MicrobesOnline Operon Predictions for Stenotrophomonas maltophilia K279a

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5775362 5775363 Smlt0001 Smlt0002 dnaA dnaN FALSE 0.478 276.000 0.328 1.000 Y NA
 5775365 10768808 Smlt0004 Smlt0004a recF   TRUE 0.763 -1082.000 0.000 NA   NA
 10768808 5775366 Smlt0004a Smlt0005   gyrB FALSE 0.137 125.000 0.000 NA   NA
 5775366 5775367 Smlt0005 Smlt0006 gyrB   FALSE 0.332 68.000 0.005 NA   NA
 5775367 5775368 Smlt0006 Smlt0007     TRUE 0.570 72.000 0.079 NA   NA
 5775368 5775369 Smlt0007 Smlt0008     FALSE 0.139 133.000 0.000 1.000   NA
 5775369 5775370 Smlt0008 Smlt0009     FALSE 0.117 144.000 0.000 1.000   NA
 5775370 5775371 Smlt0009 Smlt0010   exbB1 TRUE 0.841 95.000 0.600 0.023 N NA
 5775371 5775372 Smlt0010 Smlt0011 exbB1 exbD1 TRUE 0.972 63.000 0.600 0.064 Y NA
 5775372 5775373 Smlt0011 Smlt0012 exbD1 exbD2 TRUE 0.999 4.000 0.857 0.049 Y NA
 5775373 5775374 Smlt0012 Smlt0013 exbD2 cls FALSE 0.048 103.000 0.000 1.000 N NA
 5775374 5775375 Smlt0013 Smlt0014 cls   TRUE 0.871 41.000 0.417 NA   NA
 5775375 5775376 Smlt0014 Smlt0015     TRUE 0.840 10.000 0.009 NA   NA
 5775376 5775377 Smlt0015 Smlt0016     FALSE 0.190 102.000 0.000 NA   NA
 5775379 5775380 Smlt0018 Smlt0019     FALSE 0.218 91.000 0.000 NA   NA
 5775380 5775381 Smlt0019 Smlt0020     FALSE 0.049 198.000 0.000 NA   NA
 5775381 5775382 Smlt0020 Smlt0021     FALSE 0.154 119.000 0.000 NA   NA
 5775382 5775383 Smlt0021 Smlt0023     FALSE 0.010 620.000 0.000 NA   NA
 5775383 5775384 Smlt0023 Smlt0024     FALSE 0.016 364.000 0.000 NA   NA
 5775384 5775385 Smlt0024 Smlt0025     TRUE 0.818 39.000 0.250 NA   NA
 5775386 5775387 Smlt0026 Smlt0027     TRUE 0.996 9.000 0.409 0.073 Y NA
 5775387 5775388 Smlt0027 Smlt0028     FALSE 0.040 343.000 0.000 0.073   NA
 5775388 5775389 Smlt0028 Smlt0029     TRUE 0.928 -10.000 0.000 0.073   NA
 5775389 5775390 Smlt0029 Smlt0032     FALSE 0.001 687.000 0.000 NA N NA
 5775390 5775391 Smlt0032 Smlt0033     FALSE 0.073 166.000 0.000 NA   NA
 5775391 5775392 Smlt0033 Smlt0034     TRUE 0.849 40.000 0.333 NA   NA
 5775392 5775393 Smlt0034 Smlt0035     TRUE 0.979 20.000 1.000 NA   NA
 5775393 5775394 Smlt0035 Smlt0036   smmL TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 5775394 5775395 Smlt0036 Smlt0037 smmL smmK TRUE 0.889 10.000 0.100 1.000 N NA
 5775395 5775396 Smlt0037 Smlt0038 smmK smmJ TRUE 0.996 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 5775396 5775397 Smlt0038 Smlt0039 smmJ   FALSE 0.218 91.000 0.000 NA   NA
 5775398 5775399 Smlt0040 Smlt0041     FALSE 0.160 115.000 0.000 NA   NA
 5775399 5775400 Smlt0041 Smlt0042     FALSE 0.052 193.000 0.000 NA   NA
 5775400 5775401 Smlt0042 Smlt0043     FALSE 0.058 184.000 0.000 NA   NA
 5775401 5775402 Smlt0043 Smlt0044     FALSE 0.128 130.000 0.000 NA   NA
 5775402 5775403 Smlt0044 Smlt0045     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775404 5775405 Smlt0046 Smlt0047     FALSE 0.192 109.000 0.000 1.000   NA
 5775405 5775406 Smlt0047 Smlt0048   aspC FALSE 0.007 234.000 0.000 1.000 N NA
 5775409 5775410 Smlt0051 Smlt0052     FALSE 0.190 165.000 0.043 NA   NA
 5775410 5775411 Smlt0052 Smlt0053     TRUE 0.845 4.000 0.000 1.000   NA
 5775412 5775413 Smlt0054 Smlt0055     FALSE 0.026 261.000 0.000 NA   NA
 5775413 10768809 Smlt0055 Smlt0072     TRUE 0.767 -527.000 0.000 NA   NA
 5775414 5775415 Smlt0056 Smlt0057     FALSE 0.002 595.000 0.000 1.000 N NA
 5775415 5775416 Smlt0057 Smlt0058     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775416 5775417 Smlt0058 Smlt0059     TRUE 0.762 10.000 0.000 NA   NA
 5775417 5775418 Smlt0059 Smlt0060     FALSE 0.477 30.000 0.000 NA   NA
 5775418 5775419 Smlt0060 Smlt0061     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775419 5775420 Smlt0061 Smlt0062     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775420 5775421 Smlt0062 Smlt0063     TRUE 0.829 -13.000 0.000 NA   NA
 5775421 5775422 Smlt0063 Smlt0064     FALSE 0.281 59.000 0.000 NA   NA
 5775422 5775423 Smlt0064 Smlt0065     FALSE 0.423 34.000 0.000 NA   NA
 5775423 5775424 Smlt0065 Smlt0066   Q FALSE 0.396 36.000 0.000 NA   NA
 5775425 5775426 Smlt0067 Smlt0068     TRUE 0.992 -3.000 0.349 NA   NA
 5775426 5775427 Smlt0068 Smlt0069     FALSE 0.171 110.000 0.000 NA   NA
 5775427 5775428 Smlt0069 Smlt0073     FALSE 0.009 1026.000 0.000 NA   NA
 5775428 5775429 Smlt0073 Smlt0074     FALSE 0.181 114.000 0.000 1.000   NA
 5775431 5775432 Smlt0076 Smlt0077   phhA FALSE 0.029 243.000 0.000 NA   NA
 5775433 5775434 Smlt0078 Smlt0079     FALSE 0.050 196.000 0.000 NA   NA
 5775435 5775436 Smlt0080 Smlt0082     FALSE 0.012 451.000 0.000 NA   NA
 5775439 5775440 Smlt0085 Smlt0086     TRUE 0.987 12.000 0.846 NA   NA
 5775442 5775443 Smlt0088 Smlt0089     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5775443 5775444 Smlt0089 Smlt0090b   fpg TRUE 0.638 20.000 0.000 1.000   NA
 5775444 10768810 Smlt0090b Smlt0090a fpg   TRUE 0.769 -344.000 0.000 NA   NA
 10768810 5775445 Smlt0090a Smlt0091   mdoD FALSE 0.011 575.000 0.000 NA   NA
 5775446 5775447 Smlt0092 Smlt0093 tdk   TRUE 0.784 10.000 0.000 1.000   NA
 5775447 5775448 Smlt0093 Smlt0094     TRUE 0.608 39.000 0.000 0.018   NA
 5775449 5775450 Smlt0095 Smlt0096 rep   FALSE 0.003 261.000 0.000 NA N NA
 5775452 5775453 Smlt0098 Smlt0099 hel pyrF TRUE 0.955 -3.000 0.008 1.000   NA
 5775453 5775454 Smlt0099 Smlt0101 pyrF   FALSE 0.013 425.000 0.000 NA   NA
 5775454 5775455 Smlt0101 Smlt0102   plsB TRUE 0.909 9.000 0.043 NA   NA
 5775455 5775456 Smlt0102 Smlt0103 plsB   FALSE 0.002 374.000 0.000 NA N NA
 5775456 5775457 Smlt0103 Smlt0104   rdgC FALSE 0.297 37.000 0.012 NA N NA
 5775457 5775458 Smlt0104 Smlt0105 rdgC   TRUE 0.641 60.000 0.121 NA   NA
 5775461 5775462 Smlt0108 Smlt0109 gltD gltB TRUE 0.881 85.000 0.032 0.001 Y NA
 5775465 5775466 Smlt0112 Smlt0113     FALSE 0.142 123.000 0.000 NA   NA
 5775466 5775467 Smlt0113 Smlt0114     TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5775469 5775470 Smlt0116 Smlt0117     TRUE 0.996 4.000 0.500 NA Y NA
 5775471 5775472 Smlt0118 Smlt0119     FALSE 0.288 67.000 0.000 1.000   NA
 5775472 5775473 Smlt0119 Smlt0120   lhr TRUE 0.603 102.000 0.185 1.000   NA
 5775474 5775475 Smlt0121 Smlt0122     FALSE 0.349 41.000 0.000 NA   NA
 5775476 5775477 Smlt0123 Smlt0124     TRUE 0.996 -3.000 0.724 NA   NA
 5775477 5775478 Smlt0124 Smlt0125     TRUE 0.986 -3.000 0.172 NA   NA
 5775478 5775479 Smlt0125 Smlt0126     TRUE 0.985 -3.000 0.161 NA   NA
 5775479 5775480 Smlt0126 Smlt0127     TRUE 0.957 8.000 0.193 NA   NA
 5775480 5775481 Smlt0127 Smlt0128     TRUE 0.917 17.000 0.168 NA   NA
 5775481 5775482 Smlt0128 Smlt0129     TRUE 0.994 0.000 0.720 NA   NA
 5775482 5775483 Smlt0129 Smlt0130     TRUE 0.897 22.000 0.200 NA   NA
 5775483 5775484 Smlt0130 Smlt0131     FALSE 0.233 85.000 0.000 NA   NA
 5775486 5775487 Smlt0134 Smlt0135 hipA hipB TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5775487 5775488 Smlt0135 Smlt0136 hipB   FALSE 0.018 162.000 0.000 1.000 N NA
 5775491 5775492 Smlt0139 Smlt0140     FALSE 0.469 50.000 0.079 NA N NA
 5775492 5775493 Smlt0140 Smlt0141     TRUE 0.943 5.000 0.083 NA   NA
 5775493 5775494 Smlt0141 Smlt0142     TRUE 0.983 -3.000 0.128 NA   NA
 5775494 5775495 Smlt0142 Smlt0143     TRUE 0.877 11.000 0.107 NA N NA
 5775495 5775496 Smlt0143 Smlt0144     FALSE 0.217 93.000 0.023 NA N NA
 5775496 5775497 Smlt0144 Smlt0145     TRUE 0.892 8.000 0.023 NA   NA
 5775497 5775498 Smlt0145 Smlt0146     FALSE 0.287 57.000 0.000 NA   NA
 5775498 5775499 Smlt0146 Smlt0147     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 5775500 5775501 Smlt0148 Smlt0149     TRUE 0.810 5.000 0.000 NA   NA
 5775501 5775502 Smlt0149 Smlt0150     FALSE 0.446 74.000 0.100 NA N NA
 5775503 5775504 Smlt0151 Smlt0152 glnA glnB FALSE 0.117 348.000 0.000 1.000 Y NA
 5775504 5775505 Smlt0152 Smlt0153 glnB amtB TRUE 0.632 28.000 0.048 1.000 N NA
 5775505 5775506 Smlt0153 Smlt0154 amtB   FALSE 0.008 224.000 0.000 1.000 N NA
 5775506 5775507 Smlt0154 Smlt0155     FALSE 0.072 68.000 0.000 1.000 N NA
 5775507 5775508 Smlt0155 Smlt0156     FALSE 0.173 109.000 0.000 NA   NA
 5775508 5775509 Smlt0156 Smlt0157     FALSE 0.175 108.000 0.000 NA   NA
 5775509 5775510 Smlt0157 Smlt0158   glnL FALSE 0.015 171.000 0.000 1.000 N NA
 5775510 5775511 Smlt0158 Smlt0159 glnL glnG TRUE 0.998 -7.000 0.587 1.000 Y NA
 5775511 5775512 Smlt0159 Smlt0160 glnG sodC1 FALSE 0.133 94.000 0.007 1.000 N NA
 5775512 5775513 Smlt0160 Smlt0161 sodC1 sodC2 TRUE 0.984 32.000 0.375 0.002 Y NA
 5775514 5775515 Smlt0162 Smlt0163     FALSE 0.263 66.000 0.000 NA   NA
 5775517 5775518 Smlt0165 Smlt0166     TRUE 0.997 7.000 0.765 1.000 Y NA
 5775518 5775519 Smlt0166 Smlt0167   hemD TRUE 0.936 105.000 0.600 1.000 Y NA
 5775520 5775521 Smlt0168 Smlt0169     TRUE 0.679 33.000 0.035 NA   NA
 5775521 5775522 Smlt0169 Smlt0170     FALSE 0.459 58.000 0.019 NA   NA
 5775522 5775523 Smlt0170 Smlt0171   secB FALSE 0.432 100.000 0.158 NA N NA
 5775523 5775524 Smlt0171 Smlt0172 secB gpsA TRUE 0.568 21.000 0.015 1.000 N NA
 5775527 5775528 Smlt0175 Smlt0176     FALSE 0.029 244.000 0.000 NA   NA
 5775528 5775529 Smlt0176 Smlt0177   arsC TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA N NA
 5775529 5775530 Smlt0177 Smlt0178 arsC arsR FALSE 0.070 38.000 0.000 NA N NA
 5775532 5775533 Smlt0180 Smlt0181     FALSE 0.063 175.000 0.000 NA   NA
 5775533 5775534 Smlt0181 Smlt0182     FALSE 0.317 47.000 0.000 NA   NA
 5775534 5775535 Smlt0182 Smlt0183     FALSE 0.040 215.000 0.000 NA   NA
 5775536 5775537 Smlt0184 Smlt0185     FALSE 0.225 97.000 0.000 1.000   NA
 5775537 5775538 Smlt0185 Smlt0186     TRUE 0.599 68.000 0.100 NA   NA
 5775538 5775539 Smlt0186 Smlt0187     FALSE 0.140 124.000 0.000 NA   NA
 5775539 5775540 Smlt0187 Smlt0188     FALSE 0.233 85.000 0.000 NA   NA
 5775541 5775542 Smlt0189 Smlt0190     TRUE 0.979 -3.000 0.186 1.000 N NA
 5775542 5775543 Smlt0190 Smlt0191     FALSE 0.040 291.000 0.014 NA   NA
 5775543 5775544 Smlt0191 Smlt0192     FALSE 0.236 84.000 0.000 NA   NA
 5775544 5775545 Smlt0192 Smlt0193     FALSE 0.029 246.000 0.000 NA   NA
 5775545 5775546 Smlt0193 Smlt0194     FALSE 0.164 113.000 0.000 NA   NA
 5775546 5775547 Smlt0194 Smlt0195     FALSE 0.224 88.000 0.000 NA   NA
 5775549 5775550 Smlt0197 Smlt0198     TRUE 0.808 66.000 0.000 0.050 Y NA
 5775552 5775553 Smlt0200 Smlt0201     FALSE 0.347 70.000 0.007 NA   NA
 5775554 5775555 Smlt0203 Smlt0204     FALSE 0.041 213.000 0.000 NA   NA
 5775555 5775556 Smlt0204 Smlt0205   fabH FALSE 0.459 104.000 0.078 NA   NA
 5775556 5775557 Smlt0205 Smlt0206 fabH dhaA TRUE 0.761 95.000 0.377 1.000   NA
 5775559 5775560 Smlt0208 Smlt0209     TRUE 0.991 -3.000 0.418 1.000 N NA
 5775560 5775561 Smlt0209 Smlt0210     TRUE 0.529 82.000 0.070 NA   NA
 5775563 5775564 Smlt0212 Smlt0213   ubiB TRUE 0.994 -3.000 0.432 1.000   NA
 5775565 5775566 Smlt0214 Smlt0215     TRUE 0.960 5.000 0.167 NA   NA
 5775566 5775567 Smlt0215 Smlt0216     TRUE 0.953 11.000 0.214 NA   NA
 5775567 5775568 Smlt0216 Smlt0217     TRUE 0.980 0.000 0.214 NA   NA
 5775569 5775570 Smlt0218 Smlt0219   truC FALSE 0.070 177.000 0.000 1.000   NA
 5775572 5775573 Smlt0221 Smlt0222     FALSE 0.487 47.000 0.014 1.000   NA
 5775573 5775574 Smlt0222 Smlt0223   dcp FALSE 0.042 112.000 0.000 1.000 N NA
 5775575 5775576 Smlt0224 Smlt0225     TRUE 0.989 4.000 0.600 NA   NA
 5775577 5775578 Smlt0226 Smlt0227     FALSE 0.034 125.000 0.000 1.000 N NA
 5775579 5775580 Smlt0228 Smlt0230     FALSE 0.134 414.000 0.000 0.071 Y NA
 5775581 5775582 Smlt0231 Smlt0232 mls aceA TRUE 0.796 66.000 0.016 1.000 Y NA
 5775582 5775583 Smlt0232 Smlt0233 aceA   FALSE 0.003 418.000 0.000 1.000 N NA
 5775583 5775584 Smlt0233 Smlt0234     TRUE 0.979 18.000 0.062 0.011 Y NA
 5775584 5775585 Smlt0234 Smlt0236     FALSE 0.003 449.000 0.000 1.000 N NA
 5775586 5775587 Smlt0237 Smlt0238     TRUE 0.987 9.000 0.158 1.000 Y NA
 5775587 5775588 Smlt0238 Smlt0239     TRUE 0.991 11.000 0.316 1.000 Y NA
 5775589 5775590 Smlt0240 Smlt0241     FALSE 0.010 205.000 0.000 1.000 N NA
 5775590 5775591 Smlt0241 Smlt0242     TRUE 0.729 44.000 0.158 NA   NA
 5775593 5775594 Smlt0245 Smlt0246     TRUE 0.906 6.000 0.026 NA   NA
 5775594 5775595 Smlt0246 Smlt0247   RRM1 FALSE 0.010 708.000 0.000 NA   NA
 5775595 5775596 Smlt0247 Smlt0248 RRM1   TRUE 0.955 144.000 0.917 0.001 Y NA
 5775596 5775597 Smlt0248 Smlt0249     FALSE 0.029 243.000 0.000 NA   NA
 5775599 5775600 Smlt0251 Smlt0252     FALSE 0.049 56.000 0.000 NA N NA
 5775600 5775601 Smlt0252 Smlt0253     FALSE 0.187 122.000 0.031 1.000 N NA
 5775604 5775605 Smlt0257 Smlt0258 pncA   FALSE 0.352 56.000 0.004 NA   NA
 5775605 5775606 Smlt0258 Smlt0259     FALSE 0.024 276.000 0.000 NA   NA
 5775606 5775607 Smlt0259 Smlt0260     FALSE 0.423 34.000 0.000 NA   NA
 5775607 5775608 Smlt0260 Smlt0261     TRUE 0.857 65.000 0.078 1.000 Y NA
 5775611 5775612 Smlt0264 Smlt0265     TRUE 0.693 15.000 0.019 1.000 N NA
 5775612 5775613 Smlt0265 Smlt0266     TRUE 0.997 -3.000 0.242 1.000 Y NA
 5775613 5775614 Smlt0266 Smlt0267     TRUE 0.999 -3.000 0.627 0.002 Y NA
 5775614 5775615 Smlt0267 Smlt0268   mmsB TRUE 0.999 -3.000 0.687 1.000 Y NA
 5775616 5775617 Smlt0269 Smlt0270 ohr   FALSE 0.042 112.000 0.000 1.000 N NA
 5775618 5775619 Smlt0271 Smlt0272     FALSE 0.306 50.000 0.000 NA   NA
 5775620 5775621 Smlt0273 Smlt0274     TRUE 0.867 43.000 0.429 NA   NA
 5775622 5775623 Smlt0275 Smlt0276 dusA   FALSE 0.040 214.000 0.000 NA   NA
 5775623 5775624 Smlt0276 Smlt0277     TRUE 0.641 74.000 0.143 NA   NA
 5775624 5775625 Smlt0277 Smlt0278     TRUE 0.972 23.000 0.214 1.000 Y NA
 5775626 5775627 Smlt0279 Smlt0280     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5775627 5775628 Smlt0280 Smlt0281     TRUE 0.882 9.000 0.020 NA   NA
 5775629 5775630 Smlt0282 Smlt0283 birA   TRUE 0.975 -3.000 0.147 1.000 N NA
 5775630 5775631 Smlt0283 Smlt0284     TRUE 0.820 10.000 0.005 NA   NA
 5775631 10768811 Smlt0284 Smlt_t11     FALSE 0.341 42.000 0.000 NA   NA
 5775632 5775633 Smlt0285 Smlt0286     TRUE 0.995 0.000 1.000 NA   NA
 5775633 5775634 Smlt0286 Smlt0287     FALSE 0.017 348.000 0.000 NA   NA
 5775634 5775635 Smlt0287 Smlt0288     FALSE 0.063 175.000 0.000 NA   NA
 5775635 5775636 Smlt0288 Smlt0289     FALSE 0.252 77.000 0.000 NA   NA
 5775636 5775637 Smlt0289 Smlt0290     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775637 5775638 Smlt0290 Smlt0291     FALSE 0.015 371.000 0.000 NA   NA
 5775638 5775639 Smlt0291 Smlt0293     FALSE 0.014 410.000 0.000 NA   NA
 5775639 5775640 Smlt0293 Smlt0294     FALSE 0.261 69.000 0.000 NA   NA
 5775640 5775641 Smlt0294 Smlt0295     TRUE 0.584 24.000 0.000 1.000   NA
 5775642 5775643 Smlt0296 Smlt0297 Gp17   FALSE 0.022 287.000 0.000 NA   NA
 5775643 5775644 Smlt0297 Smlt0298     FALSE 0.057 186.000 0.000 NA   NA
 5775645 5775646 Smlt0299 Smlt0300 D GpU TRUE 0.996 -3.000 0.600 NA   NA
 5775646 5775647 Smlt0300 Smlt0301 GpU GpT TRUE 0.964 12.000 0.333 NA   NA
 5775647 5775648 Smlt0301 Smlt0302 GpT   TRUE 0.527 26.000 0.000 NA   NA
 5775648 5775649 Smlt0302 Smlt0303   GpE+E' TRUE 0.976 9.000 0.400 NA   NA
 5775649 5775650 Smlt0303 Smlt0304 GpE+E' FII TRUE 0.882 56.000 0.600 NA   NA
 5775650 5775651 Smlt0304 Smlt0305 FII FI TRUE 0.936 21.000 0.333 NA   NA
 5775651 5775652 Smlt0305 Smlt0306 FI W TRUE 0.954 16.000 0.333 NA   NA
 5775652 5775653 Smlt0306 Smlt0307 W V TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775653 5775654 Smlt0307 Smlt0308 V   FALSE 0.227 87.000 0.000 NA   NA
 5775654 5775655 Smlt0308 Smlt0309     TRUE 0.762 10.000 0.000 NA   NA
 5775655 5775656 Smlt0309 Smlt0310   I TRUE 0.991 5.000 0.833 NA   NA
 5775656 5775657 Smlt0310 Smlt0311 I J TRUE 0.990 -7.000 0.500 NA   NA
 5775657 5775658 Smlt0311 Smlt0312 J S FALSE 0.227 87.000 0.000 NA   NA
 5775658 5775659 Smlt0312 Smlt0313 S R TRUE 0.983 -3.000 0.130 NA   NA
 5775659 5775660 Smlt0313 Smlt0314 R   TRUE 0.988 -3.000 0.217 NA   NA
 5775660 5775661 Smlt0314 Smlt0315   lys TRUE 0.982 0.000 0.250 NA   NA
 5775661 5775662 Smlt0315 Smlt0316 lys   TRUE 0.978 2.000 0.250 NA   NA
 5775662 5775663 Smlt0316 Smlt0317     TRUE 0.994 -7.000 0.750 NA   NA
 5775663 5775664 Smlt0317 Smlt0318   X TRUE 0.994 3.000 1.000 NA   NA
 5775664 5775665 Smlt0318 Smlt0319 X L TRUE 0.961 0.000 0.068 NA   NA
 5775665 5775666 Smlt0319 Smlt0320 L M TRUE 0.704 105.000 0.136 0.001   NA
 5775666 5775667 Smlt0320 Smlt0321 M N TRUE 0.987 4.000 0.500 1.000   NA
 5775667 5775668 Smlt0321 Smlt0322 N O TRUE 0.875 34.000 0.300 1.000   NA
 5775669 5775670 Smlt0323 Smlt0324 P Q TRUE 0.987 0.000 0.348 NA   NA
 5775670 5775671 Smlt0324 Smlt0325 Q   FALSE 0.215 172.000 0.087 NA   NA
 5775671 5775672 Smlt0325 Smlt0327     FALSE 0.009 771.000 0.000 NA   NA
 5775672 5775673 Smlt0327 Smlt0328     FALSE 0.027 254.000 0.000 NA   NA
 5775674 5775675 Smlt0329 Smlt0330     FALSE 0.025 267.000 0.000 NA   NA
 5775675 5775676 Smlt0330 Smlt0331     TRUE 0.796 -25.000 0.000 NA   NA
 5775676 5775677 Smlt0331 Smlt0332     FALSE 0.016 366.000 0.000 NA   NA
 5775677 5775678 Smlt0332 Smlt0333     FALSE 0.504 28.000 0.000 NA   NA
 5775679 5775680 Smlt0334 Smlt0335     TRUE 0.686 59.000 0.167 NA   NA
 5775681 5775682 Smlt0336 Smlt0337     FALSE 0.246 80.000 0.000 NA   NA
 5775683 5775684 Smlt0339 Smlt0340     FALSE 0.277 60.000 0.000 NA   NA
 5775684 5775685 Smlt0340 Smlt0341   arcA FALSE 0.182 105.000 0.000 NA   NA
 5775685 5775686 Smlt0341 Smlt0342 arcA ecnA FALSE 0.090 161.000 0.000 1.000   NA
 5775686 5775687 Smlt0342 Smlt0343 ecnA   FALSE 0.043 208.000 0.000 NA   NA
 5775689 5775690 Smlt0345 Smlt0346     FALSE 0.116 168.000 0.011 NA   NA
 5775690 5775691 Smlt0346 Smlt0347     FALSE 0.052 250.000 0.014 NA   NA
 5775691 5775692 Smlt0347 Smlt0348     FALSE 0.313 106.000 0.014 1.000   NA
 5775693 5775694 Smlt0349 Smlt0350     FALSE 0.377 38.000 0.000 NA   NA
 5775694 5775695 Smlt0350 Smlt0351     FALSE 0.221 222.000 0.000 1.000 Y NA
 5775695 5775696 Smlt0351 Smlt0352     TRUE 0.980 12.000 0.833 1.000 N NA
 5775696 5775697 Smlt0352 Smlt0353     TRUE 0.829 -13.000 0.000 NA   NA
 5775697 5775698 Smlt0353 Smlt0354     TRUE 0.754 52.000 0.222 NA   NA
 5775699 5775700 Smlt0355 Smlt0357     FALSE 0.016 357.000 0.000 NA   NA
 5775700 5775701 Smlt0357 Smlt0358     TRUE 0.946 -3.000 0.006 NA   NA
 5775702 5775703 Smlt0359 Smlt0360     FALSE 0.014 394.000 0.000 NA   NA
 5775703 5775704 Smlt0360 Smlt0361     TRUE 0.976 14.000 0.820 NA N NA
 5775704 5775705 Smlt0361 Smlt0362     TRUE 0.975 15.000 0.839 NA N NA
 5775705 5775706 Smlt0362 Smlt0363     TRUE 0.804 103.000 0.810 1.000 N NA
 5775707 5775708 Smlt0364 Smlt0365     TRUE 0.993 -3.000 0.357 NA   NA
 5775708 5775709 Smlt0365 Smlt0366     TRUE 0.789 7.000 0.000 NA   NA
 5775709 5775710 Smlt0366 Smlt0367     TRUE 0.998 -3.000 0.270 0.037 Y NA
 5775711 5775712 Smlt0368 Smlt0369     TRUE 0.784 25.000 0.049 NA   NA
 5775712 5775713 Smlt0369 Smlt0370     FALSE 0.140 124.000 0.000 NA   NA
 5775713 5775714 Smlt0370 Smlt0371     FALSE 0.504 28.000 0.000 NA   NA
 5775714 5775715 Smlt0371 Smlt0372   katA TRUE 0.998 -3.000 0.719 0.049   NA
 5775715 5775716 Smlt0372 Smlt0373 katA   FALSE 0.131 137.000 0.000 1.000   NA
 5775716 5775717 Smlt0373 Smlt0374     TRUE 0.923 4.000 0.022 1.000   NA
 5775717 5775718 Smlt0374 Smlt0375     FALSE 0.257 75.000 0.000 NA   NA
 5775718 5775719 Smlt0375 Smlt0376     FALSE 0.262 67.000 0.000 NA   NA
 5775719 5775720 Smlt0376 Smlt0377     TRUE 0.527 26.000 0.000 NA   NA
 5775720 5775721 Smlt0377 Smlt0378     TRUE 0.828 68.000 0.455 NA   NA
 5775721 5775722 Smlt0378 Smlt0379     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 5775722 5775723 Smlt0379 Smlt0380     TRUE 0.989 9.000 0.857 NA   NA
 5775723 5775724 Smlt0380 Smlt0381     TRUE 0.595 102.000 0.192 NA   NA
 5775725 5775726 Smlt0382 Smlt0383     TRUE 0.527 26.000 0.000 NA   NA
 5775726 5775727 Smlt0383 Smlt0384     FALSE 0.251 78.000 0.000 NA   NA
 5775728 5775729 Smlt0385 Smlt0386     FALSE 0.216 92.000 0.000 NA   NA
 5775730 5775731 Smlt0387 Smlt0389     FALSE 0.061 191.000 0.000 1.000   NA
 5775737 5775738 Smlt0395 Smlt0396     FALSE 0.224 88.000 0.000 NA   NA
 5775739 5775740 Smlt0397 Smlt0398   argS TRUE 0.700 22.000 0.062 NA N NA
 5775740 5775741 Smlt0398 Smlt0399 argS radC FALSE 0.089 114.000 0.005 1.000 N NA
 5775741 5775742 Smlt0399 Smlt0400 radC   FALSE 0.072 70.000 0.000 1.000 N NA
 5775743 5775744 Smlt0401 Smlt0402 dfp dut TRUE 0.981 -3.000 0.201 1.000 N NA
 5775744 5775745 Smlt0402 Smlt0403 dut algC TRUE 0.795 13.000 0.039 1.000 N NA
 5775746 5775747 Smlt0404 Smlt0405 kdpE kdpD TRUE 0.976 29.000 0.379 1.000 Y NA
 5775747 5775748 Smlt0405 Smlt0406 kdpD kdpC FALSE 0.439 37.000 0.026 1.000 N NA
 5775748 5775749 Smlt0406 Smlt0407 kdpC kdpB TRUE 1.000 -3.000 0.877 0.001 Y NA
 5775749 5775750 Smlt0407 Smlt0408 kdpB kdpA TRUE 0.991 11.000 0.145 0.001 Y NA
 5775750 5775751 Smlt0408 Smlt0410 kdpA   FALSE 0.024 280.000 0.000 NA   NA
 5775751 5775752 Smlt0410 Smlt0411   pyrE TRUE 0.766 20.000 0.018 NA   NA
 5775753 5775754 Smlt0412 Smlt0413   ampG TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775754 5775755 Smlt0413 Smlt0414 ampG   FALSE 0.251 78.000 0.000 NA   NA
 5775756 5775757 Smlt0415 Smlt0416     TRUE 0.589 57.000 0.184 NA N NA
 5775758 10768812 Smlt0417 Smlt_r10     FALSE 0.011 521.000 0.000 NA   NA
 10768812 10768813 Smlt_r10 Smlt_t33     FALSE 0.055 189.000 0.000 NA   NA
 10768813 10768814 Smlt_t33 Smlt_r01     FALSE 0.036 223.000 0.000 NA   NA
 10768814 10768815 Smlt_r01 Smlt_r05     FALSE 0.145 122.000 0.000 NA   NA
 10768815 10768816 Smlt_r05 Smlt_r12     FALSE 0.012 492.000 0.000 NA   NA
 10768816 10768817 Smlt_r12 Smlt_t44     FALSE 0.236 84.000 0.000 NA   NA
 10768817 10768818 Smlt_t44 Smlt_t55     FALSE 0.477 30.000 0.000 NA   NA
 10768818 10768819 Smlt_t55 Smlt_r06     FALSE 0.036 223.000 0.000 NA   NA
 10768819 10768820 Smlt_r06 Smlt_r04     FALSE 0.145 122.000 0.000 NA   NA
 5775759 5775760 Smlt0418 Smlt0419     FALSE 0.476 87.000 0.049 NA   NA
 5775761 5775762 Smlt0420 Smlt0421   ctpA TRUE 0.735 109.000 0.408 0.033 N NA
 5775764 5775765 Smlt0423 Smlt0424     FALSE 0.041 113.000 0.000 1.000 N NA
 5775765 5775766 Smlt0424 Smlt0425   nadR TRUE 0.990 -13.000 0.143 NA Y NA
 5775768 5775769 Smlt0427 Smlt0428   ctaC TRUE 0.887 12.000 0.042 NA   NA
 5775769 5775770 Smlt0428 Smlt0429 ctaC ctaD TRUE 0.982 60.000 0.741 0.001 Y NA
 5775770 5775771 Smlt0429 Smlt0430 ctaD   TRUE 0.858 9.000 0.012 NA   NA
 5775771 5775772 Smlt0430 Smlt0431     TRUE 0.953 -3.000 0.010 NA   NA
 5775772 5775773 Smlt0431 Smlt0432     TRUE 0.963 14.000 0.536 1.000 N NA
 5775775 5775776 Smlt0434 Smlt0435     TRUE 0.846 100.000 0.722 NA   NA
 5775776 5775777 Smlt0435 Smlt0436     TRUE 0.959 11.000 0.255 NA   NA
 5775777 5775778 Smlt0436 Smlt0436A     TRUE 0.994 5.000 0.321 1.000 Y NA
 5775778 5775779 Smlt0436A Smlt0438     FALSE 0.099 147.000 0.000 NA   NA
 5775780 5775781 Smlt0439 Smlt0440     FALSE 0.490 29.000 0.000 NA   NA
 5775781 5775782 Smlt0440 Smlt0441   dnaG FALSE 0.504 28.000 0.000 NA   NA
 5775782 5775783 Smlt0441 Smlt0442 dnaG   FALSE 0.375 61.000 0.006 1.000   NA
 5775783 5775784 Smlt0442 Smlt0443     FALSE 0.199 106.000 0.000 1.000   NA
 5775784 5775785 Smlt0443 Smlt0444   rpsU TRUE 0.587 135.000 0.173 0.021   NA
 5775788 5775789 Smlt0447 Smlt0448 folB   FALSE 0.222 92.000 0.023 NA N NA
 5775789 5775790 Smlt0448 Smlt0449   bglX FALSE 0.018 129.000 0.000 NA N NA
 5775790 5775791 Smlt0449 Smlt0450 bglX   FALSE 0.073 166.000 0.000 NA   NA
 5775794 5775795 Smlt0453 Smlt0454     FALSE 0.169 111.000 0.000 NA   NA
 5775795 5775796 Smlt0454 Smlt0455     TRUE 0.966 -3.000 0.024 NA   NA
 5775796 5775797 Smlt0455 Smlt0456     TRUE 0.804 16.000 0.016 NA   NA
 5775797 5775798 Smlt0456 Smlt0458     FALSE 0.003 506.000 0.000 1.000 N NA
 5775798 5775799 Smlt0458 Smlt0459     TRUE 0.952 1.000 0.055 NA   NA
 5775800 5775801 Smlt0460 Smlt0461     FALSE 0.307 52.000 0.023 NA N NA
 5775801 5775802 Smlt0461 Smlt0462     TRUE 0.564 56.000 0.143 1.000 N NA
 5775802 5775803 Smlt0462 Smlt0463     FALSE 0.402 44.000 0.031 1.000 N NA
 5775803 5775804 Smlt0463 Smlt0465     FALSE 0.002 536.000 0.000 1.000 N NA
 5775804 5775805 Smlt0465 Smlt0466     FALSE 0.239 83.000 0.000 NA   NA
 5775805 5775806 Smlt0466 Smlt0467     FALSE 0.020 305.000 0.000 NA   NA
 5775806 5775807 Smlt0467 Smlt0468     FALSE 0.257 85.000 0.000 1.000   NA
 5775807 5775808 Smlt0468 Smlt0469     TRUE 0.614 32.000 0.015 NA   NA
 5775808 5775809 Smlt0469 Smlt0470     FALSE 0.298 167.000 0.160 NA   NA
 5775812 5775813 Smlt0476 Smlt0477     FALSE 0.255 76.000 0.000 NA   NA
 5775813 5775814 Smlt0477 Smlt0478     FALSE 0.435 33.000 0.000 NA   NA
 5775814 5775815 Smlt0478 Smlt0479     TRUE 0.608 20.000 0.000 NA   NA
 5775815 5775816 Smlt0479 Smlt0480     FALSE 0.310 49.000 0.000 NA   NA
 5775816 5775817 Smlt0480 Smlt0481     FALSE 0.088 154.000 0.000 NA   NA
 5775818 5775819 Smlt0482 Smlt0483     TRUE 0.590 87.000 0.132 NA   NA
 5775822 5775823 Smlt0487 Smlt0488     TRUE 0.625 60.000 0.223 NA N NA
 5775824 5775825 Smlt0490 Smlt0490A     FALSE 0.264 65.000 0.000 NA   NA
 5775826 5775827 Smlt0493 Smlt0494     TRUE 0.977 18.000 0.071 0.067 Y NA
 5775828 5775829 Smlt0496 Smlt0497     TRUE 0.991 4.000 0.759 NA   NA
 5775830 5775831 Smlt0498 Smlt0498A     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775831 5775832 Smlt0498A Smlt0499     FALSE 0.325 45.000 0.000 NA   NA
 5775832 5775833 Smlt0499 Smlt0500     FALSE 0.227 87.000 0.000 NA   NA
 5775833 5775834 Smlt0500 Smlt0501     TRUE 0.575 22.000 0.000 NA   NA
 5775835 5775836 Smlt0502 Smlt0503     FALSE 0.208 95.000 0.000 NA   NA
 5775836 5775837 Smlt0503 Smlt0504     FALSE 0.062 177.000 0.000 NA   NA
 5775838 5775839 Smlt0505 Smlt0506     FALSE 0.377 38.000 0.000 NA   NA
 5775840 5775841 Smlt0507 Smlt0508     TRUE 0.762 10.000 0.000 NA   NA
 5775843 5775844 Smlt0510 Smlt0510A     FALSE 0.026 265.000 0.000 NA   NA
 5775844 5775845 Smlt0510A Smlt0510B     FALSE 0.078 162.000 0.000 NA   NA
 5775845 5775846 Smlt0510B Smlt0512     FALSE 0.108 142.000 0.000 NA   NA
 5775847 5775848 Smlt0513 Smlt0514     FALSE 0.349 41.000 0.000 NA   NA
 5775848 5775849 Smlt0514 Smlt0515     FALSE 0.271 62.000 0.000 NA   NA
 5775851 5775852 Smlt0517 Smlt0518     FALSE 0.004 358.000 0.000 1.000 N NA
 5775852 5775853 Smlt0518 Smlt0519     FALSE 0.085 156.000 0.000 NA   NA
 5775855 5775856 Smlt0521 Smlt0522     FALSE 0.039 226.000 0.000 1.000   NA
 5775857 5775858 Smlt0523 Smlt0524     TRUE 0.603 -3.000 0.000 NA N NA
 5775860 5775861 Smlt0526 Smlt0527     FALSE 0.019 318.000 0.000 NA   NA
 5775861 5775862 Smlt0527 Smlt0528     TRUE 0.714 13.000 0.000 NA   NA
 5775864 5775865 Smlt0531 Smlt0532     FALSE 0.261 69.000 0.000 NA   NA
 5775865 5775866 Smlt0532 Smlt0533     TRUE 0.526 58.000 0.037 NA   NA
 5775866 5775867 Smlt0533 Smlt0534     TRUE 0.767 25.000 0.037 NA   NA
 5775867 5775868 Smlt0534 Smlt0535     FALSE 0.320 46.000 0.000 NA   NA
 5775868 5775869 Smlt0535 Smlt0537     FALSE 0.057 186.000 0.000 NA   NA
 5775869 5775870 Smlt0537 Smlt0538     TRUE 0.855 -9.000 0.000 NA   NA
 5775870 5775871 Smlt0538 Smlt0539     FALSE 0.200 98.000 0.000 NA   NA
 5775871 5775872 Smlt0539 Smlt0540     FALSE 0.096 149.000 0.000 NA   NA
 5775872 5775873 Smlt0540 Smlt0541     FALSE 0.015 381.000 0.000 NA   NA
 5775873 5775874 Smlt0541 Smlt0542     FALSE 0.026 282.000 0.000 1.000   NA
 5775874 5775875 Smlt0542 Smlt0543     TRUE 0.856 44.000 0.000 0.036 Y NA
 5775875 5775876 Smlt0543 Smlt0544     TRUE 0.744 35.000 0.100 NA   NA
 5775880 5775881 Smlt0548 Smlt0549     TRUE 0.956 30.000 0.188 NA Y NA
 5775885 5775886 Smlt0553 Smlt0554     TRUE 0.683 32.000 0.032 NA   NA
 5775886 5775887 Smlt0554 Smlt0555     FALSE 0.174 118.000 0.000 1.000   NA
 5775889 5775890 Smlt0557 Smlt0558     FALSE 0.052 192.000 0.000 NA   NA
 5775891 5775892 Smlt0559 Smlt0560     TRUE 0.702 14.000 0.000 NA   NA
 5775892 5775893 Smlt0560 Smlt0561   motB TRUE 0.724 128.000 0.571 NA   NA
 5775893 5775894 Smlt0561 Smlt0562 motB motA TRUE 0.997 4.000 0.571 1.000 Y NA
 5775894 5775895 Smlt0562 Smlt0563 motA   FALSE 0.058 91.000 0.000 1.000 N NA
 5775898 5775899 Smlt0567 Smlt0568     TRUE 0.912 -21.000 0.099 1.000 N NA
 5775901 5775902 Smlt0570 Smlt0571     TRUE 0.882 44.000 0.500 NA   NA
 5775904 5775905 Smlt0573 Smlt0574   rsuA TRUE 0.995 -3.000 0.088 1.000 Y NA
 5775905 5775906 Smlt0574 Smlt0575 rsuA   TRUE 0.977 -3.000 0.053 1.000   NA
 5775907 5775908 Smlt0576 Smlt0577 fabB fabA TRUE 0.997 0.000 0.451 1.000 Y NA
 5775910 5775911 Smlt0580 Smlt0581     FALSE 0.127 139.000 0.000 1.000   NA
 5775912 5775913 Smlt0582 Smlt0583     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5775913 5775914 Smlt0583 Smlt0584   gph FALSE 0.460 66.000 0.000 0.064   NA
 5775917 5775918 Smlt0587 Smlt0588     TRUE 0.952 -3.000 0.009 NA   NA
 5775920 5775921 Smlt0590 Smlt0591     FALSE 0.007 241.000 0.000 1.000 N NA
 5775921 5775922 Smlt0591 Smlt0592     TRUE 0.978 15.000 0.130 1.000 Y NA
 5775922 5775923 Smlt0592 Smlt0593     TRUE 0.989 3.000 0.080 1.000 Y NA
 5775924 5775925 Smlt0594 Smlt0595     TRUE 0.999 -3.000 0.566 1.000 Y NA
 5775926 5775927 Smlt0596 Smlt0597     TRUE 0.931 18.000 0.000 1.000 Y NA
 5775929 5775930 Smlt0599 Smlt0600     FALSE 0.242 82.000 0.000 NA   NA
 5775930 5775931 Smlt0600 Smlt0601     FALSE 0.316 117.000 0.028 NA   NA
 5775932 5775933 Smlt0602 Smlt0603     FALSE 0.324 54.000 0.000 1.000   NA
 5775935 5775936 Smlt0608 Smlt0609     TRUE 0.956 15.000 0.495 1.000 N NA
 5775937 5775938 Smlt0610 Smlt0611     TRUE 0.991 -19.000 0.748 1.000   NA
 5775938 5775939 Smlt0611 Smlt0612   pilU FALSE 0.142 131.000 0.000 1.000   NA
 5775940 5775941 Smlt0613 Smlt0614     TRUE 0.991 6.000 0.857 NA   NA
 5775941 5775942 Smlt0614 Smlt0615     FALSE 0.019 325.000 0.000 NA   NA
 5775942 5775943 Smlt0615 Smlt0616   cbsB FALSE 0.074 301.000 0.081 NA   NA
 5775943 5775944 Smlt0616 Smlt0617 cbsB CYS1 TRUE 0.844 124.000 0.133 0.013 Y NA
 5775944 5775945 Smlt0617 Smlt0618 CYS1 wzm TRUE 0.728 6.000 0.009 1.000 N NA
 5775945 5775946 Smlt0618 Smlt0619 wzm wzt TRUE 0.969 -10.000 0.169 0.098 N NA
 5775946 5775947 Smlt0619 Smlt0620 wzt cat TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5775947 5775948 Smlt0620 Smlt0621 cat wxocD FALSE 0.440 35.000 0.000 1.000   NA
 5775948 5775949 Smlt0621 Smlt0622 wxocD wxocA FALSE 0.098 148.000 0.000 NA   NA
 5775949 5775950 Smlt0622 Smlt0623 wxocA wxocBC TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 5775950 5775951 Smlt0623 Smlt0624 wxocBC   FALSE 0.075 164.000 0.000 NA   NA
 5775954 5775955 Smlt0627 Smlt0628     FALSE 0.387 115.000 0.000 0.001   NA
 5775955 5775956 Smlt0628 Smlt0629     TRUE 0.994 -3.000 0.429 1.000   NA
 5775956 5775957 Smlt0629 Smlt0630     TRUE 0.903 30.000 0.500 1.000 N NA
 5775957 5775958 Smlt0630 Smlt0631     TRUE 0.522 29.000 0.000 1.000   NA
 5775958 5775959 Smlt0631 Smlt0632     TRUE 0.591 38.000 0.000 0.063   NA
 5775959 5775960 Smlt0632 Smlt0633     TRUE 0.986 3.000 0.250 0.033   NA
 5775960 5775961 Smlt0633 Smlt0634     TRUE 0.980 -3.000 0.192 1.000 N NA
 5775961 5775962 Smlt0634 Smlt0635     FALSE 0.067 170.000 0.000 NA   NA
 5775962 5775963 Smlt0635 Smlt0636     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5775963 5775964 Smlt0636 Smlt0637     FALSE 0.269 11.000 0.000 NA N NA
 5775964 5775965 Smlt0637 Smlt0638     TRUE 0.950 -3.000 0.049 NA N NA
 5775965 5775966 Smlt0638 Smlt0639     TRUE 0.995 -3.000 0.098 NA Y NA
 5775966 5775967 Smlt0639 Smlt0640     FALSE 0.035 87.000 0.000 NA N NA
 5775967 5775968 Smlt0640 Smlt0641   arnC FALSE 0.448 -7.000 0.000 NA N NA
 5775968 5775969 Smlt0641 Smlt0642 arnC   FALSE 0.216 92.000 0.000 NA   NA
 5775969 5775970 Smlt0642 Smlt0644     FALSE 0.182 105.000 0.000 NA   NA
 5775970 5775971 Smlt0644 Smlt0645   etfA FALSE 0.003 402.000 0.000 1.000 N NA
 5775971 5775972 Smlt0645 Smlt0646 etfA etfB TRUE 0.998 0.000 0.316 0.012 Y NA
 5775973 5775974 Smlt0647 Smlt0648 rfbB rmlA TRUE 0.988 15.000 0.143 0.003 Y NA
 5775974 5775975 Smlt0648 Smlt0649 rmlA rmlC TRUE 0.996 -3.000 0.163 1.000 Y NA
 5775975 5775976 Smlt0649 Smlt0650 rmlC rfbD TRUE 0.995 -3.000 0.063 1.000 Y NA
 5775976 5775977 Smlt0650 Smlt0651 rfbD   FALSE 0.259 73.000 0.000 NA   NA
 5775978 5775979 Smlt0652 Smlt0653 manA manB TRUE 0.965 12.000 0.500 1.000 N NA
 5775979 5775980 Smlt0653 Smlt0654 manB   FALSE 0.053 97.000 0.000 1.000 N NA
 5775981 5775982 Smlt0655 Smlt0656 lpsI lpsJ TRUE 0.994 2.000 0.070 0.001 Y NA
 5775985 5775986 Smlt0659 Smlt0660     TRUE 0.988 -3.000 0.201 NA   NA
 5775986 5775987 Smlt0660 Smlt0661     TRUE 0.993 4.000 0.275 NA Y NA
 5775987 5775988 Smlt0661 Smlt0662     TRUE 0.996 2.000 0.472 NA Y NA
 5775990 5775991 Smlt0664 Smlt0665   proS FALSE 0.052 223.000 0.004 1.000   NA
 5775991 5775992 Smlt0665 Smlt0666 proS   FALSE 0.005 288.000 0.000 1.000 N NA
 5775992 5775993 Smlt0666 Smlt0668     FALSE 0.010 672.000 0.000 NA   NA
 5775994 5775995 Smlt0669 Smlt0670     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5775995 5775996 Smlt0670 Smlt0671   rimI TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5775997 5775998 Smlt0672 Smlt0673   valS FALSE 0.094 151.000 0.000 NA   NA
 5775998 5775999 Smlt0673 Smlt0674 valS   FALSE 0.451 73.000 0.089 1.000 N NA
 5775999 5776000 Smlt0674 Smlt0675   pepA TRUE 0.755 83.000 0.494 1.000 N NA
 5776001 5776002 Smlt0676 Smlt0677     TRUE 0.997 -3.000 0.631 0.062   NA
 5776002 5776003 Smlt0677 Smlt0678     FALSE 0.293 55.000 0.000 NA   NA
 5776005 5776006 Smlt0680 Smlt0681   dsbC FALSE 0.103 101.000 0.004 1.000 N NA
 5776008 5776009 Smlt0684 Smlt0685 purL   FALSE 0.016 395.000 0.000 1.000   NA
 5776009 5776010 Smlt0685 Smlt0686     FALSE 0.093 158.000 0.000 1.000   NA
 5776010 5776011 Smlt0686 Smlt0687   xpsE FALSE 0.028 138.000 0.000 1.000 N NA
 5776011 5776012 Smlt0687 Smlt0688 xpsE xpsF TRUE 0.984 25.000 0.255 0.005 Y NA
 5776012 5776013 Smlt0688 Smlt0689 xpsF xpsG TRUE 0.937 50.000 0.125 0.005 Y NA
 5776013 5776014 Smlt0689 Smlt0690 xpsG xpsH TRUE 0.995 10.000 0.348 0.005 Y NA
 5776014 5776015 Smlt0690 Smlt0691 xpsH xpsI TRUE 0.996 -3.000 0.130 NA Y NA
 5776015 5776016 Smlt0691 Smlt0692 xpsI xpsJ TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776016 5776017 Smlt0692 Smlt0693 xpsJ pefK TRUE 0.991 -3.000 0.308 NA   NA
 5776017 5776018 Smlt0693 Smlt0694 pefK pefL TRUE 0.998 -3.000 0.385 NA Y NA
 5776018 5776019 Smlt0694 Smlt0695 pefL xpsM TRUE 0.980 -19.000 0.364 NA   NA
 5776019 5776020 Smlt0695 Smlt0696 xpsM xpsN TRUE 0.992 -10.000 0.700 NA   NA
 5776020 5776021 Smlt0696 Smlt0697 xpsN xpsD TRUE 0.970 10.000 0.333 NA   NA
 5776022 5776023 Smlt0698 Smlt0700     FALSE 0.032 234.000 0.000 NA   NA
 5776024 5776025 Smlt0701 Smlt0702     TRUE 0.967 -3.000 0.026 NA   NA
 5776025 5776026 Smlt0702 Smlt0703   pncB FALSE 0.264 102.000 0.007 NA   NA
 5776028 5776029 Smlt0706 Smlt0707 smf-1   TRUE 0.692 86.000 0.000 1.000 Y NA
 5776029 5776030 Smlt0707 Smlt0708   mrkC TRUE 0.963 72.000 0.667 1.000 Y NA
 5776030 5776031 Smlt0708 Smlt0709 mrkC   TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 5776031 5776032 Smlt0709 Smlt0710   wecB FALSE 0.006 268.000 0.000 1.000 N NA
 5776032 5776033 Smlt0710 Smlt0711 wecB   TRUE 0.994 -3.000 0.429 NA   NA
 5776033 5776034 Smlt0711 Smlt0712   nfrB TRUE 0.953 7.000 0.159 NA   NA
 5776034 5776035 Smlt0712 Smlt0713 nfrB   TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5776036 5776037 Smlt0714 Smlt0715     FALSE 0.034 227.000 0.000 NA   NA
 5776037 5776038 Smlt0715 Smlt0716     FALSE 0.211 102.000 0.000 1.000   NA
 5776039 5776040 Smlt0717 Smlt0718   glyA FALSE 0.261 188.000 0.182 NA   NA
 5776040 5776041 Smlt0718 Smlt0719 glyA   FALSE 0.137 125.000 0.000 NA   NA
 5776041 5776042 Smlt0719 Smlt0720     FALSE 0.255 76.000 0.000 NA   NA
 5776042 5776043 Smlt0720 Smlt0721     FALSE 0.504 28.000 0.000 NA   NA
 5776043 5776044 Smlt0721 Smlt0722     FALSE 0.095 150.000 0.000 NA   NA
 5776044 5776045 Smlt0722 Smlt0723     FALSE 0.248 179.000 0.277 NA N NA
 5776046 5776047 Smlt0724 Smlt0725     FALSE 0.206 96.000 0.000 NA   NA
 5776047 5776048 Smlt0725 Smlt0726     FALSE 0.091 153.000 0.000 NA   NA
 5776049 5776050 Smlt0727 Smlt0728 ribE ribB TRUE 0.992 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 5776050 5776051 Smlt0728 Smlt0729 ribB ribH TRUE 0.783 208.000 0.417 0.002 Y NA
 5776051 5776052 Smlt0729 Smlt0730 ribH nusB TRUE 0.900 -3.000 0.011 1.000 N NA
 5776052 5776053 Smlt0730 Smlt0731 nusB   FALSE 0.182 204.000 0.225 1.000 N NA
 5776054 5776055 Smlt0732 Smlt0733     TRUE 0.752 57.000 0.000 1.000 Y NA
 5776056 5776057 Smlt0734 Smlt0735     TRUE 0.509 30.000 0.000 1.000   NA
 5776057 5776058 Smlt0735 Smlt0736     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5776058 5776059 Smlt0736 Smlt0737     FALSE 0.028 272.000 0.000 1.000   NA
 5776060 5776061 Smlt0738 Smlt0739 glcD   TRUE 0.983 -3.000 0.130 NA   NA
 5776061 5776062 Smlt0739 Smlt0741     FALSE 0.214 111.000 0.004 NA   NA
 5776062 5776063 Smlt0741 Smlt0742     TRUE 0.970 -10.000 0.172 NA   NA
 5776065 5776066 Smlt0745 Smlt0746     FALSE 0.190 102.000 0.000 NA   NA
 5776067 5776068 Smlt0747 Smlt0748     TRUE 0.977 15.000 0.635 NA   NA
 5776068 5776069 Smlt0748 Smlt0749   ftsL TRUE 0.983 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5776069 5776070 Smlt0749 Smlt0750 ftsL ftsI TRUE 0.936 -3.000 0.024 1.000 N NA
 5776070 5776071 Smlt0750 Smlt0751 ftsI murE TRUE 0.992 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 5776071 5776072 Smlt0751 Smlt0752 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.003 Y NA
 5776072 5776073 Smlt0752 Smlt0753 murF mraY TRUE 0.997 -10.000 0.309 0.004 Y NA
 5776073 5776074 Smlt0753 Smlt0754 mraY ftsW TRUE 0.940 2.000 0.018 0.004 N NA
 5776074 5776075 Smlt0754 Smlt0755 ftsW murG TRUE 0.994 -3.000 0.647 1.000 N NA
 5776075 5776076 Smlt0755 Smlt0756 murG murC TRUE 0.946 41.000 0.283 1.000 Y NA
 5776076 5776077 Smlt0756 Smlt0757 murC ddlB TRUE 0.998 -3.000 0.153 0.004 Y NA
 5776077 5776078 Smlt0757 Smlt0758 ddlB ftsQ TRUE 0.998 -3.000 0.372 NA Y NA
 5776078 5776079 Smlt0758 Smlt0759 ftsQ ftsA TRUE 0.989 -3.000 0.389 NA N NA
 5776079 5776080 Smlt0759 Smlt0760 ftsA ftsZ TRUE 0.784 170.000 0.460 1.000 Y NA
 5776080 5776081 Smlt0760 Smlt0761 ftsZ lpxC FALSE 0.142 193.000 0.134 1.000 N NA
 5776083 5776084 Smlt0763 Smlt0764   secA FALSE 0.046 279.000 0.068 1.000 N NA
 5776084 5776085 Smlt0764 Smlt0765 secA   FALSE 0.109 103.000 0.006 1.000 N NA
 5776086 5776087 Smlt0766 Smlt0767   metF FALSE 0.501 41.000 0.014 NA   NA
 5776088 5776089 Smlt0768 Smlt0769     TRUE 0.655 19.000 0.000 1.000   NA
 5776089 5776090 Smlt0769 Smlt0770     TRUE 0.969 -3.000 0.000 0.035   NA
 5776093 5776094 Smlt0773 Smlt0774     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5776094 5776095 Smlt0774 Smlt0775   sahH FALSE 0.053 202.000 0.000 1.000   NA
 5776096 5776097 Smlt0777 Smlt0778   ppc FALSE 0.139 173.000 0.089 1.000 N NA
 5776098 5776099 Smlt0779 Smlt0780   metK FALSE 0.011 161.000 0.000 NA N NA
 5776100 5776101 Smlt0781 Smlt0782     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776101 5776102 Smlt0782 Smlt0783     FALSE 0.094 151.000 0.000 NA   NA
 5776103 5776104 Smlt0784 Smlt0785     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776104 5776105 Smlt0785 Smlt0786     FALSE 0.113 139.000 0.000 NA   NA
 5776105 5776106 Smlt0786 Smlt0787   dusB FALSE 0.363 58.000 0.002 1.000   NA
 5776106 5776107 Smlt0787 Smlt0788 dusB   FALSE 0.098 148.000 0.000 NA   NA
 5776107 5776108 Smlt0788 Smlt0789     FALSE 0.171 110.000 0.000 NA   NA
 5776110 5776111 Smlt0791 Smlt0792 rbsK   TRUE 0.584 26.000 0.027 1.000 N NA
 5776112 5776113 Smlt0793 Smlt0794     FALSE 0.044 315.000 0.023 NA   NA
 5776113 5776114 Smlt0794 Smlt0795   huvA FALSE 0.147 191.000 0.046 NA   NA
 5776114 5776115 Smlt0795 Smlt0796 huvA   TRUE 0.959 5.000 0.160 NA   NA
 5776115 5776116 Smlt0796 Smlt0797     TRUE 0.875 11.000 0.024 NA   NA
 5776117 5776118 Smlt0798 Smlt0799     TRUE 0.992 -3.000 0.535 NA N NA
 5776119 5776120 Smlt0800 Smlt0801     FALSE 0.276 55.000 0.016 1.000 N NA
 5776120 5776121 Smlt0801 Smlt0802     TRUE 0.834 157.000 0.500 1.000 Y NA
 5776123 5776124 Smlt0804 Smlt0805 dgkA   TRUE 0.522 34.000 0.037 1.000 N NA
 5776124 5776125 Smlt0805 Smlt0806     FALSE 0.004 226.000 0.000 NA N NA
 5776125 5776126 Smlt0806 Smlt0807     FALSE 0.064 174.000 0.000 NA   NA
 5776126 5776127 Smlt0807 Smlt0808     TRUE 0.989 -3.000 0.111 0.065   NA
 5776127 5776128 Smlt0808 Smlt0809   lemA FALSE 0.012 463.000 0.000 NA   NA
 5776128 5776129 Smlt0809 Smlt0810 lemA   TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5776129 5776130 Smlt0810 Smlt0811     TRUE 0.933 0.000 0.015 NA   NA
 5776130 5776131 Smlt0811 Smlt0812   lgt FALSE 0.373 52.000 0.005 NA   NA
 5776131 5776132 Smlt0812 Smlt0813 lgt thyA TRUE 0.977 -3.000 0.164 1.000 N NA
 5776132 5776133 Smlt0813 Smlt0814 thyA folA TRUE 0.923 6.000 0.134 1.000 N NA
 5776134 5776135 Smlt0815 Smlt0816   apaH TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776135 5776136 Smlt0816 Smlt0817 apaH   TRUE 0.944 16.000 0.267 NA   NA
 5776136 5776137 Smlt0817 Smlt0818   ksgA TRUE 0.824 14.000 0.078 NA N NA
 5776137 5776138 Smlt0818 Smlt0819 ksgA pdxA TRUE 0.980 -3.000 0.197 1.000 N NA
 5776138 5776139 Smlt0819 Smlt0820 pdxA surA TRUE 0.982 4.000 0.561 1.000 N NA
 5776139 5776140 Smlt0820 Smlt0821 surA ostA TRUE 0.928 -3.000 0.020 1.000 N NA
 5776140 5776141 Smlt0821 Smlt0822 ostA   TRUE 0.663 90.000 0.357 NA N NA
 5776141 5776142 Smlt0822 Smlt0823     TRUE 0.853 10.000 0.013 NA   NA
 5776142 5776143 Smlt0823 Smlt0824     TRUE 0.860 9.000 0.013 NA   NA
 5776144 5776145 Smlt0825 Smlt0826 ubiH ubiF TRUE 0.999 -3.000 0.474 0.001 Y NA
 5776146 5776147 Smlt0827 Smlt0828     FALSE 0.301 52.000 0.000 NA   NA
 5776147 5776148 Smlt0828 Smlt0829     TRUE 0.922 -16.000 0.032 NA   NA
 5776148 5776149 Smlt0829 Smlt0830     FALSE 0.200 98.000 0.000 NA   NA
 5776149 5776150 Smlt0830 Smlt0831     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 5776150 5776151 Smlt0831 Smlt0832   glnS FALSE 0.331 44.000 0.000 NA   NA
 5776152 5776153 Smlt0833 Smlt0834   msrA TRUE 0.825 10.000 0.006 NA   NA
 5776154 5776155 Smlt0835 Smlt0836     TRUE 0.989 -3.000 0.111 0.065   NA
 5776155 5776156 Smlt0836 Smlt0837   talB FALSE 0.081 167.000 0.000 1.000   NA
 5776156 5776157 Smlt0837 Smlt0838 talB rnk FALSE 0.353 51.000 0.027 1.000 N NA
 5776157 5776158 Smlt0838 Smlt0839 rnk oxyR TRUE 0.690 124.000 0.008 0.099 Y NA
 5776158 5776159 Smlt0839 Smlt0840 oxyR ahpF FALSE 0.320 86.000 0.041 1.000 N NA
 5776159 5776160 Smlt0840 Smlt0841 ahpF ahpC TRUE 0.685 224.000 0.551 1.000 Y NA
 5776161 5776162 Smlt0842 Smlt0843 hemK pip FALSE 0.467 49.000 0.012 1.000   NA
 5776165 5776166 Smlt0846 Smlt0847   nudF TRUE 0.972 -7.000 0.135 1.000   NA
 5776166 5776167 Smlt0847 Smlt0848 nudF   TRUE 0.978 -3.000 0.068 1.000   NA
 5776167 5776168 Smlt0848 Smlt0849     TRUE 0.913 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5776169 5776170 Smlt0851 Smlt0852   pntAa FALSE 0.447 52.000 0.014 NA   NA
 5776171 5776172 Smlt0853 Smlt0854     TRUE 0.988 4.000 0.556 NA   NA
 5776172 5776173 Smlt0854 Smlt0855     TRUE 0.976 -3.000 0.065 NA   NA
 5776174 5776175 Smlt0856 Smlt0857 pntAb pntB TRUE 0.996 -3.000 0.321 0.001   NA
 5776177 5776178 Smlt0859 Smlt0860   ilvE FALSE 0.441 60.000 0.017 NA   NA
 5776178 5776179 Smlt0860 Smlt0861 ilvE StmPr1 FALSE 0.003 451.000 0.000 1.000 N NA
 5776180 5776181 Smlt0862 Smlt0863     FALSE 0.408 80.000 0.018 NA   NA
 5776181 5776182 Smlt0863 Smlt0864     TRUE 0.996 -3.000 0.657 NA   NA
 5776183 5776184 Smlt0865 Smlt0866     TRUE 0.967 -3.000 0.020 1.000   NA
 5776185 5776186 Smlt0868 Smlt0869     FALSE 0.050 205.000 0.000 1.000   NA
 5776186 5776187 Smlt0869 Smlt0870   prfA TRUE 0.646 6.000 0.004 1.000 N NA
 5776187 5776188 Smlt0870 Smlt0871 prfA hemA TRUE 0.962 -22.000 0.171 0.036 N NA
 5776189 5776190 Smlt0872 Smlt0873     TRUE 0.969 -3.000 0.024 1.000   NA
 5776190 5776191 Smlt0873 Smlt0874   ipk TRUE 0.933 -21.000 0.157 1.000 N NA
 5776191 10768821 Smlt0874 Smlt_t66 ipk   TRUE 0.714 13.000 0.000 NA   NA
 10768821 5776192 Smlt_t66 Smlt0875   prs FALSE 0.111 140.000 0.000 NA   NA
 5776192 5776193 Smlt0875 Smlt0876 prs rplY FALSE 0.370 110.000 0.122 1.000 N NA
 5776193 5776194 Smlt0876 Smlt0877 rplY pth TRUE 0.974 49.000 0.496 0.020 Y NA
 5776194 5776195 Smlt0877 Smlt0878 pth   FALSE 0.392 265.000 0.184 1.000 Y NA
 5776196 5776197 Smlt0880 Smlt0881     FALSE 0.042 111.000 0.000 1.000 N NA
 5776197 5776198 Smlt0881 Smlt0882     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.029 Y NA
 5776198 5776199 Smlt0882 Smlt0883     TRUE 0.666 124.000 0.000 0.029 Y NA
 5776199 5776200 Smlt0883 Smlt0884     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.029 Y NA
 5776200 5776201 Smlt0884 Smlt0885     FALSE 0.086 163.000 0.000 1.000   NA
 5776202 5776203 Smlt0886 Smlt0887     FALSE 0.089 149.000 0.015 1.000 N NA
 5776203 10768822 Smlt0887 Smlt_t72     FALSE 0.113 139.000 0.000 NA   NA
 10768822 10768823 Smlt_t72 Smlt_t74     FALSE 0.098 148.000 0.000 NA   NA
 10768823 5776204 Smlt_t74 Smlt0890   tufB FALSE 0.349 41.000 0.000 NA   NA
 5776204 10768824 Smlt0890 Smlt_t01 tufB   FALSE 0.182 105.000 0.000 NA   NA
 10768824 5776205 Smlt_t01 Smlt0891     FALSE 0.310 49.000 0.000 NA   NA
 5776205 5776206 Smlt0891 Smlt0892   nusG TRUE 0.982 11.000 0.843 1.000 N NA
 5776206 5776207 Smlt0892 Smlt0894 nusG rplK FALSE 0.252 287.000 0.681 1.000 N NA
 5776207 5776208 Smlt0894 Smlt0895 rplK rplA TRUE 0.998 5.000 0.838 0.017 Y NA
 5776208 5776209 Smlt0895 Smlt0896 rplA rplJ FALSE 0.338 384.000 0.302 1.000 Y NA
 5776209 5776210 Smlt0896 Smlt0897 rplJ rplL TRUE 0.973 64.000 0.884 1.000 Y NA
 5776210 5776211 Smlt0897 Smlt0898 rplL rpoB FALSE 0.116 352.000 0.223 1.000   NA
 5776211 5776212 Smlt0898 Smlt0899 rpoB rpoC TRUE 0.937 90.000 0.851 0.001   NA
 5776212 5776213 Smlt0899 Smlt0901 rpoC rpsL FALSE 0.049 342.000 0.122 1.000 N NA
 5776213 5776214 Smlt0901 Smlt0902 rpsL rpsG TRUE 0.997 13.000 0.620 0.003 Y NA
 5776214 5776215 Smlt0902 Smlt0903 rpsG fusA TRUE 0.885 142.000 0.579 1.000 Y NA
 5776215 5776216 Smlt0903 Smlt0904 fusA tuf TRUE 0.972 53.000 0.400 0.001 Y NA
 5776216 5776217 Smlt0904 Smlt0905 tuf rpsJ FALSE 0.403 333.000 0.318 1.000 Y NA
 5776217 5776218 Smlt0905 Smlt0906 rpsJ rplC TRUE 0.993 12.000 0.307 0.017 Y NA
 5776218 5776219 Smlt0906 Smlt0907 rplC rplD TRUE 0.995 13.000 0.486 0.013 Y NA
 5776219 5776220 Smlt0907 Smlt0908 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.013 Y NA
 5776220 5776221 Smlt0908 Smlt0909 rplW rplB TRUE 0.998 11.000 0.849 0.017 Y NA
 5776221 5776222 Smlt0909 Smlt0910 rplB rpsS TRUE 0.998 7.000 0.820 0.017 Y NA
 5776222 5776223 Smlt0910 Smlt0911 rpsS rplV TRUE 0.998 7.000 0.769 0.017 Y NA
 5776223 5776224 Smlt0911 Smlt0912 rplV rpsC TRUE 0.995 19.000 0.719 0.017 Y NA
 5776224 5776225 Smlt0912 Smlt0913 rpsC rplP TRUE 0.998 6.000 0.828 0.017 Y NA
 5776225 5776226 Smlt0913 Smlt0914 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.013 Y NA
 5776226 5776227 Smlt0914 Smlt0915 rpmC rpsQ TRUE 0.997 12.000 0.828 0.013 Y NA
 5776227 5776228 Smlt0915 Smlt0916 rpsQ rplN TRUE 0.997 12.000 0.791 0.017 Y NA
 5776228 5776229 Smlt0916 Smlt0917 rplN rplX TRUE 0.996 17.000 0.810 0.017 Y NA
 5776229 5776230 Smlt0917 Smlt0918 rplX rplE TRUE 0.997 12.000 0.758 0.013 Y NA
 5776230 5776231 Smlt0918 Smlt0919 rplE rpsN TRUE 0.989 19.000 0.309 0.013 Y NA
 5776231 5776232 Smlt0919 Smlt0920 rpsN rpsH TRUE 0.596 259.000 0.295 0.013 Y NA
 5776232 5776233 Smlt0920 Smlt0921 rpsH rplF TRUE 0.996 19.000 0.808 0.013 Y NA
 5776233 5776234 Smlt0921 Smlt0922 rplF rplR TRUE 0.977 87.000 0.815 0.013 Y NA
 5776234 5776235 Smlt0922 Smlt0923 rplR rpsE TRUE 0.923 162.000 0.814 0.017 Y NA
 5776235 5776236 Smlt0923 Smlt0924 rpsE rpmD TRUE 0.999 -7.000 0.789 0.017 Y NA
 5776236 5776237 Smlt0924 Smlt0925 rpmD rplO TRUE 0.998 7.000 0.653 0.002 Y NA
 5776237 5776238 Smlt0925 Smlt0926 rplO secY TRUE 0.983 8.000 0.730 1.000 N NA
 5776238 5776239 Smlt0926 Smlt0928 secY rpsM FALSE 0.013 348.000 0.011 1.000 N NA
 5776239 5776240 Smlt0928 Smlt0929 rpsM rpsK TRUE 0.997 12.000 0.810 0.013 Y NA
 5776240 5776241 Smlt0929 Smlt0930 rpsK rpsD TRUE 0.995 16.000 0.509 0.017 Y NA
 5776241 5776242 Smlt0930 Smlt0931 rpsD rpoA TRUE 0.822 56.000 0.549 1.000 N NA
 5776242 5776243 Smlt0931 Smlt0933 rpoA rplQ TRUE 0.520 192.000 0.873 1.000 N NA
 5776243 5776244 Smlt0933 Smlt0935 rplQ   FALSE 0.007 242.000 0.000 1.000 N NA
 5776246 5776247 Smlt0937 Smlt0939 aroH   FALSE 0.007 888.000 0.015 NA N NA
 5776248 5776249 Smlt0940 Smlt0941     TRUE 0.608 42.000 0.045 NA   NA
 5776249 5776250 Smlt0941 Smlt0942   typA TRUE 0.794 12.000 0.006 NA   NA
 5776251 5776252 Smlt0943 Smlt0944 ppi mdh FALSE 0.154 119.000 0.018 1.000 N NA
 5776252 5776253 Smlt0944 Smlt0945 mdh rluA TRUE 0.609 0.000 0.000 1.000 N NA
 5776253 5776254 Smlt0945 Smlt0947 rluA prpE FALSE 0.002 774.000 0.000 1.000 N NA
 5776254 5776255 Smlt0947 Smlt0948 prpE   FALSE 0.039 216.000 0.000 NA   NA
 5776255 5776256 Smlt0948 Smlt0949     TRUE 0.792 -28.000 0.000 NA   NA
 5776257 5776258 Smlt0950 Smlt0951 gst   TRUE 0.592 85.000 0.111 1.000   NA
 5776258 5776259 Smlt0951 Smlt0952   fadH FALSE 0.043 218.000 0.000 1.000   NA
 5776259 5776260 Smlt0952 Smlt0953 fadH   FALSE 0.015 374.000 0.000 NA   NA
 5776260 5776261 Smlt0953 Smlt0954     FALSE 0.044 207.000 0.000 NA   NA
 5776262 5776263 Smlt0955 Smlt0956     FALSE 0.037 220.000 0.000 NA   NA
 5776263 5776264 Smlt0956 Smlt0957     TRUE 0.989 -3.000 0.227 NA   NA
 5776264 5776265 Smlt0957 Smlt0958     TRUE 0.546 86.000 0.091 NA   NA
 5776269 5776270 Smlt0962 Smlt0963     FALSE 0.232 192.000 0.143 1.000   NA
 5776270 5776271 Smlt0963 Smlt0964   folC FALSE 0.231 41.000 0.006 1.000 N NA
 5776271 5776272 Smlt0964 Smlt0965 folC   FALSE 0.369 82.000 0.013 NA   NA
 5776272 5776273 Smlt0965 Smlt0966     FALSE 0.417 47.000 0.007 NA   NA
 5776273 5776274 Smlt0966 Smlt0967   purF TRUE 0.881 31.000 0.262 1.000   NA
 5776274 5776275 Smlt0967 Smlt0968 purF   TRUE 0.863 10.000 0.012 1.000   NA
 5776278 5776279 Smlt0971 Smlt0972 lpxH   FALSE 0.316 94.000 0.008 1.000   NA
 5776279 5776280 Smlt0972 Smlt0973   pimB TRUE 0.956 -19.000 0.125 1.000   NA
 5776280 5776281 Smlt0973 Smlt0974 pimB   FALSE 0.119 143.000 0.000 1.000   NA
 5776281 5776282 Smlt0974 Smlt0975   ppx FALSE 0.016 395.000 0.000 1.000   NA
 5776282 5776283 Smlt0975 Smlt0976 ppx ppk FALSE 0.280 284.000 0.076 1.000 Y NA
 5776283 5776284 Smlt0976 Smlt0977 ppk phoR TRUE 0.875 5.000 0.045 1.000 N NA
 5776284 5776285 Smlt0977 Smlt0978 phoR phoB TRUE 0.914 107.000 0.453 1.000 Y NA
 5776285 5776286 Smlt0978 Smlt0979 phoB   FALSE 0.288 117.000 0.016 1.000   NA
 5776287 5776288 Smlt0980 Smlt0981 grxC   TRUE 0.973 -3.000 0.045 NA   NA
 5776288 5776289 Smlt0981 Smlt0982     FALSE 0.039 352.000 0.025 NA   NA
 5776289 5776290 Smlt0982 Smlt0983     FALSE 0.023 292.000 0.000 0.062 N NA
 5776290 5776291 Smlt0983 Smlt0984     TRUE 0.873 54.000 0.750 1.000 N NA
 5776292 5776293 Smlt0985 Smlt0986     FALSE 0.216 92.000 0.000 NA   NA
 10768825 10768826 Smlt_t02 Smlt_t04     FALSE 0.022 290.000 0.000 NA   NA
 10768826 10768827 Smlt_t04 Smlt_t05     FALSE 0.246 80.000 0.000 NA   NA
 10768827 10768828 Smlt_t05 Smlt_t06     FALSE 0.049 197.000 0.000 NA   NA
 10768828 5776294 Smlt_t06 Smlt0987     FALSE 0.037 220.000 0.000 NA   NA
 5776294 10768829 Smlt0987 Smlt_t07     FALSE 0.113 139.000 0.000 NA   NA
 10768829 5776295 Smlt_t07 Smlt0988   tig FALSE 0.055 190.000 0.000 NA   NA
 5776295 5776296 Smlt0988 Smlt0989 tig clpP TRUE 0.932 77.000 0.351 1.000 Y NA
 5776296 5776297 Smlt0989 Smlt0990 clpP clpX TRUE 0.862 127.000 0.352 1.000 Y NA
 5776297 5776298 Smlt0990 Smlt0991 clpX lon TRUE 0.813 144.000 0.201 0.095 Y NA
 5776298 5776299 Smlt0991 Smlt0992 lon hupB FALSE 0.024 218.000 0.008 1.000 N NA
 5776299 10768830 Smlt0992 Smlt_t08 hupB   TRUE 0.714 13.000 0.000 NA   NA
 10768830 10768831 Smlt_t08 Smlt_t10     FALSE 0.057 187.000 0.000 NA   NA
 10768831 10768832 Smlt_t10 Smlt_t12     FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 10768832 10768833 Smlt_t12 Smlt_t13     FALSE 0.176 107.000 0.000 NA   NA
 10768833 5776300 Smlt_t13 Smlt0993     FALSE 0.102 146.000 0.000 NA   NA
 5776301 5776302 Smlt0994 Smlt0995     TRUE 0.890 0.000 0.000 1.000   NA
 5776303 5776304 Smlt0996 Smlt0997   rnhA TRUE 0.702 14.000 0.000 NA   NA
 5776304 5776305 Smlt0997 Smlt0998 rnhA dnaQ TRUE 0.992 5.000 0.248 1.000 Y NA
 5776310 5776311 Smlt1004 Smlt1005     TRUE 0.953 0.000 0.032 1.000   NA
 5776311 5776312 Smlt1005 Smlt1006     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776312 5776313 Smlt1006 Smlt1007     FALSE 0.012 476.000 0.000 NA   NA
 5776313 5776314 Smlt1007 Smlt1009     FALSE 0.018 359.000 0.000 1.000   NA
 5776315 5776316 Smlt1010 Smlt1011     FALSE 0.255 76.000 0.000 NA   NA
 5776316 5776317 Smlt1011 Smlt1012     FALSE 0.203 97.000 0.000 NA   NA
 5776317 5776318 Smlt1012 Smlt1013     TRUE 0.527 63.000 0.045 NA   NA
 5776318 10768835 Smlt1013 Smlt_t15     FALSE 0.018 332.000 0.000 NA   NA
 5776319 5776320 Smlt1014 Smlt1015 dnaX   TRUE 0.979 7.000 0.411 NA   NA
 5776320 5776321 Smlt1015 Smlt1016   recR TRUE 0.789 112.000 0.604 NA   NA
 5776321 5776322 Smlt1016 Smlt1017 recR   FALSE 0.219 68.000 0.013 1.000 N NA
 5776323 5776324 Smlt1018 Smlt1019     TRUE 0.929 -3.000 0.025 NA N NA
 5776324 5776325 Smlt1019 Smlt1020     TRUE 0.993 -7.000 0.727 NA   NA
 5776325 5776326 Smlt1020 Smlt1021     TRUE 0.996 -3.000 0.739 NA   NA
 5776329 5776330 Smlt1024 Smlt1025   rpmF TRUE 0.793 108.000 0.599 NA   NA
 5776330 5776331 Smlt1025 Smlt1026 rpmF fabH FALSE 0.195 92.000 0.014 1.000 N NA
 5776331 5776332 Smlt1026 Smlt1027 fabH   FALSE 0.249 79.000 0.000 NA   NA
 5776332 5776333 Smlt1027 Smlt1028   fabD FALSE 0.027 257.000 0.000 NA   NA
 5776333 5776334 Smlt1028 Smlt1029 fabD fabG TRUE 0.962 83.000 0.432 0.004 Y NA
 5776334 5776335 Smlt1029 Smlt1030 fabG acpP TRUE 0.858 153.000 0.321 0.004 Y NA
 5776335 5776336 Smlt1030 Smlt1031 acpP fabF TRUE 0.824 144.000 0.346 1.000 Y NA
 5776336 5776337 Smlt1031 Smlt1032 fabF   FALSE 0.114 215.000 0.030 0.012 N NA
 5776337 5776338 Smlt1032 Smlt1034     FALSE 0.080 198.000 0.010 NA   NA
 5776338 5776339 Smlt1034 Smlt1035     TRUE 0.988 -3.000 0.209 NA   NA
 5776339 5776340 Smlt1035 Smlt1036   holB TRUE 0.988 -3.000 0.211 0.094 N NA
 5776340 5776341 Smlt1036 Smlt1037 holB   TRUE 0.989 -3.000 0.382 NA N NA
 5776341 10768836 Smlt1037 Smlt_t16     FALSE 0.164 113.000 0.000 NA   NA
 10768836 5776342 Smlt_t16 Smlt1038     FALSE 0.032 233.000 0.000 NA   NA
 5776343 5776344 Smlt1039 Smlt1040     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776344 5776345 Smlt1040 Smlt1041     TRUE 0.993 -16.000 1.000 NA   NA
 5776345 5776346 Smlt1041 Smlt1042     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5776346 5776347 Smlt1042 Smlt1043     FALSE 0.148 121.000 0.000 NA   NA
 5776347 5776348 Smlt1043 Smlt1044     TRUE 0.632 81.000 0.154 NA   NA
 5776348 5776349 Smlt1044 Smlt1045     TRUE 0.980 3.000 0.308 NA   NA
 5776349 5776350 Smlt1045 Smlt1046     FALSE 0.176 107.000 0.000 NA   NA
 5776350 5776351 Smlt1046 Smlt1047     TRUE 0.853 2.000 0.000 NA   NA
 5776351 5776352 Smlt1047 Smlt1048     TRUE 0.782 8.000 0.000 NA   NA
 5776352 5776353 Smlt1048 Smlt1049     TRUE 0.867 -7.000 0.000 NA   NA
 5776353 5776354 Smlt1049 Smlt1050   gpW TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5776354 5776355 Smlt1050 Smlt1051 gpW V FALSE 0.298 53.000 0.000 NA   NA
 5776355 5776356 Smlt1051 Smlt1052 V   TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 5776356 5776357 Smlt1052 Smlt1053     FALSE 0.017 354.000 0.000 NA   NA
 5776357 5776358 Smlt1053 Smlt1054     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776358 5776359 Smlt1054 Smlt1055     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776359 5776360 Smlt1055 Smlt1056     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776360 5776361 Smlt1056 Smlt1057     FALSE 0.013 425.000 0.000 NA   NA
 5776361 5776362 Smlt1057 Smlt1058     FALSE 0.091 153.000 0.000 NA   NA
 5776362 5776363 Smlt1058 Smlt1059     FALSE 0.341 42.000 0.000 NA   NA
 5776363 5776364 Smlt1059 Smlt1060     FALSE 0.257 75.000 0.000 NA   NA
 5776364 5776365 Smlt1060 Smlt1061     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 5776366 5776367 Smlt1064 Smlt1065     TRUE 0.729 12.000 0.000 NA   NA
 5776367 5776368 Smlt1065 Smlt1066     FALSE 0.080 161.000 0.000 NA   NA
 5776368 5776369 Smlt1066 Smlt1067     FALSE 0.128 130.000 0.000 NA   NA
 5776369 5776370 Smlt1067 Smlt1068     TRUE 0.951 12.000 0.224 NA   NA
 5776371 5776372 Smlt1069 Smlt1070     TRUE 0.729 12.000 0.000 NA   NA
 5776374 5776375 Smlt1072 Smlt1073     FALSE 0.035 88.000 0.000 NA N NA
 5776382 5776383 Smlt1081 Smlt1082     TRUE 0.979 -3.000 0.078 NA   NA
 5776388 5776389 Smlt1087 Smlt1088     TRUE 0.948 19.000 0.357 NA   NA
 5776390 5776391 Smlt1089 Smlt1090 pilT pilU TRUE 0.948 101.000 0.436 0.015 Y NA
 5776391 5776392 Smlt1090 Smlt1091 pilU   FALSE 0.010 208.000 0.000 1.000 N NA
 5776393 5776394 Smlt1092 Smlt1093     FALSE 0.008 229.000 0.000 1.000 N NA
 5776395 5776396 Smlt1094 Smlt1095     FALSE 0.269 63.000 0.000 NA   NA
 5776397 5776398 Smlt1096 Smlt1097 tag yhgE TRUE 0.975 -3.000 0.051 NA   NA
 5776399 5776400 Smlt1098 Smlt1099     TRUE 0.970 -7.000 0.263 NA N NA
 5776400 5776401 Smlt1099 Smlt1100   pyrB TRUE 0.698 16.000 0.022 1.000 N NA
 5776401 5776402 Smlt1100 Smlt1101 pyrB   FALSE 0.011 198.000 0.000 1.000 N NA
 5776403 5776404 Smlt1102 Smlt1103     FALSE 0.047 274.000 0.012 1.000   NA
 5776404 5776405 Smlt1103 Smlt1104   ptsI FALSE 0.053 229.000 0.042 1.000 N NA
 5776405 5776406 Smlt1104 Smlt1105 ptsI ptsH TRUE 0.996 3.000 0.205 0.002 Y NA
 5776406 5776407 Smlt1105 Smlt1106 ptsH   TRUE 0.997 -7.000 0.261 0.002 Y NA
 5776407 5776408 Smlt1106 Smlt1108     FALSE 0.062 501.000 0.171 NA   NA
 5776408 5776409 Smlt1108 Smlt1109     TRUE 0.864 28.000 0.194 NA   NA
 5776409 5776410 Smlt1109 Smlt1110   rpoP TRUE 0.995 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 5776410 5776411 Smlt1110 Smlt1111 rpoP   TRUE 0.576 22.000 0.022 NA N NA
 5776411 5776412 Smlt1111 Smlt1112   rpoN FALSE 0.381 59.000 0.050 NA N NA
 5776412 5776413 Smlt1112 Smlt1113 rpoN   TRUE 0.768 40.000 0.163 1.000   NA
 5776413 5776414 Smlt1113 Smlt1114     TRUE 0.991 0.000 0.543 NA   NA
 5776414 5776415 Smlt1114 Smlt1115     TRUE 0.756 104.000 0.459 NA   NA
 5776415 5776416 Smlt1115 Smlt1116     TRUE 0.996 -3.000 0.617 NA   NA
 5776416 5776417 Smlt1116 Smlt1117   kdsD TRUE 0.871 67.000 0.598 1.000   NA
 5776418 5776419 Smlt1118 Smlt1119   murA TRUE 0.786 22.000 0.129 NA N NA
 5776419 5776420 Smlt1119 Smlt1120 murA   TRUE 0.957 -3.000 0.013 NA   NA
 5776421 5776422 Smlt1121 Smlt1122     TRUE 0.994 3.000 1.000 NA   NA
 5776422 5776423 Smlt1122 Smlt1123   purN FALSE 0.440 68.000 0.020 NA   NA
 5776423 5776424 Smlt1123 Smlt1124 purN   TRUE 0.948 -3.000 0.007 NA   NA
 5776424 5776425 Smlt1124 Smlt1125     FALSE 0.012 467.000 0.000 NA   NA
 5776425 5776426 Smlt1125 Smlt1126   purM TRUE 0.634 24.000 0.005 NA   NA
 5776427 5776428 Smlt1127 Smlt1128     TRUE 0.980 -3.000 0.087 NA   NA
 5776428 5776429 Smlt1128 Smlt1129     TRUE 0.988 -3.000 0.217 NA   NA
 5776430 5776431 Smlt1130 Smlt1131     TRUE 0.996 -3.000 0.642 NA   NA
 5776431 5776432 Smlt1131 Smlt1132     FALSE 0.342 65.000 0.006 NA   NA
 5776432 5776433 Smlt1132 Smlt1133     FALSE 0.287 69.000 0.000 1.000   NA
 5776434 5776435 Smlt1134 Smlt1135     FALSE 0.017 353.000 0.000 NA   NA
 5776435 5776436 Smlt1135 Smlt1136     TRUE 0.907 12.000 0.074 NA   NA
 5776436 5776437 Smlt1136 Smlt1137     FALSE 0.409 35.000 0.000 NA   NA
 5776438 5776439 Smlt1138 Smlt1139   apbE TRUE 0.992 -3.000 0.500 1.000 N NA
 5776439 5776440 Smlt1139 Smlt1140 apbE   TRUE 0.968 15.000 0.462 NA   NA
 5776440 5776441 Smlt1140 Smlt1141     TRUE 0.809 123.000 0.808 NA   NA
 5776441 5776442 Smlt1141 Smlt1142     TRUE 0.967 27.000 0.848 NA   NA
 5776442 5776443 Smlt1142 Smlt1144c   bfrA FALSE 0.073 255.000 0.038 NA   NA
 5776443 10768837 Smlt1144c Smlt1144b bfrA   TRUE 0.764 -869.000 0.000 NA   NA
 10768837 10768838 Smlt1144b Smlt1144     FALSE 0.009 1462.000 0.000 NA   NA
 10768838 5776444 Smlt1144 Smlt1145     FALSE 0.099 147.000 0.000 NA   NA
 5776444 5776445 Smlt1145 Smlt1146     FALSE 0.140 124.000 0.000 NA   NA
 5776445 5776446 Smlt1146 Smlt1147     TRUE 0.771 11.000 0.000 1.000   NA
 5776446 5776447 Smlt1147 Smlt1148     TRUE 0.814 69.000 0.395 1.000   NA
 5776447 5776448 Smlt1148 Smlt1149     TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 5776448 5776449 Smlt1149 Smlt1150     FALSE 0.046 202.000 0.000 NA   NA
 5776449 5776450 Smlt1150 Smlt1151     TRUE 0.988 -3.000 0.217 NA   NA
 5776452 5776453 Smlt1153 Smlt1154     TRUE 0.950 -3.000 0.041 1.000 N NA
 5776453 5776454 Smlt1154 Smlt1155     TRUE 0.997 0.000 0.482 1.000 Y NA
 5776454 5776455 Smlt1155 Smlt1156     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5776455 5776456 Smlt1156 Smlt1157     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776456 5776457 Smlt1157 Smlt1158     TRUE 0.797 18.000 0.078 1.000 N NA
 5776458 5776459 Smlt1159 Smlt1160     TRUE 0.567 163.000 0.500 1.000   NA
 5776460 5776461 Smlt1161 Smlt1162     TRUE 0.709 83.000 0.250 NA   NA
 5776461 5776462 Smlt1162 Smlt1163     TRUE 0.898 52.000 0.667 NA   NA
 5776462 5776463 Smlt1163 Smlt1164     FALSE 0.021 296.000 0.000 NA   NA
 5776465 5776466 Smlt1166 Smlt1167 pab   TRUE 0.859 132.000 0.800 0.012   NA
 5776467 5776468 Smlt1168 Smlt1169     FALSE 0.460 77.000 0.029 NA   NA
 5776468 5776469 Smlt1169 Smlt1170   murD TRUE 0.902 -19.000 0.019 NA   NA
 5776474 5776475 Smlt1175 Smlt1176     FALSE 0.248 88.000 0.000 1.000   NA
 5776476 5776477 Smlt1177 Smlt1178     TRUE 0.987 -3.000 0.200 NA   NA
 5776477 5776478 Smlt1178 Smlt1179   amyM TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 5776478 5776479 Smlt1179 Smlt1180 amyM   FALSE 0.145 122.000 0.000 NA   NA
 5776479 5776480 Smlt1180 Smlt1181     FALSE 0.094 151.000 0.000 NA   NA
 5776480 5776481 Smlt1181 Smlt1182     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776482 5776483 Smlt1183 Smlt1184     FALSE 0.220 90.000 0.000 NA   NA
 5776483 5776484 Smlt1184 Smlt1185     TRUE 0.933 13.000 0.150 1.000   NA
 5776484 5776485 Smlt1185 Smlt1186     FALSE 0.032 129.000 0.000 1.000 N NA
 5776486 5776487 Smlt1187 Smlt1188 ssb   FALSE 0.006 203.000 0.000 NA N NA
 5776487 5776488 Smlt1188 Smlt1189     TRUE 0.901 28.000 0.471 NA N NA
 5776488 5776489 Smlt1189 Smlt1190     TRUE 0.992 0.000 0.600 NA   NA
 5776489 5776490 Smlt1190 Smlt1191     TRUE 0.960 0.000 0.064 NA   NA
 5776491 5776492 Smlt1192 Smlt1193     FALSE 0.172 19.000 0.000 NA N NA
 5776492 5776493 Smlt1193 Smlt1194     TRUE 0.608 20.000 0.000 NA   NA
 5776493 5776494 Smlt1194 Smlt1195     TRUE 0.740 13.000 0.000 1.000   NA
 5776494 5776495 Smlt1195 Smlt1196     TRUE 0.778 28.000 0.067 NA   NA
 5776496 5776497 Smlt1197 Smlt1198   adrA FALSE 0.023 148.000 0.000 1.000 N NA
 5776497 5776498 Smlt1198 Smlt1199 adrA   FALSE 0.175 108.000 0.000 NA   NA
 5776498 5776499 Smlt1199 Smlt1200     FALSE 0.119 136.000 0.000 NA   NA
 5776500 5776501 Smlt1201 Smlt1202     FALSE 0.396 36.000 0.000 NA   NA
 5776503 5776504 Smlt1204 Smlt1205     TRUE 0.829 19.000 0.042 NA   NA
 5776505 5776506 Smlt1206 Smlt1207     FALSE 0.185 104.000 0.000 NA   NA
 5776506 5776507 Smlt1207 Smlt1208     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5776507 5776508 Smlt1208 Smlt1209     FALSE 0.360 44.000 0.000 1.000   NA
 5776508 5776509 Smlt1209 Smlt1210     FALSE 0.135 135.000 0.000 1.000   NA
 5776510 5776511 Smlt1211 Smlt1212     FALSE 0.098 148.000 0.000 NA   NA
 5776511 5776512 Smlt1212 Smlt1213     TRUE 0.995 -7.000 0.914 NA   NA
 5776512 5776513 Smlt1213 Smlt1214     TRUE 0.504 57.000 0.029 NA   NA
 5776513 5776514 Smlt1214 Smlt1215     FALSE 0.206 96.000 0.000 NA   NA
 5776515 5776516 Smlt1216 Smlt1217     TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5776516 5776517 Smlt1217 Smlt1218     FALSE 0.311 58.000 0.000 1.000   NA
 5776517 5776518 Smlt1218 Smlt1219     TRUE 0.999 -3.000 0.897 1.000 Y NA
 5776518 5776519 Smlt1219 Smlt1220     FALSE 0.135 126.000 0.000 NA   NA
 5776519 5776520 Smlt1220 Smlt1221     FALSE 0.249 79.000 0.000 NA   NA
 5776523 5776524 Smlt1224 Smlt1225     TRUE 0.676 106.000 0.300 1.000   NA
 5776524 5776525 Smlt1225 Smlt1226     FALSE 0.456 105.000 0.070 1.000   NA
 5776525 5776526 Smlt1226 Smlt1227     TRUE 0.981 -3.000 0.203 1.000 N NA
 5776526 5776527 Smlt1227 Smlt1228     TRUE 0.981 -3.000 0.085 1.000   NA
 5776527 5776528 Smlt1228 Smlt1229     TRUE 0.965 -7.000 0.102 NA   NA
 5776528 5776529 Smlt1229 Smlt1230     TRUE 0.991 3.000 0.700 NA   NA
 5776529 5776530 Smlt1230 Smlt1231     TRUE 0.994 -3.000 0.438 NA   NA
 5776530 5776531 Smlt1231 Smlt1232     TRUE 0.969 11.000 0.342 NA   NA
 5776531 5776532 Smlt1232 Smlt1233     FALSE 0.061 191.000 0.000 1.000   NA
 5776532 5776533 Smlt1233 Smlt1234   mqo FALSE 0.019 355.000 0.000 1.000   NA
 5776533 5776534 Smlt1234 Smlt1235 mqo   FALSE 0.037 230.000 0.000 1.000   NA
 5776534 5776535 Smlt1235 Smlt1236     FALSE 0.102 153.000 0.000 1.000   NA
 5776535 5776536 Smlt1236 Smlt1237     FALSE 0.093 159.000 0.000 1.000   NA
 5776537 5776538 Smlt1238 Smlt1240     FALSE 0.070 168.000 0.000 NA   NA
 5776538 10768839 Smlt1240 Smlt1239     TRUE 0.777 -80.000 0.000 NA   NA
 5776539 5776540 Smlt1241 Smlt1242     FALSE 0.246 80.000 0.000 NA   NA
 5776540 5776541 Smlt1242 Smlt1243     FALSE 0.216 92.000 0.000 NA   NA
 5776542 5776543 Smlt1245 Smlt1246     FALSE 0.218 155.000 0.043 NA   NA
 5776543 5776544 Smlt1246 Smlt1247     FALSE 0.109 141.000 0.000 NA   NA
 5776545 5776546 Smlt1249 Smlt1250   minE TRUE 0.542 38.000 0.015 NA   NA
 5776546 5776547 Smlt1250 Smlt1251 minE minD TRUE 0.997 3.000 0.618 NA Y NA
 5776547 5776548 Smlt1251 Smlt1252 minD minC TRUE 0.969 38.000 0.466 1.000 Y NA
 5776548 5776549 Smlt1252 Smlt1253 minC   TRUE 0.915 3.000 0.013 1.000   NA
 5776550 5776551 Smlt1254 Smlt1255     TRUE 0.999 0.000 0.900 0.034 Y NA
 5776551 5776552 Smlt1255 Smlt1256     FALSE 0.031 235.000 0.000 NA   NA
 5776552 5776553 Smlt1256 Smlt1257     FALSE 0.296 104.000 0.013 NA   NA
 5776554 5776555 Smlt1259 Smlt1260     FALSE 0.222 178.000 0.107 NA   NA
 5776555 5776556 Smlt1260 Smlt1261     TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5776556 5776557 Smlt1261 Smlt1262     TRUE 0.964 -3.000 0.020 NA   NA
 5776557 5776558 Smlt1262 Smlt1263     TRUE 0.886 46.000 0.549 NA   NA
 5776560 5776561 Smlt1265 Smlt1266     FALSE 0.473 45.000 0.014 NA   NA
 5776563 5776564 Smlt1269 Smlt1270 rfaY   FALSE 0.042 209.000 0.000 NA   NA
 5776564 5776565 Smlt1270 Smlt1271   tesB TRUE 0.912 5.000 0.026 NA   NA
 5776565 5776566 Smlt1271 Smlt1273 tesB   TRUE 0.585 142.000 0.021 1.000 Y NA
 5776568 5776569 Smlt1275 Smlt1276     FALSE 0.200 98.000 0.000 NA   NA
 5776569 5776570 Smlt1276 Smlt1277   uvrA TRUE 0.917 0.000 0.005 1.000   NA
 5776571 5776572 Smlt1278 Smlt1279 rplU rpmA TRUE 0.995 19.000 0.667 0.012 Y NA
 5776572 5776573 Smlt1279 Smlt1280 rpmA   FALSE 0.371 194.000 0.335 1.000   NA
 5776574 5776575 Smlt1282 Smlt1283   trbI TRUE 0.988 -3.000 0.214 NA   NA
 5776575 5776576 Smlt1283 Smlt1284 trbI trbG TRUE 0.974 3.000 0.000 NA Y NA
 5776576 5776577 Smlt1284 Smlt1285 trbG trbF TRUE 0.989 -3.000 0.000 NA Y NA
 5776577 5776578 Smlt1285 Smlt1286 trbF trbL TRUE 0.984 19.000 0.333 NA Y NA
 5776578 5776579 Smlt1286 Smlt1287 trbL trbJ TRUE 0.950 12.000 0.000 NA Y NA
 5776579 5776580 Smlt1287 Smlt1288 trbJ trbE TRUE 0.989 -3.000 0.000 NA Y NA
 5776580 5776581 Smlt1288 Smlt1289 trbE trbD TRUE 0.991 11.000 0.333 NA Y NA
 5776581 5776582 Smlt1289 Smlt1290 trbD trbC TRUE 0.998 -3.000 0.333 NA Y NA
 5776582 5776583 Smlt1290 Smlt1291 trbC trbB TRUE 0.997 -3.000 0.227 NA Y NA
 5776583 5776584 Smlt1291 Smlt1292 trbB   TRUE 0.985 -3.000 0.136 1.000   NA
 5776584 5776585 Smlt1292 Smlt1293   traG TRUE 0.996 -3.000 0.667 1.000   NA
 5776585 5776586 Smlt1293 Smlt1294 traG   FALSE 0.032 234.000 0.000 NA   NA
 5776586 5776587 Smlt1294 Smlt1295     FALSE 0.325 45.000 0.000 NA   NA
 5776587 5776588 Smlt1295 Smlt1296     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 5776588 5776589 Smlt1296 Smlt1297     TRUE 0.673 16.000 0.000 NA   NA
 5776589 5776590 Smlt1297 Smlt1298     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776590 5776591 Smlt1298 Smlt1299     TRUE 0.925 -13.000 0.029 NA   NA
 5776593 5776594 Smlt1301 Smlt1302     FALSE 0.388 37.000 0.000 NA   NA
 5776594 5776595 Smlt1302 Smlt1303     FALSE 0.467 33.000 0.000 1.000   NA
 5776595 5776596 Smlt1303 Smlt1304     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5776596 5776597 Smlt1304 Smlt1305     TRUE 0.962 -67.000 0.211 1.000   NA
 5776597 5776598 Smlt1305 Smlt1306     FALSE 0.060 88.000 0.000 1.000 N NA
 5776600 5776601 Smlt1308 Smlt1309     TRUE 0.990 -3.000 0.250 NA   NA
 5776601 5776602 Smlt1309 Smlt1310     TRUE 0.527 26.000 0.000 NA   NA
 5776602 5776603 Smlt1310 Smlt1311     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776603 5776604 Smlt1311 Smlt1312     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776604 5776605 Smlt1312 Smlt1313     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5776605 5776606 Smlt1313 Smlt1314     FALSE 0.004 251.000 0.000 NA N NA
 5776606 5776607 Smlt1314 Smlt1315     TRUE 0.967 27.000 0.857 NA   NA
 5776607 5776608 Smlt1315 Smlt1316     TRUE 0.799 84.000 0.429 NA   NA
 5776608 5776609 Smlt1316 Smlt1318     FALSE 0.017 352.000 0.000 NA   NA
 5776611 5776612 Smlt1320 Smlt1320A     FALSE 0.018 335.000 0.000 NA   NA
 5776613 5776614 Smlt1322 Smlt1323     FALSE 0.341 42.000 0.000 NA   NA
 5776614 5776615 Smlt1323 Smlt1324     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776616 5776617 Smlt1325 Smlt1326     TRUE 0.847 63.000 0.500 NA   NA
 5776617 5776618 Smlt1326 Smlt1327     TRUE 0.829 81.000 0.500 NA   NA
 5776618 5776619 Smlt1327 Smlt1328     FALSE 0.435 33.000 0.000 NA   NA
 5776620 5776621 Smlt1329 Smlt1331     TRUE 0.987 -34.000 0.667 NA   NA
 5776622 5776623 Smlt1332 Smlt1333     FALSE 0.388 37.000 0.000 NA   NA
 5776623 5776624 Smlt1333 Smlt1334     TRUE 0.527 26.000 0.000 NA   NA
 5776624 5776625 Smlt1334 Smlt1335     TRUE 0.986 -19.000 0.545 NA   NA
 5776625 5776626 Smlt1335 Smlt1336     FALSE 0.111 140.000 0.000 NA   NA
 5776626 5776627 Smlt1336 Smlt1337   rpsT FALSE 0.009 211.000 0.000 1.000 N NA
 5776628 5776629 Smlt1338 Smlt1339 mviN ribF TRUE 0.675 76.000 0.169 1.000   NA
 5776629 5776630 Smlt1339 Smlt1340 ribF ileS1 TRUE 0.984 -3.000 0.254 1.000 N NA
 5776630 5776631 Smlt1340 Smlt1341 ileS1 lspA TRUE 0.958 0.000 0.147 1.000 N NA
 5776631 5776632 Smlt1341 Smlt1342 lspA ispH TRUE 0.948 28.000 0.095 1.000 Y NA
 5776632 5776633 Smlt1342 Smlt1343 ispH   FALSE 0.040 224.000 0.000 1.000   NA
 5776633 5776634 Smlt1343 Smlt1344     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5776635 5776636 Smlt1345 Smlt1346     TRUE 0.996 -3.000 0.600 NA   NA
 5776636 5776637 Smlt1346 Smlt1347     FALSE 0.317 47.000 0.000 NA   NA
 5776637 5776638 Smlt1347 Smlt1348     TRUE 0.939 15.000 0.000 NA Y NA
 5776638 5776639 Smlt1348 Smlt1349     TRUE 0.987 -3.000 0.333 NA N NA
 5776640 5776641 Smlt1350 Smlt1351   ldhA FALSE 0.222 98.000 0.000 1.000   NA
 5776641 10768840 Smlt1351 Smlt_t17 ldhA   FALSE 0.301 52.000 0.000 NA   NA
 10768840 5776642 Smlt_t17 Smlt1353     FALSE 0.010 661.000 0.000 NA   NA
 5776642 5776643 Smlt1353 Smlt1354     FALSE 0.016 358.000 0.000 NA   NA
 5776643 5776644 Smlt1354 Smlt1355     FALSE 0.074 165.000 0.000 NA   NA
 5776644 5776645 Smlt1355 Smlt1356     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776646 5776647 Smlt1357 Smlt1358     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5776647 5776648 Smlt1358 Smlt1359     FALSE 0.359 40.000 0.000 NA   NA
 5776649 5776650 Smlt1360 Smlt1361 cyoA qoxB TRUE 0.999 -3.000 0.385 0.007 Y NA
 5776650 5776651 Smlt1361 Smlt1362 qoxB qoxC TRUE 0.999 -3.000 0.385 0.043 Y NA
 5776651 5776652 Smlt1362 Smlt1363 qoxC cyoxD TRUE 0.999 0.000 0.917 0.043 Y NA
 5776654 5776655 Smlt1366 Smlt1367 radA htpG TRUE 0.655 122.000 0.000 0.090 Y NA
 5776655 5776656 Smlt1367 Smlt1368 htpG   TRUE 0.916 49.000 0.727 1.000   NA
 5776656 5776657 Smlt1368 Smlt1369     FALSE 0.296 54.000 0.000 NA   NA
 5776659 5776660 Smlt1371 Smlt1372 ffh   FALSE 0.286 92.000 0.003 1.000   NA
 5776660 5776661 Smlt1372 Smlt1373     TRUE 0.975 -3.000 0.045 1.000   NA
 5776661 5776662 Smlt1373 Smlt1374   rpsP FALSE 0.103 99.000 0.004 1.000 N NA
 5776662 5776663 Smlt1374 Smlt1375 rpsP rimM TRUE 0.968 45.000 0.342 0.012 Y NA
 5776663 5776664 Smlt1375 Smlt1376 rimM trmD TRUE 0.996 9.000 0.672 1.000 Y NA
 5776664 5776665 Smlt1376 Smlt1377 trmD rplS TRUE 0.853 155.000 0.567 1.000 Y NA
 5776665 5776666 Smlt1377 Smlt1378 rplS   FALSE 0.239 83.000 0.000 NA   NA
 5776666 5776667 Smlt1378 Smlt1379     FALSE 0.244 81.000 0.000 NA   NA
 5776667 5776668 Smlt1379 Smlt1380     TRUE 0.795 39.000 0.208 NA   NA
 5776671 5776672 Smlt1384 Smlt1385   katA FALSE 0.173 109.000 0.000 NA   NA
 5776672 5776673 Smlt1385 Smlt1386 katA   FALSE 0.020 313.000 0.000 NA   NA
 5776673 5776674 Smlt1386 Smlt1387   mutS FALSE 0.122 134.000 0.000 NA   NA
 5776674 5776675 Smlt1387 Smlt1388 mutS   FALSE 0.119 136.000 0.000 NA   NA
 5776676 5776677 Smlt1389 Smlt1390     TRUE 0.924 22.000 0.300 NA   NA
 5776677 5776678 Smlt1390 Smlt1391     FALSE 0.257 75.000 0.000 NA   NA
 5776678 5776679 Smlt1391 Smlt1395     FALSE 0.010 632.000 0.000 NA   NA
 5776679 5776680 Smlt1395 Smlt1396A     FALSE 0.010 611.000 0.000 NA   NA
 5776680 5776681 Smlt1396A Smlt1399     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 5776681 5776682 Smlt1399 Smlt1400     FALSE 0.127 131.000 0.000 NA   NA
 5776682 5776683 Smlt1400 Smlt1401     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776683 5776684 Smlt1401 Smlt1402     FALSE 0.041 211.000 0.000 NA   NA
 5776684 5776685 Smlt1402 Smlt1403     FALSE 0.081 167.000 0.000 1.000   NA
 5776686 5776687 Smlt1404 Smlt1405     TRUE 0.999 -3.000 0.743 NA Y NA
 5776687 5776688 Smlt1405 Smlt1406     TRUE 0.989 -15.000 0.119 NA Y NA
 5776688 5776689 Smlt1406 Smlt1407     TRUE 0.925 -7.000 0.062 1.000 N NA
 5776689 5776690 Smlt1407 Smlt1408     FALSE 0.046 106.000 0.000 1.000 N NA
 5776692 5776693 Smlt1410 Smlt1411 map   TRUE 0.984 5.000 0.492 NA   NA
 5776693 5776694 Smlt1411 Smlt1412     FALSE 0.262 68.000 0.000 NA   NA
 5776694 5776695 Smlt1412 Smlt1413     FALSE 0.099 147.000 0.000 NA   NA
 5776695 5776696 Smlt1413 Smlt1414     TRUE 0.949 4.000 0.086 NA   NA
 5776696 5776697 Smlt1414 Smlt1415   dat TRUE 0.806 30.000 0.118 NA   NA
 5776697 5776698 Smlt1415 Smlt1416 dat   TRUE 0.889 64.000 0.152 1.000 Y NA
 5776698 5776699 Smlt1416 Smlt1417     FALSE 0.015 175.000 0.000 1.000 N NA
 5776699 5776700 Smlt1417 Smlt1418     TRUE 0.967 11.000 0.333 NA   NA
 5776700 5776701 Smlt1418 Smlt1419     TRUE 0.995 -3.000 0.583 NA   NA
 5776701 5776702 Smlt1419 Smlt1420     TRUE 0.978 2.000 0.241 NA   NA
 5776702 5776703 Smlt1420 Smlt1421   qseC TRUE 0.559 26.000 0.000 1.000   NA
 5776703 5776704 Smlt1421 Smlt1422 qseC   TRUE 0.995 -3.000 0.083 1.000 Y NA
 5776704 5776705 Smlt1422 Smlt1423     TRUE 0.875 1.000 0.000 1.000   NA
 5776712 5776713 Smlt1430 Smlt1431 gpmA   FALSE 0.018 162.000 0.000 1.000 N NA
 5776714 5776715 Smlt1432 Smlt1433   mfd FALSE 0.354 45.000 0.000 1.000   NA
 5776715 5776716 Smlt1433 Smlt1434 mfd   FALSE 0.042 150.000 0.002 1.000 N NA
 5776716 5776717 Smlt1434 Smlt1435     FALSE 0.282 96.000 0.007 NA   NA
 5776718 5776719 Smlt1436 Smlt1437     TRUE 0.998 4.000 0.776 1.000 Y NA
 5776719 5776720 Smlt1437 Smlt1438     TRUE 0.649 82.000 0.311 NA N NA
 5776720 5776721 Smlt1438 Smlt1439     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 5776721 5776722 Smlt1439 Smlt1440     FALSE 0.086 155.000 0.000 NA   NA
 5776722 5776723 Smlt1440 Smlt1441   gltX FALSE 0.099 154.000 0.000 1.000   NA
 5776723 5776724 Smlt1441 Smlt1442 gltX fur FALSE 0.346 35.000 0.012 1.000 N NA
 5776725 5776726 Smlt1443 Smlt1444     TRUE 0.981 11.000 0.578 NA   NA
 5776726 5776727 Smlt1444 Smlt1445     TRUE 0.983 0.000 0.276 NA   NA
 5776727 5776728 Smlt1445 Smlt1446     FALSE 0.159 123.000 0.000 1.000   NA
 5776729 5776730 Smlt1447 Smlt1448     TRUE 0.861 111.000 1.000 NA   NA
 5776733 5776734 Smlt1451 Smlt1452 ogt   TRUE 0.997 -3.000 0.275 1.000 Y NA
 5776734 5776735 Smlt1452 Smlt1453     TRUE 0.762 10.000 0.000 NA   NA
 5776736 5776737 Smlt1454 Smlt1455     FALSE 0.281 59.000 0.000 NA   NA
 5776737 5776738 Smlt1455 Smlt1456     FALSE 0.337 43.000 0.000 NA   NA
 5776738 5776739 Smlt1456 Smlt1458     FALSE 0.038 218.000 0.000 NA   NA
 5776739 5776740 Smlt1458 Smlt1459     FALSE 0.421 80.000 0.021 NA   NA
 5776742 5776743 Smlt1461 Smlt1462 deaD   FALSE 0.018 219.000 0.004 1.000 N NA
 5776743 5776744 Smlt1462 Smlt1463     TRUE 0.727 110.000 0.000 0.009 Y NA
 5776744 5776745 Smlt1463 Smlt1464     TRUE 0.591 35.000 0.074 1.000 N NA
 5776745 5776746 Smlt1464 Smlt1465     FALSE 0.194 145.000 0.074 1.000 N NA
 5776746 5776747 Smlt1465 Smlt1466     FALSE 0.122 134.000 0.000 NA   NA
 5776748 5776749 Smlt1467 Smlt1468     FALSE 0.409 35.000 0.000 NA   NA
 5776749 5776750 Smlt1468 Smlt1469     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776751 5776752 Smlt1470 Smlt1471     FALSE 0.273 200.000 0.000 1.000 Y NA
 5776752 5776753 Smlt1471 Smlt1472     FALSE 0.287 68.000 0.000 1.000   NA
 5776754 5776755 Smlt1473 Smlt1474     FALSE 0.102 146.000 0.000 NA   NA
 5776756 5776757 Smlt1475 Smlt1476     TRUE 0.763 24.000 0.031 NA   NA
 5776758 5776759 Smlt1477 Smlt1478     TRUE 0.591 69.000 0.095 NA   NA
 5776762 10768841 Smlt1481 Smlt1482     FALSE 0.026 264.000 0.000 NA   NA
 5776764 5776765 Smlt1484 Smlt1485     TRUE 0.994 -3.000 0.417 NA   NA
 5776766 5776767 Smlt1486 Smlt1487     FALSE 0.421 94.000 0.034 NA   NA
 5776769 5776770 Smlt1490 Smlt1491 accA   FALSE 0.162 114.000 0.000 NA   NA
 5776770 5776771 Smlt1491 Smlt1492   dnaE TRUE 0.838 -12.000 0.000 NA   NA
 5776771 5776772 Smlt1492 Smlt1493 dnaE rnhB FALSE 0.392 229.000 0.104 1.000 Y NA
 5776772 5776773 Smlt1493 Smlt1494 rnhB lpxB TRUE 0.979 -3.000 0.186 1.000 N NA
 5776773 5776774 Smlt1494 Smlt1495 lpxB lpxA TRUE 0.998 -3.000 0.289 1.000 Y NA
 5776774 5776775 Smlt1495 Smlt1496 lpxA fabZ TRUE 0.683 17.000 0.022 1.000 N NA
 5776775 5776776 Smlt1496 Smlt1497 fabZ lpxD TRUE 0.927 -3.000 0.019 1.000 N NA
 5776776 5776777 Smlt1497 Smlt1498 lpxD   FALSE 0.088 441.000 0.000 1.000 Y NA
 5776777 5776778 Smlt1498 Smlt1499     TRUE 0.991 -3.000 0.007 1.000 Y NA
 5776778 5776779 Smlt1499 Smlt1500   dxr TRUE 0.827 56.000 0.568 1.000 N NA
 5776779 5776780 Smlt1500 Smlt1501 dxr cdsA TRUE 0.996 3.000 0.372 1.000 Y NA
 5776780 5776781 Smlt1501 Smlt1502 cdsA uppS TRUE 0.998 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 5776781 5776782 Smlt1502 Smlt1503 uppS frr TRUE 0.971 6.000 0.409 1.000 N NA
 5776782 5776783 Smlt1503 Smlt1504 frr pyrH TRUE 0.772 97.000 0.626 1.000 N NA
 5776783 5776784 Smlt1504 Smlt1505 pyrH   FALSE 0.076 122.000 0.004 1.000 N NA
 5776784 5776785 Smlt1505 Smlt1506   tsf FALSE 0.015 225.000 0.002 1.000 N NA
 5776785 5776786 Smlt1506 Smlt1507 tsf rpsB TRUE 0.928 126.000 0.748 1.000 Y NA
 5776786 5776787 Smlt1507 Smlt1508 rpsB   FALSE 0.005 221.000 0.000 NA N NA
 5776787 5776788 Smlt1508 Smlt1509     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5776788 5776789 Smlt1509 Smlt1510     FALSE 0.045 204.000 0.000 NA   NA
 5776789 5776790 Smlt1510 Smlt1511     TRUE 0.994 -3.000 0.444 NA   NA
 5776790 5776791 Smlt1511 Smlt1512     TRUE 0.997 5.000 0.667 NA Y NA
 5776791 5776792 Smlt1512 Smlt1513     TRUE 0.983 -3.000 0.125 NA   NA
 5776793 5776794 Smlt1513A Smlt1514 map glnD TRUE 0.940 3.000 0.128 1.000 N NA
 5776794 5776795 Smlt1514 Smlt1515 glnD   TRUE 0.846 0.000 0.012 1.000 N NA
 5776795 5776796 Smlt1515 Smlt1517     FALSE 0.024 441.000 0.061 1.000 N NA
 5776796 5776797 Smlt1517 Smlt1518   dapE TRUE 0.986 -3.000 0.292 1.000 N NA
 5776797 5776798 Smlt1518 Smlt1520 dapE asnB FALSE 0.078 536.000 0.000 1.000 Y NA
 5776798 5776799 Smlt1520 Smlt1521 asnB   FALSE 0.050 100.000 0.000 1.000 N NA
 5776802 5776803 Smlt1525 Smlt1526 parC   FALSE 0.165 60.000 0.005 1.000 N NA
 5776804 5776805 Smlt1527 Smlt1528     TRUE 0.988 -3.000 0.333 1.000 N NA
 5776805 5776806 Smlt1528 Smlt1529   emrA TRUE 0.937 12.000 0.278 1.000 N NA
 5776806 5776807 Smlt1529 Smlt1530 emrA emrB TRUE 0.991 8.000 0.900 1.000   NA
 5776808 10768842 Smlt1530A Smlt_t18     FALSE 0.019 326.000 0.000 NA   NA
 10768842 5776809 Smlt_t18 Smlt1532     FALSE 0.306 50.000 0.000 NA   NA
 5776811 5776812 Smlt1534 Smlt1535 rnr   FALSE 0.285 95.000 0.004 1.000   NA
 5776812 5776813 Smlt1535 Smlt1536     FALSE 0.128 152.000 0.002 1.000   NA
 5776814 5776815 Smlt1537 Smlt1538   macB TRUE 0.960 6.000 0.303 1.000 N NA
 5776815 5776816 Smlt1538 Smlt1539 macB   TRUE 0.953 -3.000 0.045 1.000 N NA
 5776817 5776818 Smlt1540 Smlt1541     TRUE 0.997 7.000 0.800 1.000 Y NA
 5776818 5776819 Smlt1541 Smlt1542     FALSE 0.329 178.000 0.000 1.000 Y NA
 5776820 5776821 Smlt1543 Smlt1544 rnt   FALSE 0.069 169.000 0.000 NA   NA
 5776821 5776822 Smlt1544 Smlt1545     TRUE 0.902 26.000 0.271 NA   NA
 5776822 5776823 Smlt1545 Smlt1546     TRUE 0.995 -7.000 0.914 NA   NA
 5776823 5776824 Smlt1546 Smlt1547     TRUE 0.925 -13.000 0.029 NA   NA
 5776824 5776825 Smlt1547 Smlt1548     FALSE 0.030 239.000 0.000 NA   NA
 5776825 5776826 Smlt1548 Smlt1549   pstB TRUE 0.810 77.000 0.034 NA Y NA
 5776826 5776827 Smlt1549 Smlt1550 pstB pstA TRUE 0.998 -7.000 0.526 0.002 Y NA
 5776827 5776828 Smlt1550 Smlt1551 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.537 0.002 Y NA
 5776828 5776829 Smlt1551 Smlt1552 pstC pstS TRUE 0.881 83.000 0.033 0.002 Y NA
 5776829 5776830 Smlt1552 Smlt1554 pstS pstS FALSE 0.394 687.000 0.333 0.002 Y NA
 5776830 5776831 Smlt1554 Smlt1555 pstS   TRUE 0.747 223.000 0.750 NA Y NA
 5776831 5776832 Smlt1555 Smlt1556   nth FALSE 0.006 197.000 0.000 NA N NA
 5776832 5776833 Smlt1556 Smlt1557 nth   TRUE 0.910 0.000 0.005 NA   NA
 5776833 5776834 Smlt1557 Smlt1558   crt2 TRUE 0.959 5.000 0.160 NA   NA
 5776835 5776836 Smlt1559 Smlt1560     FALSE 0.069 258.000 0.028 1.000   NA
 5776836 5776837 Smlt1560 Smlt1561     TRUE 0.967 -3.000 0.021 1.000   NA
 5776839 5776840 Smlt1563 Smlt1564     FALSE 0.102 146.000 0.000 NA   NA
 5776841 5776842 Smlt1565 Smlt1566     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776842 5776843 Smlt1566 Smlt1567     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776843 5776844 Smlt1567 Smlt1568     FALSE 0.073 166.000 0.000 NA   NA
 5776844 5776845 Smlt1568 Smlt1569     FALSE 0.252 119.000 0.013 NA   NA
 5776845 5776846 Smlt1569 Smlt1570   aptA TRUE 0.552 64.000 0.064 NA   NA
 5776847 10768844 Smlt1571a Smlt1571 aldH   TRUE 0.762 -1412.000 0.000 NA   NA
 5776850 5776851 Smlt1574 Smlt1575     TRUE 0.613 86.000 0.267 1.000 N NA
 5776851 5776852 Smlt1575 Smlt1576     FALSE 0.203 97.000 0.000 NA   NA
 5776852 5776853 Smlt1576 Smlt1577     FALSE 0.224 88.000 0.000 NA   NA
 5776853 5776854 Smlt1577 Smlt1578     FALSE 0.303 51.000 0.000 NA   NA
 5776855 5776856 Smlt1579 Smlt1580     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5776856 5776857 Smlt1580 Smlt1581   potF TRUE 0.674 92.000 0.000 1.000 Y NA
 5776859 5776860 Smlt1584 Smlt1585 potG potH TRUE 0.998 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 5776860 5776861 Smlt1585 Smlt1586 potH potI TRUE 0.997 -3.000 0.094 0.040 Y NA
 5776861 5776862 Smlt1586 Smlt1587 potI   FALSE 0.320 84.000 0.038 1.000 N NA
 5776863 5776864 Smlt1589 Smlt1590 corA   TRUE 0.939 7.000 0.095 NA   NA
 5776864 5776865 Smlt1590 Smlt1591     TRUE 0.968 -3.000 0.029 NA   NA
 5776865 5776866 Smlt1591 Smlt1592     FALSE 0.458 65.000 0.024 NA   NA
 5776866 5776867 Smlt1592 Smlt1593     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776867 5776868 Smlt1593 Smlt1594     FALSE 0.257 75.000 0.000 NA   NA
 5776868 5776869 Smlt1594 Smlt1595     FALSE 0.310 49.000 0.000 NA   NA
 5776869 5776870 Smlt1595 Smlt1596     TRUE 0.994 -3.000 0.457 NA   NA
 5776871 5776872 Smlt1597 Smlt1598     TRUE 0.992 21.000 0.752 1.000 Y NA
 5776872 5776873 Smlt1598 Smlt1599     TRUE 0.996 -3.000 0.671 0.088 N NA
 5776874 5776875 Smlt1600 Smlt1601   gstA FALSE 0.025 167.000 0.003 NA N NA
 5776876 5776877 Smlt1602 Smlt1603     TRUE 0.818 47.000 0.500 NA N NA
 5776877 5776878 Smlt1603 Smlt1604   petA FALSE 0.042 230.000 0.033 NA N NA
 5776878 5776879 Smlt1604 Smlt1605 petA petB TRUE 0.997 0.000 0.233 0.001 Y NA
 5776879 5776880 Smlt1605 Smlt1606 petB petC TRUE 0.999 -7.000 0.630 0.001 Y NA
 5776880 5776881 Smlt1606 Smlt1607 petC sspA FALSE 0.493 135.000 0.370 NA N NA
 5776881 5776882 Smlt1607 Smlt1608 sspA sspB TRUE 0.889 85.000 0.831 NA   NA
 5776883 5776884 Smlt1609 Smlt1610     FALSE 0.377 38.000 0.000 NA   NA
 5776884 5776885 Smlt1610 Smlt1611   nadC FALSE 0.210 115.000 0.005 NA   NA
 5776885 5776886 Smlt1611 Smlt1612 nadC   TRUE 0.947 -3.000 0.006 NA   NA
 5776887 5776888 Smlt1613 Smlt1614 purE purK TRUE 0.998 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 5776888 5776889 Smlt1614 Smlt1615 purK   FALSE 0.164 113.000 0.000 NA   NA
 5776890 10768845 Smlt1616b Smlt1616a sodB   TRUE 0.770 -323.000 0.000 NA   NA
 5776891 5776892 Smlt1617 Smlt1618     TRUE 0.919 -3.000 0.016 1.000 N NA
 5776892 5776893 Smlt1618 Smlt1619     FALSE 0.036 233.000 0.000 1.000   NA
 5776893 5776894 Smlt1619 Smlt1620     FALSE 0.051 253.000 0.014 NA   NA
 5776894 5776895 Smlt1620 Smlt1621   fimU FALSE 0.137 162.000 0.014 NA   NA
 5776895 5776896 Smlt1621 Smlt1622 fimU pilV TRUE 0.996 -3.000 0.119 NA Y NA
 5776896 5776897 Smlt1622 Smlt1623 pilV pilW TRUE 0.996 -3.000 0.143 NA Y NA
 5776897 5776898 Smlt1623 Smlt1624 pilW pilX TRUE 0.991 4.000 0.171 NA Y NA
 5776898 5776899 Smlt1624 Smlt1625 pilX pilY1 TRUE 0.977 12.000 0.077 NA Y NA
 5776899 5776900 Smlt1625 Smlt1626 pilY1 pilE TRUE 0.993 8.000 0.346 NA Y NA
 5776900 10768846 Smlt1626 Smlt_t21 pilE   FALSE 0.310 49.000 0.000 NA   NA
 5776902 10768847 Smlt1628 Smlt_t23 uvrB   FALSE 0.173 109.000 0.000 NA   NA
 5776903 5776904 Smlt1629 Smlt1630     FALSE 0.260 72.000 0.000 NA   NA
 5776904 5776905 Smlt1630 Smlt1631     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5776907 5776908 Smlt1633 Smlt1634     FALSE 0.465 31.000 0.000 NA   NA
 5776909 5776910 Smlt1635 Smlt1636     TRUE 0.998 2.000 0.667 1.000 Y NA
 5776910 5776911 Smlt1636 Smlt1637     FALSE 0.304 60.000 0.000 1.000   NA
 5776911 5776912 Smlt1637 Smlt1638     TRUE 0.939 4.000 0.045 1.000   NA
 5776912 5776913 Smlt1638 Smlt1639     TRUE 0.998 4.000 0.746 0.051 Y NA
 5776913 5776914 Smlt1639 Smlt1640   msbA TRUE 0.972 -3.000 0.120 1.000 N NA
 5776914 5776915 Smlt1640 Smlt1641 msbA lpxK TRUE 0.968 0.000 0.205 1.000 N NA
 5776915 5776916 Smlt1641 Smlt1642 lpxK kdsB TRUE 0.839 75.000 0.054 1.000 Y NA
 5776916 5776917 Smlt1642 Smlt1643 kdsB   TRUE 0.955 -3.000 0.050 1.000 N NA
 5776917 5776918 Smlt1643 Smlt1644     TRUE 0.953 -3.000 0.006 1.000   NA
 5776918 5776919 Smlt1644 Smlt1645   uvrC TRUE 0.949 -3.000 0.004 1.000   NA
 5776919 5776920 Smlt1645 Smlt1646 uvrC pgsA TRUE 0.887 19.000 0.227 1.000 N NA
 5776920 10768848 Smlt1646 Smlt_t25 pgsA   FALSE 0.031 238.000 0.000 NA   NA
 10768848 5776921 Smlt_t25 Smlt1648     FALSE 0.115 138.000 0.000 NA   NA
 5776921 10768849 Smlt1648 Smlt_t26     FALSE 0.157 117.000 0.000 NA   NA
 10768849 5776922 Smlt_t26 Smlt1651     FALSE 0.015 369.000 0.000 NA   NA
 5776922 5776923 Smlt1651 Smlt1652     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 5776923 5776924 Smlt1652 Smlt1653     TRUE 0.971 11.000 0.375 NA   NA
 5776924 5776925 Smlt1653 Smlt1654     TRUE 0.989 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5776926 5776927 Smlt1655 Smlt1656     TRUE 0.867 -7.000 0.000 NA   NA
 10768850 10768851 Smlt_t27 Smlt_t29     FALSE 0.023 285.000 0.000 NA   NA
 10768851 5776928 Smlt_t29 Smlt1657     FALSE 0.409 35.000 0.000 NA   NA
 5776930 5776931 Smlt1659 Smlt1660     FALSE 0.025 271.000 0.000 NA   NA
 5776931 5776932 Smlt1660 Smlt1661     FALSE 0.026 261.000 0.000 NA   NA
 5776933 5776934 Smlt1662 Smlt1663     TRUE 0.977 18.000 0.071 0.059 Y NA
 5776935 5776936 Smlt1664 Smlt1665     FALSE 0.249 79.000 0.000 NA   NA
 5776936 5776937 Smlt1665 Smlt1666     FALSE 0.301 52.000 0.000 NA   NA
 5776939 5776940 Smlt1668 Smlt1669     TRUE 0.581 44.000 0.000 0.010   NA
 5776940 5776941 Smlt1669 Smlt1670     FALSE 0.257 75.000 0.000 NA   NA
 5776943 5776944 Smlt1672 Smlt1674     FALSE 0.331 44.000 0.000 NA   NA
 5776948 5776949 Smlt1679 Smlt1680     TRUE 0.921 21.000 0.262 NA   NA
 5776952 5776953 Smlt1683 Smlt1684     FALSE 0.069 169.000 0.000 NA   NA
 5776954 5776955 Smlt1685 Smlt1686     FALSE 0.017 353.000 0.000 NA   NA
 5776956 5776957 Smlt1687 Smlt1688     TRUE 0.977 -3.000 0.067 NA   NA
 5776958 5776959 Smlt1689 Smlt1690   hemN FALSE 0.354 45.000 0.000 1.000   NA
 5776960 5776961 Smlt1691 Smlt1692   wbpO FALSE 0.119 143.000 0.000 1.000   NA
 5776961 5776962 Smlt1692 Smlt1693 wbpO   FALSE 0.316 38.000 0.012 1.000 N NA
 5776962 5776963 Smlt1693 Smlt1694     FALSE 0.338 49.000 0.000 1.000   NA
 5776964 5776965 Smlt1695 Smlt1696   fkbP TRUE 0.924 -13.000 0.028 NA   NA
 5776966 5776967 Smlt1697 Smlt1699     FALSE 0.040 296.000 0.015 NA   NA
 5776967 5776968 Smlt1699 Smlt1700     FALSE 0.035 224.000 0.000 NA   NA
 5776968 5776969 Smlt1700 Smlt1701     FALSE 0.404 69.000 0.011 1.000   NA
 5776970 5776971 Smlt1703 Smlt1704 exoD   TRUE 0.967 -16.000 0.200 NA   NA
 5776972 5776973 Smlt1705 Smlt1706   pitA TRUE 0.966 14.000 0.030 NA Y NA
 5776974 5776975 Smlt1707 Smlt1708     FALSE 0.042 112.000 0.000 1.000 N NA
 5776975 5776976 Smlt1708 Smlt1709   parE FALSE 0.012 192.000 0.000 1.000 N NA
 5776976 5776977 Smlt1709 Smlt1710 parE   FALSE 0.262 68.000 0.000 NA   NA
 5776978 5776979 Smlt1711 Smlt1712 pyrG kdsA FALSE 0.466 90.000 0.138 1.000 N NA
 5776979 5776980 Smlt1712 Smlt1713 kdsA   TRUE 0.942 -3.000 0.004 NA   NA
 5776980 5776981 Smlt1713 Smlt1714     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5776981 5776982 Smlt1714 Smlt1715   eno FALSE 0.252 97.000 0.003 NA   NA
 5776982 5776983 Smlt1715 Smlt1716 eno   TRUE 0.954 5.000 0.241 1.000 N NA
 5776983 5776984 Smlt1716 Smlt1717   ispD TRUE 0.979 -3.000 0.185 1.000 N NA
 5776984 5776985 Smlt1717 Smlt1718 ispD ispF TRUE 0.970 35.000 0.419 1.000 Y NA
 5776985 5776986 Smlt1718 Smlt1719 ispF truD TRUE 0.987 -3.000 0.173 1.000   NA
 5776988 5776989 Smlt1721 Smlt1722 surE pcm TRUE 0.993 -3.000 0.353 1.000   NA
 5776989 5776990 Smlt1722 Smlt1723 pcm   TRUE 0.844 19.000 0.055 NA   NA
 5776990 5776991 Smlt1723 Smlt1724     TRUE 0.938 -21.000 0.074 NA   NA
 5776991 5776992 Smlt1724 Smlt1725     FALSE 0.042 210.000 0.000 NA   NA
 5776993 5776994 Smlt1726 Smlt1727     TRUE 0.820 14.000 0.014 NA   NA
 5776995 5776996 Smlt1728 Smlt1729 ftsJ ftsH FALSE 0.392 64.000 0.066 NA N NA
 5776996 5776997 Smlt1729 Smlt1730 ftsH   FALSE 0.188 103.000 0.000 NA   NA
 5776997 5776998 Smlt1730 Smlt1731     TRUE 0.810 5.000 0.000 NA   NA
 5776998 5776999 Smlt1731 Smlt1733     FALSE 0.032 234.000 0.000 NA   NA
 5776999 5777000 Smlt1733 Smlt1734   folP FALSE 0.006 247.000 0.000 1.000 N NA
 5777000 5777001 Smlt1734 Smlt1735 folP miaA TRUE 0.831 0.000 0.009 1.000 N NA
 5777001 5777002 Smlt1735 Smlt1736 miaA hfq TRUE 0.813 97.000 0.531 1.000   NA
 5777002 5777003 Smlt1736 Smlt1737 hfq hflX TRUE 0.922 15.000 0.141 1.000   NA
 5777003 5777004 Smlt1737 Smlt1738 hflX   FALSE 0.198 115.000 0.002 NA   NA
 5777004 5777005 Smlt1738 Smlt1739     TRUE 0.540 35.000 0.011 NA   NA
 5777005 5777006 Smlt1739 Smlt1740   lexA TRUE 0.526 172.000 0.500 1.000   NA
 5777006 5777007 Smlt1740 Smlt1741 lexA   FALSE 0.065 205.000 0.005 0.058 N NA
 5777007 5777008 Smlt1741 Smlt1742   recX TRUE 0.656 111.000 0.296 1.000   NA
 5777008 5777009 Smlt1742 Smlt1743 recX alaS FALSE 0.461 110.000 0.085 1.000   NA
 5777009 5777010 Smlt1743 Smlt1744 alaS   FALSE 0.102 148.000 0.020 1.000 N NA
 5777010 10768853 Smlt1744 Smlt_t31     FALSE 0.246 80.000 0.000 NA   NA
 5777011 5777012 Smlt1745 Smlt1746     FALSE 0.409 35.000 0.000 NA   NA
 5777014 5777015 Smlt1748 Smlt1749 aceE   FALSE 0.040 214.000 0.000 NA   NA
 5777016 5777017 Smlt1750 Smlt1751     TRUE 0.987 -3.000 0.333 NA N NA
 5777017 5777018 Smlt1751 Smlt1753     FALSE 0.479 138.000 0.000 NA Y NA
 5777018 5777019 Smlt1753 Smlt1754     TRUE 0.957 11.000 0.000 1.000 Y NA
 5777020 5777021 Smlt1755 Smlt1756 plcN1   TRUE 0.986 -3.000 0.300 1.000 N NA
 5777021 5777022 Smlt1756 Smlt1757     FALSE 0.037 121.000 0.000 1.000 N NA
 5777022 5777023 Smlt1757 Smlt1758   adhB TRUE 0.992 -3.000 0.139 0.007   NA
 5777026 5777027 Smlt1761 Smlt1762     FALSE 0.124 133.000 0.000 NA   NA
 10768854 10768855 Smlt_t32 Smlt_t35     FALSE 0.070 168.000 0.000 NA   NA
 10768855 5777030 Smlt_t35 Smlt1766     TRUE 0.847 -10.000 0.000 NA   NA
 5777030 5777031 Smlt1766 Smlt1767   thiD TRUE 0.984 -3.000 0.148 NA   NA
 5777031 5777032 Smlt1767 Smlt1768 thiD   TRUE 0.551 65.000 0.065 NA   NA
 5777032 5777033 Smlt1768 Smlt1769     TRUE 0.895 13.000 0.065 NA   NA
 5777033 5777034 Smlt1769 Smlt1770     TRUE 0.968 -3.000 0.027 NA   NA
 5777034 5777035 Smlt1770 Smlt1771     FALSE 0.345 85.000 0.050 1.000 N NA
 5777035 5777036 Smlt1771 Smlt1772     FALSE 0.409 93.000 0.102 1.000 N NA
 5777037 5777038 Smlt1773 Smlt1774 dapA   TRUE 0.655 33.000 0.028 NA   NA
 5777041 5777042 Smlt1777 Smlt1778 pcnB   TRUE 0.958 4.000 0.234 1.000 N NA
 5777042 5777043 Smlt1778 Smlt1779   panB TRUE 0.931 35.000 0.117 1.000 Y NA
 5777043 5777044 Smlt1779 Smlt1780 panB panC TRUE 0.999 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 5777044 5777045 Smlt1780 Smlt1781 panC   FALSE 0.504 28.000 0.000 NA   NA
 5777045 5777046 Smlt1781 Smlt1782   panD FALSE 0.224 88.000 0.000 NA   NA
 5777046 5777047 Smlt1782 Smlt1783 panD pgi TRUE 0.899 -3.000 0.011 1.000 N NA
 5777048 5777049 Smlt1784 Smlt1785     TRUE 0.997 -3.000 0.197 1.000 Y NA
 5777050 5777051 Smlt1786 Smlt1787     TRUE 0.975 -19.000 0.006 1.000 Y NA
 5777051 5777052 Smlt1787 Smlt1788     FALSE 0.011 201.000 0.000 1.000 N NA
 5777053 5777054 Smlt1789 Smlt1790 kgdA edd FALSE 0.304 207.000 0.008 1.000 Y NA
 5777054 5777055 Smlt1790 Smlt1791 edd pgl TRUE 0.912 59.000 0.202 1.000 Y NA
 5777055 5777056 Smlt1791 Smlt1792 pgl glk TRUE 0.993 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 5777056 5777057 Smlt1792 Smlt1793 glk zwf TRUE 0.995 -3.000 0.055 1.000 Y NA
 5777060 5777061 Smlt1796 Smlt1797 sdhC sdhD TRUE 0.999 -3.000 0.291 0.001 Y NA
 5777061 5777062 Smlt1797 Smlt1798 sdhD sdhA TRUE 0.991 32.000 0.705 0.001 Y NA
 5777062 5777063 Smlt1798 Smlt1799 sdhA sdhB TRUE 0.977 67.000 0.604 0.001 Y NA
 5777063 5777064 Smlt1799 Smlt1800 sdhB   TRUE 0.565 99.000 0.151 NA   NA
 5777064 5777065 Smlt1800 Smlt1801     TRUE 0.518 41.000 0.016 NA   NA
 5777065 5777066 Smlt1801 Smlt1802     TRUE 0.728 24.000 0.020 NA   NA
 5777066 5777067 Smlt1802 Smlt1803     TRUE 0.992 -7.000 0.620 0.051 N NA
 5777067 5777068 Smlt1803 Smlt1804     FALSE 0.036 222.000 0.000 NA   NA
 5777069 5777070 Smlt1805 Smlt1806   mutY TRUE 0.923 6.000 0.150 NA N NA
 5777070 5777071 Smlt1806 Smlt1807 mutY ftsY FALSE 0.122 85.000 0.004 1.000 N NA
 5777074 5777075 Smlt1810 Smlt1811   coaD TRUE 0.889 27.000 0.367 1.000 N NA
 5777075 5777076 Smlt1811 Smlt1812 coaD   FALSE 0.366 61.000 0.007 NA   NA
 5777076 5777077 Smlt1812 Smlt1813   fdx FALSE 0.238 133.000 0.020 NA   NA
 5777077 5777078 Smlt1813 Smlt1814 fdx ggt TRUE 0.978 -3.000 0.076 NA   NA
 5777078 5777079 Smlt1814 Smlt1815 ggt   FALSE 0.271 121.000 0.015 1.000   NA
 5777081 5777082 Smlt1817 Smlt1818     TRUE 0.973 -19.000 0.273 NA   NA
 5777084 5777085 Smlt1820 Smlt1821     TRUE 0.981 -3.000 0.220 NA N NA
 5777085 5777086 Smlt1821 Smlt1822     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777086 5777087 Smlt1822 Smlt1823     TRUE 0.728 14.000 0.000 1.000   NA
 5777089 5777090 Smlt1825 Smlt1826     FALSE 0.055 140.000 0.004 1.000 N NA
 5777092 5777093 Smlt1828 Smlt1829     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777093 5777094 Smlt1829 Smlt1830   smeV TRUE 0.549 140.000 0.009 1.000 Y NA
 5777094 5777095 Smlt1830 Smlt1831 smeV smeW TRUE 0.763 113.000 0.750 1.000 N NA
 5777095 5777096 Smlt1831 Smlt1832 smeW   TRUE 0.793 26.000 0.160 1.000 N NA
 5777096 5777097 Smlt1832 Smlt1833   smeX TRUE 0.977 -3.000 0.160 1.000 N NA
 5777100 5777101 Smlt1836 Smlt1837     FALSE 0.160 115.000 0.000 NA   NA
 5777101 5777102 Smlt1837 Smlt1838     FALSE 0.220 90.000 0.000 NA   NA
 5777102 5777103 Smlt1838 Smlt1839     FALSE 0.423 34.000 0.000 NA   NA
 5777103 5777104 Smlt1839 Smlt1840     TRUE 0.964 6.000 0.208 NA   NA
 5777104 5777105 Smlt1840 Smlt1841     FALSE 0.233 85.000 0.000 NA   NA
 5777108 5777109 Smlt1844 Smlt1844A     TRUE 0.976 -3.000 0.000 0.001   NA
 5777109 5777110 Smlt1844A Smlt1844B     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777110 5777111 Smlt1844B Smlt1845     FALSE 0.341 42.000 0.000 NA   NA
 5777111 5777112 Smlt1845 Smlt1846     TRUE 0.977 18.000 0.071 0.058 Y NA
 5777112 5777113 Smlt1846 Smlt1846A     FALSE 0.179 106.000 0.000 NA   NA
 5777113 5777114 Smlt1846A Smlt1846B     TRUE 0.867 -7.000 0.000 NA   NA
 5777115 5777116 Smlt1849 Smlt1849A     FALSE 0.094 151.000 0.000 NA   NA
 5777116 5777117 Smlt1849A Smlt1850     FALSE 0.020 314.000 0.000 NA   NA
 5777117 5777118 Smlt1850 Smlt1851     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777118 5777119 Smlt1851 Smlt1852     FALSE 0.037 221.000 0.000 NA   NA
 5777119 5777120 Smlt1852 Smlt1853     TRUE 0.757 64.000 0.286 NA   NA
 5777120 5777121 Smlt1853 Smlt1854     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777121 5777122 Smlt1854 Smlt1855     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777122 5777123 Smlt1855 Smlt1856     TRUE 0.993 -3.000 0.400 NA   NA
 5777123 5777124 Smlt1856 Smlt1857     TRUE 0.883 20.000 0.130 NA   NA
 5777124 5777125 Smlt1857 Smlt1858     TRUE 0.954 3.000 0.087 NA   NA
 5777125 5777126 Smlt1858 Smlt1859     FALSE 0.236 84.000 0.000 NA   NA
 5777126 5777127 Smlt1859 Smlt1860     TRUE 0.798 6.000 0.000 NA   NA
 5777127 5777128 Smlt1860 Smlt1861     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777128 5777129 Smlt1861 Smlt1862     FALSE 0.055 190.000 0.000 NA   NA
 5777129 5777130 Smlt1862 Smlt1863     TRUE 0.991 -3.000 0.286 NA   NA
 5777130 5777131 Smlt1863 Smlt1864     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5777131 5777132 Smlt1864 Smlt1865     TRUE 0.987 8.000 0.667 NA   NA
 5777132 5777133 Smlt1865 Smlt1866     FALSE 0.033 229.000 0.000 NA   NA
 5777133 5777134 Smlt1866 Smlt1867     TRUE 0.976 3.000 0.250 NA   NA
 5777134 5777135 Smlt1867 Smlt1868     TRUE 0.991 2.000 0.625 NA   NA
 5777135 5777136 Smlt1868 Smlt1869   B TRUE 0.989 11.000 0.857 1.000   NA
 5777136 5777137 Smlt1869 Smlt1870 B   TRUE 0.987 2.000 0.444 NA   NA
 5777137 5777138 Smlt1870 Smlt1871     TRUE 0.986 0.000 0.333 NA   NA
 5777138 5777139 Smlt1871 Smlt1872     TRUE 0.992 0.000 0.571 NA   NA
 5777139 5777140 Smlt1872 Smlt1873     TRUE 0.729 12.000 0.000 NA   NA
 5777140 5777141 Smlt1873 Smlt1874     TRUE 0.878 71.000 0.667 NA   NA
 5777142 5777143 Smlt1875 Smlt1876     TRUE 0.611 107.000 0.231 NA   NA
 5777143 5777144 Smlt1876 Smlt1877     FALSE 0.206 96.000 0.000 NA   NA
 5777144 5777145 Smlt1877 Smlt1878     FALSE 0.012 485.000 0.000 NA   NA
 5777145 5777146 Smlt1878 Smlt1879     TRUE 0.995 -3.000 0.521 NA   NA
 5777146 5777147 Smlt1879 Smlt1880     FALSE 0.154 119.000 0.000 NA   NA
 5777148 5777149 Smlt1881 Smlt1882     TRUE 0.999 -3.000 0.429 0.001 Y NA
 5777149 5777150 Smlt1882 Smlt1883     FALSE 0.020 311.000 0.000 NA   NA
 5777150 5777151 Smlt1883 Smlt1884     TRUE 0.988 -22.000 0.667 NA   NA
 5777151 5777152 Smlt1884 Smlt1885     TRUE 0.899 2.000 0.007 NA   NA
 5777152 5777153 Smlt1885 Smlt1886     FALSE 0.200 132.000 0.011 NA   NA
 5777153 5777154 Smlt1886 Smlt1887     TRUE 0.985 -3.000 0.156 NA   NA
 5777154 5777155 Smlt1887 Smlt1888     TRUE 0.996 -3.000 0.600 NA   NA
 5777155 5777156 Smlt1888 Smlt1889     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 5777156 5777157 Smlt1889 Smlt1890     TRUE 0.715 71.000 0.222 NA   NA
 5777157 5777158 Smlt1890 Smlt1891     TRUE 0.985 6.000 0.556 NA   NA
 5777158 5777159 Smlt1891 Smlt1892     TRUE 0.994 -3.000 0.444 NA   NA
 5777159 5777160 Smlt1892 Smlt1893     TRUE 0.978 6.000 0.375 NA   NA
 5777160 5777161 Smlt1893 Smlt1894     TRUE 0.989 6.000 0.750 NA   NA
 5777161 5777162 Smlt1894 Smlt1895     FALSE 0.208 95.000 0.000 NA   NA
 5777162 5777163 Smlt1895 Smlt1896     TRUE 0.702 14.000 0.000 NA   NA
 5777163 5777164 Smlt1896 Smlt1897     FALSE 0.200 98.000 0.000 NA   NA
 5777164 5777165 Smlt1897 Smlt1898     TRUE 0.987 1.000 0.400 NA   NA
 5777166 5777167 Smlt1900 Smlt1901     TRUE 0.986 -3.000 0.167 NA   NA
 5777167 5777168 Smlt1901 Smlt1902     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777168 5777169 Smlt1902 Smlt1903     TRUE 0.976 12.000 0.500 NA   NA
 5777169 5777170 Smlt1903 Smlt1905     FALSE 0.009 772.000 0.000 NA   NA
 5777170 5777171 Smlt1905 Smlt1906     TRUE 0.847 -10.000 0.000 NA   NA
 5777172 5777173 Smlt1907 Smlt1908     TRUE 0.779 -57.000 0.000 NA   NA
 5777174 5777175 Smlt1911 Smlt1912     FALSE 0.266 64.000 0.000 NA   NA
 5777176 5777177 Smlt1913 Smlt1914     TRUE 0.829 -13.000 0.000 NA   NA
 5777177 5777178 Smlt1914 Smlt1915     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5777178 5777179 Smlt1915 Smlt1916     TRUE 0.563 23.000 0.000 NA   NA
 5777179 5777180 Smlt1916 Smlt1917     TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5777180 5777181 Smlt1917 Smlt1918   rdgC FALSE 0.027 259.000 0.000 NA   NA
 5777181 5777182 Smlt1918 Smlt1920 rdgC   FALSE 0.086 155.000 0.000 NA   NA
 5777182 5777183 Smlt1920 Smlt1921     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777183 5777184 Smlt1921 Smlt1922     FALSE 0.148 121.000 0.000 NA   NA
 5777184 5777185 Smlt1922 Smlt1923     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777185 5777186 Smlt1923 Smlt1924     FALSE 0.274 61.000 0.000 NA   NA
 5777186 5777187 Smlt1924 Smlt1925     TRUE 0.853 2.000 0.000 NA   NA
 5777189 5777190 Smlt1927 Smlt1929     FALSE 0.011 504.000 0.000 NA   NA
 5777191 5777192 Smlt1930 Smlt1931     TRUE 0.789 -31.000 0.000 NA   NA
 5777192 5777193 Smlt1931 Smlt1932     TRUE 0.643 18.000 0.000 NA   NA
 5777193 5777194 Smlt1932 Smlt1933     TRUE 0.867 -7.000 0.000 NA   NA
 5777194 5777195 Smlt1933 Smlt1934     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777195 5777196 Smlt1934 Smlt1935     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777196 5777197 Smlt1935 Smlt1936     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777197 5777198 Smlt1936 Smlt1937     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777198 5777199 Smlt1937 Smlt1938     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777201 5777202 Smlt1940 Smlt1941     FALSE 0.310 49.000 0.000 NA   NA
 5777202 10768857 Smlt1941 Smlt_t37     FALSE 0.063 175.000 0.000 NA   NA
 10768857 5777203 Smlt_t37 Smlt1944     FALSE 0.015 379.000 0.000 NA   NA
 5777203 10768858 Smlt1944 Smlt1945     TRUE 0.591 21.000 0.000 NA   NA
 10768858 5777204 Smlt1945 Smlt1946     FALSE 0.024 279.000 0.000 NA   NA
 5777204 5777205 Smlt1946 Smlt1947     TRUE 0.810 5.000 0.000 NA   NA
 5777205 5777206 Smlt1947 Smlt1948     FALSE 0.477 30.000 0.000 NA   NA
 5777206 5777207 Smlt1948 Smlt1949     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777207 5777208 Smlt1949 Smlt1950     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777208 5777209 Smlt1950 Smlt1951     TRUE 0.991 5.000 0.800 NA   NA
 5777209 5777210 Smlt1951 Smlt1952     FALSE 0.045 205.000 0.000 NA   NA
 5777210 5777211 Smlt1952 Smlt1953     FALSE 0.012 464.000 0.000 NA   NA
 5777211 5777212 Smlt1953 Smlt1954     TRUE 0.931 4.000 0.038 NA   NA
 5777212 5777213 Smlt1954 Smlt1955     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777213 5777214 Smlt1955 Smlt1956     TRUE 0.853 2.000 0.000 NA   NA
 5777214 5777215 Smlt1956 Smlt1957     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777215 5777216 Smlt1957 Smlt1958     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777216 5777217 Smlt1958 Smlt1959     TRUE 0.829 -13.000 0.000 NA   NA
 5777217 5777218 Smlt1959 Smlt1960     TRUE 0.798 6.000 0.000 NA   NA
 5777218 5777219 Smlt1960 Smlt1961     FALSE 0.251 78.000 0.000 NA   NA
 5777219 5777220 Smlt1961 Smlt1962     FALSE 0.260 72.000 0.000 NA   NA
 5777220 5777221 Smlt1962 Smlt1963     FALSE 0.293 55.000 0.000 NA   NA
 5777221 5777222 Smlt1963 Smlt1964     TRUE 0.853 2.000 0.000 NA   NA
 5777222 5777223 Smlt1964 Smlt1965     TRUE 0.853 2.000 0.000 NA   NA
 5777223 5777224 Smlt1965 Smlt1967     FALSE 0.044 206.000 0.000 NA   NA
 5777224 5777225 Smlt1967 Smlt1968     TRUE 0.877 0.000 0.000 NA   NA
 5777225 5777226 Smlt1968 Smlt1969     TRUE 0.772 9.000 0.000 NA   NA
 5777226 5777227 Smlt1969 Smlt1970     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5777227 5777228 Smlt1970 Smlt1971     TRUE 0.853 2.000 0.000 NA   NA
 5777228 5777229 Smlt1971 Smlt1972     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 5777229 5777230 Smlt1972 Smlt1973     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5777230 5777231 Smlt1973 Smlt1974     TRUE 0.702 14.000 0.000 NA   NA
 5777231 5777232 Smlt1974 Smlt1975     FALSE 0.490 29.000 0.000 NA   NA
 5777232 5777233 Smlt1975 Smlt1976     TRUE 0.827 4.000 0.000 NA   NA
 5777233 5777234 Smlt1976 Smlt1977     FALSE 0.197 99.000 0.000 NA   NA
 5777234 5777235 Smlt1977 Smlt1978     FALSE 0.239 83.000 0.000 NA   NA
 5777235 5777236 Smlt1978 Smlt1979     FALSE 0.465 31.000 0.000 NA   NA
 5777236 5777237 Smlt1979 Smlt1980     FALSE 0.185 104.000 0.000 NA   NA
 5777237 5777238 Smlt1980 Smlt1982     FALSE 0.014 413.000 0.000 NA   NA
 5777240 5777241 Smlt1983A Smlt1984     TRUE 0.941 4.000 0.063 NA   NA
 5777247 5777248 Smlt1990 Smlt1991     FALSE 0.306 64.000 0.025 1.000 N NA
 5777248 5777249 Smlt1991 Smlt1992   dnaK TRUE 0.605 183.000 0.049 0.006 Y NA
 5777249 5777250 Smlt1992 Smlt1993 dnaK dnaJ TRUE 0.824 155.000 0.236 0.003 Y NA
 5777252 5777253 Smlt1995 Smlt1997   pdxK FALSE 0.001 575.000 0.000 NA N NA
 5777253 5777254 Smlt1997 Smlt1998 pdxK   TRUE 0.875 -3.000 0.007 1.000 N NA
 5777255 5777256 Smlt2000 Smlt2001     FALSE 0.260 71.000 0.000 NA   NA
 5777256 5777257 Smlt2001 Smlt2002     TRUE 0.927 -7.000 0.012 1.000   NA
 5777257 5777258 Smlt2002 Smlt2003     FALSE 0.427 41.000 0.005 NA   NA
 5777258 5777259 Smlt2003 Smlt2004     TRUE 0.961 -3.000 0.017 NA   NA
 5777261 5777262 Smlt2006 Smlt2007     FALSE 0.058 184.000 0.000 NA   NA
 5777263 5777264 Smlt2008 Smlt2009 queA tgt TRUE 0.830 178.000 0.360 0.001 Y NA
 5777264 5777265 Smlt2009 Smlt2010 tgt   FALSE 0.457 134.000 0.325 NA N NA
 5777265 5777266 Smlt2010 Smlt2011   secD TRUE 0.907 38.000 0.083 NA Y NA
 5777266 5777267 Smlt2011 Smlt2012 secD secF TRUE 0.984 17.000 0.084 0.001 Y NA
 5777267 5777268 Smlt2012 Smlt2015 secF   FALSE 0.010 694.000 0.000 NA   NA
 5777269 5777270 Smlt2016 Smlt2017     FALSE 0.291 92.000 0.007 NA   NA
 5777270 5777271 Smlt2017 Smlt2018     TRUE 0.955 -3.000 0.011 NA   NA
 5777274 5777275 Smlt2022 Smlt2023 cspG   FALSE 0.122 157.000 0.046 NA N NA
 5777275 5777276 Smlt2023 Smlt2024     TRUE 0.642 33.000 0.023 NA   NA
 5777276 5777277 Smlt2024 Smlt2026   apt FALSE 0.013 694.000 0.004 NA   NA
 5777278 5777279 Smlt2027 Smlt2028 dbpA   FALSE 0.091 153.000 0.000 NA   NA
 5777280 5777281 Smlt2029 Smlt2030   uup FALSE 0.107 150.000 0.000 1.000   NA
 5777282 5777283 Smlt2031 Smlt2032     TRUE 0.977 10.000 0.000 0.006 Y NA
 5777284 5777285 Smlt2033 Smlt2034 smmG smmH TRUE 0.995 -3.000 0.778 NA N NA
 5777285 5777286 Smlt2034 Smlt2035 smmH smmI TRUE 0.998 -3.000 0.481 NA Y NA
 5777287 5777288 Smlt2036 Smlt2037     TRUE 0.939 -7.000 0.024 NA   NA
 5777288 5777289 Smlt2037 Smlt2038     TRUE 0.828 15.000 0.016 1.000   NA
 5777289 5777290 Smlt2038 Smlt2039     FALSE 0.486 162.000 0.364 NA   NA
 5777290 5777291 Smlt2039 Smlt2040     TRUE 0.724 40.000 0.123 NA   NA
 5777291 5777292 Smlt2040 Smlt2041   rpmJ2 FALSE 0.173 147.000 0.014 NA   NA
 5777293 5777294 Smlt2042 Smlt2043 cmk rpsA FALSE 0.219 199.000 0.281 1.000 N NA
 5777294 5777295 Smlt2043 Smlt2044 rpsA ihfB TRUE 0.621 89.000 0.292 1.000 N NA
 5777295 5777296 Smlt2044 Smlt2045 ihfB   TRUE 0.696 76.000 0.208 NA   NA
 5777296 5777297 Smlt2045 Smlt2046     TRUE 0.985 7.000 0.576 NA   NA
 5777297 5777298 Smlt2046 Smlt2047   wbpL TRUE 0.879 4.000 0.038 1.000 N NA
 5777298 5777299 Smlt2047 Smlt2048 wbpL wbiI TRUE 0.986 4.000 0.048 1.000 Y NA
 5777299 5777300 Smlt2048 Smlt2049 wbiI galU TRUE 0.998 -3.000 0.350 1.000 Y NA
 5777301 5777302 Smlt2051 Smlt2052     TRUE 0.940 100.000 0.588 1.000 Y NA
 5777302 5777303 Smlt2052 Smlt2053     TRUE 0.567 40.000 0.019 1.000   NA
 5777304 5777305 Smlt2054 Smlt2055 ndk   TRUE 0.944 11.000 0.156 1.000   NA
 5777305 5777306 Smlt2055 Smlt2056     TRUE 0.953 -13.000 0.086 1.000   NA
 5777306 5777307 Smlt2056 Smlt2057     TRUE 0.922 19.000 0.204 1.000   NA
 5777307 5777308 Smlt2057 Smlt2058     FALSE 0.433 66.000 0.015 1.000   NA
 5777308 5777309 Smlt2058 Smlt2059     TRUE 0.995 -3.000 0.492 1.000   NA
 5777309 5777310 Smlt2059 Smlt2060     TRUE 0.927 18.000 0.203 1.000   NA
 5777311 5777312 Smlt2061 Smlt2062     FALSE 0.208 95.000 0.000 NA   NA
 5777312 5777313 Smlt2062 Smlt2063     TRUE 0.523 75.000 0.143 1.000 N NA
 5777314 5777315 Smlt2064 Smlt2065     TRUE 0.527 26.000 0.000 NA   NA
 5777315 5777316 Smlt2065 Smlt2066     FALSE 0.028 250.000 0.000 NA   NA
 5777318 5777319 Smlt2069 Smlt2071 folD guaB FALSE 0.018 478.000 0.004 1.000   NA
 5777319 5777320 Smlt2071 Smlt2072 guaB guaA TRUE 0.745 104.000 0.190 0.001   NA
 5777320 5777321 Smlt2072 Smlt2074 guaA   FALSE 0.014 386.000 0.000 NA   NA
 5777321 5777322 Smlt2074 Smlt2075     TRUE 0.714 13.000 0.000 NA   NA
 5777322 5777323 Smlt2075 Smlt2076     FALSE 0.078 162.000 0.000 NA   NA
 5777323 10768859 Smlt2076 Smlt2077     FALSE 0.017 347.000 0.000 NA   NA
 10768859 5777324 Smlt2077 Smlt2077A     FALSE 0.086 155.000 0.000 NA   NA
 5777325 5777326 Smlt2079 Smlt2080     FALSE 0.014 396.000 0.000 NA   NA
 5777327 5777328 Smlt2081 Smlt2082     TRUE 0.643 18.000 0.000 NA   NA
 5777328 5777329 Smlt2082 Smlt2083     FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5777329 5777330 Smlt2083 Smlt2084     FALSE 0.236 84.000 0.000 NA   NA
 5777331 5777332 Smlt2085 Smlt2086     FALSE 0.200 98.000 0.000 NA   NA
 5777333 5777334 Smlt2087 Smlt2088     FALSE 0.310 49.000 0.000 NA   NA
 5777335 5777336 Smlt2089 Smlt2090     TRUE 0.993 -3.000 0.355 NA   NA
 5777336 5777337 Smlt2090 Smlt2091     TRUE 0.747 11.000 0.000 NA   NA
 5777338 5777339 Smlt2092 Smlt2093     FALSE 0.208 95.000 0.000 NA   NA
 5777339 5777340 Smlt2093 Smlt2094     FALSE 0.227 87.000 0.000 NA   NA
 5777340 5777341 Smlt2094 Smlt2095     TRUE 0.614 93.000 0.176 NA   NA
 5777342 5777343 Smlt2096 Smlt2097 cheW   FALSE 0.194 108.000 0.000 1.000   NA
 5777343 5777344 Smlt2097 Smlt2098     FALSE 0.228 96.000 0.000 1.000   NA
 5777345 5777346 Smlt2099 Smlt2100   ssuE FALSE 0.326 53.000 0.000 1.000   NA
 5777346 5777347 Smlt2100 Smlt2101 ssuE   FALSE 0.127 131.000 0.000 NA   NA
 5777347 5777348 Smlt2101 Smlt2102     TRUE 0.687 15.000 0.000 NA   NA
 5777348 5777349 Smlt2102 Smlt2103     TRUE 0.927 18.000 0.000 NA Y NA
 5777349 5777350 Smlt2103 Smlt2104     TRUE 0.810 5.000 0.000 NA   NA
 5777350 5777351 Smlt2104 Smlt2105     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5777351 5777352 Smlt2105 Smlt2106     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000   NA
 5777352 5777353 Smlt2106 Smlt2107     TRUE 0.961 16.000 0.000 0.037 Y NA
 5777355 5777356 Smlt2109 Smlt2110     TRUE 0.941 34.000 0.706 NA   NA
 5777359 5777360 Smlt2113 Smlt2114     FALSE 0.013 148.000 0.000 NA N NA
 5777362 5777363 Smlt2116 Smlt2117     TRUE 0.700 29.000 0.000 0.053   NA
 5777363 5777364 Smlt2117 Smlt2118     TRUE 0.714 15.000 0.000 1.000   NA
 5777365 5777366 Smlt2119 Smlt2120     FALSE 0.349 41.000 0.000 NA   NA
 5777368 5777369 Smlt2123 Smlt2124     TRUE 0.996 -3.000 0.714 NA   NA
 5777369 5777370 Smlt2124 Smlt2125   spcN FALSE 0.195 100.000 0.000 NA   NA
 5777371 5777372 Smlt2126 Smlt2127   murB TRUE 0.920 -6.000 0.008 NA   NA
 5777372 5777373 Smlt2127 Smlt2128 murB pyrD TRUE 0.698 9.000 0.009 1.000 N NA
 5777373 5777374 Smlt2128 Smlt2129 pyrD   TRUE 0.847 9.000 0.006 1.000   NA
 5777374 5777375 Smlt2129 Smlt2130     TRUE 0.955 5.000 0.138 NA   NA
 5777375 5777376 Smlt2130 Smlt2131     FALSE 0.255 76.000 0.000 NA   NA
 5777376 5777377 Smlt2131 Smlt2132     TRUE 0.886 0.000 0.000 0.053 N NA
 10768860 5777378 Smlt_t38 Smlt2133     FALSE 0.274 61.000 0.000 NA   NA
 5777378 5777379 Smlt2133 Smlt2134     FALSE 0.064 174.000 0.000 NA   NA
 5777384 5777385 Smlt2139 Smlt2140     TRUE 0.996 -10.000 0.200 0.030 Y NA
 5777386 5777387 Smlt2141 Smlt2142     TRUE 0.996 -3.000 0.156 1.000 Y NA
 5777387 5777388 Smlt2142 Smlt2143     TRUE 0.990 0.000 0.416 1.000   NA
 5777388 5777389 Smlt2143 Smlt2144     TRUE 0.977 -3.000 0.059 1.000   NA
 5777390 5777391 Smlt2144A Smlt2148     TRUE 0.540 25.000 0.000 NA   NA
 5777392 5777393 Smlt2149 Smlt2150     TRUE 0.978 -3.000 0.077 NA   NA
 5777393 5777394 Smlt2150 Smlt2151     FALSE 0.260 70.000 0.000 NA   NA
 5777396 5777397 Smlt2153 Smlt2154     FALSE 0.154 119.000 0.000 NA   NA
 5777397 5777398 Smlt2154 Smlt2156   thrA FALSE 0.016 358.000 0.000 NA   NA
 5777398 5777399 Smlt2156 Smlt2157 thrA thrB TRUE 0.992 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 5777399 5777400 Smlt2157 Smlt2158 thrB thrC TRUE 0.964 30.000 0.233 1.000 Y NA
 5777402 5777403 Smlt2160 Smlt2161     FALSE 0.024 295.000 0.000 1.000   NA
 5777403 5777404 Smlt2161 Smlt2162   hisG TRUE 0.585 35.000 0.013 1.000   NA
 5777404 5777405 Smlt2162 Smlt2163 hisG hisD TRUE 0.998 -3.000 0.171 0.002 Y NA
 5777405 5777406 Smlt2163 Smlt2164 hisD hisC TRUE 0.999 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 5777406 5777407 Smlt2164 Smlt2165 hisC hisB TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.001 Y NA
 5777407 5777408 Smlt2165 Smlt2166 hisB hisH TRUE 0.998 -3.000 0.128 0.002 Y NA
 5777408 5777409 Smlt2166 Smlt2167 hisH hisA TRUE 0.998 -3.000 0.210 0.002 Y NA
 5777409 5777410 Smlt2167 Smlt2168 hisA hisF TRUE 0.998 -6.000 0.433 0.002 Y NA
 5777410 5777411 Smlt2168 Smlt2169 hisF hisI TRUE 0.998 -10.000 0.430 0.002 Y NA
 5777411 5777412 Smlt2169 Smlt2170 hisI   FALSE 0.251 104.000 0.003 1.000   NA
 5777412 5777413 Smlt2170 Smlt2171     FALSE 0.396 36.000 0.000 NA   NA
 5777413 5777414 Smlt2171 Smlt2172     FALSE 0.233 85.000 0.000 NA   NA
 5777414 5777415 Smlt2172 Smlt2173     FALSE 0.086 52.000 0.000 1.000 N NA
 5777415 5777416 Smlt2173 Smlt2174     TRUE 0.949 -3.000 0.038 1.000 N NA
 5777416 5777417 Smlt2174 Smlt2175     FALSE 0.095 402.000 0.000 1.000 Y NA
 5777417 5777418 Smlt2175 Smlt2176   actP FALSE 0.340 174.000 0.000 1.000 Y NA
 5777418 5777419 Smlt2176 Smlt2177 actP   TRUE 0.967 12.000 0.304 0.004 N NA
 5777420 5777421 Smlt2178 Smlt2179     FALSE 0.263 204.000 0.000 1.000 Y NA
 5777422 5777423 Smlt2180 Smlt2181     FALSE 0.026 142.000 0.000 1.000 N NA
 5777423 5777424 Smlt2181 Smlt2182     TRUE 0.507 61.000 0.115 1.000 N NA
 5777424 5777425 Smlt2182 Smlt2183   scrK TRUE 0.992 8.000 0.308 1.000 Y NA
 5777425 5777426 Smlt2183 Smlt2184 scrK   TRUE 0.994 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 5777426 5777427 Smlt2184 Smlt2185   bmnA TRUE 0.921 20.000 0.000 1.000 Y NA
 5777428 5777429 Smlt2187 Smlt2188 masA   TRUE 0.974 4.000 0.231 1.000   NA
 5777429 5777430 Smlt2188 Smlt2189     TRUE 0.601 93.000 0.148 1.000   NA
 5777431 5777432 Smlt2190 Smlt2191     FALSE 0.249 79.000 0.000 NA   NA
 5777433 5777434 Smlt2192 Smlt2193     TRUE 0.981 83.000 0.833 0.002 Y NA
 5777437 5777438 Smlt2196 Smlt2197     TRUE 0.621 63.000 0.111 NA   NA
 5777438 5777439 Smlt2197 Smlt2198     TRUE 0.826 41.000 0.294 NA   NA
 5777440 5777441 Smlt2199 Smlt2200     TRUE 0.982 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5777442 5777443 Smlt2201 Smlt2202 smeY smeZ FALSE 0.122 37.000 0.000 1.000 N NA
 5777443 5777444 Smlt2202 Smlt2203 smeZ   TRUE 0.812 -19.000 0.000 NA   NA
 5777444 5777445 Smlt2203 Smlt2204     FALSE 0.236 84.000 0.000 NA   NA
 5777446 5777447 Smlt2205 Smlt2206     FALSE 0.500 50.000 0.085 1.000 N NA
 5777447 5777448 Smlt2206 Smlt2207   hmgcL TRUE 0.542 101.000 0.125 0.053 N NA
 5777448 5777449 Smlt2207 Smlt2208 hmgcL   TRUE 0.973 -3.000 0.042 NA   NA
 5777449 5777450 Smlt2208 Smlt2209     TRUE 0.929 3.000 0.027 NA   NA
 5777451 5777452 Smlt2210 Smlt2211 feoA feoB TRUE 0.997 -3.000 0.178 1.000 Y NA
 5777452 5777453 Smlt2211 Smlt2212 feoB   TRUE 0.938 0.000 0.019 NA   NA
 5777454 5777455 Smlt2213 Smlt2214     FALSE 0.154 119.000 0.000 NA   NA
 5777455 5777456 Smlt2214 Smlt2215     TRUE 0.731 56.000 0.193 1.000   NA
 5777456 5777457 Smlt2215 Smlt2216     FALSE 0.483 5.000 0.000 1.000 N NA
 5777458 5777459 Smlt2217 Smlt2218 dapB carA FALSE 0.271 256.000 0.034 1.000 Y NA
 5777459 5777460 Smlt2218 Smlt2219 carA carB TRUE 0.883 150.000 0.345 0.001 Y NA
 5777460 5777461 Smlt2219 Smlt2220 carB greA TRUE 0.983 -3.000 0.241 1.000 N NA
 5777461 5777462 Smlt2220 Smlt2221 greA   TRUE 0.880 5.000 0.011 NA   NA
 5777464 5777465 Smlt2223 Smlt2224 recJ   FALSE 0.116 145.000 0.000 1.000   NA
 5777467 5777468 Smlt2226 Smlt2227 lytT prfB FALSE 0.103 145.000 0.000 NA   NA
 5777468 10768861 Smlt2227