MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium botulinum A2 str. Kyoto

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7549854 7549855 CLM_0001 CLM_0002 dnaA dnaN TRUE 0.710 263.000 0.328 1.000 Y NA
 7549855 7549856 CLM_0002 CLM_0003 dnaN   TRUE 0.932 19.000 0.103 1.000   NA
 7549856 7549857 CLM_0003 CLM_0004   recF TRUE 0.792 79.000 0.209 1.000   NA
 7549857 7549858 CLM_0004 CLM_0005 recF   TRUE 0.876 21.000 0.024 NA   NA
 7549858 7549859 CLM_0005 CLM_0006   gyrB TRUE 0.863 18.000 0.017 NA   NA
 7549859 7549860 CLM_0006 CLM_0007 gyrB gyrA TRUE 0.989 26.000 0.306 0.003 Y NA
 7549860 7549861 CLM_0007 CLM_0008 gyrA rrs FALSE 0.007 415.000 0.000 NA   NA
 7549861 7549862 CLM_0008 CLM_0011 rrs rrl FALSE 0.089 227.000 0.000 NA   NA
 7549862 7549863 CLM_0011 CLM_0012 rrl rrf FALSE 0.256 94.000 0.000 NA   NA
 7549863 7549864 CLM_0012 CLM_0013 rrf   TRUE 0.722 10.000 0.000 NA   NA
 7549864 7549865 CLM_0013 CLM_0014     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7549865 7549866 CLM_0014 CLM_0015     FALSE 0.207 164.000 0.000 NA   NA
 7549866 7549867 CLM_0015 CLM_0016     TRUE 0.884 16.000 0.029 NA   NA
 7549867 7549868 CLM_0016 CLM_0017     TRUE 0.936 2.000 0.014 NA   NA
 7549868 7549869 CLM_0017 CLM_0018     TRUE 0.908 5.000 0.011 NA   NA
 7549869 7549870 CLM_0018 CLM_0019     TRUE 0.560 137.000 0.016 NA   NA
 7549870 7549871 CLM_0019 CLM_0020     TRUE 0.947 25.000 0.214 NA   NA
 7549871 7549872 CLM_0020 CLM_0021     TRUE 0.964 17.000 0.370 NA   NA
 7549872 7549873 CLM_0021 CLM_0022   serS FALSE 0.013 370.000 0.000 NA   NA
 7549873 7549874 CLM_0022 CLM_0023 serS   FALSE 0.043 276.000 0.000 NA   NA
 7549874 7549875 CLM_0023 CLM_0024     TRUE 0.646 19.000 0.000 NA   NA
 7549875 7549876 CLM_0024 CLM_0025     FALSE 0.028 304.000 0.000 NA   NA
 7549876 7549877 CLM_0025 CLM_0026     TRUE 0.646 19.000 0.000 NA   NA
 7549877 7549878 CLM_0026 CLM_0027     FALSE 0.249 83.000 0.000 NA   NA
 7549879 7549880 CLM_0028 CLM_0029 psd   TRUE 0.594 103.000 0.026 NA   NA
 7549880 7549881 CLM_0029 CLM_0030     FALSE 0.267 76.000 0.000 NA   NA
 7549882 7549883 CLM_0031 CLM_0032     FALSE 0.274 133.000 0.000 NA   NA
 7549883 7549884 CLM_0032 CLM_0033   megL TRUE 0.637 160.000 0.034 1.000 N NA
 7549884 7549885 CLM_0033 CLM_0034 megL   FALSE 0.442 124.000 0.000 1.000 N NA
 7549885 7549886 CLM_0034 CLM_0035     FALSE 0.205 165.000 0.000 NA   NA
 7549886 7549887 CLM_0035 CLM_0036   srpB FALSE 0.273 123.000 0.000 NA   NA
 7549887 7549888 CLM_0036 CLM_0037 srpB dnaX FALSE 0.207 164.000 0.000 NA   NA
 7549888 7549889 CLM_0037 CLM_0038 dnaX   TRUE 0.744 65.000 0.100 NA   NA
 7549889 7549890 CLM_0038 CLM_0039   recR TRUE 0.964 33.000 0.604 NA   NA
 7549890 7549891 CLM_0039 CLM_0040 recR   TRUE 0.739 57.000 0.071 NA   NA
 7549891 7549892 CLM_0040 CLM_0041   bofA TRUE 0.845 150.000 0.417 NA   NA
 7549892 7549893 CLM_0041 CLM_0042 bofA sfsA FALSE 0.466 151.000 0.005 NA   NA
 7549893 7549894 CLM_0042 CLM_0043 sfsA   TRUE 0.631 56.000 0.015 NA   NA
 7549894 7549895 CLM_0043 CLM_0044     FALSE 0.314 118.000 0.000 1.000   NA
 7549895 7549896 CLM_0044 CLM_0045     FALSE 0.316 134.000 0.000 1.000   NA
 7549896 7549897 CLM_0045 CLM_0046     TRUE 0.951 19.000 0.222 NA   NA
 7549897 7549898 CLM_0046 CLM_0047     FALSE 0.012 383.000 0.000 NA   NA
 7549898 7549899 CLM_0047 CLM_0048     TRUE 0.581 83.000 0.007 NA N NA
 7549899 7549900 CLM_0048 CLM_0049     TRUE 0.892 29.000 0.035 NA N NA
 7549900 7549901 CLM_0049 CLM_0050   rrs FALSE 0.011 387.000 0.000 NA   NA
 7549902 7549903 CLM_0051 CLM_0052     TRUE 0.643 74.000 0.044 NA   NA
 7549904 7549905 CLM_0054 CLM_0055 rrf   TRUE 0.749 6.000 0.000 NA   NA
 7549908 7549909 CLM_0058 CLM_0059     TRUE 0.643 74.000 0.044 NA   NA
 7549910 7549911 CLM_0061 CLM_0062 rrf   TRUE 0.749 6.000 0.000 NA   NA
 7549911 7549912 CLM_0062 CLM_0063     FALSE 0.018 342.000 0.000 NA   NA
 7549912 7549913 CLM_0063 CLM_0064     TRUE 0.996 -3.000 0.800 NA   NA
 7549913 7549914 CLM_0064 CLM_0065   rrs FALSE 0.002 645.000 0.000 NA   NA
 7549915 7549916 CLM_0066 CLM_0067     TRUE 0.643 74.000 0.044 NA   NA
 7549917 7549918 CLM_0069 CLM_0071 rrf   TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 7549918 7549919 CLM_0071 CLM_0072     FALSE 0.056 259.000 0.000 NA   NA
 7549919 7549920 CLM_0072 CLM_0073     FALSE 0.248 147.000 0.000 NA   NA
 7549920 7549921 CLM_0073 CLM_0074     FALSE 0.075 235.000 0.000 NA   NA
 7549921 7549922 CLM_0074 CLM_0076     FALSE 0.263 77.000 0.000 NA   NA
 7549922 7549923 CLM_0076 CLM_0077   rrs FALSE 0.002 719.000 0.000 NA   NA
 7549924 7549925 CLM_0078 CLM_0079     TRUE 0.643 74.000 0.044 NA   NA
 7549926 7549927 CLM_0081 CLM_0082 rrf   TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 7549927 7549928 CLM_0082 CLM_0083     FALSE 0.263 140.000 0.000 NA   NA
 7549928 7549929 CLM_0083 CLM_0084   rrs FALSE 0.003 522.000 0.000 NA   NA
 7549929 7549930 CLM_0084 CLM_0087 rrs rrl FALSE 0.221 158.000 0.000 NA   NA
 7549930 7549931 CLM_0087 CLM_0088 rrl rrf FALSE 0.387 50.000 0.000 NA   NA
 7549931 7549932 CLM_0088 CLM_0089 rrf   FALSE 0.015 358.000 0.000 NA   NA
 7549932 7549933 CLM_0089 CLM_0090     FALSE 0.251 82.000 0.000 NA   NA
 7549934 7549935 CLM_0091 CLM_0092     TRUE 0.865 36.000 0.039 NA N NA
 7549938 7549939 CLM_0095 CLM_0096     TRUE 0.993 -21.000 0.120 NA   NA
 7549939 7549940 CLM_0096 CLM_0097     TRUE 0.919 24.000 0.034 1.000 N NA
 7549940 7549941 CLM_0097 CLM_0098     TRUE 0.597 81.000 0.034 NA   NA
 7549941 7549942 CLM_0098 CLM_0099     TRUE 0.865 18.000 0.018 NA   NA
 7549942 7549943 CLM_0099 CLM_0100     TRUE 0.985 2.000 0.372 NA   NA
 7549943 7549944 CLM_0100 CLM_0101     TRUE 0.881 12.000 0.011 NA   NA
 7549944 7549945 CLM_0101 CLM_0102     TRUE 0.835 82.000 0.333 1.000   NA
 7549945 7549946 CLM_0102 CLM_0103     FALSE 0.549 121.000 0.006 1.000   NA
 7549946 7549947 CLM_0103 CLM_0104     TRUE 0.940 20.000 0.078 0.006   NA
 7549947 7549948 CLM_0104 CLM_0105     FALSE 0.488 121.000 0.002 NA   NA
 7549950 7549951 CLM_0108 CLM_0109   arcA FALSE 0.008 423.000 0.000 1.000   NA
 7549952 7549953 CLM_0110 CLM_0111 ispF   FALSE 0.492 76.000 0.003 NA   NA
 7549956 7549957 CLM_0114 CLM_0115 spmA spmB TRUE 0.986 13.000 0.655 0.003   NA
 7549959 7549960 CLM_0117 CLM_0118 udgA   TRUE 0.879 29.000 0.016 1.000 N NA
 7549960 7549961 CLM_0118 CLM_0119   metG FALSE 0.024 382.000 0.000 1.000 N NA
 7549961 7549962 CLM_0119 CLM_0120 metG   FALSE 0.407 165.000 0.003 NA   NA
 7549962 7549963 CLM_0120 CLM_0121     FALSE 0.460 151.000 0.004 NA   NA
 7549963 7549964 CLM_0121 CLM_0122     FALSE 0.088 228.000 0.000 NA   NA
 7549964 7549965 CLM_0122 CLM_0123     TRUE 0.609 73.000 0.020 1.000   NA
 7549965 7549966 CLM_0123 CLM_0124   ksgA TRUE 0.976 2.000 0.093 1.000 N NA
 7549966 7549967 CLM_0124 CLM_0125 ksgA   FALSE 0.519 79.000 0.010 NA   NA
 7549967 7549968 CLM_0125 CLM_0126     TRUE 0.778 159.000 0.278 NA   NA
 7549968 7549969 CLM_0126 CLM_0127     TRUE 0.704 168.000 0.188 NA   NA
 7549969 7549970 CLM_0127 CLM_0128     TRUE 0.690 168.000 0.167 NA   NA
 7549970 7549971 CLM_0128 CLM_0129     TRUE 0.980 11.000 0.350 1.000 N NA
 7549971 7549972 CLM_0129 CLM_0130     TRUE 0.997 -3.000 0.349 NA Y NA
 7549972 7549973 CLM_0130 CLM_0131     TRUE 0.626 82.000 0.019 NA N NA
 7549973 7549974 CLM_0131 CLM_0132     FALSE 0.305 140.000 0.000 1.000   NA
 7549974 7549975 CLM_0132 CLM_0133     TRUE 0.663 15.000 0.000 NA   NA
 7549977 7549978 CLM_0135 CLM_0136     TRUE 0.687 57.000 0.037 NA   NA
 7549978 7549979 CLM_0136 CLM_0137   nrdD FALSE 0.037 290.000 0.000 NA   NA
 7549979 7549980 CLM_0137 CLM_0138 nrdD nrdG TRUE 0.977 17.000 0.315 0.001 N NA
 7549981 7549982 CLM_0139 CLM_0140     TRUE 0.970 2.000 0.111 NA   NA
 7549982 7549983 CLM_0140 CLM_0141     FALSE 0.271 120.000 0.000 NA   NA
 7549984 7549985 CLM_0142 CLM_0143 ileS   TRUE 0.595 151.000 0.009 1.000 N NA
 7549985 7549986 CLM_0143 CLM_0144     FALSE 0.374 216.000 0.017 1.000 N NA
 7549986 7549987 CLM_0144 CLM_0145     TRUE 0.818 75.000 0.160 1.000 N NA
 7549987 7549988 CLM_0145 CLM_0146     FALSE 0.019 336.000 0.000 NA   NA
 7549988 7549989 CLM_0146 CLM_0147     TRUE 0.946 5.000 0.066 NA   NA
 7549989 7549990 CLM_0147 CLM_0148     TRUE 0.953 20.000 0.210 1.000   NA
 7549990 7549991 CLM_0148 CLM_0149     FALSE 0.109 225.000 0.000 1.000   NA
 7549991 7549992 CLM_0149 CLM_0150     TRUE 0.733 187.000 0.333 1.000   NA
 7549994 7549995 CLM_0152 CLM_0153     TRUE 0.943 15.000 0.143 NA   NA
 7549995 7549996 CLM_0153 CLM_0154     TRUE 0.948 27.000 0.250 NA   NA
 7549996 7549997 CLM_0154 CLM_0155     TRUE 0.985 13.000 0.800 NA   NA
 7549999 7550000 CLM_0157 CLM_0158 cotS   TRUE 0.742 124.000 0.119 NA   NA
 7550000 7550001 CLM_0158 CLM_0159     FALSE 0.545 196.000 0.116 NA   NA
 7550001 7550002 CLM_0159 CLM_0160     TRUE 0.698 104.000 0.082 NA   NA
 7550002 7550003 CLM_0160 CLM_0161     FALSE 0.065 246.000 0.000 NA   NA
 7550003 7550004 CLM_0161 CLM_0162   cphB TRUE 0.952 -30.000 0.000 NA   NA
 7550004 7550005 CLM_0162 CLM_0163 cphB cphA TRUE 0.959 44.000 0.605 1.000 N NA
 7550005 7550006 CLM_0163 CLM_0164 cphA ispE TRUE 0.643 93.000 0.016 1.000 N NA
 7550006 7550007 CLM_0164 CLM_0165 ispE   FALSE 0.413 168.000 0.005 NA   NA
 7550007 7550008 CLM_0165 CLM_0166     TRUE 0.785 61.000 0.133 NA   NA
 7550008 7550009 CLM_0166 CLM_0167     TRUE 0.972 20.000 0.333 0.007   NA
 7550009 7550010 CLM_0167 CLM_0168     TRUE 0.942 50.000 0.500 0.007   NA
 7550010 7550011 CLM_0168 CLM_0169   spoIIR TRUE 0.730 74.000 0.109 NA   NA
 7550013 7550014 CLM_0171 CLM_0172 ypeB   FALSE 0.525 103.000 0.003 1.000   NA
 7550014 7550015 CLM_0172 CLM_0173     TRUE 0.843 25.000 0.011 NA   NA
 7550015 7550016 CLM_0173 CLM_0174     TRUE 0.630 132.000 0.039 NA   NA
 7550016 7550017 CLM_0174 CLM_0175   pyrG FALSE 0.189 234.000 0.004 NA   NA
 7550017 7550018 CLM_0175 CLM_0176 pyrG   FALSE 0.005 448.000 0.000 NA   NA
 7550018 7550019 CLM_0176 CLM_0177   rho FALSE 0.403 172.000 0.006 NA   NA
 7550021 7550022 CLM_0179 CLM_0180 tdk   TRUE 0.849 17.000 0.010 NA   NA
 7550022 7550023 CLM_0180 CLM_0181   prmC TRUE 0.950 8.000 0.098 NA   NA
 7550023 7550024 CLM_0181 CLM_0182 prmC prfA TRUE 0.883 82.000 0.081 1.000 Y NA
 7550024 7550025 CLM_0182 CLM_0183 prfA   TRUE 0.819 28.000 0.009 NA   NA
 7550025 7550026 CLM_0183 CLM_0184     TRUE 0.779 59.000 0.116 NA   NA
 7550026 7550027 CLM_0184 CLM_0185     TRUE 0.926 21.000 0.052 NA N NA
 7550027 7550028 CLM_0185 CLM_0186     TRUE 0.948 10.000 0.056 NA N NA
 7550028 7550029 CLM_0186 CLM_0187   rpiB TRUE 0.788 60.000 0.065 1.000 N NA
 7550029 7550030 CLM_0187 CLM_0188 rpiB upp TRUE 0.879 30.000 0.019 1.000 N NA
 7550032 7550033 CLM_0190 CLM_0191   tagO TRUE 0.697 108.000 0.029 1.000 N NA
 7550033 7550034 CLM_0191 CLM_0192 tagO mnaA TRUE 0.990 14.000 0.346 1.000 Y NA
 7550034 7550035 CLM_0192 CLM_0193 mnaA atpI FALSE 0.005 492.000 0.000 1.000   NA
 7550035 7550036 CLM_0193 CLM_0194 atpI atpB TRUE 0.967 15.000 0.330 1.000   NA
 7550036 7550037 CLM_0194 CLM_0195 atpB atpE TRUE 0.801 41.000 0.009 0.007   NA
 7550037 7550038 CLM_0195 CLM_0196 atpE atpF TRUE 0.773 76.000 0.095 0.007   NA
 7550038 7550039 CLM_0196 CLM_0197 atpF atpH TRUE 0.988 3.000 0.040 0.007 Y NA
 7550039 7550040 CLM_0197 CLM_0198 atpH atpA TRUE 0.997 11.000 0.864 0.007 Y NA
 7550040 7550041 CLM_0198 CLM_0199 atpA atpG TRUE 0.995 22.000 0.846 0.007 Y NA
 7550041 7550042 CLM_0199 CLM_0200 atpG atpD TRUE 0.995 14.000 0.724 0.007 Y NA
 7550042 7550043 CLM_0200 CLM_0201 atpD atpC TRUE 0.995 25.000 0.837 0.007 Y NA
 7550043 7550044 CLM_0201 CLM_0202 atpC   FALSE 0.333 193.000 0.007 NA   NA
 7550044 7550045 CLM_0202 CLM_0203   murA TRUE 0.962 24.000 0.346 NA   NA
 7550045 7550046 CLM_0203 CLM_0204 murA spoIID FALSE 0.443 268.000 0.243 1.000 N NA
 7550046 7550047 CLM_0204 CLM_0205 spoIID   FALSE 0.039 474.000 0.090 1.000 N NA
 7550047 7550048 CLM_0205 CLM_0206   spoIIID TRUE 0.730 108.000 0.093 1.000   NA
 7550048 7550049 CLM_0206 CLM_0207 spoIIID mbl TRUE 0.832 100.000 0.284 1.000   NA
 7550050 7550051 CLM_0208 CLM_0209     TRUE 0.670 49.000 0.010 NA   NA
 7550052 7550053 CLM_0210 CLM_0211     TRUE 0.759 5.000 0.000 NA   NA
 7550053 7550054 CLM_0211 CLM_0212     TRUE 0.700 12.000 0.000 NA   NA
 7550054 7550055 CLM_0212 CLM_0213     TRUE 0.644 17.000 0.000 NA   NA
 7550055 7550056 CLM_0213 CLM_0214     TRUE 0.759 5.000 0.000 NA   NA
 7550056 7550057 CLM_0214 CLM_0216   metK FALSE 0.026 310.000 0.000 NA   NA
 7550057 7550058 CLM_0216 CLM_0217 metK   FALSE 0.558 191.000 0.052 1.000 N NA
 7550058 7550059 CLM_0217 CLM_0218     TRUE 0.891 26.000 0.051 NA   NA
 7550059 7550060 CLM_0218 CLM_0219     TRUE 0.993 -27.000 0.130 NA   NA
 7550060 7550061 CLM_0219 CLM_0220   yfiA FALSE 0.039 425.000 0.080 NA   NA
 7550061 7550062 CLM_0220 CLM_0221 yfiA secA FALSE 0.390 228.000 0.050 NA N NA
 7550062 7550063 CLM_0221 CLM_0222 secA prfB FALSE 0.090 364.000 0.048 1.000 N NA
 7550065 7550066 CLM_0224 CLM_0226     FALSE 0.039 284.000 0.000 NA   NA
 7550066 7550067 CLM_0226 CLM_0227     FALSE 0.026 411.000 0.016 NA   NA
 7550067 7550068 CLM_0227 CLM_0228     TRUE 0.973 21.000 0.500 NA   NA
 7550068 7550069 CLM_0228 CLM_0229     TRUE 0.931 14.000 0.077 1.000   NA
 7550069 7550070 CLM_0229 CLM_0230     TRUE 0.575 84.000 0.022 1.000   NA
 7550070 7550071 CLM_0230 CLM_0231     TRUE 0.875 40.000 0.109 1.000   NA
 7550074 7550075 CLM_0234 CLM_0235 leuS   FALSE 0.023 377.000 0.000 NA N NA
 7550075 7550076 CLM_0235 CLM_0236     FALSE 0.070 239.000 0.000 NA   NA
 7550076 7550077 CLM_0236 CLM_0237     FALSE 0.362 53.000 0.000 NA   NA
 7550077 7550078 CLM_0237 CLM_0238     TRUE 0.631 25.000 0.000 NA   NA
 7550078 7550079 CLM_0238 CLM_0239     TRUE 0.936 -13.000 0.000 NA   NA
 7550079 7550080 CLM_0239 CLM_0240     TRUE 0.958 4.000 0.098 NA   NA
 7550082 7550083 CLM_0242 CLM_0243 fba   FALSE 0.105 214.000 0.000 NA   NA
 7550083 7550084 CLM_0243 CLM_0244     TRUE 0.698 117.000 0.082 NA   NA
 7550085 7550086 CLM_0245 CLM_0246     FALSE 0.543 138.000 0.013 NA   NA
 7550088 7550089 CLM_0248 CLM_0249     TRUE 0.730 106.000 0.094 1.000   NA
 7550089 7550090 CLM_0249 CLM_0250     TRUE 0.827 74.000 0.281 NA   NA
 7550092 7550093 CLM_0253 CLM_0254   sleB FALSE 0.370 229.000 0.041 0.064   NA
 7550093 7550094 CLM_0254 CLM_0255 sleB cysK FALSE 0.017 364.000 0.000 1.000   NA
 7550094 7550095 CLM_0255 CLM_0256 cysK cysE TRUE 0.984 15.000 0.101 0.002 Y NA
 7550095 7550096 CLM_0256 CLM_0257 cysE   TRUE 0.936 22.000 0.064 1.000 N NA
 7550096 7550097 CLM_0257 CLM_0258   plsD TRUE 0.720 148.000 0.064 1.000 N NA
 7550097 7550098 CLM_0258 CLM_0259 plsD nth TRUE 0.624 93.000 0.011 1.000 N NA
 7550098 7550099 CLM_0259 CLM_0260 nth   FALSE 0.089 275.000 0.000 1.000 N NA
 7550100 7550101 CLM_0261 CLM_0262     TRUE 0.831 26.000 0.004 1.000   NA
 7550101 7550102 CLM_0262 CLM_0263     TRUE 0.572 110.000 0.018 NA   NA
 7550103 7550104 CLM_0264 CLM_0265     FALSE 0.503 205.000 0.000 NA Y NA
 7550104 7550105 CLM_0265 CLM_0266   splB TRUE 0.663 147.000 0.027 1.000 N NA
 7550105 7550106 CLM_0266 CLM_0267 splB   TRUE 0.640 128.000 0.008 1.000 N NA
 7550106 7550107 CLM_0267 CLM_0268     TRUE 0.883 13.000 0.016 NA   NA
 7550107 7550108 CLM_0268 CLM_0269     FALSE 0.036 294.000 0.000 NA   NA
 7550108 7550109 CLM_0269 CLM_0270     TRUE 0.651 166.000 0.097 1.000   NA
 7550109 7550110 CLM_0270 CLM_0271     TRUE 0.988 2.000 0.438 1.000   NA
 7550110 7550111 CLM_0271 CLM_0272     TRUE 0.997 -7.000 0.720 0.034   NA
 7550111 7550112 CLM_0272 CLM_0273     FALSE 0.553 112.000 0.007 1.000   NA
 7550112 7550113 CLM_0273 CLM_0274   rpoN FALSE 0.184 329.000 0.125 1.000 N NA
 7550113 7550114 CLM_0274 CLM_0275 rpoN cggR FALSE 0.407 288.000 0.034 1.000 Y NA
 7550114 7550115 CLM_0275 CLM_0276 cggR gap TRUE 0.872 78.000 0.348 1.000 N NA
 7550115 7550116 CLM_0276 CLM_0277 gap pgk FALSE 0.471 297.000 0.063 0.004 Y NA
 7550116 7550117 CLM_0277 CLM_0278 pgk tpiA TRUE 0.927 62.000 0.141 1.000 Y NA
 7550117 7550118 CLM_0278 CLM_0279 tpiA gpmI TRUE 0.906 92.000 0.138 1.000 Y NA
 7550118 7550119 CLM_0279 CLM_0280 gpmI eno TRUE 0.884 56.000 0.016 1.000 Y NA
 7550119 7550120 CLM_0280 CLM_0281 eno secG FALSE 0.317 223.000 0.006 1.000 N NA
 7550120 7550121 CLM_0281 CLM_0282 secG rnr FALSE 0.499 209.000 0.064 1.000 N NA
 7550121 7550122 CLM_0282 CLM_0283 rnr surE FALSE 0.010 409.000 0.000 1.000   NA
 7550122 7550123 CLM_0283 CLM_0284 surE smpB FALSE 0.069 257.000 0.000 1.000   NA
 7550124 7550125 CLM_0285 CLM_0286     FALSE 0.002 1443.000 0.000 1.000   NA
 7550126 7550127 CLM_0287 CLM_0288     FALSE 0.005 497.000 0.000 1.000   NA
 7550127 7550128 CLM_0288 CLM_0289     FALSE 0.371 52.000 0.000 NA   NA
 7550128 7550129 CLM_0289 CLM_0290     FALSE 0.233 152.000 0.000 NA   NA
 7550129 7550130 CLM_0290 CLM_0291     FALSE 0.189 185.000 0.000 1.000   NA
 7550130 7550131 CLM_0291 CLM_0292     FALSE 0.152 188.000 0.000 NA   NA
 7550131 7550132 CLM_0292 CLM_0294     FALSE 0.015 359.000 0.000 NA   NA
 7550132 7550133 CLM_0294 CLM_0295     FALSE 0.114 221.000 0.000 1.000   NA
 7550133 7550134 CLM_0295 CLM_0296     TRUE 0.946 128.000 1.000 1.000 N NA
 7550134 7550135 CLM_0296 CLM_0297     TRUE 0.996 -7.000 0.667 NA   NA
 7550135 7550136 CLM_0297 CLM_0298     TRUE 0.891 88.000 0.667 NA   NA
 7550136 7550137 CLM_0298 CLM_0299     FALSE 0.280 178.000 0.000 NA N NA
 7550137 7550138 CLM_0299 CLM_0300     FALSE 0.018 343.000 0.000 NA   NA
 7550138 7550139 CLM_0300 CLM_0302     FALSE 0.003 545.000 0.000 NA   NA
 7550139 7550140 CLM_0302 CLM_0303     FALSE 0.004 544.000 0.000 1.000   NA
 7550140 7550141 CLM_0303 CLM_0304     FALSE 0.314 114.000 0.000 1.000   NA
 7550141 7550142 CLM_0304 CLM_0305     TRUE 0.666 26.000 0.000 1.000   NA
 7550142 7550143 CLM_0305 CLM_0306     FALSE 0.064 263.000 0.000 1.000   NA
 7550143 7550144 CLM_0306 CLM_0307     TRUE 0.899 26.000 0.050 1.000   NA
 7550144 7550145 CLM_0307 CLM_0308     TRUE 0.805 63.000 0.095 1.000 N NA
 7550145 7550146 CLM_0308 CLM_0309     FALSE 0.273 124.000 0.000 NA   NA
 7550148 7550149 CLM_0311 CLM_0313     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7550150 7550151 CLM_0314 CLM_0315 spoVAE spoVAD TRUE 0.976 23.000 0.600 NA   NA
 7550151 7550152 CLM_0315 CLM_0316 spoVAD spoVAC TRUE 0.993 1.000 0.750 NA   NA
 7550152 7550153 CLM_0316 CLM_0317 spoVAC   TRUE 0.984 13.000 0.750 NA   NA
 7550153 7550154 CLM_0317 CLM_0318     TRUE 0.986 13.000 0.857 NA   NA
 7550155 7550156 CLM_0319 CLM_0320     FALSE 0.004 501.000 0.000 NA   NA
 7550156 7550157 CLM_0320 CLM_0321     TRUE 0.957 11.000 0.167 NA   NA
 7550157 7550158 CLM_0321 CLM_0322     TRUE 0.988 22.000 0.318 1.000 Y NA
 7550158 7550159 CLM_0322 CLM_0323     TRUE 0.940 25.000 0.091 1.000 N NA
 7550159 7550160 CLM_0323 CLM_0324     TRUE 0.938 137.000 0.278 1.000 Y NA
 7550162 7550163 CLM_0326 CLM_0327     TRUE 0.919 162.000 0.294 1.000 Y NA
 7550164 7550165 CLM_0328 CLM_0329     TRUE 0.993 16.000 0.500 0.004 Y NA
 7550166 7550167 CLM_0330 CLM_0331     FALSE 0.429 98.000 0.000 1.000 N NA
 7550167 7550168 CLM_0331 CLM_0332     TRUE 0.990 10.000 0.235 1.000 Y NA
 7550168 7550169 CLM_0332 CLM_0333     TRUE 0.880 120.000 0.353 1.000 N NA
 7550169 7550170 CLM_0333 CLM_0334     TRUE 0.964 14.000 0.286 NA   NA
 7550170 7550171 CLM_0334 CLM_0335     FALSE 0.006 428.000 0.000 NA   NA
 7550171 7550172 CLM_0335 CLM_0336   glvA FALSE 0.127 343.000 0.000 1.000 Y NA
 7550172 7550173 CLM_0336 CLM_0337 glvA   TRUE 0.640 175.000 0.000 1.000 Y NA
 7550173 7550174 CLM_0337 CLM_0338     FALSE 0.056 305.000 0.000 1.000 N NA
 7550176 7550177 CLM_0340 CLM_0341     FALSE 0.018 342.000 0.000 NA   NA
 7550177 7550178 CLM_0341 CLM_0342     FALSE 0.006 435.000 0.000 NA   NA
 7550178 7550179 CLM_0342 CLM_0343     TRUE 0.773 152.000 0.158 NA N NA
 7550179 7550180 CLM_0343 CLM_0344     TRUE 0.881 27.000 0.035 1.000   NA
 7550180 7550181 CLM_0344 CLM_0345     FALSE 0.007 438.000 0.000 1.000   NA
 7550181 7550182 CLM_0345 CLM_0346     TRUE 0.884 119.000 0.385 1.000 N NA
 7550182 7550183 CLM_0346 CLM_0347   glvA FALSE 0.319 396.000 0.385 1.000 Y NA
 7550183 7550184 CLM_0347 CLM_0348 glvA   TRUE 0.990 13.000 0.375 1.000 Y NA
 7550184 7550185 CLM_0348 CLM_0349   ilvD TRUE 0.938 138.000 0.286 1.000 Y NA
 7550185 7550186 CLM_0349 CLM_0350 ilvD eda TRUE 0.942 52.000 0.091 0.063 Y NA
 7550186 7550187 CLM_0350 CLM_0351 eda   TRUE 0.990 2.000 0.091 1.000 Y NA
 7550187 7550188 CLM_0351 CLM_0352   ade FALSE 0.235 201.000 0.000 1.000 N NA
 7550188 7550189 CLM_0352 CLM_0353 ade   FALSE 0.018 402.000 0.000 1.000 N NA
 7550189 7550190 CLM_0353 CLM_0354     TRUE 0.999 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 7550190 7550191 CLM_0354 CLM_0355     FALSE 0.060 396.000 0.049 NA N NA
 7550191 7550192 CLM_0355 CLM_0356     TRUE 0.996 -16.000 0.400 NA   NA
 7550192 7550193 CLM_0356 CLM_0357     TRUE 0.911 119.000 0.750 NA   NA
 7550193 7550194 CLM_0357 CLM_0358     FALSE 0.015 356.000 0.000 NA   NA
 7550194 7550195 CLM_0358 CLM_0359     FALSE 0.101 265.000 0.000 1.000 N NA
 7550195 7550196 CLM_0359 CLM_0361     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7550196 7550197 CLM_0361 CLM_0362     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7550197 7550198 CLM_0362 CLM_0363     TRUE 0.938 34.000 0.200 1.000 N NA
 7550198 7550199 CLM_0363 CLM_0364     FALSE 0.004 491.000 0.000 NA   NA
 7550199 7550200 CLM_0364 CLM_0365     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7550200 7550201 CLM_0365 CLM_0366     TRUE 0.789 24.000 0.000 1.000 N NA
 7550201 7550202 CLM_0366 CLM_0367     FALSE 0.113 257.000 0.000 1.000 N NA
 7550202 7550203 CLM_0367 CLM_0368     TRUE 0.700 12.000 0.000 NA   NA
 7550203 7550204 CLM_0368 CLM_0369     FALSE 0.002 748.000 0.000 NA   NA
 7550204 7550205 CLM_0369 CLM_0370   panD FALSE 0.318 175.000 0.000 1.000 N NA
 7550205 7550206 CLM_0370 CLM_0371 panD   FALSE 0.377 157.000 0.000 1.000 N NA
 7550206 7550207 CLM_0371 CLM_0372     FALSE 0.255 93.000 0.000 NA   NA
 7550207 7550208 CLM_0372 CLM_0373     TRUE 0.650 21.000 0.000 NA   NA
 7550208 7550209 CLM_0373 CLM_0374     TRUE 0.801 110.000 0.000 0.002 Y NA
 7550209 7550210 CLM_0374 CLM_0375     TRUE 0.790 141.000 0.000 0.002 Y NA
 7550210 7550211 CLM_0375 CLM_0376     FALSE 0.276 151.000 0.000 1.000   NA
 7550213 7550214 CLM_0378 CLM_0379     FALSE 0.528 203.000 0.000 1.000 Y NA
 7550214 7550215 CLM_0379 CLM_0380     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.033 Y NA
 7550215 7550216 CLM_0380 CLM_0381     TRUE 0.900 34.000 0.000 1.000 Y NA
 7550216 7550217 CLM_0381 CLM_0382     TRUE 0.990 -3.000 0.150 1.000 N NA
 7550217 7550218 CLM_0382 CLM_0384     FALSE 0.010 502.000 0.000 0.047 N NA
 7550218 7550219 CLM_0384 CLM_0385   xpt TRUE 0.969 23.000 0.032 1.000 Y NA
 7550219 7550220 CLM_0385 CLM_0386 xpt   FALSE 0.011 448.000 0.000 1.000 N NA
 7550220 7550221 CLM_0386 CLM_0387     TRUE 0.996 13.000 1.000 1.000 Y NA
 7550221 7550222 CLM_0387 CLM_0388   uppP TRUE 0.762 176.000 0.222 1.000 N NA
 7550222 7550223 CLM_0388 CLM_0389 uppP   TRUE 0.989 15.000 0.333 1.000 Y NA
 7550223 7550224 CLM_0389 CLM_0390     TRUE 0.994 0.000 0.750 NA   NA
 7550224 7550225 CLM_0390 CLM_0391     FALSE 0.274 125.000 0.000 NA   NA
 7550225 7550226 CLM_0391 CLM_0392     FALSE 0.026 327.000 0.000 1.000   NA
 7550226 7550227 CLM_0392 CLM_0393     TRUE 0.992 3.000 0.869 NA   NA
 7550227 7550228 CLM_0393 CLM_0394     FALSE 0.034 296.000 0.000 NA   NA
 7550228 7550229 CLM_0394 CLM_0395     FALSE 0.013 369.000 0.000 NA   NA
 7550229 7550230 CLM_0395 CLM_0396     FALSE 0.521 135.000 0.006 NA   NA
 7550230 7550231 CLM_0396 CLM_0397     FALSE 0.022 324.000 0.000 NA   NA
 7550231 7550232 CLM_0397 CLM_0398     TRUE 0.881 179.000 1.000 NA   NA
 7550232 7550233 CLM_0398 CLM_0399     TRUE 0.995 -7.000 0.556 NA   NA
 7550233 7550234 CLM_0399 CLM_0400     TRUE 0.997 -16.000 0.556 NA   NA
 7550234 7550235 CLM_0400 CLM_0401     TRUE 0.784 72.000 0.179 NA   NA
 7550235 7550236 CLM_0401 CLM_0402     FALSE 0.159 231.000 0.000 1.000 N NA
 7550236 7550237 CLM_0402 CLM_0403     FALSE 0.009 398.000 0.000 NA   NA
 7550237 7550238 CLM_0403 CLM_0404     TRUE 0.974 27.000 0.667 NA   NA
 7550238 7550239 CLM_0404 CLM_0405     FALSE 0.055 260.000 0.000 NA   NA
 7550239 7550240 CLM_0405 CLM_0406     TRUE 0.998 -13.000 1.000 NA   NA
 7550240 7550241 CLM_0406 CLM_0407     TRUE 0.924 95.000 1.000 NA   NA
 7550241 7550242 CLM_0407 CLM_0408     TRUE 0.921 83.000 1.000 NA   NA
 7550242 7550243 CLM_0408 CLM_0409     FALSE 0.139 232.000 0.000 NA N NA
 7550245 7550246 CLM_0411 CLM_0412     TRUE 0.965 119.000 0.667 1.000 Y NA
 7550246 7550247 CLM_0412 CLM_0413   adhE FALSE 0.017 407.000 0.000 1.000 N NA
 7550247 7550248 CLM_0413 CLM_0414 adhE   FALSE 0.024 319.000 0.000 NA   NA
 7550248 7550249 CLM_0414 CLM_0415     TRUE 0.613 63.000 0.019 NA   NA
 7550250 7550251 CLM_0416 CLM_0417     FALSE 0.063 248.000 0.000 NA   NA
 7550252 7550253 CLM_0418 CLM_0419     FALSE 0.004 554.000 0.000 1.000   NA
 7550253 7550254 CLM_0419 CLM_0420     TRUE 0.713 108.000 0.038 1.000 N NA
 7550254 7550255 CLM_0420 CLM_0421     TRUE 0.979 10.000 0.038 1.000 Y NA
 7550255 7550256 CLM_0421 CLM_0422     TRUE 0.741 63.000 0.091 NA   NA
 7550256 7550257 CLM_0422 CLM_0423     TRUE 0.831 44.000 0.087 NA   NA
 7550257 7550258 CLM_0423 CLM_0424     TRUE 0.912 26.000 0.087 NA   NA
 7550259 7550260 CLM_0425 CLM_0426     FALSE 0.017 345.000 0.000 NA   NA
 7550261 7550262 CLM_0427 CLM_0428     FALSE 0.174 192.000 0.000 1.000   NA
 7550262 7550263 CLM_0428 CLM_0429     FALSE 0.031 312.000 0.000 1.000   NA
 7550265 7550266 CLM_0431 CLM_0432     FALSE 0.553 131.000 0.013 NA   NA
 7550266 7550267 CLM_0432 CLM_0433     TRUE 0.994 -54.000 0.105 1.000   NA
 7550267 7550268 CLM_0433 CLM_0434     TRUE 0.999 -10.000 0.429 1.000 Y NA
 7550268 7550269 CLM_0434 CLM_0435     FALSE 0.443 108.000 0.000 1.000 N NA
 7550269 7550270 CLM_0435 CLM_0436     FALSE 0.003 1230.000 0.000 1.000 N NA
 7550270 7550271 CLM_0436 CLM_0437     TRUE 0.991 23.000 0.431 0.048 Y NA
 7550271 7550272 CLM_0437 CLM_0438     TRUE 0.998 0.000 0.678 0.048 Y NA
 7550272 7550273 CLM_0438 CLM_0439     TRUE 0.986 11.000 0.091 0.048 Y NA
 7550273 7550274 CLM_0439 CLM_0440     TRUE 0.963 51.000 0.237 0.048 Y NA
 7550274 7550275 CLM_0440 CLM_0441     TRUE 0.988 14.000 0.221 0.048 Y NA
 7550275 7550276 CLM_0441 CLM_0442     FALSE 0.014 362.000 0.000 NA   NA
 7550277 7550278 CLM_0443 CLM_0444     TRUE 0.907 18.000 0.059 NA   NA
 7550278 7550279 CLM_0444 CLM_0445     TRUE 0.806 114.000 0.231 NA   NA
 7550280 7550281 CLM_0446 CLM_0447     FALSE 0.004 486.000 0.000 NA   NA
 7550281 7550282 CLM_0447 CLM_0448     TRUE 0.894 93.000 0.667 NA   NA
 7550282 7550283 CLM_0448 CLM_0449     FALSE 0.023 321.000 0.000 NA   NA
 7550287 7550288 CLM_0453 CLM_0454     FALSE 0.010 395.000 0.000 NA   NA
 7550288 7550289 CLM_0454 CLM_0455     TRUE 0.649 205.000 0.014 NA Y NA
 7550289 7550290 CLM_0455 CLM_0456     TRUE 0.960 36.000 0.040 0.003 Y NA
 7550290 7550291 CLM_0456 CLM_0457     TRUE 0.995 2.000 0.270 0.003 Y NA
 7550291 7550292 CLM_0457 CLM_0458     TRUE 0.840 121.000 0.294 1.000   NA
 7550292 7550293 CLM_0458 CLM_0459     FALSE 0.019 355.000 0.000 1.000   NA
 7550295 7550296 CLM_0461 CLM_0462     TRUE 0.818 78.000 0.286 NA   NA
 7550296 7550297 CLM_0462 CLM_0463     TRUE 0.796 87.000 0.250 NA   NA
 7550297 7550298 CLM_0463 CLM_0464     FALSE 0.058 254.000 0.000 NA   NA
 7550298 7550299 CLM_0464 CLM_0466     TRUE 0.651 64.000 0.034 NA   NA
 7550301 7550302 CLM_0467 CLM_0468     TRUE 0.710 137.000 0.079 1.000   NA
 7550303 7550304 CLM_0469 CLM_0470     FALSE 0.003 960.000 0.000 1.000 N NA
 7550305 7550306 CLM_0471 CLM_0472   rnhA TRUE 0.980 -25.000 0.003 NA   NA
 7550306 7550307 CLM_0472 CLM_0473 rnhA   FALSE 0.539 63.000 0.003 NA   NA
 7550307 7550308 CLM_0473 CLM_0474     TRUE 0.764 182.000 0.400 NA   NA
 7550308 7550309 CLM_0474 CLM_0475     TRUE 0.962 32.000 0.400 0.031   NA
 7550309 7550310 CLM_0475 CLM_0476     FALSE 0.006 445.000 0.000 NA   NA
 7550310 7550311 CLM_0476 CLM_0477     TRUE 0.882 31.000 0.074 NA   NA
 7550313 7550314 CLM_0479 CLM_0480   clpB FALSE 0.014 364.000 0.000 NA   NA
 7550315 7550316 CLM_0481 CLM_0482     TRUE 0.937 58.000 0.796 1.000   NA
 7550317 7550318 CLM_0483 CLM_0484 manA   FALSE 0.016 349.000 0.000 NA   NA
 7550318 7550319 CLM_0484 CLM_0485     TRUE 0.881 108.000 0.500 NA   NA
 7550319 7550320 CLM_0485 CLM_0486   rrs FALSE 0.008 410.000 0.000 NA   NA
 7550320 7550321 CLM_0486 CLM_0487 rrs   FALSE 0.256 143.000 0.000 NA   NA
 7550321 7550322 CLM_0487 CLM_0488     TRUE 0.759 5.000 0.000 NA   NA
 7550323 7550324 CLM_0489 CLM_0490     TRUE 0.643 74.000 0.044 NA   NA
 7550325 7550326 CLM_0492 CLM_0493 rrf   TRUE 0.736 8.000 0.000 NA   NA
 7550328 7550329 CLM_0495 CLM_0496     FALSE 0.004 746.000 0.000 1.000 N NA
 7550329 7550330 CLM_0496 CLM_0497     TRUE 0.711 144.000 0.027 0.062 N NA
 7550330 7550331 CLM_0497 CLM_0498     TRUE 0.764 203.000 0.054 0.062 Y NA
 7550331 7550332 CLM_0498 CLM_0499     FALSE 0.343 250.000 0.000 1.000 Y NA
 7550332 7550333 CLM_0499 CLM_0501     FALSE 0.006 523.000 0.000 NA N NA
 7550334 7550335 CLM_0502 CLM_0503   panD FALSE 0.472 88.000 0.004 NA   NA
 7550335 7550336 CLM_0503 CLM_0504 panD panC TRUE 0.945 126.000 0.342 1.000 Y NA
 7550336 7550337 CLM_0504 CLM_0505 panC panB TRUE 0.971 55.000 0.395 0.001 Y NA
 7550340 7550341 CLM_0508 CLM_0509     TRUE 0.989 3.000 0.667 NA   NA
 7550343 7550344 CLM_0511 CLM_0512 hypB   FALSE 0.450 236.000 0.115 1.000 N NA
 7550344 7550345 CLM_0512 CLM_0513   hypA TRUE 0.884 56.000 0.333 1.000   NA
 7550345 7550346 CLM_0513 CLM_0514 hypA   TRUE 0.910 38.000 0.214 NA   NA
 7550348 7550349 CLM_0516 CLM_0518   addA FALSE 0.221 158.000 0.000 NA   NA
 7550349 7550350 CLM_0518 CLM_0519 addA   TRUE 0.631 140.000 0.010 1.000 N NA
 7550350 7550351 CLM_0519 CLM_0520   pepT TRUE 0.731 77.000 0.056 1.000 N NA
 7550353 7550354 CLM_0522 CLM_0523     FALSE 0.118 206.000 0.000 NA   NA
 7550354 7550355 CLM_0523 CLM_0524     FALSE 0.387 50.000 0.000 NA   NA
 7550355 7550356 CLM_0524 CLM_0525     FALSE 0.273 105.000 0.000 NA   NA
 7550356 7550357 CLM_0525 CLM_0526     FALSE 0.107 213.000 0.000 NA   NA
 7550358 7550359 CLM_0527 CLM_0528     TRUE 0.993 13.000 0.461 0.046 Y NA
 7550361 7550362 CLM_0530 CLM_0531   thiE FALSE 0.089 265.000 0.000 NA N NA
 7550362 7550363 CLM_0531 CLM_0532 thiE thiM TRUE 0.998 -9.000 0.190 0.005 Y NA
 7550363 7550364 CLM_0532 CLM_0533 thiM thiD TRUE 0.669 231.000 0.039 0.005 Y NA
 7550365 7550366 CLM_0535 CLM_0536 ddlB   FALSE 0.555 156.000 0.004 1.000 N NA
 7550366 7550367 CLM_0536 CLM_0537     TRUE 0.991 4.000 0.182 1.000 Y NA
 7550367 7550368 CLM_0537 CLM_0538     TRUE 0.996 1.000 0.241 0.033 Y NA
 7550368 7550369 CLM_0538 CLM_0539     TRUE 0.986 12.000 0.167 1.000 Y NA
 7550369 7550370 CLM_0539 CLM_0540     TRUE 0.990 2.000 0.048 0.035 Y NA
 7550370 7550371 CLM_0540 CLM_0541     TRUE 0.938 29.000 0.222 NA   NA
 7550371 7550372 CLM_0541 CLM_0542     FALSE 0.009 402.000 0.000 NA   NA
 7550372 7550373 CLM_0542 CLM_0543     TRUE 0.995 -6.000 0.500 NA   NA
 7550373 7550374 CLM_0543 CLM_0544     FALSE 0.258 142.000 0.000 NA   NA
 7550374 7550375 CLM_0544 CLM_0545     TRUE 0.570 61.000 0.007 NA   NA
 7550375 7550376 CLM_0545 CLM_0546     TRUE 0.722 10.000 0.000 NA   NA
 7550376 7550377 CLM_0546 CLM_0547     FALSE 0.003 518.000 0.000 NA   NA
 7550377 7550378 CLM_0547 CLM_0548     FALSE 0.127 274.000 0.010 NA   NA
 7550378 7550379 CLM_0548 CLM_0549     FALSE 0.538 134.000 0.010 NA   NA
 7550379 7550380 CLM_0549 CLM_0550     FALSE 0.522 176.000 0.050 NA   NA
 7550380 7550381 CLM_0550 CLM_0551     TRUE 0.945 2.000 0.025 NA   NA
 7550382 7550383 CLM_0552 CLM_0553     TRUE 0.650 21.000 0.000 NA   NA
 7550384 7550385 CLM_0554 CLM_0555   sbcD FALSE 0.064 247.000 0.000 NA   NA
 7550385 7550386 CLM_0555 CLM_0556 sbcD sbcC TRUE 0.998 -25.000 0.669 NA N NA
 7550386 7550387 CLM_0556 CLM_0557 sbcC   TRUE 0.804 28.000 0.005 NA   NA
 7550387 7550388 CLM_0557 CLM_0558     FALSE 0.002 829.000 0.000 NA   NA
 7550390 7550391 CLM_0560 CLM_0561   cadA TRUE 0.730 76.000 0.053 1.000 N NA
 7550391 7550392 CLM_0561 CLM_0562 cadA   FALSE 0.007 420.000 0.000 NA   NA
 7550392 7550393 CLM_0562 CLM_0563     FALSE 0.002 726.000 0.000 NA   NA
 7550393 7550394 CLM_0563 CLM_0564     FALSE 0.274 133.000 0.000 NA   NA
 7550394 7550395 CLM_0564 CLM_0565     FALSE 0.483 39.000 0.000 NA   NA
 7550395 7550396 CLM_0565 CLM_0566     FALSE 0.003 528.000 0.000 NA   NA
 7550398 7550399 CLM_0568 CLM_0569     FALSE 0.002 639.000 0.000 NA   NA
 7550399 7550400 CLM_0569 CLM_0570     FALSE 0.085 268.000 0.000 NA N NA
 7550400 7550401 CLM_0570 CLM_0571     TRUE 0.985 10.000 0.667 NA   NA
 7550401 7550402 CLM_0571 CLM_0572     FALSE 0.024 320.000 0.000 NA   NA
 7550402 7550403 CLM_0572 CLM_0573   sagB TRUE 0.734 165.000 0.222 NA   NA
 7550403 7550404 CLM_0573 CLM_0574 sagB   TRUE 0.973 4.000 0.222 NA   NA
 7550404 7550405 CLM_0574 CLM_0575   sagD TRUE 0.962 16.000 0.318 NA   NA
 7550405 7550406 CLM_0575 CLM_0576 sagD   TRUE 0.992 -25.000 0.091 NA   NA
 7550406 7550407 CLM_0576 CLM_0577     TRUE 0.990 8.000 1.000 NA   NA
 7550407 7550408 CLM_0577 CLM_0578   sagG FALSE 0.026 309.000 0.000 NA   NA
 7550408 7550409 CLM_0578 CLM_0580 sagG sagH TRUE 0.983 12.000 0.500 NA N NA
 7550409 7550410 CLM_0580 CLM_0581 sagH sagI TRUE 0.980 2.000 0.160 NA N NA
 7550410 7550411 CLM_0581 CLM_0582 sagI   FALSE 0.081 244.000 0.000 1.000   NA
 7550411 7550412 CLM_0582 CLM_0583     FALSE 0.072 253.000 0.000 1.000   NA
 7550412 7550413 CLM_0583 CLM_0584     TRUE 0.966 166.000 0.857 0.023 Y NA
 7550413 7550414 CLM_0584 CLM_0585     FALSE 0.014 422.000 0.000 1.000 N NA
 7550414 7550415 CLM_0585 CLM_0586     TRUE 0.983 12.000 0.500 NA N NA
 7550415 7550416 CLM_0586 CLM_0587     TRUE 0.996 0.000 0.280 NA Y NA
 7550417 7550418 CLM_0588 CLM_0589     TRUE 0.864 118.000 0.409 NA   NA
 7550418 7550419 CLM_0589 CLM_0590     TRUE 0.711 127.000 0.091 NA   NA
 7550420 7550421 CLM_0591 CLM_0592 trmB   FALSE 0.107 213.000 0.000 NA   NA
 7550423 7550424 CLM_0594 CLM_0595     FALSE 0.480 63.000 0.000 1.000 N NA
 7550426 7550427 CLM_0597 CLM_0598     FALSE 0.094 262.000 0.000 NA N NA
 7550427 7550428 CLM_0598 CLM_0599     FALSE 0.040 297.000 0.000 1.000   NA
 7550428 7550429 CLM_0599 CLM_0600     TRUE 0.948 36.000 0.400 1.000   NA
 7550429 7550430 CLM_0600 CLM_0601     FALSE 0.523 205.000 0.000 1.000 Y NA
 7550430 7550431 CLM_0601 CLM_0602   serS FALSE 0.009 482.000 0.000 1.000 N NA
 7550431 7550432 CLM_0602 CLM_0603 serS   FALSE 0.006 595.000 0.000 1.000 N NA
 7550433 7550434 CLM_0604 CLM_0605     FALSE 0.005 493.000 0.000 1.000   NA
 7550437 7550438 CLM_0608 CLM_0609     FALSE 0.128 201.000 0.000 NA   NA
 7550442 7550443 CLM_0613 CLM_0614     FALSE 0.003 657.000 0.000 1.000   NA
 7550443 7550444 CLM_0614 CLM_0615     TRUE 0.654 38.000 0.000 0.022   NA
 7550444 7550445 CLM_0615 CLM_0616     FALSE 0.115 207.000 0.000 NA   NA
 7550445 7550446 CLM_0616 CLM_0617     TRUE 0.571 30.000 0.000 NA   NA
 7550446 7550447 CLM_0617 CLM_0618     FALSE 0.136 198.000 0.000 NA   NA
 7550447 7550448 CLM_0618 CLM_0619     TRUE 0.995 -13.000 0.250 1.000   NA
 7550448 7550449 CLM_0619 CLM_0620     TRUE 0.609 45.000 0.000 1.000 N NA
 7550449 7550450 CLM_0620 CLM_0621     TRUE 0.998 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 7550450 7550451 CLM_0621 CLM_0622     FALSE 0.281 186.000 0.000 1.000 N NA
 7550451 7550452 CLM_0622 CLM_0623     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7550453 7550454 CLM_0624 CLM_0625     FALSE 0.245 148.000 0.000 NA   NA
 7550457 7550458 CLM_0628 CLM_0629     FALSE 0.002 624.000 0.000 NA   NA
 7550458 7550459 CLM_0629 CLM_0630     FALSE 0.059 438.000 0.000 0.005 Y NA
 7550459 7550460 CLM_0630 CLM_0631     FALSE 0.020 348.000 0.000 1.000   NA
 7550460 7550461 CLM_0631 CLM_0632     TRUE 0.712 45.000 0.008 1.000   NA
 7550462 7550463 CLM_0633 CLM_0635     FALSE 0.229 294.000 0.000 1.000 Y NA
 7550463 7550464 CLM_0635 CLM_0636     TRUE 0.998 0.000 0.455 0.001 Y NA
 7550465 7550466 CLM_0637 CLM_0638     FALSE 0.005 447.000 0.000 NA   NA
 7550468 7550469 CLM_0640 CLM_0641     TRUE 0.993 3.000 0.313 NA Y NA
 7550469 7550470 CLM_0641 CLM_0642     FALSE 0.416 46.000 0.000 NA   NA
 7550470 7550471 CLM_0642 CLM_0643   pepP FALSE 0.005 471.000 0.000 NA   NA
 7550472 7550473 CLM_0644 CLM_0645     FALSE 0.007 418.000 0.000 NA   NA
 7550473 7550474 CLM_0645 CLM_0646     FALSE 0.283 149.000 0.000 1.000   NA
 7550475 7550476 CLM_0647 CLM_0648     FALSE 0.005 472.000 0.000 NA   NA
 7550476 7550477 CLM_0648 CLM_0649     FALSE 0.165 182.000 0.000 NA   NA
 7550477 7550478 CLM_0649 CLM_0650     FALSE 0.265 99.000 0.000 NA   NA
 7550478 7550479 CLM_0650 CLM_0651     FALSE 0.048 268.000 0.000 NA   NA
 7550479 7550480 CLM_0651 CLM_0652     TRUE 0.957 12.000 0.184 NA   NA
 7550480 7550481 CLM_0652 CLM_0653     FALSE 0.003 582.000 0.000 NA   NA
 7550481 7550482 CLM_0653 CLM_0654     FALSE 0.002 920.000 0.000 NA   NA
 7550484 7550485 CLM_0656 CLM_0658 mscL   FALSE 0.070 239.000 0.000 NA   NA
 7550487 7550488 CLM_0660 CLM_0661     FALSE 0.030 302.000 0.000 NA   NA
 7550488 7550489 CLM_0661 CLM_0662     TRUE 0.992 -7.000 0.165 1.000 N NA
 7550489 7550490 CLM_0662 CLM_0663     TRUE 0.965 0.000 0.035 NA   NA
 7550490 7550491 CLM_0663 CLM_0664     FALSE 0.015 359.000 0.000 NA   NA
 7550491 7550492 CLM_0664 CLM_0665   potA FALSE 0.002 803.000 0.000 NA   NA
 7550492 7550493 CLM_0665 CLM_0666 potA potB TRUE 0.998 0.000 0.789 1.000 Y NA
 7550493 7550494 CLM_0666 CLM_0667 potB potCD TRUE 0.992 0.000 0.022 0.032 Y NA
 7550496 7550497 CLM_0669 CLM_0670     FALSE 0.165 182.000 0.000 NA   NA
 7550497 7550498 CLM_0670 CLM_0671     FALSE 0.003 593.000 0.000 NA   NA
 7550498 7550499 CLM_0671 CLM_0672     FALSE 0.073 236.000 0.000 NA   NA
 7550499 7550500 CLM_0672 CLM_0673     FALSE 0.249 83.000 0.000 NA   NA
 7550502 7550503 CLM_0675 CLM_0676     FALSE 0.008 414.000 0.000 NA   NA
 7550503 7550504 CLM_0676 CLM_0678     FALSE 0.275 131.000 0.000 NA   NA
 7550504 7550505 CLM_0678 CLM_0679     TRUE 0.769 4.000 0.000 NA   NA
 7550506 7550507 CLM_0680 CLM_0681     FALSE 0.022 324.000 0.000 NA   NA
 7550508 7550509 CLM_0682 CLM_0683     FALSE 0.095 221.000 0.000 NA   NA
 7550509 7550510 CLM_0683 CLM_0684     TRUE 0.992 -10.000 0.208 NA   NA
 7550510 7550511 CLM_0684 CLM_0685   lepB TRUE 0.851 68.000 0.333 NA   NA
 7550511 7550512 CLM_0685 CLM_0686 lepB   FALSE 0.004 816.000 0.000 1.000 N NA
 7550512 7550513 CLM_0686 CLM_0687     FALSE 0.002 613.000 0.000 NA   NA
 7550513 7550514 CLM_0687 CLM_0688     TRUE 0.969 40.000 1.000 NA   NA
 7550514 7550515 CLM_0688 CLM_0689     FALSE 0.002 698.000 0.000 NA   NA
 7550515 7550516 CLM_0689 CLM_0690     FALSE 0.527 34.000 0.000 NA   NA
 7550516 7550517 CLM_0690 CLM_0691     FALSE 0.007 426.000 0.000 NA   NA
 7550517 7550518 CLM_0691 CLM_0692     TRUE 0.985 -7.000 0.080 NA   NA
 7550518 7550519 CLM_0692 CLM_0693     TRUE 0.973 37.000 1.000 NA   NA
 7550519 7550520 CLM_0693 CLM_0694     TRUE 0.920 35.000 0.222 NA   NA
 7550520 7550521 CLM_0694 CLM_0695     TRUE 0.923 34.000 0.222 NA   NA
 7550521 7550522 CLM_0695 CLM_0696     TRUE 0.968 23.000 0.400 NA   NA
 7550522 7550523 CLM_0696 CLM_0697     TRUE 0.982 -3.000 0.095 NA   NA
 7550523 7550524 CLM_0697 CLM_0698     TRUE 0.966 15.000 0.238 NA N NA
 7550524 7550525 CLM_0698 CLM_0699     FALSE 0.003 568.000 0.000 NA   NA
 7550525 7550526 CLM_0699 CLM_0700     FALSE 0.020 329.000 0.000 NA   NA
 7550526 7550527 CLM_0700 CLM_0701     FALSE 0.009 398.000 0.000 NA   NA
 7550530 7550531 CLM_0704 CLM_0705     FALSE 0.040 334.000 0.000 1.000 N NA
 7550532 7550533 CLM_0706 CLM_0707 asnS   FALSE 0.045 274.000 0.000 NA   NA
 7550533 7550534 CLM_0707 CLM_0708     TRUE 0.992 2.000 0.714 NA   NA
 7550534 7550535 CLM_0708 CLM_0709     FALSE 0.007 422.000 0.000 NA   NA
 7550537 7550538 CLM_0711 CLM_0712     TRUE 0.982 13.000 0.667 NA   NA
 7550538 7550539 CLM_0712 CLM_0713     FALSE 0.006 463.000 0.000 1.000   NA
 7550539 7550540 CLM_0713 CLM_0714     FALSE 0.214 175.000 0.000 1.000   NA
 7550540 7550541 CLM_0714 CLM_0715     TRUE 0.996 5.000 0.692 1.000 Y NA
 7550543 7550544 CLM_0717 CLM_0718     TRUE 0.943 21.000 0.085 1.000 N NA
 7550544 7550545 CLM_0718 CLM_0719     TRUE 0.993 29.000 0.932 1.000 Y NA
 7550546 7550547 CLM_0720 CLM_0721     FALSE 0.256 143.000 0.000 NA   NA
 7550547 7550548 CLM_0721 CLM_0722     TRUE 0.909 -3.000 0.000 1.000   NA
 7550551 7550552 CLM_0725 CLM_0726     TRUE 0.806 170.000 0.286 1.000 N NA
 7550554 7550555 CLM_0728 CLM_0729     TRUE 0.717 103.000 0.083 1.000   NA
 7550556 7550557 CLM_0730 CLM_0731 csaA   FALSE 0.345 208.000 0.023 1.000   NA
 7550557 7550558 CLM_0731 CLM_0732     FALSE 0.057 300.000 0.000 0.030   NA
 7550559 7550560 CLM_0733 CLM_0734     FALSE 0.011 386.000 0.000 NA   NA
 7550560 7550561 CLM_0734 CLM_0735     FALSE 0.264 383.000 0.667 NA N NA
 7550561 7550562 CLM_0735 CLM_0736     TRUE 0.993 0.000 0.636 NA   NA
 7550564 7550565 CLM_0738 CLM_0739     FALSE 0.031 345.000 0.000 NA N NA
 7550565 7550566 CLM_0739 CLM_0740     FALSE 0.274 108.000 0.000 NA   NA
 7550566 7550567 CLM_0740 CLM_0741     FALSE 0.275 132.000 0.000 NA   NA
 7550568 7550569 CLM_0742 CLM_0743     TRUE 0.861 23.000 0.015 NA   NA
 7550569 7550570 CLM_0743 CLM_0744     TRUE 0.985 -30.000 0.015 NA   NA
 7550572 7550573 CLM_0746 CLM_0747     FALSE 0.539 139.000 0.006 1.000   NA
 7550574 7550575 CLM_0748 CLM_0749   rhlE FALSE 0.011 402.000 0.000 1.000   NA
 7550575 7550576 CLM_0749 CLM_0750 rhlE   FALSE 0.003 599.000 0.000 1.000   NA
 7550576 7550577 CLM_0750 CLM_0751     TRUE 0.768 170.000 0.286 1.000   NA
 7550577 7550578 CLM_0751 CLM_0752     TRUE 0.959 28.000 0.250 1.000 N NA
 7550580 7550581 CLM_0754 CLM_0755     FALSE 0.483 39.000 0.000 NA   NA
 7550581 7550582 CLM_0755 CLM_0756     FALSE 0.162 184.000 0.000 NA   NA
 7550582 7550583 CLM_0756 CLM_0757     TRUE 0.991 -10.000 0.154 NA   NA
 7550583 7550584 CLM_0757 CLM_0758     FALSE 0.292 67.000 0.000 NA   NA
 7550584 7550585 CLM_0758 CLM_0759     FALSE 0.275 130.000 0.000 NA   NA
 7550587 7550588 CLM_0762 CLM_0763     FALSE 0.010 394.000 0.000 NA   NA
 7550588 7550589 CLM_0763 CLM_0764     TRUE 0.619 26.000 0.000 NA   NA
 7550590 7550591 CLM_0765 CLM_0766     FALSE 0.009 399.000 0.000 NA   NA
 7550592 7550593 CLM_0767 CLM_0768 licT   TRUE 0.699 208.000 0.409 1.000   NA
 7550593 7550594 CLM_0768 CLM_0769     TRUE 0.937 12.000 0.074 1.000   NA
 7550594 7550595 CLM_0769 CLM_0770     FALSE 0.179 176.000 0.000 NA   NA
 7550595 7550596 CLM_0770 CLM_0771     FALSE 0.024 319.000 0.000 NA   NA
 7550596 7550597 CLM_0771 CLM_0772     FALSE 0.367 279.000 0.190 1.000 N NA
 7550597 7550598 CLM_0772 CLM_0773     TRUE 0.793 60.000 0.071 1.000 N NA
 7550598 7550599 CLM_0773 CLM_0774     TRUE 0.912 26.000 0.089 NA   NA
 7550603 7550604 CLM_0778 CLM_0779     TRUE 0.952 7.000 0.100 NA   NA
 7550604 7550605 CLM_0779 CLM_0780     FALSE 0.049 267.000 0.000 NA   NA
 7550605 7550606 CLM_0780 CLM_0781     FALSE 0.022 342.000 0.000 1.000   NA
 7550606 7550607 CLM_0781 CLM_0782     TRUE 0.994 -37.000 0.118 1.000   NA
 7550607 7550608 CLM_0782 CLM_0783     TRUE 0.978 31.000 1.000 NA   NA
 7550608 7550609 CLM_0783 CLM_0784     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7550609 7550610 CLM_0784 CLM_0785     FALSE 0.017 348.000 0.000 NA   NA
 7550610 7550611 CLM_0785 CLM_0786     FALSE 0.075 235.000 0.000 NA   NA
 7550612 7550613 CLM_0787 CLM_0788     TRUE 0.994 -3.000 0.571 NA   NA
 7550614 7550615 CLM_0789 CLM_0790   greA TRUE 0.575 157.000 0.008 1.000 N NA
 7550615 7550616 CLM_0790 CLM_0791 greA   FALSE 0.506 168.000 0.031 NA   NA
 7550616 7550617 CLM_0791 CLM_0792     FALSE 0.043 276.000 0.000 NA   NA
 7550617 7550618 CLM_0792 CLM_0793     TRUE 0.998 -19.000 0.092 0.060 Y NA
 7550618 7550619 CLM_0793 CLM_0794     FALSE 0.035 295.000 0.000 NA   NA
 7550619 7550620 CLM_0794 CLM_0795     FALSE 0.273 105.000 0.000 NA   NA
 7550620 7550621 CLM_0795 CLM_0796     FALSE 0.253 92.000 0.000 NA   NA
 7550621 7550622 CLM_0796 CLM_0797     FALSE 0.263 98.000 0.000 NA   NA
 7550622 7550623 CLM_0797 CLM_0798     FALSE 0.005 597.000 0.000 NA N NA
 7550623 7550624 CLM_0798 CLM_0799   blaI FALSE 0.219 206.000 0.000 1.000 N NA
 7550624 7550625 CLM_0799 CLM_0800 blaI   TRUE 0.952 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7550627 7550628 CLM_0802 CLM_0803     FALSE 0.007 536.000 0.000 1.000 N NA
 7550628 7550629 CLM_0803 CLM_0804   fhuB TRUE 0.955 96.000 0.500 1.000 Y NA
 7550629 7550630 CLM_0804 CLM_0805 fhuB fhuG TRUE 0.998 0.000 0.750 0.031 Y NA
 7550630 7550631 CLM_0805 CLM_0806 fhuG fhuC TRUE 0.704 228.000 0.100 1.000 Y NA
 7550631 7550632 CLM_0806 CLM_0807 fhuC nifH TRUE 0.975 30.000 0.150 1.000 Y NA
 7550632 7550633 CLM_0807 CLM_0808 nifH   TRUE 0.992 3.000 0.571 0.045 N NA
 7550633 7550634 CLM_0808 CLM_0809     TRUE 0.993 32.000 1.000 0.035 Y NA
 7550634 7550635 CLM_0809 CLM_0810     FALSE 0.012 445.000 0.000 1.000 N NA
 7550635 7550636 CLM_0810 CLM_0811     FALSE 0.371 52.000 0.000 NA   NA
 7550637 7550638 CLM_0813 CLM_0814     FALSE 0.263 140.000 0.000 NA   NA
 7550639 7550640 CLM_0815 CLM_0816 gcvT gcvH TRUE 0.804 125.000 0.000 0.001 Y NA
 7550640 7550641 CLM_0816 CLM_0817 gcvH gcvPA TRUE 0.980 3.000 0.005 1.000 Y NA
 7550641 7550642 CLM_0817 CLM_0818 gcvPA gcvPB TRUE 0.997 0.000 0.316 0.001 Y NA
 7550642 7550643 CLM_0818 CLM_0819 gcvPB lpdA FALSE 0.458 189.000 0.010 1.000 N NA
 7550643 7550644 CLM_0819 CLM_0820 lpdA   TRUE 0.771 149.000 0.118 1.000 N NA
 7550644 7550645 CLM_0820 CLM_0821     FALSE 0.012 382.000 0.000 NA   NA
 7550645 7550646 CLM_0821 CLM_0822     FALSE 0.010 393.000 0.000 NA   NA
 7550646 7550647 CLM_0822 CLM_0823     FALSE 0.187 173.000 0.000 NA   NA
 7550647 7550648 CLM_0823 CLM_0824     FALSE 0.547 32.000 0.000 NA   NA
 7550648 7550649 CLM_0824 CLM_0825     TRUE 0.767 17.000 0.000 0.060   NA
 7550649 7550650 CLM_0825 CLM_0826     TRUE 0.999 -15.000 0.875 1.000 Y NA
 7550650 7550651 CLM_0826 CLM_0827     TRUE 0.943 73.000 0.875 1.000 N NA
 7550651 7550652 CLM_0827 CLM_0828     TRUE 0.997 -3.000 0.875 NA N NA
 7550652 7550653 CLM_0828 CLM_0829     FALSE 0.246 188.000 0.000 NA N NA
 7550653 7550654 CLM_0829 CLM_0830     FALSE 0.098 232.000 0.000 1.000   NA
 7550654 7550655 CLM_0830 CLM_0831     FALSE 0.014 362.000 0.000 NA   NA
 7550655 7550656 CLM_0831 CLM_0832     FALSE 0.309 62.000 0.000 NA   NA
 7550656 7550657 CLM_0832 CLM_0834     FALSE 0.070 239.000 0.000 NA   NA
 7550657 7550658 CLM_0834 CLM_0835     TRUE 0.908 52.000 0.273 1.000 N NA
 7550658 7550659 CLM_0835 CLM_0836     TRUE 0.997 -13.000 0.094 1.000 Y NA
 7550661 7550662 CLM_0838 CLM_0839     FALSE 0.002 1003.000 0.000 NA   NA
 7550662 7550663 CLM_0839 CLM_0840     FALSE 0.013 367.000 0.000 NA   NA
 7550663 7550664 CLM_0840 CLM_0841     FALSE 0.011 384.000 0.000 NA   NA
 7550664 7550665 CLM_0841 CLM_0842     FALSE 0.337 56.000 0.000 NA   NA
 7550665 7550666 CLM_0842 CLM_0843     FALSE 0.075 235.000 0.000 NA   NA
 7550666 7550667 CLM_0843 CLM_0844     TRUE 0.957 2.000 0.051 NA   NA
 7550669 7550670 CLM_0846 CLM_0847     TRUE 0.909 -3.000 0.000 1.000   NA
 7550670 7550671 CLM_0847 CLM_0848     FALSE 0.095 221.000 0.000 NA   NA
 7550671 7550672 CLM_0848 CLM_0849     FALSE 0.393 97.000 0.000 NA N NA
 7550672 7550673 CLM_0849 CLM_0850     FALSE 0.274 106.000 0.000 NA   NA
 7550673 7550674 CLM_0850 CLM_0851     FALSE 0.362 53.000 0.000 NA   NA
 7550674 7550675 CLM_0851 CLM_0852     FALSE 0.168 195.000 0.000 1.000   NA
 7550676 7550677 CLM_0853 CLM_0854     TRUE 0.810 99.000 0.250 NA   NA
 7550680 7550681 CLM_0857 CLM_0858     FALSE 0.004 494.000 0.000 NA   NA
 7550683 7550684 CLM_0860 CLM_0861     FALSE 0.221 158.000 0.000 NA   NA
 7550684 7550685 CLM_0861 CLM_0862     FALSE 0.301 64.000 0.000 NA   NA
 7550685 7550686 CLM_0862 CLM_0863     FALSE 0.002 678.000 0.000 NA   NA
 7550686 7550687 CLM_0863 CLM_0864     TRUE 0.995 0.000 0.800 NA   NA
 7550687 7550688 CLM_0864 CLM_0865     TRUE 0.827 162.000 0.444 NA   NA
 7550689 7550690 CLM_0866 CLM_0867   luxS TRUE 0.987 -16.000 0.010 1.000 N NA
 7550690 7550691 CLM_0867 CLM_0868 luxS metC TRUE 0.969 2.000 0.048 1.000 N NA
 7550691 7550692 CLM_0868 CLM_0869 metC   TRUE 0.670 101.000 0.021 1.000 N NA
 7550692 7550693 CLM_0869 CLM_0870     FALSE 0.003 556.000 0.000 NA   NA
 7550694 7550695 CLM_0871 CLM_0872     FALSE 0.118 252.000 0.000 1.000 N NA
 7550695 7550696 CLM_0872 CLM_0873     FALSE 0.093 222.000 0.000 NA   NA
 7550696 7550697 CLM_0873 CLM_0874     FALSE 0.032 298.000 0.000 NA   NA
 7550697 7550698 CLM_0874 CLM_0875     FALSE 0.035 303.000 0.000 1.000   NA
 7550699 7550700 CLM_0876 CLM_0877     TRUE 0.642 88.000 0.061 NA   NA
 7550700 7550701 CLM_0877 CLM_0878     FALSE 0.003 551.000 0.000 NA   NA
 7550701 7550702 CLM_0878 CLM_0879     FALSE 0.255 93.000 0.000 NA   NA
 7550703 7550704 CLM_0880 CLM_0881     FALSE 0.493 38.000 0.000 NA   NA
 7550704 7550705 CLM_0881 CLM_0882     TRUE 0.646 19.000 0.000 NA   NA
 7550705 7550706 CLM_0882 CLM_0883     FALSE 0.267 100.000 0.000 NA   NA
 7550706 7550707 CLM_0883 CLM_0884     FALSE 0.265 99.000 0.000 NA   NA
 7550707 7550708 CLM_0884 CLM_0885     FALSE 0.272 114.000 0.000 NA   NA
 7550708 7550709 CLM_0885 CLM_0886     FALSE 0.187 173.000 0.000 NA   NA
 7550709 7550710 CLM_0886 CLM_0887     FALSE 0.007 419.000 0.000 NA   NA
 7550710 7550711 CLM_0887 CLM_0888     TRUE 0.648 20.000 0.000 NA   NA
 7550711 7550712 CLM_0888 CLM_0889     FALSE 0.056 259.000 0.000 NA   NA
 7550712 7550713 CLM_0889 CLM_0890     FALSE 0.354 54.000 0.000 NA   NA
 7550714 7550715 CLM_0891 CLM_0892     TRUE 0.948 39.000 0.500 NA   NA
 7550715 7550716 CLM_0892 CLM_0893     TRUE 0.976 14.000 0.500 NA   NA
 7550716 7550717 CLM_0893 CLM_0894   botR FALSE 0.001 1226.000 0.000 NA   NA
 7550718 7550719 CLM_0895 CLM_0896 p47 ntnH TRUE 0.981 16.000 0.750 NA   NA
 7550719 7550720 CLM_0896 CLM_0897 ntnH botA TRUE 0.641 44.000 0.000 0.001   NA
 7550720 7550721 CLM_0897 CLM_0898 botA   FALSE 0.002 663.000 0.000 NA   NA
 7550721 7550722 CLM_0898 CLM_0899     FALSE 0.071 238.000 0.000 NA   NA
 7550722 7550723 CLM_0899 CLM_0900     FALSE 0.003 553.000 0.000 NA   NA
 7550723 7550724 CLM_0900 CLM_0901     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 7550724 7550725 CLM_0901 CLM_0902     FALSE 0.267 76.000 0.000 NA   NA
 7550725 7550726 CLM_0902 CLM_0903     FALSE 0.004 495.000 0.000 NA   NA
 7550728 7550729 CLM_0905 CLM_0906   arsD TRUE 0.695 21.000 0.000 1.000   NA
 7550729 7550730 CLM_0906 CLM_0907 arsD   TRUE 0.936 19.000 0.116 1.000   NA
 7550730 7550731 CLM_0907 CLM_0908     FALSE 0.422 95.000 0.000 1.000 N NA
 7550731 7550732 CLM_0908 CLM_0909   arsB TRUE 0.620 44.000 0.000 1.000 N NA
 7550732 7550733 CLM_0909 CLM_0910 arsB   TRUE 0.866 54.000 0.250 NA   NA
 7550733 7550734 CLM_0910 CLM_0912     FALSE 0.013 367.000 0.000 NA   NA
 7550736 7550737 CLM_0913 CLM_0914     FALSE 0.008 406.000 0.000 NA   NA
 7550737 7550738 CLM_0914 CLM_0915     FALSE 0.002 632.000 0.000 NA   NA
 7550738 7550739 CLM_0915 CLM_0916     TRUE 0.994 -7.000 0.400 NA   NA
 7550739 7550740 CLM_0916 CLM_0917     FALSE 0.005 454.000 0.000 NA   NA
 7550740 7550741 CLM_0917 CLM_0918   thyA TRUE 0.979 -10.000 0.017 NA   NA
 7550741 7550742 CLM_0918 CLM_0919 thyA   TRUE 0.925 12.000 0.017 1.000 N NA
 7550742 7550743 CLM_0919 CLM_0920     TRUE 0.834 46.000 0.047 1.000 N NA
 7550743 7550744 CLM_0920 CLM_0921   thiD TRUE 0.707 78.000 0.043 1.000 N NA
 7550744 7550745 CLM_0921 CLM_0922 thiD   FALSE 0.526 172.000 0.043 NA   NA
 7550747 7550748 CLM_0924 CLM_0925     TRUE 0.991 3.000 0.833 NA   NA
 7550748 7550749 CLM_0925 CLM_0926     FALSE 0.194 170.000 0.000 NA   NA
 7550749 7550750 CLM_0926 CLM_0927     TRUE 0.761 165.000 0.167 1.000 N NA
 7550750 7550751 CLM_0927 CLM_0928     TRUE 0.994 0.000 0.667 NA   NA
 7550751 7550752 CLM_0928 CLM_0929     FALSE 0.368 251.000 0.167 NA   NA
 7550752 7550753 CLM_0929 CLM_0930     FALSE 0.107 380.000 0.167 1.000   NA
 7550753 7550754 CLM_0930 CLM_0931     FALSE 0.002 801.000 0.000 NA   NA
 7550754 7550755 CLM_0931 CLM_0932     FALSE 0.047 269.000 0.000 NA   NA
 7550755 7550756 CLM_0932 CLM_0933     TRUE 0.573 184.000 0.100 NA   NA
 7550756 7550757 CLM_0933 CLM_0934     TRUE 0.999 -13.000 0.750 1.000 Y NA
 7550757 7550758 CLM_0934 CLM_0935     FALSE 0.107 213.000 0.000 NA   NA
 7550758 7550759 CLM_0935 CLM_0936     FALSE 0.083 231.000 0.000 NA   NA
 7550759 7550760 CLM_0936 CLM_0937     TRUE 0.943 172.000 0.636 1.000 Y NA
 7550760 7550761 CLM_0937 CLM_0938     FALSE 0.176 190.000 0.000 1.000   NA
 7550763 7550764 CLM_0940 CLM_0941     FALSE 0.005 465.000 0.000 NA   NA
 7550764 7550765 CLM_0941 CLM_0942   dapB FALSE 0.472 95.000 0.002 NA   NA
 7550765 7550766 CLM_0942 CLM_0943 dapB   TRUE 0.772 22.000 0.000 NA N NA
 7550766 7550767 CLM_0943 CLM_0944     FALSE 0.004 493.000 0.000 NA   NA
 7550767 7550768 CLM_0944 CLM_0946     FALSE 0.051 265.000 0.000 NA   NA
 7550768 7550769 CLM_0946 CLM_0947     FALSE 0.256 80.000 0.000 NA   NA
 7550769 7550770 CLM_0947 CLM_0948     FALSE 0.262 193.000 0.000 1.000 N NA
 7550772 7550773 CLM_0950 CLM_0951     FALSE 0.271 116.000 0.000 NA   NA
 7550773 7550774 CLM_0951 CLM_0952     FALSE 0.007 422.000 0.000 NA   NA
 7550774 7550775 CLM_0952 CLM_0953     FALSE 0.019 336.000 0.000 NA   NA
 7550775 7550776 CLM_0953 CLM_0954   brnQ FALSE 0.006 566.000 0.000 1.000 N NA
 7550776 7550777 CLM_0954 CLM_0955 brnQ brnQ TRUE 0.976 151.000 1.000 0.001 Y NA
 7550779 7550780 CLM_0957 CLM_0958   feoB TRUE 0.613 145.000 0.033 1.000   NA
 7550780 7550781 CLM_0958 CLM_0959 feoB   TRUE 0.988 -3.000 0.105 0.005   NA
 7550781 7550782 CLM_0959 CLM_0961   cobC FALSE 0.004 715.000 0.000 1.000 N NA
 7550782 7550783 CLM_0961 CLM_0962 cobC   FALSE 0.414 145.000 0.000 1.000 N NA
 7550783 7550784 CLM_0962 CLM_0963   cobS FALSE 0.018 401.000 0.000 1.000 N NA
 7550784 7550785 CLM_0963 CLM_0964 cobS   FALSE 0.005 459.000 0.000 NA   NA
 7550785 7550786 CLM_0964 CLM_0965     FALSE 0.026 309.000 0.000 NA   NA
 7550786 7550787 CLM_0965 CLM_0966     TRUE 0.660 131.000 0.053 NA   NA
 7550787 7550788 CLM_0966 CLM_0967     TRUE 0.982 18.000 0.828 NA   NA
 7550788 7550789 CLM_0967 CLM_0968     FALSE 0.003 569.000 0.000 NA   NA
 7550789 7550790 CLM_0968 CLM_0969   queD FALSE 0.047 269.000 0.000 NA   NA
 7550790 7550791 CLM_0969 CLM_0970 queD folP TRUE 0.826 104.000 0.003 1.000 Y NA
 7550791 7550792 CLM_0970 CLM_0972 folP   FALSE 0.445 153.000 0.003 NA   NA
 7550792 7550793 CLM_0972 CLM_0973   folK FALSE 0.490 101.000 0.003 NA   NA
 7550793 7550794 CLM_0973 CLM_0974 folK   FALSE 0.405 114.000 0.000 NA N NA
 7550794 7550795 CLM_0974 CLM_0975     FALSE 0.042 320.000 0.000 NA N NA
 7550795 7550796 CLM_0975 CLM_0976     TRUE 0.778 55.000 0.039 1.000 N NA
 7550796 7550797 CLM_0976 CLM_0977     FALSE 0.265 329.000 0.012 0.019 Y NA
 7550797 7550798 CLM_0977 CLM_0978     FALSE 0.002 815.000 0.000 NA   NA
 7550798 7550799 CLM_0978 CLM_0979     FALSE 0.006 441.000 0.000 NA   NA
 7550799 7550800 CLM_0979 CLM_0980     TRUE 0.984 5.000 0.500 NA   NA
 7550803 7550804 CLM_0983 CLM_0984     TRUE 0.948 19.000 0.200 NA   NA
 7550804 7550805 CLM_0984 CLM_0986     TRUE 0.993 -28.000 0.100 1.000   NA
 7550806 7550807 CLM_0987 CLM_0988     FALSE 0.002 685.000 0.000 NA   NA
 7550807 7550808 CLM_0988 CLM_0990     FALSE 0.004 496.000 0.000 NA   NA
 7550808 7550809 CLM_0990 CLM_0991     FALSE 0.397 49.000 0.000 NA   NA
 7550810 7550811 CLM_0992 CLM_0993     TRUE 0.792 18.000 0.000 0.005   NA
 7550811 7550812 CLM_0993 CLM_0994     FALSE 0.316 105.000 0.000 1.000   NA
 7550812 7550813 CLM_0994 CLM_0995     FALSE 0.147 344.000 0.000 0.060 Y NA
 7550814 7550815 CLM_0996 CLM_0997     FALSE 0.118 206.000 0.000 NA   NA
 7550815 7550816 CLM_0997 CLM_0998     FALSE 0.305 63.000 0.000 NA   NA
 7550817 7550818 CLM_0999 CLM_1000     FALSE 0.042 277.000 0.000 NA   NA
 7550819 7550820 CLM_1001 CLM_1002   lipA FALSE 0.014 364.000 0.000 NA   NA
 7550821 7550822 CLM_1003 CLM_1004 oxdD   FALSE 0.057 258.000 0.000 NA   NA
 7550822 7550823 CLM_1004 CLM_1005     TRUE 0.600 58.000 0.010 NA   NA
 7550824 7550825 CLM_1006 CLM_1007     FALSE 0.056 272.000 0.000 1.000   NA
 7550826 7550827 CLM_1008 CLM_1009     TRUE 0.990 0.000 0.400 NA   NA
 7550827 7550828 CLM_1009 CLM_1010     FALSE 0.002 661.000 0.000 NA   NA
 7550833 7550834 CLM_1015 CLM_1016     FALSE 0.083 231.000 0.000 NA   NA
 7550834 7550835 CLM_1016 CLM_1017     TRUE 0.954 -37.000 0.000 NA   NA
 7550835 7550836 CLM_1017 CLM_1019     FALSE 0.002 638.000 0.000 NA   NA
 7550836 7550837 CLM_1019 CLM_1020     FALSE 0.274 125.000 0.000 NA   NA
 7550837 7550838 CLM_1020 CLM_1021     FALSE 0.144 329.000 0.000 1.000 Y NA
 7550838 7550839 CLM_1021 CLM_1022     FALSE 0.275 128.000 0.000 NA   NA
 7550840 7550841 CLM_1023 CLM_1024 mraY   FALSE 0.260 96.000 0.000 NA   NA
 7550842 7550843 CLM_1025 CLM_1026     FALSE 0.008 425.000 0.000 1.000   NA
 7550843 7550844 CLM_1026 CLM_1028     FALSE 0.067 244.000 0.000 NA   NA
 7550844 7550845 CLM_1028 CLM_1029     FALSE 0.274 74.000 0.000 NA   NA
 7550847 7550848 CLM_1032 CLM_1033     FALSE 0.195 169.000 0.000 NA   NA
 7550848 7550849 CLM_1033 CLM_1034     FALSE 0.538 33.000 0.000 NA   NA
 7550849 7550850 CLM_1034 CLM_1035     FALSE 0.037 290.000 0.000 NA   NA
 7550852 7550853 CLM_1037 CLM_1038     FALSE 0.257 79.000 0.000 NA   NA
 7550853 7550854 CLM_1038 CLM_1039     FALSE 0.008 413.000 0.000 NA   NA
 7550855 7550856 CLM_1040 CLM_1041     FALSE 0.179 176.000 0.000 NA   NA
 7550858 7550859 CLM_1043 CLM_1044     FALSE 0.099 218.000 0.000 NA   NA
 7550859 7550860 CLM_1044 CLM_1045     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7550861 7550862 CLM_1046 CLM_1047     FALSE 0.003 540.000 0.000 NA   NA
 7550864 7550865 CLM_1049 CLM_1050     TRUE 0.996 0.000 0.333 1.000 Y NA
 7550865 7550866 CLM_1050 CLM_1051   ilvE FALSE 0.016 410.000 0.000 1.000 N NA
 7550866 7550867 CLM_1051 CLM_1052 ilvE   FALSE 0.069 240.000 0.000 NA   NA
 7550867 7550868 CLM_1052 CLM_1053     FALSE 0.086 229.000 0.000 NA   NA
 7550868 7550869 CLM_1053 CLM_1054     FALSE 0.011 387.000 0.000 NA   NA
 7550869 7550870 CLM_1054 CLM_1055     TRUE 0.791 72.000 0.100 1.000 N NA
 7550870 7550871 CLM_1055 CLM_1056     FALSE 0.074 292.000 0.000 1.000 N NA
 7550871 7550872 CLM_1056 CLM_1057     FALSE 0.026 327.000 0.000 1.000   NA
 7550874 7550875 CLM_1060 CLM_1061   cobQ FALSE 0.549 61.000 0.003 NA   NA
 7550875 7550876 CLM_1061 CLM_1062 cobQ cobD TRUE 0.992 2.000 0.092 0.011 Y NA
 7550876 7550877 CLM_1062 CLM_1063 cobD   FALSE 0.062 385.000 0.026 1.000 N NA
 7550877 7550878 CLM_1063 CLM_1064   cbiM FALSE 0.486 185.000 0.013 1.000 N NA
 7550878 7550879 CLM_1064 CLM_1065 cbiM cbiN TRUE 0.997 4.000 0.861 0.011 Y NA
 7550879 7550880 CLM_1065 CLM_1066 cbiN cbiQ TRUE 1.000 -22.000 0.804 0.001 Y NA
 7550880 7550881 CLM_1066 CLM_1067 cbiQ   FALSE 0.029 349.000 0.000 NA N NA
 7550881 7550882 CLM_1067 CLM_1068   hemC TRUE 0.996 -31.000 0.009 NA Y NA
 7550882 7550883 CLM_1068 CLM_1069 hemC   TRUE 0.864 136.000 0.031 1.000 Y NA
 7550883 7550884 CLM_1069 CLM_1070     FALSE 0.252 145.000 0.000 NA   NA
 7550884 7550885 CLM_1070 CLM_1071   hemB FALSE 0.054 262.000 0.000 NA   NA
 7550885 7550886 CLM_1071 CLM_1072 hemB cobB FALSE 0.529 233.000 0.005 1.000 Y NA
 7550886 7550887 CLM_1072 CLM_1073 cobB cobH TRUE 0.981 25.000 0.097 0.011 Y NA
 7550887 7550888 CLM_1073 CLM_1074 cobH   FALSE 0.066 298.000 0.000 1.000 N NA
 7550888 7550889 CLM_1074 CLM_1075     FALSE 0.363 60.000 0.000 1.000   NA
 7550889 7550890 CLM_1075 CLM_1076     FALSE 0.039 299.000 0.000 1.000   NA
 7550890 7550891 CLM_1076 CLM_1077     FALSE 0.008 423.000 0.000 1.000   NA
 7550891 7550892 CLM_1077 CLM_1078     FALSE 0.019 353.000 0.000 1.000   NA
 7550892 7550893 CLM_1078 CLM_1079     FALSE 0.420 52.000 0.000 1.000   NA
 7550893 7550894 CLM_1079 CLM_1080     FALSE 0.073 252.000 0.000 1.000   NA
 7550894 7550895 CLM_1080 CLM_1081     TRUE 0.866 29.000 0.032 1.000   NA
 7550895 7550896 CLM_1081 CLM_1082     TRUE 0.627 70.000 0.032 NA   NA
 7550896 7550897 CLM_1082 CLM_1084     FALSE 0.255 93.000 0.000 NA   NA
 7550897 7550898 CLM_1084 CLM_1085     TRUE 0.956 -433.000 0.000 NA   NA
 7550898 7550899 CLM_1085 CLM_1086   cbiD TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 7550899 7550900 CLM_1086 CLM_1087 cbiD cbiE TRUE 0.832 200.000 0.126 0.011 Y NA
 7550900 7550901 CLM_1087 CLM_1088 cbiE   TRUE 0.954 -37.000 0.000 NA   NA
 7550901 7550902 CLM_1088 CLM_1089     FALSE 0.270 102.000 0.000 NA   NA
 7550902 7550903 CLM_1089 CLM_1090   cbiT FALSE 0.301 64.000 0.000 NA   NA
 7550903 7550904 CLM_1090 CLM_1091 cbiT   TRUE 0.647 23.000 0.000 NA   NA
 7550904 7550905 CLM_1091 CLM_1092     FALSE 0.004 474.000 0.000 NA   NA
 7550905 7550906 CLM_1092 CLM_1093     TRUE 0.822 158.000 0.400 NA   NA
 7550906 7550907 CLM_1093 CLM_1094     FALSE 0.316 60.000 0.000 NA   NA
 7550907 7550908 CLM_1094 CLM_1095     FALSE 0.333 68.000 0.000 1.000   NA
 7550908 7550909 CLM_1095 CLM_1096     FALSE 0.387 50.000 0.000 NA   NA
 7550909 7550910 CLM_1096 CLM_1097   cobI FALSE 0.251 91.000 0.000 NA   NA
 7550910 7550911 CLM_1097 CLM_1098 cobI cobM TRUE 0.663 289.000 0.291 0.011 Y NA
 7550911 7550912 CLM_1098 CLM_1099 cobM cbiG TRUE 0.999 -22.000 0.397 0.011 Y NA
 7550912 7550913 CLM_1099 CLM_1100 cbiG cobJ TRUE 0.955 134.000 0.352 0.011 Y NA
 7550913 7550914 CLM_1100 CLM_1101 cobJ cobK TRUE 0.933 177.000 0.423 0.011 Y NA
 7550914 7550915 CLM_1101 CLM_1102 cobK   FALSE 0.500 80.000 0.006 NA   NA
 7550915 7550916 CLM_1102 CLM_1103   cbiK FALSE 0.373 216.000 0.056 NA   NA
 7550916 7550917 CLM_1103 CLM_1104 cbiK   TRUE 0.936 13.000 0.040 1.000 N NA
 7550917 7550918 CLM_1104 CLM_1105   cobO FALSE 0.443 127.000 0.000 1.000 N NA
 7550918 7550919 CLM_1105 CLM_1106 cobO   FALSE 0.117 253.000 0.000 1.000 N NA
 7550919 7550920 CLM_1106 CLM_1107     TRUE 0.811 100.000 0.152 1.000 N NA
 7550920 7550921 CLM_1107 CLM_1108   asrA TRUE 0.948 20.000 0.174 1.000   NA
 7550921 7550922 CLM_1108 CLM_1109 asrA asrB TRUE 0.998 -13.000 0.750 0.033   NA
 7550922 7550923 CLM_1109 CLM_1110 asrB arsC TRUE 0.995 13.000 0.720 0.033 Y NA
 7550923 7550924 CLM_1110 CLM_1111 arsC   FALSE 0.021 346.000 0.000 1.000   NA
 7550926 7550927 CLM_1113 CLM_1114     TRUE 0.983 21.000 0.833 NA   NA
 7550927 7550928 CLM_1114 CLM_1115     TRUE 0.990 4.000 0.833 NA   NA
 7550928 7550929 CLM_1115 CLM_1116     FALSE 0.019 650.000 0.154 NA   NA
 7550929 7550930 CLM_1116 CLM_1117     TRUE 0.999 -10.000 0.765 1.000 Y NA
 7550931 7550932 CLM_1118 CLM_1119     TRUE 0.997 1.000 0.625 1.000 Y NA
 7550932 7550933 CLM_1119 CLM_1120     TRUE 0.996 1.000 0.375 1.000 Y NA
 7550935 7550936 CLM_1123 CLM_1124     FALSE 0.560 31.000 0.000 NA   NA
 7550939 7550940 CLM_1127 CLM_1128     FALSE 0.003 682.000 0.000 1.000   NA
 7550941 7550942 CLM_1129 CLM_1130     FALSE 0.008 407.000 0.000 NA   NA
 7550942 7550943 CLM_1130 CLM_1131   dhaKL FALSE 0.010 393.000 0.000 NA   NA
 7550943 7550944 CLM_1131 CLM_1132 dhaKL dhaD TRUE 0.948 11.000 0.053 1.000 N NA
 7550944 7550945 CLM_1132 CLM_1133 dhaD   FALSE 0.052 521.000 0.250 1.000 N NA
 7550946 7550947 CLM_1134 CLM_1135     FALSE 0.206 207.000 0.000 0.012   NA
 7550947 7550948 CLM_1135 CLM_1136     FALSE 0.231 153.000 0.000 NA   NA
 7550948 7550949 CLM_1136 CLM_1137     FALSE 0.301 64.000 0.000 NA   NA
 7550949 7550950 CLM_1137 CLM_1138     FALSE 0.271 118.000 0.000 NA   NA
 7550950 7550951 CLM_1138 CLM_1139     TRUE 0.787 102.000 0.200 NA   NA
 7550951 7550952 CLM_1139 CLM_1140     TRUE 0.795 46.000 0.061 NA   NA
 7550952 7550953 CLM_1140 CLM_1141     FALSE 0.071 238.000 0.000 NA   NA
 7550953 7550954 CLM_1141 CLM_1142     FALSE 0.002 643.000 0.000 NA   NA
 11430799 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7197.000 0.000 NA   NA
 11573162 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7197.000 0.000 NA   NA
 11715554 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7197.000 0.000 NA   NA
 11430800 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7225.000 0.000 NA   NA
 11573163 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7225.000 0.000 NA   NA
 11715555 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7225.000 0.000 NA   NA
 11430801 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7264.000 0.000 NA   NA
 11573164 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7264.000 0.000 NA   NA
 11715556 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7264.000 0.000 NA   NA
 11430802 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7292.000 0.000 NA   NA
 11573165 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7292.000 0.000 NA   NA
 11715557 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7292.000 0.000 NA   NA
 11430803 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7328.000 0.000 NA   NA
 11573166 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7328.000 0.000 NA   NA
 11715558 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7328.000 0.000 NA   NA
 11430804 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7356.000 0.000 NA   NA
 11573167 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7356.000 0.000 NA   NA
 11715559 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7356.000 0.000 NA   NA
 11430805 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7392.000 0.000 NA   NA
 11573168 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7392.000 0.000 NA   NA
 11715560 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7392.000 0.000 NA   NA
 11430806 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7420.000 0.000 NA   NA
 11573169 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7420.000 0.000 NA   NA
 11715561 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7420.000 0.000 NA   NA
 11430807 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7456.000 0.000 NA   NA
 11573170 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7456.000 0.000 NA   NA
 11715562 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7456.000 0.000 NA   NA
 11430808 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7484.000 0.000 NA   NA
 11573171 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7484.000 0.000 NA   NA
 11715563 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7484.000 0.000 NA   NA
 11430809 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7521.000 0.000 NA   NA
 11573172 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7521.000 0.000 NA   NA
 11715564 7550944   CLM_1132   dhaD FALSE NA 7521.000 0.000 NA   NA
 7550954 7550955 CLM_1142 CLM_1144     FALSE 0.004 498.000 0.000 NA   NA
 7550957 7550958 CLM_1146 CLM_1147     TRUE 0.980 26.000 0.833 NA   NA
 7550960 7550961 CLM_1149 CLM_1150   recQ FALSE 0.067 244.000 0.000 NA   NA
 7550961 7550962 CLM_1150 CLM_1151 recQ   FALSE 0.442 111.000 0.000 1.000 N NA
 7550964 7550965 CLM_1153 CLM_1154     TRUE 0.848 115.000 0.333 1.000   NA
 7550965 7550966 CLM_1154 CLM_1155     FALSE 0.005 448.000 0.000 NA   NA
 7550966 7550967 CLM_1155 CLM_1156     TRUE 0.987 2.000 0.444 NA   NA
 7550967 7550968 CLM_1156 CLM_1157     TRUE 0.983 0.000 0.167 NA   NA
 7550968 7550969 CLM_1157 CLM_1158     TRUE 0.990 2.000 0.077 1.000 Y NA
 7550969 7550970 CLM_1158 CLM_1159     TRUE 0.941 15.000 0.135 NA   NA
 7550970 7550971 CLM_1159 CLM_1160   lctP FALSE 0.004 481.000 0.000 NA   NA
 7550971 7550972 CLM_1160 CLM_1161 lctP   TRUE 0.905 29.000 0.098 NA   NA
 7550972 7550973 CLM_1161 CLM_1162     TRUE 0.846 43.000 0.098 NA   NA
 7550973 7550974 CLM_1162 CLM_1163     TRUE 0.993 32.000 0.875 0.012 Y NA
 7550974 7550975 CLM_1163 CLM_1164     TRUE 0.981 61.000 0.875 0.009 Y NA
 7550975 7550976 CLM_1164 CLM_1165     FALSE 0.047 269.000 0.000 NA   NA
 7550976 7550977 CLM_1165 CLM_1166     FALSE 0.275 128.000 0.000 NA   NA
 7550977 7550978 CLM_1166 CLM_1167     FALSE 0.141 195.000 0.000 NA   NA
 7550978 7550979 CLM_1167 CLM_1168     TRUE 0.957 2.000 0.051 NA   NA
 7550980 7550981 CLM_1169 CLM_1170     FALSE 0.002 929.000 0.000 NA   NA
 7550982 7550983 CLM_1171 CLM_1172     FALSE 0.222 303.000 0.000 0.058 Y NA
 7550983 7550984 CLM_1172 CLM_1173     FALSE 0.103 215.000 0.000 NA   NA
 7550986 7550987 CLM_1175 CLM_1176     TRUE 0.963 4.000 0.111 1.000   NA
 7550987 7550988 CLM_1176 CLM_1177     FALSE 0.107 262.000 0.000 1.000 N NA
 7550988 7550989 CLM_1177 CLM_1178     TRUE 0.797 16.000 0.000 1.000 N NA
 7550993 7550994 CLM_1182 CLM_1183     FALSE 0.273 134.000 0.000 NA   NA
 7550994 7550995 CLM_1183 CLM_1184     FALSE 0.003 584.000 0.000 NA   NA
 7550995 7550996 CLM_1184 CLM_1185   feoA TRUE 0.995 17.000 0.791 0.007 Y NA
 7550996 7550997 CLM_1185 CLM_1186 feoA feoB TRUE 0.991 32.000 0.871 1.000 Y NA
 7550997 7550998 CLM_1186 CLM_1187 feoB   TRUE 0.883 21.000 0.029 NA   NA
 7551000 7551001 CLM_1189 CLM_1190   tlp FALSE 0.032 299.000 0.000 NA   NA
 7551001 7551002 CLM_1190 CLM_1191 tlp   FALSE 0.099 218.000 0.000 NA   NA
 7551002 7551003 CLM_1191 CLM_1192     TRUE 0.997 1.000 0.462 1.000 Y NA
 7551003 7551004 CLM_1192 CLM_1193     FALSE 0.272 104.000 0.000 NA   NA
 7551004 7551005 CLM_1193 CLM_1194     FALSE 0.033 297.000 0.000 NA   NA
 7551007 7551008 CLM_1196 CLM_1197     FALSE 0.047 270.000 0.000 NA   NA
 7551008 7551009 CLM_1197 CLM_1198     TRUE 0.998 0.000 0.833 1.000 Y NA
 7551010 7551011 CLM_1199 CLM_1200     FALSE 0.126 236.000 0.000 NA N NA
 7551012 7551013 CLM_1201 CLM_1202     TRUE 0.999 -10.000 0.870 0.029 Y NA
 7551013 7551014 CLM_1202 CLM_1203     TRUE 0.999 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 7551014 7551015 CLM_1203 CLM_1204     TRUE 0.925 74.000 0.196 1.000 Y NA
 7551015 7551016 CLM_1204 CLM_1205     FALSE 0.227 203.000 0.000 1.000 N NA
 7551016 7551017 CLM_1205 CLM_1206     FALSE 0.007 516.000 0.000 1.000 N NA
 7551017 7551018 CLM_1206 CLM_1207     TRUE 0.996 2.000 0.389 0.008 Y NA
 7551019 7551020 CLM_1208 CLM_1209     TRUE 0.997 3.000 1.000 NA Y NA
 7551020 7551021 CLM_1209 CLM_1210     FALSE 0.249 88.000 0.000 NA   NA
 7551021 7551022 CLM_1210 CLM_1212     FALSE 0.075 235.000 0.000 NA   NA
 7551023 7551024 CLM_1213 CLM_1214   chiA FALSE 0.274 188.000 0.000 0.005   NA
 7551024 7551025 CLM_1214 CLM_1215 chiA   FALSE 0.043 328.000 0.000 1.000 N NA
 7551025 7551026 CLM_1215 CLM_1216     FALSE 0.080 323.000 0.023 NA   NA
 7551026 7551027 CLM_1216 CLM_1217     FALSE 0.491 165.000 0.023 NA   NA
 7551027 7551028 CLM_1217 CLM_1218     FALSE 0.002 817.000 0.000 NA   NA
 7551028 7551029 CLM_1218 CLM_1219     TRUE 0.984 3.000 0.400 NA   NA
 7551030 7551031 CLM_1220 CLM_1221     FALSE 0.557 116.000 0.015 NA   NA
 7551032 7551033 CLM_1222 CLM_1223     FALSE 0.271 116.000 0.000 NA   NA
 7551035 7551036 CLM_1225 CLM_1226     FALSE 0.013 386.000 0.000 1.000   NA
 7551036 7551037 CLM_1226 CLM_1227     FALSE 0.078 247.000 0.000 1.000   NA
 7551037 7551038 CLM_1227 CLM_1228     FALSE 0.134 209.000 0.000 1.000   NA
 7551038 7551039 CLM_1228 CLM_1229     TRUE 0.827 56.000 0.107 0.032   NA
 7551039 7551040 CLM_1229 CLM_1230     TRUE 0.984 3.000 0.300 0.032   NA
 7551040 7551041 CLM_1230 CLM_1231   glpT TRUE 0.575 89.000 0.021 1.000   NA
 7551041 7551042 CLM_1231 CLM_1232 glpT argS FALSE 0.006 583.000 0.000 1.000 N NA
 7551042 7551043 CLM_1232 CLM_1233 argS arcT FALSE 0.019 399.000 0.000 1.000 N NA
 7551043 7551044 CLM_1233 CLM_1234 arcT   FALSE 0.308 139.000 0.000 1.000   NA
 7551045 7551046 CLM_1235 CLM_1236   feoB TRUE 0.876 26.000 0.034 NA   NA
 7551046 7551047 CLM_1236 CLM_1237 feoB feoA TRUE 0.988 15.000 0.308 1.000 Y NA
 7551048 7551049 CLM_1238 CLM_1239     FALSE 0.108 212.000 0.000 NA   NA
 7551049 7551050 CLM_1239 CLM_1240     FALSE 0.002 909.000 0.000 1.000   NA
 7551050 7551051 CLM_1240 CLM_1241     FALSE 0.009 412.000 0.000 1.000   NA
 7551051 7551052 CLM_1241 CLM_1243     FALSE 0.051 278.000 0.000 1.000   NA
 7551052 7551053 CLM_1243 CLM_1244     TRUE 0.996 2.000 0.511 1.000 Y NA
 7551053 7551054 CLM_1244 CLM_1245     TRUE 0.936 55.000 0.154 NA Y NA
 7551054 7551055 CLM_1245 CLM_1246     TRUE 0.866 188.000 0.250 NA Y NA
 7551055 7551056 CLM_1246 CLM_1247     FALSE 0.086 229.000 0.000 NA   NA
 7551056 7551057 CLM_1247 CLM_1248     FALSE 0.004 572.000 0.000 1.000   NA
 7551057 7551058 CLM_1248 CLM_1249     FALSE 0.004 506.000 0.000 1.000   NA
 7551058 7551059 CLM_1249 CLM_1250     FALSE 0.066 245.000 0.000 NA   NA
 7551059 7551060 CLM_1250 CLM_1251     FALSE 0.112 209.000 0.000 NA   NA
 7551064 7551065 CLM_1255 CLM_1256     FALSE 0.506 143.000 0.008 NA   NA
 7551065 7551066 CLM_1256 CLM_1257     TRUE 0.627 56.000 0.008 1.000   NA
 7551067 7551068 CLM_1258 CLM_1259     FALSE 0.027 597.000 0.000 0.003 Y NA
 7551069 7551070 CLM_1260 CLM_1261     TRUE 0.971 18.000 0.333 1.000 N NA
 7551070 7551071 CLM_1261 CLM_1262     FALSE 0.009 419.000 0.000 1.000   NA
 7551071 7551072 CLM_1262 CLM_1263     FALSE 0.265 99.000 0.000 NA   NA
 7551072 7551073 CLM_1263 CLM_1264     FALSE 0.002 803.000 0.000 NA   NA
 7551073 7551074 CLM_1264 CLM_1266     TRUE 0.979 2.000 0.217 NA   NA
 7551074 7551075 CLM_1266 CLM_1267     TRUE 0.980 19.000 0.084 0.029 Y NA
 7551075 7551076 CLM_1267 CLM_1268     TRUE 0.980 12.000 0.308 0.029 N NA
 7551076 7551077 CLM_1268 CLM_1269     FALSE 0.029 303.000 0.000 NA   NA
 7551077 7551078 CLM_1269 CLM_1270     TRUE 0.575 104.000 0.020 NA   NA
 7551078 7551079 CLM_1270 CLM_1271     TRUE 0.761 10.000 0.000 1.000   NA
 7551079 7551080 CLM_1271 CLM_1272     FALSE 0.267 76.000 0.000 NA   NA
 7551080 7551081 CLM_1272 CLM_1273     TRUE 0.963 1.000 0.050 NA   NA
 7551081 7551082 CLM_1273 CLM_1274   maa FALSE 0.038 288.000 0.000 NA   NA
 7551084 7551085 CLM_1276 CLM_1277     FALSE 0.053 276.000 0.000 1.000   NA
 7551085 7551086 CLM_1277 CLM_1278     FALSE 0.518 160.000 0.017 1.000   NA
 7551088 7551089 CLM_1280 CLM_1281   mgtE FALSE 0.004 501.000 0.000 NA   NA
 7551089 7551090 CLM_1281 CLM_1282 mgtE   FALSE 0.004 1009.000 0.000 0.055 N NA
 7551090 7551091 CLM_1282 CLM_1283     TRUE 0.745 226.000 0.110 0.055 Y NA
 7551091 7551092 CLM_1283 CLM_1284     TRUE 0.991 -22.000 0.072 NA   NA
 7551092 7551093 CLM_1284 CLM_1285     FALSE 0.002 653.000 0.000 NA   NA
 7551093 7551094 CLM_1285 CLM_1286     TRUE 0.591 167.000 0.056 1.000   NA
 7551096 7551097 CLM_1288 CLM_1289     TRUE 0.754 111.000 0.118 1.000   NA
 7551097 7551098 CLM_1289 CLM_1290     FALSE 0.039 299.000 0.000 1.000   NA
 7551098 7551099 CLM_1290 CLM_1291     FALSE 0.521 159.000 0.004 NA N NA
 7551099 7551100 CLM_1291 CLM_1292     FALSE 0.267 76.000 0.000 NA   NA
 7551100 7551101 CLM_1292 CLM_1293     FALSE 0.042 277.000 0.000 NA   NA
 7551101 7551102 CLM_1293 CLM_1294     TRUE 0.581 178.000 0.091 NA   NA
 7551102 7551103 CLM_1294 CLM_1295   xpt TRUE 0.564 161.000 0.009 1.000 N NA
 7551103 7551104 CLM_1295 CLM_1296 xpt   FALSE 0.032 298.000 0.000 NA   NA
 7551104 7551105 CLM_1296 CLM_1297     FALSE 0.034 296.000 0.000 NA   NA
 7551105 7551106 CLM_1297 CLM_1298     TRUE 0.790 199.000 0.667 NA   NA
 7551106 7551107 CLM_1298 CLM_1299     FALSE 0.018 344.000 0.000 NA   NA
 7551107 7551108 CLM_1299 CLM_1300     FALSE 0.170 180.000 0.000 NA   NA
 7551108 7551109 CLM_1300 CLM_1301     TRUE 0.674 137.000 0.065 NA   NA
 7551111 7551112 CLM_1303 CLM_1304     TRUE 0.875 182.000 1.000 NA   NA
 7551112 7551113 CLM_1304 CLM_1305     FALSE 0.010 393.000 0.000 NA   NA
 7551113 7551114 CLM_1305 CLM_1306     TRUE 0.997 2.000 0.667 0.029 Y NA
 7551114 7551115 CLM_1306 CLM_1307     TRUE 0.999 -37.000 0.900 0.029 N NA
 7551117 7551118 CLM_1309 CLM_1310   rpsA FALSE 0.010 392.000 0.000 NA   NA
 7551118 7551119 CLM_1310 CLM_1311 rpsA   FALSE 0.394 183.000 0.008 1.000   NA
 7551119 7551120 CLM_1311 CLM_1312     TRUE 0.570 172.000 0.067 NA   NA
 7551120 7551121 CLM_1312 CLM_1313     FALSE 0.002 871.000 0.000 NA   NA
 7551121 7551122 CLM_1313 CLM_1314     TRUE 0.995 0.000 0.857 NA   NA
 7551122 7551123 CLM_1314 CLM_1315     TRUE 0.996 -37.000 0.231 1.000   NA
 7551123 7551124 CLM_1315 CLM_1316     FALSE 0.020 329.000 0.000 NA   NA
 7551124 7551125 CLM_1316 CLM_1317     FALSE 0.006 433.000 0.000 NA   NA
 7551127 7551128 CLM_1319 CLM_1320     TRUE 0.977 -6.000 0.012 NA N NA
 7551128 7551129 CLM_1320 CLM_1321   panE FALSE 0.007 492.000 0.000 NA N NA
 7551129 7551130 CLM_1321 CLM_1322 panE   FALSE 0.055 307.000 0.000 1.000 N NA
 7551130 7551131 CLM_1322 CLM_1323   folD TRUE 0.987 0.000 0.082 0.001 N NA
 7551131 7551132 CLM_1323 CLM_1324 folD   FALSE 0.043 294.000 0.000 1.000   NA
 7551134 7551135 CLM_1326 CLM_1327     TRUE 0.827 117.000 0.286 NA   NA
 7551135 7551136 CLM_1327 CLM_1328     FALSE 0.545 120.000 0.012 NA   NA
 7551136 7551137 CLM_1328 CLM_1329     FALSE 0.004 672.000 0.000 NA N NA
 7551137 7551138 CLM_1329 CLM_1330   cysK FALSE 0.146 329.000 0.083 NA N NA
 7551138 7551139 CLM_1330 CLM_1331 cysK   TRUE 0.974 45.000 0.400 1.000 Y NA
 7551139 7551140 CLM_1331 CLM_1332     TRUE 0.985 35.000 0.400 0.029 Y NA
 7551140 7551141 CLM_1332 CLM_1333     TRUE 0.938 101.000 0.286 1.000 Y NA
 7551141 7551142 CLM_1333 CLM_1334     FALSE 0.324 72.000 0.000 1.000   NA
 7551142 7551143 CLM_1334 CLM_1335     FALSE 0.470 155.000 0.008 NA   NA
 7551143 7551144 CLM_1335 CLM_1336   trmU FALSE 0.504 116.000 0.004 NA   NA
 7551146 7551147 CLM_1338 CLM_1340     TRUE 0.999 -3.000 0.875 NA Y NA
 7551147 7551148 CLM_1340 CLM_1341   bcrA FALSE 0.023 374.000 0.000 NA N NA
 7551148 7551149 CLM_1341 CLM_1342 bcrA   TRUE 0.993 -7.000 0.333 NA   NA
 7551149 7551150 CLM_1342 CLM_1343     FALSE 0.007 423.000 0.000 NA   NA
 7551150 7551151 CLM_1343 CLM_1344     FALSE 0.015 355.000 0.000 NA   NA
 7551153 7551154 CLM_1346 CLM_1347     FALSE 0.270 137.000 0.000 NA   NA
 7551154 7551155 CLM_1347 CLM_1348     FALSE 0.031 300.000 0.000 NA   NA
 7551155 7551156 CLM_1348 CLM_1349     FALSE 0.003 589.000 0.000 NA   NA
 7551158 7551159 CLM_1352 CLM_1353     TRUE 0.812 14.000 0.000 1.000 N NA
 7551159 7551160 CLM_1353 CLM_1354     FALSE 0.440 64.000 0.000 NA N NA
 7551160 7551161 CLM_1354 CLM_1355     TRUE 0.965 3.000 0.000 NA Y NA
 7551161 7551162 CLM_1355 CLM_1356     FALSE 0.004 668.000 0.000 0.005   NA
 7551162 7551163 CLM_1356 CLM_1358   tyrS FALSE 0.003 639.000 0.000 1.000   NA
 7551163 7551164 CLM_1358 CLM_1359 tyrS   FALSE 0.081 281.000 0.000 1.000 N NA
 7551164 7551165 CLM_1359 CLM_1360     TRUE 0.998 -7.000 0.833 1.000 N NA
 7551165 7551166 CLM_1360 CLM_1361     TRUE 0.985 1.000 0.278 NA   NA
 7551168 7551169 CLM_1363 CLM_1364     FALSE 0.251 91.000 0.000 NA   NA
 7551169 7551170 CLM_1364 CLM_1365     FALSE 0.149 189.000 0.000 NA   NA
 7551170 7551171 CLM_1365 CLM_1367     FALSE 0.259 78.000 0.000 NA   NA
 7551171 7551172 CLM_1367 CLM_1368     TRUE 0.620 174.000 0.095 1.000   NA
 7551172 7551173 CLM_1368 CLM_1369   sdhB FALSE 0.019 400.000 0.000 1.000 N NA
 7551173 7551174 CLM_1369 CLM_1370 sdhB sdhA TRUE 0.988 13.000 0.146 0.001 Y NA
 7551178 7551179 CLM_1374 CLM_1375     FALSE 0.285 70.000 0.000 NA   NA
 7551180 7551181 CLM_1376 CLM_1377     FALSE 0.011 385.000 0.000 NA   NA
 7551181 7551182 CLM_1377 CLM_1378     TRUE 0.765 106.000 0.154 NA   NA
 7551182 7551183 CLM_1378 CLM_1379     TRUE 0.980 2.000 0.231 NA   NA
 7551183 7551184 CLM_1379 CLM_1380     TRUE 0.929 37.000 0.286 NA   NA
 7551184 7551185 CLM_1380 CLM_1381     TRUE 0.656 173.000 0.071 1.000 N NA
 7551185 7551186 CLM_1381 CLM_1382     TRUE 0.997 6.000 0.786 0.028 Y NA
 7551186 7551187 CLM_1382 CLM_1383     TRUE 0.934 199.000 0.688 0.028 Y NA
 7551188 7551189 CLM_1384 CLM_1385   cotJB TRUE 0.897 34.000 0.125 NA   NA
 7551189 7551190 CLM_1385 CLM_1386 cotJB cotJC TRUE 0.861 31.000 0.047 NA   NA
 7551190 7551191 CLM_1386 CLM_1387 cotJC   FALSE 0.144 230.000 0.000 NA N NA
 7551191 7551192 CLM_1387 CLM_1388     TRUE 0.978 17.000 0.667 NA   NA
 7551192 7551193 CLM_1388 CLM_1389     FALSE 0.003 594.000 0.000 NA   NA
 7551196 7551197 CLM_1392 CLM_1393     FALSE 0.004 516.000 0.000 NA   NA
 7551200 7551201 CLM_1396 CLM_1397     FALSE 0.503 37.000 0.000 NA   NA
 7551201 7551202 CLM_1397 CLM_1398     FALSE 0.077 234.000 0.000 NA   NA
 7551202 7551203 CLM_1398 CLM_1399     TRUE 0.970 15.000 0.400 NA   NA
 7551203 7551204 CLM_1399 CLM_1400     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 7551204 7551205 CLM_1400 CLM_1401     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 7551205 7551206 CLM_1401 CLM_1402     TRUE 0.985 20.000 1.000 NA   NA
 7551206 7551207 CLM_1402 CLM_1403     TRUE 0.988 12.000 1.000 NA   NA
 7551209 7551210 CLM_1405 CLM_1406     FALSE 0.002 663.000 0.000 NA   NA
 7551210 7551211 CLM_1406 CLM_1407     FALSE 0.273 123.000 0.000 NA   NA
 7551211 7551212 CLM_1407 CLM_1408     FALSE 0.002 647.000 0.000 NA   NA
 7551212 7551213 CLM_1408 CLM_1409     FALSE 0.040 283.000 0.000 NA   NA
 7551213 7551214 CLM_1409 CLM_1410     FALSE 0.024 319.000 0.000 NA   NA
 7551215 7551216 CLM_1411 CLM_1412     TRUE 0.819 40.000 0.014 1.000 N NA
 7551217 7551218 CLM_1414 CLM_1415 grdX grdE TRUE 0.846 91.000 0.400 NA   NA
 7551218 7551219 CLM_1415 CLM_1416 grdE grdB TRUE 0.946 33.000 0.222 0.003   NA
 7551219 7551220 CLM_1416 CLM_1418 grdB trxB FALSE 0.276 151.000 0.000 1.000   NA
 7551220 7551221 CLM_1418 CLM_1419 trxB   TRUE 0.976 34.000 0.226 1.000 Y NA
 7551221 7551222 CLM_1419 CLM_1420   grdA TRUE 0.667 86.000 0.065 1.000   NA
 7551222 7551223 CLM_1420 CLM_1421 grdA grdA TRUE 0.989 16.000 1.000 0.002   NA
 7551223 7551224 CLM_1421 CLM_1422 grdA grdC TRUE 0.727 95.000 0.054 0.003   NA
 7551224 7551225 CLM_1422 CLM_1423 grdC grdD TRUE 0.983 16.000 0.622 0.003   NA
 7551225 7551226 CLM_1423 CLM_1424 grdD   FALSE 0.013 427.000 0.000 1.000 N NA
 7551226 7551227 CLM_1424 CLM_1425     TRUE 0.630 66.000 0.005 0.055   NA
 7551227 7551228 CLM_1425 CLM_1426   mtnK FALSE 0.007 437.000 0.000 1.000   NA
 7551228 7551229 CLM_1426 CLM_1427 mtnK mtnA TRUE 0.731 140.000 0.104 1.000   NA
 7551229 7551230 CLM_1427 CLM_1428 mtnA   TRUE 0.640 24.000 0.000 NA   NA
 7551230 7551231 CLM_1428 CLM_1429     TRUE 0.644 17.000 0.000 NA   NA
 7551231 7551232 CLM_1429 CLM_1430     TRUE 0.920 174.000 0.400 1.000 Y NA
 7551232 7551233 CLM_1430 CLM_1431     FALSE 0.026 309.000 0.000 NA   NA
 7551235 7551236 CLM_1433 CLM_1434     TRUE 0.612 162.000 0.074 NA   NA
 7551236 7551237 CLM_1434 CLM_1435     TRUE 0.630 128.000 0.038 NA   NA
 7551237 7551238 CLM_1435 CLM_1436     TRUE 0.985 -3.000 0.135 NA   NA
 7551238 7551239 CLM_1436 CLM_1437     FALSE 0.003 535.000 0.000 NA   NA
 7551239 7551240 CLM_1437 CLM_1438     TRUE 0.805 48.000 0.080 NA   NA
 7551241 7551242 CLM_1439 CLM_1440     FALSE 0.012 381.000 0.000 NA   NA
 7551242 7551243 CLM_1440 CLM_1441     TRUE 0.631 25.000 0.000 NA   NA
 7551244 7551245 CLM_1442 CLM_1443     TRUE 0.973 28.000 0.667 NA   NA
 7551245 7551246 CLM_1443 CLM_1444     TRUE 0.831 57.000 0.200 NA   NA
 7551246 7551247 CLM_1444 CLM_1445     TRUE 0.994 14.000 0.500 0.001 Y NA
 7551247 7551248 CLM_1445 CLM_1446     TRUE 0.991 32.000 0.667 0.041 Y NA
 7551248 7551249 CLM_1446 CLM_1447     TRUE 0.783 116.000 0.100 1.000 N NA
 7551249 7551250 CLM_1447 CLM_1448   topB FALSE 0.022 388.000 0.000 1.000 N NA
 7551250 7551251 CLM_1448 CLM_1449 topB   FALSE 0.004 473.000 0.000 NA   NA
 7551251 7551252 CLM_1449 CLM_1450     FALSE 0.292 67.000 0.000 NA   NA
 7551254 7551255 CLM_1452 CLM_1453     FALSE 0.011 401.000 0.000 1.000   NA
 7551255 7551256 CLM_1453 CLM_1454     FALSE 0.034 305.000 0.000 1.000   NA
 7551256 7551257 CLM_1454 CLM_1455     FALSE 0.048 321.000 0.000 1.000 N NA
 7551257 7551258 CLM_1455 CLM_1456     TRUE 0.985 -7.000 0.067 1.000   NA
 7551258 7551259 CLM_1456 CLM_1457     TRUE 0.927 6.000 0.033 NA   NA
 7551259 7551260 CLM_1457 CLM_1458     FALSE 0.294 293.000 0.230 NA   NA
 7551260 7551261 CLM_1458 CLM_1459     FALSE 0.007 416.000 0.000 NA   NA
 7551261 7551262 CLM_1459 CLM_1460     FALSE 0.088 228.000 0.000 NA   NA
 7551262 7551263 CLM_1460 CLM_1461     FALSE 0.019 335.000 0.000 NA   NA
 7551263 7551264 CLM_1461 CLM_1462     FALSE 0.043 276.000 0.000 NA   NA
 7551264 7551265 CLM_1462 CLM_1463     TRUE 0.929 37.000 0.287 NA   NA
 7551265 7551266 CLM_1463 CLM_1464   copZ TRUE 0.887 123.000 0.024 0.001 Y NA
 7551266 7551267 CLM_1464 CLM_1465 copZ   FALSE 0.197 302.000 0.000 1.000 Y NA
 7551267 7551268 CLM_1465 CLM_1466     FALSE 0.069 296.000 0.000 1.000 N NA
 7551268 7551269 CLM_1466 CLM_1467     FALSE 0.019 340.000 0.000 NA   NA
 7551269 7551270 CLM_1467 CLM_1468     FALSE 0.545 164.000 0.040 NA   NA
 7551270 7551271 CLM_1468 CLM_1469     FALSE 0.046 271.000 0.000 NA   NA
 7551271 7551272 CLM_1469 CLM_1470     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 7551272 7551273 CLM_1470 CLM_1471     FALSE 0.107 213.000 0.000 NA   NA
 7551273 7551274 CLM_1471 CLM_1473     FALSE 0.016 350.000 0.000 NA   NA
 7551276 7551277 CLM_1475 CLM_1476     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 7551277 7551278 CLM_1476 CLM_1477     TRUE 0.912 -7.000 0.000 NA   NA
 7551278 7551279 CLM_1477 CLM_1478     FALSE 0.248 85.000 0.000 NA   NA
 7551279 7551280 CLM_1478 CLM_1479     FALSE 0.043 276.000 0.000 NA   NA
 7551280 7551281 CLM_1479 CLM_1480     FALSE 0.044 275.000 0.000 NA   NA
 7551281 7551282 CLM_1480 CLM_1481     FALSE 0.274 108.000 0.000 NA   NA
 7551282 7551283 CLM_1481 CLM_1482     FALSE 0.301 64.000 0.000 NA   NA
 7551283 7551284 CLM_1482 CLM_1483     FALSE 0.473 40.000 0.000 NA   NA
 7551284 7551285 CLM_1483 CLM_1484     FALSE 0.002 1144.000 0.000 NA   NA
 7551285 7551286 CLM_1484 CLM_1485     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7551286 7551287 CLM_1485 CLM_1486     FALSE 0.221 158.000 0.000 NA   NA
 7551287 7551288 CLM_1486 CLM_1487     FALSE 0.527 34.000 0.000 NA   NA
 7551288 7551289 CLM_1487 CLM_1488     FALSE 0.005 454.000 0.000 NA   NA
 7551289 7551290 CLM_1488 CLM_1489     TRUE 0.804 38.000 0.032 NA   NA
 7551292 7551293 CLM_1491 CLM_1492     FALSE 0.003 593.000 0.000 NA   NA
 7551293 7551294 CLM_1492 CLM_1493   trkA FALSE 0.002 782.000 0.000 NA   NA
 7551294 7551295 CLM_1493 CLM_1494 trkA trkH TRUE 0.997 -3.000 0.163 0.004 Y NA
 7551295 7551296 CLM_1494 CLM_1495 trkH   FALSE 0.017 407.000 0.000 1.000 N NA
 7551297 7551298 CLM_1496 CLM_1497     TRUE 0.945 15.000 0.158 NA   NA
 7551298 7551299 CLM_1497 CLM_1498     FALSE 0.006 457.000 0.000 1.000   NA
 7551300 7551301 CLM_1500 CLM_1501 rbr   FALSE 0.008 475.000 0.000 NA N NA
 7551303 7551304 CLM_1503 CLM_1504     FALSE 0.011 386.000 0.000 NA   NA
 7551304 7551305 CLM_1504 CLM_1505     FALSE 0.035 295.000 0.000 NA   NA
 7551305 7551306 CLM_1505 CLM_1506     TRUE 0.681 209.000 0.312 NA N NA
 7551306 7551307 CLM_1506 CLM_1507     TRUE 0.872 147.000 0.077 NA Y NA
 7551307 7551308 CLM_1507 CLM_1508   noxA FALSE 0.527 199.000 0.111 NA   NA
 7551310 7551311 CLM_1510 CLM_1511     FALSE 0.164 301.000 0.083 NA   NA
 7551313 7551314 CLM_1513 CLM_1514     FALSE 0.059 303.000 0.000 1.000 N NA
 7551314 7551315 CLM_1514 CLM_1515     TRUE 0.985 22.000 0.214 1.000 Y NA
 7551315 7551316 CLM_1515 CLM_1516     TRUE 0.993 3.000 0.255 1.000 Y NA
 7551317 7551318 CLM_1517 CLM_1518     TRUE 0.749 75.000 0.133 NA   NA
 7551319 7551320 CLM_1519 CLM_1520   murQ FALSE 0.085 280.000 0.000 0.003   NA
 7551320 7551321 CLM_1520 CLM_1521 murQ   TRUE 0.743 113.000 0.107 1.000   NA
 7551321 7551322 CLM_1521 CLM_1522     FALSE 0.545 191.000 0.089 1.000   NA
 7551322 7551323 CLM_1522 CLM_1523     FALSE 0.020 332.000 0.000 NA   NA
 7551323 7551324 CLM_1523 CLM_1524     FALSE 0.040 283.000 0.000 NA   NA
 7551324 7551325 CLM_1524 CLM_1525     FALSE 0.027 306.000 0.000 NA   NA
 7551325 7551326 CLM_1525 CLM_1526     TRUE 0.917 53.000 0.500 NA   NA
 7551326 7551327 CLM_1526 CLM_1527     TRUE 0.987 0.000 0.250 NA   NA
 7551329 7551330 CLM_1529 CLM_1530     FALSE 0.017 407.000 0.000 1.000 N NA
 7551330 7551331 CLM_1530 CLM_1531     TRUE 0.997 -3.000 0.235 0.028 Y NA
 7551331 7551332 CLM_1531 CLM_1532     TRUE 0.993 9.000 0.353 0.028 Y NA
 7551332 7551333 CLM_1532 CLM_1533     TRUE 0.905 99.000 0.118 1.000 Y NA
 7551333 7551334 CLM_1533 CLM_1534     TRUE 0.985 -6.000 0.059 0.029   NA
 7551334 7551335 CLM_1534 CLM_1535     FALSE 0.005 467.000 0.000 NA   NA
 7551336 7551337 CLM_1536 CLM_1537     TRUE 0.996 0.000 0.231 1.000 Y NA
 7551340 7551341 CLM_1540 CLM_1541     TRUE 0.684 135.000 0.025 1.000 N NA
 7551341 7551342 CLM_1541 CLM_1542     FALSE 0.003 913.000 0.000 NA N NA
 7551342 7551343 CLM_1542 CLM_1543     TRUE 0.999 -28.000 0.646 NA Y NA
 7551343 7551344 CLM_1543 CLM_1544     TRUE 0.934 140.000 0.270 1.000 Y NA
 7551344 7551345 CLM_1544 CLM_1545     FALSE 0.259 279.000 0.000 1.000 Y NA
 7551345 7551346 CLM_1545 CLM_1546     TRUE 0.992 -30.000 0.035 0.055   NA
 7551346 7551347 CLM_1546 CLM_1547     TRUE 0.646 127.000 0.035 1.000   NA
 7551347 7551348 CLM_1547 CLM_1548     FALSE 0.426 45.000 0.000 NA   NA
 7551348 7551349 CLM_1548 CLM_1549   rnz FALSE 0.275 132.000 0.000 NA   NA
 7551349 7551350 CLM_1549 CLM_1550 rnz   FALSE 0.021 346.000 0.000 1.000   NA
 7551350 7551351 CLM_1550 CLM_1551     FALSE 0.252 145.000 0.000 NA   NA
 7551351 7551352 CLM_1551 CLM_1552     FALSE 0.445 172.000 0.015 NA   NA
 7551352 7551353 CLM_1552 CLM_1553     TRUE 0.897 234.000 0.800 0.019 Y NA
 7551353 7551354 CLM_1553 CLM_1554     FALSE 0.203 403.000 0.600 1.000 N NA
 7551354 7551355 CLM_1554 CLM_1555     TRUE 0.974 106.000 1.000 NA Y NA
 7551355 7551356 CLM_1555 CLM_1556     TRUE 0.990 2.000 0.600 NA   NA
 7551356 7551357 CLM_1556 CLM_1557     TRUE 0.985 4.000 0.500 NA   NA
 7551358 7551359 CLM_1559 CLM_1560     FALSE 0.003 558.000 0.000 NA   NA
 7551359 7551360 CLM_1560 CLM_1561     TRUE 0.744 168.000 0.250 NA   NA
 7551361 7551362 CLM_1562 CLM_1563 pepD   FALSE 0.372 58.000 0.000 1.000   NA
 7551362 7551363 CLM_1563 CLM_1564   pdxK FALSE 0.060 266.000 0.000 1.000   NA
 7551365 7551366 CLM_1566 CLM_1567     TRUE 0.997 -13.000 0.500 1.000   NA
 7551366 7551367 CLM_1567 CLM_1568     TRUE 0.808 177.000 0.500 NA   NA
 7551367 7551368 CLM_1568 CLM_1569     FALSE 0.006 443.000 0.000 NA   NA
 7551368 7551369 CLM_1569 CLM_1570     TRUE 0.998 2.000 1.000 1.000 Y NA
 7551369 7551370 CLM_1570 CLM_1571     TRUE 0.907 74.000 0.500 1.000 N NA
 7551370 7551371 CLM_1571 CLM_1572     TRUE 0.993 -10.000 0.222 1.000   NA
 7551371 7551372 CLM_1572 CLM_1573     FALSE 0.286 69.000 0.000 NA   NA
 7551372 7551373 CLM_1573 CLM_1575     FALSE 0.017 347.000 0.000 NA   NA
 7551373 7551374 CLM_1575 CLM_1576     FALSE 0.011 384.000 0.000 NA   NA
 7551374 7551375 CLM_1576 CLM_1577     TRUE 0.716 197.000 0.024 1.000 Y NA
 7551375 7551376 CLM_1577 CLM_1578     TRUE 0.996 13.000 0.833 0.028 Y NA
 7551376 7551377 CLM_1578 CLM_1579     TRUE 0.989 19.000 0.400 1.000 Y NA
 7551377 7551378 CLM_1579 CLM_1580     FALSE 0.008 426.000 0.000 1.000   NA
 7551382 7551383 CLM_1584 CLM_1585     FALSE 0.011 384.000 0.000 NA   NA
 7551383 7551384 CLM_1585 CLM_1586     TRUE 0.818 173.000 0.500 NA   NA
 7551386 7551387 CLM_1588 CLM_1589     TRUE 0.997 2.000 0.643 0.028 Y NA
 7551387 7551388 CLM_1589 CLM_1590     TRUE 0.638 131.000 0.041 NA   NA
 7551388 7551389 CLM_1590 CLM_1591     FALSE 0.258 95.000 0.000 NA   NA
 7551389 7551390 CLM_1591 CLM_1592     FALSE 0.016 351.000 0.000 NA   NA
 7551390 7551391 CLM_1592 CLM_1593     FALSE 0.123 203.000 0.000 NA   NA
 7551391 7551392 CLM_1593 CLM_1594     TRUE 0.807 88.000 0.250 1.000   NA
 7551392 7551393 CLM_1594 CLM_1595     FALSE 0.384 56.000 0.000 1.000   NA
 7551393 7551394 CLM_1595 CLM_1596     FALSE 0.005 661.000 0.000 1.000 N NA
 7551394 7551395 CLM_1596 CLM_1597   spoVB TRUE 0.915 32.000 0.137 1.000   NA
 7551399 7551400 CLM_1601 CLM_1602     FALSE 0.029 361.000 0.000 1.000 N NA
 7551401 7551402 CLM_1604 CLM_1605   npr FALSE 0.195 169.000 0.000 NA   NA
 7551402 7551403 CLM_1605 CLM_1606 npr npr TRUE 0.979 137.000 1.000 0.004 Y NA
 7551403 7551404 CLM_1606 CLM_1607 npr npr TRUE 0.795 117.000 0.000 0.004 Y NA
 7551404 7551405 CLM_1607 CLM_1608 npr npr TRUE 0.796 120.000 0.000 0.004 Y NA
 7551405 7551406 CLM_1608 CLM_1609 npr   TRUE 0.796 121.000 0.000 0.004 Y NA
 7551406 7551407 CLM_1609 CLM_1610   nadC FALSE 0.005 603.000 0.000 1.000 N NA
 7551407 7551408 CLM_1610 CLM_1611 nadC nadB TRUE 0.997 -19.000 0.046 1.000 Y NA
 7551408 7551409 CLM_1611 CLM_1612 nadB nadA TRUE 0.985 3.000 0.042 1.000 Y NA
 7551411 7551412 CLM_1614 CLM_1615     TRUE 0.947 -13.000 0.000 1.000   NA
 7551415 7551416 CLM_1618 CLM_1619     TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 7551416 7551417 CLM_1619 CLM_1620     TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 7551417 7551418 CLM_1620 CLM_1621     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 7551418 7551419 CLM_1621 CLM_1622     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7551419 7551420 CLM_1622 CLM_1623     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7551420 7551421 CLM_1623 CLM_1624     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7551421 7551422 CLM_1624 CLM_1625     TRUE 0.912 -7.000 0.000 NA   NA
 7551422 7551423 CLM_1625 CLM_1626     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7551423 7551424 CLM_1626 CLM_1627     FALSE 0.397 49.000 0.000 NA   NA
 7551424 7551425 CLM_1627 CLM_1628     TRUE 0.947 -22.000 0.000 NA   NA
 7551425 7551426 CLM_1628 CLM_1629     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7551426 7551427 CLM_1629 CLM_1631     FALSE 0.274 133.000 0.000 NA   NA
 7551427 7551428 CLM_1631 CLM_1632     TRUE 0.969 0.000 0.051 NA   NA
 7551428 7551429 CLM_1632 CLM_1633     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7551429 7551430 CLM_1633 CLM_1634     TRUE 0.713 11.000 0.000 NA   NA
 7551430 7551431 CLM_1634 CLM_1635     FALSE 0.270 341.000 0.500 NA   NA
 7551431 7551432 CLM_1635 CLM_1636     TRUE 0.685 13.000 0.000 NA   NA
 7551432 7551433 CLM_1636 CLM_1637     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7551433 7551434 CLM_1637 CLM_1638     TRUE 0.700 12.000 0.000 NA   NA
 7551434 7551435 CLM_1638 CLM_1639     FALSE 0.403 48.000 0.000 NA   NA
 7551435 7551436 CLM_1639 CLM_1640     FALSE 0.437 44.000 0.000 NA   NA
 7551436 7551437 CLM_1640 CLM_1641     TRUE 0.663 15.000 0.000 NA   NA
 7551437 7551438 CLM_1641 CLM_1642     FALSE 0.312 61.000 0.000 NA   NA
 7551438 7551439 CLM_1642 CLM_1643     FALSE 0.280 72.000 0.000 NA   NA
 7551439 7551440 CLM_1643 CLM_1644     FALSE 0.483 39.000 0.000 NA   NA
 7551440 7551441 CLM_1644 CLM_1645     FALSE 0.275 129.000 0.000 NA   NA
 7551441 7551442 CLM_1645 CLM_1646     FALSE 0.274 107.000 0.000 NA   NA
 7551442 7551443 CLM_1646 CLM_1647     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 7551443 7551444 CLM_1647 CLM_1648     TRUE 0.998 -13.000 1.000 NA   NA
 7551444 7551445 CLM_1648 CLM_1649     TRUE 0.988 12.000 1.000 NA   NA
 7551445 7551446 CLM_1649 CLM_1650     TRUE 0.928 -10.000 0.000 NA   NA
 7551446 7551447 CLM_1650 CLM_1651     FALSE 0.055 260.000 0.000 NA   NA
 7551447 7551448 CLM_1651 CLM_1652     TRUE 0.987 1.000 0.333 NA   NA
 7551448 7551449 CLM_1652 CLM_1653     FALSE 0.032 298.000 0.000 NA   NA
 7551449 7551450 CLM_1653 CLM_1654     FALSE 0.345 55.000 0.000 NA   NA
 7551450 7551451 CLM_1654 CLM_1655     FALSE 0.214 161.000 0.000 NA   NA
 7551451 7551452 CLM_1655 CLM_1656     TRUE 0.994 0.000 0.750 NA   NA
 7551452 7551453 CLM_1656 CLM_1657     TRUE 0.959 12.000 0.200 NA   NA
 7551453 7551454 CLM_1657 CLM_1658     TRUE 0.993 -13.000 0.200 NA   NA
 7551454 7551455 CLM_1658 CLM_1659     FALSE 0.483 39.000 0.000 NA   NA
 7551455 7551456 CLM_1659 CLM_1660     FALSE 0.426 45.000 0.000 NA   NA
 7551456 7551457 CLM_1660 CLM_1661     TRUE 0.646 19.000 0.000 NA   NA
 7551457 7551458 CLM_1661 CLM_1662     TRUE 0.722 10.000 0.000 NA   NA
 7551458 7551459 CLM_1662 CLM_1663     TRUE 0.786 3.000 0.000 NA   NA
 7551459 7551460 CLM_1663 CLM_1664     FALSE 0.312 61.000 0.000 NA   NA
 7551460 7551461 CLM_1664 CLM_1665     FALSE 0.123 203.000 0.000 NA   NA
 7551461 7551462 CLM_1665 CLM_1666     TRUE 0.979 5.000 0.375 NA   NA
 7551462 7551463 CLM_1666 CLM_1667     TRUE 0.713 11.000 0.000 NA   NA
 7551463 7551464 CLM_1667 CLM_1668     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7551464 7551465 CLM_1668 CLM_1669     FALSE 0.286 69.000 0.000 NA   NA
 7551465 7551466 CLM_1669 CLM_1670     FALSE 0.511 36.000 0.000 NA   NA
 7551466 7551467 CLM_1670 CLM_1671     FALSE 0.409 47.000 0.000 NA   NA
 7551467 7551468 CLM_1671 CLM_1672     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7551468 7551469 CLM_1672 CLM_1673     TRUE 0.960 11.000 0.188 NA   NA
 7551469 7551470 CLM_1673 CLM_1674     TRUE 0.957 12.000 0.188 NA   NA
 7551470 7551471 CLM_1674 CLM_1675     TRUE 0.986 12.000 0.833 NA   NA
 7551471 7551472 CLM_1675 CLM_1676     TRUE 0.981 12.000 0.600 NA   NA
 7551472 7551473 CLM_1676 CLM_1677     TRUE 0.713 11.000 0.000 NA   NA
 7551473 7551474 CLM_1677 CLM_1678     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7551474 7551475 CLM_1678 CLM_1679     TRUE 0.651 16.000 0.000 NA   NA
 7551475 7551476 CLM_1679 CLM_1680     FALSE 0.249 88.000 0.000 NA   NA
 7551476 7551477 CLM_1680 CLM_1681     TRUE 0.991 2.000 0.667 NA   NA
 7551477 7551478 CLM_1681 CLM_1682     FALSE 0.447 43.000 0.000 NA   NA
 7551478 7551479 CLM_1682 CLM_1683     FALSE 0.022 324.000 0.000 NA   NA
 7551479 7551480 CLM_1683 CLM_1684     TRUE 0.936 -13.000 0.000 NA   NA
 7551480 7551481 CLM_1684 CLM_1685     TRUE 0.713 11.000 0.000 NA   NA
 7551481 7551482 CLM_1685 CLM_1686     FALSE 0.252 145.000 0.000 NA   NA
 7551482 7551483 CLM_1686 CLM_1687     FALSE 0.224 157.000 0.000 NA   NA
 7551484 7551485 CLM_1688 CLM_1689 hlyIII ychF TRUE 0.582 121.000 0.002 0.044   NA
 7551486 7551487 CLM_1690 CLM_1691 mraZ mraW TRUE 0.888 80.000 0.635 NA   NA
 7551487 7551488 CLM_1691 CLM_1692 mraW   FALSE 0.529 82.000 0.008 1.000   NA
 7551488 7551489 CLM_1692 CLM_1693     TRUE 0.932 16.000 0.096 1.000   NA
 7551489 7551490 CLM_1693 CLM_1694   murE TRUE 0.785 230.000 0.265 1.000 Y NA
 7551490 7551491 CLM_1694 CLM_1695 murE murF TRUE 0.989 26.000 0.328 0.003 Y NA
 7551491 7551492 CLM_1695 CLM_1696 murF mraY TRUE 0.955 36.000 0.024 0.004 Y NA
 7551492 7551493 CLM_1696 CLM_1697 mraY   TRUE 0.702 79.000 0.014 0.004 N NA
 7551493 7551494 CLM_1697 CLM_1698     FALSE 0.098 323.000 0.015 NA N NA
 7551494 7551495 CLM_1698 CLM_1699     TRUE 0.891 11.000 0.014 NA   NA
 7551495 7551496 CLM_1699 CLM_1700   sbp TRUE 0.846 35.000 0.053 NA   NA
 7551496 7551497 CLM_1700 CLM_1701 sbp   TRUE 0.964 1.000 0.053 NA   NA
 7551497 7551498 CLM_1701 CLM_1702     FALSE 0.546 93.000 0.017 NA   NA
 7551498 7551499 CLM_1702 CLM_1703     TRUE 0.887 21.000 0.032 NA   NA
 7551499 7551500 CLM_1703 CLM_1704     TRUE 0.954 17.000 0.246 NA   NA
 7551500 7551501 CLM_1704 CLM_1705     TRUE 0.977 1.000 0.118 1.000   NA
 7551501 7551502 CLM_1705 CLM_1706   divIVA TRUE 0.976 16.000 0.579 NA   NA
 7551502 7551503 CLM_1706 CLM_1707 divIVA aroB FALSE 0.032 408.000 0.006 NA N NA
 7551503 7551504 CLM_1707 CLM_1708 aroB mtnN TRUE 0.957 1.000 0.003 1.000 N NA
 7551504 7551505 CLM_1708 CLM_1709 mtnN aroF TRUE 0.723 121.000 0.046 1.000 N NA
 7551505 7551506 CLM_1709 CLM_1710 aroF aroA TRUE 0.760 167.000 0.003 1.000 Y NA
 7551506 7551507 CLM_1710 CLM_1711 aroA   FALSE 0.189 217.000 0.000 1.000 N NA
 7551507 7551508 CLM_1711 CLM_1712   lspA FALSE 0.420 224.000 0.050 1.000 N NA
 7551508 7551509 CLM_1712 CLM_1713 lspA   TRUE 0.967 4.000 0.082 1.000 N NA
 7551509 7551510 CLM_1713 CLM_1715   pyrR FALSE 0.027 496.000 0.048 1.000 N NA
 7551510 7551511 CLM_1715 CLM_1716 pyrR uraA TRUE 0.957 44.000 0.140 1.000 Y NA
 7551513 7551514 CLM_1718 CLM_1719 xth   FALSE 0.447 224.000 0.000 1.000 Y NA
 7551514 7551515 CLM_1719 CLM_1720     FALSE 0.102 230.000 0.000 1.000   NA
 7551515 7551516 CLM_1720 CLM_1721   modA FALSE 0.442 178.000 0.015 1.000   NA
 7551516 7551517 CLM_1721 CLM_1722 modA modB TRUE 0.995 10.000 0.430 0.001 Y NA
 7551517 7551518 CLM_1722 CLM_1723 modB   FALSE 0.501 327.000 0.342 1.000 Y NA
 7551518 7551519 CLM_1723 CLM_1724     TRUE 0.642 54.000 0.013 NA   NA
 7551519 7551520 CLM_1724 CLM_1725     FALSE 0.017 348.000 0.000 NA   NA
 7551520 7551521 CLM_1725 CLM_1726     FALSE 0.031 300.000 0.000 NA   NA
 7551521 7551522 CLM_1726 CLM_1727     FALSE 0.045 273.000 0.000 NA   NA
 7551522 7551523 CLM_1727 CLM_1728     TRUE 0.848 88.000 0.308 NA N NA
 7551523 7551524 CLM_1728 CLM_1729     FALSE 0.258 142.000 0.000 NA   NA
 7551524 7551525 CLM_1729 CLM_1730     TRUE 0.738 90.000 0.147 NA   NA
 7551525 7551526 CLM_1730 CLM_1731     TRUE 0.954 23.000 0.235 NA   NA
 7551526 7551527 CLM_1731 CLM_1732   mtbC TRUE 0.930 26.000 0.118 1.000   NA
 7551527 7551528 CLM_1732 CLM_1733 mtbC   TRUE 0.729 85.000 0.118 1.000   NA
 7551528 7551529 CLM_1733 CLM_1734     FALSE 0.017 947.000 0.000 0.002 Y NA
 7551529 7551530 CLM_1734 CLM_1735     TRUE 0.927 23.000 0.044 1.000 N NA
 7551530 7551531 CLM_1735 CLM_1736     TRUE 0.993 2.000 0.178 1.000 Y NA
 7551531 7551532 CLM_1736 CLM_1737     TRUE 0.947 144.000 0.444 NA Y NA
 7551534 7551535 CLM_1739 CLM_1740   asnA FALSE 0.042 329.000 0.000 1.000 N NA
 7551537 7551538 CLM_1742 CLM_1743     TRUE 0.961 27.000 0.024 1.000 Y NA
 7551538 7551539 CLM_1743 CLM_1744     FALSE 0.030 317.000 0.000 1.000   NA
 7551541 7551542 CLM_1746 CLM_1747     TRUE 0.994 1.000 0.636 1.000 N NA
 7551542 7551543 CLM_1747 CLM_1748     TRUE 0.960 12.000 0.182 1.000   NA
 7551543 7551544 CLM_1748 CLM_1749     FALSE 0.014 362.000 0.000 NA   NA
 7551544 7551545 CLM_1749 CLM_1750     TRUE 0.910 13.000 0.041 NA   NA
 7551545 7551546 CLM_1750 CLM_1751     TRUE 0.999 -7.000 0.611 0.027 Y NA
 7551546 7551547 CLM_1751 CLM_1752     TRUE 0.980 36.000 0.278 0.027 Y NA
 7551547 7551548 CLM_1752 CLM_1753     TRUE 0.958 46.000 0.121 0.027 Y NA
 7551554 7551555 CLM_1759 CLM_1760     FALSE 0.274 108.000 0.000 NA   NA
 7551555 7551556 CLM_1760 CLM_1761     FALSE 0.013 368.000 0.000 NA   NA
 7551556 7551557 CLM_1761 CLM_1762     FALSE 0.219 206.000 0.000 1.000 N NA
 7551557 7551558 CLM_1762 CLM_1763     TRUE 0.929 14.000 0.087 NA   NA
 7551560 7551561 CLM_1765 CLM_1766   ogt TRUE 0.821 29.000 0.014 NA   NA
 7551561 7551562 CLM_1766 CLM_1767 ogt   TRUE 0.849 27.000 0.014 1.000   NA
 7551562 7551563 CLM_1767 CLM_1768     TRUE 0.758 165.000 0.263 NA   NA
 7551563 7551564 CLM_1768 CLM_1769     TRUE 0.940 25.000 0.168 NA   NA
 7551564 7551565 CLM_1769 CLM_1770     FALSE 0.013 390.000 0.000 1.000   NA
 7551567 7551568 CLM_1772 CLM_1773     FALSE 0.518 57.000 0.000 0.003   NA
 7551568 7551569 CLM_1773 CLM_1774     FALSE 0.012 486.000 0.000 0.087 N NA
 7551569 7551570 CLM_1774 CLM_1775     FALSE 0.013 438.000 0.000 1.000 N NA
 7551570 7551571 CLM_1775 CLM_1776     FALSE 0.263 98.000 0.000 NA   NA
 7551571 7551572 CLM_1776 CLM_1777     FALSE 0.125 381.000 0.250 NA   NA
 7551572 7551573 CLM_1777 CLM_1779     FALSE 0.271 117.000 0.000 NA   NA
 7551576 7551577 CLM_1784 CLM_1785     TRUE 0.673 14.000 0.000 NA   NA
 7551578 7551579 CLM_1787 CLM_1788     FALSE 0.271 120.000 0.000 NA   NA
 7551580 7551581 CLM_1790 CLM_1791     TRUE 0.708 58.000 0.051 NA   NA
 7551582 7551583 CLM_1793 CLM_1794   hgdC TRUE 0.925 117.000 0.722 NA N NA
 7551583 7551584 CLM_1794 CLM_1795 hgdC queD TRUE 0.950 18.000 0.135 NA N NA
 7551584 7551585 CLM_1795 CLM_1796 queD   TRUE 0.990 2.000 0.405 1.000 N NA
 7551585 7551586 CLM_1796 CLM_1797   folE TRUE 0.987 4.000 0.429 1.000 N NA
 7551586 7551587 CLM_1797 CLM_1798 folE   FALSE 0.418 184.000 0.015 1.000   NA
 7551587 7551588 CLM_1798 CLM_1799     FALSE 0.036 294.000 0.000 NA   NA
 7551588 7551589 CLM_1799 CLM_1800     FALSE 0.248 147.000 0.000 NA   NA
 7551589 7551590 CLM_1800 CLM_1801     FALSE 0.008 412.000 0.000 NA   NA
 7551590 7551591 CLM_1801 CLM_1802     FALSE 0.023 322.000 0.000 NA   NA
 7551591 7551592 CLM_1802 CLM_1803     TRUE 0.895 22.000 0.040 NA   NA
 7551592 7551593 CLM_1803 CLM_1804   deoC FALSE 0.243 292.000 0.077 1.000 N NA
 7551593 7551594 CLM_1804 CLM_1805 deoC rbsK TRUE 0.689 129.000 0.026 1.000 N NA
 7551594 7551595 CLM_1805 CLM_1806 rbsK hisZ FALSE 0.011 456.000 0.000 1.000 N NA
 7551595 7551596 CLM_1806 CLM_1807 hisZ hisG TRUE 0.988 25.000 0.239 0.004 Y NA
 7551596 7551597 CLM_1807 CLM_1808 hisG hisD TRUE 0.944 78.000 0.254 0.004 Y NA
 7551597 7551598 CLM_1808 CLM_1809 hisD hisB TRUE 0.905 150.000 0.096 0.004 Y NA
 7551598 7551599 CLM_1809 CLM_1810 hisB hisH TRUE 0.928 128.000 0.125 0.004 Y NA
 7551599 7551600 CLM_1810 CLM_1811 hisH hisA TRUE 0.996 -3.000 0.124 0.004 Y NA
 7551600 7551601 CLM_1811 CLM_1812 hisA hisC TRUE 0.993 -3.000 0.004 0.004 Y NA
 7551601 7551602 CLM_1812 CLM_1813 hisC hisF TRUE 0.717 197.000 0.002 0.004 Y NA
 7551602 7551603 CLM_1813 CLM_1814 hisF hisI TRUE 0.953 154.000 0.430 0.004 Y NA
 7551603 7551604 CLM_1814 CLM_1815 hisI hisE TRUE 0.933 128.000 0.152 0.004 Y NA
 7551604 7551605 CLM_1815 CLM_1816 hisE   FALSE 0.510 136.000 0.005 NA   NA
 7551605 7551606 CLM_1816 CLM_1817     TRUE 0.958 14.000 0.231 NA   NA
 7551606 7551607 CLM_1817 CLM_1818     TRUE 0.957 18.000 0.267 NA   NA
 7551609 7551610 CLM_1820 CLM_1821     TRUE 0.680 81.000 0.070 1.000   NA
 7551610 7551611 CLM_1821 CLM_1822     TRUE 0.592 153.000 0.047 NA   NA
 7551611 7551612 CLM_1822 CLM_1823     FALSE 0.075 235.000 0.000 NA   NA
 7551612 7551613 CLM_1823 CLM_1824     TRUE 0.945 3.000 0.041 NA   NA
 7551613 7551614 CLM_1824 CLM_1825     TRUE 0.986 3.000 0.490 NA   NA
 7551614 7551615 CLM_1825 CLM_1826     TRUE 0.844 117.000 0.352 NA   NA
 7551615 7551616 CLM_1826 CLM_1827     TRUE 0.999 -9.000 0.741 0.019 Y NA
 7551616 7551617 CLM_1827 CLM_1828   arcA FALSE 0.006 564.000 0.000 1.000 N NA
 7551617 7551618 CLM_1828 CLM_1829 arcA arcD TRUE 0.854 103.000 0.022 1.000 Y NA
 7551620 7551621 CLM_1831 CLM_1832     FALSE 0.272 136.000 0.000 NA   NA
 7551621 7551622 CLM_1832 CLM_1833     FALSE 0.296 93.000 0.000 1.000   NA
 7551622 7551623 CLM_1833 CLM_1834     FALSE 0.003 554.000 0.000 NA   NA
 7551623 7551624 CLM_1834 CLM_1836     TRUE 0.730 9.000 0.000 NA   NA
 7551626 7551627 CLM_1838 CLM_1839     FALSE 0.512 192.000 0.067 1.000   NA
 7551627 7551628 CLM_1839 CLM_1840     FALSE 0.119 218.000 0.000 1.000   NA
 7551628 7551629 CLM_1840 CLM_1841     FALSE 0.015 381.000 0.000 1.000   NA
 7551629 7551630 CLM_1841 CLM_1842     TRUE 0.824 149.000 0.222 1.000 N NA
 7551630 7551631 CLM_1842 CLM_1843     TRUE 0.998 2.000 0.900 0.007 Y NA
 7551631 7551632 CLM_1843 CLM_1844     FALSE 0.021 392.000 0.000 1.000 N NA
 7551632 7551633 CLM_1844 CLM_1845     FALSE 0.197 302.000 0.000 1.000 Y NA
 7551633 7551634 CLM_1845 CLM_1846     FALSE 0.356 247.000 0.000 1.000 Y NA
 7551634 7551635 CLM_1846 CLM_1847     TRUE 0.962 42.000 0.167 1.000 Y NA
 7551635 7551636 CLM_1847 CLM_1848     TRUE 0.987 4.000 0.610 NA   NA
 7551636 7551637 CLM_1848 CLM_1849     FALSE 0.090 225.000 0.000 NA   NA
 7551639 7551640 CLM_1851 CLM_1852     TRUE 0.864 158.000 0.600 NA   NA
 7551641 7551642 CLM_1853 CLM_1854     TRUE 0.975 38.000 0.261 1.000 Y NA
 7551644 7551645 CLM_1856 CLM_1857     FALSE 0.047 270.000 0.000 NA   NA
 7551645 7551646 CLM_1857 CLM_1858     TRUE 0.964 9.000 0.171 1.000   NA
 7551647 7551648 CLM_1859 CLM_1860     TRUE 0.859 190.000 1.000 NA   NA
 7551650 7551651 CLM_1863 CLM_1864 metF   TRUE 0.680 155.000 0.045 0.002   NA
 7551651 7551652 CLM_1864 CLM_1865     TRUE 0.991 -10.000 0.075 0.001   NA
 7551654 7551655 CLM_1867 CLM_1868     TRUE 0.996 -7.000 0.667 NA   NA
 7551655 7551656 CLM_1868 CLM_1869   acoR FALSE 0.016 350.000 0.000 NA   NA
 7551656 7551657 CLM_1869 CLM_1870 acoR   TRUE 0.696 169.000 0.182 NA   NA
 7551657 7551658 CLM_1870 CLM_1871   acoA TRUE 0.912 21.000 0.065 NA   NA
 7551658 7551659 CLM_1871 CLM_1872 acoA acoB TRUE 0.990 3.000 0.076 0.001 Y NA
 7551659 7551660 CLM_1872 CLM_1873 acoB   TRUE 0.865 53.000 0.162 0.050   NA
 7551660 7551661 CLM_1873 CLM_1874   acoC TRUE 0.894 36.000 0.081 0.050   NA
 7551661 7551662 CLM_1874 CLM_1875 acoC acoL TRUE 0.984 13.000 0.148 1.000 Y NA
 7551662 7551663 CLM_1875 CLM_1876 acoL   TRUE 0.935 25.000 0.074 1.000 N NA
 7551663 7551664 CLM_1876 CLM_1877     FALSE 0.022 389.000 0.000 1.000 N NA
 7551664 7551665 CLM_1877 CLM_1878     TRUE 0.998 -7.000 0.793 0.086 N NA
 7551665 7551666 CLM_1878 CLM_1879   thrC FALSE 0.072 294.000 0.000 1.000 N NA
 7551666 7551667 CLM_1879 CLM_1880 thrC thrB TRUE 0.990 10.000 0.233 1.000 Y NA
 7551667 7551668 CLM_1880 CLM_1881 thrB   TRUE 0.838 127.000 0.008 1.000 Y NA
 7551668 7551669 CLM_1881 CLM_1882   hom TRUE 0.649 222.000 0.010 0.002 Y NA
 7551669 7551670 CLM_1882 CLM_1883 hom   FALSE 0.004 686.000 0.000 1.000 N NA
 7551670 7551671 CLM_1883 CLM_1884     FALSE 0.008 509.000 0.000 1.000 N NA
 7551671 7551672 CLM_1884 CLM_1885     FALSE 0.144 329.000 0.000 1.000 Y NA
 7551672 7551673 CLM_1885 CLM_1886   gltA TRUE 0.996 0.000 0.667 0.038 N NA
 7551673 7551674 CLM_1886 CLM_1887 gltA   FALSE 0.165 229.000 0.000 1.000 N NA
 7551674 7551675 CLM_1887 CLM_1888     TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 7551675 7551676 CLM_1888 CLM_1889     FALSE 0.007 423.000 0.000 NA   NA
 7551676 7551677 CLM_1889 CLM_1890     FALSE 0.274 109.000 0.000 NA   NA
 7551677 7551678 CLM_1890 CLM_1891     FALSE 0.170 180.000 0.000 NA   NA
 7551678 7551679 CLM_1891 CLM_1892     FALSE 0.015 359.000 0.000 NA   NA
 7551679 7551680 CLM_1892 CLM_1893     FALSE 0.038 288.000 0.000 NA   NA
 7551680 7551681 CLM_1893 CLM_1894     FALSE 0.157 186.000 0.000 NA   NA
 7551681 7551682 CLM_1894 CLM_1895     FALSE 0.005 468.000 0.000 NA   NA
 7551682 7551683 CLM_1895 CLM_1896     FALSE 0.226 156.000 0.000 NA   NA
 7551683 7551684 CLM_1896 CLM_1897     FALSE 0.545 38.000 0.000 1.000   NA
 7551684 7551685 CLM_1897 CLM_1898     FALSE 0.004 501.000 0.000 NA   NA
 7551685 7551686 CLM_1898 CLM_1899     TRUE 0.947 33.000 0.379 NA   NA
 7551686 7551687 CLM_1899 CLM_1900   alr FALSE 0.006 438.000 0.000 NA   NA
 7551687 7551688 CLM_1900 CLM_1901 alr   FALSE 0.010 459.000 0.000 1.000 N NA
 7551688 7551689 CLM_1901 CLM_1902     TRUE 0.612 88.000 0.016 0.086   NA
 7551689 7551690 CLM_1902 CLM_1903     FALSE 0.069 240.000 0.000 NA   NA
 7551692 7551693 CLM_1905 CLM_1906     FALSE 0.002 913.000 0.000 NA   NA
 7551697 7551698 CLM_1910 CLM_1911     FALSE 0.084 230.000 0.000 NA   NA
 7551698 7551699 CLM_1911 CLM_1912     TRUE 0.687 137.000 0.027 1.000 N NA
 7551699 7551700 CLM_1912 CLM_1913     TRUE 0.995 14.000 0.667 0.026 Y NA
 7551700 7551701 CLM_1913 CLM_1914     TRUE 0.998 4.000 1.000 0.026 Y NA
 7551701 7551702 CLM_1914 CLM_1915     TRUE 0.943 31.000 0.265 1.000   NA
 7551704 7551705 CLM_1917 CLM_1918     FALSE 0.046 271.000 0.000 NA   NA
 7551707 7551708 CLM_1920 CLM_1921     TRUE 0.603 151.000 0.011 1.000 N NA
 7551708 7551709 CLM_1921 CLM_1922     TRUE 0.973 -7.000 0.016 NA   NA
 7551709 7551710 CLM_1922 CLM_1923   pfkB TRUE 0.978 26.000 0.721 NA   NA
 7551712 7551713 CLM_1925 CLM_1926     TRUE 0.882 152.000 0.667 NA   NA
 7551715 7551716 CLM_1928 CLM_1929     FALSE 0.560 31.000 0.000 NA   NA
 7551717 7551718 CLM_1930 CLM_1931 safA   FALSE 0.009 401.000 0.000 NA   NA
 7551723 7551724 CLM_1936 CLM_1937     FALSE 0.028 323.000 0.000 1.000   NA
 7551724 7551725 CLM_1937 CLM_1938   deaD FALSE 0.399 180.000 0.006 1.000   NA
 7551725 7551726 CLM_1938 CLM_1939 deaD   FALSE 0.498 165.000 0.025 NA   NA
 7551726 7551727 CLM_1939 CLM_1940     FALSE 0.010 395.000 0.000 NA   NA
 7551727 7551728 CLM_1940 CLM_1941     FALSE 0.010 404.000 0.000 1.000   NA
 7551730 7551731 CLM_1943 CLM_1944   cheX TRUE 0.993 0.000 0.100 NA Y NA
 7551733 7551734 CLM_1946 CLM_1947     FALSE 0.498 62.000 0.000 0.002   NA
 7551739 7551740 CLM_1953 CLM_1954   hfq TRUE 0.690 101.000 0.064 1.000   NA
 7551740 7551741 CLM_1954 CLM_1955 hfq miaA TRUE 0.775 86.000 0.192 1.000   NA
 7551741 7551742 CLM_1955 CLM_1956 miaA   TRUE 0.949 15.000 0.097 1.000 N NA
 7551742 7551743 CLM_1956 CLM_1957   mutS TRUE 0.943 134.000 0.220 0.002 Y NA
 7551743 7551744 CLM_1957 CLM_1958 mutS miaB TRUE 0.701 80.000 0.041 1.000 N NA
 7551745 7551746 CLM_1959 CLM_1960     TRUE 0.677 85.000 0.087 NA   NA
 7551746 7551747 CLM_1960 CLM_1961   aspB TRUE 0.612 55.000 0.008 NA   NA
 7551748 7551749 CLM_1962 CLM_1963     TRUE 0.879 82.000 0.571 NA   NA
 7551749 7551750 CLM_1963 CLM_1964     FALSE 0.063 248.000 0.000 NA   NA
 7551750 7551751 CLM_1964 CLM_1965   cmk TRUE 0.753 64.000 0.047 1.000 N NA
 7551751 7551752 CLM_1965 CLM_1966 cmk aroH TRUE 0.667 76.000 0.020 1.000 N NA
 7551752 7551753 CLM_1966 CLM_1967 aroH   TRUE 0.972 -3.000 0.024 1.000   NA
 7551753 7551754 CLM_1967 CLM_1968   gluD FALSE 0.043 294.000 0.000 1.000   NA
 7551754 7551755 CLM_1968 CLM_1969 gluD   FALSE 0.405 234.000 0.068 1.000 N NA
 7551755 7551756 CLM_1969 CLM_1970   rluB FALSE 0.056 382.000 0.013 1.000 N NA
 7551756 7551757 CLM_1970 CLM_1971 rluB   FALSE 0.006 433.000 0.000 NA   NA
 7551757 7551758 CLM_1971 CLM_1972     FALSE 0.263 98.000 0.000 NA   NA
 7551758 7551759 CLM_1972 CLM_1973     FALSE 0.035 295.000 0.000 NA   NA
 7551760 7551761 CLM_1974 CLM_1975     FALSE 0.013 389.000 0.000 1.000   NA
 7551762 7551763 CLM_1976 CLM_1977     TRUE 0.954 2.000 0.034 1.000   NA
 7551763 7551764 CLM_1977 CLM_1978     TRUE 0.746 115.000 0.111 1.000   NA
 7551764 7551765 CLM_1978 CLM_1979     TRUE 0.734 131.000 0.111 NA   NA
 7551767 7551768 CLM_1981 CLM_1982 pcaC   FALSE 0.310 138.000 0.000 1.000   NA
 7551768 7551769 CLM_1982 CLM_1983     FALSE 0.160 185.000 0.000 NA   NA
 7551769 7551770 CLM_1983 CLM_1984     FALSE 0.077 234.000 0.000 NA   NA
 7551770 7551771 CLM_1984 CLM_1985     TRUE 0.984 -19.000 0.019 NA   NA
 7551772 7551773 CLM_1986 CLM_1987     TRUE 0.975 3.000 0.200 1.000   NA
 7551773 7551774 CLM_1987 CLM_1988     TRUE 0.985 -3.000 0.111 1.000   NA
 7551774 7551775 CLM_1988 CLM_1989     TRUE 0.682 136.000 0.056 1.000   NA
 7551776 7551777 CLM_1990 CLM_1991 hypE hypD TRUE 0.920 168.000 0.353 1.000 Y NA
 7551777 7551778 CLM_1991 CLM_1992 hypD hypC TRUE 0.998 -7.000 0.363 NA Y NA
 7551778 7551779 CLM_1992 CLM_1993 hypC hypF TRUE 0.998 -37.000 0.181 NA Y NA
 7551779 7551780 CLM_1993 CLM_1994 hypF   TRUE 0.981 -16.000 0.008 1.000   NA
 7551780 7551781 CLM_1994 CLM_1995     FALSE 0.070 255.000 0.000 1.000   NA
 7551781 7551782 CLM_1995 CLM_1996     FALSE 0.532 160.000 0.022 1.000   NA
 7551782 7551783 CLM_1996 CLM_1997   hupL TRUE 0.963 33.000 0.079 1.000 Y NA
 7551783 7551784 CLM_1997 CLM_1998 hupL hupS TRUE 0.976 102.000 0.778 0.001 Y NA
 7551785 7551786 CLM_1999 CLM_2000     FALSE 0.007 421.000 0.000 NA   NA
 7551787 7551788 CLM_2001 CLM_2002 carB carA TRUE 0.974 28.000 0.054 0.001 Y NA
 7551789 7551790 CLM_2003 CLM_2004     FALSE 0.003 602.000 0.000 NA   NA
 7551791 7551792 CLM_2005 CLM_2006     FALSE 0.128 201.000 0.000 NA   NA
 7551792 7551793 CLM_2006 CLM_2007     FALSE 0.017 362.000 0.000 1.000   NA
 7551793 7551794 CLM_2007 CLM_2008     TRUE 0.933 20.000 0.048 0.001   NA
 7551794 7551795 CLM_2008 CLM_2009     TRUE 0.989 12.000 0.154 0.001 Y NA
 7551795 7551796 CLM_2009 CLM_2010     FALSE 0.009 475.000 0.000 1.000 N NA
 7551796 7551797 CLM_2010 CLM_2011     FALSE 0.097 260.000 0.000 NA N NA
 7551800 7551801 CLM_2014 CLM_2015   ytfJ FALSE 0.289 68.000 0.000 NA   NA
 7551802 7551803 CLM_2016 CLM_2017 scpB scpA TRUE 0.996 -7.000 0.570 NA   NA
 7551803 7551804 CLM_2017 CLM_2018 scpA   TRUE 0.949 -25.000 0.000 NA   NA
 7551804 7551805 CLM_2018 CLM_2020   dacF FALSE 0.108 212.000 0.000 NA   NA
 7551805 7551806 CLM_2020 CLM_2021 dacF   TRUE 0.572 123.000 0.018 NA   NA
 7551806 7551807 CLM_2021 CLM_2022     FALSE 0.218 159.000 0.000 NA   NA
 7551807 7551808 CLM_2022 CLM_2023     TRUE 0.585 118.000 0.024 NA   NA
 7551808 7551809 CLM_2023 CLM_2024   pdp TRUE 0.672 107.000 0.061 NA   NA
 7551809 7551810 CLM_2024 CLM_2025 pdp punA FALSE 0.244 286.000 0.000 1.000 Y NA
 7551810 7551811 CLM_2025 CLM_2026 punA xerD TRUE 0.809 38.000 0.004 1.000 N NA
 7551811 7551812 CLM_2026 CLM_2027 xerD   TRUE 0.619 52.000 0.004 NA   NA
 7551812 7551813 CLM_2027 CLM_2028   spoIIM TRUE 0.981 -9.000 0.034 NA   NA
 7551815 7551816 CLM_2030 CLM_2031     FALSE 0.008 494.000 0.000 1.000 N NA
 7551816 7551817 CLM_2031 CLM_2032     FALSE 0.002 816.000 0.000 NA   NA
 7551817 7551818 CLM_2032 CLM_2033     FALSE 0.003 600.000 0.000 NA   NA
 7551818 7551819 CLM_2033 CLM_2034     FALSE 0.001 1322.000 0.000 NA   NA
 7551819 7551820 CLM_2034 CLM_2035     FALSE 0.002 679.000 0.000 NA   NA
 7551820 7551821 CLM_2035 CLM_2036     FALSE 0.318 129.000 0.000 1.000   NA
 7551821 7551822 CLM_2036 CLM_2037     TRUE 0.863 0.000 0.000 NA   NA
 7551822 7551823 CLM_2037 CLM_2038     TRUE 0.991 2.000 0.667 NA   NA
 7551823 7551824 CLM_2038 CLM_2039     FALSE 0.108 212.000 0.000 NA   NA
 7551826 7551827 CLM_2041 CLM_2042     TRUE 0.815 2.000 0.000 NA   NA
 7551827 7551828 CLM_2042 CLM_2043     TRUE 0.700 12.000 0.000 NA   NA
 7551828 7551829 CLM_2043 CLM_2044     TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 7551829 7551830 CLM_2044 CLM_2045     TRUE 0.769 4.000 0.000 NA   NA
 7551830 7551831 CLM_2045 CLM_2046     TRUE 0.651