HcinC1_010100003110     TRUE 0.875 0.000 0.000 1.000   NA
 6152543 6152544 HcinC1_010100003110 HcinC1_010100003115     TRUE 0.983 -19.000 0.625 0.004 Y NA
 6152544 6152545 HcinC1_010100003115 HcinC1_010100003120     FALSE 0.026 309.000 0.000 NA N NA
 6152545 6152546 HcinC1_010100003120 HcinC1_010100003125     FALSE 0.343 98.000 0.034 NA   NA
 6152547 6152548 HcinC1_010100003130 HcinC1_010100003135     FALSE 0.210 76.000 0.000 NA   NA
 6152548 6152549 HcinC1_010100003135 HcinC1_010100003140     TRUE 0.955 0.000 0.034 NA   NA
 6152549 6152550 HcinC1_010100003140 HcinC1_010100003145     TRUE 0.948 11.000 0.006 1.000   NA
 6152551 6152552 HcinC1_010100003150 HcinC1_010100003155     TRUE 0.948 1.000 0.028 NA N NA
 6152552 6152553 HcinC1_010100003155 HcinC1_010100003160     TRUE 0.955 28.000 0.115 NA Y NA
 6152553 6152554 HcinC1_010100003160 HcinC1_010100003165   hisB TRUE 0.720 39.000 0.022 NA N NA
 6152554 6152555 HcinC1_010100003165 HcinC1_010100003170 hisB   TRUE 0.924 -3.000 0.018 1.000   NA
 6152555 6152556 HcinC1_010100003170 HcinC1_010100003175     TRUE 0.704 -19.000 0.023 NA   NA
 6152556 6152557 HcinC1_010100003175 HcinC1_010100003180     TRUE 0.947 -3.000 0.038 NA   NA
 6152557 6152558 HcinC1_010100003180 HcinC1_010100003185   engB TRUE 0.950 -3.000 0.041 NA   NA
 6152558 6152559 HcinC1_010100003185 HcinC1_010100003190 engB   TRUE 0.842 -10.000 0.023 1.000   NA
 6152559 6152560 HcinC1_010100003190 HcinC1_010100003195     TRUE 0.663 -54.000 0.036 NA   NA
 6152560 6152561 HcinC1_010100003195 HcinC1_010100003200     TRUE 0.938 -3.000 0.031 NA   NA
 6152561 6152562 HcinC1_010100003200 HcinC1_010100003205     TRUE 0.790 31.000 0.012 1.000   NA
 6152562 6152563 HcinC1_010100003205 HcinC1_010100003210     FALSE 0.393 75.000 0.014 1.000   NA
 6152563 6152564 HcinC1_010100003210 HcinC1_010100003215     TRUE 0.466 53.000 0.002 1.000 N NA
 6152564 6152565 HcinC1_010100003215 HcinC1_010100003220     TRUE 0.707 -19.000 0.024 NA   NA
 6152565 6152566 HcinC1_010100003220 HcinC1_010100003225     TRUE 0.807 22.000 0.000 NA   NA
 6152567 6152568 HcinC1_010100003230 HcinC1_010100003235     TRUE 0.571 -13.000 0.000 NA   NA
 6152568 6152569 HcinC1_010100003235 HcinC1_010100003240     TRUE 0.489 40.000 0.000 NA   NA
 6152569 6152570 HcinC1_010100003240 HcinC1_010100003245     TRUE 0.663 29.000 0.000 NA   NA
 6152572 6152573 HcinC1_010100003255 HcinC1_010100003260     FALSE 0.044 186.000 0.000 NA   NA
 6152573 6152574 HcinC1_010100003260 HcinC1_010100003265     TRUE 0.999 11.000 1.000 NA   NA
 6152574 6152575 HcinC1_010100003265 HcinC1_010100003270     TRUE 0.998 0.000 1.000 NA   NA
 6152575 6152576 HcinC1_010100003270 HcinC1_010100003275     TRUE 0.986 -3.000 0.200 NA   NA
 6152576 6152577 HcinC1_010100003275 HcinC1_010100003280     TRUE 0.990 21.000 0.312 NA   NA
 6152577 6152578 HcinC1_010100003280 HcinC1_010100003285     TRUE 0.729 26.000 0.000 NA   NA
 6152578 6152579 HcinC1_010100003285 HcinC1_010100003290     TRUE 0.906 11.000 0.000 NA   NA
 6152579 6152580 HcinC1_010100003290 HcinC1_010100003295     TRUE 0.998 11.000 0.727 NA   NA
 6152580 6152581 HcinC1_010100003295 HcinC1_010100003300     TRUE 0.996 15.000 0.262 0.002 N NA
 6152581 6152582 HcinC1_010100003300 HcinC1_010100003305     TRUE 0.998 0.000 0.738 0.002 N NA
 6152582 6152583 HcinC1_010100003305 HcinC1_010100003310     TRUE 0.997 12.000 0.283 0.002 N NA
 6152583 6152584 HcinC1_010100003310 HcinC1_010100003315     FALSE 0.171 101.000 0.003 1.000 N NA
 6152584 6152585 HcinC1_010100003315 HcinC1_010100003320     FALSE 0.103 108.000 0.000 NA   NA
 6152585 6152586 HcinC1_010100003320 HcinC1_010100003325     FALSE 0.377 -36.000 0.000 NA   NA
 6152586 6152587 HcinC1_010100003325 HcinC1_010100003330     FALSE 0.025 340.000 0.000 NA   NA
 6152587 6152588 HcinC1_010100003330 HcinC1_010100003335     FALSE 0.051 187.000 0.000 1.000 N NA
 6152588 6152589 HcinC1_010100003335 HcinC1_010100003340     FALSE 0.026 452.000 0.000 1.000   NA
 6152589 6152590 HcinC1_010100003340 HcinC1_010100003345     TRUE 0.836 59.000 0.100 1.000   NA
 6152592 6152593 HcinC1_010100003355 HcinC1_010100003360   gatC TRUE 0.896 -3.000 0.006 1.000 N NA
 6152593 6152594 HcinC1_010100003360 HcinC1_010100003365 gatC aroE TRUE 0.507 50.000 0.002 1.000 N NA
 6152594 6152595 HcinC1_010100003365 HcinC1_010100003370 aroE   TRUE 0.899 0.000 0.004 NA N NA
 6152595 6152596 HcinC1_010100003370 HcinC1_010100003375     TRUE 0.906 16.000 0.002 NA N NA
 6152600 6152601 HcinC1_010100003395 HcinC1_010100003400     FALSE 0.151 91.000 0.000 NA   NA
 6152601 6152602 HcinC1_010100003400 HcinC1_010100003405     FALSE 0.390 52.000 0.000 NA   NA
 6152602 6152603 HcinC1_010100003405 HcinC1_010100003410     FALSE 0.174 91.000 0.000 1.000 N NA
 6152603 6152604 HcinC1_010100003410 HcinC1_010100003415     TRUE 0.450 98.000 0.059 NA   NA
 6152605 6152606 HcinC1_010100003420 HcinC1_010100003425     TRUE 0.942 3.000 0.016 1.000 N NA
 6152606 6152607 HcinC1_010100003425 HcinC1_010100003430     TRUE 0.706 -28.000 0.035 NA   NA
 6152607 6152608 HcinC1_010100003430 HcinC1_010100003435     TRUE 0.943 20.000 0.029 NA   NA
 6152608 6152609 HcinC1_010100003435 HcinC1_010100003440     TRUE 0.995 1.000 0.523 NA   NA
 6152610 6152611 HcinC1_010100003445 HcinC1_010100003450     FALSE 0.298 64.000 0.000 NA   NA
 6152611 6152612 HcinC1_010100003450 HcinC1_010100003455     TRUE 0.981 14.000 0.055 1.000 Y NA
 6152614 6152615 HcinC1_010100003465 HcinC1_010100003470     FALSE 0.138 100.000 0.000 1.000 N NA
 6152615 6152616 HcinC1_010100003470 HcinC1_010100003475     TRUE 0.949 0.000 0.026 1.000 Y NA
 6152616 6152617 HcinC1_010100003475 HcinC1_010100003480     TRUE 0.763 37.000 0.022 1.000   NA
 6152617 6152618 HcinC1_010100003480 HcinC1_010100003485   minE TRUE 0.935 1.000 0.018 NA   NA
 6152618 6152619 HcinC1_010100003485 HcinC1_010100003490 minE   TRUE 0.995 -3.000 0.618 NA Y NA
 6152619 6152620 HcinC1_010100003490 HcinC1_010100003495     FALSE 0.269 67.000 0.000 NA   NA
 6152620 6152621 HcinC1_010100003495 HcinC1_010100003500     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6152621 6152622 HcinC1_010100003500 HcinC1_010100003505     TRUE 0.890 6.000 0.000 NA   NA
 6152622 6152623 HcinC1_010100003505 HcinC1_010100003510     FALSE 0.213 82.000 0.000 1.000 N NA
 6152623 6152624 HcinC1_010100003510 HcinC1_010100003515     TRUE 0.996 0.000 0.444 0.050 Y NA
 6152625 6152626 HcinC1_010100003520 HcinC1_010100003525     TRUE 0.862 2.000 0.000 NA   NA
 6152627 6152628 HcinC1_010100003530 HcinC1_010100003535     TRUE 0.571 -13.000 0.000 NA   NA
 6152628 6152629 HcinC1_010100003535 HcinC1_010100003540     TRUE 0.887 5.000 0.000 NA   NA
 6152629 6152630 HcinC1_010100003540 HcinC1_010100003545     TRUE 0.991 -3.000 0.250 0.049 Y NA
 6152630 6152631 HcinC1_010100003545 HcinC1_010100003550     FALSE 0.063 160.000 0.000 1.000 N NA
 6152631 6152632 HcinC1_010100003550 HcinC1_010100003555     TRUE 0.748 -6.000 0.000 NA   NA
 6152632 6152633 HcinC1_010100003555 HcinC1_010100003560     TRUE 0.828 21.000 0.000 NA   NA
 6152633 6152634 HcinC1_010100003560 HcinC1_010100003565     TRUE 0.987 -3.000 0.222 NA   NA
 6152635 6152636 HcinC1_010100003570 HcinC1_010100003575     TRUE 0.930 61.000 0.429 NA   NA
 6152636 6152637 HcinC1_010100003575 HcinC1_010100003580     TRUE 0.683 82.000 0.105 NA   NA
 6152637 6152638 HcinC1_010100003580 HcinC1_010100003585     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 6152638 6152639 HcinC1_010100003585 HcinC1_010100003590     TRUE 0.683 35.000 0.000 0.050   NA
 6152639 6152640 HcinC1_010100003590 HcinC1_010100003595     FALSE 0.082 132.000 0.000 1.000   NA
 6152640 6152641 HcinC1_010100003595 HcinC1_010100003600     FALSE 0.244 75.000 0.000 1.000   NA
 6152641 6152642 HcinC1_010100003600 HcinC1_010100003605     FALSE 0.028 280.000 0.000 NA N NA
 6152642 6152643 HcinC1_010100003605 HcinC1_010100003610     TRUE 0.647 -10.000 0.000 NA   NA
 6152643 6152644 HcinC1_010100003610 HcinC1_010100003615     TRUE 0.920 11.000 0.000 1.000   NA
 6152644 6152645 HcinC1_010100003615 HcinC1_010100003620     TRUE 0.930 19.000 0.012 1.000 N NA
 6152647 6152648 HcinC1_010100003630 HcinC1_010100003635     TRUE 0.991 -3.000 0.389 NA   NA
 6152648 6152649 HcinC1_010100003635 HcinC1_010100003640     TRUE 0.906 -12.000 0.065 NA   NA
 6152650 6152651 HcinC1_010100003650 HcinC1_010100003655     FALSE 0.412 -25.000 0.000 NA   NA
 6152651 6152652 HcinC1_010100003655 HcinC1_010100003675     FALSE 0.019 1707.000 0.000 NA   NA
 6152654 6152655 HcinC1_010100003685 HcinC1_010100003690     FALSE 0.020 701.000 0.000 NA   NA
 6152655 6152656 HcinC1_010100003690 HcinC1_010100003695   groEL FALSE 0.138 95.000 0.000 NA   NA
 6152656 6152657 HcinC1_010100003695 HcinC1_010100003700 groEL groES TRUE 0.992 22.000 0.356 0.094 Y NA
 6152657 6152658 HcinC1_010100003700 HcinC1_010100003715 groES   FALSE 0.023 1224.000 0.000 1.000 N NA
 6152659 6152660 HcinC1_010100003720 HcinC1_010100003725     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152660 6152661 HcinC1_010100003725 HcinC1_010100003730     TRUE 0.850 21.000 0.000 1.000 N NA
 6152663 6152664 HcinC1_010100003740 HcinC1_010100003745     TRUE 0.869 18.000 0.000 NA   NA
 6152665 6152666 HcinC1_010100003750 HcinC1_010100003755     FALSE 0.053 163.000 0.000 NA   NA
 6152666 6152667 HcinC1_010100003755 HcinC1_010100003760   ileS TRUE 0.964 -3.000 0.061 NA   NA
 6152669 6152670 HcinC1_010100003770 HcinC1_010100003775     TRUE 0.749 25.000 0.000 NA   NA
 6152670 6152671 HcinC1_010100003775 HcinC1_010100003780     FALSE 0.204 87.000 0.003 NA   NA
 6152671 6152672 HcinC1_010100003780 HcinC1_010100003785     TRUE 0.998 9.000 0.689 1.000 N NA
 6152672 6152673 HcinC1_010100003785 HcinC1_010100003790   clpX TRUE 0.546 81.000 0.034 0.094 N NA
 6152673 6152674 HcinC1_010100003790 HcinC1_010100003795 clpX   TRUE 0.888 -7.000 0.027 1.000 N NA
 6152674 6152675 HcinC1_010100003795 HcinC1_010100003800   fabZ TRUE 0.995 12.000 0.264 1.000 N NA
 6152675 6152676 HcinC1_010100003800 HcinC1_010100003805 fabZ   TRUE 0.726 48.000 0.035 NA   NA
 6152676 6152677 HcinC1_010100003805 HcinC1_010100003810     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152677 6152678 HcinC1_010100003810 HcinC1_010100003815     FALSE 0.052 165.000 0.000 NA   NA
 6152678 6152679 HcinC1_010100003815 HcinC1_010100003820     TRUE 0.945 0.000 0.010 0.040   NA
 6152679 6152680 HcinC1_010100003820 HcinC1_010100003825     TRUE 0.947 12.000 0.006 1.000 N NA
 6152681 6152682 HcinC1_010100003830 HcinC1_010100003835     TRUE 0.611 -82.000 0.028 1.000   NA
 6152682 6152683 HcinC1_010100003835 HcinC1_010100003840     TRUE 0.974 28.000 0.222 1.000   NA
 6152683 6152684 HcinC1_010100003840 HcinC1_010100003845     TRUE 0.894 27.000 0.033 NA   NA
 6152686 6152687 HcinC1_010100003855 HcinC1_010100003860     FALSE 0.032 237.000 0.000 NA   NA
 6152687 6152688 HcinC1_010100003860 HcinC1_010100003865     TRUE 0.807 22.000 0.000 NA   NA
 6152688 6152689 HcinC1_010100003865 HcinC1_010100003870     FALSE 0.085 120.000 0.000 NA   NA
 6152691 6152692 HcinC1_010100003880 HcinC1_010100003885     TRUE 0.910 15.000 0.000 1.000   NA
 6152692 6152693 HcinC1_010100003885 HcinC1_010100003890     TRUE 0.714 -9.000 0.000 1.000   NA
 6152693 6152694 HcinC1_010100003890 HcinC1_010100003895     TRUE 0.992 -10.000 0.615 0.001 Y NA
 6152694 6152695 HcinC1_010100003895 HcinC1_010100003900     FALSE 0.027 289.000 0.000 NA   NA
 6152695 6152696 HcinC1_010100003900 HcinC1_010100003905     FALSE 0.319 -97.000 0.000 NA   NA
 6152697 6152698 HcinC1_010100003910 HcinC1_010100003915     TRUE 0.910 0.000 0.000 0.049   NA
 6152698 6152699 HcinC1_010100003915 HcinC1_010100003920     TRUE 0.862 2.000 0.000 NA   NA
 6152699 6152700 HcinC1_010100003920 HcinC1_010100003925     TRUE 0.684 28.000 0.000 NA   NA
 6152700 6152701 HcinC1_010100003925 HcinC1_010100003930     TRUE 0.878 4.000 0.000 NA   NA
 6152701 6152702 HcinC1_010100003930 HcinC1_010100003935     TRUE 0.999 9.000 1.000 NA   NA
 6152702 6152703 HcinC1_010100003935 HcinC1_010100003940   gyrB FALSE 0.032 240.000 0.000 NA   NA
 6152703 6152704 HcinC1_010100003940 HcinC1_010100003945 gyrB   TRUE 0.917 39.000 0.114 1.000 Y NA
 6152705 6152706 HcinC1_010100003950 HcinC1_010100003955     FALSE 0.307 63.000 0.000 NA   NA
 6152706 6152707 HcinC1_010100003955 HcinC1_010100003960     TRUE 0.997 -3.000 0.912 NA Y NA
 6152707 6152708 HcinC1_010100003960 HcinC1_010100003965     TRUE 0.999 10.000 0.912 NA Y NA
 6152708 6152709 HcinC1_010100003965 HcinC1_010100003970     TRUE 0.990 10.000 0.120 NA   NA
 6152710 6152711 HcinC1_010100003975 HcinC1_010100003980   thyX FALSE 0.023 432.000 0.000 NA   NA
 6152713 6152714 HcinC1_010100003990 HcinC1_010100003995     TRUE 0.990 -3.000 0.300 1.000 Y NA
 6152714 6152715 HcinC1_010100003995 HcinC1_010100004000     TRUE 0.975 -3.000 0.083 1.000   NA
 6152715 6152716 HcinC1_010100004000 HcinC1_010100004005     FALSE 0.154 399.000 0.083 NA   NA
 6152716 6152717 HcinC1_010100004005 HcinC1_010100004010     TRUE 0.866 3.000 0.000 NA   NA
 6152717 6152718 HcinC1_010100004010 HcinC1_010100004015     TRUE 0.994 -10.000 1.000 NA   NA
 6152718 6152719 HcinC1_010100004015 HcinC1_010100004020   ruvC TRUE 0.859 -3.000 0.002 NA   NA
 6152720 6152721 HcinC1_010100004025 HcinC1_010100004030 dnaA   FALSE 0.101 122.000 0.002 NA N NA
 6152722 6152723 HcinC1_010100004035 HcinC1_010100004040     TRUE 0.968 1.000 0.043 1.000 N NA
 6152725 6152726 HcinC1_010100004050 HcinC1_010100004055     TRUE 0.864 59.000 0.125 1.000 N NA
 6152726 6152727 HcinC1_010100004055 HcinC1_010100004060     TRUE 0.959 10.000 0.020 NA   NA
 6152728 6152729 HcinC1_010100004075 HcinC1_010100004080     TRUE 0.896 7.000 0.000 NA   NA
 6152729 6152730 HcinC1_010100004080 HcinC1_010100004085     TRUE 0.819 -3.000 0.000 NA Y NA
 6152730 6152731 HcinC1_010100004085 HcinC1_010100004090     TRUE 0.906 11.000 0.000 NA   NA
 6152731 6152732 HcinC1_010100004090 HcinC1_010100004095     TRUE 0.832 -6.000 0.000 0.056   NA
 6152732 6152733 HcinC1_010100004095 HcinC1_010100004100     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA N NA
 6152733 6152734 HcinC1_010100004100 HcinC1_010100004105     TRUE 0.980 -3.000 0.121 NA Y NA
 6152734 6152735 HcinC1_010100004105 HcinC1_010100004110     TRUE 0.992 15.000 0.182 NA   NA
 6152735 6152736 HcinC1_010100004110 HcinC1_010100004115     TRUE 0.993 9.000 0.231 NA   NA
 6152736 6152737 HcinC1_010100004115 HcinC1_010100004120     TRUE 0.685 -10.000 0.000 1.000   NA
 6152737 6152738 HcinC1_010100004120 HcinC1_010100004125     TRUE 0.735 -13.000 0.000 0.001   NA
 6152740 6152741 HcinC1_010100004130 HcinC1_010100004135     FALSE 0.078 126.000 0.000 NA   NA
 6152741 6152742 HcinC1_010100004135 HcinC1_010100004140     TRUE 0.890 6.000 0.000 NA   NA
 6152742 6152743 HcinC1_010100004140 HcinC1_010100004145     TRUE 0.895 15.000 0.000 NA   NA
 6152743 6152744 HcinC1_010100004145 HcinC1_010100004150     TRUE 0.878 4.000 0.000 NA   NA
 6152744 6152745 HcinC1_010100004150 HcinC1_010100004155     FALSE 0.030 263.000 0.000 NA   NA
 6152745 6152746 HcinC1_010100004155 HcinC1_010100004160     FALSE 0.169 92.000 0.000 1.000   NA
 6152746 6152747 HcinC1_010100004160 HcinC1_010100004165     TRUE 0.835 -6.000 0.000 0.048   NA
 6152747 6152748 HcinC1_010100004165 HcinC1_010100004170     FALSE 0.071 148.000 0.000 1.000   NA
 6152749 6152750 HcinC1_010100004175 HcinC1_010100004180 murD mraY TRUE 0.993 28.000 0.647 0.006 Y NA
 6152753 6152754 HcinC1_010100004205 HcinC1_010100004210     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152754 6152755 HcinC1_010100004210 HcinC1_010100004215     TRUE 0.828 21.000 0.000 NA   NA
 6152755 6152756 HcinC1_010100004215 HcinC1_010100004220     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152756 6152757 HcinC1_010100004220 HcinC1_010100004225     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152758 6152759 HcinC1_010100004230 HcinC1_010100004235     FALSE 0.112 103.000 0.000 NA   NA
 6152760 6152761 HcinC1_010100004240 HcinC1_010100004245 flhF   TRUE 0.993 20.000 0.382 1.000 N NA
 6152761 6152762 HcinC1_010100004245 HcinC1_010100004250     TRUE 0.924 41.000 0.159 NA   NA
 6152762 6152763 HcinC1_010100004250 HcinC1_010100004255   fliA TRUE 0.967 25.000 0.112 NA   NA
 6152763 6152764 HcinC1_010100004255 HcinC1_010100004260 fliA fliM TRUE 0.966 -7.000 0.118 1.000 N NA
 6152764 6152765 HcinC1_010100004260 HcinC1_010100004265 fliM   TRUE 0.989 -3.000 0.142 0.002 Y NA
 6152766 6152767 HcinC1_010100004270 HcinC1_010100004275     TRUE 0.822 -3.000 0.000 NA N NA
 6152768 6152769 HcinC1_010100004280 HcinC1_010100004285     TRUE 0.595 33.000 0.000 NA   NA
 6152770 6152771 HcinC1_010100004290 HcinC1_010100004295     TRUE 0.998 0.000 0.750 0.007   NA
 6152772 6152773 HcinC1_010100004300 HcinC1_010100004305     TRUE 0.999 10.000 0.887 NA   NA
 6152773 6152774 HcinC1_010100004305 HcinC1_010100004310     TRUE 0.999 0.000 0.962 0.036 Y NA
 6152774 6152775 HcinC1_010100004310 HcinC1_010100004315     TRUE 0.905 31.000 0.059 NA   NA
 6152776 6152777 HcinC1_010100004320 HcinC1_010100004325   lpxD FALSE 0.223 90.000 0.005 NA N NA
 6152778 6152779 HcinC1_010100004330 HcinC1_010100004335     FALSE 0.123 99.000 0.000 NA   NA
 6152779 6152780 HcinC1_010100004335 HcinC1_010100004340     TRUE 0.875 0.000 0.000 1.000   NA
 6152780 6152781 HcinC1_010100004340 HcinC1_010100004345     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6152781 6152782 HcinC1_010100004345 HcinC1_010100004350     TRUE 0.947 -3.000 0.037 NA   NA
 6152782 6152783 HcinC1_010100004350 HcinC1_010100004355     FALSE 0.041 225.000 0.000 1.000   NA
 6152784 6152785 HcinC1_010100004360 HcinC1_010100004365     FALSE 0.148 111.000 0.006 NA   NA
 6152785 6152786 HcinC1_010100004365 HcinC1_010100004370     TRUE 0.953 6.000 0.006 0.055 N NA
 6152786 6152787 HcinC1_010100004370 HcinC1_010100004375   moaA FALSE 0.292 104.000 0.016 0.039 Y NA
 6152788 6152789 HcinC1_010100004380 HcinC1_010100004385   flhB TRUE 0.952 4.000 0.026 NA N NA
 6152789 6152790 HcinC1_010100004385 HcinC1_010100004390 flhB   FALSE 0.059 171.000 0.000 1.000 N NA
 6152790 6152791 HcinC1_010100004390 HcinC1_010100004395   minC TRUE 0.864 30.000 0.030 1.000   NA
 6152791 6152792 HcinC1_010100004395 HcinC1_010100004400 minC lpxC TRUE 0.937 -3.000 0.027 1.000   NA
 6152792 6152793 HcinC1_010100004400 HcinC1_010100004405 lpxC   TRUE 0.790 39.000 0.035 NA   NA
 6152793 6152794 HcinC1_010100004405 HcinC1_010100004410     FALSE 0.409 85.000 0.032 NA   NA
 6152794 6152795 HcinC1_010100004410 HcinC1_010100004415     TRUE 0.963 19.000 0.044 NA   NA
 6152795 6152796 HcinC1_010100004415 HcinC1_010100004420   infB TRUE 0.932 -18.000 0.171 NA   NA
 6152796 6152797 HcinC1_010100004420 HcinC1_010100004425 infB   FALSE 0.430 63.000 0.000 0.048   NA
 6152798 6152799 HcinC1_010100004430 HcinC1_010100004435   lpxK FALSE 0.257 82.000 0.002 1.000 N NA
 6152799 6152800 HcinC1_010100004435 HcinC1_010100004440 lpxK   TRUE 0.965 9.000 0.024 1.000 N NA
 6152801 6152802 HcinC1_010100004445 HcinC1_010100004450     TRUE 0.992 10.000 0.093 0.002 Y NA
 6152802 6152803 HcinC1_010100004450 HcinC1_010100004455     TRUE 0.989 0.000 0.103 0.002 Y NA
 6152805 6152806 HcinC1_010100004465 HcinC1_010100004470     FALSE 0.131 115.000 0.005 NA   NA
 6152806 6152807 HcinC1_010100004470 HcinC1_010100004475     FALSE 0.025 353.000 0.000 NA   NA
 6152807 6152808 HcinC1_010100004475 HcinC1_010100004480     TRUE 0.990 0.000 0.244 NA   NA
 6152808 6152809 HcinC1_010100004480 HcinC1_010100004485     TRUE 0.994 15.000 0.280 1.000   NA
 6152810 6152811 HcinC1_010100004490 HcinC1_010100004495     FALSE 0.048 177.000 0.000 NA   NA
 6152811 6152812 HcinC1_010100004495 HcinC1_010100004500     FALSE 0.075 128.000 0.000 NA   NA
 6152812 6152813 HcinC1_010100004500 HcinC1_010100004505   flgG TRUE 0.595 33.000 0.000 NA   NA
 6152814 6152815 HcinC1_010100004510 HcinC1_010100004515     FALSE 0.280 66.000 0.000 NA   NA
 6152815 6152816 HcinC1_010100004515 HcinC1_010100004520     TRUE 0.831 -7.000 0.012 NA   NA
 6152816 6152817 HcinC1_010100004520 HcinC1_010100004525     TRUE 0.949 -3.000 0.039 NA   NA
 6152817 6152818 HcinC1_010100004525 HcinC1_010100004530     TRUE 0.958 -3.000 0.044 1.000   NA
 6152818 6152819 HcinC1_010100004530 HcinC1_010100004535     TRUE 0.807 22.000 0.000 NA   NA
 6152819 6152820 HcinC1_010100004535 HcinC1_010100004540     TRUE 0.896 7.000 0.000 NA   NA
 6152820 6152821 HcinC1_010100004540 HcinC1_010100004545     TRUE 0.475 -19.000 0.000 NA   NA
 6152821 6152822 HcinC1_010100004545 HcinC1_010100004550     TRUE 0.887 5.000 0.000 NA   NA
 6152822 6152823 HcinC1_010100004550 HcinC1_010100004555   rpsB FALSE 0.043 216.000 0.000 1.000 N NA
 6152823 6152824 HcinC1_010100004555 HcinC1_010100004560 rpsB tsf TRUE 0.997 2.000 0.748 1.000 Y NA
 6152825 6152826 HcinC1_010100004565 HcinC1_010100004570   glyS TRUE 0.864 -3.000 0.003 NA   NA
 6152828 6152829 HcinC1_010100004580 HcinC1_010100004585     TRUE 0.906 11.000 0.000 NA   NA
 6152830 6152831 HcinC1_010100004592 HcinC1_010100004597     FALSE 0.126 115.000 0.002 1.000 N NA
 6152831 6152832 HcinC1_010100004597 HcinC1_010100004602     TRUE 0.685 -10.000 0.000 1.000   NA
 6152832 6152833 HcinC1_010100004602 HcinC1_010100004607     TRUE 0.880 1.000 0.000 1.000   NA
 6152833 6152834 HcinC1_010100004607 HcinC1_010100004612     TRUE 0.798 39.000 0.033 1.000   NA
 6152834 6152835 HcinC1_010100004612 HcinC1_010100004617     FALSE 0.032 240.000 0.000 NA   NA
 6152835 6152836 HcinC1_010100004617 HcinC1_010100004622     TRUE 0.565 103.000 0.118 NA   NA
 6152836 6152837 HcinC1_010100004622 HcinC1_010100004627     TRUE 0.986 34.000 0.750 NA Y NA
 6152837 6152838 HcinC1_010100004627 HcinC1_010100004632   hemH TRUE 0.778 -13.000 0.024 NA N NA
 6152839 6152840 HcinC1_010100004637 HcinC1_010100004642     TRUE 0.982 3.000 0.098 NA   NA
 6152840 6152841 HcinC1_010100004642 HcinC1_010100004647     FALSE 0.382 63.000 0.003 NA   NA
 6152841 6152842 HcinC1_010100004647 HcinC1_010100004652     TRUE 0.566 72.000 0.036 1.000 N NA
 6152842 6152843 HcinC1_010100004652 HcinC1_010100004657     TRUE 0.874 30.000 0.033 1.000 N NA
 6152843 6152844 HcinC1_010100004657 HcinC1_010100004662     TRUE 0.987 0.000 0.130 1.000   NA
 6152845 6152846 HcinC1_010100004667 HcinC1_010100004672     TRUE 0.910 7.000 0.000 1.000   NA
 6152846 6152847 HcinC1_010100004672 HcinC1_010100004677     TRUE 0.558 -36.000 0.000 0.001   NA
 6152847 6152848 HcinC1_010100004677 HcinC1_010100004682     FALSE 0.069 135.000 0.000 NA   NA
 6152848 6152849 HcinC1_010100004682 HcinC1_010100004687     TRUE 0.451 44.000 0.000 NA   NA
 6152849 6152850 HcinC1_010100004687 HcinC1_010100004692     TRUE 0.902 13.000 0.000 NA   NA
 6152850 6152851 HcinC1_010100004692 HcinC1_010100004697     TRUE 0.896 7.000 0.000 NA   NA
 6152851 6152852 HcinC1_010100004697 HcinC1_010100004702     FALSE 0.021 543.000 0.000 NA   NA
 6152853 6152854 HcinC1_010100004707 HcinC1_010100004712     TRUE 0.440 60.000 0.005 NA   NA
 6152854 6152855 HcinC1_010100004712 HcinC1_010100004717     TRUE 0.970 0.000 0.057 NA   NA
 6152855 6152856 HcinC1_010100004717 HcinC1_010100004722     TRUE 0.995 2.000 0.429 1.000 N NA
 6152856 6152857 HcinC1_010100004722 HcinC1_010100004727     TRUE 0.988 -3.000 0.231 1.000 Y NA
 6152859 6152860 HcinC1_010100004737 HcinC1_010100004742     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6152860 6152861 HcinC1_010100004742 HcinC1_010100004747   pgk TRUE 0.876 17.000 0.000 NA Y NA
 6152861 6152862 HcinC1_010100004747 HcinC1_010100004752 pgk   TRUE 0.464 48.000 0.000 1.000   NA
 6152862 6152863 HcinC1_010100004752 HcinC1_010100004757     TRUE 0.992 3.000 0.154 0.028   NA
 6152863 6152864 HcinC1_010100004757 HcinC1_010100004762     TRUE 0.993 15.000 0.250 NA   NA
 6152864 6152865 HcinC1_010100004762 HcinC1_010100004767     TRUE 0.862 2.000 0.000 NA   NA
 6152866 6152867 HcinC1_010100004772 HcinC1_010100004777     TRUE 0.969 -3.000 0.064 1.000 Y NA
 6152867 6152868 HcinC1_010100004777 HcinC1_010100004782     TRUE 0.997 10.000 0.463 NA Y NA
 6152868 6152869 HcinC1_010100004782 HcinC1_010100004787     TRUE 0.930 -3.000 0.027 NA N NA
 6152869 6152870 HcinC1_010100004787 HcinC1_010100004792     TRUE 0.994 17.000 0.333 1.000 N NA
 6152870 6152871 HcinC1_010100004792 HcinC1_010100004797     TRUE 0.996 13.000 0.400 NA   NA
 6152871 6152872 HcinC1_010100004797 HcinC1_010100004802     TRUE 0.890 -3.000 0.008 NA   NA
 6152873 6152874 HcinC1_010100004807 HcinC1_010100004812     FALSE 0.284 95.000 0.015 1.000   NA
 6152874 6152875 HcinC1_010100004812 HcinC1_010100004817     FALSE 0.356 -46.000 0.000 NA   NA
 6152875 6152876 HcinC1_010100004817 HcinC1_010100004822     FALSE 0.332 -67.000 0.000 NA   NA
 6152877 6152878 HcinC1_010100004827 HcinC1_010100004832 lolA   TRUE 0.935 16.000 0.005 1.000 N NA
 6152878 6152879 HcinC1_010100004832 HcinC1_010100004837     TRUE 0.924 -3.000 0.019 1.000 Y NA
 6152881 6152882 HcinC1_010100004847 HcinC1_010100004852 rplI   TRUE 0.962 3.000 0.034 1.000 N NA
 6152882 6152883 HcinC1_010100004852 HcinC1_010100004857   hslU TRUE 0.998 11.000 0.752 1.000 Y NA
 6152883 6152884 HcinC1_010100004857 HcinC1_010100004862 hslU era TRUE 0.830 42.000 0.051 1.000   NA
 6152884 6152885 HcinC1_010100004862 HcinC1_010100004867 era   TRUE 0.987 18.000 0.125 NA   NA
 6152885 6152886 HcinC1_010100004867 HcinC1_010100004872     FALSE 0.270 87.000 0.011 NA   NA
 6152886 6152887 HcinC1_010100004872 HcinC1_010100004877   rpsJ FALSE 0.039 231.000 0.000 1.000 N NA
 6152887 6152888 HcinC1_010100004877 HcinC1_010100004882 rpsJ rplC TRUE 0.993 24.000 0.467 0.030 Y NA
 6152888 6152889 HcinC1_010100004882 HcinC1_010100004887 rplC rplD TRUE 0.997 12.000 0.361 0.022 Y NA
 6152889 6152890 HcinC1_010100004887 HcinC1_010100004892 rplD rplW TRUE 0.996 1.000 0.513 1.000 Y NA
 6152890 6152891 HcinC1_010100004892 HcinC1_010100004897 rplW rplB TRUE 0.999 11.000 0.849 1.000 Y NA
 6152891 6152892 HcinC1_010100004897 HcinC1_010100004902 rplB rpsS TRUE 0.999 12.000 0.820 0.030 Y NA
 6152892 6152893 HcinC1_010100004902 HcinC1_010100004907 rpsS rplV TRUE 0.999 10.000 0.769 0.030 Y NA
 6152893 6152894 HcinC1_010100004907 HcinC1_010100004912 rplV rpsC TRUE 0.998 3.000 0.719 0.030 Y NA
 6152894 6152895 HcinC1_010100004912 HcinC1_010100004917 rpsC rplP TRUE 0.998 3.000 0.828 0.030 Y NA
 6152895 6152896 HcinC1_010100004917 HcinC1_010100004922 rplP   TRUE 0.991 -13.000 0.802 0.022   NA
 6152896 6152897 HcinC1_010100004922 HcinC1_010100004927   rpsQ TRUE 0.997 22.000 0.828 0.022   NA
 6152897 6152898 HcinC1_010100004927 HcinC1_010100004932 rpsQ rplN TRUE 0.997 -3.000 0.791 0.030 Y NA
 6152898 6152899 HcinC1_010100004932 HcinC1_010100004937 rplN rplX TRUE 0.998 0.000 0.810 0.030 Y NA
 6152899 6152900 HcinC1_010100004937 HcinC1_010100004942 rplX rplE TRUE 0.998 0.000 0.758 0.022 Y NA
 6152900 6152901 HcinC1_010100004942 HcinC1_010100004947 rplE rpsN TRUE 0.997 2.000 0.496 0.022 Y NA
 6152901 6152902 HcinC1_010100004947 HcinC1_010100004952 rpsN rpsH TRUE 0.998 11.000 0.473 0.022 Y NA
 6152902 6152903 HcinC1_010100004952 HcinC1_010100004957 rpsH rplF TRUE 0.999 10.000 0.808 0.022 Y NA
 6152903 6152904 HcinC1_010100004957 HcinC1_010100004962 rplF   TRUE 0.999 15.000 0.815 0.022 Y NA
 6152904 6152905 HcinC1_010100004962 HcinC1_010100004967   rpsE TRUE 0.999 11.000 0.814 0.030 Y NA
 6152905 6152906 HcinC1_010100004967 HcinC1_010100004972 rpsE rplO TRUE 0.994 11.000 0.148 0.030 Y NA
 6152906 6152907 HcinC1_010100004972 HcinC1_010100004977 rplO secY TRUE 0.997 0.000 0.730 1.000 N NA
 6152907 6152908 HcinC1_010100004977 HcinC1_010100004982 secY   TRUE 0.958 4.000 0.026 1.000 N NA
 6152908 6152909 HcinC1_010100004982 HcinC1_010100004987   infA TRUE 0.971 2.000 0.051 1.000 Y NA
 6152909 6152910 HcinC1_010100004987 HcinC1_010100004992 infA   TRUE 0.687 84.000 0.104 1.000   NA
 6152910 6152911 HcinC1_010100004992 HcinC1_010100004997   rpsM TRUE 0.994 4.000 0.194 0.022   NA
 6152911 6152912 HcinC1_010100004997 HcinC1_010100005002 rpsM   TRUE 0.999 12.000 0.810 0.022 Y NA
 6152912 6152913 HcinC1_010100005002 HcinC1_010100005007   rpsD TRUE 0.998 10.000 0.509 0.030 Y NA
 6152913 6152914 HcinC1_010100005007 HcinC1_010100005012 rpsD   TRUE 0.993 23.000 0.549 1.000 N NA
 6152914 6152915 HcinC1_010100005012 HcinC1_010100005017   rplQ TRUE 0.999 12.000 0.873 1.000 N NA
 6152915 6152916 HcinC1_010100005017 HcinC1_010100005022 rplQ   FALSE 0.043 217.000 0.000 1.000 N NA
 6152916 6152917 HcinC1_010100005022 HcinC1_010100005027     TRUE 0.884 29.000 0.021 0.019 Y NA
 6152917 6152918 HcinC1_010100005027 HcinC1_010100005032     FALSE 0.036 219.000 0.000 NA   NA
 6152918 6152919 HcinC1_010100005032 HcinC1_010100005037     TRUE 0.994 3.000 0.400 NA   NA
 6152919 6152920 HcinC1_010100005037 HcinC1_010100005042     TRUE 0.883 101.000 0.800 NA   NA
 6152920 6152921 HcinC1_010100005042 HcinC1_010100005057     FALSE 0.018 2848.000 0.000 NA   NA
 6152921 6152922 HcinC1_010100005057 HcinC1_010100005062     TRUE 0.994 18.000 0.200 0.002 Y NA
 6152922 6152923 HcinC1_010100005062 HcinC1_010100005067     TRUE 0.989 21.000 0.138 0.002 Y NA
 6152923 6152924 HcinC1_010100005067 HcinC1_010100005072     FALSE 0.304 111.000 0.034 1.000 N NA
 6152924 6152925 HcinC1_010100005072 HcinC1_010100005077     TRUE 0.981 36.000 0.655 NA Y NA
 6152925 6152926 HcinC1_010100005077 HcinC1_010100005082     TRUE 0.997 0.000 0.844 NA N NA
 6152926 6152927 HcinC1_010100005082 HcinC1_010100005087     TRUE 0.649 72.000 0.062 NA   NA
 6152927 6152928 HcinC1_010100005087 HcinC1_010100005092     FALSE 0.045 183.000 0.000 NA   NA
 6152929 6152930 HcinC1_010100005097 HcinC1_010100005102     TRUE 0.974 24.000 0.125 NA   NA
 6152930 6152931 HcinC1_010100005102 HcinC1_010100005107     FALSE 0.066 137.000 0.000 NA   NA
 6152931 6152932 HcinC1_010100005107 HcinC1_010100005112     TRUE 0.862 25.000 0.000 0.001 N NA
 6152934 6152935 HcinC1_010100005122 HcinC1_010100005127     TRUE 0.788 23.000 0.000 NA   NA
 6152935 6152936 HcinC1_010100005127 HcinC1_010100005132     TRUE 0.861 1.000 0.000 NA   NA
 6152936 6152937 HcinC1_010100005132 HcinC1_010100005137     TRUE 0.770 24.000 0.000 NA   NA
 6152937 6152938 HcinC1_010100005137 HcinC1_010100005172     FALSE 0.018 2724.000 0.000 NA   NA
 6152938 6152939 HcinC1_010100005172 HcinC1_010100005177     FALSE 0.210 76.000 0.000 NA   NA
 6152939 6152940 HcinC1_010100005177 HcinC1_010100005182     TRUE 0.806 -7.000 0.000 0.054 N NA
 6152940 6152941 HcinC1_010100005182 HcinC1_010100005187     TRUE 0.557 83.000 0.054 1.000 Y NA
 6152941 6152942 HcinC1_010100005187 HcinC1_010100t05419     FALSE 0.146 92.000 0.000 NA   NA
 6152942 6152943 HcinC1_010100t05419 HcinC1_010100t05421     FALSE 0.298 64.000 0.000 NA   NA
 6152943 6152944 HcinC1_010100t05421 HcinC1_010100t05423     FALSE 0.269 67.000 0.000 NA   NA
 6152945 6152946 HcinC1_010100005192 HcinC1_010100005197     FALSE 0.071 147.000 0.000 1.000 N NA
 6152946 6152947 HcinC1_010100005197 HcinC1_010100005202     TRUE 0.906 10.000 0.000 NA   NA
 6152947 6152948 HcinC1_010100005202 HcinC1_010100005207     TRUE 0.895 15.000 0.000 NA   NA
 6152948 6152949 HcinC1_010100005207 HcinC1_010100005212     FALSE 0.132 97.000 0.000 NA   NA
 6152949 6152950 HcinC1_010100005212 HcinC1_010100005217     TRUE 0.647 -10.000 0.000 NA   NA
 6152950 6152951 HcinC1_010100005217 HcinC1_010100005222     TRUE 0.765 24.000 0.000 NA Y NA
 6152952 6152953 HcinC1_010100005227 HcinC1_010100005232     TRUE 0.980 4.000 0.065 1.000   NA
 6152953 6152954 HcinC1_010100005232 HcinC1_010100005237     TRUE 0.963 54.000 0.586 1.000   NA
 6152954 6152955 HcinC1_010100005237 HcinC1_010100005242     TRUE 0.996 2.000 0.389 0.002 Y NA
 6152955 6152956 HcinC1_010100005242 HcinC1_010100005247     TRUE 0.986 6.000 0.056 0.002 Y NA
 6152956 6152957 HcinC1_010100005247 HcinC1_010100005252     TRUE 0.983 4.000 0.056 0.009 Y NA
 6152957 6152958 HcinC1_010100005252 HcinC1_010100005257     TRUE 0.978 -3.000 0.064 0.004 Y NA
 6152958 6152959 HcinC1_010100005257 HcinC1_010100005262     TRUE 0.990 -7.000 0.442 0.009 Y NA
 6152959 6152960 HcinC1_010100005262 HcinC1_010100005267     TRUE 0.998 10.000 0.500 0.009 Y NA
 6152960 6152961 HcinC1_010100005267 HcinC1_010100005272     TRUE 0.978 -3.000 0.065 0.009 Y NA
 6152961 6152962 HcinC1_010100005272 HcinC1_010100005277     TRUE 0.992 -3.000 0.444 NA   NA
 6152962 6152963 HcinC1_010100005277 HcinC1_010100005282     TRUE 0.993 -3.000 0.464 NA   NA
 6152963 6152964 HcinC1_010100005282 HcinC1_010100005287     TRUE 0.998 11.000 0.650 0.009   NA
 6152964 6152965 HcinC1_010100005287 HcinC1_010100005292     TRUE 0.997 -3.000 0.650 0.009 Y NA
 6152965 6152966 HcinC1_010100005292 HcinC1_010100005297     TRUE 0.995 26.000 0.703 0.004 Y NA
 6152966 6152967 HcinC1_010100005297 HcinC1_010100005302     TRUE 0.983 -18.000 0.571 0.004 Y NA
 6152968 6152969 HcinC1_010100t05425 HcinC1_010100005307     TRUE 0.451 -21.000 0.000 NA   NA
 6152971 6152972 HcinC1_010100005317 HcinC1_010100005322 flgI   TRUE 0.956 55.000 0.569 NA   NA
 6152972 6152973 HcinC1_010100005322 HcinC1_010100005327     TRUE 0.985 -7.000 0.406 NA   NA
 6152973 6152974 HcinC1_010100005327 HcinC1_010100005332     FALSE 0.033 279.000 0.000 1.000 N NA
 6152974 6152975 HcinC1_010100005332 HcinC1_010100005337     FALSE 0.424 52.000 0.000 1.000 Y NA
 6152975 6152976 HcinC1_010100005337 HcinC1_010100005342   ispH TRUE 0.956 0.000 0.032 1.000 N NA
 6152976 6152977 HcinC1_010100005342 HcinC1_010100005347 ispH rpsA TRUE 0.650 95.000 0.118 1.000 N NA
 6152977 6152978 HcinC1_010100005347 HcinC1_010100005352 rpsA   TRUE 0.992 15.000 0.171 NA   NA
 6152978 6152979 HcinC1_010100005352 HcinC1_010100005357     TRUE 0.892 22.000 0.012 NA   NA
 6152979 6152980 HcinC1_010100005357 HcinC1_010100005362   uvrA TRUE 0.896 17.000 0.000 1.000 N NA
 6152980 6152981 HcinC1_010100005362 HcinC1_010100005367 uvrA ddl TRUE 0.797 -10.000 0.003 0.088 N NA
 6152981 6152982 HcinC1_010100005367 HcinC1_010100005372 ddl   TRUE 0.971 4.000 0.046 NA   NA
 6152982 6152983 HcinC1_010100005372 HcinC1_010100005377     TRUE 0.711 -13.000 0.010 NA   NA
 6152983 6152984 HcinC1_010100005377 HcinC1_010100005382     TRUE 0.984 11.000 0.059 1.000 N NA
 6152984 6152985 HcinC1_010100005382 HcinC1_010100005387     TRUE 0.836 45.000 0.061 1.000 N NA
 6152985 6152986 HcinC1_010100005387 HcinC1_010100005392     TRUE 0.700 34.000 0.008 NA   NA
 6152988 6152989 HcinC1_010100005402 HcinC1_010100005407     TRUE 0.945 8.000 0.012 NA   NA
 6152989 6152990 HcinC1_010100005407 HcinC1_010100005412     TRUE 0.989 -3.000 0.282 NA   NA
 6152991 6152992 HcinC1_010100005425 HcinC1_010100005430     TRUE 0.778 -7.000 0.003 NA   NA
 6152992 6152993 HcinC1_010100005430 HcinC1_010100005435     TRUE 0.972 10.000 0.013 0.003 N NA
 6152993 6152994 HcinC1_010100005435 HcinC1_010100005440     TRUE 0.966 31.000 0.211 1.000 N NA
 6152995 6152996 HcinC1_010100005445 HcinC1_010100005450     FALSE 0.039 235.000 0.000 1.000 N NA
 6152996 6152997 HcinC1_010100005450 HcinC1_010100005455     TRUE 0.993 29.000 0.667 0.002 Y NA
 6152997 6152998 HcinC1_010100005455 HcinC1_010100005460   yajC FALSE 0.364 65.000 0.003 NA N NA
 6152998 6152999 HcinC1_010100005460 HcinC1_010100005465 yajC secD TRUE 0.975 1.000 0.068 NA Y NA
 6152999 6153000 HcinC1_010100005465 HcinC1_010100005470 secD secF TRUE 0.997 3.000 0.436 0.001 Y NA
 6153000 6153001 HcinC1_010100005470 HcinC1_010100005475 secF   TRUE 0.994 23.000 0.667 NA   NA
 6153001 6153002 HcinC1_010100005475 HcinC1_010100005480     TRUE 0.983 10.000 0.062 NA   NA
 6153002 6153003 HcinC1_010100005480 HcinC1_010100005485     TRUE 0.993 10.000 0.182 NA   NA
 6153007 6153008 HcinC1_010100005505 HcinC1_010100005510     TRUE 0.986 3.000 0.117 1.000 N NA
 6153008 6153009 HcinC1_010100005510 HcinC1_010100005515     TRUE 0.880 31.000 0.037 1.000 N NA
 6153009 6153010 HcinC1_010100005515 HcinC1_010100005520     TRUE 0.979 27.000 0.277 NA   NA
 6153010 6153011 HcinC1_010100005520 HcinC1_010100005525     TRUE 0.801 34.000 0.028 NA   NA
 6153011 6153012 HcinC1_010100005525 HcinC1_010100005530     TRUE 0.945 1.000 0.026 NA   NA
 6153012 6153013 HcinC1_010100005530 HcinC1_010100005535     TRUE 0.991 18.000 0.250 NA   NA
 6153013 6153014 HcinC1_010100005535 HcinC1_010100005540     TRUE 0.953 3.000 0.026 1.000 N NA
 6153016 6153017 HcinC1_010100005550 HcinC1_010100005555     TRUE 0.901 21.000 0.000 0.007   NA
 6153017 6153018 HcinC1_010100005555 HcinC1_010100005560     TRUE 0.986 -3.000 0.105 0.002   NA
 6153018 6153019 HcinC1_010100005560 HcinC1_010100005565     TRUE 0.982 25.000 0.125 0.002   NA
 6153020 6153021 HcinC1_010100005570 HcinC1_010100005575     FALSE 0.104 174.000 0.012 1.000 N NA
 6153021 6153022 HcinC1_010100005575 HcinC1_010100005580     TRUE 0.968 24.000 0.091 1.000 N NA
 6153022 6153023 HcinC1_010100005580 HcinC1_010100005585   hemD FALSE 0.419 72.000 0.013 1.000 N NA
 6153023 6153024 HcinC1_010100005585 HcinC1_010100005590 hemD   TRUE 0.946 7.000 0.013 NA   NA
 6153024 6153025 HcinC1_010100005590 HcinC1_010100005595     TRUE 0.829 -10.000 0.024 NA   NA
 6153025 6153026 HcinC1_010100005595 HcinC1_010100005600     FALSE 0.253 74.000 0.000 1.000 N NA
 6153026 6153027 HcinC1_010100005600 HcinC1_010100005605     TRUE 0.982 -6.000 0.273 NA   NA
 6153027 6153028 HcinC1_010100005605 HcinC1_010100005610     FALSE 0.151 91.000 0.000 NA   NA
 6153028 6153029 HcinC1_010100005610 HcinC1_010100005615     FALSE 0.406 50.000 0.000 NA   NA
 6153029 6153030 HcinC1_010100005615 HcinC1_010100005620     FALSE 0.204 78.000 0.000 NA   NA
 6153030 6153031 HcinC1_010100005620 HcinC1_010100005625     TRUE 0.770 24.000 0.000 NA   NA
 6153031 6153032 HcinC1_010100005625 HcinC1_010100005630     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6153033 6153034 HcinC1_010100005635 HcinC1_010100005640     TRUE 0.904 12.000 0.000 NA   NA
 6153034 6153035 HcinC1_010100005640 HcinC1_010100005645     FALSE 0.027 292.000 0.000 NA   NA
 6153037 6153038 HcinC1_010100005655 HcinC1_010100005660     TRUE 0.840 -6.000 0.000 0.028   NA
 6153038 6153039 HcinC1_010100005660 HcinC1_010100005665     TRUE 0.615 -19.000 0.000 0.028   NA
 6153039 6153040 HcinC1_010100005665 HcinC1_010100005670     TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000   NA
 6153040 6153041 HcinC1_010100005670 HcinC1_010100005675     TRUE 0.989 -3.000 0.144 0.008   NA
 6153041 6153042 HcinC1_010100005675 HcinC1_010100005680     TRUE 0.992 1.000 0.144 0.008   NA
 6153042 6153043 HcinC1_010100005680 HcinC1_010100005685     FALSE 0.135 101.000 0.000 1.000   NA
 6153043 6153044 HcinC1_010100005685 HcinC1_010100005690     TRUE 0.828 21.000 0.000 NA   NA
 6153044 6153045 HcinC1_010100005690 HcinC1_010100005695     FALSE 0.289 65.000 0.000 NA   NA
 6153045 6153046 HcinC1_010100005695 HcinC1_010100005700     TRUE 0.866 3.000 0.000 NA   NA
 6153046 6153047 HcinC1_010100005700 HcinC1_010100005705     TRUE 0.869 18.000 0.000 NA   NA
 6153048 6153049 HcinC1_010100005710 HcinC1_010100005715     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6153049 6153050 HcinC1_010100005715 HcinC1_010100005720     TRUE 0.506 39.000 0.000 NA   NA
 6153050 6153051 HcinC1_010100005720 HcinC1_010100005725     FALSE 0.109 104.000 0.000 NA N NA
 6153051 6153052 HcinC1_010100005725 HcinC1_010100005740     FALSE 0.020 1209.000 0.000 NA N NA
 6153052 6153053 HcinC1_010100005740 HcinC1_010100005745     FALSE 0.164 112.000 0.000 0.010 N NA
 6153053 6153054 HcinC1_010100005745 HcinC1_010100005750     FALSE 0.357 62.000 0.000 1.000 N NA
 6153054 6153055 HcinC1_010100005750 HcinC1_010100005755     TRUE 0.775 25.000 0.000 1.000 Y NA
 6153055 6153056 HcinC1_010100005755 HcinC1_010100005770     FALSE 0.019 1798.000 0.000 NA   NA
 6153056 6153057 HcinC1_010100005770 HcinC1_010100005775     TRUE 0.895 15.000 0.000 NA   NA
 6153057 6153058 HcinC1_010100005775 HcinC1_010100005780     FALSE 0.177 84.000 0.000 NA   NA
 6153058 6153059 HcinC1_010100005780 HcinC1_010100005785     TRUE 0.515 -16.000 0.000 NA   NA
 6153060 6153061 HcinC1_010100005790 HcinC1_010100005795     TRUE 0.613 32.000 0.000 NA   NA
 6153061 6153062 HcinC1_010100005795 HcinC1_010100005800     TRUE 0.478 41.000 0.000 NA   NA
 6153062 6153063 HcinC1_010100005800 HcinC1_010100005805     FALSE 0.065 141.000 0.000 NA   NA
 6153063 6153064 HcinC1_010100005805 HcinC1_010100005810     FALSE 0.244 71.000 0.000 NA   NA
 6153064 6153065 HcinC1_010100005810 HcinC1_010100005815     FALSE 0.374 54.000 0.000 NA   NA
 6153065 6153066 HcinC1_010100005815 HcinC1_010100005820     TRUE 0.916 -10.000 0.062 NA   NA
 6153066 6153067 HcinC1_010100005820 HcinC1_010100005825     FALSE 0.406 67.000 0.000 0.010   NA
 6153067 6153068 HcinC1_010100005825 HcinC1_010100005830     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6153068 6153069 HcinC1_010100005830 HcinC1_010100005835     FALSE 0.068 136.000 0.000 NA   NA
 6153069 6153070 HcinC1_010100005835 HcinC1_010100005850     FALSE 0.023 1229.000 0.000 1.000 N NA
 6153070 6153071 HcinC1_010100005850 HcinC1_010100005875     TRUE 0.567 2011.000 0.690 0.017 Y NA
 6153071 6153072 HcinC1_010100005875 HcinC1_010100005880     TRUE 0.964 10.000 0.025 NA   NA
 6153072 6153073 HcinC1_010100005880 HcinC1_010100005885     TRUE 0.796 70.000 0.133 NA   NA
 6153073 6153074 HcinC1_010100005885 HcinC1_010100005890     TRUE 0.970 -3.000 0.073 NA   NA
 6153074 6153075 HcinC1_010100005890 HcinC1_010100005895     TRUE 0.994 7.000 0.277 1.000 Y NA
 6153075 6153076 HcinC1_010100005895 HcinC1_010100005900     TRUE 0.993 19.000 0.270 0.034 Y NA
 6153076 6153077 HcinC1_010100005900 HcinC1_010100005905     TRUE 0.999 11.000 0.951 0.002 Y NA
 6153078 6153079 HcinC1_010100005910 HcinC1_010100005915     FALSE 0.362 70.000 0.004 1.000   NA
 6153080 6153081 HcinC1_010100005920 HcinC1_010100005925     TRUE 0.927 80.000 0.763 NA   NA
 6153081 6153082 HcinC1_010100005925 HcinC1_010100005930     TRUE 0.754 27.000 0.002 NA   NA
 6153084 6153085 HcinC1_010100005940 HcinC1_010100005945     TRUE 0.709 -52.000 0.046 NA   NA
 6153085 6153086 HcinC1_010100005945 HcinC1_010100005950     TRUE 0.779 -22.000 0.046 NA   NA
 6153086 6153087 HcinC1_010100005950 HcinC1_010100005955     TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000   NA
 6153087 6153088 HcinC1_010100005955 HcinC1_010100005960     TRUE 0.532 40.000 0.000 1.000   NA
 6153088 6153089 HcinC1_010100005960 HcinC1_010100005965     TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6153089 6153090 HcinC1_010100005965 HcinC1_010100005970     TRUE 0.843 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 6153090 6153091 HcinC1_010100005970 HcinC1_010100005975     TRUE 0.635 33.000 0.000 1.000   NA
 6153091 6153092 HcinC1_010100005975 HcinC1_010100005980     TRUE 0.451 -21.000 0.000 NA   NA
 6153092 6153093 HcinC1_010100005980 HcinC1_010100005985     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6153093 6153094 HcinC1_010100005985 HcinC1_010100005990     TRUE 0.881 2.000 0.000 1.000   NA
 6153094 6153095 HcinC1_010100005990 HcinC1_010100005995     FALSE 0.080 124.000 0.000 NA   NA
 6153095 6153096 HcinC1_010100005995 HcinC1_010100006010     FALSE 0.020 1219.000 0.000 NA   NA
 6153098 6153099 HcinC1_010100006020 HcinC1_010100006025     FALSE 0.055 159.000 0.000 NA   NA
 6153099 6153100 HcinC1_010100006025 HcinC1_010100006030     TRUE 0.904 12.000 0.000 NA   NA
 6153101 6153102 HcinC1_010100006035 HcinC1_010100006040     TRUE 0.489 40.000 0.000 NA   NA
 6153103 6153104 HcinC1_010100006045 HcinC1_010100006050     TRUE 0.887 16.000 0.000 NA   NA
 6153104 6153105 HcinC1_010100006050 HcinC1_010100006055     TRUE 0.875 0.000 0.000 1.000   NA
 6153105 6153106 HcinC1_010100006055 HcinC1_010100006060     TRUE 0.884 3.000 0.000 1.000   NA
 6153106 6153107 HcinC1_010100006060 HcinC1_010100006065     FALSE 0.146 92.000 0.000 NA   NA
 6153107 6153108 HcinC1_010100006065 HcinC1_010100006070     TRUE 0.713 -7.000 0.000 NA   NA
 6153109 6153110 HcinC1_010100006075 HcinC1_010100006080     TRUE 0.985 -7.000 0.278 0.052   NA
 6153110 6153111 HcinC1_010100006080 HcinC1_010100006085     TRUE 0.995 -7.000 0.895 NA   NA
 6153111 6153112 HcinC1_010100006085 HcinC1_010100006090     FALSE 0.423 -24.000 0.000 NA   NA
 6153112 6153113 HcinC1_010100006090 HcinC1_010100006095     TRUE 0.832 -7.000 0.000 0.002 Y NA
 6153114 6153115 HcinC1_010100006100 HcinC1_010100006105     TRUE 0.990 0.000 0.185 1.000   NA
 6153115 6153116 HcinC1_010100006105 HcinC1_010100006110     FALSE 0.413 65.000 0.000 0.037   NA
 6153116 6153117 HcinC1_010100006110 HcinC1_010100006115     TRUE 0.851 21.000 0.000 1.000   NA
 6153117 6153118 HcinC1_010100006115 HcinC1_010100006120     TRUE 0.862 20.000 0.000 1.000 Y NA
 6153119 6153120 HcinC1_010100006125 HcinC1_010100006130 rplU rpmA TRUE 0.998 11.000 0.667 0.021 Y NA
 6153120 6153121 HcinC1_010100006130 HcinC1_010100006145 rpmA obgE FALSE 0.323 1529.000 0.335 1.000   NA
 6153121 6153122 HcinC1_010100006145 HcinC1_010100006150 obgE   FALSE 0.079 136.000 0.000 1.000   NA
 6153123 6153124 HcinC1_010100006155 HcinC1_010100006160     TRUE 0.924 -13.000 0.096 1.000 Y NA
 6153124 6153125 HcinC1_010100006160 HcinC1_010100006165     TRUE 0.994 7.000 0.154 0.028 Y NA
 6153126 6153127 HcinC1_010100006170 HcinC1_010100006175     FALSE 0.323 71.000 0.002 1.000 N NA
 6153127 6153128 HcinC1_010100006175 HcinC1_010100006180     TRUE 0.998 24.000 1.000 0.008 Y NA
 6153129 6153130 HcinC1_010100006185 HcinC1_010100006190     TRUE 0.871 23.000 0.005 1.000 N NA
 6153130 6153131 HcinC1_010100006190 HcinC1_010100006195     FALSE 0.346 70.000 0.005 NA   NA
 6153132 6153133 HcinC1_010100006200 HcinC1_010100006205     FALSE 0.027 297.000 0.000 NA   NA
 6153133 6153134 HcinC1_010100006205 HcinC1_010100006210     TRUE 0.993 12.000 0.182 NA   NA
 6153134 6153135 HcinC1_010100006210 HcinC1_010100006215     TRUE 0.973 18.000 0.057 NA   NA
 6153135 6153136 HcinC1_010100006215 HcinC1_010100006220     TRUE 0.480 92.000 0.057 NA   NA
 6153136 6153137 HcinC1_010100006220 HcinC1_010100006225     TRUE 0.997 -7.000 1.000 0.017   NA
 6153137 6153138 HcinC1_010100006225 HcinC1_010100006230     TRUE 0.986 0.000 0.125 1.000   NA
 6153138 6153139 HcinC1_010100006230 HcinC1_010100006235     TRUE 0.889 23.000 0.010 1.000   NA
 6153139 6153140 HcinC1_010100006235 HcinC1_010100006240     FALSE 0.052 184.000 0.000 1.000 N NA
 6153140 6153141 HcinC1_010100006240 HcinC1_010100006245     TRUE 0.994 19.000 0.262 0.002 Y NA
 6153143 6153144 HcinC1_010100006255 HcinC1_010100006260 xseA xseA TRUE 0.896 -7.000 0.011 0.002   NA
 6153144 6153145 HcinC1_010100006260 HcinC1_010100006265 xseA   FALSE 0.415 54.000 0.000 1.000   NA
 6153146 6153147 HcinC1_010100006280 HcinC1_010100006285     TRUE 0.987 0.000 0.134 1.000 Y NA
 6153148 6153149 HcinC1_010100006290 HcinC1_010100006295     TRUE 0.974 11.000 0.023 0.045 N NA
 6153149 6153150 HcinC1_010100006295 HcinC1_010100006300     TRUE 0.957 13.000 0.021 NA   NA
 6153150 6153151 HcinC1_010100006300 HcinC1_010100006305     TRUE 0.739 29.000 0.004 NA   NA
 6153151 6153152 HcinC1_010100006305 HcinC1_010100006310     TRUE 0.988 40.000 1.000 NA   NA
 6153152 6153153 HcinC1_010100006310 HcinC1_010100006315     TRUE 0.874 -3.000 0.004 NA   NA
 6153153 6153154 HcinC1_010100006315 HcinC1_010100006320     FALSE 0.367 69.000 0.007 NA   NA
 6153155 6153156 HcinC1_010100006325 HcinC1_010100006330     FALSE 0.172 85.000 0.000 NA   NA
 6153157 6153158 HcinC1_010100006335 HcinC1_010100006340     TRUE 0.441 45.000 0.000 NA   NA
 6153158 6153159 HcinC1_010100006340 HcinC1_010100006345     TRUE 0.451 -21.000 0.000 NA   NA
 6153159 6153160 HcinC1_010100006345 HcinC1_010100006350     TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6153160 6153161 HcinC1_010100006350 HcinC1_010100006355     TRUE 0.547 57.000 0.016 NA   NA
 6153161 6153162 HcinC1_010100006355 HcinC1_010100006360     TRUE 0.906 11.000 0.000 NA   NA
 6153162 6153163 HcinC1_010100006360 HcinC1_010100006365   carB FALSE 0.104 107.000 0.000 NA   NA
 6153163 6153164 HcinC1_010100006365 HcinC1_010100006370 carB flgL FALSE 0.030 332.000 0.000 1.000 N NA
 6153164 6153165 HcinC1_010100006370 HcinC1_010100006375 flgL   TRUE 0.946 -3.000 0.032 1.000 N NA
 6153165 6153166 HcinC1_010100006375 HcinC1_010100006380     TRUE 0.797 48.000 0.050 1.000 N NA
 6153166 6153167 HcinC1_010100006380 HcinC1_010100006385   speE FALSE 0.038 239.000 0.000 1.000 N NA
 6153167 6153168 HcinC1_010100006385 HcinC1_010100006390 speE   TRUE 0.960 9.000 0.016 1.000 N NA
 6153168 6153169 HcinC1_010100006390 HcinC1_010100006395   dapF TRUE 0.941 2.000 0.016 1.000 N NA
 6153170 6153171 HcinC1_010100006400 HcinC1_010100006405     TRUE 0.684 28.000 0.000 NA   NA
 6153172 6153173 HcinC1_010100006410 HcinC1_010100006415     TRUE 0.896 1.000 0.003 NA   NA
 6153176 6153177 HcinC1_010100006430 HcinC1_010100006435     FALSE 0.025 365.000 0.000 NA   NA
 6153177 6153178 HcinC1_010100006435 HcinC1_010100006440     TRUE 0.821 -6.000 0.003 1.000   NA
 6153179 6153180 HcinC1_010100006445 HcinC1_010100006450     TRUE 0.657 37.000 0.000 0.052   NA
 6153180 6153181 HcinC1_010100006450 HcinC1_010100006455     FALSE 0.105 115.000 0.000 1.000   NA
 6153181 6153182 HcinC1_010100006455 HcinC1_010100006460     TRUE 0.865 -3.000 0.002 1.000   NA
 6153182 6153183 HcinC1_010100006460 HcinC1_010100006465     TRUE 0.906 10.000 0.000 NA   NA
 6153183 6153184 HcinC1_010100006465 HcinC1_010100006470     FALSE 0.388 -31.000 0.000 NA   NA
 6153184 6153185 HcinC1_010100006470 HcinC1_010100006475     TRUE 0.894 -3.000 0.000 0.018   NA
 6153185 6153186 HcinC1_010100006475 HcinC1_010100006480     FALSE 0.310 79.000 0.000 0.018 N NA
 6153188 6153189 HcinC1_010100006490 HcinC1_010100006495     TRUE 0.899 14.000 0.000 NA   NA
 6153189 6153190 HcinC1_010100006495 HcinC1_010100006500     TRUE 0.856 -10.000 0.027 1.000   NA
 6153190 6153191 HcinC1_010100006500 HcinC1_010100006505     FALSE 0.282 83.000 0.000 0.027   NA
 6153191 6153192 HcinC1_010100006505 HcinC1_010100006510     TRUE 0.535 53.000 0.006 1.000   NA
 6153193 6153194 HcinC1_010100006515 HcinC1_010100006520     TRUE 0.970 -19.000 0.545 NA   NA
 6153194 6153195 HcinC1_010100006520 HcinC1_010100006525   guaA TRUE 0.931 11.000 0.002 1.000   NA
 6153195 6153196 HcinC1_010100006525 HcinC1_010100006530 guaA   FALSE 0.058 153.000 0.000 NA   NA
 6153196 6153197 HcinC1_010100006530 HcinC1_010100006535     FALSE 0.289 65.000 0.000 NA   NA
 6153198 6153199 HcinC1_010100006540 HcinC1_010100006545     TRUE 0.684 28.000 0.000 NA   NA
 6153201 6153202 HcinC1_010100006555 HcinC1_010100006560     FALSE 0.023 417.000 0.000 NA   NA
 6153202 6153203 HcinC1_010100006560 HcinC1_010100006565     FALSE 0.198 79.000 0.000 NA   NA
 6153203 6153204 HcinC1_010100006565 HcinC1_010100006570     FALSE 0.038 207.000 0.000 NA   NA
 6153204 6153205 HcinC1_010100006570 HcinC1_010100006575     FALSE 0.043 187.000 0.000 NA   NA
 6153205 6153206 HcinC1_010100006575 HcinC1_010100006580     TRUE 0.519 38.000 0.000 NA   NA
 6153206 6153207 HcinC1_010100006580 HcinC1_010100006585     FALSE 0.034 227.000 0.000 NA   NA
 6153207 6153208 HcinC1_010100006585 HcinC1_010100006590     TRUE 0.989 28.000 0.594 1.000 Y NA
 6153208 6153209 HcinC1_010100006590 HcinC1_010100006595     TRUE 0.983 32.000 0.400 0.017 Y NA
 6153209 6153210 HcinC1_010100006595 HcinC1_010100006600     TRUE 0.999 13.000 0.947 0.008 Y NA
 6153210 6153211 HcinC1_010100006600 HcinC1_010100006605     FALSE 0.047 180.000 0.000 NA   NA
 6153211 6153212 HcinC1_010100006605 HcinC1_010100006610     FALSE 0.132 97.000 0.000 NA   NA
 6153213 6153214 HcinC1_010100006615 HcinC1_010100006620   pyrE TRUE 0.975 0.000 0.071 NA   NA
 6153214 6153215 HcinC1_010100006620 HcinC1_010100006625 pyrE   TRUE 0.945 11.000 0.008 NA   NA
 6153216 6153217 HcinC1_010100006630 HcinC1_010100006635     TRUE 0.929 16.000 0.007 NA   NA
 6153217 6153218 HcinC1_010100006635 HcinC1_010100006640   flgA TRUE 0.902 27.000 0.036 NA   NA
 6153218 6153219 HcinC1_010100006640 HcinC1_010100006645 flgA   TRUE 0.949 35.000 0.191 NA   NA
 6153219 6153220 HcinC1_010100006645 HcinC1_010100006650     TRUE 0.956 19.000 0.032 1.000 Y NA
 6153220 6153221 HcinC1_010100006650 HcinC1_010100006655   tmk TRUE 0.966 4.000 0.034 1.000 N NA
 6153221 6153222 HcinC1_010100006655 HcinC1_010100006660 tmk   TRUE 0.899 14.000 0.000 NA   NA
 6153222 6153223 HcinC1_010100006660 HcinC1_010100006665     FALSE 0.367 55.000 0.000 NA   NA
 6153226 6153227 HcinC1_010100006680 HcinC1_010100006685     FALSE 0.029 274.000 0.000 NA   NA
 6153228 6153229 HcinC1_010100006690 HcinC1_010100006695     TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000   NA
 6153229 6153230 HcinC1_010100006695 HcinC1_010100006700     FALSE 0.160 95.000 0.000 1.000   NA
 6153230 6153231 HcinC1_010100006700 HcinC1_010100006705     TRUE 0.844 20.000 0.000 NA   NA
 6153231 6153232 HcinC1_010100006705 HcinC1_010100006710   rpmE FALSE 0.087 144.000 0.004 NA   NA
 6153232 6153233 HcinC1_010100006710 HcinC1_010100006715 rpmE   TRUE 0.966 5.000 0.031 1.000   NA
 6153233 6153234 HcinC1_010100006715 HcinC1_010100006720     TRUE 0.963 4.000 0.031 1.000   NA
 6153234 6153235 HcinC1_010100006720 HcinC1_010100006725     TRUE 0.781 -16.000 0.033 NA   NA
 6153235 6153236 HcinC1_010100006725 HcinC1_010100006730     TRUE 0.995 -6.000 0.882 NA   NA
 6153236 6153237 HcinC1_010100006730 HcinC1_010100006735     TRUE 0.940 30.000 0.098 NA   NA
 6153237 6153238 HcinC1_010100006735 HcinC1_010100006740     TRUE 0.968 30.000 0.202 1.000 Y NA
 6153238 6153239 HcinC1_010100006740 HcinC1_010100006745     TRUE 0.796 -13.000 0.023 1.000 N NA
 6153240 6153241 HcinC1_010100006750 HcinC1_010100006755     TRUE 0.936 -3.000 0.031 NA   NA
 6153241 6153242 HcinC1_010100006755 HcinC1_010100006760     TRUE 0.996 -3.000 0.616 0.084 Y NA
 6153242 6153243 HcinC1_010100006760 HcinC1_010100006765     TRUE 0.995 0.000 0.509 1.000 Y NA
 6153243 6153244 HcinC1_010100006765 HcinC1_010100006770     TRUE 0.968 11.000 0.030 NA   NA
 6153244 6153245 HcinC1_010100006770 HcinC1_010100006775     TRUE 0.931 0.000 0.017 NA   NA
 6153245 6153246 HcinC1_010100006775 HcinC1_010100006780     TRUE 0.940 11.000 0.003 1.000 N NA
 6153246 6153247 HcinC1_010100006780 HcinC1_010100006785     TRUE 0.882 -3.000 0.003 1.000 N NA
 6153247 6153248 HcinC1_010100006785 HcinC1_010100006790     TRUE 0.966 9.000 0.025 1.000 N NA
 6153248 6153249 HcinC1_010100006790 HcinC1_010100006795     TRUE 0.942 11.000 0.004 1.000 N NA
 6153249 6153250 HcinC1_010100006795 HcinC1_010100006800     TRUE 0.959 10.000 0.014 1.000 N NA
 6153251 6153252 HcinC1_010100006805 HcinC1_010100006810     TRUE 0.982 0.000 0.105 NA   NA
 6153253 6153254 HcinC1_010100006815 HcinC1_010100006820     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6153254 6153255 HcinC1_010100006820 HcinC1_010100006825     FALSE 0.109 104.000 0.000 NA   NA
 6153255 6153256 HcinC1_010100006825 HcinC1_010100006830     TRUE 0.982 15.000 0.070 NA   NA
 6153258 6153259 HcinC1_010100006840 HcinC1_010100006845   aspS TRUE 0.861 1.000 0.000 NA   NA
 6153259 6153260 HcinC1_010100006845 HcinC1_010100006850 aspS   TRUE 0.773 32.000 0.010 1.000 N NA
 6153262 6153263 HcinC1_010100006860 HcinC1_010100006865     TRUE 0.637 37.000 0.005 NA N NA
 6153263 6153264 HcinC1_010100006865 HcinC1_010100006870     TRUE 0.884 3.000 0.000 1.000   NA
 6153264 6153265 HcinC1_010100006870 HcinC1_010100006875     TRUE 0.808 -10.000 0.013 1.000   NA
 6153266 6153267 HcinC1_010100006880 HcinC1_010100006885 hisS   TRUE 0.791 30.000 0.009 1.000 N NA
 6153267 6153268 HcinC1_010100006885 HcinC1_010100006890     TRUE 0.865 -31.000 0.115 NA   NA
 6153268 6153269 HcinC1_010100006890 HcinC1_010100006905     FALSE 0.019 1566.000 0.000 NA   NA
 6153269 6153270 HcinC1_010100006905 HcinC1_010100006910     TRUE 0.726 51.000 0.040 NA   NA
 6153270 6153271 HcinC1_010100006910 HcinC1_010100006915     TRUE 0.452 61.000 0.007 NA   NA
 6153272 6153273 HcinC1_010100006920 HcinC1_010100006925     TRUE 0.828 21.000 0.000 NA   NA
 6153273 6153274 HcinC1_010100006925 HcinC1_010100006930     TRUE 0.899 14.000 0.000 NA   NA
 6153274 6153275 HcinC1_010100006930 HcinC1_010100006935     TRUE 0.629 31.000 0.000 NA   NA
 6153275 6153276 HcinC1_010100006935 HcinC1_010100006940     TRUE 0.980 -7.000 0.302 NA   NA
 6153277 6153278 HcinC1_010100006945 HcinC1_010100006950     TRUE 0.978 0.000 0.071 1.000 Y NA
 6153278 6153279 HcinC1_010100006950 HcinC1_010100006955     TRUE 0.999 10.000 0.929 1.000 N NA
 6153279 6153280 HcinC1_010100006955 HcinC1_010100006960     TRUE 0.993 -3.000 0.459 1.000 Y NA
 6153281 6153282 HcinC1_010100006965 HcinC1_010100006970   thiG TRUE 0.499 48.000 0.003 NA   NA
 6153282 6153283 HcinC1_010100006970 HcinC1_010100006975 thiG   TRUE 0.883 22.000 0.009 NA N NA
 6153283 6153284 HcinC1_010100006975 HcinC1_010100006980     TRUE 0.919 7.000 0.003 NA N NA
 6153284 6153285 HcinC1_010100006980 HcinC1_010100006985     TRUE 0.743 31.000 0.004 1.000 N NA
 6153285 6153286 HcinC1_010100006985 HcinC1_010100006990     FALSE 0.355 71.000 0.004 1.000 N NA
 6153288 6153289 HcinC1_010100007000 HcinC1_010100007005     TRUE 0.972 -3.000 0.071 1.000   NA
 6153289 6153290 HcinC1_010100007005 HcinC1_010100007010     FALSE 0.046 181.000 0.000 NA   NA
 6153290 6153291 HcinC1_010100007010 HcinC1_010100007015     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6153291 6153292 HcinC1_010100007015 HcinC1_010100007020     FALSE 0.307 63.000 0.000 NA   NA
 6153294 6153295 HcinC1_010100007030 HcinC1_010100007035     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6153295 6153296 HcinC1_010100007035 HcinC1_010100007040     TRUE 0.862 2.000 0.000 NA   NA
 6153296 6153297 HcinC1_010100007040 HcinC1_010100007045     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6153297 6153298 HcinC1_010100007045 HcinC1_010100007050     TRUE 0.903 9.000 0.000 NA   NA
 6153298 6153299 HcinC1_010100007050 HcinC1_010100007055     TRUE 0.904 12.000 0.000 NA   NA
 6153301 6153302 HcinC1_010100007065 HcinC1_010100007070     TRUE 0.647 -10.000 0.000 NA   NA
 6153302 6153303 HcinC1_010100007070 HcinC1_010100007075     TRUE 0.906 11.000 0.000 NA   NA
 6153307 6153308 HcinC1_010100007095 HcinC1_010100007100     TRUE 0.827 30.000 0.018 1.000 N NA
 6153308 6153309 HcinC1_010100007100 HcinC1_010100007105     TRUE 0.917 3.000 0.008 NA   NA
 6153309 6153310 HcinC1_010100007105 HcinC1_010100007110     TRUE 0.914 1.000 0.008 NA   NA
 6153310 6153311 HcinC1_010100007110 HcinC1_010100007115     TRUE 0.906 10.000 0.000 NA   NA
 6153311 6153312 HcinC1_010100007115 HcinC1_010100007120     TRUE 0.595 33.000 0.000 NA   NA
 6153312 6153313 HcinC1_010100007120 HcinC1_010100007125     FALSE 0.114 102.000 0.000 NA   NA
 6153313 6153314 HcinC1_010100007125 HcinC1_010100007130     TRUE 0.750 28.000 0.002 1.000 N NA
 6153314 6153315 HcinC1_010100007130 HcinC1_010100007135     TRUE 0.937 15.000 0.005 1.000 Y NA
 6153315 6153316 HcinC1_010100007135 HcinC1_010100007140     FALSE 0.241 85.000 0.002 1.000 N NA
 6153316 6153317 HcinC1_010100007140 HcinC1_010100007145     FALSE 0.162 109.000 0.004 1.000 N NA
 6153318 6153319 HcinC1_010100007150 HcinC1_010100007155     TRUE 0.641 43.000 0.014 NA N NA
 6153319 6153320 HcinC1_010100007155 HcinC1_010100007170     FALSE 0.018 2967.000 0.000 NA   NA
 6153320 6153321 HcinC1_010100007170 HcinC1_010100007175     TRUE 0.879 17.000 0.000 NA   NA
 6153322 6153323 HcinC1_010100007180 HcinC1_010100007185     TRUE 0.935 16.000 0.009 NA   NA
 6153325 6153326 HcinC1_010100007195 HcinC1_010100007200     FALSE 0.069 135.000 0.000 NA   NA
 6153326 6153327 HcinC1_010100007200 HcinC1_010100007205     TRUE 0.887 16.000 0.000 NA   NA
 6153327 6153328 HcinC1_010100007205 HcinC1_010100007210     TRUE 0.861 1.000 0.000 NA   NA
 6153329 6153330 HcinC1_010100007215 HcinC1_010100007220     TRUE 0.937 7.000 0.004 1.000   NA
 6153331 6153332 HcinC1_010100007225 HcinC1_010100007230 murE   TRUE 0.798 -28.000 0.057 1.000   NA
 6153332 6153333 HcinC1_010100007230 HcinC1_010100007235     TRUE 0.973 24.000 0.107 1.000   NA
 6153334 6153335 HcinC1_010100007240 HcinC1_010100007245     TRUE 0.982 21.000 0.134 NA Y NA
 6153335 6153336 HcinC1_010100007245 HcinC1_010100007250     TRUE 0.997 21.000 0.882 NA Y NA
 6153336 6153337 HcinC1_010100007250 HcinC1_010100007255     TRUE 0.957 15.000 0.019 1.000   NA
 6153337 6153338 HcinC1_010100007255 HcinC1_010100007260     TRUE 0.759 71.000 0.099 1.000   NA
 6153339 6153340 HcinC1_010100007265 HcinC1_010100007270 hemE   FALSE 0.206 92.000 0.002 1.000 N NA
 6153340 6153341 HcinC1_010100007270 HcinC1_010100007275     FALSE 0.232 78.000 0.000 1.000 N NA
 6153341 6153342 HcinC1_010100007275 HcinC1_010100007280     FALSE 0.259 69.000 0.000 NA   NA
 6153344 6153345 HcinC1_010100007285 HcinC1_010100007300   lspA FALSE 0.017 3260.000 0.000 NA   NA
 6153345 6153346 HcinC1_010100007300 HcinC1_010100007305 lspA   TRUE 0.947 23.000 0.042 1.000 N NA
 6153347 6153348 HcinC1_010100007310 HcinC1_010100007315 rpsT prfA TRUE 0.712 30.000 0.002 1.000 Y NA
 6153348 6153349 HcinC1_010100007315 HcinC1_010100007320 prfA   TRUE 0.900 3.000 0.002 1.000   NA
 6153350 6153351 HcinC1_010100007325 HcinC1_010100007330     TRUE 0.850 21.000 0.000 1.000 N NA
 6153351 6153352 HcinC1_010100007330 HcinC1_010100007335     TRUE 0.988 13.000 0.086 1.000 N NA
 6153352 6153353 HcinC1_010100007335 HcinC1_010100007340     TRUE 0.586 40.000 0.002 1.000 N NA
 6153353 6153354 HcinC1_010100007340 HcinC1_010100007345     FALSE 0.226 79.000 0.000 1.000 N NA
 6153355 6153356 HcinC1_010100007350 HcinC1_010100007355     FALSE 0.123 180.000 0.007 0.008   NA
 6153356 6153357 HcinC1_010100007355 HcinC1_010100007360     TRUE 0.440 131.000 0.104 1.000   NA
 6153357 6153358 HcinC1_010100007360 HcinC1_010100007365     FALSE 0.142 113.000 0.005 NA   NA
 6153360 6153361 HcinC1_010100007375 HcinC1_010100007380     TRUE 0.962 11.000 0.017 1.000   NA
 6153362 6153363 HcinC1_010100007385 HcinC1_010100007390 hemC   TRUE 0.954 11.000 0.010 1.000 N NA
 6153363 6153364 HcinC1_010100007390 HcinC1_010100007395   hemA TRUE 0.965 -3.000 0.040 0.038 N NA
 6153364 6153365 HcinC1_010100007395 HcinC1_010100007400 hemA   TRUE 0.981 11.000 0.051 1.000 Y NA
 6153365 6153366 HcinC1_010100007400 HcinC1_010100007405     TRUE 0.948 0.000 0.030 NA   NA
 6153366 6153367 HcinC1_010100007405 HcinC1_010100007410     TRUE 0.988 -7.000 0.514 NA   NA
 6153367 6153368 HcinC1_010100007410 HcinC1_010100007415   hisD TRUE 0.949 8.000 0.013 NA   NA
 6153368 6153369 HcinC1_010100007415 HcinC1_010100007420 hisD   FALSE 0.038 237.000 0.000 1.000   NA
 6153369 6153370 HcinC1_010100007420 HcinC1_010100007425   ubiE FALSE 0.033 283.000 0.000 1.000   NA
 6153370 6153371 HcinC1_010100007425 HcinC1_010100007430 ubiE   TRUE 0.819 -7.000 0.005 1.000 N NA
 6153371 6153372 HcinC1_010100007430 HcinC1_010100007435     TRUE 0.939 10.000 0.005 NA   NA
 6153372 6153373 HcinC1_010100007435 HcinC1_010100007440     FALSE 0.132 127.000 0.010 NA   NA
 6153373 6153374 HcinC1_010100007440 HcinC1_010100007445     TRUE 0.502 51.000 0.005 NA   NA
 6153377 6153378 HcinC1_010100007460 HcinC1_010100007465     TRUE 0.977 43.000 0.700 NA   NA
 6153379 6153380 HcinC1_010100007470 HcinC1_010100007475     TRUE 0.616 38.000 0.004 NA   NA
 6153380 6153381 HcinC1_010100007475 HcinC1_010100007480     TRUE 0.928 -19.000 0.182 NA   NA
 6153381 6153382 HcinC1_010100007480 HcinC1_010100007485     TRUE 0.960 -3.000 0.054 NA   NA
 6153382 6153383 HcinC1_010100007485 HcinC1_010100007490     TRUE 0.839 28.000 0.020 NA N NA
 6153383 6153384 HcinC1_010100007490 HcinC1_010100007495     TRUE 0.902 24.000 0.020 1.000   NA
 6153384 6153385 HcinC1_010100007495 HcinC1_010100007500     TRUE 0.986 0.000 0.143 NA   NA
 6153385 6153386 HcinC1_010100007500 HcinC1_010100007505   ubiA TRUE 0.977 21.000 0.100 NA   NA
 6153387 6153388 HcinC1_010100007510 HcinC1_010100007515   lysS TRUE 0.948 1.000 0.023 1.000   NA
 6153388 6153389 HcinC1_010100007515 HcinC1_010100007520 lysS glyA TRUE 0.967 0.000 0.044 1.000 N NA
 6153389 6153390 HcinC1_010100007520 HcinC1_010100007525 glyA   TRUE 0.726 98.000 0.271 NA   NA
 6153390 6153391 HcinC1_010100007525 HcinC1_010100007530     TRUE 0.645 30.000 0.000 NA   NA
 6153391 6153392 HcinC1_010100007530 HcinC1_010100007535     FALSE 0.319 62.000 0.000 NA   NA
 6153392 6153393 HcinC1_010100007535 HcinC1_010100007540     TRUE 0.986 1.000 0.114 1.000   NA
 6153393 6153394 HcinC1_010100007540 HcinC1_010100007545     TRUE 0.924 2.000 0.008 1.000 Y NA
 6153395 6153396 HcinC1_010100007550 HcinC1_010100007555     TRUE 0.948 4.000 0.023 NA   NA
 6153396 6153397 HcinC1_010100007555 HcinC1_010100007560     TRUE 0.521 67.000 0.012 0.081 N NA
 6153397 6153398 HcinC1_010100007560 HcinC1_010100007565     TRUE 0.998 6.000 0.846 1.000 Y NA
 6153398 6153399 HcinC1_010100007565 HcinC1_010100007570     FALSE 0.026 319.000 0.000 NA   NA
 6153399 6153400 HcinC1_010100007570 HcinC1_010100007575     TRUE 0.448 66.000 0.014 NA   NA
 6153400 6153401 HcinC1_010100007575 HcinC1_010100007580     FALSE 0.053 183.000 0.000 1.000   NA
 6153401 6153402 HcinC1_010100007580 HcinC1_010100007585   folE TRUE 0.454 165.000 0.167 1.000   NA
 6153402 6153403 HcinC1_010100007585 HcinC1_010100007590 folE   FALSE 0.175 575.000 0.102 1.000 N NA
 6153404 6153405 HcinC1_010100007595 HcinC1_010100007600     FALSE 0.021 558.000 0.000 NA   NA
 6153406 6153407 HcinC1_010100007605 HcinC1_010100007610     FALSE 0.038 210.000 0.000 NA   NA
 6153407 6153408 HcinC1_010100007610 HcinC1_010100007615   panC TRUE 0.926 8.000 0.003 NA   NA
 6153408 6153409 HcinC1_010100007615 HcinC1_010100007620 panC   TRUE 0.752 -13.000 0.012 1.000 N NA
 6153409 6153410 HcinC1_010100007620 HcinC1_010100007625   nusB TRUE 0.931 -3.000 0.023 1.000 N NA
 6153410 6153411 HcinC1_010100007625 HcinC1_010100007630 nusB ribH TRUE 0.976 6.000 0.045 1.000 N NA
 6153411 6153412 HcinC1_010100007630 HcinC1_010100007635 ribH   TRUE 0.938 -3.000 0.027 1.000 N NA
 6153412 6153413 HcinC1_010100007635 HcinC1_010100007640     TRUE 0.948 0.000 0.025 1.000 N NA
 6153414 6153415 HcinC1_010100007645 HcinC1_010100007650   ribA FALSE 0.223 74.000 0.000 NA   NA
 6153415 6153416 HcinC1_010100007650 HcinC1_010100007655 ribA   TRUE 0.970 13.000 0.030 1.000 Y NA
 6153416 6153417 HcinC1_010100007655 HcinC1_010100007660     TRUE 0.683 38.000 0.008 1.000 Y NA
 6153417 6153418 HcinC1_010100007660 HcinC1_010100007665     TRUE 0.995 0.000 0.501 1.000 Y NA
 6153418 6153419 HcinC1_010100007665 HcinC1_010100007670     TRUE 0.801 -9.000 0.000 0.004 Y NA
 6153419 6153420 HcinC1_010100007670 HcinC1_010100007675   mogA TRUE 0.748 -12.000 0.000 0.004 Y NA
 6153420 6153421 HcinC1_010100007675 HcinC1_010100007680 mogA moaC TRUE 0.953 22.000 0.028 0.004 Y NA
 6153421 6153422 HcinC1_010100007680 HcinC1_010100007685 moaC   TRUE 0.935 10.000 0.004 NA   NA
 6153423 6153424 HcinC1_010100007690 HcinC1_010100007695     TRUE 0.861 1.000 0.000 NA   NA
 6153425 6153426 HcinC1_010100007700 HcinC1_010100007705   uvrC TRUE 0.618 -13.000 0.002 NA   NA
 6153426 6153427 HcinC1_010100007705 HcinC1_010100007710 uvrC   TRUE 0.849 -3.000 0.002 NA   NA
 6153427 6153428 HcinC1_010100007710 HcinC1_010100007715     TRUE 0.994 10.000 0.250 NA   NA
 6153428 6153429 HcinC1_010100007715 HcinC1_010100007720     TRUE 0.996 3.000 0.500 1.000 Y NA
 6153429 6153430 HcinC1_010100007720 HcinC1_010100007725   rho FALSE 0.123 117.000 0.002 1.000 Y NA
 6153430 6153431 HcinC1_010100007725 HcinC1_010100007730 rho   TRUE 0.962 15.000 0.023 1.000 N NA
 6153431 6153432 HcinC1_010100007730 HcinC1_010100007735     TRUE 0.653 32.000 0.000 1.000   NA
 6153432 6153433 HcinC1_010100007735 HcinC1_010100007740     FALSE 0.032 298.000 0.000 1.000   NA
 6153434 6153435 HcinC1_010100007745 HcinC1_010100007750     TRUE 0.949 34.000 0.169 NA   NA
 6153435 6153436 HcinC1_010100007750 HcinC1_010100007755   pheT FALSE 0.279 76.000 0.002 1.000 N NA
 6153436 6153437 HcinC1_010100007755 HcinC1_010100007760 pheT   TRUE 0.997 0.000 0.574 0.001 Y NA
 6153438 6153439 HcinC1_010100007765 HcinC1_010100007770     TRUE 0.852 22.000 0.003 NA   NA
 6153439 6153440 HcinC1_010100007770 HcinC1_010100007775     TRUE 0.929 -10.000 0.076 NA   NA
 6153440 6153441 HcinC1_010100007775 HcinC1_010100007780     FALSE 0.060 167.000 0.000 1.000 N NA
 6153441 6153442 HcinC1_010100007780 HcinC1_010100007785     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6153442 6153443 HcinC1_010100007785 HcinC1_010100007790     FALSE 0.307 63.000 0.000 NA   NA
 6153443 6153444 HcinC1_010100007790 HcinC1_010100007795     FALSE 0.252 70.000 0.000 NA   NA
 6153444 6153445 HcinC1_010100007795 HcinC1_010100007800     TRUE 0.861 1.000 0.000 NA   NA
 6153445 6153446 HcinC1_010100007800 HcinC1_010100007805     TRUE 0.927 1.000 0.008 1.000   NA
 6153446 6153447 HcinC1_010100007805 HcinC1_010100007810     TRUE 0.875 0.000 0.000 1.000   NA
 6153447 6153448 HcinC1_010100007810 HcinC1_010100007815     TRUE 0.713 -7.000 0.000 NA   NA
 6153448 6153449 HcinC1_010100007815 HcinC1_010100007820     TRUE 0.862 2.000 0.000 NA   NA
 6153450 6153451 HcinC1_010100t07959 HcinC1_010100t07961     TRUE 0.879 17.000 0.000 NA   NA
 6153451 6153452 HcinC1_010100t07961 HcinC1_010100t07963     TRUE 0.749 25.000 0.000 NA   NA
 6153452 6153453 HcinC1_010100t07963 HcinC1_010100007825     FALSE 0.103 108.000 0.000 NA   NA
 6153453 6153454 HcinC1_010100007825 HcinC1_010100007830     FALSE 0.094 124.000 0.000 1.000 N NA
 6153454 6153455 HcinC1_010100007830 HcinC1_010100007835     TRUE 0.653 32.000 0.000 1.000   NA
 6153455 6153456 HcinC1_010100007835 HcinC1_010100007840     FALSE 0.357 62.000 0.000 1.000   NA
 6153456 6153457 HcinC1_010100007840 HcinC1_010100007845   fliE TRUE 0.995 9.000 0.303 1.000 N NA
 6153457 6153458 HcinC1_010100007845 HcinC1_010100007850 fliE flgC TRUE 0.996 10.000 0.271 0.005 Y NA
 6153458 6153459 HcinC1_010100007850 HcinC1_010100007855 flgC flgB TRUE 0.998 19.000 0.804 0.005 Y NA
 6153460 6153461 HcinC1_010100007860 HcinC1_010100007865     FALSE 0.041 194.000 0.000 NA   NA
 6153462 6153463 HcinC1_010100007870 HcinC1_010100007875   trmE TRUE 0.920 10.000 0.000 1.000   NA
 6153463 6153464 HcinC1_010100007875 HcinC1_010100007880 trmE   TRUE 0.734 -37.000 0.049 NA   NA
 6153464 6153465 HcinC1_010100007880 HcinC1_010100007885     TRUE 0.964 -3.000 0.061 NA   NA
 6153465 6153466 HcinC1_010100007885 HcinC1_010100007890     TRUE 0.996 14.000 0.461 NA   NA
 6153466 6153467 HcinC1_010100007890 HcinC1_010100007895     TRUE 0.995 1.000 0.540 NA   NA
 6153467 6153468 HcinC1_010100007895 HcinC1_010100007900   rpmH TRUE 0.998 10.000 0.787 1.000   NA
 6153468 6153469 HcinC1_010100007900 HcinC1_010100007905 rpmH   FALSE 0.395 63.000 0.002 1.000   NA
 6153469 6153470 HcinC1_010100007905 HcinC1_010100007910     TRUE 0.965 36.000 0.360 NA   NA
 6153470 6153471 HcinC1_010100007910 HcinC1_010100007915     TRUE 0.959 16.000 0.029 NA   NA
 6153471 6153472 HcinC1_010100007915 HcinC1_010100007920     TRUE 0.960 55.000 0.452 0.027 Y NA
 6153472 6153473 HcinC1_010100007920 HcinC1_010100007925   smpB TRUE 0.683 42.000 0.014 1.000 N NA
 6153473 6153474 HcinC1_010100007925 HcinC1_010100007930 smpB   TRUE 0.952 0.000 0.028 1.000 N NA
 6153474 6153475 HcinC1_010100007930 HcinC1_010100007935     TRUE 0.976 11.000 0.036 1.000 N NA
 6153475 6153476 HcinC1_010100007935 HcinC1_010100007940   truB TRUE 0.954 -6.000 0.046 0.020 N NA
 6153479 6153480 HcinC1_010100007963 HcinC1_010100007968     FALSE 0.031 243.000 0.000 NA   NA
 6153480 6153481 HcinC1_010100007968 HcinC1_010100007973     TRUE 0.441 45.000 0.000 NA   NA
 6153483 6153484 HcinC1_010100007983 HcinC1_010100007988     FALSE 0.094 113.000 0.000 NA   NA
 6153484 6153485 HcinC1_010100007988 HcinC1_010100007993     FALSE 0.339 91.000 0.027 NA   NA
 6153485 6153486 HcinC1_010100007993 HcinC1_010100007998     FALSE 0.333 97.000 0.027 1.000 N NA
 6153486 6153487 HcinC1_010100007998 HcinC1_010100008003     TRUE 0.988 -3.000 0.238 1.000 N NA
 6153487 6153488 HcinC1_010100008003 HcinC1_010100008008     TRUE 0.986 22.000 0.217 1.000   NA
 6153488 6153489 HcinC1_010100008008 HcinC1_010100008013     TRUE 0.857 37.000 0.048 1.000   NA
 6153489 6153490 HcinC1_010100008013 HcinC1_010100008018     FALSE 0.344 63.000 0.000 1.000 N NA
 6153490 6153491 HcinC1_010100008018 HcinC1_010100008023     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6153491 6153492 HcinC1_010100008023 HcinC1_010100008028     TRUE 0.545 36.000 0.000 NA   NA
 6153492 6153493 HcinC1_010100008028 HcinC1_010100008033     TRUE 0.780 25.000 0.000 1.000   NA
 6153493 6153494 HcinC1_010100008033 HcinC1_010100008038     TRUE 0.571 -13.000 0.000 NA   NA
 6153494 6153495 HcinC1_010100008038 HcinC1_010100008043     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6153495 6153496 HcinC1_010100008043 HcinC1_010100008048     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6153496 6153497 HcinC1_010100008048 HcinC1_010100008053     TRUE 0.713 -7.000 0.000 NA   NA
 6153497 6153498 HcinC1_010100008053 HcinC1_010100008058     TRUE 0.862 2.000 0.000 NA   NA
 6153498 6153499 HcinC1_010100008058 HcinC1_010100008063     TRUE 0.940 13.000 0.000 0.049   NA
 6153499 6153500 HcinC1_010100008063 HcinC1_010100008068     TRUE 0.700 29.000 0.000 1.000   NA
 6153500 6153501 HcinC1_010100008068 HcinC1_010100008073     TRUE 0.618 34.000 0.000 1.000   NA
 6153501 6153502 HcinC1_010100008073 HcinC1_010100008078     FALSE 0.424 53.000 0.000 1.000   NA
 6153502 6153503 HcinC1_010100008078 HcinC1_010100008083     TRUE 0.887 18.000 0.000 1.000 N NA
 6153503 6153504 HcinC1_010100008083 HcinC1_010100008088     TRUE 0.993 -3.000 0.480 NA Y NA
 6153504 6153505 HcinC1_010100008088 HcinC1_010100008093     TRUE 0.995 0.000 0.480 NA Y NA
 6153505 6153506 HcinC1_010100008093 HcinC1_010100008118     FALSE 0.019 1816.000 0.000 NA   NA
 6153506 6153507 HcinC1_010100008118 HcinC1_010100008123     TRUE 0.996 -3.000 0.571 0.034   NA
 6153507 6153508 HcinC1_010100008123 HcinC1_010100t08420     TRUE 0.451 44.000 0.000 NA   NA
 6153508 6153509 HcinC1_010100t08420 HcinC1_010100008128     FALSE 0.172 85.000 0.000 NA   NA
 6153509 6153510 HcinC1_010100008128 HcinC1_010100008133     TRUE 0.986 -16.000 0.846 NA   NA
 6153510 6153511 HcinC1_010100008133 HcinC1_010100008138     TRUE 0.914 26.000 0.038 NA   NA
 6153511 6153512 HcinC1_010100008138 HcinC1_010100008143     TRUE 0.997 -3.000 0.656 0.002 Y NA
 6153512 6153513 HcinC1_010100008143 HcinC1_010100008148     TRUE 0.995 19.000 0.460 1.000 Y NA
 6153513 6153514 HcinC1_010100008148 HcinC1_010100008153     TRUE 0.931 26.000 0.045 1.000 N NA
 6153514 6153515 HcinC1_010100008153 HcinC1_010100008158     FALSE 0.052 166.000 0.000 NA   NA
 6153516 6153517 HcinC1_010100008163 HcinC1_010100008168     TRUE 0.565 46.000 0.007 NA N NA
 6153517 6153518 HcinC1_010100008168 HcinC1_010100008173     TRUE 0.914 1.000 0.007 NA   NA
 6153518 6153519 HcinC1_010100008173 HcinC1_010100008178     TRUE 0.906 2.000 0.005 NA   NA
 6153519 6153520 HcinC1_010100008178 HcinC1_010100008183     FALSE 0.345 58.000 0.000 NA   NA
 6153520 6153521 HcinC1_010100008183 HcinC1_010100008188     TRUE 0.497 -18.000 0.000 NA   NA
 6153521 6153522 HcinC1_010100008188 HcinC1_010100008193     FALSE 0.025 348.000 0.000 NA   NA
 6153522 6153523 HcinC1_010100008193 HcinC1_010100008198     TRUE 0.997 9.000 0.448 1.000 Y NA
 6153523 6153524 HcinC1_010100008198 HcinC1_010100008203     TRUE 0.954 1.000 0.028 1.000 N NA
 6153524 6153525 HcinC1_010100008203 HcinC1_010100008208     TRUE 0.869 18.000 0.000 NA   NA
 6153525 6153526 HcinC1_010100008208 HcinC1_010100008213     FALSE 0.158 89.000 0.000 NA   NA
 6153527 6153528 HcinC1_010100008218 HcinC1_010100008223     TRUE 0.519 38.000 0.000 NA   NA
 6153529 6153530 HcinC1_010100008228 HcinC1_010100008233     TRUE 0.998 0.000 0.667 0.009   NA
 6153530 6153531 HcinC1_010100008233 HcinC1_010100008238     FALSE 0.106 106.000 0.000 NA   NA
 6153532 6153533 HcinC1_010100008243 HcinC1_010100008248   hisG TRUE 0.506 -25.000 0.004 NA   NA
 6153533 6153534 HcinC1_010100008248 HcinC1_010100008253 hisG   TRUE 0.831 31.000 0.023 1.000 N NA
 6153534 6153535 HcinC1_010100008253 HcinC1_010100008258     TRUE 0.888 0.000 0.003 NA   NA
 6153535 6153536 HcinC1_010100008258 HcinC1_010100008263     TRUE 0.878 26.000 0.024 NA   NA
 6153536 6153537 HcinC1_010100008263 HcinC1_010100008268   dut TRUE 0.871 25.000 0.017 NA   NA
 6153537 6153538 HcinC1_010100008268 HcinC1_010100008273 dut greA TRUE 0.950 4.000 0.019 1.000 N NA
 6153538 6153539 HcinC1_010100008273 HcinC1_010100008278 greA   FALSE 0.062 163.000 0.000 1.000   NA
 6153540 6153541 HcinC1_010100008283 HcinC1_010100008288   napG TRUE 0.996 10.000 0.270 0.003   NA
 6153541 6153542 HcinC1_010100008288 HcinC1_010100008293 napG napH TRUE 0.998 0.000 0.795 0.003   NA
 6153542 6153543 HcinC1_010100008293 HcinC1_010100008298 napH   TRUE 0.994 -3.000 0.385 0.003   NA
 6153543 6153544 HcinC1_010100008298 HcinC1_010100008303     TRUE 0.866 3.000 0.000 NA   NA
 6153544 6153545 HcinC1_010100008303 HcinC1_010100008308     TRUE 0.979 2.000 0.083 NA   NA
 6153545 6153546 HcinC1_010100008308 HcinC1_010100008313     FALSE 0.252 70.000 0.000 NA   NA
 6153547 6153548 HcinC1_010100008318 HcinC1_010100008323     TRUE 0.713 -7.000 0.000 NA   NA
 6153548 6153549 HcinC1_010100008323 HcinC1_010100008328     TRUE 0.985 26.000 0.385 NA   NA
 6153551 6153552 HcinC1_010100008338 HcinC1_010100008343     TRUE 0.932 16.000 0.005 1.000 N NA
 6153552 6153553 HcinC1_010100008343 HcinC1_010100008348     TRUE 0.881 2.000 0.000 1.000   NA
 6153553 6153554 HcinC1_010100008348 HcinC1_010100008353     FALSE 0.120 100.000 0.000 NA   NA
 6153554 6153555 HcinC1_010100008353 HcinC1_010100008358     FALSE 0.374 54.000 0.000 NA   NA
 6153555 6153556 HcinC1_010100008358 HcinC1_010100008363     TRUE 0.912 1.000 0.000 0.062   NA
 6153556 6153557 HcinC1_010100008363 HcinC1_010100008368     FALSE 0.158 89.000 0.000 NA   NA
 6153557 6153558 HcinC1_010100008368 HcinC1_010100008373     FALSE 0.022 475.000 0.000 NA   NA
 6153558 6153559 HcinC1_010100008373 HcinC1_010100008378     FALSE 0.031 241.000 0.000 NA N NA
 6153560 6153561 HcinC1_010100008383 HcinC1_010100008388     TRUE 0.993 3.000 0.333 NA   NA
 6153561 6153562 HcinC1_010100008388 HcinC1_010100008393     FALSE 0.208 77.000 0.000 NA   NA
 6153563 6153564 HcinC1_010100008398 HcinC1_010100008403     TRUE 0.971 -6.000 0.091 0.079 N NA
 6153564 6153565 HcinC1_010100008403 HcinC1_010100008408     TRUE 0.997 -3.000 0.629 0.001 Y NA
 6153565 6153566 HcinC1_010100008408 HcinC1_010100008413     TRUE 0.969 70.000 0.833 0.016 Y NA
 6153567 6153568 HcinC1_010100008420 HcinC1_010100008425     FALSE 0.161 88.000 0.000 NA   NA
 6153568 6153569 HcinC1_010100008425 HcinC1_010100008430     TRUE 0.950 2.000 0.029 NA   NA
 6153569 6153570 HcinC1_010100008430 HcinC1_010100008435     TRUE 0.849 -7.000 0.017 NA   NA
 6153570 6153571 HcinC1_010100008435 HcinC1_010100008440     TRUE 0.992 9.000 0.146 1.000   NA
 6153571 6153572 HcinC1_010100008440 HcinC1_010100008445   surE TRUE 0.978 10.000 0.041 1.000   NA
 6153572 6153573 HcinC1_010100008445 HcinC1_010100008450 surE   TRUE 0.962 -3.000 0.051 1.000   NA
 6153573 6153574 HcinC1_010100008450 HcinC1_010100008455     TRUE 0.713 -7.000 0.000 NA   NA
 6153574 6153575 HcinC1_010100008455 HcinC1_010100008460     TRUE 0.896 7.000 0.000 NA   NA
 6153576 6153577 HcinC1_010100008465 HcinC1_010100008470     FALSE 0.423 -24.000 0.000 NA   NA
 6153577 6153578 HcinC1_010100008470 HcinC1_010100008475     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6153579 6153580 HcinC1_010100008480 HcinC1_010100008485     TRUE 0.549 229.000 0.519 NA   NA
 6153580 6153581 HcinC1_010100008485 HcinC1_010100008490     FALSE 0.158 89.000 0.000 NA   NA
 6153581 6153582 HcinC1_010100008490 HcinC1_010100008495     TRUE 0.998 0.000 0.841 0.008 Y NA
 6153582 6153583 HcinC1_010100008495 HcinC1_010100008500     TRUE 0.996 -3.000 0.773 1.000 Y NA
 6153584 6153585 HcinC1_010100008505 HcinC1_010100008510     TRUE 0.957 -34.000 0.407 0.062 N NA
 6153585 6153586 HcinC1_010100008510 HcinC1_010100008515     TRUE 0.998 4.000 0.815 0.026 Y NA
 6153587 6153588 HcinC1_010100008520 HcinC1_010100008525     TRUE 0.957 9.000 0.014 1.000 N NA
 6153588 6153589 HcinC1_010100008525 HcinC1_010100008530     TRUE 0.952 35.000 0.221 NA   NA
 6153590 6153591 HcinC1_010100008535 HcinC1_010100008540 acpS fliL TRUE 0.974 4.000 0.047 1.000 N NA
 6153591 6153592 HcinC1_010100008540 HcinC1_010100008545 fliL   TRUE 0.929 2.000 0.014 NA N NA
 6153592 6153593 HcinC1_010100008545 HcinC1_010100008550     TRUE 0.904 11.000 0.000 NA Y NA
 6153593 6153594 HcinC1_010100008550 HcinC1_010100008555     TRUE 0.698 30.000 0.002 NA   NA
 6153594 6153595 HcinC1_010100008555 HcinC1_010100008560     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6153596 6153597 HcinC1_010100008565 HcinC1_010100008570     FALSE 0.046 181.000 0.000 NA   NA
 6153598 6153599 HcinC1_010100008575 HcinC1_010100008580 actP   TRUE 0.991 -3.000 0.375 NA   NA
 6153599 6153600 HcinC1_010100008580 HcinC1_010100008585     FALSE 0.026 330.000 0.000 NA   NA
 6153600 6153601 HcinC1_010100008585 HcinC1_010100008600     FALSE 0.019 1882.000 0.000 NA   NA
 6153601 6153602 HcinC1_010100008600 HcinC1_010100008605     TRUE 0.489 40.000 0.000 NA   NA
 6153603 6153604 HcinC1_010100008610 HcinC1_010100008615     TRUE 0.952 28.000 0.093 1.000 N NA
 6153604 6153605 HcinC1_010100008615 HcinC1_010100008620     TRUE 0.989 11.000 0.096 1.000 Y NA
 6153605 6153606 HcinC1_010100008620 HcinC1_010100008625     TRUE 0.990 4.000 0.142 1.000 N NA
 6153606 6153607 HcinC1_010100008625 HcinC1_010100008630     TRUE 0.965 7.000 0.031 NA   NA
 6153608 6153609 HcinC1_010100008635 HcinC1_010100008640     TRUE 0.571 -13.000 0.000 NA   NA
 6153610 6153611 HcinC1_010100008645 HcinC1_010100008650 recR   FALSE 0.261 83.000 0.003 1.000 N NA
 6153611 6153612 HcinC1_010100008650 HcinC1_010100008655   alr TRUE 0.867 43.000 0.071 1.000 N NA
 6153612 6153613 HcinC1_010100008655 HcinC1_010100008660 alr truD TRUE 0.936 4.000 0.008 1.000   NA
 6153614 6153615 HcinC1_010100008665 HcinC1_010100008670     TRUE 0.990 2.000 0.222 NA N NA
 6153615 6153616 HcinC1_010100008670 HcinC1_010100008675     TRUE 0.955 11.000 0.011 1.000   NA
 6153616 6153617 HcinC1_010100008675 HcinC1_010100008680     FALSE 0.056 158.000 0.000 NA   NA
 6153617 6153618 HcinC1_010100008680 HcinC1_010100008685     TRUE 0.903 21.000 0.012 NA N NA
 6153618 6153619 HcinC1_010100008685 HcinC1_010100008690     TRUE 0.928 2.000 0.013 NA   NA
 6153619 6153620 HcinC1_010100008690 HcinC1_010100008695     TRUE 0.933 13.000 0.005 NA   NA
 6153620 6153621 HcinC1_010100008695 HcinC1_010100008700     TRUE 0.943 17.000 0.013 1.000 Y NA
 6153622 6153623 HcinC1_010100008705 HcinC1_010100008710     TRUE 0.613 32.000 0.000 NA   NA
 6153624 6153625 HcinC1_010100008715 HcinC1_010100008720     TRUE 0.904 12.000 0.000 NA   NA
 6153626 6153627 HcinC1_010100008725 HcinC1_010100008730     FALSE 0.358 85.000 0.019 1.000   NA
 6153627 6153628 HcinC1_010100008730 HcinC1_010100008735     TRUE 0.966 4.000 0.034 1.000 N NA
 6153629 6153630 HcinC1_010100008740 HcinC1_010100008745     FALSE 0.231 73.000 0.000 NA   NA
 6153631 6153632 HcinC1_010100008750 HcinC1_010100008755     FALSE 0.396 51.000 0.000 NA   NA
 6153633 6153634 HcinC1_010100008760 HcinC1_010100008765     TRUE 0.733 -13.000 0.009 1.000   NA
 6153634 6153635 HcinC1_010100008765 HcinC1_010100008770     FALSE 0.322 74.000 0.004 1.000   NA
 6153635 6153636 HcinC1_010100008770 HcinC1_010100008775     TRUE 0.955 0.000 0.031 1.000   NA
 6153636 6153637 HcinC1_010100008775 HcinC1_010100008780     TRUE 0.996 0.000 0.496 0.030 Y NA
 6153637 6153638 HcinC1_010100008780 HcinC1_010100008785   gltA FALSE 0.431 60.000 0.002 1.000 N NA
 6153640 6153641 HcinC1_010100008795 HcinC1_010100008800     FALSE 0.359 56.000 0.000 NA   NA
 6153641 6153642 HcinC1_010100008800 HcinC1_010100008805     TRUE 0.896 7.000 0.000 NA   NA
 6153642 6153643 HcinC1_010100008805 HcinC1_010100008810     TRUE 0.807 22.000 0.000 NA   NA
 6153644 6153645 HcinC1_010100008815 HcinC1_010100008820     TRUE 0.913 14.000 0.000 1.000   NA
 6153645 6153646 HcinC1_010100008820 HcinC1_010100008825     FALSE 0.097 122.000 0.000 1.000 N NA
 6153646 6153647 HcinC1_010100008825 HcinC1_010100008830     FALSE 0.031 298.000 0.000 1.000 N NA
 6153647 6153648 HcinC1_010100008830 HcinC1_010100008835     TRUE 0.993 1.000 0.389 NA   NA
 6153648 6153649 HcinC1_010100008835 HcinC1_010100008840     FALSE 0.109 104.000 0.000 NA   NA
 6153650 6153651 HcinC1_010100008845 HcinC1_010100008850     FALSE 0.092 114.000 0.000 NA   NA
 6153651 6153652 HcinC1_010100008850 HcinC1_010100008855     TRUE 0.990 30.000 0.732 1.000 Y NA
 6153652 6153653 HcinC1_010100008855 HcinC1_010100008860     TRUE 0.595 33.000 0.000 NA N NA
 6153653 6153654 HcinC1_010100008860 HcinC1_010100008865     TRUE 0.852 0.000 0.000 NA Y NA
 6153654 6153655 HcinC1_010100008865 HcinC1_010100008870     TRUE 0.998 10.000 0.428 0.002 Y NA
 6153655 6153656 HcinC1_010100008870 HcinC1_010100008875     TRUE 0.993 0.000 0.219 0.002 Y NA
 6153656 6153657 HcinC1_010100008875 HcinC1_010100008880     FALSE 0.074 265.000 0.023 NA   NA
 6153658 6153659 HcinC1_010100008885 HcinC1_010100008890     FALSE 0.123 99.000 0.000 NA   NA
 6153659 6153660 HcinC1_010100008890 HcinC1_010100008895     TRUE 0.875 0.000 0.000 1.000   NA
 6153660 6153661 HcinC1_010100008895 HcinC1_010100008900     TRUE 0.438 94.000 0.042 1.000   NA
 6153661 6153662 HcinC1_010100008900 HcinC1_010100008905     TRUE 0.990 24.000 0.417 1.000   NA
 6153662 6153663 HcinC1_010100008905 HcinC1_010100008910   fabG TRUE 0.461 58.000 0.003 1.000 N NA
 6153663 6153664 HcinC1_010100008910 HcinC1_010100008915 fabG   TRUE 0.922 67.000 0.321 0.005 Y NA
 6153664 6153665 HcinC1_010100008915 HcinC1_010100008920     FALSE 0.371 125.000 0.066 1.000 Y NA
 6153665 6153666 HcinC1_010100008920 HcinC1_010100008925     TRUE 0.979 9.000 0.046 1.000 Y NA
 6153666 6153667 HcinC1_010100008925 HcinC1_010100008930     FALSE 0.057 173.000 0.000 1.000 N NA
 6153668 6153669 HcinC1_010100008935 HcinC1_010100008940   pyrG TRUE 0.938 21.000 0.026 1.000 N NA
 6153670 6153671 HcinC1_010100008945 HcinC1_010100008950     TRUE 0.883 -16.000 0.068 1.000 N NA
 6153672 6153673 HcinC1_010100008955 HcinC1_010100008960     TRUE 0.852 75.000 0.279 1.000 N NA
 6153674 6153675 HcinC1_010100008965 HcinC1_010100008970     TRUE 0.804 45.000 0.056 NA   NA
 6153675 6153676 HcinC1_010100008970 HcinC1_010100008975     TRUE 0.993 -7.000 0.778 NA   NA
 6153676 6153677 HcinC1_010100008975 HcinC1_010100008980     TRUE 0.670 46.000 0.024 NA   NA
 6153677 6153678 HcinC1_010100008980 HcinC1_010100008985     TRUE 0.939 24.000 0.046 NA   NA
 6153678 6153679 HcinC1_010100008985 HcinC1_010100008990     TRUE 0.940 -3.000 0.033 NA   NA
 6153679 6153680 HcinC1_010100008990 HcinC1_010100008995     TRUE 0.970 3.000 0.053 NA   NA
 6153680 6153681 HcinC1_010100008995 HcinC1_010100009000     FALSE 0.166 86.000 0.000 NA   NA
 6153683 6153684 HcinC1_010100009010 HcinC1_010100009015 tig clpP TRUE 0.996 10.000 0.351 1.000 Y NA
 6153684 6153685 HcinC1_010100009015 HcinC1_010100009020 clpP   TRUE 0.923 17.000 0.004 1.000 N NA
 6153685 6153686 HcinC1_010100009020 HcinC1_010100009025   def TRUE 0.675 -37.000 0.030 1.000 N NA
 6153686 6153687 HcinC1_010100009025 HcinC1_010100009030 def   TRUE 0.971 0.000 0.054 1.000 N NA
 6153687 6153688 HcinC1_010100009030 HcinC1_010100009035     TRUE 0.933 10.000 0.004 NA   NA
 6153690 6153691 HcinC1_010100009045 HcinC1_010100009050     TRUE 0.928 3.000 0.012 NA   NA
 6153691 6153692 HcinC1_010100009050 HcinC1_010100009055     TRUE 0.988 10.000 0.088 1.000   NA
 6153692 6153693 HcinC1_010100009055 HcinC1_010100009060     TRUE 0.986 9.000 0.080 NA   NA
 6153693 6153694 HcinC1_010100009060 HcinC1_010100009065     TRUE 0.995 10.000 0.323 NA   NA
 6153694 6153695 HcinC1_010100009065 HcinC1_010100009070     TRUE 0.995 11.000 0.333 NA   NA
 6153695 6153696 HcinC1_010100009070 HcinC1_010100009075     TRUE 0.882 22.000 0.009 NA   NA
 6153696 6153697 HcinC1_010100009075 HcinC1_010100009080     TRUE 0.642 36.000 0.004 NA   NA
 6153697 6153698 HcinC1_010100009080 HcinC1_010100009085     TRUE 0.993 12.000 0.182 NA   NA
 6153698 6153699 HcinC1_010100009085 HcinC1_010100009090     FALSE 0.143 93.000 0.000 NA   NA
 6153699 6153700 HcinC1_010100009090 HcinC1_010100009095     FALSE 0.334 69.000 0.002 1.000 N NA
 6153700 6153701 HcinC1_010100009095 HcinC1_010100009100     TRUE 0.958 10.000 0.019 NA   NA
 6153701 6153702 HcinC1_010100009100 HcinC1_010100009105     TRUE 0.969 -3.000 0.071 NA   NA
 6153702 6153703 HcinC1_010100009105 HcinC1_010100009110   glyQ TRUE 0.916 2.000 0.008 NA   NA
 6153703 6153704 HcinC1_010100009110 HcinC1_010100009115 glyQ   TRUE 0.905 0.000 0.003 1.000   NA
 6153704 6153705 HcinC1_010100009115 HcinC1_010100009120     TRUE 0.971 18.000 0.053 NA   NA
 6153705 6153706 HcinC1_010100009120 HcinC1_010100009125     TRUE 0.789 45.000 0.049 NA   NA
 6153706 6153707 HcinC1_010100009125 HcinC1_010100009130     TRUE 0.884 -7.000 0.024 1.000 N NA
 6153707 6153708 HcinC1_010100009130 HcinC1_010100009135   rpsF TRUE 0.439 74.000 0.020 1.000 N NA
 6153708 6153709 HcinC1_010100009135 HcinC1_010100009140 rpsF   TRUE 0.958 19.000 0.033 1.000 N NA
 6153709 6153710 HcinC1_010100009140 HcinC1_010100009145   rpsR TRUE 0.907 27.000 0.034 1.000 N NA
 6153710 6153711 HcinC1_010100009145 HcinC1_010100009150 rpsR   FALSE 0.073 148.000 0.002 NA   NA
 6153713 6153714 HcinC1_010100009160 HcinC1_010100009165     TRUE 0.663 29.000 0.000 NA   NA
 6153715 6153716 HcinC1_010100009170 HcinC1_010100009175     FALSE 0.136 120.000 0.004 1.000 N NA
 6153716 6153717 HcinC1_010100009175 HcinC1_010100009180   porA TRUE 0.996 13.000 0.268 0.002 Y NA
 6153717 6153718 HcinC1_010100009180 HcinC1_010100009185 porA porD TRUE 0.992 10.000 0.091 0.002 Y NA
 6153718 6153719 HcinC1_010100009185 HcinC1_010100009190 porD   TRUE 0.983 16.000 0.043 0.002 Y NA
 6153720 6153721 HcinC1_010100009195 HcinC1_010100009200     FALSE 0.391 57.000 0.000 1.000   NA
 6153721 6153722 HcinC1_010100009200 HcinC1_010100009205     TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000   NA
 6153722 6153723 HcinC1_010100009205 HcinC1_010100009210     FALSE 0.132 102.000 0.000 1.000 N NA
 6153723 6153724 HcinC1_010100009210 HcinC1_010100009215     FALSE 0.166 86.000 0.000 NA   NA
 6153725 6153726 HcinC1_010100009220 HcinC1_010100009225     FALSE 0.048 178.000 0.000 NA   NA
 6153726 6153727 HcinC1_010100009225 HcinC1_010100009230     FALSE 0.359 56.000 0.000 NA   NA
 6153727 6153728 HcinC1_010100009230 HcinC1_010100009235     FALSE 0.029 277.000 0.000 NA   NA
 6153728 6153729 HcinC1_010100009235 HcinC1_010100009240     FALSE 0.177 84.000 0.000 NA   NA
 6153729 6153730 HcinC1_010100009240 HcinC1_010100009245     FALSE 0.021 496.000 0.000 NA   NA
 6153730 6153731 HcinC1_010100009245 HcinC1_010100009250     FALSE 0.079 125.000 0.000 NA   NA
 6153731 6153732 HcinC1_010100009250 HcinC1_010100009255     TRUE 0.822 -3.000 0.000 NA N NA
 6153732 6153733 HcinC1_010100009255 HcinC1_010100009260     TRUE 0.612 -13.000 0.000 1.000   NA
 6153733 6153734 HcinC1_010100009260 HcinC1_010100009265     TRUE 0.647 -10.000 0.000 NA   NA
 6153735 6153736 HcinC1_010100009270 HcinC1_010100009275     FALSE 0.359 56.000 0.000 NA   NA
 6153736 6153737 HcinC1_010100009275 HcinC1_010100009280     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6153737 6153738 HcinC1_010100009280 HcinC1_010100009285     FALSE 0.040 197.000 0.000 NA   NA
 6153741 6153742 HcinC1_010100009300 HcinC1_010100009305     FALSE 0.422 48.000 0.000 NA   NA
 6153742 6153743 HcinC1_010100009305 HcinC1_010100009310     TRUE 0.946 25.000 0.062 NA   NA
 6153744 6153745 HcinC1_010100009315 HcinC1_010100009320     TRUE 0.721 67.000 0.075 NA   NA
 6153745 6153746 HcinC1_010100009320 HcinC1_010100009325   tgt TRUE 0.963 0.000 0.038 1.000 N NA
 6153746 6153747 HcinC1_010100009325 HcinC1_010100009330 tgt rbfA TRUE 0.721 -10.000 0.002 1.000 Y NA
 6153747 6153748 HcinC1_010100009330 HcinC1_010100009335 rbfA   TRUE 0.957 18.000 0.033 NA   NA
 6153748 6153749 HcinC1_010100009335 HcinC1_010100009340     TRUE 0.801 -10.000 0.016 NA   NA
 6153749 6153750 HcinC1_010100009340 HcinC1_010100009345     TRUE 0.734 -12.000 0.005 1.000   NA
 6153750 6153751 HcinC1_010100009345 HcinC1_010100009350     FALSE 0.201 97.000 0.006 NA   NA
 6153751 6153752 HcinC1_010100009350 HcinC1_010100009355   pyrH FALSE 0.058 154.000 0.000 NA   NA
 6153752 6153753 HcinC1_010100009355 HcinC1_010100009360 pyrH   TRUE 0.607 65.000 0.033 1.000 N NA
 6153753 6153754 HcinC1_010100009360 HcinC1_010100009365     TRUE 0.977 10.000 0.039 1.000 Y NA
 6153754 6153755 HcinC1_010100009365 HcinC1_010100009370     TRUE 0.908 29.000 0.045 1.000 N NA
 6153755 6153756 HcinC1_010100009370 HcinC1_010100009375     TRUE 0.979 10.000 0.043 1.000   NA
 6153756 6153757 HcinC1_010100009375 HcinC1_010100009380     TRUE 0.986 10.000 0.068 1.000   NA
 6153757 6153758 HcinC1_010100009380 HcinC1_010100009385     TRUE 0.976 11.000 0.042 NA   NA
 6153758 6153759 HcinC1_010100009385 HcinC1_010100009390     TRUE 0.897 3.000 0.003 NA   NA
 6153759 6153760 HcinC1_010100009390 HcinC1_010100009395     FALSE 0.181 111.000 0.009 1.000 N NA
 6153760 6153761 HcinC1_010100009395 HcinC1_010100009400   prmA TRUE 0.970 13.000 0.029 1.000 N NA
 6153761 6153762 HcinC1_010100009400 HcinC1_010100009405 prmA   TRUE 0.957 19.000 0.032 1.000 N NA
 6153762 6153763 HcinC1_010100009405 HcinC1_010100009410     TRUE 0.983 10.000 0.065 NA   NA
 6153763 6153764 HcinC1_010100009410 HcinC1_010100009415     TRUE 0.745 -10.000 0.005 NA   NA
 6153764 6153765 HcinC1_010100009415 HcinC1_010100009420     TRUE 0.454 60.000 0.004 1.000 N NA
 6153765 6153766 HcinC1_010100009420 HcinC1_010100009425     TRUE 0.974 16.000 0.042 1.000 N NA
 6153766 6153767 HcinC1_010100009425 HcinC1_010100009430     TRUE 0.901 1.000 0.002 1.000 N NA
 6153767 6153768 HcinC1_010100009430 HcinC1_010100009435     TRUE 0.875 0.000 0.000 1.000   NA
 6153769 6153770 HcinC1_010100009440 HcinC1_010100009445     TRUE 0.647 -10.000 0.000 NA   NA
 6153770 6153771 HcinC1_010100009445 HcinC1_010100009450     TRUE 0.803 -28.000 0.059 1.000   NA
 6153772 6153773 HcinC1_010100009455 HcinC1_010100009460     TRUE 0.866 -3.000 0.002 1.000   NA
 6153773 6153774 HcinC1_010100009460 HcinC1_010100009465     TRUE 0.972 10.000 0.015 0.012 N NA
 6153775 6153776 HcinC1_010100009470 HcinC1_010100t09627     FALSE 0.155 90.000 0.000 NA   NA
 6153776 6153777 HcinC1_010100t09627 HcinC1_010100t09629     TRUE 0.532 37.000 0.000 NA   NA
 6153777 6153778 HcinC1_010100t09629 HcinC1_010100009475     TRUE 0.506 39.000 0.000 NA   NA
 6153778 6153779 HcinC1_010100009475 HcinC1_010100009480     FALSE 0.268 98.000 0.016 1.000   NA
 6153779 6153780 HcinC1_010100009480 HcinC1_010100009485     TRUE 0.818 -13.000 0.028 1.000   NA
 6153780 6153781 HcinC1_010100009485 HcinC1_010100009490     TRUE 0.993 10.000 0.165 1.000   NA
 6153781 6153782 HcinC1_010100009490 HcinC1_010100009495     TRUE 0.979 -3.000 0.116 NA   NA
 6153782 6153783 HcinC1_010100009495 HcinC1_010100009500     TRUE 0.905 -3.000 0.013 NA   NA
 6153783 6153784 HcinC1_010100009500 HcinC1_010100009505     FALSE 0.031 310.000 0.000 1.000 N NA
 6153784 6153785 HcinC1_010100009505 HcinC1_010100009510     TRUE 0.973 0.000 0.059 1.000   NA
 6153785 6153786 HcinC1_010100009510 HcinC1_010100009515     TRUE 0.837 -7.000 0.009 1.000   NA
 6153786 6153787 HcinC1_010100009515 HcinC1_010100009520   pcm TRUE 0.956 25.000 0.068 1.000   NA
 6153787 6153788 HcinC1_010100009520 HcinC1_010100009525 pcm   TRUE 0.894 43.000 0.099 1.000   NA
 6153788 6153789 HcinC1_010100009525 HcinC1_010100009530   nrdF TRUE 0.933 -10.000 0.071 1.000   NA
 6153789 6153790 HcinC1_010100009530 HcinC1_010100t09631 nrdF   FALSE 0.127 98.000 0.000 NA   NA
 6153790 6153791 HcinC1_010100t09631 HcinC1_010100009535     FALSE 0.143 93.000 0.000 NA   NA
 6153791 6153792 HcinC1_010100009535 HcinC1_010100009540   fliH TRUE 0.930 26.000 0.052 NA N NA
 6153792 6153793 HcinC1_010100009540 HcinC1_010100009545 fliH fliG TRUE 0.964 -13.000 0.308 NA Y NA
 6153793 6153794 HcinC1_010100009545 HcinC1_010100009550 fliG fliF TRUE 0.997 18.000 0.477 0.007 Y NA
 6153794 6153795 HcinC1_010100009550 HcinC1_010100009555 fliF   TRUE 0.987 9.000 0.084 1.000 N NA
 6153796 6153797 HcinC1_010100009560 HcinC1_010100009565     TRUE 0.924 -3.000 0.018 1.000 N NA
 6153797 6153798 HcinC1_010100009565 HcinC1_010100009570     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA N NA
 6153798 6153799 HcinC1_010100009570 HcinC1_010100009575     TRUE 0.475 -19.000 0.000 NA   NA
 6153799 6153800 HcinC1_010100009575 HcinC1_010100009580     TRUE 0.856 0.000 0.000 NA   NA
 6153800 6153801 HcinC1_010100009580 HcinC1_010100009585     TRUE 0.823 -3.000 0.000 NA   NA
 6153803 6153804 HcinC1_010100009595 HcinC1_010100009600     TRUE 0.475 -19.000 0.000 NA   NA
 6153804 6153805 HcinC1_010100009600 HcinC1_010100009605     FALSE 0.072 130.000 0.000 NA   NA
 6153807 6153808 HcinC1_010100009615 HcinC1_010100009620     TRUE 0.678 -9.000 0.000 NA   NA
 6153809 6153810 HcinC1_010100009631 HcinC1_010100009636     FALSE 0.120 146.000 0.000 0.001   NA
 6153810 6153811 HcinC1_010100009636 HcinC1_010100009641     TRUE 0.913 14.000 0.000 1.000   NA
 6153811 6153812 HcinC1_010100009641 HcinC1_010100009646     TRUE 0.846 -3.000 0.000 1.000   NA
 6153812 6153813 HcinC1_010100009646 HcinC1_010100009651     TRUE 0.713 -7.000 0.000 NA   NA
 6153813 6153814 HcinC1_010100009651 HcinC1_010100009656     TRUE 0.645 30.000 0.000 NA   NA
 6153814 6153815 HcinC1_010100009656 HcinC1_010100009661     TRUE 0.981 12.000 0.059 NA   NA
 6153817 6153818 HcinC1_010100009671 HcinC1_010100009676     TRUE 0.997 3.000 0.657 1.000 Y NA
 6153818 6153819 HcinC1_010100009676 HcinC1_010100009681     TRUE 0.984 -7.000 0.209 0.002   NA
 6153820 6153821 HcinC1_010100009686 HcinC1_010100009691     TRUE 0.965 11.000 0.022 1.000   NA
 6153821 6153822 HcinC1_010100009691 HcinC1_010100009696     FALSE 0.076 141.000 0.000 1.000   NA
 6153822 6153823 HcinC1_010100009696 HcinC1_010100009701     TRUE 0.743 27.000 0.000 1.000   NA
 6153823 6153824 HcinC1_010100009701 HcinC1_010100009706     TRUE 0.991 13.000 0.122 1.000   NA
 6153824 6153825 HcinC1_010100009706 HcinC1_010100009711     TRUE 0.990 -3.000 0.286 1.000 Y NA
 6153826 6153827 HcinC1_010100009716 HcinC1_010100009721     TRUE 0.820 49.000 0.068 NA   NA
 6153827 6153828 HcinC1_010100009721 HcinC1_010100009726     FALSE 0.063 143.000 0.000 NA   NA
 6153828 6153829 HcinC1_010100009726 HcinC1_010100009731