MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium botulinum Ba4 str. 657

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7504217 7504218 CLJ_B0001 CLJ_B0002 dnaA dnaN_1 TRUE 0.555 263.000 0.328 1.000 Y NA
 7504218 7504219 CLJ_B0002 CLJ_B0003 dnaN_1   TRUE 0.948 20.000 0.103 1.000   NA
 7504219 7504220 CLJ_B0003 CLJ_B0004   recF TRUE 0.819 69.000 0.209 1.000   NA
 7504220 7504221 CLJ_B0004 CLJ_B0005 recF   TRUE 0.910 21.000 0.024 NA   NA
 7504221 7504222 CLJ_B0005 CLJ_B0006   gyrB TRUE 0.912 18.000 0.017 NA   NA
 7504222 7504223 CLJ_B0006 CLJ_B0007 gyrB gyrA TRUE 0.987 26.000 0.306 0.002 Y NA
 7504223 7504224 CLJ_B0007 CLJ_B0008 gyrA rrs_1 FALSE 0.010 416.000 0.000 NA   NA
 7504224 7504225 CLJ_B0008 CLJ_B0010 rrs_1 rrl_1 FALSE 0.116 222.000 0.000 NA   NA
 7504225 7504226 CLJ_B0010 CLJ_B0011 rrl_1 rrf_1 FALSE 0.418 93.000 0.000 NA   NA
 7504226 7504227 CLJ_B0011 CLJ_B0012 rrf_1   TRUE 0.877 8.000 0.000 NA   NA
 7504227 7504228 CLJ_B0012 CLJ_B0013     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7504228 7504229 CLJ_B0013 CLJ_B0014     FALSE 0.301 162.000 0.000 NA   NA
 7504229 7504230 CLJ_B0014 CLJ_B0015     TRUE 0.928 16.000 0.029 NA   NA
 7504230 7504231 CLJ_B0015 CLJ_B0016     TRUE 0.953 2.000 0.014 NA   NA
 7504231 7504232 CLJ_B0016 CLJ_B0017     TRUE 0.942 5.000 0.011 NA   NA
 7504232 7504233 CLJ_B0017 CLJ_B0018     TRUE 0.599 137.000 0.016 NA   NA
 7504233 7504234 CLJ_B0018 CLJ_B0019     TRUE 0.948 25.000 0.214 NA   NA
 7504234 7504235 CLJ_B0019 CLJ_B0020     TRUE 0.971 17.000 0.370 NA   NA
 7504235 7504236 CLJ_B0020 CLJ_B0021   serS_1 FALSE 0.015 370.000 0.000 NA   NA
 7504236 7504237 CLJ_B0021 CLJ_B0022 serS_1   FALSE 0.048 276.000 0.000 NA   NA
 7504237 7504238 CLJ_B0022 CLJ_B0023     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7504238 7504239 CLJ_B0023 CLJ_B0024     FALSE 0.031 305.000 0.000 NA   NA
 7504239 7504240 CLJ_B0024 CLJ_B0025     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7504240 7504241 CLJ_B0025 CLJ_B0026     FALSE 0.416 83.000 0.000 NA   NA
 7504242 7504243 CLJ_B0027 CLJ_B0028 psd   TRUE 0.650 103.000 0.026 NA   NA
 7504243 7504244 CLJ_B0028 CLJ_B0029     TRUE 0.800 76.000 0.205 NA   NA
 7504245 7504246 CLJ_B0030 CLJ_B0031     FALSE 0.289 165.000 0.000 NA   NA
 7504246 7504247 CLJ_B0031 CLJ_B0032   megL FALSE 0.103 227.000 0.000 NA   NA
 7504247 7504248 CLJ_B0032 CLJ_B0033 megL   FALSE 0.466 124.000 0.000 1.000 N NA
 7504248 7504249 CLJ_B0033 CLJ_B0034     FALSE 0.323 156.000 0.000 NA   NA
 7504249 7504250 CLJ_B0034 CLJ_B0035   srpB FALSE 0.413 123.000 0.000 NA   NA
 7504250 7504251 CLJ_B0035 CLJ_B0036 srpB dnaX_1 FALSE 0.293 164.000 0.000 NA   NA
 7504251 7504252 CLJ_B0036 CLJ_B0037 dnaX_1   TRUE 0.770 65.000 0.100 NA   NA
 7504252 7504253 CLJ_B0037 CLJ_B0038   recR TRUE 0.953 33.000 0.604 NA   NA
 7504253 7504254 CLJ_B0038 CLJ_B0039 recR   TRUE 0.767 57.000 0.071 NA   NA
 7504254 7504255 CLJ_B0039 CLJ_B0040   bofA TRUE 0.805 150.000 0.417 NA   NA
 7504255 7504256 CLJ_B0040 CLJ_B0041 bofA sfsA FALSE 0.502 151.000 0.005 NA   NA
 7504256 7504257 CLJ_B0041 CLJ_B0042 sfsA   TRUE 0.687 56.000 0.015 NA   NA
 7504257 7504258 CLJ_B0042 CLJ_B0043     FALSE 0.439 118.000 0.000 1.000   NA
 7504258 7504259 CLJ_B0043 CLJ_B0044     FALSE 0.432 134.000 0.000 1.000   NA
 7504259 7504260 CLJ_B0044 CLJ_B0045     TRUE 0.960 19.000 0.222 NA   NA
 7504260 7504261 CLJ_B0045 CLJ_B0046     FALSE 0.014 383.000 0.000 NA   NA
 7504261 7504262 CLJ_B0046 CLJ_B0047     TRUE 0.605 83.000 0.007 NA N NA
 7504262 7504263 CLJ_B0047 CLJ_B0048     TRUE 0.885 29.000 0.035 NA N NA
 7504263 7504264 CLJ_B0048 CLJ_B0049   rrs_2 FALSE 0.013 387.000 0.000 NA   NA
 7504264 7504265 CLJ_B0049 CLJ_B0051 rrs_2 rrl_2 FALSE 0.116 222.000 0.000 NA   NA
 7504265 7504266 CLJ_B0051 CLJ_B0052 rrl_2 rrf_2 FALSE 0.424 105.000 0.000 NA   NA
 7504266 7504267 CLJ_B0052 CLJ_B0053 rrf_2   TRUE 0.882 6.000 0.000 NA   NA
 7504268 7504269 CLJ_B0054 CLJ_B0055     TRUE 0.821 18.000 0.000 NA   NA
 7504270 7504271 CLJ_B0056 CLJ_B0058 rrs_3 rrl_3 FALSE 0.116 222.000 0.000 NA   NA
 7504271 7504272 CLJ_B0058 CLJ_B0059 rrl_3 rrf_3 FALSE 0.277 168.000 0.000 NA   NA
 7504272 7504273 CLJ_B0059 CLJ_B0060 rrf_3   TRUE 0.882 6.000 0.000 NA   NA
 7504273 7504274 CLJ_B0060 CLJ_B0061     FALSE 0.018 354.000 0.000 NA   NA
 7504274 7504275 CLJ_B0061 CLJ_B0062     TRUE 0.992 -3.000 0.800 NA   NA
 7504275 7504276 CLJ_B0062 CLJ_B0063   rrs_4 FALSE 0.004 645.000 0.000 NA   NA
 7504276 7504277 CLJ_B0063 CLJ_B0065 rrs_4 rrl_4 FALSE 0.116 222.000 0.000 NA   NA
 7504277 7504278 CLJ_B0065 CLJ_B0066 rrl_4 rrf_4 FALSE 0.424 105.000 0.000 NA   NA
 7504278 7504279 CLJ_B0066 CLJ_B0067 rrf_4   TRUE 0.879 7.000 0.000 NA   NA
 7504279 7504280 CLJ_B0067 CLJ_B0068     FALSE 0.144 208.000 0.000 NA   NA
 7504280 7504281 CLJ_B0068 CLJ_B0069     TRUE 0.592 43.000 0.000 NA   NA
 7504281 7504282 CLJ_B0069 CLJ_B0070   rrs_5 FALSE 0.003 719.000 0.000 NA   NA
 7504282 7504283 CLJ_B0070 CLJ_B0072 rrs_5 rrl_5 FALSE 0.110 224.000 0.000 NA   NA
 7504283 7504284 CLJ_B0072 CLJ_B0073 rrl_5 rrf_5 FALSE 0.424 105.000 0.000 NA   NA
 7504284 7504285 CLJ_B0073 CLJ_B0074 rrf_5   TRUE 0.879 7.000 0.000 NA   NA
 7504285 7504286 CLJ_B0074 CLJ_B0075     FALSE 0.386 140.000 0.000 NA   NA
 7504286 7504287 CLJ_B0075 CLJ_B0076   rrs_6 FALSE 0.005 522.000 0.000 NA   NA
 7504287 7504288 CLJ_B0076 CLJ_B0078 rrs_6 rrl_6 FALSE 0.116 222.000 0.000 NA   NA
 7504288 7504289 CLJ_B0078 CLJ_B0079 rrl_6 rrf_6 FALSE 0.424 105.000 0.000 NA   NA
 7504289 7504290 CLJ_B0079 CLJ_B0080 rrf_6   FALSE 0.015 373.000 0.000 NA   NA
 7504290 7504291 CLJ_B0080 CLJ_B0081     FALSE 0.419 82.000 0.000 NA   NA
 7504292 7504293 CLJ_B0082 CLJ_B0083     TRUE 0.853 36.000 0.039 NA N NA
 7504296 7504297 CLJ_B0086 CLJ_B0087     TRUE 0.986 -21.000 0.120 NA   NA
 7504297 7504298 CLJ_B0087 CLJ_B0088     TRUE 0.918 24.000 0.034 1.000 N NA
 7504298 7504299 CLJ_B0088 CLJ_B0089     TRUE 0.667 81.000 0.034 NA   NA
 7504299 7504300 CLJ_B0089 CLJ_B0090     TRUE 0.913 18.000 0.018 NA   NA
 7504300 7504301 CLJ_B0090 CLJ_B0091     TRUE 0.985 2.000 0.372 NA   NA
 7504301 7504302 CLJ_B0091 CLJ_B0092     TRUE 0.930 12.000 0.011 NA   NA
 7504302 7504303 CLJ_B0092 CLJ_B0093     TRUE 0.834 82.000 0.333 1.000   NA
 7504303 7504304 CLJ_B0093 CLJ_B0094     TRUE 0.599 121.000 0.006 1.000   NA
 7504304 7504305 CLJ_B0094 CLJ_B0095     TRUE 0.953 20.000 0.078 0.008   NA
 7504305 7504306 CLJ_B0095 CLJ_B0096     FALSE 0.459 156.000 0.002 NA   NA
 7504308 7504309 CLJ_B0098 CLJ_B0099   arcA_1 FALSE 0.010 422.000 0.000 1.000   NA
 7504310 7504311 CLJ_B0100 CLJ_B0101 ispF   TRUE 0.583 76.000 0.003 NA   NA
 7504314 7504315 CLJ_B0104 CLJ_B0105 spmA spmB TRUE 0.987 13.000 0.655 0.003   NA
 7504315 7504316 CLJ_B0105 CLJ_B0106 spmB   FALSE 0.116 222.000 0.000 NA   NA
 7504316 7504317 CLJ_B0106 CLJ_B0107     TRUE 0.876 66.000 0.500 NA   NA
 7504317 7504318 CLJ_B0107 CLJ_B0108     TRUE 0.784 93.000 0.188 NA   NA
 7504318 7504319 CLJ_B0108 CLJ_B0109     TRUE 0.994 3.000 0.312 NA Y NA
 7504321 7504322 CLJ_B0111 CLJ_B0112 udgA   TRUE 0.870 29.000 0.016 1.000 N NA
 7504322 7504323 CLJ_B0112 CLJ_B0113   metG FALSE 0.017 382.000 0.000 1.000 N NA
 7504323 7504324 CLJ_B0113 CLJ_B0114 metG   FALSE 0.427 165.000 0.003 NA   NA
 7504324 7504325 CLJ_B0114 CLJ_B0115     FALSE 0.496 151.000 0.004 NA   NA
 7504325 7504326 CLJ_B0115 CLJ_B0116     FALSE 0.101 228.000 0.000 NA   NA
 7504326 7504327 CLJ_B0116 CLJ_B0117     TRUE 0.665 73.000 0.020 1.000   NA
 7504327 7504328 CLJ_B0117 CLJ_B0118   ksgA TRUE 0.975 2.000 0.093 1.000 N NA
 7504328 7504329 CLJ_B0118 CLJ_B0119 ksgA   TRUE 0.606 79.000 0.010 NA   NA
 7504329 7504330 CLJ_B0119 CLJ_B0120     TRUE 0.736 159.000 0.278 NA   NA
 7504330 7504331 CLJ_B0120 CLJ_B0121     TRUE 0.660 168.000 0.188 NA   NA
 7504331 7504332 CLJ_B0121 CLJ_B0122     TRUE 0.649 168.000 0.167 NA   NA
 7504332 7504333 CLJ_B0122 CLJ_B0123     TRUE 0.980 11.000 0.350 1.000 N NA
 7504333 7504334 CLJ_B0123 CLJ_B0124     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7504334 7504335 CLJ_B0124 CLJ_B0125     FALSE 0.419 82.000 0.000 NA   NA
 7504335 7504336 CLJ_B0125 CLJ_B0126     FALSE 0.386 146.000 0.000 1.000   NA
 7504336 7504337 CLJ_B0126 CLJ_B0127     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 7504339 7504340 CLJ_B0129 CLJ_B0130     TRUE 0.730 57.000 0.037 NA   NA
 7504340 7504341 CLJ_B0130 CLJ_B0131   nrdD FALSE 0.041 290.000 0.000 NA   NA
 7504341 7504342 CLJ_B0131 CLJ_B0132 nrdD nrdG TRUE 0.978 17.000 0.315 0.001 N NA
 7504343 7504344 CLJ_B0133 CLJ_B0134     FALSE 0.395 138.000 0.000 NA   NA
 7504344 7504345 CLJ_B0134 CLJ_B0135     TRUE 0.974 2.000 0.111 NA   NA
 7504345 7504346 CLJ_B0135 CLJ_B0136     FALSE 0.414 121.000 0.000 NA   NA
 7504347 7504348 CLJ_B0137 CLJ_B0138 ileS   TRUE 0.555 151.000 0.009 1.000 N NA
 7504348 7504349 CLJ_B0138 CLJ_B0139     FALSE 0.275 217.000 0.017 1.000 N NA
 7504349 7504350 CLJ_B0139 CLJ_B0140     TRUE 0.803 75.000 0.160 1.000 N NA
 7504350 7504351 CLJ_B0140 CLJ_B0141     FALSE 0.022 336.000 0.000 NA   NA
 7504351 7504352 CLJ_B0141 CLJ_B0142     TRUE 0.963 5.000 0.066 NA   NA
 7504352 7504353 CLJ_B0142 CLJ_B0143     TRUE 0.960 20.000 0.210 1.000   NA
 7504353 7504354 CLJ_B0143 CLJ_B0144     FALSE 0.118 225.000 0.000 1.000   NA
 7504354 7504355 CLJ_B0144 CLJ_B0145     TRUE 0.637 187.000 0.333 1.000   NA
 7504357 7504358 CLJ_B0147 CLJ_B0148     TRUE 0.960 15.000 0.143 NA   NA
 7504358 7504359 CLJ_B0148 CLJ_B0149     TRUE 0.945 27.000 0.250 NA   NA
 7504359 7504360 CLJ_B0149 CLJ_B0150     TRUE 0.985 13.000 0.800 NA   NA
 7504362 7504363 CLJ_B0152 CLJ_B0153 cotS   TRUE 0.750 124.000 0.119 NA   NA
 7504363 7504364 CLJ_B0153 CLJ_B0154     FALSE 0.477 196.000 0.116 NA   NA
 7504364 7504365 CLJ_B0154 CLJ_B0155     TRUE 0.728 104.000 0.082 NA   NA
 7504365 7504366 CLJ_B0155 CLJ_B0156     FALSE 0.414 116.000 0.000 NA   NA
 7504366 7504367 CLJ_B0156 CLJ_B0157   cphB TRUE 0.944 -30.000 0.000 NA   NA
 7504367 7504368 CLJ_B0157 CLJ_B0158 cphB cphA TRUE 0.935 44.000 0.605 1.000 N NA
 7504368 7504369 CLJ_B0158 CLJ_B0159 cphA ispE TRUE 0.652 93.000 0.016 1.000 N NA
 7504369 7504370 CLJ_B0159 CLJ_B0160 ispE   FALSE 0.433 167.000 0.005 NA   NA
 7504370 7504371 CLJ_B0160 CLJ_B0161     TRUE 0.797 61.000 0.133 NA   NA
 7504371 7504372 CLJ_B0161 CLJ_B0162     TRUE 0.974 20.000 0.333 0.007   NA
 7504372 7504373 CLJ_B0162 CLJ_B0163     TRUE 0.927 50.000 0.500 0.007   NA
 7504373 7504374 CLJ_B0163 CLJ_B0164   spoIIR TRUE 0.761 74.000 0.109 NA   NA
 7504376 7504377 CLJ_B0166 CLJ_B0167 ypeB   TRUE 0.592 103.000 0.003 1.000   NA
 7504377 7504378 CLJ_B0167 CLJ_B0168     TRUE 0.876 25.000 0.011 NA   NA
 7504378 7504379 CLJ_B0168 CLJ_B0169     TRUE 0.661 132.000 0.039 NA   NA
 7504379 7504380 CLJ_B0169 CLJ_B0170   pyrG FALSE 0.156 234.000 0.004 NA   NA
 7504380 7504381 CLJ_B0170 CLJ_B0171 pyrG   FALSE 0.055 267.000 0.000 NA   NA
 7504381 7504382 CLJ_B0171 CLJ_B0172   rho FALSE 0.403 172.000 0.006 NA   NA
 7504384 7504385 CLJ_B0174 CLJ_B0175 tdk   TRUE 0.908 17.000 0.010 NA   NA
 7504385 7504386 CLJ_B0175 CLJ_B0176   prmC TRUE 0.965 8.000 0.098 NA   NA
 7504386 7504387 CLJ_B0176 CLJ_B0177 prmC prfA TRUE 0.897 82.000 0.081 1.000 Y NA
 7504387 7504388 CLJ_B0177 CLJ_B0178 prfA   TRUE 0.851 28.000 0.009 NA   NA
 7504388 7504389 CLJ_B0178 CLJ_B0179     TRUE 0.792 60.000 0.116 NA   NA
 7504389 7504390 CLJ_B0179 CLJ_B0180     TRUE 0.932 21.000 0.052 NA N NA
 7504390 7504391 CLJ_B0180 CLJ_B0181     TRUE 0.959 10.000 0.056 NA N NA
 7504391 7504392 CLJ_B0181 CLJ_B0182   rpiB TRUE 0.774 60.000 0.065 1.000 N NA
 7504392 7504393 CLJ_B0182 CLJ_B0183 rpiB upp TRUE 0.867 30.000 0.019 1.000 N NA
 7504395 7504396 CLJ_B0185 CLJ_B0186   tagO TRUE 0.685 108.000 0.029 1.000 N NA
 7504396 7504397 CLJ_B0186 CLJ_B0187 tagO mnaA TRUE 0.991 14.000 0.346 1.000 Y NA
 7504397 7504398 CLJ_B0187 CLJ_B0188 mnaA atpI FALSE 0.007 492.000 0.000 1.000   NA
 7504398 7504399 CLJ_B0188 CLJ_B0189 atpI atpB TRUE 0.973 15.000 0.330 1.000   NA
 7504399 7504400 CLJ_B0189 CLJ_B0190 atpB atpE TRUE 0.828 40.000 0.009 0.007   NA
 7504400 7504401 CLJ_B0190 CLJ_B0191 atpE atpF TRUE 0.798 76.000 0.095 0.007   NA
 7504401 7504402 CLJ_B0191 CLJ_B0192 atpF atpH TRUE 0.990 3.000 0.040 0.007 Y NA
 7504402 7504403 CLJ_B0192 CLJ_B0193 atpH atpA TRUE 0.996 11.000 0.864 0.007 Y NA
 7504403 7504404 CLJ_B0193 CLJ_B0194 atpA atpG TRUE 0.994 22.000 0.846 0.007 Y NA
 7504404 7504405 CLJ_B0194 CLJ_B0195 atpG atpD TRUE 0.995 14.000 0.724 0.007 Y NA
 7504405 7504406 CLJ_B0195 CLJ_B0196 atpD atpC TRUE 0.992 25.000 0.837 0.007 Y NA
 7504406 7504407 CLJ_B0196 CLJ_B0197 atpC   FALSE 0.302 196.000 0.007 NA   NA
 7504407 7504408 CLJ_B0197 CLJ_B0198   murA_1 TRUE 0.960 24.000 0.346 NA   NA
 7504408 7504409 CLJ_B0198 CLJ_B0199 murA_1 spoIID FALSE 0.314 256.000 0.243 1.000 N NA
 7504409 7504410 CLJ_B0199 CLJ_B0200 spoIID   FALSE 0.043 406.000 0.090 1.000 N NA
 7504410 7504411 CLJ_B0200 CLJ_B0201   spoIIID_1 TRUE 0.746 108.000 0.093 1.000   NA
 7504411 7504412 CLJ_B0201 CLJ_B0202 spoIIID_1 mbl TRUE 0.827 100.000 0.284 1.000   NA
 7504413 7504414 CLJ_B0203 CLJ_B0204     TRUE 0.713 49.000 0.010 NA   NA
 7504415 7504416 CLJ_B0205 CLJ_B0206     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7504416 7504417 CLJ_B0206 CLJ_B0207     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7504417 7504418 CLJ_B0207 CLJ_B0208     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7504418 7504419 CLJ_B0208 CLJ_B0209     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7504419 7504420 CLJ_B0209 CLJ_B0210     FALSE 0.424 101.000 0.000 NA   NA
 7504420 7504421 CLJ_B0210 CLJ_B0212   metK_1 FALSE 0.416 83.000 0.000 NA   NA
 7504421 7504422 CLJ_B0212 CLJ_B0213 metK_1   FALSE 0.450 193.000 0.052 1.000 N NA
 7504422 7504423 CLJ_B0213 CLJ_B0214     TRUE 0.907 26.000 0.051 NA   NA
 7504423 7504424 CLJ_B0214 CLJ_B0215     TRUE 0.987 -27.000 0.130 NA   NA
 7504424 7504425 CLJ_B0215 CLJ_B0216   yfiA FALSE 0.031 425.000 0.080 NA   NA
 7504425 7504426 CLJ_B0216 CLJ_B0217 yfiA secA FALSE 0.269 228.000 0.050 NA N NA
 7504426 7504427 CLJ_B0217 CLJ_B0218 secA   TRUE 0.689 32.000 0.000 NA   NA
 7504427 7504428 CLJ_B0218 CLJ_B0219   prfB TRUE 0.580 44.000 0.000 NA   NA
 7504430 7504431 CLJ_B0221 CLJ_B0223     FALSE 0.044 284.000 0.000 NA   NA
 7504431 7504432 CLJ_B0223 CLJ_B0224     FALSE 0.198 229.000 0.016 NA   NA
 7504432 7504433 CLJ_B0224 CLJ_B0225     TRUE 0.972 21.000 0.500 NA   NA
 7504433 7504434 CLJ_B0225 CLJ_B0226     TRUE 0.954 14.000 0.077 1.000   NA
 7504434 7504435 CLJ_B0226 CLJ_B0227     TRUE 0.645 84.000 0.022 1.000   NA
 7504435 7504436 CLJ_B0227 CLJ_B0228     TRUE 0.878 40.000 0.109 1.000   NA
 7504439 7504440 CLJ_B0231 CLJ_B0232   leuS FALSE 0.323 156.000 0.000 NA   NA
 7504440 7504441 CLJ_B0232 CLJ_B0233 leuS   FALSE 0.016 377.000 0.000 NA N NA
 7504441 7504442 CLJ_B0233 CLJ_B0234     FALSE 0.277 168.000 0.000 NA   NA
 7504442 7504443 CLJ_B0234 CLJ_B0235     FALSE 0.520 53.000 0.000 NA   NA
 7504443 7504444 CLJ_B0235 CLJ_B0236     TRUE 0.772 25.000 0.000 NA   NA
 7504444 7504445 CLJ_B0236 CLJ_B0237     TRUE 0.938 -13.000 0.000 NA   NA
 7504445 7504446 CLJ_B0237 CLJ_B0238     TRUE 0.969 4.000 0.098 NA   NA
 7504448 7504449 CLJ_B0240 CLJ_B0241 fba   FALSE 0.105 226.000 0.000 NA   NA
 7504449 7504450 CLJ_B0241 CLJ_B0242     TRUE 0.720 117.000 0.082 NA   NA
 7504451 7504452 CLJ_B0243 CLJ_B0244     FALSE 0.395 138.000 0.000 NA   NA
 7504454 7504455 CLJ_B0246 CLJ_B0247     TRUE 0.749 106.000 0.094 1.000   NA
 7504455 7504456 CLJ_B0247 CLJ_B0248     TRUE 0.828 74.000 0.281 NA   NA
 7504458 7504459 CLJ_B0251 CLJ_B0252   sleB FALSE 0.315 224.000 0.041 0.063   NA
 7504459 7504460 CLJ_B0252 CLJ_B0253 sleB cysK_1 FALSE 0.018 364.000 0.000 1.000   NA
 7504460 7504461 CLJ_B0253 CLJ_B0254 cysK_1 cysE TRUE 0.989 15.000 0.101 0.002 Y NA
 7504461 7504462 CLJ_B0254 CLJ_B0255 cysE   TRUE 0.937 22.000 0.064 1.000 N NA
 7504462 7504463 CLJ_B0255 CLJ_B0256   plsD TRUE 0.710 138.000 0.064 1.000 N NA
 7504463 7504464 CLJ_B0256 CLJ_B0257 plsD nth TRUE 0.636 93.000 0.011 1.000 N NA
 7504464 7504465 CLJ_B0257 CLJ_B0258 nth   FALSE 0.389 152.000 0.000 1.000 N NA
 7504466 7504467 CLJ_B0259 CLJ_B0260     TRUE 0.863 26.000 0.004 1.000   NA
 7504467 7504468 CLJ_B0260 CLJ_B0261     TRUE 0.623 110.000 0.018 NA   NA
 7504469 7504470 CLJ_B0262 CLJ_B0263     FALSE 0.477 205.000 0.000 NA Y NA
 7504470 7504471 CLJ_B0263 CLJ_B0264   splB TRUE 0.625 146.000 0.027 1.000 N NA
 7504471 7504472 CLJ_B0264 CLJ_B0265 splB   FALSE 0.139 258.000 0.008 1.000 N NA
 7504472 7504473 CLJ_B0265 CLJ_B0266     TRUE 0.930 13.000 0.016 NA   NA
 7504473 7504474 CLJ_B0266 CLJ_B0267     FALSE 0.039 294.000 0.000 NA   NA
 7504474 7504475 CLJ_B0267 CLJ_B0268     TRUE 0.528 183.000 0.097 1.000   NA
 7504475 7504476 CLJ_B0268 CLJ_B0269     TRUE 0.987 2.000 0.438 1.000   NA
 7504476 7504477 CLJ_B0269 CLJ_B0270     TRUE 0.994 -7.000 0.720 0.033   NA
 7504477 7504478 CLJ_B0270 CLJ_B0271     TRUE 0.604 112.000 0.007 1.000   NA
 7504478 7504479 CLJ_B0271 CLJ_B0272   rpoN TRUE 0.545 188.000 0.125 1.000 N NA
 7504479 7504480 CLJ_B0272 CLJ_B0273 rpoN cggR FALSE 0.301 288.000 0.034 1.000 Y NA
 7504480 7504481 CLJ_B0273 CLJ_B0274 cggR gap_1 TRUE 0.850 78.000 0.348 1.000 N NA
 7504481 7504482 CLJ_B0274 CLJ_B0275 gap_1 pgk FALSE 0.341 297.000 0.063 0.004 Y NA
 7504482 7504483 CLJ_B0275 CLJ_B0276 pgk tpiA TRUE 0.927 62.000 0.141 1.000 Y NA
 7504483 7504484 CLJ_B0276 CLJ_B0277 tpiA gpmI TRUE 0.911 87.000 0.138 1.000 Y NA
 7504484 7504485 CLJ_B0277 CLJ_B0278 gpmI eno TRUE 0.895 56.000 0.016 1.000 Y NA
 7504485 7504486 CLJ_B0278 CLJ_B0279 eno secG FALSE 0.221 224.000 0.006 1.000 N NA
 7504486 7504487 CLJ_B0279 CLJ_B0280 secG rnr FALSE 0.387 208.000 0.064 1.000 N NA
 7504487 7504488 CLJ_B0280 CLJ_B0281 rnr surE FALSE 0.013 396.000 0.000 1.000   NA
 7504488 7504489 CLJ_B0281 CLJ_B0282 surE smpB FALSE 0.072 257.000 0.000 1.000   NA
 7504491 7504492 CLJ_B0284 CLJ_B0285 ssrA   FALSE 0.017 362.000 0.000 NA   NA
 7504492 7504493 CLJ_B0285 CLJ_B0286     FALSE 0.055 267.000 0.000 NA   NA
 7504493 7504494 CLJ_B0286 CLJ_B0287     FALSE 0.340 152.000 0.000 NA   NA
 7504494 7504495 CLJ_B0287 CLJ_B0288     FALSE 0.420 95.000 0.000 NA   NA
 7504495 7504496 CLJ_B0288 CLJ_B0289     FALSE 0.237 187.000 0.000 1.000 N NA
 7504496 7504497 CLJ_B0289 CLJ_B0290     FALSE 0.020 357.000 0.000 1.000   NA
 7504497 7504498 CLJ_B0290 CLJ_B0291     FALSE 0.006 499.000 0.000 NA   NA
 7504498 7504499 CLJ_B0291 CLJ_B0292     FALSE 0.074 256.000 0.000 NA N NA
 7504499 7504500 CLJ_B0292 CLJ_B0293     TRUE 0.951 67.000 0.455 1.000 Y NA
 7504500 7504501 CLJ_B0293 CLJ_B0294     TRUE 0.883 75.000 0.545 1.000 N NA
 7504501 7504502 CLJ_B0294 CLJ_B0295     TRUE 0.994 -13.000 0.833 NA   NA
 7504502 7504503 CLJ_B0295 CLJ_B0296     TRUE 0.985 -7.000 0.167 NA   NA
 7504503 7504504 CLJ_B0296 CLJ_B0297     FALSE 0.027 316.000 0.000 NA   NA
 7504504 7504505 CLJ_B0297 CLJ_B0299     FALSE 0.005 545.000 0.000 NA   NA
 7504505 7504506 CLJ_B0299 CLJ_B0300     FALSE 0.005 552.000 0.000 1.000   NA
 7504506 7504507 CLJ_B0300 CLJ_B0301     FALSE 0.411 140.000 0.000 1.000   NA
 7504507 7504508 CLJ_B0301 CLJ_B0302     TRUE 0.656 39.000 0.000 1.000   NA
 7504508 7504509 CLJ_B0302 CLJ_B0303     TRUE 0.778 26.000 0.000 1.000   NA
 7504509 7504510 CLJ_B0303 CLJ_B0304     FALSE 0.287 170.000 0.000 1.000   NA
 7504510 7504511 CLJ_B0304 CLJ_B0305     FALSE 0.205 193.000 0.000 1.000   NA
 7504513 7504514 CLJ_B0307 CLJ_B0308     FALSE 0.080 240.000 0.000 NA   NA
 7504515 7504516 CLJ_B0309 CLJ_B0310 spoVAE_1 spoVAD_1 TRUE 0.972 23.000 0.600 NA   NA
 7504516 7504517 CLJ_B0310 CLJ_B0311 spoVAD_1 spoVAC_1 TRUE 0.991 1.000 0.750 NA   NA
 7504517 7504518 CLJ_B0311 CLJ_B0312 spoVAC_1   TRUE 0.984 13.000 0.750 NA   NA
 7504518 7504519 CLJ_B0312 CLJ_B0313     TRUE 0.986 13.000 0.857 NA   NA
 7504520 7504521 CLJ_B0314 CLJ_B0315     FALSE 0.006 501.000 0.000 NA   NA
 7504521 7504522 CLJ_B0315 CLJ_B0316     TRUE 0.970 11.000 0.167 NA   NA
 7504522 7504523 CLJ_B0316 CLJ_B0317     TRUE 0.987 22.000 0.318 1.000 Y NA
 7504523 7504524 CLJ_B0317 CLJ_B0318     TRUE 0.936 25.000 0.091 1.000 N NA
 7504524 7504525 CLJ_B0318 CLJ_B0319     TRUE 0.996 -7.000 0.278 1.000 Y NA
 7504527 7504528 CLJ_B0321 CLJ_B0322     TRUE 0.889 164.000 0.294 1.000 Y NA
 7504529 7504530 CLJ_B0323 CLJ_B0324     TRUE 0.993 16.000 0.500 0.004 Y NA
 7504531 7504532 CLJ_B0325 CLJ_B0326     TRUE 0.989 8.000 1.000 NA   NA
 7504532 7504533 CLJ_B0326 CLJ_B0327     TRUE 0.982 6.000 0.400 NA   NA
 7504533 7504534 CLJ_B0327 CLJ_B0328     TRUE 0.992 10.000 0.235 1.000 Y NA
 7504534 7504535 CLJ_B0328 CLJ_B0329     TRUE 0.843 120.000 0.353 1.000 N NA
 7504535 7504536 CLJ_B0329 CLJ_B0330     TRUE 0.972 14.000 0.286 NA   NA
 7504536 7504537 CLJ_B0330 CLJ_B0331     FALSE 0.009 427.000 0.000 NA   NA
 7504537 7504538 CLJ_B0331 CLJ_B0332   glvA_1 FALSE 0.128 317.000 0.000 1.000 Y NA
 7504538 7504539 CLJ_B0332 CLJ_B0333 glvA_1   TRUE 0.587 183.000 0.000 1.000 Y NA
 7504539 7504540 CLJ_B0333 CLJ_B0334     FALSE 0.055 283.000 0.000 1.000 N NA
 7504542 7504543 CLJ_B0336 CLJ_B0337     FALSE 0.362 146.000 0.000 NA   NA
 7504543 7504544 CLJ_B0337 CLJ_B0338     FALSE 0.340 152.000 0.000 NA   NA
 7504544 7504545 CLJ_B0338 CLJ_B0339     TRUE 0.715 153.000 0.158 NA N NA
 7504545 7504546 CLJ_B0339 CLJ_B0340     TRUE 0.897 27.000 0.035 1.000   NA
 7504546 7504547 CLJ_B0340 CLJ_B0341     FALSE 0.010 419.000 0.000 1.000   NA
 7504547 7504548 CLJ_B0341 CLJ_B0342     TRUE 0.847 119.000 0.385 1.000 N NA
 7504548 7504549 CLJ_B0342 CLJ_B0343   glvA_2 FALSE 0.200 397.000 0.385 1.000 Y NA
 7504549 7504550 CLJ_B0343 CLJ_B0344 glvA_2   TRUE 0.992 13.000 0.375 1.000 Y NA
 7504550 7504551 CLJ_B0344 CLJ_B0345   ilvD TRUE 0.926 138.000 0.286 1.000 Y NA
 7504551 7504552 CLJ_B0345 CLJ_B0346 ilvD eda TRUE 0.942 52.000 0.091 0.062 Y NA
 7504552 7504553 CLJ_B0346 CLJ_B0347 eda   TRUE 0.991 2.000 0.091 1.000 Y NA
 7504555 7504556 CLJ_B0349 CLJ_B0350 ade   FALSE 0.013 403.000 0.000 1.000 N NA
 7504556 7504557 CLJ_B0350 CLJ_B0351     TRUE 0.998 -3.000 0.889 1.000 Y NA
 7504557 7504558 CLJ_B0351 CLJ_B0352     FALSE 0.130 284.000 0.049 NA N NA
 7504558 7504559 CLJ_B0352 CLJ_B0353     TRUE 0.991 -16.000 0.400 NA   NA
 7504559 7504560 CLJ_B0353 CLJ_B0354     FALSE 0.414 119.000 0.000 NA   NA
 7504560 7504561 CLJ_B0354 CLJ_B0355     FALSE 0.018 356.000 0.000 NA   NA
 7504561 7504562 CLJ_B0355 CLJ_B0356     FALSE 0.069 265.000 0.000 1.000 N NA
 7504562 7504563 CLJ_B0356 CLJ_B0357     TRUE 0.992 3.000 0.167 1.000 Y NA
 7504563 7504564 CLJ_B0357 CLJ_B0358     TRUE 0.996 2.000 0.750 1.000 Y NA
 7504564 7504565 CLJ_B0358 CLJ_B0359     TRUE 0.925 33.000 0.200 1.000 N NA
 7504569 7504570 CLJ_B0363 CLJ_B0364     TRUE 0.939 27.000 0.000 1.000 Y NA
 7504570 7504571 CLJ_B0364 CLJ_B0365     TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.032 Y NA
 7504571 7504572 CLJ_B0365 CLJ_B0366     TRUE 0.972 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7504572 7504573 CLJ_B0366 CLJ_B0367     TRUE 0.937 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7504575 7504576 CLJ_B0370 CLJ_B0371   xpt_1 TRUE 0.973 23.000 0.032 1.000 Y NA
 7504576 7504577 CLJ_B0371 CLJ_B0372 xpt_1   FALSE 0.009 451.000 0.000 1.000 N NA
 7504577 7504578 CLJ_B0372 CLJ_B0373     TRUE 0.995 13.000 1.000 1.000 Y NA
 7504578 7504579 CLJ_B0373 CLJ_B0374   uppP_1 TRUE 0.655 177.000 0.222 1.000 N NA
 7504579 7504580 CLJ_B0374 CLJ_B0375 uppP_1   TRUE 0.991 15.000 0.333 1.000 Y NA
 7504580 7504581 CLJ_B0375 CLJ_B0376     TRUE 0.991 0.000 0.750 NA   NA
 7504581 7504582 CLJ_B0376 CLJ_B0377     TRUE 0.782 24.000 0.000 NA   NA
 7504582 7504583 CLJ_B0377 CLJ_B0378     FALSE 0.024 327.000 0.000 NA   NA
 7504583 7504584 CLJ_B0378 CLJ_B0379     TRUE 0.990 3.000 0.869 NA   NA
 7504585 7504586 CLJ_B0380 CLJ_B0381     TRUE 0.940 0.000 0.000 0.075   NA
 7504587 7504588 CLJ_B0382 CLJ_B0383     FALSE 0.015 369.000 0.000 NA   NA
 7504588 7504589 CLJ_B0383 CLJ_B0384     TRUE 0.571 135.000 0.006 NA   NA
 7504589 7504590 CLJ_B0384 CLJ_B0385     FALSE 0.025 323.000 0.000 NA   NA
 7504590 7504591 CLJ_B0385 CLJ_B0386     TRUE 0.789 179.000 1.000 NA   NA
 7504591 7504592 CLJ_B0386 CLJ_B0387     TRUE 0.992 -7.000 0.556 NA   NA
 7504592 7504593 CLJ_B0387 CLJ_B0388     TRUE 0.993 -16.000 0.556 NA   NA
 7504593 7504594 CLJ_B0388 CLJ_B0389     TRUE 0.795 73.000 0.179 NA   NA
 7504594 7504595 CLJ_B0389 CLJ_B0390     FALSE 0.114 231.000 0.000 1.000 N NA
 7504595 7504596 CLJ_B0390 CLJ_B0391     FALSE 0.012 396.000 0.000 NA   NA
 7504596 7504597 CLJ_B0391 CLJ_B0392     TRUE 0.967 27.000 0.667 NA   NA
 7504597 7504598 CLJ_B0392 CLJ_B0393     FALSE 0.099 229.000 0.000 NA   NA
 7504598 7504599 CLJ_B0393 CLJ_B0394     TRUE 0.995 -13.000 1.000 NA   NA
 7504599 7504600 CLJ_B0394 CLJ_B0395     TRUE 0.900 81.000 1.000 NA   NA
 7504600 7504601 CLJ_B0395 CLJ_B0396     FALSE 0.303 301.000 1.000 NA   NA
 7504601 7504602 CLJ_B0396 CLJ_B0397     FALSE 0.102 233.000 0.000 NA N NA
 7504604 7504605 CLJ_B0399 CLJ_B0400     TRUE 0.953 119.000 0.667 1.000 Y NA
 7504605 7504606 CLJ_B0400 CLJ_B0401   adhE FALSE 0.011 429.000 0.000 1.000 N NA
 7504606 7504607 CLJ_B0401 CLJ_B0402 adhE   FALSE 0.032 304.000 0.000 NA   NA
 7504607 7504608 CLJ_B0402 CLJ_B0403     TRUE 0.668 63.000 0.019 NA   NA
 7504609 7504610 CLJ_B0404 CLJ_B0405     FALSE 0.021 342.000 0.000 NA   NA
 7504611 7504612 CLJ_B0406 CLJ_B0407     FALSE 0.005 554.000 0.000 1.000   NA
 7504612 7504613 CLJ_B0407 CLJ_B0408     TRUE 0.700 108.000 0.038 1.000 N NA
 7504613 7504614 CLJ_B0408 CLJ_B0409     TRUE 0.986 10.000 0.038 1.000 Y NA
 7504614 7504615 CLJ_B0409 CLJ_B0410     TRUE 0.766 63.000 0.091 NA   NA
 7504615 7504616 CLJ_B0410 CLJ_B0411     FALSE 0.392 207.000 0.087 NA   NA
 7504616 7504617 CLJ_B0411 CLJ_B0412     TRUE 0.921 26.000 0.087 NA   NA
 7504618 7504619 CLJ_B0413 CLJ_B0414     FALSE 0.167 200.000 0.000 NA   NA
 7504620 7504621 CLJ_B0415 CLJ_B0416     FALSE 0.201 194.000 0.000 1.000   NA
 7504621 7504622 CLJ_B0416 CLJ_B0417     FALSE 0.031 312.000 0.000 1.000   NA
 7504624 7504625 CLJ_B0419 CLJ_B0420     TRUE 0.596 134.000 0.013 NA   NA
 7504625 7504626 CLJ_B0420 CLJ_B0421     TRUE 0.987 -54.000 0.105 1.000   NA
 7504626 7504627 CLJ_B0421 CLJ_B0422     TRUE 0.997 -10.000 0.429 1.000 Y NA
 7504627 7504628 CLJ_B0422 CLJ_B0423     FALSE 0.473 108.000 0.000 1.000 N NA
 7504628 7504629 CLJ_B0423 CLJ_B0424     FALSE 0.003 1392.000 0.000 1.000 N NA
 7504629 7504630 CLJ_B0424 CLJ_B0425     TRUE 0.990 23.000 0.431 0.046 Y NA
 7504630 7504631 CLJ_B0425 CLJ_B0426     TRUE 0.997 0.000 0.678 0.046 Y NA
 7504631 7504632 CLJ_B0426 CLJ_B0427     TRUE 0.990 11.000 0.091 0.046 Y NA
 7504632 7504633 CLJ_B0427 CLJ_B0428     TRUE 0.959 51.000 0.237 0.046 Y NA
 7504633 7504634 CLJ_B0428 CLJ_B0429     TRUE 0.991 14.000 0.221 0.046 Y NA
 7504634 7504635 CLJ_B0429 CLJ_B0430     FALSE 0.018 356.000 0.000 NA   NA
 7504636 7504637 CLJ_B0431 CLJ_B0432     TRUE 0.936 18.000 0.059 NA   NA
 7504637 7504638 CLJ_B0432 CLJ_B0433     TRUE 0.800 115.000 0.231 NA   NA
 7504639 7504640 CLJ_B0434 CLJ_B0435     FALSE 0.011 402.000 0.000 NA   NA
 7504640 7504641 CLJ_B0435 CLJ_B0436     TRUE 0.876 93.000 0.667 NA   NA
 7504641 7504642 CLJ_B0436 CLJ_B0437     FALSE 0.053 270.000 0.000 NA   NA
 7504646 7504647 CLJ_B0441 CLJ_B0442     FALSE 0.012 397.000 0.000 NA   NA
 7504647 7504648 CLJ_B0442 CLJ_B0443     FALSE 0.182 195.000 0.000 NA   NA
 7504648 7504649 CLJ_B0443 CLJ_B0444   pstA_1 TRUE 0.655 36.000 0.000 NA   NA
 7504649 7504650 CLJ_B0444 CLJ_B0445 pstA_1   TRUE 0.995 2.000 0.270 0.002 Y NA
 7504650 7504651 CLJ_B0445 CLJ_B0446     TRUE 0.825 121.000 0.294 1.000   NA
 7504651 7504652 CLJ_B0446 CLJ_B0447     FALSE 0.020 355.000 0.000 1.000   NA
 7504654 7504655 CLJ_B0449 CLJ_B0450     TRUE 0.824 78.000 0.286 NA   NA
 7504655 7504656 CLJ_B0450 CLJ_B0451     TRUE 0.806 87.000 0.250 NA   NA
 7504656 7504657 CLJ_B0451 CLJ_B0452     FALSE 0.068 254.000 0.000 NA   NA
 7504657 7504658 CLJ_B0452 CLJ_B0454     TRUE 0.699 64.000 0.034 NA   NA
 7504660 7504661 CLJ_B0455 CLJ_B0456     TRUE 0.716 137.000 0.079 1.000   NA
 7504662 7504663 CLJ_B0457 CLJ_B0458     FALSE 0.003 958.000 0.000 1.000 N NA
 7504664 7504665 CLJ_B0459 CLJ_B0460   rnhA TRUE 0.968 -25.000 0.003 NA   NA
 7504665 7504666 CLJ_B0460 CLJ_B0461 rnhA   TRUE 0.612 63.000 0.003 NA   NA
 7504666 7504667 CLJ_B0461 CLJ_B0462     TRUE 0.677 181.000 0.400 NA   NA
 7504667 7504668 CLJ_B0462 CLJ_B0463     TRUE 0.953 32.000 0.400 0.028   NA
 7504668 7504669 CLJ_B0463 CLJ_B0464     FALSE 0.029 309.000 0.000 NA   NA
 7504669 7504670 CLJ_B0464 CLJ_B0465     TRUE 0.709 30.000 0.000 NA   NA
 7504670 7504671 CLJ_B0465 CLJ_B0466     FALSE 0.249 174.000 0.000 NA   NA
 7504671 7504672 CLJ_B0466 CLJ_B0467     FALSE 0.050 273.000 0.000 NA   NA
 7504672 7504673 CLJ_B0467 CLJ_B0468   clpB FALSE 0.008 442.000 0.000 NA   NA
 7504674 7504675 CLJ_B0469 CLJ_B0470     TRUE 0.915 58.000 0.796 1.000   NA
 7504676 7504677 CLJ_B0471 CLJ_B0472 manA   FALSE 0.019 350.000 0.000 NA   NA
 7504677 7504678 CLJ_B0472 CLJ_B0473   uppP_2 TRUE 0.859 108.000 0.500 NA   NA
 7504678 7504679 CLJ_B0473 CLJ_B0474 uppP_2   TRUE 0.782 24.000 0.000 NA   NA
 7504679 7504680 CLJ_B0474 CLJ_B0475   rrs_7 FALSE 0.058 264.000 0.000 NA   NA
 7504680 7504681 CLJ_B0475 CLJ_B0476 rrs_7   FALSE 0.374 143.000 0.000 NA   NA
 7504681 7504682 CLJ_B0476 CLJ_B0477     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7504682 7504683 CLJ_B0477 CLJ_B0480   rrl_7 FALSE 0.438 74.000 0.000 NA   NA
 7504683 7504684 CLJ_B0480 CLJ_B0481 rrl_7 rrf_7 FALSE 0.423 106.000 0.000 NA   NA
 7504684 7504685 CLJ_B0481 CLJ_B0482 rrf_7   TRUE 0.877 8.000 0.000 NA   NA
 7504687 7504688 CLJ_B0484 CLJ_B0485     FALSE 0.003 923.000 0.000 1.000 N NA
 7504688 7504689 CLJ_B0485 CLJ_B0486     TRUE 0.679 143.000 0.027 0.061 N NA
 7504689 7504690 CLJ_B0486 CLJ_B0487     TRUE 0.703 203.000 0.054 0.061 Y NA
 7504690 7504691 CLJ_B0487 CLJ_B0488     FALSE 0.050 415.000 0.000 1.000 Y NA
 7504691 7504692 CLJ_B0488 CLJ_B0490     FALSE 0.006 523.000 0.000 NA N NA
 7504693 7504694 CLJ_B0491 CLJ_B0492   panD TRUE 0.567 88.000 0.004 NA   NA
 7504694 7504695 CLJ_B0492 CLJ_B0493 panD panC FALSE 0.384 308.000 0.342 1.000 Y NA
 7504695 7504696 CLJ_B0493 CLJ_B0494 panC panB TRUE 0.579 276.000 0.395 0.001 Y NA
 7504699 7504700 CLJ_B0497 CLJ_B0498     TRUE 0.988 3.000 0.667 NA   NA
 7504702 7504703 CLJ_B0500 CLJ_B0501 hypB   FALSE 0.306 236.000 0.115 1.000 N NA
 7504703 7504704 CLJ_B0501 CLJ_B0502   hypA TRUE 0.875 56.000 0.333 1.000   NA
 7504704 7504705 CLJ_B0502 CLJ_B0503 hypA   TRUE 0.905 38.000 0.214 NA   NA
 7504707 7504708 CLJ_B0505 CLJ_B0506     FALSE 0.418 93.000 0.000 NA   NA
 7504708 7504709 CLJ_B0506 CLJ_B0507   addA FALSE 0.316 158.000 0.000 NA   NA
 7504709 7504710 CLJ_B0507 CLJ_B0508 addA   TRUE 0.595 142.000 0.010 1.000 N NA
 7504710 7504711 CLJ_B0508 CLJ_B0509   pepT TRUE 0.733 76.000 0.056 1.000 N NA
 7504713 7504714 CLJ_B0511 CLJ_B0512     FALSE 0.152 206.000 0.000 NA   NA
 7504714 7504715 CLJ_B0512 CLJ_B0513     TRUE 0.823 140.000 0.400 NA   NA
 7504715 7504716 CLJ_B0513 CLJ_B0514     FALSE 0.254 173.000 0.000 NA   NA
 7504716 7504717 CLJ_B0514 CLJ_B0515     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7504717 7504718 CLJ_B0515 CLJ_B0516     FALSE 0.423 138.000 0.000 NA N NA
 7504719 7504720 CLJ_B0517 CLJ_B0518     TRUE 0.994 13.000 0.461 0.045 Y NA
 7504722 7504723 CLJ_B0520 CLJ_B0521   thiE FALSE 0.063 265.000 0.000 NA N NA
 7504723 7504724 CLJ_B0521 CLJ_B0522 thiE thiM_1 TRUE 0.996 -9.000 0.190 0.005 Y NA
 7504724 7504725 CLJ_B0522 CLJ_B0523 thiM_1 thiD_1 TRUE 0.620 222.000 0.039 0.005 Y NA
 7504726 7504727 CLJ_B0525 CLJ_B0526   ddlB FALSE 0.417 112.000 0.000 NA   NA
 7504727 7504728 CLJ_B0526 CLJ_B0527 ddlB   FALSE 0.503 157.000 0.004 1.000 N NA
 7504728 7504729 CLJ_B0527 CLJ_B0528     TRUE 0.992 4.000 0.182 1.000 Y NA
 7504729 7504730 CLJ_B0528 CLJ_B0529     TRUE 0.995 1.000 0.241 0.031 Y NA
 7504730 7504731 CLJ_B0529 CLJ_B0530     TRUE 0.990 12.000 0.167 1.000 Y NA
 7504731 7504732 CLJ_B0530 CLJ_B0531     TRUE 0.991 2.000 0.048 0.033 Y NA
 7504732 7504733 CLJ_B0531 CLJ_B0532     TRUE 0.934 29.000 0.222 NA   NA
 7504733 7504734 CLJ_B0532 CLJ_B0533     FALSE 0.011 402.000 0.000 NA   NA
 7504734 7504735 CLJ_B0533 CLJ_B0534     TRUE 0.991 -6.000 0.500 NA   NA
 7504735 7504736 CLJ_B0534 CLJ_B0535     FALSE 0.374 143.000 0.000 NA   NA
 7504736 7504737 CLJ_B0535 CLJ_B0536     TRUE 0.636 61.000 0.007 NA   NA
 7504737 7504738 CLJ_B0536 CLJ_B0537     TRUE 0.872 10.000 0.000 NA   NA
 7504738 7504739 CLJ_B0537 CLJ_B0538     FALSE 0.005 519.000 0.000 NA   NA
 7504739 7504740 CLJ_B0538 CLJ_B0539     FALSE 0.466 163.000 0.010 NA   NA
 7504740 7504741 CLJ_B0539 CLJ_B0540     TRUE 0.586 134.000 0.010 NA   NA
 7504741 7504742 CLJ_B0540 CLJ_B0541     FALSE 0.490 176.000 0.050 NA   NA
 7504742 7504743 CLJ_B0541 CLJ_B0542     TRUE 0.958 2.000 0.025 NA   NA
 7504744 7504745 CLJ_B0543 CLJ_B0544     TRUE 0.805 21.000 0.000 NA   NA
 7504746 7504747 CLJ_B0545 CLJ_B0546 sbcD sbcC TRUE 0.994 -25.000 0.669 NA N NA
 7504747 7504748 CLJ_B0546 CLJ_B0547 sbcC   TRUE 0.789 35.000 0.005 NA   NA
 7504748 7504749 CLJ_B0547 CLJ_B0548     FALSE 0.003 827.000 0.000 NA   NA
 7504749 7504750 CLJ_B0548 CLJ_B0549     FALSE 0.007 465.000 0.000 NA   NA
 7504750 7504751 CLJ_B0549 CLJ_B0550   cadA_1 TRUE 0.730 76.000 0.053 1.000 N NA
 7504751 7504752 CLJ_B0550 CLJ_B0551 cadA_1   FALSE 0.009 420.000 0.000 NA   NA
 7504752 7504753 CLJ_B0551 CLJ_B0552     FALSE 0.192 190.000 0.000 NA   NA
 7504753 7504754 CLJ_B0552 CLJ_B0553     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7504754 7504755 CLJ_B0553 CLJ_B0554     FALSE 0.006 497.000 0.000 NA   NA
 7504759 7504760 CLJ_B0558 CLJ_B0559     FALSE 0.008 450.000 0.000 NA N NA
 7504760 7504761 CLJ_B0559 CLJ_B0560     TRUE 0.985 10.000 0.667 NA   NA
 7504762 7504763 CLJ_B0561 CLJ_B0562     TRUE 0.940 0.000 0.000 0.072   NA
 7504764 7504765 CLJ_B0563 CLJ_B0564   sagB TRUE 0.690 165.000 0.222 NA   NA
 7504765 7504766 CLJ_B0564 CLJ_B0565 sagB sagC TRUE 0.978 4.000 0.222 NA   NA
 7504766 7504767 CLJ_B0565 CLJ_B0566 sagC sagD TRUE 0.970 16.000 0.318 NA   NA
 7504767 7504768 CLJ_B0566 CLJ_B0567 sagD   TRUE 0.984 -25.000 0.091 NA   NA
 7504768 7504769 CLJ_B0567 CLJ_B0568     TRUE 0.989 8.000 1.000 NA   NA
 7504769 7504770 CLJ_B0568 CLJ_B0569   sagG FALSE 0.020 344.000 0.000 NA   NA
 7504770 7504771 CLJ_B0569 CLJ_B0570 sagG sagH TRUE 0.982 12.000 0.500 NA N NA
 7504771 7504772 CLJ_B0570 CLJ_B0571 sagH sagI TRUE 0.979 2.000 0.160 NA N NA
 7504772 7504773 CLJ_B0571 CLJ_B0572 sagI   FALSE 0.016 375.000 0.000 1.000   NA
 7504774 7504775 CLJ_B0573 CLJ_B0574     TRUE 0.843 118.000 0.409 NA   NA
 7504775 7504776 CLJ_B0574 CLJ_B0575     TRUE 0.726 127.000 0.091 NA   NA
 7504777 7504778 CLJ_B0576 CLJ_B0577 trmB   FALSE 0.136 212.000 0.000 NA   NA
 7504780 7504781 CLJ_B0579 CLJ_B0580     FALSE 0.516 63.000 0.000 1.000 N NA
 7504783 7504784 CLJ_B0582 CLJ_B0583     FALSE 0.068 262.000 0.000 NA N NA
 7504784 7504785 CLJ_B0583 CLJ_B0584     FALSE 0.040 297.000 0.000 1.000   NA
 7504785 7504786 CLJ_B0584 CLJ_B0585     TRUE 0.937 36.000 0.400 1.000   NA
 7504786 7504787 CLJ_B0585 CLJ_B0586     FALSE 0.491 205.000 0.000 1.000 Y NA
 7504787 7504788 CLJ_B0586 CLJ_B0587   serS_2 FALSE 0.008 481.000 0.000 1.000 N NA
 7504788 7504789 CLJ_B0587 CLJ_B0588 serS_2   FALSE 0.005 595.000 0.000 1.000 N NA
 7504790 7504791 CLJ_B0589 CLJ_B0590     FALSE 0.018 362.000 0.000 1.000   NA
 7504794 7504795 CLJ_B0593 CLJ_B0594     FALSE 0.179 196.000 0.000 NA   NA
 7504800 7504801 CLJ_B0599 CLJ_B0600     FALSE 0.359 147.000 0.000 NA   NA
 7504804 7504805 CLJ_B0603 CLJ_B0604     FALSE 0.004 623.000 0.000 NA   NA
 7504805 7504806 CLJ_B0604 CLJ_B0605     FALSE 0.022 680.000 0.000 0.005 Y NA
 7504806 7504807 CLJ_B0605 CLJ_B0606     FALSE 0.021 351.000 0.000 1.000   NA
 7504807 7504808 CLJ_B0606 CLJ_B0607     TRUE 0.741 45.000 0.008 1.000   NA
 7504809 7504810 CLJ_B0608 CLJ_B0610     FALSE 0.174 294.000 0.000 1.000 Y NA
 7504810 7504811 CLJ_B0610 CLJ_B0611     TRUE 0.997 0.000 0.455 0.001 Y NA
 7504812 7504813 CLJ_B0612 CLJ_B0613     FALSE 0.006 488.000 0.000 NA   NA
 7504815 7504816 CLJ_B0615 CLJ_B0616     TRUE 0.994 3.000 0.313 NA Y NA
 7504816 7504817 CLJ_B0616 CLJ_B0617     FALSE 0.017 361.000 0.000 NA   NA
 7504817 7504818 CLJ_B0617 CLJ_B0618     TRUE 0.875 9.000 0.000 NA   NA
 7504818 7504819 CLJ_B0618 CLJ_B0619   pepP FALSE 0.006 508.000 0.000 NA   NA
 7504820 7504821 CLJ_B0620 CLJ_B0621     FALSE 0.383 141.000 0.000 NA   NA
 7504821 7504822 CLJ_B0621 CLJ_B0622     FALSE 0.448 69.000 0.000 NA   NA
 7504822 7504823 CLJ_B0622 CLJ_B0623     TRUE 0.566 67.000 0.000 0.013   NA
 7504824 7504825 CLJ_B0624 CLJ_B0625     FALSE 0.005 516.000 0.000 NA   NA
 7504825 7504826 CLJ_B0625 CLJ_B0626     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7504826 7504827 CLJ_B0626 CLJ_B0627     FALSE 0.217 182.000 0.000 NA   NA
 7504827 7504828 CLJ_B0627 CLJ_B0628     FALSE 0.455 66.000 0.000 NA   NA
 7504828 7504829 CLJ_B0628 CLJ_B0629     FALSE 0.054 269.000 0.000 NA   NA
 7504829 7504830 CLJ_B0629 CLJ_B0630     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 7504830 7504831 CLJ_B0630 CLJ_B0631     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7504831 7504832 CLJ_B0631 CLJ_B0632     FALSE 0.009 422.000 0.000 NA   NA
 7504832 7504833 CLJ_B0632 CLJ_B0633     FALSE 0.003 919.000 0.000 NA   NA
 7504835 7504836 CLJ_B0635 CLJ_B0637 mscL   FALSE 0.084 237.000 0.000 NA   NA
 7504838 7504839 CLJ_B0639 CLJ_B0640     FALSE 0.433 76.000 0.000 NA   NA
 7504839 7504840 CLJ_B0640 CLJ_B0641     FALSE 0.058 264.000 0.000 NA   NA
 7504840 7504841 CLJ_B0641 CLJ_B0642     TRUE 0.986 -7.000 0.165 1.000 N NA
 7504841 7504842 CLJ_B0642 CLJ_B0643     TRUE 0.967 0.000 0.035 NA   NA
 7504842 7504843 CLJ_B0643 CLJ_B0644     FALSE 0.025 325.000 0.000 NA   NA
 7504843 7504844 CLJ_B0644 CLJ_B0645   potA FALSE 0.004 665.000 0.000 1.000 N NA
 7504844 7504845 CLJ_B0645 CLJ_B0646 potA potB TRUE 0.997 0.000 0.789 1.000 Y NA
 7504845 7504846 CLJ_B0646 CLJ_B0647 potB potCD TRUE 0.991 0.000 0.022 0.031 Y NA
 7504846 7504847 CLJ_B0647 CLJ_B0648 potCD   FALSE 0.005 606.000 0.000 NA N NA
 7504847 7504848 CLJ_B0648 CLJ_B0649     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7504852 7504853 CLJ_B0653 CLJ_B0654     FALSE 0.089 234.000 0.000 NA   NA
 7504853 7504854 CLJ_B0654 CLJ_B0655     FALSE 0.416 83.000 0.000 NA   NA
 7504856 7504857 CLJ_B0657 CLJ_B0658     FALSE 0.006 477.000 0.000 NA   NA
 7504857 7504858 CLJ_B0658 CLJ_B0659     FALSE 0.010 418.000 0.000 NA   NA
 7504860 7504861 CLJ_B0661 CLJ_B0662   lepB_1 FALSE 0.329 161.000 0.000 1.000   NA
 7504861 7504862 CLJ_B0662 CLJ_B0663 lepB_1   FALSE 0.004 832.000 0.000 1.000 N NA
 7504862 7504863 CLJ_B0663 CLJ_B0664     FALSE 0.004 605.000 0.000 NA   NA
 7504863 7504864 CLJ_B0664 CLJ_B0665     TRUE 0.954 40.000 1.000 NA   NA
 7504864 7504865 CLJ_B0665 CLJ_B0666     FALSE 0.003 694.000 0.000 NA   NA
 7504865 7504866 CLJ_B0666 CLJ_B0667     FALSE 0.003 789.000 0.000 NA   NA
 7504866 7504867 CLJ_B0667 CLJ_B0668     TRUE 0.979 -7.000 0.080 NA   NA
 7504867 7504868 CLJ_B0668 CLJ_B0669     TRUE 0.958 37.000 1.000 NA   NA
 7504868 7504869 CLJ_B0669 CLJ_B0670     TRUE 0.915 35.000 0.222 NA   NA
 7504869 7504870 CLJ_B0670 CLJ_B0671     TRUE 0.633 176.000 0.222 NA   NA
 7504870 7504871 CLJ_B0671 CLJ_B0672     TRUE 0.965 23.000 0.400 NA   NA
 7504871 7504872 CLJ_B0672 CLJ_B0673     TRUE 0.736 93.000 0.095 NA   NA
 7504872 7504873 CLJ_B0673 CLJ_B0674     TRUE 0.970 15.000 0.238 NA N NA
 7504873 7504874 CLJ_B0674 CLJ_B0675     FALSE 0.005 565.000 0.000 1.000   NA
 7504874 7504875 CLJ_B0675 CLJ_B0676     FALSE 0.400 137.000 0.000 NA   NA
 7504875 7504876 CLJ_B0676 CLJ_B0677     FALSE 0.003 729.000 0.000 NA   NA
 7504876 7504877 CLJ_B0677 CLJ_B0678     FALSE 0.023 329.000 0.000 NA   NA
 7504877 7504878 CLJ_B0678 CLJ_B0679     FALSE 0.012 397.000 0.000 NA   NA
 7504878 7504879 CLJ_B0679 CLJ_B0680     FALSE 0.006 488.000 0.000 NA   NA
 7504880 7504881 CLJ_B0681 CLJ_B0682     FALSE 0.027 335.000 0.000 1.000 N NA
 7504882 7504883 CLJ_B0683 CLJ_B0684 asnS   FALSE 0.003 720.000 0.000 NA   NA
 7504885 7504886 CLJ_B0686 CLJ_B0687     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7504886 7504887 CLJ_B0687 CLJ_B0688     FALSE 0.003 736.000 0.000 NA   NA
 7504887 7504888 CLJ_B0688 CLJ_B0689     TRUE 0.945 21.000 0.085 1.000 N NA
 7504888 7504889 CLJ_B0689 CLJ_B0690     TRUE 0.989 29.000 0.932 1.000 Y NA
 7504889 7504890 CLJ_B0690 CLJ_B0691     TRUE 0.572 53.000 0.000 1.000 N NA
 7504890 7504891 CLJ_B0691 CLJ_B0692     FALSE 0.133 214.000 0.000 NA   NA
 7504891 7504892 CLJ_B0692 CLJ_B0693     FALSE 0.414 87.000 0.000 NA   NA
 7504893 7504894 CLJ_B0694 CLJ_B0695     TRUE 0.774 141.000 0.200 NA N NA
 7504894 7504895 CLJ_B0695 CLJ_B0696     TRUE 0.995 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 7504898 7504899 CLJ_B0699 CLJ_B0700     TRUE 0.722 169.000 0.286 1.000 N NA
 7504901 7504902 CLJ_B0702 CLJ_B0703     TRUE 0.742 102.000 0.083 1.000   NA
 7504903 7504904 CLJ_B0704 CLJ_B0705 csaA   FALSE 0.303 208.000 0.023 1.000   NA
 7504904 7504905 CLJ_B0705 CLJ_B0706     FALSE 0.039 298.000 0.000 1.000   NA
 7504908 7504909 CLJ_B0709 CLJ_B0710     FALSE 0.005 520.000 0.000 NA   NA
 7504910 7504911 CLJ_B0711 CLJ_B0712     FALSE 0.226 180.000 0.000 NA   NA
 7504912 7504913 CLJ_B0713 CLJ_B0714 rhlE   FALSE 0.005 599.000 0.000 1.000   NA
 7504913 7504914 CLJ_B0714 CLJ_B0715     TRUE 0.696 172.000 0.286 1.000   NA
 7504914 7504915 CLJ_B0715 CLJ_B0716     TRUE 0.948 28.000 0.250 1.000 N NA
 7504917 7504918 CLJ_B0718 CLJ_B0719     FALSE 0.413 123.000 0.000 NA   NA
 7504918 7504919 CLJ_B0719 CLJ_B0720     FALSE 0.007 473.000 0.000 NA   NA
 7504919 7504920 CLJ_B0720 CLJ_B0721     FALSE 0.453 67.000 0.000 NA   NA
 7504920 7504921 CLJ_B0721 CLJ_B0722     FALSE 0.410 130.000 0.000 NA   NA
 7504922 7504923 CLJ_B0723 CLJ_B0724     FALSE 0.271 169.000 0.000 NA   NA
 7504924 7504925 CLJ_B0725 CLJ_B0726 licT   TRUE 0.582 207.000 0.409 1.000   NA
 7504925 7504926 CLJ_B0726 CLJ_B0727     TRUE 0.959 12.000 0.074 1.000   NA
 7504926 7504927 CLJ_B0727 CLJ_B0728     FALSE 0.004 628.000 0.000 1.000   NA
 7504927 7504928 CLJ_B0728 CLJ_B0729     TRUE 0.724 158.000 0.190 1.000 N NA
 7504928 7504929 CLJ_B0729 CLJ_B0730   ric TRUE 0.779 60.000 0.071 1.000 N NA
 7504929 7504930 CLJ_B0730 CLJ_B0731 ric   TRUE 0.922 26.000 0.089 NA   NA
 7504934 7504935 CLJ_B0735 CLJ_B0736     TRUE 0.879 7.000 0.000 NA   NA
 7504935 7504936 CLJ_B0736 CLJ_B0737     FALSE 0.003 899.000 0.000 NA   NA
 7504936 7504937 CLJ_B0737 CLJ_B0738     FALSE 0.340 152.000 0.000 NA   NA
 7504937 7504938 CLJ_B0738 CLJ_B0739     FALSE 0.491 57.000 0.000 NA   NA
 7504938 7504939 CLJ_B0739 CLJ_B0740     TRUE 0.987 -37.000 0.118 1.000   NA
 7504939 7504940 CLJ_B0740 CLJ_B0741     TRUE 0.966 31.000 1.000 NA   NA
 7504940 7504941 CLJ_B0741 CLJ_B0742     FALSE 0.003 1301.000 0.000 NA   NA
 7504941 7504942 CLJ_B0742 CLJ_B0743     FALSE 0.045 290.000 0.000 1.000   NA
 7504942 7504943 CLJ_B0743 CLJ_B0744   greA_1 TRUE 0.614 136.000 0.008 1.000 N NA
 7504943 7504944 CLJ_B0744 CLJ_B0745 greA_1   FALSE 0.503 168.000 0.031 NA   NA
 7504944 7504945 CLJ_B0745 CLJ_B0746     FALSE 0.049 274.000 0.000 NA   NA
 7504945 7504946 CLJ_B0746 CLJ_B0747     TRUE 0.895 95.000 0.041 0.070 Y NA
 7504946 7504947 CLJ_B0747 CLJ_B0748     FALSE 0.415 88.000 0.000 NA   NA
 7504947 7504948 CLJ_B0748 CLJ_B0749     FALSE 0.123 219.000 0.000 NA   NA
 7504948 7504949 CLJ_B0749 CLJ_B0750     FALSE 0.204 186.000 0.000 NA   NA
 7504949 7504950 CLJ_B0750 CLJ_B0751     TRUE 0.988 -3.000 0.333 NA   NA
 7504950 7504951 CLJ_B0751 CLJ_B0752     TRUE 0.984 4.000 0.444 NA   NA
 7504951 7504952 CLJ_B0752 CLJ_B0753     FALSE 0.176 197.000 0.000 NA   NA
 7504952 7504953 CLJ_B0753 CLJ_B0754     FALSE 0.358 153.000 0.000 1.000   NA
 7504953 7504954 CLJ_B0754 CLJ_B0755     TRUE 0.908 1.000 0.000 NA   NA
 7504954 7504955 CLJ_B0755 CLJ_B0756     FALSE 0.266 170.000 0.000 NA   NA
 7504955 7504956 CLJ_B0756 CLJ_B0757     FALSE 0.006 555.000 0.000 1.000 N NA
 7504956 7504957 CLJ_B0757 CLJ_B0758     FALSE 0.112 351.000 0.000 0.004 Y NA
 7504957 7504958 CLJ_B0758 CLJ_B0759   fhuB TRUE 0.947 96.000 0.500 1.000 Y NA
 7504958 7504959 CLJ_B0759 CLJ_B0760 fhuB fhuG TRUE 0.997 0.000 0.750 0.030 Y NA
 7504959 7504960 CLJ_B0760 CLJ_B0761 fhuG fhuC TRUE 0.589 229.000 0.100 1.000 Y NA
 7504960 7504961 CLJ_B0761 CLJ_B0762 fhuC nifH TRUE 0.973 30.000 0.150 1.000 Y NA
 7504961 7504962 CLJ_B0762 CLJ_B0763 nifH   TRUE 0.990 3.000 0.571 0.044 N NA
 7504962 7504963 CLJ_B0763 CLJ_B0764     TRUE 0.998 -13.000 1.000 0.031 Y NA
 7504963 7504964 CLJ_B0764 CLJ_B0765     FALSE 0.010 445.000 0.000 1.000 N NA
 7504964 7504965 CLJ_B0765 CLJ_B0766     FALSE 0.470 61.000 0.000 NA   NA
 7504967 7504968 CLJ_B0768 CLJ_B0769 gcvT gcvH TRUE 0.829 125.000 0.000 0.001 Y NA
 7504968 7504969 CLJ_B0769 CLJ_B0770 gcvH gcvPA TRUE 0.985 3.000 0.005 1.000 Y NA
 7504969 7504970 CLJ_B0770 CLJ_B0771 gcvPA gcvPB TRUE 0.996 0.000 0.316 0.001 Y NA
 7504970 7504971 CLJ_B0771 CLJ_B0772 gcvPB   FALSE 0.080 298.000 0.010 1.000 N NA
 7504971 7504972 CLJ_B0772 CLJ_B0773     FALSE 0.519 194.000 0.118 1.000 N NA
 7504972 7504973 CLJ_B0773 CLJ_B0774     FALSE 0.093 232.000 0.000 NA   NA
 7504973 7504974 CLJ_B0774 CLJ_B0775     TRUE 0.877 8.000 0.000 NA   NA
 7504974 7504975 CLJ_B0775 CLJ_B0776     FALSE 0.024 326.000 0.000 NA   NA
 7504975 7504976 CLJ_B0776 CLJ_B0777     TRUE 0.883 52.000 0.273 1.000 N NA
 7504976 7504977 CLJ_B0777 CLJ_B0778     TRUE 0.984 -13.000 0.094 1.000   NA
 7504979 7504980 CLJ_B0780 CLJ_B0781     FALSE 0.403 136.000 0.000 NA   NA
 7504980 7504981 CLJ_B0781 CLJ_B0782     TRUE 0.759 26.000 0.000 NA   NA
 7504983 7504984 CLJ_B0784 CLJ_B0785     FALSE 0.010 415.000 0.000 NA   NA
 7504984 7504985 CLJ_B0785 CLJ_B0786     FALSE 0.343 199.000 0.027 NA   NA
 7504985 7504986 CLJ_B0786 CLJ_B0787     TRUE 0.582 152.000 0.027 1.000   NA
 7504986 7504987 CLJ_B0787 CLJ_B0788     TRUE 0.725 54.000 0.025 NA   NA
 7504987 7504988 CLJ_B0788 CLJ_B0789     FALSE 0.008 438.000 0.000 NA   NA
 7504989 7504990 CLJ_B0790 CLJ_B0791   luxS TRUE 0.974 -16.000 0.010 1.000 N NA
 7504990 7504991 CLJ_B0791 CLJ_B0792 luxS metC TRUE 0.969 2.000 0.048 1.000 N NA
 7504991 7504992 CLJ_B0792 CLJ_B0793 metC   TRUE 0.668 100.000 0.021 1.000 N NA
 7504995 7504996 CLJ_B0796 CLJ_B0797     FALSE 0.240 181.000 0.000 1.000   NA
 7504997 7504998 CLJ_B0798 CLJ_B0799     TRUE 0.697 88.000 0.061 NA   NA
 7504998 7504999 CLJ_B0799 CLJ_B0800     FALSE 0.005 533.000 0.000 NA   NA
 7504999 7505000 CLJ_B0800 CLJ_B0801     TRUE 0.748 93.000 0.111 NA   NA
 7505001 7505002 CLJ_B0802 CLJ_B0803     FALSE 0.110 224.000 0.000 NA   NA
 7505002 7505003 CLJ_B0803 CLJ_B0804     TRUE 0.832 19.000 0.000 NA N NA
 7505003 7505004 CLJ_B0804 CLJ_B0805     FALSE 0.424 105.000 0.000 NA   NA
 7505004 7505005 CLJ_B0805 CLJ_B0806     FALSE 0.120 220.000 0.000 NA   NA
 7505005 7505006 CLJ_B0806 CLJ_B0807     FALSE 0.083 238.000 0.000 NA   NA
 7505006 7505007 CLJ_B0807 CLJ_B0808     TRUE 0.810 20.000 0.000 NA   NA
 7505007 7505008 CLJ_B0808 CLJ_B0809     FALSE 0.140 210.000 0.000 NA   NA
 7505008 7505009 CLJ_B0809 CLJ_B0810     FALSE 0.016 388.000 0.000 1.000 N NA
 7505009 7505010 CLJ_B0810 CLJ_B0811     FALSE 0.370 144.000 0.000 NA   NA
 7505010 7505011 CLJ_B0811 CLJ_B0812     FALSE 0.008 433.000 0.000 NA   NA
 7505013 7505014 CLJ_B0814 CLJ_B0815     TRUE 0.990 -7.000 0.400 NA   NA
 7505014 7505015 CLJ_B0815 CLJ_B0816     FALSE 0.007 454.000 0.000 NA   NA
 7505015 7505016 CLJ_B0816 CLJ_B0817   thyA TRUE 0.970 -10.000 0.017 NA   NA
 7505016 7505017 CLJ_B0817 CLJ_B0818 thyA   TRUE 0.943 12.000 0.017 1.000 N NA
 7505017 7505018 CLJ_B0818 CLJ_B0819     TRUE 0.815 46.000 0.047 1.000 N NA
 7505018 7505019 CLJ_B0819 CLJ_B0820   thiD_2 TRUE 0.714 78.000 0.043 1.000 N NA
 7505019 7505020 CLJ_B0820 CLJ_B0821 thiD_2   FALSE 0.477 177.000 0.043 NA   NA
 7505022 7505023 CLJ_B0823 CLJ_B0824     TRUE 0.990 3.000 0.833 NA   NA
 7505023 7505024 CLJ_B0824 CLJ_B0825     FALSE 0.048 276.000 0.000 NA   NA
 7505024 7505025 CLJ_B0825 CLJ_B0826     FALSE 0.037 461.000 0.167 1.000 N NA
 7505025 7505026 CLJ_B0826 CLJ_B0827     TRUE 0.991 0.000 0.667 NA   NA
 7505026 7505027 CLJ_B0827 CLJ_B0828     TRUE 0.772 118.000 0.167 NA   NA
 7505027 7505028 CLJ_B0828 CLJ_B0829     TRUE 0.868 46.000 0.167 1.000   NA
 7505028 7505029 CLJ_B0829 CLJ_B0830     FALSE 0.003 863.000 0.000 NA   NA
 7505029 7505030 CLJ_B0830 CLJ_B0831     FALSE 0.051 271.000 0.000 NA   NA
 7505030 7505031 CLJ_B0831 CLJ_B0832     FALSE 0.512 184.000 0.100 NA   NA
 7505031 7505032 CLJ_B0832 CLJ_B0833     TRUE 0.998 -13.000 0.750 1.000 Y NA
 7505032 7505033 CLJ_B0833 CLJ_B0834     FALSE 0.006 507.000 0.000 NA   NA
 7505033 7505034 CLJ_B0834 CLJ_B0835     FALSE 0.395 138.000 0.000 NA   NA
 7505034 7505035 CLJ_B0835 CLJ_B0836     TRUE 0.906 172.000 0.636 1.000 Y NA
 7505035 7505036 CLJ_B0836 CLJ_B0837     FALSE 0.212 189.000 0.000 1.000   NA
 7505038 7505039 CLJ_B0839 CLJ_B0840     TRUE 0.993 0.000 0.080 0.030 Y NA
 7505039 7505040 CLJ_B0840 CLJ_B0841     TRUE 0.992 3.000 0.167 1.000 Y NA
 7505042 7505043 CLJ_B0843 CLJ_B0844   dapB_1 FALSE 0.004 664.000 0.000 NA   NA
 7505043 7505044 CLJ_B0844 CLJ_B0845 dapB_1   TRUE 0.817 22.000 0.000 NA N NA
 7505044 7505045 CLJ_B0845 CLJ_B0846     FALSE 0.008 466.000 0.000 NA N NA
 7505045 7505046 CLJ_B0846 CLJ_B0847     FALSE 0.152 206.000 0.000 NA   NA
 7505046 7505047 CLJ_B0847 CLJ_B0848     FALSE 0.423 80.000 0.000 NA   NA
 7505047 7505048 CLJ_B0848 CLJ_B0849     FALSE 0.223 193.000 0.000 1.000 N NA
 7505050 7505051 CLJ_B0851 CLJ_B0852     FALSE 0.414 116.000 0.000 NA   NA
 7505051 7505052 CLJ_B0852 CLJ_B0853     FALSE 0.005 533.000 0.000 NA   NA
 7505052 7505053 CLJ_B0853 CLJ_B0854     FALSE 0.021 341.000 0.000 NA   NA
 7505053 7505054 CLJ_B0854 CLJ_B0855   brnQ FALSE 0.004 746.000 0.000 1.000 N NA
 7505056 7505057 CLJ_B0857 CLJ_B0858 feoA_1   TRUE 0.633 143.000 0.033 1.000   NA
 7505057 7505058 CLJ_B0858 CLJ_B0859   feoB_1 TRUE 0.985 -3.000 0.105 0.005   NA
 7505058 7505059 CLJ_B0859 CLJ_B0861 feoB_1 cobC FALSE 0.011 431.000 0.000 1.000 N NA
 7505059 7505060 CLJ_B0861 CLJ_B0862 cobC   FALSE 0.417 145.000 0.000 1.000 N NA
 7505060 7505061 CLJ_B0862 CLJ_B0863   cobS FALSE 0.063 271.000 0.000 1.000 N NA
 7505061 7505062 CLJ_B0863 CLJ_B0864 cobS   FALSE 0.266 170.000 0.000 NA   NA
 7505062 7505063 CLJ_B0864 CLJ_B0865     FALSE 0.029 309.000 0.000 NA   NA
 7505063 7505064 CLJ_B0865 CLJ_B0866     TRUE 0.683 131.000 0.053 NA   NA
 7505064 7505065 CLJ_B0866 CLJ_B0867     TRUE 0.981 18.000 0.828 NA   NA
 7505065 7505066 CLJ_B0867 CLJ_B0868     FALSE 0.005 517.000 0.000 NA   NA
 7505066 7505067 CLJ_B0868 CLJ_B0869     FALSE 0.050 273.000 0.000 NA   NA
 7505067 7505068 CLJ_B0869 CLJ_B0870   folP TRUE 0.846 104.000 0.003 1.000 Y NA
 7505068 7505069 CLJ_B0870 CLJ_B0871 folP   FALSE 0.441 162.000 0.003 NA   NA
 7505069 7505070 CLJ_B0871 CLJ_B0872   folK TRUE 0.571 100.000 0.003 NA   NA
 7505070 7505071 CLJ_B0872 CLJ_B0873 folK   FALSE 0.442 119.000 0.000 NA N NA
 7505071 7505072 CLJ_B0873 CLJ_B0874     FALSE 0.049 284.000 0.000 NA N NA
 7505072 7505073 CLJ_B0874 CLJ_B0875     TRUE 0.769 55.000 0.039 1.000 N NA
 7505073 7505074 CLJ_B0875 CLJ_B0876     TRUE 0.857 142.000 0.012 0.017 Y NA
 7505074 7505075 CLJ_B0876 CLJ_B0877     FALSE 0.003 727.000 0.000 NA   NA
 7505075 7505076 CLJ_B0877 CLJ_B0878     FALSE 0.008 443.000 0.000 NA   NA
 7505076 7505077 CLJ_B0878 CLJ_B0879     TRUE 0.985 5.000 0.500 NA   NA
 7505080 7505081 CLJ_B0882 CLJ_B0883     TRUE 0.958 19.000 0.200 NA   NA
 7505081 7505082 CLJ_B0883 CLJ_B0884     TRUE 0.986 -28.000 0.100 1.000   NA
 7505083 7505084 CLJ_B0885 CLJ_B0886     FALSE 0.003 685.000 0.000 NA   NA
 7505084 7505085 CLJ_B0886 CLJ_B0887     FALSE 0.003 721.000 0.000 1.000   NA
 7505085 7505086 CLJ_B0887 CLJ_B0888     FALSE 0.484 58.000 0.000 NA   NA
 7505087 7505088 CLJ_B0889 CLJ_B0890     TRUE 0.884 18.000 0.000 0.004   NA
 7505088 7505089 CLJ_B0890 CLJ_B0891     FALSE 0.450 105.000 0.000 1.000   NA
 7505090 7505091 CLJ_B0892 CLJ_B0893     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7505091 7505092 CLJ_B0893 CLJ_B0894     FALSE 0.249 174.000 0.000 NA   NA
 7505092 7505093 CLJ_B0894 CLJ_B0895     FALSE 0.044 284.000 0.000 NA   NA
 7505094 7505095 CLJ_B0896 CLJ_B0897     FALSE 0.048 277.000 0.000 NA   NA
 7505096 7505097 CLJ_B0898 CLJ_B0899   lipA FALSE 0.016 364.000 0.000 NA   NA
 7505098 7505099 CLJ_B0900 CLJ_B0901 oxdD   FALSE 0.323 156.000 0.000 NA   NA
 7505099 7505100 CLJ_B0901 CLJ_B0902     TRUE 0.661 58.000 0.010 NA   NA
 7505101 7505102 CLJ_B0903 CLJ_B0904     FALSE 0.012 399.000 0.000 1.000   NA
 7505105 7505106 CLJ_B0907 CLJ_B0908     FALSE 0.039 294.000 0.000 NA   NA
 7505108 7505109 CLJ_B0910 CLJ_B0911     TRUE 0.988 0.000 0.400 NA   NA
 7505110 7505111 CLJ_B0912 CLJ_B0913     FALSE 0.007 457.000 0.000 NA   NA
 7505111 7505112 CLJ_B0913 CLJ_B0914     FALSE 0.012 392.000 0.000 NA   NA
 7505120 7505121 CLJ_B0922 CLJ_B0923     TRUE 0.945 -37.000 0.000 NA   NA
 7505121 7505122 CLJ_B0923 CLJ_B0924     FALSE 0.007 469.000 0.000 NA   NA
 7505122 7505123 CLJ_B0924 CLJ_B0925     FALSE 0.433 76.000 0.000 NA   NA
 7505123 7505124 CLJ_B0925 CLJ_B0926     FALSE 0.412 127.000 0.000 NA   NA
 7505126 7505127 CLJ_B0928 CLJ_B0929     FALSE 0.346 156.000 0.000 1.000   NA
 7505127 7505128 CLJ_B0929 CLJ_B0930     FALSE 0.136 212.000 0.000 NA   NA
 7505128 7505129 CLJ_B0930 CLJ_B0931     FALSE 0.080 240.000 0.000 NA   NA
 7505129 7505130 CLJ_B0931 CLJ_B0932     TRUE 0.602 42.000 0.000 NA   NA
 7505131 7505132 CLJ_B0933 CLJ_B0934     FALSE 0.028 312.000 0.000 NA   NA
 7505132 7505133 CLJ_B0934 CLJ_B0935     TRUE 0.602 42.000 0.000 NA   NA
 7505136 7505137 CLJ_B0938 CLJ_B0939     FALSE 0.266 170.000 0.000 NA   NA
 7505137 7505138 CLJ_B0939 CLJ_B0940     TRUE 0.681 33.000 0.000 NA   NA
 7505138 7505139 CLJ_B0940 CLJ_B0941     FALSE 0.040 293.000 0.000 NA   NA
 7505139 7505140 CLJ_B0941 CLJ_B0942     FALSE 0.039 294.000 0.000 NA   NA
 7505141 7505142 CLJ_B0943 CLJ_B0944     FALSE 0.239 176.000 0.000 NA   NA
 7505145 7505146 CLJ_B0947 CLJ_B0948     FALSE 0.413 125.000 0.000 NA   NA
 7505146 7505147 CLJ_B0948 CLJ_B0949     TRUE 0.940 0.000 0.000 0.068   NA
 7505149 7505150 CLJ_B0951 CLJ_B0952     TRUE 0.995 0.000 0.333 1.000 Y NA
 7505150 7505151 CLJ_B0952 CLJ_B0953   ilvE FALSE 0.013 410.000 0.000 1.000 N NA
 7505151 7505152 CLJ_B0953 CLJ_B0954 ilvE   FALSE 0.080 240.000 0.000 NA   NA
 7505152 7505153 CLJ_B0954 CLJ_B0955     FALSE 0.094 231.000 0.000 NA   NA
 7505153 7505154 CLJ_B0955 CLJ_B0956     FALSE 0.013 387.000 0.000 NA   NA
 7505154 7505155 CLJ_B0956 CLJ_B0957     TRUE 0.781 72.000 0.100 1.000 N NA
 7505155 7505156 CLJ_B0957 CLJ_B0958     FALSE 0.028 330.000 0.000 1.000 N NA
 7505156 7505157 CLJ_B0958 CLJ_B0959     FALSE 0.027 327.000 0.000 1.000   NA
 7505158 7505159 CLJ_B0960 CLJ_B0961 tipA   FALSE 0.012 397.000 0.000 NA   NA
 7505160 7505161 CLJ_B0963 CLJ_B0964   cobQ TRUE 0.621 61.000 0.003 NA   NA
 7505161 7505162 CLJ_B0964 CLJ_B0965 cobQ cobD TRUE 0.993 2.000 0.092 0.011 Y NA
 7505162 7505163 CLJ_B0965 CLJ_B0966 cobD   FALSE 0.037 385.000 0.026 1.000 N NA
 7505163 7505164 CLJ_B0966 CLJ_B0967   cbiM FALSE 0.375 189.000 0.013 1.000 N NA
 7505164 7505165 CLJ_B0967 CLJ_B0968 cbiM cbiN TRUE 0.997 4.000 0.861 0.011 Y NA
 7505165 7505166 CLJ_B0968 CLJ_B0969 cbiN cbiQ TRUE 0.998 -22.000 0.804 0.001 Y NA
 7505166 7505167 CLJ_B0969 CLJ_B0970 cbiQ   FALSE 0.022 346.000 0.000 NA N NA
 7505167 7505168 CLJ_B0970 CLJ_B0971   hemC TRUE 0.992 -31.000 0.009 NA Y NA
 7505168 7505169 CLJ_B0971 CLJ_B0972 hemC   FALSE 0.245 303.000 0.031 1.000 Y NA
 7505169 7505170 CLJ_B0972 CLJ_B0973     FALSE 0.350 150.000 0.000 NA   NA
 7505170 7505171 CLJ_B0973 CLJ_B0974   hemB FALSE 0.013 385.000 0.000 NA   NA
 7505171 7505172 CLJ_B0974 CLJ_B0975 hemB cobB FALSE 0.119 358.000 0.005 1.000 Y NA
 7505172 7505173 CLJ_B0975 CLJ_B0976 cobB   FALSE 0.415 115.000 0.000 NA   NA
 7505173 7505174 CLJ_B0976 CLJ_B0977   cobH FALSE 0.455 66.000 0.000 NA   NA
 7505174 7505175 CLJ_B0977 CLJ_B0978 cobH   FALSE 0.283 167.000 0.000 NA   NA
 7505175 7505176 CLJ_B0978 CLJ_B0979     FALSE 0.050 273.000 0.000 NA   NA
 7505176 7505177 CLJ_B0979 CLJ_B0980     FALSE 0.043 285.000 0.000 NA   NA
 7505177 7505178 CLJ_B0980 CLJ_B0981     FALSE 0.440 115.000 0.000 1.000   NA
 7505178 7505179 CLJ_B0981 CLJ_B0982     FALSE 0.477 68.000 0.000 1.000   NA
 7505179 7505180 CLJ_B0982 CLJ_B0983     FALSE 0.158 208.000 0.000 1.000   NA
 7505180 7505181 CLJ_B0983 CLJ_B0984     TRUE 0.683 70.000 0.032 NA   NA
 7505181 7505182 CLJ_B0984 CLJ_B0985     TRUE 0.808 93.000 0.250 NA   NA
 7505182 7505183 CLJ_B0985 CLJ_B0986   cbiD TRUE 0.722 29.000 0.000 NA   NA
 7505183 7505184 CLJ_B0986 CLJ_B0987 cbiD cbiE TRUE 0.776 199.000 0.126 0.011 Y NA
 7505184 7505185 CLJ_B0987 CLJ_B0988 cbiE   FALSE 0.423 106.000 0.000 NA   NA
 7505185 7505186 CLJ_B0988 CLJ_B0989   cbiT FALSE 0.423 98.000 0.000 NA   NA
 7505186 7505187 CLJ_B0989 CLJ_B0990 cbiT   TRUE 0.993 0.000 1.000 NA   NA
 7505187 7505188 CLJ_B0990 CLJ_B0991     FALSE 0.005 514.000 0.000 NA   NA
 7505188 7505189 CLJ_B0991 CLJ_B0992     TRUE 0.773 158.000 0.400 NA   NA
 7505189 7505190 CLJ_B0992 CLJ_B0993     FALSE 0.475 60.000 0.000 NA   NA
 7505190 7505191 CLJ_B0993 CLJ_B0994     FALSE 0.474 69.000 0.000 1.000   NA
 7505191 7505192 CLJ_B0994 CLJ_B0995     TRUE 0.539 50.000 0.000 NA   NA
 7505192 7505193 CLJ_B0995 CLJ_B0996   cobI FALSE 0.416 91.000 0.000 NA   NA
 7505193 7505194 CLJ_B0996 CLJ_B0997 cobI cobM FALSE 0.499 289.000 0.291 0.011 Y NA
 7505194 7505195 CLJ_B0997 CLJ_B0998 cobM   TRUE 0.713 183.000 0.397 0.011   NA
 7505195 7505196 CLJ_B0998 CLJ_B0999   cobJ TRUE 0.857 134.000 0.352 0.011   NA
 7505196 7505197 CLJ_B0999 CLJ_B1000 cobJ cobK TRUE 0.970 49.000 0.423 0.011 Y NA
 7505197 7505198 CLJ_B1000 CLJ_B1001 cobK   FALSE 0.092 275.000 0.006 NA   NA
 7505198 7505199 CLJ_B1001 CLJ_B1002     TRUE 0.791 23.000 0.000 NA   NA
 7505199 7505200 CLJ_B1002 CLJ_B1003   cbiK FALSE 0.266 170.000 0.000 NA   NA
 7505200 7505201 CLJ_B1003 CLJ_B1004 cbiK   TRUE 0.951 13.000 0.040 1.000 N NA
 7505201 7505202 CLJ_B1004 CLJ_B1005   cobO FALSE 0.407 148.000 0.000 1.000 N NA
 7505202 7505203 CLJ_B1005 CLJ_B1006 cobO   FALSE 0.084 253.000 0.000 1.000 N NA
 7505203 7505204 CLJ_B1006 CLJ_B1007     TRUE 0.793 100.000 0.152 1.000 N NA
 7505204 7505205 CLJ_B1007 CLJ_B1008   asrA TRUE 0.957 20.000 0.174 1.000   NA
 7505205 7505206 CLJ_B1008 CLJ_B1009 asrA asrB TRUE 0.995 -13.000 0.750 0.030   NA
 7505206 7505207 CLJ_B1009 CLJ_B1010 asrB arsC TRUE 0.995 13.000 0.720 0.030 Y NA
 7505207 7505208 CLJ_B1010 CLJ_B1011 arsC   FALSE 0.022 346.000 0.000 1.000   NA
 7505208 7505209 CLJ_B1011 CLJ_B1012     FALSE 0.003 986.000 0.000 NA   NA
 7505209 7505210 CLJ_B1012 CLJ_B1013     TRUE 0.979 21.000 0.833 NA   NA
 7505210 7505211 CLJ_B1013 CLJ_B1014     TRUE 0.989 4.000 0.833 NA   NA
 7505211 7505212 CLJ_B1014 CLJ_B1015     FALSE 0.017 650.000 0.154 NA   NA
 7505212 7505213 CLJ_B1015 CLJ_B1016     TRUE 0.998 -10.000 0.765 1.000 Y NA
 7505214 7505215 CLJ_B1017 CLJ_B1018     TRUE 0.996 1.000 0.625 1.000 Y NA
 7505215 7505216 CLJ_B1018 CLJ_B1019     TRUE 0.995 1.000 0.375 1.000 Y NA
 7505216 7505217 CLJ_B1019 CLJ_B1020   dhaKL FALSE 0.015 390.000 0.000 1.000 N NA
 7505217 7505218 CLJ_B1020 CLJ_B1021 dhaKL dhaD TRUE 0.959 11.000 0.053 1.000 N NA
 7505218 7505219 CLJ_B1021 CLJ_B1022 dhaD   FALSE 0.156 315.000 0.250 1.000 N NA
 7505220 7505221 CLJ_B1023 CLJ_B1024     FALSE 0.181 219.000 0.000 0.012   NA
 7505221 7505222 CLJ_B1024 CLJ_B1025     FALSE 0.335 153.000 0.000 NA   NA
 7505222 7505223 CLJ_B1025 CLJ_B1026     FALSE 0.077 243.000 0.000 NA   NA
 7505223 7505224 CLJ_B1026 CLJ_B1027     TRUE 0.793 101.000 0.200 NA   NA
 7505224 7505225 CLJ_B1027 CLJ_B1028     TRUE 0.808 46.000 0.061 NA   NA
 7505225 7505226 CLJ_B1028 CLJ_B1029     FALSE 0.005 537.000 0.000 1.000   NA
 7505226 7505227 CLJ_B1029 CLJ_B1030     TRUE 0.655 36.000 0.000 NA   NA
 7505228 7505229 CLJ_B1031 CLJ_B1032     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7505229 7505230 CLJ_B1032 CLJ_B1033     TRUE 0.984 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7505230 7505231 CLJ_B1033 CLJ_B1034     TRUE 0.919 2.000 0.000 1.000 N NA
 7505231 7505232 CLJ_B1034 CLJ_B1035   add FALSE 0.005 636.000 0.000 1.000 N NA
 7505233 7505234 CLJ_B1036 CLJ_B1037     TRUE 0.973 26.000 0.833 NA   NA
 7505236 7505237 CLJ_B1039 CLJ_B1040   recQ FALSE 0.075 246.000 0.000 NA   NA
 7505237 7505238 CLJ_B1040 CLJ_B1041 recQ   FALSE 0.470 111.000 0.000 1.000 N NA
 7505240 7505241 CLJ_B1043 CLJ_B1044     FALSE 0.440 115.000 0.000 1.000   NA
 7505241 7505242 CLJ_B1044 CLJ_B1045     FALSE 0.015 373.000 0.000 NA   NA
 7505242 7505243 CLJ_B1045 CLJ_B1046     TRUE 0.986 2.000 0.444 NA   NA
 7505243 7505244 CLJ_B1046 CLJ_B1047     TRUE 0.981 0.000 0.167 NA   NA
 7505244 7505245 CLJ_B1047 CLJ_B1048     TRUE 0.985 14.000 0.077 1.000 Y NA
 7505245 7505246 CLJ_B1048 CLJ_B1049     TRUE 0.959 15.000 0.135 NA   NA
 7505246 7505247 CLJ_B1049 CLJ_B1050   lctP FALSE 0.006 482.000 0.000 NA   NA
 7505247 7505248 CLJ_B1050 CLJ_B1051 lctP   TRUE 0.911 29.000 0.098 NA   NA
 7505248 7505249 CLJ_B1051 CLJ_B1052     TRUE 0.851 43.000 0.098 NA   NA
 7505249 7505250 CLJ_B1052 CLJ_B1053     TRUE 0.989 32.000 0.875 0.012 Y NA
 7505250 7505251 CLJ_B1053 CLJ_B1054     TRUE 0.973 61.000 0.875 0.009 Y NA
 7505251 7505252 CLJ_B1054 CLJ_B1055     FALSE 0.053 270.000 0.000 NA   NA
 7505252 7505253 CLJ_B1055 CLJ_B1056     FALSE 0.411 128.000 0.000 NA   NA
 7505253 7505254 CLJ_B1056 CLJ_B1057     FALSE 0.188 193.000 0.000 NA   NA
 7505254 7505255 CLJ_B1057 CLJ_B1058     TRUE 0.966 2.000 0.051 NA   NA
 7505256 7505257 CLJ_B1059 CLJ_B1060     FALSE 0.003 949.000 0.000 NA   NA
 7505258 7505259 CLJ_B1061 CLJ_B1062     FALSE 0.161 307.000 0.000 0.058 Y NA
 7505259 7505260 CLJ_B1062 CLJ_B1063     FALSE 0.131 215.000 0.000 NA   NA
 7505262 7505263 CLJ_B1065 CLJ_B1066     FALSE 0.003 712.000 0.000 NA   NA
 7505263 7505264 CLJ_B1066 CLJ_B1067     TRUE 0.899 4.000 0.000 1.000   NA
 7505264 7505265 CLJ_B1067 CLJ_B1068     FALSE 0.074 262.000 0.000 1.000 N NA
 7505265 7505266 CLJ_B1068 CLJ_B1069     TRUE 0.861 16.000 0.000 1.000 N NA
 7505270 7505271 CLJ_B1073 CLJ_B1074     FALSE 0.407 134.000 0.000 NA   NA
 7505271 7505272 CLJ_B1074 CLJ_B1075     FALSE 0.004 584.000 0.000 NA   NA
 7505272 7505273 CLJ_B1075 CLJ_B1076   feoA_2 TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7505273 7505274 CLJ_B1076 CLJ_B1077 feoA_2 feoB_2 TRUE 0.987 32.000 0.871 1.000 Y NA
 7505274 7505275 CLJ_B1077 CLJ_B1078 feoB_2   TRUE 0.915 21.000 0.029 NA   NA
 7505277 7505278 CLJ_B1080 CLJ_B1081   tlp FALSE 0.034 299.000 0.000 NA   NA
 7505278 7505279 CLJ_B1081 CLJ_B1082 tlp   FALSE 0.125 218.000 0.000 NA   NA
 7505279 7505280 CLJ_B1082 CLJ_B1083     TRUE 0.996 1.000 0.462 1.000 Y NA
 7505280 7505281 CLJ_B1083 CLJ_B1084     TRUE 0.655 36.000 0.000 NA   NA
 7505281 7505282 CLJ_B1084 CLJ_B1085     FALSE 0.135 213.000 0.000 NA   NA
 7505282 7505283 CLJ_B1085 CLJ_B1086     TRUE 0.898 117.000 1.000 NA   NA
 7505283 7505284 CLJ_B1086 CLJ_B1087     TRUE 0.744 54.000 0.034 NA   NA
 7505286 7505287 CLJ_B1089 CLJ_B1090     FALSE 0.026 320.000 0.000 NA   NA
 7505287 7505288 CLJ_B1090 CLJ_B1091     FALSE 0.063 260.000 0.000 NA   NA
 7505288 7505289 CLJ_B1091 CLJ_B1092     TRUE 0.997 0.000 0.833 1.000 Y NA
 7505290 7505291 CLJ_B1093 CLJ_B1094     FALSE 0.095 236.000 0.000 NA N NA
 7505292 7505293 CLJ_B1095 CLJ_B1096     TRUE 0.998 -10.000 0.870 0.029 Y NA
 7505293 7505294 CLJ_B1096 CLJ_B1097     TRUE 0.998 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 7505294 7505295 CLJ_B1097 CLJ_B1098     TRUE 0.928 70.000 0.196 1.000 Y NA
 7505295 7505296 CLJ_B1098 CLJ_B1099     FALSE 0.491 57.000 0.000 NA   NA
 7505296 7505297 CLJ_B1099 CLJ_B1100     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7505297 7505298 CLJ_B1100 CLJ_B1101     FALSE 0.019 360.000 0.000 1.000   NA
 7505299 7505300 CLJ_B1102 CLJ_B1103     TRUE 0.996 3.000 1.000 NA Y NA
 7505300 7505301 CLJ_B1103 CLJ_B1104     FALSE 0.026 321.000 0.000 NA   NA
 7505302 7505303 CLJ_B1105 CLJ_B1106     FALSE 0.014 382.000 0.000 NA   NA
 7505303 7505304 CLJ_B1106 CLJ_B1107     FALSE 0.092 233.000 0.000 NA   NA
 7505304 7505305 CLJ_B1107 CLJ_B1108     FALSE 0.005 521.000 0.000 NA   NA
 7505305 7505306 CLJ_B1108 CLJ_B1109     FALSE 0.017 368.000 0.000 1.000   NA
 7505306 7505307 CLJ_B1109 CLJ_B1110     FALSE 0.389 184.000 0.023 NA   NA
 7505307 7505308 CLJ_B1110 CLJ_B1111     FALSE 0.495 165.000 0.023 NA   NA
 7505309 7505310 CLJ_B1112 CLJ_B1113     TRUE 0.610 116.000 0.015 NA   NA
 7505310 7505311 CLJ_B1113 CLJ_B1114     FALSE 0.015 384.000 0.000 1.000   NA
 7505312 7505313 CLJ_B1115 CLJ_B1116     FALSE 0.103 227.000 0.000 NA   NA
 7505313 7505314 CLJ_B1116 CLJ_B1117     FALSE 0.170 204.000 0.000 1.000   NA
 7505314 7505315 CLJ_B1117 CLJ_B1118     FALSE 0.155 209.000 0.000 1.000   NA
 7505315 7505316 CLJ_B1118 CLJ_B1119     TRUE 0.834 57.000 0.107 0.030   NA
 7505316 7505317 CLJ_B1119 CLJ_B1120     TRUE 0.985 3.000 0.300 0.030   NA
 7505317 7505318 CLJ_B1120 CLJ_B1121   glpT TRUE 0.643 89.000 0.021 1.000   NA
 7505318 7505319 CLJ_B1121 CLJ_B1122 glpT argS FALSE 0.005 581.000 0.000 1.000 N NA
 7505319 7505320 CLJ_B1122 CLJ_B1123 argS arcT FALSE 0.008 472.000 0.000 1.000 N NA
 7505320 7505321 CLJ_B1123 CLJ_B1124 arcT   FALSE 0.046 289.000 0.000 1.000   NA
 7505322 7505323 CLJ_B1125 CLJ_B1126   feoB_3 TRUE 0.897 26.000 0.034 NA   NA
 7505323 7505324 CLJ_B1126 CLJ_B1127 feoB_3 feoA_3 TRUE 0.990 15.000 0.308 1.000 Y NA
 7505325 7505326 CLJ_B1128 CLJ_B1129     FALSE 0.133 214.000 0.000 NA   NA
 7505326 7505327 CLJ_B1129 CLJ_B1130     FALSE 0.009 443.000 0.000 1.000   NA
 7505327 7505328 CLJ_B1130 CLJ_B1131     FALSE 0.011 412.000 0.000 1.000   NA
 7505328 7505329 CLJ_B1131 CLJ_B1133     FALSE 0.052 278.000 0.000 1.000   NA
 7505329 7505330 CLJ_B1133 CLJ_B1134     TRUE 0.996 2.000 0.511 1.000 Y NA
 7505330 7505331 CLJ_B1134 CLJ_B1135     TRUE 0.934 56.000 0.154 NA Y NA
 7505331 7505332 CLJ_B1135 CLJ_B1136     TRUE 0.807 189.000 0.250 NA Y NA
 7505332 7505333 CLJ_B1136 CLJ_B1137     FALSE 0.099 229.000 0.000 NA   NA
 7505333 7505334 CLJ_B1137 CLJ_B1138     FALSE 0.005 572.000 0.000 1.000   NA
 7505336 7505337 CLJ_B1140 CLJ_B1141     FALSE 0.086 236.000 0.000 NA   NA
 7505337 7505338 CLJ_B1141 CLJ_B1142     FALSE 0.142 209.000 0.000 NA   NA
 7505342 7505343 CLJ_B1146 CLJ_B1147     TRUE 0.544 143.000 0.008 NA   NA
 7505343 7505344 CLJ_B1147 CLJ_B1148     TRUE 0.682 56.000 0.008 1.000   NA
 7505345 7505346 CLJ_B1149 CLJ_B1150     FALSE 0.027 599.000 0.000 0.003 Y NA
 7505347 7505348 CLJ_B1151 CLJ_B1152     TRUE 0.971 18.000 0.333 1.000 N NA
 7505348 7505349 CLJ_B1152 CLJ_B1153     FALSE 0.010 419.000 0.000 1.000   NA
 7505349 7505350 CLJ_B1153 CLJ_B1154     FALSE 0.423 99.000 0.000 NA   NA
 7505350 7505351 CLJ_B1154 CLJ_B1155     FALSE 0.003 808.000 0.000 NA   NA
 7505351 7505352 CLJ_B1155 CLJ_B1156     TRUE 0.980 2.000 0.217 NA   NA
 7505352 7505353 CLJ_B1156 CLJ_B1157     TRUE 0.979 26.000 0.084 0.029 Y NA
 7505353 7505354 CLJ_B1157 CLJ_B1158     TRUE 0.982 12.000 0.308 0.029 N NA
 7505354 7505355 CLJ_B1158 CLJ_B1159     FALSE 0.032 304.000 0.000 NA   NA
 7505355 7505356 CLJ_B1159 CLJ_B1160     TRUE 0.634 104.000 0.020 NA   NA
 7505356 7505357 CLJ_B1160 CLJ_B1161     TRUE 0.883 10.000 0.000 1.000   NA
 7505357 7505358 CLJ_B1161 CLJ_B1162     FALSE 0.436 75.000 0.000 NA   NA
 7505358 7505359 CLJ_B1162 CLJ_B1163     TRUE 0.968 1.000 0.050 NA   NA
 7505359 7505360 CLJ_B1163 CLJ_B1164     FALSE 0.350 150.000 0.000 NA   NA
 7505360 7505361 CLJ_B1164 CLJ_B1165   maa TRUE 0.908 1.000 0.000 NA   NA
 7505363 7505364 CLJ_B1167 CLJ_B1168     FALSE 0.052 278.000 0.000 1.000   NA
 7505364 7505365 CLJ_B1168 CLJ_B1169     FALSE 0.523 160.000 0.017 1.000   NA
 7505367 7505368 CLJ_B1171 CLJ_B1172   mgtE FALSE 0.006 501.000 0.000 NA   NA
 7505368 7505369 CLJ_B1172 CLJ_B1173 mgtE   FALSE 0.004 1010.000 0.000 0.055 N NA
 7505369 7505370 CLJ_B1173 CLJ_B1174     TRUE 0.650 225.000 0.110 0.055 Y NA
 7505370 7505371 CLJ_B1174 CLJ_B1175     TRUE 0.983 -22.000 0.072 NA   NA
 7505371 7505372 CLJ_B1175 CLJ_B1176     FALSE 0.004 652.000 0.000 NA   NA
 7505372 7505373 CLJ_B1176 CLJ_B1177     TRUE 0.550 170.000 0.056 1.000   NA
 7505375 7505376 CLJ_B1179 CLJ_B1180     TRUE 0.762 111.000 0.118 1.000   NA
 7505376 7505377 CLJ_B1180 CLJ_B1181     FALSE 0.038 299.000 0.000 1.000   NA
 7505377 7505378 CLJ_B1181 CLJ_B1182     FALSE 0.479 159.000 0.004 NA N NA
 7505378 7505379 CLJ_B1182 CLJ_B1183     TRUE 0.600 76.000 0.006 NA   NA
 7505379 7505380 CLJ_B1183 CLJ_B1184     FALSE 0.047 278.000 0.000 NA   NA
 7505380 7505381 CLJ_B1184 CLJ_B1185     TRUE 0.536 178.000 0.091 NA   NA
 7505381 7505382 CLJ_B1185 CLJ_B1186   xpt_2 FALSE 0.512 161.000 0.009 1.000 N NA
 7505382 7505383 CLJ_B1186 CLJ_B1187 xpt_2   FALSE 0.035 298.000 0.000 NA   NA
 7505383 7505384 CLJ_B1187 CLJ_B1188     FALSE 0.037 295.000 0.000 NA   NA
 7505384 7505385 CLJ_B1188 CLJ_B1189     TRUE 0.664 200.000 0.667 NA   NA
 7505385 7505386 CLJ_B1189 CLJ_B1190     FALSE 0.020 344.000 0.000 NA   NA
 7505386 7505387 CLJ_B1190 CLJ_B1191     FALSE 0.016 363.000 0.000 NA   NA
 7505387 7505388 CLJ_B1191 CLJ_B1192     TRUE 0.689 137.000 0.065 NA   NA
 7505388 7505389 CLJ_B1192 CLJ_B1193     FALSE 0.003 773.000 0.000 NA   NA
 7505389 7505390 CLJ_B1193 CLJ_B1194     TRUE 0.775 182.000 1.000 NA   NA
 7505390 7505391 CLJ_B1194 CLJ_B1195     FALSE 0.012 394.000 0.000 NA   NA
 7505391 7505392 CLJ_B1195 CLJ_B1196     TRUE 0.997 2.000 0.667 0.028 Y NA
 7505392 7505393 CLJ_B1196 CLJ_B1197     TRUE 0.996 -37.000 0.900 0.028 N NA
 7505395 7505396 CLJ_B1199 CLJ_B1200     TRUE 0.964 14.000 0.167 NA   NA
 7505396 7505397 CLJ_B1200 CLJ_B1201   rpsA FALSE 0.014 383.000 0.000 NA   NA
 7505397 7505398 CLJ_B1201 CLJ_B1202 rpsA   FALSE 0.368 183.000 0.008 1.000   NA
 7505398 7505399 CLJ_B1202 CLJ_B1203     TRUE 0.538 172.000 0.067 NA   NA
 7505399 7505400 CLJ_B1203 CLJ_B1204     FALSE 0.003 865.000 0.000 NA   NA
 7505400 7505401 CLJ_B1204 CLJ_B1205     TRUE 0.992 0.000 0.857 NA   NA
 7505401 7505402 CLJ_B1205 CLJ_B1206     TRUE 0.990 -37.000 0.231 1.000   NA
 7505402 7505403 CLJ_B1206 CLJ_B1207     FALSE 0.004 673.000 0.000 1.000   NA
 7505405 7505406 CLJ_B1209 CLJ_B1210     TRUE 0.967 -6.000 0.012 NA N NA
 7505406 7505407 CLJ_B1210 CLJ_B1211   panE FALSE 0.007 492.000 0.000 NA N NA
 7505407 7505408 CLJ_B1211 CLJ_B1212 panE   FALSE 0.040 303.000 0.000 1.000 N NA
 7505408 7505409 CLJ_B1212 CLJ_B1213   folD TRUE 0.983 0.000 0.082 0.001 N NA
 7505409 7505410 CLJ_B1213 CLJ_B1214 folD   FALSE 0.027 326.000 0.000 1.000   NA
 7505412 7505413 CLJ_B1216 CLJ_B1217     TRUE 0.815 118.000 0.286 NA   NA
 7505413 7505414 CLJ_B1217 CLJ_B1218     TRUE 0.602 113.000 0.012 NA   NA
 7505414 7505415 CLJ_B1218 CLJ_B1219     FALSE 0.004 669.000 0.000 NA N NA
 7505415 7505416 CLJ_B1219 CLJ_B1220   cysK_2 FALSE 0.083 333.000 0.083 NA N NA
 7505416 7505417 CLJ_B1220 CLJ_B1221 cysK_2   TRUE 0.967 45.000 0.400 1.000 Y NA
 7505417 7505418 CLJ_B1221 CLJ_B1222     TRUE 0.981 35.000 0.400 0.028 Y NA
 7505418 7505419 CLJ_B1222 CLJ_B1223     TRUE 0.933 105.000 0.286 1.000 Y NA
 7505419 7505420 CLJ_B1223 CLJ_B1224     FALSE 0.021 350.000 0.000 1.000   NA
 7505420 7505421 CLJ_B1224 CLJ_B1225     FALSE 0.495 155.000 0.008 NA   NA
 7505421 7505422 CLJ_B1225 CLJ_B1226   trmU_1 TRUE 0.569 118.000 0.004 NA   NA
 7505422 7505423 CLJ_B1226 CLJ_B1227 trmU_1   FALSE 0.226 180.000 0.000 NA   NA
 7505423 7505424 CLJ_B1227 CLJ_B1228     FALSE 0.019 349.000 0.000 NA   NA
 7505424 7505425 CLJ_B1228 CLJ_B1229     TRUE 0.997 -3.000 0.875 NA Y NA
 7505425 7505426 CLJ_B1229 CLJ_B1230   bcrA FALSE 0.016 375.000 0.000 NA N NA
 7505426 7505427 CLJ_B1230 CLJ_B1231 bcrA   TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7505427 7505428 CLJ_B1231 CLJ_B1232     FALSE 0.004 604.000 0.000 NA   NA
 7505428 7505429 CLJ_B1232 CLJ_B1233     FALSE 0.019 347.000 0.000 NA   NA
 7505431 7505432 CLJ_B1235 CLJ_B1236     FALSE 0.034 300.000 0.000 NA   NA
 7505432 7505433 CLJ_B1236 CLJ_B1237     FALSE 0.004 589.000 0.000 NA   NA
 7505435 7505436 CLJ_B1239 CLJ_B1240     FALSE 0.428 78.000 0.000 NA   NA
 7505436 7505437 CLJ_B1240 CLJ_B1241     FALSE 0.489 64.000 0.000 NA N NA
 7505437 7505438 CLJ_B1241 CLJ_B1242     TRUE 0.977 3.000 0.000 NA Y NA
 7505438 7505439 CLJ_B1242 CLJ_B1243     FALSE 0.006 657.000 0.000 0.005   NA
 7505439 7505440 CLJ_B1243 CLJ_B3989     FALSE 0.407 134.000 0.000 NA   NA
 7505440 7505441 CLJ_B3989 CLJ_B1244   tyrS_1 FALSE 0.009 426.000 0.000 NA   NA
 7505441 7505442 CLJ_B1244 CLJ_B1245 tyrS_1   FALSE 0.052 287.000 0.000 1.000 N NA
 7505442 7505443 CLJ_B1245 CLJ_B1246     TRUE 0.994 -7.000 0.833 1.000 N NA
 7505443 7505444 CLJ_B1246 CLJ_B1247     TRUE 0.984 1.000 0.278 NA   NA
 7505446 7505447 CLJ_B1249 CLJ_B1250     FALSE 0.416 91.000 0.000 NA   NA
 7505447 7505448 CLJ_B1250 CLJ_B1251     FALSE 0.195 189.000 0.000 NA   NA
 7505448 7505449 CLJ_B1251 CLJ_B1252     FALSE 0.428 78.000 0.000 NA   NA
 7505449 7505450 CLJ_B1252 CLJ_B1253     TRUE 0.569 175.000 0.095 1.000   NA
 7505450 7505451 CLJ_B1253 CLJ_B1254     TRUE 0.946 -49.000 0.000 NA   NA
 7505451 7505452 CLJ_B1254 CLJ_B1255   sdhB FALSE 0.027 318.000 0.000 NA   NA
 7505452 7505453 CLJ_B1255 CLJ_B1256 sdhB sdhA TRUE 0.991 13.000 0.146 0.001 Y NA
 7505458 7505459 CLJ_B1261 CLJ_B1262     FALSE 0.014 381.000 0.000 NA   NA
 7505459 7505460 CLJ_B1262 CLJ_B1263     FALSE 0.422 107.000 0.000 NA   NA
 7505460 7505461 CLJ_B1263 CLJ_B1264     TRUE 0.759 26.000 0.000 NA   NA
 7505461 7505462 CLJ_B1264 CLJ_B1265     TRUE 0.647 37.000 0.000 NA   NA
 7505462 7505463 CLJ_B1265 CLJ_B1266     TRUE 0.658 154.000 0.071 1.000 N NA
 7505463 7505464 CLJ_B1266 CLJ_B1267     TRUE 0.996 6.000 0.786 0.028 Y NA
 7505464 7505465 CLJ_B1267 CLJ_B1268     TRUE 0.873 200.000 0.688 0.028 Y NA
 7505466 7505467 CLJ_B1269 CLJ_B1270   cotJB TRUE 0.899 34.000 0.125 NA   NA
 7505467 7505468 CLJ_B1270 CLJ_B1271 cotJB cotJC TRUE 0.874 31.000 0.047 NA   NA
 7505468 7505469 CLJ_B1271 CLJ_B1272 cotJC   FALSE 0.106 230.000 0.000 NA N NA
 7505469 7505470 CLJ_B1272 CLJ_B1273     TRUE 0.979 17.000 0.667 NA   NA
 7505470 7505471 CLJ_B1273 CLJ_B1274     FALSE 0.009 424.000 0.000 NA   NA
 7505474 7505475 CLJ_B1277 CLJ_B1278     FALSE 0.005 516.000 0.000 NA   NA
 7505478 7505479 CLJ_B1281 CLJ_B1282     TRUE 0.647 37.000 0.000 NA   NA
 7505479 7505480 CLJ_B1282 CLJ_B1283     FALSE 0.030 307.000 0.000 NA   NA
 7505480 7505481 CLJ_B1283 CLJ_B1284     TRUE 0.975 15.000 0.400 NA   NA
 7505481 7505482 CLJ_B1284 CLJ_B1285     TRUE 0.992 -3.000 0.667 NA   NA
 7505482 7505483 CLJ_B1285 CLJ_B1286     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7505483 7505484 CLJ_B1286 CLJ_B1287     TRUE 0.987 12.000 1.000 NA   NA
 7505486 7505487 CLJ_B1289 CLJ_B1290     FALSE 0.004 586.000 0.000 NA   NA
 7505487 7505488 CLJ_B1290 CLJ_B1291     FALSE 0.047 278.000 0.000 NA   NA
 7505488 7505489 CLJ_B1291 CLJ_B1292     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7505489 7505490 CLJ_B1292 CLJ_B1293     FALSE 0.003 799.000 0.000 NA   NA
 7505490 7505491 CLJ_B1293 CLJ_B1294     FALSE 0.053 270.000 0.000 NA   NA
 7505491 7505492 CLJ_B1294 CLJ_B1295     FALSE 0.024 327.000 0.000 NA   NA
 7505493 7505494 CLJ_B1296 CLJ_B1297 gapN   TRUE 0.806 40.000 0.014 1.000 N NA
 7505495 7505496 CLJ_B1299 CLJ_B1300 grdX grdE TRUE 0.841 91.000 0.400 NA   NA
 7505496 7505497 CLJ_B1300 CLJ_B1301 grdE   TRUE 0.941 33.000 0.222 0.002   NA
 7505497 7505498 CLJ_B1301 CLJ_B1302   trxB FALSE 0.346 156.000 0.000 1.000   NA
 7505498 7505499 CLJ_B1302 CLJ_B1303 trxB   TRUE 0.972 35.000 0.226 1.000 Y NA
 7505499 7505500 CLJ_B1303 CLJ_B1304     FALSE 0.415 86.000 0.000 NA   NA
 7505500 7505501 CLJ_B1304 CLJ_B1306   grdC FALSE 0.421 96.000 0.000 NA   NA
 7505501 7505502 CLJ_B1306 CLJ_B1307 grdC grdD TRUE 0.984 16.000 0.622 0.002   NA
 7505502 7505503 CLJ_B1307 CLJ_B1308 grdD   FALSE 0.005 610.000 0.000 1.000 N NA
 7505503 7505504 CLJ_B1308 CLJ_B1309     TRUE 0.682 66.000 0.005 0.065   NA
 7505504 7505505 CLJ_B1309 CLJ_B1310   mtnK FALSE 0.009 435.000 0.000 1.000   NA
 7505505 7505506 CLJ_B1310 CLJ_B1311 mtnK mtnA TRUE 0.728 140.000 0.104 1.000   NA
 7505506 7505507 CLJ_B1311 CLJ_B1312 mtnA   TRUE 0.816 24.000 0.000 1.000 N NA
 7505507 7505508 CLJ_B1312 CLJ_B1313     TRUE 0.980 2.000 0.000 1.000 Y NA
 7505508 7505509 CLJ_B1313 CLJ_B1314     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 7505509 7505510 CLJ_B1314 CLJ_B1315     TRUE 0.805 21.000 0.000 NA   NA
 7505510 7505511 CLJ_B1315 CLJ_B1316   araD TRUE 0.882 58.000 0.014 NA Y NA
 7505511 7505512 CLJ_B1316 CLJ_B1317 araD   TRUE 0.876 175.000 0.400 1.000 Y NA
 7505512 7505513 CLJ_B1317 CLJ_B1318     FALSE 0.437 128.000 0.000 1.000   NA
 7505513 7505514 CLJ_B1318 CLJ_B1319     TRUE 0.558 110.000 0.000 0.001   NA
 7505514 7505515 CLJ_B1319 CLJ_B1320     FALSE 0.099 229.000 0.000 NA   NA
 7505517 7505518 CLJ_B1322 CLJ_B1323     TRUE 0.599 162.000 0.074 NA   NA
 7505518 7505519 CLJ_B1323 CLJ_B1324     TRUE 0.664 128.000 0.038 NA   NA
 7505519 7505520 CLJ_B1324 CLJ_B1325     TRUE 0.982 -3.000 0.135 NA   NA
 7505520 7505521 CLJ_B1325 CLJ_B1326     FALSE 0.005 533.000 0.000 NA   NA
 7505521 7505522 CLJ_B1326 CLJ_B1327     TRUE 0.816 48.000 0.080 NA   NA
 7505523 7505524 CLJ_B1328 CLJ_B1329     FALSE 0.014 381.000 0.000 NA   NA
 7505524 7505525 CLJ_B1329 CLJ_B1330     TRUE 0.772 25.000 0.000 NA   NA
 7505526 7505527 CLJ_B1331 CLJ_B1332     TRUE 0.965 28.000 0.667 NA   NA
 7505527 7505528 CLJ_B1332 CLJ_B1333     TRUE 0.834 57.000 0.200 NA   NA
 7505528 7505529 CLJ_B1333 CLJ_B1334     TRUE 0.994 14.000 0.500 0.001 Y NA
 7505529 7505530 CLJ_B1334 CLJ_B1335     TRUE 0.986 32.000 0.667 0.040 Y NA
 7505530 7505531 CLJ_B1335 CLJ_B1336   guaD TRUE 0.760 116.000 0.100 1.000 N NA
 7505531 7505532 CLJ_B1336 CLJ_B1337 guaD topB FALSE 0.017 384.000 0.000 1.000 N NA
 7505532 7505533 CLJ_B1337 CLJ_B1338 topB   FALSE 0.028 312.000 0.000 NA   NA
 7505533 7505534 CLJ_B1338 CLJ_B1339     TRUE 0.629 66.000 0.008 NA   NA
 7505534 7505535 CLJ_B1339 CLJ_B1340     FALSE 0.003 693.000 0.000 NA   NA
 7505535 7505536 CLJ_B1340 CLJ_B1341     FALSE 0.012 401.000 0.000 1.000   NA
 7505536 7505537 CLJ_B1341 CLJ_B1342     FALSE 0.034 305.000 0.000 1.000   NA
 7505537 7505538 CLJ_B1342 CLJ_B1343     FALSE 0.032 320.000 0.000 1.000 N NA
 7505538 7505539 CLJ_B1343 CLJ_B1344     TRUE 0.979 -7.000 0.067 1.000   NA
 7505539 7505540 CLJ_B1344 CLJ_B1345     TRUE 0.953 6.000 0.033 NA   NA
 7505540 7505541 CLJ_B1345 CLJ_B1346     FALSE 0.179 295.000 0.230 NA   NA
 7505541 7505542 CLJ_B1346 CLJ_B1347     FALSE 0.010 415.000 0.000 NA   NA
 7505542 7505543 CLJ_B1347 CLJ_B1348     FALSE 0.101 228.000 0.000 NA   NA
 7505543 7505544 CLJ_B1348 CLJ_B1349     FALSE 0.022 334.000 0.000 NA   NA
 7505544 7505545 CLJ_B1349 CLJ_B1350     FALSE 0.123 219.000 0.000 NA   NA
 7505545 7505546 CLJ_B1350 CLJ_B1351     TRUE 0.920 37.000 0.287 NA   NA
 7505546 7505547 CLJ_B1351 CLJ_B1352   copZ TRUE 0.891 123.000 0.024 0.001 Y NA
 7505547 7505548 CLJ_B1352 CLJ_B1353 copZ   FALSE 0.154 302.000 0.000 1.000 Y NA
 7505548 7505549 CLJ_B1353 CLJ_B1354     FALSE 0.011 426.000 0.000 1.000 N NA
 7505549 7505550 CLJ_B1354 CLJ_B1355     FALSE 0.040 292.000 0.000 NA   NA
 7505550 7505551 CLJ_B1355 CLJ_B1356     TRUE 0.542 164.000 0.040 NA   NA
 7505551 7505552 CLJ_B1356 CLJ_B1357     FALSE 0.009 431.000 0.000 NA   NA
 7505553 7505554 CLJ_B1358 CLJ_B1359 nimB   FALSE 0.430 135.000 0.000 1.000   NA
 7505554 7505555 CLJ_B1359 CLJ_B1360     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7505555 7505556 CLJ_B1360 CLJ_B1361     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7505557 7505558 CLJ_B1362 CLJ_B1363     TRUE 0.965 24.000 0.400 1.000   NA
 7505558 7505559 CLJ_B1363 CLJ_B1364     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7505559 7505560 CLJ_B1364 CLJ_B1366     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7505562 7505563 CLJ_B1367 CLJ_B1368     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7505563 7505564 CLJ_B1368 CLJ_B1369     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7505564 7505565 CLJ_B1369 CLJ_B1370     FALSE 0.421 96.000 0.000 NA   NA
 7505565 7505566 CLJ_B1370 CLJ_B1371     FALSE 0.420 95.000 0.000 NA   NA
 7505566 7505567 CLJ_B1371 CLJ_B1372     TRUE 0.841 15.000 0.000 NA   NA
 7505567 7505568 CLJ_B1372 CLJ_B1373     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7505568 7505569 CLJ_B1373 CLJ_B1374     FALSE 0.470 61.000 0.000 NA   NA
 7505569 7505570 CLJ_B1374 CLJ_B1375     FALSE 0.514 54.000 0.000 NA   NA
 7505570 7505571 CLJ_B1375 CLJ_B1376     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7505571 7505572 CLJ_B1376 CLJ_B1377     FALSE 0.478 59.000 0.000 NA   NA
 7505572 7505573 CLJ_B1377 CLJ_B1378     TRUE 0.592 43.000 0.000 NA   NA
 7505573 7505574 CLJ_B1378 CLJ_B1379     FALSE 0.422 107.000 0.000 NA   NA
 7505574 7505575 CLJ_B1379 CLJ_B1380     FALSE 0.451 68.000 0.000 NA   NA
 7505575 7505576 CLJ_B1380 CLJ_B1381     TRUE 0.580 44.000 0.000 NA   NA
 7505576 7505577 CLJ_B1381 CLJ_B1382     TRUE 0.664 35.000 0.000 NA   NA
 7505577 7505578 CLJ_B1382 CLJ_B1383     FALSE 0.499 56.000 0.000 NA   NA
 7505578 7505579 CLJ_B1383 CLJ_B1384     TRUE 0.640 38.000 0.000 NA   NA
 7505579 7505580 CLJ_B1384 CLJ_B1385     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7505580 7505581 CLJ_B1385 CLJ_B1386     TRUE 0.746 27.000 0.000 NA   NA
 7505581 7505582 CLJ_B1386 CLJ_B1387     FALSE 0.422 107.000 0.000 NA   NA
 7505582 7505583 CLJ_B1387 CLJ_B1388     TRUE 0.534 51.000 0.000 NA   NA
 7505583 7505584 CLJ_B1388 CLJ_B1389     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7505584 7505585 CLJ_B1389 CLJ_B1390     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7505585 7505586 CLJ_B1390 CLJ_B1391     FALSE 0.113 223.000 0.000 NA   NA
 7505586 7505587 CLJ_B1391 CLJ_B1392     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7505587 7505588 CLJ_B1392 CLJ_B1393     FALSE 0.381 148.000 0.000 1.000   NA
 7505588 7505589 CLJ_B1393 CLJ_B1394     TRUE 0.701 165.000 0.222 1.000   NA
 7505589 7505590 CLJ_B1394 CLJ_B1395     TRUE 0.992 -13.000 0.444 NA   NA
 7505590 7505591 CLJ_B1395 CLJ_B1396     TRUE 0.871 57.000 0.375 NA   NA
 7505591 7505592 CLJ_B1396 CLJ_B1397     TRUE 0.943 -25.000 0.000 NA   NA
 7505592 7505593 CLJ_B1397 CLJ_B1398     TRUE 0.889 4.000 0.000 NA   NA
 7505593 7505594 CLJ_B1398 CLJ_B1399     TRUE 0.983 0.000 0.222 NA   NA
 7505594 7505595 CLJ_B1399 CLJ_B1400     TRUE 0.927 -6.000 0.000 NA   NA
 7505595 7505596 CLJ_B1400 CLJ_B1401     TRUE 0.810 20.000 0.000 NA   NA
 7505596 7505597 CLJ_B1401 CLJ_B1402     FALSE 0.073 248.000 0.000 NA   NA
 7505597 7505598 CLJ_B1402 CLJ_B1403     TRUE 0.564 46.000 0.000 NA   NA
 7505598 7505599 CLJ_B1403 CLJ_B1404     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7505599 7505600 CLJ_B1404 CLJ_B1405     TRUE 0.882 6.000 0.000 NA   NA
 7505600 7505601 CLJ_B1405 CLJ_B1406     TRUE 0.987 3.000 0.600 NA   NA
 7505601 7505602 CLJ_B1406 CLJ_B1407     FALSE 0.442 72.000 0.000 NA   NA
 7505602 7505603 CLJ_B1407 CLJ_B1408     TRUE 0.632 39.000 0.000 NA   NA
 7505603 7505604 CLJ_B1408 CLJ_B1409     TRUE 0.986 -3.000 0.273 NA   NA
 7505604 7505605 CLJ_B1409 CLJ_B1410     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7505605 7505606 CLJ_B1410 CLJ_B1411     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7505606 7505607 CLJ_B1411 CLJ_B1412     TRUE 0.990 -7.000 0.400 NA   NA
 7505607 7505608 CLJ_B1412 CLJ_B1413     TRUE 0.987 -7.000 0.250 NA   NA
 7505608 7505609 CLJ_B1413 CLJ_B1414     TRUE 0.908 1.000 0.000 NA   NA
 7505609 7505610 CLJ_B1414 CLJ_B1415     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7505610 7505611 CLJ_B1415 CLJ_B1416     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7505611 7505612 CLJ_B1416 CLJ_B1417     FALSE 0.423 98.000 0.000 NA   NA
 7505612 7505613 CLJ_B1417 CLJ_B1418     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7505613 7505614 CLJ_B1418 CLJ_B1419     TRUE 0.623 40.000 0.000 NA   NA
 7505614 7505615 CLJ_B1419 CLJ_B1420     FALSE 0.078 242.000 0.000 NA   NA
 7505615 7505616 CLJ_B1420 CLJ_B1421     FALSE 0.015 372.000 0.000 NA   NA
 7505616 7505617 CLJ_B1421 CLJ_B1422     FALSE 0.029 311.000 0.000 NA   NA
 7505617 7505618 CLJ_B1422 CLJ_B1423     FALSE 0.249 174.000 0.000 NA   NA
 7505618 7505619 CLJ_B1423 CLJ_B1424     TRUE 0.939 -15.000 0.000 NA   NA
 7505619 7505620 CLJ_B1424 CLJ_B1425     FALSE 0.362 146.000 0.000 NA   NA
 7505620 7505621 CLJ_B1425 CLJ_B1426     FALSE 0.007 454.000 0.000 NA   NA
 7505621 7505622 CLJ_B1426 CLJ_B1427     TRUE 0.640 38.000 0.000 NA   NA
 7505624 7505625 CLJ_B1429 CLJ_B1430     FALSE 0.004 600.000 0.000 NA   NA
 7505625 7505626 CLJ_B1430 CLJ_B1431   trkA FALSE 0.003 788.000 0.000 NA   NA
 7505626 7505627 CLJ_B1431 CLJ_B1432 trkA trkH TRUE 0.995 -3.000 0.163 0.004 Y NA
 7505627 7505628 CLJ_B1432 CLJ_B1433 trkH   FALSE 0.008 451.000 0.000 NA   NA
 7505628 7505629 CLJ_B1433 CLJ_B1434     TRUE 0.941 -19.000 0.000 NA   NA
 7505630 7505631 CLJ_B1435 CLJ_B1436     TRUE 0.961 15.000 0.158 NA   NA
 7505631 7505632 CLJ_B1436 CLJ_B1437     FALSE 0.006 507.000 0.000 NA   NA
 7505633 7505634 CLJ_B1439 CLJ_B1440 rbr   FALSE 0.041 296.000 0.000 NA N NA
 7505636 7505637 CLJ_B1442 CLJ_B1443     FALSE 0.243 175.000 0.000 NA   NA
 7505637 7505638 CLJ_B1443 CLJ_B1444     FALSE 0.422 97.000 0.000 NA   NA
 7505638 7505639 CLJ_B1444 CLJ_B1445     FALSE 0.045 282.000 0.000 NA   NA
 7505639 7505640 CLJ_B1445 CLJ_B1446     FALSE 0.527 210.000 0.312 NA N NA
 7505640 7505641 CLJ_B1446 CLJ_B1447     TRUE 0.864 147.000 0.077 NA Y NA
 7505641 7505642 CLJ_B1447 CLJ_B1448   noxA FALSE 0.465 198.000 0.111 NA   NA
 7505643 7505644 CLJ_B1449 CLJ_B1450     FALSE 0.484 58.000 0.000 NA   NA
 7505645 7505646 CLJ_B1451 CLJ_B1452     TRUE 0.790 55.000 0.083 NA   NA
 7505648 7505649 CLJ_B1454 CLJ_B1455     FALSE 0.040 303.000 0.000 1.000 N NA
 7505649 7505650 CLJ_B1455 CLJ_B1456     TRUE 0.985 22.000 0.214 1.000 Y NA
 7505650 7505651 CLJ_B1456 CLJ_B1457     TRUE 0.994 3.000 0.255 1.000 Y NA
 7505652 7505653 CLJ_B1458 CLJ_B1459     TRUE 0.774 75.000 0.133 NA   NA
 7505654 7505655 CLJ_B1460 CLJ_B1461   murQ FALSE 0.075 279.000 0.000 0.003   NA
 7505655 7505656 CLJ_B1461 CLJ_B1462 murQ   TRUE 0.754 113.000 0.107 1.000   NA
 7505656 7505657 CLJ_B1462 CLJ_B1463     FALSE 0.035 425.000 0.089 1.000   NA
 7505657 7505658 CLJ_B1463 CLJ_B1464     FALSE 0.439 118.000 0.000 1.000   NA
 7505658 7505659 CLJ_B1464 CLJ_B1465     FALSE 0.442 83.000 0.000 1.000   NA
 7505659 7505660 CLJ_B1465 CLJ_B1466     FALSE 0.014 381.000 0.000 NA   NA
 7505660 7505661 CLJ_B1466 CLJ_B1467     FALSE 0.044 284.000 0.000 NA   NA
 7505661 7505662 CLJ_B1467 CLJ_B1468     FALSE 0.068 254.000 0.000 NA   NA
 7505662 7505663 CLJ_B1468 CLJ_B1469     TRUE 0.901 53.000 0.500 NA   NA
 7505663 7505664 CLJ_B1469 CLJ_B1470     TRUE 0.984 0.000 0.250 NA   NA
 7505666 7505667 CLJ_B1472 CLJ_B1473     FALSE 0.057 278.000 0.000 1.000 N NA
 7505667 7505668 CLJ_B1473 CLJ_B1474     TRUE 0.996 -3.000 0.235 0.027 Y NA
 7505668 7505669 CLJ_B1474 CLJ_B1475     TRUE 0.994 9.000 0.353 0.027 Y NA
 7505669 7505670 CLJ_B1475 CLJ_B1476     FALSE 0.423 99.000 0.000 NA   NA
 7505670 7505671 CLJ_B1476 CLJ_B1477     FALSE 0.007 458.000 0.000 NA   NA
 7505672 7505673 CLJ_B1478 CLJ_B1479     TRUE 0.995 0.000 0.231 1.000 Y NA
 7505676 7505677 CLJ_B1482 CLJ_B1483     TRUE 0.659 135.000 0.025 1.000 N NA
 7505677 7505678 CLJ_B1483 CLJ_B1484     FALSE 0.003 1004.000 0.000 NA N NA
 7505678 7505679 CLJ_B1484 CLJ_B1485     TRUE 0.988 -28.000 0.000 NA Y NA
 7505679 7505680 CLJ_B1485 CLJ_B1486     TRUE 0.787 126.000 0.000 1.000 Y NA
 7505680 7505681 CLJ_B1486 CLJ_B1487     TRUE 0.782 135.000 0.000 1.000 Y NA
 7505681 7505682 CLJ_B1487 CLJ_B1488     TRUE 0.984 -30.000 0.035 0.054   NA
 7505682 7505683 CLJ_B1488 CLJ_B1489     TRUE 0.674 127.000 0.035 1.000   NA
 7505683 7505684 CLJ_B1489 CLJ_B1490   rnz FALSE 0.049 284.000 0.000 1.000   NA
 7505684 7505685 CLJ_B1490 CLJ_B1491 rnz   FALSE 0.015 369.000 0.000 NA   NA
 7505685 7505686 CLJ_B1491 CLJ_B1492     FALSE 0.366 145.000 0.000 NA   NA
 7505686 7505687 CLJ_B1492 CLJ_B1493     TRUE 0.929 13.000 0.015 NA   NA
 7505687 7505688 CLJ_B1493 CLJ_B1494     TRUE 0.975 54.000 0.800 0.018 Y NA
 7505688 7505689 CLJ_B1494 CLJ_B1495     TRUE 0.716 188.000 0.600 1.000 N NA
 7505689 7505690 CLJ_B1495 CLJ_B1496     TRUE 0.900 109.000 1.000 NA   NA
 7505690 7505691 CLJ_B1496 CLJ_B1497     TRUE 0.988 2.000 0.600 NA   NA
 7505691 7505692 CLJ_B1497 CLJ_B1498     TRUE 0.974 19.000 0.500 NA   NA
 7505693 7505694 CLJ_B1499 CLJ_B1500     FALSE 0.005 553.000 0.000 NA   NA
 7505694 7505695 CLJ_B1500 CLJ_B1501   cspA TRUE 0.692 168.000 0.250 NA   NA
 7505696 7505697 CLJ_B1502 CLJ_B1503 pepD_1   TRUE 0.696 34.000 0.000 1.000   NA
 7505697 7505698 CLJ_B1503 CLJ_B1504     FALSE 0.009 446.000 0.000 1.000   NA
 7505700 7505701 CLJ_B1506 CLJ_B1507     TRUE 0.993 -13.000 0.500 1.000   NA
 7505701 7505702 CLJ_B1507 CLJ_B1508     TRUE 0.730 175.000 0.500 NA   NA
 7505702 7505703 CLJ_B1508 CLJ_B1509     FALSE 0.009 428.000 0.000 NA   NA
 7505703 7505704 CLJ_B1509 CLJ_B1510     TRUE 0.997 2.000 1.000 1.000 Y NA
 7505704 7505705 CLJ_B1510 CLJ_B1511     TRUE 0.900 57.000 0.500 1.000 N NA
 7505705 7505706 CLJ_B1511 CLJ_B1512     TRUE 0.988 -10.000 0.222 1.000   NA
 7505706 7505707 CLJ_B1512 CLJ_B1513     FALSE 0.448 69.000 0.000 NA   NA
 7505707 7505708 CLJ_B1513 CLJ_B1514     FALSE 0.020 346.000 0.000 NA   NA
 7505708 7505709 CLJ_B1514 CLJ_B1515     FALSE 0.011 401.000 0.000 NA   NA
 7505709 7505710 CLJ_B1515 CLJ_B1516     FALSE 0.415 88.000 0.000 NA   NA
 7505710 7505711 CLJ_B1516 CLJ_B1517     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7505712 7505713 CLJ_B1518 CLJ_B1519     TRUE 0.940 0.000 0.000 0.062   NA
 7505718 7505719 CLJ_B1524 CLJ_B1525 bdhA   FALSE 0.014 384.000 0.000 NA   NA
 7505719 7505720 CLJ_B1525 CLJ_B1526     TRUE 0.737 174.000 0.500 NA   NA
 7505722 7505723 CLJ_B1528 CLJ_B1529     TRUE 0.997 2.000 0.643 0.027 Y NA
 7505723 7505724 CLJ_B1529 CLJ_B1530     TRUE 0.668 130.000 0.041 NA   NA
 7505724 7505725 CLJ_B1530 CLJ_B1531     FALSE 0.420 95.000 0.000 NA   NA
 7505725 7505726 CLJ_B1531 CLJ_B1532     FALSE 0.018 354.000 0.000 NA   NA
 7505726 7505727 CLJ_B1532 CLJ_B1533     FALSE 0.158 203.000 0.000 NA   NA
 7505727 7505728 CLJ_B1533 CLJ_B1534     FALSE 0.174 270.000 0.079 1.000   NA
 7505728 7505729 CLJ_B1534 CLJ_B1535     FALSE 0.525 56.000 0.000 1.000   NA
 7505729 7505730 CLJ_B1535 CLJ_B1536     FALSE 0.008 480.000 0.000 1.000 N NA
 7505730 7505731 CLJ_B1536 CLJ_B1537     TRUE 0.913 32.000 0.137 1.000   NA
 7505735 7505736 CLJ_B1541 CLJ_B1542     FALSE 0.021 361.000 0.000 1.000 N NA
 7505737 7505738 CLJ_B1543 CLJ_B1544   npr_1 FALSE 0.283 167.000 0.000 NA   NA
 7505738 7505739 CLJ_B1544 CLJ_B1545 npr_1 npr_2 TRUE 0.966 137.000 1.000 0.006 Y NA
 7505739 7505740 CLJ_B1545 CLJ_B1546 npr_2 npr_3 TRUE 0.823 116.000 0.000 0.006 Y NA
 7505740 7505741 CLJ_B1546 CLJ_B1547 npr_3 npr_4 TRUE 0.823 120.000 0.000 0.006 Y NA
 7505741 7505742 CLJ_B1547 CLJ_B1548 npr_4 npr_5 TRUE 0.931 34.000 0.000 0.006 Y NA
 7505742 7505743 CLJ_B1548 CLJ_B1549 npr_5 nadC FALSE 0.005 602.000 0.000 1.000 N NA
 7505743 7505744 CLJ_B1549 CLJ_B1550 nadC nadB TRUE 0.994 -19.000 0.046 1.000 Y NA
 7505744 7505745 CLJ_B1550 CLJ_B1551 nadB nadA TRUE 0.989 3.000 0.042 1.000 Y NA
 7505747 7505748 CLJ_B1553 CLJ_B1554 hlyIII ychF TRUE 0.630 121.000 0.002 0.042   NA
 7505749 7505750 CLJ_B1555 CLJ_B1556 mraZ mraW TRUE 0.875 80.000 0.635 NA   NA
 7505750 7505751 CLJ_B1556 CLJ_B1557 mraW   TRUE 0.609 82.000 0.008 1.000   NA
 7505751 7505752 CLJ_B1557 CLJ_B1558     TRUE 0.954 16.000 0.096 1.000   NA
 7505752 7505753 CLJ_B1558 CLJ_B1559   murE TRUE 0.661 230.000 0.265 1.000 Y NA
 7505753 7505754 CLJ_B1559 CLJ_B1560 murE murF TRUE 0.987 26.000 0.328 0.003 Y NA
 7505754 7505755 CLJ_B1560 CLJ_B1561 murF mraY_2 TRUE 0.955 36.000 0.024 0.004 Y NA
 7505755 7505756 CLJ_B1561 CLJ_B1562 mraY_2   TRUE 0.713 79.000 0.014 0.004 N NA
 7505756 7505757 CLJ_B1562 CLJ_B1563     FALSE 0.061 319.000 0.015 NA N NA
 7505757 7505758 CLJ_B1563 CLJ_B1564     TRUE 0.935 11.000 0.014 NA   NA
 7505758 7505759 CLJ_B1564 CLJ_B1565   sbp TRUE 0.865 34.000 0.053 NA   NA
 7505759 7505760 CLJ_B1565 CLJ_B1566 sbp   TRUE 0.968 1.000 0.053 NA   NA
 7505760 7505761 CLJ_B1566 CLJ_B1567     TRUE 0.622 93.000 0.017 NA   NA
 7505761 7505762 CLJ_B1567 CLJ_B1568     TRUE 0.917 21.000 0.032 NA   NA
 7505762 7505763 CLJ_B1568 CLJ_B1569     TRUE 0.965 17.000 0.246 NA   NA
 7505763 7505764 CLJ_B1569 CLJ_B1570     TRUE 0.978 1.000 0.118 1.000   NA
 7505764 7505765 CLJ_B1570 CLJ_B1571     TRUE 0.978 16.000 0.579 NA   NA
 7505765 7505766 CLJ_B1571 CLJ_B1572   aroB FALSE 0.022 408.000 0.006 NA N NA
 7505766 7505767 CLJ_B1572 CLJ_B1573 aroB mtnN TRUE 0.955 1.000 0.003 1.000 N NA
 7505767 7505768 CLJ_B1573 CLJ_B1574 mtnN aroF TRUE 0.705 121.000 0.046 1.000 N NA
 7505768 7505769 CLJ_B1574 CLJ_B1575 aroF aroA TRUE 0.745 167.000 0.003 1.000 Y NA
 7505769 7505770 CLJ_B1575 CLJ_B1576 aroA   FALSE 0.152 217.000 0.000 1.000 N NA
 7505770 7505771 CLJ_B1576 CLJ_B1577   lspA FALSE 0.060 354.000 0.050 1.000 N NA
 7505771 7505772 CLJ_B1577 CLJ_B1578 lspA   TRUE 0.970 4.000 0.082 1.000 N NA
 7505772 7505773 CLJ_B1578 CLJ_B1580   pyrR_1 FALSE 0.020 497.000 0.048 1.000 N NA
 7505773 7505774 CLJ_B1580 CLJ_B1581 pyrR_1 pyrP TRUE 0.953 44.000 0.140 1.000 Y NA
 7505776 7505777 CLJ_B1583 CLJ_B1584 xth   FALSE 0.347 233.000 0.000 1.000 Y NA
 7505777 7505778 CLJ_B1584 CLJ_B1585     FALSE 0.103 231.000 0.000 1.000   NA
 7505778 7505779 CLJ_B1585 CLJ_B1586   modA FALSE 0.245 180.000 0.000 1.000   NA
 7505779 7505780 CLJ_B1586 CLJ_B1587 modA modB TRUE 0.995 10.000 0.430 0.001 Y NA
 7505780 7505781 CLJ_B1587 CLJ_B1588 modB   FALSE 0.344 323.000 0.342 1.000 Y NA
 7505781 7505782 CLJ_B1588 CLJ_B1589     TRUE 0.695 54.000 0.013 NA   NA
 7505782 7505783 CLJ_B1589 CLJ_B1590     FALSE 0.019 348.000 0.000 NA   NA
 7505783 7505784 CLJ_B1590 CLJ_B1591     FALSE 0.019 350.000 0.000 NA   NA
 7505784 7505785 CLJ_B1591 CLJ_B1592     FALSE 0.050 273.000 0.000 NA   NA
 7505785 7505786 CLJ_B1592 CLJ_B1593     TRUE 0.894 48.000 0.308 NA N NA
 7505786 7505787 CLJ_B1593 CLJ_B1594     FALSE 0.379 142.000 0.000 NA   NA
 7505787 7505788 CLJ_B1594 CLJ_B1595     TRUE 0.765 88.000 0.147 NA   NA
 7505788 7505789 CLJ_B1595 CLJ_B1596     TRUE 0.953 24.000 0.235 NA   NA
 7505789 7505790 CLJ_B1596 CLJ_B1597   mtbC TRUE 0.934 26.000 0.118 1.000   NA
 7505790 7505791 CLJ_B1597 CLJ_B1598 mtbC   TRUE 0.767 80.000 0.118 1.000   NA
 7505791 7505792 CLJ_B1598 CLJ_B1599     FALSE 0.008 449.000 0.000 NA   NA
 7505792 7505793 CLJ_B1599 CLJ_B1600     TRUE 0.759 26.000 0.000 NA   NA
 7505793 7505794 CLJ_B1600 CLJ_B1601     TRUE 0.927 23.000 0.044 1.000 N NA
 7505794 7505795 CLJ_B1601 CLJ_B1602     TRUE 0.993 2.000 0.178 1.000 Y NA
 7505795 7505796 CLJ_B1602 CLJ_B1603     TRUE 0.890 170.000 0.444 NA Y NA
 7505798 7505799 CLJ_B1605 CLJ_B1606   asnA FALSE 0.028 330.000 0.000 1.000 N NA
 7505801 7505802 CLJ_B1608 CLJ_B1609     TRUE 0.964 27.000 0.024 1.000 Y NA
 7505802 7505803 CLJ_B1609 CLJ_B1610     FALSE 0.034 306.000 0.000 1.000   NA
 7505805 7505806 CLJ_B1612 CLJ_B1613     TRUE 0.945 13.000 0.041 NA   NA
 7505806 7505807 CLJ_B1613 CLJ_B1614     TRUE 0.994 -7.000 0.611 0.027 N NA
 7505807 7505808 CLJ_B1614 CLJ_B1615     TRUE 0.977 36.000 0.278 0.027 Y NA
 7505808 7505809 CLJ_B1615 CLJ_B1616     TRUE 0.955 46.000 0.121 0.027 Y NA
 7505815 7505816 CLJ_B1622 CLJ_B1623     FALSE 0.420 108.000 0.000 NA   NA
 7505816 7505817 CLJ_B1623 CLJ_B1624     FALSE 0.016 367.000 0.000 NA   NA
 7505817 7505818 CLJ_B1624 CLJ_B1625     TRUE 0.664 35.000 0.000 NA   NA
 7505818 7505819 CLJ_B1625 CLJ_B1626     FALSE 0.004 655.000 0.000 NA   NA
 7505820 7505821 CLJ_B1627 CLJ_B1628 chiA   TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7505824 7505825 CLJ_B1631 CLJ_B1632     FALSE 0.345 151.000 0.000 NA   NA
 7505825 7505826 CLJ_B1632 CLJ_B1633   ogt TRUE 0.849 29.000 0.014 NA   NA
 7505826 7505827 CLJ_B1633 CLJ_B1634 ogt   TRUE 0.872 27.000 0.014 1.000   NA
 7505827 7505828 CLJ_B1634 CLJ_B1635     TRUE 0.709 165.000 0.263 NA   NA
 7505828 7505829 CLJ_B1635 CLJ_B1636     TRUE 0.943 25.000 0.168 NA   NA
 7505829 7505830 CLJ_B1636 CLJ_B1637     FALSE 0.006 513.000 0.000 1.000   NA
 7505830 7505831 CLJ_B1637 CLJ_B1638     FALSE 0.146 214.000 0.000 1.000   NA
 7505831 7505832 CLJ_B1638 CLJ_B1639     FALSE 0.010 477.000 0.000 0.088 N NA
 7505832 7505833 CLJ_B1639 CLJ_B1640     FALSE 0.010 437.000 0.000 1.000 N NA
 7505833 7505834 CLJ_B1640 CLJ_B1641     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7505834 7505835 CLJ_B1641 CLJ_B1642     FALSE 0.413 126.000 0.000 NA   NA
 7505835 7505836 CLJ_B1642 CLJ_B1643     FALSE 0.104 236.000 0.000 1.000 N NA
 7505836 7505837 CLJ_B1643 CLJ_B1644     TRUE 0.996 13.000 1.000 0.006 Y NA
 7505837 7505838 CLJ_B1644 CLJ_B1645     FALSE 0.067 255.000 0.000 NA   NA
 7505838 7505839 CLJ_B1645 CLJ_B1646     TRUE 0.811 99.000 0.250 NA   NA
 7505839 7505840 CLJ_B1646 CLJ_B1647     TRUE 0.722 29.000 0.000 NA   NA
 7505843 7505844 CLJ_B1651 CLJ_B1652     TRUE 0.976 14.000 0.386 NA   NA
 7505845 7505846 CLJ_B1653 CLJ_B1654     TRUE 0.783 121.000 0.143 1.000 N NA
 7505846 7505847 CLJ_B1654 CLJ_B1655     TRUE 0.987 11.000 0.750 1.000   NA
 7505847 7505848 CLJ_B1655 CLJ_B1656     TRUE 0.990 0.000 0.600 NA   NA
 7505848 7505849 CLJ_B1656 CLJ_B1657     TRUE 0.865 132.000 0.600 NA   NA
 7505850 7505851 CLJ_B1658 CLJ_B1659     TRUE 0.742 58.000 0.051 NA   NA
 7505851 7505852 CLJ_B1659 CLJ_B1660     FALSE 0.234 178.000 0.000 NA   NA
 7505853 7505854 CLJ_B1662 CLJ_B1663     TRUE 0.992 0.000 0.722 NA N NA
 7505854 7505855 CLJ_B1663 CLJ_B1664   queD TRUE 0.958 17.000 0.135 NA N NA
 7505855 7505856 CLJ_B1664 CLJ_B1665 queD   TRUE 0.987 2.000 0.405 1.000 N NA
 7505856 7505857 CLJ_B1665 CLJ_B1666   folE TRUE 0.986 4.000 0.429 1.000 N NA
 7505857 7505858 CLJ_B1666 CLJ_B1667 folE   FALSE 0.396 182.000 0.015 1.000   NA
 7505858 7505859 CLJ_B1667 CLJ_B1668     TRUE 0.593 114.000 0.005 1.000   NA
 7505859 7505860 CLJ_B1668 CLJ_B1669     FALSE 0.271 169.000 0.000 NA   NA
 7505860 7505861 CLJ_B1669 CLJ_B1670   deoC FALSE 0.025 324.000 0.000 NA   NA
 7505861 7505862 CLJ_B1670 CLJ_B1671 deoC rbsK FALSE 0.059 339.000 0.026 1.000 N NA
 7505862 7505863 CLJ_B1671 CLJ_B1672 rbsK hisZ FALSE 0.008 468.000 0.000 1.000 N NA
 7505863 7505864 CLJ_B1672 CLJ_B1673 hisZ hisG TRUE 0.987 25.000 0.239 0.004 Y NA
 7505864 7505865 CLJ_B1673 CLJ_B1674 hisG hisD TRUE 0.943 79.000 0.254 0.004 Y NA
 7505865 7505866 CLJ_B1674 CLJ_B1675 hisD hisB TRUE 0.902 145.000 0.096 0.004 Y NA
 7505866 7505867 CLJ_B1675 CLJ_B1676 hisB hisH TRUE 0.924 126.000 0.125 0.004 Y NA
 7505867 7505868 CLJ_B1676 CLJ_B1677 hisH hisA TRUE 0.995 -3.000 0.124 0.004 Y NA
 7505868 7505869 CLJ_B1677 CLJ_B1678 hisA hisC TRUE 0.991 -3.000 0.004 0.004 Y NA
 7505869 7505870 CLJ_B1678 CLJ_B1679 hisC hisF TRUE 0.648 200.000 0.002 0.004 Y NA
 7505870 7505871 CLJ_B1679 CLJ_B1680 hisF hisI TRUE 0.987 28.000 0.430 0.004 Y NA
 7505871 7505872 CLJ_B1680 CLJ_B1681 hisI hisE FALSE 0.414 121.000 0.000 NA   NA
 7505872 7505873 CLJ_B1681 CLJ_B1682 hisE   FALSE 0.395 138.000 0.000 NA   NA
 7505873 7505874 CLJ_B1682 CLJ_B1683     TRUE 0.969 14.000 0.231 NA   NA
 7505874 7505875 CLJ_B1683 CLJ_B1684     TRUE 0.965 18.000 0.267 NA   NA
 7505877 7505878 CLJ_B1686 CLJ_B1687     TRUE 0.725 81.000 0.070 1.000   NA
 7505878 7505879 CLJ_B1687 CLJ_B1688     TRUE 0.600 153.000 0.047 NA   NA
 7505879 7505880 CLJ_B1688 CLJ_B1689     FALSE 0.087 235.000 0.000 NA   NA
 7505880 7505881 CLJ_B1689 CLJ_B1690     TRUE 0.961 3.000 0.041 NA   NA
 7505881 7505882 CLJ_B1690 CLJ_B1691     TRUE 0.986 3.000 0.490 NA   NA
 7505882 7505883 CLJ_B1691 CLJ_B1692     TRUE 0.828 117.000 0.352 NA   NA
 7505883 7505884 CLJ_B1692 CLJ_B1693     TRUE 0.998 -9.000 0.741 0.017 Y NA
 7505884 7505885 CLJ_B1693 CLJ_B1694   arcA_2 FALSE 0.006 564.000 0.000 1.000 N NA
 7505885 7505886 CLJ_B1694 CLJ_B1695 arcA_2 arcD TRUE 0.863 125.000 0.022 1.000 Y NA
 7505888 7505889 CLJ_B1697 CLJ_B1698     FALSE 0.395 138.000 0.000 NA   NA
 7505889 7505890 CLJ_B1698 CLJ_B1699     FALSE 0.418 93.000 0.000 NA   NA
 7505890 7505891 CLJ_B1699 CLJ_B1700     TRUE 0.623 40.000 0.000 NA   NA
 7505893 7505894 CLJ_B1702 CLJ_B1703     FALSE 0.462 189.000 0.067 1.000   NA
 7505895 7505896 CLJ_B1704 CLJ_B1705     TRUE 0.940 0.000 0.000 0.061   NA
 7505897 7505898 CLJ_B1706 CLJ_B1707     FALSE 0.014 381.000 0.000 NA   NA
 7505898 7505899 CLJ_B1707 CLJ_B1708     TRUE 0.770 149.000 0.222 1.000 N NA
 7505899 7505900 CLJ_B1708 CLJ_B1709     TRUE 0.997 2.000 0.900 0.006 Y NA
 7505900 7505901 CLJ_B1709 CLJ_B1710     FALSE 0.015 393.000 0.000 1.000 N NA
 7505901 7505902 CLJ_B1710 CLJ_B1711     FALSE 0.178 293.000 0.000 1.000 Y NA
 7505902 7505903 CLJ_B1711 CLJ_B1712     FALSE 0.293 248.000 0.000 1.000 Y NA
 7505903 7505904 CLJ_B1712 CLJ_B1713     TRUE 0.958 42.000 0.167 1.000 Y NA
 7505904 7505905 CLJ_B1713 CLJ_B1714     TRUE 0.987 4.000 0.610 NA   NA
 7505905 7505906 CLJ_B1714 CLJ_B1715     FALSE 0.105 226.000 0.000 NA   NA
 7505908 7505909 CLJ_B1717 CLJ_B1718     TRUE 0.873 101.000 0.600 NA   NA
 7505909 7505910 CLJ_B1718 CLJ_B1719     FALSE 0.379 142.000 0.000 NA   NA
 7505911 7505912 CLJ_B1720 CLJ_B1721     TRUE 0.997 -22.000 0.261 1.000 Y NA
 7505913 7505914 CLJ_B1722 CLJ_B1723     TRUE 0.527 52.000 0.000 NA   NA
 7505915 7505916 CLJ_B1724 CLJ_B1725     FALSE 0.053 270.000 0.000 NA   NA
 7505916 7505917 CLJ_B1725 CLJ_B1726     TRUE 0.973 9.000 0.171 1.000   NA
 7505917 7505918 CLJ_B1726 CLJ_B1727     FALSE 0.029 309.000 0.000 NA   NA
 7505919 7505920 CLJ_B1728 CLJ_B1729     TRUE 0.954 40.000 1.000 NA   NA
 7505922 7505923 CLJ_B1732 CLJ_B1733 metF   TRUE 0.654 160.000 0.045 0.002   NA
 7505923 7505924 CLJ_B1733 CLJ_B1734     TRUE 0.986 -10.000 0.075 0.001   NA
 7505926 7505927 CLJ_B1736 CLJ_B1737   acoR FALSE 0.011 403.000 0.000 NA   NA
 7505927 7505928 CLJ_B1737 CLJ_B1738 acoR   TRUE 0.779 122.000 0.182 NA   NA
 7505928 7505929 CLJ_B1738 CLJ_B1739   acoA TRUE 0.932 21.000 0.065 NA   NA
 7505929 7505930 CLJ_B1739 CLJ_B1740 acoA acoB TRUE 0.992 3.000 0.076 0.001 Y NA
 7505930 7505931 CLJ_B1740 CLJ_B1741 acoB   FALSE 0.436 75.000 0.000 NA   NA
 7505931 7505932 CLJ_B1741 CLJ_B1742   acoC TRUE 0.655 36.000 0.000 NA   NA
 7505932 7505933 CLJ_B1742 CLJ_B1743 acoC acoL TRUE 0.989 13.000 0.148 1.000 Y NA
 7505933 7505934 CLJ_B1743 CLJ_B1744 acoL   TRUE 0.930 25.000 0.074 1.000 N NA
 7505934 7505935 CLJ_B1744 CLJ_B1745     FALSE 0.025 344.000 0.000 1.000 N NA
 7505935 7505936 CLJ_B1745 CLJ_B1746     TRUE 0.995 -7.000 0.793 0.087 N NA
 7505936 7505937 CLJ_B1746 CLJ_B1747   thrC FALSE 0.044 297.000 0.000 1.000 N NA
 7505937 7505938 CLJ_B1747 CLJ_B1748 thrC thrB TRUE 0.992 10.000 0.233 1.000 Y NA
 7505938 7505939 CLJ_B1748 CLJ_B1749 thrB   TRUE 0.847 127.000 0.008 1.000 Y NA
 7505939 7505940 CLJ_B1749 CLJ_B1750   hom_1 TRUE 0.564 223.000 0.010 0.003 Y NA
 7505940 7505941 CLJ_B1750 CLJ_B1751 hom_1   FALSE 0.005 615.000 0.000 1.000 N NA
 7505941 7505942 CLJ_B1751 CLJ_B1752     FALSE 0.007 510.000 0.000 1.000 N NA
 7505942 7505943 CLJ_B1752 CLJ_B1753     FALSE 0.111 329.000 0.000 1.000 Y NA
 7505943 7505944 CLJ_B1753 CLJ_B1754   gltA_1 TRUE 0.993 0.000 0.667 0.038 N NA
 7505944 7505945 CLJ_B1754 CLJ_B1755 gltA_1   FALSE 0.119 229.000 0.000 1.000 N NA
 7505945 7505946 CLJ_B1755 CLJ_B1756     FALSE 0.004 664.000 0.000 NA   NA
 7505946 7505947 CLJ_B1756 CLJ_B1757     FALSE 0.005 564.000 0.000 NA   NA
 7505947 7505948 CLJ_B1757 CLJ_B1758     FALSE 0.008 440.000 0.000 NA   NA
 7505948 7505949 CLJ_B1758 CLJ_B1759     FALSE 0.419 94.000 0.000 NA   NA
 7505949 7505950 CLJ_B1759 CLJ_B1760     FALSE 0.226 180.000 0.000 NA   NA
 7505950 7505951 CLJ_B1760 CLJ_B1761     FALSE 0.017 358.000 0.000 NA   NA
 7505951 7505952 CLJ_B1761 CLJ_B1762     FALSE 0.011 403.000 0.000 NA   NA
 7505952 7505953 CLJ_B1762 CLJ_B1763     FALSE 0.271 169.000 0.000 NA   NA
 7505954 7505955 CLJ_B1764 CLJ_B1765     FALSE 0.496 62.000 0.000 NA N NA
 7505955 7505956 CLJ_B1765 CLJ_B1766     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7505957 7505958 CLJ_B1767 CLJ_B1768     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7505958 7505959 CLJ_B1768 CLJ_B1769     TRUE 0.805 21.000 0.000 NA   NA
 7505959 7505960 CLJ_B1769 CLJ_B1770     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7505960 7505961 CLJ_B1770 CLJ_B1771     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7505961 7505962 CLJ_B1771 CLJ_B1772     TRUE 0.640 38.000 0.000 NA   NA
 7505962 7505963 CLJ_B1772 CLJ_B1773     FALSE 0.491 57.000 0.000 NA   NA
 7505963 7505964 CLJ_B1773 CLJ_B1774     TRUE 0.942 -22.000 0.000 NA   NA
 7505964 7505965 CLJ_B1774 CLJ_B1775     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7505965 7505966 CLJ_B1775 CLJ_B1776     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7505966 7505967 CLJ_B1776 CLJ_B1777     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7505967 7505968 CLJ_B1777 CLJ_B1778     TRUE 0.970 0.000 0.051 NA   NA
 7505968 7505969 CLJ_B1778 CLJ_B1779     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7505969 7505970 CLJ_B1779 CLJ_B1780     TRUE 0.869 11.000 0.000 NA   NA
 7505970 7505971 CLJ_B1780 CLJ_B1781     FALSE 0.153 341.000 0.500 NA   NA
 7505971 7505972 CLJ_B1781 CLJ_B1782     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7505972 7505973 CLJ_B1782 CLJ_B1783     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7505973 7505974 CLJ_B1783 CLJ_B1784     FALSE 0.455 66.000 0.000 NA   NA
 7505974 7505975 CLJ_B1784 CLJ_B1785     TRUE 0.602 42.000 0.000 NA   NA
 7505975 7505976 CLJ_B1785 CLJ_B1786     FALSE 0.453 67.000 0.000 NA   NA
 7505976 7505977 CLJ_B1786 CLJ_B1787     FALSE 0.458 65.000 0.000 NA   NA
 7505977 7505978 CLJ_B1787 CLJ_B1788     TRUE 0.689 32.000 0.000 NA   NA
 7505978 7505979 CLJ_B1788 CLJ_B1789     TRUE 0.709 30.000 0.000 NA   NA
 7505979 7505980 CLJ_B1789 CLJ_B1790     FALSE 0.451 68.000 0.000 NA   NA
 7505980 7505981 CLJ_B1790 CLJ_B1791     TRUE 0.799 22.000 0.000 NA   NA
 7505981 7505982 CLJ_B1791 CLJ_B1792     FALSE 0.458 65.000 0.000 NA   NA
 7505982 7505983 CLJ_B1792 CLJ_B1793     FALSE 0.514 54.000 0.000 NA   NA
 7505983 7505984 CLJ_B1793 CLJ_B1794     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7505984 7505985 CLJ_B1794 CLJ_B1795     FALSE 0.478 59.000 0.000 NA   NA
 7505985 7505986 CLJ_B1795 CLJ_B1796     FALSE 0.046 279.000 0.000 NA   NA
 7505986 7505987 CLJ_B1796 CLJ_B1797     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7505987 7505988 CLJ_B1797 CLJ_B1798     TRUE 0.923 -3.000 0.000 NA   NA
 7505988 7505989 CLJ_B1798 CLJ_B1799     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7505989 7505990 CLJ_B1799 CLJ_B1800     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7505990 7505991 CLJ_B1800 CLJ_B1801     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7505991 7505992 CLJ_B1801 CLJ_B1802     TRUE 0.869 11.000 0.000 NA   NA
 7505992 7505993 CLJ_B1802 CLJ_B1803     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7505993 7505994 CLJ_B1803 CLJ_B1804     FALSE 0.413 122.000 0.000 NA   NA
 7505994 7505995 CLJ_B1804 CLJ_B1805     FALSE 0.425 104.000 0.000 NA   NA
 7505995 7505996 CLJ_B1805 CLJ_B1806     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7505996 7505997 CLJ_B1806 CLJ_B1807     TRUE 0.930 -7.000 0.000 NA   NA
 7505997 7505998 CLJ_B1807 CLJ_B1808     FALSE 0.370 144.000 0.000 NA   NA
 7505998 7505999 CLJ_B1808 CLJ_B1809     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7505999 7506000 CLJ_B1809 CLJ_B1810     FALSE 0.262 171.000 0.000 NA   NA
 7506000 7506001 CLJ_B1810 CLJ_B1811     FALSE 0.271 169.000 0.000 NA   NA
 7506001 7506002 CLJ_B1811 CLJ_B1812     TRUE 0.611 41.000 0.000 NA   NA
 7506002 7506003 CLJ_B1812 CLJ_B1813     TRUE 0.991 -7.000 0.294 0.001   NA
 7506003 7506004 CLJ_B1813 CLJ_B1814     TRUE 0.975 14.000 0.368 NA   NA
 7506004 7506005 CLJ_B1814 CLJ_B1815     TRUE 0.989 -10.000 0.263 NA   NA
 7506005 7506006 CLJ_B1815 CLJ_B1816     TRUE 0.805 21.000 0.000 NA   NA
 7506006 7506007 CLJ_B1816 CLJ_B1817     FALSE 0.446 70.000 0.000 NA   NA
 7506007 7506008 CLJ_B1817 CLJ_B1818     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506008 7506009 CLJ_B1818 CLJ_B1819     TRUE 0.791 23.000 0.000 NA   NA
 7506009 7506010 CLJ_B1819 CLJ_B1820     TRUE 0.810 20.000 0.000 NA   NA
 7506010 7506011 CLJ_B1820 CLJ_B1821     TRUE 0.962 20.000 0.250 NA   NA
 7506011 7506012 CLJ_B1821 CLJ_B1822     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7506012 7506013 CLJ_B1822 CLJ_B1823     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7506013 7506014 CLJ_B1823 CLJ_B1824     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506014 7506015 CLJ_B1824 CLJ_B1825     TRUE 0.938 -13.000 0.000 NA   NA
 7506015 7506016 CLJ_B1825 CLJ_B1826     TRUE 0.935 -10.000 0.000 NA   NA
 7506016 7506017 CLJ_B1826 CLJ_B1827     TRUE 0.989 2.000 0.667 NA   NA
 7506017 7506018 CLJ_B1827 CLJ_B1828     TRUE 0.889 4.000 0.000 NA   NA
 7506018 7506019 CLJ_B1828 CLJ_B1829     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7506019 7506020 CLJ_B1829 CLJ_B1830     FALSE 0.421 81.000 0.000 NA   NA
 7506020 7506021 CLJ_B1830 CLJ_B1831     FALSE 0.458 65.000 0.000 NA   NA
 7506021 7506022 CLJ_B1831 CLJ_B1832     FALSE 0.415 88.000 0.000 NA   NA
 7506022 7506023 CLJ_B1832 CLJ_B1833     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506023 7506024 CLJ_B1833 CLJ_B1834     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7506024 7506025 CLJ_B1834 CLJ_B1835     TRUE 0.986 3.000 0.500 NA   NA
 7506025 7506026 CLJ_B1835 CLJ_B1836     TRUE 0.975 3.000 0.160 NA   NA
 7506026 7506027 CLJ_B1836 CLJ_B1837     TRUE 0.990 1.000 0.720 NA   NA
 7506027 7506028 CLJ_B1837 CLJ_B1838     TRUE 0.994 -19.000 0.708 NA   NA
 7506028 7506029 CLJ_B1838 CLJ_B1839     TRUE 0.889 4.000 0.000 NA   NA
 7506029 7506030 CLJ_B1839 CLJ_B1840     TRUE 0.681 33.000 0.000 NA   NA
 7506030 7506031 CLJ_B1840 CLJ_B1841     TRUE 0.994 -7.000 1.000 NA   NA
 7506031 7506032 CLJ_B1841 CLJ_B1842     FALSE 0.012 396.000 0.000 NA   NA
 7506032 7506033 CLJ_B1842 CLJ_B1843     FALSE 0.043 287.000 0.000 NA   NA
 7506033 7506034 CLJ_B1843 CLJ_B1844     TRUE 0.791 23.000 0.000 NA   NA
 7506034 7506035 CLJ_B1844 CLJ_B1845     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7506035 7506036 CLJ_B1845 CLJ_B1846     TRUE 0.611 41.000 0.000 NA   NA
 7506036 7506037 CLJ_B1846 CLJ_B1847     FALSE 0.005 550.000 0.000 NA   NA
 7506037 7506038 CLJ_B1847 CLJ_B1848     FALSE 0.032 304.000 0.000 NA   NA
 7506038 7506039 CLJ_B1848 CLJ_B1849     TRUE 0.938 -13.000 0.000 NA   NA
 7506039 7506040 CLJ_B1849 CLJ_B1850     TRUE 0.939 -15.000 0.000 NA   NA
 7506040 7506041 CLJ_B1850 CLJ_B1851     FALSE 0.356 148.000 0.000 NA   NA
 7506041 7506042 CLJ_B1851 CLJ_B1852     FALSE 0.005 561.000 0.000 NA   NA
 7506042 7506043 CLJ_B1852 CLJ_B1853     TRUE 0.938 33.000 0.379 NA   NA
 7506043 7506044 CLJ_B1853 CLJ_B1854   alr_1 FALSE 0.008 438.000 0.000 NA   NA
 7506044 7506045 CLJ_B1854 CLJ_B1855 alr_1   FALSE 0.009 452.000 0.000 1.000 N NA
 7506045 7506046 CLJ_B1855 CLJ_B1856     TRUE 0.675 88.000 0.016 0.085   NA
 7506046 7506047 CLJ_B1856 CLJ_B1857     FALSE 0.080 240.000 0.000 NA   NA
 7506053 7506054 CLJ_B1863 CLJ_B1864     TRUE 0.660 137.000 0.027 1.000 N NA
 7506054 7506055 CLJ_B1864 CLJ_B1865     TRUE 0.995 14.000 0.667 0.025 Y NA
 7506055 7506056 CLJ_B1865 CLJ_B1866     TRUE 0.997 4.000 1.000 0.025 Y NA
 7506056 7506057 CLJ_B1866 CLJ_B1867     TRUE 0.977 31.000 0.265 1.000 Y NA
 7506058 7506059 CLJ_B1868 CLJ_B1869     TRUE 0.944 -13.000 0.000 1.000   NA
 7506059 7506060 CLJ_B1869 CLJ_B1870     FALSE 0.279 187.000 0.000 0.022   NA
 7506061 7506062 CLJ_B1871 CLJ_B1872     TRUE 0.908 1.000 0.000 NA   NA
 7506062 7506063 CLJ_B1872 CLJ_B1873     TRUE 0.902 2.000 0.000 NA   NA
 7506063 7506064 CLJ_B1873 CLJ_B1874     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7506064 7506065 CLJ_B1874 CLJ_B1875     TRUE 0.592 43.000 0.000 NA   NA
 7506065 7506066 CLJ_B1875 CLJ_B1876     TRUE 0.848 14.000 0.000 NA   NA
 7506066 7506067 CLJ_B1876 CLJ_B1877     TRUE 0.833 16.000 0.000 NA   NA
 7506067 7506068 CLJ_B1877 CLJ_B1878     FALSE 0.446 70.000 0.000 NA   NA
 7506068 7506069 CLJ_B1878 CLJ_B1879     FALSE 0.420 95.000 0.000 NA   NA
 7506069 7506070 CLJ_B1879 CLJ_B1880     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7506070 7506071 CLJ_B1880 CLJ_B1881     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506071 7506072 CLJ_B1881 CLJ_B1882     TRUE 0.547 49.000 0.000 NA   NA
 7506072 7506073 CLJ_B1882 CLJ_B1883     FALSE 0.514 54.000 0.000 NA   NA
 7506073 7506074 CLJ_B1883 CLJ_B1884     TRUE 0.826 17.000 0.000 NA   NA
 7506074 7506075 CLJ_B1884 CLJ_B1885     FALSE 0.478 59.000 0.000 NA   NA
 7506075 7506076 CLJ_B1885 CLJ_B1886     TRUE 0.592 43.000 0.000 NA   NA
 7506076 7506077 CLJ_B1886 CLJ_B1887     TRUE 0.709 30.000 0.000 NA   NA
 7506077 7506078 CLJ_B1887 CLJ_B1888     TRUE 0.592 43.000 0.000 NA   NA
 7506078 7506079 CLJ_B1888 CLJ_B1889     TRUE 0.869 11.000 0.000 NA   NA
 7506079 7506080 CLJ_B1889 CLJ_B1890     TRUE 0.697 31.000 0.000 NA   NA
 7506080 7506081 CLJ_B1890 CLJ_B1891     FALSE 0.451 68.000 0.000 NA   NA
 7506081 7506082 CLJ_B1891 CLJ_B1892     TRUE 0.799 22.000 0.000 NA   NA
 7506082 7506083 CLJ_B1892 CLJ_B1893     TRUE 0.592 43.000 0.000 NA   NA
 7506083 7506084 CLJ_B1893 CLJ_B1894     TRUE 0.640 38.000 0.000 NA   NA
 7506084 7506085 CLJ_B1894 CLJ_B1895     FALSE 0.422 107.000 0.000 NA   NA
 7506085 7506086 CLJ_B1895 CLJ_B1896     TRUE 0.992 -3.000 0.667 NA   NA
 7506086 7506087 CLJ_B1896 CLJ_B1897     TRUE 0.987 12.000 1.000 NA   NA
 7506087 7506088 CLJ_B1897 CLJ_B1898     TRUE 0.987 12.000 1.000 NA   NA
 7506088 7506089 CLJ_B1898 CLJ_B1899     TRUE 0.935 -10.000 0.000 NA   NA
 7506089 7506090 CLJ_B1899 CLJ_B1900     FALSE 0.063 260.000 0.000 NA   NA
 7506090 7506091 CLJ_B1900 CLJ_B1901     TRUE 0.985 1.000 0.333 NA   NA
 7506091 7506092 CLJ_B1901 CLJ_B1902     FALSE 0.035 298.000 0.000 NA   NA
 7506092 7506093 CLJ_B1902 CLJ_B1903     FALSE 0.345 151.000 0.000 NA   NA
 7506093 7506094 CLJ_B1903 CLJ_B1904     FALSE 0.306 161.000 0.000 NA   NA
 7506094 7506095 CLJ_B1904 CLJ_B1905     TRUE 0.991 0.000 0.750 NA   NA
 7506095 7506096 CLJ_B1905 CLJ_B1906     TRUE 0.970 12.000 0.200 NA   NA
 7506096 7506097 CLJ_B1906 CLJ_B1907     TRUE 0.986 -7.000 0.200 NA   NA
 7506097 7506098 CLJ_B1907 CLJ_B1908     TRUE 0.632 39.000 0.000 NA   NA
 7506098 7506099 CLJ_B1908 CLJ_B1909     TRUE 0.571 45.000 0.000 NA   NA
 7506099 7506100 CLJ_B1909 CLJ_B1910     TRUE 0.816 19.000 0.000 NA   NA
 7506100 7506101 CLJ_B1910 CLJ_B1911     TRUE 0.872 10.000 0.000 NA   NA
 7506101 7506102 CLJ_B1911 CLJ_B1912     TRUE 0.894 3.000 0.000 NA   NA
 7506102 7506103 CLJ_B1912 CLJ_B1913     FALSE 0.470 61.000 0.000 NA   NA
 7506103 7506104 CLJ_B1913 CLJ_B1914     FALSE 0.006 498.000 0.000 NA   NA
 7506104 7506105 CLJ_B1914 CLJ_B1915     TRUE 0.863 12.000 0.000 NA   NA
 7506105 7506106 CLJ_B1915 CLJ_B1916     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7506106 7506107 CLJ_B1916 CLJ_B1917     FALSE 0.110 224.000 0.000 NA   NA
 7506107 7506108 CLJ_B1917 CLJ_B1918     TRUE 0.580 44.000 0.000 NA   NA
 7506108 7506109 CLJ_B1918 CLJ_B1919     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506109 7506110 CLJ_B1919 CLJ_B1920     TRUE 0.971 11.000 0.188 NA   NA
 7506110 7506111 CLJ_B1920 CLJ_B1921     TRUE 0.970 12.000 0.188 NA   NA
 7506111 7506112 CLJ_B1921 CLJ_B1922     TRUE 0.987 9.000 0.833 NA   NA
 7506112 7506113 CLJ_B1922 CLJ_B1923     TRUE 0.983 12.000 0.600 NA   NA
 7506113 7506114 CLJ_B1923 CLJ_B1924     TRUE 0.856 13.000 0.000 NA   NA
 7506114 7506115 CLJ_B1924 CLJ_B1925     TRUE 0.915 0.000 0.000 NA   NA
 7506115 7506116 CLJ_B1925 CLJ_B1926     TRUE 0.885 5.000 0.000 NA   NA
 7506116 7506117 CLJ_B1926 CLJ_B1927   uviB FALSE 0.425 102.000 0.000 NA   NA
 7506117 7506118 CLJ_B1927 CLJ_B1928 uviB   TRUE 0.989 2.000 0.667 NA   NA
 7506118 7506119 CLJ_B1928 CLJ_B1929     TRUE 0.602 42.000 0.000 NA   NA
 7506119 7506120 CLJ_B1929 CLJ_B1930     FALSE 0.206 185.000 0.000 NA   NA
 7506120 7506121 CLJ_B1930 CLJ_B1931     FALSE 0.484 58.000 0.000 NA   NA
 7506121 7506122 CLJ_B1931 CLJ_B1932     FALSE 0.412 127.000 0.000 NA   NA
 7506122 7506123 CLJ_B1932 CLJ_B1933     TRUE 0.655 36.000 0.000 NA   NA
 7506123 7506124 CLJ_B1933 CLJ_B1934     TRUE 0.995 -13.000 1.000 NA   NA
 7506124 7506125 CLJ_B1934 CLJ_B1935     TRUE 0.939 -15.000 0.000 NA   NA
 7506125 7506126 CLJ_B1935 CLJ_B1936     FALSE 0.014 379.000 0.000 NA   NA
 7506128 7506129 CLJ_B1938 CLJ_B1939     FALSE 0.051 271.000 0.000 NA   NA
 7506131 7506132 CLJ_B1941 CLJ_B1942     TRUE 0.563 151.000 0.011 1.000 N NA
 7506132 7506133 CLJ_B1942 CLJ_B1943     TRUE 0.968 -7.000 0.016 NA   NA
 7506133 7506134 CLJ_B1943 CLJ_B1944   pfkB_1 TRUE 0.970 26.000 0.721 NA   NA
 7506136 7506137 CLJ_B1946 CLJ_B1947     TRUE 0.835 152.000 0.667 NA   NA
 7506139 7506140 CLJ_B1949 CLJ_B1950     TRUE 0.697 31.000 0.000 NA   NA
 7506141 7506142 CLJ_B1951 CLJ_B1952 safA   FALSE 0.011 401.000 0.000 NA   NA
 7506145 7506146 CLJ_B1955 CLJ_B1956     TRUE 0.944 -28.000 0.000 NA   NA
 7506148 7506149 CLJ_B1958 CLJ_B1959     FALSE 0.028 323.000 0.000 1.000   NA
 7506149 7506150 CLJ_B1959 CLJ_B1960   dbpA FALSE 0.381 180.000 0.006 1.000   NA
 7506150 7506151 CLJ_B1960 CLJ_B1961 dbpA   FALSE 0.500 165.000 0.025 NA   NA
 7506151 7506152 CLJ_B1961 CLJ_B1962     FALSE 0.012 395.000 0.000 NA   NA
 7506152 7506153 CLJ_B1962 CLJ_B1963     FALSE 0.012 404.000 0.000 1.000   NA
 7506155 7506156 CLJ_B1965 CLJ_B1966   cheX TRUE 0.993 0.000 0.100 NA Y NA
 7506158 7506159 CLJ_B1968 CLJ_B1969     TRUE 0.603 61.000 0.000 0.002   NA
 7506164 7506165 CLJ_B1974 CLJ_B1975   hfq TRUE 0.721 101.000 0.064 1.000   NA
 7506165 7506166 CLJ_B1975 CLJ_B1976 hfq miaA TRUE 0.792 86.000 0.192 1.000   NA
 7506166 7506167 CLJ_B1976 CLJ_B1977 miaA   TRUE 0.957 16.000 0.097 1.000 N NA
 7506167 7506168 CLJ_B1977 CLJ_B1978   mutS TRUE 0.923 145.000 0.220 0.002 Y NA
 7506168 7506169 CLJ_B1978 CLJ_B1979 mutS miaB TRUE 0.711 79.000 0.041 1.000 N NA
 7506170 7506171 CLJ_B1980 CLJ_B1981     TRUE 0.724 85.000 0.087 NA   NA
 7506171 7506172 CLJ_B1981 CLJ_B1982   aspB_1 TRUE 0.674 55.000 0.008 NA   NA
 7506173 7506174 CLJ_B1983 CLJ_B1984     TRUE 0.871 78.000 0.571 NA   NA
 7506174 7506175 CLJ_B1984 CLJ_B1985     FALSE 0.074 247.000 0.000 NA   NA
 7506175 7506176 CLJ_B1985 CLJ_B1986   cmk TRUE 0.744 64.000 0.047 1.000 N NA
 7506176 7506177 CLJ_B1986 CLJ_B1987 cmk aroH TRUE 0.666 80.000 0.020 1.000 N NA
 7506177 7506178 CLJ_B1987 CLJ_B1988 aroH   TRUE 0.966 0.000 0.024 1.000   NA
 7506178 7506179 CLJ_B1988 CLJ_B1989   gluD FALSE 0.043 294.000 0.000 1.000   NA
 7506179 7506180 CLJ_B1989 CLJ_B1990 gluD   FALSE 0.272 234.000 0.068 1.000 N NA
 7506180 7506181 CLJ_B1990 CLJ_B1991   rluB FALSE 0.034 382.000 0.013 1.000 N NA
 7506181 7506182 CLJ_B1991 CLJ_B1992 rluB