MicrobesOnline Operon Predictions for Klebsiella pneumoniae 342

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5731630 5731631 KPK_0001 KPK_0002 dnaA dnaN TRUE 0.988 5.000 0.328 1.000 Y NA
 5731631 5731632 KPK_0002 KPK_0003 dnaN recF TRUE 0.730 147.000 0.318 1.000 Y NA
 5731632 5731633 KPK_0003 KPK_0004 recF gyrB TRUE 0.970 29.000 0.249 0.003 Y NA
 5731633 5731634 KPK_0004 KPK_0005 gyrB yidA FALSE 0.039 201.000 0.004 0.099   NA
 5731634 5731635 KPK_0005 KPK_0006 yidA   FALSE 0.005 210.000 0.000 NA   NA
 5731635 5731636 KPK_0006 KPK_0007     TRUE 0.843 -3.000 0.091 NA   NA
 5731636 5731637 KPK_0007 KPK_0008     FALSE 0.054 78.000 0.000 NA   NA
 5731639 5731640 KPK_0010 KPK_0011 ibpA ibpB TRUE 0.701 117.000 0.099 NA Y NA
 5731640 5731641 KPK_0011 KPK_0013 ibpB   FALSE 0.122 146.000 0.069 NA   NA
 5731643 5731644 KPK_0014 KPK_0015 aglA aglB_1 TRUE 0.988 -3.000 0.309 1.000 Y NA
 5731644 5731645 KPK_0015 KPK_0016 aglB_1   FALSE 0.048 101.000 0.000 NA   NA
 5731645 5731646 KPK_0016 KPK_0017     FALSE 0.282 -10.000 0.000 NA   NA
 5731646 5731647 KPK_0017 KPK_0018     TRUE 0.963 -3.000 0.429 NA   NA
 5731648 5731649 KPK_0019 KPK_0020 dsdA dsdX TRUE 0.960 15.000 0.083 1.000 Y NA
 5731651 5731652 KPK_0022 KPK_0023 emrD   FALSE 0.053 176.000 0.054 NA   NA
 5731652 5731653 KPK_0023 KPK_0024     FALSE 0.251 70.000 0.054 NA   NA
 5731654 5731655 KPK_0025 KPK_0026 ivbL ilvB FALSE 0.476 105.000 0.216 NA   NA
 5731655 5731656 KPK_0026 KPK_0027 ilvB ilvN TRUE 0.987 4.000 0.649 0.002   NA
 5731656 5731657 KPK_0027 KPK_0028 ilvN uhpA FALSE 0.163 153.000 0.118 1.000   NA
 5731657 5731658 KPK_0028 KPK_0029 uhpA uhpB TRUE 0.970 -3.000 0.000 0.013 Y NA
 5731658 5731659 KPK_0029 KPK_0030 uhpB uhpC TRUE 0.741 12.000 0.000 0.088 N NA
 5731659 5731660 KPK_0030 KPK_0031 uhpC uhpT FALSE 0.488 146.000 0.000 0.081 Y NA
 5731660 5731661 KPK_0031 KPK_0032 uhpT   FALSE 0.189 137.000 0.091 NA   NA
 5731662 5731663 KPK_0033 KPK_0034     TRUE 0.959 -16.000 0.636 NA   NA
 5731665 5731666 KPK_0036 KPK_0037     TRUE 0.852 145.000 0.421 0.019 Y NA
 5731666 5731667 KPK_0037 KPK_0038     TRUE 0.909 98.000 0.300 0.015 Y NA
 5731667 5731668 KPK_0038 KPK_0039     TRUE 0.997 12.000 0.889 0.015 Y NA
 5731669 5731670 KPK_0040 KPK_0041     FALSE 0.006 212.000 0.000 1.000 N NA
 5731670 5731671 KPK_0041 KPK_0043     TRUE 0.967 14.000 0.571 1.000   NA
 5731673 5731674 KPK_0044 KPK_0045   ligK TRUE 0.954 -3.000 0.353 NA   NA
 5731674 5731675 KPK_0045 KPK_0046 ligK   TRUE 0.946 1.000 0.309 NA   NA
 5731675 5731676 KPK_0046 KPK_0047     TRUE 0.879 3.000 0.133 NA   NA
 5731677 5731678 KPK_0048 KPK_0049     FALSE 0.167 122.000 0.054 NA   NA
 5731678 5731679 KPK_0049 KPK_0050   murP FALSE 0.072 152.000 0.036 1.000   NA
 5731679 5731680 KPK_0050 KPK_0051 murP murQ TRUE 0.679 25.000 0.087 1.000   NA
 5731680 5731681 KPK_0051 KPK_0052 murQ   FALSE 0.021 163.000 0.000 1.000   NA
 5731681 5731682 KPK_0052 KPK_0053   eefC TRUE 0.704 46.000 0.143 0.081 N NA
 5731682 5731683 KPK_0053 KPK_0054 eefC eefB TRUE 0.970 4.000 0.367 0.081 N NA
 5731683 5731684 KPK_0054 KPK_0055 eefB eefA TRUE 0.907 0.000 0.167 1.000 N NA
 5731691 5731692 KPK_0062 KPK_0063     TRUE 0.727 0.000 0.041 NA   NA
 5731694 5731695 KPK_0065 KPK_0066   nlpA FALSE 0.025 128.000 0.000 NA N NA
 5731695 5731696 KPK_0066 KPK_0068 nlpA   FALSE 0.188 25.000 0.000 NA   NA
 5731698 5731699 KPK_0069 KPK_0071     TRUE 0.868 22.000 0.258 1.000   NA
 5731702 5731703 KPK_0073 KPK_0074     TRUE 0.811 2.000 0.000 0.045   NA
 5731703 5731704 KPK_0074 KPK_0075     FALSE 0.063 113.000 0.000 1.000   NA
 5731704 5731705 KPK_0075 KPK_0076     FALSE 0.012 168.000 0.000 NA   NA
 5731706 5731707 KPK_0077 KPK_0078   yicI TRUE 0.939 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5731707 5731708 KPK_0078 KPK_0079 yicI   FALSE 0.092 159.000 0.000 0.026 N NA
 5731709 5731710 KPK_0080 KPK_0081     TRUE 0.990 13.000 0.500 1.000 Y NA
 5731710 5731711 KPK_0081 KPK_0082     FALSE 0.003 251.000 0.000 NA   NA
 5731711 5731712 KPK_0082 KPK_0083     FALSE 0.355 141.000 0.257 NA   NA
 5731714 5731715 KPK_0085 KPK_0086 glpK glpF FALSE 0.407 22.000 0.010 1.000 N NA
 5731716 5731717 KPK_0087 KPK_0088   sbp FALSE 0.058 152.000 0.023 1.000   NA
 5731717 5731718 KPK_0088 KPK_0089 sbp cdh FALSE 0.112 170.000 0.115 1.000 N NA
 5731718 5731719 KPK_0089 KPK_0090 cdh   FALSE 0.463 65.000 0.139 1.000 N NA
 5731720 5731721 KPK_0091 KPK_0092 tpiA   FALSE 0.202 110.000 0.058 NA   NA
 5731723 5731724 KPK_0094 KPK_0095 fpr glpX FALSE 0.165 151.000 0.117 1.000 N NA
 5731724 5731725 KPK_0095 KPK_0096 glpX recG FALSE 0.184 51.000 0.004 1.000 N NA
 5731725 5731726 KPK_0096 KPK_0097 recG trmH TRUE 0.822 6.000 0.076 1.000 N NA
 5731726 5731727 KPK_0097 KPK_0098 trmH spoT TRUE 0.853 5.000 0.095 1.000 N NA
 5731727 5731728 KPK_0098 KPK_0099 spoT rpoZ TRUE 0.974 19.000 0.291 1.000 Y NA
 5731728 5731729 KPK_0099 KPK_0100 rpoZ gmk TRUE 0.801 55.000 0.471 1.000 N NA
 5731734 5731735 KPK_0105 KPK_0106     FALSE 0.001 395.000 0.000 NA   NA
 5731735 5731736 KPK_0106 KPK_0107     FALSE 0.076 87.000 0.000 1.000   NA
 5731736 5731737 KPK_0107 KPK_0108     TRUE 0.994 -7.000 0.752 1.000 Y NA
 5731737 5731738 KPK_0108 KPK_0109     TRUE 0.975 -13.000 0.671 0.098 N NA
 5731738 5731739 KPK_0109 KPK_0110   rph FALSE 0.063 96.000 0.000 1.000 N NA
 5731739 5731740 KPK_0110 KPK_0111 rph pyrE FALSE 0.316 112.000 0.108 1.000 N NA
 5731741 5731742 KPK_0112 KPK_0113     FALSE 0.013 176.000 0.000 1.000 N NA
 5731742 5731743 KPK_0113 KPK_0114   dut FALSE 0.185 125.000 0.060 1.000 N NA
 5731743 5731744 KPK_0114 KPK_0115 dut coaBC TRUE 0.851 -22.000 0.201 1.000 N NA
 5731745 5731746 KPK_0116 KPK_0117 radC rpmB FALSE 0.010 217.000 0.002 1.000 N NA
 5731746 5731747 KPK_0117 KPK_0118 rpmB rpmG TRUE 0.984 21.000 0.332 0.010 Y NA
 5731747 5731748 KPK_0118 KPK_0119 rpmG mutM FALSE 0.101 136.000 0.034 1.000 N NA
 5731749 5731750 KPK_0120 KPK_0121 coaD   TRUE 0.613 3.000 0.023 NA N NA
 5731750 5731751 KPK_0121 KPK_0122   waaA TRUE 0.971 0.000 0.083 NA Y NA
 5731751 5731752 KPK_0122 KPK_0123 waaA   TRUE 0.603 92.000 0.000 NA Y NA
 5731752 5731753 KPK_0123 KPK_0124     TRUE 0.838 30.000 0.000 NA Y NA
 5731753 5731754 KPK_0124 KPK_0125     TRUE 0.984 3.000 0.111 0.016 Y NA
 5731754 5731755 KPK_0125 KPK_0126   rfaQ TRUE 0.985 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 5731756 5731757 KPK_0127 KPK_0128     FALSE 0.329 19.000 0.000 1.000   NA
 5731758 5731759 KPK_0129 KPK_0130 waaL   FALSE 0.064 65.000 0.000 NA   NA
 5731759 5731760 KPK_0130 KPK_0131   rfaC TRUE 0.661 0.000 0.024 NA   NA
 5731760 5731761 KPK_0131 KPK_0132 rfaC rfaF TRUE 0.990 4.000 0.205 0.001 Y NA
 5731761 5731762 KPK_0132 KPK_0133 rfaF rfaD TRUE 0.977 9.000 0.146 1.000 Y NA
 5731763 5731764 KPK_0134 KPK_0135 kbl tdh TRUE 0.967 13.000 0.547 1.000 N NA
 5731764 5731765 KPK_0135 KPK_0136 tdh   FALSE 0.022 170.000 0.008 NA N NA
 5731766 5731767 KPK_0137 KPK_0138     TRUE 0.851 4.000 0.088 1.000   NA
 5731767 5731768 KPK_0138 KPK_0139   gpmI TRUE 0.898 10.000 0.170 1.000 N NA
 5731769 5731770 KPK_0140 KPK_0141   grxC FALSE 0.173 105.000 0.048 NA N NA
 5731770 5731771 KPK_0141 KPK_0142 grxC secB FALSE 0.236 61.000 0.038 1.000 N NA
 5731771 5731772 KPK_0142 KPK_0143 secB   TRUE 0.925 0.000 0.206 1.000 N NA
 5731772 5731773 KPK_0143 KPK_0144   cysE TRUE 0.721 74.000 0.429 1.000 N NA
 5731774 5731775 KPK_0145 KPK_0146   lldD FALSE 0.028 181.000 0.020 1.000 N NA
 5731775 5731776 KPK_0146 KPK_0147 lldD   TRUE 0.950 0.000 0.309 1.000 N NA
 5731776 5731777 KPK_0147 KPK_0148   lldP TRUE 0.978 -3.000 0.652 1.000 N NA
 5731777 5731778 KPK_0148 KPK_0149 lldP   FALSE 0.002 285.000 0.000 NA   NA
 5731780 5731781 KPK_0150 KPK_0152 mtlR mtlD TRUE 0.929 0.000 0.230 NA N NA
 5731781 5731782 KPK_0152 KPK_0153 mtlD mtlA TRUE 0.856 103.000 0.292 1.000 Y NA
 5731783 5731784 KPK_0154 KPK_0155     TRUE 0.972 4.000 0.556 NA   NA
 5731784 5731785 KPK_0155 KPK_0156     FALSE 0.274 107.000 0.081 1.000 N NA
 5731785 5731786 KPK_0156 KPK_0157   selA FALSE 0.169 106.000 0.040 1.000 N NA
 5731786 5731787 KPK_0157 KPK_0158 selA selB TRUE 0.986 -3.000 0.569 0.001 N NA
 5731788 5731789 KPK_0159 KPK_0160 sgbE   TRUE 0.978 -6.000 0.200 1.000 Y NA
 5731789 5731790 KPK_0160 KPK_0161   sgbH TRUE 0.986 -7.000 0.360 1.000 Y NA
 5731790 5731791 KPK_0161 KPK_0162 sgbH lyx TRUE 0.996 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 5731791 5731792 KPK_0162 KPK_0163 lyx   TRUE 0.909 79.000 0.455 NA Y NA
 5731792 5731793 KPK_0163 KPK_0164     TRUE 0.546 37.000 0.091 NA   NA
 5731793 5731794 KPK_0164 KPK_0165     TRUE 0.735 25.000 0.136 NA   NA
 5731794 5731795 KPK_0165 KPK_0166   dlgD TRUE 0.753 12.000 0.062 NA N NA
 5731796 5731797 KPK_0167 KPK_0168   aegA FALSE 0.054 110.000 0.000 1.000 N NA
 5731798 5731799 KPK_0169 KPK_0170 avtA malS FALSE 0.093 169.000 0.085 1.000 N NA
 5731801 5731802 KPK_0172 KPK_0173 xylR xylH FALSE 0.044 235.000 0.146 1.000 N NA
 5731802 5731803 KPK_0173 KPK_0174 xylH xylG TRUE 0.983 -22.000 0.469 1.000 Y NA
 5731803 5731804 KPK_0174 KPK_0175 xylG xylF TRUE 0.933 65.000 0.518 NA Y NA
 5731805 5731806 KPK_0176 KPK_0177 xylA_1 xylB_1 TRUE 0.646 93.000 0.007 1.000 Y NA
 5731806 5731807 KPK_0177 KPK_0178 xylB_1   FALSE 0.012 169.000 0.000 NA   NA
 5731807 5731808 KPK_0178 KPK_0179     FALSE 0.344 35.000 0.032 NA   NA
 5731810 5731811 KPK_0181 KPK_0182   glyQ FALSE 0.072 128.000 0.010 NA   NA
 5731811 5731812 KPK_0182 KPK_0183 glyQ glyS TRUE 0.996 10.000 0.651 0.001 Y NA
 5731812 5731813 KPK_0183 KPK_0184 glyS hokA FALSE 0.001 327.000 0.000 NA   NA
 5731813 5731814 KPK_0184 KPK_0185 hokA   FALSE 0.002 302.000 0.000 NA   NA
 5731815 5731816 KPK_0186 KPK_0187 cspA   FALSE 0.079 253.000 0.000 1.000 Y NA
 5731816 5731817 KPK_0187 KPK_0188   pcaK FALSE 0.017 162.000 0.000 1.000 N NA
 5731819 5731820 KPK_0190 KPK_0191 tkrA   TRUE 0.905 25.000 0.417 1.000 N NA
 5731820 5731821 KPK_0191 KPK_0192     TRUE 0.795 105.000 0.175 1.000 Y NA
 5731821 5731822 KPK_0192 KPK_0193     TRUE 0.973 4.000 0.571 NA   NA
 5731822 5731823 KPK_0193 KPK_0194     TRUE 0.508 112.000 0.263 NA   NA
 5731827 5731828 KPK_0197 KPK_0199   tag TRUE 0.546 -22.000 0.028 1.000   NA
 5731829 5731830 KPK_0200 KPK_0201     FALSE 0.002 240.000 0.000 NA N NA
 5731830 5731831 KPK_0201 KPK_0202     FALSE 0.018 243.000 0.000 0.087   NA
 5731831 5731832 KPK_0202 KPK_0203     FALSE 0.006 197.000 0.000 NA   NA
 5731832 5731833 KPK_0203 KPK_0204     FALSE 0.039 119.000 0.000 NA   NA
 5731833 5731834 KPK_0204 KPK_0205   dppA FALSE 0.000 1003.000 0.000 NA   NA
 5731834 5731835 KPK_0205 KPK_0206 dppA dppB TRUE 0.699 135.000 0.087 0.080 Y NA
 5731835 5731836 KPK_0206 KPK_0207 dppB dppC TRUE 0.996 10.000 0.779 0.080 Y NA
 5731836 5731837 KPK_0207 KPK_0208 dppC dppD TRUE 0.992 11.000 0.560 1.000 Y NA
 5731837 5731838 KPK_0208 KPK_0209 dppD dppF TRUE 0.995 -3.000 0.500 0.003 Y NA
 5731838 5731839 KPK_0209 KPK_0210 dppF   FALSE 0.001 515.000 0.000 NA   NA
 5731839 5731840 KPK_0210 KPK_0211     TRUE 0.903 -9.000 0.250 NA   NA
 5731840 5731841 KPK_0211 KPK_0212     TRUE 0.933 20.000 0.458 1.000 N NA
 5731841 5731842 KPK_0212 KPK_0213     TRUE 0.953 33.000 0.643 0.002   NA
 5731842 5731843 KPK_0213 KPK_0214     TRUE 0.977 0.000 0.360 0.002   NA
 5731843 5731844 KPK_0214 KPK_0215     TRUE 0.976 3.000 0.360 0.002   NA
 5731844 5731845 KPK_0215 KPK_0216     TRUE 0.961 12.000 0.444 1.000   NA
 5731846 5731847 KPK_0217 KPK_0218 bcsG bcsF FALSE 0.384 -3.000 0.000 NA   NA
 5731847 5731848 KPK_0218 KPK_0219 bcsF bcsE FALSE 0.395 0.000 0.000 NA   NA
 5731849 5731850 KPK_0220 KPK_0221   yhjQ TRUE 0.961 12.000 0.464 NA   NA
 5731850 5731851 KPK_0221 KPK_0222 yhjQ bcsA TRUE 0.971 -3.000 0.545 NA N NA
 5731851 5731852 KPK_0222 KPK_0223 bcsA bcsB TRUE 0.836 11.000 0.000 0.002   NA
 5731852 5731853 KPK_0223 KPK_0224 bcsB bcsZ FALSE 0.480 7.000 0.000 1.000   NA
 5731853 5731854 KPK_0224 KPK_0225 bcsZ bcsC FALSE 0.336 -18.000 0.000 1.000   NA
 5731854 5731855 KPK_0225 KPK_0226 bcsC   FALSE 0.062 67.000 0.000 NA   NA
 5731855 5731856 KPK_0226 KPK_0227     FALSE 0.060 70.000 0.000 NA   NA
 5731856 5731857 KPK_0227 KPK_0228   dctA FALSE 0.250 157.000 0.229 1.000 N NA
 5731857 5731858 KPK_0228 KPK_0229 dctA   FALSE 0.037 221.000 0.088 1.000   NA
 5731859 5731860 KPK_0230 KPK_0231 kdgK   FALSE 0.313 -7.000 0.000 NA   NA
 5731862 5731863 KPK_0233 KPK_0234     FALSE 0.003 272.000 0.000 1.000   NA
 5731863 5731864 KPK_0234 KPK_0235     FALSE 0.320 107.000 0.098 1.000   NA
 5731866 5731867 KPK_0237 KPK_0238     FALSE 0.077 67.000 0.000 1.000 N NA
 5731867 5731868 KPK_0238 KPK_0239     FALSE 0.004 240.000 0.000 1.000 N NA
 5731870 5731871 KPK_0241 KPK_0242 gor yhiR FALSE 0.385 73.000 0.100 1.000   NA
 5731872 5731873 KPK_0243 KPK_0244   prlC FALSE 0.028 183.000 0.018 1.000   NA
 5731873 5731874 KPK_0244 KPK_0245 prlC   TRUE 0.846 8.000 0.098 NA   NA
 5731875 5731876 KPK_0246 KPK_0247   uspA FALSE 0.003 257.000 0.000 1.000 N NA
 5731880 5731881 KPK_0251 KPK_0252     FALSE 0.436 142.000 0.333 1.000   NA
 5731881 5731882 KPK_0252 KPK_0253     TRUE 0.959 13.000 0.444 1.000   NA
 5731882 5731883 KPK_0253 KPK_0254     TRUE 0.768 65.000 0.500 NA N NA
 5731883 5731884 KPK_0254 KPK_0255     TRUE 0.994 11.000 0.667 NA Y NA
 5731886 5731887 KPK_0257 KPK_0258   nikR FALSE 0.001 337.000 0.000 1.000 N NA
 5731887 5731888 KPK_0258 KPK_0259 nikR nikE TRUE 0.580 -12.000 0.031 1.000 N NA
 5731888 5731889 KPK_0259 KPK_0260 nikE nikD TRUE 0.989 -3.000 0.161 0.001 Y NA
 5731889 5731890 KPK_0260 KPK_0261 nikD nikC TRUE 0.991 0.000 0.227 0.001 Y NA
 5731890 5731891 KPK_0261 KPK_0262 nikC nikB TRUE 0.997 -3.000 0.629 0.001 Y NA
 5731891 5731892 KPK_0262 KPK_0263 nikB nikA TRUE 0.998 0.000 0.833 0.001 Y NA
 5731892 5731893 KPK_0263 KPK_0264 nikA   FALSE 0.030 140.000 0.000 1.000 N NA
 5731894 5731895 KPK_0265 KPK_0266 padC arnB FALSE 0.001 397.000 0.000 1.000 N NA
 5731895 5731896 KPK_0266 KPK_0267 arnB arnC TRUE 0.989 2.000 0.378 NA Y NA
 5731896 5731897 KPK_0267 KPK_0268 arnC arnA TRUE 0.983 -3.000 0.220 NA Y NA
 5731897 5731898 KPK_0268 KPK_0269 arnA   TRUE 0.991 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 5731898 5731899 KPK_0269 KPK_0270   arnT TRUE 0.707 0.000 0.031 1.000 N NA
 5731899 5731900 KPK_0270 KPK_0271 arnT   FALSE 0.442 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5731900 5731901 KPK_0271 KPK_0273     TRUE 0.929 0.000 0.226 NA   NA
 5731904 5731905 KPK_0275 KPK_0276     FALSE 0.275 74.000 0.066 NA   NA
 5731907 5731908 KPK_0278 KPK_0279 zntA   TRUE 0.722 79.000 0.325 0.087   NA
 5731910 5731911 KPK_0281 KPK_0282     TRUE 0.706 -10.000 0.063 NA   NA
 5731912 5731913 KPK_0283 KPK_0284 ftsY ftsE TRUE 0.918 3.000 0.117 0.097 N NA
 5731913 5731914 KPK_0284 KPK_0285 ftsE ftsX TRUE 0.968 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 5731914 5731915 KPK_0285 KPK_0286 ftsX rpoH FALSE 0.012 270.000 0.051 1.000 N NA
 5731917 5731918 KPK_0288 KPK_0289     TRUE 0.584 148.000 0.150 NA Y NA
 5731918 5731919 KPK_0289 KPK_0290   livJ FALSE 0.069 258.000 0.000 NA Y NA
 5731920 5731921 KPK_0291 KPK_0292     TRUE 0.811 4.000 0.074 NA   NA
 5731921 5731922 KPK_0292 KPK_0293     FALSE 0.001 313.000 0.000 NA   NA
 5731923 5731924 KPK_0294 KPK_0295   livK FALSE 0.043 110.000 0.000 NA   NA
 5731924 5731925 KPK_0295 KPK_0296 livK livH TRUE 0.779 62.000 0.067 1.000 Y NA
 5731925 5731926 KPK_0296 KPK_0297 livH livM TRUE 0.995 -3.000 0.574 0.080 Y NA
 5731926 5731927 KPK_0297 KPK_0298 livM livG TRUE 0.993 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 5731927 5731928 KPK_0298 KPK_0299 livG livF TRUE 0.998 2.000 0.967 0.028 Y NA
 5731928 5731929 KPK_0299 KPK_0300 livF ugpB FALSE 0.003 272.000 0.000 1.000 N NA
 5731929 5731930 KPK_0300 KPK_0301 ugpB ugpA TRUE 0.958 107.000 0.793 0.080 Y NA
 5731930 5731931 KPK_0301 KPK_0302 ugpA ugpE TRUE 0.991 -3.000 0.306 0.080 Y NA
 5731931 5731932 KPK_0302 KPK_0303 ugpE ugpC TRUE 0.990 2.000 0.272 0.080 Y NA
 5731932 5731933 KPK_0303 KPK_0304 ugpC ugpQ TRUE 0.832 -3.000 0.080 1.000 N NA
 5731936 5731937 KPK_0307 KPK_0308     FALSE 0.003 228.000 0.000 NA N NA
 5731938 5731939 KPK_0309 KPK_0310     FALSE 0.037 122.000 0.000 NA   NA
 5731939 5731940 KPK_0310 KPK_0311   gntR FALSE 0.041 115.000 0.000 NA   NA
 5731940 5731941 KPK_0311 KPK_0312 gntR gntK FALSE 0.012 181.000 0.000 1.000 N NA
 5731941 5731942 KPK_0312 KPK_0313 gntK gntU TRUE 0.952 0.000 0.000 1.000 Y NA
 5731944 5731945 KPK_0315 KPK_0316 asd glgB FALSE 0.004 239.000 0.000 1.000 N NA
 5731945 5731946 KPK_0316 KPK_0317 glgB glgX TRUE 0.980 -3.000 0.049 0.002 Y NA
 5731946 5731947 KPK_0317 KPK_0318 glgX glgC TRUE 0.846 81.000 0.228 1.000 Y NA
 5731947 5731948 KPK_0318 KPK_0319 glgC glgA TRUE 0.988 0.000 0.307 1.000 Y NA
 5731948 5731949 KPK_0319 KPK_0320 glgA glgP TRUE 0.971 18.000 0.228 1.000 Y NA
 5731949 5731950 KPK_0320 KPK_0321 glgP   FALSE 0.005 215.000 0.000 NA   NA
 5731952 5731953 KPK_0323 KPK_0324 glpE   TRUE 0.800 51.000 0.405 1.000   NA
 5731953 5731954 KPK_0324 KPK_0325   glpR TRUE 0.639 50.000 0.190 1.000   NA
 5731956 5731957 KPK_0327 KPK_0328   malP FALSE 0.001 344.000 0.000 NA   NA
 5731957 5731958 KPK_0328 KPK_0329 malP malQ TRUE 0.965 11.000 0.000 0.026 Y NA
 5731959 5731960 KPK_0330 KPK_0331 gntT yhgI FALSE 0.002 337.000 0.000 1.000   NA
 5731960 5731961 KPK_0331 KPK_0332 yhgI gntX FALSE 0.351 59.000 0.066 1.000   NA
 5731962 5731963 KPK_0333 KPK_0334     FALSE 0.091 121.000 0.016 NA   NA
 5731964 5731965 KPK_0335 KPK_0336   feoB FALSE 0.363 10.000 0.000 NA   NA
 5731965 5731966 KPK_0336 KPK_0337 feoB feoA TRUE 0.938 29.000 0.177 1.000 Y NA
 5731968 5731969 KPK_0339 KPK_0340   greB TRUE 0.770 101.000 0.123 1.000 Y NA
 5731970 5731971 KPK_0341 KPK_0342 ompR envZ TRUE 0.994 -3.000 0.584 1.000 Y NA
 5731972 5731973 KPK_0343 KPK_0344 pckA hslO FALSE 0.005 360.000 0.048 1.000 N NA
 5731973 5731974 KPK_0344 KPK_0345 hslO hslR TRUE 0.803 19.000 0.140 1.000 N NA
 5731974 5731975 KPK_0345 KPK_0346 hslR   TRUE 0.795 -3.000 0.056 1.000   NA
 5731975 5731976 KPK_0346 KPK_0347     FALSE 0.467 61.000 0.122 1.000   NA
 5731979 5731980 KPK_0350 KPK_0351 hofM   TRUE 0.973 -16.000 0.870 NA   NA
 5731980 5731981 KPK_0351 KPK_0352     TRUE 0.928 -10.000 0.348 NA   NA
 5731981 5731982 KPK_0352 KPK_0353     TRUE 0.945 -10.000 0.444 NA   NA
 5731982 5731983 KPK_0353 KPK_0354   hofQ TRUE 0.644 -64.000 0.072 NA   NA
 5731983 5731984 KPK_0354 KPK_0355 hofQ aroK FALSE 0.060 271.000 0.319 1.000 N NA
 5731984 5731985 KPK_0355 KPK_0356 aroK aroB TRUE 0.883 56.000 0.208 1.000 Y NA
 5731985 5731986 KPK_0356 KPK_0357 aroB damX FALSE 0.133 85.000 0.022 NA   NA
 5731986 5731987 KPK_0357 KPK_0358 damX dam TRUE 0.540 79.000 0.234 NA   NA
 5731987 5731988 KPK_0358 KPK_0359 dam rpe TRUE 0.651 18.000 0.053 1.000 N NA
 5731988 5731989 KPK_0359 KPK_0360 rpe gph TRUE 0.721 -7.000 0.050 1.000   NA
 5731989 5731990 KPK_0360 KPK_0361 gph trpS TRUE 0.841 -7.000 0.118 1.000   NA
 5731991 5731992 KPK_0362 KPK_0363 cysG nirD FALSE 0.021 153.000 0.000 1.000 N NA
 5731992 5731993 KPK_0363 KPK_0364 nirD nirB TRUE 0.991 -3.000 0.829 0.001 N NA
 5731995 5731996 KPK_0365 KPK_0367 tsgA   FALSE 0.313 -7.000 0.000 NA   NA
 5731997 5731998 KPK_0368 KPK_0369 ppiA   TRUE 0.541 107.000 0.286 NA   NA
 5731998 5731999 KPK_0369 KPK_0370   fic TRUE 0.909 -10.000 0.286 NA   NA
 5731999 5732000 KPK_0370 KPK_0371 fic pabA FALSE 0.285 33.000 0.008 1.000 N NA
 5732000 5732001 KPK_0371 KPK_0373 pabA argD TRUE 0.751 91.000 0.088 1.000 Y NA
 5732002 5732003 KPK_0372 KPK_0374   crp FALSE 0.485 52.000 0.111 NA   NA
 5732005 5732006 KPK_0376 KPK_0377     TRUE 0.792 37.000 0.303 NA   NA
 5732006 5732007 KPK_0377 KPK_0378     TRUE 0.925 -3.000 0.222 NA   NA
 5732007 5732008 KPK_0378 KPK_0379     FALSE 0.014 202.000 0.016 NA   NA
 5732009 5732010 KPK_0380 KPK_0381 kefG kefB TRUE 0.977 -13.000 0.927 1.000   NA
 5732010 5732011 KPK_0381 KPK_0382 kefB   TRUE 0.956 12.000 0.400 1.000   NA
 5732011 5732012 KPK_0382 KPK_0383   slyD TRUE 0.662 94.000 0.370 1.000   NA
 5732014 5732015 KPK_0385 KPK_0386 fkpA   FALSE 0.255 169.000 0.310 NA   NA
 5732015 5732016 KPK_0386 KPK_0387   tusD TRUE 0.927 0.000 0.220 NA   NA
 5732016 5732017 KPK_0387 KPK_0388 tusD tusC TRUE 0.995 0.000 0.790 NA Y NA
 5732017 5732018 KPK_0388 KPK_0389 tusC tusB TRUE 0.995 8.000 0.804 NA Y NA
 5732018 5732019 KPK_0389 KPK_0390 tusB rpsL FALSE 0.163 125.000 0.058 NA N NA
 5732019 5732020 KPK_0390 KPK_0391 rpsL rpsG TRUE 0.958 97.000 0.620 0.002 Y NA
 5732020 5732021 KPK_0391 KPK_0392 rpsG fusA_1 TRUE 0.928 97.000 0.579 1.000 Y NA
 5732021 5732022 KPK_0392 KPK_0393 fusA_1 tuf_1 TRUE 0.949 70.000 0.400 0.001 Y NA
 5732022 5732023 KPK_0393 KPK_0394 tuf_1 bfd FALSE 0.017 180.000 0.007 NA N NA
 5732023 5732024 KPK_0394 KPK_0396 bfd bfr TRUE 0.691 74.000 0.033 NA Y NA
 5732026 5732027 KPK_0397 KPK_0398   rpsJ FALSE 0.005 210.000 0.000 NA   NA
 5732027 5732028 KPK_0398 KPK_0399 rpsJ rplC TRUE 0.969 33.000 0.307 0.013 Y NA
 5732028 5732029 KPK_0399 KPK_0400 rplC rplD TRUE 0.994 11.000 0.486 0.010 Y NA
 5732029 5732030 KPK_0400 KPK_0401 rplD rplW TRUE 0.995 -3.000 0.513 0.010 Y NA
 5732030 5732031 KPK_0401 KPK_0402 rplW rplB TRUE 0.995 18.000 0.849 0.013 Y NA
 5732031 5732032 KPK_0402 KPK_0403 rplB rpsS TRUE 0.995 17.000 0.820 0.013 Y NA
 5732032 5732033 KPK_0403 KPK_0404 rpsS rplV TRUE 0.996 15.000 0.769 0.013 Y NA
 5732033 5732034 KPK_0404 KPK_0405 rplV rpsC TRUE 0.994 18.000 0.719 0.013 Y NA
 5732034 5732035 KPK_0405 KPK_0406 rpsC rplP TRUE 0.997 13.000 0.828 0.013 Y NA
 5732035 5732036 KPK_0406 KPK_0408 rplP rpmC TRUE 0.997 0.000 0.802 0.010 Y NA
 5732038 5732039 KPK_0409 KPK_0410 rplX rplE TRUE 0.996 15.000 0.758 0.010 Y NA
 5732039 5732040 KPK_0410 KPK_0411 rplE rpsN TRUE 0.993 15.000 0.496 0.010 Y NA
 5732040 5732041 KPK_0411 KPK_0412 rpsN rpsH TRUE 0.979 34.000 0.473 0.010 Y NA
 5732041 5732042 KPK_0412 KPK_0413 rpsH rplF TRUE 0.997 13.000 0.808 0.010 Y NA
 5732042 5732043 KPK_0413 KPK_0414 rplF rplR TRUE 0.997 10.000 0.815 0.010 Y NA
 5732043 5732044 KPK_0414 KPK_0415 rplR rpsE TRUE 0.996 15.000 0.814 0.013 Y NA
 5732044 5732045 KPK_0415 KPK_0416 rpsE rpmD TRUE 0.997 4.000 0.789 0.013 Y NA
 5732045 5732046 KPK_0416 KPK_0417 rpmD rplO TRUE 0.997 4.000 0.653 0.002 Y NA
 5732046 5732047 KPK_0417 KPK_0418 rplO secY TRUE 0.980 8.000 0.730 1.000 N NA
 5732047 5732048 KPK_0418 KPK_0419 secY rpsM FALSE 0.004 297.000 0.011 1.000 N NA
 5732048 5732049 KPK_0419 KPK_0420 rpsM rpsD FALSE 0.032 440.000 0.000 0.013 Y NA
 5732049 5732050 KPK_0420 KPK_0421 rpsD rpoA TRUE 0.927 26.000 0.549 1.000 N NA
 5732050 5732051 KPK_0421 KPK_0422 rpoA rplQ TRUE 0.933 41.000 0.873 1.000 N NA
 5732051 5732052 KPK_0422 KPK_0423 rplQ   FALSE 0.097 109.000 0.012 NA   NA
 5732052 5732053 KPK_0423 KPK_0424   zntR TRUE 0.847 3.000 0.095 NA   NA
 5732054 5732055 KPK_0425 KPK_0426 mscL trkA FALSE 0.089 141.000 0.035 1.000 N NA
 5732055 5732056 KPK_0426 KPK_0427 trkA rsmB TRUE 0.842 14.000 0.122 1.000 N NA
 5732056 5732057 KPK_0427 KPK_0428 rsmB fmt TRUE 0.919 53.000 0.305 1.000 Y NA
 5732057 5732058 KPK_0428 KPK_0429 fmt def TRUE 0.971 15.000 0.058 0.015 Y NA
 5732059 5732060 KPK_0430 KPK_0431 dprA smg TRUE 0.828 15.000 0.124 NA   NA
 5732060 5732061 KPK_0431 KPK_0432 smg   TRUE 0.860 27.000 0.331 NA   NA
 5732061 5732062 KPK_0432 KPK_0433     TRUE 0.876 5.000 0.137 NA N NA
 5732062 5732063 KPK_0433 KPK_0434   aroE TRUE 0.829 4.000 0.087 NA N NA
 5732063 5732064 KPK_0434 KPK_0436 aroE   TRUE 0.724 -3.000 0.043 NA   NA
 5732066 5732067 KPK_0437 KPK_0438   rrsA FALSE 0.002 272.000 0.000 NA   NA
 5732067 5732068 KPK_0438 KPK_0439 rrsA rrlA FALSE 0.006 196.000 0.000 NA   NA
 5732068 5732069 KPK_0439 KPK_0440 rrlA rrf FALSE 0.049 99.000 0.000 NA   NA
 5732069 5732070 KPK_0440 KPK_0441 rrf   FALSE 0.319 14.000 0.000 NA   NA
 5732070 5732071 KPK_0441 KPK_0442   rrfA FALSE 0.127 36.000 0.000 NA   NA
 5732072 5732073 KPK_0443 KPK_0444   acrF FALSE 0.002 298.000 0.000 NA   NA
 5732073 5732074 KPK_0444 KPK_0445 acrF acrE TRUE 0.983 13.000 0.889 1.000 N NA
 5732076 5732077 KPK_0447 KPK_0448 fis dusB TRUE 0.771 25.000 0.161 1.000 N NA
 5732077 5732078 KPK_0448 KPK_0449 dusB prmA FALSE 0.038 358.000 0.042 1.000 Y NA
 5732078 5732079 KPK_0449 KPK_0450 prmA panF TRUE 0.706 12.000 0.041 1.000 N NA
 5732079 5732080 KPK_0450 KPK_0451 panF   TRUE 0.968 -10.000 0.682 NA   NA
 5732080 5732081 KPK_0451 KPK_0452   accC FALSE 0.300 111.000 0.103 NA   NA
 5732081 5732082 KPK_0452 KPK_0453 accC accB TRUE 0.991 11.000 0.275 0.001 Y NA
 5732082 5732083 KPK_0453 KPK_0454 accB aroQ TRUE 0.859 23.000 0.254 1.000 N NA
 5732083 5732084 KPK_0454 KPK_0455 aroQ   FALSE 0.009 233.000 0.006 1.000   NA
 5732084 5732085 KPK_0455 KPK_0456     TRUE 0.989 0.000 0.790 0.050   NA
 5732086 5732087 KPK_0457 KPK_0458     FALSE 0.052 80.000 0.000 NA   NA
 5732087 5732088 KPK_0458 KPK_0459   mreB FALSE 0.002 306.000 0.000 1.000 N NA
 5732088 5732089 KPK_0459 KPK_0460 mreB mreC TRUE 0.832 71.000 0.689 1.000 N NA
 5732089 5732090 KPK_0460 KPK_0461 mreC mreD TRUE 0.996 0.000 0.550 0.002 Y NA
 5732090 5732091 KPK_0461 KPK_0462 mreD maf_2 TRUE 0.912 8.000 0.206 NA N NA
 5732091 5732092 KPK_0462 KPK_0463 maf_2 cafA TRUE 0.960 3.000 0.417 NA N NA
 5732092 5732093 KPK_0463 KPK_0464 cafA   TRUE 0.783 38.000 0.296 NA   NA
 5732093 5732094 KPK_0464 KPK_0465   tldD FALSE 0.209 89.000 0.050 NA   NA
 5732096 5732097 KPK_0467 KPK_0468 aaeX aaeA TRUE 0.848 8.000 0.100 NA   NA
 5732097 5732098 KPK_0468 KPK_0469 aaeA aaeB FALSE 0.377 6.000 0.000 NA   NA
 5732098 5732099 KPK_0469 KPK_0470 aaeB   FALSE 0.052 81.000 0.000 NA   NA
 5732102 5732103 KPK_0473 KPK_0474   ycfR TRUE 0.776 99.000 0.625 NA   NA
 5732103 5732104 KPK_0474 KPK_0475 ycfR argR FALSE 0.001 374.000 0.000 NA   NA
 5732104 5732105 KPK_0475 KPK_0476 argR   FALSE 0.336 13.000 0.000 NA   NA
 5732106 5732107 KPK_0477 KPK_0478 mdh   FALSE 0.086 132.000 0.020 1.000 N NA
 5732107 5732108 KPK_0478 KPK_0479     TRUE 0.990 -13.000 0.429 0.004 Y NA
 5732108 5732109 KPK_0479 KPK_0480     FALSE 0.006 212.000 0.000 1.000 N NA
 5732109 5732110 KPK_0480 KPK_0481   ddtA FALSE 0.170 33.000 0.000 1.000 N NA
 5732110 5732111 KPK_0481 KPK_0482 ddtA ttdB TRUE 0.997 0.000 0.667 0.001 Y NA
 5732111 5732112 KPK_0482 KPK_0483 ttdB oadG_2 FALSE 0.470 142.000 0.025 1.000 Y NA
 5732112 5732113 KPK_0483 KPK_0484 oadG_2 oadA_2 TRUE 0.995 16.000 0.720 0.002 Y NA
 5732113 5732114 KPK_0484 KPK_0485 oadA_2 oadB_2 TRUE 0.996 16.000 0.886 0.002 Y NA
 5732114 5732115 KPK_0485 KPK_0486 oadB_2   FALSE 0.152 60.000 0.019 NA N NA
 5732116 5732117 KPK_0487 KPK_0488 degS degQ TRUE 0.909 88.000 0.262 0.002 Y NA
 5732117 5732118 KPK_0488 KPK_0489 degQ   FALSE 0.129 174.000 0.154 NA   NA
 5732119 5732120 KPK_0490 KPK_0491   rplM FALSE 0.004 267.000 0.003 NA   NA
 5732120 5732121 KPK_0491 KPK_0492 rplM rpsI TRUE 0.994 16.000 0.601 0.010 Y NA
 5732121 5732122 KPK_0492 KPK_0493 rpsI sspA FALSE 0.003 312.000 0.014 NA N NA
 5732122 5732123 KPK_0493 KPK_0494 sspA sspB TRUE 0.984 4.000 0.831 NA   NA
 5732123 5732124 KPK_0494 KPK_0495 sspB   FALSE 0.039 119.000 0.000 NA   NA
 5732125 5732126 KPK_0496 KPK_0497 gltD gltB TRUE 0.984 10.000 0.096 0.001 Y NA
 5732128 5732129 KPK_0499 KPK_0500     FALSE 0.283 87.000 0.073 1.000 N NA
 5732130 5732131 KPK_0501 KPK_0502   arcB FALSE 0.056 150.000 0.022 1.000 N NA
 5732131 5732132 KPK_0502 KPK_0503 arcB elbB FALSE 0.003 234.000 0.000 NA N NA
 5732132 5732133 KPK_0503 KPK_0504 elbB mtgA TRUE 0.797 -3.000 0.066 NA   NA
 5732134 5732135 KPK_0505 KPK_0506 ptsO   TRUE 0.908 -3.000 0.182 NA   NA
 5732135 5732136 KPK_0506 KPK_0507   ptsN TRUE 0.642 46.000 0.186 NA   NA
 5732136 5732137 KPK_0507 KPK_0508 ptsN yfiA TRUE 0.833 71.000 0.728 NA N NA
 5732137 5732138 KPK_0508 KPK_0509 yfiA rpoN TRUE 0.961 23.000 0.820 NA N NA
 5732138 5732139 KPK_0509 KPK_0510 rpoN lptB TRUE 0.616 48.000 0.163 1.000   NA
 5732139 5732140 KPK_0510 KPK_0511 lptB lptA TRUE 0.971 7.000 0.543 NA   NA
 5732140 5732141 KPK_0511 KPK_0512 lptA   TRUE 0.927 -31.000 0.459 NA   NA
 5732141 5732142 KPK_0512 KPK_0513   kdsC TRUE 0.976 -3.000 0.617 NA   NA
 5732142 5732143 KPK_0513 KPK_0514 kdsC kdsD TRUE 0.966 15.000 0.598 1.000   NA
 5732143 5732144 KPK_0514 KPK_0515 kdsD   TRUE 0.901 15.000 0.226 1.000 N NA
 5732145 5732146 KPK_0516 KPK_0517     TRUE 0.992 8.000 0.530 NA Y NA
 5732146 5732147 KPK_0517 KPK_0518     TRUE 0.973 5.000 0.562 NA   NA
 5732147 5732148 KPK_0518 KPK_0519   ttg2D TRUE 0.839 19.000 0.188 NA   NA
 5732148 5732149 KPK_0519 KPK_0520 ttg2D   TRUE 0.948 0.000 0.308 NA   NA
 5732149 5732150 KPK_0520 KPK_0521     TRUE 0.545 137.000 0.453 NA   NA
 5732150 5732151 KPK_0521 KPK_0522   murA TRUE 0.660 54.000 0.258 NA N NA
 5732152 5732153 KPK_0523 KPK_0524 sfsB ispB FALSE 0.008 197.000 0.000 1.000 N NA
 5732154 5732155 KPK_0525 KPK_0526 rplU rpmA TRUE 0.992 21.000 0.667 0.010 Y NA
 5732155 5732156 KPK_0526 KPK_0527 rpmA   FALSE 0.126 93.000 0.019 NA   NA
 5732156 5732157 KPK_0527 KPK_0528     FALSE 0.496 16.000 0.015 NA   NA
 5732161 5732162 KPK_0532 KPK_0533 rrmJ hflB FALSE 0.424 91.000 0.152 1.000 N NA
 5732162 5732163 KPK_0533 KPK_0534 hflB folP TRUE 0.614 99.000 0.325 1.000 N NA
 5732163 5732164 KPK_0534 KPK_0535 folP glmM TRUE 0.916 -7.000 0.260 1.000 N NA
 5732164 5732165 KPK_0535 KPK_0536 glmM secG FALSE 0.010 230.000 0.016 1.000 N NA
 5732165 5732166 KPK_0536 KPK_0537 secG   FALSE 0.369 9.000 0.000 NA   NA
 5732166 5732167 KPK_0537 KPK_0538     FALSE 0.022 144.000 0.000 NA   NA
 5732168 5732169 KPK_0539 KPK_0540     FALSE 0.001 350.000 0.000 NA   NA
 5732169 5732170 KPK_0540 KPK_0541     FALSE 0.170 27.000 0.000 NA   NA
 5732170 5732171 KPK_0541 KPK_0542   argG FALSE 0.357 11.000 0.000 NA   NA
 5732172 5732173 KPK_0543 KPK_0544     FALSE 0.005 209.000 0.000 NA   NA
 5732173 5732174 KPK_0544 KPK_0545   nusA TRUE 0.944 28.000 0.759 NA   NA
 5732174 5732175 KPK_0545 KPK_0546 nusA infB TRUE 0.884 25.000 0.342 1.000 N NA
 5732175 5732176 KPK_0546 KPK_0547 infB rbfA TRUE 0.916 103.000 0.530 1.000 Y NA
 5732176 5732177 KPK_0547 KPK_0548 rbfA truB TRUE 0.988 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5732177 5732178 KPK_0548 KPK_0549 truB rpsO TRUE 0.643 149.000 0.211 1.000 Y NA
 5732180 5732181 KPK_0551 KPK_0552 pnp nlpI FALSE 0.256 109.000 0.071 1.000   NA
 5732181 5732182 KPK_0552 KPK_0553 nlpI deaD FALSE 0.056 178.000 0.053 1.000   NA
 5732182 5732183 KPK_0553 KPK_0554 deaD mtr FALSE 0.049 144.000 0.004 1.000 N NA
 5732184 5732185 KPK_0555 KPK_0556     FALSE 0.078 144.000 0.041 NA N NA
 5732185 5732186 KPK_0556 KPK_0557     TRUE 0.998 6.000 0.948 0.003 Y NA
 5732187 5732188 KPK_0558 KPK_0560     TRUE 0.934 -6.000 0.295 1.000   NA
 5732192 5732193 KPK_0563 KPK_0564     FALSE 0.208 76.000 0.045 NA   NA
 5732194 5732195 KPK_0565 KPK_0566   diaA TRUE 0.974 10.000 0.613 NA   NA
 5732195 5732196 KPK_0566 KPK_0567 diaA   TRUE 0.786 26.000 0.187 1.000 N NA
 5732196 5732197 KPK_0567 KPK_0568     TRUE 0.804 -42.000 0.172 NA   NA
 5732200 5732201 KPK_0571 KPK_0572   garL FALSE 0.170 27.000 0.000 NA   NA
 5732201 5732202 KPK_0572 KPK_0573 garL garR TRUE 0.896 27.000 0.424 1.000 N NA
 5732202 5732203 KPK_0573 KPK_0574 garR garK FALSE 0.079 65.000 0.000 1.000 N NA
 5732206 5732207 KPK_0577 KPK_0578     FALSE 0.188 25.000 0.000 NA   NA
 5732209 5732210 KPK_0580 KPK_0581     FALSE 0.034 127.000 0.000 NA   NA
 5732210 5732211 KPK_0581 KPK_0582     FALSE 0.056 75.000 0.000 NA   NA
 5732211 5732212 KPK_0582 KPK_0583     FALSE 0.016 339.000 0.161 NA   NA
 5732212 5732213 KPK_0583 KPK_0584     TRUE 0.909 -3.000 0.185 NA   NA
 5732213 5732214 KPK_0584 KPK_0585     TRUE 0.908 3.000 0.185 NA   NA
 5732214 5732215 KPK_0585 KPK_0586     TRUE 0.878 46.000 0.609 NA   NA
 5732215 5732216 KPK_0586 KPK_0587     TRUE 0.590 150.000 0.684 NA   NA
 5732216 5732217 KPK_0587 KPK_0588     TRUE 0.971 3.000 0.529 NA   NA
 5732217 5732218 KPK_0588 KPK_0589   exuR FALSE 0.001 343.000 0.000 NA   NA
 5732218 5732219 KPK_0589 KPK_0590 exuR exuT TRUE 0.601 128.000 0.433 1.000 N NA
 5732220 5732221 KPK_0591 KPK_0592 uxaC uxaA TRUE 0.949 19.000 0.092 1.000 Y NA
 5732221 5732222 KPK_0592 KPK_0593 uxaA   FALSE 0.267 130.000 0.126 NA   NA
 5732223 5732224 KPK_0594 KPK_0595 sstT alx FALSE 0.005 232.000 0.000 1.000 N NA
 5732224 5732225 KPK_0595 KPK_0596 alx   FALSE 0.003 272.000 0.000 1.000   NA
 5732225 5732226 KPK_0596 KPK_0597     FALSE 0.292 74.000 0.072 NA   NA
 5732226 5732227 KPK_0597 KPK_0598     FALSE 0.053 79.000 0.000 NA   NA
 5732227 5732228 KPK_0598 KPK_0599     FALSE 0.039 130.000 0.000 1.000 N NA
 5732229 5732230 KPK_0600 KPK_0601     FALSE 0.068 77.000 0.000 1.000 N NA
 5732231 5732232 KPK_0602 KPK_0603 fadH lsrK FALSE 0.007 292.000 0.035 1.000 N NA
 5732232 5732233 KPK_0603 KPK_0604 lsrK lsrR TRUE 0.709 38.000 0.200 1.000 N NA
 5732234 5732235 KPK_0605 KPK_0606 lsrA lsrC TRUE 0.996 -3.000 0.818 1.000 Y NA
 5732235 5732236 KPK_0606 KPK_0607 lsrC lsrD TRUE 0.997 1.000 0.788 0.078 Y NA
 5732236 5732237 KPK_0607 KPK_0608 lsrD lsrB TRUE 0.996 -3.000 0.844 NA Y NA
 5732237 5732238 KPK_0608 KPK_0609 lsrB lsrF TRUE 0.972 12.000 0.125 NA Y NA
 5732238 5732239 KPK_0609 KPK_0610 lsrF lsrG TRUE 0.795 -3.000 0.056 1.000   NA
 5732240 5732241 KPK_0611 KPK_0612 ygjG   FALSE 0.002 258.000 0.000 NA N NA
 5732243 5732244 KPK_0614 KPK_0615     FALSE 0.357 11.000 0.000 NA   NA
 5732244 5732245 KPK_0615 KPK_0616   dhaM FALSE 0.082 76.000 0.000 1.000   NA
 5732245 5732246 KPK_0616 KPK_0617 dhaM dhaL TRUE 0.865 11.000 0.118 1.000   NA
 5732246 5732247 KPK_0617 KPK_0618 dhaL dhaK TRUE 0.990 11.000 0.226 0.001 Y NA
 5732248 5732249 KPK_0619 KPK_0620     FALSE 0.005 215.000 0.000 NA   NA
 5732249 5732250 KPK_0620 KPK_0622   dhaR TRUE 0.662 102.000 0.400 1.000 N NA
 5732251 5732252 KPK_0621 KPK_0623   dhaG TRUE 0.751 1.000 0.049 NA   NA
 5732252 5732253 KPK_0623 KPK_0624 dhaG dhaT FALSE 0.220 21.000 0.000 NA   NA
 5732253 5732254 KPK_0624 KPK_0625 dhaT   FALSE 0.507 22.000 0.037 NA   NA
 5732255 5732256 KPK_0626 KPK_0627 dhaB dhaC TRUE 0.991 13.000 1.000 0.001   NA
 5732256 5732257 KPK_0627 KPK_0628 dhaC dhaE TRUE 0.987 3.000 0.600 0.001   NA
 5732257 5732258 KPK_0628 KPK_0629 dhaE dhaF TRUE 0.976 13.000 0.714 NA   NA
 5732258 5732259 KPK_0629 KPK_0630 dhaF   FALSE 0.081 54.000 0.000 NA   NA
 5732260 5732261 KPK_0631 KPK_0632     FALSE 0.170 27.000 0.000 NA   NA
 5732263 5732264 KPK_0634 KPK_0635   evgA TRUE 0.969 5.000 0.000 0.011 Y NA
 5732266 5732267 KPK_0637 KPK_0638     FALSE 0.009 181.000 0.000 NA   NA
 5732268 5732269 KPK_0639 KPK_0640     FALSE 0.225 -28.000 0.000 NA   NA
 5732269 5732270 KPK_0640 KPK_0641     FALSE 0.373 8.000 0.000 NA   NA
 5732273 5732274 KPK_0644 KPK_0645 rpoD dnaG FALSE 0.105 219.000 0.299 1.000 N NA
 5732274 5732275 KPK_0645 KPK_0646 dnaG rpsU FALSE 0.232 112.000 0.067 1.000 N NA
 5732277 5732278 KPK_0648 KPK_0649   ureG FALSE 0.021 153.000 0.000 1.000 N NA
 5732278 5732279 KPK_0649 KPK_0650 ureG ureF TRUE 0.996 9.000 0.550 0.002 Y NA
 5732279 5732280 KPK_0650 KPK_0651 ureF ureE TRUE 0.996 2.000 0.560 0.002 Y NA
 5732280 5732281 KPK_0651 KPK_0652 ureE ureC TRUE 0.971 10.000 0.315 0.001 N NA
 5732281 5732282 KPK_0652 KPK_0653 ureC ureB TRUE 0.994 -7.000 0.486 0.001 Y NA
 5732282 5732283 KPK_0653 KPK_0654 ureB ureA TRUE 0.996 10.000 0.595 0.001 Y NA
 5732283 5732284 KPK_0654 KPK_0655 ureA ureD TRUE 0.986 10.000 0.664 0.002 N NA
 5732287 5732288 KPK_0658 KPK_0659 folB uppP FALSE 0.068 198.000 0.128 1.000 N NA
 5732289 5732290 KPK_0660 KPK_0661 cca   FALSE 0.398 62.000 0.106 NA N NA
 5732290 5732291 KPK_0661 KPK_0662     FALSE 0.395 0.000 0.000 NA   NA
 5732292 5732293 KPK_0663 KPK_0664   glnE TRUE 0.627 21.000 0.053 1.000   NA
 5732293 5732294 KPK_0664 KPK_0665 glnE hldE FALSE 0.386 59.000 0.083 1.000 N NA
 5732294 5732295 KPK_0665 KPK_0666 hldE glgS FALSE 0.006 219.000 0.000 1.000   NA
 5732300 5732301 KPK_0671 KPK_0672     TRUE 0.976 6.000 0.632 NA   NA
 5732301 5732302 KPK_0672 KPK_0673   tolC FALSE 0.370 168.000 0.480 NA   NA
 5732303 5732304 KPK_0674 KPK_0675     TRUE 0.964 -3.000 0.443 NA   NA
 5732304 5732305 KPK_0675 KPK_0676   cpdA TRUE 0.908 25.000 0.433 NA   NA
 5732305 5732306 KPK_0676 KPK_0677 cpdA yqiA TRUE 0.964 0.000 0.427 NA   NA
 5732306 5732307 KPK_0677 KPK_0678 yqiA parE TRUE 0.769 31.000 0.217 NA   NA
 5732308 5732309 KPK_0679 KPK_0680   mdaB FALSE 0.469 82.000 0.074 0.043   NA
 5732309 5732310 KPK_0680 KPK_0681 mdaB qseC FALSE 0.213 107.000 0.052 1.000   NA
 5732310 5732311 KPK_0681 KPK_0682 qseC qseB TRUE 0.993 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 5732312 5732313 KPK_0683 KPK_0684     FALSE 0.229 78.000 0.053 NA   NA
 5732313 5732314 KPK_0684 KPK_0685   parC TRUE 0.568 122.000 0.005 1.000 Y NA
 5732314 5732315 KPK_0685 KPK_0686 parC plsC FALSE 0.031 192.000 0.043 1.000 N NA
 5732315 5732316 KPK_0686 KPK_0687 plsC sufI FALSE 0.430 84.000 0.154 1.000 N NA
 5732316 5732317 KPK_0687 KPK_0688 sufI   FALSE 0.342 34.000 0.025 1.000 N NA
 5732318 5732319 KPK_0689 KPK_0690 dkgA yqhD FALSE 0.283 146.000 0.200 1.000   NA
 5732321 5732322 KPK_0692 KPK_0693   metC FALSE 0.359 132.000 0.212 NA   NA
 5732323 5732324 KPK_0694 KPK_0695 exbB exbD TRUE 0.997 7.000 0.810 0.092 Y NA
 5732324 5732325 KPK_0695 KPK_0696 exbD   FALSE 0.024 141.000 0.000 NA   NA
 5732325 5732326 KPK_0696 KPK_0697     FALSE 0.088 123.000 0.017 NA   NA
 5732326 5732327 KPK_0697 KPK_0698     FALSE 0.126 79.000 0.017 NA   NA
 5732328 5732329 KPK_0699 KPK_0700     FALSE 0.095 48.000 0.000 NA   NA
 5732330 5732331 KPK_0701 KPK_0702   gsp FALSE 0.054 77.000 0.000 NA   NA
 5732331 5732332 KPK_0702 KPK_0703 gsp   FALSE 0.392 146.000 0.000 1.000 Y NA
 5732333 5732334 KPK_0704 KPK_0705     FALSE 0.006 200.000 0.000 NA   NA
 5732334 5732335 KPK_0705 KPK_0706     FALSE 0.051 87.000 0.000 NA   NA
 5732337 5732338 KPK_0708 KPK_0709     TRUE 0.983 12.000 0.133 0.019 Y NA
 5732338 5732339 KPK_0709 KPK_0710     FALSE 0.000 680.000 0.000 NA   NA
 5732339 5732340 KPK_0710 KPK_0711     FALSE 0.046 105.000 0.000 NA   NA
 5732342 5732343 KPK_0713 KPK_0714 nupG mltC FALSE 0.036 192.000 0.056 NA   NA
 5732343 5732344 KPK_0714 KPK_0715 mltC yggX TRUE 0.529 49.000 0.128 NA N NA
 5732344 5732345 KPK_0715 KPK_0716 yggX mutY TRUE 0.702 29.000 0.150 NA N NA
 5732346 5732347 KPK_0717 KPK_0718 trmB   TRUE 0.851 0.000 0.092 NA   NA
 5732347 5732348 KPK_0718 KPK_0719     TRUE 0.566 51.000 0.155 NA   NA
 5732349 5732350 KPK_0720 KPK_0721   rdgB TRUE 0.901 -7.000 0.218 1.000 N NA
 5732350 5732351 KPK_0721 KPK_0722 rdgB   TRUE 0.559 13.000 0.016 NA   NA
 5732351 5732352 KPK_0722 KPK_0723     TRUE 0.828 -3.000 0.081 NA   NA
 5732352 5732353 KPK_0723 KPK_0724     TRUE 0.823 21.000 0.189 NA   NA
 5732354 5732355 KPK_0725 KPK_0726     FALSE 0.006 349.000 0.000 0.061 N NA
 5732356 5732357 KPK_0727 KPK_0728     TRUE 0.937 0.000 0.263 NA N NA
 5732357 5732358 KPK_0728 KPK_0729   gshB FALSE 0.100 175.000 0.120 NA N NA
 5732358 5732359 KPK_0729 KPK_0730 gshB rsmE TRUE 0.810 21.000 0.173 NA   NA
 5732359 5732360 KPK_0730 KPK_0731 rsmE endA FALSE 0.485 92.000 0.201 NA   NA
 5732360 5732361 KPK_0731 KPK_0732 endA sprT FALSE 0.492 95.000 0.210 NA   NA
 5732361 5732362 KPK_0732 KPK_0733 sprT galP FALSE 0.193 78.000 0.042 NA   NA
 5732362 5732363 KPK_0733 KPK_0734 galP metK FALSE 0.001 379.000 0.000 1.000 N NA
 5732363 5732364 KPK_0734 KPK_0735 metK   FALSE 0.039 148.000 0.004 NA   NA
 5732365 5732366 KPK_0736 KPK_0737   speA FALSE 0.106 87.000 0.009 NA   NA
 5732366 5732367 KPK_0737 KPK_0738 speA speB FALSE 0.138 234.000 0.055 1.000 Y NA
 5732371 5732372 KPK_0742 KPK_0743 tktA_1 epd FALSE 0.024 385.000 0.000 1.000 Y NA
 5732372 5732373 KPK_0743 KPK_0744 epd pgk TRUE 0.918 40.000 0.070 0.005 Y NA
 5732373 5732374 KPK_0744 KPK_0745 pgk fbaA TRUE 0.804 98.000 0.056 0.005 Y NA
 5732374 5732375 KPK_0745 KPK_0746 fbaA mscS FALSE 0.024 192.000 0.038 NA N NA
 5732375 5732376 KPK_0746 KPK_0747 mscS argO FALSE 0.078 152.000 0.049 NA   NA
 5732376 5732377 KPK_0747 KPK_0748 argO   FALSE 0.276 90.000 0.075 NA   NA
 5732382 5732383 KPK_0753 KPK_0754     FALSE 0.005 324.000 0.034 NA   NA
 5732384 5732385 KPK_0755 KPK_0756   pepP FALSE 0.485 24.000 0.036 NA   NA
 5732385 5732386 KPK_0756 KPK_0757 pepP ubiH TRUE 0.681 -3.000 0.026 1.000 N NA
 5732386 5732387 KPK_0757 KPK_0758 ubiH   TRUE 0.995 11.000 0.474 0.000 Y NA
 5732387 5732388 KPK_0758 KPK_0759   gcvT FALSE 0.002 390.000 0.004 1.000 N NA
 5732388 5732389 KPK_0759 KPK_0760 gcvT gcvH TRUE 0.982 25.000 0.317 0.001 Y NA
 5732389 5732390 KPK_0760 KPK_0761 gcvH gcvP FALSE 0.354 207.000 0.249 1.000 Y NA
 5732390 5732391 KPK_0761 KPK_0762 gcvP   FALSE 0.148 61.000 0.006 1.000 N NA
 5732392 5732393 KPK_0763 KPK_0764 scsD scsC TRUE 0.987 -10.000 0.298 0.004 Y NA
 5732393 5732394 KPK_0764 KPK_0765 scsC scsB TRUE 0.993 2.000 0.317 0.004 Y NA
 5732394 5732395 KPK_0765 KPK_0766 scsB scsA TRUE 0.779 56.000 0.438 NA   NA
 5732397 5732398 KPK_0768 KPK_0769 bglA   TRUE 0.517 120.000 0.167 0.025 N NA
 5732399 5732400 KPK_0770 KPK_0771     FALSE 0.121 164.000 0.113 NA   NA
 5732402 5732403 KPK_0773 KPK_0774     TRUE 0.655 -19.000 0.061 NA   NA
 5732405 5732406 KPK_0776 KPK_0777 xerD dsbC TRUE 0.672 23.000 0.079 1.000 N NA
 5732406 5732407 KPK_0777 KPK_0778 dsbC recJ TRUE 0.833 6.000 0.082 1.000 N NA
 5732407 5732408 KPK_0778 KPK_0779 recJ prfB FALSE 0.158 86.000 0.028 1.000 N NA
 5732408 5732409 KPK_0779 KPK_0780 prfB lysS TRUE 0.985 10.000 0.162 0.038 Y NA
 5732411 5732412 KPK_0782 KPK_0783     FALSE 0.052 81.000 0.000 NA   NA
 5732412 5732413 KPK_0783 KPK_0784     FALSE 0.023 142.000 0.000 NA   NA
 5732413 5732414 KPK_0784 KPK_0785     TRUE 0.797 -31.000 0.160 NA   NA
 5732414 5732415 KPK_0785 KPK_0786     FALSE 0.000 1054.000 0.000 NA   NA
 5732415 5732416 KPK_0786 KPK_0787     FALSE 0.001 357.000 0.000 NA   NA
 5732416 5732417 KPK_0787 KPK_0788     TRUE 0.860 99.000 1.000 NA   NA
 5732420 5732421 KPK_0791 KPK_0792     FALSE 0.138 33.000 0.000 NA   NA
 5732421 5732422 KPK_0792 KPK_0793     TRUE 0.754 21.000 0.033 0.042   NA
 5732422 5732423 KPK_0793 KPK_0794     FALSE 0.380 3.000 0.000 NA   NA
 5732424 5732425 KPK_0795 KPK_0796     FALSE 0.012 170.000 0.000 NA   NA
 5732426 5732427 KPK_0797 KPK_0798     FALSE 0.241 19.000 0.000 NA   NA
 5732428 5732429 KPK_0799 KPK_0800 arsR_1 arsB_1 FALSE 0.103 53.000 0.000 1.000 N NA
 5732429 5732430 KPK_0800 KPK_0801 arsB_1 arsC_1 TRUE 0.946 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5732430 5732431 KPK_0801 KPK_0802 arsC_1   FALSE 0.001 478.000 0.000 1.000 N NA
 5732431 5732432 KPK_0802 KPK_0803     FALSE 0.008 184.000 0.000 NA   NA
 5732433 5732434 KPK_0804 KPK_0805 mdtP mdtO TRUE 0.977 -3.000 0.625 NA   NA
 5732434 5732435 KPK_0805 KPK_0806 mdtO mdtN TRUE 0.984 13.000 1.000 NA   NA
 5732435 5732436 KPK_0806 KPK_0807 mdtN   TRUE 0.976 7.000 0.625 NA   NA
 5732437 5732438 KPK_0808 KPK_0809     TRUE 0.887 12.000 0.168 NA   NA
 5732439 5732440 KPK_0810 KPK_0811   fimH FALSE 0.322 168.000 0.400 NA   NA
 5732440 5732441 KPK_0811 KPK_0812 fimH fimG TRUE 0.983 18.000 0.833 0.006   NA
 5732441 5732442 KPK_0812 KPK_0813 fimG fimF TRUE 0.994 13.000 0.500 0.006 Y NA
 5732442 5732443 KPK_0813 KPK_0814 fimF fimD TRUE 0.991 11.000 0.500 1.000 Y NA
 5732443 5732444 KPK_0814 KPK_0815 fimD fimC TRUE 0.948 81.000 0.750 1.000 Y NA
 5732444 5732445 KPK_0815 KPK_0816 fimC   TRUE 0.973 50.000 0.800 1.000 Y NA
 5732445 5732446 KPK_0816 KPK_0817   fimA TRUE 0.936 80.000 0.400 0.006 Y NA
 5732446 5732447 KPK_0817 KPK_0818 fimA fimE FALSE 0.001 481.000 0.000 1.000 N NA
 5732447 5732448 KPK_0818 KPK_0819 fimE   FALSE 0.007 191.000 0.000 NA   NA
 5732448 5732449 KPK_0819 KPK_0820   fimB FALSE 0.016 154.000 0.000 NA   NA
 5732449 5732450 KPK_0820 KPK_0821 fimB   FALSE 0.198 24.000 0.000 NA   NA
 5732453 5732454 KPK_0824 KPK_0825     TRUE 0.684 62.000 0.000 1.000 Y NA
 5732454 5732455 KPK_0825 KPK_0826     TRUE 0.939 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5732455 5732456 KPK_0826 KPK_0827     FALSE 0.003 274.000 0.000 1.000   NA
 5732456 5732457 KPK_0827 KPK_0829     FALSE 0.040 137.000 0.000 1.000   NA
 5732461 5732462 KPK_0832 KPK_0833 mrkF   TRUE 0.953 72.000 0.750 1.000 Y NA
 5732462 5732463 KPK_0833 KPK_0834   mrkC TRUE 0.996 12.000 1.000 1.000 Y NA
 5732463 5732464 KPK_0834 KPK_0835 mrkC   TRUE 0.993 -9.000 0.750 1.000 Y NA
 5732464 5732465 KPK_0835 KPK_0836     TRUE 0.996 14.000 0.750 0.006 Y NA
 5732466 5732467 KPK_0837 KPK_0838     FALSE 0.392 144.000 0.000 NA Y NA
 5732467 5732468 KPK_0838 KPK_0839     FALSE 0.377 6.000 0.000 NA   NA
 5732468 5732469 KPK_0839 KPK_0840     FALSE 0.001 383.000 0.000 NA   NA
 5732469 5732470 KPK_0840 KPK_0841     FALSE 0.113 120.000 0.033 NA N NA
 5732470 5732471 KPK_0841 KPK_0842     FALSE 0.279 125.000 0.119 NA   NA
 5732472 5732473 KPK_0843 KPK_0844     FALSE 0.049 119.000 0.000 1.000 N NA
 5732473 5732474 KPK_0844 KPK_0845     FALSE 0.004 250.000 0.000 1.000   NA
 5732475 5732476 KPK_0846 KPK_0847 ogl   FALSE 0.036 124.000 0.000 NA   NA
 5732477 5732478 KPK_0848 KPK_0850 kduD araE FALSE 0.002 299.000 0.000 1.000 N NA
 5732480 5732481 KPK_0851 KPK_0852   cscA TRUE 0.882 17.000 0.219 1.000   NA
 5732481 5732482 KPK_0852 KPK_0853 cscA   FALSE 0.188 122.000 0.062 NA   NA
 5732483 5732484 KPK_0854 KPK_0855 togB togA TRUE 0.969 17.000 0.101 0.076 Y NA
 5732484 5732485 KPK_0855 KPK_0856 togA togN TRUE 0.980 13.000 0.131 0.076 Y NA
 5732485 5732486 KPK_0856 KPK_0857 togN togM TRUE 0.996 -7.000 0.917 0.076 Y NA
 5732486 5732487 KPK_0857 KPK_0858 togM   FALSE 0.001 307.000 0.000 NA   NA
 5732487 5732488 KPK_0858 KPK_0859   kdgF FALSE 0.379 4.000 0.000 NA   NA
 5732493 5732494 KPK_0864 KPK_0865     TRUE 0.991 8.000 0.480 1.000 Y NA
 5732494 5732495 KPK_0865 KPK_0866     FALSE 0.421 68.000 0.120 1.000 N NA
 5732495 5732496 KPK_0866 KPK_0868     TRUE 0.976 -3.000 0.583 1.000   NA
 5732498 5732499 KPK_0869 KPK_0870 aas lplT TRUE 0.835 -7.000 0.124 NA   NA
 5732500 5732501 KPK_0871 KPK_0872 tas   FALSE 0.017 221.000 0.043 NA   NA
 5732501 5732502 KPK_0872 KPK_0873     TRUE 0.609 124.000 0.429 NA   NA
 5732502 5732503 KPK_0873 KPK_0874   mutH FALSE 0.273 64.000 0.052 1.000 N NA
 5732503 5732504 KPK_0874 KPK_0875 mutH   FALSE 0.142 86.000 0.026 NA   NA
 5732505 5732506 KPK_0876 KPK_0877 nudH ptsP TRUE 0.555 13.000 0.008 1.000 N NA
 5732506 5732507 KPK_0877 KPK_0878 ptsP lgt FALSE 0.004 246.000 0.000 1.000 N NA
 5732507 5732508 KPK_0878 KPK_0879 lgt thyA TRUE 0.898 7.000 0.164 1.000 N NA
 5732508 5732509 KPK_0879 KPK_0880 thyA ppdA FALSE 0.005 272.000 0.016 NA N NA
 5732509 5732510 KPK_0880 KPK_0881 ppdA ppdB TRUE 0.984 -9.000 0.368 NA Y NA
 5732510 5732511 KPK_0881 KPK_0882 ppdB   TRUE 0.939 15.000 0.373 NA   NA
 5732511 5732512 KPK_0882 KPK_0883   ppdC TRUE 0.950 -15.000 0.538 NA   NA
 5732512 5732513 KPK_0883 KPK_0884 ppdC recC TRUE 0.776 13.000 0.076 NA N NA
 5732513 5732514 KPK_0884 KPK_0885 recC ptrA FALSE 0.132 154.000 0.092 1.000 N NA
 5732514 5732515 KPK_0885 KPK_0886 ptrA recB TRUE 0.851 -3.000 0.092 1.000 N NA
 5732515 5732516 KPK_0886 KPK_0887 recB recD TRUE 0.997 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 5732517 5732518 KPK_0888 KPK_0889   argA FALSE 0.004 232.000 0.000 NA   NA
 5732519 5732520 KPK_0890 KPK_0891 amiC cobD FALSE 0.300 18.000 0.000 1.000 N NA
 5732521 5732522 KPK_0892 KPK_0893 pduX pduW TRUE 0.609 56.000 0.080 0.003 N NA
 5732522 5732523 KPK_0893 KPK_0894 pduW pduV TRUE 0.944 -3.000 0.292 1.000 N NA
 5732523 5732524 KPK_0894 KPK_0895 pduV pduU TRUE 0.974 5.000 0.100 1.000 Y NA
 5732524 5732525 KPK_0895 KPK_0896 pduU pduT TRUE 0.941 0.000 0.286 NA N NA
 5732525 5732526 KPK_0896 KPK_0897 pduT pduS TRUE 0.995 3.000 0.714 NA Y NA
 5732526 5732527 KPK_0897 KPK_0898 pduS pduQ TRUE 0.986 -3.000 0.259 1.000 Y NA
 5732527 5732528 KPK_0898 KPK_0899 pduQ pduP TRUE 0.984 12.000 0.148 0.042 Y NA
 5732528 5732529 KPK_0899 KPK_0900 pduP pduO TRUE 0.775 -3.000 0.049 1.000   NA
 5732529 5732530 KPK_0900 KPK_0901 pduO pduN TRUE 0.930 11.000 0.268 NA   NA
 5732530 5732531 KPK_0901 KPK_0902 pduN pduM TRUE 0.942 4.000 0.296 NA   NA
 5732531 5732532 KPK_0902 KPK_0903 pduM pduL TRUE 0.931 -3.000 0.242 NA   NA
 5732532 5732533 KPK_0903 KPK_0904 pduL pduK TRUE 0.985 0.000 0.242 NA Y NA
 5732533 5732534 KPK_0904 KPK_0905 pduK pduJ TRUE 0.986 22.000 0.645 NA Y NA
 5732534 5732535 KPK_0905 KPK_0906 pduJ pduH TRUE 0.787 19.000 0.130 NA   NA
 5732535 5732536 KPK_0906 KPK_0907 pduH pduG TRUE 0.719 -10.000 0.068 NA   NA
 5732536 5732537 KPK_0907 KPK_0908 pduG pduE TRUE 0.962 13.000 0.500 NA   NA
 5732537 5732538 KPK_0908 KPK_0909 pduE pduD TRUE 0.986 15.000 0.759 0.001   NA
 5732538 5732539 KPK_0909 KPK_0910 pduD pduC TRUE 0.966 11.000 0.273 0.001   NA
 5732539 5732540 KPK_0910 KPK_0911 pduC pduB TRUE 0.758 19.000 0.100 1.000 N NA
 5732540 5732541 KPK_0911 KPK_0912 pduB pduA TRUE 0.825 -3.000 0.083 NA N NA
 5732542 5732543 KPK_0913 KPK_0914   pduF FALSE 0.002 266.000 0.000 NA   NA
 5732543 5732544 KPK_0914 KPK_0915 pduF pocR FALSE 0.107 203.000 0.231 1.000 N NA
 5732544 5732545 KPK_0915 KPK_0916 pocR cobB FALSE 0.001 552.000 0.000 1.000 N NA
 5732545 5732546 KPK_0916 KPK_0917 cobB cbiB TRUE 0.986 -3.000 0.124 0.008 Y NA
 5732546 5732547 KPK_0917 KPK_0918 cbiB cobH TRUE 0.983 11.000 0.107 0.008 Y NA
 5732547 5732548 KPK_0918 KPK_0919 cobH cbiD TRUE 0.988 -3.000 0.168 0.008 Y NA
 5732548 5732549 KPK_0919 KPK_0920 cbiD cbiE TRUE 0.982 -6.000 0.126 0.008 Y NA
 5732549 5732550 KPK_0920 KPK_0921 cbiE cbiT TRUE 0.989 -10.000 0.300 0.000 Y NA
 5732550 5732551 KPK_0921 KPK_0922 cbiT cobM TRUE 0.973 -7.000 0.056 0.008 Y NA
 5732551 5732552 KPK_0922 KPK_0923 cobM cbiG TRUE 0.988 -19.000 0.397 0.008 Y NA
 5732552 5732553 KPK_0923 KPK_0924 cbiG cobJ TRUE 0.993 0.000 0.352 0.008 Y NA
 5732553 5732554 KPK_0924 KPK_0925 cobJ cobK TRUE 0.994 -3.000 0.423 0.008 Y NA
 5732554 5732555 KPK_0925 KPK_0926 cobK cbiK TRUE 0.956 11.000 0.029 1.000 Y NA
 5732555 5732556 KPK_0926 KPK_0927 cbiK cobI TRUE 0.965 -3.000 0.048 1.000 Y NA
 5732556 5732557 KPK_0927 KPK_0928 cobI cbiM TRUE 0.909 0.000 0.058 0.008 N NA
 5732557 5732558 KPK_0928 KPK_0929 cbiM cbiN TRUE 0.997 2.000 0.861 0.008 Y NA
 5732558 5732559 KPK_0929 KPK_0930 cbiN cbiQ TRUE 0.996 -13.000 0.804 0.001 Y NA
 5732559 5732560 KPK_0930 KPK_0931 cbiQ cbiO TRUE 0.988 9.000 0.152 0.001 Y NA
 5732560 5732561 KPK_0931 KPK_0932 cbiO cobQ TRUE 0.707 -3.000 0.033 1.000 N NA
 5732561 5732562 KPK_0932 KPK_0933 cobQ cobU TRUE 0.938 -6.000 0.000 1.000 Y NA
 5732562 5732563 KPK_0933 KPK_0934 cobU cobT TRUE 0.782 44.000 0.000 1.000 Y NA
 5732564 5732565 KPK_0935 KPK_0936     TRUE 0.978 4.000 0.667 NA   NA
 5732565 5732566 KPK_0936 KPK_0937     TRUE 0.959 -19.000 0.667 NA   NA
 5732566 5732567 KPK_0937 KPK_0938   vasA TRUE 0.953 -36.000 0.667 NA   NA
 5732567 5732568 KPK_0938 KPK_0939 vasA   FALSE 0.035 125.000 0.000 NA   NA
 5732568 5732569 KPK_0939 KPK_0940     TRUE 0.943 0.000 0.286 NA   NA
 5732569 5732570 KPK_0940 KPK_0941     FALSE 0.001 439.000 0.000 NA   NA
 5732570 5732571 KPK_0941 KPK_0942     FALSE 0.050 90.000 0.000 NA   NA
 5732571 5732572 KPK_0942 KPK_0943     FALSE 0.236 -22.000 0.000 NA   NA
 5732572 5732573 KPK_0943 KPK_0944     FALSE 0.230 20.000 0.000 NA   NA
 5732573 5732574 KPK_0944 KPK_0945     FALSE 0.004 216.000 0.000 NA   NA
 5732574 5732575 KPK_0945 KPK_0946     TRUE 0.978 3.000 0.667 NA   NA
 5732575 5732576 KPK_0946 KPK_0947     TRUE 0.951 -3.000 0.333 NA   NA
 5732576 5732577 KPK_0947 KPK_0948     FALSE 0.382 2.000 0.000 NA   NA
 5732577 5732578 KPK_0948 KPK_0949     FALSE 0.001 491.000 0.000 NA   NA
 5732578 5732579 KPK_0949 KPK_0950     FALSE 0.000 601.000 0.000 NA   NA
 5732579 5732580 KPK_0950 KPK_0951     FALSE 0.138 33.000 0.000 NA   NA
 5732580 5732581 KPK_0951 KPK_0952     FALSE 0.127 36.000 0.000 NA   NA
 5732582 5732583 KPK_0953 KPK_0954 mltA   FALSE 0.063 88.000 0.000 1.000 N NA
 5732584 5732585 KPK_0955 KPK_0956 csdE csdA TRUE 0.948 0.000 0.122 0.001   NA
 5732586 5732587 KPK_0957 KPK_0958   gcvA FALSE 0.001 352.000 0.000 NA   NA
 5732587 5732588 KPK_0958 KPK_0959 gcvA   TRUE 0.699 20.000 0.081 NA   NA
 5732588 5732589 KPK_0959 KPK_0960     TRUE 0.854 -7.000 0.144 NA   NA
 5732590 5732591 KPK_0961 KPK_0962 fucR fucU TRUE 0.906 59.000 0.308 1.000 Y NA
 5732591 5732592 KPK_0962 KPK_0963 fucU fucK TRUE 0.983 2.000 0.211 1.000 Y NA
 5732594 5732595 KPK_0964 KPK_0966 fucI fucP TRUE 0.903 33.000 0.104 NA Y NA
 5732595 5732596 KPK_0966 KPK_0967 fucP   FALSE 0.001 316.000 0.000 NA   NA
 5732597 5732598 KPK_0968 KPK_0969 fucA fucO TRUE 0.563 28.000 0.066 1.000 N NA
 5732599 5732600 KPK_0970 KPK_0971 xni   FALSE 0.062 97.000 0.000 1.000 N NA
 5732601 5732602 KPK_0972 KPK_0973     FALSE 0.054 78.000 0.000 NA   NA
 5732602 5732603 KPK_0973 KPK_0974     FALSE 0.430 47.000 0.065 1.000   NA
 5732603 5732604 KPK_0974 KPK_0975     TRUE 0.553 74.000 0.231 NA   NA
 5732604 5732605 KPK_0975 KPK_0976     FALSE 0.316 -3.000 0.000 NA N NA
 5732605 5732606 KPK_0976 KPK_0977     TRUE 0.981 -3.000 0.182 1.000 Y NA
 5732606 5732607 KPK_0977 KPK_0978     TRUE 0.947 -3.000 0.000 NA Y NA
 5732607 5732608 KPK_0978 KPK_0979     FALSE 0.005 194.000 0.000 NA N NA
 5732608 5732609 KPK_0979 KPK_0980     TRUE 0.824 -7.000 0.105 1.000 N NA
 5732610 5732611 KPK_0981 KPK_0982   sdaB FALSE 0.031 139.000 0.000 1.000 N NA
 5732611 5732612 KPK_0982 KPK_0983 sdaB sdaC TRUE 0.670 66.000 0.000 1.000 Y NA
 5732612 5732613 KPK_0983 KPK_0984 sdaC   FALSE 0.001 510.000 0.000 NA   NA
 5732613 5732614 KPK_0984 KPK_0985   queF FALSE 0.247 112.000 0.079 NA   NA
 5732615 5732616 KPK_0986 KPK_0987     FALSE 0.000 633.000 0.000 NA   NA
 5732616 5732617 KPK_0987 KPK_0988   truC TRUE 0.972 0.000 0.518 NA   NA
 5732617 5732618 KPK_0988 KPK_0989 truC   TRUE 0.920 5.000 0.209 1.000 N NA
 5732618 5732619 KPK_0989 KPK_0990     FALSE 0.001 472.000 0.000 1.000 N NA
 5732619 5732620 KPK_0990 KPK_0991   gudX FALSE 0.442 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5732620 5732621 KPK_0991 KPK_0992 gudX gudD TRUE 0.954 18.000 0.000 0.000 Y NA
 5732621 5732622 KPK_0992 KPK_0993 gudD   FALSE 0.072 73.000 0.000 1.000 N NA
 5732624 5732625 KPK_0995 KPK_0996 rumA relA FALSE 0.243 121.000 0.082 1.000 N NA
 5732625 5732626 KPK_0996 KPK_0997 relA   FALSE 0.003 412.000 0.040 1.000   NA
 5732626 5732627 KPK_0997 KPK_0998   pyrG FALSE 0.007 281.000 0.025 1.000   NA
 5732627 5732628 KPK_0998 KPK_0999 pyrG eno FALSE 0.275 81.000 0.068 1.000 N NA
 5732630 5732631 KPK_1001 KPK_1002     FALSE 0.036 124.000 0.000 NA   NA
 5732633 5732634 KPK_1004 KPK_1005 cysJ cysI TRUE 0.997 0.000 0.791 0.001 Y NA
 5732634 5732635 KPK_1005 KPK_1006 cysI cysH FALSE 0.359 99.000 0.116 1.000 N NA
 5732637 5732638 KPK_1008 KPK_1009 cysF cysD TRUE 0.990 10.000 0.417 1.000 Y NA
 5732638 5732639 KPK_1009 KPK_1010 cysD cysN TRUE 0.985 10.000 0.574 0.000 N NA
 5732639 5732640 KPK_1010 KPK_1011 cysN cysC TRUE 0.989 0.000 0.340 1.000 Y NA
 5732640 5732641 KPK_1011 KPK_1012 cysC   TRUE 0.620 51.000 0.198 NA   NA
 5732641 5732642 KPK_1012 KPK_1013   ftsB FALSE 0.071 141.000 0.028 NA   NA
 5732642 5732643 KPK_1013 KPK_1014 ftsB ispD TRUE 0.833 20.000 0.185 1.000 N NA
 5732643 5732644 KPK_1014 KPK_1015 ispD ispF TRUE 0.991 0.000 0.419 1.000 Y NA
 5732644 5732645 KPK_1015 KPK_1016 ispF truD TRUE 0.910 -3.000 0.173 1.000   NA
 5732645 5732646 KPK_1016 KPK_1017 truD surE TRUE 0.878 -19.000 0.235 1.000   NA
 5732646 5732647 KPK_1017 KPK_1018 surE pcm TRUE 0.946 -6.000 0.353 1.000   NA
 5732647 5732648 KPK_1018 KPK_1019 pcm nlpD FALSE 0.115 126.000 0.030 1.000 N NA
 5732648 5732649 KPK_1019 KPK_1020 nlpD rpoS FALSE 0.164 158.000 0.142 1.000 N NA
 5732650 5732651 KPK_1021 KPK_1022     FALSE 0.384 -3.000 0.000 NA   NA
 5732654 5732655 KPK_1025 KPK_1026 kpdB kpdC TRUE 0.975 0.000 0.000 0.001 Y NA
 5732655 5732656 KPK_1026 KPK_1027 kpdC kpdD TRUE 0.848 11.000 0.000 0.001   NA
 5732656 5732657 KPK_1027 KPK_1028 kpdD   FALSE 0.001 338.000 0.000 NA   NA
 5732658 5732659 KPK_1029 KPK_1030 mutS   FALSE 0.001 459.000 0.000 1.000 N NA
 5732659 5732660 KPK_1030 KPK_1031   hmuV FALSE 0.012 179.000 0.000 1.000 N NA
 5732660 5732661 KPK_1031 KPK_1032 hmuV hmuU TRUE 0.978 -7.000 0.220 1.000 Y NA
 5732661 5732662 KPK_1032 KPK_1033 hmuU hmuT TRUE 0.996 0.000 0.852 1.000 Y NA
 5732662 5732663 KPK_1033 KPK_1034 hmuT hmuS TRUE 0.990 -3.000 0.384 1.000 Y NA
 5732663 5732664 KPK_1034 KPK_1035 hmuS   TRUE 0.652 72.000 0.000 1.000 Y NA
 5732666 5732667 KPK_1037 KPK_1038     FALSE 0.183 36.000 0.000 1.000   NA
 5732668 5732669 KPK_1039 KPK_1040     FALSE 0.061 68.000 0.000 NA   NA
 5732670 5732671 KPK_1041 KPK_1042 afeD afeC TRUE 0.994 -6.000 0.525 0.005 Y NA
 5732671 5732672 KPK_1042 KPK_1043 afeC afeB TRUE 0.997 -3.000 0.857 0.092 Y NA
 5732672 5732673 KPK_1043 KPK_1044 afeB afeA TRUE 0.996 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 5732673 5732674 KPK_1044 KPK_1045 afeA   FALSE 0.011 182.000 0.000 1.000 N NA
 5732674 5732675 KPK_1045 KPK_1046     TRUE 0.852 57.000 0.143 1.000 Y NA
 5732675 5732676 KPK_1046 KPK_1047     TRUE 0.874 51.000 0.143 1.000 Y NA
 5732676 5732677 KPK_1047 KPK_1048     TRUE 0.981 24.000 0.333 0.014 Y NA
 5732677 5732678 KPK_1048 KPK_1049     TRUE 0.997 10.000 0.857 0.014 Y NA
 5732679 5732680 KPK_1050 KPK_1051     FALSE 0.107 263.000 0.000 0.018 Y NA
 5732680 5732681 KPK_1051 KPK_1052     TRUE 0.914 13.000 0.222 1.000   NA
 5732681 5732682 KPK_1052 KPK_1053     TRUE 0.796 50.000 0.222 0.006   NA
 5732683 5732684 KPK_1054 KPK_1055 fhlA hypE FALSE 0.024 185.000 0.019 1.000 N NA
 5732684 5732685 KPK_1055 KPK_1056 hypE hypD TRUE 0.989 -3.000 0.353 1.000 Y NA
 5732685 5732686 KPK_1056 KPK_1057 hypD hypC TRUE 0.949 0.000 0.000 NA Y NA
 5732686 5732687 KPK_1057 KPK_1058 hypC hypB TRUE 0.923 -9.000 0.000 NA Y NA
 5732687 5732688 KPK_1058 KPK_1059 hypB hypA TRUE 0.971 4.000 0.306 0.002   NA
 5732689 5732690 KPK_1060 KPK_1061 hycA hycB FALSE 0.051 83.000 0.000 NA   NA
 5732690 5732691 KPK_1061 KPK_1062 hycB hycC TRUE 0.950 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5732691 5732692 KPK_1062 KPK_1063 hycC hycD TRUE 0.990 3.000 0.382 1.000 Y NA
 5732692 5732693 KPK_1063 KPK_1064 hycD hycE TRUE 0.974 17.000 0.235 1.000 Y NA
 5732693 5732694 KPK_1064 KPK_1065 hycE hycF TRUE 0.539 165.000 0.200 1.000 Y NA
 5732694 5732695 KPK_1065 KPK_1066 hycF hycG TRUE 0.976 0.000 0.111 1.000 Y NA
 5732695 5732696 KPK_1066 KPK_1067 hycG   TRUE 0.895 -3.000 0.156 NA   NA
 5732696 5732697 KPK_1067 KPK_1069   hycI TRUE 0.939 -7.000 0.360 NA   NA
 5732698 5732699 KPK_1068 KPK_1070   ascB FALSE 0.050 182.000 0.061 NA   NA
 5732699 5732700 KPK_1070 KPK_1071 ascB ascF TRUE 0.976 27.000 0.485 1.000 Y NA
 5732701 5732702 KPK_1072 KPK_1073 ascG hydN FALSE 0.456 136.000 0.316 1.000 N NA
 5732702 5732703 KPK_1073 KPK_1074 hydN hypF TRUE 0.634 9.000 0.018 1.000 N NA
 5732703 5732704 KPK_1074 KPK_1075 hypF hoxN TRUE 0.648 -3.000 0.018 1.000 N NA
 5732704 5732705 KPK_1075 KPK_1076 hoxN   FALSE 0.000 513.000 0.000 NA N NA
 5732707 5732708 KPK_1078 KPK_1079     TRUE 0.988 -3.000 0.341 NA Y NA
 5732709 5732710 KPK_1080 KPK_1081 norW norV TRUE 0.832 -3.000 0.083 NA   NA
 5732712 5732713 KPK_1082 KPK_1084 gutQ srlR TRUE 0.965 -7.000 0.562 1.000 N NA
 5732713 5732714 KPK_1084 KPK_1085 srlR gutM TRUE 0.837 68.000 0.183 NA Y NA
 5732714 5732715 KPK_1085 KPK_1086 gutM srlD FALSE 0.373 125.000 0.197 NA N NA
 5732715 5732716 KPK_1086 KPK_1087 srlD srlB TRUE 0.924 13.000 0.260 1.000 N NA
 5732716 5732717 KPK_1087 KPK_1088 srlB srlE TRUE 0.994 14.000 0.533 0.014 Y NA
 5732717 5732718 KPK_1088 KPK_1089 srlE srlA TRUE 0.993 -3.000 0.349 0.014 Y NA
 5732721 5732722 KPK_1092 KPK_1093     TRUE 0.994 -3.000 0.465 0.091 Y NA
 5732722 5732723 KPK_1093 KPK_1094     TRUE 0.990 8.000 0.400 1.000 Y NA
 5732723 5732724 KPK_1094 KPK_1095     FALSE 0.066 139.000 0.021 NA   NA
 5732724 5732725 KPK_1095 KPK_1096   recA FALSE 0.293 91.000 0.082 NA   NA
 5732725 5732726 KPK_1096 KPK_1097 recA recX TRUE 0.638 71.000 0.296 1.000   NA
 5732726 5732727 KPK_1097 KPK_1098 recX alaS FALSE 0.025 252.000 0.085 1.000   NA
 5732727 5732728 KPK_1098 KPK_1099 alaS csrA FALSE 0.003 365.000 0.020 1.000 N NA
 5732728 5732729 KPK_1099 KPK_1100 csrA   FALSE 0.001 322.000 0.000 NA   NA
 5732729 5732730 KPK_1100 KPK_1101     FALSE 0.380 3.000 0.000 NA   NA
 5732730 5732731 KPK_1101 KPK_1102     FALSE 0.002 281.000 0.000 NA   NA
 5732731 5732732 KPK_1102 KPK_1103     FALSE 0.069 60.000 0.000 NA   NA
 5732732 5732733 KPK_1103 KPK_1104     FALSE 0.004 227.000 0.000 NA   NA
 5732733 5732734 KPK_1104 KPK_1105     FALSE 0.002 288.000 0.000 NA   NA
 5732734 5732735 KPK_1105 KPK_1106     FALSE 0.139 125.000 0.044 NA   NA
 5732735 5732736 KPK_1106 KPK_1107     TRUE 0.799 -3.000 0.067 NA   NA
 5732736 5732737 KPK_1107 KPK_1108   gshA FALSE 0.308 67.000 0.071 NA   NA
 5732737 5732738 KPK_1108 KPK_1109 gshA luxS FALSE 0.105 164.000 0.087 1.000 N NA
 5732738 5732739 KPK_1109 KPK_1111 luxS   FALSE 0.178 53.000 0.006 1.000 N NA
 5732740 5732741 KPK_1110 KPK_1112 leuA_2 emrB FALSE 0.253 137.000 0.136 1.000 N NA
 5732741 5732742 KPK_1112 KPK_1113 emrB emrA TRUE 0.977 16.000 0.875 1.000 N NA
 5732742 5732743 KPK_1113 KPK_1114 emrA mprA FALSE 0.269 126.000 0.107 1.000 N NA
 5732743 5732744 KPK_1114 KPK_1115 mprA   FALSE 0.249 91.000 0.065 NA   NA
 5732744 5732745 KPK_1115 KPK_1116     TRUE 0.978 -10.000 0.915 NA   NA
 5732745 5732746 KPK_1116 KPK_1117   proX FALSE 0.221 184.000 0.013 NA Y NA
 5732746 5732747 KPK_1117 KPK_1118 proX proW TRUE 0.959 79.000 0.695 0.075 Y NA
 5732747 5732748 KPK_1118 KPK_1119 proW proV TRUE 0.992 -7.000 0.630 1.000 Y NA
 5732748 5732749 KPK_1119 KPK_1120 proV nrdF FALSE 0.001 358.000 0.000 1.000 N NA
 5732749 5732750 KPK_1120 KPK_1121 nrdF nrdE TRUE 0.981 11.000 0.071 0.001 Y NA
 5732750 5732751 KPK_1121 KPK_1122 nrdE nrdI TRUE 0.938 -27.000 0.081 NA Y NA
 5732751 5732752 KPK_1122 KPK_1123 nrdI nrdH TRUE 0.635 -3.000 0.026 NA N NA
 5732752 5732753 KPK_1123 KPK_1124 nrdH   FALSE 0.018 184.000 0.009 NA   NA
 5732758 5732759 KPK_1129 KPK_1130   stpA FALSE 0.001 517.000 0.000 NA   NA
 5732762 5732763 KPK_1132 KPK_1134     TRUE 0.608 8.000 0.023 NA N NA
 5732763 5732764 KPK_1134 KPK_1135     FALSE 0.069 76.000 0.000 1.000 N NA
 5732765 5732766 KPK_1136 KPK_1137     FALSE 0.103 60.000 0.000 1.000   NA
 5732767 5732768 KPK_1138 KPK_1139     FALSE 0.085 52.000 0.000 NA   NA
 5732769 5732770 KPK_1140 KPK_1141 olgA   FALSE 0.006 201.000 0.000 NA   NA
 5732770 5732771 KPK_1141 KPK_1142     FALSE 0.001 385.000 0.000 NA   NA
 5732771 5732772 KPK_1142 KPK_1143     FALSE 0.062 67.000 0.000 NA   NA
 5732772 5732773 KPK_1143 KPK_1144     FALSE 0.363 10.000 0.000 NA   NA
 5732773 5732774 KPK_1144 KPK_1145     FALSE 0.493 130.000 0.000 1.000 Y NA
 5732774 5732775 KPK_1145 KPK_1147     TRUE 0.948 8.000 0.000 1.000 Y NA
 5732776 5732777 KPK_1146 KPK_1148     TRUE 0.950 37.000 0.333 1.000 Y NA
 5732779 5732780 KPK_1150 KPK_1151     FALSE 0.015 158.000 0.000 NA   NA
 5732780 5732781 KPK_1151 KPK_1152     FALSE 0.085 61.000 0.000 1.000 N NA
 5732781 5732782 KPK_1152 KPK_1153     FALSE 0.435 6.000 0.000 1.000 N NA
 5732782 5732783 KPK_1153 KPK_1154     FALSE 0.445 1.000 0.000 1.000 N NA
 5732783 5732784 KPK_1154 KPK_1155     TRUE 0.967 31.000 1.000 0.075 N NA
 5732784 5732785 KPK_1155 KPK_1156     TRUE 0.836 20.000 0.182 1.000   NA
 5732785 5732786 KPK_1156 KPK_1157     TRUE 0.905 6.000 0.182 NA   NA
 5732786 5732787 KPK_1157 KPK_1158     FALSE 0.292 11.000 0.000 NA N NA
 5732788 5732789 KPK_1159 KPK_1160     FALSE 0.001 649.000 0.000 1.000   NA
 5732789 5732790 KPK_1160 KPK_1161     FALSE 0.007 189.000 0.000 NA   NA
 5732791 5732792 KPK_1162 KPK_1163 oqxB oqxA TRUE 0.956 24.000 0.750 1.000 N NA
 5732795 5732796 KPK_1166 KPK_1167     FALSE 0.028 135.000 0.000 NA   NA
 5732797 5732798 KPK_1168 KPK_1169     FALSE 0.001 450.000 0.000 NA   NA
 5732798 5732799 KPK_1169 KPK_1170     FALSE 0.047 102.000 0.000 NA   NA
 5732799 5732800 KPK_1170 KPK_1171     FALSE 0.012 169.000 0.000 NA   NA
 5732801 5732802 KPK_1172 KPK_1173     TRUE 0.966 -3.000 0.065 NA Y NA
 5732802 5732803 KPK_1173 KPK_1174     FALSE 0.097 63.000 0.000 1.000   NA
 5732803 5732804 KPK_1174 KPK_1175     TRUE 0.961 0.000 0.400 NA   NA
 5732804 5732805 KPK_1175 KPK_1176     TRUE 0.968 -3.000 0.491 NA   NA
 5732805 5732806 KPK_1176 KPK_1177     FALSE 0.000 1002.000 0.000 NA   NA
 5732808 5732809 KPK_1179 KPK_1180     TRUE 0.813 -10.000 0.124 NA   NA
 5732810 5732811 KPK_1181 KPK_1182   recN FALSE 0.094 148.000 0.049 1.000 N NA
 5732811 5732812 KPK_1182 KPK_1183 recN ppnK FALSE 0.452 87.000 0.170 1.000 N NA
 5732814 5732815 KPK_1185 KPK_1186     TRUE 0.908 20.000 0.349 NA   NA
 5732816 5732817 KPK_1187 KPK_1188 ffh rpsP FALSE 0.048 307.000 0.361 1.000 N NA
 5732817 5732818 KPK_1188 KPK_1189 rpsP rimM TRUE 0.986 19.000 0.342 0.009 Y NA
 5732818 5732819 KPK_1189 KPK_1190 rimM trmD TRUE 0.980 32.000 0.672 1.000 Y NA
 5732819 5732820 KPK_1190 KPK_1191 trmD rplS TRUE 0.969 40.000 0.567 1.000 Y NA
 5732820 5732821 KPK_1191 KPK_1192 rplS   FALSE 0.076 119.000 0.005 NA   NA
 5732821 5732822 KPK_1192 KPK_1193     FALSE 0.462 57.000 0.120 NA   NA
 5732823 5732824 KPK_1194 KPK_1195     TRUE 0.957 14.000 0.475 1.000 N NA
 5732824 5732825 KPK_1195 KPK_1196     TRUE 0.955 -7.000 0.475 NA   NA
 5732825 5732826 KPK_1196 KPK_1197     FALSE 0.040 116.000 0.000 NA   NA
 5732827 5732828 KPK_1198 KPK_1199 aroF tyrA TRUE 0.957 10.000 0.030 1.000 Y NA
 5732828 5732829 KPK_1199 KPK_1201 tyrA   FALSE 0.315 63.000 0.073 NA N NA
 5732830 5732831 KPK_1200 KPK_1202 pheA   FALSE 0.006 255.000 0.015 NA N NA
 5732831 5732832 KPK_1202 KPK_1203     FALSE 0.004 272.000 0.004 NA   NA
 5732833 5732834 KPK_1204 KPK_1205 rluD   TRUE 0.901 -3.000 0.168 NA   NA
 5732834 5732835 KPK_1205 KPK_1206   clpB FALSE 0.241 130.000 0.108 NA   NA
 5732835 5732836 KPK_1206 KPK_1207 clpB rrsB FALSE 0.001 473.000 0.000 NA   NA
 5732836 5732837 KPK_1207 KPK_1208 rrsB   FALSE 0.051 86.000 0.000 NA   NA
 5732837 5732838 KPK_1208 KPK_1209   rrlB FALSE 0.010 178.000 0.000 NA   NA
 5732838 5732839 KPK_1209 KPK_1210 rrlB rrfB FALSE 0.007 190.000 0.000 NA   NA
 5732839 5732840 KPK_1210 KPK_1211 rrfB kgtP FALSE 0.001 429.000 0.000 NA   NA
 5732841 5732842 KPK_1212 KPK_1213   pssA TRUE 0.516 42.000 0.089 NA   NA
 5732842 5732843 KPK_1213 KPK_1214 pssA   FALSE 0.432 121.000 0.121 0.073 N NA
 5732843 5732844 KPK_1214 KPK_1215     TRUE 0.748 35.000 0.222 NA   NA
 5732844 5732845 KPK_1215 KPK_1216     FALSE 0.060 70.000 0.000 NA   NA
 5732851 5732852 KPK_1221 KPK_1223 nadB   FALSE 0.004 222.000 0.000 NA   NA
 5732853 5732854 KPK_1224 KPK_1225 rpoE rseA TRUE 0.925 33.000 0.705 NA N NA
 5732854 5732855 KPK_1225 KPK_1226 rseA rseB TRUE 0.996 0.000 0.856 NA Y NA
 5732855 5732856 KPK_1226 KPK_1227 rseB rseC TRUE 0.994 -3.000 0.609 NA Y NA
 5732856 5732857 KPK_1227 KPK_1228 rseC lepA FALSE 0.032 186.000 0.045 NA N NA
 5732857 5732858 KPK_1228 KPK_1229 lepA lepB TRUE 0.891 14.000 0.187 1.000   NA
 5732858 5732859 KPK_1229 KPK_1230 lepB rnc FALSE 0.032 250.000 0.117 1.000   NA
 5732859 5732860 KPK_1230 KPK_1231 rnc era TRUE 0.933 -3.000 0.127 0.058   NA
 5732860 5732861 KPK_1231 KPK_1232 era recO TRUE 0.855 12.000 0.109 1.000   NA
 5732861 5732862 KPK_1232 KPK_1233 recO pdxJ TRUE 0.888 12.000 0.166 1.000 N NA
 5732862 5732863 KPK_1233 KPK_1234 pdxJ acpS TRUE 0.953 0.000 0.326 1.000 N NA
 5732864 5732865 KPK_1235 KPK_1236     FALSE 0.301 57.000 0.056 NA   NA
 5732866 5732867 KPK_1237 KPK_1239 yhfB tadA FALSE 0.503 30.000 0.062 NA N NA
 5732869 5732870 KPK_1240 KPK_1241 purL   FALSE 0.001 574.000 0.000 1.000 N NA
 5732870 5732871 KPK_1241 KPK_1242     FALSE 0.374 30.000 0.029 NA   NA
 5732871 5732872 KPK_1242 KPK_1243     TRUE 0.540 -13.000 0.029 NA   NA
 5732872 5732873 KPK_1243 KPK_1244   glnB FALSE 0.474 66.000 0.146 1.000 N NA
 5732878 5732879 KPK_1248 KPK_1250 csiE   FALSE 0.053 79.000 0.000 NA   NA
 5732880 5732881 KPK_1251 KPK_1252     TRUE 0.846 -9.000 0.150 NA   NA
 5732881 5732882 KPK_1252 KPK_1253     FALSE 0.049 100.000 0.000 NA   NA
 5732884 5732885 KPK_1255 KPK_1256   iscR FALSE 0.032 253.000 0.126 1.000 N NA
 5732885 5732886 KPK_1256 KPK_1257 iscR iscS FALSE 0.288 180.000 0.424 1.000 N NA
 5732886 5732887 KPK_1257 KPK_1258 iscS iscU TRUE 0.908 26.000 0.448 1.000 N NA
 5732887 5732888 KPK_1258 KPK_1259 iscU iscA TRUE 0.952 20.000 0.359 0.002   NA
 5732888 5732889 KPK_1259 KPK_1260 iscA hscB TRUE 0.757 75.000 0.500 1.000   NA
 5732889 5732890 KPK_1260 KPK_1261 hscB hscA TRUE 0.991 16.000 0.634 1.000 Y NA
 5732890 5732891 KPK_1261 KPK_1262 hscA fdx TRUE 0.983 2.000 0.794 1.000 N NA
 5732891 5732892 KPK_1262 KPK_1263 fdx iscX TRUE 0.978 2.000 0.625 1.000   NA
 5732892 5732893 KPK_1263 KPK_1264 iscX pepB FALSE 0.497 72.000 0.171 1.000   NA
 5732893 5732894 KPK_1264 KPK_1265 pepB sseB TRUE 0.541 98.000 0.253 NA   NA
 5732895 5732896 KPK_1266 KPK_1267     FALSE 0.047 103.000 0.000 NA   NA
 5732896 5732897 KPK_1267 KPK_1268   sseA FALSE 0.013 165.000 0.000 NA   NA
 5732898 5732899 KPK_1269 KPK_1270   pbpC TRUE 0.981 1.000 0.711 1.000   NA
 5732899 5732900 KPK_1270 KPK_1271 pbpC ndk FALSE 0.034 161.000 0.008 1.000 N NA
 5732900 5732901 KPK_1271 KPK_1272 ndk   FALSE 0.025 291.000 0.156 1.000   NA
 5732901 5732902 KPK_1272 KPK_1273     FALSE 0.379 4.000 0.000 NA   NA
 5732902 5732903 KPK_1273 KPK_1274     FALSE 0.036 124.000 0.000 NA   NA
 5732903 5732904 KPK_1274 KPK_1275   ispG TRUE 0.820 27.000 0.233 1.000   NA
 5732904 5732905 KPK_1275 KPK_1276 ispG hisS FALSE 0.499 92.000 0.207 1.000 N NA
 5732905 5732906 KPK_1276 KPK_1277 hisS   TRUE 0.787 35.000 0.259 1.000   NA
 5732906 5732907 KPK_1277 KPK_1278     TRUE 0.966 11.000 0.492 1.000   NA
 5732907 5732908 KPK_1278 KPK_1279   engA FALSE 0.502 96.000 0.203 1.000   NA
 5732908 5732909 KPK_1279 KPK_1280 engA   FALSE 0.059 118.000 0.000 1.000   NA
 5732909 5732910 KPK_1280 KPK_1282     FALSE 0.303 50.000 0.044 NA   NA
 5732912 5732913 KPK_1283 KPK_1284 guaB guaA TRUE 0.912 68.000 0.190 0.000 Y NA
 5732913 5732914 KPK_1284 KPK_1285 guaA   FALSE 0.005 261.000 0.002 1.000 N NA
 5732914 5732915 KPK_1285 KPK_1286     FALSE 0.047 292.000 0.309 1.000 N NA
 5732915 5732916 KPK_1286 KPK_1287     TRUE 0.729 4.000 0.044 NA   NA
 5732916 5732917 KPK_1287 KPK_1288     FALSE 0.264 -13.000 0.000 NA   NA
 5732918 5732919 KPK_1289 KPK_1290 trbL trbJ FALSE 0.326 194.000 0.167 NA Y NA
 5732919 5732920 KPK_1290 KPK_1291 trbJ   FALSE 0.002 270.000 0.000 NA   NA
 5732920 5732921 KPK_1291 KPK_1292     TRUE 0.968 3.000 0.500 NA   NA
 5732921 5732922 KPK_1292 KPK_1293     FALSE 0.001 407.000 0.000 NA   NA
 5732922 5732923 KPK_1293 KPK_1294     FALSE 0.085 52.000 0.000 NA   NA
 5732923 5732924 KPK_1294 KPK_1295     TRUE 0.595 4.000 0.013 NA   NA
 5732925 5732926 KPK_1296 KPK_1297     FALSE 0.045 106.000 0.000 NA   NA
 5732926 5732927 KPK_1297 KPK_1298     FALSE 0.020 148.000 0.000 NA   NA
 5732932 5732933 KPK_1303 KPK_1304 ppx ppk TRUE 0.992 4.000 0.486 1.000 Y NA
 5732935 5732936 KPK_1306 KPK_1307     FALSE 0.230 -25.000 0.000 NA   NA
 5732938 5732939 KPK_1309 KPK_1310 purN purM TRUE 0.991 -3.000 0.230 0.001 Y NA
 5732939 5732940 KPK_1310 KPK_1311 purM   FALSE 0.384 -3.000 0.000 NA   NA
 5732941 5732942 KPK_1312 KPK_1313 bglK   TRUE 0.946 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5732942 5732943 KPK_1313 KPK_1314   upp FALSE 0.010 218.000 0.005 1.000 N NA
 5732943 5732944 KPK_1314 KPK_1315 upp uraA TRUE 0.764 87.000 0.101 1.000 Y NA
 5732944 5732945 KPK_1315 KPK_1317 uraA hda FALSE 0.150 123.000 0.048 NA   NA
 5732946 5732947 KPK_1316 KPK_1318     FALSE 0.033 128.000 0.000 NA   NA
 5732947 5732948 KPK_1318 KPK_1319     TRUE 0.933 10.000 0.259 1.000   NA
 5732949 5732950 KPK_1320 KPK_1321     FALSE 0.078 55.000 0.000 NA   NA
 5732951 5732952 KPK_1322 KPK_1323   gcvR TRUE 0.859 4.000 0.102 1.000 N NA
 5732953 5732954 KPK_1324 KPK_1325 dapA   TRUE 0.912 17.000 0.000 NA Y NA
 5732954 5732955 KPK_1325 KPK_1326   purC FALSE 0.003 217.000 0.000 NA N NA
 5732955 5732956 KPK_1326 KPK_1327 purC   FALSE 0.038 120.000 0.000 NA   NA
 5732956 5732957 KPK_1327 KPK_1328     FALSE 0.363 10.000 0.000 NA   NA
 5732957 5732958 KPK_1328 KPK_1329     FALSE 0.212 77.000 0.048 NA   NA
 5732959 5732960 KPK_1330 KPK_1331   dapE FALSE 0.383 27.000 0.025 NA   NA
 5732960 5732961 KPK_1331 KPK_1332 dapE   TRUE 0.943 4.000 0.292 1.000 N NA
 5732961 5732962 KPK_1332 KPK_1333   acrD FALSE 0.001 553.000 0.000 1.000 N NA
 5732962 5732963 KPK_1333 KPK_1334 acrD   FALSE 0.319 14.000 0.000 NA   NA
 5732964 5732965 KPK_1335 KPK_1336     TRUE 0.531 59.000 0.167 1.000 N NA
 5732965 5732966 KPK_1336 KPK_1338     TRUE 0.680 64.000 0.333 NA   NA
 5732967 5732968 KPK_1337 KPK_1339 tktB talA TRUE 0.992 17.000 0.739 1.000 Y NA
 5732969 5732970 KPK_1340 KPK_1341 maeB   FALSE 0.029 219.000 0.070 1.000 N NA
 5732970 5732971 KPK_1341 KPK_1342   eutP TRUE 0.939 13.000 0.000 1.000 Y NA
 5732971 5732972 KPK_1342 KPK_1343 eutP   TRUE 0.898 -22.000 0.000 NA Y NA
 5732972 5732973 KPK_1343 KPK_1344   eutT TRUE 0.982 -3.000 0.214 NA Y NA
 5732973 5732974 KPK_1344 KPK_1345 eutT eutD TRUE 0.789 -10.000 0.095 1.000 N NA
 5732974 5732975 KPK_1345 KPK_1346 eutD eutM TRUE 0.959 39.000 0.455 NA Y NA
 5732975 5732976 KPK_1346 KPK_1347 eutM eutN FALSE 0.487 129.000 0.000 NA Y NA
 5732976 5732977 KPK_1347 KPK_1348 eutN eutE TRUE 0.939 12.000 0.000 NA Y NA
 5732977 5732978 KPK_1348 KPK_1349 eutE eutJ FALSE 0.420 10.000 0.000 1.000 N NA
 5732978 5732979 KPK_1349 KPK_1350 eutJ eutG TRUE 0.959 -10.000 0.556 1.000 N NA
 5732979 5732980 KPK_1350 KPK_1351 eutG eutH FALSE 0.008 200.000 0.000 1.000 N NA
 5732980 5732981 KPK_1351 KPK_1352 eutH eutA TRUE 0.947 -3.000 0.000 NA Y NA
 5732981 5732982 KPK_1352 KPK_1353 eutA eutB TRUE 0.992 12.000 0.600 NA Y NA
 5732982 5732983 KPK_1353 KPK_1354 eutB eutC TRUE 0.944 21.000 0.000 0.001 Y NA
 5732983 5732984 KPK_1354 KPK_1355 eutC   TRUE 0.946 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5732984 5732985 KPK_1355 KPK_1356     TRUE 0.834 12.000 0.106 NA N NA
 5732985 5732986 KPK_1356 KPK_1357     TRUE 0.705 46.000 0.250 NA N NA
 5732987 5732988 KPK_1358 KPK_1359 hemF amiA TRUE 0.685 0.000 0.025 1.000 N NA
 5732989 5732990 KPK_1360 KPK_1361     TRUE 0.673 -13.000 0.059 NA   NA
 5732990 5732991 KPK_1361 KPK_1362     TRUE 0.559 62.000 0.204 NA   NA
 5732991 5732992 KPK_1362 KPK_1363     TRUE 0.619 95.000 0.333 NA   NA
 5732994 5732995 KPK_1365 KPK_1366 cysP cysT TRUE 0.982 0.000 0.479 0.002 N NA
 5732995 5732996 KPK_1366 KPK_1367 cysT cysW TRUE 0.987 0.000 0.583 0.000 N NA
 5732996 5732997 KPK_1367 KPK_1368 cysW cysA TRUE 0.970 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 5732997 5732998 KPK_1368 KPK_1370 cysA cysM FALSE 0.171 119.000 0.049 1.000 N NA
 5732999 5733000 KPK_1369 KPK_1371     FALSE 0.009 182.000 0.000 NA   NA
 5733001 5733002 KPK_1372 KPK_1373 pdxK   TRUE 0.901 0.000 0.160 NA   NA
 5733003 5733004 KPK_1374 KPK_1375 crr ptsI TRUE 0.860 43.000 0.000 0.017 Y NA
 5733004 5733005 KPK_1375 KPK_1376 ptsI pstH TRUE 0.852 45.000 0.000 0.017 Y NA
 5733005 5733006 KPK_1376 KPK_1377 pstH cysK FALSE 0.003 381.000 0.019 1.000 N NA
 5733006 5733007 KPK_1377 KPK_1378 cysK cysZ FALSE 0.408 177.000 0.122 1.000 Y NA
 5733008 5733009 KPK_1379 KPK_1380   zipA FALSE 0.088 51.000 0.000 NA   NA
 5733009 5733010 KPK_1380 KPK_1381 zipA ligA FALSE 0.124 70.000 0.002 1.000 N NA
 5733010 5733011 KPK_1381 KPK_1383 ligA   TRUE 0.617 2.000 0.017 NA   NA
 5733014 5733015 KPK_1385 KPK_1386     FALSE 0.379 4.000 0.000 NA   NA
 5733015 5733016 KPK_1386 KPK_1387     FALSE 0.102 45.000 0.000 NA   NA
 5733016 5733017 KPK_1387 KPK_1388     FALSE 0.102 45.000 0.000 NA   NA
 5733019 5733020 KPK_1390 KPK_1391     TRUE 0.964 4.000 0.250 0.006   NA
 5733021 5733022 KPK_1392 KPK_1393     FALSE 0.113 41.000 0.000 NA   NA
 5733022 5733023 KPK_1393 KPK_1394     FALSE 0.005 209.000 0.000 NA   NA
 5733026 5733027 KPK_1397 KPK_1398     FALSE 0.368 131.000 0.214 NA   NA
 5733031 5733032 KPK_1402 KPK_1403     TRUE 0.997 -3.000 0.744 0.012 Y NA
 5733034 5733035 KPK_1405 KPK_1406 cynX   FALSE 0.316 -3.000 0.000 NA N NA
 5733037 5733038 KPK_1407 KPK_1409     FALSE 0.002 271.000 0.000 NA   NA
 5733038 5733039 KPK_1409 KPK_1410     FALSE 0.003 249.000 0.000 NA   NA
 5733039 5733040 KPK_1410 KPK_1411     FALSE 0.050 89.000 0.000 NA   NA
 5733043 5733044 KPK_1414 KPK_1415   fadI FALSE 0.083 158.000 0.061 NA   NA
 5733044 5733045 KPK_1415 KPK_1416 fadI fadJ TRUE 0.991 0.000 0.430 1.000 Y NA
 5733045 5733046 KPK_1416 KPK_1417 fadJ sixA FALSE 0.006 210.000 0.000 1.000 N NA
 5733048 5733049 KPK_1419 KPK_1420 prmB aroC FALSE 0.497 43.000 0.081 1.000 N NA
 5733049 5733050 KPK_1420 KPK_1421 aroC mepA TRUE 0.670 3.000 0.025 1.000 N NA
 5733050 5733051 KPK_1421 KPK_1422 mepA   TRUE 0.907 0.000 0.160 1.000   NA
 5733051 5733052 KPK_1422 KPK_1423     TRUE 0.897 0.000 0.153 NA   NA
 5733052 5733053 KPK_1423 KPK_1424     TRUE 0.874 32.000 0.425 NA   NA
 5733055 5733056 KPK_1426 KPK_1427 fabB   FALSE 0.004 210.000 0.000 NA N NA
 5733058 5733059 KPK_1429 KPK_1430     TRUE 0.956 118.000 0.789 0.014 Y NA
 5733059 5733060 KPK_1430 KPK_1431     TRUE 0.972 -13.000 0.105 0.014 Y NA
 5733060 5733061 KPK_1431 KPK_1432     TRUE 0.923 61.000 0.250 0.017 Y NA
 5733063 5733064 KPK_1434 KPK_1435 pdxB   TRUE 0.869 64.000 0.097 0.012 Y NA
 5733064 5733065 KPK_1435 KPK_1436   truA TRUE 0.740 0.000 0.040 1.000 N NA
 5733065 5733066 KPK_1436 KPK_1437 truA   FALSE 0.444 27.000 0.038 NA   NA
 5733066 5733067 KPK_1437 KPK_1438   accD FALSE 0.021 187.000 0.020 NA   NA
 5733067 5733068 KPK_1438 KPK_1439 accD folC TRUE 0.685 76.000 0.383 1.000 N NA
 5733068 5733069 KPK_1439 KPK_1440 folC   TRUE 0.882 -10.000 0.216 NA   NA
 5733069 5733070 KPK_1440 KPK_1441   cvpA FALSE 0.044 217.000 0.116 NA   NA
 5733070 5733071 KPK_1441 KPK_1442 cvpA purF TRUE 0.794 34.000 0.262 1.000   NA
 5733071 5733072 KPK_1442 KPK_1443 purF ubiX FALSE 0.140 136.000 0.056 1.000 N NA
 5733076 5733077 KPK_1447 KPK_1448 hisJ hisQ TRUE 0.973 65.000 0.833 0.073 Y NA
 5733077 5733078 KPK_1448 KPK_1449 hisQ hisM TRUE 0.997 -3.000 0.900 0.017 Y NA
 5733078 5733079 KPK_1449 KPK_1450 hisM hisP TRUE 0.994 8.000 0.643 1.000 Y NA
 5733082 5733083 KPK_1452 KPK_1454   folX TRUE 0.792 19.000 0.122 1.000   NA
 5733083 5733084 KPK_1454 KPK_1455 folX   FALSE 0.047 66.000 0.000 NA N NA
 5733085 5733086 KPK_1456 KPK_1457     FALSE 0.412 57.000 0.092 NA   NA
 5733086 5733087 KPK_1457 KPK_1458   yfcD TRUE 0.675 58.000 0.143 0.010   NA
 5733088 5733089 KPK_1459 KPK_1460 pta ackA FALSE 0.299 201.000 0.634 1.000   NA
 5733089 5733090 KPK_1460 KPK_1461 ackA   FALSE 0.178 26.000 0.000 NA   NA
 5733091 5733092 KPK_1462 KPK_1463     TRUE 0.509 88.000 0.221 NA   NA
 5733092 5733093 KPK_1463 KPK_1464   yfbT TRUE 0.950 12.000 0.375 NA   NA
 5733093 5733094 KPK_1464 KPK_1465 yfbT   TRUE 0.631 77.000 0.308 1.000   NA
 5733095 5733096 KPK_1466 KPK_1467 yfbR   FALSE 0.366 82.000 0.104 1.000   NA
 5733097 5733098 KPK_1468 KPK_1469   lrhA FALSE 0.004 217.000 0.000 NA   NA
 5733098 5733099 KPK_1469 KPK_1470 lrhA   FALSE 0.040 117.000 0.000 NA   NA
 5733099 5733100 KPK_1470 KPK_1471   nuoA FALSE 0.001 392.000 0.000 NA   NA
 5733100 5733101 KPK_1471 KPK_1472 nuoA nuoB TRUE 0.990 16.000 0.377 0.002 Y NA
 5733101 5733102 KPK_1472 KPK_1473 nuoB nuoC TRUE 0.964 88.000 0.691 0.002 Y NA
 5733102 5733103 KPK_1473 KPK_1474 nuoC nuoE TRUE 0.994 3.000 0.407 0.004 Y NA
 5733103 5733104 KPK_1474 KPK_1475 nuoE nuoF TRUE 0.989 -3.000 0.186 0.004 Y NA
 5733104 5733105 KPK_1475 KPK_1476 nuoF nuoG TRUE 0.958 32.000 0.180 0.004 Y NA
 5733105 5733106 KPK_1476 KPK_1477 nuoG nuoH TRUE 0.996 -3.000 0.664 0.004 Y NA
 5733106 5733107 KPK_1477 KPK_1478 nuoH nuoI TRUE 0.992 15.000 0.423 0.004 Y NA
 5733107 5733108 KPK_1478 KPK_1479 nuoI nuoJ TRUE 0.994 11.000 0.428 0.004 Y NA
 5733108 5733109 KPK_1479 KPK_1480 nuoJ nuoK TRUE 0.992 -3.000 0.269 0.002 Y NA
 5733109 5733110 KPK_1480 KPK_1481 nuoK nuoL TRUE 0.990 -3.000 0.211 0.004 Y NA
 5733110 5733111 KPK_1481 KPK_1482 nuoL nuoM FALSE 0.454 302.000 0.713 0.001 Y NA
 5733111 5733112 KPK_1482 KPK_1483 nuoM nuoN TRUE 0.995 7.000 0.437 0.001 Y NA
 5733114 5733115 KPK_1485 KPK_1486   menF FALSE 0.041 136.000 0.000 1.000   NA
 5733115 5733116 KPK_1486 KPK_1487 menF menD TRUE 0.863 83.000 0.281 1.000 Y NA
 5733116 5733117 KPK_1487 KPK_1488 menD   TRUE 0.954 -3.000 0.355 NA   NA
 5733117 5733118 KPK_1488 KPK_1489   menB TRUE 0.915 15.000 0.280 NA   NA
 5733118 5733119 KPK_1489 KPK_1490 menB menC TRUE 0.990 0.000 0.171 0.001 Y NA
 5733119 5733120 KPK_1490 KPK_1491 menC menE TRUE 0.971 0.000 0.283 0.001 N NA
 5733124 5733125 KPK_1495 KPK_1496     FALSE 0.070 103.000 0.000 1.000   NA
 5733125 5733126 KPK_1496 KPK_1497     FALSE 0.008 206.000 0.000 1.000   NA
 5733126 5733127 KPK_1497 KPK_1498     TRUE 0.833 11.000 0.090 1.000 N NA
 5733127 5733128 KPK_1498 KPK_1499     FALSE 0.083 43.000 0.000 NA N NA
 5733128 5733129 KPK_1499 KPK_1500     FALSE 0.244 15.000 0.000 NA N NA
 5733130 5733131 KPK_1501 KPK_1502 glpC glpB TRUE 0.985 -3.000 0.547 0.001 N NA
 5733131 5733132 KPK_1502 KPK_1503 glpB glpA TRUE 0.981 -10.000 0.650 0.001 N NA
 5733133 5733134 KPK_1504 KPK_1505 glpT glpQ TRUE 0.956 10.000 0.396 1.000 N NA
 5733134 5733135 KPK_1505 KPK_1506 glpQ   FALSE 0.369 9.000 0.000 NA   NA
 5733136 5733137 KPK_1507 KPK_1508   nrdB TRUE 0.796 0.000 0.057 1.000 N NA
 5733137 5733138 KPK_1508 KPK_1509 nrdB nrdA TRUE 0.962 102.000 0.667 0.001 Y NA
 5733138 5733139 KPK_1509 KPK_1510 nrdA ubiG FALSE 0.001 345.000 0.000 1.000 N NA
 5733140 5733141 KPK_1511 KPK_1512 gyrA rcsC FALSE 0.179 132.000 0.013 0.089 N NA
 5733142 5733143 KPK_1513 KPK_1514 rcsB yojN TRUE 0.989 16.000 0.558 1.000 Y NA
 5733143 5733144 KPK_1514 KPK_1515 yojN   FALSE 0.002 287.000 0.000 NA   NA
 5733145 5733146 KPK_1516 KPK_1517 ompC apbE FALSE 0.245 104.000 0.066 1.000 N NA
 5733146 5733147 KPK_1517 KPK_1518 apbE ada FALSE 0.201 74.000 0.038 1.000 N NA
 5733147 5733148 KPK_1518 KPK_1519 ada alkB TRUE 0.666 0.000 0.030 NA N NA
 5733148 5733149 KPK_1519 KPK_1520 alkB   FALSE 0.286 75.000 0.076 NA N NA
 5733149 5733150 KPK_1520 KPK_1522   mgtE FALSE 0.376 156.000 0.024 1.000 Y NA
 5733153 5733154 KPK_1524 KPK_1525 eco   FALSE 0.016 154.000 0.000 NA   NA
 5733154 5733155 KPK_1525 KPK_1526     FALSE 0.001 349.000 0.000 NA   NA
 5733155 5733156 KPK_1526 KPK_1527     FALSE 0.059 71.000 0.000 NA   NA
 5733156 5733157 KPK_1527 KPK_1528     FALSE 0.012 170.000 0.000 NA   NA
 5733158 5733159 KPK_1529 KPK_1530     TRUE 0.947 9.000 0.000 1.000 Y NA
 5733159 5733160 KPK_1530 KPK_1531     TRUE 0.991 10.000 0.300 0.017 Y NA
 5733160 5733161 KPK_1531 KPK_1532     TRUE 0.965 -43.000 0.136 0.073 Y NA
 5733161 5733162 KPK_1532 KPK_1533     FALSE 0.378 5.000 0.000 NA   NA
 5733162 5733163 KPK_1533 KPK_1534     FALSE 0.006 195.000 0.000 NA   NA
 5733164 5733165 KPK_1535 KPK_1536     FALSE 0.055 76.000 0.000 NA   NA
 5733165 5733166 KPK_1536 KPK_1537     FALSE 0.498 19.000 0.027 NA   NA
 5733172 5733173 KPK_1543 KPK_1544     FALSE 0.217 137.000 0.024 0.014 N NA
 5733174 5733175 KPK_1545 KPK_1546 rsuA bcr TRUE 0.720 -3.000 0.036 1.000 N NA
 5733175 5733176 KPK_1546 KPK_1547 bcr   FALSE 0.001 331.000 0.000 NA   NA
 5733177 5733178 KPK_1548 KPK_1549     TRUE 0.983 2.000 0.758 1.000   NA
 5733178 5733179 KPK_1549 KPK_1550     TRUE 0.990 0.000 0.833 0.073   NA
 5733179 5733180 KPK_1550 KPK_1551     TRUE 0.988 10.000 0.848 0.073   NA
 5733180 5733181 KPK_1551 KPK_1552     TRUE 0.697 69.000 0.394 NA N NA
 5733181 5733182 KPK_1552 KPK_1553   spr FALSE 0.121 189.000 0.219 NA N NA
 5733182 5733183 KPK_1553 KPK_1554 spr   FALSE 0.001 314.000 0.000 NA   NA
 5733183 5733184 KPK_1554 KPK_1555     FALSE 0.395 0.000 0.000 NA   NA
 5733184 5733185 KPK_1555 KPK_1556     TRUE 0.741 44.000 0.275 NA   NA
 5733185 5733186 KPK_1556 KPK_1557     FALSE 0.358 121.000 0.167 NA   NA
 5733191 5733192 KPK_1562 KPK_1563     FALSE 0.218 -33.000 0.000 NA   NA
 5733192 5733193 KPK_1563 KPK_1564     TRUE 0.987 2.000 1.000 NA   NA
 5733195 5733196 KPK_1566 KPK_1567 fruB fruK TRUE 0.976 1.000 0.112 1.000 Y NA
 5733196 5733197 KPK_1567 KPK_1568 fruK fruA TRUE 0.988 17.000 0.562 1.000 Y NA
 5733198 5733199 KPK_1569 KPK_1570 nfo   FALSE 0.199 72.000 0.040 NA   NA
 5733200 5733201 KPK_1571 KPK_1572   lysP FALSE 0.171 178.000 0.222 1.000 N NA
 5733201 5733202 KPK_1572 KPK_1573 lysP cirA FALSE 0.002 300.000 0.000 1.000 N NA
 5733204 5733205 KPK_1575 KPK_1576 folE   TRUE 0.970 16.000 0.719 NA   NA
 5733205 5733206 KPK_1576 KPK_1577   galS FALSE 0.445 156.000 0.500 NA   NA
 5733206 5733207 KPK_1577 KPK_1578 galS mglB FALSE 0.001 297.000 0.000 NA N NA
 5733207 5733208 KPK_1578 KPK_1579 mglB mglA TRUE 0.804 119.000 0.250 NA Y NA
 5733208 5733209 KPK_1579 KPK_1580 mglA mglC TRUE 0.994 16.000 0.905 1.000 Y NA
 5733210 5733211 KPK_1581 KPK_1582     FALSE 0.384 -3.000 0.000 NA   NA
 5733211 5733212 KPK_1582 KPK_1583   sanA FALSE 0.041 115.000 0.000 NA   NA
 5733212 5733213 KPK_1583 KPK_1584 sanA cdd FALSE 0.007 293.000 0.045 NA   NA
 5733213 5733214 KPK_1584 KPK_1585 cdd   FALSE 0.351 129.000 0.198 NA N NA
 5733214 5733215 KPK_1585 KPK_1586     TRUE 0.926 -10.000 0.340 NA   NA
 5733216 5733217 KPK_1587 KPK_1588 dusC   FALSE 0.001 357.000 0.000 1.000 N NA
 5733217 5733218 KPK_1588 KPK_1589   bglG FALSE 0.230 156.000 0.200 1.000   NA
 5733218 5733219 KPK_1589 KPK_1590 bglG bglF FALSE 0.413 143.000 0.312 1.000   NA
 5733219 5733220 KPK_1590 KPK_1591 bglF bglB TRUE 0.989 16.000 0.562 1.000 Y NA
 5733224 5733225 KPK_1595 KPK_1596   pbpG FALSE 0.086 189.000 0.145 NA   NA
 5733226 5733227 KPK_1597 KPK_1598   dld FALSE 0.259 86.000 0.064 1.000 N NA
 5733228 5733229 KPK_1599 KPK_1600 bglX   FALSE 0.208 137.000 0.099 1.000 N NA
 5733229 5733230 KPK_1600 KPK_1601     TRUE 0.979 8.000 0.521 0.072 N NA
 5733230 5733231 KPK_1601 KPK_1602     TRUE 0.989 -7.000 0.489 1.000 Y NA
 5733231 5733232 KPK_1602 KPK_1604     TRUE 0.987 -16.000 0.542 1.000 Y NA
 5733234 5733235 KPK_1605 KPK_1606     TRUE 0.997 -6.000 0.877 0.012 Y NA
 5733235 5733236 KPK_1606 KPK_1607     FALSE 0.346 48.000 0.051 NA   NA
 5733239 5733240 KPK_1609 KPK_1611     TRUE 0.789 -25.000 0.143 NA   NA
 5733242 5733243 KPK_1612 KPK_1614     TRUE 0.963 3.000 0.412 1.000   NA
 5733245 5733246 KPK_1615 KPK_1617     FALSE 0.222 -30.000 0.000 NA   NA
 5733247 5733248 KPK_1618 KPK_1619 thiM thiD TRUE 0.978 -3.000 0.037 0.004 Y NA
 5733248 5733249 KPK_1619 KPK_1620 thiD fbaB FALSE 0.161 148.000 0.098 1.000 N NA
 5733251 5733252 KPK_1622 KPK_1623 dalD xylB_2 TRUE 0.981 10.000 0.200 1.000 Y NA
 5733252 5733253 KPK_1623 KPK_1624 xylB_2 dalT TRUE 0.695 71.000 0.375 1.000 N NA
 5733253 5733254 KPK_1624 KPK_1625 dalT   TRUE 0.927 49.000 1.000 1.000   NA
 5733254 5733255 KPK_1625 KPK_1626     FALSE 0.010 298.000 0.000 0.071   NA
 5733255 5733256 KPK_1626 KPK_1627     FALSE 0.382 120.000 0.171 1.000 N NA
 5733256 5733257 KPK_1627 KPK_1628     TRUE 0.989 -3.000 0.240 0.072 Y NA
 5733257 5733258 KPK_1628 KPK_1629     TRUE 0.996 -3.000 0.640 0.072 Y NA
 5733258 5733259 KPK_1629 KPK_1630     TRUE 0.993 -7.000 0.692 1.000 Y NA
 5733259 5733260 KPK_1630 KPK_1631     TRUE 0.996 11.000 0.733 0.025 Y NA
 5733261 5733262 KPK_1632 KPK_1633     FALSE 0.004 246.000 0.000 1.000 N NA
 5733262 5733263 KPK_1633 KPK_1634   baeR FALSE 0.004 319.000 0.018 1.000 N NA
 5733263 5733264 KPK_1634 KPK_1635 baeR baeS TRUE 0.994 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 5733264 5733265 KPK_1635 KPK_1636 baeS   TRUE 0.888 -3.000 0.139 1.000 N NA
 5733265 5733266 KPK_1636 KPK_1637   mdtC TRUE 0.963 2.000 0.438 NA N NA
 5733266 5733267 KPK_1637 KPK_1638 mdtC mdtB TRUE 0.966 1.000 0.062 NA Y NA
 5733267 5733268 KPK_1638 KPK_1639 mdtB mdtA TRUE 0.960 0.000 0.400 NA N NA
 5733272 5733273 KPK_1643 KPK_1644     TRUE 0.930 15.000 0.000 1.000 Y NA
 5733273 5733274 KPK_1644 KPK_1645     FALSE 0.009 290.000 0.000 0.088 N NA
 5733275 5733276 KPK_1646 KPK_1647 alkA udk FALSE 0.051 115.000 0.000 1.000 N NA
 5733276 5733277 KPK_1647 KPK_1648 udk dcd TRUE 0.760 91.000 0.098 1.000 Y NA
 5733277 5733278 KPK_1648 KPK_1649 dcd asmA FALSE 0.476 31.000 0.057 NA N NA
 5733280 5733281 KPK_1651 KPK_1652 galF   FALSE 0.001 394.000 0.000 1.000   NA
 5733281 5733282 KPK_1652 KPK_1653     FALSE 0.000 711.000 0.000 NA   NA
 5733282 5733283 KPK_1653 KPK_1654     FALSE 0.025 139.000 0.000 NA   NA
 5733283 5733284 KPK_1654 KPK_1655   gfcE FALSE 0.233 146.000 0.167 NA   NA
 5733284 5733285 KPK_1655 KPK_1656 gfcE etk FALSE 0.018 456.000 0.000 1.000 Y NA
 5733285 5733286 KPK_1656 KPK_1657 etk   TRUE 0.606 85.000 0.000 NA Y NA
 5733286 5733287 KPK_1657 KPK_1658     TRUE 0.902 4.000 0.174 NA   NA
 5733287 5733288 KPK_1658 KPK_1659     FALSE 0.461 11.000 0.000 1.000   NA
 5733288 5733289 KPK_1659 KPK_1660     FALSE 0.264 -13.000 0.000 NA   NA
 5733289 5733290 KPK_1660 KPK_1661     FALSE 0.395 0.000 0.000 NA   NA
 5733290 5733291 KPK_1661 KPK_1662     FALSE 0.350 12.000 0.000 NA   NA
 5733291 5733292 KPK_1662 KPK_1663     FALSE 0.363 10.000 0.000 NA   NA
 5733292 5733293 KPK_1663 KPK_1664     FALSE 0.220 21.000 0.000 NA   NA
 5733293 5733294 KPK_1664 KPK_1665     FALSE 0.373 8.000 0.000 NA   NA
 5733294 5733295 KPK_1665 KPK_1666     FALSE 0.004 210.000 0.000 NA N NA
 5733295 5733296 KPK_1666 KPK_1667   gnd FALSE 0.009 166.000 0.000 NA N NA
 5733296 5733297 KPK_1667 KPK_1668 gnd cpsB_1 FALSE 0.005 226.000 0.000 1.000 N NA
 5733297 5733298 KPK_1668 KPK_1669 cpsB_1 cpsG_1 TRUE 0.762 23.000 0.133 1.000 N NA
 5733298 5733299 KPK_1669 KPK_1670 cpsG_1 ugd FALSE 0.017 164.000 0.000 1.000 N NA
 5733299 5733300 KPK_1670 KPK_1671 ugd   FALSE 0.003 277.000 0.000 1.000   NA
 5733304 5733305 KPK_1675 KPK_1676 cpsB_2 cpsG_2 TRUE 0.762 23.000 0.133 1.000 N NA
 5733305 5733306 KPK_1676 KPK_1677 cpsG_2   TRUE 0.976 6.000 0.125 1.000 Y NA
 5733306 5733307 KPK_1677 KPK_1678     TRUE 0.994 3.000 0.450 0.088 Y NA
 5733307 5733308 KPK_1678 KPK_1679     TRUE 0.630 20.000 0.000 0.088   NA
 5733308 5733309 KPK_1679 KPK_1680     FALSE 0.461 11.000 0.000 1.000   NA
 5733309 5733310 KPK_1680 KPK_1681     TRUE 0.911 47.000 0.093 0.014 Y NA
 5733310 5733311 KPK_1681 KPK_1682     TRUE 0.990 10.000 0.256 0.014 Y NA
 5733312 5733313 KPK_1683 KPK_1684 hisIE hisF TRUE 0.993 -6.000 0.430 0.002 Y NA
 5733313 5733314 KPK_1684 KPK_1685 hisF hisA TRUE 0.990 -18.000 0.433 0.002 Y NA
 5733314 5733315 KPK_1685 KPK_1686 hisA hisH TRUE 0.990 0.000 0.210 0.002 Y NA
 5733315 5733316 KPK_1686 KPK_1687 hisH hisB TRUE 0.987 0.000 0.128 0.002 Y NA
 5733316 5733317 KPK_1687 KPK_1688 hisB hisC TRUE 0.993 -3.000 0.341 0.002 Y NA
 5733317 5733318 KPK_1688 KPK_1689 hisC hisD TRUE 0.992 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 5733318 5733319 KPK_1689 KPK_1690 hisD hisG TRUE 0.947 40.000 0.171 0.002 Y NA
 5733319 5733320 KPK_1690 KPK_1691 hisG hisL FALSE 0.187 146.000 0.003 0.002   NA
 5733321 5733322 KPK_1692 KPK_1693     FALSE 0.272 39.000 0.015 1.000 N NA
 5733322 5733323 KPK_1693 KPK_1694     FALSE 0.002 290.000 0.000 1.000 N NA
 5733324 5733325 KPK_1695 KPK_1696   nifQ FALSE 0.000 763.000 0.000 NA   NA
 5733325 5733326 KPK_1696 KPK_1697 nifQ nifB TRUE 0.899 0.000 0.039 0.003   NA
 5733326 5733327 KPK_1697 KPK_1698 nifB nifA FALSE 0.195 165.000 0.071 0.003   NA
 5733327 5733328 KPK_1698 KPK_1699 nifA nifL TRUE 0.988 -3.000 0.214 0.088 Y NA
 5733330 5733331 KPK_1701 KPK_1702 nifM   TRUE 0.805 0.000 0.057 1.000   NA
 5733331 5733332 KPK_1702 KPK_1703     TRUE 0.943 -3.000 0.133 0.003   NA
 5733332 5733333 KPK_1703 KPK_1704   nifV TRUE 0.946 3.000 0.300 1.000   NA
 5733333 5733334 KPK_1704 KPK_1705 nifV nifS TRUE 0.982 13.000 0.250 1.000 Y NA
 5733334 5733335 KPK_1705 KPK_1706 nifS nifU TRUE 0.970 16.000 0.716 1.000 N NA
 5733335 5733336 KPK_1706 KPK_1707 nifU nifX FALSE 0.006 195.000 0.000 NA   NA
 5733336 5733337 KPK_1707 KPK_1708 nifX nifN TRUE 0.677 -13.000 0.060 NA   NA
 5733337 5733338 KPK_1708 KPK_1709 nifN nifE TRUE 0.995 10.000 0.475 0.001 Y NA
 5733338 5733339 KPK_1709 KPK_1710 nifE   FALSE 0.000 581.000 0.000 NA   NA
 5733339 5733340 KPK_1710 KPK_1711   nifT TRUE 0.772 11.000 0.063 NA   NA
 5733340 5733341 KPK_1711 KPK_1712 nifT nifK TRUE 0.747 40.000 0.100 0.003   NA
 5733341 5733342 KPK_1712 KPK_1713 nifK nifD TRUE 0.984 56.000 0.902 0.001 Y NA
 5733342 5733343 KPK_1713 KPK_1714 nifD nifH TRUE 0.835 17.000 0.033 0.001 N NA
 5733348 5733349 KPK_1719 KPK_1720 dacD gyrI FALSE 0.091 177.000 0.110 NA N NA
 5733349 5733350 KPK_1720 KPK_1721 gyrI   FALSE 0.320 99.000 0.096 NA   NA
 5733350 5733351 KPK_1721 KPK_1722     FALSE 0.162 168.000 0.180 NA   NA
 5733351 5733352 KPK_1722 KPK_1723   cobS FALSE 0.001 312.000 0.000 NA   NA
 5733352 5733353 KPK_1723 KPK_1724 cobS   TRUE 0.938 28.000 0.056 0.008 Y NA
 5733358 5733359 KPK_1728 KPK_1730   shiA FALSE 0.075 47.000 0.000 NA N NA
 5733360 5733361 KPK_1731 KPK_1732     TRUE 0.941 11.000 0.300 1.000   NA
 5733361 5733362 KPK_1732 KPK_1733     FALSE 0.003 222.000 0.000 NA N NA
 5733362 5733363 KPK_1733 KPK_1734     TRUE 0.698 91.000 0.444 NA   NA
 5733365 5733366 KPK_1736 KPK_1737     FALSE 0.010 179.000 0.000 NA   NA
 5733366 5733367 KPK_1737 KPK_1739     FALSE 0.008 206.000 0.000 1.000   NA
 5733369 5733370 KPK_1740 KPK_1741 pemI pemK TRUE 0.994 1.000 0.667 NA Y NA
 5733372 5733373 KPK_1743 KPK_1744     FALSE 0.033 128.000 0.000 NA   NA
 5733374 5733375 KPK_1745 KPK_1746 amn pmrD FALSE 0.030 131.000 0.000 NA   NA
 5733377 5733378 KPK_1748 KPK_1749     FALSE 0.442 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5733379 5733380 KPK_1750 KPK_1751     FALSE 0.001 429.000 0.000 NA   NA
 5733380 5733381 KPK_1751 KPK_1752     FALSE 0.085 52.000 0.000 NA   NA
 5733381 5733382 KPK_1752 KPK_1753     TRUE 0.768 -7.000 0.076 NA   NA
 5733382 5733383 KPK_1753 KPK_1754     FALSE 0.265 60.000 0.049 NA   NA
 5733383 5733384 KPK_1754 KPK_1755     TRUE 0.974 -3.000 0.101 1.000 Y NA
 5733384 5733385 KPK_1755 KPK_1756     FALSE 0.250 38.000 0.014 NA   NA
 5733385 5733386 KPK_1756 KPK_1757     TRUE 0.561 -13.000 0.033 NA   NA
 5733388 5733389 KPK_1759 KPK_1760     TRUE 0.797 50.000 0.407 NA   NA
 5733389 5733390 KPK_1760 KPK_1761     FALSE 0.002 286.000 0.000 NA   NA
 5733391 5733392 KPK_1762 KPK_1763     FALSE 0.038 120.000 0.000 NA   NA
 5733392 5733393 KPK_1763 KPK_1764     FALSE 0.001 394.000 0.000 NA   NA
 5733393 5733394 KPK_1764 KPK_1765     FALSE 0.001 392.000 0.000 NA   NA
 5733394 5733395 KPK_1765 KPK_1766     FALSE 0.002 292.000 0.000 NA   NA
 5733397 5733398 KPK_1768 KPK_1769     TRUE 0.985 -7.000 0.200 0.008 Y NA
 5733398 5733399 KPK_1769 KPK_1770     TRUE 0.993 -3.000 0.357 0.008 Y NA
 5733399 5733400 KPK_1770 KPK_1771     FALSE 0.145 139.000 0.000 0.058   NA
 5733400 5733401 KPK_1771 KPK_1772     FALSE 0.313 -7.000 0.000 NA   NA
 5733401 5733402 KPK_1772 KPK_1773     TRUE 0.937 9.000 0.286 NA   NA
 5733402 5733403 KPK_1773 KPK_1774     FALSE 0.000 769.000 0.000 NA   NA
 5733403 5733404 KPK_1774 KPK_1775   virB11 TRUE 0.784 61.000 0.500 NA   NA
 5733404 5733405 KPK_1775 KPK_1776 virB11   TRUE 0.990 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 5733405 5733406 KPK_1776 KPK_1777   virB9 TRUE 0.995 -3.000 0.778 NA Y NA
 5733406 5733407 KPK_1777 KPK_1778 virB9 virB8 TRUE 0.991 -3.000 0.444 NA Y NA
 5733407 5733408 KPK_1778 KPK_1779 virB8   FALSE 0.313 -7.000 0.000 NA   NA
 5733408 5733409 KPK_1779 KPK_1780     FALSE 0.389 90.000 0.136 NA   NA
 5733409 5733410 KPK_1780 KPK_1781     FALSE 0.347 72.000 0.091 NA   NA
 5733410 5733411 KPK_1781 KPK_1782     TRUE 0.964 12.000 0.500 NA   NA
 5733411 5733412 KPK_1782 KPK_1783     TRUE 0.960 23.000 0.800 NA   NA
 5733412 5733413 KPK_1783 KPK_1784     TRUE 0.985 12.000 1.000 NA   NA
 5733413 5733414 KPK_1784 KPK_1785     FALSE 0.380 3.000 0.000 NA   NA
 5733414 5733415 KPK_1785 KPK_1786     FALSE 0.058 72.000 0.000 NA   NA
 5733415 5733416 KPK_1786 KPK_1787     FALSE 0.001 395.000 0.000 NA   NA
 5733416 5733417 KPK_1787 KPK_1788     FALSE 0.433 -10.000 0.002 NA   NA
 5733417 5733418 KPK_1788 KPK_1789     TRUE 0.815 54.000 0.500 NA   NA
 5733418 5733419 KPK_1789 KPK_1790     FALSE 0.001 333.000 0.000 NA   NA
 5733419 5733420 KPK_1790 KPK_1791     FALSE 0.003 260.000 0.000 NA   NA
 5733420 5733421 KPK_1791 KPK_1792     FALSE 0.384 -3.000 0.000 NA   NA
 5733421 5733422 KPK_1792 KPK_1793     FALSE 0.091 50.000 0.000 NA   NA
 5733422 5733423 KPK_1793 KPK_1794     TRUE 0.891 46.000 0.667 NA   NA
 5733423 5733424 KPK_1794 KPK_1795     FALSE 0.369 9.000 0.000 NA   NA
 5733424 5733425 KPK_1795 KPK_1796     FALSE 0.074 57.000 0.000 NA   NA
 5733425 5733426 KPK_1796 KPK_1797     TRUE 0.970 -3.000 0.000 0.014 Y NA
 5733426 5733427 KPK_1797 KPK_1798     FALSE 0.239 27.000 0.000 1.000   NA
 5733427 5733428 KPK_1798 KPK_1799     FALSE 0.001 419.000 0.000 1.000   NA
 5733430 5733431 KPK_1801 KPK_1802   alkJ FALSE 0.368 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5733431 5733432 KPK_1802 KPK_1803 alkJ   TRUE 0.827 15.000 0.118 1.000 N NA
 5733433 5733434 KPK_1804 KPK_1805     TRUE 0.958 10.000 0.425 NA N NA
 5733434 5733435 KPK_1805 KPK_1806     TRUE 0.962 -3.000 0.419 NA   NA
 5733435 5733436 KPK_1806 KPK_1807     TRUE 0.678 -7.000 0.047 NA   NA
 5733436 5733437 KPK_1807 KPK_1808     FALSE 0.005 205.000 0.000 NA   NA
 5733437 5733438 KPK_1808 KPK_1809     FALSE 0.001 445.000 0.000 NA   NA
 5733439 5733440 KPK_1810 KPK_1811     FALSE 0.000 819.000 0.000 NA   NA
 5733440 5733441 KPK_1811 KPK_1812     FALSE 0.014 161.000 0.000 NA   NA
 5733442 5733443 KPK_1813 KPK_1814 nac cbl TRUE 0.863 107.000 0.222 0.085 Y NA
 5733443 5733444 KPK_1814 KPK_1815 cbl   FALSE 0.051 84.000 0.000 NA   NA
 5733445 5733446 KPK_1816 KPK_1817     FALSE 0.001 309.000 0.000 NA   NA
 5733447 5733448 KPK_1818 KPK_1819     FALSE 0.089 127.000 0.026 NA N NA
 5733448 5733449 KPK_1819 KPK_1820     FALSE 0.001 398.000 0.000 1.000 N NA
 5733449 5733450 KPK_1820 KPK_1821     TRUE 0.997 -3.000 0.750 0.071 Y NA
 5733450 5733451 KPK_1821 KPK_1823     TRUE 0.993 -7.000 0.750 1.000 Y NA
 5733452 5733453 KPK_1822 KPK_1824     FALSE 0.019 168.000 0.000 1.000   NA
 5733453 5733454 KPK_1824 KPK_1825     FALSE 0.492 1.000 0.000 1.000   NA
 5733454 5733455 KPK_1825 KPK_1826     TRUE 0.617 -3.000 0.004 1.000   NA
 5733456 5733457 KPK_1827 KPK_1828   ntaA TRUE 0.946 5.000 0.000 NA Y NA
 5733457 5733458 KPK_1828 KPK_1829 ntaA aatB FALSE 0.167 22.000 0.000 NA N NA
 5733459 5733460 KPK_1830 KPK_1831     FALSE 0.000 557.000 0.000 NA   NA
 5733461 5733462 KPK_1832 KPK_1833     FALSE 0.000 545.000 0.000 NA   NA
 5733463 5733464 KPK_1834 KPK_1835     FALSE 0.000 761.000 0.000 NA   NA
 5733465 5733466 KPK_1836 KPK_1837     FALSE 0.001 410.000 0.000 NA N NA
 5733466 5733467 KPK_1837 KPK_1838     FALSE 0.000 1302.000 0.000 NA N NA
 5733467 5733468 KPK_1838 KPK_1839     TRUE 0.922 16.000 0.333 NA N NA
 5733468 5733469 KPK_1839 KPK_1840     TRUE 0.959 1.000 0.400 NA N NA
 5733470 5733471 KPK_1841 KPK_1842     FALSE 0.001 455.000 0.000 1.000 N NA
 5733471 5733472 KPK_1842 KPK_1843     FALSE 0.014 161.000 0.000 NA   NA
 5733472 5733473 KPK_1843 KPK_1844   mtfA FALSE 0.049 100.000 0.000 NA   NA
 5733475 5733476 KPK_1846 KPK_1847     FALSE 0.005 214.000 0.000 NA   NA
 5733477 5733478 KPK_1848 KPK_1849     FALSE 0.081 54.000 0.000 NA   NA
 5733478 5733479 KPK_1849 KPK_1850     FALSE 0.420 43.000 0.062 NA   NA
 5733479 5733480 KPK_1850 KPK_1851   dcm FALSE 0.481 44.000 0.074 1.000   NA
 5733480 5733481 KPK_1851 KPK_1853 dcm vsr TRUE 0.956 -19.000 0.048 0.057 Y NA
 5733483 5733484 KPK_1854 KPK_1855     FALSE 0.084 116.000 0.008 NA   NA
 5733484 5733485 KPK_1855 KPK_1856     FALSE 0.058 72.000 0.000 NA   NA
 5733489 5733490 KPK_1860 KPK_1861     FALSE 0.395 0.000 0.000 NA   NA
 5733492 5733493 KPK_1863 KPK_1864   dcyD TRUE 0.909 96.000 0.469 1.000 Y NA
 5733493 5733494 KPK_1864 KPK_1865 dcyD   TRUE 0.946 16.000 0.050 1.000 Y NA
 5733494 5733495 KPK_1865 KPK_1866     TRUE 0.979 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 5733495 5733496 KPK_1866 KPK_1867   sdiA FALSE 0.009 319.000 0.071 1.000 N NA
 5733498 5733499 KPK_1869 KPK_1870 uvrY uvrC TRUE 0.917 -3.000 0.086 0.028 N NA
 5733499 5733500 KPK_1870 KPK_1871 uvrC pgsA TRUE 0.621 58.000 0.227 1.000 N NA
 5733500 5733501 KPK_1871 KPK_1872 pgsA   FALSE 0.018 151.000 0.000 NA   NA
 5733501 5733502 KPK_1872 KPK_1873     FALSE 0.115 40.000 0.000 NA   NA
 5733502 5733503 KPK_1873 KPK_1874     FALSE 0.336 13.000 0.000 NA   NA
 5733505 5733506 KPK_1876 KPK_1877     FALSE 0.051 85.000 0.000 NA   NA
 5733513 5733514 KPK_1884 KPK_1885 togT   FALSE 0.001 295.000 0.000 NA N NA
 5733514 5733515 KPK_1885 KPK_1886     FALSE 0.222 -30.000 0.000 NA   NA
 5733516 5733517 KPK_1887 KPK_1888   araF FALSE 0.000 655.000 0.000 NA   NA
 5733517 5733518 KPK_1888 KPK_1889 araF araG TRUE 0.967 61.000 0.917 NA Y NA
 5733518 5733519 KPK_1889 KPK_1890 araG araH TRUE 0.992 15.000 0.451 0.003 Y NA
 5733519 5733520 KPK_1890 KPK_1891 araH otsB FALSE 0.362 162.000 0.037 1.000 Y NA
 5733520 5733521 KPK_1891 KPK_1892 otsB otsA TRUE 0.967 -25.000 0.068 0.000 Y NA
 5733523 5733524 KPK_1894 KPK_1895     FALSE 0.378 5.000 0.000 NA   NA
 5733526 5733527 KPK_1897 KPK_1898   cutC FALSE 0.240 77.000 0.057 NA   NA
 5733528 5733529 KPK_1899 KPK_1900     TRUE 0.947 -3.000 0.315 NA   NA
 5733529 5733530 KPK_1900 KPK_1901     TRUE 0.524 40.000 0.089 NA   NA
 5733530 5733531 KPK_1901 KPK_1902     FALSE 0.506 53.000 0.126 NA   NA
 5733531 5733532 KPK_1902 KPK_1903     TRUE 0.841 -3.000 0.089 NA   NA
 5733533 5733534 KPK_1904 KPK_1905 aspS nudB TRUE 0.768 2.000 0.050 1.000 N NA
 5733534 5733535 KPK_1905 KPK_1906 nudB   FALSE 0.414 28.000 0.035 NA   NA
 5733535 5733536 KPK_1906 KPK_1907   ruvC TRUE 0.788 35.000 0.277 NA   NA
 5733536 5733537 KPK_1907 KPK_1908 ruvC ruvA TRUE 0.941 80.000 0.451 0.012 Y NA
 5733537 5733538 KPK_1908 KPK_1909 ruvA ruvB TRUE 0.996 9.000 0.549 0.001 Y NA
 5733539 5733540 KPK_1910 KPK_1911 znuB znuC TRUE 0.997 0.000 0.755 0.086 Y NA
 5733541 5733542 KPK_1912 KPK_1913 znuA   TRUE 0.828 16.000 0.131 1.000 N NA
 5733542 5733543 KPK_1913 KPK_1914   msbB TRUE 0.834 118.000 0.299 1.000 Y NA
 5733544 5733545 KPK_1915 KPK_1916     FALSE 0.079 65.000 0.000 1.000 N NA
 5733545 5733546 KPK_1916 KPK_1917     FALSE 0.437 63.000 0.111 1.000   NA
 5733548 5733549 KPK_1919 KPK_1920 pykA   FALSE 0.043 126.000 0.000 1.000 N NA
 5733549 5733550 KPK_1920 KPK_1921     FALSE 0.127 36.000 0.000 NA   NA
 5733551 5733552 KPK_1922 KPK_1923 zwf edd FALSE 0.141 223.000 0.041 1.000 Y NA
 5733552 5733553 KPK_1923 KPK_1924 edd eda TRUE 0.967 39.000 0.523 1.000 Y NA
 5733555 5733556 KPK_1926 KPK_1927     FALSE 0.023 142.000 0.000 NA   NA
 5733556 5733557 KPK_1927 KPK_1928   prtB FALSE 0.254 121.000 0.092 NA   NA
 5733558 5733559 KPK_1929 KPK_1930 exoX holE_1 FALSE 0.079 79.000 0.000 1.000   NA
 5733560 5733561 KPK_1931 KPK_1932     TRUE 0.977 4.000 0.613 1.000   NA
 5733561 5733562 KPK_1932 KPK_1933     TRUE 0.966 17.000 0.704 NA   NA
 5733563 5733564 KPK_1934 KPK_1935     FALSE 0.048 101.000 0.000 NA   NA
 5733566 5733567 KPK_1936 KPK_1938     TRUE 0.599 110.000 0.353 NA   NA
 5733567 5733568 KPK_1938 KPK_1939     FALSE 0.313 116.000 0.121 NA   NA
 5733568 5733569 KPK_1939 KPK_1940     TRUE 0.565 130.000 0.420 NA   NA
 5733569 5733570 KPK_1940 KPK_1941     TRUE 0.966 -31.000 0.840 NA   NA
 5733571 5733572 KPK_1942 KPK_1943   proQ TRUE 0.728 98.000 0.081 NA Y NA
 5733572 5733573 KPK_1943 KPK_1944 proQ prc TRUE 0.888 20.000 0.304 NA N NA
 5733573 5733574 KPK_1944 KPK_1945 prc   FALSE 0.038 236.000 0.042 0.019 N NA
 5733578 5733579 KPK_1949 KPK_1950     TRUE 0.747 75.000 0.500 NA   NA
 5733579 5733580 KPK_1950 KPK_1952     FALSE 0.170 27.000 0.000 NA   NA
 5733582 5733583 KPK_1953 KPK_1954 cspC   FALSE 0.010 188.000 0.000 1.000 N NA
 5733583 5733584 KPK_1954 KPK_1955   rrmA FALSE 0.275 61.000 0.045 1.000   NA
 5733585 5733586 KPK_1956 KPK_1957     FALSE 0.001 420.000 0.000 NA   NA
 5733586 5733587 KPK_1957 KPK_1958   manZ TRUE 0.858 63.000 0.755 NA   NA
 5733587 5733588 KPK_1958 KPK_1959 manZ manY TRUE 0.997 4.000 0.939 0.018 Y NA
 5733588 5733589 KPK_1959 KPK_1960 manY manX TRUE 0.886 57.000 0.106 0.018 Y NA
 5733591 5733592 KPK_1962 KPK_1963   sdaA FALSE 0.239 183.000 0.389 NA N NA
 5733592 5733593 KPK_1963 KPK_1964 sdaA   FALSE 0.366 163.000 0.409 1.000   NA
 5733593 5733594 KPK_1964 KPK_1965   pabB TRUE 0.874 4.000 0.116 1.000   NA
 5733597 5733598 KPK_1968 KPK_1969     FALSE 0.149 146.000 0.082 1.000 N NA
 5733598 5733599 KPK_1969 KPK_1970   slp FALSE 0.304 39.000 0.024 1.000 N NA
 5733599 5733600 KPK_1970 KPK_1971 slp fadD FALSE 0.075 206.000 0.169 1.000 N NA
 5733600 5733601 KPK_1971 KPK_1972 fadD rnd FALSE 0.407 70.000 0.115 1.000 N NA
 5733602 5733603 KPK_1973 KPK_1974 minE minD TRUE 0.994 4.000 0.618 NA Y NA
 5733603 5733604 KPK_1974 KPK_1975 minD minC TRUE 0.979 24.000 0.466 1.000 Y NA
 5733605 5733606 KPK_1976 KPK_1977     TRUE 0.664 17.000 0.056 NA   NA
 5733606 5733607 KPK_1977 KPK_1978     FALSE 0.306 95.000 0.088 NA   NA
 5733608 5733609 KPK_1979 KPK_1980     FALSE 0.059 151.000 0.036 NA N NA
 5733609 5733610 KPK_1980 KPK_1981   nhaB TRUE 0.735 129.000 0.723 1.000 N NA
 5733611 5733612 KPK_1982 KPK_1983   fadR FALSE 0.052 81.000 0.000 NA   NA
 5733614 5733615 KPK_1985 KPK_1986 dadA alr_1 TRUE 0.897 10.000 0.168 1.000 N NA
 5733616 5733617 KPK_1987 KPK_1988 cvrA ldcA FALSE 0.327 93.000 0.103 NA N NA
 5733619 5733620 KPK_1990 KPK_1991     FALSE 0.336 13.000 0.000 NA   NA
 5733620 5733621 KPK_1991 KPK_1992   foxA FALSE 0.009 180.000 0.000 NA   NA
 5733621 5733622 KPK_1992 KPK_1993 foxA treA FALSE 0.003 261.000 0.000 1.000 N NA
 5733623 5733624 KPK_1994 KPK_1995   paeX FALSE 0.069 60.000 0.000 NA   NA
 5733624 5733625 KPK_1995 KPK_1996 paeX   FALSE 0.009 183.000 0.000 NA   NA
 5733625 5733626 KPK_1996 KPK_1997     TRUE 0.979 -6.000 0.805 NA   NA
 5733626 5733627 KPK_1997 KPK_1998     TRUE 0.956 -3.000 0.365 NA   NA
 5733627 5733628 KPK_1998 KPK_1999     TRUE 0.927 17.000 0.383 NA N NA
 5733629 5733630 KPK_2000 KPK_2001     TRUE 0.966 -13.000 0.182 NA Y NA
 5733630 5733631 KPK_2001 KPK_2002     TRUE 0.973 3.000 0.111 NA Y NA
 5733631 5733632 KPK_2002 KPK_2003     TRUE 0.995 -13.000 0.810 0.070 Y NA
 5733632 5733633 KPK_2003 KPK_2004     TRUE 0.986 10.000 0.190 0.070 Y NA
 5733634 5733635 KPK_2005 KPK_2006     FALSE 0.070 75.000 0.000 1.000 N NA
 5733635 5733636 KPK_2006 KPK_2007     TRUE 0.932 -7.000 0.333 NA N NA
 5733637 5733638 KPK_2008 KPK_2009     FALSE 0.053 59.000 0.000 NA N NA
 5733638 5733639 KPK_2009 KPK_2010     FALSE 0.296 61.000 0.000 0.070 N NA
 5733639 5733640 KPK_2010 KPK_2011     TRUE 0.997 0.000 0.918 0.070 Y NA
 5733640 5733641 KPK_2011 KPK_2012     TRUE 0.933 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5733642 5733643 KPK_2013 KPK_2014 tdcA tdcB FALSE 0.147 94.000 0.023 1.000 N NA
 5733643 5733644 KPK_2014 KPK_2015 tdcB tdcC TRUE 0.893 26.000 0.029 1.000 Y NA
 5733644 5733645 KPK_2015 KPK_2016 tdcC tdcD TRUE 0.730 28.000 0.154 1.000 N NA
 5733645 5733646 KPK_2016 KPK_2017 tdcD   TRUE 0.968 29.000 0.400 1.000 Y NA
 5733646 5733647 KPK_2017 KPK_2018     FALSE 0.001 395.000 0.000 1.000 N NA
 5733647 5733648 KPK_2018 KPK_2019     TRUE 0.786 110.000 0.175 1.000 Y NA
 5733648 5733649 KPK_2019 KPK_2020     TRUE 0.989 10.000 0.263 0.070 Y NA
 5733649 5733650 KPK_2020 KPK_2021     TRUE 0.986 -3.000 0.268 1.000 Y NA
 5733650 5733651 KPK_2021 KPK_2022     TRUE 0.997 -3.000 0.881 0.024 Y NA
 5733655 5733656 KPK_2026 KPK_2027   citH FALSE 0.006 210.000 0.000 1.000 N NA
 5733656 5733657 KPK_2027 KPK_2029 citH   TRUE 0.946 12.000 0.357 NA N NA
 5733658 5733659 KPK_2028 KPK_2030     FALSE 0.063 113.000 0.000 1.000   NA
 5733662 5733663 KPK_2033 KPK_2034 dgoR dgoK TRUE 0.981 -3.000 0.733 1.000 N NA
 5733663 5733664 KPK_2034 KPK_2035 dgoK dgoA TRUE 0.991 -55.000 0.909 1.000 Y NA
 5733664 5733665 KPK_2035 KPK_2036 dgoA   TRUE 0.972 -3.000 0.385 0.069 N NA
 5733665 5733666 KPK_2036 KPK_2037     FALSE 0.038 95.000 0.000 NA N NA
 5733666 5733667 KPK_2037 KPK_2038     TRUE 0.968 -3.000 0.500 NA N NA
 5733669 5733670 KPK_2040 KPK_2041     FALSE 0.002 284.000 0.000 NA   NA
 5733670 5733671 KPK_2041 KPK_2042     TRUE 0.987 -3.000 1.000 NA   NA
 5733671 5733672 KPK_2042 KPK_2043     TRUE 0.984 4.000 0.857 NA   NA
 5733672 5733673 KPK_2043 KPK_2045     FALSE 0.039 118.000 0.000 NA   NA
 5733675 5733676 KPK_2046 KPK_2047     TRUE 0.932 3.000 0.250 NA   NA
 5733676 5733677 KPK_2047 KPK_2048     FALSE 0.097 63.000 0.000 1.000   NA
 5733677 5733678 KPK_2048 KPK_2049     FALSE 0.017 174.000 0.000 1.000   NA
 5733678 5733679 KPK_2049 KPK_2050     FALSE 0.004 221.000 0.000 NA   NA
 5733679 5733680 KPK_2050 KPK_2051     FALSE 0.002 288.000 0.000 NA   NA
 5733680 5733681 KPK_2051 KPK_2052     FALSE 0.001 465.000 0.000 NA   NA
 5733681 5733682 KPK_2052 KPK_2053     FALSE 0.028 134.000 0.000 NA   NA
 5733682 5733683 KPK_2053 KPK_2054     TRUE 0.965 -45.000 0.857 NA   NA
 5733683 5733684 KPK_2054 KPK_2055     TRUE 0.965 -19.000 0.750 NA   NA
 5733684 5733685 KPK_2055 KPK_2056     TRUE 0.968 3.000 0.500 NA   NA
 5733685 5733686 KPK_2056 KPK_2057     FALSE 0.230 20.000 0.000 NA   NA
 5733686 5733687 KPK_2057 KPK_2058     FALSE 0.019 149.000 0.000 NA   NA
 5733687 5733688 KPK_2058 KPK_2059     FALSE 0.051 84.000 0.000 NA   NA
 5733689 5733690 KPK_2060 KPK_2061 engD pth TRUE 0.774 118.000 0.184 1.000 Y NA
 5733691 5733692 KPK_2062 KPK_2063     FALSE 0.004 221.000 0.000 NA   NA
 5733693 5733694 KPK_2064 KPK_2065   prs FALSE 0.007 278.000 0.027 1.000 N NA
 5733694 5733695 KPK_2065 KPK_2066 prs ispE FALSE 0.024 184.000 0.018 1.000 N NA
 5733695 5733696 KPK_2066 KPK_2067 ispE lolB TRUE 0.682 0.000 0.024 1.000 N NA
 5733697 5733698 KPK_2068 KPK_2069 hemA prfA TRUE 0.771 43.000 0.171 0.035 N NA
 5733698 5733699 KPK_2069 KPK_2070 prfA hemK TRUE 0.985 0.000 0.229 1.000 Y NA
 5733699 5733700 KPK_2070 KPK_2071 hemK   TRUE 0.867 0.000 0.109 NA   NA
 5733700 5733701 KPK_2071 KPK_2072     TRUE 0.911 4.000 0.195 NA   NA
 5733701 5733702 KPK_2072 KPK_2073   kdsA TRUE 0.550 40.000 0.089 1.000   NA
 5733704 5733705 KPK_2075 KPK_2076 chaB chaC FALSE 0.248 137.000 0.140 NA   NA
 5733705 5733706 KPK_2076 KPK_2077 chaC   FALSE 0.111 42.000 0.000 NA   NA
 5733707 5733708 KPK_2078 KPK_2079     FALSE 0.052 82.000 0.000 NA   NA
 5733708 5733709 KPK_2079 KPK_2080     FALSE 0.131 35.000 0.000 NA   NA
 5733710 5733711 KPK_2081 KPK_2082 nasR   FALSE 0.350 12.000 0.000 NA   NA
 5733711 5733712 KPK_2082 KPK_2083   nasF FALSE 0.041 115.000 0.000 NA   NA
 5733712 5733713 KPK_2083 KPK_2084 nasF nasE TRUE 0.992 2.000 0.514 NA Y NA
 5733713 5733714 KPK_2084 KPK_2085 nasE nasD TRUE 0.994 10.000 0.396 0.000 Y NA
 5733714 5733715 KPK_2085 KPK_2086 nasD nasB FALSE 0.004 1205.000 0.135 1.000 N NA
 5733715 5733716 KPK_2086 KPK_2087 nasB nasA TRUE 0.980 0.000 0.065 0.044 Y NA
 5733716 5733717 KPK_2087 KPK_2088 nasA   FALSE 0.380 3.000 0.000 NA   NA
 5733717 5733718 KPK_2088 KPK_2090     FALSE 0.377 6.000 0.000 NA   NA
 5733719 5733720 KPK_2089 KPK_2091 narL narX TRUE 0.995 11.000 0.521 0.011 Y NA
 5733723 5733724 KPK_2094 KPK_2095 narG narH TRUE 0.995 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 5733724 5733725 KPK_2095 KPK_2096 narH narJ TRUE 0.996 -3.000 0.588 0.002 Y NA
 5733725 5733726 KPK_2096 KPK_2098 narJ narI TRUE 0.974 0.000 0.000 0.002 Y NA
 5733729 5733730 KPK_2100 KPK_2101     FALSE 0.005 214.000 0.000 NA   NA
 5733730 5733731 KPK_2101 KPK_2102   purU FALSE 0.015 159.000 0.000 NA   NA
 5733731 5733732 KPK_2102 KPK_2103 purU   TRUE 0.678 43.000 0.200 NA   NA
 5733733 5733734 KPK_2104 KPK_2105     FALSE 0.223 90.000 0.048 1.000   NA
 5733734 5733735 KPK_2105 KPK_2106   galU FALSE 0.118 198.000 0.235 1.000 N NA
 5733739 5733740 KPK_2110 KPK_2111     FALSE 0.008 184.000 0.000 NA   NA
 5733742 5733743 KPK_2113 KPK_2114 oppA oppB TRUE 0.852 86.000 0.151 0.069 Y NA
 5733743 5733744 KPK_2114 KPK_2115 oppB oppC TRUE 0.996 15.000 0.870 0.069 Y NA
 5733744 5733745 KPK_2115 KPK_2116 oppC oppD TRUE 0.992 12.000 0.554 1.000 Y NA
 5733745 5733746 KPK_2116 KPK_2117 oppD oppF TRUE 0.994 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 5733746 5733747 KPK_2117 KPK_2118 oppF   FALSE 0.292 55.000 0.042 1.000   NA
 5733748 5733749 KPK_2119 KPK_2120   cls TRUE 0.757 35.000 0.231 NA   NA
 5733749 5733750 KPK_2120 KPK_2121 cls   FALSE 0.000 786.000 0.000 NA   NA
 5733752 5733753 KPK_2123 KPK_2124     FALSE 0.001 484.000 0.000 NA   NA
 5733753 5733754 KPK_2124 KPK_2125     FALSE 0.242 -19.000 0.000 NA   NA
 5733754 5733755 KPK_2125 KPK_2126     FALSE 0.242 -19.000 0.000 NA   NA
 5733755 5733756 KPK_2126 KPK_2127     FALSE 0.000 1655.000 0.000 NA   NA
 5733756 5733757 KPK_2127 KPK_2128     FALSE 0.003 254.000 0.000 NA   NA
 5733757 5733758 KPK_2128 KPK_2129     FALSE 0.005 211.000 0.000 NA   NA
 5733758 5733759 KPK_2129 KPK_2130     FALSE 0.001 340.000 0.000 NA   NA
 5733761 5733762 KPK_2132 KPK_2133     FALSE 0.161 106.000 0.041 NA   NA
 5733762 5733763 KPK_2133 KPK_2134   pfkB FALSE 0.050 93.000 0.000 NA   NA
 5733764 5733765 KPK_2135 KPK_2136     FALSE 0.007 189.000 0.000 NA   NA
 5733765 5733766 KPK_2136 KPK_2137     FALSE 0.002 271.000 0.000 NA   NA
 5733766 5733767 KPK_2137 KPK_2138   thrS FALSE 0.001 433.000 0.000 NA   NA
 5733767 5733768 KPK_2138 KPK_2139 thrS infC TRUE 0.826 79.000 0.186 1.000 Y NA
 5733768 5733769 KPK_2139 KPK_2140 infC rpmI TRUE 0.936 97.000 0.652 1.000 Y NA
 5733769 5733770 KPK_2140 KPK_2141 rpmI rplT TRUE 0.985 51.000 0.928 0.009 Y NA
 5733770 5733771 KPK_2141 KPK_2142 rplT pheS FALSE 0.115 307.000 0.202 1.000 Y NA
 5733771 5733772 KPK_2142 KPK_2143 pheS pheT TRUE 0.994 16.000 0.574 0.000 Y NA
 5733772 5733773 KPK_2143 KPK_2144 pheT ihfA TRUE 0.920 5.000 0.208 1.000 N NA
 5733774 5733775 KPK_2145 KPK_2146     TRUE 0.902 -3.000 0.179 NA N NA
 5733775 5733776 KPK_2146 KPK_2147     TRUE 0.718 50.000 0.278 1.000 N NA
 5733777 5733778 KPK_2148 KPK_2149   btuC FALSE 0.036 124.000 0.000 NA   NA
 5733780 5733781 KPK_2151 KPK_2152 btuE btuD TRUE 0.633 0.000 0.012 1.000 N NA
 5733781 5733782 KPK_2152 KPK_2153 btuD   FALSE 0.291 82.000 0.083 NA N NA
 5733782 5733783 KPK_2153 KPK_2154     FALSE 0.041 114.000 0.000 NA   NA
 5733784 5733785 KPK_2155 KPK_2156   aroH FALSE 0.092 147.000 0.054 NA N NA
 5733785 5733786 KPK_2156 KPK_2157 aroH   FALSE 0.199 155.000 0.165 1.000   NA
 5733786 5733787 KPK_2157 KPK_2158     FALSE 0.021 145.000 0.000 NA   NA
 5733789 5733790 KPK_2160 KPK_2161 ydiK   FALSE 0.060 70.000 0.000 NA   NA
 5733791 5733792 KPK_2162 KPK_2163   ydiI TRUE 0.873 -3.000 0.129 NA N NA
 5733792 5733793 KPK_2163 KPK_2164 ydiI   FALSE 0.005 204.000 0.000 NA   NA
 5733795 5733796 KPK_2166 KPK_2167     FALSE 0.002 263.000 0.000 NA   NA
 5733796 5733797 KPK_2167 KPK_2168     TRUE 0.956 24.000 0.775 NA   NA
 5733798 5733799 KPK_2169 KPK_2170     TRUE 0.978 12.000 0.190 NA Y NA
 5733799 5733800 KPK_2170 KPK_2171     TRUE 0.990 0.000 0.375 1.000 Y NA
 5733800 5733801 KPK_2171 KPK_2172     TRUE 0.997 0.000 1.000 1.000 Y NA
 5733801 5733802 KPK_2172 KPK_2173     FALSE 0.018 159.000 0.000 1.000 N NA
 5733803 5733804 KPK_2174 KPK_2175     FALSE 0.063 96.000 0.000 1.000 N NA
 5733804 5733805 KPK_2175 KPK_2176     TRUE 0.752 75.000 0.500 1.000 N NA
 5733805 5733806 KPK_2176 KPK_2177     TRUE 0.984 -3.000 0.857 NA N NA
 5733808 5733809 KPK_2179 KPK_2180   sufA FALSE 0.001 475.000 0.000 NA   NA
 5733809 5733810 KPK_2180 KPK_2181 sufA sufB TRUE 0.717 3.000 0.041 NA   NA
 5733810 5733811 KPK_2181 KPK_2182 sufB sufC TRUE 0.986 17.000 0.466 1.000 Y NA
 5733811 5733812 KPK_2182 KPK_2183 sufC sufD TRUE 0.983 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 5733812 5733813 KPK_2183 KPK_2184 sufD sufS TRUE 0.915 -3.000 0.193 1.000 N NA
 5733813 5733814 KPK_2184 KPK_2185 sufS sufE TRUE 0.895 12.000 0.183 NA   NA
 5733814 5733815 KPK_2185 KPK_2186 sufE   FALSE 0.326 101.000 0.103 NA   NA
 5733816 5733817 KPK_2187 KPK_2188 lpp pykF FALSE 0.002 313.000 0.000 1.000 N NA
 5733818 5733819 KPK_2189 KPK_2190     FALSE 0.252 18.000 0.000 NA   NA
 5733819 5733820 KPK_2190 KPK_2191     FALSE 0.049 100.000 0.000 NA   NA
 5733822 5733823 KPK_2193 KPK_2194     FALSE 0.044 72.000 0.000 NA N NA
 5733823 5733824 KPK_2194 KPK_2195     FALSE 0.227 16.000 0.000 NA N NA
 5733824 5733825 KPK_2195 KPK_2197     FALSE 0.092 57.000 0.000 1.000 N NA
 5733826 5733827 KPK_2196 KPK_2198     TRUE 0.995 -3.000 0.792 1.000 Y NA
 5733827 5733828 KPK_2198 KPK_2199     TRUE 0.988 -10.000 0.500 1.000 Y NA
 5733828 5733829 KPK_2199 KPK_2200   mhpR FALSE 0.063 93.000 0.000 1.000 N NA
 5733830 5733831 KPK_2201 KPK_2202 mhpA mhpB TRUE 0.973 2.000 0.333 0.005   NA
 5733831 5733832 KPK_2202 KPK_2203 mhpB mhpC TRUE 0.907 18.000 0.300 1.000   NA
 5733832 5733833 KPK_2203 KPK_2204 mhpC mhpD TRUE 0.941 11.000 0.300 1.000   NA
 5733833 5733834 KPK_2204 KPK_2205 mhpD mhpF TRUE 0.988 -7.000 0.444 1.000 Y NA
 5733834 5733835 KPK_2205 KPK_2206 mhpF mhpE TRUE 0.982 -3.000 0.750 1.000 N NA
 5733835 5733836 KPK_2206 KPK_2207 mhpE   TRUE 0.792 76.000 0.600 1.000 N NA
 5733836 5733837 KPK_2207 KPK_2208     FALSE 0.063 66.000 0.000 NA   NA
 5733838 5733839 KPK_2209 KPK_2210     TRUE 0.971 6.000 0.511 1.000   NA
 5733840 5733841 KPK_2211 KPK_2212     FALSE 0.027 145.000 0.000 1.000 N NA
 5733841 5733842 KPK_2212 KPK_2213     TRUE 0.844 -3.000 0.087 1.000 N NA
 5733842 5733843 KPK_2213 KPK_2214     FALSE 0.435 6.000 0.000 1.000 N NA
 5733843 5733844 KPK_2214 KPK_2215     TRUE 0.969 -3.000 0.000 0.016 Y NA
 5733844 5733845 KPK_2215 KPK_2216     TRUE 0.992 -19.000 0.667 0.069 Y NA
 5733845 5733846 KPK_2216 KPK_2217     TRUE 0.993 -6.000 0.630 1.000 Y NA
 5733848 5733849 KPK_2219 KPK_2220   fitB FALSE 0.088 51.000 0.000 NA   NA
 5733849 5733850 KPK_2220 KPK_2221 fitB fitC TRUE 0.995 12.000 0.857 1.000 Y NA
 5733850 5733851 KPK_2221 KPK_2222 fitC fitD TRUE 0.987 -3.000 0.182 0.069 Y NA
 5733851 5733852 KPK_2222 KPK_2223 fitD fitE TRUE 0.973 14.000 0.156 1.000 Y NA
 5733852 5733853 KPK_2223 KPK_2224 fitE   TRUE 0.933 -3.000 0.242 1.000 N NA
 5733853 5733854 KPK_2224 KPK_2225     FALSE 0.316 93.000 0.087 1.000 N NA
 5733854 5733855 KPK_2225 KPK_2226     TRUE 0.938 64.000 0.393 0.081 Y NA
 5733855 5733856 KPK_2226 KPK_2227     TRUE 0.983 -13.000 0.392 1.000 Y NA
 5733857 5733858 KPK_2228 KPK_2229     FALSE 0.028 121.000 0.000 NA N NA
 5733858 5733859 KPK_2229 KPK_2230     FALSE 0.083 62.000 0.000 1.000 N NA
 5733861 5733862 KPK_2232 KPK_2233     TRUE 0.988 -3.000 0.719 0.044   NA
 5733862 5733863 KPK_2233 KPK_2234     FALSE 0.095 48.000 0.000 NA   NA
 5733863 5733864 KPK_2234 KPK_2235     FALSE 0.136 200.000 0.294 NA   NA
 5733864 5733865 KPK_2235 KPK_2236     FALSE 0.023 143.000 0.000 NA   NA
 5733865 5733866 KPK_2236 KPK_2237     FALSE 0.111 42.000 0.000 NA   NA
 5733866 5733867 KPK_2237 KPK_2238     FALSE 0.031 115.000 0.000 NA N NA
 5733869 5733870 KPK_2240 KPK_2241 fdhA   FALSE 0.005 247.000 0.000 1.000   NA
 5733871 5733872 KPK_2242 KPK_2243     FALSE 0.241 19.000 0.000 NA   NA
 5733872 5733873 KPK_2243 KPK_2244     TRUE 0.962 75.000 0.688 0.069 Y NA
 5733873 5733874 KPK_2244 KPK_2245     TRUE 0.977 -7.000 0.585 0.069 N NA
 5733878 5733879 KPK_2249 KPK_2250     TRUE 0.992 3.000 0.895 0.001   NA
 5733879 5733880 KPK_2250 KPK_2251     TRUE 0.985 11.000 0.579 0.001 N NA
 5733880 5733881 KPK_2251 KPK_2252   ccmA FALSE 0.064 84.000 0.000 1.000 N NA
 5733881 5733882 KPK_2252 KPK_2253 ccmA ccmB TRUE 0.996 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 5733882 5733883 KPK_2253 KPK_2254 ccmB ccmC TRUE 0.974 50.000 0.501 0.001 Y NA
 5733883 5733884 KPK_2254 KPK_2255 ccmC ccmD TRUE 0.971 -3.000 0.501 1.000 N NA
 5733884 5733885 KPK_2255 KPK_2256 ccmD ccmE TRUE 0.918 -16.000 0.344 1.000 N NA
 5733885 5733886 KPK_2256 KPK_2257 ccmE ccmF TRUE 0.990 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 5733886 5733887 KPK_2257 KPK_2258 ccmF dsbE TRUE 0.997 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 5733887 5733888 KPK_2258 KPK_2259 dsbE   FALSE 0.222 -30.000 0.000 NA   NA
 5733888 5733889 KPK_2259 KPK_2260   ccmI FALSE 0.384 -3.000 0.000 NA   NA
 5733891 5733892 KPK_2262 KPK_2263     FALSE 0.002 279.000 0.000 NA