MicrobesOnline Operon Predictions for Haliangium ochraceum DSM 14365

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7486604 7486605 Hoch_0001 Hoch_0002     TRUE 0.765 718.000 0.328 1.000 Y NA
 7486605 7486606 Hoch_0002 Hoch_0003     TRUE 0.996 10.000 0.318 1.000 Y NA
 7486606 7486607 Hoch_0003 Hoch_0004     TRUE 0.987 61.000 0.249 0.003 Y NA
 7486607 7486608 Hoch_0004 Hoch_0005     TRUE 0.822 122.000 0.003 1.000 N NA
 7486608 7486609 Hoch_0005 Hoch_0006     FALSE 0.065 240.000 0.000 NA   NA
 7486609 7486610 Hoch_0006 Hoch_0007     TRUE 0.846 -3.000 0.000 NA   NA
 7486611 7486612 Hoch_0008 Hoch_0009     FALSE 0.165 133.000 0.000 NA   NA
 7486613 7486614 Hoch_0010 Hoch_0011     TRUE 0.779 5.000 0.000 1.000 N NA
 7486614 7486615 Hoch_0011 Hoch_0012     FALSE 0.321 90.000 0.000 1.000   NA
 7486617 7486618 Hoch_0014 Hoch_0015     FALSE 0.074 219.000 0.000 NA   NA
 7486619 7486620 Hoch_0016 Hoch_0017     TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000   NA
 7486621 7486622 Hoch_0018 Hoch_0019     FALSE 0.080 207.000 0.000 NA   NA
 7486623 7486624 Hoch_0020 Hoch_0021     FALSE 0.335 74.000 0.000 NA   NA
 7486624 7486625 Hoch_0021 Hoch_0022     FALSE 0.390 48.000 0.000 NA   NA
 7486625 7486626 Hoch_0022 Hoch_0023     FALSE 0.328 88.000 0.000 1.000   NA
 7486626 7486627 Hoch_0023 Hoch_0024     TRUE 0.474 31.000 0.000 NA   NA
 7486627 7486628 Hoch_0024 Hoch_0025     FALSE 0.314 82.000 0.000 NA   NA
 7486630 7486631 Hoch_0027 Hoch_0028     TRUE 0.464 32.000 0.000 NA   NA
 7486631 7486632 Hoch_0028 Hoch_0029     TRUE 0.846 -3.000 0.000 NA   NA
 7486632 7486633 Hoch_0029 Hoch_0030     FALSE 0.184 124.000 0.000 NA   NA
 7486634 7486635 Hoch_0031 Hoch_0032     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 7486635 7486636 Hoch_0032 Hoch_0033     FALSE 0.340 72.000 0.000 NA   NA
 7486637 7486638 Hoch_0034 Hoch_0035     TRUE 0.994 0.000 0.667 NA   NA
 7486638 7486639 Hoch_0035 Hoch_0036     FALSE 0.272 96.000 0.000 NA   NA
 7486639 7486640 Hoch_0036 Hoch_0037     TRUE 0.992 4.000 0.750 NA   NA
 7486640 7486641 Hoch_0037 Hoch_0038     FALSE 0.098 180.000 0.000 NA   NA
 7486642 7486643 Hoch_0039 Hoch_0040     FALSE 0.383 50.000 0.000 NA   NA
 7486644 7486645 Hoch_0041 Hoch_0042     FALSE 0.189 122.000 0.000 NA   NA
 7486646 7486647 Hoch_0043 Hoch_0044     TRUE 0.633 14.000 0.000 NA   NA
 7486647 7486648 Hoch_0044 Hoch_0045     FALSE 0.034 440.000 0.000 NA   NA
 7486648 7486649 Hoch_0045 Hoch_0046     FALSE 0.105 172.000 0.000 NA   NA
 7486649 7486650 Hoch_0046 Hoch_0047     FALSE 0.347 70.000 0.000 NA   NA
 7486651 7486652 Hoch_0048 Hoch_0049     FALSE 0.285 100.000 0.000 1.000 N NA
 7486652 7486653 Hoch_0049 Hoch_0050     TRUE 0.549 25.000 0.000 1.000 N NA
 7486654 7486655 Hoch_0051 Hoch_0052     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 7486655 7486656 Hoch_0052 Hoch_0053     FALSE 0.111 166.000 0.000 NA   NA
 7486656 7486657 Hoch_0053 Hoch_0054     TRUE 0.846 -3.000 0.000 NA   NA
 7486658 7486659 Hoch_0055 Hoch_0056     FALSE 0.208 114.000 0.000 NA   NA
 7486660 7486661 Hoch_0057 Hoch_0058     TRUE 0.846 -3.000 0.000 NA   NA
 7486661 7486662 Hoch_0058 Hoch_0059     TRUE 0.998 -3.000 0.063 0.016 Y NA
 7486663 7486664 Hoch_0060 Hoch_0061     TRUE 0.995 -3.000 0.371 NA   NA
 7486664 7486665 Hoch_0061 Hoch_0062     TRUE 0.846 -3.000 0.000 NA   NA
 7486665 7486666 Hoch_0062 Hoch_0063     FALSE 0.254 107.000 0.000 1.000   NA
 7486666 7486667 Hoch_0063 Hoch_0064     FALSE 0.078 230.000 0.000 1.000   NA
 7486668 7486669 Hoch_0065 Hoch_0066     TRUE 0.730 8.000 0.000 NA   NA
 7486669 7486670 Hoch_0066 Hoch_0067     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 7486670 7486671 Hoch_0067 Hoch_0068     FALSE 0.078 229.000 0.000 1.000   NA
 7486674 7486675 Hoch_0071 Hoch_0072     TRUE 0.989 55.000 0.832 0.001 Y NA
 7486676 7486677 Hoch_R0001 Hoch_0073     FALSE 0.351 69.000 0.000 NA   NA
 7486677 7486678 Hoch_0073 Hoch_0074     TRUE 0.626 17.000 0.000 1.000   NA
 7486679 7486680 Hoch_0075 Hoch_0076     TRUE 0.972 -7.000 0.000 NA Y NA
 7486680 7486681 Hoch_0076 Hoch_0077     FALSE 0.184 124.000 0.000 NA   NA
 7486682 7486683 Hoch_0078 Hoch_0079     FALSE 0.373 71.000 0.000 1.000   NA
 7486683 7486684 Hoch_0079 Hoch_0080     FALSE 0.057 296.000 0.000 1.000   NA
 7486684 7486685 Hoch_0080 Hoch_0081     FALSE 0.123 198.000 0.000 0.090   NA
 7486685 7486686 Hoch_0081 Hoch_0082     TRUE 0.974 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7486688 7486689 Hoch_0084 Hoch_0085     FALSE 0.121 170.000 0.000 1.000 N NA
 7486690 7486691 Hoch_0086 Hoch_0087     FALSE 0.364 62.000 0.000 NA   NA
 7486691 7486692 Hoch_0087 Hoch_0088     FALSE 0.216 120.000 0.000 1.000 N NA
 7486692 7486693 Hoch_0088 Hoch_0089     TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7486695 7486696 Hoch_0091 Hoch_0092     TRUE 0.559 36.000 0.000 0.007   NA
 7486696 7486697 Hoch_0092 Hoch_0093     FALSE 0.043 340.000 0.000 NA   NA
 7486700 7486701 Hoch_0096 Hoch_0097     TRUE 0.986 3.000 0.008 NA   NA
 7486701 7486702 Hoch_0097 Hoch_0098     TRUE 0.454 33.000 0.000 NA   NA
 7486702 7486703 Hoch_0098 Hoch_0099     TRUE 0.765 4.000 0.000 NA   NA
 7486705 7486706 Hoch_0101 Hoch_0102     FALSE 0.092 188.000 0.000 NA   NA
 7486707 7486708 Hoch_0103 Hoch_0104     FALSE 0.024 1101.000 0.000 NA   NA
 7486708 7486709 Hoch_0104 Hoch_0105     FALSE 0.249 102.000 0.000 NA   NA
 7486709 7486710 Hoch_0105 Hoch_0106     FALSE 0.086 197.000 0.000 NA   NA
 7486715 7486716 Hoch_0111 Hoch_R0002     FALSE 0.117 161.000 0.000 NA   NA
 7486716 7486717 Hoch_R0002 Hoch_R0003     FALSE 0.201 117.000 0.000 NA   NA
 7486717 7486718 Hoch_R0003 Hoch_R0004     FALSE 0.070 227.000 0.000 NA   NA
 7486718 7486719 Hoch_R0004 Hoch_R0005     FALSE 0.138 146.000 0.000 NA   NA
 7486719 7486720 Hoch_R0005 Hoch_0112     FALSE 0.063 244.000 0.000 NA   NA
 7486721 7486722 Hoch_0113 Hoch_0114     TRUE 0.646 23.000 0.000 0.014   NA
 7486722 7486723 Hoch_0114 Hoch_0115     TRUE 0.943 58.000 0.059 1.000   NA
 7486723 7486724 Hoch_0115 Hoch_0116     TRUE 0.912 89.000 0.034 NA   NA
 7486725 7486726 Hoch_R0006 Hoch_R0007     FALSE 0.393 47.000 0.000 NA   NA
 7486727 7486728 Hoch_0117 Hoch_0118     FALSE 0.366 57.000 0.000 NA   NA
 7486728 7486729 Hoch_0118 Hoch_0119     FALSE 0.036 403.000 0.000 NA   NA
 7486730 7486731 Hoch_0120 Hoch_0121     FALSE 0.272 96.000 0.000 NA   NA
 7486732 7486733 Hoch_0122 Hoch_0123     FALSE 0.373 53.000 0.000 NA   NA
 7486733 7486734 Hoch_0123 Hoch_0124     TRUE 0.454 33.000 0.000 NA   NA
 7486734 7486735 Hoch_0124 Hoch_0125     FALSE 0.107 185.000 0.000 1.000   NA
 7486735 7486736 Hoch_0125 Hoch_0126     TRUE 0.789 4.000 0.000 1.000   NA
 7486736 7486737 Hoch_0126 Hoch_0127     TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 7486737 7486738 Hoch_0127 Hoch_0128     TRUE 0.846 -3.000 0.000 NA   NA
 7486738 7486739 Hoch_0128 Hoch_0129     TRUE 0.846 -3.000 0.000 NA   NA
 7486739 7486740 Hoch_0129 Hoch_0130     FALSE 0.113 177.000 0.000 1.000 N NA
 7486741 7486742 Hoch_R0008 Hoch_R0009     FALSE 0.075 217.000 0.000 NA   NA
 7486742 7486743 Hoch_R0009 Hoch_0131     FALSE 0.319 80.000 0.000 NA   NA
 7486744 7486745 Hoch_0132 Hoch_0133     TRUE 0.986 3.000 0.005 NA N NA
 7486745 7486746 Hoch_0133 Hoch_0134     TRUE 0.842 -27.000 0.000 NA   NA
 7486746 7486747 Hoch_0134 Hoch_0135     TRUE 0.730 8.000 0.000 NA   NA
 7486747 7486748 Hoch_0135 Hoch_0136     TRUE 0.990 32.000 0.102 0.034 Y NA
 7486749 7486750 Hoch_0137 Hoch_0138     FALSE 0.275 95.000 0.000 NA   NA
 7486750 7486751 Hoch_0138 Hoch_0139     FALSE 0.101 176.000 0.000 NA   NA
 7486751 7486752 Hoch_0139 Hoch_0140     TRUE 0.441 43.000 0.000 1.000   NA
 7486754 7486755 Hoch_0142 Hoch_0143     TRUE 0.846 -3.000 0.000 NA   NA
 7486756 7486757 Hoch_0144 Hoch_0145     FALSE 0.275 95.000 0.000 NA   NA
 7486757 7486758 Hoch_0145 Hoch_0146     FALSE 0.396 46.000 0.000 NA   NA
 7486758 7486759 Hoch_0146 Hoch_0147     FALSE 0.396 46.000 0.000 NA   NA
 7486759 7486760 Hoch_0147 Hoch_0148     FALSE 0.060 286.000 0.000 1.000 N NA
 7486761 7486762 Hoch_0149 Hoch_0150     FALSE 0.141 144.000 0.000 NA   NA
 7486762 7486763 Hoch_0150 Hoch_0151     TRUE 0.995 -3.000 0.800 NA   NA
 7486763 7486764 Hoch_0151 Hoch_0152     TRUE 0.933 11.000 0.000 NA Y NA
 7486765 7486766 Hoch_0153 Hoch_0154     FALSE 0.322 79.000 0.000 NA   NA
 7486769 7486770 Hoch_0157 Hoch_0158     FALSE 0.147 141.000 0.000 NA   NA
 7486770 7486771 Hoch_0158 Hoch_0159     FALSE 0.383 50.000 0.000 NA   NA
 7486772 7486773 Hoch_0160 Hoch_0161     FALSE 0.373 53.000 0.000 NA   NA
 7486774 7486775 Hoch_0162 Hoch_0163     FALSE 0.398 60.000 0.000 1.000 N NA
 7486781 7486782 Hoch_0169 Hoch_0170     FALSE 0.198 118.000 0.000 NA   NA
 7486782 7486783 Hoch_0170 Hoch_0171     FALSE 0.040 366.000 0.000 NA   NA
 7486783 7486784 Hoch_0171 Hoch_0172     FALSE 0.036 410.000 0.000 NA   NA
 7486784 7486785 Hoch_0172 Hoch_0173     FALSE 0.284 93.000 0.000 NA   NA
 7486791 7486792 Hoch_0179 Hoch_0180     TRUE 0.436 44.000 0.000 1.000   NA
 7486792 7486793 Hoch_0180 Hoch_0181     FALSE 0.061 282.000 0.000 1.000   NA
 7486793 7486794 Hoch_0181 Hoch_0182     FALSE 0.302 87.000 0.000 NA   NA
 7486794 7486795 Hoch_0182 Hoch_0183     FALSE 0.026 863.000 0.000 NA   NA
 7486795 7486796 Hoch_0183 Hoch_0184     FALSE 0.059 260.000 0.000 NA   NA
 7486799 7486800 Hoch_0187 Hoch_0188     TRUE 0.807 0.000 0.000 NA   NA
 7486800 7486801 Hoch_0188 Hoch_0189     TRUE 0.846 -3.000 0.000 NA   NA
 7486801 7486802 Hoch_0189 Hoch_0190     TRUE 0.846 -3.000 0.000 NA   NA
 7486802 7486803 Hoch_0190 Hoch_0191     TRUE 0.846 -3.000 0.000 NA   NA
 7486803 7486804 Hoch_0191 Hoch_0192     TRUE 0.633 14.000 0.000 NA   NA
 7486804 7486805 Hoch_0192 Hoch_0193     TRUE 0.848 -7.000 0.000 NA   NA
 7486805 7486806 Hoch_0193 Hoch_0194     TRUE 0.765 7.000 0.000 1.000   NA
 7486806 7486807 Hoch_0194 Hoch_0195     TRUE 0.514 25.000 0.000 NA   NA
 7486808 7486809 Hoch_0196 Hoch_0197     FALSE 0.416 41.000 0.000 NA   NA
 7486809 7486810 Hoch_0197 Hoch_0198     TRUE 0.464 32.000 0.000 NA   NA
 7486810 7486811 Hoch_0198 Hoch_0199     TRUE 0.514 25.000 0.000 NA   NA
 7486812 7486813 Hoch_0200 Hoch_0201     FALSE 0.403 44.000 0.000 NA   NA
 7486813 7486814 Hoch_0201 Hoch_0202     FALSE 0.332 87.000 0.000 1.000 N NA
 7486814 7486815 Hoch_0202 Hoch_0203     FALSE 0.249 102.000 0.000 NA   NA
 7486815 7486816 Hoch_0203 Hoch_0204     FALSE 0.073 222.000 0.000 NA   NA
 7486816 7486817 Hoch_0204 Hoch_0205     TRUE 0.996 -7.000 1.000 1.000 N NA
 7486817 7486818 Hoch_0205 Hoch_0206     TRUE 0.841 -31.000 0.000 NA   NA
 7486818 7486819 Hoch_0206 Hoch_0207     FALSE 0.140 145.000 0.000 NA   NA
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 7487979 7487980 Hoch_1364 Hoch_1365     FALSE 0.427 38.000 0.000 NA   NA
 7487980 7487981 Hoch_1365 Hoch_1366     FALSE 0.075 218.000 0.000 NA   NA
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 7488003 7488004 Hoch_1388 Hoch_1389     FALSE 0.114 210.000 0.000 0.066   NA
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