MicrobesOnline Operon Predictions for Burkholderia pseudomallei MSHR346

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7545588 7545589 GBP346_A0002 GBP346_A0003 rpmH   TRUE 0.849 17.000 0.787 1.000   NA
 7545589 7545590 GBP346_A0003 GBP346_A0004     TRUE 0.657 80.000 0.540 NA   NA
 7545590 7545591 GBP346_A0004 GBP346_A0005     TRUE 0.795 9.000 0.461 NA   NA
 7545595 7545596 GBP346_A0009 GBP346_A0010 trmE   FALSE 0.142 169.000 0.008 1.000   NA
 7545597 7545598 GBP346_A0011 GBP346_A0012     FALSE 0.022 140.000 0.000 NA   NA
 7545598 7545599 GBP346_A0012 GBP346_A0013     TRUE 0.854 -3.000 0.800 NA   NA
 7545599 7545600 GBP346_A0013 GBP346_A0014     TRUE 0.778 -7.000 0.800 NA   NA
 7545600 7545601 GBP346_A0014 GBP346_A0015     FALSE 0.001 368.000 0.000 NA   NA
 7545601 7545602 GBP346_A0015 GBP346_A0016     TRUE 0.840 0.000 0.500 NA   NA
 7545602 7545603 GBP346_A0016 GBP346_A0017     FALSE 0.003 253.000 0.000 NA   NA
 7545603 7545604 GBP346_A0017 GBP346_A0018     FALSE 0.001 408.000 0.000 NA   NA
 7545606 7545607 GBP346_A0020 GBP346_A0021     FALSE 0.002 273.000 0.000 NA   NA
 7545609 7545610 GBP346_A0023 GBP346_A0024     FALSE 0.000 650.000 0.000 NA   NA
 7545610 7545611 GBP346_A0024 GBP346_A0025     FALSE 0.000 988.000 0.000 NA   NA
 7545612 7545613 GBP346_A0026 GBP346_A0027     FALSE 0.461 63.000 0.128 NA   NA
 7545615 7545616 GBP346_A0029 GBP346_A0030 speG   FALSE 0.335 12.000 0.027 NA   NA
 7545616 7545617 GBP346_A0030 GBP346_A0031     FALSE 0.003 242.000 0.000 NA   NA
 7545617 7545618 GBP346_A0031 GBP346_A0032     FALSE 0.025 216.000 0.028 NA   NA
 7545620 7545621 GBP346_A0034 GBP346_A0035   alkA TRUE 0.923 -3.000 0.087 0.060 N NA
 7545621 7545622 GBP346_A0035 GBP346_A0036 alkA   FALSE 0.122 1.000 0.000 NA   NA
 7545622 7545623 GBP346_A0036 GBP346_A0037   gshA_1 FALSE 0.052 39.000 0.000 NA   NA
 7545624 7545625 GBP346_A0038 GBP346_A0039     FALSE 0.002 263.000 0.000 NA   NA
 7545625 7545626 GBP346_A0039 GBP346_A0040     FALSE 0.048 89.000 0.000 NA   NA
 7545626 7545627 GBP346_A0040 GBP346_A0041     FALSE 0.051 44.000 0.000 NA   NA
 7545627 7545628 GBP346_A0041 GBP346_A0042     TRUE 0.799 103.000 0.750 NA N NA
 7545629 7545630 GBP346_A0043 GBP346_A0044 potF_1   TRUE 0.716 29.000 0.176 NA N NA
 7545630 7545631 GBP346_A0044 GBP346_A0045   aguB FALSE 0.402 11.000 0.042 NA   NA
 7545632 7545633 GBP346_A0046 GBP346_A0047     TRUE 0.700 -28.000 0.667 NA   NA
 7545635 7545636 GBP346_A0049 GBP346_A0050     FALSE 0.107 -3.000 0.000 NA   NA
 7545636 7545637 GBP346_A0050 GBP346_A0051     FALSE 0.000 1272.000 0.000 NA   NA
 7545638 7545639 GBP346_A0052 GBP346_A0053     FALSE 0.331 56.000 0.061 NA   NA
 7545639 7545640 GBP346_A0053 GBP346_A0054     TRUE 0.663 38.000 0.486 NA   NA
 7545643 7545644 GBP346_A0057 GBP346_A0058     FALSE 0.119 211.000 0.087 1.000   NA
 7545644 7545645 GBP346_A0058 GBP346_A0059     FALSE 0.474 60.000 0.022 1.000   NA
 7545645 7545646 GBP346_A0059 GBP346_A0060     FALSE 0.245 -3.000 0.003 NA   NA
 7545647 7545648 GBP346_A0061 GBP346_A0062 def_1 fmt TRUE 0.953 32.000 0.105 0.025 Y NA
 7545650 7545651 GBP346_A0064 GBP346_A0065     TRUE 0.683 110.000 0.062 1.000 N NA
 7545651 7545652 GBP346_A0065 GBP346_A0066     FALSE 0.039 165.000 0.007 NA   NA
 7545652 7545653 GBP346_A0066 GBP346_A0067   sun FALSE 0.012 168.000 0.000 NA   NA
 7545653 7545654 GBP346_A0067 GBP346_A0068 sun   FALSE 0.600 -3.000 0.094 NA   NA
 7545654 7545655 GBP346_A0068 GBP346_A0069     TRUE 0.872 2.000 0.810 NA   NA
 7545655 7545656 GBP346_A0069 GBP346_A0070     TRUE 0.904 1.000 0.605 1.000   NA
 7545656 7545657 GBP346_A0070 GBP346_A0071     FALSE 0.052 60.000 0.000 NA   NA
 7545657 7545658 GBP346_A0071 GBP346_A0072     FALSE 0.032 129.000 0.000 NA   NA
 7545658 7545659 GBP346_A0072 GBP346_A0073     FALSE 0.143 -19.000 0.005 NA   NA
 7545659 7545660 GBP346_A0073 GBP346_A0074     TRUE 0.692 94.000 0.270 1.000   NA
 7545660 7545661 GBP346_A0074 GBP346_A0075   queD TRUE 0.800 20.000 0.139 1.000 N NA
 7545661 7545662 GBP346_A0075 GBP346_A0076 queD   FALSE 0.188 32.000 0.015 NA   NA
 7545662 7545663 GBP346_A0076 GBP346_A0077     TRUE 0.715 65.000 0.750 NA   NA
 7545663 7545664 GBP346_A0077 GBP346_A0078     FALSE 0.554 34.000 0.214 NA   NA
 7545664 7545665 GBP346_A0078 GBP346_A0079     TRUE 0.870 -3.000 0.417 1.000   NA
 7545666 7545667 GBP346_A0080 GBP346_A0081 mrdB mrdA TRUE 0.825 12.000 0.073 1.000 N NA
 7545667 7545668 GBP346_A0081 GBP346_A0082 mrdA   FALSE 0.117 5.000 0.000 NA   NA
 7545668 7545669 GBP346_A0082 GBP346_A0083   mreD FALSE 0.054 27.000 0.000 NA   NA
 7545669 7545670 GBP346_A0083 GBP346_A0084 mreD mreC TRUE 0.988 -3.000 0.550 0.003 Y NA
 7545670 7545671 GBP346_A0084 GBP346_A0085 mreC   TRUE 0.834 120.000 0.689 1.000 N NA
 7545672 7545673 GBP346_A0086 GBP346_A0087     TRUE 0.971 113.000 0.643 0.002 Y NA
 7545673 7545674 GBP346_A0087 GBP346_A0088     TRUE 0.990 3.000 0.492 0.002 Y NA
 7545674 7545675 GBP346_A0088 GBP346_A0089     FALSE 0.354 127.000 0.016 1.000   NA
 7545675 7545676 GBP346_A0089 GBP346_A0090   xth_1 FALSE 0.484 33.000 0.024 1.000   NA
 7545679 7545680 GBP346_A0093 GBP346_A0094     FALSE 0.350 -10.000 0.054 NA   NA
 7545680 7545681 GBP346_A0094 GBP346_A0095   metW FALSE 0.518 12.000 0.087 NA   NA
 7545681 7545682 GBP346_A0095 GBP346_A0096 metW metX TRUE 0.822 -3.000 0.509 NA   NA
 7545682 7545683 GBP346_A0096 GBP346_A0097 metX   FALSE 0.036 349.000 0.006 1.000 N NA
 7545683 7545684 GBP346_A0097 GBP346_A0098     TRUE 0.608 -33.000 0.122 1.000   NA
 7545684 7545685 GBP346_A0098 GBP346_A0099     TRUE 0.737 -3.000 0.069 1.000   NA
 7545685 7545686 GBP346_A0099 GBP346_A0100     FALSE 0.137 21.000 0.003 NA   NA
 7545687 7545688 GBP346_A0101 GBP346_A0102     FALSE 0.279 18.000 0.030 NA   NA
 7545688 7545689 GBP346_A0102 GBP346_A0103     TRUE 0.960 20.000 0.682 1.000 Y NA
 7545690 7545691 GBP346_A0104 GBP346_A0105 hslU hslV TRUE 0.977 10.000 0.752 1.000 Y NA
 7545691 7545692 GBP346_A0105 GBP346_A0106 hslV dksA FALSE 0.359 156.000 0.011 1.000 N NA
 7545692 7545693 GBP346_A0106 GBP346_A0107 dksA   FALSE 0.003 539.000 0.045 NA   NA
 7545693 7545694 GBP346_A0107 GBP346_A0108     FALSE 0.106 178.000 0.094 NA   NA
 7545694 7545695 GBP346_A0108 GBP346_A0109   xerC FALSE 0.590 89.000 0.110 1.000   NA
 7545695 7545696 GBP346_A0109 GBP346_A0110 xerC   TRUE 0.722 31.000 0.714 NA   NA
 7545696 7545697 GBP346_A0110 GBP346_A0111   dapF FALSE 0.510 48.000 0.175 NA   NA
 7545697 7545698 GBP346_A0111 GBP346_A0112 dapF   TRUE 0.665 41.000 0.010 1.000 N NA
 7545704 7545705 GBP346_A0118 GBP346_A0119     FALSE 0.002 268.000 0.000 NA   NA
 7545705 7545706 GBP346_A0119 GBP346_A0120     FALSE 0.375 122.000 0.125 NA   NA
 7545706 7545707 GBP346_A0120 GBP346_A0121     FALSE 0.319 -3.000 0.014 NA   NA
 7545710 7545711 GBP346_A0124 GBP346_A0125     FALSE 0.306 41.000 0.053 NA   NA
 7545712 7545713 GBP346_A0126 GBP346_A0127     FALSE 0.200 134.000 0.062 NA   NA
 7545713 7545714 GBP346_A0127 GBP346_A0128     TRUE 0.831 35.000 0.312 1.000 N NA
 7545714 7545715 GBP346_A0128 GBP346_A0129     FALSE 0.463 79.000 0.150 NA   NA
 7545717 7545718 GBP346_A0131 GBP346_A0132   fliJ TRUE 0.968 57.000 0.317 0.007 Y NA
 7545718 7545719 GBP346_A0132 GBP346_A0133 fliJ fliI TRUE 0.958 6.000 0.070 1.000 Y NA
 7545719 7545720 GBP346_A0133 GBP346_A0134 fliI   TRUE 0.940 -6.000 0.115 1.000 Y NA
 7545720 7545721 GBP346_A0134 GBP346_A0135   fliG TRUE 0.976 -7.000 0.320 0.004 Y NA
 7545721 7545722 GBP346_A0135 GBP346_A0136 fliG fliF TRUE 0.970 -10.000 0.220 0.007 Y NA
 7545723 7545724 GBP346_A0137 GBP346_A0138 fliE fliS TRUE 0.959 68.000 0.149 0.004 Y NA
 7545724 7545725 GBP346_A0138 GBP346_A0139 fliS   TRUE 0.819 -3.000 0.189 1.000   NA
 7545725 7545726 GBP346_A0139 GBP346_A0140     FALSE 0.595 110.000 0.143 1.000   NA
 7545726 7545727 GBP346_A0140 GBP346_A0141     FALSE 0.573 -3.000 0.000 1.000   NA
 7545727 7545728 GBP346_A0141 GBP346_A0142     FALSE 0.019 218.000 0.016 NA   NA
 7545729 7545730 GBP346_A0143 GBP346_A0144     FALSE 0.276 199.000 0.113 1.000 N NA
 7545730 7545731 GBP346_A0144 GBP346_A0145     FALSE 0.135 242.000 0.075 1.000 N NA
 7545731 7545732 GBP346_A0145 GBP346_A0146     TRUE 0.979 -3.000 0.143 0.016 Y NA
 7545732 7545733 GBP346_A0146 GBP346_A0147   fpr_1 FALSE 0.020 414.000 0.000 1.000 N NA
 7545733 7545734 GBP346_A0147 GBP346_A0148 fpr_1   FALSE 0.242 213.000 0.133 1.000 N NA
 7545734 7545735 GBP346_A0148 GBP346_A0149     TRUE 0.708 66.000 0.714 NA   NA
 7545735 7545736 GBP346_A0149 GBP346_A0150     TRUE 0.858 7.000 0.833 NA   NA
 7545736 7545737 GBP346_A0150 GBP346_A0151     FALSE 0.046 97.000 0.000 NA   NA
 7545738 7545739 GBP346_A0152 GBP346_A0153     FALSE 0.540 72.000 0.065 1.000   NA
 7545739 7545740 GBP346_A0153 GBP346_A0154   hip FALSE 0.377 135.000 0.065 1.000   NA
 7545740 7545741 GBP346_A0154 GBP346_A0155 hip   FALSE 0.085 231.000 0.074 1.000   NA
 7545741 7545742 GBP346_A0155 GBP346_A0157     FALSE 0.561 46.000 0.231 NA   NA
 7545744 7545745 GBP346_A0158 GBP346_A0159     TRUE 0.930 112.000 0.072 0.063 Y NA
 7545745 7545746 GBP346_A0159 GBP346_A0160     TRUE 0.970 75.000 0.779 0.063 Y NA
 7545746 7545747 GBP346_A0160 GBP346_A0161     TRUE 0.980 2.000 0.560 1.000 Y NA
 7545747 7545748 GBP346_A0161 GBP346_A0162     TRUE 0.988 -3.000 0.377 0.001 Y NA
 7545748 7545749 GBP346_A0162 GBP346_A0163     TRUE 0.727 5.000 0.188 NA   NA
 7545750 7545751 GBP346_A0164 GBP346_A0165     TRUE 0.862 -3.000 0.939 NA   NA
 7545753 7545754 GBP346_A0167 GBP346_A0168     FALSE 0.595 59.000 0.092 1.000   NA
 7545754 7545755 GBP346_A0168 GBP346_A0169     TRUE 0.965 -3.000 0.155 1.000 Y NA
 7545758 7545759 GBP346_A0172 GBP346_A0173     TRUE 0.888 122.000 0.110 1.000 Y NA
 7545759 7545760 GBP346_A0173 GBP346_A0174     TRUE 0.722 64.000 0.060 1.000 N NA
 7545760 7545761 GBP346_A0174 GBP346_A0175     TRUE 0.866 -3.000 0.087 1.000 N NA
 7545762 7545763 GBP346_A0176 GBP346_A0177     FALSE 0.004 219.000 0.000 NA   NA
 7545765 7545766 GBP346_A0179 GBP346_A0180     TRUE 0.856 26.000 0.211 0.003   NA
 7545766 7545767 GBP346_A0180 GBP346_A0181     FALSE 0.569 104.000 0.330 NA   NA
 7545768 7545769 GBP346_A0182 GBP346_A0183 flgB flgC TRUE 0.974 84.000 0.714 0.004 Y NA
 7545769 7545770 GBP346_A0183 GBP346_A0184 flgC   TRUE 0.907 54.000 0.221 NA Y NA
 7545770 7545771 GBP346_A0184 GBP346_A0185     TRUE 0.885 28.000 0.093 NA Y NA
 7545771 7545772 GBP346_A0185 GBP346_A0186   flgF TRUE 0.975 27.000 0.533 0.004 Y NA
 7545772 7545773 GBP346_A0186 GBP346_A0187 flgF flgG TRUE 0.974 34.000 0.357 0.001 Y NA
 7545773 7545774 GBP346_A0187 GBP346_A0188 flgG flgH TRUE 0.974 21.000 0.463 0.007 Y NA
 7545774 7545775 GBP346_A0188 GBP346_A0189 flgH flgI TRUE 0.975 -6.000 0.256 0.008 Y NA
 7545775 7545776 GBP346_A0189 GBP346_A0190 flgI flgJ TRUE 0.983 1.000 0.131 0.008 Y NA
 7545776 7545777 GBP346_A0190 GBP346_A0191 flgJ   FALSE 0.289 216.000 0.000 NA Y NA
 7545777 7545778 GBP346_A0191 GBP346_A0192   flgK FALSE 0.592 65.000 0.057 NA N NA
 7545778 7545779 GBP346_A0192 GBP346_A0193 flgK flgL TRUE 0.969 16.000 0.074 0.002 Y NA
 7545779 7545780 GBP346_A0193 GBP346_A0194 flgL   FALSE 0.402 118.000 0.133 NA   NA
 7545780 7545781 GBP346_A0194 GBP346_A0195     FALSE 0.501 59.000 0.158 NA   NA
 7545781 7545782 GBP346_A0195 GBP346_A0196     TRUE 0.686 -3.000 0.158 NA   NA
 7545784 7545785 GBP346_A0198 GBP346_A0199     TRUE 0.989 -3.000 0.571 0.002 Y NA
 7545785 7545786 GBP346_A0199 GBP346_A0200     FALSE 0.397 -12.000 0.074 NA   NA
 7545788 7545789 GBP346_A0202 GBP346_A0203     FALSE 0.230 18.000 0.018 NA   NA
 7545791 7545792 GBP346_A0205 GBP346_A0206     FALSE 0.297 144.000 0.188 NA   NA
 7545793 7545794 GBP346_A0207 GBP346_A0208     TRUE 0.737 60.000 0.875 NA   NA
 7545794 7545795 GBP346_A0208 GBP346_A0209     FALSE 0.003 252.000 0.000 NA   NA
 7545795 7545796 GBP346_A0209 GBP346_A0210     TRUE 0.655 -42.000 0.571 NA   NA
 7545796 7545797 GBP346_A0210 GBP346_A0211     TRUE 0.764 -3.000 0.286 NA   NA
 7545797 7545798 GBP346_A0211 GBP346_A0212   hpnI_1 FALSE 0.336 -33.000 0.069 NA   NA
 7545798 7545799 GBP346_A0212 GBP346_A0213 hpnI_1   FALSE 0.095 382.000 0.000 1.000 Y NA
 7545799 7545800 GBP346_A0213 GBP346_A0214     TRUE 0.654 102.000 0.583 NA   NA
 7545800 7545801 GBP346_A0214 GBP346_A0215     FALSE 0.009 182.000 0.000 NA   NA
 7545801 7545802 GBP346_A0215 GBP346_A0216     FALSE 0.057 21.000 0.000 NA   NA
 7545803 7545804 GBP346_A0217 GBP346_A0218     TRUE 0.677 20.000 0.429 NA   NA
 7545804 7545805 GBP346_A0218 GBP346_A0219     FALSE 0.367 128.000 0.143 NA   NA
 7545807 7545808 GBP346_A0221 GBP346_A0222   gor FALSE 0.035 197.000 0.026 NA   NA
 7545810 7545811 GBP346_A0224 GBP346_A0225 argG_1   FALSE 0.091 126.000 0.004 NA   NA
 7545811 7545812 GBP346_A0225 GBP346_A0226     FALSE 0.570 108.000 0.333 NA   NA
 7545812 7545813 GBP346_A0226 GBP346_A0227     FALSE 0.082 13.000 0.000 NA   NA
 7545813 7545814 GBP346_A0227 GBP346_A0228     FALSE 0.052 61.000 0.000 NA   NA
 7545814 7545815 GBP346_A0228 GBP346_A0229     FALSE 0.001 337.000 0.000 NA   NA
 7545817 7545818 GBP346_A0231 GBP346_A0232     FALSE 0.002 300.000 0.000 NA   NA
 7545818 7545819 GBP346_A0232 GBP346_A0233     FALSE 0.595 -3.000 0.091 NA   NA
 7545819 7545820 GBP346_A0233 GBP346_A0234     TRUE 0.687 0.000 0.127 NA   NA
 7545820 7545821 GBP346_A0234 GBP346_A0236     FALSE 0.220 34.000 0.025 NA   NA
 7545823 7545824 GBP346_A0237 GBP346_A0238     TRUE 0.975 11.000 0.750 1.000 Y NA
 7545824 7545825 GBP346_A0238 GBP346_A0239     TRUE 0.945 -3.000 1.000 1.000 N NA
 7545825 7545826 GBP346_A0239 GBP346_A0240     TRUE 0.836 -3.000 0.625 NA   NA
 7545826 7545827 GBP346_A0240 GBP346_A0241     TRUE 0.849 4.000 0.600 NA   NA
 7545827 7545828 GBP346_A0241 GBP346_A0242     FALSE 0.558 114.000 0.333 NA   NA
 7545829 7545830 GBP346_A0243 GBP346_A0244 glmS_1 glmU TRUE 0.886 64.000 0.010 1.000 Y NA
 7545830 7545831 GBP346_A0244 GBP346_A0245 glmU   FALSE 0.129 39.000 0.003 NA   NA
 7545831 7545832 GBP346_A0245 GBP346_A0246     FALSE 0.004 234.000 0.000 NA   NA
 7545832 7545833 GBP346_A0246 GBP346_A0247   folB_1 TRUE 0.768 -3.000 0.059 NA N NA
 7545833 7545834 GBP346_A0247 GBP346_A0248 folB_1   TRUE 0.662 82.000 0.211 1.000   NA
 7545835 7545836 GBP346_A0249 GBP346_A0250     FALSE 0.371 18.000 0.058 NA   NA
 7545836 7545837 GBP346_A0250 GBP346_A0251     FALSE 0.322 -3.000 0.014 NA   NA
 7545838 7545839 GBP346_A0252 GBP346_A0253     FALSE 0.023 312.000 0.143 NA   NA
 7545839 7545840 GBP346_A0253 GBP346_A0254     TRUE 0.949 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 7545840 7545841 GBP346_A0254 GBP346_A0255     TRUE 0.883 -3.000 0.128 1.000 N NA
 7545841 7545842 GBP346_A0255 GBP346_A0256     FALSE 0.437 171.000 0.176 1.000 N NA
 7545842 7545843 GBP346_A0256 GBP346_A0257     FALSE 0.480 63.000 0.143 NA   NA
 7545843 7545844 GBP346_A0257 GBP346_A0258     FALSE 0.315 57.000 0.056 NA   NA
 7545846 7545847 GBP346_A0259 GBP346_A0261     TRUE 0.688 -42.000 0.750 NA   NA
 7545848 7545849 GBP346_A0262 GBP346_A0263     TRUE 0.863 34.000 0.560 1.000 N NA
 7545849 7545850 GBP346_A0263 GBP346_A0264     FALSE 0.334 106.000 0.080 NA   NA
 7545852 7545853 GBP346_A0266 GBP346_A0267     FALSE 0.484 95.000 0.174 NA   NA
 7545856 7545857 GBP346_A0270 GBP346_A0271     FALSE 0.352 6.000 0.017 NA   NA
 7545857 7545858 GBP346_A0271 GBP346_A0272     FALSE 0.448 56.000 0.119 NA   NA
 7545858 7545859 GBP346_A0272 GBP346_A0273     TRUE 0.921 86.000 0.176 1.000 Y NA
 7545859 7545860 GBP346_A0273 GBP346_A0274     FALSE 0.591 5.000 0.079 NA   NA
 7545860 7545861 GBP346_A0274 GBP346_A0275     FALSE 0.181 25.000 0.013 NA   NA
 7545865 7545866 GBP346_A0278 GBP346_A0280     TRUE 0.720 47.000 0.769 NA   NA
 7545866 7545867 GBP346_A0280 GBP346_A0281     FALSE 0.003 238.000 0.000 NA   NA
 7545868 7545869 GBP346_A0282 GBP346_A0283     TRUE 0.860 -3.000 0.880 NA   NA
 7545869 7545870 GBP346_A0283 GBP346_A0284     FALSE 0.324 102.000 0.074 NA   NA
 7545871 7545872 GBP346_A0285 GBP346_A0286     TRUE 0.682 28.000 0.500 NA   NA
 7545873 7545874 GBP346_A0287 GBP346_A0288     TRUE 0.746 57.000 1.000 NA   NA
 7545875 7545876 GBP346_A0289 GBP346_A0290 dapA_1   FALSE 0.223 131.000 0.065 NA   NA
 7545876 7545877 GBP346_A0290 GBP346_A0291     TRUE 0.635 -43.000 0.500 NA   NA
 7545877 7545878 GBP346_A0291 GBP346_A0292     FALSE 0.001 395.000 0.000 NA   NA
 7545881 7545882 GBP346_A0295 GBP346_A0296     FALSE 0.244 49.000 0.033 NA   NA
 7545882 7545883 GBP346_A0296 GBP346_A0297     FALSE 0.004 235.000 0.000 NA   NA
 7545883 7545884 GBP346_A0297 GBP346_A0298     FALSE 0.015 503.000 0.000 1.000 N NA
 7545884 7545885 GBP346_A0298 GBP346_A0299     TRUE 0.692 73.000 0.667 NA   NA
 7545891 7545892 GBP346_A0305 GBP346_A0306     FALSE 0.001 314.000 0.000 NA   NA
 7545892 7545893 GBP346_A0306 GBP346_A0308     TRUE 0.764 -3.000 0.286 NA   NA
 7545895 7545896 GBP346_A0309 GBP346_A0310     TRUE 0.979 33.000 0.600 0.001 Y NA
 7545896 7545897 GBP346_A0310 GBP346_A0312     TRUE 0.762 15.000 0.526 NA   NA
 7545900 7545901 GBP346_A0314 GBP346_A0315 bioB bioD TRUE 0.945 73.000 0.025 0.002 Y NA
 7545901 7545902 GBP346_A0315 GBP346_A0316 bioD bioF TRUE 0.982 -3.000 0.121 0.002 Y NA
 7545902 7545903 GBP346_A0316 GBP346_A0317 bioF bioA TRUE 0.978 -3.000 0.054 0.002 Y NA
 7545905 7545906 GBP346_A0319 GBP346_A0320     FALSE 0.125 164.000 0.075 NA   NA
 7545906 7545907 GBP346_A0320 GBP346_A0321     FALSE 0.181 32.000 0.014 NA   NA
 7545907 7545908 GBP346_A0321 GBP346_A0322     FALSE 0.055 25.000 0.000 NA   NA
 7545908 7545909 GBP346_A0322 GBP346_A0323     FALSE 0.574 31.000 0.070 1.000   NA
 7545909 7545910 GBP346_A0323 GBP346_A0324     TRUE 0.767 -13.000 0.087 1.000 N NA
 7545910 7545911 GBP346_A0324 GBP346_A0325   aceK TRUE 0.789 58.000 0.158 1.000 N NA
 7545911 7545912 GBP346_A0325 GBP346_A0326 aceK   FALSE 0.514 -3.000 0.059 NA   NA
 7545914 7545915 GBP346_A0328 GBP346_A0329     FALSE 0.062 234.000 0.032 1.000   NA
 7545915 7545916 GBP346_A0329 GBP346_A0330     FALSE 0.226 98.000 0.034 NA   NA
 7545916 7545917 GBP346_A0330 GBP346_A0331     FALSE 0.041 196.000 0.034 NA   NA
 7545917 7545918 GBP346_A0331 GBP346_A0332     FALSE 0.454 -19.000 0.118 NA   NA
 7545920 7545921 GBP346_A0334 GBP346_A0335     TRUE 0.807 17.000 0.434 1.000   NA
 7545921 7545922 GBP346_A0335 GBP346_A0336     TRUE 0.806 52.000 0.573 NA N NA
 7545922 7545923 GBP346_A0336 GBP346_A0337   argS FALSE 0.598 67.000 0.062 NA N NA
 7545924 7545925 GBP346_A0338 GBP346_A0339     FALSE 0.491 104.000 0.200 NA   NA
 7545926 7545927 GBP346_A0340 GBP346_A0341 metH   TRUE 0.953 46.000 0.041 0.001 Y NA
 7545927 7545928 GBP346_A0341 GBP346_A0342     FALSE 0.152 188.000 0.216 NA   NA
 7545928 7545929 GBP346_A0342 GBP346_A0343     FALSE 0.137 183.000 0.162 NA   NA
 7545929 7545930 GBP346_A0343 GBP346_A0344     FALSE 0.441 79.000 0.130 NA   NA
 7545931 7545932 GBP346_A0345 GBP346_A0346     FALSE 0.365 -3.000 0.022 NA   NA
 7545932 7545933 GBP346_A0346 GBP346_A0347     FALSE 0.258 80.000 0.044 NA   NA
 7545933 7545934 GBP346_A0347 GBP346_A0348     TRUE 0.624 90.000 0.413 NA   NA
 7545934 7545935 GBP346_A0348 GBP346_A0349     FALSE 0.449 37.000 0.121 NA   NA
 7545935 7545936 GBP346_A0349 GBP346_A0350     FALSE 0.050 67.000 0.000 NA   NA
 7545938 7545939 GBP346_A0352 GBP346_A0353   rfaE_1 FALSE 0.398 141.000 0.119 1.000   NA
 7545940 7545941 GBP346_A0354 GBP346_A0355     FALSE 0.156 104.000 0.015 NA   NA
 7545941 7545942 GBP346_A0355 GBP346_A0356     TRUE 0.893 6.000 0.147 1.000 N NA
 7545942 7545943 GBP346_A0356 GBP346_A0357     FALSE 0.024 272.000 0.000 1.000   NA
 7545943 7545944 GBP346_A0357 GBP346_A0358     FALSE 0.551 74.000 0.074 1.000   NA
 7545945 7545946 GBP346_A0359 GBP346_A0360     TRUE 0.973 -3.000 0.922 NA Y NA
 7545946 7545947 GBP346_A0360 GBP346_A0361     TRUE 0.942 24.000 0.750 NA Y NA
 7545947 7545948 GBP346_A0361 GBP346_A0362     TRUE 0.609 19.000 0.239 NA   NA
 7545948 7545949 GBP346_A0362 GBP346_A0363     FALSE 0.429 32.000 0.103 NA   NA
 7545949 7545950 GBP346_A0363 GBP346_A0364     FALSE 0.564 106.000 0.320 NA   NA
 7545950 7545951 GBP346_A0364 GBP346_A0365     FALSE 0.513 47.000 0.179 NA   NA
 7545951 7545952 GBP346_A0365 GBP346_A0366     FALSE 0.004 776.000 0.079 NA   NA
 7545952 7545953 GBP346_A0366 GBP346_A0367     TRUE 0.830 90.000 0.390 1.000 N NA
 7545953 7545954 GBP346_A0367 GBP346_A0368     TRUE 0.683 -3.000 0.155 NA   NA
 7545956 7545957 GBP346_A0370 GBP346_A0371   lipB FALSE 0.214 93.000 0.028 NA   NA
 7545957 7545958 GBP346_A0371 GBP346_A0372 lipB lipA TRUE 0.979 -7.000 0.319 0.001 Y NA
 7545958 7545959 GBP346_A0372 GBP346_A0374 lipA   FALSE 0.131 36.000 0.004 NA   NA
 7545960 7545961 GBP346_A0373 GBP346_A0375   ggt_1 FALSE 0.379 128.000 0.032 1.000   NA
 7545962 7545963 GBP346_A0376 GBP346_A0377     FALSE 0.008 186.000 0.000 NA   NA
 7545965 7545966 GBP346_A0379 GBP346_A0380     TRUE 0.947 55.000 0.450 1.000 Y NA
 7545966 7545967 GBP346_A0380 GBP346_A0381     TRUE 0.973 10.000 0.050 0.005 Y NA
 7545967 7545968 GBP346_A0381 GBP346_A0382     TRUE 0.862 26.000 0.500 1.000 N NA
 7545968 7545969 GBP346_A0382 GBP346_A0383     FALSE 0.001 377.000 0.000 NA   NA
 7545969 7545970 GBP346_A0383 GBP346_A0384     TRUE 0.704 12.000 0.263 NA   NA
 7545970 7545971 GBP346_A0384 GBP346_A0385   dctA FALSE 0.010 368.000 0.000 1.000   NA
 7545971 7545972 GBP346_A0385 GBP346_A0386 dctA   TRUE 0.810 3.000 0.000 1.000 N NA
 7545972 7545973 GBP346_A0386 GBP346_A0387     TRUE 0.875 49.000 0.000 1.000 Y NA
 7545975 7545976 GBP346_A0389 GBP346_A0391     FALSE 0.000 540.000 0.000 NA   NA
 7545977 7545978 GBP346_A0390 GBP346_A0392     FALSE 0.403 18.000 0.069 NA   NA
 7545979 7545980 GBP346_A0393 GBP346_A0394     FALSE 0.476 22.000 0.125 NA   NA
 7545981 7545982 GBP346_A0395 GBP346_A0396     FALSE 0.196 138.000 0.074 NA   NA
 7545983 7545984 GBP346_A0397 GBP346_A0398   amt TRUE 0.802 33.000 0.189 1.000 N NA
 7545984 7545985 GBP346_A0398 GBP346_A0399 amt gshA_2 FALSE 0.011 359.000 0.000 1.000   NA
 7545985 7545986 GBP346_A0399 GBP346_A0400 gshA_2 gshB TRUE 0.634 28.000 0.120 1.000   NA
 7545986 7545987 GBP346_A0400 GBP346_A0401 gshB   FALSE 0.323 173.000 0.048 1.000 N NA
 7545987 7545988 GBP346_A0401 GBP346_A0402   ptsH TRUE 0.967 77.000 0.261 0.002 Y NA
 7545988 7545989 GBP346_A0402 GBP346_A0403 ptsH ptsP TRUE 0.836 178.000 0.205 0.002 Y NA
 7545989 7545990 GBP346_A0403 GBP346_A0404 ptsP   FALSE 0.256 63.000 0.037 NA   NA
 7545991 7545992 GBP346_A0405 GBP346_A0406     TRUE 0.707 105.000 0.082 1.000 N NA
 7545992 7545993 GBP346_A0406 GBP346_A0407     FALSE 0.155 221.000 0.036 1.000 N NA
 7545994 7545995 GBP346_A0408 GBP346_A0409   grxC TRUE 0.834 12.000 0.269 NA N NA
 7545995 7545996 GBP346_A0409 GBP346_A0410 grxC secB TRUE 0.764 117.000 0.221 1.000 N NA
 7545996 7545997 GBP346_A0410 GBP346_A0411 secB gpsA TRUE 0.805 17.000 0.097 1.000 N NA
 7545997 7545998 GBP346_A0411 GBP346_A0412 gpsA   FALSE 0.387 120.000 0.127 NA   NA
 7545999 7546000 GBP346_A0413 GBP346_A0414     TRUE 0.702 -3.000 0.045 1.000   NA
 7546001 7546002 GBP346_A0415 GBP346_A0416     FALSE 0.015 237.000 0.018 NA   NA
 7546002 7546003 GBP346_A0416 GBP346_A0417     FALSE 0.404 50.000 0.095 NA   NA
 7546003 7546004 GBP346_A0417 GBP346_A0418   ctaD_1 TRUE 0.977 44.000 0.741 0.003 Y NA
 7546004 7546005 GBP346_A0418 GBP346_A0419 ctaD_1   FALSE 0.329 24.000 0.057 NA   NA
 7546005 7546006 GBP346_A0419 GBP346_A0420     FALSE 0.301 22.000 0.046 NA   NA
 7546006 7546007 GBP346_A0420 GBP346_A0421     FALSE 0.538 17.000 0.129 NA   NA
 7546007 7546008 GBP346_A0421 GBP346_A0422     FALSE 0.323 134.000 0.152 NA   NA
 7546010 7546011 GBP346_A0424 GBP346_A0425     FALSE 0.457 149.000 0.722 NA   NA
 7546011 7546012 GBP346_A0425 GBP346_A0426     TRUE 0.706 44.000 0.255 1.000   NA
 7546012 7546013 GBP346_A0426 GBP346_A0427   cyoE TRUE 0.963 13.000 0.321 1.000 Y NA
 7546013 7546014 GBP346_A0427 GBP346_A0428 cyoE   FALSE 0.473 20.000 0.009 1.000   NA
 7546016 7546017 GBP346_A0430 GBP346_A0431     TRUE 0.829 -3.000 0.571 NA   NA
 7546017 7546018 GBP346_A0431 GBP346_A0432     TRUE 0.818 1.000 0.389 NA   NA
 7546018 7546019 GBP346_A0432 GBP346_A0433     FALSE 0.003 251.000 0.000 NA   NA
 7546019 7546020 GBP346_A0433 GBP346_A0434     FALSE 0.048 319.000 0.562 NA   NA
 7546020 7546021 GBP346_A0434 GBP346_A0435     TRUE 0.914 1.000 0.771 1.000   NA
 7546021 7546022 GBP346_A0435 GBP346_A0436     FALSE 0.006 207.000 0.000 NA   NA
 7546022 7546023 GBP346_A0436 GBP346_A0437     TRUE 0.673 -22.000 0.500 NA   NA
 7546023 7546024 GBP346_A0437 GBP346_A0438     TRUE 0.831 6.000 0.200 1.000   NA
 7546025 7546026 GBP346_A0439 GBP346_A0440     FALSE 0.436 44.000 0.114 NA   NA
 7546028 7546029 GBP346_A0441 GBP346_A0443     TRUE 0.776 76.000 0.167 1.000 N NA
 7546029 7546030 GBP346_A0443 GBP346_A0444     TRUE 0.724 45.000 0.800 NA   NA
 7546030 7546031 GBP346_A0444 GBP346_A0445     FALSE 0.527 75.000 0.211 NA   NA
 7546031 7546032 GBP346_A0445 GBP346_A0446     TRUE 0.830 -7.000 0.158 1.000 N NA
 7546032 7546033 GBP346_A0446 GBP346_A0447     TRUE 0.912 6.000 0.250 1.000 N NA
 7546033 7546034 GBP346_A0447 GBP346_A0448     TRUE 0.870 -3.000 0.417 1.000   NA
 7546034 7546035 GBP346_A0448 GBP346_A0449     TRUE 0.769 40.000 0.500 1.000   NA
 7546035 7546036 GBP346_A0449 GBP346_A0450     TRUE 0.930 2.000 0.375 1.000 N NA
 7546036 7546037 GBP346_A0450 GBP346_A0451     TRUE 0.969 -3.000 0.625 NA Y NA
 7546037 7546038 GBP346_A0451 GBP346_A0452     TRUE 0.945 18.000 0.571 NA Y NA
 7546038 7546039 GBP346_A0452 GBP346_A0453     TRUE 0.881 8.000 0.133 1.000 N NA
 7546039 7546040 GBP346_A0453 GBP346_A0454     FALSE 0.582 -10.000 0.200 NA   NA
 7546040 7546041 GBP346_A0454 GBP346_A0455     TRUE 0.796 5.000 0.333 NA   NA
 7546041 7546042 GBP346_A0455 GBP346_A0456     TRUE 0.655 19.000 0.333 NA   NA
 7546042 7546043 GBP346_A0456 GBP346_A0457     TRUE 0.841 -3.000 0.667 NA   NA
 7546043 7546044 GBP346_A0457 GBP346_A0458     TRUE 0.659 33.000 0.444 NA   NA
 7546044 7546045 GBP346_A0458 GBP346_A0459     TRUE 0.619 56.000 0.333 NA   NA
 7546045 7546046 GBP346_A0459 GBP346_A0460     TRUE 0.647 80.000 0.500 NA   NA
 7546047 7546048 GBP346_A0461 GBP346_A0462     FALSE 0.067 743.000 0.000 0.064 Y NA
 7546048 7546049 GBP346_A0462 GBP346_A0463   nagA TRUE 0.682 99.000 0.049 1.000 N NA
 7546049 7546050 GBP346_A0463 GBP346_A0464 nagA   TRUE 0.781 -16.000 0.122 1.000 N NA
 7546050 7546051 GBP346_A0464 GBP346_A0465     TRUE 0.803 58.000 0.200 1.000 N NA
 7546051 7546052 GBP346_A0465 GBP346_A0466   nagE TRUE 0.961 113.000 0.258 0.002 Y NA
 7546053 7546054 GBP346_A0467 GBP346_A0468     FALSE 0.005 211.000 0.000 NA   NA
 7546054 7546055 GBP346_A0468 GBP346_A0469     FALSE 0.003 244.000 0.000 NA   NA
 7546055 7546056 GBP346_A0469 GBP346_A0470     FALSE 0.107 -3.000 0.000 NA   NA
 7546056 7546057 GBP346_A0470 GBP346_A0471     FALSE 0.221 28.000 0.023 NA   NA
 7546057 7546058 GBP346_A0471 GBP346_A0472   cydB_1 FALSE 0.283 19.000 0.034 NA   NA
 7546058 7546059 GBP346_A0472 GBP346_A0473 cydB_1 cydA TRUE 0.967 38.000 0.474 0.058 Y NA
 7546059 7546060 GBP346_A0473 GBP346_A0474 cydA   TRUE 0.736 -10.000 0.625 NA   NA
 7546060 7546061 GBP346_A0474 GBP346_A0475   rpoH FALSE 0.001 479.000 0.000 NA   NA
 7546061 7546062 GBP346_A0475 GBP346_A0476 rpoH   FALSE 0.019 198.000 0.005 NA   NA
 7546063 7546064 GBP346_A0477 GBP346_A0478     TRUE 0.634 42.000 0.381 NA   NA
 7546067 7546068 GBP346_A0481 GBP346_A0482     FALSE 0.012 648.000 0.000 0.067   NA
 7546068 7546069 GBP346_A0482 GBP346_A0483     TRUE 0.671 -3.000 0.026 1.000   NA
 7546069 7546070 GBP346_A0483 GBP346_A0484     TRUE 0.708 -3.000 0.048 1.000   NA
 7546070 7546071 GBP346_A0484 GBP346_A0485   nirB_1 TRUE 0.960 13.000 0.539 0.001 N NA
 7546072 7546073 GBP346_A0486 GBP346_A0487   maiA FALSE 0.247 -13.000 0.027 NA   NA
 7546073 7546074 GBP346_A0487 GBP346_A0489 maiA   FALSE 0.227 38.000 0.027 NA   NA
 7546076 7546077 GBP346_A0490 GBP346_A0491   coaD TRUE 0.808 111.000 0.367 1.000 N NA
 7546077 7546078 GBP346_A0491 GBP346_A0492 coaD   FALSE 0.346 -48.000 0.088 NA   NA
 7546079 7546080 GBP346_A0493 GBP346_A0494 hisC_1 pth TRUE 0.650 86.000 0.014 1.000 N NA
 7546080 7546081 GBP346_A0494 GBP346_A0495 pth   TRUE 0.962 114.000 0.496 0.024 Y NA
 7546081 7546082 GBP346_A0495 GBP346_A0496     FALSE 0.451 164.000 0.122 1.000 N NA
 7546082 7546083 GBP346_A0496 GBP346_A0497     FALSE 0.051 47.000 0.000 NA   NA
 7546083 7546084 GBP346_A0497 GBP346_A0498   ispE FALSE 0.052 53.000 0.000 NA   NA
 7546084 7546085 GBP346_A0498 GBP346_A0499 ispE lolB TRUE 0.789 34.000 0.157 1.000 N NA
 7546085 7546086 GBP346_A0499 GBP346_A0500 lolB   TRUE 0.886 -3.000 0.139 1.000 N NA
 7546087 7546088 GBP346_A0501 GBP346_A0502 mutM mutY TRUE 0.977 5.000 0.021 0.003 Y NA
 7546089 7546090 GBP346_A0503 GBP346_A0504     FALSE 0.297 27.000 0.047 NA   NA
 7546090 7546091 GBP346_A0504 GBP346_A0505     FALSE 0.504 86.000 0.194 NA   NA
 7546091 7546092 GBP346_A0505 GBP346_A0506     TRUE 0.886 129.000 0.177 1.000 Y NA
 7546092 7546093 GBP346_A0506 GBP346_A0507   raiA FALSE 0.189 224.000 0.309 NA N NA
 7546093 7546094 GBP346_A0507 GBP346_A0508 raiA rpoN_1 FALSE 0.575 150.000 0.574 NA N NA
 7546094 7546095 GBP346_A0508 GBP346_A0509 rpoN_1   FALSE 0.381 136.000 0.075 1.000   NA
 7546095 7546096 GBP346_A0509 GBP346_A0510   lptA TRUE 0.825 -3.000 0.543 NA   NA
 7546096 7546097 GBP346_A0510 GBP346_A0511 lptA   TRUE 0.694 19.000 0.459 NA   NA
 7546097 7546098 GBP346_A0511 GBP346_A0512     TRUE 0.842 6.000 0.617 NA   NA
 7546098 7546099 GBP346_A0512 GBP346_A0513     TRUE 0.889 -3.000 0.598 1.000   NA
 7546100 7546101 GBP346_A0514 GBP346_A0515   apt TRUE 0.825 -3.000 0.022 1.000 N NA
 7546101 7546102 GBP346_A0515 GBP346_A0516 apt   TRUE 0.660 94.000 0.022 1.000 N NA
 7546102 7546103 GBP346_A0516 GBP346_A0517     TRUE 0.734 13.000 0.124 1.000   NA
 7546103 7546104 GBP346_A0517 GBP346_A0518   purU_1 TRUE 0.816 52.000 0.955 1.000   NA
 7546105 7546106 GBP346_A0519 GBP346_A0520   uvrA FALSE 0.019 201.000 0.007 NA   NA
 7546107 7546108 GBP346_A0521 GBP346_A0522     TRUE 0.646 114.000 0.037 1.000 N NA
 7546109 7546110 GBP346_A0523 GBP346_A0524     TRUE 0.745 54.000 1.000 NA   NA
 7546116 7546117 GBP346_A0530 GBP346_A0531     FALSE 0.048 76.000 0.000 NA   NA
 7546117 7546118 GBP346_A0531 GBP346_A0532     FALSE 0.021 144.000 0.000 NA   NA
 7546118 7546119 GBP346_A0532 GBP346_A0533     TRUE 0.603 52.000 0.308 NA   NA
 7546119 7546120 GBP346_A0533 GBP346_A0534     TRUE 0.788 -3.000 0.357 NA   NA
 7546120 7546121 GBP346_A0534 GBP346_A0535     FALSE 0.500 22.000 0.143 NA   NA
 7546121 7546122 GBP346_A0535 GBP346_A0536     TRUE 0.611 -27.000 0.333 NA   NA
 7546122 7546123 GBP346_A0536 GBP346_A0537     FALSE 0.054 30.000 0.000 NA   NA
 7546123 7546124 GBP346_A0537 GBP346_A0538     FALSE 0.006 207.000 0.000 NA   NA
 7546126 7546127 GBP346_A0540 GBP346_A0541     TRUE 0.784 18.000 1.000 NA   NA
 7546127 7546128 GBP346_A0541 GBP346_A0542     FALSE 0.004 227.000 0.000 NA   NA
 7546128 7546129 GBP346_A0542 GBP346_A0543     FALSE 0.003 242.000 0.000 NA   NA
 7546129 7546130 GBP346_A0543 GBP346_A0544     TRUE 0.841 -3.000 0.667 NA   NA
 7546131 7546132 GBP346_A0545 GBP346_A0546     TRUE 0.698 11.000 0.226 NA   NA
 7546132 7546133 GBP346_A0546 GBP346_A0547     TRUE 0.820 -3.000 0.194 1.000   NA
 7546133 7546134 GBP346_A0547 GBP346_A0548     TRUE 0.966 2.000 0.889 0.001   NA
 7546134 7546135 GBP346_A0548 GBP346_A0549     FALSE 0.520 92.000 0.205 NA   NA
 7546135 7546136 GBP346_A0549 GBP346_A0550     FALSE 0.481 70.000 0.154 NA   NA
 7546138 7546139 GBP346_A0552 GBP346_A0553     FALSE 0.591 65.000 0.286 NA   NA
 7546140 7546141 GBP346_A0554 GBP346_A0555     TRUE 0.779 77.000 0.667 1.000   NA
 7546141 7546142 GBP346_A0555 GBP346_A0556     TRUE 0.951 35.000 0.545 1.000 Y NA
 7546142 7546143 GBP346_A0556 GBP346_A0557     TRUE 0.808 -3.000 0.455 NA   NA
 7546143 7546144 GBP346_A0557 GBP346_A0558     TRUE 0.713 -33.000 0.800 NA   NA
 7546145 7546146 GBP346_A0559 GBP346_A0560     TRUE 0.802 28.000 0.667 1.000   NA
 7546146 7546147 GBP346_A0560 GBP346_A0561     TRUE 0.669 50.000 0.500 NA   NA
 7546147 7546148 GBP346_A0561 GBP346_A0562     FALSE 0.000 627.000 0.000 NA   NA
 7546149 7546150 GBP346_A0563 GBP346_A0564     TRUE 0.818 -3.000 0.500 NA   NA
 7546150 7546151 GBP346_A0564 GBP346_A0565     TRUE 0.831 -3.000 0.583 NA   NA
 7546151 7546152 GBP346_A0565 GBP346_A0566     TRUE 0.792 -3.000 0.375 NA   NA
 7546152 7546153 GBP346_A0566 GBP346_A0567     TRUE 0.823 -3.000 0.520 NA   NA
 7546153 7546154 GBP346_A0567 GBP346_A0568     TRUE 0.872 -3.000 0.440 1.000   NA
 7546154 7546155 GBP346_A0568 GBP346_A0569     FALSE 0.031 245.000 0.000 1.000   NA
 7546155 7546156 GBP346_A0569 GBP346_A0570     TRUE 0.818 -3.000 0.500 NA   NA
 7546157 7546158 GBP346_A0571 GBP346_A0572     FALSE 0.000 531.000 0.000 NA   NA
 7546158 7546159 GBP346_A0572 GBP346_A0573     TRUE 0.817 33.000 0.636 NA N NA
 7546159 7546160 GBP346_A0573 GBP346_A0574     TRUE 0.938 72.000 0.857 NA Y NA
 7546160 7546161 GBP346_A0574 GBP346_A0575     TRUE 0.731 181.000 0.364 1.000 Y NA
 7546162 7546163 GBP346_A0576 GBP346_A0577     FALSE 0.583 22.000 0.231 NA   NA
 7546164 7546165 GBP346_A0578 GBP346_A0580     FALSE 0.358 92.000 0.081 NA   NA
 7546167 7546168 GBP346_A0581 GBP346_A0582     TRUE 0.802 49.000 0.553 NA N NA
 7546169 7546170 GBP346_A0583 GBP346_A0584     FALSE 0.268 150.000 0.052 1.000   NA
 7546171 7546172 GBP346_A0585 GBP346_A0586     TRUE 0.940 2.000 0.558 1.000 N NA
 7546172 7546173 GBP346_A0586 GBP346_A0587     FALSE 0.460 11.000 0.058 NA   NA
 7546173 7546174 GBP346_A0587 GBP346_A0588     FALSE 0.540 -3.000 0.068 NA   NA
 7546175 7546176 GBP346_A0589 GBP346_A0590 queF ilvA_1 FALSE 0.581 20.000 0.062 1.000   NA
 7546176 7546177 GBP346_A0590 GBP346_A0591 ilvA_1   FALSE 0.002 275.000 0.000 NA   NA
 7546178 7546179 GBP346_A0592 GBP346_A0593     TRUE 0.790 20.000 0.118 1.000 N NA
 7546179 7546180 GBP346_A0593 GBP346_A0594     FALSE 0.578 -3.000 0.084 NA   NA
 7546180 7546181 GBP346_A0594 GBP346_A0595     FALSE 0.361 48.000 0.074 NA   NA
 7546181 7546182 GBP346_A0595 GBP346_A0596     FALSE 0.493 90.000 0.044 1.000   NA
 7546182 7546183 GBP346_A0596 GBP346_A0597     TRUE 0.613 81.000 0.135 1.000   NA
 7546183 7546184 GBP346_A0597 GBP346_A0598   ubiB TRUE 0.835 13.000 0.432 1.000   NA
 7546184 7546185 GBP346_A0598 GBP346_A0599 ubiB   FALSE 0.107 -3.000 0.000 NA   NA
 7546185 7546186 GBP346_A0599 GBP346_A0600     FALSE 0.054 26.000 0.000 NA   NA
 7546186 7546187 GBP346_A0600 GBP346_A0601     FALSE 0.266 101.000 0.050 NA   NA
 7546187 7546188 GBP346_A0601 GBP346_A0602     FALSE 0.511 71.000 0.190 NA   NA
 7546188 7546189 GBP346_A0602 GBP346_A0603   aspS FALSE 0.319 57.000 0.057 NA   NA
 7546189 7546190 GBP346_A0603 GBP346_A0604 aspS nudB FALSE 0.194 210.000 0.050 1.000 N NA
 7546190 7546191 GBP346_A0604 GBP346_A0605 nudB   TRUE 0.874 -3.000 0.105 1.000 N NA
 7546191 7546192 GBP346_A0605 GBP346_A0606     FALSE 0.218 190.000 0.176 1.000   NA
 7546192 7546193 GBP346_A0606 GBP346_A0607     TRUE 0.806 58.000 0.767 1.000   NA
 7546193 7546194 GBP346_A0607 GBP346_A0608     TRUE 0.751 158.000 0.108 1.000 Y NA
 7546194 7546195 GBP346_A0608 GBP346_A0609     TRUE 0.769 180.000 0.588 1.000 Y NA
 7546195 7546196 GBP346_A0609 GBP346_A0610     TRUE 0.936 17.000 0.100 1.000 Y NA
 7546199 7546200 GBP346_A0613 GBP346_A0614     FALSE 0.321 46.000 0.059 NA   NA
 7546201 7546202 GBP346_A0615 GBP346_A0616     FALSE 0.465 12.000 0.064 NA   NA
 7546203 7546204 GBP346_A0617 GBP346_A0618     TRUE 0.852 4.000 0.642 NA   NA
 7546205 7546206 GBP346_A0619 GBP346_A0620     TRUE 0.792 61.000 0.168 1.000 N NA
 7546206 7546207 GBP346_A0620 GBP346_A0621   pdxA TRUE 0.870 22.000 0.561 1.000 N NA
 7546207 7546208 GBP346_A0621 GBP346_A0622 pdxA ksgA TRUE 0.805 32.000 0.197 1.000 N NA
 7546211 7546212 GBP346_A0624 GBP346_A0626     FALSE 0.128 85.000 0.006 NA   NA
 7546212 7546213 GBP346_A0626 GBP346_A0627     FALSE 0.409 48.000 0.099 NA   NA
 7546213 7546214 GBP346_A0627 GBP346_A0628     TRUE 0.822 43.000 0.279 1.000 N NA
 7546214 7546215 GBP346_A0628 GBP346_A0629   glyS TRUE 0.807 18.000 0.123 1.000 N NA
 7546215 7546216 GBP346_A0629 GBP346_A0630 glyS glyQ TRUE 0.984 17.000 0.651 0.001 Y NA
 7546216 7546217 GBP346_A0630 GBP346_A0631 glyQ lnt FALSE 0.075 256.000 0.000 1.000 N NA
 7546217 7546218 GBP346_A0631 GBP346_A0632 lnt   TRUE 0.803 43.000 0.557 NA N NA
 7546218 7546219 GBP346_A0632 GBP346_A0633     FALSE 0.048 503.000 0.019 NA Y NA
 7546219 7546220 GBP346_A0633 GBP346_A0634     FALSE 0.193 21.000 0.014 NA   NA
 7546221 7546222 GBP346_A0635 GBP346_A0636     FALSE 0.039 119.000 0.000 NA   NA
 7546223 7546224 GBP346_A0637 GBP346_A0638   miaB TRUE 0.818 24.000 0.220 1.000 N NA
 7546224 7546225 GBP346_A0638 GBP346_A0639 miaB   FALSE 0.051 52.000 0.000 NA   NA
 7546225 7546226 GBP346_A0639 GBP346_A0640     FALSE 0.047 93.000 0.000 NA   NA
 7546226 7546227 GBP346_A0640 GBP346_A0641     TRUE 0.650 -3.000 0.125 NA   NA
 7546228 7546229 GBP346_A0642 GBP346_A0643     FALSE 0.553 134.000 0.194 NA N NA
 7546229 7546230 GBP346_A0643 GBP346_A0645   ribB FALSE 0.019 424.000 0.000 1.000 N NA
 7546231 7546232 GBP346_A0646 GBP346_A0647     FALSE 0.323 130.000 0.122 NA   NA
 7546232 7546233 GBP346_A0647 GBP346_A0648     FALSE 0.462 77.000 0.146 NA   NA
 7546233 7546234 GBP346_A0648 GBP346_A0649   asnB_1 TRUE 0.892 44.000 0.023 1.000 Y NA
 7546234 7546235 GBP346_A0649 GBP346_A0650 asnB_1   TRUE 0.884 44.000 0.007 1.000 Y NA
 7546235 7546236 GBP346_A0650 GBP346_A0651     TRUE 0.950 39.000 0.017 0.001 Y NA
 7546236 7546237 GBP346_A0651 GBP346_A0652     FALSE 0.525 22.000 0.007 NA N NA
 7546239 7546240 GBP346_A0654 GBP346_A0655   glpK TRUE 0.733 113.000 0.131 1.000 N NA
 7546240 7546241 GBP346_A0655 GBP346_A0656 glpK   TRUE 0.952 52.000 0.032 0.001 Y NA
 7546248 7546249 GBP346_A0663 GBP346_A0664     FALSE 0.592 70.000 0.306 NA   NA
 7546250 7546251 GBP346_A0665 GBP346_A0666 rhlE   TRUE 0.649 128.000 0.088 1.000 N NA
 7546251 7546252 GBP346_A0666 GBP346_A0667     TRUE 0.979 20.000 1.000 0.013 Y NA
 7546253 7546254 GBP346_A0668 GBP346_A0669     TRUE 0.771 -3.000 0.308 NA   NA
 7546259 7546260 GBP346_A0673 GBP346_A0675     TRUE 0.952 50.000 0.636 1.000 Y NA
 7546260 7546261 GBP346_A0675 GBP346_A0676     FALSE 0.590 23.000 0.250 NA   NA
 7546262 7546263 GBP346_A0677 GBP346_A0678     FALSE 0.292 149.000 0.214 NA   NA
 7546264 7546265 GBP346_A0679 GBP346_A0680     FALSE 0.430 81.000 0.125 NA   NA
 7546268 7546269 GBP346_A0683 GBP346_A0684     TRUE 0.704 -3.000 0.182 NA   NA
 7546269 7546270 GBP346_A0684 GBP346_A0685   ybbB FALSE 0.185 50.000 0.016 NA   NA
 7546271 7546272 GBP346_A0686 GBP346_A0687     FALSE 0.317 164.000 0.444 NA   NA
 7546273 7546274 GBP346_A0688 GBP346_A0689     FALSE 0.107 -3.000 0.000 NA   NA
 7546275 7546276 GBP346_A0690 GBP346_A0691     TRUE 0.940 66.000 0.333 1.000 Y NA
 7546277 7546278 GBP346_A0692 GBP346_A0693     TRUE 0.764 -45.000 0.667 1.000   NA
 7546278 7546279 GBP346_A0693 GBP346_A0694   pncB_1 TRUE 0.828 -3.000 0.025 1.000 N NA
 7546279 7546280 GBP346_A0694 GBP346_A0695 pncB_1   FALSE 0.241 151.000 0.038 1.000   NA
 7546281 7546282 GBP346_A0696 GBP346_A0697     FALSE 0.325 -3.000 0.014 NA   NA
 7546282 7546283 GBP346_A0697 GBP346_A0698     TRUE 0.666 66.000 0.500 NA   NA
 7546283 7546284 GBP346_A0698 GBP346_A0699     TRUE 0.740 -9.000 0.600 NA   NA
 7546284 7546285 GBP346_A0699 GBP346_A0700     TRUE 0.764 -3.000 0.286 NA   NA
 7546285 7546286 GBP346_A0700 GBP346_A0701     TRUE 0.983 17.000 0.786 0.003 Y NA
 7546286 7546287 GBP346_A0701 GBP346_A0702     TRUE 0.725 53.000 0.062 1.000 N NA
 7546288 7546289 GBP346_A0703 GBP346_A0704     TRUE 0.755 -10.000 0.750 NA   NA
 7546289 7546290 GBP346_A0704 GBP346_A0705     TRUE 0.818 -3.000 0.500 NA   NA
 7546290 7546291 GBP346_A0705 GBP346_A0706     FALSE 0.439 -10.000 0.088 NA   NA
 7546292 7546293 GBP346_A0707 GBP346_A0708 vasA_1   TRUE 0.694 53.000 0.600 NA   NA
 7546293 7546294 GBP346_A0708 GBP346_A0709     FALSE 0.003 239.000 0.000 NA   NA
 7546295 7546296 GBP346_A0710 GBP346_A0711     FALSE 0.389 30.000 0.000 1.000   NA
 7546297 7546298 GBP346_A0712 GBP346_A0713     TRUE 0.793 -30.000 0.733 1.000   NA
 7546298 7546299 GBP346_A0713 GBP346_A0714     TRUE 0.808 27.000 0.733 1.000   NA
 7546299 7546300 GBP346_A0714 GBP346_A0715     TRUE 0.696 8.000 0.182 NA   NA
 7546302 7546303 GBP346_A0717 GBP346_A0718     FALSE 0.001 484.000 0.000 NA   NA
 7546305 7546306 GBP346_A0720 GBP346_A0721     FALSE 0.051 -24.000 0.000 NA   NA
 7546307 7546308 GBP346_A0722 GBP346_A0723     FALSE 0.048 92.000 0.000 NA   NA
 7546309 7546310 GBP346_A0724 GBP346_A0725     FALSE 0.363 73.000 0.000 1.000   NA
 7546310 7546311 GBP346_A0725 GBP346_A0726     FALSE 0.001 413.000 0.000 NA   NA
 7546311 7546312 GBP346_A0726 GBP346_A0727     FALSE 0.000 519.000 0.000 NA   NA
 7546312 7546313 GBP346_A0727 GBP346_A0728     FALSE 0.002 295.000 0.000 NA   NA
 7546315 7546316 GBP346_A0729 GBP346_A0731     FALSE 0.021 144.000 0.000 NA   NA
 7546316 7546317 GBP346_A0731 GBP346_A0732     FALSE 0.052 37.000 0.000 NA   NA
 7546317 7546318 GBP346_A0732 GBP346_A0733     TRUE 0.688 67.000 0.600 NA   NA
 7546318 7546319 GBP346_A0733 GBP346_A0734     FALSE 0.044 223.000 0.000 1.000   NA
 7546319 7546320 GBP346_A0734 GBP346_A0735     TRUE 0.959 24.000 0.812 1.000 Y NA
 7546321 7546322 GBP346_A0736 GBP346_A0737 recA   TRUE 0.870 0.000 0.296 1.000   NA
 7546322 7546323 GBP346_A0737 GBP346_A0738     FALSE 0.065 145.000 0.010 NA   NA
 7546323 7546324 GBP346_A0738 GBP346_A0739     FALSE 0.345 80.000 0.076 NA   NA
 7546324 7546325 GBP346_A0739 GBP346_A0740   sucD TRUE 0.961 97.000 0.151 0.001 Y NA
 7546325 7546326 GBP346_A0740 GBP346_A0741 sucD   FALSE 0.569 151.000 0.220 1.000 N NA
 7546326 7546327 GBP346_A0741 GBP346_A0742     TRUE 0.817 114.000 0.462 1.000 N NA
 7546327 7546328 GBP346_A0742 GBP346_A0743     FALSE 0.148 238.000 0.229 NA N NA
 7546328 7546329 GBP346_A0743 GBP346_A0744     FALSE 0.315 51.000 0.057 NA   NA
 7546329 7546330 GBP346_A0744 GBP346_A0745     TRUE 0.650 -3.000 0.125 NA   NA
 7546330 7546331 GBP346_A0745 GBP346_A0746     TRUE 0.722 10.000 0.250 NA   NA
 7546331 7546332 GBP346_A0746 GBP346_A0747     TRUE 0.629 17.000 0.222 NA   NA
 7546333 7546334 GBP346_A0748 GBP346_A0749 moaC   FALSE 0.198 12.000 0.003 NA   NA
 7546336 7546337 GBP346_A0751 GBP346_A0752     FALSE 0.272 42.000 0.043 NA   NA
 7546337 7546338 GBP346_A0752 GBP346_A0753     FALSE 0.536 -7.000 0.131 NA   NA
 7546338 7546339 GBP346_A0753 GBP346_A0754     FALSE 0.399 20.000 0.075 NA   NA
 7546339 7546340 GBP346_A0754 GBP346_A0755   rfaF FALSE 0.255 132.000 0.088 NA   NA
 7546340 7546341 GBP346_A0755 GBP346_A0756 rfaF   FALSE 0.362 128.000 0.138 NA   NA
 7546341 7546342 GBP346_A0756 GBP346_A0757   ilvE_1 FALSE 0.554 66.000 0.223 NA   NA
 7546343 7546344 GBP346_A0758 GBP346_A0759     TRUE 0.804 -3.000 0.434 NA   NA
 7546344 7546345 GBP346_A0759 GBP346_A0760   pgk FALSE 0.088 132.000 0.009 NA   NA
 7546345 7546346 GBP346_A0760 GBP346_A0761 pgk   FALSE 0.114 81.000 0.003 NA   NA
 7546346 7546347 GBP346_A0761 GBP346_A0762   pyk_1 FALSE 0.266 -21.000 0.038 NA   NA
 7546347 7546348 GBP346_A0762 GBP346_A0763 pyk_1 fba FALSE 0.504 281.000 0.218 0.004 Y NA
 7546348 7546349 GBP346_A0763 GBP346_A0764 fba purC FALSE 0.263 190.000 0.055 1.000 N NA
 7546349 7546350 GBP346_A0764 GBP346_A0765 purC purE TRUE 0.898 36.000 0.038 1.000 Y NA
 7546350 7546351 GBP346_A0765 GBP346_A0766 purE purK TRUE 0.965 80.000 0.201 0.001 Y NA
 7546351 7546352 GBP346_A0766 GBP346_A0767 purK   TRUE 0.675 12.000 0.027 NA N NA
 7546353 7546354 GBP346_A0768 GBP346_A0769     TRUE 0.895 105.000 0.255 NA Y NA
 7546354 7546355 GBP346_A0769 GBP346_A0770     FALSE 0.005 209.000 0.000 NA   NA
 7546355 7546356 GBP346_A0770 GBP346_A0771   dacB FALSE 0.214 -24.000 0.024 NA   NA
 7546357 7546358 GBP346_A0772 GBP346_A0773     FALSE 0.041 -166.000 0.000 NA   NA
 7546358 7546359 GBP346_A0773 GBP346_A0774     TRUE 0.981 4.000 0.724 1.000 Y NA
 7546359 7546360 GBP346_A0774 GBP346_A0775     FALSE 0.262 136.000 0.111 NA   NA
 7546360 7546361 GBP346_A0775 GBP346_A0776     FALSE 0.538 57.000 0.200 NA   NA
 7546361 7546362 GBP346_A0776 GBP346_A0777     FALSE 0.514 160.000 0.733 1.000   NA
 7546362 7546363 GBP346_A0777 GBP346_A0778     TRUE 0.634 128.000 0.867 NA   NA
 7546363 7546364 GBP346_A0778 GBP346_A0779     TRUE 0.722 28.000 0.700 NA   NA
 7546366 7546367 GBP346_A0781 GBP346_A0782     TRUE 0.710 20.000 0.545 NA   NA
 7546367 7546368 GBP346_A0782 GBP346_A0783     TRUE 0.910 16.000 0.750 1.000 N NA
 7546368 7546369 GBP346_A0783 GBP346_A0784     TRUE 0.951 4.000 0.250 0.056 N NA
 7546369 7546370 GBP346_A0784 GBP346_A0786     TRUE 0.687 88.000 0.667 NA   NA
 7546371 7546372 GBP346_A0785 GBP346_A0787     FALSE 0.355 88.000 0.080 NA   NA
 7546375 7546376 GBP346_A0790 GBP346_A0791   fghA TRUE 0.737 14.000 0.136 1.000   NA
 7546377 7546378 GBP346_A0792 GBP346_A0793     TRUE 0.959 -40.000 0.379 0.099 Y NA
 7546378 7546379 GBP346_A0793 GBP346_A0794     TRUE 0.935 35.000 0.233 1.000 Y NA
 7546379 7546380 GBP346_A0794 GBP346_A0795     FALSE 0.589 190.000 0.080 1.000 Y NA
 7546381 7546382 GBP346_A0796 GBP346_A0797     FALSE 0.206 -45.000 0.029 NA   NA
 7546382 7546383 GBP346_A0797 GBP346_A0798     TRUE 0.863 5.000 0.059 1.000 N NA
 7546383 7546384 GBP346_A0798 GBP346_A0799     TRUE 0.891 -12.000 0.000 1.000 Y NA
 7546384 7546385 GBP346_A0799 GBP346_A0800     TRUE 0.875 51.000 0.000 1.000 Y NA
 7546385 7546386 GBP346_A0800 GBP346_A0801     TRUE 0.978 -3.000 0.148 0.056 Y NA
 7546386 7546387 GBP346_A0801 GBP346_A0802     TRUE 0.988 -3.000 0.918 0.056 Y NA
 7546387 7546388 GBP346_A0802 GBP346_A0803     TRUE 0.703 -3.000 0.045 1.000   NA
 7546388 7546389 GBP346_A0803 GBP346_A0805     TRUE 0.706 61.000 0.250 1.000   NA
 7546390 7546391 GBP346_A0804 GBP346_A0806     FALSE 0.107 -3.000 0.000 NA   NA
 7546391 7546392 GBP346_A0806 GBP346_A0807     FALSE 0.339 145.000 0.087 1.000   NA
 7546393 7546394 GBP346_A0808 GBP346_A0809     TRUE 0.856 -3.000 0.222 NA N NA
 7546395 7546396 GBP346_A0810 GBP346_A0811   xylB_1 TRUE 0.744 87.000 0.109 1.000 N NA
 7546396 7546397 GBP346_A0811 GBP346_A0812 xylB_1   TRUE 0.931 37.000 0.200 1.000 Y NA
 7546397 7546398 GBP346_A0812 GBP346_A0813     FALSE 0.460 172.000 0.229 1.000 N NA
 7546399 7546400 GBP346_A0814 GBP346_A0815     FALSE 0.441 136.000 0.000 1.000 N NA
 7546400 7546401 GBP346_A0815 GBP346_A0816   panE_1 TRUE 0.917 5.000 0.263 1.000 N NA
 7546404 7546405 GBP346_A0819 GBP346_A0820 kynA kynU TRUE 0.936 84.000 0.347 1.000 Y NA
 7546405 7546406 GBP346_A0820 GBP346_A0821 kynU kynB TRUE 0.613 42.000 0.111 1.000   NA
 7546410 7546411 GBP346_A0825 GBP346_A0826     FALSE 0.383 -30.000 0.088 NA   NA
 7546411 7546412 GBP346_A0826 GBP346_A0827     TRUE 0.638 27.000 0.353 NA   NA
 7546412 7546413 GBP346_A0827 GBP346_A0828   pdxH FALSE 0.552 132.000 0.036 1.000 N NA
 7546415 7546416 GBP346_A0830 GBP346_A0831     FALSE 0.227 54.000 0.027 NA   NA
 7546417 7546418 GBP346_A0832 GBP346_A0833     FALSE 0.032 217.000 0.046 NA   NA
 7546419 7546420 GBP346_A0834 GBP346_A0835     FALSE 0.348 -18.000 0.063 NA   NA
 7546421 7546422 GBP346_A0836 GBP346_A0837     TRUE 0.690 71.000 0.040 1.000 N NA
 7546422 7546423 GBP346_A0837 GBP346_A0838   xerD TRUE 0.959 0.000 0.046 1.000 Y NA
 7546425 7546426 GBP346_A0840 GBP346_A0841 ybaK   FALSE 0.498 109.000 0.061 1.000   NA
 7546432 7546433 GBP346_A0847 GBP346_A0848 mviN   TRUE 0.710 10.000 0.069 1.000   NA
 7546434 7546435 GBP346_A0849 GBP346_A0850     TRUE 0.839 -3.000 0.042 1.000 N NA
 7546435 7546436 GBP346_A0850 GBP346_A0851   kdsB FALSE 0.200 209.000 0.056 1.000 N NA
 7546436 7546437 GBP346_A0851 GBP346_A0852 kdsB   FALSE 0.319 174.000 0.265 1.000   NA
 7546437 7546438 GBP346_A0852 GBP346_A0853   lpxK TRUE 0.878 -19.000 0.263 0.001   NA
 7546438 7546439 GBP346_A0853 GBP346_A0854 lpxK   FALSE 0.100 124.000 0.006 NA   NA
 7546440 7546441 GBP346_A0855 GBP346_A0856 xseA   FALSE 0.224 197.000 0.037 1.000 N NA
 7546441 7546442 GBP346_A0856 GBP346_A0857     FALSE 0.025 270.000 0.000 1.000   NA
 7546442 7546443 GBP346_A0857 GBP346_A0858     FALSE 0.303 165.000 0.429 NA   NA
 7546444 7546445 GBP346_A0859 GBP346_A0860     FALSE 0.128 216.000 0.000 1.000 N NA
 7546446 7546447 GBP346_A0861 GBP346_A0862   panE_2 FALSE 0.453 16.000 0.074 NA   NA
 7546457 7546458 GBP346_A0872 GBP346_A0874     TRUE 0.865 -3.000 1.000 NA   NA
 7546460 7546461 GBP346_A0875 GBP346_A0876     FALSE 0.051 64.000 0.000 NA   NA
 7546461 7546462 GBP346_A0876 GBP346_A0877     FALSE 0.052 61.000 0.000 NA   NA
 7546462 7546463 GBP346_A0877 GBP346_A0878     TRUE 0.716 28.000 0.667 NA   NA
 7546463 7546464 GBP346_A0878 GBP346_A0879     TRUE 0.683 -45.000 0.750 NA   NA
 7546465 7546466 GBP346_A0880 GBP346_A0881 fusA_1   FALSE 0.346 125.000 0.115 NA   NA
 7546466 7546467 GBP346_A0881 GBP346_A0882     FALSE 0.292 -3.000 0.010 NA   NA
 7546467 7546468 GBP346_A0882 GBP346_A0883     FALSE 0.002 674.000 0.016 NA   NA
 7546473 7546474 GBP346_A0888 GBP346_A0889 clpS clpA TRUE 0.832 -3.000 0.596 NA   NA
 7546474 7546475 GBP346_A0889 GBP346_A0890 clpA   TRUE 0.643 100.000 0.018 1.000 N NA
 7546475 7546476 GBP346_A0890 GBP346_A0891     TRUE 0.680 88.000 0.636 NA   NA
 7546476 7546477 GBP346_A0891 GBP346_A0892     FALSE 0.260 165.000 0.292 NA   NA
 7546478 7546479 GBP346_A0893 GBP346_A0894   coaBC TRUE 0.802 64.000 0.201 1.000 N NA
 7546479 7546480 GBP346_A0894 GBP346_A0895 coaBC lspA TRUE 0.685 62.000 0.024 1.000 N NA
 7546480 7546481 GBP346_A0895 GBP346_A0896 lspA ileS_1 TRUE 0.876 0.000 0.071 1.000 N NA
 7546481 7546482 GBP346_A0896 GBP346_A0897 ileS_1 ribF TRUE 0.783 112.000 0.254 1.000 N NA
 7546483 7546484 GBP346_A0898 GBP346_A0899 purN   TRUE 0.802 -3.000 0.099 NA N NA
 7546484 7546485 GBP346_A0899 GBP346_A0900     FALSE 0.481 12.000 0.069 NA   NA
 7546485 7546486 GBP346_A0900 GBP346_A0901     FALSE 0.126 206.000 0.078 1.000   NA
 7546488 7546489 GBP346_A0903 GBP346_A0904 nadA nadC TRUE 0.984 -3.000 0.198 0.003 Y NA
 7546490 7546491 GBP346_A0905 GBP346_A0906 nadB rpmG TRUE 0.680 57.000 0.019 1.000 N NA
 7546491 7546492 GBP346_A0906 GBP346_A0907 rpmG rpmB TRUE 0.946 18.000 0.002 0.014 Y NA
 7546492 7546493 GBP346_A0907 GBP346_A0908 rpmB radC TRUE 0.750 36.000 0.091 1.000 N NA
 7546494 7546495 GBP346_A0909 GBP346_A0910   ispH_1 TRUE 0.942 3.000 0.626 1.000 N NA
 7546495 7546496 GBP346_A0910 GBP346_A0911 ispH_1   FALSE 0.002 290.000 0.000 NA   NA
 7546496 7546497 GBP346_A0911 GBP346_A0912     FALSE 0.004 223.000 0.000 NA   NA
 7546497 7546498 GBP346_A0912 GBP346_A0913     TRUE 0.985 11.000 0.917 0.056 Y NA
 7546498 7546499 GBP346_A0913 GBP346_A0914     TRUE 0.939 63.000 0.303 1.000 Y NA
 7546499 7546500 GBP346_A0914 GBP346_A0915     TRUE 0.980 12.000 0.333 0.023 Y NA
 7546500 7546501 GBP346_A0915 GBP346_A0916     FALSE 0.571 45.000 0.250 NA   NA
 7546502 7546503 GBP346_A0917 GBP346_A0918     TRUE 0.669 17.000 0.099 1.000   NA
 7546503 7546504 GBP346_A0918 GBP346_A0919     FALSE 0.081 277.000 0.040 1.000 N NA
 7546506 7546507 GBP346_A0920 GBP346_A0922     FALSE 0.506 33.000 0.160 NA   NA
 7546509 7546510 GBP346_A0924 GBP346_A0925     TRUE 0.936 115.000 0.115 0.059 Y NA
 7546512 7546513 GBP346_A0927 GBP346_A0928     TRUE 0.706 15.000 0.111 1.000   NA
 7546513 7546514 GBP346_A0928 GBP346_A0929     TRUE 0.817 82.000 0.333 1.000 N NA
 7546515 7546516 GBP346_A0930 GBP346_A0931     FALSE 0.353 99.000 0.086 NA   NA
 7546516 7546517 GBP346_A0931 GBP346_A0932     FALSE 0.000 857.000 0.000 NA   NA
 7546517 7546518 GBP346_A0932 GBP346_A0933     FALSE 0.001 436.000 0.000 NA   NA
 7546518 7546519 GBP346_A0933 GBP346_A0934     FALSE 0.004 221.000 0.000 NA   NA
 7546519 7546520 GBP346_A0934 GBP346_A0935     TRUE 0.683 26.000 0.500 NA   NA
 7546522 7546523 GBP346_A0937 GBP346_A0938     FALSE 0.550 24.000 0.200 NA   NA
 7546523 7546524 GBP346_A0938 GBP346_A0939     TRUE 0.852 8.000 0.833 NA   NA
 7546524 7546525 GBP346_A0939 GBP346_A0940     FALSE 0.041 114.000 0.000 NA   NA
 7546525 7546526 GBP346_A0940 GBP346_A0941     FALSE 0.000 707.000 0.000 NA   NA
 7546526 7546527 GBP346_A0941 GBP346_A0942     FALSE 0.009 180.000 0.000 NA   NA
 7546529 7546530 GBP346_A0944 GBP346_A0945     FALSE 0.046 -39.000 0.000 NA   NA
 7546530 7546531 GBP346_A0945 GBP346_A0946     FALSE 0.016 152.000 0.000 NA   NA
 7546531 7546532 GBP346_A0946 GBP346_A0947     FALSE 0.003 242.000 0.000 NA   NA
 7546532 7546533 GBP346_A0947 GBP346_A0948     FALSE 0.000 808.000 0.000 NA   NA
 7546534 7546535 GBP346_A0949 GBP346_A0950     FALSE 0.003 238.000 0.000 NA   NA
 7546538 7546539 GBP346_A0953 GBP346_A0954     TRUE 0.623 84.000 0.429 NA   NA
 7546539 7546540 GBP346_A0954 GBP346_A0955     TRUE 0.744 27.000 0.857 NA   NA
 7546540 7546541 GBP346_A0955 GBP346_A0956     FALSE 0.039 254.000 0.000 NA N NA
 7546541 7546542 GBP346_A0956 GBP346_A0957     FALSE 0.413 -12.000 0.000 1.000   NA
 7546542 7546543 GBP346_A0957 GBP346_A0958     TRUE 0.845 -3.000 0.714 NA   NA
 7546543 7546544 GBP346_A0958 GBP346_A0959     TRUE 0.857 -3.000 0.833 NA   NA
 7546544 7546545 GBP346_A0959 GBP346_A0960     FALSE 0.050 436.000 0.000 NA Y NA
 7546545 7546546 GBP346_A0960 GBP346_A0961     FALSE 0.000 1146.000 0.000 NA   NA
 7546546 7546547 GBP346_A0961 GBP346_A0962     TRUE 0.956 -3.000 0.667 0.001   NA
 7546547 7546548 GBP346_A0962 GBP346_A0963     FALSE 0.033 1724.000 0.000 1.000 Y NA
 7546548 7546549 GBP346_A0963 GBP346_A0964     FALSE 0.156 205.000 0.000 1.000 N NA
 7546549 7546550 GBP346_A0964 GBP346_A0965     FALSE 0.044 223.000 0.000 1.000   NA
 7546550 7546551 GBP346_A0965 GBP346_A0966     FALSE 0.002 300.000 0.000 NA   NA
 7546551 7546552 GBP346_A0966 GBP346_A0967     FALSE 0.040 116.000 0.000 NA   NA
 7546552 7546553 GBP346_A0967 GBP346_A0968     FALSE 0.025 379.000 0.000 1.000 N NA
 7546553 7546554 GBP346_A0968 GBP346_A0969     TRUE 0.873 -3.000 0.444 1.000   NA
 7546554 7546555 GBP346_A0969 GBP346_A0970   trbB TRUE 0.869 -3.000 0.409 1.000   NA
 7546555 7546556 GBP346_A0970 GBP346_A0971 trbB   TRUE 0.912 -3.000 0.000 NA Y NA
 7546556 7546557 GBP346_A0971 GBP346_A0972     TRUE 0.912 -3.000 0.000 NA Y NA
 7546557 7546558 GBP346_A0972 GBP346_A0973     TRUE 0.953 11.000 0.333 NA Y NA
 7546558 7546559 GBP346_A0973 GBP346_A0974   trbJ TRUE 0.970 -3.000 0.667 NA Y NA
 7546559 7546560 GBP346_A0974 GBP346_A0975 trbJ trbL TRUE 0.824 49.000 0.000 NA Y NA
 7546560 7546561 GBP346_A0975 GBP346_A0976 trbL   TRUE 0.948 13.000 0.333 NA Y NA
 7546561 7546562 GBP346_A0976 GBP346_A0977   trbG TRUE 0.961 -3.000 0.333 NA Y NA
 7546562 7546563 GBP346_A0977 GBP346_A0978 trbG   TRUE 0.973 3.000 0.667 NA Y NA
 7546563 7546564 GBP346_A0978 GBP346_A0979     TRUE 0.671 -3.000 0.143 NA   NA
 7546566 7546567 GBP346_A0981 GBP346_A0982     FALSE 0.001 365.000 0.000 NA   NA
 7546567 7546568 GBP346_A0982 GBP346_A0983     TRUE 0.974 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 7546568 7546569 GBP346_A0983 GBP346_A0984     FALSE 0.573 -3.000 0.000 1.000   NA
 7546569 7546570 GBP346_A0984 GBP346_A0985     FALSE 0.003 979.000 0.000 1.000   NA
 7546570 7546571 GBP346_A0985 GBP346_A0986     FALSE 0.052 53.000 0.000 NA   NA
 7546571 7546572 GBP346_A0986 GBP346_A0987     FALSE 0.054 30.000 0.000 NA   NA
 7546572 7546573 GBP346_A0987 GBP346_A0988     FALSE 0.001 355.000 0.000 NA   NA
 7546573 7546574 GBP346_A0988 GBP346_A0989     FALSE 0.031 130.000 0.000 NA   NA
 7546575 7546576 GBP346_A0990 GBP346_A0991     FALSE 0.328 155.000 0.000 1.000 N NA
 7546576 7546577 GBP346_A0991 GBP346_A0992     TRUE 0.660 24.000 0.000 0.052   NA
 7546578 7546579 GBP346_A0993 GBP346_A0994     FALSE 0.009 1045.000 0.000 0.055   NA
 7546579 7546580 GBP346_A0994 GBP346_A0995     FALSE 0.042 229.000 0.000 1.000   NA
 7546580 7546581 GBP346_A0995 GBP346_A0996     FALSE 0.378 53.000 0.000 1.000   NA
 7546581 7546582 GBP346_A0996 GBP346_A0997     FALSE 0.378 39.000 0.000 1.000   NA
 7546583 7546584 GBP346_A0998 GBP346_A0999     FALSE 0.307 159.000 0.341 NA   NA
 7546585 7546586 GBP346_A1000 GBP346_A1001     TRUE 0.603 25.000 0.273 NA   NA
 7546586 7546587 GBP346_A1001 GBP346_A1002     TRUE 0.667 -3.000 0.139 NA   NA
 7546587 7546588 GBP346_A1002 GBP346_A1003     TRUE 0.890 81.000 0.048 1.000 Y NA
 7546588 7546589 GBP346_A1003 GBP346_A1004     TRUE 0.944 23.000 0.636 0.001 N NA
 7546589 7546590 GBP346_A1004 GBP346_A1005   cobA_1 TRUE 0.845 54.000 0.411 1.000 N NA
 7546591 7546592 GBP346_A1006 GBP346_A1007 cbiX   FALSE 0.553 32.000 0.059 1.000   NA
 7546592 7546593 GBP346_A1007 GBP346_A1008     TRUE 0.943 4.000 0.631 0.058   NA
 7546594 7546595 GBP346_A1009 GBP346_A1010     TRUE 0.852 44.000 0.494 1.000 N NA
 7546595 7546596 GBP346_A1010 GBP346_A1011     FALSE 0.166 22.000 0.009 NA   NA
 7546597 7546598 GBP346_A1012 GBP346_A1013     FALSE 0.402 44.000 0.094 NA   NA
 7546598 7546599 GBP346_A1013 GBP346_A1014   ilvD FALSE 0.216 48.000 0.025 NA   NA
 7546600 7546601 GBP346_A1015 GBP346_A1016     FALSE 0.107 -3.000 0.000 NA   NA
 7546601 7546602 GBP346_A1016 GBP346_A1017   lgt FALSE 0.107 -3.000 0.000 NA   NA
 7546605 7546606 GBP346_A1020 GBP346_A1021     FALSE 0.048 76.000 0.000 NA   NA
 7546606 7546607 GBP346_A1021 GBP346_A1022     FALSE 0.047 83.000 0.000 NA   NA
 7546607 7546608 GBP346_A1022 GBP346_A1023     FALSE 0.381 -3.000 0.025 NA   NA
 7546611 7546612 GBP346_A1027 GBP346_A1028     TRUE 0.963 -3.000 0.130 1.000 Y NA
 7546612 7546613 GBP346_A1028 GBP346_A1029   cobT TRUE 0.898 44.000 0.042 1.000 Y NA
 7546613 7546614 GBP346_A1029 GBP346_A1030 cobT cobS TRUE 0.981 7.000 0.164 0.010 Y NA
 7546614 7546615 GBP346_A1030 GBP346_A1031 cobS cobC TRUE 0.772 -15.000 0.102 1.000 N NA
 7546615 7546616 GBP346_A1031 GBP346_A1033 cobC   FALSE 0.250 47.000 0.035 NA   NA
 7546617 7546618 GBP346_A1032 GBP346_A1034   btuF FALSE 0.060 166.000 0.025 NA   NA
 7546618 7546619 GBP346_A1034 GBP346_A1035 btuF   TRUE 0.900 6.000 0.180 1.000 N NA
 7546619 7546620 GBP346_A1035 GBP346_A1036   cobD TRUE 0.936 -7.000 0.463 0.010 N NA
 7546620 7546621 GBP346_A1036 GBP346_A1037 cobD   TRUE 0.948 -6.000 0.191 1.000 Y NA
 7546622 7546623 GBP346_A1038 GBP346_A1039 cobQ   FALSE 0.006 281.000 0.005 NA   NA
 7546623 7546624 GBP346_A1039 GBP346_A1040     FALSE 0.012 359.000 0.092 NA   NA
 7546625 7546626 GBP346_A1041 GBP346_A1042 panD panC TRUE 0.942 53.000 0.342 1.000 Y NA
 7546626 7546627 GBP346_A1042 GBP346_A1043 panC   FALSE 0.001 402.000 0.000 NA   NA
 7546627 7546628 GBP346_A1043 GBP346_A1044     FALSE 0.019 193.000 0.003 NA   NA
 7546628 7546629 GBP346_A1044 GBP346_A1045     FALSE 0.498 5.000 0.048 NA   NA
 7546630 7546631 GBP346_A1046 GBP346_A1047     TRUE 0.778 14.000 0.575 NA   NA
 7546631 7546632 GBP346_A1047 GBP346_A1048     FALSE 0.002 296.000 0.000 NA   NA
 7546632 7546633 GBP346_A1048 GBP346_A1050     TRUE 0.818 -3.000 0.500 NA   NA
 7546634 7546635 GBP346_A1049 GBP346_A1051   metG FALSE 0.003 247.000 0.000 NA   NA
 7546635 7546636 GBP346_A1051 GBP346_A1052 metG   FALSE 0.016 482.000 0.000 1.000 N NA
 7546637 7546638 GBP346_A1053 GBP346_A1054   sodC FALSE 0.521 133.000 0.021 1.000 N NA
 7546638 7546639 GBP346_A1054 GBP346_A1055 sodC dcd TRUE 0.637 104.000 0.017 1.000 N NA
 7546639 7546640 GBP346_A1055 GBP346_A1056 dcd   TRUE 0.726 103.000 0.105 1.000 N NA
 7546640 7546641 GBP346_A1056 GBP346_A1057     TRUE 0.696 3.000 0.141 NA   NA
 7546642 7546643 GBP346_A1058 GBP346_A1059   argH_1 FALSE 0.448 33.000 0.009 1.000   NA
 7546643 7546644 GBP346_A1059 GBP346_A1060 argH_1   FALSE 0.288 169.000 0.002 1.000 N NA
 7546644 7546645 GBP346_A1060 GBP346_A1061     FALSE 0.027 782.000 0.000 NA Y NA
 7546645 7546646 GBP346_A1061 GBP346_A1062     TRUE 0.774 8.000 0.333 NA   NA
 7546648 7546649 GBP346_A1063 GBP346_A1065     FALSE 0.501 -3.000 0.056 NA   NA
 7546652 7546653 GBP346_A1068 GBP346_A1069   hemC FALSE 0.143 35.000 0.006 NA   NA
 7546653 7546654 GBP346_A1069 GBP346_A1070 hemC   TRUE 0.979 0.000 0.023 0.002 Y NA
 7546654 7546655 GBP346_A1070 GBP346_A1072     TRUE 0.981 5.000 0.765 1.000 Y NA
 7546656 7546657 GBP346_A1071 GBP346_A1073     FALSE 0.389 33.000 0.083 NA   NA
 7546657 7546658 GBP346_A1073 GBP346_A1074     TRUE 0.808 39.000 0.588 NA N NA
 7546658 7546659 GBP346_A1074 GBP346_A1075     TRUE 0.905 87.000 0.529 0.062 N NA
 7546662 7546663 GBP346_A1078 GBP346_A1079     TRUE 0.695 71.000 0.667 NA   NA
 7546665 7546666 GBP346_A1081 GBP346_A1082 nadE_1   TRUE 0.826 61.000 0.288 1.000 N NA
 7546669 7546670 GBP346_A1084 GBP346_A1086     TRUE 0.948 35.000 0.467 1.000 Y NA
 7546670 7546671 GBP346_A1086 GBP346_A1087     TRUE 0.986 -3.000 0.467 0.012 Y NA
 7546671 7546672 GBP346_A1087 GBP346_A1088     FALSE 0.531 211.000 0.000 0.066 Y NA
 7546672 7546673 GBP346_A1088 GBP346_A1089     FALSE 0.506 -39.000 0.200 NA   NA
 7546676 7546677 GBP346_A1092 GBP346_A1093   ompR FALSE 0.548 68.000 0.222 NA   NA
 7546677 7546678 GBP346_A1093 GBP346_A1094 ompR   TRUE 0.938 -16.000 0.227 1.000 Y NA
 7546679 7546680 GBP346_A1095 GBP346_A1096     FALSE 0.476 127.000 0.267 NA   NA
 7546681 7546682 GBP346_A1097 GBP346_A1098     TRUE 0.958 54.000 0.846 1.000 Y NA
 7546683 7546684 GBP346_A1099 GBP346_A1100     FALSE 0.597 57.000 0.286 NA   NA
 7546684 7546685 GBP346_A1100 GBP346_A1101     TRUE 0.838 -3.000 0.647 NA   NA
 7546685 7546686 GBP346_A1101 GBP346_A1102     FALSE 0.001 364.000 0.000 NA   NA
 7546687 7546688 GBP346_A1103 GBP346_A1104 otsA_1   TRUE 0.644 -7.000 0.255 NA   NA
 7546689 7546690 GBP346_A1105 GBP346_A1106     FALSE 0.000 770.000 0.000 NA   NA
 7546690 7546691 GBP346_A1106 GBP346_A1107     FALSE 0.436 124.000 0.196 NA   NA
 7546691 7546692 GBP346_A1107 GBP346_A1108     FALSE 0.000 574.000 0.000 NA   NA
 7546693 7546694 GBP346_A1109 GBP346_A1110     TRUE 0.748 0.000 0.200 NA   NA
 7546694 7546695 GBP346_A1110 GBP346_A1112     FALSE 0.003 258.000 0.000 NA   NA
 7546696 7546697 GBP346_A1111 GBP346_A1113     TRUE 0.617 -31.000 0.364 NA   NA
 7546699 7546700 GBP346_A1115 GBP346_A1116     FALSE 0.020 273.000 0.065 NA   NA
 7546700 7546701 GBP346_A1116 GBP346_A1117     TRUE 0.702 17.000 0.385 NA   NA
 7546702 7546703 GBP346_A1118 GBP346_A1119     FALSE 0.419 13.000 0.053 NA   NA
 7546705 7546706 GBP346_A1121 GBP346_A1122     TRUE 0.848 6.000 0.667 NA   NA
 7546706 7546707 GBP346_A1122 GBP346_A1123     TRUE 0.671 102.000 0.667 NA   NA
 7546707 7546708 GBP346_A1123 GBP346_A1124     FALSE 0.001 313.000 0.000 NA   NA
 7546708 7546709 GBP346_A1124 GBP346_A1125     TRUE 0.718 18.000 0.500 NA   NA
 7546709 7546710 GBP346_A1125 GBP346_A1126     FALSE 0.371 161.000 0.600 NA   NA
 7546710 7546711 GBP346_A1126 GBP346_A1127     FALSE 0.000 952.000 0.000 NA   NA
 7546713 7546714 GBP346_A1129 GBP346_A1130     FALSE 0.044 102.000 0.000 NA   NA
 7546714 7546715 GBP346_A1130 GBP346_A1131     FALSE 0.054 30.000 0.000 NA   NA
 7546716 7546717 GBP346_A1132 GBP346_A1133     TRUE 0.865 -3.000 1.000 NA   NA
 7546717 7546718 GBP346_A1133 GBP346_A1134     FALSE 0.002 303.000 0.000 NA   NA
 7546719 7546720 GBP346_A1135 GBP346_A1136     FALSE 0.051 -25.000 0.000 NA   NA
 7546721 7546722 GBP346_A1137 GBP346_A1138     FALSE 0.000 614.000 0.000 NA   NA
 7546723 7546724 GBP346_A1139 GBP346_A1140     FALSE 0.002 284.000 0.000 NA   NA
 7546724 7546725 GBP346_A1140 GBP346_A1141     FALSE 0.005 212.000 0.000 NA   NA
 7546725 7546726 GBP346_A1141 GBP346_A1142     TRUE 0.818 -3.000 0.500 NA   NA
 7546726 7546727 GBP346_A1142 GBP346_A1143     FALSE 0.001 356.000 0.000 NA   NA
 7546727 7546728 GBP346_A1143 GBP346_A1144     FALSE 0.067 -7.000 0.000 NA   NA
 7546728 7546729 GBP346_A1144 GBP346_A1145     TRUE 0.679 -7.000 0.333 NA   NA
 7546729 7546730 GBP346_A1145 GBP346_A1146     TRUE 0.793 -7.000 1.000 NA   NA
 7546730 7546731 GBP346_A1146 GBP346_A1147     TRUE 0.822 10.000 0.667 NA   NA
 7546731 7546732 GBP346_A1147 GBP346_A1148     TRUE 0.653 76.000 0.500 NA   NA
 7546732 7546733 GBP346_A1148 GBP346_A1149     FALSE 0.054 28.000 0.000 NA   NA
 7546736 7546737 GBP346_A1152 GBP346_A1153     FALSE 0.048 89.000 0.000 NA   NA
 7546737 7546738 GBP346_A1153 GBP346_A1154     FALSE 0.001 360.000 0.000 NA   NA
 7546739 7546740 GBP346_A1155 GBP346_A1156     FALSE 0.005 215.000 0.000 NA   NA
 7546740 7546741 GBP346_A1156 GBP346_A1157     TRUE 0.840 11.000 1.000 NA   NA
 7546741 7546742 GBP346_A1157 GBP346_A1158     TRUE 0.840 0.000 0.500 NA   NA
 7546745 7546746 GBP346_A1161 GBP346_A1162     FALSE 0.571 21.000 0.211 NA   NA
 7546746 7546747 GBP346_A1162 GBP346_A1163     FALSE 0.001 461.000 0.000 NA   NA
 7546748 7546749 GBP346_A1164 GBP346_A1165     FALSE 0.127 132.000 0.024 NA   NA
 7546749 7546750 GBP346_A1165 GBP346_A1166   parE FALSE 0.172 206.000 0.007 0.093   NA
 7546750 7546751 GBP346_A1166 GBP346_A1167 parE parC TRUE 0.960 59.000 0.106 0.002 Y NA
 7546756 7546757 GBP346_A1172 GBP346_A1173     FALSE 0.053 33.000 0.000 NA   NA
 7546758 7546759 GBP346_A1174 GBP346_A1175     TRUE 0.903 2.000 0.600 1.000   NA
 7546759 7546760 GBP346_A1175 GBP346_A1176     FALSE 0.032 276.000 0.000 NA N NA
 7546760 7546761 GBP346_A1176 GBP346_A1177     FALSE 0.107 -3.000 0.000 NA   NA
 7546762 7546763 GBP346_A1178 GBP346_A1179     TRUE 0.739 132.000 0.394 1.000 N NA
 7546763 7546764 GBP346_A1179 GBP346_A1180     FALSE 0.026 262.000 0.000 1.000   NA
 7546764 7546765 GBP346_A1180 GBP346_A1181     TRUE 0.671 5.000 0.125 NA   NA
 7546765 7546766 GBP346_A1181 GBP346_A1182     TRUE 0.724 65.000 0.216 NA N NA
 7546766 7546767 GBP346_A1182 GBP346_A1183     TRUE 0.654 61.000 0.155 1.000   NA
 7546767 7546768 GBP346_A1183 GBP346_A1184     FALSE 0.438 101.000 0.141 NA   NA
 7546769 7546770 GBP346_A1185 GBP346_A1186     FALSE 0.509 136.000 0.028 1.000 N NA
 7546770 7546771 GBP346_A1186 GBP346_A1187     TRUE 0.747 0.000 0.020 NA N NA
 7546771 7546772 GBP346_A1187 GBP346_A1188     TRUE 0.781 0.000 0.047 NA N NA
 7546772 7546773 GBP346_A1188 GBP346_A1189     FALSE 0.311 -3.000 0.012 NA   NA
 7546773 7546774 GBP346_A1189 GBP346_A1190     FALSE 0.300 93.000 0.058 NA   NA
 7546774 7546775 GBP346_A1190 GBP346_A1191     FALSE 0.096 193.000 0.115 NA   NA
 7546775 7546776 GBP346_A1191 GBP346_A1192     TRUE 0.849 -3.000 0.750 NA   NA
 7546777 7546778 GBP346_A1193 GBP346_A1194   tal FALSE 0.001 366.000 0.000 NA   NA
 7546778 7546779 GBP346_A1194 GBP346_A1195 tal   FALSE 0.142 111.000 0.012 NA   NA
 7546779 7546780 GBP346_A1195 GBP346_A1196     FALSE 0.362 40.000 0.074 NA   NA
 7546780 7546781 GBP346_A1196 GBP346_A1197     FALSE 0.322 84.000 0.067 NA   NA
 7546781 7546782 GBP346_A1197 GBP346_A1198     FALSE 0.145 213.000 0.431 NA   NA
 7546783 7546784 GBP346_A1199 GBP346_A1200     TRUE 0.974 41.000 0.688 0.012 Y NA
 7546787 7546788 GBP346_A1203 GBP346_A1204 nth   TRUE 0.856 5.000 0.048 1.000 N NA
 7546792 7546793 GBP346_A1208 GBP346_A1209     FALSE 0.396 42.000 0.091 NA   NA
 7546794 7546795 GBP346_A1210 GBP346_A1211     TRUE 0.610 -3.000 0.100 NA   NA
 7546796 7546797 GBP346_A1212 GBP346_A1213     FALSE 0.279 172.000 0.114 NA N NA
 7546798 7546799 GBP346_A1214 GBP346_A1215   purT FALSE 0.002 292.000 0.000 NA   NA
 7546799 7546800 GBP346_A1215 GBP346_A1216 purT   FALSE 0.103 170.000 0.070 NA   NA
 7546800 7546801 GBP346_A1216 GBP346_A1217     TRUE 0.703 59.000 0.647 NA   NA
 7546801 7546802 GBP346_A1217 GBP346_A1218     FALSE 0.599 20.000 0.235 NA   NA
 7546802 7546803 GBP346_A1218 GBP346_A1219     TRUE 0.647 84.000 0.500 NA   NA
 7546803 7546804 GBP346_A1219 GBP346_A1220     FALSE 0.346 14.000 0.034 NA   NA
 7546805 7546806 GBP346_A1221 GBP346_A1222     FALSE 0.055 24.000 0.000 NA   NA
 7546806 7546807 GBP346_A1222 GBP346_A1223     FALSE 0.504 44.000 0.039 1.000   NA
 7546808 7546809 GBP346_A1224 GBP346_A1225   dnaE FALSE 0.025 177.000 0.002 NA   NA
 7546809 7546810 GBP346_A1225 GBP346_A1226 dnaE msbA TRUE 0.662 40.000 0.008 1.000 N NA
 7546810 7546811 GBP346_A1226 GBP346_A1227 msbA   TRUE 0.701 54.000 0.039 1.000 N NA
 7546811 7546812 GBP346_A1227 GBP346_A1228     FALSE 0.121 348.000 0.000 1.000 Y NA
 7546812 7546813 GBP346_A1228 GBP346_A1229     TRUE 0.748 -3.000 0.250 NA   NA
 7546813 7546814 GBP346_A1229 GBP346_A1230     TRUE 0.795 -3.000 0.391 NA   NA
 7546814 7546815 GBP346_A1230 GBP346_A1231     TRUE 0.906 87.000 0.092 1.000 Y NA
 7546818 7546819 GBP346_A1234 GBP346_A1235     FALSE 0.023 304.000 0.125 NA   NA
 7546819 7546820 GBP346_A1235 GBP346_A1236     TRUE 0.855 -3.000 0.812 NA   NA
 7546820 7546821 GBP346_A1236 GBP346_A1237     FALSE 0.001 354.000 0.000 NA   NA
 7546821 7546822 GBP346_A1237 GBP346_A1238     FALSE 0.003 254.000 0.000 NA   NA
 7546822 7546823 GBP346_A1238 GBP346_A1239     FALSE 0.005 496.000 0.074 NA   NA
 7546823 7546824 GBP346_A1239 GBP346_A1240     FALSE 0.118 178.000 0.111 NA   NA
 7546826 7546827 GBP346_A1241 GBP346_A1243     FALSE 0.001 323.000 0.000 NA   NA
 7546828 7546829 GBP346_A1244 GBP346_A1245     FALSE 0.530 30.000 0.182 NA   NA
 7546829 7546830 GBP346_A1245 GBP346_A1246     FALSE 0.000 692.000 0.000 NA   NA
 7546830 7546831 GBP346_A1246 GBP346_A1247     TRUE 0.634 74.000 0.438 NA   NA
 7546834 7546835 GBP346_A1250 GBP346_A1251   maf_1 TRUE 0.878 9.000 0.417 NA N NA
 7546835 7546836 GBP346_A1251 GBP346_A1252 maf_1   FALSE 0.360 53.000 0.074 NA   NA
 7546836 7546837 GBP346_A1252 GBP346_A1253     TRUE 0.606 57.000 0.307 NA   NA
 7546837 7546838 GBP346_A1253 GBP346_A1254   nadD FALSE 0.480 5.000 0.044 NA   NA
 7546838 7546839 GBP346_A1254 GBP346_A1255 nadD hemF TRUE 0.955 -3.000 0.066 1.000 Y NA
 7546839 7546840 GBP346_A1255 GBP346_A1256 hemF purD FALSE 0.571 131.000 0.043 1.000 N NA
 7546840 7546841 GBP346_A1256 GBP346_A1257 purD   FALSE 0.209 111.000 0.034 NA   NA
 7546841 7546842 GBP346_A1257 GBP346_A1258     FALSE 0.125 40.000 0.002 NA   NA
 7546842 7546843 GBP346_A1258 GBP346_A1259   upp FALSE 0.125 39.000 0.002 NA   NA
 7546844 7546845 GBP346_A1260 GBP346_A1261   mgsA FALSE 0.130 239.000 0.046 1.000 N NA
 7546845 7546846 GBP346_A1261 GBP346_A1262 mgsA   FALSE 0.012 895.000 0.032 1.000 N NA
 7546846 7546847 GBP346_A1262 GBP346_A1263     FALSE 0.371 6.000 0.021 NA   NA
 7546847 7546848 GBP346_A1263 GBP346_A1264   kdpF FALSE 0.127 130.000 0.020 NA   NA
 7546848 7546849 GBP346_A1264 GBP346_A1265 kdpF kdpA TRUE 0.930 -3.000 0.192 0.001   NA
 7546849 7546850 GBP346_A1265 GBP346_A1266 kdpA kdpB TRUE 0.982 -3.000 0.091 0.001 Y NA
 7546850 7546851 GBP346_A1266 GBP346_A1267 kdpB kdpC TRUE 0.988 13.000 0.877 0.001 Y NA
 7546851 7546852 GBP346_A1267 GBP346_A1268 kdpC   FALSE 0.277 8.000 0.009 NA   NA
 7546852 7546853 GBP346_A1268 GBP346_A1269     TRUE 0.797 -3.000 0.400 NA   NA
 7546853 7546854 GBP346_A1269 GBP346_A1270     TRUE 0.888 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 7546856 7546857 GBP346_A1272 GBP346_A1273     FALSE 0.051 216.000 0.086 NA   NA
 7546857 7546858 GBP346_A1273 GBP346_A1274     FALSE 0.096 192.000 0.114 NA   NA
 7546858 7546859 GBP346_A1274 GBP346_A1275     FALSE 0.595 -3.000 0.091 NA   NA
 7546859 7546860 GBP346_A1275 GBP346_A1276     FALSE 0.341 -3.000 0.017 NA   NA
 7546860 7546861 GBP346_A1276 GBP346_A1277     FALSE 0.190 -19.000 0.016 NA   NA
 7546861 7546862 GBP346_A1277 GBP346_A1278     FALSE 0.178 22.000 0.012 NA   NA
 7546862 7546863 GBP346_A1278 GBP346_A1279     FALSE 0.247 -39.000 0.042 NA   NA
 7546863 7546864 GBP346_A1279 GBP346_A1280     FALSE 0.520 -3.000 0.061 NA   NA
 7546864 7546865 GBP346_A1280 GBP346_A1281     FALSE 0.012 344.000 0.000 1.000   NA
 7546865 7546866 GBP346_A1281 GBP346_A1282     FALSE 0.132 266.000 0.133 1.000 N NA
 7546866 7546867 GBP346_A1282 GBP346_A1283     FALSE 0.051 50.000 0.000 NA   NA
 7546868 7546869 GBP346_A1284 GBP346_A1286     FALSE 0.008 494.000 0.000 NA N NA
 7546869 7546870 GBP346_A1286 GBP346_A1287     FALSE 0.001 418.000 0.000 NA   NA
 7546870 7546871 GBP346_A1287 GBP346_A1288     TRUE 0.758 -3.000 0.273 NA   NA
 7546871 7546872 GBP346_A1288 GBP346_A1289     FALSE 0.366 195.000 0.246 1.000 N NA
 7546872 7546873 GBP346_A1289 GBP346_A1290     TRUE 0.967 9.000 0.256 1.000 Y NA
 7546873 7546874 GBP346_A1290 GBP346_A1291     FALSE 0.597 22.000 0.255 NA   NA
 7546874 7546875 GBP346_A1291 GBP346_A1292     FALSE 0.189 91.000 0.021 NA   NA
 7546875 7546876 GBP346_A1292 GBP346_A1293     TRUE 0.773 7.000 0.310 NA   NA
 7546876 7546877 GBP346_A1293 GBP346_A1294     FALSE 0.348 31.000 0.064 NA   NA
 7546877 7546878 GBP346_A1294 GBP346_A1295     FALSE 0.489 -3.000 0.052 NA   NA
 7546879 7546880 GBP346_A1296 GBP346_A1297   ilvB FALSE 0.094 128.000 0.006 NA   NA
 7546880 7546881 GBP346_A1297 GBP346_A1298 ilvB ilvN TRUE 0.968 112.000 0.371 0.001 Y NA
 7546881 7546882 GBP346_A1298 GBP346_A1299 ilvN ilvC_1 TRUE 0.956 83.000 0.092 0.001 Y NA
 7546882 7546883 GBP346_A1299 GBP346_A1300 ilvC_1   TRUE 0.634 122.000 0.046 1.000 N NA
 7546883 7546884 GBP346_A1300 GBP346_A1301     TRUE 0.960 17.000 0.466 1.000 Y NA
 7546884 7546885 GBP346_A1301 GBP346_A1302   leuA FALSE 0.046 360.000 0.073 1.000 N NA
 7546886 7546887 GBP346_A1303 GBP346_A1304     TRUE 0.952 57.000 0.571 1.000 Y NA
 7546887 7546888 GBP346_A1304 GBP346_A1305     FALSE 0.001 444.000 0.000 NA   NA
 7546889 7546890 GBP346_A1306 GBP346_A1307     FALSE 0.338 -48.000 0.083 NA   NA
 7546890 7546891 GBP346_A1307 GBP346_A1308   rpsO FALSE 0.489 106.000 0.020 NA N NA
 7546891 7546892 GBP346_A1308 GBP346_A1309 rpsO pnp FALSE 0.309 304.000 0.335 1.000 Y NA
 7546892 7546893 GBP346_A1309 GBP346_A1310 pnp   TRUE 0.642 114.000 0.034 1.000 N NA
 7546893 7546894 GBP346_A1310 GBP346_A1311   tpiA TRUE 0.756 60.000 0.099 1.000 N NA
 7546894 7546895 GBP346_A1311 GBP346_A1312 tpiA   TRUE 0.778 80.000 0.184 1.000 N NA
 7546895 7546896 GBP346_A1312 GBP346_A1313     FALSE 0.043 108.000 0.000 NA   NA
 7546896 7546897 GBP346_A1313 GBP346_A1314     FALSE 0.015 155.000 0.000 NA   NA
 7546897 7546898 GBP346_A1314 GBP346_A1315     TRUE 0.971 81.000 0.507 0.003 Y NA
 7546898 7546899 GBP346_A1315 GBP346_A1316     TRUE 0.973 21.000 0.328 0.003 Y NA
 7546899 7546900 GBP346_A1316 GBP346_A1317   nuoD TRUE 0.983 12.000 0.483 0.006 Y NA
 7546900 7546901 GBP346_A1317 GBP346_A1318 nuoD   TRUE 0.872 169.000 0.355 0.006 Y NA
 7546901 7546902 GBP346_A1318 GBP346_A1319   nuoF TRUE 0.986 -3.000 0.343 0.006 Y NA
 7546902 7546903 GBP346_A1319 GBP346_A1320 nuoF nuoG TRUE 0.967 83.000 0.395 0.006 Y NA
 7546903 7546904 GBP346_A1320 GBP346_A1321 nuoG   TRUE 0.989 1.000 0.515 0.006 Y NA
 7546904 7546905 GBP346_A1321 GBP346_A1322     TRUE 0.981 16.000 0.500 0.006 Y NA
 7546905 7546906 GBP346_A1322 GBP346_A1323     TRUE 0.965 110.000 0.442 0.006 Y NA
 7546906 7546907 GBP346_A1323 GBP346_A1324     TRUE 0.977 19.000 0.484 0.003 Y NA
 7546907 7546908 GBP346_A1324 GBP346_A1325     TRUE 0.977 18.000 0.451 0.006 Y NA
 7546908 7546909 GBP346_A1325 GBP346_A1326   nuoM TRUE 0.973 16.000 0.175 0.006 Y NA
 7546909 7546910 GBP346_A1326 GBP346_A1327 nuoM nuoN_1 TRUE 0.971 25.000 0.340 0.006 Y NA
 7546910 7546911 GBP346_A1327 GBP346_A1328 nuoN_1   TRUE 0.752 0.000 0.202 NA   NA
 7546911 7546912 GBP346_A1328 GBP346_A1329     FALSE 0.320 37.000 0.058 NA   NA
 7546912 7546913 GBP346_A1329 GBP346_A1330     FALSE 0.107 152.000 0.046 NA   NA
 7546913 7546914 GBP346_A1330 GBP346_A1331     FALSE 0.496 61.000 0.155 NA   NA
 7546914 7546915 GBP346_A1331 GBP346_A1332     TRUE 0.978 12.000 0.174 0.004 Y NA
 7546915 7546916 GBP346_A1332 GBP346_A1333     TRUE 0.905 41.000 0.060 1.000 Y NA
 7546916 7546917 GBP346_A1333 GBP346_A1334     TRUE 0.982 -3.000 0.224 0.033 Y NA
 7546917 7546918 GBP346_A1334 GBP346_A1335     TRUE 0.619 93.000 0.400 NA   NA
 7546918 7546919 GBP346_A1335 GBP346_A1336     TRUE 0.769 -3.000 0.300 NA   NA
 7546920 7546921 GBP346_A1337 GBP346_A1338     TRUE 0.699 44.000 0.643 NA   NA
 7546921 7546922 GBP346_A1338 GBP346_A1339     TRUE 0.682 28.000 0.500 NA   NA
 7546922 7546923 GBP346_A1339 GBP346_A1340     TRUE 0.922 10.000 0.531 1.000 N NA
 7546924 7546925 GBP346_A1341 GBP346_A1342     FALSE 0.343 82.000 0.075 NA   NA
 7546926 7546927 GBP346_A1343 GBP346_A1344     TRUE 0.668 46.000 0.500 NA   NA
 7546928 7546929 GBP346_A1345 GBP346_A1346     FALSE 0.300 59.000 0.050 NA   NA
 7546930 7546931 GBP346_A1347 GBP346_A1348     FALSE 0.203 160.000 0.152 NA   NA
 7546931 7546932 GBP346_A1348 GBP346_A1349     FALSE 0.495 67.000 0.163 NA   NA
 7546932 7546933 GBP346_A1349 GBP346_A1350     FALSE 0.425 -49.000 0.139 NA   NA
 7546934 7546935 GBP346_A1352 GBP346_A1353   rrs_1 FALSE 0.051 65.000 0.000 NA   NA
 7546935 7546936 GBP346_A1353 GBP346_A1354 rrs_1   FALSE 0.047 83.000 0.000 NA   NA
 7546936 7546937 GBP346_A1354 GBP346_A1355     FALSE 0.053 34.000 0.000 NA   NA
 7546937 7546938 GBP346_A1355 GBP346_A4280   rrl_1 FALSE 0.001 392.000 0.000 NA   NA
 7546938 7546939 GBP346_A4280 GBP346_A1356 rrl_1 rrf_1 FALSE 0.008 184.000 0.000 NA   NA
 7546939 7546940 GBP346_A1356 GBP346_A1357 rrf_1   FALSE 0.000 757.000 0.000 NA   NA
 7546942 7546943 GBP346_A1359 GBP346_A1360     FALSE 0.038 320.000 0.000 1.000 N NA
 7546943 7546944 GBP346_A1360 GBP346_A1361     FALSE 0.149 20.000 0.004 NA   NA
 7546944 7546945 GBP346_A1361 GBP346_A1362     TRUE 0.652 34.000 0.429 NA   NA
 7546945 7546946 GBP346_A1362 GBP346_A1363     FALSE 0.013 164.000 0.000 NA   NA
 7546947 7546948 GBP346_A1364 GBP346_A1365     FALSE 0.567 -3.000 0.078 NA   NA
 7546948 7546949 GBP346_A1365 GBP346_A1366     TRUE 0.718 98.000 1.000 NA   NA
 7546950 7546951 GBP346_A1367 GBP346_A1368     FALSE 0.541 68.000 0.214 NA   NA
 7546951 7546952 GBP346_A1368 GBP346_A1369     FALSE 0.043 224.000 0.000 1.000   NA
 7546952 7546953 GBP346_A1369 GBP346_A1370     TRUE 0.629 40.000 0.364 NA   NA
 7546953 7546954 GBP346_A1370 GBP346_A1371     FALSE 0.002 276.000 0.000 NA   NA
 7546954 7546955 GBP346_A1371 GBP346_A1372     TRUE 0.989 0.000 0.500 0.012 Y NA
 7546955 7546956 GBP346_A1372 GBP346_A1373     TRUE 0.796 8.000 0.429 NA   NA
 7546956 7546957 GBP346_A1373 GBP346_A1374     TRUE 0.693 28.000 0.545 NA   NA
 7546957 7546958 GBP346_A1374 GBP346_A1375     TRUE 0.951 8.000 0.714 0.003   NA
 7546958 7546959 GBP346_A1375 GBP346_A1376     TRUE 0.989 -3.000 0.933 0.012 Y NA
 7546959 7546960 GBP346_A1376 GBP346_A1377     FALSE 0.532 49.000 0.200 NA   NA
 7546961 7546962 GBP346_A1378 GBP346_A1379     TRUE 0.902 35.000 0.188 NA Y NA
 7546963 7546964 GBP346_A1380 GBP346_A1381     FALSE 0.170 106.000 0.019 NA   NA
 7546967 7546968 GBP346_A1384 GBP346_A1385     TRUE 0.792 -3.000 0.375 NA   NA
 7546968 7546969 GBP346_A1385 GBP346_A1386     TRUE 0.972 1.000 0.538 NA Y NA
 7546969 7546970 GBP346_A1386 GBP346_A1387     TRUE 0.885 14.000 0.800 NA N NA
 7546973 7546974 GBP346_A1390 GBP346_A1391     TRUE 0.825 6.000 0.500 NA   NA
 7546975 7546976 GBP346_A1392 GBP346_A1393     FALSE 0.238 -39.000 0.038 NA   NA
 7546977 7546978 GBP346_A1394 GBP346_A1395     FALSE 0.489 90.000 0.171 NA   NA
 7546978 7546979 GBP346_A1395 GBP346_A1396     FALSE 0.581 -3.000 0.086 NA   NA
 7546979 7546980 GBP346_A1396 GBP346_A1397     FALSE 0.142 136.000 0.039 NA   NA
 7546983 7546984 GBP346_A1400 GBP346_A1401     TRUE 0.794 11.000 0.021 1.000 N NA
 7546984 7546985 GBP346_A1401 GBP346_A1402     TRUE 0.945 -10.000 0.026 0.051 Y NA
 7546986 7546987 GBP346_A1403 GBP346_A1404     TRUE 0.717 -3.000 0.200 NA   NA
 7546988 7546989 GBP346_A1405 GBP346_A1406     TRUE 0.780 -3.000 0.333 NA   NA
 7546989 7546990 GBP346_A1406 GBP346_A1407     TRUE 0.792 -3.000 0.375 NA   NA
 7546990 7546991 GBP346_A1407 GBP346_A1408     FALSE 0.002 301.000 0.000 NA   NA
 7546992 7546993 GBP346_A1409 GBP346_A1410 recC recB TRUE 0.990 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 7546993 7546994 GBP346_A1410 GBP346_A1411 recB   TRUE 0.957 -3.000 0.688 0.001   NA
 7546994 7546995 GBP346_A1411 GBP346_A1412     TRUE 0.670 -3.000 0.025 1.000   NA
 7546996 7546997 GBP346_A1413 GBP346_A1414     FALSE 0.001 469.000 0.000 NA   NA
 7546997 7546998 GBP346_A1414 GBP346_A1415     FALSE 0.043 108.000 0.000 NA   NA
 7547000 7547001 GBP346_A1417 GBP346_A1418     FALSE 0.003 252.000 0.000 NA   NA
 7547001 7547002 GBP346_A1418 GBP346_A1419   thiC FALSE 0.004 224.000 0.000 NA   NA
 7547002 7547003 GBP346_A1419 GBP346_A1421 thiC   FALSE 0.022 184.000 0.003 NA   NA
 7547004 7547005 GBP346_A1422 GBP346_A1423     FALSE 0.052 39.000 0.000 NA   NA
 7547005 7547006 GBP346_A1423 GBP346_A1424     FALSE 0.107 -3.000 0.000 NA   NA
 7547006 7547007 GBP346_A1424 GBP346_A1425     TRUE 0.726 16.000 0.000 0.050   NA
 7547007 7547008 GBP346_A1425 GBP346_A1426     FALSE 0.001 316.000 0.000 NA   NA
 7547008 7547009 GBP346_A1426 GBP346_A1427     TRUE 0.647 4.000 0.106 NA   NA
 7547011 7547012 GBP346_A1429 GBP346_A1430     FALSE 0.227 155.000 0.167 NA   NA
 7547012 7547013 GBP346_A1430 GBP346_A1431     FALSE 0.407 150.000 0.529 NA   NA
 7547014 7547015 GBP346_A1432 GBP346_A1433     FALSE 0.202 216.000 0.382 1.000   NA
 7547015 7547016 GBP346_A1433 GBP346_A1434     FALSE 0.236 -69.000 0.044 NA   NA
 7547016 7547017 GBP346_A1434 GBP346_A1435     FALSE 0.556 0.000 0.060 NA   NA
 7547018 7547019 GBP346_A1436 GBP346_A1437     FALSE 0.247 176.000 0.400 NA   NA
 7547020 7547021 GBP346_A1438 GBP346_A1439     TRUE 0.920 95.000 0.870 0.051 N NA
 7547021 7547022 GBP346_A1439 GBP346_A1440     TRUE 0.878 57.000 0.761 1.000 N NA
 7547022 7547023 GBP346_A1440 GBP346_A1441     FALSE 0.004 646.000 0.000 1.000   NA
 7547023 7547024 GBP346_A1441 GBP346_A1442     FALSE 0.565 68.000 0.250 NA   NA
 7547024 7547025 GBP346_A1442 GBP346_A1443     FALSE 0.122 2.000 0.000 NA   NA
 7547025 7547026 GBP346_A1443 GBP346_A1444     FALSE 0.001 384.000 0.000 NA   NA
 7547031 7547032 GBP346_A1449 GBP346_A1450     TRUE 0.610 53.000 0.320 NA   NA
 7547033 7547034 GBP346_A1451 GBP346_A1452     FALSE 0.263 34.000 0.038 NA   NA
 7547037 7547038 GBP346_A1455 GBP346_A1456   glmS_2 FALSE 0.378 -123.000 0.111 NA   NA
 7547039 7547040 GBP346_A1457 GBP346_A1458     TRUE 0.758 22.000 1.000 NA   NA
 7547040 7547041 GBP346_A1458 GBP346_A1459     FALSE 0.123 0.000 0.000 NA   NA
 7547041 7547042 GBP346_A1459 GBP346_A1460     FALSE 0.047 -36.000 0.000 NA   NA
 7547044 7547045 GBP346_A1462 GBP346_A1463     FALSE 0.117 5.000 0.000 NA   NA
 7547045 7547046 GBP346_A1463 GBP346_A1464     FALSE 0.363 28.000 0.069 NA   NA
 7547046 7547047 GBP346_A1464 GBP346_A1465     TRUE 0.831 -3.000 0.586 NA   NA
 7547047 7547048 GBP346_A1465 GBP346_A1466     FALSE 0.071 -6.000 0.000 NA   NA
 7547050 7547051 GBP346_A1468 GBP346_A1469     FALSE 0.373 118.000 0.115 NA   NA
 7547051 7547052 GBP346_A1469 GBP346_A1470     FALSE 0.052 38.000 0.000 NA   NA
 7547052 7547053 GBP346_A1470 GBP346_A1471     TRUE 0.818 -3.000 0.500 NA   NA
 7547053 7547054 GBP346_A1471 GBP346_A1472     TRUE 0.935 32.000 0.583 NA Y NA
 7547054 7547055 GBP346_A1472 GBP346_A1473     FALSE 0.284 164.000 0.333 NA   NA
 7547056 7547057 GBP346_A1474 GBP346_A1475     FALSE 0.052 35.000 0.000 NA   NA
 7547057 7547058 GBP346_A1475 GBP346_A1476     FALSE 0.046 -40.000 0.000 NA   NA
 7547060 7547061 GBP346_A1478 GBP346_A1479     TRUE 0.656 95.000 0.021 1.000 N NA
 7547062 7547063 GBP346_A1480 GBP346_A1481     FALSE 0.071 187.000 0.066 NA   NA
 7547064 7547065 GBP346_A1482 GBP346_A1483 madL madM TRUE 0.818 14.000 0.945 NA   NA
 7547065 7547066 GBP346_A1483 GBP346_A1484 madM   FALSE 0.275 21.000 0.036 NA   NA
 7547066 7547067 GBP346_A1484 GBP346_A1485   mdcA TRUE 0.740 -3.000 0.231 NA   NA
 7547067 7547068 GBP346_A1485 GBP346_A1486 mdcA mdcC TRUE 0.710 14.000 0.316 NA   NA
 7547068 7547069 GBP346_A1486 GBP346_A1487 mdcC mdcD TRUE 0.804 -3.000 0.438 NA   NA
 7547069 7547070 GBP346_A1487 GBP346_A1488 mdcD mdcE TRUE 0.734 -13.000 0.700 NA   NA
 7547070 7547071 GBP346_A1488 GBP346_A1489 mdcE mdcG FALSE 0.381 -25.000 0.085 NA   NA
 7547071 7547072 GBP346_A1489 GBP346_A1490 mdcG   TRUE 0.736 -3.000 0.068 1.000   NA
 7547072 7547073 GBP346_A1490 GBP346_A1491   mdcH TRUE 0.900 -3.000 0.203 1.000 N NA
 7547073 7547074 GBP346_A1491 GBP346_A1492 mdcH   FALSE 0.357 34.000 0.070 NA   NA
 7547074 7547075 GBP346_A1492 GBP346_A1493     FALSE 0.000 520.000 0.000 NA   NA
 7547075 7547076 GBP346_A1493 GBP346_A1494     FALSE 0.006 420.000 0.061 NA   NA
 7547076 7547077 GBP346_A1494 GBP346_A1496     FALSE 0.001 317.000 0.000 NA   NA
 7547079 7547080 GBP346_A1497 GBP346_A1498     FALSE 0.047 78.000 0.000 NA   NA
 7547081 7547082 GBP346_A1499 GBP346_A1500 dnaQ rnhA TRUE 0.945 19.000 0.248 1.000 Y NA
 7547082 7547083 GBP346_A1500 GBP346_A1501 rnhA   TRUE 0.777 -3.000 0.111 1.000   NA
 7547084 7547085 GBP346_A1502 GBP346_A1503 gloB   FALSE 0.295 177.000 0.233 1.000   NA
 7547085 7547086 GBP346_A1503 GBP346_A1504     FALSE 0.204 135.000 0.067 NA   NA
 7547088 7547089 GBP346_A1506 GBP346_A1507     FALSE 0.051 48.000 0.000 NA   NA
 7547091 7547092 GBP346_A1509 GBP346_A1510 carA   TRUE 0.897 32.000 0.026 1.000 Y NA
 7547092 7547093 GBP346_A1510 GBP346_A1511   carB TRUE 0.895 52.000 0.030 1.000 Y NA
 7547093 7547094 GBP346_A1511 GBP346_A1512 carB   TRUE 0.767 119.000 0.241 1.000 N NA
 7547094 7547095 GBP346_A1512 GBP346_A1513     TRUE 0.626 0.000 0.089 NA   NA
 7547096 7547097 GBP346_A1514 GBP346_A1515     FALSE 0.061 19.000 0.000 NA   NA
 7547098 7547099 GBP346_A1516 GBP346_A1517 rrmJ   FALSE 0.287 168.000 0.095 NA N NA
 7547099 7547100 GBP346_A1517 GBP346_A1518   folP TRUE 0.796 113.000 0.325 1.000 N NA
 7547100 7547101 GBP346_A1518 GBP346_A1519 folP glmM TRUE 0.827 26.000 0.260 1.000 N NA
 7547101 7547102 GBP346_A1519 GBP346_A1520 glmM pstS FALSE 0.019 436.000 0.000 1.000 N NA
 7547102 7547103 GBP346_A1520 GBP346_A1521 pstS pstC TRUE 0.848 155.000 0.039 0.002 Y NA
 7547103 7547104 GBP346_A1521 GBP346_A1522 pstC pstA TRUE 0.989 -3.000 0.537 0.002 Y NA
 7547104 7547105 GBP346_A1522 GBP346_A1523 pstA pstB TRUE 0.983 16.000 0.526 0.002 Y NA
 7547105 7547106 GBP346_A1523 GBP346_A1524 pstB phoU TRUE 0.926 20.000 0.317 NA Y NA
 7547106 7547107 GBP346_A1524 GBP346_A1525 phoU phoB TRUE 0.665 29.000 0.104 NA N NA
 7547107 7547108 GBP346_A1525 GBP346_A1526 phoB phoR TRUE 0.944 70.000 0.453 1.000 Y NA
 7547112 7547113 GBP346_A1530 GBP346_A1531     FALSE 0.504 122.000 0.273 NA   NA
 7547114 7547115 GBP346_A1532 GBP346_A1533     FALSE 0.596 107.000 0.400 NA   NA
 7547117 7547118 GBP346_A1535 GBP346_A1536     TRUE 0.818 -3.000 0.500 NA   NA
 7547118 7547119 GBP346_A1536 GBP346_A1537     FALSE 0.003 251.000 0.000 NA   NA
 7547120 7547121 GBP346_A1538 GBP346_A1539     FALSE 0.160 152.000 0.085 NA   NA
 7547122 7547123 GBP346_A1540 GBP346_A1541     FALSE 0.548 64.000 0.214 NA   NA
 7547125 7547126 GBP346_A1543 GBP346_A1544     FALSE 0.250 83.000 0.042 NA   NA
 7547126 7547127 GBP346_A1544 GBP346_A1545     FALSE 0.020 298.000 0.096 NA   NA
 7547128 7547129 GBP346_A1546 GBP346_A1547     TRUE 0.647 66.000 0.444 NA   NA
 7547130 7547131 GBP346_A1548 GBP346_A1549     FALSE 0.129 297.000 0.320 1.000 N NA
 7547132 7547133 GBP346_A1550 GBP346_A1551     FALSE 0.006 207.000 0.000 NA   NA
 7547133 7547134 GBP346_A1551 GBP346_A1552     FALSE 0.000 1374.000 0.000 NA   NA
 7547136 7547137 GBP346_A1554 GBP346_A1555     FALSE 0.247 86.000 0.040 NA   NA
 7547137 7547138 GBP346_A1555 GBP346_A1556     FALSE 0.000 1467.000 0.000 NA   NA
 7547138 7547139 GBP346_A1556 GBP346_A1557     FALSE 0.000 1527.000 0.000 NA   NA
 7547139 7547140 GBP346_A1557 GBP346_A1558     FALSE 0.002 261.000 0.000 NA   NA
 7547145 7547146 GBP346_A1562 GBP346_A1564     FALSE 0.393 159.000 0.000 0.005   NA
 7547148 7547149 GBP346_A1566 GBP346_A1567     TRUE 0.838 9.000 0.750 NA   NA
 7547149 7547150 GBP346_A1567 GBP346_A1568     TRUE 0.672 -43.000 0.667 NA   NA
 7547150 7547151 GBP346_A1568 GBP346_A1569     FALSE 0.068 17.000 0.000 NA   NA
 7547151 7547152 GBP346_A1569 GBP346_A1570     TRUE 0.841 -3.000 0.667 NA   NA
 7547153 7547154 GBP346_A1571 GBP346_A1572     FALSE 0.467 36.000 0.130 NA   NA
 7547155 7547156 GBP346_A1573 GBP346_A1574     FALSE 0.452 18.000 0.091 NA   NA
 7547157 7547158 GBP346_A1575 GBP346_A1576     FALSE 0.055 24.000 0.000 NA   NA
 7547158 7547159 GBP346_A1576 GBP346_A1577     FALSE 0.054 28.000 0.000 NA   NA
 7547160 7547161 GBP346_A1578 GBP346_A1579 treY malQ TRUE 0.982 -3.000 0.141 0.004 Y NA
 7547161 7547162 GBP346_A1579 GBP346_A1580 malQ treZ TRUE 0.982 -3.000 0.167 0.004 Y NA
 7547162 7547163 GBP346_A1580 GBP346_A1581 treZ glgX TRUE 0.962 27.000 0.107 0.002 Y NA
 7547163 7547164 GBP346_A1581 GBP346_A1582 glgX glgB TRUE 0.971 53.000 0.323 0.002 Y NA
 7547164 7547165 GBP346_A1582 GBP346_A1583 glgB   TRUE 0.980 -3.000 0.115 0.004 Y NA
 7547165 7547166 GBP346_A1583 GBP346_A1584     TRUE 0.946 -3.000 0.544 0.004   NA
 7547170 7547171 GBP346_A1587 GBP346_A1589     FALSE 0.203 168.000 0.200 NA   NA
 7547171 7547172 GBP346_A1589 GBP346_A1590     FALSE 0.006 203.000 0.000 NA   NA
 7547175 7547176 GBP346_A1593 GBP346_A1594     FALSE 0.011 170.000 0.000 NA   NA
 7547176 7547177 GBP346_A1594 GBP346_A1595     FALSE 0.569 84.000 0.286 NA   NA
 7547177 7547178 GBP346_A1595 GBP346_A1596     TRUE 0.646 25.000 0.375 NA   NA
 7547178 7547179 GBP346_A1596 GBP346_A1597     FALSE 0.111 456.000 0.000 0.069 Y NA
 7547179 7547180 GBP346_A1597 GBP346_A1598     FALSE 0.051 42.000 0.000 NA   NA
 7547180 7547181 GBP346_A1598 GBP346_A1599     FALSE 0.076 15.000 0.000 NA   NA
 7547181 7547182 GBP346_A1599 GBP346_A1600     TRUE 0.614 32.000 0.308 NA   NA
 7547184 7547185 GBP346_A1602 GBP346_A1603     FALSE 0.001 367.000 0.000 NA   NA
 7547185 7547186 GBP346_A1603 GBP346_A1604     TRUE 0.686 101.000 0.750 NA   NA
 7547186 7547187 GBP346_A1604 GBP346_A1605     TRUE 0.695 36.000 0.600 NA   NA
 7547187 7547188 GBP346_A1605 GBP346_A1606     TRUE 0.766 81.000 0.600 1.000   NA
 7547188 7547189 GBP346_A1606 GBP346_A1607     TRUE 0.890 2.000 0.107 1.000 N NA
 7547189 7547190 GBP346_A1607 GBP346_A1608     TRUE 0.709 17.000 0.143 1.000   NA
 7547191 7547192 GBP346_A1609 GBP346_A1610     TRUE 0.724 46.000 0.800 NA   NA
 7547192 7547193 GBP346_A1610 GBP346_A1611     TRUE 0.877 35.000 0.667 0.048   NA
 7547193 7547194 GBP346_A1611 GBP346_A1612     TRUE 0.759 27.000 0.400 1.000   NA
 7547194 7547195 GBP346_A1612 GBP346_A1613     FALSE 0.510 79.000 0.200 NA   NA
 7547199 7547200 GBP346_A1617 GBP346_A1618     TRUE 0.616 24.000 0.300 NA   NA
 7547200 7547201 GBP346_A1618 GBP346_A1619     FALSE 0.002 260.000 0.000 NA   NA
 7547202 7547203 GBP346_A1620 GBP346_A1621     TRUE 0.776 16.000 0.667 NA   NA
 7547203 7547204 GBP346_A1621 GBP346_A1622     TRUE 0.812 3.000 0.375 NA   NA
 7547204 7547205 GBP346_A1622 GBP346_A1623     FALSE 0.506 137.000 0.625 NA   NA
 7547207 7547208 GBP346_A1625 GBP346_A1626     FALSE 0.594 109.000 0.400 NA   NA
 7547208 7547209 GBP346_A1626 GBP346_A1627     FALSE 0.000 908.000 0.000 NA   NA
 7547209 7547210 GBP346_A1627 GBP346_A1628     FALSE 0.023 139.000 0.000 NA   NA
 7547210 7547211 GBP346_A1628 GBP346_A1629     FALSE 0.046 -40.000 0.000 NA   NA
 7547211 7547212 GBP346_A1629 GBP346_A1630     TRUE 0.739 18.000 0.600 NA   NA
 7547212 7547213 GBP346_A1630 GBP346_A1631     TRUE 0.714 13.000 0.308 NA   NA
 7547213 7547214 GBP346_A1631 GBP346_A1632     TRUE 0.826 4.000 0.462 NA   NA
 7547214 7547215 GBP346_A1632 GBP346_A1633     TRUE 0.786 3.000 0.286 NA   NA
 7547217 7547218 GBP346_A1635 GBP346_A1636     FALSE 0.000 1242.000 0.000 NA   NA
 7547219 7547220 GBP346_A1637 GBP346_A1638     FALSE 0.049 71.000 0.000 NA   NA
 7547221 7547222 GBP346_A1639 GBP346_A1640     FALSE 0.002 282.000 0.000 NA   NA
 7547222 7547223 GBP346_A1640 GBP346_A1641     FALSE 0.050 69.000 0.000 NA   NA
 7547223 7547224 GBP346_A1641 GBP346_A1642     FALSE 0.017 150.000 0.000 NA   NA
 7547224 7547225 GBP346_A1642 GBP346_A1643     TRUE 0.662 -30.000 0.500 NA   NA
 7547227 7547228 GBP346_A1645 GBP346_A1647     FALSE 0.002 260.000 0.000 NA   NA
 7547230 7547231 GBP346_A1648 GBP346_A1649     FALSE 0.001 449.000 0.000 NA   NA
 7547232 7547233 GBP346_A1650 GBP346_A1651     TRUE 0.850 0.000 0.571 NA   NA
 7547233 7547234 GBP346_A1651 GBP346_A1652     FALSE 0.002 274.000 0.000 NA   NA
 7547234 7547235 GBP346_A1652 GBP346_A1653     TRUE 0.809 45.000 0.833 1.000   NA
 7547236 7547237 GBP346_A1654 GBP346_A1655     TRUE 0.752 3.000 0.211 NA   NA
 7547239 7547240 GBP346_A1657 GBP346_A1658     TRUE 0.673 86.000 0.600 NA   NA
 7547240 7547241 GBP346_A1658 GBP346_A1659     TRUE 0.655 -13.000 0.364 NA   NA
 7547241 7547242 GBP346_A1659 GBP346_A1660     TRUE 0.699 53.000 0.636 NA   NA
 7547242 7547243 GBP346_A1660 GBP346_A1661     FALSE 0.564 77.000 0.269 NA   NA
 7547243 7547244 GBP346_A1661 GBP346_A1662     FALSE 0.551 18.000 0.156 NA   NA
 7547244 7547245 GBP346_A1662 GBP346_A1663     TRUE 0.941 45.000 0.879 NA Y NA
 7547245 7547246 GBP346_A1663 GBP346_A1664     TRUE 0.798 16.000 0.848 NA   NA
 7547246 7547247 GBP346_A1664 GBP346_A1665     FALSE 0.001 411.000 0.000 NA   NA
 7547247 7547248 GBP346_A1665 GBP346_A1666     TRUE 0.988 1.000 0.429 0.010 Y NA
 7547249 7547250 GBP346_A1667 GBP346_A1668     TRUE 0.902 2.000 0.000 0.048 N NA
 7547250 7547251 GBP346_A1668 GBP346_A1669     TRUE 0.658 -3.000 0.130 NA   NA
 7547251 7547252 GBP346_A1669 GBP346_A1670     FALSE 0.552 -3.000 0.073 NA   NA
 7547252 7547253 GBP346_A1670 GBP346_A1671     FALSE 0.003 240.000 0.000 NA   NA
 7547253 7547254 GBP346_A1671 GBP346_A1672     FALSE 0.181 64.000 0.015 NA   NA
 7547254 7547255 GBP346_A1672 GBP346_A1673   acpA_1 FALSE 0.105 198.000 0.031 1.000   NA
 7547259 7547260 GBP346_A1676 GBP346_A1678     FALSE 0.055 25.000 0.000 NA   NA
 7547261 7547262 GBP346_A1679 GBP346_A1680     TRUE 0.675 19.000 0.391 NA   NA
 7547268 7547269 GBP346_A1686 GBP346_A1687     FALSE 0.001 332.000 0.000 NA   NA
 7547273 7547274 GBP346_A1691 GBP346_A1692     TRUE 0.681 -3.000 0.154 NA   NA
 7547274 7547275 GBP346_A1692 GBP346_A1693     FALSE 0.141 -204.000 0.013 NA   NA
 7547275 7547276 GBP346_A1693 GBP346_A1694     FALSE 0.376 5.000 0.020 NA   NA
 7547276 7547277 GBP346_A1694 GBP346_A1695     TRUE 0.945 29.000 0.059 0.048 Y NA
 7547277 7547278 GBP346_A1695 GBP346_A1696     TRUE 0.974 -3.000 0.059 0.020 Y NA
 7547279 7547280 GBP346_A1697 GBP346_A1698     TRUE 0.971 0.000 0.199 1.000 Y NA
 7547280 7547281 GBP346_A1698 GBP346_A1699     TRUE 0.844 -3.000 0.048 1.000 N NA
 7547281 7547282 GBP346_A1699 GBP346_A1700     TRUE 0.788 11.000 0.014 1.000 N NA
 7547282 7547283 GBP346_A1700 GBP346_A1701     TRUE 0.681 14.000 0.079 1.000   NA
 7547283 7547284 GBP346_A1701 GBP346_A1702     TRUE 0.808 13.000 0.289 1.000   NA
 7547284 7547285 GBP346_A1702 GBP346_A1703     TRUE 0.880 101.000 0.156 NA Y NA
 7547286 7547287 GBP346_A1704 GBP346_A1705     TRUE 0.806 -7.000 0.448 1.000   NA
 7547287 7547288 GBP346_A1705 GBP346_A1706     TRUE 0.932 13.000 0.440 0.001   NA
 7547288 7547289 GBP346_A1706 GBP346_A1707     FALSE 0.241 165.000 0.078 1.000   NA
 7547289 7547290 GBP346_A1707 GBP346_A1708     FALSE 0.002 276.000 0.000 NA   NA
 7547290 7547291 GBP346_A1708 GBP346_A1709     FALSE 0.001 304.000 0.000 NA   NA
 7547291 7547292 GBP346_A1709 GBP346_A1710     TRUE 0.612 15.000 0.172 NA   NA
 7547292 7547293 GBP346_A1710 GBP346_A1711     TRUE 0.750 11.000 0.345 NA   NA
 7547293 7547294 GBP346_A1711 GBP346_A1712     TRUE 0.677 98.000 0.667 NA   NA
 7547295 7547296 GBP346_A1713 GBP346_A1714 galU_1 valS TRUE 0.645 87.000 0.010 1.000 N NA
 7547297 7547298 GBP346_A1715 GBP346_A1716   mtnN TRUE 0.840 -3.000 0.043 1.000 N NA
 7547301 7547302 GBP346_A1718 GBP346_A1720     TRUE 0.724 79.000 1.000 NA   NA
 7547302 7547303 GBP346_A1720 GBP346_A1721     TRUE 0.630 14.000 0.182 NA   NA
 7547303 7547304 GBP346_A1721 GBP346_A1722     TRUE 0.704 -3.000 0.182 NA   NA
 7547304 7547305 GBP346_A1722 GBP346_A1723     TRUE 0.664 17.000 0.286 NA   NA
 7547306 7547307 GBP346_A1724 GBP346_A1725     FALSE 0.463 139.000 0.500 NA   NA
 7547308 7547309 GBP346_A1726 GBP346_A1727     TRUE 0.825 32.000 1.000 1.000   NA
 7547309 7547310 GBP346_A1727 GBP346_A1728     FALSE 0.240 35.000 0.031 NA   NA
 7547310 7547311 GBP346_A1728 GBP346_A1729   wrbA TRUE 0.839 -3.000 0.657 NA   NA
 7547313 7547314 GBP346_A1731 GBP346_A1732     FALSE 0.047 85.000 0.000 NA   NA
 7547315 7547316 GBP346_A1733 GBP346_A1734     TRUE 0.716 100.000 0.073 0.055   NA
 7547316 7547317 GBP346_A1734 GBP346_A1735   aroC TRUE 0.639 84.000 0.008 1.000 N NA
 7547317 7547318 GBP346_A1735 GBP346_A1737 aroC   FALSE 0.247 -3.000 0.004 NA   NA
 7547320 7547321 GBP346_A1738 GBP346_A1739     TRUE 0.721 45.000 0.300 1.000   NA
 7547324 7547325 GBP346_A1742 GBP346_A1743     FALSE 0.005 509.000 0.000 1.000   NA
 7547328 7547329 GBP346_A1746 GBP346_A1747     TRUE 0.992 2.000 0.789 0.001 Y NA
 7547330 7547331 GBP346_A1748 GBP346_A1749     TRUE 0.844 44.000 0.412 1.000 N NA
 7547331 7547332 GBP346_A1749 GBP346_A1750     TRUE 0.680 15.000 0.267 NA   NA
 7547333 7547334 GBP346_A1751 GBP346_A1752     FALSE 0.002 991.000 0.027 NA   NA
 7547334 7547335 GBP346_A1752 GBP346_A1753     FALSE 0.523 74.000 0.202 NA   NA
 7547335 7547336 GBP346_A1753 GBP346_A1754   relA TRUE 0.718 45.000 0.202 NA N NA
 7547336 7547337 GBP346_A1754 GBP346_A1755 relA   FALSE 0.043 109.000 0.000 NA   NA
 7547339 7547340 GBP346_A1757 GBP346_A1758 thrS infC TRUE 0.916 104.000 0.186 1.000 Y NA
 7547340 7547341 GBP346_A1758 GBP346_A1759 infC rpmI TRUE 0.733 193.000 0.652 1.000 Y NA
 7547341 7547342 GBP346_A1759 GBP346_A1760 rpmI rplT TRUE 0.977 31.000 0.928 0.012 Y NA
 7547342 7547343 GBP346_A1760 GBP346_A1761 rplT pheS TRUE 0.883 131.000 0.202 1.000 Y NA
 7547343 7547344 GBP346_A1761 GBP346_A1762 pheS pheT TRUE 0.976 88.000 0.574 0.001 Y NA
 7547344 7547345 GBP346_A1762 GBP346_A1763 pheT ihfA TRUE 0.795 73.000 0.208 1.000 N NA
 7547345 7547346 GBP346_A1763 GBP346_A1764 ihfA   TRUE 0.861 59.000 0.535 1.000 N NA
 7547347 7547348 GBP346_A1765 GBP346_A1766     FALSE 0.001 467.000 0.000 NA   NA
 7547348 7547349 GBP346_A1766 GBP346_A1767     FALSE 0.001 402.000 0.000 NA   NA
 7547349 7547350 GBP346_A1767 GBP346_A1768     FALSE 0.004 229.000 0.000 NA   NA
 7547350 7547351 GBP346_A1768 GBP346_A1769     TRUE 0.836 11.000 0.900 NA   NA
 7547351 7547352 GBP346_A1769 GBP346_A1770     FALSE 0.052 41.000 0.000 NA   NA
 7547353 7547354 GBP346_A1771 GBP346_A1772     FALSE 0.000 564.000 0.000 NA   NA
 7547355 7547356 GBP346_A1773 GBP346_A1774     FALSE 0.458 149.000 0.733 NA   NA
 7547356 7547357 GBP346_A1774 GBP346_A1775     FALSE 0.003 239.000 0.000 NA   NA
 7547358 7547359 GBP346_A1776 GBP346_A1777     FALSE 0.013 165.000 0.000 NA   NA
 7547361 7547362 GBP346_A1779 GBP346_A1780     FALSE 0.053 419.000 0.000 NA Y NA
 7547362 7547363 GBP346_A1780 GBP346_A1781     FALSE 0.518 64.000 0.013 NA N NA
 7547363 7547364 GBP346_A1781 GBP346_A1782     FALSE 0.004 305.000 0.004 NA   NA
 7547364 7547365 GBP346_A1782 GBP346_A1783     TRUE 0.851 -3.000 0.759 NA   NA
 7547365 7547366 GBP346_A1783 GBP346_A1784     TRUE 0.823 92.000 0.342 1.000 N NA
 7547366 7547367 GBP346_A1784 GBP346_A1785   rbfA TRUE 0.951 58.000 0.530 1.000 Y NA
 7547367 7547368 GBP346_A1785 GBP346_A1786 rbfA   TRUE 0.940 54.000 0.318 1.000 Y NA
 7547369 7547370 GBP346_A1787 GBP346_A1788     TRUE 0.810 23.000 0.733 1.000   NA
 7547370 7547371 GBP346_A1788 GBP346_A1789     TRUE 0.921 68.000 0.833 0.083 N NA
 7547371 7547372 GBP346_A1789 GBP346_A1790     TRUE 0.836 100.000 0.500 1.000 N NA
 7547372 7547373 GBP346_A1790 GBP346_A1791     FALSE 0.089 200.000 0.125 NA   NA
 7547374 7547375 GBP346_A1792 GBP346_A1793 typA sucA FALSE 0.033 339.000 0.000 1.000 N NA
 7547375 7547376 GBP346_A1793 GBP346_A1794 sucA sucB TRUE 0.909 135.000 0.667 1.000 Y NA
 7547376 7547377 GBP346_A1794 GBP346_A1795 sucB lpdA_1 TRUE 0.926 100.000 0.253 1.000 Y NA
 7547377 7547378 GBP346_A1795 GBP346_A1796 lpdA_1   FALSE 0.376 104.000 0.103 NA   NA
 7547378 7547379 GBP346_A1796 GBP346_A1797     FALSE 0.135 195.000 0.206 NA   NA
 7547382 7547383 GBP346_A1799 GBP346_A1801     FALSE 0.120 175.000 0.104 NA   NA
 7547383 7547384 GBP346_A1801 GBP346_A1802     TRUE 0.722 50.000 0.778 NA   NA
 7547385 7547386 GBP346_A1803 GBP346_A1804     FALSE 0.006 206.000 0.000 NA   NA
 7547386 7547387 GBP346_A1804 GBP346_A1805     FALSE 0.590 81.000 0.333 NA   NA
 7547387 7547388 GBP346_A1805 GBP346_A1806     TRUE 0.919 83.000 0.467 NA Y NA
 7547388 7547389 GBP346_A1806 GBP346_A1807     TRUE 0.965 -3.000 0.450 NA Y NA
 7547389 7547390 GBP346_A1807 GBP346_A1808   cpaB_1 TRUE 0.920 80.000 0.483 NA Y NA
 7547390 7547391 GBP346_A1808 GBP346_A1809 cpaB_1   TRUE 0.926 64.000 0.468 NA Y NA
 7547391 7547392 GBP346_A1809 GBP346_A1810     TRUE 0.953 67.000 0.696 1.000 Y NA
 7547392 7547393 GBP346_A1810 GBP346_A1811   tadA_1 TRUE 0.981 4.000 0.732 1.000 Y NA
 7547393 7547394 GBP346_A1811 GBP346_A1812 tadA_1   TRUE 0.954 -7.000 0.822 NA Y NA
 7547394 7547395 GBP346_A1812 GBP346_A1813     TRUE 0.974 6.000 0.844 NA Y NA
 7547395 7547396 GBP346_A1813 GBP346_A1814     TRUE 0.871 37.000 0.068 NA Y NA
 7547396 7547397 GBP346_A1814 GBP346_A1815     FALSE 0.401 22.000 0.083 NA   NA
 7547397 7547398 GBP346_A1815 GBP346_A1816     TRUE 0.619 8.000 0.111 NA   NA
 7547398 7547399 GBP346_A1816 GBP346_A1817     FALSE 0.519 17.000 0.118 NA   NA
 7547399 7547400 GBP346_A1817 GBP346_A1818     FALSE 0.372 91.000 0.088 NA   NA
 7547402 7547403 GBP346_A1820 GBP346_A1822     TRUE 0.755 15.000 0.500 NA   NA
 7547404 7547405 GBP346_A1821 GBP346_A1823     FALSE 0.536 21.000 0.174 NA   NA
 7547405 7547406 GBP346_A1823 GBP346_A1824     TRUE 0.658 -3.000 0.130 NA   NA
 7547406 7547407 GBP346_A1824 GBP346_A1825     FALSE 0.209 75.000 0.026 NA   NA
 7547407 7547408 GBP346_A1825 GBP346_A1826     FALSE 0.124 217.000 0.000 1.000 N NA
 7547408 7547409 GBP346_A1826 GBP346_A1827     FALSE 0.006 204.000 0.000 NA   NA
 7547410 7547411 GBP346_A1828 GBP346_A1829     FALSE 0.431 144.000 0.172 1.000   NA
 7547411 7547412 GBP346_A1829 GBP346_A1830     TRUE 0.725 47.000 0.317 1.000   NA
 7547413 7547414 GBP346_A1831 GBP346_A1832     FALSE 0.004 237.000 0.000 NA   NA
 7547414 7547415 GBP346_A1832 GBP346_A1833     FALSE 0.320 151.000 0.300 NA   NA
 7547416 7547417 GBP346_A1834 GBP346_A1835     TRUE 0.640 42.000 0.400 NA   NA
 7547418 7547419 GBP346_A1836 GBP346_A1837     FALSE 0.015 156.000 0.000 NA   NA
 7547420 7547421 GBP346_A1838 GBP346_A1839 rnr   TRUE 0.792 132.000 0.147 0.015 N NA
 7547421 7547422 GBP346_A1839 GBP346_A1840     FALSE 0.215 11.000 0.004 NA   NA
 7547422 7547423 GBP346_A1840 GBP346_A1841     TRUE 0.640 63.000 0.400 NA   NA
 7547423 7547424 GBP346_A1841 GBP346_A1842   rpiA FALSE 0.074 269.000 0.005 1.000 N NA
 7547424 7547425 GBP346_A1842 GBP346_A1843 rpiA   FALSE 0.034 338.000 0.000 1.000 N NA
 7547425 7547426 GBP346_A1843 GBP346_A1845     TRUE 0.793 100.000 0.938 1.000   NA
 7547427 7547428 GBP346_A1844 GBP346_A1846     FALSE 0.459 90.000 0.143 NA   NA
 7547428 7547429 GBP346_A1846 GBP346_A1847     TRUE 0.956 130.000 0.857 0.047 Y NA
 7547429 7547430 GBP346_A1847 GBP346_A1848   pyrD TRUE 0.634 111.000 0.022 1.000 N NA
 7547430 7547431 GBP346_A1848 GBP346_A1849 pyrD   TRUE 0.667 105.000 0.044 1.000 N NA
 7547431 7547432 GBP346_A1849 GBP346_A1850   aat TRUE 0.939 34.000 0.285 1.000 Y NA
 7547432 7547433 GBP346_A1850 GBP346_A1851 aat   TRUE 0.840 9.000 0.058 1.000 N NA
 7547433 7547434 GBP346_A1851 GBP346_A1852     FALSE 0.001 373.000 0.000 NA   NA
 7547435 7547436 GBP346_A1853 GBP346_A1854     TRUE 0.775 5.000 0.273 NA   NA
 7547436 7547437 GBP346_A1854 GBP346_A1855     TRUE 0.725 30.000 0.053 1.000 N NA
 7547437 7547438 GBP346_A1855 GBP346_A1856     TRUE 0.727 91.000 1.000 NA   NA
 7547438 7547439 GBP346_A1856 GBP346_A1857     FALSE 0.053 33.000 0.000 NA   NA
 7547441 7547442 GBP346_A1859 GBP346_A1860 ssuD_1   TRUE 0.864 18.000 0.340 1.000 N NA
 7547442 7547443 GBP346_A1860 GBP346_A1861     TRUE 0.972 -3.000 0.321 1.000 Y NA
 7547443 7547444 GBP346_A1861 GBP346_A1862     TRUE 0.895 89.000 0.435 0.083 N NA
 7547444 7547445 GBP346_A1862 GBP346_A1863     FALSE 0.456 129.000 0.261 NA   NA
 7547445 7547446 GBP346_A1863 GBP346_A1864     TRUE 0.725 74.000 0.933 NA   NA
 7547447 7547448 GBP346_A1865 GBP346_A1866     FALSE 0.049 72.000 0.000 NA   NA
 7547451 7547452 GBP346_A1869 GBP346_A1870     FALSE 0.052 59.000 0.000 NA   NA
 7547454 7547455 GBP346_A1872 GBP346_A1873     FALSE 0.042 276.000 0.019 NA N NA
 7547455 7547456 GBP346_A1873 GBP346_A1874     FALSE 0.001 356.000 0.000 NA   NA
 7547456 7547457 GBP346_A1874 GBP346_A1875     FALSE 0.008 315.000 0.030 NA   NA
 7547458 7547459 GBP346_A1876 GBP346_A1877   nodI TRUE 0.992 5.000 0.955 0.001 Y NA
 7547461 7547462 GBP346_A1879 GBP346_A1880     TRUE 0.641 34.000 0.389 NA   NA
 7547464 7547465 GBP346_A1882 GBP346_A1883 lexA   FALSE 0.051 64.000 0.000 NA   NA
 7547466 7547467 GBP346_A1884 GBP346_A1885   cysT TRUE 0.797 133.000 0.097 0.002 N NA
 7547467 7547468 GBP346_A1885 GBP346_A1886 cysT cysW TRUE 0.975 -3.000 0.935 0.001 N NA
 7547468 7547469 GBP346_A1886 GBP346_A1887 cysW   TRUE 0.969 14.000 0.587 1.000 Y NA
 7547469 7547470 GBP346_A1887 GBP346_A1888     TRUE 0.712 70.000 0.058 1.000 N NA
 7547470 7547471 GBP346_A1888 GBP346_A1889     FALSE 0.536 115.000 0.294 NA   NA
 7547471 7547472 GBP346_A1889 GBP346_A1890     FALSE 0.366 95.000 0.088 NA   NA
 7547474 7547475 GBP346_A1892 GBP346_A1893     TRUE 0.950 71.000 0.600 1.000 Y NA
 7547475 7547476 GBP346_A1893 GBP346_A1894     TRUE 0.782 30.000 0.129 1.000 N NA
 7547476 7547477 GBP346_A1894 GBP346_A1895   rbsK_1 TRUE 0.919 -3.000 0.355 1.000 N NA
 7547477 7547478 GBP346_A1895 GBP346_A1896 rbsK_1   FALSE 0.132 215.000 0.000 1.000 N NA
 7547478 7547479 GBP346_A1896 GBP346_A1897     FALSE 0.001 329.000 0.000 NA   NA
 7547479 7547480 GBP346_A1897 GBP346_A1898     FALSE 0.032 177.000 0.010 NA   NA
 7547480 7547481 GBP346_A1898 GBP346_A1899     TRUE 0.628 124.000 0.683 NA   NA
 7547481 7547482 GBP346_A1899 GBP346_A1900     TRUE 0.870 0.000 0.761 NA   NA
 7547482 7547483 GBP346_A1900 GBP346_A1901     FALSE 0.154 -33.000 0.011 NA   NA
 7547483 7547484 GBP346_A1901 GBP346_A1902     FALSE 0.304 108.000 0.068 NA   NA
 7547484 7547485 GBP346_A1902 GBP346_A1903     FALSE 0.040 253.000 0.000 NA N NA
 7547485 7547486 GBP346_A1903 GBP346_A1904     FALSE 0.448 52.000 0.121 NA   NA
 7547486 7547487 GBP346_A1904 GBP346_A1905     FALSE 0.200 140.000 0.000 1.000   NA
 7547487 7547488 GBP346_A1905 GBP346_A1906     TRUE 0.627 48.000 0.000 1.000 N NA
 7547488 7547489 GBP346_A1906 GBP346_A1907     TRUE 0.959 27.000 0.795 1.000 Y NA
 7547489 7547490 GBP346_A1907 GBP346_A1908     FALSE 0.000 558.000 0.000 NA   NA
 7547490 7547491 GBP346_A1908 GBP346_A1909     FALSE 0.514 26.000 0.160 NA   NA
 7547491 7547492 GBP346_A1909 GBP346_A1910   cpaB_2 TRUE 0.943 13.000 0.250 NA Y NA
 7547492 7547493 GBP346_A1910 GBP346_A1911 cpaB_2   TRUE 0.929 35.000 0.500 NA Y NA
 7547493 7547494 GBP346_A1911 GBP346_A1912     FALSE 0.518 34.000 0.175 NA   NA
 7547494 7547495 GBP346_A1912 GBP346_A1913     TRUE 0.695 11.000 0.222 NA   NA
 7547495 7547496 GBP346_A1913 GBP346_A1914     TRUE 0.941 -39.000 0.472 1.000 Y NA
 7547496 7547497 GBP346_A1914 GBP346_A1915     TRUE 0.943 -3.000 0.103 NA Y NA
 7547497 7547498 GBP346_A1915 GBP346_A1916     TRUE 0.946 -3.000 0.120 NA Y NA
 7547498 7547499 GBP346_A1916 GBP346_A1917     TRUE 0.969 -3.000 0.607 NA Y NA
 7547499 7547500 GBP346_A1917 GBP346_A1918     TRUE 0.949 -3.000 0.143 NA Y NA
 7547500 7547501 GBP346_A1918 GBP346_A1919     TRUE 0.744 -7.000 0.571 NA   NA
 7547501 7547502 GBP346_A1919 GBP346_A1920     FALSE 0.002 300.000 0.000 NA   NA
 7547502 7547503 GBP346_A1920 GBP346_A1921     FALSE 0.421 45.000 0.105 NA   NA
 7547503 7547504 GBP346_A1921 GBP346_A1922     TRUE 0.818 -3.000 0.500 NA   NA
 7547504 7547505 GBP346_A1922 GBP346_A1923     FALSE 0.592 2.000 0.074 NA   NA
 7547505 7547506 GBP346_A1923 GBP346_A1924     TRUE 0.990 3.000 0.692 0.010 Y NA
 7547507 7547508 GBP346_A1925 GBP346_A1926     FALSE 0.011 353.000 0.000 1.000   NA
 7547509 7547510 GBP346_A1927 GBP346_A1928     TRUE 0.848 17.000 0.211 1.000 N NA
 7547510 7547511 GBP346_A1928 GBP346_A1929   oprA TRUE 0.954 -3.000 0.368 0.047 N NA
 7547511 7547512 GBP346_A1929 GBP346_A1931 oprA   FALSE 0.602 -13.000 0.250 NA   NA
 7547513 7547514 GBP346_A1930 GBP346_A1932     FALSE 0.107 -3.000 0.000 NA   NA
 7547514 7547515 GBP346_A1932 GBP346_A1933     FALSE 0.052 59.000 0.000 NA   NA
 7547518 7547519 GBP346_A1936 GBP346_A1937     TRUE 0.847 150.000 0.400 1.000 Y NA
 7547519 7547520 GBP346_A1937 GBP346_A1938     TRUE 0.939 121.000 0.700 1.000 Y NA
 7547520 7547521 GBP346_A1938 GBP346_A1939     TRUE 0.871 -3.000 0.421 1.000   NA
 7547522 7547523 GBP346_A1940 GBP346_A1941     TRUE 0.802 -3.000 0.429 NA   NA
 7547523 7547524 GBP346_A1941 GBP346_A1942     TRUE 0.765 9.000 0.333 NA   NA
 7547524 7547525 GBP346_A1942 GBP346_A1943     TRUE 0.612 77.000 0.375 NA   NA
 7547525 7547526 GBP346_A1943 GBP346_A1944     TRUE 0.650 53.000 0.438 NA   NA
 7547526 7547527 GBP346_A1944 GBP346_A1945     FALSE 0.003 240.000 0.000 NA   NA
 7547528 7547529 GBP346_A1946 GBP346_A1947     TRUE 0.775 102.000 0.542 NA N NA
 7547529 7547530 GBP346_A1947 GBP346_A1948   rbsA TRUE 0.918 -6.000 0.125 NA Y NA
 7547530 7547531 GBP346_A1948 GBP346_A1949 rbsA   TRUE 0.936 -7.000 0.111 1.000 Y NA
 7547531 7547532 GBP346_A1949 GBP346_A1950     TRUE 0.628 -3.000 0.111 NA   NA
 7547532 7547533 GBP346_A1950 GBP346_A1951     TRUE 0.678 -3.000 0.150 NA   NA
 7547533 7547534 GBP346_A1951 GBP346_A1952     TRUE 0.791 31.000 0.150 1.000 N NA
 7547534 7547535 GBP346_A1952 GBP346_A1953     TRUE 0.879 -3.000 0.120 1.000 N NA
 7547535 7547536 GBP346_A1953 GBP346_A1954     FALSE 0.048 90.000 0.000 NA   NA
 7547536 7547537 GBP346_A1954 GBP346_A1955     FALSE 0.107 -3.000 0.000 NA   NA
 7547537 7547538 GBP346_A1955 GBP346_A1956     FALSE 0.376 35.000 0.079 NA   NA
 7547538 7547539 GBP346_A1956 GBP346_A1957     TRUE 0.624 56.000 0.342 NA   NA
 7547539 7547540 GBP346_A1957 GBP346_A1958     TRUE 0.638 59.000 0.382 NA   NA
 7547540 7547541 GBP346_A1958 GBP346_A1959     TRUE 0.666 38.000 0.176 1.000   NA
 7547541 7547542 GBP346_A1959 GBP346_A1960     TRUE 0.972 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 7547542 7547543 GBP346_A1960 GBP346_A1961     FALSE 0.409 -3.000 0.031 NA   NA
 7547543 7547544 GBP346_A1961 GBP346_A1962     FALSE 0.467 -3.000 0.046 NA   NA
 7547545 7547546 GBP346_A1963 GBP346_A1964     FALSE 0.001 498.000 0.000 NA   NA
 7547546 7547547 GBP346_A1964 GBP346_A1965     FALSE 0.001 385.000 0.000 NA   NA
 7547548 7547549 GBP346_A1966 GBP346_A1967     TRUE 0.966 49.000 0.200 0.002 Y NA
 7547549 7547550 GBP346_A1967 GBP346_A1968   pvdA TRUE 0.960 -3.000 0.300 NA Y NA
 7547550 7547551 GBP346_A1968 GBP346_A1969 pvdA   TRUE 0.762 48.000 0.333 NA N NA
 7547551 7547552 GBP346_A1969 GBP346_A1970     FALSE 0.442 65.000 0.012 1.000   NA
 7547553 7547554 GBP346_A1971 GBP346_A1972   cobO TRUE 0.892 5.000 0.069 0.009   NA
 7547554 7547555 GBP346_A1972 GBP346_A1973 cobO   TRUE 0.739 59.000 0.026 0.009   NA
 7547556 7547557 GBP346_A1975 GBP346_A1976   hoxN FALSE 0.001 401.000 0.000 NA   NA
 7547557 7547558 GBP346_A1976 GBP346_A1977 hoxN cobW FALSE 0.481 122.000 0.072 1.000   NA
 7547558 7547559 GBP346_A1977 GBP346_A1978 cobW cobN TRUE 0.709 67.000 0.274 1.000   NA
 7547559 7547560 GBP346_A1978 GBP346_A1979 cobN   FALSE 0.313 -3.000 0.013 NA   NA
 7547560 7547561 GBP346_A1979 GBP346_A1980     FALSE 0.574 -3.000 0.081 NA   NA
 7547561 7547562 GBP346_A1980 GBP346_A1982     TRUE 0.924 81.000 0.568 NA Y NA
 7547564 7547565 GBP346_A1983 GBP346_A1984     FALSE 0.055 25.000 0.000 NA   NA
 7547566 7547567 GBP346_A1985 GBP346_A1986     TRUE 0.829 -3.000 0.571 NA   NA
 7547567 7547568 GBP346_A1986 GBP346_A1987     FALSE 0.193 170.000 0.200 NA   NA
 7547568 7547569 GBP346_A1987 GBP346_A1988     FALSE 0.012 345.000 0.000 1.000   NA
 7547569 7547570 GBP346_A1988 GBP346_A1989   cobI TRUE 0.979 -3.000 0.097 0.008 Y NA
 7547570 7547571 GBP346_A1989 GBP346_A1990 cobI   TRUE 0.982 -3.000 0.191 0.008 Y NA
 7547571 7547572 GBP346_A1990 GBP346_A1991   cobG TRUE 0.826 -7.000 0.149 1.000 N NA
 7547572 7547573 GBP346_A1991 GBP346_A1993 cobG   FALSE 0.004 224.000 0.000 NA   NA
 7547574 7547575 GBP346_A1994 GBP346_A1995 cobL cbiD TRUE 0.975 -3.000 0.043 0.008 Y NA
 7547575 7547576 GBP346_A1995 GBP346_A1996 cbiD cobK TRUE 0.980 -3.000 0.123 0.008 Y NA
 7547576 7547577 GBP346_A1996 GBP346_A1997 cobK cobM FALSE 0.284 339.000 0.076 0.008 Y NA
 7547578 7547579 GBP346_A1998 GBP346_A1999     FALSE 0.532 131.000 0.500 NA   NA
 7547581 7547582 GBP346_A2001 GBP346_A2002     FALSE 0.549 118.000 0.333 NA   NA
 7547582 7547583 GBP346_A2002 GBP346_A2003     FALSE 0.123 0.000 0.000 NA   NA
 7547585 7547586 GBP346_A2005 GBP346_A2006     FALSE 0.057 284.000 0.000 1.000 N NA
 7547587 7547588 GBP346_A2007 GBP346_A2008     FALSE 0.447 -3.000 0.041 NA   NA
 7547589 7547590 GBP346_A2009 GBP346_A2010   arcC FALSE 0.557 0.000 0.061 NA   NA
 7547590 7547591 GBP346_A2010 GBP346_A2011 arcC argF_2 TRUE 0.943 86.000 0.483 1.000 Y NA
 7547591 7547592 GBP346_A2011 GBP346_A2012 argF_2 arcA TRUE 0.923 65.000 0.150 1.000 Y NA
 7547592 7547593 GBP346_A2012 GBP346_A2013 arcA   TRUE 0.977 -3.000 0.562 1.000 Y NA
 7547597 7547598 GBP346_A2017 GBP346_A2018     FALSE 0.241 36.000 0.031 NA   NA
 7547598 7547599 GBP346_A2018 GBP346_A2019     TRUE 0.977 -3.000 0.542 1.000 Y NA
 7547599 7547600 GBP346_A2019 GBP346_A2020     TRUE 0.976 -3.000 0.489 1.000 Y NA
 7547600 7547601 GBP346_A2020 GBP346_A2021     TRUE 0.960 -3.000 0.521 0.046 N NA
 7547602 7547603 GBP346_A2022 GBP346_A2023     FALSE 0.389 -3.000 0.026 NA   NA
 7547604 7547605 GBP346_A2024 GBP346_A2025     TRUE 0.754 77.000 0.500 1.000   NA
 7547608 7547609 GBP346_A2028 GBP346_A2029     TRUE 0.969 38.000 0.333 0.006 Y NA
 7547609 7547610 GBP346_A2029 GBP346_A2030     FALSE 0.556 43.000 0.222 NA   NA
 7547611 7547612 GBP346_A2031 GBP346_A2032     FALSE 0.499 165.000 0.219 1.000 N NA
 7547613 7547614 GBP346_A2033 GBP346_A2034     FALSE 0.015 157.000 0.000 NA   NA
 7547614 7547615 GBP346_A2034 GBP346_A2036     FALSE 0.004 231.000 0.000 NA   NA
 7547617 7547618 GBP346_A2037 GBP346_A2038     FALSE 0.575 -13.000 0.211 NA   NA
 7547618 7547619 GBP346_A2038 GBP346_A2039     FALSE 0.149 62.000 0.008 NA   NA
 7547619 7547620 GBP346_A2039 GBP346_A2040     FALSE 0.459 28.000 0.011 1.000   NA
 7547620 7547621 GBP346_A2040 GBP346_A2041     TRUE 0.665 56.000 0.172 1.000   NA
 7547621 7547622 GBP346_A2041 GBP346_A2042   argG_2 TRUE 0.657 41.000 0.005 1.000 N NA
 7547622 7547623 GBP346_A2042 GBP346_A2043 argG_2 argH_2 TRUE 0.971 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 7547623 7547624 GBP346_A2043 GBP346_A2044 argH_2   TRUE 0.705 18.000 0.004 1.000 N NA
 7547624 7547625 GBP346_A2044 GBP346_A2045     FALSE 0.352 54.000 0.069 NA   NA
 7547625 7547626 GBP346_A2045 GBP346_A2046     FALSE 0.581 -3.000 0.086 NA   NA
 7547626 7547627 GBP346_A2046 GBP346_A2047     TRUE 0.841 -3.000 0.667 NA   NA
 7547627 7547628 GBP346_A2047 GBP346_A2048     TRUE 0.885 35.000 0.005 1.000 Y NA
 7547628 7547629 GBP346_A2048 GBP346_A2049   ltaE TRUE 0.883 43.000 0.003 1.000 Y NA
 7547629 7547630 GBP346_A2049 GBP346_A2050 ltaE   TRUE 0.845 -3.000 0.050 1.000 N NA
 7547630 7547631 GBP346_A2050 GBP346_A2051     TRUE 0.908 -3.000 0.033 0.052 N NA
 7547631 7547632 GBP346_A2051 GBP346_A2052     TRUE 0.778 6.000 0.300 NA   NA
 7547632 7547633 GBP346_A2052 GBP346_A2053     TRUE 0.668 -34.000 0.571 NA   NA
 7547633 7547634 GBP346_A2053 GBP346_A2054     TRUE 0.674 125.000 0.429 1.000   NA
 7547635 7547636 GBP346_A2055 GBP346_A2056     FALSE 0.003 252.000 0.000 NA   NA
 7547636 7547637 GBP346_A2056 GBP346_A2057     FALSE 0.005 546.000 0.000 1.000   NA
 7547637 7547638 GBP346_A2057 GBP346_A2058     FALSE 0.018 298.000 0.000 1.000   NA
 7547638 7547639 GBP346_A2058 GBP346_A2059     FALSE 0.004 588.000 0.000 1.000   NA
 7547639 7547640 GBP346_A2059 GBP346_A2060     FALSE 0.033 128.000 0.000 NA   NA
 7547640 7547641 GBP346_A2060 GBP346_A2061     FALSE 0.001 311.000 0.000 NA   NA
 7547641 7547642 GBP346_A2061 GBP346_A2062     FALSE 0.007 428.000 0.000 1.000   NA
 7547643 7547644 GBP346_A2063 GBP346_A2064     FALSE 0.000 1542.000 0.000 NA   NA
 7547644 7547645 GBP346_A2064 GBP346_A2065     FALSE 0.001 455.000 0.000 NA   NA
 7547645 7547646 GBP346_A2065 GBP346_A2066     FALSE 0.037 122.000 0.000 NA   NA
 7547646 7547647 GBP346_A2066 GBP346_A2067     FALSE 0.052 56.000 0.000 NA   NA
 7547648 7547649 GBP346_A2068 GBP346_A2069     FALSE 0.003 249.000 0.000 NA   NA
 7547649 7547650 GBP346_A2069 GBP346_A2070     FALSE 0.076 15.000 0.000 NA   NA
 7547650 7547651 GBP346_A2070 GBP346_A2071     FALSE 0.024 137.000 0.000 NA   NA
 7547652 7547653 GBP346_A2072 GBP346_A2073     TRUE 0.842 7.000 0.667 NA   NA
 7547653 7547654 GBP346_A2073 GBP346_A2074     FALSE 0.006 203.000 0.000 NA   NA
 7547656 7547657 GBP346_A2076 GBP346_A2077     FALSE 0.063 203.000 0.000 1.000   NA
 7547658 7547659 GBP346_A2078 GBP346_A2079     FALSE 0.054 29.000 0.000 NA   NA
 7547660 7547661 GBP346_A2080 GBP346_A2081     FALSE 0.269 34.000 0.040 NA   NA
 7547661 7547662 GBP346_A2081 GBP346_A2082     TRUE 0.696 -10.000 0.450 NA   NA
 7547662 7547663 GBP346_A2082 GBP346_A2083     TRUE 0.716 6.000 0.184 NA   NA
 7547663 7547664 GBP346_A2083 GBP346_A2084     TRUE 0.748 -3.000 0.250 NA   NA
 7547665 7547666 GBP346_A2085 GBP346_A2086     TRUE 0.845 -3.000 0.700 NA   NA
 7547667 7547668 GBP346_A2087 GBP346_A2088     FALSE 0.054 212.000 0.000 1.000   NA
 7547671 7547672 GBP346_A2091 GBP346_A2092     TRUE 0.897 -3.000 0.191 1.000 N NA
 7547673 7547674 GBP346_A2093 GBP346_A2094     FALSE 0.167 181.000 0.214 NA   NA
 7547674 7547675 GBP346_A2094 GBP346_A2095   hutU_1 FALSE 0.336 19.000 0.051 NA   NA
 7547675 7547676 GBP346_A2095 GBP346_A2096 hutU_1   TRUE 0.757 37.000 0.102 1.000 N NA
 7547676 7547677 GBP346_A2096 GBP346_A2097     TRUE 0.875 18.000 0.444 1.000 N NA
 7547677 7547678 GBP346_A2097 GBP346_A2098     FALSE 0.596 90.000 0.333 NA   NA
 7547678 7547679 GBP346_A2098 GBP346_A2099     FALSE 0.002 291.000 0.000 NA   NA
 7547680 7547681 GBP346_A2100 GBP346_A2101     TRUE 0.705 -48.000 1.000 NA   NA
 7547681 7547682 GBP346_A2101 GBP346_A2102     FALSE 0.558 121.000 0.375 NA   NA
 7547682 7547683 GBP346_A2102 GBP346_A2103     FALSE 0.000 619.000 0.000 NA   NA
 7547685 7547686 GBP346_A2105 GBP346_A2106     FALSE 0.002 267.000 0.000 NA   NA
 7547686 7547687 GBP346_A2106 GBP346_A2107     FALSE 0.001 413.000 0.000 NA   NA
 7547687 7547688 GBP346_A2107 GBP346_A2108   cysC_1 FALSE 0.170 54.000 0.012 NA   NA
 7547690 7547691 GBP346_A2110 GBP346_A2111     TRUE 0.747 42.000 0.033 0.008   NA
 7547691 7547692 GBP346_A2111 GBP346_A2112     FALSE 0.405 120.000 0.025 1.000   NA
 7547692 7547693 GBP346_A2112 GBP346_A2113     TRUE 0.963 -3.000 0.667 0.048 N NA
 7547693 7547694 GBP346_A2113 GBP346_A2114     TRUE 0.675 35.000 0.190 1.000   NA
 7547694 7547695 GBP346_A2114 GBP346_A2115     TRUE 0.709 -3.000 0.190 NA   NA
 7547695 7547696 GBP346_A2115 GBP346_A2116     FALSE 0.401 132.000 0.222 NA   NA
 7547696 7547697 GBP346_A2116 GBP346_A2117     FALSE 0.453 111.000 0.167 NA   NA
 7547697 7547698 GBP346_A2117 GBP346_A2118     FALSE 0.539 18.000 0.027 1.000   NA
 7547698 7547699 GBP346_A2118 GBP346_A2119     FALSE 0.004 622.000 0.000 1.000   NA
 7547699 7547700 GBP346_A2119 GBP346_A2120     FALSE 0.241 197.000 0.750 NA   NA
 7547700 7547701 GBP346_A2120 GBP346_A2121     FALSE 0.001 417.000 0.000 NA   NA
 7547701 7547702 GBP346_A2121 GBP346_A2122     TRUE 0.617 125.000 0.667 NA   NA
 7547702 7547703 GBP346_A2122 GBP346_A2123     TRUE 0.837 99.000 0.500 1.000 N NA
 7547703 7547704 GBP346_A2123 GBP346_A2124     TRUE 0.832 22.000 0.267 1.000 N NA
 7547704 7547705 GBP346_A2124 GBP346_A2125     TRUE 0.803 -34.000 0.250 1.000 N NA
 7547705 7547706 GBP346_A2125 GBP346_A2126     TRUE 0.980 17.000 0.815 0.046 Y NA
 7547706 7547707 GBP346_A2126 GBP346_A2127     TRUE 0.990 2.000 0.852 0.046 Y NA
 7547707 7547708 GBP346_A2127 GBP346_A2128     TRUE 0.958 79.000 0.261 0.046 Y NA
 7547708 7547709 GBP346_A2128 GBP346_A2129     FALSE 0.583 70.000 0.286 NA   NA
 7547709 7547710 GBP346_A2129 GBP346_A2130     TRUE 0.606 70.000 0.333 NA   NA
 7547710 7547711 GBP346_A2130 GBP346_A2131     TRUE 0.931 44.000 0.548 NA Y NA
 7547711 7547712 GBP346_A2131 GBP346_A2132     FALSE 0.414 109.000 0.129 NA   NA
 7547712 7547713 GBP346_A2132 GBP346_A2133     TRUE 0.674 -7.000 0.109 1.000   NA
 7547713 7547714 GBP346_A2133 GBP346_A2134     TRUE 0.729 -10.000 0.582 NA   NA
 7547714 7547715 GBP346_A2134 GBP346_A2135     FALSE 0.002 297.000 0.000 NA   NA
 7547716 7547717 GBP346_A2136 GBP346_A2137     TRUE 0.704 109.000 1.000 NA   NA
 7547718 7547719 GBP346_A2138 GBP346_A2139     FALSE 0.048 91.000 0.000 NA   NA
 7547720 7547721 GBP346_A2140 GBP346_A2141     FALSE 0.002 290.000 0.000 NA   NA
 7547721 7547722 GBP346_A2141 GBP346_A2142     FALSE 0.005 215.000 0.000 NA   NA
 7547725 7547726 GBP346_A2145 GBP346_A2146     FALSE 0.082 13.000 0.000 NA   NA
 7547726 7547727 GBP346_A2146 GBP346_A2147     TRUE 0.656 73.000 0.500 NA   NA
 7547727 7547728 GBP346_A2147 GBP346_A2148     FALSE 0.094 327.000 0.000 NA Y NA
 7547728 7547729 GBP346_A2148 GBP346_A2149     TRUE 0.988 0.000 0.444 0.010 Y NA
 7547729 7547730 GBP346_A2149 GBP346_A2150     FALSE 0.002 302.000 0.000 NA   NA
 7547730 7547731 GBP346_A2150 GBP346_A2151     TRUE 0.825 6.000 0.500 NA   NA
 7547733 7547734 GBP346_A2152 GBP346_A2154     FALSE 0.002 279.000 0.000 NA   NA
 7547734 7547735 GBP346_A2154 GBP346_A2155     FALSE 0.005 213.000 0.000 NA   NA
 7547737 7547738 GBP346_A2157 GBP346_A2158   fimD TRUE 0.951 -9.000 0.308 1.000 Y NA
 7547738 7547739 GBP346_A2158 GBP346_A2159 fimD   TRUE 0.979 7.000 0.750 1.000 Y NA
 7547739 7547740 GBP346_A2159 GBP346_A2160     TRUE 0.959 22.000 0.750 1.000 Y NA
 7547743 7547744 GBP346_A2163 GBP346_A2164     TRUE 0.692 -33.000 0.667 NA   NA
 7547744 7547745 GBP346_A2164 GBP346_A2165     FALSE 0.129 199.000 0.222 NA   NA
 7547746 7547747 GBP346_A2166 GBP346_A2167     TRUE 0.865 -3.000 1.000 NA   NA
 7547747 7547748 GBP346_A2167 GBP346_A2168     FALSE 0.000 630.000 0.000 NA   NA
 7547748 7547749 GBP346_A2168 GBP346_A2169     TRUE 0.839 -3.000 0.000 0.006   NA
 7547749 7547750 GBP346_A2169 GBP346_A2170     FALSE 0.002 293.000 0.000 NA   NA
 7547751 7547752 GBP346_A2171 GBP346_A2173     FALSE 0.552 129.000 0.500 NA   NA
 7547754 7547755 GBP346_A2174 GBP346_A2175     TRUE 0.819 86.000 0.333 1.000 N NA
 7547755 7547756 GBP346_A2175 GBP346_A2176     TRUE 0.819 7.000 0.500 NA   NA
 7547756 7547757 GBP346_A2176 GBP346_A2177     TRUE 0.840 0.000 0.500 NA   NA
 7547758 7547759 GBP346_A2178 GBP346_A2179     FALSE 0.005 215.000 0.000 NA   NA
 7547759 7547760 GBP346_A2179 GBP346_A2180     TRUE 0.651 121.000 0.750 NA   NA
 7547760 7547761 GBP346_A2180 GBP346_A2181     FALSE 0.456 175.000 0.043 0.079 N NA
 7547761 7547762 GBP346_A2181 GBP346_A2182     TRUE 0.971 -3.000 0.057 0.079 Y NA
 7547762 7547763 GBP346_A2182 GBP346_A2183     TRUE 0.780 21.000 0.111 1.000 N NA
 7547764 7547765 GBP346_A2184 GBP346_A2185   nosZ FALSE 0.008 276.000 0.012 NA   NA
 7547765 7547766 GBP346_A2185 GBP346_A2186 nosZ nosD FALSE 0.422 196.000 0.029 0.003 N NA
 7547766 7547767 GBP346_A2186 GBP346_A2187 nosD nosF TRUE 0.889 -18.000 0.941 1.000 N NA
 7547767 7547768 GBP346_A2187 GBP346_A2188 nosF   TRUE 0.865 -3.000 1.000 NA   NA
 7547768 7547769 GBP346_A2188 GBP346_A2189     TRUE 0.792 -3.000 0.375 NA   NA
 7547769 7547770 GBP346_A2189 GBP346_A2190     TRUE 0.813 11.000 0.667 NA   NA
 7547770 7547771 GBP346_A2190 GBP346_A2191     TRUE 0.875 3.000 0.889 NA   NA
 7547771 7547772 GBP346_A2191 GBP346_A2192     FALSE 0.566 22.000 0.211 NA   NA
 7547772 7547773 GBP346_A2192 GBP346_A2193   nosR TRUE 0.800 59.000 0.192 1.000 N NA
 7547773 7547774 GBP346_A2193 GBP346_A2194 nosR   FALSE 0.565 -3.000 0.077 NA   NA
 7547774 7547775 GBP346_A2194 GBP346_A2196     FALSE 0.183 72.000 0.018 NA   NA
 7547777 7547778 GBP346_A2198 GBP346_A2199     TRUE 0.744 62.000 1.000 NA   NA
 7547778 7547779 GBP346_A2199 GBP346_A2200     TRUE 0.818 -3.000 0.500 NA   NA
 7547780 7547781 GBP346_A2201 GBP346_A2202     TRUE 0.685 9.000 0.182 NA   NA
 7547782 7547783 GBP346_A2203 GBP346_A2204     FALSE 0.400 67.000 0.095 NA   NA
 7547785 7547786 GBP346_A2206 GBP346_A2207     FALSE 0.596 -3.000 0.092 NA   NA
 7547787 7547788 GBP346_A2208 GBP346_A2209 lys   FALSE 0.247 79.000 0.040 NA   NA
 7547788 7547789 GBP346_A2209 GBP346_A2210     FALSE 0.047 94.000 0.000 NA   NA
 7547791 7547792 GBP346_A2211 GBP346_A2213     FALSE 0.497 -3.000 0.054 NA   NA
 7547792 7547793 GBP346_A2213 GBP346_A2214     FALSE 0.503 55.000 0.162 NA   NA
 7547793 7547794 GBP346_A2214 GBP346_A2215     FALSE 0.023 139.000 0.000 NA   NA
 7547794 7547795 GBP346_A2215 GBP346_A2216     FALSE 0.107 -3.000 0.000 NA   NA
 7547795 7547796 GBP346_A2216 GBP346_A2217     TRUE 0.717 -40.000 1.000 NA   NA
 7547800 7547801 GBP346_A2221 GBP346_A2222     FALSE 0.601 -27.000 0.312 NA   NA
 7547801 7547802 GBP346_A2222 GBP346_A2223     FALSE 0.584 58.000 0.260 NA   NA
 7547802 7547803 GBP346_A2223 GBP346_A2224     FALSE 0.012 619.000 0.000 1.000 N NA
 7547803 7547804 GBP346_A2224 GBP346_A2225     TRUE 0.914 5.000 0.235 1.000 N NA
 7547804 7547805 GBP346_A2225 GBP346_A2226     TRUE 0.928 85.000 0.238 1.000 Y NA
 7547805 7547806 GBP346_A2226 GBP346_A2227     TRUE 0.925 84.000 0.571 NA Y NA
 7547806 7547807 GBP346_A2227 GBP346_A2228     FALSE 0.253 116.000 0.053 NA   NA
 7547810 7547811 GBP346_A2231 GBP346_A2232     FALSE 0.328 110.000 0.079 NA   NA
 7547813 7547814 GBP346_A2234 GBP346_A2235     TRUE 0.886 -3.000 0.400 NA N NA
 7547814 7547815 GBP346_A2235 GBP346_A2236     TRUE 0.918 3.000 0.667 NA N NA
 7547818 7547819 GBP346_A2239 GBP346_A2240     TRUE 0.692 -6.000 0.333 NA   NA
 7547819 7547820 GBP346_A2240 GBP346_A2241     FALSE 0.416 22.000 0.091 NA   NA
 7547820 7547821 GBP346_A2241 GBP346_A2242     TRUE 0.782 11.000 0.491 NA   NA
 7547821 7547822 GBP346_A2242 GBP346_A2243     FALSE 0.012 313.000 0.058 NA   NA
 7547823 7547824 GBP346_A2244 GBP346_A2245     FALSE 0.561 51.000 0.230 NA   NA
 7547824 7547825 GBP346_A2245 GBP346_A2246     FALSE 0.541 40.000 0.203 NA   NA
 7547826 7547827 GBP346_A2247 GBP346_A2248     TRUE 0.988 -3.000 0.938 0.045 Y NA
 7547827 7547828 GBP346_A2248 GBP346_A2249   potG TRUE 0.950 63.000 0.533 1.000 Y NA
 7547828 7547829 GBP346_A2249 GBP346_A2250 potG potF_2 TRUE 0.943 91.000 0.474 1.000 Y NA
 7547830 7547831 GBP346_A2251 GBP346_A2252     TRUE 0.817 5.000 0.429