MicrobesOnline Operon Predictions for Xanthomonas campestris pv. campestris str. B100

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5744225 5744226 xccb100_0001 xccb100_0002 dnaA dnaN TRUE 0.590 276.000 0.328 1.000 Y NA
 5744226 5744227 xccb100_0002 xccb100_0003 dnaN   FALSE 0.135 838.000 0.318 1.000 Y NA
 5744227 5744228 xccb100_0003 xccb100_0004   gyrB TRUE 0.961 95.000 0.249 0.005 Y NA
 5744228 5744229 xccb100_0004 xccb100_0005 gyrB   FALSE 0.312 68.000 0.005 NA   NA
 5744229 5744230 xccb100_0005 xccb100_0006     TRUE 0.571 63.000 0.079 NA   NA
 5744230 5744231 xccb100_0006 xccb100_0007     TRUE 0.590 139.000 0.063 1.000   NA
 5744231 5744232 xccb100_0007 xccb100_0008   tonB1 TRUE 0.576 154.000 0.095 1.000 N NA
 5744232 5744233 xccb100_0008 xccb100_0009 tonB1 exbB1 TRUE 0.942 86.000 0.600 0.017 N NA
 5744233 5744234 xccb100_0009 xccb100_0010 exbB1 exbD1 TRUE 0.968 47.000 0.600 0.059 Y NA
 5744234 5744235 xccb100_0010 xccb100_0011 exbD1 exbD2 TRUE 0.998 4.000 0.857 0.045 Y NA
 5744235 5744236 xccb100_0011 xccb100_0012 exbD2   FALSE 0.005 615.000 0.000 NA   NA
 5744236 5744237 xccb100_0012 xccb100_0013   exbD3 FALSE 0.037 253.000 0.000 NA   NA
 5744238 5744239 xccb100_0014 xccb100_0015 pdxJ   TRUE 0.801 8.000 0.009 NA   NA
 5744239 5744240 xccb100_0015 xccb100_0016   cls1 TRUE 0.811 75.000 0.417 NA   NA
 5744242 5744243 xccb100_0018 xccb100_0019   fadL FALSE 0.008 629.000 0.000 1.000   NA
 5744244 5744245 xccb100_0020 xccb100_0021     TRUE 0.702 29.000 0.096 NA   NA
 5744245 5744246 xccb100_0021 xccb100_0022   serA2 TRUE 0.941 0.000 0.043 NA   NA
 5744246 5744247 xccb100_0022 xccb100_0023 serA2   FALSE 0.042 240.000 0.000 NA   NA
 5744248 5744249 xccb100_0024 xccb100_0025 ctp   FALSE 0.313 401.000 0.408 0.040 N NA
 5744250 5744251 xccb100_0026 xccb100_0027     FALSE 0.246 58.000 0.000 1.000   NA
 5744252 5744253 xccb100_0028 xccb100_0029   egl1 FALSE 0.008 434.000 0.000 NA   NA
 5744253 5744254 xccb100_0029 xccb100_0030 egl1 egl2 FALSE 0.197 409.000 0.000 0.003 Y NA
 5744254 5744255 xccb100_0030 xccb100_0031 egl2 egl3 FALSE 0.110 631.000 0.000 0.003 Y NA
 5744257 5744258 xccb100_0033 xccb100_0034     FALSE 0.140 153.000 0.000 NA   NA
 5744258 5744259 xccb100_0034 xccb100_0035     FALSE 0.189 37.000 0.000 NA   NA
 5744259 5744260 xccb100_0035 xccb100_0036   gltD FALSE 0.166 45.000 0.000 NA   NA
 5744260 5744261 xccb100_0036 xccb100_0037 gltD gltB TRUE 0.928 122.000 0.032 0.001 Y NA
 5744261 5744262 xccb100_0037 xccb100_0038 gltB   FALSE 0.166 203.000 0.011 NA   NA
 5744264 5744265 xccb100_0040 xccb100_0041     FALSE 0.003 925.000 0.000 NA   NA
 5744266 5744267 xccb100_0042 xccb100_0043     FALSE 0.056 219.000 0.000 NA   NA
 5744268 5744269 xccb100_0044 xccb100_0045     FALSE 0.041 291.000 0.000 1.000   NA
 5744269 5744270 xccb100_0045 xccb100_0046     TRUE 0.971 -3.000 0.136 NA   NA
 5744273 5744274 xccb100_0049 xccb100_0050     TRUE 0.935 4.000 0.000 NA Y NA
 5744274 5744275 xccb100_0050 xccb100_0051     FALSE 0.006 527.000 0.000 NA   NA
 5744275 5744276 xccb100_0051 xccb100_0052     FALSE 0.041 242.000 0.000 NA   NA
 5744276 5744277 xccb100_0052 xccb100_0053     TRUE 0.642 -6.000 0.000 NA   NA
 5744278 5744279 xccb100_0054 xccb100_0055     TRUE 0.974 11.000 0.600 1.000   NA
 5744280 5744281 xccb100_0056 xccb100_0057 xylR avrBs2 TRUE 0.849 139.000 0.667 NA N NA
 5744282 5744283 xccb100_0058 xccb100_0059     TRUE 0.978 -3.000 0.010 0.016   NA
 5744283 5744284 xccb100_0059 xccb100_PS001     FALSE 0.073 198.000 0.000 NA   NA
 5744285 5744286 xccb100_0060 xccb100_0061     TRUE 0.615 33.000 0.000 0.082   NA
 5744289 5744290 xccb100_0063 xccb100_0064     FALSE 0.104 174.000 0.000 NA   NA
 5744290 5744291 xccb100_0064 xccb100_0065     FALSE 0.017 326.000 0.000 NA   NA
 5744291 5744292 xccb100_0065 xccb100_0066     FALSE 0.442 -31.000 0.000 NA   NA
 5744293 5744294 xccb100_0067 xccb100_0068     TRUE 0.992 0.000 0.833 NA   NA
 5744295 5744296 xccb100_0069 xccb100_0070     FALSE 0.169 68.000 0.000 NA   NA
 5744296 5744297 xccb100_0070 xccb100_0071     FALSE 0.450 13.000 0.000 NA   NA
 5744297 5744298 xccb100_0071 xccb100_0072     FALSE 0.096 178.000 0.000 NA   NA
 5744298 5744299 xccb100_0072 xccb100_0073     FALSE 0.182 39.000 0.000 NA   NA
 5744299 5744300 xccb100_0073 xccb100_0074     FALSE 0.123 163.000 0.000 NA   NA
 5744300 5744301 xccb100_0074 xccb100_0075     FALSE 0.009 400.000 0.000 NA   NA
 5744301 5744302 xccb100_0075 xccb100_0076     TRUE 0.630 6.000 0.000 NA   NA
 5744304 5744305 xccb100_0078 xccb100_0079     FALSE 0.161 48.000 0.000 NA   NA
 5744309 5744310 xccb100_0083 xccb100_0084     TRUE 0.977 -3.000 0.194 NA   NA
 5744310 5744311 xccb100_0084 xccb100_0085     FALSE 0.536 112.000 0.022 1.000   NA
 5744312 5744313 xccb100_0086 xccb100_0087     FALSE 0.006 489.000 0.000 NA   NA
 5744313 5744314 xccb100_0087 xccb100_0088   aes FALSE 0.078 192.000 0.000 NA   NA
 5744314 5744315 xccb100_0088 xccb100_0089 aes   TRUE 0.590 107.000 0.077 NA N NA
 5744315 5744316 xccb100_0089 xccb100_0090     TRUE 0.848 16.000 0.143 NA   NA
 5744316 5744317 xccb100_0090 xccb100_0091   proP1 FALSE 0.006 819.000 0.000 1.000   NA
 5744319 5744320 xccb100_0093 xccb100_0094     TRUE 0.700 -25.000 0.009 NA   NA
 5744321 5744322 xccb100_0095 xccb100_0096     TRUE 0.854 149.000 0.724 NA   NA
 5744322 5744323 xccb100_0096 xccb100_0097     TRUE 0.975 -3.000 0.172 NA   NA
 5744323 5744324 xccb100_0097 xccb100_0098     TRUE 0.603 158.000 0.161 NA   NA
 5744324 5744325 xccb100_0098 xccb100_0099     TRUE 0.891 14.000 0.193 NA   NA
 5744325 5744326 xccb100_0099 xccb100_0100     TRUE 0.603 160.000 0.168 NA   NA
 5744326 5744327 xccb100_0100 xccb100_0101     TRUE 0.935 21.000 0.720 NA   NA
 5744327 5744328 xccb100_0101 xccb100_0102   tldD TRUE 0.885 15.000 0.200 NA   NA
 5744328 5744329 xccb100_0102 xccb100_0103 tldD tldD FALSE 0.003 807.000 0.000 NA   NA
 5744329 5744330 xccb100_0103 xccb100_0104 tldD   FALSE 0.175 128.000 0.000 NA   NA
 5744330 5744331 xccb100_0104 xccb100_0105   fbp FALSE 0.041 241.000 0.000 NA   NA
 5744331 5744332 xccb100_0105 xccb100_0106 fbp aat FALSE 0.131 177.000 0.000 1.000 N NA
 5744333 5744334 xccb100_0107 xccb100_0108     TRUE 0.749 169.000 0.500 NA   NA
 5744334 5744335 xccb100_0108 xccb100_0109     FALSE 0.012 365.000 0.000 NA   NA
 5744335 5744336 xccb100_0109 xccb100_0110   aldA FALSE 0.049 227.000 0.000 NA   NA
 5744336 5744337 xccb100_0110 xccb100_0111 aldA   FALSE 0.297 165.000 0.014 NA   NA
 5744339 5744340 xccb100_0113 xccb100_0114     TRUE 0.941 0.000 0.043 NA   NA
 5744340 5744341 xccb100_0114 xccb100_0115   dnl TRUE 0.735 7.000 0.000 1.000   NA
 5744342 5744343 xccb100_0116 xccb100_0117   lctD FALSE 0.067 228.000 0.000 1.000 N NA
 5744346 5744347 xccb100_0120 xccb100_0121     FALSE 0.177 126.000 0.000 NA   NA
 5744348 5744349 xccb100_0122 xccb100_0123     TRUE 0.971 -3.000 0.133 NA   NA
 5744350 5744351 xccb100_0124 xccb100_0125     FALSE 0.208 195.000 0.015 NA   NA
 5744352 5744353 xccb100_0126 xccb100_0127   kdgK FALSE 0.180 155.000 0.000 1.000 N NA
 5744354 5744355 xccb100_0128 xccb100_0129     FALSE 0.442 179.000 0.000 0.025   NA
 5744355 5744356 xccb100_0129 xccb100_0130   pme1 FALSE 0.535 13.000 0.000 1.000 N NA
 5744356 5744357 xccb100_0130 xccb100_0131 pme1 pel4 TRUE 0.846 0.000 0.000 1.000   NA
 5744357 5744358 xccb100_0131 xccb100_0132 pel4   FALSE 0.373 16.000 0.000 NA   NA
 5744358 5744359 xccb100_0132 xccb100_0133     TRUE 0.749 123.000 0.250 NA   NA
 5744361 5744362 xccb100_0135 xccb100_0136     TRUE 0.569 10.000 0.000 NA   NA
 5744363 5744364 xccb100_0137 xccb100_0138     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744364 5744365 xccb100_0138 xccb100_0139     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744368 5744369 xccb100_0142 xccb100_0143     FALSE 0.158 49.000 0.000 NA   NA
 5744369 5744370 xccb100_0143 xccb100_0144     TRUE 0.572 81.000 0.000 0.080   NA
 5744371 5744372 xccb100_0145 xccb100_0146     FALSE 0.077 193.000 0.000 NA   NA
 5744372 5744373 xccb100_0146 xccb100_0147     FALSE 0.085 186.000 0.000 NA   NA
 5744374 5744375 xccb100_0148 xccb100_0149   treS TRUE 0.996 -3.000 0.544 0.015   NA
 5744375 5744376 xccb100_0149 xccb100_0150 treS glgB1 TRUE 0.993 -3.000 0.027 0.015 Y NA
 5744377 5744378 xccb100_0151 xccb100_0152     TRUE 0.745 61.000 0.286 NA   NA
 5744378 5744379 xccb100_0152 xccb100_0153     FALSE 0.427 -40.000 0.000 NA   NA
 5744380 5744381 xccb100_0154 xccb100_0155     TRUE 0.569 -10.000 0.000 NA   NA
 5744381 5744382 xccb100_0155 xccb100_0156     TRUE 0.966 -3.000 0.100 NA   NA
 5744382 5744383 xccb100_0156 xccb100_0157     FALSE 0.167 134.000 0.000 NA   NA
 5744383 5744384 xccb100_0157 xccb100_0158   fdh FALSE 0.378 130.000 0.012 NA   NA
 5744385 5744386 xccb100_0159 xccb100_0160   chlE FALSE 0.217 62.000 0.000 1.000 N NA
 5744386 5744387 xccb100_0160 xccb100_0161 chlE apeH TRUE 0.993 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 5744388 5744389 xccb100_0162 xccb100_0163 mhpD dctP TRUE 0.666 37.000 0.097 1.000 N NA
 5744389 5744390 xccb100_0163 xccb100_0164 dctP dctQ TRUE 0.990 11.000 0.756 NA Y NA
 5744390 5744391 xccb100_0164 xccb100_0165 dctQ dctM TRUE 0.994 0.000 0.390 NA Y NA
 5744391 5744392 xccb100_0165 xccb100_0166 dctM xylB3 TRUE 0.872 99.000 0.125 1.000 Y NA
 5744392 5744393 xccb100_0166 xccb100_0167 xylB3   TRUE 0.682 132.000 0.143 1.000 N NA
 5744393 5744394 xccb100_0167 xccb100_0168   kduI FALSE 0.005 694.000 0.000 1.000 N NA
 5744394 5744395 xccb100_0168 xccb100_0169 kduI kduD TRUE 0.862 76.000 0.571 1.000 N NA
 5744395 5744396 xccb100_0169 xccb100_0170 kduD rpi2 FALSE 0.470 159.000 0.047 1.000 N NA
 5744396 5744397 xccb100_0170 xccb100_0171 rpi2   FALSE 0.045 262.000 0.000 1.000 N NA
 5744398 5744399 xccb100_0172 xccb100_0173   phhA FALSE 0.175 199.000 0.010 NA   NA
 5744400 5744401 xccb100_0174 xccb100_0175   fpvA1 FALSE 0.045 262.000 0.000 1.000 N NA
 5744401 5744402 xccb100_0175 xccb100_PS003 fpvA1   FALSE 0.129 159.000 0.000 NA   NA
 5744402 5744403 xccb100_PS003 xccb100_0176     FALSE 0.464 -25.000 0.000 NA   NA
 5744403 5744404 xccb100_0176 xccb100_0177     TRUE 0.904 -100.000 0.286 NA   NA
 5744405 5744406 xccb100_0178 xccb100_0179     FALSE 0.014 349.000 0.000 NA   NA
 5744406 5744407 xccb100_0179 xccb100_0180     FALSE 0.028 275.000 0.000 NA   NA
 5744408 5744409 xccb100_0181 xccb100_0182     TRUE 0.864 29.000 0.333 1.000   NA
 5744409 5744410 xccb100_0182 xccb100_0183     FALSE 0.503 61.000 0.026 1.000   NA
 5744410 5744411 xccb100_0183 xccb100_0184     TRUE 0.977 -3.000 0.171 1.000 N NA
 5744413 5744414 xccb100_0186 xccb100_0187     TRUE 0.985 -3.000 0.354 NA   NA
 5744414 5744415 xccb100_0187 xccb100_0188     TRUE 0.711 16.000 0.029 NA   NA
 5744417 5744418 xccb100_0190 xccb100_0191     FALSE 0.030 320.000 0.000 1.000   NA
 5744418 5744419 xccb100_0191 xccb100_0192     FALSE 0.169 68.000 0.000 NA   NA
 5744419 5744420 xccb100_0192 xccb100_0193     FALSE 0.013 360.000 0.000 NA   NA
 5744420 5744421 xccb100_0193 xccb100_0194     TRUE 0.784 16.000 0.079 NA N NA
 5744421 5744422 xccb100_0194 xccb100_0195     TRUE 0.933 4.000 0.083 NA   NA
 5744422 5744423 xccb100_0195 xccb100_0196   cls2 TRUE 0.970 -3.000 0.128 NA   NA
 5744423 5744424 xccb100_0196 xccb100_0197 cls2   FALSE 0.287 223.000 0.107 NA N NA
 5744424 5744425 xccb100_0197 xccb100_0198   plsC1 TRUE 0.925 -3.000 0.023 NA N NA
 5744425 5744426 xccb100_0198 xccb100_0199 plsC1   FALSE 0.414 55.000 0.023 NA   NA
 5744426 5744427 xccb100_0199 xccb100_0200     FALSE 0.483 58.000 0.042 NA   NA
 5744427 5744428 xccb100_0200 xccb100_0201     FALSE 0.020 983.000 0.083 NA   NA
 5744428 5744429 xccb100_0201 xccb100_0202     FALSE 0.016 330.000 0.000 NA   NA
 5744430 5744431 xccb100_0203 xccb100_0204   uppP TRUE 0.641 91.000 0.100 NA   NA
 5744432 5744433 xccb100_0205 xccb100_0206 glnA1 glnB1 FALSE 0.188 282.000 0.000 1.000 Y NA
 5744433 5744434 xccb100_0206 xccb100_0207 glnB1 amtB TRUE 0.888 -10.000 0.048 1.000 N NA
 5744434 5744435 xccb100_0207 xccb100_0208 amtB ntrB FALSE 0.041 271.000 0.000 1.000 N NA
 5744435 5744436 xccb100_0208 xccb100_0209 ntrB ntrC TRUE 0.996 -7.000 0.587 0.083 Y NA
 5744436 5744437 xccb100_0209 xccb100_0210 ntrC   FALSE 0.004 753.000 0.000 NA   NA
 5744437 5744438 xccb100_0210 xccb100_0211   sod1 FALSE 0.166 45.000 0.000 NA   NA
 5744438 5744439 xccb100_0211 xccb100_0212 sod1 sod2 TRUE 0.967 49.000 0.375 0.002 Y NA
 5744440 5744441 xccb100_0213 xccb100_0214     FALSE 0.439 39.000 0.018 NA   NA
 5744442 5744443 xccb100_0215 xccb100_0216 fadA1   FALSE 0.384 124.000 0.011 NA   NA
 5744444 5744445 xccb100_0217 xccb100_0218     TRUE 0.997 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 5744445 5744446 xccb100_0218 xccb100_0219   hemD TRUE 0.951 104.000 0.600 1.000 Y NA
 5744447 5744448 xccb100_0220 xccb100_0221     FALSE 0.413 120.000 0.014 NA   NA
 5744448 5744449 xccb100_0221 xccb100_0222     TRUE 0.566 31.000 0.035 NA   NA
 5744449 5744450 xccb100_0222 xccb100_0223     FALSE 0.452 89.000 0.019 NA   NA
 5744450 5744451 xccb100_0223 xccb100_0224   secB TRUE 0.684 110.000 0.158 NA N NA
 5744451 5744452 xccb100_0224 xccb100_0225 secB gpsA TRUE 0.658 18.000 0.015 1.000 N NA
 5744454 5744455 xccb100_0227 xccb100_0228 poxB   FALSE 0.168 44.000 0.000 NA   NA
 5744455 5744456 xccb100_0228 xccb100_0229     FALSE 0.229 30.000 0.000 NA   NA
 5744457 5744458 xccb100_0230 xccb100_0231     FALSE 0.311 55.000 0.007 NA   NA
 5744459 5744460 xccb100_0232 xccb100_0233   fabH1 TRUE 0.613 102.000 0.078 NA   NA
 5744460 5744461 xccb100_0233 xccb100_0234 fabH1   FALSE 0.399 167.000 0.026 1.000   NA
 5744461 5744462 xccb100_0234 xccb100_0235   dhaA FALSE 0.546 131.000 0.036 1.000   NA
 5744464 5744465 xccb100_0237 xccb100_0238     TRUE 0.838 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5744466 5744467 xccb100_0239 xccb100_0240     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744468 5744469 xccb100_0241 xccb100_0242     TRUE 0.559 65.000 0.070 NA   NA
 5744470 5744471 xccb100_0243 xccb100_0244     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 5744472 5744473 xccb100_0245 xccb100_0246   ubiB1 TRUE 0.989 -3.000 0.432 1.000   NA
 5744473 5744474 xccb100_0246 xccb100_0247 ubiB1   FALSE 0.423 97.000 0.005 1.000   NA
 5744476 5744477 xccb100_0249 xccb100_0250   plsC2 TRUE 0.906 3.000 0.014 1.000   NA
 5744477 5744478 xccb100_0250 xccb100_0251 plsC2   TRUE 0.687 17.000 0.013 1.000   NA
 5744478 5744479 xccb100_0251 xccb100_0252   dcp1 FALSE 0.084 225.000 0.000 1.000   NA
 5744480 5744481 xccb100_0253 xccb100_0254     FALSE 0.009 412.000 0.000 NA   NA
 5744483 5744484 xccb100_0256 xccb100_0257     TRUE 0.637 41.000 0.118 NA   NA
 5744484 5744485 xccb100_0257 xccb100_0258     TRUE 0.637 35.000 0.000 NA Y NA
 5744486 5744487 xccb100_0259 xccb100_0260 aceB aceA TRUE 0.621 176.000 0.016 1.000 Y NA
 5744487 5744488 xccb100_0260 xccb100_0261 aceA   FALSE 0.110 190.000 0.000 1.000 N NA
 5744488 5744489 xccb100_0261 xccb100_0262     TRUE 0.981 4.000 0.000 0.010 Y NA
 5744492 5744493 xccb100_0265 xccb100_0266   mccA FALSE 0.426 103.000 0.008 1.000 N NA
 5744493 5744494 xccb100_0266 xccb100_0267 mccA mccB TRUE 0.745 275.000 0.158 0.001 Y NA
 5744494 5744495 xccb100_0267 xccb100_0268 mccB ivd TRUE 0.982 11.000 0.316 1.000 Y NA
 5744496 5744497 xccb100_0269 xccb100_0270     FALSE 0.468 59.000 0.036 NA   NA
 5744497 5744498 xccb100_0270 xccb100_0271     TRUE 0.986 -3.000 0.400 NA   NA
 5744499 5744500 xccb100_0272 xccb100_0273     TRUE 0.967 -3.000 0.111 NA   NA
 5744500 5744501 xccb100_0273 xccb100_0274     TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 5744501 5744502 xccb100_0274 xccb100_0275     TRUE 0.876 19.000 0.286 NA   NA
 5744503 5744504 xccb100_0276 xccb100_0277     FALSE 0.411 204.000 0.158 NA   NA
 5744507 5744508 xccb100_0280 xccb100_0281     FALSE 0.504 98.000 0.032 NA   NA
 5744509 5744510 xccb100_0282 xccb100_0283     FALSE 0.466 80.000 0.026 NA   NA
 5744510 5744511 xccb100_0283 xccb100_0284     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744511 5744512 xccb100_0284 xccb100_0285     FALSE 0.025 285.000 0.000 NA   NA
 5744512 5744513 xccb100_0285 xccb100_0286   ohr TRUE 0.650 98.000 0.086 1.000 N NA
 5744513 5744514 xccb100_0286 xccb100_0287 ohr   FALSE 0.309 20.000 0.000 NA   NA
 5744514 5744515 xccb100_0287 xccb100_0288     TRUE 0.671 4.000 0.000 NA   NA
 5744515 5744516 xccb100_0288 xccb100_0289     FALSE 0.005 587.000 0.000 NA   NA
 5744518 5744519 xccb100_0291 xccb100_0292     TRUE 0.775 54.000 0.000 0.079 Y NA
 5744520 5744521 xccb100_0293 xccb100_0294     FALSE 0.487 68.000 0.019 1.000   NA
 5744521 5744522 xccb100_0294 xccb100_0295     TRUE 0.776 112.000 0.028 0.033   NA
 5744523 5744524 xccb100_0296 xccb100_0297     FALSE 0.189 89.000 0.000 NA   NA
 5744524 5744525 xccb100_0297 xccb100_0298   rluE FALSE 0.034 260.000 0.000 NA   NA
 5744526 5744527 xccb100_0299 xccb100_0300   hrpB FALSE 0.037 397.000 0.012 1.000   NA
 5744529 5744530 xccb100_0302 xccb100_0303     FALSE 0.420 117.000 0.014 NA   NA
 5744530 5744531 xccb100_0303 xccb100_0304     TRUE 0.893 -30.000 0.167 NA   NA
 5744531 5744532 xccb100_0304 xccb100_0305   uriC TRUE 0.966 -3.000 0.103 NA   NA
 5744532 5744533 xccb100_0305 xccb100_0306 uriC   TRUE 0.956 -3.000 0.061 NA   NA
 5744533 5744534 xccb100_0306 xccb100_0307     TRUE 0.918 -3.000 0.013 NA   NA
 5744534 5744535 xccb100_0307 xccb100_0308     TRUE 0.951 -3.000 0.036 1.000 N NA
 5744535 5744536 xccb100_0308 xccb100_0309     TRUE 0.966 -10.000 0.060 1.000 Y NA
 5744537 5744538 xccb100_0310 xccb100_0311     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744540 5744541 xccb100_0313 xccb100_0314     FALSE 0.008 427.000 0.000 NA   NA
 5744541 5744542 xccb100_0314 xccb100_0315   cls3 TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 5744543 5744544 xccb100_0316 xccb100_0317 ggt1 gatA TRUE 0.957 0.000 0.068 1.000 N NA
 5744544 5744545 xccb100_0317 xccb100_0318 gatA iunH FALSE 0.216 137.000 0.000 1.000 N NA
 5744545 5744546 xccb100_0318 xccb100_0319 iunH add TRUE 0.580 130.000 0.048 1.000   NA
 5744546 5744547 xccb100_0319 xccb100_0320 add   FALSE 0.498 122.000 0.017 1.000   NA
 5744549 5744550 xccb100_0322 xccb100_0323     TRUE 0.939 18.000 0.091 0.001 N NA
 5744551 5744552 xccb100_0324 xccb100_0325   tatD FALSE 0.011 336.000 0.000 NA N NA
 5744553 5744554 xccb100_0326 xccb100_0327     FALSE 0.005 613.000 0.000 NA   NA
 5744556 5744557 xccb100_0329 xccb100_0330   fhuA1 FALSE 0.260 69.000 0.000 1.000   NA
 5744558 5744559 xccb100_0331 xccb100_0332 npdA namA FALSE 0.483 49.000 0.031 1.000 N NA
 5744559 5744560 xccb100_0332 xccb100_0333 namA garR FALSE 0.505 53.000 0.040 1.000 N NA
 5744560 5744561 xccb100_0333 xccb100_0334 garR   FALSE 0.013 357.000 0.000 NA   NA
 5744561 5744562 xccb100_0334 xccb100_0335   purU FALSE 0.056 219.000 0.000 NA   NA
 5744563 5744564 xccb100_0336 xccb100_0337 cmfA metF2 FALSE 0.027 277.000 0.000 NA   NA
 5744564 5744565 xccb100_0337 xccb100_0338 metF2 metR FALSE 0.533 116.000 0.031 1.000 N NA
 5744566 5744567 xccb100_0339 xccb100_0340     FALSE 0.468 170.000 0.088 NA   NA
 5744567 5744568 xccb100_0340 xccb100_0341   metE TRUE 0.983 -7.000 0.775 NA   NA
 5744569 5744570 xccb100_0342 xccb100_0343     FALSE 0.004 750.000 0.000 NA   NA
 5744571 5744572 xccb100_0344 xccb100_0345     FALSE 0.107 171.000 0.000 NA   NA
 5744572 5744573 xccb100_0345 xccb100_0346     FALSE 0.021 304.000 0.000 NA   NA
 5744573 5744574 xccb100_0346 xccb100_0347   tsr2 TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744575 5744576 xccb100_0348 xccb100_0349     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744576 5744577 xccb100_0349 xccb100_0350     FALSE 0.169 70.000 0.000 NA   NA
 5744577 5744578 xccb100_0350 xccb100_0351     FALSE 0.178 79.000 0.000 NA   NA
 5744578 5744579 xccb100_0351 xccb100_0352     FALSE 0.168 66.000 0.000 NA   NA
 5744579 5744580 xccb100_0352 xccb100_0353     FALSE 0.056 219.000 0.000 NA   NA
 5744580 5744581 xccb100_0353 xccb100_0354     FALSE 0.169 68.000 0.000 NA   NA
 5744583 5744584 xccb100_0356 xccb100_0357     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744585 5744586 xccb100_0358 xccb100_0359     FALSE 0.422 -42.000 0.000 NA   NA
 5744592 5744593 xccb100_0365 xccb100_0366 pigH pigH FALSE 0.175 77.000 0.000 NA   NA
 5744595 5744596 xccb100_0368 xccb100_0369   xerD1 FALSE 0.420 14.000 0.000 NA   NA
 5744599 5744600 xccb100_0372 xccb100_0373     FALSE 0.157 141.000 0.000 NA   NA
 5744600 5744601 xccb100_0373 xccb100_0374     FALSE 0.184 82.000 0.000 NA   NA
 5744602 5744603 xccb100_0375 xccb100_0376 pcaK   FALSE 0.527 149.000 0.056 1.000 N NA
 5744603 5744604 xccb100_0376 xccb100_0377     FALSE 0.020 346.000 0.000 1.000 N NA
 5744604 5744605 xccb100_0377 xccb100_0378     TRUE 0.862 123.000 0.600 NA   NA
 5744605 5744606 xccb100_0378 xccb100_0379     TRUE 0.660 33.000 0.091 NA   NA
 5744606 5744607 xccb100_0379 xccb100_0380     TRUE 0.888 37.000 0.286 0.064 N NA
 5744609 5744610 xccb100_0382 xccb100_0383     FALSE 0.058 217.000 0.000 NA   NA
 5744611 5744612 xccb100_0384 xccb100_0385 glpK glpF FALSE 0.383 68.000 0.008 1.000 N NA
 5744612 5744613 xccb100_0385 xccb100_0386 glpF glpD FALSE 0.485 185.000 0.129 1.000 N NA
 5744613 5744614 xccb100_0386 xccb100_0387 glpD glpR FALSE 0.072 349.000 0.040 1.000 N NA
 5744614 5744615 xccb100_0387 xccb100_0388 glpR   FALSE 0.062 235.000 0.000 1.000 N NA
 5744615 5744616 xccb100_0388 xccb100_0389     TRUE 0.971 13.000 0.170 0.001 N NA
 5744617 5744618 xccb100_0390 xccb100_0391 gctA gctB TRUE 0.999 -3.000 0.739 0.001 Y NA
 5744618 5744619 xccb100_0391 xccb100_0392 gctB pcaF TRUE 0.995 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 5744619 5744620 xccb100_0392 xccb100_0393 pcaF pcaH TRUE 0.848 73.000 0.066 0.001 N NA
 5744620 5744621 xccb100_0393 xccb100_0394 pcaH pcaG TRUE 0.998 5.000 0.782 0.001 Y NA
 5744621 5744622 xccb100_0394 xccb100_0395 pcaG pcaB TRUE 0.786 69.000 0.314 1.000 N NA
 5744622 5744623 xccb100_0395 xccb100_0396 pcaB pcaD TRUE 0.848 10.000 0.014 1.000   NA
 5744623 5744624 xccb100_0396 xccb100_0397 pcaD pcaC TRUE 0.916 28.000 0.600 1.000   NA
 5744624 5744625 xccb100_0397 xccb100_0398 pcaC   FALSE 0.006 486.000 0.000 NA   NA
 5744627 5744628 xccb100_0400 xccb100_0401 rioK   FALSE 0.034 290.000 0.000 1.000 N NA
 5744629 5744630 xccb100_0402 xccb100_0403   gidA FALSE 0.032 263.000 0.000 NA   NA
 5744630 5744631 xccb100_0403 xccb100_0404 gidA   FALSE 0.184 118.000 0.000 NA   NA
 5744631 5744632 xccb100_0404 xccb100_0405     TRUE 0.865 133.000 0.667 NA   NA
 5744633 5744634 xccb100_0406 xccb100_0407 trpB   FALSE 0.524 -15.000 0.000 NA   NA
 5744634 5744635 xccb100_0407 xccb100_0408     FALSE 0.168 44.000 0.000 NA   NA
 5744636 5744637 xccb100_0409 xccb100_0410 aspH bioC FALSE 0.038 276.000 0.000 1.000 N NA
 5744637 5744638 xccb100_0410 xccb100_0411 bioC   TRUE 0.672 97.000 0.000 1.000 Y NA
 5744638 5744639 xccb100_0411 xccb100_0412     FALSE 0.029 273.000 0.000 NA   NA
 5744639 5744640 xccb100_0412 xccb100_0413   bioH FALSE 0.309 20.000 0.000 NA   NA
 5744640 5744641 xccb100_0413 xccb100_0414 bioH   TRUE 0.627 32.000 0.065 NA   NA
 5744641 5744642 xccb100_0414 xccb100_0415   bioF FALSE 0.412 33.000 0.008 NA   NA
 5744642 5744643 xccb100_0415 xccb100_0416 bioF bioB TRUE 0.958 100.000 0.168 0.002 Y NA
 5744646 5744647 xccb100_rna007 xccb100_0419     FALSE 0.127 160.000 0.000 NA   NA
 5744647 5744648 xccb100_0419 xccb100_0420     FALSE 0.178 40.000 0.000 NA   NA
 5744649 5744650 xccb100_0421 xccb100_0422 fpvA2   FALSE 0.158 57.000 0.000 NA   NA
 5744650 5744651 xccb100_0422 xccb100_0423   sod3 TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744654 5744655 xccb100_0426 xccb100_0427   tbp FALSE 0.259 26.000 0.000 NA   NA
 5744655 5744656 xccb100_0427 xccb100_0428 tbp sufS FALSE 0.206 51.000 0.000 1.000 N NA
 5744656 5744657 xccb100_0428 xccb100_0429 sufS   FALSE 0.204 159.000 0.000 1.000   NA
 5744657 5744658 xccb100_0429 xccb100_0430     TRUE 0.699 24.000 0.000 0.077   NA
 5744659 5744660 xccb100_0431 xccb100_0432     FALSE 0.427 -40.000 0.000 NA   NA
 5744665 5744666 xccb100_0437 xccb100_0438     FALSE 0.187 190.000 0.008 NA   NA
 5744668 5744669 xccb100_0440 xccb100_0441 glgA glgB2 TRUE 0.997 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 5744669 5744670 xccb100_0441 xccb100_0442 glgB2 glgZ TRUE 0.998 2.000 0.600 0.005 Y NA
 5744670 5744671 xccb100_0442 xccb100_0443 glgZ malQ TRUE 0.995 -3.000 0.093 0.015 Y NA
 5744671 5744672 xccb100_0443 xccb100_0444 malQ glgY TRUE 0.996 -3.000 0.141 0.015 Y NA
 5744672 5744673 xccb100_0444 xccb100_0445 glgY   TRUE 0.940 -3.000 0.031 NA   NA
 5744673 5744674 xccb100_0445 xccb100_0446   glgX1 TRUE 0.780 43.000 0.333 NA   NA
 5744674 5744675 xccb100_0446 xccb100_0447 glgX1   TRUE 0.907 -31.000 0.016 NA Y NA
 5744677 5744678 xccb100_0449 xccb100_0450   virK FALSE 0.017 323.000 0.000 NA   NA
 5744680 5744681 xccb100_0452 xccb100_0453   acrA1 TRUE 0.845 75.000 0.500 1.000 N NA
 5744681 5744682 xccb100_0453 xccb100_0454 acrA1 acrB TRUE 0.993 -3.000 0.857 NA N NA
 5744682 5744683 xccb100_0454 xccb100_0455 acrB   TRUE 0.718 132.000 0.218 NA   NA
 5744683 5744684 xccb100_0455 xccb100_0456     TRUE 0.764 18.000 0.074 NA   NA
 5744684 5744685 xccb100_0456 xccb100_0457     TRUE 0.960 -3.000 0.074 NA   NA
 5744686 5744687 xccb100_0458 xccb100_0459 rhlE1   FALSE 0.003 837.000 0.000 NA   NA
 5744688 5744689 xccb100_0460 xccb100_PS004     FALSE 0.113 168.000 0.000 NA   NA
 5744689 5744690 xccb100_PS004 xccb100_PS005     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744690 5744691 xccb100_PS005 xccb100_PS006     FALSE 0.374 -133.000 0.000 NA   NA
 5744692 5744693 xccb100_0461 xccb100_0462 pdhC   TRUE 0.957 -3.000 0.064 NA   NA
 5744693 5744694 xccb100_0462 xccb100_0463   pdhB TRUE 0.927 2.000 0.042 NA   NA
 5744694 5744695 xccb100_0463 xccb100_0464 pdhB   TRUE 0.997 -7.000 0.458 0.001 Y NA
 5744695 5744696 xccb100_0464 xccb100_0465     FALSE 0.301 178.000 0.013 1.000   NA
 5744697 5744698 xccb100_0466 xccb100_0467 tdo   FALSE 0.071 409.000 0.000 1.000 Y NA
 5744698 5744699 xccb100_0467 xccb100_0468     TRUE 0.920 12.000 0.211 NA   NA
 5744701 5744702 xccb100_0470 xccb100_0471 hpd   FALSE 0.046 278.000 0.000 1.000   NA
 5744702 5744703 xccb100_0471 xccb100_0472   hmgA FALSE 0.514 100.000 0.017 1.000   NA
 5744706 5744707 xccb100_0475 xccb100_0476 phaG phaF TRUE 0.998 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 5744707 5744708 xccb100_0476 xccb100_0477 phaF phaE TRUE 0.999 -3.000 0.937 0.056 Y NA
 5744708 5744709 xccb100_0477 xccb100_0478 phaE phaD TRUE 0.998 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 5744709 5744710 xccb100_0478 xccb100_0479 phaD phaC TRUE 0.999 -3.000 0.976 0.006 Y NA
 5744710 5744711 xccb100_0479 xccb100_0480 phaC phaA TRUE 0.999 -3.000 0.881 0.006 Y NA
 5744713 5744714 xccb100_0482 xccb100_0483     FALSE 0.005 573.000 0.000 NA   NA
 5744714 5744715 xccb100_0483 xccb100_0484     FALSE 0.193 110.000 0.000 NA   NA
 5744715 5744716 xccb100_0484 xccb100_0485     FALSE 0.180 80.000 0.000 NA   NA
 5744716 5744717 xccb100_0485 xccb100_0486     FALSE 0.162 60.000 0.000 NA   NA
 5744717 5744718 xccb100_0486 xccb100_0487   purC FALSE 0.327 117.000 0.004 NA   NA
 5744720 5744721 xccb100_0489 xccb100_0490     FALSE 0.185 38.000 0.000 NA   NA
 5744722 5744723 xccb100_0491 xccb100_0492 rpe   TRUE 0.961 -3.000 0.050 1.000   NA
 5744723 5744724 xccb100_0492 xccb100_0493     FALSE 0.048 275.000 0.000 1.000   NA
 5744724 5744725 xccb100_0493 xccb100_0494   trpE FALSE 0.009 483.000 0.000 1.000 N NA
 5744725 5744726 xccb100_0494 xccb100_0495 trpE ltaE TRUE 0.976 0.000 0.007 1.000 Y NA
 5744726 5744727 xccb100_0495 xccb100_0496 ltaE   TRUE 0.817 10.000 0.007 1.000   NA
 5744727 5744728 xccb100_0496 xccb100_0497   trpG TRUE 0.834 11.000 0.017 1.000   NA
 5744728 5744729 xccb100_0497 xccb100_0498 trpG   FALSE 0.466 124.000 0.013 1.000   NA
 5744729 5744730 xccb100_0498 xccb100_0499   trpD FALSE 0.391 125.000 0.003 1.000   NA
 5744730 5744731 xccb100_0499 xccb100_0500 trpD   TRUE 0.914 82.000 0.293 1.000 Y NA
 5744731 5744732 xccb100_0500 xccb100_0501     TRUE 0.947 -7.000 0.010 NA Y NA
 5744734 5744735 xccb100_0503 xccb100_0504     FALSE 0.372 162.000 0.019 1.000 N NA
 5744737 5744738 xccb100_0506 xccb100_0507 rplM rpsI TRUE 0.998 3.000 0.601 0.013 Y NA
 5744739 5744740 xccb100_rna008 xccb100_rna009     FALSE 0.156 55.000 0.000 NA   NA
 5744741 5744742 xccb100_0508 xccb100_0509 nudH   TRUE 0.818 -7.000 0.015 NA N NA
 5744742 5744743 xccb100_0509 xccb100_0510   bfr FALSE 0.511 224.000 0.070 NA Y NA
 5744744 5744745 xccb100_0511 xccb100_0512     TRUE 0.998 1.000 0.556 0.026 Y NA
 5744745 5744746 xccb100_0512 xccb100_0513     FALSE 0.534 39.000 0.045 NA   NA
 5744747 5744748 xccb100_0514 xccb100_0515     TRUE 0.935 4.000 0.086 NA   NA
 5744748 5744749 xccb100_0515 xccb100_0516     TRUE 0.595 80.000 0.079 NA   NA
 5744749 5744750 xccb100_0516 xccb100_0517   nudC FALSE 0.343 77.000 0.007 NA   NA
 5744750 5744751 xccb100_0517 xccb100_0518 nudC   FALSE 0.454 137.000 0.020 1.000 N NA
 5744751 5744752 xccb100_0518 xccb100_0519     TRUE 0.671 4.000 0.000 NA   NA
 5744753 5744754 xccb100_0520 xccb100_0521     TRUE 0.968 0.000 0.148 NA   NA
 5744754 5744755 xccb100_0521 xccb100_0522     FALSE 0.027 335.000 0.000 1.000   NA
 5744755 5744756 xccb100_0522 xccb100_0523     FALSE 0.411 68.000 0.011 1.000 N NA
 5744758 5744759 xccb100_0525 xccb100_0526   purD FALSE 0.188 88.000 0.000 NA   NA
 5744759 5744760 xccb100_0526 xccb100_0527 purD   FALSE 0.336 34.000 0.002 NA   NA
 5744760 5744761 xccb100_0527 xccb100_0528   purH FALSE 0.443 24.000 0.003 NA   NA
 5744762 5744763 xccb100_0529 xccb100_0530 pgsA   TRUE 0.860 55.000 0.215 NA Y NA
 5744763 5744764 xccb100_0530 xccb100_0531     TRUE 0.982 -3.000 0.285 NA   NA
 5744764 5744765 xccb100_0531 xccb100_0532     TRUE 0.964 -3.000 0.090 NA   NA
 5744765 5744766 xccb100_0532 xccb100_0533     TRUE 0.977 -3.000 0.200 NA   NA
 5744766 5744767 xccb100_0533 xccb100_0534     TRUE 0.851 -21.000 0.069 NA   NA
 5744767 5744768 xccb100_0534 xccb100_0535   plsC3 TRUE 0.993 -3.000 0.246 1.000 Y NA
 5744768 5744769 xccb100_0535 xccb100_0536 plsC3 cdsA1 TRUE 0.992 -3.000 0.595 1.000   NA
 5744769 5744770 xccb100_0536 xccb100_0537 cdsA1   FALSE 0.005 941.000 0.000 1.000   NA
 5744771 5744772 xccb100_0538 xccb100_0539     FALSE 0.186 116.000 0.000 NA   NA
 5744772 5744773 xccb100_0539 xccb100_0540     FALSE 0.025 286.000 0.000 NA   NA
 5744776 5744777 xccb100_0543 xccb100_0544     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 5744778 5744779 xccb100_0545 xccb100_0546 accC   FALSE 0.393 43.000 0.014 NA   NA
 5744779 5744780 xccb100_0546 xccb100_0547   accB FALSE 0.523 18.000 0.004 NA   NA
 5744780 5744781 xccb100_0547 xccb100_0548 accB aroQ TRUE 0.770 80.000 0.254 1.000 N NA
 5744781 5744782 xccb100_0548 xccb100_0549 aroQ dsbD FALSE 0.004 830.000 0.000 1.000 N NA
 5744782 5744783 xccb100_0549 xccb100_0550 dsbD   TRUE 0.865 6.000 0.014 1.000 N NA
 5744783 5744784 xccb100_0550 xccb100_0551     FALSE 0.007 601.000 0.000 1.000 N NA
 5744785 5744786 xccb100_0552 xccb100_0553 groES groEL TRUE 0.933 146.000 0.269 0.094 Y NA
 5744786 5744787 xccb100_0553 xccb100_0554 groEL   FALSE 0.449 163.000 0.000 0.094   NA
 5744787 5744788 xccb100_0554 xccb100_0555     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744788 5744789 xccb100_0555 xccb100_0556     FALSE 0.132 129.000 0.000 NA N NA
 5744789 5744790 xccb100_0556 xccb100_0557     FALSE 0.185 38.000 0.000 NA   NA
 5744791 5744792 xccb100_0558 xccb100_0559     FALSE 0.097 177.000 0.000 NA   NA
 5744795 5744796 xccb100_0561 xccb100_0562     TRUE 0.904 -100.000 0.286 NA   NA
 5744799 5744800 xccb100_0565 xccb100_0566   ach FALSE 0.103 211.000 0.000 1.000   NA
 5744801 5744802 xccb100_0567 xccb100_0568     FALSE 0.011 374.000 0.000 NA   NA
 5744803 5744804 xccb100_0569 xccb100_0570 gnl1   TRUE 0.926 0.000 0.025 NA   NA
 5744805 5744806 xccb100_0571 xccb100_0572     FALSE 0.165 62.000 0.000 NA   NA
 5744806 5744807 xccb100_0572 xccb100_0573   fecR TRUE 0.954 13.000 0.571 NA N NA
 5744807 5744808 xccb100_0573 xccb100_0574 fecR   FALSE 0.193 110.000 0.000 NA   NA
 5744808 5744809 xccb100_0574 xccb100_0575   fhuE2 FALSE 0.168 44.000 0.000 NA   NA
 5744809 5744810 xccb100_0575 xccb100_0576 fhuE2   TRUE 0.778 32.000 0.222 NA   NA
 5744810 5744811 xccb100_0576 xccb100_0577     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744811 5744812 xccb100_0577 xccb100_0578     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744812 5744813 xccb100_0578 xccb100_0579   glnE FALSE 0.081 190.000 0.000 NA   NA
 5744814 5744815 xccb100_0580 xccb100_0581     FALSE 0.005 564.000 0.000 NA   NA
 5744815 5744816 xccb100_0581 xccb100_0582     FALSE 0.048 229.000 0.000 NA   NA
 5744816 5744817 xccb100_0582 xccb100_0583     TRUE 0.964 -3.000 0.088 NA   NA
 5744817 5744818 xccb100_0583 xccb100_0584     TRUE 0.582 47.000 0.088 NA   NA
 5744819 5744820 xccb100_0585 xccb100_0586     TRUE 0.673 91.000 0.132 NA   NA
 5744821 5744822 xccb100_0587 xccb100_0588     TRUE 0.734 114.000 0.223 NA N NA
 5744823 5744824 xccb100_0589 xccb100_0590   mdcC TRUE 0.959 10.000 0.342 NA   NA
 5744824 5744825 xccb100_0590 xccb100_0591 mdcC mdcD FALSE 0.149 422.000 0.438 NA   NA
 5744825 5744826 xccb100_0591 xccb100_0592 mdcD mdcE TRUE 0.992 -3.000 0.700 NA   NA
 5744826 5744827 xccb100_0592 xccb100_0593 mdcE mdcG TRUE 0.948 3.000 0.102 NA   NA
 5744827 5744828 xccb100_0593 xccb100_0594 mdcG   TRUE 0.969 -3.000 0.085 1.000   NA
 5744828 5744829 xccb100_0594 xccb100_0595   mdcH TRUE 0.645 164.000 0.203 1.000 N NA
 5744829 5744830 xccb100_0595 xccb100_0596 mdcH   TRUE 0.645 90.000 0.070 1.000   NA
 5744830 5744831 xccb100_0596 xccb100_0597     TRUE 0.805 80.000 0.300 1.000   NA
 5744832 5744833 xccb100_0598 xccb100_0599 gph1   TRUE 0.941 -3.000 0.015 1.000   NA
 5744833 5744834 xccb100_0599 xccb100_0600     TRUE 0.991 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 5744834 5744835 xccb100_0600 xccb100_0601     TRUE 0.988 1.000 0.125 1.000 Y NA
 5744836 5744837 xccb100_0602 xccb100_0603     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 5744837 5744838 xccb100_0603 xccb100_0604   galA1 FALSE 0.010 388.000 0.000 NA   NA
 5744838 5744839 xccb100_0604 xccb100_0605 galA1 aceE FALSE 0.015 377.000 0.000 1.000 N NA
 5744839 5744840 xccb100_0605 xccb100_0606 aceE rt FALSE 0.084 225.000 0.000 1.000   NA
 5744840 5744841 xccb100_0606 xccb100_0607 rt   FALSE 0.060 256.000 0.000 1.000   NA
 5744841 5744842 xccb100_0607 xccb100_0608     FALSE 0.278 39.000 0.000 1.000   NA
 5744842 5744843 xccb100_0608 xccb100_0609     TRUE 0.575 81.000 0.000 0.075   NA
 5744844 5744845 xccb100_0610 xccb100_0611     TRUE 0.619 33.000 0.000 0.075   NA
 5744848 5744849 xccb100_0613 xccb100_0614     TRUE 0.559 75.000 0.000 0.075   NA
 5744849 5744850 xccb100_0614 xccb100_0615   V FALSE 0.416 -43.000 0.000 NA   NA
 5744852 5744853 xccb100_0617 xccb100_0618     TRUE 0.575 81.000 0.000 0.075   NA
 5744853 5744854 xccb100_0618 xccb100_0619     FALSE 0.187 86.000 0.000 NA   NA
 5744856 5744857 xccb100_PS010 xccb100_0621     FALSE 0.022 300.000 0.000 NA   NA
 5744857 5744858 xccb100_0621 xccb100_0622     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744858 5744859 xccb100_0622 xccb100_0623     FALSE 0.117 166.000 0.000 NA   NA
 5744859 5744860 xccb100_0623 xccb100_0624     FALSE 0.199 35.000 0.000 NA   NA
 5744860 5744861 xccb100_0624 xccb100_0625     FALSE 0.180 80.000 0.000 NA   NA
 5744863 5744864 xccb100_0627 xccb100_0628     FALSE 0.016 329.000 0.000 NA   NA
 5744864 5744865 xccb100_0628 xccb100_0629     FALSE 0.121 164.000 0.000 NA   NA
 5744867 5744868 xccb100_0631 xccb100_0632     FALSE 0.138 154.000 0.000 NA   NA
 5744868 5744869 xccb100_0632 xccb100_0633     FALSE 0.503 94.000 0.041 NA N NA
 5744870 5744871 xccb100_0634 xccb100_0635     FALSE 0.028 275.000 0.000 NA   NA
 5744871 5744872 xccb100_0635 xccb100_0636     FALSE 0.450 13.000 0.000 NA   NA
 5744872 5744873 xccb100_0636 xccb100_0637     FALSE 0.043 284.000 0.000 1.000   NA
 5744873 5744874 xccb100_0637 xccb100_0638     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744874 5744875 xccb100_0638 xccb100_0639     FALSE 0.169 70.000 0.000 NA   NA
 5744875 5744876 xccb100_0639 xccb100_0640     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744876 5744877 xccb100_0640 xccb100_0641     TRUE 0.588 -9.000 0.000 NA   NA
 5744877 5744878 xccb100_0641 xccb100_0642     TRUE 0.700 3.000 0.000 NA   NA
 5744878 5744879 xccb100_0642 xccb100_0643     FALSE 0.045 232.000 0.000 NA   NA
 5744880 5744881 xccb100_0644 xccb100_0645     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5744882 5744883 xccb100_0646 xccb100_0647 dpp   FALSE 0.125 161.000 0.000 NA   NA
 5744883 5744884 xccb100_0647 xccb100_0648     FALSE 0.161 139.000 0.000 NA   NA
 5744885 5744886 xccb100_PS011 xccb100_PS012     FALSE 0.395 -79.000 0.000 NA   NA
 5744886 5744887 xccb100_PS012 xccb100_0649     FALSE 0.223 31.000 0.000 NA   NA
 5744898 5744899 xccb100_0660 xccb100_0661   cel1 FALSE 0.536 166.000 0.000 1.000 Y NA
 5744900 5744901 xccb100_0662 xccb100_0663   cycA FALSE 0.008 430.000 0.000 NA   NA
 5744901 5744902 xccb100_0663 xccb100_0664 cycA   FALSE 0.539 148.000 0.062 1.000 N NA
 5744903 5744904 xccb100_0665 xccb100_0666     FALSE 0.145 150.000 0.000 NA   NA
 5744904 5744905 xccb100_0666 xccb100_0667   treA FALSE 0.013 356.000 0.000 NA   NA
 5744905 5744906 xccb100_0667 xccb100_0668 treA   FALSE 0.055 220.000 0.000 NA   NA
 5744907 5744908 xccb100_0669 xccb100_0670 mutM1   FALSE 0.136 155.000 0.000 NA   NA
 5744909 5744910 xccb100_0671 xccb100_0672   ptrA FALSE 0.023 295.000 0.000 NA   NA
 5744912 5744913 xccb100_0674 xccb100_0675   engXCA FALSE 0.006 656.000 0.000 1.000 N NA
 5744914 5744915 xccb100_0676 xccb100_0677 sulP   FALSE 0.058 239.000 0.000 1.000 N NA
 5744917 5744918 xccb100_0679 xccb100_0680 folH   FALSE 0.007 701.000 0.000 1.000   NA
 5744918 5744919 xccb100_0680 xccb100_0681   opgH FALSE 0.018 318.000 0.000 NA   NA
 5744919 5744920 xccb100_0681 xccb100_0682 opgH estA TRUE 0.554 106.000 0.046 NA   NA
 5744920 5744921 xccb100_0682 xccb100_0683 estA   TRUE 0.924 4.000 0.037 1.000   NA
 5744921 5744922 xccb100_0683 xccb100_0684     TRUE 0.987 25.000 0.775 0.032 Y NA
 5744922 5744923 xccb100_0684 xccb100_0685   hemC TRUE 0.592 31.000 0.032 1.000 N NA
 5744927 5744928 xccb100_0689 xccb100_0690   pep FALSE 0.474 69.000 0.034 NA   NA
 5744928 5744929 xccb100_0690 xccb100_0691 pep   FALSE 0.048 229.000 0.000 NA   NA
 5744929 5744930 xccb100_0691 xccb100_0692     TRUE 0.879 86.000 0.667 NA   NA
 5744932 5744933 xccb100_0694 xccb100_0695     FALSE 0.026 774.000 0.105 NA   NA
 5744933 5744934 xccb100_0695 xccb100_0696     FALSE 0.455 40.000 0.024 NA   NA
 5744934 5744935 xccb100_0696 xccb100_0697   dapF TRUE 0.795 -10.000 0.012 NA   NA
 5744935 5744936 xccb100_0697 xccb100_0698 dapF   TRUE 0.929 -12.000 0.175 NA   NA
 5744936 5744937 xccb100_0698 xccb100_0699   xerC TRUE 0.982 -7.000 0.714 NA   NA
 5744937 5744938 xccb100_0699 xccb100_0700 xerC   FALSE 0.137 415.000 0.000 0.074 Y NA
 5744938 5744939 xccb100_0700 xccb100_0701     TRUE 0.904 18.000 0.000 0.074 Y NA
 5744939 5744940 xccb100_0701 xccb100_0702   hslV FALSE 0.064 231.000 0.000 1.000 N NA
 5744940 5744941 xccb100_0702 xccb100_0703 hslV hslU TRUE 0.960 112.000 0.752 1.000 Y NA
 5744942 5744943 xccb100_0704 xccb100_0705   codA FALSE 0.055 220.000 0.000 NA   NA
 5744943 5744944 xccb100_0705 xccb100_0706 codA   TRUE 0.940 -3.000 0.014 1.000   NA
 5744944 5744945 xccb100_0706 xccb100_0707     TRUE 0.693 26.000 0.044 1.000   NA
 5744945 5744946 xccb100_0707 xccb100_0708     TRUE 0.990 -3.000 0.578 NA   NA
 5744947 5744948 xccb100_0709 xccb100_0710 ubiE1   FALSE 0.176 191.000 0.002 1.000 N NA
 5744948 5744949 xccb100_0710 xccb100_0711   ampB FALSE 0.543 45.000 0.047 1.000 N NA
 5744949 5744950 xccb100_0711 xccb100_0712 ampB   FALSE 0.021 788.000 0.070 NA   NA
 5744950 5744951 xccb100_0712 xccb100_0713   gph2 FALSE 0.481 40.000 0.031 NA   NA
 5744953 5744954 xccb100_0715 xccb100_0716   mxaF1 FALSE 0.072 199.000 0.000 NA   NA
 5744954 5744955 xccb100_0716 xccb100_0717 mxaF1   TRUE 0.990 -3.000 0.500 1.000 N NA
 5744955 5744956 xccb100_0717 xccb100_0718     TRUE 0.951 -52.000 0.500 1.000   NA
 5744956 5744957 xccb100_0718 xccb100_0719     TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.007   NA
 5744957 5744958 xccb100_0719 xccb100_0720   adh FALSE 0.300 35.000 0.000 1.000   NA
 5744958 5744959 xccb100_0720 xccb100_0721 adh   TRUE 0.975 11.000 0.667 1.000 N NA
 5744960 5744961 xccb100_0722 xccb100_0723 acoR   FALSE 0.007 608.000 0.000 1.000 N NA
 5744962 5744963 xccb100_0724 xccb100_0725 mreB mreC FALSE 0.418 310.000 0.689 1.000 N NA
 5744963 5744964 xccb100_0725 xccb100_0726 mreC mreD TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 5744964 5744965 xccb100_0726 xccb100_0727 mreD mrdA TRUE 0.966 4.000 0.013 1.000 Y NA
 5744965 5744966 xccb100_0727 xccb100_0728 mrdA ftsW1 TRUE 0.929 -3.000 0.013 1.000 N NA
 5744966 5744967 xccb100_0728 xccb100_0729 ftsW1   FALSE 0.014 397.000 0.000 1.000 N NA
 5744968 5744969 xccb100_0730 xccb100_0731     FALSE 0.376 -117.000 0.000 NA   NA
 5744969 5744970 xccb100_0731 xccb100_0732     TRUE 0.844 84.000 0.500 NA   NA
 5744971 5744972 xccb100_0733 xccb100_0734     FALSE 0.188 88.000 0.000 NA   NA
 5744972 5744973 xccb100_0734 xccb100_0735     FALSE 0.181 123.000 0.000 NA   NA
 5744973 5744974 xccb100_0735 xccb100_0736     FALSE 0.430 -39.000 0.000 NA   NA
 5744974 5744975 xccb100_0736 xccb100_0737     FALSE 0.260 69.000 0.000 1.000   NA
 5744975 5744976 xccb100_0737 xccb100_0738   pglA1 FALSE 0.022 357.000 0.000 1.000   NA
 5744976 5744977 xccb100_0738 xccb100_0739 pglA1 mltB FALSE 0.188 265.000 0.000 NA Y NA
 5744977 5744978 xccb100_0739 xccb100_0740 mltB rlpA TRUE 0.993 -3.000 0.298 NA Y NA
 5744978 5744979 xccb100_0740 xccb100_0741 rlpA dacC TRUE 0.811 129.000 0.080 NA Y NA
 5744981 5744982 xccb100_0743 xccb100_0744   lipB TRUE 0.939 -12.000 0.219 NA   NA
 5744982 5744983 xccb100_0744 xccb100_0745 lipB lipA TRUE 0.990 15.000 0.319 0.001 Y NA
 5744983 5744984 xccb100_0745 xccb100_0746 lipA prc FALSE 0.071 224.000 0.000 1.000 N NA
 5744988 5744989 xccb100_0750 xccb100_0751 nadM   TRUE 0.980 4.000 0.078 1.000 Y NA
 5744989 5744990 xccb100_0751 xccb100_0752     TRUE 0.774 -22.000 0.022 NA   NA
 5744990 5744991 xccb100_0752 xccb100_0753     TRUE 0.767 -7.000 0.003 NA   NA
 5744991 5744992 xccb100_0753 xccb100_0754     TRUE 0.883 -3.000 0.003 NA   NA
 5744992 5744993 xccb100_0754 xccb100_0755     FALSE 0.543 126.000 0.053 NA   NA
 5744993 5744994 xccb100_0755 xccb100_0756     FALSE 0.508 84.000 0.035 NA   NA
 5744994 5744995 xccb100_0756 xccb100_0757   gnd TRUE 0.662 23.000 0.042 NA   NA
 5744999 5745000 xccb100_0761 xccb100_0762     TRUE 0.990 -3.000 0.093 1.000 Y NA
 5745000 5745001 xccb100_0762 xccb100_0763     TRUE 0.992 4.000 0.116 0.025 Y NA
 5745001 5745002 xccb100_0763 xccb100_0764   folK1 FALSE 0.479 93.000 0.017 1.000 N NA
 5745004 5745005 xccb100_0766 xccb100_0767     TRUE 0.730 -12.000 0.005 NA   NA
 5745006 5745007 xccb100_PS013 xccb100_PS014     FALSE 0.369 -333.000 0.000 NA   NA
 5745008 5745009 xccb100_0768 xccb100_0769     TRUE 0.805 80.000 0.373 NA   NA
 5745009 5745010 xccb100_0769 xccb100_0770     TRUE 0.721 2.000 0.000 NA   NA
 5745010 5745011 xccb100_0770 xccb100_0771   xcsC FALSE 0.433 -37.000 0.000 NA   NA
 5745011 5745012 xccb100_0771 xccb100_0772 xcsC xcsD TRUE 0.997 -3.000 0.575 1.000 Y NA
 5745012 5745013 xccb100_0772 xccb100_0773 xcsD xcsE TRUE 0.998 5.000 0.776 0.005 Y NA
 5745013 5745014 xccb100_0773 xccb100_0774 xcsE xcsF TRUE 0.996 -13.000 0.653 0.005 Y NA
 5745014 5745015 xccb100_0774 xccb100_0775 xcsF xcsG TRUE 0.985 27.000 0.599 0.005 Y NA
 5745015 5745016 xccb100_0775 xccb100_0776 xcsG   TRUE 0.989 10.000 0.425 0.005   NA
 5745016 5745017 xccb100_0776 xccb100_0777   xcsI TRUE 0.989 -16.000 0.605 0.005   NA
 5745017 5745018 xccb100_0777 xccb100_0778 xcsI xcsJ TRUE 0.997 -3.000 0.569 0.005   NA
 5745018 5745019 xccb100_0778 xccb100_0779 xcsJ xcsK TRUE 0.996 -3.000 0.461 1.000 Y NA
 5745019 5745020 xccb100_0779 xccb100_0780 xcsK xcsL TRUE 0.998 -3.000 0.537 0.054 Y NA
 5745020 5745021 xccb100_0780 xccb100_0781 xcsL xcsM TRUE 0.997 -3.000 0.811 1.000 Y NA
 5745021 5745022 xccb100_0781 xccb100_0782 xcsM xcsN TRUE 0.992 -3.000 0.649 1.000   NA
 5745022 5745023 xccb100_0782 xccb100_0783 xcsN   FALSE 0.030 321.000 0.000 1.000   NA
 5745023 5745024 xccb100_0783 xccb100_0784   gluP1 TRUE 0.622 46.000 0.093 1.000 N NA
 5745024 5745025 xccb100_0784 xccb100_0785 gluP1   TRUE 0.921 11.000 0.140 1.000 N NA
 5745025 5745026 xccb100_0785 xccb100_0786   glmS1 TRUE 0.887 7.000 0.030 1.000 N NA
 5745026 5745027 xccb100_0786 xccb100_0787 glmS1 nagA TRUE 0.920 3.000 0.030 1.000 N NA
 5745027 5745028 xccb100_0787 xccb100_0788 nagA   FALSE 0.032 315.000 0.000 1.000   NA
 5745028 5745029 xccb100_0788 xccb100_0789   fpvA3 FALSE 0.007 648.000 0.000 1.000   NA
 5745030 5745031 xccb100_0790 xccb100_0791 cca slt FALSE 0.513 71.000 0.034 1.000 N NA
 5745033 5745034 xccb100_0793 xccb100_0794 betA betB TRUE 0.883 91.000 0.634 1.000 N NA
 5745034 5745035 xccb100_0794 xccb100_0795 betB betT FALSE 0.422 41.000 0.012 1.000 N NA
 5745035 5745036 xccb100_0795 xccb100_0796 betT   FALSE 0.477 125.000 0.029 NA   NA
 5745036 5745037 xccb100_0796 xccb100_0797   dsbA1 FALSE 0.545 50.000 0.074 NA   NA
 5745037 5745038 xccb100_0797 xccb100_0798 dsbA1 dsbA2 TRUE 0.982 94.000 0.714 0.005 Y NA
 5745038 5745039 xccb100_0798 xccb100_0799 dsbA2   TRUE 0.798 105.000 0.286 1.000 N NA
 5745040 5745041 xccb100_0800 xccb100_0801 engB gshA FALSE 0.088 223.000 0.000 1.000   NA
 5745042 5745043 xccb100_0802 xccb100_0803     TRUE 0.992 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 5745044 5745045 xccb100_0804 xccb100_0805     FALSE 0.104 174.000 0.000 NA   NA
 5745047 5745048 xccb100_0807 xccb100_0808     TRUE 0.721 2.000 0.000 NA   NA
 5745048 5745049 xccb100_0808 xccb100_0809     FALSE 0.436 -36.000 0.000 NA   NA
 5745049 5745050 xccb100_0809 xccb100_0810     TRUE 0.836 64.000 0.531 NA   NA
 5745050 5745051 xccb100_0810 xccb100_0811   gfa TRUE 0.599 67.000 0.061 1.000   NA
 5745051 5745052 xccb100_0811 xccb100_0812 gfa fghA TRUE 0.583 60.000 0.057 1.000   NA
 5745054 5745055 xccb100_0814 xccb100_0815     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5745056 5745057 xccb100_0816 xccb100_0817     TRUE 0.868 93.000 0.600 NA   NA
 5745058 5745059 xccb100_0818 xccb100_0819 celS1 celS2 FALSE 0.231 286.000 0.000 0.001   NA
 5745060 5745061 xccb100_PS015 xccb100_PS016     FALSE 0.164 46.000 0.000 NA   NA
 5745061 5745062 xccb100_PS016 xccb100_0820     FALSE 0.064 207.000 0.000 NA   NA
 5745062 5745063 xccb100_0820 xccb100_0821     TRUE 0.721 2.000 0.000 NA   NA
 5745063 5745064 xccb100_0821 xccb100_0822     FALSE 0.030 268.000 0.000 NA   NA
 5745064 5745065 xccb100_0822 xccb100_0823     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5745065 5745066 xccb100_0823 xccb100_0824     FALSE 0.102 175.000 0.000 NA   NA
 5745066 5745067 xccb100_0824 xccb100_0825     TRUE 0.998 9.000 0.874 0.004 Y NA
 5745068 5745069 xccb100_0826 xccb100_0827     FALSE 0.486 12.000 0.000 NA   NA
 5745070 5745071 xccb100_0828 xccb100_0829     FALSE 0.400 71.000 0.016 NA   NA
 5745073 5745074 xccb100_0831 xccb100_0832     FALSE 0.431 58.000 0.017 1.000 N NA
 5745074 5745075 xccb100_0832 xccb100_0833     TRUE 0.978 0.000 0.013 1.000 Y NA
 5745076 5745077 xccb100_0834 xccb100_0835   engC FALSE 0.062 212.000 0.000 NA   NA
 5745077 5745078 xccb100_0835 xccb100_0836 engC   TRUE 0.946 0.000 0.052 NA   NA
 5745078 5745079 xccb100_0836 xccb100_0837     FALSE 0.441 103.000 0.016 NA   NA
 5745080 5745081 xccb100_0838 xccb100_0839 suh suxA TRUE 0.617 34.000 0.052 1.000 N NA
 5745083 5745084 xccb100_0841 xccb100_0842 suxR phbB FALSE 0.361 179.000 0.038 1.000 N NA
 5745084 5745085 xccb100_0842 xccb100_0843 phbB citH FALSE 0.541 163.000 0.094 1.000 N NA
 5745085 5745086 xccb100_0843 xccb100_0844 citH oprP1 FALSE 0.200 225.000 0.048 NA N NA
 5745087 5745088 xccb100_0845 xccb100_0846 tctD tctE TRUE 0.983 -7.000 0.190 1.000 Y NA
 5745088 5745089 xccb100_0846 xccb100_0847 tctE   TRUE 0.976 0.000 0.190 1.000 N NA
 5745089 5745090 xccb100_0847 xccb100_0848     TRUE 0.723 100.000 0.158 1.000 N NA
 5745090 5745091 xccb100_0848 xccb100_0849     FALSE 0.188 93.000 0.000 NA   NA
 5745092 5745093 xccb100_0850 xccb100_0851   oprO TRUE 0.649 116.000 0.130 NA N NA
 5745094 5745095 xccb100_0852 xccb100_0853 dctA1 maeB TRUE 0.786 148.000 0.058 1.000 Y NA
 5745097 5745098 xccb100_0855 xccb100_0856     TRUE 0.867 11.000 0.058 NA   NA
 5745098 5745099 xccb100_0856 xccb100_0857   waaL TRUE 0.942 -19.000 0.050 NA Y NA
 5745102 5745103 xccb100_0860 xccb100_0861 raxC pcm TRUE 0.669 21.000 0.028 1.000 N NA
 5745103 5745104 xccb100_0861 xccb100_0862 pcm   FALSE 0.485 129.000 0.023 1.000 N NA
 5745105 5745106 xccb100_0863 xccb100_0864     TRUE 0.963 -3.000 0.000 NA Y NA
 5745108 5745109 xccb100_0866 xccb100_0867 leuC leuD TRUE 0.993 -37.000 0.463 0.001 Y NA
 5745109 5745110 xccb100_0867 xccb100_0868 leuD ubiE2 TRUE 0.639 33.000 0.060 1.000 N NA
 5745110 5745111 xccb100_0868 xccb100_0869 ubiE2 leuB TRUE 0.793 -28.000 0.026 1.000 N NA
 5745112 5745113 xccb100_0870 xccb100_0871 leuA trpB TRUE 0.981 -3.000 0.013 1.000 Y NA
 5745113 5745114 xccb100_0871 xccb100_0872 trpB ilvM TRUE 0.680 19.000 0.017 1.000   NA
 5745114 5745115 xccb100_0872 xccb100_0873 ilvM ilvB TRUE 0.993 -16.000 0.943 0.001   NA
 5745115 5745116 xccb100_0873 xccb100_0874 ilvB ilvC TRUE 0.902 46.000 0.012 0.001 Y NA
 5745117 5745118 xccb100_0875 xccb100_0876 ggt3   TRUE 0.702 79.000 0.154 1.000 N NA
 5745119 5745120 xccb100_0877 xccb100_0878     FALSE 0.031 266.000 0.000 NA   NA
 5745121 5745122 xccb100_0879 xccb100_PS017 thiC   FALSE 0.010 395.000 0.000 NA   NA
 5745122 5745123 xccb100_PS017 xccb100_PS018     FALSE 0.156 54.000 0.000 NA   NA
 5745123 5745124 xccb100_PS018 xccb100_0880     FALSE 0.183 120.000 0.000 NA   NA
 5745124 5745125 xccb100_0880 xccb100_0881     TRUE 0.841 49.000 0.500 1.000   NA
 5745126 5745127 xccb100_0882 xccb100_0883     FALSE 0.031 266.000 0.000 NA   NA
 5745127 5745128 xccb100_0883 xccb100_0884     FALSE 0.017 325.000 0.000 NA   NA
 5745128 5745129 xccb100_0884 xccb100_0885   ppa FALSE 0.356 147.000 0.009 1.000 N NA
 5745132 5745133 xccb100_0888 xccb100_0889     FALSE 0.018 317.000 0.000 NA   NA
 5745134 5745135 xccb100_0890 xccb100_0891   pfkA FALSE 0.022 300.000 0.000 NA   NA
 5745136 5745137 xccb100_0892 xccb100_0893 adk   FALSE 0.066 356.000 0.000 0.090 N NA
 5745137 5745138 xccb100_0893 xccb100_0894     TRUE 0.739 15.000 0.015 1.000   NA
 5745138 5745139 xccb100_0894 xccb100_0895     FALSE 0.292 142.000 0.005 NA   NA
 5745141 5745142 xccb100_0897 xccb100_0898     FALSE 0.377 150.000 0.019 NA   NA
 5745142 5745143 xccb100_0898 xccb100_0899     FALSE 0.010 393.000 0.000 NA   NA
 5745143 5745144 xccb100_0899 xccb100_0900     FALSE 0.192 103.000 0.000 NA   NA
 5745146 5745147 xccb100_0902 xccb100_0903 argM   TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5745148 5745149 xccb100_PS019 xccb100_PS020     FALSE 0.372 -139.000 0.000 NA   NA
 5745150 5745151 xccb100_0904 xccb100_0905 fepA   TRUE 0.653 133.000 0.095 1.000   NA
 5745151 5745152 xccb100_0905 xccb100_0906   lao TRUE 0.925 -6.000 0.000 0.048   NA
 5745152 5745153 xccb100_0906 xccb100_0907 lao   TRUE 0.984 -3.000 0.065 0.048 N NA
 5745153 5745154 xccb100_0907 xccb100_0908     TRUE 0.628 26.000 0.050 NA N NA
 5745154 5745155 xccb100_0908 xccb100_0909   hisC2 TRUE 0.563 33.000 0.050 NA N NA
 5745155 5745156 xccb100_0909 xccb100_0910 hisC2 azu FALSE 0.243 85.000 0.000 1.000 N NA
 5745157 5745158 xccb100_0911 xccb100_0912 malT hemL FALSE 0.066 229.000 0.000 1.000 N NA
 5745159 5745160 xccb100_0913 xccb100_0914     TRUE 0.916 -9.000 0.000 0.023   NA
 5745163 5745164 xccb100_0917 xccb100_0918     FALSE 0.433 77.000 0.020 NA   NA
 5745164 5745165 xccb100_0918 xccb100_0919   rpi1 FALSE 0.322 133.000 0.006 NA   NA
 5745165 5745166 xccb100_0919 xccb100_0920 rpi1   FALSE 0.397 102.000 0.011 NA   NA
 5745166 5745167 xccb100_0920 xccb100_0921   fthC TRUE 0.913 -3.000 0.011 NA   NA
 5745167 5745168 xccb100_0921 xccb100_4471 fthC   FALSE 0.012 366.000 0.000 NA   NA
 5745168 5745169 xccb100_4471 xccb100_0922     FALSE 0.246 28.000 0.000 NA   NA
 5745169 5745170 xccb100_0922 xccb100_0923     TRUE 0.954 -3.000 0.053 NA   NA
 5745171 5745172 xccb100_0924 xccb100_0925   pepP TRUE 0.932 13.000 0.329 NA   NA
 5745173 5745174 xccb100_0926 xccb100_0927     TRUE 0.565 29.000 0.029 NA   NA
 5745174 5745175 xccb100_0927 xccb100_0928     FALSE 0.335 198.000 0.072 NA   NA
 5745175 5745176 xccb100_0928 xccb100_0929     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 5745176 5745177 xccb100_0929 xccb100_0930   hemN FALSE 0.322 68.000 0.006 NA   NA
 5745177 5745178 xccb100_0930 xccb100_0931 hemN   TRUE 0.882 17.000 0.218 1.000 N NA
 5745178 5745179 xccb100_0931 xccb100_0932     TRUE 0.883 -3.000 0.003 NA   NA
 5745179 5745180 xccb100_0932 xccb100_0933   rph TRUE 0.891 -3.000 0.005 NA   NA
 5745181 5745182 xccb100_0934 xccb100_0935   gmk TRUE 0.774 112.000 0.276 NA   NA
 5745182 5745183 xccb100_0935 xccb100_0936 gmk rpoZ FALSE 0.499 245.000 0.471 1.000 N NA
 5745183 5745184 xccb100_0936 xccb100_0937 rpoZ relA1 TRUE 0.894 144.000 0.291 1.000 Y NA
 5745186 5745187 xccb100_0939 xccb100_0940   kdgD FALSE 0.111 169.000 0.000 NA   NA
 5745187 5745188 xccb100_0940 xccb100_0941 kdgD   TRUE 0.985 0.000 0.104 0.059 N NA
 5745188 5745189 xccb100_0941 xccb100_0942   garP FALSE 0.246 115.000 0.000 1.000 N NA
 5745189 5745190 xccb100_0942 xccb100_0943 garP gudD TRUE 0.706 20.000 0.037 1.000 N NA
 5745190 5745191 xccb100_0943 xccb100_0944 gudD   FALSE 0.269 77.000 0.000 1.000   NA
 5745191 5745192 xccb100_0944 xccb100_0945   garD FALSE 0.332 31.000 0.000 1.000   NA
 5745192 5745193 xccb100_0945 xccb100_0946 garD   FALSE 0.123 138.000 0.000 NA N NA
 5745193 5745194 xccb100_0946 xccb100_0947     TRUE 0.737 19.000 0.076 NA N NA
 5745194 5745195 xccb100_0947 xccb100_0948   rlhA FALSE 0.383 129.000 0.007 1.000 N NA
 5745195 5745196 xccb100_0948 xccb100_0949 rlhA rpmE2 FALSE 0.388 72.000 0.008 1.000 N NA
 5745196 5745197 xccb100_0949 xccb100_0950 rpmE2   TRUE 0.888 -3.000 0.004 NA   NA
 5745197 5745198 xccb100_0950 xccb100_0951   gltA FALSE 0.534 18.000 0.005 NA   NA
 5745199 5745200 xccb100_0952 xccb100_0953     FALSE 0.041 430.000 0.050 NA   NA
 5745201 5745202 xccb100_0954 xccb100_0955 pilM pilN TRUE 0.996 0.000 0.616 NA Y NA
 5745202 5745203 xccb100_0955 xccb100_0956 pilN   TRUE 0.997 -3.000 0.770 NA Y NA
 5745203 5745204 xccb100_0956 xccb100_0957     TRUE 0.997 -3.000 0.680 NA Y NA
 5745204 5745205 xccb100_0957 xccb100_0958     TRUE 0.973 20.000 0.668 NA Y NA
 5745205 5745206 xccb100_0958 xccb100_0959     FALSE 0.421 153.000 0.017 1.000   NA
 5745206 5745207 xccb100_0959 xccb100_0960     TRUE 0.712 21.000 0.060 NA   NA
 5745207 5745208 xccb100_0960 xccb100_0961     TRUE 0.983 -3.000 0.308 NA   NA
 5745208 5745209 xccb100_0961 xccb100_0962     TRUE 0.954 -3.000 0.055 NA   NA
 5745209 5745210 xccb100_0962 xccb100_0963     TRUE 0.951 -3.000 0.027 1.000   NA
 5745210 5745211 xccb100_0963 xccb100_0964     TRUE 0.965 -3.000 0.095 NA   NA
 5745211 5745212 xccb100_0964 xccb100_0965   dctA2 FALSE 0.038 566.000 0.100 NA   NA
 5745212 5745213 xccb100_0965 xccb100_0966 dctA2 tkt FALSE 0.322 239.000 0.150 1.000 N NA
 5745214 5745215 xccb100_0967 xccb100_0968 pip1   FALSE 0.229 148.000 0.000 1.000   NA
 5745215 5745216 xccb100_0968 xccb100_0969     TRUE 0.553 66.000 0.000 0.072   NA
 5745216 5745217 xccb100_0969 xccb100_0970   lytM FALSE 0.013 352.000 0.000 NA   NA
 5745217 5745218 xccb100_0970 xccb100_0971 lytM   TRUE 0.951 4.000 0.146 NA   NA
 5745218 5745219 xccb100_0971 xccb100_0972     FALSE 0.036 302.000 0.000 1.000   NA
 5745219 5745220 xccb100_0972 xccb100_0973     TRUE 0.676 68.000 0.167 NA   NA
 5745220 5745221 xccb100_0973 xccb100_0974     FALSE 0.527 134.000 0.053 NA   NA
 5745221 5745222 xccb100_0974 xccb100_0975     TRUE 0.591 113.000 0.040 1.000   NA
 5745222 5745223 xccb100_0975 xccb100_0976   modC FALSE 0.536 49.000 0.040 1.000   NA
 5745223 5745224 xccb100_0976 xccb100_0977 modC modB TRUE 0.952 0.000 0.041 1.000   NA
 5745224 5745225 xccb100_0977 xccb100_0978 modB modA TRUE 0.996 11.000 0.627 0.001 Y NA
 5745225 5745226 xccb100_0978 xccb100_0979 modA   FALSE 0.115 270.000 0.014 1.000   NA
 5745226 5745227 xccb100_0979 xccb100_0980   nucS TRUE 0.897 14.000 0.158 1.000   NA
 5745227 5745228 xccb100_0980 xccb100_0981 nucS ompW2 FALSE 0.183 229.000 0.017 1.000   NA
 5745228 5745229 xccb100_0981 xccb100_0982 ompW2 ompW1 TRUE 0.915 120.000 0.034 0.006 Y NA
 5745229 5745230 xccb100_0982 xccb100_0983 ompW1   FALSE 0.056 219.000 0.000 NA   NA
 5745231 5745232 xccb100_0984 xccb100_0985 gapA   FALSE 0.062 212.000 0.000 NA   NA
 5745232 5745233 xccb100_0985 xccb100_0986     FALSE 0.305 171.000 0.020 NA   NA
 5745233 5745234 xccb100_0986 xccb100_0987     TRUE 0.979 0.000 0.283 NA   NA
 5745234 5745235 xccb100_0987 xccb100_0988   pgk FALSE 0.019 314.000 0.000 NA   NA
 5745235 5745236 xccb100_0988 xccb100_0989 pgk   TRUE 0.917 -3.000 0.004 1.000   NA
 5745236 5745237 xccb100_0989 xccb100_0990   pykA FALSE 0.409 140.000 0.009 1.000   NA
 5745237 5745238 xccb100_0990 xccb100_0991 pykA fba FALSE 0.213 465.000 0.010 0.004 Y NA
 5745239 5745240 xccb100_0992 xccb100_0993     FALSE 0.006 507.000 0.000 NA   NA
 5745240 5745241 xccb100_0993 xccb100_0994   cysK FALSE 0.090 164.000 0.000 NA N NA
 5745241 5745242 xccb100_0994 xccb100_0995 cysK cysG TRUE 0.765 17.000 0.048 1.000 N NA
 5745243 5745244 xccb100_0996 xccb100_0997 cysB   TRUE 0.800 95.000 0.333 NA   NA
 5745246 5745247 xccb100_0999 xccb100_1000     TRUE 0.574 183.000 0.250 NA   NA
 5745247 5745248 xccb100_1000 xccb100_1001     TRUE 0.984 -3.000 0.312 NA   NA
 5745249 5745250 xccb100_1002 xccb100_1003 cysH cysI TRUE 0.971 -3.000 0.116 1.000 N NA
 5745250 5745251 xccb100_1003 xccb100_1004 cysI cysJ TRUE 0.994 16.000 0.791 0.001 Y NA
 5745252 5745253 xccb100_1005 xccb100_1006 cysD cysNC TRUE 0.993 0.000 0.203 0.001 N NA
 5745253 5745254 xccb100_1006 xccb100_1007 cysNC toxG FALSE 0.045 263.000 0.000 1.000 N NA
 5745254 5745255 xccb100_1007 xccb100_1008 toxG toxH TRUE 0.979 -3.000 0.260 NA N NA
 5745255 5745256 xccb100_1008 xccb100_1009 toxH pepN FALSE 0.007 387.000 0.000 NA N NA
 5745256 5745257 xccb100_1009 xccb100_1010 pepN   TRUE 0.872 16.000 0.167 1.000 N NA
 5745257 5745258 xccb100_1010 xccb100_1011   alsT TRUE 0.720 101.000 0.154 1.000 N NA
 5745258 5745259 xccb100_1011 xccb100_1012 alsT rlmB TRUE 0.960 -3.000 0.055 1.000 N NA
 5745259 5745260 xccb100_1012 xccb100_1013 rlmB estB TRUE 0.925 3.000 0.036 1.000 N NA
 5745262 5745263 xccb100_1015 xccb100_1016     TRUE 0.731 138.000 0.200 1.000   NA
 5745266 5745267 xccb100_1019 xccb100_1020     FALSE 0.156 52.000 0.000 NA   NA
 5745267 5745268 xccb100_1020 xccb100_1021     FALSE 0.450 13.000 0.000 NA   NA
 5745268 5745269 xccb100_1021 xccb100_1022   mscL FALSE 0.438 115.000 0.007 1.000   NA
 5745269 5745270 xccb100_1022 xccb100_1023 mscL   FALSE 0.385 62.000 0.008 1.000 N NA
 5745270 5745271 xccb100_1023 xccb100_1024     TRUE 0.879 93.000 0.667 NA   NA
 5745273 5745274 xccb100_1026 xccb100_1027   trmB FALSE 0.443 67.000 0.012 1.000   NA
 5745274 5745275 xccb100_1027 xccb100_1028 trmB thiG TRUE 0.562 146.000 0.060 1.000   NA
 5745275 5745276 xccb100_1028 xccb100_1029 thiG thiS TRUE 0.847 49.000 0.130 1.000 Y NA
 5745277 5745278 xccb100_1030 xccb100_rna010     FALSE 0.181 123.000 0.000 NA   NA
 5745278 5745279 xccb100_rna010 xccb100_1031     FALSE 0.169 68.000 0.000 NA   NA
 5745279 5745280 xccb100_1031 xccb100_1032     FALSE 0.015 341.000 0.000 NA   NA
 5745280 5745281 xccb100_1032 xccb100_1033     TRUE 0.982 -7.000 0.706 NA   NA
 5745282 5745283 xccb100_1034 xccb100_1035     TRUE 0.956 18.000 1.000 NA   NA
 5745283 5745284 xccb100_1035 xccb100_1036     TRUE 0.902 41.000 1.000 NA   NA
 5745285 5745286 xccb100_1037 xccb100_1038   ndpA TRUE 0.569 10.000 0.000 NA   NA
 5745286 5745287 xccb100_1038 xccb100_1039 ndpA   TRUE 0.972 10.000 0.556 NA   NA
 5745288 5745289 xccb100_1040 xccb100_1041     TRUE 0.569 10.000 0.000 NA   NA
 5745289 5745290 xccb100_1041 xccb100_1042     FALSE 0.186 116.000 0.000 NA   NA
 5745290 5745291 xccb100_1042 xccb100_1043     FALSE 0.003 1147.000 0.000 NA   NA
 5745291 5745292 xccb100_1043 xccb100_1044     FALSE 0.156 52.000 0.000 NA   NA
 5745294 5745295 xccb100_1046 xccb100_1047     FALSE 0.259 26.000 0.000 NA   NA
 5745297 5745298 xccb100_1049 xccb100_1050     FALSE 0.464 -25.000 0.000 NA   NA
 5745300 5745301 xccb100_1052 xccb100_1053     FALSE 0.156 55.000 0.000 NA   NA
 5745301 5745302 xccb100_1053 xccb100_1054     FALSE 0.373 16.000 0.000 NA   NA
 5745302 5745303 xccb100_1054 xccb100_1055     FALSE 0.192 112.000 0.000 NA   NA
 5745304 5745305 xccb100_1056 xccb100_1057 radC1   FALSE 0.169 69.000 0.000 NA   NA
 5745305 5745306 xccb100_1057 xccb100_1058     FALSE 0.075 195.000 0.000 NA   NA
 5745306 5745307 xccb100_1058 xccb100_1059     FALSE 0.194 36.000 0.000 NA   NA
 5745307 5745308 xccb100_1059 xccb100_1060   mod FALSE 0.167 134.000 0.000 NA   NA
 5745308 5745309 xccb100_1060 xccb100_1061 mod   TRUE 0.978 3.000 0.000 0.071 Y NA
 5745309 5745310 xccb100_1061 xccb100_1062     FALSE 0.420 14.000 0.000 NA   NA
 5745310 5745311 xccb100_1062 xccb100_1063     FALSE 0.171 43.000 0.000 NA   NA
 5745311 5745312 xccb100_1063 xccb100_1064     FALSE 0.169 133.000 0.000 NA   NA
 5745313 5745314 xccb100_1065 xccb100_1066     FALSE 0.251 27.000 0.000 NA   NA
 5745319 5745320 xccb100_1071 xccb100_1072     FALSE 0.039 249.000 0.000 NA   NA
 5745320 5745321 xccb100_1072 xccb100_1073     FALSE 0.063 211.000 0.000 NA   NA
 5745321 5745322 xccb100_1073 xccb100_1074     FALSE 0.398 15.000 0.000 NA   NA
 5745322 5745323 xccb100_1074 xccb100_1075     FALSE 0.171 131.000 0.000 NA   NA
 5745323 5745324 xccb100_1075 xccb100_1076   xrvA TRUE 0.909 91.000 1.000 NA   NA
 5745325 5745326 xccb100_1077 xccb100_1078   glgX2 FALSE 0.182 39.000 0.000 NA   NA
 5745327 5745328 xccb100_1079 xccb100_1080 rimK   FALSE 0.053 223.000 0.000 NA   NA
 5745328 5745329 xccb100_1080 xccb100_1081   colR TRUE 0.857 31.000 0.429 NA   NA
 5745329 5745330 xccb100_1081 xccb100_1082 colR colS TRUE 0.990 -7.000 0.400 1.000 Y NA
 5745331 5745332 xccb100_1083 xccb100_1084     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 5745332 5745333 xccb100_1084 xccb100_1085     FALSE 0.172 75.000 0.000 NA   NA
 5745333 5745334 xccb100_1085 xccb100_1086   coaE FALSE 0.006 532.000 0.000 NA   NA
 5745334 5745335 xccb100_1086 xccb100_1087 coaE pilD TRUE 0.873 14.000 0.122 1.000 N NA
 5745335 5745336 xccb100_1087 xccb100_1088 pilD   TRUE 0.990 7.000 0.454 1.000 Y NA
 5745337 5745338 xccb100_1089 xccb100_1090 pilA   FALSE 0.261 72.000 0.000 1.000   NA
 5745338 5745339 xccb100_1090 xccb100_1091     TRUE 0.895 11.000 0.095 NA   NA
 5745339 5745340 xccb100_1091 xccb100_1092     TRUE 0.980 -3.000 0.250 NA   NA
 5745340 5745341 xccb100_1092 xccb100_1093     FALSE 0.501 35.000 0.013 1.000   NA
 5745342 5745343 xccb100_1094 xccb100_1095   pilS TRUE 0.903 209.000 0.556 0.088 Y NA
 5745344 5745345 xccb100_1096 xccb100_1097 sucC sucD TRUE 0.991 25.000 0.806 0.001 Y NA
 5745345 5745346 xccb100_1097 xccb100_1098 sucD   TRUE 0.639 20.000 0.012 1.000   NA
 5745346 5745347 xccb100_1098 xccb100_1099     TRUE 0.987 4.000 0.833 NA   NA
 5745347 5745348 xccb100_1099 xccb100_1100   nadE TRUE 0.921 -3.000 0.014 NA   NA
 5745349 5745350 xccb100_1101 xccb100_1102     FALSE 0.013 452.000 0.000 1.000   NA
 5745351 5745352 xccb100_1103 xccb100_1104 rluD   TRUE 0.964 2.000 0.168 NA   NA
 5745352 5745353 xccb100_1104 xccb100_1105     FALSE 0.475 21.000 0.004 NA   NA
 5745353 5745354 xccb100_1105 xccb100_1106     TRUE 0.865 -13.000 0.052 NA   NA
 5745354 5745355 xccb100_1106 xccb100_1107     FALSE 0.350 17.000 0.000 NA   NA
 5745356 5745357 xccb100_1108 xccb100_1109   gcd FALSE 0.008 529.000 0.000 1.000 N NA
 5745359 5745360 xccb100_1111 xccb100_1112 otsA cga TRUE 0.987 -3.000 0.057 1.000 Y NA
 5745360 5745361 xccb100_1112 xccb100_1113 cga otsB TRUE 0.864 50.000 0.174 1.000 Y NA
 5745361 5745362 xccb100_1113 xccb100_1114 otsB   FALSE 0.005 697.000 0.000 1.000 N NA
 5745363 5745364 xccb100_1115 xccb100_1116     TRUE 0.688 24.000 0.057 NA   NA
 5745364 5745365 xccb100_1116 xccb100_1117     TRUE 0.716 90.000 0.182 NA   NA
 5745365 5745366 xccb100_1117 xccb100_1118     TRUE 0.976 -3.000 0.182 NA   NA
 5745366 5745367 xccb100_1118 xccb100_1119     FALSE 0.010 394.000 0.000 NA   NA
 5745368 5745369 xccb100_1120 xccb100_1121 gst1   FALSE 0.432 44.000 0.010 1.000   NA
 5745370 5745371 xccb100_1122 xccb100_1123   clpB FALSE 0.134 156.000 0.000 NA   NA
 5745371 5745372 xccb100_1123 xccb100_1124 clpB   FALSE 0.295 131.000 0.003 NA   NA
 5745372 5745373 xccb100_1124 xccb100_1125     FALSE 0.168 44.000 0.000 NA   NA
 5745373 5745374 xccb100_1125 xccb100_1126   metY FALSE 0.464 -25.000 0.000 NA   NA
 5745374 5745375 xccb100_1126 xccb100_1127 metY   FALSE 0.004 965.000 0.000 1.000 N NA
 5745375 5745376 xccb100_1127 xccb100_1128     FALSE 0.181 123.000 0.000 NA   NA
 5745376 5745377 xccb100_1128 xccb100_1129     TRUE 0.977 -3.000 0.200 NA   NA
 5745377 5745378 xccb100_1129 xccb100_1130   cobA TRUE 0.934 -3.000 0.024 NA   NA
 5745378 5745379 xccb100_1130 xccb100_1131 cobA cobB TRUE 0.993 3.000 0.069 0.006 Y NA
 5745379 5745380 xccb100_1131 xccb100_1132 cobB cobD TRUE 0.912 23.000 0.000 0.006 Y NA
 5745380 5745381 xccb100_1132 xccb100_1133 cobD cobC TRUE 0.924 139.000 0.463 0.006 N NA
 5745381 5745382 xccb100_1133 xccb100_1134 cobC   TRUE 0.985 -3.000 0.033 0.006 N NA
 5745382 5745383 xccb100_1134 xccb100_1135   cobU TRUE 0.967 -12.000 0.079 1.000 Y NA
 5745383 5745384 xccb100_1135 xccb100_1136 cobU cobT TRUE 0.991 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 5745384 5745385 xccb100_1136 xccb100_1137 cobT   TRUE 0.838 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5745385 5745386 xccb100_1137 xccb100_1138     TRUE 0.838 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5745386 5745387 xccb100_1138 xccb100_1139     FALSE 0.229 41.000 0.000 1.000 N NA
 5745388 5745389 xccb100_1140 xccb100_1141     TRUE 0.981 -3.000 0.222 1.000 N NA
 5745389 5745390 xccb100_1141 xccb100_1142     TRUE 0.950 -22.000 0.433 NA   NA
 5745390 5745391 xccb100_1142 xccb100_1143     TRUE 0.988 -3.000 0.463 NA   NA
 5745391 5745392 xccb100_1143 xccb100_1144     TRUE 0.961 -33.000 0.561 1.000   NA
 5745392 5745393 xccb100_1144 xccb100_1145   fecA1 TRUE 0.567 185.000 0.194 1.000   NA
 5745393 5745394 xccb100_1145 xccb100_1146 fecA1   TRUE 0.972 1.000 0.194 1.000 N NA
 5745394 5745395 xccb100_1146 xccb100_1147   kefB2 FALSE 0.104 193.000 0.000 1.000 N NA
 5745397 5745398 xccb100_1149 xccb100_1150     FALSE 0.266 333.000 0.000 0.022 Y NA
 5745398 5745399 xccb100_1150 xccb100_1151     FALSE 0.028 276.000 0.000 NA   NA
 5745399 5745400 xccb100_1151 xccb100_1152     FALSE 0.057 218.000 0.000 NA   NA
 5745401 5745402 xccb100_1153 xccb100_1154     TRUE 0.683 51.000 0.200 NA   NA
 5745404 5745405 xccb100_1156 xccb100_1157     FALSE 0.188 94.000 0.000 NA   NA
 5745405 5745406 xccb100_1157 xccb100_1158   xynA1 FALSE 0.168 44.000 0.000 NA   NA
 5745407 5745408 xccb100_1159 xccb100_1160     FALSE 0.130 413.000 0.300 1.000 N NA
 5745408 5745409 xccb100_1160 xccb100_1161   ggpS FALSE 0.147 170.000 0.000 1.000 N NA
 5745409 5745410 xccb100_1161 xccb100_1162 ggpS   TRUE 0.989 -3.000 0.125 NA Y NA
 5745411 5745412 xccb100_1163 xccb100_1164     TRUE 0.901 -3.000 0.007 NA   NA
 5745414 5745415 xccb100_1166 xccb100_1167     FALSE 0.011 477.000 0.000 1.000   NA
 5745415 5745416 xccb100_1167 xccb100_1168     TRUE 0.587 125.000 0.075 NA   NA
 5745416 5745417 xccb100_1168 xccb100_1169     FALSE 0.328 76.000 0.006 NA   NA
 5745417 5745418 xccb100_1169 xccb100_1170     TRUE 0.751 130.000 0.277 NA   NA
 5745418 5745419 xccb100_1170 xccb100_1171     TRUE 0.972 113.000 0.451 0.010 Y NA
 5745419 5745420 xccb100_1171 xccb100_1172     FALSE 0.182 200.000 0.007 1.000 N NA
 5745420 5745421 xccb100_1172 xccb100_1173     TRUE 0.949 3.000 0.111 NA   NA
 5745421 5745422 xccb100_1173 xccb100_1174     FALSE 0.301 40.000 0.002 NA   NA
 5745422 5745423 xccb100_1174 xccb100_1175     TRUE 0.609 53.000 0.082 1.000   NA
 5745423 5745424 xccb100_1175 xccb100_1176     TRUE 0.969 12.000 0.593 1.000   NA
 5745424 5745425 xccb100_1176 xccb100_1177     TRUE 0.972 92.000 0.556 0.051 Y NA
 5745425 5745426 xccb100_1177 xccb100_1178     TRUE 0.967 -10.000 0.460 NA   NA
 5745426 5745427 xccb100_1178 xccb100_1179     FALSE 0.287 265.000 0.215 NA   NA
 5745427 5745428 xccb100_1179 xccb100_1180     TRUE 0.851 58.000 0.592 1.000 N NA
 5745428 5745429 xccb100_1180 xccb100_1181     TRUE 0.965 7.000 0.278 1.000   NA
 5745429 5745430 xccb100_1181 xccb100_1182     TRUE 0.591 45.000 0.059 1.000   NA
 5745430 5745431 xccb100_1182 xccb100_1183     TRUE 0.573 197.000 0.270 1.000   NA
 5745431 5745432 xccb100_1183 xccb100_rna011     FALSE 0.163 47.000 0.000 NA   NA
 5745433 5745434 xccb100_1184 xccb100_1185     FALSE 0.246 28.000 0.000 NA   NA
 5745434 5745435 xccb100_1185 xccb100_1186     FALSE 0.188 93.000 0.000 NA   NA
 5745436 5745437 xccb100_1187 xccb100_1188     FALSE 0.156 55.000 0.000 NA   NA
 5745437 5745438 xccb100_1188 xccb100_1189     TRUE 0.995 -3.000 0.083 0.030 Y NA
 5745440 5745441 xccb100_1191 xccb100_1192     TRUE 0.904 -100.000 0.286 NA   NA
 5745441 5745442 xccb100_1192 xccb100_1193     FALSE 0.170 160.000 0.000 1.000 N NA
 5745444 5745445 xccb100_1195 xccb100_1196     FALSE 0.186 166.000 0.000 1.000   NA
 5745446 5745447 xccb100_1197 xccb100_1198     FALSE 0.005 588.000 0.000 NA   NA
 5745449 5745450 xccb100_1200 xccb100_1201     FALSE 0.075 194.000 0.000 NA   NA
 5745450 5745451 xccb100_1201 xccb100_1202     FALSE 0.006 494.000 0.000 NA   NA
 5745451 5745452 xccb100_1202 xccb100_1203     TRUE 0.789 79.000 0.333 NA   NA
 5745452 5745453 xccb100_1203 xccb100_1204     FALSE 0.347 140.000 0.011 NA   NA
 5745453 5745454 xccb100_1204 xccb100_1205     FALSE 0.035 358.000 0.005 1.000 N NA
 5745455 5745456 xccb100_1206 xccb100_1207     FALSE 0.420 14.000 0.000 NA   NA
 5745457 5745458 xccb100_1208 xccb100_1209   glk2 TRUE 0.839 106.000 0.400 1.000 N NA
 5745458 5745459 xccb100_1209 xccb100_1210 glk2   FALSE 0.015 342.000 0.000 NA   NA
 5745459 5745460 xccb100_1210 xccb100_1211     FALSE 0.032 263.000 0.000 NA   NA
 5745460 5745461 xccb100_1211 xccb100_1212     FALSE 0.386 61.000 0.015 NA   NA
 5745461 5745462 xccb100_1212 xccb100_1213   pqqD TRUE 0.996 -3.000 0.361 0.002   NA
 5745462 5745463 xccb100_1213 xccb100_1214 pqqD   TRUE 0.996 -3.000 0.404 0.002   NA
 5745463 5745464 xccb100_1214 xccb100_1215     TRUE 0.998 -3.000 0.825 0.002   NA
 5745464 5745465 xccb100_1215 xccb100_1216   pqqA TRUE 0.847 66.000 0.073 0.002   NA
 5745466 5745467 xccb100_1217 xccb100_1218 relA2   TRUE 0.638 87.000 0.065 1.000   NA
 5745469 5745470 xccb100_1220 xccb100_1221     TRUE 0.798 13.000 0.021 1.000   NA
 5745470 5745471 xccb100_1221 xccb100_1222     FALSE 0.011 505.000 0.000 1.000   NA
 5745472 5745473 xccb100_1223 xccb100_1224     TRUE 0.904 -100.000 0.286 NA   NA
 5745474 5745475 xccb100_1225 xccb100_1226     TRUE 0.968 0.000 0.002 NA Y NA
 5745476 5745477 xccb100_1227 xccb100_1228   gshB TRUE 0.968 -3.000 0.089 1.000 N NA
 5745478 5745479 xccb100_1229 xccb100_1230     TRUE 0.965 18.000 0.085 0.024 Y NA
 5745479 5745480 xccb100_1230 xccb100_1231     TRUE 0.989 -3.000 0.076 1.000 Y NA
 5745480 5745481 xccb100_1231 xccb100_1232     TRUE 0.980 40.000 0.795 0.014 Y NA
 5745481 5745482 xccb100_1232 xccb100_1233   pilL TRUE 0.975 114.000 0.554 0.014 Y NA
 5745482 5745483 xccb100_1233 xccb100_1234 pilL cheB1 TRUE 0.987 8.000 0.054 0.014 Y NA
 5745483 5745484 xccb100_1234 xccb100_1235 cheB1   TRUE 0.844 35.000 0.071 0.014   NA
 5745484 5745485 xccb100_1235 xccb100_PS021     FALSE 0.020 308.000 0.000 NA   NA
 5745485 5745486 xccb100_PS021 xccb100_PS022     FALSE 0.422 -42.000 0.000 NA   NA
 5745487 5745488 xccb100_1236 xccb100_1237     TRUE 0.925 -3.000 0.017 NA   NA
 5745488 5745489 xccb100_1237 xccb100_1238     TRUE 0.707 88.000 0.168 NA   NA
 5745490 5745491 xccb100_1239 xccb100_1240 aspG   TRUE 0.730 18.000 0.038 1.000 N NA
 5745491 5745492 xccb100_1240 xccb100_1241     FALSE 0.078 218.000 0.000 1.000 N NA
 5745492 5745493 xccb100_1241 xccb100_1242     TRUE 0.736 -7.000 0.000 1.000   NA
 5745493 5745494 xccb100_1242 xccb100_1243     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5745497 5745498 xccb100_1246 xccb100_1247     FALSE 0.134 156.000 0.000 NA   NA
 5745498 5745499 xccb100_1247 xccb100_1248   hsdR TRUE 0.991 -3.000 0.644 NA   NA
 5745499 5745500 xccb100_1248 xccb100_1249 hsdR hsdS TRUE 0.998 -3.000 0.265 0.002 Y NA
 5745500 5745501 xccb100_1249 xccb100_1250 hsdS   FALSE 0.030 268.000 0.000 NA   NA
 5745501 5745502 xccb100_1250 xccb100_1251   hsdM TRUE 0.912 -7.000 0.073 NA   NA
 5745502 5745503 xccb100_1251 xccb100_1252 hsdM   TRUE 0.948 18.000 0.291 0.070   NA
 5745504 5745505 xccb100_1253 xccb100_1254     FALSE 0.006 522.000 0.000 NA   NA
 5745505 5745506 xccb100_1254 xccb100_1255     FALSE 0.204 34.000 0.000 NA   NA
 5745506 5745507 xccb100_1255 xccb100_1256     FALSE 0.132 157.000 0.000 NA   NA
 5745508 5745509 xccb100_1257 xccb100_1258 bga2   TRUE 0.905 63.000 0.300 1.000 Y NA
 5745509 5745510 xccb100_1258 xccb100_1259     TRUE 0.868 137.000 0.600 1.000   NA
 5745510 5745511 xccb100_1259 xccb100_1260   bgl2 TRUE 0.852 88.000 0.429 1.000   NA
 5745511 5745512 xccb100_1260 xccb100_1261 bgl2 bmnA TRUE 0.838 260.000 0.500 0.024 Y NA
 5745512 5745513 xccb100_1261 xccb100_1262 bmnA nahA TRUE 0.983 22.000 0.417 0.013 Y NA
 5745513 5745514 xccb100_1262 xccb100_1263 nahA chiA TRUE 0.907 123.000 0.286 0.013   NA
 5745514 5745515 xccb100_1263 xccb100_1264 chiA fucA1 TRUE 0.961 15.000 0.214 0.013   NA
 5745515 5745516 xccb100_1264 xccb100_1265 fucA1   TRUE 0.689 203.000 0.600 1.000 N NA
 5745517 5745518 xccb100_1266 xccb100_1267   glk3 FALSE 0.060 213.000 0.000 NA   NA
 5745519 5745520 xccb100_1268 xccb100_1269     TRUE 0.874 -9.000 0.041 NA   NA
 5745521 5745522 xccb100_1270 xccb100_1271     TRUE 0.952 12.000 0.373 1.000 N NA
 5745522 5745523 xccb100_1271 xccb100_1272     FALSE 0.458 35.000 0.007 1.000   NA
 5745523 5745524 xccb100_1272 xccb100_1273     TRUE 0.894 -3.000 0.006 NA   NA
 5745524 5745525 xccb100_1273 xccb100_1274     FALSE 0.014 351.000 0.000 NA   NA
 5745525 5745526 xccb100_1274 xccb100_1275     TRUE 0.989 4.000 0.313 NA Y NA
 5745526 5745527 xccb100_1275 xccb100_1276     FALSE 0.340 106.000 0.008 NA N NA
 5745527 5745528 xccb100_1276 xccb100_1277     TRUE 0.966 140.000 0.317 0.001 Y NA
 5745529 5745530 xccb100_1278 xccb100_1279     FALSE 0.188 91.000 0.000 NA   NA
 5745533 5745534 xccb100_1282 xccb100_1283     FALSE 0.392 57.000 0.017 NA   NA
 5745535 5745536 xccb100_1284 xccb100_1285 fadE1   TRUE 0.950 -3.000 0.045 NA   NA
 5745538 5745539 xccb100_1287 xccb100_1288     FALSE 0.049 228.000 0.000 NA   NA
 5745539 5745540 xccb100_1288 xccb100_1289     FALSE 0.378 123.000 0.010 NA   NA
 5745541 5745542 xccb100_1290 xccb100_1291     TRUE 0.738 12.000 0.013 NA   NA
 5745542 5745543 xccb100_1291 xccb100_1292     TRUE 0.867 -40.000 0.128 NA   NA
 5745544 5745545 xccb100_1293 xccb100_1294     FALSE 0.421 52.000 0.025 NA   NA
 5745545 5745546 xccb100_1294 xccb100_1295     FALSE 0.400 48.000 0.008 1.000   NA
 5745546 5745547 xccb100_1295 xccb100_1296     FALSE 0.350 116.000 0.006 NA   NA
 5745548 5745549 xccb100_1297 xccb100_1298     TRUE 0.989 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 5745549 5745550 xccb100_1298 xccb100_1299     TRUE 0.986 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 5745551 5745552 xccb100_1300 xccb100_1301 cpo   FALSE 0.070 201.000 0.000 NA   NA
 5745552 5745553 xccb100_1301 xccb100_1302     FALSE 0.083 189.000 0.000 NA   NA
 5745555 5745556 xccb100_1304 xccb100_1305     TRUE 0.884 11.000 0.080 NA   NA
 5745556 5745557 xccb100_1305 xccb100_1306     TRUE 0.979 -3.000 0.222 NA   NA
 5745558 5745559 xccb100_1307 xccb100_1308     TRUE 0.839 82.000 0.000 0.015 Y NA
 5745559 5745560 xccb100_1308 xccb100_1309     TRUE 0.671 190.000 0.000 0.015 Y NA
 5745561 5745562 xccb100_1310 xccb100_1311     FALSE 0.030 269.000 0.000 NA   NA
 5745562 5745563 xccb100_1311 xccb100_1312     FALSE 0.007 455.000 0.000 NA   NA
 5745563 5745564 xccb100_1312 xccb100_1313     TRUE 0.658 13.000 0.006 NA   NA
 5745564 5745565 xccb100_1313 xccb100_1314     FALSE 0.006 936.000 0.002 NA   NA
 5745565 5745566 xccb100_1314 xccb100_1315     TRUE 0.970 -27.000 0.208 1.000 Y NA
 5745567 5745568 xccb100_1316 xccb100_1317     FALSE 0.308 131.000 0.004 NA   NA
 5745568 5745569 xccb100_1317 xccb100_1318     TRUE 0.971 13.000 0.911 NA   NA
 5745569 5745570 xccb100_1318 xccb100_1319     TRUE 0.753 28.000 0.143 NA   NA
 5745570 5745571 xccb100_1319 xccb100_1320     TRUE 0.981 3.000 0.455 NA   NA
 5745571 5745572 xccb100_1320 xccb100_1321     TRUE 0.825 35.000 0.379 NA   NA
 5745572 5745573 xccb100_1321 xccb100_1322     TRUE 0.948 13.000 0.470 NA   NA
 5745573 5745574 xccb100_1322 xccb100_1323     TRUE 0.972 2.000 0.244 NA   NA
 5745574 5745575 xccb100_1323 xccb100_1324     FALSE 0.078 192.000 0.000 NA   NA
 5745577 5745578 xccb100_1326 xccb100_1327     FALSE 0.223 31.000 0.000 NA   NA
 5745578 5745579 xccb100_1327 xccb100_1328     FALSE 0.174 76.000 0.000 NA   NA
 5745581 5745582 xccb100_1330 xccb100_1331     TRUE 0.813 97.000 0.364 NA   NA
 5745582 5745583 xccb100_1331 xccb100_1332     TRUE 0.971 11.000 0.647 NA   NA
 5745583 5745584 xccb100_1332 xccb100_1333     TRUE 0.872 38.000 0.647 NA   NA
 5745585 5745586 xccb100_1334 xccb100_1335     FALSE 0.246 28.000 0.000 NA   NA
 5745590 5745591 xccb100_1339 xccb100_1340     FALSE 0.416 -43.000 0.000 NA   NA
 5745591 5745592 xccb100_1340 xccb100_1341     FALSE 0.006 513.000 0.000 NA   NA
 5745593 5745594 xccb100_1342 xccb100_1343   pip2 FALSE 0.174 439.000 0.520 1.000 N NA
 5745596 5745597 xccb100_1345 xccb100_1346 pel1   FALSE 0.071 224.000 0.000 1.000 N NA
 5745597 5745598 xccb100_1346 xccb100_1347     FALSE 0.016 367.000 0.000 1.000 N NA
 5745598 5745599 xccb100_1347 xccb100_1348     TRUE 0.998 0.000 0.667 0.046 Y NA
 5745600 5745601 xccb100_1349 xccb100_1350   mgtE2 FALSE 0.481 99.000 0.012 1.000   NA
 5745601 5745602 xccb100_1350 xccb100_1351 mgtE2 ptsI FALSE 0.508 144.000 0.042 1.000 N NA
 5745602 5745603 xccb100_1351 xccb100_1352 ptsI ptsH TRUE 0.953 59.000 0.205 0.002 Y NA
 5745603 5745604 xccb100_1352 xccb100_1353 ptsH manX TRUE 0.995 -7.000 0.261 0.002 Y NA
 5745604 5745605 xccb100_1353 xccb100_1354 manX   FALSE 0.063 487.000 0.171 NA   NA
 5745605 5745606 xccb100_1354 xccb100_1355   hprK TRUE 0.829 21.000 0.194 NA   NA
 5745606 5745607 xccb100_1355 xccb100_1356 hprK ptsN TRUE 0.987 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 5745607 5745608 xccb100_1356 xccb100_1357 ptsN   TRUE 0.578 22.000 0.022 NA N NA
 5745608 5745609 xccb100_1357 xccb100_1358   rpoN1 FALSE 0.529 88.000 0.050 NA N NA
 5745609 5745610 xccb100_1358 xccb100_1359 rpoN1   TRUE 0.727 40.000 0.163 1.000   NA
 5745610 5745611 xccb100_1359 xccb100_1360     TRUE 0.988 0.000 0.543 NA   NA
 5745611 5745612 xccb100_1360 xccb100_1361     TRUE 0.952 -22.000 0.459 NA   NA
 5745612 5745613 xccb100_1361 xccb100_1362   kdsC TRUE 0.991 -3.000 0.617 NA   NA
 5745613 5745614 xccb100_1362 xccb100_1363 kdsC kdsD TRUE 0.860 49.000 0.598 1.000   NA
 5745615 5745616 xccb100_1364 xccb100_1365   murA TRUE 0.650 115.000 0.129 NA N NA
 5745616 5745617 xccb100_1365 xccb100_1366 murA   TRUE 0.918 -3.000 0.013 NA   NA
 5745618 5745619 xccb100_1367 xccb100_1368     TRUE 0.989 4.000 1.000 NA   NA
 5745619 5745620 xccb100_1368 xccb100_1369     FALSE 0.460 37.000 0.020 NA   NA
 5745620 5745621 xccb100_1369 xccb100_1370     FALSE 0.433 35.000 0.014 NA   NA
 5745621 5745622 xccb100_1370 xccb100_1371     FALSE 0.546 17.000 0.005 NA   NA
 5745623 5745624 xccb100_1372 xccb100_1373     TRUE 0.963 -3.000 0.087 NA   NA
 5745624 5745625 xccb100_1373 xccb100_1374     TRUE 0.979 -3.000 0.217 NA   NA
 5745626 5745627 xccb100_1375 xccb100_1376     TRUE 0.991 -3.000 0.642 NA   NA
 5745627 5745628 xccb100_1376 xccb100_1377     FALSE 0.301 55.000 0.006 NA   NA
 5745628 5745629 xccb100_1377 xccb100_1378     FALSE 0.192 164.000 0.000 1.000   NA
 5745630 5745631 xccb100_1379 xccb100_1380     FALSE 0.297 63.000 0.004 NA   NA
 5745631 5745632 xccb100_1380 xccb100_1381     FALSE 0.020 308.000 0.000 NA   NA
 5745633 5745634 xccb100_1382 xccb100_1383     TRUE 0.990 -3.000 0.500 1.000 N NA
 5745634 5745635 xccb100_1383 xccb100_1384     TRUE 0.589 219.000 0.462 1.000 N NA
 5745635 5745636 xccb100_1384 xccb100_1385     TRUE 0.861 152.000 0.808 NA   NA
 5745636 5745637 xccb100_1385 xccb100_1386     TRUE 0.941 22.000 0.848 NA   NA
 5745637 5745638 xccb100_1386 xccb100_1387     TRUE 0.889 6.000 0.038 NA   NA
 5745638 5745639 xccb100_1387 xccb100_1388     TRUE 0.963 -7.000 0.250 1.000   NA
 5745639 5745640 xccb100_1388 xccb100_1389   fhuA2 TRUE 0.784 49.000 0.312 1.000   NA
 5745640 5745641 xccb100_1389 xccb100_1390 fhuA2   FALSE 0.093 345.000 0.000 NA Y NA
 5745641 5745642 xccb100_1390 xccb100_1391     TRUE 0.979 -3.000 0.217 NA   NA
 5745642 5745643 xccb100_1391 xccb100_1392   csd TRUE 0.582 143.000 0.066 1.000   NA
 5745643 5745644 xccb100_1392 xccb100_1393 csd sufD TRUE 0.954 -3.000 0.041 1.000 N NA
 5745644 5745645 xccb100_1393 xccb100_1394 sufD sufC TRUE 0.995 0.000 0.482 1.000 Y NA
 5745645 5745646 xccb100_1394 xccb100_1395 sufC sufB TRUE 0.898 165.000 0.466 1.000 Y NA
 5745646 5745647 xccb100_1395 xccb100_1396 sufB sufR TRUE 0.818 16.000 0.078 1.000 N NA
 5745648 5745649 xccb100_1397 xccb100_1398     TRUE 0.870 108.000 0.500 1.000   NA
 5745650 5745651 xccb100_1399 xccb100_1400     FALSE 0.466 213.000 0.250 NA   NA
 5745651 5745652 xccb100_1400 xccb100_1401     TRUE 0.853 54.000 0.667 NA   NA
 5745652 5745653 xccb100_1401 xccb100_1402     TRUE 0.763 78.000 0.286 NA   NA
 5745653 5745654 xccb100_1402 xccb100_1403     TRUE 0.763 144.000 0.286 1.000   NA
 5745654 5745655 xccb100_1403 xccb100_1404     FALSE 0.010 545.000 0.000 1.000   NA
 5745655 5745656 xccb100_1404 xccb100_1405     FALSE 0.442 -31.000 0.000 NA   NA
 5745657 5745658 xccb100_1406 xccb100_1407     TRUE 0.965 137.000 0.436 0.015 Y NA
 5745658 5745659 xccb100_1407 xccb100_1408     FALSE 0.043 238.000 0.000 NA   NA
 5745660 5745661 xccb100_1409 xccb100_1410     FALSE 0.053 223.000 0.000 NA   NA
 5745661 5745662 xccb100_1410 xccb100_1411     FALSE 0.496 -18.000 0.000 NA   NA
 5745662 5745663 xccb100_1411 xccb100_1412     TRUE 0.953 -3.000 0.051 NA   NA
 5745664 5745665 xccb100_1413 xccb100_1414     TRUE 0.954 -7.000 0.263 NA N NA
 5745665 5745666 xccb100_1414 xccb100_1415     TRUE 0.723 16.000 0.022 1.000 N NA
 5745666 5745667 xccb100_1415 xccb100_1416     FALSE 0.015 382.000 0.000 1.000 N NA
 5745667 5745668 xccb100_1416 xccb100_1417     FALSE 0.385 152.000 0.011 1.000   NA
 5745669 5745670 xccb100_1418 xccb100_1419     TRUE 0.966 32.000 0.800 0.012   NA
 5745671 5745672 xccb100_1420 xccb100_1421     TRUE 0.767 -16.000 0.014 NA   NA
 5745672 5745673 xccb100_1421 xccb100_1422     TRUE 0.964 -3.000 0.091 NA   NA
 5745673 5745674 xccb100_1422 xccb100_1423   murD TRUE 0.770 -19.000 0.019 NA   NA
 5745674 5745675 xccb100_1423 xccb100_1424 murD   FALSE 0.183 154.000 0.000 1.000 N NA
 5745677 5745678 xccb100_1426 xccb100_1427   ompV FALSE 0.003 613.000 0.000 NA N NA
 5745678 5745679 xccb100_1427 xccb100_1428 ompV   FALSE 0.121 59.000 0.000 NA N NA
 5745679 5745680 xccb100_1428 xccb100_1429     FALSE 0.230 77.000 0.000 1.000 N NA
 5745680 5745681 xccb100_1429 xccb100_1430     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 5745683 5745684 xccb100_1432 xccb100_1433     FALSE 0.163 138.000 0.000 NA   NA
 5745684 5745685 xccb100_1433 xccb100_1434     TRUE 0.601 8.000 0.000 NA   NA
 5745685 5745686 xccb100_1434 xccb100_1435     TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.046 Y NA
 5745686 5745687 xccb100_1435 xccb100_1436     TRUE 0.999 2.000 0.917 0.001 Y NA
 5745687 5745688 xccb100_1436 xccb100_1437     TRUE 0.605 30.000 0.056 NA N NA
 5745688 5745689 xccb100_1437 xccb100_1438     FALSE 0.004 676.000 0.000 NA   NA
 5745691 5745692 xccb100_1440 xccb100_1441     TRUE 0.870 128.000 0.667 NA   NA
 5745693 5745694 xccb100_1442 xccb100_1443     TRUE 0.760 37.000 0.250 NA   NA
 5745696 5745697 xccb100_1445 xccb100_1446     TRUE 0.969 0.000 0.156 NA   NA
 5745698 5745699 xccb100_1447 xccb100_1448     FALSE 0.454 33.000 0.014 NA   NA
 5745700 5745701 xccb100_1449 xccb100_1450     FALSE 0.038 250.000 0.000 NA   NA
 5745701 5745702 xccb100_1450 xccb100_1451     FALSE 0.014 348.000 0.000 NA   NA
 5745703 5745704 xccb100_1452 xccb100_1453 gpm1   TRUE 0.602 88.000 0.045 1.000   NA
 5745704 5745705 xccb100_1453 xccb100_1454     TRUE 0.830 166.000 0.667 1.000   NA
 5745705 5745706 xccb100_1454 xccb100_1455   cls4 FALSE 0.183 154.000 0.000 1.000 N NA
 5745707 5745708 xccb100_1456 xccb100_1457 cheB2   TRUE 0.991 -3.000 0.136 1.000 Y NA
 5745708 5745709 xccb100_1457 xccb100_1458     TRUE 0.969 -16.000 0.136 1.000 Y NA
 5745709 5745710 xccb100_1458 xccb100_1459     TRUE 0.959 27.000 0.500 1.000 Y NA
 5745710 5745711 xccb100_1459 xccb100_1460     TRUE 0.997 11.000 1.000 0.014 Y NA
 5745711 5745712 xccb100_1460 xccb100_1461   cheA1 TRUE 0.925 72.000 0.091 0.014 Y NA
 5745712 5745713 xccb100_1461 xccb100_1462 cheA1   TRUE 0.962 19.000 0.455 NA Y NA
 5745713 5745714 xccb100_1462 xccb100_1463     FALSE 0.003 752.000 0.000 NA N NA
 5745714 5745715 xccb100_1463 xccb100_1464     FALSE 0.010 690.000 0.002 1.000 N NA
 5745715 5745716 xccb100_1464 xccb100_1465     FALSE 0.313 56.000 0.007 NA   NA
 5745717 5745718 xccb100_1466 xccb100_1467 creB   TRUE 0.700 3.000 0.000 NA   NA
 5745718 5745719 xccb100_1467 xccb100_1468   creC TRUE 0.721 2.000 0.000 NA   NA
 5745719 5745720 xccb100_1468 xccb100_1469 creC creD TRUE 0.781 104.000 0.311 NA N NA
 5745720 5745721 xccb100_1469 xccb100_1470 creD   TRUE 0.843 8.000 0.019 NA   NA
 5745721 5745722 xccb100_1470 xccb100_1471     FALSE 0.187 86.000 0.000 NA   NA
 5745722 5745723 xccb100_1471 xccb100_1472     TRUE 0.569 10.000 0.000 NA   NA
 5745723 5745724 xccb100_1472 xccb100_1473     TRUE 0.829 60.000 0.437 1.000   NA
 5745724 5745725 xccb100_1473 xccb100_1474     FALSE 0.482 137.000 0.038 NA   NA
 5745725 5745726 xccb100_1474 xccb100_1475     FALSE 0.303 70.000 0.004 NA   NA
 5745726 5745727 xccb100_1475 xccb100_1476   fur2 TRUE 0.714 14.000 0.012 1.000 N NA
 5745728 5745729 xccb100_1477 xccb100_1478     FALSE 0.035 257.000 0.000 NA   NA
 5745730 5745731 xccb100_1479 xccb100_1480     TRUE 0.905 16.000 0.278 1.000 N NA
 5745731 5745732 xccb100_1480 xccb100_1481   oprN2 TRUE 0.989 2.000 0.263 0.037 N NA
 5745732 5745733 xccb100_1481 xccb100_1482 oprN2   TRUE 0.689 26.000 0.053 1.000 N NA
 5745733 5745734 xccb100_1482 xccb100_1483     FALSE 0.040 272.000 0.000 1.000 N NA
 5745740 5745741 xccb100_1489 xccb100_1490 araJ   TRUE 0.660 61.000 0.158 NA   NA
 5745741 5745742 xccb100_1490 xccb100_4470     TRUE 0.965 -3.000 0.000 0.029   NA
 5745743 5745744 xccb100_1492 xccb100_1493     FALSE 0.093 180.000 0.000 NA   NA
 5745744 5745745 xccb100_1493 xccb100_1494     TRUE 0.991 2.000 1.000 NA   NA
 5745745 5745746 xccb100_1494 xccb100_1495     FALSE 0.006 800.000 0.000 1.000   NA
 5745747 5745748 xccb100_1496 xccb100_1497 fdhA   TRUE 0.982 0.000 0.333 NA   NA
 5745748 5745749 xccb100_1497 xccb100_1498   cydA1 TRUE 0.889 13.000 0.154 NA   NA
 5745749 5745750 xccb100_1498 xccb100_1499 cydA1 cydB1 TRUE 0.965 22.000 0.154 0.045 Y NA
 5745751 5745752 xccb100_1500 xccb100_1501     TRUE 0.986 -3.000 0.400 NA   NA
 5745752 5745753 xccb100_1501 xccb100_1502     FALSE 0.183 120.000 0.000 NA   NA
 5745753 5745754 xccb100_1502 xccb100_1503     FALSE 0.167 65.000 0.000 NA   NA
 5745755 5745756 xccb100_1504 xccb100_1505     TRUE 0.912 109.000 1.000 NA   NA
 5745757 5745758 xccb100_1506 xccb100_1507 clcA1 enpP FALSE 0.446 46.000 0.013 1.000   NA
 5745758 5745759 xccb100_1507 xccb100_1508 enpP   FALSE 0.030 450.000 0.013 1.000   NA
 5745759 5745760 xccb100_1508 xccb100_1509     TRUE 0.998 -3.000 0.275 0.001 Y NA
 5745761 5745762 xccb100_1510 xccb100_1511     TRUE 0.662 66.000 0.154 NA   NA
 5745762 5745763 xccb100_1511 xccb100_1512     FALSE 0.191 113.000 0.000 NA   NA
 5745763 5745764 xccb100_1512 xccb100_1513     TRUE 0.762 26.000 0.138 NA   NA
 5745764 5745765 xccb100_1513 xccb100_1514     FALSE 0.466 112.000 0.021 NA   NA
 5745766 5745767 xccb100_1515 xccb100_1516     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5745767 5745768 xccb100_1516 xccb100_1517     TRUE 0.718 11.000 0.005 NA   NA
 5745768 5745769 xccb100_1517 xccb100_1518     FALSE 0.486 30.000 0.005 1.000   NA
 5745770 5745771 xccb100_1519 xccb100_1520     FALSE 0.224 176.000 0.004 1.000 N NA
 5745771 5745772 xccb100_1520 xccb100_1521     TRUE 0.960 -3.000 0.057 1.000 N NA
 5745773 5745774 xccb100_1522 xccb100_1523     FALSE 0.006 539.000 0.000 NA   NA
 5745774 5745775 xccb100_1523 xccb100_1524     FALSE 0.178 40.000 0.000 NA   NA
 5745776 5745777 xccb100_1525 xccb100_1526   ampC2 TRUE 0.648 61.000 0.167 NA N NA
 5745777 5745778 xccb100_1526 xccb100_1527 ampC2   FALSE 0.029 303.000 0.000 1.000 N NA
 5745778 5745779 xccb100_1527 xccb100_1528     FALSE 0.103 318.000 0.000 0.050 N NA
 5745782 5745783 xccb100_1531 xccb100_1532     TRUE 0.821 60.000 0.500 NA   NA
 5745783 5745784 xccb100_1532 xccb100_1533     TRUE 0.746 16.000 0.042 NA   NA
 5745784 5745785 xccb100_1533 xccb100_1534     FALSE 0.393 270.000 0.000 0.041 Y NA
 5745787 5745788 xccb100_1536 xccb100_1537     FALSE 0.043 238.000 0.000 NA   NA
 5745788 5745789 xccb100_1537 xccb100_1538     FALSE 0.169 69.000 0.000 NA   NA
 5745789 5745790 xccb100_1538 xccb100_1539     TRUE 0.602 17.000 0.011 NA   NA
 5745791 5745792 xccb100_1540 xccb100_1541     TRUE 0.744 10.000 0.005 NA   NA
 5745792 5745793 xccb100_1541 xccb100_1542     FALSE 0.082 408.000 0.182 NA N NA
 5745793 5745794 xccb100_1542 xccb100_1543     TRUE 0.812 22.000 0.199 NA N NA
 5745794 5745795 xccb100_1543 xccb100_1544     TRUE 0.914 -3.000 0.006 1.000 N NA
 5745795 5745796 xccb100_1544 xccb100_1545     FALSE 0.491 48.000 0.044 NA   NA
 5745799 5745800 xccb100_1548 xccb100_1549 tonB   FALSE 0.011 438.000 0.000 1.000 N NA
 5745800 5745801 xccb100_1549 xccb100_1550     FALSE 0.191 100.000 0.000 NA   NA
 5745801 5745802 xccb100_1550 xccb100_1551     FALSE 0.171 43.000 0.000 NA   NA
 5745803 5745804 xccb100_1552 xccb100_1553     TRUE 0.982 1.000 0.417 NA N NA
 5745804 5745805 xccb100_1553 xccb100_1554     TRUE 0.658 170.000 0.296 NA   NA
 5745809 5745810 xccb100_1558 xccb100_1559     FALSE 0.350 128.000 0.008 NA   NA
 5745813 5745814 xccb100_1562 xccb100_1563 ispA   TRUE 0.971 1.000 0.177 1.000 N NA
 5745814 5745815 xccb100_1563 xccb100_1564     FALSE 0.441 32.000 0.006 1.000 N NA
 5745815 5745816 xccb100_1564 xccb100_1565     FALSE 0.360 85.000 0.002 1.000 N NA
 5745817 5745818 xccb100_1566 xccb100_1567     TRUE 0.857 8.000 0.012 1.000   NA
 5745821 5745822 xccb100_1570 xccb100_1571     TRUE 0.895 67.000 0.062 0.083 Y NA
 5745822 5745823 xccb100_1571 xccb100_1572     TRUE 0.612 88.000 0.062 1.000 N NA
 5745823 5745824 xccb100_1572 xccb100_1573     FALSE 0.548 29.000 0.024 NA   NA
 5745824 5745825 xccb100_1573 xccb100_1574     TRUE 0.935 -3.000 0.024 NA   NA
 5745825 5745826 xccb100_1574 xccb100_1575     TRUE 0.976 11.000 0.800 NA   NA
 5745828 5745829 xccb100_1577 xccb100_1578   nlpC TRUE 0.961 110.000 1.000 NA Y NA
 5745830 5745831 xccb100_1579 xccb100_1580     TRUE 0.639 91.000 0.098 NA   NA
 5745831 5745832 xccb100_1580 xccb100_1581   dadA1 TRUE 0.963 4.000 0.231 NA   NA
 5745832 5745833 xccb100_1581 xccb100_1582 dadA1   TRUE 0.930 -3.000 0.013 1.000 N NA
 5745833 5745834 xccb100_1582 xccb100_1583     TRUE 0.679 8.000 0.000 1.000 N NA
 5745834 5745835 xccb100_1583 xccb100_1584     TRUE 0.578 42.000 0.046 1.000   NA
 5745836 5745837 xccb100_1585 xccb100_1586     TRUE 0.940 185.000 0.400 0.002 Y NA
 5745837 5745838 xccb100_1586 xccb100_1587     FALSE 0.530 253.000 0.000 0.002 Y NA
 5745838 5745839 xccb100_1587 xccb100_1588     FALSE 0.017 364.000 0.000 1.000 N NA
 5745839 5745840 xccb100_1588 xccb100_1589     FALSE 0.221 363.000 0.000 0.021 Y NA
 5745841 5745842 xccb100_1590 xccb100_1591     TRUE 0.681 96.000 0.112 1.000 N NA
 5745843 5745844 xccb100_1592 xccb100_1593     FALSE 0.012 370.000 0.000 NA   NA
 5745844 5745845 xccb100_1593 xccb100_1594     FALSE 0.546 26.000 0.017 NA   NA
 5745845 5745846 xccb100_1594 xccb100_1595     TRUE 0.937 -3.000 0.017 1.000 N NA
 5745846 5745847 xccb100_1595 xccb100_1596     FALSE 0.093 219.000 0.000 1.000   NA
 5745851 5745852 xccb100_1600 xccb100_1601     TRUE 0.617 -7.000 0.000 NA   NA
 5745854 5745855 xccb100_1603 xccb100_1604     FALSE 0.182 122.000 0.000 NA   NA
 5745857 5745858 xccb100_1606 xccb100_1607   psd FALSE 0.025 283.000 0.000 NA   NA
 5745858 5745859 xccb100_1607 xccb100_1608 psd   TRUE 0.962 -3.000 0.051 1.000   NA
 5745860 5745861 xccb100_1609 xccb100_1610     TRUE 0.569 -10.000 0.000 NA   NA
 5745861 5745862 xccb100_1610 xccb100_1611     TRUE 0.569 -10.000 0.000 NA   NA
 5745862 5745863 xccb100_1611 xccb100_1612     TRUE 0.813 -7.000 0.005 1.000 N NA
 5745863 5745864 xccb100_1612 xccb100_1613     TRUE 0.741 85.000 0.008 0.006 N NA
 5745864 5745865 xccb100_1613 xccb100_1614     FALSE 0.007 805.000 0.008 NA N NA
 5745865 5745866 xccb100_1614 xccb100_1615     TRUE 0.972 -3.000 0.143 NA   NA
 5745866 5745867 xccb100_1615 xccb100_1616     FALSE 0.310 40.000 0.003 NA   NA
 5745867 5745868 xccb100_1616 xccb100_1617     TRUE 0.974 -3.000 0.139 1.000 N NA
 5745870 5745871 xccb100_1619 xccb100_1620     TRUE 0.892 -3.000 0.005 NA   NA
 5745871 5745872 xccb100_1620 xccb100_1621     TRUE 0.902 -3.000 0.008 NA   NA
 5745872 5745873 xccb100_1621 xccb100_1622   accD FALSE 0.513 202.000 0.232 1.000 N NA
 5745873 5745874 xccb100_1622 xccb100_1623 accD glmM TRUE 0.919 -3.000 0.008 1.000 N NA
 5745874 5745875 xccb100_1623 xccb100_1624 glmM   FALSE 0.424 115.000 0.005 1.000   NA
 5745875 5745876 xccb100_1624 xccb100_1625     FALSE 0.418 49.000 0.023 NA   NA
 5745876 5745877 xccb100_1625 xccb100_1626     TRUE 0.972 -3.000 0.143 NA   NA
 5745877 5745878 xccb100_1626 xccb100_1627     TRUE 0.812 -54.000 0.070 NA   NA
 5745878 5745879 xccb100_1627 xccb100_1628     TRUE 0.991 -3.000 0.619 NA   NA
 5745880 5745881 xccb100_1629 xccb100_1630     TRUE 0.614 55.000 0.125 NA   NA
 5745882 5745883 xccb100_1631 xccb100_1632     TRUE 0.759 34.000 0.184 1.000 N NA
 5745883 5745884 xccb100_1632 xccb100_rna012     FALSE 0.157 50.000 0.000 NA   NA
 5745884 5745885 xccb100_rna012 xccb100_1633     FALSE 0.163 61.000 0.000 NA   NA
 5745885 5745886 xccb100_1633 xccb100_1634     TRUE 0.994 -30.000 0.507 0.002 Y NA
 5745886 5745887 xccb100_1634 xccb100_1635     TRUE 0.971 37.000 0.328 0.002 Y NA
 5745887 5745888 xccb100_1635 xccb100_1636     TRUE 0.998 -3.000 0.483 0.005 Y NA
 5745888 5745889 xccb100_1636 xccb100_1637     TRUE 0.998 -3.000 0.355 0.005 Y NA
 5745889 5745890 xccb100_1637 xccb100_1638     TRUE 0.996 4.000 0.343 0.005 Y NA
 5745890 5745891 xccb100_1638 xccb100_1639     TRUE 0.998 -3.000 0.395 0.005 Y NA
 5745891 5745892 xccb100_1639 xccb100_1640     TRUE 0.999 -3.000 0.515 0.005 Y NA
 5745892 5745893 xccb100_1640 xccb100_1641     TRUE 0.998 1.000 0.500 0.005 Y NA
 5745893 5745894 xccb100_1641 xccb100_1642     TRUE 0.996 8.000 0.442 0.005 Y NA
 5745894 5745895 xccb100_1642 xccb100_1643     TRUE 0.999 -3.000 0.484 0.002 Y NA
 5745895 5745896 xccb100_1643 xccb100_1644     TRUE 0.996 8.000 0.451 0.005 Y NA
 5745896 5745897 xccb100_1644 xccb100_1645     TRUE 0.977 21.000 0.175 0.002 Y NA
 5745897 5745898 xccb100_1645 xccb100_1646     TRUE 0.972 37.000 0.340 0.002 Y NA
 5745898 5745899 xccb100_1646 xccb100_rna013     FALSE 0.068 202.000 0.000 NA   NA
 5745899 5745900 xccb100_rna013 xccb100_1647     FALSE 0.072 199.000 0.000 NA   NA
 5745900 5745901 xccb100_1647 xccb100_1648     TRUE 0.985 5.000 0.759 NA   NA
 5745901 5745902 xccb100_1648 xccb100_1649     TRUE 0.784 54.000 0.342 1.000 N NA
 5745902 5745903 xccb100_1649 xccb100_1650     TRUE 0.946 110.000 0.530 1.000 Y NA
 5745903 5745904 xccb100_1650 xccb100_1651     TRUE 0.915 79.000 0.318 1.000 Y NA
 5745904 5745905 xccb100_1651 xccb100_1652     TRUE 0.852 158.000 0.211 1.000 Y NA
 5745905 5745906 xccb100_1652 xccb100_1653     TRUE 0.922 81.000 0.335 1.000 Y NA
 5745906 5745907 xccb100_1653 xccb100_1654     FALSE 0.193 110.000 0.000 NA   NA
 5745908 5745909 xccb100_1655 xccb100_1656     TRUE 0.892 -3.000 0.005 NA   NA
 5745909 5745910 xccb100_1656 xccb100_1657     TRUE 0.771 9.000 0.006 NA   NA
 5745911 5745912 xccb100_1658 xccb100_1659     TRUE 0.997 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 5745914 5745915 xccb100_1661 xccb100_1662     TRUE 0.935 -3.000 0.016 1.000 N NA
 5745915 5745916 xccb100_1662 xccb100_1663     TRUE 0.905 -3.000 0.013 NA N NA
 5745916 5745917 xccb100_1663 xccb100_1664     FALSE 0.002 762.000 0.000 NA N NA
 5745917 5745918 xccb100_1664 xccb100_1665     FALSE 0.425 106.000 0.014 NA   NA
 5745920 5745921 xccb100_1667 xccb100_1668 fimT pilV TRUE 0.972 10.000 0.139 NA Y NA
 5745921 5745922 xccb100_1668 xccb100_1669 pilV pilW TRUE 0.996 -3.000 0.667 NA Y NA
 5745922 5745923 xccb100_1669 xccb100_1670 pilW pilX TRUE 0.996 -3.000 0.615 NA Y NA
 5745923 5745924 xccb100_1670 xccb100_1671 pilX pilY TRUE 0.984 10.000 0.346 NA Y NA
 5745924 5745925 xccb100_1671 xccb100_1672 pilY   TRUE 0.993 0.000 0.346 NA Y NA
 5745925 5745926 xccb100_1672 xccb100_rna014     FALSE 0.159 58.000 0.000 NA   NA
 5745928 5745929 xccb100_1674 xccb100_rna015     FALSE 0.190 99.000 0.000 NA   NA
 5745929 5745930 xccb100_rna015 xccb100_1675     FALSE 0.009 400.000 0.000 NA   NA
 5745930 5745931 xccb100_1675 xccb100_1676   virD4 TRUE 0.890 34.000 0.667 NA   NA
 5745931 5745932 xccb100_1676 xccb100_1677 virD4   FALSE 0.014 350.000 0.000 NA   NA
 5745932 5745933 xccb100_1677 xccb100_1678   ptlE TRUE 0.805 130.000 0.400 NA   NA
 5745933 5745934 xccb100_1678 xccb100_1679 ptlE ptlF TRUE 0.995 -3.000 0.400 NA Y NA
 5745934 5745935 xccb100_1679 xccb100_1680 ptlF virB10 TRUE 0.997 -3.000 0.800 NA Y NA
 5745935 5745936 xccb100_1680 xccb100_1681 virB10 virB11 TRUE 0.997 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 5745936 5745937 xccb100_1681 xccb100_1682 virB11 virB1 TRUE 0.794 51.000 0.429 NA   NA
 5745937 5745938 xccb100_1682 xccb100_1683 virB1   TRUE 0.767 59.000 0.333 NA   NA
 5745938 5745939 xccb100_1683 xccb100_1684   ptlB TRUE 0.986 -7.000 1.000 NA   NA
 5745939 5745940 xccb100_1684 xccb100_1685 ptlB virB4 TRUE 0.879 100.000 0.192 NA Y NA
 5745940 5745941 xccb100_1685 xccb100_1686 virB4   TRUE 0.914 -7.000 0.077 NA   NA
 5745941 5745942 xccb100_1686 xccb100_1687   virB6_1 TRUE 0.849 101.000 0.500 NA   NA
 5745942 5745943 xccb100_1687 xccb100_1688 virB6_1   TRUE 0.982 3.000 0.500 NA   NA
 5745943 5745944 xccb100_1688 xccb100_1689     FALSE 0.161 139.000 0.000 NA   NA
 5745944 5745945 xccb100_1689 xccb100_1690     FALSE 0.161 48.000 0.000 NA   NA
 5745945 5745946 xccb100_1690 xccb100_1691     FALSE 0.292 104.000 0.000 1.000   NA
 5745946 5745947 xccb100_1691 xccb100_1692     TRUE 0.617 -7.000 0.000 NA   NA
 5745947 5745948 xccb100_1692 xccb100_1693   virB6_2 TRUE 0.849 101.000 0.500 NA   NA
 5745948 5745949 xccb100_1693 xccb100_1694 virB6_2   FALSE 0.309 20.000 0.000 NA   NA
 5745949 5745950 xccb100_1694 xccb100_1695     FALSE 0.062 212.000 0.000 NA   NA
 5745950 5745951 xccb100_1695 xccb100_1696     TRUE 0.722 106.000 0.182 NA   NA
 5745951 5745952 xccb100_1696 xccb100_1697   aglA1 FALSE 0.007 668.000 0.000 1.000   NA
 5745953 5745954 xccb100_1698 xccb100_1699     FALSE 0.029 324.000 0.000 1.000   NA
 5745955 5745956 xccb100_1700 xccb100_1701   suc TRUE 0.977 -3.000 0.200 NA   NA
 5745956 5745957 xccb100_1701 xccb100_1702 suc cgt TRUE 0.982 0.000 0.333 NA   NA
 5745959 5745960 xccb100_1704 xccb100_1705     TRUE 0.894 112.000 0.186 1.000 Y NA
 5745960 5745961 xccb100_1705 xccb100_1706   rpmI TRUE 0.788 241.000 0.652 1.000 Y NA
 5745961 5745962 xccb100_1706 xccb100_1707 rpmI   TRUE 0.997 11.000 0.928 0.011 Y NA
 5745962 5745963 xccb100_1707 xccb100_1708     FALSE 0.454 300.000 0.202 1.000 Y NA
 5745963 5745964 xccb100_1708 xccb100_1709     TRUE 0.980 130.000 0.574 0.001 Y NA
 5745964 5745965 xccb100_1709 xccb100_1710   ihfA TRUE 0.851 21.000 0.208 1.000 N NA
 5745965 5745966 xccb100_1710 xccb100_1711 ihfA   TRUE 0.964 -19.000 0.535 1.000 N NA
 5745966 5745967 xccb100_1711 xccb100_rna016     FALSE 0.163 61.000 0.000 NA   NA
 5745967 5745968 xccb100_rna016 xccb100_1712   gumB FALSE 0.020 308.000 0.000 NA   NA
 5745968 5745969 xccb100_1712 xccb100_1713 gumB gumC TRUE 0.993 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 5745969 5745970 xccb100_1713 xccb100_1714 gumC gumD FALSE 0.228 243.000 0.000 NA Y NA
 5745970 5745971 xccb100_1714 xccb100_1715 gumD gumE TRUE 0.716 83.000 0.188 NA   NA
 5745971 5745972 xccb100_1715 xccb100_1716 gumE gumF TRUE 0.969 -3.000 0.125 NA   NA
 5745972 5745973 xccb100_1716 xccb100_1717 gumF gumG TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.002 Y NA
 5745973 5745974 xccb100_1717 xccb100_1718 gumG gumH TRUE 0.648 68.000 0.111 1.000 N NA
 5745974 5745975 xccb100_1718 xccb100_1719 gumH gumI TRUE 0.988 -3.000 0.111 NA Y NA
 5745975 5745976 xccb100_1719 xccb100_1720 gumI gumJ TRUE 0.981 -3.000 0.273 NA   NA
 5745976 5745977 xccb100_1720 xccb100_1721 gumJ gumK FALSE 0.167 65.000 0.000 NA   NA
 5745977 5745978 xccb100_1721 xccb100_1722 gumK gumL FALSE 0.175 41.000 0.000 NA   NA
 5745978 5745979 xccb100_1722 xccb100_1723 gumL gumM TRUE 0.884 8.000 0.043 NA   NA
 5745979 5745980 xccb100_1723 xccb100_1724 gumM   TRUE 0.555 35.000 0.043 NA   NA
 5745980 5745981 xccb100_1724 xccb100_1725   gumN FALSE 0.521 57.000 0.059 NA   NA
 5745981 5745982 xccb100_1725 xccb100_1726 gumN gumO FALSE 0.496 60.000 0.044 NA   NA
 5745982 5745983 xccb100_1726 xccb100_1727 gumO gumP TRUE 0.956 0.000 0.050 1.000   NA
 5745983 5745984 xccb100_1727 xccb100_1728 gumP   TRUE 0.983 -3.000 0.233 1.000   NA
 5745984 5745985 xccb100_1728 xccb100_1729   ugcG TRUE 0.971 -9.000 0.077 1.000 Y NA
 5745985 5745986 xccb100_1729 xccb100_1730 ugcG   TRUE 0.601 8.000 0.000 NA   NA
 5745986 5745987 xccb100_1730 xccb100_1731     TRUE 0.919 -15.000 0.167 NA   NA
 5745988 5745989 xccb100_1732 xccb100_1733 dxs   TRUE 0.687 14.000 0.007 1.000 N NA
 5745989 5745990 xccb100_1733 xccb100_1734   fadE2 FALSE 0.004 873.000 0.000 1.000 N NA
 5745990 5745991 xccb100_1734 xccb100_1735 fadE2   TRUE 0.823 38.000 0.333 1.000   NA
 5745991 5745992 xccb100_1735 xccb100_1736     TRUE 0.856 77.000 0.500 1.000   NA
 5745993 5745994 xccb100_rna017 xccb100_1737     FALSE 0.007 476.000 0.000 NA   NA
 5745996 5745997 xccb100_1739 xccb100_1740     FALSE 0.021 303.000 0.000 NA   NA
 5746001 5746002 xccb100_PS023 xccb100_PS024     FALSE 0.402 -69.000 0.000 NA   NA
 5746002 5746003 xccb100_PS024 xccb100_1744     FALSE 0.039 244.000 0.000 NA   NA
 5746003 5746004 xccb100_1744 xccb100_1745     FALSE 0.166 136.000 0.000 NA   NA
 5746005 5746006 xccb100_1746 xccb100_1748     TRUE 0.594 152.000 0.150 NA N NA
 5746006 5746007 xccb100_1748 xccb100_1749     FALSE 0.077 266.000 0.004 1.000 N NA
 5746007 5746008 xccb100_1749 xccb100_1750     FALSE 0.345 126.000 0.002 1.000 N NA
 5746009 5746010 xccb100_1751 xccb100_4469     TRUE 0.986 0.000 0.062 1.000 Y NA
 5746010 5746011 xccb100_4469 xccb100_1752     TRUE 0.977 -3.000 0.143 1.000   NA
 5746011 5746012 xccb100_1752 xccb100_1753     TRUE 0.983 -28.000 0.600 0.044   NA
 5746012 5746013 xccb100_1753 xccb100_1754   dapA2 TRUE 0.976 -3.000 0.133 1.000   NA
 5746013 5746014 xccb100_1754 xccb100_1755 dapA2 aldH TRUE 0.583 185.000 0.044 0.054 N NA
 5746014 5746015 xccb100_1755 xccb100_1756 aldH   TRUE 0.965 -3.000 0.077 1.000 N NA
 5746015 5746016 xccb100_1756 xccb100_1757     FALSE 0.060 370.000 0.051 NA   NA
 5746016 5746017 xccb100_1757 xccb100_1758     TRUE 0.992 -3.000 0.750 NA   NA
 5746017 5746018 xccb100_1758 xccb100_1759     TRUE 0.561 65.000 0.071 NA   NA
 5746018 5746019 xccb100_1759 xccb100_1760     TRUE 0.968 -10.000 0.071 1.000 Y NA
 5746019 5746020 xccb100_1760 xccb100_1761     TRUE 0.988 0.000 0.500 1.000 N NA
 5746020 5746021 xccb100_1761 xccb100_1762     TRUE 0.805 147.000 0.500 NA   NA
 5746022 5746023 xccb100_1763 xccb100_1764     TRUE 0.700 3.000 0.000 NA   NA
 5746024 5746025 xccb100_1765 xccb100_1766     FALSE 0.009 580.000 0.000 1.000   NA
 5746025 5746026 xccb100_1766 xccb100_1767     FALSE 0.050 270.000 0.000 1.000   NA
 5746026 5746027 xccb100_1767 xccb100_1768     TRUE 0.990 -3.000 0.462 1.000   NA
 5746027 5746028 xccb100_1768 xccb100_1769     TRUE 0.963 -3.000 0.053 1.000   NA
 5746028 5746029 xccb100_1769 xccb100_1770   avrXccA2 FALSE 0.074 196.000 0.000 NA   NA
 5746029 5746030 xccb100_1770 xccb100_1771 avrXccA2   FALSE 0.008 424.000 0.000 NA   NA
 5746030 5746031 xccb100_1771 xccb100_1772     TRUE 0.699 152.000 0.200 1.000   NA
 5746032 5746033 xccb100_1773 xccb100_1774     FALSE 0.023 295.000 0.000 NA   NA
 5746033 5746034 xccb100_1774 xccb100_1775     FALSE 0.117 53.000 0.000 NA N NA
 5746034 5746035 xccb100_1775 xccb100_1776     FALSE 0.006 535.000 0.000 NA   NA
 5746037 5746038 xccb100_1778 xccb100_1779     FALSE 0.286 93.000 0.000 1.000   NA
 5746039 5746040 xccb100_1780 xccb100_1781     TRUE 0.987 -3.000 0.367 1.000 N NA
 5746040 5746041 xccb100_1781 xccb100_1782     FALSE 0.328 63.000 0.007 NA   NA
 5746041 5746042 xccb100_1782 xccb100_1783     FALSE 0.210 202.000 0.020 NA   NA
 5746042 5746043 xccb100_1783 xccb100_1784   ggt2 TRUE 0.960 -3.000 0.076 NA   NA
 5746043 5746044 xccb100_1784 xccb100_1785 ggt2   FALSE 0.043 284.000 0.000 1.000   NA
 5746046 5746047 xccb100_1787 xccb100_1788   phy TRUE 0.978 0.000 0.220 1.000 N NA
 5746047 5746048 xccb100_1788 xccb100_1789 phy   TRUE 0.890 6.000 0.020 1.000   NA
 5746048 5746049 xccb100_1789 xccb100_1790     FALSE 0.099 176.000 0.000 NA   NA
 5746051 5746052 xccb100_1792 xccb100_1793     FALSE 0.052 305.000 0.004 1.000 N NA
 5746052 5746053 xccb100_1793 xccb100_1794     TRUE 0.973 79.000 0.360 0.001 Y NA
 5746053 5746054 xccb100_1794 xccb100_1795     TRUE 0.759 133.000 0.325 NA N NA
 5746054 5746055 xccb100_1795 xccb100_1796     FALSE 0.294 308.000 0.083 NA Y NA
 5746055 5746056 xccb100_1796 xccb100_1797     TRUE 0.949 109.000 0.084 0.001 Y NA
 5746057 5746058 xccb100_1798 xccb100_1799   rpfN FALSE 0.018 388.000 0.000 1.000   NA
 5746058 5746059 xccb100_1799 xccb100_1800 rpfN fruA TRUE 0.596 172.000 0.025 0.048 N NA
 5746059 5746060 xccb100_1800 xccb100_1801 fruA fruK TRUE 0.925 154.000 0.562 1.000 Y NA
 5746060 5746061 xccb100_1801 xccb100_1802 fruK fruB TRUE 0.993 -3.000 0.195 1.000 Y NA
 5746063 5746064 xccb100_1804 xccb100_1805   acrA2 TRUE 0.975 13.000 1.000 1.000 N NA
 5746064 5746065 xccb100_1805 xccb100_1806 acrA2   TRUE 0.952 15.000 0.571 1.000 N NA
 5746069 5746070 xccb100_1810 xccb100_1811     FALSE 0.023 330.000 0.000 1.000 N NA
 5746070 5746071 xccb100_1811 xccb100_1812     TRUE 0.945 34.000 0.133 0.022 Y NA
 5746071 5746072 xccb100_1812 xccb100_1813     FALSE 0.320 156.000 0.013 NA   NA
 5746072 5746073 xccb100_1813 xccb100_1814     FALSE 0.023 440.000 0.013 NA   NA
 5746073 5746074 xccb100_1814 xccb100_1815     TRUE 0.895 11.000 0.064 1.000   NA
 5746075 5746076 xccb100_1816 xccb100_1817     TRUE 0.821 7.000 0.011 NA   NA
 5746076 5746077 xccb100_1817 xccb100_1818     TRUE 0.997 -3.000 0.086 0.001 Y NA
 5746077 5746078 xccb100_1818 xccb100_1820     FALSE 0.006 662.000 0.000 1.000 N NA
 5746079 5746080 xccb100_1821 xccb100_1822     TRUE 0.782 86.000 0.267 1.000 N NA
 5746080 5746081 xccb100_1822 xccb100_1823     TRUE 0.813 75.000 0.375 1.000 N NA
 5746081 5746082 xccb100_1823 xccb100_1824   glnA2 TRUE 0.997 0.000 0.750 1.000 Y NA
 5746083 5746084 xccb100_1825 xccb100_1826   glnA3 TRUE 0.941 7.000 0.111 1.000   NA
 5746084 5746085 xccb100_1826 xccb100_1827 glnA3   FALSE 0.032 263.000 0.000 NA   NA
 5746085 5746086 xccb100_1827 xccb100_1828     FALSE 0.182 81.000 0.000 NA   NA
 5746086 5746087 xccb100_1828 xccb100_1829     FALSE 0.080 217.000 0.000 1.000 N NA
 5746087 5746088 xccb100_1829 xccb100_1830     FALSE 0.167 161.000 0.000 1.000 N NA
 5746088 5746089 xccb100_1830 xccb100_1831     TRUE 0.994 -3.000 0.880 1.000   NA
 5746089 5746090 xccb100_1831 xccb100_1832     TRUE 0.930 20.000 0.520 1.000   NA
 5746090 5746091 xccb100_1832 xccb100_1833     TRUE 0.684 82.000 0.125 1.000 N NA
 5746091 5746092 xccb100_1833 xccb100_1834     TRUE 0.995 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 5746092 5746093 xccb100_1834 xccb100_1835     TRUE 0.995 -3.000 0.094 0.036 Y NA
 5746095 5746096 xccb100_PS025 xccb100_PS026     FALSE 0.464 -25.000 0.000 NA   NA
 5746097 5746098 xccb100_1837 xccb100_1838     TRUE 0.965 -3.000 0.095 NA   NA
 5746098 5746099 xccb100_1838 xccb100_1839   corC TRUE 0.939 -3.000 0.029 NA   NA
 5746099 5746100 xccb100_1839 xccb100_1840 corC   FALSE 0.060 330.000 0.024 NA   NA
 5746100 5746101 xccb100_1840 xccb100_1841     TRUE 0.878 0.000 0.005 NA   NA
 5746101 5746102 xccb100_1841 xccb100_1842     FALSE 0.270 56.000 0.002 NA   NA
 5746102 5746103 xccb100_1842 xccb100_1843     FALSE 0.033 261.000 0.000 NA   NA
 5746103 5746104 xccb100_1843 xccb100_1844     FALSE 0.055 666.000 0.220 1.000 N NA
 5746104 5746105 xccb100_1844 xccb100_1845   gst2 FALSE 0.340 67.000 0.003 1.000 N NA
 5746106 5746107 xccb100_1846 xccb100_1847     TRUE 0.989 -3.000 0.500 NA   NA
 5746107 5746108 xccb100_1847 xccb100_1848     FALSE 0.052 364.000 0.033 NA   NA
 5746108 5746109 xccb100_1848 xccb100_1849     TRUE 0.997 0.000 0.233 0.001 Y NA
 5746109 5746110 xccb100_1849 xccb100_1850     TRUE 0.997 8.000 0.630 0.001 Y NA
 5746110 5746111 xccb100_1850 xccb100_1851     TRUE 0.696 166.000 0.370 NA N NA
 5746111 5746112 xccb100_1851 xccb100_1852     TRUE 0.892 79.000 0.831 NA   NA
 5746112 5746113 xccb100_1852 xccb100_1853     FALSE 0.425 32.000 0.009 NA   NA
 5746117 5746118 xccb100_1857 xccb100_1858     TRUE 0.995 10.000 0.500 0.013 Y NA
 5746120 5746121 xccb100_1860 xccb100_1861     FALSE 0.003 818.000 0.000 NA   NA
 5746122 5746123 xccb100_1862 xccb100_1863     FALSE 0.506 16.000 0.000 1.000   NA
 5746123 5746124 xccb100_1863 xccb100_1864     FALSE 0.389 25.000 0.000 1.000   NA
 5746125 5746126 xccb100_1865 xccb100_1866     FALSE 0.259 26.000 0.000 NA   NA
 5746126 5746127 xccb100_1866 xccb100_1867     FALSE 0.175 41.000 0.000 NA   NA
 5746128 5746129 xccb100_1868 xccb100_rna018     FALSE 0.099 176.000 0.000 NA   NA
 5746129 5746130 xccb100_rna018 xccb100_1869     FALSE 0.189 90.000 0.000 NA   NA
 5746131 5746132 xccb100_1870 xccb100_1871   lig2 TRUE 0.949 12.000 0.400 NA   NA
 5746134 5746135 xccb100_1873 xccb100_1874     FALSE 0.193 107.000 0.000 NA   NA
 5746136 5746137 xccb100_1875 xccb100_1876     FALSE 0.371 118.000 0.004 1.000 N NA
 5746138 5746139 xccb100_1877 xccb100_1878     TRUE 0.968 -3.000 0.118 NA   NA
 5746139 5746140 xccb100_1878 xccb100_1879     FALSE 0.388 71.000 0.014 NA   NA
 5746140 5746141 xccb100_1879 xccb100_1880     FALSE 0.393 152.000 0.016 1.000 N NA
 5746141 5746142 xccb100_1880 xccb100_1881     TRUE 0.888 0.000 0.007 NA   NA
 5746142 5746143 xccb100_1881 xccb100_1882     TRUE 0.989 0.000 0.625 NA   NA
 5746144 5746145 xccb100_1883 xccb100_1884     FALSE 0.500 94.000 0.031 NA   NA
 5746145 5746146 xccb100_1884 xccb100_1885     TRUE 0.727 90.000 0.014 0.030 N NA
 5746148 5746149 xccb100_1887 xccb100_1888     FALSE 0.436 86.000 0.007 1.000   NA
 5746149 5746150 xccb100_1888 xccb100_1889     TRUE 0.934 -3.000 0.011 1.000   NA
 5746150 5746151 xccb100_1889 xccb100_1890     FALSE 0.343 59.000 0.010 NA   NA
 5746152 5746153 xccb100_1891 xccb100_1892 cspB gst3 FALSE 0.309 201.000 0.046 1.000 N NA
 5746155 5746156 xccb100_1894 xccb100_1895   apt FALSE 0.326 85.000 0.004 NA   NA
 5746159 5746160 xccb100_1898 xccb100_1899     TRUE 0.986 -3.000 0.400 NA   NA
 5746163 5746164 xccb100_1902 xccb100_1903     FALSE 0.292 61.000 0.007 NA N NA
 5746164 5746165 xccb100_1903 xccb100_1904     TRUE 0.975 -3.000 0.200 NA N NA
 5746167 5746168 xccb100_1906 xccb100_1907     TRUE 0.770 6.000 0.002 NA   NA
 5746168 5746169 xccb100_1907 xccb100_1908     TRUE 0.857 6.000 0.018 NA   NA
 5746169 5746170 xccb100_1908 xccb100_1909     TRUE 0.733 29.000 0.104 1.000 N NA
 5746170 5746171 xccb100_1909 xccb100_1910     TRUE 0.949 11.000 0.259 1.000   NA
 5746171 5746172 xccb100_1910 xccb100_1911     FALSE 0.541 29.000 0.022 NA   NA
 5746173 5746174 xccb100_1912 xccb100_1913 pglA2 pme2 FALSE 0.005 742.000 0.000 1.000 N NA
 5746175 5746176 xccb100_1914 xccb100_1915     FALSE 0.052 267.000 0.000 1.000   NA
 5746176 5746177 xccb100_1915 xccb100_1916     FALSE 0.528 94.000 0.040 NA   NA
 5746178 5746179 xccb100_1917 xccb100_1918     TRUE 0.999 -3.000 0.859 0.001 Y NA
 5746179 5746180 xccb100_1918 xccb100_1919     TRUE 0.996 -3.000 0.407 1.000 Y NA
 5746180 5746181 xccb100_1919 xccb100_1920     FALSE 0.004 826.000 0.000 1.000 N NA
 5746181 5746182 xccb100_1920 xccb100_1921     TRUE 0.817 0.000 0.000 1.000 N NA
 5746182 5746183 xccb100_1921 xccb100_1922     TRUE 0.909 -3.000 0.010 NA   NA
 5746184 5746185 xccb100_1923 xccb100_1924     FALSE 0.246 58.000 0.000 1.000   NA
 5746185 5746186 xccb100_1924 xccb100_1925     FALSE 0.420 14.000 0.000 NA   NA
 5746187 5746188 xccb100_1926 xccb100_1927     TRUE 0.943 -3.000 0.034 NA   NA
 5746188 5746189 xccb100_1927 xccb100_1928     TRUE 0.895 -3.000 0.006 NA   NA
 5746190 5746191 xccb100_1929 xccb100_1930     FALSE 0.019 310.000 0.000 NA   NA
 5746191 5746192 xccb100_1930 xccb100_1931     TRUE 0.838 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5746192 5746193 xccb100_1931 xccb100_1932     FALSE 0.288 31.000 0.000 1.000 N NA
 5746193 5746194 xccb100_1932 xccb100_1933     FALSE 0.330 243.000 0.004 1.000 Y NA
 5746194 5746195 xccb100_1933 xccb100_1934     TRUE 0.712 49.000 0.009 1.000 Y NA
 5746195 5746196 xccb100_1934 xccb100_1935     TRUE 0.832 6.000 0.006 1.000 N NA
 5746196 5746197 xccb100_1935 xccb100_1936     TRUE 0.920 -3.000 0.008 1.000 N NA
 5746197 5746198 xccb100_1936 xccb100_1937     TRUE 0.767 76.000 0.020 1.000 Y NA
 5746198 5746199 xccb100_1937 xccb100_1938     TRUE 0.901 -3.000 0.002 1.000 N NA
 5746199 5746200 xccb100_1938 xccb100_1939     TRUE 0.936 0.000 0.036 NA   NA
 5746200 5746201 xccb100_1939 xccb100_1940     TRUE 0.582 59.000 0.091 NA   NA
 5746201 5746202 xccb100_1940 xccb100_1941     TRUE 0.863 160.000 0.007 0.001 Y NA
 5746204 5746205 xccb100_1943 xccb100_1944     FALSE 0.168 66.000 0.000 NA   NA
 5746206 5746207 xccb100_1945 xccb100_rna019     FALSE 0.187 86.000 0.000 NA   NA
 5746207 5746208 xccb100_rna019 xccb100_1946     FALSE 0.165 63.000 0.000 NA   NA
 5746208 5746209 xccb100_1946 xccb100_1947   cydB2 TRUE 0.750 79.000 0.256 NA   NA
 5746209 5746210 xccb100_1947 xccb100_1948 cydB2 cydA2 TRUE 0.993 16.000 0.953 0.043 Y NA
 5746211 5746212 xccb100_1949 xccb100_1950 msbA2 msbA3 TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.003 Y NA
 5746213 5746214 xccb100_1951 xccb100_1952     TRUE 0.611 22.000 0.011 1.000   NA
 5746214 5746215 xccb100_1952 xccb100_1953     FALSE 0.076 341.000 0.039 1.000 N NA
 5746215 5746216 xccb100_1953 xccb100_1954     TRUE 0.995 -6.000 1.000 NA Y NA
 5746216 5746217 xccb100_1954 xccb100_1955     TRUE 0.978 21.000 1.000 NA Y NA
 5746217 5746218 xccb100_1955 xccb100_1956     TRUE 0.998 -7.000 1.000 0.003 Y NA
 5746218 5746219 xccb100_1956 xccb100_1957     TRUE 0.904 124.000 0.016 0.003 Y NA
 5746219 5746220 xccb100_1957 xccb100_1958     TRUE 0.941 -3.000 0.016 1.000   NA
 5746220 5746221 xccb100_1958 xccb100_1959     TRUE 0.941 -3.000 0.015 1.000   NA
 5746221 5746222 xccb100_1959 xccb100_1960     TRUE 0.934 77.000 0.051 0.001 Y NA
 5746222 5746223 xccb100_1960 xccb100_1961     TRUE 0.996 -3.000 0.074 0.003 Y NA
 5746224 5746225 xccb100_1962 xccb100_1963 aspC2   TRUE 0.618 148.000 0.099 1.000   NA
 5746228 5746229 xccb100_1966 xccb100_1967     TRUE 0.947 -7.000 0.210 NA N NA
 5746229 5746230 xccb100_1967 xccb100_1968     TRUE 0.823 -61.000 0.083 NA   NA
 5746231 5746232 xccb100_1969 xccb100_1970     TRUE 0.966 -3.000 0.103 NA   NA
 5746232 5746233 xccb100_1970 xccb100_1971     FALSE 0.005 472.000 0.000 NA N NA
 5746233 5746234 xccb100_1971 xccb100_1972     TRUE 0.902 107.000 0.750 1.000 N NA
 5746234 5746235 xccb100_1972 xccb100_1973     TRUE 0.734 68.000 0.250 NA   NA
 5746235 5746236 xccb100_1973 xccb100_1974   malE TRUE 0.952 4.000 0.156 NA   NA
 5746236 5746237 xccb100_1974 xccb100_1975 malE malF TRUE 0.998 -3.000 0.660 0.035 Y NA
 5746237 5746238 xccb100_1975 xccb100_1976 malF malG TRUE 0.996 -3.000 0.160 0.035 Y NA
 5746238 5746239 xccb100_1976 xccb100_1977 malG   TRUE 0.990 -3.000 0.500 1.000   NA
 5746239 5746240 xccb100_1977 xccb100_1978     TRUE 0.942 -3.000 0.034 NA   NA
 5746241 5746242 xccb100_1979 xccb100_1980     TRUE 0.862 -7.000 0.024 NA   NA
 5746242 5746243 xccb100_1980 xccb100_1981     TRUE 0.875 7.000 0.016 1.000   NA
 5746243 5746244 xccb100_1981 xccb100_1982     TRUE 0.801 79.000 0.364 NA   NA
 5746244 5746245 xccb100_1982 xccb100_1983     FALSE 0.417 192.000 0.123 NA   NA
 5746245 5746246 xccb100_1983 xccb100_1984   rpmJ FALSE 0.182 203.000 0.014 NA   NA
 5746247 5746248 xccb100_1985 xccb100_1986     TRUE 0.607 185.000 0.281 1.000 N NA
 5746248 5746249 xccb100_1986 xccb100_1987     TRUE 0.798 92.000 0.292 1.000 N NA
 5746249 5746250 xccb100_1987 xccb100_1988     TRUE 0.705 64.000 0.208 NA   NA
 5746250 5746251 xccb100_1988 xccb100_1989     TRUE 0.978 7.000 0.576 NA   NA
 5746251 5746252 xccb100_1989 xccb100_1990     TRUE 0.945 0.000 0.038 1.000 N NA
 5746252 5746253 xccb100_1990 xccb100_1991     TRUE 0.935 14.000 0.048 1.000 Y NA
 5746253 5746254 xccb100_1991 xccb100_1992   galU TRUE 0.994 0.000 0.350 1.000 Y NA
 5746254 5746255 xccb100_1992 xccb100_1993 galU kefB1 FALSE 0.442 175.000 0.067 1.000 N NA
 5746257 5746258 xccb100_1995 xccb100_1996     FALSE 0.423 104.000 0.004 1.000   NA
 5746258 5746259 xccb100_1996 xccb100_1997     TRUE 0.630 6.000 0.000 NA   NA
 5746259 5746260 xccb100_1997 xccb100_1998   guaA1 FALSE 0.508 -16.000 0.000 NA   NA
 5746261 5746262 xccb100_1999 xccb100_2000     TRUE 0.862 45.000 0.667 NA   NA
 5746262 5746263 xccb100_2000 xccb100_2001     FALSE 0.019 372.000 0.000 1.000   NA
 5746263 5746264 xccb100_2001 xccb100_2002     TRUE 0.996 -7.000 0.600 0.028 Y NA
 5746265 5746266 xccb100_2003 xccb100_2004     TRUE 0.971 -3.000 0.107 1.000 N NA
 5746266 5746267 xccb100_2004 xccb100_2005     TRUE 0.959 -3.000 0.071 NA   NA
 5746267 5746268 xccb100_2005 xccb100_2006     FALSE 0.507 114.000 0.033 NA   NA
 5746268 5746269 xccb100_2006 xccb100_2007     TRUE 0.573 137.000 0.082 NA   NA
 5746269 5746270 xccb100_2007 xccb100_2008     FALSE 0.010 390.000 0.000 NA   NA
 5746271 5746272 xccb100_2009 xccb100_2010     FALSE 0.030 319.000 0.000 1.000   NA
 5746273 5746274 xccb100_2011 xccb100_2012     TRUE 0.936 -3.000 0.016 1.000 N NA
 5746274 5746275 xccb100_2012 xccb100_2013     FALSE 0.406 72.000 0.011 1.000 N NA
 5746276 5746277 xccb100_2014 xccb100_2015 mscS2 ppsA TRUE 0.908 0.000 0.018 NA N NA
 5746278 5746279 xccb100_2016 xccb100_2017     FALSE 0.257 206.000 0.043 NA   NA
 5746279 5746280 xccb100_2017 xccb100_2018     FALSE 0.479 59.000 0.040 NA   NA
 5746282 5746283 xccb100_2020 xccb100_2021 pssA1   FALSE 0.419 60.000 0.022 NA   NA
 5746283 5746284 xccb100_2021 xccb100_2022     TRUE 0.978 -3.000 0.210 NA   NA
 5746284 5746285 xccb100_2022 xccb100_2023     FALSE 0.479 103.000 0.032 NA N NA
 5746285 5746286 xccb100_2023 xccb100_2024     TRUE 0.803 -30.000 0.043 NA   NA
 5746288 5746289 xccb100_2026 xccb100_2027     FALSE 0.395 105.000 0.010 NA   NA
 5746290 5746291 xccb100_2028 xccb100_2029     TRUE 0.820 66.000 0.000 0.022 Y NA
 5746292 5746293 xccb100_rna020 xccb100_2030     FALSE 0.026 280.000 0.000 NA   NA
 5746294 5746295 xccb100_rna021 xccb100_rna022     FALSE 0.156 54.000 0.000 NA   NA
 5746297 5746298 xccb100_rna023 xccb100_rna024     FALSE 0.161 48.000 0.000 NA   NA
 5746298 5746299 xccb100_rna024 xccb100_2032     FALSE 0.188 87.000 0.000 NA   NA
 5746299 5746300 xccb100_2032 xccb100_2033     TRUE 0.979 66.000 0.688 0.006 Y NA
 5746301 5746302 xccb100_2034 xccb100_2035   mdtB TRUE 0.992 -3.000 0.778 NA N NA
 5746302 5746303 xccb100_2035 xccb100_2036 mdtB mdtC TRUE 0.995 -3.000 0.481 NA Y NA
 5746304 5746305 xccb100_2037 xccb100_2038   eda FALSE 0.085 187.000 0.000 NA   NA
 5746305 5746306 xccb100_2038 xccb100_2039 eda edd TRUE 0.931 53.000 0.523 1.000 Y NA
 5746306 5746307 xccb100_2039 xccb100_2040 edd pgl TRUE 0.868 146.000 0.202 1.000 Y NA
 5746307 5746308 xccb100_2040 xccb100_2041 pgl glk1 TRUE 0.983 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 5746308 5746309 xccb100_2041 xccb100_2042 glk1 zwf1 TRUE 0.987 -3.000 0.055 1.000 Y NA
 5746312 5746313 xccb100_2045 xccb100_2046   sdhC FALSE 0.381 57.000 0.016 NA   NA
 5746313 5746314 xccb100_2046 xccb100_2047 sdhC sdhD TRUE 0.998 -3.000 0.291 0.001 Y NA
 5746314 5746315 xccb100_2047 xccb100_2048 sdhD sdhA TRUE 0.988 31.000 0.705 0.001 Y NA
 5746315 5746316 xccb100_2048 xccb100_2049 sdhA   TRUE 0.857 1.000 0.004 NA   NA
 5746316 5746317 xccb100_2049 xccb100_2050   sdhB FALSE 0.539 17.000 0.004 NA   NA
 5746317 5746318 xccb100_2050 xccb100_2051 sdhB   TRUE 0.693 98.000 0.151 NA   NA
 5746318 5746319 xccb100_2051 xccb100_2052     FALSE 0.478 32.000 0.016 NA   NA
 5746319 5746320 xccb100_2052 xccb100_2053     TRUE 0.704 15.000 0.020 NA   NA
 5746320 5746321 xccb100_2053 xccb100_2054     TRUE 0.925 50.000 0.620 0.046 N NA
 5746323 5746324 xccb100_2056 xccb100_2057     FALSE 0.320 19.000 0.000 NA   NA
 5746324 5746325 xccb100_2057 xccb100_2058   exbB2 TRUE 0.669 29.000 0.045 1.000   NA
 5746325 5746326 xccb100_2058 xccb100_2059 exbB2 exbD4 TRUE 0.998 4.000 0.746 0.046 Y NA
 5746326 5746327 xccb100_2059 xccb100_2060 exbD4 msbA1 TRUE 0.972 -3.000 0.120 1.000 N NA
 5746327 5746328 xccb100_2060 xccb100_2061 msbA1 lpxK TRUE 0.980 -3.000 0.205 1.000 N NA
 5746328 5746329 xccb100_2061 xccb100_2062 lpxK kdsB TRUE 0.807 45.000 0.054 1.000 Y NA
 5746329 5746330 xccb100_2062 xccb100_2063 kdsB ptpA TRUE 0.958 -3.000 0.050 1.000 N NA
 5746330 5746331 xccb100_2063 xccb100_2064 ptpA   TRUE 0.898 -3.000 0.006 NA   NA
 5746331 5746332 xccb100_2064 xccb100_2065     TRUE 0.888 -3.000 0.004 NA   NA
 5746332 5746333 xccb100_2065 xccb100_2066     TRUE 0.978 0.000 0.227 1.000 N NA
 5746333 5746334 xccb100_2066 xccb100_rna025     FALSE 0.189 37.000 0.000 NA   NA
 5746334 5746335 xccb100_rna025 xccb100_rna026     FALSE 0.169 70.000 0.000 NA   NA
 5746335 5746336 xccb100_rna026 xccb100_rna027     FALSE 0.182 81.000 0.000 NA   NA
 5746336 5746337 xccb100_rna027 xccb100_2067     FALSE 0.053 223.000 0.000 NA   NA
 5746339 5746340 xccb100_2069 xccb100_2070   orfT FALSE 0.251 27.000 0.000 NA   NA
 5746340 5746341 xccb100_2070 xccb100_2071 orfT avrXccC FALSE 0.163 138.000 0.000 NA   NA
 5746345 5746346 xccb100_2075 xccb100_2076     TRUE 0.585 81.000 0.000 0.064   NA
 5746346 5746347 xccb100_2076 xccb100_2077     FALSE 0.261 223.000 0.000 0.064   NA
 5746347 5746348 xccb100_2077 xccb100_2078     TRUE 0.920 75.000 0.500 0.064   NA
 5746351 5746352 xccb100_2081 xccb100_2082     FALSE 0.098 199.000 0.000 1.000 N NA
 5746352 5746353 xccb100_2082 xccb100_2083     TRUE 0.629 33.000 0.000 0.064   NA
 5746353 5746354 xccb100_2083 xccb100_2084     FALSE 0.248 48.000 0.000 1.000   NA
 5746354 5746355 xccb100_2084 xccb100_2085     FALSE 0.125 161.000 0.000 NA   NA
 5746356 5746357 xccb100_2086 xccb100_2087   thrA FALSE 0.005 723.000 0.000 1.000 N NA
 5746357 5746358 xccb100_2087 xccb100_2088 thrA   TRUE 0.980 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 5746360 5746361 xccb100_2090 xccb100_2091     FALSE 0.326 100.000 0.003 NA   NA
 5746363 5746364 xccb100_2093 xccb100_2094     FALSE 0.260 133.000 0.000 1.000   NA
 5746364 5746365 xccb100_2094 xccb100_2095     TRUE 0.845 10.000 0.013 1.000   NA
 5746365 5746366 xccb100_2095 xccb100_2096     TRUE 0.997 -3.000 0.171 0.002 Y NA
 5746366 5746367 xccb100_2096 xccb100_2097   hisC1 TRUE 0.998 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 5746367 5746368 xccb100_2097 xccb100_2098 hisC1   TRUE 0.998 -3.000 0.341 0.002 Y NA
 5746368 5746369 xccb100_2098 xccb100_2099     TRUE 0.997 -3.000 0.128 0.002 Y NA
 5746369 5746370 xccb100_2099 xccb100_2100     TRUE 0.997 -3.000 0.210 0.002 Y NA
 5746370 5746371 xccb100_2100 xccb100_2101     TRUE 0.997 -6.000 0.433 0.002 Y NA
 5746371 5746372 xccb100_2101 xccb100_2102     TRUE 0.996 -10.000 0.430 0.002 Y NA
 5746372 5746373 xccb100_2102 xccb100_2103     FALSE 0.028 349.000 0.003 NA   NA
 5746374 5746375 xccb100_2104 xccb100_2105     FALSE 0.218 203.000 0.012 1.000   NA
 5746375 5746376 xccb100_2105 xccb100_2106     TRUE 0.973 3.000 0.231 1.000   NA
 5746376 5746377 xccb100_2106 xccb100_2107     TRUE 0.750 34.000 0.148 1.000   NA
 5746377 5746378 xccb100_2107 xccb100_2108     FALSE 0.021 696.000 0.041 1.000 N NA
 5746378 5746379 xccb100_2108 xccb100_2109     TRUE 0.983 74.000 0.833 0.003 Y NA
 5746380 5746381 xccb100_2110 xccb100_2111     FALSE 0.193 107.000 0.000 NA   NA
 5746383 5746384 xccb100_2113 xccb100_2114     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5746384 5746385 xccb100_2114 xccb100_2115     TRUE 0.666 35.000 0.111 NA   NA
 5746385 5746386 xccb100_2115 xccb100_2116     TRUE 0.787 -3.000 0.000 NA   NA
 5746387 5746388 xccb100_2117 xccb100_2118     TRUE 0.933 2.000 0.051 NA   NA
 5746388 5746389 xccb100_2118 xccb100_2119   fadB1 TRUE 0.650 101.000 0.085 1.000 N NA
 5746389 5746390 xccb100_2119 xccb100_2120 fadB1   TRUE 0.841 104.000 0.125 0.052 N NA
 5746390 5746391 xccb100_2120 xccb100_2121     TRUE 0.772 77.000 0.054 0.052 N NA
 5746392 5746393 xccb100_2122 xccb100_2123 feoA feoB TRUE 0.996 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5746393 5746394 xccb100_2123 xccb100_2124 feoB   TRUE 0.914 2.000 0.028 NA   NA
 5746394 5746395 xccb100_2124 xccb100_2125     TRUE 0.798 64.000 0.400 NA   NA
 5746395 5746396 xccb100_2125 xccb100_2126     FALSE 0.430 43.000 0.021 NA   NA
 5746396 5746397 xccb100_2126 xccb100_2127     TRUE 0.985 -3.000 0.031 0.012   NA
 5746397 5746398 xccb100_2127 xccb100_2128     FALSE 0.265 75.000 0.000 1.000   NA
 5746398 5746399 xccb100_2128 xccb100_2129     TRUE 0.800 81.000 0.034 1.000 Y NA
 5746399 5746400 xccb100_2129 xccb100_2130     TRUE 0.761 0.000 0.000 NA   NA
 5746400 5746401 xccb100_2130 xccb100_2131     FALSE 0.159 58.000 0.000 NA   NA
 5746401 5746402 xccb100_2131 xccb100_2132   greA TRUE 0.982 -3.000 0.241 1.000 N NA
 5746402 5746403 xccb100_2132 xccb100_2133 greA rpfE TRUE 0.851 4.000 0.011 NA   NA
 5746403 5746404 xccb100_2133 xccb100_2134 rpfE   TRUE 0.910 -3.000 0.010 NA   NA
 5746405 5746406 xccb100_2135 xccb100_2136 rpfI   FALSE 0.189 90.000 0.000 NA   NA
 5746406 5746407 xccb100_2136 xccb100_2137     TRUE 0.712 85.000 0.000 0.002   NA
 5746407 5746408 xccb100_2137 xccb100_2138     FALSE 0.269 25.000 0.000 NA   NA
 5746409 5746410 xccb100_2139 xccb100_2140     FALSE 0.035 258.000 0.000 NA   NA
 5746410 5746411 xccb100_2140 xccb100_2141     TRUE 0.823 212.000 0.162 0.030 Y NA
 5746411 5746412 xccb100_2141 xccb100_2142   rpfG FALSE 0.349 139.000 0.005 1.000 N NA
 5746412 5746413 xccb100_2142 xccb100_2143 rpfG rpfH TRUE 0.959 2.000 0.133 NA   NA
 5746413 5746414 xccb100_2143 xccb100_2144 rpfH rpfC TRUE 0.921 8.000 0.100 NA   NA
 5746415 5746416 xccb100_2145 xccb100_2146 rpfF   TRUE 0.858 177.000 0.108 0.052 Y NA
 5746419 5746420 xccb100_2149 xccb100_2150     TRUE 0.975 -3.000 0.177 NA   NA
 5746420 5746421 xccb100_2150 xccb100_2151   acnB FALSE 0.413 53.000 0.023 NA   NA
 5746421 5746422 xccb100_2151 xccb100_2152 acnB   FALSE 0.210 196.000 0.007 1.000   NA
 5746423 5746424 xccb100_2153 xccb100_2154