MicrobesOnline Operon Predictions for Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. E02-1180

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6461831 6461832 SentesTyphi_010100000005 SentesTyphi_010100000010   ansB TRUE 0.761 19.000 0.000 NA   NA
 6461833 6461834 SentesTyphi_010100000025 SentesTyphi_010100000030     TRUE 0.890 8.000 0.000 NA   NA
 6461834 6461835 SentesTyphi_010100000030 SentesTyphi_010100000035     TRUE 0.898 -3.000 0.081 NA   NA
 6461836 6461837 SentesTyphi_010100000050 SentesTyphi_010100000055     FALSE 0.161 130.000 0.000 1.000 N NA
 6461838 6461839 SentesTyphi_010100000060 SentesTyphi_010100000065     TRUE 0.964 0.000 0.263 NA N NA
 6461839 6461840 SentesTyphi_010100000065 SentesTyphi_010100000070     FALSE 0.089 216.000 0.120 NA N NA
 6461840 6461841 SentesTyphi_010100000070 SentesTyphi_010100000075     TRUE 0.903 20.000 0.173 NA   NA
 6461841 6461842 SentesTyphi_010100000075 SentesTyphi_010100000080     TRUE 0.855 29.000 0.201 NA   NA
 6461842 6461843 SentesTyphi_010100000080 SentesTyphi_010100000085     TRUE 0.559 96.000 0.210 NA   NA
 6461843 6461844 SentesTyphi_010100000085 SentesTyphi_010100000090     FALSE 0.253 79.000 0.042 NA   NA
 6461844 6461845 SentesTyphi_010100000090 SentesTyphi_010100000095     FALSE 0.024 479.000 0.000 1.000 N NA
 6461845 6461846 SentesTyphi_010100000095 SentesTyphi_010100000100     FALSE 0.086 149.000 0.004 NA   NA
 6461847 6461848 SentesTyphi_010100000105 SentesTyphi_010100000110     FALSE 0.272 228.000 0.055 1.000 Y NA
 6461852 6461853 SentesTyphi_010100000130 SentesTyphi_010100000135     FALSE 0.041 270.000 0.000 NA   NA
 6461854 6461855 SentesTyphi_010100000140 SentesTyphi_010100000165   pntB FALSE 0.086 1977.000 0.000 0.084 N NA
 6461855 6461856 SentesTyphi_010100000165 SentesTyphi_010100000170 pntB pntA TRUE 0.999 11.000 0.745 0.001 Y NA
 6461858 6461859 SentesTyphi_010100000200 SentesTyphi_010100000205     FALSE 0.113 83.000 0.004 1.000 N NA
 6461859 6461860 SentesTyphi_010100000205 SentesTyphi_010100000210     FALSE 0.026 356.000 0.000 1.000 N NA
 6461860 6461861 SentesTyphi_010100000210 SentesTyphi_010100000225     FALSE 0.023 1244.000 0.000 1.000 N NA
 6461864 6461865 SentesTyphi_010100000240 SentesTyphi_010100000245 glpQ glpT TRUE 0.982 5.000 0.396 1.000 N NA
 6461866 6461867 SentesTyphi_010100000250 SentesTyphi_010100000255 glpA   TRUE 0.995 -10.000 0.650 0.001 N NA
 6461867 6461868 SentesTyphi_010100000255 SentesTyphi_010100000270     FALSE 0.029 1612.000 0.000 NA   NA
 6461869 6461870 SentesTyphi_010100000275 SentesTyphi_010100000280     TRUE 0.984 6.000 0.400 NA   NA
 6461870 6461871 SentesTyphi_010100000280 SentesTyphi_010100000285     TRUE 0.874 26.000 0.250 NA N NA
 6461871 6461872 SentesTyphi_010100000285 SentesTyphi_010100000290     FALSE 0.293 56.000 0.060 NA N NA
 6461878 6461879 SentesTyphi_010100000330 SentesTyphi_010100000335     TRUE 0.889 10.000 0.000 NA   NA
 6461879 6461880 SentesTyphi_010100000335 SentesTyphi_010100000340     FALSE 0.187 133.000 0.000 NA   NA
 6461881 6461882 SentesTyphi_010100000345 SentesTyphi_010100000350     FALSE 0.031 376.000 0.000 NA   NA
 6461884 6461885 SentesTyphi_010100000360 SentesTyphi_010100000365     FALSE 0.270 79.000 0.000 NA   NA
 6461888 6461889 SentesTyphi_010100000380 SentesTyphi_010100000385     FALSE 0.034 329.000 0.000 NA   NA
 6461890 6461891 SentesTyphi_010100000400 SentesTyphi_010100000405   pphA FALSE 0.053 227.000 0.000 NA   NA
 6461892 6461893 SentesTyphi_010100000410 SentesTyphi_010100000415     TRUE 0.665 110.000 0.353 NA   NA
 6461893 6461894 SentesTyphi_010100000415 SentesTyphi_010100000420   yebU FALSE 0.381 115.000 0.121 NA   NA
 6461894 6461895 SentesTyphi_010100000420 SentesTyphi_010100000425 yebU   TRUE 0.967 -24.000 0.420 NA   NA
 6461896 6461897 SentesTyphi_010100000440 SentesTyphi_010100000445     TRUE 0.693 98.000 0.081 NA Y NA
 6461897 6461898 SentesTyphi_010100000445 SentesTyphi_010100000450     TRUE 0.927 20.000 0.304 NA N NA
 6461898 6461899 SentesTyphi_010100000450 SentesTyphi_010100000455     FALSE 0.243 196.000 0.042 0.021 N NA
 6461903 6461904 SentesTyphi_010100000475 SentesTyphi_010100000480     TRUE 0.808 71.000 0.500 NA   NA
 6461904 6461905 SentesTyphi_010100000480 SentesTyphi_010100000485     FALSE 0.028 806.000 0.000 NA   NA
 6461905 6461906 SentesTyphi_010100000485 SentesTyphi_010100000490     FALSE 0.046 220.000 0.000 1.000 N NA
 6461906 6461907 SentesTyphi_010100000490 SentesTyphi_010100000495   rrmA FALSE 0.382 66.000 0.045 1.000   NA
 6461909 6461910 SentesTyphi_010100000505 SentesTyphi_010100000510   umuC FALSE 0.126 161.000 0.000 NA   NA
 6461911 6461912 SentesTyphi_010100t00727 SentesTyphi_010100000515     FALSE 0.286 74.000 0.000 NA   NA
 6461912 6461913 SentesTyphi_010100000515 SentesTyphi_010100000520     TRUE 0.554 32.000 0.040 NA   NA
 6461914 6461915 SentesTyphi_010100000525 SentesTyphi_010100000530     TRUE 0.628 28.000 0.000 NA   NA
 6461916 6461917 SentesTyphi_010100000535 SentesTyphi_010100000540     FALSE 0.445 125.000 0.024 0.023 N NA
 6461918 6461919 SentesTyphi_010100000545 SentesTyphi_010100000550     FALSE 0.224 110.000 0.000 NA   NA
 6461919 6461920 SentesTyphi_010100000550 SentesTyphi_010100000555     TRUE 0.834 28.000 0.182 1.000 N NA
 6461920 6461921 SentesTyphi_010100000555 SentesTyphi_010100000560     FALSE 0.031 391.000 0.000 NA   NA
 6461922 6461923 SentesTyphi_010100000575 SentesTyphi_010100000580     TRUE 0.997 0.000 0.833 0.054   NA
 6461923 6461924 SentesTyphi_010100000580 SentesTyphi_010100000585     TRUE 0.997 10.000 0.848 0.054   NA
 6461924 6461925 SentesTyphi_010100000585 SentesTyphi_010100000590     TRUE 0.642 107.000 0.394 NA N NA
 6461925 6461926 SentesTyphi_010100000590 SentesTyphi_010100000595   spr FALSE 0.097 326.000 0.219 NA N NA
 6461926 6461927 SentesTyphi_010100000595 SentesTyphi_010100000600 spr   FALSE 0.030 414.000 0.000 NA   NA
 6461927 6461928 SentesTyphi_010100000600 SentesTyphi_010100000605     TRUE 0.864 36.000 0.275 NA   NA
 6461928 6461929 SentesTyphi_010100000605 SentesTyphi_010100000610     FALSE 0.099 213.000 0.085 NA   NA
 6461930 6461931 SentesTyphi_010100000615 SentesTyphi_010100000620     FALSE 0.029 539.000 0.000 NA   NA
 6461933 6461934 SentesTyphi_010100000640 SentesTyphi_010100000645   fruK TRUE 0.985 0.000 0.112 1.000 Y NA
 6461934 6461935 SentesTyphi_010100000645 SentesTyphi_010100000650 fruK   TRUE 0.993 17.000 0.562 1.000 Y NA
 6461936 6461937 SentesTyphi_010100000655 SentesTyphi_010100000660     FALSE 0.247 79.000 0.040 NA   NA
 6461938 6461939 SentesTyphi_010100000665 SentesTyphi_010100000670     FALSE 0.071 190.000 0.000 1.000 N NA
 6461939 6461940 SentesTyphi_010100000670 SentesTyphi_010100000675     FALSE 0.025 387.000 0.000 1.000 N NA
 6461942 6461943 SentesTyphi_010100000695 SentesTyphi_010100000700     TRUE 0.986 5.000 0.400 1.000   NA
 6461945 6461946 SentesTyphi_010100000710 SentesTyphi_010100000715 folE   TRUE 0.987 15.000 0.719 NA   NA
 6461946 6461947 SentesTyphi_010100000715 SentesTyphi_010100000720     TRUE 0.639 150.000 0.500 NA   NA
 6461950 6461951 SentesTyphi_010100000737 SentesTyphi_010100000742   ligA FALSE 0.416 73.000 0.106 1.000 N NA
 6461951 6461952 SentesTyphi_010100000742 SentesTyphi_010100000747 ligA   TRUE 0.826 2.000 0.017 NA   NA
 6461956 6461957 SentesTyphi_010100000767 SentesTyphi_010100000772     TRUE 0.611 55.000 0.111 1.000   NA
 6461957 6461958 SentesTyphi_010100000772 SentesTyphi_010100000777     FALSE 0.112 268.000 0.130 1.000   NA
 6461959 6461960 SentesTyphi_010100t00784 SentesTyphi_010100t00786     TRUE 0.889 5.000 0.000 NA   NA
 6461960 6461961 SentesTyphi_010100t00786 SentesTyphi_010100t00788     TRUE 0.490 42.000 0.000 NA   NA
 6461961 6461962 SentesTyphi_010100t00788 SentesTyphi_010100t00790     TRUE 0.454 46.000 0.000 NA   NA
 6461963 6461964 SentesTyphi_010100000790 SentesTyphi_010100000795     FALSE 0.015 385.000 0.019 1.000 N NA
 6461964 6461965 SentesTyphi_010100000795 SentesTyphi_010100000800     TRUE 0.962 50.000 0.187 0.013 Y NA
 6461965 6461966 SentesTyphi_010100000800 SentesTyphi_010100000805     TRUE 0.974 41.000 0.203 0.013 Y NA
 6461967 6461968 SentesTyphi_010100000810 SentesTyphi_010100000815   pdxK FALSE 0.207 193.000 0.160 NA   NA
 6461969 6461970 SentesTyphi_010100000820 SentesTyphi_010100000825     TRUE 0.829 15.000 0.059 1.000 N NA
 6461970 6461971 SentesTyphi_010100000825 SentesTyphi_010100000830     FALSE 0.379 55.000 0.000 NA   NA
 6461972 6461973 SentesTyphi_010100000835 SentesTyphi_010100000840 cysM   FALSE 0.175 121.000 0.049 1.000 N NA
 6461973 6461974 SentesTyphi_010100000840 SentesTyphi_010100000845   cysW TRUE 0.982 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 6461974 6461975 SentesTyphi_010100000845 SentesTyphi_010100000850 cysW   TRUE 0.954 62.000 0.583 0.001 N NA
 6461975 6461976 SentesTyphi_010100000850 SentesTyphi_010100000855     TRUE 0.995 0.000 0.479 0.002 N NA
 6461976 6461977 SentesTyphi_010100000855 SentesTyphi_010100000860     FALSE 0.108 158.000 0.000 1.000 N NA
 6461977 6461978 SentesTyphi_010100000860 SentesTyphi_010100000865     FALSE 0.026 236.000 0.000 NA N NA
 6461978 6461979 SentesTyphi_010100000865 SentesTyphi_010100000870     TRUE 0.678 95.000 0.333 NA   NA
 6461979 6461980 SentesTyphi_010100000870 SentesTyphi_010100000875     TRUE 0.655 62.000 0.204 NA   NA
 6461980 6461981 SentesTyphi_010100000875 SentesTyphi_010100000880     TRUE 0.829 -13.000 0.059 NA   NA
 6461982 6461983 SentesTyphi_010100000885 SentesTyphi_010100000890     TRUE 0.774 -40.000 0.000 NA   NA
 6461983 6461984 SentesTyphi_010100000890 SentesTyphi_010100000895     TRUE 0.803 3.000 0.025 1.000 N NA
 6461984 6461985 SentesTyphi_010100000895 SentesTyphi_010100000900     FALSE 0.101 181.000 0.000 NA   NA
 6461985 6461986 SentesTyphi_010100000900 SentesTyphi_010100000905     FALSE 0.139 213.000 0.133 NA   NA
 6461987 6461988 SentesTyphi_010100000910 SentesTyphi_010100000915     FALSE 0.286 48.000 0.000 NA N NA
 6461988 6461989 SentesTyphi_010100000915 SentesTyphi_010100000920     TRUE 0.754 13.000 0.000 NA N NA
 6461989 6461990 SentesTyphi_010100000920 SentesTyphi_010100000925     TRUE 0.980 10.000 0.043 1.000 Y NA
 6461990 6461991 SentesTyphi_010100000925 SentesTyphi_010100000930     TRUE 0.988 19.000 0.000 0.001 Y NA
 6461991 6461992 SentesTyphi_010100000930 SentesTyphi_010100000935   eutA TRUE 0.973 12.000 0.000 NA Y NA
 6461992 6461993 SentesTyphi_010100000935 SentesTyphi_010100000940 eutA   TRUE 0.968 -3.000 0.000 NA Y NA
 6461993 6461994 SentesTyphi_010100000940 SentesTyphi_010100000945     TRUE 0.498 119.000 0.222 1.000 N NA
 6461994 6461995 SentesTyphi_010100000945 SentesTyphi_010100000950     TRUE 0.772 -10.000 0.000 1.000 N NA
 6461995 6461996 SentesTyphi_010100000950 SentesTyphi_010100000955     TRUE 0.859 11.000 0.000 1.000 N NA
 6461996 6461997 SentesTyphi_010100000955 SentesTyphi_010100000960     TRUE 0.973 12.000 0.000 NA Y NA
 6461997 6461998 SentesTyphi_010100000960 SentesTyphi_010100000965   eutD FALSE 0.030 443.000 0.000 NA   NA
 6461998 6461999 SentesTyphi_010100000965 SentesTyphi_010100000970 eutD eutD TRUE 0.872 29.000 0.000 0.068   NA
 6461999 6462000 SentesTyphi_010100000970 SentesTyphi_010100000975 eutD   TRUE 0.818 -3.000 0.048 1.000 N NA
 6462000 6462001 SentesTyphi_010100000975 SentesTyphi_010100000980     TRUE 0.987 -3.000 0.214 NA Y NA
 6462001 6462002 SentesTyphi_010100000980 SentesTyphi_010100000985     TRUE 0.941 -22.000 0.017 NA Y NA
 6462002 6462003 SentesTyphi_010100000985 SentesTyphi_010100000990     TRUE 0.968 13.000 0.017 1.000 Y NA
 6462003 6462004 SentesTyphi_010100000990 SentesTyphi_010100000995     FALSE 0.043 258.000 0.000 NA   NA
 6462006 6462007 SentesTyphi_010100001005 SentesTyphi_010100001010 nudF   TRUE 0.980 -3.000 0.443 NA   NA
 6462007 6462008 SentesTyphi_010100001010 SentesTyphi_010100001015     TRUE 0.946 25.000 0.433 NA   NA
 6462008 6462009 SentesTyphi_010100001015 SentesTyphi_010100001020     TRUE 0.983 0.000 0.427 NA   NA
 6462009 6462010 SentesTyphi_010100001020 SentesTyphi_010100001025     TRUE 0.873 28.000 0.217 NA   NA
 6462011 6462012 SentesTyphi_010100001030 SentesTyphi_010100001045     FALSE 0.038 719.000 0.000 1.000   NA
 6462012 6462013 SentesTyphi_010100001045 SentesTyphi_010100001050     TRUE 0.995 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 6462014 6462015 SentesTyphi_010100001055 SentesTyphi_010100001060     FALSE 0.313 72.000 0.053 NA   NA
 6462015 6462016 SentesTyphi_010100001060 SentesTyphi_010100001065     TRUE 0.584 111.000 0.005 1.000 Y NA
 6462016 6462017 SentesTyphi_010100001065 SentesTyphi_010100001080     FALSE 0.023 1067.000 0.000 1.000 N NA
 6462017 6462018 SentesTyphi_010100001080 SentesTyphi_010100001085     FALSE 0.034 322.000 0.000 NA   NA
 6462018 6462019 SentesTyphi_010100001085 SentesTyphi_010100001090     FALSE 0.096 184.000 0.000 NA   NA
 6462019 6462020 SentesTyphi_010100001090 SentesTyphi_010100001095     FALSE 0.187 133.000 0.000 NA   NA
 6462020 6462021 SentesTyphi_010100001095 SentesTyphi_010100001100     TRUE 0.809 16.000 0.000 NA   NA
 6462021 6462022 SentesTyphi_010100001100 SentesTyphi_010100001115     FALSE 0.029 1620.000 0.000 NA   NA
 6462023 6462024 SentesTyphi_010100001120 SentesTyphi_010100001125     FALSE 0.412 45.000 0.000 1.000 N NA
 6462024 6462025 SentesTyphi_010100001125 SentesTyphi_010100001140     FALSE 0.023 1131.000 0.000 1.000 N NA
 6462027 6462028 SentesTyphi_010100001150 SentesTyphi_010100001155     TRUE 0.454 140.000 0.212 NA   NA
 6462029 6462030 SentesTyphi_010100001160 SentesTyphi_010100001165     TRUE 0.818 -7.000 0.048 NA   NA
 6462030 6462031 SentesTyphi_010100001165 SentesTyphi_010100001170     TRUE 0.998 13.000 0.810 0.067 Y NA
 6462032 6462033 SentesTyphi_010100001175 SentesTyphi_010100001180     FALSE 0.276 124.000 0.078 NA   NA
 6462033 6462034 SentesTyphi_010100001180 SentesTyphi_010100001185     TRUE 0.988 -13.000 1.000 NA   NA
 6462035 6462036 SentesTyphi_010100001190 SentesTyphi_010100001195     FALSE 0.311 71.000 0.052 NA   NA
 6462036 6462037 SentesTyphi_010100001195 SentesTyphi_010100001210     FALSE 0.030 2035.000 0.000 NA   NA
 6462037 6462038 SentesTyphi_010100001210 SentesTyphi_010100001215     FALSE 0.124 190.000 0.077 NA   NA
 6462038 6462039 SentesTyphi_010100001215 SentesTyphi_010100001220     TRUE 0.997 3.000 0.615 NA Y NA
 6462040 6462041 SentesTyphi_010100001225 SentesTyphi_010100001230     TRUE 0.627 21.000 0.019 NA   NA
 6462042 6462043 SentesTyphi_010100001235 SentesTyphi_010100001240     TRUE 0.952 93.000 0.262 0.002 Y NA
 6462043 6462044 SentesTyphi_010100001240 SentesTyphi_010100001245     FALSE 0.300 157.000 0.154 NA   NA
 6462045 6462046 SentesTyphi_010100001250 SentesTyphi_010100001255     TRUE 0.789 -31.000 0.051 NA   NA
 6462046 6462047 SentesTyphi_010100001255 SentesTyphi_010100001260   rplM FALSE 0.019 301.000 0.003 NA   NA
 6462047 6462048 SentesTyphi_010100001260 SentesTyphi_010100001265 rplM rpsI TRUE 0.998 16.000 0.601 0.015 Y NA
 6462048 6462049 SentesTyphi_010100001265 SentesTyphi_010100001270 rpsI sspA FALSE 0.006 315.000 0.014 NA N NA
 6462049 6462050 SentesTyphi_010100001270 SentesTyphi_010100001275 sspA   TRUE 0.993 6.000 0.831 NA   NA
 6462050 6462051 SentesTyphi_010100001275 SentesTyphi_010100001280     FALSE 0.127 118.000 0.009 NA   NA
 6462051 6462052 SentesTyphi_010100001280 SentesTyphi_010100001285     FALSE 0.257 135.000 0.091 1.000 N NA
 6462052 6462053 SentesTyphi_010100001285 SentesTyphi_010100001290     TRUE 0.596 116.000 0.318 1.000 N NA
 6462053 6462054 SentesTyphi_010100001290 SentesTyphi_010100001295     TRUE 0.717 47.000 0.143 1.000   NA
 6462054 6462055 SentesTyphi_010100001295 SentesTyphi_010100001300     TRUE 0.986 15.000 0.143 0.001   NA
 6462055 6462056 SentesTyphi_010100001300 SentesTyphi_010100001305     TRUE 0.968 -3.000 0.238 1.000   NA
 6462056 6462057 SentesTyphi_010100001305 SentesTyphi_010100001310     TRUE 0.987 -3.000 0.222 NA Y NA
 6462058 6462059 SentesTyphi_010100001315 SentesTyphi_010100001320   codB TRUE 0.986 -13.000 0.250 1.000 Y NA
 6462061 6462062 SentesTyphi_010100001330 SentesTyphi_010100001335   gltD FALSE 0.067 208.000 0.000 NA   NA
 6462062 6462063 SentesTyphi_010100001335 SentesTyphi_010100001340 gltD gltB TRUE 0.996 10.000 0.096 0.001 Y NA
 6462064 6462065 SentesTyphi_010100001345 SentesTyphi_010100001350     FALSE 0.029 561.000 0.000 NA   NA
 6462065 6462066 SentesTyphi_010100001350 SentesTyphi_010100001355     FALSE 0.081 338.000 0.113 1.000   NA
 6462067 6462068 SentesTyphi_010100001360 SentesTyphi_010100001365     TRUE 0.999 13.000 0.886 0.001 Y NA
 6462068 6462069 SentesTyphi_010100001365 SentesTyphi_010100001370     TRUE 0.999 16.000 0.720 0.001 Y NA
 6462070 6462071 SentesTyphi_010100001375 SentesTyphi_010100001380     FALSE 0.293 122.000 0.083 NA   NA
 6462071 6462072 SentesTyphi_010100001380 SentesTyphi_010100001385     TRUE 0.473 87.000 0.146 NA   NA
 6462072 6462073 SentesTyphi_010100001385 SentesTyphi_010100001390     FALSE 0.042 261.000 0.000 NA   NA
 6462074 6462075 SentesTyphi_010100001395 SentesTyphi_010100001400     TRUE 0.847 0.000 0.045 1.000 N NA
 6462075 6462076 SentesTyphi_010100001400 SentesTyphi_010100001405     FALSE 0.162 190.000 0.125 1.000 N NA
 6462076 6462077 SentesTyphi_010100001405 SentesTyphi_010100001410     TRUE 0.990 7.000 0.576 NA   NA
 6462077 6462078 SentesTyphi_010100001410 SentesTyphi_010100001415     FALSE 0.168 202.000 0.143 NA   NA
 6462080 6462081 SentesTyphi_010100001425 SentesTyphi_010100001430     FALSE 0.032 350.000 0.000 NA   NA
 6462081 6462082 SentesTyphi_010100001430 SentesTyphi_010100001435     TRUE 0.885 1.000 0.000 NA   NA
 6462082 6462083 SentesTyphi_010100001435 SentesTyphi_010100001440   cysB FALSE 0.037 293.000 0.000 NA   NA
 6462088 6462089 SentesTyphi_010100001465 SentesTyphi_010100001470     TRUE 0.824 -3.000 0.050 1.000 N NA
 6462090 6462091 SentesTyphi_010100001475 SentesTyphi_010100001480     TRUE 0.680 101.000 0.075 NA Y NA
 6462091 6462092 SentesTyphi_010100001480 SentesTyphi_010100001485     TRUE 0.977 8.000 0.281 NA   NA
 6462093 6462094 SentesTyphi_010100001490 SentesTyphi_010100001505     FALSE 0.160 1598.000 0.000 1.000 Y NA
 6462094 6462095 SentesTyphi_010100001505 SentesTyphi_010100001510     TRUE 0.998 10.000 0.221 0.001 Y NA
 6462095 6462096 SentesTyphi_010100001510 SentesTyphi_010100001515   trpA TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 6462096 6462097 SentesTyphi_010100001515 SentesTyphi_010100001520 trpA   FALSE 0.038 752.000 0.000 1.000   NA
 6462097 6462098 SentesTyphi_010100001520 SentesTyphi_010100001525     TRUE 0.825 74.000 0.115 0.002   NA
 6462098 6462099 SentesTyphi_010100001525 SentesTyphi_010100001530     TRUE 0.972 20.000 0.115 0.002   NA
 6462101 6462102 SentesTyphi_010100001540 SentesTyphi_010100001545     TRUE 0.856 26.000 0.169 NA   NA
 6462102 6462103 SentesTyphi_010100001545 SentesTyphi_010100001550     FALSE 0.418 57.000 0.061 NA   NA
 6462103 6462104 SentesTyphi_010100001550 SentesTyphi_010100001555     FALSE 0.215 170.000 0.167 NA N NA
 6462106 6462107 SentesTyphi_010100001565 SentesTyphi_010100001570 hemG   TRUE 0.982 12.000 0.455 1.000 N NA
 6462107 6462108 SentesTyphi_010100001570 SentesTyphi_010100001575     TRUE 0.827 39.000 0.202 1.000   NA
 6462108 6462109 SentesTyphi_010100001575 SentesTyphi_010100001580     TRUE 0.954 0.000 0.127 1.000   NA
 6462110 6462111 SentesTyphi_010100001585 SentesTyphi_010100001590 fadB fadA TRUE 0.916 10.000 0.000 1.000   NA
 6462113 6462114 SentesTyphi_010100t01599 SentesTyphi_010100t01601     FALSE 0.219 112.000 0.000 NA   NA
 6462116 6462117 SentesTyphi_010100001606 SentesTyphi_010100001611     FALSE 0.042 366.000 0.000 1.000   NA
 6462117 6462118 SentesTyphi_010100001611 SentesTyphi_010100001616     TRUE 0.986 3.000 0.000 0.001   NA
 6462118 6462119 SentesTyphi_010100001616 SentesTyphi_010100001621     TRUE 0.805 32.000 0.129 1.000   NA
 6462119 6462120 SentesTyphi_010100001621 SentesTyphi_010100001626   aceK FALSE 0.122 101.000 0.016 1.000 N NA
 6462124 6462125 SentesTyphi_010100001656 SentesTyphi_010100001661     FALSE 0.446 47.000 0.000 NA   NA
 6462126 6462127 SentesTyphi_010100001666 SentesTyphi_010100001671     FALSE 0.333 63.000 0.000 NA   NA
 6462127 6462128 SentesTyphi_010100001671 SentesTyphi_010100001676     TRUE 0.844 -13.000 0.000 1.000   NA
 6462128 6462129 SentesTyphi_010100001676 SentesTyphi_010100001681     TRUE 0.942 17.000 0.000 0.067   NA
 6462130 6462131 SentesTyphi_010100001716 SentesTyphi_010100001721     TRUE 0.888 64.000 0.778 NA   NA
 6462131 6462132 SentesTyphi_010100001721 SentesTyphi_010100001726     TRUE 0.991 -3.000 1.000 NA   NA
 6462132 6462133 SentesTyphi_010100001726 SentesTyphi_010100001731     TRUE 0.947 0.000 0.140 NA   NA
 6462133 6462134 SentesTyphi_010100001731 SentesTyphi_010100001736     FALSE 0.169 143.000 0.000 NA   NA
 6462135 6462136 SentesTyphi_010100001741 SentesTyphi_010100001746 malG malF TRUE 0.998 15.000 0.814 0.052 Y NA
 6462136 6462137 SentesTyphi_010100001746 SentesTyphi_010100001751 malF malE TRUE 0.620 132.000 0.060 1.000 Y NA
 6462138 6462139 SentesTyphi_010100001756 SentesTyphi_010100001761   lamB TRUE 0.882 92.000 0.133 0.067 Y NA
 6462139 6462140 SentesTyphi_010100001761 SentesTyphi_010100001766 lamB   FALSE 0.343 164.000 0.171 1.000   NA
 6462140 6462141 SentesTyphi_010100001766 SentesTyphi_010100001771   ubiC FALSE 0.069 183.000 0.025 NA   NA
 6462141 6462142 SentesTyphi_010100001771 SentesTyphi_010100001776 ubiC ubiA TRUE 0.988 14.000 0.248 NA Y NA
 6462144 6462145 SentesTyphi_010100001786 SentesTyphi_010100001791     FALSE 0.398 109.000 0.141 1.000 N NA
 6462145 6462146 SentesTyphi_010100001791 SentesTyphi_010100001796     FALSE 0.113 179.000 0.033 1.000   NA
 6462146 6462147 SentesTyphi_010100001796 SentesTyphi_010100001801     TRUE 0.768 59.000 0.006 0.002   NA
 6462147 6462148 SentesTyphi_010100001801 SentesTyphi_010100001806     TRUE 0.792 -18.000 0.000 NA   NA
 6462148 6462149 SentesTyphi_010100001806 SentesTyphi_010100001811     TRUE 0.761 19.000 0.000 NA   NA
 6462151 6462152 SentesTyphi_010100001821 SentesTyphi_010100001826     FALSE 0.235 88.000 0.017 1.000   NA
 6462152 6462153 SentesTyphi_010100001826 SentesTyphi_010100001831   pspG FALSE 0.152 168.000 0.070 NA   NA
 6462155 6462156 SentesTyphi_010100001851 SentesTyphi_010100001856 alr   FALSE 0.234 186.000 0.181 1.000 N NA
 6462156 6462157 SentesTyphi_010100001856 SentesTyphi_010100001861   aphA FALSE 0.093 187.000 0.026 1.000   NA
 6462157 6462158 SentesTyphi_010100001861 SentesTyphi_010100001866 aphA   FALSE 0.116 130.000 0.009 NA   NA
 6462158 6462159 SentesTyphi_010100001866 SentesTyphi_010100001871     TRUE 0.831 3.000 0.018 NA   NA
 6462160 6462161 SentesTyphi_010100001876 SentesTyphi_010100001881     TRUE 0.988 -13.000 1.000 NA   NA
 6462161 6462162 SentesTyphi_010100001881 SentesTyphi_010100001886   uvrA FALSE 0.092 144.000 0.003 NA   NA
 6462162 6462163 SentesTyphi_010100001886 SentesTyphi_010100001891 uvrA uvrA TRUE 0.742 -6.000 0.018 NA   NA
 6462164 6462165 SentesTyphi_010100001896 SentesTyphi_010100001901     FALSE 0.028 1052.000 0.000 NA   NA
 6462165 6462166 SentesTyphi_010100001901 SentesTyphi_010100001906     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6462166 6462167 SentesTyphi_010100001906 SentesTyphi_010100001911     FALSE 0.054 384.000 0.091 NA   NA
 6462168 6462169 SentesTyphi_010100001936 SentesTyphi_010100001941     TRUE 0.797 55.000 0.000 0.006   NA
 6462173 6462174 SentesTyphi_010100001971 SentesTyphi_010100001976     FALSE 0.021 293.000 0.028 1.000 N NA
 6462174 6462175 SentesTyphi_010100001976 SentesTyphi_010100001981     FALSE 0.043 347.000 0.000 1.000   NA
 6462176 6462177 SentesTyphi_010100001986 SentesTyphi_010100001991     TRUE 0.889 10.000 0.000 NA   NA
 6462177 6462178 SentesTyphi_010100001991 SentesTyphi_010100001996     FALSE 0.379 55.000 0.000 NA   NA
 6462178 6462179 SentesTyphi_010100001996 SentesTyphi_010100002001     TRUE 0.830 15.000 0.000 NA   NA
 6462179 6462180 SentesTyphi_010100002001 SentesTyphi_010100002006     TRUE 0.818 -7.000 0.000 NA   NA
 6462181 6462182 SentesTyphi_010100002011 SentesTyphi_010100002016     TRUE 0.766 81.000 0.500 1.000 N NA
 6462182 6462183 SentesTyphi_010100002016 SentesTyphi_010100002021     FALSE 0.130 110.000 0.000 NA N NA
 6462183 6462184 SentesTyphi_010100002021 SentesTyphi_010100002026     TRUE 0.644 32.000 0.065 NA   NA
 6462188 6462189 SentesTyphi_010100002046 SentesTyphi_010100002051     TRUE 0.976 15.000 0.426 NA   NA
 6462189 6462190 SentesTyphi_010100002051 SentesTyphi_010100002056     TRUE 0.941 11.000 0.115 NA   NA
 6462190 6462191 SentesTyphi_010100002056 SentesTyphi_010100002061     FALSE 0.036 303.000 0.000 NA   NA
 6462191 6462192 SentesTyphi_010100002061 SentesTyphi_010100002066     TRUE 0.657 26.000 0.000 NA   NA
 6462192 6462193 SentesTyphi_010100002066 SentesTyphi_010100002071   gabD TRUE 0.772 22.000 0.000 1.000   NA
 6462193 6462194 SentesTyphi_010100002071 SentesTyphi_010100002076 gabD   TRUE 0.962 15.000 0.303 1.000 N NA
 6462194 6462195 SentesTyphi_010100002076 SentesTyphi_010100002081     TRUE 0.705 130.000 0.121 1.000 Y NA
 6462195 6462196 SentesTyphi_010100002081 SentesTyphi_010100002086     TRUE 0.920 42.000 0.625 1.000 N NA
 6462198 6462199 SentesTyphi_010100002106 SentesTyphi_010100002111     TRUE 0.892 10.000 0.083 NA N NA
 6462199 6462200 SentesTyphi_010100002111 SentesTyphi_010100002116     FALSE 0.140 134.000 0.028 NA   NA
 6462204 6462205 SentesTyphi_010100002136 SentesTyphi_010100002151     FALSE 0.029 1507.000 0.000 NA   NA
 6462205 6462206 SentesTyphi_010100002151 SentesTyphi_010100002156     FALSE 0.022 272.000 0.009 NA   NA
 6462206 6462207 SentesTyphi_010100002156 SentesTyphi_010100002161   nrdI TRUE 0.599 -3.000 0.026 NA N NA
 6462207 6462208 SentesTyphi_010100002161 SentesTyphi_010100002166 nrdI   TRUE 0.987 0.000 0.162 NA Y NA
 6462208 6462209 SentesTyphi_010100002166 SentesTyphi_010100002171   nrdF TRUE 0.997 11.000 0.167 0.001 Y NA
 6462209 6462210 SentesTyphi_010100002171 SentesTyphi_010100002186 nrdF   FALSE 0.024 1549.000 0.000 1.000 N NA
 6462210 6462211 SentesTyphi_010100002186 SentesTyphi_010100002201     FALSE 0.015 1231.000 0.000 NA N NA
 6462211 6462212 SentesTyphi_010100002201 SentesTyphi_010100002206     FALSE 0.029 497.000 0.000 NA   NA
 6462213 6462214 SentesTyphi_010100002211 SentesTyphi_010100002216     FALSE 0.032 350.000 0.000 NA   NA
 6462214 6462215 SentesTyphi_010100002216 SentesTyphi_010100002221     FALSE 0.031 218.000 0.000 NA N NA
 6462216 6462217 SentesTyphi_010100002226 SentesTyphi_010100002241 pflA   FALSE 0.045 1606.000 0.092 1.000 N NA
 6462217 6462218 SentesTyphi_010100002241 SentesTyphi_010100002246     TRUE 0.762 60.000 0.345 1.000 N NA
 6462218 6462219 SentesTyphi_010100002246 SentesTyphi_010100002251     FALSE 0.030 405.000 0.000 NA   NA
 6462220 6462221 SentesTyphi_010100002256 SentesTyphi_010100002261     FALSE 0.057 186.000 0.014 NA   NA
 6462221 6462222 SentesTyphi_010100002261 SentesTyphi_010100002266     TRUE 0.705 71.000 0.033 1.000 Y NA
 6462222 6462223 SentesTyphi_010100002266 SentesTyphi_010100002271     FALSE 0.067 143.000 0.003 1.000 N NA
 6462223 6462224 SentesTyphi_010100002271 SentesTyphi_010100002276   cmk FALSE 0.042 173.000 0.004 1.000 N NA
 6462224 6462225 SentesTyphi_010100002276 SentesTyphi_010100002281 cmk rpsA TRUE 0.567 114.000 0.281 1.000 N NA
 6462225 6462226 SentesTyphi_010100002281 SentesTyphi_010100002286 rpsA ihfB FALSE 0.439 156.000 0.292 1.000 N NA
 6462226 6462227 SentesTyphi_010100002286 SentesTyphi_010100002291 ihfB   FALSE 0.042 230.000 0.003 1.000   NA
 6462227 6462228 SentesTyphi_010100002291 SentesTyphi_010100002306   lpxK FALSE 0.040 1783.000 0.000 1.000   NA
 6462228 6462229 SentesTyphi_010100002306 SentesTyphi_010100002326 lpxK   FALSE 0.128 1329.000 0.263 NA   NA
 6462229 6462230 SentesTyphi_010100002326 SentesTyphi_010100002331     TRUE 0.965 -3.000 0.265 NA   NA
 6462230 6462231 SentesTyphi_010100002331 SentesTyphi_010100002336     FALSE 0.043 211.000 0.023 NA   NA
 6462233 6462234 SentesTyphi_010100002346 SentesTyphi_010100002351     TRUE 0.955 -7.000 0.325 NA N NA
 6462234 6462235 SentesTyphi_010100002351 SentesTyphi_010100002356     TRUE 0.949 -19.000 0.036 NA Y NA
 6462235 6462236 SentesTyphi_010100002356 SentesTyphi_010100002361   mukB TRUE 0.994 0.000 0.000 0.001 Y NA
 6462236 6462237 SentesTyphi_010100002361 SentesTyphi_010100002366 mukB   FALSE 0.043 345.000 0.000 1.000   NA
 6462237 6462238 SentesTyphi_010100002366 SentesTyphi_010100002371     FALSE 0.242 260.000 0.372 NA   NA
 6462239 6462240 SentesTyphi_010100002386 SentesTyphi_010100002391     FALSE 0.045 252.000 0.060 1.000 N NA
 6462240 6462241 SentesTyphi_010100002391 SentesTyphi_010100002396   asnC FALSE 0.023 632.000 0.000 1.000 N NA
 6462241 6462242 SentesTyphi_010100002396 SentesTyphi_010100002401 asnC   FALSE 0.028 201.000 0.005 1.000 N NA
 6462244 6462245 SentesTyphi_010100002421 SentesTyphi_010100002426     FALSE 0.066 195.000 0.000 1.000 N NA
 6462245 6462246 SentesTyphi_010100002426 SentesTyphi_010100002431     TRUE 0.504 41.000 0.000 NA   NA
 6462246 6462247 SentesTyphi_010100002431 SentesTyphi_010100002436     TRUE 0.890 6.000 0.000 NA   NA
 6462247 6462248 SentesTyphi_010100002436 SentesTyphi_010100002451     FALSE 0.114 1174.000 0.000 0.061   NA
 6462248 6462249 SentesTyphi_010100002451 SentesTyphi_010100002456     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6462249 6462250 SentesTyphi_010100002456 SentesTyphi_010100002461     TRUE 0.876 6.000 0.040 NA   NA
 6462250 6462251 SentesTyphi_010100002461 SentesTyphi_010100002466   kil FALSE 0.251 91.000 0.000 NA   NA
 6462251 6462252 SentesTyphi_010100002466 SentesTyphi_010100002471 kil   FALSE 0.046 244.000 0.000 NA   NA
 6462253 6462254 SentesTyphi_010100002476 SentesTyphi_010100002481     TRUE 0.928 20.000 0.000 0.061   NA
 6462254 6462255 SentesTyphi_010100002481 SentesTyphi_010100002486     FALSE 0.054 272.000 0.000 1.000   NA
 6462255 6462256 SentesTyphi_010100002486 SentesTyphi_010100002491     TRUE 0.915 3.000 0.000 1.000   NA
 6462256 6462257 SentesTyphi_010100002491 SentesTyphi_010100002496     TRUE 0.979 11.000 0.333 NA   NA
 6462257 6462258 SentesTyphi_010100002496 SentesTyphi_010100002501     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6462258 6462259 SentesTyphi_010100002501 SentesTyphi_010100002506     TRUE 0.876 0.000 0.000 NA   NA
 6462259 6462260 SentesTyphi_010100002506 SentesTyphi_010100002511     TRUE 0.889 4.000 0.000 NA   NA
 6462260 6462261 SentesTyphi_010100002511 SentesTyphi_010100002516     FALSE 0.070 205.000 0.000 NA   NA
 6462261 6462262 SentesTyphi_010100002516 SentesTyphi_010100002521     FALSE 0.181 136.000 0.000 NA   NA
 6462262 6462263 SentesTyphi_010100002521 SentesTyphi_010100002526     FALSE 0.047 243.000 0.000 NA   NA
 6462263 6462264 SentesTyphi_010100002526 SentesTyphi_010100002531     TRUE 0.812 11.000 0.013 NA   NA
 6462264 6462265 SentesTyphi_010100002531 SentesTyphi_010100002536     FALSE 0.095 185.000 0.000 NA   NA
 6462265 6462266 SentesTyphi_010100002536 SentesTyphi_010100002541     FALSE 0.033 335.000 0.000 NA   NA
 6462266 6462267 SentesTyphi_010100002541 SentesTyphi_010100002546     TRUE 0.876 0.000 0.000 NA   NA
 6462267 6462268 SentesTyphi_010100002546 SentesTyphi_010100002551     TRUE 0.888 3.000 0.000 NA   NA
 6462268 6462269 SentesTyphi_010100002551 SentesTyphi_010100002556     FALSE 0.187 133.000 0.000 NA   NA
 6462271 6462272 SentesTyphi_010100002566 SentesTyphi_010100002571     FALSE 0.123 163.000 0.000 NA   NA
 6462272 6462273 SentesTyphi_010100002571 SentesTyphi_010100002586     FALSE 0.029 612.000 0.000 NA   NA
 6462273 6462274 SentesTyphi_010100002586 SentesTyphi_010100002591     FALSE 0.236 105.000 0.000 NA   NA
 6462274 6462275 SentesTyphi_010100002591 SentesTyphi_010100002596     FALSE 0.030 414.000 0.000 NA   NA
 6462277 6462278 SentesTyphi_010100002606 SentesTyphi_010100002611     TRUE 0.892 34.000 0.000 1.000 Y NA
 6462278 6462279 SentesTyphi_010100002611 SentesTyphi_010100002616     TRUE 0.707 67.000 0.308 1.000 N NA
 6462279 6462280 SentesTyphi_010100002616 SentesTyphi_010100002621     TRUE 0.937 21.000 0.029 1.000 Y NA
 6462280 6462281 SentesTyphi_010100002621 SentesTyphi_010100002626     FALSE 0.036 206.000 0.023 1.000 N NA
 6462283 6462284 SentesTyphi_010100002636 SentesTyphi_010100002641     TRUE 0.990 35.000 0.361 0.003 Y NA
 6462284 6462285 SentesTyphi_010100002641 SentesTyphi_010100002646   flgA TRUE 0.863 92.000 0.330 NA Y NA
 6462286 6462287 SentesTyphi_010100002651 SentesTyphi_010100002656 flgB flgC TRUE 0.999 4.000 0.824 0.004 Y NA
 6462287 6462288 SentesTyphi_010100002656 SentesTyphi_010100002661 flgC flgD TRUE 0.987 12.000 0.186 NA Y NA
 6462288 6462289 SentesTyphi_010100002661 SentesTyphi_010100002666 flgD flgE TRUE 0.938 27.000 0.116 NA Y NA
 6462289 6462290 SentesTyphi_010100002666 SentesTyphi_010100002671 flgE flgF TRUE 0.996 21.000 0.476 0.004 Y NA
 6462290 6462291 SentesTyphi_010100002671 SentesTyphi_010100002676 flgF flgG TRUE 0.998 14.000 0.420 0.001 Y NA
 6462291 6462292 SentesTyphi_010100002676 SentesTyphi_010100002681 flgG flgH TRUE 0.946 89.000 0.268 0.006 Y NA
 6462292 6462293 SentesTyphi_010100002681 SentesTyphi_010100002686 flgH flgI TRUE 0.993 12.000 0.073 0.007 Y NA
 6462293 6462294 SentesTyphi_010100002686 SentesTyphi_010100002691 flgI flgJ TRUE 0.992 0.000 0.036 0.007 Y NA
 6462294 6462295 SentesTyphi_010100002691 SentesTyphi_010100002706 flgJ flgL FALSE 0.373 1740.000 0.000 0.007 Y NA
 6462300 6462301 SentesTyphi_010100002746 SentesTyphi_010100002751     TRUE 0.876 0.000 0.000 NA   NA
 6462302 6462303 SentesTyphi_010100002756 SentesTyphi_010100002761     TRUE 0.876 0.000 0.000 NA   NA
 6462303 6462304 SentesTyphi_010100002761 SentesTyphi_010100002766     TRUE 0.988 4.000 0.500 NA   NA
 6462304 6462305 SentesTyphi_010100002766 SentesTyphi_010100002771     TRUE 0.790 -19.000 0.000 NA   NA
 6462305 6462306 SentesTyphi_010100002771 SentesTyphi_010100002776     TRUE 0.889 5.000 0.000 NA   NA
 6462306 6462307 SentesTyphi_010100002776 SentesTyphi_010100002781     TRUE 0.876 0.000 0.000 NA   NA
 6462307 6462308 SentesTyphi_010100002781 SentesTyphi_010100002786     TRUE 0.792 17.000 0.000 NA   NA
 6462308 6462309 SentesTyphi_010100002786 SentesTyphi_010100002791     TRUE 0.775 -37.000 0.000 NA   NA
 6462309 6462310 SentesTyphi_010100002791 SentesTyphi_010100002796     TRUE 0.984 -7.000 0.667 NA   NA
 6462310 6462311 SentesTyphi_010100002796 SentesTyphi_010100002801     TRUE 0.861 69.000 0.667 NA   NA
 6462311 6462312 SentesTyphi_010100002801 SentesTyphi_010100002806     TRUE 0.982 -3.000 0.500 NA   NA
 6462312 6462313 SentesTyphi_010100002806 SentesTyphi_010100002821     FALSE 0.028 887.000 0.000 NA   NA
 6462313 6462314 SentesTyphi_010100002821 SentesTyphi_010100002826     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6462314 6462315 SentesTyphi_010100002826 SentesTyphi_010100002831     TRUE 0.890 7.000 0.000 NA   NA
 6462317 6462318 SentesTyphi_010100002841 SentesTyphi_010100002846     FALSE 0.240 103.000 0.000 NA   NA
 6462319 6462320 SentesTyphi_010100002851 SentesTyphi_010100002856     TRUE 0.993 0.000 1.000 NA   NA
 6462320 6462321 SentesTyphi_010100002856 SentesTyphi_010100002861     TRUE 0.994 4.000 1.000 NA   NA
 6462321 6462322 SentesTyphi_010100002861 SentesTyphi_010100002866     TRUE 0.981 -19.000 0.667 NA   NA
 6462322 6462323 SentesTyphi_010100002866 SentesTyphi_010100002871     TRUE 0.991 2.000 0.667 NA   NA
 6462323 6462324 SentesTyphi_010100002871 SentesTyphi_010100002876     TRUE 0.991 -3.000 1.000 NA   NA
 6462324 6462325 SentesTyphi_010100002876 SentesTyphi_010100002881     TRUE 0.986 -40.000 1.000 NA   NA
 6462325 6462326 SentesTyphi_010100002881 SentesTyphi_010100002886     TRUE 0.986 -37.000 1.000 NA   NA
 6462326 6462327 SentesTyphi_010100002886 SentesTyphi_010100002891     TRUE 0.989 -7.000 1.000 NA   NA
 6462327 6462328 SentesTyphi_010100002891 SentesTyphi_010100002896     TRUE 0.901 69.000 1.000 NA   NA
 6462328 6462329 SentesTyphi_010100002896 SentesTyphi_010100002901     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6462329 6462330 SentesTyphi_010100002901 SentesTyphi_010100002906     TRUE 0.800 -13.000 0.000 NA   NA
 6462330 6462331 SentesTyphi_010100002906 SentesTyphi_010100002911     TRUE 0.989 -7.000 1.000 NA   NA
 6462331 6462332 SentesTyphi_010100002911 SentesTyphi_010100002916     TRUE 0.991 -3.000 1.000 NA   NA
 6462333 6462334 SentesTyphi_010100002921 SentesTyphi_010100002926     TRUE 0.792 17.000 0.000 NA   NA
 6462335 6462336 SentesTyphi_010100002931 SentesTyphi_010100002936     TRUE 0.838 17.000 0.000 1.000   NA
 6462340 6462341 SentesTyphi_010100002956 SentesTyphi_010100002961     TRUE 0.874 91.000 1.000 NA   NA
 6462341 6462342 SentesTyphi_010100002961 SentesTyphi_010100002966     TRUE 0.900 12.000 0.000 1.000   NA
 6462342 6462343 SentesTyphi_010100002966 SentesTyphi_010100002971     TRUE 0.917 47.000 0.700 1.000 N NA
 6462344 6462345 SentesTyphi_010100002976 SentesTyphi_010100002981     TRUE 0.899 31.000 0.320 NA   NA
 6462345 6462346 SentesTyphi_010100002981 SentesTyphi_010100002996     FALSE 0.032 4105.000 0.000 NA   NA
 6462346 6462347 SentesTyphi_010100002996 SentesTyphi_010100003001     TRUE 0.761 19.000 0.000 NA   NA
 6462348 6462349 SentesTyphi_010100003006 SentesTyphi_010100003011     TRUE 0.978 -3.000 0.077 1.000 Y NA
 6462349 6462350 SentesTyphi_010100003011 SentesTyphi_010100003016     TRUE 0.997 0.000 0.300 0.051 Y NA
 6462353 6462354 SentesTyphi_010100003031 SentesTyphi_010100003036   entE TRUE 0.981 10.000 0.000 1.000 Y NA
 6462354 6462355 SentesTyphi_010100003036 SentesTyphi_010100003041 entE   TRUE 0.972 14.000 0.000 1.000 Y NA
 6462355 6462356 SentesTyphi_010100003041 SentesTyphi_010100003046     TRUE 0.974 0.000 0.024 1.000 Y NA
 6462356 6462357 SentesTyphi_010100003046 SentesTyphi_010100003051     TRUE 0.980 3.000 0.065 NA Y NA
 6462357 6462358 SentesTyphi_010100003051 SentesTyphi_010100003056     FALSE 0.257 182.000 0.222 NA N NA
 6462358 6462359 SentesTyphi_010100003056 SentesTyphi_010100003061     TRUE 0.757 64.000 0.333 NA   NA
 6462362 6462363 SentesTyphi_010100003076 SentesTyphi_010100003081     TRUE 0.964 -27.000 0.333 1.000   NA
 6462363 6462364 SentesTyphi_010100003081 SentesTyphi_010100003086     FALSE 0.151 166.000 0.000 1.000   NA
 6462365 6462366 SentesTyphi_010100003101 SentesTyphi_010100003106     FALSE 0.033 335.000 0.000 NA   NA
 6462366 6462367 SentesTyphi_010100003106 SentesTyphi_010100003111     TRUE 0.644 242.000 0.551 1.000 Y NA
 6462369 6462370 SentesTyphi_010100003121 SentesTyphi_010100003126     FALSE 0.034 303.000 0.044 NA   NA
 6462370 6462371 SentesTyphi_010100003126 SentesTyphi_010100003131   glnH FALSE 0.024 477.000 0.000 1.000 N NA
 6462371 6462372 SentesTyphi_010100003131 SentesTyphi_010100003136 glnH glnP TRUE 0.731 146.000 0.000 0.064 Y NA
 6462372 6462373 SentesTyphi_010100003136 SentesTyphi_010100003141 glnP glnQ TRUE 0.968 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 6462373 6462374 SentesTyphi_010100003141 SentesTyphi_010100003146 glnQ   FALSE 0.096 119.000 0.039 NA N NA
 6462376 6462377 SentesTyphi_010100003156 SentesTyphi_010100003161     FALSE 0.027 285.000 0.027 NA   NA
 6462378 6462379 SentesTyphi_010100003166 SentesTyphi_010100003191     FALSE 0.042 2891.000 0.000 1.000   NA
 6462380 6462381 SentesTyphi_010100003196 SentesTyphi_010100003201     TRUE 0.967 0.000 0.236 1.000 N NA
 6462381 6462382 SentesTyphi_010100003201 SentesTyphi_010100003216     FALSE 0.014 1721.000 0.018 1.000 N NA
 6462382 6462383 SentesTyphi_010100003216 SentesTyphi_010100003221     TRUE 0.968 116.000 0.609 0.005 Y NA
 6462384 6462385 SentesTyphi_010100003226 SentesTyphi_010100003231     FALSE 0.133 157.000 0.000 NA   NA
 6462386 6462387 SentesTyphi_010100003236 SentesTyphi_010100003241     TRUE 0.876 0.000 0.000 NA   NA
 6462388 6462389 SentesTyphi_010100003246 SentesTyphi_010100003251     FALSE 0.086 190.000 0.000 NA   NA
 6462389 6462390 SentesTyphi_010100003251 SentesTyphi_010100003256     FALSE 0.028 333.000 0.037 NA   NA
 6462390 6462391 SentesTyphi_010100003256 SentesTyphi_010100003261     TRUE 0.748 -25.000 0.037 NA   NA
 6462391 6462392 SentesTyphi_010100003261 SentesTyphi_010100003266   moaE FALSE 0.347 48.000 0.025 NA   NA
 6462392 6462393 SentesTyphi_010100003266 SentesTyphi_010100003271 moaE moaD TRUE 0.999 2.000 0.501 0.004 Y NA
 6462393 6462394 SentesTyphi_010100003271 SentesTyphi_010100003276 moaD moaC TRUE 0.994 -7.000 0.175 0.004 Y NA
 6462394 6462395 SentesTyphi_010100003276 SentesTyphi_010100003281 moaC   TRUE 0.996 3.000 0.109 0.004 Y NA
 6462395 6462396 SentesTyphi_010100003281 SentesTyphi_010100003286   moaA TRUE 0.986 22.000 0.108 0.004 Y NA
 6462397 6462398 SentesTyphi_010100003291 SentesTyphi_010100003316     FALSE 0.032 5284.000 0.000 NA   NA
 6462399 6462400 SentesTyphi_010100003321 SentesTyphi_010100003326 bioD   TRUE 0.868 -7.000 0.054 1.000   NA
 6462400 6462401 SentesTyphi_010100003326 SentesTyphi_010100003331     FALSE 0.175 208.000 0.133 1.000   NA
 6462401 6462402 SentesTyphi_010100003331 SentesTyphi_010100003336     TRUE 0.996 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 6462403 6462404 SentesTyphi_010100003341 SentesTyphi_010100003346     FALSE 0.223 58.000 0.003 NA   NA
 6462405 6462406 SentesTyphi_010100003351 SentesTyphi_010100003356     TRUE 0.995 2.000 0.315 0.001   NA
 6462407 6462408 SentesTyphi_010100003361 SentesTyphi_010100003366     TRUE 0.807 -10.000 0.000 NA   NA
 6462408 6462409 SentesTyphi_010100003366 SentesTyphi_010100003371     TRUE 0.968 -3.000 0.000 NA Y NA
 6462409 6462410 SentesTyphi_010100003371 SentesTyphi_010100003376   hybD TRUE 0.997 0.000 0.828 1.000 Y NA
 6462410 6462411 SentesTyphi_010100003376 SentesTyphi_010100003381 hybD   TRUE 0.961 -7.000 0.291 NA   NA
 6462411 6462412 SentesTyphi_010100003381 SentesTyphi_010100003386     TRUE 0.834 -7.000 0.055 NA   NA
 6462412 6462413 SentesTyphi_010100003386 SentesTyphi_010100003391     TRUE 0.960 28.000 0.667 NA   NA
 6462413 6462414 SentesTyphi_010100003391 SentesTyphi_010100003406     FALSE 0.015 1129.000 0.000 NA N NA
 6462416 6462417 SentesTyphi_010100003416 SentesTyphi_010100003421     FALSE 0.038 670.000 0.000 1.000   NA
 6462418 6462419 SentesTyphi_010100003426 SentesTyphi_010100003431     TRUE 0.997 12.000 0.647 1.000 Y NA
 6462419 6462420 SentesTyphi_010100003431 SentesTyphi_010100003436     FALSE 0.336 111.000 0.070 1.000   NA
 6462420 6462421 SentesTyphi_010100003436 SentesTyphi_010100003441     TRUE 0.850 53.000 0.000 0.001   NA
 6462422 6462423 SentesTyphi_010100003446 SentesTyphi_010100003451     FALSE 0.029 599.000 0.000 NA   NA
 6462423 6462424 SentesTyphi_010100003451 SentesTyphi_010100003456     TRUE 0.881 39.000 0.000 0.004   NA
 6462426 6462427 SentesTyphi_010100003466 SentesTyphi_010100003471     TRUE 0.876 0.000 0.000 NA   NA
 6462429 6462430 SentesTyphi_010100003481 SentesTyphi_010100003486     FALSE 0.371 122.000 0.125 NA   NA
 6462430 6462431 SentesTyphi_010100003486 SentesTyphi_010100003491     FALSE 0.103 209.000 0.083 NA   NA
 6462431 6462432 SentesTyphi_010100003491 SentesTyphi_010100003496     TRUE 0.993 11.000 0.864 NA   NA
 6462433 6462434 SentesTyphi_010100003501 SentesTyphi_010100003506     FALSE 0.028 777.000 0.000 NA   NA
 6462434 6462435 SentesTyphi_010100003506 SentesTyphi_010100003511     FALSE 0.030 450.000 0.000 NA   NA
 6462435 6462436 SentesTyphi_010100003511 SentesTyphi_010100003516     TRUE 0.785 -22.000 0.000 NA   NA
 6462436 6462437 SentesTyphi_010100003516 SentesTyphi_010100003521     FALSE 0.035 305.000 0.000 NA   NA
 6462437 6462438 SentesTyphi_010100003521 SentesTyphi_010100003526     FALSE 0.043 259.000 0.000 NA   NA
 6462438 6462439 SentesTyphi_010100003526 SentesTyphi_010100003531     FALSE 0.031 403.000 0.000 NA   NA
 6462439 6462440 SentesTyphi_010100003531 SentesTyphi_010100003536     FALSE 0.298 243.000 0.000 0.001   NA
 6462440 6462441 SentesTyphi_010100003536 SentesTyphi_010100003541     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6462442 6462443 SentesTyphi_010100003546 SentesTyphi_010100003551     FALSE 0.030 444.000 0.000 NA   NA
 6462444 6462445 SentesTyphi_010100003556 SentesTyphi_010100003571     FALSE 0.374 2159.000 0.000 0.008 Y NA
 6462445 6462446 SentesTyphi_010100003571 SentesTyphi_010100003591   smpB FALSE 0.026 11563.000 0.000 1.000 N NA
 6462447 6462448 SentesTyphi_010100003596 SentesTyphi_010100003601     TRUE 0.906 -10.000 0.124 NA   NA
 6462449 6462450 SentesTyphi_010100003606 SentesTyphi_010100003611     FALSE 0.209 102.000 0.049 1.000 N NA
 6462450 6462451 SentesTyphi_010100003611 SentesTyphi_010100003616   ppnK TRUE 0.488 86.000 0.170 1.000 N NA
 6462453 6462454 SentesTyphi_010100003626 SentesTyphi_010100003631     FALSE 0.122 121.000 0.008 NA   NA
 6462454 6462455 SentesTyphi_010100003631 SentesTyphi_010100003636     TRUE 0.765 65.000 0.349 NA   NA
 6462456 6462457 SentesTyphi_010100003641 SentesTyphi_010100003646   rpsP FALSE 0.178 344.000 0.361 1.000 N NA
 6462457 6462458 SentesTyphi_010100003646 SentesTyphi_010100003651 rpsP rimM TRUE 0.996 16.000 0.342 0.014 Y NA
 6462458 6462459 SentesTyphi_010100003651 SentesTyphi_010100003656 rimM trmD TRUE 0.976 45.000 0.672 1.000 Y NA
 6462459 6462460 SentesTyphi_010100003656 SentesTyphi_010100003661 trmD rplS TRUE 0.974 41.000 0.567 1.000 Y NA
 6462461 6462462 SentesTyphi_010100003666 SentesTyphi_010100003671     TRUE 0.977 -7.000 0.475 NA   NA
 6462463 6462464 SentesTyphi_010100003676 SentesTyphi_010100003681   tyrA TRUE 0.981 10.000 0.000 1.000 Y NA
 6462464 6462465 SentesTyphi_010100003681 SentesTyphi_010100003686 tyrA   FALSE 0.312 58.000 0.000 1.000 N NA
 6462466 6462467 SentesTyphi_010100003691 SentesTyphi_010100003696 pheA   FALSE 0.008 251.000 0.015 NA N NA
 6462467 6462468 SentesTyphi_010100003696 SentesTyphi_010100003701     FALSE 0.021 272.000 0.004 NA   NA
 6462469 6462470 SentesTyphi_010100003706 SentesTyphi_010100003711 rluD   TRUE 0.945 -3.000 0.168 NA   NA
 6462476 6462477 SentesTyphi_010100t04113 SentesTyphi_010100t04115     TRUE 0.604 30.000 0.000 NA   NA
 6462478 6462479 SentesTyphi_010100003751 SentesTyphi_010100003756 mltA   FALSE 0.192 109.000 0.000 1.000 N NA
 6462480 6462481 SentesTyphi_010100003761 SentesTyphi_010100003766     FALSE 0.040 273.000 0.000 NA   NA
 6462481 6462482 SentesTyphi_010100003766 SentesTyphi_010100003771     TRUE 0.990 0.000 0.122 0.001   NA
 6462483 6462484 SentesTyphi_010100003776 SentesTyphi_010100003781     FALSE 0.032 347.000 0.000 NA   NA
 6462484 6462485 SentesTyphi_010100003781 SentesTyphi_010100003786     TRUE 0.835 19.000 0.081 NA   NA
 6462485 6462486 SentesTyphi_010100003786 SentesTyphi_010100003791     TRUE 0.922 -7.000 0.144 NA   NA
 6462487 6462488 SentesTyphi_010100003796 SentesTyphi_010100003801     TRUE 0.920 58.000 0.308 1.000 Y NA
 6462488 6462489 SentesTyphi_010100003801 SentesTyphi_010100003806     TRUE 0.991 2.000 0.211 1.000 Y NA
 6462489 6462490 SentesTyphi_010100003806 SentesTyphi_010100003811   fucI TRUE 0.780 146.000 0.269 1.000 Y NA
 6462490 6462491 SentesTyphi_010100003811 SentesTyphi_010100003816 fucI   TRUE 0.918 32.000 0.104 NA Y NA
 6462492 6462493 SentesTyphi_010100003821 SentesTyphi_010100003826     TRUE 0.806 17.000 0.066 1.000 N NA
 6462494 6462495 SentesTyphi_010100003831 SentesTyphi_010100003836 xni   FALSE 0.087 171.000 0.044 1.000 N NA
 6462495 6462496 SentesTyphi_010100003836 SentesTyphi_010100003841     TRUE 0.901 59.000 0.238 1.000 Y NA
 6462496 6462497 SentesTyphi_010100003841 SentesTyphi_010100003846     FALSE 0.029 565.000 0.000 NA   NA
 6462497 6462498 SentesTyphi_010100003846 SentesTyphi_010100003851   queF FALSE 0.297 114.000 0.079 NA   NA
 6462499 6462500 SentesTyphi_010100003856 SentesTyphi_010100003861     FALSE 0.029 611.000 0.000 NA   NA
 6462500 6462501 SentesTyphi_010100003861 SentesTyphi_010100003866     TRUE 0.987 0.000 0.518 NA   NA
 6462501 6462502 SentesTyphi_010100003866 SentesTyphi_010100003871     TRUE 0.916 19.000 0.209 1.000 N NA
 6462502 6462503 SentesTyphi_010100003871 SentesTyphi_010100003876     FALSE 0.024 481.000 0.000 1.000 N NA
 6462503 6462504 SentesTyphi_010100003876 SentesTyphi_010100003891     FALSE 0.019 1357.000 0.037 1.000 N NA
 6462504 6462505 SentesTyphi_010100003891 SentesTyphi_010100003896     FALSE 0.197 78.000 0.037 1.000 N NA
 6462505 6462506 SentesTyphi_010100003896 SentesTyphi_010100003911   rumA FALSE 0.026 2857.000 0.000 1.000 N NA
 6462506 6462507 SentesTyphi_010100003911 SentesTyphi_010100003916 rumA relA TRUE 0.483 52.000 0.082 1.000 N NA
 6462507 6462508 SentesTyphi_010100003916 SentesTyphi_010100003921 relA   TRUE 0.511 154.000 0.000 1.000 Y NA
 6462508 6462509 SentesTyphi_010100003921 SentesTyphi_010100003926     TRUE 0.884 -34.000 0.118 NA   NA
 6462510 6462511 SentesTyphi_010100003931 SentesTyphi_010100003936     FALSE 0.029 1445.000 0.000 NA   NA
 6462511 6462512 SentesTyphi_010100003936 SentesTyphi_010100003941     FALSE 0.351 59.000 0.000 NA   NA
 6462512 6462513 SentesTyphi_010100003941 SentesTyphi_010100003946     TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.010 Y NA
 6462513 6462514 SentesTyphi_010100003946 SentesTyphi_010100003951     TRUE 0.989 15.000 0.000 0.010 Y NA
 6462514 6462515 SentesTyphi_010100003951 SentesTyphi_010100003956     TRUE 0.657 26.000 0.000 NA   NA
 6462515 6462516 SentesTyphi_010100003956 SentesTyphi_010100003961     FALSE 0.344 60.000 0.000 NA   NA
 6462516 6462517 SentesTyphi_010100003961 SentesTyphi_010100003966     TRUE 0.974 13.000 0.000 1.000 Y NA
 6462518 6462519 SentesTyphi_010100003981 SentesTyphi_010100003986 mazG   FALSE 0.052 228.000 0.025 1.000   NA
 6462519 6462520 SentesTyphi_010100003986 SentesTyphi_010100003991   eno FALSE 0.285 83.000 0.068 1.000 N NA
 6462520 6462521 SentesTyphi_010100003991 SentesTyphi_010100003996 eno   FALSE 0.081 136.000 0.010 1.000 N NA
 6462521 6462522 SentesTyphi_010100003996 SentesTyphi_010100004001     FALSE 0.039 484.000 0.000 1.000   NA
 6462524 6462525 SentesTyphi_010100004021 SentesTyphi_010100004026     FALSE 0.424 76.000 0.116 1.000 N NA
 6462527 6462528 SentesTyphi_010100004056 SentesTyphi_010100004061     TRUE 0.961 17.000 0.336 NA   NA
 6462528 6462529 SentesTyphi_010100004061 SentesTyphi_010100004076     FALSE 0.028 1092.000 0.000 NA   NA
 6462529 6462530 SentesTyphi_010100004076 SentesTyphi_010100004081     TRUE 0.974 0.000 0.282 NA   NA
 6462530 6462531 SentesTyphi_010100004081 SentesTyphi_010100004086     TRUE 0.972 20.000 0.589 NA   NA
 6462531 6462532 SentesTyphi_010100004086 SentesTyphi_010100004091     TRUE 0.988 3.000 0.509 NA   NA
 11502554 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3844.000 0.000 NA   NA
 11644917 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3844.000 0.000 NA   NA
 11787309 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3844.000 0.000 NA   NA
 11502555 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3847.000 0.000 NA   NA
 11644918 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3847.000 0.000 NA   NA
 11787310 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3847.000 0.000 NA   NA
 11502556 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3905.000 0.000 NA   NA
 11644919 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3905.000 0.000 NA   NA
 11787311 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3905.000 0.000 NA   NA
 11502557 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3934.000 0.000 NA   NA
 11644920 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3934.000 0.000 NA   NA
 11787312 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3934.000 0.000 NA   NA
 6462533 6462534 SentesTyphi_010100004096 SentesTyphi_010100004101     FALSE 0.111 171.000 0.000 NA   NA
 11502558 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3966.000 0.000 NA   NA
 11644921 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3966.000 0.000 NA   NA
 11787313 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3966.000 0.000 NA   NA
 11502559 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3995.000 0.000 NA   NA
 11644922 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3995.000 0.000 NA   NA
 11787314 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 3995.000 0.000 NA   NA
 11502560 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4027.000 0.000 NA   NA
 11644923 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4027.000 0.000 NA   NA
 11787315 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4027.000 0.000 NA   NA
 11502561 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4056.000 0.000 NA   NA
 11644924 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4056.000 0.000 NA   NA
 11787316 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4056.000 0.000 NA   NA
 11502562 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4088.000 0.000 NA   NA
 11644925 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4088.000 0.000 NA   NA
 11787317 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4088.000 0.000 NA   NA
 11502563 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4117.000 0.000 NA   NA
 11644926 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4117.000 0.000 NA   NA
 11787318 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4117.000 0.000 NA   NA
 11502564 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4149.000 0.000 NA   NA
 11644927 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4149.000 0.000 NA   NA
 11787319 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4149.000 0.000 NA   NA
 11502565 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4178.000 0.000 NA   NA
 11644928 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4178.000 0.000 NA   NA
 11787320 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4178.000 0.000 NA   NA
 11502566 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4210.000 0.000 NA   NA
 11644929 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4210.000 0.000 NA   NA
 11787321 6462528   SentesTyphi_010100004061     FALSE NA 4210.000 0.000 NA   NA
 6462539 6462540 SentesTyphi_010100004130 SentesTyphi_010100004135     TRUE 0.837 18.000 0.074 NA   NA
 6462540 6462541 SentesTyphi_010100004135 SentesTyphi_010100004140     FALSE 0.216 158.000 0.114 1.000 N NA
 6462541 6462542 SentesTyphi_010100004140 SentesTyphi_010100004145     TRUE 0.968 -31.000 0.526 NA N NA
 6462542 6462543 SentesTyphi_010100004145 SentesTyphi_010100004150   trmE FALSE 0.097 183.000 0.000 NA   NA
 6462543 6462544 SentesTyphi_010100004150 SentesTyphi_010100004155 trmE   TRUE 0.500 143.000 0.221 1.000   NA
 6462544 6462545 SentesTyphi_010100004155 SentesTyphi_010100004160     TRUE 0.986 3.000 0.461 NA   NA
 6462545 6462546 SentesTyphi_010100004160 SentesTyphi_010100004165   rnpA TRUE 0.975 -36.000 0.540 NA   NA
 6462546 6462547 SentesTyphi_010100004165 SentesTyphi_010100004170 rnpA rpmH TRUE 0.932 50.000 0.787 1.000   NA
 6462548 6462549 SentesTyphi_010100004175 SentesTyphi_010100004190 dnaA recF FALSE 0.282 1302.000 0.000 0.087 Y NA
 6462549 6462550 SentesTyphi_010100004190 SentesTyphi_010100004195 recF gyrB TRUE 0.989 29.000 0.249 0.003 Y NA
 6462551 6462552 SentesTyphi_010100004200 SentesTyphi_010100004205     FALSE 0.181 115.000 0.000 1.000 N NA
 6462552 6462553 SentesTyphi_010100004205 SentesTyphi_010100004210     TRUE 0.755 17.000 0.000 1.000 N NA
 6462554 6462555 SentesTyphi_010100004215 SentesTyphi_010100004220     FALSE 0.072 202.000 0.000 NA   NA
 6462555 6462556 SentesTyphi_010100004220 SentesTyphi_010100004225     TRUE 0.908 -3.000 0.091 NA   NA
 6462556 6462557 SentesTyphi_010100004225 SentesTyphi_010100004230     TRUE 0.988 -3.000 0.679 NA   NA
 6462559 6462560 SentesTyphi_010100004240 SentesTyphi_010100004245     TRUE 0.980 -10.000 0.500 1.000   NA
 6462560 6462561 SentesTyphi_010100004245 SentesTyphi_010100004250     TRUE 0.819 -88.000 0.000 1.000   NA
 6462562 6462563 SentesTyphi_010100004255 SentesTyphi_010100004260     FALSE 0.033 336.000 0.000 NA   NA
 6462564 6462565 SentesTyphi_010100004265 SentesTyphi_010100004270     FALSE 0.127 160.000 0.000 NA   NA
 6462568 6462569 SentesTyphi_010100004305 SentesTyphi_010100004310     FALSE 0.230 115.000 0.066 1.000 N NA
 6462569 6462570 SentesTyphi_010100004310 SentesTyphi_010100004315     FALSE 0.220 84.000 0.000 1.000 N NA
 6462571 6462572 SentesTyphi_010100004320 SentesTyphi_010100004325 umuC   FALSE 0.024 446.000 0.000 1.000 N NA
 6462572 6462573 SentesTyphi_010100004325 SentesTyphi_010100004330     TRUE 0.969 -13.000 0.400 NA   NA
 6462575 6462576 SentesTyphi_010100004340 SentesTyphi_010100004345     FALSE 0.031 367.000 0.000 NA   NA
 6462576 6462577 SentesTyphi_010100004345 SentesTyphi_010100004350     FALSE 0.312 80.000 0.062 NA   NA
 6462577 6462578 SentesTyphi_010100004350 SentesTyphi_010100004355     FALSE 0.352 74.000 0.000 1.000   NA
 6462578 6462579 SentesTyphi_010100004355 SentesTyphi_010100004360     TRUE 0.982 -19.000 0.000 0.058 Y NA
 6462581 6462582 SentesTyphi_010100004370 SentesTyphi_010100004375     TRUE 0.634 19.000 0.008 NA   NA
 6462582 6462583 SentesTyphi_010100004375 SentesTyphi_010100004380     FALSE 0.209 77.000 0.025 NA   NA
 6462583 6462584 SentesTyphi_010100004380 SentesTyphi_010100004385     FALSE 0.339 165.000 0.208 NA   NA
 6462585 6462586 SentesTyphi_010100004390 SentesTyphi_010100004395     FALSE 0.035 310.000 0.000 NA   NA
 6462588 6462589 SentesTyphi_010100004405 SentesTyphi_010100004410   fliR FALSE 0.032 281.000 0.000 1.000 N NA
 6462589 6462590 SentesTyphi_010100004410 SentesTyphi_010100004415 fliR fliQ TRUE 0.994 9.000 0.028 0.002 Y NA
 6462590 6462591 SentesTyphi_010100004415 SentesTyphi_010100004420 fliQ fliP TRUE 0.999 10.000 0.827 0.011 Y NA
 6462591 6462592 SentesTyphi_010100004420 SentesTyphi_010100004425 fliP   TRUE 0.990 0.000 0.203 1.000 Y NA
 6462592 6462593 SentesTyphi_010100004425 SentesTyphi_010100004430   fliN TRUE 0.995 0.000 0.443 1.000 Y NA
 6462593 6462594 SentesTyphi_010100004430 SentesTyphi_010100004435 fliN fliM TRUE 0.996 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 6462594 6462595 SentesTyphi_010100004435 SentesTyphi_010100004440 fliM fliL TRUE 0.986 90.000 0.957 0.001 Y NA
 6462595 6462596 SentesTyphi_010100004440 SentesTyphi_010100004445 fliL   TRUE 0.754 105.000 0.119 1.000 Y NA
 6462596 6462597 SentesTyphi_010100004445 SentesTyphi_010100004450   fliJ TRUE 0.997 -3.000 0.317 0.005 Y NA
 6462597 6462598 SentesTyphi_010100004450 SentesTyphi_010100004455 fliJ fliI TRUE 0.950 22.000 0.073 1.000 Y NA
 6462598 6462599 SentesTyphi_010100004455 SentesTyphi_010100004460 fliI fliH TRUE 0.978 0.000 0.000 1.000 Y NA
 6462599 6462600 SentesTyphi_010100004460 SentesTyphi_010100004465 fliH fliG TRUE 0.988 -7.000 0.005 0.003 Y NA
 6462600 6462601 SentesTyphi_010100004465 SentesTyphi_010100004470 fliG fliF TRUE 0.949 -7.000 0.220 NA   NA
 6462601 6462602 SentesTyphi_010100004470 SentesTyphi_010100004475 fliF fliF TRUE 0.836 3.000 0.020 NA   NA
 6462604 6462605 SentesTyphi_010100004485 SentesTyphi_010100004490     FALSE 0.036 298.000 0.000 NA   NA
 6462605 6462606 SentesTyphi_010100004490 SentesTyphi_010100004495     TRUE 0.990 -3.000 0.844 NA   NA
 6462610 6462611 SentesTyphi_010100004515 SentesTyphi_010100004520   rpmF TRUE 0.892 52.000 0.599 NA   NA
 6462611 6462612 SentesTyphi_010100004520 SentesTyphi_010100004525 rpmF   TRUE 0.508 164.000 0.418 1.000 N NA
 6462612 6462613 SentesTyphi_010100004525 SentesTyphi_010100004530     TRUE 0.964 80.000 0.380 0.004 Y NA
 6462613 6462614 SentesTyphi_010100004530 SentesTyphi_010100004535     TRUE 0.994 16.000 0.182 0.004 Y NA
 6462614 6462615 SentesTyphi_010100004535 SentesTyphi_010100004540   fabG TRUE 0.998 13.000 0.432 0.004 Y NA
 6462615 6462616 SentesTyphi_010100004540 SentesTyphi_010100004545 fabG   TRUE 0.908 156.000 0.321 0.004 Y NA
 6462616 6462617 SentesTyphi_010100004545 SentesTyphi_010100004550     TRUE 0.888 86.000 0.346 1.000 Y NA
 6462617 6462618 SentesTyphi_010100004550 SentesTyphi_010100004555     FALSE 0.435 124.000 0.187 1.000 N NA
 6462618 6462619 SentesTyphi_010100004555 SentesTyphi_010100004560     TRUE 0.973 3.000 0.204 1.000   NA
 6462619 6462620 SentesTyphi_010100004560 SentesTyphi_010100004565   tdk TRUE 0.988 -10.000 0.209 0.001   NA
 6462620 6462621 SentesTyphi_010100004565 SentesTyphi_010100004570 tdk   TRUE 0.951 -3.000 0.211 1.000 N NA
 6462621 6462622 SentesTyphi_010100004570 SentesTyphi_010100004575     TRUE 0.984 11.000 0.110 NA Y NA
 6462622 6462623 SentesTyphi_010100004575 SentesTyphi_010100004580     FALSE 0.005 295.000 0.004 NA N NA
 6462623 6462624 SentesTyphi_010100004580 SentesTyphi_010100004595     FALSE 0.137 2602.000 0.005 1.000 Y NA
 6462624 6462625 SentesTyphi_010100004595 SentesTyphi_010100004600     TRUE 0.895 3.000 0.051 NA   NA
 6462625 6462626 SentesTyphi_010100004600 SentesTyphi_010100004605     TRUE 0.983 14.000 0.516 NA   NA
 6462626 6462627 SentesTyphi_010100004605 SentesTyphi_010100004610   thiK TRUE 0.957 -19.000 0.310 NA   NA
 6462627 6462628 SentesTyphi_010100004610 SentesTyphi_010100004625 thiK   FALSE 0.073 1062.000 0.151 NA   NA
 6462628 6462629 SentesTyphi_010100004625 SentesTyphi_010100004630     FALSE 0.051 255.000 0.057 NA   NA
 6462629 6462630 SentesTyphi_010100004630 SentesTyphi_010100004635     FALSE 0.151 189.000 0.071 1.000   NA
 6462632 6462633 SentesTyphi_010100004645 SentesTyphi_010100004650     FALSE 0.133 157.000 0.000 NA   NA
 6462634 6462635 SentesTyphi_010100004655 SentesTyphi_010100004660     FALSE 0.133 148.000 0.006 1.000   NA
 6462636 6462637 SentesTyphi_010100004665 SentesTyphi_010100004670   lolD TRUE 0.971 -7.000 0.175 0.062 N NA
 6462637 6462638 SentesTyphi_010100004670 SentesTyphi_010100004675 lolD   TRUE 0.976 0.000 0.125 0.062 N NA
 6462638 6462639 SentesTyphi_010100004675 SentesTyphi_010100004680     TRUE 0.859 29.000 0.225 1.000 N NA
 6462639 6462640 SentesTyphi_010100004680 SentesTyphi_010100004685     TRUE 0.969 19.000 0.119 1.000 Y NA
 6462641 6462642 SentesTyphi_010100004690 SentesTyphi_010100004695 potD potC TRUE 0.961 25.000 0.007 0.049 Y NA
 6462642 6462643 SentesTyphi_010100004695 SentesTyphi_010100004700 potC sifA FALSE 0.034 316.000 0.000 NA   NA
 6462643 6462644 SentesTyphi_010100004700 SentesTyphi_010100004705 sifA potB FALSE 0.034 329.000 0.000 NA   NA
 6462644 6462645 SentesTyphi_010100004705 SentesTyphi_010100004710 potB potA TRUE 0.995 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 6462646 6462647 SentesTyphi_010100004715 SentesTyphi_010100004720     TRUE 0.915 4.000 0.000 1.000   NA
 6462649 6462650 SentesTyphi_010100004730 SentesTyphi_010100004735     FALSE 0.205 121.000 0.000 NA   NA
 6462651 6462652 SentesTyphi_010100004740 SentesTyphi_010100004745     FALSE 0.033 333.000 0.000 NA   NA
 6462652 6462653 SentesTyphi_010100004745 SentesTyphi_010100004750     TRUE 0.939 7.000 0.098 NA   NA
 6462654 6462655 SentesTyphi_010100004755 SentesTyphi_010100004760     FALSE 0.028 325.000 0.000 1.000 N NA
 6462659 6462660 SentesTyphi_010100004780 SentesTyphi_010100004785     FALSE 0.058 219.000 0.000 NA   NA
 6462660 6462661 SentesTyphi_010100004785 SentesTyphi_010100004790     TRUE 0.521 39.000 0.000 NA   NA
 6462661 6462662 SentesTyphi_010100004790 SentesTyphi_010100004795     TRUE 0.806 10.000 0.000 NA N NA
 6462664 6462665 SentesTyphi_010100004820 SentesTyphi_010100004825 nagB nagA TRUE 0.985 60.000 0.557 0.001 Y NA
 6462665 6462666 SentesTyphi_010100004825 SentesTyphi_010100004830 nagA   TRUE 0.916 5.000 0.000 1.000   NA
 6462666 6462667 SentesTyphi_010100004830 SentesTyphi_010100004835     TRUE 0.749 24.000 0.000 1.000   NA
 6462667 6462668 SentesTyphi_010100004835 SentesTyphi_010100004850   asnB FALSE 0.023 1091.000 0.000 1.000 N NA
 6462668 6462669 SentesTyphi_010100004850 SentesTyphi_010100t05157 asnB   FALSE 0.055 223.000 0.000 NA   NA
 6462669 6462670 SentesTyphi_010100t05157 SentesTyphi_010100t05159     TRUE 0.890 9.000 0.000 NA   NA
 6462670 6462671 SentesTyphi_010100t05159 SentesTyphi_010100t05161     TRUE 0.688 24.000 0.000 NA   NA
 6462671 6462672 SentesTyphi_010100t05161 SentesTyphi_010100t05163     TRUE 0.552 36.000 0.000 NA   NA
 6462672 6462673 SentesTyphi_010100t05163 SentesTyphi_010100t05165     TRUE 0.809 16.000 0.000 NA   NA
 6462673 6462674 SentesTyphi_010100t05165 SentesTyphi_010100t05167     FALSE 0.446 47.000 0.000 NA   NA
 6462676 6462677 SentesTyphi_010100004865 SentesTyphi_010100004870     FALSE 0.219 205.000 0.220 1.000 N NA
 6462677 6462678 SentesTyphi_010100004870 SentesTyphi_010100004875     TRUE 0.980 -3.000 0.457 NA   NA
 6462678 6462679 SentesTyphi_010100004875 SentesTyphi_010100004880     FALSE 0.287 158.000 0.150 NA   NA
 6462679 6462680 SentesTyphi_010100004880 SentesTyphi_010100004895     FALSE 0.025 1975.000 0.000 1.000 N NA
 6462680 6462681 SentesTyphi_010100004895 SentesTyphi_010100004900     TRUE 0.683 160.000 0.000 0.048 Y NA
 6462681 6462682 SentesTyphi_010100004900 SentesTyphi_010100004905     TRUE 0.999 0.000 0.933 0.015 Y NA
 6462682 6462683 SentesTyphi_010100004905 SentesTyphi_010100004910     TRUE 0.994 0.000 0.379 1.000 Y NA
 6462683 6462684 SentesTyphi_010100004910 SentesTyphi_010100004915   rihA FALSE 0.412 117.000 0.195 NA N NA
 6462684 6462685 SentesTyphi_010100004915 SentesTyphi_010100004920 rihA   TRUE 0.585 32.000 0.000 NA   NA
 6462686 6462687 SentesTyphi_010100004925 SentesTyphi_010100004940     FALSE 0.030 2090.000 0.000 NA   NA
 6462687 6462688 SentesTyphi_010100004940 SentesTyphi_010100004945     TRUE 0.498 50.000 0.000 1.000   NA
 6462688 6462689 SentesTyphi_010100004945 SentesTyphi_010100004950     TRUE 0.988 23.000 0.409 0.001   NA
 6462690 6462691 SentesTyphi_010100004955 SentesTyphi_010100004960 leuS   TRUE 0.923 15.000 0.182 NA N NA
 6462691 6462692 SentesTyphi_010100004960 SentesTyphi_010100004965   holA TRUE 0.950 0.000 0.199 NA N NA
 6462692 6462693 SentesTyphi_010100004965 SentesTyphi_010100004970 holA nadD TRUE 0.777 -7.000 0.045 1.000 N NA
 6462695 6462696 SentesTyphi_010100004980 SentesTyphi_010100004985     TRUE 0.876 0.000 0.000 NA   NA
 6462696 6462697 SentesTyphi_010100004985 SentesTyphi_010100004990     FALSE 0.089 189.000 0.000 NA   NA
 6462697 6462698 SentesTyphi_010100004990 SentesTyphi_010100004995     TRUE 0.979 4.000 0.307 NA   NA
 6462698 6462699 SentesTyphi_010100004995 SentesTyphi_010100005000     TRUE 0.526 31.000 0.031 NA   NA
 6462699 6462700 SentesTyphi_010100005000 SentesTyphi_010100005005     TRUE 0.863 3.000 0.046 1.000 N NA
 6462700 6462701 SentesTyphi_010100005005 SentesTyphi_010100005010     TRUE 0.726 11.000 0.035 NA N NA
 6462701 6462702 SentesTyphi_010100005010 SentesTyphi_010100005015     TRUE 0.926 67.000 0.475 NA Y NA
 6462702 6462703 SentesTyphi_010100005015 SentesTyphi_010100005020     FALSE 0.320 108.000 0.081 NA   NA
 6462703 6462704 SentesTyphi_010100005020 SentesTyphi_010100005025   lipB TRUE 0.569 100.000 0.219 NA   NA
 6462704 6462705 SentesTyphi_010100005025 SentesTyphi_010100005030 lipB   FALSE 0.029 302.000 0.000 1.000 N NA
 6462705 6462706 SentesTyphi_010100005030 SentesTyphi_010100005035     FALSE 0.027 206.000 0.005 1.000 N NA
 6462707 6462708 SentesTyphi_010100005040 SentesTyphi_010100005045 tatE   FALSE 0.162 256.000 0.196 1.000   NA
 6462710 6462711 SentesTyphi_010100005055 SentesTyphi_010100005060 cspE   FALSE 0.426 188.000 0.333 1.000   NA
 6462713 6462714 SentesTyphi_010100005070 SentesTyphi_010100005075 dpiA   TRUE 0.957 -31.000 0.000 1.000 Y NA
 6462715 6462716 SentesTyphi_010100005080 SentesTyphi_010100005085     TRUE 0.972 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 6462716 6462717 SentesTyphi_010100005085 SentesTyphi_010100005090     TRUE 0.995 -3.000 0.537 0.002 N NA
 6462717 6462718 SentesTyphi_010100005090 SentesTyphi_010100005095     TRUE 0.995 10.000 0.373 0.001 N NA
 6462718 6462719 SentesTyphi_010100005095 SentesTyphi_010100005100   citX TRUE 0.755 48.000 0.231 1.000 N NA
 6462719 6462720 SentesTyphi_010100005100 SentesTyphi_010100005105 citX citG TRUE 0.989 -28.000 0.400 1.000 Y NA
 6462720 6462721 SentesTyphi_010100005105 SentesTyphi_010100005110 citG   TRUE 0.781 38.000 0.194 1.000 N NA
 6462721 6462722 SentesTyphi_010100005110 SentesTyphi_010100005115     FALSE 0.127 110.000 0.024 1.000 N NA
 6462722 6462723 SentesTyphi_010100005115 SentesTyphi_010100005120     FALSE 0.023 235.000 0.018 1.000 N NA
 6462726 6462727 SentesTyphi_010100005135 SentesTyphi_010100005140     TRUE 0.994 0.000 1.000 1.000   NA
 6462727 6462728 SentesTyphi_010100005140 SentesTyphi_010100005145     TRUE 0.997 -3.000 0.444 0.046 Y NA
 6462728 6462729 SentesTyphi_010100005145 SentesTyphi_010100005150     TRUE 0.880 122.000 0.556 0.046   NA
 6462730 6462731 SentesTyphi_010100005167 SentesTyphi_010100005172     FALSE 0.275 341.000 0.556 NA   NA
 6462731 6462732 SentesTyphi_010100005172 SentesTyphi_010100005177     TRUE 0.805 109.000 0.667 NA   NA
 6462732 6462733 SentesTyphi_010100005177 SentesTyphi_010100005182     TRUE 0.701 23.000 0.000 NA   NA
 6462733 6462734 SentesTyphi_010100005182 SentesTyphi_010100005187     FALSE 0.187 133.000 0.000 NA   NA
 6462734 6462735 SentesTyphi_010100005187 SentesTyphi_010100005192     FALSE 0.175 140.000 0.000 NA   NA
 6462736 6462737 SentesTyphi_010100005197 SentesTyphi_010100005202     FALSE 0.018 324.000 0.000 NA N NA
 6462737 6462738 SentesTyphi_010100005202 SentesTyphi_010100005207     FALSE 0.035 310.000 0.000 NA   NA
 6462739 6462740 SentesTyphi_010100005222 SentesTyphi_010100005227 gmhA   FALSE 0.414 164.000 0.229 1.000   NA
 6462742 6462743 SentesTyphi_010100005237 SentesTyphi_010100005242     FALSE 0.056 220.000 0.000 NA   NA
 6462743 6462744 SentesTyphi_010100005242 SentesTyphi_010100005247   prfH TRUE 0.969 -3.000 0.303 NA   NA
 6462746 6462747 SentesTyphi_010100005257 SentesTyphi_010100005262   frsA FALSE 0.149 89.000 0.000 NA N NA
 6462747 6462748 SentesTyphi_010100005262 SentesTyphi_010100005267 frsA   FALSE 0.359 58.000 0.000 NA   NA
 6462750 6462751 SentesTyphi_010100005277 SentesTyphi_010100005282   proA TRUE 0.993 12.000 0.026 0.001 Y NA
 6462751 6462752 SentesTyphi_010100005282 SentesTyphi_010100t05509 proA   FALSE 0.213 116.000 0.000 NA   NA
 6462752 6462753 SentesTyphi_010100t05509 SentesTyphi_010100005287     FALSE 0.054 224.000 0.000 NA   NA
 6462754 6462755 SentesTyphi_010100005292 SentesTyphi_010100005297     TRUE 0.825 -34.000 0.000 1.000   NA
 6462755 6462756 SentesTyphi_010100005297 SentesTyphi_010100005322     FALSE 0.165 3373.000 0.000 0.009   NA
 6462757 6462758 SentesTyphi_010100005327 SentesTyphi_010100005332     TRUE 0.639 196.000 1.000 NA   NA
 6462758 6462759 SentesTyphi_010100005332 SentesTyphi_010100005337     FALSE 0.033 336.000 0.000 NA   NA
 6462759 6462760 SentesTyphi_010100005337 SentesTyphi_010100005342     FALSE 0.440 100.000 0.182 NA N NA
 6462760 6462761 SentesTyphi_010100005342 SentesTyphi_010100005347     TRUE 0.986 18.000 1.000 NA   NA
 6462761 6462762 SentesTyphi_010100005347 SentesTyphi_010100005352     FALSE 0.033 341.000 0.000 NA   NA
 6462762 6462763 SentesTyphi_010100005352 SentesTyphi_010100005357     FALSE 0.035 260.000 0.000 1.000 N NA
 6462763 6462764 SentesTyphi_010100005357 SentesTyphi_010100005362     TRUE 0.882 11.000 0.000 NA   NA
 6462764 6462765 SentesTyphi_010100005362 SentesTyphi_010100005367     FALSE 0.359 58.000 0.000 NA   NA
 6462767 6462768 SentesTyphi_010100005377 SentesTyphi_010100005382     FALSE 0.273 78.000 0.000 NA   NA
 6462768 6462769 SentesTyphi_010100005382 SentesTyphi_010100005387     FALSE 0.027 332.000 0.000 1.000 N NA
 6462769 6462770 SentesTyphi_010100005387 SentesTyphi_010100005392     FALSE 0.073 189.000 0.000 1.000 N NA
 6462770 6462771 SentesTyphi_010100005392 SentesTyphi_010100005407     FALSE 0.032 3257.000 0.000 NA   NA
 6462771 6462772 SentesTyphi_010100005407 SentesTyphi_010100005412     FALSE 0.297 71.000 0.000 NA   NA
 6462772 6462773 SentesTyphi_010100005412 SentesTyphi_010100005417     TRUE 0.996 -3.000 0.333 0.046 Y NA
 6462773 6462774 SentesTyphi_010100005417 SentesTyphi_010100005422     TRUE 0.945 -22.000 0.000 0.046   NA
 6462774 6462775 SentesTyphi_010100005422 SentesTyphi_010100005427     TRUE 0.876 0.000 0.000 NA   NA
 6462775 6462776 SentesTyphi_010100005427 SentesTyphi_010100005442     FALSE 0.029 1373.000 0.000 NA   NA
 6462780 6462781 SentesTyphi_010100005462 SentesTyphi_010100005467 prpB   TRUE 0.707 123.000 0.502 1.000 N NA
 6462781 6462782 SentesTyphi_010100005467 SentesTyphi_010100005472   prpD TRUE 0.844 38.000 0.216 1.000   NA
 6462782 6462783 SentesTyphi_010100005472 SentesTyphi_010100005477 prpD prpE TRUE 0.892 41.000 0.038 0.001   NA
 6462785 6462786 SentesTyphi_010100005487 SentesTyphi_010100005492     FALSE 0.151 86.000 0.000 NA N NA
 6462789 6462790 SentesTyphi_010100005509 SentesTyphi_010100005514     FALSE 0.031 400.000 0.000 NA   NA
 6462791 6462792 SentesTyphi_010100005519 SentesTyphi_010100005524     FALSE 0.095 185.000 0.000 NA   NA
 6462795 6462796 SentesTyphi_010100005539 SentesTyphi_010100005544     FALSE 0.028 730.000 0.000 NA   NA
 6462797 6462798 SentesTyphi_010100005559 SentesTyphi_010100005564     TRUE 0.972 -7.000 0.400 NA   NA
 6462800 6462801 SentesTyphi_010100005584 SentesTyphi_010100005589     FALSE 0.144 153.000 0.000 NA   NA
 6462801 6462802 SentesTyphi_010100005589 SentesTyphi_010100005604     FALSE 0.032 2967.000 0.000 NA   NA
 6462804 6462805 SentesTyphi_010100005614 SentesTyphi_010100005619     FALSE 0.049 236.000 0.000 NA   NA
 6462805 6462806 SentesTyphi_010100005619 SentesTyphi_010100005634     FALSE 0.038 1098.000 0.000 1.000   NA
 6462806 6462807 SentesTyphi_010100005634 SentesTyphi_010100005639     TRUE 0.998 0.000 0.500 0.016 Y NA
 6462807 6462808 SentesTyphi_010100005639 SentesTyphi_010100005644     TRUE 0.937 146.000 0.500 0.016 Y NA
 6462808 6462809 SentesTyphi_010100005644 SentesTyphi_010100005649     TRUE 0.999 11.000 0.667 0.010 Y NA
 6462809 6462810 SentesTyphi_010100005649 SentesTyphi_010100005654     FALSE 0.346 222.000 0.400 1.000   NA
 6462811 6462812 SentesTyphi_010100005659 SentesTyphi_010100005664     TRUE 0.809 16.000 0.000 NA   NA
 6462815 6462816 SentesTyphi_010100005674 SentesTyphi_010100005679     TRUE 0.991 12.000 0.250 1.000 Y NA
 6462817 6462818 SentesTyphi_010100005684 SentesTyphi_010100005689     TRUE 0.556 121.000 0.257 NA   NA
 6462820 6462821 SentesTyphi_010100005699 SentesTyphi_010100005704     TRUE 0.910 6.000 0.076 1.000 N NA
 6462821 6462822 SentesTyphi_010100005704 SentesTyphi_010100005709     TRUE 0.928 5.000 0.095 1.000 N NA
 6462822 6462823 SentesTyphi_010100005709 SentesTyphi_010100005714   rpoZ TRUE 0.984 19.000 0.291 1.000 Y NA
 6462823 6462824 SentesTyphi_010100005714 SentesTyphi_010100005739 rpoZ   FALSE 0.031 2615.000 0.000 NA   NA
 6462824 6462825 SentesTyphi_010100005739 SentesTyphi_010100005744     FALSE 0.045 248.000 0.000 NA   NA
 6462828 6462829 SentesTyphi_010100005759 SentesTyphi_010100005764 rph pyrE FALSE 0.152 79.000 0.022 1.000 N NA
 6462830 6462831 SentesTyphi_010100005769 SentesTyphi_010100005774 slmA dut FALSE 0.234 108.000 0.060 1.000 N NA
 6462831 6462832 SentesTyphi_010100005774 SentesTyphi_010100005779 dut   TRUE 0.924 -22.000 0.201 1.000 N NA
 6462833 6462834 SentesTyphi_010100005784 SentesTyphi_010100005789 radC rpmB FALSE 0.021 218.000 0.002 1.000 N NA
 6462834 6462835 SentesTyphi_010100005789 SentesTyphi_010100005794 rpmB rpmG TRUE 0.993 21.000 0.332 0.013 Y NA
 6462835 6462836 SentesTyphi_010100005794 SentesTyphi_010100005799 rpmG   FALSE 0.166 98.000 0.034 1.000 N NA
 6462837 6462838 SentesTyphi_010100005804 SentesTyphi_010100005809 coaD   TRUE 0.795 9.000 0.020 1.000 N NA
 6462839 6462840 SentesTyphi_010100005814 SentesTyphi_010100005819     TRUE 0.807 -10.000 0.000 NA   NA
 6462840 6462841 SentesTyphi_010100005819 SentesTyphi_010100005824     TRUE 0.978 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 6462841 6462842 SentesTyphi_010100005824 SentesTyphi_010100005829     TRUE 0.925 -7.000 0.121 1.000   NA
 6462842 6462843 SentesTyphi_010100005829 SentesTyphi_010100005834     FALSE 0.030 450.000 0.000 NA   NA
 6462843 6462844 SentesTyphi_010100005834 SentesTyphi_010100005839     FALSE 0.344 60.000 0.000 NA   NA
 6462844 6462845 SentesTyphi_010100005839 SentesTyphi_010100005844     TRUE 0.990 6.000 0.167 1.000 Y NA
 6462845 6462846 SentesTyphi_010100005844 SentesTyphi_010100005849     TRUE 0.998 18.000 0.833 0.002 Y NA
 6462846 6462847 SentesTyphi_010100005849 SentesTyphi_010100005854     TRUE 0.952 23.000 0.375 1.000   NA
 6462847 6462848 SentesTyphi_010100005854 SentesTyphi_010100005859     FALSE 0.414 150.000 0.214 NA   NA
 6462848 6462849 SentesTyphi_010100005859 SentesTyphi_010100005864     TRUE 0.563 99.000 0.214 NA   NA
 6462850 6462851 SentesTyphi_010100005869 SentesTyphi_010100005874     TRUE 0.839 40.000 0.036 NA Y NA
 6462851 6462852 SentesTyphi_010100005874 SentesTyphi_010100005879     TRUE 0.997 0.000 0.205 0.001 Y NA
 6462852 6462853 SentesTyphi_010100005879 SentesTyphi_010100005884   rfaD TRUE 0.989 3.000 0.146 1.000 Y NA
 6462854 6462855 SentesTyphi_010100005889 SentesTyphi_010100005894   tdh TRUE 0.988 10.000 0.547 1.000 N NA
 6462858 6462859 SentesTyphi_010100005911 SentesTyphi_010100005916     FALSE 0.119 165.000 0.000 NA   NA
 6462859 6462860 SentesTyphi_010100005916 SentesTyphi_010100005921     TRUE 0.761 19.000 0.000 NA   NA
 6462860 6462861 SentesTyphi_010100005921 SentesTyphi_010100005926     FALSE 0.029 605.000 0.000 NA   NA
 6462862 6462863 SentesTyphi_010100005931 SentesTyphi_010100005936     TRUE 0.998 10.000 0.875 NA Y NA
 6462864 6462865 SentesTyphi_010100005953 SentesTyphi_010100005958 pssA   TRUE 0.606 115.000 0.121 0.061 N NA
 6462865 6462866 SentesTyphi_010100005958 SentesTyphi_010100005963     TRUE 0.726 54.000 0.222 NA   NA
 6462866 6462867 SentesTyphi_010100005963 SentesTyphi_010100005968     FALSE 0.403 73.000 0.084 NA   NA
 6462870 6462871 SentesTyphi_010100005983 SentesTyphi_010100005998     FALSE 0.038 753.000 0.000 1.000   NA
 6462875 6462876 SentesTyphi_010100006018 SentesTyphi_010100006023     TRUE 0.945 32.000 0.705 NA N NA
 6462876 6462877 SentesTyphi_010100006023 SentesTyphi_010100006028   rseB TRUE 0.997 0.000 0.856 NA Y NA
 6462877 6462878 SentesTyphi_010100006028 SentesTyphi_010100006033 rseB   TRUE 0.995 -3.000 0.609 NA Y NA
 6462878 6462879 SentesTyphi_010100006033 SentesTyphi_010100006038     FALSE 0.022 259.000 0.045 NA N NA
 6462879 6462880 SentesTyphi_010100006038 SentesTyphi_010100006043     TRUE 0.940 17.000 0.187 1.000   NA
 6462880 6462881 SentesTyphi_010100006043 SentesTyphi_010100006048   rnc FALSE 0.145 217.000 0.117 1.000   NA
 6462881 6462882 SentesTyphi_010100006048 SentesTyphi_010100006053 rnc era TRUE 0.977 -3.000 0.127 0.050   NA
 6462882 6462883 SentesTyphi_010100006053 SentesTyphi_010100006058 era recO TRUE 0.944 12.000 0.109 1.000   NA
 6462883 6462884 SentesTyphi_010100006058 SentesTyphi_010100006063 recO   TRUE 0.946 12.000 0.166 1.000 N NA
 6462884 6462885 SentesTyphi_010100006063 SentesTyphi_010100006068   acpS TRUE 0.975 0.000 0.326 1.000 N NA
 6462886 6462887 SentesTyphi_010100006073 SentesTyphi_010100006078     FALSE 0.395 53.000 0.000 NA   NA
 6462888 6462889 SentesTyphi_010100006083 SentesTyphi_010100006088     FALSE 0.310 45.000 0.000 NA N NA
 6462891 6462892 SentesTyphi_010100006098 SentesTyphi_010100006113 murQ   FALSE 0.149 1375.000 0.316 NA   NA
 6462892 6462893 SentesTyphi_010100006113 SentesTyphi_010100006118     FALSE 0.288 58.000 0.062 NA N NA
 6462894 6462895 SentesTyphi_010100006123 SentesTyphi_010100006128     TRUE 0.816 1.000 0.013 NA   NA
 6462896 6462897 SentesTyphi_010100006133 SentesTyphi_010100006138     FALSE 0.023 696.000 0.000 1.000 N NA
 6462897 6462898 SentesTyphi_010100006138 SentesTyphi_010100006143     FALSE 0.267 80.000 0.000 NA   NA
 6462898 6462899 SentesTyphi_010100006143 SentesTyphi_010100006148     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6462899 6462900 SentesTyphi_010100006148 SentesTyphi_010100006153     TRUE 0.474 77.000 0.146 1.000 N NA
 6462901 6462902 SentesTyphi_010100006158 SentesTyphi_010100006163     TRUE 0.940 56.000 0.400 1.000 Y NA
 6462902 6462903 SentesTyphi_010100006163 SentesTyphi_010100006168   cadB TRUE 0.690 83.000 0.000 1.000 Y NA
 6462903 6462904 SentesTyphi_010100006168 SentesTyphi_010100006173 cadB   FALSE 0.026 350.000 0.000 1.000 N NA
 6462904 6462905 SentesTyphi_010100006173 SentesTyphi_010100006178     FALSE 0.082 182.000 0.000 1.000 N NA
 6462906 6462907 SentesTyphi_010100006183 SentesTyphi_010100006188 glyA   FALSE 0.056 255.000 0.044 1.000   NA
 6462907 6462908 SentesTyphi_010100006188 SentesTyphi_010100006203     FALSE 0.017 1398.000 0.013 NA   NA
 6462909 6462910 SentesTyphi_010100006218 SentesTyphi_010100006223     TRUE 0.989 42.000 0.636 0.028 Y NA
 6462910 6462911 SentesTyphi_010100006223 SentesTyphi_010100006228     TRUE 0.993 4.000 0.318 0.028   NA
 6462911 6462912 SentesTyphi_010100006228 SentesTyphi_010100006233     FALSE 0.099 182.000 0.000 NA   NA
 6462912 6462913 SentesTyphi_010100006233 SentesTyphi_010100006238     FALSE 0.090 146.000 0.003 NA   NA
 6462914 6462915 SentesTyphi_010100006243 SentesTyphi_010100006248     FALSE 0.092 242.000 0.126 1.000 N NA
 6462915 6462916 SentesTyphi_010100006248 SentesTyphi_010100006253     TRUE 0.461 181.000 0.424 1.000 N NA
 6462916 6462917 SentesTyphi_010100006253 SentesTyphi_010100006258     TRUE 0.932 28.000 0.448 1.000 N NA
 6462917 6462918 SentesTyphi_010100006258 SentesTyphi_010100006263   iscA TRUE 0.979 29.000 0.359 0.002   NA
 6462918 6462919 SentesTyphi_010100006263 SentesTyphi_010100006268 iscA hscB TRUE 0.492 197.000 0.500 1.000   NA
 6462919 6462920 SentesTyphi_010100006268 SentesTyphi_010100006273 hscB hscA TRUE 0.996 13.000 0.634 1.000 Y NA
 6462920 6462921 SentesTyphi_010100006273 SentesTyphi_010100006278 hscA   TRUE 0.992 2.000 0.794 1.000 N NA
 6462921 6462922 SentesTyphi_010100006278 SentesTyphi_010100006283     TRUE 0.990 12.000 0.625 1.000   NA
 6462922 6462923 SentesTyphi_010100006283 SentesTyphi_010100006288     TRUE 0.704 54.000 0.171 1.000   NA
 6462923 6462924 SentesTyphi_010100006288 SentesTyphi_010100006293     TRUE 0.584 110.000 0.253 NA   NA
 6462924 6462925 SentesTyphi_010100006293 SentesTyphi_010100006298     FALSE 0.031 383.000 0.000 NA   NA
 6462926 6462927 SentesTyphi_010100006303 SentesTyphi_010100006308   sseA FALSE 0.046 246.000 0.000 NA   NA
 6462927 6462928 SentesTyphi_010100006308 SentesTyphi_010100006313 sseA sseA TRUE 0.970 -10.000 0.028 0.001   NA
 6462929 6462930 SentesTyphi_010100006318 SentesTyphi_010100006323     TRUE 0.993 1.000 0.711 1.000   NA
 6462930 6462931 SentesTyphi_010100006323 SentesTyphi_010100006338     FALSE 0.025 2530.000 0.000 1.000 N NA
 6462931 6462932 SentesTyphi_010100006338 SentesTyphi_010100006353     FALSE 0.335 801.000 0.000 0.013 Y NA
 6462932 6462933 SentesTyphi_010100006353 SentesTyphi_010100006358   ndk FALSE 0.069 140.000 0.002 1.000 N NA
 6462933 6462934 SentesTyphi_010100006358 SentesTyphi_010100006363 ndk   FALSE 0.200 207.000 0.156 1.000   NA
 6462934 6462935 SentesTyphi_010100006363 SentesTyphi_010100006368     FALSE 0.035 294.000 0.020 1.000   NA
 6462935 6462936 SentesTyphi_010100006368 SentesTyphi_010100006373   ispG TRUE 0.904 27.000 0.233 1.000   NA
 6462936 6462937 SentesTyphi_010100006373 SentesTyphi_010100006378 ispG hisS TRUE 0.492 111.000 0.207 1.000 N NA
 6462937 6462938 SentesTyphi_010100006378 SentesTyphi_010100006383 hisS   TRUE 0.969 14.000 0.259 1.000   NA
 6462938 6462939 SentesTyphi_010100006383 SentesTyphi_010100006388     TRUE 0.988 11.000 0.492 1.000   NA
 6462939 6462940 SentesTyphi_010100006388 SentesTyphi_010100006393   engA TRUE 0.537 119.000 0.203 1.000   NA
 6462940 6462941 SentesTyphi_010100006393 SentesTyphi_010100006398 engA   FALSE 0.156 89.000 0.009 NA   NA
 6462941 6462942 SentesTyphi_010100006398 SentesTyphi_010100006413     FALSE 0.031 2596.000 0.000 NA   NA
 6462942 6462943 SentesTyphi_010100006413 SentesTyphi_010100006418     TRUE 0.508 138.000 0.250 NA   NA
 6462943 6462944 SentesTyphi_010100006418 SentesTyphi_010100006473     FALSE 0.032 14325.000 0.000 NA   NA
 6462944 6462945 SentesTyphi_010100006473 SentesTyphi_010100006478   guaA TRUE 0.956 70.000 0.190 0.001 Y NA
 6462946 6462947 SentesTyphi_010100006483 SentesTyphi_010100006488     FALSE 0.052 229.000 0.000 NA   NA
 6462947 6462948 SentesTyphi_010100006488 SentesTyphi_010100006493     TRUE 0.956 16.000 0.273 NA   NA
 6462948 6462949 SentesTyphi_010100006493 SentesTyphi_010100006498     FALSE 0.042 264.000 0.000 NA   NA
 6462951 6462952 SentesTyphi_010100006508 SentesTyphi_010100006513     TRUE 0.996 5.000 0.486 1.000 Y NA
 6462952 6462953 SentesTyphi_010100006513 SentesTyphi_010100006518   purN FALSE 0.041 189.000 0.017 1.000 N NA
 6462953 6462954 SentesTyphi_010100006518 SentesTyphi_010100006523 purN   TRUE 0.997 0.000 0.230 0.002 Y NA
 6462955 6462956 SentesTyphi_010100006538 SentesTyphi_010100006543     FALSE 0.179 71.000 0.048 NA N NA
 6462958 6462959 SentesTyphi_010100006588 SentesTyphi_010100006593     TRUE 0.994 6.000 0.295 1.000 Y NA
 6462960 6462961 SentesTyphi_010100006598 SentesTyphi_010100006603 bcp gcvR TRUE 0.923 0.000 0.102 1.000 N NA
 6462962 6462963 SentesTyphi_010100006608 SentesTyphi_010100006613     TRUE 0.984 17.000 0.267 NA Y NA
 6462963 6462964 SentesTyphi_010100006613 SentesTyphi_010100006618     FALSE 0.024 175.000 0.019 NA N NA
 6462964 6462965 SentesTyphi_010100006618 SentesTyphi_010100006623     FALSE 0.109 132.000 0.006 NA   NA
 6462965 6462966 SentesTyphi_010100006623 SentesTyphi_010100006628     TRUE 0.756 16.000 0.029 NA   NA
 6462967 6462968 SentesTyphi_010100006633 SentesTyphi_010100006638     TRUE 0.535 28.000 0.025 NA   NA
 6462968 6462969 SentesTyphi_010100006638 SentesTyphi_010100006643     TRUE 0.976 4.000 0.292 1.000 N NA
 6462970 6462971 SentesTyphi_010100006658 SentesTyphi_010100006663     FALSE 0.323 65.000 0.000 NA   NA
 6462971 6462972 SentesTyphi_010100006663 SentesTyphi_010100006668     FALSE 0.028 756.000 0.000 NA   NA
 6462972 6462973 SentesTyphi_010100006668 SentesTyphi_010100006673     FALSE 0.267 80.000 0.000 NA   NA
 6462973 6462974 SentesTyphi_010100006673 SentesTyphi_010100006678     FALSE 0.029 596.000 0.000 NA   NA
 6462974 6462975 SentesTyphi_010100006678 SentesTyphi_010100006693     FALSE 0.029 1459.000 0.000 NA   NA
 6462975 6462976 SentesTyphi_010100006693 SentesTyphi_010100006703     FALSE 0.028 980.000 0.000 NA   NA
 6462976 6462977 SentesTyphi_010100006703 SentesTyphi_010100006708     FALSE 0.041 407.000 0.000 1.000   NA
 6462977 6462978 SentesTyphi_010100006708 SentesTyphi_010100006713     FALSE 0.267 80.000 0.000 NA   NA
 6462978 6462979 SentesTyphi_010100006713 SentesTyphi_010100006718     FALSE 0.089 189.000 0.000 NA   NA
 6462979 6462980 SentesTyphi_010100006718 SentesTyphi_010100006723     FALSE 0.068 207.000 0.000 NA   NA
 6462982 6462983 SentesTyphi_010100006733 SentesTyphi_010100006748     FALSE 0.030 2117.000 0.000 NA   NA
 6462983 6462984 SentesTyphi_010100006748 SentesTyphi_010100006763     FALSE 0.030 1734.000 0.000 NA   NA
 6462986 6462987 SentesTyphi_010100006783 SentesTyphi_010100006788 sdhC sdhD TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 6462987 6462988 SentesTyphi_010100006788 SentesTyphi_010100006793 sdhD sdhA TRUE 0.999 0.000 0.705 0.002 Y NA
 6462988 6462989 SentesTyphi_010100006793 SentesTyphi_010100006798 sdhA sdhB TRUE 0.998 17.000 0.604 0.002 Y NA
 6462989 6462990 SentesTyphi_010100006798 SentesTyphi_010100006803 sdhB kgd FALSE 0.180 526.000 0.067 1.000 Y NA
 6462990 6462991 SentesTyphi_010100006803 SentesTyphi_010100006818 kgd sucC FALSE 0.158 1366.000 0.000 1.000 Y NA
 6462991 6462992 SentesTyphi_010100006818 SentesTyphi_010100006823 sucC   TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 6462992 6462993 SentesTyphi_010100006823 SentesTyphi_010100006828     TRUE 0.604 30.000 0.000 NA   NA
 6462993 6462994 SentesTyphi_010100006828 SentesTyphi_010100006833     FALSE 0.029 1435.000 0.000 NA   NA
 6462994 6462995 SentesTyphi_010100006833 SentesTyphi_010100006838     TRUE 0.985 16.000 0.000 0.045 Y NA
 6462995 6462996 SentesTyphi_010100006838 SentesTyphi_010100006843     TRUE 0.929 15.000 0.149 NA   NA
 6462996 6462997 SentesTyphi_010100006843 SentesTyphi_010100006848     TRUE 0.876 0.000 0.000 NA   NA
 6462997 6462998 SentesTyphi_010100006848 SentesTyphi_010100006853     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6462998 6462999 SentesTyphi_010100006853 SentesTyphi_010100006858     FALSE 0.091 229.000 0.095 NA   NA
 6462999 6463000 SentesTyphi_010100006858 SentesTyphi_010100006863     TRUE 0.991 6.000 0.593 1.000   NA
 6463000 6463001 SentesTyphi_010100006863 SentesTyphi_010100006868     TRUE 0.998 4.000 0.556 0.060 Y NA
 6463001 6463002 SentesTyphi_010100006868 SentesTyphi_010100006873   tolA TRUE 0.502 65.000 0.114 NA   NA
 6463003 6463004 SentesTyphi_010100006878 SentesTyphi_010100006883     TRUE 0.997 0.000 0.765 1.000 Y NA
 6463004 6463005 SentesTyphi_010100006883 SentesTyphi_010100006888   hemD TRUE 0.990 22.000 0.600 1.000 Y NA
 6463005 6463006 SentesTyphi_010100006888 SentesTyphi_010100006893 hemD hemC TRUE 0.997 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 6463007 6463008 SentesTyphi_010100006898 SentesTyphi_010100006903 cyaA   FALSE 0.230 108.000 0.000 NA   NA
 6463008 6463009 SentesTyphi_010100006903 SentesTyphi_010100006908     FALSE 0.094 186.000 0.000 NA   NA
 6463010 6463011 SentesTyphi_010100006913 SentesTyphi_010100006918 cyaY   FALSE 0.302 70.000 0.000 NA   NA
 6463011 6463012 SentesTyphi_010100006918 SentesTyphi_010100006923     TRUE 0.788 -21.000 0.000 NA   NA
 6463013 6463014 SentesTyphi_010100006928 SentesTyphi_010100006933   dapF FALSE 0.212 37.000 0.021 NA N NA
 6463014 6463015 SentesTyphi_010100006933 SentesTyphi_010100006938 dapF   TRUE 0.947 -3.000 0.175 NA   NA
 6463015 6463016 SentesTyphi_010100006938 SentesTyphi_010100006943   xerC TRUE 0.988 -3.000 0.714 NA   NA
 6463016 6463017 SentesTyphi_010100006943 SentesTyphi_010100006948 xerC   TRUE 0.983 0.000 0.367 1.000   NA
 6463017 6463018 SentesTyphi_010100006948 SentesTyphi_010100006953   uvrD FALSE 0.393 136.000 0.128 1.000   NA
 6463018 6463019 SentesTyphi_010100006953 SentesTyphi_010100006958 uvrD   FALSE 0.014 472.000 0.021 1.000 N NA
 6463020 6463021 SentesTyphi_010100006963 SentesTyphi_010100006968     TRUE 0.939 16.000 0.200 NA   NA
 6463021 6463022 SentesTyphi_010100006968 SentesTyphi_010100006973     FALSE 0.402 35.000 0.006 NA   NA
 6463022 6463023 SentesTyphi_010100006973 SentesTyphi_010100006978     TRUE 0.632 44.000 0.099 NA   NA
 6463025 6463026 SentesTyphi_010100006988 SentesTyphi_010100006993   obgE TRUE 0.791 16.000 0.015 1.000   NA
 6463030 6463031 SentesTyphi_010100007013 SentesTyphi_010100007018 rrmJ hflB FALSE 0.432 104.000 0.152 1.000 N NA
 6463031 6463032 SentesTyphi_010100007018 SentesTyphi_010100007023 hflB folP TRUE 0.636 104.000 0.325 1.000 N NA
 6463032 6463033 SentesTyphi_010100007023 SentesTyphi_010100007028 folP glmM TRUE 0.952 -7.000 0.260 1.000 N NA
 6463033 6463034 SentesTyphi_010100007028 SentesTyphi_010100007033 glmM secG FALSE 0.024 223.000 0.016 1.000 N NA
 6463034 6463035 SentesTyphi_010100007033 SentesTyphi_010100t07165 secG   TRUE 0.845 14.000 0.000 NA   NA
 6463037 6463038 SentesTyphi_010100t07167 SentesTyphi_010100007043     FALSE 0.067 208.000 0.000 NA   NA
 6463038 6463039 SentesTyphi_010100007043 SentesTyphi_010100007048   nusA TRUE 0.964 28.000 0.759 NA   NA
 6463039 6463040 SentesTyphi_010100007048 SentesTyphi_010100007053 nusA nusA TRUE 0.960 18.000 0.004 0.001   NA
 6463040 6463041 SentesTyphi_010100007053 SentesTyphi_010100007058 nusA infB TRUE 0.925 25.000 0.342 1.000 N NA
 6463041 6463042 SentesTyphi_010100007058 SentesTyphi_010100007063 infB rbfA TRUE 0.675 221.000 0.530 1.000 Y NA
 6463042 6463043 SentesTyphi_010100007063 SentesTyphi_010100007068 rbfA truB TRUE 0.993 0.000 0.318 1.000 Y NA
 6463043 6463044 SentesTyphi_010100007068 SentesTyphi_010100007073 truB rpsO TRUE 0.721 151.000 0.211 1.000 Y NA
 6463044 6463045 SentesTyphi_010100007073 SentesTyphi_010100007078 rpsO   TRUE 0.605 212.000 0.335 1.000 Y NA
 6463045 6463046 SentesTyphi_010100007078 SentesTyphi_010100007083     FALSE 0.344 110.000 0.071 1.000   NA
 6463046 6463047 SentesTyphi_010100007083 SentesTyphi_010100007088     FALSE 0.143 179.000 0.053 1.000   NA
 6463047 6463048 SentesTyphi_010100007088 SentesTyphi_010100007093     FALSE 0.061 154.000 0.009 1.000 N NA
 6463049 6463050 SentesTyphi_010100007098 SentesTyphi_010100007103     FALSE 0.048 178.000 0.041 NA N NA
 6463050 6463051 SentesTyphi_010100007103 SentesTyphi_010100007108     TRUE 0.999 9.000 0.948 0.004 Y NA
 6463052 6463053 SentesTyphi_010100007113 SentesTyphi_010100007118     TRUE 0.968 -6.000 0.295 1.000   NA
 6463058 6463059 SentesTyphi_010100007143 SentesTyphi_010100007148     TRUE 0.990 10.000 0.613 NA   NA
 6463059 6463060 SentesTyphi_010100007148 SentesTyphi_010100007153     TRUE 0.885 22.000 0.187 1.000 N NA
 6463060 6463061 SentesTyphi_010100007153 SentesTyphi_010100007158     TRUE 0.916 -42.000 0.172 NA   NA
 6463062 6463063 SentesTyphi_010100007167 SentesTyphi_010100007172   mobA TRUE 0.989 -18.000 0.064 0.003 Y NA
 6463064 6463065 SentesTyphi_010100007177 SentesTyphi_010100007192     FALSE 0.028 1081.000 0.000 NA   NA
 6463069 6463070 SentesTyphi_010100007212 SentesTyphi_010100007217     FALSE 0.208 119.000 0.000 NA   NA
 6463070 6463071 SentesTyphi_010100007217 SentesTyphi_010100007222     FALSE 0.164 189.000 0.107 NA   NA
 6463072 6463073 SentesTyphi_010100007227 SentesTyphi_010100007232 glnG glnL TRUE 0.998 9.000 0.587 0.080 Y NA
 6463073 6463074 SentesTyphi_010100007232 SentesTyphi_010100007237 glnL glnA FALSE 0.036 274.000 0.053 1.000 N NA
 6463078 6463079 SentesTyphi_010100007257 SentesTyphi_010100007262     TRUE 0.799 41.000 0.179 1.000   NA
 6463079 6463080 SentesTyphi_010100007262 SentesTyphi_010100007267     TRUE 0.917 -55.000 0.018 0.083   NA
 6463080 6463081 SentesTyphi_010100007267 SentesTyphi_010100007272     TRUE 0.995 -7.000 0.911 0.083   NA
 6463081 6463082 SentesTyphi_010100007272 SentesTyphi_010100007277     FALSE 0.035 213.000 0.028 1.000 N NA
 6463082 6463083 SentesTyphi_010100007277 SentesTyphi_010100007282     TRUE 0.781 32.000 0.156 1.000 N NA
 6463086 6463087 SentesTyphi_010100007297 SentesTyphi_010100007302     FALSE 0.019 309.000 0.000 NA N NA
 6463088 6463089 SentesTyphi_010100007307 SentesTyphi_010100007312     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6463089 6463090 SentesTyphi_010100007312 SentesTyphi_010100007317     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6463090 6463091 SentesTyphi_010100007317 SentesTyphi_010100007322     TRUE 0.889 10.000 0.000 NA   NA
 6463091 6463092 SentesTyphi_010100007322 SentesTyphi_010100007327     FALSE 0.252 90.000 0.000 NA   NA
 6463092 6463093 SentesTyphi_010100007327 SentesTyphi_010100007332     TRUE 0.968 -3.000 0.000 NA Y NA
 6463093 6463094 SentesTyphi_010100007332 SentesTyphi_010100007337     TRUE 0.889 10.000 0.000 NA   NA
 6463095 6463096 SentesTyphi_010100007342 SentesTyphi_010100007347     FALSE 0.247 97.000 0.000 NA   NA
 6463096 6463097 SentesTyphi_010100007347 SentesTyphi_010100007352     FALSE 0.063 212.000 0.000 NA   NA
 6463098 6463099 SentesTyphi_010100007357 SentesTyphi_010100007362     TRUE 0.648 53.000 0.155 NA   NA
 6463099 6463100 SentesTyphi_010100007362 SentesTyphi_010100007367   trmB TRUE 0.928 0.000 0.092 NA   NA
 6463101 6463102 SentesTyphi_010100007372 SentesTyphi_010100007377     TRUE 0.802 28.000 0.150 1.000 N NA
 6463102 6463103 SentesTyphi_010100007377 SentesTyphi_010100007382   mltC FALSE 0.308 116.000 0.128 NA N NA
 6463103 6463104 SentesTyphi_010100007382 SentesTyphi_010100007387 mltC   FALSE 0.067 217.000 0.056 NA   NA
 6463104 6463105 SentesTyphi_010100007387 SentesTyphi_010100007402     FALSE 0.031 2465.000 0.000 NA   NA
 6463105 6463106 SentesTyphi_010100007402 SentesTyphi_010100007407     TRUE 0.521 39.000 0.000 NA   NA
 6463106 6463107 SentesTyphi_010100007407 SentesTyphi_010100t07424     FALSE 0.233 106.000 0.000 NA   NA
 6463107 6463108 SentesTyphi_010100t07424 SentesTyphi_010100007412     FALSE 0.126 161.000 0.000 NA   NA
 6463115 6463116 SentesTyphi_010100007446 SentesTyphi_010100007451   glk FALSE 0.023 723.000 0.000 1.000 N NA
 6463122 6463123 SentesTyphi_010100007491 SentesTyphi_010100t07513     FALSE 0.083 193.000 0.000 NA   NA
 6463123 6463124 SentesTyphi_010100t07513 SentesTyphi_010100t07515     TRUE 0.480 43.000 0.000 NA   NA
 6463125 6463126 SentesTyphi_010100007496 SentesTyphi_010100007501     TRUE 0.993 2.000 0.250 0.004   NA
 6463128 6463129 SentesTyphi_010100007515 SentesTyphi_010100007520     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6463129 6463130 SentesTyphi_010100007520 SentesTyphi_010100007525     TRUE 0.977 1.000 0.000 NA Y NA
 6463130 6463131 SentesTyphi_010100007525 SentesTyphi_010100007530     TRUE 0.786 0.000 0.000 NA N NA
 6463131 6463132 SentesTyphi_010100007530 SentesTyphi_010100007535     FALSE 0.024 441.000 0.000 1.000 N NA
 6463134 6463135 SentesTyphi_010100007545 SentesTyphi_010100007550     TRUE 0.877 33.000 0.044 NA Y NA
 6463136 6463137 SentesTyphi_010100007555 SentesTyphi_010100007560   dcd TRUE 0.750 91.000 0.098 1.000 Y NA
 6463137 6463138 SentesTyphi_010100007560 SentesTyphi_010100007565 dcd   FALSE 0.419 39.000 0.057 NA N NA
 6463140 6463141 SentesTyphi_010100007575 SentesTyphi_010100007580     TRUE 0.975 6.000 0.286 1.000 N NA
 6463141 6463142 SentesTyphi_010100007580 SentesTyphi_010100007585     FALSE 0.016 2244.000 0.000 NA N NA
 6463142 6463143 SentesTyphi_010100007585 SentesTyphi_010100007590     TRUE 0.967 3.000 0.259 NA N NA
 6463143 6463144 SentesTyphi_010100007590 SentesTyphi_010100007620     FALSE 0.031 2417.000 0.000 NA   NA
 6463144 6463145 SentesTyphi_010100007620 SentesTyphi_010100007625     TRUE 0.864 16.000 0.077 NA   NA
 6463145 6463146 SentesTyphi_010100007625 SentesTyphi_010100007630     TRUE 0.749 24.000 0.000 1.000   NA
 6463146 6463147 SentesTyphi_010100007630 SentesTyphi_010100007635     TRUE 0.975 25.000 0.000 0.008 Y NA
 6463147 6463148 SentesTyphi_010100007635 SentesTyphi_010100007640     TRUE 0.967 3.000 0.217 1.000 N NA
 6463148 6463149 SentesTyphi_010100007640 SentesTyphi_010100007655     FALSE 0.023 1224.000 0.000 1.000 N NA
 6463149 6463150 SentesTyphi_010100007655 SentesTyphi_010100007660     TRUE 0.844 111.000 1.000 1.000 N NA
 6463150 6463151 SentesTyphi_010100007660 SentesTyphi_010100007665     TRUE 0.847 54.000 0.538 NA N NA
 6463151 6463152 SentesTyphi_010100007665 SentesTyphi_010100007670     TRUE 0.645 102.000 0.304 NA   NA
 6463152 6463153 SentesTyphi_010100007670 SentesTyphi_010100007685     FALSE 0.038 1297.000 0.000 1.000   NA
 6463153 6463154 SentesTyphi_010100007685 SentesTyphi_010100007690   wcaM TRUE 0.976 11.000 0.292 NA   NA
 6463154 6463155 SentesTyphi_010100007690 SentesTyphi_010100007695 wcaM   FALSE 0.366 178.000 0.259 NA   NA
 6463155 6463156 SentesTyphi_010100007695 SentesTyphi_010100007700     FALSE 0.170 378.000 0.000 1.000 Y NA
 6463156 6463157 SentesTyphi_010100007700 SentesTyphi_010100007705     TRUE 0.995 0.000 0.084 0.002 Y NA
 6463157 6463158 SentesTyphi_010100007705 SentesTyphi_010100007710     TRUE 0.946 48.000 0.053 0.003 Y NA
 6463158 6463159 SentesTyphi_010100007710 SentesTyphi_010100007715     TRUE 0.992 4.000 0.211 1.000 Y NA
 6463159 6463160 SentesTyphi_010100007715 SentesTyphi_010100007720     TRUE 0.867 6.000 0.000 1.000 N NA
 6463160 6463161 SentesTyphi_010100007720 SentesTyphi_010100007725     TRUE 0.739 16.000 0.038 1.000 N NA
 6463161 6463162 SentesTyphi_010100007725 SentesTyphi_010100007730     TRUE 0.997 5.000 0.624 1.000 Y NA
 6463162 6463163 SentesTyphi_010100007730 SentesTyphi_010100007735     TRUE 0.969 27.000 0.247 1.000 Y NA
 6463163 6463164 SentesTyphi_010100007735 SentesTyphi_010100007740     TRUE 0.946 35.000 0.018 0.024 Y NA
 6463164 6463165 SentesTyphi_010100007740 SentesTyphi_010100007745     TRUE 0.993 -3.000 0.111 0.008 Y NA
 6463165 6463166 SentesTyphi_010100007745 SentesTyphi_010100007750     TRUE 0.565 70.000 0.167 NA   NA
 6463166 6463167 SentesTyphi_010100007750 SentesTyphi_010100007755     FALSE 0.096 245.000 0.118 NA   NA
 6463167 6463168 SentesTyphi_010100007755 SentesTyphi_010100007770     FALSE 0.029 1569.000 0.000 NA   NA
 6463168 6463169 SentesTyphi_010100007770 SentesTyphi_010100007775     TRUE 0.972 1.000 0.023 NA Y NA
 6463169 6463170 SentesTyphi_010100007775 SentesTyphi_010100007780     TRUE 0.764 -13.000 0.000 1.000 N NA
 6463170 6463171 SentesTyphi_010100007780 SentesTyphi_010100007785     FALSE 0.023 583.000 0.000 1.000 N NA
 6463171 6463172 SentesTyphi_010100007785 SentesTyphi_010100007790     FALSE 0.048 164.000 0.005 1.000 N NA
 6463172 6463173 SentesTyphi_010100007790 SentesTyphi_010100007795     FALSE 0.040 237.000 0.000 1.000 N NA
 6463174 6463175 SentesTyphi_010100007810 SentesTyphi_010100007815     TRUE 0.998 -6.000 0.430 0.003 Y NA
 6463175 6463176 SentesTyphi_010100007815 SentesTyphi_010100007820     TRUE 0.997 -18.000 0.433 0.003 Y NA
 6463176 6463177 SentesTyphi_010100007820 SentesTyphi_010100007825   hisH TRUE 0.997 0.000 0.210 0.003 Y NA
 6463177 6463178 SentesTyphi_010100007825 SentesTyphi_010100007830 hisH   TRUE 0.996 0.000 0.128 0.003 Y NA
 6463178 6463179 SentesTyphi_010100007830 SentesTyphi_010100007835     TRUE 0.997 -3.000 0.341 0.003 Y NA
 6463179 6463180 SentesTyphi_010100007835 SentesTyphi_010100007840   hisD TRUE 0.997 -3.000 0.294 0.003 Y NA
 6463180 6463181 SentesTyphi_010100007840 SentesTyphi_010100007845 hisD hisG TRUE 0.927 103.000 0.171 0.003 Y NA
 6463182 6463183 SentesTyphi_010100007860 SentesTyphi_010100007865     FALSE 0.031 286.000 0.000 1.000 N NA
 6463183 6463184 SentesTyphi_010100007865 SentesTyphi_010100007870     TRUE 0.796 -15.000 0.000 NA   NA
 6463186 6463187 SentesTyphi_010100007900 SentesTyphi_010100007905     TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.044 Y NA
 6463187 6463188 SentesTyphi_010100007905 SentesTyphi_010100007920     FALSE 0.015 1447.000 0.000 NA N NA
 6463188 6463189 SentesTyphi_010100007920 SentesTyphi_010100007935     FALSE 0.029 1421.000 0.000 NA   NA
 6463190 6463191 SentesTyphi_010100007940 SentesTyphi_010100007945     TRUE 0.802 58.000 0.080 0.003 N NA
 6463191 6463192 SentesTyphi_010100007945 SentesTyphi_010100007950     TRUE 0.951 -15.000 0.292 1.000 N NA
 6463192 6463193 SentesTyphi_010100007950 SentesTyphi_010100007955     TRUE 0.991 5.000 0.200 1.000 Y NA
 6463193 6463194 SentesTyphi_010100007955 SentesTyphi_010100007960     TRUE 0.924 0.000 0.133 NA N NA
 6463194 6463195 SentesTyphi_010100007960 SentesTyphi_010100007965     TRUE 0.997 3.000 0.714 NA Y NA
 6463195 6463196 SentesTyphi_010100007965 SentesTyphi_010100007970     TRUE 0.975 24.000 0.259 1.000 Y NA
 6463196 6463197 SentesTyphi_010100007970 SentesTyphi_010100007975     TRUE 0.991 12.000 0.000 0.028 Y NA
 6463197 6463198 SentesTyphi_010100007975 SentesTyphi_010100007980     TRUE 0.883 -3.000 0.000 1.000   NA
 6463198 6463199 SentesTyphi_010100007980 SentesTyphi_010100007985     TRUE 0.976 10.000 0.268 NA   NA
 6463199 6463200 SentesTyphi_010100007985 SentesTyphi_010100007990     TRUE 0.666 81.000 0.296 NA   NA
 6463200 6463201 SentesTyphi_010100007990 SentesTyphi_010100007995     TRUE 0.962 -3.000 0.242 NA   NA
 6463201 6463202 SentesTyphi_010100007995 SentesTyphi_010100008000     TRUE 0.991 0.000 0.242 NA Y NA
 6463202 6463203 SentesTyphi_010100008000 SentesTyphi_010100008005     TRUE 0.987 25.000 0.645 NA Y NA
 6463203 6463204 SentesTyphi_010100008005 SentesTyphi_010100008010     TRUE 0.745 20.000 0.000 NA   NA
 6463204 6463205 SentesTyphi_010100008010 SentesTyphi_010100008015     TRUE 0.807 -10.000 0.000 NA   NA
 6463205 6463206 SentesTyphi_010100008015 SentesTyphi_010100008020     FALSE 0.421 207.000 0.500 NA   NA
 6463206 6463207 SentesTyphi_010100008020 SentesTyphi_010100008025     TRUE 0.997 15.000 0.759 0.001   NA
 6463207 6463208 SentesTyphi_010100008025 SentesTyphi_010100008030     TRUE 0.985 11.000 0.000 0.001   NA
 6463208 6463209 SentesTyphi_010100008030 SentesTyphi_010100008035     TRUE 0.721 19.000 0.000 1.000 N NA
 6463209 6463210 SentesTyphi_010100008035 SentesTyphi_010100008040     TRUE 0.900 -3.000 0.083 NA   NA
 6463211 6463212 SentesTyphi_010100008045 SentesTyphi_010100008050     FALSE 0.199 217.000 0.231 1.000 N NA
 6463212 6463213 SentesTyphi_010100008050 SentesTyphi_010100008075   cbiC FALSE 0.026 2931.000 0.000 1.000 N NA
 6463213 6463214 SentesTyphi_010100008075 SentesTyphi_010100008080 cbiC cbiD TRUE 0.996 0.000 0.168 0.007 Y NA
 6463214 6463215 SentesTyphi_010100008080 SentesTyphi_010100008085 cbiD   TRUE 0.993 -6.000 0.126 0.007 Y NA
 6463216 6463217 SentesTyphi_010100008090 SentesTyphi_010100008095 tolC   FALSE 0.384 213.000 0.480 NA   NA
 6463217 6463218 SentesTyphi_010100008095 SentesTyphi_010100008100     TRUE 0.991 6.000 0.632 NA   NA
 6463222 6463223 SentesTyphi_010100008120 SentesTyphi_010100008125     TRUE 0.971 20.000 0.500 1.000   NA
 6463223 6463224 SentesTyphi_010100008125 SentesTyphi_010100008130     TRUE 0.992 15.000 0.375 0.006   NA
 6463228 6463229 SentesTyphi_010100008150 SentesTyphi_010100008155     TRUE 0.977 19.000 0.641 NA   NA
 6463229 6463230 SentesTyphi_010100008155 SentesTyphi_010100008160     FALSE 0.288 103.000 0.065 NA   NA
 6463231 6463232 SentesTyphi_010100008165 SentesTyphi_010100008180     FALSE 0.042 3008.000 0.000 1.000   NA
 6463233 6463234 SentesTyphi_010100008185 SentesTyphi_010100008190   cca FALSE 0.400 63.000 0.106 NA N NA
 6463235 6463236 SentesTyphi_010100008195 SentesTyphi_010100008200   folB FALSE 0.405 98.000 0.128 1.000 N NA
 6463237 6463238 SentesTyphi_010100008205 SentesTyphi_010100008210     FALSE 0.372 56.000 0.000 NA   NA
 6463238 6463239 SentesTyphi_010100008210 SentesTyphi_010100008225   rpsU FALSE 0.028 1144.000 0.000 NA   NA
 6463239 6463240 SentesTyphi_010100008225 SentesTyphi_010100008230 rpsU dnaG FALSE 0.055 236.000 0.067 1.000 N NA
 6463240 6463241 SentesTyphi_010100008230 SentesTyphi_010100008235 dnaG   TRUE 0.474 150.000 0.299 1.000 N NA
 6463243 6463244 SentesTyphi_010100t08282 SentesTyphi_010100008255     FALSE 0.028 1083.000 0.000 NA   NA
 6463245 6463246 SentesTyphi_010100008260 SentesTyphi_010100008265     FALSE 0.397 388.000 0.000 0.004 Y NA
 6463247 6463248 SentesTyphi_010100008270 SentesTyphi_010100008275     FALSE 0.109 171.000 0.024 1.000   NA
 6463249 6463250 SentesTyphi_010100008282 SentesTyphi_010100008287     FALSE 0.225 157.000 0.075 1.000   NA
 6463250 6463251 SentesTyphi_010100008287 SentesTyphi_010100008292   ilvM TRUE 0.940 18.000 0.205 1.000   NA
 6463251 6463252 SentesTyphi_010100008292 SentesTyphi_010100008297 ilvM   TRUE 0.998 -3.000 0.943 0.002   NA
 6463254 6463255 SentesTyphi_010100008307 SentesTyphi_010100008312     FALSE 0.042 261.000 0.000 NA   NA
 6463255 6463256 SentesTyphi_010100008312 SentesTyphi_010100008317     TRUE 0.984 16.000 0.667 NA   NA
 6463257 6463258 SentesTyphi_010100008322 SentesTyphi_010100008327     TRUE 0.790 33.000 0.154 NA   NA
 6463258 6463259 SentesTyphi_010100008327 SentesTyphi_010100008332     FALSE 0.029 538.000 0.000 NA   NA
 6463259 6463260 SentesTyphi_010100008332 SentesTyphi_010100008337     TRUE 0.778 68.000 0.400 NA   NA
 6463260 6463261 SentesTyphi_010100008337 SentesTyphi_010100008342     TRUE 0.993 0.000 1.000 NA   NA
 6463261 6463262 SentesTyphi_010100008342 SentesTyphi_010100008347     TRUE 0.991 -3.000 1.000 1.000 N NA
 6463262 6463263 SentesTyphi_010100008347 SentesTyphi_010100008362     FALSE 0.031 2564.000 0.000 NA   NA
 6463265 6463266 SentesTyphi_010100008382 SentesTyphi_010100008387     TRUE 0.982 -3.000 0.500 NA   NA
 6463267 6463268 SentesTyphi_010100008392 SentesTyphi_010100008397     TRUE 0.990 0.000 0.667 NA   NA
 6463269 6463270 SentesTyphi_010100008402 SentesTyphi_010100008407     TRUE 0.995 4.000 1.000 1.000   NA
 6463272 6463273 SentesTyphi_010100008417 SentesTyphi_010100008422     TRUE 0.741 68.000 0.333 NA   NA
 6463273 6463274 SentesTyphi_010100008422 SentesTyphi_010100008427     TRUE 0.989 -3.000 0.750 NA   NA
 6463274 6463275 SentesTyphi_010100008427 SentesTyphi_010100008442     FALSE 0.031 2775.000 0.000 NA   NA
 6463275 6463276 SentesTyphi_010100008442 SentesTyphi_010100008447     TRUE 0.830 15.000 0.000 NA   NA
 6463276 6463277 SentesTyphi_010100008447 SentesTyphi_010100008452     FALSE 0.379 55.000 0.000 NA   NA
 6463277 6463278 SentesTyphi_010100008452 SentesTyphi_010100008457     TRUE 0.889 10.000 0.000 NA   NA
 6463279 6463280 SentesTyphi_010100008462 SentesTyphi_010100008467 cysN   TRUE 0.989 -13.000 0.340 1.000 Y NA
 6463280 6463281 SentesTyphi_010100008467 SentesTyphi_010100008472     TRUE 0.542 96.000 0.198 NA   NA
 6463281 6463282 SentesTyphi_010100008472 SentesTyphi_010100008477   ftsB FALSE 0.031 258.000 0.028 NA   NA
 6463282 6463283 SentesTyphi_010100008477 SentesTyphi_010100008482 ftsB ispD TRUE 0.906 19.000 0.185 1.000 N NA
 6463283 6463284 SentesTyphi_010100008482 SentesTyphi_010100008487 ispD ispF TRUE 0.995 0.000 0.419 1.000 Y NA
 6463284 6463285 SentesTyphi_010100008487 SentesTyphi_010100008492 ispF truD TRUE 0.955 -3.000 0.173 1.000   NA
 6463285 6463286 SentesTyphi_010100008492 SentesTyphi_010100008497 truD surE TRUE 0.950 -25.000 0.235 1.000   NA
 6463286 6463287 SentesTyphi_010100008497 SentesTyphi_010100008502 surE pcm TRUE 0.974 -6.000 0.353 1.000   NA
 6463289 6463290 SentesTyphi_010100008512 SentesTyphi_010100008517 nlpD   TRUE 0.530 63.000 0.142 1.000 N NA
 6463291 6463292 SentesTyphi_010100008522 SentesTyphi_010100008527     TRUE 0.985 11.000 0.444 NA   NA
 6463292 6463293 SentesTyphi_010100008527 SentesTyphi_010100008532     TRUE 0.992 10.000 0.250 NA Y NA
 6463296 6463297 SentesTyphi_010100008547 SentesTyphi_010100008552     TRUE 0.901 0.000 0.065 NA   NA
 6463297 6463298 SentesTyphi_010100008552 SentesTyphi_010100008557     TRUE 0.959 -82.000 0.355 NA   NA
 6463298 6463299 SentesTyphi_010100008557 SentesTyphi_010100008562     TRUE 0.906 -3.000 0.088 NA   NA
 6463299 6463300 SentesTyphi_010100008562 SentesTyphi_010100008567     TRUE 0.993 5.000 0.265 1.000 Y NA
 6463300 6463301 SentesTyphi_010100008567 SentesTyphi_010100008572     TRUE 0.889 40.000 0.071 1.000 Y NA
 6463301 6463302 SentesTyphi_010100008572 SentesTyphi_010100008597     FALSE 0.168 2558.000 0.000 1.000 Y NA
 6463304 6463305 SentesTyphi_010100008617 SentesTyphi_010100008622     TRUE 0.890 9.000 0.000 NA   NA
 6463308 6463309 SentesTyphi_010100008637 SentesTyphi_010100008642     TRUE 0.987 0.000 0.483 1.000   NA
 6463309 6463310 SentesTyphi_010100008642 SentesTyphi_010100008647     FALSE 0.054 270.000 0.000 1.000   NA
 6463310 6463311 SentesTyphi_010100008647 SentesTyphi_010100008652     FALSE 0.041 395.000 0.000 1.000   NA
 6463312 6463313 SentesTyphi_010100008667 SentesTyphi_010100008672     TRUE 0.978 -3.000 0.360 1.000   NA
 6463313 6463314 SentesTyphi_010100008672 SentesTyphi_010100008677     TRUE 0.935 25.000 0.320 1.000   NA
 6463314 6463315 SentesTyphi_010100008677 SentesTyphi_010100008682     TRUE 0.976 24.000 0.300 0.010   NA
 6463315 6463316 SentesTyphi_010100008682 SentesTyphi_010100008687     TRUE 0.960 -3.000 0.200 1.000   NA
 6463316 6463317 SentesTyphi_010100008687 SentesTyphi_010100008692     TRUE 0.954 -22.000 0.300 NA   NA
 6463317 6463318 SentesTyphi_010100008692 SentesTyphi_010100008697     TRUE 0.990 7.000 0.571 NA   NA
 6463318 6463319 SentesTyphi_010100008697 SentesTyphi_010100008702     TRUE 0.961 0.000 0.188 NA   NA
 6463319 6463320 SentesTyphi_010100008702 SentesTyphi_010100008707   spaP TRUE 0.994 -10.000 0.625 1.000 Y NA
 6463320 6463321 SentesTyphi_010100008707 SentesTyphi_010100008712 spaP   TRUE 0.996 26.000 0.833 0.010 Y NA
 6463321 6463322 SentesTyphi_010100008712 SentesTyphi_010100008717     TRUE 0.999 4.000 1.000 0.070 Y NA
 6463322 6463323 SentesTyphi_010100008717 SentesTyphi_010100008722     TRUE 0.997 -13.000 0.682 0.070 Y NA
 6463323 6463324 SentesTyphi_010100008722 SentesTyphi_010100008737     FALSE 0.038 637.000 0.000 1.000   NA
 6463324 6463325 SentesTyphi_010100008737 SentesTyphi_010100008742     FALSE 0.353 235.000 0.125 0.006   NA
 6463325 6463326 SentesTyphi_010100008742 SentesTyphi_010100008747     TRUE 0.892 71.000 0.286 0.006   NA
 6463326 6463327 SentesTyphi_010100008747 SentesTyphi_010100008752     TRUE 0.612 55.000 0.143 NA   NA
 6463327 6463328 SentesTyphi_010100008752 SentesTyphi_010100008757     FALSE 0.117 216.000 0.111 NA   NA
 6463328 6463329 SentesTyphi_010100008757 SentesTyphi_010100008762     TRUE 0.473 44.000 0.000 NA   NA
 6463329 6463330 SentesTyphi_010100008762 SentesTyphi_010100008767     TRUE 0.643 27.000 0.000 NA   NA
 6463330 6463331 SentesTyphi_010100008767 SentesTyphi_010100008772     TRUE 0.615 37.000 0.000 1.000   NA
 6463332 6463333 SentesTyphi_010100008777 SentesTyphi_010100008782     TRUE 0.826 18.000 0.000 1.000   NA
 6463333 6463334 SentesTyphi_010100008782 SentesTyphi_010100008787     FALSE 0.090 1087.000 0.000 0.054 N NA
 6463335 6463336 SentesTyphi_010100008792 SentesTyphi_010100008797     TRUE 0.966 25.000 0.667 NA   NA
 6463336 6463337 SentesTyphi_010100008797 SentesTyphi_010100008802     TRUE 0.833 82.000 0.667 NA   NA
 6463337 6463338 SentesTyphi_010100008802 SentesTyphi_010100008807     TRUE 0.967 -3.000 0.286 NA   NA
 6463338 6463339 SentesTyphi_010100008807 SentesTyphi_010100008812     TRUE 0.960 -7.000 0.238 1.000   NA
 6463340 6463341 SentesTyphi_010100008817 SentesTyphi_010100008822     FALSE 0.248 104.000 0.051 NA   NA
 6463342 6463343 SentesTyphi_010100008827 SentesTyphi_010100008832   pssA TRUE 0.605 45.000 0.089 NA   NA
 6463344 6463345 SentesTyphi_010100008837 SentesTyphi_010100008842 secE nusG TRUE 0.837 2.000 0.037 1.000 N NA
 6463345 6463346 SentesTyphi_010100008842 SentesTyphi_010100008847 nusG rplK TRUE 0.669 158.000 0.681 1.000 N NA
 6463346 6463347 SentesTyphi_010100008847 SentesTyphi_010100008852 rplK rplA TRUE 0.999 4.000 0.838 0.016 Y NA
 6463347 6463348 SentesTyphi_010100008852 SentesTyphi_010100008857 rplA rplJ TRUE 0.599 416.000 0.302 0.016 Y NA
 6463348 6463349 SentesTyphi_010100008857 SentesTyphi_010100008862 rplJ rplL TRUE 0.961 67.000 0.884 0.013   NA
 6463349 6463350 SentesTyphi_010100008862 SentesTyphi_010100008877 rplL   FALSE 0.027 4629.000 0.008 1.000   NA
 6463350 6463351 SentesTyphi_010100008877 SentesTyphi_010100008882     FALSE 0.254 87.000 0.000 NA   NA
 6463354 6463355 SentesTyphi_010100008897 SentesTyphi_010100008902 thiH thiG TRUE 0.997 -3.000 0.277 0.005 Y NA
 6463355 6463356 SentesTyphi_010100008902 SentesTyphi_010100008907 thiG   TRUE 0.985 2.000 0.087 1.000 Y NA
 6463356 6463357 SentesTyphi_010100008907 SentesTyphi_010100008922     FALSE 0.156 731.000 0.000 1.000 Y NA
 6463357 6463358 SentesTyphi_010100008922 SentesTyphi_010100008927     TRUE 0.994 0.000 0.063 0.005 Y NA
 6463359 6463360 SentesTyphi_010100008932 SentesTyphi_010100008937     TRUE 0.663 73.000 0.033 NA Y NA
 6463360 6463361 SentesTyphi_010100008937 SentesTyphi_010100008942     FALSE 0.023 843.000 0.000 1.000 N NA
 6463361 6463362 SentesTyphi_010100008942 SentesTyphi_010100008947   rplC TRUE 0.961 62.000 0.307 0.016 Y NA
 6463362 6463363 SentesTyphi_010100008947 SentesTyphi_010100008952 rplC rplD TRUE 0.998 11.000 0.486 0.013 Y NA
 6463363 6463364 SentesTyphi_010100008952 SentesTyphi_010100008957 rplD rplW TRUE 0.976 65.000 0.513 0.013 Y NA
 6463364 6463365 SentesTyphi_010100008957 SentesTyphi_010100008962 rplW rplB TRUE 0.998 18.000 0.849 0.016 Y NA
 6463365 6463366 SentesTyphi_010100008962 SentesTyphi_010100008967 rplB rpsS TRUE 0.998 17.000 0.820 0.016 Y NA
 6463366 6463367 SentesTyphi_010100008967 SentesTyphi_010100008972 rpsS rplV TRUE 0.998 15.000 0.769 0.016 Y NA
 6463367 6463368 SentesTyphi_010100008972 SentesTyphi_010100008977 rplV rpsC TRUE 0.997 18.000 0.719 0.016 Y NA
 6463368 6463369 SentesTyphi_010100008977 SentesTyphi_010100008982 rpsC rplP TRUE 0.999 13.000 0.828 0.016 Y NA
 6463369 6463370 SentesTyphi_010100008982 SentesTyphi_010100008987 rplP   TRUE 0.999 0.000 0.802 0.013 Y NA
 6463370 6463371 SentesTyphi_010100008987 SentesTyphi_010100008992   rpsQ TRUE 0.999 0.000 0.828 0.013 Y NA
 6463371 6463372 SentesTyphi_010100008992 SentesTyphi_010100008997 rpsQ rplN TRUE 0.867 164.000 0.791 0.013   NA
 6463372 6463373 SentesTyphi_010100008997 SentesTyphi_010100009002 rplN rplN TRUE 0.935 -58.000 0.003 0.013   NA
 6463373 6463374 SentesTyphi_010100009002 SentesTyphi_010100009007 rplN rplX TRUE 0.997 11.000 0.810 0.013   NA
 6463374 6463375 SentesTyphi_010100009007 SentesTyphi_010100009012 rplX rplE TRUE 0.998 15.000 0.758 0.013 Y NA
 6463375 6463376 SentesTyphi_010100009012 SentesTyphi_010100009017 rplE rpsN TRUE 0.997 15.000 0.496 0.013 Y NA
 6463376 6463377 SentesTyphi_010100009017 SentesTyphi_010100009022 rpsN rpsH TRUE 0.990 34.000 0.473 0.013 Y NA
 6463377 6463378 SentesTyphi_010100009022 SentesTyphi_010100009027 rpsH rplF TRUE 0.999 13.000 0.808 0.013 Y NA
 6463378 6463379 SentesTyphi_010100009027 SentesTyphi_010100009032 rplF rplR TRUE 0.999 10.000 0.815 0.013 Y NA
 6463379 6463380 SentesTyphi_010100009032 SentesTyphi_010100009037 rplR rpsE TRUE 0.998 15.000 0.814 0.016 Y NA
 6463380 6463381 SentesTyphi_010100009037 SentesTyphi_010100009042 rpsE rpmD TRUE 0.999 4.000 0.789 0.016 Y NA
 6463381 6463382 SentesTyphi_010100009042 SentesTyphi_010100009047 rpmD rplO TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 6463382 6463383 SentesTyphi_010100009047 SentesTyphi_010100009052 rplO secY TRUE 0.991 8.000 0.730 1.000 N NA
 6463383 6463384 SentesTyphi_010100009052 SentesTyphi_010100009057 secY rpmJ TRUE 0.472 32.000 0.036 1.000 N NA
 6463384 6463385 SentesTyphi_010100009057 SentesTyphi_010100009062 rpmJ rpsM TRUE 0.806 147.000 0.086 0.013 Y NA
 6463385 6463386 SentesTyphi_010100009062 SentesTyphi_010100009067 rpsM   TRUE 0.998 17.000 0.810 0.013 Y NA
 6463386 6463387 SentesTyphi_010100009067 SentesTyphi_010100009072   rpsD TRUE 0.991 34.000 0.509 0.016 Y NA
 6463387 6463388 SentesTyphi_010100009072 SentesTyphi_010100009077 rpsD   TRUE 0.952 26.000 0.549 1.000 N NA
 6463388 6463389 SentesTyphi_010100009077 SentesTyphi_010100009082   rplQ TRUE 0.946 41.000 0.873 1.000 N NA
 6463389 6463390 SentesTyphi_010100009082 SentesTyphi_010100009087 rplQ   FALSE 0.149 105.000 0.012 NA   NA
 6463390 6463391 SentesTyphi_010100009087 SentesTyphi_010100009092   zntR TRUE 0.933 11.000 0.095 NA   NA
 6463391 6463392 SentesTyphi_010100009092 SentesTyphi_010100009097 zntR   TRUE 0.689 59.000 0.219 NA   NA
 6463393 6463394 SentesTyphi_010100009102 SentesTyphi_010100009107 mscL trkA FALSE 0.115 142.000 0.035 1.000 N NA
 6463394 6463395 SentesTyphi_010100009107 SentesTyphi_010100009112 trkA   TRUE 0.832 22.000 0.122 1.000 N NA
 6463395 6463396 SentesTyphi_010100009112 SentesTyphi_010100009117   fmt TRUE 0.932 52.000 0.305 1.000 Y NA
 6463396 6463397 SentesTyphi_010100009117 SentesTyphi_010100009122 fmt def TRUE 0.960 16.000 0.058 0.019   NA
 6463398 6463399 SentesTyphi_010100009127 SentesTyphi_010100009132     TRUE 0.981 4.000 0.333 NA   NA
 6463399 6463400 SentesTyphi_010100009132 SentesTyphi_010100009137     FALSE 0.194 128.000 0.000 NA   NA
 6463400 6463401 SentesTyphi_010100009137 SentesTyphi_010100009142     TRUE 0.760 102.000 0.500 NA   NA
 6463401 6463402 SentesTyphi_010100009142 SentesTyphi_010100009147     FALSE 0.033 340.000 0.000 NA   NA
 6463402 6463403 SentesTyphi_010100009147 SentesTyphi_010100009152     TRUE 0.991 0.000 0.727 NA   NA
 6463403 6463404 SentesTyphi_010100009152 SentesTyphi_010100009157     FALSE 0.028 807.000 0.000 NA   NA
 6463404 6463405 SentesTyphi_010100009157 SentesTyphi_010100009162     FALSE 0.446 47.000 0.000 NA   NA
 6463405 6463406 SentesTyphi_010100009162 SentesTyphi_010100009167     FALSE 0.028 719.000 0.000 NA   NA
 6463406 6463407 SentesTyphi_010100009167 SentesTyphi_010100009172     TRUE 0.622 120.000 0.000 1.000 Y NA
 6463407 6463408 SentesTyphi_010100009172 SentesTyphi_010100009177     TRUE 0.752 65.000 0.000 1.000 Y NA
 6463408 6463409 SentesTyphi_010100009177 SentesTyphi_010100009182     TRUE 0.985 -3.000 0.500 1.000   NA
 6463409 6463410 SentesTyphi_010100009182 SentesTyphi_010100009187     TRUE 0.661 145.000 0.500 NA   NA
 6463410 6463411 SentesTyphi_010100009187 SentesTyphi_010100009192     TRUE 0.975 -13.000 0.500 NA   NA
 6463413 6463414 SentesTyphi_010100009207 SentesTyphi_010100009217     FALSE 0.031 395.000 0.000 NA   NA
 6463415 6463416 SentesTyphi_010100009222 SentesTyphi_010100009227     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6463416 6463417 SentesTyphi_010100009227 SentesTyphi_010100009232     FALSE 0.092 256.000 0.119 NA   NA
 6463418 6463419 SentesTyphi_010100009237 SentesTyphi_010100009242     FALSE 0.177 123.000 0.050 1.000 N NA
 6463419 6463420 SentesTyphi_010100009242 SentesTyphi_010100009247     FALSE 0.023 539.000 0.000 1.000 N NA
 6463420 6463421 SentesTyphi_010100009247 SentesTyphi_010100009252     TRUE 0.738 55.000 0.269 1.000 N NA
 6463421 6463422 SentesTyphi_010100009252 SentesTyphi_010100009257     FALSE 0.026 354.000 0.000 1.000 N NA
 6463422 6463423 SentesTyphi_010100009257 SentesTyphi_010100009262     FALSE 0.025 470.000 0.011 1.000   NA
 6463426 6463427 SentesTyphi_010100009277 SentesTyphi_010100009282     TRUE 0.994 14.000 0.200 0.048 Y NA
 6463428 6463429 SentesTyphi_010100009287 SentesTyphi_010100t09379     FALSE 0.037 291.000 0.000 NA   NA
 6463429 6463430 SentesTyphi_010100t09379 SentesTyphi_010100009292     FALSE 0.267 80.000 0.000 NA   NA
 6463432 6463433 SentesTyphi_010100009302 SentesTyphi_010100009307 lysS prfB TRUE 0.995 10.000 0.162 0.041 Y NA
 6463433 6463434 SentesTyphi_010100009307 SentesTyphi_010100009312 prfB   FALSE 0.019 322.000 0.028 1.000 N NA
 6463434 6463435 SentesTyphi_010100009312 SentesTyphi_010100009317     TRUE 0.917 6.000 0.082 1.000 N NA
 6463435 6463436 SentesTyphi_010100009317 SentesTyphi_010100009322   xerD TRUE 0.743 24.000 0.079 1.000 N NA
 6463438 6463439 SentesTyphi_010100009332 SentesTyphi_010100009337     TRUE 0.824 -19.000 0.061 NA   NA
 6463440 6463441 SentesTyphi_010100009342 SentesTyphi_010100009347     TRUE 0.716 15.000 0.004 NA   NA
 6463442 6463443 SentesTyphi_010100009352 SentesTyphi_010100009357     FALSE 0.225 164.000 0.113 NA   NA
 6463445 6463446 SentesTyphi_010100009367 SentesTyphi_010100009372     FALSE 0.029 456.000 0.000 NA   NA
 6463447 6463448 SentesTyphi_010100009379 SentesTyphi_010100009384     TRUE 0.999 0.000 0.667 0.001 Y NA
 6463448 6463449 SentesTyphi_010100009384 SentesTyphi_010100009389     TRUE 0.566 33.000 0.057 1.000 N NA
 6463449 6463450 SentesTyphi_010100009389 SentesTyphi_010100009394     FALSE 0.283 211.000 0.333 1.000 N NA
 6463450 6463451 SentesTyphi_010100009394 SentesTyphi_010100009399     TRUE 0.997 -13.000 0.429 0.004 Y NA
 6463451 6463452 SentesTyphi_010100009399 SentesTyphi_010100009404     FALSE 0.111 120.000 0.020 1.000 N NA
 6463453 6463454 SentesTyphi_010100009409 SentesTyphi_010100009414     FALSE 0.217 113.000 0.000 NA   NA
 6463454 6463455 SentesTyphi_010100009414 SentesTyphi_010100009419     FALSE 0.133 157.000 0.000 NA   NA
 6463455 6463456 SentesTyphi_010100009419 SentesTyphi_010100009424     TRUE 0.802 104.000 0.625 NA   NA
 6463457 6463458 SentesTyphi_010100009429 SentesTyphi_010100009434     FALSE 0.081 172.000 0.027 NA   NA
 6463459 6463460 SentesTyphi_010100009439 SentesTyphi_010100009444     FALSE 0.233 106.000 0.000 NA   NA
 6463461 6463462 SentesTyphi_010100009449 SentesTyphi_010100009454     FALSE 0.309 65.000 0.019 1.000   NA
 6463463 6463464 SentesTyphi_010100009459 SentesTyphi_010100009464     FALSE 0.243 104.000 0.027 1.000   NA
 6463464 6463465 SentesTyphi_010100009464 SentesTyphi_010100009469     FALSE 0.096 150.000 0.033 1.000 N NA
 6463465 6463466 SentesTyphi_010100009469 SentesTyphi_010100009474     FALSE 0.031 291.000 0.000 1.000 N NA
 6463466 6463467 SentesTyphi_010100009474 SentesTyphi_010100009479     FALSE 0.087 209.000 0.000 1.000   NA
 6463467 6463468 SentesTyphi_010100009479 SentesTyphi_010100009484     TRUE 0.898 37.000 0.025 0.001   NA
 6463468 6463469 SentesTyphi_010100009484 SentesTyphi_010100009489     TRUE 0.966 -19.000 0.025 0.001   NA
 6463469 6463470 SentesTyphi_010100009489 SentesTyphi_010100009494   clpX FALSE 0.311 186.000 0.201 1.000   NA
 6463470 6463471 SentesTyphi_010100009494 SentesTyphi_010100009499 clpX   TRUE 0.524 252.000 0.352 1.000 Y NA
 6463471 6463472 SentesTyphi_010100009499 SentesTyphi_010100009504   tig TRUE 0.530 247.000 0.351 1.000 Y NA
 6463472 6463473 SentesTyphi_010100009504 SentesTyphi_010100009509 tig   FALSE 0.017 347.000 0.000 NA N NA
 6463474 6463475 SentesTyphi_010100009514 SentesTyphi_010100009519   ampG TRUE 0.768 44.000 0.256 NA N NA
 6463475 6463476 SentesTyphi_010100009519 SentesTyphi_010100009534 ampG   FALSE 0.015 1419.000 0.000 NA N NA
 6463476 6463477 SentesTyphi_010100009534 SentesTyphi_010100009539     TRUE 0.998 -10.000 0.697 0.043 Y NA
 6463477 6463478 SentesTyphi_010100009539 SentesTyphi_010100009544     TRUE 0.998 0.000 0.485 0.043 Y NA
 6463478 6463479 SentesTyphi_010100009544 SentesTyphi_010100009549     TRUE 0.963 15.000 0.118 0.069 N NA
 6463481 6463482 SentesTyphi_010100009559 SentesTyphi_010100009564     TRUE 0.946 0.000 0.106 1.000   NA
 6463482 6463483 SentesTyphi_010100009564 SentesTyphi_010100009569     FALSE 0.039 283.000 0.000 NA   NA
 6463483 6463484 SentesTyphi_010100009569 SentesTyphi_010100009574     TRUE 0.977 -3.000 0.385 NA   NA
 6463488 6463489 SentesTyphi_010100009604 SentesTyphi_010100009609     TRUE 0.965 0.000 0.227 1.000 N NA
 6463490 6463491 SentesTyphi_010100009624 SentesTyphi_010100009629     TRUE 0.969 -21.000 0.043 0.001   NA
 6463491 6463492 SentesTyphi_010100009629 SentesTyphi_010100009634     TRUE 0.657 119.000 0.406 1.000 N NA
 6463494 6463495 SentesTyphi_010100009644 SentesTyphi_010100009659 tpx   FALSE 0.011 1118.000 0.007 1.000 N NA
 6463498 6463499 SentesTyphi_010100009674 SentesTyphi_010100009679     FALSE 0.053 277.000 0.000 1.000   NA
 6463502 6463503 SentesTyphi_010100009694 SentesTyphi_010100009699     TRUE 0.792 17.000 0.000 NA   NA
 6463503 6463504 SentesTyphi_010100009699 SentesTyphi_010100009704     TRUE 0.768 -102.000 0.000 NA   NA
 6463504 6463505 SentesTyphi_010100009704 SentesTyphi_010100009709     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6463506 6463507 SentesTyphi_010100009714 SentesTyphi_010100009719     TRUE 0.507 58.000 0.094 NA   NA
 6463509 6463510 SentesTyphi_010100009729 SentesTyphi_010100009734   mgsA FALSE 0.271 95.000 0.055 NA   NA
 6463514 6463515 SentesTyphi_010100009764 SentesTyphi_010100009769     FALSE 0.030 299.000 0.000 1.000 N NA
 6463518 6463519 SentesTyphi_010100009794 SentesTyphi_010100009799     FALSE 0.044 256.000 0.000 NA   NA
 6463519 6463520 SentesTyphi_010100009799 SentesTyphi_010100009804     TRUE 0.984 -3.000 0.531 NA   NA
 6463520 6463521 SentesTyphi_010100009804 SentesTyphi_010100009809     TRUE 0.993 5.000 0.819 NA   NA
 6463521 6463522 SentesTyphi_010100009809 SentesTyphi_010100009814     TRUE 0.830 15.000 0.000 NA   NA
 6463523 6463524 SentesTyphi_010100009819 SentesTyphi_010100009824 panC panB TRUE 0.957 126.000 0.395 0.001 Y NA
 6463524 6463525 SentesTyphi_010100009824 SentesTyphi_010100009829 panB   FALSE 0.190 110.000 0.000 1.000 N NA
 6463525 6463526 SentesTyphi_010100009829 SentesTyphi_010100009844     FALSE 0.150 632.000 0.000 0.009   NA
 6463526 6463527 SentesTyphi_010100009844 SentesTyphi_010100009849     TRUE 0.994 15.000 0.571 0.009   NA
 6463527 6463528 SentesTyphi_010100009849 SentesTyphi_010100009854     TRUE 0.982 -13.000 0.571 1.000   NA
 6463528 6463529 SentesTyphi_010100009854 SentesTyphi_010100009859     TRUE 0.962 75.000 1.000 1.000 Y NA
 6463529 6463530 SentesTyphi_010100009859 SentesTyphi_010100009864     TRUE 0.789 180.000 0.500 1.000 Y NA
 6463530 6463531 SentesTyphi_010100009864 SentesTyphi_010100009869     FALSE 0.025 395.000 0.000 1.000 N NA
 6463531 6463532 SentesTyphi_010100009869 SentesTyphi_010100009874   pcnB TRUE 0.957 -3.000 0.234 1.000 N NA
 6463532 6463533 SentesTyphi_010100009874 SentesTyphi_010100009879 pcnB   FALSE 0.337 246.000 0.131 1.000 Y NA
 6463533 6463534 SentesTyphi_010100009879 SentesTyphi_010100009884     TRUE 0.638 69.000 0.231 1.000 N NA
 6463534 6463535 SentesTyphi_010100009884 SentesTyphi_010100009889     FALSE 0.245 177.000 0.151 NA   NA
 6463535 6463536 SentesTyphi_010100009889 SentesTyphi_010100009894     TRUE 0.785 17.000 0.045 NA   NA
 6463537 6463538 SentesTyphi_010100009899 SentesTyphi_010100009904   mrcB FALSE 0.346 141.000 0.158 1.000 N NA
 6463538 6463539 SentesTyphi_010100009904 SentesTyphi_010100009919 mrcB   FALSE 0.025 2533.000 0.000 1.000 N NA
 6463539 6463540 SentesTyphi_010100009919 SentesTyphi_010100009924     TRUE 0.978 0.000 0.047 1.000 Y NA
 6463540 6463541 SentesTyphi_010100009924 SentesTyphi_010100009929     TRUE 0.979 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 6463544 6463545 SentesTyphi_010100009954 SentesTyphi_010100009959     TRUE 0.823 37.000 0.213 NA   NA
 6463545 6463546 SentesTyphi_010100009959 SentesTyphi_010100009964     TRUE 0.845 -7.000 0.073 1.000 N NA
 6463547 6463548 SentesTyphi_010100009969 SentesTyphi_010100009974 dgt   FALSE 0.286 130.000 0.101 1.000 N NA
 6463548 6463549 SentesTyphi_010100009974 SentesTyphi_010100009979     FALSE 0.080 194.000 0.080 NA N NA
 6463552 6463553 SentesTyphi_010100009994 SentesTyphi_010100009999 dapD   TRUE 0.712 30.000 0.097 1.000 N NA
 6463553 6463554 SentesTyphi_010100009999 SentesTyphi_010100010004     TRUE 0.537 113.000 0.243 1.000 N NA
 6463555 6463556 SentesTyphi_010100010009 SentesTyphi_010100010014 rpsB tsf TRUE 0.691 258.000 0.748 1.000 Y NA
 6463556 6463557 SentesTyphi_010100010014 SentesTyphi_010100010019 tsf pyrH TRUE 0.589 146.000 0.416 1.000 N NA
 6463557 6463558 SentesTyphi_010100010019 SentesTyphi_010100010024 pyrH frr TRUE 0.693 147.000 0.626 1.000 N NA
 6463558 6463559 SentesTyphi_010100010024 SentesTyphi_010100010029 frr   FALSE 0.263 55.000 0.032 1.000 N NA
 6463559 6463560 SentesTyphi_010100010029 SentesTyphi_010100010034     FALSE 0.164 313.000 0.025 1.000 Y NA
 6463560 6463561 SentesTyphi_010100010034 SentesTyphi_010100010039   cdsA TRUE 0.994 13.000 0.400 1.000 Y NA
 6463561 6463562 SentesTyphi_010100010039 SentesTyphi_010100010044 cdsA   TRUE 0.898 12.000 0.080 1.000 N NA
 6463562 6463563 SentesTyphi_010100010044 SentesTyphi_010100010049     TRUE 0.953 32.000 0.204 1.000 Y NA
 6463563 6463564 SentesTyphi_010100010049 SentesTyphi_010100010054     TRUE 0.857 123.000 0.354 1.000 Y NA
 6463564 6463565 SentesTyphi_010100010054 SentesTyphi_010100010059   lpxD TRUE 0.998 4.000 0.814 1.000 Y NA
 6463565 6463566 SentesTyphi_010100010059 SentesTyphi_010100010064 lpxD fabZ TRUE 0.826 106.000 0.796 1.000 N NA
 6463566 6463567 SentesTyphi_010100010064 SentesTyphi_010100010069 fabZ   TRUE 0.993 4.000 0.850 1.000 N NA
 6463567 6463568 SentesTyphi_010100010069 SentesTyphi_010100010074   lpxB TRUE 0.993 0.000 0.289 1.000 Y NA
 6463568 6463569 SentesTyphi_010100010074 SentesTyphi_010100010079 lpxB rnhB TRUE 0.945 -3.000 0.186 1.000 N NA
 6463569 6463570 SentesTyphi_010100010079 SentesTyphi_010100010084 rnhB dnaE TRUE 0.953 24.000 0.104 1.000 Y NA
 6463570 6463571 SentesTyphi_010100010084 SentesTyphi_010100010089 dnaE   TRUE 0.922 13.000 0.122 1.000 N NA
 6463572 6463573 SentesTyphi_010100010094 SentesTyphi_010100010099     TRUE 0.888 3.000 0.000 NA   NA
 6463579 6463580 SentesTyphi_010100010139 SentesTyphi_010100010144     FALSE 0.166 159.000 0.000 1.000   NA
 6463580 6463581 SentesTyphi_010100010144 SentesTyphi_010100010149     FALSE 0.278 111.000 0.000 1.000   NA
 6463581 6463582 SentesTyphi_010100010149 SentesTyphi_010100010154     TRUE 0.628 76.000 0.200 1.000   NA
 6463584 6463585 SentesTyphi_010100010174 SentesTyphi_010100010179     TRUE 0.837 103.000 0.778 NA   NA
 6463585 6463586 SentesTyphi_010100010179 SentesTyphi_010100010184     FALSE 0.086 190.000 0.000 NA   NA
 6463586 6463587 SentesTyphi_010100010184 SentesTyphi_010100010189     FALSE 0.042 366.000 0.000 1.000   NA
 6463589 6463590 SentesTyphi_010100010199 SentesTyphi_010100010204     FALSE 0.036 299.000 0.000 NA   NA
 6463590 6463591 SentesTyphi_010100010204 SentesTyphi_010100010209     TRUE 0.570 56.000 0.120 NA   NA
 6463591 6463592 SentesTyphi_010100010209 SentesTyphi_010100010214     TRUE 0.507 77.000 0.148 NA   NA
 6463592 6463593 SentesTyphi_010100010214 SentesTyphi_010100010219     TRUE 0.998 0.000 0.564 0.043 Y NA
 6463593 6463594 SentesTyphi_010100010219 SentesTyphi_010100010224     TRUE 0.997 -7.000 0.537 0.043 Y NA
 6463594 6463595 SentesTyphi_010100010224 SentesTyphi_010100010229   rnfD TRUE 0.999 1.000 0.814 0.043 Y NA
 6463595 6463596 SentesTyphi_010100010229 SentesTyphi_010100010234 rnfD   TRUE 0.999 4.000 0.924 0.043 Y NA
 6463596 6463597 SentesTyphi_010100010234 SentesTyphi_010100010249     FALSE 0.023 693.000 0.000 1.000 N NA
 6463597 6463598 SentesTyphi_010100010249 SentesTyphi_010100010254   tppB FALSE 0.023 641.000 0.000 1.000 N NA
 6463598 6463599 SentesTyphi_010100010254 SentesTyphi_010100010259 tppB   TRUE 0.655 104.000 0.344 1.000 N NA
 6463600 6463601 SentesTyphi_010100010264 SentesTyphi_010100010269     FALSE 0.274 60.000 0.041 1.000 N NA
 6463601 6463602 SentesTyphi_010100010269 SentesTyphi_010100010274     FALSE 0.181 127.000 0.054 1.000 N NA
 6463602 6463603 SentesTyphi_010100010274 SentesTyphi_010100010279     FALSE 0.150 134.000 0.034 NA   NA
 6463603 6463604 SentesTyphi_010100010279 SentesTyphi_010100010284   anmK FALSE 0.210 88.000 0.034 NA   NA
 6463607 6463608 SentesTyphi_010100010299 SentesTyphi_010100010304     TRUE 0.985 3.000 0.412 NA   NA
 6463608 6463609 SentesTyphi_010100010304 SentesTyphi_010100010309     TRUE 0.925 0.000 0.088 NA   NA
 6463610 6463611 SentesTyphi_010100010314 SentesTyphi_010100010319     FALSE 0.285 80.000 0.033 1.000   NA
 6463611 6463612 SentesTyphi_010100010319 SentesTyphi_010100010324     FALSE 0.407 51.000 0.045 NA   NA
 6463613 6463614 SentesTyphi_010100010329 SentesTyphi_010100010334     TRUE 0.777 59.000 0.362 1.000 N NA
 6463614 6463615 SentesTyphi_010100010334 SentesTyphi_010100010339     FALSE 0.297 69.000 0.057 1.000 N NA
 6463615 6463616 SentesTyphi_010100010339 SentesTyphi_010100010344     FALSE 0.412 101.000 0.136 1.000 N NA
 6463618 6463619 SentesTyphi_010100010354 SentesTyphi_010100010359     FALSE 0.246 98.000 0.000 NA   NA
 6463619 6463620 SentesTyphi_010100010359 SentesTyphi_010100010364     FALSE 0.043 127.000 0.015 NA N NA
 6463620 6463621 SentesTyphi_010100010364 SentesTyphi_010100010369     FALSE 0.024 468.000 0.000 1.000 N NA
 6463621 6463622 SentesTyphi_010100010369 SentesTyphi_010100010384     FALSE 0.023 1111.000 0.000 1.000 N NA
 6463622 6463623 SentesTyphi_010100010384 SentesTyphi_010100010389     FALSE 0.031 289.000 0.000 1.000 N NA
 6463625 6463626 SentesTyphi_010100010399 SentesTyphi_010100t10531     FALSE 0.146 152.000 0.000 NA   NA
 6463626 6463627 SentesTyphi_010100t10531 SentesTyphi_010100t10533     TRUE 0.882 11.000 0.000 NA   NA
 6463628 6463629 SentesTyphi_010100010404 SentesTyphi_010100010409     TRUE 0.997 -3.000 0.406 0.069 Y NA
 6463629 6463630 SentesTyphi_010100010409 SentesTyphi_010100010414     TRUE 0.998 1.000 0.516 0.069 Y NA
 6463630 6463631 SentesTyphi_010100010414 SentesTyphi_010100010419     TRUE 0.993 -3.000 0.091 0.010 Y NA
 6463631 6463632 SentesTyphi_010100010419 SentesTyphi_010100010434     FALSE 0.028 1018.000 0.000 NA   NA
 6463632 6463633 SentesTyphi_010100010434 SentesTyphi_010100010439     TRUE 0.790 -19.000 0.000 NA   NA
 6463633 6463634 SentesTyphi_010100010439 SentesTyphi_010100010444     TRUE 0.888 3.000 0.000 NA   NA
 6463634 6463635 SentesTyphi_010100010444 SentesTyphi_010100010449     TRUE 0.998 -10.000 0.647 0.007 Y NA
 6463635 6463636 SentesTyphi_010100010449 SentesTyphi_010100010454     TRUE 0.981 -15.000 0.636 NA   NA
 6463636 6463637 SentesTyphi_010100010454 SentesTyphi_010100010459     TRUE 0.799 58.000 0.364 NA   NA
 6463637 6463638 SentesTyphi_010100010459 SentesTyphi_010100010464     TRUE 0.974 -10.000 0.462 NA   NA
 6463638 6463639 SentesTyphi_010100010464 SentesTyphi_010100010469     TRUE 0.712 135.000 0.538 NA   NA
 6463639 6463640 SentesTyphi_010100010469 SentesTyphi_010100010474     TRUE 0.983 18.000 0.786 NA   NA
 6463640 6463641 SentesTyphi_010100010474 SentesTyphi_010100010479     TRUE 0.858 130.000 0.407 0.010   NA
 6463641 6463642 SentesTyphi_010100010479 SentesTyphi_010100010484     TRUE 0.978 -3.000 0.407 NA   NA
 6463642 6463643 SentesTyphi_010100010484 SentesTyphi_010100010489     TRUE 0.980 -22.000 0.650 NA   NA
 6463643 6463644 SentesTyphi_010100010489 SentesTyphi_010100010494     FALSE 0.249 94.000 0.000 NA   NA
 6463644 6463645 SentesTyphi_010100010494 SentesTyphi_010100010499     FALSE 0.245 99.000 0.000 NA   NA
 6463645 6463646 SentesTyphi_010100010499 SentesTyphi_010100010504     FALSE 0.029 518.000 0.000 NA   NA
 6463646 6463647 SentesTyphi_010100010504 SentesTyphi_010100010509     FALSE 0.405 52.000 0.000 NA   NA
 6463647 6463648 SentesTyphi_010100010509 SentesTyphi_010100010514     TRUE 0.888 3.000 0.000 NA   NA
 6463649 6463650 SentesTyphi_010100010533 SentesTyphi_010100010538     TRUE 0.845 14.000 0.000 NA   NA
 6463650 6463651 SentesTyphi_010100010538 SentesTyphi_010100010543     TRUE 0.830 15.000 0.000 NA   NA
 6463651 6463652 SentesTyphi_010100010543 SentesTyphi_010100010548     TRUE 0.889 5.000 0.000 NA   NA
 6463652 6463653 SentesTyphi_010100010548 SentesTyphi_010100010553     TRUE 0.870 12.000 0.000 NA   NA
 6463653 6463654 SentesTyphi_010100010553 SentesTyphi_010100010558     TRUE 0.490 42.000 0.000 NA   NA
 6463654 6463655 SentesTyphi_010100010558 SentesTyphi_010100010563     TRUE 0.777 -34.000 0.000 NA   NA
 6463655 6463656 SentesTyphi_010100010563 SentesTyphi_010100010568     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6463656 6463657 SentesTyphi_010100010568 SentesTyphi_010100010573     TRUE 0.800 -13.000 0.000 NA   NA
 6463657 6463658 SentesTyphi_010100010573 SentesTyphi_010100010578     TRUE 0.807 -10.000 0.000 NA   NA
 6463658 6463659 SentesTyphi_010100010578 SentesTyphi_010100010583     TRUE 0.889 4.000 0.000 NA   NA
 6463659 6463660 SentesTyphi_010100010583 SentesTyphi_010100010598     FALSE 0.029 457.000 0.000 NA   NA
 6463660 6463661 SentesTyphi_010100010598 SentesTyphi_010100010603     FALSE 0.105 178.000 0.000 NA   NA
 6463661 6463662 SentesTyphi_010100010603 SentesTyphi_010100010608     FALSE 0.329 64.000 0.000 NA   NA
 6463662 6463663 SentesTyphi_010100010608 SentesTyphi_010100010613     TRUE 0.889 4.000 0.000 NA   NA
 6463663 6463664 SentesTyphi_010100010613 SentesTyphi_010100010618     TRUE 0.888 3.000 0.000 NA   NA
 6463664 6463665 SentesTyphi_010100010618 SentesTyphi_010100010623     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6463665 6463666 SentesTyphi_010100010623 SentesTyphi_010100010628     FALSE 0.080 195.000 0.000 NA   NA
 6463666 6463667 SentesTyphi_010100010628 SentesTyphi_010100010633     TRUE 0.876 0.000 0.000 NA   NA
 6463667 6463668 SentesTyphi_010100010633 SentesTyphi_010100010638     FALSE 0.154 149.000 0.000 NA   NA
 6463668 6463669 SentesTyphi_010100010638 SentesTyphi_010100010643     FALSE 0.253 88.000 0.000 NA   NA
 6463669 6463670 SentesTyphi_010100010643 SentesTyphi_010100010648     TRUE 0.809 16.000 0.000 NA   NA
 6463670 6463671 SentesTyphi_010100010648 SentesTyphi_010100010653     TRUE 0.937 1.000 0.100 NA   NA
 6463671 6463672 SentesTyphi_010100010653 SentesTyphi_010100010658     TRUE 0.989 -3.000 0.792 NA   NA
 6463672 6463673 SentesTyphi_010100010658 SentesTyphi_010100010663     TRUE 0.876 0.000 0.000 NA   NA
 6463673 6463674 SentesTyphi_010100010663 SentesTyphi_010100010668     TRUE 0.830 15.000 0.000 NA   NA
 6463674 6463675 SentesTyphi_010100010668 SentesTyphi_010100010673     FALSE 0.029 585.000 0.000 NA   NA
 6463676 6463677 SentesTyphi_010100010678 SentesTyphi_010100010683     FALSE 0.035 313.000 0.000 NA   NA
 6463678 6463679 SentesTyphi_010100010688 SentesTyphi_010100010693     FALSE 0.029 208.000 0.014 1.000 N NA
 6463679 6463680 SentesTyphi_010100010693 SentesTyphi_010100010698     FALSE 0.173 166.000 0.081 NA   NA
 6463681 6463682 SentesTyphi_010100010703 SentesTyphi_010100010708     TRUE 0.809 16.000 0.000 NA   NA
 6463682 6463683 SentesTyphi_010100010708 SentesTyphi_010100010713     TRUE 0.910 23.000 0.250 1.000 N NA
 6463684 6463685 SentesTyphi_010100010718 SentesTyphi_010100010723     TRUE 0.892 34.000 0.000 1.000 Y NA
 6463685 6463686 SentesTyphi_010100010723 SentesTyphi_010100010728     FALSE 0.111 191.000 0.000 1.000   NA
 6463686 6463687 SentesTyphi_010100010728 SentesTyphi_010100010733   rbn TRUE 0.836 -6.000 0.031 1.000   NA
 6463687 6463688 SentesTyphi_010100010733 SentesTyphi_010100010738 rbn   TRUE 0.907 -3.000 0.069 1.000   NA
 6463688 6463689 SentesTyphi_010100010738 SentesTyphi_010100010743     TRUE 0.593 45.000 0.065 1.000   NA
 6463690 6463691 SentesTyphi_010100010748 SentesTyphi_010100010753     TRUE 0.976 -3.000 0.375 NA   NA
 6463691 6463692 SentesTyphi_010100010753 SentesTyphi_010100010758     FALSE 0.255 86.000 0.000 NA   NA
 6463693 6463694 SentesTyphi_010100010763 SentesTyphi_010100010768     TRUE 0.941 0.000 0.120 NA   NA
 6463695 6463696 SentesTyphi_010100010773 SentesTyphi_010100010778     TRUE 0.512 32.000 0.030 NA   NA
 6463698 6463699 SentesTyphi_010100010788 SentesTyphi_010100010813     FALSE 0.032 3782.000 0.000 NA   NA
 6463703 6463704 SentesTyphi_010100010833 SentesTyphi_010100010838     TRUE 0.990 0.000 0.675 NA   NA
 6463706 6463707 SentesTyphi_010100010848 SentesTyphi_010100010853     TRUE 0.875 -3.000 0.063 NA   NA
 6463707 6463708 SentesTyphi_010100010853 SentesTyphi_010100010868     FALSE 0.023 1091.000 0.000 1.000 N NA
 6463708 6463709 SentesTyphi_010100010868 SentesTyphi_010100010873   rhaB TRUE 0.993 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 6463710 6463711 SentesTyphi_010100010878 SentesTyphi_010100010883     TRUE 0.953 153.000 0.800 0.020 Y NA
 6463713 6463714 SentesTyphi_010100010893 SentesTyphi_010100010898     TRUE 0.541 37.000 0.000 NA   NA
 6463715 6463716 SentesTyphi_010100010903 SentesTyphi_010100010908     TRUE 0.960 -7.000 0.000 NA Y NA
 6463717 6463718 SentesTyphi_010100010923 SentesTyphi_010100010928     TRUE 0.559 70.000 0.129 1.000   NA
 6463718 6463719 SentesTyphi_010100010928 SentesTyphi_010100010933     TRUE 0.870 12.000 0.000 NA   NA
 6463721 6463722 SentesTyphi_010100010963 SentesTyphi_010100010968 fieF   FALSE 0.068 185.000 0.040 1.000 N NA
 6463722 6463723 SentesTyphi_010100010968 SentesTyphi_010100010973     FALSE 0.060 204.000 0.049 1.000 N NA
 6463723 6463724 SentesTyphi_010100010973 SentesTyphi_010100010978     FALSE 0.375 101.000 0.115 1.000 N NA
 6463724 6463725 SentesTyphi_010100010978 SentesTyphi_010100010993     FALSE 0.024 1611.000 0.000 1.000 N NA
 6463725 6463726 SentesTyphi_010100010993 SentesTyphi_010100010998     TRUE 0.806 10.000 0.000 NA N NA
 6463726 6463727 SentesTyphi_010100010998 SentesTyphi_010100011003     FALSE 0.247 54.000 0.000 NA N NA
 6463729 6463730 SentesTyphi_010100011013 SentesTyphi_010100011018     TRUE 0.604 30.000 0.000 NA   NA
 6463731 6463732 SentesTyphi_010100011023 SentesTyphi_010100011028     FALSE 0.245 99.000 0.000 NA   NA
 6463732 6463733 SentesTyphi_010100011028 SentesTyphi_010100011033     FALSE 0.163 129.000 0.000 1.000 N NA
 6463735 6463736 SentesTyphi_010100t11235 SentesTyphi_010100t11237     FALSE 0.333 63.000 0.000 NA   NA
 6463736 6463737 SentesTyphi_010100t11237 SentesTyphi_010100t11239     TRUE 0.889 4.000 0.000 NA   NA
 6463737 6463738 SentesTyphi_010100t11239 SentesTyphi_010100011043     FALSE 0.035 304.000 0.000 NA   NA
 6463738 6463739 SentesTyphi_010100011043 SentesTyphi_010100011048   alaS FALSE 0.024 235.000 0.020 1.000 N NA
 6463739 6463740 SentesTyphi_010100011048 SentesTyphi_010100011053 alaS recX FALSE 0.098 236.000 0.085 1.000   NA
 6463740 6463741 SentesTyphi_010100011053 SentesTyphi_010100011058 recX recA TRUE 0.635 117.000 0.296 1.000   NA
 6463741 6463742 SentesTyphi_010100011058 SentesTyphi_010100011063 recA   FALSE 0.356 85.000 0.082 NA   NA
 6463743 6463744 SentesTyphi_010100011068 SentesTyphi_010100011083     FALSE 0.029 1343.000 0.000 NA   NA
 6463744 6463745 SentesTyphi_010100011083 SentesTyphi_010100011088     TRUE 0.997 -3.000 0.349 0.009 Y NA
 6463745 6463746 SentesTyphi_010100011088 SentesTyphi_010100011093     TRUE 0.998 12.000 0.533 0.009 Y NA
 6463746 6463747 SentesTyphi_010100011093 SentesTyphi_010100011098     TRUE 0.968 12.000 0.260 1.000 N NA
 6463747 6463748 SentesTyphi_010100011098 SentesTyphi_010100011103     TRUE 0.504 77.000 0.197 NA N NA
 6463748 6463749 SentesTyphi_010100011103 SentesTyphi_010100011108   srlR TRUE 0.488 199.000 0.183 NA Y NA
 6463749 6463750 SentesTyphi_010100011108 SentesTyphi_010100011113 srlR gutQ TRUE 0.979 -7.000 0.562 1.000 N NA
 6463750 6463751 SentesTyphi_010100011113 SentesTyphi_010100011128 gutQ   FALSE 0.024 1701.000 0.000 1.000 N NA
 6463751 6463752 SentesTyphi_010100011128 SentesTyphi_010100011133     TRUE 0.920 -3.000 0.111 NA   NA
 6463753 6463754 SentesTyphi_010100011138 SentesTyphi_010100011143     FALSE 0.079 146.000 0.018 1.000 N NA
 6463754 6463755 SentesTyphi_010100011143 SentesTyphi_010100011148     FALSE 0.074 201.000 0.000 NA   NA
 6463755 6463756 SentesTyphi_010100011148 SentesTyphi_010100011153   hycI TRUE 0.543 27.000 0.022 NA   NA
 6463756 6463757 SentesTyphi_010100011153 SentesTyphi_010100011158 hycI   TRUE 0.969 -7.000 0.360 NA   NA
 6463757 6463758 SentesTyphi_010100011158 SentesTyphi_010100011163     TRUE 0.910 -3.000 0.094 NA   NA
 6463758 6463759 SentesTyphi_010100011163 SentesTyphi_010100011168     TRUE 0.981 0.000 0.067 1.000 Y NA
 6463759 6463760 SentesTyphi_010100011168 SentesTyphi_010100011173     TRUE 0.981 10.000 0.000 1.000 Y NA
 6463760 6463761 SentesTyphi_010100011173 SentesTyphi_010100011178     TRUE 0.957 18.000 0.000 1.000 Y NA
 6463761 6463762 SentesTyphi_010100011178 SentesTyphi_010100011183     TRUE 0.995 3.000 0.382 1.000 Y NA
 6463762 6463763 SentesTyphi_010100011183 SentesTyphi_010100011188     TRUE 0.988 0.000 0.154 1.000 Y NA
 6463763 6463764 SentesTyphi_010100011188 SentesTyphi_010100011193     FALSE 0.373 270.000 0.667 NA   NA
 6463765 6463766 SentesTyphi_010100011198 SentesTyphi_010100011203 hypA   TRUE 0.913 70.000 0.306 0.002   NA
 6463766 6463767 SentesTyphi_010100011203 SentesTyphi_010100011208     TRUE 0.959 -9.000 0.000 NA Y NA
 6463767 6463768 SentesTyphi_010100011208 SentesTyphi_010100011213     TRUE 0.975 0.000 0.000 NA Y NA
 6463768 6463769 SentesTyphi_010100011213 SentesTyphi_010100011218     TRUE 0.992 -3.000 0.353 1.000 Y NA
 6463770 6463771 SentesTyphi_010100011239 SentesTyphi_010100011244   ddl TRUE 0.994 2.000 0.372 NA Y NA
 6463771 6463772 SentesTyphi_010100011244 SentesTyphi_010100011249 ddl murC TRUE 0.994 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 6463772 6463773 SentesTyphi_010100011249 SentesTyphi_010100011254 murC murG TRUE 0.791 144.000 0.283 1.000 Y NA
 6463773 6463774 SentesTyphi_010100011254 SentesTyphi_010100011259 murG   TRUE 0.986 -3.000 0.647 1.000 N NA
 6463774 6463775 SentesTyphi_010100011259 SentesTyphi_010100011264   murD TRUE 0.968 28.000 0.297 0.003 N NA
 6463775 6463776 SentesTyphi_010100011264 SentesTyphi_010100011269 murD mraY TRUE 0.999 3.000 0.647 0.004 Y NA
 6463776 6463777 SentesTyphi_010100011269 SentesTyphi_010100011274 mraY murF TRUE 0.998 2.000 0.309 0.004 Y NA
 6463777 6463778 SentesTyphi_010100011274 SentesTyphi_010100011279 murF murE TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 6463778 6463779 SentesTyphi_010100011279 SentesTyphi_010100011294 murE   FALSE 0.149 1768.000 0.000 0.003 N NA
 6463779 6463780 SentesTyphi_010100011294 SentesTyphi_010100011299   mraW TRUE 0.956 -3.000 0.227 1.000 N NA
 6463780 6463781 SentesTyphi_010100011299 SentesTyphi_010100011304 mraW   TRUE 0.990 2.000 0.635 NA   NA
 6463781 6463782 SentesTyphi_010100011304 SentesTyphi_010100011309     FALSE 0.029 606.000 0.000 NA   NA
 6463782 6463783 SentesTyphi_010100011309 SentesTyphi_010100011314     TRUE 0.947 -16.000 0.000 0.046   NA
 6463783 6463784 SentesTyphi_010100011314 SentesTyphi_010100011319   ilvH FALSE 0.062 284.000 0.063 1.000   NA
 6463785 6463786 SentesTyphi_010100011324 SentesTyphi_010100011329     FALSE 0.239 203.000 0.235 1.000 N NA
 6463790 6463791 SentesTyphi_010100011359 SentesTyphi_010100011364   oppB TRUE 0.868 122.000 0.151 0.044 Y NA
 6463791 6463792 SentesTyphi_010100011364 SentesTyphi_010100011379 oppB oppD FALSE 0.156 934.000 0.000 1.000 Y NA
 6463792 6463793 SentesTyphi_010100011379 SentesTyphi_010100011384 oppD   TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.001 Y NA
 6463793 6463794 SentesTyphi_010100011384 SentesTyphi_010100011389     TRUE 0.824 48.000 0.042 1.000 Y NA
 6463795 6463796 SentesTyphi_010100011394 SentesTyphi_010100011399   cls TRUE 0.628 77.000 0.231 NA   NA
 6463801 6463802 SentesTyphi_010100011424 SentesTyphi_010100011439     FALSE 0.029 582.000 0.000 NA   NA
 6463802 6463803 SentesTyphi_010100011439 SentesTyphi_010100011444   mepA TRUE 0.961 0.000 0.160 1.000   NA
 6463803 6463804 SentesTyphi_010100011444 SentesTyphi_010100011449 mepA   FALSE 0.079 153.000 0.025 1.000 N NA
 6463804 6463805 SentesTyphi_010100011449 SentesTyphi_010100011454     TRUE 0.624 36.000 0.081 1.000 N NA
 6463807 6463808 SentesTyphi_010100011464 SentesTyphi_010100011479   fadI FALSE 0.041 2357.000 0.000 1.000   NA
 6463809 6463810 SentesTyphi_010100011484 SentesTyphi_010100011489     TRUE 0.704 106.000 0.400 NA   NA
 6463810 6463811 SentesTyphi_010100011489 SentesTyphi_010100011494     FALSE 0.032 361.000 0.000 NA   NA
 6463811 6463812 SentesTyphi_010100011494 SentesTyphi_010100011499     FALSE 0.148 385.000 0.000 NA Y NA
 6463813 6463814 SentesTyphi_010100011504 SentesTyphi_010100011509     TRUE 0.998 -9.000 0.525 0.004 Y NA
 6463814 6463815 SentesTyphi_010100011509 SentesTyphi_010100011514     TRUE 0.998 -3.000 0.857 0.077 Y NA
 6463815 6463816 SentesTyphi_010100011514 SentesTyphi_010100011519     TRUE 0.997 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 6463818 6463819 SentesTyphi_010100011539 SentesTyphi_010100011554     FALSE 0.031 2446.000 0.000 NA   NA
 6463821 6463822 SentesTyphi_010100011564 SentesTyphi_010100011569     FALSE 0.063 155.000 0.013 1.000 N NA
 6463822 6463823 SentesTyphi_010100011569 SentesTyphi_010100011574     FALSE 0.263 187.000 0.245 NA N NA
 6463823 6463824 SentesTyphi_010100011574 SentesTyphi_010100011579     FALSE 0.342 92.000 0.122 NA N NA
 6463824 6463825 SentesTyphi_010100011579 SentesTyphi_010100011584   hslU TRUE 0.998 10.000 0.752 1.000 Y NA
 6463825 6463826 SentesTyphi_010100011584 SentesTyphi_010100011589 hslU   FALSE 0.283 67.000 0.051 1.000 N NA
 6463826 6463827 SentesTyphi_010100011589 SentesTyphi_010100011594     TRUE 0.773 93.000 0.158 NA Y NA
 6463829 6463830 SentesTyphi_010100011604 SentesTyphi_010100011609   glpK TRUE 0.685 21.000 0.000 1.000 N NA
 6463830 6463831 SentesTyphi_010100011609 SentesTyphi_010100011614 glpK glpX FALSE 0.125 112.000 0.025 1.000 N NA
 6463831 6463832 SentesTyphi_010100011614 SentesTyphi_010100011619 glpX   FALSE 0.384 97.000 0.117 1.000 N NA
 6463834 6463835 SentesTyphi_010100011629 SentesTyphi_010100011634   tpiA FALSE 0.248 113.000 0.058 NA   NA
 6463836 6463837 SentesTyphi_010100011639 SentesTyphi_010100011644     TRUE 0.869 10.000 0.007 1.000   NA
 6463837 6463838 SentesTyphi_010100011644 SentesTyphi_010100011649     FALSE 0.307 97.000 0.000 1.000   NA
 6463838 6463839 SentesTyphi_010100011649 SentesTyphi_010100011654     TRUE 0.896 29.000 0.000 NA Y NA
 6463839 6463840 SentesTyphi_010100011654 SentesTyphi_010100011659     TRUE 0.967 29.000 0.844 NA   NA
 6463840 6463841 SentesTyphi_010100011659 SentesTyphi_010100011664     TRUE 0.940 -532.000 0.000 0.043   NA
 6463841 6463842 SentesTyphi_010100011664 SentesTyphi_010100011669     TRUE 0.997 0.000 0.788 0.043   NA
 6463842 6463843 SentesTyphi_010100011669 SentesTyphi_010100011674     TRUE 0.996 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 6463844 6463845 SentesTyphi_010100011679 SentesTyphi_010100011684     TRUE 0.998 -3.000 0.429 0.004 Y NA
 6463845 6463846 SentesTyphi_010100011684 SentesTyphi_010100011689     FALSE 0.292 106.000 0.000 1.000   NA
 6463847 6463848 SentesTyphi_010100011694 SentesTyphi_010100011699     FALSE 0.039 283.000 0.000 NA   NA
 6463849 6463850 SentesTyphi_010100011704 SentesTyphi_010100011709     TRUE 0.890 9.000 0.000 NA   NA
 6463851 6463852 SentesTyphi_010100011714 SentesTyphi_010100011719     TRUE 0.501 145.000 0.273 NA   NA
 6463854 6463855 SentesTyphi_010100011729 SentesTyphi_010100011734     FALSE 0.045 334.000 0.000 1.000   NA
 6463856 6463857 SentesTyphi_010100011739 SentesTyphi_010100011744     TRUE 0.908 0.000 0.070 NA   NA
 6463859 6463860 SentesTyphi_010100011754 SentesTyphi_010100011759     TRUE 0.960 5.000 0.167 NA   NA
 6463860 6463861 SentesTyphi_010100011759 SentesTyphi_010100011764     TRUE 0.967 -3.000 0.278 NA   NA
 6463862 6463863 SentesTyphi_010100011769 SentesTyphi_010100011774     FALSE 0.181 115.000 0.000 1.000 N NA
 6463863 6463864 SentesTyphi_010100011774 SentesTyphi_010100011779     FALSE 0.152 136.000 0.000 1.000 N NA
 6463864 6463865 SentesTyphi_010100011779 SentesTyphi_010100011784     FALSE 0.029 526.000 0.000 NA   NA
 6463866 6463867 SentesTyphi_010100011789 SentesTyphi_010100011794   sifB TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA   NA
 6463867 6463868 SentesTyphi_010100011794 SentesTyphi_010100011799 sifB   FALSE 0.040 274.000 0.000 NA   NA
 6463869 6463870 SentesTyphi_010100011804 SentesTyphi_010100011809     FALSE 0.287 79.000 0.032 1.000   NA
 6463870 6463871 SentesTyphi_010100011809 SentesTyphi_010100011824     FALSE 0.029 1322.000 0.000 NA   NA
 6463871 6463872 SentesTyphi_010100011824 SentesTyphi_010100011829     FALSE 0.215 156.000 0.088 NA   NA
 6463872 6463873 SentesTyphi_010100011829 SentesTyphi_010100011834     TRUE 0.939 -13.000 0.175 1.000   NA
 6463876 6463877 SentesTyphi_010100011849 SentesTyphi_010100011854     TRUE 0.981 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 6463877 6463878 SentesTyphi_010100011854 SentesTyphi_010100011859     TRUE 0.995 11.000 0.148 0.014 Y NA
 6463878 6463879 SentesTyphi_010100011859 SentesTyphi_010100011864     TRUE 0.984 14.000 0.500 1.000   NA
 6463879 6463880 SentesTyphi_010100011864 SentesTyphi_010100011869     TRUE 0.728 132.000 0.500 1.000   NA
 6463880 6463881 SentesTyphi_010100011869 SentesTyphi_010100011874     TRUE 0.977 12.000 0.000 1.000 Y NA
 6463881 6463882 SentesTyphi_010100011874 SentesTyphi_010100011879     TRUE 0.981 10.000 0.000 1.000 Y NA
 6463882 6463883 SentesTyphi_010100011879 SentesTyphi_010100011884     TRUE 0.906 0.000 0.000 1.000   NA
 6463884 6463885 SentesTyphi_010100011889 SentesTyphi_010100011894     TRUE 0.870 12.000 0.000 NA   NA
 6463885 6463886 SentesTyphi_010100011894 SentesTyphi_010100011899   mdoD FALSE 0.070 205.000 0.000 NA   NA
 6463886 6463887 SentesTyphi_010100011899 SentesTyphi_010100011904 mdoD   FALSE 0.046 220.000 0.000 1.000 N NA
 6463887 6463888 SentesTyphi_010100011904 SentesTyphi_010100011909     TRUE 0.660 49.000 0.143 NA   NA
 6463888 6463889 SentesTyphi_010100011909 SentesTyphi_010100011914     FALSE 0.033 334.000 0.000 NA   NA
 6463890 6463891 SentesTyphi_010100011919 SentesTyphi_010100011924     TRUE 0.971 23.000 0.044 0.055 Y NA
 6463891 6463892 SentesTyphi_010100011924 SentesTyphi_010100011929     TRUE 0.929 25.000 0.000 1.000 Y NA
 6463892 6463893 SentesTyphi_010100011929 SentesTyphi_010100011934     TRUE 0.972 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 6463893 6463894 SentesTyphi_010100011934 SentesTyphi_010100011939     FALSE 0.180 137.000 0.000 NA   NA
 6463898 6463899 SentesTyphi_010100011969 SentesTyphi_010100011974     TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 6463899 6463900 SentesTyphi_010100011974 SentesTyphi_010100011979     TRUE 0.996 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 6463900 6463901 SentesTyphi_010100011979 SentesTyphi_010100011984     TRUE 0.971 -3.000 0.344 1.000 N NA
 6463901 6463902 SentesTyphi_010100011984 SentesTyphi_010100011989     TRUE 0.981 -3.000 0.501 1.000 N NA
 6463902 6463903 SentesTyphi_010100011989 SentesTyphi_010100011994     TRUE 0.988 52.000 0.501 0.001 Y NA
 6463903 6463904 SentesTyphi_010100011994 SentesTyphi_010100011999     TRUE 0.997 0.000 0.503 0.002   NA
 6463906 6463907 SentesTyphi_010100012009 SentesTyphi_010100012014   torD FALSE 0.175 263.000 0.000 0.041   NA
 6463907 6463908 SentesTyphi_010100012014 SentesTyphi_010100012019 torD   TRUE 0.965 -7.000 0.077 0.041   NA
 6463908 6463909 SentesTyphi_010100012019 SentesTyphi_010100012024     TRUE 0.994 -10.000 0.263 0.041 Y NA
 6463909 6463910 SentesTyphi_010100012024 SentesTyphi_010100012039     FALSE 0.015 797.000 0.000 NA N NA
 6463915 6463916 SentesTyphi_010100012064 SentesTyphi_010100012069     FALSE 0.051 232.000 0.000 NA   NA
 6463916 6463917 SentesTyphi_010100012069 SentesTyphi_010100012074     FALSE 0.028 900.000 0.000 NA   NA
 6463918 6463919 SentesTyphi_010100012079 SentesTyphi_010100012084     TRUE 0.963