MicrobesOnline Operon Predictions for Bacteroides cellulosilyticus DSM 14838

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6376988 6376989 BACCELL_00002 BACCELL_00003     TRUE 0.976 0.000 0.875 1.000 N NA
 6376989 6376990 BACCELL_00003 BACCELL_00004     TRUE 0.667 67.000 0.102 1.000 N NA
 6376990 6376991 BACCELL_00004 BACCELL_00005     TRUE 0.978 19.000 0.136 0.057 Y NA
 6376992 6376993 BACCELL_00006 BACCELL_00007     FALSE 0.190 206.000 0.118 NA   NA
 6376993 6376994 BACCELL_00007 BACCELL_00008     FALSE 0.379 2.000 0.000 NA   NA
 6376994 6376995 BACCELL_00008 BACCELL_00009     TRUE 0.989 32.000 0.980 0.085   NA
 6376995 6376996 BACCELL_00009 BACCELL_00010     TRUE 0.958 16.000 0.373 0.081   NA
 6376996 6376997 BACCELL_00010 BACCELL_00011     TRUE 0.963 27.000 0.500 1.000   NA
 6376997 6376998 BACCELL_00011 BACCELL_00012     TRUE 0.811 14.000 0.172 NA N NA
 6376998 6376999 BACCELL_00012 BACCELL_00013     FALSE 0.381 6.000 0.000 NA   NA
 6376999 6377000 BACCELL_00013 BACCELL_00014     FALSE 0.040 230.000 0.000 1.000   NA
 6377000 6377001 BACCELL_00014 BACCELL_00015     TRUE 0.926 -3.000 0.393 NA   NA
 6377001 6377002 BACCELL_00015 BACCELL_00016     TRUE 0.954 3.000 0.526 NA   NA
 6377002 6377003 BACCELL_00016 BACCELL_00017     TRUE 0.912 12.000 0.316 NA   NA
 6377005 6377006 BACCELL_00019 BACCELL_00020     FALSE 0.384 4.000 0.000 NA   NA
 6377006 6377007 BACCELL_00020 BACCELL_00021     FALSE 0.228 77.000 0.000 NA   NA
 6377007 6377008 BACCELL_00021 BACCELL_00022     FALSE 0.212 101.000 0.000 NA   NA
 6377008 6377009 BACCELL_00022 BACCELL_00023     FALSE 0.120 145.000 0.000 NA   NA
 6377009 6377010 BACCELL_00023 BACCELL_00024     FALSE 0.370 12.000 0.000 NA   NA
 6377010 6377011 BACCELL_00024 BACCELL_00025     FALSE 0.367 14.000 0.000 NA   NA
 6377011 6377012 BACCELL_00025 BACCELL_00026     FALSE 0.368 13.000 0.000 NA   NA
 6377012 6377013 BACCELL_00026 BACCELL_00027     FALSE 0.375 8.000 0.000 NA   NA
 6377013 6377014 BACCELL_00027 BACCELL_00028     FALSE 0.212 86.000 0.000 NA   NA
 6377014 6377015 BACCELL_00028 BACCELL_00029     FALSE 0.260 61.000 0.000 NA   NA
 6377015 6377016 BACCELL_00029 BACCELL_00030     FALSE 0.322 -13.000 0.000 NA   NA
 6377016 6377017 BACCELL_00030 BACCELL_00031     FALSE 0.003 608.000 0.000 NA   NA
 6377017 6377018 BACCELL_00031 BACCELL_00032     TRUE 0.955 110.000 1.000 NA   NA
 6377018 6377019 BACCELL_00032 BACCELL_00033     TRUE 0.911 22.000 0.286 NA   NA
 6377019 6377020 BACCELL_00033 BACCELL_00034     TRUE 0.945 27.000 0.429 NA   NA
 6377020 6377021 BACCELL_00034 BACCELL_00035     TRUE 0.954 57.000 0.750 NA   NA
 6377021 6377022 BACCELL_00035 BACCELL_00036     TRUE 0.877 116.000 0.500 NA   NA
 6377022 6377023 BACCELL_00036 BACCELL_00037     TRUE 0.945 39.000 0.500 NA   NA
 6377023 6377024 BACCELL_00037 BACCELL_00038     TRUE 0.931 -19.000 0.500 NA   NA
 6377024 6377025 BACCELL_00038 BACCELL_00039     TRUE 0.960 -37.000 0.800 NA   NA
 6377025 6377026 BACCELL_00039 BACCELL_00040     FALSE 0.004 429.000 0.000 NA   NA
 6377026 6377027 BACCELL_00040 BACCELL_00041     FALSE 0.290 -28.000 0.000 NA   NA
 6377027 6377028 BACCELL_00041 BACCELL_00042     FALSE 0.206 106.000 0.000 NA   NA
 6377028 6377029 BACCELL_00042 BACCELL_00043     FALSE 0.188 117.000 0.000 NA   NA
 6377029 6377030 BACCELL_00043 BACCELL_00044     FALSE 0.384 5.000 0.000 NA   NA
 6377030 6377031 BACCELL_00044 BACCELL_00045     TRUE 0.973 -24.000 1.000 NA   NA
 6377031 6377032 BACCELL_00045 BACCELL_00046     TRUE 0.965 2.000 0.667 NA   NA
 6377032 6377033 BACCELL_00046 BACCELL_00047     FALSE 0.340 -7.000 0.000 NA   NA
 6377033 6377034 BACCELL_00047 BACCELL_00048     FALSE 0.375 0.000 0.000 NA   NA
 6377035 6377036 BACCELL_00049 BACCELL_00050     TRUE 0.904 18.000 0.000 1.000 Y NA
 6377037 6377038 BACCELL_00051 BACCELL_00052     FALSE 0.386 41.000 0.007 NA   NA
 6377038 6377039 BACCELL_00052 BACCELL_00053     FALSE 0.377 37.000 0.002 NA   NA
 6377040 6377041 BACCELL_00054 BACCELL_00055     FALSE 0.251 65.000 0.000 NA   NA
 6377041 6377042 BACCELL_00055 BACCELL_00056     FALSE 0.375 17.000 0.000 NA   NA
 6377042 6377043 BACCELL_00056 BACCELL_00057     TRUE 0.468 46.000 0.000 1.000   NA
 6377045 6377046 BACCELL_00059 BACCELL_00060     FALSE 0.370 12.000 0.000 NA   NA
 6377047 6377048 BACCELL_00061 BACCELL_00062     TRUE 0.981 19.000 1.000 NA   NA
 6377048 6377049 BACCELL_00062 BACCELL_00063     FALSE 0.219 81.000 0.000 NA   NA
 6377049 6377050 BACCELL_00063 BACCELL_00064     TRUE 0.943 32.000 0.000 0.048 Y NA
 6377050 6377051 BACCELL_00064 BACCELL_00065     TRUE 0.738 19.000 0.000 0.048   NA
 6377051 6377052 BACCELL_00065 BACCELL_00066     FALSE 0.246 68.000 0.000 NA   NA
 6377052 6377053 BACCELL_00066 BACCELL_00067     FALSE 0.235 74.000 0.000 NA   NA
 6377053 6377054 BACCELL_00067 BACCELL_00068     FALSE 0.375 8.000 0.000 NA   NA
 6377056 6377057 BACCELL_00070 BACCELL_00071     TRUE 0.838 -7.000 0.182 1.000 N NA
 6377057 6377058 BACCELL_00071 BACCELL_00072     TRUE 0.622 3.000 0.034 1.000 N NA
 6377058 6377059 BACCELL_00072 BACCELL_00073     FALSE 0.016 252.000 0.000 NA   NA
 6377061 6377062 BACCELL_00075 BACCELL_00076     TRUE 0.948 -15.000 0.600 NA   NA
 6377064 6377065 BACCELL_00078 BACCELL_00079     TRUE 0.936 20.000 0.035 1.000 Y NA
 6377065 6377066 BACCELL_00079 BACCELL_00080     TRUE 0.915 4.000 0.200 0.084 N NA
 6377070 6377071 BACCELL_00084 BACCELL_00085     TRUE 0.519 202.000 0.500 NA   NA
 6377071 6377072 BACCELL_00085 BACCELL_00086     FALSE 0.224 79.000 0.000 NA   NA
 6377072 6377073 BACCELL_00086 BACCELL_00087     FALSE 0.392 22.000 0.000 NA   NA
 6377073 6377074 BACCELL_00087 BACCELL_00088     FALSE 0.103 149.000 0.000 1.000 N NA
 6377076 6377077 BACCELL_00090 BACCELL_00091     FALSE 0.340 -7.000 0.000 NA   NA
 6377077 6377078 BACCELL_00091 BACCELL_00092     FALSE 0.242 70.000 0.000 NA   NA
 6377079 6377080 BACCELL_00093 BACCELL_00094     FALSE 0.004 424.000 0.000 NA   NA
 6377080 6377081 BACCELL_00094 BACCELL_00095     FALSE 0.028 143.000 0.000 NA N NA
 6377081 6377082 BACCELL_00095 BACCELL_00096     FALSE 0.035 238.000 0.000 1.000   NA
 6377082 6377083 BACCELL_00096 BACCELL_00097     TRUE 0.544 4.000 0.000 1.000   NA
 6377084 6377085 BACCELL_00098 BACCELL_00099     FALSE 0.368 13.000 0.000 NA   NA
 6377086 6377087 BACCELL_00100 BACCELL_00101     FALSE 0.368 15.000 0.000 NA   NA
 6377087 6377088 BACCELL_00101 BACCELL_00102     FALSE 0.368 13.000 0.000 NA   NA
 6377088 6377089 BACCELL_00102 BACCELL_00103     FALSE 0.185 119.000 0.000 NA   NA
 6377089 6377090 BACCELL_00103 BACCELL_00104     TRUE 0.739 36.000 0.000 0.050   NA
 6377090 6377091 BACCELL_00104 BACCELL_00105     TRUE 0.566 174.000 0.333 NA   NA
 6377094 6377095 BACCELL_00108 BACCELL_00109     TRUE 0.981 4.000 1.000 NA   NA
 6377095 6377096 BACCELL_00109 BACCELL_00110     TRUE 0.406 24.000 0.000 NA   NA
 6377096 6377097 BACCELL_00110 BACCELL_00111     TRUE 0.996 10.000 1.000 1.000 Y NA
 6377100 6377101 BACCELL_00114 BACCELL_00115     FALSE 0.375 0.000 0.000 NA   NA
 6377101 6377102 BACCELL_00115 BACCELL_00116     FALSE 0.367 14.000 0.000 NA   NA
 6377102 6377103 BACCELL_00116 BACCELL_00117     FALSE 0.127 142.000 0.000 NA   NA
 6377103 6377104 BACCELL_00117 BACCELL_00118     FALSE 0.352 40.000 0.000 NA   NA
 6377104 6377105 BACCELL_00118 BACCELL_00119     FALSE 0.228 77.000 0.000 NA   NA
 6377105 6377106 BACCELL_00119 BACCELL_00120     FALSE 0.233 75.000 0.000 NA   NA
 6377106 6377107 BACCELL_00120 BACCELL_00121     FALSE 0.371 16.000 0.000 NA   NA
 6377107 6377108 BACCELL_00121 BACCELL_00122     TRUE 0.955 -43.000 0.062 0.009 Y NA
 6377108 6377109 BACCELL_00122 BACCELL_00123     FALSE 0.378 37.000 0.000 NA   NA
 6377109 6377110 BACCELL_00123 BACCELL_00124     FALSE 0.379 18.000 0.000 NA   NA
 6377110 6377111 BACCELL_00124 BACCELL_00125     FALSE 0.288 -30.000 0.000 NA   NA
 6377111 6377112 BACCELL_00125 BACCELL_00126     FALSE 0.361 -3.000 0.000 NA   NA
 6377113 6377114 BACCELL_00127 BACCELL_00128     FALSE 0.373 9.000 0.000 NA   NA
 6377114 6377115 BACCELL_00128 BACCELL_00129     FALSE 0.382 3.000 0.000 NA   NA
 6377115 6377116 BACCELL_00129 BACCELL_00130     TRUE 0.401 31.000 0.000 NA   NA
 6377116 6377117 BACCELL_00130 BACCELL_00131     TRUE 0.410 25.000 0.000 NA   NA
 6377118 6377119 BACCELL_00132 BACCELL_00133     FALSE 0.035 238.000 0.000 1.000   NA
 6377120 6377121 BACCELL_00134 BACCELL_00135     TRUE 0.756 111.000 0.222 NA   NA
 6377121 6377122 BACCELL_00135 BACCELL_00136     FALSE 0.007 333.000 0.000 NA   NA
 6377123 6377124 BACCELL_00137 BACCELL_00138     TRUE 0.535 17.000 0.000 1.000   NA
 6377126 6377127 BACCELL_00140 BACCELL_00141     FALSE 0.133 140.000 0.000 NA   NA
 6377128 6377129 BACCELL_00142 BACCELL_00143     FALSE 0.039 196.000 0.000 NA   NA
 6377131 6377132 BACCELL_00145 BACCELL_00146     TRUE 0.746 23.000 0.000 0.059   NA
 6377132 6377133 BACCELL_00146 BACCELL_00147     TRUE 0.526 14.000 0.000 1.000   NA
 6377133 6377134 BACCELL_00147 BACCELL_00148     FALSE 0.279 127.000 0.000 1.000   NA
 6377134 6377135 BACCELL_00148 BACCELL_00149     FALSE 0.337 90.000 0.000 1.000   NA
 6377137 6377138 BACCELL_00151 BACCELL_00152     TRUE 0.520 -3.000 0.000 1.000   NA
 6377140 6377141 BACCELL_00154 BACCELL_00155     FALSE 0.318 112.000 0.000 1.000   NA
 6377141 6377142 BACCELL_00155 BACCELL_00156     TRUE 0.956 -7.000 0.636 NA   NA
 6377142 6377143 BACCELL_00156 BACCELL_00157     FALSE 0.285 53.000 0.000 NA   NA
 6377145 6377146 BACCELL_00159 BACCELL_00160     TRUE 0.965 2.000 0.667 NA   NA
 6377146 6377147 BACCELL_00160 BACCELL_00161     FALSE 0.378 7.000 0.000 NA   NA
 6377147 6377148 BACCELL_00161 BACCELL_00162     FALSE 0.382 3.000 0.000 NA   NA
 6377148 6377149 BACCELL_00162 BACCELL_00163     TRUE 0.963 -3.000 0.667 NA   NA
 6377149 6377150 BACCELL_00163 BACCELL_00164     TRUE 0.928 29.000 0.333 NA   NA
 6377150 6377151 BACCELL_00164 BACCELL_00165     TRUE 0.919 0.000 0.333 NA   NA
 6377151 6377152 BACCELL_00165 BACCELL_00166     FALSE 0.315 46.000 0.000 NA   NA
 6377152 6377153 BACCELL_00166 BACCELL_00167     FALSE 0.361 -3.000 0.000 NA   NA
 6377153 6377154 BACCELL_00167 BACCELL_00168     FALSE 0.375 0.000 0.000 NA   NA
 6377154 6377155 BACCELL_00168 BACCELL_00169     FALSE 0.361 -3.000 0.000 NA   NA
 6377156 6377157 BACCELL_00170 BACCELL_00171     FALSE 0.361 -3.000 0.000 NA   NA
 6377157 6377158 BACCELL_00171 BACCELL_00172     FALSE 0.370 12.000 0.000 NA   NA
 6377158 6377159 BACCELL_00172 BACCELL_00173     FALSE 0.379 2.000 0.000 NA   NA
 6377159 6377160 BACCELL_00173 BACCELL_00174     TRUE 0.405 29.000 0.000 NA   NA
 6377162 6377163 BACCELL_00176 BACCELL_00177     FALSE 0.379 2.000 0.000 NA   NA
 6377163 6377164 BACCELL_00177 BACCELL_00178     FALSE 0.049 184.000 0.000 NA   NA
 6377164 6377165 BACCELL_00178 BACCELL_00179     FALSE 0.231 77.000 0.003 NA   NA
 6377166 6377167 BACCELL_00180 BACCELL_00181     FALSE 0.122 144.000 0.000 NA   NA
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