MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium botulinum A3 str. Loch Maree

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5716062 5716063 CLK_3133 CLK_3134 dnaA dnaN TRUE 0.557 263.000 0.328 1.000 Y NA
 5716063 5716064 CLK_3134 CLK_3135 dnaN   TRUE 0.968 20.000 0.103 1.000   NA
 5716064 5716065 CLK_3135 CLK_3136   recF TRUE 0.814 69.000 0.209 1.000   NA
 5716065 5716066 CLK_3136 CLK_3137 recF   TRUE 0.941 21.000 0.024 NA   NA
 5716066 5716067 CLK_3137 CLK_3138   gyrB TRUE 0.946 18.000 0.017 NA   NA
 5716067 5716068 CLK_3138 CLK_3139 gyrB gyrA TRUE 0.994 26.000 0.306 0.002 Y NA
 5716068 5716069 CLK_3139 CLK_3816 gyrA rrsA FALSE 0.006 416.000 0.000 NA   NA
 5716069 5716070 CLK_3816 CLK_3817 rrsA rrlA FALSE 0.068 222.000 0.000 NA   NA
 5716070 5716071 CLK_3817 CLK_3818 rrlA rrfA FALSE 0.319 94.000 0.000 NA   NA
 5716071 5716072 CLK_3818 CLK_3819 rrfA   TRUE 0.906 8.000 0.000 NA   NA
 5716072 5716073 CLK_3819 CLK_3820     TRUE 0.923 2.000 0.000 NA   NA
 5716073 5716074 CLK_3820 CLK_3149     FALSE 0.130 194.000 0.000 NA   NA
 5716074 5716075 CLK_3149 CLK_3150     TRUE 0.958 16.000 0.029 NA   NA
 5716075 5716076 CLK_3150 CLK_3151     TRUE 0.968 2.000 0.014 NA   NA
 5716076 5716077 CLK_3151 CLK_3152     TRUE 0.961 5.000 0.011 NA   NA
 5716077 5716078 CLK_3152 CLK_3153     TRUE 0.554 137.000 0.016 NA   NA
 5716078 5716079 CLK_3153 CLK_3154     TRUE 0.969 25.000 0.214 NA   NA
 5716079 5716080 CLK_3154 CLK_3155     TRUE 0.985 17.000 0.370 NA   NA
 5716080 5716081 CLK_3155 CLK_3156   serS FALSE 0.008 370.000 0.000 NA   NA
 5716081 5716082 CLK_3156 CLK_3822 serS   FALSE 0.029 275.000 0.000 NA   NA
 5716082 5716083 CLK_3822 CLK_3823     TRUE 0.861 19.000 0.000 NA   NA
 5716083 5716084 CLK_3823 CLK_3824     FALSE 0.017 305.000 0.000 NA   NA
 5716084 5716085 CLK_3824 CLK_3825     TRUE 0.861 19.000 0.000 NA   NA
 5716085 5716086 CLK_3825 CLK_3826     FALSE 0.338 83.000 0.000 NA   NA
 5716087 5716088 CLK_3158 CLK_3159 psd   TRUE 0.618 112.000 0.026 NA   NA
 5716088 5716089 CLK_3159 CLK_3160     FALSE 0.354 76.000 0.000 NA   NA
 5716090 5716091 CLK_3827 CLK_3162     FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 5716091 5716092 CLK_3162 CLK_3163   megL FALSE 0.516 160.000 0.034 1.000 N NA
 5716092 5716093 CLK_3163 CLK_3164 megL   FALSE 0.327 124.000 0.000 1.000 N NA
 5716093 5716094 CLK_3164 CLK_3828     FALSE 0.224 165.000 0.000 NA   NA
 5716094 10253779 CLK_3828 CLK_3975   srpB FALSE 0.341 123.000 0.000 NA   NA
 10253779 5716095 CLK_3975 CLK_3165 srpB dnaX FALSE 0.230 164.000 0.000 NA   NA
 5716095 5716096 CLK_3165 CLK_3166 dnaX   TRUE 0.772 65.000 0.100 NA   NA
 5716096 5716097 CLK_3166 CLK_3167   recR TRUE 0.974 33.000 0.604 NA   NA
 5716097 5716098 CLK_3167 CLK_3168 recR   TRUE 0.803 57.000 0.071 NA   NA
 5716098 5716099 CLK_3168 CLK_3169   bofA TRUE 0.803 150.000 0.417 NA   NA
 5716099 5716100 CLK_3169 CLK_3170 bofA sfsA FALSE 0.453 151.000 0.005 NA   NA
 5716100 5716101 CLK_3170 CLK_3171 sfsA   TRUE 0.715 56.000 0.015 NA   NA
 5716101 5716102 CLK_3171 CLK_3172     FALSE 0.372 118.000 0.000 1.000   NA
 5716102 5716103 CLK_3172 CLK_3173     FALSE 0.348 134.000 0.000 1.000   NA
 5716103 5716104 CLK_3173 CLK_3174     TRUE 0.978 19.000 0.222 NA   NA
 5716104 5716105 CLK_3174 CLK_3175     FALSE 0.008 383.000 0.000 NA   NA
 5716105 5716106 CLK_3175 CLK_3176     FALSE 0.507 83.000 0.007 NA N NA
 5716106 5716107 CLK_3176 CLK_3177     TRUE 0.920 29.000 0.035 NA N NA
 5716107 5716108 CLK_3177 CLK_3830   rrsB FALSE 0.007 387.000 0.000 NA   NA
 5716108 5716109 CLK_3830 CLK_3831 rrsB rrlB FALSE 0.068 222.000 0.000 NA   NA
 5716109 5716110 CLK_3831 CLK_3832 rrlB rrfB FALSE 0.533 52.000 0.000 NA   NA
 5716110 5716111 CLK_3832 CLK_3833 rrfB   TRUE 0.910 6.000 0.000 NA   NA
 5716113 5716114 CLK_3834 CLK_3835 rrsC rrlC FALSE 0.068 222.000 0.000 NA   NA
 5716114 5716115 CLK_3835 CLK_3836 rrlC rrfC FALSE 0.533 52.000 0.000 NA   NA
 5716115 5716116 CLK_3836 CLK_3837 rrfC   TRUE 0.910 6.000 0.000 NA   NA
 5716116 5716117 CLK_3837 CLK_3193     FALSE 0.010 355.000 0.000 NA   NA
 5716117 5716118 CLK_3193 CLK_3194     TRUE 0.995 -3.000 0.800 NA   NA
 5716118 5716119 CLK_3194 CLK_3838   rrsD FALSE 0.003 645.000 0.000 NA   NA
 5716119 5716120 CLK_3838 CLK_3839 rrsD rrlD FALSE 0.068 222.000 0.000 NA   NA
 5716120 5716121 CLK_3839 CLK_3840 rrlD rrfD TRUE 0.543 51.000 0.000 NA   NA
 5716121 5716122 CLK_3840 CLK_3841 rrfD   TRUE 0.908 7.000 0.000 NA   NA
 5716122 5716123 CLK_3841 CLK_3203     FALSE 0.038 261.000 0.000 NA   NA
 5716123 5716124 CLK_3203 CLK_3204     FALSE 0.012 332.000 0.000 NA   NA
 5716124 5716125 CLK_3204 CLK_3205     FALSE 0.311 142.000 0.000 NA   NA
 5716125 5716126 CLK_3205 CLK_3842   rrsE FALSE 0.003 719.000 0.000 NA   NA
 5716126 5716127 CLK_3842 CLK_3843 rrsE rrlE FALSE 0.068 222.000 0.000 NA   NA
 5716127 5716128 CLK_3843 CLK_3844 rrlE rrfE TRUE 0.543 51.000 0.000 NA   NA
 5716128 5716129 CLK_3844 CLK_3845 rrfE   TRUE 0.908 7.000 0.000 NA   NA
 5716129 5716130 CLK_3845 CLK_3214     FALSE 0.316 140.000 0.000 NA   NA
 5716130 5716131 CLK_3214 CLK_3846   rrsF FALSE 0.004 522.000 0.000 NA   NA
 5716131 5716132 CLK_3846 CLK_3847 rrsF rrlF FALSE 0.068 222.000 0.000 NA   NA
 5716132 5716133 CLK_3847 CLK_3848 rrlF rrfF FALSE 0.533 52.000 0.000 NA   NA
 5716133 5716134 CLK_3848 CLK_3222 rrfF   FALSE 0.329 133.000 0.000 NA   NA
 5716134 5716135 CLK_3222 CLK_3223     FALSE 0.456 59.000 0.000 NA   NA
 5716135 5716136 CLK_3223 CLK_3849     FALSE 0.341 82.000 0.000 NA   NA
 5716137 5716138 CLK_3225 CLK_3226     TRUE 0.884 36.000 0.039 NA N NA
 5716141 5716142 CLK_3229 CLK_3230     TRUE 0.989 -21.000 0.120 NA   NA
 5716142 5716143 CLK_3230 CLK_3231     TRUE 0.939 24.000 0.034 1.000 N NA
 5716143 5716144 CLK_3231 CLK_3232     TRUE 0.640 81.000 0.034 NA   NA
 5716144 5716145 CLK_3232 CLK_3233     TRUE 0.946 18.000 0.018 NA   NA
 5716145 5716146 CLK_3233 CLK_3234     TRUE 0.991 2.000 0.372 NA   NA
 5716146 5716147 CLK_3234 CLK_3235     TRUE 0.955 12.000 0.011 NA   NA
 5716147 5716148 CLK_3235 CLK_3236     TRUE 0.826 82.000 0.333 1.000   NA
 5716148 5716149 CLK_3236 CLK_3237     TRUE 0.550 121.000 0.006 1.000   NA
 5716149 5716150 CLK_3237 CLK_3238     TRUE 0.971 20.000 0.078 0.007   NA
 5716150 5716151 CLK_3238 CLK_3239     FALSE 0.409 156.000 0.002 NA   NA
 5716153 5716154 CLK_3241 CLK_3242   arcA FALSE 0.006 422.000 0.000 1.000   NA
 5716158 5716159 CLK_3246 CLK_3247 spmA   TRUE 0.993 13.000 0.655 0.003   NA
 5716161 5716162 CLK_3249 CLK_3250 udgA   TRUE 0.901 29.000 0.016 1.000 N NA
 5716162 5716163 CLK_3250 CLK_3251   metG FALSE 0.008 381.000 0.000 1.000 N NA
 5716163 5716164 CLK_3251 CLK_3252 metG   FALSE 0.369 165.000 0.003 NA   NA
 5716164 5716165 CLK_3252 CLK_3253     FALSE 0.447 151.000 0.004 NA   NA
 5716165 5716166 CLK_3253 CLK_3254     FALSE 0.060 227.000 0.000 NA   NA
 5716166 5716167 CLK_3254 CLK_3255     TRUE 0.629 73.000 0.020 1.000   NA
 5716167 5716168 CLK_3255 CLK_3256   ksgA TRUE 0.983 2.000 0.093 1.000 N NA
 5716168 5716169 CLK_3256 CLK_3257 ksgA   TRUE 0.555 79.000 0.010 NA   NA
 5716169 5716170 CLK_3257 CLK_3258     TRUE 0.735 157.000 0.278 NA   NA
 5716170 5716171 CLK_3258 CLK_3259     TRUE 0.638 168.000 0.188 NA   NA
 5716171 5716172 CLK_3259 CLK_3260     TRUE 0.625 168.000 0.167 NA   NA
 5716172 5716173 CLK_3260 CLK_3261     TRUE 0.988 11.000 0.350 1.000 N NA
 5716173 5716174 CLK_3261 CLK_3262     TRUE 0.998 -3.000 0.349 NA Y NA
 5716174 5716175 CLK_3262 CLK_3263     TRUE 0.567 82.000 0.019 NA N NA
 5716175 5716176 CLK_3263 CLK_3264     FALSE 0.336 140.000 0.000 1.000   NA
 5716178 5716179 CLK_3266 CLK_3267     TRUE 0.764 57.000 0.037 NA   NA
 5716179 5716180 CLK_3267 CLK_3268   nrdD FALSE 0.022 290.000 0.000 NA   NA
 5716180 5716181 CLK_3268 CLK_3269 nrdD nrdG TRUE 0.986 17.000 0.315 0.001 N NA
 5716182 5716183 CLK_3270 CLK_3271     FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 5716183 5716184 CLK_3271 CLK_3272     TRUE 0.984 2.000 0.111 NA   NA
 5716184 5716185 CLK_3272 CLK_3273     FALSE 0.345 121.000 0.000 NA   NA
 5716186 5716187 CLK_3274 CLK_3275 ileS   FALSE 0.464 151.000 0.009 1.000 N NA
 5716187 5716188 CLK_3275 CLK_3276     FALSE 0.181 216.000 0.017 1.000 N NA
 5716188 5716189 CLK_3276 CLK_3277     TRUE 0.766 75.000 0.160 1.000 N NA
 5716189 5716190 CLK_3277 CLK_3278     FALSE 0.012 336.000 0.000 NA   NA
 5716190 5716191 CLK_3278 CLK_3279     TRUE 0.978 5.000 0.066 NA   NA
 5716191 5716192 CLK_3279 CLK_3280     TRUE 0.976 20.000 0.210 1.000   NA
 5716192 5716193 CLK_3280 CLK_3281     FALSE 0.068 225.000 0.000 1.000   NA
 5716193 5716194 CLK_3281 CLK_3282     TRUE 0.614 187.000 0.333 1.000   NA
 5716196 5716197 CLK_3284 CLK_3285     TRUE 0.978 15.000 0.143 NA   NA
 5716197 5716198 CLK_3285 CLK_3286     TRUE 0.968 27.000 0.250 NA   NA
 5716198 5716199 CLK_3286 CLK_3287     TRUE 0.992 13.000 0.800 NA   NA
 5716201 5716202 CLK_3289 CLK_3290 cotS   TRUE 0.736 124.000 0.119 NA   NA
 5716202 5716203 CLK_3290 CLK_3291     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5716203 5716204 CLK_3291 CLK_3292     TRUE 0.699 36.000 0.000 NA   NA
 5716204 5716205 CLK_3292 CLK_3293     TRUE 0.694 104.000 0.082 NA   NA
 5716205 5716206 CLK_3293 CLK_3294   cphB FALSE 0.425 198.000 0.109 1.000   NA
 5716206 5716207 CLK_3294 CLK_3295 cphB cphA TRUE 0.950 44.000 0.605 1.000 N NA
 5716207 5716208 CLK_3295 CLK_3296 cphA ispE TRUE 0.543 93.000 0.016 1.000 N NA
 5716208 5716209 CLK_3296 CLK_3297 ispE   FALSE 0.043 296.000 0.005 NA   NA
 5716209 5716210 CLK_3297 CLK_3298     TRUE 0.813 61.000 0.133 NA   NA
 5716210 5716211 CLK_3298 CLK_3299     TRUE 0.984 20.000 0.333 0.006   NA
 5716211 5716212 CLK_3299 CLK_3300     TRUE 0.946 50.000 0.500 0.006   NA
 5716212 5716213 CLK_3300 CLK_3301     TRUE 0.744 74.000 0.109 NA   NA
 5716215 5716216 CLK_3303 CLK_3304 ypeB   FALSE 0.510 103.000 0.003 1.000   NA
 5716216 5716217 CLK_3304 CLK_3305     TRUE 0.913 25.000 0.011 NA   NA
 5716217 5716218 CLK_3305 CLK_3306     TRUE 0.634 132.000 0.039 NA   NA
 5716218 5716219 CLK_3306 CLK_3307   pyrG FALSE 0.103 234.000 0.004 NA   NA
 5716219 5716220 CLK_3307 CLK_3308 pyrG   FALSE 0.034 267.000 0.000 NA   NA
 5716220 5716221 CLK_3308 CLK_3309   rho FALSE 0.348 172.000 0.006 NA   NA
 5716223 5716224 CLK_3311 CLK_3312 tdk   TRUE 0.942 17.000 0.010 NA   NA
 5716224 5716225 CLK_3312 CLK_3313     TRUE 0.980 8.000 0.098 NA   NA
 5716225 5716226 CLK_3313 CLK_3314   prfA TRUE 0.913 82.000 0.081 1.000 Y NA
 5716226 5716227 CLK_3314 CLK_3315 prfA   TRUE 0.898 28.000 0.009 NA   NA
 5716227 5716228 CLK_3315 CLK_3316     TRUE 0.817 59.000 0.116 NA   NA
 5716228 5716229 CLK_3316 CLK_3317     TRUE 0.952 21.000 0.052 NA N NA
 5716229 5716230 CLK_3317 CLK_3318     TRUE 0.973 9.000 0.056 NA N NA
 5716230 5716231 CLK_3318 CLK_3319   rpiB TRUE 0.770 60.000 0.065 1.000 N NA
 5716231 5716232 CLK_3319 CLK_3320 rpiB upp TRUE 0.901 30.000 0.019 1.000 N NA
 5716232 5716233 CLK_3320 CLK_3321 upp   FALSE 0.062 514.000 0.041 1.000 Y NA
 5716233 5716234 CLK_3321 CLK_3322   tagO TRUE 0.611 108.000 0.029 1.000 N NA
 5716234 5716235 CLK_3322 CLK_3323 tagO mnaA TRUE 0.996 14.000 0.346 1.000 Y NA
 5716235 5716236 CLK_3323 CLK_3324 mnaA   FALSE 0.005 492.000 0.000 1.000   NA
 5716236 5716237 CLK_3324 CLK_3325   atpB TRUE 0.985 15.000 0.330 1.000   NA
 5716237 5716238 CLK_3325 CLK_3326 atpB atpE TRUE 0.851 40.000 0.009 0.007   NA
 5716238 5716239 CLK_3326 CLK_3327 atpE atpF TRUE 0.773 76.000 0.095 0.007   NA
 5716239 5716240 CLK_3327 CLK_3328 atpF atpH TRUE 0.996 3.000 0.040 0.007 Y NA
 5716240 5716241 CLK_3328 CLK_3329 atpH atpA TRUE 0.998 11.000 0.864 0.007 Y NA
 5716241 5716242 CLK_3329 CLK_3330 atpA atpG TRUE 0.997 22.000 0.846 0.007 Y NA
 5716242 5716243 CLK_3330 CLK_3331 atpG atpD TRUE 0.998 14.000 0.724 0.007 Y NA
 5716243 5716244 CLK_3331 CLK_3332 atpD atpC TRUE 0.997 25.000 0.837 0.007 Y NA
 5716244 5716245 CLK_3332 CLK_3333 atpC   FALSE 0.245 195.000 0.007 NA   NA
 5716245 5716246 CLK_3333 CLK_3334   murA TRUE 0.977 24.000 0.346 NA   NA
 5716246 5716247 CLK_3334 CLK_3335 murA spoIID FALSE 0.256 246.000 0.243 1.000 N NA
 5716247 5716248 CLK_3335 CLK_3336 spoIID   FALSE 0.028 405.000 0.090 1.000 N NA
 5716248 5716249 CLK_3336 CLK_3337   spoIIID TRUE 0.720 108.000 0.093 1.000   NA
 5716249 5716250 CLK_3337 CLK_3338 spoIIID   TRUE 0.801 100.000 0.284 1.000   NA
 5716251 5716252 CLK_3339 CLK_3340     TRUE 0.752 49.000 0.010 NA   NA
 5716253 5716254 CLK_3852 CLK_3853     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5716254 5716255 CLK_3853 CLK_3854     TRUE 0.898 12.000 0.000 NA   NA
 5716255 5716256 CLK_3854 CLK_3855     TRUE 0.873 17.000 0.000 NA   NA
 5716256 5716257 CLK_3855 CLK_3856     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5716257 5716258 CLK_3856 CLK_3345     FALSE 0.325 101.000 0.000 NA   NA
 5716258 5716259 CLK_3345 CLK_3346   metK FALSE 0.335 84.000 0.000 NA   NA
 5716259 5716260 CLK_3346 CLK_3347 metK   FALSE 0.376 191.000 0.052 1.000 N NA
 5716260 5716261 CLK_3347 CLK_3348     TRUE 0.942 26.000 0.051 NA   NA
 5716261 5716262 CLK_3348 CLK_3349     TRUE 0.990 -27.000 0.130 NA   NA
 5716262 5716263 CLK_3349 CLK_3350   yfiA FALSE 0.024 425.000 0.080 NA   NA
 5716263 5716264 CLK_3350 CLK_3351 yfiA secA FALSE 0.184 228.000 0.050 NA N NA
 5716264 5716265 CLK_3351 CLK_3352 secA prfB FALSE 0.033 364.000 0.048 1.000 N NA
 5716267 5716268 CLK_3354 CLK_3355     FALSE 0.024 285.000 0.000 NA   NA
 5716268 5716269 CLK_3355 CLK_3356     FALSE 0.024 362.000 0.016 NA   NA
 5716269 5716270 CLK_3356 CLK_3357     TRUE 0.984 21.000 0.500 NA   NA
 5716270 5716271 CLK_3357 CLK_3358     TRUE 0.974 14.000 0.077 1.000   NA
 5716271 5716272 CLK_3358 CLK_3359     TRUE 0.601 84.000 0.022 1.000   NA
 5716272 5716273 CLK_3359 CLK_3360     TRUE 0.907 40.000 0.109 1.000   NA
 5716275 5716276 CLK_3362 CLK_3363     FALSE 0.281 151.000 0.000 NA   NA
 5716277 5716278 CLK_3364 CLK_3365 leuS   FALSE 0.006 401.000 0.000 NA N NA
 5716278 5716279 CLK_3365 CLK_3860     FALSE 0.219 166.000 0.000 NA   NA
 5716279 5716280 CLK_3860 CLK_3367     FALSE 0.522 53.000 0.000 NA   NA
 5716280 5716281 CLK_3367 CLK_3368     TRUE 0.816 25.000 0.000 NA   NA
 5716281 5716282 CLK_3368 CLK_3369     TRUE 0.942 -13.000 0.000 NA   NA
 5716282 5716283 CLK_3369 CLK_3370     TRUE 0.982 4.000 0.098 NA   NA
 5716285 5716286 CLK_3372 CLK_3373 fba   FALSE 0.061 226.000 0.000 NA   NA
 5716286 5716287 CLK_3373 CLK_3374     TRUE 0.714 117.000 0.082 NA   NA
 5716288 5716289 CLK_3375 CLK_3376     FALSE 0.003 665.000 0.000 NA   NA
 5716291 5716292 CLK_3378 CLK_3379     TRUE 0.718 106.000 0.094 1.000   NA
 5716292 5716293 CLK_3379 CLK_3380     TRUE 0.821 74.000 0.281 NA   NA
 5716295 5716296 CLK_3382 CLK_3383   sleB FALSE 0.228 225.000 0.041 0.068   NA
 5716296 5716297 CLK_3383 CLK_3384 sleB cysK FALSE 0.010 364.000 0.000 1.000   NA
 5716297 5716298 CLK_3384 CLK_3385 cysK cysE TRUE 0.995 15.000 0.101 0.002 Y NA
 5716298 5716299 CLK_3385 CLK_3386 cysE   TRUE 0.955 22.000 0.064 1.000 N NA
 5716299 5716300 CLK_3386 CLK_3387     TRUE 0.629 148.000 0.064 1.000 N NA
 5716300 5716301 CLK_3387 CLK_3388   nth FALSE 0.519 93.000 0.011 1.000 N NA
 5716301 5716302 CLK_3388 CLK_3389 nth   FALSE 0.007 384.000 0.000 1.000 N NA
 5716303 5716304 CLK_3390 CLK_3391     FALSE 0.292 148.000 0.000 NA   NA
 5716306 5716307 CLK_3393 CLK_3394     TRUE 0.901 26.000 0.004 1.000   NA
 5716307 5716308 CLK_3394 CLK_3395     TRUE 0.583 110.000 0.018 NA   NA
 5716309 5716310 CLK_3396 CLK_3397     FALSE 0.472 206.000 0.000 NA Y NA
 5716310 5716311 CLK_3397 CLK_3398   splB TRUE 0.558 147.000 0.027 1.000 N NA
 5716311 5716312 CLK_3398 CLK_3399 splB   FALSE 0.035 309.000 0.008 1.000 N NA
 5716312 5716313 CLK_3399 CLK_3400     TRUE 0.956 13.000 0.016 NA   NA
 5716313 5716314 CLK_3400 CLK_3401     FALSE 0.021 294.000 0.000 NA   NA
 5716314 5716315 CLK_3401 CLK_3402     FALSE 0.495 183.000 0.097 1.000   NA
 5716315 5716316 CLK_3402 CLK_3403     TRUE 0.992 2.000 0.438 1.000   NA
 5716316 5716317 CLK_3403 CLK_3404     TRUE 0.996 -7.000 0.720 0.038   NA
 5716317 5716318 CLK_3404 CLK_3405     TRUE 0.555 112.000 0.007 1.000   NA
 5716318 5716319 CLK_3405 CLK_3406   rpoN FALSE 0.064 330.000 0.125 1.000 N NA
 5716319 5716320 CLK_3406 CLK_3407 rpoN cggR FALSE 0.274 288.000 0.034 1.000 Y NA
 5716320 5716321 CLK_3407 CLK_3408 cggR gap TRUE 0.826 78.000 0.348 1.000 N NA
 5716321 5716322 CLK_3408 CLK_3409 gap pgk FALSE 0.311 297.000 0.063 0.004 Y NA
 5716322 5716323 CLK_3409 CLK_3410 pgk tpiA TRUE 0.947 62.000 0.141 1.000 Y NA
 5716323 5716324 CLK_3410 CLK_3411 tpiA gpmI TRUE 0.922 87.000 0.138 1.000 Y NA
 5716324 5716325 CLK_3411 CLK_3412 gpmI eno TRUE 0.931 56.000 0.016 1.000 Y NA
 5716325 5716326 CLK_3412 CLK_3413 eno secG FALSE 0.126 224.000 0.006 1.000 N NA
 5716326 5716327 CLK_3413 CLK_3414 secG rnr FALSE 0.288 210.000 0.064 1.000 N NA
 5716327 5716328 CLK_3414 CLK_3415 rnr surE FALSE 0.007 401.000 0.000 1.000   NA
 5716328 5716329 CLK_3415 CLK_3416 surE smpB FALSE 0.044 257.000 0.000 1.000   NA
 5716331 5716332 CLK_3418 CLK_3419     FALSE 0.003 728.000 0.000 NA   NA
 5716336 5716337 CLK_3423 CLK_3424     FALSE 0.160 187.000 0.000 1.000   NA
 5716337 5716338 CLK_3424 CLK_3425     FALSE 0.010 360.000 0.000 1.000   NA
 5716338 5716339 CLK_3425 CLK_3426     FALSE 0.004 490.000 0.000 NA   NA
 5716339 5716340 CLK_3426 CLK_3427     FALSE 0.003 665.000 0.000 NA   NA
 5716340 5716341 CLK_3427 CLK_3428   lysP FALSE 0.004 547.000 0.000 NA   NA
 5716341 5716342 CLK_3428 CLK_3429 lysP   FALSE 0.004 542.000 0.000 1.000   NA
 5716342 5716343 CLK_3429 CLK_3430     FALSE 0.336 140.000 0.000 1.000   NA
 5716343 5716344 CLK_3430 CLK_3431     TRUE 0.681 39.000 0.000 1.000   NA
 5716344 5716345 CLK_3431 CLK_3432     TRUE 0.942 28.000 0.033 0.017   NA
 5716345 5716346 CLK_3432 CLK_3433     FALSE 0.153 189.000 0.000 1.000   NA
 5716346 5716347 CLK_3433 CLK_3434     FALSE 0.046 263.000 0.000 0.069 N NA
 5716347 5716348 CLK_3434 CLK_3435     TRUE 0.913 50.000 0.000 1.000 Y NA
 5716348 5716349 CLK_3435 CLK_3436     FALSE 0.311 100.000 0.000 1.000 N NA
 5716349 5716350 CLK_3436 CLK_3437     TRUE 0.986 3.000 0.182 NA   NA
 5716350 5716351 CLK_3437 CLK_3438     TRUE 0.992 8.000 0.667 NA   NA
 5716353 5716354 CLK_3440 CLK_3441     TRUE 0.999 0.000 0.800 0.038 Y NA
 5716354 5716355 CLK_3441 CLK_3442     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.050 Y NA
 5716355 5716356 CLK_3442 CLK_3443     FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 5716356 5716357 CLK_3443 CLK_3444     TRUE 0.983 11.000 0.167 NA   NA
 5716357 5716358 CLK_3444 CLK_3445     TRUE 0.994 22.000 0.318 1.000 Y NA
 5716358 5716359 CLK_3445 CLK_3446     TRUE 0.954 25.000 0.091 1.000 N NA
 5716359 5716360 CLK_3446 CLK_3447     TRUE 0.938 137.000 0.278 1.000 Y NA
 5716361 5716362 CLK_3448 CLK_3449     FALSE 0.308 92.000 0.000 1.000 N NA
 5716363 5716364 CLK_3450 CLK_3451     TRUE 0.855 74.000 0.455 1.000 N NA
 5716364 5716365 CLK_3451 CLK_3452     TRUE 0.999 -22.000 0.455 1.000 Y NA
 5716367 5716368 CLK_3454 CLK_3455 glvA   TRUE 0.897 168.000 0.294 1.000 Y NA
 5716369 5716370 CLK_3456 CLK_3457     TRUE 0.997 16.000 0.500 0.004 Y NA
 5716371 5716372 CLK_3458 CLK_3459     TRUE 0.901 8.000 0.000 1.000 N NA
 5716372 5716373 CLK_3459 CLK_3460     TRUE 0.996 10.000 0.235 1.000 Y NA
 5716373 5716374 CLK_3460 CLK_3461     TRUE 0.827 120.000 0.353 1.000 N NA
 5716374 5716375 CLK_3461 CLK_3462     TRUE 0.985 14.000 0.286 NA   NA
 5716375 5716376 CLK_3462 CLK_3463   alr FALSE 0.048 240.000 0.000 NA   NA
 5716376 5716377 CLK_3463 CLK_3464 alr   FALSE 0.004 519.000 0.000 1.000 N NA
 5716377 5716378 CLK_3464 CLK_3465   glvA FALSE 0.115 316.000 0.000 1.000 Y NA
 5716378 5716379 CLK_3465 CLK_3466 glvA   TRUE 0.617 183.000 0.000 1.000 Y NA
 5716379 5716380 CLK_3466 CLK_3467     FALSE 0.023 285.000 0.000 1.000 N NA
 5716382 5716383 CLK_3469 CLK_3470     FALSE 0.298 146.000 0.000 NA   NA
 5716383 5716384 CLK_3470 CLK_3471     FALSE 0.343 81.000 0.000 NA   NA
 5716384 5716385 CLK_3471 CLK_3472     FALSE 0.005 436.000 0.000 NA   NA
 5716385 5716386 CLK_3472 CLK_3473     TRUE 0.668 156.000 0.158 NA N NA
 5716386 5716387 CLK_3473 CLK_3474     TRUE 0.935 27.000 0.035 1.000   NA
 5716387 5716388 CLK_3474 CLK_3475     FALSE 0.008 386.000 0.000 1.000   NA
 5716388 5716389 CLK_3475 CLK_3476     TRUE 0.827 104.000 0.000 0.038 Y NA
 5716389 5716390 CLK_3476 CLK_3477     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.038 Y NA
 5716390 5716391 CLK_3477 CLK_3478     TRUE 0.923 1.000 0.000 1.000 N NA
 5716391 5716392 CLK_3478 CLK_3479     TRUE 0.919 2.000 0.000 1.000 N NA
 5716392 5716393 CLK_3479 CLK_3480     FALSE 0.004 468.000 0.000 1.000 N NA
 5716393 5716394 CLK_3480 CLK_3481     TRUE 0.833 119.000 0.385 1.000 N NA
 5716394 5716395 CLK_3481 CLK_3482   glvA TRUE 0.561 266.000 0.385 1.000 Y NA
 5716395 5716396 CLK_3482 CLK_3483 glvA   TRUE 0.997 13.000 0.375 1.000 Y NA
 5716396 5716397 CLK_3483 CLK_3484   ilvD TRUE 0.938 138.000 0.286 1.000 Y NA
 5716397 5716398 CLK_3484 CLK_3485 ilvD eda TRUE 0.964 52.000 0.091 0.067 Y NA
 5716398 5716399 CLK_3485 CLK_3486 eda   TRUE 0.996 2.000 0.091 1.000 Y NA
 5716401 5716402 CLK_3488 CLK_3489 ade   FALSE 0.006 403.000 0.000 1.000 N NA
 5716402 5716403 CLK_3489 CLK_3490     TRUE 0.999 0.000 0.889 1.000 Y NA
 5716403 5716404 CLK_3490 CLK_3491     FALSE 0.006 397.000 0.000 NA N NA
 5716404 5716405 CLK_3491 CLK_3492     TRUE 0.944 -16.000 0.000 NA   NA
 5716405 5716406 CLK_3492 CLK_3493     TRUE 0.889 118.000 0.750 NA   NA
 5716406 5716407 CLK_3493 CLK_3494     FALSE 0.012 341.000 0.000 NA   NA
 5716407 5716408 CLK_3494 CLK_3495     FALSE 0.034 263.000 0.000 1.000 N NA
 5716408 5716409 CLK_3495 CLK_3496     TRUE 0.997 3.000 0.167 1.000 Y NA
 5716409 5716410 CLK_3496 CLK_3497     TRUE 0.998 2.000 0.750 1.000 Y NA
 5716410 5716411 CLK_3497 CLK_3498     TRUE 0.705 35.000 0.000 1.000 N NA
 5716413 5716414 CLK_3500 CLK_3501     FALSE 0.515 202.000 0.000 1.000 Y NA
 5716414 5716415 CLK_3501 CLK_3502     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.037 Y NA
 5716415 5716416 CLK_3502 CLK_3503     TRUE 0.958 34.000 0.000 1.000 Y NA
 5716416 5716417 CLK_3503 CLK_3504     TRUE 0.988 -3.000 0.150 1.000 N NA
 5716417 5716418 CLK_3504 CLK_3505     FALSE 0.005 502.000 0.000 0.050 N NA
 5716418 5716419 CLK_3505 CLK_3506   xpt TRUE 0.987 23.000 0.032 1.000 Y NA
 5716419 5716420 CLK_3506 CLK_3507 xpt   FALSE 0.003 587.000 0.000 1.000 N NA
 5716420 5716421 CLK_3507 CLK_3508     TRUE 0.998 13.000 1.000 1.000 Y NA
 5716421 5716422 CLK_3508 CLK_3509     FALSE 0.074 342.000 0.222 1.000 N NA
 5716422 5716423 CLK_3509 CLK_3510     TRUE 0.996 14.000 0.333 1.000 Y NA
 5716423 5716424 CLK_3510 CLK_3511     TRUE 0.995 0.000 0.750 NA   NA
 5716424 5716425 CLK_3511 CLK_3512     FALSE 0.006 418.000 0.000 NA   NA
 5716425 5716426 CLK_3512 CLK_3513     TRUE 0.995 3.000 0.869 NA   NA
 5716426 5716427 CLK_3513 CLK_3514     FALSE 0.020 296.000 0.000 NA   NA
 5716427 5716428 CLK_3514 CLK_3515     FALSE 0.008 369.000 0.000 NA   NA
 5716428 5716429 CLK_3515 CLK_3516     FALSE 0.513 135.000 0.006 NA   NA
 5716429 5716430 CLK_3516 CLK_3517     FALSE 0.014 323.000 0.000 NA   NA
 5716430 5716431 CLK_3517 CLK_3518     TRUE 0.793 178.000 1.000 NA   NA
 5716431 5716432 CLK_3518 CLK_3519     TRUE 0.995 -7.000 0.556 NA   NA
 5716432 5716433 CLK_3519 CLK_3520     TRUE 0.995 -16.000 0.556 NA   NA
 5716433 5716434 CLK_3520 CLK_3521     TRUE 0.788 72.000 0.179 NA   NA
 5716434 5716435 CLK_3521 CLK_3522     FALSE 0.053 231.000 0.000 1.000 N NA
 5716435 5716436 CLK_3522 CLK_3523     FALSE 0.007 398.000 0.000 NA   NA
 5716436 5716437 CLK_3523 CLK_3524     TRUE 0.982 27.000 0.667 NA   NA
 5716437 5716438 CLK_3524 CLK_3525     FALSE 0.040 256.000 0.000 NA   NA
 5716438 5716439 CLK_3525 CLK_3526     TRUE 0.997 -13.000 1.000 NA   NA
 5716439 5716440 CLK_3526 CLK_3527     TRUE 0.892 95.000 1.000 NA   NA
 5716440 5716441 CLK_3527 CLK_3528     TRUE 0.900 83.000 1.000 NA   NA
 5716441 5716442 CLK_3528 CLK_3529     FALSE 0.046 233.000 0.000 NA N NA
 5716444 5716445 CLK_3531 CLK_3532     TRUE 0.964 113.000 0.667 1.000 Y NA
 5716445 5716446 CLK_3532 CLK_3533   adhE FALSE 0.005 428.000 0.000 1.000 N NA
 5716446 5716447 CLK_3533 CLK_3534 adhE   FALSE 0.015 319.000 0.000 NA   NA
 5716447 5716448 CLK_3534 CLK_3535     TRUE 0.662 63.000 0.019 NA   NA
 5716449 5716450 CLK_3536 CLK_3537     FALSE 0.011 343.000 0.000 NA   NA
 5716451 5716452 CLK_3538 CLK_3539     FALSE 0.008 396.000 0.000 1.000   NA
 5716452 5716453 CLK_3539 CLK_3540     TRUE 0.634 108.000 0.038 1.000 N NA
 5716453 5716454 CLK_3540 CLK_3541     TRUE 0.994 10.000 0.038 1.000 Y NA
 5716454 5716455 CLK_3541 CLK_3542     TRUE 0.775 63.000 0.091 NA   NA
 5716455 5716456 CLK_3542 CLK_3543     TRUE 0.877 44.000 0.087 NA   NA
 5716456 5716457 CLK_3543 CLK_3544     TRUE 0.952 26.000 0.087 NA   NA
 5716458 5716459 CLK_3545 CLK_3546     FALSE 0.023 288.000 0.000 NA   NA
 5716460 5716461 CLK_3547 CLK_3548     FALSE 0.141 194.000 0.000 1.000   NA
 5716461 5716462 CLK_3548 CLK_3549     FALSE 0.017 312.000 0.000 1.000   NA
 5716464 5716465 CLK_3551 CLK_3552     TRUE 0.548 132.000 0.013 NA   NA
 5716465 5716466 CLK_3552 CLK_3553     TRUE 0.990 -54.000 0.105 1.000   NA
 5716466 5716467 CLK_3553 CLK_3554     TRUE 0.998 -10.000 0.429 1.000 Y NA
 5716467 5716468 CLK_3554 CLK_3555     FALSE 0.325 108.000 0.000 1.000 N NA
 5716468 5716469 CLK_3555 CLK_3556     FALSE 0.002 1230.000 0.000 1.000 N NA
 5716469 5716470 CLK_3556 CLK_3557     TRUE 0.995 23.000 0.431 0.050 Y NA
 5716470 5716471 CLK_3557 CLK_3558     TRUE 0.999 0.000 0.678 0.050 Y NA
 5716471 5716472 CLK_3558 CLK_3559     TRUE 0.995 11.000 0.091 0.050 Y NA
 5716472 5716473 CLK_3559 CLK_3560     TRUE 0.972 54.000 0.237 0.050 Y NA
 5716473 5716474 CLK_3560 CLK_3561     TRUE 0.996 14.000 0.221 0.050 Y NA
 5716474 5716475 CLK_3561 CLK_3562     FALSE 0.010 354.000 0.000 NA   NA
 5716476 5716477 CLK_3563 CLK_3564     TRUE 0.964 18.000 0.059 NA   NA
 5716477 5716478 CLK_3564 CLK_3565     TRUE 0.797 113.000 0.231 NA   NA
 5716479 5716480 CLK_3566 CLK_3567     FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 5716480 5716481 CLK_3567 CLK_3568     TRUE 0.870 87.000 0.667 NA   NA
 5716481 5716482 CLK_3568 CLK_3569     FALSE 0.016 312.000 0.000 NA   NA
 5716486 5716487 CLK_3573 CLK_3574     FALSE 0.007 396.000 0.000 NA   NA
 5716487 5716488 CLK_3574 CLK_3575     TRUE 0.600 204.000 0.014 NA Y NA
 5716488 5716489 CLK_3575 CLK_3576     TRUE 0.979 36.000 0.040 0.002 Y NA
 5716489 5716490 CLK_3576 CLK_3577     TRUE 0.998 2.000 0.270 0.002 Y NA
 5716490 5716491 CLK_3577 CLK_3578     TRUE 0.820 121.000 0.294 1.000   NA
 5716491 5716492 CLK_3578 CLK_3579     FALSE 0.005 486.000 0.000 1.000   NA
 5716494 5716495 CLK_3581 CLK_3582     TRUE 0.815 78.000 0.286 NA   NA
 5716495 5716496 CLK_3582 CLK_3583     TRUE 0.791 87.000 0.250 NA   NA
 5716496 5716497 CLK_3583 CLK_3584     FALSE 0.042 253.000 0.000 NA   NA
 5716497 5716498 CLK_3584 CLK_3586     TRUE 0.700 64.000 0.034 NA   NA
 5716500 5716501 CLK_3587 CLK_3588     TRUE 0.693 137.000 0.079 1.000   NA
 5716505 5716506 CLK_3592 CLK_3593   rnhA TRUE 0.972 -25.000 0.003 NA   NA
 5716506 5716507 CLK_3593 CLK_3594 rnhA   TRUE 0.591 63.000 0.003 NA   NA
 5716507 5716508 CLK_3594 CLK_3595     FALSE 0.167 181.000 0.000 NA   NA
 5716508 5716509 CLK_3595 CLK_3596     TRUE 0.974 32.000 0.429 0.029   NA
 5716509 5716510 CLK_3596 CLK_3597     FALSE 0.010 351.000 0.000 NA   NA
 5716510 5716511 CLK_3597 CLK_3598     TRUE 0.882 15.000 0.000 NA   NA
 5716511 5716512 CLK_3598 CLK_3599     FALSE 0.031 271.000 0.000 NA   NA
 5716512 5716513 CLK_3599 CLK_3600   clpB FALSE 0.005 456.000 0.000 NA   NA
 5716514 5716515 CLK_3601 CLK_3602     TRUE 0.933 58.000 0.796 1.000   NA
 5716516 5716517 CLK_3603 CLK_3604 manA   FALSE 0.011 348.000 0.000 NA   NA
 5716517 5716518 CLK_3604 CLK_3605     TRUE 0.853 108.000 0.500 NA   NA
 5716518 5716519 CLK_3605 CLK_3867   rrsG FALSE 0.006 410.000 0.000 NA   NA
 5716519 5716520 CLK_3867 CLK_3868 rrsG   FALSE 0.307 143.000 0.000 NA   NA
 5716520 5716521 CLK_3868 CLK_3869     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5716521 5716522 CLK_3869 CLK_3870   rrlG FALSE 0.361 74.000 0.000 NA   NA
 5716522 5716523 CLK_3870 CLK_3871 rrlG rrfG FALSE 0.330 132.000 0.000 NA   NA
 5716523 5716524 CLK_3871 CLK_3872 rrfG   TRUE 0.906 8.000 0.000 NA   NA
 5716526 5716527 CLK_3618 CLK_3619     FALSE 0.003 746.000 0.000 1.000 N NA
 5716527 5716528 CLK_3619 CLK_3620     TRUE 0.611 143.000 0.027 0.066 N NA
 5716528 5716529 CLK_3620 CLK_3621     FALSE 0.516 238.000 0.054 0.066 Y NA
 5716529 5716530 CLK_3621 CLK_3622     FALSE 0.082 350.000 0.000 1.000 Y NA
 5716530 5716531 CLK_3622 CLK_3623     FALSE 0.003 519.000 0.000 NA N NA
 5716532 5716533 CLK_3624 CLK_3625   panD FALSE 0.500 88.000 0.004 NA   NA
 5716533 5716534 CLK_3625 CLK_3626 panD panC TRUE 0.782 208.000 0.342 1.000 Y NA
 5716534 5716535 CLK_3626 CLK_3627 panC panB TRUE 0.842 203.000 0.395 0.001 Y NA
 5716538 5716539 CLK_3630 CLK_3631     TRUE 0.994 3.000 0.667 NA   NA
 5716539 5716540 CLK_3631 CLK_3632     FALSE 0.016 313.000 0.000 NA   NA
 5716541 5716542 CLK_3633 CLK_3634     FALSE 0.003 625.000 0.000 NA N NA
 5716543 5716544 CLK_3635 CLK_3636 hypB   FALSE 0.009 359.000 0.000 NA   NA
 5716544 5716545 CLK_3636 CLK_3637     FALSE 0.373 71.000 0.000 NA   NA
 5716545 5716546 CLK_3637 CLK_3638   addA FALSE 0.005 437.000 0.000 NA   NA
 5716546 5716547 CLK_3638 CLK_3639 addA   FALSE 0.511 140.000 0.010 1.000 N NA
 5716547 5716548 CLK_3639 CLK_3640   pepT TRUE 0.681 77.000 0.056 1.000 N NA
 5716550 5716551 CLK_3642 CLK_3643     FALSE 0.345 121.000 0.000 NA   NA
 5716551 5716552 CLK_3643 CLK_3644     TRUE 0.837 122.000 0.400 NA   NA
 5716552 5716553 CLK_3644 CLK_3645     FALSE 0.145 188.000 0.000 NA   NA
 5716553 5716554 CLK_3645 CLK_3646     TRUE 0.861 19.000 0.000 NA   NA
 5716554 5716555 CLK_3646 CLK_3647     FALSE 0.288 138.000 0.000 NA N NA
 5716556 5716557 CLK_3648 CLK_3649     TRUE 0.997 13.000 0.461 0.049 Y NA
 5716559 5716560 CLK_3651 CLK_3652   thiE FALSE 0.030 265.000 0.000 NA N NA
 5716560 5716561 CLK_3652 CLK_3653 thiE thiM TRUE 0.998 -9.000 0.190 0.004 Y NA
 5716561 5716562 CLK_3653 CLK_3654 thiM thiD TRUE 0.539 231.000 0.039 0.004 Y NA
 5716563 5716564 CLK_3655 CLK_3656   ddlB FALSE 0.347 112.000 0.000 NA   NA
 5716564 5716565 CLK_3656 CLK_3657 ddlB   FALSE 0.411 156.000 0.004 1.000 N NA
 5716565 5716566 CLK_3657 CLK_3658     TRUE 0.996 4.000 0.182 1.000 Y NA
 5716566 5716567 CLK_3658 CLK_3659     TRUE 0.998 1.000 0.241 0.037 Y NA
 5716567 5716568 CLK_3659 CLK_3660     TRUE 0.996 12.000 0.167 1.000 Y NA
 5716568 5716569 CLK_3660 CLK_3661     TRUE 0.996 2.000 0.048 0.035 Y NA
 5716569 5716570 CLK_3661 CLK_3662     TRUE 0.963 29.000 0.222 NA   NA
 5716570 5716571 CLK_3662 CLK_3663     FALSE 0.006 418.000 0.000 NA   NA
 5716571 5716572 CLK_3663 CLK_3664     TRUE 0.994 -6.000 0.500 NA   NA
 5716572 5716573 CLK_3664 CLK_3665     FALSE 0.307 143.000 0.000 NA   NA
 5716573 5716574 CLK_3665 CLK_3666     TRUE 0.628 61.000 0.007 NA   NA
 5716574 5716575 CLK_3666 CLK_3667     FALSE 0.435 61.000 0.000 NA   NA
 5716575 5716576 CLK_3667 CLK_3668     FALSE 0.004 519.000 0.000 NA   NA
 5716576 5716577 CLK_3668 CLK_3669     FALSE 0.064 276.000 0.010 NA   NA
 5716577 5716578 CLK_3669 CLK_3670     FALSE 0.532 134.000 0.010 NA   NA
 5716578 5716579 CLK_3670 CLK_3671     FALSE 0.466 176.000 0.050 NA   NA
 5716579 5716580 CLK_3671 CLK_3672     TRUE 0.973 2.000 0.025 NA   NA
 5716581 5716582 CLK_3673 CLK_3674     TRUE 0.845 21.000 0.000 NA   NA
 5716583 5716584 CLK_3675 CLK_3676   sbcC TRUE 0.996 -25.000 0.669 NA N NA
 5716584 5716585 CLK_3676 CLK_3677 sbcC   TRUE 0.841 35.000 0.005 NA   NA
 5716585 5716586 CLK_3677 CLK_3678     TRUE 0.944 -16.000 0.000 NA   NA
 5716586 5716587 CLK_3678 CLK_3679     FALSE 0.002 1119.000 0.000 NA   NA
 5716587 5716588 CLK_3679 CLK_3680     FALSE 0.288 149.000 0.000 NA   NA
 5716588 5716589 CLK_3680 CLK_3681     FALSE 0.018 302.000 0.000 NA   NA
 5716589 5716590 CLK_3681 CLK_3682     FALSE 0.099 206.000 0.000 NA   NA
 5716590 5716591 CLK_3682 CLK_3683     TRUE 0.936 0.000 0.000 1.000   NA
 5716591 5716592 CLK_3683 CLK_3684     FALSE 0.003 787.000 0.000 NA   NA
 5716592 5716593 CLK_3684 CLK_3685     FALSE 0.005 466.000 0.000 NA   NA
 5716593 5716594 CLK_3685 CLK_3686   cadA TRUE 0.678 76.000 0.053 1.000 N NA
 5716594 5716595 CLK_3686 CLK_3875 cadA   FALSE 0.006 411.000 0.000 NA   NA
 5716595 5716596 CLK_3875 CLK_3688     TRUE 0.799 27.000 0.000 NA   NA
 5716596 5716597 CLK_3688 CLK_3689     FALSE 0.004 516.000 0.000 NA   NA
 5716598 5716599 CLK_3690 CLK_3691     FALSE 0.022 290.000 0.000 NA   NA
 5716599 5716600 CLK_3691 CLK_3692     TRUE 0.987 3.000 0.192 NA   NA
 5716600 5716601 CLK_3692 CLK_3693     TRUE 0.554 50.000 0.000 NA   NA
 5716602 5716603 CLK_3694 CLK_3695     FALSE 0.006 386.000 0.000 NA N NA
 5716603 5716604 CLK_3695 CLK_3696     TRUE 0.992 10.000 0.667 NA   NA
 5716604 5716605 CLK_3696 CLK_3697     FALSE 0.014 321.000 0.000 NA   NA
 5716605 5716606 CLK_3697 CLK_3698   sagB TRUE 0.673 165.000 0.222 NA   NA
 5716606 5716607 CLK_3698 CLK_3699 sagB sagC TRUE 0.987 4.000 0.222 NA   NA
 5716607 5716608 CLK_3699 CLK_3700 sagC sagD TRUE 0.984 16.000 0.318 NA   NA
 5716608 5716609 CLK_3700 CLK_3701 sagD   TRUE 0.988 -25.000 0.091 NA   NA
 5716609 5716610 CLK_3701 CLK_3702     TRUE 0.994 8.000 1.000 NA   NA
 5716610 5716611 CLK_3702 CLK_3703   sagG FALSE 0.022 293.000 0.000 NA   NA
 5716611 5716612 CLK_3703 CLK_3704 sagG sagH TRUE 0.990 12.000 0.500 NA N NA
 5716612 5716613 CLK_3704 CLK_3705 sagH sagI TRUE 0.986 2.000 0.160 NA N NA
 5716613 5716614 CLK_3705 CLK_3706 sagI   FALSE 0.009 375.000 0.000 1.000   NA
 5716615 5716616 CLK_3707 CLK_3708     TRUE 0.846 118.000 0.409 NA   NA
 5716616 5716617 CLK_3708 CLK_3709     TRUE 0.708 127.000 0.091 NA   NA
 5716618 5716619 CLK_3710 CLK_3711 trmB   FALSE 0.084 213.000 0.000 NA   NA
 5716621 5716622 CLK_3713 CLK_3714 fabG   TRUE 0.695 63.000 0.032 1.000 N NA
 5716624 5716625 CLK_3716 CLK_3717     FALSE 0.032 262.000 0.000 NA N NA
 5716625 5716626 CLK_3717 CLK_3718     FALSE 0.022 297.000 0.000 1.000   NA
 5716626 5716627 CLK_3718 CLK_3719     TRUE 0.960 36.000 0.400 1.000   NA
 5716627 5716628 CLK_3719 CLK_3720     FALSE 0.486 205.000 0.000 1.000 Y NA
 5716630 5716631 CLK_3722 CLK_3723 serS   FALSE 0.003 598.000 0.000 1.000 N NA
 5716632 5716633 CLK_3724 CLK_3725     FALSE 0.004 499.000 0.000 1.000   NA
 5716636 5716637 CLK_3728 CLK_3729     FALSE 0.125 196.000 0.000 NA   NA
 5716642 5716643 CLK_3734 CLK_3735     FALSE 0.292 148.000 0.000 NA   NA
 5716643 5716644 CLK_3735 CLK_3736     FALSE 0.002 1194.000 0.000 1.000 N NA
 5716645 5716646 CLK_3737 CLK_3738     FALSE 0.003 624.000 0.000 NA   NA
 5716646 5716647 CLK_3738 CLK_3739     FALSE 0.031 617.000 0.000 0.005 Y NA
 5716647 5716648 CLK_3739 CLK_3740     FALSE 0.012 347.000 0.000 1.000   NA
 5716648 5716649 CLK_3740 CLK_3741     TRUE 0.777 45.000 0.008 1.000   NA
 5716650 5716651 CLK_3742 CLK_3743     FALSE 0.154 294.000 0.000 1.000 Y NA
 5716651 5716652 CLK_3743 CLK_3744     TRUE 0.998 0.000 0.455 0.001 Y NA
 5716653 5716654 CLK_3745 CLK_3746     FALSE 0.005 432.000 0.000 NA   NA
 5716656 5716657 CLK_3748 CLK_3749     TRUE 0.997 3.000 0.313 NA Y NA
 5716657 5716658 CLK_3749 CLK_3750     TRUE 0.742 33.000 0.000 NA   NA
 5716658 5716659 CLK_3750 CLK_3751     FALSE 0.141 189.000 0.000 NA   NA
 5716659 5716660 CLK_3751 CLK_3752   pepP FALSE 0.072 220.000 0.000 NA   NA
 5716661 5716662 CLK_3753 CLK_3754     FALSE 0.380 69.000 0.000 NA   NA
 5716662 5716663 CLK_3754 CLK_3755     FALSE 0.502 67.000 0.000 0.016   NA
 5716664 5716665 CLK_3756 CLK_3757     FALSE 0.003 622.000 0.000 NA   NA
 5716665 5716666 CLK_3757 CLK_3758     FALSE 0.010 355.000 0.000 NA   NA
 5716666 5716667 CLK_3758 CLK_3759     FALSE 0.005 428.000 0.000 NA   NA
 5716667 5716668 CLK_3759 CLK_3760     TRUE 0.983 12.000 0.184 NA   NA
 5716668 5716669 CLK_3760 CLK_3761     FALSE 0.004 540.000 0.000 NA   NA
 5716669 5716670 CLK_3761 CLK_3762     FALSE 0.003 917.000 0.000 NA   NA
 5716672 5716673 CLK_3764 CLK_3765 mscL   FALSE 0.009 366.000 0.000 NA   NA
 5716675 5716676 CLK_3767 CLK_3768     FALSE 0.003 582.000 0.000 NA   NA
 5716676 5716677 CLK_3768 CLK_3769     TRUE 0.989 -7.000 0.165 1.000 N NA
 5716677 5716678 CLK_3769 CLK_3770     TRUE 0.979 0.000 0.035 NA   NA
 5716678 5716679 CLK_3770 CLK_3771   potA FALSE 0.002 1249.000 0.000 NA   NA
 5716679 5716680 CLK_3771 CLK_3772 potA potB TRUE 0.999 0.000 0.789 1.000 Y NA
 5716680 5716681 CLK_3772 CLK_3773 potB   TRUE 0.995 3.000 0.022 0.036 Y NA
 5716683 5716684 CLK_3775 CLK_3776     FALSE 0.176 179.000 0.000 NA   NA
 5716684 5716685 CLK_3776 CLK_3777     FALSE 0.005 426.000 0.000 NA   NA
 5716685 5716686 CLK_3777 CLK_3778     FALSE 0.256 157.000 0.000 NA   NA
 5716688 5716689 CLK_3780 CLK_3781     FALSE 0.070 221.000 0.000 NA   NA
 5716689 5716690 CLK_3781 CLK_3782     TRUE 0.991 -10.000 0.208 NA   NA
 5716690 5716691 CLK_3782 CLK_3783   lepB TRUE 0.848 68.000 0.333 NA   NA
 5716691 5716692 CLK_3783 CLK_3784 lepB   FALSE 0.002 810.000 0.000 1.000 N NA
 5716692 5716693 CLK_3784 CLK_3785     FALSE 0.003 594.000 0.000 NA   NA
 5716693 5716694 CLK_3785 CLK_3786     TRUE 0.970 40.000 1.000 NA   NA
 5716694 5716695 CLK_3786 CLK_3787     FALSE 0.003 694.000 0.000 NA   NA
 5716695 5716696 CLK_3787 CLK_3788     FALSE 0.003 788.000 0.000 NA   NA
 5716696 5716697 CLK_3788 CLK_3789     TRUE 0.986 -7.000 0.080 NA   NA
 5716697 5716698 CLK_3789 CLK_3790     TRUE 0.974 37.000 1.000 NA   NA
 5716698 5716699 CLK_3790 CLK_3791     TRUE 0.947 35.000 0.222 NA   NA
 5716699 5716700 CLK_3791 CLK_3792     TRUE 0.951 34.000 0.222 NA   NA
 5716700 5716701 CLK_3792 CLK_3793     TRUE 0.980 23.000 0.400 NA   NA
 5716701 5716702 CLK_3793 CLK_3794     TRUE 0.986 -3.000 0.095 NA   NA
 5716702 5716703 CLK_3794 CLK_3795     TRUE 0.981 15.000 0.238 NA N NA
 5716703 5716704 CLK_3795 CLK_3796     FALSE 0.004 522.000 0.000 NA   NA
 5716704 5716705 CLK_3796 CLK_3797     FALSE 0.012 338.000 0.000 NA   NA
 5716705 5716706 CLK_3797 CLK_3798     FALSE 0.007 397.000 0.000 NA   NA
 5716709 5716710 CLK_3801 CLK_3802     FALSE 0.005 448.000 0.000 1.000 N NA
 5716713 5716714 CLK_3805 CLK_3806     FALSE 0.025 620.000 0.000 NA Y NA
 5716714 5716715 CLK_3806 CLK_3807     TRUE 0.977 16.000 0.143 NA   NA
 5716715 5716716 CLK_3807 CLK_3808     FALSE 0.019 299.000 0.000 NA   NA
 5716716 5716717 CLK_3808 CLK_3809     FALSE 0.060 227.000 0.000 NA   NA
 5716717 5716718 CLK_3809 CLK_3810     FALSE 0.010 353.000 0.000 NA   NA
 5716718 5716719 CLK_3810 CLK_3811     TRUE 0.994 2.000 0.714 NA   NA
 5716719 5716720 CLK_3811 CLK_3812     FALSE 0.326 135.000 0.000 NA   NA
 5716720 5716721 CLK_3812 CLK_3813     FALSE 0.084 213.000 0.000 NA   NA
 5716721 5716722 CLK_3813 CLK_3814     FALSE 0.005 429.000 0.000 NA   NA
 5716722 5716723 CLK_3814 CLK_3815     TRUE 0.991 13.000 0.667 NA   NA
 5716723 5716724 CLK_3815 CLK_0001     FALSE 0.004 598.000 0.000 1.000   NA
 5716724 5716725 CLK_0001 CLK_0002     FALSE 0.182 197.000 0.000 0.011   NA
 5716725 5716726 CLK_0002 CLK_0003     FALSE 0.202 175.000 0.000 1.000   NA
 5716726 5716727 CLK_0003 CLK_0004     TRUE 0.998 5.000 0.692 1.000 Y NA
 5716727 5716728 CLK_0004 CLK_0005     TRUE 0.651 41.000 0.000 1.000   NA
 5716728 5716729 CLK_0005 CLK_0006     FALSE 0.366 73.000 0.000 NA   NA
 5716729 5716730 CLK_0006 CLK_0007     FALSE 0.351 116.000 0.000 NA   NA
 5716730 5716731 CLK_0007 CLK_0008     TRUE 0.961 21.000 0.085 1.000 N NA
 5716731 5716732 CLK_0008 CLK_0009     TRUE 0.995 29.000 0.932 1.000 Y NA
 5716733 5716734 CLK_0010 CLK_0011     FALSE 0.274 143.000 0.000 NA N NA
 5716734 5716735 CLK_0011 CLK_0012     TRUE 0.992 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5716736 5716737 CLK_0013 CLK_0014 rodA   TRUE 0.878 16.000 0.000 NA   NA
 5716739 5716740 CLK_0016 CLK_0017     TRUE 0.672 171.000 0.286 1.000 N NA
 5716740 5716741 CLK_0017 CLK_0018     FALSE 0.019 305.000 0.000 1.000   NA
 5716743 5716744 CLK_0020 CLK_0021     TRUE 0.703 103.000 0.083 1.000   NA
 5716745 5716746 CLK_0022 CLK_0023 csaA   FALSE 0.238 208.000 0.023 1.000   NA
 5716746 5716747 CLK_0023 CLK_0024     FALSE 0.028 300.000 0.000 0.028   NA
 5716748 5716749 CLK_0025 CLK_0026     FALSE 0.009 367.000 0.000 NA   NA
 5716749 5716750 CLK_0026 CLK_0027     FALSE 0.004 520.000 0.000 NA   NA
 5716752 5716753 CLK_0029 CLK_0030     FALSE 0.330 132.000 0.000 NA   NA
 5716754 5716755 CLK_0031 CLK_0032     TRUE 0.926 23.000 0.015 NA   NA
 5716757 5716758 CLK_0034 CLK_0035     FALSE 0.012 337.000 0.000 NA   NA
 5716759 5716760 CLK_0036 CLK_0037 rhlE   FALSE 0.004 576.000 0.000 1.000   NA
 5716760 5716761 CLK_0037 CLK_0038     TRUE 0.684 171.000 0.286 1.000   NA
 5716761 5716762 CLK_0038 CLK_0039     TRUE 0.966 28.000 0.250 1.000 N NA
 5716763 5716764 CLK_0040 CLK_0041     FALSE 0.012 336.000 0.000 NA   NA
 5716764 5716765 CLK_0041 CLK_0042     TRUE 0.996 -16.000 0.625 0.034   NA
 5716765 5716766 CLK_0042 CLK_0043     TRUE 0.934 79.000 0.185 1.000 Y NA
 5716766 5716767 CLK_0043 CLK_0044     TRUE 0.997 2.000 0.185 0.035 Y NA
 5716767 5716768 CLK_0044 CLK_0045     TRUE 0.999 1.000 0.625 0.035 Y NA
 5716769 5716770 CLK_0046 CLK_0047     TRUE 0.995 -3.000 0.713 1.000 N NA
 5716770 5716771 CLK_0047 CLK_0048     FALSE 0.351 116.000 0.000 NA   NA
 5716773 5716774 CLK_0050 CLK_0051     FALSE 0.351 118.000 0.000 NA   NA
 5716774 5716775 CLK_0051 CLK_0052     FALSE 0.013 331.000 0.000 NA   NA
 5716775 5716776 CLK_0052 CLK_0053     FALSE 0.333 129.000 0.000 NA   NA
 5716778 5716779 CLK_0055 CLK_0056     FALSE 0.522 208.000 0.409 1.000   NA
 5716779 5716780 CLK_0056 CLK_0057     TRUE 0.976 12.000 0.074 1.000   NA
 5716780 5716781 CLK_0057 CLK_0058     FALSE 0.003 631.000 0.000 1.000   NA
 5716781 5716782 CLK_0058 CLK_0059     TRUE 0.683 158.000 0.190 1.000 N NA
 5716782 5716783 CLK_0059 CLK_0060     FALSE 0.087 292.000 0.071 1.000 N NA
 5716783 5716784 CLK_0060 CLK_0061     TRUE 0.952 26.000 0.089 NA   NA
 5716784 5716785 CLK_0061 CLK_0062     FALSE 0.011 343.000 0.000 NA   NA
 5716785 5716786 CLK_0062 CLK_0063   gltS FALSE 0.003 771.000 0.000 1.000 N NA
 5716786 5716787 CLK_0063 CLK_0064 gltS   FALSE 0.030 272.000 0.000 NA   NA
 5716789 5716790 CLK_0066 CLK_0067     TRUE 0.962 70.000 0.500 1.000 Y NA
 5716790 5716791 CLK_0067 CLK_0068     TRUE 0.997 7.000 0.250 1.000 Y NA
 5716791 5716792 CLK_0068 CLK_0069     TRUE 0.958 21.000 0.062 NA   NA
 5716792 5716793 CLK_0069 CLK_0070     FALSE 0.008 381.000 0.000 NA   NA
 5716793 5716794 CLK_0070 CLK_0071     TRUE 0.980 7.000 0.100 NA   NA
 5716796 5716797 CLK_0073 CLK_0074     FALSE 0.012 342.000 0.000 1.000   NA
 5716797 5716798 CLK_0074 CLK_0075     TRUE 0.990 -37.000 0.118 1.000   NA
 5716798 5716799 CLK_0075 CLK_0076     TRUE 0.983 31.000 1.000 NA   NA
 5716799 5716800 CLK_0076 CLK_0077   blaI FALSE 0.003 731.000 0.000 NA   NA
 5716800 5716801 CLK_0077 CLK_0078 blaI   TRUE 0.979 40.000 0.182 NA Y NA
 5716802 5716803 CLK_0079 CLK_0080     TRUE 0.994 -3.000 0.571 NA   NA
 5716804 5716805 CLK_0081 CLK_0082     FALSE 0.435 61.000 0.000 NA   NA
 5716805 5716806 CLK_0082 CLK_0083   greA FALSE 0.431 157.000 0.008 1.000 N NA
 5716806 5716807 CLK_0083 CLK_0084 greA   FALSE 0.464 168.000 0.031 NA   NA
 5716807 5716808 CLK_0084 CLK_0085     FALSE 0.048 240.000 0.000 NA   NA
 5716808 5716809 CLK_0085 CLK_0086     FALSE 0.134 192.000 0.000 NA   NA
 5716809 5716810 CLK_0086 CLK_0087     FALSE 0.003 551.000 0.000 1.000 N NA
 5716810 5716811 CLK_0087 CLK_0088   fhuB TRUE 0.952 96.000 0.500 1.000 Y NA
 5716811 5716812 CLK_0088 CLK_0089 fhuB fhuG TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.035 Y NA
 5716812 5716813 CLK_0089 CLK_0090 fhuG   TRUE 0.829 176.000 0.100 1.000 Y NA
 5716813 5716814 CLK_0090 CLK_0091   nifH TRUE 0.994 17.000 0.150 1.000 Y NA
 5716814 5716815 CLK_0091 CLK_0092 nifH   TRUE 0.994 3.000 0.571 0.047 N NA
 5716815 5716816 CLK_0092 CLK_0093     TRUE 0.992 40.000 1.000 0.036 Y NA
 5716816 5716817 CLK_0093 CLK_0094     FALSE 0.013 324.000 0.000 1.000 N NA
 5716817 5716818 CLK_0094 CLK_0095     FALSE 0.037 262.000 0.000 NA   NA
 5716820 5716821 CLK_0097 CLK_0098 gcvT gcvH TRUE 0.843 125.000 0.000 0.001 Y NA
 5716821 5716822 CLK_0098 CLK_0099 gcvH gcvPA TRUE 0.993 3.000 0.005 1.000 Y NA
 5716822 5716823 CLK_0099 CLK_0100 gcvPA gcvPB TRUE 0.998 0.000 0.316 0.001 Y NA
 5716823 5716824 CLK_0100 CLK_0101 gcvPB lpdA FALSE 0.272 189.000 0.010 1.000 N NA
 5716824 5716825 CLK_0101 CLK_0102 lpdA   TRUE 0.973 17.000 0.118 1.000 N NA
 5716825 5716826 CLK_0102 CLK_0103     FALSE 0.004 494.000 0.000 NA   NA
 5716826 5716827 CLK_0103 CLK_0104     FALSE 0.007 393.000 0.000 NA   NA
 5716827 5716828 CLK_0104 CLK_0105     FALSE 0.008 387.000 0.000 1.000   NA
 5716828 5716829 CLK_0105 CLK_0106     TRUE 0.953 -3.000 0.000 0.064   NA
 5716829 5716830 CLK_0106 CLK_0107     TRUE 0.999 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 5716830 5716831 CLK_0107 CLK_0108     TRUE 0.904 73.000 0.875 1.000 N NA
 5716833 5716834 CLK_0110 CLK_0111     FALSE 0.003 754.000 0.000 NA   NA
 5716834 5716835 CLK_0111 CLK_0112     FALSE 0.059 232.000 0.000 1.000   NA
 5716835 5716836 CLK_0112 CLK_0113     FALSE 0.334 85.000 0.000 NA   NA
 5716836 5716837 CLK_0113 CLK_0114     FALSE 0.029 274.000 0.000 NA   NA
 5716837 5716838 CLK_0114 CLK_0115     TRUE 0.814 94.000 0.375 NA   NA
 5716838 5716839 CLK_0115 CLK_0116     FALSE 0.157 184.000 0.000 NA   NA
 5716839 5716840 CLK_0116 CLK_0117     TRUE 0.979 2.000 0.051 NA   NA
 5716842 5716843 CLK_0119 CLK_0120     TRUE 0.887 14.000 0.000 NA   NA
 5716843 5716844 CLK_0120 CLK_0121     FALSE 0.026 281.000 0.000 NA   NA
 5716844 5716845 CLK_0121 CLK_0122     TRUE 0.731 34.000 0.000 NA   NA
 5716845 5716846 CLK_0122 CLK_0123     TRUE 0.585 46.000 0.000 NA   NA
 5716846 5716847 CLK_0123 CLK_0124     FALSE 0.009 363.000 0.000 NA   NA
 5716847 5716848 CLK_0124 CLK_0125     FALSE 0.017 306.000 0.000 NA   NA
 5716848 5716849 CLK_0125 CLK_0126     TRUE 0.899 52.000 0.273 1.000 N NA
 5716849 5716850 CLK_0126 CLK_0127     TRUE 0.997 -13.000 0.094 1.000 Y NA
 5716850 5716851 CLK_0127 CLK_0128     FALSE 0.003 694.000 0.000 NA   NA
 5716851 5716852 CLK_0128 CLK_0129     FALSE 0.032 270.000 0.000 NA   NA
 5716852 5716853 CLK_0129 CLK_0130     FALSE 0.007 400.000 0.000 NA   NA
 5716853 5716854 CLK_0130 CLK_0131     FALSE 0.496 56.000 0.000 NA   NA
 5716856 5716857 CLK_0133 CLK_0134     FALSE 0.003 770.000 0.000 NA   NA
 5716857 5716858 CLK_0134 CLK_0135     FALSE 0.290 199.000 0.027 NA   NA
 5716858 5716859 CLK_0135 CLK_0136     FALSE 0.322 99.000 0.000 NA   NA
 5716859 5716860 CLK_0136 CLK_0137     FALSE 0.327 102.000 0.000 NA   NA
 5716860 5716861 CLK_0137 CLK_0138     FALSE 0.028 277.000 0.000 NA   NA
 5716861 5716862 CLK_0138 CLK_0139     FALSE 0.117 199.000 0.000 NA   NA
 5716863 5716864 CLK_0140 CLK_0141   luxS TRUE 0.974 -16.000 0.010 1.000 N NA
 5716864 5716865 CLK_0141 CLK_0142 luxS metC TRUE 0.978 2.000 0.048 1.000 N NA
 5716865 5716866 CLK_0142 CLK_0143 metC   FALSE 0.066 282.000 0.021 1.000 N NA
 5716867 5716868 CLK_0144 CLK_0145     FALSE 0.008 366.000 0.000 1.000 N NA
 5716869 5716870 CLK_0146 CLK_0147     TRUE 0.671 88.000 0.061 NA   NA
 5716870 5716871 CLK_0147 CLK_0148     FALSE 0.004 534.000 0.000 NA   NA
 5716871 5716872 CLK_0148 CLK_0149     FALSE 0.334 128.000 0.000 NA   NA
 5716872 5716873 CLK_0149 CLK_0150     FALSE 0.008 382.000 0.000 NA   NA
 5716874 5716875 CLK_0151 CLK_0152     FALSE 0.246 160.000 0.000 NA   NA
 5716875 5716876 CLK_0152 CLK_0153     TRUE 0.841 19.000 0.000 NA N NA
 5716876 5716877 CLK_0153 CLK_0154     FALSE 0.042 252.000 0.000 NA   NA
 5716877 5716878 CLK_0154 CLK_0155     FALSE 0.281 151.000 0.000 NA   NA
 5716878 5716879 CLK_0155 CLK_0156     FALSE 0.009 368.000 0.000 NA   NA
 5716879 5716880 CLK_0156 CLK_0157     TRUE 0.853 20.000 0.000 NA   NA
 5716882 5716883 CLK_0159 CLK_0160     TRUE 0.947 -45.000 0.000 NA   NA
 5716883 5716884 CLK_0160 CLK_0161     FALSE 0.006 410.000 0.000 NA   NA
 5716884 5716885 CLK_0161 CLK_0162     TRUE 0.991 0.000 0.278 1.000 N NA
 5716885 5716886 CLK_0162 CLK_0163     FALSE 0.250 158.000 0.000 NA   NA
 5716888 5716889 CLK_0165 CLK_0166 arsC   FALSE 0.010 365.000 0.000 1.000   NA
 5716889 5716890 CLK_0166 CLK_0167     FALSE 0.304 144.000 0.000 NA   NA
 5716890 5716891 CLK_0167 CLK_0169     FALSE 0.003 566.000 0.000 NA   NA
 5716891 5716892 CLK_0169 CLK_0170     FALSE 0.006 402.000 0.000 NA   NA
 5716892 5716893 CLK_0170 CLK_0171     FALSE 0.005 436.000 0.000 NA   NA
 5716893 5716894 CLK_0171 CLK_0172     TRUE 0.994 10.000 1.000 NA   NA
 5716894 5716895 CLK_0172 CLK_0173     FALSE 0.004 551.000 0.000 NA   NA
 5716895 5716896 CLK_0173 CLK_0174     TRUE 0.993 -7.000 0.400 NA   NA
 5716896 5716897 CLK_0174 CLK_0175     FALSE 0.003 637.000 0.000 NA   NA
 5716897 5716898 CLK_0175 CLK_0176   thyA TRUE 0.977 -10.000 0.017 NA   NA
 5716898 5716899 CLK_0176 CLK_0177 thyA   TRUE 0.958 12.000 0.017 1.000 N NA
 5716899 5716900 CLK_0177 CLK_0178     TRUE 0.838 46.000 0.047 1.000 N NA
 5716900 5716901 CLK_0178 CLK_0179   thiD TRUE 0.658 78.000 0.043 1.000 N NA
 5716901 5716902 CLK_0179 CLK_0180 thiD   FALSE 0.477 172.000 0.043 NA   NA
 5716904 5716905 CLK_0182 CLK_0183     TRUE 0.994 3.000 0.833 NA   NA
 5716905 5716906 CLK_0183 CLK_0184     TRUE 0.947 -36.000 0.000 NA   NA
 5716906 5716907 CLK_0184 CLK_0185     FALSE 0.003 696.000 0.000 NA   NA
 5716907 5716908 CLK_0185 CLK_0186     FALSE 0.031 271.000 0.000 NA   NA
 5716908 5716909 CLK_0186 CLK_0187     FALSE 0.483 184.000 0.100 NA   NA
 5716909 5716910 CLK_0187 CLK_0188     TRUE 0.999 -13.000 0.750 NA Y NA
 5716910 5716911 CLK_0188 CLK_0189     FALSE 0.004 512.000 0.000 NA   NA
 5716911 5716912 CLK_0189 CLK_0190     FALSE 0.316 140.000 0.000 NA   NA
 5716912 5716913 CLK_0190 CLK_0191     TRUE 0.947 154.000 0.636 1.000 Y NA
 5716913 5716914 CLK_0191 CLK_0192     FALSE 0.150 190.000 0.000 1.000   NA
 5716916 5716917 CLK_0194 CLK_0195     FALSE 0.003 673.000 0.000 NA   NA
 5716917 5716918 CLK_0195 CLK_0196   hypB FALSE 0.079 269.000 0.015 NA   NA
 5716918 5716919 CLK_0196 CLK_0197 hypB   TRUE 0.914 38.000 0.115 1.000 N NA
 5716919 5716920 CLK_0197 CLK_0198     TRUE 0.824 83.000 0.333 1.000   NA
 5716920 5716921 CLK_0198 CLK_0199     FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 5716921 5716922 CLK_0199 CLK_0200   dapB FALSE 0.002 681.000 0.000 NA N NA
 5716922 5716923 CLK_0200 CLK_0201 dapB   TRUE 0.815 22.000 0.000 NA N NA
 5716923 5716924 CLK_0201 CLK_0202     FALSE 0.004 555.000 0.000 NA   NA
 5716924 5716925 CLK_0202 CLK_0203     FALSE 0.320 97.000 0.000 NA   NA
 5716925 5716926 CLK_0203 CLK_0204     FALSE 0.005 426.000 0.000 NA   NA
 5716926 5716927 CLK_0204 CLK_0205     FALSE 0.011 343.000 0.000 NA   NA
 5716927 5716928 CLK_0205 CLK_0206     FALSE 0.023 287.000 0.000 NA   NA
 5716928 5716929 CLK_0206 CLK_0207     FALSE 0.446 60.000 0.000 NA   NA
 5716929 5716930 CLK_0207 CLK_0208     FALSE 0.347 112.000 0.000 NA   NA
 5716930 5716931 CLK_0208 CLK_0209     FALSE 0.126 193.000 0.000 1.000 N NA
 5716931 5716932 CLK_0209 CLK_0210     FALSE 0.003 617.000 0.000 NA   NA
 5716932 5716933 CLK_0210 CLK_0211     TRUE 0.872 128.000 0.667 NA   NA
 5716933 5716934 CLK_0211 CLK_0212     FALSE 0.006 421.000 0.000 NA   NA
 5716934 5716935 CLK_0212 CLK_0213     FALSE 0.012 336.000 0.000 NA   NA
 5716935 5716936 CLK_0213 CLK_0214   brnQ FALSE 0.003 566.000 0.000 1.000 N NA
 5716938 5716939 CLK_0216 CLK_0217 feoA feoB TRUE 0.605 144.000 0.033 1.000   NA
 5716939 5716940 CLK_0217 CLK_0218 feoB feoB-1 TRUE 0.989 -3.000 0.105 0.005   NA
 5716940 5716941 CLK_0218 CLK_0220 feoB-1 cobC FALSE 0.003 674.000 0.000 1.000 N NA
 5716943 5716944 CLK_0221 CLK_0222   cobS FALSE 0.030 270.000 0.000 1.000 N NA
 5716944 5716945 CLK_0222 CLK_0223 cobS   FALSE 0.028 276.000 0.000 NA   NA
 5716945 5716946 CLK_0223 CLK_0224     FALSE 0.467 58.000 0.000 NA   NA
 5716946 5716947 CLK_0224 CLK_0225     TRUE 0.669 125.000 0.053 NA   NA
 5716947 5716948 CLK_0225 CLK_0226     TRUE 0.990 18.000 0.828 NA   NA
 5716948 5716949 CLK_0226 CLK_0227     FALSE 0.004 527.000 0.000 NA   NA
 5716951 5716952 CLK_0229 CLK_0230   folP TRUE 0.848 92.000 0.003 1.000 Y NA
 5716952 5716953 CLK_0230 CLK_0231 folP   FALSE 0.376 164.000 0.003 NA   NA
 5716953 5716954 CLK_0231 CLK_0232   folK FALSE 0.488 100.000 0.003 NA   NA
 5716954 5716955 CLK_0232 CLK_0233 folK   FALSE 0.315 119.000 0.000 NA N NA
 5716955 5716956 CLK_0233 CLK_0234     FALSE 0.021 284.000 0.000 NA N NA
 5716956 5716957 CLK_0234 CLK_0235     TRUE 0.780 55.000 0.039 1.000 N NA
 5716957 5716958 CLK_0235 CLK_0236     FALSE 0.369 262.000 0.012 0.019 Y NA
 5716958 5716959 CLK_0236 CLK_0237     FALSE 0.003 572.000 0.000 NA N NA
 5716959 5716960 CLK_0237 CLK_0238     FALSE 0.010 354.000 0.000 NA   NA
 5716960 5716961 CLK_0238 CLK_0239   uppS FALSE 0.005 470.000 0.000 NA   NA
 5716961 5716962 CLK_0239 CLK_0240 uppS   FALSE 0.145 188.000 0.000 NA   NA
 5716962 5716963 CLK_0240 CLK_0241     FALSE 0.011 344.000 0.000 NA   NA
 5716963 5716964 CLK_0241 CLK_0242     TRUE 0.992 5.000 0.500 NA   NA
 5716964 5716965 CLK_0242 CLK_0243     FALSE 0.004 557.000 0.000 NA   NA
 5716965 5716966 CLK_0243 CLK_0244     FALSE 0.319 93.000 0.000 NA   NA
 5716968 5716969 CLK_0246 CLK_0247   cadD FALSE 0.018 302.000 0.000 NA   NA
 5716969 5716970 CLK_0247 CLK_0248 cadD   FALSE 0.288 149.000 0.000 NA   NA
 5716970 5716971 CLK_0248 CLK_0249     FALSE 0.336 127.000 0.000 NA   NA
 5716973 5716974 CLK_0251 CLK_0252   nimA FALSE 0.005 487.000 0.000 1.000   NA
 5716976 5716977 CLK_0254 CLK_0255     FALSE 0.003 910.000 0.000 NA   NA
 5716977 5716978 CLK_0255 CLK_0256     FALSE 0.446 60.000 0.000 NA   NA
 5716983 5716984 CLK_0261 CLK_0262     TRUE 0.977 19.000 0.200 NA   NA
 5716984 5716985 CLK_0262 CLK_0263     TRUE 0.989 -28.000 0.100 1.000   NA
 5716986 5716987 CLK_0264 CLK_0265     FALSE 0.121 198.000 0.000 NA   NA
 5716987 5716988 CLK_0265 CLK_0266     FALSE 0.321 92.000 0.000 NA   NA
 5716988 5716989 CLK_0266 CLK_0267     FALSE 0.014 322.000 0.000 NA   NA
 5716989 5716990 CLK_0267 CLK_0268     FALSE 0.028 687.000 0.000 0.015 Y NA
 5716990 5716991 CLK_0268 CLK_0269     FALSE 0.320 97.000 0.000 NA   NA
 5716992 5716993 CLK_0270 CLK_0271     TRUE 0.868 18.000 0.000 NA   NA
 5716994 5716995 CLK_0272 CLK_0273     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5716995 5716996 CLK_0273 CLK_0274     FALSE 0.467 58.000 0.000 NA   NA
 5716996 5716997 CLK_0274 CLK_0275     TRUE 0.554 50.000 0.000 NA   NA
 5716997 5716998 CLK_0275 CLK_0276     FALSE 0.019 300.000 0.000 NA   NA
 5716999 5717000 CLK_0277 CLK_0278     FALSE 0.028 277.000 0.000 NA   NA
 5717001 5717002 CLK_0279 CLK_0280     FALSE 0.009 364.000 0.000 NA   NA
 5717005 5717006 CLK_0283 CLK_0284     TRUE 0.674 58.000 0.010 NA   NA
 5717007 5717008 CLK_0285 CLK_0286     FALSE 0.007 398.000 0.000 1.000   NA
 5717009 5717010 CLK_0287 CLK_0288     FALSE 0.132 193.000 0.000 NA   NA
 5717010 5717011 CLK_0288 CLK_0289     TRUE 0.990 5.000 0.386 NA   NA
 5717014 5717015 CLK_0292 CLK_0293     TRUE 0.568 58.000 0.000 0.034   NA
 5717015 5717016 CLK_0293 CLK_0294     FALSE 0.334 85.000 0.000 NA   NA
 5717016 5717017 CLK_0294 CLK_0295     TRUE 0.893 13.000 0.000 NA   NA
 5717017 5717018 CLK_0295 CLK_0296     FALSE 0.337 126.000 0.000 NA   NA
 5717019 5717020 CLK_0297 CLK_0298     TRUE 0.992 0.000 0.400 NA   NA
 5717020 5717021 CLK_0298 CLK_0299     FALSE 0.003 595.000 0.000 NA   NA
 5717022 5717023 CLK_0300 CLK_0301     TRUE 0.834 81.000 0.000 0.055 Y NA
 5717024 5717025 CLK_0302 CLK_0303     FALSE 0.283 243.000 0.000 NA Y NA
 5717025 5717026 CLK_0303 CLK_0304   mraY FALSE 0.009 354.000 0.000 NA N NA
 5717027 5717028 CLK_0305 CLK_0306     FALSE 0.072 220.000 0.000 NA   NA
 5717028 5717029 CLK_0306 CLK_0307     FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 5717029 5717030 CLK_0307 CLK_0308     FALSE 0.037 267.000 0.000 1.000   NA
 5717030 5717031 CLK_0308 CLK_0309     TRUE 0.964 23.000 0.111 1.000   NA
 5717032 5717033 CLK_0310 CLK_0311     TRUE 0.903 112.000 1.000 NA   NA
 5717034 5717035 CLK_0312 CLK_0313     FALSE 0.030 273.000 0.000 NA   NA
 5717035 5717036 CLK_0313 CLK_0314     FALSE 0.012 335.000 0.000 NA   NA
 5717036 5717037 CLK_0314 CLK_0315     FALSE 0.004 510.000 0.000 NA   NA
 5717037 5717038 CLK_0315 CLK_0316     TRUE 0.785 73.000 0.162 1.000   NA
 5717038 5717039 CLK_0316 CLK_0317     FALSE 0.095 211.000 0.000 1.000   NA
 5717041 5717042 CLK_0319 CLK_0320     FALSE 0.533 52.000 0.000 NA   NA
 5717044 5717045 CLK_0322 CLK_0323     TRUE 0.775 30.000 0.000 NA   NA
 5717045 5717046 CLK_0323 CLK_0324     FALSE 0.010 357.000 0.000 NA   NA
 5717047 5717048 CLK_0325 CLK_0326     FALSE 0.190 174.000 0.000 NA   NA
 5717050 5717051 CLK_0328 CLK_0329     FALSE 0.059 228.000 0.000 NA   NA
 5717052 5717053 CLK_0330 CLK_0331     FALSE 0.325 90.000 0.000 NA   NA
 5717053 5717054 CLK_0331 CLK_0332     FALSE 0.004 490.000 0.000 NA   NA
 5717055 5717056 CLK_0333 CLK_0334     FALSE 0.003 602.000 0.000 NA   NA
 5717057 5717058 CLK_0335 CLK_0336     FALSE 0.045 246.000 0.000 NA   NA
 5717058 5717059 CLK_0336 CLK_0337     FALSE 0.024 286.000 0.000 NA   NA
 5717059 5717060 CLK_0337 CLK_0338     TRUE 0.981 3.000 0.087 NA   NA
 5717060 5717061 CLK_0338 CLK_0339     FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 5717063 5717064 CLK_0341 CLK_0342     TRUE 0.998 0.000 0.333 1.000 Y NA
 5717064 5717065 CLK_0342 CLK_0343     FALSE 0.022 292.000 0.000 NA   NA
 5717065 5717066 CLK_0343 CLK_0344     FALSE 0.007 395.000 0.000 NA   NA
 5717066 5717067 CLK_0344 CLK_0345     FALSE 0.012 342.000 0.000 1.000   NA
 5717067 5717068 CLK_0345 CLK_0346     TRUE 0.722 79.000 0.100 1.000 N NA
 5717068 5717069 CLK_0346 CLK_0347   cobU FALSE 0.026 278.000 0.000 1.000 N NA
 5717069 5717070 CLK_0347 CLK_0348 cobU   TRUE 0.655 89.000 0.051 NA   NA
 5717070 5717071 CLK_0348 CLK_0349     TRUE 0.992 9.000 0.667 NA   NA
 5717073 5717074 CLK_0351 CLK_0352 cobQ cobD TRUE 0.997 2.000 0.092 0.011 Y NA
 5717074 5717075 CLK_0352 CLK_0353 cobD   TRUE 0.566 143.000 0.026 1.000 N NA
 5717075 5717076 CLK_0353 CLK_0354   cbiM FALSE 0.305 184.000 0.013 1.000 N NA
 5717076 5717077 CLK_0354 CLK_0355 cbiM cbiN TRUE 0.999 4.000 0.861 0.011 Y NA
 5717077 5717078 CLK_0355 CLK_0356 cbiN cbiQ TRUE 0.999 -37.000 0.804 0.002 Y NA
 5717078 5717079 CLK_0356 CLK_0357 cbiQ   FALSE 0.005 416.000 0.000 NA N NA
 5717079 5717080 CLK_0357 CLK_0358   hemC TRUE 0.995 -31.000 0.009 NA Y NA
 5717080 5717081 CLK_0358 CLK_0359 hemC   FALSE 0.222 303.000 0.031 1.000 Y NA
 5717081 5717082 CLK_0359 CLK_0360   hemB TRUE 0.896 130.000 0.044 1.000 Y NA
 5717082 5717083 CLK_0360 CLK_0361 hemB cobB TRUE 0.850 93.000 0.005 1.000 Y NA
 5717083 5717084 CLK_0361 CLK_0362 cobB   FALSE 0.222 158.000 0.000 NA N NA
 5717084 5717085 CLK_0362 CLK_0363   cobH FALSE 0.388 62.000 0.000 NA N NA
 5717087 5717088 CLK_0365 CLK_0366     FALSE 0.029 279.000 0.000 1.000   NA
 5717088 5717089 CLK_0366 CLK_0367     FALSE 0.011 352.000 0.000 1.000   NA
 5717089 5717090 CLK_0367 CLK_0368     FALSE 0.219 166.000 0.000 NA   NA
 5717090 5717091 CLK_0368 CLK_0369     FALSE 0.387 68.000 0.000 NA   NA
 5717091 5717092 CLK_0369 CLK_0370     FALSE 0.047 250.000 0.000 1.000   NA
 5717092 5717093 CLK_0370 CLK_0371     FALSE 0.078 217.000 0.000 NA   NA
 5717093 5717094 CLK_0371 CLK_0372     TRUE 0.788 102.000 0.250 NA   NA
 5717094 5717095 CLK_0372 CLK_0373   cbiD TRUE 0.947 13.000 0.005 NA   NA
 5717095 5717096 CLK_0373 CLK_0374 cbiD cbiE TRUE 0.858 176.000 0.126 0.011 Y NA
 5717096 5717097 CLK_0374 CLK_0375 cbiE   FALSE 0.088 211.000 0.000 NA   NA
 5717097 5717098 CLK_0375 CLK_0376   cbiT FALSE 0.298 146.000 0.000 NA   NA
 5717098 5717099 CLK_0376 CLK_0377 cbiT   TRUE 0.930 0.000 0.000 NA   NA
 5717101 5717102 CLK_0379 CLK_0380     TRUE 0.767 158.000 0.400 NA   NA
 5717102 5717103 CLK_0380 CLK_0381     FALSE 0.483 57.000 0.000 NA   NA
 5717103 5717104 CLK_0381 CLK_0382     FALSE 0.409 68.000 0.000 1.000   NA
 5717104 5717105 CLK_0382 CLK_0383     TRUE 0.554 50.000 0.000 NA   NA
 5717105 5717106 CLK_0383 CLK_0384   cobI FALSE 0.323 91.000 0.000 NA   NA
 5717106 5717107 CLK_0384 CLK_0385 cobI cobM FALSE 0.467 288.000 0.291 0.011 Y NA
 5717107 5717108 CLK_0385 CLK_0386 cobM   TRUE 0.992 5.000 0.397 0.011   NA
 5717108 5717109 CLK_0386 CLK_0387   cobJ TRUE 0.845 134.000 0.352 0.011   NA
 5717109 5717110 CLK_0387 CLK_0388 cobJ cobK TRUE 0.909 177.000 0.423 0.011 Y NA
 5717110 5717111 CLK_0388 CLK_0389 cobK   FALSE 0.524 85.000 0.006 NA   NA
 5717111 5717112 CLK_0389 CLK_0390   cbiK TRUE 0.547 164.000 0.056 NA   NA
 5717112 5717113 CLK_0390 CLK_0391 cbiK   TRUE 0.967 13.000 0.040 1.000 N NA
 5717113 5717114 CLK_0391 CLK_0392   cobO FALSE 0.096 205.000 0.000 1.000 N NA
 5717114 5717115 CLK_0392 CLK_0393 cobO   FALSE 0.040 253.000 0.000 1.000 N NA
 5717115 5717116 CLK_0393 CLK_0394     TRUE 0.737 90.000 0.152 1.000 N NA
 5717116 5717117 CLK_0394 CLK_0395   asrA TRUE 0.974 20.000 0.174 1.000   NA
 5717117 5717118 CLK_0395 CLK_0396 asrA asrB TRUE 0.996 -13.000 0.750 0.034   NA
 5717118 5717119 CLK_0396 CLK_0397 asrB arsC TRUE 0.998 13.000 0.720 0.034 Y NA
 5717119 5717120 CLK_0397 CLK_0398 arsC   FALSE 0.240 158.000 0.000 1.000 N NA
 5717120 5717121 CLK_0398 CLK_0399     TRUE 0.942 -13.000 0.000 NA   NA
 5717121 5717122 CLK_0399 CLK_0400     TRUE 0.577 47.000 0.000 NA   NA
 5717122 5717123 CLK_0400 CLK_0401     TRUE 0.999 -16.000 0.750 1.000 Y NA
 5717123 5717124 CLK_0401 CLK_0402     FALSE 0.004 564.000 0.000 1.000   NA
 5717124 5717125 CLK_0402 CLK_0403     FALSE 0.017 312.000 0.000 1.000   NA
 5717125 5717126 CLK_0403 CLK_0404     TRUE 0.986 20.000 0.556 1.000 N NA
 5717126 5717127 CLK_0404 CLK_0405     TRUE 0.987 15.000 0.444 1.000 N NA
 5717127 5717128 CLK_0405 CLK_0406     TRUE 0.986 -16.000 0.067 NA   NA
 5717130 5717131 CLK_0408 CLK_0409     TRUE 0.989 21.000 0.833 NA   NA
 5717131 5717132 CLK_0409 CLK_0410     TRUE 0.994 4.000 0.833 NA   NA
 5717132 5717133 CLK_0410 CLK_0411     FALSE 0.017 651.000 0.154 NA   NA
 5717133 5717134 CLK_0411 CLK_0412     TRUE 0.999 -10.000 0.765 1.000 Y NA
 5717135 5717136 CLK_0413 CLK_0414     TRUE 0.998 1.000 0.625 1.000 Y NA
 5717143 5717144 CLK_0421 CLK_0422     FALSE 0.018 310.000 0.000 1.000   NA
 5717145 5717146 CLK_0423 CLK_0424 dhaKL dhaD TRUE 0.972 11.000 0.053 1.000 N NA
 5717146 5717147 CLK_0424 CLK_0425 dhaD   FALSE 0.025 564.000 0.250 1.000 N NA
 5717148 5717149 CLK_0426 CLK_0427     TRUE 0.716 35.000 0.000 NA   NA
 5717149 5717150 CLK_0427 CLK_0428     FALSE 0.153 204.000 0.000 0.015   NA
 5717150 5717151 CLK_0428 CLK_0429     FALSE 0.267 155.000 0.000 NA   NA
 5717151 5717152 CLK_0429 CLK_0430     FALSE 0.058 229.000 0.000 NA   NA
 5717152 5717153 CLK_0430 CLK_0431     TRUE 0.765 101.000 0.200 NA   NA
 5717153 5717154 CLK_0431 CLK_0432     TRUE 0.872 42.000 0.061 NA   NA
 5717154 5717155 CLK_0432 CLK_0433     FALSE 0.083 214.000 0.000 NA   NA
 5717155 5717156 CLK_0433 CLK_0434     TRUE 0.860 74.000 0.486 NA   NA
 5717156 5717157 CLK_0434 CLK_0435     FALSE 0.311 142.000 0.000 NA   NA
 5717159 5717160 CLK_0437 CLK_0438     TRUE 0.622 208.000 0.833 NA   NA
 5717160 5717161 CLK_0438 CLK_0439     FALSE 0.002 955.000 0.000 NA   NA
 5717161 5717162 CLK_0439 CLK_0440   recQ FALSE 0.045 244.000 0.000 NA   NA
 5717162 5717163 CLK_0440 CLK_0441 recQ   FALSE 0.332 111.000 0.000 1.000 N NA
 5717165 5717166 CLK_0443 CLK_0444     TRUE 0.832 115.000 0.333 1.000   NA
 5717166 5717167 CLK_0444 CLK_0445   lctP FALSE 0.004 530.000 0.000 1.000   NA
 5717167 5717168 CLK_0445 CLK_0446 lctP   TRUE 0.947 29.000 0.098 NA   NA
 5717168 5717169 CLK_0446 CLK_0447     TRUE 0.886 43.000 0.098 NA   NA
 5717169 5717170 CLK_0447 CLK_0448     TRUE 0.995 32.000 0.875 0.011 Y NA
 5717170 5717171 CLK_0448 CLK_0449     TRUE 0.981 61.000 0.875 0.009 Y NA
 5717171 5717172 CLK_0449 CLK_0450     FALSE 0.032 266.000 0.000 1.000 N NA
 5717172 5717173 CLK_0450 CLK_0451     TRUE 0.998 4.000 0.643 NA Y NA
 5717173 5717174 CLK_0451 CLK_0452     FALSE 0.167 181.000 0.000 NA   NA
 5717174 5717175 CLK_0452 CLK_0453     TRUE 0.993 0.000 0.500 NA   NA
 5717175 5717176 CLK_0453 CLK_0454     TRUE 0.709 172.000 0.400 NA   NA
 5717176 5717177 CLK_0454 CLK_0455     FALSE 0.094 208.000 0.000 NA   NA
 5717177 5717178 CLK_0455 CLK_0456     TRUE 0.979 2.000 0.051 NA   NA
 5717179 5717180 CLK_0457 CLK_0458     FALSE 0.003 948.000 0.000 NA   NA
 5717181 5717182 CLK_0459 CLK_0460     FALSE 0.140 307.000 0.000 0.062 Y NA
 5717182 5717183 CLK_0460 CLK_0461     FALSE 0.070 221.000 0.000 NA   NA
 5717185 5717186 CLK_0463 CLK_0464     TRUE 0.922 4.000 0.000 1.000   NA
 5717186 5717187 CLK_0464 CLK_0465     FALSE 0.028 274.000 0.000 1.000 N NA
 5717187 5717188 CLK_0465 CLK_0466     TRUE 0.872 16.000 0.000 1.000 N NA
 5717192 5717193 CLK_0470 CLK_0471     FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 5717193 5717194 CLK_0471 CLK_0472     FALSE 0.004 525.000 0.000 NA   NA
 5717194 5717195 CLK_0472 CLK_0473     TRUE 0.998 17.000 0.791 0.008 Y NA
 5717195 5717196 CLK_0473 CLK_0474   feoB TRUE 0.994 32.000 0.871 1.000 Y NA
 5717196 5717197 CLK_0474 CLK_0475 feoB   TRUE 0.945 21.000 0.029 NA   NA
 5717197 5717198 CLK_0475 CLK_0476     FALSE 0.080 216.000 0.000 NA   NA
 5717200 5717201 CLK_0478 CLK_0479   tlp FALSE 0.019 299.000 0.000 NA   NA
 5717203 5717204 CLK_0481 CLK_0482     FALSE 0.004 515.000 0.000 1.000 N NA
 5717204 5717205 CLK_0482 CLK_0483     TRUE 0.998 1.000 0.462 1.000 Y NA
 5717205 5717206 CLK_0483 CLK_0484     FALSE 0.330 104.000 0.000 NA   NA
 5717206 5717207 CLK_0484 CLK_0485     FALSE 0.020 297.000 0.000 NA   NA
 5717209 5717210 CLK_0487 CLK_0488     FALSE 0.032 270.000 0.000 NA   NA
 5717210 5717211 CLK_0488 CLK_0489     TRUE 0.999 0.000 0.833 1.000 Y NA
 5717212 5717213 CLK_0490 CLK_0491     FALSE 0.044 236.000 0.000 NA N NA
 5717214 5717215 CLK_0492 CLK_0493     TRUE 0.999 -10.000 0.870 0.033 Y NA
 5717215 5717216 CLK_0493 CLK_0494     TRUE 0.999 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 5717216 5717217 CLK_0494 CLK_0495     TRUE 0.938 74.000 0.196 1.000 Y NA
 5717217 5717218 CLK_0495 CLK_0496     FALSE 0.103 203.000 0.000 1.000 N NA
 5717218 5717219 CLK_0496 CLK_0497     FALSE 0.012 332.000 0.000 1.000 N NA
 5717219 5717220 CLK_0497 CLK_0498     TRUE 0.998 2.000 0.389 0.007 Y NA
 5717221 5717222 CLK_0499 CLK_0500     TRUE 0.999 3.000 1.000 NA Y NA
 5717222 5717223 CLK_0500 CLK_0501     FALSE 0.014 324.000 0.000 NA   NA
 5717224 5717225 CLK_0502 CLK_0503     FALSE 0.003 603.000 0.000 NA   NA
 5717225 5717226 CLK_0503 CLK_0504     FALSE 0.017 311.000 0.000 1.000   NA
 5717226 5717227 CLK_0504 CLK_0505     FALSE 0.039 323.000 0.023 NA   NA
 5717227 5717228 CLK_0505 CLK_0506     FALSE 0.453 165.000 0.023 NA   NA
 5717229 5717230 CLK_0507 CLK_0508     TRUE 0.581 116.000 0.015 NA   NA
 5717230 5717231 CLK_0508 CLK_0509     FALSE 0.008 385.000 0.000 1.000   NA
 5717232 5717233 CLK_0510 CLK_0511     FALSE 0.009 374.000 0.000 1.000   NA
 5717233 5717234 CLK_0511 CLK_0512     FALSE 0.082 218.000 0.000 1.000   NA
 5717234 5717235 CLK_0512 CLK_0513     FALSE 0.099 209.000 0.000 1.000   NA
 5717235 5717236 CLK_0513 CLK_0514     TRUE 0.854 57.000 0.107 0.034   NA
 5717236 5717237 CLK_0514 CLK_0515     TRUE 0.991 3.000 0.300 0.034   NA
 5717237 5717238 CLK_0515 CLK_0516   glpT TRUE 0.590 89.000 0.021 1.000   NA
 5717238 5717239 CLK_0516 CLK_0517 glpT argS FALSE 0.003 620.000 0.000 1.000 N NA
 5717239 5717240 CLK_0517 CLK_0518 argS   FALSE 0.006 404.000 0.000 1.000 N NA
 5717240 5717241 CLK_0518 CLK_0519     FALSE 0.022 297.000 0.000 1.000   NA
 5717242 5717243 CLK_0520 CLK_0521   feoB TRUE 0.934 26.000 0.034 NA   NA
 5717243 5717244 CLK_0521 CLK_0522 feoB feoA TRUE 0.996 15.000 0.308 1.000 Y NA
 5717245 5717246 CLK_0523 CLK_0524     FALSE 0.084 213.000 0.000 NA   NA
 5717246 5717247 CLK_0524 CLK_0525     FALSE 0.006 435.000 0.000 1.000   NA
 5717247 5717248 CLK_0525 CLK_0526     FALSE 0.007 412.000 0.000 1.000   NA
 5717248 5717249 CLK_0526 CLK_0527     FALSE 0.030 278.000 0.000 1.000   NA
 5717249 5717250 CLK_0527 CLK_0528     TRUE 0.998 2.000 0.511 1.000 Y NA
 5717250 5717251 CLK_0528 CLK_0529     TRUE 0.959 56.000 0.154 NA Y NA
 5717251 5717252 CLK_0529 CLK_0530     TRUE 0.833 188.000 0.250 NA Y NA
 5717252 5717253 CLK_0530 CLK_0531     FALSE 0.058 229.000 0.000 NA   NA
 5717253 5717254 CLK_0531 CLK_0532     FALSE 0.004 572.000 0.000 1.000   NA
 5717256 5717257 CLK_0534 CLK_0535     FALSE 0.051 236.000 0.000 NA   NA
 5717257 5717258 CLK_0535 CLK_0536     FALSE 0.089 210.000 0.000 NA   NA
 5717262 5717263 CLK_0540 CLK_0541     FALSE 0.498 143.000 0.008 NA   NA
 5717263 5717264 CLK_0541 CLK_0542     TRUE 0.700 56.000 0.008 1.000   NA
 5717265 5717266 CLK_0543 CLK_0544     FALSE 0.032 598.000 0.000 0.003 Y NA
 5717267 5717268 CLK_0545 CLK_0546     TRUE 0.983 18.000 0.333 1.000 N NA
 5717268 5717269 CLK_0546 CLK_0547     FALSE 0.006 422.000 0.000 1.000   NA
 5717269 5717270 CLK_0547 CLK_0548     FALSE 0.322 99.000 0.000 NA   NA
 5717270 5717271 CLK_0548 CLK_0549     FALSE 0.003 806.000 0.000 NA   NA
 5717271 5717272 CLK_0549 CLK_0550     TRUE 0.988 2.000 0.217 NA   NA
 5717272 5717273 CLK_0550 CLK_0551     TRUE 0.993 19.000 0.084 0.033 Y NA
 5717273 5717274 CLK_0551 CLK_0552     TRUE 0.988 12.000 0.308 0.033 N NA
 5717274 5717275 CLK_0552 CLK_0553     FALSE 0.018 303.000 0.000 NA   NA
 5717275 5717276 CLK_0553 CLK_0554     TRUE 0.577 104.000 0.020 NA   NA
 5717276 5717277 CLK_0554 CLK_0555     TRUE 0.910 10.000 0.000 1.000   NA
 5717277 5717278 CLK_0555 CLK_0556     FALSE 0.354 76.000 0.000 NA   NA
 5717278 5717279 CLK_0556 CLK_0557     TRUE 0.980 1.000 0.050 NA   NA
 5717279 5717280 CLK_0557 CLK_0558   maa FALSE 0.023 289.000 0.000 NA   NA
 5717282 5717283 CLK_0560 CLK_0561     FALSE 0.031 276.000 0.000 1.000   NA
 5717283 5717284 CLK_0561 CLK_0562     FALSE 0.478 160.000 0.017 1.000   NA
 5717286 5717287 CLK_0564 CLK_0565   mgtE FALSE 0.003 631.000 0.000 NA   NA
 5717287 5717288 CLK_0565 CLK_0566 mgtE   FALSE 0.003 1001.000 0.000 0.059 N NA
 5717288 5717289 CLK_0566 CLK_0567   serA TRUE 0.623 225.000 0.110 0.059 Y NA
 5717289 5717290 CLK_0567 CLK_0568 serA   TRUE 0.987 -22.000 0.072 NA   NA
 5717290 5717291 CLK_0568 CLK_0569     FALSE 0.002 1037.000 0.000 NA   NA
 5717291 5717292 CLK_0569 CLK_0570     FALSE 0.533 168.000 0.056 1.000   NA
 5717294 5717295 CLK_0572 CLK_0573     TRUE 0.746 111.000 0.118 1.000   NA
 5717295 5717296 CLK_0573 CLK_0574     FALSE 0.021 299.000 0.000 1.000   NA
 5717296 5717297 CLK_0574 CLK_0575     FALSE 0.382 158.000 0.004 NA N NA
 5717297 5717298 CLK_0575 CLK_0576     FALSE 0.354 76.000 0.000 NA   NA
 5717298 5717299 CLK_0576 CLK_0577     FALSE 0.028 277.000 0.000 NA   NA
 5717299 5717300 CLK_0577 CLK_0578     FALSE 0.511 178.000 0.091 NA   NA
 5717300 5717301 CLK_0578 CLK_0579   xpt FALSE 0.416 161.000 0.009 1.000 N NA
 5717301 5717302 CLK_0579 CLK_0580 xpt   FALSE 0.018 301.000 0.000 NA   NA
 5717302 5717303 CLK_0580 CLK_0581     FALSE 0.016 310.000 0.000 NA   NA
 5717303 5717304 CLK_0581 CLK_0582     TRUE 0.660 196.000 0.667 NA   NA
 5717304 5717305 CLK_0582 CLK_0583     FALSE 0.011 344.000 0.000 NA   NA
 5717305 5717306 CLK_0583 CLK_0584     FALSE 0.167 181.000 0.000 NA   NA
 5717306 5717307 CLK_0584 CLK_0585     TRUE 0.684 126.000 0.065 NA   NA
 5717307 5717308 CLK_0585 CLK_0586     FALSE 0.026 280.000 0.000 NA   NA
 5717308 5717309 CLK_0586 CLK_0587     TRUE 0.774 182.000 1.000 NA   NA
 5717309 5717310 CLK_0587 CLK_0588     FALSE 0.008 380.000 0.000 NA   NA
 5717310 5717311 CLK_0588 CLK_0589     TRUE 0.999 2.000 0.667 0.033 Y NA
 5717311 5717312 CLK_0589 CLK_0590     TRUE 0.997 -37.000 0.900 0.033 N NA
 5717314 5717315 CLK_0592 CLK_0593     TRUE 0.980 14.000 0.167 NA   NA
 5717315 5717316 CLK_0593 CLK_0594   rpsA FALSE 0.007 399.000 0.000 NA   NA
 5717316 5717317 CLK_0594 CLK_0595 rpsA   FALSE 0.312 183.000 0.008 1.000   NA
 5717317 5717318 CLK_0595 CLK_0596     FALSE 0.514 172.000 0.067 NA   NA
 5717318 5717319 CLK_0596 CLK_0597     FALSE 0.003 869.000 0.000 NA   NA
 5717319 5717320 CLK_0597 CLK_0598     TRUE 0.995 0.000 0.857 NA   NA
 5717320 5717321 CLK_0598 CLK_0599     TRUE 0.993 -37.000 0.231 1.000   NA
 5717321 5717322 CLK_0599 CLK_0600     FALSE 0.015 318.000 0.000 NA   NA
 5717322 5717323 CLK_0600 CLK_0601   asdA FALSE 0.006 422.000 0.000 NA   NA
 5717325 5717326 CLK_0603 CLK_0604     TRUE 0.970 -6.000 0.012 NA N NA
 5717326 5717327 CLK_0604 CLK_0605   panE FALSE 0.004 494.000 0.000 NA N NA
 5717327 5717328 CLK_0605 CLK_0606 panE fchA FALSE 0.017 302.000 0.000 1.000 N NA
 5717328 5717329 CLK_0606 CLK_0607 fchA folD TRUE 0.987 0.000 0.082 0.001 N NA
 5717329 5717330 CLK_0607 CLK_0608 folD   FALSE 0.016 320.000 0.000 1.000   NA
 5717332 5717333 CLK_0610 CLK_0611     TRUE 0.816 115.000 0.286 NA   NA
 5717333 5717334 CLK_0611 CLK_0612     TRUE 0.563 112.000 0.012 NA   NA
 5717334 5717335 CLK_0612 CLK_0613     FALSE 0.002 672.000 0.000 NA N NA
 5717335 5717336 CLK_0613 CLK_0614   cysK FALSE 0.053 330.000 0.083 NA N NA
 5717336 5717337 CLK_0614 CLK_0615 cysK   TRUE 0.982 45.000 0.400 1.000 Y NA
 5717337 5717338 CLK_0615 CLK_0616     TRUE 0.991 35.000 0.400 0.033 Y NA
 5717338 5717339 CLK_0616 CLK_0617   iscS TRUE 0.940 104.000 0.286 1.000 Y NA
 5717339 5717340 CLK_0617 CLK_0618 iscS   FALSE 0.012 346.000 0.000 1.000   NA
 5717340 5717341 CLK_0618 CLK_0619     FALSE 0.447 156.000 0.008 NA   NA
 5717341 5717342 CLK_0619 CLK_0620   trmU-1 FALSE 0.528 116.000 0.004 NA   NA
 5717342 5717343 CLK_0620 CLK_0621 trmU-1   FALSE 0.027 279.000 0.000 NA   NA
 5717343 5717344 CLK_0621 CLK_0622     FALSE 0.446 60.000 0.000 NA   NA
 5717344 5717345 CLK_0622 CLK_0623     TRUE 0.946 -30.000 0.000 NA   NA
 5717345 5717346 CLK_0623 CLK_0624     FALSE 0.134 192.000 0.000 NA   NA
 5717346 5717347 CLK_0624 CLK_0626     TRUE 0.999 -3.000 0.875 NA Y NA
 5717349 5717350 CLK_0627 CLK_0628 bcrA   TRUE 0.993 -7.000 0.333 NA   NA
 5717350 5717351 CLK_0628 CLK_0629     FALSE 0.018 303.000 0.000 NA   NA
 5717351 5717352 CLK_0629 CLK_0630     FALSE 0.010 353.000 0.000 NA   NA
 5717354 5717355 CLK_0632 CLK_0633     TRUE 0.992 6.000 0.556 1.000 N NA
 5717355 5717356 CLK_0633 CLK_0634     FALSE 0.020 296.000 0.000 NA   NA
 5717356 5717357 CLK_0634 CLK_0635     FALSE 0.003 586.000 0.000 NA   NA
 5717359 5717360 CLK_0637 CLK_0638     TRUE 0.881 14.000 0.000 1.000 N NA
 5717360 5717361 CLK_0638 CLK_0639     FALSE 0.372 64.000 0.000 NA N NA
 5717361 5717362 CLK_0639 CLK_0640     TRUE 0.989 3.000 0.000 NA Y NA
 5717362 5717363 CLK_0640 CLK_0641     TRUE 0.947 -46.000 0.000 NA   NA
 5717363 5717364 CLK_0641 CLK_0642     FALSE 0.335 84.000 0.000 NA   NA
 5717366 5717367 CLK_0644 CLK_0645     TRUE 0.876 15.000 0.000 1.000 N NA
 5717367 5717368 CLK_0645 CLK_0646   amyB FALSE 0.003 639.000 0.000 1.000   NA
 5717368 10253780 CLK_0646 CLK_3992 amyB   FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 10253780 5717369 CLK_3992 CLK_0647   tyrS FALSE 0.003 558.000 0.000 NA   NA
 5717369 5717370 CLK_0647 CLK_0648 tyrS   FALSE 0.025 280.000 0.000 1.000 N NA
 5717370 5717371 CLK_0648 CLK_0649     TRUE 0.996 -7.000 0.833 1.000 N NA
 5717371 5717372 CLK_0649 CLK_0650     TRUE 0.990 1.000 0.278 NA   NA
 5717374 5717375 CLK_0652 CLK_0653     FALSE 0.323 91.000 0.000 NA   NA
 5717375 5717376 CLK_0653 CLK_0654     FALSE 0.150 186.000 0.000 NA   NA
 5717376 5717377 CLK_0654 CLK_0655     FALSE 0.349 78.000 0.000 NA   NA
 5717377 5717378 CLK_0655 CLK_0656     TRUE 0.541 175.000 0.095 1.000   NA
 5717378 5717379 CLK_0656 CLK_0657   sdhB FALSE 0.006 401.000 0.000 1.000 N NA
 5717379 5717380 CLK_0657 CLK_0658 sdhB sdhA TRUE 0.996 13.000 0.146 0.001 Y NA
 5717384 5717385 CLK_0662 CLK_0663     FALSE 0.377 70.000 0.000 NA   NA
 5717386 5717387 CLK_0664 CLK_0665     FALSE 0.008 369.000 0.000 NA   NA
 5717387 5717388 CLK_0665 CLK_0666     FALSE 0.340 109.000 0.000 NA   NA
 5717388 5717389 CLK_0666 CLK_0667     TRUE 0.998 6.000 0.786 0.033 Y NA
 5717389 5717390 CLK_0667 CLK_0668     TRUE 0.907 188.000 0.688 0.033 Y NA
 5717391 5717392 CLK_0669 CLK_0670   cotJB TRUE 0.937 34.000 0.125 NA   NA
 5717392 5717393 CLK_0670 CLK_0671 cotJB cotJC TRUE 0.924 31.000 0.047 NA   NA
 5717393 5717394 CLK_0671 CLK_0672 cotJC   FALSE 0.090 204.000 0.000 NA N NA
 5717394 5717395 CLK_0672 CLK_0673     TRUE 0.989 17.000 0.667 NA   NA
 5717395 5717396 CLK_0673 CLK_0674     FALSE 0.006 423.000 0.000 NA   NA
 5717399 5717400 CLK_0677 CLK_0678     FALSE 0.004 516.000 0.000 NA   NA
 5717403 5717404 CLK_0681 CLK_0682     FALSE 0.003 670.000 0.000 NA   NA
 5717404 5717405 CLK_0682 CLK_0683     FALSE 0.008 369.000 0.000 NA   NA
 5717407 5717408 CLK_0685 CLK_0686     FALSE 0.002 995.000 0.000 NA   NA
 5717408 5717409 CLK_0686 CLK_0687     FALSE 0.003 586.000 0.000 NA   NA
 5717409 5717410 CLK_0687 CLK_0688     FALSE 0.024 290.000 0.000 1.000   NA
 5717410 5717411 CLK_0688 CLK_0689     FALSE 0.350 119.000 0.000 NA   NA
 5717411 5717412 CLK_0689 CLK_0690     FALSE 0.003 797.000 0.000 NA   NA
 5717412 5717413 CLK_0690 CLK_0691     FALSE 0.025 284.000 0.000 NA   NA
 5717413 5717414 CLK_0691 CLK_0692     FALSE 0.015 318.000 0.000 NA   NA
 5717415 5717416 CLK_0693 CLK_0694     TRUE 0.814 40.000 0.014 1.000 N NA
 5717417 5717418 CLK_0695 CLK_0696 grdX grdE TRUE 0.825 91.000 0.400 NA   NA
 5717418 5717419 CLK_0696 CLK_0697 grdE grdB TRUE 0.963 33.000 0.222 0.003   NA
 5717419 5717420 CLK_0697 CLK_0699 grdB trxB FALSE 0.240 165.000 0.000 1.000   NA
 5717420 5717421 CLK_0699 CLK_0700 trxB   TRUE 0.987 35.000 0.226 1.000 Y NA
 5717421 5717422 CLK_0700 CLK_0701   grdA FALSE 0.354 85.000 0.000 1.000   NA
 5717422 5717423 CLK_0701 CLK_0702 grdA   TRUE 0.897 22.000 0.000 0.002   NA
 5717423 5717424 CLK_0702 CLK_0703   grdC TRUE 0.712 95.000 0.054 0.003   NA
 5717424 5717425 CLK_0703 CLK_0704 grdC grdD TRUE 0.991 16.000 0.622 0.003   NA
 5717425 5717426 CLK_0704 CLK_0705 grdD   FALSE 0.003 525.000 0.000 1.000 N NA
 5717426 5717427 CLK_0705 CLK_0706     TRUE 0.642 67.000 0.005 0.059   NA
 5717427 5717428 CLK_0706 CLK_0707   mtnK FALSE 0.006 430.000 0.000 1.000   NA
 5717428 5717429 CLK_0707 CLK_0708 mtnK mtnA TRUE 0.710 140.000 0.104 1.000   NA
 5717429 5717430 CLK_0708 CLK_0709 mtnA   TRUE 0.815 24.000 0.000 1.000 N NA
 5717430 5717431 CLK_0709 CLK_0710     TRUE 0.990 2.000 0.000 1.000 Y NA
 5717431 5717432 CLK_0710 CLK_0711     TRUE 0.987 15.000 0.000 0.032 Y NA
 5717432 5717433 CLK_0711 CLK_0712     TRUE 0.978 21.000 0.000 NA Y NA
 5717433 5717434 CLK_0712 CLK_0713     TRUE 0.919 58.000 0.014 NA Y NA
 5717434 5717435 CLK_0713 CLK_0714     TRUE 0.897 175.000 0.400 1.000 Y NA
 5717435 5717436 CLK_0714 CLK_0715     FALSE 0.016 309.000 0.000 NA   NA
 5717438 5717439 CLK_0717 CLK_0718     TRUE 0.576 163.000 0.074 NA   NA
 5717439 5717440 CLK_0718 CLK_0719     TRUE 0.613 142.000 0.038 NA   NA
 5717440 5717441 CLK_0719 CLK_0720     TRUE 0.988 -3.000 0.135 NA   NA
 5717441 5717442 CLK_0720 CLK_0721     FALSE 0.003 690.000 0.000 NA   NA
 5717442 5717443 CLK_0721 CLK_0722     TRUE 0.859 48.000 0.080 NA   NA
 5717444 5717445 CLK_0723 CLK_0724     FALSE 0.009 361.000 0.000 NA   NA
 5717446 5717447 CLK_0725 CLK_0726     TRUE 0.981 28.000 0.667 NA   NA
 5717447 5717448 CLK_0726 CLK_0727     TRUE 0.863 57.000 0.200 NA   NA
 5717448 5717449 CLK_0727 CLK_0728     TRUE 0.997 14.000 0.500 0.001 Y NA
 5717449 5717450 CLK_0728 CLK_0729     TRUE 0.994 32.000 0.667 0.043 Y NA
 5717450 5717451 CLK_0729 CLK_0730     TRUE 0.727 116.000 0.100 1.000 N NA
 5717451 5717452 CLK_0730 CLK_0731   topB FALSE 0.007 392.000 0.000 1.000 N NA
 5717452 5717453 CLK_0731 CLK_0732 topB   TRUE 0.851 39.000 0.024 NA   NA
 5717453 5717454 CLK_0732 CLK_0733     FALSE 0.027 279.000 0.000 NA   NA
 5717454 5717455 CLK_0733 CLK_0734     TRUE 0.613 64.000 0.008 NA   NA
 5717455 5717456 CLK_0734 CLK_0735     FALSE 0.003 692.000 0.000 NA   NA
 5717456 5717457 CLK_0735 CLK_0736     FALSE 0.008 397.000 0.000 1.000   NA
 5717457 5717458 CLK_0736 CLK_0737     FALSE 0.019 304.000 0.000 1.000   NA
 5717458 5717459 CLK_0737 CLK_0738     FALSE 0.013 322.000 0.000 1.000 N NA
 5717459 5717460 CLK_0738 CLK_0739     TRUE 0.985 -7.000 0.067 NA   NA
 5717460 5717461 CLK_0739 CLK_0740     TRUE 0.971 6.000 0.033 NA   NA
 5717461 5717462 CLK_0740 CLK_0741     FALSE 0.138 293.000 0.230 NA   NA
 5717462 5717463 CLK_0741 CLK_0742     FALSE 0.006 414.000 0.000 NA   NA
 5717463 5717464 CLK_0742 CLK_0743     FALSE 0.059 228.000 0.000 NA   NA
 5717464 5717465 CLK_0743 CLK_0744     FALSE 0.012 335.000 0.000 NA   NA
 5717465 5717466 CLK_0744 CLK_0745     FALSE 0.078 217.000 0.000 NA   NA
 5717466 5717467 CLK_0745 CLK_0746     TRUE 0.947 37.000 0.287 NA   NA
 5717467 5717468 CLK_0746 CLK_0747   copZ TRUE 0.903 123.000 0.024 0.001 Y NA
 5717468 5717469 CLK_0747 CLK_0748 copZ   FALSE 0.169 287.000 0.000 1.000 Y NA
 5717469 5717470 CLK_0748 CLK_0749     FALSE 0.019 297.000 0.000 1.000 N NA
 5717470 5717471 CLK_0749 CLK_0750     FALSE 0.022 293.000 0.000 NA   NA
 5717471 5717472 CLK_0750 CLK_0751     FALSE 0.517 164.000 0.040 NA   NA
 5717472 5717473 CLK_0751 CLK_0752     FALSE 0.011 344.000 0.000 NA   NA
 5717475 5717476 CLK_0754 CLK_0755     TRUE 0.842 42.000 0.032 NA   NA
 5717478 5717479 CLK_0757 CLK_0758     FALSE 0.003 615.000 0.000 NA   NA
 5717479 5717480 CLK_0758 CLK_0759   trkA FALSE 0.003 788.000 0.000 NA   NA
 5717480 5717481 CLK_0759 CLK_0760 trkA trkH TRUE 0.998 -3.000 0.163 0.004 Y NA
 5717482 5717483 CLK_0761 CLK_0762     FALSE 0.007 390.000 0.000 NA   NA
 5717484 5717485 CLK_0763 CLK_0764     FALSE 0.002 1288.000 0.000 NA   NA
 5717486 5717487 CLK_0765 CLK_0766     TRUE 0.978 15.000 0.158 NA   NA
 5717487 5717488 CLK_0766 CLK_0767     FALSE 0.004 509.000 0.000 1.000   NA
 5717489 5717490 CLK_0768 CLK_0769 rbr   FALSE 0.005 425.000 0.000 NA N NA
 5717492 5717493 CLK_0771 CLK_0772     FALSE 0.302 145.000 0.000 NA   NA
 5717493 5717494 CLK_0772 CLK_0773     FALSE 0.320 97.000 0.000 NA   NA
 5717494 5717495 CLK_0773 CLK_0774     FALSE 0.025 282.000 0.000 NA   NA
 5717495 5717496 CLK_0774 CLK_0775     FALSE 0.447 209.000 0.312 NA N NA
 5717496 5717497 CLK_0775 CLK_0776     TRUE 0.889 147.000 0.077 NA Y NA
 5717497 5717498 CLK_0776 CLK_0777   noxA FALSE 0.410 199.000 0.111 NA   NA
 5717499 5717500 CLK_0778 CLK_0779     FALSE 0.171 178.000 0.000 1.000 N NA
 5717501 5717502 CLK_0780 CLK_0781     FALSE 0.017 302.000 0.000 1.000 N NA
 5717502 5717503 CLK_0781 CLK_0782     TRUE 0.993 22.000 0.214 1.000 Y NA
 5717503 5717504 CLK_0782 CLK_0783     TRUE 0.997 3.000 0.255 1.000 Y NA
 5717505 5717506 CLK_0784 CLK_0785     TRUE 0.761 74.000 0.133 NA   NA
 5717507 5717508 CLK_0786 CLK_0787     FALSE 0.043 280.000 0.000 0.003   NA
 5717508 5717509 CLK_0787 CLK_0788     TRUE 0.743 114.000 0.107 1.000   NA
 5717509 5717510 CLK_0788 CLK_0789     FALSE 0.027 422.000 0.089 1.000   NA
 5717510 5717511 CLK_0789 CLK_0790     FALSE 0.372 118.000 0.000 1.000   NA
 5717511 5717512 CLK_0790 CLK_0791     TRUE 0.823 24.000 0.000 NA   NA
 5717512 5717513 CLK_0791 CLK_0792     FALSE 0.007 391.000 0.000 NA   NA
 5717513 5717514 CLK_0792 CLK_0793     FALSE 0.026 280.000 0.000 NA   NA
 5717514 5717515 CLK_0793 CLK_0794     FALSE 0.004 519.000 0.000 NA   NA
 5717515 5717516 CLK_0794 CLK_0795     TRUE 0.925 53.000 0.500 NA   NA
 5717516 5717517 CLK_0795 CLK_0796     TRUE 0.990 0.000 0.250 NA   NA
 5717519 5717520 CLK_0798 CLK_0799     FALSE 0.005 460.000 0.000 1.000 N NA
 5717520 5717521 CLK_0799 CLK_0800     TRUE 0.998 -3.000 0.235 0.032 Y NA
 5717521 5717522 CLK_0800 CLK_0801     TRUE 0.997 9.000 0.353 0.032 Y NA
 5717522 5717523 CLK_0801 CLK_0802     TRUE 0.915 99.000 0.118 1.000 Y NA
 5717523 5717524 CLK_0802 CLK_0803     TRUE 0.987 -6.000 0.059 0.031   NA
 5717524 5717525 CLK_0803 CLK_0804     FALSE 0.005 446.000 0.000 NA   NA
 5717526 5717527 CLK_0805 CLK_0806     TRUE 0.997 0.000 0.231 1.000 Y NA
 5717530 5717531 CLK_0809 CLK_0810     TRUE 0.583 135.000 0.025 1.000 N NA
 5717531 5717532 CLK_0810 CLK_0811     FALSE 0.002 873.000 0.000 NA N NA
 5717532 5717533 CLK_0811 CLK_0812     TRUE 0.999 -28.000 0.646 NA Y NA
 5717533 5717534 CLK_0812 CLK_0813     TRUE 0.934 141.000 0.270 1.000 Y NA
 5717534 5717535 CLK_0813 CLK_0814     TRUE 0.809 85.000 0.000 1.000 Y NA
 5717535 5717536 CLK_0814 CLK_0815     TRUE 0.987 -30.000 0.035 0.059   NA
 5717536 5717537 CLK_0815 CLK_0816     TRUE 0.645 127.000 0.035 1.000   NA
 5717537 5717538 CLK_0816 CLK_0817   rnz FALSE 0.026 287.000 0.000 1.000   NA
 5717538 5717539 CLK_0817 CLK_0818 rnz   FALSE 0.005 459.000 0.000 1.000   NA
 5717539 5717540 CLK_0818 CLK_0819     FALSE 0.302 145.000 0.000 NA   NA
 5717540 5717541 CLK_0819 CLK_0820     FALSE 0.389 172.000 0.015 NA   NA
 5717541 5717542 CLK_0820 CLK_0821     TRUE 0.608 286.000 0.800 0.020 Y NA
 5717542 5717543 CLK_0821 CLK_0822     TRUE 0.678 188.000 0.600 1.000 N NA
 5717543 5717544 CLK_0822 CLK_0823     TRUE 0.969 109.000 1.000 NA Y NA
 5717544 5717545 CLK_0823 CLK_0824     TRUE 0.994 2.000 0.600 NA   NA
 5717545 5717546 CLK_0824 CLK_0825     TRUE 0.986 19.000 0.500 NA   NA
 5717547 5717548 CLK_0826 CLK_0827     FALSE 0.003 558.000 0.000 NA   NA
 5717548 5717549 CLK_0827 CLK_0828     TRUE 0.673 168.000 0.250 NA   NA
 5717550 5717551 CLK_0829 CLK_0830 pepD   TRUE 0.749 34.000 0.000 1.000   NA
 5717551 5717552 CLK_0830 CLK_0831   pdxK FALSE 0.004 498.000 0.000 1.000   NA
 5717554 5717555 CLK_0833 CLK_0834     TRUE 0.995 -13.000 0.500 1.000   NA
 5717555 5717556 CLK_0834 CLK_0835     TRUE 0.732 173.000 0.500 NA   NA
 5717556 5717557 CLK_0835 CLK_0836     FALSE 0.005 439.000 0.000 NA   NA
 5717557 5717558 CLK_0836 CLK_0837     TRUE 0.999 2.000 1.000 1.000 Y NA
 5717558 5717559 CLK_0837 CLK_0838     TRUE 0.863 74.000 0.500 1.000 N NA
 5717559 5717560 CLK_0838 CLK_0839     TRUE 0.992 -10.000 0.222 1.000   NA
 5717560 5717561 CLK_0839 CLK_0840     FALSE 0.380 69.000 0.000 NA   NA
 5717561 5717562 CLK_0840 CLK_0841     FALSE 0.013 326.000 0.000 NA   NA
 5717562 5717563 CLK_0841 CLK_0842     FALSE 0.006 402.000 0.000 NA   NA
 5717563 5717564 CLK_0842 CLK_0843     TRUE 0.895 73.000 0.024 1.000 Y NA
 5717564 5717565 CLK_0843 CLK_0844     TRUE 0.998 13.000 0.833 0.032 Y NA
 5717565 5717566 CLK_0844 CLK_0845     TRUE 0.996 19.000 0.400 1.000 Y NA
 5717566 5717567 CLK_0845 CLK_0846     FALSE 0.343 137.000 0.000 1.000   NA
 5717571 5717572 CLK_0850 CLK_0851     FALSE 0.008 384.000 0.000 NA   NA
 5717572 5717573 CLK_0851 CLK_0852     TRUE 0.732 173.000 0.500 NA   NA
 5717575 5717576 CLK_0854 CLK_0855     TRUE 0.998 2.000 0.643 0.032 Y NA
 5717576 5717577 CLK_0855 CLK_0856     TRUE 0.643 131.000 0.041 NA   NA
 5717577 5717578 CLK_0856 CLK_0857     FALSE 0.319 95.000 0.000 NA   NA
 5717578 5717579 CLK_0857 CLK_0858     TRUE 0.911 54.000 0.000 0.058 Y NA
 5717579 5717580 CLK_0858 CLK_0859     FALSE 0.212 168.000 0.000 NA   NA
 5717580 5717581 CLK_0859 CLK_0860     FALSE 0.005 474.000 0.000 NA   NA
 5717582 5717583 CLK_0861 CLK_0862     FALSE 0.429 123.000 0.000 0.058   NA
 5717584 5717585 CLK_0863 CLK_0864     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5717585 5717586 CLK_0864 CLK_0865     FALSE 0.329 133.000 0.000 NA   NA
 5717586 5717587 CLK_0865 CLK_0866     FALSE 0.005 466.000 0.000 NA   NA
 5717587 5717588 CLK_0866 CLK_0867     TRUE 0.577 47.000 0.000 NA   NA
 5717588 5717589 CLK_0867 CLK_0868     FALSE 0.320 97.000 0.000 NA   NA
 5717589 5717590 CLK_0868 CLK_0869     FALSE 0.351 115.000 0.000 NA   NA
 5717590 5717591 CLK_0869 CLK_0870     TRUE 0.816 25.000 0.000 NA   NA
 5717591 5717592 CLK_0870 CLK_0871     FALSE 0.018 303.000 0.000 NA   NA
 5717592 5717593 CLK_0871 CLK_0872     FALSE 0.370 72.000 0.000 NA   NA
 5717593 5717594 CLK_0872 CLK_0873     FALSE 0.020 296.000 0.000 NA   NA
 5717594 5717595 CLK_0873 CLK_0874     FALSE 0.446 60.000 0.000 NA   NA
 5717595 5717596 CLK_0874 CLK_0875     TRUE 0.792 28.000 0.000 NA   NA
 5717596 5717597 CLK_0875 CLK_0876     FALSE 0.366 73.000 0.000 NA   NA
 5717597 5717598 CLK_0876 CLK_0877     FALSE 0.380 69.000 0.000 NA   NA
 5717598 5717599 CLK_0877 CLK_0878     FALSE 0.338 125.000 0.000 NA   NA
 5717599 5717600 CLK_0878 CLK_0879     FALSE 0.348 120.000 0.000 NA   NA
 5717600 5717601 CLK_0879 CLK_0880     TRUE 0.566 49.000 0.000 NA   NA
 5717601 5717602 CLK_0880 CLK_0881     FALSE 0.052 234.000 0.000 NA   NA
 5717602 5717603 CLK_0881 CLK_0882     FALSE 0.298 146.000 0.000 NA   NA
 5717603 5717604 CLK_0882 CLK_0883     TRUE 0.934 -3.000 0.000 NA   NA
 5717604 5717605 CLK_0883 CLK_0884     TRUE 0.823 24.000 0.000 NA   NA
 5717605 5717606 CLK_0884 CLK_0885     TRUE 0.602 44.000 0.000 NA   NA
 5717606 5717607 CLK_0885 CLK_0886     FALSE 0.267 155.000 0.000 NA   NA
 5717607 5717608 CLK_0886 CLK_0887     FALSE 0.361 74.000 0.000 NA   NA
 5717608 5717609 CLK_0887 CLK_0888     FALSE 0.335 84.000 0.000 NA   NA
 5717609 5717610 CLK_0888 CLK_0889     TRUE 0.941 -10.000 0.000 NA   NA
 5717610 5717611 CLK_0889 CLK_0890     TRUE 0.986 1.000 0.125 NA   NA
 5717611 5717612 CLK_0890 CLK_0891     TRUE 0.968 16.000 0.062 NA   NA
 5717612 5717613 CLK_0891 CLK_0892     TRUE 0.917 63.000 0.800 NA   NA
 5717613 5717614 CLK_0892 CLK_0893     TRUE 0.918 58.000 0.600 NA   NA
 5717614 5717615 CLK_0893 CLK_0894     TRUE 0.880 114.000 0.667 NA   NA
 5717615 5717616 CLK_0894 CLK_0895     FALSE 0.483 57.000 0.000 NA   NA
 5717616 5717617 CLK_0895 CLK_0898     TRUE 0.878 16.000 0.000 NA   NA
 5717617 5717618 CLK_0898 CLK_0899     TRUE 0.915 4.000 0.000 NA   NA
 5717618 5717619 CLK_0899 CLK_0900     TRUE 0.906 8.000 0.000 NA   NA
 5717619 5717620 CLK_0900 CLK_0901     TRUE 0.901 11.000 0.000 NA   NA
 5717620 5717621 CLK_0901 CLK_0902     TRUE 0.930 0.000 0.000 NA   NA
 5717621 5717622 CLK_0902 CLK_0903     FALSE 0.203 171.000 0.000 NA   NA
 5717622 5717623 CLK_0903 CLK_0904     FALSE 0.276 153.000 0.000 NA   NA
 5717623 5717624 CLK_0904 CLK_0905     FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 5717624 5717625 CLK_0905 CLK_0906     TRUE 0.994 2.000 0.667 NA   NA
 5717625 5717626 CLK_0906 CLK_0907     TRUE 0.930 0.000 0.000 NA   NA
 5717626 5717627 CLK_0907 CLK_0908     FALSE 0.333 129.000 0.000 NA   NA
 5717627 5717628 CLK_0908 CLK_0909     FALSE 0.321 98.000 0.000 NA   NA
 5717628 5717629 CLK_0909 CLK_0910     FALSE 0.004 509.000 0.000 NA   NA
 5717629 5717630 CLK_0910 CLK_0911     FALSE 0.108 203.000 0.000 NA   NA
 5717630 5717631 CLK_0911 CLK_0912     FALSE 0.269 220.000 0.079 1.000   NA
 5717631 5717632 CLK_0912 CLK_0913     FALSE 0.519 56.000 0.000 1.000   NA
 5717632 5717633 CLK_0913 CLK_0914     FALSE 0.004 480.000 0.000 1.000 N NA
 5717633 5717634 CLK_0914 CLK_0915   spoVB TRUE 0.948 32.000 0.137 1.000   NA
 5717638 5717639 CLK_0919 CLK_0920     FALSE 0.009 360.000 0.000 1.000 N NA
 5717640 5717641 CLK_0921 CLK_0923   npr FALSE 0.179 178.000 0.000 NA   NA
 5717641 5717642 CLK_0923 CLK_0924 npr npr TRUE 0.972 137.000 1.000 0.004 Y NA
 5717642 5717643 CLK_0924 CLK_0925 npr npr TRUE 0.847 116.000 0.000 0.004 Y NA
 5717643 5717644 CLK_0925 CLK_0926 npr npr TRUE 0.975 119.000 1.000 0.004 Y NA
 5717644 5717645 CLK_0926 CLK_0927 npr   TRUE 0.843 121.000 0.000 0.004 Y NA
 5717645 5717646 CLK_0927 CLK_0928   nadC FALSE 0.003 603.000 0.000 1.000 N NA
 5717646 5717647 CLK_0928 CLK_0929 nadC nadB TRUE 0.997 -19.000 0.046 1.000 Y NA
 5717647 5717648 CLK_0929 CLK_0930 nadB nadA TRUE 0.995 3.000 0.042 1.000 Y NA
 5717650 5717651 CLK_0932 CLK_0933 hlyIII ychF TRUE 0.573 121.000 0.002 0.043   NA
 5717652 5717653 CLK_0934 CLK_0935 mraZ mraW TRUE 0.873 80.000 0.635 NA   NA
 5717653 5717654 CLK_0935 CLK_0936 mraW   TRUE 0.553 82.000 0.008 1.000   NA
 5717654 5717655 CLK_0936 CLK_0937     TRUE 0.974 16.000 0.096 1.000   NA
 5717655 5717656 CLK_0937 CLK_0938   murE TRUE 0.646 231.000 0.265 1.000 Y NA
 5717656 5717657 CLK_0938 CLK_0939 murE murF TRUE 0.994 26.000 0.328 0.003 Y NA
 5717657 5717658 CLK_0939 CLK_0940 murF mraY TRUE 0.976 36.000 0.024 0.004 Y NA
 5717658 5717659 CLK_0940 CLK_0941 mraY   TRUE 0.626 79.000 0.014 0.004 N NA
 5717659 5717660 CLK_0941 CLK_0942     FALSE 0.032 323.000 0.015 NA N NA
 5717660 5717661 CLK_0942 CLK_0943     TRUE 0.958 11.000 0.014 NA   NA
 5717661 5717662 CLK_0943 CLK_0944   sbp TRUE 0.915 34.000 0.053 NA   NA
 5717662 5717663 CLK_0944 CLK_0945 sbp   TRUE 0.980 1.000 0.053 NA   NA
 5717663 5717664 CLK_0945 CLK_0946     TRUE 0.556 93.000 0.017 NA   NA
 5717664 5717665 CLK_0946 CLK_0947     TRUE 0.947 21.000 0.032 NA   NA
 5717665 5717666 CLK_0947 CLK_0948     TRUE 0.981 17.000 0.246 NA   NA
 5717666 5717667 CLK_0948 CLK_0949     TRUE 0.986 1.000 0.118 1.000   NA
 5717667 5717668 CLK_0949 CLK_0950   divIVA TRUE 0.989 16.000 0.579 NA   NA
 5717668 5717669 CLK_0950 CLK_0951 divIVA aroB FALSE 0.012 406.000 0.006 NA N NA
 5717669 5717670 CLK_0951 CLK_0952 aroB mtnN TRUE 0.961 1.000 0.003 1.000 N NA
 5717670 5717671 CLK_0952 CLK_0953 mtnN aroF TRUE 0.658 121.000 0.046 1.000 N NA
 5717671 5717672 CLK_0953 CLK_0954 aroF aroA TRUE 0.764 167.000 0.003 1.000 Y NA
 5717672 5717673 CLK_0954 CLK_0955 aroA   FALSE 0.074 217.000 0.000 1.000 N NA
 5717673 5717674 CLK_0955 CLK_0956   lspA FALSE 0.208 223.000 0.050 1.000 N NA
 5717674 5717675 CLK_0956 CLK_0957 lspA   TRUE 0.980 4.000 0.082 1.000 N NA
 5717675 5717676 CLK_0957 CLK_0958   pyrR FALSE 0.015 497.000 0.048 1.000 N NA
 5717676 5717677 CLK_0958 CLK_0959 pyrR   TRUE 0.973 44.000 0.140 1.000 Y NA
 5717679 5717680 CLK_0961 CLK_0962 xth   FALSE 0.351 227.000 0.000 1.000 Y NA
 5717680 5717681 CLK_0962 CLK_0963     FALSE 0.010 358.000 0.000 1.000   NA
 5717681 5717682 CLK_0963 CLK_0964   modA FALSE 0.357 180.000 0.015 1.000   NA
 5717682 5717683 CLK_0964 CLK_0965 modA modB TRUE 0.998 10.000 0.430 0.001 Y NA
 5717683 5717684 CLK_0965 CLK_0966 modB   FALSE 0.328 323.000 0.342 1.000 Y NA
 5717684 5717685 CLK_0966 CLK_0967     TRUE 0.724 54.000 0.013 NA   NA
 5717685 5717686 CLK_0967 CLK_0968     FALSE 0.010 352.000 0.000 NA   NA
 5717686 5717687 CLK_0968 CLK_0969     FALSE 0.007 401.000 0.000 NA   NA
 5717687 5717688 CLK_0969 CLK_0970     FALSE 0.022 291.000 0.000 NA   NA
 5717688 5717689 CLK_0970 CLK_0971     TRUE 0.915 48.000 0.308 NA N NA
 5717689 5717690 CLK_0971 CLK_0972     FALSE 0.311 142.000 0.000 NA   NA
 5717690 5717691 CLK_0972 CLK_0973     TRUE 0.739 90.000 0.147 NA   NA
 5717691 5717692 CLK_0973 CLK_0974     TRUE 0.972 24.000 0.235 NA   NA
 5717692 5717693 CLK_0974 CLK_0975   mtbC TRUE 0.959 26.000 0.118 1.000   NA
 5717693 5717694 CLK_0975 CLK_0976 mtbC   TRUE 0.746 80.000 0.118 1.000   NA
 5717694 5717695 CLK_0976 CLK_0977     FALSE 0.029 689.000 0.000 0.002 Y NA
 5717695 5717696 CLK_0977 CLK_0978     TRUE 0.947 23.000 0.044 1.000 N NA
 5717696 5717697 CLK_0978 CLK_0979     TRUE 0.998 -31.000 0.178 1.000 Y NA
 5717697 5717698 CLK_0979 CLK_0980     TRUE 0.950 131.000 0.444 NA Y NA
 5717700 5717701 CLK_0982 CLK_0983   asnA FALSE 0.012 328.000 0.000 1.000 N NA
 5717703 5717704 CLK_0985 CLK_0986     TRUE 0.983 27.000 0.024 1.000 Y NA
 5717704 5717705 CLK_0986 CLK_0987     FALSE 0.016 317.000 0.000 1.000   NA
 5717707 5717708 CLK_0989 CLK_0990     TRUE 0.994 1.000 0.636 1.000 N NA
 5717708 5717709 CLK_0990 CLK_0991     TRUE 0.983 12.000 0.182 1.000   NA
 5717709 5717710 CLK_0991 CLK_0992     FALSE 0.009 362.000 0.000 NA   NA
 5717710 5717711 CLK_0992 CLK_0993     TRUE 0.968 13.000 0.041 NA   NA
 5717711 5717712 CLK_0993 CLK_0994     TRUE 0.995 -7.000 0.611 0.031 N NA
 5717712 5717713 CLK_0994 CLK_0995     TRUE 0.988 36.000 0.278 0.031 Y NA
 5717713 5717714 CLK_0995 CLK_0996     TRUE 0.974 46.000 0.121 0.031 Y NA
 5717720 5717721 CLK_1002 CLK_1003     FALSE 0.337 108.000 0.000 NA   NA
 5717721 5717722 CLK_1003 CLK_1004     FALSE 0.009 366.000 0.000 NA   NA
 5717722 5717723 CLK_1004 CLK_1005     FALSE 0.032 270.000 0.000 NA   NA
 5717724 5717725 CLK_1006 CLK_1007     TRUE 0.912 5.000 0.000 NA   NA
 5717728 5717729 CLK_1010 CLK_1011     FALSE 0.281 151.000 0.000 NA   NA
 5717729 5717730 CLK_1011 CLK_1012   ogt TRUE 0.900 29.000 0.014 NA   NA
 5717730 5717731 CLK_1012 CLK_1013 ogt   TRUE 0.709 57.000 0.014 1.000   NA
 5717731 5717732 CLK_1013 CLK_1014     TRUE 0.694 165.000 0.263 NA   NA
 5717732 5717733 CLK_1014 CLK_1015     TRUE 0.965 25.000 0.168 NA   NA
 5717733 5717734 CLK_1015 CLK_1016     TRUE 0.812 45.000 0.021 1.000   NA
 5717734 5717735 CLK_1016 CLK_1017     FALSE 0.008 397.000 0.000 1.000   NA
 5717735 5717736 CLK_1017 CLK_1018     FALSE 0.009 381.000 0.000 1.000   NA
 5717736 5717737 CLK_1018 CLK_1019     TRUE 0.899 57.000 0.000 0.094 Y NA
 5717737 5717738 CLK_1019 CLK_1020     FALSE 0.028 289.000 0.000 0.094 N NA
 5717738 5717739 CLK_1020 CLK_1021     FALSE 0.005 436.000 0.000 1.000 N NA
 5717739 5717740 CLK_1021 CLK_1022     FALSE 0.321 98.000 0.000 NA   NA
 5717740 5717741 CLK_1022 CLK_1023     FALSE 0.057 383.000 0.250 NA   NA
 5717741 5717742 CLK_1023 CLK_1024     FALSE 0.342 110.000 0.000 NA   NA
 5717747 5717748 CLK_1029 CLK_1030     TRUE 0.774 58.000 0.051 NA   NA
 5717749 5717750 CLK_1031 CLK_1032   hgdC TRUE 0.874 127.000 0.722 NA N NA
 5717750 5717751 CLK_1032 CLK_1033 hgdC   TRUE 0.972 18.000 0.135 NA N NA
 5717751 5717752 CLK_1033 CLK_1034     TRUE 0.992 2.000 0.405 1.000 N NA
 5717752 5717753 CLK_1034 CLK_1035   folE TRUE 0.991 4.000 0.429 1.000 N NA
 5717753 5717754 CLK_1035 CLK_1036 folE   FALSE 0.331 184.000 0.015 1.000   NA
 5717754 5717755 CLK_1036 CLK_1037     FALSE 0.524 104.000 0.005 1.000   NA
 5717755 5717756 CLK_1037 CLK_1038     FALSE 0.208 169.000 0.000 NA   NA
 5717756 5717757 CLK_1038 CLK_1039   deoC FALSE 0.014 324.000 0.000 NA   NA
 5717757 5717758 CLK_1039 CLK_1040 deoC rbsK FALSE 0.029 352.000 0.026 1.000 N NA
 5717758 5717759 CLK_1040 CLK_1041 rbsK   FALSE 0.008 384.000 0.000 NA   NA
 5717759 5717760 CLK_1041 CLK_1042     FALSE 0.351 118.000 0.000 NA   NA
 5717760 5717761 CLK_1042 CLK_1043     TRUE 0.983 14.000 0.231 NA   NA
 5717761 5717762 CLK_1043 CLK_1044     TRUE 0.981 18.000 0.267 NA   NA
 5717764 5717765 CLK_1046 CLK_1047     TRUE 0.703 81.000 0.070 1.000   NA
 5717765 5717766 CLK_1047 CLK_1048     TRUE 0.589 153.000 0.047 NA   NA
 5717766 5717767 CLK_1048 CLK_1049     FALSE 0.017 307.000 0.000 NA   NA
 5717767 5717768 CLK_1049 CLK_1050     TRUE 0.976 3.000 0.041 NA   NA
 5717768 5717769 CLK_1050 CLK_1051     TRUE 0.992 3.000 0.490 NA   NA
 5717769 5717770 CLK_1051 CLK_1052     TRUE 0.832 117.000 0.352 NA   NA
 5717770 5717771 CLK_1052 CLK_1053     TRUE 0.999 -9.000 0.741 0.020 Y NA
 5717771 5717772 CLK_1053 CLK_1054   arcA FALSE 0.003 564.000 0.000 1.000 N NA
 5717772 5717773 CLK_1054 CLK_1055 arcA arcD TRUE 0.881 125.000 0.022 1.000 Y NA
 5717775 5717776 CLK_1057 CLK_1058     FALSE 0.012 339.000 0.000 NA   NA
 5717776 5717777 CLK_1058 CLK_1059     FALSE 0.418 190.000 0.067 1.000   NA
 5717777 5717778 CLK_1059 CLK_1060     FALSE 0.006 425.000 0.000 1.000   NA
 5717778 5717779 CLK_1060 CLK_1061     FALSE 0.008 386.000 0.000 1.000   NA
 5717779 5717780 CLK_1061 CLK_1062     FALSE 0.292 148.000 0.000 NA   NA
 5717780 5717781 CLK_1062 CLK_1064     TRUE 0.923 2.000 0.000 NA   NA
 5717781 5717782 CLK_1064 CLK_1065     FALSE 0.007 392.000 0.000 1.000 N NA
 5717782 5717783 CLK_1065 CLK_1066     FALSE 0.157 293.000 0.000 1.000 Y NA
 5717783 5717784 CLK_1066 CLK_1067     FALSE 0.278 248.000 0.000 1.000 Y NA
 5717784 5717785 CLK_1067 CLK_1068     TRUE 0.976 42.000 0.167 1.000 Y NA
 5717785 5717786 CLK_1068 CLK_1069     TRUE 0.993 4.000 0.610 NA   NA
 5717786 5717787 CLK_1069 CLK_1070     FALSE 0.061 226.000 0.000 NA   NA
 5717789 5717790 CLK_1072 CLK_1073     TRUE 0.859 101.000 0.600 NA   NA
 5717791 5717792 CLK_1074 CLK_1075     TRUE 0.998 -22.000 0.261 1.000 Y NA
 5717796 5717797 CLK_1079 CLK_1080     TRUE 0.984 9.000 0.171 1.000   NA
 5717797 5717798 CLK_1080 CLK_1081     FALSE 0.036 263.000 0.000 NA   NA
 5717799 5717800 CLK_1082 CLK_1083     TRUE 0.739 190.000 1.000 NA   NA
 5717802 5717803 CLK_1085 CLK_1086 metF   TRUE 0.545 173.000 0.045 0.002   NA
 5717803 5717804 CLK_1086 CLK_1087     TRUE 0.990 -10.000 0.075 0.001   NA
 5717806 5717807 CLK_1089 CLK_1090     FALSE 0.003 672.000 0.000 NA   NA
 5717807 5717808 CLK_1090 CLK_1091     TRUE 0.995 -7.000 0.667 NA   NA
 5717808 5717809 CLK_1091 CLK_1092   acoR FALSE 0.013 331.000 0.000 NA   NA
 5717809 5717810 CLK_1092 CLK_1093 acoR   TRUE 0.592 176.000 0.182 NA   NA
 5717810 5717811 CLK_1093 CLK_1094   acoA TRUE 0.959 21.000 0.065 NA   NA
 5717811 5717812 CLK_1094 CLK_1095 acoA acoB TRUE 0.996 3.000 0.076 0.001 Y NA
 5717812 5717813 CLK_1095 CLK_1096 acoB acoX TRUE 0.892 52.000 0.162 0.055   NA
 5717813 5717814 CLK_1096 CLK_1097 acoX acoC TRUE 0.928 36.000 0.081 0.055   NA
 5717814 5717815 CLK_1097 CLK_1098 acoC acoL TRUE 0.995 13.000 0.148 1.000 Y NA
 5717815 5717816 CLK_1098 CLK_1099 acoL   TRUE 0.950 25.000 0.074 1.000 N NA
 5717816 5717817 CLK_1099 CLK_1100     FALSE 0.007 388.000 0.000 1.000 N NA
 5717817 5717818 CLK_1100 CLK_1101     TRUE 0.996 -7.000 0.793 0.093 N NA
 5717818 5717819 CLK_1101 CLK_1102   thrC FALSE 0.019 297.000 0.000 1.000 N NA
 5717819 5717820 CLK_1102 CLK_1103 thrC thrB TRUE 0.996 10.000 0.233 1.000 Y NA
 5717820 5717821 CLK_1103 CLK_1104 thrB   TRUE 0.864 127.000 0.008 1.000 Y NA
 5717821 5717822 CLK_1104 CLK_1105   hom FALSE 0.517 223.000 0.010 0.003 Y NA
 5717822 5717823 CLK_1105 CLK_1106 hom   FALSE 0.003 632.000 0.000 1.000 N NA
 5717823 5717824 CLK_1106 CLK_1107     FALSE 0.004 510.000 0.000 1.000 N NA
 5717824 5717825 CLK_1107 CLK_1108     FALSE 0.099 329.000 0.000 1.000 Y NA
 5717825 5717826 CLK_1108 CLK_1109   gltA TRUE 0.995 0.000 0.667 0.041 N NA
 5717826 5717827 CLK_1109 CLK_1110 gltA   FALSE 0.055 229.000 0.000 1.000 N NA
 5717827 5717828 CLK_1110 CLK_1111     TRUE 0.908 7.000 0.000 NA   NA
 5717828 5717829 CLK_1111 CLK_1112     FALSE 0.006 424.000 0.000 NA   NA
 5717829 5717830 CLK_1112 CLK_1113     FALSE 0.319 94.000 0.000 NA   NA
 5717830 5717831 CLK_1113 CLK_1114     FALSE 0.108 203.000 0.000 NA   NA
 5717831 5717832 CLK_1114 CLK_1115     FALSE 0.010 350.000 0.000 NA   NA
 5717832 5717833 CLK_1115 CLK_1116     FALSE 0.337 108.000 0.000 NA   NA
 5717833 5717834 CLK_1116 CLK_1117     FALSE 0.022 291.000 0.000 NA   NA
 5717834 5717835 CLK_1117 CLK_1118     FALSE 0.004 496.000 0.000 NA   NA
 5717835 5717836 CLK_1118 CLK_1119     FALSE 0.262 156.000 0.000 NA   NA
 5717836 5717837 CLK_1119 CLK_1120     TRUE 0.692 38.000 0.000 1.000   NA
 5717837 5717838 CLK_1120 CLK_1121     FALSE 0.004 501.000 0.000 NA   NA
 5717838 5717839 CLK_1121 CLK_1122     TRUE 0.964 33.000 0.379 NA   NA
 5717839 5717840 CLK_1122 CLK_1123   alr FALSE 0.005 438.000 0.000 NA   NA
 5717840 5717841 CLK_1123 CLK_1124 alr   FALSE 0.005 459.000 0.000 1.000 N NA
 5717841 5717842 CLK_1124 CLK_1125     TRUE 0.741 58.000 0.016 0.093   NA
 5717842 5717843 CLK_1125 CLK_1126     FALSE 0.050 238.000 0.000 NA   NA
 5717845 5717846 CLK_1128 CLK_1129     FALSE 0.003 911.000 0.000 NA   NA
 5717850 5717851 CLK_1133 CLK_1134     TRUE 0.587 137.000 0.027 1.000 N NA
 5717851 5717852 CLK_1134 CLK_1135     TRUE 0.998 14.000 0.667 0.031 Y NA
 5717852 5717853 CLK_1135 CLK_1136     TRUE 0.999 4.000 1.000 0.031 Y NA
 5717853 5717854 CLK_1136 CLK_1137     TRUE 0.963 31.000 0.265 1.000   NA
 5717856 5717857 CLK_1139 CLK_1140     FALSE 0.030 272.000 0.000 NA   NA
 5717859 5717860 CLK_1142 CLK_1143     FALSE 0.489 148.000 0.011 1.000 N NA
 5717860 5717861 CLK_1143 CLK_1144     TRUE 0.938 -7.000 0.000 NA   NA
 5717861 5717862 CLK_1144 CLK_1145   fruK TRUE 0.807 26.000 0.000 NA   NA
 5717864 5717865 CLK_1147 CLK_1148     TRUE 0.842 151.000 0.667 NA   NA
 5717867 5717868 CLK_1150 CLK_1151     TRUE 0.685 37.000 0.000 NA   NA
 5717869 5717870 CLK_1152 CLK_1153 safA   FALSE 0.006 402.000 0.000 NA   NA
 5717871 5717872 CLK_1154 CLK_1155     FALSE 0.008 371.000 0.000 1.000 N NA
 5717874 5717875 CLK_1157 CLK_1158     FALSE 0.004 538.000 0.000 NA   NA
 5717877 5717878 CLK_1160 CLK_1161     FALSE 0.015 323.000 0.000 1.000   NA
 5717878 5717879 CLK_1161 CLK_1162   deaD FALSE 0.281 188.000 0.006 1.000   NA
 5717879 5717880 CLK_1162 CLK_1163 deaD   FALSE 0.526 154.000 0.025 NA   NA
 5717880 5717881 CLK_1163 CLK_1164     FALSE 0.007 394.000 0.000 NA   NA
 5717881 5717882 CLK_1164 CLK_1165     FALSE 0.005 456.000 0.000 1.000   NA
 5717884 5717885 CLK_1167 CLK_1168   cheX TRUE 0.996 0.000 0.100 NA Y NA
 5717887 5717888 CLK_1170 CLK_1171     TRUE 0.565 61.000 0.000 0.002   NA
 5717893 5717894 CLK_1176 CLK_1177     TRUE 0.947 -40.000 0.000 NA   NA
 5717894 5717895 CLK_1177 CLK_1178   hfq TRUE 0.816 25.000 0.000 NA   NA
 5717895 5717896 CLK_1178 CLK_1179 hfq miaA TRUE 0.774 86.000 0.192 1.000   NA
 5717896 5717897 CLK_1179 CLK_1180 miaA   TRUE 0.971 17.000 0.097 1.000 N NA
 5717897 5717898 CLK_1180 CLK_1181   mutS TRUE 0.934 146.000 0.220 0.002 Y NA
 5717898 5717899 CLK_1181 CLK_1182 mutS miaB TRUE 0.653 80.000 0.041 1.000 N NA
 5717900 5717901 CLK_1183 CLK_1184     TRUE 0.702 85.000 0.087 NA   NA
 5717901 5717902 CLK_1184 CLK_1185   aspB TRUE 0.699 55.000 0.008 NA   NA
 5717903 5717904 CLK_1186 CLK_1187     FALSE 0.341 82.000 0.000 NA   NA
 5717904 5717905 CLK_1187 CLK_1188     FALSE 0.044 247.000 0.000 NA   NA
 5717905 5717906 CLK_1188 CLK_1189   cmk TRUE 0.714 65.000 0.047 1.000 N NA
 5717906 5717907 CLK_1189 CLK_1190 cmk aroH TRUE 0.595 76.000 0.020 1.000 N NA
 5717907 5717908 CLK_1190 CLK_1191 aroH   TRUE 0.976 0.000 0.024 1.000   NA
 5717908 5717909 CLK_1191 CLK_1192   gluD FALSE 0.023 294.000 0.000 1.000   NA
 5717909 5717910 CLK_1192 CLK_1193 gluD   FALSE 0.188 234.000 0.068 1.000 N NA
 5717910 5717911 CLK_1193 CLK_1194   rluB FALSE 0.019 382.000 0.013 1.000 N NA
 5717913 5717914 CLK_1196 CLK_1197     FALSE 0.321 98.000 0.000 NA   NA
 5717914 5717915 CLK_1197 CLK_1198     FALSE 0.021 295.000 0.000 NA   NA
 5717916 5717917 CLK_1199 CLK_1200     FALSE 0.008 388.000 0.000 1.000   NA
 5717918 5717919 CLK_1201 CLK_1202     TRUE 0.995 2.000 0.034 1.000 Y NA
 5717919 5717920 CLK_1202 CLK_1203     TRUE 0.747 115.000 0.111 1.000   NA
 5717920 5717921 CLK_1203 CLK_1204     TRUE 0.738 119.000 0.111 NA   NA
 5717923 5717924 CLK_1206 CLK_1207 pcaC   FALSE 0.009 368.000 0.000 1.000   NA
 5717924 5717925 CLK_1207 CLK_1208     FALSE 0.153 185.000 0.000 NA   NA
 5717925 5717926 CLK_1208 CLK_1209     FALSE 0.052 234.000 0.000 NA   NA
 5717926 5717927 CLK_1209 CLK_1210     TRUE 0.640 67.000 0.019 NA   NA
 5717928 5717929 CLK_1211 CLK_1212     TRUE 0.987 3.000 0.200 1.000   NA
 5717929 5717930 CLK_1212 CLK_1213     TRUE 0.987 -3.000 0.111 1.000   NA
 5717930 5717931 CLK_1213 CLK_1214     TRUE 0.674 134.000 0.056 1.000   NA
 5717932 5717933 CLK_1215 CLK_1216 hypE hypD TRUE 0.906 167.000 0.353 1.000 Y NA
 5717933 5717934 CLK_1216 CLK_1217 hypD   TRUE 0.998 -7.000 0.363 NA Y NA
 5717934 5717935 CLK_1217 CLK_1218   hypF TRUE 0.998 -37.000 0.181 NA Y NA
 5717935 5717936 CLK_1218 CLK_1219 hypF   TRUE 0.974 -16.000 0.008 NA   NA
 5717936 5717937 CLK_1219 CLK_1220     FALSE 0.338 83.000 0.000 NA   NA
 5717937 5717938 CLK_1220 CLK_1221     FALSE 0.348 120.000 0.000 NA   NA
 5717938 5717939 CLK_1221 CLK_1222     FALSE 0.508 157.000 0.022 1.000   NA
 5717939 5717940 CLK_1222 CLK_1223   hupL TRUE 0.983 33.000 0.079 1.000 Y NA
 5717940 5717941 CLK_1223 CLK_1224 hupL hupS TRUE 0.969 102.000 0.778 0.001 Y NA
 5717942 5717943 CLK_1225 CLK_1226     FALSE 0.006 421.000 0.000 NA   NA
 5717944 5717945 CLK_1227 CLK_1228 carB carA TRUE 0.988 28.000 0.054 0.001 Y NA
 5717946 5717947 CLK_1229 CLK_1230     FALSE 0.004 490.000 0.000 NA   NA
 5717948 5717949 CLK_1231 CLK_1232     FALSE 0.011 350.000 0.000 1.000   NA
 5717949 5717950 CLK_1232 CLK_1233     TRUE 0.968 20.000 0.048 0.001   NA
 5717950 5717951 CLK_1233 CLK_1234     TRUE 0.996 12.000 0.154 0.001 Y NA
 5717951 5717952 CLK_1234 CLK_1235     FALSE 0.039 259.000 0.000 NA   NA
 5717952 5717953 CLK_1235 CLK_1236     FALSE 0.058 229.000 0.000 NA   NA
 5717953 5717954 CLK_1236 CLK_1237     FALSE 0.032 262.000 0.000 NA N NA
 5717957 5717958 CLK_1240 CLK_1241   ytfJ FALSE 0.387 68.000 0.000 NA   NA
 5717959 5717960 CLK_1242 CLK_1243 scpB scpA TRUE 0.995 -7.000 0.570 NA   NA
 5717960 5717961 CLK_1243 CLK_1244 scpA   FALSE 0.328 134.000 0.000 NA   NA
 5717961 5717962 CLK_1244 CLK_1245   dacF FALSE 0.062 225.000 0.000 NA   NA
 5717962 5717963 CLK_1245 CLK_1246 dacF   TRUE 0.583 123.000 0.018 NA   NA
 5717963 5717964 CLK_1246 CLK_1247     FALSE 0.298 146.000 0.000 NA   NA
 5717964 5717965 CLK_1247 CLK_1248     TRUE 0.568 142.000 0.024 NA   NA
 5717965 5717966 CLK_1248 CLK_1249   pdp TRUE 0.677 107.000 0.061 NA   NA
 5717966 5717967 CLK_1249 CLK_1250 pdp punA FALSE 0.172 286.000 0.000 1.000 Y NA
 5717967 5717968 CLK_1250 CLK_1251 punA xerD TRUE 0.805 38.000 0.004 1.000 N NA
 5717968 5717969 CLK_1251 CLK_1252 xerD   TRUE 0.598 63.000 0.004 NA   NA
 5717969 5717970 CLK_1252 CLK_1253     TRUE 0.981 -9.000 0.034 NA   NA
 5717972 5717973 CLK_1255 CLK_1256     FALSE 0.004 493.000 0.000 1.000 N NA
 5717975 5717976 CLK_1258 CLK_1259     FALSE 0.002 1698.000 0.000 NA   NA
 5717976 5717977 CLK_1259 CLK_1260     FALSE 0.325 136.000 0.000 NA   NA
 5717977 5717978 CLK_1260 CLK_1262   spo0A FALSE 0.246 160.000 0.000 NA   NA
 5717978 5717979 CLK_1262 CLK_1263 spo0A spoIVB FALSE 0.050 429.000 0.393 1.000   NA
 5717979 5717980 CLK_1263 CLK_1264 spoIVB metA FALSE 0.006 422.000 0.000 1.000   NA
 5717980 5717981 CLK_1264 CLK_1265 metA hom TRUE 0.980 27.000 0.005 1.000 Y NA
 5717981 5717982 CLK_1265 CLK_1266 hom   TRUE 0.962 40.000 0.017 1.000 Y NA
 5717982 5717983 CLK_1266 CLK_1267   recN FALSE 0.018 299.000 0.000 1.000 N NA
 5717983 5717984 CLK_1267 CLK_1268 recN argR TRUE 0.974 13.000 0.086 1.000 N NA
 5717984 5717985 CLK_1268 CLK_1269 argR ppnK TRUE 0.984 2.000 0.117 1.000 N NA
 5717985 5717986 CLK_1269 CLK_1270 ppnK   TRUE 0.986 0.000 0.120 1.000 N NA
 5717986 5717987 CLK_1270 CLK_1271   dxs TRUE 0.971 22.000 0.189 1.000 N NA
 5717987 5717988 CLK_1271 CLK_1272 dxs   TRUE 0.978 1.000 0.037 NA   NA
 5717988 5717989 CLK_1272 CLK_1273   ispA FALSE 0.003 803.000 0.000 NA   NA
 5717989 5717990 CLK_1273 CLK_1274 ispA xseB TRUE 0.665 125.000 0.053 1.000 N NA
 5717990 5717991 CLK_1274 CLK_1275 xseB xseA TRUE 0.956 94.000 0.412 0.001 Y NA
 5717991 5717992 CLK_1275 CLK_1276 xseA nusB TRUE 0.681 71.000 0.043 1.000 N NA
 5717992 5717993 CLK_1276 CLK_1277 nusB asp TRUE 0.773 139.000 0.223 NA   NA
 5717993 5717994 CLK_1277 CLK_1278 asp   TRUE 0.727 82.000 0.108 NA   NA
 5717994 5717995 CLK_1278 CLK_1279     TRUE 0.883 62.000 0.407 NA   NA
 5717995 5717996 CLK_1279 CLK_1280   spoIIIAF TRUE 0.888 139.000 0.907 NA   NA
 5717996 5717997 CLK_1280 CLK_1281 spoIIIAF   TRUE 0.975 36.000 0.918 NA   NA
 5717997 5717998 CLK_1281 CLK_1282     TRUE 0.994 9.000 0.864 NA   NA
 5717998 5717999 CLK_1282 CLK_1283     TRUE 0.985 27.000 0.895 NA   NA
 5717999 5718000 CLK_1283 CLK_1284     TRUE 0.964 43.000 0.926 NA   NA
 5718000 5718001 CLK_1284 CLK_1285     TRUE 0.965 37.000 0.604 NA   NA
 5718001 5718002 CLK_1285 CLK_1286     FALSE 0.436 195.000 0.112 NA   NA
 5718002 5718003 CLK_1286 CLK_1287   efp TRUE 0.855 41.000 0.037 NA   NA
 5718003 5718004 CLK_1287 CLK_1288 efp aroQ FALSE 0.527 89.000 0.010 1.000 N NA
 5718004 5718005 CLK_1288 CLK_1289 aroQ aroK TRUE 0.832 155.000 0.015 1.000 Y NA
 5718005 5718006 CLK_1289 CLK_1290 aroK   TRUE 0.573 134.000 0.020 NA   NA
 5718006 5718007 CLK_1290 CLK_1291     TRUE 0.994 6.000 1.000 NA   NA
 5718007 5718008 CLK_1291 CLK_1292     TRUE 0.984 16.000 0.333 NA   NA
 5718008 5718009 CLK_1292 CLK_1293     TRUE 0.978 28.000 0.500 NA   NA
 5718009 5718010 CLK_1293 CLK_1294     TRUE 0.995 -21.000 0.500 NA   NA
 5718010 5718011 CLK_1294 CLK_1295     TRUE 0.994 -3.000 0.500 NA   NA
 5718011 5718012 CLK_1295 CLK_1296     TRUE 0.996 -19.000 0.667 NA   NA
 5718012 5718013 CLK_1296 CLK_1297     FALSE 0.365 221.000 0.250 NA   NA
 5718013 5718014 CLK_1297 CLK_1298     FALSE 0.150 186.000 0.000 NA   NA
 5718014 5718015 CLK_1298 CLK_1299     FALSE 0.127 195.000 0.000 NA   NA
 5718015 5718016 CLK_1299 CLK_1300     TRUE 0.987 -6.000 0.100 NA   NA
 5718016 5718017 CLK_1300 CLK_1301     TRUE 0.910 6.000 0.000 NA   NA
 5718017 5718018 CLK_1301 CLK_1302     TRUE 0.941 -10.000 0.000 NA   NA
 5718018 5718019 CLK_1302 CLK_1303     FALSE 0.056 231.000 0.000 NA   NA
 5718019 5718020 CLK_1303 CLK_1304     FALSE 0.373 71.000 0.000 NA   NA
 5718020 5718021 CLK_1304 CLK_1305     TRUE 0.942 -12.000 0.000 NA   NA
 5718021 5718022 CLK_1305 CLK_1306     TRUE 0.942 -13.000 0.000 NA   NA
 5718022 5718023 CLK_1306 CLK_1307     FALSE 0.330 87.000 0.000 NA   NA
 5718023 5718024 CLK_1307 CLK_1308     TRUE 0.995 0.000 0.714 NA   NA
 5718024 5718025 CLK_1308 CLK_1309     TRUE 0.998 0.000 0.333 0.003 Y NA
 5718025 5718026 CLK_1309 CLK_1310     FALSE 0.245 153.000 0.000 NA N NA
 5718026 5718027 CLK_1310 CLK_1311     TRUE 0.712 145.000 0.135 NA   NA
 5718027 5718028 CLK_1311 CLK_1312     FALSE 0.003 662.000 0.000 NA   NA
 5718028 5718029 CLK_1312 CLK_1313     TRUE 0.993 -31.000 0.286 NA   NA
 5718029 5718030 CLK_1313 CLK_1314     FALSE 0.057 230.000 0.000 NA   NA
 5718030 5718031 CLK_1314 CLK_1315     TRUE 0.645 40.000 0.000 NA   NA
 5718031 5718032 CLK_1315 CLK_1316     FALSE 0.343 81.000 0.000 NA   NA
 5718032 5718033 CLK_1316 CLK_1317     TRUE 0.923 2.000 0.000 NA   NA
 5718033 5718034 CLK_1317 CLK_1318     TRUE 0.853 20.000 0.000 NA   NA
 5718034 5718035 CLK_1318 CLK_1319     TRUE 0.923 2.000 0.000 NA   NA
 5718035 5718036 CLK_1319 CLK_1320     TRUE 0.979 16.000 0.182 NA   NA
 5718036 5718037 CLK_1320 CLK_1321     TRUE 0.992 -15.000 0.273 NA   NA
 5718037 5718038 CLK_1321 CLK_1322     TRUE 0.930 0.000 0.000 NA   NA
 5718038 5718039 CLK_1322 CLK_1323     TRUE 0.554 50.000 0.000 NA   NA
 5718039 5718040 CLK_1323 CLK_1324     TRUE 0.775 30.000 0.000 NA   NA
 5718040 5718041 CLK_1324 CLK_1325     TRUE 0.824 57.000 0.100 NA   NA
 5718041 5718042 CLK_1325 CLK_1326     TRUE 0.991 0.000 0.300 NA   NA
 5718042 5718043 CLK_1326 CLK_1327     TRUE 0.994 0.000 0.583 NA   NA
 5718043 5718044 CLK_1327 CLK_1328     TRUE 0.995 1.000 0.750 NA   NA
 5718044 5718045 CLK_1328 CLK_1329     TRUE 0.934 -3.000 0.000 NA   NA
 5718045 5718046 CLK_1329 CLK_1330     TRUE 0.994 0.000 0.667 NA   NA
 5718046 5718047 CLK_1330 CLK_1331     TRUE 0.994 2.000 0.667 NA   NA
 5718047 5718048 CLK_1331 CLK_1332     TRUE 0.585 46.000 0.000 NA   NA
 5718048 5718049 CLK_1332 CLK_1333     TRUE 0.853 20.000 0.000 NA   NA
 5718049 5718050 CLK_1333 CLK_1334     FALSE 0.033 269.000 0.000 NA   NA
 5718050 5718051 CLK_1334 CLK_1335     FALSE 0.091 209.000 0.000 NA   NA
 5718051 5718052 CLK_1335 CLK_1336     TRUE 0.992 0.000 0.333 NA   NA
 5718052 5718053 CLK_1336 CLK_1337     TRUE 0.985 4.000 0.167 NA   NA
 5718053 5718054 CLK_1337 CLK_1338     FALSE 0.338 83.000 0.000 NA   NA
 5718054 5718055 CLK_1338 CLK_1339     FALSE 0.441 87.000 0.000 0.008   NA
 5718055 5718056 CLK_1339 CLK_1340     FALSE 0.074 247.000 0.000 0.001   NA
 5718056 5718057 CLK_1340 CLK_1341     FALSE 0.309 163.000 0.000 0.055   NA
 5718057 5718058 CLK_1341 CLK_1342     FALSE 0.033 288.000 0.000 0.077   NA
 5718058 5718059 CLK_1342 CLK_1343     TRUE 0.967 30.000 0.222 0.054   NA
 5718059 5718060 CLK_1343 CLK_1344     TRUE 0.594 48.000 0.000 1.000   NA
 5718060 5718061 CLK_1344 CLK_1345     TRUE 0.784 29.000 0.000 NA   NA
 5718061 5718062 CLK_1345 CLK_1346     FALSE 0.446 60.000 0.000 NA   NA
 5718062 5718063 CLK_1346 CLK_1347     FALSE 0.496 56.000 0.000 NA   NA
 5718063 5718064 CLK_1347 CLK_1348     TRUE 0.775 30.000 0.000 NA   NA
 5718064 5718065 CLK_1348 CLK_1349     FALSE 0.416 67.000 0.000 1.000   NA
 5718065 5718066 CLK_1349 CLK_1350     TRUE 0.915 4.000 0.000 NA   NA
 5718066 5718067 CLK_1350 CLK_1351     TRUE 0.887