MicrobesOnline Operon Predictions for Anaerocellum thermophilum DSM 6725

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
5772526	5772527	Athe_0001	Athe_0002			TRUE	0.817	5.000	0.000	NA		NA
5772527	5772528	Athe_0002	Athe_0003			TRUE	0.667	42.000	0.000	NA		NA
5772528	5772529	Athe_0003	Athe_0004			TRUE	0.996	26.000	0.318	1.000	Y	NA
5772529	5772530	Athe_0004	Athe_0005			TRUE	0.924	32.000	0.024	NA		NA
5772530	5772531	Athe_0005	Athe_0006			TRUE	0.930	-3.000	0.017	NA		NA
5772531	5772532	Athe_0006	Athe_0007			TRUE	0.796	18.000	0.000	NA		NA
5772532	5772533	Athe_0007	Athe_0008			FALSE	0.020	239.000	0.000	NA		NA
5772533	5772534	Athe_0008	Athe_0009			FALSE	0.013	289.000	0.000	NA		NA
5772534	5772535	Athe_0009	Athe_0010			FALSE	0.254	86.000	0.000	NA		NA
5772535	5772536	Athe_0010	Athe_0011			FALSE	0.004	1053.000	0.000	NA		NA
5772536	5772537	Athe_0011	Athe_0012			FALSE	0.034	197.000	0.000	NA		NA
5772537	5772538	Athe_0012	Athe_0013			FALSE	0.180	111.000	0.000	NA		NA
5772538	5772539	Athe_0013	Athe_0014			TRUE	0.802	9.000	0.000	NA		NA
5772539	5772540	Athe_0014	Athe_0015			FALSE	0.146	123.000	0.000	NA		NA
5772540	5772541	Athe_0015	Athe_0016			FALSE	0.125	128.000	0.000	NA		NA
5772541	5772542	Athe_0016	Athe_0017			TRUE	0.821	4.000	0.000	NA		NA
5772544	5772545	Athe_0019	Athe_0020			TRUE	0.844	24.000	0.000	NA		NA
5772546	5772547	Athe_0021	Athe_0022			FALSE	0.188	109.000	0.000	NA		NA
5772548	5772549	Athe_0023	Athe_0024			FALSE	0.019	242.000	0.000	1.000		NA
5772549	5772550	Athe_0024	Athe_0025			FALSE	0.011	307.000	0.000	NA		NA
5772550	5772551	Athe_0025	Athe_0026			TRUE	0.869	-16.000	0.000	NA		NA
5772551	5772552	Athe_0026	Athe_0027			TRUE	0.667	42.000	0.000	NA		NA
5772553	5772554	Athe_0028	Athe_0029			TRUE	0.866	-10.000	0.000	NA		NA
5772554	5772555	Athe_0029	Athe_0030			FALSE	0.216	101.000	0.000	NA		NA
5772558	5772559	Athe_0033	Athe_0034			TRUE	0.877	18.000	0.007	NA		NA
5772559	5772560	Athe_0034	Athe_0035			FALSE	0.120	130.000	0.000	NA		NA
5772560	5772561	Athe_0035	Athe_0036			TRUE	0.985	26.000	0.286	0.081		NA
5772563	5772564	Athe_0038	Athe_0039			TRUE	0.968	2.000	0.100	NA		NA
5772564	5772565	Athe_0039	Athe_0040			TRUE	0.866	-10.000	0.000	NA		NA
5772565	5772566	Athe_0040	Athe_0041			TRUE	0.790	17.000	0.000	NA		NA
5772566	5772567	Athe_0041	Athe_0042			TRUE	0.981	8.000	0.308	NA		NA
5772567	5772568	Athe_0042	Athe_0043			TRUE	0.984	30.000	0.294	NA		NA
5772568	5772569	Athe_0043	Athe_0044			TRUE	0.986	-3.000	0.294	NA		NA
5772569	5772570	Athe_0044	Athe_0045			TRUE	0.991	-16.000	0.500	NA		NA
5772570	5772571	Athe_0045	Athe_0046			FALSE	0.269	106.000	0.000	NA	N	NA
5772571	5772572	Athe_0046	Athe_0047			FALSE	0.120	165.000	0.002	1.000	N	NA
5772572	5772573	Athe_0047	Athe_0048			TRUE	0.996	31.000	0.286	0.013	Y	NA
5772573	5772574	Athe_0048	Athe_R0001			FALSE	0.241	92.000	0.000	NA		NA
5772574	5772575	Athe_R0001	Athe_R0002			TRUE	0.833	23.000	0.000	NA		NA
5772577	5772578	Athe_0050	Athe_0051			TRUE	0.945	16.000	0.062	NA		NA
5772578	5772579	Athe_0051	Athe_0052			TRUE	0.990	33.000	0.074	1.000	Y	NA
5772579	5772580	Athe_0052	Athe_0053			TRUE	0.998	31.000	0.667	1.000	Y	NA
5772580	5772581	Athe_0053	Athe_0054			TRUE	0.916	45.000	0.000	1.000	Y	NA
5772581	5772582	Athe_0054	Athe_0055			TRUE	0.984	23.000	0.025	1.000	Y	NA
5772582	5772583	Athe_0055	Athe_0056			TRUE	0.960	16.000	0.000	1.000	Y	NA
5772583	5772584	Athe_0056	Athe_0057			TRUE	0.817	5.000	0.000	NA		NA
5772584	5772585	Athe_0057	Athe_0058			TRUE	0.840	0.000	0.000	NA		NA
5772585	5772586	Athe_0058	Athe_0059			TRUE	0.839	30.000	0.000	NA		NA
5772586	5772587	Athe_0059	Athe_0060			TRUE	0.853	-3.000	0.000	NA		NA
5772587	5772588	Athe_0060	Athe_0061			TRUE	0.836	1.000	0.000	NA		NA
5772588	5772589	Athe_0061	Athe_0062			TRUE	0.982	-12.000	0.182	NA		NA
5772589	5772590	Athe_0062	Athe_0063			FALSE	0.267	83.000	0.000	1.000		NA
5772591	5772592	Athe_0064	Athe_0065			TRUE	0.809	20.000	0.000	NA		NA
5772593	5772594	Athe_0066	Athe_0067			FALSE	0.171	114.000	0.000	NA		NA
5772594	5772595	Athe_0067	Athe_0068			TRUE	0.709	40.000	0.000	NA		NA
5772595	5772596	Athe_0068	Athe_0069			TRUE	0.390	62.000	0.000	NA		NA
5772596	5772597	Athe_0069	Athe_0070			TRUE	0.827	3.000	0.000	NA		NA
5772597	5772598	Athe_0070	Athe_0071			FALSE	0.227	97.000	0.000	NA		NA
5772598	5772599	Athe_0071	Athe_0072			FALSE	0.004	791.000	0.000	NA		NA
5772599	5772600	Athe_0072	Athe_0073			FALSE	0.160	118.000	0.000	NA		NA
5772600	5772601	Athe_0073	Athe_0074			FALSE	0.333	72.000	0.000	NA		NA
5772601	5772602	Athe_0074	Athe_0075			FALSE	0.258	85.000	0.000	NA		NA
5772602	5772603	Athe_0075	Athe_0076			TRUE	0.872	-34.000	0.000	NA		NA
5772603	5772604	Athe_0076	Athe_0077			FALSE	0.333	72.000	0.000	NA		NA
5772604	5772605	Athe_0077	Athe_0078			FALSE	0.058	168.000	0.000	NA		NA
5772607	5772608	Athe_0080	Athe_0081			TRUE	0.997	24.000	0.597	1.000	Y	NA
5772608	5772609	Athe_0081	Athe_0082			TRUE	0.509	74.000	0.016	NA		NA
5772609	5772610	Athe_0082	Athe_0083			TRUE	0.988	18.000	0.667	NA		NA
5772610	5772611	Athe_0083	Athe_0084			TRUE	0.982	25.000	0.222	NA		NA
5772611	5772612	Athe_0084	Athe_0085			FALSE	0.024	223.000	0.000	NA		NA
5772612	5772613	Athe_0085	Athe_0086			TRUE	0.993	48.000	0.875	0.045	Y	NA
5772613	5772614	Athe_0086	Athe_0087			TRUE	0.882	92.000	0.700	NA		NA
5772614	5772615	Athe_0087	Athe_0088			FALSE	0.005	563.000	0.000	NA		NA
5772615	5772616	Athe_0088	Athe_0089			FALSE	0.013	286.000	0.000	NA		NA
5772616	5772617	Athe_0089	Athe_0090			FALSE	0.008	391.000	0.000	1.000		NA
5772617	5772618	Athe_0090	Athe_0091			TRUE	0.609	46.000	0.000	NA		NA
5772619	5772620	Athe_0092	Athe_0093			FALSE	0.006	490.000	0.000	NA		NA
5772621	5772622	Athe_0094	Athe_0095			TRUE	0.474	54.000	0.000	NA		NA
5772622	5772623	Athe_0095	Athe_0096			FALSE	0.009	456.000	0.000	NA	N	NA
5772623	5772624	Athe_0096	Athe_0097			FALSE	0.123	149.000	0.000	1.000	N	NA
5772627	5772628	Athe_0100	Athe_0101			TRUE	0.825	32.000	0.000	NA		NA
5772628	5772629	Athe_0101	Athe_0102			TRUE	0.941	22.000	0.024	1.000	N	NA
5772629	5772630	Athe_0102	Athe_0103			TRUE	0.993	-3.000	0.100	0.023	Y	NA
5772630	5772631	Athe_0103	Athe_0104			TRUE	0.968	13.000	0.100	NA	N	NA
5772632	5772633	Athe_0105	Athe_0106			TRUE	0.948	104.000	0.545	0.004	Y	NA
5772633	5772634	Athe_0106	Athe_0107			TRUE	0.991	4.000	0.094	0.004	Y	NA
5772635	5772636	Athe_0108	Athe_0109			TRUE	0.844	24.000	0.000	NA		NA
5772636	5772637	Athe_0109	Athe_0110			TRUE	0.813	6.000	0.000	NA		NA
5772637	5772638	Athe_0110	Athe_0111			TRUE	0.937	49.000	0.286	NA		NA
5772638	5772639	Athe_0111	Athe_0112			FALSE	0.320	92.000	0.000	NA	N	NA
5772639	5772640	Athe_0112	Athe_0113			TRUE	0.997	-3.000	0.448	NA	Y	NA
5772640	5772641	Athe_0113	Athe_0114			TRUE	0.535	74.000	0.021	NA		NA
5772641	5772642	Athe_0114	Athe_0115			TRUE	0.959	56.000	1.000	NA		NA
5772642	5772643	Athe_0115	Athe_0116			TRUE	0.994	29.000	1.000	NA		NA
5772643	5772644	Athe_0116	Athe_0117			TRUE	0.979	-22.000	0.125	NA		NA
5772644	5772645	Athe_0117	Athe_0118			TRUE	0.981	-3.000	0.125	1.000	N	NA
5772646	5772647	Athe_0119	Athe_0120			FALSE	0.029	212.000	0.000	NA		NA
5772647	5772648	Athe_0120	Athe_0121			FALSE	0.028	215.000	0.000	NA		NA
5772648	5772649	Athe_0121	Athe_0122			TRUE	0.970	33.000	0.143	NA		NA
5772649	5772650	Athe_0122	Athe_0123			TRUE	0.982	-3.000	0.218	NA		NA
5772650	5772651	Athe_0123	Athe_0124			TRUE	0.986	3.000	0.423	NA		NA
5772651	5772652	Athe_0124	Athe_0125			TRUE	0.980	-13.000	0.150	NA		NA
5772652	5772653	Athe_0125	Athe_0126			TRUE	0.974	30.000	0.135	NA		NA
5772653	5772654	Athe_0126	Athe_0127			TRUE	0.995	6.000	0.286	NA	Y	NA
5772654	5772655	Athe_0127	Athe_0128			TRUE	0.602	189.000	0.207	NA	Y	NA
11540869	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	238.000	0.000	NA		NA
11683232	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	238.000	0.000	NA		NA
11825624	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	238.000	0.000	NA		NA
11540870	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	267.000	0.000	NA		NA
11683233	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	267.000	0.000	NA		NA
11825625	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	267.000	0.000	NA		NA
11540871	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	303.000	0.000	NA		NA
11683234	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	303.000	0.000	NA		NA
11825626	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	303.000	0.000	NA		NA
11540872	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	332.000	0.000	NA		NA
11683235	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	332.000	0.000	NA		NA
11825627	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	332.000	0.000	NA		NA
11540873	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	368.000	0.000	NA		NA
11683236	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	368.000	0.000	NA		NA
11825628	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	368.000	0.000	NA		NA
11540874	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	397.000	0.000	NA		NA
11683237	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	397.000	0.000	NA		NA
11825629	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	397.000	0.000	NA		NA
11540875	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	433.000	0.000	NA		NA
11683238	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	433.000	0.000	NA		NA
11825630	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	433.000	0.000	NA		NA
11540876	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	462.000	0.000	NA		NA
11683239	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	462.000	0.000	NA		NA
11825631	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	462.000	0.000	NA		NA
11540877	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	498.000	0.000	NA		NA
11683240	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	498.000	0.000	NA		NA
11825632	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	498.000	0.000	NA		NA
11540878	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	527.000	0.000	NA		NA
11683241	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	527.000	0.000	NA		NA
11825633	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	527.000	0.000	NA		NA
11540879	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	562.000	0.000	NA		NA
11683242	5772655		Athe_0128			FALSE	NA	562.000	0.000	NA		NA
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5773117	5773118	Athe_0581	Athe_0582			TRUE	0.996	6.000	0.333	0.007	Y	NA
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5774377	5774378	Athe_1813	Athe_1814			TRUE	0.992	2.000	0.626	1.000	N	NA
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5774534	5774535	Athe_1970	Athe_1971			FALSE	0.004	1081.000	0.000	NA		NA
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5774543	5774544	Athe_1977	Athe_1978			FALSE	0.254	86.000	0.000	NA		NA
5774544	5774545	Athe_1978	Athe_1979			FALSE	0.221	126.000	0.007	1.000		NA
5774545	5774546	Athe_1979	Athe_1980			TRUE	0.996	6.000	0.342	1.000	Y	NA
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5774547	5774548	Athe_1981	Athe_1982			TRUE	0.961	-3.000	0.055	1.000		NA
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5774553	5774554	Athe_1985	Athe_1986			FALSE	0.003	1386.000	0.000	NA		NA
5774554	5774555	Athe_1986	Athe_1987			FALSE	0.014	272.000	0.000	NA		NA
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5774556	5774557	Athe_1988	Athe_1989			FALSE	0.018	247.000	0.000	NA		NA
5774557	5774558	Athe_1989	Athe_1990			FALSE	0.012	292.000	0.000	NA		NA
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5774559	5774560	Athe_1991	Athe_1992			FALSE	0.290	78.000	0.000	NA		NA
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5774689	5774690	Athe_2122	Athe_2123			FALSE	0.044	185.000	0.000	1.000		NA
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5774692	5774693	Athe_2125	Athe_2126			TRUE	0.992	6.000	0.113	1.000	Y	NA
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5774698	5774699	Athe_2131	Athe_2132			TRUE	0.392	87.000	0.009	NA		NA
5774699	5774700	Athe_2132	Athe_2133			TRUE	0.914	28.000	0.008	NA		NA
5774700	5774701	Athe_2133	Athe_2134			TRUE	0.946	31.000	0.024	NA	N	NA
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5774702	5774703	Athe_2135	Athe_2136			TRUE	0.946	-7.000	0.028	NA		NA
5774703	5774704	Athe_2136	Athe_2137			FALSE	0.333	106.000	0.011	1.000		NA
5774704	5774705	Athe_2137	Athe_2138			TRUE	0.997	33.000	0.674	0.071	Y	NA
5774705	5774706	Athe_2138	Athe_2139			FALSE	0.038	220.000	0.000	1.000	N	NA
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5774707	5774708	Athe_2140	Athe_2141			TRUE	0.989	21.000	0.667	NA		NA
5774708	5774709	Athe_2141	Athe_2142			TRUE	0.987	30.000	0.400	NA		NA
5774709	5774710	Athe_2142	Athe_2143			TRUE	0.882	49.000	0.091	NA		NA
5774710	5774711	Athe_2143	Athe_2144			TRUE	0.969	37.000	0.141	NA	N	NA
5774711	5774712	Athe_2144	Athe_2145			TRUE	0.844	24.000	0.000	NA		NA
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5775198	5775199	Athe_2617	Athe_2618			FALSE	0.006	491.000	0.000	NA		NA
5775199	5775200	Athe_2618	Athe_2619			TRUE	0.998	-16.000	0.600	0.006	Y	NA
5775200	5775201	Athe_2619	Athe_2620			TRUE	0.984	-16.000	0.133	1.000	N	NA
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5775203	5775204	Athe_2622	Athe_2623			FALSE	0.014	275.000	0.000	NA		NA
5775204	5775205	Athe_2623	Athe_2624			TRUE	0.993	-16.000	0.667	NA		NA
5775205	5775206	Athe_2624	Athe_2625			TRUE	0.991	-18.000	0.500	NA		NA
5775206	5775207	Athe_2625	Athe_2626			FALSE	0.062	186.000	0.000	0.066	N	NA
5775207	5775208	Athe_2626	Athe_2627			TRUE	0.998	-13.000	0.667	0.010	Y	NA
5775209	5775210	Athe_2628	Athe_2629			FALSE	0.039	190.000	0.000	NA		NA
5775210	5775211	Athe_2629	Athe_2630			FALSE	0.104	137.000	0.000	NA		NA
5775211	5775212	Athe_2630	Athe_2631			FALSE	0.019	242.000	0.000	NA		NA
5775212	5775213	Athe_2631	Athe_2632			TRUE	0.754	38.000	0.000	NA		NA
5775213	5775214	Athe_2632	Athe_2633			TRUE	0.853	26.000	0.000	NA		NA
5775214	5775215	Athe_2633	Athe_2634			FALSE	0.008	388.000	0.000	NA		NA
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5775216	5775217	Athe_2635	Athe_2636			FALSE	0.206	104.000	0.000	NA		NA
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