MicrobesOnline Operon Predictions for Heliobacterium modesticaldum Ice1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 10257501 10257502 HM1_0003 HM1_0004     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10257502 10257503 HM1_0004 HM1_0005     FALSE 0.191 52.000 0.000 NA   NA
 10257505 10257506 HM1_0007 HM1_0008     FALSE 0.083 201.000 0.000 NA   NA
 10257506 10257507 HM1_0008 HM1_0009     TRUE 0.996 -3.000 0.373 NA   NA
 10257507 10257508 HM1_0009 HM1_0010     FALSE 0.143 84.000 0.000 NA   NA
 10257509 10257510 HM1_0011 HM1_0012     FALSE 0.132 142.000 0.000 NA   NA
 10257510 10257511 HM1_0012 HM1_0013     FALSE 0.052 275.000 0.000 NA   NA
 10257512 10257513 HM1_0014 HM1_0015   htpG FALSE 0.050 283.000 0.000 NA   NA
 10257513 10257514 HM1_0015 HM1_0016 htpG   FALSE 0.034 398.000 0.000 NA   NA
 10257514 10257515 HM1_0016 HM1_0017     FALSE 0.038 352.000 0.000 NA   NA
 10257518 10257519 HM1_0020 HM1_0021     FALSE 0.272 19.000 0.000 NA   NA
 10257519 10257520 HM1_0021 HM1_0022     FALSE 0.274 18.000 0.000 NA   NA
 10257520 10257521 HM1_0022 HM1_0023     FALSE 0.144 124.000 0.000 NA   NA
 10257521 10257522 HM1_0023 HM1_0024     FALSE 0.044 312.000 0.000 NA   NA
 10257522 10257523 HM1_0024 HM1_0025     TRUE 0.982 86.000 1.000 NA   NA
 10257523 10257524 HM1_0025 HM1_0026     TRUE 0.971 184.000 1.000 NA   NA
 10257525 10257526 HM1_0027 HM1_0028     FALSE 0.038 353.000 0.000 NA   NA
 10257526 10257527 HM1_0028 HM1_0029     FALSE 0.029 476.000 0.000 NA   NA
 10257531 10257532 HM1_0033 HM1_0034     FALSE 0.142 94.000 0.000 NA   NA
 10257532 10257533 HM1_0034 HM1_0035     FALSE 0.025 638.000 0.000 NA   NA
 10257533 10257534 HM1_0035 HM1_0036     FALSE 0.037 368.000 0.000 NA   NA
 10257534 10257535 HM1_0036 HM1_0037     FALSE 0.304 13.000 0.000 NA   NA
 10257535 10257536 HM1_0037 HM1_0038     FALSE 0.272 22.000 0.000 NA   NA
 10257536 10257537 HM1_0038 HM1_0039     FALSE 0.043 317.000 0.000 NA   NA
 10257537 10257538 HM1_0039 HM1_0040     FALSE 0.318 11.000 0.000 NA   NA
 10257538 10257539 HM1_0040 HM1_0041     FALSE 0.028 490.000 0.000 NA   NA
 10257539 10257540 HM1_0041 HM1_0042     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10257541 10257542 HM1_0043 HM1_0044     FALSE 0.148 209.000 0.000 1.000   NA
 10257544 10257545 HM1_0046 HM1_0047     FALSE 0.142 86.000 0.000 NA   NA
 10257546 10257547 HM1_0048 HM1_0049     FALSE 0.142 86.000 0.000 NA   NA
 10257547 10257548 HM1_0049 HM1_0050     FALSE 0.238 34.000 0.000 NA   NA
 10257548 10257549 HM1_0050 HM1_0051     FALSE 0.262 28.000 0.000 NA   NA
 10257549 10257550 HM1_0051 HM1_0052     FALSE 0.287 15.000 0.000 NA   NA
 10257550 10257551 HM1_0052 HM1_0053     FALSE 0.147 117.000 0.000 NA   NA
 10257551 10257552 HM1_0053 HM1_0054     FALSE 0.167 63.000 0.000 NA   NA
 10257553 10257554 HM1_0055 HM1_0056     TRUE 0.668 54.000 0.000 1.000 N NA
 10257555 10257556 HM1_0057 HM1_0058 guaA hpt TRUE 0.948 103.000 0.013 1.000 Y NA
 10257558 10257559 HM1_0060 HM1_0061     FALSE 0.091 187.000 0.000 NA   NA
 10257559 10257560 HM1_0061 HM1_0062     TRUE 0.978 -3.000 0.025 1.000   NA
 10257560 10257561 HM1_0062 HM1_0063   moaC TRUE 0.960 3.000 0.012 1.000   NA
 10257561 10257562 HM1_0063 HM1_0064 moaC moaA TRUE 0.984 141.000 0.071 0.005 Y NA
 10257562 10257563 HM1_0064 HM1_0065 moaA   FALSE 0.145 80.000 0.000 NA   NA
 10257564 10257565 HM1_0066 HM1_0067     FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 10257566 10257567 HM1_0068 HM1_0069     TRUE 0.758 28.000 0.000 1.000 N NA
 10257569 10257570 HM1_0071 HM1_0072     TRUE 0.785 55.000 0.000 1.000 Y NA
 10257570 10257571 HM1_0072 HM1_0073     TRUE 0.998 21.000 0.588 1.000 Y NA
 10257571 10257572 HM1_0073 HM1_0074     TRUE 0.909 107.000 0.008 1.000 N NA
 10257572 10257573 HM1_0074 HM1_0075   lcfA TRUE 0.945 87.000 0.031 1.000 N NA
 10257573 10257574 HM1_0075 HM1_0076 lcfA pykA FALSE 0.249 372.000 0.000 1.000 N NA
 10257574 10257575 HM1_0076 HM1_0077 pykA   FALSE 0.115 162.000 0.000 NA   NA
 10257575 10257576 HM1_0077 HM1_0078   pfkA FALSE 0.266 27.000 0.000 NA   NA
 10257576 10257577 HM1_0078 HM1_0079 pfkA   FALSE 0.109 167.000 0.000 NA   NA
 10257577 10257578 HM1_0079 HM1_0080   accA TRUE 0.523 -34.000 0.000 NA   NA
 10257578 10257579 HM1_0080 HM1_0081 accA accD TRUE 0.999 0.000 0.234 0.002 Y NA
 10257579 10257580 HM1_0081 HM1_0082 accD   FALSE 0.144 109.000 0.000 NA   NA
 10257580 10257581 HM1_0082 HM1_0083   mtrB FALSE 0.266 27.000 0.000 NA   NA
 10257581 10257582 HM1_0083 HM1_0084 mtrB dnaE TRUE 0.867 130.000 0.021 1.000   NA
 10257585 10257586 HM1_0087 HM1_0088 feoA   TRUE 0.970 20.000 0.067 1.000   NA
 10257586 10257587 HM1_0088 HM1_0089     TRUE 0.996 -12.000 0.148 0.006   NA
 10257590 10257591 HM1_0091 HM1_0093   lcfA FALSE 0.142 87.000 0.000 NA   NA
 10257591 10257592 HM1_0093 HM1_0094 lcfA   FALSE 0.079 208.000 0.000 NA   NA
 10257592 10257593 HM1_0094 HM1_0095   metX FALSE 0.105 171.000 0.000 NA   NA
 10257593 10257594 HM1_0095 HM1_0096 metX cysD TRUE 0.973 16.000 0.006 1.000 Y NA
 10257600 10257601 HM1_0102 HM1_0103   pfk TRUE 0.526 -7.000 0.000 NA   NA
 10257601 10257602 HM1_0103 HM1_0104 pfk   TRUE 0.545 156.000 0.000 1.000 N NA
 10257604 10257605 HM1_0106 HM1_0107     FALSE 0.143 106.000 0.000 NA   NA
 10257605 10257606 HM1_0107 HM1_0108     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10257606 10257607 HM1_0108 HM1_0109     FALSE 0.147 119.000 0.000 NA   NA
 10257607 10257608 HM1_0109 HM1_0110   glgA FALSE 0.144 82.000 0.000 NA   NA
 10257608 10257609 HM1_0110 HM1_0111 glgA   TRUE 0.600 122.000 0.000 1.000 N NA
 10257609 10257610 HM1_0111 HM1_0112     TRUE 0.761 27.000 0.000 1.000 N NA
 10257610 10257611 HM1_0112 HM1_0113     FALSE 0.325 275.000 0.000 1.000 N NA
 10257611 10257612 HM1_0113 HM1_0114     TRUE 0.593 95.000 0.000 1.000 N NA
 10257612 10257613 HM1_0114 HM1_0115     TRUE 0.516 136.000 0.000 NA N NA
 10257614 10257615 HM1_0116 HM1_0117     FALSE 0.141 102.000 0.000 NA   NA
 10257615 10257616 HM1_0117 HM1_0118     FALSE 0.142 88.000 0.000 NA   NA
 10257617 10257618 HM1_0121 HM1_0122     TRUE 0.451 2.000 0.000 NA   NA
 10257618 10257619 HM1_0122 HM1_0123     FALSE 0.042 322.000 0.000 NA   NA
 10257619 10257620 HM1_0123 HM1_0124     FALSE 0.063 242.000 0.000 NA   NA
 10257620 10257621 HM1_0124 HM1_0125     FALSE 0.082 203.000 0.000 NA   NA
 10257621 10257622 HM1_0125 HM1_0126     TRUE 0.995 -3.000 0.330 NA   NA
 10257622 10257623 HM1_0126 HM1_0127     TRUE 0.996 1.000 0.491 NA   NA
 10257623 10257624 HM1_0127 HM1_0128     TRUE 0.876 487.000 0.400 NA   NA
 10257624 10257625 HM1_0128 HM1_0129     FALSE 0.027 547.000 0.000 NA   NA
 10257625 10257626 HM1_0129 HM1_0130     FALSE 0.146 79.000 0.000 NA   NA
 10257626 10257627 HM1_0130 HM1_0131     FALSE 0.047 300.000 0.000 NA   NA
 10257627 10257628 HM1_0131 HM1_0132     TRUE 0.997 -6.000 0.600 NA   NA
 10257628 10257629 HM1_0132 HM1_0133     TRUE 0.996 2.000 0.500 NA   NA
 10257629 10257630 HM1_0133 HM1_0134     FALSE 0.152 73.000 0.000 NA   NA
 10257630 10257631 HM1_0134 HM1_0135     FALSE 0.295 14.000 0.000 NA   NA
 10257631 10257632 HM1_0135 HM1_0136     FALSE 0.052 574.000 0.000 1.000   NA
 10257632 10257633 HM1_0136 HM1_0137     FALSE 0.047 713.000 0.000 1.000   NA
 10257633 10257634 HM1_0137 HM1_0138     TRUE 0.643 19.000 0.000 0.003   NA
 10257634 10257635 HM1_0138 HM1_0139     FALSE 0.090 300.000 0.000 1.000   NA
 10257635 10257636 HM1_0139 HM1_0140     FALSE 0.229 37.000 0.000 NA   NA
 10257636 10257637 HM1_0140 HM1_0141     FALSE 0.069 227.000 0.000 NA   NA
 10257637 10257638 HM1_0141 HM1_0142     FALSE 0.375 37.000 0.000 1.000   NA
 10257638 10257639 HM1_0142 HM1_0143     FALSE 0.274 18.000 0.000 NA   NA
 10257639 10257640 HM1_0143 HM1_0144     FALSE 0.149 75.000 0.000 NA   NA
 10257640 10257641 HM1_0144 HM1_0145     FALSE 0.146 114.000 0.000 NA   NA
 10257641 10257642 HM1_0145 HM1_0639     FALSE 0.046 951.000 0.000 1.000   NA
 10257642 10257643 HM1_0639 HM1_0638     FALSE 0.207 483.000 0.000 1.000 N NA
 10257644 10257645 HM1_0637 HM1_0636     FALSE 0.258 29.000 0.000 NA   NA
 10257646 10257647 HM1_0635 HM1_0634     FALSE 0.169 62.000 0.000 NA   NA
 10257647 10257648 HM1_0634 HM1_0633     TRUE 0.857 0.000 0.000 NA N NA
 10257648 10257649 HM1_0633 HM1_0632     TRUE 0.997 -3.000 0.080 1.000 Y NA
 10257649 10257650 HM1_0632 HM1_0631     TRUE 0.998 19.000 0.564 1.000 Y NA
 10257650 10257651 HM1_0631 HM1_0630     FALSE 0.268 26.000 0.000 NA   NA
 10257651 10257652 HM1_0630 HM1_0629     FALSE 0.125 151.000 0.000 NA   NA
 10257652 10257653 HM1_0629 HM1_0628     TRUE 0.817 -3.000 0.000 0.006   NA
 10257653 10257654 HM1_0628 HM1_0627     TRUE 0.523 -34.000 0.000 NA   NA
 10257654 10257655 HM1_0627 HM1_0626     FALSE 0.318 11.000 0.000 NA   NA
 10257657 10257658 HM1_0624 HM1_0623     FALSE 0.102 271.000 0.000 1.000   NA
 10257658 10257659 HM1_0623 HM1_0622     TRUE 0.991 12.000 0.333 1.000   NA
 10257659 10257660 HM1_0622 HM1_0621     FALSE 0.303 57.000 0.000 1.000   NA
 10257660 10257661 HM1_0621 HM1_0620     FALSE 0.282 16.000 0.000 NA   NA
 10257661 10257662 HM1_0620 HM1_0619     FALSE 0.287 15.000 0.000 NA   NA
 10257662 10257663 HM1_0619 HM1_0618     FALSE 0.311 12.000 0.000 NA   NA
 10257663 10257664 HM1_0618 HM1_0617     FALSE 0.036 378.000 0.000 NA   NA
 10257664 10257665 HM1_0617 HM1_0616     FALSE 0.145 111.000 0.000 NA   NA
 10257665 10257666 HM1_0616 HM1_0615     TRUE 0.995 5.000 0.667 NA   NA
 10257666 10257667 HM1_0615 HM1_0614     FALSE 0.238 34.000 0.000 NA   NA
 10257667 10257668 HM1_0614 HM1_0613     FALSE 0.274 18.000 0.000 NA   NA
 10257668 10257669 HM1_0613 HM1_0612     TRUE 0.994 5.000 0.500 NA   NA
 10257669 10257670 HM1_0612 HM1_0611     TRUE 0.986 20.000 0.250 NA   NA
 10257670 10257671 HM1_0611 HM1_0610     FALSE 0.142 91.000 0.000 NA   NA
 10257671 10257672 HM1_0610 HM1_0609     TRUE 0.999 -3.000 0.364 0.011 Y NA
 10257672 10257673 HM1_0609 HM1_0608     TRUE 0.999 0.000 0.545 0.011 Y NA
 10257675 10257676 HM1_0607 HM1_0605     FALSE 0.158 68.000 0.000 NA   NA
 10257676 10257677 HM1_0605 HM1_0604   fic FALSE 0.096 180.000 0.000 NA   NA
 10257679 10257680 HM1_0602 HM1_0601     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10257680 10257681 HM1_0601 HM1_0600     FALSE 0.295 14.000 0.000 NA   NA
 10257681 10257682 HM1_0600 HM1_0599     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10257682 10257683 HM1_0599 HM1_0598     FALSE 0.167 63.000 0.000 NA   NA
 10257683 10257684 HM1_0598 HM1_0597     FALSE 0.068 230.000 0.000 NA   NA
 10257684 10257685 HM1_0597 HM1_0596     TRUE 0.963 -10.000 0.000 0.011 Y NA
 10257685 10257686 HM1_0596 HM1_0595     TRUE 0.999 -16.000 0.200 0.011 Y NA
 10257686 10257687 HM1_0595 HM1_0594     FALSE 0.134 140.000 0.000 NA   NA
 10257687 10257688 HM1_0594 HM1_0593     FALSE 0.148 76.000 0.000 NA   NA
 10257688 10257689 HM1_0593 HM1_0592     FALSE 0.142 93.000 0.000 NA   NA
 10257689 10257690 HM1_0592 HM1_0591     TRUE 0.995 -3.000 0.250 NA   NA
 10257690 10257691 HM1_0591 HM1_0590     TRUE 0.524 -6.000 0.000 NA   NA
 10257691 10257692 HM1_0590 HM1_0589     TRUE 0.439 3.000 0.000 NA   NA
 10257692 10257693 HM1_0589 HM1_0588     FALSE 0.349 7.000 0.000 NA   NA
 10257693 10257694 HM1_0588 HM1_0587     TRUE 0.999 -3.000 0.571 NA Y NA
 10257694 10257695 HM1_0587 HM1_0586     TRUE 0.674 -3.000 0.000 1.000   NA
 10257695 10257696 HM1_0586 HM1_0585     TRUE 0.439 3.000 0.000 NA   NA
 10257696 10257697 HM1_0585 HM1_0584   comC TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   NA
 10257697 10257698 HM1_0584 HM1_0583 comC   TRUE 0.996 -10.000 0.400 NA   NA
 10257698 10257699 HM1_0583 HM1_0582     FALSE 0.146 113.000 0.000 NA   NA
 10257699 10257700 HM1_0582 HM1_0581     FALSE 0.217 42.000 0.000 NA   NA
 10257700 10257701 HM1_0581 HM1_0580   spoVG FALSE 0.205 48.000 0.000 NA   NA
 10257701 10257702 HM1_0580 HM1_0579 spoVG   TRUE 0.982 66.000 0.600 NA   NA
 10257702 10257703 HM1_0579 HM1_0578     FALSE 0.232 36.000 0.000 NA   NA
 10257703 10257704 HM1_0578 HM1_0577     FALSE 0.141 104.000 0.000 NA   NA
 10257704 10257705 HM1_0577 HM1_0576   spoVT TRUE 0.993 13.000 0.714 NA   NA
 10257705 10257706 HM1_0576 HM1_0575 spoVT   TRUE 0.996 -10.000 0.286 NA   NA
 10257706 10257707 HM1_0575 HM1_0574   dam FALSE 0.153 72.000 0.000 NA   NA
 10257707 10257708 HM1_0574 HM1_0573 dam   FALSE 0.337 8.000 0.000 NA   NA
 10257708 10257709 HM1_0573 HM1_0572     FALSE 0.141 102.000 0.000 NA   NA
 10257709 10257710 HM1_0572 HM1_0571     TRUE 0.451 2.000 0.000 NA   NA
 10257710 10257711 HM1_0571 HM1_0570     FALSE 0.056 261.000 0.000 NA   NA
 10257711 10257712 HM1_0570 HM1_0569     FALSE 0.362 6.000 0.000 NA   NA
 10257712 10257713 HM1_0569 HM1_0568     FALSE 0.318 11.000 0.000 NA   NA
 10257713 10257714 HM1_0568 HM1_0567     FALSE 0.385 5.000 0.000 NA   NA
 10257714 10257715 HM1_0567 HM1_0566     FALSE 0.272 19.000 0.000 NA   NA
 10257715 10257716 HM1_0566 HM1_0565     FALSE 0.142 105.000 0.000 NA   NA
 10257716 10257717 HM1_0565 HM1_0564     FALSE 0.063 242.000 0.000 NA   NA
 10257717 10257718 HM1_0564 HM1_0563     FALSE 0.163 65.000 0.000 NA   NA
 10257718 10257719 HM1_0563 HM1_0562     FALSE 0.040 336.000 0.000 NA   NA
 10257719 10257720 HM1_0562 HM1_0561     TRUE 0.522 -36.000 0.000 NA   NA
 10257720 10257721 HM1_0561 HM1_0560     FALSE 0.030 470.000 0.000 NA   NA
 10257721 10257722 HM1_0560 HM1_0559     TRUE 0.791 79.000 0.000 0.020 Y NA
 10257722 10257723 HM1_0559 HM1_0558     FALSE 0.232 36.000 0.000 NA   NA
 10257723 10257724 HM1_0558 HM1_0557   pepF FALSE 0.073 220.000 0.000 NA   NA
 10257724 10257725 HM1_0557 HM1_0556 pepF   TRUE 0.596 125.000 0.000 1.000 N NA
 10257725 10257726 HM1_0556 HM1_0555   ppaC FALSE 0.378 237.000 0.000 1.000 N NA
 10257726 10257727 HM1_0555 HM1_0554 ppaC   TRUE 0.766 24.000 0.000 1.000 N NA
 10257727 10257728 HM1_0554 HM1_0553     FALSE 0.120 155.000 0.000 NA   NA
 10257728 10257729 HM1_0553 HM1_0552     FALSE 0.144 108.000 0.000 NA   NA
 10257729 10257730 HM1_0552 HM1_0551     TRUE 0.624 2.000 0.000 1.000   NA
 10257730 10257731 HM1_0551 HM1_0550     TRUE 0.776 16.000 0.000 1.000 N NA
 10257733 10257734 HM1_0548 HM1_0547     FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 10257734 10257735 HM1_0547 HM1_0546     FALSE 0.295 14.000 0.000 NA   NA
 10257735 10257736 HM1_0546 HM1_0545     TRUE 0.439 3.000 0.000 NA   NA
 10257736 10257737 HM1_0545 HM1_0544     FALSE 0.109 167.000 0.000 NA   NA
 10257738 10257739 HM1_0543 HM1_0542     FALSE 0.152 73.000 0.000 NA   NA
 10257740 10257741 HM1_0541 HM1_0540 lexA   FALSE 0.034 399.000 0.000 NA   NA
 10257743 10257744 HM1_0538 HM1_0537     TRUE 0.433 18.000 0.000 1.000   NA
 10257744 10257745 HM1_0537 HM1_0536     TRUE 0.976 -10.000 0.025 NA   NA
 10257745 10257746 HM1_0536 HM1_0535     FALSE 0.183 55.000 0.000 NA   NA
 10257746 10257747 HM1_0535 HM1_0534     FALSE 0.278 17.000 0.000 NA   NA
 10257747 10257748 HM1_0534 HM1_0533     TRUE 0.958 152.000 0.217 NA   NA
 10257748 10257749 HM1_0533 HM1_0532     TRUE 0.991 5.000 0.070 1.000 N NA
 10257749 10257750 HM1_0532 HM1_0531     TRUE 0.986 -19.000 0.059 NA   NA
 10257750 10257751 HM1_0531 HM1_0530   alaS TRUE 0.927 163.000 0.110 NA   NA
 10257755 10257756 HM1_0526 HM1_0525   dgt FALSE 0.040 337.000 0.000 NA   NA
 10257756 10257757 HM1_0525 HM1_0524 dgt   FALSE 0.189 595.000 0.000 1.000 N NA
 10257757 10257758 HM1_0524 HM1_0523     TRUE 0.975 51.000 0.135 0.098   NA
 10257759 10257760 HM1_0522 HM1_0521     FALSE 0.155 293.000 0.000 0.036   NA
 10257760 10257761 HM1_0521 HM1_0520     FALSE 0.094 513.000 0.000 0.036   NA
 11417726 10257755   HM1_0526     FALSE NA 8546.000 0.000 NA   NA
 11560089 10257755   HM1_0526     FALSE NA 8546.000 0.000 NA   NA
 11702481 10257755   HM1_0526     FALSE NA 8546.000 0.000 NA   NA
 11417727 10257755   HM1_0526     FALSE NA 8583.000 0.000 NA   NA
 11560090 10257755   HM1_0526     FALSE NA 8583.000 0.000 NA   NA
 11702482 10257755   HM1_0526     FALSE NA 8583.000 0.000 NA   NA
 11417728 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2525.000 0.000 NA   NA
 11560091 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2525.000 0.000 NA   NA
 11702483 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2525.000 0.000 NA   NA
 11417729 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2486.000 0.000 NA   NA
 11560092 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2486.000 0.000 NA   NA
 11702484 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2486.000 0.000 NA   NA
 11417730 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2449.000 0.000 NA   NA
 11560093 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2449.000 0.000 NA   NA
 11702485 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2449.000 0.000 NA   NA
 11417731 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2412.000 0.000 NA   NA
 11560094 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2412.000 0.000 NA   NA
 11702486 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2412.000 0.000 NA   NA
 11417732 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2375.000 0.000 NA   NA
 11560095 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2375.000 0.000 NA   NA
 11702487 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2375.000 0.000 NA   NA
 11417733 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2337.000 0.000 NA   NA
 11560096 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2337.000 0.000 NA   NA
 11702488 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2337.000 0.000 NA   NA
 11417734 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2300.000 0.000 NA   NA
 11560097 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2300.000 0.000 NA   NA
 11702489 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2300.000 0.000 NA   NA
 11417735 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2263.000 0.000 NA   NA
 11560098 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2263.000 0.000 NA   NA
 11702490 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2263.000 0.000 NA   NA
 11417736 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2226.000 0.000 NA   NA
 11560099 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2226.000 0.000 NA   NA
 11702491 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2226.000 0.000 NA   NA
 11417737 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2188.000 0.000 NA   NA
 11560100 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2188.000 0.000 NA   NA
 11702492 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2188.000 0.000 NA   NA
 11417738 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2151.000 0.000 NA   NA
 11560101 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2151.000 0.000 NA   NA
 11702493 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2151.000 0.000 NA   NA
 11417739 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2113.000 0.000 NA   NA
 11560102 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2113.000 0.000 NA   NA
 11702494 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2113.000 0.000 NA   NA
 11417740 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2076.000 0.000 NA   NA
 11560103 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2076.000 0.000 NA   NA
 11702495 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2076.000 0.000 NA   NA
 11417741 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2039.000 0.000 NA   NA
 11560104 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2039.000 0.000 NA   NA
 11702496 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2039.000 0.000 NA   NA
 11417742 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2002.000 0.000 NA   NA
 11560105 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2002.000 0.000 NA   NA
 11702497 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 2002.000 0.000 NA   NA
 11417743 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1966.000 0.000 NA   NA
 11560106 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1966.000 0.000 NA   NA
 11702498 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1966.000 0.000 NA   NA
 11417744 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1929.000 0.000 NA   NA
 11560107 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1929.000 0.000 NA   NA
 11702499 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1929.000 0.000 NA   NA
 11417745 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1890.000 0.000 NA   NA
 11560108 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1890.000 0.000 NA   NA
 11702500 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1890.000 0.000 NA   NA
 11417746 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1853.000 0.000 NA   NA
 11560109 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1853.000 0.000 NA   NA
 11702501 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1853.000 0.000 NA   NA
 11417747 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1813.000 0.000 NA   NA
 11560110 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1813.000 0.000 NA   NA
 11702502 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1813.000 0.000 NA   NA
 11417748 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1776.000 0.000 NA   NA
 11560111 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1776.000 0.000 NA   NA
 11702503 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1776.000 0.000 NA   NA
 11417749 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1741.000 0.000 NA   NA
 11560112 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1741.000 0.000 NA   NA
 11702504 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1741.000 0.000 NA   NA
 11417750 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1704.000 0.000 NA   NA
 11560113 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1704.000 0.000 NA   NA
 11702505 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1704.000 0.000 NA   NA
 11417751 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1667.000 0.000 NA   NA
 11560114 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1667.000 0.000 NA   NA
 11702506 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1667.000 0.000 NA   NA
 11417752 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1630.000 0.000 NA   NA
 11560115 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1630.000 0.000 NA   NA
 11702507 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1630.000 0.000 NA   NA
 11417753 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1592.000 0.000 NA   NA
 11560116 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1592.000 0.000 NA   NA
 11702508 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1592.000 0.000 NA   NA
 11417754 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1555.000 0.000 NA   NA
 11560117 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1555.000 0.000 NA   NA
 11702509 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1555.000 0.000 NA   NA
 11417755 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1518.000 0.000 NA   NA
 11560118 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1518.000 0.000 NA   NA
 11702510 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1518.000 0.000 NA   NA
 11417756 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1481.000 0.000 NA   NA
 11560119 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1481.000 0.000 NA   NA
 11702511 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1481.000 0.000 NA   NA
 11417757 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1443.000 0.000 NA   NA
 11560120 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1443.000 0.000 NA   NA
 11702512 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1443.000 0.000 NA   NA
 11417758 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1406.000 0.000 NA   NA
 11560121 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1406.000 0.000 NA   NA
 11702513 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1406.000 0.000 NA   NA
 11417759 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1370.000 0.000 NA   NA
 11560122 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1370.000 0.000 NA   NA
 11702514 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1370.000 0.000 NA   NA
 11417760 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1333.000 0.000 NA   NA
 11560123 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1333.000 0.000 NA   NA
 11702515 10257763   HM1_0518   cas4 FALSE NA 1333.000 0.000 NA   NA
 10257762 10257763 HM1_0519 HM1_0518   cas4 TRUE 0.885 203.000 0.088 NA   NA
 10257763 10257764 HM1_0518 HM1_0517 cas4 cas2 TRUE 0.998 -6.000 0.246 NA Y NA
 10257764 10257765 HM1_0517 HM1_0516 cas2 cas1 TRUE 0.999 3.000 0.632 NA Y NA
 10257767 10257768 HM1_0514 HM1_0513     TRUE 0.995 -43.000 0.250 NA   NA
 10257768 10257769 HM1_0513 HM1_0512     TRUE 0.989 15.000 0.364 NA   NA
 10257769 10257770 HM1_0512 HM1_0511     TRUE 0.984 35.000 0.273 NA   NA
 10257770 10257771 HM1_0511 HM1_0510   cas3 TRUE 0.995 -10.000 0.278 NA   NA
 10257771 10257772 HM1_0510 HM1_0509 cas3   FALSE 0.226 38.000 0.000 NA   NA
 10257772 10257773 HM1_0509 HM1_0508     TRUE 0.439 3.000 0.000 NA   NA
 10257773 10257774 HM1_0508 HM1_0507     FALSE 0.226 38.000 0.000 NA   NA
 10257774 10257775 HM1_0507 HM1_0506     FALSE 0.142 90.000 0.000 NA   NA
 10257775 10257776 HM1_0506 HM1_0505     FALSE 0.153 72.000 0.000 NA   NA
 10257777 10257778 HM1_0504 HM1_0503     FALSE 0.060 248.000 0.000 NA   NA
 10257778 10257779 HM1_0503 HM1_0502     FALSE 0.141 104.000 0.000 NA   NA
 10257779 10257780 HM1_0502 HM1_0501     TRUE 0.439 3.000 0.000 NA   NA
 10257781 10257782 HM1_0500 HM1_0499     TRUE 0.429 24.000 0.000 1.000   NA
 10257782 10257783 HM1_0499 HM1_0498     FALSE 0.123 152.000 0.000 NA   NA
 10257784 10257785 HM1_0497 HM1_0496     FALSE 0.039 343.000 0.000 NA   NA
 10257786 10257787 HM1_0495 HM1_0494     FALSE 0.258 29.000 0.000 NA   NA
 10257787 10257788 HM1_0494 HM1_0493     TRUE 0.999 -13.000 0.440 0.020 Y NA
 10257788 10257789 HM1_0493 HM1_0492     TRUE 0.999 -19.000 0.349 1.000 Y NA
 10257789 10257790 HM1_0492 HM1_0491     TRUE 0.999 1.000 0.363 0.013 Y NA
 10257790 10257791 HM1_0491 HM1_0490     TRUE 0.980 115.000 0.088 NA Y NA
 10257791 10257792 HM1_0490 HM1_0489     FALSE 0.300 428.000 0.000 NA Y NA
 10257792 10257793 HM1_0489 HM1_0488     FALSE 0.146 122.000 0.000 NA   NA
 10257793 10257794 HM1_0488 HM1_0487     FALSE 0.207 47.000 0.000 NA   NA
 10257794 10257795 HM1_0487 HM1_0486   asnB FALSE 0.051 276.000 0.000 NA   NA
 10257795 10257796 HM1_0486 HM1_0485 asnB   FALSE 0.078 211.000 0.000 NA   NA
 10257799 10257800 HM1_0482 HM1_0481 oorA oorB TRUE 0.997 -3.000 0.062 0.002 Y NA
 10257800 10257801 HM1_0481 HM1_0480 oorB paaK TRUE 0.984 200.000 0.569 1.000 N NA
 10257801 10257802 HM1_0480 HM1_0478 paaK   FALSE 0.271 70.000 0.000 1.000   NA
 10257803 10257804 HM1_0479 HM1_0477     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10257804 10257805 HM1_0477 HM1_0476   gerAA TRUE 0.615 20.000 0.000 0.007   NA
 10257805 10257806 HM1_0476 HM1_0475 gerAA   FALSE 0.295 171.000 0.000 0.043   NA
 10257806 10257807 HM1_0475 HM1_0474   lonA TRUE 0.857 215.000 0.055 1.000   NA
 10257807 10257808 HM1_0474 HM1_0473 lonA lonB TRUE 0.996 129.000 0.435 0.002 Y NA
 10257808 10257809 HM1_0473 HM1_0472 lonB clpX TRUE 0.947 247.000 0.042 0.004 Y NA
 10257809 10257810 HM1_0472 HM1_0471 clpX clpP TRUE 0.969 18.000 0.004 1.000 Y NA
 10257810 10257811 HM1_0471 HM1_0470 clpP tig TRUE 0.939 71.000 0.004 1.000 Y NA
 10257811 10257812 HM1_0470 HM1_0469 tig   FALSE 0.097 179.000 0.000 NA   NA
 10257812 10257813 HM1_0469 HM1_0468     FALSE 0.161 66.000 0.000 NA   NA
 10257813 10257814 HM1_0468 HM1_0467     FALSE 0.171 61.000 0.000 NA   NA
 10257814 10257815 HM1_0467 HM1_0466   rdgB FALSE 0.027 569.000 0.000 NA   NA
 10257815 10257816 HM1_0466 HM1_0465 rdgB rph TRUE 0.973 221.000 0.262 1.000 N NA
 10257816 10257817 HM1_0465 HM1_0464 rph fumB TRUE 0.913 60.000 0.003 1.000 N NA
 10257817 10257818 HM1_0464 HM1_0463 fumB ttdA TRUE 0.997 32.000 0.262 0.001 Y NA
 10257818 10257819 HM1_0463 HM1_0462 ttdA hgdC TRUE 0.437 205.000 0.000 1.000 N NA
 10257819 10257820 HM1_0462 HM1_0461 hgdC   TRUE 0.990 141.000 0.722 NA N NA
 10257820 10257821 HM1_0461 HM1_0460   murI TRUE 0.884 130.000 0.006 NA N NA
 10257821 10257822 HM1_0460 HM1_0459 murI   FALSE 0.167 63.000 0.000 NA   NA
 10257822 10257823 HM1_0459 HM1_0458     FALSE 0.096 180.000 0.000 NA   NA
 10257823 10257824 HM1_0458 HM1_0457     FALSE 0.141 103.000 0.000 NA   NA
 10257825 10257826 HM1_0456 HM1_0455     FALSE 0.113 164.000 0.000 NA   NA
 10257826 10257827 HM1_0455 HM1_0454     TRUE 0.992 -9.000 0.068 0.043   NA
 10257828 10257829 HM1_0453 HM1_0452     FALSE 0.246 32.000 0.000 NA   NA
 10257829 10257830 HM1_0452 HM1_0451     TRUE 0.643 0.000 0.000 1.000   NA
 10257830 10257831 HM1_0451 HM1_0450     TRUE 0.526 -19.000 0.000 NA   NA
 10257831 10257832 HM1_0450 HM1_0449     FALSE 0.146 78.000 0.000 NA   NA
 10257834 10257835 HM1_0447 HM1_0446     FALSE 0.180 56.000 0.000 NA   NA
 10257835 10257836 HM1_0446 HM1_0445   pduL TRUE 0.446 169.000 0.000 NA N NA
 10257836 10257837 HM1_0445 HM1_0444 pduL   FALSE 0.088 191.000 0.000 NA   NA
 10257839 10257840 HM1_0443 HM1_0441   cheC TRUE 0.693 119.000 0.000 NA Y NA
 10257840 10257841 HM1_0441 HM1_0440 cheC spoIIAA TRUE 0.875 7.000 0.000 NA Y NA
 10257841 10257842 HM1_0440 HM1_0439 spoIIAA   FALSE 0.152 73.000 0.000 NA   NA
 10257842 10257843 HM1_0439 HM1_0438     TRUE 0.460 1.000 0.000 NA   NA
 10257843 10257844 HM1_0438 HM1_0437     FALSE 0.238 34.000 0.000 NA   NA
 10257844 10257845 HM1_0437 HM1_0436     TRUE 0.693 -12.000 0.000 1.000   NA
 10257845 10257846 HM1_0436 HM1_0435     FALSE 0.103 269.000 0.000 1.000   NA
 10257846 10257847 HM1_0435 HM1_0434     TRUE 0.582 245.000 0.000 0.051 Y NA
 10257847 10257848 HM1_0434 HM1_0433   nirB FALSE 0.260 76.000 0.000 1.000   NA
 10257849 10257850 HM1_0432 HM1_0431     FALSE 0.131 144.000 0.000 NA   NA
 10257850 10257851 HM1_0431 HM1_0430     FALSE 0.316 54.000 0.000 1.000   NA
 10257851 10257852 HM1_0430 HM1_0429     TRUE 0.948 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 10257852 10257853 HM1_0429 HM1_0428     FALSE 0.147 119.000 0.000 NA   NA
 10257854 10257855 HM1_0427 HM1_0426 nrfA nrfH TRUE 0.991 49.000 0.286 NA N NA
 10257855 10257856 HM1_0426 HM1_0425 nrfH   TRUE 0.526 -7.000 0.000 NA   NA
 10257856 10257857 HM1_0425 HM1_0424     FALSE 0.143 126.000 0.000 NA   NA
 10257857 10257858 HM1_0424 HM1_0423     FALSE 0.143 84.000 0.000 NA   NA
 10257858 10257859 HM1_0423 HM1_0422     FALSE 0.086 198.000 0.000 NA   NA
 10257859 10257860 HM1_0422 HM1_0421     FALSE 0.142 95.000 0.000 NA   NA
 10257862 10257863 HM1_0419 HM1_0418     FALSE 0.071 223.000 0.000 NA   NA
 10257864 10257865 HM1_0417 HM1_0416     TRUE 0.526 -7.000 0.000 NA   NA
 10257869 10257870 HM1_0412 HM1_0411     FALSE 0.147 119.000 0.000 NA   NA
 10257870 10257871 HM1_0411 HM1_0410     TRUE 0.471 0.000 0.000 NA   NA
 10257871 10257872 HM1_0410 HM1_0409     FALSE 0.141 97.000 0.000 NA   NA
 10257872 10257873 HM1_0409 HM1_0408     FALSE 0.255 123.000 0.000 1.000   NA
 10257873 10257874 HM1_0408 HM1_0407     FALSE 0.230 146.000 0.000 1.000   NA
 10257874 10257875 HM1_0407 HM1_0406   bcsA FALSE 0.051 596.000 0.000 1.000   NA
 10257875 10257876 HM1_0406 HM1_0405 bcsA   TRUE 0.904 64.000 0.029 1.000   NA
 10257877 10257878 HM1_0404 HM1_0403     FALSE 0.142 88.000 0.000 NA   NA
 10257879 10257880 HM1_0402 HM1_0401     FALSE 0.032 425.000 0.000 NA   NA
 10257880 10257881 HM1_0401 HM1_0400     TRUE 0.867 154.000 0.039 NA   NA
 10257883 10257884 HM1_0398 HM1_0397     FALSE 0.337 8.000 0.000 NA   NA
 10257884 10257885 HM1_0397 HM1_0396     FALSE 0.023 1013.000 0.000 NA   NA
 10257886 10257887 HM1_0395 HM1_0394 bioA bioD TRUE 0.997 -19.000 0.053 0.002 Y NA
 10257887 10257888 HM1_0394 HM1_0393 bioD bioY FALSE 0.140 100.000 0.000 NA   NA
 10257888 10257889 HM1_0393 HM1_0392 bioY   FALSE 0.096 180.000 0.000 NA   NA
 10257889 10257890 HM1_0392 HM1_0391     FALSE 0.144 81.000 0.000 NA   NA
 10257892 10257893 HM1_0389 HM1_0388     FALSE 0.252 107.000 0.000 1.000   NA
 10257893 10257894 HM1_0388 HM1_0387     FALSE 0.078 211.000 0.000 NA   NA
 10257894 10257895 HM1_0387 HM1_0386     FALSE 0.028 501.000 0.000 NA   NA
 10257901 10257902 HM1_0380 HM1_0379 oadA   TRUE 0.687 50.000 0.000 1.000 N NA
 10257902 10257903 HM1_0379 HM1_0378   mmdA TRUE 0.861 313.000 0.020 1.000 Y NA
 10257903 10257904 HM1_0378 HM1_0377 mmdA   TRUE 0.976 120.000 0.108 1.000 N NA
 10257904 10257905 HM1_0377 HM1_0376     TRUE 0.988 22.000 0.053 0.001 N NA
 10257905 10257906 HM1_0376 HM1_0375   sucD TRUE 0.653 139.000 0.000 0.039 N NA
 10257906 10257907 HM1_0375 HM1_0374 sucD sucC TRUE 0.999 3.000 0.537 0.001 Y NA
 10257907 10257908 HM1_0374 HM1_0373 sucC sdhB TRUE 0.461 287.000 0.000 1.000 Y NA
 10257908 10257909 HM1_0373 HM1_0372 sdhB sdhA TRUE 0.999 3.000 0.231 0.001 Y NA
 10257909 10257910 HM1_0372 HM1_0371 sdhA sdhC TRUE 0.990 23.000 0.184 0.001   NA
 10257911 10257912 HM1_0370 HM1_0369   trxB FALSE 0.026 586.000 0.000 NA   NA
 10257912 10257913 HM1_0369 HM1_0368 trxB glcA FALSE 0.225 420.000 0.000 1.000 N NA
 10257913 10257914 HM1_0368 HM1_0367 glcA   TRUE 0.434 207.000 0.000 1.000 N NA
 10257914 10257915 HM1_0367 HM1_0365     FALSE 0.173 60.000 0.000 NA   NA
 10257916 10257917 HM1_0366 HM1_0364   glcD TRUE 0.998 3.000 0.192 1.000 Y NA
 10257917 10257918 HM1_0364 HM1_0363 glcD   TRUE 0.859 21.000 0.000 1.000 Y NA
 10257918 10257919 HM1_0363 HM1_0362     TRUE 0.996 6.000 0.390 0.001   NA
 10257921 10257922 HM1_0360 HM1_0359     TRUE 0.999 2.000 0.797 0.006 Y NA
 10257922 10257923 HM1_0359 HM1_0358   oorA TRUE 0.999 4.000 0.822 0.006 Y NA
 10257923 10257924 HM1_0358 HM1_0357 oorA   TRUE 0.978 9.000 0.048 0.006   NA
 10257926 10257927 HM1_0355 HM1_0354     TRUE 0.538 30.000 0.000 0.087   NA
 10257927 10257928 HM1_0354 HM1_0353     FALSE 0.071 222.000 0.000 NA   NA
 10257928 10257929 HM1_0353 HM1_0352   rnz FALSE 0.051 277.000 0.000 NA   NA
 10257931 10257932 HM1_0350 HM1_0349     TRUE 0.416 4.000 0.000 NA   NA
 10257932 10257933 HM1_0349 HM1_0348     FALSE 0.173 60.000 0.000 NA   NA
 10257933 10257934 HM1_0348 HM1_0347     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10257934 10257935 HM1_0347 HM1_0346     FALSE 0.217 42.000 0.000 NA   NA
 10257935 10257936 HM1_0346 HM1_0345     FALSE 0.105 171.000 0.000 NA   NA
 10257938 10257939 HM1_0343 HM1_0342     TRUE 0.471 0.000 0.000 NA   NA
 10257939 10257940 HM1_0342 HM1_0341     FALSE 0.143 126.000 0.000 NA   NA
 10257940 10257941 HM1_0341 HM1_0340     FALSE 0.282 16.000 0.000 NA   NA
 10257941 10257942 HM1_0340 HM1_0339     FALSE 0.359 42.000 0.000 1.000   NA
 10257942 10257943 HM1_0339 HM1_0338     FALSE 0.232 36.000 0.000 NA   NA
 10257943 10257944 HM1_0338 HM1_0337     FALSE 0.337 8.000 0.000 NA   NA
 10257944 10257945 HM1_0337 HM1_0336     FALSE 0.025 602.000 0.000 NA   NA
 10257945 10257946 HM1_0336 HM1_0335     TRUE 0.631 49.000 0.000 NA N NA
 10257946 10257947 HM1_0335 HM1_0334     TRUE 0.995 -3.000 0.082 1.000 N NA
 10257947 10257948 HM1_0334 HM1_0333     FALSE 0.177 180.000 0.000 1.000   NA
 10257948 10257949 HM1_0333 HM1_0332     FALSE 0.142 88.000 0.000 NA   NA
 10257949 10257950 HM1_0332 HM1_0331     FALSE 0.272 20.000 0.000 NA   NA
 10257952 10257953 HM1_0329 HM1_0328     TRUE 0.995 -3.000 0.333 NA   NA
 10257954 10257955 HM1_0327 HM1_0326     FALSE 0.163 65.000 0.000 NA   NA
 10257956 10257957 HM1_0325 HM1_0324   spoVAF TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10257957 10257958 HM1_0324 HM1_0323 spoVAF spoVAE TRUE 0.988 1.000 0.100 NA   NA
 10257958 10257959 HM1_0323 HM1_0322 spoVAE   FALSE 0.274 18.000 0.000 NA   NA
 10257959 10257960 HM1_0322 HM1_0321   sigF FALSE 0.048 296.000 0.000 NA   NA
 10257960 10257961 HM1_0321 HM1_0320 sigF spoIIAB TRUE 0.997 14.000 0.842 1.000 N NA
 10257961 10257962 HM1_0320 HM1_0319 spoIIAB spoIIAA TRUE 0.999 -3.000 0.669 0.004 Y NA
 10257962 10257963 HM1_0319 HM1_0318 spoIIAA dacA TRUE 0.981 179.000 0.276 1.000 N NA
 10257963 10257964 HM1_0318 HM1_0317 dacA   FALSE 0.279 66.000 0.000 1.000   NA
 10257964 10257965 HM1_0317 HM1_0316   pdp TRUE 0.430 19.000 0.000 1.000   NA
 10257965 10257966 HM1_0316 HM1_0315 pdp deoB TRUE 0.994 -13.000 0.058 1.000 N NA
 10257966 10257967 HM1_0315 HM1_0314 deoB xerD TRUE 0.968 32.000 0.024 1.000 N NA
 10257967 10257968 HM1_0314 HM1_0313 xerD   TRUE 0.592 128.000 0.000 1.000 N NA
 10257968 10257969 HM1_0313 HM1_0312     FALSE 0.220 41.000 0.000 NA   NA
 10257971 10257972 HM1_0310 HM1_0309 spoIIM   TRUE 0.604 387.000 0.033 NA   NA
 10257972 10257973 HM1_0309 HM1_0308   pepT TRUE 0.734 34.000 0.000 1.000 N NA
 10257973 10257974 HM1_0308 HM1_0307 pepT   TRUE 0.900 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10257974 10257975 HM1_0307 HM1_0306     TRUE 0.554 223.000 0.000 1.000 Y NA
 10257975 10257976 HM1_0306 HM1_0305     FALSE 0.142 127.000 0.000 NA   NA
 10257976 10257977 HM1_0305 HM1_0304   spo0A FALSE 0.385 5.000 0.000 NA   NA
 10257977 10257978 HM1_0304 HM1_0303 spo0A spoIVB TRUE 0.980 117.000 0.393 1.000   NA
 10257980 10257981 HM1_0301 HM1_0300 recN argR TRUE 0.986 30.000 0.086 1.000 N NA
 10257981 10257982 HM1_0300 HM1_0299 argR   TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10257982 10257983 HM1_0299 HM1_0298   nadF TRUE 0.416 4.000 0.000 NA   NA
 10257983 10257984 HM1_0298 HM1_0297 nadF   TRUE 0.772 150.000 0.004 1.000   NA
 10257984 10257985 HM1_0297 HM1_0296     TRUE 0.792 118.000 0.003 1.000   NA
 10257985 10257986 HM1_0296 HM1_0295   dxs TRUE 0.968 51.000 0.042 1.000 N NA
 10257988 10257989 HM1_0293 HM1_0292 ispA xseB TRUE 0.990 3.000 0.041 1.000 N NA
 10257989 10257990 HM1_0292 HM1_0291 xseB xseA TRUE 0.999 -24.000 0.412 0.001 Y NA
 10257990 10257991 HM1_0291 HM1_0290 xseA gltD TRUE 0.904 92.000 0.006 1.000 N NA
 10257991 10257992 HM1_0290 HM1_0289 gltD   TRUE 0.999 -9.000 0.692 0.049 N NA
 10257994 10257995 HM1_0287 HM1_0286   nusB TRUE 0.981 4.000 0.015 1.000 N NA
 10257995 10257996 HM1_0286 HM1_0285 nusB   TRUE 0.929 34.000 0.032 NA   NA
 10257996 10257997 HM1_0285 HM1_0284     TRUE 0.841 81.000 0.018 NA   NA
 10257997 10257998 HM1_0284 HM1_0283   accC TRUE 0.959 185.000 0.373 NA   NA
 10257998 10257999 HM1_0283 HM1_0282 accC oadA TRUE 0.994 13.000 0.109 0.001 N NA
 10257999 10258000 HM1_0282 HM1_0281 oadA spoIIIAH FALSE 0.049 290.000 0.000 NA   NA
 10258000 10258001 HM1_0281 HM1_0280 spoIIIAH spoIIIAG TRUE 0.996 -3.000 0.509 NA   NA
 10258001 10258002 HM1_0280 HM1_0279 spoIIIAG spoIIIAF TRUE 0.986 55.000 0.907 NA   NA
 10258002 10258003 HM1_0279 HM1_0278 spoIIIAF spoIIIAE TRUE 0.989 44.000 0.918 NA   NA
 10258003 10258004 HM1_0278 HM1_0277 spoIIIAE spoIIIAD TRUE 0.982 120.000 0.864 NA   NA
 10258004 10258005 HM1_0277 HM1_0276 spoIIIAD spoIIIAC TRUE 0.985 64.000 0.895 NA   NA
 10258005 10258006 HM1_0276 HM1_0275 spoIIIAC spoIIIAB TRUE 0.992 17.000 0.926 NA   NA
 10258006 10258007 HM1_0275 HM1_0274 spoIIIAB spoIIIAA TRUE 0.997 -27.000 0.604 NA   NA
 10258007 10258008 HM1_0274 HM1_0273 spoIIIAA spoIIIAA TRUE 0.527 -16.000 0.000 NA   NA
 10258008 10258009 HM1_0273 HM1_0272 spoIIIAA   TRUE 0.913 181.000 0.112 NA   NA
 10258009 10258010 HM1_0272 HM1_0271   efp TRUE 0.884 84.000 0.037 NA   NA
 10258010 10258011 HM1_0271 HM1_0270 efp   TRUE 0.982 115.000 0.160 1.000 N NA
 10258011 10258012 HM1_0270 HM1_0269     FALSE 0.150 74.000 0.000 NA   NA
 10258012 10258013 HM1_0269 HM1_0268     TRUE 0.918 199.000 0.146 NA   NA
 10258013 10258014 HM1_0268 HM1_0267     FALSE 0.272 20.000 0.000 NA   NA
 10258014 10258015 HM1_0267 HM1_0266     FALSE 0.142 87.000 0.000 NA   NA
 10258015 10258016 HM1_0266 HM1_0265     FALSE 0.224 39.000 0.000 NA   NA
 10258016 10258017 HM1_0265 HM1_0264     FALSE 0.202 49.000 0.000 NA   NA
 10258017 10258018 HM1_0264 HM1_0263     FALSE 0.331 9.000 0.000 NA   NA
 10258018 10258019 HM1_0263 HM1_0262     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10258019 10258020 HM1_0262 HM1_0261   pilN TRUE 0.527 -16.000 0.000 NA   NA
 10258020 10258021 HM1_0261 HM1_0260 pilN xcpT TRUE 0.830 22.000 0.000 NA Y NA
 10258021 10258022 HM1_0260 HM1_0259 xcpT   TRUE 0.903 25.000 0.000 0.003 Y NA
 10258022 10258023 HM1_0259 HM1_0258     TRUE 0.993 4.000 0.047 1.000 Y NA
 10258023 10258024 HM1_0258 HM1_0257     FALSE 0.146 115.000 0.000 NA   NA
 10258024 10258025 HM1_0257 HM1_0256     FALSE 0.318 11.000 0.000 NA   NA
 10258025 10258026 HM1_0256 HM1_0255     TRUE 0.603 199.000 0.000 1.000 Y NA
 10258026 10258027 HM1_0255 HM1_0254   pilN TRUE 0.999 -3.000 0.770 NA Y NA
 10258027 10258028 HM1_0254 HM1_0253 pilN   TRUE 0.703 72.000 0.000 NA Y NA
 10258028 10258029 HM1_0253 HM1_0252     TRUE 0.977 11.000 0.005 1.000 Y NA
 10258029 10258030 HM1_0252 HM1_0251     TRUE 0.989 36.000 0.047 0.003 Y NA
 10258030 10258031 HM1_0251 HM1_0250   pilT TRUE 0.986 236.000 0.493 1.000 Y NA
 10258031 10258032 HM1_0250 HM1_0249 pilT   TRUE 0.900 18.000 0.000 0.006 Y NA
 10258032 10258033 HM1_0249 HM1_0248   aroB TRUE 0.595 107.000 0.000 1.000 N NA
 10258033 10258034 HM1_0248 HM1_0247 aroB aroK TRUE 0.989 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 10258034 10258035 HM1_0247 HM1_0246 aroK aroC TRUE 0.966 25.000 0.002 1.000 Y NA
 10258035 10258036 HM1_0246 HM1_0245 aroC aroE TRUE 0.946 121.000 0.009 1.000 Y NA
 10258038 10258039 HM1_0243 HM1_0242 yqeG pyrE FALSE 0.157 69.000 0.000 NA   NA
 10258039 10258040 HM1_0242 HM1_0241 pyrE pyrF TRUE 0.973 141.000 0.054 1.000 Y NA
 10258041 10258042 HM1_0240 HM1_0239     FALSE 0.111 166.000 0.000 NA   NA
 10258043 10258044 HM1_0238 HM1_0237   cwlJ TRUE 0.980 139.000 0.722 NA   NA
 10258046 10258047 HM1_0235 HM1_0234   spoIIIC FALSE 0.108 168.000 0.000 NA   NA
 10258049 10258050 HM1_0232 HM1_0231 ppk   FALSE 0.077 338.000 0.000 1.000   NA
 10258050 10258051 HM1_0231 HM1_0230     FALSE 0.155 201.000 0.000 1.000   NA
 10258051 10258052 HM1_0230 HM1_0229     TRUE 0.519 7.000 0.000 1.000   NA
 10258052 10258053 HM1_0229 HM1_0228     TRUE 0.728 5.000 0.000 0.007   NA
 10258053 10258054 HM1_0228 HM1_0227     TRUE 0.932 -3.000 0.000 0.007 N NA
 10258054 10258055 HM1_0227 HM1_0226     TRUE 0.767 21.000 0.000 1.000 N NA
 10258057 10258058 HM1_0224 HM1_0223     FALSE 0.217 155.000 0.000 1.000   NA
 10258058 10258059 HM1_0223 HM1_0222     FALSE 0.161 66.000 0.000 NA   NA
 10258059 10258060 HM1_0222 HM1_0221   trmB TRUE 0.527 -15.000 0.000 NA   NA
 10258060 10258061 HM1_0221 HM1_0220 trmB   FALSE 0.282 65.000 0.000 1.000   NA
 10258063 10258064 HM1_0218 HM1_0217 glgP   FALSE 0.094 182.000 0.000 NA   NA
 10258067 10258068 HM1_0214 HM1_0213   cbiM FALSE 0.143 125.000 0.000 NA   NA
 10258068 10258069 HM1_0213 HM1_0212 cbiM cbiN TRUE 0.999 -3.000 0.861 0.015 Y NA
 10258069 10258070 HM1_0212 HM1_0211 cbiN   FALSE 0.240 139.000 0.000 1.000   NA
 10258070 10258071 HM1_0211 HM1_0210     FALSE 0.141 102.000 0.000 NA   NA
 10258071 10258072 HM1_0210 HM1_0209   cbiQ FALSE 0.078 211.000 0.000 NA   NA
 10258072 10258073 HM1_0209 HM1_0208 cbiQ cbiO TRUE 0.998 21.000 0.335 0.004 Y NA
 10258074 10258075 HM1_0207 HM1_0206 cybH   TRUE 0.998 13.000 0.355 0.048 Y NA
 10258075 10258076 HM1_0206 HM1_0205     TRUE 0.992 8.000 0.028 0.002 Y NA
 10258076 10258077 HM1_0205 HM1_0204   thiD FALSE 0.399 224.000 0.000 1.000 N NA
 10258077 10258078 HM1_0204 HM1_0203 thiD thiL TRUE 0.778 149.000 0.000 0.005 Y NA
 10258080 10258081 HM1_0202 HM1_0200 thiC   FALSE 0.090 188.000 0.000 NA   NA
 10258085 10258086 HM1_0196 HM1_0195     FALSE 0.165 64.000 0.000 NA   NA
 10258086 10258087 HM1_0195 HM1_0194     FALSE 0.150 74.000 0.000 NA   NA
 10258087 10258088 HM1_0194 HM1_0193   garK TRUE 0.529 164.000 0.000 1.000 N NA
 10258088 10258089 HM1_0193 HM1_0192 garK   FALSE 0.146 122.000 0.000 NA   NA
 10258092 10258093 HM1_0189 HM1_0188     FALSE 0.111 166.000 0.000 NA   NA
 10258093 10258094 HM1_0188 HM1_0187     FALSE 0.145 80.000 0.000 NA   NA
 10258095 10258096 HM1_0186 HM1_0185 cas1 cas5 TRUE 0.704 676.000 0.100 NA   NA
 10258096 10258097 HM1_0185 HM1_0184 cas5   TRUE 0.965 3.000 0.024 NA   NA
 10258097 10258098 HM1_0184 HM1_0183     TRUE 0.960 3.000 0.017 NA   NA
 10258098 10258099 HM1_0183 HM1_0182     TRUE 0.986 10.000 0.190 NA   NA
 10258099 10258100 HM1_0182 HM1_0181   cas3 TRUE 0.994 -16.000 0.179 NA   NA
 10258101 10258102 HM1_0180 HM1_0179     FALSE 0.136 138.000 0.000 NA   NA
 10258103 10258104 HM1_0178 HM1_0177   spoVR FALSE 0.023 1595.000 0.000 NA   NA
 10258104 10258105 HM1_0177 HM1_0176 spoVR   FALSE 0.177 57.000 0.000 NA   NA
 10258105 10258106 HM1_0176 HM1_0175     FALSE 0.046 302.000 0.000 NA   NA
 10258106 10258107 HM1_0175 HM1_0174     TRUE 0.529 164.000 0.000 1.000 N NA
 10258107 10258108 HM1_0174 HM1_0173     TRUE 0.998 16.000 0.947 0.009 Y NA
 10258108 10258109 HM1_0173 HM1_0172     TRUE 0.593 94.000 0.000 1.000 N NA
 10258111 10258112 HM1_0170 HM1_0169   glnQ TRUE 0.994 112.000 0.389 1.000 Y NA
 10258112 10258113 HM1_0169 HM1_0168 glnQ   TRUE 0.603 77.000 0.000 1.000 N NA
 10258115 10258116 HM1_0166 HM1_0165 yhbH   TRUE 0.950 13.000 0.033 NA   NA
 10258116 10258117 HM1_0165 HM1_0164     TRUE 0.573 184.000 0.000 NA Y NA
 10258117 10258118 HM1_0164 HM1_0163     FALSE 0.255 292.000 0.000 NA N NA
 10258118 10258119 HM1_0163 HM1_0162   hgdC TRUE 0.987 55.000 0.216 NA N NA
 10258120 10258121 HM1_0161 HM1_0160     FALSE 0.024 778.000 0.000 NA   NA
 10258121 10258122 HM1_0160 HM1_0159     FALSE 0.191 52.000 0.000 NA   NA
 10258122 10258123 HM1_0159 HM1_0158     TRUE 0.997 -7.000 0.375 1.000   NA
 10258125 10258126 HM1_0156 HM1_0155     FALSE 0.023 1288.000 0.000 NA   NA
 10258126 10258127 HM1_0155 HM1_0154     FALSE 0.196 51.000 0.000 NA   NA
 10258130 10258131 HM1_0151 HM1_0150     TRUE 0.976 51.000 0.135 0.082   NA
 10258135 10258136 HM1_0146 HM1_0640     FALSE 0.125 363.000 0.000 0.030   NA
 10258137 10258138 HM1_1332 HM1_1331     TRUE 0.983 15.000 0.190 NA   NA
 10258138 10258139 HM1_1331 HM1_1330     TRUE 0.992 11.000 0.455 NA   NA
 10258139 10258140 HM1_1330 HM1_1329     TRUE 0.996 -3.000 0.375 NA   NA
 10258144 10258145 HM1_1325 HM1_1324   cotJB FALSE 0.272 21.000 0.000 NA   NA
 10258145 10258146 HM1_1324 HM1_1323 cotJB   TRUE 0.960 28.000 0.062 NA   NA
 10258147 10258148 HM1_1322 HM1_1321 smpB   FALSE 0.250 104.000 0.000 1.000   NA
 10258148 10258149 HM1_1321 HM1_1320     TRUE 0.905 72.000 0.045 NA   NA
 10258149 10258150 HM1_1320 HM1_1319     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10258150 10258151 HM1_1319 HM1_1318   hppA TRUE 0.525 196.000 0.000 0.079 N NA
 10258151 10258152 HM1_1318 HM1_1317 hppA secG TRUE 0.873 73.000 0.019 1.000   NA
 10258152 10258153 HM1_1317 HM1_1316 secG eno TRUE 0.600 482.000 0.032 1.000   NA
 10258153 10258154 HM1_1316 HM1_1315 eno gpmI TRUE 0.985 144.000 0.136 1.000 Y NA
 10258156 10258157 HM1_1313 HM1_1312 tpiA pgk TRUE 0.958 141.000 0.024 1.000 Y NA
 10258157 10258158 HM1_1312 HM1_1311 pgk gapA TRUE 0.981 150.000 0.063 0.007 Y NA
 10258158 10258159 HM1_1311 HM1_1310 gapA rpoN TRUE 0.932 161.000 0.030 1.000 N NA
 10258159 10258160 HM1_1310 HM1_1309 rpoN   FALSE 0.354 44.000 0.000 1.000   NA
 10258160 10258161 HM1_1309 HM1_1308     TRUE 0.948 4.000 0.006 1.000   NA
 10258161 10258162 HM1_1308 HM1_1307     TRUE 0.990 23.000 0.470 NA   NA
 10258162 10258163 HM1_1307 HM1_1306     TRUE 0.995 -3.000 0.259 NA   NA
 10258163 10258164 HM1_1306 HM1_1305   malQ FALSE 0.143 125.000 0.000 NA   NA
 10258164 10258165 HM1_1305 HM1_1304 malQ   TRUE 0.963 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 10258167 10258168 HM1_1303 HM1_1301   uvrC FALSE 0.177 57.000 0.000 NA   NA
 10258169 10258170 HM1_1300 HM1_1299 pgi   TRUE 0.416 4.000 0.000 NA   NA
 10258170 10258171 HM1_1299 HM1_1298     FALSE 0.202 49.000 0.000 NA   NA
 10258173 10258174 HM1_1296 HM1_1295     FALSE 0.082 204.000 0.000 NA   NA
 10258174 10258175 HM1_1295 HM1_1294     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10258177 10258178 HM1_1292 HM1_1291     FALSE 0.220 41.000 0.000 NA   NA
 10258178 10258179 HM1_1291 HM1_1290     FALSE 0.041 334.000 0.000 NA   NA
 10258179 10258180 HM1_1290 HM1_1289     TRUE 0.936 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10258180 10258181 HM1_1289 HM1_1288     FALSE 0.099 177.000 0.000 NA   NA
 10258181 10258182 HM1_1288 HM1_1287     FALSE 0.177 57.000 0.000 NA   NA
 10258182 10258183 HM1_1287 HM1_1286     FALSE 0.210 46.000 0.000 NA   NA
 10258185 10258186 HM1_1284 HM1_1283     FALSE 0.142 86.000 0.000 NA   NA
 10258190 10258191 HM1_1279 HM1_1278     FALSE 0.059 249.000 0.000 NA   NA
 10258191 10258192 HM1_1278 HM1_1277     FALSE 0.092 185.000 0.000 NA   NA
 10258195 10258196 HM1_1274 HM1_1273     TRUE 0.941 144.000 0.060 0.009   NA
 10258196 10258197 HM1_1273 HM1_1272     TRUE 0.959 74.000 0.030 0.022 N NA
 10258197 10258198 HM1_1272 HM1_1271   ftsX TRUE 0.987 42.000 0.064 1.000 Y NA
 10258198 10258199 HM1_1271 HM1_1270 ftsX   TRUE 0.999 -3.000 0.431 1.000 Y NA
 10258199 10258200 HM1_1270 HM1_1269   tktC TRUE 0.898 106.000 0.004 1.000 N NA
 10258200 10258201 HM1_1269 HM1_1268 tktC tktN TRUE 0.996 14.000 0.120 0.001 Y NA
 10258201 10258202 HM1_1268 HM1_1267 tktN prfB FALSE 0.390 230.000 0.000 1.000 N NA
 10258202 10258203 HM1_1267 HM1_1266 prfB secA TRUE 0.906 235.000 0.048 1.000 N NA
 10258203 10258204 HM1_1266 HM1_1265 secA   TRUE 0.888 242.000 0.050 NA N NA
 10258204 10258205 HM1_1265 HM1_1264     FALSE 0.146 122.000 0.000 NA   NA
 10258205 10258206 HM1_1264 HM1_1263     FALSE 0.272 21.000 0.000 NA   NA
 10258206 10258207 HM1_1263 HM1_1262     TRUE 0.993 84.000 0.392 1.000 Y NA
 10258207 10258208 HM1_1262 HM1_1261     TRUE 0.974 192.000 0.071 0.020 Y NA
 10258208 10258209 HM1_1261 HM1_1260   spsG TRUE 0.432 173.000 0.000 NA N NA
 10258209 10258210 HM1_1260 HM1_1258 spsG   TRUE 0.946 170.000 0.033 NA Y NA
 10258210 10258211 HM1_1258 HM1_1257   spsF TRUE 0.994 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 10258211 10258212 HM1_1257 HM1_1256 spsF   FALSE 0.173 60.000 0.000 NA   NA
 10258213 10258214 HM1_1255 HM1_1254     TRUE 0.972 63.000 0.229 NA   NA
 10258214 10258215 HM1_1254 HM1_1253     FALSE 0.287 15.000 0.000 NA   NA
 10258215 10258216 HM1_1253 HM1_1252     FALSE 0.246 32.000 0.000 NA   NA
 10258216 10258217 HM1_1252 HM1_1251   fliS FALSE 0.045 309.000 0.000 NA   NA
 10258217 10258218 HM1_1251 HM1_1250 fliS hag TRUE 0.995 55.000 0.440 1.000 Y NA
 10258219 10258220 HM1_1249 HM1_1248     TRUE 0.697 47.000 0.000 1.000 N NA
 10258220 10258221 HM1_1248 HM1_1247     TRUE 0.818 24.000 0.000 0.034 N NA
 10258221 10258222 HM1_1247 HM1_1246   fabG TRUE 0.998 4.000 0.333 1.000 Y NA
 10258222 10258223 HM1_1246 HM1_1245 fabG   TRUE 0.992 25.000 0.895 NA   NA
 10258223 10258224 HM1_1245 HM1_1244     FALSE 0.325 10.000 0.000 NA   NA
 10258224 10258225 HM1_1244 HM1_1243   glf TRUE 0.779 57.000 0.000 1.000 Y NA
 10258225 10258226 HM1_1243 HM1_1242 glf   TRUE 0.961 -24.000 0.008 NA   NA
 10258226 10258227 HM1_1242 HM1_1241     TRUE 0.416 4.000 0.000 NA   NA
 10258227 10258228 HM1_1241 HM1_1240     FALSE 0.205 48.000 0.000 NA   NA
 10258228 10258229 HM1_1240 HM1_1239     FALSE 0.141 102.000 0.000 NA   NA
 10258229 10258230 HM1_1239 HM1_1238     FALSE 0.159 67.000 0.000 NA   NA
 10258230 10258231 HM1_1238 HM1_1237   algA TRUE 0.520 -46.000 0.000 NA   NA
 10258231 10258232 HM1_1237 HM1_1236 algA   FALSE 0.270 25.000 0.000 NA   NA
 10258232 10258233 HM1_1236 HM1_1235     FALSE 0.069 228.000 0.000 NA   NA
 10258233 10258234 HM1_1235 HM1_1234     FALSE 0.139 133.000 0.000 NA   NA
 10258234 10258235 HM1_1234 HM1_1233     FALSE 0.272 22.000 0.000 NA   NA
 10258235 10258236 HM1_1233 HM1_1232     FALSE 0.207 47.000 0.000 NA   NA
 10258236 10258237 HM1_1232 HM1_1231     FALSE 0.114 163.000 0.000 NA   NA
 10258237 10258238 HM1_1231 HM1_1230     FALSE 0.287 15.000 0.000 NA   NA
 10258238 10258239 HM1_1230 HM1_1229     FALSE 0.258 29.000 0.000 NA   NA
 10258239 10258240 HM1_1229 HM1_1228     FALSE 0.258 29.000 0.000 NA   NA
 10258240 10258241 HM1_1228 HM1_1227     FALSE 0.143 83.000 0.000 NA   NA
 10258245 10258246 HM1_1222 HM1_1221     FALSE 0.039 350.000 0.000 NA   NA
 10258246 10258247 HM1_1221 HM1_1220     TRUE 0.997 -13.000 0.500 NA   NA
 10258247 10258248 HM1_1220 HM1_1219     TRUE 0.990 22.000 0.500 NA   NA
 10258248 10258249 HM1_1219 HM1_1218     FALSE 0.043 317.000 0.000 NA   NA
 10258249 10258250 HM1_1218 HM1_1217   capD FALSE 0.349 7.000 0.000 NA   NA
 10258250 10258251 HM1_1217 HM1_1216 capD   TRUE 0.956 112.000 0.154 NA   NA
 10258251 10258252 HM1_1216 HM1_1215   flaG FALSE 0.140 100.000 0.000 NA   NA
 10258252 10258253 HM1_1215 HM1_1214 flaG   FALSE 0.141 104.000 0.000 NA   NA
 10258253 10258254 HM1_1214 HM1_1213   fliS FALSE 0.146 79.000 0.000 NA   NA
 10258254 10258255 HM1_1213 HM1_1212 fliS   TRUE 0.729 258.000 0.035 NA   NA
 10258255 10258256 HM1_1212 HM1_1211   fliD TRUE 0.416 4.000 0.000 NA   NA
 10258256 10258257 HM1_1211 HM1_1210 fliD fliC TRUE 0.691 201.000 0.000 0.004 Y NA
 10258257 10258258 HM1_1210 HM1_1209 fliC csrA FALSE 0.227 414.000 0.000 1.000 N NA
 10258258 10258259 HM1_1209 HM1_1208 csrA   TRUE 0.983 1.000 0.064 NA   NA
 10258259 10258260 HM1_1208 HM1_1207     TRUE 0.962 43.000 0.096 NA   NA
 10258260 10258261 HM1_1207 HM1_1206   flgL TRUE 0.918 234.000 0.207 NA   NA
 10258261 10258262 HM1_1206 HM1_1205 flgL flgK TRUE 0.971 44.000 0.064 0.002   NA
 10258262 10258263 HM1_1205 HM1_1204 flgK   FALSE 0.053 270.000 0.000 NA   NA
 10258263 10258264 HM1_1204 HM1_1203     FALSE 0.047 300.000 0.000 NA   NA
 10258264 10258265 HM1_1203 HM1_1202     FALSE 0.091 187.000 0.000 NA   NA
 10258265 10258266 HM1_1202 HM1_1201   flgM TRUE 0.950 48.000 0.031 0.003   NA
 10258266 10258267 HM1_1201 HM1_1200 flgM   TRUE 0.843 181.000 0.043 NA   NA
 10258267 10258268 HM1_1200 HM1_1199     TRUE 0.824 203.000 0.045 NA   NA
 10258268 10258269 HM1_1199 HM1_1198     TRUE 0.976 21.000 0.130 NA   NA
 10258269 10258270 HM1_1198 HM1_1197     FALSE 0.253 30.000 0.000 NA   NA
 10258270 10258271 HM1_1197 HM1_1196     FALSE 0.057 259.000 0.000 NA   NA
 10258271 10258272 HM1_1196 HM1_1195     TRUE 0.998 9.000 0.519 0.020 Y NA
 10258272 10258273 HM1_1195 HM1_1194     FALSE 0.143 84.000 0.000 NA   NA
 10258273 10258274 HM1_1194 HM1_1193     FALSE 0.140 101.000 0.000 NA   NA
 10258274 10258275 HM1_1193 HM1_1192   pgm TRUE 0.416 4.000 0.000 NA   NA
 10258277 10258278 HM1_1190 HM1_1189     FALSE 0.054 268.000 0.000 NA   NA
 10258278 10258279 HM1_1189 HM1_1188     FALSE 0.056 261.000 0.000 NA   NA
 10258279 10258280 HM1_1188 HM1_1187     FALSE 0.056 260.000 0.000 NA   NA
 10258280 10258281 HM1_1187 HM1_1186     FALSE 0.171 61.000 0.000 NA   NA
 10258281 10258282 HM1_1186 HM1_1185     TRUE 0.527 -13.000 0.000 NA   NA
 10258282 10258283 HM1_1185 HM1_1184   fabZ TRUE 0.915 152.000 0.015 1.000 N NA
 10258286 10258287 HM1_1181 HM1_1180     FALSE 0.142 94.000 0.000 NA   NA
 10258288 10258289 HM1_1179 HM1_1178     FALSE 0.073 220.000 0.000 NA   NA
 10258289 10258290 HM1_1178 HM1_1177     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10258290 10258291 HM1_1177 HM1_1176     FALSE 0.102 173.000 0.000 NA   NA
 10258291 10258292 HM1_1176 HM1_1175   rfbD FALSE 0.030 459.000 0.000 NA   NA
 10258292 10258293 HM1_1175 HM1_1174 rfbD cysA TRUE 0.597 110.000 0.000 1.000 N NA
 10258293 10258294 HM1_1174 HM1_1173 cysA   TRUE 0.700 29.000 0.000 NA N NA
 10258294 10258295 HM1_1173 HM1_1172     TRUE 0.715 19.000 0.000 NA N NA
 10258295 10258296 HM1_1172 HM1_1171   cysT TRUE 0.967 -30.000 0.000 0.001 Y NA
 10258296 10258297 HM1_1171 HM1_1170 cysT   TRUE 0.947 -36.000 0.000 1.000 Y NA
 10258297 10258298 HM1_1170 HM1_1169     FALSE 0.138 219.000 0.000 1.000   NA
 10258298 10258299 HM1_1169 HM1_1168   cysNC FALSE 0.092 295.000 0.000 1.000   NA
 10258299 10258300 HM1_1168 HM1_1167 cysNC cysD TRUE 0.998 0.000 0.250 0.001 N NA
 10258300 10258301 HM1_1167 HM1_1166 cysD   FALSE 0.070 374.000 0.000 1.000   NA
 10258301 10258302 HM1_1166 HM1_1165     TRUE 0.997 -13.000 0.500 NA   NA
 10258302 10258303 HM1_1165 HM1_1164     FALSE 0.042 321.000 0.000 NA   NA
 10258303 10258304 HM1_1164 HM1_1163     TRUE 0.458 14.000 0.000 1.000   NA
 10258304 10258305 HM1_1163 HM1_1162     FALSE 0.318 11.000 0.000 NA   NA
 10258306 10258307 HM1_1161 HM1_1160     FALSE 0.250 31.000 0.000 NA   NA
 10258307 10258308 HM1_1160 HM1_1159     TRUE 0.996 -3.000 0.521 NA   NA
 10258308 10258309 HM1_1159 HM1_1158     FALSE 0.113 164.000 0.000 NA   NA
 10258309 10258310 HM1_1158 HM1_1157     FALSE 0.023 961.000 0.000 NA   NA
 10258311 10258312 HM1_1156 HM1_1155     FALSE 0.145 111.000 0.000 NA   NA
 10258312 10258313 HM1_1155 HM1_1154     TRUE 0.998 -3.000 0.521 0.078   NA
 10258315 10258316 HM1_1152 HM1_1151     FALSE 0.337 8.000 0.000 NA   NA
 10258316 10258317 HM1_1151 HM1_1150     FALSE 0.385 5.000 0.000 NA   NA
 10258317 10258318 HM1_1150 HM1_1149   gmhA TRUE 0.471 0.000 0.000 NA   NA
 10258318 10258319 HM1_1149 HM1_1148 gmhA   TRUE 0.747 72.000 0.000 1.000 Y NA
 10258319 10258320 HM1_1148 HM1_1147     FALSE 0.087 307.000 0.000 1.000   NA
 10258320 10258321 HM1_1147 HM1_1146     FALSE 0.248 102.000 0.000 1.000   NA
 10258323 10258324 HM1_1144 HM1_1143     TRUE 0.933 1.000 0.000 1.000 Y NA
 10258324 10258325 HM1_1143 HM1_1142     TRUE 0.859 22.000 0.000 1.000 Y NA
 10258325 10258326 HM1_1142 HM1_1141     TRUE 0.921 10.000 0.000 0.005 Y NA
 10258326 10258327 HM1_1141 HM1_1140     TRUE 0.936 0.000 0.000 1.000 Y NA
 10258329 10258330 HM1_1138 HM1_1137     TRUE 0.828 26.000 0.000 NA Y NA
 10258330 10258331 HM1_1137 HM1_1136     FALSE 0.049 289.000 0.000 NA   NA
 10258331 10258332 HM1_1136 HM1_1135     FALSE 0.029 478.000 0.000 NA   NA
 10258332 10258333 HM1_1135 HM1_1134     TRUE 0.414 96.000 0.000 0.007   NA
 10258333 10258334 HM1_1134 HM1_1133     FALSE 0.270 25.000 0.000 NA   NA
 10258334 10258335 HM1_1133 HM1_1132     FALSE 0.385 5.000 0.000 NA   NA
 10258335 10258336 HM1_1132 HM1_1131     TRUE 0.977 107.000 0.444 NA   NA
 10258336 10258337 HM1_1131 HM1_1130     FALSE 0.058 255.000 0.000 NA   NA
 10258338 10258339 HM1_1129 HM1_1128     FALSE 0.122 153.000 0.000 NA   NA
 10258341 10258342 HM1_1126 HM1_1125 rpoE   FALSE 0.362 6.000 0.000 NA   NA
 10258343 10258344 HM1_1124 HM1_1123     TRUE 0.976 25.000 0.032 1.000 N NA
 10258344 10258345 HM1_1123 HM1_1122     TRUE 0.976 -12.000 0.024 NA   NA
 10258345 10258346 HM1_1122 HM1_1121     FALSE 0.141 104.000 0.000 NA   NA
 10258346 10258347 HM1_1121 HM1_1120     FALSE 0.278 17.000 0.000 NA   NA
 10258347 10258348 HM1_1120 HM1_1119     TRUE 0.991 18.000 0.643 NA   NA
 10258348 10258349 HM1_1119 HM1_1118     FALSE 0.180 56.000 0.000 NA   NA
 10258349 10258350 HM1_1118 HM1_1117   flgG FALSE 0.144 124.000 0.000 NA   NA
 10258350 10258351 HM1_1117 HM1_1116 flgG   TRUE 0.969 311.000 0.150 0.004 Y NA
 10258351 10258352 HM1_1116 HM1_1115   galU FALSE 0.221 436.000 0.000 1.000 N NA
 10258352 10258353 HM1_1115 HM1_1114 galU   TRUE 0.592 104.000 0.000 1.000 N NA
 10258353 10258354 HM1_1114 HM1_1113   spoIIID TRUE 0.971 105.000 0.284 NA   NA
 10258354 10258355 HM1_1113 HM1_1112 spoIIID   FALSE 0.033 402.000 0.000 NA   NA
 10258355 10258356 HM1_1112 HM1_1111     FALSE 0.079 208.000 0.000 NA   NA
 10258356 10258357 HM1_1111 HM1_1110   spoIID FALSE 0.212 160.000 0.000 1.000   NA
 10258357 10258358 HM1_1110 HM1_1109 spoIID murA TRUE 0.975 207.000 0.243 1.000 N NA
 10258358 10258359 HM1_1109 HM1_1108 murA   FALSE 0.272 19.000 0.000 NA   NA
 10258359 10258360 HM1_1108 HM1_1107     FALSE 0.057 258.000 0.000 NA   NA
 10258360 10258361 HM1_1107 HM1_1106     FALSE 0.165 64.000 0.000 NA   NA
 10258361 10258362 HM1_1106 HM1_1105   atpC TRUE 0.637 179.000 0.000 1.000 Y NA
 10258362 10258363 HM1_1105 HM1_1104 atpC atpD TRUE 0.998 19.000 0.837 0.004 Y NA
 10258363 10258364 HM1_1104 HM1_1103 atpD atpG TRUE 0.998 46.000 0.724 0.004 Y NA
 10258364 10258365 HM1_1103 HM1_1102 atpG atpA TRUE 0.998 52.000 0.846 0.004 Y NA
 10258365 10258366 HM1_1102 HM1_1101 atpA atpH TRUE 0.998 41.000 0.864 0.004 Y NA
 10258366 10258367 HM1_1101 HM1_1100 atpH atpF TRUE 0.999 -6.000 0.222 0.004 Y NA
 10258367 10258368 HM1_1100 HM1_1099 atpF atpE TRUE 0.987 114.000 0.077 0.004 Y NA
 10258368 10258369 HM1_1099 HM1_1098 atpE atpB TRUE 0.996 87.000 0.557 0.004 Y NA
 10258369 10258370 HM1_1098 HM1_1097 atpB   TRUE 0.988 34.000 0.330 1.000   NA
 10258370 10258371 HM1_1097 HM1_1096     FALSE 0.202 49.000 0.000 NA   NA
 10258373 10258374 HM1_1094 HM1_1093     FALSE 0.161 66.000 0.000 NA   NA
 10258374 10258375 HM1_1093 HM1_1092   comE FALSE 0.268 26.000 0.000 NA   NA
 10258375 10258376 HM1_1092 HM1_1091 comE upp TRUE 0.863 436.000 0.041 1.000 Y NA
 10258376 10258377 HM1_1091 HM1_1090 upp glyA TRUE 0.967 60.000 0.051 1.000 N NA
 10258377 10258378 HM1_1090 HM1_1089 glyA   TRUE 0.952 93.000 0.145 NA   NA
 10258378 10258379 HM1_1089 HM1_1088   rpiB TRUE 0.971 -3.000 0.020 NA   NA
 10258379 10258380 HM1_1088 HM1_1087 rpiB   TRUE 0.966 31.000 0.020 1.000 N NA
 10258380 10258381 HM1_1087 HM1_1086     TRUE 0.982 28.000 0.196 NA   NA
 10258381 10258382 HM1_1086 HM1_1085     TRUE 0.881 97.000 0.036 NA   NA
 10258382 10258383 HM1_1085 HM1_1084     TRUE 0.951 123.000 0.020 NA Y NA
 10258383 10258384 HM1_1084 HM1_1083   prfA TRUE 0.990 7.000 0.040 1.000 Y NA
 10258384 10258385 HM1_1083 HM1_1082 prfA   TRUE 0.957 29.000 0.060 NA   NA
 10258385 10258386 HM1_1082 HM1_1081   rpmE TRUE 0.957 56.000 0.115 NA   NA
 10258386 10258387 HM1_1081 HM1_1080 rpmE   TRUE 0.579 139.000 0.000 1.000 N NA
 10258387 10258388 HM1_1080 HM1_1079     FALSE 0.044 310.000 0.000 NA   NA
 10258388 10258389 HM1_1079 HM1_1078   glpX FALSE 0.096 180.000 0.000 NA   NA
 10258389 10258390 HM1_1078 HM1_1077 glpX   TRUE 0.814 392.000 0.016 1.000 Y NA
 10258390 10258391 HM1_1077 HM1_1076   fbaA TRUE 0.991 12.000 0.057 1.000 Y NA
 10258391 10258392 HM1_1076 HM1_1075 fbaA   TRUE 0.957 162.000 0.227 NA   NA
 10258392 10258393 HM1_1075 HM1_1074     FALSE 0.173 60.000 0.000 NA   NA
 10258395 10258396 HM1_1072 HM1_1071   sppA TRUE 0.616 568.000 0.053 NA   NA
 10258396 10258397 HM1_1071 HM1_1070 sppA alr TRUE 0.925 70.000 0.012 1.000 N NA
 10258397 10258398 HM1_1070 HM1_1069 alr   TRUE 0.991 88.000 0.500 1.000 N NA
 10258398 10258399 HM1_1069 HM1_1068   pyrG TRUE 0.715 309.000 0.004 1.000 N NA
 10258401 10258402 HM1_1067 HM1_1065 rpoE argS TRUE 0.692 391.000 0.010 1.000 N NA
 10258402 10258403 HM1_1065 HM1_1064 argS   TRUE 0.989 -13.000 0.079 NA   NA
 10258403 10258404 HM1_1064 HM1_1063     FALSE 0.138 134.000 0.000 NA   NA
 10258404 10258405 HM1_1063 HM1_1062   speD TRUE 0.900 -3.000 0.000 1.000 N NA
 10258407 10258408 HM1_1060 HM1_1059     TRUE 0.803 66.000 0.000 0.049 Y NA
 10258408 10258409 HM1_1059 HM1_1058     FALSE 0.147 116.000 0.000 NA   NA
 10258411 10258412 HM1_1056 HM1_1055     FALSE 0.146 78.000 0.000 NA   NA
 10258414 10258415 HM1_1053 HM1_1052     FALSE 0.169 62.000 0.000 NA   NA
 10258417 10258418 HM1_1050 HM1_1049   spoVAE TRUE 0.962 104.000 0.200 NA   NA
 10258418 10258419 HM1_1049 HM1_1048 spoVAE spoVAD TRUE 0.979 101.000 0.600 NA   NA
 10258419 10258420 HM1_1048 HM1_1047 spoVAD spoVAC TRUE 0.996 2.000 0.750 NA   NA
 10258420 10258421 HM1_1047 HM1_1046 spoVAC   TRUE 0.981 85.000 0.750 NA   NA
 10258421 10258422 HM1_1046 HM1_1045     TRUE 0.991 29.000 0.857 NA   NA
 10258422 10258423 HM1_1045 HM1_1044     FALSE 0.058 254.000 0.000 NA   NA
 10258423 10258424 HM1_1044 HM1_1043     FALSE 0.074 218.000 0.000 NA   NA
 10258425 10258426 HM1_1042 HM1_1041     FALSE 0.034 390.000 0.000 NA   NA
 10258427 10258428 HM1_1040 HM1_1039   gltD FALSE 0.102 173.000 0.000 NA   NA
 10258428 10258429 HM1_1039 HM1_1038 gltD   FALSE 0.311 12.000 0.000 NA   NA
 10258429 10258430 HM1_1038 HM1_1037   gltB FALSE 0.250 31.000 0.000 NA   NA
 10258432 10258433 HM1_1035 HM1_1034   hisJ TRUE 0.767 21.000 0.000 1.000 N NA
 10258433 10258434 HM1_1034 HM1_1033 hisJ   TRUE 0.526 104.000 0.000 NA N NA
 10258436 10258437 HM1_1031 HM1_1030     TRUE 0.523 -33.000 0.000 NA   NA
 10258437 10258438 HM1_1030 HM1_1029   nuoG FALSE 0.054 514.000 0.000 1.000   NA
 10258438 10258439 HM1_1029 HM1_1028 nuoG   TRUE 0.995 -3.000 0.143 0.007   NA
 10258439 10258440 HM1_1028 HM1_1027     FALSE 0.253 83.000 0.000 1.000   NA
 10258440 10258441 HM1_1027 HM1_1026     FALSE 0.198 167.000 0.000 1.000   NA
 10258441 10258442 HM1_1026 HM1_1025   thyX FALSE 0.319 281.000 0.000 1.000 N NA
 10258448 10258449 HM1_1019 HM1_1018     FALSE 0.248 100.000 0.000 1.000   NA
 10258449 10258450 HM1_1018 HM1_1017     FALSE 0.130 228.000 0.000 1.000   NA
 10258450 10258451 HM1_1017 HM1_1016     TRUE 0.997 -58.000 0.700 1.000   NA
 10258451 10258452 HM1_1016 HM1_1015     FALSE 0.367 121.000 0.000 0.100   NA
 10258452 10258453 HM1_1015 HM1_1014     TRUE 0.940 56.000 0.041 0.100   NA
 10258453 10258454 HM1_1014 HM1_1013     TRUE 0.997 -31.000 0.871 NA   NA
 10258454 10258455 HM1_1013 HM1_1012     TRUE 0.981 15.000 0.161 NA   NA
 10258455 10258456 HM1_1012 HM1_1011     FALSE 0.045 304.000 0.000 NA   NA
 10258456 10258457 HM1_1011 HM1_1010     FALSE 0.039 344.000 0.000 NA   NA
 10258457 10258458 HM1_1010 HM1_1009     FALSE 0.031 441.000 0.000 NA   NA
 10258458 10258459 HM1_1009 HM1_1008     FALSE 0.063 242.000 0.000 NA   NA
 10258459 10258460 HM1_1008 HM1_1007     FALSE 0.163 65.000 0.000 NA   NA
 10258460 10258461 HM1_1007 HM1_1006     FALSE 0.040 336.000 0.000 NA   NA
 10258461 10258462 HM1_1006 HM1_1005     TRUE 0.522 -36.000 0.000 NA   NA
 10258462 10258463 HM1_1005 HM1_1004     FALSE 0.035 387.000 0.000 NA   NA
 10258463 10258464 HM1_1004 HM1_1003     FALSE 0.362 6.000 0.000 NA   NA
 10258464 10258465 HM1_1003 HM1_1002   hrpB FALSE 0.079 208.000 0.000 NA   NA
 10258465 10258466 HM1_1002 HM1_1001 hrpB   FALSE 0.173 60.000 0.000 NA   NA
 10258466 10258467 HM1_1001 HM1_1000     FALSE 0.038 355.000 0.000 NA   NA
 10258469 10258470 HM1_0998 HM1_0997 aor   FALSE 0.056 261.000 0.000 NA   NA
 10258470 10258471 HM1_0997 HM1_0996     FALSE 0.024 693.000 0.000 NA   NA
 10258472 10258473 HM1_0995 HM1_0994     FALSE 0.074 219.000 0.000 NA   NA
 10258474 10258475 HM1_0993 HM1_0992     FALSE 0.084 200.000 0.000 NA   NA
 10258475 10258476 HM1_0992 HM1_0991     FALSE 0.142 127.000 0.000 NA   NA
 10258476 10258477 HM1_0991 HM1_0990     FALSE 0.135 139.000 0.000 NA   NA
 10258477 10258478 HM1_0990 HM1_0989     TRUE 0.846 93.000 0.014 1.000   NA
 10258478 10258479 HM1_0989 HM1_0988     TRUE 0.958 -22.000 0.005 NA   NA
 10258479 10258480 HM1_0988 HM1_0987   murA FALSE 0.050 285.000 0.000 NA   NA
 10258480 10258481 HM1_0987 HM1_0986 murA   TRUE 0.973 140.000 0.385 NA   NA
 10258481 10258482 HM1_0986 HM1_0985     FALSE 0.066 235.000 0.000 NA   NA
 10258482 10258483 HM1_0985 HM1_0984   trxB TRUE 0.729 96.000 0.000 1.000 Y NA
 10258483 10258484 HM1_0984 HM1_0983 trxB   FALSE 0.181 680.000 0.000 1.000 N NA
 10258484 10258485 HM1_0983 HM1_0982     FALSE 0.118 244.000 0.000 1.000   NA
 10258485 10258486 HM1_0982 HM1_0981     TRUE 0.945 251.000 0.540 NA   NA
 10258486 10258487 HM1_0981 HM1_0980   lgt FALSE 0.077 212.000 0.000 NA   NA
 10258487 10258488 HM1_0980 HM1_0979 lgt   FALSE 0.111 166.000 0.000 NA   NA
 10258488 10258489 HM1_0979 HM1_0978     FALSE 0.148 76.000 0.000 NA   NA
 10258489 10258490 HM1_0978 HM1_0977   purA FALSE 0.054 266.000 0.000 NA   NA
 10258492 10258493 HM1_0975 HM1_0974 dnaB   TRUE 0.982 116.000 0.131 0.099 N NA
 10258493 10258494 HM1_0974 HM1_0973   rplI TRUE 0.940 105.000 0.024 1.000 N NA
 10258494 10258495 HM1_0973 HM1_0972 rplI   TRUE 0.962 188.000 0.119 1.000 N NA
 10258495 10258496 HM1_0972 HM1_0971     TRUE 0.988 9.000 0.210 NA   NA
 10258496 10258497 HM1_0971 HM1_0970   ssb FALSE 0.069 228.000 0.000 NA   NA
 10258497 10258498 HM1_0970 HM1_0969 ssb ychF TRUE 0.593 94.000 0.000 1.000 N NA
 10258499 10258500 HM1_0968 HM1_0967     FALSE 0.145 123.000 0.000 NA   NA
 10258501 10258502 HM1_0966 HM1_0965     TRUE 0.983 6.000 0.121 NA   NA
 10258502 10258503 HM1_0965 HM1_0964     TRUE 0.499 9.000 0.000 1.000   NA
 10258503 10258504 HM1_0964 HM1_0963     FALSE 0.349 7.000 0.000 NA   NA
 10258504 10258505 HM1_0963 HM1_0962     TRUE 0.902 30.000 0.014 NA   NA
 10258505 10258506 HM1_0962 HM1_0961     TRUE 0.968 -3.000 0.010 1.000   NA
 10258506 10258507 HM1_0961 HM1_0960     FALSE 0.263 74.000 0.000 1.000   NA
 10258507 10258508 HM1_0960 HM1_0959     TRUE 0.992 12.000 0.600 NA   NA
 10258508 10258509 HM1_0959 HM1_0958     TRUE 0.523 -31.000 0.000 NA   NA
 10258509 10258510 HM1_0958 HM1_0957     FALSE 0.141 98.000 0.000 NA   NA
 10258510 10258511 HM1_0957 HM1_0956     FALSE 0.054 267.000 0.000 NA   NA
 10258511 10258512 HM1_0956 HM1_0955     FALSE 0.295 14.000 0.000 NA   NA
 10258512 10258513 HM1_0955 HM1_0954     FALSE 0.146 120.000 0.000 NA   NA
 10258516 10258517 HM1_0951 HM1_0950 acsA   FALSE 0.257 354.000 0.000 1.000 N NA
 10258517 10258518 HM1_0950 HM1_0949     FALSE 0.165 64.000 0.000 NA   NA
 10258519 10258520 HM1_0948 HM1_0947   comB FALSE 0.235 35.000 0.000 NA   NA
 10258520 10258521 HM1_0947 HM1_0946 comB   TRUE 0.974 13.000 0.038 0.001   NA
 10258521 10258522 HM1_0946 HM1_0945     FALSE 0.251 89.000 0.000 1.000   NA
 10258522 10258523 HM1_0945 HM1_0944   thiS TRUE 0.529 164.000 0.000 1.000 N NA
 10258523 10258524 HM1_0944 HM1_0943 thiS gerKB FALSE 0.299 59.000 0.000 1.000   NA
 10258524 10258525 HM1_0943 HM1_0942 gerKB   TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10258525 10258526 HM1_0942 HM1_0941   gerAC TRUE 0.439 3.000 0.000 NA   NA
 10258526 10258527 HM1_0941 HM1_0940 gerAC gerKA TRUE 0.994 27.000 0.500 0.006   NA
 10258527 10258528 HM1_0940 HM1_0939 gerKA   FALSE 0.142 86.000 0.000 NA   NA
 10258528 10258529 HM1_0939 HM1_0938     FALSE 0.191 52.000 0.000 NA   NA
 10258534 10258535 HM1_0933 HM1_0932     TRUE 0.976 51.000 0.135 0.075   NA
 10258535 10258536 HM1_0932 HM1_0931     FALSE 0.155 282.000 0.000 0.075   NA
 10258537 10258538 HM1_0930 HM1_0929     FALSE 0.142 96.000 0.000 NA   NA
 10258539 10258540 HM1_0928 HM1_0927     FALSE 0.293 175.000 0.000 0.028   NA
 10258541 10258542 HM1_0926 HM1_0925 spoIIR   FALSE 0.085 199.000 0.000 NA   NA
 10258542 10258543 HM1_0925 HM1_0924   selB TRUE 0.593 127.000 0.000 1.000 N NA
 10258543 10258544 HM1_0924 HM1_0923 selB   FALSE 0.146 114.000 0.000 NA   NA
 10258546 10258547 HM1_0921 HM1_0920     TRUE 0.527 91.000 0.000 NA N NA
 10258547 10258548 HM1_0920 HM1_0919     FALSE 0.142 86.000 0.000 NA   NA
 10258548 10258549 HM1_0919 HM1_0918     TRUE 0.718 224.000 0.021 NA   NA
 10258549 10258550 HM1_0918 HM1_0917   nifS TRUE 0.974 2.000 0.037 NA   NA
 10258550 10258551 HM1_0917 HM1_0916 nifS parB TRUE 0.921 121.000 0.012 1.000 N NA
 10258551 10258552 HM1_0916 HM1_0915 parB   TRUE 0.999 -7.000 0.827 1.000 N NA
 10258552 10258553 HM1_0915 HM1_0914   gidB TRUE 0.937 521.000 0.339 1.000 N NA
 10258553 10258554 HM1_0914 HM1_0913 gidB gidA TRUE 0.998 -3.000 0.466 1.000 N NA
 10258554 10258555 HM1_0913 HM1_0912 gidA trmE TRUE 0.984 43.000 0.266 1.000   NA
 10258555 10258556 HM1_0912 HM1_0911 trmE   FALSE 0.257 114.000 0.000 1.000   NA
 10258556 10258557 HM1_0911 HM1_0910   spoIIIJ TRUE 0.951 0.000 0.003 1.000   NA
 10258557 10258558 HM1_0910 HM1_0909 spoIIIJ   TRUE 0.987 41.000 0.461 NA   NA
 10258558 10258559 HM1_0909 HM1_0908   rnpA TRUE 0.996 2.000 0.540 NA   NA
 10258559 10258560 HM1_0908 HM1_0907 rnpA rpmH TRUE 0.990 45.000 0.787 1.000   NA
 10258560 10258561 HM1_0907 HM1_0906 rpmH   FALSE 0.077 213.000 0.000 NA   NA
 10258562 10258563 HM1_0905 HM1_0904 dnaA dnaN TRUE 0.991 160.000 0.328 1.000 Y NA
 10258563 10258564 HM1_0904 HM1_0903 dnaN recF TRUE 0.998 6.000 0.318 1.000 Y NA
 10258564 10258565 HM1_0903 HM1_0902 recF   TRUE 0.960 12.000 0.047 NA   NA
 10258565 10258566 HM1_0902 HM1_0901   gyrB TRUE 0.880 108.000 0.034 NA   NA
 10258566 10258567 HM1_0901 HM1_0900 gyrB   TRUE 0.414 218.000 0.000 1.000 N NA
 10258567 10258568 HM1_0900 HM1_0899   mutB TRUE 0.859 22.000 0.000 1.000 Y NA
 10258569 10258570 HM1_0898 HM1_0897     FALSE 0.220 41.000 0.000 NA   NA
 10258571 10258572 HM1_0896 HM1_0895   hbd TRUE 0.993 27.000 0.118 1.000 Y NA
 10258572 10258573 HM1_0895 HM1_0894 hbd bcd TRUE 0.985 77.000 0.110 1.000 Y NA
 10258573 10258574 HM1_0894 HM1_0893 bcd crt TRUE 0.957 88.000 0.020 1.000 Y NA
 10258574 10258575 HM1_0893 HM1_0892 crt etfB TRUE 0.979 17.000 0.040 1.000 N NA
 10258575 10258576 HM1_0892 HM1_0891 etfB etfA TRUE 0.996 53.000 0.373 0.011 Y NA
 10258576 10258577 HM1_0891 HM1_0890 etfA   TRUE 0.996 -3.000 0.055 1.000 Y NA
 10258578 10258579 HM1_0889 HM1_0888     TRUE 0.600 113.000 0.000 1.000 N NA
 10258579 10258580 HM1_0888 HM1_0887     TRUE 0.958 -3.000 0.000 0.016 Y NA
 10258580 10258581 HM1_0887 HM1_0886     TRUE 0.948 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 10258581 10258582 HM1_0886 HM1_0885     TRUE 0.999 5.000 0.617 0.011 Y NA
 10258582 10258583 HM1_0885 HM1_0884     TRUE 0.727 101.000 0.000 1.000 Y NA
 10258583 10258584 HM1_0884 HM1_0883     TRUE 0.548 301.000 0.000 0.003 Y NA
 10258585 10258586 HM1_0882 HM1_0881 gyrA   TRUE 0.590 100.000 0.000 1.000 N NA
 10258586 10258587 HM1_0881 HM1_0880     TRUE 0.488 178.000 0.000 1.000 N NA
 10258587 10258588 HM1_0880 HM1_0879     TRUE 0.861 18.000 0.000 1.000 Y NA
 10258588 10258589 HM1_0879 HM1_0878     TRUE 0.928 -18.000 0.000 0.098 N NA
 10258589 10258590 HM1_0878 HM1_0877     FALSE 0.037 365.000 0.000 NA   NA
 10258590 10258591 HM1_0877 HM1_0876     TRUE 0.522 -36.000 0.000 NA   NA
 10258591 10258592 HM1_0876 HM1_0875     FALSE 0.040 336.000 0.000 NA   NA
 10258592 10258593 HM1_0875 HM1_0874     FALSE 0.163 65.000 0.000 NA   NA
 10258593 10258594 HM1_0874 HM1_0873     FALSE 0.064 238.000 0.000 NA   NA
 10258594 10258595 HM1_0873 HM1_0872     FALSE 0.043 318.000 0.000 NA   NA
 10258595 10258596 HM1_0872 HM1_0871     TRUE 0.934 -142.000 0.000 NA Y NA
 10258596 10258597 HM1_0871 HM1_0870     TRUE 0.416 4.000 0.000 NA   NA
 10258597 10258598 HM1_0870 HM1_0869     FALSE 0.041 335.000 0.000 NA   NA
 10258598 10258599 HM1_0869 HM1_0868     FALSE 0.043 314.000 0.000 NA   NA
 10258599 10258600 HM1_0868 HM1_0867     TRUE 0.999 6.000 0.429 0.002 Y NA
 10258600 10258601 HM1_0867 HM1_0866   nifH TRUE 0.995 34.000 0.429 1.000 N NA
 10258601 10258602 HM1_0866 HM1_0865 nifH nifD TRUE 0.935 172.000 0.020 0.002 N NA
 10258602 10258603 HM1_0865 HM1_0864 nifD nifK TRUE 0.999 -3.000 0.902 0.002 Y NA
 10258603 10258604 HM1_0864 HM1_0863 nifK nifE TRUE 0.989 237.000 0.380 0.002 Y NA
 10258604 10258605 HM1_0863 HM1_0862 nifE nifN TRUE 0.999 -3.000 0.475 0.002 Y NA
 10258605 10258606 HM1_0862 HM1_0861 nifN nifX TRUE 0.996 13.000 0.663 0.003   NA
 10258606 10258607 HM1_0861 HM1_0860 nifX fdxB TRUE 0.989 4.000 0.160 NA   NA
 10258607 10258608 HM1_0860 HM1_0859 fdxB nifB FALSE 0.142 89.000 0.000 NA   NA
 10258608 10258609 HM1_0859 HM1_0858 nifB nifV TRUE 0.430 19.000 0.000 1.000   NA
 10258609 10258610 HM1_0858 HM1_0857 nifV   FALSE 0.142 86.000 0.000 NA   NA
 10258610 10258611 HM1_0857 HM1_0856     FALSE 0.226 38.000 0.000 NA   NA
 10258611 10258612 HM1_0856 HM1_0855     FALSE 0.047 299.000 0.000 NA   NA
 10258612 10258613 HM1_0855 HM1_0854   pdxT TRUE 0.998 9.000 0.488 NA Y NA
 10258613 10258614 HM1_0854 HM1_0853 pdxT pcaD FALSE 0.143 126.000 0.000 NA   NA
 10258614 10258615 HM1_0853 HM1_0852 pcaD   FALSE 0.064 413.000 0.000 1.000   NA
 10258615 10258616 HM1_0852 HM1_0851   serA TRUE 0.996 4.000 0.113 1.000 Y NA
 10258616 10258617 HM1_0851 HM1_0850 serA serS TRUE 0.943 58.000 0.016 1.000 N NA
 10258617 10258618 HM1_0850 HM1_0849 serS   FALSE 0.272 21.000 0.000 NA   NA
 10258618 10258619 HM1_0849 HM1_0848     FALSE 0.200 50.000 0.000 NA   NA
 10258619 10258620 HM1_0848 HM1_0847     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10258620 10258621 HM1_0847 HM1_0846     FALSE 0.295 14.000 0.000 NA   NA
 10258621 10258622 HM1_0846 HM1_0845     FALSE 0.140 100.000 0.000 NA   NA
 10258623 10258624 HM1_0844 HM1_0843     TRUE 0.524 129.000 0.000 NA N NA
 10258624 10258625 HM1_0843 HM1_0842     FALSE 0.142 96.000 0.000 NA   NA
 10258626 10258627 HM1_0841 HM1_0840   dhaK TRUE 0.808 274.000 0.016 1.000 N NA
 10258627 10258628 HM1_0840 HM1_0839 dhaK dhaL TRUE 0.806 140.000 0.000 0.001 Y NA
 10258628 10258629 HM1_0839 HM1_0838 dhaL dhaM TRUE 0.458 14.000 0.000 1.000   NA
 10258629 10258630 HM1_0838 HM1_0837 dhaM   TRUE 0.962 119.000 0.081 0.002   NA
 10258630 10258631 HM1_0837 HM1_0836   ptsI TRUE 0.997 10.000 0.150 0.001 Y NA
 10258631 10258632 HM1_0836 HM1_0835 ptsI   FALSE 0.189 399.000 0.000 NA N NA
 10258632 10258633 HM1_0835 HM1_0834     TRUE 0.873 -3.000 0.000 NA N NA
 10258633 10258634 HM1_0834 HM1_0833     TRUE 0.999 -3.000 0.838 0.004 Y NA
 10258634 10258635 HM1_0833 HM1_0832     FALSE 0.146 113.000 0.000 NA   NA
 10258635 10258636 HM1_0832 HM1_0831     FALSE 0.213 44.000 0.000 NA   NA
 10258636 10258637 HM1_0831 HM1_0830     TRUE 0.982 24.000 0.192 NA   NA
 10258637 10258638 HM1_0830 HM1_0829     FALSE 0.035 386.000 0.000 NA   NA
 10258638 10258639 HM1_0829 HM1_0828     FALSE 0.140 130.000 0.000 NA   NA
 10258639 10258640 HM1_0828 HM1_0827     FALSE 0.142 86.000 0.000 NA   NA
 10258640 10258641 HM1_0827 HM1_0826     FALSE 0.119 158.000 0.000 NA   NA
 10258641 10258642 HM1_0826 HM1_0825     FALSE 0.167 63.000 0.000 NA   NA
 10258642 10258643 HM1_0825 HM1_0824     FALSE 0.027 549.000 0.000 NA   NA
 10258643 10258644 HM1_0824 HM1_0823     FALSE 0.100 176.000 0.000 NA   NA
 10258648 10258649 HM1_0819 HM1_0818     FALSE 0.226 149.000 0.000 1.000   NA
 10258651 10258652 HM1_0816 HM1_0815     FALSE 0.053 273.000 0.000 NA   NA
 10258655 10258656 HM1_0812 HM1_0811     FALSE 0.258 29.000 0.000 NA   NA
 10258657 10258658 HM1_0810 HM1_0809   recR TRUE 0.995 4.000 0.604 NA   NA
 10258658 10258659 HM1_0809 HM1_0808 recR bofA TRUE 0.771 166.000 0.014 NA   NA
 10258659 10258660 HM1_0808 HM1_0807 bofA   FALSE 0.069 227.000 0.000 NA   NA
 10258660 10258661 HM1_0807 HM1_0806     FALSE 0.028 498.000 0.000 NA   NA
 10258661 10258662 HM1_0806 HM1_0805   oorA TRUE 0.977 95.000 0.455 NA   NA
 10258662 10258663 HM1_0805 HM1_0804 oorA   TRUE 0.998 16.000 0.846 0.005 Y NA
 10258663 10258664 HM1_0804 HM1_0803   oorC TRUE 0.999 3.000 0.846 0.005 Y NA
 10258664 10258665 HM1_0803 HM1_0802 oorC oorD TRUE 0.958 125.000 0.081 0.005   NA
 10258665 10258666 HM1_0802 HM1_0801 oorD   FALSE 0.094 182.000 0.000 NA   NA
 10258666 10258667 HM1_0801 HM1_0800     FALSE 0.123 152.000 0.000 NA   NA
 10258667 10258668 HM1_0800 HM1_0799     FALSE 0.111 166.000 0.000 NA   NA
 10258668 10258669 HM1_0799 HM1_0798     FALSE 0.033 402.000 0.000 NA   NA
 10258670 10258671 HM1_0797 HM1_0796     FALSE 0.161 66.000 0.000 NA   NA
 10258671 10258672 HM1_0796 HM1_0795     TRUE 0.968 16.000 0.071 NA   NA
 10258672 10258673 HM1_0795 HM1_0794     TRUE 0.997 11.000 0.229 0.071 Y NA
 10258673 10258674 HM1_0794 HM1_0793     TRUE 0.953 2.000 0.011 NA   NA
 10258674 10258675 HM1_0793 HM1_0792     TRUE 0.992 15.000 0.933 NA   NA
 10258676 10258677 HM1_0791 HM1_0790     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10258677 10258678 HM1_0790 HM1_0789     FALSE 0.025 666.000 0.000 NA   NA
 10258678 10258679 HM1_0789 HM1_0788     TRUE 0.997 -7.000 0.500 NA   NA
 10258679 10258680 HM1_0788 HM1_0787     FALSE 0.098 178.000 0.000 NA   NA
 10258680 10258681 HM1_0787 HM1_0786     TRUE 0.741 32.000 0.000 1.000 N NA
 10258681 10258682 HM1_0786 HM1_0785     TRUE 0.414 218.000 0.000 1.000 N NA
 10258683 10258684 HM1_0784 HM1_0783     FALSE 0.304 13.000 0.000 NA   NA
 10258684 10258685 HM1_0783 HM1_0782   dsbD FALSE 0.105 171.000 0.000 NA   NA
 10258685 10258686 HM1_0782 HM1_0781 dsbD   TRUE 0.674 -3.000 0.000 1.000   NA
 10258686 10258687 HM1_0781 HM1_0780     FALSE 0.127 149.000 0.000 NA   NA
 10258687 10258688 HM1_0780 HM1_0779     TRUE 0.973 25.000 0.107 NA   NA
 10258688 10258689 HM1_0779 HM1_0778     FALSE 0.163 65.000 0.000 NA   NA
 10258689 10258690 HM1_0778 HM1_0777   arsB TRUE 0.937 93.000 0.023 1.000 N NA
 10258691 10258692 HM1_0776 HM1_0775     TRUE 0.968 123.000 0.240 NA   NA
 10258692 10258693 HM1_0775 HM1_0774     TRUE 0.965 92.000 0.017 0.016 Y NA
 10258693 10258694 HM1_0774 HM1_0773     TRUE 0.996 -51.000 0.052 1.000 Y NA
 10258694 10258695 HM1_0773 HM1_0772     FALSE 0.152 204.000 0.000 1.000   NA
 10258695 10258696 HM1_0772 HM1_0771     FALSE 0.316 54.000 0.000 1.000   NA
 10258696 10258697 HM1_0771 HM1_0770   gyaR FALSE 0.203 165.000 0.000 1.000   NA
 10258697 10258698 HM1_0770 HM1_0769 gyaR   FALSE 0.120 155.000 0.000 NA   NA
 10258698 10258699 HM1_0769 HM1_0767   adcA FALSE 0.059 249.000 0.000 NA   NA
 10258701 10258702 HM1_0766 HM1_0765     TRUE 0.471 0.000 0.000 NA   NA
 10258702 10258703 HM1_0765 HM1_0763     FALSE 0.092 185.000 0.000 NA   NA
 10258704 10258705 HM1_0764 HM1_0762     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10258706 10258707 HM1_0761 HM1_0760   speA TRUE 0.938 37.000 0.043 NA   NA
 10258707 10258708 HM1_0760 HM1_0759 speA tmk TRUE 0.944 51.000 0.012 1.000 N NA
 10258708 10258709 HM1_0759 HM1_0758 tmk holB TRUE 0.994 43.000 0.254 0.096 N NA
 10258709 10258710 HM1_0758 HM1_0757 holB   TRUE 0.979 63.000 0.372 NA   NA
 10258710 10258711 HM1_0757 HM1_0756     TRUE 0.975 44.000 0.183 NA   NA
 10258711 10258712 HM1_0756 HM1_0755     TRUE 0.960 11.000 0.043 NA   NA
 10258713 10258714 HM1_0754 HM1_0753     FALSE 0.183 55.000 0.000 NA   NA
 10258715 10258716 HM1_0752 HM1_0751 metG   TRUE 0.997 1.000 0.221 NA N NA
 10258716 10258717 HM1_0751 HM1_0750     TRUE 0.752 133.000 0.004 NA   NA
 10258717 10258718 HM1_0750 HM1_0749     FALSE 0.352 184.000 0.000 0.001   NA
 10258722 10258723 HM1_0745 HM1_0743   ksgA TRUE 0.974 124.000 0.093 1.000 N NA
 10258725 10258726 HM1_0742 HM1_0741   amt TRUE 0.513 169.000 0.000 1.000 N NA
 10258726 10258727 HM1_0741 HM1_0740 amt   FALSE 0.098 178.000 0.000 NA   NA
 10258729 10258730 HM1_0738 HM1_0737 ispE   TRUE 0.907 -24.000 0.000 1.000 N NA
 10258730 10258731 HM1_0737 HM1_0736     TRUE 0.977 58.000 0.288 NA   NA
 10258731 10258732 HM1_0736 HM1_0735     FALSE 0.105 171.000 0.000 NA   NA
 10258732 10258733 HM1_0735 HM1_0734     FALSE 0.139 133.000 0.000 NA   NA
 10258733 10258734 HM1_0734 HM1_0733     TRUE 0.524 -6.000 0.000 NA   NA
 10258734 10258735 HM1_0733 HM1_0732     FALSE 0.272 20.000 0.000 NA   NA
 10258735 10258736 HM1_0732 HM1_0731   ilvA FALSE 0.221 152.000 0.000 1.000   NA
 10258736 10258737 HM1_0731 HM1_0730 ilvA spoVG TRUE 0.888 164.000 0.009 1.000 N NA
 10258739 10258740 HM1_0728 HM1_0727 glmU prs TRUE 0.980 46.000 0.069 1.000 N NA
 10258742 10258743 HM1_0725 HM1_0724   pth TRUE 0.996 56.000 0.496 0.025 Y NA
 10258744 10258745 HM1_0723 HM1_0722     FALSE 0.167 63.000 0.000 NA   NA
 10258746 10258747 HM1_0721 HM1_0720 mfd   TRUE 0.590 100.000 0.000 1.000 N NA
 10258747 10258748 HM1_0720 HM1_0719   spoVT TRUE 0.489 151.000 0.000 NA N NA
 10258748 10258749 HM1_0719 HM1_0718 spoVT spoVB FALSE 0.180 56.000 0.000 NA   NA
 10258749 10258750 HM1_0718 HM1_0717 spoVB   TRUE 0.877 32.000 0.003 1.000   NA
 10258750 10258751 HM1_0717 HM1_0716   hup FALSE 0.246 133.000 0.000 1.000   NA
 10258751 10258752 HM1_0716 HM1_0715 hup   TRUE 0.607 75.000 0.000 1.000 N NA
 10258752 10258753 HM1_0715 HM1_0714     TRUE 0.941 98.000 0.108 NA   NA
 10258753 10258754 HM1_0714 HM1_0713     TRUE 0.991 22.000 0.774 NA   NA
 10258754 10258755 HM1_0713 HM1_0712     TRUE 0.858 150.000 0.032 NA   NA
 10258755 10258756 HM1_0712 HM1_0710     FALSE 0.173 60.000 0.000 NA   NA
 10258757 10258758 HM1_0711 HM1_0709     TRUE 0.996 4.000 0.796 1.000   NA
 10258759 10258760 HM1_0708 HM1_0707     FALSE 0.362 6.000 0.000 NA   NA
 10258760 10258761 HM1_0707 HM1_0705     FALSE 0.337 8.000 0.000 NA   NA
 10258763 10258764 HM1_0704 HM1_0703 hemA   FALSE 0.282 16.000 0.000 NA   NA
 10258766 10258767 HM1_0701 HM1_0700 cyhA   FALSE 0.035 379.000 0.000 NA   NA
 10258767 10258768 HM1_0700 HM1_0699   petC TRUE 0.471 0.000 0.000 NA   NA
 10258768 10258769 HM1_0699 HM1_0698 petC petB TRUE 0.975 4.000 0.024 0.040   NA
 10258769 10258770 HM1_0698 HM1_0697 petB petD TRUE 0.956 17.000 0.024 0.017   NA
 10258770 10258771 HM1_0697 HM1_0696 petD petA FALSE 0.408 66.000 0.000 0.040   NA
 10258771 10258772 HM1_0696 HM1_0695 petA   FALSE 0.142 89.000 0.000 NA   NA
 10258772 10258773 HM1_0695 HM1_0694   tspO FALSE 0.147 119.000 0.000 NA   NA
 10258773 10258774 HM1_0694 HM1_0693 tspO bchJ FALSE 0.237 141.000 0.000 1.000   NA
 10258774 10258775 HM1_0693 HM1_0692 bchJ bchG TRUE 0.471 109.000 0.000 0.001   NA
 10258777 10258778 HM1_0690 HM1_0689 pshA bchM TRUE 0.429 130.000 0.000 0.004   NA
 10258778 10258779 HM1_0689 HM1_0688 bchM bchE TRUE 0.992 15.000 0.094 0.005 N NA
 10258779 10258780 HM1_0688 HM1_0687 bchE chlL TRUE 0.934 -3.000 0.000 0.005 N NA
 10258780 10258781 HM1_0687 HM1_0686 chlL bchN TRUE 0.995 -51.000 0.039 0.001 N NA
 10258781 10258782 HM1_0686 HM1_0685 bchN bchB TRUE 0.999 -3.000 0.591 0.001 Y NA
 10258782 10258783 HM1_0685 HM1_0684 bchB bchI TRUE 0.837 24.000 0.000 0.005 N NA
 10258783 10258784 HM1_0684 HM1_0683 bchI bchD TRUE 0.999 -3.000 0.465 0.002 Y NA
 10258784 10258785 HM1_0683 HM1_0682 bchD bchH TRUE 0.915 14.000 0.000 0.002 Y NA
 10258785 10258786 HM1_0682 HM1_0681 bchH crtN TRUE 0.623 68.000 0.000 1.000 N NA
 10258786 10258787 HM1_0681 HM1_0680 crtN spoIIE FALSE 0.222 434.000 0.000 1.000 N NA
 10258787 10258788 HM1_0680 HM1_0679 spoIIE tilS TRUE 0.941 162.000 0.041 1.000 N NA
 10258788 10258789 HM1_0679 HM1_0678 tilS   TRUE 0.966 128.000 0.051 0.095 N NA
 10258789 10258790 HM1_0678 HM1_0677   ndk TRUE 0.932 129.000 0.012 0.095 N NA
 10258790 10258791 HM1_0677 HM1_0676 ndk   FALSE 0.035 381.000 0.000 NA   NA
 10258791 10258792 HM1_0676 HM1_0675     FALSE 0.141 103.000 0.000 NA   NA
 10258792 10258793 HM1_0675 HM1_0674     FALSE 0.141 97.000 0.000 NA   NA
 10258793 10258794 HM1_0674 HM1_0673     FALSE 0.037 365.000 0.000 NA   NA
 10258794 10258795 HM1_0673 HM1_0672   fhs TRUE 0.841 107.000 0.018 NA   NA
 10258795 10258796 HM1_0672 HM1_0671 fhs   TRUE 0.887 127.000 0.029 1.000   NA
 10258796 10258797 HM1_0671 HM1_0670   folP TRUE 0.970 19.000 0.067 1.000   NA
 10258797 10258798 HM1_0670 HM1_0669 folP folB TRUE 0.948 98.000 0.003 0.004 Y NA
 10258798 10258799 HM1_0669 HM1_0668 folB panC TRUE 0.841 257.000 0.005 1.000 Y NA
 10258799 10258800 HM1_0668 HM1_0667 panC panD TRUE 0.998 4.000 0.342 1.000 Y NA
 10258800 10258801 HM1_0667 HM1_0666 panD nadA TRUE 0.891 214.000 0.009 1.000 Y NA
 10258801 10258802 HM1_0666 HM1_0665 nadA nadB TRUE 0.993 81.000 0.210 0.003 Y NA
 10258802 10258803 HM1_0665 HM1_0664 nadB nadC TRUE 0.986 221.000 0.223 0.003 Y NA
 10258803 10258804 HM1_0664 HM1_0663 nadC   TRUE 0.994 -10.000 0.027 1.000 Y NA
 10258804 10258805 HM1_0663 HM1_0662     TRUE 0.993 -16.000 0.044 1.000 N NA
 10258805 10258806 HM1_0662 HM1_0661     TRUE 0.916 230.000 0.054 1.000 N NA
 10258806 10258807 HM1_0661 HM1_0660   entB TRUE 0.519 167.000 0.000 1.000 N NA
 10258808 10258809 HM1_0659 HM1_0658 bchX   FALSE 0.183 55.000 0.000 NA   NA
 10258809 10258810 HM1_0658 HM1_0657     FALSE 0.235 35.000 0.000 NA   NA
 10258810 10258811 HM1_0657 HM1_0656     TRUE 0.997 -7.000 0.625 NA   NA
 10258811 10258812 HM1_0656 HM1_0655   bchZ FALSE 0.311 12.000 0.000 NA   NA
 10258812 10258813 HM1_0655 HM1_0654 bchZ bchY TRUE 0.999 4.000 0.632 0.017 Y NA
 10258814 10258815 HM1_0653 HM1_0652     FALSE 0.272 23.000 0.000 NA   NA
 10258815 10258816 HM1_0652 HM1_0651     FALSE 0.127 149.000 0.000 NA   NA
 10258816 10258817 HM1_0651 HM1_0650     FALSE 0.331 9.000 0.000 NA   NA
 10258817 10258818 HM1_0650 HM1_0649     FALSE 0.159 67.000 0.000 NA   NA
 10258818 10258819 HM1_0649 HM1_0648     FALSE 0.215 43.000 0.000 NA   NA
 10258821 10258822 HM1_0646 HM1_0645     TRUE 0.995 -55.000 0.261 NA   NA
 10258822 10258823 HM1_0645 HM1_0644   greA TRUE 0.924 150.000 0.065 1.000   NA
 10258823 10258824 HM1_0644 HM1_0643 greA lysS FALSE 0.256 112.000 0.000 1.000   NA
 10258824 10258825 HM1_0643 HM1_3153 lysS   TRUE 0.845 -3.000 0.000 0.001   NA
 10258825 10258826 HM1_3153 HM1_3154     FALSE 0.023 1925.000 0.000 NA   NA
 10258826 10258827 HM1_3154 HM1_1334     FALSE 0.023 3778.000 0.000 NA   NA
 10258830 10258831 HM1_1337 HM1_1338     TRUE 0.996 1.000 0.589 NA   NA
 10258831 10258832 HM1_1338 HM1_1339     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10258833 10258834 HM1_1340 HM1_1341     TRUE 0.621 51.000 0.000 NA N NA
 10258834 10258835 HM1_1341 HM1_1342     TRUE 0.986 52.000 0.681 NA   NA
 10258835 10258836 HM1_1342 HM1_1343     TRUE 0.994 12.000 0.848 1.000   NA
 10258836 10258837 HM1_1343 HM1_1344   clpC TRUE 0.988 159.000 0.425 1.000 N NA
 10258839 10258840 HM1_1346 HM1_1347 radA   TRUE 0.987 4.000 0.126 NA   NA
 10258841 10258842 HM1_1348 HM1_1349     TRUE 0.992 14.000 0.762 NA   NA
 10258843 10258844 HM1_1350 HM1_1351     FALSE 0.130 145.000 0.000 NA   NA
 10258844 10258845 HM1_1351 HM1_1352     FALSE 0.205 48.000 0.000 NA   NA
 10258845 10258846 HM1_1352 HM1_1353     TRUE 0.942 141.000 0.126 NA   NA
 10258846 10258847 HM1_1353 HM1_1354   ispD TRUE 0.991 -7.000 0.108 NA   NA
 10258847 10258848 HM1_1354 HM1_1355 ispD gltX TRUE 0.669 366.000 0.004 1.000 N NA
 10258848 10258849 HM1_1355 HM1_1356 gltX cysE TRUE 0.732 400.000 0.017 1.000 N NA
 10258849 10258850 HM1_1356 HM1_1357 cysE cysS TRUE 0.999 -58.000 0.483 0.036 N NA
 10258850 10258851 HM1_1357 HM1_1358 cysS   TRUE 0.987 3.000 0.078 1.000   NA
 10258851 10258852 HM1_1358 HM1_1359     TRUE 0.933 245.000 0.150 0.003   NA
 10258852 10258853 HM1_1359 HM1_1360     TRUE 0.974 17.000 0.109 NA   NA
 10258853 10258854 HM1_1360 HM1_1361   rpoE TRUE 0.972 138.000 0.361 NA   NA
 10258854 10258855 HM1_1361 HM1_1362 rpoE rpmG FALSE 0.408 220.000 0.000 1.000 N NA
 10258855 10258856 HM1_1362 HM1_1363 rpmG secE TRUE 0.974 100.000 0.100 1.000 N NA
 10258856 10258857 HM1_1363 HM1_1364 secE nusG TRUE 0.999 -3.000 0.843 1.000 N NA
 10258857 10258858 HM1_1364 HM1_1365 nusG rplK TRUE 0.995 41.000 0.681 1.000 N NA
 10258858 10258859 HM1_1365 HM1_1366 rplK rplA TRUE 0.997 62.000 0.838 0.021 Y NA
 10258859 10258860 HM1_1366 HM1_1367 rplA rplJ TRUE 0.983 262.000 0.302 0.021 Y NA
 10258860 10258861 HM1_1367 HM1_1368 rplJ rplL TRUE 0.996 105.000 0.884 0.015 Y NA
 10258863 10258864 HM1_1370 HM1_1371 rpoB rpoC TRUE 0.998 39.000 0.851 0.001 Y NA
 10258864 10258865 HM1_1371 HM1_1372 rpoC   TRUE 0.947 185.000 0.065 1.000 N NA
 10258865 10258866 HM1_1372 HM1_1373   rpsL TRUE 0.971 70.000 0.022 0.021 Y NA
 10258866 10258867 HM1_1373 HM1_1374 rpsL rpsG TRUE 0.982 19.000 0.009 0.003 Y NA
 10258867 10258868 HM1_1374 HM1_1375 rpsG fusA TRUE 0.997 41.000 0.579 1.000 Y NA
 10258868 10258869 HM1_1375 HM1_1376 fusA tuf TRUE 0.996 90.000 0.400 0.001 Y NA
 10258869 10258870 HM1_1376 HM1_1377 tuf rpsJ TRUE 0.949 1558.000 0.318 1.000 Y NA
 10258870 10258871 HM1_1377 HM1_1378 rpsJ rplC TRUE 0.998 31.000 0.467 0.021 Y NA
 10258871 10258872 HM1_1378 HM1_1379 rplC rplD TRUE 0.998 29.000 0.544 0.015 Y NA
 10258872 10258873 HM1_1379 HM1_1380 rplD rplW TRUE 0.999 0.000 0.307 0.015 Y NA
 10258873 10258874 HM1_1380 HM1_1381 rplW rplB TRUE 0.998 30.000 0.849 0.021 Y NA
 10258874 10258875 HM1_1381 HM1_1382 rplB rpsS TRUE 0.997 66.000 0.820 0.021 Y NA
 10258875 10258876 HM1_1382 HM1_1383 rpsS rplV TRUE 0.998 27.000 0.769 0.021 Y NA
 10258876 10258877 HM1_1383 HM1_1384 rplV rpsC TRUE 0.999 4.000 0.719 0.021 Y NA
 10258877 10258878 HM1_1384 HM1_1385 rpsC rplP TRUE 0.999 4.000 0.828 0.021 Y NA
 10258878 10258879 HM1_1385 HM1_1386 rplP rpmC TRUE 0.999 -10.000 0.802 0.015 Y NA
 10258879 10258880 HM1_1386 HM1_1387 rpmC rpsQ TRUE 0.998 27.000 0.828 0.015 Y NA
 10258880 10258881 HM1_1387 HM1_1388 rpsQ rplN TRUE 0.998 25.000 0.791 0.021 Y NA
 10258881 10258882 HM1_1388 HM1_1389 rplN rplX TRUE 0.998 19.000 0.810 0.021 Y NA
 10258882 10258883 HM1_1389 HM1_1390 rplX rplE TRUE 0.998 28.000 0.758 0.015 Y NA
 10258883 10258884 HM1_1390 HM1_1391 rplE rpsN TRUE 0.998 23.000 0.496 0.015 Y NA
 10258884 10258885 HM1_1391 HM1_1392 rpsN rpsH TRUE 0.998 28.000 0.473 0.015 Y NA
 10258885 10258886 HM1_1392 HM1_1393 rpsH rplF TRUE 0.998 46.000 0.808 0.015 Y NA
 10258886 10258887 HM1_1393 HM1_1394 rplF rplR TRUE 0.998 34.000 0.815 0.015 Y NA
 10258887 10258888 HM1_1394 HM1_1395 rplR rpsE TRUE 0.998 27.000 0.814 0.021 Y NA
 10258888 10258889 HM1_1395 HM1_1396 rpsE rpmD TRUE 0.999 12.000 0.789 0.021 Y NA
 10258889 10258890 HM1_1396 HM1_1397 rpmD rplO TRUE 0.998 19.000 0.653 0.003 Y NA
 10258890 10258891 HM1_1397 HM1_1398 rplO secY TRUE 0.998 4.000 0.730 1.000 N NA
 10258891 10258892 HM1_1398 HM1_1399 secY adk TRUE 0.986 128.000 0.241 1.000 N NA
 10258892 10258893 HM1_1399 HM1_1400 adk map TRUE 0.998 -3.000 0.290 1.000 N NA
 10258893 10258894 HM1_1400 HM1_1401 map   TRUE 0.991 3.000 0.185 NA   NA
 10258894 10258895 HM1_1401 HM1_1402   infA TRUE 0.970 24.000 0.090 NA   NA
 10258895 10258896 HM1_1402 HM1_1403 infA rpmJ TRUE 0.979 61.000 0.257 1.000   NA
 10258896 10258897 HM1_1403 HM1_1404 rpmJ rpsM TRUE 0.989 25.000 0.194 0.015   NA
 10258897 10258898 HM1_1404 HM1_1405 rpsM rpsK TRUE 0.998 19.000 0.810 0.015 Y NA
 10258898 10258899 HM1_1405 HM1_1406 rpsK rpsD TRUE 0.998 30.000 0.509 0.021 Y NA
 10258899 10258900 HM1_1406 HM1_1407 rpsD rpoA TRUE 0.995 46.000 0.549 1.000 N NA
 10258900 10258901 HM1_1407 HM1_1408 rpoA rplQ TRUE 0.996 31.000 0.873 1.000 N NA
 10258901 10258902 HM1_1408 HM1_1409 rplQ cbiO FALSE 0.226 415.000 0.000 1.000 N NA
 10258902 10258903 HM1_1409 HM1_1410 cbiO cbiO TRUE 0.961 -24.000 0.000 0.016 Y NA
 10258903 10258904 HM1_1410 HM1_1411 cbiO cbiQ TRUE 0.947 -6.000 0.000 1.000 Y NA
 10258904 10258905 HM1_1411 HM1_1412 cbiQ truA TRUE 0.990 134.000 0.404 1.000 N NA
 10258905 10258906 HM1_1412 HM1_1413 truA rplM TRUE 0.935 211.000 0.031 1.000 Y NA
 10258906 10258907 HM1_1413 HM1_1414 rplM rpsI TRUE 0.998 19.000 0.601 0.015 Y NA
 10258907 10258908 HM1_1414 HM1_1415 rpsI cheW FALSE 0.217 456.000 0.000 1.000 N NA
 10258908 10258909 HM1_1415 HM1_1416 cheW cheA TRUE 0.988 59.000 0.070 0.015 Y NA
 10258909 10258910 HM1_1416 HM1_1417 cheA   TRUE 0.859 20.000 0.000 1.000 Y NA
 10258910 10258911 HM1_1417 HM1_1418     TRUE 0.731 106.000 0.000 1.000 Y NA
 10258913 10258914 HM1_1420 HM1_1421   groES FALSE 0.089 189.000 0.000 NA   NA
 10258914 10258915 HM1_1421 HM1_1422 groES groEL TRUE 0.994 170.000 0.674 0.094 Y NA
 10258915 10258916 HM1_1422 HM1_1423 groEL cwlD FALSE 0.361 247.000 0.000 1.000 N NA
 10258916 10258917 HM1_1423 HM1_1424 cwlD   FALSE 0.109 257.000 0.000 1.000   NA
 10258917 10258918 HM1_1424 HM1_1425     FALSE 0.103 269.000 0.000 1.000   NA
 10258918 10258919 HM1_1425 HM1_1426     TRUE 0.968 141.000 0.217 1.000   NA
 10258919 10258920 HM1_1426 HM1_1427     TRUE 0.593 90.000 0.000 1.000 N NA
 10258920 10258921 HM1_1427 HM1_1428   argC TRUE 0.683 161.000 0.000 1.000 Y NA
 10258921 10258922 HM1_1428 HM1_1429 argC argJ TRUE 0.997 38.000 0.303 0.002 Y NA
 10258922 10258923 HM1_1429 HM1_1430 argJ argB TRUE 0.990 183.000 0.239 0.002 Y NA
 10258923 10258924 HM1_1430 HM1_1431 argB argD TRUE 0.968 160.000 0.052 1.000 Y NA
 10258924 10258925 HM1_1431 HM1_1432 argD carA TRUE 0.968 -3.000 0.011 1.000   NA
 10258925 10258926 HM1_1432 HM1_1434 carA carB TRUE 0.908 74.000 0.017 0.002   NA
 10258928 10258929 HM1_1435 HM1_1436 argF argG TRUE 0.963 221.000 0.088 1.000 Y NA
 10258929 10258930 HM1_1436 HM1_1437 argG   FALSE 0.044 311.000 0.000 NA   NA
 10258930 10258931 HM1_1437 HM1_1438     FALSE 0.152 73.000 0.000 NA   NA
 10258935 10258936 HM1_1443 HM1_1444     FALSE 0.027 565.000 0.000 NA   NA
 10258936 10258937 HM1_1444 HM1_1445     FALSE 0.024 680.000 0.000 NA   NA
 10258937 10258938 HM1_1445 HM1_1446     TRUE 0.526 -7.000 0.000 NA   NA
 10258939 10258940 HM1_1448 HM1_1449     TRUE 0.978 140.000 0.588 NA   NA
 10258940 10258941 HM1_1449 HM1_1450   metF FALSE 0.065 237.000 0.000 NA   NA
 10258941 10258942 HM1_1450 HM1_1451 metF xpt FALSE 0.261 351.000 0.000 1.000 N NA
 10258942 10258943 HM1_1451 HM1_1452 xpt   FALSE 0.202 49.000 0.000 NA   NA
 10258944 10258945 HM1_1453 HM1_1454     TRUE 0.976 87.000 0.400 NA   NA
 10258947 10258948 HM1_1456 HM1_1457     FALSE 0.126 234.000 0.000 1.000   NA
 10258949 10258950 HM1_1458 HM1_1459     FALSE 0.035 383.000 0.000 NA   NA
 10258951 10258952 HM1_1460 HM1_1461 argH   FALSE 0.255 111.000 0.000 1.000   NA
 10258952 10258953 HM1_1461 HM1_1462   pshB TRUE 0.413 79.000 0.000 0.011   NA
 10258953 10258954 HM1_1462 HM1_1463 pshB   TRUE 0.524 -30.000 0.000 NA   NA
 10258954 10258955 HM1_1463 HM1_1464     FALSE 0.091 186.000 0.000 NA   NA
 10258955 10258956 HM1_1464 HM1_1465   paaK FALSE 0.226 38.000 0.000 NA   NA
 10258956 10258957 HM1_1465 HM1_1466 paaK oorA TRUE 0.993 33.000 0.234 1.000 N NA
 10258957 10258958 HM1_1466 HM1_1467 oorA oorB TRUE 0.999 3.000 0.766 0.002 Y NA
 10258962 10258963 HM1_1471 HM1_1472 icd mdh TRUE 0.989 55.000 0.115 1.000 Y NA
 10258964 10258965 HM1_1473 HM1_1474     FALSE 0.191 52.000 0.000 NA   NA
 10258968 10258969 HM1_1477 HM1_1478     FALSE 0.099 177.000 0.000 NA   NA
 10258969 10258970 HM1_1478 HM1_1479     TRUE 0.992 7.000 0.028 0.002 Y NA
 10258970 10258971 HM1_1479 HM1_1480   cybH TRUE 0.998 13.000 0.355 0.040 Y NA
 10258971 10258972 HM1_1480 HM1_1481 cybH   TRUE 0.924 207.000 0.021 1.000 Y NA
 10258972 10258973 HM1_1481 HM1_1482   hypA TRUE 0.427 25.000 0.000 1.000   NA
 10258973 10258974 HM1_1482 HM1_1483 hypA hypB TRUE 0.990 2.000 0.062 0.002   NA
 10258974 10258975 HM1_1483 HM1_1484 hypB hypF TRUE 0.963 63.000 0.018 1.000 Y NA
 10258975 10258976 HM1_1484 HM1_1485 hypF hypC TRUE 0.992 4.000 0.046 NA Y NA
 10258976 10258977 HM1_1485 HM1_1486 hypC hypD TRUE 0.979 97.000 0.084 NA Y NA
 10258977 10258978 HM1_1486 HM1_1487 hypD hypE TRUE 0.992 145.000 0.353 1.000 Y NA
 10258978 10258979 HM1_1487 HM1_1488 hypE   FALSE 0.258 29.000 0.000 NA   NA
 10258979 10258980 HM1_1488 HM1_1489     FALSE 0.042 323.000 0.000 NA   NA
 10258985 10258986 HM1_1494 HM1_1495     FALSE 0.142 87.000 0.000 NA   NA
 10258986 10258987 HM1_1495 HM1_1496     TRUE 0.471 0.000 0.000 NA   NA
 10258990 10258991 HM1_1499 HM1_1500     TRUE 0.593 92.000 0.000 1.000 N NA
 10258991 10258992 HM1_1500 HM1_1501     TRUE 0.983 21.000 0.017 0.068 Y NA
 10258992 10258993 HM1_1501 HM1_1502     TRUE 0.999 -3.000 0.671 0.068 N NA
 10258993 10258994 HM1_1502 HM1_1503     TRUE 0.454 292.000 0.000 1.000 Y NA
 10258994 10258995 HM1_1503 HM1_1504   motA FALSE 0.357 249.000 0.000 1.000 N NA
 10258995 10258996 HM1_1504 HM1_1505 motA motB TRUE 0.998 0.000 0.257 1.000 Y NA
 10258996 10258997 HM1_1505 HM1_1506 motB   FALSE 0.235 142.000 0.000 1.000   NA
 10258998 10258999 HM1_1507 HM1_1508     TRUE 0.571 64.000 0.000 NA N NA
 10259000 10259001 HM1_1509 HM1_1510   ilvE FALSE 0.036 378.000 0.000 NA   NA
 10259001 10259002 HM1_1510 HM1_1511 ilvE ilvD TRUE 0.962 64.000 0.017 1.000 Y NA
 10259002 10259003 HM1_1511 HM1_1512 ilvD ilvN TRUE 0.904 27.000 0.000 0.002 Y NA
 10259003 10259004 HM1_1512 HM1_1513 ilvN ilvC TRUE 0.990 125.000 0.130 0.002 Y NA
 10259004 10259005 HM1_1513 HM1_1514 ilvC ilvB TRUE 0.955 101.000 0.005 0.002 Y NA
 10259005 10259006 HM1_1514 HM1_1515 ilvB leuA TRUE 0.938 150.000 0.011 1.000 Y NA
 10259006 10259007 HM1_1515 HM1_1516 leuA leuC TRUE 0.964 276.000 0.086 0.002 Y NA
 10259007 10259008 HM1_1516 HM1_1517 leuC leuD TRUE 0.999 0.000 0.615 0.001 Y NA
 10259008 10259009 HM1_1517 HM1_1518 leuD leuB TRUE 0.953 251.000 0.051 0.002 Y NA
 10259009 10259010 HM1_1518 HM1_1519 leuB   TRUE 0.858 300.000 0.016 1.000 Y NA
 10259010 10259011 HM1_1519 HM1_1520     FALSE 0.207 47.000 0.000 NA   NA
 10259013 10259014 HM1_1522 HM1_1523     TRUE 0.996 -3.000 0.502 NA   NA
 10259014 10259015 HM1_1523 HM1_1524     TRUE 0.969 25.000 0.083 NA   NA
 10259015 10259016 HM1_1524 HM1_1525   glmM TRUE 0.830 134.000 0.017 NA   NA
 10259016 10259017 HM1_1525 HM1_1526 glmM glmS TRUE 0.761 462.000 0.030 1.000 N NA
 10259018 10259019 HM1_1527 HM1_1528     TRUE 0.463 189.000 0.000 1.000 N NA
 10259020 10259021 HM1_1529 HM1_1530     FALSE 0.251 91.000 0.000 1.000   NA
 10259021 10259022 HM1_1530 HM1_1532     FALSE 0.235 142.000 0.000 1.000   NA
 10259024 10259025 HM1_1533 HM1_1534     FALSE 0.246 32.000 0.000 NA   NA
 10259025 10259026 HM1_1534 HM1_1535     FALSE 0.337 8.000 0.000 NA   NA
 10259026 10259027 HM1_1535 HM1_1536     TRUE 0.998 3.000 0.304 1.000 Y NA
 10259027 10259028 HM1_1536 HM1_1537     FALSE 0.033 413.000 0.000 NA   NA
 10259029 10259030 HM1_1538 HM1_1539     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10259031 10259032 HM1_1540 HM1_1541     TRUE 0.993 13.000 0.222 NA N NA
 10259037 10259038 HM1_1546 HM1_1547 pceA   TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10259038 10259039 HM1_1547 HM1_1548   modA FALSE 0.385 5.000 0.000 NA   NA
 10259039 10259040 HM1_1548 HM1_1549 modA   TRUE 0.761 65.000 0.000 1.000 Y NA
 10259040 10259041 HM1_1549 HM1_1550   modB TRUE 0.999 -54.000 0.342 1.000 Y NA
 10259041 10259042 HM1_1550 HM1_1551 modB   FALSE 0.038 361.000 0.000 NA   NA
 10259042 10259043 HM1_1551 HM1_1552     FALSE 0.141 102.000 0.000 NA   NA
 10259045 10259046 HM1_1554 HM1_1555     FALSE 0.226 38.000 0.000 NA   NA
 10259050 10259051 HM1_1559 HM1_1560     TRUE 0.976 51.000 0.135 0.070   NA
 10259053 10259054 HM1_1562 HM1_1563     FALSE 0.082 921.000 0.000 0.026   NA
 10259055 10259056 HM1_1564 HM1_1565     FALSE 0.027 527.000 0.000 NA   NA
 10259056 10259057 HM1_1565 HM1_1566     FALSE 0.027 564.000 0.000 NA   NA
 10259060 10259061 HM1_1569 HM1_1570     FALSE 0.049 290.000 0.000 NA   NA
 10259063 10259064 HM1_1573 HM1_1574     TRUE 0.526 -7.000 0.000 NA   NA
 10259064 10259065 HM1_1574 HM1_1575     FALSE 0.024 691.000 0.000 NA   NA
 10259065 10259066 HM1_1575 HM1_1576     FALSE 0.148 76.000 0.000 NA   NA
 10259066 10259067 HM1_1576 HM1_1577     TRUE 0.894 4.000 0.000 0.068 N NA
 10259068 10259069 HM1_1578 HM1_1579     FALSE 0.140 100.000 0.000 NA   NA
 10259069 10259070 HM1_1579 HM1_1580     TRUE 0.990 32.000 0.639 NA   NA
 10259070 10259071 HM1_1580 HM1_1581     FALSE 0.081 206.000 0.000 NA   NA
 10259072 10259073 HM1_1582 HM1_1583     TRUE 0.799 51.000 0.000 1.000 Y NA
 10259074 10259075 HM1_1584 HM1_1585     TRUE 0.992 15.000 0.911 NA   NA
 10259075 10259076 HM1_1585 HM1_1586     TRUE 0.928 97.000 0.073 NA   NA
 10259076 10259077 HM1_1586 HM1_1587     TRUE 0.998 -34.000 0.125 1.000 Y NA
 10259077 10259078 HM1_1587 HM1_1588   sbcD TRUE 0.597 81.000 0.000 1.000 N NA
 10259078 10259079 HM1_1588 HM1_1589 sbcD sbcC TRUE 0.999 -3.000 0.669 1.000 Y NA
 10259079 10259080 HM1_1589 HM1_1590 sbcC hymD FALSE 0.220 41.000 0.000 NA   NA
 10259080 10259081 HM1_1590 HM1_1591 hymD mviN FALSE 0.167 63.000 0.000 NA   NA
 10259081 10259082 HM1_1591 HM1_1592 mviN murF FALSE 0.252 84.000 0.000 1.000   NA
 10259082 10259083 HM1_1592 HM1_1593 murF glpP TRUE 0.447 200.000 0.000 1.000 N NA
 10259083 10259084 HM1_1593 HM1_1594 glpP   FALSE 0.030 473.000 0.000 NA   NA
 10259084 10259085 HM1_1594 HM1_1595     TRUE 0.522 -36.000 0.000 NA   NA
 10259085 10259086 HM1_1595 HM1_1596   glpK FALSE 0.346 259.000 0.000 1.000 N NA
 10259086 10259087 HM1_1596 HM1_1597 glpK glpA TRUE 0.453 469.000 0.000 0.001 Y NA
 10259087 10259088 HM1_1597 HM1_1598 glpA glpB TRUE 0.999 0.000 0.650 0.001 N NA
 10259088 10259089 HM1_1598 HM1_1599 glpB glpC TRUE 0.999 -3.000 0.547 0.001 N NA
 10259089 10259090 HM1_1599 HM1_1600 glpC pykA TRUE 0.786 14.000 0.000 1.000 N NA
 10259092 10259093 HM1_1602 HM1_1603 gapA pgk TRUE 0.988 3.000 0.002 0.006 Y NA
 10259093 10259094 HM1_1603 HM1_1604 pgk tpiA TRUE 0.960 94.000 0.024 1.000 Y NA
 10259094 10259095 HM1_1604 HM1_1605 tpiA eno TRUE 0.928 138.000 0.003 1.000 Y NA
 10259095 10259096 HM1_1605 HM1_1607 eno   FALSE 0.383 235.000 0.000 1.000 N NA
 10259099 10259100 HM1_1609 HM1_1610     FALSE 0.271 24.000 0.000 NA   NA
 10259100 10259101 HM1_1610 HM1_1611     FALSE 0.146 79.000 0.000 NA   NA
 10259101 10259102 HM1_1611 HM1_1612     FALSE 0.146 122.000 0.000 NA   NA
 10259103 10259104 HM1_1613 HM1_1614 gph   FALSE 0.210 161.000 0.000 1.000   NA
 10259104 10259105 HM1_1614 HM1_1615     FALSE 0.060 248.000 0.000 NA   NA
 10259105 10259106 HM1_1615 HM1_1616     FALSE 0.165 64.000 0.000 NA   NA
 10259107 10259108 HM1_1617 HM1_1618     FALSE 0.133 223.000 0.000 1.000   NA
 10259110 10259111 HM1_1620 HM1_1621     FALSE 0.118 160.000 0.000 NA   NA
 10259112 10259113 HM1_1622 HM1_1623     FALSE 0.025 604.000 0.000 NA   NA
 10259113 10259114 HM1_1623 HM1_1624     FALSE 0.088 192.000 0.000 NA   NA
 10259114 10259115 HM1_1624 HM1_1625     FALSE 0.062 245.000 0.000 NA   NA
 10259115 10259116 HM1_1625 HM1_1626     FALSE 0.207 47.000 0.000 NA   NA
 10259116 10259117 HM1_1626 HM1_1627   filD FALSE 0.041 334.000 0.000 NA   NA
 10259117 10259118 HM1_1627 HM1_1628 filD   TRUE 0.507 171.000 0.000 1.000 N NA
 10259118 10259119 HM1_1628 HM1_1629     FALSE 0.355 250.000 0.000 1.000 N NA
 10259119 10259120 HM1_1629 HM1_1630     TRUE 0.730 35.000 0.000 1.000 N NA
 10259120 10259121 HM1_1630 HM1_1632     FALSE 0.385 5.000 0.000 NA   NA
 10259125 10259126 HM1_1635 HM1_1636     FALSE 0.083 201.000 0.000 NA   NA
 10259126 10259127 HM1_1636 HM1_1637     FALSE 0.158 68.000 0.000 NA   NA
 10259127 10259128 HM1_1637 HM1_1638     TRUE 0.527 -9.000 0.000 NA   NA
 10259128 10259129 HM1_1638 HM1_1639     TRUE 0.675 273.000 0.026 NA   NA
 10259129 10259130 HM1_1639 HM1_1640     TRUE 0.995 -7.000 0.269 NA   NA
 10259130 10259131 HM1_1640 HM1_1641   speH FALSE 0.169 62.000 0.000 NA   NA
 10259132 10259133 HM1_1642 HM1_1643 aspB   TRUE 0.503 172.000 0.000 1.000 N NA
 10259134 10259135 HM1_1644 HM1_1645     TRUE 0.994 -3.000 0.031 1.000 Y NA
 10259135 10259136 HM1_1645 HM1_1646   bcrA TRUE 0.955 89.000 0.031 0.090 N NA
 10259136 10259137 HM1_1646 HM1_1647 bcrA   TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10259137 10259138 HM1_1647 HM1_1648     FALSE 0.141 102.000 0.000 NA   NA
 10259139 10259140 HM1_1649 HM1_1650     FALSE 0.173 60.000 0.000 NA   NA
 10259141 10259142 HM1_1651 HM1_1652     FALSE 0.052 581.000 0.000 1.000   NA
 10259144 10259145 HM1_1654 HM1_1655     FALSE 0.026 576.000 0.000 NA   NA
 10259146 10259147 HM1_1656 HM1_1657     FALSE 0.304 13.000 0.000 NA   NA
 10259147 10259148 HM1_1657 HM1_1658     FALSE 0.145 112.000 0.000 NA   NA
 10259149 10259150 HM1_1659 HM1_1660     TRUE 0.451 2.000 0.000 NA   NA
 10259150 10259151 HM1_1660 HM1_1661     TRUE 0.528 -12.000 0.000 NA   NA
 10259154 10259155 HM1_1664 HM1_1665     FALSE 0.086 198.000 0.000 NA   NA
 10259156 10259157 HM1_1666 HM1_1667     TRUE 0.993 10.000 0.556 NA   NA
 10259157 10259158 HM1_1667 HM1_1668     FALSE 0.140 100.000 0.000 NA   NA
 10259158 10259159 HM1_1668 HM1_1669     FALSE 0.036 374.000 0.000 NA   NA
 10259159 10259160 HM1_1669 HM1_1670     FALSE 0.047 300.000 0.000 NA   NA
 10259160 10259161 HM1_1670 HM1_1671   prfC FALSE 0.052 274.000 0.000 NA   NA
 10259161 10259162 HM1_1671 HM1_1672 prfC   FALSE 0.196 51.000 0.000 NA   NA
 10259162 10259163 HM1_1672 HM1_1673     FALSE 0.105 171.000 0.000 NA   NA
 10259164 10259165 HM1_1674 HM1_1675 cstA   TRUE 0.974 152.000 0.061 1.000 Y NA
 10259165 10259166 HM1_1675 HM1_1676   lytS TRUE 0.997 22.000 0.262 0.018 Y NA
 10259166 10259167 HM1_1676 HM1_1677 lytS   FALSE 0.076 214.000 0.000 NA   NA
 10259168 10259169 HM1_1678 HM1_1679 bioB   FALSE 0.119 158.000 0.000 NA   NA
 10259170 10259171 HM1_1680 HM1_1681   cysK TRUE 0.603 77.000 0.000 1.000 N NA
 10259173 10259174 HM1_1683 HM1_1684     FALSE 0.220 41.000 0.000 NA   NA
 10259174 10259175 HM1_1684 HM1_1685     FALSE 0.147 117.000 0.000 NA   NA
 10259175 10259176 HM1_1685 HM1_1686     FALSE 0.235 35.000 0.000 NA   NA
 10259177 10259178 HM1_1687 HM1_1688     FALSE 0.038 361.000 0.000 NA   NA
 10259178 10259179 HM1_1688 HM1_1689     TRUE 0.521 -37.000 0.000 NA   NA
 10259179 10259180 HM1_1689 HM1_1690     TRUE 0.975 90.000 0.386 NA   NA
 10259180 10259181 HM1_1690 HM1_1691     TRUE 0.995 4.000 0.523 NA   NA
 10259181 10259182 HM1_1691 HM1_1692     FALSE 0.089 190.000 0.000 NA   NA
 10259183 10259184 HM1_1693 HM1_1694     FALSE 0.304 13.000 0.000 NA   NA
 10259184 10259185 HM1_1694 HM1_1695     FALSE 0.253 30.000 0.000 NA   NA
 10259185 10259186 HM1_1695 HM1_1696   rpsR FALSE 0.034 388.000 0.000 NA   NA
 10259186 10259187 HM1_1696 HM1_1697 rpsR rpsF TRUE 0.996 53.000 0.319 0.015 Y NA
 10259187 10259188 HM1_1697 HM1_1698 rpsF   TRUE 0.457 193.000 0.000 1.000 N NA
 10259188 10259189 HM1_1698 HM1_1699     TRUE 0.524 341.000 0.000 0.001 Y NA
 10259189 10259190 HM1_1699 HM1_1700     TRUE 0.965 29.000 0.077 NA   NA
 10259190 10259191 HM1_1700 HM1_1701     FALSE 0.152 73.000 0.000 NA   NA
 10259192 10259193 HM1_1702 HM1_1703   cheW TRUE 0.779 57.000 0.000 1.000 Y NA
 10259193 10259194 HM1_1703 HM1_1704 cheW acpS TRUE 0.893 90.000 0.003 1.000 N NA
 10259194 10259195 HM1_1704 HM1_1705 acpS   TRUE 0.989 -12.000 0.028 NA N NA
 10259195 10259196 HM1_1705 HM1_1706     TRUE 0.957 52.000 0.035 NA N NA
 10259196 10259197 HM1_1706 HM1_1707   alr TRUE 0.799 12.000 0.000 1.000 N NA
 10259197 10259198 HM1_1707 HM1_1708 alr   FALSE 0.249 98.000 0.000 1.000   NA
 10259198 10259199 HM1_1708 HM1_1709     TRUE 0.993 6.000 0.221 0.068   NA
 10259199 10259200 HM1_1709 HM1_1710     FALSE 0.262 75.000 0.000 1.000   NA
 10259200 10259201 HM1_1710 HM1_1711     TRUE 0.765 0.000 0.000 0.034   NA
 10259201 10259202 HM1_1711 HM1_1712   ansA TRUE 0.683 33.000 0.000 NA N NA
 10259202 10259203 HM1_1712 HM1_1713 ansA   TRUE 0.808 5.000 0.000 NA N NA
 10259203 10259204 HM1_1713 HM1_1714   spo0F TRUE 0.950 253.000 0.154 1.000 N NA
 10259204 10259205 HM1_1714 HM1_1715 spo0F dam TRUE 0.563 148.000 0.000 1.000 N NA
 10259205 10259206 HM1_1715 HM1_1716 dam   FALSE 0.142 92.000 0.000 NA   NA
 10259206 10259207 HM1_1716 HM1_1717     TRUE 0.521 -37.000 0.000 NA   NA
 10259207 10259208 HM1_1717 HM1_1718     TRUE 0.995 -36.000 0.217 1.000   NA
 10259208 10259209 HM1_1718 HM1_1719   rimI TRUE 0.990 3.000 0.127 1.000   NA
 10259209 10259210 HM1_1719 HM1_1720 rimI   FALSE 0.257 78.000 0.000 1.000   NA
 10259210 10259211 HM1_1720 HM1_1721     FALSE 0.254 110.000 0.000 1.000   NA
 10259211 10259212 HM1_1721 HM1_1722     FALSE 0.248 130.000 0.000 1.000   NA
 10259212 10259213 HM1_1722 HM1_1723     FALSE 0.155 70.000 0.000 NA   NA
 10259213 10259214 HM1_1723 HM1_1724   gcp FALSE 0.295 14.000 0.000 NA   NA
 10259214 10259215 HM1_1724 HM1_1725 gcp araD TRUE 0.603 77.000 0.000 1.000 N NA
 10259215 10259216 HM1_1725 HM1_1726 araD   FALSE 0.026 599.000 0.000 NA   NA
 10259216 10259217 HM1_1726 HM1_1727     FALSE 0.047 300.000 0.000 NA   NA
 10259217 10259218 HM1_1727 HM1_1728     FALSE 0.031 450.000 0.000 NA   NA
 10259220 10259221 HM1_1730 HM1_1731 metB metC TRUE 0.998 18.000 0.600 0.003 Y NA
 10259221 10259222 HM1_1731 HM1_1732 metC   FALSE 0.128 147.000 0.000 NA   NA
 10259222 10259223 HM1_1732 HM1_1733     TRUE 0.506 -3.000 0.000 NA   NA
 10259223 10259224 HM1_1733 HM1_1734   cysK FALSE 0.253 30.000 0.000 NA   NA
 10259224 10259225 HM1_1734 HM1_1735 cysK   FALSE 0.137 136.000 0.000 NA   NA
 10259226 10259227 HM1_1736 HM1_1737     TRUE 0.998 3.000 0.429 NA Y NA
 10259227 10259228 HM1_1737 HM1_1738     TRUE 0.499 146.000 0.000 NA N NA
 10259229 10259230 HM1_1739 HM1_1740   rex FALSE 0.120 241.000 0.000 1.000   NA
 10259230 10259231 HM1_1740 HM1_1741 rex   FALSE 0.128 230.000 0.000 1.000   NA
 10259231 10259232 HM1_1741 HM1_1742     TRUE 0.524 -27.000 0.000 NA   NA
 10259232 10259233 HM1_1742 HM1_1743   nuoE TRUE 0.518 -183.000 0.000 NA   NA
 10259233 10259234 HM1_1743 HM1_1744 nuoE nuoF TRUE 0.998 15.000 0.368 0.006 Y NA
 10259234 10259235 HM1_1744 HM1_1745 nuoF fdhA TRUE 0.985 15.000 0.167 1.000   NA
 10259237 10259238 HM1_1747 HM1_1748   polA FALSE 0.120 155.000 0.000 NA   NA
 10259238 10259239 HM1_1748 HM1_1749 polA mutM TRUE 0.994 14.000 0.101 1.000 Y NA
 10259239 10259240 HM1_1749 HM1_1750 mutM   TRUE 0.960 -43.000 0.003 1.000   NA
 10259240 10259241 HM1_1750 HM1_1751     TRUE 0.892 136.000 0.045 NA   NA
 10259241 10259242 HM1_1751 HM1_1752   coaE TRUE 0.885 104.000 0.038 NA   NA
 10259242 10259243 HM1_1752 HM1_1753 coaE   TRUE 0.993 -13.000 0.058 NA N NA
 10259243 10259244 HM1_1753 HM1_1754     FALSE 0.140 131.000 0.000 NA   NA
 10259244 10259245 HM1_1754 HM1_1755     FALSE 0.087 193.000 0.000 NA   NA
 10259247 10259248 HM1_1757 HM1_1758 pdaD speE TRUE 0.886 109.000 0.028 1.000   NA
 10259248 10259249 HM1_1758 HM1_1759 speE   FALSE 0.157 69.000 0.000 NA   NA
 10259249 10259250 HM1_1759 HM1_1760     FALSE 0.385 5.000 0.000 NA   NA
 10259250 10259251 HM1_1760 HM1_1761     TRUE 0.416 4.000 0.000 NA   NA
 10259253 10259254 HM1_1763 HM1_1764     FALSE 0.272 19.000 0.000 NA   NA
 10259257 10259258 HM1_1767 HM1_1768     FALSE 0.024 796.000 0.000 NA   NA
 10259259 10259260 HM1_1769 HM1_1770   pspA FALSE 0.155 70.000 0.000 NA   NA
 10259262 10259263 HM1_1772 HM1_1773     FALSE 0.052 275.000 0.000 NA   NA
 10259263 10259264 HM1_1773 HM1_1774     FALSE 0.304 13.000 0.000 NA   NA
 10259264 10259265 HM1_1774 HM1_1775     FALSE 0.140 100.000 0.000 NA   NA
 10259266 10259267 HM1_1776 HM1_1777     FALSE 0.258 29.000 0.000 NA   NA
 10259267 10259268 HM1_1777 HM1_1778     FALSE 0.304 13.000 0.000 NA   NA
 10259269 10259270 HM1_1779 HM1_1780   thrS FALSE 0.138 134.000 0.000 NA   NA
 10259271 10259272 HM1_1781 HM1_1782     FALSE 0.145 112.000 0.000 NA   NA
 10259272 10259273 HM1_1782 HM1_1783     TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.029   NA
 10259273 10259274 HM1_1783 HM1_1784     TRUE 0.791 -3.000 0.000 0.029   NA
 10259274 10259275 HM1_1784 HM1_1785     TRUE 0.674 -3.000 0.000 1.000   NA
 10259275 10259276 HM1_1785 HM1_1786     TRUE 0.620 21.000 0.000 0.006   NA
 10259276 10259277 HM1_1786 HM1_1787     FALSE 0.402 31.000 0.000 1.000   NA
 10259277 10259278 HM1_1787 HM1_1788   aroB TRUE 0.967 16.000 0.022 NA N NA
 10259279 10259280 HM1_1789 HM1_1790 infC rpmI TRUE 0.997 37.000 0.652 1.000 Y NA
 10259280 10259281 HM1_1790 HM1_1791 rpmI rplT TRUE 0.997 63.000 0.928 0.014 Y NA
 10259281 10259282 HM1_1791 HM1_1792 rplT trkH TRUE 0.573 142.000 0.000 1.000 N NA
 10259282 10259283 HM1_1792 HM1_1793 trkH trkA TRUE 0.997 9.000 0.133 0.003 Y NA
 10259283 10259284 HM1_1793 HM1_1794 trkA   TRUE 0.993 -3.000 0.044 1.000 N NA
 10259288 10259289 HM1_1798 HM1_1799 pheT   TRUE 0.875 142.000 0.038 NA   NA
 10259289 10259290 HM1_1799 HM1_1800     TRUE 0.827 83.000 0.015 NA   NA
 10259290 10259291 HM1_1800 HM1_1801     TRUE 0.830 115.000 0.015 NA   NA
 10259292 10259293 HM1_1802 HM1_1803 cydB cydA TRUE 0.996 -3.000 0.044 0.038 Y NA
 10259294 10259295 HM1_1804 HM1_1805     TRUE 0.969 138.000 0.078 1.000 N NA
 10259296 10259297 HM1_1806 HM1_1807     FALSE 0.143 125.000 0.000 NA   NA
 10259297 10259298 HM1_1807 HM1_1808     FALSE 0.154 71.000 0.000 NA   NA
 10259298 10259299 HM1_1808 HM1_1809     TRUE 0.999 6.000 0.889 1.000 Y NA
 10259299 10259300 HM1_1809 HM1_1810     TRUE 0.598 111.000 0.000 1.000 N NA
 10259300 10259301 HM1_1810 HM1_1811     FALSE 0.232 36.000 0.000 NA   NA
 10259302 10259303 HM1_1812 HM1_1813 tyrS   TRUE 0.780 184.000 0.022 NA   NA
 10259303 10259304 HM1_1813 HM1_1814     FALSE 0.036 369.000 0.000 NA   NA
 10259304 10259305 HM1_1814 HM1_1815     TRUE 0.522 -36.000 0.000 NA   NA
 10259305 10259306 HM1_1815 HM1_1816     FALSE 0.056 260.000 0.000 NA   NA
 10259306 10259307 HM1_1816 HM1_1817     FALSE 0.163 65.000 0.000 NA   NA
 10259307 10259308 HM1_1817 HM1_1818     FALSE 0.349 7.000 0.000 NA   NA
 10259308 10259309 HM1_1818 HM1_1819     FALSE 0.067 234.000 0.000 NA   NA
 10259309 10259310 HM1_1819 HM1_1820     FALSE 0.146 114.000 0.000 NA   NA
 10259310 10259311 HM1_1820 HM1_1821     FALSE 0.349 7.000 0.000 NA   NA
 10259311 10259312 HM1_1821 HM1_1822     FALSE 0.062 244.000 0.000 NA   NA
 10259312 10259313 HM1_1822 HM1_1823     TRUE 0.526 -7.000 0.000 NA   NA
 10259313 10259314 HM1_1823 HM1_1824     FALSE 0.385 5.000 0.000 NA   NA
 10259316 10259317 HM1_1826 HM1_1827   ruvC TRUE 0.886 28.000 0.007 NA   NA
 10259317 10259318 HM1_1827 HM1_1828 ruvC ruvA TRUE 0.999 -3.000 0.451 0.011 Y NA
 10259318 10259319 HM1_1828 HM1_1829 ruvA ruvB TRUE 0.998 15.000 0.549 0.003 Y NA
 10259319 10259320 HM1_1829 HM1_1830 ruvB   TRUE 0.946 10.000 0.024 NA   NA
 10259320 10259321 HM1_1830 HM1_1831     TRUE 0.987 -3.000 0.069 NA   NA
 10259321 10259322 HM1_1831 HM1_1832     TRUE 0.872 65.000 0.023 NA   NA
 10259322 10259323 HM1_1832 HM1_1833     TRUE 0.975 80.000 0.375 NA   NA
 10259323 10259324 HM1_1833 HM1_1834   spoIID FALSE 0.086 198.000 0.000 NA   NA
 10259324 10259325 HM1_1834 HM1_1835 spoIID queA TRUE 0.986 0.000 0.017 1.000 N NA
 10259325 10259326 HM1_1835 HM1_1836 queA   TRUE 0.995 98.000 0.360 0.001 Y NA
 10259326 10259327 HM1_1836 HM1_1837   yajC TRUE 0.986 95.000 0.325 NA N NA
 10259327 10259328 HM1_1837 HM1_1838 yajC   FALSE 0.127 149.000 0.000 NA   NA
 10259328 10259329 HM1_1838 HM1_1839     FALSE 0.155 70.000 0.000 NA   NA
 10259329 10259330 HM1_1839 HM1_1840   secD TRUE 0.947 64.000 0.071 1.000   NA
 10259330 10259331 HM1_1840 HM1_1841 secD secF TRUE 0.998 19.000 0.516 0.001 Y NA
 10259331 10259332 HM1_1841 HM1_1842 secF   TRUE 0.832 224.000 0.011 1.000 N NA
 10259332 10259333 HM1_1842 HM1_1843     FALSE 0.363 246.000 0.000 1.000 N NA
 10259333 10259334 HM1_1843 HM1_1844   dtd TRUE 0.982 85.000 0.177 1.000 N NA
 10259334 10259335 HM1_1844 HM1_1845 dtd   TRUE 0.985 -3.000 0.048 1.000   NA
 10259335 10259336 HM1_1845 HM1_1846     TRUE 0.939 40.000 0.035 1.000   NA
 10259336 10259337 HM1_1846 HM1_1847   hisS TRUE 0.986 0.000 0.017 1.000 N NA
 10259337 10259338 HM1_1847 HM1_1848 hisS aspS TRUE 0.989 145.000 0.161 0.033 Y NA
 10259338 10259339 HM1_1848 HM1_1849 aspS   TRUE 0.984 -3.000 0.008 1.000 N NA
 10259339 10259340 HM1_1849 HM1_1850     TRUE 0.930 10.000 0.014 NA   NA
 10259340 10259341 HM1_1850 HM1_1851   trxA TRUE 0.983 33.000 0.238 NA   NA
 10259341 10259342 HM1_1851 HM1_1852 trxA   FALSE 0.262 28.000 0.000 NA   NA
 10259342 10259343 HM1_1852 HM1_1853     FALSE 0.268 26.000 0.000 NA   NA
 10259343 10259344 HM1_1853 HM1_1854     FALSE 0.257 120.000 0.000 1.000   NA
 10259344 10259345 HM1_1854 HM1_1855     FALSE 0.025 664.000 0.000 NA   NA
 10259345 10259346 HM1_1855 HM1_1856     FALSE 0.141 102.000 0.000 NA   NA
 10259346 10259347 HM1_1856 HM1_1857     FALSE 0.258 29.000 0.000 NA   NA
 10259347 10259348 HM1_1857 HM1_1858   cbiQ TRUE 0.883 84.000 0.036 NA   NA
 10259348 10259349 HM1_1858 HM1_1859 cbiQ   TRUE 0.997 -27.000 0.673 1.000   NA
 10259349 10259350 HM1_1859 HM1_1860     TRUE 0.991 -19.000 0.118 NA   NA
 10259350 10259351 HM1_1860 HM1_1861   phrB FALSE 0.130 145.000 0.000 NA   NA
 10259351 10259352 HM1_1861 HM1_1863 phrB   FALSE 0.412 182.000 0.000 NA N NA
 10259354 10259355 HM1_1864 HM1_1865 nifS   TRUE 0.990 3.000 0.043 1.000 N NA
 10259355 10259356 HM1_1865 HM1_1866   trmU TRUE 0.938 220.000 0.073 1.000 N NA
 10259356 10259357 HM1_1866 HM1_1867 trmU   TRUE 0.757 87.000 0.004 NA   NA
 10259357 10259358 HM1_1867 HM1_1868     TRUE 0.957 18.000 0.054 NA   NA
 10259358 10259359 HM1_1868 HM1_1869     TRUE 0.906 103.000 0.054 NA   NA
 10259361 10259362 HM1_1871 HM1_1872     FALSE 0.219 442.000 0.000 1.000 N NA
 10259362 10259363 HM1_1872 HM1_1873     TRUE 0.943 81.000 0.027 1.000 N NA
 10259363 10259364 HM1_1873 HM1_1874     TRUE 0.998 12.000 0.385 0.010 Y NA
 10259364 10259365 HM1_1874 HM1_1875     TRUE 0.999 -10.000 0.846 0.010 Y NA
 10259365 10259366 HM1_1875 HM1_1876     TRUE 0.997 -25.000 0.545 1.000   NA
 10259366 10259367 HM1_1876 HM1_1877     FALSE 0.101 272.000 0.000 1.000   NA
 10259367 10259368 HM1_1877 HM1_1878   lysA FALSE 0.055 508.000 0.000 1.000   NA
 10259368 10259369 HM1_1878 HM1_1879 lysA   FALSE 0.146 122.000 0.000 NA   NA
 10259369 10259370 HM1_1879 HM1_1880     FALSE 0.304 13.000 0.000 NA   NA
 10259370 10259371 HM1_1880 HM1_1881     FALSE 0.232 36.000 0.000 NA   NA
 10259371 10259372 HM1_1881 HM1_1882     TRUE 0.992 -7.000 0.094 1.000   NA
 10259372 10259373 HM1_1882 HM1_1883   trpS TRUE 0.962 104.000 0.158 1.000   NA
 10259373 10259374 HM1_1883 HM1_1885 trpS scpA TRUE 0.974 7.000