MicrobesOnline Operon Predictions for Eubacterium eligens ATCC 27750

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7501168 7501169 EUBELI_00001 EUBELI_00002     FALSE 0.582 302.000 0.328 1.000 Y NA
 7501169 7501170 EUBELI_00002 EUBELI_00003     TRUE 0.864 18.000 0.006 1.000   NA
 7501170 7501171 EUBELI_00003 EUBELI_00004     TRUE 0.813 9.000 0.006 1.000   NA
 7501171 7501172 EUBELI_00004 EUBELI_00005     TRUE 0.986 36.000 0.249 1.000 Y NA
 7501172 7501173 EUBELI_00005 EUBELI_00006     TRUE 0.730 227.000 0.306 0.002 Y NA
 7501173 7501174 EUBELI_00006 EUBELI_00007     FALSE 0.310 59.000 0.000 NA   NA
 7501174 7501175 EUBELI_00007 EUBELI_00008     FALSE 0.569 -22.000 0.000 NA   NA
 7501175 7501176 EUBELI_00008 EUBELI_00009     TRUE 0.721 22.000 0.000 NA   NA
 7501176 7501177 EUBELI_00009 EUBELI_00010     TRUE 0.995 16.000 0.262 0.001 Y NA
 7501177 7501178 EUBELI_00010 EUBELI_00011     FALSE 0.295 72.000 0.000 NA   NA
 7501178 7501179 EUBELI_00011 EUBELI_00012     FALSE 0.008 407.000 0.000 NA   NA
 7501179 7501180 EUBELI_00012 EUBELI_00013     FALSE 0.008 419.000 0.000 NA   NA
 7501180 7501181 EUBELI_00013 EUBELI_00014     FALSE 0.290 88.000 0.000 NA   NA
 7501181 7501182 EUBELI_00014 EUBELI_00015     FALSE 0.013 334.000 0.000 NA   NA
 7501182 7501183 EUBELI_00015 EUBELI_00016     FALSE 0.061 163.000 0.000 NA   NA
 7501183 7501184 EUBELI_00016 EUBELI_00017     FALSE 0.318 54.000 0.000 NA   NA
 7501184 7501185 EUBELI_00017 EUBELI_00018     TRUE 0.624 9.000 0.000 NA   NA
 7501185 7501186 EUBELI_00018 EUBELI_00019     FALSE 0.366 46.000 0.000 NA   NA
 7501186 7501187 EUBELI_00019 EUBELI_00020     FALSE 0.338 50.000 0.000 NA   NA
 7501187 7501188 EUBELI_00020 EUBELI_00021     TRUE 0.616 5.000 0.000 NA   NA
 7501188 7501189 EUBELI_00021 EUBELI_00022     FALSE 0.266 93.000 0.000 NA   NA
 7501189 7501190 EUBELI_00022 EUBELI_00023     TRUE 0.955 21.000 0.095 NA   NA
 7501190 7501191 EUBELI_00023 EUBELI_00024     TRUE 0.745 -12.000 0.014 NA N NA
 7501191 7501192 EUBELI_00024 EUBELI_00025     TRUE 0.793 -10.000 0.004 NA   NA
 7501192 7501193 EUBELI_00025 EUBELI_00026     TRUE 0.734 52.000 0.059 NA   NA
 7501193 7501194 EUBELI_00026 EUBELI_00027     TRUE 0.980 15.000 0.372 NA   NA
 7501194 7501195 EUBELI_00027 EUBELI_00028     TRUE 0.919 -7.000 0.077 NA   NA
 7501195 7501196 EUBELI_00028 EUBELI_00029     TRUE 0.931 14.000 0.078 0.006   NA
 7501198 7501199 EUBELI_00031 EUBELI_00032     TRUE 0.970 17.000 0.197 NA   NA
 7501199 7501200 EUBELI_00032 EUBELI_00033     FALSE 0.019 266.000 0.000 NA   NA
 7501201 7501202 EUBELI_00034 EUBELI_00035     FALSE 0.579 31.000 0.000 NA   NA
 7501203 7501204 EUBELI_00036 EUBELI_00037     FALSE 0.135 82.000 0.000 1.000 N NA
 7501204 7501205 EUBELI_00037 EUBELI_00038     TRUE 0.890 17.000 0.047 NA N NA
 7501205 7501206 EUBELI_00038 EUBELI_00039     FALSE 0.010 237.000 0.000 NA N NA
 7501206 7501207 EUBELI_00039 EUBELI_00040     FALSE 0.006 519.000 0.000 NA   NA
 7501207 7501208 EUBELI_00040 EUBELI_00041     FALSE 0.284 90.000 0.000 NA   NA
 7501208 7501209 EUBELI_00041 EUBELI_00042     TRUE 0.622 8.000 0.000 NA   NA
 7501209 7501210 EUBELI_00042 EUBELI_00043     FALSE 0.072 155.000 0.000 NA   NA
 7501210 7501211 EUBELI_00043 EUBELI_00044     FALSE 0.091 142.000 0.000 1.000   NA
 7501211 7501212 EUBELI_00044 EUBELI_00045     TRUE 0.640 1.000 0.000 NA   NA
 7501214 7501215 EUBELI_00047 EUBELI_00048     FALSE 0.087 108.000 0.000 1.000 N NA
 7501216 7501217 EUBELI_00049 EUBELI_00050     FALSE 0.022 170.000 0.000 1.000 N NA
 7501217 7501218 EUBELI_00050 EUBELI_00051     FALSE 0.359 172.000 0.197 1.000 N NA
 7501218 7501219 EUBELI_00051 EUBELI_00052     FALSE 0.488 19.000 0.000 1.000 N NA
 7501219 7501220 EUBELI_00052 EUBELI_00053     FALSE 0.325 53.000 0.000 1.000   NA
 7501220 7501221 EUBELI_00053 EUBELI_00054     FALSE 0.254 95.000 0.000 NA   NA
 7501222 7501223 EUBELI_00055 EUBELI_00056     FALSE 0.458 37.000 0.000 NA   NA
 7501223 7501224 EUBELI_00056 EUBELI_00057     FALSE 0.525 34.000 0.000 NA   NA
 7501225 7501226 EUBELI_00058 EUBELI_00059     TRUE 0.633 2.000 0.000 NA   NA
 7501227 7501228 EUBELI_00060 EUBELI_00061     FALSE 0.038 141.000 0.000 1.000 N NA
 7501228 7501229 EUBELI_00061 EUBELI_00062     TRUE 0.859 -6.000 0.048 1.000 N NA
 7501229 7501230 EUBELI_00062 EUBELI_00063     TRUE 0.994 11.000 0.325 0.010 Y NA
 7501232 7501233 EUBELI_00065 EUBELI_00066     TRUE 0.640 -3.000 0.000 NA   NA
 7501233 7501234 EUBELI_00066 EUBELI_00067     TRUE 0.877 -3.000 0.029 1.000   NA
 7501234 7501235 EUBELI_00067 EUBELI_00068     FALSE 0.114 134.000 0.000 1.000   NA
 7501235 7501236 EUBELI_00068 EUBELI_00069     FALSE 0.379 206.000 0.013 1.000 Y NA
 7501236 7501237 EUBELI_00069 EUBELI_00070     FALSE 0.060 122.000 0.000 1.000 N NA
 7501237 7501238 EUBELI_00070 EUBELI_00071     TRUE 0.998 0.000 0.725 1.000 Y NA
 7501240 7501241 EUBELI_00073 EUBELI_00074     FALSE 0.461 94.000 0.004 NA   NA
 7501243 7501244 EUBELI_00076 EUBELI_00077     FALSE 0.308 61.000 0.000 NA   NA
 7501244 7501245 EUBELI_00077 EUBELI_00078     TRUE 0.909 41.000 0.200 NA   NA
 7501245 7501246 EUBELI_00078 EUBELI_00079     TRUE 0.617 6.000 0.000 NA   NA
 7501246 7501247 EUBELI_00079 EUBELI_00080     TRUE 0.986 43.000 0.382 NA Y NA
 7501247 7501248 EUBELI_00080 EUBELI_00081     TRUE 0.914 8.000 0.071 NA   NA
 7501248 7501249 EUBELI_00081 EUBELI_00082     TRUE 0.861 0.000 0.020 NA   NA
 7501249 7501250 EUBELI_00082 EUBELI_00083     FALSE 0.387 44.000 0.000 NA   NA
 7501251 7501252 EUBELI_00084 EUBELI_00085     TRUE 0.994 22.000 0.188 1.000 Y NA
 7501252 7501253 EUBELI_00085 EUBELI_00086     TRUE 0.993 32.000 0.378 0.002 Y NA
 7501253 7501254 EUBELI_00086 EUBELI_00087     TRUE 0.972 66.000 0.241 0.002 Y NA
 7501255 7501256 EUBELI_00088 EUBELI_00089     FALSE 0.107 99.000 0.000 1.000 N NA
 7501256 7501257 EUBELI_00089 EUBELI_00090     TRUE 0.990 16.000 0.105 0.020 Y NA
 7501257 7501258 EUBELI_00090 EUBELI_00091     FALSE 0.293 74.000 0.000 1.000   NA
 7501258 7501259 EUBELI_00091 EUBELI_00092     TRUE 0.636 2.000 0.000 1.000   NA
 7501259 7501260 EUBELI_00092 EUBELI_00093     TRUE 0.949 25.000 0.000 1.000 Y NA
 7501260 7501261 EUBELI_00093 EUBELI_00094     TRUE 0.997 23.000 0.522 1.000 Y NA
 7501261 7501262 EUBELI_00094 EUBELI_00095     TRUE 0.702 17.000 0.000 NA   NA
 7501262 7501263 EUBELI_00095 EUBELI_00096     TRUE 0.692 16.000 0.000 NA   NA
 7501263 7501264 EUBELI_00096 EUBELI_00097     TRUE 0.627 -7.000 0.000 NA   NA
 7501264 7501265 EUBELI_00097 EUBELI_00098     FALSE 0.322 53.000 0.000 NA   NA
 7501265 7501266 EUBELI_00098 EUBELI_00099     TRUE 0.898 10.000 0.050 NA   NA
 7501266 7501267 EUBELI_00099 EUBELI_00100     TRUE 0.627 10.000 0.000 NA   NA
 7501267 7501268 EUBELI_00100 EUBELI_00101     TRUE 0.640 -3.000 0.000 NA   NA
 7501268 7501269 EUBELI_00101 EUBELI_00102     TRUE 0.618 4.000 0.000 NA   NA
 7501269 7501270 EUBELI_00102 EUBELI_00103     TRUE 0.986 -3.000 0.568 NA   NA
 7501270 7501271 EUBELI_00103 EUBELI_00104     TRUE 0.721 22.000 0.000 NA   NA
 7501271 7501272 EUBELI_00104 EUBELI_00105     FALSE 0.318 54.000 0.000 NA   NA
 7501272 7501273 EUBELI_00105 EUBELI_00106     FALSE 0.085 146.000 0.000 1.000   NA
 7501273 7501274 EUBELI_00106 EUBELI_00107     FALSE 0.390 10.000 0.000 1.000 N NA
 7501274 7501275 EUBELI_00107 EUBELI_00108     TRUE 0.598 30.000 0.000 1.000   NA
 7501275 7501276 EUBELI_00108 EUBELI_00109     TRUE 0.651 14.000 0.000 1.000   NA
 7501276 7501277 EUBELI_00109 EUBELI_00110     FALSE 0.014 203.000 0.000 1.000 N NA
 7501277 7501278 EUBELI_00110 EUBELI_00111     FALSE 0.482 23.000 0.000 1.000 N NA
 7501278 7501279 EUBELI_00111 EUBELI_00112     TRUE 0.702 17.000 0.000 NA   NA
 7501279 7501280 EUBELI_00112 EUBELI_00113     FALSE 0.192 110.000 0.000 NA   NA
 7501280 7501281 EUBELI_00113 EUBELI_00114     TRUE 0.640 13.000 0.000 1.000   NA
 7501281 7501282 EUBELI_00114 EUBELI_00115     TRUE 0.938 2.000 0.167 1.000 N NA
 7501282 7501283 EUBELI_00115 EUBELI_00116     TRUE 0.912 54.000 0.333 1.000   NA
 7501283 7501284 EUBELI_00116 EUBELI_00117     TRUE 0.976 24.000 0.250 NA   NA
 7501284 7501285 EUBELI_00117 EUBELI_00118     TRUE 0.715 19.000 0.000 NA   NA
 7501285 7501286 EUBELI_00118 EUBELI_00119     TRUE 0.613 -10.000 0.000 NA   NA
 7501286 7501287 EUBELI_00119 EUBELI_00120     TRUE 0.696 24.000 0.000 NA   NA
 7501287 7501288 EUBELI_00120 EUBELI_00121     FALSE 0.047 185.000 0.000 NA   NA
 7501288 7501289 EUBELI_00121 EUBELI_00122     FALSE 0.009 397.000 0.000 NA   NA
 7501289 7501290 EUBELI_00122 EUBELI_00123     FALSE 0.177 114.000 0.000 NA   NA
 7501290 7501291 EUBELI_00123 EUBELI_00124     FALSE 0.206 107.000 0.000 NA   NA
 7501291 7501292 EUBELI_00124 EUBELI_00125     FALSE 0.274 92.000 0.000 NA   NA
 7501292 7501293 EUBELI_00125 EUBELI_00126     FALSE 0.153 120.000 0.000 NA   NA
 7501293 7501294 EUBELI_00126 EUBELI_00127     TRUE 0.604 29.000 0.000 NA   NA
 7501294 7501295 EUBELI_00127 EUBELI_00128     TRUE 0.669 15.000 0.000 NA   NA
 7501295 7501296 EUBELI_00128 EUBELI_00129     FALSE 0.407 42.000 0.000 NA   NA
 7501296 7501297 EUBELI_00129 EUBELI_00130     FALSE 0.505 35.000 0.000 NA   NA
 7501297 7501298 EUBELI_00130 EUBELI_00131     TRUE 0.616 5.000 0.000 NA   NA
 7501298 7501299 EUBELI_00131 EUBELI_00132     TRUE 0.821 -43.000 0.024 1.000   NA
 7501299 7501300 EUBELI_00132 EUBELI_00133     TRUE 0.873 20.000 0.008 NA   NA
 7501300 7501301 EUBELI_00133 EUBELI_00134     TRUE 0.720 20.000 0.000 NA   NA
 7501301 7501302 EUBELI_00134 EUBELI_00135     FALSE 0.054 171.000 0.000 NA   NA
 7501302 7501303 EUBELI_00135 EUBELI_00136     FALSE 0.315 55.000 0.000 NA   NA
 7501303 7501304 EUBELI_00136 EUBELI_00137     FALSE 0.072 155.000 0.000 NA   NA
 7501304 7501305 EUBELI_00137 EUBELI_00138     FALSE 0.370 -10.000 0.000 NA N NA
 7501305 7501306 EUBELI_00138 EUBELI_00139     TRUE 0.595 30.000 0.000 NA   NA
 7501306 7501307 EUBELI_00139 EUBELI_00140     FALSE 0.351 48.000 0.000 NA   NA
 7501307 7501308 EUBELI_00140 EUBELI_00141     FALSE 0.159 118.000 0.000 NA   NA
 7501308 7501309 EUBELI_00141 EUBELI_00142     TRUE 0.974 -3.000 0.419 1.000 N NA
 7501309 7501310 EUBELI_00142 EUBELI_00143     TRUE 0.954 -7.000 0.173 NA   NA
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 7502498 7502499 EUBELI_01331 EUBELI_01332     FALSE 0.302 69.000 0.000 NA   NA
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